Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP043320 | Pseudomonas sp. C27(2019) chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,WYL,cas3,DinG,csa3,cas14j,RT | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043320_1 | 656962-657066 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043320_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043320_1
>1.1|656987|55|NZ_CP043320|CRISPRCasFinder GTCGCCTATGAATGGGTGACCTACAGTGGTGCAAGGTCGGCACTTTAGGGCAGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043320_1
The CRISPR arrays of NZ_CP043320_1 >merge|NZ_CP043320|1|656962-657066|CRISPRCasFinder CGTTGGCGTGTGTTTGGTTGATTTTGTCGCCTATGAATGGGTGACCTACAGTGGTGCAAGGTCGGCACTTTAGGGCAGGCGTTGGCAGTGTGTTTGGTTGATTTT >NZ_CP043320|1|1|656962-657066|CRISPRCasFinder CGTTGGCGTGTGTTTGGTTGATTTT GTCGCCTATGAATGGGTGACCTACAGTGGTGCAAGGTCGGCACTTTAGGGCAGGC GTTGGCAGTGTGTTTGGTTGATTTT
>NZ_CP043320.1|WP_151183894.1|656137_656785_-|hypothetical-protein MRHLRIISLVLLALALSACQSFTASSAITQPALRLQGNLTHNGENWLLQPCTVQENYTLELPTALDDEFKSLLAESPNGLFADLSGQLDNEQKHFSVSQRYRVQIEGYNCNDPDFERLLLRASGNEPFWSILQTPRGLIFNQIDQPTIALPYIEEQLPDGRFHISTQANNQNLQLWITPQRCTDSMSGSIYHLNTQLQWNQQTLQGCAAFGALRD >NZ_CP043320.1|WP_151183893.1|655099_656098_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MLRIAINGYGRIGRNILRTLFERGLHDKLQIVAINDLGDAKTLAHLTRFDSTFGRFAHSVQLDGESLQIGNQSIRLLSQADPALLPWQELGVDVVLECTGRMKQRQQAQQHITTGARRVLLAHPMDDADITVVYGVNHQLLDNQHIISNASCTTNCLAPLAKVLHEGVGIQHGMMTTVHAYTNDQNLLDKSHKDLYRARAAASSIIPTSTGAAKAIGLVIPELAGRLDGMAVRVPTQNVSLVDLSFIAERDTSREEINDILSAGATLLPQGVMECNEQPLVSCDFNGYPVSCVADLTQTRVQDNFVKVLAWYDNEWAFANRMLDVLTSWRGV >NZ_CP043320.1|WP_151183892.1|654800_655004_+|hypothetical-protein MNVDARIAELEMRQAFQDDTIQALNDVIVEQQRLLARMQTQLELLAQRQNDMHSQFDETPNEPPPHY >NZ_CP043320.1|WP_151183891.1|654369_654804_+|HIT-domain-containing-protein MFDLDERLKNDTVVIADSVLCRILLMNDSRYPWLILVPRIASVSEVFELTAVQQQQLWQEASDVGRVLKSEFQADKMNIATLGNVVKQLHMHVVVRMQEDAAWPAPVWGNGAAQPYSENAKSQMCTRMRAAIAQIDLIKTEVDL >NZ_CP043320.1|WP_151183890.1|652800_654129_-|OprD-family-porin MQMIKLSVIALAVAAASTQMAVASQQSESNGFIEDSKLDTHARVLYMNRDFRNDSGTTTRNSYNEDTGLGLKAIYESGFTQGTVGFGVDAFGLQGIKLDSGRGRNGNGQFPTHSNGKAQDNYSQAGGAVKARISNTVLKYGNQFVSLPVLATDDSRLLPETTTGFLVTSNEIENLELNLGHFTALSAQSQTGHDSVSDDDYGTLRSLDLVGGRYNFTDDLSVAYYYSDADLGHKGDGNRLEIKKHYTNVNYTLPIADAQSLNFDFNMYNSKFNDKDAPRGDRSSTNNVWSLAAAYTLDAHTFTVAHQRVTGGQDAGYVYGYDGGGAVFLANSVQYQDFDQKGEKSYQVRYDLDMATFGVPGLSFMTRYVRGSNIEDQSVADTGRNNGKNWERDIEAKYVLQSGAAKDLAFRVRQATYRSNDAAGTVDNNEVRLIVEYPLSIL >NZ_CP043320.1|WP_151183889.1|650899_652615_-|proline--tRNA-ligase MRTSQYLLSTLKETPADAVVISHQLMLRAGMIRRLASGLYTWLPLGLRVLRKAEAVVREEMNAAGALEVLMPAVQPAELWQESGRWEEYGPELLRLKDRHQREFCVGPTHEEVITDLARNELSSYRQLPINFYQIQTKFRDEIRPRFGLMRGREFIMKDAYSFHTDQASLQETYDRMHQAYTNIFTRLGLNFRPVEADTGSIGGTGSHEFHVLAASGEDDIAFSTASNYAANIEKAEALPRETNRGEATQELRLVDTPNTKTIEQLTEQFSIAVEKTIKTLIVRGVEENTLVALIVRGDHTLNEIKAANHPLVASPLEFAGDAEIFDACGAYPGSLGPKDLAIACIIDRSVALMSDFAAGANQEDKHWFGLNWERDLELPEIADLRNVQAGDPSPDGQGTLEIKRGIEVGHIFQLGTKYSESMNCTVMGEDGKPATLTMGCYGIGVSRVVAAAIEQNYDDNGIIWPAALAPFDVAIVPMKYDKPEVKEATDKLYEQLTAAGFDVLLDDRDKKTSPGVKFADMELIGIPQRVVISERSLKEGTLEYKGRRDTESQHIAIEQALDVISKQLRA >NZ_CP043320.1|WP_151183888.1|650239_650728_+|recombination-regulator-RecX MPFFCEAEMLDTPVSIRRAAMNLLARREHGYVELSRKLRQRGAEAEMIDVELQRLMDDGLLSEQRYVESYIRSRANTGRGPMRIREELTQRGLARELVECALAGADIDWQAQMQDLWQRRFSGQVTDLKDKAKQSRFLAQRGYAAEEIRYLLDGQRFQGVDD >NZ_CP043320.1|WP_151185984.1|649151_650189_+|recombinase-RecA MDENKKKALAAALGQIERQFGKGAVMRMGDHERVAIPAISTGSLGLDIALGIGGLPKGRIVEIYGPESSGKTTLTLSVIAEAQKVGATCAFIDAEHALDPEYAGKLGVNIDDLYVSQPDTGEQALEIADMLVRSNAMDVIVIDSVAALVPKAEIEGDMGDTHVGLQARLMSQALRKITGNIKNANCLVIFINQIRMKIGVMFGSPETTTGGNALKFYSSVRLDIRRIGAVKEGDEITGNETRVKVVKNKVAAPFRQAEFQILYGKGIYRNGEIIDLGVQQGLIEKSGAWYSHKGVRMGQGKANSARYLEENPEICQAIEQQIRDQLLAPAPSNNKQQAVVEDTVE >NZ_CP043320.1|WP_151183887.1|648547_649081_+|CinA-family-protein MFTITQLAEQLGQQLLKQNAFVSTAESCTGGGIAEAITRVAGSSAWFEVGFVTYSNRQKMRVLQVAEADLQRDGAVSQSVVEGMARGAQQLSGAQYTVAVSGVAGPGGGSVEKPVGTVCLAWAHGMQVQSACWHFAGDRQSVRQQSVQAALAGLLCVMEGRAANDWQQCLKKHLPNQ >NZ_CP043320.1|WP_151183886.1|647621_648416_+|glutamate-racemase MDKHAAIGVFDSGLGGISVLHAIRNLLPAESLIYIADSAHVPYGEKSPEFIVQRSLAISEFLLAQRVKAIVVACNTATAAAVSELRQRWPDVLIVGMEPAVKPAVQASQSGKVGVLATTGTLRSARFAALLERFASDVEVITQPCPGLVELIEAGELQTDTTRALLSSYVEPLLQAGCDTLILGCTHYPLLKPLLQRMVPEYVQLIDTGEAVARRLQSELGKHNLLAEAQQPLDHFYGSGDTCATERTLAMLWPEAQPVIALGF >NZ_CP043320.1|WP_151183895.1|657574_658135_-|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MNIPNIITVMRVALIPVFIVLFWLPFSWSYWAASAVFAFASLTDWLDGYLARRLNQSTPFGAFLDPVADKLIVAVALVLLVAEHNNIWLTLPAIIIICREIMVSALREWMAEIGERAQVAVSSIGKWKTAAQMVALIILLANPPAFNGWVIGGYILLTLSAVLTLWSMVQYLLAAKPHLHTNQTDD >NZ_CP043320.1|WP_151183896.1|658173_660000_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MTTPLFDASAFLRSCTQHPGVYRMFSAEQQLLYIGKAKNLKNRLSSYFKSTINAPKTAALVAKIASIELTVTANETEALLLEQTLIKQWRPPYNILLRDDKSYPYVLLSDNSFPRLGMHRGSKKHNGRYFGPYPSAGAIKESLSVLQKAFKVRQCEDSFYNNRSRPCLQYQIKRCKAPCVGLVEHDEYAEDVRHSVMFLEGRSNALTDELTQSMEQAAQALDFEKAASIRDQIALLRRVQDQQSMEGGHGNVDIIAANVSPGGASVHVISVRDGRVLGSNNFFPQVAIEEDSADVLAAFTAQYYLSHKDRDFPDELIVTSEHSDWPAIAAAIAQQCGKNINIRYRVRGTRARWQQLAMTNAEQALLARLANRTQMTARFTALAKALDLAEAPEHLECFDISHSSGEATVASCVVFGPEGPRKSDYRTYNIEGVTAGDDYAAMRQVLHRRLSSALENNGKLPDVLLVDGGKGQLNMAREVFAELNISQILLLGVAKGVTRKAGFETLYINDTATELNLPEHSPALHLIQQIRDEAHRFAITGHRARRGKTRRTSVLEGIAGVGPKRRRELLKYFGGLQELSRASVEEIAKTPGISKTLAESIYSALHNA >NZ_CP043320.1|WP_151183897.1|660009_660657_-|response-regulator MIKLLLVDDHDLVRTAIARMLGDISDLHVVGQASSGEQAYNMVGELSPHVVVMDIRMPGIGGLEATRKIKQRFPEVNILALSACEDEPFPTRLLQAGASGYLTKGACIDETVQAIRQIAAGKHYLSPSIAQQMALKSFDINQQSCPFEQLSKREMQISLMIASGQKTQLISDLLCVSPKTVNTYRYRIFEKLNIENDVELALLAVRHNLVENSTI >NZ_CP043320.1|WP_151185985.1|660823_661936_+|ribonuclease-D MNWISNDAELAERCKYWNTLAFIALDTEFIRVDTFYPIAGLLQVSDGEGTYLLDPLLISNWQPLAQVLRNQKVVKVLHACGEDLEVFSRLIGVLPKPMFDTQVAAGYLNIGFSMGYSRLVQHVLNIELPKGETRSDWLQRPLSELQVLYAAQDTEYLVDVYRALEEQLTEQKYAWVLEDGAFLVADYTEETDPFDLWRGIKQAWKLAPQQLAALRELAAWREQQARLRDVPRNRIVRESTLWALAHEQPADMTHLAELEDMHPRILRKEGATLLGIIKKVKALPESAWPAALPEPLPIEASKVLKRLRKVGFEMGHELDIAPELMLRKKKLEALLRTGYPSGPYSLPESLRGWRRELMGDALLACLEDVQ >NZ_CP043320.1|WP_151183898.1|661932_662226_+|hypothetical-protein MKRICSVYHSSKKAGMYLYVLRADALKRVPAPLLELFGTPKRAFDLVLTPERRLVREDISQVLSNLDSQGYHLQLPPPEDEYIVHWPEELLRRNDPV >NZ_CP043320.1|WP_151183899.1|662894_663107_-|cold-shock-protein MSNRQTGVVKWFNDEKGFGFITPQSGDDLFVHFRAIQSDGFKSLKEGQTVSFVAARGQKGMQAEEVQVVS >NZ_CP043320.1|WP_151183900.1|663447_664014_+|dCTP-deaminase