Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044497 | Haemophilus influenzae strain PittGG chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,DEDDh,cas3 | 3 | 1 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044497_1 | 380803-381126 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP044497_1
|
5 spacers
spacers of NZ_CP044497_1
>1.1|380831|34|NZ_CP044497|CRT GTTGGTGGGCTAAAGCCCACCCTACAACTACTGA >1.2|380893|22|NZ_CP044497|CRT ATTGGTGGGCTACAACGACTAA >1.3|380943|34|NZ_CP044497|CRT GTTGGTGGGCTAAAGCCCACCCTACAACTACTGA >1.4|381005|34|NZ_CP044497|CRT ATTGGTGGGCTAAAGCTCACCCTACAACTACTGA >1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT GTTGGTGGGCTGAAGCCCACCCTACAACGACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP044497_1
The CRISPR arrays of NZ_CP044497_1 >merge|NZ_CP044497|1|380803-381126|CRT AGCCCACCAAAATATCTCACAATTGTTTGTTGGTGGGCTAAAGCCCACCCTACAACTACTGAAGCCCTCCAAAATATCTCACGATTGTTTATTGGTGGGCTACAACGACTAAAGCCCACCAAAATATCTTACGATTGTTTGTTGGTGGGCTAAAGCCCACCCTACAACTACTGAAGCCCACCAAAATATCTCACGATTGTTTATTGGTGGGCTAAAGCTCACCCTACAACTACTGAAGCCCACAAAAATATCTCACGATTGTTTGTTGGTGGGCTGAAGCCCACCCTACAACGACTAAAGCCCACCAAAATATCACGATTGTTT >NZ_CP044497|1|1|380803-381126|CRT AGCCCACCAAAATATCTCACAATTGTTT GTTGGTGGGCTAAAGCCCACCCTACAACTACTGA AGCCCTCCAAAATATCTCACGATTGTTT ATTGGTGGGCTACAACGACTAA AGCCCACCAAAATATCTTACGATTGTTT GTTGGTGGGCTAAAGCCCACCCTACAACTACTGA AGCCCACCAAAATATCTCACGATTGTTT ATTGGTGGGCTAAAGCTCACCCTACAACTACTGA AGCCCACAAAAATATCTCACGATTGTTT GTTGGTGGGCTGAAGCCCACCCTACAACGACT AAAGCCCACCAAAATATCACGATTGTTT
>NZ_CP044497.1|WP_012055159.1|378989_380735_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MMIDKRLINTVSDSKKWIGVTVLWNWVALVGGIISAVVFSYILQAAYFHELSLLSAVILGILLIAALALRAFAGKKSVQASYFASTKVKHELRSLIYRKLASMPLNQVNQQSTSSIIQVASEGVEQLEIYFGRYLPQLFYSLLAPLTLFVFLIFFSFKTAVILLICVPLIPMSIIAVNKIAKKLLAKYWSIYVGLGSSFLDNLQGLITLKIYQDDAYKAKAMDKEAEHFRKITMKVLTMQLNSVSLMDLLAYGGAAIGILTALLQFQNAQLSVLGVILFILLSSEFFIPLRLLGSFFHVAMNGKAASDKIFTLLDTPVETQQSAVDFEAKNNLQVEIKDLHFSYSEEKPAITGLDVSILPNQLSVFVGKSGCGKSTLVSLLMGFNKAQQGEILFNGQNALNIDRTSFYQKVSLVSHSSYVFKGSLRENMTMAKIDATDEQIYACLEQVNLAHFVCENGGLDMQLLSRGANLSGGQIQRLALARALLHNAELYIFDEATSNIDVESEEIILQFIQQFKQQKTIVMISHRLANAVNADCINVLDQGKLIEQGTHESLMAKQDAYAEMFQQQKDLEQIREVANA >NZ_CP044497.1|WP_012055160.1|377338_378997_-|thiol-reductant-ABC-exporter-subunit-CydC MRKNGFVVMGHLLKLVTPLAHIMAFTITMGTLGFLAAIFIMVLGAMGLVNLLNFDTHLSFSGILTALIVLAVARGVLRYLEQMSGHYIAFKLLALLRDKVFSSLRRLAFVKLQDKQAGQLVSLVTNDIELLEVFYAHTIAPIMIAFFTSAILLLVFAQLSSWFVLVALAAYLTVGVILPIITTKLAREDGRRYRELVGEMNDFFLDSVRGMKEIQLFGYAKQRLDEIQQRSQKIDTAFERIKDQEAKVRVYTEVAVSVFNIIMLFTGLILFSLDKIDFAAFLIGVILLMSSYGPVIALSNLSSNLLQTLASGERVLSLLAEEPELKDVESAVDLKEVSCIDVENVNFAYGEEQILSDVSLSVKKGEILGIHGRSGSGKSTLLKLLMRFYDPKSGSIKINGETLPNINTRSLRDNMAYITQQTYIFNETIEENIRLARRDATLEEIMEAAKKASIHDFILSLPQGYQTKMTELGGNLSDGEKQRIGIARAFLHNAPIILLDEPTSNLDSLNEAMILKSLLNVKAEKLIILVSHRQSTMAICDQVIGIENGRMS >NZ_CP044497.1|WP_005672749.1|376283_377285_+|class-II-fructose-bisphosphatase MNRALAIEFSRVTEAAALAAYTWLGRGDKNAADDAAVKAMRYMLNLIHMDAEIVIGEGEIDEAPMLYVGEKVGSGLGELVSIAVDPIDGTRMTAMGQSNAISVLAAGGKNTFLKAPDMYMEKLVVGSNVKGIIDLNLPLEQNLRRIASKLGKSLSDLTVMVLAKPRHDAVIKQIHNLGAKVLAIPDGDVAGSVLCCLPDAEVDLLYGIGGAPEGVAAAAAIRALGGDMQARLIPRNEVKGDTEENKKIAANEIQRCAALGVKVNEVLKLEDLVRDDNLVFTATGITNGDLLKGISRKGNLASTETILIRGKSRTIRKIQSIHYLDDLYKILNI >NZ_CP044497.1|WP_005650820.1|375903_376122_-|cell-division-protein-ZapB MSLEILDQLEEKIKQAVETIQLLQLEVEELKEKNAESQRNIENLQTENEQLKNEHRNWQEHIRSLLGKFDNV >NZ_CP044497.1|WP_005667635.1|375366_375807_-|FMN-binding-protein-MioC MHICILSGSTLGGAEYVAEHLNDVLETQGFSTALFHGPNLSDIENEKIWLIVTSTHGAGELPDNLKPLFDELANSQKDFSDVRFAVVGLGSSDYDTFCYAADKVEQTLQAKSAVKICETLKIDVLNVDDQESYAEEWLPSFIEGLK >NZ_CP044497.1|WP_006995247.1|374935_375370_-|D-tyrosyl-tRNA(Tyr)-deacylase MIALIQRVSQAKVNVKGETIGKIGKGLLVLLGVEKEDNREKADKLAEKVLNYRIFSDENDKMNLNVQQAQGELLIVSQFTLAADTQKGLRPSFSKGAPPALANELYEYFIQKCAEKLPVSTGQFAADMQVSLTNDGPVTFWLNV >NZ_CP044497.1|WP_005661209.1|374154_374631_+|2-C-methyl-D-erythritol-2,4-cyclodiphosphate-synthase MIRIGHGFDVHAFGEDRPLIIGGVEVPYHTGFIAHSDGDVALHALTDAILGAAALGDIGKLFPDTDMQYKNADSRGLLREAFRQVQEKGYKIGNVDITIIAQAPKMRPHIDAMRAKIAEDIQCDIEQVNVKATTTEKLGFTGRQEGIACEAVALLIRQ >NZ_CP044497.1|WP_005655267.1|373480_374158_+|2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate-cytidylyltransferase MARSIIAVLPAAGVGSRMQADKPKQYLTLLGKTLLEHTLDVMLSYPAVSKIILAVSKDDPYISTLSLDPKIQLVEGGTTRAESVLNGLNAIAEKNAWVLVHDAARPCLQHADIDKLLAIEDKQGAILAIPVTDTIKRADNQQCIVKTEDRSQLWQAMTPQFFPVDILRDALSTGIQQGANITDEASAIELAGFRPHLVAGRSDNLKVTRPEDLALAEFYLTRNKL >NZ_CP044497.1|WP_005661211.1|373202_373481_+|cell-division-protein-FtsB MRLLILILLSVLVLFQYNFWFGSNGFLDYRQNAEKIKENQAENEKLSQRNQRINAEIQGLTKGFEAIEERARMQHGLVKENEVFYHIVKESK >NZ_CP044497.1|WP_005632242.1|372612_373080_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MSEKYVVTWDMFQMHARKLSERLLPASQWKGIIAVSRGGLFPAAVLARELGLRHIETVCIASYHDHNNQGELQVLHAAQVPNGGEGFIVVDDLVDTGNTARAIRQMYPNAKFVTVFAKPAGAELVDDYVIDIPQNTWIEQPWDLGLTFVPPLSRK >NZ_CP044497.1|WP_012055158.1|381335_384383_+|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor MTNFRLNVLAYSVMLGLTASVAYAEPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQDSNVSEQLEQINVSGSTENSATKTPPKIAETVKTAKTLEREQANNIKDIVKYETGVTVVEAGRFGQSGFAIRGVDENRVAINIDGLRQAETLSSQGFKELFEGYGNFNNTRNGAEIETLKEVNITKGANSIKSGSGSLGGSVIYKTKDARDYLLNKDYYVSYKKGYATENNQSFNTLTLAGRYKKFDALVVTTSRNGHELENYDYKNADSLTQGKKREKADPYKIEQDSTLLKLSFNPTENHRFTLAADLYEHRSRGQDLSYTLKYQRSGHETPEVESRHTNDKTKRRNISFSYENFSQTPFWDTLKITFSKQKIKTRARTDEYCDAGVRYCEGTANPAGLKLKNGEITRRDGSELQFKEKEKNNSTPSNNDKIYDFKKFIDTDDQVIEDKLALRRASETWYDCLIFNCEKDTKIKVFEGEKHYGHDGKWKEFDLEIEELNGKKFAKIKNAGYKTRSIIPSSPGFLENLWQERDLDTNTQQLNLDLTKDFKTWHIEHNLQYGGSYNTAMKRMVNRAGYNASDVQWWATPTLGKDSWTGKPHTCATSSDAYNANLCPHVDPEFSYLLPIKTTGKSVYLFDNFVITDYLSFDLGYRYDNIHYQPKYKHGITPKLPDDIVKGLFIPLDNSQSNNSAKVKENVQQNIDYIAKQNKKYKAHSYSFVSTIDPTSFLRLQLKYSKGFRTPTSDEMYFTFKHPDFTILPNTDLKPEIAKTKEIAFTLHNDDWGFISTSLFKTNYKNFIDLIFKEKRSFKVGKPGSQGETLPFSLYQNINRDNASLKGIEINSKVFLGKMAKFMDGFNLSYKYTYQKGRMNGNIPMNAIQPRTMVYGLGYDHPNHKFGFDFYTTHVASKNPEDTYNMFYKEEKKTDSTIKWRSKSYTILDLIGYVQPIKNLTIRAGVYNLTNRKYITWDSARSIRSFGTSNVIEQTTGLGINRFYAPGRNYKMSVQFEF >NZ_CP044497.1|WP_005694481.1|384652_385012_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MYEILFYRDQNDIEPVKEYLLSLAQNESKDSRIKLNKIRDYVKLLSELGTSVGKPYVKHLDGEIWELRPIRDRILFARLMDGRFVLLHQFMKKTQKTPKREIQTAQQRLSELKERLKNE >NZ_CP044497.1|WP_005650837.1|385004_385301_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNKISPLGSNWNEFEQQIFNEEEIRESNLRVALIKELITSRQQLGISQKQLETLSGVKQPMIARIEKGQTNPQLETLLKLLAPLGKTLSIVPLRVKNA >NZ_CP044497.1|WP_012055157.1|385461_387378_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIIFSNLSLKRGQTELLENASATINPKQKVGLVGKNGCGKSSLFALLKKELMPEGGEVNYPANWRVSWVNQETPALDISAIDYVIQGDREYCRLQQELERANERNDGNAIARIHGQLETLDAWTIQSRAASLLHGLGFSQEETIQPVKAFSGGWRMRLNLAQALLCPSDLLLLDEPTNHLDLDAVIWLERWLVQYQGTLVLISHDRDFLDPIVTKILHIENQKLNEYTGDYSSFEVQRATKLAQQTAMYRQQQQKISHLQKYIDRFKAKATKAKQAQSRMKALERMELIAPAYVDNPFTFKFRPPQSLPNPLVMIEQASAGYGSGESAVEILSKIKLNLVPGSRIGLLGKNGAGKSTLIKLLAGELTALSGTVQLAKGVQLGYFAQHQLDTLRADESALWHMQKLAPEQTEQQVRDYLGSFAFHGDKVNQAVKSFSGGEKARLVLALIVWQRPNLLLLDEPTNHLDLDMRQALTEALVDYEGSLVVVSHDRHLLRNTVEEFYLVHDKKVEEFKGDLEDYQKWLSEQNSTSENKVSEKVGDNENSVQNRKEQKRREAELRQQTAPLRKKITQLEEKMNKFSSELANIENQLADAELYNAENKEKLTALLAQQVDVKKALDDVETEWMTAQEELEEMLQA >NZ_CP044497.1|WP_012055156.1|387387_387924_+|hypothetical-protein MNQSLFHHSKQQEYCPQCGAPLQIKQGKKGLFLGCSAYPECDYLRPLQRAEHKVLKTLDEICPKCSNLLQLKQGSFGMFIGCSHYPECDFVVREESESEEKITCPECKTGHLISRRGRQGKIFYGCDNFPKCKFSLPAKPYSVPCPTCHFPLSLLKSENGEKQIFQCANKTCRHIFEQ >NZ_CP044497.1|WP_012055155.1|387939_388491_+|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MNREQIADALRQNQVVAYPTEAVFGLGCNPQSESAVKKLLDLKQRPVEKGLILVAPSLDFFRPFVDFEQINDEQLSRLQGKYERPTTWIVPAKSTTPHFLTGKFDSIAVRLCDHPSVKALCEITGFALTSTSANLTGEPPCRIADEVRSQFGADFPVLDEMVGRAHNPSEIRDLRTNQLFRQG >NZ_CP044497.1|WP_012055154.1|388494_389301_+|shikimate-dehydrogenase MDLYAVWGNPIVQSKSPLIQNKLATQTHQTIEYIAKLGDLDAFEQQLLAFFEEGAKGCNITSPFKERAYQLADEYSQRAKLAEACNTLKKLDDGKLYADNTDGIGLVTDLERLNWLRPNQRVLILGAGGATKGVLLPLLQAQQNIVLANRTFLKAKELAERFQPYGNIQAASMDSIPLQTYDVVINATSAGLSGGTAPVDAEILKLGSAFYDMQYTKGTDTPFIALCKSLGLTNISDGFGMLVAQAAHSFHLWRGVMPNFVAVYEQLK >NZ_CP044497.1|WP_012055153.1|389312_390071_+|DUF3800-domain-containing-protein MENKYSDFMVYVDESGDHSLQSIDKNYPVFVLAFCIFYKDHYRNNIVPQIQKLKFDYFGHDMVILHEHEIRKEKGDFNIFTSREQREEFMERISSIIEKTNFILAACVIDKRKIPQNETTHPYHFSLKHCLETLYEFVCEKHQEDKITFVAVESRGRNEDRELELEFLRICDGQNKFKKSLPFQVKIVPKQINSVGLQVADLVARPIGRHILDSNQPNRAFEILKKKFYCEGGRKILGENFDQKGLKHFPYS >NZ_CP044497.1|WP_041174862.1|390180_390744_+|DNA-3-methyladenine-glycosylase-I MQQITRCPWVGEQPIYIDYHDKEWGKPEFDSQKLFEKICLEGQQAGLSWITVLKKRESYRVAFHQFDPKKIATMTALDIDDCMKNAGLIRHRAKLEAIVKNAKAYLEMEKCGENFSDFIWSFVNHKPIVNDVPDLRTVPAKTEASKALSKALKKRGFVFVGETTCYAFMQSMGLVDDHLNDCPCKTR >NZ_CP044497.1|WP_012055151.1|390740_391505_-|glycosyltransferase-family-2-protein MPTISVAMIVKNEAQDLANCLDTVKNWVDEIIILDSGSTDNTKEIALSYGAKFYENRDWQGFGKQRQLAQQYVTSDYVLWLDADERVTPKLQRAILSAVKNNRENTVYEIPRVSEVFGREIRHSGWYPDYVVRLYRTNYAQYNDSLVHEKVEFPAGTKVEKLTGDLEHFTYKSIHHYLVKSAGYAKAWADQRQAKGKKATLWQGITHALGCFVKMYLLKAGFLDGKQGFLLAVLSAHSTFVKYADLWERDQHKH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044497_1 | 1.1|380831|34|NZ_CP044497|CRT | 380831-380864 | 34 | NZ_CP044497.1 | 443843-443876 | 2 | 0.941 |
NZ_CP044497_1 | 1.3|380943|34|NZ_CP044497|CRT | 380943-380976 | 34 | NZ_CP044497.1 | 443843-443876 | 2 | 0.941 |
NZ_CP044497_1 | 1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT | 381067-381098 | 32 | NZ_CP044497.1 | 381127-381158 | 2 | 0.938 |
NZ_CP044497_1 | 1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT | 381067-381098 | 32 | NZ_CP044497.1 | 411404-411435 | 2 | 0.938 |
1. spacer 1.1|380831|34|NZ_CP044497|CRT matches to position: 443843-443876, mismatch: 2, identity: 0.941
gttggtgggctaaagcccaccctacaactactga CRISPR spacer gttggtgggctttagcccaccctacaactactga Protospacer *********** *********************
2. spacer 1.3|380943|34|NZ_CP044497|CRT matches to position: 443843-443876, mismatch: 2, identity: 0.941
gttggtgggctaaagcccaccctacaactactga CRISPR spacer gttggtgggctttagcccaccctacaactactga Protospacer *********** *********************
3. spacer 1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT matches to position: 381127-381158, mismatch: 2, identity: 0.938
gttggtgggctgaagcccaccctacaacgact CRISPR spacer gttggtgggctgaagcccagcctacaactact Protospacer ******************* ******** ***
4. spacer 1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT matches to position: 411404-411435, mismatch: 2, identity: 0.938
gttggtgggctgaagcccaccctacaacgact CRISPR spacer gttggtgggctaaagcccaccctacaactact Protospacer ***********.**************** ***
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP044497_1 | 1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT | 381067-381098 | 32 | NZ_CP025432 | Paracoccus zhejiangensis strain J6 plasmid pPZ02, complete sequence | 22283-22314 | 10 | 0.688 |
