Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671 | Listeria monocytogenes strain 52859 chromosome, complete genome | 4 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas2,RT,DEDDh,csa3 | 2 | 15 | 7 | 3 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671_1 | 214854-215008 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP032671_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP032671_1
>1.1|214904|55|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder ACCGATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTCATTCGAA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP032671_1
The CRISPR arrays of NZ_CP032671_1 >merge|NZ_CP032671|1|214854-215008|CRISPRCasFinder TTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGACACCGATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTCATTCGAATTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGAC >NZ_CP032671|1|1|214854-215008|CRISPRCasFinder TTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGAC ACCGATGCTTCTTGGTTTTAATGCTCCTGCTACATCGGAACCGAGCTCATTCGAA TTTCCACCACCACCTACGGATGAAGAGTTAAGACTTGCTTTGCCAGAGAC
>NZ_CP032671.1|WP_003728173.1|212329_213862_+|zinc-metalloproteinase-PrtA MKSKLICIIMVIAFQAHFNMAVKADSVGEERLRNNIQAKRNPADLKALPDSCEAKDFYKNFKILDMTKDKLGVTHYTLALSSDGYLTDNDEIKVHVTPDNKITFINGDLQQGQLRITNQIKITEKNAIEKAFEAIGQSEAHVKSYIGNPVKEKEIIINSRTKRLVYNIKLIFAEPEVASWIIQVDAETGAILKKQNMLSEVERADTHKDFQALGKGANRLLQRPLHVMKINDLFYLVDRTHKGLIRTFDLNHKTDASFGKVVSNKTNMFTDPEFSSAVDAHFYASEVYDYYKNVHQLESLDGKGGEIDSFVHYGLNCNNAFWDGREILYGDGDKKNFKPFSCAKTIVGHELTHAVIQYSAGLEYEGQSGALNESFADVFGYFIAPNHWLIGEDVCVRGLRDGRIRSIKDPDKYNQAAHMKDYESLPITEEGDWGGVHFNSGIPNKAAYNTITKLGKEKTEQLYFRALKYYLTKKAQFTDAKKALQQAAKDLYGEDASKKVAEAWEAVGVN >NZ_CP032671.1|WP_003728174.1|210405_211995_+|cholesterol-dependent-cytolysin-listeriolysin-O MKKIMLVFITLILVSLPIAQQTEAKDASAFNKENLISSMAPPASPPASPKTPIEKKHADEIDKYIQGLDYNKNNVLVYHGDAVTNVPPRKGYKDGNEYIVVEKKKKSINQNNADIQVVNAISSLTYPGALVKANSELVENQPDVLPVKRDSLTLSIDLPGMTNQDNKIVVKNATKSNVNNAVNTLVERWNEKYAQAYPNVSAKIDYDDEMAYSESQLIAKFGTAFKAVNNSLNVNFGAISEGKMQEEVISFKQIYYNVNVNEPTRPSRFFGKAVTKEQLQALGVNAENPPAYISSVAYGRQVYLKLSTNSHSTKVKAAFDAAVSGKSVSGDVELTNIIKNSSFKAVIYGGSAKDEVQIIDGNLGDLRDILKKGATFNRETPGVPIAYTTNFLKDNELAVIKNNSEYIETTSKAYTDGKINIDHSGGYVAQFNISWDEINYDPEGNEIVQHKNWSENNKSKLAHFTSSIYLPGNARNINVYAKECTGLAWEWWRTVIDDRNLPLVKNRNISIWGTTLYPKYSNSVDNPIE >NZ_CP032671.1|WP_031647994.1|209209_210163_-|phosphatidylinositol-specific-phospholipase-C-domain-containing-protein MYKNYLQRTLVLVLCFILCFFTFPLGGKAYSLNNWNKPIKNSVTTKQWMSALPDTTSLAALSIPGTHDTMSYNGDMTWTLTKPLAQTQTMSLYQQLEAGIRYIDIRAKDNLKIYHGPIFLNASLSGVLETITQFLKKNPKETIIMRLKDEQNSNDSFDYRIQPLINIYKDYFYTTPRTDTSNKIPTLKNVRGKILLLSENHTKKPLVINSHKFGMQFGASNQVIQDDYNGPSVKTKFKEIVQTAYQASKADNKLFLNHISATSLTFTPRQYAAALNNKVEQFVLNLTSEKVRGLGILIMDFPEKQTIKNIIKNNKFN >NZ_CP032671.1|WP_003722729.1|208223_208937_-|listeriolysin-transcriptional-regulator-PrfA MNAQAEEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELGYSSGIAHSSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN >NZ_CP032671.1|WP_003722728.1|207223_208180_+|ribose-phosphate-diphosphokinase MSNEYFDPKLKIFSLNSNRELAEEIAKEVGIELGKSSVTHFSDGEIQINIEESIRGCHVYVIQSTSNPVNQNLMELLIMIDALKRASAATINIVMPYYGYARQDRKARSREPITAKLVANLIETAGATRMITLDMHAPQIQGFFDIPIDHLNAVRLLSDYFSERHLGDDLVVVSPDHGGVTRARKMADRLKAPIAIIDKRRPRPNVAEVMNIVGNVEGKVCIIIDDIIDTAGTITLAAKALREAGATKVYACCSHPVLSGPAMKRIEESPIEKLVVTNSIALPEEKWIDKMEQLSVAALLGEAIVRVHENASVSSLFE >NZ_CP032671.1|WP_003740374.1|205799_207173_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MSKRYAVVLAAGQGTRMKSKLYKVLHPVCGKPMVEHVVDQISTLNVDKVVTIVGHGAEKVQEHLAGKSEFVKQEEQLGTAHAVLQAKAELAGKDGVTLVVCGDTPLIEASTMEALLKYHHEKRAKATILTTVIEDPTGYGRIIRDDLGIVEKIVEHKDATEKEQRISEINTGTYCFDNKALFEALENVSNDNVQGEYYLPDVIKILKDSDEVVAAYRMESFEESLGVNDRIALAEASRLMQRRINENHMRNGVTLVNPENTYIDIDVKIGQDTVIEPGVMLHGETVIGDDCVVTSGSEIVNSVIGERVHVRTSSIFESKVGDDVQIGPYAHLRPESDIHDHVKIGNYVETKKAVVGEGTKLPHFIYMGDAEIGKNVNVGCGSIAVNYDGKNKAKTIIGDNVFVGCNSNLIAPVKVGDRAFIAAGSTITKDVPDDALGIARAKQDNKLGYAKHLNHGK >NZ_CP032671.1|WP_003722726.1|205104_205413_+|septation-protein-SpoVG MQVTDVRLRRVETDGRMRAIASITLDEEFVVHDIRVIDGNNGLFVAMPSKRGVDGEFRDIAHPINSDTRAKIQEVVLAEYERVGEEEATAVTEEESESVSAE >NZ_CP032671.1|WP_003722725.1|204677_204986_+|septation-protein-SpoVG MEITDVRLRRVETDGRMKAISSITIDGEFVIHDIRVIDGNEGLFVAMPSKRTPDGEFRDIAHPINSGTRAKIQEAVLAAYEVADEPAVNEESSADESIVEEN >NZ_CP032671.1|WP_003725507.1|202784_203993_+|FtsX-like-permease-family-protein MNVLQSMKMAWKQLKASKLRSFLTMLGIIIGVASVILLVSLGNGVTQEVDDQMGDLGSNLITVVNSSVNPNDKYTYDEVMKYQNIDGVKSVSPELSGQVNATFDYKNSSNKVIGTNDQYKAARSLEMKEGRFLLPIDTEYGQKVAVIGSTVASDLFGFGDPIGETIRLNGMPYKVVGVLKEKGASMMGSSDDQIFIPISSAQRLLKDTNVRTIYVETKSAEDVDFVVNTLESRLAIKFGDEKEQEKNASSAQMGPSYQVINQQEILNAFNTISTTLTTALGAIAAISLVVGGIGIMNIMLVSVSERTREIGIRKALGAKKRAILLQFLIESIVISVCGGIIGIIIGVSGALIFGSVAGISSGITAGTIIFSFVFSLCIGVIFGIAPANKASKLRPIDALRSE >NZ_CP032671.1|WP_003722723.1|202095_202788_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPKPLIDMKNLTKTYTLGGETFKALDDVTFTVEQGEFLSIVGPSGSGKSTLMNMIGCLDVPDEGSYHLDDVDVFKLSDNKLSEIRNKKIGFIFQQFNLLPKLSAFENVELPLIYAGLSVSAREKAAIECLEKVGLLEKRRNLPTQLSGGQQQRVAIARALAGKPQILLADEPTGALDSKTGKEVMGILQELNRAGNTIVMITHDPTIASYGTRSIRIQDGKLFHEEATQA >NZ_CP032671.1|WP_012681030.1|216016_216886_+|phospholipase-C MKFKKVVLGMCLTASVLVFPVTIKASACCDEYLKPPAAPHDIDSKLPHKLSWSADNPTNTDVNTHYWLFKQAEKILAKDVDHMRANLMNELKNFDKQIAQGIYDADHKNPYYDTSTFLSHFYNPDKDNTYLPGFANAKITGAKYFNQSVADYREGKFDTAFYKLGLAIHYYTDISQPMHANNFTAISYPPGYHCAYENYVDTIKHNYQATEDMVVQRFCSNDVKEWLYENAKRAKADYPKIVNAKTKKSYLVGNSEWKKDTVEPTGARLRDSQQTLAGFLEFWSKKTNE >NZ_CP032671.1|WP_003725733.1|216957_217281_+|hypothetical-protein MYIKGRLIFFFVMFVIALCSVLILLIIKMSVWKEEPFNLSDAKEIECLGSCKIKNTNQKIHFFSIKKNLFEEKGNMAGILNEHERKGADKSIFIVILDDEKGIANEE >NZ_CP032671.1|WP_003725734.1|217413_217875_+|DUF1307-domain-containing-protein MKMLKKGTTVLFVMIMAVMLVACGDKEETKTYSLSQNGVDSKLTYTYKGDKVTKQTAENTMSYASLGVASKEDAEKMLKATSDKFQGIDGLKEKIEYKDDKAIETLEVDYTKISSEDMNKIPGMSSNGDTSKGISMEESAKMLESQGYKEVSK >NZ_CP032671.1|WP_003725735.1|217927_218260_-|putative-heavy-metal-binding-protein MIVTTSPNIEGKQIIEYKKIVFGEVITGVNFMKDIGAGLRNFFGGRSQGYEDELINAREEAIREMEQRAKDIGANAVIGVDIDYEVLGADNGMLMVTASGTAVVIEAQDY >NZ_CP032671.1|WP_003725736.1|218326_219058_-|DNA-alkylation-repair-protein MRLRMLFLLYLIYSRGVTRTITFDQLNTELQALENPNTIKIFRNHGCPDSLDLYGLKIGDLKKIIRREKLTKNHELAVELIESNNSDLIYLGLLAINPDKITTEQIEKWNIIFRETWSQLTFGLASIVSKRDDALLFAKTWIESDYDLTKSMGWQIYSEHINNLPEAEALLQRAKETLQTETNRTRYSMNGFIITCGIYKDDLHEKAMEAAKSVGKVHVNLGNTACKVPDAISYIEKARNRTK >NZ_CP032671.1|WP_003722739.1|219078_220020_-|L-lactate-dehydrogenase MKDHQKIILVGDGAVGSSYAFACVNLSIGQEFGIIDIDKDRTIGDAMDLSHAVPFSTPKKIYSANYSDCHDADLVVVTAGTAQKPGETRLDLVNRNIKIMKGIVDEVMASGFDGIFLIASNPVDILTYATWKFSGLPKERVIGSGTSLDTARFRMSIADYLKVDARNVHGYILGEHGDTEFPAWSHTTVGGLPITEWISEDEQGAMDTIFVSVRDAAYEIINKKGATFYGVAAALARITKAILNNENAILPLSVYLDGHYGMNDIYIGAPAVVNRQGVRHIVEMNLNDKEKEQMKNSADTLKKVLDDAMKQID >NZ_CP032671.1|WP_003722740.1|220313_220937_+|50S-ribosomal-protein-L25/general-stress-protein-Ctc MATTLEVQKRETTQHSEVTRLRSEGKVPGIIYGYKSENVPVSVDSLELIKAVRDNGRNAVFSVTVDGKKLNVLLHEYQVDPLKDVLVHVDLLAVDMNEEVETDVRVVLVGDAPGVKAGGVLQQIIHDVKVSATPEKLPETIELDISSLEIGDVLTTNDLPENKDYVVQAEEEETVVTVSAPRAEEEPTTTEAPEPEAVHGKDEEPVE >NZ_CP032671.1|WP_003725737.1|221026_221611_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MLDKSVPHISAIMVNHDATNYPEFHLPEGYSFCFYKDGLEEDWCRLQLETGQVLSMDSIRARFETEFGNEKEKLAKRCVFVEAPNGEIIGTAMLWDGNTFGEMASRIHWVAVLDSHGGKGIAKALLSKILGLNKSSFVYLTTQTGSYQAIYLYQKFGFEKYVGKTPENWKTVNFQEEKEAAWQIIENKIAEHQA >NZ_CP032671.1|WP_003725738.1|221717_222278_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKLIAGLGNPGKKYERTRHNVGFMVVDELSFRHQTPWKKSKFNGMTSEIIVGGEKMILVKPLTFMNASGECIRPLMDYYNIPIEDVVIVYDDLDLPVGKIRLRQKGSAGGHNGMKSIIQHVKTQEFNRIRVGVSRPLKGEVIHYVLGDFPKAEQPDIIAAIQKSADAIEDFAQTPFIEVMNKYNQK >NZ_CP032671.1|WP_003728167.1|222391_225931_+|transcription-repair-coupling-factor MKGLQQLIYEQKDIRAVLNALDEKEKAQLVTGLTGSSRALFASVVEGASKRPVVFVTHNLYHAQKLYDDLLSLMDVDRLFLYPADELISSELSISSPELRGQRVEALDFLLSGKPGIVIVPVAGLRKMLPPVSLWKHFNISIVEGEEIDPDVLRQKLVTMGYTMSGMVNTPGEFSVRGGIIDIYPITEEFPIRIELFDTEVDSLRFFDVETQRSTTRVEEFRLLPATEIILDQSYYPDIVKRLEKKMTHTLNELKENEDKQALVENLEEDLEMLRSGVKPDMFFKYIGLAYPDPASLFDYFPKNTAILLDEFGRILETEESLEREEAEWQTETLSRMETVRDVQVSHSFKKLLEANHSPKIYLSLFQKQMASMRVSKTTNIVYKQMQQFHGQMNVLKTELESWHKNNYAVVILAPNLERAEKMQQTLTDYDMESTILKKESDVPKYGMVQFVIGTFQNGFELPLAKVAIISETELFNKKIKKVKKRQKLSNAERIQSYSELKVGDYVVHVNHGIARYVGMETLDINGVHKDYLLLVYQGEDKLFIPVDQLDLVQKYVGAEGKSPRLNKLGGAEWKRVKKKVQASVQDIADDLIKLYAEREAEKGYAFSADDEMQREFEEAFPYQETEDQLRSISEIKKDMERPRPMDRLLVGDVGYGKTEVALRAAFKAIMDGKQVAFLVPTTILAQQHFETMKERFQGFPIEIGLLSRFRTKKQQTETLKGMKNGTVDVVVGTHRLLSKDVEYQDLGLLIVDEEQRFGVTHKEKIKQMRSKIDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIETPPANRFPVQTYVAEQNNVLVREAIERELARDGQVYYLYNRVESITQKADEISAMVPDARVATAHGQMGESELESVILSFLEGEFDVLVTTTIIETGVDIPNVNTLFVQDADRMGLSQLYQLRGRVGRWNRIAYAYFMYQKDKILREEAEKRLSAIKEFTELGSGFKIAMRDLSIRGAGNILGAQQHGFIDSVGFDLYSQMLKEAIEAKKPKEEQKQIVPVEIDIQADAYIPEYYITDGRQKIEMYKRFRNIETLSELEDLQSDMIDRFGEYPEEVEYLFTMTELKVHALEVGIESVKQEQNKITMLFSESGTAGIRGDIVMQIIGEFGRMVGVGMEGTQLKITINVQNKPLKEWLYQVKSLAEKLRGAMKERASAEN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671_2 | 512599-513183 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP032671_2
|
7 spacers
spacers of NZ_CP032671_2
>2.1|512638|39|NZ_CP032671|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >2.2|512716|39|NZ_CP032671|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG >2.3|512794|39|NZ_CP032671|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >2.4|512872|39|NZ_CP032671|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >2.5|512950|39|NZ_CP032671|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >2.6|513028|39|NZ_CP032671|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >2.7|513106|39|NZ_CP032671|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP032671_2