MSIKPDKWIRRMAQEHGMIEPFVERQVRTEGEERLISYGVSSYGYDVRCADEFKVFTNLHSVTVDPKNFDEKSFVDVKGPVCIIPPNSFALARTVEFFRIPRNVLTICLGKSTYARCGIIVNVTPLEPEWEGHVTLEFSNTTTLPAKIYANEGVAQMLFFESDEECEVSYKDRDGKYQGQRGVTLPRA >NZ_CP043320.1|WP_151183901.1|664617_666447_-|SLC13-family-permease MNLQLGWVLLLLLFAVALFVRNKPRMDVVALLMIVALPLTGVLSVQETLAGFSDPSVVVIAALFVIGEGLVRTGIAYQLGERLMHRAGSSETRLIVLLMLTVAGLGSVMSSTGVVAIFIPVVLSIAARLKISPSRLMMPLSFAGLISGMLTLVATPPNMIVHSELVRAGYAGFSFFTFAPIGLTVLVLGIFYMLATRRWLASADSKKTAGEARHNIADLVREYRLAGRERRLRVRPNSTLVGQTLNELQLRQQYGINVIAVERQRRFRISLLGATGSTELLSGDVLLVDLVSPTIDLLNSYYELGVEPVTMQSSYFSDHQRELGMAEVMLPPDSRLAGKTIQELGFRSHRKLNVMGLRRNQQALDGLLVDEKLKAGDTLLVAGNWKHIRNLQGHSRDFLVLSLPAEVDDVAPALSQAPHALFSLAVMIILMVTGIVPNVLAVLIGCLLMGAFRCIDMDSAYRSIHWQSIVLIVGMLPFALALQKTGGIDLAVNGLLGLFGNAGPRMILAILFVATAVIGLFISNTATAVLMAPVAIASAQAMQASAAPFAMIVALAASAAFMTPISSPVNTLILGPGQYCFSDFVRIGVPFTVLVMLTSVILVPILFPL >NZ_CP043320.1|WP_151183902.1|666448_667243_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKANDLHITFNPDTPIETRALCGMSLQIPSGQFVTVIGTNGAGKSTFLNAISGDLSVDSGSILIDDNDVTELPVWERAKQVARVFQDPMAGTCEDLTIEENMSLAEQRGQRRGLSRAIKVSLREEFREHLATLGLGLENRLHDRIGLLSGGQRQAVSLLMAALRPSQILLLDEHTAALDPRTADFVLQLTQRIVKEKQLTTMMVTHSMRQALDVGDRTIMLHQGQVVLDVSGDKRKGLDVPDLLAMFEQVRGEKLADDALLLS >NZ_CP043320.1|WP_151183903.1|667244_668135_-|ABC-transporter-permease MSLFSMFGALEIGLIFSLVALGVFISFRLLRFPDLTVDGSFPLGGAVGALCISNGMDPFLATALAALAGAGAGIITAILNVHLKIMDLLASILMMIALYSINLRIMGKPNIPLIMEPTLFTILEPSWLVDYIARPAILVLIVLFAKLALDAYFSTRQGLAIRATGSNPRMARAQGVNTGAMIILGMAISNGLVGLAGALFAQSQGGADISMGIGTIVIGLAAVIVGESILPSRKLFLVTLAVILGAIVYRFFIALALNSDFIGLEAQDLNLVTALLVTFALVIPLIKQRFSRRKRV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043320_2 | 1370577-1370667 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043320_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043320_2
>2.1|1370603|39|NZ_CP043320|CRISPRCasFinder ATGAATGCCCACCCTACCGTCTGCATGGGAATATTGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043320_2
The CRISPR arrays of NZ_CP043320_2 >merge|NZ_CP043320|2|1370577-1370667|CRISPRCasFinder GGGCATGGCAAACTGTAATCGTGGGCATGAATGCCCACCCTACCGTCTGCATGGGAATATTGTGCGGGCATGGCAAACTGTAATCGTGGGC >NZ_CP043320|2|2|1370577-1370667|CRISPRCasFinder GGGCATGGCAAACTGTAATCGTGGGC ATGAATGCCCACCCTACCGTCTGCATGGGAATATTGTGC GGGCATGGCAAACTGTAATCGTGGGC
>NZ_CP043320.1|WP_151184462.1|1369532_1370501_+|sulfate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSIEVRQVHKQFGNFTALNNINLDIQAGELVALLGPSGCGKTTLLRIIAGLETPDTGSILFNGDDVSRRDVRKRNVGFVFQHYALFRHMTVFDNVAFGLRMKSRRERPSEAVIAEKVQELLRMVQLDWLSDRYPEQLSGGQRQRIALARALAVEPQILLLDEPFGALDAKVRKELRRWLANLHEDINLTSVFVTHDQEEAMEVADRIVVMNKGVIEQIGTPAQVYENPASEFVYHFLGDSNRLKVADQDIQFRPHEVLLSKVAAADHQAGIVRDIRPLGAITRVTMKVEGQDEPIEAEVSRDDINLQGLQRGATLFFKPKAS >NZ_CP043320.1|WP_151184461.1|1368677_1369529_+|sulfate-ABC-transporter-permease-subunit-CysW MSSTSSHNSSNASSWARLALIIAAWATFIVFLVLPLTIVLTEALKMGVAHFFDSMLEPDAISALKLTLLAVAISVPLNLVFGVAAAWCVSKHDFYGKSVLITLIDLPFSVSPIIAGLVYVLLFGAQGFFGEWLMEHDIQIIFAVPGIVLATLFVTVPFVARELIPLMQQQGTQEEEAARLLGASGWQMFWHVTVPNIKWGLMYGVVLCTARAMGEFGAVSVVSGHIRGFTNTLPLHVEILYNEYNHVAAFSVASLLLILALLMLLLKQWSESRINRQLNNGDE >NZ_CP043320.1|WP_151184460.1|1367848_1368667_+|sulfate-ABC-transporter-permease-subunit-CysT MSRRTSPVIPGFGLTLGYTLVYLSLLVFIPLAGMFIYAAQLSWSEFYAIVSAPRVVAALKLSFGTAFIAALLNGVIGTLFAWVLVRYRFPGRKVIDAMIDLPFALPTAVAGIALTALYSPNGFIGHWAADFGISIAYTPFGITLALTFVTLPFVVRTIQPVLADIPRELEEAATCLGARPLQVFRHVLLPALLPAWLTGFALAFARGVGEYGSVIFIAGNMPGKTEILPLLIMVKLDQYDYVGATAIGVMMLMVSFVLLLLINLLQRYVAKG >NZ_CP043320.1|WP_151184459.1|1366900_1367539_-|peroxiredoxin MSIQLGDIAPDFQQASSAGDISFHQWLGDSWGVLFSHPADFTPVCTTELGFTAKLKDEFAARNVKAIALSVDPVDSHHKWIKDINETQGTTVNFPILADDDRKVSKLYDLIHPNADNTLTVRSLFVIDPNKKVRLTITYPASTGRNFHEILRVIDSLQLTDNYKVATPANWIDGEDVVIVPSIQDKAELVERFPKGYTAVKPYLRLTPQPNR >NZ_CP043320.1|WP_151184458.1|1366243_1366828_-|alpha/beta-hydrolase MRQTTDVRYLIVPGWQGSPAEHWQSHWQQVLPECTRVEQDDWLLPQRQAWIAQLEAQIAADQRPVVLIAHSLGCVTVAHWAAQASAGLLARVRGALLVAPADVERIDCPAALVNFAPIPTEPLPFPSVLIGSSNDHAADAQRAVLFARQWGSTVTILSQAGHINVQSGHHRWEQGFAWLYQLQERSDRGYQRSA >NZ_CP043320.1|WP_151184457.1|1364631_1366191_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MTSDKTITLVLQIASLVALAILWWLSAPIWTSAVLLVPAFVVPLLQRPVLVEPSSQGTVQATELARHLSHTTTASALSAAAVSHAAQQLQQRLVSLVNSAQRIESSAGQMITTEEATAQLSEESLDAASNVRSNSQAGQTSLEQAILSMQTLAQQADSSRTLIDNLSQRSSEIQQVAAVIKGIASQTNLLALNAAIEAARAGEYGRGFAVVADEVRGLASRTADATEEVDRMLQDIQQHTIEVAEQQHKLIEDLNSSVVLVENAGAQLIDITALAVNVEQQVANIVSGTQSNRMQLDDLFKEVAQIRQDLSDSDQQTAQLSQSAVLLEAQTEGVSEKLSEVSLSEYHQHIYELAQDAAQKIGAQFERDIAQGRISEAELFDRNYKEIANTNPKKYSTAFDKYTDQVLSAIQEPVLTQNPNTVFAITSTPQGYIPTHNTVYSQPLTGDYQHDYLNNRTKRIFNDRVGARCGNHQKPLLLQTYIRETGEHMHDISVPIYVHDKHWGGFRIGYHPEKTSRTN >NZ_CP043320.1|WP_151184456.1|1363457_1364273_+|hypothetical-protein MRLTDTVLHDCFYHPSTGLTLDPARDFGLPLYECNARLKAVRSSLDRQQQLLWANNGPAVLVWLQGPDCSGKDGVIRNCLRGLNPQGVRVSSFAKPTEQQRQENFLERFRQQLPPPGMLTVFNRTPYESIVSDLADGYIDDAQAAGRLQQMLAFEAQLAQQNIHLIKVYLHISKDEQKRRLQQRFAKPEKHWKISAADLAGHRLFATIENNWDHTFKQSSTASHPWHIVPANNKPLRNLLFCSLLAQKLEALNLQWPQPELPFALEDLDII >NZ_CP043320.1|WP_151184455.1|1362448_1363456_+|nucleoid-associated-protein-YejK MSIHHCIIHFIEKKPEDSPATVQLGEEVLPNSTAVQHLLADLNDSYNSKPSKAWGLFQADSTQWPLQSWLSNYLAEQSDFVQFSQQAVEHLKKQIDENSLSLSGHVLFAHYQHGMTEHLIIAVLQHSDGMLISEGLDVETARHLDLSQLHLAARINLSEWKNNSQSKQYISYLKGKFGKKIIDGFLDFLGCEEGVDGPSETRTLLKAFSEFVESEDLPEEKAREQTNNLISYANTQTRRGEVVSIEGLSEVLDEENPQAFYNHIRNKDYGLSPEIPADKRTLSAFHRFTGRAEGISISFESHLLGSKVEYDESRDMLIIRQLPTQLKDQLKRSKD >NZ_CP043320.1|WP_151184454.1|1361041_1362370_+|C4-dicarboxylate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MNRILQDVSIMLRANLWLVPILAALVTGLFYFVAPPPPMHATMSTGGPHGGYTSFAEKLRIELAKEGFELELVNSSGSRQNTERLLDENSGINIALMQSGQELGLNAQQRQKLYNLGAVYQEPLWLFTRSDVEINTLRDLLPLRTAVGSARGGTRMMINPLLEANQIDSANLPDTWRPYSGKKALSRLLDDQLDAAFFLGPAEGAIVQQAASHSELQLVHFKQAAAYRARLPFITEINVGQGLLNLASDQPHQDTTIISPVAMLIANESFHPALTALILAAAQEVMKSGSLIDAPDTWPQNLPHDFSKLTEAEYFHNKGLPLLQRYLPFRIASLADRYIILVIPLLVLLFPLFKVAGPLYRWRIRARIYRWYKYLRDVDKRFTNHTLPEHLDSEIKRLTELQVELAKVEVPLSYTNELYELHLHVRYVLQRLERLKTAHSAA >NZ_CP043320.1|WP_151184453.1|1359587_1361009_+|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MHNILIVEDEPIIRSALRRLLERNQYKVSEAGSVQEAQEQHDISAFDLIISDLRLPGAPGTEMIKLAEPKPVLIMTSYASLRSAVDSMRLGAIDYIAKPFDHDEMLQTIARIIHDHQQSAALAADCDDESTALSETPVVDNSDIGIIGSSPAMQALYVKIRKVAPTDSNVLIQGESGTGKELVARALHNLSSRAKAPMISVNCAAIPETLIESELFGHEKGAFTGAVSARTGLVEAADGGTLFLDEIGELPLEAQARLLRVLQEGEIRRVGSVQSQKVNVRLVAATHRDLKHLAKTGGFREDLYYRLHVIALHLPALRDRGNDVVEIADILLDRQRLRMHKDPMSFTEQASKALQKYSWPGNVRELENALERAVILCEGTQVTTELMGIDVDLAAEKSAQDTADVAAEAEADADAQQLDASKLSLEDYFQHFVLEHQDQMTETELASKLGISRKCLWERRQRFGIPRRKSSGT >NZ_CP043320.1|WP_151184463.1|1370734_1371505_-|STAS/SEC14-domain-containing-protein MLKQIPAPDHLIALKLDGKLSAEDVQTYHSILEKKLLQHAQIGIYVDLTDLTDMTANALIEGTKADLVLFSHLKQLSRCAFVSDKEWPQTLISAAQHLLPVLDLKIFPSSQSEKALAWAAELRDTTAVIKPAIRFLATSKADVLAFEVNGLITSEEMPDVIKQLEDFFAAHDKVRLLNRMKNFAGFDPLILMQSSLISMKLTAMNRLERYAIVGAPNWMCKAVDAINPLFTDIDIQTFSADQEDQAWAWLDAELVE >NZ_CP043320.1|WP_151184464.1|1371698_1372430_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MFLDLDLTKTMRSGKSEFHLGLAFASSSERLVVLGPSGSGKSLLLQMIAGLLKPDSGHLKLAGRTLFDQKQGINLTPQQRQVAFLFQNYALFPHLSVRQNVAFSLRTGLLNPSAKMANKTVDYWLDNFGLEPVQHQKPHELSGGQRQRTALARALVTEPRALLLDEPFSALDPDLRIHMRKELRELQERLAVPLILITHDVEDVKVFAEQTLCLKEGQIDLQRQHSMQVSQQALCCAKHVHGC >NZ_CP043320.1|WP_151184465.1|1372434_1373112_-|molybdate-ABC-transporter-permease-subunit MDAVWVALSLSLKVAGWATALNIILGISVGFFLARSRFPGRDLLDTVLTLPMVMPPTVLGYYLLVLVGRRSAFGAWLYDTFGINLIFTWQGAVIAATVVAFPLVFKPARAAFEAVDGQLEQAARVLGVSELAIFFRITLPLAWRGILAGVLLAFARALGEFGATLMVAGSIPGRTQTLSIAVYEAVQAGKDDTANMLVVITSIVCVVVLLSASRLAPGRVSERIR >NZ_CP043320.1|WP_151184466.1|1373127_1373883_-|molybdate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MLKKNLKTLLAAALISASGSAWAAEITVSAAASLTNAFKDIAANFEAAHPEHKILLNFAGSGELLQQIAKGAPVDVFASADQITMDKAQEQGLLNEASRTDFVRNTVVVITPTHSTLKLIELADLQQAALQRLAVSNPESVPVGRYSKEALLAHELWDALADKMINTQNVRQSLDYVARDEVDAGFVYATDAAIMADKVKVQFTVPLQTVVSYPIAITKEGSSKELSQQFIDYTFSEASQAVFNSYGFSQP >NZ_CP043320.1|WP_151184467.1|1374018_1375218_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MALLNVDAALQILLEQAQAAADLETELLSLDSAENRVLAEPLLAQFAMPPWPNSSMDGYAVRSAEVQAGQVLPVSQKIFAGHSPEPLTEGTCARIFTGAPMPEGADAVEMQENTEELDDGTVRFAQAVRAAKFVRPKGQEALPGDEILPAGIRLGPIELAMAASMGCAQVKVRRQFRVAVISTGDELVEPGQPLAPGQIYNSNRTLLIQCLKRLGCAIVDMGILPDDIQLTRNRLAELQGVDLMLSSGGVSVGEADYLGQVLREEGELDFWKLALKPGKPFTLGRYQGVPVIGLPGNPTSSLVTFLILARPYILTRMGVSDPLAQSFVVPVNFAMPVAGVRREFIRVSLVDGRAEKLDNQCSGVLRSATQSHGLLELPENTTCEVGDYLRFWPFSSLLN >NZ_CP043320.1|WP_151184468.1|1375219_1375756_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MSHVSSQFVPLNVALLTVSDTRTPETDTSGQYLFDQLIKAGHTVVERMILKDNLYQIRAQVASWVASDDTHVVLITGGTGFTDRDSTPEAVSCLFDQHVEGFGELFRHISYTEIGNSTIQSRALAGLSNHTLICCMPGSTNACRTAWEGILIDQLDASHKPCNFVAHLGKKTACSGRD >NZ_CP043320.1|WP_151184469.1|1375823_1376426_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MPNIPLFADCSIVLLAGGRGQRMGGQDKGWVSWQGNALIEHMQRVVRPLTNDLIISCNRNHARYQPLADQLVSDPDHDFTGPLVGIISALKVARHPYLIVLPCDAPRIDQALLMQLYQQAGERPAMFKHQGHWQPLFSIIAKAQLSALQELWEAGERSPKHALLQLNPVALHCADDEKRLANFNDPSVLQQPLLIKETLC >NZ_CP043320.1|WP_151184470.1|1376419_1376896_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MLTHLDEHGRANMVDVTEKANTQREATAESWVRMLPSTLAMITDGEHPKGDVFAVARIAGIQAAKRTHELIPLCHPLLLTSIKVHLTAHAPDQVHITATCKLSGQTGVEMEALTAASVAALTIYDMCKAVDRAMVIERTQLLEKLGGKSGHYQLDSAT >NZ_CP043320.1|WP_151184471.1|1376918_1377167_+|molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MLTVQFLARYREALDCESEQLPWQPEWQTIEDVRNFLVARDGVWTVLSDPRIMCALNQDVCSLQEPLKAGDELAFFPMVTGG >NZ_CP043320.1|WP_151184472.1|1377172_1377640_+|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit-MoaE MSIRVQTAPFDPGAELNAVHAGDLSVGAVATFTGYVRDINQDQSIKELFLEHYPGMTEKALAKIRDEALQRWPLIDAHILHRVGPLSLAEPIVFVATSSMHRDAAFAACEFIMDYLKIRAPFWKKEQTATGTHWVDGRDSDTDAAARWDTEKDKR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP043320_3 | 1420787-1420938 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP043320_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP043320_3
>3.1|1420836|54|NZ_CP043320|CRISPRCasFinder ATCTGTCAGCCTTTAACAGCTTGTACGTGGCATAGCGTGCTTCGGGATGGGTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP043320_3
The CRISPR arrays of NZ_CP043320_3 >merge|NZ_CP043320|3|1420787-1420938|CRISPRCasFinder TTTTTTCGTCGGTTTTTGACCTGCATTCCGTAGTCTGAAGCTGGTGCTTATCTGTCAGCCTTTAACAGCTTGTACGTGGCATAGCGTGCTTCGGGATGGGTATTTTTTTCGTCGGTTTTTGACCTGCATTCTGTAGTCTGAAGCTGGTGCTT >NZ_CP043320|3|3|1420787-1420938|CRISPRCasFinder TTTTTTCGTCGGTTTTTGACCTGCATTCCGTAGTCTGAAGCTGGTGCTT ATCTGTCAGCCTTTAACAGCTTGTACGTGGCATAGCGTGCTTCGGGATGGGTAT TTTTTTCGTCGGTTTTTGACCTGCATTCTGTAGTCTGAAGCTGGTGCTT
>NZ_CP043320.1|WP_151184503.1|1418342_1420628_+|YgiQ-family-radical-SAM-protein MHAAKPLYDYPKYWAECFGPAPFLPMSRAEMDQLGWDSCDVIIVTGDAYVDHPSFGMAVIGRVLEAQGFRVGIISQPDWRNKDDFMQLGEPNLFFGVAAGNMDSMINRYTADRKVRSDDAYTAGALAGKRPDRASLVYTQRCKEAYSNTPIVLGGIEASLRRIAHYDYWQDSVRRSILMDSTADILLYGNAERAIVEVAQRLSWGESIADIDDIRGTSFIRRNTPSDWFELDSTRIDRPGRVDRIINPYINTQDTEACAVEQQSAAQTGQDDVQIVQLLDHPRLTRERTVIRIPSFEKVRNDPVLYAHANRVLHLETNPGNARALVQRHDNQDVWLNPPPIPLTTEEMDYVFGLPYARVPHPIYGKAKIPAYETIRFSINIMRGCFGGCTFCSITEHEGRIIQNRSHDSIVQEIEDMRDKVPGFTGVVSDLGGPTANMYRLACSSPEIEAACRKPSCVFPGICQNLNTDHTSLIELYRKARDIPGVKKVLIASGLRYDLAVESPEYVRELVTHHVGGYLKIAPEHTEEGPLEHMMKPGIGNYDRFRKMFERFTKEAGKEQYLIPYFIAAHPGTTDTDMLNLALWLKKNNFRADQVQAFYPSPMATATAMYHSGKNPLRKVTYKSPATEIVKSEEQRRLHKAFLRYHDPKSWPQIREALMRMGRSDLIGDGKQHLIPAQQPHADGYRSARRKNSTPAKGEKAARPLLTQHTGLPPRTTGATDDKPQWHKREQAKAAAEAKLRAERGKKPAAKGGKRKPAKPR >NZ_CP043320.1|WP_151184502.1|1416702_1417851_-|cation-transporter MDGRQSAQARNKAMRTTSVVGAIVNLVLTIAKVVFGVIGQSHALIADGVHSLADLSTDLMVWFAAKYSNQPADKEHPYGHARIETAFTVGLGVVLILTAIGIVVDSAQRLLNPETLLQPTSIVLWIAAISILANEGLYHYTMRVARQFNSGLLKANAWHHRSDAISSVVVLLGVAGSLMGLPYLDAFAALAVALMIGHVGWTQAWTSIRELVDTGLEPKTASALKRIIKTIEGVQGVHMLRSRRMGGVYLIDVHIVVDERLSVSEGHKISEYVRLKLIDSHEYISDALVHIDAEDDSVAALCTDSPMRREVLTDLRRVWADQIEAEELEQVTLHYLNGKVHVDLVRSMQTVDANAQQLIERLQEQAQALDYIGEVKVLYRYP >NZ_CP043320.1|WP_151184501.1|1415345_1416614_-|tryptophan-permease MTAIHTLSKPTRFGGAMIVAGTAIGAGMLANPTATSGVWFVGSVLLLLYVWFCMYVSGLMLLEATLHFPQGASFHTVVKGLLGPRWNIITGLAVTFVLYSLTYAYIFVGGGLTQNSLSALSGWVFDQPLQPSRQLASVVFLLVLATSVWVSTKLVDRFATVLIGGMLISFFLSTGSLIQSATASVLLNLPVQDQHSYWPYIWAALPVCLASFGYHGNVPSLVSYYNKHAQPVARSILWGSLLALAMYVLWQLAVQGNLPRAEFAPVIAADGDVAVLLQVLSTYVKTDNIGRILSAFAYMAIASSFLGVTLGLFDYIRDLCHFSDTAGGRFKAALLTFLPPLFACLAFPTGFVKVMGYVGLMAAIWAALVPALLVRASRKRFTSTSYQVFGGTFMIGFVLLFAVAAFFAQVLLLLQALPVFKG >NZ_CP043320.1|WP_151184500.1|1413729_1414866_-|elongation-factor-P-maturation-arginine-rhamnosyltransferase-EarP MRARWDIFCRVIDNFGDIGVTWRLAQQLSQEHPFDVRLWVDDLSAFHAICSAVVSTAEQQVVDGVDVCLWPDESSITQYDCADVVIEAFACQLPESYIALMRSKQQVLWLNLEYLTAEPWAAECHALPSLQSGGLQKYFFFPGFTGQTGGLLREADLLSRRDAFLNSNTLRADYLASLAVQAQQGERLISLFAYANPALPSWLDALSQDSRSNRLLVLQGPLQSSVASWFAIKELKIGEIYQRGSLTVQALPYIEQKNFDQLLWCCDLNCVRGEDSFVRAQWAAKTLLWHIYPQQESAHLDKLEAFLSIYNNDLGEQAKHALNSLHRAWNQQDDMHAPWQQFVAQEHALQKHAKHWSAQQKKQPDLATKLACFYQDWL >NZ_CP043320.1|WP_151184499.1|1413119_1413686_-|elongation-factor-P MKTAQEFRAGQVANIDGSPWVIQKTEFNKSGRNAAVVKMKLKNLLNGTAAESVYRADDKFEAIILDRKDVTYSYFADPLYVFMDSEYNQYEVEKSDLEAVLPYIEDGMSDECAAVFYDDKVISIELPNTIVREIIYTEPAVRGDTSGKVMKTARLSTGHELQVSSFCEIGDSIEIDTRTGEYKSRIKA >NZ_CP043320.1|WP_151186025.1|1412164_1412926_-|spermidine-synthase MLVEQAEKRILTQEKDKYGVISVVESNGFRYLQFGNDIEQSCVLYENPLWLKYDYTRAMLLGSLCHAHPETALFLGLGAGSLTEVCLAVLPLEDVEVLELREALPRLAVDYFGMSDDPRLTIRIGDALELIESAETADLIFLDMYTDSGPSVGHLAWNFLQACQDKLNLGGWLIINQWATLDGRPLGAALLRGIFYRHYWEIPVKEGNVILLVPSSFEQSPPIPLLRQQAARVAEHLGYDISYLIEMIRPASE >NZ_CP043320.1|WP_151184498.1|1411432_1412122_+|crotonase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MSELIHYSCNQGIATLTLNNGKVNAISPDMITAFNSCLDQAEQDRAIVIITGQPGILSGGYDLKVMTASPESAINLVASGSTLARRMLAHPYPIIVACPGHAIAKGAFLLLSADYRIGVDGAFNIGLNEVLIGMTMHHAGIELAKDRLSKAAFQRSVINGELFSPVAAIDAGFLDRVVPAEELMQSALGVATLMKKINMKAHRNTKLKVRKSLLEALDAAIELDKAHLA >NZ_CP043320.1|WP_151186024.1|1411017_1411254_-|sulfurtransferase-TusA MLIEADAELDARGLFCPEPVMMLHTKVRELAAGEVLKVSATDPSTQRDIPKFCTFLEHQLLDSSEEDGTYTYFIRKKL >NZ_CP043320.1|WP_151184497.1|1410075_1410966_-|NAD(+)-kinase MEQFRNIGIIGRMGSIRVLDTIRRLKRYLIGRHLHVILEDRIAEMLPGHNLQTSSRKLLGEVCDLVIVVGGDGSMLGAARALAQHKVPVLGINRGSLGFLTDILPEHLESQISEVLAGNYTTEQRFLLEAEVRRDGVTIGEGDALNDVVFHPGKSTRMIEFELFIDGQFVYSLKADGLIIATPTGSTAYALSAGGPIMHPRLDAIVIVPMHPHTLSSRPIVVDADSELKVVVAEDMSIYPLVSCDGQNHVTCAPGDTLHVQRKPQKLHLIHPLDHNFYAVCRDKLGWGSRLGQDNK >NZ_CP043320.1|WP_151184496.1|1409101_1410076_-|serine/threonine-protein-phosphatase MWIDPARNYDLIGDVHGCAQSLERLLALLGYKKHAGVWQHSDRQALFLGDLIDRGPQIRETLHIVHAMVEAGHAISIMGNHEYYALAWNTTLEHGGEEAYVREHSAHHARLQRETLEQFAEHPYDWQDFNQWFLTLPLFIDADRFRAVHACWDDRLIHTLRNRFADGRIDTEFIRQSATSGSFADQAFNRLLRGVNLPLPYGMSLIGQDGYRRSSFRTKFWHDEQPALTYGDAVFQPDALPEHIAQKPLPAQYLRQINAYDAEQPLLFVGHYWRQGQPSLIRPNLACLDYSAVNGGKLVAYRLGQEQQLLPQNFVWVDAHEQGH >NZ_CP043320.1|WP_151184504.1|1422191_1423514_+|MATE-family-efflux-transporter MQKKYLADQSLPRALFSMTWPMLFGAVALMSFQLVDSIFISMLGMQPLAALGFSLPLQQLLIGVQIGIGIAATALISRAIGAGNLDHAKYMGGLVVITGCCVSFILCTLIWLLRMPLLNALGAGAELLPYTESYWLPWLSSAWLGAFLYFANSISRANGDTRLPGLMMVFTSVLNMLLDPLFIFTFGLGLPGAAYATIVACLAGAAIMYSRILKRHWLAFDPSKLPIAAALREIAKTSAPAMLSQLMPGTASLLATRIVAGFGGSAIAAWTLGSRLELFSIVIVLALTMALPPMIGRLYGSKQLDRAHSMVLVAVRFVIGLQLTIALLWMASRGLIAPALAPDQDSEVYLLSYMLWVPFSYAALGVCMLMVSVCNALGMPMRAVWISTLRLFFCYLPALWVGASIAEMSGLYIGVLLGNVAAGLLAWNLYKRGLQHIQKT >NZ_CP043320.1|WP_151184505.1|1423594_1424806_-|O-succinylhomoserine-sulfhydrylase MTTDWQAGRLNSELTDAGFDTLAVRAGQQRSFEAEHSEAIFTTSSYVFRSAADAAASFAGERESNVYSRYTNPTVRTFEERLAALEGAEKCVATASGMSAVLATVMSLCSMGDHILVSRSIFGATVSLFDKYCARFGIEISYVQIDDLAAWQGACTEKTKLLFIESPSNPLAELADIRALSEIAHAANALLMVDNCFCTPVLQKPLALGADIVIHSATKYIDGQGRCLGGAVLGSAELMKEVVGFLRTTGPTMSPFNAWVFLKGLETLRLRMNAHCQSAQQLAQWLEQQPKVKKVYYSGLASHPQHELAKQQQSGFGAVVSFEVEGGKEAAWRCIDATRMISITANLGDTKTTITHPGTTTHGRLPAEERVKAGIHDGLIRIAVGLEEFADIQADVQRGLNAV >NZ_CP043320.1|WP_151184506.1|1424906_1426421_-|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIVGKSNINQALYDALTVLQHRGQDAAGMVTSKNGRLFLRKDNGLVRDVFRTRHMKELIGNVGIGHIRYPTAGSSSSAEAQPFYVNSPYGITLAHNGNLTNVEQLAKEIYQSDLRHVNTNSDSEVLLNVFAHELSVCGKLQPGKEDVFAAVSRVHQRCRGGYAVVSMITGYGVLGFRDPNGIRPIVFGQRHTDDGVEYMIASESVALDVLGFTLIRDLAPGEAVYITEDGQLHTRQCAANPVLNPCIFEHVYLARPDSIIDGVSVYKARLRMGEKLADKILRERPDHDIDVVIPIPDTSRTSALELANRLGVKYREGFVKNRYIGRTFIMPGQAERKKSVRQKLNAIELEFRGKNVMLVDDSIVRGTTCKQIIQMAREAGAKNVYFCSAAPAVRYQNVYGIDMPSVHELIAHNRSTEEVAQLIGADWLLYQDLEDLVESVQGGKIQIDQFDCAVFNGEYVTGDIDAEYLQRIENERNDLSLIAEQVSQATIGLHNSEAD >NZ_CP043320.1|WP_151184507.1|1426506_1427004_-|CvpA-family-protein MSFNWADALILSIIVISSLISLSRGFVKEALSLVTWIVAAVIAWMFGGSLAHHFQPYIDTHSIRVIAACAILFLVTLLIGALVNFLITQLVRATGLTGTDRLLGMVFGAARGLVLVIILIGLLSLAPVEHDAWWQQSTLIPHFLLIADWSKNLILGLSGVWISAA >NZ_CP043320.1|WP_151184508.1|1427096_1427726_-|SPOR-domain-containing-protein MAAAESKLKQRIVGAIVLVALAVIFLPMLFKQEDTAREVVVQVPPMPEAPAVPQVPVAEVAVPEPEADDTWDEPLIPETPAAPQSLPDAPVPAEKPVAEVQPAPVQPDVKAEPQPELQQPTPQAVEPGIDKNNLPVSWSVQLASLTNKDNAQALRDSYRDKQYNAYVRSADGTHRVLIGPLIKQEEAQAMCKRLKSREGQDCFVVRYEP >NZ_CP043320.1|WP_151184509.1|1427831_1429109_-|bifunctional-tetrahydrofolate-synthase/dihydrofolate-synthase MQARDLQQWLSYLEQLHPNEIDMGLLRVHAVAQRLGLPRIANKIITVTGTNGKGSTCAFLASLLAQHGLKVGVYSSPHLLKYNERVRIDGQNVTDQQLCDAFTAVEQARSDTSLTYFEMGTLAAFWLFAQASLDVAILEVGLGGRLDAVNIVDPDIAVVTNIGLDHSDWLGSTRDSVAYEKSGIFRAGRPAICGDLFPPEQLLNQSALLNAPLLLRGRDFDLAISPDSWHWRCVDAQGHLTQLQDIPLLRLPIENAALALQVYALLGLPWQAEALVRGLSNARMTGRLQELQLGYQGRILHMMLDVAHNPHAASYLAERLKSQPIQGRRLAVLGVLDDKDLVGVLDCMQEQITDWAVAALPTVRSCKVEYLQHTLESRQATVTSYASIAQAIEAQCAQAAEDDQIIVFGSFYTVAEALKWLERDA >NZ_CP043320.1|WP_151184510.1|1429112_1430054_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MNNWLVDKLIPSIMRSETKKSSVPEGLWHKCTSCDAVLYKPELEKTFDVCPKCNHHMRINARTRLDIFLDKEGREEIAADLEPTDRIRFRDTKRYRDRITAAQKQTGEKDALIAMSGTLEGMPVVAAAFEFAFMGGSMGAIVGERFVQAANVALEQRCPLICFSASGGARMQEALISLMQMAKTSAVIARLREESIPFISVLTDPVYGGVSASLAMLGDVIVAEPNALIGFAGPRVIEQTVREKLPEGFQRSEFLLEHGAIDMIVPRAELRPRVASVLRQLMDMPTIPVVAVDAVVESEAAKVSVASDSEARA >NZ_CP043320.1|WP_151184511.1|1430135_1430780_-|phosphoribosylanthranilate-isomerase MRVRTKICGITRVEDAVVAAQAGADAIGLVFYAKSPRAVSVAQAQKIVAALPPFVTVVGLFVNAARSEVNAVLDSVPLDVLQFHGDETPAECEAFSRPYFRALRMQPGLDIAALSAQYSGAQGVLLDAWVPGVHGGTGERFDWARIPENLAKPLILAGGLNADNVGQAVRQVQPWAVDVSGGVEVSPGIKDAEKIRKFLYAVHMNNTQLCDGSL >NZ_CP043320.1|WP_151184512.1|1430791_1431658_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MSIETTPTAALEAAVGVSRIALGVEYKGSNYHGFQLQVAGTPSVQGCLEEALQQINAGRPVRLSCAGRTDAMVHACGQVIHFDTDIERPMRAWVMGANRYLPKDISVVWAQSMPLDFHSRFSAVARRYRYVIYSDEIRPAHLAEEVTWTHQVLDIEKMRAAARCFVGTHNFNAVRASGCQAHSPVRTIHHLQLFEFGKLIIIDVRANAFLHHMVRNLAGILMMIGAGERPVEWAQAVLESCDRKAGGVTAPPHGLYMVQVEYPEQFKLPERYLGPHFLSGLPDSFADK >NZ_CP043320.1|WP_151184513.1|1431661_1434574_-|FimV-family-protein MLQVRKLVLAVAAATAFSSSFTHALGLGDLAVKSSLNQPLEAEISLLEVRDLTAIEIKTQLASPEEFSKAGIDRQFFLTGLKFSPVIGANGKPFIRVTSSKPVKEPYLNFLVEVLWPNGRLLREYTLLLDPPLYKPQQVIYAPQPAVTAAAPRAVQAAPRQVRQPQPVARTAAPTRTALQGTDYRVQKNDTLWVIAQRTGGSASVHQTMLAIQDLNPNAFIDGNINRMKSGQVLRLPTEQDIRSRSRADAIAQVSQQNTDWKAGRAAPARAERQLDATHRTTAGAAPAQIEKADSLRLVADAPGQAGQAADEGSAASLQNLQDQLALSKERLDSTRLENEDLASRVEDLNSQLDKLKRLIELKDNQLAQLQSSVDAPLEPTDAVVVDGSSETVDAVDATAVVEASIETLDQAEATVADSIEAIDTVQEPTVAEVEADAQAEAEVAPEPETLEPVTPEVEPVTPEAEAVEPEVPAVTQPAAETAEEKSIVDRVMDDPMLLAATGGAAILALLLLLMAISRNRARKEAELYDEQLSETLTPDDSPLEAPETDVLAASSLAAESDAFDTDFAFEEPVADTQFKQEAADPIAEANSYISFGRFNQAADVLHAAIEQEPQRTDLRLKLLEVCADLEDHGGFSRQITEITEIGGVESELEHLKARYPHMLGAEQVANIADDLNDDDFADLSLDDITLDSPYLLSATSTEQLDTELDDLSALLADADTADKPADTEFSLDLDLSEPATPAAETAFEFGDDFAVEEKDSLDLDIDSFDFDLDAADETQKASTDDEFSLDDLALELADSEAAEAPSFDLSEEFSLPEQDKSETTAFGQQIDEVSAELEALSESLDTDGLADDTLIDPRHSQFDLDDLGDLGDLDDFEDKPAEQAKVAAPTPSSEDDLKLTDLEIEDLGDVEDDFSFLSGTDETATKLDLARAYIDMGDAEGARDILDEVVVEGTAAQQDEARELISQLG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