1. spacer 1.5|381067|32|NZ_CP044497|CRT matches to NZ_CP025432 (Paracoccus zhejiangensis strain J6 plasmid pPZ02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gttggtgggctgaagcccaccctacaacgact CRISPR spacer tagggcgggctgaagcccgccctacaggcgat Protospacer **.************.*******. . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
660604 : 712681
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP044497|660604:712681|DBSCAN-SWA 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72 | Mannheimia_phage(12.2%) | plate,integrase,head,tRNA,terminase | attL 655383:655399|attR 692177:692193 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1422181 : 1439595
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044497|1422181:1439595|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP044497|1422181:1439595|1432267_1432546_-|WP_011272618.1|DBSCAN-SWA MNHLLTFYEKIIFTNPLETGIPEAVAKLALLNDYSALRAWREHLGLTQAEVASRLGISQAAYSQHENSQTLRKSTRIKIATALGINSAQLDF >NZ_CP044497|1422181:1439595|1423227_1423668_+|WP_074040106.1|DBSCAN-SWA MEMKKVIIEMIDRIPGGKSAVAGFLGFTESELNNRLYQTKGQRFKNEELIALQLEYGCTDFIDELCRNAGGRFVPDVAEDELDKVELANLQLRELSARGLLFAALEKALEDGEITSKEEDKIRQALSKHLAATQHSIECAIVLHKK >NZ_CP044497|1422181:1439595|1438698_1439595_+|WP_112083119.1|DBSCAN-SWA MALVNKPDESIFASSAKQGEVDNFPDLLRGWGITFDQTQGIPPMEWFNFLFKRLDEKHTYLMQRGLPEWSATQDYTKGSCVQFDGISYRALKNSKNNSPNESDSQYWVRWGFALSEITRATLQQYGIVQLSSATNSDSETEAATSKAVKTAYDKAVEAKTTAESKVGLRGNESIQGTKSFESKIIGFRGIGVADSQTYANANHLLNMGANDGDGWIEYKKINRAIGTIRIRANGELSYNNQKIYHAGAKPQFNTDIEGKPNTLAGYGIGNFKVEEFRGNLNELLTALEQEIEQWQFPT >NZ_CP044497|1422181:1439595|1426528_1427095_+|WP_011962088.1|DBSCAN-SWA 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MNILDGIKSLALKLGSKQDQTYYARGLSLTDDLMQIEALWRDNWIANKVCIKRSEDMVRNWRDIFSNDLKSEQLDEFTKLERRLKLRETLTKALQWSSLYGAVGLLLVTDTINITSPLQPTERLKRLIILPKWKISPTGQRDDDVFSPNFGRYSEYTIIGGTQSVLVHHSRLLIINANDAPLSDNDVWGVSDFEKIIDVLKRFDSASANVGDLIFESKIDIFKIAGLSDKISAGLENDVAHVISAVQSIKSATNSLLLDAENEYDRKELSFGGLKDLLTEFRNAVAGAADMPVTILFGQSVSGLASGDEDIQNYHESIHRLQETRLRPVLEVLDTLLCNELFGGQPDDWWFEFLPLTVVKQEQQVNMLNTFATAANTLIQNGVVNEYQVANELRESGLFANISADDIEEMKNADELAQKF >NZ_CP044497|1422181:1439595|1438233_1438689_+|WP_011962076.1|DBSCAN-SWA MSYAYEQAPARAGEVGKHVGQFRVINGYQLRKFFGFRNSPNALGFSQKRLGGAQWYRKRDPLSDSVRLSDDDYRFLIKCRILKNYQIGTLPNLIEACLFIFGEGCHIVDNYDMTVSISVPNAITSDFKKFAINHLDILPRQAGVQYLFNLI >NZ_CP044497|1422181:1439595|1427785_1428154_+|WP_011962086.1|DBSCAN-SWA MSYSVERVLEKWGNCWGRDRIGTEYPSTTISIPVLPTVRKAHIRFLTDDECLKIEEQIMNLHEDSLLQYQILMALYVQQANERDICTALHISPACMYRERAKGVRFLKGAFTGAKIKFMFLG >NZ_CP044497|1422181:1439595|1422181_1422880_-|WP_048955182.1|DBSCAN-SWA 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MLNQLKQSLRLNLALTLVCLSLFLTDCTKKITTKAEYIYPPQAYTAPCVKTAFTGETYGDVVIQLVKVTAERDKCASQVDHLNKWINQAKGGK >NZ_CP044497|1422181:1439595|1426020_1426440_+|WP_074040113.1|DBSCAN-SWA MSQYKPFFLRDQRIKNNCLDLIKELPTDDKKPLVVKIQAITRNLEQNAKFHAMCQDVANQAEFMGRKLTMEQWKVLFISGHAIATNQKADVVPGLEGEFVNIRESSAQMSISRMASLIEYVTAYGVANGVKFNDRWGFK >NZ_CP044497|1422181:1439595|1435798_1436980_+|WP_041174838.1|DBSCAN-SWA MTNDVERALQQPQGSFFMDDAKGFQAISARALMKVLEKYEKSDRTSQAENIANGFVGRGDAQNHAEVSTNLKNQTGIDLSAYLRNSPNIAERVNALTAGNIQLIKSIRAQYLDKVQNAVMQAMVRGSLNKDLAAQIKDLGKTTEKRAMFIARDQSSKLNAALTQVRHEEVGIKKYMWSASLDERVRESYAEKDGQIFEYANPPADTGHPGHDVNCRCVQIPVLDDVVNLKSEETELSYQAAEPNKTGKMDLDELFESSIGGGGNKSFSNFGGVNSELIALAKESIGLDITDWQHSIDESSIRHILKQHGNEKAENKRGQRAVTKKDILLLPLVVSAFDSIEYTGTSDSGNETFLIKKEIDDEIFSVQEVRKRHKKIAVKTMWIKRKKKATSSA >NZ_CP044497|1422181:1439595|1425759_1425984_+|WP_005650520.1|DBSCAN-SWA MTSYKCPKCGAELEDFYTPDYFISSSEWDDDRFRCNGHLIEPIPFPQVSKFSAVNRTKSCGYFGLEDLGVEYKE >NZ_CP044497|1422181:1439595|1428980_1429439_+|WP_011962084.1|DBSCAN-SWA MGRRDNIKANLAKLKERFPNVFFDTKPLVPTIIDDMLAVLGDDELSKVVRGAMRYYLDSPSYLKRFVRRKWIRDVNGSKVRLITAEEKQLARERLNQINEHNSKANAEYRFAIALARETNIEYKKVELLEQKNPEKSKVVVIHRRTPKIKSE >NZ_CP044497|1422181:1439595|1437120_1438221_+|WP_011962077.1|DBSCAN-SWA MKFTDKTTQAATQRTITKDGFLVVPATISKIGVFDYLATELGLKEDGIKKVARTEKSLFNDETIKSFENATLTVGHPKDGVNAKNWKQLSVGVVRNVKRVGDELTAEAWIYDEQAIKTVQEHGVEQLSCGYDCDIKPSTVQDADFEMSPMIGNHVAIVAKGRCGGSVKLADEDKTIMGKTAKILNAFLGAFGIKLSDEQKKQIEDEEKSGSEEGKEPKGEQPTELKEKQSEPENKKEDDVEKEELEKRLKAKDEEIQALKEAQAKRDAEVKQAAVLADAKTAFKEVNFADNATVREIQESTVVAQGIFTKDEAAKLSDEEISGAYQTAKAVVAKLADERKSLGSILLGDAEPKAAPKIDFNKTYNS |
22 | Haemophilus_phage(57.89%) | terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1522312 : 1535220
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044497|1522312:1535220|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP044497|1522312:1535220|1532976_1535220_+|WP_011962019.1|DBSCAN-SWA MTNINYEGIEQMPLRTFTEKAYLNYSMYVIMDRALPFIGDGLKPVQRRIVYAMSELGLNATAKYKKSARTVGDVLGKFHPHGDSACYEAMVLMAQPFSYRYPLVDGQGNWGAPDDPKSFAAMRYTESRLSKIAEILLSELGQGTVDYQPNFDGTLAEPQYLPARLPHILLNGTTGIAVGMATDIPPHNINEIADAAVMLLDNPKARLDDVLEIVQGPDFPTEAEIISPKSEIRKIYEQGRGSIKMRATWKKEDGEIIISALPHQSSPSKVIAQIADQMTAKKLPMLEDIRDEADHENPIRIVLVPRSNRVDTDALMAHLFATTDLEKSYRVNMNMIGLDHKPAVKGLLEILNEWLTFRRTTVTRRLQYRLDKVLSRLHILEGLMIAFLNIDEVIEIIRHEDDPKAELMARFNLSDEQADAILNLRLRHLAKLEENQLKAEQDELEKERLNLEAILGSERRLNTLIKKEIQEDAKKYASPRMSQLVEREEAKMISESDMTPAEPVTVILSEMGWVRCAKGHDIDPKSLSYKAGDSYLAHACGKSNQAVVFIDSTGRSYALDPLSLPSARSQGEPLTGKLNLPTGATIEYVVMASEQQELLMASDAGYGFICKFEDLIARNKTGKALISLPENAKVLKPKTLINSTALVVAITSAGRMLIFPAQDLPVLSKGKGNKMITIPAANAKDRSELLTKLLLISDQASLEFYSGKRKIVLKPEDLQKFRAERGRKGSTLPRGLHTNLEIMVVEP >NZ_CP044497|1522312:1535220|1530003_1530939_+|WP_011962020.1|DBSCAN-SWA MKNEKLPQFQPHFLAPKYWLFWLGVAIWRSILCLPYPILRHIGHGFGWLFSHLKVGKRRAAIARRNLELCFPDMPENEREAILQENLRSVGMAIIETGMAWFWSDSRIKKWSKVEGLHYLKENQKDGIVLVGVHFLTLELGARIIGLHHPGIGVYRPNDNPLLDWLQTQGRLRSNKDMLDRKDLRGMIKALRHEETIWYAPDHDYGRKNAVFAPFFAVPDACTTTGSYYLLKSSQNSKVIPFAPLRNKDGSGYTVSISAPVDFTDLQDETAIATRMNQIVEKEIMKGISQYMWLHRRFKTRPDEKTPSLYD >NZ_CP044497|1522312:1535220|1528476_1529907_-|WP_011962021.1|DBSCAN-SWA MAQYSAEFKQAKVLVLGDVMLDRYWFGATNRISPEAPVPVVRVQENEERAGGAANVAMNIASLNVPVQLMGLIGQDETGSALSLLLEKQKIDCNFVALETHPTITKLRILSRHQQLLRLDFEEDFNNVDCKDLLAKLESAVKNYGALILSDYGKGTLKDVQKMIQIARKANVPVLIDPKGTDFERYCGATLLTPNMSEFEAVVGKCNTEEEIIKKGLKLISDIELTALLVTRSEKGMTLLRPNQEPYHLPTVAKEVFDVTGAGDTVISVLATALADGRSFEESCYLANVAAGIVVGKLGTSTVSTVELENAIHARPETGFGIMSEAELKDAVAQAKARGEKIVMTNGCFDILHPGHISYLENARKLGDRLIVAVNSDDSVKRLKGESRPINNLENRMAVLAGLASVDWLVPFTEDTPQHLIGEILPDLLVKGGDYKPEEIAGSKEVWANGGDVKVLNFENGCSTTNVIEKIKLLKD >NZ_CP044497|1522312:1535220|1522312_1523461_+|WP_005694012.1|DBSCAN-SWA MVKLGRKPKLVENQLQNKPIIELRSIKKSYGSNTIINDFNLTINNGEFVTILGPSGCGKTTVLRLLAGLEELDSGSIILDGEDITNVPAEKRHINTVFQSYALFPHMTIFENVAFGLRMQKVPNEEIKPRVLEALRMVQLEEMADRKPTQLSGGQQQRIAIARAVVNKPKVLLLDESLSALDYKLRKQMQQELKMLQRQLGITFIFVTHDQEEAITMSDRIVLLRKGKIAQDGSPREIYEDPANLFVARFIGEINVFEATVIERKSEQVVLANVEGRICDIYTDMPVEKDQKLQVLLRPEDIVIEELDENEHSKAIIGHIIDRTYKGMTLESTVEFDHNGMRVLVSEFFNEDDPHMDHSIGQRVGITWHEGWEVVLNDEDNQ >NZ_CP044497|1522312:1535220|1526367_1526952_-|WP_080491702.1|DBSCAN-SWA MLLKPNNLLILDEPTNDLDVETLELLEEILTDYQGTLLIVSHDRQFIDNTATECYLFEGEGRLNKYVGGFFDAKQQQTNFWASKAVEEQAKAKKSEPLKEESAVKNDRTSKPKSVKLSYKEQRELEQLPQLLEELETKITVLQAEIADPAFFQQAHDITDAKLKALADTEAELETAFLRWEELEEKKNLTDGKA >NZ_CP044497|1522312:1535220|1528044_1528284_-|WP_005655119.1|DBSCAN-SWA MSLTYLDLFSGAGGLSLGFDYAEFRQLLSIELEPVYCETYRVNFPHHRVLQQDLTQLSNEQASLYRSDIPNRGIAGVEE >NZ_CP044497|1522312:1535220|1526924_1527449_-|WP_074039479.1|DBSCAN-SWA MQNRTTKLSALSGGWVRKAALARALVCDPDVLLLDEPTNHLDVEAIEWLENFLLDFQGSIVFISHDRSFIRKMATRIVDLDRGQLRSYLGNYDLYLTTKEENLRVEALQNELFDKHLAQEEVWIRQGIKARRTRNEGRVRALKAMREERQLKPYRGENEIVYCSQNCCSNQIIY >NZ_CP044497|1522312:1535220|1524304_1525075_+|WP_005650699.1|DBSCAN-SWA MSRLLRNAFMFVVYAYLYIPIIILVTNSFNKDRYGLSWKGFSWNWYERLFNNDTLIQAAIHSVTIAFFAATLATIVGGLTAIALYRYRFRGKQAVSGMLFIVMMSPDIVMAVSLLALFMVVGISLGFWSLLLAHVTFCLPYVTVTIFSRLNGFDSRMLEAAKDLGASEVTILRKIILPLALPAVVSGWLLSFTISLDDVVVSSFVSGVSYEILPLRIFSLVKTGVTPEVNALATIMIVLSLALVVLSQLITRKNNH >NZ_CP044497|1522312:1535220|1523444_1524305_+|WP_015702226.1|DBSCAN-SWA MKIINNKFQKITVAIIFSWLIFFVLIPNLLVLAVSFLTRDGSNFYAFPITIENYTNLFNPLYAQVVWNSLSMSGIATIICLLIGYPFAFMMSKIHPKYRPLLLFLVVLPFWTNSLIRIYGMKVFLGVKGILNTMLIDMGILSAPIRILNTEIAVIIGLVYLLLPFMILPLYSAIEKLDHRLLEAARDLGANTFQRFFRVILPLTMPGIIAGCLLVLLPAMGMFYVADLLGGAKVLLVGNVIKSEFLISRNWPFGSAVSIGLTVLMALLIFVYYRANKLLNKKVELE >NZ_CP044497|1522312:1535220|1525147_1526287_+|WP_005659551.1|DBSCAN-SWA MPVIRQVVFYDSLTGEQTKMKKFAGLITASFVAATLTACNDKDAKQETAKATAAANDTVYLYTWTEYVPDGLLDEFTKETGIKVIVSSLESNETMYAKLKTQGESGGYDVIAPSNYFVSKMAREGMLKELDHSKLPVLKELDPDWLNKPYDKGNKYSLPQLLGAPGIAFNTNTYKGEQFTSWADLWKPEFANKVQLLDDAREVFNIALLKIGQDPNTQDPAIIKQAYEELLKLRPNVLSFNSDNPANSFISGEVEVGQLWNGSVRIAKKEKAPLNMVFPKEGPVLWVDTLAIPVTAKNPEGAHKLINYMLGKKTAEKLTLAIGYPTSNIEAKKALPKEITEDPAIYPSADILKNSHWQDDVGDAIQFYEQYYQELKAAK >NZ_CP044497|1522312:1535220|1531011_1532910_+|WP_074039474.1|DBSCAN-SWA MTTNYSAQEITVLKDLEPVQIRPGMYTDTTRPNHLAQEVIDNSVDEALAGFATKIEVILHPDQSIEVTDNGRGMPVDIHPTEGVSGVEVILTKLHAGGKFSNKNYEFAGGLHGVGISVVNALSERMDIQVKRNGEVYKIAFENGSKVEELEIIGTCGRRTTGTTVHFKPNPKYFDSAKFSVSRLRHLLRAKAVLCPGLEIKFIDKVNNTQDIWLYEDGLSDYLIEAVNGFETLPKKPFVGEFKGANEAVSWALLWLPEGGELIGESYVNLIPTIQGGTHVNGLRQGLLDSIREFCEFRNLLPRGVKLTADDIWDRCSYILSLKMQDAQFAGQTKERLSSRQSAVFVSGVLKDAFSLWLNQNVQDAEKLAEIAISSAQRRLRAAKKVVRKKLVSGPALPGKLADCGSQDLEKTELFLVEGDSAGGSAKQARDREYQAILPLRGKILNTWEVSPDQVLGSTEIHDIAVALGIDPDSNDLSQLRYGKVCILADADSDGLHIATLLCALFLRHFPKLVQDGHVYVAMPPLYRIDLNKEVFYALDENEKEAILDRLKNKKGKPNVQRFKGLGEMNPSQLRETTMDPNTRRLVQLTYDLGEDQGSDTLELMDMLLAKKRSEDRKNWLQAKGDQVDLSV |
11 | Mycoplasma_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1686657 : 1695170
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044497|1686657:1695170|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP044497|1686657:1695170|1692294_1693182_+|WP_005653671.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >NZ_CP044497|1686657:1695170|1688788_1689022_+|WP_012055447.1|DBSCAN-SWA MRGKRIKSLFINSIKIAFKVYGFDVEFKDIGESRLILFLKCSTLLLIYSQILLFHKIDGTIITVNLNRLKIVYDGYF >NZ_CP044497|1686657:1695170|1689005_1691189_+|WP_112083313.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLVGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGQVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGNRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >NZ_CP044497|1686657:1695170|1691308_1692280_+|WP_020910114.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEILMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGMPGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NZ_CP044497|1686657:1695170|1687759_1688395_+|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NZ_CP044497|1686657:1695170|1687333_1687759_+|WP_005663812.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYKSGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NZ_CP044497|1686657:1695170|1693191_1694184_+|WP_005694258.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NZ_CP044497|1686657:1695170|1686657_1687341_+|WP_074039407.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENVEAITFQYGQRHAIELEKARTIAQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_CP044497|1686657:1695170|1694186_1695170_+|WP_005663823.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1826391 : 1835457