The CRISPR arrays of NZ_CP032671_2 >merge|NZ_CP032671|2|512599-513183|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NZ_CP032671|2|1|512599-513183|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NZ_CP032671.1|WP_068996299.1|509721_511806_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNLIAEEVAQEKPAEVEQLEEIPTTDELMQNPDVREQPVADSDDPDLTVVSSGDFWTLYYNSANDEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKRIKHIEIEEATLTGNFVYYFRGTVFPVLESVRIEQCNLSGVTSFARAFEGDSESESPLEKVIIRDNDYPETPSLTDISRMFVLCRKLSELDVSGLNTSSVTNMSTVFGNTNSLKELDISNFDTSSVTDMSYMFAACESLEELDLSTLDTSSVTNMYSMFSYCYNFEELDLSNFDTSSVTNMQQMFYGCDNLEELDLSNFDTSSVTNMHLMFGACKSLEELDLSTFDTSSVANMRGMFGECNSLEKLDLSTFDTSSVTNMQIMFVECTSLEELDLSTFDTSSVTNMDRMFENSTALKSLYLDNFTDAASMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFNRLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEEMEEQKVQNKVSGEYWEEMLPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPATVSATIYAKWVENYTVIIPASISLNEASELKVEGINRGGKTLSVGLNYGKTTISESNKLTLSNTADTTVQCLAPLSWDGSETNPKNAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NZ_CP032671.1|WP_061391596.1|507919_509458_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLSSFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDLLESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDSLKPFEERLTSDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_CP032671.1|WP_003728092.1|505734_507285_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP032671.1|WP_003728093.1|504641_505742_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP032671.1|WP_003728992.1|503357_504641_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVSGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP032671.1|WP_003740428.1|501628_503224_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP032671.1|WP_003721242.1|500525_501473_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP032671.1|WP_031644083.1|499372_500521_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLVDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSKLQDISTAFAEIAPVDNLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP032671.1|WP_003725186.1|497216_499376_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP032671.1|WP_003728096.1|496344_497100_-|DUF4866-domain-containing-protein 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MKITDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAYVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFDDISKWKILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHGKISLAEVEEFLQALVMVDGRLYLANIALAEWFVAQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITNADLRLTDAELLAKLNANSDAREKIQLLESPHLEENEVDFTYHHKKKMRLINPSVLVDGRLIPADELSEKVREMNDWASEKSKHGIYIKVT >NZ_CP032671.1|WP_003727316.1|519124_519307_+|hypothetical-protein MYKNTVYTRGIMVLYEIGYLLEGLNGLFYFSMYKIMYIDTICVILNINLSKSILNVLIFA >NZ_CP032671.1|WP_012681110.1|519428_520256_+|hypothetical-protein MKKRLIGIITALLLVSGILLSPQMAQAETKVDYDALYQQGVSEGIINKADVSLETWIKENESEYNQVYQDGLKDGVYDASLSYEEWIKLNNYGQPPVVDENWEEVPQKPMLKGVYKGYNIKKGDILITNGTSSSGLLGHAAIANGNEYILDIPGAGKTTRQVPTSKWMSDYDPEGWVKVYRLKDSSVANAAANWADKNYYSTKGTSKQNIFPKYGMTGSRYSKNPTYCSKIVLQAYYFGTGNKPVVQVFPSLVTVYDLPNYFSKAYKPQQVKYFK >NZ_CP032671.1|WP_003727314.1|520283_520643_+|DUF3139-domain-containing-protein MKKYKKWWITIGLVLIICIIGYIYWFAIPKHTANEAVDDYLAAQKINSTQVKTRDIQKDWTRGGYYVTIVFKDDPNLVYEYNYNSKRNTPYHINLLVFKDGSSQEDDQVKHPPLQEQKD >NZ_CP032671.1|WP_046670297.1|520968_521529_+|TetR-family-transcriptional-regulator MAESLITKKAIAGGLMELCQHKRFEKISIADITNICGLNRQTFYYHFTDKYDLLTWTYENDFFHCLADGITLENWDKHVLKMLESIKENADFYKNTVSADASILSFCFSKLTNSLFMDLFEKIDKNGAVNEADRVFYAEFFSYGCSGVLIKWITRGFKEAPEMIANQLFRLAKDTEFLANSMYREN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671_3 | 566705-568354 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP032671_3
|
25 spacers
spacers of NZ_CP032671_3
>3.1|566734|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC >3.2|566800|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT >3.3|566865|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG >3.4|566929|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAG >3.5|566995|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC >3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTG >3.7|567125|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTCAAAACCTCCCACACCCGCTATGAATAAATT >3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGAGTATCAGCGCTAAAAGAGATTGTTAAGCGCC >3.9|567254|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAGAACATAAGCTTCACTCTTTAAAGGGAGTAAA >3.10|567319|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC >3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTG >3.12|567450|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC >3.13|567516|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGC >3.14|567580|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG >3.15|567645|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT >3.16|567710|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT >3.17|567775|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG >3.18|567838|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC >3.19|567901|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTAC >3.20|567967|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAGCGTTAGCGGCATTGTTCGAAAGTAATTTA >3.21|568030|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTA >3.22|568095|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA >3.23|568160|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG >3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTT >3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT TTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT |
cas2,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP032671_3
The CRISPR arrays of NZ_CP032671_3 >merge|NZ_CP032671|3|566705-568354|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGACGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAGTTCAAAACCTCCCACACCCGCTATGAATAAATTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACGAGTATCAGCGCTAAAAGAGATTGTTAAGCGCCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTAAGAACATAAGCTTCACTCTTTAAAGGGAGTAAAGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTACGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAATGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGCGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTACGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAGCGTTAGCGGCATTGTTCGAAAGTAATTTAGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTAGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGAGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGGGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTTGTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAATGTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA >NZ_CP032671|3|1|566705-568290|PILER-CR GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTTCCTACTTTTTGACATAAAAAATAAGCCGAGTTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AAGTTCAAAACCTCCCACACCCGCTATGAATAAATT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACGAGTATCAGCGCTAAAAGAGATTGTTAAGCGCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTAAGAACATAAGCTTCACTCTTTAAAGGGAGTAAA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG 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AAGTTCAAAACCTCCCACACCCGCTATGAATAAATT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACGAGTATCAGCGCTAAAAGAGATTGTTAAGCGCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTAAGAACATAAGCTTCACTCTTTAAAGGGAGTAAA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGTATCGCCTTCGCTAGGCGTTTCGGGCGGCGTTTCC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACTTTAGAGAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACTG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT CTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGAAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT ACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTAC GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AGAAGCGTTAGCGGCATTGTTCGAAAGTAATTTA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTGTTCGACGGCTTAGACAACCATCACGCTTCTTTA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT AAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT GTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTT GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT TTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT GTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA
>NZ_CP032671.1|WP_003721310.1|566228_566507_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILIYDISIENGGAKVWRNVFKICKKYLTHVQKSVFEGEITPALLVKLRMELDKYIRDDQDSVIVFSSRQQRWLEKEFWGLTDEKTSNFF >NZ_CP032671.1|WP_046670317.1|563736_565926_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MHKYLAKSNPEETIQEHTDNLLKNYQRLKKLYPAVEIDWYLLELVCLLHDLGKMNLLFQTKLGNASGKGKEIPHGYLSVAFVPDSKLEEMGYSEDEIKVVYQAIARHHERKYDFSDSEWKKEIIKLEEQWAGFIYSQLGENAEYSSEVEMLYFYPGSRIFEGNSAADAETFKKYVLLKGLLNRIDFAASGGIDVELENDFLMDSMEVQLAHFKAENPEADWNALQKYMMQHQNENIVVIAETGMGKTEAGLLWLGNNKGFFTLPLRAAINAIYERITKNIVTTNQAERVGLLHSETYSQYLLHEGNAEMDIDEYYTRTRQMSLPITICTLDQLFDFVFRYAGFEHKLATLSYSKVIIDEIQMYSPDLLAYLILGLSYIDKFGGKFCIMTATLPGIVTDLLLENGVDFVQPEDKFVSSRIRHSMEMVHTEIESEFIKPFFNNNRILVICNTISKAKKIYSELKEHFQGEEIHLIHSQFIKKDRSAKEDAIFKDGQKDSKKKCIWVATQVVEASLDIDFDLLFTELSDVNGLFQRMGRCYRNRRLDVDTNVYVFDGGAKVCSGVGIDNFIDKLIFENSKTILNEHAGVLTEEKKMELVEQVYSTEALSGSKFYKELIRTINYVKAFESYLMNKADVRRRFRNINSVSVIPEEVWQDNAEEINSYFVTLRKTSKEISTKEKIIARTNLAEFMVSIPDYLYKKGESVVREINRYESVIEFKCGYSSDVGVFMR >NZ_CP032671.1|WP_003731262.1|562886_563669_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MLIMKAIRVKLWQDLVNFKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMVHTLCGFTSYHEMKISIQGKYFSKVNDLATRYEFKNGMTYDASRHQIKVDKYGVSRGVSTVELLVDLELLLHIIPEDPSLVPIIEKAFREPIEFPSLGRREDIATIQKVEVVDVEKRQPKKSTEISDGYNAYVPISLTENNSVHFKSHESSVGRDKLLGTRYLLTEKYERVNHGTEKAPKFFRKWRKKDVIYSSRIFVSKKDVFFFDEDDYLVFIEEEE >NZ_CP032671.1|WP_031643486.1|562039_562909_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNKGLAMTIIFQAESANYGESLGNISSLKKISRNNGDQYTYISRQAIRYNLMDQIGEKEAPVKAEGGGDKKVIQFLSEATITDFPELDFFGYLKTEKGSGGQKRSAKVRLSNAISLETFKGDLDFLTNKGQADKLNENMNIAQAEIHKSYYRYTMTIDLDQIGIDGEIALENKEKARRVKKLMDTVAFLYRDIRGRREDLKPLFVIGGVYDVKNPVFQNVVDVADNNIVIKNIKDLLTYEDIKENTRVGIIDGQFANSDEVKVELKAESVPAFFNDIKGKIDAYYESN >NZ_CP032671.1|WP_003731260.1|560361_562050_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MRTEIEVRANDWLINAGLIGFLNIVGKENVRIDGQSIYFTADLLEDFETKYFNFFIQEFKETLSWYKIVSYKETMEQFRIDEFASFDEVALGNLNKYMKDVVKFYLKKVNYIKVFPLIDPSANVTKWLENLNTINLTKKQRWDEVKADIIEEVKQTYTQLDLIIDFCASEKGLQYLGAKNLIYSVINKGWSGVSFLFKQTKFIDPYLDYKTTFVDSVLDYLDTDLSKAKYNCFNCNQPIKNLKLDLSFMNDVGFDTARKTSHVWDFNNDVATCPICRLIYSCVPAGFTYVYGEGMFVNDSYGVEELHRVNERMRNSILSFNQDGINSTNTYRALVESITMEHENNRRYELADIQLVRYENEHYRFNLLSKKMLHIVNDSKGILKGLIRCGYKEGNLNVNLYKEVLQHLMNNENLFTLIHKLIYYKQTSVNGLYYNMGHVSGILDINTKFLKEMEVMTNISQNQLWFVQNCGKEFKEGYVKKKSENKISGITYKLLNSLKVNDKDGFMDTLLNSYSYLAMPIPDVFIKMFSDNEAFKSVGYAFMLGVGGEKTKKEDGGNTDEK >NZ_CP032671.1|WP_003731259.1|559623_560346_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKINCDFDSKIIPKDFQSKVVSLFKAGIMKSSPERYENLFGGNKHKQYTFSVYLPKPQNKGAEIQLNEANCIINFSTGDAETGIIFYNALISLRGSKILFGAGNNITIKNIQIVPEKKIIGNRTILRTLSPVVSRDHNRETFKNWFYSFEDEEFEPTLKRNMLPYLIDAFGEQARYDLEKLKITPISMKKVVVYCHEIHIESSVGIFELEAEAYLQKYLVENGLGTMTGSGFGMIEQL >NZ_CP032671.1|WP_003727297.1|558455_559271_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLMMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGISPKDFADSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NZ_CP032671.1|WP_096929182.1|556904_558335_-|CapA-family-protein MKRRTYVIITGLVLIFVAGAFWITNSTNQSDQKATQTEPLKKTSPANVKTISSEAKKTLNSLASSGADKASISDLNQLIKELKSYPVEKNDSGAYLQNLTACLEAVKSYTTGKTDEKTLGKVYPAFLASEQKLSAIEKTNQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFQKNNGNNTYVYKNCLPWFKSDDYTVINAESAFTNATKAENKKWRIKSDPAHVAFLPASGVEAANLANNHTMDYFQVGYDDTLKAFKENNIPVFNTEAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKENTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTKEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NZ_CP032671.1|WP_003721301.1|556426_556858_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NZ_CP032671.1|WP_096929181.1|554496_556326_+|lmo0514-family-class-1-internalin MKKALKLFLATFCMFIMIYPSTAAHAEETNIVNIPDANLKTYLNGLLKQASDAPITKTQMNTIQTVTLSGSTYTDLTGLEEAGNLVTLSLNNTNIQTLEPIKNQTSLTYLTVGGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSISGSEVTHNVFKTFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISALASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNETNQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSARLSITDDGITVSGVTKEEFDNLDEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMNSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDATSEEQFLKDVHAETDDGTAVKSDFDQVVKLDVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITADSQISYKKESTKSVDEFLQEIHSSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLNAINDRGQKADPVTVVVTVTTSDGGHVNPVPPTPEVKPTPQEETDPTIIPEPQSENSEDPVKENNAKTEEKANKTSLTTKENKVEKADKAEKTNQPKTKALPQTGDTNKSTLPIAGVMLSLAALLIFRKSKS >NZ_CP032671.1|WP_003731264.1|568426_568795_-|DUF1304-domain-containing-protein MAILAFILTFIVMIEHIYIMILEMFFANTNLAAKTFGVEKELLANKKVQTLFANQGLYNGFLAAGLVWGLFFAGAGMAETVQIFFLSCVVVAALFGGATSSKGILVKQGLPAVLALVVVLLV >NZ_CP032671.1|WP_003727295.1|568941_570357_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MQQEATGGQKIRPIPIIASFLMAGFIGLFSETALNMALSDLIQVFDISSATVQWLTTGYLLTLGILVPISGLLLQWFTTRGLFFTAVSFSIAGTLIAALSPTFAMLMIGRVVQAVGTALLLPLMFNTILLIFPEHKRGSAMGMIGLVIMFAPAVGPTISGLILENLTWNWIFWISLPFLIIALLFGMKFMQNVSVVTKPKIDILSIILSTLGFGGVVFAFSSAGESGWGSATVLVSIIVGGLALGLFVWRQLTMEKPLMDLKVFKYPMFTLGLILVFISFMMILSTMILLPLYLQNSLALAAFSAGLVLLPGGVLNGLMSPFTGRLFDAYGPRALVIPGFIVAVVALFFLTRIEVGTSALTIIVLHSVLMIGISMVMMPAQTNGLNQLPPKLYPDGTAIMNTLQQVSGAIGTAVAITIMSAGQKAYMETAQGVGPEQMVASLTAGIQNAFVFGLIMACIGLLCSLFIRKAK >NZ_CP032671.1|WP_003740448.1|570487_571492_+|ROK-family-transcriptional-regulator MAIPRDLKELNKKNIKSILRQQGAMTKAEIAEVTGLSVVTVNKLIRDLVENEEILEQDNSVATGGRRAVSYEINPNFQQVLVISLQEKWKKITYSFSVYNLLGEPEFVEDMSGEDLDITALKRNTKDLVCAFPKISCVVIGVPGIEIGGKLRAMDFPLLLNVQLRETLEAEVNLPVLVETDTNAAILGYKNRPVKEENIVGLYYPERFPPGAGLLMNGEILKGQNGLAGEIKHMPLQVDWDNFDFSVDEIKAHIRKMVLLTMSFYDPETIVLYTNFYFGQKDFTEELTEELKQVYPYAVLPEIVLSRKFTTDYRIGLLAFGIDYLENNMTDWRI >NZ_CP032671.1|WP_012681121.1|571769_574757_+|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R MAEAKFEAALIKKLETEGWTYREDLSNVSIKKLEEHWRDILNETNAHKLNGVPLSEIEFGLILQELQRIKTPYDAQLLLVGAGGVGSIPITRDDGSSLEVEIFYEDDVAGGRSRYEIVNQVRFDNLPKGLTTKRIIDVALLINGIPVVHIEEKDEHLQNQWRAFEQLKGYHGDGLYKGLFAFVQVQVIMSQHSAHYFARPNAFEQYNKTFVFGWRDENNKDITDAFEFIHQVMSIPALHRLVTVNMIPDASNDNIMVMRSYQIQATREILQRMKEMEASGLVQKEGGYIWHTTGSGKTVTSFKVAQLLASAPRIKNVLFIVDRIDLIDQTLENFKSFAYAHFKNRIKKVNGRELKRELKRKGSSQILLISVQGLTKAVKKGLENDDWNVIIMDEAHRSASGESVKLIKKALKKTTWFGFTGTPNFYSDEINDVKTTREISTHDIFGKRLHTYTIKDAIGDGNVLGFDVTYFKPHWVVEHPQEDFSEKDYEKEVYQSDVYRQEVVKDILDNWTKTSSGALIAGKREENAFQAMFAVSGKQAAVNYYNIFKSKGSHLNVAMTFSRDESNEHGTKEQNEALKNAIKDYTEKFNVASILDAKDPARAYMLDITKRLARKRPYNQGKEEDRLDLVIVSDQLLTGFDSKFINVIYMDKMLKEGMLIQAISRTNRTFDLNSKPHGKVRFYRQGDEMREFVENALRIYTRGGNDTLQEAEEETKNQLPKDLENDDILAKPQSHQINELEEAILRLKELAGDDFSQVPRGQNDLKEFVGLALTTQTKIQQLIQQGYELGSEIEELNEQGEATGRMVRLNISSIDEFGALQARLYDAKEKLPPEERPDLTEIKIGIEFYHHEIIDYDMLVELLNTFMDEKNKSNKDAIEKHIVPMDEESQHEIHGIVDDIEAGHITEHFTTDSLQETRKKYRTEHRELKVRRWAANQKVNGNRIVEAFDLFLPGHTLIDNPKLADIVREIEEEENIGFFEASDFEEELMAFFNSL >NZ_CP032671.1|WP_009928927.1|574804_576394_+|type-I-restriction-modification-system-subunit-M MALSTEQKTKMWAMLNQTRGQIGLTAYKDYIFGILFYKYLSEKATHWLNGVLRGENWESVYSQDSVKALNYMKKNLGYAIQPNEFFVDWKKAIDTDRFNIGMMTDTFTHFNQQIAFEAKNDFEGIFDGMRFDSADLGANAQARASVMISMIELLSSPEFDLSGSNDTVSDIYEYLVAQFATVLASDMGQYYTPKEISNVMARILTFGREDMEKFSIFDPTVGSGSLLLTTASYMKNSGRRGVIKYYGQEKDATPYRLSRMNLMMHGIEYNDININHADTLESDWPDGVVDGKDTPRMFDAVMANPPYSAHWNNKDREDDPRWREYGVSPKTKADYAFLLHCLYHLEDNGRMAIILPHGVLFRGASEGRIRKALIDKHQIEAIIGFPEKLFLNTPIPVCVVILRKNRIESDVLFVDASKGFEKIKKQNNLRSEDVEKIVDTVINRKEIEKYSHVATLDEIKENDYNLNIPRYVDTFEEEEAIDLVALGNEMVALNADIKKAETDFLGLLDELAVTADTKEIIEATKAVFR >NZ_CP032671.1|WP_031641459.1|576390_577596_+|restriction-endonuclease-subunit-S MKKLEKSVPVIRFKGFSEAWEQRKLGDLVVDYVEKTSVQNQFPMLTSSQQKGIVLQEDYFANRQVTTENNIGYFVLPRGYFTFRSRSDNDVFVFNRNDIIDRGIISYFYPVFTLKSADSDFFLRRINNGIQRQLSIQAEGTGQHVLSLKKFKNIVAMFPSEGEQKKIGSFFKQLDDTIALHQRKLDTLKQMKKGLLQQMFPKSEEDVPKIRFADFDEEWYQRKLGEEFEKINERNDGSFGKTHWISVAKMYFVEPNKVLSNNIDTRTYVMRKGDIAFEGHSNTDFKFGRFVANDIGPGIVSELFPVYRHKTNYDNNYWKNAIQLEHIMAPIYSKSITSSGNSSNKLDSKHFLNQKIYIADFEEQEKIGSIFKQLDNTIILYQNKLNKFDILKKAYLQTMFI >NZ_CP032671.1|WP_012681123.1|577680_578610_+|site-specific-integrase MKAKKRKEQTFHEYFKEWVDLYKVGAIRSITLQKYYVTEQKIQELVPELKIKDLDRYTYQQLLNNYALTHEKQTTMDFHHHLKGAILDAVDEGVLNQNPTRKIVIKGKNPRPKKAKFLNQFEVQVLLKELNLKEDINWDWFILLIIKTGLRFSEALALTPSDFDFSTQKISINKTWDYKMVTGSFQPTKNESSNRKIQIDWQLAMQFSQLIKMKDSDKPIFVKSRVFNSTINNRLKVLCQNANIPTITIHSLRHTHASLLLFAGVSIASVANRLGHSSMTTTQETYLHIIQELENQDNDKIIRHLSMLM >NZ_CP032671.1|WP_077397267.1|578649_579849_-|restriction-endonuclease-subunit-S MLPLFYVISHYSNLPFRAWEQRKFIEIINRLSKTSNSSILPKVEYEDIIAEEGRLNKDISNKFDSRKGILFQPKNILYGKLRPYLKNWLYPDFKGVAVGDFWVFEAIEATPRFIYNLIQSDSYQKVANDTAGTKMPRSDWTKVSNSSFFIPKESSEQKRIGTFFKQLDDTIALHQRKLDTLKQMKKGLLQQMFPKSEEDVPKIRFADFDEEWYQRKLGEISDKVIEKNKESTYFETLTNSAEYGIISQREFFNKDISNEKNLNGYYIVRENDFVYNPRISNYAPVGPIKRNKLGRIGIVSPLYYVFRTFDTNQSFLEYYFDGTVWHNFMLLNGDSGARADRFAIKDSVLKEMPIPYSTLYEQEKISFFLDEITIIINLHQNKLKKLSSLKKAYLQNMFI >NZ_CP032671.1|WP_003726689.1|579895_581212_-|6-phospho-beta-glucosidase MTKGIKIATIGGGSSYTPELIEGFIKRQDELPVRELWLVDVEAGREKLEIVGNLAKRMVEKAGVDMEVHLTLDREEALKDADFVTTQLRVGLLDARVKDERIPNSYGVVGQETNGPGGMFKGLRTIPVILDICKDMERLCPDAWLINFANPAGMVTEAVLRYSNQKKVVGLCNGPIGIERNIAETLGVDVSEIYVEFVGLNHMVFAKTVYHNGKDVTKDVVFKMTEDEAGSSLKNINATGWDKTFLRTLNMIPIDYLRYYWQTKQQLEDQARAYAEHGTRAEVVKKVEAELFELYKQEELAEKPKQLEQRGGAYYSEAACNLINSIYNDKRDIQIVNTRNNGAILDIDPDSAVETNCVITRQGPIPLASGRLPIAINGIIQEIKTFERLTAEAAVTGDYDKALLAMTINPLTPSESVAREMLDELLEAHKEYLPNFFK >NZ_CP032671.1|WP_003726690.1|581413_582166_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MLFLDKNLELNDTELDIYNYIVANLDKVVYMRIRDLATEAHVSTTTILRFCRKFGCNGFSEFRVKLQLYLEEQKLAQIDMADETTYIDFLKRTAQPEFKAQIQNAVEILRDRELVLFAGVGSSGVIAEYGAIYFSSLFTLALHIEDPLNHPFYHLSSKLSDKICMIAISVEGENEDIIRYIHQLKAQNCKVISITNSAKSTIARLSDANIAYYINKEMYQEANITSQLPALYTIENIAREIRTQIDKEKM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP032671_4 | 2215442-2216018 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP032671_4
|
7 spacers
spacers of NZ_CP032671_4
>4.1|2215473|47|NZ_CP032671|CRT CTTCAAGTGAGCTGCACTCAAAAAACATTTGCTGCATATTAGTAACG >4.2|2215551|47|NZ_CP032671|CRT CTTCAAGTGAGCTGCACTCAAAAAACATGCCCTGCATATTAGTAACG >4.3|2215629|47|NZ_CP032671|CRT CTTCAAGGCTATTACAAGCAGCAAACATGGCAGCCATATTAGTTACT >4.4|2215707|47|NZ_CP032671|CRT TCTCAAGTGCTCTACAGGTACTAAACATGGCCTGCATAGTAGTAGCG >4.5|2215785|47|NZ_CP032671|CRT CTTTAAGACTGGTACTATTAACAAACATGGCAGCCATATTAGTTACT >4.6|2215863|47|NZ_CP032671|CRT TTTCAAGTGCTTTACAGTCCCTAAACATATAATACATATCATTCACG >4.7|2215941|47|NZ_CP032671|CRT TCTCAAGTGATTCACAGTATCCAAACATGCTATTCATATTATTAACG >4.8|2215716|25|NZ_CP032671|PILER-CR CTCTACAGGTACTAAACATGGCCTG >4.9|2215794|34|NZ_CP032671|PILER-CR CTTTAAGACTGGTACTATTAACAAACATGGCAGC >4.10|2215881|25|NZ_CP032671|PILER-CR CTTTACAGTCCCTAAACATATAATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP032671_4
The CRISPR arrays of NZ_CP032671_4 >merge|NZ_CP032671|4|2215442-2216018|CRT,PILER-CR AAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCTAGCTCTTCAAGTGAGCTGCACTCAAAAAACATTTGCTGCATATTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAGCTCTTCAAGTGAGCTGCACTCAAAAAACATGCCCTGCATATTAGTAACGGAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCTAACTCTTCAAGGCTATTACAAGCAGCAAACATGGCAGCCATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCCAATTTCTCAAGTGCTCTACAGGTACTAAACATGGCCTGCATAGTAGTAGCGGAACTGGTATCAAAATTACTTACATCTAATTCTTTAAGACTGGTACTATTAACAAACATGGCAGCCATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAATTTTTCAAGTGCTTTACAGTCCCTAAACATATAATACATATCATTCACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATTCAATTTCTCAAGTGATTCACAGTATCCAAACATGCTATTCATATTATTAACGGCACTCGTATCCCAGTTGCTTAAATCCAGTT >NZ_CP032671|4|3|2215442-2216018|CRT AAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCTAGCT CTTCAAGTGAGCTGCACTCAAAAAACATTTGCTGCATATTAGTAACG GAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAGCT CTTCAAGTGAGCTGCACTCAAAAAACATGCCCTGCATATTAGTAACG GAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCTAACT CTTCAAGGCTATTACAAGCAGCAAACATGGCAGCCATATTAGTTACT GAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCCAATT TCTCAAGTGCTCTACAGGTACTAAACATGGCCTGCATAGTAGTAGCG GAACTGGTATCAAAATTACTTACATCTAATT CTTTAAGACTGGTACTATTAACAAACATGGCAGCCATATTAGTTACT GAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAATT TTTCAAGTGCTTTACAGTCCCTAAACATATAATACATATCATTCACG GAACTCGTATCAAAATTACTTACATTCAATT TCTCAAGTGATTCACAGTATCCAAACATGCTATTCATATTATTAACG GCACTCGTATCCCAGTTGCTTAAATCCAGTT >NZ_CP032671|4|2|2215663-2215949|PILER-CR CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTAAATCCAATTTCTCAAGTG CTCTACAGGTACTAAACATGGCCTG CATAGTAGTAGCGGAACTGGTATCAAAATTACTTACATCTAATTCTTTAAGAC TGGTACTATTAACAAACATGGCAGCCATATTAGT TACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAATTTTTCAAGTGCTTTACAGT CCCTAAACATATAATACATATCATT CACGGAACTCGTATCAAAATTACTTACATTCAATTTCTCAAGTG
