Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722 | Staphylococcus lugdunensis strain SL13 chromosome, complete genome | 9 crisprs | csa3,WYL,cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1,cas3,DEDDh,DinG | 4 | 9 | 11 | 2 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041722_1 | 46739-46825 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_1
>1.1|46769|27|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder GTTGTTCGTGGAAATGCTTGTTGCATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_1
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_1 >merge|NZ_CP041722|1|46739-46825|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCGTTGTTCGTGGAAATGCTTGTTGCATTTCTTTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGC >NZ_CP041722|1|1|46739-46825|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGC GTTGTTCGTGGAAATGCTTGTTGCATT TCTTTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGC
>NZ_CP041722.1|WP_002478774.1|45825_46533_+|hypothetical-protein MEQSRSQHPTYQRTQYQPDYQLQTTKKRSWVSIIIHFIVLVLTAISGYSMYKQPLFIFGLKDTEVGYTQLKNFKQSLSNLSELSINSDQVTKLNGLGLSDIAKQLEALSIKPEHIEQLKSVIEQINMLFNIFFGLCILSLILTILTLLFNRTLLKLLNFLSIASMLAIVVYFMIAIDYLAQRIAKLLNNAYVQITPDQVIIEADATHNAIILLICCLALIFLSLFFRSKRQIKRL >NZ_CP041722.1|WP_012990759.1|44708_45617_-|alpha/beta-hydrolase MRTYMMNRVVNKYLLHNRSIQFKDEGQFNQFMEKRRNANRLKHKQPSTLNVKSNLDKLMLDDMQVFRFNFRHETGKKILYLHGGYNTLQPSPFHWRLMDKLTLATLYEVVLPIYPKAPEFHIDDTFKAIQAVYVQLVDEVGAENIVVMGDGTGGALALSFVQSLIKQQLSMPRKLYLLSPLLDATLSNPEITEKLQQQDQFVNRQGVHDILSVWAAGKPLNNAEISPINGNLEGLPPIVMFGAGKEIYYPDMERLDFYLSEQRQPIEFFRYPKMIHDFSLFPIHESHKVVKQIAQTIDNDLR >NZ_CP041722.1|WP_070817224.1|44286_44676_+|hypothetical-protein MTKSSIEKIKSYLLDLHDDLKLNLIDMNQTKDMFMNEPSTELLRRALNMSYYQGQKQALDWLQYNVESQDSHTLMTLIEDKLHLLTEQDSKVKNLAIMAKELPEQLSQEAHRDGQRSILKHIKTRIDVF >NZ_CP041722.1|WP_002478777.1|43813_44281_+|thioesterase MIFTVQGMVQQSQIDHNAHMHDADYNYIFSDAINQFNYTHGLSLAERQALHYTIFTVEEHTTYLAEMSLGEHYIIQLFIYNYDDKRIHFFLKLIKENGTLAATNEVMMLGIDSTTRKAAAFPEPYFTEMTSYYKTQDISQWPKQLGHQIGIPNKG >NZ_CP041722.1|WP_002478778.1|42747_43695_-|magnesium/cobalt-transporter-CorA MSITIRYQTPHTSLTTVPDIADVPKDATIVWYDFEDATAKENDFLRENFDFNYLEIDDTITGVPRVKYKAYDDYQYIVFHSINSDDYSPRALNVFLKNNVLVTYHHKHFSSLMKVAKWNAYHHDGELDCADIVIHILDMMVDKYFDFVYDIEEKVYNFEDKHVDDALSKKVMDNVFKLRSDLIKIKRVMFPMQELVETIKSEGNLIVDSKHSMYIQHIDDHLIKQSNIIRTSQEMTNEIRENYESYSSFRMNSIMQILTLVSVIFSPLTFIAGVYGMNFDNMPELRWHYSYYICLVVMLVIAIALIIFFRKKRWF >NZ_CP041722.1|WP_002460158.1|41649_42702_-|type-2-isopentenyl-diphosphate-Delta-isomerase MSNFQREQRKNEHVEIAMAQQDAPASDFDRVRFVHHSIPHIDVAQVNLSTHTSNFKLDYPLYINAMTGGSEWTKQINEKLATVARETGLAMAVGSTHAALRNPDMIESFRIARQVNPEGVIFSNVGADVPVERAVEAVELMEAQALQIHVNAPQELVMPEGNRTFASWMDNIAKMINHVPVPVIIKEVGFGFSKETFKALKDIGVTYVDVSGRGGTNFVSIENERRSNKDMNYLANWGQSTVESLLESQAYQSSLNIFASGGIRTPLDAIKSLALGAKAVGMSRPFLNHVENEGVEQTITFVAQFTTQMQQIMTMLNAPDIEALKQSQLIFDQQLLSWMEQRHIDIDRGL >NZ_CP041722.1|WP_002478779.1|40916_41525_+|DNA-3-methyladenine-glycosylase MDFIVPSTIDTAKALLGVKVIYNDDGQIYSGYIVETEAYLGFDDRAAHGFGGKQTPKVTSLYQRGGTIYGHIMHTHLLINFVTQQAGVPEGVLIRAIEPVDGIEAMKINRGKYGYELTNGPGKWTKAFHIPRAIDGTLLNVGRLSIDTKNRKYPREIEASARIGIPNKGIWTSKPLRYTVKGNPYVSRIPKKNMRAAIDTWK >NZ_CP041722.1|WP_002460156.1|40463_40679_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEVVTRLNKVKVYRGYSKISQLELARAVGVSRQTINMIENGKYNPSLKLCVNIAKTLGTTLDTLFWENDT >NZ_CP041722.1|WP_002478780.1|38898_39909_-|aldose-1-epimerase MIVEVEKQRHGIDLIKIDNNETSIVFSNYGARIVAWKFHDNNIVLGNRVEADEFYLNNPLKFGATIGRYSGRIEAGAFKLNQDRYQLEQNDGLNHIHGGSNGCDQVLFDYDIVEGISDVKVIFRAKLNASDDGYPGDLALKVIHHYDIEHRWTITYEAETTATTIFNPTNHVYFNLNRDNNVIDNHQIHAKDLKMYLLNRQHFLLNDTPINLASQFGSDHITFQKIFQAHQDDIKQQMERYQGLDHPFELSEQTLSVENGEFKLQIDTDMPYVVIYTMNHPETWESQLNIYKPHSGFTLETQFLPNDINYFGQQAPSILRAGQQFSSTTSYQISEQ >NZ_CP041722.1|WP_002478781.1|38169_38823_+|MOSC-domain-containing-protein MIPVVAISTGKIQHLPYSTKKPMISALDKIPFTGRMWLSIDGFSEDEQAYKDHGGPHKAVCCFSQSNYDMYKEDLAQLPTYAMFGENVTVKHLDERDVYFGNQYRLGEAILEVSEMREPCWKIQAKYQIPDLVKRMTASGKTGFYFRVIQEGYVSQEDNLELLTQANKASRLSVYELNDIYYNDRKNISRISYALNNPYLSPSRREKLSRLYHRACK >NZ_CP041722.1|WP_002478773.1|46869_48834_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MTTTFIIGYIVVALIFIGLINFFVVKSRKKNKNKGQFKEQRNLQDSKSQQSKFKISDLDKEEMSKNGFNQSKSNDIEDDKRKHQFNDTTEHIATTETGDTSDKLQHADETSHGVNQGDDAHDAINPNSVEGRVNEQIKNQNEDFVFGKNVTRAQIIAAMLFGMFIAILNQTLLNVALPRINTEFNISASTGQWLMTGFMLVNGILIPISAFLFNKYSYRKLFIIALTLFTLGSLVCAISTNFPIMMTGRVLQAIGAGILMPLGSNVIVTIFPPERRGVAMGTMGIAMILAPAIGPTLSGYIVQNYHWNVMFYGMFILGLIAIIIGFIWFRLYQRTTNPKADYQGVVYSTIGFGALLYGFSEAGNKGWGSTEIIVMFILGAVFITLFVIRELTMKAPMLNLEVLKSSTYTLTTIINMVVMMSLFGGMILLPIYLQNLRGFSALDSGLLMLPGALVMGALGPVAGKLLDTVGLKPLALFGIAVMTYGTYELTKLNLDTPYMHIMSIYIIRSFGMAFVMMPLMTAAINALPPRLISHGNAFLNTMRQLAGSIGTAILVTVMTTQTTQHFNAFSTELDKTNPVVQDHMRELATQYGGEQGAMKVLSMFVQKISSVDGINDAFWIATALSILAFILSLFLKSKKKADAEHDKMMSKEHI >NZ_CP041722.1|WP_002460169.1|48846_49494_-|HlyD-family-secretion-protein MKKLILINVITIVVLAVIGIIGFHFYNNATSYVTTDNAKVDGKQIKIASPTSGQIKSFDAKEGDKLSKGDKVATVVGKSESGDTQSMDIKMPQNGTIVKTDGAEGSMAQAGNPIAYAYNLDELYITANVDEKDVSSIEKGNDVDVTIDAQGTTVSGKVEHVGQATANSFSLMPSSNSDGNYTKVSQVVPVKISLDSTPSKDVVPGMNAEVKIHKN >NZ_CP041722.1|WP_002478772.1|49626_50178_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKNRAKYRIIFNFVHLLEQYPFEAITTKLICAHSNVNRSTFYANFKDKYDLYDIIQNYHKKKYINLLDTLYNDFEDVKSNNMKIHKFFVIVLKYIQRKKAFFHAVFITHPNREIAIEYFQLTKVKYEKILTDYNTTIENKSAFVTYTLGGQTAILLSWLKDGCQESPHKIADILLANTIKLQR >NZ_CP041722.1|WP_002478771.1|50619_51825_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MSSQQRDKQSLIFIIILGALTAIGPLSIDMFLPGLPEIKHDFNTSTAISQLTLSLFMIGLALGNLFVGPISDAIGRKMPLVVSMFIFTLASFSIIFVSNIWVMIVLRFVQGLTGGASAVISRAIASDLYSGKALTKFLALLMLVNGIAPIIAPTLGGIILSVSIWRTVFIVLTVFGILMLLGSALKVTESLHIEQRETSGIKVIFKNFGKLLATPKYVLPMLIQGVTFIMLFSYISASPFLIQKIYGQSPFAFSLIFASIGVTLIISSQLTGKLVDYVDRQQLLRILTVIQIVGVIIVGFVLTNHWSFWILIIGLIVLVAPVTGVATLGFAIAMDERTTGSGSASSLLGLLQSLLGGLVTPLVNLKGEYNSTPYLIIISIAALALMMLQIVNYFVFKESTE >NZ_CP041722.1|WP_012990757.1|51926_53300_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MTTCPKCGEEIKNEQTNHCPNCGATINDNGENSSNQASNEATIRLKKIVPWAIGGFIIILLIIVFVLLKNFNSPDAQAKILINAIDNDDSQKVATMLTTRDNKVDETEAQTYIKYIKKEVGMTKFIFDIRETVEKLNKSETRVAAYLQTRAGENVLRVSKNGRRYLIFNNMSFTPPTKEVTVKPKEDTKYEFKDDGRNKKVVAEADKETTIGKFIPGNYAIDAKKITDNGVFTGYLKFDFKYANSNTVDVNEDFNEAKVHVKIKNGEQLSRSSLKVKINDRTWDYGNAKVYGPYPKNKDITVSATGKVKGKTFETETKSIKADKLTDNTDVTVSFDDDDISDYIEKKEKEDNSLKNKLGSFFSSYSLSLNQAIAQSDFSLVHSFLKKGSSSYDKVRKNIASNTSARLVSPIILSVDQTGDTIKAKVQGFGLNGLPVVKNYVLEESKDDLGYKLVKVD >NZ_CP041722.1|WP_002460174.1|53397_53859_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSTISKSHIDFMKQFIDDVNTLTAKLFKDIQNEYGISVEQSNVLRLLSNHQALTITEITEKQGVNKAAVSRRIKKLIDAKLVCLEKPNSHIDQRLKYIKLSTKGQQYIDESKNILSRIANDMVKDFSSNEIEQALNVLCIIDSRIKQFNKQFD >NZ_CP041722.1|WP_002478769.1|54034_54988_+|YdcF-family-protein MLSISIAFLTFICIVPTLFNSQTFVSLRLYFISVILAFSFVLINLWQQSFVLCYFSLFIVLVTVLFVKHFYLIKQQQGRQLLQELMKYIYRLLLFSCACAYISLIHVPVFTGLFIWFSLIAISTLTTFALYLCFSSAFGRMTNHCTFDGIIVLGAGIFTEAVTPLLASRLNRALSIYNQQSHCTIIVSGGQGKDEPISEALAMKRYLLSHGVPEQSIIMEAHSTNTAENFLYSKSIIDAMTPKPNKLLVVTSQFHILRALRFAQKFGLPVQGIGSSTPCHLLARSLIRDFLGLMHQYKLLLTLYFALLFISAILLNL >NZ_CP041722.1|WP_002478768.1|55078_55747_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLKVANLRKTFGQGEAKTQVLKGIDFEIADGEFVILNGASGSGKTTLLTMLGGLLTPTEGTIEVNDKPLFSTQSHNSALRLTDIGFIFQAAYLIPYLSVIEQLTLVGKEAGQSHNDAQQRARTLLSDIGLAHRLDAYPHMLSGGEKQRVAIMRAFMNQPKIILADEPTASLDAKRAVQVVDMIKTQIKSNHMMGIMITHDERLFAYADRVIQLYDGQIVPG >NZ_CP041722.1|WP_002478767.1|55743_56805_-|ABC-transporter-permease MMKLAWREITFYKFRYILITLIIILLASMVLFITGLAQGLARENISFFEQQHAQHYVMQKMSQPQLEKSNISAQDTSKVRTILQQQPTRLKPQVLTVNQDSLDVMTVTTDKTFKPQLQAGTYPKKAHDIAINNKLTAKGIQIGDKVHFKGHSTHYHVTGILENTMYAHSSMLWMTQEGFEQLNKQAATVFPVKDLNEEQRSQLADDSKLELVKPDTLQANIASYQAEQAPLNLMVMSLFVITAIVLSAFFYVMTIQKISQIGILKAIGIKTRHLLIALIGQIMLITLFGVSIAVGLIWSLTFVMPVTMPFYIHLTNILVILGGFVLVALIGALLSMIKVLKVDPIEAIGGNAS >NZ_CP041722.1|WP_002460180.1|56932_57607_+|response-regulator-transcription-factor MVNCLIVDDDQTILDYVASHLNNEGYHTYTKPSGTAALQFLEQQTVDIAIVDIMMAGMDGFELCQQIKLDFDLPVIMLTARDALTDKERAFLSGTDDYVTKPFEIKELIFRIKAVLRRYQINAEHIIQLGNLTLNDNYMEVQVDHKTMTLPKKEFQLLYMLTSHPKQVFLRDTLIEKVWGFDYEGDERTLDVHIKRLRQRLSKLAANVTITTVRGQGYKVEAHV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041722_2 | 187625-187705 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_2
>2.1|187648|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder AGAAATGCGTTTTGCATTTCTTTTTGCTGGGGCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_2
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_2 >merge|NZ_CP041722|2|187625-187705|CRISPRCasFinder CCACCCCAGCTTGCGTTGTCCGTAGAAATGCGTTTTGCATTTCTTTTTGCTGGGGCCCCCACCCCAGCTTGCGTTATCCGT >NZ_CP041722|2|2|187625-187705|CRISPRCasFinder CCACCCCAGCTTGCGTTGTCCGT AGAAATGCGTTTTGCATTTCTTTTTGCTGGGGCCC CCACCCCAGCTTGCGTTATCCGT
>NZ_CP041722.1|WP_012990736.1|186596_187358_+|DNA-binding-response-regulator MNILIVDDEPLARNELHYLLDNIPTVKHVEEAENISETLEHLLYASFDAVFLDINLMDESGIDLAEKIKKMQYAPYIIFATAHDTFAVKAFELNATDYILKPFEQQRIEQTIEKIARTKQYVNSAADQNKLEPQNHQNINTHTKQTVLPIEVDERIHVLNVEDIVAVTVNNGITTIHSVNQDYQTSEKLNYYEKKLPTTQFLKIHRSTIINKVHIKTVEHWFNYTYQLTMTSDIKLQVSRSYMKTFKQEIGID >NZ_CP041722.1|WP_002460334.1|184841_186596_+|sensor-histidine-kinase MFNLFILLLERVGLIIIIAYLLMNTSHFKTMMGEREKWRSQWQLLIIFGLFAITSNFTGIEIKDGQIISSNIYYHLNSEASMANTRVLTIGASGLIGGPYVALFVGIISGLSRMYIGGADAYTYLISSIIIGLTSGFIGHLAIKNHRYPTVLQGAVIGIINEAIQMLCILIFSEDTTAAIELVQLISLPMILINSIGTAIFLSIILSTLKQEEQARAVQTHDVLQIANETLPYFRAGLNEASAKRVAEVILPLMNVSAVAITNKKDILTHVGAGSDHHIAKKEIITNLSKEVIRSGQLKEAESKEGIGCNHDNCPLEAAIVIPLYTNHNVVGTLKFYFKDKHDVTNSTKQLARGLAEIFSSQLELGKAETQSKLLRDAEIKSLQAQVNPHFFFNAINTISALVRIDSEKARKLLLQLSQFFRSNLQGARNNTITLEKELQQVEAYLSLEQARFPNRFHIDYHIDKQYHHILIPPFIIQILVENAIKHAFKNRKANNHITVTASQHDDAIQLTVTDNGQGIPKERIPLLGQISVNSETGTGSGLENLNRRLIGLYGPTSQLSITSTNKGTRVSCMIPYHEQKEDI >NZ_CP041722.1|WP_002478679.1|183139_184534_-|MFS-transporter MNTSQEFRGDNRLLAGIIIGVLTFWLFAQSVVSVIPALQSSFNANIGTINIAVSLTSLFAGLFVVGAGDIADKFGRVKMTYLGLALNIVGSLLIIIAPFPWLLITGRALQGLAGACIMPATLAIVNTYFLGKERQRALSYWSIGSWGGSGICSLFGGWVASTIGWHWIFIISIALSFVAFFLIKHTPETKAETTGSEVKKFDVIGLILLVITLLSVNVVVTQASDKGLFSPMILTLFVVFFIAGFAFLIYENKADNPLVDFHLFRNKGYSGATVSNFMLNGVAGGTIVVINTFYQQKLGFTSGQAGMISITYLISVLIMIRVGEKILQAQGAKRPLLFGSAFTFIGLLLLSLTFLPDIWYIISSVVGYLLFGTGLGMYATPSTDTAVAEAPDEKVGVASGVYKMASSLGNAFGVAMSSTIYGLFASAMNLQWGGAAGVLFNAGIAVLAFFMILLLVPKRTNMTP >NZ_CP041722.1|WP_002478680.1|182024_182957_-|2-dehydropantoate-2-reductase MKIAIAGSGALGSGFGAMMYKQNYDVTFIDGWEPQAQAVKQDGLHIDINGEANHLNIPMYHDTEIPKGDQYDVIFLFTKSMQLSDMLEQIKPHIHEHTIMVCTMNGLKHEDVIVNYVDEARIVRGVTVWTAGLESPGHTHLMGAGPVEIGALIPDGQANVDVVFDILKHSGLNPLKSENLQQSIWKKICVNGTANALCTVLECRLSTLNASEYALNLVYKLTQEILAVATIDGVHLNVDDIYDYLVDLNHKVGPHFPSMYQDLINNQRLTEIDYINGAVARLGQEHGIDAPVNQFVTNLIHAKESQRQAK >NZ_CP041722.1|WP_002478681.1|181576_181843_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MGYLERETFITIAVIAMRNTYFYEIKNIAVDINYQCQGLDRRLMEQIFTDYRGTTMYGGTSDSPVTQSFYRSLGFKYVETNKVFYYQL >NZ_CP041722.1|WP_002478682.1|180521_181373_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MVKIFVTGATGLIGTKLTQRLLEEGYDVAGFTTSEQGKQRLEAANVKAYIGDILKADTIEAAIADFQPEIIINQITDLKKVDMTANTKVRIDGSKNLIDAALKHHVKKVIAQSIAFTYEPGEGLATEETPLDDHSTGDRKITVEGVEGLEEQTARMDNYVVLRFGWLYGPGTWYGKDGMIYNQFIDGEVTLSDGVTSFVHLDDAVETSIQAINFANGIYNVADDEPVKGSDFAQWYKQQLKVNPKVNITPAEPFERGVSNEKFKSQGGTLQYKSWKDGMNPIQ >NZ_CP041722.1|WP_002460326.1|179636_180458_+|membrane-protein-insertase-YidC MNKHTRLLFFSCILLLAGCNYSKKQHQTGFFFYVFVKPIDWLLHSIGQLFHSYGIAIILIVIIIRSILLPLMLNQMKQMHTLREKRAIVQDEISDIQTQMRQASTPEIRKEANQLLLAKYKEYGISPFKSILGSLPIFIQIPIILGLLACIKHPTSDALAQHPHFLWFNLMHPDIWLALLAGLLYFIQPLVNAIHYPKGQRKTYYTMMVLSPLFIIYASLHSAAAISLYWVVSASFLIVQTHFGHRRYKKQAQAAAIQLENYIAQRDQTSSQH >NZ_CP041722.1|WP_012990737.1|178013_179525_+|serine-hydrolase-FLP MKKKIFAFLGGTIFVVTILTIAMIINHHINQKKTETMLSKSSQHYIDKIITSEMDSGHIPGLSVLIMKDNKVYLNKGYGYANTSTKVKATPKTRYEIASNTKAFTGYAILQLENEGKLHLSDKVSKYVPGFYMKYKDKRIDDITINQLIAQTSGIPGDITDNDTITSKNDSLSGIVDSIKGRELNNKPGDQFEYSNMNYDILGLIVQKVSGQSYSSYLENQIFSPLNMHQTYVKGDTEKKGSTAQGYEIKHGKAVKDNPKYNVGDGPAAYMVSSTKDLESWMSRQLNPTQATQSLVQSSHKPKVKTADDNKAPSYATGWFVDDSEANTIVYHPGTLENFSSYILLNKKKNYGIVVLANAYSDKTPDIAEDLNSQILNNKNYTTIENAINQSSLVSYVIITLSLFITIAIAFYMLRRIINIYHGTFVIHVQWKLLGYFLIIMAVFISLMTAIYLLPDLVMGNTNWDFIMVWLPLHAKLALWSVMLTILCATITLVTMLFSKKKR >NZ_CP041722.1|WP_002460323.1|175905_177732_-|APC-family-permease MFNQFKRLIIGKPKRNRELKNEKISKFKALAILSSDALSSVAYGPEQILLTLSIVGAAAAWYTLPIAVAVLILLAALTLSYRQIIYAYPKGGGAYMVSKSNLGEKWGLLAGGSLLVDYILTVAVSISSGADALVAAIPTLYSHKVLIACLLVLFILLLNLRGLTESATVLSYPVYLFIVGLIVMIIIGTFKVATGQAEPHMQSAVGTAVPGVSLFLLLKAFSSGASSLTGVEAISNAVTNFKEPGPNNAVKTLIAMGSILGFLLVGIVGLSYWYGILPQEETTVLSQLAKHVLGQNVAYYFVQATTVMILVLAANTGFTAFPMLAASMAKDKYMPVMFTARGDRLGYSNSIIVLGVLAIILIILFDGKTENLIPLYATGVFIPFTLAQFGMVIKWIKGREKGWAVKLIANAVGGTITFVVFMIFLITKFNQVWPILIFLPIVVIGFLKIRMHYRDIAEQLRSNAMIQDMPIVDKNLALVPISSITSAVDKSIYYAQMIADDVIAVHVSFGDKDETCLQNKWKAHFPDIRLVILRSEYRSVIRPISRFIDKINKKANDKNYVITVVVPQFVTKKPWHNFLHNQTSIRLKMHLFYQKNVILATIPYKLKK >NZ_CP041722.1|WP_002478684.1|174572_175517_-|hypothetical-protein MRKGIVMILLALGLTLAGCSHHDNDNKESSTKSDKSSKTDTETVKIKDDDKMTDKEKEYKELEKKASKKEKVDIMGKLDPLVTEKSLTNKTGMQGWKDYKELMKKVEIADYNYVKESKGASMKEVDDFFKDKKGVKRKEIKNPGGLKQIDYWYVDPSGKKIGKSNIPEFYAEILTKYKDGKLVYASIEPGFYTADFAKALDGDKMKDIKTLNQLVAPKPVSYGIGQMKYSGIPLVNVSVIAKAPAKKKEDQVPVLAFYTFSPFNYNSDKEPQVAYLSGIEFMSGSRDFGNSNYLSMMKFIKEQKEVLDQGVHDS >NZ_CP041722.1|WP_002478678.1|187868_188330_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MANENVNKAKAHSQSVVSKTYNFFQQALTIAVILLISKIIESFIPFPMPASVIGLVLLFIALCTGIVKLGQVESVGTALTNNISFLFVPAGVSVINSLPILSKNPILIILLIIISTLLLLVCVGFASQFLVTKSLFPTAEQNEKSRHVEGDNH >NZ_CP041722.1|WP_002478677.1|188329_189031_+|antiholin-like-protein-LrgB MIEHLGINTPYFGILVSLIPFVIAQYFYKKTNGFFLLAPLFVAMVAGIAFLKLTGISYAQYKVGGDIIYFFLEPATISFAIPLYKKRDVLKKYWLQIFGGITLGTLAALILIYLVSTLFQLGNTVSASMLPQAATTAIALPVSTGIGGVKELTSLAVILNAVVISALGTKIVKWFKISNPIARGLALGTSGHTLGVAAAKDLGETEESMGSIAVVIVGVIIVAIVPPLASILF >NZ_CP041722.1|WP_070817284.1|189302_189944_-|DUF443-family-protein MLCESKIINKNPKYRIIKYKDDYLMVDIVSHWFTFLFPMINWFIPKRYAKLSEVEYNNLNIVKPVKNSGASIGVGLAILISVLLRKYVFIFDVQVQQSIAVISCIIGFLCVFIFFLYINKKVTLDIYKINKTHSKIILIPTLKNIGFTLFSYIFLGGFVWMILYGLTVENLYNIFIFIIWIGSIALFFFFNMFAIMDKKVHIILKNKEMNCHG >NZ_CP041722.1|WP_002460342.1|190077_190389_-|DUF4176-domain-containing-protein MITIGSIVYLKGGSQKMMILNRGPIIEQDDKKVMFDYSACKYPLGLVENQIYYFNTENVDRVIFEGYSDDDEIRFQELYQEMLNELSDDITRGEVEEKQFGLE >NZ_CP041722.1|WP_002478675.1|190385_191042_-|DUF443-family-protein MKWEVVIMLCESKIIRMNPKYRIIKYNNDYFMVDTICHWITFLFPMINWFVSKRYAKLSEEEYNNLDIVKPVKNSGASIGAGLAILISALLRNYVNIFNIQIQESVAVLSCVIGFLGVFIFFLHINKKVTLDIYKRNKTHSKTILIPTLKSIGFTLTSYVLCGGCALIIMEMLTIDHLYNVFIFILWVIWIAFFFFINMFAIMDKKVHVILKNKEVKI >NZ_CP041722.1|WP_002478674.1|191091_191718_-|DUF443-family-protein MLCESKIINMNPKYRIIKYNDDYLMVDTISHWITFLFPMINWFVPKRYAKLSEEEYNNLDIVKPVKNSGASIGVGIIIILNVLFRKYIDVFNVQVQESVAILSCVIGFLGIFIFFLYINKKVTLDIYKRNKTKSKIILIPTLKNFGFTLFSYLLFGGISWVTMEMLTIDHLYNIFMFIVWIGIIAAFFFVNMFAIIDKKVHIILKNKV >NZ_CP041722.1|WP_002478673.1|191720_193178_-|transposase MSIDMYLNKSKNQASNMRKLSQAMNQSYDSLNNAVLQFVTKEDLQGKAYRSAKQFFSAVVIPLSYSMKTLSDMTEEACTTFVERYTQEVDNQSLKESELEEDINELKQRIALLEEINGGLKKYLSEKRDTISRNNRMIASLEQQKHELEEKLRKLQEFNQKSPEIFKDVEAFQDVVKQGLNQLQTSWNPVTKEFNIPSGKDLEWAKVSNEKYLKVAMKKIEEKAKTGKLNKQDGKIIQEYAEKHQDEDLPQSLINYFIQNKDNIKQSLEIDISSKLIEQIGVQSKNIGVFINTAGGYKGPKGPNSFVQVKRTWGDAIIKDSKEFAKNGKILGGVITGLGFFISVRSDLNEGKTCGEALSHNALTMSAGWVTSTIISGTIIALAANPVGWAALAGIAVGTLAAYGADWAYQNNKLGIKDKVDWLGHKMDPVLGQLGQTKDQTIKILDNTATNVSNGVKNTAETVKNTVGEAVNNIGDNMNPMKWKW >NZ_CP041722.1|WP_002478672.1|193167_193533_-|hypothetical-protein MDKVTTLNNQIYKTNLEVETLTEQQRGLIHLINDYEDATRNTEKLYDRLIYRYGSSNSAFSLEQHRDEFQQEKQAILEELIDNQDNVKHQIRKLNDCIEVLEAQRNIELHKANEKGHDYEH >NZ_CP041722.1|WP_002478671.1|193548_193821_-|TIGR04197-family-type-VII-secretion-effector MSEIKSDMSKTYHAYYIINNATRSCSSISEPGKDESTTVSGNKNAHTAIEQLLTINTSITAALEKANTTLKEVGDSFEAMDLTLGNQISK >NZ_CP041722.1|WP_002460346.1|194130_194811_-|ABC-transporter-permease MDGNLLQQLAHYYSTNFGYLMGLFFKHLLMSVYGVLFASIVGIPIGIFIARFKKLAWPVITIANVIQTVPAIAMLAILMLALGLGPTTVVVTVFLYGLLPIIKNTYTGIVEVDANIKDAGKGMGMTSNQVLRMIELPLSLSVIIGGIRIALVVAVGIVAIGSFIGAPTLGDIIIRGTNSTDGTAFILAGAIPIALIAILIDIGLRMLERKLDPTQKKKGPQPQTIN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_3 | 219932-220012 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_3