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044497|1826391:1835457|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAAAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAGGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTCATTAGTATTGTGTGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAAATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGACGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCAATGGCATTACGCGTAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCTGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGCACTGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACCAAACCTCACACCATTGTGGATAAACCACAAGCATCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACAATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTACTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCCTACGCAGCCAAATCGGTTTAGTGACTCAAGACACTTCGTTGCTGCATCGTTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCGAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCGGCTGATTTCATTCCATTCCTCACTGATGCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCTCATGTTGGAGAACGAGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGCGTATTGCTATTGCTCGTGTCATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGCGCACTGGATTCTGAAGTGGAAGTGGCGATACAAGAAAGTCTCGATAAGATGATGGAAAATAAAACAGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGTCTAATCGTACTTGATAAAGGACAAATTGTTGAACAAGGTACGCACGCTGAATTACTAGAACTCAATGGCTTATATGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGGAAGTGCTGAATAATATTGCGTTTATCATATTTAATTAATTGCACTGTAATCAAACTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTAAATTTCACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATCGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACTTTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTGAAATAACGCCATCGATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCGCAAAGCTGGCAATTCATTTCTTTTACTTTTAGTACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAGAAATGGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGCAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACGATAAATATAATCCAATATAAAACGATGAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCGCATAATGAAATTATGAGCATGGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCCAAACCAATCAACCAAGTGGACGAGACACCAAATACTAAATAGATTAATGGCACAATACAGCATAAAGTTGACGCCACCGCGGCACTAAGTGCGGTGGCTATGGCAATCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGAGACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGATCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCCACTTCTGCGTATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCAAAGTCACGGGCATGATTAAATCCGACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCCTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCAGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCCACTGGTACCCAACCAAAACCAGCAAGGTAGAATTCAGCACGGCAGTGCTGACCGCCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTCGCACTACCGAAAGCACCTTTGGAATATTTACCCATTTTCTCTGCCGCACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGGGCTGGAATGTCTGCCGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAATACGCCAGTAGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCGCCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAATGGTGAATAAGTTCTGCTTTTTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTACGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATACCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTACTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATAGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATCGTGACTTTTAAATCACGTTTTTGTGCATCTTTATCCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCACCGTATTTATTGTTTTCTGTTATATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATTGATTTCACTTGTTGGTATTCTCCATTAAATGGCAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTAGTGCAACTAAATCGTAGGTTTGAGTGAATTCGTAAAGATGGGAGTCTGTATTGTAGTTTGGAATAATGGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACACGCAGAAAACACCGCAACCGCGATAAGTTTCTTCATGAAAAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAATACGCCACTATGCTAACGGATTTTTAAATCTATAGTCAATTTGTTATTCCAAAATTTATAAAAACATCAACCTACTAAAATACCCTATAAATAATGTACCTATTAATAATTAGTTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTACTCAATCTTACTGTGGGGGACGATATTATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAATACCTCAATGAAAATAGCCAGGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGGGTGTATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGTAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATCAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCAGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCAGGCACTGATGCAGCCCTCGTTTCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCTGCGGATGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTAATGATGGTATCGCTAAAACCCCAGAATGGGCGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP044497|1826391:1835457|1828359_1828638_-|WP_005651690.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNIDGVISTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NZ_CP044497|1826391:1835457|1828646_1828964_-|WP_074039468.1|DBSCAN-SWA MATALSAAVASTLCCIVPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIIFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >NZ_CP044497|1826391:1835457|1830345_1832766_+|WP_074039464.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQYLNENSQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVSALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >NZ_CP044497|1826391:1835457|1832775_1833393_+|WP_005669796.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRIKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRAKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKHARLSSDTSGFLGNPREV >NZ_CP044497|1826391:1835457|1828983_1830093_-|WP_012055371.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVFSACGSLAHANTIIPNYNTDSHLYEFTQTYDLVALKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYITENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKIVGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAADIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >NZ_CP044497|1826391:1835457|1833394_1834234_+|WP_012055369.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIATGAIFFALAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVLLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG >NZ_CP044497|1826391:1835457|1826391_1828236_+|WP_012055373.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKGHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNNITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRSQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLTDAQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSGSAE >NZ_CP044497|1826391:1835457|1834956_1835457_+|WP_012055367.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQFRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NZ_CP044497|1826391:1835457|1834345_1834957_+|WP_012055368.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTYKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENQPHLLIEFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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