>NZ_CP032671.1|WP_003728455.1|2214061_2214535_-|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVEWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETTQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP032671.1|WP_003733326.1|2213556_2214042_-|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGATSDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP032671.1|WP_070786598.1|2213223_2213529_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRRSKKKE >NZ_CP032671.1|WP_150969213.1|2212882_2213149_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MARIEYEEKIQKSLLVLYFRGSTIQSICRKYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP032671.1|WP_003725774.1|2211458_2212559_+|quinolinate-synthase-NadA MNLLETVEQDTMPTHYKQMTQAEMIARVTEIKAQLGENLFIPCHHYQKDEVVPFADAIGDSLQLAQIAAQNKKAKHIVFCGVHFMAETADMLTTSEQIVTLPDMRAGCSMADMADIHQLTNAWPKLQTLFGDTILPVTYINSTAAIKSFVGEHGGTTVTSSNATKIVSWALEQKERIFFLPDQHLGRNTAFELGIPLEHMAIWNPIKNELEYEGNLDDCKVILWKGYCSVHQHFTVKNIENIRKNNPKMRIIVHPECTHEVVSLADDSGSTKKIVTEINNAAPGTEWAVGTEANLVGRIIQENPDKKIVSLNPFMCPCMTMNRIDLPHLLWTLEAIQNGEQRNQIKVDKQTTKFALKALERMLQLS >NZ_CP032671.1|WP_003725773.1|2210616_2211462_+|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase MNSILMNQAIQAFLLEDIGQHDLSAETVFPRDTMGEGVFLAKETGILCGISIPPKVYELLGGNIQFEAYKKDGDWIQKGDIIAAVTAPVRTLLSGERVILNLMQRMSGIASQTNFAVKQLDDSAIRICDTRKTAPGLRAFDKYAVQTGGGFNHRNGLYDGVMLKDNHIAFSGGITSAVSTVREKLGHMVKIEVETETAEQVKEAVQAGADIIMFDNRTPEEIKQLVKLVPPHITTEISGNVTLENIHRYKGSGANYLSLGSLTHSVRAFDISFNSKGGIKA >NZ_CP032671.1|WP_003730798.1|2209165_2210620_+|L-aspartate-oxidase MTKERVIIIGSGIAGCTAAFRLMHDYDVTIITKGLKEESNSMLAQGGVAAAVSKNDTPKKHFSDTFQAGCFHNKVLAVNQLVTNGPIVIQKLIAEGMTFDEQNGELSLGLEGAHQLPRILHTGGDQTGKFLTTFLQEKLTNIHWQEQKMAIEIIKQNDSAIGVHCLDKENRLHTYYGEHIILASGGLGQLFPVTTNAATISGDGLALAYRAGAKLTDMEFIQFHPTLLFLNGRCHGLISEAVRGEGAKLIRADGSAVMTDVHPRADLAPRDIVAATLFAEIQDGNEVFLDITPIPNFEERFPGITANLDAYHVPFRETKRIPVHPGAHFLMGGIRTDLQGKTNIPGLYAIGEVANAGVHGANRLASNSLLETLVFGEKVAEYILTQKTNLIDHPEIPLSNQTQTPHLPDKQLLQEKIWETLGITRKPEKITEFLHWLTDFDYANHTRETAEISHMLITAKLIAESALKRTESLGAHRILKGVIK >NZ_CP032671.1|WP_003725771.1|2207927_2209034_-|cysteine-desulfurase MIYFDHAATTKMSEASLQVFMDASREFFANSESLHDAGTKSAALLEKCRESFSELLQVPNRGILFTSGGTESNQIAIQTLIHTTDKKEVLVSPLEHASVWQQLMALEQAGKCRIKVLPVDSFGQVNPATLEKMISAETGLIIIQHVNSEIGTIQPIAELAHIAKKAGVFFHTDIVQSFGKIDLDLSDATSFSISSHKIYGPKGAGILFMKPDSPLQAVLPDVHHEFGFRPGTVNVPAIAAFTTAAYDIIENREQEAIRAMKLKAAICDTLEARVEVEGGPNTSPYILGLTLPNMQGQEALLALNEADIQISTTSACSLRDLAPSRTLIATGKTTEEANRFIRLSFGRENELNDSIIFKEEIDKLLRKR >NZ_CP032671.1|WP_003727955.1|2207401_2207923_-|transcription-repressor-NadR MKKILGDTRRQMILKWLKEAEAPISGNQLAQKTNVSRQVIVQDISLLKAGNEPIMATPQGYIYAKETSYTGERRVIAVKHTKEQAAEELNILVDHGVSIIDVIVDHPIYGEITASLHLKSRFDVEKFVRKLQTTGATMLSGLTDGTHLHTIEADTKEQLEQAIKALDKAGFLI >NZ_CP032671.1|WP_003725769.1|2206778_2207306_-|DivIVA-domain-containing-protein MPLSPLDIHNKEFTRGFRGYDEDEVNDFLDQIIKDYEQVIKEKKRIEDTLNNSEERLGHFTNIEETLNKSLIVAQTAAEEVKASAEKEAKLIIREAEKNADRILSDSLSKARKIAIEIEDLKRQSKVFRERLRMLVEAQMDLIKSEDWQQMMAYDVDATELASIKEVEAAESEER >NZ_CP032671.1|WP_150969217.1|2216888_2218883_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSDVITEEVAQEKPAEVENLEEVPTTDELMQNPEVREQSVADSDDPDLTVVNSGAYWTIYRNTVNKEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKYIKHIEIEEATLTGSFEAYFRDNVFTVLESVRIEQCNLSGVTSFRSAFEGQLALGKVIIRDNYYPETPFLTNIKRMFASCSKISELDVSGLNTSSVTDMEYVFAGPVVLEKLDVSNFDTSSVTNMRGMFAGCRSLEELDVSHFDTSSVTNMHYMFQYCELLEKLDVSHFDTSSVTNMHYMFGGCTSLEALDVSNFDTSSVTTMETMFAGCASLEELDISNFNTSSVTNMKTMFHGCTSLEELDLSNFDTSSVTKMNNIFENCTALKSLYLDNFTDAAIMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFTGLENTSWYDEKNWVQFATLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQSKISGEYWDEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEATELKVEGINRGSKALSVGLNRLATSVSESNELTLANTADTTVQCSAPLSWDGSENNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGTYTGNLVFSINYE >NZ_CP032671.1|WP_150969219.1|2219145_2220684_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQVLANEVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGSQVEITGDEFSLRIFYTFLFLVAYSGDRWPFSFVQYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKTPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDYASEQVNDNLSIPFSEKEMELLRYCFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLTSDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_CP032671.1|WP_003733593.1|2220705_2221485_-|methyltransferase-domain-containing-protein MNKETERKLAASLTSQSIEILPFIPYFLQDFFELGSSPKDITYLIKQHMPLSAESNFLDLACGKGAVSIGIAKELGNPVKGIDLIPAFIEEAKCKAKEAQVESLCQFEVGDVNKSVQNEKNYDAVIFGAAADILGNPAETLEKLQGTVKEGGYIIIDEAYVPELAHNNQVKYQNYEYLTRNEWLNLFEQNQLQLVEELEGTAEVDFELEKQHLLTRANELIQQYPEKKALFEGYLKSQWSEYDDLEEHLIAVTWILHKK >NZ_CP032671.1|WP_003728337.1|2221512_2222106_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPKLVTGYERQQTKNLIIEHTSHLIYIKKGIQGFTVEDITRAARIGKRKFYTCFPSKEACLFEVVEYSYQAQLEAFKKIMEEKGSLKSKMTRFLKEVYLSEKSINNYFSPEDFHAILQKLPPTYTEREERMTSEVLETAMTYIDLTRAQWEALVMLLDCLTYTATRSYVETAKKAKEETLDILIHSIADYVEKQTQC >NZ_CP032671.1|WP_012681384.1|2223291_2224068_-|RNA-binding-protein MDGIYQHFRAEEYAFIDKILGITMQVENEYTPQLTDFLDPRQRFITETVIGGYDEINVQFFGGVAHAERRRALIYPDYYTPTEADFEIALFHIRYPVKFTTLTHQKILGTLMSLGMKRDIFGDILNNGSEWQLLVESTMKDYLTLQLEKIGKVNVMLEETDLANAVYAPVVWEEMGLTVSSMRLDVIISNVHHISRQKAKQLVTAGLVKVNWKTVENPDFECEEEDVLSARGYGRVKVLSTGGRTKKDKIRIEIGYLK >NZ_CP032671.1|WP_003724066.1|2224192_2224483_-|YggT-family-protein MQSILYQVVEIILFIIRWLPTLMFIYFLMSWFPGARESKIGQFLARIFEPILEPFRRIIPPIGMFDISSLVAYFIFQYAMRVLTGLIQVYVIPMLF >NZ_CP032671.1|WP_003724067.1|2224505_2224964_-|cell-division-protein-SepF MGLSNKFKSFFFLDEEEEYYEEEVAREPEPMQKKTKKEKPNKNRFYAVEEDDAKVVSMQGAQFSSRMVLAEPRVYAEAQELADYLKEYKSVVVNLQRISHDQATRIVDFLSGTVYALGGDIQRVGNNIFLCTPDNVEVDGSISEMLDEQNFM >NZ_CP032671.1|WP_003726459.1|2224967_2225657_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MTKQANLQKVTAQIERACEESNRQPEDVTLVAVTKTIDVAGITELYDLGIRHFGENRADVFQEKTVALADKEDICWHYIGSLQTRKVKDVLPKIDYLHSLDRSSLAKEIEKRATKPVKCFLQVNISGEESKHGFSKEEALSFLQEANFTFIEIVGLMTMAPITNSDIELHHVFHELKQLQQEIHALQLNNIPCTELSMGMTNDYGVAITEGATFIRVGRALVSDDNMEV >NZ_CP032671.1|WP_003728828.1|2225775_2226951_-|cell-division-protein-FtsZ MLEFDTSSESLATIKVIGVGGGGNNAVNRMIEHGVQGVEFISVNTDAQALNLAKAETKLQIGTKLTRGLGAGAVPEIGKKAAEESREQIEEALKGSDMVFVTAGMGGGTGTGAAPVIAQIAKEMGALTVGVVTRPFGFEGPKRTKQALTGTEAMKEAVDTLIVIPNDRLLQIVDKNTPMLEAFREADNVLRQGVQGISDLIAVPGLINLDFADVKTIMTNRGSALMGIGIATGENRAAEAAKKAISSPLLETSVDGAKGVLMNITGGSNLSLYEVQEAAEIVSSASDEDVNMIFGSVINDELKDELIVTVIATGFDEEKQAQQQAQANRRPNQSIQVNRPNYAVQDEQQNDYAQNAPQQANAPVHEQQAEPQQNSSDVDVPAFIRNRNRRG >NZ_CP032671.1|WP_003728335.1|2227017_2228298_-|cell-division-protein-FtsA MGDSEIYVSLDIGTASVKVIIAEMADDRLNIIGVGNVESSGIKKGIIIDIDKTVESIKKAIEQAERMVGVEISQVIVGVVSSQVHLEACRGIVAVGSENREITDEDVWNVMDAAQVVPLSPEREIINTIPDQFVVDGLTGITDPRGMIGVRLEMEGTLITGSKTILHNTLRCVERAGLEISDIALQPLAEASISLSEDDKEFGTALVNVGAGTTTVSVFEQGRLTYTGVIPVGGDNITKDLSLGLNTSTANADRVKLDHGYAFYDDASPDEVFAIDVIGSDQKQHFTQVEVADIIEARMEEIFQLVVEELTRVGKTHLPGGYVLTGGSMAIPGAIDLAGKTLAAHVRLAIPDYIGVREPSFTTAVGLIKYAYQMAELEGRDVSSSASEPRYDDEAPKQKQPKPKQKKSDDEKVSTKMKNFFGAFFE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671_3 | 3.10|567319|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567319-567355 | 37 | NZ_CP032671.1 | 730828-730864 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567060-567095 | 36 | NZ_CP032671.1 | 731630-731665 | 1 | 0.972 |
1. spacer 3.10|567319|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 730828-730864, mismatch: 0, identity: 1.0
agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc CRISPR spacer agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc Protospacer *************************************
2. spacer 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 731630-731665, mismatch: 1, identity: 0.972
cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccgaattg Protospacer ********************************.***
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671_3 | 3.2|566800|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 566800-566835 | 36 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 16672-16707 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.3|566865|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 566865-566899 | 35 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 31167-31201 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.7|567125|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567125-567160 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 18341-18376 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.16|567710|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567710-567745 | 36 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 18563-18598 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.16|567710|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567710-567745 | 36 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 18563-18598 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.20|567967|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567967-568000 | 34 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 19172-19205 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.20|567967|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567967-568000 | 34 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 19172-19205 | 0 | 1.0 |
NZ_CP032671_3 | 3.1|566734|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 566734-566770 | 37 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 9186-9222 | 1 | 0.973 |
NZ_CP032671_3 | 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567060-567095 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 17910-17945 | 1 | 0.972 |
NZ_CP032671_3 | 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567190-567224 | 35 | MH341452 | Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome | 377-411 | 1 | 0.971 |
NZ_CP032671_3 | 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567190-567224 | 35 | KP399678 | Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome | 330-364 | 1 | 0.971 |
NZ_CP032671_3 | 3.1|566734|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 566734-566770 | 37 | MT500540 | Listeria phage LP-HM00113468, complete genome | 35729-35765 | 2 | 0.946 |