507460 : 576127
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043320|507460:576127|DBSCAN-SWA TATGCAAGAGCAAGAAAGTATAAAAGCGCAGGATGAGCGCTTTATGCGCGAAGCATTGCAACTGGCGGAGCAGGGCGCGGCCTTAGGTGAAGTGCCAGTGGGGGCTGTGCTGGTGCAGGATGGCGACATTATTGGTCGCGGCTTTAACAGCCCAATCAGTTTGAATGACCCCAGTGCGCATGCTGAGGTGCAAGCGATACGGGATGCTGCCGCGCATCTGCAAAACTATCGCCTGCCTGATACCACGCTGTATGTCACTTTGGAGCCGTGCCATATGTGTGCGGGGTTAATTGTGCATGCGCGCATTGCTCGCGTGGTGTTTGCCGCCAATGAGCCGCGTGCTGGTGCAGCAGCAAGCCAAGGTTGCTTCTTTTCTCAGTCGTTCTTAAATCATCGTGTTGAAATAAGCAGTGGCGTGTTAGCGCAGGAATCCGCGCAGATGCTCAAAGCTTTTTTTAAAGCACGCCGCGAGGCTAAAACTACTGCGTTGTAATGGCCGGATCAACTGCGTCTAGCGTGCCGTTATTGGGTGCAAAGCCTGGTGTATGGGTTGTGCCGCTGGCAATGCTGGTGCCTTCGATTTGCGGCTGAGTGACCCAGGTTAAAATATCGTAATAGCGACGAATATTATTGACGAAGTGCACAGGCTCACCGCCGCGCGCATAGCCGTAGCGGGTTTTGCTGTACCACTGTTTTTGCGCTAAGCGCGGCAGAATTGTTTTTACATCCAGCCATTTATTTGGATCGAGCCCTTCAGCAGCGGTCAACTTGCGCGCATCCTCAAGGTGCCCCATGCCGACGTTGTAGGAGGCGAGGGCAAACCAGAGACGATCAGCTTCATAAATGCTGTCGGGCAGTTGTTCTATCAGTTTGGCAATGTAACGCGCACCGCCTTGGATGCTTTGTTTCGGGTCCAAGCGGTTAGTGACGCCCATGGCCTTCGCTGTGCGTTGAGTTAGCATCATTAAACCACGCACGCCTGTTTTCGAGGTGGCAGTGGGCAGCCAGTGTGATTCTTGATAGCCCATAGCTGCCAGTAAACGCCAATCTACGGCGTACTTTTTTGCGGCATCGCGAAAGCTTGCTTCATAGCTGGGTAGGCGCTGCTGTAGGTGTCTGGCAAAGGCGTAAGCGCCAACATAGCCAAGGGTGTCAACATGACCGTAATAGCGCTCCGCGAGGTTTTGTAGAAGACCTGATTTTTTTGCATTGGCTAAAAAGCGATTGATTTCATTAAGCAAACTGACGTCATCGCCCGCAGCAATGGCCCAGCGCTGTTGGTGGCTGTCTTGTAAGGTGAAAGCAACGCGGATATTAGGGAAGTAAACTTGGTTCATCGCGACCTGGTTGGAATTAACCAGCGTCAGGTCAATCTGCTTCTCATCAACCATGCGCAATAAATCAACACTTTCGACTTGATCTGATACGTCGTAACTCAGCGCTGGGAGGTCTTTCTTTAGCGCGTTAAGATCGCTTGCATGAATGCTGCCTTTAAGCACCAATAGGCTTTTGCCGACTAAGTGCTTGGGCTGCTTGGGGCGTTTGTTATTACGATTGTAAATAACTTGTGAGGCGACTTCGAGATAGGGGTCGGAGAAGCGAGTGTGGGTTAAGCGCTCGGGACTTGAGATTAACGCTGCTGCGGCCAATACAGGGCCCTCTGCAGAGCCTAAACGGCTAAACAGTTGATCAATATTGTCTGCGACTTCAATTTTCAGCTCAACGCCGAGCTGATCAGCGAAGCGCTTAACCAGCTCATATTCAAACCCGGTATCACCGTTGCGGTCTTGGAAATAGGTTGAGGGACTATTGCGGGTGATGACATGCAAAACGCCTTGCTCTTGAATGCGTTCAAGGGTTGAGGGTGGTTTACCGCAACCGTTGAGCATAGCGAGCAAGCTGGCTGCACAGCAGAAAAGTAGGCAGCGAAGCGGATTAAGGGTCAGTGAATACATGCGCGCATTATACGCAAATGCCGCTTGTTGCAGCAAAGAAAAGCACTGGGCTGTCTGTTGAGTTGTGAATAGATATACCTTGGTGCGTCTGATAAATGGGCAAATGATAGATTTGGATGGTTATTTATTGCTATGGGCACTAGAATATGCGCCCATTTCATACAATTTTTTGAGGCTGTCACGACGATGCTGATCTTGCGCGGCGCTCCTGCCCTTTCTGCTTTTCGCCACGAGAAACTTTTTGAACAGTTATGCCAAAAAGTCCCCTCTGTCAGCGGTTTGTACGCTGAGTTTGCTCATTTCATTGAGGTTTCAGCTGCATTAAGCAGTGAAGAAGGCCAAGTCCTTAGTCGTTTGCTCAAGTATGGCCCAAGTGTGCCTAGCCAAGAGCCTAGCGGACGCCTGTTTTTAGTGGTGCCGCGTTTTGGCACAATCTCACCATGGTCCAGTAAAGCAACGGATATTGCCAAAAACTGTGGACTTGAAAAAGTACAGCGCATTGAGCGCGGCATGGCCTATTACATCACCGGTGATTACAGTGATGCTGATGCGCAGTTAATTGCTGCTGCGTTGCACGATCGCATGACCCAGTTGGTGTTGGGCACAATGGAAGAGGCATCAGCGTTATTCAGTCATGCACAGCCGCGTCCGTTAGCGGTAATTGATGTTTTGCAGGGTGGTATCGAGAGCCTAGAAAAAGCCAATATTGAGCTTGGTTTGGCACTGGCTGAAGATGAAATCGAATACCTCGATAACAGCTTTAAAAAGTTAGGTCGCAATCCGCATGACATTGAATTGATGATGTTTGCTCAGGCTAACTCTGAGCATTGCCGGCATAAAATTTTTAACGCCAGCTGGGATGTTGATGGCCAGGCGCAAGAAAAGTCCTTGTTTGCGATGATCAAGAACACCTTTGCGATGAACAGTGAAGGCGTGTTGTCAGCTTATAAAGATAACGCTTCAGTGATTGAAGGCTTTACTGCAGGACGTTTCTTTCCCGACCCTGTCAGCGGCGAGTATGCTGCGCATCAAGAACCCATTCATATCTTGATGAAAGTTGAAACCCACAACCACCCGACCGCGATTGCTCCTTTCCCAGGCGCTTCTACTGGTTCTGGTGGTGAGATTCGTGATGAGGGTGCGACCGGTCGAGGTTCCAAGCCAAAAGCAGGCTTAACGGGTTTCACTGTGTCTAACCTCAATATTCCAGGCTACATTCAGCCTTGGGAAGTGCCCTACGGTAAGCCAGAGCGCATTGTTGATGCACTGGACATCATGATTGAAGGCCCATTGGGTGGTGCGGCGTTTAATAATGAATTTGGCCGCCCAGCAATTACTGGTTACTTCCGTACTTTTGAGCAGGCGATTGACACCCCGCGCGGTGAAGAAGTGCGCGGCTACCACAAGCCGATTATGCTGGCCGGTGGTTTGGGTAATATCCGTGCTGAACATGTACAAAAAGACGATATTGCGGTTGGCAGTAAGTTGATTGTGCTTGGCGGTCCAGCCATGTTGATTGGTTTGGGCGGTGGTGCAGCTTCATCTATGGCCACTGGCGCCTCATCAGCTGATTTAGACTTTGCTTCGGTGCAGCGCGAAAACCCAGAAATGGAGCGCCGTTGCCAAGAAGTGATCGACCGTTGCTGGCAGTTAGGCGACGATAATCCGATTAGCTTTATCCATGACGTCGGTGCTGGCGGTTTATCCAATGCCTTCCCTGAACTGGTGAATGATGCAGGGCGTGGCGGTATCTTTAACTTGCGTAATATTCCCAATGACGAGCCGGGCATGAGCCCATTGGAAATTTGGTGCAATGAGTCGCAAGAGCGCTATGTGATGGCGGTTAAGCCAGAAAATCTTGAGCGTTTTGCTGCTATTTGTGAGCGTGAGCGTTGCCCTTTTGCGGTTGTTGGGGAAGCCACTGAAGAGCGTCATCTGATTGTTGCTGACAGTCACTTTGATAACACACCTGTGGATATGCCGCTGGATGTATTGCTGGGCAAGCCACCGCGCATGCACCGCAGTGTCACCCGTGAAGAAGAGATGACGGACAACTTTGCCGATGCGCAGTACAGCCTCAAAGAGGCCGTTGAGCGCATTTTGCGCCACCCTGCGGTAGGCAGCAAAAGTTTCTTAATCACCATCGGTGATCGCAGCGTCACAGGTTTAGTGGCGCGTGATCAGTTTGTCGGTCCATGGCAAGTGCCCGTGGCGGATTGCGCAGTCACTGCGAGTAGCTTTGACGCCTATGTCGGCGAAGCGATGGCGATGGGTGAGCGCACGCCGTTAGCGGTCTTGGACGCGCCAGCCTCGGGCCGCATGGCAGTGGGAGAGGCAGTAACCAACCTTGCGGCTGCACGCATTAATAAAATTTCTGATATTCGCTTATCGGCAAACTGGATGGCCGCAACCGGTCACCCAGGTGAAGATGCACGTTTGTATGACACCGTGCAAGCGGTAGGTATGGAGCTGTGTCCTGCGCTGGGAATTACCATTCCCGTGGGCAAGGACTCAATGTCGATGAAAACCAACTGGCAGGACGAGGGCGCTGATAAGTCAGTGATTTCACCGCTGTCGCTGGTGATTACCGGTTTTGCTCCAGTGCCAGATATTCGTCAAACGCTCACTCCGCAACTGCGCCTTGATAAAGGTGACAGCGCGTTAGTGTTGATTGATTTAGGCCGTGGTCAAAACCGTTTGGGCGTCTCTATTTTTGCTCAGGTGTACAGTCAAGTCGGTCAGCAAACGCCCGATGTCGACAGCCCTGAAGACTTAAAAGCCTTCTTTGCGACAATTCAAAGCCTGAATGCGCAGCAGCGTTTATTGGCGTATCACGACCGCTCTGATGGTGGTTTACTTACCACTGTTTTGGAAATGGCCTTTGCTGGGCGTTGTGGTTTAGATATCAATCTTGATGCTTTGAATATTGCTGCTGAGCAAGTCAATGCAGCCTTACTCAACGAAGAGTTGGGTGCAGTGGTGCAGGTGCTTAACAGTGATCTTGAGGCTGTGGTTGACGCATTTGCGCAGGCAGGTTTGGCTGAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP043320|507460:576127|518180_519434_-|WP_151183780.1|DBSCAN-SWA MDDIQISYLLGLLVFLILCSAFFSSSETGLLSLNRYRLRHMSREGNRSAQRAQRLLSTPDRLLGTILVGNNVVNILAASIATVIAVDIWGDTGVVIATTGLTIVILIFGEITPKTLAALRPELIAFPASRIILLLMAPLRPIVWLTGAISNGLLRLLGVDTRHHSSDSLSTEELRSVVREAGQELPGNRQDMLLGILDLENVTVNDIMIPRNEVFGIDLNSNLDQIIWQLRTTTHTRLPLYRENINQIIGVIHMRQIARLLTLNKLTHDDLQEACSDPYFVPESTPLSTQLLNFQKHKRRIGIVVDEYGDVEGIVTLEDILEEIVGEFSDQHRANPELRQLSDGSYTIDGAAYIRDINKALEWELPSDGPKTLNGLITEILEFIPEGAVCIQIGPYYLETLEIKDNRVSRARLWGSD >NZ_CP043320|507460:576127|544365_544887_+|WP_151183803.1|DBSCAN-SWA MEKSIEMLWKLYLKDDPDLKGAKLRLASRAKLAKPWVTGVASPQGTTTMLSNVEIHKAWTNPHALNIARKTIESNPKFTLRELSHSMLSQVQQKVTSNPYVWWIYESSSPKRRAVHEDATGVTFIKLDGKWQLVYPCQALGVLVGRQGAGYYEDIPRNAYFVLCENEAAARKH >NZ_CP043320|507460:576127|536012_536933_-|WP_151183799.1|DBSCAN-SWA 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60 | Burkholderia_phage(11.76%) | transposase,integrase,tRNA | attL 507908:507923|attR 581796:581811 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1253298 : 1261100
