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NZ_CP045156 | Yersinia pestis strain SCPM-O-B-5935 (I-1996) plasmid pCD, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP045157 | Yersinia pestis strain SCPM-O-B-5935 (I-1996) plasmid pPCP, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 96100
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>NZ_CP045155|0:96100|5863_6130_-|WP_000920226.1|DBSCAN-SWA MLKSIINGGATTPTMLAKEIVFCHGEHAVVALPNILGAAGISATEREFALVSEQVVKIIARVAKHLNHDAIKFDEAAASKRINESKGA >NZ_CP045155|0:96100|81052_82309_-|WP_002211787.1|terminase|DBSCAN-SWA MAIPSSLSLVQLHSGQMQVFQSPHRFKVVCAGRRWGKSRLSISTIIRAAAKEKKQRVWYVAPTYQMARQILWDDLQEVLPRKWVRKKNDTTMTIVLKNGSEIALKGADKPDTLRGVALHFVVLDEFQDMKPDTWYKVLRPTLSSTRGGALIIGTPKGFSEFHKLWTIGQNKDLQRKGQWKSWQFVTADSPFVPSAEIEAAKNDMDPKSFAQEYLASFENMSGRVYYPFDRNVHVKPLQFNPKLPIWVGQDFNIDPMSSVILQPQPNGELWAVDEVVLFSSNTAEVCDELERRFWRWKSQVTIFPDPAGAYRQHARGESDVDIFKEKGFLRVDYPKKHPPIADRVNAVNRMLMSASGETRLYIDPKCKHLIDSLEKVIYKPGSRDMDKTGGIEHSADALGYPVHRRYPVKNRVILGGSR >NZ_CP045155|0:96100|6129_7074_-|WP_002225551.1|DBSCAN-SWA 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95 | Salmonella_phage(78.38%) | integrase,terminase,tail,transposase | attL 13549:13566|attR 26607:26624 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP045154_1 | 259346-259458 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045154_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP045154_1
>1.1|259373|59|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder GGACGTCAACAACCCATTCAAAATCAAAAACGTATTAAAAGCCTAAGGATGATGGTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045154_1
The CRISPR arrays of NZ_CP045154_1 >merge|NZ_CP045154|1|259346-259458|CRISPRCasFinder CTTCACTCGGCTGCTCAAATGTGCTTTGGACGTCAACAACCCATTCAAAATCAAAAACGTATTAAAAGCCTAAGGATGATGGTCTGGCTTCACTCGCTGCTCAAATGTGCTTT >NZ_CP045154|1|1|259346-259458|CRISPRCasFinder CTTCACTCGGCTGCTCAAATGTGCTTT GGACGTCAACAACCCATTCAAAATCAAAAACGTATTAAAAGCCTAAGGATGATGGTCTG GCTTCACTCGCTGCTCAAATGTGCTTT
>NZ_CP045154.1|WP_100067904.1|257781_259136_-|IS3-like-element-IS1661-family-transposase MKHPFSTRLAAVQHYLSGKATLRETARQFSVGKSPLTRWIRAFRRQGEAGLEHHLSRTYTPEFRLCVVRYMMANRCSAADASAHFNIPNETIIQNWMKRYREGGKEALNPSKTGPTMPKDKYEHDSKPFSEMTHAELEKELEYLRAENAYPKKAESPERRKGTQGAAEKTRIVQALTAEHRLSCLLCAAKLARSTYYYHASKPDGVIDDYADAVKAIGALSRRHAQRYGYRRMTVALRKEGFTLNHKTVRKLMNQHGLLSLIRRKKYRSYRADGGRASDNLLARNFTSEISGLKWCTDVTEFRVGAQKLYLSVIQDLFNNEIISWHMSERAALILTCKTLEKALKVKGRKEGLMLHSDQGWHYRTPMWRSMLVEAGIRQSMSRKGNCLDNAVMENFFSHLKAEMYHRKKYDSATVLKRDIVEYIHYYNTERISLKTGGMSPAEYRTQVEKQ >NZ_CP045154.1|WP_002208933.1|256711_257596_+|methylenetetrahydrofolate-reductase MSFFHANQREALNQSLSELQGQINVSFEFFPPRTSEMEDTLWSSIDRLSTLKPKFVSVTYGANSGERDRTHSIIKGIKERTGLEAAPHLTCIDASPTQLRDIAIDYWNSGIRHIVALRGDLPPNSGKPEMYACDLVGLLKDVGDFDISVAAYPEIHPEAKSAQADLINLKRKIDAGANRAITQFFFDVESYLRFRDRCVATGIDVEIVPGILPVSNFKQLQRFATMTNVRVPNWMTSIFDGLDNDPETRKMVGASVAMDMVKILSREGVKDFHFYTLNRAELSYAICHTLGVRP >NZ_CP045154.1|WP_002208934.1|254043_256479_+|bifunctional-aspartate-kinase/homoserine-dehydrogenase-II MNATAVAAAATGRQLHKFGGSSLADVKCYLRVANIMANYSHPGDLMVVSAAGSTTNQLISWLKLSQNDRLSAHQVQQSLRRYQHDLINGLLPPEMAEPLISEFIHDLERLAGLLDNKIDDVIYAEVVGHGEIWSARLMSALLNKLDMDAVWLDARRFLRAERAAQPQIDESRSYPLLQQLMAQHPHQRLVVTGFISRNEAGETVLLGRNGSDYSATQVGALAGAERVTIWSDVAGVYSADPRKVKDACLLPLLRLDEASELARLAAPVLHTRTLQPVSGSDIDLQLRCSYQPEQGSTRIERVLASGLGAKIVTSHDDVCLIELQIASHHDFSLAQKEIDLLLKRAQIKPLATGIHPDRNLLQLCYTSEVVNSALRVLEDAALPGKLSLREGLALVALVGAGVSKNPLHSHRFYQQLKDQPVEFVWQAEDGISMVAVLRLGPTEHLIQGLHQSLFRAEKRIGLMLFGKGNIGARWLELFAREQKSLSARSGFEFVLAGVVDSRRSLLSYDGLDASRTLAFYNDEAKEQDEESLFLWMRAHPFDDLVVLDVTASPSLAEQYLDFASYGFHVISANKLAGASSSNNYRQIRDAFAKTGRHWLYNATVGAGLPVNHTVRDLRDSGDSILAISGIFSGTLSWLFLQFDGSVPFTELVDQAWQQGLTEPDPRVDLSGQDVMRKLVILAREAGYDIEPNQVRVESLVPAGAESGSVDQFFENGEALNQQMIQRLEAAKEMGLVLRYVARFDANGKARVGVEAVRTDHPLASLLPCDNVFAIESRWYRDNPLVIRGPGAGRDVTAGAIQSDLNRLSQLL >NZ_CP045154.1|WP_002208935.1|252186_252504_-|met-regulon-transcriptional-regulator-MetJ MAEWNGEYVSPYAEHGKKSKQVKKITVSIPLKVLKILTDERTRRQVNNLRHATNSELLCEAFLHAFTGQPLPNDEDLRKERSDEIPEAAKILMRELGVDPDTWEY >NZ_CP045154.1|WP_002208936.1|251382_251838_-|hypothetical-protein MNPNYAKPSAAFTAASWSALLGGFVIFLIGLWNADMQLNERGYYFAVLILGLFSAVSLQKTVRDKLEGLAITSIYYGLCWVAFIVAVLLLCIGLWNATLALSEKGFYGVTFFMTLFGAIAVQKNTRDSAMSSDTESASLFKKVRDQLKAED >NZ_CP045154.1|WP_002216737.1|250624_250840_+|50S-ribosomal-protein-L31 MKQGIHPKYEQVTASCSCGNVIKINSTVGHDLNLDVCGECHPFYTGKQRDVASGGRVDRFNKRFSVPGAKK >NZ_CP045154.1|WP_002208938.1|248183_250382_-|primosomal-protein-N' MSVVQVALPVPLARTFDYRLDSAMACPVVGARVSVPFGKRKAIGIVVGLSDTSTFPLEQLKTIDAILDNHSLFPPSLWRILCWATEYYHYPIGEVLFHALPILLRQGRPAQSAPLWQWFVTEQGRATPPESLKRAPKQQQALAALLQKPVYRHQVNEMALTESALQALRSKGLIDLRAQEATTTDWRHSFSVLGERLRLNTEQATAVGAIRSEDNQFAAWLLAGVTGSGKTEVYLSVLENILAQGRQALILVPEIGLTPQTIARFRERFNAPVEVLHSGLNDSERLSVWLRARSGEAAIVIGTRSALFTPFSRLGVIIIDEEHDSSYKQQEGWRYHARDLAVFRAREEGIPIVMGTATPALETLHNVQMGKYRQLTLTKRAGSAKPAAQHLLDLKGLPLKVGLSQPLLKQMKTHLQAGNQVILFLNRRGYAPALLCHECGWIAECQRCDHYYTLHQNHRQLRCHHCDSQRPVPQQCPKCGSTHLVSVGVGTEQLENELAPLFPETPITRIDRDTTSRKGSLEQYLADVHQGGARILIGTQMLAKGHHFPDVTLVALLDVDGALFSADFRSAERFAQLYTQVSGRAGRAGKQGEVILQTHHPEHPLLQILLQQGYDAFAKQALEERKSVFLPPYTSHIIVRSEDHDNQQSALFLQQLRNLLEASPLKDEALWIMGPVPALQAKRGGRFRWQLLLQHPSRQLLQRLIKTSQPLISTLPQARKVKWTIDVDPIDS >NZ_CP045154.1|WP_002208941.1|245890_246736_-|cell-division-protein-FtsN MAQRDYVSRGRSGARRKSTSRKKRSAPIVSKTVMALAVALLVVFVGGLYFITHNKPGELPLLPNHDPRTGNGLPPKPEERWRYIKELENRQIGVPMPTEPSAGGEVNAKTELTNEQRQLLEQMQADMRQQPTQLSEVPYNQGMQQVPRSAVTIKPPATSVQPQPVTPPRQTTIPVQPQAPAPVRTPPAAPVTQAVTPPKVEKEKEKTQRWMVQCGSFKAVDQAESIRAQLAFAGIESRITSGGGWNRVVLGPYNSKAAADKALQRLQGAGQSGCIPLSVGG >NZ_CP045154.1|WP_002208942.1|245266_245791_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MTTIVSVRRDGHVVIGGDGQVTLGNTVMKGNAKKVRRLYNNKVIAGFAGGTADAFTLFELFERKLEMHQGHLTKAAVELAKDWRTDRMLRKLEALLAVADETASLIITGNGDVVQPEDDLIAIGSGGPYAQSAARALLENTELGARDIVEKSLSIAGDICIYTNRFQTIEELTY >NZ_CP045154.1|WP_002208943.1|243864_245196_-|HslU--HslV-peptidase-ATPase-subunit MSEMTPREIVSELDSHIIGQDKAKRAVAIALRNRWRRMQLNEELRHEVTPKNILMIGPTGVGKTEIARRLAKLANAPFIKVEATKFTEVGYVGKEVDSIIRDLTDAAVKMVRHQSIEKMRYRAEELAEERILDVLIPPAKNNWGVPDESQEPSATRQTFRKKLREGQLDDKEIEIDLAAAPMGVEIMAPPGMEEMTNQLQSMFQNIAGQKQKPRKIKIKEALKLLIEEEAAKLVNPEELKQQAIDAVEQHGIVFIDEIDKICKRGQTSGPDVSREGVQRDLLPLVEGCTVSTKHGMVKTDHILFIASGAFQVSSPSDLIPELQGRLPIRVELQALTTDDFERILTEPSASLTEQYKALMATEGVTIEFTREGIRKIAEAAWQVNERTENIGARRLHTVLERLMEDISYDASESSGQSITIDAEYVGKHLDELVADEDLSRFIL >NZ_CP045154.1|WP_002209491.1|259877_262514_-|phosphoenolpyruvate-carboxylase MNEQYSAMRSNVSMLGTLLGDTIKEALGEHILDRVETIRKLSKSSRAGNEASRQELLTTLQNLSNDELLPVARAFSQFLNLTNTAEQYHSISPHGEAASNPEALAQLFTRLKDKKLSDQDMRSAVDDLSIELVLTAHPTEITRRTLIHKLVEVNTCLSQLDHNDLADYERNKIMRRLRQLVAQSWHTDEIRKLRPSPVDEAKWGFAVVENSLWEGVPAFLREFNEQLENSLDYRLPVEAVPIRFTSWMGGDRDGNPNVTAEITRHVLLLSRWKATDLFLRDIQVLVSELSMSECTPELRELAGGEEVLEPYRQLMKNVRTQLTNTQAYLEARLKGERVLPPHDLLVSNDQLWEPLYACYQSLKACGMEIIANGQLLDTLRRVRCFGVPLVRIDVRQESTRHTDAIAELTRYLGLGDYESWSESDKQAFLVRELNSKRPLVPLKWEPSAETQEVLETCRVIAEAPQGSIAAYVISMAKVPSDVLAVHLLLKEAGCPFTLPVAPLFETLDDLNNADDVMTQLLGIDWYRGLIQGKQMVMIGYSDSAKDAGVMAASWAQYRAQDALIKTCEKAGITLTLFHGRGGSIGRGGAPAHAALLSQPPGSLKGGLRVTEQGEMIRFKFGLPEVTISSLALYAGAILEANLLPPPEPKKEWIEVMDLLSDASCDMYRSYVRENPEFVRYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRRPDGGVESLRAIPWIFAWTQNRLMLPAWLGAGAGLQRAIDAGKQDVLATMCRDWPFFSTRIGMLEMVFAKADLWLAEYYDQRLVDKSLWPLGQQLRDQLAADIKVVLAIANDDHLMADLPWIAESIALRNVYTDPLNVLQAELLHRSRQQEHPDACVEQALMVTIAGVAAGMRNTG >NZ_CP045154.1|WP_002223919.1|262887_264051_-|acetylornithine-deacetylase MKLPPFIELYRALIATPSISAADSALDQSNEALINLLAGWFADLGFRVEIQPVPDTRHKFNLLASIGENENGEGHGGLLLAGHTDTVPYDEGRWTRDPFTLTEHDHKLYGLGTADMKGFFAFILDAVRDIDASKLTKPLYILATADEETTMAGARYFAANTQLRPDFAIIGEPTSLQPVRAHKGHISNAIRITGQSGHSSDPARGVNAIDLMHESITQLMALRTTLQERYHNPAFTIPYPTMNFGHINGGDAANRICACCELHMDIRPLPGLTLSDLNELMTEALEPVSQRWPGRLSIDELHPPIPGYECPTDHHMVGVIEKLLGERTAVVNYCTEAPFIQQVCPTLVLGPGSINQAHQPDEFIDMAFIEPTRELIGQLVDHFCQQK >NZ_CP045154.1|WP_002209489.1|264301_265306_+|N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate-reductase MLNTLIVGASGYAGAELTAYLNRHPHMNITGLAVSAQSADAGKLLSDLHPQLKGILDLPLQPLVDVAQAAKGIDVVFLATAHEVSHDLAPQFLAAGCVVFDLSGAFRVRDAAFYSQYYGFEHQHPDWLDKAVYGLAEWQSEDIKQAQLIAVPGCYPTASQLALKPLVDGQLLNDAQWPVINAVSGVSGAGRKASMGNSFCEVSLQPYGLFTHRHQPEIVTHLGTPVIFTPHLGNFARGILATITCRLKAGVTAQNIADAYHHAYQNKPLVRLYQQGVPALKAVVGLPFCDIGFSVQGEHLIIVATEDNLLKGAAAQAVQCMNIRFGFPETQSLL >NZ_CP045154.1|WP_002209488.1|265474_266248_+|acetylglutamate-kinase MNPLVIKLGGVLLDSEEALERLFTALVTYREKHERPLVIMHGGGCLVDELMKRLALPVVKKNGLRVTPADQIDIITGALAGTANKTLLAWAVKHQINAVGLCLADGNTVTVTLLDAELGHVGKAQPGSAALVQTLLAAGYMPIISSIGITVEGQLMNVNADQAATALAATLGADLILLSDVSGILDGKGQRIAEMTAQKAEQLIAQGIITDGMVVKVNAALDAARSLGRPVDIASWRHSEQLPALFNGVPIGTRISV >NZ_CP045154.1|WP_002209487.1|266414_267788_+|argininosuccinate-lyase MALWGGRFSQAADQRFKQFNDSLRFDYRLAEQDIIGSVAWSKALVTVGVLNADEQQQLEQALSVLLEEVQANPHAILASDAEDIHSWVETKLIDKVGDLGKKLHTGRSRNDQVATDLKLWCKFQITELQTAVQQLQQALVMTAEANQDAVMPGYTHLQRAQPVTFAHWCLAYVEMLSRDESRLQDTLKRLDVSPLGCGALAGTAYAIDREQLAGWLGFASATRNSLDSVSDRDHVLELLSDASIGMVHLSRFAEDLIFFNSGEAAFVDLSDRVTSGSSLMPQKKNPDALELIRGKCGRVQGALTGMTMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDALDTWLDCLHMAALVLDGIQVKRPRCKEAAEQGYANATELADYLVAKGVPFREAHHIVGEAVVEAIRQGKALEALALSDLQQFSSVIGDDVYPILALQSCLDKRVAKGGVSPQQVASAIAEAKARLF >NZ_CP045154.1|WP_002209485.1|268386_270879_+|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor MDNIIRDKKTIISVNKITTCILFALVTQGYSGQLAANTAETPTNNNDMALDKLNVEGKGNAHDSDWIYDEPRSVSEITREQLDNRPARHAADILEQTPGVYSSVSQQDPGLSINIRGIQDYGRVNMNIDGMRQNFMKSGHGQRNGSMYIDPEILSNVVIERGIFNGIGGAGAIGGIATFNTINASDFLAPEKELGGHIRAMTGDNGTRFIGSGALALGNPNGDILLAVSERNLKDYWPGNKGVLAGLRLYSPTRNVGDDLKNTKTLFTGYKMRSQLAKVGWNFEAGQRLEFSYLQTQIASPNASMLSEVLALSPSGKEITKIGWRNTSFTNVENRNIALDYRLNPEHISWLDATAKIYYVDTNDETDNANSLFKEYFWTQTRLKTRGLQLQNTNTFTPSDAHQIRLKYGLEWFSDKSEGYSTRKLIERTTPPGKRAITSTFAQLNYEYDDWLRLEGGLRYDQFRLKGNTWLHTRSFLQPYTFENPCDRRIHEQSEKPGSRCSSRRPATMRWDVDRCEQQLSPTLAMGVKPGLEWLEFFGSYGKSWRPPAMTEVLATGTAHGYSWVLPNPFVAAERARTWEAGFNIQQSNLFIEDDHFAAKVAYFDTRIANYINLELGKAKPKFGGDSFTDVAYVNNLLKTRFRGLEYQLSYDAGTFYTNINYTRMIGVNNVCSPYAWLGGLQSVKYKYVGKVEQIYAVENEVANNYVTCMNANVLFGSSAYLPGDRGSLTLGSRIFDRRLDFGTVIRYNKGYQDRSAQDENGNPLTAYVADWPKYIVYDLYASYKVTNNLILRSSIENITNRAYLVNYGDTLSFAPSRGRTIQGGFEYKF >NZ_CP045154.1|WP_002209484.1|271100_271718_+|hemophore-HasA MSTTIQYNSNYADYSISSYLREWANNFGDIDQAPAETKDRGSFSGSSTLFSGTQYAIGSSHSNPEGMIAEGDLKYSFMPQHTFHGQIDTLQFGKDLATNAGGPSAGKHLEKIDITFNELDLSGEFDSGKSMTENHQGDMHKSVRGLMKGNPDPMLEVMKAKGINVDTAFKDLSIASQYPDSGYMSDAPMVDTVGVVDCHDMLLAA >NZ_CP045154.1|WP_002209483.1|271883_273692_+|type-I-secretion-system-permease/ATPase MESCKTPGASSVPPTILSVLAGNKKILWGIGLFTAVINLLMLAPAIYMLQVYDRVLASANTMTLLMLTVLVLGVFVFIGLLEWVRSAVVIRLGTQIDMQLNQPVFNAAFAANLKGHNTPAAQALNDLTVLRQFATGNALFAFFDAPWFPLYLLVIFLLHPWLGMLAAAGAGILVVLAWLNQWICKKPLHDASIITSHATQQANANLRNADVIEAMGMLKALRERWLMQHANFLYQQNLASDKSSRVTAVAKSSRQALQSMMLGLGALLVIYNEITAGVMIAGSILIGRVLGPIDQLIAVWKQWSHARLAYQRLSQLLAQHPSSPTGMVLPAPQGKLNVTQLMACKPGTHIPVLHSINFELQPGDVLGILGPSGSGKSTLAKLLVASQPTFSGTVRLDSADLSRWDKTQLGEFIGYLPQNIQLFRGTVAENIARFGAIDTAKVVAAAQLADVHDLILHLPQGYDTPLGDDGEGLSGGQRQRIALARAMYGIPRLIVLDEPNASLDKEGEQALLASIIQLKQQGCTIVMITHKPELLSGSDYLLFLKNGQMDLFDRTQAVLQNIQGKDKPAVQPEAKILNSRSGWSNGVSYGIGPARTTSSPKP >NZ_CP045154.1|WP_002209482.1|273767_275096_+|HlyD-family-type-I-secretion-periplasmic-adaptor-subunit MLPESVCYSVANANRQPPLQINSGRYLNIGGGLVVIGFIGFLLWAGLAPLDKGVAVTGLLVVAENRKVIQPLQGGRIQQLHVTEGDEIVSGQLLVTLDDTAIRNQRDNLQHQYLSALAQEARLTAEQNDLDVITFPQALLEHATQPAVERNIILQQQLLHHRRQAHLSEIARLSTQLTRHQARLDGLQAMRSNHQRQSNLFQQQLDSVQLLAKDGHIAKNKLLEMESQSTSLQARVEQSTSDIAEAHKLIDETEQHVLQRREQYQSENSEQLAKAQQNTQELVQRLNIAEYELSHTRIFAPVSGSVIALAQHTVGGVVSSGQALMEIVPSGQPLFVEAQLPVELIDKVAVGLPVDLNFSAFNQSNTPRLQGSVWRIGADRIQPPPTSPPYYPLTVAIDLDPTELAIRPGMAVDVFIRTGERSLLSYLFKPFTDRLHLALAEE >NZ_CP045154.1|WP_002209481.1|275160_275964_+|energy-transducer-TonB MNRLQQSSDKLIFWLVGALLACGIHIYALWWLSTASIPAIPTSYPAAIMMELSAEPEFMQNLPQNSVVGITQNIIEPAVEQRVNQPDDIVDLPTLPEQPEGQREITRKEPIKVKRPAENRATSRKPVNKETQESDSKQSSPAAAASAMLSGTSQQVAAAVNSDSSHRQQAQVSWKSRLQGHLMGFKRYPSSARKQQQQGTAMIRFVVDKNGYVSSVQLSHSSGTSALDREALAIIKRAQPLPKPPAELLSQGQITLSLPVDFNLKRK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP045154_2 | 1429754-1430023 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP045154_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP045154_2