NZ_CP032671_3 | 3.15|567645|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567645-567680 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 26132-26167 | 2 | 0.944 |
NZ_CP032671_3 | 3.21|568030|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568030-568065 | 36 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 38302-38337 | 2 | 0.944 |
NZ_CP032671_3 | 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567190-567224 | 35 | DQ003637 | Listeria phage A500, complete genome | 334-368 | 3 | 0.914 |
NZ_CP032671_3 | 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567190-567224 | 35 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 8756-8790 | 3 | 0.914 |
NZ_CP032671_3 | 3.22|568095|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568095-568130 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 41996-42031 | 3 | 0.917 |
NZ_CP032671_3 | 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567060-567095 | 36 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 227438-227473 | 4 | 0.889 |
NZ_CP032671_3 | 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568226-568261 | 36 | FW590615 | JP 2010534058-A/25: ANTIBIOTIC RESISTANCE FREE LISTERIA STRAINS AND METHODS FOR CONSTRUCTING AND USING SAME | 3844-3879 | 4 | 0.889 |
NZ_CP032671_3 | 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568226-568261 | 36 | HI504184 | Sequence 26 from Patent EP2147092 | 3844-3879 | 4 | 0.889 |
NZ_CP032671_3 | 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568226-568261 | 36 | AJ417489 | bacteriophage U153 int gene for U153 integrase | 3844-3879 | 4 | 0.889 |
NZ_CP032671_3 | 3.22|568095|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568095-568130 | 36 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 32760-32795 | 5 | 0.861 |
NZ_CP032671_3 | 3.18|567838|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567838-567871 | 34 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1764851-1764884 | 6 | 0.824 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | MN694189 | Marine virus AFVG_250M578, complete genome | 47879-47913 | 6 | 0.829 |
NZ_CP032671_3 | 3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567385-567420 | 36 | AP013647 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C72-MedDCM-OCT-S41-C96, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 13305-13340 | 8 | 0.778 |
NZ_CP032671_3 | 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 568226-568261 | 36 | NC_019743 | Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08, complete sequence | 4997-5032 | 8 | 0.778 |
NZ_CP032671_3 | 3.3|566865|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 566865-566899 | 35 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 176358-176392 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.18|567838|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567838-567871 | 34 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 39302-39335 | 9 | 0.735 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | MK448625 | Streptococcus satellite phage Javan738, complete genome | 5960-5994 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | MK448449 | Streptococcus satellite phage Javan356, complete genome | 4490-4524 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | MK448636 | Streptococcus satellite phage Javan749, complete genome | 6112-6146 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | NZ_CP045037 | Lactobacillus mali strain LM596 plasmid unnamed2, complete sequence | 34734-34768 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | NZ_CP018177 | Lactobacillus hordei strain TMW 1.1822 plasmid pL11822-1, complete sequence | 11325-11359 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT | 568291-568325 | 35 | NZ_CP018181 | Lactobacillus nagelii strain TMW 1.1827 plasmid pL11827-1, complete sequence | 63608-63642 | 9 | 0.743 |
NZ_CP032671_3 | 3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567385-567420 | 36 | NZ_AP015030 | Pseudomonas putida strain KF715 plasmid pKF715A, complete sequence | 410342-410377 | 11 | 0.694 |
NZ_CP032671_3 | 3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 567385-567420 | 36 | NZ_CP018048 | Pseudomonas aeruginosa strain DN1 plasmid unnamed1, complete sequence | 142304-142339 | 11 | 0.694 |
1. spacer 3.2|566800|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt CRISPR spacer attacagtacaagcaagggttattgagttaaatatt Protospacer ************************************
2. spacer 3.3|566865|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaatgataagagcggaaagaaaactttcaaggg CRISPR spacer attaatgataagagcggaaagaaaactttcaaggg Protospacer ***********************************
3. spacer 3.7|567125|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagttcaaaacctcccacacccgctatgaataaatt CRISPR spacer aagttcaaaacctcccacacccgctatgaataaatt Protospacer ************************************
4. spacer 3.16|567710|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
5. spacer 3.16|567710|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat CRISPR spacer ctggttactcaactggcgacagtaatacacctcaat Protospacer ************************************
6. spacer 3.20|567967|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer **********************************
7. spacer 3.20|567967|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta CRISPR spacer agaagcgttagcggcattgttcgaaagtaattta Protospacer **********************************
8. spacer 3.1|566734|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
caatgcttaaaccgagagcatcaaattgttcccatgc CRISPR spacer caatgcttaaacctagagcatcaaattgttcccatgc Protospacer ************* ***********************
9. spacer 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccgaattg Protospacer ********************************.***
10. spacer 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341452 (Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
acgagtatcagcgctaaaagagattgttaagcgcc CRISPR spacer acgggtatcagcgctaaaagagattgttaagcgcc Protospacer ***.*******************************
11. spacer 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP399678 (Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
acgagtatcagcgctaaaagagattgttaagcgcc CRISPR spacer acgggtatcagcgctaaaagagattgttaagcgcc Protospacer ***.*******************************
12. spacer 3.1|566734|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT500540 (Listeria phage LP-HM00113468, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
caatgcttaaaccgagagcatcaaattgttcccatgc CRISPR spacer caatgcttaacccaagagcatcaaattgttcccatgc Protospacer ********** **.***********************
13. spacer 3.15|567645|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gtccacatcgacaataaaaaacacattgtatcactt CRISPR spacer gtccacattgacaacaaaaaacacattgtatcactt Protospacer ********.*****.*********************
14. spacer 3.21|568030|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ttgttcgacggcttagacaaccatcacgcttcttta CRISPR spacer cttttcgacggcttagacaaccatcacgcttcttta Protospacer .* *********************************
15. spacer 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ003637 (Listeria phage A500, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
acgagtatcagcgctaaaagagattgttaagcgcc CRISPR spacer acgagtatcagcattaaaagagattgttaagcgtc Protospacer ************..*******************.*
16. spacer 3.8|567190|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
acgagtatcagcgctaaaagagattgttaagcgcc CRISPR spacer acgagtatcagcattaaaagagattgttaagcgtc Protospacer ************..*******************.*
17. spacer 3.22|568095|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
tataaaatattgcccaatgtgcggaaggagtttgga CRISPR spacer tataaaatattgtccaatgtgtggaaggagtttggg Protospacer ************.********.*************.
18. spacer 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccttgctc Protospacer ****************************** *.*
19. spacer 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FW590615 (JP 2010534058-A/25: ANTIBIOTIC RESISTANCE FREE LISTERIA STRAINS AND METHODS FOR CONSTRUCTING AND USING SAME) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt CRISPR spacer ttataatccttaattccgtattgatttgctagtttt Protospacer *.****.******************.*********
20. spacer 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HI504184 (Sequence 26 from Patent EP2147092) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt CRISPR spacer ttataatccttaattccgtattgatttgctagtttt Protospacer *.****.******************.*********
21. spacer 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ417489 (bacteriophage U153 int gene for U153 integrase) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt CRISPR spacer ttataatccttaattccgtattgatttgctagtttt Protospacer *.****.******************.*********
22. spacer 3.22|568095|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
tataaaatattgcccaatgtgcggaaggagtttgga CRISPR spacer cattgaattttgcccaatgtgcggaaggagcttgga Protospacer .** .*** *********************.*****
23. spacer 3.18|567838|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
agaaaaaaaacatctttccaatttgttgttttgc CRISPR spacer agcaaaaaaacatctttcctatttgttttatcac Protospacer ** **************** ******* * *..*
24. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694189 (Marine virus AFVG_250M578, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer taataaaaaatgagggcttagaaaatgaaaaaatt Protospacer * *.*** ******.***************** *
25. spacer 3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013647 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C72-MedDCM-OCT-S41-C96, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
actttagagaaagaaaaacaagaaaaag----taaaactg CRISPR spacer tctttagaaaaagaaatacaagaaaaaagatttaaa---- Protospacer *******.******* **********. ****
26. spacer 3.24|568226|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019743 (Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
gtgtaattcttaattccgtattgattcgctagtttt--- CRISPR spacer gtgtaattcttactgccgtattgatt---taactctgaa Protospacer ************ * *********** **..*.*
27. spacer 3.3|566865|35|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
attaatgataagagcggaaagaaaactttcaaggg CRISPR spacer gaaattaaaaagagagcaaagaaaactttcaagga Protospacer . * *.* ***** * *****************.
