Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP046126 | Enterococcus casseliflavus strain EC291 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP046124 | Enterococcus casseliflavus strain EC291 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP046125 | Enterococcus casseliflavus strain EC291 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP046123 | Enterococcus casseliflavus strain EC291 chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,WYL,RT,cas3,DinG,DEDDh,cas14j | 0 | 1 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
7561 : 57088
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046125|7561:57088|DBSCAN-SWA GTTATTTTTTTTTGTCATTTTTCACTGCTGTTAGGATGCCAAAGATGATCGTTGCGATTAAAGAACCGAAACTAATCATTAGCCCTAATGCTTCAGCTACAGACAAAAGGCTTCTCCTTTCTAAAGAGTGAACACTTACTTTCATAAGCATCACCACCTTCCAAAAGATAGCCACCGTCACAAACTTTACTGTACTCATATTATACCATAACTCACGCTAAAAACCTAGATTTATCAAGGCTTTTAGCGTTTTTTTCTCGACATTATTCAAGCAAAAAGCTTGTTCCTTCAGTCGCTCCAGCCACCACCACCGCTCCTTCAGAAACCGTGTTGCTGCCACAACCCGAAGTGATCAATAGAAAAAAATACCAGGATCAGGCAGAGATCTCTTGTTCTTTTAAAGCCAAAATAGACAAAGCATTCGCAAACTGCAGTAAGCCTAATTGAGAATCATCGACGATCACATTTTTCTGATAATGGATCCGATCGCTCACATGATTGATTGATAGTCCGTAGACAAAACGCATCAAAAAAATCTTTCGTCTCCGATCGGTGATTTCTGGTTTATATGGATGGCTAATGGCCGTCAGACCCAAAGAAAACAAGTGGTGAAAATAAAGAAACTCTTGTTTGAACTGCTGATTTTCTTGAACAAAGCTAGAGTGTTTGATTTCTGGTATATCTTGGTCTAAGAGCGAATACGTTGAATGAATCGGTGGCATCCTCGTCAATCCCATCCTTTCTCTTGAAACAAGATAACTAGAGAGCATCGATCCGATCTCTCCTTTGGTTTTTTCCCAATCGATCACCTCTTTTTCAGGTAATTCGAATTGGTGAACATCAAATAATCGCACATTATTCCTCTTTTCATGATAGGTGATACAAACAGTTGTTGTTTGAACCTGAATTTTATATCAAAAAAGACCTGGGGGTTCCAGGTCTTTTTTCGTCTTTGTTTCTCAAAATGGCAAATCATCATCTGGTAAATCGATTGCCGAGCTGCTTTGTGCAAATGGATCTGTTTCTTGTTTAGGTAGCGGTGGCGGTGTTGGTTTGCTTTTTTCAGCTGTTTCGTTGGATTCATTCGCACGCTGCTCAGACACATCTTTTGATTCCATTAATTGAAACGTCTCTGCCACGACTTCTGTGACGAACACTCGCTGTCCTTGTGGGTTATCGTAAGATCTTGTCTGAATACGTCCAGTCACGCCGAGAAGCGTCCCTTTCTTGGCGTAATTGGCAAGGGTTTCGGCTGGTTTACGCCAAATGACACAATTTATGAAGTCAGCTTCTCTTTGACCGCTTTGATTGGTAAAATTTCGATTCACGGCCAAAGTGAACGTGGCCACTGCAGCACCGTTTGGTGTAAATTTTAGTTCTGGATCTCTCGTTAATCTTCCTACTAATACGACGTTATTGATCATGCTTTATTTCCTACTTTCTTTGCTTTTTTTGGCGCATTGACAAATGATACAAAAGTGATCTGTCCCGTATCGCTCAACTTGATTTTTGCATGATAGGTCGTCTTGTCTGCCTTTTTGATTCCTGAAACCACGGTTTCTTTCCCGACTAACAAATCCTTCAGATTGGTTTTCGTCAATTTTTTCTTCCGGAACTGATCAGATAACGTAAACGTACAGTTGGGATAATTCGAACAACCGTAGAAGGACTTTTTCAACACCACATTTCCGCCACATTTCGGACATTTCCCGATCGTCTGCTTATCTGCTTCTTTTTTGACTTCCGCTTGGTAGGTGTGGAAATTCAACTTCTGAACATCATCTGGCACGTGTTCGATCAAATGCACGATAAACTTCTTGATATTGGCAATAAAGGTCTCTTGATTCCCTTCTTTTTTACCGATTTTCTTTAAGTACGTTTCCCATTTTGCCGTCATTTCAGCACTCGTCAATAAGTGCTGGCTTTCTACTGCCTGGCACAGTAATTTTCCTTTTTCGGTGACGATCAATTTATTTTTTTCTACTTTGATATATTCTTTTTGCTTCAGTGTTTCAATAATGCTCGCACGTGTCGCTTCTGTACCGATTCCTTCGACTTCCTGAAGGATCTTGATCGCTTGTTCATCATCTACGGTCTTATTAGCCGTTTTCATCGCTGTAAGCAACGTGCCTTCAGTAAATGGTTTCGGTGGCTGCGTCTCTTTCTGTACGCTTTTTACCTCCGCTTGAATCGCTTCACCGATCATCACAGCTGGTAATGTTTGGCTCTCTTCGTTCTCCTTGTTGGTATCGGTTTTGAATAAGATCTTCCATCCCTCGACTTTTGGCACTTTTCCCGTCGCTTTGAAACAAAGAGTTGACACGGTGGTTTCTATTACGGTTTCTTCATAAGTGTAGTCTGGTAAAAACATAGCTAATGTAGTTTTCATAACTAGAAGATAGATCTTCTTTTGTAGATCATCTAATTTATTAAAGGCTGACTCACTTGCGACTTGCTTCGTTGGAATAATGGCGTAATGCTCTTGCACCTTACTTCCATCGACATATCGCTTTCTTGGCTGATCTTGTGCCATGGGTTCATCTATGGATAAAAAACGGGCATAACTGTCGTAATTCGCTTTTAAGTATTGAAATTCACTGTCTGTAATAAATGGTGTATCTGTTCTTGGATAGCTCAACAATTTTGCTTCATACAGTCCTTGCATGGCTTTCAACGTCTGACTGGCTGTTGCTTTGTACAGCTGATTGATTTTTGACTGCAGACTGCTCAATGAGAATAAATTGGGACTATTCGTTTTCTTCATTTTTGTTTGAAGATCTTTGATCGTTCCTGGTTGTGTGCCGATTGCAGCGCCCTTAGAAGAAACAAAGGAAAGTAGTTCCTCTTTAGTAGAAAAACGTTGTGACGGGCTTAATAGGGCTTTGAACGAGCCAGTCGTTGCCTTGATCAATGATTCGATTTCATAAAATGGTTCTTTTTTAAAATGCTCGATCATTTGTTGGCGTTGATAGATCATGTAAAGCGTTGGTGTTTGTACTCGTCCAAGAGAGAACGTTCCATTTGCTCCTTTTGAACGAAGATTCAACGTGTATAGCATACTCCCGTTCATGCCAATGAGCCAGTCGGCAATTTGCCGTGTCTGTGCTTCTTGATAAAAAGGATAATAGTCCATTCCTGGCTTTAAGTTTTGAAACCCACTACGAATCACATCTTTTTCAAGACTATTGATCCATAAACGTTTGTATGTTTTTTTAGTAGAAAAAGCGCCTGATTCATGAATGATCGACCAGGCGAATATCGATAGGTAAACTTTTGAAGTAATCTCCAGTTTTTCCCCCGATCCACACCGTGCATGCGATTTTCACCGCACACGGCGTTCCATCAACAAATTAAACCTTTTGTTTTCCTAAGTCTCGCAACCAAATTAATAATGTAGTAAGGTGTTTCTAACTAACAACCTTAATTTATTCAGCCTTTTGACCTGTTCATCATTAAGGTTTAATAAGGTCATATATCGCTGAATAGTATCTTCCTTGGTAGCATGTATTAGAATATGAACTTCAGGTTTAACAATAATCAAGTTACTATACTTGTCATCTTTAGATAAATGATAAGGTATCTTATGATGACAATGCATATCTAGGACATTTAGTTCTTCACCCGTTACCGAACACTTACCCGACTGAGCTATAAATAATGAAATTCGATTATCATTAAATTCCACTGTTGCTCTGTCGCTGACTACAGGATGGCTCCTGATCCAACGAAGTGCTATTTCAGATACGGCTGATTGATTACGATGAATGAGCTCACGTCCCTCAGGGGTGTATTTATTAATTTTAACTTTAAGGTACATAGGGTTCCTATGTTGTACAAAACTAACTGGTATAATTGGGCGTCCCGCCAGGTATCTAATATTCTTTGACTGGACGTAGTTCAATATCCCTTTATCTTTACCAGTATATTTACCCATTTTTGTCAATCCATCGATAGACAATCGATTTCTCATTGTCAGAAGAACTGAGTAATGAACTTTTTTAAAATCTTTATTAACGTGAGTTGCTATTCGATAGTAACCGTGCATGCCAATAACTTTACTATTATAATTCCCTATAGCTCTAATAGTATTCATGCTATTAGGTGATTTTTTGATTTCCTTGATTTGCTCTTTAAGTTCTATTCTCATACGGTTAATTGCTTTATCCGAAACATGAGAGTGCATTATATATCTATTTTTCCCTTTTCTTTCCAGCTTTAAATTGAAACCTAGAAACTCACTACTTTCCTTACGAAGGTTCGTGATTTTGGATTTTTCGATAGATACAGGTAGATGCAATCGCTGTTCCAACCATTGTATCGAAGCATGATAAAGTAGTTCAGCCGTTTTCCGGTTATGACAAAATAATTTGAAATCATCTGCATAACGAACTATATAGAACTCTTTTAGTTTTGTATGTGAGCGCATTTTCCTATGATGATTTCCCATATGCTCGGTCCCATTAGCATTGTACTGTGTCTTAATTTCAGACATATACCTTGTTTCCCATTGTTCCGATATCCACCAATCAAATTCATTAAGATTAATATTGGCTAATAGTGGGGATAAAATTCCACCTTGTGGTGTACCCTTTTTCGGAAATTGAATAGTACCATTAGGTAGTACAACTGGAGCTTTTAGCATTTTACGGATAATAGCGAGAAGTTCTTTATCCCGGATACCCATAGTCCACATTTGTCGTATTAATTTTGAGTGCCAAACTTCATCGAAGAAACCTTGAATATCTATATCAACACAGTATCCCATTTTTATAATATTCATCTTCTTGGCACAATCAGCAATTGCGTGTTCGGCAGACCGGTTAGGTCTAAAACCGTGACTATGTGGGTTGAATTTTGCTTCACATATTGGTTCTAATACTTGCAAGATACATTGTTGAGCTACCCTATCCCAAATAGAAGGAATTCCTAATGGTCTAGTTTTTCCATTTGGTTTGGGAATTTCAGTTCGCTTAACTTTTCTTGGTTTGTAAAATTTGAAC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>NZ_CP046125|7561:57088|49112_49934_+|WP_104884698.1|DBSCAN-SWA MGKVYVVGNFKGGVGKTKSVTMLAYESAVIKDKKTLVVDLDPQGNATSILAKTGELNEISKNITVGFEEGDLSTQITPIINNLDLIASNTTFRNLTKILMNRFPNDEIKQITYLKELLNPLKEVYDAIYIDVPPTISDYSDNAMLAADYCIIVLQTQELSLDGAQTYIAYMQYLADTYDNDLQVLGIIPCMLRPGGRVDTKVLDQAKELYGGNVLDTIVKYQERLKVYDVEGIHVSYSYTGKPDGWDIKAHQVFIDVLNELDRHEEILESLED >NZ_CP046125|7561:57088|10945_12832_-|WP_002295588.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP046125|7561:57088|37319_37631_-|WP_002336236.1|DBSCAN-SWA MVNKQKNYNSEWDVELKKLRKCLRDSEIKYIEKGISSEQNETTMFDRLNILIKFYEEANTNFNEFSINSSISQPHVTNRIKNDKLKKLKRYKELVKKQDESIN |
55 | Bacillus_phage(25.0%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046123_1 | 989218-989302 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046123_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046123_1
>1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder CTAAACTCGATACAAATCCGGAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046123_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046123_1 >merge|NZ_CP046123|1|989218-989302|CRISPRCasFinder TAAGGGTCCGGCGGGTGGCGAGCACCAAAACTAAACTCGATACAAATCCGGAACGTAAGGGTCCGGCGGGTGGCAAGCACCAAAA >NZ_CP046123|1|1|989218-989302|CRISPRCasFinder TAAGGGTCCGGCGGGTGGCGAGCACCAAAA CTAAACTCGATACAAATCCGGAACG TAAGGGTCCGGCGGGTGGCAAGCACCAAAA
