Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP045700 | Vibrio sp. SM1977 chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP045699 | Vibrio sp. SM1977 chromosome 1, complete sequence | 1 crisprs | cas3,DEDDh,cas5f,cas7f,cas6f,csx1,DinG,csa3,RT | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP045699_1 | 967831-967918 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP045699_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP045699_1
>1.1|967859|32|NZ_CP045699|CRISPRCasFinder GCACTATCTCAAGAGCAGATCAATTGGATGCG |
cas6f,cas7f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP045699_1
The CRISPR arrays of NZ_CP045699_1 >merge|NZ_CP045699|1|967831-967918|CRISPRCasFinder GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTAAAAATGCACTATCTCAAGAGCAGATCAATTGGATGCGGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTAAAAAT >NZ_CP045699|1|1|967831-967918|CRISPRCasFinder GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTAAAAAT GCACTATCTCAAGAGCAGATCAATTGGATGCG GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTAAAAAT
>NZ_CP045699.1|WP_153446846.1|967101_967713_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MTQRYYFIVKFLLEDVDAGLLAGRCISTLHGFINNNLTGKNQVGVSFPLWSDDTLGNAVAFVADDKELLIGLSFQPYFSLMKSEELFDLSPVVPVPTDLPEIRFVRNQTIGKSFLGSKRRRMKRAQSRAETMGKLITPQPNEEREFELFHRVPLTSKSTGEEMMLHVQKQSNVEVVDTNFNAYGLATNQAWKGTVPDLKNAML >NZ_CP045699.1|WP_153448147.1|966073_967105_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MKLCKQLNYVRSLSSGKACFFFLDNDQKMQPISIDRTRLRGSKGDYSQAYSGDLKRKNVAPHELAQGNIHFIEECYVPPTVNEIYCAFSLRIKANSLKPEVCSDEEVRVTLTHLAMLYAENGGYEELAQRYAKNILLGTWLWRNRESRGVRIEVLNSEQTSFVIENALKLSWHGSWDKKSTTVLNKLTHYLTQALTSSQDYFYMDIKATISVGWGDEVFPSQEFLDQKENGKPTKRLSTVCLPDELETVAFHAQKVGAAIQCIDDWWQDDADKPLRVNEYGADREYVIARRHSSLNTDFYYLISQAEHWIDVLNQSKTIPDEVHFIMSVLVKGGLFNSSKDSQ >NZ_CP045699.1|WP_153446844.1|963945_966045_+|hypothetical-protein MTKLSELIAIENLTDRQAALKKAFMPYSDLVEVDGNERDALRVLVNLSLTKPECKNWLDKERAKQYLSNPENISIGCDEVKWMHTHNLKFPDCRVAKQRLLAEPLICDESFISSTSVMSSLGWSHNSAVYKHTIWLLNEFMWQGNPTNILCFIAQQDEFWLKVLKSCGLKVAAFKALKNAIEKDLPTSTLPNRVDPFSKQVRFPWNNDYLSITPVVSHVMQVELERMSRQSGRTLKFTTMYFPNSPSIGNLCGSLGGNMKVLHYPIEVQASKKRTFSSSKNQTQCFFDDYQLTNAKFCKVLSHLCGAEALKTRKQRKHVRQYQLRIARKQIGLWLLPLIELRDHIDSELDSHIIDSDDPIIDPFLYGTESKLSELLILLNQRLHQTLQNNRYSSRYAYHPELLSVLKIQLKWILEQLSSPQAAPNDYGDHKVNHDEQEQYIHLSSLRVEDANAMSCPYLCGAPSLTSIWGFVHNYQRQLNQSLDGAATFEFESFAVFIRNENINMTAKLTEPSVLAAKRTLSHAKRPTIIATNLVDIEFDMVIKVRSVGRLSDYGRQLKTSLPTIFSGGALFQPRLDSADNWLCCYQKQSDVFYRIKSLPAYGVWLVPSDLQPTRFSELASILAQDDSLIPISNGYHFLEQPTLRSNSLTSLHAYAENTLGVAKRLNPIDVRFSAKDHFFKQAFWTQHNYSASILIPKA >NZ_CP045699.1|WP_153446842.1|962731_963943_+|hypothetical-protein MEFKFTHYPDETLESFLLRLSQYQGYERFAHFAEDLWHETLEQHEAMAGAFPFELSRVNLYHAQTSSQMRVRVFMHLAKKFELPQFNIMNTPLSHSKAIFSPNYKAVFRNNIDYPFSFLRKRFTPVCSQCLAQSPHIRQQWQFIPHQACHIHHIKLLHHCPECKTRLEYQSTESITQCDCGYDLTMAIPEQAGVSQVQVARWLMGEVVDDAGLMASSISISERYGFLLWYVNRYGELEGINMESFVHYCESWPKGLQQDLNATFNKADMVRVRPWNKTFFHEVFGTLLKDCRQLPNRRINHNPVLMAVLDGLTQLIANNPRNKQANIGDVLLSPLEASTLLSCTTDEIYRLYEFGELKAAVRLKLHSKLASQQSAFTLRSIIEMKLARMCSSSDGMNVYLPDW >NZ_CP045699.1|WP_153446840.1|960864_962610_+|restriction-endonuclease-subunit-S MSNEHSREHNVESLITEHIDIWTSTIKSKSASGRGSSKKIDLYGIKKLRELILELAVRGKLVPQDPSDEPAEVLLERIAIEKAQLVKDKKIKKPKALPEISEEEKPFELPNGWEWSRLGNTGFGSTGKTPNTKKVEYFKGNIPFIGPGQITLNGQILESEKFLSAEGLKNSTECVLGDILMVCIGGSIGKAAIAKQTMGFNQQINAIRALKIRSEYLYLAVSTITFYEELLDISTGSATPIINRGKWEELLVPIPPLQEQHRIVAKVDELMILCDQLESQTEKQLSAHQQLVETLLATLVASENAAELNQNWKRLAAYFDLLFTTEVSIDQLKQTILQLAVMGKLVPQNPNDEPASKLLERIKAEKEQLIKDKIYQKTSKLKPINTDIQYPSNWVSVQTGQVCPSIVPNRDRPKSFTGNIPWVTLPAFPTQGFYLDNTNVELALTALEVQQYSARLIPEKSVLMSCVGRFGLTAINTTSVTSNQQVHAFIVLNGLLPEYLSMVIKVEGKFLENVATSTTIAYLNKTNCESIQFGLPPTEEQHRIVSKADALMAICDQLKTKLSESQQTQLHLTDAIVEQAV >NZ_CP045699.1|WP_153446838.1|959365_960865_+|N-6-DNA-methylase MSISSAIKSIQDIMRKDAGVDGDAQRLGQMSWLLFLKVFDAQEEELELELDNYKAPIPEKYLWRNWAQDSQGITGDALLEFVNDDLFYNLKNFTAPVDLNPRGHVVKEAFSDAFNYMKNGTLLRQVINKLNEIDFTDSSERHLFGDIYEQILRDLQSAGNSGEFYTPRAVTRFIVNRLDPKLGETIMDPATGTGGFLACSFDHVKENYVNTAADHQTLQQQIHGVEKKQLPHLLCITNMMLHGIEVPVQIKHGNTLNKPLSSWDSNINVIATNPPFGGTEEDGIEKNFPSDMQTRETADLFLQLIIEVLDSGDETKAGGRAGVVLPDGTLFGEGVKTKIKKMLTEECNLHTIVRLPNGVFNPYTGIKTNILFFTKGTPTKDVWFYEHPYPEGVKNYNKTKPMKFEEFQAEIDWWGCEEDGFASRVETHQAWKVSIDDIIARNFNLDIKNPYQGEVVNHDPVALLAEYQTQQAEISELRNQLKDILGAALTSGSQSGEQA >NZ_CP045699.1|WP_153446836.1|958288_959284_+|Abi-family-protein MPLTPAKPFKQYDELINILTDRGMHIADTPRAIRKLTQVGYYRLSGFWYPARKIQRDDNQNPINCEFLNRPKRSNHFEPKTQFEQVVNLYLFDKQLRLVMLDGLERIEVYIRSVIAHELGRGKAKMPGSGDDIPDPLAWQDADYINGKFLTRKGNKRSLWSDWQNKHEKLIKRSREDCIVWHQRNDKEMPFWVVIEAWDFGTLSKYYGMLKDKYRQNICAKLGITDKKETDVLRAWLMEMNILRNRCAHHTRIWNQQSSKQLKLTSHAYFDDIRGDENTLSRLYGVMRVMWFLIEQIGPNSTWFKQLNHLIEEFPTVPGCPLSSLGLPNPH >NZ_CP045699.1|WP_153446834.1|955592_958049_+|DEAD/DEAH-box-helicase MTTSINKSKLSETDIITKFILPAVKQAGWDDMTQIRQEVKLRDGKVIVRGQAAARKKVKSADIVLYHKPSMPLAVIEAKANKHEVGKGMQQGLDYANLLEVPFIFASNGDGFIFHDKTNLSQLETEIQLEDFPTPAQLWEKFCIWKGYKTEHLPVITQDYHDDGSGKSPRYYQLQAINKTVEAIASGQDRVLLVMATGTGKTYTAFQIIWRLWKSKAKKRILFLADRNILVDQTKTNDFQPFGPAMTKVTGRTVDPAYEIHLALYQALTGPEESQKAYKQVDPDFFDLIVIDECHRGSASEESAWREILEYFSSASQVGLTATPKETDEVSNIEYFGDPVYSYTLKQGIEDGFLAPYKVVRVDIDVDVQGWRPRKGQTDKDGNIIEDRIYNQKDFDRTMVIDERTDLVAQTITNYLKRTDPMAKTIVFCNDIDHAERMRRALVNLNPEQMAKNEKYVMKITGDDEIGKAQLDNFINPKRKYPVIATTSELMTTGVDAQTCKLVVLDQGIQSMTKFKQVIGRGTRINDKYGKLWFTILDFKKATELFADEKFDGEPERIKVTKPEDFDNPEGITDIVDGVDPEDIIDADYPFGDDIDPDSIHEPDAPFGTPSGDNDPTNTTGGDDWTDEEKIRKYHVNGVQVKALAERVQYYDTDGKLVTESFKDYTRKTIAKQFTSLNDFTKKWQDADRKQAIIDELAEEGIIWQALEEEVGKDMDPFDMICHVAYDMPMLTRKERAENVKKRNYFTKYGETAQVVLSNLLDKYADEGVTEIENIHVLKVKPFDEMGRPLEIIKKGFGGKQAYLEAVNELEAEIYQSA >NZ_CP045699.1|WP_153446832.1|954940_955462_+|hypothetical-protein MKKEKDFIRKFLIENEMSDFTVRDVVNLLMLKDSSFDVRKKTYQYVYRNVCRLETLGRLRSYGFQRHRRFKKLGALYLKESNFELNGLNTIFQDNPILAELDDEKAKAETDLAIVLGEVDEYKTLISRLPKHKSVLQGLIVQTSDKSARLLGKINALSTVIEYSSTNIDDRGV >NZ_CP045699.1|WP_153446830.1|954513_954828_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MQKDNPIPARLKAARKKAKITQKNLGVKIGMEESSASGRMNHYEKGRHIPDIGTLRRMAEELDVPLNYFFCDDDVMAELVCAINKLSDNDKLDLIDTLKKKSNV >NZ_CP045699.1|WP_153446848.1|968135_968540_+|S24-family-peptidase MKVIPISAGAGITGFESPAAEYSQLSLSLDDLLVDHPSSTFLCKACGDSMQNVGIFSQDILIVDRHEVAKNLDVVVANFNGEFVCKIIDMKNRLLLSANEKIQPVAVFDYDQFSIEGVVVRSIRCHRPSYLLAS >NZ_CP045699.1|WP_153446849.1|968544_969705_+|DUF4113-domain-containing-protein MFALVDANAFYCSAEQVFRPDLRGKPLVVLSNNDGCIVAANRQAKELGIPKFAPFFKVRELCEKQGVIALSSNYELYADLSAKMMAVIGRFAPVQHIYSIDESFLSLRHCHQAIPCLLTHGALIRRAVWKECRLPVCVGMGETLTLAKLANHAAKKIEGYQGVCILNNETARQQVLKSVDVSEVWGIGRRLSAKLKVMKVHTAWDLSRLEPAVAQRQFNVEVERIVYLHSLQQALSKHTAIAAYKARQQHSLCKVLMCFAASSPYDVKPVSHKMVHSFAYPTSDTTVLTHTVMAMAKAMFQQGERYYKIGVGLLDLVEGKHAQIDFLNPKPDDPRLMAVFDGLNQRYGTDSVFLAAQGIEHKWAMRRERLSPQYTTKWGDLPVVRC >NZ_CP045699.1|WP_153446851.1|969765_970098_-|DUF1508-domain-containing-protein MSGKFEMYTDAAGEFRFRLKAGNGQNILASEGYTTKASCENGIESVKTNAPDDSRFERKETASGKHMFNLKAGNHQVIGTSQSYASIASRDNGIESVKTNAPSAQVEDLT >NZ_CP045699.1|WP_153446853.1|970293_970446_+|DUF4113-domain-containing-protein MGDALNQRYGTDSVFLVVQGFDEKWAMWRERLSPHYTTWWEGSADCEVLV >NZ_CP045699.1|WP_153446855.1|970586_971516_+|PD-(D/E)XK-nuclease-superfamily-protein