28. spacer 3.18|567838|34|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
agaaaaaaaacatctttccaatttgttgttttgc----- CRISPR spacer aagaaaaaaacatatttccaatt-----ttttccaaaaa Protospacer *..********** ********* **** *
29. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448625 (Streptococcus satellite phage Javan738, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtatgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer * **** ****************.****.*
30. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448449 (Streptococcus satellite phage Javan356, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtatgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer * **** ****************.****.*
31. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448636 (Streptococcus satellite phage Javan749, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer gtctgaactatgaggacttagaaagtgaagacctg Protospacer *.**** ****************.****.*
32. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045037 (Lactobacillus mali strain LM596 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
33. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018177 (Lactobacillus hordei strain TMW 1.1822 plasmid pL11822-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
34. spacer 3.25|568291|35|NZ_CP032671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018181 (Lactobacillus nagelii strain TMW 1.1827 plasmid pL11827-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgaaatatgaggacttagaaaatgaaaaaaat CRISPR spacer ttaagaaatataaggacttagtaaatgaagttatg Protospacer ** *******.********* *******. *
35. spacer 3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP015030 (Pseudomonas putida strain KF715 plasmid pKF715A, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
actttagagaaagaaaaacaagaaaaagtaaaactg CRISPR spacer gaaaaagagaaagagaaacaagagaaagtaacaagc Protospacer . *********.********.******* *
36. spacer 3.11|567385|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018048 (Pseudomonas aeruginosa strain DN1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
actttagagaaagaaaaacaagaaaaagtaaaactg CRISPR spacer gaaaaagagaaagagaaacaagagaaagtaacaagc Protospacer . *********.********.******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
132197 : 138724
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP032671|132197:138724|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATCGGACCATATTTTTCTGCGTAATGAGTAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTACGACGAGCAAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATAATTGTTTCCTGTTTAGTGATGTTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCGTCCCATTTAAATAAAGACCTGGCAATTTGTAAGGCATTTTTTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGTGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAAATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACGTCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAACTCCATAATAATTGCCCTCCACATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTTGCGCCAATAGCACCGAATTGGTGACAATGTTGCTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTAATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCGCTTGGGGACAGAGAAAAAGGACTGTTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCAAGTGAGTACCGAGAATACAAACGAACTAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGTTAATTGGAGTATCGAGATCGTCTCTTGCGGAATGGAAGCGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGCCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGACGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCGCACAATTAAGGAGTGATAACATGCAGGTTTTAGTGTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAGCGATTTTTTGCGGATCTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACACTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGATATAATAAAGAGGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTAAATCAGATGGATGATTTATATCGCACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTACGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGAGCAGTATTAGAAATCGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACGTCATTTTACGATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACAAGAGGTTGTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTTTCATCCGTTGACATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATCAAATGTGGTCTCGACCGAATTTTACTTTCTGTTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTAAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAATGATAGATACGCTTATCCAAACAGGGTTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAGCTATTAGCGGTTGCGGGGCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGTGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGAGATCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAGAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTACCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAATTCGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCACGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGATAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTACGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGGGGAAAGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTGAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAGATGGCGATGGTTGTAGAGCGGCGGTTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAATCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAACTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCCGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGGATTGGTGGCATGAGTACAATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAAGCATCTAGGCGGTTTGATGTCATCTATTGGTGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTTGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCACTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGGCTTTATTACTAATATCTTTACGATTATCGTGACGATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATCTGGAATGCCATTATGACGACGATTTCCGGAATTATTGAAGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACGGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTGGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACCGTGGTAGATAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTCGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGCGTTGAAATCGGCAAAATACCACAATTAATTTCCGGTACAACAAGTTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTGGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGGGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCCGAGGTAGTTAGCCGTAACCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAATTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGCGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCCAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATCGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCGGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGCTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGACATGAATTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCGGAAAGAGCTCCAAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP032671|132197:138724|137905_138724_+|WP_003734720.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYRKELQKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NZ_CP032671|132197:138724|134343_134733_+|WP_003728212.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEMIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NZ_CP032671|132197:138724|136040_137909_+|WP_009928420.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKKHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIGFITNIFTIIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNAIMTTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTSFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NZ_CP032671|132197:138724|133207_133636_+|WP_003724946.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRLIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKPQPVQQEMIDVLAFHLDKTKDEIGALPASAIECQYEAFVINEAHN >NZ_CP032671|132197:138724|135305_135608_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NZ_CP032671|132197:138724|132655_132991_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >NZ_CP032671|132197:138724|133647_134064_+|WP_003728213.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADLERFRMITGLSKKPHLLRNGFLEEPQFEPVAFSARYNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK >NZ_CP032671|132197:138724|132197_132650_-|WP_003728215.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGTIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVTHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NZ_CP032671|132197:138724|134745_135258_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NZ_CP032671|132197:138724|135649_136054_+|WP_003740367.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISDNEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERGKVNGGF |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
700319 : 758410
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP032671|700319:758410|DBSCAN-SWA ATTATTTAACTTCTTTTATTCCGTAAACGCTTGATATTATATTATCTACATGTCTAGATTCTTGTTGTTCCATTTCGTCAATTATATGACTGTATGTTTGTAATGTAGTTGTAATTGAATTATGCCCCAAGCGCTTCGAGAGGTATTTAATATTAACGTTCTTAAACAATAATAAAGATGCGTGCGTGTGTCTTAAAGCGTGACTTGTAATCGAAGGAGTAATGCCGCTTTTTTCGCAGAATTTTTTTAAAGTCTTATTAACGGCATTGTTACTAACTACTTGAAAAGAATCGAAACTGCAAAAAACTAGATTGTGTTTGTTTCGAATGTTTTTCTTCAACTCGAATTTAGTTTGCTCTAATTTTATTTCTCGTAGTAGTTCAATTGTCTTTTCATCAATTGTAATAGATCTCTTGCTAGAAAAGTTTTTCGTGTCACTAAAGAACTTAGTATATTTATAATCCCACGTTTTATTTATGATGACACTTTTCTTTTCGAAGTCAACACAATCCCAAGTTAATCCTAACGCTTCGGAAAATCGACACCCGGTAGCTATTTGAAAGAAGATGATATTCCTTGATGTATATTCAACTTTGTGTGTATTCATCAAATTTTTAGTCAGGATAATTAATTGTTTTTCAGTTAAGAATTTCTCGCTTTCTTTTTGAGTTGGGGCGTTTCCTATCGCCCGAACGCGATACGTGGGATCTTTATATATTACCCCTTCTTGAACAGCGTCTTTTATACAAGCGCGCATATAAGTATGTTTCTTTTTAACCGTTGCAGTTGCTCTCTCTTCGCCGTATTTATTTAAAACTTCTTGATACTTTTTTCTTGTTAAATTTTTTAACTTTATTCCATCGAAATTTGCTTTAACAAAGTTTAGCGTGCTATTTATGTCAACGTCGTTTTCGATGCTCAATTTACCTTTTTTATAGATTTTAAACCATTCCTCGAAATAATCAGTGAATAAAGTTTCTCCTTCATCTAAATGAAATCCTTTGCTTAATTTGTTCTTTATTGCGCTTTCGGCAAGTTGAGCTTCCTTTTTAGTTCTATATTTTTTGTCGCTATTTATACGCCCGTATTTTCCGTTTTCTTTTTTAAAACTTATGCGGTATGACCAGTAATTTTCGCGTTTATAAACAGCCATTGAGGCACCTACTTTCAATCTTTATTTAGGATAAATCATTACGCTAGTGATAGTATCACCCATATAGTCCAAGTTTGATACATTGTAGATAATGTTATCCGCTGTTTTTTTTGCATCCTCTTTTTCATCTACTGCGTTCTTGATGAAATCTATAGTATCAGTTCCATCAATTGCTTTATTTAATATAACGTTTGTTGCAGCAACTGATAAAATGAAATTTTGATAATCTGTAAAAGATGAAATTGAAGCGTCGGAATTATTTTCTGAATAAGAAAGGCGTATGCTCATAATATTTTTTCCATCTAAAGAAACTGAAAAACCGTCCTGCTGATTTTTTGCTGAATCAACGCTTGGAATTTTGGTGTTTAATCCAGGATATTGTTCGCTTAGTTCATTGAATTGTTTTTCAAAATCATAGTATGCGATTAATTTACTTTTTTTAGGAACTTTTACTTTTGTAGTTGTCTTTTTATCATCTTTTTCAGATGTTACTTGATAAGTGGTGTCCGACAACATGCGAGGGACAACTAGAACAAAGTCACCTTCGCTATTTACGATATCGCTCTTTTCTCCAGATTCGTCTATCAGCGTTACTTTTGCTCCTGGATCAGTCTTACCGTTTACATTAATTACAAATTCGTCTTTTTGTTTTTCTTTGATTGAAAGTTCAGGTTCTCCGCATCCGAAGAGAAATACATTTAAAATAAGCACAAAGCCCAGAATCATCTTTTTCATTTAAGTTCCGCCTTTTCAAGAACGTTAGTTCTGTTTTTTTGATAAAAATAAAAATCATCCATACCGAAGTTCTGATAAAGAAGAACTTTGTAATAAATAATTGCGTATAGATAACATTCGATTTCTTATAATATTACTAGTAGTTGTAGGAAATAGTTCAAGTAAATCTTGCTCAATGTAATCAGATGAGAAATCTATAAAATTCAGCATGTGGTACGGAATCGATATGTACATTAAATTACGATTTGCGTTTGTTTCTTGTTGATTAACGGTTGCAACGTTCATTAATCGTTGATTGCCATAGTGTGTAATAATATGAACTAGCTCGTGATGAATTTTTTCAATAGACTGATCTTTTGATAATCCCTGCGCTAAAACAATACCCCCGTGATCAGCCAGTGACATCGAAAACTCACCTTTTACTATAAATAAATTTAGTTCAACTAATATGTTTTCAATCCCTAGATCGCAAGGCGTTAAAATGTTTTTTGATATTAAATAATCAGACAAGTATTTTTCGGACAAGCTAGGCTGGTAAACATCTAAAATATTCAATTATTCATCCCCTTGAAATTCTTTTTCGATTTTATCGATTTCCTCTCTATGCCTTTTAATGATTGAAATGTATTCGTTAACCTTTTGCAAATCCTCGTCTGTTAACCCTTCCAAGTTATCGAACGCTAAATTTTCAGGAATGAAAGAGTTTTCATTTTCTCTGCCTAATAAATAATCAGTAGGAACATTGAAAAAATCAGCAAGTCTTACTAGGGTATCATCCTTCAATGCTCTTTGGTCAGTTTCCCACATTGCGACAGAACTTGGAGAAACCTTTAATTTGTTTGCTAACTCCGTTTGGCTAATACCTGTTTTTTTTCTTAAAAATGCAATTCGTTTTCCTAAACTCACGATATAATCCTCCTCGGTGATATATTTATATTATATCTCACAAATAGTGAGTGTAAAGAGATAAATCGAAAAGTTCACAAAAAGTGAGTAAAATAATTGACACTCACTTTAAGTGTGTGTTATTATACTTACTGAGAGTGAGGGGTGAGAGTTATGAATCGAGTAAAACAAGAGCGAATTAACAAAGGGCTTCCTCAAACTGAAGCTGCTAAACTCATAGGGATTTCTAGTGGAATGCTTGCAATGATTGAAATTGGAAAACGGCGAGGGTCCGATGAAGTAAAAAAGAAAATAGCTAAATTTTATGGAAAGTCGGTTGGCTATCTTTTTTTTAATGAAACACTCACTTAGAGTGTGGGGGAGGGGTGAGAAAATGGCGACGCAAGAGTTAAGTGTAACGATACCAATTCCAGAATCACATGTAATTATTACTAAAACAGAATACGAAGAGTTGCTAAAACAAGAAATTGTTGGAAAGTATTGGGATTTAAAAGCATTGGAAAATAAAATTGGAAGAAAACGGGACTGGATAGAAGAAAAAATCCTCTACAAACCTAGTTTTAGAAGTATGTTAGACGTTGACGAAAATCCAGACGGTTTCGTGAAATATCCGTCGTCTGAAAATCGCAAATGGTCATTTCTTGCTAGCAAGATGAACGATTTTCTTGAAAATAATTTCCCGGAAATTATGAGGGGGTGATGGAATTGATCTTTGAAATAACGCTATTAGTTTTTGCGTTAGGCTCTGCAATAGCAACGTTTGCCGGAGCGCAAAAAAATAGCCCTACGCGACAACGTAGGACCGATAAATAATAAATTGTAATTCAATTATAACTTAAAAAAGCGCGACACGCAAGGAGGGCTTATTAGGCATGTCTGTAATCAACAATAACAATCTACTGATAAATGACTATCCGCTTCAAGTACTACCAGCATTAGCAAGGGAAATCGGTTTAAACGAAGCGATTGTTTTGCAACAAATTCACTACTGGTTAAACAAAAAACAAAATTTGATTGATGGCAAATATTGGACCTACGGAAGTGCAAAAAAATGGCAGGAAGAAAATTTTTCTTTCTGGAGCATGAACACCGTCAAGCGAGCTTTCACGTCTTTAAAAGAACAAGGTTTGTTAATAACAGCAAACTATAATAAAAGAAAATTTGATAAAACGGTTTGGTATTCCATTGATTACGAGCGATTGAACTTAGTAAGTCGGCGGTTAGTTCAAAGTGAGTTGACGATCGACCCAAATTGGGGCAATCGAACGGCCCAAAATGAGCCTACGATAGACCCAATTCGGGTCGATGCATTGGCCCAAAATGAGACAACCAATACCTTAGACTTAAAAGAGACTTCTAAAGAGAATAAAAAGAATACTGTCGAGAAACTCGACGACGCATCCGTTTTTAAAAATGTTATTGCTTTTTTAAACGAAAATGCAGAAACAAATTACAAACATACAACGAAGAGCACGCAAACGCTAATAAAAGCAAGACTAAACGACGGCTTTGGATTTGAAGATTTTAAAAAAGTAATCATCATAAAATGTAAGGAATGGAAAAATGATAGTTCGATGAATCAATATTTACGTCCAGCCACACTTTTTGGGACTAAATTCGAGAGCTATTTAAATCAAAAAGTAATTTCTGGGAATCGAAAAAAGCCTTGGGAAAAAGAAACAAAAAAAGAAGTATTGCCCGATTGGTTTGATAAAGATCAAAACCAAGTTGCTAAAAAAGAAAAACTGTCCGTTGAAGAAACTAAAGCGCTAGAAGACCAAGTGGCAGAGATAAAAGCGAGGTTGAACGCTAAAAAAAGTTTACACGGATGACAAAAAAGCATAGATTAAACAAAAATTTGAAGAAGCACAAACGAAACACAAACAAAATCAACGGAAAAGAGGCCTGAAAAATGAAAGAATCCGAAATGGACAAAGTGCGAAAAATGAATGTTGCGAAAATCAGACAATTGCAAAGTGAAGTGATAGCAAAAATAGAAACGAATTACGACGAACTTTCAAGAGATGAACGAAAGGAATTGCAAAATGATCTAAAGTTTTTAGAAGGCATTAGAGATTCTAAAAAAGGAATCACGGCGGCAAGTAAACTCCTAGCTTTTACAGTAGAGGAATATAAAGAACTAGCAAAGTCAAATTCGGATAAAAGTATTGCAGACGAACTCGGTGTTTGTCGTTCAACGTTCGCG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70 | Listeria_phage(60.53%) | capsid,terminase,tail,portal,head,holin,protease,integrase,transposase | attL 693025:693042|attR 756158:756175 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1178493 : 1185915