>NZ_CP046123.1|WP_154694251.1|987239_989102_+|heavy-metal-translocating-P-type-ATPase MQQYILSKKNVITVISGLLIVLGFFSHFVLENVGLSEWSLIIASVFGITPIAIQAFQAMKVKVISIDVLVSIAAIGALFIQNYEESAIVTFLFLFGHYLEQRTLNQTRSAIKELTEMAPESALKQMDNGEFEEVEVDDIDEGDILLVKTGAKVPVDGIVLTGEGHINEASITGEAVPVNKLADAEVFAGTILENGTIQIRADRVGEDTTFGKIIELVEEAQDSKSEAERFIDRFSKYYTPAVLVLAIVVWAFSQNIELAITILVLGCPGALVIGVPVSNVAGIGNGARNGVLLKGSEVIQDFSNVDTIVFDKTGTLTVGNPTVAATELYEKDPAETLGYLASVERESDHPLAKAVLNQIGETNFYPVEGTEVVKGGGIVSSVAGHRVAVGNVALMEKENVTLSKKVQKDVKRFEQQGNSLVLTAVDGELKVLMGIRDQVRPGVKANLQELKDLGVKNLVVLSGDNQGTVDVVAGELGLTEAHGHMLPEDKSAYIGKLQQRGQIVAFVGDGVNDSPSLALADIGIAMGSGTDVAIETSDVVLMNSNFSNLPHALGLVKATANNMKQNIVISIGVVLVLLTSVFFSEWMNMSIGMLVHEGSILVVIFNGMRLMKYKLKGRKE >NZ_CP046123.1|WP_003103602.1|986808_987042_+|heavy-metal-associated-domain-containing-protein MEKAILQLETLSCPSCMQKIEGAVKSVNGIDKDSIKVLFNSSKVKTNFDSAVTSIEEIQKAIENVGYPVLKAKVKAA >NZ_CP046123.1|WP_154694642.1|986398_986662_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGHFYFRLTGEVALSYVLWYSVGRFFIEGMRTDSLWIGEWIRVSQALSLALFIGAIVVWFIRRQDYPPISYYSDGNKGQKKTIKMVN >NZ_CP046123.1|WP_154694226.1|984935_986321_+|ISNCY-family-transposase MNEDKKYKVIKAVAEKRKEKKRACVELGLSTRQVNRLIKDYQKGGKAIFSHGNRGKTAKHAVPKETKKQVVELYQSFKIQPNVKHFTEILKEDYDICYTDTTIRRILYQANILSPKTQRKTRKKIKARIKAKSMKGEKKAENPLVPRAEDQMELPEKSHPSRPRKKYQGELIQMDASSYNWFGKEVTHLHLAIDDASGNIVGAYFDTQETLKGYYHVLNQILTKQGIPLAFLTDKRTVFEYTSKAMRAVEEDTFTQFGFACHQLGIEIRTSSIPQAKGRVERLNGTVQSRLPVDLELAGIQSIEEANHFLTKWVRTFNKKFGHKTKESIYEKAPTKSEINLLLARVANRKLDSGHHIRYQNNYYLPTEGSEDKYFTRKSKVLIIEAFNGDIYVNIAEKIYTTRSLKEHDYYSKEFDPIPEQKKERRQYIPPQSHPWKLESFKRYLRSVGKTLEEYEAEQTA >NZ_CP046123.1|WP_154694250.1|984622_984871_+|hypothetical-protein MNQEAHGGPVTRQFLENLYLPEFIIEQMNINGTYYHPTFLYESLWSLLGFVLIVTIRNRKQLLRQGEVALSYVLYHSNVIMS >NZ_CP046123.1|WP_014125708.1|984199_984613_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGFVLGVLNPHVVEIGSVVIHWYGVIIAAGILAALQLSTKEAKKKGLEEDTIIDMALWAIPIGLLGARLYYVLFELGYYLQNPGQILAIWNGGIAIYGGLIAGGGTLYWYAKKKGTSLALVLDILAPNVLLAQSIGR >NZ_CP046123.1|WP_028790832.1|983876_984215_+|hypothetical-protein MHYFWVIVAITLSAAGAFFVVPFTKNTIGGEAKTSNVVEADRLAMEKEEEVVKGAGVIGHGKVAYYEASDQGAKSEFTVWFPWSLAGILFSITMTRMTRKIEEMEQIEWDSY >NZ_CP046123.1|WP_124007094.1|982940_983648_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MTQYTQPHAAGDHSACIRLVPIFNHLEESSMDRIAGKAHTKHYQKGEFLFRSQEKDDALYIVNRGKVRIYRLSNSGKEQLVRILNPGDFTGEWTLFNPDAVHEEYAEATRDTSVCMIQQHDVQEFLKEYHAISLKLLGEMSQRLESSGRQTAQVAVESVITRLVLFLAENVEPEMGNSPTITLPMAKKDIASYLGTTPETISRKFGELEDEGLIQQLSGKRIKIQDLDDLLLYSE >NZ_CP046123.1|WP_154694249.1|982183_982756_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MTENKASQERTPQERFQEEQEHKEHVHHTKINAAAISDHLLGNMHTLHVKLHQYHWYVNGANFFTLHEKFEVLYNQNEEWFDKLAERLIISGHKPASTTAEFEKYSMLSEDAINKYAKAEDMVENIIEDFRSTRELTIRAIRLVQDEGDDALEDTLIAFKNDLDKNIWMLQAFIGKEALEDDDAFDEDED >NZ_CP046123.1|WP_154694175.1|980810_981973_-|IS3-family-transposase MSKRTRRTFSQEFKQQIVNLYLAGKPRVEIIREYELTASAFDKWVKQSKTSGSFKGKDNLTPEQKELLELRKRNQQLEMENDILKQAALIFGPKRQVIDANKHLYPISAMCRILGLSRQSYYYQSKPKKDESELEEVVAEEFIRSRKAYGSRKIKKALSKRGIRISRRKISRIMKNRGLKSSYTVAYFKVHHSTCNEAKTTNVLNRKFLRDNPLEAIVTDLTYVRVGKKWNYICFILDLFNREILGYSCGEHKDAVLVKKAFSRIKQPLTEVEIFHTDRGKEFDNQAIDELLTTFDINRSLSHKGCPFDNAVAESTYKSLKVEFVYQYTFETLQQLDLELFDYVNWWNHLRLHGTLGYETPVGYRNQRLAQRILDNELGCANASEAV >NZ_CP046123.1|WP_005237711.1|989371_989551_+|hypothetical-protein MAKKEYKRMSIKETTQITRQLNAIYKAAHLLQEHFVDKKVSFVGEVSTVAIIFSTTNFI >NZ_CP046123.1|WP_142429341.1|990123_991265_+|IS3-family-transposase MAKANKKFDEDFKKTILDLNQSGQSVEELAEQYGIATQTIYRWKKLHTKNEATGMTEAEILAMKKEMARMQEENTIPKKGFNHIRSKVKMSDVFEFIQSNVHDHDVKQMCTVLEAPKSSYYDWKKKKPSKRQSENKRLNRLISGIYFENKGIYGAPKIHKILVGRGESLSLKKVQILMRKLGLRSVTLKKYKPGKQVKVKSEGRKNLLNQDFTTTSINQKWVTDITYIHTLKDGWTYLSTIQDLHTKKVIGWKFGKQMTKELVIETLDHALLHQTPSENLIIHSDLGSQYTSEAYEAKLNELNIRHSFSRKGCPYDNAGIESFHASLKKEEVYPSKAYENFEAAHLALFQYIEGFYNRKRIHSSINYLTPNQMEELALQA >NZ_CP046123.1|WP_005225225.1|991848_992541_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MAHHHHHSHIDCIRLVPIFNHLNEEQMSLIAQSAQEVHYAKNALLFGNGDKDDTLYIINNGRVRVYNLNESGREQTVRILNPGDFMGEVAIFQTESYHSNYAEAISEVSICRIHKKDMDDYLGAYPEIMRRILSDVTKRLQVSEKQTMQVGMEQVESRIIDFLSEYVEDEENHTYVTLPMSKKDLASYLGTTPETISRKFSSLEERGLIKQHTQKYVEIFDLDKLLFASS >NZ_CP046123.1|WP_086293250.1|992651_993083_-|hypothetical-protein MVYPESAPKNWREILDETHMRWIESPLHDKDFNPDGTIKKPHWHVMLSADGPITLKAVEKIIEPLNVPAPQKVGSGRGMIRYFIHLDNPEKYQYSRDEIVGHGGADVESYFELTKTNKISVMKDIATYIYENEIDNYADFLGF >NZ_CP046123.1|WP_154694252.1|993037_994228_-|plasmid-recombination-protein MSYLVARMQKMKAGNLVGMGNHNQRLTDNHSNKDIDTERSYLNYDLVNRTDNYKTDIQQFINDNKSSSHAVRKDAILINEWIITSDNQFFKDKDDKEIKDFFEQAKDYFAEKFGDNNIRYAQVHLDETTPHMHLGIVPFNAEHKLSAKTVFNRQAFQAVQDELPTYLQERGFNLERGEKGSERKNLTVSEYKKAKDELKEMTTTLEQRKSEVLALSNDKTPTIKKESLDLKDEMKTVKVPSGETIDIGKLRHEFMKNEERKTGNVIIPKDKLNALIQGYEDLYSSNERLKKYVETDLPKEITKVKGKYSELVKEYNDLVRKSNRNIETIEDLEKENKSLKNEIKGIYRGFTAFFEKSKSVTAEQIKTLVEGVVSEVKEFGHLLCIQRVRQKIGERF >NZ_CP046123.1|WP_114148892.1|994384_995796_+|IS3-family-transposase MAKYPFELKLKIVKEYLSGVGGYRYLANKYGISSKSQVSNWVNAYREYGEEGLLRKHQNQKYSVQFKLNALELYQTSEMSYREVASTLEMNNPALIANWMRNFREAGIEGLSKEKGRPLTLTRKKENKKENTTTEERERIKALEKQVRSLQIENAFLKELRKLRKQEAQQRRKNQSHESSPASEDPFKLVELLETLKFPKATYMYWQKRFDRPNPDQEIEEKMLEIRKEHKDYGCLRLKKELENQGIHVNKKKIQRLIKKLGIEVKSYTRKSRRYNSYRGKVGTVAKNRIHRRFYTNICHQKITTDTTEFKYYEVDTTGVVRQKKLYLDPFMDFYNSEILSYRISEKPNALAIMEGLEEAIQMTNDCPFRRTFHSDQGWAYQMNAYKNKLKQHKIFKSMSRKGNCLDNSPMENFFGLLKQEIFHGEVYRSLDELKTKIDQYIYYYNHKRIKKKLNWRSPVQFREAVKTAV >NZ_CP046123.1|WP_154694253.1|995887_996514_-|CadD-family-cadmium-resistance-transporter MGQTIISAIGVYISTSIDYLIILIILFAQLSQNKQKWHIYAGQYLGTGLLVGASLVAAYVVNFVPEAWMVGLLGLIPIYLGIRFAIVGEGEEEEEEEEEIIERLEQSKANQLFWTVTLLTIASGGDNLGIYIPYFASLDWSQTLVALLVFAIGIIIFCELSRVLSSIPLISETIEKYERIIVPLVFIPLGLYIMYESGTIETFLNFIL >NZ_CP046123.1|WP_154694254.1|996914_997109_-|hypothetical-protein MTGKFKDELLTVVADNDLKNIIQLRRYFENHSDEFTFKNITRFHQTINNNVDVFGLYFGGNLQN >NZ_CP046123.1|WP_086293440.1|997976_998240_+|hypothetical-protein MDSLSLLEIMTNAKLEQDHTKIQELFSSDVYQEAVTMSKKVVRNKNYRFKNRKDESKKEEKKKVKSVQEDVKKERDFNDIVSQYLPK >NZ_CP046123.1|WP_081132265.1|998570_998924_+|hypothetical-protein MIYTISDIQKLCTPIFLEWEIKKAFLFGSYARNEATETSDLDILIDGEGSLLHNIFDVIRLKSKLSSALKKEIDLITLRAINSETNKKRNPLLKENIEADCVMIYDFKTSDSFKVKG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046123_2 | 3154636-3154776 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046123_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046123_2
>2.1|3154689|35|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder GGTTTCATCATCTGCTCTGTGCGGCTTGCGCCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046123_2
The CRISPR arrays of NZ_CP046123_2 >merge|NZ_CP046123|2|3154636-3154776|CRISPRCasFinder CAGTCGCAGTGATTCCGCTGCTTGGTCACTACCCTCGCTGCTCTCGCCTAGTAGGTTTCATCATCTGCTCTGTGCGGCTTGCGCCGCTCAGTCGCAGTGATTCCGCTGCTTGGTCACTACGCTCGCTGCTCTCGCCTAGTA >NZ_CP046123|2|2|3154636-3154776|CRISPRCasFinder CAGTCGCAGTGATTCCGCTGCTTGGTCACTACCCTCGCTGCTCTCGCCTAGTA GGTTTCATCATCTGCTCTGTGCGGCTTGCGCCGCT CAGTCGCAGTGATTCCGCTGCTTGGTCACTACGCTCGCTGCTCTCGCCTAGTA
>NZ_CP046123.1|WP_010749123.1|3152286_3154404_-|polyribonucleotide-nucleotidyltransferase MTEKQVFKTTWGGRPLEVEVGQLAKQANGAVLVRYGDTVVLSAAVASKEAKDTDFFPLTINYEEKMYAVGKVPGGFIKREGRPSTEATLTARLIDRPIRPMFAEGFRNEVQVTNIVMSVEQDCTPAMAAMLGSSLALSISDIPFDGPIAGVDVGRVNGEYVLNPTVEQAEQTDIELTVAGTKKAINMVESGAKEVSEEDMLGALLFGFDAIKELVAFQEEVVAAVGKPKMEVKLLQVDADLKKEIFDGYYQTMKTAVMTEEKLAREDEIDKVKDTVKEVYAEKFAGHEEEAQFLKEVKQIAEDLEKDVVRELITIDKIRPDGRQLDEIRPLASEVGLLPRVHGSGLFTRGQTQALSACTLAPLGEHQIIDGLGVEESKRFIHHYNFPQFSVGSTGRAGSPGRREIGHGALGERALAQVIPDETDFPYTIRLVAEVLESNGSSSQASICAGTLALMDAGVPIKAPVAGIAMGLVSDGKNYTILTDIQGLEDHLGDMDFKVAGTKDGITALQMDIKIQGITEQILTEALDQAKKARMEILNELTSTLAAPREELSQYAPKIEMIQIDPAKIKDVIGKGGDTINGIIDETGVKIDIDQDGKVSIASADAEMIQKAIKIIEELTKEVKVGEVYLGKVVRIEKFGAFVNLIKGKDGLVHISQLANERVNKVEDVVKEGDEILVKVTEIDKQGRVNLSRKALLNEDKAEKK >NZ_CP046123.1|WP_010749124.1|3150675_3152076_-|glycoside-hydrolase-family-1-protein MKQTFPTDFLWGASISAHQTEGAYQTDGKGLSVQDTRPRDNHEIADFTVAVDHYHKYKEDIALLAEMGIKIFRFSIAWSRIFPEGRGTINQKGLDHYSDVIDELLKHGIQPFVTLNHFDLPQALEEEGGWTKRSTVEAFAAYAKTLFTAYGDRVTHWLTINEPNIMLLVDQKILGKKIPLSEKYQQFHHLMIAEKYAFEACHEIVPNGKIGPVPNISLVYAATSRPEDNQAALYFNSVRNWAYLDFACFGRYNTVFQDYLNQNGLTIDFGPEDEALMKRALPDFVAMNFYTTVTVEQPTEAGDMKNGISDQQSEDIMERGFYKGFTNTFLKKNAFNWTIDPLGLKTTLQTLYDRYYLPIIITENGLGAEDHLEADGTVHDPYRIDYLSQHISQCLAAINAGVDLIGYSPWSAIDLISVHEGIRKRYGFIYVDRNDAQEKEQKRVRKDSFYWYQKLIEEGAIPSLEE >NZ_CP046123.1|WP_154694622.1|3149332_3150673_-|PTS-cellobiose-transporter-subunit-IIC MTSVFTFLETRLMPPLNKLANLRFIRAIMQAGIITVPFTIVGSIFLIINNLPQIIPPLAGFFEQTILRFSPLYSVVTTMSVGSIAVFYCLATGYYLTEIYHKEDHLTMSSFVGALLSLFAFLMTIVQVDITDGAAQLLQSESETAIVYNGISIGGWITRFSGVGIFIGIITAVLATAVYRFCVRRKITIQMPEGVPDGVSKAFASLIPAILIAFLMVAINGVLAVFHTDLHGLLSKPFEFVKELTGSWLGIIVIMLLIHLLWAVGVHGTAVIKNSFINPILLVALTENIDGANNIFAGDFVNMYIFMGGAGSTLGLVLLMLFVAKSQQLKVLGKAAILPGLFNINEPVIFGAPIVYNPYLIIPFIITPLINVTIAYFASSFGFVDKVITGIPWISPVGIGAFLGTGGDFRAILIALINLGVSILCYYPFFKMYDGKLYTEQLANHA >NZ_CP046123.1|WP_010749126.1|3147329_3149252_+|cadmium-translocating-P-type-ATPase