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043320|1253298:1261100|DBSCAN-SWA CATGAACCCGTCAATAGCAACAGATCAGCCAGAGCAGGGCGTAGAGCAACTGCCGCTCGCCTTGATTTATGGCGAAGCACTCAGCACATTACCGGTAGATTTATACATTCCACCGGATGCGCTTGAGGTGATTTTGGAGGCCTTTGAAGGGCCTCTGGATTTGTTGCTGTATCTGATACGCAAGGAAAATATCGATATTCTTGATATTCAAGTTGCGCAAATTACTCAGCAATACATGGCTTATGTTGAGCTGATGAAAGCCGTGCGCCTAGAGCTGGCTGCTGAGTATTTGGTGATGGCGGCCATGTTGGCGGAAATCAAGTCACGCATGCTGCTACCGCGCTCTAAACACAGTAGCGCTGATGATGAAGATGACCCGCGCGCTGAGTTAATTCGTCGACTGCAAGAGTATGAGCGTTTTAAAGCAGTGGCCGAGGATCTCGATGAGATACCGCGAATGGGCCGTGATGTATTTGCCGCGCAAGCTGTTGCGCCTGATGCGCGAGCGCGTCGATTGATGCCTGATGTGGCATTAGAGGAGGTCTTGCTGGCGATGTCTGCGGTATTGCGCCGTGCCGATATGTTTGAAAGCCACCAAATCAGTCGTGAAACGCTATCAACCCGTGAACGCATGAGTATGGTTTTAGAAGCCTTACGCGACGGTGCTTTTGTACCTTTTGCGCGTTTGTTCACCTTAGAAGAAGGGCGTTTGGGTGTGGTTGTTACCTTTATGGCTATTTTAGAACTGGTTAAAGAGTCTCTGATTGAACTGGTGCAAAATGAGCCCTACAGCGAGATCCATGTGCGAGCGAGAACGCATGAATACACTTGATTTTACTGATGCTGAGCATTTTTCCAAAGTGCTTGAAGCCGTGCTATTAGCTGCTGGCAAGCCGTTAAACCTAGAGCGTATTGCGGAGCTATTTGATGACGATGCGCAGCCCAGTCAGCAGCAAATAAAAGATGCTTTGGCTTGTTTATCCAGCTCGCTGCAAGGACGTGCTTATCAATTAAATGAAGTGGCATCCGGTTTTCGCTTGCAAGTGCGTACAGAGTATTCATCATGGGTTGGGCGTTTATGGGAAGAACGGCCACAACGTTATTCGCGCGCTATGTTAGAAACCTTGGCTTTAATTGCATATCGTCAGCCCATTACACGGGGTGAGATTGAAGATGTACGTGGCGTTGCAGTCAGTTCGCACATTATCAAAACCTTACTTGAGCGTGAATGGGTGCGTGTCGTTGGCTATAAAGACGTACCGGGTAAACCAGCGATGCTAGCCACCACCAAAACGTTTTTAGATTACTTCAACTTGCGTGGCTTGGATCAATTGCCAAGTCTCAGTGAACTGAAAGAGTTGCCACCCTCGATAGACGAACTAACAGCGCCTGCACAGCCAGTCGCAGCACAGGCCAGTATTGAGTCAATACCTATAGACGCTGAAGACACTGACAATGATAAACAGGTGAGCTTCAGCTCATTACTGGCTGAGCTTAATAATATGGAGCAAGGCCTCATCACGGATTTTTCTGATCCTGCACTTGATCAGCAGTCATCAATCGATGCGGGCGGCATAGAAGAATCGCAGTCAGTAGACGCTAAAGATTGATCCTTGGGTGTATGTCCATAAATGCCATAATCAATATTATGTTAAATTGACTATATGAAATAACCGCCACGACGATCAGACTGCAGCGTATTGTCACATCCCCCAGTGTTGTCCTGCGTGTTAAATTTGCGAATCTAGATAAATATCAATAACCTCAAAAAGGATCACCTGCTATGCGATTTGCTGCCCTTACTGCCAGTTTTTTTGCATTGACCATGACTGCGGCATTACCTGTTTATGCTGAGAGCGAGCACCAACCTGTTACACAGAGCGTAGAAACACAACAAGCTGGCATTAAGGTGGTCACTGCGTGGTCACGAGAGTTGCCTCCTACTGCTCCAGTTGGCGCTGCGTTTATGCATATTGAAAACCACAGCGACCTGGCCGATAGACTTATCAGCGCAGAGAGCTCAATTGCGCACGTCACTGAGCTGCATGCACACATTCATGAAGGTGATGTGATGCGCATGGTTAAGGTCGATACGATTGATGTCCCCGCGCACGGTCAGCTCACCCTTGAGCCCGGTGGTTACCATGTCATGCTCATTGATTTGAAAAAGCCTTTGATTGCTGGTGAAACGCTGCCGCTGACCCTGCAGTTTGAACATGCAGGACAAATGGATATCACCGTAAATATTAAAAGCAGCGATGCTGGCACATCTGTTGAACAGCATGAAATGGACCACAGTGCTCATTAACAACACTTGTATTGCAGGCTAACTAAAGAGCCACACAGCAAAACGGCGCAGAGTATGCGCCGTTTTTATTTCAGTCACACAATAGCCTGCTTACGCACTGGGTGTGCGCATGGTGACAAATTCTTCAGCAGCTGTTGGGTGGATGCCAATGGTGTCATCAAACACTTGCTTAGTAGCGCCTGCTTTCAACGCCACAGCAATGCCCTGCATCAACTCCCCTGAATCAGGCCCAACCATATGACAACCCAACACACGGTCTGTGGCCTCATCGACAATCAGCTTCATAAAGATGCGTTCTTGTTGATCTGACAGGCTGAGTTTCATAGGTCTAAAGCTGGTTTTAAAAATCTGCACAGCAAAGCCATCTGCCCTTGCCTGCTCTTCGCTTATACCGACAGTGGCAATATTTGGCAGGCTGAACACCGCGGTTGGAATTAAATTGTAATCGACTGGGCGGTACTCTTCTTTGCGGAATAAGCGTCGCGCTACCGCCATGCCTTCAGCTAAGGCCACTGGCGTCAATTGCATACCGCCGGTGACATCACCAATGGCTAAAATGCTGCTTTCTGAGGTTTGATACAGTTCATCAACAGCGATATTACCTCGCTCGTCTAGCTTAACATTGACGTTTTCTAGGCCGAGATTATCCAGCATTGGGCGGCGGCCGGTGGCGTAGAAAATGCAATCAACTTCAGTTGTTTGACCGTCTTTGAAAGTGATGAGTAAGCTGTCATCTGCATTTTTATCAATACGTTGCACGTCACAATTAAAGCGCAGTGTCATATCTGTTTTCAACAGCTCTTGATGCAAGTGTTCACGCACATCTTGGTCAAAACCGCGTAAAAACAAATCACCGCGATACGCCAACTGTGTCTCTGAACCTAATCCTTCAAATACTGAAGCAAACTCAACAGCAATATAGCCACCACCAATTACCAGCACGCGCTTGGGTTGTTCTTTTAGGAAGAAAACTTGGTTGGAGTCTGTGGCGTGCTCACGGCCTGGGATATCTGGAATCTGTGGCCAGCCGCCGACTGCAATAAGGATATGCTCGGCTGTGTACTGCGTGCCCTCTACGTCCACGGTATGTGCATCAACCAGTTTGGCATGGCCATTAAGCAAGTTGACACCGCTGTTCACCAGTAACTTTTCATAGATACCGTTGAGGCGTTCAATTTCAGTGTTTTTGTTGTTAATTAAGGTGGTCCAGTCGAAACCCTTAGCTTCAACATCCCAGCCAAAGCTGCGGCTGAGTTTAAATTCATCGTGGTAATGCGCGGCATACACCATCAGCTTTTTCGGCACACAACCGACGTTGACACAGGTGCCGCCCAAATAACGGCTTTCGGCAACAGCAACTTTTGCACCATAGGATGCGGCGGAACGGGCGGCGCGTACACCACCTGAACCTGCACCAATGACAAACAAATCAAAATCATAGGACATACACTATTCTCCAGTTCAGGTGGTTATGATATTGAGCCAAAAACTATTGACCCTTGTTATACAGGTTTTCGTAACAGAAATTGGTGGCTTCAATGTAACCTTCAACACTACCACAATCAAAACGCTGGCCTTTAAATTTATAAGCGAGAACGCAGCCATCTTGTGCTTGCTTCATCAAAGCATCGGTAATTTGAATTTCACCGCCCTTGCCAGGTTCAGTTTGCGCGATTAAATCAAAAATATCGGGTGTTAAAATATAGCGACCAATAATGGCAAGGTTAGATGGCGCATCTTCAGGTTTAGGCTTTTCAACCATGGAGTGCACACGGTAAATATCTTCGCGGATCATCTCACCGGCAATGACACCATATTTAGCGGTGTCTTCCATCGGCACTTCTTGGATCGCGACAATCGAGCAACGGAACTGCTTGTACAGTTTAATCATCTGCTGCAAGACGCCATCGCCTTCAGTATTAATGCACAGGTCATCGGCCAGCACCACAGCAAAGGCTTCATCACCAATCAGTGTGCGCCCTGTCAGTATGGCATGCCCTAGCCCTTTCATTTGAATTTGTCGGGTATAGGAAAATGTGCAGCCATCAATTAGATTGCGCACGCCCTTTAGATACTCTTCTTTGTCAGTACCTAGAATCTGCTGCTCCATTTCATAGCTGATATCAAAATGATCTTCGATAGCGCGCTTGTTGCGGCCAGTAACAATGGCAATCTCTTTAAGACCTGCTTCTAGTGCTTCCTCTACACCATACTGGATCAGTGGTTTATTAACGATGGGGAGCATTTCTTTAGGCATGGCTTTTGTGGCAGGTAAAAAACGTGTGCCGTAACCCGCAGCAGGAAATAAGCATTTTTTAATCATGGCCAATCCTTGTGTAATCGCTGTGCATGCTTAACATGCTGTTAGATATCGTCATCAATAAGTAAAAAGCACAATTGAGACTATAAAAAAGGCTCTATTATAAGCCAATAGAGCCTTTGCCTGAACATGAAGCTATAGGCAACTAGTCGTTGCTAGCAACACCTAAGATGTGCAGTAAGCTTAAGAACAAGTTGTAGATTGATACATATAGGCTGATTGTCGCCATGATGTAGTTGCGCTCACCGCCATTAATAATGGCGCTGGTTTGGAACAAGATCACAGCAGAAGAAAACAGCACAAAACCTGCACTAATGGCCAGCTGTAAGCCTGAGATATCAAAAATAAAGCTTGCAATGATTGCTGCCAGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP043320|1253298:1261100|1255695_1257051_-|WP_151184368.1|DBSCAN-SWA MSYDFDLFVIGAGSGGVRAARSAASYGAKVAVAESRYLGGTCVNVGCVPKKLMVYAAHYHDEFKLSRSFGWDVEAKGFDWTTLINNKNTEIERLNGIYEKLLVNSGVNLLNGHAKLVDAHTVDVEGTQYTAEHILIAVGGWPQIPDIPGREHATDSNQVFFLKEQPKRVLVIGGGYIAVEFASVFEGLGSETQLAYRGDLFLRGFDQDVREHLHQELLKTDMTLRFNCDVQRIDKNADDSLLITFKDGQTTEVDCIFYATGRRPMLDNLGLENVNVKLDERGNIAVDELYQTSESSILAIGDVTGGMQLTPVALAEGMAVARRLFRKEEYRPVDYNLIPTAVFSLPNIATVGISEEQARADGFAVQIFKTSFRPMKLSLSDQQERIFMKLIVDEATDRVLGCHMVGPDSGELMQGIAVALKAGATKQVFDDTIGIHPTAAEEFVTMRTPSA >NZ_CP043320|1253298:1261100|1258070_1258739_-|WP_151184370.1|DBSCAN-SWA MREPQNYSYEQSTAIRSESSAILRNTYGLLALTLAFSGLVAYISQQMNMPHPGIMLTLVGFYGLFFLTMRLRNSGWGLLTTFALTGFMGYTLGPILNMYMGMPNGASVISSAFAMTAFVFAGLSAYVLITRKDMSFLNGFITVGFFVLLAAIIASFIFDISGLQLAISAGFVLFSSAVILFQTSAIINGGERNYIMATISLYVSIYNLFLSLLHILGVASND >NZ_CP043320|1253298:1261100|1259216_1261100_-|WP_151184371.1|DBSCAN-SWA MLTSTISRHRLWIRLALTWLAFLVLLLVYWLRLDASHHNQLVEAEKHAQLRAGQTAHALSMQVRAQLMSIDFVLEHLAQHWLDHDEVVFRKLIDLAQQGIFTEALDVLIVADTDGHVLFESNAQQDQDPSLRRLSIADRDYFKKLAQPGAHNFLISRPERNTLTQRWTVQFSYKIVKNNTFLGVIVASVASEHLAEAFKLVYSEQNDVVLLALDDGQYLARTHGLDETLGEKTPAEREFTQQPDKHKGHYNLASPIDGVERIYAWHRIPGFPVVLSLGLSKEKVLTPVLLAIKHSRTQNFIATVLLILAALWISNLVFTKAKQNRSLLQSKERLATLLDRVPAAVLLENESNVIVSVNEQLCSLFNLDVKPQSLIGLRHEQLLEMLNQEQAAWLQLPSSTLKQKQTTEEVDDEVTGRSYRIDWVPIQRGQRYLGHVWFIHDVSLHKQKKQELMILATIDALTGLHNRRSFLEILQQQLLLTRQHTPGALLLLDIDHFKRVNDTYGHLAGDLVIQNITQAIRDTLRKDDFSGRIGGEEFAVLLPKVTVQHAIELAERLRKNIAATPTTLPTKTIYVTVSIGIASLYQQDISGVQNQADQALYRAKNAGRNRVCCIEHTATDAVDALLE >NZ_CP043320|1253298:1261100|1253298_1254129_+|WP_151184365.1|DBSCAN-SWA