Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044499 | Lactobacillus dextrinicus strain LH506 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas4,cas1,cas2,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,csa3,DEDDh,DinG,csn2 | 2 | 4 | 5 | 2 |
1. NZ_CP044499
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044499_1 | 121966-127865 | TypeI-A |
NA
Consensus repeat of NZ_CP044499_1
|
89 spacers
spacers of NZ_CP044499_1
>1.1|121996|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCTTCCTTCACCCATAAAAATTTTGTTAATATAG >1.2|122062|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGCTGAACGTAAATCAGGTCACTGGAAAAATCTA >1.3|122128|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTGCAAACAACGAAAACTTCGCAAACTCAAACGC >1.4|122194|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACAACTCTTACTAAAATACAATGAGGCAAAAG >1.5|122260|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAATGACACCATGACACTACCCGACAACCTCGA >1.6|122326|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATATGAATGATACTAGCTCGACTGGTTTTGGGTG >1.7|122392|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATCATGAAAGAATCGCTTCTTCAAGCGATGCAAG >1.8|122458|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTATCGTATGAACACAAAACTATATCAAACAAA >1.9|122524|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGTTGGTTTTCCAGAACTACCGTATAGCTGAAA >1.10|122589|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATATCAGTAAGTATGAAAACATTAACTGGACAA >1.11|122655|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAGAAAACGCTAATCATTTCGCGCGACGAATAAA >1.12|122721|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAGAAAACGCTAATCATTTCGCGCGACGAATAAA >1.13|122787|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTAAAGTGGAAAACGCGTTCCTTTGGAGCAAAAGA >1.14|122854|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAATGAGTTAGAACGATTTAAGACTGAATACAAG >1.15|122920|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGTTTCGCGGTATGCGTCTTGTATTTGCAAAATC >1.16|122986|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATCAATCGCTGGCGTGGAAGTGTCAGGGTCAAC >1.17|123051|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGATTTGTCAGTTGTCAAGTGGTTTTAAGAATGG >1.18|123117|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAAAAACTGAATTGTCGTGATTGGCACACCTTGC >1.19|123183|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCCAAGCCGTCATTTCAATATTGAAATATTGTTCC >1.20|123249|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACGAATTACGTTTATACGCTAACGAGGTTTACAAC >1.21|123315|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATATCAATAATTTTTATGTATTAAATCATAAAAA >1.22|123381|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGAAAAAGAAAACGCAAATCATTTTGCGCAACGAAT >1.23|123449|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTAGTACTCTTACTCCGGGCTGTGGCTAAGTT >1.24|123515|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAATTGTTGATTAAGCCAACCTTTTTCGATGCTTTC >1.25|123583|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTATCCAGATCATGCATAGTTTGATTGAGCTGCG >1.26|123649|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGGATAATCAATTCGTTCACGGAAAGTTGCACC >1.27|123714|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTGAAGCGTCACAATATTGCCAACGCGTCTATA >1.28|123779|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCGCAATTTGCAATAGAATTTGTGCGTTCAGAATA >1.29|123846|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTAAAAATGTCACCCCCGCAAATCACGAAGCGACA >1.30|123913|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTTCCTGATCCTTGATAATATTAAAGAACGTGAC >1.31|123979|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGATACTCAACATAGCGTAGTGGAAATGTTGAGC >1.32|124045|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTTGCGTTGTCCGTCCAAAATAATGGAGGCTT >1.33|124111|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCACAATCGGTGTAGTAACCTTAGACGTCATGGT >1.34|124177|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTTCAGACGGCAAAGTTGGGTTTAGTACAACT >1.35|124242|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACCTCGTATGCTGAAAAAGCGGGCGTTGAATTGG >1.36|124308|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACGTAATGATATGTTATCATTTGCCATTTGTTGT >1.37|124373|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAATACGTTCACAATGACACTCATATTTTATATT >1.38|124438|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTAGACCAAATCGCGAACCAAGTTGGAGCAGAC >1.39|124504|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAATCCGAAGCGTCAATACCTTGTTCACGATCTT >1.40|124570|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGTTGCAATCGTCGCATCACTTGATGTCCAAGTAAC >1.41|124638|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGAGATAATGATTTGCGTACGTCTTTACCAAACAT >1.42|124705|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTTCATACTTAGATGTGTTTCGCAAATCAAATTT >1.43|124771|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGGACCTGTCTTACCAGCTTGCGCGACTGAATAACC >1.44|124839|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGACATACAACATAGCTGATATTGACAATGGTTTC >1.45|124905|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGACGCGATTATTAAAGTAATCAAAAACGCGGGA >1.46|124971|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACACCAACGCGAATTGGGCAATTCCCGAACAATCA >1.47|125037|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGAAATGGTCTTTCGAACAATGTATCGAACAATT >1.48|125103|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATAAATTTTTGAGTTGGAATTTTTGTCGCTTTG >1.49|125169|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAATTCTTGTGCCAAATCAAAGAATAAGTTATTA >1.50|125235|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGGTTTCTCAAACATTATCTCAACGCCTGACGCTT >1.51|125302|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAACACGACCGGCGCTAGTGTATTGCCACAGGTCA >1.52|125368|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTTGTAGTATCTGATACATTCCAATCAGATTGA >1.53|125433|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATGCGACAAAATCGCCGGGCGATTTCACGCAATT >1.54|125499|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGGTTCGGACAAGCCGATTACGTTAAAGGGTTACA >1.55|125566|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTTGATACTGGCGAGCCATCAAAGCTAATGCC >1.56|125631|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCGTCAAGCTATGTACCATTTTGAAGACTTTGCA >1.57|125696|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTCCGCGCAATGGGTGATTATCAAGTCGCAACA >1.58|125762|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTATAATAAAATCTTAATTGAAGTTAAATAAAT >1.59|125827|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAACTTTGACCAGGTCTATCAGTGGTTACTCCAC >1.60|125894|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGTATCAATAACTGCGTATTCATTGACGTTATTAG >1.61|125960|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAACCCTGGTAGATTAGCCAAGGCACTACCCAC >1.62|126025|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGCAATATTAAGTGTACTCATGGCGACAGAAACT >1.63|126091|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACCAAGTTGAGCATTCTGCGGACTAACAATATC >1.64|126156|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAATCACCGGGCGCTTTCAGTCAGTTATGAACC >1.65|126221|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAAACATCTGAGTCACCTTGCCAATCTCTATGTT >1.66|126287|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGCTAAATTGTGAAGTAAGTACGGAACAACATT >1.67|126353|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGTGAGTATCAACTGACCAATCTACATCAGTAAA >1.68|126418|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCGATAAAATTAGCGGTTATAGTTTTTGGCAATC >1.69|126483|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAGAAATGCAACGTATCGCTGATGAGCAAGAC >1.70|126549|1222|NZ_CP044499|PILER-CR AACGGTAAAATCGCCAAACTGGTAGCTAATTTAGCGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTCGATTGGTGCGTCATCAGTTAGAAAGGCATGCCCAGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTCAGGACTTTTAACGTTTCTAACCTGAATAGCTGGTGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATATTGAACGTTGGTTAGGATATGACATCTTGGGTTGAGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATGAAGATGGTTCAGACCGCGTTTTGGGCTATGTAACTGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATACGACAGGCTGGGAAACAACAATTCCAAGCGTAACTGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATAAGCTTGCAAACTCAATAATCTCGTTGCGCTCGTTGGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATATTTAATGGATCAAATCGATAAAACGCCAAAAGAAAGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATAGACTACTCGTCATCTTTGAGTAATCAACGCCAAGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTCGGCAACACGAATACCAAATTCCTTGACCAAATCATGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTTTATTGCACGTTTCTTGCAATCTACCAACCAAGTTGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTCGGCAACACGAATACCAAATTCCTTGACCAAATCATGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTTTTTAAGGCTTCACCCATATCGCTTGCTTCAGCAGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATCATTTAGCGTCCTGAATATTAACGTAGACTCGCTTCGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATAAACTTAACAATGTGTTTATTGGCTTTTCGCCATTTCGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATAAGTTAATGAATTTCAGTAGCCGTGGTGGTCATAAGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATAGGATTTCTTTGATGCTATTTCAAAGACCGGTACGGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTTGAAGTTGTTCAATATCAATATTATCCACTCGATTGTTTTTATCTAAAGAGTATTGAATGTAAATTAGCTACCACCACTTCGGGGTTGGCGAATCCAAACAT >1.71|126549|35|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT AACGGTAAAATCGCCAAACTGGTAGCTAATTTAGC >1.72|126614|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGATTGGTGCGTCATCAGTTAGAAAGGCATGCCCA >1.73|126680|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGGACTTTTAACGTTTCTAACCTGAATAGCTGGT >1.74|126746|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGAACGTTGGTTAGGATATGACATCTTGGGTTGA >1.75|126812|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGATGGTTCAGACCGCGTTTTGGGCTATGTAACT >1.76|126878|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGACAGGCTGGGAAACAACAATTCCAAGCGTAACT >1.77|126944|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGCTTGCAAACTCAATAATCTCGTTGCGCTCGTTG >1.78|127010|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTAATGGATCAAATCGATAAAACGCCAAAAGAAA >1.79|127076|34|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGACTACTCGTCATCTTTGAGTAATCAACGCCAA >1.80|127140|37|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGGCAACACGAATACCAAATTCCTTGACCAAATCAT >1.81|127207|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATTGCACGTTTCTTGCAATCTACCAACCAAGTT >1.82|127273|37|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGGCAACACGAATACCAAATTCCTTGACCAAATCAT >1.83|127340|35|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTAAGGCTTCACCCATATCGCTTGCTTCAGCA >1.84|127405|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTTAGCGTCCTGAATATTAACGTAGACTCGCTTC >1.85|127471|37|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAACTTAACAATGTGTTTATTGGCTTTTCGCCATTTC >1.86|127538|35|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTAATGAATTTCAGTAGCCGTGGTGGTCATAA >1.87|127603|35|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGATTTCTTTGATGCTATTTCAAAGACCGGTACG >1.88|127668|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAAGTTGTTCAATATCAATATTATCCACTCGATT >1.89|127734|37|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGCTACCACCACTTCGGGGTTGGCGAATCCAAACAT >1.90|127801|35|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT CAGCTTCGGTAGTTCAACAATCAATGAACATTTGT |