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP032671|1178493:1185915|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCTGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGGGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGAAGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATTAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAGAGTATGTCAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTTATAAAAAGCATCTCAGATAACCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATTGTGATGGTAGATAGTGATGATTATATTAGCAAAAACCTAGTAGAAATTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGACGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACTGATAAGCAAGAACGTAAAAACCTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGCAAACTAACAGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATATAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGTTTAACATCAGTCTTAGAACAAAATTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGACGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATTCGAACGTTATTTTGATTGATCAAGAAAATCAGGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGTCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTTACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAATACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCTTTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAGAAAAGGTAAATGTTATTCCTGATGTTGGTTATTATTGGCGCAGTCGGGAGGGGGGAGCAAAATCTATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAACATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAATGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACAACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTCGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAAGACAAAATACTTCGGATCTTAAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAAACTACCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTATTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAATTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGAGAATTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGCTTGGCTGAAGCACAATTAATTGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGATGACGAAACGTTTGCAGAATTCGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTACATCGGCGGTTGCGATTCGACGAGTAATGTTCGCGCTGGAAAGATTTTCGGTATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTATCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCGATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGTATTCGTTTAGATAGCGGGGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTGGATGAGGCTGGTTTTACAGAAGCGAAAATTTTTGCTTCGAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCAATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAAGATTCGATTAAACTTTCGAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACTCCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTAGCGGACGAATCACTCGAAAATGTGGATAAACTAACGATGTTCCACCCAGTTCATACGTATATTATGAAAACAGTCGAGAACTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCGATTTTCCAAAACGGAGAACTTGTATATGATATGCCTTCACTAGATGAAATTAAAGCATATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACAGTTCGTCCGGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAGGTACGTAAAAGTGTCCAGCTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACACGAAGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCAGAAACGGGTGACGATGAGTACCAATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGACCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCTTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTCGCTAAAGGTAACGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTACAATACGCAATTGCAGCGATGCATAAAGGCGTAGTAGTTGGAACCGATCACTCCGCAGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAGTACGGCGACGGTGGAACGGATATTAATCCACTATTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTTGGCTGCCCAGAACATCTATATTTGAAAAAACCGACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGTAAGGAAGTTCCAGCAGATGCTGCAGCAAAAATTGAGAACTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACTATATTTGACGATTTCTGGAAATAGGAGGCTGTTTAAATGAAAGTTGGTTATGGTTTATTAACTGCATTTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP032671|1178493:1185915|1179896_1180910_+|WP_003727001.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHSNVILIDQENQGVSAVRNNGVKVATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKYHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNVIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNECKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKQLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_CP032671|1178493:1185915|1178898_1179882_+|WP_003727002.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEEYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVEICLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKNLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_CP032671|1178493:1185915|1178493_1178877_+|WP_003730941.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKEVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NZ_CP032671|1178493:1185915|1182620_1183445_+|WP_003727000.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >NZ_CP032671|1178493:1185915|1183457_1183766_+|WP_003724634.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILLEAAEGLDDYNTCIQYIVSESETEPDTVFVSEIWVDKGHHAASLDNPAVQETIARAKPMIKEIKQIQELDILGGKGI >NZ_CP032671|1178493:1185915|1181118_1182609_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NZ_CP032671|1178493:1185915|1184358_1185915_+|WP_096929145.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVEKPNRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTITSKSCPIAGIADEERSLYGVQFHPEVRHSAYGNELLKNFALNICGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGEQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP032671|1178493:1185915|1183825_1184230_+|WP_009917597.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSATSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFLEKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELSIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMDAKNSK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1323374 : 1380207
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP032671|1323374:1380207|DBSCAN-SWA TTTATTTAGCTGCTTTACTCGCGGCAGAAATGACTGAAACTTGTTTCAAACCTTTACTAATAAGTCGTAAGATAACGAACCAAACAACAATGATTAAAACAATTTGTTTAAATGCAATTGCTGGAAGCGGATTGAACGGGCAATCCCAAATGAAATGTAAAGCAATCGGAATAATAAACCATTTCCAGAAAGTTCCTGTGAAAATGTGGTGCATTCCAAGTTTTTGATCACCTTTAGCGATAACAAGTGCGGCACCAGTAATAGCAGCCCAGGCAACATGGCCGCCGATAGACTGCCAACCACGGCTAAAGATAACATTGAGCATCGTTTCACCGGCAATATGAATATCTTTGAATAAAAAGGCAGCATCCACACTATAGTTAAACGCGTACCCAAGTGATTCAAATGCAGCAAATCCAGCCCCAACAGCGGCACCGATAAGTAAACCATTTAAAATGTACTTCGAGTTTAATGAACGAATGAAGAGAGCAACAATAATCATTTTCCCAGTTTCTTCAATAAAACCAACCAAAAGTGCATTAAAATAATTTAATTTTCCAACTGGAATAATGGAGTAAATAACAAGTGTTGCAACAAGCGCTGCTACACCACCGATAAAGAACATTCGCACTACGTCAAAAACGCTGATGTTACGAGGTGCATTCGTTTCGAAAAAGAATAATAAAACAGAAAACGGAACTGCAAATGAACCAATTACCATAAGGCCCGGTATTGTATTACTGTTATCAAACAAATATGTACATGCTAGAAGTAAAAAATACGTGACGATTAACACTAAGAAAACTCGGGAGAATACCCAAGGATGTGGCCAAGAATGAGGGATATCACTTATTGCTGGAGTAGTATACTTAGTACCAGCAATAAAGACTTTTTCGCCTTCTTCTTTAGAGTGCTTTTTAAAAACAGCAGAGAAAAGGTTGCTAATTTTTAATTCTGAATTCCCGTGGTTTCCAATATGTTGATATAATTCTGTTTGCTTAAATGCAATCCACTCTGGATGAGGGGATTTTTGGACCAATGTAAGATTATTAATCTCTTTCTTTCTATATAGAGCAATCATCTCTACATTTGTAAAAGGACCCATTTTCTGTTCGTTCTTTTTGAAGTACCATTCTGACAAATGAAACTCCCCCTTTAGCTTTTTATTTTGACTCTATTAATTATTCCCAAAAACGCTAAAAGTTAAACGAGCAAAGGAACTAATCGTTTATTTTCTTCGCTTGTTCATAAAGAAAATTAATCGAATCAGCTAAAAAAGCTGCTGCGGACTCATTTAGCGGTTGTCCATCTAAATTTAAATCATCCTCATATTTTAAATCTTCACTAATTTTAGTTATTCTTTTCCCAATATCTTTCTCATTTTGGAGTTCACTAGGAGCATAGGTTGGGATGCTTTGTTGGCCAAGTAAATAATCGACACTAACATCATAAAGTGTTGCAATTTGAGTCACCATTTCTAAATCTGGTTCCCGAATACCATATTCCCAATTGCCATAAGTGGAAGGTGCTTTTAAACCAAGCCTTCTAGCTGTTTCTGCTTTTGACCAACCTTGTTTTTCCCGTAATAAAGTAAGTCTGTTACTTAAATTTGGCATAATTTCACTCCTTTTTGTTTGATTATACAATATCTTACTCAGTTTAGCTACATTTTAACACATAACGTATTATTTTCTGATTGACATAGTCGTATTGTGTTGTTAGAATTGTATTAACAACTCAAATTGTGTAGATAAGGAGAAGATGACATGAAAACAGTAGACACCAGAAGAATTAATACAACAAAAATTCGAGAATTACGGTTGCAGCGAGGAATCACCCAAGCTTTCATTGCGCGACGGATGGGCTATAGGTACACATCAGGATACAGTAACATTGAAAAAGGAACTGTTAGACTATCACACAAAAATGCTGTTATTCTTAGTGAAATTTTAATGTGCGATTTGAAATTCTTTTATGAATAACTAGACTAGACACGGGGGAAAGATGTAAGATGAAAAGAATATCTTTTTAACAAATTATGTATGGATTTAATTTAAAATAAACGCACACAAAATGTGTGGAATTTGAGCGAAGGAGTAAACATCATGAGGAAAAAAACGTTAGCAGTGTTTCTTGTTTTTACGGTGTTAGTTGCGTTATTAGCGCCAACTAATGCAAGCGCATATACAAAACTTGGATATGTGATGACAAAGGCTAGTGCAAAAAATTTTAAAATTTATATTAACGGTTCGGCGAAAGGGTTTAAAAATATTATTATAAGCGGTGCGAAAGCTTGGAATCCTTCTCCTTACTTAAATACGGTTAGCATAGGAAATGATGTCAAGCCTAACTTTACGGTTAGTAGTTCGGGTACAAATAAGGGGAGTGTTTTGGCGGTCTGCAACACCACTTACTACAAATCAAATAAATTAATCTCCAAGAATGAGATCACTTTGTATAAAGGCTTTCGTTCACTTTCAACGAATCATAAAATAGAAACTATTGTGCATGAGTTTGGTCATGGCTTTGGCTTAGGGCACGTGAAAACTAAAAATGCAATTATGTTAGACAAAGGATTTATAAATAAAACAAAACCTCAAACAGACGATTTTAATGGCATCAAAGCTTTATATAAGTAAAAAGGAGGAATGACAATGAAGAAAAGAATAACAATGATTCTAGGTTTAGTATGTCTTAGTACATTAACTGCTTGTTCTAATAGTGAAAATGTGAAAGAAAAAACATCAGAAGAACCAGCAACAGCTCAAAACGGAGCAGAAACAATAAAGGCGCACAATGGGGTGGTCTCTTATCACGGAAAATACCTCAAACTTGCTGAAAATATGGATACCCTTGAAAAAGATGCCCCAATTATCATTAAAGCAACCAAAAAATCTGAAAAAACAACTGTAACAAAAGAAACAAAAGAAAATGTATTTCCAACCGATTTTTATACGATGAGCGATGTGCAAATAAATTCTATTGAGAAAGATACAACAGGAAAATTGAGCGAGAGTATGACTATTAAAGTGTTGGAGTATAGCGTAGAAAATGTTTTGGTAGAAGGGAAAGAATATGATTTAACTATTGATGGTTATAAAAATATGGAAAAGGGAGAAGAATATACACTTTTCTTAGAAAAAAATCCAGATGGTGAAAATTATATACTATCAAATGCAGTTATAAGTAAATTCCCAGTGGAAGAATTACCTGAAGAAGAATTGTTCTTAGATGGAGGGCAAACAACGGAAGAAACAGATAGCATTGAAGAAATTTATCAGGAGGTCTATCAAGAAGTTTTGGAAGAATTCGGTGAATAAAAAAGTTTAAACGCCCGTAAGACCTCGGTGTAAAAATCGAGGTCTAATTTTTTTGAAATAAAAATTTGATAAAAAATGAAGTTTAATCTAGACAGTTTTTCGTGATAAAACACCATAAAAGCCTCTTGACAGAACCAGACTATACAAGTAGAATGAATCAAACCAAATCAACATTTTTGCTAGAAATGGTTAGATTTTTAACAATAAGGGTAAATCCAGTTAGTATAAATAAAGCTTTTTCAACTAAAAGGAGATAAAACGATGAGTGGAAGTGGTGCTTTTTTTCCAATGAGTGTTAAAAAATTTCTGGAAAAAGGGATTACCTCGTTGTCCGAAGAAGAAAAAATGAGTACGCTACATTATTTGGAGAATGCGTATCATCAAGAGCCTTGCAACGAGGAAATTGTACATAGATTAATTCAATTTTATAATCAGACAGATAAAACGAAGAAAGCGCAAGAAATTGGACAAAACTTTTTGACGATGAATGGCTATGATAAGGAAATTCTTGGAGAGCTATCTGTAACATTTATGAAAGAAGATAATATGGATACGTACTTCACATTAGTTAGGCATTATATGGAAGAAGAAAAAAAAGAAGCAACGGAAGAAATAGCTGACAATGTTATTCCTTTTCCCAAACAGTTTGTCCCAAGAAGAGACATTCGTGAATTTGCGTCTTGGCATACGACGGAACAATTGGAGTTTTTACAAGAAGCTCGTTTCTTAGAAATAGATTCATTTTTGCCAGCTTTTAAAGCTTTTCTAGCGGATGATAGTTTTTCCCCGTTTGTTCAGTCGATGATTTTCGAATTAATGCAAGAAAAAGAAATAAATGAAGATATTACAGTTCAAAAAATAGATAAGCACGGTATTTTTAATCCAAGTCTTGTGCCAATGCTTGCTGATAACAAATTTGCGGAAGCTATTTTTGCTGGACTCGCTGAGATGCTCGAACATAGTAATCCAAGTCTTTTAGAGCAAGTGATTGGTATTATTCAGCAACATCTATTTATGCTTTATCCATTTGAATTAGAGCCTCAAGAAGTAGATGTTTGGATAAACGCATACTATAAATGGGCGAATGCAATGTACGGTAATTATTGTGTTATTTCGGATGATGTGAATCACTTAGCAGTAGAAGAAGCTATTTCCATTATTGAAGAGTTAGAAATTAGGCAGCAAAATTATTTTATATAATGATATTTCTTGTTTTCAAGTCAGGGATATCTGTGTTATTATTAGTGAGTATGGCTGAAACTTGTCATGAGAGTAATTAAATTGAACTAAATAGATGATGGAGGGAATTATACCATGTCAGTAAAATGGGAAAAACAAGAAGGTAATGTTGGAAAACTTACTTTTGAAATTGAACAAGAAAAAGTAAAAGAAGGTTTAGATAGAGCTTTCGTAAAAGTGCGTAAAACTCTTAATGTGCCTGGCTTCCGTAAAGGGAAAGTTCCACGTCAAATTTTCAATCAACGTTTTGGTGAAGAAGCTCTTTTCCAAGATGCGCTTGATATCTTGCTTCCAGAAGTATATTCTGCAGCAATTGACGAAGCTGGTATTGATCCAGTGGATACTCCTCAAGTAAACATTGAGTCTATGGAAAAAGGCGAAACTTGGGTTTTAACAGCAGAAGTTACTGTAAAACCTGAAGTGAAACTTGGAGATTACAAA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57 | Bacillus_virus(16.67%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1762917 : 1810369
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP032671|1762917:1810369|DBSCAN-SWA 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68 | Listeria_phage(95.08%) | terminase,plate,head,holin,integrase | attL 1762736:1762751|attR 1810531:1810546 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1943802 : 1952088