MSKSESSAVFSTIACLLLMATGFLMASFSIPYSFVPYLLAILAGGWKQTWEGTQELVHDKRLNVDLLMALAAIGACIIGHWFEGAMLTFIFCLSGALEEYTTNKSTREISSLMALQPTTALKMIESGELVEVPVEALQLKDTIMVAKGSAIPIDGIVIQGNSSVDEAAISGESIPVEKRLGSEVFGGTINLGQPLYIEVTQTSENTRFAKIIQLVEEAQQMPSQTATLIEKIERIYVPIVLIAVPLMIVLCTFFTNWGFQESFYRGMVLLVVASPCALVASATPATLAAISHAARLGVLCKGGQALDAFANVKAIAFDKTGTLTRGKPAVTDVHLLLDEPFIPQLIVGMEKQSNHPLAEAILAYFHDEKPLELAVEEQAGVGLAATYQAAHWTIGKEVDLTSVAASEQTRIHELKAAGKTLIYINRDRVLAGYLALLDQPRPEARESLAYFNEQGIHTTMLTGDHLGTAKVIAAEIGLSDYESDCLPDEKTTRIKEMKETYKINAMVGDGINDAPALATASVGIAMGEGTDVAMDVADIVLMKNDLLRLVDSHRLAKKLQRIIKQNIVFSISVILLLIASNFLEFLTLPLGVVGHEGSTILVILNGLRMLLPLHKETPQQAKPTRKDCDDCVLYQQSLHT >NZ_CP046123.1|WP_010749127.1|3145994_3147035_+|type-2-isopentenyl-diphosphate-Delta-isomerase MNRKDEHVSLAKAFHKEHSNDFDAVRLVHQSFPQIDVADVSIATTVFDRSFSSPFFINAMTGGSEKTLKINQELAEIAQACELMMATGSVSAALKDPSVADSFRIVRKANPDGFLLANIGAGSPVENAQRAVELFDADALQIHLNAPQELVMPEGDRQFSQWLSLLEKTMASVAVPVVVKEVGFGMSRETIQQLLAIGVQTIDVAGSGGTSFTQIENARRKKRELAYLDTFGQSTVISLLEANEIQQPFTRIASGGVRDAYDIFKALCLGADSVGLSATILVLLLSKGKEETIATLQSWKEQLQLLYTMAGQTSTKDLTKVQLIFSGAVKEWCEARQIPLAKYSLR >NZ_CP046123.1|WP_010749128.1|3144915_3145998_+|phosphomevalonate-kinase MIELSVPGKLFIAGEYAVVEPGHPAIIVAVDQFITVTVEEARKNGSIQSAQYSDLPIRWTRRKGELVLDHRDNPFHYILAAIRLTEKYAQEKGIPLSFYDLKVTSELDNSNGRKYGLGSSGAVTVATVKALNLYYQMEMDRLTQFKIAALAHLAVQGNGSCGDIAASCYGGWIAFSTFDHDWVLTKQKDHTLTELIAFDWPGLSIRPLTVPKSLRLLIGWTGSPASTSDLVDQVYQSKEEKENAYAAFLAASKDCVNRLIDGFLNEDSRTIKKMITENRKLLRELSALTGVPIETPALKKLCDLAENYCGAAKSSGAGGGDCGIVIVDQKTGILPLMSAWEKAEITPLPLHVYHYREDLS >NZ_CP046123.1|WP_005228088.1|3143880_3144879_+|diphosphomevalonate-decarboxylase MYKGKARAYTNIALIKYWGKQDETFILPMNNSLSLTLDAFYTETTVAFSPDFTQDRFTLDGVVQTDAATKKVADFLDLVRKKADCPWYATVESQNFVPTAAGLASSASGLAALAGACSEALDLNLSEQALSRLARRGSGSACRSIYGGFAEWHQGTDETSFATQVPSNGWEEELSMIFILINAQAKEVSSREGMRRTVETSSFYPGWLSATASDLVKMKQAIAEKDFTALGETTEANALKMHGTTLAAEPPFTYWSSESLRAMECVRMLRKKGLACYFTMDAGPNVKVLCQKQEEQTILRELSAHFASEQLVTAHAGKGLAFLPVEESSPIN >NZ_CP046123.1|WP_080647016.1|3142919_3143888_+|mevalonate-kinase MWGKLPKEMRKIMSIGTGIATGKIILMGEHSVVYGEPAIAFPFAGAKVQVEITANEKNTLISSYYHGLLEEVPSHLKNVKDLLHRLQQDFHTGPFATSIVSTIPSERGMGSSAAVAVALTRAFFDWIKKDFTKEELMTYVNFSEKIAHGNPSGIDAAAASGTDAIYFIKGHPITSFPLTIDGYLLVADTGIKGQTREAVKSVAHLFETSKQLASQAIQRLGIETKRAKEAIIANQLEILGESMNNAHQALQQLGVSNQQLDQLVSSALAHGAYGAKLTGGGRGGCMIALTKTKEQAENISRILLSDGARAAWIQGLGVYEHV >NZ_CP046123.1|WP_034696309.1|3142005_3142668_-|deoxynucleoside-kinase MSELGDMSVIVLAGTIGAGKSSLTALIANHFGSQAFYESIDDNEVLPLFYADPNKYAFLLQIYFLNKRFESIKQAMKDDNNVLDRSIYEDSLLFHLNADLGRATDTEVKVYDELLANMLEELPYAAHKKHPDLLVHIRVSFETMLERIEKRGREYEQLTFDPSLYDYYKELNKRYDQWYEEYNESPKIQIDGDQFNFVEDPQAAQAVLTMVEDALKDARK >NZ_CP046123.1|WP_010749131.1|3141010_3141916_-|magnesium-transporter-CorA-family-protein MENKHVFYDGNYEWIQVDQQDAKSVMALQKQYHLSDEMLTYSLDKNERARVEYDAEEEALLLVFNVPQQEKRDNHFETSPMTFILKKKQIFTFASHDTRYVIPMMERLILQKPQQTPLHFLFQSLFLISGTFFPLVEEVNSDRIRLNQRLREKTTNKNLLQMSDLEVGLVFLVSATKQNAVLLEQIKALSIYRLMDDDEREQLDDALIEAKQAVEMTLLAFQILEQLSGTYNNLLNNNLNDTMKFLTVWSLLLTVPSIVTSFFGMNVPLPFTNSIFGWGIALLISLVLSVWMLIALWRRIR >NZ_CP046123.1|WP_005228072.1|3154874_3155144_-|30S-ribosomal-protein-S15 MAISKERKNEIINKFARHEGDTGSPEVQIAVLTEEINHLNEHARMHKKDHHSYRGLMKKVGHRRNLLAYLRQKDVQRYRELIQALGLRR >NZ_CP046123.1|WP_005228070.1|3155360_3156221_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSVLSRIESMKNELSLSEKKLFAFMEANPEKVPSMTASQLAEATGISAPTVVRFAKKTGFASLTDLKIQLSAESGLRHNANEHLGYADVELNEPFHAITSKLSHNAQVTMNETAQLLEEQLMLAAAELIATRERIFVCGIGASSLIAQDIQQKWTRLGKIVVFENDYNLLLPQLVKNEKKSLVWVISNSGHTPEMVHLAEIAKNLGVPILSLTRFGSNPLTKLADVPLQVSRSKEANQRSAATNSIIAHLLAVDVLFYVFLSKNEKLARNIYASRQAIADFREKYL >NZ_CP046123.1|WP_010749122.1|3156448_3157759_-|family-20-glycosylhydrolase MNEAHNEFVDYKKATALFATMGWQMPDHQPQIVLRPSLDADFRFEKQQIIVSTPEKVYPATTKYWRDFFTDQLREGSYAAAIPERCLMIDIGRKFYSLMDLKAVVRSMACFQFTHLQLHFSENEGFRIESEQFPEIVSEEYLTKQEIRELIAYAHEHRIAIIPDFDSPGHLRQVLAQKPEWQLPTADGTRDDRALNILDSEAVAFIQEVYREYAQLFEDSTYFHIGADEFIDFDHLENFPQMIEAARERYGEKASGIEVFIDYVNELAAFVESLGFVVRVWNDGFYRLNRQEQTTLTENCQISYWTRWNQNMAPADVFFEKGYTMINHNDNFFYYVLGEAAGYTYPTYEKISNEFQLTTFANGQQVAQEQLAQTQAIALSVWADVPEAQTSREVIQAIFWLQAAIAQKVYQEKDRPKAAYQKLFDSWVVSYLEEEQ >NZ_CP046123.1|WP_010749121.1|3158081_3158621_-|hypothetical-protein MKNGIIVYQSKYGAVKKYVHWLQDATGFSSLETPKAKIAEVMDYDTIIFCGGIYASGIAGLSFLKKNTNQLKDKEILIFCAGASAPEEDVVKKLKEQNLTGPLKDIPLFYGRGQWQESKMNFFDRNLVKMLRKAAAKKAPHTYDPQMKALMEANGQDCDWTDKKYLGPLVDYLEQGLFQ >NZ_CP046123.1|WP_010749120.1|3158654_3159224_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPKQRITKEMVVDAAFEIARKGGMEHVIVKNIAEKLGCSVQPIYSYCTNMEGLRTEVEQKARQFLQAYLEAHSDPQDLFRSTGHAYLQLAKEEPHILSIFVLQKRANVSSLEDLYQLETNPQVAQRIAADLTISIETAKQLHMHMLIYTIGIGTIFSVTTPGIPLDEIYAQQEKAYETFLEQAIAGTKP >NZ_CP046123.1|WP_010749119.1|3159505_3160687_-|AI-2E-family-transporter MKETQKKPHSWFWKWFLNNQAVTSLLVILLILLILLLFTKVSYLFEPVWQFLAIVGLPIILAGILYYLMNPTVDYLERKGIKRIYSIFGLFILVVGLIVWGVVVIIPKIQEQSMSFADNLPGYLTIIENKVNEILSDPIFSQVQEQIEASNEKLISSLTDIVQNLSRSTIQNLGSFFGAVATIVLAVITMPFILFYLLKDGRKLAPYFVKFLPTKMRQPSLVVLKEMNDQVSSYIRGQLTVAFAVAVMFMIGFSIIGLDYAITLGIAAGFLNLIPYLGSFLAMIPAVFLGIVGGPVLLIQVLIVFVIEQTIEGRLISPLVLGNELSIHPVTILLVLLTSGKLFGLVGVILGIPVYAAAKVVITHVFEWYTRVSSLYKEEEPIPEAPPENTPEV >NZ_CP046123.1|WP_005228025.1|3160702_3161056_-|PTS-glucitol/sorbitol-transporter-subunit-IIA MKKGTIKEIGPQAIDSQERMIIFFGEEATDTLREYSVIQTIPDSQALVVTKGDQITFGDQTYQVQYVGTVVNQILQTIQHVTFVFDEVPAEDQLSSAIYLTPTVLPKLEVGMQVTYD >NZ_CP046123.1|WP_010749118.1|3161174_3162197_+|lactonase-family-protein MLQTIYLGTYTRRESKGIYSIALDTEKGTLTDLTLCAEEKSPTYLARSKKEAVYSVTEVDGNGGAAAYTPDFTLLNTATEEGAPLCYVAVDETRQLLYGANYHKGEVNVYKILEDGSIEATDSIYHDEPVGSHENQDKPHVHYTDLTPDQRLAVCDLGTDRVYTYDISEDGKLTEVAVYVAEDGTGPRHLVFHPTNQYAYLVGELDSSLTVLRYNEADGSFENIQKVPTIPADFTDFNSGAAVRISNDGRFVYSSNRGHNSIAVFEVTDEGAGLTFVQSISTEGDFPRDFDLDPTNDYLVCANQNSDNLTLYKRDEATGKLTVLEKDIYAPECVCVLFKK >NZ_CP046123.1|WP_005233740.1|3162216_3162567_+|hypothetical-protein MFDKTPKELVLKDFSNIYNKCQSTFELVTSRKYNESLVLLTTAETYAIAEKAYIRCDTAKELQTAEVIAFFDAFEIYYFELKQVLFHDDDDFVSLKNRLEKMKDTYEALTASFHLL >NZ_CP046123.1|WP_034696319.1|3162909_3164460_+|IS1182-family-transposase MYTNYNMNQLTLDLSTSFSPKENHVAVFIHELVEALQINDPYLFGRPREYDLGAMLKLVLFAYTRETFTSRKIERLAEENLYARWLTQERVPTYRTIARFCVSNDVQELTNKGLDQLTEYLRARNLIDDALFIDGTKILADANKYSFVWKKNTIRFDQMNREKLLTMMTELREAYALKQIPEGTTLTVDMIDELLTRMELRLEELEKEVEATKRLSPNPAKQQRRTLKSQVRKLNTKREKVLEHQTQFSTYGTRNSYSKTDHDATFMRLKEDPMKNGQLKPAYNLQIATCNQFVLGYDVFQNPTDTKTLKPLLEKMKIAQKSPHYLVADAGYGSESNYRYIEDELPQHTALIPYGTMFKEQSKKWQTDDRKVMNWDYEPKEDFYIDPKGVRFNFHAYRQRTDADGFVRDFKEYQAEKTDANQALIPEALTPKGNRRKITVNPSWEYHKEKQKERLSTPEIQKIYGRRKIDVETVFGFMKACLGFTRYTVRGLEKVRKQTGLLITAINMMKLTKIGT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_CP012385 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence | 115087-115111 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135340 | Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2 | 61608-61632 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_CP012367 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence | 146682-146706 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135298 | Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2 | 167426-167450 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | MT074686 | Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence | 186269-186293 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135279 | Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2 | 103666-103690 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135198 | Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2 | 171062-171086 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135182 | Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2 | 142461-142485 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_AP022823 | Enterococcus saigonensis strain VE80 plasmid pVE80-1, complete sequence | 53060-53084 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135365 | Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2 | 154412-154436 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135415 | Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2 | 187352-187376 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135395 | Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2 | 187352-187376 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135345 | Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2 | 136374-136398 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135409 | Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2 | 187352-187376 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_LR135385 | Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2 | 185805-185829 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_CP040704 | Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence | 15460-15484 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_CP044275 | Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence | 148556-148580 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_CP018066 | Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence | 126397-126421 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_AP019409 | Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence | 129782-129806 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NC_020208 | Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence | 33029-33053 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046123_1 | 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder | 989248-989272 | 25 | NZ_MG674581 | Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence | 114355-114379 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012385 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135340 (Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012367 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135298 (Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135198 (Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135182 (Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022823 (Enterococcus saigonensis strain VE80 plasmid pVE80-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135489 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135365 (Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135415 (Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135395 (Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135345 (Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135409 (Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135385 (Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040704 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044275 (Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018066 (Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaactcgatacaaatccggaacg CRISPR spacer ctaaactcgatacaaatccggaacg Protospacer *************************
20. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaactcgatacaaatccggaacg CRISPR spacer ctaaactcgatacaaatccggaacg Protospacer *************************
22. spacer 1.1|989248|25|NZ_CP046123|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG674581 (Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaactcgatacaaatccggaacg CRISPR spacer ctaaactcgatacaaatccggaacg Protospacer *************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
753531 : 762258
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046123|753531:762258|DBSCAN-SWA AATGAATAAACTAAGAAGCGATTTTTTATGGGGTGGCGCAGTCGCTGCTCACCAATTGGAAGGCGGCTATCGTGCGGGTGGAAAAGGCGTGAGTGTCGCTGATGTCATGACTGTCGGAGGCAACGGAATTCCTCGCCGAATCACGGAAGGGATCCAACCGGGCGAAAGCTATCCCAATCATGAAGCGATCGATTTTTATCATCGGTATCCTGAAGACATCAAGCTTTTTGCCGAATTAGGGTTGAAGTGCTTCCGAACATCGATTGCCTGGACCCGTATTTTTCCAAAGGGGGATGAGCACGAGCCGAATGAGGAAGGCCTGGCCTTTTATGATCAATTATTCGATGAGTGTTTAAGCTATGGCATTGAGCCAGTCATTACCCTGTCTCACTTTGAAATGCCTTATCATTTAGTGACCGAATACGGAGGTTGGCGTAACCGTAAATTGATCGATTTGTTTGTCCGCTTTGCAGAAGTTTGTTTTACGCGCTATCAAAAGAAAGTGAAGTATTGGATGACCTTCAATGAAATCAATAATCAAGCAAACTATAAAGAAGATTTTGCGCCATTTACCAATTCTGGTCTGTTCTTTACGGAAGGAGAAGACCGAGAAAAAGTCATGTACCAAGCAGCTCATTACGAGCTCGTTGCCAGTGCAAAAGCGGTGGTGCTAGGACATGCGATCAATCCTGCGTTTCAAATCGGATCGATGATCGCGATGTGCCCAATCTATCCGTATTCTTGCGATCCCAAAGACATGATGGCAGCCACGGTGGCCATGCAACGGCGCTATTGGTTTTCAGATGTTCATGCCCGTGGGCACTATCCGAGTTATATGCGCAGCTATTTTGAAAGAAAACAATTTGATTTAGATATCACCCCTGAAGATGAAGCAGCTTTGGCAAAAGGTTGTGTTGACTACATTGGTTTTAGCTACTATATGTCTTTTGCGATCAAAGGCAAGGAGAATGATCCAACCTATGACTATGATGAGAGCCAAGATCTGGTGGACAATCCTTATGTCGATGCTTCTGAATGGGGCTGGCAGATTGATCCCGTAGGCTTGCGCTATGCCATGAACTGGTTTAACGAACGCTACGAATTACCGCTTTTCATTGTAGAAAATGGCTTTGGTGCGGTGGATACGGTGGAAGAGGATGGACAGATCCACGATGACTACCGTATTGACTACCTAAAAGCCCATATCGAAATGATGAAAGAAGCAGTAGCTTATGATGGCGTCGACTTATTAGGTTATACACCGTGGGGCATCATTGACTTAGTTTCTGCGGGGACAGGGGAAATGAAGAAACGCTATGGTGTGATCTATGTGGACAAAGACAATGAAGGAAATGGAACCCTTGCTCGTCAGAAGAAAGATTCATTTGCATGGTATCAGCAAGTGATTGCGTCCAATGGCACGAAGGTCTAAAGAAAAAAACGTTACGCAAAATTTCTGCGTAGCGTTTTTTCTTTAGGGCATTTGGATATAGCCGTAATGAAGCAATAACTGAATAATAATAACTAAAGTGTTCATTCCCACATGGGTGATCATGGAAGTCCAAATACTGCCGGTCAAAGCATAAAGCCCAGAAAAGAACAGTCCTAAGAAAATATAGACTAAGAGATGATTGTCATTGTGGGCAAAGGCAAAGGCTACGGCGCTGACCACTACACCAACCCAAACATTGCTGTATTTCCCAATGATGCCAACTAAGGCTCTGCGGAAAACAAATTCCTCCATAATTGGCCCACCGACCATTGCTGCGAGAGCAAAGAGTGGGTTTTGCACCACGATGGCAATGATGTTTTCGGTATTTTGCGAAGCGCTGACTTCTCCGAAAAAGGATTCGATAAAGATGGCTAGATTTTGCAACAAAATCGCTGCGACAATGCCGGTTAGCCCGTAAATAAGAATCGCTGAGACTTTGGTTCTTTTGTGTTCAAACGATAGCGGTTCTGTTTGTTTGAAATACAAGAAAAACATGATCGCTGCACCAGCTAAGTAACCGATCGTTGTTGCTGCTACTTGATGTCCGCTAGGGACGAAGGCGATCGGTAGAAAAAAGACGATGCCGTAAGTAAGAATCGTGGACAAAGAATATTTTGATAAAGACATAGTTGTTTCCTCACACTCCTTTGCTTCATTATAGACTAGGTTGCTTCTAGAAACAAAAAATCCTACTATATTTATCAATCAATTAGAAATGCAAAAAAAATTTAGCAAAAGGCTTGCAAAAATTTGGGAAAATGAGTAATATTGAAACTGTAAGTTAGCACTCGATACAAGAGAGTGCTAATGCTAAATTCTATAACATTCATTGGAGGGATTTATCGTGTTAAGACCATTAGGTGATCGTGTGATTATCGAAGTCGCAAAAGAAGAAGAAAAAACTGTAGGCGGAATCGTGCTTGCATCAGCAGCAAAAGAAAAACCACAAACGGGTACCGTTATTGCAGTCGGCGAAGGACGCACGCTCGAAAACGGTGAAAAAGCTCCTGTTGCTGTCAACGTTGGCGAACAAGTAATGTTCGAAAAATACGCTGGCACAGAAGTGAAATATGAAGGAACAGAATATTTGATCGTTGCTGCAAAAGATATCATTGCAGTAGTAGAATAAGAAAAATAAAAAATACTTGAGGTGATGAAATCATGGCAAAAGAAATCAAATTTGCAGAAGACGCACGCGCAGCAATGCTTCGTGGGGTAGATAAATTAGCAGATACAGTAAAAGTAACCTTAGGCCCTAAAGGTCGTAACGTGGTTTTAGAAAAATCTTACGGTTCACCATTGATCACAAATGACGGTGTAACGATCGCTAAAGAAATCGAATTAGAAGATCATTTTGAAAACATGGGCGCAAAACTTGTTTCTGAAGTCGCTTCAAAAACAAACGATATCGCTGGTGACGGAACAACGACTGCTACGTTATTGACACAAGCAATCGTTCGTGAAGGATTGAAAAATGTCACCGCTGGTGCGAACCCATTAGGTATTCGTCGTGGGATCGAAATGGCAACAAAAGTGGCTGTAGAAGAGCTACACAACATTTCATCAATCGTTGATTCAAAAGAAGCAATCGCACAAGTTGGTGCTGTTTCTTCTGGTAGTGAAAAAGTTGGTCAATACATCGCTGATGCAATGGAAAAAGTCGGCAATGACGGTGTTATCACTATTGAAGAATCAAAAGGGATCGAAACAGAATTAGATGTTGTGGAAGGAATGCAATTTGATCGTGGTTACTTATCACAATACATGGTAACTGACAACGATAAAATGGAAGCAGCGTTAGAAAATCCATACATCTTGATCACTGACAAAAAAATCTCTAACATCCAAGATATCTTGCCATTGTTAGAACAAATCTTACAACAATCAAAACCATTATTGATCATCGCTGATGACGTTGATGGCGAAGCATTACCAACACTTGTATTGAACAAAATCCGTGGAACATTCAATGTTGTCGCAGTGAAAGCACCAGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGCTAGAAGACATTGCGATCTTAACTGGTGGTACAGTGATCACTGAAGACTTAGGTCTTGAGTTGAAAGATGCAACCATCGATAACTTAGGTCAAGCAAGCAAAGTGGTTGTGGATAAAGACAACACAACAATCGTTGAAGGTGCTGGTGAAAAAGAAGCAATTGACGCACGCGTTCAATTGATCAAAAAACAAATCGCTGATACAACTTCTGACTTTGACCGTGAAAAACTACAAGAACGCTTAGCAAAACTTGCTGGTGGGGTTGCTGTGATCAAAGTTGGGGCACCAACTGAAACTGAATTGAAAGAATTGAAATTACGTATTGAAGATGCATTGAATGCAACACGTGCCGCTGTTGAAGAAGGCATGGTCTCAGGTGGGGGAACTGCCTTAGTCAATGTCATCAACAAAGTTGCAGAAATCGAAACAGATGGCGATGCAGCAACAGGTGTCAAAATCGTTTTACGTGCCTTAGAAGAACCAGTTCGTCAAATTGCTGAAAATGCAGGCTACGAAGGTTCAGTGATCATCGACAAATTGAAAAACGCTGACTTAGGCGTTGGTTTCAATGCAGCAACTGGCGAATGGGTAAACATGCTAGAAGCTGGGATCGTTGACCCAACAAAAGTGACGCGTTCTGCATTACAAAACGCAGCTTCTGTTGCCGCATTATTGTTAACAACTGAAGCAGTCGTTGCCGACAAACCAGAACCAGCAGCGCCAGCAGCTCCTGCAATGGACCCATCAATGGGTATGGGCGGCATGATGTAGTTATAATAAAAGAACCTCTATTTATAGGGGTTCTTTTGTTTGTTTAATGTCAATTTTATACAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAATTACAAATTGTTTAATCGATCGACAACCTGCTCTTTGGATTTTTTGGTTACGTGATTATAAATTGATAAAGTCGTGTTGGCATCGGAATGTCCGACTCTCTCCATTATGGTTTTTAAAGGAAGATTCAATTCAGCTAGTAAAGAAATATGACTATGTCTGAATATGTGTGAGGATAAGTTTTTATCCCATTTTAGTTCGTCTTGAACTCTATGCAGTACCATATTAAAGCTATGGAGAGACAACGGAGTACCTCTAGATGATTTTAATATATAATCCTCGTTACTTTGGGAGCCGAATACTAAAGAGTTGTGTTCTATGATTTCATTAACAATTTTTACTGCTCTATTAGGCAAAGAAACTATTCTTTTAGAATAGATATTTTTAGGTGAAGTTTTTATAGCATCTGCCATTTTTAAGAAAGAATAGTCCAATGTGCCGTTAATATCCAAAGTACTCCCGTCAAAGTCCTTTACTTGTAATGCCTGTAACTCTCCGTATCTTAGGCCTGTTAAATATAACAATTCTGCAATGTTAGCGTGCAATAATCTTTTAGTAGATTTTCTCATATATACAAGCAACTCTGTCATTTCGCTTTGATCAAGGTATTTTTCATCCATGTTCTTTTTTCTTTTTTCTTCTTCAGCTTTTTTTCTTTGAATTTTGACATTCAGCGCTAGATTTTGTTTAATATACTTTTTCTCAACTGCATAATTCAACATGATTGAAAGGGTCGTCTTGGTCTGTTTCGTATAATTCAAGGATAGATCACCGAAAGTATACATTTTTTCTGTAATATTACGAATCATATTCTCGTCTATATTTCGAACAAGAACATCGTCAGATATAACTTTCTGAATATGTTTCATCATCTTTGGAACTTTGGTCCAGCTTGTTCTTTTTACATGTTGTTGATAATAAACAAACCACTCTTCGTAAAGCTCCTTGAAAGTGATGTCAGATTTATCATAATTACTCAAAGCTTCCTCTATTTTTTTGTCTAATATTTTCTGTGCATTCTTCCAGGCTCTGGAAGAATCACTTGTTAGAACAGTACTTGTCTTTTTCCATTTTTCGGTATAGGGATCTTTGTATCTTTCTATAAACTTATATCTTCCGTTGCCTAAAGATTCGCTCCACATTGTGTGTACCTCAATTCTTTGTTACAATAGGCATGACTAAATAAGCCTATCGTTTATTTTGTTTTGCACGCCTGTCTTTGGTCGGAGGGGCGTGTTTTTTTCTTTACTCGTAATAGCCTTGTTCGATAGCTTCTAATGTTTGAATTTCACCAGATATTAATTCTCTATCTCGAATACTTTTTATTTCATTATATATACGTCTTGCATTTTCAGAAGTTCCTTCAGGCAATGTTGTTTGCTCAGCTTGACTACCATTAAATGAATCTTCATATTGACCGGAACCTACTACATAAGTTTCGTTTTCACTAGCTCTGACTGCTTCTTCCCAATCCTCGGCTGTCCAGCCTTCAGCCTTTGCTTTTTCCCACTCAGCTTCACCTTCTTGCCAGCTTGCTGGCATATCGGAAAGGCCTTCGTTATAGGAACTATCTTCATTGGGATTATTTGTATTGGCTAAAGATTTTGTTTCTTCAGGCTTTTCTAATTCAGTCAAATCAATTTCATAAATACCTATTTCTTTATCTTCATACATAGCTATCATTTTAACTGGGAAATCTAAGTTATCCAGAGAGTAAGTCTCTATTATGTCCACGGTTTTATCGGGTAACAGTTCATCAGAACGAGAGTTTTCTTTATCAACTTGCTCATTATATGATTCGACATCATCTGTTGATCCAAATGCATCTAAGCTATAGTAGGTATTATCGAGATCAACCTCAGAAGTTTCATTCTCTTGTTTAAATAAAACGTAATCATTAATAATATCAATAGGTGTGATATTGTTATCTGAAGTATTCTTTAATGAATACGTTATATATAACCCATAGCCATCTTCAGACGGACTTTTAACTATTTCAGAATTTTTATAAGTAAGTTCAAACTCGTCAGTAATGATTTTCCCATATTCGAAGTCAGCTTTCTGTTCTTCAGAAACAGAAGTCGTTTGAGAAGTTGTATCAGTTGGGGGAGTTGTACTTTCTTCATTATTAGAACATCCGGTCATTATTAAACCAACAAACAATAAGCACGGTACGACTTTTTTCATCTTCTTTCCTCATTGTTCGTTGATGATATTGAAGCAATCTGCATTATTCCGTTGAATGAAGTTGCTTATCATGCGAATGATATCCAAAAATATGTAAATGGCCAACCGTACTATCCACTTAGAAGTATCTTAGGAAATGCTAACTACTCCACGATTGGGGTTGAAATGTGTTTGGATAAGAAGGGAAACATTACTGAAAAAACTTTCCAAAACACTGTTAAGGCTGTTAAAGAATTGATCGCTATCCATCCTAATATTACAAGAGAAAAGATTTGGCGACACTTTGACGTAACAGGTAAGAATTGTCCGGCTCCTTGGGTAGCAAAGCCAAGCGAATTAGAACGATTTAAAGATGCAGTCTTTGGCTCGAATGGGAATTCTAGTAATAACAACACTTCATCAGAAAAGCCAAGCACGCCAGCTAGTAAGCCAAGTTATATTACCTTATCAGTAGATGGCAAGTTTGGTCCGGCTACTGCAAGGCGGTTGCAGCAATATTTTGGGACCACACAAGACGGTGTCATCAGTCATCAGTATAAGCAGAAATTTAATCAGAATATTTATGCCGCACAATTTGATCAAACACTGAGAGGATCTAATGTAATACGTGCTTTGCAGAAATTGCTAGGAGTCTCTCAAGATGGATTAATGGGTCAAGCCACAATCAAAGCATTACAAAAGCGATTGGGTACTACGCAAGATGGTATTATCAGTCCAGTTTCAAACGTGGTATCTGCATTGCAAAAAGTACTGAATACTAACAAATTACCTTAGAACTATTTTGTATATATTTGCAAACCATTGATAGGAGTTGTCAGCATGACTAATGAAACTAGGGCACACATTCGCAGCATACTATGGCAATATAAAAAGATCGAAAAAACATTTAAAGAGTTCTCAGATATTATTGCAACAGATAGGAACCCTTATATGGAGTATCCATTAGGTGAAGAAAATCCAAGCTGGACAATGAATCAAATTTTATTTTACAAATCATTTTTAAGAGTGGTCAATGGTGTTCTAGAAGATTCAACACTTGATGTTAGAGATATATTTTATGTGAAGTATTACAACGGCCATTCTAAGAAATGTATAGCGATTGTAGCTGCGGAAACTTTTCTAAGCGAATCTACTATAAAGAGAAGAGATGCAGAATTTATTAATGAAATCGCAAAAAGATTAGGCTGGCTATCGGTTTGACCTCTTTCTATACCCATTATGGTTTAACATTTAATTAAGGACGTACGTTCACCATGGACGCATGGTTAAAAAGAGAGGGGAAATTAAAAATGGCTAGTATTGAAAATATGATCAAATGGTTTAAGGATCGAGAAGGTAAAGTAACTTATTCAATGAATTCACGTTTAGGACCAAATAGTTATGACTGTAGTTCGGCTGTGTACTTTTCATTGATTGCGGGAGGTTTCTTACCTTCGGGTACAGGGATTGGAAATACAGACTCACTATTTGCGTTAGAAGGTAAATTGCTTACTTCGATTACTCGTTCTGAAGTGAAACGGGGGGACATTTTTGTTGCAGGGTACAAGGGAAACTCTGGCGGTTCGGATGGACACACTGGGGTTTTTGTTGATAGTACAAATATTATTCATTGTACCTTAGGAGGCGGAAAAAATGGAATCGTAACGACGCCAGCTACAAATTGGATGGGAGATTATAGTGGATTGCCAGTATACTTTTACCGATTAAAGGGCGCTAACCCTCCATTTAAGTACAAAGTGGATGACGTTGTTTATATCAAAAACAATGCTACTCATTACTTTAATGGTGACTTAATTAGTGATAACGACAAGAAACTTGCTGGAAAAGTAACGGGTGTTAAGTATGACGATACCGGCCGAAATGGTGAGCATAACTTAGTGTTTGTAAAACAAGTTCAAACACCTACAATTATTAATCACTGGACCTTAGAACGTGATTTGGAGAAGTGGTCTCCAACAACTACCTATATTTCTAATGGTGAAATTGTCAAATTCAAAGCAGCAGCACAGAGAACAGTAGAAGGAACACTATTGACATCTGATCAGAAATCAAAAAGTGTAAAAAAAGTCGATACAATAGATATTGCACCAGTGAATGTTGGTACAGGAACTAGTTATCGTAAGTACAAGCTTGAGGGGATTGCTGGATGGATCTATGAAACTGATGTTCAAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046123|753531:762258|757896_759036_-|WP_154694181.1|integrase|DBSCAN-SWA MWSESLGNGRYKFIERYKDPYTEKWKKTSTVLTSDSSRAWKNAQKILDKKIEEALSNYDKSDITFKELYEEWFVYYQQHVKRTSWTKVPKMMKHIQKVISDDVLVRNIDENMIRNITEKMYTFGDLSLNYTKQTKTTLSIMLNYAVEKKYIKQNLALNVKIQRKKAEEEKRKKNMDEKYLDQSEMTELLVYMRKSTKRLLHANIAELLYLTGLRYGELQALQVKDFDGSTLDINGTLDYSFLKMADAIKTSPKNIYSKRIVSLPNRAVKIVNEIIEHNSLVFGSQSNEDYILKSSRGTPLSLHSFNMVLHRVQDELKWDKNLSSHIFRHSHISLLAELNLPLKTIMERVGHSDANTTLSIYNHVTKKSKEQVVDRLNNL >NZ_CP046123|753531:762258|755004_755649_-|WP_154694179.1|protease|DBSCAN-SWA MSLSKYSLSTILTYGIVFFLPIAFVPSGHQVAATTIGYLAGAAIMFFLYFKQTEPLSFEHKRTKVSAILIYGLTGIVAAILLQNLAIFIESFFGEVSASQNTENIIAIVVQNPLFALAAMVGGPIMEEFVFRRALVGIIGKYSNVWVGVVVSAVAFAFAHNDNHLLVYIFLGLFFSGLYALTGSIWTSMITHVGMNTLVIIIQLLLHYGYIQMP >NZ_CP046123|753531:762258|753531_754962_+|WP_154694178.1|DBSCAN-SWA MNKLRSDFLWGGAVAAHQLEGGYRAGGKGVSVADVMTVGGNGIPRRITEGIQPGESYPNHEAIDFYHRYPEDIKLFAELGLKCFRTSIAWTRIFPKGDEHEPNEEGLAFYDQLFDECLSYGIEPVITLSHFEMPYHLVTEYGGWRNRKLIDLFVRFAEVCFTRYQKKVKYWMTFNEINNQANYKEDFAPFTNSGLFFTEGEDREKVMYQAAHYELVASAKAVVLGHAINPAFQIGSMIAMCPIYPYSCDPKDMMAATVAMQRRYWFSDVHARGHYPSYMRSYFERKQFDLDITPEDEAALAKGCVDYIGFSYYMSFAIKGKENDPTYDYDESQDLVDNPYVDASEWGWQIDPVGLRYAMNWFNERYELPLFIVENGFGAVDTVEEDGQIHDDYRIDYLKAHIEMMKEAVAYDGVDLLGYTPWGIIDLVSAGTGEMKKRYGVIYVDKDNEGNGTLARQKKDSFAWYQQVIASNGTKV >NZ_CP046123|753531:762258|760900_761281_+|WP_154694184.1|DBSCAN-SWA MTNETRAHIRSILWQYKKIEKTFKEFSDIIATDRNPYMEYPLGEENPSWTMNQILFYKSFLRVVNGVLEDSTLDVRDIFYVKYYNGHSKKCIAIVAAETFLSESTIKRRDAEFINEIAKRLGWLSV >NZ_CP046123|753531:762258|760093_760855_+|WP_154694183.1|DBSCAN-SWA MFVDDIEAICIIPLNEVAYHANDIQKYVNGQPYYPLRSILGNANYSTIGVEMCLDKKGNITEKTFQNTVKAVKELIAIHPNITREKIWRHFDVTGKNCPAPWVAKPSELERFKDAVFGSNGNSSNNNTSSEKPSTPASKPSYITLSVDGKFGPATARRLQQYFGTTQDGVISHQYKQKFNQNIYAAQFDQTLRGSNVIRALQKLLGVSQDGLMGQATIKALQKRLGTTQDGIISPVSNVVSALQKVLNTNKLP >NZ_CP046123|753531:762258|759139_760081_-|WP_154694182.1|DBSCAN-SWA MKKVVPCLLFVGLIMTGCSNNEESTTPPTDTTSQTTSVSEEQKADFEYGKIITDEFELTYKNSEIVKSPSEDGYGLYITYSLKNTSDNNITPIDIINDYVLFKQENETSEVDLDNTYYSLDAFGSTDDVESYNEQVDKENSRSDELLPDKTVDIIETYSLDNLDFPVKMIAMYEDKEIGIYEIDLTELEKPEETKSLANTNNPNEDSSYNEGLSDMPASWQEGEAEWEKAKAEGWTAEDWEEAVRASENETYVVGSGQYEDSFNGSQAEQTTLPEGTSENARRIYNEIKSIRDRELISGEIQTLEAIEQGYYE >NZ_CP046123|753531:762258|755866_756151_+|WP_005225291.1|DBSCAN-SWA MLRPLGDRVIIEVAKEEEKTVGGIVLASAAKEKPQTGTVIAVGEGRTLENGEKAPVAVNVGEQVMFEKYAGTEVKYEGTEYLIVAAKDIIAVVE >NZ_CP046123|753531:762258|761370_762258_+|WP_142962785.1|DBSCAN-SWA MASIENMIKWFKDREGKVTYSMNSRLGPNSYDCSSAVYFSLIAGGFLPSGTGIGNTDSLFALEGKLLTSITRSEVKRGDIFVAGYKGNSGGSDGHTGVFVDSTNIIHCTLGGGKNGIVTTPATNWMGDYSGLPVYFYRLKGANPPFKYKVDDVVYIKNNATHYFNGDLISDNDKKLAGKVTGVKYDDTGRNGEHNLVFVKQVQTPTIINHWTLERDLEKWSPTTTYISNGEIVKFKAAAQRTVEGTLLTSDQKSKSVKKVDTIDIAPVNVGTGTSYRKYKLEGIAGWIYETDVQK >NZ_CP046123|753531:762258|756183_757812_+|WP_154694180.1|DBSCAN-SWA MAKEIKFAEDARAAMLRGVDKLADTVKVTLGPKGRNVVLEKSYGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATLLTQAIVREGLKNVTAGANPLGIRRGIEMATKVAVEELHNISSIVDSKEAIAQVGAVSSGSEKVGQYIADAMEKVGNDGVITIEESKGIETELDVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEAALENPYILITDKKISNIQDILPLLEQILQQSKPLLIIADDVDGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVITEDLGLELKDATIDNLGQASKVVVDKDNTTIVEGAGEKEAIDARVQLIKKQIADTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAPTETELKELKLRIEDALNATRAAVEEGMVSGGGTALVNVINKVAEIETDGDAATGVKIVLRALEEPVRQIAENAGYEGSVIIDKLKNADLGVGFNAATGEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQNAASVAALLLTTEAVVADKPEPAAPAAPAMDPSMGMGGMM |
9 | uncultured_virus(28.57%) | protease,integrase | attL 757876:757895|attR 765209:765228 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
964746 : 991264