MNPSIATDQPEQGVEQLPLALIYGEALSTLPVDLYIPPDALEVILEAFEGPLDLLLYLIRKENIDILDIQVAQITQQYMAYVELMKAVRLELAAEYLVMAAMLAEIKSRMLLPRSKHSSADDEDDPRAELIRRLQEYERFKAVAEDLDEIPRMGRDVFAAQAVAPDARARRLMPDVALEEVLLAMSAVLRRADMFESHQISRETLSTRERMSMVLEALRDGAFVPFARLFTLEEGRLGVVVTFMAILELVKESLIELVQNEPYSEIHVRARTHEYT >NZ_CP043320|1253298:1261100|1257094_1257928_-|WP_151184369.1|DBSCAN-SWA MIKKCLFPAAGYGTRFLPATKAMPKEMLPIVNKPLIQYGVEEALEAGLKEIAIVTGRNKRAIEDHFDISYEMEQQILGTDKEEYLKGVRNLIDGCTFSYTRQIQMKGLGHAILTGRTLIGDEAFAVVLADDLCINTEGDGVLQQMIKLYKQFRCSIVAIQEVPMEDTAKYGVIAGEMIREDIYRVHSMVEKPKPEDAPSNLAIIGRYILTPDIFDLIAQTEPGKGGEIQITDALMKQAQDGCVLAYKFKGQRFDCGSVEGYIEATNFCYENLYNKGQ >NZ_CP043320|1253298:1261100|1255080_1255605_+|WP_151184367.1|DBSCAN-SWA MRFAALTASFFALTMTAALPVYAESEHQPVTQSVETQQAGIKVVTAWSRELPPTAPVGAAFMHIENHSDLADRLISAESSIAHVTELHAHIHEGDVMRMVKVDTIDVPAHGQLTLEPGGYHVMLIDLKKPLIAGETLPLTLQFEHAGQMDITVNIKSSDAGTSVEQHEMDHSAH >NZ_CP043320|1253298:1261100|1254115_1254907_+|WP_151184366.1|DBSCAN-SWA MNTLDFTDAEHFSKVLEAVLLAAGKPLNLERIAELFDDDAQPSQQQIKDALACLSSSLQGRAYQLNEVASGFRLQVRTEYSSWVGRLWEERPQRYSRAMLETLALIAYRQPITRGEIEDVRGVAVSSHIIKTLLEREWVRVVGYKDVPGKPAMLATTKTFLDYFNLRGLDQLPSLSELKELPPSIDELTAPAQPVAAQASIESIPIDAEDTDNDKQVSFSSLLAELNNMEQGLITDFSDPALDQQSSIDAGGIEESQSVDAKD |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1506179 : 1585732
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP043320|1506179:1585732|DBSCAN-SWA CATGAGCCAACTGACCTTTGCCGAAGCAGAGTACCAGAACAAAAAGCGTAAGACGCGTCGTGAGATTTTCTTGGAAAAAATGGATGCCATTATTCCTTGGAAGCGCTTGGAGAATCGCGCCGCTAAGCATTACCCAAAAGGTGAAATGGGGCGTCCCCCTTATCCGCTCAGTGTGATGCTGCGTGTGCATTGCTTGCAGTTGTTCTACAACCTTAGCGATCCTGCTCTGGAAGATTCGCTGTATGAAATTGAATCAATACGCCGCTTTGCAGGATTGCGTTTGTCAGACAATATTCCTGATGAAACAACGATTTTAAACTTCCGTCACTTCCTTGAAAAGCATGGGCTGGGCAAGCTATTTCTGAAGGAAATTAACAAGCACTTGCAGCATCAAGGCTTGCTGTTTCGCGAAGGCACCATTGTGGATGCCAGCATTATTTCCGCACCGAGCTCAACGAAAAATCAAAGCCGCAAGCGCGACCCAGAAATGCATTCCAGCAAGAAAGGCAACCAATGGCACTTTGGCATGAAGATGCATATCGGCGTGGATGATGTCACAGGTATGATTCATAGCGTGGAAAGTACGGCTGCCAATGTGCACGACGTAACCATGACTGCAAGCCTTCTACATGGCGAAGAAAAGCGTGTATTTGGTGATGCTGGATACCTAGGTGTTGAAAAACGCAGGGAAAACAAAGAGCGCAAAAATCTTGCCTGGCTGATCAGTGCTCGAATCAGTAAGCGTAAAACCATGACCGAAAATGAGCAGGAAATTGAAAAAATGAAAGCCAAGCTACGCGCTAAAGTTGAGCATCCGTTTCGCTACATCAAGTGCGTATTTGGCTATAACAAAGTCCGTTACAAAGGGCTTGATAAAAACCATAACCGTTTATGCCTGCTAGCAGGACTAACGAACCTCATGATCAGCAGAAAATACTTGCTGGCTTAGGGTTAGTGCGCCCTTAATCCGCCAAAACGGCGAATTAAGGGCTAAAAGAGGTGGTTTTACCTCGAAAACGGCCTTTTTTAGCTGTTTTTTTGAGTTTTCGAGTCATTTTCTGAAAAGCTCAATAATAAGCTGAGATTTTCAGAGGCTCCTTAATAACGGCCCTGGAAAAAGCCCCGCAGTAAGCCCCATAACCAGCCCAAAACTTAAGAAATACTCCACGCCAGCTTCAGTCCTGAAAAGAGTGCAAAGATTTGTTTTATTGAGCAAGGCCGACAGCAGGCACACGCACTGCCCTGGGAAAGCCGCCAATGAGTTTGCAGTCAAACAGCCAAAGGCCGAATAACAAGCTCAGCATCACAGCAAACACCACTAATCTTTTTTATCGATAGTAATTTCAATAGATTTGCTATTACCAGCAAACCACTTCTGCACATACAAGGTACCCACGATAGGCGCGCTTCCTTCAACAGGAACTTCCTTATAGCGAACACTGTTTTTTGTTTCTTTCTCGTATTCAAACAGAACTGTTTTCTTTGACATACATCTTTCCTCGCTTAATTTTTCTTAACTTGCTAGGCAGTGCTCACAATGTTTTTAAACAATAAACACGCGTGCTGGTCGTGATTGGGACAGGCGCGCACATCATTCGTGAACACCCAAATCCCCGTTACAATACACGTCGGTCGCGTAAATCCTTAAATGCCATGGCTAGCGCGAGTAAAATAATCAACGTCACCGTCAACAATCCCAAGCTCACCGCAATCGACCAAGTGGTATAGGGACGCACAGCAAAGACAATAGCGGTAATCACCGCAATACCCACCGAAGTACCAATACGCTGCCCGGTTTGCATAATGGCCCCAGAGCTGCCCGCGTAGGCCAGCGGCACTTCGGCCAGGGTTAGAGTCTGGTTGGGACTGATCACCGAGCCTTGGCCCAAACCAAAAAAAGCCAATGACAACAAGAGCCACCAAATACTTATACCCAGATACTCATGCAGCAGCACTACGGCGACACTGCAAAGCAGTCCAAAAATAGCAAAACCCAAGCCGCCAATGACAATTTTACGACCATAGTAATTCACCCGCTTACCCGCCCAGTTGGCGGAATAGGCAGACAGCAACGCTGAAGGGATACCGACCATACCGGCTTCAAACGCTGAGAAACCAAGGCCTTGTTGCACATACAAAGGAATCAATACCCAGACACTGGTCATACCTAAAAAATACAGCGTCATAATAATGCTGCCGTTGCGGTAACTCGACGTGGCAAAAATCTTTAAATCCACCATGGGGCTATAACCACGCCGCGTGTACCAGCGTTCCCAACGTGCCCACAGGTAAAACAAAAGCAAGCCTGCAGGAAATAGCATCCACAGCAGTCCAGACGGGTCCGTTTCAACAAAAGGATAGAGCACTGCCAGCACCCCTAAACCAAGCAACAATGCCCCGACTGGGTCTAGAGAACTCAAGCCTTGATGATGCTGCGATTTTGGCTTGTGGATCAAGGGCCGAGGAAACCACAGCAATGCCAATACAATGGTTAATAGCCCCATTGGCACATTAATCAGAAATGTCAGACGCCAGCCAAGTTCTGCACCACCCAGCTCAATCAATAGCCCACCAAGAATCGGACCAATGGCAACCGACACACCTACCGTAGTCCCAAAAAAGCCAAACGCACGGCCGCGCTCTGATCCTTGAAAATACTGCTGGATCATACCCACCGCTTGCGGGTTCACAAACCCCGAGCCAACACCCTGAACAAAGCGCGCAGCATTAAGCCAATGCGCATCCGGCGCTAAACCAGCGGCAACTGACGCTAAGGTAAACAGGGTTACGCCTAGGATAAAAAAACCACCACGCCCCATCAGGTCCCCTGCGCGTCCGGCACTGACCAAGACCACACCAAAGGTCAGCGCATAGCCGGAAAGTACCCACTGGATATCAGACTGACTGGCATCCAGCGCATCTTGAATCGAGGCCAAGGCCACATTCACCACACTGACACTCATCAGCGACATAAAAACGGCGATGAGTAACACTACAAGAATCTTCCAGCGCACAGGATCGCTGCTGGGGTCGGTGGCGGTATGTTGTGGTGCTGTCAGTTGAGTCATTTAAAAACCATGTAAGGCGATCATATTAGTACCATTCTAAGTTAAGGAAGCGCTGAATAATTACCTACATTGTCAGAGCTAGATAACAGTATTCAATACCTCCTTAAAGGTTATTACTGACTATGTATTAATTTTTTAGATACTCACTGGGCACGCCGTAACTCGAAATATATAAATAACGCACAGCACGTGTGGCAGCCACATGAAACAATGCGCGCTCGTTCAAGTCAGTTAAGCGCTGCTCCACGACATCCTGTGAGGCCTGCATAGCGACTCGCAAAGGCACTACGCCATCGTTAATCCCTGCCATCATCACACAGCGAAACTCTAAACCTTTAATCCGGTGCATAGTGGCAAAGCGCACACCATCTTTAGCACGATCATCGACTTTTTGCCGTGACAGGGTGTGCGTTGGCAAGCCCTCGCTTTGTAGGATCTGCTCATAGTCACTGCACAGTCTATTGGTGCGCGCTACGATGCATATTTCTGACAAAGAGACGCCTTCACTTTGCAAGTGCTGAATCTGCTGCACAATCCACCGGCCTTCACTGGCTAAGTCAGCACAGTTCTGCACGATAGGCGCTTGGCCTAAGATCAGCGAACGGTAATCCTTAGTGCCATCCAGGCCGCCATCCAGATCATCAATTTCGACACCCTCTAACAGCGCAGTGGCATAACGGCGGATTAATTCTGTGGTGCGGTAATTGATTTTCAGCTTACGCCCACGCCCCATAATATTGATGCCACATTGACTGAGGGTTGTTTTACGCTGATAAATCCGTTGGTGGGCATCACCGACTATAAACATATCGTTAGGCTGCTCTGGAACCAAGGCACGTAAAAGCTTTAACGCTTCAGCGGCAAAATCTTGGCCTTCATCCAGCACCACGGCATGGTAACTGCGCTTATCATCACCTTTATTTAGCAGCTCAAGCGCGTAATGCACGGCATCTTCTGCGGTAACAAAACCACCGCGCGCCAACTGCTCACGCATCTCTTCAAACACGGGCCATATATCGGCACGCTGTCGACGATTCAAGGCGACACCGCGGCCCACACGGCTAGCAGTAAAGTACTCTTGGCGGCTACGCACTTGTTGCGACAAAATCACCCGCTGCCACTCTTCTTTATAAAAGCTATCAGGCAGACCTAACTCGCCTGGCACTAAAGCCATGGCTTGCGTCCAGCACTGATCATAGTGCTTATCACGGCCGCCTGGATAAATGATGCTGGATTGGTAGCCATTACGCTTTACAAACTGGCTGACCCAAGCATCTAAGTTAACCACTTCAATACGTTGAAATTGTTCTGGTGTGCAAATTTTGCGCAAGTTATCGGCAATATCTAAAGCCAGGTTGCTGGTAAAGGTGGTAAACAATAAACGCGCCCCTTTCGGCCAGTTTGGCTGTGCGACTAACCAACGGGCGCGGTGCATAGCCACCACCGTTTTACCTGTGCCTGCGCCACCCAAAACCCGCACCGGCCCCTTCCAATCACGCTCAACCAACTGACGTTGCGACGGATGCAAAAACACACGCCAGCGCTCCAGTGGCGCATTGAGCATACGGCCTAACTCTTGCTCATCTTCAGGCACATGGAAGCGGCGCTGAGTGGCTGGATGCTCTAATGCTGCGGCAAAGTCTTGGGTGTCGACAGAGTGCTGCTTAGGCGCAGCATATTCTTGCAAGACATCGCTCAAAGAGGTGCCGGCCGCCAACAAATACAAGGCTTCAAAAGCTTCAACAGGCAAACGTGCTTCAGCTTTTTCTAGCGCCTGCTCGCTGCCCAAGGCTTGCACTAAAGCCAGACGTTCTTGCGGCACACCTAAACTCAACAAGGTTGCTTCATCTAAATTAAACAAAGGTTTGCTCGACTCAGCATCTTGCGATGCTGGGCTTTGAGTCTCGACGTGCTGAGCATGCTCTGCAGCGC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56 | Mycobacterium_phage(21.05%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1592577 : 1596592
