Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642 | Lactobacillus helveticus strain LZ-R-5 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas14j,cas3,csa3,cas2,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas4,cas1,DEDDh,DinG,cas14k,Cas14u_CAS-V | 3 | 6 | 12 | 2 |
1. NZ_CP045642
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642_1 | 372620-372755 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045642_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP045642_1
>1.1|372644|27|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder TGAAGCGTCTAAAACCATTAGAAAACC >1.2|372695|37|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGCGCAAAATTACGCTCAGTACAAAAGTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045642_1
The CRISPR arrays of NZ_CP045642_1 >merge|NZ_CP045642|1|372620-372755|CRISPRCasFinder TATCCCGTCTAGCTAGGGATGAAATGAAGCGTCTAAAACCATTAGAAAACCTATCCCGTCTCATTAGGAATGAAATTAGCTCAGCGCAAAATTACGCTCAGTACAAAAGTATTATCCCGTCTCATTAGGGATGAAA >NZ_CP045642|1|1|372620-372755|CRISPRCasFinder TATCCCGTCTAGCTAGGGATGAAA TGAAGCGTCTAAAACCATTAGAAAACC TATCCCGTCTCATTAGGAATGAAA TTAGCTCAGCGCAAAATTACGCTCAGTACAAAAGTAT TATCCCGTCTCATTAGGGATGAAA
>NZ_CP045642.1|WP_146042801.1|372498_372600_-|hypothetical-protein MSRCYKPPVRGMHPHCRKFGSDSAVKNMYKPPV >NZ_CP045642.1|WP_046813869.1|371358_371577_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKLTDQQVTAIKRKRGELDLSITSLANATGVSKWTLIYIFKHDHRNVNSATFKKLNDWLVNQYNHDLVKEVN >NZ_CP045642.1|WP_046813868.1|370935_371358_-|hypothetical-protein MSETMQSNKSKVSAQMTLNLDGLTFPSRDAKLTSIEKRVYNLLSTGKENARPSSYFTEILGISRRNLSDVVKRLKLKSLDVGSTRDDGYYKFKDVQEYLDFMSRDAHELAERNKVHDAMRSTPLGRKLFADMNQESKEEN >NZ_CP045642.1|WP_046813867.1|370630_370933_-|hypothetical-protein MKQSKDKEITINDAIIGLKQLDDPVFGSISYRNPCTTVTIRTHDRVIKTTLEQIRIAVFKFNAETFGFIFKNQWFCNQKEFDKWNAKTKRLASHELKANF >NZ_CP045642.1|WP_080948189.1|370035_370611_-|hypothetical-protein MTKYLINNDDVIRIGQKLYQLSSNSPETDFLKCKDASKDYEERLIENDINAEIFHDGNDQNTTALMQGDLVQSKQESDLKFILISTRLMPLQEAKYALDAYSKNQRPNVVKIPNPKPTLKASKQYDKRDHRMTKDIDTLKALVDNAENQGWETIDGVNYGASHTWREVAQLALDLADQQEWFDRYDNKYFN >NZ_CP045642.1|WP_118953649.1|369699_369960_-|DNA-binding-protein MKDGLKQATNTRPYLNRKEIAKYFGVAESTITFWASLGMPVAVIDGRKLYGKQSITAWLKAHEMPSQKAMEQTKKPLTIGVVKDVQ >NZ_CP045642.1|WP_046813865.1|368121_369615_-|HTH-domain-containing-protein MFLFRKAVKHEMNNVKSEKTNINPNLHIPTALIKNYSLSGLALLVYGELNGLYSKHKQCFITDKALSERLNRSIASIQRAIRDLKNLGLITSKQKPHFKGRLVTVPPLNAKKFLLIPVAIVRNHDLSIGAMLLYGSLYSRQKKLIKINTDKYQEDAPLIICVTKSELADEFRKTSRAIGYQLKELEKNKYINLISNKGINVEITLVPLKMTSILSGSDKKGENDIYTAIKFGQKVRSSTGTTDDYSPNNLGKKRASTYEKYVVPPRKKMSIDLGKKRETNRTLIKINKGENYSFSSSNKDQRGAVDPFDPFEVGEPLKEPVYYDSIPNANDAPPIQQENESLEDIAKLEADLNELDQRSAQRVKATKTGKGGSEVGTKDKQQDQPSTQQAKATGTGNTTSSNNASKPKQQKSQYEPYDGINLEYQVKELQEMLRCKTNRRYIITSQQKPLIQQRLKEGFTLYDFEKAIDYLIQQKQSISAKELVINISNYLNKINSN >NZ_CP045642.1|WP_046814581.1|367874_368069_+|hypothetical-protein MDNLASFLSSLTYWQTINLYITLLQARSNISFNDAKKQAIVNYSNASNLKKMLNESLNSPSPKE >NZ_CP045642.1|WP_046813864.1|366019_366553_+|hypothetical-protein MIRMKKKKNETLKITWIMTAVYWVVGLLCMFWGKLDHVFSGQLKDINNVYALTLLIVLILPLLFSILLSMKVKPPRLICNPLVTVIYLLVVIAAGMAYYFQNIIGYFFPIILFVLMAFLAIFYALFKTFRNKKKGKYYFIDGKDREECRNFWDAYKQYYAMGLTSGIIEGLLSAVFK >NZ_CP045642.1|WP_080948188.1|365630_365723_-|putative-holin-like-toxin MSVYDCISLILLFGMFVLALLTYIDHHDKK >NZ_CP045642.1|WP_046813870.1|372870_374022_+|site-specific-integrase MNNDIKEYTTPSGKKRYKFAIYVGKSEVTGKSIQARKRGFKSYEDALKCYALISSKIADNTYTGLEIKNHKVSDVYRVWLESYKDTVKTSTLVNVKQFFKNHILKDLGSYYIERLTPFKCQRVAQKWALELPKTFNALIIYSNKLLDYAVRFDYIRKNPMRMIIKPKKQAEHKEFTDFYTKQELNAFLKASKNENIKIYTFFRLLAYSGMRKGEALALKWSDIDFTSNTISINKTVSIGNKHRVVVNNTTKTKRNRAISMDARTMQLLKEWRFQQRQDLLRLGFNPFDKEQVVFQNFDNEVVRPNLVAVWNKRICDKNGLRRIKIHGFRHTHASLLFDAGVPMEDVKQRLGHASIQTTMDIYTHVTKDKQDKTALSFAQYMEN >NZ_CP045642.1|WP_153245665.1|374271_374544_+|co-chaperone-GroES MGDRVIVKVKDEEEKTVGGIVLASNAKKKPTEGEVVAVGEGAYASNGEKIPMSVKKGDVVLYDRYSGTNVEYEGEKYLVLHEKDILAIAK >NZ_CP045642.1|WP_003627769.1|374598_376221_+|chaperonin-GroEL MAKDIKFSENARRSLLKGVDKLADTVKTTIGPKGRNVVLEQSYGNPDITNDGVTIAKSIELKDRYENMGAKLVAEAAQKTNDIAGDGTTTATVLTQAIAREGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATKAAVDELHKISHKVESKDQIANVAAVSSASKEIGALIADAMEKVGHDGVITIEDSRGINTELSVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILITDKKISNIQDILPLLQEIVQQGKSLLIIADDITGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAQLQDIAALTGGTVITEDLGLELKDTKIDQLGQARRITVTKDSTTIVGGAGSKEAIDERVDTIRKQIEDSTSDFDKKKLQERLAKLTGGVAVIHVGAATETELKERRYRIEDALNSTRAAVDEGYVAGGGTALVNVEKAVREVKGETTDEQTGINIVLRALSAPVRQIAENAGKDGSVILDKLEHQENEIGYNAATDKWENMVDAGIIDPTKVTRTALQNAASIAALLLTTEAVVAEIPEPKQAAPQGGAGAPMGM >NZ_CP045642.1|WP_153245832.1|376403_378980_+|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MMEQYYEIKKQYPDAFLFYRVGDFYELFEDDAVKGAQILELTLTHRSNKTKNPIPMAGVPHMAVDTYVNTLVEKGYKVALCEQLEDPKKAKGMVKRGIIQLVTPGTMMNEGPNDAKDSNYLTSVVTTKSGFGLAYSDLSTGEIYSTHLKSFAAVSNELLSLRTREVVYSGPLTEQNKDFLHKANITVSAPTPIEGEHAEISYVEQNLTNGAEKSATRQLVGYLLSTQKRSLAHLQIAKSYEVNQYLQMSHTVQNNLELVASAKTGKKMGSLFWVLDKTHTAMGGRLLKQWLARPLLNVDIINHREKMVQALLDGYFTRENIIDALKGVYDLERLTGRIAFGNVNARELLQLSRSLQAVPVILDALNQSDSDVLIDFAKKIDPLKGVAELISTTLVKDPPLLTTEGGLIRDGVDKQLDRYRDAMNNGKKWLVQMETDERQKTGIENLKVGFNKVFGYYIQVSNGNKSKVPLDRYTRKQTLTNAERYITPELKEHENLILEAQTRSTDLEYDLFVQLRDEVKKYIPALQKLGNQLAALDVYCSFATVAEQNNYCRPSFHTDSQDIDVVNGRHPVVEKVMTAGSYIPNDVKMDSATNIFLITGPNMSGKSTYMRQMALIAIMAQVGSFVPADSAALPIFDQIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMSEANDALQYATKRSLVLFDEIGRGTATYDGMALAGAIVKYLHDKVGAKALFATHYHELTSLDETLDYLKNIHVGATEENGKLIFLHKILPGPADQSYGIHVAQLAGLPRTVLREATKLLKRLEAQGSELAPVSQQLDLFAQPEAASDEVDDNDSENSPMTDAEQEVLDDISNLYLADKTPLQIMQMVANWQKDLKDDK >NZ_CP045642.1|WP_046813872.1|378979_380890_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MAKIHELSENLTNQIAAGEVIERPASVVKELVENSLDAGATRIRVDFIDAGLKQIVVQDNGTGIARDQVDLAFTRHATSKISNEHDLFKVSTLGFRGEALASISAVSHVEIVTATENAIGIKADFSGGSKKGQEDAASQKGTKITVQDLFFNTPARLKYLRSPRTEIMKIVDIINRLSLGYPHVSFTLSNTGKVLFRTTGNGNLKQTVANVYGRHIAEKMESFEAKDSDFKITGLMSKPELTRSTRNFISILLNGRYIKNFQLSNAIMDGYGSKLAARHYPIVVIAIHVDPLLVDVNVHPTKQEVRLSKEKELSRLITGAISDALLDKTEQSSGFANLENKRETLVDQLEFNLNQDVVNTTRKMPEVHEEAEKPEFLVKQEAKNSEEPKNETEHNYVDINIPREDDQYIITKTWDKNVALQQKLMPFSNKKVDQEVISTGDETLANNLPRLAYVGKIDTYLLAENDGDLYLIDQVAARRRLQFEQIYQTITSKKIVQQGLLTPIVLEFGNLDFLQIKDKIYQIKQLGIYLDEFGQNSFIVRSYPTWIHDHVEESIREILDNYLNLDKGKTQNLFKRVAALEAKRSVKGKINLSAAEGTQIITDLRKTSDPYHDADGRLILVRISQNELRKMFKKGE >NZ_CP045642.1|WP_153245666.1|380891_381479_+|Holliday-junction-branch-migration-protein-RuvA MYEYFEGIVTVITPSYIVVDVNGVGYKVYSPTPFAYQKGDKAKIFIEQVVRDTGITLYGFQSEDDKELFLKLLSVSGIGPKSALAIMAAEDANSLAEAIEQGEVKYLTRFPGVGKKTASQIVLDLKGKLRDYVARLDRQDKNKEISPALNDALLALIALGYTQKELDRITPKLEEVNADTADQYIKKGLALLLKK >NZ_CP045642.1|WP_003627765.1|381527_382544_+|Holliday-junction-branch-migration-DNA-helicase-RuvB MVENEDAVTSGEVENSEEEAMELSLRPQTLDQYLGQKRVKKEMSIYIKAAKQRDEALDHVLLYGPPGLGKTTLAFVIANELGVHLKSTSGPAIEKAGDLVALLSDLDPGDVLFIDEIHRLAKPVEEVLYSAMEDYYIDIVIGEGQTTHAVHVPLPPFTLIGATTLAGQLSAPLRDRFGIVEHMQYYTIDELEKIVQRSSDVFHTSIAPEAAHELARRSRGTPRVANRFLKRVRDFAEVKGEKTISLATTEGALKQLQVDDEGLDQTDRRLLRTMIEGYNGGPVGIRTLAANVGEDMETIESLYEPYLLQHGFILLGPRGRMVTDKAYLQLGLPVPGDK >NZ_CP045642.1|WP_153245667.1|382593_383028_+|preprotein-translocase-subunit-YajC MKDLNTLFLANAGAAGGSNMMMIILFIVLIGFTYFGMIRPQKKQQQQRLQMMDKLKKGDGVVLVDGLHAKVDKINSDKTIVVDADGIYLTFERMAVRRVIPAVASVEENDAPAADKTEDTASKEDTSATDTKTTDASDETKEDK >NZ_CP045642.1|WP_046813874.1|383162_384614_+|glucose-6-phosphate-dehydrogenase MRNIPVVMIIFGGSGDLAHRKLYPALFNLYQRGLIHDNFAVIGTARRPWSHEYLREQVSDAVHETHDEVDENSLKHFASHFYYQSHDVTNVEHYETLKKLAQELDDRYCAHGNRLFYMAMAPRFFGTIATHINDQCLTGSGFNRIVLEKPFGHDLASAEKLNKEITASFNEEDIFRIDHYLGKEMVQNIMPMRFTNPLIKNIWSADYIKNIQVTLAERLGVEARGGYYDTSGALRDMVQNHIFQIITLLAMPEPKDLTSAGVHKAKQALLESMIIPSPEEVKKDFVRGQYLGSDTTLAYRQEPNVDENSTTETFVAGKVKFKEGPVAGVPIYFRTGKEFKEKKNRIDIVLKHINNPYGQAYSNKITIEIDPTSKIYITINGKKIDQPGIRRENLTYEFSKSEMAKVPDGYERLLQDVFVNDLTNFTHWSELKRYWEFIDSVEADWQKENETGDAKIAQYLPYRMGPKEANDIFETPTEHWIYE >NZ_CP045642.1|WP_046813875.1|384606_385728_+|DNA-polymerase-IV MNKQNLLPQNDIHRRIIHLDMDAFYASVETQRNPELKNKALVIGQDPRNNGGHGVVATCNYVARKYGVHSAMPAIKAVKLIPKSELVFVRPDFKKYRSVSAKIHSFMHEITDKVESIALDEAYLDVTHNKLGQNLAVQLAIGLQRRIRTELGLNSSFGVSYNKFLAKMGSEYAKPFGRTVILPYEAKQFLGMQKIEKFPGVGPKTQEQLHEMGIYTGADLQKVADFVLIKKFKKMGYFLAQHAHGIDLRPVIADSDTNRKSIGMERTYEPAIYTRDEALTHIRHYCKHLEDELKKRNFFAQTVVIKVRDNDFDTVTKRRKLTKPSNSQYDYYESARELFDKTSSFLEKGIRLIGVTVTDFKKDEYQTINLFDY |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642_2 | 545754-548447 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045642_2
|
40 spacers
spacers of NZ_CP045642_2