MKELNTFQSVNERDVDLLVLEELNVSDSFAQWFVCRVREEITSIKTLGAWHSVVDTNLGESDLVYIYQSDDLSSQAILIENKIDASAQAQQGEIYRLRGNRGLEDGLWQDFRTCIIAPKAYIARNAEPYDAAISYEEIMVYLAAQGDKRGLYKAQTLRDAIEKNRRGYVATVCIKTTDFAQKYLAYASEHFPQLNPEQPKPRANGHDWIHFYPEPINKKIRIIHQIYGKVIKLQFLGQADNFDDIKSHFEGLECSGYRIIKSGKSVNIETPLPEISIAEQSFDSVLEEIGIALNKAQQLHSWMENYHSV >NZ_CP045699.1|WP_153446857.1|971834_972392_-|hypothetical-protein MSLKSNLVKVGCLVVAVVLFLSGYELGASITENRLTRLAYSEMYGWGSPLYSWSVTSNNKVISLKLPSGLRGNSSYIGMSSDRKAPFVIVKEVPSKGLRCLNVESKTIKIKNQFVNVEQQCLANGFVRISPISEEAIAYFQSVLESEEFISFHLSGEYIENFRSKHFMRSFEQYEKEIAALNRVL >NZ_CP045699.1|WP_153448148.1|972864_973347_+|hypothetical-protein MLDRYPQNSKYEALEFSIDGKKILYRKGNVTPDRPGNFLSIWKRPDENSTDPRRTMPYEEHDLDYLFVEVSDCDISKRGIYIFPLTALIDKGVVTSNKAKGKMAFRVFPPWTSSRGELKSKVFSDSAKKTQRWQSHFFLWIEDNEIVDLEKFNNIFSSLS >NZ_CP045699.1|WP_153448149.1|973537_974134_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MVVFKKTKRSGVKKPFRLEEIWRIRTRLEIENSLMQLALLNLAIDSKLRASDLLSLRVCDVSSQDMIFSRVKHIQRKTDIEVQFEITTRTQQSLMKWILISSLNASDFLFPSQRRQQQPISYSYYRYLVRKWASDLGLDSNLYGTHSMRRTKATLVYAKTKNIRAVQLLLGHTKVDNTIRYLGVELEDALLLSEGTDC >NZ_CP045699.1|WP_153446859.1|974408_974879_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MSVNIRSAVISDSKAISELILPLAKKYICPTCDASAHYILLNSMSEENVGKYLSTNYNYVIAVTANDEVVGVAGVRDNSHLYHLFVDDNFQGNGLSRQLWEAVKEESIKNGNSGIFTVNSAVNAESVYSRFGFKRTEGIRNRQGMIDIPMLLDLEY >NZ_CP045699.1|WP_108092694.1|975153_976026_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKVLIAGANGYIGSHVTKMFVESGFEVSTYSRASGVLPDARKLTKVPADLSGYFDIVVNCARPHWSEFSPEEIVDIESKLLTQLDRLAAEGATKIHTSGVWLFGNASHNDLKVFRLKPLDVVKLDAVTIGRAIKKKWHVVYCPSLVYGGENCQLKRIVDSLSDQTIQVAIPSQGHNQYIHVNDIARFYLSLVQGRISSAQHFIAETKGYSPEEFSQLLLDSRIIKKVSKSNWREFENIFGFSAVEIEKLNLKLPVSPLFEPKESLRKYIENYTYKRLRFQDTLSNPNLAC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
611789 : 619853
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045699|611789:619853|DBSCAN-SWA AATGCTTAAGCGTGACATGAATATTGCGGATTATGATGCCGATTTATTTACTGCGATTCAGGAAGAAACCCTTCGTCAAGAAGAGCATATTGAACTTATCGCTTCAGAAAACTACACCAGCCCGCGTGTAATGGAAGCTCAAGGCTCTCAGTTAACCAATAAATACGCCGAAGGCTACCCTGGTAAGCGTTACTACGGCGGTTGTGAGTTTGTTGATAAAGTCGAAACATTGGCGATTGAGCGTGCGTGTGAATTATTTGGCGCAGAATACGCAAACGTACAACCACACTCTGGCTCTCAAGCCAATAACGCGGTTTACATGGCGCTATTAAATGCAGGCGATACTGTTCTTGGTATGAGCTTAGCGCACGGTGGTCACTTAACTCATGGTTCTCCAGTGAATTTCTCTGGCAAACTTTATAACATCATTCCATACGGTATCGATGAAGCCGGTCAAATTAACTACGAGGAAATGGAAGCGCTGGCGATTGAACATAAACCAAAAATGATCATCGGTGGTTTCTCAGCGTATTCTCAAGTTTGTGATTGGGCGCGTATGCGTGAAATCGCCGACAAAGTGGGTGCTTACTTCTTTGTTGATATGGCGCACGTTGCCGGTCTTATTGCGGCAGGTGAATATCCAAACCCAGTACCACATGCACACGTTGTGACCACAACAACGCATAAAACATTAGCCGGCCCTCGCGGTGGTTTAATTCTTTCTAATGCCGGTGAAGACCTGTACAAGAAATTAAACTCGGCGGTTTTCCCAGGTGGTCAAGGTGGCCCTCTAATGCATGTTATCGCAGCTAAAGCGGTGGCGTTTAAAGAAGCACTAGAGCCAGAGTTTAAAGAGTACCAAGCACGCGTGGTACTGAACGCTAAAGCGATGGTGGCAGAATTTTTAGCGCGCGGTTACAACATCGTGTCAGGTTCAACTGAAAACCATTTGTTCTTGGTGGATTTAATCGACAAAGACATCACAGGTAAAGAAGCCGATGCCGCATTAGGTTCAGCTAACATTACGGTTAACAAGAACTCAGTGCCAAACGATCCTCGTAGCCCGTTTGTTACTTCTGGTATCCGCGTTGGTTCGCCGTCTATTACTCGTCGCGGCTTCACTGAAGAAGACGCCAAAAACCTTGCTGGTTGGATGTGTGACATTCTAGACAACCTAGGTGATGAGTCTGTGATTGCCGCAACCAAAGCAAAAGTATTAGAAATTTGTAAGCGCAAGCCAGTTTACGCTTAATTTCTTCGCGTAGCTGAACTGACGTTATAACCACTAAAAAGCCAATGTCATCTGATGTTGGTTTTTTTTGTCTATTTATACTGTCATTATTGCTATTATGGCATTTCATTTATTGCATGGATTGTATTTTTAAGCATGAAGAAGCTCATATTTTTATTCTTGTTTTTACCTTTGATAGCCAATGCCGCCGATTTTGATAAAGGCATAGAAGCGTATTCAAAGGGCGATTTTAAAGAGGCTTTTAAAGAGTTTTTGCCACTATCAACTATCGGGAATTCGAGTGCGCAATTTAATTTAGGACTCATGTATAGCAATGGACTTGGTGTAATTCAAAGTGATGAAGAAGCGGCAAAGTGGTACCAAAAAGCGGCAGATCAAGGTGTTGCGAGTGCTCAATTTAATCTAGGCAATATGTATAGCGATGGCCGTGGTGTGATTCAAAGTGATGAAGAAGCGGCAAAGTGGTATCAACAAGCCGCTGAGCAAGGTTATGCCAGTGCTCAATTTAATCTCGCCATAAGATACCTCGATGGGCGAGGTGTTATTCAAAGCGATAAAGATGCAGCCAAGTGGTTTCAAAAAGCCGCTGCTCAAGGGCATAAGAAAGCTCAAGTTAATCTGGCCTCTATGTATAGAAGTGGACGTGGGGTGCTTCAAGTTTACACTGTGGCGGCAAAGTGGTACCAAAAAGCGGCTGAGCAAGGCTATGCGGTTGCTCAATATAATTTAGGAACACTGTATAGTAAGGGGCAAGGCGTTAACCAAAGCTATATTTATGCCTATATGTGGGCAGATATTGCTGCTTATAATGGCTTTGATGCTTCCAGATTAAAAGTCGAACTAACGCAAGAAATGAGCAAGGAAGATATCGCAGAAGCTCAAGAAATGTCGGCGCAATGTTTTGAATCAAACTATGAAGATTGTGACGGTTGAAGATCAATAATTAGTATTGATGAAAGCGCATATCAAGTTTTAAAAATGCTTATTGTAGAATAAATACTATTAATTCAGGTAATTCAATGAAACTGTTAATCACACTCCTAAGTATCACGCTCTTATTAACGGGTTGCGCTGAATCCCGTTCTACCTATACTCCAGCGAAAAATACCAGCAATTATAACAACACTTTTGCCAATTTATTAGAACCGGCTAAGCGAGGTGATGCGAGTGCGCAGGCTCAACTCGCGACTCGATACTACAATGGTGATGGGGTTGAACAAAATTATCAACAAGCGGCAATCTGGATGGAAAAATCTGCAGCTCAAGGCTATATGAATGCACAATTTAATTTAGGCAGTATGTATCAAACTGGTTTAGGTGTATCGCAGGATCTACAAAAGGCTGCTGAGTTGTACCAAAAGTCTGCCGATCAAGGGTATATGTATGCCCAATTTAATTTAGGCCGCATGTATCAAAATGGTCTAGGTGTTCCTGAGGAACAACAAAAAGCTGCCGAGTTGTATCAGCGATCTGCAGAGCAAGGAAATAGGTATGCACAAGCTAACTTGGGTGAAATGTATCTCAATGGACAAGGTGTCGATCAGAATGATCAAAAGGCGGCAATATGGTTTGAGAATGCAGCACTCCAAGGAGATGCGAGTTCACAATATTATTTAGCGGTGCTGTATCAAAATGGTCGAGGTGTGACTCAAAGCGATATTAATGCGTATATGTGGGTGAATATTGCCGATTATAATGATGCTGATACTAAGCAATTAAAATCAGAACTGACAAAAGTGATGACTAATGCTGATGTGACCAAAGCTCAAGATCTATCACTGATCTGTCTAGAGTCTAATTACAAAAAGTGCGGTTAGTTGTATGGATGACTAGTTTATCTATATAACCTTACTTCAATAACATTATTAATTTTACTACAAAAAAACGCAAGCCCATGACGGTGCTTGCGTTTTTTGTTCAATTAATAATAAAGGTACTAATCTTTCTTGTTAATACTGATCATTGAGCCTGACTTACATTTGAACATGTAGTAGCGGCTGCTTTCGTTAAACTGACCTAAACCACCGCCTGAGCAGTAAGAAGCATTTAAGTCTTGCATAGTATCTAACGTTTTGGCGTTATCCATTGCGAACTTAGATCCGTCAGCACAAACAATGCGTACTTTGCCGTCATCGCTAGTCGAGAACACTTTAACTTCAGTATTACAAAGTTGGAAAGACGCATCTAAGTAGTTGTCTTCTTGAGTGGTTGATGAACAACCAGAAACCGCCAATACCAGCAATCCAGCTAATCCTAAATATTTCATTATATTCTTCCTTTGTGCATCGGTTGAGAAAGGTTAACTCAACTTAAATATTAAAAGCTAACGAAAAGGTTATCTTTAAAAATAGTTAACTAAGTGTAACCGTATAATAGACTTAGCTCAACATTTAAGCGGCATAGCTGGTCGCTAAGCAACAATATTTCGGATAAACTAACCCGATAAGATTTGAGGATTTAAGGAAAAGTTATGCATTGTCCATTTTGTGCTGAAAATGACACCAAAGTGATTGATTCTCGCTTAGTGGCGGATGGTCATCAAGTGCGTCGTCGTCGCCAATGCTTGGCGTGCAGTGAGCGATTCACCACCTTTGAAAGTGCTGAATTAGTGATGCCGAAAGTAATAAAAACCAATGGTAATCGTGAACCGTTCAATGAAGATAAAATGATAGGTGGACTGCAACGCTCACTAGAAAAACGCCCGGTCAGCGCCGATGCGGTCGAGCTTGCTATTAGCCACATTAAGTCACAATTACGCGCCACCGGTGAGCGGGAAGTACCAAGCGAAATGATTGGTAACTTGGTAATGAACGAGCTAAAAACCTTAGATAAAGTGGCCTATATCCGCTTTGCATCTGTGTATCGTAGTTTTGAAGATATTCGTGAGTTTGGTGAAGAAATCGCTCGCCTAGAAGATTAACACTCACAAACAAGACAGCCACATGATAAAAAACATGATGAATGAGTTATGCTGAATAATCCAAAAGGGTAGATATGCCATTTTCCGATTTTGATCACCAGATGATGTCTCAAGCCTTAACCTTAGCCAAGCAAGGTGTTTTTACTACTGCGCCAAACCCCAATGTGGGTTGTGTTATCACACTTGAAGATAAAGTGATTGGTGAAGGGGCGCATTTAAAAGCGGGACAACCGCATGCAGAAGTGCACGCATTAAAGCAAGCCTCAGAGCAAGCAAAAGGCGCAACGGCTTATGTGACGTTAGAGCCGTGTTCCCATTTTGGCCGTACGCCGCCGTGCGCAGAGGCGCTGATTAAAGCGCAAGTCAGCCGAGTGGTGTGCGCGATGCAAGATCCCAATCCTCAAGTCGCAGGTCGCGGTATTAAAATGTTGCGTGATGCAGGGATCCAAGTCGATGTTGGCTTATTAGAAGCCGATGCTGTTGCGCTTAATCGCGGTTTTATTAAACGCATGCAAACCGGTATGCCATTTGTTCAGCTTAAATTAGCGGCCAGTCTGGATGGTAAAACCGCATTTAAAAACGGTGAAAGCAAATGGATCACGGGCCCTCAAGCGCGTCAAGATGTGCAAGTGTTTCGAGCCAAAGCCGGCGCTATTTTATCAACCAGTAAAACCGTGCTCGATGATAACGCTTCGCTCAATGTTCGTTGGGATGATTTACCCGCATCGGTTTCTCAAGTTTATGAACAATCCTCGCTGCGCCAGCCGCTGCGTGTCATTTTAGATCGCAGTGACAAGCTAATAGAAAACACCGCCTTGCGAGCGAAAAGTAACTTAAACCTGTTTAAATCCTCGGGTGATATTTTATTGATCAAGGCTATCGATAATGTACCTACTGATAGCAGACCTGTTGAGAGTACGTCTGTTAATCGTGCCTCTGCCGAAAGCGCAGCTCTGATTGACGATAGTGTTGTATCCGTGCAGGCAAGATTAAAGCAAGTGCAATTAAATCACGCGCAACCCGTACAGTTTGATCTATCTTTATTATTAAAGCAGTTGGCTGATGAGCATAATATCAATCATATTTGGGTGGAGGCGGGGGCAACTTTAGCCACCAGTTTTATTGAGCAGGGCTTGGTTGATGAGCTGATTGTGTATCTTGCACCAAAATTGATGGGCACCGATGGACGTGGTTTAACCCAAATTACAGGTTTAGAATCAATGCAGCAAGCGATTGATCTCACCATTAAAGATTGCCGCATGGTCGGCGACGATATTCGCTTGATTGCGACCCTTAATTCAAAATAAAAAGAGATTGTATGTTTACAGGTATTGTTGAAGCCGTTGGCACTATTTCTGCCATTATCCCTAAAGGGGAAGATGTCACCATTACAGTTGACTGCGGTAAATTAGATATGTCCGATGTGAAGTTGGGCGACAGTATTGCTACCAATGGCGTATGTTTAACTGTGGTGCAATTTTCTAGCCATAGTTATAGCGCTGACCTCTCTTTAGAAACATTAAAACGCACCGGCTTTACCCAATATCAAGTGGGCGATAACGTCAATCTTGAAAAAGCGATGCTACCGTCGACTCGTTTTGGCGGTCATATTGTGTCTGGTCACGTCGATGAAGTTGGAACGATTATTGAGCGTCAACCTGTAGGTCGCGCAGTGGAATATTGGGTGCAAGTACCCAGTCATTTATCACGTTACATTGCCGAAAAAGGCTCGATCACCATTGACGGTATCAGCTTAACGGTGAACGATGTGCGTAAAGACAGCTTTAAAATTACCATCGTGCCGCATACCTCGGCAGAAACCACGGTCGACAGTTTTGTGGTTGGGCATAAAGTGAACTTAGAAGTGGATATCATTGCACGTTATTTAGAACGTTTGATTTCAGGTAAGGCGCAAGATGAATCAACGCCTGAATCACTGGTAACGATGGATTTATTACAAAAGAATGGTTTCGCTTAATTCTCTCAATCAGCGAGACCTTAATCTCAAATTTAAAGGACTTTAGCATGGCAATTAGCAGCTCAAAACAGATTATTGAAGATATTCGTTTAGGTAAGATGGTCATTCTTATGGATGATGAAGATCGCGAAAATGAAGGCGATCTTATTATGGCTGCCGAGCATATTACCCCAGAAGCGGTTAACTTTATGGCCACTCATGGGCGTGGTCTAATTTGTCTAACCTTAACCAAAGAGCGTTGTCATAATCTTGGCCTGCCACCAATGGTGCAAGATAATAACGCGCAATACACCACCAACTTTACCGTATCAATTGAAGCGGCAGAAGGGGTGACGACCGGTATTTCAGCCGCCGATCGCGCAGTCACCGTGCAAGCGGCAGTGGCAAAAAATGCCAAAGCAGTCGATTTAGTTCAGCCTGGACACATCTTCCCATTAGCGGCGCAAGAAGGCGGAGTTTTAACTCGCGCTGGCCATACGGAAGCGGGGTGCGATTTAGCACGTCTTGCTGGCCTTGAACCTGCGTCTGTGATTGTTGAAATATTAAACGAAGATGGCACCATGGCGCGCCGTCCTGATCTAGAAATATTTGCTGAAAAACACGGGGTTAAGTTAGGCACAATTGCTGATTTGATTGAATACCGCAATAACACTGAAACCACGATTGAACGTGTTGCCAGTTGCCAACTGCCCACCGAGTTTGGTGATTTTGAGTTAGTGACCTACCGTGACACCATCGATAATCAAATCCATTATGCTTTGCAAAAAGAAACGGTTAAAAAAGGTGATGCACCGTTAGTACGGGTTCACTTACAAGATACGTTTACCGATCTTTTGCATTCAAACCGTGCCGCCGATCGCAGCTGGAGCTTAGATCGCGCGATGCAACGTATTGGCCGTGATGGTGGCGTGTTGGTAGTATTGGGGCACGAAGAATCACCTCAATCGATCATTAATAAAGTAAAAGCCTTTGAGCAACAAGATAACGCTACCGCGCCAGTGATGGCGAAAAAGCTAGGAACCTCACGCCGAGTAGGAGTAGGCTCTCAAATTCTTGCTGATCTAGGGGTGACAGATATGCGTTTATTGTCTTCGGCAACCAAACGCTATCATGCACTTTCTGGGTTTGGTTTGAATGTTGTCGAGTACGTTACCGAGTAATTATTTTCTTCGTACTTGAAGCTGCAGCTTTGTTGACCGCGTTTATTCCCCCCAATCATGTAGGCAAGCTACACTCATGGGGCTTCATAAACTTGTCGCCTCGCTGCAACCTCAATTACTTTGAAAATATAAGCGAGGGCATCTCGTTACTTGTTGATGGAAAACGCTTTTATTTGAGCGAGACGCTTTCAAGCAACGAGATGCGAATTACCAATGGATATTGATCACAAATTTATGATAGAATCCGCCGATTCTCACTCTATAGAAAAACAGTTTAAGGATAACTTATGAAAGTAATCGAAGGTGATTTCTCAGCACCGAACGCAAAAATTGCGATCGTGATTTCTCGTTTCAACAGTTTTATTAACGAAAGTTTACTTTCTGGCGCGATTGATACGTTAAAACGTCATGGTCAAGTGGCTGATGATAATATTACCGTTGTTCGTTGTCCTGGCGCGGTTGAACTACCACTGACTGCTCAATATGTAGCAAAAACAGGTAAGTACGACGCGATTGTTTCTCTAGGTACTGTGATCCGTGGTGGTACACCACATTTTGATTACGTGTGCAGCGAGTGTAATAAAGGTTTAGCTCAAGTGTCTTTGGAATACAGTCTTCCAGTGGCATTTGGCGTATTAACCGTTGATACCATCGATCAGGCGATCGAACGCGCAGGCACCAAGGCTGGTAATAAAGGGCAAGAAGCGGCTCTTAGCGCACTAGAAATGATCAACGTTTTAAATGAAATTCACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045699|611789:619853|619385_619853_+|WP_153446382.1|DBSCAN-SWA MKVIEGDFSAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQVADDNITVVRCPGAVELPLTAQYVAKTGKYDAIVSLGTVIRGGTPHFDYVCSECNKGLAQVSLEYSLPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGQEAALSALEMINVLNEIH >NZ_CP045699|611789:619853|617278_617938_+|WP_153446379.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEAVGTISAIIPKGEDVTITVDCGKLDMSDVKLGDSIATNGVCLTVVQFSSHSYSADLSLETLKRTGFTQYQVGDNVNLEKAMLPSTRFGGHIVSGHVDEVGTIIERQPVGRAVEYWVQVPSHLSRYIAEKGSITIDGISLTVNDVRKDSFKITIVPHTSAETTVDSFVVGHKVNLEVDIIARYLERLISGKAQDESTPESLVTMDLLQKNGFA >NZ_CP045699|611789:619853|614059_614857_+|WP_153446373.1|DBSCAN-SWA MKLLITLLSITLLLTGCAESRSTYTPAKNTSNYNNTFANLLEPAKRGDASAQAQLATRYYNGDGVEQNYQQAAIWMEKSAAQGYMNAQFNLGSMYQTGLGVSQDLQKAAELYQKSADQGYMYAQFNLGRMYQNGLGVPEEQQKAAELYQRSAEQGNRYAQANLGEMYLNGQGVDQNDQKAAIWFENAALQGDASSQYYLAVLYQNGRGVTQSDINAYMWVNIADYNDADTKQLKSELTKVMTNADVTKAQDLSLICLESNYKKCG >NZ_CP045699|611789:619853|614976_615306_-|WP_153446374.1|DBSCAN-SWA MKYLGLAGLLVLAVSGCSSTTQEDNYLDASFQLCNTEVKVFSTSDDGKVRIVCADGSKFAMDNAKTLDTMQDLNASYCSGGGLGQFNESSRYYMFKCKSGSMISINKKD >NZ_CP045699|611789:619853|616034_617267_+|WP_153446377.1|DBSCAN-SWA MPFSDFDHQMMSQALTLAKQGVFTTAPNPNVGCVITLEDKVIGEGAHLKAGQPHAEVHALKQASEQAKGATAYVTLEPCSHFGRTPPCAEALIKAQVSRVVCAMQDPNPQVAGRGIKMLRDAGIQVDVGLLEADAVALNRGFIKRMQTGMPFVQLKLAASLDGKTAFKNGESKWITGPQARQDVQVFRAKAGAILSTSKTVLDDNASLNVRWDDLPASVSQVYEQSSLRQPLRVILDRSDKLIENTALRAKSNLNLFKSSGDILLIKAIDNVPTDSRPVESTSVNRASAESAALIDDSVVSVQARLKQVQLNHAQPVQFDLSLLLKQLADEHNINHIWVEAGATLATSFIEQGLVDELIVYLAPKLMGTDGRGLTQITGLESMQQAIDLTIKDCRMVGDDIRLIATLNSK >NZ_CP045699|611789:619853|613175_613973_+|WP_153446372.1|DBSCAN-SWA MKKLIFLFLFLPLIANAADFDKGIEAYSKGDFKEAFKEFLPLSTIGNSSAQFNLGLMYSNGLGVIQSDEEAAKWYQKAADQGVASAQFNLGNMYSDGRGVIQSDEEAAKWYQQAAEQGYASAQFNLAIRYLDGRGVIQSDKDAAKWFQKAAAQGHKKAQVNLASMYRSGRGVLQVYTVAAKWYQKAAEQGYAVAQYNLGTLYSKGQGVNQSYIYAYMWADIAAYNGFDASRLKVELTQEMSKEDIAEAQEMSAQCFESNYEDCDG >NZ_CP045699|611789:619853|611789_613040_+|WP_153446370.1|DBSCAN-SWA MLKRDMNIADYDADLFTAIQEETLRQEEHIELIASENYTSPRVMEAQGSQLTNKYAEGYPGKRYYGGCEFVDKVETLAIERACELFGAEYANVQPHSGSQANNAVYMALLNAGDTVLGMSLAHGGHLTHGSPVNFSGKLYNIIPYGIDEAGQINYEEMEALAIEHKPKMIIGGFSAYSQVCDWARMREIADKVGAYFFVDMAHVAGLIAAGEYPNPVPHAHVVTTTTHKTLAGPRGGLILSNAGEDLYKKLNSAVFPGGQGGPLMHVIAAKAVAFKEALEPEFKEYQARVVLNAKAMVAEFLARGYNIVSGSTENHLFLVDLIDKDITGKEADAALGSANITVNKNSVPNDPRSPFVTSGIRVGSPSITRRGFTEEDAKNLAGWMCDILDNLGDESVIAATKAKVLEICKRKPVYA >NZ_CP045699|611789:619853|615510_615960_+|WP_153446376.1|DBSCAN-SWA MHCPFCAENDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACSERFTTFESAELVMPKVIKTNGNREPFNEDKMIGGLQRSLEKRPVSADAVELAISHIKSQLRATGEREVPSEMIGNLVMNELKTLDKVAYIRFASVYRSFEDIREFGEEIARLED >NZ_CP045699|611789:619853|617985_619098_+|WP_153446381.1|DBSCAN-SWA MAISSSKQIIEDIRLGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHITPEAVNFMATHGRGLICLTLTKERCHNLGLPPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRAVTVQAAVAKNAKAVDLVQPGHIFPLAAQEGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNEDGTMARRPDLEIFAEKHGVKLGTIADLIEYRNNTETTIERVASCQLPTEFGDFELVTYRDTIDNQIHYALQKETVKKGDAPLVRVHLQDTFTDLLHSNRAADRSWSLDRAMQRIGRDGGVLVVLGHEESPQSIINKVKAFEQQDNATAPVMAKKLGTSRRVGVGSQILADLGVTDMRLLSSATKRYHALSGFGLNVVEYVTE |
9 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
973537 : 1060738