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046123|964746:991264|DBSCAN-SWA TTTATGCAGGTATTCCTAATAATATCTTCATTTCCGTGCAGACTGAAAACCCGAAGAGAGTGCCTTCTTTTCGGTTCTTCTTATATAATCCTCGAATGGCTTCCATGCCTTTAATCGTGGTTGAGGCTGTTCGTAAGCTTCGATAAAATTTGTTTCGTCTCTTGATGGGACGATGATCTTGTTCAATGAGGTTATTTAGATATTTCACCGTGCGATGTTCTGTTCGCTGGTAAAACCCGTGTGCCTGTAATTTTTTGAAGGCACTGGCAATAGAGGGAGCTTTATCGGTCACCAGAACCCTTGGTTCATCGAACTGTTTAACTAATCTCTTGAGAAAGGCGTAAGCTGCTTGTGTATCTCGCTTTTTCCGTAACCATATATCCAGAGTGAGACCATCTGCATCAATGGCGCGATAAAGATAATGCCATTTTCCTTTGATTTTAATATAGGTCTCGTCCATTTTCCACGAATAAATGGACTGTTTGTTTTTCCTCTTCCAAATGTTGTAAAGTAGTTTCCCATATTCCTGTACCCAACGATAGACAGTGGTGTGAGACACGTTAATACCACGGTTGTACAGAATTTCTTGGACGTCACGATAACTCAGGTTGTACCGAAGATAGTAGCCTACAGCGACAATAATCACATCTTTCTGAAATTGTTTGCCTTTAAAATGGTTCATCTTCGTTACTCCTCCTAGTTCCTATTAAACTCAGTTTACCCTATAATGGATCTGAGGGGAAACTTTGCAACAGAACCCTTAAGTTGATTTATTAACTTGAGAAGGTATTTTTTTCTGAAAAATGATAATGAAAATCAAAATGTTCATTTCTATCAATTTTGAAGTCAAAAAAATAAAGTACAGCCCAGAAATTTGCTCTGTACTTTAAAAAACTGGTTAAATGAAGATGAAATCGCTCCCTTATTTTTTAGTATTGGTGGAATTAAAAGGTACTTTTTAAACAAAAACTACACATAAGAAATAAAAAAAATAAAAAAAGTATTGAAATGTAATTGCTTTCAGTATATGCTATATCCATAAACGCGCGTTCATGGGATGTTCATCGTATAAAAAAAGGTGGAAATGAGCGTATCGTTTTTCTTTTTAACAAATCATGAACGCGCGTTTATGAGTTTGAATCAAGCTGCAATATAAGAAGGCAAACTGCAAGACCTTCATTTTAAGGAGAAGTGTTATGGGGAAAATAAGTTTAGGAATAGACATAGGAGGGACGTTCATTAAGTATGCATTAATAGACAAGCAACATCGCATCAAAGAGAAGTGGAAAGTCGAAACGGTTAAGTACAATACAGCCGACGAATTTTACGATTATATATGTTCAAATATAAGAAATGTAGATGAAATTGACAAAATCGGTGTAAGCGCACCCGGCCTTATTGATGAAGATTCGAATGTTAAATCCTATGCTGCTCCTAACGTAGCTATAATGTACGGCACAAATATCAATAATGAAATCAACAAAAGGACAAATAAAAAAGTGTCCGCAATCAATGATGCAAAAGCGGCAGGTTTATGTGAGTTTAAAATTGGAAATGCAAAGGGATACAAATCTTCAGCGTTTTTGATTATAGGTACAGGAACAGGCGGATGCATATGCGACGAAAACGGAGTTGTGTATGGAAAAGATTCGTTTGCGGGGGAATTCCATAATATGCCTTTTGTAAACGCTGAGATAGGCGGCCTTGATAAGATGGGTGATTATGCTTCGATAACCGGATTGGTTAATTTATACAATAAAAAAGCTAATCGGGAGGAGCAGGTTCAGTATGGAAATGAGGTTTGCAAGAAGTACCTAAACGGAAATGAATCAGCTGTGTCTTCAGTAGATGAATGGATAGGAAACATAGTGGCTCAATTAATAGTAATCACCGTTTTTTATAATCCTGAAGTGATATGCATCGGTGGAGGAATATCCGAAGAAAACTGGTTCATCAATAAAGTAAGAGAAACGTATAAGAAAACCTGTAGGGAGTATTTAGAAGCGGATTTTATTACTACCGAAATCAATAGATGCAAGCATAATAACGATGCCAACATACTGGGTGCTGTTATAAAAGCTTCTATCTAAAATACACAACAGTTTTGTTTCAAGAAAGAATGTTTGAAAATAAATTTATATTGAAAACGGAGGAGAAGATTCAGTGATATACGAAGAATTAGACAAATTCCAAGATGATTTCCTATGGGGATCGGCATCTGCAGCGTATCAGGTTGAAGGAGCATGGGACAAAGATGGAAAGGGGGAAAGTGTATGGGATGTGTACACCCGCCAACCGGGGACAACATTTAAGAATACAAACGGGAATATCGCGGTCGACCATTACAATAGATACAAAGAAGACGTAGCTTTAATGGCTGAAATGGGATTGAAAGCTTATAGATTCTCAATTGCATGGACACGTATTTATCCCAATGGAAGAAATGAAGTAAATGAAGAAGGCTTAAAATTTTATGAAAACTTGATAGATGAACTTATCGCGAACAATATCCAACCAATCATTACGTTGTACCATTGGGATTTACCTCAACATCTTCAAGATTTGTACGGCGGATGGGAATCAAGAGAAATCATTCATGATTTTAATGAATACTGTGTAACGTTATTCAAGAGATTTGGGAATAAAGTTAAGCACTGGGTATCATTGAATGAACAAAATATATTTGTAACACTAGGTTACGTAACCGCTATGCACCCGCCAGCTGTTAAAGATCAAAAGAGAATGCTTGAGGCGAATCATATAGCGAACTTAGCTAATGCTACCGTAATTGAATCCTTCAAAAAATATGTTCCAGACGGTATGATTGGACCAAGCTTTGCATTTGGACCAGTTTATCCATTCAGTTGCGATCCAAAAGATGTTTTATCCGCAGAAAATGCAGAGGATTTAAATTGCAATTGGTGGCTCGATGTTTATTGCAAAGGTAAATATCCAGTGTTCGCTTTTAAATATTACGAAAGACTTGGAATCGCACCCACTATTGAAGATGGAGATCTTGAATTGTTGGAAAGAGTAAAACCAGATTTTATCGGAATAAATTATTACCAAACAAGCACAGTTGCATTCAATCCGCTTGATGGAGTAGGGCAATCGGAAGGTATCAATAACACAGGTAAAAAAGGCACCACTAAAGAAAGCGGATTACCCGGAGTTTATAAAAATGCAAAAAATGCACATCTGGAAACAACAAATTGGGACTGGGCAATTGATCCTACTGGTTTAAGAATTGGACTAAGAAGATTGACCAGCAAATATAATCTTCCAATACTTATTACAGAAAACGGGCTTGGAGAATTCGACAAGCTTGAAGAAGACGACACTGTCAATGATGCTCACAGAATCGATTACTTGAGCGCACATATCAAGGCTTGTAAAGAAGCAATAACAGATGGTGTTGATCTTCTAGGCTACTGCACGTGGTCATTTACAGATTTGTTAAGCTGGTTGAATGGTTATCAAAAACGCTATGGATTTGTGTATGTGGACAGAGATGAAAATGATCAAAAAGATTTGAGAAGAATCAAAAAGAACAGCTTCTATTGGTACAAAAATGTTATTCGCACCAATGGAGAAGAGTTATAAGAATCGTTCACAATCAATGAATATGAAAAAACAAGGAGAGATAGACCATGAAAAAAATTTTACTAGTATGTTCAGCAGGAATGTCCACAAGTTTGCTTGTGACCAAAATGAGAAACTCCGCAAAGGAAAAAGGAATTGAAGTAGAAATAGATGCCCTTCCAGTTGCAGAGGCAAGTACGGCCGTTGATAATGTCGATATCGTTCTTTTAGGACCACAAGTGCGTTTCCAGAAAGGGACCGTTGAAAAACTTGTAAAAGGCAGAATTCCCGTAGAAGTGATGGACATGCGGCTGTATGGAATGATGAATGGAAAAGCGATTTTAGAAGACGCTTTACAAAAAATAAACTAGGAAAAGAGGCTAAAAAAAGTGAGTTTTATGGACAAATTTCAAAGTGCTGTAGAAAGATTGTTAGTGCCTGTATCTACAAAGTTGAACGCTCAAAGACACATATGCGCAGTAAGAGATGCTTTTATTTTATCATTCCCATTAACGATGGCAGGATCATTGATGGTGTTATTGAATAATGTTTTCTTGTCAGCAGATGGATTCATGTTTAAAATCTTGCAATTCGATAAACTTTTTCCGGGTATTGTTAAATTCCAAGCAGTGTTCGCTCCAGTTGTTAAAGGTTCAGCTGATATTTTCTCGATTTTGATTGTGTTTTTGATAGCCAGAAACCTTGCGAAACTAATGGAAGGCGATGATTTGTTGACAGGTTTGACCGCAATCTCTGTTTATTTCATCATCTATCCTGATTATTTCGATAATGAAGGAGTAAATTATCTAACAAATCAATATATGGGCGCACAAGGGTTGTTTGTAGCAATTTTGGTTGGGCTCTTGGTCGGCGAACTAATGTCTAGATTAGCAAAATCAGATAAGTTAGAAATTAAAATGCCAGAACAAGTACCTTCAGCAGTTGCAAGATCCTTCAAAGTGTTGATCCCGATTATCATCACGACGATTTTCTTCTCCGTCCTCAACTACTTTGTAAAAATGGCTGCACCAGGCGGATTACATGAATTAATTTATAACATCATTCAAACACCATTGACCAGAATGAGTCAAAGTTTATTCTCAGTGCTTATTTTATCATTATTATCTCAATCGCTATGGGCTATGGGAATACACGGACCAAATACGATTGCAGCTATTCGAGATACCATGTTCTCGGAAGCCGGAAACGCAAACCTCTTACATTATGCTGAAAGCGGTACTACATGGGGAGCGCCTTATCCGATAACGTACAGTGGTTTAGCTACTGCTTTCTCTGAATATGGCGGTTCAGGAGCGACATTGGGTCTAATCATTGCTATGTTGATTTTCTCGAAAAATAAGGAATCGAAAAGTATTGCCAAACTTTCTTTGGCACCCGGTTTGTTCAATATAAACGAA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25 | Streptococcus_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
994384 : 1051792
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046123|994384:1051792|DBSCAN-SWA 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46 | Streptococcus_phage(31.25%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1230285 : 1238875
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046123|1230285:1238875|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046123|1230285:1238875|1236090_1237257_+|WP_010747887.1|DBSCAN-SWA MNISVFGLGYVGLANALLLSQNEQVKAYDIVKEKIDLLSQSKSPLEDKEIHEFLKRDDLNLEFTNDFEDAVNFADYLIIATPTDYDEVKNYFNTSTVEDVIEKALEIRPDATFIIKSTVPVGYTLDVKEKFKTENIIFSPEFLREGKALYDNLHPSRIVVGEVSDRGAEVASLFKENAWDEDVTVLLTNSTEAEAIKLFSNTYLALRVAYFNELDTYAESRGLDSRQIIEGVGLDPRIGTHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLRANYEDVPSNIIGAIVDANTTRKDFIANQILAKNPKTVGIYRLTMKANSDNFRYSSIQGIMKRIKAKGIEVVVYEPSLNEETFFNSKVIKDFEEFKEISDIIVSNRFEGILEDVKEKVYTRDIFGDN >NZ_CP046123|1230285:1238875|1235207_1236038_+|WP_010747886.1|DBSCAN-SWA MYLITGGNGQLGSELRHLFDEKGIDYVSTDAKEMDITDETVTMEKVKEIRPSVIFHCAAYTAVDKAEEEGKELDELINVTGTRNVALAAKAIGAKLVYISTDYVFDGEKQVGEYQVDDQVNPQNEYGRTKLLGEQAVQEILDDYYIIRTSWVFGRYGHNFVYTMQRLAKEHKTLTVVNDQYGRPTWTRTLAEFMLYVIEKQAPTGIYHLSNDNSCSWHEFACEILKNSDVVVKPIPSSEFPQKAKRPQYSVMNLSKAKELGFEIPTWQEALKEMLK >NZ_CP046123|1230285:1238875|1237278_1238151_+|WP_010747888.1|DBSCAN-SWA MKKVRKVVIPAAGLGTRFLPATKAIAKEMLPIVDKPTIQFIVEEAIASGIEDILVVTGKAKRPIEDHFDSNFELESNLSSKGKKELLALVEETTGINLHFIRQKRPLGLGHAVLQAKAFVGDEPFIVMLGDDIMEDDVPLTKQLINNYEKTNASTLAVMKVPHEDTSKYGIINPSEEAAKDLYSVSEFIEKPSPADAPSDLAIIGRYLLRPEIFGILEDQEPGAGNEIQLTDAIDSLNKIQRVFAHEFKGKRYDVGDKLGMIEANIEYGLKHPEIKDELRSYIKELAERI >NZ_CP046123|1230285:1238875|1238260_1238875_-|WP_154694305.1|DBSCAN-SWA MTIAEKIKEIRLKLGLTQQEVSEKLFVTRQTISNWENNRSTPDIDTLIKLSDLYQIDLESLLKPEQLAEEPEIKSEEKKPTLRLPLYLLNLTAVVACVFTDFLTPTGTMTLWTAAAHFLLLVNFVLLFGFFLTKKRPLPAKTIVFALGKGLLILAIILGFTLWSNKGASADALHLIGHNYGHFICLTFKAIGVIYLFDWRKFEM >NZ_CP046123|1230285:1238875|1233532_1234114_+|WP_010747884.1|DBSCAN-SWA MGKLRITKTNLKDVVIIEPEVFGDHRGYFTESYSQEDFNAAGLEYKFVQDNHSLSVEAGVLRGLHFQKGEAAQTKLIRVITGAVLDVIVDIRKGSSTYGKWEGFILSEINHRQLLVPKGFAHGFVTLTPNVNFFYKCDNYYNADADAGIAFDDPDLAIDWSIAKEQAILSEKDKHHPTLKEFEAENPFVYGKI >NZ_CP046123|1230285:1238875|1231372_1232614_+|WP_154694304.1|DBSCAN-SWA MKRTIINPGPMFFFSWAIILYLSTLQLYGLKLASETSYHIMGIGIYSFAAGHIASFFFGGKYKFVLQKESHTKMFTWEINYKLVYLLCALTIIYNIVGTIPSLIYLIQGGSLGSIRTAIQNSDTNFTSDSIIMNFLKMFIARPFVNILPSIAICDFLIGKRNKKLLFLTTVILLMGLISTGGRNQIINLGISLVICFVIIGKQNTEKINMKKFKKKYGKFFIATFLLVLFIVYIATKSRSGDAAVRQLYYYFAMQPVMLDNWVSVVDSSNLLGWGMASFNGIFFVIFWMLHNLLFFPYPDFFNNIFTMVLNTENIWVTIGVAGVNANAYVTTFWHLYLDGRIFGVVLGMFIYGYYVTRVFSQAYFNTNLKKISLYCLMYFGTFLMFTRFPFSNIYFAVSWIMIAFFVFRKKYY >NZ_CP046123|1230285:1238875|1232660_1233530_+|WP_010747883.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPLTKATSKQLMPIYDKPMIYYPLSTLMLAGIREIMIISTPQDTPRFKELFGDGQELGIRLEYAIQPNPDGLAQAFLIGEKFIGNDSVCLILGDNIYYGGGLSKMLQRAAKNDIGATVFGYHVNDPERFGVVEFNEQMQAVSIEEKPAKPKSNYAVTGLYFYDNEVVEIAKQIKPSERGELEITDVNQRYLELGKLSVEVMGRGFAWLDTGTHESLLEASTFIETIEKRQNLKVACLEEIAYRMGYISCEALIELAQPLKKNQYGQYLLRLASEG >NZ_CP046123|1230285:1238875|1234128_1235157_+|WP_010747885.1|DBSCAN-SWA MKRIIVTGGAGFIGSNFVHYVVKYQPHVHVTVLDKLTYAGNKENLEGLPEDRVELVVGDIADASLVDELVKQADAVVHYAAESHNDNSLKDPFPFVQTNLIGTYTLIEACRKYDVRYHHVSTDEVYGDLPLRKDLPGHGEGPGEKFTDQTPYNPSSPYSSTKAGSDLLVKAWVRSFGLRATLSNCSNNYGPYQHIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGEGKNVRDWIHTNDHSSAVWTILTKGRIGETYLIGADGEADNKSVIETILTLMGEPKDAYDHVTDRPGHDLRYAIDASKLKEELGWLPMFTDFEEGLADTIDWYRNNPSWWQDEKAQVEKSYAEQGQ >NZ_CP046123|1230285:1238875|1230285_1231233_+|WP_010747881.1|DBSCAN-SWA MFNNYNNNPVLYTDMISSLKKINREKKNILSSKEYRVGNSLIKNRNKLKEEGIGAFFSILDNYKRFKKGKSYSMASYIKKSEVKRSSDYFNDDRIAVYTCIIGNYDQLQEPLFCPDNCDFYAITDFNIPPNSCWKRIDVRDYESEVSQFNSVMTNRYFKFHPEKLFRDYKYSVYVDGNIRIYTDMTEYINRIAYYGLATFSHSQRNCVYKEAEACIAMGKAEHNSITEQIQYIRNQKMPEQYGLPTCCIIAREHNQESCIKLMDSWWEEFLRFPYRDQLSFPFALFKNKVEISKITVLGENVFEDDSFEFVNHIK |