>2.1|545784|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATGTCAGAATTTTCATACAAAAATCCTAAAAACTT >2.2|545851|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCAATAGAAAGGGCAGTGATTGGAATATGCCGA >2.3|545916|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCGGCTTTTATACAGATCAATTCAATTCATTCACTG >2.4|545983|34|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTGAAACTAAGTGAACGTTATGTATAGGGCACA >2.5|546047|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCAACAATGGTATTAGTGGAATTGACAAGGTATT >2.6|546113|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAACCAATGGAACGACTTTGGCAACTATAAGTA >2.7|546178|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCAAAGGTGCTGCTATCAATTGGTCAATTCCTGA >2.8|546243|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGCTCATCAATATATGCGATTAATATCCTAACGT >2.9|546309|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAGCAAACAGCGTGATCATGTGATTTATCACG >2.10|546374|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTTGAGTTTGAGAAACGCATTGCTTTTATGTTTC >2.11|546441|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTAAGCCTTCGATCATCTCATAATCAATATCTGC >2.12|546507|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATATTGCCCGAAATGTTAAGGGCGCAAAGCTCAG >2.13|546572|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGAACAACAGCAGAATAACCACATAACTCCATACAA >2.14|546639|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATAACGCTTATATACGCTAATTTACAATTTTAAGC >2.15|546706|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACAACTCACTCACTCAATAACTTAACTCACTTAAA >2.16|546772|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATATAAGTTGTGATTTTTAAGCCATTTCTCGCTTA >2.17|546839|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATGAAAAGCTAGTTGAAAAGTATCTTGAATTGA >2.18|546905|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTATATGTGCAAGGTAAAGGGCACACGGAAAAAG >2.19|546971|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCAAAAAAAGTAGAAAACTACAAAGAGCTTGCT >2.20|547036|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTTAGCAGTATAAGTATGTTTATTTAGATCATC >2.21|547101|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTATATGTGCAAGGTAAAGGGCACACGGAAAAAG >2.22|547167|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAACCTATCTGCTAGCGAACACAACAAGGCAAACTC >2.23|547234|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTATCTGACGTGTAGCCCAATCAACTGAACTAGAT >2.24|547300|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTAAGCACCTACTTTCATGCCGTGTGTAGCAAG >2.25|547366|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGAACTAAAGCAGACTTATGCTGATTTAGCTGC >2.26|547431|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTTAGTACCTATCCGGCGCTGTGAACGGTTTTGA >2.27|547497|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT ATTAGTAGCTGACTACAATTCCTTACAATCTAATCA >2.28|547563|63|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT TTAAGTCATATAATCTTAAAAACGGTAATAAGTCATATAATCTTAAAAACGGTAAAAAGAAGT >2.29|547656|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAATTCAACAATGCAGGAAATGGTGATCAATCA >2.30|547721|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTTAGCAGTATAAGTATGTTTATTTAGATCATC >2.31|547786|37|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTTTGAGTGGTAAAACTTATTTTGCTTTGCTTTA >2.32|547853|37|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTGATTTAAGCTTGACTCAAGGTGATGATAAGGACG >2.33|547920|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATCTATATCCTTTCTTTTGGTCGTTGGACTTT >2.34|547985|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGCATGGGGGATTAAGTCAGCATTAATGGAGCTT >2.35|548051|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACGATGACAATGTCGACTCAATGGTTTATGCCGTT >2.36|548117|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAAATTTTTACATACATTCATGAGAAAACCACACC >2.37|548183|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTCAGGTGGTAACGGAATGCTTGAACCCATTG >2.38|548248|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT AAACTTGAATGATCTATAGTACCTCTTTTTGAGTGA >2.39|548314|38|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT TTTTGAAAGTTTAATCTAAAAGTTTTAGTAGTTGGTAG >2.40|548382|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder AAAGCCGAATTTTACACCAACTTTACTAAATATGCT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045642_2
The CRISPR arrays of NZ_CP045642_2 >merge|NZ_CP045642|2|545754-548447|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCAATGTCAGAATTTTCATACAAAAATCCTAAAAACTTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGATCAATAGAAAGGGCAGTGATTGGAATATGCCGAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCTCGGCTTTTATACAGATCAATTCAATTCATTCACTGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGACTGAAACTAAGTGAACGTTATGTATAGGGCACAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAGTCAACAATGGTATTAGTGGAATTGACAAGGTATTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAAGAACCAATGGAACGACTTTGGCAACTATAAGTAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAGCAAAGGTGCTGCTATCAATTGGTCAATTCCTGAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTTTGCTCATCAATATATGCGATTAATATCCTAACGTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGTAAGCAAACAGCGTGATCATGTGATTTATCACGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAAGTTTGAGTTTGAGAAACGCATTGCTTTTATGTTTCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGCTAAGCCTTCGATCATCTCATAATCAATATCTGCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGATATTGCCCGAAATGTTAAGGGCGCAAAGCTCAGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTCGAACAACAGCAGAATAACCACATAACTCCATACAAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGATATAACGCTTATATACGCTAATTTACAATTTTAAGCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCACAACTCACTCACTCAATAACTTAACTCACTTAAAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTAATATAAGTTGTGATTTTTAAGCCATTTCTCGCTTAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAAGATGAAAAGCTAGTTGAAAAGTATCTTGAATTGAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGCTATATGTGCAAGGTAAAGGGCACACGGAAAAAGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTTTCAAAAAAAGTAGAAAACTACAAAGAGCTTGCTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGCTTAGCAGTATAAGTATGTTTATTTAGATCATCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGCTATATGTGCAAGGTAAAGGGCACACGGAAAAAGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTTAACCTATCTGCTAGCGAACACAACAAGGCAAACTCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGCTATCTGACGTGTAGCCCAATCAACTGAACTAGATGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTATCTAAGCACCTACTTTCATGCCGTGTGTAGCAAGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGGATGAACTAAAGCAGACTTATGCTGATTTAGCTGCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCTCTTAGTACCTATCCGGCGCTGTGAACGGTTTTGAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGATTAGTAGCTGACTACAATTCCTTACAATCTAATCAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTTAAGTCATATAATCTTAAAAACGGTAATAAGTCATATAATCTTAAAAACGGTAAAAAGAAGTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTTAAATTCAACAATGCAGGAAATGGTGATCAATCAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTGCTTAGCAGTATAAGTATGTTTATTTAGATCATCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTTGCTTTGAGTGGTAAAACTTATTTTGCTTTGCTTTAGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAGTGATTTAAGCTTGACTCAAGGTGATGATAAGGACGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTCTATCTATATCCTTTCTTTTGGTCGTTGGACTTTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGACTGCATGGGGGATTAAGTCAGCATTAATGGAGCTTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGCACGATGACAATGTCGACTCAATGGTTTATGCCGTTGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGACAAATTTTTACATACATTCATGAGAAAACCACACCGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGTAATTCAGGTGGTAACGGAATGCTTGAACCCATTGGTTTTTATTTAACTTAAGAGAAATGTAAAGAAACTTGAATGATCTATAGTACCTCTTTTTGAGTGAGTTTTTATTTAATTTAAGAGAAATGTGAATTTTTGAAAGTTTAATCTAAAAGTTTTAGTAGTTGGTAGGTCTTTATTTAATCTAAGGGAAATGTAAATAAAGCCGAATTTTACACCAACTTTACTAAATATGCTGATTTTATCTAACTTAGGAGGAAAATAATT 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MGETSTVTIDFRINSWLENAGIVGLTRILKANPRYRGSYKEKENTLEVDPKVFDNFSDLYFNFFIKNYGQATRYWRIVSEENFLKSLKENGFKDFDNKKLKELTDWFDNVLKYSVNSASYKKVIKFINSDYDIKAEVKDCNKKIRTLNKKNFLTESPEEAKEILQELINQLLKAIEYFSTDPARKYFPAKTLSYTVINKAWNGVSFLNPQAKNLDFYDDYQNYFVAPVQKYLQEDHSKDKYICSTCGRPIKRLEYSYGFLNDMGYDLNRKTSNAWNFKNDLYICPVCQFLYSLVPAGFTYNMASQGIFINENSSIRNLQGKNDATFNSMMRDIRSNTQTSPYRAFSAAFKDAEASGQNAALANIQLITYNNDHYNFQIIPIVASKVLIKVVEKKYTVKQTGEVKSYLANLYNAGISNFRGAGYYSILENVLNCLFNNTNLFSIIQELELLKVGNTAGCYYNTFQIMTVIRMNGWFLNELHKYRRSENAMKVEEDKLTKARGCGMHVRMGYDNENKAKTLAYKMLEAIRANSTDRFMELLLNAYLYLDKTVPKIFIETQSNTEVFKEYAFAFIAGLIGSSNAEQDK >NZ_CP045642.1|WP_003627162.1|537052_537808_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFGIPIHLLPKNSEEKEIKINIDYDAYILSLIKTGLSTENPALFKELFGKPTQKNYSTSVFFPNATFTKDNIVLDKNGEMKLYFSTANTNLAINFYNSFVYLDHLDAEKLPFGHSYLADVKKLYTIELPKITKDRVIFKTMSTIVIRNDEGRFISCPNDSTEEGLAEFNDALRRNTFNKLRDNESLASTVKGLKFKPIKMRKTVRKSFGLNIECTKGIFELEGNPTLLNFIQESGLGEKTGTFSGMISLA >NZ_CP045642.1|WP_003629695.1|533920_534574_+|flavodoxin MFGRTYSDLGPVVGQINGEDIRANQLERRGYDWENGYGTPSDGQDTNRDGQPVRKLTKDAKSIIIFWSCSGSTKLLASKIARETGADILEITLRNPYPANYRKTLNRANCERIQNDPPELEMLSQYDTIYLGYQTWAMTLSQPMRAFLLEYGGEFSNKKIAPFLSEGGYGSGDSTELIREFIARDGGKNNTYTSALVVDGNRVDESDVEVKRWLKTI >NZ_CP045642.1|WP_003627167.1|532894_533776_+|SPFH-domain-containing-protein