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043320|1592577:1596592|DBSCAN-SWA AATGAGTAAAAATATTTTAGAAGTCTCTGACTTAACCATGCGCTTTGGCGGTTTATTAGCCGTGAACGGTGTCGGCCTGAGTATTAAACAGGGTCAGATTGTTTCAATGATCGGTCCTAACGGTGCAGGAAAAACCACCGTATTTAACTGCTTAACCGGTTTTTATCAGCCCACTAGCGGTAAAATTCTCTTTGCTGGCGAAGAAATCCAAGGCATGCCTGGCTTTAAAATTGCGCGCAAAGGCATGATTCGTACCTTCCAACATGTACGTCTATTTAAAGACATGACCGTGCTAGAAAATCTACTGGTAGCGCAGCATCAGCATCTCAACAACAGCTTGCTCGCTGGCTTATTTAAAACCCGCAGTTATCGCAATGCTGAACAAGAGGCACTGGATAATGCTGCCTATTGGCTAAAAAAAGTCGGGCTTCTCGATGATGCCAACCGTGAAGCGGGCACACTCGCCTACGGCCAACAACGTCGCCTCGAAATTGCCCGCTGCATGGTAACTCGCCCTTCACTGTTAATGCTTGATGAGCCGGCCGCGGGCTTAAACCCCAGCGAAACCGATGGCCTTAAGCAGCTGATTAATGATTTACGCGACAACTATGGCATCAGTGTTTTATTGATTGAGCATGATATGAAACTGGTTATGGATATTTCTGACCACATCACCGTGATCAATCAGGGCACCCCCTTAGCCGCTGGAACGCCCGAACACGTGCGTAATAACCCTGCGGTGATTAAAGCTTATCTGGGTGAGGAATAAACATGCTGGTGATGAACAATGTATGCACCTTTTACGGAAAAATTCAGGCACTGCATGACGTTTCGATTCAAGTAAACCGTGGTGAAATTGTCACCTTGATTGGTGCCAATGGCGCCGGCAAAACCACCCTGATGATGACCTTGTGTGGCGATCCGCAAGCCGCCACTGGCGATATCATTTACGAAGGTCAACCGTTGCGTGGTAAAACGACTGCGCAAATTATGCGCATGGGTATGGCGATTGTGCCGGAAGGTCGGCGCGTATTTTCACGTTTAACCGTGGAAGAGAACCTCGCCATGGGCGCTTTCTTCTGTGATGACAAGCATGTACAGAACGAGCGTTTAGATCGCGTACTGTCACTCTTCCCACGCTTGCATGAGCGTTTTCAGCAGCGCGCTGGCACCATGAGCGGTGGCGAACAGCAGATGCTGGCGATTGGCCGCGCCTTGATGAGTGAGCCGCGCTTATTGTTGCTTGATGAGCCATCGCTGGGTCTTGCACCGATCATTATCCAGCAGATTTTCAAAATTCTAGAACAGCTGCGCAGCGCTGGCGTGACAGTGTTCTTAGTTGAGCAGAACGCCAACCAAGCGTTAAAACTGGCGGACCGCGGTTATGTGATGGAACACGGTCGCATTGTTCTAGAGGATACCGGTGACAACTTACTCAGCAATGAGGCGGTGCGTCAGGCTTACTTAGGCGGCTAATTGATTCACTTAAGCAAAAATAGCGGTGCAAGCCGATTTCGATCCTTGGCACCGCTACATGCCTTTAGTTTAAATGACGATTTTCCCACATCTGTGCAGCCTGACTAAACGCTTCCTCACGATCACGAGCTAAACCACGCAAAGCTAAAGCCATAGTCGCGAGGATGGCTTGTTCGCCATATAAGTCCTGTTCATCACCCTGCCAGACGGCTAATAAGCGCTCCAGCTCTAAAGTGGGCGCTTTCACCTGACGGCCAATTTGTGCAGGCCACTCTTCGCTCCATGCATGTCCATCCGCTGCGCCTAGCAGCTGGTCAGTGACATCGGGACGTACTTCAATTTCCCCACCATCACCTTTGATCACTAAAGCATGATCGCCGAGAATGACGTTGGCTTGCTGGTGCACCTGCTGATAACCTGGATGAAAAACACTCTGCAGGCCACACGTTGCTGACAATGGATTAAGTAAGCGCGCCAATGAATGCACGGGTGAGCGCAAGCCTAAAGTGCTGCGCAAATCGATCATGCGCTGCAAGCGTGGCATCCACACGCTCAAGGGTATAAAAGCAATATTTTGACTTTCAATCTGTTCAGCCACGTCATGCCAAGAGGTACACGAAGCAATGGCTAAGGCGTCAAGAACATCTTCGGCATACATGCGCCCAGCCGTATGACGTCCTCCGCCGTGCAGCAAAATGCGAATACCATTATTAGCTAGGGCTTTGGCAGCCAACATAAACCAAGGTAACTGGCGGCGCTTACCTGCGTACGCTGGCCAATCAATATCAACTGTGATCGCCGGTGCCCTCACCCGCTCACGTACCGCACGAGTAAAGCCGGCCAGCTCTTCTGGTGTTTCTTCTTTAAAACGCAAGAGCATTAAAAAAGCACCGAGCTGCGTGTCTTCGACTTGGCCATCGAGCAACATACCCATCGCTTGATAAGCTTCATCGCCTGTTAGACCACGTGAGCCTTTTTGCCCTTTTCCTAAAATACGCACAAAAGGGGCAAAAGGGTGTTCCTTAGATTCGCTCATCACAGCACTCCAAACCGCTAACATTTTTAGTTTGGATGCAGCATACGTGGTTTAGCCGCGCTAGGCATTAACGCAACTTGATATAGATCAAGATTGAGCGCAAGTCTATCTTTTAAAAGCAATTAGCGGGTTTTGGTAAGCCGGCCAGACGCGCGGCCAGCTTGGCAGGCATGCCGTTAAACAGACCATTGAGATAGAGACTGTTACCTTTCTCTTTACCCAAGTTAAGAGCGACATACTTAACCAAAGCGCGGCTGGCAGGTGATAACTGAAATTGAGCGTAAAACTGCTGCAGCAGATAGAGAATTTCCCAATGCGCATCGCTTAATTCGATGCCTTCACGCTCAGCCAGCGCATGTGCCACTTGCGGCGACCAATCCGCTAAATTACACAGGCAGGCATCTTGATCGAGCGCAATTTCACGCCCATCAATAATTAGTTTATCTGCTCTCATGTCCAACTGATGACCCGCGGGTAATCAACGCACAATGCAACAAAGGCCGGATAATCGAGCATGGATACTGGCATATCAGCACTATCAACCGCTCGTGCCGACACATCTTCCTCTAGCGCATATAAGTGGAACGCACGATCACAGTCCCGCAATTGCTCAGCCGCTGCACTGCCAGCGCGCAAGGCCTGCACCGCTTCACCGCACAGAACAATTCCATCACCAGCAGAAAGCACGCGCAAGCAACTGCTCAGTTGTGCCGTAAGTGCTGGTGAGGCATTTAAAATATGTAAGGTTGTCATTAAAGTGTCACCACATAGTCATGTTGGCGAATAAGCTGTTGTATTTGCTGATCATCCAATTTATCCGCAGCCAGCGCTAAAGGTCTATCCGCTAGACCACGCTGGCTTAAACACTGCTGCGCGACATACAACTGCTCAATGCCGAACATGGGCAAGGCTTGCAAATTGGCCGACAGATCTTTTTGCTCAAGGGTTTGCGGCTGTTGTTGCGCTAACAATTGCAGTACGCCATCATCCATAAACAAGATGCTCAAGGGCAAATCAAAGGCTCCGGCAGCTAAAGCAATGTCTAGGGCTTCTGCAGCACTGACGCCAGCCCAGGGTGCGTGGCGACTGATCAATAAGACTGATTTGGCCATCACTCACCTCCAAAGCTGATCAAGCGATCGGCCTGCTGTAAGCCATCATGCAACTGACCGAGCCCGGACAACTGATAGCCCTCAGCAAGATTCACCGCACCACGCCCAAAGCGTTGTGCTTCGGCTTGATCAAGCACGCCACGGCGTAACGCGGCAGCAATGCAAACCACCGCATCTAACTCATGTTCAGCAATAAAAGCTTGCCACTGCTGGGCAATATCCTGCTGATCTTGCGCAACCACAAGGTTGTTGGATGCGCTCAAAACACCGTCTTGATAGAAAAACACCCGAACAATCTCATGCCCTGCCGCTAGCACCGCTTGGGCAAAACGCAAGGCACGTCGGGTAGAGGGCGCAGCGCTGGAAGACAAGACGTTAATTACAAATTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP043320|1592577:1596592|1593347_1594052_+|WP_151184626.1|DBSCAN-SWA MLVMNNVCTFYGKIQALHDVSIQVNRGEIVTLIGANGAGKTTLMMTLCGDPQAATGDIIYEGQPLRGKTTAQIMRMGMAIVPEGRRVFSRLTVEENLAMGAFFCDDKHVQNERLDRVLSLFPRLHERFQQRAGTMSGGEQQMLAIGRALMSEPRLLLLDEPSLGLAPIIIQQIFKILEQLRSAGVTVFLVEQNANQALKLADRGYVMEHGRIVLEDTGDNLLSNEAVRQAYLGG >NZ_CP043320|1592577:1596592|1596199_1596592_-|WP_151184631.1|DBSCAN-SWA MKFVINVLSSSAAPSTRRALRFAQAVLAAGHEIVRVFFYQDGVLSASNNLVVAQDQQDIAQQWQAFIAEHELDAVVCIAAALRRGVLDQAEAQRFGRGAVNLAEGYQLSGLGQLHDGLQQADRLISFGGE >NZ_CP043320|1592577:1596592|1595538_1595841_-|WP_151184629.1|DBSCAN-SWA MTTLHILNASPALTAQLSSCLRVLSAGDGIVLCGEAVQALRAGSAAAEQLRDCDRAFHLYALEEDVSARAVDSADMPVSMLDYPAFVALCVDYPRVISWT >NZ_CP043320|1592577:1596592|1594116_1595088_-|WP_151184627.1|DBSCAN-SWA MSESKEHPFAPFVRILGKGQKGSRGLTGDEAYQAMGMLLDGQVEDTQLGAFLMLLRFKEETPEELAGFTRAVRERVRAPAITVDIDWPAYAGKRRQLPWFMLAAKALANNGIRILLHGGGRHTAGRMYAEDVLDALAIASCTSWHDVAEQIESQNIAFIPLSVWMPRLQRMIDLRSTLGLRSPVHSLARLLNPLSATCGLQSVFHPGYQQVHQQANVILGDHALVIKGDGGEIEVRPDVTDQLLGAADGHAWSEEWPAQIGRQVKAPTLELERLLAVWQGDEQDLYGEQAILATMALALRGLARDREEAFSQAAQMWENRHLN >NZ_CP043320|1592577:1596592|1595840_1596200_-|WP_151184630.1|DBSCAN-SWA MAKSVLLISRHAPWAGVSAAEALDIALAAGAFDLPLSILFMDDGVLQLLAQQQPQTLEQKDLSANLQALPMFGIEQLYVAQQCLSQRGLADRPLALAADKLDDQQIQQLIRQHDYVVTL >NZ_CP043320|1592577:1596592|1595200_1595542_-|WP_151184628.1|DBSCAN-SWA MRADKLIIDGREIALDQDACLCNLADWSPQVAHALAEREGIELSDAHWEILYLLQQFYAQFQLSPASRALVKYVALNLGKEKGNSLYLNGLFNGMPAKLAARLAGLPKPANCF >NZ_CP043320|1592577:1596592|1592577_1593345_+|WP_151184625.1|DBSCAN-SWA MSKNILEVSDLTMRFGGLLAVNGVGLSIKQGQIVSMIGPNGAGKTTVFNCLTGFYQPTSGKILFAGEEIQGMPGFKIARKGMIRTFQHVRLFKDMTVLENLLVAQHQHLNNSLLAGLFKTRSYRNAEQEALDNAAYWLKKVGLLDDANREAGTLAYGQQRRLEIARCMVTRPSLLMLDEPAAGLNPSETDGLKQLINDLRDNYGISVLLIEHDMKLVMDISDHITVINQGTPLAAGTPEHVRNNPAVIKAYLGEE |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2655759 : 2698044
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP043320|2655759:2698044|DBSCAN-SWA 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40 | Burkholderia_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 2650726:2650739|attR 2663181:2663194 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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