>3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder GTTGTTCGCGGAAATGCTTGTCGCATTTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_3
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_3 >merge|NZ_CP041722|3|219932-220012|CRISPRCasFinder TTTGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCGTTGTTCGCGGAAATGCTTGTCGCATTTCTTTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTG >NZ_CP041722|3|3|219932-220012|CRISPRCasFinder TTTGTTGGGGCCCACCCCAACTTGC GTTGTTCGCGGAAATGCTTGTCGCATTTCTT TTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTG
>NZ_CP041722.1|WP_002478657.1|218404_219685_+|O-acetylhomoserine-aminocarboxypropyltransferase/cysteine-synthase MTNQNWHFETQTIHAGQEIDDFSKSRAVPIYQTSSYVFDNTQHAQDLFALAQPGNIYTRIMNPTQNVFEERVAALEGGIGALATSSGQAAITLALLNIVNTGDEIVASSNLYGGSYNLLNVTFKKLGITVHFVDPDHPENFAAQINDNTKAIYAETMGNPKIDVLDITAVADVAHQHGIPLIIDNTFASPYLCRPFEFGADIVIHSATKFIGGHGTSIGGIIVDSGKFNWDNGKFPGLVEPDESYHGVSYTKDVGEAAYITKARVQLLRDLGSAVSPYNVHEFLIGLETLHLRMERHSANALKVAQFLDQHPKVTWVNYPGLVNNKYHALAEKYLPKGQGAILTFGVDGSVEDISRFVDALDLFSLLANVGDSKSLVIHPASTTHLQLSEEEQRKSGVLPEMVRLSIGTENADDIINDLAQALETV >NZ_CP041722.1|WP_002478658.1|217044_217875_+|phosphonate-ABC-transporter,-permease-protein-PhnE MTHEPQTFQSPKYNLSTKRQKQRVIKRWVIAIVVALIVIWGFAGMPALELKSKSVEILKAIFSGLFHPDLGYIYIPEGEDLLRGLLETFAIAVIGTFIAAIICIPFAFLGANNLVKLRPVTGTTKFILSVIRVFPEIVMALIFIKAVGPGSFSGVLALGIHSVGMLGKLFVEDIESLDFTSVESLKASGANKTKTLVFAVIPQILPSFLSLILYRFELNLRSASILGLIGAGGIGTPLIFALQTRSWDRVGIILIGLVIMVAIVDLISGAIRKRIV >NZ_CP041722.1|WP_002460370.1|216241_217048_+|phosphonate-ABC-transporter,-permease-protein-PhnE MTSPATSTNKYDKYLNKKLSLKTSFSILIVAVLVIWSFVYTGFSFSDLMVGVPQIGDFFKQMFPPEWSYLKAIWQPMLDTIRMAIVGTFLGAIVSVPIALICASNIIRTKWITIPARFILNIVRTIPDLLLAAIFVAVFGIGQIPGVLALFILTICVIAKLLYEAIETIEPGPMEAMTAVGANKTKWIVFGVVPQIISTYFSYVLFAFEINIRASAVLGLVGAGGIGLFYDSTLGLFQYPRTAMIILFTLVIVVIIDYVSSKVREQLA >NZ_CP041722.1|WP_002460368.1|215466_216240_+|phosphonate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSQIEFKDVSKVYPNGHVGLKDINLNIEKGDFAVIVGLSGAGKSTLLRSVNRLHDVTSGDITIEGKSITQAKGKSLLLMRRNIGMIFQHFNLVKRSTVLRNVLSGRVGYHPTWKMILGLFPKEDKIKAMDALERVNILDKFDQRSDELSGGQQQRISIARALAQEPSIILADEPVASLDPLTTKQVMDDLKKINEELGITILINLHFVDLALEYGTRIIGLRDGELVYDGPAEEATEEVFNEIYGRQLKADEKLGVN >NZ_CP041722.1|WP_002460367.1|214387_215341_+|phosphate/phosphite/phosphonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKHVKYLLLLVLSVVIFAAACGGNSSLDNNSKSSNSESGKGNYKPKELTVQFVPSQNADKLEAKAKPLEKLLSKELDIPVKVSVSTNYNTIVEAMKSKKVDVGFLPPTAYTLAHDQKAADLLLQAQRFGVNKDGSPTKKLVKDYKSEILVKKDSGIKSLKDLKGKKIALQDVTSTAGYTFPIATLKEKAGIDATKDMKIVNMKGHDQSIISLLNGDVDAAAVFQDARNVVKKDQPNVFKDTKILELTKPIPNDTISVRPDMDKDFQKKLKKAFKDISKTKEGHKIISEVYSHEGYTDAKDSDFDIVREYEKKVKDMQ >NZ_CP041722.1|WP_002478659.1|212617_214141_-|DNA-binding-protein MKMIKVVSSTIVASALALSMFPSTQAAETNTASRTVLFDNSHGQTAGAADWVIDGGFSDYADSMKKQGFAVKSLDGEANISQESLKNSDILVIPEANIPFKTTEQQAIVNFVNHGGSIIFISDHYNADRNLNRIDSSEAMNGYRRGAYADMTKDMDQGEKQSKAMAGVSSSDWLAQNFGVRFRYNALGDLNTSNLVSSDESFGITKGVKSVSMHAGSTLAITDPKKAKGIVYTPDHLGNNAKWSHAVDQGVYNGGGKAEGAYIAIAKVGKGKAAFIGDSSLVEDSSPKYLREDTGKTKKTYDGFKEEDNAQLLNNLTSWLSKKEATPNLAKSGVKLDKATVLHDFEQPQNSTEPQKEPWSQPPEGYHWYDRSTFAPGSYGSTKSTKDDGDKQPGDQPAVQNVAFAIPKDVQANTPFNITINLSQLPANQSLDNLKLGIYQDGGKQIGQFSTDGKSYSNIGYGSLPTIKVNKDGTASVTISAKVTESLKGANIRLKQGDKTLKTEKLK >NZ_CP041722.1|WP_002478660.1|211062_212601_-|bifunctional-metallophosphatase/5'-nucleotidase MTQLAFYILSDIHGYIFPTDFKQTKGYKPMGLLLANHIIEQDRQRYDASFKIDNGDFLQGSPFCHYLATHIHSSKPLTDIYNRIGFDFGTLGNHEFNYGLNYLTQSINRLNYPILCANILKDNKSLTEQGIMYIKKQGYNIGIIGLTTQYIPHWERPEYIQHLTFNSAVQTLEDILPQVREQADIVVVSYHGGFERNIDTYQPTEVLTGENEASEILQRFGSDIDVLITGHQHREIAAIKHDTVILQPGTRATQIGKVTLTFNDRRQLVQRTSELLPVHDDSAFKLTDKDSQLMSDVDTWLDTPIAEIQQNMIVDEPFTARIAPHPFINVLLHALLQTSGAQIASTALFDSATGFDKTITMRDIINNYPFPNTFKVLEMTGKGIREALEQSARYFDLTDSGDVGINDTFLNPKPQHYNYDIFGGVSYNIKVSEPMGHRVHDIKVEGQPLVEDKIYTVCVNNYRAVGGGDYNMFAEAKVVKDIQVEGAQLLIDYLTHHNLNNMPQVVDFKVEI >NZ_CP041722.1|WP_002478661.1|209233_210811_+|FMN-binding-glutamate-synthase-family-protein MILTTMQFIVNVIIVSCLLFVVLLGLWLLFKDKHQKQHSVLRNFPLLGRIRYFSEKIGPEMRQYLYANDTEGKPFSRVDYKNIVIAGKYNSRMTSFGTLKHYEHGFYIQNAMFPLQSTELVIDNQHMISTFIYQVDNERLFKRDEHRKPADIKPFQLDDQHAVVIGNDLAHPFIVKRLVGQSGMSYGALGQRAITALSQGLARAGTWMNTGEGGLSDYHLSGGGDIIFQIGPGLFGVRDQEGNFSKDEFVKLVNQSAIKAFELKLAQGAKTRGGHMEGNKVTEEIAQIRNVKPFQTINSPNRFNFISNAAELITFVDELKQLGQKPVGFKIVVSHVDEIEILVKEMIRLDKYPSFITVDGGEGGTGATFQELQDGVGLPLFTALPIVSGMLERYGIRDKIKIFASGKLITPDKIAIALGLGADLVNIARGMMISVGCIMSQQCHLNTCPVGVATTDPKKEKALIVEEKTFRVTNYITSLHEGLYNIAAAVGVNNPTNITAQHIIHQQQNGTLQSIDTYKLKLLEP >NZ_CP041722.1|WP_002478662.1|208153_208918_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQTLNTYNTRQPIDAHVKKRLFWVIPVYVFLKVLMPIIIVFGVYGIWAVLTQDKPTQVIYPIVLTLSFIVAEIVTLKCFFFLYQQKLRTIYQRLSSDIKPMLWPIVIVSCLTLLAYYGGQCIAHHLNQPWGFQHSQSEQYLSGMFTHPHALPFVWVSMVVLRPLVEELIFRHLFIHELAKCIPMVVAMIFSIIADVVAHSYHYHSVLEIGIYSLIPIGAVIIYRWSQQNLLAAYVYHSMTQCIIFLVLSYQSYL >NZ_CP041722.1|WP_002460360.1|207351_208131_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MNHRMTKNNRISSMTYHQNPWRQPQMVKRDFLLILVYVLGNMYLPFILADAINWLSFTLLHRPSGLTYTSQLYALLAQLSVVLIFWALHYRALLNTAIARVKQLQRYIYLMIIVLLVMYVANIVYANVMQFLPEHWQFHDTQNEQEIRKLFSNIKVWPLLFLNIVIITPIVEELLFRHLLIHELGKKLSYPVMSIISILLFAGIHVTDATSPFEIGPYLIMATSFVVAYNMSGRNLAVTIALHSFNNLLSFILTLLQFL >NZ_CP041722.1|WP_002478656.1|220055_220511_-|DUF1307-domain-containing-protein MKKFIAMIAIVVITIVTLSACDKERTKTYEGDIDGKHVITSLTYKNNKVISQSTISTLKYDDMGLSEKEGKALFKKHKALENAKGVDYRLTSERDKIDEKVDIDYNKADIQKIKRNFDLFSYDKNNHKVNMENSVKYLKKLGFEEKSKMTK >NZ_CP041722.1|WP_002478655.1|220676_221753_+|M42-family-metallopeptidase MKASIELLKTLTDVNGIAGQEMQVKETMRDYLNPISDSIIEDHLGGIFGKREATYGTKSIMLAGHLDEIGFIVTKIDNEGFIKFQPIGGWWSQVMLSQKVTITTDQGQEIRGIIGSKPPHVLEAEERKKAVDIKDMFIDIGARSREDVEQHGIEVGNMITPYSEFETLANSKYLTAKAFDNRYGCAVAVEVLKNLKDENLGINLYAGATVQEEVGLRGAKVAAQTIKPDLAIAVDVCVPYDIPGMSGQTSETALGNGPVVIMMDASSIAHQGLRQHIKEVAKKHYISVQWDTTPGGGTDAGSIHVANEGIPTITIGVALRYMHSNVSVLHTDDYENSVRLITEIVRSLNDETYQQIVW >NZ_CP041722.1|WP_002460377.1|221987_223535_+|aminobenzoyl-glutamate-transporter MPSSVKRKEKASFITRFLNGVEWVGNKLPDPAVLFFMMCVLLAVMTWVISWFNVSVKHPGNGHTIHIKSIISTDGIAMIMNDAIKNFSEFPALGLVLAVMIGIGAAEKSGYFDKLLISVVNHASKKLILPTIIFIGIMGSIAGDATTVILPPLAAMLFIKIGYHPIAGLAMAYASSLGGFGANLIIGMQDALVYAFTNPATKIVTDKVNTNVAMNWYFIAASVFMLIPTLYFTTTKLVIPHLGKYDDSKAELDDTDQPSSTVTPIEQRALRWANISFIVLVVALIICAIPEGSWLRNPKTGSLIDNSPLINGVGLVILVIFLIPGVIYGVLSKQIKSTKDLGKMISDSLATMSSFILIVFFAAQLLAFLKWSNLGVIVAVKGANLLQGQHGIVLIIGILILSGLVNMVIGSASAKWGILAPIFVPMMLLIGFHPAFTQMIYRVGDSITNPITPMMPYMPLLLTYAQKYDKNMKLGSLLSSLMPYTIVLSIVWTLFLIIWYLLGIPVGPGGPIKAN >NZ_CP041722.1|WP_150891387.1|223844_225383_+|exopolyphosphatase MEERIGLIDIGSNTIRLVIFKFSKTAGLNEILNIKTPARLSQYLTSKKEMSKDGIKVLIEALKSFKKVAQEFNVTELHPIATAAIRQSKNKNAIIKQVKKELNIDMKIIPELDEAYYGFYAITHTTEIANGVSVDIGGGSTEVTLFKDKELVESHSFPFGVVTLTRMFFENKAHNNKSAIKDMEKFISSQFDELSWLQDKKVALVGVGGSARNVARIHQSEHSYPIGGVHNYTMPDNDIEEVLDIIRKSDRDDLTNLDGLSRDRVDIILPAVCVFKALYKKVNATQFTFSRNGLREGYIIKQIRDRYTDVFDKYNVRKEAIHFLANEYQIEESSSASRLKLAKSLLSQIMQYSEFNLSDKEQRLFEEGAYIYYLGSFIDSDSSSPHSYYIIANSMINGYTHKDRVKLALLASFKNKSLLKFYCTETNWFGNKEIDTIQILGGIIKFVNALNISHTSFVEDVSLKPLKKAEEDFELIVYHKGEPIAEKYQAMRQKKHIEKVLKGKVAITFTKY >NZ_CP041722.1|WP_002478653.1|225475_227641_+|RNA-degradosome-polyphosphate-kinase MQNQLGENNINLPQYYNNRELSWLDFNYRVLQEAYDDNNPLLEKLNFISIFSSNLDEFFMVRVAGLKDQVKMGYDKPENKAQMTPQEQVDAIQEKNTTYVDKQYERYNELIEELRQYDIEMSQPEQLSNQLLTRLEQEFKTTILPTLTPLGIDAYHPFPKLNNKSLNIFVDIDTEDAINSAIVQIPSLIPRFITLNEGTKQYVLMVEDVITYFINYLFTGYEVLNTFTFRITRNADLTIHEDGAEDLLIEIERFLKERKSGSAVRLEVDGRTANSDDIPWLIDTLEVENNDVYFVNGPLDLTFLFGLVDHLSHKLKFLTYEQYTPQVPRSLGTNNIYELALKRDIFFHHPYESFQPIVDFIREAADDPDTIAIKQTLYRVSKDSPIIKSLKEAAEKGKQVTVLVELKARFDEENNVHWARMLEDAGCHVIYGMTHLKTHSKIALVVKRTHGTLTSFVHLGTGNYNDKTAKLYTDMGIITTNKEIAEDAINFFNYLSGYSVKPVYNKLIVAPFDIRDVFIDRIDKEIKSHHEHGNGHIIMKMNSLTDKAIIKKLFEASQAGVKIQLIIRGICCLKPGIPGISENIEVVSIVGRLLEHSRIYYFYNNGDQRIYLSSADVMTRNMIKRVEILFPVEDNDIAKRLLDYMNLQLSDNQKGRYQDQYGQYHYIKNDMSPLNSQAYLMQKAIKYGKQLKKLASQPSGVPVVSKRGAGWVKKLRDTFKR >NZ_CP041722.1|WP_002478652.1|228023_229259_-|acetylornithine-deacetylase MEQRLFDLLELLVKYNTESPPGRNTNPLQDDIQRLLEDLGFTIQREVLYPNDSIIVATLKGEDPTAPKLILNGHVDVASVDDDREWNYPPFELTHVNDWLYGRGVSDMKGGMAALFYVLERLHQEGRLPQGDIIVHSVVGEEVGEAGTKRACEIGPKADLALVLDTSDNMALGQGGVITGWITVKSKHTIHDGARHQTIHAGGGLFGASAIEKMMKVIQALNELERHWAVMKSSPGMPPGANTINPAVIEGGRHPAFIADECRLWITVHYLPNECYEDVIAEIETYLNQVAAADIWLKDHPLSFEWGGASMIEDKGEIFPSFEIPTTHPGFKALQQAHELVHHKPLEHGMSTTVTDGGWTAHFGIPTILYGPGSLTEAHSVDEKITATELQTYSEVLYQYLKQWYQHPVKN >NZ_CP041722.1|WP_002478651.1|229458_230154_-|SDR-family-oxidoreductase MDNIVGRVAVITGASSGIGKEIAKAMHSMGFRVVLAGRNRKRLNQVAMHMRKYERLIVEIDMTQRQEVEALIAKAIEYFGRVDILVNSAGLSLSSQITSHQVEDWDAMIDTNLKGTLYAINAVLPHFQQYKEGHIINLASISAEEVTKDSTVYSATKAAVQMISRGLEKDLARTGIKVTSILPGMVDTPMTEQSDFGGRKKLETYDIAESIRYAITQPPHVNVNQITIRPV >NZ_CP041722.1|WP_002478650.1|230308_230575_+|DUF1413-domain-containing-protein MTYHDRVMKLRAEKKRMGFSFRFEDLFSEEELLNMTVAQRKTAEKKFIREIDNMHDVRMPFSSQDGFKNKLYNLEYQYNEVKKNFKVV >NZ_CP041722.1|WP_002460385.1|230729_230921_-|hypothetical-protein MRKVIEQVIFSNESSYKIHVHTGVNQGLIGDIRDGYITIDSMPYIDAERLYQYGLEHKEVVPS >NZ_CP041722.1|WP_012990726.1|231104_232460_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MMVEQFDLIVVGAGPGGYVASIRAAQLGMKVAVIEKDRVGGTCFNVGCIQSKLLIEHGKRVYEMNQAKDWGIFANHIELDINKMNHRKDEVVDEIIGNVHHLFDENHVNYIQGEAVVHSDLSVEVNGRVLHANDIVLATGSSPFVPPIEDVDKIDYETTDSFFKHSTLPEQLTIVGGGVIATELASAMADLSVHVTILESGDNILRSEDKDVQASIRKLLDHQGVKIVTHARVNKVDTDAVYLENGSQLPYGTLLFATGRRPNLQAFESLNLTMEDKTIKVNEFNETSVPHVYAIGDLVAGYQLAHTASAHGAVVAEKIAGLNPDPVKQEDIPRCIYTRVESASIGLSEAQAIAQGYDVKVTQSNFKEAPKALIKGETNGVIKMVIDKATHHILGIFAAGPNATDVVGQMSAMRAAHGQLEDLAAMIQPHPALSETIGETANAYFNKAIHQ |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_4 | 404007-404090 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_4
>4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAGCAGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_4
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_4 >merge|NZ_CP041722|4|404007-404090|CRISPRCasFinder TTCGCTAAGCAAAGCAAGTTGGGGTTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAGCAGAAATTCGCCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTT >NZ_CP041722|4|4|404007-404090|CRISPRCasFinder TTCGCTAAGCAAAGCAAGTTGGGGTT GGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAGCAGAAA TTCGCCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTT
>NZ_CP041722.1|WP_002478541.1|401799_403425_-|BCCT-family-transporter MKKEKIMDWPTFIGTVVILLLAVIPMMAFPSASEKVITDINSAISNSIGSLYLFIGLAILCFVLYIAFGKYGNVTLGKASDKPEFSNFSWASMLFCAGIGSDILYWGVIEWAYYYQVPPNGAKPMSDQALTFATQYGMFHWGPIAWAIYVLPALPIGYLVFVKKQPIYKISQACRPVLKGQTDKFLGKLVDVLFIFGLLGGAATSLALGVPMISAGVEKLTGLDGQNMVLRSIILFTITVIFAISSYTGLKKGIQKLSDVNVWLSFLLLGFVFIVGPTIFIMETTITGFGNMLRDFFHMATWMEPFGGIKGRKETNFPQDWTIFYWSWWLVYAPFIGLFIARISKGRRLKEVILGTIVYGTLGCVLFFGIFGNYAVYLQISEQFNVIQYLNSHGTEATIIEVMHQLPFPTTVIVLFLLSAFLFLATTFDSGSYILAAATQKKVLGEPLKANRLFWAFALCLLPFSLMLVGGERALEVLKTASILASVPLIVIFICMMVSFIITLSKDRIKLETRADKLKEVERRSLRIVQVRENNDEDDNL >NZ_CP041722.1|WP_002478542.1|401186_401747_+|GbsR/MarR-family-transcriptional-regulator MVHSQSNEEKLEAAKDLVINSIGQTMDLYGTNRSVGNLFGTMVFEGSMTLDEMREHLQMSKPSMSAGVKKLQEFDLVKQQFTRGSRKQHFIAEKDFFTFFRNFFTKKWEREVDTNMAAIIEAEKIITSVLNDEAIDDEIKQDALNIEQQLKHTKIYCQWLSNLTTALETGEIFDYFPIPNSQENNN >NZ_CP041722.1|WP_012990700.1|399328_400819_-|betaine-aldehyde-dehydrogenase MKLVEKLSQRQYIDGKWVESSNKNTREIINPYNQEVVFTVTEGTAEDAEQAILAARRAFEDGEWSLETSEVRGKKVRAIADKITEHRDELAQLETLDTGKTLGESYADMDDIANVFNYFAGLADKDGGEIINTPIPNTESKVVKEPVGVVTQITPWNYPLLQASWKIAPALATGCSLVMKPSEITPLTTIRVFELMEEVGFPKGVINLILSSGEEVGDTLSGHKEVDLVSFTGGIETGKHIMKNAANNVTNIALELGGKNPNIIFADADFDLAVDQALNGGYFHAGQVCSAGSRILVHNDIKGDFEKALIDRVGKIKLGNGFDDDTEMGPVISTEHRDKIESYMEIAKKEGATIAIGGKRPDREDLQNGLFFEPTVITNCDTSMRIVQEEVFGPVVTIEEFDSEEEVIELANDSIYGLAGAVFTKDLGKAQRVANKLKLGTVWINDFHPYFAQAPWGGFKQSGIGRELGKEGLEEYLISKHILTNTKPEPINFFSK >NZ_CP041722.1|WP_002478544.1|397530_399237_-|choline-dehydrogenase MSENKSYDYVIIGGGSAGSVLGARLSEDKDKNVLVLEAGRSDYPWDLFIQMPAALMFPSGNPFYDWRYQTEEEPHMGRKVDHARGKVLGGSSSINGMIYQRGNPLDYEGWAEPEGMESWDFAHCLPYFKKLEKTFGAAPHDQFRGHQGPIKLKRGPATNPLFKSFFNAGVEAGYHKTEDVNGFRQEGFGPFDSQVHHGRRMSASRAYLRPAMKRKNLTVKTRAFVTELHFEGNKATGVTFKRNGKNHTVNAGEVILSGGAFNTPQLLQLSGIGDADFLKSKGIEPRVHLPGVGENFEDHLEVYIQHECKEPVSLQPSLDVKRMPWIGLQWIFARKGAAASNHFEGGAFVRSNDQVAYPNLMFHFLPIAVRYDGQKAPVAHGYQVHVGPMYSNSRGSLKIKSKDPFEKPSIVFNYLSTKEDEQEWVEAIRVARNILSQKAMDSFNGGEISPGPSVQTDEEILDWVRKDGETALHPSCSAKMGPATDPMAVVDPLTMKVHGMENLRVVDASAMPRTTNGNIHAPVLMLAEKAADIIRGKKPLEPQYVDYYIHGKHDPNDGAMEHNPYYPY >NZ_CP041722.1|WP_002478545.1|396104_397283_-|amidohydrolase MGETLVERLKAKEQRMIDIRRYLHEHPELSFHETETPKYIAEFYKDKACDVQTNVGPNGVKVTIDSGKPGKTIAIRADFDALPIQEDTGLSYASQNEGVMHACGHDAHTAYMLVLAETLIEMKDQFSGKVVVIHQPAEEMPPGGAKGMIEDGVLEGVDHVLGIHVMTNMTSGKIYYHEGNTQTGRAYFKLTIHGEGGHGSSPHTAKDAIVAGANFVTTAQNVVSRRLSPFETGVVTIGSFDGKGQFNVIKDTVEIEGDVRALTDATRDTIKYELERIVQGIATSFDVQYDFEFQPDYPALYNDPQFTSYIVETLRQAQLPDVIGVEECEPQPPSEDFAYYAQALPSTFLYSGAAPQQGHAYPHHHPKFNIDESSMLVAAEAVGTIVLDYLQG >NZ_CP041722.1|WP_002460576.1|395696_395966_-|hypothetical-protein MTFYDYMQNFVGDQTPLGELAHYLNKDCQFPKHEKTTDNILSYFIDEIELDDEHLETVKRSLSLYEQQTVHFSLVDHIKTEPKENVNED >NZ_CP041722.1|WP_070817270.1|395257_395707_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MKINEKAPYYALEATSPQTMRIYKNHQHFEYMILESINELIDNGYCMLNHLYVNKGQEGAFEQKFLQCQQHLASVPGFRALRFLRPNEQGQHYVIITQWLNHQSFKNWQQSSAYSQTHQKRGTSQGADVRLVNRKLSYHIGIICERYTS >NZ_CP041722.1|WP_002478547.1|393028_394621_-|acyl--CoA-ligase MKQSSLLAPETYNIVSEIEKHVSDQDKNAIIYENGHNDPIAVTYADLMKQANQVGHVLLNHGLKKGDKILIMMPRSISTYRIYIAALKLGIAIIPSSEMLRTKDLQYRISHGEIDAVITMPEFIKEFLNIEEYTSLTKFVVAGHHEAWISIDDERLNQSEELDMAPTSRDDIAILSYTSGTTGNPKAVTHTHGWGFAHMKMAPKHWLSIKEDDLVWATAAPGWQKWVWTPFLSIMGSGATAFVYNGKFNPTRYLELLQNFKINVLCCTPTEYRMMAKLSNLDKYDIHHLHSAVSAGEPLNKEVVNQFEAHFGLTVRDGYGQTESTLLIGFLKDTKPRPGSMGKAIPGSDTTVVDDEGRQVAPGVKGNIGVPLDLPALFKGYYKDEARTKAAHAGKYYITGDLAHIDEDGYFWFEGRSDDIIISSGYTIGPFEVEDALTHHPAVKECAVVASPHEIRGNIVKAFVILNEGYKASDDLVKTLQDFTKKTVAPYKYPRAIEFVEDLPKTNSGKIRRVELRDAERQKYNQQFKQ >NZ_CP041722.1|WP_002478548.1|390155_392780_-|pyruvate,-phosphate-dikinase MTKYIYAFDEGQRTMKDLLGGKGANLSEMKRLGLPVPDGFTITTEACIEYLRQHAQLPTEVKTQLVDHLAAFTKRTGKAFSSDTNLLLVSVRSGAKISMPGMMDTILNLGLNDDNVETLASKTGDVRFAYDCYRRLLQMFGEVVYNIPMVAFDTYFEDYKQRHGFENDAAISADGLKDICERFKTIYLEEARKPFPQEPLKQLEEAIEAVFKSWDNDRARVYRDLNEIPHDIGTAVNIQEMVFGNSGDKSGTGVAFTRNPVTGENRLFGEYLLNAQGEDVVAGIRTPQDIQTLYDQMPDVHQAFVKVTKQLEAHYKDMQDIEFTIENGKLYLLQTRNGKRTAKAAVKIAVDLANEGLITQQEAMRKVDVKAIDQLLHPNFDDKALAEATTISTLGLPASPGAATGQIVFSAEDAKVQADSGKKVILMRPETSPEDIEGMVASEAIITTHGGMTSHAAVVARGMGKCCVTGCSDLEINTSAKTVYYPDGELHEGDTISVDGSKGDIYFGEIKTVNAEHSEDFDQFMTWAEDTARLSVRMNAETPQDIEAGYQFGAKGIGLVRTEHMFFGAERLVEMRRFILASSYDERVDALNAIEKYQVEDFEAIFRLSGERPTIVRLLDPPLHEFLPNSAEDIQHVAQQLNISEDILKKRIVDLHEVNPMLGHRGCRLAVTYPELYEMQVEAIISSVIRLKKEGINCKPEIMIPLVSTVEEFTVLKEDLVETIHKLEQQAGEKVDYLVGTMIETPRACLIAGELAEHCDFFSFGTNDLTQLAYGFSRDDAGKFINVYTERNILKLDPFQTLDKDGVGRLIQIAVEQAKRVNSNIKIGVCGELGGDAKSIHQFNKLSIDYVSCSPFRVPGAIIATAQSQVEESE >NZ_CP041722.1|WP_002478549.1|389335_390151_-|kinase/pyrophosphorylase MKQHVLKLFIVSDSIGETAQRMIQATLTQFPDLTQVEIKKFPYIKNEEEFLNVLNLAHEQGAIVATTLVNPSFNSLGHRFAEEKALPYVDYMSELISIVQEQTQTEPLLESGALRKLNDEYFKRIKAIEYSVKYDDGKHFSDIGEADALIVGVSRTSKTPLSMYLANKGYKIANIPLVPEVAIPESVFKQKGLKVFGLTASPQYIANIRKNRVETLGLTQESQYNSLERIKKELSYAEEVFKKLNATVINTEYKSIEESAFYIEKFLQPKY >NZ_CP041722.1|WP_002478540.1|404347_405640_-|anaerobic-C4-dicarboxylate-transporter MILFAIEIGIMIAAILLGLRTAGALGCGIFAIVAQLIMIFVFQLPPGSAPVTAVLIILSIGIAGGTLQSTGGIDYLVYLASKVIEKYPKSIIFISPIIVFIFVFGIGTANIALSLEPIIAKTAMKAGIQPRRPLIASVLTANLALLCSPAAAATAYIISVLAGYDISMGKYLSVVFPTAILTMLLLSVFCTLAGRKKEQAQRFELKDLEVKVPTTFPSKVKLGVASFLLCVVGILTFGIFPQLMPSFNIDGKSVEVTMTEIVQFFMYLAAAINLLLNKIDTTDILSSHITQSAIGALFAVLGPGWLGATVFNAPQNLKILKEDVGAVIQVAPWLVILLVSIVAIVVISQTATASIMFPIVLSIGIPPMFFVAMVQTINVNFVIPAQPTLLFAVDLDETKRTKVTSFIIPGFFMITVSVLIGFSIKAILGY >NZ_CP041722.1|WP_002478539.1|405996_406533_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MSVLDVTEGRGYIAKIEQHSFVDGEGVRVSMYVSGCPFLCEGCYNVAAQRFTYGEPFNDETLEAILHYCEPDYIAGLSILGGEPFCNVDITLKVARAFRQKFGHRKSLWVWTGFLYEYLSHDAGIRHQLLSLIDVLVDGPFIQALFQPNLAYKGSLNQRVINVPASLKKGTPVIYVED >NZ_CP041722.1|WP_002478538.1|406534_408382_-|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MKQLEAELQGLITKDPAIVNENANKDSNTFSTMRDLTAGVVSKSYALQHLLPKRVAQAHKNGDIHFHDLDYHPFQPLTNCCLIDATSMLQHGFEIGNANVTTPKSIQTASAQLVQIIANVSSSQYGGCTVDRVDELLSTYARHNEAHHRKVAETFVRADAIEDYVDQQVTKDVNDAIESLEYEINTLYTSNGQTPFVTLGFGLGTDKLSRKIQQAILNTRIKGLGKNRITAIFPKLVFTIKKGVNFSEEDPNYDVKQLALKCSTKRMYPDVLNYDTLVDILGDFKAPMGCRSFLPAWRDAQGQFENSGRCNLGVVTLNIPRIAIESQGDKLTFWRLFHERMDILHEALLYRIERVAQAVPENAPILYKSGAFKYKLQEGEDVTDLFKHRRATISMGYIGLYEAATVFYGPNWETNPDAKAFTLDILKEMKDYQLEWTEETDVWFSIYSTPSESLTDRFCRLDYERFGSIPDITDKGYYQNSFHYDVRKDITPFEKIDFEKDYPYYASGGFIHYCEYPKLNHNLKALEAVWDYAYDKVGYLGTNIPIDRCYECGYEGDFETTAQGYTCPHCGNHDPKTVDVVKRTCGYLGNPVQRPVIEGRQKEICARVKHMKEPK >NZ_CP041722.1|WP_002478537.1|408580_409351_-|CHAP-domain-containing-protein MKKIATATIATAGFATIALAGGHDAHAAEQNNNGYNPNDPYSYSYSYTIDQQGNYHYTWQGNWSPNQAQQGQYYSYNYTNTAGTQNYNYNTQYSQNYQPQTQAYHANNGGGLGASYSTSDRNVKVTTTQAPSSHASNTSGGSAFSGKSGSSSNLYTAGQCTYYVFDKVGGKIGSTWGNASNWASAAASEGYNVSNSPKQGAVMQTSQGAYGHVAYVEKVNSDGSVKVSEMNYNGGPGVVSTRTISASQASSYNYIS >NZ_CP041722.1|WP_002478536.1|409739_410960_-|ArgE/DapE-family-deacylase MTVLSEQERIDILADIVNINTENNNEIEVCYYLKELLQRYDIESKIIEIEGKRSNLVAEIGSGRPVIGISGHMDVVDAGDEAQWMYPPFELHEQDGKLYGRGTSDMKGGLAALVIAMIEIKASNLLQQGTIRLLATAAEEKEMSGSMLFRDKGYVDDLDGLIIGEPSDHYINYANKGSMGIKIKAKGVAAHSSLPNLGHNAIDDIIRYIQKIKEKYEDIKNNDNKHSLDVSPLIKDYFGDKFNDKELRKLENVAEGLVIVNSIIYGGEQFNTVPESAYAEFNIRTIPEYDNEAIIQLFEETLYEVDQAQLSMEITTNHAPVYSNKDNLLVKSFTEYKDDLTVTALVGATDASELLKGIDNVDLTIIGPGFMRQAHRANEYIDKQHYLDFIDLYQHVIVDYLNKKSN >NZ_CP041722.1|WP_002478535.1|411264_411864_-|adenylyl-sulfate-kinase MSQSSHITWHDSEVTKADRQKQNGHKSAVIWFTGLSGSGKSTVSVALEQALFELGKHAYRLDGDNVRHGLNKNLGFSPEDRKENIRRIGEVSKLLVDAGTIAITAFISPYRVDRDDVRNILEDGEFIEVYTQCSVEECEKRDPKGLYAKARSGEIKEFTGINAPYEAPYHPEITINTEQQSVEQAVAHILNYLTDNKYL >NZ_CP041722.1|WP_002478534.1|411880_413059_-|sulfate-adenylyltransferase MSVSKDILHYTIKPHGGVLINRVVEGIERTQLSQAAQSYKAITLNPWAISDLELIAIGGFSPLTGFMGQEDYNQVIEKTHLTDGSVWSIPITLPVTEDVASKLEIGDHIALYGEDGALYGTLKLTEKYTYDKKREAQLVYGTTDVKHPGVKKVYDKGNVYLAGPIQLLKRPQHNKFADYHLDPHETRQLFHDLGWKTVVGFQTRNPVHRAHEYIQKSALEIVDGLLLNPLVGETKADDIPADVRMESYETILKHYYPKNRARLVIYPAAMRYAGPKEAVLHAIVRKNYGCTHFIVGRDHAGVGDYYGTYEAQQFISQFEDELDIQILKFEHAFYCEACGNMATAKTCPHDATQHVHLSGTKVREKLRNGEALPTKFSRPEVAEVLIKGLQQH >NZ_CP041722.1|WP_002460596.1|413081_413981_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MKKLLIFALAGFLAQLVDGSLGMGFGASSSSILLTYGITPAIVSATVHFSEIATTAASGTSHWKFDNVHRSTMLKLAIPGAIFGFLGAAFLTHIHSSVIKPYIAIFLLAMGFYILYQFLFRRQHETHEHVGQLSGWKLIPQGAIAGLLDAIGGGGWGPVNTPILLSSKKIQPRYAIGTVSASEFFVTLATSLSFILFLGITQINWWLVVALSIGGMAAAPISAYLTKILPINILAICVGGLIIFTNSNALLSYFVDNSTIINVIRFAIICSILVLIIFVAIRNRLLSFSYKKNRVNKYN >NZ_CP041722.1|WP_002478533.1|413998_414610_-|NAD(P)-binding-protein MNMPLMVDLAGQRIVIVGGGQVAARRASNFIDYCQDIHIISPQVHSSLEDLINAGQITWHQKEFDAADIAGAFLVVAATNNKAVNQQVKALVPPGCLFNNAEDATSGNVTIPNILKRGKLTLSVATQGASPKLGIQIIEQLSHTYDERYEQYVEFLYQCRQTLKRINIEPSYRQALLAKIVSDDYLDLDKQQAFLRWLQAQAE >NZ_CP041722.1|WP_002460598.1|414630_415410_-|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MGKVYLVGAGPGDPELITVKGLKAIKQADVILYDRLVNRELLDYATAGTKLFYCGKDPNRQSLPQSETNKMLVSLAKKGHTVTRLKGGDPFVFGRGGEEAEILAQHHIAFEIIPGITAGIAAPAYAGIPVTHRDFSSSVAFVTAVNKPGMTKAAYWEHLAHGPETLCIYMGVKRLSEICGLLIKYGKPIDTPVALIHLGTTAYQQTVTGTLSTITEVAKNIKNPAMIVIGQVVQMHDKIQWFTEQTEQMRMDYSQVNSK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_5 | 743877-744699 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_5
|
11 spacers
spacers of NZ_CP041722_5
>5.1|743913|39|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT TTACTTAGTAGAGGCAAAAACAGACGTAAATAAAATGTT >5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGGTTTTGAAACACCTTGTTTAAACATTCTA >5.3|744056|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATAAAATGGTTGACAAATAAAATAGCAACTGG >5.4|744127|37|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAACCTTTCATAAGTCATTAACTACTGTATATAAAG >5.5|744200|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGAGATATTTAAACTAATAGTGTAAAAGTGCACA >5.6|744271|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGAAGACCCAGTCGACAGTGTAGAAGATTTACCA >5.7|744342|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAAAACAAAAACTATATAAAAGGATATGATGAA >5.8|744413|37|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGACACTTATGAATTGGTTAATAGAAATACAGAA >5.9|744486|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTAATCCAAATGAAATGTATTTAACAATTGATTAT >5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATTTATTAAAAGACATGTAAAAGAAGGACAAAT >5.11|744630|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGGAAAGACATTATTATTACATCACCTTTTAT |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_5
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_5 >merge|NZ_CP041722|5|743877-744699|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTTTGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTTTACTTAGTAGAGGCAAAAACAGACGTAAATAAAATGTTGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTCAGGTTTTGAAACACCTTGTTTAAACATTCTAGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTTTAATAAAATGGTTGACAAATAAAATAGCAACTGGGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTGAAACCTTTCATAAGTCATTAACTACTGTATATAAAGGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTTGGAGATATTTAAACTAATAGTGTAAAAGTGCACAGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTTAGAAGACCCAGTCGACAGTGTAGAAGATTTACCAGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTAACAAAACAAAAACTATATAAAAGGATATGATGAAGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTTAATGACACTTATGAATTGGTTAATAGAAATACAGAAGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTATTAATCCAAATGAAATGTATTTAACAATTGATTATGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTAAAATTTATTAAAAGACATGTAAAAGAAGGACAAATGTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATTGTTGGAAAGACATTATTATTACATCACCTTTTATGTTCTCGTCCCCTTTTATACTGGGTATTCTCTGATT >NZ_CP041722|5|5|743877-744699|CRISPRCasFinder CTTTTTGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TTACTTAGTAGAGGCAAAAACAGACGTAAATAAAATGTT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT CAGGTTTTGAAACACCTTGTTTAAACATTCTA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TTAATAAAATGGTTGACAAATAAAATAGCAACTGG GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT GAAACCTTTCATAAGTCATTAACTACTGTATATAAAG GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TGGAGATATTTAAACTAATAGTGTAAAAGTGCACA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TAGAAGACCCAGTCGACAGTGTAGAAGATTTACCA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT AACAAAACAAAAACTATATAAAAGGATATGATGAA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TAATGACACTTATGAATTGGTTAATAGAAATACAGAA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT ATTAATCCAAATGAAATGTATTTAACAATTGATTAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT AAAATTTATTAAAAGACATGTAAAAGAAGGACAAAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT GTTGGAAAGACATTATTATTACATCACCTTTTAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACTGGGTATTCTCTGATT >NZ_CP041722|5|1|743877-744699|CRT CTTTTTGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TTACTTAGTAGAGGCAAAAACAGACGTAAATAAAATGTT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT CAGGTTTTGAAACACCTTGTTTAAACATTCTA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TTAATAAAATGGTTGACAAATAAAATAGCAACTGG GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT GAAACCTTTCATAAGTCATTAACTACTGTATATAAAG GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TGGAGATATTTAAACTAATAGTGTAAAAGTGCACA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TAGAAGACCCAGTCGACAGTGTAGAAGATTTACCA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT AACAAAACAAAAACTATATAAAAGGATATGATGAA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TAATGACACTTATGAATTGGTTAATAGAAATACAGAA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT ATTAATCCAAATGAAATGTATTTAACAATTGATTAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT AAAATTTATTAAAAGACATGTAAAAGAAGGACAAAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT GTTGGAAAGACATTATTATTACATCACCTTTTAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACTGGGTATTCTCTGATT >NZ_CP041722|5|1|743952-744699|PILER-CR GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT CAGGTTTTGAAACACCTTGTTTAAACATTCTA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TTAATAAAATGGTTGACAAATAAAATAGCAACTGG GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT GAAACCTTTCATAAGTCATTAACTACTGTATATAAAG GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TGGAGATATTTAAACTAATAGTGTAAAAGTGCACA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TAGAAGACCCAGTCGACAGTGTAGAAGATTTACCA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT AACAAAACAAAAACTATATAAAAGGATATGATGAA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT TAATGACACTTATGAATTGGTTAATAGAAATACAGAA GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT ATTAATCCAAATGAAATGTATTTAACAATTGATTAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT AAAATTTATTAAAAGACATGTAAAAGAAGGACAAAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACGGGGTATTCTCTGATT GTTGGAAAGACATTATTATTACATCACCTTTTAT GTTCTCGTCCCCTTTTATACTGGGTATTCTCTGATT
>NZ_CP041722.1|WP_002479159.1|743329_743683_-|hypothetical-protein MEEVLDLIINLVKLFIIVPYWLISVGVTAFFYFKLVVFIRNTFKAFFDKYFYGEDSDSIPYAVGPYIMIITAMLIGLGIVMVIVLFFNALLGQNLYTLLFIVGVILLIIKFKRGYKN >NZ_CP041722.1|WP_002479158.1|742350_742977_+|4'-phosphopantetheinyl-transferase-superfamily-protein MKLFITQMNHTYKDIAHWMSQSHRQLKKPERLTYRFSKDKWMHRIGDLLIQYSIEHTHGLMPSQWSYDIQPNGHVKIASPIDIYVNLSYSFPYIICAIDHLPIGADIEEIKGMDDLNIAKQFSTNEFNQIQTLEDFYTIWTKKESYSKMIGEGLIRGLAYYDVTKPLYYQHHTIKFKQHLIDNCIIQLCHISSNHPFEIVDVPLKQLF >NZ_CP041722.1|WP_150891417.1|735172_742354_+|amino-acid-adenylation-domain-containing-protein 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>NZ_CP041722.1|WP_002479153.1|732942_733728_-|tandem-type-lipoprotein MRQSRKLKLGICLILLIILIGSCIILTKTNSRNAQIKKTFNQTLSLYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFDKGDKGTWIIHSEMVIEPKGRNMESRGMVLHVNRNTRTTKGYFLISEITEDKKGYVHNKDKKYPVKMEHNKIIPIKPIPNDKLKKEIENFKFFVQYGNFKDFKDYKNGDISYNPNVPSYSAKYLLNNDDYNVQQLRKRYNIPTKQAPELKLKGDGDLKGSSIGSKDLEFTFVENKKENIFFTDSVQFTPSEVNKS >NZ_CP041722.1|WP_002479152.1|732084_732852_-|tandem-type-lipoprotein MEHSKKLKLCASLFILVIFVGGCGSFNKEAQIKKSFNKTLSVYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFDKDDKGTWIIYSEMVIEPKGKNMESRGMVLYINRNTRTTKGNFIVNEITEDSKGRPTNNKKKYPVKMEHNRIIPTKPIPNDKLKKEIENFKFFVQYGNFKDFKDYKNGDISYNPNVPSYSAKYQLNNDDYNVKQLRKRYNIPTKQAPELKLQGDGDLKGSSIGSKDLEFTFVENQEENIFFTDSIDFTPTEHS >NZ_CP041722.1|WP_041612264.1|731229_732015_-|tandem-type-lipoprotein MRQSRQLKLGICLILLIILIGGCVILTKINNRNAQIKESFNKTLSLYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFEKGDKGTWIVNSEMVIGPKGKNMESRGMVLYINRNTRTTKGYYFISETTYDNNGRPKDDEKRYPVKMAHNKIIPTKRIPDDKLKKEIENFKFFVQYGNFKDFKDYKNGDISYNPNVPSYSAKYLLSNDDYNVQQLRKRYNIPTKQAPELKLKGDGDLKGSSIGSKDLEFTFVENKKENIFFTDSVQFTPSKDNKS >NZ_CP041722.1|WP_014533190.1|730182_730968_-|tandem-type-lipoprotein MRQSRKLKLGICLILLIILIGGCIILTKTNSRNAQIKKTFNQTLRLYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFEKGDKGTWIIYSKMIIEPKGRNMESRGMVLHINRNTRTTRGNFIVNEITEDSKGRPLNNKKKYPVKMEHNRIIPTKPIHDDKLKKEIENFKFFVQYGSFKDFKDYKNGDISYNPNVPSYSAKYQLSNDDYNVQQLRKRYNIPTKQAPELKLKGDGDLKGSSIGSKDLEFTFVENQEENIYFTDTVQFTPSEVDKT >NZ_CP041722.1|WP_002479149.1|728860_730186_-|hypothetical-protein MNQTEYKIKPGNIKGNSEETSTVSKISYEIENANNSGLKRDKINEQIEGLKEYDKFPGNLEYVDSYTDPKTGTTTSAFLNKETGKVTLGMTGTNLHKGAMLKQAFGVASPQDYRDVYETLNDIRADINIGLHSVTDKDPHYKNTQDFIKGIKKDYDIDTITGHSLGGRDAIILGTSNDIKHIVVYNPAPLAVKDVSILYDDGEELKKMIEKYDGHIVRFVSNQDILDAGVRDLMYETAGEKIVIKNGEGHSMDGFLIKGTQAKILAELKRVKGYQDANNKSFKSVRKQTRRRLDKVETLRANWIQTNGGALSSSQQQLLESLTALTIAQGLSQLVDEESQHLKKMYQSMAHKFGENWKKAQEAGNEIAEKLTFAEVIDELRAGGAYESKLETDPQRKIDNKLKKLNDVSKNCDDYIAKIKQSIHAIVEKDKALASQIGGIM >NZ_CP041722.1|WP_002479148.1|728534_728861_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP041722.1|WP_002479169.1|752533_753439_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKNIIYVENHYFVTAKDNSIKFRNIIDKTEKFYFFSDIEAIIFDHYRSYFSHKLVIKCMQNNIAILFCDNKHSPMTQLLSEYGMSNRIQRIQTQFRFSGRSKERVWKKIVVGKIINQARCVENNIDKSKSIVLKELAKEVKPGDNNNREAIAAKIYFRDLYGPQFKRGRYNDIINSALNYGYSIIRSFIKRELAIHGFEMSLGIKHHSTENPFNLADDVIEVFRPFVDNMVYNIVMKDGVKVFDTKEKKVLLNVLFEKCIIDKKIVRLLDSIKIMIDSLIRCYKENTATYLLIPKMIEVGN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_6 | 1531214-1531304 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_6
>6.1|1531238|43|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_6
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_6 >merge|NZ_CP041722|6|1531214-1531304|CRISPRCasFinder AAACTCGTCATGCTCGTTAAGTGCAATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACTAAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC >NZ_CP041722|6|6|1531214-1531304|CRISPRCasFinder AAACTCGTCATGCTCGTTAAGTGC AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC
>NZ_CP041722.1|WP_002458881.1|1529077_1530787_+|PAS-domain-S-box-protein MLKFHQRLLLLLCTITIISFIGLGAIMHHSIYQTLTDKKVADLTKKTENYSKLEEQGKTEEIKNIAKNENISVKITEGNKIIFETKSHYDINPAIDNAANPSNIIYDRADEGYHYTFKNKFSNEAIYISGIDDEMVNLQKELWKYIALIGVVVLIAIYLAVRSIKRTYIRPINEVTYATSLLADGYYHVRVPESNVKETKALFVTTNELARRLQKLNNKQKIQSNRLKTTLENIPSSVLMIDKYGEIVVANHSYYEVFGLEEKVENKDYNDFIDDKIKQLILEAFKTEKSMYNQVEVNINNVHHKYFDVSCVPILSKSKKHLQGMVVVLHDITNLKKLENLRREFVANVSHELKTPITSIKGFAETLIEGAKDDVASLDMFLNIILKESNRIESLVMDLLDLSHIEQQRELETAYVNLSELAHNTVDNLQNQAKDKNIEIIDEISPDIIFKANKNKIAQVITNLLSNAINYSLENNRVIVRVYRQQSKVYLEIQDFGIGISKEEQKHIFERFYRVDKARSRDSGGTGLGLSITKHIVEAHHGVISVKSEPNKGSTFKVTFTDNYSNNEV >NZ_CP041722.1|WP_002478052.1|1528367_1529078_+|response-regulator-transcription-factor MSQKILVVDDEQSIVTLLKYNLETAGYIVEVAYDGEEALEKVEKVQPDLIVLDVMLPKKDGIEVCKTIRSDKNLVPILMLTAKDDEFDRVLGLELGADDYMTKPFSPREVVARVKAILRRSQFVNEAANDAANEEDILIENIRIRPEFFEVYKDDELLELTPKEFELLLYLIERQGRVITREHMLNSVWNYEFAGDSRIVDVHISHLRDKLEENPKQPKLIKTVRGLGYKLERPKA >NZ_CP041722.1|WP_002478051.1|1526895_1528164_+|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MSAEKIVKTQDGLQVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKQIVWKEVLAGQKAYDETGEWLPSETLKTIEEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQQLDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTEEVKKVIDFLQNEMGASNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNGRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLAHNEFADKVFTWQQYDEIVENDGKEAANKAQERAEQQGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSELLSSVLMLEHLGWQEAADKITDAIESTIASKIVTYDFARLMDGATEVSTSEFADELIKNLK >NZ_CP041722.1|WP_002458878.1|1525729_1526848_+|citrate-synthase MAELKKGLEGVIAAETKISSIIGSQLTYAGYDIDDLAENAEFEEIVFLLKNYRLPTEEELADLKKKLNYYMTLNPRVYKHFEEYVTDNVHPMTALRTSVSYIAHFDPNAEGESEEKILERSIRIQAKVASLVTAFARVRDGKEPLKPKAELNYAGNFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALVLHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANERVMNMLSEVKSVDQVDDYLDEKFANKEKIMGFGHRVYKEGDPRAKYLREMSRKITSETGRSELYDISIAIEKRMKEEKGLIPNVDFFSATVYHSMDIPHDLFTPIFAVSRTAGWTAHILEQYRDNRIMRPRAKYIGEKDRKYIPIEER >NZ_CP041722.1|WP_002458877.1|1524024_1525383_-|amino-acid-permease MEDKLQRELSNRHVQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIAMTGPSILLTYILIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNKYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPQIPNWVSALFCVLILMTFNLLSARLFGELEFWFAIIKIATIVGLIVVGLVMILMAYKTQFGSASFANLYQNGIFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPQKTIPKAINSVPLRILVFYVGALAVIMSIIPWDKVSPDDSPFVRLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLADQQQAPPIFRSTNKQGVPHIAIIGSSVFLLVAALLNYIFPDATLVFTYVTTISTVLFLVVWGLILWAYINYSRRNPELHKQSTYKLPGGKYMGYIILLFFVFVFALLFVNVETRRAIYFTPVWFIILGLMYYRYKQMAKKTK >NZ_CP041722.1|WP_002478049.1|1521710_1523471_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMLEKLMKAGMNVARLNFSHGSHEEHKARIDTIRKVAKKLGKTIGILLDTKGPEIRTHDMKDGLIMLEKGKEVIVSMTQVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLVELEVKEIDKANGEVRCEILNTGELKNKKGVNLPGVRVNLPGITDKDADDILFGIKEDVDYIAASFVRRPSDVLDIREILERENNHNITIFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPESVPIVQKDLIRKCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSFVNAIGVSVAHTALNLNVKAIVAATESGSTAVTISKYRPHSDIIAVTPSAHTARQLALVWGAYPVIKKGRKTTDDLLNNSVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGEKGTTNMMKLHLVGDEIAKGQGVGRESVVGQSVVADDASDLEGKDLSNSIIITTSVDETLVPYIEKAAGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTIVGVEHATKEIKDGILITVDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP041722.1|WP_002458875.1|1520724_1521693_+|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNNIEVYGIYQGYQGLLDDNIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPQFKEAEHRKVGIDNLRKRGIEGLVVVGGDGSYRGAQRISEECPEIQTIGVPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIECVDKIRDTASSHARTFIVEVMGRDCGDLALWAGLSVGAETIMVPEVKTEIKDVAEKIESGIKRGKKHSIVMVAEGCMSGQECADELMKYINVDTRVSVLGHIQRGGSPSGTDRVLASRLGGHAVDLLIQGKSGLGVGITHNQLTATPFDEIFKISDHKFNNDIYELAKKLSI >NZ_CP041722.1|WP_002478048.1|1519617_1520562_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLYDIKNKIESLKESQQKNDVDLQDEIDLLEASLKRETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTLLDYIPHIFDAFIEFHGDRNFRDDPAMVGGIAYLNEMPVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIAKNLIEMASLTVPVIAIVIGEGGSGGALGIGVANRILMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSSLAKMAAETMKITANDLLQLKIIDNVIEEPLGGAHRDIEIQAQHIKAAFENELAELSKLNKKQLAEDRYNKFRHIGSFVD >NZ_CP041722.1|WP_002458873.1|1518758_1519616_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRSSKKKKYLTVQDSKQNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAVSDEGSFQEFDKGMTSANPLDFPGYEEKIEKDQQKTDLQEAVVTGIATLENLPFGIAVMDSRFRMGSMGSVVGEKICRIIDYCTEHRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPEDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRKDMKETLAQILKMHQEVN >NZ_CP041722.1|WP_002478047.1|1517440_1518670_+|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDDALQMHKENQGKLQVTPNVKVTNKKELSLAYSPGVAEPCKEIHEDPRTVYDYTIKRNTVAVVTDGTAVLGLGNIGAAASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALDTTDTEEIIQTVKLISPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTLAGLINALRIVDKPLSDIKIVLNGAGAAGIAICKLLDAYGVRHMIMCDSKGAIYENRPYGMNETKSFVAKFTNKDKIEGSLQDVIKEADVFIGVSIADLLTKEMVQSMSKDAIIFAMANPNPEIKPEDAKEAGAKVIGTGRSDFPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIANLIQPDELRPDYCIPDPFDKRVAPSVAREVARAAMETGVARIEVEPQAIYDKTMKLTDIQ >NZ_CP041722.1|WP_002478053.1|1531351_1533985_+|DNA-polymerase-I MDKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYTPEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMSKDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEHNFEVIHHFDNINFKKLDNAIIHFEIDGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLASYIIDPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLELPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAVDVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKAFKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIHGDDIHAATAMKVFGVEKDQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK >NZ_CP041722.1|WP_070817240.1|1534001_1534874_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVEHVKRGIEPFIINTIIKSVTFSSKVIDGKSDGKETIIKGINLDGFRQFTEGYKIYKVERRSKYINIYIEKNQECRVLISHLGMAGGFFIVNHLDEIHAPNYRKHWHVIFHLSNGKLLVYSDIRRFGEIRNVQALNNYASFKNMAPEPFDESALDHYLTYLNQPKVKHKSIKQLILDHKVIAGCGNIYACEALYRAAIHPATEVQSLNQQARQNLFLEVQAVLNEGIEYGGTSISDYRHADGKTGTMQLRLNVYKQQQCKKCGHKIEQQVIATRNSHFCPVCQK >NZ_CP041722.1|WP_002478055.1|1534889_1535495_+|dephospho-CoA-kinase MPKVIGLTGGIATGKSTVSELLTAYGFKVVDADIAAREAVKKGSAGLEQIRQTFGNEAINDDGEMNRQYMGQLVFNHPDKRTELNEIVHPIVHQLMDKEKSHYLNQGYNVVMDIPLLFENELEDTVDEVWLVYTSESIQIDRLMERNNLSLEEAKARVYSQISIDKKSRMADIVIDNLGDKLELKQNVERILTDQGYINQE >NZ_CP041722.1|WP_002458885.1|1535641_1536643_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MSTNIAINGMGRIGRMVLRIALKNEALNVVAINASYPPETIAHLINYDTTHGRYDKRVEPIESGIRVEGHDIKLVSDRNPENLPWKDLEIDIVIEATGKFNHGDKAKAHIQAGAKKVLLTGPSKGGKVQMVVKGVNDQDLDTDTYDIFSNASCTTNCIGPVAKVLNDSFGIENGLMTTVHAITNDQNNIDNPHKDLRRARSCGESIIPTSTGAAKALKEVMPELNGKLHGIALRVPTQNVSLVDLVVDLKQKVTVDEVNHAFRDANLQGIIDVEEAPLVSKDYNTNPHSAVIDAKNTMVMGDNKVKVIAWYDNEWGYSNRVVEVANQLGELIK >NZ_CP041722.1|WP_002478056.1|1536817_1537825_+|biotin-synthase-BioB MNLANQIINGKYLTQAECLKIYRDASLATLDLVHEAYLIRRHYFGHKVKLNMILNAKSGICSEDCGYCGQSREMKHKQRYTLVSNETICKGADVASNNKIGTYCIVMSGRGPSDKEVEHITKTVKDIKKDHPQLKICACLGLANEEQAEKLKAAGVDRYNHNINTSESYHGQVVSTHTYNERIQTLSYMKEHHISPCSGVICGMGESDEDIIDMAFALKKIDADSIPVNFLHPIQGTKFGSMDDLTPMKCLRILSIFRLINPTKEIRVAGGREVNLQSLQPLALQIANSIFVGDYLITGGQPNELDYQMLEDLGFEIDYGNDDEITFSHPQFKSK >NZ_CP041722.1|WP_002458887.1|1538141_1538612_+|transcriptional-repressor-NrdR MKCPKCSSTHSKVVDSRHADEANAIRRRRECEKCGTRFTTFEHIEVSPLIVVKKDGTREQFLREKILNGLVRSCEKRPVRYQQLEDITNKVEWQLRDEGHTEISSRDIGEHVMNLLMHVDQVSYVRFASVYKEFKDVDQLLASMQGILNDNKRSDS >NZ_CP041722.1|WP_002478057.1|1538612_1539989_+|helicase-DnaB MTMQAYQFDLRPRDSFEVIRHFELSQAHLEILNRLYAPLIGTHAIGLYHYLNQFVSENNQELLTHYTIMNELKVNLLDFRKTMDYLEGIGLLKSFVRHQSDNSNFIYELIQPPTAYQFFNDPMLSVFLFSEVDKKRFVQLKQYFEQDRKDLTNYQNITHKFTEVFKMPNKDIKIDSQNIKSSQYYKGLDLSNEHFDFELLKELLQHHFISSEIVTDEAKALILQLATLYGLTVEAMKRMILNSITSAQTLSFEELRKQARSYYLIEHEQQLPKLAINADKYYDSESQHTRDNSTNTKQDEWLSSLDNISPVDMLSSWSGSEPTHQQKLMIEELVSREKLPLGVINILLQFVMLKNEMMLPKKYIFEVASNWKKLGISNAKEAYERALKMNEPKQVERKPQNAKNRYYGKQIVSREKTPKWLENRDTAKRQEKIKKKDDNLEKDRQQFLEQLKKDWGDD >NZ_CP041722.1|WP_002478058.1|1539988_1540909_+|primosomal-protein-DnaI MKSFKNIMGSDSNLEQRISQIKQQVINDSDVKQFLTMHQSELTNAMIDRDLNVLQEFKDQQKHYDGHDYHSCPNFVKGHIPELYVEDERIKIKYLPCPCKIKYDEARFDSQLVTSHHMQRDTLNAKLNDIFTEDRDRLEIAIKANHICKSIINGKSVKGLYIYGPFGTGKSFILGAMANQLKSQKVASTIVYLPEYIRSLKNGFKDGSYEQRLARIREAGILMLDDIGAEEVTPWVRDEIIGPLLHYRMVQELPTFFSSNLSFEELEHHLSITREGAEKTKAARIIERIKSLADDVYLEGKNYRNN >NZ_CP041722.1|WP_002458891.1|1541268_1543206_+|threonine--tRNA-ligase MTKINIQFPDGNKKAFDKGITTEEIAQSISPGLRKKAVAGKFNQQLIDLARPLEEDGEIEIVTPGSEEALEVLRHSTAHLMANALKRLYGNVQFGVGPVIEGGFYYDFDMENKISSDDFEKIEKMMKQIVNENHKIERKVVSREEAKEFFKDDPYKLELIDAIPQDEMVTLYSQGDFTDLCRGVHVPSTAKIKEFKLLSTAGAYWRGDSNNKMLQRIYGTAFFDKKDLKAHLQLLEERRERDHRKIGKDLELFTNNQLVGAGLPLWLPNGATIRREIERYIVDKEVSMGYDHVYTPVLANVDLYRTSGHWAHYRDDMFPPMKLDENEEMVLRPMNCPHHMMIYKNKPHSYRELPIRLAELGTMHRYEASGAVSGLQRVRGMTLNDSHIFVRPDQIKDEFKRVVHMIQDVYKDFGFEDYTFRLSYRDPEDKEKYMDDDDMWNKAESMLKEAVDELGLPYVEAIGEAAFYGPKLDVQVKTAMGKEETLSTAQLDFLLPERFELTYIGSDGEYHRPVVIHRGVVSTMERFVAFLTEETKGAFPTWLAPKQVEIIPVNVDLHYDYARNLQDELKSQGVRVEIDDRNEKMGYKIREAQMQKIPYQIVVGDKEVENNQVNVRQYGSQDQQTLERDEFIWNLVDEIRLKKHR >NZ_CP041722.1|WP_002458892.1|1543669_1545163_+|amino-acid-permease MSKIESQNGGIIRGLKDRHISMIAMGGCIGTGLFMTSGGAIHDAGALGALIAYAIIGIMVFFLMTSLGEMATYLPVSGSFSTYATRFVDPSLGFALGWNYWFNWVITVAADVTIAAQVIQYWTPMAGIPAWLWSCIFLVIIFSLNSLSVRIYGESEYWFALIKVVTVIIFIAIGLLTIIGIMGGKFVGFETFTKGEGPILGGNFGGSLLSILGVFLVAGFSFQGTELIGITAGESENPERAVPKAIKQVFWRILLFYILAIFVIGMLIPYDSNALMGGDNSIATSPFTLVFKNAGLAFAASFMNAVILTSVLSAGNSGMYASTRMLYSMSKDKLAFPIFGKTNKYGVPYLSLLLTAILVIIIFLVQKVSGNAYEYIVAASGMTGFIAWVGIAVSHYRFRRAFQRQHHNKKELKYKAKWFPFGPIFAGILCVIVIIGQDVDFIKTGEFDLNRFVITYMGIPVFLVFFIYHKLRYKTKKIPLEEVDLRQDVHMNEIKHH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_7 | 2095506-2095592 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_7
>7.1|2095536|27|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder TGTTGGCTTTCGTTTTGAAAGCCTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_7
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_7 >merge|NZ_CP041722|7|2095506-2095592|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCGTTGTTTGTTGGCTTTCGTTTTGAAAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCGTTGTT >NZ_CP041722|7|7|2095506-2095592|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCGTTGTT TGTTGGCTTTCGTTTTGAAAGCCTCTG TGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCGTTGTT
>NZ_CP041722.1|WP_002478365.1|2094705_2095245_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDIGMKLKNLRMLKNLTQEELAERTDLTKGYISQIESQHASPSMETFLNILEVLGTRPSDFFQEKTKEKVLYTAEDQTIYDEYDKGYILKWLVTNSNEYDMEPLMLTLKPGASYKHFQPSNSDTFIYCLEGQITLSLGNQLYRANAEDALYFRANDVHQLCNNSKQNVTILIVATASYL >NZ_CP041722.1|WP_002478364.1|2093596_2094691_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQPLLSFKSVSKGYDDLNILDHMDLDIESGYFYTLLGPSGCGKTTILKLIAGFETPDSGEIIYQNRSIENLPANKRKVNTVFQDYALFPHLNVYDNIAFGLKLKKLSKKDIDQKVTDALKLVKLSGYEQRSINDMSGGQKQRVAIARAIVNEPEILLLDESLSALDLKLRTEMQYELRELQSRLGITFIFVTHDQEEALALSDYIFVMKDGKIQQFGTPTDIYDEPVNRFVADFIGESNIVNGTMVKDYVVNIYGQDFDCVDMGIPSGKKVEVVIRPEDISLIEAEAGLFKATVDSLLFRGVHYEICCVDRKGYEWVIQTTKKADVGSEVGLYFEPESIHIMVPGETEEEFDKRIESYEDTDDE >NZ_CP041722.1|WP_002493062.1|2092806_2093604_-|ABC-transporter-permease MSNIKKILLVPYILWMIIFIILPVLLLIYFSFTDINGHFSFTNYQQIFQYKYFEMFWDSILYAALITMITLFISYPTAYFIRNAKNPNFWLLILIIPTWINLLLKTYAFIGLLSHDGLINKVLGILNVPKVDMLFTSAAFLVVASYIYIPFMILPIFNSMKSIPVNLIQASSDLGANPFTTFRKVILPLTKEGVLTGVQVTFIPSLSLFMITRLIAGNKVINIGTSIEEQFLVIQNYGMGATIAIVLIVFMALILIITKSNDERR >NZ_CP041722.1|WP_002459417.1|2091988_2092801_-|ABC-transporter-permease MKWYGKLYISILLVILYVPIFFLMFYSFNSGGNMIHFEHFTFEHYQSLFKNDKLMAIIFNTIAVALLAASISTVIGTFGAIALFYLRQKKLKVTLLTLNNVLMVSSDVVIGASFLIMFTALGHFTGIGLGFGTVLASHIAFCIPIVVIVVLPQLYEMNHNILNAARDLGATESQILSRVLIPNLMPAIIGGFFMALTYSLDDFTVSFFVTGNGFSVLSVEVYAMARKGISMEVNAISTLLFVVIVIGIVGYYGIQRSLKRKPRLKRGMLR >NZ_CP041722.1|WP_150891502.1|2090918_2091992_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKQFLQLVCGALVIGLLCLGISHLFSGHEKAKSGKKIYVYNWGEYIDPELIKQFENQTGIEVIYETFDSNEAMEAKIKNGGAHYDVAFPSEYTVQKLKRANLLVPLNHHKLPNMRNLDPDYLDKSYDKGNQYSIPYFFGTVGILYNKQAYPDASFNHWSDLYQERYRNDVLLVDGAREIIGLSLNKLGYSLNDTNSQHLRQAEQDLKKLGPQVRGVVGDEVTMMLQQNEGNIAVVWSGVAAPLVQGSDKYNYVVPKEGSNLWFDNMVIPRTAQNKEGAYQFINFLLDAENSKKNTEWVGYATPNKAARQLLPNEIRNDHRFYPTQQEQARLEVYKDLGQRTLGNYNESFLNFKMSLK >NZ_CP041722.1|WP_002478362.1|2089799_2090846_-|DUF4064-domain-containing-protein MSGEQYTQIKRPVSRLTEKILGWFSWIFLLLMTIITMFIALVSFSNDTSIQNLEATLNNNDLIQQILGNNGFNTTQFVIWLQNGIWAVIVYFIICLLISFLALISMNIRILSGILFLVASVVTLPLVLLFVTLIIPIFFFIIAIMMFARKNKVEIVPAYGYPGYDDNFDYRYNEPDYQQQPPIYDDYERHQPNDDMAYHMPQETSNSSFNEDDKYDQYPKRAIMSDYQSTDDEDEAPQVLSRQAKYHKNKYQDEFSDEGAAPFNEAVVQQEPVLDKKELKAQRKQEKAEIKARKREKRKAYNQRMKEKRKNQPSAVNQRRMNYEERKQIFNHENSAKDQQESHLDDSK >NZ_CP041722.1|WP_002478361.1|2089212_2089668_-|DUF4064-domain-containing-protein MKTKKELVIAWIANGLSLIFLLFNILSMLLTDEKNNVKEYEQMAKQFAGKNVTVTPELIHFIMVFFIGILAFSTILGIAATTLIKNRSLIAIFLFISAVLIGLFSMNIIAMILWLIVIVLLIVKRNQYKNDSDWHAEQYKHAEKKENPYIY >NZ_CP041722.1|WP_002459413.1|2087597_2088950_+|divalent-metal-cation-transporter MNKRDTTHQPKHLSLDEINNTIKFDSNGTSSQKFLAFLGPGLLVAVGYMDPGNWITSMQGGAQFGYTLLFIILISSLSAMLLQSMTLRLGIATSHDLAQMTKHYLSKPVAIIFWIIAELAIIATDIAEVIGSAIALNLLLGIPLIVGAIITVCDVFLLLFIMKFGFRKIEAIVGTLIFTVLAIFVFEVFISSPSTTAILEGFVPHKEIITNHGILYIALGIVGATIMPHNLYLHSSIVQSRQYDRHSIKEKAQAIKYATIDSNLQLSVAFVVNCLLLVLGASLFYGVNQDQLGGFYDLYHALRTQPILGAALGAIMSTLFAVALLASGQNSTITGTLAGQIVMEGFLNISLPNWLRRLVTRAIAVIPVIICLIIFKGNEEKIEQLLVFSQVFLSIALPFSLIPLQLSTSNKQLMGPFVNKSWVNYCSWILIIVLSVLNVYLIIETFKEFI >NZ_CP041722.1|WP_002478360.1|2086724_2087336_+|DUF1054-domain-containing-protein MTKYTFKQKDFKAFDVDGLDPRMEALEAHVRPQLRALGDYFADYFTSQTGETFYSHVAKHARRSVNPPKDTWVAFATNKRGYKMLPHFQIGLFKDHLFIMYGVMHETKDKAQRVKTFDKHFDTLTHLPEDYRICLDHMKPDKPLIKDLSVDELHEAIDRVKNVKKGEFFVARTLAPNDKRLKSDRAFLNFVEETFNEFIKFYA >NZ_CP041722.1|WP_002459411.1|2085726_2086542_-|inositol-monophosphatase-family-protein MALYDFAKSLILEAGNNVRLMMKEKLSIETKSNPNDLVTNVDKATETYIYEAIHSNYPEHKVIGEEGHGHNIRNIDGVVWVVDPIDGTLNFVHQRENFAISIGIYYNGEAYAGFVYDVMKDALYHAKVHEGAFENNHRLEAIGTSELKSSLIGINPNWVTKPIIGPIFQPVVNRARSSRAYGSAALEIIAVAKGQLAAYITPRLQPWDFAGGLIILNEVGGKGSNLLGETLEITHPDSVLMANQTVHEELLQQFFLPHQQTLTELHAKYYK >NZ_CP041722.1|WP_002459421.1|2095630_2095918_-|UPF0223-family-protein MEYQYPLDMDWTHDEMLKVIAFFNQIERYYESSVLSDQVIAHYRNFKQIVPGKAEEKQIFKEFEQNSGYNSYQVIKEATTQNKPTHIQQKNNTRT >NZ_CP041722.1|WP_150891504.1|2096121_2097528_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MVVGDFPIETDTIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGQKVTIVEKGNLGGVCLNVGCIPSKALLHASHRFVEAQHSENLGVIAESVSLKFDKVQEFKQSVVNKLTGGVEGLLKGNKVEIVKGEAYFVDNNSLRVMDEKSAQTYNFKNAIIATGSRPIEIPNFEFGKRVIDSTGALNLQEVPGKLVVVGGGYIGSELGTAFANFGSEVTILEGAKDILGGFEKQMTQPVKKGMKDKGIEIITEAMAKNAEETENGVKVTYEAKGEEQTIEADYVLVTVGRRPNTDELGLEELGLKFAERGLLEVDKQSRTSIDNIYAIGDIVPGLPLAHKASYEAKVAAEAISGQASEVDYIGMPAVCFTEPELAQVGYTEAQAKEEGLEYKASKFPYAANGRALSLDDTTGFVKLITLKEDDTLIGAQVAGNGASDIISELGLAIEAGMNAEDIALTVHAHPTLGEMSMEAAEKAIGLPIHTM >NZ_CP041722.1|WP_002459423.1|2097531_2098836_-|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MAFEFRLPDIGEGIHEGEIVKWFVKAGDTIEEDDVLAEVQNDKSVVEIPSPVSGTIEEVVVDEGTVAVVGDVIVKIDAPDAEEMQFKGHDDDSSAKEEPAKEEAKAETEEAPAASASQDEEVDENRKIKAMPSVRKYAREKGVNIKAVAGSGKNGRITKEDIDNHLNGGGAQAASASNESASASTSEETSAPQTQSVPEGDFPETTEKIPAMRRAIAKAMVNSKHTAPHVTLMDEIDVQDLWDHRKKFKEIAAEQGIKLTFLPYVVKALVSALKKYPALNTSFNEEAGEIVHKHYWNIGIAADTDRGLLVPVVKNADRKSIFQISDEINELAVKARDGKLTSEEMKGATCTISNIGSAGGQWFTPVINHPEVAILGIGRIAQKPIVKDGEIVAAPVLALSLSFDHRQIDGATGQNAMNHIKRLLNNPELLLMEG >NZ_CP041722.1|WP_002459424.1|2099048_2100026_-|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MAQMTMVQAINNALKTELQNDENVLIFGEDVGVNGGVFRVTEGLQKEFGEDRVFDTPLAESGIGGLALGLTTQGYRPVMEIQFLGFVFEVFDEVAGQIARTRFRSGGTKTAPVTIRTPFGGGVHTPELHADNLEGILAQSPGIKVVIPSGPYDAKGLLISSIRSNDPVVYLEHMKLYRSFREEVPEEEYTIEIGKAKVVKEGTDITLIAYGAMVQESVKAAEELEKDGHSVEVIDLRTVQPLDMDTLVASVEKTGRVVVVQEAQRQSGVGANVAAELQERAILSLEAPIARVAAADTVYPFTQAENVWLPNKNDIVEQAKATLEF >NZ_CP041722.1|WP_002459425.1|2100029_2101142_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring)-E1-component-subunit-alpha MAPKLQAQFDAVKVLNETQSKFEMVQILDVDGNVVNEDLVPDLTDEQLVELMERMVWTRILDQRSISLNRQGRLGFYAPTAGQEASQLASQYALEKEDFILPGYRDVPQIIWHGLPLTEAFLFSRGHFKGNQFPEGVNAFSPQIIIGAQYIQTAGVAFGIKKRGKKAVAITYTGDGGSSQGDFYEGINFASAYKAPAIFVIQNNNYAISTPRSKQTAATTLAQKAISVGIPGIQVDGMDPLAVYQATKEARDRAVAGEGPTLIETMTYRYGPHTMAGDDPTRYRTSDEDAEWEKKDPLVRFRKFLENKGLWNEDKENEVIERAKDDIKKAIKEADKVEKQKVTDLMDIMYEEMPQNLAEQYEIYKEKESK >NZ_CP041722.1|WP_002459426.1|2101308_2101938_-|cell-wall-binding-lipoprotein MKLYRALGVLLASTLLLAGCTTDRKEVRAYEDTIQQASSNEQVINSTGQKLNDLEKQKQQYYKKIVTNNPDTRVKVADKMISNINERSKEFNKEVKAMNASNKEFKKASKHINQIKDDSKRKELKELDDALKDKYKKHDDYAAAYRNILDKERSYFKLLKQKTVMQQQEKEKGEAINKAQKTFKQKFEAYIKALNKVNKEKGDIDKISE >NZ_CP041722.1|WP_002478367.1|2102075_2102627_+|peptide-deformylase MLTMKDIIKDGHPTLRAEAQDVDFPLSDEDKQTLKSMREFLINSQDDEIANRYGLRSGVGLAAPQIDISKKMIAVYLPDDGNGRSYDLMLVNPKVVSYSVQYAYLPTGEGCLSVDKNIPGLVHRHYRVTVKAKDIDGKDVKLRLKGYPAIVVQHEIDHLNGIMFYDHIDAEHPLTPLPDSIEV >NZ_CP041722.1|WP_002459428.1|2103061_2103280_+|DNA-dependent-RNA-polymerase-auxiliary-subunit-epsilon-family-protein MAIFKVFYQHNKNEVIVRENTQTIYVEGETEEQVRRYLKDRNYNIEFITKLEGAHLEYEKEHSEHFNVENAE >NZ_CP041722.1|WP_002478368.1|2103279_2104959_+|ribonuclease-J 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041722_8 | 2188296-2188390 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_8