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP045699|973537:1060738|DBSCAN-SWA CATGGTGGTTTTCAAAAAAACAAAACGAAGTGGCGTCAAAAAGCCTTTTCGGCTTGAGGAAATTTGGCGGATCAGAACCAGACTAGAGATTGAAAATAGTTTGATGCAGCTTGCACTACTTAACTTAGCTATTGATAGCAAACTTAGAGCTAGTGACTTGCTCTCGCTCAGGGTTTGCGATGTATCTTCGCAAGATATGATATTTAGTCGTGTTAAGCATATTCAGCGCAAAACAGACATTGAAGTTCAATTTGAAATAACGACAAGAACTCAACAAAGTCTAATGAAATGGATTTTGATTTCTTCGCTAAACGCCAGCGATTTTCTTTTTCCAAGCCAAAGACGACAGCAACAACCAATTAGCTATTCGTACTATAGATACCTAGTCAGAAAGTGGGCGTCAGATCTAGGGTTGGATTCTAACCTTTATGGCACTCACTCAATGAGGCGAACCAAAGCGACATTAGTTTATGCAAAAACGAAAAATATTCGAGCGGTGCAGCTTTTGCTGGGACATACAAAGGTAGATAACACGATTCGCTATCTTGGTGTTGAATTAGAAGACGCATTGTTACTTTCAGAAGGCACTGATTGTTAGTCGAAAGGAACCCTATTTTTTAGGGTTTCAATTAGCTACTATTCTGACAAGCTGTTGCCCCAAAGTTCGTTAGAGCAAATACTTTACACAATTTAGGGGCATGCGTTTTGCCCTACGAAAAGTTATCCAAATTCGGTAGCTGTCAAAATTATGCCACACAGAAAACCGCCCCCATTATCTTTATCACTAACCTATTAATTTATTGTTGAAGCGTAAAAAGAAAGGCATTATGTGATCATGGAATACAAACGCCTCTTAGCAATTAGGAGAAACAATGAGCGTAAATATCAGAAGTGCAGTAATCAGTGATTCGAAGGCAATCAGTGAATTAATCTTACCTTTAGCAAAAAAATATATTTGTCCTACTTGTGATGCGTCTGCACACTATATTTTGCTCAATTCAATGTCAGAGGAAAATGTAGGAAAGTATTTATCCACCAATTACAACTATGTTATTGCCGTGACTGCGAATGATGAAGTGGTTGGCGTGGCTGGAGTTCGAGACAACTCTCATTTATATCACCTTTTTGTCGATGATAATTTTCAGGGCAATGGGCTTTCCCGCCAATTATGGGAAGCGGTTAAAGAAGAATCAATAAAAAATGGGAACAGCGGTATCTTTACGGTTAACTCGGCGGTAAATGCAGAAAGCGTATACTCACGGTTTGGTTTTAAACGCACTGAGGGCATCAGAAATCGGCAAGGAATGATTGATATTCCAATGCTGTTAGATCTTGAGTACTAACAAGCGTTTTTGCCCAGAGACGTGTCTCTAAAACGTTTGTGCCCCATTCCTTTTCAGCGCGAAAGTTTACTCACAATCTGTGATTGTACGTTTGCCTTACCTGTAGTTATCCGAGGGAGTGTCGAAGTAAGCTTTTTAAAAATTATGCGTCATTTTGCAATCTAATACACAATATCTATCATTAACCCATTGATTGTAAATTGATCAATGATTAAAAAGGCTGCATGATAGGAGTATAAAAAGCGTTATGTGTAATCCAAAGTTAAGGGAAAGAATGAAAGTACTTATTGCAGGAGCCAATGGATATATTGGTAGCCACGTGACGAAGATGTTTGTTGAAAGTGGTTTTGAAGTTTCGACATACAGCAGGGCTAGCGGTGTCCTACCTGATGCTAGAAAGCTCACTAAAGTGCCCGCAGATTTATCTGGTTACTTTGATATTGTTGTAAATTGTGCTCGTCCACATTGGTCAGAATTTTCGCCAGAGGAAATAGTTGATATAGAGTCCAAGCTGCTAACGCAGTTGGATAGGCTAGCGGCTGAAGGTGCGACCAAAATTCACACTTCGGGCGTTTGGCTATTCGGTAATGCGTCTCACAACGACCTCAAAGTGTTTAGGTTGAAGCCTTTAGATGTGGTGAAACTGGACGCAGTTACAATAGGTCGTGCTATTAAAAAGAAGTGGCATGTAGTTTATTGTCCTAGTTTGGTTTATGGCGGTGAAAACTGTCAGCTAAAGCGAATTGTCGACTCTTTATCTGACCAAACGATTCAAGTAGCTATACCATCTCAAGGTCATAACCAATACATCCACGTCAATGACATCGCAAGGTTTTATTTATCGTTGGTGCAAGGTCGAATTTCCTCAGCACAACATTTTATTGCCGAGACTAAGGGGTATAGCCCTGAAGAGTTTTCCCAGTTGTTGCTGGACTCTCGAATCATAAAAAAAGTCAGCAAAAGTAATTGGCGTGAGTTTGAAAATATCTTTGGCTTTTCGGCAGTAGAAATAGAAAAACTGAATCTTAAACTTCCAGTTAGCCCTTTGTTTGAACCGAAAGAGTCCTTAAGGAAGTACATAGAAAATTACACATACAAGCGTTTAAGGTTTCAAGATACTTTGTCTAATCCCAATCTCGCATGTTAGAACCAATACTCTAACGCGCTTCTGTCCAATTATGAGTTAGTGAGTAGTAATAAACGTTAAGTTTACTCAGAAGTGATATTGAAGAGTTGTAAGTAACTTTCTTACAGAAATTTGTATGGTTTGGTTTTTATGCAAACTTTTACTGCAAAGTTATGCAATCTTCTATTGCAAAAGTGCATGTAAGTTATTGATTATTTATTTTTATTATGCAGACTTATGTTGCACACATCACCTTCTACTGCTTTATCTTTACTTATCAAGTAATTACTTCCCTAGCTATAACAATGAAAGTAAATTGGTACTAAACAGTGGTACTAAACATGCGCTATCTCACTAGAAAACCATCTGGAATTTGGTACTTTCGCTATCAAATACCTAAAGCATTTCAAGCTCAATTCTATAATCGAACTGAATTTAAAAGATCCTTGCACACAAGAGATTATCAGCGTGCTGCTTTACTTGCGCTGAAGTTAGAGCTTGAACTTAGGCAAAAGATTGCTGAGCCCGAAAATCAATTTGACTCCACACAGATCAATGGCGAACCTGTCTTAGTGTCTGTTACGACTAAATCTAGATTACATATTCTGGTCAAGCCCAATAGGACACCTGACTTTGTAATTTTTCATAGTCGATTGGCGTTAAATCACCAAGCGTAGTATGCAACCTTTCATGGTTGTAATACCGGATATATTCTTCAACATCTTCTTTCATTGCATCACGCGTTAAATAAACCACATTGAGTAGCCATTCATTTTTCAAGCTACCGAAGAACCGTTCGACGACTGCATTGTCTAAACAAGCTCCAACGCTGCTCATTGATGATGTGATACCATTTCTCGTTAACAGGTGCTGAAATGAACTGCTGGTGTACTGTGAGCCTCTATCACTATGGAAAAGTAAGCCTCTTTGAGGCTTACGAAGTGTAATTGCCATTTGTAATGCACGTTCAACGAGACCTACCGTCATGCGATCTGATAATGCCCAACCAATGATCCGGCGTGAATGTAAATCCATGACTACAGCCAGATACATCCAACCTTGATTGGTTCTCAGATAAGTAACATCTCCGGCCCAAATACGATTGGGCACTGTAGGATTAAATTGTTGTTTTAATATATTATCTGCAACGCTATCACTATGTTTCCGCTTGGTGGTGATTTTATAAGCTCGACGCTGACGCACAACAAGACCTAACTTACGCATGATGGTGCGAGTACGATAACGCCCGATAGTGAAGCCTTCTTCACGTAGTTTCTTAGCTAATTGACGAGAGCCTAAACTTCCACGACTGCGCTTGAATAAGCGCTTGGCAGTTCTGTATAAATTAAGCTCTTGCTCAGTAATGATCTGAGCAGGTCGTGCTAACCAATCATAAAATGCACTGCGGCTTACTTTTAGAGCGTTACAAAGCATTTTTATTGGAAATCGAGAGCGATGCTCTCGAATAAATTGAAACTTTACTTCATTTCTTTCGCAAAGAAGGCGCTGGCTTTTTTTAGGATCTCTTTCTCCATTCTAAGCTGCTTTACTTCCTTTCTCAGAGCCATTAATTCCGTTTTTTCATCTGCGTTGACAGATGAATTATTGAGTTCGTCAGCCTTCTGCTTCCAAGTGTAAAGCAGGTTTTGTGATACTCCCAACGCATCAGCAGCTTGGGCGACAGAATACCCTTGTTCGGTAATAAGGCCGATTGCCTCTTCTTTAAATTCTTTCGTATAAGTTCGATATTGACGTTTTGTATTCATATTCACCTCGATTGATTATCGTATTATCCACAATCAAGGTGTCCAGATCGATTAGACCAGAATAATACCCATTCATTTTGACAATTAGAATATAACCTTAATGTTTCTTAACGCTAAACAATAAAGCCGGTAATACCGTTAAGCTATACAACAATAAAAAGCCTATTGCGATGGTGAGTAAAAATCCAATACTGAACATGCCACGGTGATCGGCAAGTAATAACGAGCCGAAGGTCACTATGGTAGTAAGAGAGCTTAAAATCGCCGCTTTAGGTGTGGAGGATTGATAAAACTCTTTCACCGATCCCACCGAGCGAAAACGTTCAACAATATGAATGCCGTTATCGACACCTAGCCCAAAAATAAGCGGGATCACGATAATATTGGCCATATTGAGTGAATAACCACTCCAATGCGCGACCGCCATTGTCGACAAGGTGGTGAGCAGTAATGGAATAAAGCTTAGCACCACGTCATGCTTATGCTTTAAGGCAAACAACAAGACTAATGCTATCAAGCCTAATGAATAACAGGTGGCTTGTATGAAGGCGGTGGTAATTATCTTACCGACTTGTTGCTCTGCTACTGGGCGACCGGTGGCATTTGGGGCAATTTTTTGTACCGCAGCAATAAATTGGTCGAGCTGTTTAACATCACGCATATTGCCCGATGGGTAGGCGACCACTAACGCATAGTCTTGGTTGTAATAACGTTGCGCCAGTGCTTGAGGAATATCCTTGATTGTCGGTTGCGGCGCTTGCATCA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MKLIKKHLDSIERNGKLVQYTEESLTFRMTPSGHKSWQFRYKSPITHKIRLLKIADYHILTITQARSICRDLLAQVAEGRDPHISKGGNIPTLNECFERWLVVSKFSRTTERTYRNIWSNHSGYVKSALYTKVDRRMIIDYARANIESHDLKRFFYTIIAGVTKWCESEYLDLDSSQFQGLLKLERKPDTKEMKYITADRLPEFISGVSKCGLDDNRKIATLLLLVWGVRIQSLLNMKWKDIDLAGGVATIFETKVNTVVRIHMTELIKGWFESMQNGRQQPDHYIFHARRNLDKPRDRQFITSVYDAINETETTPHRLRYTFSSILNTASFDPLMIETCLSHKVMSDISRIYNKADYLEQRKPLYQFMSDLVQCGGHVERVEAVSEVNNQSGAGAGGWRQRGIEV >NZ_CP045699|973537:1060738|1038920_1039538_-|WP_153446930.1|DBSCAN-SWA MAQTLYDRTLAFAGICQAVALVQQVAKNGHCDDDAFEATLKTIVNMNPSSTLDVFGDESNLKLGLETLIKGIDNSPSGTEATRYIISIMSLERKLNARSDAMTQLGDRLETVSRQTEHFDLLDDQMISNLASVYLDVISPVGPRIQIAGTPAVLQQTTNQHKVRALLLAGMRCAVLWRQVGGKRRHLLLGRKKMVEQAKILLARA >NZ_CP045699|973537:1060738|1055489_1055708_-|WP_153446947.1|DBSCAN-SWA MATGTVKWFNNAKGFGFICPEGEEGDIFAHYSTIKMDGYRTLKAGQQVSYEVESGPKGSHASLVMPVEDQSK >NZ_CP045699|973537:1060738|1001921_1002599_+|WP_153446883.1|DBSCAN-SWA MDFSVIIDSLPLYLEGLWTTFWLVGLSLIIGLFIAIPAGVARSSKNKLINFPVWCYSYFFRGTPLLIQLYLIYYGMNQFMQVKDTLWEHAWFCALVAFVLNTGAYTAEIIAGAIRGLDKGEIEAARAYGMSNWKVYRRIILPSALRRALPAYSNEVIFMLHGSAIAGIVTVMDITGVARLVNSRTYAPFEAFFTAGVFYMILSMSLIYAFKLTEKRLLAYTKPLS |
93 | Vibrio_phage(53.19%) | head,terminase,tail,integrase,portal,capsid,protease,tRNA,transposase | attL 1028578:1028594|attR 1059352:1059368 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1850900 : 1858341
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP045699|1850900:1858341|DBSCAN-SWA AATGCCAAAAGAAGCCACTAAAAACAACGCCACAAAAGCATTACATACACCTATGATGCAGCAATATTTACGTTTAAAAGCGGAAAACCCTGACATCTTGCTGTTTTATCGTATGGGCGATTTTTATGAATTGTTTTACAGCGATGCTAAACGTGCTTCCCAGTTATTGGATATCTCACTCACCAAGCGTGGCGCTTCTGCTGGCGAGCCTATTCCAATGGCGGGCGTGCCTTATCATGCAGTCGAAGGTTATCTCGCCAAATTAGTCCAATTAGGTGAATCGGTCGCCATTTGTGAGCAAGTTGGCGATCCTGCCACCAGCAAAGGGCCGGTTGAGCGTAAAGTGGTGCGCATTGTGACTCCTGGCACTGTCACCGACGAAGCTTTATTGCCAGAGCGGATCGATAACTTAGTCGCGGCTATTTTCCAGCAAGACGATAAATTTGGTTACGCCACTTTAGATATGACTTCGGGCCGCTTCCAGTTATGCGAGCCACAAAGCTTTGAAGCAATGCAAGCTGAGTTACAAAGAACCTCACCGAAAGAATTATTGTATCCAGAAGATTTTGCCAGCCGTGAGTTATTGGAAAAAACCAAAGGTCAACGTCGCCGCCCGATCTGGGAATTTGAGCTCGATACTGCCAAGCAACAACTCAACTTGCAATTTGGCACACGCGACTTAGTGGGTTTTGGCGTAGAAAATGCCAAGCTCGGTTTATGCGCCGCCGGTTGCTTAATTCAATATGTAAAAGATACCCAGCGCACCGCCCTGCCGCATATTCGCTCGCTAACTTTAGACCGACAAGATGATTCAGTTATCTTAGACGCCGCCACTCGCCGTAATTTAGAGATCACCCAAAACCTTGCCGGTGGTAGCGATAACACATTAGCAGAAGTACTTGATCACACCGCCACTCCAATGGGCAGCCGGATGTTTAAGCGTTGGCTACATCAGCCGGTACGTAATAGCCGAGTATTGGATCAGCGTCTTGATGCCATCAGCGAATTAAAACAAAACACCTACTTTGCTGATTTGCATCCTGTATTAAAAGGCATTGGCGATATTGAACGTATTTTAGCCCGTTTGGCACTGCGCTCTGCTCGCCCAAGAGATCTGGCTCGCTTACGAAATGCCATGCAACAATTGCCGGAATTAGCCTCTCTTTCTGCCGATTTTAAGCATGACTATCTGCAAAAACTCACCGCTCTAACCCAGCCAATGGATTCAATTTGTGAATTACTGGAGCGAGCAATAAAAGAAAATCCGCCGGTAGTGATCCGTGATGGTGGCGTATTAGAACAAGGCTACAACGCCGAGTTAGATGAATTACGCAATTTGGCTGATGGTGCCAAAGATTACTTAGATAAAATGGAAGCAGATGAAAAAGAACGTCATGGCATTGAGAGCTTAAAAGTTGGTTACAACAATGTGCACGGATTCTTTATTCAAGTTAGCCGCGGTCAAAGCCATTTAGTGCCTCCGCATTATGTGCGCCGTCAAACCTTAAAAAATGCCGAACGCTACATTATTCCTGAGCTTAAAGAGCATGAAGATAAAGTGCTTAATTCGAAATCCAAAGCGCTGGCACTAGAGAAACGTTTATGGGAAGAGTTATTTGACTTATTGATACCCGATCTTGAAGCGTTGCAAAATCTCGCCTCGGCATTATCTCAATTTGATGTACTGCAAAACTTAGCCGAACGCGCCGACACCCTTAACTATTGTCGCCCAACGATGACTAAAACCGCTGGCTTGAGCATTACCGCCGGTCGTCACCCCGTGGTCGAACAGGTGCTAAGCGAACCTTTTATTGCCAACCCGATTGAATTAAATCCGCAGCGTCAAATGCTGATCATCACCGGTCCTAACATGGGGGGTAAATCGACTTATATGCGTCAAACGGCCTTAATTGCGTTATTGGCTCACATTGGCAGTTATGTTCCGGCCGAGTCCGCCACTATCGGCTCGATTGATCGGATCTTTACCCGTATTGGCGCGCAAGATGATCTTGCCTCTGGCCGCTCTACCTTTATGGTCGAAATGACCGAAACTGCCAATATTTTGCATAATGCGACTAAAAATAGTTTGGTACTAATGGATGAAATTGGCCGCGGGACCAGCACTTACGATGGTTTGTCATTAGCTTGGGCCAGTGCGCAATGGTTGGCGAGCAAGATTGGCGCGCTGACCTTATTTGCCACCCATTATTTTGAATTAACCGAGCTGCCAAACCAAATTGATAATCTGGCTAATGTTCACCTTGATGCCATCGAGCACGGTGACACCATCGCCTTTATGCATGCGGTACAAGAAGGCGCGGCCAGTAAATCGTATGGTTTAGCGGTCGCCAGTTTGGCCGGTGTTCCCAAACAAGTGATCACCCAAGCCAAAAACAAACTTAAGCAACTTGAATCACTTGGTCAGCAAAAAGCGGTGCAAAATAATACGGGCGTAAAACCGGTACGAGTTGAGCAACAGTTGAGTTTGATCCCCGATCCAAGTGAAGTGGAGCAAGCATTGAGCCAAATTAATCCCGATGATATGAGCCCAAGAGAAGCATTAGAGGCATTGTATCGCTTAAAAACGCTGCTATGAGTTCAGGGCTATGTAGTGGTACGGTGATTTTACTCTAAGCCTTACTGACGACTAAAGTAACGGCACTTTCTAGCTAACCTTATTATCTCGAGTATCGACATAAACATTCGCCACTCGAGATAATTAACTCAAACCAGCCAATGAATCATCTTATTGATATTGAACTGCTCAATATTAACCAAGTTTTATTAACCCTTAAAAACATCAAGAAAGAGTACTCCCTCCCTTTTTTTCATCTCTATTCATAATAATTACCCTTAGATCACAGTATTAATAATTACTTGTTTTTTAGGGCTTTGTTGCGTAATTCGATGAAACTAAATGTGAAACTGACGATCAGATCGTTTACTCCCCACTAAACCATCGATATTCATGCCAAAACCTCGTTATAAGACCAAAAACTGGAAGTTATATAATCAATCACTGATTAAACGTGGTTCACTGACTTTCTGGATTGATGAAGAAGCTATCCAAGAATGGAAAGAAGCTAAACAAGGGCTACGTGGTAGACCTCGTATTTTCAGTGATTTAGCAATAACAACAGCGCTTATGGTAAAACGTATATTTTCAATGCCCTTAAGAGCATTGCAGGGATTTATTGATTCTGTATTTCAACTTGCTAATGTCCCGCTCACTTGCCCTCATTATTCTTGTATTAGTCGTAGGGCTAAAGAGGTTGAAGTCTCATTCAAAACGAAAGCTCGTGGCACGATACAACACTTAGCCATTGATTCTACTGGCCTCAAGGTTTACGGCGAGGGTGAATGGAAAGTCAGGAAACATGGAACTGATGGGAAGCGCCGGATCTGGCGTAAGTTACATATAGGTGTTGATGTCGTTACTCATGAAATTATTGCGGCAGAACTCACTTTCTCGAATGTCAGTGACGGAGACGTTCTACCTAATTTACTAAAGCAAACACGTCGAAAGATCTTAAAAGTATCAGGCGATAGTGCTTACGATACTCGACAATGCTATGAAGCCATTCGTATCAAAAAAGCCACCCCACTTGTGCCTCCAAGACTTGGTGCAGTCTTTTGGGAAAAGGGACATCCACGAAATTTATCCGTCGGGTTTCAACAGTTTTATGGTTCTAATAAGCAGTGGAAAACACGGTTTGGGTATCATAAAAGGTCAATTTCAGAAACGGCAATGCATCGAGTGAAAAAGCTATTGGGCGGAACACTCAGCTTAAGAAATTATAATGCCCAAGTTGGGGAAGCTTACGCAATGATCAAAGCTTTAAATAAACTAACAGGGCTAGGTATGCCTAAAACTTACCGAATTGATTGAAATAATACCATTCTAGTGTTGTCACCTCTAAATTTGAATTACGCAACAAAGCCCCTAATAAAGGCTGGTTCTTCTTATTCCGCTTATTTGGCCCAACCAAAGCATACTTCGATCTTAGCTGGAAACCGGATGATCTGATTGAAGTTAAATAGCTTGATAGCCTAAAAATAGAAAAGGGAAGCCACGCTGGCTTCCCTTTTATTTTTCTGTACTGTATTTTTCTATTCTATTCTTAGCTTTTCTTGGCTTAGCTTAGATTGGGTTAATGAGTCATTAGCGTTTCGTTTAATCATTTTCAACGTTAAACAATGACTCCATATTCAAGCCTTGTTTCATTAAGATCTCTCTTAAGCGACGTAAGCCTTCAACTTGGATTTGACGCACACGTTCACGAGTTAGATTAATTTCACGACCAACTTCTTCTAAAGTGGAGGGCTCATAGCCTAAAAGTCCAAAGCGGCGCGCTAATACTTCTTTTTGTTTTGGGTTGAGTTCATCTAACCAATTGATTAATGAATTTCGAATATCATCATCTTGAGTAGACACTTCCGGATCTGAATTATGGATATCAGGGATAATATCTAGCAGGGCTTTTTCACCATCGCCACCAATTGGGGTATCGACAGAGCTGATACGCTCATTCAAGCGCAGCATTTTTGACACATCACCCACTGGCTTATCCAACGTTTCTGCAATTTCTTCTGCGGTTGGTTCATGATCGAGTTTTTGCGCCAGTTCACGCGCAGTACGCAAGTAGATATTCAACTCTTTAACCACATGAATTGGCAACCGAATGGTACGGGTTTGATTCATTAACGCCCGTTCGATGGTTTGTCTGATCCACCAGGTCGCATAAGTCGAGAAGCGAAAACCTCTTTCTGGGTCAAATTTTTCGACCGCGCGGATAAGGCCAAGGTTTCCCTCTTCGATTAAATCGAGTAACGCTAAACCACGGCTATTATAACGACGAGAAATCTTAACCACTAAACGCAGATTACTTTCAATCATACGTTTACGAGCTGCGGCATCACCACGTAAAGCTCGGCGTGCATAAAGCACTTCTTCTTCTGCGGTCAGTAGAGGAGAAAAGCCGATTTCACCTAAGTAAAGTTGAGTGGCATCAAGGTTTTTGGCCGAGACTTCATACTCGCCTTTTTTCTCTTCCTTGCGAGTTTTGGCTTCTACTGCTTTAACATCAAATTTTCTATTATCGATGTCGTTGGTTTTAACTGCTGCATTGCTGATACTCATAAGCGCCTCCCCTGGCGAATTAAGTTAGCAAGACATAACAACTTAATATGTCCTTATGGTAAGTAGTTATTTGGATTAACCGGCTTACCTTTGTATCTAATTTCAAAATGTAACCGAACACTATTGGTACCGGTACTGCCCATTGTTGCAATTTTCTGGCCAGTTTTTACACTTTGTCCTTCTGTTATTAGCAAGCTATCATTGTGAGCATAAGCGCTGAGATAGTCTTCATTATGTTTAATAATAATGAGATTCCCATAGCCTCGAAGTGCGTTACCCGCATATACCACCACCCCTGATGCGGTAGCGGATACATCTTGACCTCGTTGCCCAGCAATATCGAGTCCTTTGTTACCTTGGTCACCTAAAGCAAACTTAGATATTACTCGTCCTCTGGTTGGCCACACCCATTTATCTATTTTTTCATTTGGTTGTGTCGTTGCAGTGACATTTTGATTAACACTTTGTTTACTTGTGTTACCAACATACTCTTCTGATTTCGATTGTTCAACAGCTGTCGATGATTGTTTTTGCACCACTTTAGTCTTAGATGAAGCCTTATTTTGACTCCCCCCTGCGCCGGTTCCATCAAATGATGGTGGAACATAAGCTGTGCGCCATAGGTTTAGCTTCTGACCTGGGCGGATAGTGTAAGGGGGTTTTAGGTGGTTAAAGCGGATGATTTCATTAAAATCTTTGTCTGCCATATAGGCTATGGTAAACACACTGTCGCCTTTTTTCACTTGATAGTAGCTACCCTTAAAGCTGCCGCGTCCGTCTTTTGTACCATTTAGCGCACAACCTGATAATAATGACAATAAAGCCAAAATAGTGGCGCTCCATTTCATCCAGTGCAACATCGAATTTCTGTTCAATTTAGGCTAAGTCCCCAGATATTAAAGGGACAAATCTTACCGCTTCTACCAAAGTAGATAGGCACTCACCTTGTCGCTTTTGTATTTTGATTAAATTTTGCTGTTGGTCACCGATTGGGATGATTAAACGCCCCCCTTCGGCTAATTGGTCAAATAAAGCAGGTGGTAGGTGTGCCGCTGCTGCGGTAACAATAATCGCATCATAAGGACCTTTTGCCGCCCAACCTTGCCAGCCGTCACCATGTTTGGTCGATACATTGTAAACATCCAATTGCTTTAATAAGCGTTTAGCATTCCACTGCAAAGACTTGATCCGCTCCACTGAATAAACGTGATCCACTAATTTGGATAAAATAGCCGTTTGATAACCAGATCCGGTGCCAATTTCTAATACTCGGCTATGCGGTTTAAGTTCCAACAATTGCGTCATTTTTGCCACAATATAGGGCTGAGAGATAGTCTGCCCTGCACCAATAGGAAGCGCATTATTGTCATAAGCTTGATGACGCATCGCTTGAGGCAAAAAATACTCTCTTGGCAGAGTTTGCATCACCTCTAAAATTTGAGGGTTATTGATGCCGTTATCCATTAAAAAATCAGCTAATTGATGGGCTTTAATATTCTTCATTATTGCCTGTGTATTGTCTTTATTAAAATGAAAATCCGTAAGGTAAAAGATAACCGCGTTATTACTTCAACCAATCCTGCATACCCGCAATGGCTTTATGTGCAGTTAAATCAACTCGTAATGGCGTGATTGATACTTCGCCTTTTTCAATCGTATAGAAATCGGTGCCTTCACCGTTATCGGCTTCTTTACCTGGAGGCCCTAACCAATAAACTTCTTGCCCTCTCGGATCGAGTTGCTTGATCATATCTTCGGCGTGATGACGAGCACCCAGTCGAGTTACGCTTGTTCCGGCCAGTTGTTCTAACGCTAGGTCAGGCACATTGACATTGATCAGTTGTTGCCTAGGAATAGGGTGTTTCACATGTTGCAATACCAAATCTTTTGCAATTTGGGCTGCGCTCTCAAAATGGGTATGACCGACCAGTGAAATCGCAATCGCTTGTATACCTAAGAAGTGCCCTTCCATCGCCGCGGCGACAGTGCCGGAATACAGCACATCATCACCAAGATTGGCACCATGATTGATGCCGGAAACCAACAAATCTGGCAATTCGTCTTTCATTAATTCATTTAATGCAAAATGCACACAATCAGTTGGCGTACCTTGTACGCTGTAGACATTCGGGCGAATTTGATTGACTCGTAACGGGTTTTCAAGAGTTAATGAATTTGAGGCTCCAGAGCGGTTTCTATCTGGCGCCACTATGATCACTTCAGCAATATCCGACAACGCTTGCGCCAATGTATTGATACCTTGCGCATGCACGCCATCATCATTACTCAGTAATATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP045699|1850900:1858341|1857603_1858341_-|WP_153447595.1|DBSCAN-SWA MKILLSNDDGVHAQGINTLAQALSDIAEVIIVAPDRNRSGASNSLTLENPLRVNQIRPNVYSVQGTPTDCVHFALNELMKDELPDLLVSGINHGANLGDDVLYSGTVAAAMEGHFLGIQAIAISLVGHTHFESAAQIAKDLVLQHVKHPIPRQQLINVNVPDLALEQLAGTSVTRLGARHHAEDMIKQLDPRGQEVYWLGPPGKEADNGEGTDFYTIEKGEVSITPLRVDLTAHKAIAGMQDWLK >NZ_CP045699|1850900:1858341|1856915_1857542_-|WP_153447594.1|DBSCAN-SWA MKNIKAHQLADFLMDNGINNPQILEVMQTLPREYFLPQAMRHQAYDNNALPIGAGQTISQPYIVAKMTQLLELKPHSRVLEIGTGSGYQTAILSKLVDHVYSVERIKSLQWNAKRLLKQLDVYNVSTKHGDGWQGWAAKGPYDAIIVTAAAAHLPPALFDQLAEGGRLIIPIGDQQQNLIKIQKRQGECLSTLVEAVRFVPLISGDLA >NZ_CP045699|1850900:1858341|1850900_1853495_+|WP_153447590.1|DBSCAN-SWA