9 | Escherichia_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1349108 : 1391999
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046123|1349108:1391999|DBSCAN-SWA CTCAGGCATACAAACTTGCTATCTCGGAAACGATTTTTGATCTATTTTTATTTCTCATCTCATCCAATACGTGAGCATAAACTTCTTGAGTGACTGAGGTGTTTTTATGACCCAATCTTTCGGAGACAACAAATATATCCAAATCTCTATACAATAATATAGATGCGTGAGTATGTCTTAGCCCATGAAAAGTTATTGGCTTTTTTATACCAACTTGTTTTTGAATCTTTTTGAGGGTTTTGTTGGCAGCATCCGGAGTGATAGGTCCATTGGATAAATTGTAAAAGACGAGATCATGCTCGTTTTTGATTTTATTAGCAAATAGCAACTCTTTTTGCTGTAATTTATATTTCTTCAAGATATTCAGCGTGTGATCATCAACATCCACAGTGCGATTCGATGTTTCGTTTTTTGTTGGTCCAAAACCACCGCCAGTTTTATATTGCCATGTCTTGTTTACGATAATCTCCTTTGATTCGAAATCAATGTCACTCCAAGTTAATCCGAGTAGCTCGGAGAATCTAAGTCCAGTTGTTCCAGCAACTAGGATCATATAAGGCGAAGAGTAAATAGGGTTTAATCGAAGTTCTGTTTCTTTCATTAATAACTTAAATTCTTCATAGTTTAAGAACTTGTCATCACTTGACTTCGTTTCTTTAGCGCCCGTTATTATTGCTTTGTAAGTGACATCATTCAGGATTGCTTTATCTGCAAGTGCATCTGTTAAGCAAGCTCTTAAGTGAGTGTGAAACCTTTTTGTAGTAGCTTTAGCATGAGTTTCAGAAAACTCATTTAAAACCTTTTGATACTTACTCCTGGTCAACTTTCCGATGGAAGTATCTCCGAAATACTTTTCAATGTTTGAAAGTGTATTTTGATATCGACTATATGTGACAGCACTCACTGTATTCTTCTTATAGAGTTCAGCCCACTCCTTAAAGTAGTCATATAGAGATTTATCCTTATCTATTGGTTGATATCCACCTATTAAATTCAATTCCATTTCTGCAGCGGCGGCAGAAGCTTCTCCTTTTGTAGCAAAACCGCTTTTTCTCATCTTTGAAAATGTTCCATCTGGCTTTTTAAACGAAATCTCGTATTGCCACTTTTTTCCTCGTTTAACTAATCTTGCCAATTGAATCAACTCCTTGGTTTTGATACAATAAGCATGACAAATAAGCTTATTGTTTGTTTTAAAGCACACCAATCTTTGGACGGGGAGGTGTGCTATTTTTAATGCGAAAAATTACTTCTCAACGTTTTATCCACCTCTTCGAAAAGGCAGCTTCTTATTCCGTAATACTCCATAAACTTCGTAGAATTTAGTTGCTCAAACTCCATATCATTTTCTTCAAGATACACATCGATCAACATTTTTACAGCTAACAAGTTAGCTTCACTTTCTATTTTGGAGTTCCAAACAAAACTTCTTTTATATAAAACGCCGTAGGTATCATGGTTTTCCAAGGCGTGCGCTAATTCATGTGCAATCTCGAAATTGACGTCATTGGCTCCAAGGATGGTCTCGTTAATTACAATAGCTCGCTCCTTTGGCCAATAAAATCCTCGTCGTTGCATTTTGGTAAATATTAAATCGATATCTAGCTCACGGAGCTTAGATAGAAGACGGGGGCTAATTGAATCCAACTATATCAACTCACTTTTTATTTTTTCTGTATGACTCAATAACTGATTTCAAGAAGACTCTCTCATCGTGACTAACAGGTTTACCGTCAAAAGTAAGTATGGTTGATTCATCTTCAAAATCAATAGGCGCTCCATTTGAATCCTTCATTTGATCTGTCATTCCCAGAAGATAATCTGAGCTAATATTTAAATATCTTGCAACTTTAGCTAATTTATCAGCCGATGGCGCATTGGAAGACCACTTGCTAATTGAACCATTTGACAAATCATTAGCCCTTTCAATCTGCGCTATACTAATGTTCTTCAACCTTGCTATCTCTTTGATTCTCTCATAAATACCCACAATAAATACCTCCGTAAAATTTCTGCACTTTATTGTTGACCCCGAAAATATTCTGTGGTATATTACAAGTGTACCTAAGCTTGGCGGCTAAAAAAGGTATCGGAAATAACCATCTTTGTATATGCACTTCGGAGTTTTACCAATGTTCCGTGCGGTTTATTTGCTATGCACTTAGTTTAGAATATATTCTGCATTGTGTCAATAACAAAGTTGGTTTTTCTTAGAAAATATTCGGGAGGTGTTCAATTTGTTTTACGATAGTGTAAAAAAAGCAGCTGAAGCAAAAGGTGTTTCCATTAGAAAAACTGAAATAGATCTAGATTTTAGTAACGGATCAATCTCTAAATGGAACAAGTCAGTACCTTCGGTGGACAAGCTTCTAAAAGTAGCTGATTACTTAGAGATTCCAATCTCTGACTTATTAAGTAAAAAACAGGCTGTATAAGGAGGAGCGTTTATGGATCAGTGTATTAAGGCGAATATAGTTATCCAAATTCCTGAAGAGTACATTCTGGTTGAAAAGACGGAGTATGAACGTTTGAAGATTGAGGATGACTTGGGCAAATGGTGGACCTTATCTGATGTAATGAAACGAGTCAATCGTAAAAGAACTTGGCTTCTGGAAAATCTGCTGAACAATCCCAAGTACAGGAATAAGATCGATATTCGCAAAGGTGGATTTGTTAAATATCCAGCTGGGGGAAAGGATAGTTATCTTTTTCTGGCAAGTGAGACCAAGAAGTTTTTGGAAGATAATTTTCAAGAATTATTAAAGTAGTAATTGAGGAGGAACCAAAATGGAAATCACAATCAAAGCAACACCAGAAGAAATAGCAAAATTGCTCCAAGCTATCGGTAGTAGCAAGGAGCAGACTAAACGTAAACATCCAGAAGCTAAGTTTTAAAAAGGATATCCATTCTTTTTGACTTCTTCATCTTCGATCATTTTAAGGTTTCGTTTTTCAAATGTTTCTTTATCGGCGCCTAAGACATATTTACCGTACTCGTTGTATTCATCTTTGTATTGAGTTACGGAAATTAATTTCCAACCAGACTTCAAAAGATCGTTGACATATTTTTCTTCATTATTTGAAACTAATAAACTTTCAACTTGATAAATATCATCATAATCCAAAGTAATATCCTCCTTATTAATTATTTCAGCCTGTCACACTGATAAGGAAATTATACCAAAGAAAGGAATGAAAAAATGAATACACCACAAATTTTTAATTTCGAACAAAACGAGGTTCGAACTGTTTTGGTAAATGACGAACCATATTTTGTAGGAAAAGACGTTGCAGAAGTTTTGGGATATAGCAACACTCAAAAAGCTATCCTAACTCATGTAGATGCAGAAGATAAGGGGGTAACAAAATGGGACACCCTTGGCGGGAAGCAACAAATGACGATCATCAATGAATCAGGGCTATACAGCTTAATACTTAAATCCAAGTTACCAAACGCAAAGAAGTTCAAACGTTGGGTGACAAGCGAAGTCCTTCCAACAATCAGAAAAACAGGAAGCTACACAAACGTTCCTCAAAGTTTCGCTCAGGCATTGCGACTAGCAGCTGACCTAGAAGAAAAGAACCAACTGCTCGAACAGCAAATCGCTGAATATGAACCGAAAATCAGTTACCTAGATATGATCCTGTCATCAACTGATACAGTAGCAACTTCTCAAATCGCAGCAGATTACGGAATGTCGGCAATCGCACTGAATAAATTGCTTAATGAGTTAGGTGTTCAGCATAAAGTCAGTGGTCAATGGATTCTGTACCGCAAACACATGAACCAAGGATACACAAAATCGCACACAAGCGAGATTCCAAAAGCTGATGGCGGCGTAAAAGTTGTGATGAATACTAAATGGACGCAAAAGGGGCGTGTCTTCATATACAACTTATTAACTGCAGAAGGTTACTATCCTCAAATGGATCTATTGGATGAAAAATAACCCCACGCGGAAGGAGGGGCTGAATATGACAGTAATCTATTTGCTTATTTTAATCTTACAAATAGTCAATTTAGTTATGTTAGTTAAAATTCATAGGGATTAACTTACTTTTCTTAAAGCAAGAGATTGGCTTGTTTGCTGAGATGAGTACAGTATCTGGAATCTCGTCCACATAATAAGAAAATGTGACTTCTTGTGAAGGGAGCAGATAAACCTCACCTTGAAAGTTATCACTGGTTTCCAAATCTCTACTAACGAAGTTGGGCATTCTGTAAGGATTAACTAAACTAGTCGCAAGTTCAATCCCTGAAAAATTGGCAGCGTGCTTTCTATCGTATTCTTCAGCTTTAATATCGTTCAATTTTGTGAGGTGCTCATAAGGATCAAATTGATTATCTGTAATGATTGAATTATTTAAATACAAAGATAGTTTTTGTAATCTCAGTGGTTTTGGAGAAGTGTTTACAATAGAAAACTCAATGAAGTTTTGTGAGTAAAGTACGTATTTTTCGACATGACACAAGTCTATTGAGTATCTACTTGAAAGCCAAGTGAGGATGGTTGATCCGACCGCAAGTAACAAAGCGATTAAGGCGATTAAAGTATCTGTTGTAAAAATCATTTCCATTAATAGGTACCTCTTTTTAACTATTATTATACCAGTTTTGGTTGAAGTGTTCGATTCAAATAATAACCCCACACGGAAGGAGGGGCTAGGGTGAAAAAAAATATTGATAAAGATTTGGTTTTATCTATTTTAGTTATGATTCTTTCAGCAATTGCGATTCTGGGGAATATGTTGTAACTAAATCAAAGTCAATTGTATAAAATCTGTTATTAACTTTAATGCTAAAGTCTAATTTTTCATCAAATAGGTCTTCTGTAGTATCTCGATTTGGGAAAGCAAGAAATAATGATTCCGCCGTTTTGGCTGGCAGATTTATAGGTAATCCAGAGGATTTTAATTTTCGACCGTCAATAAAATCTATAATAGTGTGTTCATACGATGTAGATCGTAAAATCATTTCTTGATTTTTTTTAGATAAAGTT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62 | Enterococcus_phage(28.57%) | terminase,integrase,coat,tail,head,portal | attL 1341811:1341825|attR 1359900:1359914 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1741341 : 1754245
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP046123|1741341:1754245|DBSCAN-SWA 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14 | Streptococcus_phage(88.89%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2184729 : 2259013
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP046123|2184729:2259013|DBSCAN-SWA 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83 | Enterococcus_phage(40.48%) | tRNA,transposase,terminase,holin,tail,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2409832 : 2423740
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP046123|2409832:2423740|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP046123|2409832:2423740|2422441_2423740_-|WP_005229504.1|tRNA|DBSCAN-SWA MESIQILDAKKHVGETVQIGAWVANKRSSGKIAFLQLRDGTAYFQGIVVKSEVGEEVFQLAKNLNQETAVLVTGEIREDSRSKFGYEIGISGLEVVGESHDYPITPKEHGTDFLMDHRHLWLRSSKQHAIMQIRNEIIRATYEFFNKNGFIKIDPPILTGSAPEGTTDLFETNYFDQKAYLSQSGQLYMEAAAMAFGKVFSFGPTFRAEKSKTRRHLIEFWMIEPEMAFMHQEESLEVQEQYVAFLVQNVLDNCDYALDVLGRDREVLKKYTKLPFPRISYDDAVALLQKNGFDDIQWGDDFGSPHETFIANSFDQPVFILNYPKAIKPFYMKPHPTREDVVICADMIAPEGYGEIIGGSERAIDHEYLLEQIRAHGLDENEYSWYLDLRKYGSVPHTGFGLGLERTVTWLSGIEHVRESIPFPRLLNRIYP >NZ_CP046123|2409832:2423740|2409832_2412907_-|WP_010749354.1|DBSCAN-SWA 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12 | Escherichia_phage(25.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2535467 : 2602632
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP046123|2535467:2602632|DBSCAN-SWA 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57 | Lactococcus_phage(44.83%) | transposase,holin,tail,capsid,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3031614 : 3038636