csa3,cas4,cas1,cas2,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044499_1
The CRISPR arrays of NZ_CP044499_1 >merge|NZ_CP044499|1|121966-127865|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_CP044499.1|WP_057756555.1|113879_115379_-|D-alanine--poly(phosphoribitol)-ligase-subunit-DltA MITNIISAIDDIATKTPEQSAYDYLGTNYSYRELVQRANALAELLITKKLPAKAPIIVYGGQQFEMLVAFLAAVKTGHAYIPVDSHSAKERLLMIQDTAHAPLIIAIESLPMDLDIDVINLATIQQLTPVATLKDNLPVQGNDNFYIIFTSGTTGKPKGVQISHDNLLSFVNWLVSDFQWPQQPSVLAQAPFSFDLSVMGLYPTLVTGGTLKALPRAITEDFKQLFATLPQLELGVWISTPSLVEMCLLLKDFNSENYPNLTHFLFCGEELSHKTAATLLARFPEAHVYNTYGPTEATVAVTGVEITPAILEKYERLPIGHVKHDTHIAIKPVDHTEVGEILISGPSVSKGYLNLPEKTAAAFEKQANLQAYHSGDLGFFGEDDLLFYRGRMDFQIKFNGYRIELEEINFYLRQSPLIKQGVVVPRYNADHRVVQLIAIIAPNETTTSEKELTKAIKAELTDNIMPYMMPQRFVYRDELPLSANDKVDIKALIQEVNSQ >NZ_CP044499.1|WP_057756552.1|112668_113883_-|D-alanyl-lipoteichoic-acid-biosynthesis-protein-DltB MINLQPYSNPTYFAIILSGLLPVIIGLYYGKRLKIYESLISLVFLIFTFGGNHWHQGIALIGYTIFQVLLTIGYAHYRQQKKNQTSVFVTMIVLSIIPLAIVKLTPLFPANHGFNLGFLGISYLTFKTVQVLMELRDGTIKEISASQYLHFLLFFPTISSGPIDRYRRFLKDYENPPARDVYLQNINKAVFYLFQGFLYKYIIGYYLGTRLLPVVTHLALGQRLAFGGTGFSWYLLAYMYVYSLYLFFDFAGYSLFAISISYFMGIQTPQNFNKPFASHNIKEFWNRWHMTLSFWFRDFIFMRFTFWIMKHRWLKNRVRISQLAYLVNFLIMGFWHGVTWYYIVYGLFHAGAIIINDYWLRFKKKHQDKIPHNRFTEYFAIFLTFNVVCFSFLIFSGFLDKLWF >NZ_CP044499.1|WP_057756680.1|127961_128453_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRAITGGDINYYFVCQRKLWLSTHQVRFEAENERVQLGSVLDQESYQREHHQRMIDGVVAIDFIQNWKIVHEVKQSRAIEKASEFQLKYYMYYLKKKGIAIDQGVLDYPKLKERIELQLTPEDELEIDQVLHAIKTIINQDEMPPRTKKNICRSCAYQEFCFS >NZ_CP044499.1|WP_057756570.1|128475_129465_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MESYYLFSNGDLKRKDNVVRLTRQDGKYKDLKIELTRDIFLFGEVSMNTKCLNFLSQNNIPLHLFNYYGYYTGSFYPREANVSGKLLIRQVAAQTDKKKRLELAQKFVQGAARNCYRNLSYYHGRHKDVGEAMNQMKALIKLIPRTNDVQELMGVEGNLHAIYYSAWPAIFNIDTGFTTRVRRPPDNMVNTLLSFLNMLTYSVCLSEIYVSQLNPTISYLHVPSERRFSLSLDISEIFKPLLVDRLIFTCVNKQIVTESDFENGSNNCYLKQGAQRKILEQFDQKLKQTIMYEPLGRNVSYRYLIRLECYKLIKDLLHDEPYKPFTMGW >NZ_CP044499.1|WP_057756572.1|129470_129752_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVIIVYDISLENKGARVLNRVFKICKKYLTHVQLSVFEGELTPAKLTKLKAELNQYIRDDLDSIIIFTNQRSEWLKKEYLGQDLSEQTSAFF >NZ_CP044499.1|WP_057756574.1|130040_130793_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFTVELTLNSTKESILLAPGYQSSLVSLLKSALEVVNPEYFKDLYENGNPMKLYTFGVYFPNAKFTHEGVELEGENVKLIWNFSCIEPRMAMVFYNGILSIKQTVNQHPRRLIGSTLITDVKIHQINLPTITSNTITIRTLSPIVSRDHQAKDKDWFYSYKDPEFIQMLKRTMTTKYESFFGRLTPAIIDNFEVTPIQPKKNVVKSYEKWVECSAGVYVLKGQPELLELIRDGGLGSRTGLGFGMVEVI >NZ_CP044499.1|WP_057756576.1|130817_132197_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MEQAETIQFTMNDWLSNAGIVGLHNILANADLSPRENENVLSMDTTDLDDFAHYYFKFFLDQYQSLSSYAKIMAYQEKFNHWQQTDYEDFSAEDYADFKDYIQNTLKYYAKANSFKKIYPLVINHLDVIQATKELPKLINLTQKNNFKVKRPEIIELMKEISQQLKPIYDYFTAPDAKKYFPVLSTLYTVVNNTWTNISYFNRSNKEPDFYIAYEKTFVDPVREYLTIDHSKDKYHCSNCNRPVTKTDLSYTFLNDMGFDTARKTSNVWDFNNDLTICPICQLMYSCSSAGFNFIYGHGLFVNSNNNIDELISINRKINQEIWQSSDDKRQVTPYAAMIRTLTEQQLKDKEYVLDDVQVIEYENEHYRFNILPRNIVRLFKKDAASFNRLRGANYSLNGTRHYVYEEVADHVLNSQNLYLYVNQILKIYLSQPTAVFIQAEQVDALLKINHDFLEGMKN >NZ_CP044499.1|WP_057756578.1|132196_132526_+|hypothetical-protein MTEEKVTDSTAIADIRKQGYFLQKAYEGNNIKKVNGIALKLLDDLRANNRDLFMNRVLNSYMYANKPIPQFFDQIFDSDERFQEIGLAFTAGLIAVIPGKNEGKNKEAE >NZ_CP044499.1|WP_057756580.1|132525_133416_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MMNKKGLTATIIFIAESANYGESLGNIANLKKMTRGNGSQYTYISRQALRYNIVEQLDEPLAKLSQDGDNSKAVIQFDKNASVTDFPELDFFGYLKTAKESSGLKRSAKVRLSNAIALEPYLGDTDFLTNMGLAARLRAEKGNDANNSIAQSQIQRSYYRYTITIDLDQIGIDAVDGTNLDNAEKSRRVQKLLDTIAFLYRDIRGRREDLKPLFIVGGVYDIKNPVFENIVTVDKNSIKVKPILEAEESLPNETFTGVVSDQFDNDEQLKTELKAGTVGSVIKNLKQKVGDYYEGN >NZ_CP044499.1|WP_057756582.1|133402_134185_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAIRLKLYQETANYRLPASFDLKQSYPLPPYSTVIGMVHSLCEFTTYQPMKVSIQGKHFSRVNDLYTRHQFKPGVKFEVGRHQLKTSEGFGITSGPGHTEMLVDVNLLIHIIPEDQSLVPVIEKAFKAPIEYPSLGRREDLVKIDSCDVVEVEERELDADTAEDLNIDAQNSELSAYVPYELINGEDGLIDASKNSFTVAGTIFNLHKSYELVGIGKGKSKKYRRQWRNETVVYTSNFKVQPEESYLLDTDTNHIIFPV >NZ_CP044499.1|WP_057756584.1|134199_136560_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKFLAKSKDKAGHEETIVEHTNELLNQLAYLKTLYPQALSSEGWELLEVACVDHDLGKMNLKFQEKLQSHQTMLAGEIPHALLSITLLNRKQLESIYAKKDVSALYKAIAFHHYRDLSKYNSLDYKTERLKLNEMALKFPFSQIKSKHQLLLDPGETTPPPSKYFNLETRARNNDRFLNYDLYVMLKGLLNRIDYAASGHYDVEKPAGALQPALLKNTLQKWREHNPNADWNKMQRYVLEHRQDNLIIRAQTGMGKTEAALLWAADDKTFFTLPLRIAIDSIYTRLSTKVFTQKTAPDNIGKLDSDTDEFMLSLAGQMDSDELEVYGAQLKSWSLPLTITTLDQVFNFVYHYINFEMKLATLSYSKVIIDEIQMYDENLLAYIIYGLGEILRMGGHFMIMTATLPEFVVDLLCQNKDFRDVIEQTGQLPYKKPEPFIKNDAPLRHNIKIERNNINAEKILTVFDHNKVLVVCNTIQCAIKIYNEILTSGINKDKVHLIHSHFIHADRMKKQTEILEFGDIHTHDDGIWIGTQILEASLDLDFDVLLTELSELNGLFQRMGRCYRNRDTAPLGTNVFVFVGTDDIYPSGIKYVVDAGFFKLSRMFLMRQGDGPLNEATKMNLVETTYTTDNIKEYSSQYYQRLNKTMVYLQDIANDGKTKSEVDMLFRGIDSKNVIPQSVYVEHEETIRQAYEILTTPMRELSKNGNENPRNMKSAAIVTIKNFLVPISNYQYKKLKDNNRIDLDRLAKKQSNFHYLIADVPYDDEIGLQMPTINVNDFVNEYSNIF >NZ_CP044499.1|WP_057756586.1|137723_138842_+|hypothetical-protein MTKVGKELLMQLKEATGPFVTIMLNTPADHQGVEKAQLKFKNFAKEAKKRFEKKYPDANWESYQAKLDALATDQSFWRSASTSVAIFLTESDTLVHHLSIHTDDQYYVGDTPYLLAAIRNSQFNYTYYLLALNRDSMKLYFVDNEQISLVDLPDGAPIDVPTALGEETRDGSLSYTSQGRGTGSKEGVTYHGVNTKDEEVEIDWKNYYQAVDTFLRSDLDNEAGYPLYLFALPENQTMFKKYAKADFFSTDAAISMSPSTLTDNEIGEKAIPEIAKQLAEKEVTEYQDLLNGKFIEQLVDIVPMTEDGRVANLFIATSNLVDGYGEDPDAEYDRRQVLNTMTINALKNNGEAHILDQKAVPGEKSLLAVLRY |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044499_2 | 136755-137510 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP044499_2
|
11 spacers
spacers of NZ_CP044499_2
>2.1|136785|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTCCTTAGCTTAATCTTCATCAGTGTTTACTTC >2.2|136852|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGATTAAATCCGGGCAATTAAGGCGTCCAAAGAAC >2.3|136918|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCGTGACATTGAAGTTAATACGTATTCCAACATG >2.4|136984|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTAATCGATATTGAAACTGACGAAGAAGAAG >2.5|137049|37|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTGCCAAACACGATTGCCATATATGCCTTATCAGT >2.6|137116|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACGATATGCAACGCGTCACCGGTGCGAAAAACG >2.7|137181|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATGCTTTTTGGCAATCAGTGGTTGCTCAGTTATTG >2.8|137247|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAGTGTGCTTGTTGTAACATCACTTTTCTGAAAC >2.9|137313|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAGCATTTGAGCAGTGTCTGCGTCATAAATATTC >2.10|137379|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACCTCCTTATTTCTTTAGATAGCTATCTTTAAATC >2.11|137445|36|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT CTTGAACGGAGAATTGAGCAAATGCAAGATTGGGTT |
cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,cas2,cas1,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044499_2
The CRISPR arrays of NZ_CP044499_2 >merge|NZ_CP044499|2|136755-137510|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATAAATTTCCTTAGCTTAATCTTCATCAGTGTTTACTTCGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATATGATTAAATCCGGGCAATTAAGGCGTCCAAAGAACGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATTCCCGTGACATTGAAGTTAATACGTATTCCAACATGGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATAAAGTTAATCGATATTGAAACTGACGAAGAAGAAGGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATCCTTGCCAAACACGATTGCCATATATGCCTTATCAGTGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATAGACGATATGCAACGCGTCACCGGTGCGAAAAACGGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATCATGCTTTTTGGCAATCAGTGGTTGCTCAGTTATTGGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATTTCAGTGTGCTTGTTGTAACATCACTTTTCTGAAACGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATACTAGCATTTGAGCAGTGTCTGCGTCATAAATATTCGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAATTACCTCCTTATTTCTTTAGATAGCTATCTTTAAATCGTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAGCTTGAACGGAGAATTGAGCAAATGCAAGATTGGGTTGTTTTTATCTAAAAAGTATTGAATATAAAA >NZ_CP044499|2|3|136755-137444|PILER-CR GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AAATTTCCTTAGCTTAATCTTCATCAGTGTTTACTTC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT ATGATTAAATCCGGGCAATTAAGGCGTCCAAAGAAC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TCCCGTGACATTGAAGTTAATACGTATTCCAACATG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AAAGTTAATCGATATTGAAACTGACGAAGAAGAAG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT CCTTGCCAAACACGATTGCCATATATGCCTTATCAGT GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AGACGATATGCAACGCGTCACCGGTGCGAAAAACG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT CATGCTTTTTGGCAATCAGTGGTTGCTCAGTTATTG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TTCAGTGTGCTTGTTGTAACATCACTTTTCTGAAAC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT ACTAGCATTTGAGCAGTGTCTGCGTCATAAATATTC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TACCTCCTTATTTCTTTAGATAGCTATCTTTAAATC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAG >NZ_CP044499|2|2|136755-137510|CRISPRCasFinder GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AAATTTCCTTAGCTTAATCTTCATCAGTGTTTACTTC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT ATGATTAAATCCGGGCAATTAAGGCGTCCAAAGAAC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TCCCGTGACATTGAAGTTAATACGTATTCCAACATG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AAAGTTAATCGATATTGAAACTGACGAAGAAGAAG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT CCTTGCCAAACACGATTGCCATATATGCCTTATCAGT GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AGACGATATGCAACGCGTCACCGGTGCGAAAAACG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT CATGCTTTTTGGCAATCAGTGGTTGCTCAGTTATTG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TTCAGTGTGCTTGTTGTAACATCACTTTTCTGAAAC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT ACTAGCATTTGAGCAGTGTCTGCGTCATAAATATTC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TACCTCCTTATTTCTTTAGATAGCTATCTTTAAATC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAG CTTGAACGGAGAATTGAGCAAATGCAAGATTGGGTT GTTTTTATCTAAAAAGTATTGAATATAAAA >NZ_CP044499|2|2|136755-137510|CRT GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AAATTTCCTTAGCTTAATCTTCATCAGTGTTTACTTC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT ATGATTAAATCCGGGCAATTAAGGCGTCCAAAGAAC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TCCCGTGACATTGAAGTTAATACGTATTCCAACATG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AAAGTTAATCGATATTGAAACTGACGAAGAAGAAG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT CCTTGCCAAACACGATTGCCATATATGCCTTATCAGT GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT AGACGATATGCAACGCGTCACCGGTGCGAAAAACG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT CATGCTTTTTGGCAATCAGTGGTTGCTCAGTTATTG GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TTCAGTGTGCTTGTTGTAACATCACTTTTCTGAAAC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT ACTAGCATTTGAGCAGTGTCTGCGTCATAAATATTC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAT TACCTCCTTATTTCTTTAGATAGCTATCTTTAAATC GTTTTTATTTAAAGAGTATTGAATGTAAAG CTTGAACGGAGAATTGAGCAAATGCAAGATTGGGTT GTTTTTATCTAAAAAGTATTGAATATAAAA