>8.1|2188331|25|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder AGAAATTCTTTGTGCTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_8
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_8 >merge|NZ_CP041722|8|2188296-2188390|CRISPRCasFinder TTCCCCAGCTTGCACATTTCTGTTGAATTTCTTACAGAAATTCTTTGTGCTGGGGCCCCGTTCCCCAGCTTGCACATTTCTGTTAAATTTCTTAC >NZ_CP041722|8|8|2188296-2188390|CRISPRCasFinder TTCCCCAGCTTGCACATTTCTGTTGAATTTCTTAC AGAAATTCTTTGTGCTGGGGCCCCG TTCCCCAGCTTGCACATTTCTGTTAAATTTCTTAC
>NZ_CP041722.1|WP_002459509.1|2187260_2188058_+|hypothetical-protein MAEELKLMHNESREDANLSPVSKIEIYSFFDPFDSDCFKLSALISKLRIEYNQYIRIRHILNPSLRVLTKCQAQSTSEFDNIALAYKAAELQGRLRAERFIHLMQNEIVPKCDIITEDMICNCIKNAGLDYEVFKEDLQTSKLTESLKVDLHIAREMEIEQSPSLVFFNENIHEEGLKVEGLYPYHIYTYIINELMGTPIEKQLPPKLEIYIQKKQLVTMEELLTIYEWPEKLLNKELKKLVLQQKIEKLYYPEGHFWKSKMPKL >NZ_CP041722.1|WP_002478418.1|2186872_2187238_+|hypothetical-protein MTSTPYDIIGQEALYKMIDHFYALVEQDDRINHLFPGDFQETSRKQKQFLTQFLGGPNLYTAEHGHPMLKKRHLRFKITTYERDAWLENMYIAIQAAQFPAGVGEYLYERLRLTANHMVNA >NZ_CP041722.1|WP_002478417.1|2186200_2186773_+|CYTH-domain-containing-protein MSTNHEIEFKQLLTASQYDDIRQKYFQNVMPFSQTNFYIDTSDFKLKANHSALRIRVKDDSYELTLKVPATVGLTEYNHSTNLIPEIGKTLTLQQFPEDIQHQLMQFDITDDELNILGSLTTHRMEVYFKHQLLVLDHSEYLGTEDYELEFEVNDYEQGKQIFLNFLQECGIDYVKPKNKVQRFFDYKAQ >NZ_CP041722.1|WP_002459506.1|2185659_2186007_-|hypothetical-protein MRIYVNEIKVKDDGIYCYSDDPTDGLEEVGQMLVDSDNYGFAYILDDGQSYSYLIFVEETWSMLHENRDKTIIVNDDLKLEHFQEEFDFILDNIVGNNNYGKEFVAAVEKTFELE >NZ_CP041722.1|WP_002478416.1|2185007_2185643_-|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNQWDQFLTPYKQAVDELKVKLKGLRKQYEVGEHASPIEFVTGRVKPITSIIDKANKRGIPFDRLQQEMYDIAGLRMMCQFVDDIDVVVKMLRQRQDFRVIEERDYINNTKQSGYRSYHVIIEYPIETLDGQKKILAEIQIRTLAMNFWATIEHTLRYKYDGDYPDEIQHRLERAAEAAYLLDEEMSEIKEEIQEAQKYYSQKRAKKHDNN >NZ_CP041722.1|WP_002478415.1|2184183_2184993_-|NAD-kinase MRYTILSKGDSKSNALKHKMISHMKDFHMTQNDENPEIVISVGGDGTLLQAFHQYSHMLSQVAFVGVHTGHLGFYADWLPHEVEKLIIEINNSEFQVIEYPLLEMIVRYNDNGYETRYLALNEATMKTDNGSTLVVDVNIRGKHFERFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGALIHPSLEAIQIAEIASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCYITPVNHDTIRTTIDHVSIKHKNVSGIQYRVANEKVRFARFRPFPFWKRVHDSFIESDDER >NZ_CP041722.1|WP_002478414.1|2183332_2184187_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MRFTYAIKSPDVLKSFLQQQGFSKKTTSAIKQNGALLVNHEPVTVRYQLQPGDKLTIILPTEIPSANLQAFHHPLDIVYEDDYLLIVCKPSLQNCAPSREHPHESLIEQVLAYCHENDNDFTPHIVTRLDRNTTGLVLLAKHGHIHHLLSHIKINKRYIALCHGATQPEGIIEAPIARANDSIITRQVSSTGKYAKSTYRTLNSKQNVSLCEVTLHTGRTHQIRVHFQYIGHPLIGDALYGGNHDMIHNHCLQCTALQFKHPILHKTISITIDYKQLICLYNML >NZ_CP041722.1|WP_002478413.1|2181921_2183307_-|magnesium-transporter MSMEIEKADNDQHAVYNQSLLDELLNNNDIDDFRKEFLAMHSYEQSEYFEDSDNVIRHKIFQLLSPQEVAGFFDQLEIDDEDYEQLFDTMNAQYASKVLEEMSYDNAVDILNELSKPKVASLLTLMNKDDANEIKALLHYEEDTAGGIMTTEYISLEAETPVKEALMLVKSQAPDAETIYVIFATNVEGQLVGVLSLRDLIVSENDAYIEDIMSERVISVNVADDQEHVAQKMRDYDFIALPVVDYQDHLLGIITIDDILDVMDEEASEDYSRLAGVSDIDSTNDSIVKTAAKRLPWLIILTFLGMITATILGNFEDTLSKVALLAAFIPIISGMSGNSGTQSLAVSVRNISTGEIDEQSKFRVALREAGSGMLSGSVCAIILFLIIVVVFKQPFLALIVAASLTIAMTVGTLVGSMIPLLMNKINIDPAVASGPFITTINDIVSMLIYFGLATSFMSYLT >NZ_CP041722.1|WP_002459501.1|2180066_2181911_-|sodium:proton-antiporter MEFFSLVIVVVAAFFTPILVNRLNISFLPVVVAEILMGVIIGNSFLNLVEKDSMLNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFSAFKKDTRNRQGQSQEDKNVPSHLNMALTVFIFIMIISIVLAYAFKWLGLVDDVLLMIIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIGQFILLVAVLADLFTMVLLTVYGALNGQGGGSIWLSAILVVFTAIFYIIGILFKHMSFLQKLMSGTTQIGIRAIFALIILLVALAEGVGAEYILGAFLAGVVVSLLKPDEELVQKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLDIPSLIKEPALLIIIPVLIGAFLISKLLPVLFIRRWFDTKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKIAEQLKTISSETSGILILSAVITCVFVPVVFKKLFPIPDEVNRRIEVALIGKNQLTIPIAQNLTSQLYNVSLYFRKDLSDHRHLADSITVLEINDYDEAILTRLGLFDNDIVVCATNDDDINRRVAMMAEEHGVNRVICRLETMTDDVGMKNSGIEIFSNFLSNKIFLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIEMLNHKYENLELRNFPFGGDVIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYKDRLIVTGSKEYVDELKGELEFYY >NZ_CP041722.1|WP_002459500.1|2179008_2179779_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MLNLENKTFVIMGIANKRSIGFGVAKVLDKLGAKLVFTYRKERSRKELEKLLEQLNQNDPKLYQIDVQKDEDVINGFAKIGEEVGNIDGVYHSIAFANIEDLRGRFSETSREGFLLAQDISSYSLTLVAHEAKKIMPHGGSIVATTYLGGEFAVQNYNVMGVAKASLEANVKYLALDLGQDNIRVNAISAGPIRTLSAKGVGGFNTILKEIEERAPLRRNVDQEEVGKTAAYLLSDLSSGVTGENIHVDSGFHAIK >NZ_CP041722.1|WP_002478419.1|2188704_2190513_-|oligoendopeptidase-F MSQQLTREEQEQQYPQYTWDLTTIFESDEAFEQAFKSVENKIGEEQRYQGHLGDNAQTLYEALAFEDELGSQLEKVYVYAHLKQDQDTANDKYTGFESRAHQLIIKFSSAWSFLIPEILQIDEVKLQTFIDENDNLKRYAFDLKLINEKREHILDADTEKLLTEAQDALSTPSNVYGMFSNADLEFEDAIDKDGNTHPLTQGTFIKYLESDDRKLRESAYKNVYKAYGSHNNMLGATLAGEVKKNVFNARTHHYKSARQRALSNNHIPEEVYDNLVDTVHKYLPLLHRYTKLRQELLGLDDLKMYDLYTPLVKDIKFEMPYEEAKSWMLKALEPMGEEYLNVVKEGLENRWVDVYENKGKRSGGYSSGAHLTNPFILLNWSDTISDLYTLIHEFGHSAHSYFSRQNQPSNASDYSIFVAEVASTCNEALLSDYMDKHLDDERRLLLLNQELERFRATLFRQTMFAEFEHKIHQIEEAGEPLTPTRMNEEYAALNKQYFGETVETDEDISKEWSRIPHFYMNYYVYQYATGYSAAQSLSHQILTEGKPAVERYINEFLKKGSSNYPIEILKNAGVDMTSPKPIEQACEVFEQKLDAFEKLIKA >NZ_CP041722.1|WP_002478420.1|2190564_2191536_-|competence-protein-CoiA MLSAFNNKRQLIKAVDAMNSEHYYCPSCRELVILKRGYKVKAHFAHRSHSLCIHAKGESQLHYQMKYHIAQSYLLHGQKVEIEPFLTDIQQYPDLLINDKFVIELQLSTIPFNIIKQRTKGLMSVGKHVIWLLQGLQFSRNQLTLTQFQSSFIHPEQRTLYEWDDREKSFYCYHHIQHLGGKRFSARKTQTSPLNILKLQSPCPSVSFKLANHHIKYYIQQCRRQNSVLEPTLSAIYQLRLSDDQATQFLGYIFPNQIYINSHPIAWQAQLLLYLAHKINFNSFKSSVKFRNLLFSNATEEDILNMLITQYKQTFDSMFKRAK >NZ_CP041722.1|WP_002478421.1|2191636_2192368_-|adaptor-protein-MecA MRIERVDETTVKLFITYSDIEARGFSREDLWTNRKRGEEFFWSMMDEINQEEEFVVEGPLWIQVHAFEKGVEVLISKSKNDEAMDEAMNMSDDDANDQFDQQLNELLAASVLDKDQKADDMFEQRANNKSTNKSDTVQSQRANMRTIIVKFDDLEHVIDYAYHHNQATDSYEDLLYMLDSNYYYAVHFDEKVEQEDINDFYSQLLEYAYPTDKTEVYLDDYGKIIMSYNVTAQVRRYFPDTAE >NZ_CP041722.1|WP_002459514.1|2192588_2192984_-|transcriptional-regulator-Spx MVTLFTSPSCTSCRKAKAWLQEHDIPYTERNIFSEHLTIDEIKQILKMTEDGTDEIISTRSKTYQKLNVDIDSLPLQDLYSIIQDNPGLLRRPIILDDKRLQVGYNEDEIRRFLPRKVRTFQLKEAQRLVD >NZ_CP041722.1|WP_002459515.1|2193271_2194261_+|tryptophan--tRNA-ligase METLFSGIQPSGIPTLGNYIGALKQFVEVQDDYDCFFCIVDQHAITVPQDRLKLRKQIKQLAAIYLASGIDPDKSTLFIQSEVPAHVQAGWMLTTIASVGELERMTQYKDKAQKRTDGIPAGLLTYPPLMAADIVLYNTNIVPVGEDQKQHMELTRNLVERFNSRYNDVLTKPEIRMPKIGGRVMSLQEPTKKMSKSDDNQKNFISLLDEPHIAAKKIKSAVTDSDGIIKFDRDNKPGISNLLSIYSSLTDESIQDIEQKYEGEGYGKLKSDLAEIVKDFLTTFQEKYNAFYQSEELDIILDKGRDKAHKASMKTLKKMEKAMGLGRKR >NZ_CP041722.1|WP_002478422.1|2194447_2195203_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEPGHTFLAKLGKTRLRPGGKKATDWLITQGQFSYKKQVLEVACNMCTTSIYLAKTYQCHITAVDLNKKALDKGRLNVKKAHLEHLIQLQQANAIRLPFEDNQFDIILNEAMLTMLPMKAKQQAVAEYFRVLKPGGILLTQDVAVMNDDKEKEVIQHLSSAINVNVTPLTPEHWTQLYKEAGFSSVHNHYEPMTLMTPKGMIYDEGIFGTIKIIKNALKKDNRSMFKRMFITFKNHKSDLNYIVHAATK >NZ_CP041722.1|WP_002478423.1|2195411_2197064_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein 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>NZ_CP041722.1|WP_002478424.1|2198020_2199103_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSERVLEVNDLHVSFDINAGEVQAVRGVDFYLNKGETLAIVGESGSGKSVTTKAITKLFQGDAGRIKQGEIIFLGEDLAQKSENELIKLRGKDISMIFQDPMTSLNPTMQIGKQVMEPLIKHKHFSKSQAKKRALEILNLVGLPNAEKRFKAYPHQFSGGQRQRIVIATALACEPKVLIADEPTTALDVTMQAQILDLMKKLQQKINTSIIFITHDLGVVANIADRVAVMYGGQMIETGDVDEIFYDPKHPYTWGLLSSMPDLDTKNDTPLVAIPGTPPDLLNPPQGDAFARRSQYALDVDFKAEPPWFKISPTHFVKSWLLDERAPKVEPPEMVQKRAHNMPNNYDKPLKVERVSFNEK >NZ_CP041722.1|WP_002478425.1|2199117_2200182_-|ABC-transporter-permease MTQNIDKSLDDQSNAAMTHTSEGIMATDFVMRDIDLNKEPEMQRESKNFWQDAWAQLKRNKLAIVGMIGLILIVILAFIGPMLSHHDYAEQDVNRRNLPAKIPVLDKVSFLPFDGTGSDGSNAYDKAKVNENFWFGTDQLGRDLWTRTWKGAQISLFIGIVAAILDIFIGVVYGAISGFFGGRVDNVMQRILEIVASIPNLIVVILFVLIFEPSIWTIILAMSITGWLGMSRVVRGEFLKLKNLEFVMASRTLGASKFNLIFKHILPNTLGAIVVTSMFTVPSAIFFEAFLSFIGIGVPAPQTSLGSLVNDGRAMLLIHPHELFIPATVLSLLILFFYLFSDGLRDAFDPKMRK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041722_9 | 2432189-2432268 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041722_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041722_9
>9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder GGCCCCAACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041722_9
The CRISPR arrays of NZ_CP041722_9 >merge|NZ_CP041722|9|2432189-2432268|CRISPRCasFinder CCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCGCCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGG >NZ_CP041722|9|9|2432189-2432268|CRISPRCasFinder CCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGG GGCCCCAACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCG CCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGG
>NZ_CP041722.1|WP_002479357.1|2431134_2432049_+|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MTDKYNHGVLFYHEHSGLKDIYNGLGEVTKALSSICKQLSIQVSENEGDIIKYCQKIKQGDYGQKIDILFILGGDGTVNEMVNGVMKHQLDLPIGIIPGGTFNDFTKTLNIHPNFKQASEQLKYAQIGQYDVIQVNKEFALNFVGLGLIVQNAENVQNGAKDIFGKLSYIGSTVKTLMDPSNFDFTLTIDGEKTTGNTSMLLIANGPNIGGSRIPLTDLSPQDGKLNTFIFDEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIDHISGKDIRIDTKPIMKVDIDGEIRLEAPLDIKVLPKALKLLTIPT >NZ_CP041722.1|WP_012990941.1|2429301_2430807_+|peptide-MFS-transporter MASHNSHELAVEKIPHKGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYYAINQGGLGIDKATAMSIMSVYGALIYMSSIPGAWIADRITGTRGATLIGAVLIIIGHVCLSLPFQMFGLFASMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRIDAGFVIFYMSVNLGALISPIILQNFLDVNNFHGGFLIAAIGMALGLVWYILFNRKTLGQVGMQPTNPLTAEEKKKYTFIIVAIVAVITAVLIVTYLTNTLSFNLVSNTVLVLGIVLPIIYFATMIYSKDVDDTERSRVKAFIPLFILGMIFWSIQEQGSNVLNIYGLEKSDMHLNIFGWTTRFGEAWFQSINPLFILLFAPLISLMWMKMGKKQPSLPVKFALGTFLAGLSYLIMGLIGVSYGSTTFSVNWVILSYVICVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKSFNAQMMSVWLLTNASAQAINGTVVKYIDDLGQTTYFILLGSIAVVVTLIVLAFTPIIKKAMKGIH >NZ_CP041722.1|WP_002479355.1|2428516_2429017_+|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MTQGRQEEEMKDITLLGNQNNNYQFDYRPDVLETFVNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYARMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >NZ_CP041722.1|WP_002479354.1|2427634_2428504_+|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIYKYKQPMFGKLRNQPLLIGRSTLGLIGVLLNIFAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLSLLFLHEKVRKYQISAMIIAIMGMLLIVKPEFSSAMLPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSRREQPYTIVFYFSLFSVIVLIPFSIATFEPMTTTQILYLLGAGLAAAVGQIGITLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGETPDMYAIVGYIIIISASYYMFDQARRESNTQQSH >NZ_CP041722.1|WP_002459743.1|2426362_2426761_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKVIYFSFSGNVQRFIKRTELSDVMEITEDNCQEEVNEPYILVTGTIGFGEVPQEVQQFLQVNHQHLQAVAASGNRNWGQNFAKAGQTISEQYNVPLLMKFEVQGSNSDVKEFKDKVGQFNENYEREKIQSY >NZ_CP041722.1|WP_002459742.1|2424294_2426400_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKESGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDDEIERLHYLVDHDFYFNVFDKYSEIDLREITDFAKSIEFNFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVTIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEQYYDDMVANPNIIKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIDDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYFAKNKIGYESEEAKDFANVFFMMMNYYSLERSMQIAKERGQVYQDFEQSDYANGKYFSFYTAQDITPRFAKVQQLFEGIEIPTAEDWKALQQQVEAHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NZ_CP041722.1|WP_002459741.1|2423086_2424055_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDDERNTFKRALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKADKIIENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGIDAQSLRNELSENEKQQADKEMYVLLEDLYSNEVSYTHMLYDDIGLTEDVLNYVKYNGNKALSNLGFDPYFEEKDFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALRDEDFIFEN >NZ_CP041722.1|WP_002459740.1|2421740_2422718_-|ABC-transporter-permease MKLLLKGYTLLICLVIMSIISLFVGVSQLSITDIFHLTKEQLNILLSSRIPRTVSILISGSTLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLVCFPQGHILLKLAFAVLCSLFGTFLFVKLIEMIRVKEVIFVPLLGIMLGGIVSSFTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLIITYIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVNYEQIVRIALFITASITALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTMMLGACFVLFSDIIGRLIVYPFEINIGLTIGVFGTVIFLVLLMKGRKNYANDFE >NZ_CP041722.1|WP_002479353.1|2420800_2421760_-|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit MQMTLNKKLCALIGVTVIAALFYLFVGLDYEIFDYQFQSRFRKFILIILVGGAIGTSVVVFQAITRNRLLTPSIMGLDSVYLFAKVIPIFLLGAQSQFVTNIYLNFALTLVGMVLFALILFQFMFKVGNFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFIQLIMDPDSFLAVQSAMFANFDASNSNLVIGSAILLCTLVIVIIVILPYLDVLLLGRAQAMNLGVNYSRVTRLLLILVALLVSISTALVGPITFLGLLTVNLAHEFMKTFQHKYILPATILMGWISLFIAQWIVENLFEATTEVSLIIDLIGGSYFIYLLIKRRNTN >NZ_CP041722.1|WP_002459738.1|2420021_2420804_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MIRIKNMTQSIQGKAILKDISVDIQKGRLTSLIGPNGAGKSTLLSAISRIIEHDSGAIELEDIDIAAYRKNLLAQKLSILKQTNHTDMNITVEQLVNFGRFPYSKGRMKEADYEQVDYAINLLHLEDIRQRDLKTLSGGQRQRAYIAMTIAQNTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRRLCRELNKTIVIVLHDINFASCYSDDIIALKDGELVKADEKDAVIQKEVLQELYDMNVAIESIKGQRICLYFDEQLVEDVT >NZ_CP041722.1|WP_002479359.1|2432422_2432953_-|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRQKIAIDMDEVLADTLGAIIEAVNKQTNLGITMEGLNGKKLKHMIPEHDGLVREILNAPGFFRQLPVLPAAQEVVEKLAAQYDVYIATAAMDVPTSFHDKYEWLLQHFPFLDPQHFVFCGRKNIVKTDYLIDDNPRQLAIFEGEPIIYTAAHNVNETRFTRVNGWKEVEAYFLN >NZ_CP041722.1|WP_002459751.1|2433190_2434246_-|histidinol-phosphate-transaminase MKKQLDQLSAYQPGLSPRALKQQFGIEGELYKLASNENLYGPSPKVKQAITDHLDELYYYPETGSPSLRKAISAHLHIDESRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEATFGQYYHNAIVESADVVQVPLKNGGFDLEGILNEVDEQTALVWLCNPNNPTGTYFTHEKLHDFLSRVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLKLQEEFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVIATNEAIDKWNIIRPPFNVTRISEYAAIAALEDQDYLHDITQKNAQERQKFYAIPQSKHFLPSQTNFIFVVTDKVQELYQQLLQVGCITRPFPTGVRITIGFPEQNDKMIEVLQQFDY >NZ_CP041722.1|WP_002459752.1|2434368_2435883_-|peptide-MFS-transporter MNNKNYTRQEIVSSVPQKGFFGHPKGLSTLFFTEFWERFSYYGMKAILAYYLYYAVTDGGFGLSQATGLQIVSIYGALIYMSGSIGGWIADRIIGTRHALFYGGILIMFGHILLAIPGNFTLVLIALLLLITGTGLLKPNISTTVGDLYSHDDVRLDGAFTIFYMGINLGSLLAPFITGYLQTRLGFHVGFAAAAVGMFLGLVVYVVTNKRFLGLAGLSVPNPLKKEEIKRLSLMVGSAIIMFAIILIVLQFTGLLSLESFTLIVTIIGIVLPIYIFIYMITNKKTNEVERKRIYSYIPLFITSVAFWMIQEQGSTVLANFADQNTQLSMSKLTNGLIDFQIPAAWAQSLNPIFIVVLAPVFANLWTRLGKHNPSTVHKFALGAIFAGLSYLVMMIPLMSSTELTHPLWLALSFLFITVGELCISPVGLSVTSKLAPKHLSAQMMALWMLSNATAQSINSQTVVFFKRISEQQFFMYSGLFTLIIGVLLFLISPIVIRAMRGVH >NZ_CP041722.1|WP_002479360.1|2436163_2437678_-|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MNEFITTLNARKEELLATLIEHIQISFIALLIAILIAVPLGIVLTKAKRISEIVMNIAAVLQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGIRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNPSLILIGAIPAALLAIIFDVILRLMAKLSYKKLMLATGAILLVIIIAIVAPLLSHKGDTITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETDDTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEDLKSKKEAAVYQQAKDSLQSKYDMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAQKHHLKTIDDLAKVTDQLKPGFTLEFNDRPDGFKAVKKAYNLNINNVKTMEPKLRYSAIEKGDINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDNKHVFPPYQGAPMFKEKFLNEHKEIKAPLNRLAGKISDEEMQEMNYKVTVKNEDPYQVAKAFLKKEGLIK >NZ_CP041722.1|WP_002459754.1|2437674_2438643_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEFKNVTKRYGQNIAVHDLSFKINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIPLTEGYIYFKDKPVSDFPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKEIDQRVDELLEMVGLEPDKYKNRKPDELSGGQRQRVGVVRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLLALQTKINKTIVFVTHDIQEAMKLGDRICVMNQGHIEQIDTPLGFKTHPQSKFVQEFMGNYLQQTSVSQHIKLKELDITTPLNEMAASTDYPVVSADQYIDDLFDMLSKHEALLVENHDTHVQSLLTREDVFEYLAQGQRGETA >NZ_CP041722.1|WP_002459755.1|2438859_2440641_-|DNA-helicase-RecQ MEAILSHYFGYQSFRPGQKEIITKILAHHNVLGVLPTGGGKSICYQIPGLKLGGTTVVISPLISLMKDQVDQLKAMGIHAAYLNSSLSQKQQKQIEQELASGKIQFLYVAPERFENQYFLSILRKLEIHLIAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVIQKVMTLPQDFVVIALTATATTEVQRDIMDKLYISADNRVKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYVQAHRDEAGIIYCSTRKQVEELQEAIQSIDLEAAIYHAGLSNKEREQAQNDFVYDRIKVVVATNAFGMGIDKSNVRYVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLYSERDKGLHEYFISVSQADDDYKDKMGEKLTKMLQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECQQCSNCVQENKTYDMTKEAKMIVSCVARMRQQENYSVIIQVLRGEQSDYIKYNHYDQLSTYGIMKAYTTSELSHLIDELRFKGFLNEHNEILICDQSVQSLLKEDVTIFTTPFRQKSKEKVYINTVEGVDRALYNELVDVRKQLSNKLGIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQEMIAIEGVGSYKLKHYCPNFLERIQSYKANIS >NZ_CP041722.1|WP_002479361.1|2440654_2442538_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein 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>NZ_CP041722.1|WP_002479363.1|2443632_2445570_-|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSIRKKKISLFTFFILTVLTVTLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALILSVFLFFKGKKAYWFIFIAGFLLTFLLYANVVYFRFFTDFLTFSTLNQASNVESMGGAVTASFKWYDFVYFIDTFIYLFILIFKNNWLDKRVFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIQNNQQKALASEDDLTKVLNYTKQKRTKANPEYFGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKQDFRYYPNFFHQTGQGKTSDSEFMMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYTSNVMHGDYKTFWNRDQIYRHFGIDKFYDATYYDMSEDNVVNLGLKDKEFFKESAGYQKKMKKPFYSHLITLTNHYPFTLDDKDADIDKPNTGDSTVDGYIQTAHYLDQALEQYVNDLKKEGLYDDSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEQITPAKFTDLNRTGFWLKIPGKEGTVDKTYAGQMDVMPTILHLVGIDTKNYIMMGTDLLSKEHKDVIPFRNGDFITQNYKYVNGKIYSNKDNKLLEKKPKDFDKNKQQVEKDLEMSDSILNGDLFRFYNNPDFKKVNPAKYEYKTGPKGNQK >NZ_CP041722.1|WP_002479364.1|2446120_2447125_-|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_1 | 1.1|46769|27|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 46769-46795 | 27 | NZ_CP041722.1 | 628847-628873 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP041722_9 | 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 2432212-2432245 | 34 | NZ_CP041722.1 | 1487271-1487304 | 0 | 1.0 |
NZ_CP041722_1 | 1.1|46769|27|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 46769-46795 | 27 | NZ_CP041722.1 | 3891-3917 | 1 | 0.963 |
NZ_CP041722_1 | 1.1|46769|27|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 46769-46795 | 27 | NZ_CP041722.1 | 3948-3974 | 1 | 0.963 |
NZ_CP041722_9 | 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 2432212-2432245 | 34 | NZ_CP041722.1 | 1307546-1307579 | 1 | 0.971 |
NZ_CP041722_9 | 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 2432212-2432245 | 34 | NZ_CP041722.1 | 1326000-1326033 | 1 | 0.971 |
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NZ_CP041722_4 | 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 404033-404064 | 32 | NZ_CP041722.1 | 332187-332218 | 2 | 0.938 |
NZ_CP041722_4 | 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 404033-404064 | 32 | NZ_CP041722.1 | 553912-553943 | 2 | 0.938 |
NZ_CP041722_4 | 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 404033-404064 | 32 | NZ_CP041722.1 | 553969-554000 | 2 | 0.938 |
NZ_CP041722_4 | 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 404033-404064 | 32 | NZ_CP041722.1 | 959233-959264 | 2 | 0.938 |
NZ_CP041722_4 | 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 404033-404064 | 32 | NZ_CP041722.1 | 1807419-1807450 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP041722_5 | 5.6|744271|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744271-744305 | 35 | NZ_CP041722.1 | 2568819-2568853 | 2 | 0.943 |
NZ_CP041722_9 | 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 2432212-2432245 | 34 | NZ_CP041722.1 | 10813-10846 | 2 | 0.941 |
1. spacer 1.1|46769|27|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to position: 628847-628873, mismatch: 0, identity: 1.0
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ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg Protospacer **********************************
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ggggccccaacaaagagaatttcgagcagaaa CRISPR spacer ggggccccaacagagagaatttcgagaagaaa Protospacer ************.************* *****
13. spacer 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to position: 1807419-1807450, mismatch: 2, identity: 0.938
ggggccccaacaaagagaatttcgagcagaaa CRISPR spacer ggggccccaacagagagaatttcgagaagaaa Protospacer ************.************* *****
14. spacer 5.6|744271|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1127858-1127892, mismatch: 2, identity: 0.943
tagaagacccagtcgacagtgtagaagatttacca CRISPR spacer tagaagaccaagtcgatagtgtagaagatttacca Protospacer ********* ******.******************
15. spacer 5.6|744271|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2568819-2568853, mismatch: 2, identity: 0.943
tagaagacccagtcgacagtgtagaagatttacca CRISPR spacer tagaagaccaagtcgatagtgtagaagatttacca Protospacer ********* ******.******************
16. spacer 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to position: 10813-10846, mismatch: 2, identity: 0.941
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer ggccccaacagagagaaatacgaaaagcatttcg Protospacer **********.********.**************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722_5 | 5.9|744486|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744486-744521 | 36 | MF417885 | Uncultured Caudovirales phage clone 3S_9, partial genome | 31092-31127 | 0 | 1.0 |
NZ_CP041722_5 | 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744558-744593 | 36 | NZ_CP033113 | Staphylococcus aureus strain ST20130944 plasmid pST20130944, complete sequence | 45-80 | 0 | 1.0 |
NZ_CP041722_5 | 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744558-744593 | 36 | NZ_CP033115 | Staphylococcus aureus strain ST20130945 plasmid pST20130945, complete sequence | 45-80 | 0 | 1.0 |
NZ_CP041722_5 | 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744558-744593 | 36 | NC_010616 | Staphylococcus aureus plasmid pWBG1773, complete sequence | 780-815 | 1 | 0.972 |
NZ_CP041722_5 | 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744558-744593 | 36 | NZ_CP053959 | Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed2, complete sequence | 789-824 | 2 | 0.944 |
NZ_CP041722_3 | 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 219957-219987 | 31 | NZ_CP049244 | Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence | 187192-187222 | 6 | 0.806 |
NZ_CP041722_5 | 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743988-744019 | 32 | NZ_CP031836 | Lactobacillus amylolyticus strain L5 plasmid p1, complete sequence | 118579-118610 | 7 | 0.781 |
NZ_CP041722_5 | 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743988-744019 | 32 | NZ_CP020458 | Lactobacillus amylolyticus strain L6 plasmid pL6-1, complete sequence | 120475-120506 | 7 | 0.781 |
NZ_CP041722_5 | 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743988-744019 | 32 | NZ_CP053469 | Fusobacterium nucleatum strain Fn12230 plasmid unnamed, complete sequence | 14099-14130 | 7 | 0.781 |
NZ_CP041722_3 | 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 219957-219987 | 31 | NZ_CP020539 | Sphingobium herbicidovorans strain MH plasmid pMSHV, complete sequence | 485450-485480 | 9 | 0.71 |
NZ_CP041722_3 | 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 219957-219987 | 31 | NZ_CP022118 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Macclesfield str. S-1643 plasmid unnamed1, complete sequence | 59911-59941 | 9 | 0.71 |
NZ_CP041722_3 | 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 219957-219987 | 31 | NZ_CP017563 | Paraburkholderia sprentiae WSM5005 plasmid pl1WSM5005, complete sequence | 962765-962795 | 9 | 0.71 |
NZ_CP041722_4 | 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 404033-404064 | 32 | NZ_CP049244 | Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence | 399493-399524 | 9 | 0.719 |
NZ_CP041722_5 | 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 743988-744019 | 32 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 273710-273741 | 9 | 0.719 |
NZ_CP041722_9 | 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder | 2432212-2432245 | 34 | MN094788 | Achromobacter phage Motura, complete genome | 4294-4327 | 9 | 0.735 |
NZ_CP041722_5 | 5.3|744056|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744056-744090 | 35 | NZ_CP030786 | Escherichia albertii strain 2012EL-1823B plasmid unnamed3, complete sequence | 13037-13071 | 10 | 0.714 |
NZ_CP041722_5 | 5.3|744056|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744056-744090 | 35 | NZ_CP034167 | Escherichia albertii strain 2014C-4015 plasmid p2014C-4015-3, complete sequence | 105082-105116 | 10 | 0.714 |
NZ_CP041722_5 | 5.5|744200|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744200-744234 | 35 | CP024685 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-1-490K, complete sequence | 468716-468750 | 10 | 0.714 |
NZ_CP041722_5 | 5.7|744342|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 744342-744376 | 35 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 64963-64997 | 10 | 0.714 |
1. spacer 5.9|744486|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF417885 (Uncultured Caudovirales phage clone 3S_9, partial genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaatccaaatgaaatgtatttaacaattgattat CRISPR spacer attaatccaaatgaaatgtatttaacaattgattat Protospacer ************************************
2. spacer 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033113 (Staphylococcus aureus strain ST20130944 plasmid pST20130944, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaatttattaaaagacatgtaaaagaaggacaaat CRISPR spacer aaaatttattaaaagacatgtaaaagaaggacaaat Protospacer ************************************
3. spacer 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033115 (Staphylococcus aureus strain ST20130945 plasmid pST20130945, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaatttattaaaagacatgtaaaagaaggacaaat CRISPR spacer aaaatttattaaaagacatgtaaaagaaggacaaat Protospacer ************************************
4. spacer 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010616 (Staphylococcus aureus plasmid pWBG1773, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aaaatttattaaaagacatgtaaaagaaggacaaat CRISPR spacer aaaatttattaaaagacatgtaaaagaagggcaaat Protospacer ******************************.*****
5. spacer 5.10|744558|36|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053959 (Staphylococcus capitis strain FDAARGOS_753 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aaaatttattaaaagacatgtaaaagaaggacaaat CRISPR spacer aaaatttattaaacgacatgtgaaagaaggacaaat Protospacer ************* *******.**************
6. spacer 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049244 (Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
-gttgttcgcggaaatgcttgtcgcatttctt CRISPR spacer tgatg-tcgcagaaatgcttgccgcatttcca Protospacer * ** ****.**********.********.
7. spacer 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031836 (Lactobacillus amylolyticus strain L5 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caggttttgaaacaccttgtttaaacattcta CRISPR spacer tctgctttcaaacaccttgtttaaaccttcaa Protospacer . *.*** ***************** *** *
8. spacer 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020458 (Lactobacillus amylolyticus strain L6 plasmid pL6-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caggttttgaaacaccttgtttaaacattcta CRISPR spacer tctgctttcaaacaccttgtttaaaccttcaa Protospacer . *.*** ***************** *** *
9. spacer 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053469 (Fusobacterium nucleatum strain Fn12230 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
caggttttgaaacaccttgtttaaacattcta CRISPR spacer caagaatcaaaacaccttctttaaaaattcta Protospacer **.* *..********* ****** ******
10. spacer 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020539 (Sphingobium herbicidovorans strain MH plasmid pMSHV, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gttgttcgcggaaatgcttgtcgcatttctt CRISPR spacer gctgttcgcggacatgcttgacgcagccgaa Protospacer *.********** ******* **** ..
11. spacer 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022118 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Macclesfield str. S-1643 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gttgttcgcggaaatgcttgtcgcatttctt CRISPR spacer aaagagtccggaaatgcttgtcgcctttttt Protospacer . * . **************** ***.**
12. spacer 3.1|219957|31|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017563 (Paraburkholderia sprentiae WSM5005 plasmid pl1WSM5005, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
gttgttcgcggaaatgcttgtcgcatttctt CRISPR spacer attgttcgcggaaaggctcgtcgccgcgttc Protospacer .************* ***.***** . .*.
13. spacer 4.1|404033|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049244 (Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ggggccccaacaaagagaatttcgagcagaaa CRISPR spacer gcagaaccaacaaaaagaattgcgagcagcgg Protospacer * .* ********.****** ******* ..
14. spacer 5.2|743988|32|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caggttttgaaacaccttgtttaaacattcta CRISPR spacer tcttttctgaaacaccttctttaaacacaata Protospacer . **.*********** ********. **
15. spacer 9.1|2432212|34|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder matches to MN094788 (Achromobacter phage Motura, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ggccccaacaaagagaaatgcgaaaagcatttcg CRISPR spacer agttccaacaaagagaactgcgaacagcgcgtgg Protospacer .*..************* ****** ***.. * *
16. spacer 5.3|744056|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP030786 (Escherichia albertii strain 2012EL-1823B plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ttaataaaatggttgacaaataaaatagcaactgg CRISPR spacer ctaataaaatggctgagaaataaaattaaagaaga Protospacer .***********.*** ********* . *. *.
17. spacer 5.3|744056|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034167 (Escherichia albertii strain 2014C-4015 plasmid p2014C-4015-3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ttaataaaatggttgacaaataaaatagcaactgg CRISPR spacer ctaataaaatggctgagaaataaaatcaaagaaga Protospacer .***********.*** ********* . *. *.