MPKEATKNNATKALHTPMMQQYLRLKAENPDILLFYRMGDFYELFYSDAKRASQLLDISLTKRGASAGEPIPMAGVPYHAVEGYLAKLVQLGESVAICEQVGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVTDEALLPERIDNLVAAIFQQDDKFGYATLDMTSGRFQLCEPQSFEAMQAELQRTSPKELLYPEDFASRELLEKTKGQRRRPIWEFELDTAKQQLNLQFGTRDLVGFGVENAKLGLCAAGCLIQYVKDTQRTALPHIRSLTLDRQDDSVILDAATRRNLEITQNLAGGSDNTLAEVLDHTATPMGSRMFKRWLHQPVRNSRVLDQRLDAISELKQNTYFADLHPVLKGIGDIERILARLALRSARPRDLARLRNAMQQLPELASLSADFKHDYLQKLTALTQPMDSICELLERAIKENPPVVIRDGGVLEQGYNAELDELRNLADGAKDYLDKMEADEKERHGIESLKVGYNNVHGFFIQVSRGQSHLVPPHYVRRQTLKNAERYIIPELKEHEDKVLNSKSKALALEKRLWEELFDLLIPDLEALQNLASALSQFDVLQNLAERADTLNYCRPTMTKTAGLSITAGRHPVVEQVLSEPFIANPIELNPQRQMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALLAHIGSYVPAESATIGSIDRIFTRIGAQDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATKNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWASAQWLASKIGALTLFATHYFELTELPNQIDNLANVHLDAIEHGDTIAFMHAVQEGAASKSYGLAVASLAGVPKQVITQAKNKLKQLESLGQQKAVQNNTGVKPVRVEQQLSLIPDPSEVEQALSQINPDDMSPREALEALYRLKTLL >NZ_CP045699|1850900:1858341|1853867_1854788_+|WP_153447591.1|transposase|DBSCAN-SWA MPKPRYKTKNWKLYNQSLIKRGSLTFWIDEEAIQEWKEAKQGLRGRPRIFSDLAITTALMVKRIFSMPLRALQGFIDSVFQLANVPLTCPHYSCISRRAKEVEVSFKTKARGTIQHLAIDSTGLKVYGEGEWKVRKHGTDGKRRIWRKLHIGVDVVTHEIIAAELTFSNVSDGDVLPNLLKQTRRKILKVSGDSAYDTRQCYEAIRIKKATPLVPPRLGAVFWEKGHPRNLSVGFQQFYGSNKQWKTRFGYHKRSISETAMHRVKKLLGGTLSLRNYNAQVGEAYAMIKALNKLTGLGMPKTYRID >NZ_CP045699|1850900:1858341|1855073_1856039_-|WP_153447592.1|DBSCAN-SWA MSISNAAVKTNDIDNRKFDVKAVEAKTRKEEKKGEYEVSAKNLDATQLYLGEIGFSPLLTAEEEVLYARRALRGDAAARKRMIESNLRLVVKISRRYNSRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERALMNQTRTIRLPIHVVKELNIYLRTARELAQKLDHEPTAEEIAETLDKPVGDVSKMLRLNERISSVDTPIGGDGEKALLDIIPDIHNSDPEVSTQDDDIRNSLINWLDELNPKQKEVLARRFGLLGYEPSTLEEVGREINLTRERVRQIQVEGLRRLREILMKQGLNMESLFNVEND >NZ_CP045699|1850900:1858341|1856092_1856899_-|WP_153447593.1|DBSCAN-SWA MLHWMKWSATILALLSLLSGCALNGTKDGRGSFKGSYYQVKKGDSVFTIAYMADKDFNEIIRFNHLKPPYTIRPGQKLNLWRTAYVPPSFDGTGAGGSQNKASSKTKVVQKQSSTAVEQSKSEEYVGNTSKQSVNQNVTATTQPNEKIDKWVWPTRGRVISKFALGDQGNKGLDIAGQRGQDVSATASGVVVYAGNALRGYGNLIIIKHNEDYLSAYAHNDSLLITEGQSVKTGQKIATMGSTGTNSVRLHFEIRYKGKPVNPNNYLP |
6 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1913893 : 1921213
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP045699|1913893:1921213|DBSCAN-SWA ACTACTTTGTGCGCGGGCAAATTTCAGCTTGCGGAAAAAAGAACTCAATTTCACGCGCCGCTGACTCCTGACTATCGGAACCATGCACCGAATTATAACGCATGCTAAGTGCATAATCAGCACGAATGGTGCCACAAGCCGCTTCTTCAGGATTAGTTTTTCCCATTAGTTCGCGGTAACGTATGATCGCATTTTCGCCTTCCAACACTTGAACCATAACCGGCCCTGATGTCATAAACTCTTTTAAACCATCAAAGAAGGGTTTACCTTCATGTTCAGCATAAAAACCGCTTGCTTGAGCATCGGTCAAATGCAGCATTTTAGCCGCCACAATCGACAGTCCCGCTTTTTCAAAACGATGATAAATCTCACCAATTAAATTGCGCTCGACCGCATCGGGCTTAATAATTGAAAACGTTCTTTCCGTAGCCATAATTTATGTCCTATTTAATTTATTATCGTTAAGAGAGGATCGCTCCTCTCCTTGTCAGAAAATTATTTCGCTTGTTCAATTAACAGCCCAGCTAAGGTTCTTACGCCCATACCGGTTGCGCCTGCCGACCATTTGTCACTGCTGGTTTTACGGTAAGTACCCGCGCAATCAAAGTGCAACCAGCCTTTTTTATAATCCTCAACAAAATACGACAAGAAAGCGGCTGCCGTACTAGCGCCTGGAGAATAACCTCCCGCTGAGATGTTAGACATATCGGCGAAATTAGACGGCAGCATCTTGCGGTGAAAGTCTTCCACCGGTAATTGCCATAGACCTTCTGATTCTACTTTGGCTTGTTTCAGTGCTTTTTGCGCCAATTTATCATCAAACGATAATAAAGCGTGATAGTCATTGCCAAGTGCATTTTTAGCTGCGCCGGTTAAGGTGGCGCAATCAATAATAAGCTTAGGGTTTTGCTCGCTGGCGTACATGAGACCATCGGCTAACACCAAGCGACCTTCGGCATCGGTATTCATCACTTCAACCGTCTTACCATTCTTATATGTGATCACATCACCCAGCTTTAACGCGCGACCAGAGATCATGTTTTCTGCGCAGCATAAGATCAGTTTGACACGCTTGTTTAAGCCGCGAGTAATCGCTAACGCTAAACCGCCCGCAATGGTGCCCGCTCCGCCCATATCGGCTTTCATTGAATCCATAAAGCCAGAGCCTTTGATGCTGTAACCACCGGAATCAAACGTGATCCCTTTACCGACTAAACAAGCAAACACTGGTGCGTTGTCATCACCGGTTGGGTTAAAGTCCAGTTGCAACATGGCAGAGGTGCGCTCAGAGCCACGACCTACAGCATAAATTCCATTCCAACCTTCGGTCAGCAGATCTTTATCTTTCACGATGCGGTAGCTTACACTGCCTTGTGGTGCAATAGACTTAATGAACTCGCCAGCCATGGTCGCCAATTGACGTGGCGCCACTTCTTCAGCGCTTTTATTGATAATATCGCGCACCCAATCGGTAGTTTTGATCCGCGCTTCAAGCTCGGTTTGTTGAGCAGCGTCTAATGCAGGCCAAGTAATTGGGTTACCTTGTTTCGATGAACGGTAACCTTGTACAAATGCCCAGATTTTCTCTAAATCCCAACCTTCACCGCTAAGTTCAATGTGCTTAAGACCTTGAGCGTCTAATTTACGTGCTGCACGCTGCACCGCATCGATATCGGTTGCAGAAGTTATGTGAATAACTGCGCCATTTTCATCAAAAGATAGCAGCGCTTTTTCACCCCATTGTGGCAAAGCGGCTTGTTGTGTAATTGAAACCAACATAGATGTAGACATTTCGACTCCTTTCTCACTTTAATGTGGCTTGAGTAGCCAAGAGAATTAATAGGTGAATGTAAAAAACTGAGAACTATCATAATGGATTTTTACTGATTTAACATGAAAACGGCAAGAGACTTGTGCACTAAATAGCATAAAAGCCTCCGAAGAGGCTTTAATTGGCGTAACAAGATATTGACTCATGCAATGATTGATTAAAGTGCCATCAAAATGGATTACCTTTCAACGACAACTGATCAATGACCAGCAAAATCAGCAATCAACGACAATCAACGACAATCAAAGTCATTGAAGTGACTATCCAGCGAATAAAACTTAAACTTCATCCAACCAGCACAATAAAATCGCTTCGAGAATTTTCTCATTTGACTTATTAGGCTGATCATCAAACTCTTCAAGTTCGGTGATCCATTGATGCATATCGGTAAAACGAACTGTGGTTGGATCTAAATCCGGAAACTTCTCATACAGTTCGATCGCGATATCTTGTGAATCAGACCATTTTAATCCCATAACCCTATCCTTTTGGTTTAATGTTTTTCTGATGCTAGGTTGATGGTGTAACGAGGGATCTCAACCACCAGATCTTGATCTTCGACTAATGCTTGGCAACCTAAACGAGACTCAGGCTCTAAACCCCATGCTTTATCTAGCATGTCGTCTTCAAGTTCTTCGCTTTCTTCTAATGAATCAAAACCTTCACGAATAATGATGTGACAAGTGGTACAGGCACAAGATTTTTCACACGCATGCTCAATACCAATTCCATTTTTTAACGCCACATCCAGTACTGACTCGCCTTTTTTCGCTTCTAATACCGCGCCTTCTGGGCATAATTCTTCATGTGGTAGTACAACAATCTTAGGCATAATCCATCCTACTCTAATTATTTAATTGGTATTTATTATTCAATTGGTGTTATAGGTTATCCACTGATTGGCCAGACAGCGCCGCTCGAATTGATACATCCATACGACGAGAAGCAAAATCTTGGCTCGCTTTATCGGTATCTTTAATGCCTTGTTCAATCGCATCGGCATCGGTGCCATTACGCAAACCAATCAACACTTTCAATGAGCCTTCAATCGCTTGATATTCTTCAACACTGAGTAATTGCTCGCCGTTTTCTTGTAATGCCACCAGCAAGCCTTCAATCACGCGGTCTGCTTCGACTTTTTGTTCCGCTAGCGCTCGAGTCTGCATATCTTGTTTAGCATGAGTCATTGATGCTTTAAGCATGTCGGCGATTTCATTGTCGCTTAAACCATACGATGGTTTAACTTGAATATCCGCTTGCACGCCGGTACTTTTTTCCATCGCGGTGACCGATAGTAAGCCATCGGCATCGACTTGATAAGTTACGCGAATATGCGCTGCGCCCGCTTTCATTGGCGGAATACCACGCAAAGTAAACTGCGCTAAAGAGCGACAATCCCCGACCATTTCACGTTCACCTTGAGCTACATGCACCAACATTGCGGTTTGACCGTCTTTAAAAGTGGTAAATTCTTGTGCTTTGGCAACGGGAATAGTGGTGTTACGTGGAATGATTTTCTCCACTAAACCTCCCATGGTTTCGATCCCAAGTGACAATGGGATCACATCCAGTAATAGCATGTCAGAATCGGGCTTATTACCGATTAAGATATCCGCTTGAATACCGGCGCCAATCGCGACCACTTCATCTGGATTAATGCTGGTTAATGGCGTTTGACCAAAGAAGTCACCGACCATATTCCGCACCAATAATGTGCGAGTCGAACCGCCGACCATCACCACTTCGGCAACTTCATCGACGCTAACTTCAGCATCTTTTAAAGCGCGGCGACATGATAAAAGTGTTTTTTTCACTAACGGTTGGATCAAGTGTTCAAATTGCTCACGAGTCAAGGTAATGAAAGTACCAAGCACATCAACTTGAACTTGGGCTTGTTGTGATAATTCAACTTTGGCTTGGGTCGCCGCATCCAGTAGAACTCGATGTTGCTCGGCGCTTAACTGCTGTTTAATATCAGCCTGTTGCTTGAAAAAATCGACAATAAGATCATCAAAATCATCACCACCAAGCGCAGAGTCACCACCTGTGGCTAGCACTTCAAATACGCCTTTAGATAAACGCAATAATGAAATATCAAAGGTACCACCGCCAAGATCGTAGACTGCAATGACACCTTCTTGACCTGAATCTAAACCATAAGCGATTGCCGCCGCTGTCGGCTCGTTGAGTAAGCGTAAAACTTTGAGACCCGCTAATTCAGCCGCATCTTTGGTACCGGCACGTTGGGCATCATCAAAATAAGCGGGAACAGTAATCACCACGCCTTCTAATTCATGAGCTAAGACTTTCTCTGCTCGCGCTGCTAATGACTTTAATATTTCACTCGAGATTTGGATAGGATTTACCTGACCAGTTGGTACTTCAATTAAAGGCAAGCCATTGTCGCTGGCTTTAAATTGGTAAGGTAAGGTGGTGTAGCGTGTTTGAATATCCGCCAAAGAACGACCGATTAAACGTTTTGCCGAGCTAATAGTATGAATAGGGTTGCTTTGCGCCAATGCTTTAGCCGCATGGCCCACTACAATATTTTGCTCACCGTAATTGACAACAGAAGGAAGAATGGTTTGCTGATTTTCATCGGCTAAAGGGGTGCAACTTCCACTGCGCACAGCGGCAACTAATGAATTGGTGGTACCGAGATCGATACCGACGGCAAATTTATGTTGATGAGGTGCAGCGCTTTGTCCTGGTTCGGCAATTTGAAGTAACATGGTATTACTCGGTCCTTTTATCTTGGCCTATTAACCCAGCAGTTTATCTTCTAACTGCTCAATTTCGAGGCGTAATTTATTGACAAACTTAAGTTTTCTTACGCTATCAGCCGCAACATTCCAATCTTGATTAATTAATTGTTGTTGTAATTGTTCGATTTGCTGCTGATACATGGCTTGAATTTTACTATCAAAATCAACTAATGCGCTATCAGGATCACGAGAATGCGAAATATCTTCAAGTGTTTCGCGTAATTCCATTTGCTCCATTAGAAAAGCGGGATCACTCATCGTTTGTTGTTCGCCACGAATATCTACGCCTTGTAAAGCGAGTATGTATTCGGCGCGATTTAAAGGGTGTTTTAAGGTTTGATAAGCATCATTTATTTCAGTTGCTTTTTGCACTGACATCAGACGATCGCGCTCTGAGGCAGACGCGAATTTATCAGGGTGGAATTGGCGTTGCAGATCTCTAAACTTATCCGATAGCTGATTTTTATCTAAATCGAACTGATTAGACAGGCCAAATAATTCAAAGTGATTCATAATGCGGCTTCTTTTGAACTGAGAGATAAAACCAAACCGCCGCTCGTTGTCATCATAAACTACCGGCTGTCATAATAAGATGAATAAAAACAGTTAAATGTTCAAGCTTTTAGATGTTAGAAGCTGCTAGACATTAAAGCTTTCGCCACAACCACACTCACCTTTTACATTCGGGTTATTAAACTTAAAGCCCTCATTTAAGCCTTCTTTGGCAAAATCGAGTTCAGTACCATCAAGATAAACTAAGCTTTTTGGATCAATAATGATTTTAACACCATCATGTTCAAATACTTGATCTTCTTCATTGAGTGCATCGACAAACTCAAGTACATACGCCATACCAGAACATCCCGTGGTTCTTACTCCTAAGCGTAAACCTAGACCTTTCCCGCGGTTTTCTAAAAATGTTCTTACGCGACCTGCTGCCGCATCTGTCATGGTAATGGCCATACTTCAACCTTGTGTAGTTTCAATCAATATAAGTAAAAATAAAACGAGTAAAGAATAAGGGAAGATAATCACCTTCCCTCACTAAACCAGTCTTACTGATGTTTCTTTTTGTAATCGGATACCGCTGCTTTGATCGCATCTTCTGCTAAAATTGAGCAGTGTACTTTCACTGGTGGTAGTGCCAATTCTTCAGCAATTTCAGAGTTTTTGATTGATGCTGCTTCATCTAAACTTTTACCTTTCACCCATTCAGTGACCAGTGAGCTTGATGCAATAGCAGAACCACAACCATAAGTTTTGAATTTCGCATCTTCGATAATGCCTTCTGGTGATACTTTAATTTGCAGTTTCATTACGTCACCACAAGCTGGAGCACCAACCATACCGCTACCGATAGATGGATCTTCTTTATCAAAAGAACCGACGTTACGTGGGTTCTCATAATGTTCAATTACTTTTTCGCTATACGCCATAATATTGTCCTCAAATCCTTGCTACTGAGGTTGGAATGATCGATACCATATCCAACCTAAGTCGATAATTAGTATTAGTGATGTGCCCACTCAACCGTGTTCAAATCAACCCCTTCCTTGTACATATCCCAAAGTGGTGACATATCACGGAGCTTTGTTACGGCAACAATGATCTGCTCAACCGCGTAATCAATTTCTTCTACGGTAGTGAAGCGACCAAATGAGAAACGAACTGAGCTATGCGCTAATTCATCTTCTAAACCAAGTGCACGTAAAACATACGATGGCTCTAGGCTAGCTGAAGTACAAGCAGAGCCCGATGATACTGCTAAGTCTTTTAATGCCATCAACAATGATTCACCTTCAACGAAAGCAAAGCTAATGTTGAGGTTGTTTGGTAAGCGCTGTTCTAAATCACCATTAATGGTTAACGCCTCCATGTCTTTCAAGCCATTAAGCAAACGGGTACGCAGCATTAATGCGTGATCGTAATCTTGTTGCATTTCTTGTTTAGCAATCGCAAAGGCTTCGCCCATACCCACGATTTGGTGAGTAGGAAGAGTGCCTGAACGGAAACCACGCTCATGACCACCACCGTGCATTTGCGCTTCAAGGCGAACGCGAGGCTTGCGGCTAACATATAATGCGCCAATGCCTTTCGGGCCATAAATTTTGTGTGCTGAGAATGAGATCAAATCCACTTTCAACTGCTGTACGTCGATGGGTAATTTACCCGCAGATTGTGCTGCATCCATGTGGAAGATGATTTTGCGTTCACGACACATGTCGCCAATCGCGTTAACATCTTGCACCACACCGATTTCATTATTCACATGCATGATAGACACTAATACCGTATCTTCACGCAGTGCCGCTTGCAGTTTTTTCAGATCAATTAAGCCATTGGTTTCAGGCTCAAGATACGTCACGTCAAAACCTTCACGCTCTAGTTGGCGGCATGGATCAAGCACGGCTTTGTGCTCGGTTTTGCAGGTAATGATGTGCTTGCCTTTCTTACCGTAAAAGTGCGCCGCACCTTTAATCGCTAAGTTGTCTGATTCAGTTGCGCCCGAGGTAAAGACAATTTCACGCGGGTCTGCATTGATAAGCTCGGCGATTTGGTCACGCGCATGATCGACAGCTTCTTCTGCTTGCCAACCAAAACGGTGCGAGCGAGAGGCTGGATTACCAAAATTGCCATCCATCGTCATACATTGAACCATTTTGTCGGCGACGCGAGGATCAACTGGACAAGTTGCTGAATAGTCAAAATAAATAGGCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP045699|1913893:1921213|1919127_1919451_-|WP_153447646.1|DBSCAN-SWA MAITMTDAAAGRVRTFLENRGKGLGLRLGVRTTGCSGMAYVLEFVDALNEEDQVFEHDGVKIIIDPKSLVYLDGTELDFAKEGLNEGFKFNNPNVKGECGCGESFNV >NZ_CP045699|1913893:1921213|1918485_1919001_-|WP_153447645.1|DBSCAN-SWA MNHFELFGLSNQFDLDKNQLSDKFRDLQRQFHPDKFASASERDRLMSVQKATEINDAYQTLKHPLNRAEYILALQGVDIRGEQQTMSDPAFLMEQMELRETLEDISHSRDPDSALVDFDSKIQAMYQQQIEQLQQQLINQDWNVAADSVRKLKFVNKLRLEIEQLEDKLLG >NZ_CP045699|1913893:1921213|1914387_1915683_-|WP_153447641.1|DBSCAN-SWA MSTSMLVSITQQAALPQWGEKALLSFDENGAVIHITSATDIDAVQRAARKLDAQGLKHIELSGEGWDLEKIWAFVQGYRSSKQGNPITWPALDAAQQTELEARIKTTDWVRDIINKSAEEVAPRQLATMAGEFIKSIAPQGSVSYRIVKDKDLLTEGWNGIYAVGRGSERTSAMLQLDFNPTGDDNAPVFACLVGKGITFDSGGYSIKGSGFMDSMKADMGGAGTIAGGLALAITRGLNKRVKLILCCAENMISGRALKLGDVITYKNGKTVEVMNTDAEGRLVLADGLMYASEQNPKLIIDCATLTGAAKNALGNDYHALLSFDDKLAQKALKQAKVESEGLWQLPVEDFHRKMLPSNFADMSNISAGGYSPGASTAAAFLSYFVEDYKKGWLHFDCAGTYRKTSSDKWSAGATGMGVRTLAGLLIEQAK >NZ_CP045699|1913893:1921213|1916604_1918455_-|WP_153447644.1|DBSCAN-SWA MLLQIAEPGQSAAPHQHKFAVGIDLGTTNSLVAAVRSGSCTPLADENQQTILPSVVNYGEQNIVVGHAAKALAQSNPIHTISSAKRLIGRSLADIQTRYTTLPYQFKASDNGLPLIEVPTGQVNPIQISSEILKSLAARAEKVLAHELEGVVITVPAYFDDAQRAGTKDAAELAGLKVLRLLNEPTAAAIAYGLDSGQEGVIAVYDLGGGTFDISLLRLSKGVFEVLATGGDSALGGDDFDDLIVDFFKQQADIKQQLSAEQHRVLLDAATQAKVELSQQAQVQVDVLGTFITLTREQFEHLIQPLVKKTLLSCRRALKDAEVSVDEVAEVVMVGGSTRTLLVRNMVGDFFGQTPLTSINPDEVVAIGAGIQADILIGNKPDSDMLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKIIPRNTTIPVAKAQEFTTFKDGQTAMLVHVAQGEREMVGDCRSLAQFTLRGIPPMKAGAAHIRVTYQVDADGLLSVTAMEKSTGVQADIQVKPSYGLSDNEIADMLKASMTHAKQDMQTRALAEQKVEADRVIEGLLVALQENGEQLLSVEEYQAIEGSLKVLIGLRNGTDADAIEQGIKDTDKASQDFASRRMDVSIRAALSGQSVDNL >NZ_CP045699|1913893:1921213|1916216_1916555_-|WP_153447643.1|DBSCAN-SWA MPKIVVLPHEELCPEGAVLEAKKGESVLDVALKNGIGIEHACEKSCACTTCHIIIREGFDSLEESEELEDDMLDKAWGLEPESRLGCQALVEDQDLVVEIPRYTINLASEKH >NZ_CP045699|1913893:1921213|1919998_1921213_-|WP_153447648.1|DBSCAN-SWA MKLPIYFDYSATCPVDPRVADKMVQCMTMDGNFGNPASRSHRFGWQAEEAVDHARDQIAELINADPREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYGKKGKHIITCKTEHKAVLDPCRQLEREGFDVTYLEPETNGLIDLKKLQAALREDTVLVSIMHVNNEIGVVQDVNAIGDMCRERKIIFHMDAAQSAGKLPIDVQQLKVDLISFSAHKIYGPKGIGALYVSRKPRVRLEAQMHGGGHERGFRSGTLPTHQIVGMGEAFAIAKQEMQQDYDHALMLRTRLLNGLKDMEALTINGDLEQRLPNNLNISFAFVEGESLLMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLEDELAHSSVRFSFGRFTTVEEIDYAVEQIIVAVTKLRDMSPLWDMYKEGVDLNTVEWAHH >NZ_CP045699|1913893:1921213|1913893_1914325_-|WP_153447640.1|DBSCAN-SWA MATERTFSIIKPDAVERNLIGEIYHRFEKAGLSIVAAKMLHLTDAQASGFYAEHEGKPFFDGLKEFMTSGPVMVQVLEGENAIIRYRELMGKTNPEEAACGTIRADYALSMRYNSVHGSDSQESAAREIEFFFPQAEICPRTK >NZ_CP045699|1913893:1921213|1916001_1916199_-|WP_153447642.1|DBSCAN-SWA MGLKWSDSQDIAIELYEKFPDLDPTTVRFTDMHQWITELEEFDDQPNKSNEKILEAILLCWLDEV >NZ_CP045699|1913893:1921213|1919543_1919924_-|WP_153447647.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIEHYENPRNVGSFDKEDPSIGSGMVGAPACGDVMKLQIKVSPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSLDEAASIKNSEIAEELALPPVKVHCSILAEDAIKAAVSDYKKKHQ |
9 | Powai_lake_megavirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
278995 : 324865
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045700|278995:324865|DBSCAN-SWA GTTAAGCGACCATCAATGGTGGTCTACCACCATTGGCTTTATGAGGCCGTTCATTATTATAAAACCAAAGCCAATTGGTTGCATAGTCTTGGACATCTTCCAATGACTCGAAAATGTGCTTACTCACCCAACTGTATCGAATGGTTCGGTTATGCCTTTCAATATAAGCATTTTGTTGTGGATTCCCCGGTTGAATGTAATCAATCCGGATTCCATGTTGTTTTGCCCAGTTAGTAAATTCATGACTAATGAATTCAGGCCCATTATCACATCGGATAGCGATTGGTTTTAGGCGCCATTCTAGAAGTTGATCCAACGTGCGAATAACTCGTAAAGCAGGTAAAGAAAATCCTGCTTCAATTGCTAAACCTTCTCGACGATAGTCATCAATCACATTAAATAAACGGTAATTTCGGCCGTCCGATAACTGATCATGCATAAAATCTATAGACCAAACTTGATCAGACCGGAGCGGTTCCTTTAATGGTTCTGGTTTATTACGTTTTAATCTTCGACGCGGCTTAATACGAAGATTTAAGGCTAACTCACAGTAAATACGATAAACGCGTTTATGATTCCAACGATAGCCTTTTACATTACGTAAATAGTCAAAGCACAAGCCAAACCCCCAATCACTTTGAGTTGATGTGAGTGAGATTAACCAATCAGCAATTAAATCATTTTTAGCACTCAGTTTAGGCTGATATCGATAACAGGTTTCACTTACGTGAAACCATTCGCATGCTTTTTTAATACTGACTAAATGTTTCGCCACCGAACTCTGAGCCATAACACGACGCTCACAGGGCTTCACCACTTTTTTGACATAGCATCTTGAATAACTTCAGCTTTTAGCCGTTCTTCAGCATACATTTTTTTGAGTCGACGATTTTCATCTTCAAGCTCTTTTAATCGAGCCATTAACGAGGCATCCATACCACCATATTTTGCACGCCATTTATAAAAAGAAGCGTTACTCATTCCATGCTCACGACAAAGCTCAGGCACAGGAGTGCCTGCTTCAGCTTGTTTTAGTATGGAGAGGATCTGACTGTCCGTGTATCGTGATTTTTTCATATTGAATCTCCTACGTTTAGATTACGAGAAAATTCTACTTTTGCCAGCAGTTATTTTTCGGGGGGATTACCTAATCTCTATTAATGGGCATTTTGTCCTGTGTGTGTAAACCCTTCATAAGCTAAAAACATGCCTAAGCCAATTGCTGGTAATAAAATCACAACATTTTTTAGAAAATCTAATTGACTATAAAAATTAATTGGATTGAGTAAATCAGGCGATTGGACAAGGTAATGATCTGGAGAACCAAGCATGGTAAGTATATACACTATTGCTGGGACACCAAAAATACCAAAGATGAACCCAACGACAGCTGCTAATATTTTATTTAACATATTCATATTATCACCCCCGCTTTTCAACACCATTATCGTTTTTATTGATGGCATCAATATACGACTGTCTTTAGTTGAAGAACTGTTGATTAGTCCATTTAATTTCTATGTTTTTTAGATTACTCCTGTTATAAAAAAGTAAATTCGGGATAGATCACAAAGGTTAGTTTCTATACAAAAAAGATCGGAGATTGGTCACAATCAGCGATCTTTTATCTATAAACATAGGTACATTTTCTACAGGTAAACTAATCTTAGTTAATCCAATCTAAGTGACATTAAGTATAGCTTATTGCTACAGATTGTTTGACATTCGGCGTTATAAATTGCCGCCGATACCAATGCTAGGGTTGACATAGACTGGTCCAATTTTAAATGGCGCTCCAATGTCTAAATTGGCATAAGGAGTACAAGAAGCCAAAAGTAATACAGTTGCTGTTAACGCAATAATTCGTTTTAAATTCTTCATTTTTTGCTCTCCTGTATGACAAAGCCTGCGCCAGCAGGATCACGGATGATGGCAACAGTACCATTGCGAACGGCTTTCGTTGGGGCCATTAATACCACGCCGCCATTTTGTTTTACTTTCTCAATCGTCGTTTTTACATTATCGACTCTTATGTAGTTAACCCAAGTGGTACTGACATCAGCGTTAGGCTTTTTAACAAAACCAAAAGCAGGTTTGTTGTTAATCGTTAAATACTGATAACTATTTTTCGCCAGTGTTTTTTCACCGCTTTTATACTGCCCAAGTTGCTGATAAAACGCTTGGCTTTGCGCGACATCTTGGGTCCACACTTCTTGCCACATCCAATTACCTGATTGTTTCGGCAGTGTAACTGGGTCGCCTGATACGGTATTGAGAACAGAGAATACGGCCCCTTGAGGATCTTGCAATACGGCAATATCACCACTACACACGTCCTTTTAAAGTGGTTTTCTTAATTAAGGTTTTGCCACCGGCTTTTTCTGACAAGCTTACGGTTTGGTCAATATTGTCAGTTGAAATAACCGGTAACCAATAGTTGGTATTGCTGTTCGCCGGCAGTTTTTCCATACCGGCAATGTATTGTTCTTGATATTGGATCAGGCTGTAATCATCGTTAATGGCTTCAAATTTCCAGCCAAAACATGTTGGTAAAAAGGTTTAACTTGCTCTGGATTGGTGGTTGCCAAATCGCGCCAAACAATCGTGCCGGGGGTTTTAACGCTACTATCGGTTAAAGCGGGAAAGGTCATGGATGGCGATCCACTACAAGCAGCAAGCAATAATGTTATTGCACCTGCAATGGGCAGTGAAAACCATTTTTTTGCCAGTATTTCATTATGTCTGTCCTTGTTTGGTTAAAAATGTAATGGTTTAATGATCTTGGAGGGTTCTATAGCCTATAATTGACTGCAATATAGGAACCTAACTATGAATATTAACACTCGAAAAAAACGACTAAATTACACACATAAACAAAAGCACGAGTACGCCAGATTGATGATTGAAGAGCATTATACCAATCAACAAATTATGGATATATCAGGCGCTGGCGCTACTGCGGTTGCTCGTTGGAAAAAGCAGTACATAGATGAACAGCGTGGTGAATTCGCACCCGATAAAGTGCCTTTAGATGCCGATAAACGATTAATCGAAGAACTGAAAAAAGAGTTGGCAGAATCAAGAGAAGATGTTCGATTGTTAAAAAAAGCAACCGCCTTGTTCATACGCGACAATCCAAACTTGAAGTGATTCAACAACTGAGCAAGGCAGAGCCTAAAATTTCTATTCAGAGATTATGTGGGCTGCTTGAGTTACCCATATCAAGCTATTACTACACGCCAGTGACTCGAGTTGCCGATGAGGTGCTCGGGAATAAAATGAAGACTATTTTCGAAGACACTTTTTATTGTTATGGAAAGCGACGATTGGCTTTTGAGTTGAATAAAGAAGAATCCGTCACTGTTGGTTTATTTAAAACCGCTAGGCTAATGAAAACATTATAATTAGTCGCTAAGCGACCGAAGAAACCACACTATTATGCTCAGGGAAAAGAACGACCGACTACACCAAACTTATTAAAAAGAGCATTTAACCCGACTGATTTGAATACTCATTGGGTTGGCGATATTACGTTTATTCGCTCACATCAAGGTTGGAGCTATTTAGCCACAGTGATGGACTTGGCGAATCGAGAAATTGTTGGTTATGCACTGTCGAAAACACCGGATGCCCAGTTGGCTAAACAAGCTTTAACGAATGCGATTGCTCAGCATAAACCAACAACGAAGGGGTTGATGTTTCACTCCGATCAGGGTGTACAATATACGGCAAAGTTATTCCAAGAAACGCTTCTCGATCACAACATGATACAAAGTATGAGTCGGCGAGGGTGTTGCTGGGACAATGCCGTACAAGAACGATTCTTCCGCAATTTGAAAACGGAATATCTGAACGACCTAAGCTTCATCAATCACCCATCGGTGGTAACCGCCGTCGAACGGTATATTAGCTTCTACAACTACAGACGATTGAACTCCGCGATTGATTATCTAACGCCAGTTCAAAAGCGCCAAGAATTACTAAAAGTGGCTTAGAACTCCTACAGGATTGCTTGACCATTACAAAAGAGCGAATCGAAGGAAGGGGTAAAAATAGTGTCATGTCGAAGATATTGAAATTATATGGGATTTTTTTGCTACGGGTAACTGTTTTAATGTCGCTTACCTCAAATAGCGAGCAAATTTCCTATGTCACTTCAAATAAAGAGAATATTTCTTAAATAATGTAAGCACATGTATATTCATCAACTATTCTTAATTGTGATGGAAGCTGGTTGTTTTCTTTACCAAGTTAATACTAAAAGTAAAGTCAGCAACTTTCAAAACAATCAGGATCAGATGAGATGCGTATGTTTAAACAATTATGGTTAGTCAGTTTAGGGTTATTGGGTTTCGGAGTTATCCCAGCGACAGCTCAAGCGGATGAGCAATATGATACCGGCCAGAAAAAAGCCGCGGTTTGTATGACTTGTCACGGTAAAGCGGGGGTCTCAGATATCGCTATTTATCCTAACCTGCAAGGGCAGAAATTTGAGTATTTAGTCACCACACTTAAAGCTTATAAACGACGTCAACGAACAGGGGGGCTTGCGTTAGTGATGTATGAACAAGCCGATAGCCTGACCGAGCAAGACATGAAAGACATTAGTTATTTCTTTTCCAAAGTCACTTCTCAATCCATATCAGAACCAACTCAATCCAAACCTGAACCTAGCGCACAATAGCGTTAAAACGTGATGGATGGAGATAACAAGGAGGTGAACAATGGAAATTAATTACGATATGAAAGTGGTGAAATATTTCATCATTACCAGTTTGATCTGGGCGCTACTCGGTATGACTGTTGGGTTAATACTTGCAGCGCAACTTTATTGGCCAATACTCAATTTTGATTCTGAATACTTTCAATTTGGTCGATTACGCCCCTTGCATACTTCTGGGGTTATTTTTGGTTTTGTAGTCAATATTTTGATGGGGACGTCACTGTATATTGTGCAACGTACCAGTAAAACGACACTGTTTAATAAAAGTTTAGCTTGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP045700|278995:324865|320402_320999_+|WP_153448488.1|DBSCAN-SWA MGHSVAEWTSSLVLQMPRGLIWNYEPNSTLYKYVAGYAPRLEAAETNADLLLDEMRPETCFQTLPEWETYLGLPECNVSNQGFESRRAAVVEKYHRKGGLQAWNIEKLAADLGFDIEVQEIFPHHCLRGCTYPLYEERYRHVLRINVYGITQAYATCLDNCLTPLVLQTAAILECTLNTIKLGGKYYEYVYYYDEESV >NZ_CP045700|278995:324865|301351_301642_+|WP_153448466.1|DBSCAN-SWA MSMHEVLQQDRRLVMLRVLNESPAYTANESILDSSLDAYGHRISRDLVLSEMHWLQEQGLITCKDMSGTLVATITQRGSDVAEGQATHPGVKRPRP >NZ_CP045700|278995:324865|313310_313661_+|WP_153448480.1|tail|DBSCAN-SWA MRILGEVVVRNNGNQLKTKKGSTLNSGGYTNTSHIGPGRVWGKSREYTAPTIQVTIAAAEDVDVMDINAMEAATLTWEGDNGIDYMMTGCAPQAPFQLSDSGEITGTFEGEKVERV >NZ_CP045700|278995:324865|294385_294706_+|WP_153448448.1|DBSCAN-SWA MMHFNEKRRAVRNAIERLEREGAAVIGWNVKLAIPTITIEMPPVSLMTKAYTVTERKAGKRVTSHVAKLSGCLVRWYDSELPEAFFITQHLNPYAPELIASWPTNL >NZ_CP045700|278995:324865|300827_301049_+|WP_153448464.1|DBSCAN-SWA MTDVIDQAAKLEQRQRDAAIARARQVTEQKPQMIDGDTIVCACCGEPIPLKRLEINPAATLCVACKSQLEKER 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>NZ_CP045700|278995:324865|299319_299868_+|WP_153448460.1|DBSCAN-SWA MSQDFPFNTRDYSLSFCHALMFVLEKEGGLTADGGYVDDPQDRGGETKFGISQRAFPHENIADLTIDDAVALYYAHYWLVASCNDLPDPLSLAVFDAAVQHGVRAAIKMLQEVAGVVADGIYGPKTHEAVYAKDDEYLLSVYHLRRARFYARIIKKNPTQSRFIEGWHNRLSDCLEAAWELV >NZ_CP045700|278995:324865|321786_322470_+|WP_153448490.1|DBSCAN-SWA MKLAQYHFETGEYLRTVDAVKNIKSKEFMIPPYHTPDFPVAELEENEYHAFLDNNGNVPRDYNDGTWQAKERFVKVTAYNKQTKQPKEFEDKTLFDDEYTLLEPKPFQKWEGEQWVQDDEAVAEYNASNGKVIRDTAISSDLNALSAQWDVVSDAADIRRVINDAETINAQETDTTQFRLADNTWRDTSLAELREVLRVFIARKRDIWDQFAQWDATDKLEPFSPEY >NZ_CP045700|278995:324865|305637_306432_+|WP_153448470.1|DBSCAN-SWA MPSDSDKYDFVPTDVLNWFKKKAIEPSFDYKDVWKQEHTNAFTVAKMLNADLLVDVKTLVEDAIEQGQTFAQFRDILKPLLVKSGWWGVQEMDDPLTKETKTVQLGSEGRIKTIYRTNMRTARAAGQWERIERTKRAMPYLLYQLGPSVEHRVDHVKWKDLLLPVDDEWWQQHMPPNGWGCKCWIRQVSKYEYGKLTESDKVSTTAPQGKTKQWVNKRTGEVETLPEGIEPGWNYNPGQAREQAMKADLNKKEARMRETYSKPL >NZ_CP045700|278995:324865|308363_309263_+|WP_153448473.1|head|DBSCAN-SWA 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59 | Vibrio_phage(89.47%) | plate,head,transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
533078 : 641900
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP045700|533078:641900|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP045700|533078:641900|614994_615609_-|WP_153448736.1|DBSCAN-SWA MASNRNLLFDIDLDEIEAIQNIYSATEAQVRAAYNRALTRTAKTMRALTNKKIKDELQLKRMKDLRRRLQTFRLKSTSKQSKLDELKLWFGMNDIPVGKLKGRMKPIGSKKNPQGAVFNPSGKIGTQSYDKGFIARAYGRKSIFTRSTESRYPIKEARVSVADDLQDTIEDEIFSELSTVFMKHFETDLKGRVKMGMNKTGWQS >NZ_CP045700|533078:641900|638255_639479_+|WP_153448769.1|integrase|DBSCAN-SWA MAQNAGIELPKGIEIHGNKLRIIFYNNGKRYREALGLEPTKQNINFASRKREAIMYEIKIGIFNYAAHFPNSKHASGKPRALDISELAKRFLESKAHDVRSSTLQRYDWVLRDFIMCYGENRSCDTLSPRSLSQFRQELVKGKAGRTINRNLVTINAFLSWLYKMEYIDRDLSEVLTRVKESPADIQPFSVGEIDKILSSCHQLQHRNMVTLLLYTGIRSGELCALAWEDVDFNNKTIHVRRSTYDNRGLKTTKTDNERFVDLMPPAIEALKAQRHLTYLYPANSHQVELPGKSYRTEKLRFVFNPKVVRAQKGSDYDYYGKRALGRIWKELCSKANVEYRNQYQLRHTYASWMITHANVNVSYLAHQMGHADITMVAKVYGKWLTESNKKESDRVWSELLKIQNKK >NZ_CP045700|533078:641900|538482_539301_-|WP_153449018.1|DBSCAN-SWA 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97 | Vibrio_phage(64.29%) | terminase,portal,capsid,tail,integrase,plate | attL 587793:587808|attR 642304:642319 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
729710 : 780239
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP045700|729710:780239|DBSCAN-SWA 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66 | Vibrio_phage(87.5%) | plate,transposase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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