>NZ_CP044499.1|WP_057756584.1|134199_136560_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKFLAKSKDKAGHEETIVEHTNELLNQLAYLKTLYPQALSSEGWELLEVACVDHDLGKMNLKFQEKLQSHQTMLAGEIPHALLSITLLNRKQLESIYAKKDVSALYKAIAFHHYRDLSKYNSLDYKTERLKLNEMALKFPFSQIKSKHQLLLDPGETTPPPSKYFNLETRARNNDRFLNYDLYVMLKGLLNRIDYAASGHYDVEKPAGALQPALLKNTLQKWREHNPNADWNKMQRYVLEHRQDNLIIRAQTGMGKTEAALLWAADDKTFFTLPLRIAIDSIYTRLSTKVFTQKTAPDNIGKLDSDTDEFMLSLAGQMDSDELEVYGAQLKSWSLPLTITTLDQVFNFVYHYINFEMKLATLSYSKVIIDEIQMYDENLLAYIIYGLGEILRMGGHFMIMTATLPEFVVDLLCQNKDFRDVIEQTGQLPYKKPEPFIKNDAPLRHNIKIERNNINAEKILTVFDHNKVLVVCNTIQCAIKIYNEILTSGINKDKVHLIHSHFIHADRMKKQTEILEFGDIHTHDDGIWIGTQILEASLDLDFDVLLTELSELNGLFQRMGRCYRNRDTAPLGTNVFVFVGTDDIYPSGIKYVVDAGFFKLSRMFLMRQGDGPLNEATKMNLVETTYTTDNIKEYSSQYYQRLNKTMVYLQDIANDGKTKSEVDMLFRGIDSKNVIPQSVYVEHEETIRQAYEILTTPMRELSKNGNENPRNMKSAAIVTIKNFLVPISNYQYKKLKDNNRIDLDRLAKKQSNFHYLIADVPYDDEIGLQMPTINVNDFVNEYSNIF >NZ_CP044499.1|WP_057756582.1|133402_134185_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAIRLKLYQETANYRLPASFDLKQSYPLPPYSTVIGMVHSLCEFTTYQPMKVSIQGKHFSRVNDLYTRHQFKPGVKFEVGRHQLKTSEGFGITSGPGHTEMLVDVNLLIHIIPEDQSLVPVIEKAFKAPIEYPSLGRREDLVKIDSCDVVEVEERELDADTAEDLNIDAQNSELSAYVPYELINGEDGLIDASKNSFTVAGTIFNLHKSYELVGIGKGKSKKYRRQWRNETVVYTSNFKVQPEESYLLDTDTNHIIFPV >NZ_CP044499.1|WP_057756580.1|132525_133416_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MMNKKGLTATIIFIAESANYGESLGNIANLKKMTRGNGSQYTYISRQALRYNIVEQLDEPLAKLSQDGDNSKAVIQFDKNASVTDFPELDFFGYLKTAKESSGLKRSAKVRLSNAIALEPYLGDTDFLTNMGLAARLRAEKGNDANNSIAQSQIQRSYYRYTITIDLDQIGIDAVDGTNLDNAEKSRRVQKLLDTIAFLYRDIRGRREDLKPLFIVGGVYDIKNPVFENIVTVDKNSIKVKPILEAEESLPNETFTGVVSDQFDNDEQLKTELKAGTVGSVIKNLKQKVGDYYEGN >NZ_CP044499.1|WP_057756578.1|132196_132526_+|hypothetical-protein MTEEKVTDSTAIADIRKQGYFLQKAYEGNNIKKVNGIALKLLDDLRANNRDLFMNRVLNSYMYANKPIPQFFDQIFDSDERFQEIGLAFTAGLIAVIPGKNEGKNKEAE >NZ_CP044499.1|WP_057756576.1|130817_132197_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MEQAETIQFTMNDWLSNAGIVGLHNILANADLSPRENENVLSMDTTDLDDFAHYYFKFFLDQYQSLSSYAKIMAYQEKFNHWQQTDYEDFSAEDYADFKDYIQNTLKYYAKANSFKKIYPLVINHLDVIQATKELPKLINLTQKNNFKVKRPEIIELMKEISQQLKPIYDYFTAPDAKKYFPVLSTLYTVVNNTWTNISYFNRSNKEPDFYIAYEKTFVDPVREYLTIDHSKDKYHCSNCNRPVTKTDLSYTFLNDMGFDTARKTSNVWDFNNDLTICPICQLMYSCSSAGFNFIYGHGLFVNSNNNIDELISINRKINQEIWQSSDDKRQVTPYAAMIRTLTEQQLKDKEYVLDDVQVIEYENEHYRFNILPRNIVRLFKKDAASFNRLRGANYSLNGTRHYVYEEVADHVLNSQNLYLYVNQILKIYLSQPTAVFIQAEQVDALLKINHDFLEGMKN >NZ_CP044499.1|WP_057756574.1|130040_130793_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFTVELTLNSTKESILLAPGYQSSLVSLLKSALEVVNPEYFKDLYENGNPMKLYTFGVYFPNAKFTHEGVELEGENVKLIWNFSCIEPRMAMVFYNGILSIKQTVNQHPRRLIGSTLITDVKIHQINLPTITSNTITIRTLSPIVSRDHQAKDKDWFYSYKDPEFIQMLKRTMTTKYESFFGRLTPAIIDNFEVTPIQPKKNVVKSYEKWVECSAGVYVLKGQPELLELIRDGGLGSRTGLGFGMVEVI >NZ_CP044499.1|WP_057756572.1|129470_129752_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVIIVYDISLENKGARVLNRVFKICKKYLTHVQLSVFEGELTPAKLTKLKAELNQYIRDDLDSIIIFTNQRSEWLKKEYLGQDLSEQTSAFF >NZ_CP044499.1|WP_057756570.1|128475_129465_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MESYYLFSNGDLKRKDNVVRLTRQDGKYKDLKIELTRDIFLFGEVSMNTKCLNFLSQNNIPLHLFNYYGYYTGSFYPREANVSGKLLIRQVAAQTDKKKRLELAQKFVQGAARNCYRNLSYYHGRHKDVGEAMNQMKALIKLIPRTNDVQELMGVEGNLHAIYYSAWPAIFNIDTGFTTRVRRPPDNMVNTLLSFLNMLTYSVCLSEIYVSQLNPTISYLHVPSERRFSLSLDISEIFKPLLVDRLIFTCVNKQIVTESDFENGSNNCYLKQGAQRKILEQFDQKLKQTIMYEPLGRNVSYRYLIRLECYKLIKDLLHDEPYKPFTMGW >NZ_CP044499.1|WP_057756680.1|127961_128453_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRAITGGDINYYFVCQRKLWLSTHQVRFEAENERVQLGSVLDQESYQREHHQRMIDGVVAIDFIQNWKIVHEVKQSRAIEKASEFQLKYYMYYLKKKGIAIDQGVLDYPKLKERIELQLTPEDELEIDQVLHAIKTIINQDEMPPRTKKNICRSCAYQEFCFS >NZ_CP044499.1|WP_057756568.1|120904_121780_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFYTIKELIEQSKAYPSVAELMIATEIDNTGRNKQEIRQLMERNLEAMEASINKGVAGVKSLTGLTGGEAKKMDDYLQAGNFLSGDLVVTAVRNAIAVNEVNAGMGLICATPTAGSAGVLAGVLFAIRDRLGLSHDQQVDFLFTAGAFGLVIGNNAGIAGAEGGCQEEVGSASAMAAAAAVLASGGTVEQASYAVAITLQNLMGLICDPVAGLVEIPCVKRNAMGASQAMVSADMALAGLTSVIPTDEVIEAVRRVGEQMPSAFKETAEGGMATTPTALRLKEEIWGTDDK >NZ_CP044499.1|WP_057756586.1|137723_138842_+|hypothetical-protein MTKVGKELLMQLKEATGPFVTIMLNTPADHQGVEKAQLKFKNFAKEAKKRFEKKYPDANWESYQAKLDALATDQSFWRSASTSVAIFLTESDTLVHHLSIHTDDQYYVGDTPYLLAAIRNSQFNYTYYLLALNRDSMKLYFVDNEQISLVDLPDGAPIDVPTALGEETRDGSLSYTSQGRGTGSKEGVTYHGVNTKDEEVEIDWKNYYQAVDTFLRSDLDNEAGYPLYLFALPENQTMFKKYAKADFFSTDAAISMSPSTLTDNEIGEKAIPEIAKQLAEKEVTEYQDLLNGKFIEQLVDIVPMTEDGRVANLFIATSNLVDGYGEDPDAEYDRRQVLNTMTINALKNNGEAHILDQKAVPGEKSLLAVLRY >NZ_CP044499.1|WP_057756588.1|138919_140035_-|DUF2974-domain-containing-protein MKNIINYLENFGPQTFAQMPFNELDATILAQLAYLDYTILERQPSYKFAAINDQKLLKSAIKQTWNPQANLKLLQALQKSRRYQNLKWHNWETKTNVKAEEQFSAVTLEFAPKQYFVAFRGTTSTLVDWKEDFNMTFLETIPSQKSALQYYQRMTRLHPGRFYIGGHSKGGNLATYAAIHSQGMAQQVLKGAYSIDGPGLKTPLPLTIKVKIHKFIPEASIVGLLLEPEANYQVVKSNGAGIKQHDPFTWQIKNNHFQLIAAPNELSQFTQHTVTNWLTSLDDATKQEFLDSLYTILKNIDADQIDNIEQNWLTTLKLLAPEILNSKNETKQQWRFVTNKLLNSIFAEAKIIIDTKRPHLEQLYSKQLKKH >NZ_CP044499.1|WP_057756590.1|140219_141629_-|C69-family-dipeptidase MIKRKKGSCTTILVGKDATIDGSTLIARNEDGAGPLDPQRFVVVNPNEQPKHYKAVLSPVELDLPDNPLRYTSTPEADLSSGIWAAAGINANNVAMTATETITTNSRILGVDPLTKDGLGEEDFVVITLPYINSAREGVKRLGALLEKYGTYETNGICFSDKDEVWYFESIAGHHWAAIRIPDDAYVVAPNRFNIAEFDFNSDDTMFAADLPELIEKYHLNPDRDQVNLRHIFGSATIKDTRYNNPRAWYGQKYFNPEFDTDPFDQDLPFICRTDKKISIEDVKFVLSSHYQNTVYDAYGSLGTAEEKKLLRPIGINRNQELHILQIRNDVPAEIAGIHWLAFGPNTFNAVVPFYANVTDTPENYKNTTTELNPNNIYWLTNIMALIGDSNFDLYEDEENIFEQNTVAACRHLQIEADQAYKSHTDIQAYLGDINNQMADLYQKNANTLLGQMLAFGEPKMNLKFQLHD >NZ_CP044499.1|WP_057756592.1|141924_142890_+|ferrochelatase MKKGILLVNLGTPEQPKAGPVRRYLRKFLGDRRVIDMPRVPWWLILNLMILPTRPKHSAELYQKIWSDEKGSPLLYYTQRQATQLQEKFPDQMVRYAMCYSKPFVPDILSEMMALGMEELTVIPMYPQYSQTTVAPVFDQVSDYFKDKANIPQIYFQQSFYREPLYIKYMANQIKAELAHEKYDKIIFSYHGIPQKYVKHGDPYPKQCDETTRQVMELIGDFPYLQTYQSKFGPSEWLTPATADIMKKLPQQGNKRILVLTPAFVADCLETLEEIEHENRDYFMKNGGEIFTYLHPLNDSPVFTDLLEKIVLDHETVKEHH >NZ_CP044499.1|WP_057756594.1|142941_143235_+|DUF1905-domain-containing-protein MAKNKVYQYTAVIKASEVGKGGAYVVFPYDIREEFGRGRVKVHVTFDGVPYDGSIINMGVKNPDGSICYIIGVRKAIREQLHKTIGDSLIVTVQEKA >NZ_CP044499.1|WP_057756596.1|143322_144798_-|UbiD-family-decarboxylase MSLEKWDLRKVLAELQQHDGQYHETDVEVDPDAQLAGVYRYIGAGGTVVRPTQEGPAMMFNNVKGFNDTRVLIGLMASRKRVGLMFHHDYQTLGQFLNEAVTKPVWPTMVEEKDAPAHEVIHRATDEDFDIRKLVAAPTNTPRDAGPYITVGVVAGSSMDKSKSDVTIHRMVLEDKDKIGIYIMPGGRHIGAFAEEYEKANQPMPITISIGLDPAITIGATFEPPTTPFGYNGLGVAGAIRQQPVELVKGITVDENAIARAEYTLEGYIMPNERIQEDINTHTGKAMPEFPGYDGDANPALQVIKVTAVTHRKENPIMQSVIGPSEEHVSMAGIPTEASILSLVERAIPGKVLNVYNPPAGGGKLMTIMQIHKENAADEGIQRQAALLAFSAFKELKTVILVDDDVDIFDMNDVIWTMNTRFQADQDLMVLQGMRNHPLDPSERPEYDPKSIRFRGMSSKLVIDGTVPFDMKDQFERAQFQEVPDWEKYLK >NZ_CP044499.1|WP_083479546.1|144978_145743_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MLQCEQRGDAGMFHNIDLKSLSELELDVYNYIISHPKQVQQLTIRQLASEAHVSTTTISRFCQKMNLSGFSELKYVIRDELHAEQHVYPSYDISTPLTDFFTKVSRDEFDQKIDQCVKMIQQAKLVVFVGIGSSGSLGDYGARFLANAGAFALSIKDPFQPSLRNDTDLSETLFIVLSVSGMTKEIIMRSGEYKQNGAKIVAITNHEHSPITTLADLTISYYMPERNAGDHVNMTTQVPVVYLLETMANRFAES >NZ_CP044499.1|WP_057756599.1|145924_147274_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MQNFINQRILPPVMKFVSTKPISALKNGMLYVMPFTIVGSIFLLLANLPVPAWSNWMASTGMVPYWNVAYNASFAIMALFAVIGIAFSYVHDEGYEGLPAGMIAATCFLMVMRPSNGVTIGEKVVATPAQMAQTTFIDRDWLGGKGMIAAILIGLIVGIVYSWFLKKNITIKLPDQVPPNVASSFTALIPATVLITGFMLIYLFFDKVTHSTMTEWIYKAIQTPLQGLTDSFGGMLAIAFLVPFLWFFGVHGATIVGGIMGPLLQANALDNQKILDSGKALTVANGGHIVTQQLMDQFMTVTGSGMTIGLVVFMVFFAKSEQWKTLGRLSLVPGVFNINEPILFAAPVVMNPILGVPFFLAPMTSAILTWVAMRLGWIPLFGGTLVPWTTPPIISGFLVGGIKIAIWQALMLVLTFFIYLPFARKQDQILSAQEHGENTEEIINEAEAK >NZ_CP044499.1|WP_057756601.1|147381_148812_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLRKDFLWGGAVAAHQLEGGWQEGGKGVSVADIMTAGANGVPRRITNGVLPGENYPNHEAIDFYGHYKEDVKLFADMGFKCFRTSIAWTRIFPNGDDAEPNEAGLKFYDDLFDEMHKYNIEPVITLSHFEIPYHLVTEYGGWSNRKLIDFFVKFAEVCFKRYQGKVKYWMTFNEINNQTNYDSDFALMTNSGLTVQPGEDMERTMYQASHYELVASALAVQKGHEIDPDNQIGCMIAMVPIYPLTSKPADIMMAEKAMQSRYWFTDVHCNGRYPSWMPVFFERHGYNLDITETDLDVLAEGTVDYIGFSYYMSNTIEDHDDSPEYHYVESNNHTKNPYLEESEWGWAVDPEGLRYGMNWFNDRYHLPQFIVENGFGAVDKIAEDGKIHDDYRIDYLRRHIEQMKLAVEYDGIDLMGYTPWGCIDLVSAGTGQMSKRYGFIYVDKDDEGNGTLARSPKDSFYWYKNVIASNGDEL >NZ_CP044499.1|WP_057756682.1|148938_150036_-|cation-transporter MNMIKSILKDRLLQITAVLAVLSLIMARPRLADINFDTLWSLTAMMILIQIFNYLHILDYCAYRLTGYANNTRQLVWLFLALGFVSAMFLTNDVAVLTLVPLYLYVAKQYKLPEILPVTLITMAANLGSAITPFGNAHNIFVLAKFHVSAMHFFSWTIPIAIFSVVMASAYTFILKPTPIDHISTQKIYIPPRPTILAIIAALIVFAGVLGFIPSWVGTIVTAVLATALKPNIMSKVDYATILTFLGFFIIVSDVSQNAIVKTTIASLVTTPSSVYFGAIGVSQFISNVPTTVLFAKFTHHVAALLYGANIGGLGTLVGSMANLLAFKQYTRYGTIDSRKFLIRFTALNLLTLAIFTLFGWFVIK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044499_1 | 1.9|122524|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122524-122558 | 35 | NZ_CP044499.1 | 893027-893061 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP044499_1 | 1.40|124570|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 124570-124607 | 38 | NZ_CP044499.1 | 892043-892080 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.9|122524|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 893027-893061, mismatch: 0, identity: 1.0
atcgttggttttccagaactaccgtatagctgaaa CRISPR spacer atcgttggttttccagaactaccgtatagctgaaa Protospacer ***********************************
2. spacer 1.40|124570|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 892043-892080, mismatch: 1, identity: 0.974
acagttgcaatcgtcgcatcacttgatgtccaagtaac CRISPR spacer acagttgcaatcgtcgaatcacttgatgtccaagtaac Protospacer **************** *********************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044499_1 | 1.56|125631|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 125631-125665 | 35 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 31342-31376 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP044499_1 | 1.85|127471|37|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 127471-127507 | 37 | NC_020305 | Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 plasmid unnamed, complete sequence | 26578-26614 | 8 | 0.784 |
| NZ_CP044499_2 | 2.4|136984|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 136984-137018 | 35 | NC_019401 | Cronobacter phage vB_CsaM_GAP32, complete genome | 183789-183823 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP044499_1 | 1.4|122194|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122194-122229 | 36 | NC_030925 | Bacillus phage Shbh1, complete genome | 48294-48329 | 9 | 0.75 |
1. spacer 1.56|125631|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tgcgtcaagctatgtaccattttgaagactttgca CRISPR spacer ttcgtcaagctatgaatcattttgaagagtgtttt Protospacer * ************ *.*********** * * .