MMARIIIGIIVVLVIVYVCCGFKIVPQNNEGLVETLGKYSKTVKAGFIFVWPLFQRIRKVPLALQPLEISKYSIITKDNAEISTSLTLNYLVTDSYRYFYNNTDSVESMVQLIRGHLRDIIGRMDLNAALGSTKEINDQLFTATGDLTDIYGIKVVRVNVDELLPSAEIQHAMDKQLTADREKTAAIAKAEGEARTIGMTTKAKNDALVATAKANAEAVKTQADADAYRVQKMQEALSKAGEGYFRNQSLDSFNQLAQGPNNLIVVGKDEMTDLGKVPALRKVWDASDDKKDK >NZ_CP045642.1|WP_046814408.1|548601_551265_+|DNA-polymerase-I MADKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLESFKSPDDLHTNAIYAFKNMLDVLLKDVDPTHVLVAFDAGKVTFRTKMYGEYKGGRAKTPEELLEQMPYIQEMLHDLGIKTYELKNYEADDIIGTFAAKGEKAGFTTTIVTGDRDLTQLASDKTTVEVTKSGVSQLEAYTPEHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVEGIGPKTASNLIQEYGSVENLYDHIDEMKKSKRKERLIRDKDKAFLAKKLATIDRDSPVTIDIDDVKREPVDYEKLRQFYEKMNFRKFLAELNASGAAQDGAEVEKVEYTVLNDDNVKDVKATEKDTVEFYLEMLGANYHLADFVGFSLKINDKIYVSRDVDLLEEDNIKHILEDEKIKKNVFDLKRSMVGAHRLGIHTHGLDYDMLLASYLVNNENNSNDLGEIAHLYGDYSVKTDLEVYGKGKSEHIPDDDDELFNHLASKVNAIESLKKTLLEKLKDHEQDALFDTIEIPTARVLARMEMNGMKVEASTLIQLQNEFAVKLKKLEDKIYGQASEKFNLNSPKQLGHILFEKLGLPVIKKTKTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVSKILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQPDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTEEGKQIRKAFVPSEPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHSHTAMKIFHLESPDEVTPLMRRHAKAVNFGIVYGISDYGLSKNLGISRKRAQEFIDNYFEQYPQIEDYMNKAVQEARDKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKYTVRAFAERTAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVIQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSGWGHNWYDAK >NZ_CP045642.1|WP_003627142.1|551274_552105_+|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase MPEMPEVETVRRTLIPLIKGKTIEKVILWYPKIVATDHEKFLSELPGKKIIDIDRYAKYLLIRLSDNLTIVSHLRMEGKYHLTTSDAPKDKHDHVEFIFTDGTALRYNDVRKFGRMQLILTGTERQTTGIGKLGYEPNSSEFTSEYLVNGLKRKKKNIKNTLLDQSVVAGLGNIYVDEVLWRTKIHPLSQANKIPAEKVMELHDQINQIITEAIKLQGTTVHSFLNANGQVGGFQSKLQVYGHVGEPCPVCGTKFEKIKVNGRGTTFCPHCQVIYK >NZ_CP045642.1|WP_023191597.1|552101_552704_+|dephospho-CoA-kinase MSYVLALTGGIATGKSTADDFFRKKNIPIIDCDQIARELMEPGNASWQAIKDHFGMEYLNSDQTINRKKLGQLVFSNKQALSELNQVTHPLIFDKTVAKIKEYRDFALVILDAPVYFEAGLDNKHVANGVLVITLPEQLQIERLKKRNNLTDQEAINRINSQMPLVEKEKMADFVVANTGTIKELENKLKQILIKIREEE >NZ_CP045642.1|WP_003627138.1|552707_553175_+|transcriptional-repressor-NrdR MECPNCHQNASRVIDSRPSDENRAIRRRRECENCGFRFTTFERIETAPLLVIKNDGTREPFNRKKILHGVMAAGQKRPISSDQFEQLVDHVENKVRKQGISEISSKKIGQYVMDELADLDDVAYIRFASIYREFKDMSSFMKTMEDMMAKKGKGN >NZ_CP045642.1|WP_003627136.1|553178_554510_+|hypothetical-protein MFETADPKHLYYVANRIRLFPEDEKVLIKLYQPLVGAVAVALYQTLIQNYDPYGIISDSKGIYSLQEQLDCSLKQLFNSLHKLEAVGLVQTFLSDNVFNNVLVFKLLQVPAADKFFATPLLASLLKEKVGVPTFHDLSHAFAQEAKLKEKPIKNAKDVSANFFDVFRLPGDEAITPSSDVVQAAQENKVHEVEIAKVNDHDSIDWDFIKQEYSRYQIPASEIDLNKEQIRGLIQTYGLSEKEFVDESLPCLHGSYSLNMRDISNTLAENYKRTNTRENVQTQLNEGRKKALATIKDMDDNDKKLLKAANESSPAEFLYKLKTQKGGITSANEKQIINNLHTQYGLPEDLINILTYTCLTYDTVVSSNLAYKIANDWLQHGVATAVQALQYVKKRRNSFGKKRPVRTYQKRVEKGTDWSKKKADRDAGISTEQLKNLFKDLNNK >NZ_CP045642.1|WP_012212130.1|554541_555450_+|primosomal-protein-DnaI MEPIDKVIKKIVKERNLGDAQSLISQALHDPDVQAFLTANANKIDQKMVQNSMSNLYEYYSQKHTANKVMAGYAPQLFLNGKVIDIRYVPTKAKLAQDRKQAAERRLQLIDVPTRLHDVSLSEIDVNDDRKQVLTLIYDFLRKYKQDPHVQGLYLSGDYGVGKTYILAGLANYVVTNMNKNVVFLHVPTFIAGLASHFDDNSLQSEIRRLSECDLLILDDIGAESLSQWSRDDVLGVILQARMDNVLPTFFSSNLDMEALESHFEETRNATDPVKARRLMQRVRFLAKEVVVSGPDRRNSLH >NZ_CP045642.1|WP_046814407.1|555741_557676_+|threonine--tRNA-ligase MSFSITLPDGSKKDFEESLTIADLAQNIATSLGKAAVAGKVNGELKPLDYKLDSDSEVAIITNKDEEGLDVLRATAAFVFEAVAKCEYPELRLGEHVADEDGFYVDTDKDDQIKVGELPKLEKAMQKVIKNGEKIEHVQIAKSELEDLYKNDKFKSELLAKVEGDTVDAYKLGDFVDFGFDALLPNTGKIKQFKLLSVAGAYWLGKSSNPMLQRIFGTAFFKEADLKADLKRRQEIKERDHRTIGRDLDLFFVDPKVGAGLPYWMPKGATIRRVVERYIIDREVADGYQHVYTPVLMNLDAYKTSGHWAHYRDDMFPPMDMGDGEMLELRPMNCPSHIQIFKHHIRSYRDLPLRVAELGMMHRYEKSGALSGLQRVREMTLNDGHTFVALDQVQTEFAKILKLIMEVYKDFDITDYYFRLSYRDPKNTDKYFANDEMWEKSQKMLKGAMDDLGLDYVEAEGEAAFYGPKLDIQTKTALGNDETMSTIQLDFMLPDRFDLTYVGKDGEEHRPVMIHRGIVGTMERFIAYLTEIYKGAFPTWLAPVQAEIIPVNNEAHGEYAEKVRAELAKRGFRVEVDDRNEKMGYKIRESQTQKVPYTLVLGDEEMKSGKVNLRRYGTDEEISKSLDDFINEIDADVKSYSREN >NZ_CP045642.1|WP_023192349.1|558505_559036_+|hypothetical-protein MKKKLLLFLGAILLILGFAKLSSVNADAATIKATDWGAKKVFTTPKKTRGVWYYKEGKKVKKFKITAHTIDGVKLYKELNGKNSDRWVNKLIKADKKSGYKLADKVGESAWACHTIKYHKIIGFNADGWLAGSGDGFYYVPVKKNVKGKKANALRVGEGAGNYLSYYAYKSRKLVK >NZ_CP045642.1|WP_046814406.1|559226_559835_+|IS607-family-transposase MKAGKVMDLLQISRSTLKRYREKGILEAKKLPTGQYDFDDDSVFLLKNKHSKRLTVLYGRVSTYKQKADLANQMQELSDFAQSKGFQANDSFQDIASGISFKNRKQFFKMLDLILAGKVKRVIITRKDRLSRVGFELFEYLFQNYGTEIDVISDEMNPKTDEQELFEEIISLLHCFSMREYSHRRAERKLFEATLNQKGKTK >NZ_CP045642.1|WP_012212124.1|562394_562688_+|ACT-domain-containing-protein MIFIFFAKTDEELSLVCETKNAPSKTINREDGWRAFKIEGQLDFLLIGILAKIAQLLANNGISIFAVSTFNTDYILVKDNNFDSAIKILSENNYEIK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642_3 | 1451135-1451239 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045642_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP045642_3
>3.1|1451171|33|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder CCAGAGGGGGTAACGATTCGTTCACCCTTTTTA |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045642_3
The CRISPR arrays of NZ_CP045642_3 >merge|NZ_CP045642|3|1451135-1451239|CRISPRCasFinder GTATTAATTACTAATAATAAGCAAGCCAGTTTAAACCCAGAGGGGGTAACGATTCGTTCACCCTTTTTATGTATTAATTACTAAAATAAGCAAGCCAGTTTAAAC >NZ_CP045642|3|3|1451135-1451239|CRISPRCasFinder GTATTAATTACTAATAATAAGCAAGCCAGTTTAAAC CCAGAGGGGGTAACGATTCGTTCACCCTTTTTA TGTATTAATTACTAAAATAAGCAAGCCAGTTTAAAC
>NZ_CP045642.1|WP_003631016.1|1450816_1451092_+|hypothetical-protein MEFKLDQQQETEIKTYVLDVVKDAIKQATTANKPYLNRKEIAKYFGVAESTISYWASLGMPVAVIDGRKLYGKQSITNWLKSHEMPSIKAK >NZ_CP045642.1|WP_003631017.1|1450586_1450814_+|hypothetical-protein METTQQKLSSAIYEMNRIAEQLFVSYGLLSKLIDDVPEDDPFDPISTKKMLQHVANELADYSTDLSDSAKSNKER >NZ_CP045642.1|WP_003631018.1|1450364_1450583_+|hypothetical-protein MTNYSADGSNVVNRWYKDGYLYCAFVDGTIMEYGRNKIPERYIEVMRNELAQTIQELQSNEYDFDELEPMEA >NZ_CP045642.1|WP_046813997.1|1450165_1450372_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSKEYLTFKEAMSYMGFTTYDSLRKTIKQGLPVIKFGNSKRISKTAIDEFMQAHTVQAHPSKAVVNHD >NZ_CP045642.1|WP_052747885.1|1449315_1450017_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNRIKELREKRSLSQRQFVTDFNKYISTNEEQYKNKRGVKKITFGTASRWENSLNKPTEYMWQALADFFNVSVAYLKGAYSKKEIAQITQETYKKNYYQQSNDILIRVFSSICDDYFVSIGAVPINIKKEWRLIPPEKVESLEFWKNILEELYIPYVAIRWLIEKPSLDASKKDVIDAVKGAMSAYSYSSSRYNERCIFIAKHTFYRKQVKKDQAPEYLDFNREHPLDNQIYY >NZ_CP045642.1|WP_046813998.1|1448015_1449173_-|site-specific-integrase MNNDIKEYTTPSGKKRYRFNLYVGVDETTGHSIQIRKQGYKSKKEAQEAYLNYQLKVIKGEYIPESKGHITFNKLYEMWLKIYRETVKTSTYATTTRYFDDHILKQLGSKYIDKLTVLDCQKAVNIWFNDAPKTYKRFMRYTNNVLNYGINNLELISKNPMNKVIPPKAKNKPKPFTDFYSKDELNIFLRDAKEYNFKYFVFFRLLAYSGMRKGEALALKWSDINFKDNTISINKDVTVGLNNELYEDTPKTENSFRTLDMDAATMEYLKEWRLMQQKTMLKLGYNFLNSDNLLFSTINNGYLSMSKPRQWNVAICKKYDLRRIKIHGFRHTHASLLFEAGASMNEVKARLGHADINTTMNIYTHVTDDQKKDTANKLVRLLEGK >NZ_CP045642.1|WP_023191663.1|1446485_1447838_+|Mur-ligase-family-protein MSFKSGIAKVAGKSSYWFLHNVLKGGTSFPGKFAMKIDPNVLNSLAQGYETVIVTGTNGKTMTTALIVEALKKKYGDVLTNPSGSNMQQGIVTAFLAHKHKRVKRKIAVLEVDEANVKMVTKLLHPSVFVLTNIFRDQMDRYGEIYTTYDKIVDGIKLAPDATIIANGDASIFSSVELPNKKIFYGFKLPNDKPENDFKAPVNTDGVLCPKCDHILHYHSRIYANLGDFFCPNCGYHRPDLTFTVNNILEQTPNSLKFQMGNKDYSINIGGTYNIYNALAAYSVARHFGLTEAEVAQAFAENKRIFGRQELIHYGNRDIDLILVKNPVGLDEVLHMLNTEKDDYSLVALLNANHADGIDTSWIWDADFEGLNKDKIKKILVGGQRWHDMGFRLEIAGFDPGTMSTNPDYDSLIEEIKKLPTKKVYILSTYTAMLALRRKMAEKKIIKAGM >NZ_CP045642.1|WP_046813999.1|1445736_1446336_-|thymidine-kinase MSQLFFRYGAMSSGKTIEILKVAHNYEAQGRKIALMTSGLDNRSGVGTVASRIGLHRKAIPITADMNLYTYIEKMNSYDLADGKGKLACVLIDEAQFLKRHHVLECAKIVDEFNIPVMAFGLKNDFQNHLFEGSENLLIFADKIEEMKTICHYCGHKATMNLRVNNGKPVYEGEQVQIGGDESYYPVCRYHYFHPGIQR >NZ_CP045642.1|WP_153245779.1|1443798_1444656_+|peptide-chain-release-factor-N(5)-glutamine-methyltransferase MPKTLKEIRIKAGETAENACPEDIDYVLAERLNLTPSEFELKQDMVLSDDQLKQANKDIKKLAKGVSPQYILGYAWFFGYKIMVQRGVLIPRFETEELVEWTLKSLKSGDKVLDLGTGSGCITVALAKEAEKKGIKDLTLYASDITDAALRTSEENFLTYDLDVVTRKANVLIGLEKFDKIISNPPYIKTTEKKEMDANVLQNEPKEALFAGSDGLDFYKKFAKQVRDHLNSHGEFFLEFGFSEEDQLKELFAKELPDFDIEFRKDMAGKPRMVHGRWQKFEWIK >NZ_CP045642.1|WP_025283443.1|1442787_1443789_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase METKIFKKDQIDEAVKLLAEGELVAFPTETVYGLGAIATKEKSVKGVYAAKGRPSDNPLIVTVSDEKMMERYAKEVPERAKKLIKHFWPGPLTLLLFVKTGTLPDAVTGGLDTVAFRCPDDQLTHDLIAKLGYPIVGPSANTSTKPSPTTAEHVYHDLKDKIAGIIDGGPTRVGLESTIIDLSVKTPIVLRPGEITPEELSKVLGEKVLINTGKVADKDVPKAPGMKYRHYAPSEPVVVVDDPADFGKIDFNDKTGVAALGSVLDQINLPEENKFDLGKNLIDADHNLFGALRYFDDKDDIETIYVQGFDEGEESLAYMNRLNKAAGGHHLNK >NZ_CP045642.1|WP_080948258.1|1452259_1453855_+|DNA-primase MRPKWDKKDGASTYGQRTIDKAITGTTETFNSSRDATAKDVYGFNHDTKTINQLKATLKQQGLEQRQLIKEQNIADGHPQKKAILNFRRVTSILEKYILWAVVGNNQDDWQKSALYFYNPESGIYEKNNLLIEELINTVEPQITEKNIKEVKSKLRIEGKRKYLTNNPNLYVLGNGIFDAKKHQLLDYSPKFVFTSKIAVNYNPNAQEPKFDNWSFSKWINEDIAQGKEDKIKLIWQTFKAVVNSNYSYHSAVFLLDAKHGSAGKGTFEQLLENIAGEGNYASIKLNEFEKDAILATIVNKPLVIGDDNDPNKPIDSSERFKSASTGDSITINDKYEKAYSYKPTCLIVQSLNDLPKFKDNSDATYRRIRVIKFNKHYTENASNRKIKDEYIYNKDLLEWIVKTAIDVKIDGVMVHTEESNAILKENKIDSEPFLQFVNDIVIPNENGYRFQDTTYQAYRTWYKNTGHNIIYLESFRDFNKKMREHGFKQRRKTRDNHKLQVWLNIQLNTDSMNLTYMDLKDIKDTKDTKY >NZ_CP045642.1|WP_003628016.1|1456309_1457323_+|serine-hydrolase MIDYNKTQHLIESMVLERVVPGVNYTFIKDKQIFTSTTGFASIYPTVTQLSPFAEYDLASLTKVLATENVLLKLYDQGKLNFTEPLQEFIPEFKDSRIRLYHLLTHTSGIRGWIPHRDELNHDELLKAIINLPVTGEFEHKMRYADTNFILLGLVIKKIFNRPVQEVATTEVFNQMPLAHTTFSPKKEACVPTAIVNGHVLQGVPHDPKARQLRADCGSAGLFSTMQDLITFSQGYLGLKKDVLPYSQKTVSLLFDNKNPAGVKPRSWGWDLRFDPKNHYPIILHTGFTGTLMILDRIKRSGLILLTNRIHPTGHNTIFLAMREKIIRSFLKENSKA >NZ_CP045642.1|WP_080948199.1|1457592_1458822_-|IS110-family-transposase MMKQNIIFGIDVSSKSSTVCVVIDRIKQGETFKITNDSFGYQDLLDRLNQYLITPLVVFEATGVYSLSLQAFLEDYHIKYLKLNPLKAKKLMDNNLRHNKTDKVDAYRLALIQFNAPQKLRAPQPKEYHELQNASRYYEELTQALIINKNQLHRNLQSTFPQIESIFSTSSGRVYWTIVSLFPHAQYVLNHNESQVFQSLLAISGIGRQRAHYLTTRLYALARQAYPYDNESSITIRAIQRNIANLFSLSAERDNVINYMEKLAMQANARSLTIYESIPGIAKTTAVRLVAELGDLRRFDTSAQIDAFVGIDPGRYQSGEKNSHLGITKHGNHLARKILYRTITQMETVKATQLCHITDYYDKKKRSSNSRGYKKIAIASVHKLIRTMFALIKHDQLYDYNVATHNQRL >NZ_CP045642.1|WP_003626134.1|1462000_1463341_-|glucose-6-phosphate-isomerase MSLINFDSSKLTPFVHENELGEMQAMVNAANTELRDGTGAGSDFRGWLDLPVDYDKDEFARIKKAAKKIQGDSEVLICIGIGGSYLGAQAAIELLNSNFYGKEKTDMPIVVFCGNSLSGSYLYDLIEWLGDKDFSINVISKSGTTTEPSVAFRIFKDKLIKKYGKEEAAKRIYATTDRQKGALKTEADAEGYEEFVVPDDIGGRYSVLTAVGLLPIAAAGADIDALMKGAADARADYTDTDVHKNSPYQYAALRNILYRKGYTTEIVENYEPSLRMFGEWCKQLMGESEGKDNKGIWPSSANFTTDLHSLGQYIQEGLRNLFETVIRVENPRHDVKIPGDEKNLDQLNFLEGKSLNYVNDRAYEGVVLAHTDGGVPVMTVNIPDQTEHTLGYMIYFFELAIAISGYLNGINPFNQPGVEEYKRNMFGLLNKPGYENLHDDLTKRLK >NZ_CP045642.1|WP_003626132.1|1463416_1464031_-|VanZ-family-protein MLFFGPLYNLLAERYATSINHFALVKLTFLALDKTFFYFLIFAVLRLIWLLFVRRRRSIKSEISVWIFAFYLILILMLTTFRDTYFPWQLAFNFNRPLSDVNLVFMKETWKLVYAPSRLDFFYNSFGNIMCFVPFGILFPIVFSKKQSFFKTIVIGMLFSIFIETLQFLLATGVSDIDDVFFNTCGAILGYLIYLFFKKLCMRL >NZ_CP045642.1|WP_046813993.1|1464155_1466327_+|LTA-synthase-family-protein MLKEKNMKKKISNFIQTRTGFLVLLVFCFWIKYIFAAYFDFNLGLSDPYQHIIMWLSPIGTAVILISIGFYIPKPIISYIAMLIIDFANTALLFANIIYYRQFTDFLTIKTMTNAGKVSQGLGKSTVALLHPSDILIWIDLIVIIILLVIHKIRIDQKSYGLSMPIAITSVGALITTLNIFLAETSRPRLLRNTFDRSYVVKYLGIDAFTAYDGFKSAKNVQVTKNANASDLNDILNFTKKIYAAPSSADFGVEKNKNVIVIHLESFQQFLINLKVNGKEVTPFLNSLYRNKHTLSFDNFYHQVGLGRTSDAENMLETSTYGITDGSLFTSLGSENTFQAAPQILRQDGYTSAVFHGNVGTFWNRNDVYKNMGYNYFFDKNYYSSQTKDSSGYGLKDKLLFAESIKYLEQIQQPFYAKFITVTNHIPFELDKEDRDPNFQTTKTRDQTINNYFETAHYLDEAVHEFFNYLKASGLYKNSMIVIYGDHYGLSNSENETLAPIINESADTWNTYNNVQMQRVPFMIHANNLKGKISHEIAGEIDVLPTLLHLLGINNKGYVQFGNDMLSPHRQNWIVLRNGTIISSKYIIVGDKGIKGTVYNRINGRQIIDFSPQEKKEITTLAKKAKDSLHYSDLLNNHNLLRFYTPAGFVPVDPTQFNYSDNYQKMIAIRQDLADSSTSLYSRNHNRSTTKLYKTDASKLHNREKDITKVPEEVLKKPVNRSR >NZ_CP045642.1|WP_046813992.1|1466542_1467733_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLKGIKLRLYPNRTQQNQLEQMFGNDRFVWNQMLAMMNERYQNNKDLPFLGKFKLNYLLKPLKKEYPFLKNSDSSSLQVVNEFLTQSWKNFFQDKTGQIGKPRFHSRKYLKKSYTGKSIIKTAGKRYLKIPKLGYVKTSKTGVLQNTKIKRYTVLLEPTGKYYLSLQVEISEPEKYSLTGKRVGIDVGVADFAILSNGLKYPSFNSSYFEKKAKVWQRKYARRRHLVKLLVLQDRNKRVLCPRSLESFTNWQKAQKSKAKCQAKAANQRRDYLHKLTTHLVKQYDVIAIEDLKTKNLQKNHHLAKSIANASWRMFRQMLEYKCEWYGKKLIAVDPKNTSRICSKCGYNSGAKPLEIREWTCSKCQTKHDRDINAAVNILHKGSTKPTGQGLAMVTS >NZ_CP045642.1|WP_003626128.1|1467825_1469283_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKLIYQNMLGFLLIIVTTISIIGYSEIGYARNQAYMQNYQRMESYANSLGELAETDEKNGTALLNDNFLNQLEFVLRGDDVHLRIFNDQNMQIYPRVNAKVQLSDKIFSTLKNGQEIRIQNNHAEHSPIGSTKDAYTGVLVPWRNGKNLVGVAWISSKVTHVERPIYMSKRNLLRALLVTVAVGLILSFIISYYSTKRIKRLSRATQKVALGNFNVQIAHKDSDEIDQLAENFNKMVKALKQSNEEVRAQENRRDQFMADAAHEMRTPLTTINGILEGLQYDAIPEESKPKSIDLMQRETKRLVRLVNENLDYEKIRNNQIMLIKTDFDAMPILRDLKSQLKQNAGKANDEISVTGPEKLPIYADRDRFTQVMVNLVQNAIQFTHDGQIEISGKRLEHASEIFVKDNGIGMSKDQTKYIFERFFKADPSRARMGTGESGLGLAIVSSLIKQHGGKVKVDSEPGKGSTFTIIFYDKGYEQFISKDQ >NZ_CP045642.1|WP_153245780.1|1469286_1470036_+|response-regulator MSLRILMVEDDNSVAEMMGMFFKKEGWQQDIAVDGVEAVDMFKENADKYDLITLDLNLPKKDGIQVAKEVRAISPTVPIIMLTARGSESDQVLGLGIGADEYVTKPFSPIALIARIKALHRRVMMEEDVQTQENNNQEYEIQTAHLKISKDRREVLFDDQLVVDLTPKEFDLLYTMAQKPKQVFSRDQLLDLVWGYEYYGEERTVDAHIKKLRQKLEKVGAKVIQTVWGVGYKFDDSQVKYQSLNPFVL >NZ_CP045642.1|WP_003633551.1|1470008_1470398_-|SdpI-family-protein MIYVACGSIMAVIGIIWLISPAKKPNRIYGYLSYLAQVNKASFKFAQRRASLYCILFGLIQVAIGVIIHYLNWDRYFLIWLLTFYLFILLPIVFTEKSLKSFLSELHELPHDYVDPDQVKRQRTKGFRD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642_4 | 1661330-1661509 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045642_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP045642_4
>4.1|1661351|58|NZ_CP045642|PILER-CR ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC >4.2|1661430|59|NZ_CP045642|PILER-CR TCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045642_4
The CRISPR arrays of NZ_CP045642_4 >merge|NZ_CP045642|4|1661330-1661509|PILER-CR ATGTGGGATTCGAACCCACGCATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCCATGTGGGATTTGAACCCACGATCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGGATGTGGGATTTGAACCCACGC >NZ_CP045642|4|3|1661330-1661509|PILER-CR ATGTGGGATTCGAACCCACGC ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC ATGTGGGATTTGAACCCACGA TCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG ATGTGGGATTTGAACCCACGC
>NZ_CP045642.1|WP_046813930.1|1656787_1658116_+|uracil-permease MSKKENFRNPDAILDVYEKPEFGQGVLLSLQHTFAMFGSTVLVPILIGINPSIALLSSGIGTLVHMILTHFKIPAYLGSSFAFVATMQALMKADGYPAVAQGAIASGLVYVIVALIIAKVGSGWVNKVLPPIVVGPIIIVIGLSLATTAANDAMMNNQKYDLTYFGVAIFTLVMTLVFQMCFKGFTSLVSIMLGIICGYVLACLLGIVDFSGVEKAAWFSIPSLDVMGISYHFKWYPAAILAMAPIAFVTMTEHMGHIMVLNSLTKRNFFKNPGLHKTMMGDGISTIIAGFIGGPPTTSYGENIGVLAMTKVHSVWVLAGAAVCAIIFSFVGKLAALIESIPMPVIGGISFLLFGTIASNGLKILVDDKVDFGEKRNMLIASVILVIGIGGAYLQLGNFQLTSVALSTIIGMILNWVLPKKAASEKALEEKNKQKQDGKIYQ >NZ_CP045642.1|WP_020829065.1|1656243_1656774_+|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR MAKEIIDAIGMKRALMRMTYEIVERNKGTENLVLVGIKTRGLYLAQRIAANLKKLEDVEISVGAIDVLQYRDDLPESKKEKMIHNQQLDFDITDKNVVLVDDVLFTGRTIRAALDALMDQGRPAKINLAVLVDRGHRELPIRPDFIGKNIPTAMNEEVKVSMTEVDDKDSIELINK >NZ_CP045642.1|WP_046813931.1|1654483_1655953_-|MFS-transporter MNKKQLFMVTLALLLANIMSGLDATIINTAIPAIVSDLHGIQYMGWIVACFLLGMSVSVPIWGKLGERMGNKFAFELSLALFILGSLLEGIAPDIYFFLIARILMGVGAGGMGSLPYVIVGYIYPNIKRRTVILGYIAASFSAASIAGPLVGGWIVDTLSWHWVFYINVPLGLIAIILSFVYYKGIRKPNKNTQFDKLGAFTLIAGLTSFLIGIQLLGMVSLPVVLGFIILGILLLVVFIRAERKAKSPVVPLSVFTNKALVGDFLIFALAWGSYIAVNTYLPMWAQAILGASALVGGMTLIPNSIVDIVGSQTAPYFLRHVNNYHLLIANLTIMAITAVGLILAPISTPYQILALIAAFSGFGVGSIFVILQIKVQVDASEKDMAPATSLSFLIRILALTIMAAIYGVIMNLALGRGIAGHPGITMTMMNKLIDAESAKSLPVQLLPTMRKIFYGGIREIMIVSLVLLVAAYVVNYLYNRHEEKIMAE >NZ_CP045642.1|WP_046813932.1|1652793_1654530_+|IS1182-family-transposase MYQNYTTGQTALTLNLDFTIPNNHLANTISCFVDSIPEDVLLGDTAKTGRPAYHPAMMLKILLFAYSRRVFSGRKIELMLEENLPMMVLAEKQKISYHTINNFRSGDHANELVKKSFLYFTNLLEAEGLINEGAIFIDGTKIEADANRYTFVWRKAAEKFHEKLKGQAVELYDELIAKEVVKAMAQEKVQTSQGLEELAQETEDEIEKLTKEIEQEPKAIPGGSLRKARRRGLKKLLHRLKKDYVPRMKKYEEAEEIFAGRNSYSKTDHDATFMHMKEDHMKNGQLKPGYNIQAATTDQYVVGFALYPNPTDFKTLEPFLKQMPILDKFDKIVADAGYGSEYNYSMLEKEYPDKKYYIPYTMYEKEKTRKYRNDPTKLANWFYDEKDDYYLDQNGVRFNFKYYSQRKDRSTGQVRDFKVYEADEFQLTPELERLAKTKSGRQRQVRYNPNWQYLKEKAKEVLQSPEGRHIYSMRKYDVEPIFGHLKNVFGMRRTHLRGKKKVETDVGIAFMMMNLSKYWNRRWSKDQFSLFKNKNREKKRPIKLKLRVELIVFRYLRVGYFPDTILPLFFLHGGYKDN >NZ_CP045642.1|WP_046813933.1|1651442_1652648_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MKEKPIWKKNLFVLSIAVFIAGIAFSEVMPFLPLYIDTLGKFSHQQLNFWSGFIYSGTYLVSALISPWWGKLADKKGRKPMTLRASLGMAIVIGCMGLVTNVYQLFILRMLQGVFAGFVSNSNALIATETPKEKSGQALGTMASSFTAGNLLGPFIGGALASIFSYRVTFFITGGLLLISFFLSLFFVHETDFKQVTEKKLATASGIIKELRSPQLIFGLLLTTLIIQAANNLINPIVSLYVKQLMANHGNVVFISGVIAALPGIATFLAASRFGALGDRIGTHKIIVGGFIGATILFFLTAFVQNTVELGILRFLVGFTDACLFPQVQTLLTKNTPAKITGRIFSWNQSAMYVGNIFGPLLGSTISGLTSYSMVFIVTAIIVVFNLILFKFNVINNLRQK >NZ_CP045642.1|WP_153245815.1|1650248_1651337_+|M42-family-peptidase MQKEQEIQMLKEFSDANSTSGFEEEFVKLFTSYAEKTANIEVDGMLNVYASKKENKGDRPVIQLDAHSDAVGFITQAVRPNGLIKFVPLGGWVKYNIPALKVKVRNRDGEYIPGVVATKPPHFMTAAERNNVPDVVDMSIDVGSSSREETIKDYKIDTGCPIFVDVKCEYHEKSGLFFGKDFDDRFGAGAMIDVLDNLKGEETNFDVVAALSSQEEVGLRGAYVTARKVKPDLCLVLESCPADDTFTPDWLSQTGLKRGPMLRDMDTTFLPNPKFQQYACDLADKNNIPYTRSVRTGGGQDGAAIYYENGAPTIVIGIPVRYEHSPYCFSSYKDFKASVDLATAIIRDITQEKLDSNFLLNN >NZ_CP045642.1|WP_153245814.1|1648508_1650176_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSDLSLKFGGRTLYEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKLLEGKLEPTTGSISIDPNERMSSLNQDHFAFEDFTVMDTVIQGHKELYQVMKEKDALYAKPDFGDEDGVKAAELESKFAELDGWNAEANASKLLQSLDIPESEHQMLMKELPESEKVKVLLAQALFGNPDILLLDEPTNGLDVHTVEWLENFLADYPNIVIVVSHDRHFLNQVCTEMCDVDRGKIQLYVGNYDFWYESSKLANELVANQNAKKEEKIKQLQEFIARFSANASKSRQATSRKKQLDKITLDDIKPSSRKYPFVKFEMHRDLGNDLVKVENVSYSVDGEKILDNVSFIVRPGDKVAFLSRNALATTALLDIIAGKIKPDTGTVTWGQTTAFNYMSRDLNANFNNDDLTILDWLRQYATKEQDDNTFLRGFLGRMLFSGEEIEKKIKVLSGGEKVRCQLSRMMLESANVLIMDDPTNHLDLESITALNDALVAYPGSILFTSHDHEFIQTIANHIIEVGPKGIVSRQDTTYDEFLDKESIQDQVEKIYSLYLTIINLKNQNYV >NZ_CP045642.1|WP_046813935.1|1647556_1648228_-|hypothetical-protein MDNLPFSSVTGKLDNIPFNYDHAGTKEVVVNNVIGDYFNPVTKKYEISDHTFVVGHIKDSNLDQDIAIEQMQQAAMNIINELNKRQMPPHMVMSHLLTDVEKAKQVVTDDDVKISQLSKETGISEEILSDYRENPATLKKASNSTIERLITKYYEKYFNRNEIEKFRFMLIKTVMAYLKENKKDEIDYDPVYELYKLCQQADWHRLARMEEIWRAFYTVDNQH >NZ_CP045642.1|WP_046813936.1|1646015_1646834_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKKRFFLSTLLIGIALFTLSACSQNKKQNVYQTVKSTKTINWGVKADTPLFGSMNIKTGKINGFEIDLAKALTKEMLGKNAKANFVTTTANTKIQLLKNRNVDAVIAAMTITPEREKQVDFSKPYFPAGQSIMVAKNNKIKNVKDLNNKKVLVVKGTTAADAVKKFAPKAEILQFDDYGQAFTALKADQGDAFVTDNGILVGILRDSSGYKLVGGNFTNQPYGIAVNKGQTEMDKQINLALTKLEKDGTYNRLLKKWFGNIPGFNVKTAEKY >NZ_CP045642.1|WP_153245813.1|1645393_1645873_-|winged-helix-DNA-binding-protein MKISESEKLNMAIVHGNRAYQQWDQDHELSDYLSVILYELLLRKKLTQKQLVGLTDLPKQSINKGIKILHDSGYLAMSVDPHDKRVRFCELTAAGNKYAKQKMQSLFRLEEQTAQKLGSEKMQLLTDLLTEWSNTFWDFLNEERSKDPLLPFCVLKISW >NZ_CP045642.1|WP_046813929.1|1661909_1663226_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MRKKVVPRNKAKYEHLASEYLVAGNSKLDQCSHDLYNRALYDLRQGFFKRNYVKGYCDLDQRFKKRYSARESMLYHSLFYVQSAQQTLKEVNTIWSAWLKAIKAYQANPGKFTGRPRMPKYLAKGQRHVFFVTNQNAKVKDDYLIIPKLGFKLKLTPHLKAIQRVAFKPVYGGYKAIVQYKTNRDIDYLPDNGRYMGIDPGVDNAFACVANIQKAPLLVNGRAIKSVNQYYNKERSRLKALQARYHQLESIVDTQQGKKPVYRETKAMRRITAWRNRKIRQFAHKASKRIVDYALSCGANTIVIGNNKSWKRSSDMGRKNNQNFIGIPHKVMIDMIQYKANLAGISVIRTNESYTSQTSALDHEKPCWENGSQSRKRQGKTPINRRIHRGLFQSNNGRLVNADITGALQIIRKVFPKFSLDEGIEDAVLHPVKWSPLI >NZ_CP045642.1|WP_003627960.1|1663255_1663864_-|IS607-family-transposase MKAGKVMDLLQISRSTLKRYREKGILEAKKLPTGQYDFDDDSVFLLKNKHSKRLTVLYGRVSTYKQKADLANQMQELSDFAQSKGFQANDSFQDIASGISFKNRKQFFKMLDLILAGKVKRVIITRKDRLSRVGFELFEYLFQNYGTEIDVISDEMNPKTDEQELFEEIISLLHCFSMREYSHRRAERKLFEATLNQKEKTK >NZ_CP045642.1|WP_046813928.1|1663966_1664467_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNIPENAWVKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQGFNIGKTLLNAAENELKRMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYSHKLLV >NZ_CP045642.1|WP_046813927.1|1665808_1666255_-|hypothetical-protein MINNWVSSSKELQLLVDDYLLTVNYRSVIENDLVNYTQGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPESYRELLSEHVGNTDDWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKIFGFMVRIFILQKLGITIDKPKILNKFKNVLTAHYY >NZ_CP045642.1|WP_003626883.1|1666613_1666817_+|cold-shock-protein MQTGTVKWFNADKGFGFITGSSDNKDVFVHFSAIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGSRGPQATNVVPQ >NZ_CP045642.1|WP_003626886.1|1668865_1669657_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MQMKIKVALAQFNIQFADPDKNQQRVAELTSIAAKAGADVIVFPEMWNIGYALNQLDRLADDGGRTTTKLFYRLARQYQISIVGGSVAVKEGGHFYNRTLIVDPLGQVVGKYDKVHLFRLMNEHRYLTAGNQENYFRLAGVPSASFICYDLRFPEWIRTVARHGSAVLYFPAEWPAVRIPQWTTMLKARAIENQAFVVAVNRVGDDPDNHYNGHSLAIDPLGNVIADAGENDGITYAELDLTQLATVRGAIPVFVDRRPDLYK >NZ_CP045642.1|WP_046813926.1|1669677_1670856_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MEFQQSKLLGRLPKQFFASLVAKVNHKIESGVDVINLGQGNPDKPTPEYIVKATQKWVADPATHKYSPFQGLPEFKQAAADFYAEKYGAHFDPEKEVAILGGSKIGLVELPWALMNPGDTYLLPDPGYPDYFSGAALGGVKFETVPLLAKNNFLPDLKAIPEAVAQRAKFFYLNYPNNPTGAVATKKFYEELVSWAKKYHVGIISDFAYGALGFDGQAPRSFMQTPGAKDVGIEFYTFSKTFNMAGWRIAFAVGNQDIIGALNLIQDHLFVSLFPALQRAAIDALQGSQRDAEIAKIVGRYEERRNAFVDAAEKIGWHAFVPKGTFYAWMPVPAGYTSESFADLLLDKAGVAVAPGNGFGKHGEGYVRIGLLIEPARLKEAVARIAKLHLFD >NZ_CP045642.1|WP_046813925.1|1670874_1671837_+|2-dehydropantoate-2-reductase MTLKYTVLGAGAMGLRFGVLLQELAGAKVDFVDNWAPEVKTIQQQGGVYVSRDHEDRHLVPIKIYSPEDYHGDPDVFIVFAKQMTLADLLKRSAHFFHPDHQYVFSGMNGMGHIEKINQYFPKEHVVAGTCLIGTVLNKAGDVDFIGKSGAGSINMAAQTEKADDRVKQIVADFTAANINPHLNNNFLGTLLTKVVFNSVINTICTLFEIQMGQFIDYDGSEKLGKQLINEAYDVAERAGIQLLSTREEEWQTIKYVSSVTNPLHYPSMYQDMSKDRPTEVDYINGYIYQLGKKYNYEASTHDFLRNLVHLAENTRKFRK >NZ_CP045642.1|WP_153245816.1|1673278_1674682_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MEKNQIIDLEITDLSYEAMGVAHYNGMTVFVTNALPGEVVSAKILKVKKNFAFAKIEKIKKESPDRVNVKLNQGVQSGLASLAHIKYDKQLDFKRNQVVNLLKKAHLENIEVGETLASPEEVGYRNKAQVPVREVNGQLEIGFFRRHSHDLMPLTHFFTTDSEIDRVLVAVRDILRKYKVPAYDEINNNGEVRYLEVRRSKSTGEMMVILVCLHKDFMQLPNVAAEVSQIPGVSGLILNHNPKKTNVILGPKDYLVFGNDQITDQIGDLKFRISPQSFFQINSLQTPRLYNLAIKQADLKPDDVVIDAYSGIGTIGLSVAKHVKAVRGIEVVRDAIKDAKDNAKLNDITNAKYYLGKAEEIMPRWAKSGLKTDVVFVDPPRKGLTPEFIDAAVKTGPKKIVYISCNPATLVRDLQLFQEKSYEFNRIDPVDMFPQTPHVESVTVLERTEKKQPAFLINHLILYYYNT >NZ_CP045642.1|WP_046813923.1|1674993_1676370_+|Na+/H+-antiporter-NhaC MKKEKVSFTESIIILIALLAILGISVIKFGLSPEVPVLFTVLLLTFWARFRGFTWKDVQDGIKEGIGVAIIPIFIFILIGALIGLWIKAGIIPSIMVLGFHLISGSFFVPSVFIACAIVGVAIGSGFTTISTVGIALFGIGASMNANLALVAGAIISGAVFGDKMSPLSDSTNLSSAVAESELFAHIKNMMWSTIPSFIVSLILFWILGNSGHMDPTKIERTSHVLQTNFSISWWAVVPIVFMLLCAWRKVPAIPTLFINIAATVIMIFVQNPHESVQSLNNLIMNGFVAKTSDASVNALLTRGGISSMMATVALIISTLSLGGMLMKFNVVQSAMEPLVKHLRKPGRLITVTILSGICINLFVGEQYLSVILPGRAFKPAFDKIKLSPLALSRVLEDGGSVINYLIPWGVAGSFAATTLGVPVLQFLPFVFFSLLSPVFSIISGFTGIGLKWAKDKK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642_2 | 2.1|545784|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 545784-545820 | 37 | NZ_CP045642.1 | 1366280-1366316 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP045642_2 | 2.11|546441|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 546441-546476 | 36 | NZ_CP045642.1 | 2079230-2079265 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP045642_2 | 2.27|547497|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT | 547497-547532 | 36 | NZ_CP045642.1 | 1262351-1262386 | 1 | 0.972 |
1. spacer 2.1|545784|37|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1366280-1366316, mismatch: 0, identity: 1.0
caatgtcagaattttcatacaaaaatcctaaaaactt CRISPR spacer caatgtcagaattttcatacaaaaatcctaaaaactt Protospacer *************************************
2. spacer 2.11|546441|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2079230-2079265, mismatch: 0, identity: 1.0
tgctaagccttcgatcatctcataatcaatatctgc CRISPR spacer tgctaagccttcgatcatctcataatcaatatctgc Protospacer ************************************
3. spacer 2.27|547497|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1262351-1262386, mismatch: 1, identity: 0.972
attagtagctgactacaattccttacaatctaatca CRISPR spacer attagtagctgactacaattccttacaatcgaatca Protospacer ****************************** *****
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642_3 | 3.1|1451171|33|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder | 1451171-1451203 | 33 | NC_005355 | Lactobacillus prophage Lj965, complete genome | 10515-10547 | 3 | 0.909 |
| NZ_CP045642_3 | 3.1|1451171|33|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder | 1451171-1451203 | 33 | AY459535 | Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome | 10515-10547 | 3 | 0.909 |
| NZ_CP045642_2 | 2.5|546047|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 546047-546082 | 36 | MN855636 | Bacteriophage sp. isolate 140, complete genome | 936-971 | 7 | 0.806 |
| NZ_CP045642_2 | 2.19|546971|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 546971-547005 | 35 | NZ_CP019991 | Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-3 | 15682-15716 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP045642_2 | 2.33|547920|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 547920-547954 | 35 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 35302-35336 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP045642_2 | 2.20|547036|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 547036-547070 | 35 | MN694447 | Marine virus AFVG_250M387, complete genome | 11213-11247 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP045642_2 | 2.30|547721|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 547721-547755 | 35 | MN694447 | Marine virus AFVG_250M387, complete genome | 11213-11247 | 10 | 0.714 |
1. spacer 3.1|1451171|33|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder matches to NC_005355 (Lactobacillus prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
ccagagggggtaacgattcgttcacccttttta CRISPR spacer ccagagggggtaacgattcgttcaccccttaaa Protospacer ***************************.** *
2. spacer 3.1|1451171|33|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder matches to AY459535 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
ccagagggggtaacgattcgttcacccttttta CRISPR spacer ccagagggggtaacgattcgttcaccccttaaa Protospacer ***************************.** *
3. spacer 2.5|546047|36|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855636 (Bacteriophage sp. isolate 140, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtcaacaatggtattagtggaattgacaaggtatt CRISPR spacer gattaatcgtggtattactggaattgacaaggtatt Protospacer ..*.**. .******** ******************
4. spacer 2.19|546971|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019991 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-3) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttcaaa----aaaagtagaaaactacaaagagcttgct CRISPR spacer
----aaaaagcaaaagaagaacactacaaagagcttaac Protospacer
*** ***** **** **************. .
5. spacer 2.33|547920|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctatctatatcctttcttttggtcgttggacttt CRISPR spacer tttatctatatcctttcttttaatcgtttaatgaa Protospacer *.*******************..***** .*.