>2.1|1429780|35|NZ_CP045154|PILER-CR AACTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA >2.2|1429841|34|NZ_CP045154|PILER-CR AAGACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA >2.3|1429901|35|NZ_CP045154|PILER-CR AACCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT >2.4|1429962|34|NZ_CP045154|PILER-CR AAAGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA >2.5|1429782|33|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA >2.6|1429843|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA >2.7|1429903|33|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT >2.8|1429964|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT AGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045154_2
The CRISPR arrays of NZ_CP045154_2 >merge|NZ_CP045154|2|1429754-1430023|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAACTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAGACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAACCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCTGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAAGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATAGA >NZ_CP045154|2|1|1429754-1430021|PILER-CR GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGA AACTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGA AAGACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGA AACCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGA AAAGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATA >NZ_CP045154|2|2|1429754-1430023|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA AGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATAGA >NZ_CP045154|2|1|1429754-1430023|CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA AGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATAGA
>NZ_CP045154.1|WP_002223316.1|1428844_1429393_-|DUF1440-domain-containing-protein MSEKRVNLQVIAWATIIGGFVSSLVKSGTEVNMPPRVVGEISPPAANIDAWLGWLGINSHSMDYVYQGVTISGAVVLYHWLFSFVFAFVYVLLSAYWPKVRLWYSAAYGLSITVAIHGVLIPALGFRHPAYLAGETGWLWNLNGYELWSEIIGHLCWSASLEICLVAVLAFFSKPIKGIWAN >NZ_CP045154.1|WP_002210294.1|1422459_1428438_-|alpha-2-macroglobulin-family-protein MDLLRFLLISPFALIKGLYRLSAYLLRLVGRLLRPVVGNLNWRAPQWMTKTANGLHCAFNRSEQWVAKHPKGISAAIVLLMAAASAAFYGYHWYLNRPQPIEPAPMVYQETSIRVSAPRTVNYQAQKPEAQPLSLNFMHSAAPITAMGQVVDQGISLTPAIEGEWKWATERTLVFTPKKAWPMGANYQITIDTEKLLAPQIKLNQTELNFTTPAFAYQLEKAEYYQDPQEAQKRSTIFHVQFNAPVDVASFEKQILLGLVEGKSKSEKKLNFSVVYDEKKLNAWIHSQPLMPMDKGGSVHLSINKGVNASVAATPTTQAQNKWVSVPNLYSLAVNSINATLVESDNNNGERALIIAISDAVKDKEIKNAVKAWLLPQHNFQAKESAKTSTDFYPWDMDDIDDNLLQQSTPLALTLNEAEQEYQPIFSFKFDAPSYRTLLIEVNNSLTSVGGYKMPEKIYQIVRVPDYPKTLRFMSQGSLLSMQGDKQISVAARNMTGMKLDIKRVIPSQLQHIVSFKSSEYSSAHFNRLSDEYFTEHFQYQTALNNDNPGEINYQGVDLSRYLANNPSARRGVFLLTLSAWDPEKRDNQQHSEEDYDEDQEWVGDSRFVVITDLGIITKQSQDRSRDVFVQSIHSGLPAADAKVSVVAKNGVVLLSQITDSKGHVHFPALDAFKNERQPVMFLVEKEGDVSFLPTRATYDRNLDFSRFDIDGEETPSDPRTLSSYLFSDRGVYRPGDRFNIGLITRTANWATALDGVPLRAEIRDPRDTLMSTLPITLDSSGFNELSYTTGENSPTGEWNVYLYLVGKNNETSMLLGHTTVNVKEFEPDRLKVQLQLTPERQQGWVKPQELQANINVQNLFGTPAQERRVTSRLILRPMYPSFAPFPDYLFYENRHNSDGFETELEEQTTDLQGMATIPLDLKSYADATYQLQLLSEAFEAGGGRSVAATARVLVSPYDSLVGVKADGDLSYINRDAVRKLNIIAVDPSLNKIALPDLSLSLIEQKYISVLTKQDSGVYKYQSRLKEQLVSEQPLQISPTGTDFTLVTQQPGDFILVVKDSQGQVLNRISYTVAGNANLTRSLDRNTELKLKLNQAEYLQGEEIEIAINAPYAGSGLITIEKDKVYSWQWFHSDTTSSVQRIRIPPAMEGNGYINVQFVRDVNSDEIFMSPLSYGVMPFKISTKARQAAIELASPSVIKPGEVLPIKVTTDSPQRVVVFAVDEGILQVARYRLKDPLDYFFRKRELSVQSAQILDLILPEFSKLMALTSAPGGDAGEGLDLHLNPFKRKQDKPVAYWSGITEVNGETTFNYPIPDYFNGKIRVMAISATPDRIGKVQTSTTVRDNFILTPNVPAMVAPGDEFDVTVGVSNNLQGLKGKAVDITVRLTPPPQLEVVGEAQHSLSLAEKRETLVSFRLRARSALGDAPLVFDASYGSQSSRRTVSTSVRPAMPFRTQSVMGRMEGNKHTVTNLRQMFDNYAQRQATASHSPLVLTQGLARYLADYPYYSSEQIVSRSIPLIMQSKHPEMDSALNQNEVRDQLKNMLRILSSRQNSTGAIGLWHASPTPDPFVTPYVVQFLLEAKSAGYSLPNDILEGANNALRLLAARPYDDLYSLRLRAFAVYLLTLQGEITTNTLASVQSTLQQLYPDSWQTDLSAIYLASSYRLLKMDDEANKLLQPTWKQLGKAYSKAWWTQNYFDPLVQDATRLYLITRHFPEKVSSIPPQALENMVLALRDEHYTTYSSAMSILALESYTSQVAAQQDTPETLQIIEISKSKGIDPNVISTLNGLFVQGDFTGEAKAIQFNNYASAPAWYVVNQSGYDLQPPKDAISNGLEISRSYTDEQGKPVTQVTLGQKVNVHLKIRANAKQGQNNLAIVDLLPGGFEVVQQTAPEPEFYDNQDDQDEETGSGWQSPLMVSGSSWYPDYSDIREDRVIIYGSASTDVKEFIYQIKSTNTGRFVVPPAYGEAMYDRNVQALSVGKGHILVVPPEAK >NZ_CP045154.1|WP_002213775.1|1421886_1422345_+|IS200/IS605-like-element-IS1541B-family-transposase MRDEKSLAHTRWNCKYHIVFAPKYRRQVFYREKRRAIGSILRKLCEWKNVNILEAECCVDHIHMLLEIPPKMSVSGFMGYLKGKSSLMLYEQFGDLKFKYRNREFWCRGYYVDTVGKNTARIQEYIKHQLEEDKMGEQLSIPYPGSPFTGRK >NZ_CP045154.1|WP_138921619.1|1419328_1421641_-|penicillin-binding-protein-1C MALFLLALLVIGFRLWPHPPLSQGLPLSTAYYDRHGTLLRLSLANDDRYRLWTPLEEISPLVIQGIQLHEDRGFYYHPGVNPISLLRGFWQSYVQGGRQQGGSTLTMQLARMHWHLNTRSPTGKLRQIARAIQLELSYSKHDILEAYLNYAPYGRNIESIAAASLIYFDKKPQQLTLPEALTLAVLPQSPSYRIDPTTGVLGSALTQARNRLFVRWQQTYPTDSSQMALFQLPLSLRQPEKMPYIAPHFIEQIRRQNQQLANTQSQVDTTLDANLQQLVEKQVEAFIRRNNSRGIHNAAVLLLDTRDMGVRALVGSANYYDREIQGQVNGTNAKRSPGSTLKPFIYALGLEQGILHPMTILKDVPSSFGAYAPENFDHRFLGPVTATDALNFSRNIPAVYVASRLRQPTLYQFLRLSGVTNMASENHYGLSLVLGGGEITLQELARLYAMLANRGTLHPIQMVQTDKTLPSIRLLSEAASFITLDMLRQHRRPGDTLAQSPTSLPVYWKTGTSWGFRDAWSAGIFGPYVLIVWEGNFAGKGNSAFVGADAAAPLFFNIIDSIQANYPALREPKHPWPPQLKRVAICLASGNLPTPWCQQQGKTWFIPGKSPIKVDTVYRPVVIDINSGQAACLPYDRSQTRTEVFEFWPSDLANVFAQAGLPKRQPPDRSHCKEGNTLASGNAPRITSPLRNTTYTLRQSQQGRDQIVFSATLDADSTTTYWFVDDIYLGSSTSKKSIDWHPTRSGQYRIRAIDDHGRADSRLIRVEKVD >NZ_CP045154.1|WP_002209745.1|1418870_1419116_+|transcriptional-regulator MDKQDWHPADILAGLKKRGTTMAALSRKSGLASSTLANTLLRPWPKGERLIAEVLELHPAEIWPSRYLKPKKSPAESVNPG >NZ_CP045154.1|WP_002216002.1|1417616_1418198_-|hypothetical-protein MKYNSVLKTFVDDDYRLEDHLDFKKQHADIRYQKLHKQLNEMSDENMHALLTIEEGEYFLKTLCNPNPHQSWKDAIFSCTDPTSVFFGSLVESLSVSRIVFEIRGFGVTATEYVGKNGSSYIKLSGYAGIRKYLDATRYLIDNPKILDIGIGTQGIENGIVRGARFCIVFSAAYRSVELLLKDEYGLADFLLI >NZ_CP045154.1|WP_002209746.1|1416947_1417349_-|DUF1240-domain-containing-protein MVKINRPLVGAFAILLFFLSSWGCWFSLSGYLAFFKLSDVIIFSWKVGFVIFAVPLLFYFSYLAFFSAIKNKPAIMNNKLANALAILAILGSIISLFSSAYISYSLTEYSYKSCPRSSWMSPNKYVKDIKLCP >NZ_CP045154.1|WP_002209748.1|1416313_1416715_-|DUF1240-domain-containing-protein MVKINRPLFGAFAVFLLFLSCWVSWFSLNGYWDFFKLSDVIIFSWKVGVMIFGAPVLFYFSYLAFYCAIKNKPAKVNNKLANTFAMLAMLGVVISFFSSVYIGYSLTEYGYKLCSRSSWMSPNEYVKDIKLCP >NZ_CP045154.1|WP_002209749.1|1415729_1416302_+|Hcp-family-type-VI-secretion-system-effector MSNLIYASVNGKKQGLISAGCSSLNSIGNRCQAGHEDQIQVLSLNHSISRQQNVAHHPVHFVKPIDKSSPLLGVAISENERINVVFYFYRVNSAGQLELYYEVKLTDASIVDITSVYPHSIDNNEMIPYEKIQLKYKSIAWDHKSAGTSGYSVWEDRVYSFLISSTLFQVCLNIFIFFNWLVYQNYFWEK >NZ_CP045154.1|WP_002227852.1|1415454_1415706_+|hypothetical-protein MMKNNKNINKDEFSDKLSQQIKEMINNSQLDSVEILSVVMESIFSLFSETEGHLAEMKFIDSAGEDYRFILRLEVPPILERQH >NZ_CP045154.1|WP_002210296.1|1430026_1430881_-|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MTTASNLSELQQQIRDRYDNLSKRLQQVSRYVLDNTNSVAFDTVAVIAERADVPPSTLIRFANAFDFSGFNEMKQLFRMNLVEETASYTDRARLFRAMESEAVPETPLGILQEFARSNAQALQQLAARTEPEMLQRAVELLAQADTIYVVGLRRSFSVAAYLTYALSHLECRPVQLHGLGGMLREQVNSIKARDIVVSISFSPYAEETVMVSEIAASAGARQIVITDSQISPLATFSDLCFVVKEAQVDAFRSQSATLCLVQSLVVALAYQQEAQAGAALAHRQ >NZ_CP045154.1|WP_002210297.1|1431234_1432761_+|CoA-acylating-methylmalonate-semialdehyde-dehydrogenase METVANFINGKCVFSCGNSVTSGSPRAQAIFNSATGEPIRQVMMSTAQETEQAITAAQQAFASWSRQAPLKRARVMFRFKSLLEQHLDALAQLISEEHGKVYSDAVGELTRGLEVVEFACGIPHLQKGEHSANVGTGVDNHSLMQPLGVCVGITPFNFPAMVPMWMFPIALATGNTFVLKPSEKDPSLAVRLAQLLTEAGLPDGVFNVVQGDKTAVDVLLTDPRVQAVSFVGSTPIAEYIYQTASAHGKRCQALGGAKNHCILMPDADMDMAASAIMGAAYGAAGERCMALSVVLAVGDETADNLCARLEQQISTLRVGPGLAQEPENDMGPLISAPHRAKVLGYIDSGVAQKATLRIDGRGLKVAGHEQGYFVGPTLFDHVTPAMTIYQEEIFGPVLSVVRIADYRSAVDLINRHEYGNGTAIFTRDGGTARRFCEEVQVGMVGVNVPIPVPVAFHSFGGWKRSIFGPLNVHGNDGVRFYTRMKTITARWPEAQHDQGAAFSMPTLG >NZ_CP045154.1|WP_002359655.1|1432795_1434721_+|3D-(3,5/4)-trihydroxycyclohexane-1,2-dione-acylhydrolase-(decyclizing) MKTVRMTMAQALVRFLNQQYVAIDGQEVAFVHGVMTIFGHGNVLGIGQALEENPGHLQVHQGCNEQGMAHMAIGFAKQYRRQRIYAVSSSIGPGAANMVTAAATATANRIPLLLLPGDIYASRQPDPVLQQIEQYHDLSISTNDCFRPVSRYWDRINRPEQLMSAMLSAMRVLTDPADTGAVTLCLPQDVQGEAWDYPASFFERRVHRIERRPPDTRRLSDALSLIARKRRPLVVCGGGVRYSGAHEAFRAFVENAQLPFTETQAGKGALPSDHPLNLGGIGVTGGLAANRLAPQADLVIGIGTRLTDFTTGSKALFSHPEVAFLLLNVAEFDALKLDATALIADARVGLEALTEGLAGYRTAWQGDIIEAKAAWCDECQRLWSRTWRPDEVPEVAGHLDDSLQEYAEVLNTTLTQTRVLGLINQHIEDDAIVVGAAGSLPGDLQRLWQVKTADTYHLEYGYSCMGYEIAAAIGAKIAMPHQPVYAMVGDGSYMMLHSELHTAVQEGLKITVLLFDNAGFGCINNLQMGHGMGSFCTESRHRNHESGQLNGPLICVDFAQNAESYGCRAWRVHDEPSLLAALAASRDHPGPVLLDIKVLPKSMTHDYASWWRTGDAQIARSPAVQQAAERTQMKVKRARQY >NZ_CP045154.1|WP_002210300.1|1436125_1437055_+|sugar-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLILAALIVFTSGVAFAENEQIVFSTPNLAMPFEVHMQRTAVKTAKALGVKLQVLDGQGSSPKQVADLENAITRGAQGFIVSPNDINAISSAVEEIQQAKLPVVTLDRSVESEKKVPHFGANNYKGGEAIANYVKSMFPNGAEIVLLTGQPGSSSNIERTKGIRDSLKTGGDKYRIVVDQTGNWMRSEGMRIIESVLPSLPKPPQVILSANDDMALGAIEALQSHGMKPGEIMVTGFDAVPEALARVREGWMAVTADQRPGYAVTTAMNQLVANIRDQKAITGADFLPTMITKENLDQAERVSEAGK >NZ_CP045154.1|WP_002223323.1|1437103_1438651_+|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSQPLLKITDMAKSFSGVWALSNVQLTLEQGEIHALLGENGAGKSTLLKALSGAQPQTHGEIWFNGEMLALDDSPVERQNKGIITIYQEVNLLPNMTVAENMFLGREPRRRQVFVDEKAVNQEAQAILDYLQLNVSPTTAVARLSIAQQQMVEIARALTLNAKLIVMDEPSAALSDSEVESLHRVVRELKGRGVSIIYVTHRLHEVFQLCDRFTVFQDGRYTGSDEVAGTNVEKIIRLMVGRDVVFNRRPASETHHQDQPIRLSVQGLCREKPPLDPHGVALKDISFHVHAGEVLGIAGLVGAGRTEVARCLFGAGAFTSGNFEIDGVPYQPRDPMFALEQGIALVPEDRKKEGAVQGLSIRDNLTLSSLAGLLQWRFFVNTRKEDQLIETYRLALQIKMVNSEQAVRKLSGGNQQKVILARCMALNPRILIVDEPTRGIDVGTKSEVHQVLFDMAKQGVAVIVISSDLPEVLAVSDRIITLSEGRVTGEIHGDDASEERLMTMMTINHNALNAA >NZ_CP045154.1|WP_002210302.1|1438662_1439691_+|ABC-transporter-permease MLQPLSKPQASVKSAMRFDPITFFERFGVLIFMFLLLIFFQLQNSNFLSERNIFNILTEVSIYGIMAVGMTFVILTAGIDLSVGSILAVSAMTAAYVIKGDNFTTIDPNAWGGMSWLIGLSICLAMGTLIGFLQGLGVTRLRLPPFIVTLGGMTIWRGLTLVINDGAPIAGFDAGYRWWGRGDLLGISIPIWIFAIVAIAGYLALHKTRWGRFVYAIGGNPEAARLAGVNVKRVLVSVYVVIGCLAGLAGFILSARLGSAEAVAGISFELRVIASVVIGGTSLMGGYGRIGGTIIGSIIMGILINGLVLMNVSAYYQQIITGLIIVLAVAFDTYAKNRRGAL >NZ_CP045154.1|WP_002210303.1|1439714_1440848_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MKEVRIGLIGTGYIGKAHAIAYAQAPTVFELRGKLVREMVAEVSPALAAQRAQAFGFNRFTCDWRELVADPAIDVVDICSPNYLHKEMALAAIHHGKHVYAEKPLALNARDASEMAAAATRAGVKTLVGFNYIKNPSAKLAKEIIERGEIGEVIHFYGTHNEDYMADPNTPIHWHCLHATAGLGALGDLAAHIVSMAQYLVGEITQVCGDLKTVVVTRPASVGSSARVAVENEDQAHAMVRFVNGAQGVIEASRVACGRKMGLSYMITGTQGAISFTQERMAELKLYLHNDPVNRQGFRTLLVGPAHPEYAAFCMAAGHGIGFNDQKTVEVRDLIDGIAMDTPLWPDFAEGWKVSRILDAIALSHQDSRWVNVTDIV >NZ_CP045154.1|WP_002210304.1|1440879_1442850_+|5-dehydro-2-deoxygluconokinase MSVEKQFSVSAEKTCNTENKCNTEKKFDVICMGRIAVDLYGQQIGARLEDVASFAKYLGGSSGNVAYGSARQGLRSSMLARVGDEHMGRFLREELHQVGCDTSHLTTDKKRLTALVLLSIKDRDTFPLIFYRDNCADMAITAQDFSEQYIASARSLAITGTHLSHPNTREAVLTALRYARRNGVRTVLDIDYRPVLWGLTSLGDGETRFIESHQVTAELLAVFNLFDVIVGTEEEFHIAGGSTNTLDALRGVREVSDAALVCKRGALGCSVYTEAIPQTLDEGLTVSGVRVKVLNVLGAGDAFMSGLLRGYLNDEGWPQACRYANACGALVVSRHGCAPAMPSKIELDNYLARADAVVRPDLDVHLNHLHRVTTRRRQWPELCVMAFDHRSQLEEMALQCGADLCHISTLKTLILQASREAVHTAGLQGKAGLLCDGTFGQDALNAITGAGWWIGRPIELPGSRPLAMEHGNIGSQLIGWPQEHIVKCLVFFHPEDAYSLRLEQEQKIIEVYRACCQSGHELLLEVILPAGMPRSDELYLRAISRFYNLGVYPDWWKLPPLASEGWAALNKLIERRDPHCRGVVILGLDASLEALRTGFNAAAGYPIVKGFAVGRTLFGDASLAWLKRDIDDTQLIARIRDNYLQLITLWRERGQK >NZ_CP045154.1|WP_002227877.1|1443002_1443923_+|myo-inosose-2-dehydratase MRKTEADRHTTAVQLGINPLTWTNDDLPSLGAETSLETCLSEGKEAGFAGFELGNKFSREAGVLGPILEHHQLKLVSGWYSGRLLERSVEEEIVAVRSHLALLRELGAKVMVFAEVSGCIHGEQQTPVHLRPRFPPARWAEYGAKLTAFARYTQALGVQIAYHHHMGTVIESAQDIDNLMIHTGEEVGLLLDTGHLTFAGADPLAVAQRWIARINHVHCKDVRTSVLADVKNRKTSFLDAVLSGVFTVPGDGGVDYPPIMALLKQHGYQGWLVVEAEQDPNVAHPMTYARMGYHNLSRLAHNAGLI >NZ_CP045154.1|WP_002210306.1|1443932_1444748_+|5-deoxy-glucuronate-isomerase MSRLLSRRQAPDERGLTQRITPAQAGWGYVGFEVYELNEGQPLTLTAVPDERCLVLIAGRASISTPSAQFPNIGDRMSPFERHKPWAVYVTPGEAVQVQAITPLELAVCSAPGKGTYPTRLISPEDIGAEARGKGHNQRYVHNILPEDHPADSLLVVEVYTNEGASSSYPSHKHDTDNPPHETYLEETYYHRLNPEQGFCMQRVYTDDRSLDECMAVYNREVVMVPRGYHPVATMAGYDSYYLNVMAGPVRKWIFSWENDHVWINHNYPIT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP045154_3 | 1986282-1986403 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045154_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP045154_3
>3.1|1986315|56|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder TAGTGGAGGGGGAGGATTGAGTTTTTTCCAAAAAAACATATTGCAGTATTAAATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045154_3