2. spacer 1.85|127471|37|NZ_CP044499|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_020305 (Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
aaacttaacaa--tgtgtttattggcttttcgccatttc CRISPR spacer --atcatacaatttgtttttattggctttacgccatttc Protospacer *.. **** *** ************ *********
3. spacer 2.4|136984|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019401 (Cronobacter phage vB_CsaM_GAP32, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
aaagttaatcgatattgaaactgacgaagaagaag CRISPR spacer aatgtgtgaagacattgaaactggcgaagaagaag Protospacer ** ** . **.**********.***********
4. spacer 1.4|122194|36|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_030925 (Bacillus phage Shbh1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atttacaactcttactaaaatacaatgaggcaaaag CRISPR spacer attgacaactcttactataatacaatatagtgtaat Protospacer *** ************* ********. .*.. **
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
390263 : 399185
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044499|390263:399185|DBSCAN-SWA GATGGAATTAAGTGAAATCAAAAATCAATTAAATGCAGCTAATGCCAAAATAAAGCAGTTCAGGGGGTCTCTTTGACTTCGATGCCTTAGAAGAAGCGATCGCGTTAAATGAACATAAGATGGTTGAACCAGATTTTTGGAATGATAGTGAAGCTGCCAAGCAACTAATTGCTGAAAACAATGGCTTAAAAGAAAAGTACGATAATTTCAAACAATTAGTAACGTCTGCTGAAAATATTGAAGTGAGTCTAGAACTACTTCAAGAAGATGATGACGCTGATTTGCGTCGTGAAGTAGAAGCTGATGTTACTAAATTACAAGAGCAGTTACATGCATATGAATTGAGTCTTTTATTGTCTGAACAATATGACGCTAATAATGCTATTTTGGAAATTCATCCTGGTGCTGGCGGCACAGAATCCCAAGATTGGGGCTCAATGTTGTTACGTATGTATCAGCGCTGGGCAGCTAGTCATCATTTTACAACAGAGATTGCTGACTATCAGCCTGGTGATGAAGCTGGCTTAAAGAGTGTCACAATGATGATTAAAGGCCATAATGCTTATGGCTTGTTACGTTCAGAAAATGGTGTCCACCGACTGGTGAGAATTTCACCATTTGATGCCGCTGGACGTCGGCATACTTCCTTTGCGTCAGTGGAGATTATGCCGGAACTGGATAATAGTATTGAAGTTGAGATTAATCCTGATGATTTACGTGTGGATGTCTTCCGTTCTAGTGGTGCCGGCGGTCAGCATATTAATAAGACTTCGTCAGCGGTTCGCCTGACCCATTTACCAACTGGGATTGTCGTGAGTTCCCAAGCGCAACGGTCACAATTACAGAACCGAGAAACAGCTATGAGTATGCTGGAAGCTAAGCTTTATCAATTGAAGCAAGAAGAACAACGCAAAAAAGAAGCAGCGATTAAAGGCGTACAAGCAGATATTGGATGGGGTTCGCAAATTCGTTCTTATGTCTTTCATCCATATACAATGGTTAAAGATCACCGGACCAATTACGAAACCGGAAACGGCCAAGCTGTTATGGACGGCGATATCGATGAATTTATTTATCATTATTTACAATGGGAATTACAACAGAAGAATCCCGATTAGTTAGATGAGGTGAGAAAATGACGGAAAATAATGGCACGATCAAATTAAAAGAGGTTACAAAGAATTATCCTAATGGTGTCGCGGCGTTGAAAGATATTTCGTTAACTGTTCAAACCGGAGAGTTTGTTTATTTAGTTGGCCAAAGTGGTGCTGGTAAATCAACGTTAGTTAAATTACTATATCGCGAATTAGTCCCAACTAGCGGCGAAATTACCGTTAATGGCTTTGATCTGCAACATTTACGAGAGCGTGAAGTTCCCAAGTTACGCCGGACACTAGGTGTTGTTTTTCAAGATTTTAAGCTGTTACCTAAAATGACCGTAGCTGAAAACGTTGGCTATGCTTTGCATGTATTAGGGAAAAATAACGATGAAATTCGTAGTGCTGTTACGCAAGTATTAGCAGAAGTTGGCCTAGAAGCCCAAGCTGATCATTTCCCTGATGAACTTTCAGGTGGTCAGCAACAGCGTATTGCCATTGCACGGGCAATTGTTAATTCACCACAAATTGTGATTGCAGATGAGCCGACAGGTAATCTTGATCCCAAAACTTCAGCGGGAATTATGACGATTTTCCAACGAATTAATGATCGTGGTACGACGGTAATTATGGCAACACATAATCAACAAATTGTTGACGAATTACCTCATCGTGTGGTTGAAGTAGTTGATGGTCAAATCGTTCGCGATGAGGAAGGAGGTCAATATACTCATGAACTGGACAACAATGCGTAATCATTTGCACGATAGCTTTAAAAGTATTTGGCGAAATGGCTGGATGGCTTTTGCAGCAATTAGTGGCGTTGCAGTTACTATTTTATTAGTTGGTATCTCCTTGGCTTTGGTCTTTAACGTGACTAAGTTATCTCATGATGTTGAAAACGATGTGCGCGTGCAAGTTTCAATTGAACCTAAGACAACGGATCGGCAAGAGGCAGCTTTAAAGGCACAACTACAAAAAATTAAACACGTTGATCAAGTGACATTTTCGTCAAAAGAAAACGAGTTGAAAAAGGTAGTTCGTCAATATGGCAACTCTTTTGAAATGTTTAATGGCGATGATAATCCGTTAAGTGATGTCTTCGTTGTACGTGCAACTGATCCAGAAAAAACAGTGGCTATTGCTAAGCAAGCCAAAAAATTAGATCATGTGGCTCGAGCTAATTATGGCGGCACTCAAACTAAAAAATTATTTAAAACAATGAATGGTATTCGTAATTGGGGGATGGCTTTTTCCGTCTTATTATTGGTTGTGGCTATTTTCTTAATTGCGAACACTATCAGAATTACGATTCTGTCGCGACAAAATGAAATTGAAATTATGCGTTTAGTTGGCGCGACGCGCTGGTATATTCGCTGGCCTTTTATCCTTGAAGGTGCTTGGACAGGCTTATTAGGGGCTATCCTACCTTTAGTAATTATCGATTTTGGCTATGTATCTGTTTATAACGGTGTGGGGCAACAACTAACGACTTCTGGTTATCATTTGCTGACACCAAATGCATTACTCTTACCTTTAAATATTGCTTTAATTGTGATTGCCATGTTAATTGGTTCATTGGGCGCAGCTGTTTCAATGCGACGCTTTTTAAAAATATAACCTTTTAAAAACCAACCGATAATTTTGTCGGTTGTTTTTTTTATTGCTGTTGATTGAACGCGAAGAAATACAGGTGATCTGTGGCTACAAGCGGACAATGCCAGTGCCAGCATGCTATACTATAGATTAGATAATTGTATATAAGACAATCAAATTTGGCTTATTGCAGGTAAAAATTTCAAGGGGTTTAGTATGAAGAAGATATTGGTTGTTGACGATGAAATGGCAATTCGACAATTGATTACTTATAATCTCCAACATGCAGGCTATCAAGTTGAAGAAGCGGCTGATGGGCAACTGGCCTTATCAAAGGCAGCTACAGGTGAATTTGATTTTGTTGTTTTAGATTTAATGCTACCTAAACTTGATGGTATTGAGGTAACCAAACGTTTGCGAGAACAAAATATTGAAGTGCCGATTTTAATTTTAACGGCTAAGCATGAAGAAGCAGATAAAATTATTGGCTTGGAGTTAGGCGCCGATGACTATATGACTAAACCGTTTAGTCCCCGTGAGTTATTAGCACGAGTCAAAGCCATTTTAAGGCGCAGCGAGTCGATGGCCACCACTAAGGCAACGGTTGTTTACTTTGGCGATGTTAGTTGGGAATTAGACCGTCACCATTTGGTTAAAAATGGCAGTGATTTGAATTTAACGAAGAAAGAATATGAGTTACTCAAGTTTCTCGTTGCCAATCGGCAAAAAGTTGTTACACGCGATCAAATTATGACGAATGTTTGGCAGACACAAGAAGCAGTTATTAGCCGCATGGTTGATATCCAGATTAGTCATTTACGCGATAAAATTGAACCGGATCCTAAGCAACCACAATTTTTATTAACGGTGCGCGGCTATGGATACCGTTTGGAGGTAAGTCACATTGAAAAATAAATCATGGGTACGTCGTTATGGTTTAGGATTACTAGCGGTTGGTTTTTACGTTTTAATTTTAATTTTTGTCAATCGCTTTTTAGTAACCAATCAAAAACAAGAAATCAAAAATTTCGGTGCAGAATATCAAGCAGAAGTTTTAACCAAAGATCATGAACAAACATTAGCTCGTTGGCGCAAAAACTTTAAGTTGTCAGCGATTGATTTACCAGCAGAGGGTAGTAGCGAGTTAGCGCGAGTTGCGAAGAATGCCGTGGATCACAATATTGTGAATTCAACCAAACCATTCACTAAAGTTCAATACAATGGACAAACAACTTGGCTCTATTTGGTCAGTGATCCTAAAACTAATAAAGGTCAGGCTGTTTTAATTCAACCCGCTACAACCGTACGCACCCATTATTTAAAGACGTGGATTGGGTTTACCGTTATTTATTTATTAATCTTGGCAGCGTTAGGTTGGTTCATCGTTCGCCGTCGGCAACAATTAACACAAAAGTTGGCTCAATTAACTGAGAATATTAAAGCAGTAGAAAATCATCAGGAACCAGAGTCGGTTATTTTAACTCCAGATGATCCATTGTTTGATTTATCAGTGCAAGTTAATGAATTAGGAACAACGTTAAATTCGCAATTACGGGATGCTAAACTTCAAGAACAAAGTTTACGATCGTTAATTGAGAACTTGCCGCTAGGGGTAATGTTAATTGACGAGTCTGGTCAAGTTGATATGGCCAACCATGCATTAGGCGAGATTTTAAATACACCAATTTGGCCGGATCAGCTTGCTACCTATGTTGATTACGTTAAAACTTATGCCTTGAGTCGAATGATTGAGCATGCGTTACGTGATCCATTAAAGCACACACATCGGCGGCAAGATATTCAATTAGTTGGCGATGATGGTCGTTTCGTTGAGGCTGATGTTATTTCATTGGTGAACCAAGATGGCGACACGCCTAAACAAAAAGTTTTAGTAATGTTATATGACTTAACTGAGATTAAGCAAAACGAACGCATGCAATTAGACTTTGTTTCCAACGCTAGTCATGAGTTGCGCACACCAGTTACCTCCATTGCCGGATTTGCAGAAACATTACTAGCAGGTGCTAAGGATGATCCTCAAAAATCAACTGAGTTTATTCAAATTATTCGGGATCAAGCGCAACACTTAGAGGCTTTAATTGCTGATATTTTATTATTATCAAAAGCTGATCAAGCTCAACCGTTAAGTTGGGAAGCTGTTGATGTTGACGAGCTTATTCTAGACGAAGAAAAATCACTACAGCAACAAATTGCCGCTAAATCATTAGAAGTAACACTTGATCATCAACACTACCAAGCACCAACTTTTACAGATGTTACTAAACTTCGCCAAATTGTTCGCAATTTGTTAACCAATGCAATTATGTATAATCATCCCCAAGGTAAGATTCAAATTACCTTACAAACAACTGCTGATACTTTGAAGCTGGCGTTCAAAGATACTGGTGATGGTTTAACCACAGAAGATCAATCTCGCATTTTTGAACGCTTCTATCGTGCAGATCATTCTCATCAACATGATAATGGTGGAACCGGGTTAGGCTTAGCAATTGTAGCTAATCTAGTTGAGCAACTTGGCGGTCAAGTTCAGGTTAAGAGTCAGTTAGGTGTAGGTAGTATCTTCACTGTTGAATTACCATTGAGCCAAGATAATGACCAATAAAATTTAAAGATATTGCAAATTATCACTAAAATTTACAATACTTTTACATTAAACGGGTCTTTTTGTTACATGACATCCATATACTGGTAAGTAGTTACTATGGAGGAATGAGACTTGAAAAAGAAATGGATCTTGTTTTTAGGTTTAATACCATTTGTATTTTTACTTTCAAGCTGCGGTTTGAAACAATCAGGACAGTCAATTACAGCAGTTGGTTCATCGGCGTTACAGCCATTAGTTGAAGCTGCTGGTGATCGTTATACTGAAGACCACGCTGGTGAATTTATTAATGTTCAAGGCGGTGGCTCCGGTACAGGTTTGTCACAAATTCAAGCTGGCTCTGTTGAAATAGGTAATTCTGACTTATATGCAGAGCAGAAGTCAGGTATTGATCCGACAGGCTTAGTTGATCATAAAGTGGCCGTTGTTGGTGTAACACCAGTTGTGAATAAAGATATTCCAATTAAAAATCTATCGACAGATGAATTAGCACAAATCTTTTCTGGTGATATTACGAACTGGAAGCAATTGGGTGGGCCAGATCAGAAGATTGTTGTGATTAACCGTGCTCAAGGTAGTGGTACACGTGATACTTTTGAGCGCTGGGTAATGAAGGGCCGTAGTACCGTTCAGGCACAAGAACAAGACTCGACCGGAATGGTACGTCAGATTGTCGCTTCAACACCAGGTGCTATTAGTTATATGGCTTTCCCATATGTGGATGACACCATCAAAACAATTAAAGTTGATAATGTTGCACCAAAAGATAAAAATGTAAAAACTAATAAGTGGAAAATTTGGTCGTACGAGCACATGTACACAAATGGCAAACCGACTGGGTTAACTGCACGATTCATGGATTATATTTTATCTGATAAAATCCAAGATGAAATTGTGGCTTCAATGGGCTATATTCCCGTTAAGGATATGAAGGTTAGTCGTAATTTAGCAGGAAAGGTGGAGACAATTAAATGAACAATGACGAAATTCGGGCCAATCTTTTAAAACGTTCCCGGGCTAGTAGAAATGAACGCTTTGGTAAATTGATCTCTGGCGCCTGCATTACGATTATTATTGCAGTCGTTGTTTCAATTTTTTATTTTGTAGCTTCTAAAGGTTTAGCAACCTTCTTTGAAGATAAAGTTAATTTATGGAAGTTTTTAACGGGCACAATTTGGAACCCATCAGCTAAAGACGCACAAGGTAATCCTCAAGTGGGAGCTTTACCAATGATTGTTGGTTCATTTTCGGTCACTTTTTTAGCGGCGATTATTGCAACACCGTTTGCAATTGGAGCAGCGGTCTTTATGACTGAAATTTCACCACGCCTAGGTAAAAAAGTTTTGCAACCCGTAATTGAATTACTAGTTGGTATTCCATCAGTTGTTTATGGCTTTATTGGTTTATCTGTTGTAGTTCCTTTTGTTCGTCATACATTTGGCGGTAGTGGGTTTGGTATTTTGTCTGGGACGTTTGTATTGTTTGTCATGATTTTGCCAACCGTTACGTCAATGACTGTTGATGCGCTTAAGAGTGTACCACGCGCTTATCGCGAAGCTTCGTTAGCCTTAGGTGCTACGAGATGGCAGACGATTTATAAAGTTGTCTTAAGAGCTTCAACTTCGGGAATTATCACGGCCGTTGTCTTCGGAATGTCACGAGCTTTTGGTGAAGCATTAGCTGTTCAGATGGTTATTGGTAATGCGATGTTGTTACCACAAAACTTAATCTCACCAGCTTCAACATTAACCAGTGTCTTGACGATGGGCATGGGTAACTCAGTTATGGGTTCATTAAGTAATAATGCGCTTTGGTCATTAGCACTATTACTGTTGATTATGCCATTAATCTTTAATATCTTGATTCGTTGGATTGGTAAGAAGGGGGCAATGCGTTAATGACACCACGTAAATGGGATAAGATTGCCACCTTTGTTTTATACATGATTTCAATTTTCATTATTTTTGTCTTGGCATTCCTGTTACTTTATATTTTAATTTCTGGACTACCTAATGTTAGCTGGCATTTTATTACCAGTAAATCTAGTTCGTTTCAAGCAGGCGGCGGTATTGGCGTTCAGTTATTCAACTCTGTTTATTTATTAGTTTTGGCAATGATTATTTCAGTACCACTTTCATTAGGCGCAGGTATTTGGTTATCTGAATATGCACCTAAAAACTGGATCACAAGCTTAATTCGTAACGCTATTGAAATTTTAAGTTCATTACCTTCAGTTGTGGTTGGTTTATTTGGTTTCTTAGTTTTTTCTATCAATATGAAATTTGGTTTCTCGATTTTATCTGGTGCCTTGGCGTTGACGGTCTTTAATCTACCTTTGTTAACGCGTAAAGTTGAAGATTCGCTGCAAGCTATTCACTATACGCAACGTGAAGCCGGCTATGCTTTAGGTTTGTCACGTTGGGAAACAGTCATTCATGTCGTTGTTCCTGCTGCTTTGCCAGGTATTATTACAGGGATGATCTTGGGAATGGGTCGAATTTTTGGTGAGGCCGCTGCTTTGATCTATACAGCTGGACAAAGTTCGCCATCATTAGACTTCAGTAATTGGAATCCATTATATATTGCCAGTCCTTTGAACCCAATGCGATCAGCTGAAACATTAGCTGTCCATATTTGGAAGATTAACTCAGAGGGTATTATTCCTGATGCAACACAAGTTTCGGCTGCTTCTTCAGCTGTTTTAGTATTATTTGTTTTACTTTTAAATTTCCTAGCGCGTTATGTGGGCAATCGCCTCTATGCTCGCTTAACTGGTGTAAAGGAGCGCAACTAGTTCATGAAGACTTATGATAGTGAAGATCGCTATATTAAAGATTTAGACGATGGTAAGCGCGAGATTGCGCTATCTACTGATGATATCCATGTTTCTTATGGGACTCATGAAGCAATTCATGGCGTTTCGTTAGCTTTTGAACGGTTTAAGATTACGGCATTAATCGGAGCCTCTGGTTCTGGAAAGTCAACTTATTTACGTTCGTTAAACCGCATGAATGATAATATTGCTGGTACTAAAGTAACTGGTAAAATTATGTATCGCGGTTTAGACGTTAATAGTAATGAAGTTGATGTCTATGAAATGCGCAAACATATTGGCATGGTTTTTCAACAACCCAATCCCTTTGCTAAGTCAATTTATGACAACATCACTTTTGCCTTACAACGTCATGGTGAAAAACGTAAAGATGTCTTAGACGAAACGGTTGAAACGACCTTGAAGCAGGCTGGCTTATGGGAGCAAGTTAAAGATGATCTTCATCAAAGTGCTTTAGCTTTATCCGGCGGTCAAGCGCAACGTTTATGTATTGCTCGTGCGATTGCCATGAAGCCTGATATCTTATTATTAGACGAACCGGCCGCTGTACTTGATCCAATTTCAACGGCAACGTTAGAAGAAACATTGATGGAATTAAAAGAACGTTACACGATTATTATTGTGACCCATAATATGCAACAGGCTGGACGGATTAGTGACTATACCGCATTTTTCCATTTAGGTAATGCTTTGGAATATGATGAAACACGTAAAATCTTTACGCGTCCGAAAATTCAGGCCACTGAAGATTATGTTTCTGGTCACTTTGGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044499|390263:399185|392091_392979_+|WP_057754024.1|DBSCAN-SWA MNWTTMRNHLHDSFKSIWRNGWMAFAAISGVAVTILLVGISLALVFNVTKLSHDVENDVRVQVSIEPKTTDRQEAALKAQLQKIKHVDQVTFSSKENELKKVVRQYGNSFEMFNGDDNPLSDVFVVRATDPEKTVAIAKQAKKLDHVARANYGGTQTKKLFKTMNGIRNWGMAFSVLLLVVAIFLIANTIRITILSRQNEIEIMRLVGATRWYIRWPFILEGAWTGLLGAILPLVIIDFGYVSVYNGVGQQLTTSGYHLLTPNALLLPLNIALIVIAMLIGSLGAAVSMRRFLKI >NZ_CP044499|390263:399185|391397_392114_+|WP_057754027.1|DBSCAN-SWA MTENNGTIKLKEVTKNYPNGVAALKDISLTVQTGEFVYLVGQSGAGKSTLVKLLYRELVPTSGEITVNGFDLQHLREREVPKLRRTLGVVFQDFKLLPKMTVAENVGYALHVLGKNNDEIRSAVTQVLAEVGLEAQADHFPDELSGGQQQRIAIARAIVNSPQIVIADEPTGNLDPKTSAGIMTIFQRINDRGTTVIMATHNQQIVDELPHRVVEVVDGQIVRDEEGGQYTHELDNNA >NZ_CP044499|390263:399185|393859_395578_+|WP_057754018.1|DBSCAN-SWA MKNKSWVRRYGLGLLAVGFYVLILIFVNRFLVTNQKQEIKNFGAEYQAEVLTKDHEQTLARWRKNFKLSAIDLPAEGSSELARVAKNAVDHNIVNSTKPFTKVQYNGQTTWLYLVSDPKTNKGQAVLIQPATTVRTHYLKTWIGFTVIYLLILAALGWFIVRRRQQLTQKLAQLTENIKAVENHQEPESVILTPDDPLFDLSVQVNELGTTLNSQLRDAKLQEQSLRSLIENLPLGVMLIDESGQVDMANHALGEILNTPIWPDQLATYVDYVKTYALSRMIEHALRDPLKHTHRRQDIQLVGDDGRFVEADVISLVNQDGDTPKQKVLVMLYDLTEIKQNERMQLDFVSNASHELRTPVTSIAGFAETLLAGAKDDPQKSTEFIQIIRDQAQHLEALIADILLLSKADQAQPLSWEAVDVDELILDEEKSLQQQIAAKSLEVTLDHQHYQAPTFTDVTKLRQIVRNLLTNAIMYNHPQGKIQITLQTTADTLKLAFKDTGDGLTTEDQSRIFERFYRADHSHQHDNGGTGLGLAIVANLVEQLGGQVQVKSQLGVGSIFTVELPLSQDNDQ >NZ_CP044499|390263:399185|397475_398372_+|WP_057754009.1|DBSCAN-SWA MTPRKWDKIATFVLYMISIFIIFVLAFLLLYILISGLPNVSWHFITSKSSSFQAGGGIGVQLFNSVYLLVLAMIISVPLSLGAGIWLSEYAPKNWITSLIRNAIEILSSLPSVVVGLFGFLVFSINMKFGFSILSGALALTVFNLPLLTRKVEDSLQAIHYTQREAGYALGLSRWETVIHVVVPAALPGIITGMILGMGRIFGEAAALIYTAGQSSPSLDFSNWNPLYIASPLNPMRSAETLAVHIWKINSEGIIPDATQVSAASSAVLVLFVLLLNFLARYVGNRLYARLTGVKERN >NZ_CP044499|390263:399185|396549_397476_+|WP_057754012.1|DBSCAN-SWA MNNDEIRANLLKRSRASRNERFGKLISGACITIIIAVVVSIFYFVASKGLATFFEDKVNLWKFLTGTIWNPSAKDAQGNPQVGALPMIVGSFSVTFLAAIIATPFAIGAAVFMTEISPRLGKKVLQPVIELLVGIPSVVYGFIGLSVVVPFVRHTFGGSGFGILSGTFVLFVMILPTVTSMTVDALKSVPRAYREASLALGATRWQTIYKVVLRASTSGIITAVVFGMSRAFGEALAVQMVIGNAMLLPQNLISPASTLTSVLTMGMGNSVMGSLSNNALWSLALLLLIMPLIFNILIRWIGKKGAMR >NZ_CP044499|390263:399185|398375_399185_+|WP_057754007.1|DBSCAN-SWA MKTYDSEDRYIKDLDDGKREIALSTDDIHVSYGTHEAIHGVSLAFERFKITALIGASGSGKSTYLRSLNRMNDNIAGTKVTGKIMYRGLDVNSNEVDVYEMRKHIGMVFQQPNPFAKSIYDNITFALQRHGEKRKDVLDETVETTLKQAGLWEQVKDDLHQSALALSGGQAQRLCIARAIAMKPDILLLDEPAAVLDPISTATLEETLMELKERYTIIIVTHNMQQAGRISDYTAFFHLGNALEYDETRKIFTRPKIQATEDYVSGHFG >NZ_CP044499|390263:399185|390263_391379_+|WP_151425823.1|DBSCAN-SWA MELSEIKNQLNAANAKIKQFRGSLDFDALEEAIALNEHKMVEPDFWNDSEAAKQLIAENNGLKEKYDNFKQLVTSAENIEVSLELLQEDDDADLRREVEADVTKLQEQLHAYELSLLLSEQYDANNAILEIHPGAGGTESQDWGSMLLRMYQRWAASHHFTTEIADYQPGDEAGLKSVTMMIKGHNAYGLLRSENGVHRLVRISPFDAAGRRHTSFASVEIMPELDNSIEVEINPDDLRVDVFRSSGAGGQHINKTSSAVRLTHLPTGIVVSSQAQRSQLQNRETAMSMLEAKLYQLKQEEQRKKEAAIKGVQADIGWGSQIRSYVFHPYTMVKDHRTNYETGNGQAVMDGDIDEFIYHYLQWELQQKNPD >NZ_CP044499|390263:399185|395692_396553_+|WP_057754015.1|DBSCAN-SWA MKKKWILFLGLIPFVFLLSSCGLKQSGQSITAVGSSALQPLVEAAGDRYTEDHAGEFINVQGGGSGTGLSQIQAGSVEIGNSDLYAEQKSGIDPTGLVDHKVAVVGVTPVVNKDIPIKNLSTDELAQIFSGDITNWKQLGGPDQKIVVINRAQGSGTRDTFERWVMKGRSTVQAQEQDSTGMVRQIVASTPGAISYMAFPYVDDTIKTIKVDNVAPKDKNVKTNKWKIWSYEHMYTNGKPTGLTARFMDYILSDKIQDEIVASMGYIPVKDMKVSRNLAGKVETIK >NZ_CP044499|390263:399185|393171_393870_+|WP_057754021.1|DBSCAN-SWA MKKILVVDDEMAIRQLITYNLQHAGYQVEEAADGQLALSKAATGEFDFVVLDLMLPKLDGIEVTKRLREQNIEVPILILTAKHEEADKIIGLELGADDYMTKPFSPRELLARVKAILRRSESMATTKATVVYFGDVSWELDRHHLVKNGSDLNLTKKEYELLKFLVANRQKVVTRDQIMTNVWQTQEAVISRMVDIQISHLRDKIEPDPKQPQFLLTVRGYGYRLEVSHIEK |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
657723 : 673000
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044499|657723:673000|DBSCAN-SWA 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13 | Streptococcus_phage(81.82%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
816972 : 897159
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044499|816972:897159|DBSCAN-SWA 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MKKLKISQFVQTRLGFFALLTAVFWIKTVFAYYVDFSLGASDPLQHFLMFFNPIGTTLLLFSMALYIKKPKISYAVMFIIYLLNTILLFANVIYYRQFTDFLTFNTIFSVGKVSSGLGKSTISLLQWYDLLLWLDVILIAIALARHVIKIDPKPLPTKHAFTATTLAVFVFLLNLTLSEANRPQLLTRTFDRNYIVKYLGLDTFMVYDSVKTAQNNQIRSSADGTDINSVLNYTKSHQVPANPEYFGQAKGKNVIILHLESFQQFLIDFKVNGQEVTPFLNSLYHNKNTLAFSNFYHEVGQGKTSDAENMLETGVFGLPEGSVFTSLGTDNTFQGAPAILQQSAGYSSAVFHGNVGSFWNRNHVYKNLGYNYFFDSSYFNTSTEANIGYGLKDKLLFAESIKYLEQLQQPFYTKFITVTNHFPFPLADSDTDFQRPETDDKAVNNYFATAHYLDQAVKEFFDYLNKSGLAKNTLVMIYGDHYGLSDKDNKSLATLMNRSSDDWTALDNMNLQRVPFMLHMDGLKGGIQTQYGGEIDVLPTLLHLLGINTNKYVLFGQDLMSSKLQQLVAFRNNNFVTNKYTVLGGNGANGSIYDNETGELLTELSPALTKQINQWQAEVDHALSLSDSLNMKNLLRFYTPSGFKPVDPSQFNYLDQVNELIQTREKLKGRSTSLYSEKGKSTTSLYITDAPELTDPETDIDSLPKSSSTDGETTTNSASSSSNISSQK |
112 | Lactobacillus_phage(33.33%) | integrase,holin,head,terminase,capsid,tail,portal | attL 861328:861387|attR 899328:899405 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1124887 : 1131947