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP032671|1943802:1952088|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP032671|1943802:1952088|1946845_1949065_-|WP_009918191.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPKVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_CP032671|1943802:1952088|1950795_1952088_-|WP_003729814.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_CP032671|1943802:1952088|1943802_1944369_-|WP_003728224.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTHQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLVGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQVIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_CP032671|1943802:1952088|1949057_1949741_-|WP_003726212.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_CP032671|1943802:1952088|1949744_1949990_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_CP032671|1943802:1952088|1944365_1945415_-|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NZ_CP032671|1943802:1952088|1950001_1950715_-|WP_003726214.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAGAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP032671|1943802:1952088|1945433_1946861_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2623869 : 2631711
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP032671|2623869:2631711|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGTCCTACTTGTGCTGGTGTTTCCCCGCTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCTGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCTTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAGTCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGCCCAACGGTTGATTGGATATACTTGATATTATCGATTTGCCTAACAGCCGCATTAATTGTCTTGTTGAGATTCGCCGTTTCACAGTTCACTAGCCTGTTCACCGAATTCCGCATATCACGCATAATCCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCTGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCATTGAGATCGAATTGATTCATCAAAGCGCAAATCGCCTCATTGTGCTCCTCATAAACAGAGAAAATTTCTAAATGATAAGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGACCCACTTGCCAAAAAGGCTCCACGTAAATAAGCACGTTTGGCGCTCCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGTAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCTGACTTCAAGCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAACTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCTATTGGCACTTCGTATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATGGCTGCATTCTCGGTTTGGACATCCATTATCACTAATTGATTCGAAAACGAGATGGCACCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCAATAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAAGCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCAGCATGGCGCACAAGGCCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATGGCTTCTACGCCAAGCTCTTCCATTCCTTTGGCATTATGCTCTACTTGCGCAACATCCTCTGGGAATAAAAGTTCTTTCGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAAAGATTTTCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATATGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATGTTCGTAATGTATACTTTCGGAGCCTTGCTTGCTATAATTTCATCAGCTAATTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAAATACTTGTGTATAAACTCCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATATGGTTTTACATTTTCTGGTTCAATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAGATGAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTTCCAATAACATGCCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATATTGAAATAAATCGACAACCCGTGGATCAACATTGGATAAAGCTAGCATGACATTGCGTATATCACCTGGGGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACGGTCACAATGGCCGTTAAATGTATATCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATGACTGGAAGACCGGTCCCGCCACCGATTACTACTACTTTAGGTTTCGTTTCCTTTTTCATATTAACGGCCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGTGAAATCGTTGTTTCATATTTTTGTTGAATTGCCTTACCAACGAACTCTGTCAAAGCTACTGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGAAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACATATTCATACACATCTTCATCAAGTCCTGTCAGCGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGCACATCAAACACTAAATCAGCATCAATCGGAATGCCGTATTTGAAACCAAATGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGCTCGCGTAACTCACGTGGCGCCATATTCGATGTATTAATAACTAACTGCGAACGGCCTTTTAAATCACTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCGTCTAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGGATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGCGCTGGTTCAATGGAATCAAAAAACTCACGGCCGCGAAGATCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAGCTCCCAGAACTTTGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCGACTGTTTTTCCTGCTCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACAAATAATATCTATCTTCCATTTTAGCACACTTCTCACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGTTGCACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCGGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGCAAATGAATCGCTTCGGTTTTTCCAGTAGCAATCCAAGTTGTTTCGCTTCTTAAATAATCTTCCGCACGTTCCACGGGGAATCCACCCATACTTGTTGGTAGTTGCTCGCGAAAATTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCCGAGAACCATCCTTACCGCTTAAAGTTAAGGAAACTAGATCTTCTTTGTAATAGCCAAACTCAGCATAAATTTGCTCTAAATCTTCTAGTAAACTTCCACCTTCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCCGCAATCGCAAGCACCGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAACGGCTTAACCATATAACCATTACTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCCGCACCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACAATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCTGGCAATTCATTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCGCCAATTTGGTTTCCAGATAACACTTCATATTCGCCGTCAAGATTACGAACTGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGATCTGTTCCAACTAAAATGTCGCCACCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCGGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATATTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGGGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCTCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCCCCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGTGGGTTATGGCTAGCTGTAATAACAATCCCACCAAACGCATTTAAATGACGTACTGCAAAGGAAAGTTCCGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAGCTTTTCACACCATGATGCCCTAATACCGCCGCAGATTCAAAAGCAAATTCGCGTGACATATGACGAGGGTCATACGCAATTACTATTCCGCGCTTCTTAGCCTCGTCACCGTTCTCCGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATGCGGTTTGTTCCAGCGCCTAGTACACCACGCATCCCAGCCGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCCTCAAGTTCTTTTTCATTTGCTTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCGTCATGGTTAATCGCATCTACTAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGCACAGTTCGCTCGCCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACTATTTTCATGTTTTAAAATGAATGCATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGAAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTGTCACTATTAACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTTAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATCGCTTTTCGCTTCATAATCAAGCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATATTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGCTCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTACCGTCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATGCGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTATGGGGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGGGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTACCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACGTCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCACGCGCTTTATCACTTGAAGCAATTAACGTTCCTGGATCTCCTGCACGGCGTGGTACAACTTCAGCTGGAATTTCTTTACCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACTGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGGTTGAAAATATTACTTTCCCCGCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTTTAATATGCGCGTCAATTAAATCTTCTACTTGTACATAATCACGAATACAAGTACCATCAGGCGTATTGTAGTCGTCACCGTAAATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGGACTAAGTGTGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATTGAACCATCCGCTTTGGCGCCAGCAACATTAAAATACCGGAGTGCAACATATTTCATATCATACGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTCGTTTCGCCGTAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATCGGTACTCGTTCTGGCTCACCATATGTTGCAGCGCTAGAAGAAAAGACAATATGTTTCACACCAAATTGCTCCATCACTTCTAAGACAATTTGCGTACCATAAACATTATTATTTAAATAAACAAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAGTGAACCACACCATCTACCTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCCTTATCTCGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTTTATGAATGGATTCCTTGTGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCCCCTAATACTTGTCTTTGTCTTCCATTTTACACTACTCAAGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCCTAGACCCATTTGCACTTTTTACTATTATTTAGCTGCTTCAGCTTCTAATGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCGTTTTGTCCAGCAAGTCCGCCATCGCCTGTTGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCAGCTGCAAAAATACCAGGAAGGTTTGTACGCATTTCCTCATCTGTTACGATATAGCCCTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACACCATCCACTGGCATAATAGATTCGGAACCATCCACTGTGGAAACAAGTTTTGCTCCAGTTACTTTTTTGCCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTGAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCGCGCAATTTATCACGACGGTGTACTATCGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAATAAGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACGATTAATTCGCGATTTTTGAAGAACGCTCCATCACAAACAGCACAATAAGAAACGCCGCGTCCACTAAGCTCTTCTTCGCCAGCTGCACCAAGTTTCCGGTGTTCAGCACCAGTCGCAATAATAATCGCCCGAGCTTTATAGGTTTTCGATCCAGCCGTTACAGTTTTAAATTCTTTGCCATCAACGACTTCTTTAATGTCCCCATAAGCATACTCAGCGCCAAATTGTTTCGCACCGCTAAGCATCTTATCGGATAAATCGGGTCCTAAAATACTATCAAATCCAGGGTAATTTTCAACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCAGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCAGCTGTCATTCCAGCTGGTCCCGCTCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP032671|2623869:2631711|2625818_2626694_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_CP032671|2623869:2631711|2630751_2631711_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP032671|2623869:2631711|2628573_2629635_-|WP_003741152.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHAFILKHENSRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_CP032671|2623869:2631711|2623869_2624841_-|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NZ_CP032671|2623869:2631711|2626801_2628532_-|WP_003725409.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGDEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA >NZ_CP032671|2623869:2631711|2624848_2625817_-|WP_003731212.1|DBSCAN-SWA MKKETKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE >NZ_CP032671|2623869:2631711|2629651_2630635_-|WP_009918601.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVVHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP032671.1|WP_031641918.1|705024_705381_+|MerR-family-transcriptional-regulator |
705024_705381_+
Protein sequences of NZ_CP032671.1|WP_031641918.1|705024_705381_+|MerR-family-transcriptional-regulator>NZ_CP032671.1|WP_031641918.1|705024_705381_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKESEMDKVRKMNVAKIRQLQSEVIAKIETNYDELSRDERKELQNDLKFLEGIRDSKKGITAASKLLAFTVEEYKELAKSNSDKSIADELGVCRSTFADWKRKKNLVPWNNNVKGRNI |
118 aa aa | NA | NA | NA | 700319-758410 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032671 position: 731665-731630, mismatch: 1 cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccgaattg Protospacer ********************************.*** 2. spacer 3.10|567319|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032671 position: 730864-730828, mismatch: 0 agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc CRISPR spacer agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc Protospacer ************************************* |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP032671.1|WP_031641923.1|702260_702761_-|hypothetical-protein |
702260_702761_-
Protein sequences of NZ_CP032671.1|WP_031641923.1|702260_702761_-|hypothetical-protein>NZ_CP032671.1|WP_031641923.1|702260_702761_-|hypothetical-protein MNILDVYQPSLSEKYLSDYLISKNILTPCDLGIENILVELNLFIVKGEFSMSLADHGGIVLAQGLSKDQSIEKIHHELVHIITHYGNQRLMNVATVNQQETNANRNLMYISIPYHMLNFIDFSSDYIEQDLLELFPTTTSNIIRNRMLSIRNYLLQSSSLSELRYG |
166 aa aa | NA | NA | NA | 700319-758410 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032671 position: 731665-731630, mismatch: 1 cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccgaattg Protospacer ********************************.*** 2. spacer 3.10|567319|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032671 position: 730864-730828, mismatch: 0 agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc CRISPR spacer agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc Protospacer ************************************* |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP032671.1|WP_150969098.1|747061_747346_-|hypothetical-protein |
747061_747346_-
Protein sequences of NZ_CP032671.1|WP_150969098.1|747061_747346_-|hypothetical-protein>NZ_CP032671.1|WP_150969098.1|747061_747346_-|hypothetical-protein MEFMSMIVTGIVLAAIISGLSFVVGKFSGLSWFWIAFCANSGFFIIFITVQNSFPDNAAVALSYLNLGIGVVLIALTLFQSSNWLFKKTMQRKH |
94 aa aa | NA | NA | NA | 700319-758410 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.6|567060|36|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032671 position: 731665-731630, mismatch: 1 cttcctactttttgacataaaaaataagccgagttg CRISPR spacer cttcctactttttgacataaaaaataagccgaattg Protospacer ********************************.*** 2. spacer 3.10|567319|37|NZ_CP032671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032671 position: 730864-730828, mismatch: 0 agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc CRISPR spacer agtatcgccttcgctaggcgtttcgggcggcgtttcc Protospacer ************************************* |