The CRISPR arrays of NZ_CP045154_3 >merge|NZ_CP045154|3|1986282-1986403|CRISPRCasFinder CTTAATGCCAATATTAATCGACATAATCAATTGTAGTGGAGGGGGAGGATTGAGTTTTTTCCAAAAAAACATATTGCAGTATTAAATCTCTTAATGCCAATATTAATCGATATAATCAATTG >NZ_CP045154|3|3|1986282-1986403|CRISPRCasFinder CTTAATGCCAATATTAATCGACATAATCAATTG TAGTGGAGGGGGAGGATTGAGTTTTTTCCAAAAAAACATATTGCAGTATTAAATCT CTTAATGCCAATATTAATCGATATAATCAATTG
>NZ_CP045154.1|WP_002213038.1|1985282_1986029_-|SDR-family-oxidoreductase MKKTILITGALSGIGNTATKLFSEMGYNVVFSGRRPEEGRVILDDLKRINKDVLYVNADMNSESDIKHLIEMTLERFGSLDVAVNCAGTVGETAEIQAVTQDNFHLVFNTNVLGTLLAMKYQIPVMVERGKGSIINISSIAGLVGLPSTGIYVASKHAIEGLTKTAALEVATTGVRINSISPGPVEGKMFDRFLGHDENNKKAFIEMMPNKRFTTQEEVAHTIVFLAEDNVTAITGQTITIDGGYTAQ >NZ_CP045154.1|WP_002213039.1|1982711_1985129_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTTTLDIINSAKDLDPAEYRAFFLQSKAPLFYDLRFLIAAEQSPLLNVSKIFYLLARDEGRLIALVPLYLQEFRSADPLGLLISSAKLSIESEERGLFSHIIHCTDTTIPTLSHDPSLYARIFDAITAIAQAELARYFCFLNVQDGVLLREAQRNGLNINYMVDKFSIELDAFPDFDSFAQALPKYRRYEMVRQLRIFNRSDAKVRILAPPFDNEIEKLARLYYLTTQRLGTPYYWPESQLAVFCRLCGDLVRLIVVEQNGQIVSGFICFEEDGALHFWSAGMDDESSDFSPYTLGVSAVYRYAFEKGINLIECGRLNSHIKTRLGFKPKRLYSIVSQDLGIPAATQTSLSQLKLASQLDGEVRLASHPAFDEWYLTSVWNGRGPTRRPAGIVRAATEADVIRTIVFAKERGMEVSVRGSGHNYVGCFLRVDTLMLDISGLKGLDIDSRHKRAIVESGVSSGQLCHALAAKGLAFPTGHVKEVGISGFLLGGGLGINCSQWGGMSVFNVQALDIVTADGHLRHVSETQEPDLFWAARGAGPCSFFVVTRFYLSCYSLPRVITNSLYTLPFTYLHDLLARLEDASPPTNLQVMVSVSPPTSGDTPAVLLNILAFTDSPQEAQALCESFETRLELPLTALAINQPSNFETIYEQFSSMVVSKRFYADNILTDNTQELVSILSRYLSDAPSRGALTTIFWRGVTTYPQAAFSAHGKFFVSTYAQWDDAKDDSVNKYWLKRMYDELQEIARSRYINEYDLETRAGETSKCFAAENWERLQRLRLEYDPDGVFVDVQQLEEHGDQPGANN >NZ_CP045154.1|WP_002213046.1|1978739_1979069_-|sulfurtransferase-TusE MLEFEGRIIDTDAQGYLKNSTDWSEALAPVLAEQEGITLTEPHWEVVRFVRAFYQEFNTSPAIRMLVKAMAQKYGEEKGNSRYLYRLFPKGPAKQATKIAGLPKPVKCI >NZ_CP045154.1|WP_002213049.1|1978409_1978688_+|acylphosphatase MSKIYIVAYVYGVVQGVGFRYSTQRQAQQLGVTGYAKNCDDGSVEVVASGNPQAVERLMEWIRQGGPRGARVDRLLTEPYPPTPFETFSIRY >NZ_CP045154.1|WP_002213052.1|1977125_1978316_-|23S-rRNA-(cytosine(1962)-C(5))-methyltransferase-RlmI MTVRLILAKGREKSLLRRHPWIFSGAVQRLEGDALSGETIDILDSQGKWLARAAYSPESQILARVWTFQQDEVIDCAFFIRRLQQAQNWRDWLAQRDGLNGYRLIAGESDGLPGITIDRFQNFLVLQLLSAGAEYQRETLVSALQHCYPECSIYDRSDVSVRKKEGLPLTQGLICGEMPPALLPISENGMQLFVDIQQGHKTGFYLDQRDSRLAARNYANGRRVLNCFSYTGAFAVAALMGNCQQVISVDTSQSVLDIAKQNIELNQLDLSKTEFVRDDVFQLLRSYRAQGEKFDLIIMDPPKFVENKSQLASACRGYKDINMLAIQLLRPGGILLSFSCSGLMPVDLFQKILADAALDAGHDIQFIEQFRQAADHPVIAAYPEGLYLKGFACRVM >NZ_CP045154.1|WP_002213054.1|1976747_1977065_-|heat-shock-protein-HspQ MIASKFGIGQQVRHSLHGYLGVVIDIDPEYSLAPPEPDEVANNKTLRSSPWYHVVIEDDDGQPVHTYLAEAQLTYEDVDAHPEQPSLDELAASIRHQLQAPHLRN >NZ_CP045154.1|WP_002213056.1|1976222_1976639_+|CoA-binding-protein MHDKDIADILKKVKTIALVGASDIPSRPSYRVMAYLLQQGYQVTPVNPKLAGELLLGQLVYAELADIPHAIDMVDVFRNSDAAYCIAQDAIAIGAKVLWLQIGVINEQAAILATDAGLQVVMDRCPKIELPRLGLEKG >NZ_CP045154.1|WP_002213058.1|1975226_1975907_-|DUF2057-family-protein MKLGLVAGMLAVCFSFSSVAMTLKLTPEIDLLVVDGKNMSGSLLKGADSLELNSGMHQILFKVIKPLPTDPLVLYSSPPLIVVFNAHNTRSVAIKLPVINTLRDGHQFSKNPLYQLIGDNGHPLSVRHDVLRQDHLNNSTTLETVMAAYNVGKYNASVPAFAAIPPSPVSAVPGTTIPVAGVNTPHKTASLQGENVTEQMLQYWFLQANPETQKRFLIWAKKQPIH >NZ_CP045154.1|WP_002213060.1|1974583_1975048_-|methylglyoxal-synthase MELTTRTIAARKHIALVSHDHCKKSLLAWVMENRDLLAQHELYATGTTGNLVQKATGIDVHCLLSGPMGGDQEVGALISEKKIDILIFFWDPLNAVPHDPDVKALLRLATVWNIPVATNRSTADFLIGSTLFSSEVTIAIPDYDRYMQQRLDLK >NZ_CP045154.1|WP_002221095.1|1972468_1974523_+|DNA-helicase-IV MELKATSFGKHLSQHPYNRVRLLNAGIEVCGDKHQYLIPFNQLVSIQCKRGIVWGELEFELPQQKVVRLHGTEWQETQHFYHYLLGVWQQWSEEMSQVCAEVLHKQVESIKRIEQQDKWFKRSELGQIQVMIREAFSALPMPVERLAAFESCRADYECCLRWLQQGRHSVERCNQQWTARMLEEYQDFFQNVETSPLNASQSRAVVNGEDSVLVLAGAGSGKTSVLVARAGWLLRRNEALPEQILLLAFGRQAADEMNSRIKQRLGVDSIQAKTFHALALHIIQQGSRKTPVISKLESDSQARRALLIQHWQQQCSEKKAQAKGWREWLTDELEWDVADGDFWQDKRLAARLASRLERWVGLMRMYGGSQAEMIEQANDEVRDLFQKRIRLMAPLLKAWKTALKDEGAVDFSGLIHQAVNLLEKGRFVSPWKHVLVDEFQDISPQRAMLLAALRKQNKQTCLFAVGDDWQAIYRFSGAELSLTTAFSEHFGEGAECALDTTYRFNDRIGDIANRFIQQNPYQLKKPLNSLSKGNKKSVMILPDEQLEALLDKLSGFVKDGERILILARYHHLRPEVLQKAATRWPKLTIDFMTIHASKGQQADYVIIVGLHEGNDGFPAAARESVLEDVLLPPPEDFPDAEERRLLYVAITRAKHQVWLLQDTARPSIFVSQLSELGALVQRKP >NZ_CP045154.1|WP_002213036.1|1986759_1986978_+|hypothetical-protein MYLLQQIELCPDQILHAWKISQNPQVSEVFEIEVVSSEEDAEEAVLFWKAYFSSLGETVIDGRHVGDTFSRF >NZ_CP045154.1|WP_002213034.1|1987241_1987766_+|beta-hydroxyacyl-ACP-dehydratase MKNTELNFLKTNFLFNQDITNELNTSFGQDIIKKMIPHREPFLMVDNVELINIECRLIKAIRRVDEKDPVFGGHFPNDPIYPGVLQQESMFQTALILMYFLLNETAIPPAEENIIHAVGTRVYDVFHLSAVRPGELMTIRCCITEYDTFLATAIVQITVNDQIVTVGKGEFHVF >NZ_CP045154.1|WP_002213032.1|1987755_1989039_+|beta-ketoacyl-[acyl-carrier-protein]-synthase-family-protein MSSDRIVITGVAINTPIGDTLDLVGNNLLSGKSAIGYWRNFDTSNIYSKIGGQIPEYDIEGKLHAFSNRIPDIVLSRAEKVFKQTTKGVQLSVLMAMEAWLDAGLFEHIIDPFDCGIICGGHNLSDKYLLDQQKIFSDEPEFIDAFSGLNSLDTDHSSSVAQVLNTKGFAYLVGGTCATGNIAIQTAINAIKVDKKQVVAVVCPMASFHPMMLHSLTILEAICYSQYQDTPTKASRPYDINRSGFLPSEGGAVLIFEQAEHAKNRGAKIYAELLGASVNSDANHLGDPSHEGQVRVIQDVLKKCNISPEQVDYVSAHATSTKLGDIVELKSIKRVFGSHAEKLIINAPKSLLGHTMWASGVVEAAIAIWQMRQGEFHQSHNIETLDPAVELNVCASGNVKKEVNIFLNNSFGMGGINSASLFSRYHG >NZ_CP045154.1|WP_002213030.1|1989040_1989778_+|SDR-family-oxidoreductase MNLFISGGASGIGRSVVIAALSKGWNVGFSYHNNKEGAQQLLDIAVAEFPRQLCRAYQLDVIDSGAVEYVGDRLLVDFSNIDAVVCNAGIDLPGNLVSMTDEDWALVLNTNLTGTFYLIRYFLPLFLANKYGRIVTLSSLAKDGSSGQAAYAASKAGLVGLTKTTAKEYGHFGITANVVVPGLINTEIIGDDIKGIKNFFAQYAPVGRLGSPSEVAEAILFLVAKESSYVNGAVFNVTGGIDWVY >NZ_CP045154.1|WP_002213028.1|1989793_1991032_+|hydroxymethylglutaryl-CoA-synthase-family-protein MNSIGIEKISIYPSSLALKLSELAQARGGDNKYIQESLMVIKRSLVPQWEDAVTLAVNSAKDMLNDQDRSDIGLFIIATESGLDQEKAISTWAHRYLGLPATCRVFELKSACHAGAAALKMAESWISSGLNRGKKVLLINVDISNNMICHGKMEYSLGAGAIALLISDNPVFAVIETGKSGIHTHEVTDVIRPLPWKEVAFDVEASLFSYMDGLENAFEEYCHQTPEARESTYFNYNLYHVPFPGISKEAHKVLLELQGLFGKEALATSFKQKVMPSLYYAQKIGATYCGSIFLSLFSLMVKAPEIKSGDRIGVYSYGSGSCAEYFSMQVGDQAVEIAQQQGAALDILLTQRKILDVAAYEQLENARSAQMQGKDYRLDGDNLQDWYTHHYSGSGLLILERIDNHLRRYRYA >NZ_CP045154.1|WP_002213026.1|1991024_1991744_+|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MHEYVTVPIKFSPDSLADFENRFISALNDERYKVIVLIGGPTYFSMGMDLTYISTHYDADFVSQFCHILKMVRNSHKPVLAKVEGNVIAGGLALLSVVDFILSSDSASFSLPEVTFGITPTIAMSCLLERIRPHHLKYFVWSSSVISAKQALKWGLIDQINTLENLDQDIQVISNKLSRIPKSAIRESKLLLAEQYSFEESLDLGSHLLVERLNDAQTIEKIRHYLEDIKLFNDEYADD >NZ_CP045154.1|WP_002213025.1|1991745_1992498_+|enoyl-CoA-hydratase MKKIYLRKSDEGIAFMHINDPVNKNAIDDEFCLQLHGIVDTIKQDKTIKVLILVGLPDIFCTGGTEAFLQSLITHYKTNIEHEYANHLKHFLNIPIPVIAAMEGSATGGGLVLGLYADILVAAEESRYGMSFMNMGFTPGMGSTAMSKEAFGYYTGFEMMVTGNYIRGSELKGKCCFNYILPRAMVMEKAIELATSIAEKPRHSLELLKKYMSIDRRKMLEETSTIEAFMHHIAFNQSNIEQQIQDNYTG >NZ_CP045154.1|WP_002213024.1|1992500_1993289_+|SDR-family-oxidoreductase MLNNLSEMTVLVTGGTKGIGRATVESFVKAGAKVYGTYFWGDNLDELENHFSQYLNRPVFLQADISDEEITTQLIEKIAQENKKIDILILNAAFAPQFKDTYKFRGLLDSIEHNSWPLITYIDCIKQHFGQYPGYVVAITSEGHRSCHITGYDYVAASKAVLETLTKYIGARENIIINCISPGVVDTEAFELVFGKKAQAFIRKFDPDFIVSPEAVGNVSVALCSGLMDAVRGQVITVDNGRMFTDNFTKWIDMIETNFIEK >NZ_CP045154.1|WP_162006469.1|1993375_1993816_+|lipocalin-like-domain-containing-protein MSNTNRNLFLGRWKLESCIGNSGGIHIYPIGREPFGMLIYTEQYMMVFISSVERTQFSTEDIRAIPSEQIVADFPKFETYCGHYIVNHDEKIVTHFIDNSKIPNQIGTQFRRYFSFEHEKLVLKSIDSLLLNDESWLFELVWNKQE >NZ_CP045154.1|WP_002213017.1|1993853_1994102_+|acyl-carrier-protein MDRDHIASIVKKHIVNSIDGAKEHEIDLQKSMADYGASSLDIVSVVSGVMRELKIKIPRTELKNIKSINGLIDLFVTSSSES |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP045154_4 | 2112086-2112293 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP045154_4
|
3 spacers
spacers of NZ_CP045154_4
>4.1|2112114|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG >4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA >4.3|2112234|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT GTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAAC |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045154_4
The CRISPR arrays of NZ_CP045154_4 >merge|NZ_CP045154|4|2112086-2112293|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAGGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAGTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAACGTTCACTGCCGCACAGGCAGCCCAATAA >NZ_CP045154|4|2|2112086-2112233|PILER-CR GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA >NZ_CP045154|4|4|2112086-2112293|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAAC GTTCACTGCCGCACAGGCAGCCCAATAA >NZ_CP045154|4|2|2112086-2112293|CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAAC GTTCACTGCCGCACAGGCAGCCCAATAA
>NZ_CP045154.1|WP_002211902.1|2110199_2111591_+|APC-family-permease MAHDATVAVGTNQTGTNNRVQLRKTLTLVQVVMMGLAYLQPMTIFDTFGIVSGLTDGHVATSYAIALIAVLFTAVSYGKLVKRFPSAGSAYTYAQKSISPNVGFMVGWSSLLDYLFMPMINILLAKIYLEAIFPGVPSWIFVGALVSLMTLFNLRGINIVANLNSVIVVVQVAIMVVFMGLLIHGVYQGEGAGTLVSARPFYSENAHLVPMITGATILCFSFLGFDGISSLSEETPNAGKVIPKAIFLTALIGGIIFIAVSYCLQLYFPDISRFTDPEASQPEIMLFVAGKFFQSVILCFSCVTVLASGMAAHAGVSRLLYVMGRDGVFPEKVFGYVHPKWRTPAINVLLVGGVALSAISFDLVTATALINFGALVAFTFVNLSVIAQFYVRERRNSTFKDHFNYLILPMIGAGTVGVLWVNLESSSMTLGLVWGAIGLSYMVWKTRAFRRALPQFTEEPAQL >NZ_CP045154.1|WP_002213775.1|2109315_2109774_+|IS200/IS605-like-element-IS1541B-family-transposase MRDEKSLAHTRWNCKYHIVFAPKYRRQVFYREKRRAIGSILRKLCEWKNVNILEAECCVDHIHMLLEIPPKMSVSGFMGYLKGKSSLMLYEQFGDLKFKYRNREFWCRGYYVDTVGKNTARIQEYIKHQLEEDKMGEQLSIPYPGSPFTGRK >NZ_CP045154.1|WP_002216312.1|2107938_2109030_+|oxidoreductase MSANAIRVQVGPANYFSFPGAIDKLSEFYPQAALDKALWIYGERALAAAQDYLPKAFHGPQAVRAKFSTHCSQSTVADLVSAAGGDRQVVIGIGGGAVLDTAKVVARQLGVPLVAIPTIAATCAAWTPLSVWYNEAGQALNFEIFNDANHLVLVEPRIMLHAPVEYLLAGIGDTLAKWYEAVVLSPQPETLSLTVRLGLQAALEIRNVLLKQSEAALQAVAQGELTQDFLDVVDAIIAGGGMVGGLGERYTRVAAAHAVHNGLTLLPQTEHFLHGTKVAYGILVQTALLGQDEVLRSLIVAFNQLGLPTHLAALDVDINDREAIDRVIGRILKPGESIHYLPIALNSEKVWAAIEQVEIAAQH >NZ_CP045154.1|WP_002216311.1|2106759_2107653_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSIPPSRLEMRNISISFSGFHALQEVDFTLEGGSTHALIGANGAGKSTLMAILSGAHNHYRGEIFIDGQPIDIHSPRQARQHGIHVVQQEVDVALIPTLSVAENIMLDELADRGHLFNWPQLYRQAEALLEQLELKLNVRQRLESCTLAEKQQVLLARALSHQCRFLILDEPTAPLDQEESARLFRVVRRLQSEGIGIVFISHRIHELREVCDQLTVLRDGRRVSHDTMEGMSGEQIVEKMLGHTLEDISPLGERQSAAKHGCRKHYCRKHCYRSAAYMISISCAISPSHYIRAKF >NZ_CP045154.1|WP_002216310.1|2106112_2106802_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MRDISLTLHQGEILGIAGLAGAGKTELCKALFGDTPSTLERGELSGKAWRPRSPDRSVAQGLALVPEERRKEGIFIDEGIPMNLSVAADDSFSRWSLFSRRQELSWAKELIERLGIRTSSPQQKLAHLSGGNQQKVAIGKWLRGDAQVLIFDEPTKGVDIKAKQDLFSLIDQLAQQGKGIIYASGEFSELVGLCDRICVLWDGRIVAELNAAEVDEETLLLFSTGGTPQ >NZ_CP045154.1|WP_002211900.1|2105120_2106116_-|ABC-transporter-permease MSKELPLPDVQPWRHQLFDFLYKWGMLLTVVALIALFGLASDNFLDPNNIINILRSIAIVTVIAIGVSISLSIGGFDLSVGSTASLANAVVVSLFVWYGFGTTGAIILTLLICTLVGLFNAFLIVVLKIPDMLATLASLFVIQGVAMTYSRGGSITQSMLLPSGDMAEGVIPEIFSALGQVPVIVLIMLAVTVVVQLYLSLTKHGRRMYAIGGNPQAARLAGIRTVRYRVLAYVLSAQLAALGGILLASRIGSSQVNAGSGYLMDAVAAAYIGFSLAGSGKPNAFGTLIGAIILGVLQNGLVMLSVPYYAMDIIKGLVLAMALALTYIQKR >NZ_CP045154.1|WP_157131899.1|2104441_2104732_-|hypothetical-protein MQQKNNLENFALSICLAEGFPDGEINSEAFSAVGAYVELGAYPVEAYEEVSELAKKFLEKKYISKNGESKLTVMKCIDLSQSSELSAIKDKYTRHI >NZ_CP045154.1|WP_002211898.1|2103459_2104287_+|SDR-family-oxidoreductase MKKVAIIGLGWLGMPLAQSLSRRGIDVVGSKTTPDGVDAARMSGINCYPLVLTPELICEPDDLAQLMAVDALVITLPASRTTAGGDHYFQAVQQVVDSALAFGVPRIIFTSSTSVYGETRGRIKESSPLQPVTVAGKTLMALEQWLHQLPHTSVDILRLAGLVGTDRHPGRFLAGKTGVKGGSQGVNLVHQEDVIAAIELLLNRPKGGHLYNLCAPIHPRKRDFYPACARALQLTPPEFAVEEQEGANREIDGSKICSELGFEYLYPDPSRMPLN >NZ_CP045154.1|WP_002231208.1|2103036_2103084_-|his-operon-leader-peptide MNRVQFNHHHHHHPD >NZ_CP045154.1|WP_002211896.1|2101854_2102754_-|ATP-phosphoribosyltransferase MLDKTRLRIAMQKSGRLSDESQELLSRCGIKINLQQQRLIAFAENMPIDILRVRDDDIPGLVMDGVVDLGIIGENVLEEELLNRRAQGDDPRYFTLRRLDFGGCRLSLAAPLDAEYTGPQCLQDTRIATSYPHILKQYLDKQGVRFKSCLLNGSVEVAPRAGLADAICDLVSTGATLEANGLREVEVIYRSKACLIQRDGEMSVDKQQLIDRLMTRIQGVIQARESKYIMMHAPSERLDEIITLLPGAERPTILPLAGDKSRVAMHMVSSETLFWETMEKLKALGASSILVLPIEKMME >NZ_CP045154.1|WP_002211904.1|2112327_2113758_-|exodeoxyribonuclease-I MSDKNKQPTFYVHDYETFGQRPALDRPAQFAGVRTDLDFNLVEEPLVIYCKPADDYLPQPEAVMITGITPQHALANGVNEAEFSRQIHQAFSVPGTCILGYNNIRFDDEVSRNIFYRNFYDPYAYSWQGGNSRWDLLDVMRACYALRPEGIVWPENDDGLPSFKLEHLTKANGVEHLQAHDAMSDVYATIAMAKLVKQAQPRLFDYLYQHRSKHKINALIDIAEMTPLVHVSGMFGAARGNTSWVAPLAWHPENKNAVIMCDLAGDMSPLLELDSDTLRERLYTRRDKLQAQESAIPIKLVHINKCPVLAPAKTLLPENADRLGIDRQRCLQNLQLLRQNPQVREKVVALFAQAEPFAVTDDVDTQLYNGFFSDADRATIKIIQQTESQNLPALDLTFQDPRLEALLFRFRARNYPNTLNDSEQQRWLQHRREALSPERVQDYVLQLEQFYNQYEDDKEKLALLKALFEYAKGLVS >NZ_CP045154.1|WP_002211905.1|2114050_2115160_+|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MKKLLLTGATGFLGGAVLEKLLLASSDFNYLLLVRANTPEQGLMRIRENLEKFYLPNELINKININHVLLGDLAEPDSFINDVRIDDVTHVINCAAIASFGNNPLIWKVNVEGTLAFGKRMAQVAGLQRFVHVGTAMACTPEADTVVDERVLSTENDAHLVEYTKSKSAIECLLAEHCPTLPLVFARPSIVVGHTRLGCQPSSSIFWVFRMALMLRKFMCSLDDHIDVIPVDYCADALLYILEYPNLPDDIYHISAGEKGSVSFSEIDQAMSVAAKQKPVGVNYSQVEYTALVQMRNQLKGIFGPCNERLMLKAMRLYGSFAMLNVRFSNERLLSLGMPRTPRFTDYIARCVESSHGMTIQQQMAVDFK >NZ_CP045154.1|WP_002217522.1|2115593_2115911_+|DUF496-family-protein MDNASKPTFQDVLEFVRMFRRKNKLQREIVDNEKKIRDNQKRVLLLDNLSEYIKPGMSIEEVQAIIANMRGDYEDRVDDYIIKNADLSKERRELSKKLKAMGEVK >NZ_CP045154.1|WP_002209743.1|2116281_2117490_+|IS256-family-transposase MDEKKLKALAAELAKGLKTEADLNAFSRMLTKLTVETALNAELTEHLGHEKNTPKSGSNTRNGYSSKTLLCDDGEIELNTPRDRENTFEPQLIKKNQTRITQMDSQILSLYAKGMTTREIVATFKEMYDADVSPTLISKVTDAVKEQVAEWQNRQLDALYPIVYMDCIVVKVRQNGSVINKAVFLALGINTEGQKELLGMWLAENEGAKFWLSVLTELKNRGLQDILIACVDGLKGFPDAINSVYPQTHIQLCIIHMVRNSLKYVSWKDYKAVTSGLKMVYQAPTEEAALMALDKFAEAWDDKYPQISKSWRTHWENLNTFFGYPPDIRKAIYTTNAIESVNSVIRAAIKKRKVFPTDDSVRKVVYLAIKDASKKWSMPIQNWRLAMSRFIIEFGDRLSDHL >NZ_CP045154.1|WP_002216388.1|2117452_2120605_-|inverse-autotransporter-beta-barrel-domain-containing-protein MSLYRISSLHQAKQLNKNKQLNKTRISKSVVWANIVIQAIFPLSIAFTPAVMAAETVGASDEKPRSASQAEQSTANAATRLASILTNDDSAKQASSIARGTAANAGNEALQKWFNQFGSAKVQLNLDEKLSLKGSQLDVLLPLTDSPDLLTFTQLGGRYIDDRVTLNVGLGQRHFFAQQMLGYNLFIDHDASYSHTRIGVGAEYGRDFINLAANGYFGVSGWKNSPDLDKYDEKVANGFDLRSEAYLPTLPQLGGKLIYEQYFGDEVGLFGVDNRQKNPLAVTLGVNYTPIPLFTVGVDHKMGRAGMNDTRFNLGFNYAFGTPLTHQLDSDAVAIKRSLMGSRYNLVDRNNQIVMKYRKQNRVTLELPARVSGAARQTMPLVANATAQQGIDRLEWEASALTLAGGKITGSGNNWQITLPSYLSGGEGNNTYRISAIAYDTLGNASPVAYSDLVVDSHGVNTNASGLTAAPEILPANASASSVIEFNIKDNANQPITGIADELAFSLELVELPEELAKAKARSVPLKTVSHTLTKITESAPGIYQATLTSGSKPQLINITAQINGVPLADVQTKVTLIADESTATLQTSSLQIITNGSLADDTDANQIRAVVVDAYGNKLSGVQVNFTVGNNAKITETTLSDKQGGVTAAITSTKAGTYTVTAELNGVTQQIDVNFIPDAGTATLDDSDEYKLQWVTNGQVADGESTNSVQLTVVDKFGNTVPGVDVAFTTDIGAIISEVTPTDANGVATAKIISSQAKSHTVKATLNRKEQTVEVNFIADTATAEITANNFTVEVDGQVAGSGTNQVQALVVDKKGNPVANMTVNFTATNGVVVETTSAKTDENGKVTTNLSMTNVGGTISTVTATMINSANVTSTQDKPVIFYPDFTKATLNTPANTYSGFNINSGFPTTGFKNTHFQLSPHGITGANSDYDWVSSHPNVSVSNTGAITLQDNPGGKVTITATWKHDSSKVFTYDFTLNYWVGLYSSTNLSWAQANASCINAGMRLPTNREVSAGQDVRGVGSLLSLSIILCNCHRIKGDRSGGHRTR >NZ_CP045154.1|WP_002211911.1|2121629_2122934_+|MFS-transporter MSNFNHYPDPTLNSAIKKAWYRLMPLMFIMYFVAFIDRINVGFAKDAMSADIGLSQSAFALGAGIFFAAYALFGIPANLMMNKLGAKVWLSSTTVVWGLLSAGTGLVSNEYQFVILRFLLGVAEAGFYPGILLLASIYFPNKIRASVIGIFVLGVPAALTLGSPISGALLDMQGFLGQPGWFWMFLLEGLPAVGLGIFAFFYLDDSPATARYLNPEEKQALLTQLSIEQSDTESSSVKAVLLSPKVWHLALIYGTIQVGVYGLIFFLPSQVATLLGSTLGFKESLVAAIPWAFSALGVYYIPRYADRKTHRRNPIATLNLVVAAIGLIISAYASPVLAIAALCLCAIGFLAVQPIFWTFPAQILSGKALAAGIGFCTTMGAFFSFLAPIIRVEAESQFNSPPAGLITLALFSLLSATLIFSLKFWPAKATAEVI >NZ_CP045154.1|WP_002211912.1|2122942_2123365_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MSAPLPYIKPGERVIIYDGVCALCTGWVNFLIRHDRRHTVRLSAVQSKKGHALLEWAGLPTDKINTLVLIENQQVYLRSEAIFRVIANLPWPWRILGVLRIFPRPLRDRCYDGIALNRYRLFGRYDAVRKLKADHERRFL >NZ_CP045154.1|WP_002216393.1|2123792_2124533_+|SDR-family-oxidoreductase MNLKGKKALVTAAGQGIGFNTATLFARKGAEVIASDINIAALSNIPGITAVSLDVTDTLAINDVAQAIGPIDVLFNCAGVVHSGDILTCSEQEWQFALDLNVTAMFHMIRAFLPGMIACQQGSIINMSSVASSIKGVPNRFAYSTSKAAVIGLTRSVAADYVTQGIRCNAICPGTVESPSLRQRIAVQAHAEGRSEADVFQAFAARQPIGRIGKAEEIAQLALYLASDASAYTTGTIHIIDGGWSN >NZ_CP045154.1|WP_002211916.1|2124580_2125423_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKLLRYGPVGEERPALLDELGEIRDLSAHIEDISGKFLLPATLYKLRQLDSASLPLVRGEQRLGACVGHVGKFICVGLNYADHAAETGAEIPQEPVIFNKWTSAIIGPNDDIEIPRNSVKTDWEVELGVVIGTGGRYIGEANAMSYVAGYCVVNDISEREFQLEHGGTWDKGKGCDTFGPIGPWLVTRDEIPDPHQLGLWLDVDGRRYQNGSTRTMIFKIPQIISYLSRFMSLQSGDVISTGTPPGVGLGQKPPVYLHAGQIMRLGIEGLGEQCQKTIQA >NZ_CP045154.1|WP_002211917.1|2125454_2126732_+|L-fuconate-dehydratase MTIITALRTEDVRFPTSLELDGSDAMNPDPDYSAAYVILDTDNPALSGHGLTFTIGRGNEICCVAIHALEHLIVGRDLASMTANMGKFWREFTSDSQLRWIGPEKGAIHLATGAVINAVWDLWSKAEGKPLWRLVADMSPEELVRCIDFRYITDCITPEEALTLLQQRAHNKALRLEKLQDEGYPCYTTSAGWLGYPDDKLRRLCQDAVDAGFDYLKLKVGRDLEDDIRRVRITREVLGPDRKLMIDANQIWETNEAIPWVNQLAFANPWFIEEPTNPDDIEGHRRIRQGVAPVKVATGEMCQNRIMFKQFIMREAIDVVQIDACRLGGVNEVLAVMLMAAKYDLPVCPHAGGVGLCEYVQHLAMIDYLCIAGTDKGRVIEYVDHLHEHFVHPCVIKNAAYMPPEQPGFSIEMHQSSIEKYRFRV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP045154_5 | 3088686-3088895 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP045154_5
|
3 spacers
spacers of NZ_CP045154_5
>5.1|3088715|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT TCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGA >5.2|3088775|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGT >5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGA >5.4|3088776|30|NZ_CP045154|PILER-CR AAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGT >5.5|3088836|30|NZ_CP045154|PILER-CR TTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGA |
cas1,cas3f,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045154_5
The CRISPR arrays of NZ_CP045154_5 >merge|NZ_CP045154|5|3088686-3088895|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTGATTATTGCCTGTGCGGCAGTGAACTCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGTTTTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAACATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACA >NZ_CP045154|5|5|3088686-3088894|CRISPRCasFinder ATTTGATTATTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGA TTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGT TTTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAAC ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGA TTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_CP045154|5|3|3088686-3088894|CRT ATTTGATTATTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGA TTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGT TTTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAAC ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGA TTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_CP045154|5|3|3088746-3088895|PILER-CR TTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACG AAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGT TTTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAACA TTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGA TTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACA
>NZ_CP045154.1|WP_002210191.1|3087346_3088327_-|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MENAIHSSDLKTILHSKRSNIYYLEYCRVLVNGGRVEYVTDEGKQSLYWNIPIANTTVIMLGTGTSVTQAAMREFARAGVLVGFCGGGGTPLFAANDVEVNVSWLTAQSEYRPTEYLHDWVSFWFDDEKRLAAAVAFQRIRIAQIQQHWLSSHIQRESLFPVNHDQLLFILTRFEQNLANCLTSNDLMVQEAVLTKALYKLAANTVNYGDFTRAKRGGGIDLANRFLDHGNYLAYGLAATATWVIGLPHGLSVLHGKTRRGGLVFDVADLIKDALVLPQAFIAAMQGEEEQEFRQRCISGFQRTEALDVMIDGIKETAALCSQVPR >NZ_CP045154.1|WP_002228501.1|3084062_3087350_-|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLISQCHKRALNETRRILDQFAERKGDRTWQTAITQEGLNTLRKLLRRTARRNSAVACHWIKSNNQSELLWIVGNLRRFNAEGTVPTNTTQRDILRSQDENNWHSVETIALLAGIAGLFHDFGKANVLFQQGLQGQGKTYQPYRHEWVSLRLFQAFVEQKNDIQWLTALSQINPADETTLMSNLVKDGLDDYTNPLAALPPLAKTIAWLILSHHRLPVYPSKDYHRPPKVEEIDDWLHQQLMPVWNSTNMDSGDWREKDKLDVWRFPHGTPLQSAEWCKKAQKFAKRALRQPSLVNDGHLNQRFTSHMARLVLMLADHHYSSLPATPGWQDKNYQVFANTHNKMRDANAHSKTIEMKQRLDEHNIGVGQNALLLGRSLPHIRKTLPAITRHKGFKQRSVQEKYRWQDKAFDLAVTLRERSLQQGFFGVNMASTGCGKTFANARIMYGLSDEKQGCRFSVALGLRTLTLQTGTALQQKLTLQKDDLAVLIGSQSVLQLYQLNNDKLEPRGTGSQSADKFFSEHQYVSYDGSLDDGRLSTWLSNNDRLKRLLCAPVLVCTIDHLIPATESLRGGKQIAPMLRLLTSDLVLDEPDDFDRNDLPALCRLVNWAGMLGSRVLLSSATLPPALVQALFNAYRAGRADYQQASGQPDTPVNICCAWFDEHGVAQQDIQQSKDFIQHHGDFITRRVGKLSTAEVLRRAELIPVSSASVKNGSVLDAMAAVMRDSMLRLHQAHHQTHPSEKTVSVGVVRMANIDPLVAIAQRLYAMAAPENYRIHYCVYHSQHPLAVRSAIERRLDVTLTRYQPNALWQVAEIEHALQHHPEQHHLFVVLATSVVEVGRDHDYDWALAEPSSMRSFIQLAGRVQRHRQVAPQMANMHILQKNFKALTQKDPAIPVYCKPGFETTRCRLNTHDLDKLLLPSQYKVINAISRIQERTKLEPRDNFVDLEHLSLRLILQGSAEPLKYYAALWWRKQATWSGEQQRCPPFRQSSPDEQHNLWIDDEADKPVFKRLDSDQIEWKVSDGFQDVELTLAAGNSAWIDTDCLRIYQWLAESLNKELNEVSRQFGEVRLPKKDGERWHYHPLLGVFGALD >NZ_CP045154.1|WP_002222491.1|3082307_3083654_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MSDEGLAAFIVSYIKSREQPKLEAFDKEAEKRLAGLTQAEDIALAQQEIAQQRQELIARYEVRNWLTDAANRAGQIKLATHAPKYTHSDSKSSGILNIELQSKKKDYFSSVDLAEQASDVIGNAAVFDLVKLLQSECEGGSLIKCLEQGDNSVLKLFSNDDELVEEWTTKFKSILNNEKFTSHKLAKQFYFPVGPDQYHLLSPLFSSSLAQAMHQRIIEARFSDQSKEAKAAHKAGRWHPTVRVLYLDTAVQHIGGTKPQNISYLNSVRGGKVWLLPCGAPSWKNIQKPPIKYRSIFHDRSEFTVLARNNLWQMQLYLLGVKPLSNTMDIRAARLACCDEIIDILFNYVAEIQNLDGTNGWSDAEDCKLKRSEQLWLDPTRAMDDPVFKLEREKEDWKQEVSQDFGYWLNRWLQHDELVFGYVEQREWSSLFKQRLREFEQGSLETSS >NZ_CP045154.1|WP_002211868.1|3081360_3082311_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MSSLIVLHQVRVENANAIAGLTYGFPAITHFLGYSHALSRKLQSSHGLTLRGCAVICHYQQVHAYLSGWDYVFSLTRNPLTKEAKTAAFNEEGRMHMTVSLVIECDGTIANGDDGANALEKHLASLCLTQRLAGGTITNIRRVKVINYPETEVATRRLLCRLLPGFALLDRSELLAEHLNRLRQTNPQAEMLDAWLDFSALKIQAIPPQSDTPVESGAPAPWGYVGKPAAGYLVPIVTGYRAISPLYAPGEVDKTRDPHTPFRFVESLYGIGEWRGLHRITDLRQLLWGYHQEGDNYLCRCALPASVDTYLLNDEE >NZ_CP045154.1|WP_002211867.1|3080338_3081343_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MAKATIKTASVLAFERKLSNSDAMMYAGNWGQTDNWQPIIIKEKAVRGTISNRLKNALASDPAKLDAEIQKANLQRVDVAALPFDTDTLKMSFTLRVLGNLATPSVCNDQEYQAELASVINGYISEQSFSVLAARYAENLANGRFLWRNRVGAEDIKVCITSQTKSYQFDSNEFSLRQFSQPSKELTALAQEIEQGLAGNGFAFFTVDAFVRLGNGQEVFPSQELVLDSNSKKSKVLYQIDGIAALHSQKVGNALRTIDDWYPDATELALGPIAVEPYGSVTSRGKAYRQPKQKMDFYTLLDNWVTKGTVPAVEQQHYVMATLIRGGVFGEKGE >NZ_CP045154.1|WP_002211866.1|3079773_3080328_-|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDHYLDIRVLPDPEFSAQTLLEALFAKLHRALVATIPGRVGVSFPTAGKTLGSQLRLHGSRGDLLELQSAGWLKGLQDYCECSEILPVPADVKHRTIRRVQVKSSAQRLRRRSVSKGWLTEEQARLRIPDSHDKRCDLPFLRLKSRSSEQYFLLFIEQGTLQASATTGEFSAYGLSVNATIPWF >NZ_CP045154.1|WP_002211865.1|3078676_3079696_+|aldo/keto-reductase MDYIKLGHCGLQVSRLCLGTMNMGSKQWKPWVFDKAESTPLIKHALDCGINFIDLADFYSAGVGEEVVGRIVKNLMSRDELVLTTKVGYPIGHGPNNQGHSRKHIMASIDASLKRLGTDYIDIYMLHYFDINTPVEETWSAMNDIIHSGKARYTGVSTMFTWQLSKILWCCERNGFAKPINMQLQLNCAYREEEREMIPQCRDQGLGISAFSPLARGLLSCDFSSVRNKTDFFTQEMYADVTSLNIAQSVERVAKNRGITPAQVAQAWVLNHPGTDCMLVGADTIEQINSAVTALRISLNAEEHFELERNYTPCDVINDYTAGQRIAREARPPSGIFAP >NZ_CP045154.1|WP_002211864.1|3078162_3078666_+|formaldehyde-activating-enzyme MQMYIGEGFAGNGVNAAHINIMIGPRDGVVGQAFAASLASPSQGHYPFIVVIKPNVAAKPMTLYVNKAEIRSELHGRATWGASQAAVAKAVAEALLANLFPPEAEDDWCIITANWVNIDCDDIDEVYRNNYRACTTALHAAMAKTPKRDQLTHALTQLSNPFFTPKA >NZ_CP045154.1|WP_002211863.1|3076757_3078116_+|MFS-transporter MQTLPSEKIRMDDVPLNRFHIRIAGLTFGAHFIDGYILGLIGFALIQLKPIMALTPLWEGLLGSAALIGLFLGSLILGWISDYIGRQKIFSFSFVIITLASALQFFASTPEQLFILRVIVGIGIGGDYSVGHTLLAEFSPRKHRGVLLGAFSVIWTFGYVSASFVGHYLSMVSPEAWRWLLSSAALPALLILLVRIGTPESPRWLMGKGREDDAMAIVHKYFGPNVTLIDEEPATSTRRFLSLFGRKYWRRTAFNSLFFVCLVIPYFAIYTFLPSILNVMALSQNFATDLLLNGLLVVGALVGIVLTAFCSRRSFLISSFIFLATCLLLLSILPSNQTFWLIALFAAFTLVMSAVSNLVGVFPAESFPTEVRSMGVGFATSMSRLGSAIGTSLLPLAIVNYGMPVTTTLLAFVLIIGAIVSIAWAPETKGLTLVDASQSATTPRPPSSIIPN >NZ_CP045154.1|WP_002216551.1|3076424_3076634_-|hypothetical-protein MVIGDLLTETDRLFQKRTAAMDDLFSSPGPVRLILFVMAMCQPKYKAASAFYAYPSEKKVRDPPLNSYK >NZ_CP045154.1|WP_002210192.1|3089231_3090476_+|mechanosensitive-ion-channel MQQRISQWLERLGMEFSDVMSLTMVIGLILLISVMIHLVLHRVVLAALQRRGQQSQRIWQQAITKHKLFQRVALLLQGIIINLQAVLWLQNGSQTQAVIVTAAQVWIMAFALLALFSLLDTLLALLRQSSVAHQLPLRGICQGLKLVAAIFIGIMIVSLLMGRSPLLLLSGLGAMTAVLMLVFKDPILGLVAGIQLSANDMLKIGDWLEMPKYGADGAVTDIGLTTVKVRNWDNTVTTIPTYALISDSFKNWRSMSESGGRRIKRSINIDTTSVHFLSEQEQQRLTLNPLLQHYLSEKSQELNQYNQQIALDLSSPLNGRRLTNIGTLRAYLVAYLRAHLGIHQSMTLMVRQLAPTPEGLPLEVYAFTNTTIWAEYEGIQADIFDHIFAVVSEFDLRIHQTPSGNDMRSMLAKV >NZ_CP045154.1|WP_002210193.1|3091052_3092327_-|hypothetical-protein MKLLNTLVCIIGLTSFSSSAKLVNAEHLDALYQKVTVANKTELGLIHIYSEFPDYRWVKDPIEGVSAIDDVARAAIFYQRQYQATGSAADLEKVKSLVEFILYQRADNGYFYNFIYPDHSINKEYKTSVAEPNWWTWRALWALTQVYPTLVKTDNALAQRTRETIFATIDVIYKDFNFKQTRGEKEGVAVPEWLPHTAGDQASVLLMALSDAQALEAKPEIEKMMRSLAAGIMLMQVKDTSSPVNGAFLSWQNLWHGYGNSQAYALLVAGNRLGDRDMIKAAFNELDHFHPWLISNGLLNEFTVRQQGEKVTLIEQKKFSQIAYIIRPMVFANIKAWEISRDAVYLERAVDLSLWFFKNNPAQAQMYYPVTGIAFDGIDSATTVNKNSGAESTIEALLTLQLIESIPDAKRMLESALEKRNIKQ >NZ_CP045154.1|WP_002210194.1|3092365_3093481_-|hypothetical-protein