18. spacer 5.5|744200|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP024685 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-1-490K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tggagatatttaaactaatagtgtaaaagtgcaca CRISPR spacer tcagcctatttagactaatagtttaaaagtgtaac Protospacer * .. ******.********* ********.*
19. spacer 5.7|744342|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aacaaaacaaaaactatataaaaggatatgatgaa CRISPR spacer tagcaaacaaaaactatataaaaaaatatggaatg Protospacer * *******************..*****. . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
477568 : 515284
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041722|477568:515284|DBSCAN-SWA TTTACAGGTTTTCATACATTTTATTATATAAAACGTTAACTTCATTCTTTAATGCTTTATTCTCTTTTTCTAATTTTTTAATTTTTCTTTTCAAGGATTCAATAATTGCATTTTTCCCATCATTTTTGGCTTGAATTACATTTGATTGAGTGTTGTGTTTACGCAATTCTTCAATTTTATTTCGGATTTCTTTATAATTATACAAAGTAGCTTTTGAAACATTTGCATATTTAGAAACAACATTAAAGTTAATCTCTATATTTTCTTTTAAGAGCCTTTCTATTGCAGAATTTACTTTTATTTCTGTATTAGCTTTTTTTCTTTTATGTATTTCTTTCATTTGTTTTTTTCTATCATAATCCCCCATAAGTCCTCCTATGTTTTCATCCTATTATTTCTACCAAAAATAACATTTCCATCTTTTATATTTTTTAATATGTCTTCATATTTTTCTAATAAATTGACATGCTTTTCTACCATATCATCTCTATTAAAATTTTTAGCTACCTCTATAGAATTAATGGTAGATTTAACAAGCAATTCATACTTTTCTACATCTAAATTTGAAAATCCTATTGCTAAATCTTTGCATGGTTTACCTGAATTACAAGTTAAACATGGTGGTGCTTCCATATATGGGCAGTTACCTTTTAACCTTGCATGGCACGTACCATATGGATTGTCCATAGCATTTAATTTATGCTCTTGCCATAAAGAGTTCAACGCATTCTCAGAAAGTTCACTACTATGTTTAATATTTTTTACTTTACCATCAATATCAAAGGTGAATGCTCCTTGATCTATAACTGATTCAAATGCTTTTCTTTTAGTATCATCAAGAAGTTTCGCATATCTAAGTGTCATTTCAGGAGAAGCATGAGCTAATAGTTCTTGAATAGTTAGAATATCAACTCCACCATTAAGCAACTTAACAGCATATGTATGCCTAAACTGATGTGTTTTAAAGTGAAAAATTTCTCCCTTTTCATCAACAATATTTTTAGTTTTAGCTAAATAATTTAAATGAGAACGAACTAAATGTTGAGTATATGGCATTCCTTTTCTCTTACCTTTATATATAACGAATATATAATTATTAGGATTGTTGTCCTTAGTACTTTGTCTTTTAGAACTTGCAATTAAAACTGCTAATATATCGGCTAATTGCTCATCAATAGGTATTCTATGGCCTTTTACAAAAGTTTTTGCTATATCAGTGACTATAGAATATTTACCATTAATTTTAGTAAGGCAGTTATCTTTTAAAGTTAATACATCTGATATACGTAAACCCGTTTTAAATGCTATCCAAATGATAGGTATGATTTCTTCAGGTAAGGAATTTATATTTTCAAATAATTGATCTAATACAAAATCAGGAATATAATCAATTTGATTTTTTTCGATTTTTTCATGTTTAGGCAAATCTTGTGGCAAAAACAGAAATCTTATATCTTCTATAGGTGCTATGCTATATTTTTCCATAATTATATCATTCAAAAACCTTCTAACTAATTTGAGTTCTTCCCGCACAAAATTTTTTACACTTCGTACGTTTTTACTTTTTGCATATTTAAAAATAGAATCTATATACACTTCCATATGGTTTCTTTCTAAATTATTCAAGTCATTCCAATTAGGTTCTTGATTATGTATACTGTTAAAAAATCTACTTAAAACCCTGACGTACACTCTACCTGTCGCAAAATTTAGATTTCCTGTTATTAATCGTTGTTTCAAATATCGTTTCACGGAATTTCTTATATTAAATGAGCCTATACTTTTGAAATTTAAATAGTTCCCAGTAAGTGTTTTATTATAAGTCAAACCATACATTTCTAAATTTCTTATATCCCATATGTCTTTATCCCACTCTTCTCTGTCGTCAACCATTTTTGAAAACTGCCTATAAAACTTTTTTAAGCTTGCAGCTAAAGGCGCTTTTACTTTGTAATTTCCAAAAACAACACTTTTCGACCTTTTCCAAGTTGGCGCATTTCGATTTTCCAACCATTTAATCCATTCTTTTTCTAAACTACTAAATTCGTAGTCAAGCAAGGAATTTAAATCAGGGAATATTTCATTACAAAAAGAAGCAATTTTATTAATATGTACTGCACCACTATTGAATAAAGAGTTTAAAGACCAATACTCAGTAACAATAAATTTAAGACAAATATATTTAAATTCTAGATTTAAGTTTTTGTTTTTGAAATTAAAAAATACATTTTTCCTTTTACCACTATATCTTTTTAAATCATCATGAAATTGGTTGAAAATCTTAAAATTAGAAACATGCCATACATCATTTTTATAAAAATAGTCACTATAAATATCCATGTAAGTGATATTCCCCTCAGAATTTATACTTTTACTTTTTAAAAAGCAAAGTTCCTTTTTAAATTTACTTTGAAAAAATTCATTTGTATTTTGAACGCTATTATTCATGTCAATCTCCCTATTCAAATATTTGGAACGAATCTTTCACTTTCTCCCAATTCTCACGTATAAGCTGATCATCATTGTGTATATACAAATTCATAGTCGTTTGTATATTACTGTGACCAAGCCGTTCTTGAACCTGTTTTATATTTTTACTTTTATTGTAAAAAATAGTAGCATGAGTATGTCTTAATAGATGAGGATGAACATTTATTCCAGTTTTCTTTCTTAAACGTTTAAATATCGAATTTACGTCATTATAATCTAAGGGATCTCCAACATGCTTACCTCTAATTTTAATAAACAAAAATTCAGAACTAGTTGAAACTTCATCCAATACTTCATACAGATAATCATCATATAAATCAATCAAAGATTGTGAAATATATATTTTACGTTCTCCACTTTTTAATCTAGCTCCATTTTTATTCTTTCTAGTTTTCAAAATGATTTGATGTCCGTTAGTCAAATCATATTTGATATCATCTATGTAAAGTGACAACAATTCCCCAATACGCAATCCCGTTTCATATAATAATTGAATCATAAATTTATCTCTGAGGTTTTTTGATGCATTTATTAACTCTTTTATTTCACTGGTACTCAATATTTTCATTTTTTCTCTTGGCTCTTTGACTTTCAATGTGTTTGTTAATAATAAATTATTAGTATTTACATGATCTAAAAAGCTTTTATAAGAAGATTTACGATTACTTTCTTTTAAAATTGATTTAGCAATATCTACATTAAATTTTTTAGTCCTAAATAAGTAATCGTAAAAATTAGTAACTACAGTAATAGTTAAGTTTATAGTTCTAGCACTTTTACTATTTAGTAGTCTATCTTTATATATAACTTTTTTATATCTCTGAGGTGACTTTAACCACATTACAAAATCTACTAAGTCATCAAAAGTTGCATCATTATGATTTTTGTCTATTAACTCAAGGTACATAAAATATCTCTTTAAACAATAAGCATATGTCTTTAAAGTATTCTCACTTTTATCAACACTCTCTAAATACTTTAAATAATAGATAACATCTTCAACTGGATTTAAATTACTATCAATTATCATAAAGTTCTTTCCACTGTTAGAATTCACATTTACTATTTTCATAATATAATCCCTTTCTTAAATTTAATTTAAGAATACACTAGTTTAACAATTTTTCATATTATACATATAATACGTACTAAAATTAGTTTAGTTAACAAATTTTCTAATGAATATCTCACAATTTTTTATACATATTATACAAAGTAAACTCTAAAATTATTAATACATATAACCGTTTGCGACAATGCCAGAGCAATATCAACAGCTGCGTGACTATATCGAAGAACAAAATAAAATTGACATGCCCAGCTTATCTGAAGACCAATTAACACTCATCAATCGCAATTTAACAACGAAATTCGTCCACCAGCAACTCGCTATTATTAGTTATTGGCGCAGTGGTTATATCCATTCAATCTCTGGCTATATTAAACATCTTGACACGCAACAGCAATATATTGTTATAAGTAATGAGCGTGGCAATGAAACAATGAACTTGGATTTTAATGTCTTATGTAATGTGGAATAACCTCAAATGTCTAGACGAAAAAATAGCTATGAAGACGTCTTTTATCACTGTCTTCATAGACTACTTATATTATTTACTTGTTGTAAATCTCGCATCGCTCATATCTACTTCAACTACTTTGCCATGTTTAACAAAGCATGTAACTCCTAAACCCTTTTTTGTTGATTTATAGACGAACAGGCTTATATCTTTTCTATTTGTATCATCTTTAACTTTTTTCAAGTTGTTACCATAAGCTTTAACTAACTTGTCATATGTTAAGTTACCTTTAACGACAAATTGAACTTTACTCGCTTTACGACCATTCGCTGTAACACCAGTGAACTTTTAATTATACTTTTCTACTACTTTCTTACTGTGAGTTGGGAGCAGGACAGAGTTCATAGCTAATCTTAGTATGTCTCCTACATATTAGACTTTAGCCTTATATGAAAATTAAGTCGAAATCATTTTTTTAATAGTGTAAAATGATAAAGCATACATTATTTGCATCATAAAACTCAATACATAGATATAAGGTGAAGTTTAATACATAATCATTTAGACGATGGAGGCATTATTTTTGAAAAAAGTATTAGCAGCTATAACTATTTTATTACTCGTTGTTGCTTTAGGCTTTTCTGTGTTTTTTGCAGCTACGACAACGCATCATTCAACTTCCGACCAGAAAGACAAGGTTGAATCTACTAAGAAAAAGAATGATACACACAAAGACAACAGCCCTGAAGACGATGCACAATTAGACACACCGCAGTCGGCAAACAATGCTACTACAGCACCTGCCAACAATGGACAAAATGTTCAGCAACAGGCACCCCAATATCATTATCAACAACAGCAACCTGTAAAATCTCAACAGTCTGCTGAGCAACAAAAATCAAATGAAACACCTAAGAAAAATAACAATGCGAATTCAAACCACGGCAACAACGCTAAGTCACAGCAGCACAGTGGCCAAGGTAGTGGCGG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34 | Clostridium_phage(33.33%) | integrase,protease,transposase | attL 469799:469813|attR 489342:489356 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1097753 : 1131006
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041722|1097753:1131006|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(58.54%) | portal,tail,capsid,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1290636 : 1304590
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041722|1290636:1304590|DBSCAN-SWA 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20 | Staphylococcus_phage(75.0%) | integrase,terminase | attL 1292586:1292605|attR 1307245:1307264 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1425490 : 1455743
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041722|1425490:1455743|DBSCAN-SWA 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32 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1572529 : 1581548
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041722|1572529:1581548|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041722|1572529:1581548|1572529_1573534_+|WP_002478078.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSFHQEDSAFEYSLRPTYLKQYIGQTTIKSNLEVFIQAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEHELKEIIIRTADVLGTSIDDESAVELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNGDDQIYIETTKKALKLLQVDEQGLDYIDHKMMNCIINQYQGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATAFAYEHFMKSKEKRE >NZ_CP041722|1572529:1581548|1578733_1581010_+|WP_002478082.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWNHNEPTQYIDEQIAKKYKLSPIIKKVLESKHIVNEKDIEGLLNGQQQLHEPWLLSDMTKAIERINLAIDKHERILIYGDYDADGVTSTTIMVKTLQSLGAEVGWYIPNRFSEGYGPNELAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGYREIEMIQELGVDVIVTDHHEMGSTLPDAFAIVHPMHPEFDYPCPNLCGAGVAYKVSQALLKNNVPPYYIALASIGTIADLVSLTDENRTIVKTGLSILNDYQPIQIAALLNEANYNDPIDEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMTEDAEEAAFLAEQVNHFNNERKDIVSKITEEALLLAKEEVAKGRQFLLLAKENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTLILNIDDEQHYAKGSARSIEQVSMFEILSDHQNLISKFGGHHMAAGMTMPIENISELREGLNAWMANLAQTTSFDQKKQIDVKITEDEITVNNIYDIERLKPFGIDFNKPLFELDDVNVNSLKAIGKDKNHLKMTIGNSNLATLYWNSGSLVDELELNQPINMIGQLQINEWNGNQSPQFIIQDIAINQQQILDYRSKRKQLSIDFHDEQLAILIHPQKEKLDHNYYHYGETIDEHVNRVVLRDLPLSLAHLSESMNGHQFSQIYVVLQHQHSIYFEGMPDKKTFKACFKILMSKQKVNLVNDGMALSKFLGIQPNTLKFMLKVFLELGFIIDSNGIISVNQNPNKQDIEASQVYQTRKARIEVEKLMLYDDFQHLKHWIIEQMG >NZ_CP041722|1572529:1581548|1576184_1578473_+|WP_002478081.1|DBSCAN-SWA MKKGSRIVAFILLIVLLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVKPLQKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPRIQVEDPDRIRVQLAGVKNQNQARDVLSSQANLTIRDANDNVKLTGKDIVQGSAKQEFKQQTNEPTVTFKLKDRDKFKKVTEEISKKKENMMVVWLDYEKGDSYHKELQKKNENDRKYVSAASVNQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQISELLNAGSLPVKLDELTSTSVGAQFGQDALDKTIFASFIGIAVIYLFMVGFYRLPGFVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYTKANRSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNYFKKKFWLFGVKKKQRHDINEGKDVHDLKTSFERWNFVKLAKPLIGLSILILIVGIVILSIFKLNLGIDFSSGSRVDVESNHSLSQAKVEKTMKDVGLKADEIQINGDGKKQATIMFKHDLAKKDIAKLNDKFKNEFGHSPSVNTVSPVIGQELAKNALKALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILLFGAPSIFNFSLALLVGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSDKGKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP041722|1572529:1581548|1575738_1575999_+|WP_002458927.1|DBSCAN-SWA MNLTAILIPVLFLLVFYFLIIRPQQKRAKEHREMVNRVEAGQKITTIGGLKGTVKAVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP041722|1572529:1581548|1573536_1574562_+|WP_002478079.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNKETGDMKHQHFKDVINYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGVKEETGAKVEMLMLTQIENNDWEVLLKPAKRIKVGNQLSFGEGKIIAECIKELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKARLDDPDRYQTVYAKENGSAAAPTAGLHFTDNLLKDIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVENINEHEMHSEYYQMTENTAKLLNNTKLQGHRIIAVGTTSTRTLETIRRDHSQFIATSGWTDIFIYPGFEFKAIDALITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQFILTAYRKAVELEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP041722|1572529:1581548|1581029_1581548_+|WP_002458930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVTYAKEREVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEALGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP041722|1572529:1581548|1574580_1575720_+|WP_002478080.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELTDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTSRWAERCLKAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYNMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSIGRLVIKNAQFANDFRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEAFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1707212 : 1715909
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041722|1707212:1715909|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041722|1707212:1715909|1707936_1708470_+|WP_012990840.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSQGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEMEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP041722|1707212:1715909|1709359_1710085_+|WP_002459064.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >NZ_CP041722|1707212:1715909|1714529_1715909_+|WP_002459069.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS >NZ_CP041722|1707212:1715909|1712540_1713083_+|WP_002478165.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIGFVLTFLKFPLPFFPPYLTLDFSDVPTLLATFSMGPIAGIIVAFIKNLLNFFFNMGDPVGPVANFLAGISFLLTAYYVNKRGHVANKAMITALVMATLVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLADIVKNIKIIIVSGIIPFNIIKGAIISIIFILLYRRIKSVLK >NZ_CP041722|1707212:1715909|1713224_1713473_-|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP041722|1707212:1715909|1707212_1707944_+|WP_002459061.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >NZ_CP041722|1707212:1715909|1710068_1711817_+|WP_002478164.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDAKRISHVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAEINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >NZ_CP041722|1707212:1715909|1713583_1714543_+|WP_002459068.1|DBSCAN-SWA MKDIILYSKQHSFTYKTNKSIFNLLTGKKTHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERFMAQNVNNDMTIKVHPRYTYDSLVHTFNCIQLLIQTLSNTQQNVYSFIPISQHGLIQRKVKQIYYYIKKEDKDSAFITELNQLFKALYTNNNNYCCLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIESIPEQHLFNLEMNELVTLMYELEIEYRYPILSQCIIKPSLLHKTHITQQQLKQRFSMTQIAQKQHVKLNTIEDHILELFIKGYITHYFDFISEDGFHQFNEFYNKHRGERLKAYKQAFPNLSYFEIKLMIVGIERGELIARG >NZ_CP041722|1707212:1715909|1708472_1709210_+|WP_002478163.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGN |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2120413 : 2128883
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041722|2120413:2128883|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACCTTAGCTATAACACTAGGATAAAGTTCATATTCTAATTGTTTGACTCGTTCTTCCAAATTTTCTTTGGTATCATCCGGTTTGATCTCGCATTGTCTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCAACATAATGAACTGTTGATCCTGTAACATTATCACCACTATTAAAAGCCTGACCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTTGGCAATAATGATGGATGAATATTTAAAATCTTACCTTCGTATGCATCTAACAAATCAGGACCAATTAGCCTCATATAACCTGCGAGAATAATCCATTCCACTTCTTCACGCTCTAGTAAACGAATCAAATGGTGTTCATAGGCAGATTTTGAGTCAAAATCTTTTGGTTCGTTGATATTAACTGCTACCTTTAACTGTTTTGCGCGTTCAATACAATACGCATCGAGATGATCAGTATAAAGTGAAGTAATTTCTATATTGTTGAGTTCTCCTTTATCCACTTTTAAAACAATATTTTCGAAATTACTGCCCGACCCAGAGGCAAAAATAGCTACCTTAGTCACTATTCTACCCCCTTGAGATAAATAGGCACATGTGCATCTTCTATAACATTGCCTATGTGGTAAGCAGGGACATCGTGTTTTTTTAGGACATCTAGTGCTTTAGCAATGTCATCTTGACTAACGATGACCGTATACCCTATTCCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATCCGTAGAAATTTGTCCTTGTTGTTGTAACCAGTCAAAAATAGGAGGTGTTGGGAATGTATTCACATCAATTTGCGCAGCTAAACCATCAGGTAACACTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTGATATGATTCATCCCCATGATTGTTACTTTATCTTTTAAATCAAGTATCGGTTTCACATAGAGTCGCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGTTTGACCATTGAAGTCATCGTATAAATCAATGTCAGTCTGTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATCCCACTAGAAGCTAAACCAATAATTGCATGACCTGCTTTTATATTTGAGCCATCAATGTATTCTGCTTTTTCAACAGCACCGACAGCAAAGCCAGCTAAGTCATACTCACCTTCATGATACATTTCTCCCATCTCCGCGGTTTCACCACCAATCAGTGCGGTATTTGTTTGTTGACATCCTTCGCTGACTCCTTTTACAATCTGCTCAATAACTTCTGGAACAACTTTATTTGCCGCAATATAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCTCCAGTTGTAAGAATGTCATTCACACACATGGCTACGGCATCAATTCCAATGGTGTCATGTCTGTCATGATCGATAGCTAACTTTAACTTTGTTCCTACACCGTCTGTACCTGACACAAGCATAGGCGCTGTCATCTGCAATTGTGATAAGTCAAATGTCGCACCAAAACCACCTAAGCCACCTAAGACTTCTTTTCGTAGTGTTCGCTTTACATGTGCTGACATTCTTTCTACTGCTTCATATCCTGCTTCTATATCTACTCCAGATTGTTCATAAGCTTTAGACATTTTTATTTCCCTCTCGATCATAATAGTGTTGGTGATTCTCGATATATGCTTTTTGTCGTGGGCTCAAGTGCTTAAAATAATTTTCTTCATAATCATACAAACCAGCTGGATAATCACCTGTAAAACTTTCTAAACATAGACCACTATATGGCGCATCATAGTCTAAGCCAATAGCTTCTATTAAACCATCAACGCTTAAATAGGCTAATGAGTCGGCACCTATATGGTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGAAATCAACTCAGCAGTAGTTGAAACATCAATACCATAAAAGCTTGGAAACATAAATTCTGGTGATGCGATCCTTACATGTACTTCTTTAGCACCGGAATCTTTGAGCATTTTGACTATACGTTTAATAGTTGTGCCACGTACAATTGAGTCATCGACTAAAATAATTTTTTTACCTTCTACAATGTCTTTGACAGCTGATAGTTTGACACGTACCCCTTGTTCTCTCAATTCTTGAGTTGGTTGGATGAACGTTCTAGCGACATATTGATTTTTAACTAATCCCATTTCATAAGGCAGCTGGCTTTCTTCAGCATAGCCACTAGCTGCTGATAATGATGAATTAGGTACACCAATAACCATATCTGCTTCTACAGGATTTTCTTGAGCTAATTTCTTTCCAGAAGCTTTACGAACTGCATGCACATTCTTACCAGCTATTGTAGAGTCTGGACGCGCAAAATAAATATATTCCATTGCTGAAATCGCAGTACTTGTGTGTTTTGTATATGATTTTATTTTTATACCTTCGTCATTGATAACGACATATTCTCCTGCGTGAACATCTTGGATAAATTCTCCACCTAAAACATCAATAGCGCATGTTTCACTTGCTAATATATAAGTTCCATCTTGCATTTTTCCGACCGCTAATGGTCTAATGGCATTAGGATCAACTGCACCATATAAAGCATCCTTCGTCAAAATCGTAAAGGTAAAACCACCTTTAATTTGGCGTAGACTTTCTTTTAGTGCTTCTTCAAATGTTGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATCACTTCAGTATCTGAAGACGAATGAAATATTGCCCCATGCTTTTCTAAGTATTGTCGTAATGATTGTGCGTTGATCAAATTTCCGTTATGACATACTGCAACGCTCATATCATAAAAATGATAGAGAAATGGTTGAATATTCTCGATACCTTTATTGCCTGATGTTGCATAACGTACATGACCTATAGCGTTACGACCTGTTTTTAATTGTTCCATTTGCACTTCTTTGATTGCTTCAGTTAACAGCCCTACACCACGTTCACCTTTTAATGTGTTACCATCTGTGACAACAATTCCAGCGCCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATATGTCAATTGAGCTGCCTCTGCATGGTTCCAAATTCCAAATACGCCACACTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACATTGCGCAATAGCTCCTTCCCATTGTGCTTTTATATCAGAAGCTCTCTTAGAAATTGATGTATGAGCAGCTGCAACATTAAATTCATCCGTATCTGTAAGTTGACCTATTTCAATTGCATGCTCAATATTTAATTCTTGTCCTGCTTTAACAGCAATCACATAACGTCCTTGCGTTTCACTGAATAACTGTGCATCTGAAAGATTTACTTTAGCTTTTAATCCAAGACTATAATGCGCACTGATTCTAGCGAGAGTAATTAACAATCCACCTTTGCCAACAGTCTGTACGTGTGAAGCCACACCATTTCTAATTGCCTTTTTAACGGCTTCACCCTTTGTCACTTCATCGCTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTCACTTTGCCGTATAACAATTTTTCAATTTGACTGCCACCGAAATCATCCCTAGTATCTCCAACTAAGTACAATTTATGTCCTGCTTGAGGATGGAAATCATTTAAATATTCGATATTTTCAATTAGCCCTACCATACCAACAACTGGTGTTGGAAAAATAGATGTACCACGTGTTTCGTTATAAAGCGAAACATTACCAGATACTACTGGTGTTTTTAAAATTTCACATGCTTCTGACATCCCTTTTGTTGAATCTATTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAATCTGTCATTGCAAGTGGCGTGGCACCAACAGCAATTAAATTGCGATAGGCTTCTGCCACTACCATTTTTCCACCTTCATATGGTTGATTAAAGACATAACGTGCTTCGCCATCAATGGTAGAAGCAATCGCTTTTTGGGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGACTGTAAACCTGGTTTAATGATTGTATTGGCACCCACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATTGTTGGATGTGTGAGTAACTGGTCAAATACCTCTTGAACATTGATAGAATTATAATCATTTTTAGAAGTATTATATGCCTTTTCTTCGCCTTCAAGCACATAAACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGATTGCACTGGAATATCTGCAAATACTTCATCCTCATATTTAAGTACAAAACGGTCTGTATTTGTTACTTCACCAATAACAGCACTATCTAATTCATGTTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCCTTTTCAACAACAAGTAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGAGATATGCCAGGTTCTCTAGTCGGCACTTGGTCTAAATTTAATATTAAGCCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCAGACGATGACGATGTTAATCCGGCTGCTCCCATATCTTGAATACCTACGAGCTCTTTGTATGTAATTGCTTCTAGGGTAGCTTCCATTAATTTCTTACCTACAAAAGGGTCGCCAATTTGAACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGACGCAAACGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTCAAACCAACATATATAACTGAATTTCCTTCGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAATCATATCATGGTCAATAATACCTACACACATCGCATTAACTAATGGATTGCCATCATAACGATCATCAAATTCAATTTCACCTGCAGTAGTAGGAATACCGATACAGTTACCATAGCCACCTATACCGCGAACGACCCCTTTTAGTAGTCGTTGATTTTGTTTCACTGATAATTCACCAAAACGCAAACTGTTTAATAAATTAATAGGTCGTGCACCTATTGACACAATGTCACGAATAATCCCACCTACGCCAGTTGCTGCACCTTGATATGGTTCAATTGCTGAAGGGTGATTATGTGATTCAACTTTAAAAACGACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACTACACCAGCACCTTCACCTGGTCCCATCAATATACGCTCACCTGTAGTGGGAAATTGTTTTAAAAATGGTTTAGAATGTTTATATGAACAATGTTCACTCCACATAACAGAAAATATACCTACTTCAGTAAAGTTTGGTTCTCTACCTAGAACATCACAAACTTTAGTGTACTCAGCATCACTTAAACCCATATCTTGATATAATTTTTCAACTTTAATTTCTTCAATACTAGGTTCAATAAACTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTATTAACCATTGCTTCGAATAATTTTACGCCACTATCAGTACCAAGAATTGTTTCAAGTGCACGTTCTGGATGAGGCATCATACCACACACATTCCCTTCTTTATTCACGATGCCAGCAATATCTTTATATGAGCCATTAGGATTGTCTTGATACGTTAATATGATTTGGTTATTGGTTACTAATTCTTCATATATGTCATCAGTGCAATAATAGTGCCCTTCACCATGTGCTACTGGATATACTACGAGATCATTGTTTTCATATAAGTTAGTAAAAGGCGTTTGATTATTAACAATTTTTAAGGTTTCATTTCTACTAATAAATAAATGGGAATCGTTATGAAGTAAAGCTCCTGGTAATAAGCCAATTTCAGTTAAAATTTGAAAACCATTGCATACACCTAATACTGGTTTACCTTCACTTGCTAAACGTTTAACTTCATCAATTACTGGGGCTACGCTAGCCATGGCGCCTGAGCGCAAATAATCTCCAAATGAAAATCCTCCTGGTATAAGTACACCATCAAAACCTTCAAGTGATGTCTCACGATAATCTACATATTCAGCTTCAGCACCTGTTTTAATCGCCGCGTTATACATATCTCTATCACAATTAGAACCAGGGAATACGAGAACTGCAAATTTCATATCATGCATTCTCCTTTTCATCAACGATTTTATAGCTGTATTCTTCAATGACTGTATTGGCAAATAACTTTTCACTAAGCGTTGTAATGATGTTATCAACTGCTTCATCCGTAGCTTCATCAACAGACATATATAATACTTTGCCGACGCGGATATCATTGACTTGCGTATAACCTAAGTCATGTACAGCACGATTTAATGCTTGCCCTTGAGTATCTAATACTTGTGGTTGTAAAGTAATATGAAGTTCAATCGTTTTCATTATTTAACTTCCTCCAATTTATTTAAAAATGTTTGATATGTGTCAATCAGTGAGCCTGTTTCATTTCTGTATACATCTTTGTCAAAATTCGTACCTGAATCCTTGTCCCATATACGACAAGTGTCTGGTGAAATTTCATCTGCTAATAAAATTTTTCCATCTTGTGTTTTTCCAAATTCTATTTTGAAATCCACAAGCTGTAAATCCATTTCATCCATAAGTTGTATCAGTACATGATTGATATCCTTAGCCATTTGTTTTAATGTTTGTATTTCTTCATCGTTGGCAATGTTTAATAGTTTGACATGGTCATCAGTAATTAGCGGATCATTTAAGTCATCATTTTTATAAAAAAATTCAACTAGTGGTTCGTTAAATTGATATCCTTTATCTAAACCTAAGCGTTTCGTGATGGAGCCCGCTGCAACGTTACGAACAACAACTTCTAATGGAATAATCTTTACTTCTTTAACTAATTGTTCTGTCTCAGATAATTGTTTAATAAAATGACTCTCTATACCTTTATGGCTTAAATAATCAAATATAATAGATGTAATTTGATTGTTTAAGCGACCTTTGCCTTTCATGGTATCTTTTTTCGCACCATTGCCAGCCGTTACTTCATCTTTATACTCAACACGCAATTGATTTTCTACTTCAGTAGAAAATACTCTTTTTGCTTTACCTTCATATAATAATGCCATTTATAACTCTCTCCCTTCGAATTGTTTAAGCATGGTAGCTTCAGTGGCATTTACATCATCTGTTAGTATCGTCATGTGACCCATCTTGCGATCTGGTTTACGTTCAGCTTTGCCATAAATATGAACATGCCATTCTGGATGTTGACCAAAATCGTCTTCTAATAAATCTAAATCTCGACCAAGTAAATTCATCATAACGGCAGGCTTTAGCAGTTCTATAGTCTGAGGTAATGTCTGACCAGTTATCGCAAGAATATGCGTATCGAATTGAGAATAATCACATGCTTCAATAGAATAGTGACCTGAATTATGTGGCCTTGGTGCAATTTCATTAACATATAATTGATTTTGTTTATCGATAAAGAATTCCACTGTAAACGTGCCAACAAAATGTACAGTATCGATGATTTTGTTTACTTCTATTCTTGCTAGTTGTTCTTTGTCACTGCGTGCTGGAACAATTGTTTTAAATAATATTTGATTGCGATGTTCATTTTCTTGTAATGGGAAATACGTCGTTTGTTTTTGATTACCGATTGTGACAGTTAATGATACTTCTCGTTCAATGTCGAGGTATTGCTCAGCTACACATTCTTGTTGCGCAATAAGCTGTTTGGCTTCTTCTATCGCCGTATGATCTTTAACTAAAATTTGTCCTTTCCCGTCGTAACCACCAAATCTTGTTTTGATGATAAAAGGATAGCCTAACTCTTCTATGGCATTGTATAAATCATCTATATTGTTTATTGATAAAAATGGAACAATATGAGCCCCGGCTCGCTCTAATGTTTGTTTTTCGGTTAGTCGATCTTGAAGTAATTCTATTGCTTGGTAACCTTGAGGAATATTAAATTGTTCAGATAACGTCTTTAATTGTTGTGCTGAGATATTTTCAAATTCATACGTAATGACATCTGATTTTTCACCAAGTTCTTGTAAAGCTTGTGTATCATCATAGGCAGCAGTGATAAACTCATTAGCAATATGATGGCATGGGCAATCTGTATTTGGATCTAAACAAATAACTTTAAAACCCATTTTTTGAGCAGATTGGGTCATCATTTTTCCTAACTGTCCACCACCAATAATGCCTATAGTGTCGCCAAACTTTAACTTATTGAAGCTCATGCTGCATGTCCCCTACTTTCTTAACGAGTGTTTTTTCATAATTTTCTAACTTTTTAAGTACTGACTTGTGACTGATACTTAGAATTCTCGCAGCTAAAATACCCGCATTTTTAGCACCAGATTTCCCTATAGCTGTTGTAGCAACAGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGACAATAGCGAATCTAGTCCTTTTAAGCTTTTTGATTCGATTGGCACACCAATCACCGGTAAGGTTGTCATTGATGCTACCATACCCGGTAAATGCGCTGCACCACCAGCTCCCGCAATAATGATATCGTAATCATTAGCGCGCGCTTGGTTTGCGAAATCGTACATTAATTTTGGTGTACGATGTGCCGAAACAACTTTCTTATCAAACGGAATACCAAATTCTTCTAACATCGCACAACTTTCTTGCATAATCTTCCAATCTGAAGAACTACCCATAATGACTGCTACTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041722|2120413:2128883|2127286_2128414_-|WP_002478382.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLKTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >NZ_CP041722|2120413:2128883|2120979_2122011_-|WP_002478378.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDHDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKAGHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE >NZ_CP041722|2120413:2128883|2128400_2128883_-|WP_150891510.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLKKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ >NZ_CP041722|2120413:2128883|2120413_2120980_-|WP_002478377.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHLDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFDSKSAYEHHLIRLLEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK >NZ_CP041722|2120413:2128883|2126321_2126582_-|WP_002459451.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >NZ_CP041722|2120413:2128883|2125648_2126320_-|WP_002478380.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVNSWREQHV >NZ_CP041722|2120413:2128883|2123466_2125656_-|WP_002478379.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFVLKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLLTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD >NZ_CP041722|2120413:2128883|2126581_2127286_-|WP_002478381.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >NZ_CP041722|2120413:2128883|2122003_2123488_-|WP_002459448.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVINDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2348337 : 2364337
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP041722|2348337:2364337|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP041722|2348337:2364337|2351833_2352187_-|WP_049395135.1|DBSCAN-SWA MEVITVKVIEKEISKVPNEYLRIYDTIQNSKDKYITKSKILNLMGYESNSTNERWLRNAISKLIDDYGYPIGCSYKKHERGYYIITTDEEKHQAMQSLKKLADGSMRRYEALKRIEL >NZ_CP041722|2348337:2364337|2349749_2350232_-|WP_037558951.1|terminase|DBSCAN-SWA MDKLTPKQERFANEYIKTLNVTQSAIKAGYSPNSAHVTGSRLLRKEKVDEYIKSKKDEIIDDTILSAKEILYLLTQSAIGDETETKEVVVKKGTFERNPDTGRMNLVYNEHVEKVDVPIKPSDRLKARDLLGRYHSIFTDKVEMSMVVPTFIDDIGRFEE >NZ_CP041722|2348337:2364337|2361475_2361940_-|WP_002479322.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKHGEIYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGERTREVGYSIIPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAMKRDVDRAMKARY >NZ_CP041722|2348337:2364337|2361961_2364337_-|WP_150891522.1|DBSCAN-SWA 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20 | Staphylococcus_phage(70.59%) | integrase,terminase | attL 2347080:2347137|attR 2361008:2361065 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2416393 : 2434246
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP041722|2416393:2434246|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP041722|2416393:2434246|2424294_2426400_-|WP_002459742.1|DBSCAN-SWA MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKESGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDDEIERLHYLVDHDFYFNVFDKYSEIDLREITDFAKSIEFNFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVTIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEQYYDDMVANPNIIKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIDDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYFAKNKIGYESEEAKDFANVFFMMMNYYSLERSMQIAKERGQVYQDFEQSDYANGKYFSFYTAQDITPRFAKVQQLFEGIEIPTAEDWKALQQQVEAHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NZ_CP041722|2416393:2434246|2416393_2417347_-|WP_141760421.1|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Caudovirales_phage(58.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2448768 : 2455389
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP041722|2448768:2455389|DBSCAN-SWA 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CACTTTGATTGTCCCGCTTCACGTTCTACATTTTTATATGAAAAGACTTTTGTATTATAACCAATCCAAGCAAATAATCCTTTTGAAAAACGATTGTTCTCTTGCAACTCAGCAATTGCACACACAGCTCGTTGACTCAACAATCTAAAATCTCCTACCCCATCGACAAACTGGACATCTTCAACAAATGCATTAATCAATTTATAATACATCTTTGTCACTATTTTACGTGATAGCTGTTCGCCTTCTCTATCACGTTGGGCAATGACTTGATCATAACCCTCTAGATAACCATCAATCATATTGGGTATAAATTCAGGAGGATGCTGTAAATCACCATCTATCATAATGACAGCGTCTACATCAACACTATGGTGAAAACCTGCAATCATCGCTGATTCTTTACCAAAATTCCTACTAAATGAAATAAACTTTACGTGTTTATCTTCTAACGACAATTGCTGTATGTGTTGAATCGTACTATCTTTGCTACCATCATCAATAAATAATAAATCATAGTCATAATTTTTTTCGTTACTGTCTTTCAACATAATTTCAGTCAATCGCTCATATGTTTTTAATACGACTTCTCCTTCGTTATAACAGGGGACAATGACTCTGATTTTCATCCGATTACTTCCTTTACTTATTTCTTAATACTATTTTATCAATTTATTCATAAAACGCGCTAGTATCGTTCTTTAATTTTACAAAAAATTAATAAAGTTGCAAGCGAACTAGTTTTTAAAGCTATTTTATTTTTTTAAGTAGGCTTATCATTTGTACTATTTTAAATCGCCAATGCTAACATCATCAGGATCTTTCCCTTGTCTTGCATTGCGATTCAAACTATCAATTTCTGCAATTTCAGCTAATTCCAAATTAAAATTAAATAAATCGAAATTTTCTTTAATTCGTGAAGGTGTCTGAGACTTAGGTATAATGATACGATTATGTGCTAAGTGCCAACGCAACACGATTTGAGCCGGTGTCTTGTCGTGTTGTTGGGCAATATGTTGAATTGTTGAATCATCTAATAATCCGCGATTGCGCATTAATGGCATCCATGCCGTTACAGTAATATCGTGTTTATCGCAAAAGTCTTGAACATCCTGTTGATTAAAGTAAGGATGCAATTCAATTTGGTTAATTTGTGGAACGATATTGGTTTCTTGCATTAATTTTTCCAAGTGATGAATTTTAAAATTACATACGCCAATCGCTTTTACTTTACCTTCATGATATAAATCCTCTAGTGCTTTATATGTTTCAATATATCGTCCATTCTGTTCACATGTCCAATGAATCAAGAATAAATCAAAATAATCAAGACCCATGTTATCTAAAGAACGTTGGAAATAGGCTTTCGTCTGTTCATAACCTTGATGATCATTCCATACCTTAGACGTGATAAACAATTCTTCACGTGGCACACCACTATTCTTTAAAGCCTGTCCTAATGATGCCTCATTGCCATAAAAATATGCAGTATCAAATGCACGATAGCCGGTTTCTATAGCTTGTTGAATGACTTTCGGCATATCTTCATCAGTGATTTTATAAACACCAAAACCTACTTTGGGCATAGGATAGCCATTATTTAATAATTGCGTATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP041722|2448768:2455389|2449903_2450500_-|WP_002479366.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >NZ_CP041722|2448768:2455389|2450835_2451507_+|WP_002459764.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNDDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >NZ_CP041722|2448768:2455389|2451508_2451928_+|WP_002459765.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH >NZ_CP041722|2448768:2455389|2452742_2453333_+|WP_002459767.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVLAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY >NZ_CP041722|2448768:2455389|2448768_2449920_-|WP_002459762.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML >NZ_CP041722|2448768:2455389|2451927_2452644_+|WP_002459766.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP041722|2448768:2455389|2453373_2454396_-|WP_002459768.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAELQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >NZ_CP041722|2448768:2455389|2454552_2455389_-|WP_070817153.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGVPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWTCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIELHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK |
8 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2536836 : 2598452
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP041722|2536836:2598452|DBSCAN-SWA CTTATAAATTCAATGCAATCACTGTTTGATTTTTCTCAATTTTCTTAATGCCAATAAACTTCATTGTTTCTTGCGTCGTCTGGTGACCTAAATATTTTTGTATTATCGAAATTGAAATACCCGATTCATAGGCATGATATGCAAATGTTTTGCGCAAAGTTGTTAATCCTATATGTAAAATACCTAATTCTTCTGCTGCTTGATGAATAATTCTATAGGCCTGCTGTCTTGAAAGCGCCTGATGTGTACGTATTGATTGGAATAATAATTGCTGATTAGCCAATTGATAGTCATCAATATAATCTGTCAGTTCTTGACGTAATGTTTCAGGCAACTTAATCTTAATTGACGGTACTGTGTTTTCAATCCAAGCTGTTTTAATATTCCCTCTTTGCAGATTTTTAATATCTTTCACTTCTAATTTTAATAAGTCTGTCAATCTAATGCCGGTATGAATTGCTAATTTGAAAAATAAATAATCTCGCTTAGATTTCATGCTAAGCACTTGATACATACGCTTAATATCTTCTTTATTTCTAATAGGTTCTACTTGATTCATTTGGCCACCTCATAATTGTTTCTCATTTAATAATAATACATATTTAAGTTACATAAAAGAATTATGCTTATATATTCAAATTCATTTGGCTCTTTTGATAATGCGCAACGATATATAAAGTGTAAGGAGGTGAAAATAATGAATCAAATCAATCAACTGACTGTTCAGCTTACTGAAATCAAACTTAATGATGCAGGTAAAGCACAAGAACAAAAACGACGCTTTGCAAAACTGAATCCACAAGCCACTGCAGACCAAATCAAATCATTTTCTCAAATTATAAGTCAACTTACTGGTTTAAAATTTGATAAAGTGGAAGCGATTAAAACTGAAGAAATTGTATAATAAGGAGGACATATCATGCCAAAAACTCTAGAATTAGTATTTAAAACGGCTGATAATAAAAATGCTAGACTGCAAGTTCCAAATATCGTTGCAACAACCGATGCAGATCATGTTAAAGAAGCCATGAATAACTTAATTGCATTGAAAATTTTAAATCCAACAACTGGTTTACCAGTTAAAGCTATTGCGGCTTATCTCATTGACAAATCAACAACTGCCATTTTTGAAGAAAAGTAACTTGTTCATACTAATATCCATAGCAATTGATTATTATTAACCATTTTTGACGGAGTCTGGGGCATCATTATTTTTCAGGCTCTGAACTCTATATTGATGGTAGTTAACTGGATTGAAAATACGCTTACACCAAGCTTTTCAATCCTAGTCAACCTTGCCGGGGTGGGACTACGAATTCACAATGAATTCTGTCCCGCCCCCTATCTATTTTTTAACAACTATCTTTTATCGTACTTTTATTTCAGCTATAATAAGGCCAATCACTTATTTTAAAGAAAGCGTGTTTACTTATGATATTACTATTTATATTCGGTCTTATTGCCGGTATGGTCGTACCTATTCAAACGTCAATTAATTCAAGGCTAAGCTATTATACGAAGTCATCATTTTATGCATCGACCATTTCCTTTTTCACCGGAACACTTTTTTTAGTTGTGCTTAATTTAATATTCAATCCACAGCTACTACATATCATACATACTCAACAAACTTCTTTTAATTACACATGGTTTGTAGGTGGTTTACTTGGCGTTTGTTTTCTAACAGGTAACTTACTGTTATTACCACGACTGGGTGCTGCTTTGACAGTTGTCATGACCGTAACTGGGCAAATTTTCATGGGGGTAATTATCGATACCTTTGGCATACTTGGAGCTCAGCAACATACGTTCACTACGCTCAAAGCTTTAGGTACATGTTGTTTGCTTTTAGGAATTATTTTAATGAACTATTTGCCGAAATCAAAGTTGACTGAAACCAAACAGCCACGTTTTTATTTATGGCTTATCATTGGTCTCATTTTTGGTTTTGCACCCCCGTTACAAACAACAATTAATAGTTCGCTAGCCCAACAAGTGCATTCCTCCCTTTTTGCATCTCTAGTATCTTTTAGTGTTGGAACAATGGCTTTATTCATCTTAACATTATTATTTCATCGTAATTTACGTCTTGAGCGTTACCATGAAACGCAAGGAGCATTGCATCCGATACATTTTATCGGAGGTCTGCTAGGCGTAGCATTTGTCACTGCAAACATTGTCCTAATGCCTCATTTAGGTGCAGCTTTAACTACGATTATAGGTATGTTAGGTCAAATGCTTATGGGTGTTATTATTGATCATTTCGGTTTATTGGGGACACCTCAAAATCGTATCACTATAAGAAAAACATTCGGTCTTATCGCCATTGCTTTAGGGATTATTTTGCTGCGGCTTTTTTAATAGACATTTGTCTTGTCTCAAGCCTTAGAACGTGAAATCATTTAATATCGTTCTGAGGCTTTCAATATAGCCAAAATATTGTATAATATTTTTATAAAATAACCCCGAGGTGATTTAACTTGCCCACAATATTCAAACATCGTTTTATTTTCCCCTTACTCCTACTATTAATTGTTCTAGCTATTTGCCTGATGGTTTATCACACGTATTTTAATCAACCTAAATCTTCCCCAACTTTAATAACCGTGAAACCATACCAATCAGCCTCATTTACCGCTATGGAACAACCTAAATCCTTTTATGAATTACGTTATCACTCAAGCTATGGCTATATAGATCATATTTATGTCAAAAATCAGCAACTCATCCAAAAACAGACACCTTTATTAACTTACTATAATCCTCAATTAGAACCCCTTATTCTTGCACAAAAGAAATTGCTTACTCAAATTAATCATTCAAACGTTTCTAACACATTTAAAGATCAAGCCCGTTTAAAATTTATTAGTGATATTGCAGTTGAACAAAATCATTTAGTAACACGTTTAACTTCTCCAATCAAGGGGTATGTTTTGATAAACAACACGACGCCCTCAAAAGAAAATGATATTATCTTAACGATTACAAGTGAAGAGCATATCATCGTTGGAGATTTACCAGAAACATTCCGCAATAAATTTAAAATAGATGAAGAAGTTACATTACTAACCAGCAATAATCAACAATTTTATGGCAAAATCAATAGTATTTCTCCAATTCCTAAGGCATATCATACAAAAAATTCTGTTTATCGCGTTATAATAAAATCTGATAAAAATTGTCCTCTTGGCACACACATTAAAGTTGCACCGTACCACACAACTTTTGAACTACCACAGTCAGTATTAATTCAAAAAGATTGCGTTTTGATTTCAAAAAATAACAAATTAATTAAAAGAGAAGTAAAATACACTAAGAGTTCAAAAAAAGGGTATATTATTATAACGCAAGGTTTAAATATTAATGACCGCGTTGTAAGACATCCTGAAGCCAAAGATATTTATGATTGAGCACACTTAATGACACTTAACTAATTTTTTTATATAATGAGACTAAACTAAATTACGCCGACATTAATTTGTAATATGAAAATTCTGTTAAATAAAAACTAACTTATCTCAAAACAATATTTTGTTTTATTAAGTGTTTTTATGTTTACTTTTTATTTTTATTTAGTTATAATTAACTAAATAATATAGCATTAAGTGCATTTAAATAAGTTTTATTGACTTCAAACTATCCATAGGCAACGCTTTAATTTTTTTATAAATCTGTATGATTATTAAATTGGGTACGGTGTCTTATAGTAAATGAGGAAATATATTGGGGAGGTTTCACATATGGCAGTTTCAAAAATCAATGATTGCTTTGAATTATTAGCGATGGTTACTTATGCTGACAAATTGAAAGGTATTATAAAGAAAGAATTCTCAATTAGTTTTGAAGAATTCGCAGTTTTAACATATATCAGTCAAAATAAAGAGGATAAATATTATTTGAAAGATATTATTAATCATTTAAATTACAAACAACCACAAGTTGTTAAAGCTGTTAAAAATTTGTCTCAAGAAAACTATTTCGATAAAAGACGTAACGAACATGATGAAAGAACTGTATTAATTTTTGTTAATGCAACACAACGCAAAAAAATCGACAAGCTATTAGAGCAAGTAAACAACCGTATTACAGAAGCAAATAAAGATGCATAAGTCAGCACATAATAATGCAATATTATTGCATAAACGCGATCAGCTATAAGCTAATCGCGTTTTTTATTGACTAGAAAATGAGTGTAATAACAAACTTATTCTAGTTTTACTAATAGTATGATCAAAACACATTTCACTACACAAATTAAGCCATTAAAAACATATTTTTCCATAATCTTTTACTATAGACTATTAAATTTCAATAGATCTCAATCTCGCTTATTATCATGTTAAGAATGACTTGCATCAATAAACTGAGTTAAAAATGACAAAAAGTGATCAGGTTCTTCAATGTGTGGTGCATGTCCTGAGTATTCAAACAACTCCTTTTGGACACGCGTAAAATGGTTATCAATATCATCGTCACTAATTAATGGATCATATTTGCCATCAATAACCAATGTTGGCACATGTATAGTCGTTGGCTGTTCAGCTTGACTATTGCTTATTGAATATAATGCTCTACTGGCAGTCGCATTGTCTTCTGACGTAGCCTTATGATATAAATATTGTGCTTGGAACCATTTCATTGCCCGACTTTGTTCCTTGAAAATGTAAGGAAATAATATCAAAATAGCCTCTGAACGATTGAAACCTTGAATCTCTTCTTGATGCTCAATCATCAACTGTGTAAAACCATGGACGACGGCCTTACGTTTAGAAGAAATCAACGTTAAAGACAACACTCGGCTAGGATATTGTTCAGTAAATTCACGTGCAACCATGCCCCCCATCTCATGGCCGACTAAATGAGCCGTACAGATTCCCAAATGACGCATGATTGCTTTTAAATCCCCAATATGGTCAGATAAGTGATACACATCTGGTCTCGAAGACTTACCATGACCACGTAAATCATATGTAATAACTCGATACTGTGTTTTTAACGCT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>NZ_CP041722|2536836:2598452|2555131_2555638_-|WP_002479423.1|DBSCAN-SWA MAENKGFKFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANQEAFIDIGGMHARAQVEKGVKWITDKETVEGDDAKEYWLCWVTTERSEQGPYYAGVTACYLLVNKSIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHVIIDHIGDNNKQVLKKFLQSHNSEMWNNSSSELHLAFE >NZ_CP041722|2536836:2598452|2551237_2551654_-|WP_002479419.1|DBSCAN-SWA MTKTVKINTKQVLKQNGDKQQFDMTTIGVWQQRQSEFIRYEENIEDANVNVTIKIDQQGVKLIRKGDINMNLHFVEGKTTTTLYDISAGRLTLTVKTLSILHFVNKSGGKLKIHYELYQEDEKMGTYQYEINYKEISE >NZ_CP041722|2536836:2598452|2569020_2569974_-|WP_070866289.1|tail|DBSCAN-SWA MDVLIQKFDGESFTLGSAGIIVHDFNVSGLELDTEYEQIDGLHGRFDMGGVYRKRTVSVPISFIAGELSDFPLHRDKLFNIVTDLDGFYIREMRRPKRLQYEFRDTTSDSGGLILDENNKETSFDTPQTANEMSSGKRYKVRLANVISLSQSNHKGEAELEFETIELPFAESVNTTLSLHNNKNYQNSKDWSHGMGLISNSEAYNYVFDAVNALSFYYPGNIPNDQSNMDKIIKFEFKKDSKGFSFAINDILVIIEDVDFKAGETLIFDGQNILNNNLSILQSSNYTQPEIKIGWNKIEIKNNAVVKTTVDARCYYK >NZ_CP041722|2536836:2598452|2569994_2571812_-|WP_150891528.1|DBSCAN-SWA 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78 | Staphylococcus_phage(48.94%) | holin,integrase,tail,capsid,tRNA,head | attL 2536450:2536471|attR 2559455:2559476 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041722.1|WP_000033736.1|1102702_1102912_-|hypothetical-protein |
1102702_1102912_-
Protein sequences of NZ_CP041722.1|WP_000033736.1|1102702_1102912_-|hypothetical-protein>NZ_CP041722.1|WP_000033736.1|1102702_1102912_-|hypothetical-protein MSKHIYACLLGEWVNLSESENVVIDNSYTDANLWYKEVGHKMFDYNQMHIGYNGIDYFIHPSFIQVLTK |
69 aa aa | NA | NA | NA | 1097753-1131006 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.6|744271|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP041722 position: 1127858-1127892, mismatch: 2 tagaagacccagtcgacagtgtagaagatttacca CRISPR spacer tagaagaccaagtcgatagtgtagaagatttacca Protospacer ********* ******.****************** |
||||||||||||||
NZ_CP041722.1|WP_000033736.1|2593342_2593552_+|hypothetical-protein |
2593342_2593552_+
Protein sequences of NZ_CP041722.1|WP_000033736.1|2593342_2593552_+|hypothetical-protein>NZ_CP041722.1|WP_000033736.1|2593342_2593552_+|hypothetical-protein MSKHIYACLLGEWVNLSESENVVIDNSYTDANLWYKEVGHKMFDYNQMHIGYNGIDYFIHPSFIQVLTK |
69 aa aa | NA | NA | NA | 2536836-2598452 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.6|744271|35|NZ_CP041722|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP041722 position: 2568853-2568819, mismatch: 2 tagaagacccagtcgacagtgtagaagatttacca CRISPR spacer tagaagaccaagtcgatagtgtagaagatttacca Protospacer ********* ******.****************** |