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044499|1124887:1131947|DBSCAN-SWA CTTAAGCTGTATAGAATATCACGGCTAAAGCACCAGCACCTGTATGGGTGGCCACAACTGGTGAAGTTGGCGCCACTAAAATTGAAATTTCAGGGAAAATGGCATTTAATTGTTCTTTAATCTTATTAGCTAACCCTAAATCATCAGCATGAGAAATCCCAATCCCTAGAATTGGTGCAGTTGTTTCTTTCATTTGATTAACTAAATCGTTATAAAAATTATTGATTGTCTTAATTCCGCGGCCCTTATGAATTGGTACGATAGCATTATCTTCAAACTTCAAAACAACTTTAATGTTTAATAAGTTTGATAATAAACCAGAAACTTTACTTAAACGACCACCTTTAACCAAATTATTCAAACTTGAAACAGACAAGAATAACTTAGTGTGTTCCTTAATCTTTTCCATAGCGGCAATAATTTCATCACGCTCTTTGCCAGCTTGCGCTAACTTAGCAGCTTCAATAACTTGAAAAGCCATTGCTCGGTCAATATATTCACTGTCAATAACGGTTACAGCAGCTTTAGAAATTTGAGCTGCTTGACGTGCCGCATTTACCGTGCCACTTAAACCATGGGACATATGCACTGAAAGAATTTCGCTACCATCAGCGGATAGTTCGTCATAAAGATCCAAAAAAGTCCCAATTGATGGCTGACTAGTCTGCGGTAAGTTTTTAGCTTCGGCCATTTTGGCCATAAATTCAGGTCGGGTAATGTTAACGCCATCAGTATAAATCATTTTATCAATGACAATGGTTAAAGGAACCACATGAATTTCATATTTTTTTGCTTCTTCATCTGTTAATTGGATGGATGAATCAGTAACAATCTTAATTTTATTAGTCATGGATAGCTTCCTCCGAAAATCGATCAAAATATCATTCAGAATATTATTCTAATTGCAGATAATCGTAATACAGAACGTACGAATTGTCTATTAATAGCCTATACTAAAACTTCTGCTTAACAGCGTTTGCTAAATTGCCATCAACAATAAATATTATAACATGGTATTGAATTAACTCACCAATAAATATTTATCTTTACATCTAATTATCAAAACTAGATGATAACAAAAATTAATTTGTTGTTCTTGTTTTAGCTTAACCCCGGTGATACTCATTAAAACTAAATTCTGGCGTTGTTGCAGTTACCGGGTGAACTTGTTGTTTCACTAAATTAAACTTCGACCAAGGCAATGTCGGCATGTAAACATCGCCTTGATAACTAGCTTTAATCGTAGTTTGATACAGGACATCAACTGAATCAACAAAGGTCTCAAATAACGAAACGCCACCGATTACTAAATAGTTTTGCTCTGGCGCAGCAGCAATTGCCGAACGAATCGCAGTTATCTGATTAAAGACGCGAACACTGTCAGGGAATTGGTCAGCAGCTTGCGTCGTTAAGACCCAATTTTGCCGCCGTGGTAGTGGACCGTTAGGAAATGAGTCATAAGTTTTTCGGCCCATAATGATGGTCTGTCCCACTGTTAATGCTTGAAAATGTTTTAAATCGGCCGGTAAATGCCAAGGTAGTTGGCCATGATCACCAATTAAATGCTGTTGATCTTCTGCCCAAATGAATGCTAACAAAGTATCACTCCTAAACTGCGACTGGCGCAGAAATTGCTGGTGCTGGGTCATAGCCAATTAACTTAATATCTTTCATTGTATAATCCGCTAAATCTGGCTTAATTTCATCAGTTAACCAAAGCGTTGGTGCGGCTTTAGGTGTCCGCTGTAATTGTTGGTTAACTTGGTCAATATGATTGTGATAAATATGAGCATCACCAAACGTATGAATGAATTCACCAACTTGTAACCCAGTTTGATGTGCTACTAAATGAGTCAGTAGTGCATAGCTGGCAATATTAAAAGGCACGCCCAAAAAGATATCTGCACTTCGTTGGTACAACTGCAAAGATAACTTACCATCATTTACATAAAATTGGAACAGCGTATGACATGGTGGTAAAGCCATTTGTGGAACATCCTCAGGATTCCAGGCACTAACAATTAACCGGCGTGAATCTGGATTAGTTTTAATCTGTTGAATGACATCGACCAGTTGATCAATTGTTTCATGACGACTTGTTTCCCAAGCGCGCCATTGCCGACCATAAATTGGACCTAATTCACCATACTTAGCAGCAAAATCTGTATCAGCTAAAATCTGGTCACAGAAAAGTTGATGCTGTTCTTGATAAACTTTAGCAAATTCTGCATCAGCTAACGCTTGATGAGCAAAATTAGTCATATCTGGACCTTGATAATCAGCACTTTTGACATAATTTTCAAAAGCCCATTCATCCCAAATATGATTCTTGTGTTGTAAAAGGTAACGAATATTCGTGTCACCCTTTAAAAACCACAATAACTCACTTTTAATTAAGCCAAACGGCACTTTTTTGGTAGTTAATATGGGGAACCCGGCTTGTAAATCAAAATGAATTTGATAACCAAAAATACTGTTCGTTCCGGTATTAGTCCGATCATGTTTGCGGTGGCCCTGAGTTAAAACAGTGCTAGCAAATTGTAAATACTTCTCTTCATTAGGATTCACGATGAGTCCCTCTTTCTCAATCAGTTTGTTGTTTAATCCACTCAATTAATGCTTCATTATGATTAACGACTTCACCCATGACGACTGCGTGTTCAACTTGGTTTAACCATTGCCCAATTTCTGGGCCAGGTTTAAGACCTAACTTTTGAATTAACGTTTGTCCATCAATGGCTAGTTCGTGACGATTTTTGATAGGAAGATTCTGGTAATGAATGGCCAATTGAGTAAAGTCAGCATCCAATTGTAAAATAGGCCAAATGGTGGCTAACCGCTCAATAATGGTAGCATCCACTTGGTAAAGTTGGCTAGCACCAGGCTGTGGGTTTGTTTGTAACAACCGACTAAAAGCTAACGTATGCTGACTATCAGCAATCACTTCATTAGCTGATTTCCAGCTGTGTAAGAGCTGCTGTTGTTGTGCTAGAGTTAGACTAAACCCCTCACCTAAAAGCGTCCAGATTGCTGCCTCGTCCATTAAGGGCTGTTGTGTGGCAACAAATTTAGGATAATTACCAGTTAAGTAATCTTTAAAGAAGGGTGTGTTTTTAATCAAGCCGGTGGCAACAAATAACTTCCAACCAATTAACCAGTTTGCACTCAACATCATCTTTTCAAATTCAGTATGAATACGTTCAACGGCAATCTTTTGCAAAAGCTCAGCGTTGTGTAGTAAGCTGACATAAGTATCTGTGGTAATATCAAAGCCGAGCTGACTAGCAAAACGAACGGCACGCATCATTCTTAAAGCATCTTCATGGAACCGTTCATCTGCATTACCAACAGCGCGAATCGTTTGTGCTGCTAAATCAGCTAACCCATCAAATTCATCAATCACTAGGCCGTCAGCACGAACAGCTAAGGCGTTAATGGTAAAATCACGTCGTTGTAAATCTTGTTTAAGTGAGCGCACGAAAGTAACGTGATCTGGTCGGCGGAAATCTTGATAACCCGATTCAGTTCTAAAAGTTGTCACTTCATAGCCAATACCATGTTGCATGACGGTGACTGTTCCATGTTTAATGCCGGTATCAATAGTTTTAGGAAAAATTTCTTTAATTTCTGCAGGAAAGGCGCTAGTTGCAATATCTACATCTGCAATAGCTTTTCCTAACAGCGTATCGCGCACAGAACCGCCGACAAAATAAGCTTCGTATCCGTGAGCCTCAATTTGTTGTAAAATAGGTAGTGCCTGTTGAAATTCATTGGGAAACGCTGTTAAATACATGTCAACACCTGTCCTTGATTAACTCATTTAATCATTATAGTTTCTATTGTAAAACTGCACAGAAATGAGTGCAATTTTTGAATCATAATCTTCAATAATTAATAAGATTTGCCTAATTATAAAAAATCAAAGTGGAGGTATGAATATGACAAATATCGATTGGAAAACTGTGGATTGGAAAACCACGCTTCGTGAATTTATCATGATTATACTCGGCGCCTTAATCTATGGCTTCGGTTTAGTTGCGATTAACATCAAAAACAACTTAGCCGAAGGTGGTATGACTGGTGTTACTTTGATTTTGCGGGCATGGTGGCATTTAGACCCGGCCTACTCAACAATCTTTTTAAACATTCCACTTATTATTCTAGGCTACCATTTTTTAGGTCGTAAAGGAATGATCTATACTATTTTTGGTACATTGGCTTTATCCGGTTCACTGTGGATGTGGCAGCGAGTTCCTTTCATGCTTAACATTAACTTACACCATGATTTATTCATTGCTGGTGTTTTGGCGGGGATTTTTGGTGGTTTTGGTTCAGGTTTAATCTATCGCTATGGTGGTACAACCGGTGGTAGCGACGTGATTGCTCGTATCCTTGAATTAGAGCGTGGTATCCCCATGGGCCGAACTTTACTGGCCATTGATGTGATTGTACTGTTAACTTCGCTTACTTACTTAGATATTGAACATATGATGTATACGTTGCTTTCATCTTTTGTTTTTTCAAGGATTGTTGATGCCACTCAAGACGGTAGTTACTCTGCTAAGGGATTATTAATTATCAGCGAAAAGCATGAAGAAATTGCCCATGCGCTCATGAATGAATTGGAACGTGGCGCCACTTTCTTAAGCGCTGAGGGTGGCTACCAACATGACCGCCGACCAATTGTCTATTGTGTCGTGGCACCTAGCGAAGTTGTTCAAGCTAAAAAAATTATTATGAATTTAGATTCGAGTGCCTTTATCTCAATAATTGATGTGCATGAAGCTGTTGGTGAAGGCTTTACTTATATGCGCAAACCAACGCATAATTTACTTTCACTACGTACCACTAAAAAATAAAGAAAGAAGCAGACAATTTGTCTGCTTCTTTTTATTTACATATTTTTAATTCTAAAAATCGTTATCTTCTAATTCTAAAAGCAGCGCTTGAAAATCATCATCATCAGGAACTAATTTTAAATATTGTTGCACGGCCATTTTTAATTCATCTTTAGCTGCTTGAGACTGTAAGAACAACGCGAACTGTTTCATAAATTGTGGATTGTCTTTTAAATTAGGATAAGCAATAAAATAATTTTCGCGTGCTTGATCAACCTCATCCAACTGATCATAAGCCTGTGCTAATTCCCAATTAACTTGTGGGTCAGCTTCATCTTCTTGTTCAGCAACAGCCGCTAGTAACTCGACACTATCTTGAGCGCGACCAGCCCGCAAATAATGCTCACCTAACATTAGCCGTAATGACTGCGCTTCTGGATCAATCGTAAGCCCCTTCTTGAGTAAGTCTTCCACTTGATGCTTAGCGCCAACTTTAGCCGCTGCTTGGGCACCCAGACGATACAACTCAAGATTAAACTCATCATAACCCAGCCCCACTTGAGCTGTTTGCAAGGCTTGATCGTAGCGACCTAATGTTGATTGACTTTGCACCAAAGGACGATAAAGCGAACTATAATCAGCATTTTGTTGTTGCAAGCGTGTTAAAATCTTGATTGCTTTTTCATCATCATTTACCTGCTGATACAAGACGCCTAGTTCAAATAGTTGATCATCGGTCGCTAAATTTTCTGTTAGTTTTTCATCAATGGCAATGGCTTCTTCATACTGACCCAATCCCGATAAACACTGAGCTAAACGTTGCTGAATTGAAACCTGCGCAAAGTAATCAACACCGGCTTCAGTCAAGCTTTGGTAGTATGGCAGTGCTTCTTGGTAGCGACCTAAACTTAAATATAGCTCACCTAACGCAAAATCCACAACCGGTTCGTCTGGCAACAAGGCCTTAGCAGTCAATAACTTTTGTTCACTAACCTCTGGCAAATTCAAAGATTGATAAAGATCAGCCGCTGTTAGTAAACTTTGCGGATAAACTTCTGAACTTTGCGAAATATGGTCAAGTTGCAGCAAGGCCTCATCCGTTTGATCATCACTAATGGCCAATTCCGCCAAAATTAAACGAACATCATCTGCGTCAGGATATTTCTGCAATAACTTTTCTGCAATCCGGCGGGCCTGATTATTAAACCCAATTGCTTGTAACTCCTCGGCTAAACTAAATAAAGTATCGTCATCATCATGGCGCAATGCTGATGCGAATTTCTTCTTAGCTTCATCTAAATCTTGATCCTCTAACGCCTGCAGCATTTCTTCCGAATAAGTCATAGAGTACCTCGCTACTTTCTAATGTTTTTAATTAACGTTCAATAAAACTTAACCTATTAATTATAGCGAATAATTAATAACGGCGCTATTGTCACAACTTTTTAGTTTATTCTAGCAGACCTCTTCTTATTAGTTTAATAATTTAATTCTACCATGCTACGGCTCCGAAAAATTGCCAGGTGGAACGTAGTGGACACTATTTGAAGCCAATTGCTAATTGTCTTCAAACTAGGTCTTACTGTAATTGCTAAAGCAATAACAGTAATTTCACCACTGACCGGCATTTTCCTACGCTGCTTAAATTTAATTTGGCATCAATAAAATCTAGCTGCATCAACTTGCTAGTTCCGCCGAGTTTATTTAGTGATGGAGTGAGATGCTGGTCAGCCGCGGAATTATTGTTAATGGTTGACCATTTACAATAAAGTTTGTATTTAAGACAAATTGGTTTTAATTTGGCTTAAATCAAAGCTCGCAGCGTTACACCAGCAATTTCACAGAGGCATCAAGAACGTCACTTTGAATATTTAGCTAAAAATTCAGAACAACAAAAAAAGACCGACACAATTGTCGGCCTTAGTACTTCAATGTAATGTTAAATTCTTATTTAACAGCATCCTTCAAAGCCTTACCTGGCTTGAATGCAGGTACAGTGCTTGCAGGGATTTCGATTTCAGCACCAGTTTGAGGGTTGCGGCCTTTACGAGCTGCACGTTGACGAACTTCGAAGTTACCAAAGCCGATCAATTGAACCTTCTCACCCTTAGCAAGTGTTGATTGGATTGAACTAAATACAGCGTCAACTGCAGCAGTTGCGTCTTTCTTAGTTAAACCAGTCTTTGATGCTACGTTATCGATTAATTCTGCTTTATTTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044499|1124887:1131947|1124887_1125736_-|WP_057754933.1|DBSCAN-SWA MTNKIKIVTDSSIQLTDEEAKKYEIHVVPLTIVIDKMIYTDGVNITRPEFMAKMAEAKNLPQTSQPSIGTFLDLYDELSADGSEILSVHMSHGLSGTVNAARQAAQISKAAVTVIDSEYIDRAMAFQVIEAAKLAQAGKERDEIIAAMEKIKEHTKLFLSVSSLNNLVKGGRLSKVSGLLSNLLNIKVVLKFEDNAIVPIHKGRGIKTINNFYNDLVNQMKETTAPILGIGISHADDLGLANKIKEQLNAIFPEISILVAPTSPVVATHTGAGALAVIFYTA >NZ_CP044499|1124887:1131947|1128881_1129745_+|WP_083479530.1|DBSCAN-SWA MIILGALIYGFGLVAINIKNNLAEGGMTGVTLILRAWWHLDPAYSTIFLNIPLIILGYHFLGRKGMIYTIFGTLALSGSLWMWQRVPFMLNINLHHDLFIAGVLAGIFGGFGSGLIYRYGGTTGGSDVIARILELERGIPMGRTLLAIDVIVLLTSLTYLDIEHMMYTLLSSFVFSRIVDATQDGSYSAKGLLIISEKHEEIAHALMNELERGATFLSAEGGYQHDRRPIVYCVVAPSEVVQAKKIIMNLDSSAFISIIDVHEAVGEGFTYMRKPTHNLLSLRTTKK >NZ_CP044499|1124887:1131947|1127470_1128679_-|WP_057754924.1|tRNA|DBSCAN-SWA MYLTAFPNEFQQALPILQQIEAHGYEAYFVGGSVRDTLLGKAIADVDIATSAFPAEIKEIFPKTIDTGIKHGTVTVMQHGIGYEVTTFRTESGYQDFRRPDHVTFVRSLKQDLQRRDFTINALAVRADGLVIDEFDGLADLAAQTIRAVGNADERFHEDALRMMRAVRFASQLGFDITTDTYVSLLHNAELLQKIAVERIHTEFEKMMLSANWLIGWKLFVATGLIKNTPFFKDYLTGNYPKFVATQQPLMDEAAIWTLLGEGFSLTLAQQQQLLHSWKSANEVIADSQHTLAFSRLLQTNPQPGASQLYQVDATIIERLATIWPILQLDADFTQLAIHYQNLPIKNRHELAIDGQTLIQKLGLKPGPEIGQWLNQVEHAVVMGEVVNHNEALIEWIKQQTD >NZ_CP044499|1124887:1131947|1125992_1126535_-|WP_083479502.1|DBSCAN-SWA MTQHQQFLRQSQFRSDTLLAFIWAEDQQHLIGDHGQLPWHLPADLKHFQALTVGQTIIMGRKTYDSFPNGPLPRRQNWVLTTQAADQFPDSVRVFNQITAIRSAIAAAPEQNYLVIGGVSLFETFVDSVDVLYQTTIKASYQGDVYMPTLPWSKFNLVKQQVHPVTATTPEFSFNEYHRG >NZ_CP044499|1124887:1131947|1126494_1127454_-|WP_057754927.1|DBSCAN-SWA MNPNEEKYLQFASTVLTQGHRKHDRTNTGTNSIFGYQIHFDLQAGFPILTTKKVPFGLIKSELLWFLKGDTNIRYLLQHKNHIWDEWAFENYVKSADYQGPDMTNFAHQALADAEFAKVYQEQHQLFCDQILADTDFAAKYGELGPIYGRQWRAWETSRHETIDQLVDVIQQIKTNPDSRRLIVSAWNPEDVPQMALPPCHTLFQFYVNDGKLSLQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHLVAHQTGLQVGEFIHTFGDAHIYHNHIDQVNQQLQRTPKAAPTLWLTDEIKPDLADYTMKDIKLIGYDPAPAISAPVAV >NZ_CP044499|1124887:1131947|1131671_1131947_-|WP_057754915.1|DBSCAN-SWA MANKAELIDNVASKTGLTKKDATAAVDAVFSSIQSTLAKGEKVQLIGFGNFEVRQRAARKGRNPQTGAEIEIPASTVPAFKPGKALKDAVK >NZ_CP044499|1124887:1131947|1129796_1131068_-|WP_057754918.1|DBSCAN-SWA MTYSEEMLQALEDQDLDEAKKKFASALRHDDDDTLFSLAEELQAIGFNNQARRIAEKLLQKYPDADDVRLILAELAISDDQTDEALLQLDHISQSSEVYPQSLLTAADLYQSLNLPEVSEQKLLTAKALLPDEPVVDFALGELYLSLGRYQEALPYYQSLTEAGVDYFAQVSIQQRLAQCLSGLGQYEEAIAIDEKLTENLATDDQLFELGVLYQQVNDDEKAIKILTRLQQQNADYSSLYRPLVQSQSTLGRYDQALQTAQVGLGYDEFNLELYRLGAQAAAKVGAKHQVEDLLKKGLTIDPEAQSLRLMLGEHYLRAGRAQDSVELLAAVAEQEDEADPQVNWELAQAYDQLDEVDQARENYFIAYPNLKDNPQFMKQFALFLQSQAAKDELKMAVQQYLKLVPDDDDFQALLLELEDNDF |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1448949 : 1456967
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044499|1448949:1456967|DBSCAN-SWA GTCAACTTTCATGGTGTAACGCCTCTTCACTGGCCAAAACATCAGCCGCCATCTTTTGCCGGGCGCTTATGAGTTGTTTTTGAATCTCAGGATCGGCCATGCCTAATAATTGAGCCGCCAAGTAACCAGCATTACGAGCCCCAGCTTCACCGATAGCCATGGTCGCAACAGGAACACCAGCTGGCATTTGTACGATACTTAATAGTGAATCAACGCCATTTAAAGTCTGGCTTTGAACAGGAACCCCAATCACAGGTACGACAGTATTGGCCGCCAACATGCCTGGCAAGTGTGCTGCCCCACCGGCACCAGCAATAATCAATTGGACACCGTTGGCCAAGGCCAGTTCCGCAAATTCCGTCAATCGAGCCGGTGTGCGGTGAGCCGAAATAATTTTTGTCTCATACTTGATTTTCAAGTCAGTTAAAACTTCGGCCGTTTTTTGTAGCGTTTGCCAATCAGAAATGGAACCCATGACGATCTGAACGTTTTCCATATCAGTCTCCTTTTTAGTTCGTGTTTTTTATATTTTGTAATCATATTAAAGCACATATAAATATAAAAATCTATATTTTATTAACAATTATTTTACATCCAGTTTTATTGTTCGTCTTTTGCTAATGATTTTTACTTTTTTAAACCTTTAGACATGTTCGTAGATTCAAAAAGGTGATTTGTTTAATCCTCAGAATAAAAGCTGGCTGATAGGACATATTTCAAGCCAATATTGCCACAAAAAAAGTGCCGCTAAAGTAAAAACTTTAGCAGCACTTAATCTCTTTAATCTCTAGTGGTTATTCTTTTGATGCTTTCTTAGTGACATCATATTTATTCTCAATATTATGGGCCACAAAGTTAAAGGCCTTCATCATTTCCCGACGTGTCAAAATACCACAGAATACATTGTCGGCATCCACAACTGGCACAAAGGGATTGTCTACTAATAGATGTAACACTTCATCCATATTCGCATCGTCTTTAACGGTATCGAATTCTGTTTGCATCACATCTTTAACTATCAAGCTTTGTAATGGTTGCTGACTAATATCATCAAGTTCAATCATCTTGTTAGTAATCATTGGTATCGTCAATAGACCTAATAAATGAGATTGACCATCCAATACGGGGATTTTTGAGTAACGCACTTTGGTTAACAGTAGAAATGCATGTGTCAACGGATTATCTTCCTGAACAGACGCAACTTTATCTCCAGGAATTAAAAAACCATTTTCTTTTTCCGCTAACATATCTTGAATCGATTTGGCAATCATTAAGAATTGATCCTTTCCATTTTCAGCAATATTTAAACAAAACTTAATTGTATTCCTGGCTAATACCTGTATAATTTTTACTTGTATACTATTCTTTGGAGGAAAGAAATGACATATCCATTAGCAATACGTTTAGCAGCAGAATTTATTGGAACGGCTATCATGGTCCTACTGGGCAATGGTTCCGTAGCCAACGTTGATTTGAAAGGCACTAAGGGCGAACATGGTGGTTGGATTTTAATCTCACTAGGTTATGGTGCCGGGGTCATGATTCCCGCTTTGATTTTTGGTGGTATTTCGGGTAACCACATCAATCCAGCTTTTACTTTAGGACTAGCTTTCTCTGGTCTCTTCCCTTGGCATGAAGTACTGCCTTATATTACCGTCCAATTGTTAGGTGCCTTTGTCGGTCAAGCAATTGTCGTCTTGGCTTATAAGCCTTATTATAACATGACCACAAATCCCGATAGCATTCTTGGTACCTTCTCAACCATTGATAATGCCCACAGTCGCTTCAATGGTTTCATCAACGAATTCGTTGGTACTTACATTCTCGTCTTTGCTGCTTTAGGTATCACTAAGGCACCGTTTTTCAATAACAACTTAGGTACAGCCCATTTAGCTTTAGGCTTCTTAGTGATGACCTTGGTAGCATCATTAGGCGGTCCAACTGGTCCAGCCTTGAATCCAGCTCGTGATTTATCACCACGTATTTTACATGCCTTATTACCCTTAAAAAACAAGAGTGATTCGCATTGGCATTACGCTTGGGTACCAGTTGTTGCTCCAATTCTTGCTGGTATTTTAGCTGTCTTCACTTATAAAAACGTCTTTTTAATCTGGCATCCTTAAGATAGCACACTGATTAAAATTAACAATAATGCTAAAGGCCGAGAAAATTTTTCTCGGCCTTTTTTAATGTTCTTTTTGTTGAAACGTTAATTTTAAACCGGGTACAGGTTGCAAATTACGTTGATAATATTGGACTTGGATCTGACCGTCTGCTACTTCCACAATAGCATAAGTACCTTTCAATGAAACAAACCGACCACGTGGCTGACTAATTGAACCTGGATTTAAAAATAGTCGTCCTTGATCCATCACACAAGCTAATTGATGCGTATGACCATAAAATACTAAGTTAGCCGCTTGTTCTTGTGCGAGTAATGATAACTGTTCTAAACCAAAATTCACGCCATAACGATGACCATGAACAACTAGAATTTTCTGGTCGGCAATTGTTGTCGTTTCTTGAAGCGGAAAGTTTTGGTCAAAATCCATATTACCTTGCACGATTATGAAATGTGATCGTAATGGATCCGTCCAGCTTAATTCAGAATCACCACAATGAATCAGTGCGTCAACTTGCCCTTCATAATGTTCAACTAACGTTTGTAAAATCTGATCATCGCCATGACTATCACTGACAATCAATAATTTCATTTGACTTGCTCCTGTTCTTGCCACCATTGTTGCCAAACTGGTAATAAGTTCTTAATAGCTGCACCACGATGACTATATTGATTTTTCTCTGCAGCCGTCATTTCAGCGAAAGTTTTATCTAACTCAGCTAAGTAAAACAATGGATCATAACCAAAGCCATCATCGCCTCGAGGAACTGTCAAAATTTGGCCAGGAACATTGCCTTCAACAACCAAATCAGCAGCAGGACGATCGGGCCAAGCCATAACCAATGTTGTGTGAAAGTTAGCCGTACGTTCTTCAGGGGCTACACCCCCAAGATTGGCCAATAAACGCGCATTATTAGCAGCATCGTTATGCGCCTCTCCCGCGTAACGTGCCGAATAAATTCCCGGTTGTCCATGCAAATAATCAACCTGTAAACCTGAATCGTCTGCCAAAACTGGTGTTTTTAAAATCTGAGCAAAGTGATCAGCCTTTAGACGCGCATTTTCTTCAAAAGTTCGTCCGGTTTCATTAACCTGAGCCAAATGATCAAAATCGTTTAATGTTTTGACTTGCCAACCAGCAGGTTCAAAGACCGCCCGAAATTCTCGAGCTTTGCCATTATTCTGCGTTGCAATCACTAAAACTTTCTCCATGATTAATCAGTAATCTCCTTTTCTAAATGAACTTGTTGCGCTTTAAGATCATTAAGTCCTAACCACTGTGAACCAATTAAATCAAACATTTCTGGTGCGGCTGTTGTGTAAAATTCAGCAGTTGCTAAACGGTCGGTATTTAAATTAGCCAATTTGAAATAATCAAGCAATACAGAAACTTCCGAAACTGTTTCCGCACCTGAATCAATCAGCCGCACATCGTCTCCTAAATATTCCTGAATCAAAGGTCGTAATAAAGGATAGTGAGTACAACCAAGAATCAGTGTATCAATGGCCGTTTGTTTAAATGGTGCCAAAGTTTCTGCAACGACTTTACGTGCTAATGGTGTATCAAACTCGTTACTTTCCACTAATGGAACAAACTTAGGCGCTGCTAAACTGGTCACCTTTAACTGAGCATTACGGTCATGGAGGGCTTTAACATAAGCTTGAGACTTATACGTCCCCTCTGTTGAAATAATACCAATCTGATTATTCTGAGTCGCCTTAATAGCAGCCCGTGTTCCTGGTAAAATAACGCCGACCACCGGAATATCTAACTTAGGTTTAATCATCTCTAACGCTGCAGCCGTTGCTGTATTACAAGCAATGACTAACATTTTAATGTCTTTTTTTAATAAGAACTGCACCATTTGCCAAGTAAACTCCTGTACTTGACTAGCTGGCCGCGGCCCATAAGGTAGACGTGCTTGGTCACCGATAAAAACAATATCTTCATGTGGTAATTGACGCAGTGCTTCTTTAACTACCGTTAAACCGCCAACCCCTGAATCTAAAAAACCTATTGGCTGATTTGCCATATTTCTAAGCCTCCCGAATTTGAATTAGTCTATATTGTCTCTTTTTTTGTTGTTTTTTTCAAGTGATGGCATGAATGGTATCGTTAATTTGTTTTAGATTCAATTGGAATAATTTGGTTGTAAATTTCAGAAAGTAACAATAATTTCTCTGAAACTTACATTTATTTTCCTGCAAATTTATGATAACCTAGTTAGAAACCCTTTTTTAAGGTGGGATAAGGAGCCTAGGGGCTACCTAAATTTGAAAGGAAGATTGAATCTTGGAACACACAGCAAGACAGCATCACAATTTTTTAACGTACTTGAAATGGCTCGGTAAGCAACTACAAGGTTGGCCGCAACAAAGCTATTATTTATTTTGGTTTAGCTTAGGATTACAACTTATGACACTTGTTTCTAATCCCATCACAACAGTAGCTGTGATTACTTTTATCGGAACTACCCTTGGGGTAACTTGTATCTTGAGTATTAGCGCTGCAAAATCTGTCAATGGTTGGCTTGGTCTATTATCTGCAGCTTGTTTTATTTATGCCGGTTGGTCGGCTAAGAACTATTTAGCAATTTTTGAACAAGTGGCTTATATTATTACCCTTGATTTACCAATTCTGCTATCGGTTAAGTCTTGGAATAACGATACCGTTAATCATTTACGTAAGTTTGGCACTAAGCAGTGGCTAATTGCCATTATCGGTACCATTGTTGTCTATGGAATTTCTGGTTGGGCAATTGGTACGTTCACTAACGATCCACGTCCTTGGATTGATGCGTTGAGCTTCGCTGTTAGTTTAACCGCAGGTATTATGTGCTTTATGCGCTATAACAACCAATATATTTGGTGGACTTTCAGTAGTATTTTCCAGATTGTGTTGTGGAGCATTACCTTTAGTCAAGGCGATGCCACTTTAGCAATGGCCATTAATTCCTCGGTCTATATTATTAATGATATTCTCGCCTTCACGGTCAGTCCTTGGTTCAATCACGGCCGCCGCCGGATCGGTTTAAAAGAAATTAAATAAAAAACTACTTAAATTATAGACAAAAAAAGCTCAAAGCATTTACGCTTTGAGCTTTTTTATTAGGCTGTATATTTAGCCAATGTTTCTTGAAGTTGTTCTTTACTGTGATAGCCGACAACCTTTTCAACCACTTCGCCATCTTTTTTAATGAGCAAAGTTGGAATTGCCATAATTCCAAATGATTGTGGTGTATTTGGATTTTCATCGACATCCATCTTTGTAAACTTAACGTCTTTCATTTCTTCTTCAAGTTTTTCCACAACTGGTGATTGCATCCGACATGGACCACACCAAGTTGCCCAAAAGTCAGTTAAAACAACACCATGATCTGTTTCTTGAGCAAATGTTTTATCTGTAATAGCCTTAACCATTTAAAGGACCTCCATTCAAATCTTACATCACTATATTATCGCATAATCTCAAGTGATTACAATTATTTTGCTTACTAAAAATAACTAAGTTTTTTAATTGATCTAGCTATGAGACAACCAACTTATTTGAAATAAACTAAAGTGGCCCCATTGCCGCCGGCTGAAGCTGGTGCATATTCATATTTTTTAACGCGACGATTACGTTTCAAATAATCTTGTACACCCTGACGAATTGCACCAGTGCCTTTGCCATGAACAATCGTAACTGTTTCATAACCGGCTAATAAAGCTGAATCAATATATTGATCTAAATTAGCAAGTGCTTCTTCATAACGTTGACCACGTAAATCCAGTTGGGTCGCGACATGAGAATTGCTACCGCGAACTGTCACAATATGCCGTTGTGGGGCAGTCTTTTCCGGCTTAATTTTTTCTAAATCACGTGCTGGTAATTTCATTTTAATAATACCGACTTGTACTTCAAACTGCTTGTCATTAAATCTCTGCGTAATGACACCTGTTTGGCCATATGAGAGAACTTTAACGTCATCGCCGACTGATAGCTCTTGTTTCTTTTTAGCTCGCTGTAAAACACGATTATGAGCTAATTGACGCTCTGGATGTAACTTATTTAACTTTCCCTTAGCATCGATTAATTGATTCTCTTTAACATCAGTTCGCCCAGTAAGGCGCATTTGTCGTAATTCATCAATCACTTCATCAGCTTGTTTTTGAGCATCGTTAACAAGTTCATCGGCTTTGTCTTCTGCCTTACTCATGAGTTGATCGCGCTGCGCATTGAAGTCAGCCCAAGCGTGACTTAATTCTTGATGCAATTCAGTAGCATCGGCTAATTGTTGCTGCAGCTCTATGCCGGCTGCTTCTGTTTGCTTACGCTGTTGTTCAAGATCGTTAATCATATTATTTAAATCTTGACTAGCATCATTCATTAATGCCTGTGCTGCTGCCACAATTGCTTCCGGCATACCTAAGCGCTTAGAAATATCAAAGGCATTCGAACGACCAGGTACACCAATTAATAAACGATAAGTTGGCTGTAACGATTCAACATCAAACTCCATACTAGCGTTAATTGTCCCTGGGCGTTCATAGCCATATAACTTCAACTCAGGATAATGCGTTGATGCCACGACATAGGCACCAACCCCACCAAGATAATCAAGAATTGCAATCGCTAAGCTTGCGCCTTCTTGAGGATCAGTTCCAGCACCGAGTTCGTCAAATAAAACTAAATCTTGATCATTAACTTGATCCAGGATCTGAATAATATTATCCATATGCGCTGAAAAAGTACTCAAATTCTGTTCAATTGATTGCTCATCGCCAATGTCAGCAAAAACCTCTCGGAAAATACCAATCTGACTTTCTTCAGCGGCTGGGATAAATAAACCTGCTTGTGCCATTAATTGGATTAAGCCTAAGGTTTTCAAAGTGATCGTCTTACCACCGGTGTTGGGGCCAGTCACAACAATAGCCTGATAGTCTTTACCAATTGCAATGTCATTGCTAACGACTTTCTTCTGATCAATCAGTGGATGTCGGGCTTGACGTAATGCCACTTCATTATTGGCATTAATAATGGGCTCAGTCGCCTTAATTTCAGCGGCATAATGGGCTTTAGCATTGATAAAGTCAAGCTGTCCCATGACCGTTTGGTTATGGCGTAATTCATTTGTATAGGGTGCCAACATAACTGACAATTCAGCAAAAATACGCTCAATCTCTTGTTTTTCTGCAAGTTGATCTTGGCGCAATTTATTATTTAAATTCAAAACACTTTGCGGCTCAACATAAAAAGTTTGACCACTTGCACTTTGGTCATGAATAATGCCACCAAATTGATGTTTGTATTCAGAACGAACGGGCACTACATAACGTTCGTCACGAATTGTAACAATCGGCTCAGTTAAATATTTCGCATTACTACCATGTGTGTATTCGTCCATCTTGCTACGAATTTGGGTTTCAGTGCTATGAATTGTTTTACGAATAGCCGCTAGCTTGGTTGACGCCTCATCTAAAACAGCACCGTCAGAATCAATACTGCGCCGTAACATTTGAGTTTGTTCAGGTAAACCCACTAATTGCTCGATTAAATGTGGTAAGGCGCGTAATTGAAATGGTAAATCTAAATCACGGAAAAAGCGTAAAACGGAACTCGTTGCTTGTAAATTACGACTAATCGCTGCTAATTCAGGACCATTGAGATTACCGCCAATGTCAAGTCGTTTTAAAGATGGCGCAACACTTTGTAATTGGGCAATCGGTAACCCGCCTTTAACCCGTAATAGGTCAGCACCATCTTTTGTTTCATCGAGTCGTTGTTGGACTTGATCTCGTTTGGCAACAGGTACCAATGCCTGAGCTAACTCTTGGCCCATACCTGTTCGTAAATATGGTTGTAACTTTTGTTTAATCTTATTAAATTCAAGTGTTGTTAATACTTTGGTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044499|1448949:1456967|1454178_1454490_-|WP_057757367.1|DBSCAN-SWA MVKAITDKTFAQETDHGVVLTDFWATWCGPCRMQSPVVEKLEEEMKDVKFTKMDVDENPNTPQSFGIMAIPTLLIKKDGEVVEKVVGYHSKEQLQETLAKYTA >NZ_CP044499|1448949:1456967|1452284_1453103_-|WP_057757363.1|DBSCAN-SWA MANQPIGFLDSGVGGLTVVKEALRQLPHEDIVFIGDQARLPYGPRPASQVQEFTWQMVQFLLKKDIKMLVIACNTATAAALEMIKPKLDIPVVGVILPGTRAAIKATQNNQIGIISTEGTYKSQAYVKALHDRNAQLKVTSLAAPKFVPLVESNEFDTPLARKVVAETLAPFKQTAIDTLILGCTHYPLLRPLIQEYLGDDVRLIDSGAETVSEVSVLLDYFKLANLNTDRLATAEFYTTAAPEMFDLIGSQWLGLNDLKAQQVHLEKEITD >NZ_CP044499|1448949:1456967|1453486_1454119_+|WP_151425897.1|DBSCAN-SWA MTLVSNPITTVAVITFIGTTLGVTCILSISAAKSVNGWLGLLSAACFIYAGWSAKNYLAIFEQVAYIITLDLPILLSVKSWNNDTVNHLRKFGTKQWLIAIIGTIVVYGISGWAIGTFTNDPRPWIDALSFAVSLTAGIMCFMRYNNQYIWWTFSSIFQIVLWSITFSQGDATLAMAINSSVYIINDILAFTVSPWFNHGRRRIGLKEIK >NZ_CP044499|1448949:1456967|1451134_1451662_-|WP_057757359.1|DBSCAN-SWA MKLLIVSDSHGDDQILQTLVEHYEGQVDALIHCGDSELSWTDPLRSHFIIVQGNMDFDQNFPLQETTTIADQKILVVHGHRYGVNFGLEQLSLLAQEQAANLVFYGHTHQLACVMDQGRLFLNPGSISQPRGRFVSLKGTYAIVEVADGQIQVQYYQRNLQPVPGLKLTFQQKEH >NZ_CP044499|1448949:1456967|1449742_1450219_-|WP_057757354.1|DBSCAN-SWA MIAKSIQDMLAEKENGFLIPGDKVASVQEDNPLTHAFLLLTKVRYSKIPVLDGQSHLLGLLTIPMITNKMIELDDISQQPLQSLIVKDVMQTEFDTVKDDANMDEVLHLLVDNPFVPVVDADNVFCGILTRREMMKAFNFVAHNIENKYDVTKKASKE >NZ_CP044499|1448949:1456967|1454612_1456967_-|WP_057757369.1|DBSCAN-SWA MNTKVLTTLEFNKIKQKLQPYLRTGMGQELAQALVPVAKRDQVQQRLDETKDGADLLRVKGGLPIAQLQSVAPSLKRLDIGGNLNGPELAAISRNLQATSSVLRFFRDLDLPFQLRALPHLIEQLVGLPEQTQMLRRSIDSDGAVLDEASTKLAAIRKTIHSTETQIRSKMDEYTHGSNAKYLTEPIVTIRDERYVVPVRSEYKHQFGGIIHDQSASGQTFYVEPQSVLNLNNKLRQDQLAEKQEIERIFAELSVMLAPYTNELRHNQTVMGQLDFINAKAHYAAEIKATEPIINANNEVALRQARHPLIDQKKVVSNDIAIGKDYQAIVVTGPNTGGKTITLKTLGLIQLMAQAGLFIPAAEESQIGIFREVFADIGDEQSIEQNLSTFSAHMDNIIQILDQVNDQDLVLFDELGAGTDPQEGASLAIAILDYLGGVGAYVVASTHYPELKLYGYERPGTINASMEFDVESLQPTYRLLIGVPGRSNAFDISKRLGMPEAIVAAAQALMNDASQDLNNMINDLEQQRKQTEAAGIELQQQLADATELHQELSHAWADFNAQRDQLMSKAEDKADELVNDAQKQADEVIDELRQMRLTGRTDVKENQLIDAKGKLNKLHPERQLAHNRVLQRAKKKQELSVGDDVKVLSYGQTGVITQRFNDKQFEVQVGIIKMKLPARDLEKIKPEKTAPQRHIVTVRGSNSHVATQLDLRGQRYEEALANLDQYIDSALLAGYETVTIVHGKGTGAIRQGVQDYLKRNRRVKKYEYAPASAGGNGATLVYFK >NZ_CP044499|1448949:1456967|1451658_1452282_-|WP_057757361.1|DBSCAN-SWA MEKVLVIATQNNGKAREFRAVFEPAGWQVKTLNDFDHLAQVNETGRTFEENARLKADHFAQILKTPVLADDSGLQVDYLHGQPGIYSARYAGEAHNDAANNARLLANLGGVAPEERTANFHTTLVMAWPDRPAADLVVEGNVPGQILTVPRGDDGFGYDPLFYLAELDKTFAEMTAAEKNQYSHRGAAIKNLLPVWQQWWQEQEQVK >NZ_CP044499|1448949:1456967|1448949_1449444_-|WP_057757352.1|DBSCAN-SWA MENVQIVMGSISDWQTLQKTAEVLTDLKIKYETKIISAHRTPARLTEFAELALANGVQLIIAGAGGAAHLPGMLAANTVVPVIGVPVQSQTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGEAGARNAGYLAAQLLGMADPEIQKQLISARQKMAADVLASEEALHHES >NZ_CP044499|1448949:1456967|1450327_1451071_+|WP_057757357.1|DBSCAN-SWA MTYPLAIRLAAEFIGTAIMVLLGNGSVANVDLKGTKGEHGGWILISLGYGAGVMIPALIFGGISGNHINPAFTLGLAFSGLFPWHEVLPYITVQLLGAFVGQAIVVLAYKPYYNMTTNPDSILGTFSTIDNAHSRFNGFINEFVGTYILVFAALGITKAPFFNNNLGTAHLALGFLVMTLVASLGGPTGPALNPARDLSPRILHALLPLKNKSDSHWHYAWVPVVAPILAGILAVFTYKNVFLIWHP |
9 | Lactobacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP044499.1|WP_057755738.1|865170_865353_+|hypothetical-protein |
865170_865353_+
Protein sequences of NZ_CP044499.1|WP_057755738.1|865170_865353_+|hypothetical-protein>NZ_CP044499.1|WP_057755738.1|865170_865353_+|hypothetical-protein MRKGIIGRENQIRWIASVEHRSFDEVNFEMLPFDDDMVETRYQDLFYEYQSLIRQKMILA |
60 aa aa | NA | NA | NA | 816972-897159 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.9|122524|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044499 position: 893061-893027, mismatch: 0 atcgttggttttccagaactaccgtatagctgaaa CRISPR spacer atcgttggttttccagaactaccgtatagctgaaa Protospacer *********************************** 2. spacer 1.40|124570|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044499 position: 892080-892043, mismatch: 1 acagttgcaatcgtcgcatcacttgatgtccaagtaac CRISPR spacer acagttgcaatcgtcgaatcacttgatgtccaagtaac Protospacer **************** ********************* |
|||||||||||||||||||||
| NZ_CP044499.1|WP_057755737.1|865445_866012_+|hypothetical-protein |
865445_866012_+
Protein sequences of NZ_CP044499.1|WP_057755737.1|865445_866012_+|hypothetical-protein>NZ_CP044499.1|WP_057755737.1|865445_866012_+|hypothetical-protein MDISKALHRVEKRLNVTPKVVQTDTHNKYSKSTIYNWWGGSNIKANDAVEVSKAIKDFATANDLASQFFGIFRMLDGDKFKEDALSVEAFAEFEEQEKVDAFSKYHVRKLLASSDLTHAEQKDLYDSACELLDSLLMNYKLLVLICEEQHIDLWDVYKERRKYYINAGYVEPERKEKLWMRRQSQSMD |
188 aa aa | NA | NA | NA | 816972-897159 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.9|122524|35|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044499 position: 893061-893027, mismatch: 0 atcgttggttttccagaactaccgtatagctgaaa CRISPR spacer atcgttggttttccagaactaccgtatagctgaaa Protospacer *********************************** 2. spacer 1.40|124570|38|NZ_CP044499|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044499 position: 892080-892043, mismatch: 1 acagttgcaatcgtcgcatcacttgatgtccaagtaac CRISPR spacer acagttgcaatcgtcgaatcacttgatgtccaagtaac Protospacer **************** ********************* |