MKHKKYLPLFLMAGICSVAQADNSPDVVSANNMDNRTFFAGDKIRIVKDGGETIEAVVELSDDNIGIVRIPKDEKAYFHGNWLAEYKIEHFRNEGRSTNSRPVHEIVFADGRVNFGDTGWNTGFLLKQVRFTSDSRNESNHKVDFRMVEMEIRPAWSKSIDKHWFMFEGIYLGKTGYEKNRTTGGDNNIGGDGYGFRPYYRYQVSDRLSVNTDVKMLVEDKDARGADNGRFQFYEALVNVNYRVADNVHVGIEVFRKEGQDFNHNGTKTANVLEQELRPWVAWNMGKNNFLFKMEPQLRRIGGQDGYRETSKAQKYIFNYSYPIADRVYLVAEYFYRVEHDKKFWDRGVRDNKSYSDTTTHFGKLGINYIF >NZ_CP045154.1|WP_002213840.1|3093603_3094542_-|DUF1861-family-protein MMRHAPPASVAQLFADYQKRTAHNTFSTGRLEFTGVGDKDVYNITAPFTSAGQVVIAGRVEARDSEHSTIVFFSEQQGQWAPVENAPTFQLQDPFFTRIEDELILGGVEINPHPDNPRQLIWHTVFFRGRDIHSLTRFASGPPGMKDIRLCHIQQGRIGVFTRPQGKIGGRGTIGYVEINNLEALTPETITSAELFEQQFNSEEWGGVNETHLLCDGTIGLLSHIACFDQHGRRHYYPGVFIFNPDTKNYTPIKIIAARDNFLPGATKRPDLVDVIFPGGLIVLPNNGWRLYVGASDAEAHWIDIEDPFSGF >NZ_CP045154.1|WP_002210196.1|3094568_3095624_-|glycosidase MMRYSGNPLITPQDITPSHPGFKVECAFNAGITKLGDETIMLIRIAESVIPESEGITVVPLLMEISGHWQVTTRVFKHDDPAYDFSDPRLISDIADPSTVYLTSLSHLRVARSHDGVTFVVDDQPFIFPANGDEAFGCEDARITQIDGAYYINYSAVSAKGICTALAVTQDFTDVKRLGLIFCPDNRDACLFPEKINGKYMTLHRPAPKHFGKPEIWLASSLDLLHWGDHRHLLGTSQDPWDALKLGGGAQMLKTEKGWLQIYHGVDATQRYSLGALLLDLEQPTKILAKSPVPLLQPQAPYELHGFFGNVVFTCGALIENDSLRVYYGAADECMCLAEMPLAQLWQHLSV >NZ_CP045154.1|WP_002210197.1|3095770_3096595_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease MKKNINSLIIHLVMFSLALSWLYPYIWMVLSSFKQSADIYTTGLFGSAYSLDNYRFLFENSGRVEKPFLKTLFNSLFISTVVTVAVTLSSMFIGFALAKMQFKGQSLFRNLLFLQMVFPASMFIIPQFVLVRELGLLNTYSAMIVPFLMSSWGIFMISQSFQGTPNDYIHAAKIDNASLWQIMIYLMMPLNKAIIAIVALFTFVGTWDNFLWPLIVIQDESKMPLSVLLATFSKSYGVYVGPVIAGAVIQTIPIVVLFILFRKYFMQGMSLSLK >NZ_CP045154.1|WP_002210198.1|3096595_3097471_-|sugar-ABC-transporter-permease MTFLKLKDKQVGSVLAASYLGYTSIFWFYPFIWLAVLSLTEWRFVGIPTFNGLNNFILVMQDPLFWKSMLNVMRFLMYYLPIVFISSFLFAFGLQKLKHGRTFVALSFLLANVSSGVAYSIVFSKIFSQNGPLNTFLYDWFGFTLPWLTSPDFAMLSIALVVTWKFVGYYGLILFSGLNSIPKEIYSAAELDNTRTIKRLFHITLPMINPQLIMVLVLAITVSFAIFTEPYLITGGGPLNSTTTPMIVMYETAFMKMQPSWAATMSIFIALISFGIILGVRKLLERKVEIV >NZ_CP045154.1|WP_002210199.1|3097579_3098866_-|carbohydrate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MLEKMKNTLISLAIASSCVVFTGCDNDTASAKNEKQDITLWIAPNNVQEAFWSEVVGEWNKQPDKKKVVFSTIPAAGSSEEAIMNAIASDRAPDISENIFTGFGSQLADLGQVVDLSTLDGYENLISTRQMTDIMDNWRYNGKNYILPIYMNPVLFWWRGDLLKEQGFSEVPKTYDEVYALSEKYTIPDKRYAIQATSGRNWWDRWFDFIALYYAQSDGKPYIANQQASYDNQAGRDVLDFMHTLFSKKWTLYDFGQDDPLVTGKVLGAVRGPWDISRYQQQYPEILKHIKMGPMLVKEQQDKPHTFADGKGLVLFSHSKVKPEAWEFIQWVFSQPKFDKRWMELTGMPPARADLLTNPFFAEYYQEHPYAAAYAEYVNVAIPPVSSGETVEIQRSMTQMIEKTAFNTATPDEALQQSIKEVNAILKP >NZ_CP045154.1|WP_002210200.1|3099137_3100178_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MTTGKKRETLKTIAETLNVTHTTVSNVFNRPEKVSPELREKILAYAESINYHGPAGAGRFLRTGKCGTLGVIFNDNLSYVFSDRHDIALMRGIAEECEKNGINIALMPLKTNNALKKRMMGALVDGYILNATYNNDEVVQAALTSGLPVITTDIKLQNFTCVSIDDGAAMQAICHHLLAAGHKKFGIVSFPVKRLPGELTSLAEFSTDYDNGVAFGRISACITALSDAGIDLHTSYVAEQPHSETGGEKAAKALLAKEPGISAIICLSDRFAFGVYQFCQDHNIPVPGQIAITGFDDIDIQDPPVGLTTIRQPTVLKGREAARALISGQLDNDISLDFELVVRDSA >NZ_CP045154.1|WP_002210201.1|3100194_3101583_+|phosphomannomutase/phosphoglucomutase MEKLTCFKAYDIRGKLGSELNEEIAYRIGRAYCQWLKPAKVVVGGDARATSVELKNALAKGLMDGGADVIDIGMVGTEEVYFATRFYGVDGGIQVTASHNPIDYNGMKLVKKDAQPISGDNGLYEIQRLAQDNHFAPPGVRGQLETQLVREHYVEHLLSYIDLNALLPMKIVVNAGNGAAGPTLDALEAALAKRKVPISFIKINHQPDSSFPNGIPNPMLPENQWSTRQAVCEHQADLGIAWDGDFDRCFFFDHLGNFIEGYYIVGLLAEKFLLTNNMGKATHNTDKIIHDPRLTWNTIDIVQTLNGTAIESKTGHAFIKDAMRHHDAVYGGEMSAHHYFREFGYCDSGMIPWLLVIELLSKKTTSLFSLIESRKAKFPVSGELNFTVSDPKTKIQQIKQFYADSAIHVTGIDGLSMEFEHWRFNLRSSNTEPLVRLNIETRGDVTLLEQKTAQLTQLLYPK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP045154_2 | 2.8|1429964|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 1429964-1429995 | 32 | NZ_CP045154.1 | 2549031-2549062 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.8|1429964|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2549031-2549062, mismatch: 0, identity: 1.0
agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer ********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP045154_2 | 2.8|1429964|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 1429964-1429995 | 32 | MT374852 | Yersinia phage vB_YpM_3, complete genome | 12-43 | 0 | 1.0 |
NZ_CP045154_2 | 2.4|1429962|34|NZ_CP045154|PILER-CR | 1429962-1429995 | 34 | MT374852 | Yersinia phage vB_YpM_3, complete genome | 10-43 | 1 | 0.971 |
NZ_CP045154_4 | 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2112174-2112205 | 32 | MH616963 | CrAssphage sp. isolate ctbg_1, complete genome | 86942-86973 | 7 | 0.781 |
NZ_CP045154_5 | 5.1|3088715|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088715-3088745 | 31 | CP049262 | Cronobacter sakazakii strain CS-09 plasmid pCsaCS09b, complete sequence | 69637-69667 | 7 | 0.774 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NC_021534 | Vibrio phage pYD38-A genomic sequence | 3299-3329 | 7 | 0.774 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | JF974294 | Aeromonas phage pIS4-A genomic sequence | 21966-21996 | 7 | 0.774 |
NZ_CP045154_5 | 5.4|3088776|30|NZ_CP045154|PILER-CR | 3088776-3088805 | 30 | NZ_CP031943 | Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence | 4007-4036 | 7 | 0.767 |
NZ_CP045154_5 | 5.5|3088836|30|NZ_CP045154|PILER-CR | 3088836-3088865 | 30 | NZ_CP013487 | Vibrio alginolyticus strain ATCC 33787 plasmid pMBL287, complete sequence | 166773-166802 | 7 | 0.767 |
NZ_CP045154_4 | 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2112174-2112205 | 32 | NZ_CP010358 | Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-8, complete sequence | 46720-46751 | 8 | 0.75 |
NZ_CP045154_4 | 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2112174-2112205 | 32 | NC_019694 | Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02, complete sequence | 20911-20942 | 8 | 0.75 |
NZ_CP045154_5 | 5.2|3088775|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088775-3088805 | 31 | NZ_CP031943 | Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence | 4007-4037 | 8 | 0.742 |
NZ_CP045154_2 | 2.7|1429903|33|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 1429903-1429935 | 33 | NZ_CP040366 | Bacillus flexus isolate 1-2-1 plasmid punnamed3, complete sequence | 923-955 | 9 | 0.727 |
NZ_CP045154_4 | 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2112174-2112205 | 32 | MT774386 | CrAssphage cr110_1, complete genome | 42858-42889 | 9 | 0.719 |
NZ_CP045154_4 | 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2112174-2112205 | 32 | NZ_CP028934 | Campylobacter jejuni strain FORC_083 plasmid pFORC_083_2, complete sequence | 25849-25880 | 9 | 0.719 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | MF679145 | Escherichia coli plasmid pBJ114-96, complete sequence | 37586-37616 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_KP453775 | Klebsiella pneumoniae strain ST11 plasmid pKP12226, complete sequence | 60831-60861 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP021340 | Escherichia coli strain 95NR1 plasmid p95NR1A, complete sequence | 67671-67701 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP021336 | Escherichia coli strain 95JB1 plasmid p95JB1A, complete sequence | 67672-67702 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP024832 | Escherichia coli strain CREC-532 plasmid pCREC-532_2, complete sequence | 33830-33860 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP024817 | Escherichia coli strain CREC-629 plasmid pCREC-629_2, complete sequence | 62769-62799 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP029117 | Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4 | 15616-15646 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP029117 | Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4 | 112580-112610 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP023961 | Escherichia coli strain FDAARGOS_448 plasmid unnamed2, complete sequence | 16858-16888 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | AP023233 | Escherichia coli YJ4 plasmid pYJ4-b DNA, complete genome | 47570-47600 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP019075 | Escherichia coli strain CRE1493 plasmid p1493-4, complete sequence | 16520-16550 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP015837 | Escherichia coli strain MS6198 plasmid pMS6198C, complete sequence | 3287-3317 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP011063 | Escherichia coli str. Sanji plasmid pSJ_98, complete sequence | 37637-37667 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | NZ_CP040920 | Escherichia coli strain FC853_EC plasmid p853EC1, complete sequence | 33436-33466 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT | 3088835-3088865 | 31 | AP023222 | Escherichia coli M505 plasmid pM505-b DNA, complete genome | 93735-93765 | 9 | 0.71 |
NZ_CP045154_5 | 5.4|3088776|30|NZ_CP045154|PILER-CR | 3088776-3088805 | 30 | AP014500 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S32-C79, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces | 26487-26516 | 9 | 0.7 |
NZ_CP045154_2 | 2.3|1429901|35|NZ_CP045154|PILER-CR | 1429901-1429935 | 35 | NZ_CP040366 | Bacillus flexus isolate 1-2-1 plasmid punnamed3, complete sequence | 923-957 | 10 | 0.714 |
1. spacer 2.8|1429964|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT374852 (Yersinia phage vB_YpM_3, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer ********************************
2. spacer 2.4|1429962|34|NZ_CP045154|PILER-CR matches to MT374852 (Yersinia phage vB_YpM_3, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaagactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer caagactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer *********************************
3. spacer 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH616963 (CrAssphage sp. isolate ctbg_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer aattataaaagatgctgataaaaagattatta Protospacer * **** ***********.******* . * *
4. spacer 5.1|3088715|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP049262 (Cronobacter sakazakii strain CS-09 plasmid pCsaCS09b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tcaggggactggcgaacaatgtctttcatga CRISPR spacer acgtcgcgctggcgaacaatctctttcatga Protospacer *. * .************ **********
5. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021534 (Vibrio phage pYD38-A genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attacctgaatggcatttgctttatgcctga Protospacer ****.************* ****. * **
6. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to JF974294 (Aeromonas phage pIS4-A genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attacctgaatggcatttgctttatgcctga Protospacer ****.************* ****. * **
7. spacer 5.4|3088776|30|NZ_CP045154|PILER-CR matches to NZ_CP031943 (Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaaggtaagatgggcaagcttctagtagt CRISPR spacer tatgagaaagatgggcaagcttttagtggt Protospacer * ..* ***************.****.**
8. spacer 5.5|3088836|30|NZ_CP045154|PILER-CR matches to NZ_CP013487 (Vibrio alginolyticus strain ATCC 33787 plasmid pMBL287, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer cttgttcagtggcattttctttggcacaga Protospacer .* .* *.****************.****
9. spacer 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010358 (Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-8, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer atttattaatgatgctgacgaaaatatggcac Protospacer ********* *********.**** * .*
10. spacer 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019694 (Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer atttattaaagaagctgccaaaagagcatcaa Protospacer ************ **** *****... *.**
11. spacer 5.2|3088775|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031943 (Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gaaaaggtaagatgggcaagcttctagtagt CRISPR spacer ttatgagaaagatgggcaagcttttagtggt Protospacer * ..* ***************.****.**
12. spacer 2.7|1429903|33|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040366 (Bacillus flexus isolate 1-2-1 plasmid punnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ccgaaatcatcagatgtaattaagatttttgct CRISPR spacer aatggattatcagatgtaattaagtttttttcc Protospacer ..**.**************** ***** *.
13. spacer 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774386 (CrAssphage cr110_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer tgctattgaagatgctgataaaaagaaacttg Protospacer .****.**********.******** .* .
14. spacer 4.2|2112174|32|NZ_CP045154|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028934 (Campylobacter jejuni strain FORC_083 plasmid pFORC_083_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer gcacattacagacgctgacaaaaagaaagtta Protospacer .. .**** ***.************** * *
15. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF679145 (Escherichia coli plasmid pBJ114-96, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
16. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KP453775 (Klebsiella pneumoniae strain ST11 plasmid pKP12226, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
17. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021340 (Escherichia coli strain 95NR1 plasmid p95NR1A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
18. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021336 (Escherichia coli strain 95JB1 plasmid p95JB1A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
19. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024832 (Escherichia coli strain CREC-532 plasmid pCREC-532_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
20. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024817 (Escherichia coli strain CREC-629 plasmid pCREC-629_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
21. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029117 (Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
22. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029117 (Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
23. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023961 (Escherichia coli strain FDAARGOS_448 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
24. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP023233 (Escherichia coli YJ4 plasmid pYJ4-b DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
25. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019075 (Escherichia coli strain CRE1493 plasmid p1493-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
26. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015837 (Escherichia coli strain MS6198 plasmid pMS6198C, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
27. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011063 (Escherichia coli str. Sanji plasmid pSJ_98, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
28. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040920 (Escherichia coli strain FC853_EC plasmid p853EC1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
29. spacer 5.3|3088835|31|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP023222 (Escherichia coli M505 plasmid pM505-b DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attatctgaatggcattttctttggcgcaga CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgttt Protospacer ********* ***** *******..*
30. spacer 5.4|3088776|30|NZ_CP045154|PILER-CR matches to AP014500 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S32-C79, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaaaggtaagatgggcaagcttctagtagt CRISPR spacer gttgtagaagatgtgcaagcttctagtaat Protospacer . . . ****** **************.*
31. spacer 2.3|1429901|35|NZ_CP045154|PILER-CR matches to NZ_CP040366 (Bacillus flexus isolate 1-2-1 plasmid punnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aaccgaaatcatcagatgtaattaagatttttgct CRISPR spacer ataatggattatcagatgtaattaagtttttttcc Protospacer * ..**.**************** ***** *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
438042 : 510633
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045154|438042:510633|DBSCAN-SWA TATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACCGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATACGCCGCGACCTGCTGTTGCTTCACTCCTGGATGAATACCGGGATTATATTCGTCAACGCATCGCCGATGCTCATCCTTACAAAATCCCGGCAACGGTAATCGCTCGCGAGATCAGAGACCAGGGATATCGTGGCGGAATGACCATTCTCAGGGCATTCATTCGTTCTCTCTCGGTTCCTCAGGAGCAGGAGCCTGCCGTTCGGTTCGAAACTGAACCCGGACGACAGATGCAGGTTGACTGGGGCACTATGCGTAATGGTCGCTCACCGCTTCACGTGTTCGTTGCTGTTCTCGGATACAGCCGAATGCTGTACATCGAATTCACTGACAATATGCGTTATGACACGCTGGAGACCTGCCATCGTAATGCGTTCCGCTTCTTTGGTGGTGTGCCGCGCGAAGTGTTGTATGACAATATGAAAACTGTGGTTCTGCAACGTGACGCATATCAGACCGGTCAGCACCGGTTCCATCCTTCGCTGTGGCAGTTCGGCAAGGAGATGGGCTTCTCTCCCCGACTGTGTCGCCCCTTCAGGGCACAGACTAAAGGTAAGGTGGAACGGATGGTGCAGTACACCCGTAACAGTTTTTACATCCCACTAATGACTCGCCTGCGCCCGATGGGGATCACTGTCGATGTTGAAACAGCCAACCGCCACGGTCTGCGCTGGCTGCACGATGTCGCTAACCAACGAAAGCATGAAACAATCCAGGCCCGTCCCTGCGATCGCTGGCTCGAAGAGCAGCAGTCCATGCTGGCACTGCCTCCGGAGAAAAAAGAGTATGACGTGCATCTTGATGAAAATCTGGTGAACTTCGACAAACACCCCCTGCATCATCCACTCTCCATCTACGACTCATTCTGCAGAGGAGTGGCGTGATGATGGAACTGCAACATCAACGACTGATGGCGCTCGCCGGGCAGTTGCAACTGGAAAGCCTTATAAGCGCAGCGCCTGCGCTGTCACAACAGGCAGTAGACCAGGAATGGAGTTATATGGACTTCCTGGAGCATCTGCTTCATGAAGAAAAACTGGCACGTCATCAACGTAAACAGGCGATGTATACCCGAATGGCAGCCTTCCCGGCGGTGAAAACGTTCGAAGAGTATGACTTCACATTCGCCACCGGAGCACCGCAGAAGCAACTCCAGTCGTTACGCTCACTCAGCTTCATAGAACGTAATGAAAATATCGTATTACTGGGGCCATCAGGTGTGGGGAAAACCCATCTGGCAATAGCGATGGGCTATGAAGCAGTCCGTGCAGGTATCAAAGTTCGCTTCACAACAGCAGCAGATCTGTTACTTCAGTTATCTACGGCACAACGTCAGGGCCGTTATAAAACGACGCTTCAGCGTGGAGTAATGGCCCCCCGCCTGCTCATCATTGATGAAATAGGCTATCTGCCGTTCAGTCAGGAAGAAGCAAAGCTGTTCTTCCAGGTCATCGCTAAACGTTACGAAAAGAGCGCAATGATCCTGACATCCAATCTGCCGTTCGGGCAGTGGGATCAAACGTTCGCCGGTGATGCAGCACTGACCTCAGCGATGCTGGACCGTATCTTACACCACTCACATGTCGTTCAAATCAAAGGAGAAAGCTATCGACTCAGACAGAAACGAAAGGCCGGGGTTATAGCAGAAGCTAATCCTGAGTAAAACGGTGGATCAATATTGGGCCGTTGGTGGAGATATAAGTGGATCACTTTTCATCCGTCGTTGACAGTGATGAGTTAGATGCCTGTTTAGCATTGGGTTTATCTATAGGTATCACGGGTTGGGTTTGCGATGAGCGTCGTGGCCTTGATCTTAGAGCTTTGCTCCCGCGTATTCCTGTTCAGCAGCTATTGTTGGAAACTGATGCTCCCTATTTATTGCCAAGGGATTTGAATCCTAAACCTGCATCACGTCGCAATGAACCCTGTTTTCTGCCCCATATCGTCCAGCAGGTTGCAGCCTGGCGACAAGAAGACCCTAATTGGCTAGGACAGAAAACTGATGAAAACGCCCGCCGGGTTTTCCGGCTGGTTTGAGTTAGGAGAACAATATGAGCTATGCATTTCCGGGCACCTTTCCTGGTCGCCGTATGCGCCGTGTACGCTGTCATGATTTCAGCCGCCGTTTGGTTGCCGAGAATCACTTGACGGTCAATGACTTGATTTACCCGGTGTTTGTCATGGAAGGGACTCACCAGCAACAAGCCGTTTCTTCAATGCCGGGGGTCTCTCGTATGACAATTGATCTGCTGCTGAAAGAAGCAGAAGCAATTGCTAAGCTCGGTGTGCCGGTTATATCGCTATTCCCGGTCATTGAAGCAGGGAAAAAATCATTATATGCAGAAGAGGCATATAACCCGGATGGTTTAGTTCAGCGTACTGTGCGTGCGTTGAAAGATGCAGTTCCTGAGCTAGGTATTCTGACTGACGTGGCACTCGATCCCTATACGACCCATGGTCAAGATGGTGTGATTGATTCTGATGGTTACGTGATCAATGATGTCACCAAAGAGATTCTAGTGCGTCAGGCACTATCGCATGCTGAAGCTGGCGCTGAGATTATTGCACCAAGCGATATGATGGATGGCCGTATAGGTGCAATTCGTGATCAATTAGAGCGCCAAGGGTTAGTGAACACCCAGATAATGGCTTATTCGGCTAAGTATGCGTCTTGCTACTATGGCCCATTCCGCGATGCAATTGGCTCGAGCAGTAATCTAAAAGGGGGGGATAAAAAAACTTATCAGATGGATCCCGCCAACAGTGATGAAGCACTGCAAGAAATAGCTCAAGATTTACAAGAAGGCGCTGATATGGTGATGGTAAAACCAGGAATGCCATATCTGGATGTTGTACGCAGGGTGAAAGATACTTTTGGTGTTCCAACCTTTGCCTATCAGGTGTCTGGTGAATATGCCATGCATATGGCAGCGATTCAGAATGGCTGGCTCCAAGAGAAACCGACGGTGATGGAGTCGTTGTTATGCTTTAAGCGTGCAGGTGCGGATGGCGTATTAACTTATTTCGCAAAGCAAGTTGCGCAATGGCTACATGATGACCAGATGCAGCGCTAAAGGATCATAACTAAGAGTCACAGCATTCAGATAGGCACTAACTGCGCCTATCTGAATGAATTCTATAATGATGAGGTAATACTCATCCAGATTATTGTAAGTCAGCGTGTTATTGCTTTTCGAACTGACGATTGTCCAGGCTATGCTTAATTTGGCTATTGAGCATATTCAGTAACAACATCGAGCGGGCTTCACCATCTGGTTCGGTATAAATAGCCTGTAATCCGGCAAAAACGCCATCAATAATTTTTACGATATCACCAGGTTTCGGTACTTCAGGGGCAATTATCTTATCCACAGCATGGGCTTGCATATCAGCAATGACGGTTGCTGGGATCACCGCGGGCTGTGTACCAAAACGAACAAAATGGCTGCCCCCCCGGGTGGCGCTGACGGTTGTGGTATGGATATTTTCCGGGTCAAACTCAGCGAATAAATAATTGGGGAATAGAGCCTCTATTACCTCAATACGTTTCCCTCGAACTATCTTTTCGATAGCCACTATTGGTGTCCAACAGTTTACAGTTTGCCGTTCCAAATGCTCTTTGGCACGTAAAATCTGACCGCGTTTACAATACAATAAATACCAAGATTTCATAGTTTCACATACCTTTGGGTACTATTTAGCAGCATAACAAAAGCAGTGAGCGAGATATAGTGAGGAAAAATGGATCACTTCCAATATACAGATTATTTTGAGCGGTACGGATTGTACCTATGCTGATGAGAATTAGCGATAAATAATAACATGACGTTATTTTAAGGTGAGTTTGTATTCATTTTTAACAAAAAGACAGCAACCACTATAAAGACAGCTTATAATGGCGCATCCCATAGCCGCCGAAATGATCAGCATGAAATACCGTGACTTACGTGACTTCCTCTCATTACTGGAACAGAGGGGGGAACTTAAACGCATTAGCCAGCCCATTGATCCTTATTTGGAAATGACAGAAATTGCCGATCGCACGTTACGTGCTGGTGGGCCTGCGTTACTTTTTGAGAACCCTAAAGGTTACAGCATGCCCGTGTTGTGTAATCTGTTTGGCACCGCTAAGCGAGTCGCCATGGGGATGGGGCAAGAAGATGTCAGCGCCCTGCGAGATGTTGGTAAATTATTGGCCTTCCTGAAAGAACCCGATCCCCCAAAAGGTTTCCGTGACTTATTTGATAAGCTGCCAAAATTTAAGCAGGTATTGAATATGCCAACGAAACGCTTGAACTCGGCCCCGTGTCAGGAGCAAGTTTGGCAAGGTGAGGATGTTGATTTAAGTCGCATCCCTGTGATGCACTGCTGGCCAGAAGATGCCGCACCACTAGTCTCTTGGGGGTTGACTATTACACGTGGTCCCCACAAAGAACGGCAGAATCTAGGCATCTATCGCCAGCAGGTATTGGGTAAAAACAAATTAATTATGCGTTGGCTATCGCATCGTGGTGGTGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGAGGCACACCCTGGTGAACGTTTTCCGGTCGCTGTCGCCTTGGGAGCAGACCCTGCTACGATCTTAGCCGCAGTGACCCCGGTACCAGACACGCTGTCTGAATATGCCTTTGCCGGCTTGTTACGCGGCCATAAAACGGAAGTGGTGAAGTGTCTTTCCAATGACCTTGAAGTTCCTGCAAGTGCAGAAATTGTATTGGAAGGATATATCGAACAAGGTGATATGGCTCCGGAAGGTCCTTATGGTGATCATACGGGCTATTACAATGAAATAGATAATTTCCCCGTGTTTACCGTCACGCATATTACACAGCGCCAAGA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58 | Escherichia_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
627733 : 690092
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP045154|627733:690092|DBSCAN-SWA AATGAGTGACTACAAGAATACCCTGAACTTGCCTGAAACAGGGTTCCCGATGCGCGGCGATCTGGCTAAGCGTGAACCTGACATGCTGAAACGTTGGTATGAGCAGGATTTATACGGGATTATTCGTGCGGCCAAGAAAGGTAAAAAGACCTTTATTTTGCACGATGGCCCCCCTTATGCGAACGGCAACATTCATATTGGTCACTCTGTTAACAAAATTCTCAAAGATATTATTGTTAAATCAAAAGGAATGGCTGGATATGATTCACCGTATATCCCCGGTTGGGATTGTCATGGTTTGCCTATCGAGCTAAAAGTTGAACAATTAATTGGTAAGCCGGGTGAGAAAGTCAGCGCTGCAGAGTTCCGGACTGCTTGCCGTAAATATGCCGCTGAGCAGGTTGAAGGCCAGAAGAAAGATTTTATTCGTCTGGGCGTGTTGGGTGATTGGGACCATCCTTACCTAACGATGGATTTCAAAACTGAAGCCAATATTATCCGCGCATTAAGCAAAATCATTGATAACGGTCATCTGCATAAAGGTGCCAAACCTGTGCATTGGTGTACCGATTGCGGTTCGTCGCTGGCTGAAGCAGAAGTTGAATATTACGATAAGACGTCACAATCTATTGATGTGCGTTTTAACGCGGTTGATACGGCAACTGTTGCGGCCAAATTTGGTGTATCTGCTGTTAACGGCCCAATCTCACTGGTTATCTGGACTACCACGCCATGGACTCTGCCTGCTAACCGGGCTATTTCACTGAATGCCGAATATCTTTACCAGTTGGTTCAGGTTGAGGGCGAGTGCCTGATTCTGGCAGCCGATCTGGTTGAGAGCGTCATGAAGCGCGCGGGCATTACTCAGTGGGCCGTGTTGGGAAGTTGCACAGGCTCCGATCTGGAACTGTTGCGCTTTACCCATCCCTTTATGGGCTTTGATGTTCCAGCCATTTTAGGTGACCACGTTACATTGGATGCCGGTACCGGTGCGGTTCACACCGCGCCAGGTCACGGCCCGGATGACTTTGTTATCGGCCAAAAATATGGCTTAGAAGTGGCGAACCCTGTCGGTCCAAACGGTTGCTATCTGGCGGGTACGTATCCAACGCTGGACGGCCTGTTTGTGTTTAAAGCCAACGATGTGGTTGTCGAGTTGCTGCGTGAGAAAGGCGCACTGCTGCACGTTGAAAAACTGCTCCACAGCTACCCATGCTGCTGGCGTCACAAAACTCCTATTATCTTCCGTGCAACGCCGCAGTGGTTTATCAGCATGGATCAGAAGGGGTTGCGTAAGCAGTCACTTCAAGAGATCAAAGGCGTGCAATGGATCCCGGATTGGGGTCAGGCGCGTATCGAAACCATGGTAGCAAACCGCCCAGACTGGTGTATCTCTCGTCAGCGTACTTGGGGTGTGCCGATGTCTCTGTTCGTTCACAAAGAGACCGAACAACTTCATCCGCGCAGTATTGAACTGATGGAAGAAGTGGCCAAACGTGTTGAGCAAGATGGCATTCAAGCGTGGTGGGATCTGGATCCGGCAGAGATTTTAGGTGCCGATGCCGCAGATTATGTCAAAGTGCCAGATACGCTGGACGTATGGTTTGACTCTGGTTCCACCCATTCTTCGGTCGTTGACGTCCGCCCTGAATTTGGGGGTCATAGCCCGGATATGTATCTGGAAGGTTCTGACCAGCACCGCGGCTGGTTTATGTCTTCATTGATGATTGCTACGGCGATGAAAGGTAAAGCGCCTTACCGTCAGGTTCTGACCCACGGTTTTACTGTGGATGGTCAGGGTCGCAAAATGTCCAAATCCATTGGTAACACCATCAGCCCACAAGATGTCATGAACAAGCTGGGGGGTGACATTCTGCGCCTATGGGTGGCATCAACCGACTATACCGGTGAGATTGCTGTTTCTGATGAAATTCTGAAACGCTCTGCGGACTCCTATCGTCGTATCCGTAATACCGCACGCTTCCTATTAGCTAACCTAAACGGCTTTGATCCCGCACAGCATCAAGTGAAACCGGAAGAGATGGTTGTAGTCGATCGCTGGGCGGTTGGCCGTGCGCAAGCGGCTCAGGCAGAAATTATGGAAGCGTATGAGAATTACGATTTCCATTTGGTAGTGCAACGGCTGATGCAGTTTTGCTCGGTTGAGATGGGATCCTTCTATCTGGATATCATTAAAGACCGTCAGTACACCGCGAAAGGTGACGGCATTGCACGCCGTAGCTGCCAGACAGCACTGTTCCATATTGCCGAGGCGTTGGTGCGCTGGATGGCCCCAATCATGTCCTTCACTGCGGATGAAATCTGGAATCATCTGCCGGGCGAGCGTCAACAATATGTCTTCACTGAAGAATGGTATGACGGTCTGTTTGGTTTGGCGGGCAACGAAAGTATGAATGATACTTTCTGGGCTGAATTGTTGAAAGTGCGCGGCGAAGTGAACAAAGTGTTGGAGCAGGCCCGTAGCGATAAACGTATTGGTGGCTCATTAGAGGCCGCAGTGACGTTATACGCAGAGCCTGAACTGGCTGCTCGTTTGAACAGTTTGCAAGATGAATTGCGCTTTGTTCTACTGACTTCTGCCGCTAAAGTGGCCGCTTATGCTGATGCGGGCAATGATGCTCAGCAAAGTGAATTAATTGCCGGGTTGAAAATTACCTTTAATAAGGCTGACGGCGAGAAGTGCCCACGTTGCTGGCATTACACGCAAGATGTCGGTTTGGTAGCAGAGCACGCTGAACTGTGTGGGCGCTGTGTCACTAACGTTGCTGGTGATGGTGAGGAGCGTAAGTTCGCCTGATGAATAAACCTATTTGCTCGACCGGATTGCGCTGGTTATGGCTGGCAGTTGTCGTTGTCATCTTGGATATCAGCAGCAAACAGTGGGTCATGGCCCACTTTGCTCTGTATGAATCGGTGCCACTGATTCCTTTTTTCAACCTAACCTATGCGCAGAATTTTGGCGCAGCATTTAGCTTCTTGGCGGATAAAAGTGGTTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATAGGCATCTCCGTCGTACTGATGGTGATGATGTATCGCTCAACAGCAAAGCAACGCCTGATAAATTGTGCTTATGCATTAATTATCGGTGGTGCACTCGGGAATTTATATGACCGTTTAGTGCATGGCGCAGTCAACGATTTTCTCGATTTTTACATCAATAACTGGCATTTCCCGACGTTCAATTTGGCCGATGTGGCGATATGCATTGGCGCTGCGTTGGTTATTTTTGAAGGCTTCTTAAGTCCGGTAGAAAAAAACGCGGTGAATAACGATGAGTGATATGTCCGAATTTGTGCAAGATACCGAATCGGTACAAAATACTGGAACGGTAAAAACGACTACAGCGGTGCAAAATAATGGCGCTGTTTTAGTGCATTTCACTCTGAAGCTTGAAGATGGTTCAACGGCCGAGTCAACACGCACTCACGGTAAACCGGCGCTCTTTCGTTTAGGTGATAACAGCCTTTCTGATGCACTGGAACAGCAATTGTTGGGGCTGACCGTGGGCGATAAGCACGCTTTTACGTTACGCCCTGAAGATGCTTTTGGTGTAGAAAATCCAGACCTTATTCAGTATTTCACTCCACGTGATTTTGCTGAGACTGGTGTGCCAGATGCCGGCACCATCATGTTATTCAGCTCTCGCGATGGCAGCGAAATGCCGGGTGTCGTACGGGAAGTCGCAGAAGAGTCTATTACTGTTGATTTTAATCACCCGTTGGCTGGGCACTCTGTCAGTTTTGAACTTGAAATACTGGAGATTGACCCCCAACAGGAGGTTGTCTATGCAGATATTGCTGGCTAATCCACGTGGCTTTTGTGCTGGCGTTGACCGGGCTATCAGTATTGTTGAACGTGCGATAGAAATGTATGGCGCGCCAATTTATGTACGCCATGAGGTGGTACATAACCGCTATGTGGTTGAGAGCCTGTGCGAGCGCGGTGCTATCTTCATCGAGGAAATTTCAGAGGTGCCAGATGGCTCCATTCTGATTTTCTCGGCCCATGGTGTGTCACAGGCCGTTCGGGCAGAGGCCCGTTCACGTAATTTGACGATGCTGTTTGATGCAACCTGTCCATTGGTTACCAAAGTCCATATGGAAGTCGCCCGTGCGAGCCGTAAGGGTAAAGAAGCTATTTTGATCGGCCATGCCGGTCATCCAGAAGTGGAAGGGACCATGGGGCAATACAGCAACCCTAACGGGGGGATGTATTTGGTTGAATCGCCTGATGACGTTTGGCAGTTGAATGTCAAAGATGAGAATAATCTATGTTTTATGACGCAGACCACCTTATCGGTTGATGATACCTCTGCTGTTATCGATGCGTTGAACACGCGCTTCCCAAAGATAGTCGGCCCACGCAAAGATGATATTTGCTATGCCACAACCAATCGGCAAGAGGCAGTACGTAATCTGGCAAATGATGCCGATATCGTATTGGTCGTGGGGTCGAAAAACTCCTCTAACTCTAACCGATTGGCCGAACTGGTACAGCGAATGGGTAAGCCCGCTTATCTGATTGACTCTGCGGCAGATATTCAGGAATTTTGGTTACAGGGCGCCAAGTGTATCGGTGTTACCGCTGGTGCATCTGCCCCTGATATTTTGGTGCAGCAAGTGATTGCACGCTTAAAAGATCTTGGTGCTGGTGAATCGATTGAACTCAGCGGTCGCGAAGAAAATATTGTTTTTGAAGTACCGAAAGAACTGCGTGTTGAGGTTAAACAGATCGACTGATTCAGGTGTTTCTTTGTCGATCAGATAGGTGTTTACTCAATATGTATTTACTGACGAAAGCAGCCCTTTGCGGCTGCTTGAGGTTATTGATAATGCTATTTTTAGCCTCGTGAATGAAGGGTTGACCGCACCTAGGGGCACTTCGGTGGCTTACGCCACTACGACCCCAACGGCACGTTTCCCCTTCAATTGACTTTGTCAGCAGTCTGAAGC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46 | Bodo_saltans_virus(16.67%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1222713 : 1267349
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP045154|1222713:1267349|DBSCAN-SWA 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38 | uncultured_Mediterranean_phage(23.08%) | tRNA,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1367590 : 1422345
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP045154|1367590:1422345|DBSCAN-SWA 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54 | uncultured_virus(20.0%) | integrase,tRNA,transposase,protease | attL 1362928:1362946|attR 1438956:1438974 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1704423 : 1749782
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP045154|1704423:1749782|DBSCAN-SWA 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39 | Pseudomonas_phage(25.0%) | transposase,coat,plate,tail,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1872642 : 2034842
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP045154|1872642:2034842|DBSCAN-SWA 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120 | Escherichia_phage(15.62%) | plate,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2521142 : 2621628
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP045154|2521142:2621628|DBSCAN-SWA 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104 | Escherichia_phage(14.81%) | transposase,lysis,integrase,tRNA,tail | attL 2531694:2531724|attR 2572708:2572738 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2885123 : 2943890
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP045154|2885123:2943890|DBSCAN-SWA 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52 | Tupanvirus(18.18%) | tRNA,transposase,protease,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3222365 : 3292391
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP045154|3222365:3292391|DBSCAN-SWA 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60 | uncultured_virus(22.22%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3427737 : 3504175
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP045154|3427737:3504175|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(18.75%) | tRNA,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3573889 : 3580061
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP045154|3573889:3580061|DBSCAN-SWA TATGTCTGATATTAATTTGATCCGCTTACCTGAAGTGATTGAGAAAATACGACTGAAAAAATCATCAATTTATCATTTGATTAGCCTCAATCAATTCCCTCGCCCAATAAAATTAGGGCCGCGTTCAGTGGCCTGGGTTGAAAGTGAAGTCGATGAATGGGTCATTATCAGAATCAATCAACGCGAGGAGGGTCGCAACTAATGATTTTTTATTTTTTTCTGGCGGGCGCTTTGCAGTATAATCCTTTCGCTGCGGCAAAATCCGTAGCCGGAATTAGCGTTCCGAAAATCTTCTTGATACCTAGCCTCGTCATTCAGACATGGTCTTTTATAGGTATGGCTTGCGCACACCCGTCAATGGTGGCCCAGGCGGGGGCTCCGAAAGGAGCGCCGGTTTCCAAGAAGTCCGGTAACGCTAACTCCGTCTGGGCTACCACCCAAGGGATTAGCGTCTCAGGTGGTAGTCATTACAACTACTTCTTGGAGGCGGCCCAATGGCTACTACCCTTCACTGTCTGTACCCGCAATACGTTCGTACCCATCCGGGGGTGTGCTATGCATAACTCTTCCCCGCTCACGATTGAAGAAATTGTTGATCACTGCCACGCACTGGTATTGGCAATGCTCGAAATTACCGATCCTACAGCGAAAGAACTGTTGCTATTTATTCTGGCTGAACGGCTGGATTTGCTGCAACTGATGCTGGATGAAGTGCCGGATGCAGAGGAGGCTAACCATGAGTAGGTTTGTTTCCGACATCATTCGCGCATCACAACACCACTGGAGCAATATCCTTTCCTCCTTAGCTATTCCTATTCCCCACCTTAACAAACATGGCCCCTGCCCCGTCTGCGGAGGTAAAGACCGTTTTCGTTTTGATGATAAAAAAGGGCGAGGAACGTGGTTCTGCAACTATTGCGGGCACGGCGATGGTCTGGATTTGGTCACTCTGGTGCGACAATGTGATGTGATTCAGGCCGCCAGAGAAATCTCCCGCTTAACAGACTTAGCCCCAACAGCGCCCGCCAAAGAAAGAACTGAACAGCCCCTTCACTCAGACATGACACAAAAAGTCACTGCCCTGCTGGCTGCCTGTTCGCAGGGAACCAGTGATTACCTGTTGCATAAGGGCTTAAATCATCCAGTCTTTCTCATGCCCGCCAACAGTGCTAAAAATATTGGCGGGGTGCATTTTAATGTGGGCAGCATGGTGCTGCCACTGGTGGATCTGAGTGGCAACACTACCGGTGCGCTGTTAATCAATCGCCGGGGAGAAAAGCGTTTACTGCCCGGCTCGCGGATTAAATCTTCATTTATCCCCATCACTCACCACACTCTGTCGCAGACAATAATCATTACTGAAGGCTTTGCCACCGGCCTCGTCATATCACGATTTGTCACCGCCACAGTTGTTGCCGCTATCTCAGCCACTAATCTGACCCAGGTTGCTGTGGCACTGCGTGAACGTTATCCCGACGCGCAGATTATTATCGCGGCGGATAACGACGTAACAAACTCTGACAACAATCCCGGCAAACAACAGGCGGAATACGCCGCTCTTGCAGTCAATGGCTTAGTGACCCTGCCACCCACCTGCGGCAAAGCTGACTGGGATGATTATCGCCAACAAGTCGGAACGGACGCCGCCCGTATCGAGTTTTTCCGCCAACTCTACAATCCCAGGGAATGGATATGAAAACACCACTCATTCTGCTCGAACGCGAACCTGTGTCATTGACTACAAACCTGCCGTTGCGCAAAGGCTCCGACGGCTATAACACCCCGCAGGATTACAATATTAAGGGCCACTTGCCAAGTAACACACTGGCCAGTATTTACGGGCCAAGCGGCTCGTATAAATCCTTTTTGGCCGTCTCATGGGCCTGTCATATTGCCACCGGCAAGCCGTGGGCCTCGCGGCGTGTGACCCAAGGTTCCGTCGTCTATATCGTCGGAGAAGGCGGTATCGGCGTGCCACGGCGTATCCGCGCGTGGGGAATGGAATTTAACGGCGGCACACCGATTGAATCGCTCTACCGCATCGACTGCCCGGTATTTCCCGCCAGCCCGGAGAGCGCCATTCAGGTGATTAAAGCGGCTCAGGATGTCACCGAGCAAACCGGCTCGCCGGTGCGCCTGATTGTACTGGATACGCTGGCACGCTGCTTTGGTGGCTCCGACGAGAACGCTGCCAAAGATATGGGCGCATTTATTCAGGGGTGTGATTATATCAAGGCAGAAACTGGCGCTACGGTGTTGGTTATCCATCATTCGGGCAAAGATCTGGATAAAGGCGCGCGCGGCTCCAGTGCCTTTCGCGCGGCGTTGGATGTCGAATTCAATGTTCGTCGTGAGGGCGACGGCGGCGCACTGGTGCTGAGTTGCACCAAAATGAAGGATTCAGAAGAACCCACCACGCGGGCCTACGACCTCTCGCCGCTCAATTTGTATATCGATAACGATGGCGAAGAAGTTAACTCATTGGTGCTATGTGATAAAGGCCGTGAAGTCAGCGATGAAGGCTCACCCTATGAGGCGGAACTGGCGAGTATTCAGCGCCTGACGGCTAATCATATCGCGCTGTGGCAATCTATCCGCTCCCGTACCGCCAGTGGTGAGGCCTGTACAAAATCGCTGGTGAGGGATGATATGCGCGGCATGGGTTTTGATGTTGCGAAGAAATTTACCCGCTGGCTCGACAAGCTGGAAACTGATGGGCTGATTCATATTGATGGGGAGAATATTTGCCCTAATTCATTAAGCAATACAGCAAGAAACTAACTGGGGGATAAAGTGGGAATTAAGTGGGGGAACATCGAATTTTTAACTAATTTAGCCTCAAATCCCCCACTTCCCACTTGCCTATACACACTAAATGGGGGAAAGAGAGCAAACCCGCGTCATGACTGGGTTGAGAGCACAGAGCCAAAATCCAGGTGGGGGAAGAAGTGGTACAGGCTAAATGGGGGATAAGATGGGGGAAGGATTTAGGCTTGGTACTGATTTTATCAAAACGGTACATAATTTCTTGTTAAATGGCCTTAGCACTAAATCCCACTAAGACCATACGATGAATGACTTCGAATACCGGACTGTTAAACTGATTTTTTACCTTTATTTCAGATTTAATCATGCGGTAATCGATGCAAGATGTGAAAACTGAAATCCCGTTGCAGATACCACACTAAGCAGTGTTTTTAGTGTTGGATTACCTGAAGGTGATAACGTCCGGTACAGTGTTTCTCTCGATACACCCGCTTTTTTAGCCACACTTGCCATCCCTCCTCGGGCCTCAACTACATGACGTAGGGCCATCAGAAAGGCTTCTTGCCCTCCTTCCTCATCAATATCTAGAAGAGCCTGATGCAGATATACTTGCGCAAATTCAGGGTCTTCCATAAGAAGCTGAACCATAGCGTCATCATGTAAACGGGCTTTGGCCATAATCATTACCTCGTTAAATAATCTTTAAGACACACAATAGCCTGATCGATGTCGGCATTCTGCGAGCGCTTATCACCGCCCAAAAGCAACAACACGACTTCACCGTCAACAAGGCTGTAATAAACCCTGTAACCTGGCCCCTGGTCTATACGAAGTTCCCAGACACCTTCACGGCAAGGCTTATGATCCCCAAAGTTCCCCGAAGCGATCCGGTTAACTCTTGATGATATTTTTGCCTTAGCGATCGAATCACGGAGACTCTTCAAATACTCCATGTATAAATCCCGTCCCTCGGGAGTCAGATAGTGTTTGATCGTTTTCATCAATATATTGTAGCCTTTAGGCTACATTTCGCAAGTTGATTTCACCATAAATCATGCCACTATTTGCGATACCTACTTGGTAGCCCAATATGCAAAGGCCACCCCAAAATATCCTTATTGGTGTGTCACTTTCCTGCATTGGTATACGTTTAGGTATACGAAACAAATTTGAATTAGTTTTTTATCAATAGAAACAATGCATTGATTAATCTATTCAGCGTCCCCCAGCCCAAATGTTAAACCGGTTATTACCAGATAAGTCCGGTGAAGTACGGAAAGCCCGCATCCCTTCTAGGTTTGCGGGCTTTTTTGTGTCTGTAGTAGTCCAAGGATATCCGCCTGAAGCCAGAGACAATTGGTATACGCTAAGATAGGTACCAATGGACGTATACCAATTACAGGGAAGAACCTTGCATGGCGCGGACTACACGCCCCCTCACCCACACCGAAGTACAAAAAGCAAAAACCACCGACAAAGACCTAACCCTCCATGATGGTGATGGTTTATTTCTGTTAGTTGTAACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAGGAGAGTTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACCGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATACGCCGCGACCTGCTGTTGCTTCACTCCTGGATGAATACCGGGATTATATTCGTCAACGCATCGCCGATGCTCATCCTTACAAAATCCCGGCAACGGTAATCGCTCGCGAGATCAGAGACCAGGGATATCGTGGCGGAATGACCATTCTCAGGGCATTCATTCGTTCTCTCTCGGTTCCTCAGGAGCAGGAGCCTGCCGTTCGGTTCGAAACTGAACCCGGACGACAGATGCAGGTTGACTGGGGCACTATGCGTAATGGTCGCTCACCGCTTCACGTGTTCGTTGCTGTTCTCGGATACAGCCGAATGCTGTACATCGAATTCACTGACAATATGCGTTATGACACGCTGGAGACCTGCCATCGTAATGCGTTCCGCTTCTTTGGTGGTGTGCCGCGCGAAGTGTTGTATGACAATATGAAAACTGTGGTTCTGCAACGTGACGCATATCAGACCGGTCAGCACCGGTTCCATCCTTCGCTGTGGCAGTTCGGCAAGGAGATGGGCTTCTCTCCCCGACTGTGTCGCCCCTTCAGGGCACAGACTAAAGGTAAGGTGGAACGGATGGTGCAGTACACCCGTAACAGTTTTTACATCCCACTAATGACTCGCCTGCGCCCGATGGGGATCACTGTCGATGTTGAAACAGCCAACCGCCACGGTCTGCGCTGGCTGCACGATGTCGCTAACCAACGAAAGCATGAAACAATCCAGGCCCGTCCCTGCGATCGCTGGCTCGAAGAGCAGCAGTCCATGCTGGCACTGCCTCCGGAGAAAAAAGAGTATGACGTGCATCTTGATGAAAATCTGGTGAACTTCGACAAACACCCCCTGCATCATCCACTCTCCATCTACGACTCATTCTGCAGAGGAGTGGCGTGATGATGGAACTGCAACATCAACGACTGATGGCGCTCGCCGGGCAGTTGCAACTGGAAAGCCTTATAAGCGCAGCGCCTGCGCTGTCACAACAGGCAGTAGACCAGGAATGGAGTTATATGGACTTCCTGGAGCATCTGCTTCATGAAGAAAAACTGGCACGTCATCAACGTAAACAGGCGATGTATACCCGAATGGCAGCCTTCCCGGCGGTGAAAACGTTCGAAGAGTATGACTTCACATTCGCCACCGGAGCACCGCAGAAGCAACTCCAGTCGTTACGCTCACTCAGCTTCATAGAACGTAATGAAAATATCGTATTACTGGGGCCATCAGGTGTGGGGAAAACCCATCTGGCAATAGCGATGGGCTATGAAGCAGTCCGTGCAGGTATCAAAGTTCGCTTCACAACAGCAGCAGATCTGTTACTTCAGTTATCTACGGCACAACGTCAGGGCCGTTATAAAACGACGCTTCAGCGTGGAGTAATGGCCCCCCGCCTGCTCATCATTGATGAAATAGGCTATCTGCCGTTCAGTCAGGAAGAAGCAAAGCTGTTCTTCCAGGTCATCGCTAAACGTTACGAAAAGAGCGCAATGATCCTGACATCCAATCTGCCGTTCGGGCAGTGGGATCAAACGTTCGCCGGTGATGCAGCACTGACCTCAGCGATGCTGGACCGTATCTTACACCACTCACATGTCGTTCAAATCAAAGGAGAAAGCTATCGACTCAGACAGAAACGAAAGGCCGGGGTTATAGCAGAAGCTAATCCTGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP045154|3573889:3580061|3574089_3574632_+|WP_002215949.1|DBSCAN-SWA MIFYFFLAGALQYNPFAAAKSVAGISVPKIFLIPSLVIQTWSFIGMACAHPSMVAQAGAPKGAPVSKKSGNANSVWATTQGISVSGGSHYNYFLEAAQWLLPFTVCTRNTFVPIRGCAMHNSSPLTIEEIVDHCHALVLAMLEITDPTAKELLLFILAERLDLLQLMLDEVPDAEEANHE >NZ_CP045154|3573889:3580061|3579281_3580061_+|WP_001297096.1|DBSCAN-SWA MMELQHQRLMALAGQLQLESLISAAPALSQQAVDQEWSYMDFLEHLLHEEKLARHQRKQAMYTRMAAFPAVKTFEEYDFTFATGAPQKQLQSLRSLSFIERNENIVLLGPSGVGKTHLAIAMGYEAVRAGIKVRFTTAADLLLQLSTAQRQGRYKTTLQRGVMAPRLLIIDEIGYLPFSQEEAKLFFQVIAKRYEKSAMILTSNLPFGQWDQTFAGDAALTSAMLDRILHHSHVVQIKGESYRLRQKRKAGVIAEANPE >NZ_CP045154|3573889:3580061|3574624_3575584_+|WP_002215950.1|DBSCAN-SWA MSRFVSDIIRASQHHWSNILSSLAIPIPHLNKHGPCPVCGGKDRFRFDDKKGRGTWFCNYCGHGDGLDLVTLVRQCDVIQAAREISRLTDLAPTAPAKERTEQPLHSDMTQKVTALLAACSQGTSDYLLHKGLNHPVFLMPANSAKNIGGVHFNVGSMVLPLVDLSGNTTGALLINRRGEKRLLPGSRIKSSFIPITHHTLSQTIIITEGFATGLVISRFVTATVVAAISATNLTQVAVALRERYPDAQIIIAADNDVTNSDNNPGKQQAEYAALAVNGLVTLPPTCGKADWDDYRQQVGTDAARIEFFRQLYNPREWI >NZ_CP045154|3573889:3580061|3575580_3576669_+|WP_002210707.1|DBSCAN-SWA MKTPLILLEREPVSLTTNLPLRKGSDGYNTPQDYNIKGHLPSNTLASIYGPSGSYKSFLAVSWACHIATGKPWASRRVTQGSVVYIVGEGGIGVPRRIRAWGMEFNGGTPIESLYRIDCPVFPASPESAIQVIKAAQDVTEQTGSPVRLIVLDTLARCFGGSDENAAKDMGAFIQGCDYIKAETGATVLVIHHSGKDLDKGARGSSAFRAALDVEFNVRREGDGGALVLSCTKMKDSEEPTTRAYDLSPLNLYIDNDGEEVNSLVLCDKGREVSDEGSPYEAELASIQRLTANHIALWQSIRSRTASGEACTKSLVRDDMRGMGFDVAKKFTRWLDKLETDGLIHIDGENICPNSLSNTARN >NZ_CP045154|3573889:3580061|3577337_3577655_-|WP_002215951.1|DBSCAN-SWA MKTIKHYLTPEGRDLYMEYLKSLRDSIAKAKISSRVNRIASGNFGDHKPCREGVWELRIDQGPGYRVYYSLVDGEVVLLLLGGDKRSQNADIDQAIVCLKDYLTR >NZ_CP045154|3573889:3580061|3578259_3579282_+|WP_000255944.1|transposase|DBSCAN-SWA MVTFETVMEIKILHKQGMSSRAIARELGISRNTVKRYLQAKSEPPKYTPRPAVASLLDEYRDYIRQRIADAHPYKIPATVIAREIRDQGYRGGMTILRAFIRSLSVPQEQEPAVRFETEPGRQMQVDWGTMRNGRSPLHVFVAVLGYSRMLYIEFTDNMRYDTLETCHRNAFRFFGGVPREVLYDNMKTVVLQRDAYQTGQHRFHPSLWQFGKEMGFSPRLCRPFRAQTKGKVERMVQYTRNSFYIPLMTRLRPMGITVDVETANRHGLRWLHDVANQRKHETIQARPCDRWLEEQQSMLALPPEKKEYDVHLDENLVNFDKHPLHHPLSIYDSFCRGVA >NZ_CP045154|3573889:3580061|3577017_3577332_-|WP_002210705.1|DBSCAN-SWA MAKARLHDDAMVQLLMEDPEFAQVYLHQALLDIDEEGGQEAFLMALRHVVEARGGMASVAKKAGVSRETLYRTLSPSGNPTLKTLLSVVSATGFQFSHLASITA >NZ_CP045154|3573889:3580061|3573889_3574090_+|WP_002210709.1|DBSCAN-SWA MSDINLIRLPEVIEKIRLKKSSIYHLISLNQFPRPIKLGPRSVAWVESEVDEWVIIRINQREEGRN |
8 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3820059 : 3895410
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP045154|3820059:3895410|DBSCAN-SWA ATTACTTACGGCCCGTAAACGGGCTACCGGGATACGGGATCGAGAGTTGCTCACCCATTTTATCCTCTTCCAATTGGTGCTTTATGTATTCTTGTATCCTGGCCGTGTTTTTCCCTACCGTATCAACGTAATACCCTCGACACCAAAACTCCCTGTTACGGTATTTGAACTTCAAATCGCCAAACTGCTCATAAAGCATCAGACTGCTCTTTCCCTTCAGGTACCCCATAAATCCCGAGACACTCATCTTGGGCGGGATCTCCAGAAGCATATGGATGTGATCCACACAGTATTCTGCTTCCAGGATATTCACGTTTTTCCATTCGCACAGTTTTCTTAAAATACTGCCAATCGCTCTGCGTTTTTCCCTGTAGAACACCTGCCTTCGGTACTTCGGCGCAAAAACTATATGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCATCCCTCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTGAACATTTGCAGTTGCCAGACCGCAAACTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTTATAACTGACCCAAAGCTGAAAGCTTTACTGAACCCCCAGCCTAGCTGGGGGTTTTCTGGGCACAAAAAAAAGACCGCAAAAGCGGTCTTTTAACAGGTGCATTACCGAGATTCTCATCACTGTTCACACCCATTTGCAGTATTGATAACGTCGTTGCCTGTTTTAACAGTTAATGACTTTTTAACGGCTAATCGCTCTTTAGGGACTAATCGCTTCTTAACCGTTAATTACTTCAGCAGCGCCTGAGCTTTCGCCACCACGTTTTCCACGGTGAAACCAAACTCTTTGAACAGCAATTCAGCTGGCGCTGATTCACCAAACGTGGTCATACCGACAACCGCGCCATTCAGGCCAACGTATTTGTACCAATAATCCGCAATACCCGCTTCTACGGCAACACGTGCGCTAACCGCAGATGGCAATACTGACTCACGGTAAGCCGCATCTTGTTTATCGAATGCATCAGTTGATGGCATAGAGACAACGCGGACTTTACGGCCAGTGGCCGTCAGTTGATCAGCCGCAGCAACTGCTAACTCCACTTCAGAGCCGGTAGCAATCAGGATCAGTTCAGGCTGGCCTGCACAATCCTTCAGCACATACCCGCCTTTGGCGATATTGGCTAGCTGCTCCGCAGTACGTGGCTGCTGTGCCAGATTCTGTCGGGAGAAGATCAGTGCGCTTGGGCCATCTTTACGTTCCAGCGCATACTGCCATGCCACTGCAGATTCGACCTGATCACAAGGACGCCAGGTACTCATATTCGGGGTAACACGCAGGCTGGCCATCTGTTCAACAGGCTGATGGGTTGGGCCATCTTCGCCCAGACCAATAGAGTCATGGGTATAAACGAACACGCTACGGATTTTCATCAGTGCCGCCATGCGCACTGCGTTACGGGCATATTCCACAAACATCAGGAAGGTTGCGCCGTAAGGGATGAAACCGCCGTGCAGGGCAATACCGTTCATGATGGCAGACATACCAAATTCACGGACACCGTAGTGAATGTAGTTACCAGCCAGATCGTCGCTCAAGGATTTAGAGCCAGACCAGATAGTCAGGTTACTCGGTGCCAGGTCAGCAGAACCGCCCAGGAACTCAGGTAACACTTTACCGAAGGCTTCCAGCGCATTTTGTGAGGCTTTGCGGCTGGCAATATTTGCTGGATTGGCTTGCAATTGTTCGATGAATTTCTTGGATTCAACGGCCCAGTTAGCCGGTAATTCACCGCTGACACGACGTTTGAATTCAGCCGCCAGTTCTGGATAAGCCTTGGCATACGCAGCGAACTTCTCGTTCCAGGCCGCTTCTTTGGCTTTGCCCGCTTCTTTGGCATCCCATGCCGCATAGATATCTTGTGGGATTTCAAATGCCGGGTATTTCCAACCTAATGCTTCACGGGTTGCTGCCACTTCCGCTTCACCTAATGGCGCACCATGGGAATCATGGGTTCCAGCTTTGTTTGGTGAGCCAAAACCAATAATCGTTTTGCACATCAACAATGAAGGCTTGTCGGTAACCTTATGTGCTTCTTCGATAGCCGCTTTAATAGAGTCCGCGTTATGGCCATCAACACCCCGTACCACATGCCAGCCGTAGGCTTCGAAACGGGCCGCCGTGTCATCAGTGAACCAGCCTTCAACATGACCATCGATAGAAATACCGTTGTCATCATAGAAAGCCGTCAGTTTGCCCAGCTTCATCGTACCGGCCAGAGAGCAAACCTCGTGAGAGATCCCTTCCATCATGCAACCATCGCCCATAAAGGCGTAGGTATGGTGATCGACAATGTCGTGACCTGGGCGGTTAAACTGCGCCCCCAGCGTGCGTTCTGCGATAGCAAAACCAACAGCATTGGCAATGCCTTGCCCCAATGGCCCAGTGGTGGTTTCTACACCAGCGGTATAACCATATTCAGGGTGGCCAGGCGTTTTAGAGTGCAGTTGGCGGAAATTTTTTAGCTCTTCCATCGGCAGGTCATAACCTGTGAGATGCAACAGGCTATAAATCAACATGGAGCCGTGACCATTTGACAGGACGAAACGGTCACGATCAGCCCAGTGTGGGTTAGTTGGATTATGGTTCAGATAATCACGCCACAGGACTTCGGCAATATCTGCCATACCCATCGGGGCTCCGGGATGGCCGGACTTCGCTTTTTGCACGGCATCCATGCTTAGTGCGCGGATAGCGTTGGCAAGCTCTTTACGAGAGGACATGTTTTACTCCAGGTCGGATTAACAAAGCGTTCAAGATTACCATTTTCTCAGACTCAGCATTGAAACGGCAATCACTATACTCTAAATAATTCGAGTTGCAGGAAGGCGGCAACTGAGTGCATCCCCAAGAGCTTACACAAGTAAGAGATTGGGGTGAACAAAAGCAGCCACCGCACAACGACAAACCATAGGCTACAACAATAATTTCGGGCAAGACCTATTGCCAACAGAGTAGAACAAGCGTGAGCGATCCAACAACTATTAATGCAATTCCAACAGCTATTAATGCAATAGATAGTAATGATGTGATTATGATGAGCGGATAGCGGTGGTAAATAGATTGCAGTGATAAGGAGATGACTGTGATGAGTAGATTACTGTGATGAGGAGATTGCAGTAATAAATAGGTGACTGCTGCTAATTCGGGCCATCACCGATAGAATAGCCTGCTTCAAACGAAAAAATGGCCAACCCACAGGAAGAACGTGTTATGAAAATTCGTACCTCAATGATTGCACTGAGCCTGGCTGCACTATTAAGTGGCTGTCAAAGCCTCAATACTGAAGGCTTAATGCAGTCAGGTGCGCAAGCATTTCAGGCCGCAACCTTGAATGATGCTGACGTGAAAGCCCTTAGTGAAAAATCTTGCGTTGAAATGGATCAAAAAGCCCAGATCGCTTCAGCGGATAGTCAATATGGTAAACGTATGGCAAAAATTGCTGCCGCCTTGGGCGATAACATTAATGGCACCCCAGCTAACTATAAGGTCTATGTGACCAAGGACGTTAATGCTTGGGCAATGGCTAATGGCTGCATTCGTGTCTACAGCGGTTTGATGGATATGATGACCGACAATGAAGTAGAAGGTGTCGTGGGCCATGAAATGGGCCATGTGGCATTGGGGCACACCCGTAAAGCCATGCAGGTGGCCTACGGAACAACCGCGCTACGGACGGCTATCGCCTCTGCAGGCGGTGTCGTGGGTACCTTGTCGCAATCTCAGCTAGCAGATCTCGGTGAGAAACTGGTTAATGCCCAATTCTCGCAAAAACAAGAAAGCGAAGCCGATGATTACTCATTCGATTTGCTGAAAAAACGGGGCATTGACCCGAACGGTCTGGTAACCAGTTTTGAAAAATTGGCCTCAATGGAAGCGGGCCGTAACAGCAGTATGTTCGATGATCATCCATCGTCACAAGCCAGAGCAGAGCATATTCGCCAACGTATTGCGGCGGAGAAGTAACACTTAACGCCAGTCTCTTATCAATGCAGACGCCCCACTGTTGGGGCGTCAGACTGCTGACAAACCCCGATGACGCGATCTTGAACGGTGAGGATAGGCAGAGGAGTAAAGCGTCCGCGCCAAGGATGGCGCGGCTCGAGCCTACATGGATGTATTTACGGCGTCTTTACGATCTGCCTGTTCTCTCCGTCGCGGGCACTTTGTCAATAACCTCACTCCCCACTGTTGGGGCGTGAGTTCTGTAGCTGACGTTTGATATTTGATAGCTAATAGCTATTAGCCATGCCTGCTACTCGCCATCGCCATCCAAATTAACGTCGATCTGATCGCCATTGATCCGCACAGCATAGGTGTTTAAATCGCGATCGCCCGGCTCACGCAAACACTGCCCTGTCCGCACATTAAACAGAGCACCATGTAGCGGGCATTCAATGATTTCACCATCATTAATTCCTTGGCTTAGTAATGCATAGGCATGAGGACAAATATCTTCCATCGCAAAATACTCGCCCTCCACCAGATAAATACCCACTCTGTTATTACCCGCTTGAGCCGAAAACGGGAAATCTGGTTTGATATCATTCACCTTACAGACGCTGAACCAGCCCATTGAGATGTCTCCAGATTATTATTACGACGAAAGTCTAAACCGCTAACATAAGTGTGGTCGATATTCGGGCAATCACCACCGCCTTAGGAGAGGGTCGCGCCGAAAAAAAGGACAAACCTGAGTTTGCCCTTTAATCGATACTGAATAAATCGTTAGTGATTATTCGTCTTCAAGATATGTGTAGCCGTACAAGCCAGCCTCAAACTCTTCCAGGAACTGCGCCTGCAATTCGGTATCCAGATCGGTTTCTTTTACCTGACCGCGGAAATGTTCCAGCAATTTTTCAGGGTTCAATTGGACGTATTCCAACATATCCGCCACTGTATCGCCTTCATCGGTCTGCTCAACCTCTACCGTGCCATCAGGGAAGACATAAACATCTACC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54 | Staphylococcus_phage(25.0%) | plate,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
4230023 : 4292459
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP045154|4230023:4292459|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP045154|4230023:4292459|4284536_4284896_+|WP_002210086.1|DBSCAN-SWA MISLSTLFGLGKSMMLLAGVVAIVWGVQASRTLDRLNQENVQLTTQLARIGQINQQLTQHIQATTVQLKQAQEQERLEGEKSSELQKRLRLAQKGNRCAEEPVPAAVIRMQQQSFSDGK >NZ_CP045154|4230023:4292459|4264638_4264920_-|WP_002210098.1|DBSCAN-SWA MVKVVFDFNHIPDLPAFYRAFSQNFALSEDFGANLDALWDVVTGEIALPVEIEFVHFSRRHQRRFAAIVLLLEEAEEELAGRLHFNVVDEHIV >NZ_CP045154|4230023:4292459|4241530_4242313_-|WP_002210122.1|DBSCAN-SWA MLVKSLASLGRRGINVCASFGRAGLMLFNALVGRPEPRKQWPLLIKQLYSVGVQSLLIIVVSGLFIGMVLGLQGFLILTTYSAEASLGMMVSLSLLRELGPVVTALLFAGRAGSALTAEIGLMKATEQISSLEMMAIDPLRRVVAPRFWAGLISMPLLTAIFVAVGIWGGSVVGVDWKGIDSGFFWSAMQNAVEWRTDLLNCLIKSLVFALTVTWIALFNGYDAVPTSEGISRATTRTVVHSSLAVLGLDFVLTALMFGN >NZ_CP045154|4230023:4292459|4236224_4236683_-|WP_002213775.1|transposase|DBSCAN-SWA MRDEKSLAHTRWNCKYHIVFAPKYRRQVFYREKRRAIGSILRKLCEWKNVNILEAECCVDHIHMLLEIPPKMSVSGFMGYLKGKSSLMLYEQFGDLKFKYRNREFWCRGYYVDTVGKNTARIQEYIKHQLEEDKMGEQLSIPYPGSPFTGRK 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55 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | tail,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP045154.1|WP_002214494.1|2577045_2577402_+|hypothetical-protein |
2577045_2577402_+
Protein sequences of NZ_CP045154.1|WP_002214494.1|2577045_2577402_+|hypothetical-protein>NZ_CP045154.1|WP_002214494.1|2577045_2577402_+|hypothetical-protein MKYSTLAAVIFGISATLSSATNPVQAAEASLINLVCQLKDGNDLLAILDGPNQQLIIDKSVFQFIKVNPEGQGEALIFQKANSEEQVIASLNISALPIRLAVVDEVQASQYTCTHTQA |
118 aa aa | NA |
HTH_GNTR
HTH_GNTR HTH domain information
|
NA | 2521142-2621628 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.8|1429964|32|NZ_CP045154|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045154 position: 2549031-2549062, mismatch: 0 agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer ******************************** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
43798 : 66770
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045156|43798:66770|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045156|43798:66770|60557_62873_+|WP_002213256.1|transposase|DBSCAN-SWA MPVDFLTTEQEQNYGCYVAEPNDVQLVRYFHLDERDLAFIYQRRGKHNRLGIALQLTTARFLGTFITDLTQVLPGVQHFVAVQLNIRRPEVLSRYAERDTTRREHTAQIKEYYGYHEFGDFPWSFRLKRLLYTRAWLSNERPGLMFDFATAWLLQNKILLPGATTLVRLVSEIRERANQRLWKKLAAIHYLTELNGTKKRLLDDAPEHIITGPWKRLVYDAEGRIQRAGYSLCLLERLQDALRRRDIWLKNSDRWGDLREKLLQGEEWQAQRVLVCRALGHPTDGHKGVQQLAVQLDETWRAVASRFEGNTEVHICNDGKYPSLTISSLEKLEEPLSLLRLNNRVRQLLPPVDLTELLLEIDARTGFTREFTHVSESGARAQDLHISLCAVLMAEACNIGLEPLIKHNIPALTRHRLSWMKQNYLQAETLVSANARLVDFQSTLELARRWGGGEVASVDGMRFVTPVKTVNSGPNRKYFGSGRGITWYNFVSDQYSGFHGIVVPGTLRDSIFVLEGLLEQQTGLNPVEIMTDTAGTSDIIFGLFWLLGYQFSPRLADAGEAVFWRVDKSANYGALDELARGCADLSKAENQWDEMMRTAGSLKLGTIHASELIRSLLKSSRPSGLAQAIMAVGRVNKTLYLLNYIDDEDYRRRILTQLNRGESRHAVARAICYGQRGEIRKRYREGQEDQLGALGLVTNAVVLWNTLYMQEALSWMRSNGEETRDEDIARLSPLMHGHINMLGHYTFTLSDDILNGELRALNFNLNNELSP >NZ_CP045156|43798:66770|50216_51182_+|WP_002213354.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP045156|43798:66770|65822_66281_+|WP_002213246.1|DBSCAN-SWA MGGMAAHWFTYQYAVPFCGRAKTLVTLSNAEGESVLISPQQNTAQDISLFMPRELTVSQGDRVRFTRSDTDRGYVANSLWEVAGFTEDGAVRFRQGDQEKIVDPQKATEDRHIDLAYTLTAYGVQGASERFVIALFGAEGGRKRMATLHLFT >NZ_CP045156|43798:66770|45266_45815_+|WP_002213007.1|DBSCAN-SWA MFIKDTYNMRALCTALEQSAPDTIINTSKEENNSYYCATAHLLRTDVCSLVNRVGIEPLKSGSILSTLEELWQAVGIVYRLYEWQHVSDIDTNFKKLPNNSDFGLVFSVLDCDIEYVFIGKKDSEGNIEFYDPKNSLLIENDDIKKYLYDEDFHRFCIMLIISKSELEELSRESCDQECIMG >NZ_CP045156|43798:66770|49053_50220_+|WP_002220902.1|DBSCAN-SWA MDLKSTLDRCIERGQFMTQEIAKSQFGNDSPAARTITRRWRITEAAELVGVTPQTIRNYEDSGKLPPPDTAMIGRVEQRTGYSIQQINDMRDVFKTRLSKPKGENPVVLAIAAHKGGAYKTSTSVHIAQWMALQGLRVLLIDATDPQATASLYHGYVPDLHIHEEDTLLPYYLGQRDDAAYAIKPTCWPNLEVIPSCLAVHRIESEIYGLHDQGKLPVAPHLLLRAAIESVWDSYDVVVLDSAPNLGIGTINVVCAADVIVVPTPAELYDYVSTLQFFTMLRDLMSNIDLNGFEPDVRVLITKFSNAIGSQSQWMDDQIRNAWGGMVLKEVVRVTDEVGKGQVRMRTVFEQAANQRSTPAAWRNAVSIWEPVCAEIFNRLVKPRWENA >NZ_CP045156|43798:66770|46412_47042_+|WP_002229770.1|DBSCAN-SWA 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20 | Enterobacteria_phage(50.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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