6. spacer 2.20|547036|35|NZ_CP045642|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694447 (Marine virus AFVG_250M387, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgcttagcagtataagtatgtttatttagatcatc CRISPR spacer gtcttagcaatataagtatttttatttacttgtgt Protospacer *******.********* ******** * .
7. spacer 2.30|547721|35|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694447 (Marine virus AFVG_250M387, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgcttagcagtataagtatgtttatttagatcatc CRISPR spacer gtcttagcaatataagtatttttatttacttgtgt Protospacer *******.********* ******** * .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
198457 : 267671
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045642|198457:267671|DBSCAN-SWA 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58 | Lactobacillus_virus(11.11%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
372870 : 382544
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP045642|372870:382544|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP045642|372870:382544|374598_376221_+|WP_003627769.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSENARRSLLKGVDKLADTVKTTIGPKGRNVVLEQSYGNPDITNDGVTIAKSIELKDRYENMGAKLVAEAAQKTNDIAGDGTTTATVLTQAIAREGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATKAAVDELHKISHKVESKDQIANVAAVSSASKEIGALIADAMEKVGHDGVITIEDSRGINTELSVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILITDKKISNIQDILPLLQEIVQQGKSLLIIADDITGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAQLQDIAALTGGTVITEDLGLELKDTKIDQLGQARRITVTKDSTTIVGGAGSKEAIDERVDTIRKQIEDSTSDFDKKKLQERLAKLTGGVAVIHVGAATETELKERRYRIEDALNSTRAAVDEGYVAGGGTALVNVEKAVREVKGETTDEQTGINIVLRALSAPVRQIAENAGKDGSVILDKLEHQENEIGYNAATDKWENMVDAGIIDPTKVTRTALQNAASIAALLLTTEAVVAEIPEPKQAAPQGGAGAPMGM >NZ_CP045642|372870:382544|372870_374022_+|WP_046813870.1|integrase|DBSCAN-SWA MNNDIKEYTTPSGKKRYKFAIYVGKSEVTGKSIQARKRGFKSYEDALKCYALISSKIADNTYTGLEIKNHKVSDVYRVWLESYKDTVKTSTLVNVKQFFKNHILKDLGSYYIERLTPFKCQRVAQKWALELPKTFNALIIYSNKLLDYAVRFDYIRKNPMRMIIKPKKQAEHKEFTDFYTKQELNAFLKASKNENIKIYTFFRLLAYSGMRKGEALALKWSDIDFTSNTISINKTVSIGNKHRVVVNNTTKTKRNRAISMDARTMQLLKEWRFQQRQDLLRLGFNPFDKEQVVFQNFDNEVVRPNLVAVWNKRICDKNGLRRIKIHGFRHTHASLLFDAGVPMEDVKQRLGHASIQTTMDIYTHVTKDKQDKTALSFAQYMEN >NZ_CP045642|372870:382544|376403_378980_+|WP_153245832.1|DBSCAN-SWA MMEQYYEIKKQYPDAFLFYRVGDFYELFEDDAVKGAQILELTLTHRSNKTKNPIPMAGVPHMAVDTYVNTLVEKGYKVALCEQLEDPKKAKGMVKRGIIQLVTPGTMMNEGPNDAKDSNYLTSVVTTKSGFGLAYSDLSTGEIYSTHLKSFAAVSNELLSLRTREVVYSGPLTEQNKDFLHKANITVSAPTPIEGEHAEISYVEQNLTNGAEKSATRQLVGYLLSTQKRSLAHLQIAKSYEVNQYLQMSHTVQNNLELVASAKTGKKMGSLFWVLDKTHTAMGGRLLKQWLARPLLNVDIINHREKMVQALLDGYFTRENIIDALKGVYDLERLTGRIAFGNVNARELLQLSRSLQAVPVILDALNQSDSDVLIDFAKKIDPLKGVAELISTTLVKDPPLLTTEGGLIRDGVDKQLDRYRDAMNNGKKWLVQMETDERQKTGIENLKVGFNKVFGYYIQVSNGNKSKVPLDRYTRKQTLTNAERYITPELKEHENLILEAQTRSTDLEYDLFVQLRDEVKKYIPALQKLGNQLAALDVYCSFATVAEQNNYCRPSFHTDSQDIDVVNGRHPVVEKVMTAGSYIPNDVKMDSATNIFLITGPNMSGKSTYMRQMALIAIMAQVGSFVPADSAALPIFDQIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMSEANDALQYATKRSLVLFDEIGRGTATYDGMALAGAIVKYLHDKVGAKALFATHYHELTSLDETLDYLKNIHVGATEENGKLIFLHKILPGPADQSYGIHVAQLAGLPRTVLREATKLLKRLEAQGSELAPVSQQLDLFAQPEAASDEVDDNDSENSPMTDAEQEVLDDISNLYLADKTPLQIMQMVANWQKDLKDDK >NZ_CP045642|372870:382544|378979_380890_+|WP_046813872.1|DBSCAN-SWA MAKIHELSENLTNQIAAGEVIERPASVVKELVENSLDAGATRIRVDFIDAGLKQIVVQDNGTGIARDQVDLAFTRHATSKISNEHDLFKVSTLGFRGEALASISAVSHVEIVTATENAIGIKADFSGGSKKGQEDAASQKGTKITVQDLFFNTPARLKYLRSPRTEIMKIVDIINRLSLGYPHVSFTLSNTGKVLFRTTGNGNLKQTVANVYGRHIAEKMESFEAKDSDFKITGLMSKPELTRSTRNFISILLNGRYIKNFQLSNAIMDGYGSKLAARHYPIVVIAIHVDPLLVDVNVHPTKQEVRLSKEKELSRLITGAISDALLDKTEQSSGFANLENKRETLVDQLEFNLNQDVVNTTRKMPEVHEEAEKPEFLVKQEAKNSEEPKNETEHNYVDINIPREDDQYIITKTWDKNVALQQKLMPFSNKKVDQEVISTGDETLANNLPRLAYVGKIDTYLLAENDGDLYLIDQVAARRRLQFEQIYQTITSKKIVQQGLLTPIVLEFGNLDFLQIKDKIYQIKQLGIYLDEFGQNSFIVRSYPTWIHDHVEESIREILDNYLNLDKGKTQNLFKRVAALEAKRSVKGKINLSAAEGTQIITDLRKTSDPYHDADGRLILVRISQNELRKMFKKGE >NZ_CP045642|372870:382544|381527_382544_+|WP_003627765.1|DBSCAN-SWA MVENEDAVTSGEVENSEEEAMELSLRPQTLDQYLGQKRVKKEMSIYIKAAKQRDEALDHVLLYGPPGLGKTTLAFVIANELGVHLKSTSGPAIEKAGDLVALLSDLDPGDVLFIDEIHRLAKPVEEVLYSAMEDYYIDIVIGEGQTTHAVHVPLPPFTLIGATTLAGQLSAPLRDRFGIVEHMQYYTIDELEKIVQRSSDVFHTSIAPEAAHELARRSRGTPRVANRFLKRVRDFAEVKGEKTISLATTEGALKQLQVDDEGLDQTDRRLLRTMIEGYNGGPVGIRTLAANVGEDMETIESLYEPYLLQHGFILLGPRGRMVTDKAYLQLGLPVPGDK >NZ_CP045642|372870:382544|374271_374544_+|WP_153245665.1|DBSCAN-SWA MGDRVIVKVKDEEEKTVGGIVLASNAKKKPTEGEVVAVGEGAYASNGEKIPMSVKKGDVVLYDRYSGTNVEYEGEKYLVLHEKDILAIAK >NZ_CP045642|372870:382544|380891_381479_+|WP_153245666.1|DBSCAN-SWA MYEYFEGIVTVITPSYIVVDVNGVGYKVYSPTPFAYQKGDKAKIFIEQVVRDTGITLYGFQSEDDKELFLKLLSVSGIGPKSALAIMAAEDANSLAEAIEQGEVKYLTRFPGVGKKTASQIVLDLKGKLRDYVARLDRQDKNKEISPALNDALLALIALGYTQKELDRITPKLEEVNADTADQYIKKGLALLLKK |
7 | uncultured_virus(50.0%) | integrase | attL 366600:366628|attR 374094:374122 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
388335 : 475653
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP045642|388335:475653|DBSCAN-SWA AATGAAGAAACTAACTAGTTCAGAGTTTCGCCAAATGTTCCTTGACTTCTTCAAGGATCATGGCCATATGATTATGCCAAGTGCATCACTTATTCCACAAGATGACCCAACTCTTCTTTGGATTAACTCTGGTGTTGCTACTATGAAGAAATATTTTGATGGTTCAGTTGTACCAAAGAACCACAGGATTACTTCTTCTCAAAAGTCAATCAGAACTAACGATATTGAAAATGTTGGTAAGACTGCTCGTCACCAAACTTTCTTTGAAATGCTTGGTAACTTCTCAGTAGGTGATTACTTTAGAGATGAAGCTATTCCTTGGGCTTGGGAATTCTTAACTAGTCCTAAGTGGCTTGGCTTACCAAAGGAAAAGCTTTACTGTACTGTTTATCCAAAAGACGTTGATTCACAACGTGTCTGGGAAAAAGCTGGTATGCCAGCAGACCATATTGTTAAGTTAGAAGACAACTTCTGGGATATTGGTGAAGGTCCATGTGGTCCTGATACTGAAATTTTCTACGACCGTGGTCAAGAAAACAACGACGTTGCTGAAGACGATCCAGAAAACTTCCCAGGTGGTGAAAATGCACGTTACCTTGAAATTTGGAACATCGTATTTTCACAATACAACCACTTGCCAAATGGTAAGTACGTAGACCAACCACACAAGAACATCGATACTGGTATGGGGCTTGAACGTGTACTTTCAATTTTGCAAGATGCACCAACTAACTTTGAAACTGACTTATTCTTGCCAATTATTCATGCTACTGAAGAAATGACTGACGGTAAGAAATACGGTGAAAACAAAGAAGACACTACTGCATTCAAGATTATTGCCGACCACGTTCGTGCCGTAAGTTTTGCTATTGCTGATGGTGCTCTTCCATCAAACTCAGGTCGTGGTTACGTTCTTCGTCGTTTGATCCGTCGTGCAGACCTTCACGGTCAACGTTTAGGCATTAAGGGCGCCTTCCTTTACAAGCTTGTACCAGTTGTTGGTAAGATTATGCAAAGTCACTACCCAGAAGTTATGGATCAACGTAGTTTTATCGAAAACGTAATTCAAAACGAAGAAGAAAGATTCCAAGCTGCTCTTGATACTGGTTTGACTTTGCTTGATGACTTAATTGATAAGGCTAAGAAGTCAGATGACAAGACCATCTCAGGTAAGGATGCCTTCAAGATGTTTGATACTTACGGCTTCCCATACGAATTAACCTTTGAATCAGCTCAAGATGCTGGCCTTAAGGTTGATAAGAAGGGCTTCGATGCTGAAATGCAAGCTCAAAAGGAACGTGCACGTAAGGCTCGTGGTGATCTTCAATCAATGGGTCGGCAAGATGTAACTTTGATGAACATTAAGGACAAGTCAGTCTTTGAACGTGACACTTATGAAGAACCACATGCTAAGCTTCTTGACATCGTTGTTGACGATAAGTTAGTTGATAAGGCTGATGGTGAACATGCAACCTTAGTCTTTGACAAGACTCCATTTTACGCAGAACGTGGTGGACAAGTTGCTGACCACGGTAACATTTATGATCAAGATGGTGAACTTGTTGCTAAGGTAACAGATGTCCAACATGCTCCAAATAACCAAAACTTACACTTTGTTGATCTTATTTTGCCAATGGAAAAGGGCAAGGAATATGTTTTGAAGATCGACAAGGAACGTCGTGAAGGTTTACGTCACTCTCACTCAGCAACTCACTTGCTTCACGCTGCACTTCGTCAAGTTTTAGGTGAACATACTCACCAAGCAGGTTCATTAGTTGATCCTGACTACTTGAGATTTGACTTCACTGCTATGGAACCAATGACTCCACGTGAAATTAAGTCAGTCGAAGAATTAGTTAACCAAAAGATTTGGGAAGCTATCGATGTTAAGACTACTATCACTACACCTGAAGAAGGTGAAAAGATGGGTGCCTTAGCCCTCTTTGATGGTAAGTACGGCGACAAAGTTCGTGTTGTTCAAATGGGTGACTTCTCATCAGAATTCTGTGGTGGTACTCACTGTTCTAACACTAACCAAATTGGTATTTTCAAGATTATTTCTGAATCAGCTGTTGGTGCTGGTATGCGTAGAATTGAAGCTGTAACTTCAAAGAAGGCATACCAATACTTAGCAAACCGTTCAAGCTTGCTTGATGATATTCAAGCTGATGTTAAGGCAACTAAGCCAGATAACATCATTGATAAGATTGACTCACTTGAAAGTGACTTGCATGACAGTCAAAAGCAAGTTGAAGCATTGACTAAGCAAATCAACCAAGCTAAGGCTGGTCAAATCTTTGACGATGTAAAACAAGCTGGCGATTTGACTGTAATTGCTACTGTTGCAGATGTTAACGGCATGAACGACCTTCGTGAACTTGCTGATAACTGGAAGAGCGGCAACAAGTCAGATGTTTTAGTTTTAGCTGCTGAAAATGATGGCAAGGCTAATATGATTATTAGTTTAGGTCAAAAGGCTTTGGACAAGGGTCTTAAAGCCGGCGACTTAATTAAGAAGGCTGCTCCAATCTTTGGTGGTGGCGGCGGTGGTCGTCCTAACATGGCTCAAGCTGGTGGTAAGAGGCCAGAAGGTCTTAACGATGCTATCAAGGCTGTAATCGAAGAAATTTCTAAGAACTAAGAATTAATTAATTGTGTTTAAGCTTTTTTTCAAGTAAAATTGTTGGCAGGAGGAATAAATATGAGTTCGCTAGATAAGACTATGCATTTTGACTTTAATCAAAATAAAGGAAAGAATGTTTATGACACTCTGCAAGATGTTTACAATGCGCTTGAAGAAAAGGGCTATAATCCTGTCAACCAGATTGTAGGTTACTTACTTTCTGGCGATCCTGCTTATATTCCACGGCATAATGATGCCCGTAACTTAATTCTTAAGCACGAACGTGATGAAATTATTGAGGAACTCGTTAAGAGCTATCTTGGTAAGAATAAATAATGCGATTATTAGGTTTAGATATAGGCTCTAAAACTGTGGGTGTTGCGGTCAGTGATGAGTTAGGAATTACTGCACAGAAGTTAGAAACTATTAAGATTGATGAAACCAAATATAATTTTGGCATGCGTCCATTGAAGAAGTTGGTTAGACAATATGAAGTAGATGGCTTTGTATTAGGTCTACCTAAGAATATGGATGGCACTTCGGGAGCTTCAGTAACCCGCAGTAAGGCTTATGGCAAAAGACTCGAAGAAAAGTTTGGCTTGCCCGTGCATTATTCTGATGAAAGACTAACAACTATCGAATCACGCCGAGTACTTGTAGAAGATGCAGGTATTCATGATCGTAAGAAACGTAAACAAGTGATTGATCAGATGGCAGCGGTGCTCATATTGCAAAATTATTTGGATTTACACCGAAAGGATTAATAATGGCAGCACAAGTTAATGGTGACGATAAAGATCGTCAAATTACTTTGATCGATGATCAAGGTAATGAAGAATTGTATGAAGTATTATTTACTTTTCATTCAGATGATTATGATAAGTCATATGTGCTTCTTTACCCAGCCGCTGTTGGGGACGACGAAGATATTGAAGTACAGGCTTTCAGTTATGATGCAGATGACGCAGGTGATGTCACAAGCAGTGATTTGCACGAAATTGAATCTGATGATGAATGGGACATGGTACAAGGAGTTTTAAATACTTTCTTGGATGATGATCGCCTAAGTGGTAAATAATAAAAAAAGGACTAGCTGCGGCTGGTCCTTTTTGTTAGTTTTTGAAAAGAAATATAGATAGCTAATGAATGATAAAATTTTAAAAATCTTAGAGTTTGGCGAAATTACTAAAAGATTAAGCAAATTAGCAATTACCGCTCCAGCTAAAGAGGCAGCACTAAAATTGCGACCAAGCAGTAATTTTGACCAAGTACAAAATGAATTAAAGCAAACGTTGGCATTGGCTGACTTATTGCGAGTTAAAGGACGGCTTCCGTTAACTGACTTTCAAGATGTTCATCCTAGTACTAAAAGATTGGGCGTTAAGGCAAATTTAAATGCACAAGAGCTAGGGAATTTGCTTCTTGTTTTAAGTTTAGCTAATGAAATCAACGAATTTCTGGAAGATGTTGATGATGAAAAGCTTAACTTATCAGCTATTGATTCAGTTTTGGATCAGCTAGATGTTCCAGATCTTTTATTTAGAGAATTAAAAAAGTCAGTTGACTATGATGGTGAAGTACTTGATACTGCTTCAAATGCATTAGCGCGTTTGCGTCATGATATGCGCAGCAATGAAGAAGATATTAAGAATCGGATGGATGCTTATACTAAAGGAAATAGCAGTAAGTACTTATCTGAACAAATCGTTACTATTCGTGATGATCGCTATGTTATTCCGGTTAAGCAAGAATATCGTGGCAAGTTTGGCGGTGTGGTTCATGATCAAAGTGCCAGTGGTCAGACTTTATTCATTGAACCTGAAGCAGTATTGAATTTAAACAACCGCCAACAGAATTTAATTGCTCAAGAAAAACAAGAAATTCGCAATATTTTAAAGCATTTGTCTAGCTTAGCTAGAGAAGAGATCAACAGCATCAATAATATTGCCAATTCATTGACTCGCTTAGACTTTTTACAGGCAAAAGCAAAGTTAGCTAAAGAAATGAAGGCCAGCGAACCTAAGTTGACTCAGGATCATTCGTTAGAATTACGGAATGCACGCCATCCGTTGATTGATCCAGAAAAAGTTGTTCCTAACGATATTCGCTTAGGTGGCGATTATGACACAATGCTGATTACTGGGCCAAACACTGGTGGTAAGACTATTACTCTTAAAACCGCGGGGTTGTTGCAATTAATGGCTCAGTCTGGTCTATTTATTCCAGCTGAAGAAGGCAGCAAAGTTGGCGTATTCAAAGAAGTTTACGCTGATATTGGTGATGAACAATCAATTGAACAATCATTAAGTACTTTTTCATCACATATTAATGACATCATTGCCATTATGAAAAACGTAGATAAAGAAACTTTGGTTTT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58 | Staphylococcus_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
740375 : 824833
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP045642|740375:824833|DBSCAN-SWA 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95 | Lactobacillus_phage(59.09%) | integrase,head,capsid,transposase,holin,tail,portal,tRNA,terminase,protease | attL 741891:741907|attR 788088:788104 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
859859 : 917984
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP045642|859859:917984|DBSCAN-SWA 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70 | Lactobacillus_phage(50.0%) | transposase,integrase,terminase | attL 874642:874658|attR 888442:888458 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1258726 : 1305741
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP045642|1258726:1305741|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP045642|1258726:1305741|1289635_1290064_-|WP_046814053.1|DBSCAN-SWA MINRVVLTGRPTKNLELRSTKSGANVCSFTLAVDRNFKSKNGEREADFISCIAWKKTAEVMSKYVKKGSVIGVDGRIQTRSYDNRDGQRVYVTEVVVEDFSFLGGADKDSQVSKNNQSSPNQSNDPFDSSEPTGIADDDLPF >NZ_CP045642|1258726:1305741|1267638_1268670_-|WP_046814071.1|DBSCAN-SWA MNKKEKPKNKSKPYKGRKKTTAEIKISKKVDDLEKKAEYAHRNALQANKKSLDFAEMAFNAKNAKDKAKYSRLTAKYLDKYKACIKKYKNYKRQINKARTKKRRVVKTRTTDQSAMASIIQEHSKEFTGEGNMAIFPTKNGQESDVVFFAPVNTESESNSSNVTSYAVDQGAPRKSYARFSSKTVTIDGLIADADTGTAHDKWVKLRTWHSNHEELTFSGDIYYKHLIISQLDRQFTGYQNTMQVSITFTFVRAAEITTSNQKKKHAKRSKSSKTVAGNRKKKYTAITIKQGDTLWGLAQQYGTSVSWLQKVNHIKNPNRIFAGNPIYVNDRKHKAKSKVRVK >NZ_CP045642|1258726:1305741|1265755_1266235_-|WP_046814074.1|DBSCAN-SWA MAQSQNEERKQWYKAMRKFKWGIIAGIQCAFLAKVIKYYEDTHTADIQPLANSSDGEVSAQYLDIPVSENCYMIDEIIKQLKPELTKIDKKCSSNIVEKLPKKRLMRDGVPVVAVVLDRDNDNWKGGRAVNNYVPNSSRLHNANDAIIIGVLGGDAENG >NZ_CP045642|1258726:1305741|1264208_1265390_-|WP_046814076.1|plate|DBSCAN-SWA 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53 | Lactobacillus_phage(46.43%) | plate,integrase,head,transposase,holin,terminase | attL 1267016:1267031|attR 1314112:1314127 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1552862 : 1619159
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP045642|1552862:1619159|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1635491 : 1710127
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP045642|1635491:1710127|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_virus(15.79%) | transposase,tRNA,integrase | attL 1706643:1706702|attR 1714640:1714714 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1716226 : 1786364
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP045642|1716226:1786364|DBSCAN-SWA 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56 | Lactococcus_phage(14.29%) | transposase,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1801082 : 1864924
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP045642|1801082:1864924|DBSCAN-SWA 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51 | Bacillus_phage(15.38%) | transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1922019 : 1984851
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP045642|1922019:1984851|DBSCAN-SWA 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49 | Lactococcus_phage(18.18%) | transposase,holin,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1989230 : 2051397
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP045642|1989230:2051397|DBSCAN-SWA ATTATTGGACTGCTTTATTTAAGACCATATTTCGATATTCTATCGGAGTATGGTTTTTTAGTACCGTTTTGATTCTATCATGATTGTAGTAATGAATGTATTCTTTGATTGCTTGCTCTAATTCATCCATGGTTTTGAATGTTTTTTCAAAGCCATAGAACATCTCACGCTTAAGAATACCAAAAAAACCTTCCATTAAGCCATCATCTAAAGAATTGCCTTTGCGTGACATAGATTGAGAAACACCATGATTTTTAAGCCAAGCTTGGAATGCAGCGTGCTGATATTGCCAGCCTTGATCAGTATGAAAAATTAGGCCATTAAGAGCTGGATGTTTCTTATAAGCTAAATCCAGCATATCCATAACTTGTTTCAATACTGGATGACGGCTTAATGTATAAGCAACAATCTCTTGACTGCAGCCATCCATCACAGGCGATAGATAAAGCTTTTCTCCATTAAGGTGAAATTCAGTAATATCTGAGTACCAATGCCTATCTGGGATAATCGCCGCAAAATGACGTTTAATTAAATTGGACTTGATTTTTCCAATAGTTCCTTTATAGCTTGAATATTTAAATCTACGTCTGATGGTAACGGCATATAAATGCATTTTGACCATTAATCGCTTGACGCGCTTATGATTCACTCTCATACCTTCTCGATGCAATTGAGCAGTAATTCTGCGGTAACCATACCGGTGTCTGTGCTCTTCGAATATTTCTTTAATCCGCTTCATAACTTTTTCGTTTTTTAAATTTTTGTCATCTTTAGTCAAAGTGTAGTAATAATTACTGCGCGACAGATGTGGCAGATCAGGATTGGCATTGATCGTATCAAGCACAAACTTAACGGTTACGTGAAGTTCCTGCCTTAGCTGAGTAACCGTAGTAGCTATTTCTTGTGCTGTTGGTTTTTGGTTCTTTGGGAGACTAAGGCGTTCAATTTTTTTACAAACTCGTTCTCGACAGTAAGTCTTAAGTTCTTCTGTTTTAGGTCTTTTATCTGCCTTTGAAGCTCCTCTATCTGCTTGTCTTTGTTCTTCATGGGTAGGTCTGCCTTTCTTGTGATTAATGACATTATACCCATCTTCTTTATATTTGCGAATCCAATTATGAATTTGTCCACCATTGGATAAACCTAGCTCTAATGATACTCGGCGAGCTGATTCATGAGCAAAAAGGACTCTTTTAATGGCTTTTTCTTTGAACTCTGTTGCATAATTTTCGTATGGCTTATCTAGAACTTTTACTCCATAACGCTCCATTAAGCTTAATACATATCTTAAATTACCAGAAGTAACATTGTATTCTCTACCTAATTGCTCAACTGATTTACCATAATTTTTCCAGCTATTGTAAATATCAATTTTGTCTTGTTTAGATAATTTGGACATAACAAAAACCCCGAAATTCTTGTCCGAATTTCGGGGTTCATATCATATTTTGCAGATTGAGCTTTTTAATTTCTATTCTTAATAATTATAAAACACGTTTAGCAACTGATGGGTAAAAGTACATGCTAATAGCTTGCTTTTTAATACCTTGACCTGGCGTTGCGGCATGAACATACTTGCCATCACCAACATAAATACCTACGTGGTAAGGAGATGAAGTTGAACCCCAGAATAATAAGTCACCTTTTTTAAGATGGTTTAAGGATACGCGCTTACCTTTGTTTACCTGACTATATGTAGTTCTAGGCAAGGTCTTATTGGCAGCTTTTTTATAAACGTATTGAGCTAAGCCTGAGCAGTCAAATGCGGAAGGACCAGTTGCACCGTAAACATATGGCTTACTTACTTGCTTCTTAGCAAGTTTAGCAACTGCGTTACGCTTTCCCTTTTTGCTTGCTGCTTGTACAGTTTGTGATTGATTCAAATTAGGCACATTGATTAAAGATACGCCTGTAAAGAATAATGATAAAACTGCAACTAACTTAACTAAACTACGCTTAAATTCCAATGTATTTCTCCTTAATATTATTTCTTAGGTCAAATGATTCGTTTAATCACTCAACGGTTTATATATTACCCAAGAAATATTACAAAGAGATGTTAAAAAGACTACTATCGAATTAAGCAATTTGACAAAGCTAGTAAAATTTTGTAATTGAGTAATAATTATTTACTTAACTTATTTTGTCCAATCTTATTGCTACGCTTTTTAGGGATGATATTAAGAGCCATGGCAGCTACTACGACAAGGACTGCTCCTACCCAATCCATTGGCATCATAATTAACCCAAAGACAAGTACAGAGCCAATCGTTGCAGAAAATGGTTCGAATGCATCAAGCAGACTAGCAGTTGAAGGGACAACATAGCGCAAGGCATTAGCCATAATTTGGAATGGAATGATGGTACCAATTATTACAACCGCTGCTGTATATAGCCAAACCTCAGACTTATTAGGAATTGCTTGAAATTGTGGCTGAATAATTACTAGGCTAAGTCCGGCAAATAGCATCCCCCAACCAGTCACTACCATACTGGATTCTTTTTTAACAATATTAACAGGAATTAAAGTATAAGCTGCTTCACCTACGGCTGAAAGCAAGCCCCAAAAAAGAGACGCTGGTGTAATTGCCAAATGATCAAACTGACCATGCGTCGACAAAAGAAAAACACCCAAGAAAGCACAAATTGCGGCAATGATATCCAATCTACGCATAACTTGTTTGTGCGTGATAGTCAGGTAAGCCCAAAACAGGACCGATAAATTGTAAAATTGTTGCAATTGATGCATTAGCAACTTTGATACACATAAAATAGAATAATTGCACGGGTAATAATCCAAATACACCATAAGCAATAATCACCCAAGCATCGTGCTTATTTTTTATTGTAGCAATTGGTTTCTGTTTCAAAATTCCAGCTACAATTAACAAAATAATTCCTGAAGTAACCATTCTTCTTTTCCCAATTCTAAACTAGCACCTTCTATACATAGCAAAAAGAAACTAGCAGGGAAATTGGTTTTTGCACAAAAATATCCGCCCAAAGGCGACCACTTCTAAAGTTGATTTAAATGATACAAAGTATAACCAACCGCACCAATTACCAAGCCGATTATATACATCCACCAAAGAACTGGATGGAAGGCTAAAAGGATCAATGAAACAAACATTGTAGCTACGCTTGAATTTCTTGTTAGACGTTTTTTACCAAAAAGCAGACCAAACATAATTCCAGCTGTGGTAAAAACGTAGAATGTATCAGCACTCATCAATATATTTTCAATGATTGCCAATTGTCCTGCTTGAGGTTTACCTGCAATATCTACAAAAATTTCGTAACAAGAAAAAGCCGCAATTGCAAAAGAAAGAATGACAGTGATTAAGCTAATTGTGCGAAAAATAGCTTTTTGCTTTTGAACGGGCGTCTCTTCCATAAATGTTTTCAGGAAGAAAGAACGATCTTTTTTAACGGCTACGACCTTACCAGTCTTCTTGTCATGCCAATTATATGCCCAGCTAATTACAAAGAAAGCCAAAATTAACACGAACTGAATAATCATTAAACGCCAGAAAATTTGAATAGCGAAAACTACTGTAGTCAAAAGTAAAAGAGCATAAATCAGTTCAGCGTAAAGTACATATCTGATACGTTTTTTATCTTTAAATAAGCGTGTAAAAGTTTCAGAATTTGGATCCATCATTACTATTTTCCCCTTCTTTAGAGCTTAGCTCGGTAGGAAAACCATATTCCGATTAAGCTAACTAACATCCCTAATATATTAGTAATCAACAATGGAGATTTTGCCAATAATAAAACAATTGCTAAAAATATAGTGATAACACTGGCTACCCTAATGAATCTCTTATTAGCTGCTAAAATACCGATAGCTAATCCAACCATGATCAGAACATATGCAAAATCCCCATATAACATAATGTTCATGGCTGTGTCACTAAGTTTAAATTTAAATGGCATTTCAAAAAGAATATTCCAGAGTTGATGAGAAAATCTAATGGCACTGCCCAGCGCGATGAAGAAAATTAGGCCTTCAAATAAGCGCAAGAAAAACAACTTAGTGAGCCTAATACTTGTAATGGTCTCCCACAGCGTATCACGCTTTCTCATACGAATAATTGGATCTCCTCGATCAAAGATCCAACCAACTACTAAATATAATGAAATTACGATGCCTTGAACTAAAAGCAAGTGCATGAACATTGAAAAATCATAGAGCAAACTTAGCAATAAAAGAATTACATAAAATAGCTCAAGATAAGCCAGTACTTTGTCAACTTTACGCCGCTTTAACCATGGCTTTAAATCATCTCATCCATGTGGTCGTTCACGATCTCACCTACTTTTAATTTTAATCTAATTATCCATGATTATATTCTAATTTTTTAAAAAATACCAGAAGTTTTCAAAAAATTAAAAATTGCAAAATAAGCACCCATGATTTTTATTCACCTTACTTCATTTCACCTGTATAATTGATTAAAAATATATCCTATCCGATTTTAATTACATTTTAATATTTATAGTATTTTTAGGATATTTTATTTTGATATTGACGCATGAGCGACGGTCGCTTAAATCCGGTTTTATGTCTGTCTTAACACTTTTCAGTCTTGCACTTTTTGCGGCAACTGTACTAGTTAACATTGCAGACCTTGATCCCCATTATAAAGATTGGATTTTGCCGCTTCTTGTATTTGGCTTAGCAGCGGTCGCTTTAGGAGTCACCGTTTTTGCTTTTACTCTGATTATTATGTTTTTATATGATGGCATAAAAATTATTCGTAAAGAAGGCAATCGTTGGACAAATTATTTGTCACTAGCCATGGGAATTGTCATTATTTTCTTTTTGTTCTTCTACCCACAATTAGGCAAATTCAGTCACGATTCATGGCTTGTTTATCCTTATGGATTTTTGTGGCTCGTTATCATCTACTTAGTAACTATTATGATGATGTACACGTTAACCGCCTGGATCAATTTAATCAACTGGCATGTTCCTCATCTTGATTACGTCGTTGTACTTG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MIERYTRPEMGKIWTDENKYAAWLEVEIAATRAWAEQGEVPAADAEKIAKNASFTAERVAELEAVTHHDVVAFTRTVSESLGPEKKWVHFGLTSTDVVDTAQGLLLKQADEIIRKDLHELKETIAEKAKKYKYTVEMGRTHGVQAEPTTFGLKLARWYAEINRDIDRFEHAAKGVESGKISGAVGTFANVSPEIETSVMKQLGLTQQSITSQVLPRDLHAEYIAMLALIATSIENWATEIRGLQRSEIHEVEEHFRAGQKGSSAMPHKRNPIGSENLCGMARVMRGHIVTAYEDVALWHERDISHSSAERVILPDTTIGIDYMLHRFNRILTNLDVFPETMLKNMDRTYGLIYSQRVLLKLIDEAGLSREKAYDMVQKLTAKSWNEQKQFRPLVENSEIMNYLSKEDIDDAFDYHYHLRYVDDIFKKLGLDD >NZ_CP045642|1989230:2051397|2028841_2030356_-|WP_046814556.1|DBSCAN-SWA MIQDVIKRIDEIAEQEPDRVVYDYLGKTNTYGELKQRSNAWAHKIAAMDIPDHAPIMIWGGQTFEVIASFLGCVKSGHAYIPIASYSNAERLTMIQDVSKSPMVLEIDPLPDVDLSDVQVLKASEVEDGDFTVNEDDFVEGDDNYYIIFTSGTTGKPKGVQISHDNLLSFVNWELSDFNLPENPSFLAQAPYSFDLSVMSLYPALVSAGKLVVLPHDVTQNFGQLFQTLPKMQFNVWVSTPSFAQMCFLDKTFDSEHHPDLTHFLFCGEELPHSEADMLKKKFPASHIFNTYGPTETTVAVTQVEITDEVLEKYDRLPIGKVKEDTEITIDTSKGDKPGEGEIIISGPSVSKGYMNNPEKTEAAFFHEDGKKYASYRSGDAGFFNGDMLFYRGRIDFQIKFNGYRIELEEINFYLTKNKYVRYGVAAPKYSKDHTVKQIVAEIELKQGVAHQHSEAALTKEIREDLAKNVMPYMIPQRFVYQDKLPISQNGKVDIKAVIKEVNK >NZ_CP045642|1989230:2051397|2040066_2040696_-|WP_003624995.1|DBSCAN-SWA MKRGMEMLILAIVIILVILGILKVQDMNKVSSEQVVQKVLTNCEFNQVKVDTSNANIKVKQGNHYRVLFEGRQKLLPKVEVKNKRLIVEDKDGIKVVNGNLFDLFKKHSVVPQITIELPNEKLKNIEIDNSNGSVTVQGVAVSQGEIDLSNGNIMVDHSTADGYDLDTSNGHVEINGSNKGDSYSKDDKARRVLSIDNSNGDITVSYGG >NZ_CP045642|1989230:2051397|2010568_2012692_-|WP_003630601.1|protease|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP045642|1989230:2051397|1996342_1996822_-|WP_003625080.1|DBSCAN-SWA MLENGVPPAMIDHLTAGILKKYNDRLLDEVQRILPELDIQEATSLDDPNRNVLEEKAIVHVIARDKKHNKYGLIIQVGSQEPGENILEVANSYQEEIVFGGLGCPEEEFKVAYVVFLCRTDPFGKGKPRYEYYGGKYNKETHQTFSAPNVIFLNLSSKK >NZ_CP045642|1989230:2051397|2027603_2028842_-|WP_023190737.1|DBSCAN-SWA MNFNFINLQPYSNPQYFVYLMIALIPIILGLYFGHRFKTYEAIFSIVFLFLIFDGSHWQQGVNLLIWLVYEFILTFAYQYYRHHGKNKTWVFSLAVILAIIPLAAVKYLTAFPDNSIGFVIGFLGISYVTFKTVQVIMEMRDGAIKKVDPVTYARFLLFFPTISSGPIDRYRRFKKDYEKVPTRDAYITDLQYAVRYLFQGFLYKFVIGWFFGTYWLPKITASALAVGNANGGLKLSWWVLAYMYCYSMYLFFDFAGYSLFAVSISYFMGIHTPMNFNKPFISKNIKDFWNRWHMTLSFWFRDYIYMRFTFFAMKKKLFKNRNRLSQVSYFLLFLIMGFWHGLTWYYIVYGIFHAAAICINDAWLRFKRKHKKQIPHNKFTEWFAIFLTFNVVCFSFLIFSGFLSQLWFGWK >NZ_CP045642|1989230:2051397|1995007_1995595_+|WP_046814545.1|DBSCAN-SWA MERIALIGPNGIGKSTLLNLIRNKIQPDHGRIIHHGEINYIPQIDYTDTINNFKSAGEKRLTLIENTIWLPGSLLLLDEPTVYLDENNFENLLYLLKNYNGALLVASHDLDFINRLCQKTIILQPNKVIHFPGNYSQYLEQHQINNQSVINFNEKRELLQHKINDKIIALQQKSNNYNHFKSQKDSTRPFYLAQS >NZ_CP045642|1989230:2051397|2023897_2024623_-|WP_046814554.1|protease|DBSCAN-SWA MYANLGALAFLIAACYMTYCWDHRLNPNLKFKTSSNWSYLVLTVLIIFVIWDILWNICSGAMSRFISQAFLQSSFCFAWKPFFDAISTGVSEETFRYLSIVTLLECLKETKHQVTFVVIISAMIFGAFHLLNVMDEPFIAAISQVIMAFVRGLVLAIIYLYTGKLWAMMIIHGMYDYFMFLQPIGISTSNSIFIIYCVIEVIIPILLTIWMLTGKRYKVLQANARRIKLRQNFSFYKVPIL >NZ_CP045642|1989230:2051397|1996919_1997282_-|WP_003625077.1|DBSCAN-SWA MKKFVSFTIRLIVLLAGIALAGFMVWQFFTDASMLDVDIQTQGPVIIVIFSLVALIALGASVSFFTDKNMGSTIFLGALLTVIALILWLKNQDLADIYRWYFIYGLLVAVLCPFFRKDTK >NZ_CP045642|1989230:2051397|2018539_2018776_+|WP_003625040.1|DBSCAN-SWA MPRKHFELNSDIAKLIDKYNEINDTDFNELVNKALRFYLVNQMSYKDVQDALKETDVETSRYVDEAMRSSMGDINRNY |
53 | Lactobacillus_virus(11.76%) | transposase,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP045642.1|WP_046814052.1|1290260_1290701_-|hypothetical-protein |
1290260_1290701_-
Protein sequences of NZ_CP045642.1|WP_046814052.1|1290260_1290701_-|hypothetical-protein>NZ_CP045642.1|WP_046814052.1|1290260_1290701_-|hypothetical-protein MDYRDIEKEIVDGKMKCVMAKYRVAQEIPINIMLTTGKHYYAMLDSSMTWREIKQIYYRGYIGDDELVDFKKILSHDSYKNLSKFRLKNGKSILIRNSQIIGMIFDENVIMANINDFASELEKIANEYNLSDEEIDKYEIDNYLGW |
146 aa aa | NA | NA | NA | 1258726-1305741 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.27|547497|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045642 position: 1262386-1262351, mismatch: 1 attagtagctgactacaattccttacaatctaatca CRISPR spacer attagtagctgactacaattccttacaatcgaatca Protospacer ****************************** ***** |
||||||||||||||
| NZ_CP045642.1|WP_046814044.1|1294373_1294619_-|hypothetical-protein |
1294373_1294619_-
Protein sequences of NZ_CP045642.1|WP_046814044.1|1294373_1294619_-|hypothetical-protein>NZ_CP045642.1|WP_046814044.1|1294373_1294619_-|hypothetical-protein MMQEEDLRKTKLDHVLSYIVIAAMKFLEFTSILFLPLLVVQQLVIFNHPYKAILFLLVLLILSSAYLAHLLKSRKDKKNGR |
81 aa aa | NA | NA | NA | 1258726-1305741 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.27|547497|36|NZ_CP045642|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045642 position: 1262386-1262351, mismatch: 1 attagtagctgactacaattccttacaatctaatca CRISPR spacer attagtagctgactacaattccttacaatcgaatca Protospacer ****************************** ***** |