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP046123|3031614:3038636|DBSCAN-SWA TTTGGACACTTCATATTGGGGTGTCTTTTTTATTTACAAGGAGATGATAAGAATAACAAATCTTACTTTAGGAAGCCTCTTTGACGGTATCGGTGTCTTCCCTCTTGCCGCTCAAAAACAGGGCATTACACTATCATGGGCAAGTGAAATCGAAAAAGCACCGATTCGTATTACAAAGAAACAGTTTCCCCATACGATTCATTTAGGAGATTTAACCAAACTACATGGTGGAAAAATTCCACCGGTTGATATTGTCACGTTTGGATCCCCTTGTCAGAACCTCTCAACCATTGGAAATCGTGAAGGATTAGCTGGCAAAAAATCCAATTTATTTTATGAAGCTATCAGAATTATTGAAGAAATGAGGGATGCCACCAATGGAAAGTATCCAACTCTCGCTATTTGGGAAAACGTCATGGGAGCTTTTTCATCGAATGACCGGATGGATTTTAAGGCCGTCTTGGAAGCCTTCGTTCAAACCGAAGTTCCAATTCCTCCCTCTCGTCAATGGGCAAATGCCGGTATGGTGCGAGGGAGAAATGTTGATGTGTGTTGGCGAGTCCTTGATAGTCAATATTGGGGTGTCCCCCAACGACGCCGAAGAATCTTTCTCGTCGCAGATTTTAGAGACTTCCGTGCCAGAGAAATATTATTTGACACCCAAGGAATGCAGTCGCATCTTGAAACTTGCGACCAGAACAGGTTGTCGTCCCCCAAAGACAATCGAAGCCTTACTACTAAAGCAGGGCGGCAACTATTCCTCTATCCCTTCCAAGAGCGCCGAATGCGTACGTATGCAAAAGAAAAAAATACCAAAGGATTCGTCTCCAGTTTCGGACAATCAACTGACCCTTTTCCCACTCTCTTAGCAGGTACTGTTGATACCTTTGCTTATTGGCAAGAAGGATTTGAAACTGAAGGGTTTGTTCGGAAGCTCATTCCACTTGAATGTGAGCGAATCATGGGTTTGCCTGAAAATTGGACACAATATGGATTTGATAATCAATTAATCAGTGACTCTGCCCGATACAAAGCACTAGGAAACTCTATCGTTGTTCCCTGTGCGGAATTTATTTTGTCGAATGTCGCAAAGGTCTATGGTAAAGGAGAATCGTATGGTTAAACACGCGAACGCTTAAACGCTGCCCAACAATTATTATGTACCAATTCAATCAATCAGTTGTCTGCGGCGATGCATAACTTCCAATTTTTACAACATATTGACGGCCGAGAAGTGCGTGGACGTCAAGCAATCGCAGAACAATTGATGGAAGTCGAAGAATACCTACTGATTGTTAAAAATCAAATACAAACTATTCGGAATTTATACAAGGAGAAATAAAAATGGATAACACAATTCAAGTATACGTCACCAACCTTAGTCGATTTGAGTATGACGGACTAATTATTGCCGCTTGGTTCACCCTACCTGTTTCTTTGGATGAACTAAGAGAAAAGCTACAATTGGAAACAGATGAAAGTTATGAAATTGAAGATTGGGAAGCCCCTTTCCGATTAACAGACGATGGGGATATTCTCACACTCAATCGTTTAGCGCTTTTAATCGAGGAAAACTGTCACTATGACTTATTTCCTTATTTAGATGAATTGATTGACTTAGATGTCTTTGAATCTCATGAGGATGGCTTAAAGCGATTAAATCATTTCGAGCACTTTGAAGAAAAGCCAACTGATCCAGATATTTTGGAAGATACCTTTGAGTTATCCGATGGCACCTATTTTACCATTTAAAGCAGTTTGACTAATCCAATAGTTGAGCTGCTTTTTTGTTTGGAAAGGAAGTGTATCAATGAGGAAAATCTCACGTTCCCCGCCGATCACAACAACAATTTTTAAGCTTATTTCAATACAAAATTTTGAATGAAAAGAGGAAAAACAATGGAATTAAAACACGTAGTACCGATTATGAAAGACACATTTGGACACTTAGAATTTGCGGGCGAAGGGAATGTTGAACAACGACGCATCAATGGTCGTTTAGCTACTGTTTCTCGTAGCTATAACCTATATTCAGATATACAACGTGCTGATGATATTGAGGTGATTTTACCTCATACAGCCGGAGAAAAATTCTTTGAAGTGGAAGAATCGGTCAAATTGATTAACCCACGCATTATCGCAGAAGGTTATAAGATTGGCGAACGAGGATTCACGAATTACATTTTACATGCAGACGATATGGTCAAAGCCTAAAGGAGGAAAATACACATGAGATTAGCACAAGGAATTATTATCGACAAAGAAAAAACGTTTGGACGGTTGAAATTTTCTGCACTACGTCGGGAAGTTTTTCTAAACAATGAAGATGGCAGTGTATCAACTGAAGTCAAAGAACGAACCTATGATTTAAAATCACGTGAACAAGGACGAATGATTCAAGTCAGTATTCCCGCTTCAATTCCATTACGAGAATTTGATTACAATGCTGAAGTGGAATTAATCAACCCAATCGCAGACACCGTAGCCAATGCGACTTATCGTGGGGCGGATGTTGATTGGTACATTAAGGCCGATGATTTGGTTCTAAAGAATAAAACCACACCGAAAATTGAGCCAAAGAATAAACAGGGATAGCCCATGAAACTCTTACAAAGAAAAGGAAAACGAATCAGACCAAGCGATAAACACTTGGTCTTTCAGTTTTTCTTTGGTGCTATATTAAGTTGTTGGTTACTTGCATTTTTTCCCTTTCATCTCGCTTTTTTCAGTCGAACTACTTGGCAACTAGAGGAATTTAAACAACACTTTTTCAGTCCCTATGGTAGTCTATCACTCGTCTTCTCACTTCTTACTGTTGGTTTTCTCCTCTATTTACTGTATCGGTATGGGTTCGATTATTACAAGAGTTTAACCCATCGTCAAAAACTCGCTCGAATGATTCTAGAAAACGGATGGTTAGAAACAAAACAAGTGGAAGAATTTCAACTCTTTGAAGATTCCCCTGCTAAAAAGAAAGAAAAAATCAGCTACTTTGCTAAGTTCTACTATCGAATGCACAACGGACTGATTGTTATTACTGTTGAAATCACATTAGGTAAATACCAAGATCAATTGTTACGCTTAGAGAAGAAATTGGAATCAGGCTTGTACTGTGAGCTAGTCGATAAAGAACTCAAAGACTCTTTTGTGGAATACACCCTACTCTATGACACGATTGCCAATCGAGTTTCAATTGAAGAGGTTTCTGTGAAAGATGGGGCTATGCAATTGATGAAAAATTTGGCGTGGGCTTTCGATTCTTTGCCTCATATGTTGATTGCAGGTGGAACCGGTGGTGGGAAAACGTATTTCATTCTTACGATTATTGAGTCCCTTCTTCAAACCAACGCCAAGCTGTTTATCCTTGATCCCAAAAATGCCGATTTAGCGGACTTAGGAACAGTGATGGATAATGTCTATTGCCAAAAAGAAGAAATATCTGCATGTATCGATGATTTTTATGCTCGCATGATGGCGCGTAGTCTCGATATGAAGAAAATGCCTCATTATAAAACAGGCGAAAATTACGCTTATCTAAACCTAGAACCAAACTTCCTTATTTTTGATGAGTATGTGGCGTATATGGAAATGTTGAGTGCTAAAGAAAATATGGCAGTCATGAATAAATTAAAACAAATCGTCATGTTAGGTCGGCAAGCGGGATTCTTTATTATCTTGGCTTGTCAGCGACCGGATGCAAAATACTTACAAGATGGGATTCGTGATCAGTTTAATTTTCGTGTGGCACTTGGGCGTATGAGTGAGCTTGGGTATTCCATGATGTTTGGAGATGTCGATAAAGATTTCTTTTTAAAACAAATTAAAGGCCGAGGATATGTAGATGTTGGAACCAATGTCATTAGCGAATTCTACACACCACTTGTTCCTAAAGGACATGATTTTTTAGAAACGATTGGTGCCTTGTGTCACTCGAAACCATTAGTAAAAAAGGAGGAATCTGAAGATGGAGTTTGATGATTGCATTTATCGTTTGTATGAACTTTCAAGAACTGAGAATGAAGAATTACAACAACGTTTTCACTCTCTAGCTTCTGATGTCAGTAAAAATGGGATTACTGGTTTAGTCCCTATCGAAGAAGGCGGCATTACAGATGGCGTTCCACTCACTGTGGTTCTATCTATCTTACAATCAGGGTTAGAACTAGCCACCTCTCCTTTTGACCGGACAAAAATTGAAGCCTTGTATAATGACTTACTTTCAGAAGGTATCGATGGCTATACGAAATAGCACGGATAGAAGCGGAATTTTTAAACAAACTGCGGTATAGTTAATGTAACAAGATGGGAGGAATTGCCATGTCTCACTTTACCCGTACTGTTTTTACCAGTTTGCATCCAGCCTATTTGATCCGTCAGTATATCTTTAGTGGTATTGTCACTGCGTTTTTCTATTTTTCAAGTCCTGATACTGCCCCTACTTCATTTTATGTCTTTTTAGGATTAAACTTTCTTCTCTATCCATTTGCTATGTTTGTTTATGATTCGATTGTCTCTCTTTTAATGGGGAATAATGTGTGGATTACCAGTGGCATTTTTGCCTTCATTTGGGGCTTCATCAAAATTTTATTAATTTACTTCTTTAGTGTTTTGATTGCGCCAATTGGCATCCTTATTCTGTATTTTACAAATCGTTAGAGAATTAGATTATAGAGGTCTTCCATTCGTCCCGTAGAAAAGATGTGAAGGATCGAAGGAGCCTGTGACTGATACTTTATATCTTTTAGAGGGGAAACATGAGCGTAGTCGAATGTATAAAATCAAGAATATCAACAATTTCACTGCCCATTAGTGGAAAGAACAACGTAATAAACGGAACACAGACAGAAAAAGTCATGACGGCAGCGCATAAGTCATGGCTTTTTCTTATCTGGTGGGTGTGGCTTGCCACGCCCACCTTGATTAACCCCCCCATTCTAACAGGGGGGTAGAAATACAAAAATAATAAGCAATAAAGGCTTAGGAACTTTGATACAACAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP046123|3031614:3038636|3031614_3032736_+|WP_154694614.1|DBSCAN-SWA MDTSYWGVFFIYKEMIRITNLTLGSLFDGIGVFPLAAQKQGITLSWASEIEKAPIRITKKQFPHTIHLGDLTKLHGGKIPPVDIVTFGSPCQNLSTIGNREGLAGKKSNLFYEAIRIIEEMRDATNGKYPTLAIWENVMGAFSSNDRMDFKAVLEAFVQTEVPIPPSRQWANAGMVRGRNVDVCWRVLDSQYWGVPQRRRRIFLVADFRDFRAREILFDTQGMQSHLETCDQNRLSSPKDNRSLTTKAGRQLFLYPFQERRMRTYAKEKNTKGFVSSFGQSTDPFPTLLAGTVDTFAYWQEGFETEGFVRKLIPLECERIMGLPENWTQYGFDNQLISDSARYKALGNSIVVPCAEFILSNVAKVYGKGESYG >NZ_CP046123|3031614:3038636|3033842_3034208_+|WP_002405422.1|DBSCAN-SWA MRLAQGIIIDKEKTFGRLKFSALRREVFLNNEDGSVSTEVKERTYDLKSREQGRMIQVSIPASIPLREFDYNAEVELINPIADTVANATYRGADVDWYIKADDLVLKNKTTPKIEPKNKQG >NZ_CP046123|3031614:3038636|3034211_3035588_+|WP_154694615.1|DBSCAN-SWA MKLLQRKGKRIRPSDKHLVFQFFFGAILSCWLLAFFPFHLAFFSRTTWQLEEFKQHFFSPYGSLSLVFSLLTVGFLLYLLYRYGFDYYKSLTHRQKLARMILENGWLETKQVEEFQLFEDSPAKKKEKISYFAKFYYRMHNGLIVITVEITLGKYQDQLLRLEKKLESGLYCELVDKELKDSFVEYTLLYDTIANRVSIEEVSVKDGAMQLMKNLAWAFDSLPHMLIAGGTGGGKTYFILTIIESLLQTNAKLFILDPKNADLADLGTVMDNVYCQKEEISACIDDFYARMMARSLDMKKMPHYKTGENYAYLNLEPNFLIFDEYVAYMEMLSAKENMAVMNKLKQIVMLGRQAGFFIILACQRPDAKYLQDGIRDQFNFRVALGRMSELGYSMMFGDVDKDFFLKQIKGRGYVDVGTNVISEFYTPLVPKGHDFLETIGALCHSKPLVKKEESEDGV >NZ_CP046123|3031614:3038636|3035577_3035862_+|WP_002405424.1|DBSCAN-SWA MEFDDCIYRLYELSRTENEELQQRFHSLASDVSKNGITGLVPIEEGGITDGVPLTVVLSILQSGLELATSPFDRTKIEALYNDLLSEGIDGYTK >NZ_CP046123|3031614:3038636|3033512_3033827_+|WP_005228395.1|DBSCAN-SWA MELKHVVPIMKDTFGHLEFAGEGNVEQRRINGRLATVSRSYNLYSDIQRADDIEVILPHTAGEKFFEVEESVKLINPRIIAEGYKIGERGFTNYILHADDMVKA >NZ_CP046123|3031614:3038636|3036693_3037884_+|WP_002405427.1|DBSCAN-SWA MLINLKQQVLELKERRKNYGVSQNKLATAVGISRQYLSEIETEKVVPSSELLSELDVLLERFNPELPLEMLFDYVRIRFPTTNPEGVIENILKLKMKYMLHEEYAFYSYEEQYVFGDIAVMVSHDIEKGVLVEMKGKGCRQFEHFLLAQRRTWVDFFLDVFAVNGVYKRLDLAINDKVGLLNIPELTRKCQNEECISVFRSFKNYRSGELVRQHEKADMGDTLYIGSLKSEVYFCIYQKDYEQYVKLGIPLEENPVKNRFEIRLKNERALHAVIDLLNNGNVGETTFSIINRYIRFVDKDSNKRRSQWKINADWAFFLGENQRKLKLTSEPEPYSFDRTLNWLSRQVIPTLKLAMKIDKLNQTSVIQNMIDYAELSDRQKKILQQQTLPVEEVIIN >NZ_CP046123|3031614:3038636|3032957_3033365_+|WP_002405419.1|DBSCAN-SWA MDNTIQVYVTNLSRFEYDGLIIAAWFTLPVSLDELREKLQLETDESYEIEDWEAPFRLTDDGDILTLNRLALLIEENCHYDLFPYLDELIDLDVFESHEDGLKRLNHFEHFEEKPTDPDILEDTFELSDGTYFTI >NZ_CP046123|3031614:3038636|3037897_3038119_+|WP_002405428.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYNWFLSNAESLVLMAIVVIGVYLGFKREFSKLIGFLIIALIAVGLVFNAAGVKDVLLNLFNRIIGA >NZ_CP046123|3031614:3038636|3038135_3038636_+|WP_010783150.1|DBSCAN-SWA MDMQVYISNLGKYNEGEIVGAWFQPPIDMEEVKEKIGLNDQYEEYTIHDYELPFEIGEYTPISEINRLCALIEEIEDTEILKELKEIQSMWFSSLEDLIEHKDDIICYSDCDSMEDVATYYVEETGQLGEVPSNLQNYIDYQSLGRDMELEGNFLVTSNGVFEYLG >NZ_CP046123|3031614:3038636|3035915_3036269_+|WP_002405425.1|DBSCAN-SWA MGGIAMSHFTRTVFTSLHPAYLIRQYIFSGIVTAFFYFSSPDTAPTSFYVFLGLNFLLYPFAMFVYDSIVSLLMGNNVWITSGIFAFIWGFIKILLIYFFSVLIAPIGILILYFTNR |
10 | Streptococcus_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3042738 : 3054636
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP046123|3042738:3054636|DBSCAN-SWA TTTGGAGGTGTTTAAACTGAAAAAACTAAAAAGCTATACCAGTATTTGGTCCGTTGAAAAAGTGATTTATGCCATCAACGACTTTAAACTTCCCTTTCCAATTAGTTTTAGTCAGATGGCTTGGTTTGTTTGTAGTCTGTTTACGGTGATTCTACTGGCTGATATCCCTCCTCTTTCATTGATTGAGGGGGCGTTATTGAAATATGTCGGCATTCCTGTTGGCTTGACTTGGTTCATGAGTCAAAAGACGTTCGATGGGAAGAAACCCTATCGTTTTATTCAAACCGTTGTCACTTATGCCTTCCGTCCCAAACGAACCTATGCTGGAAAAAAAGTAACCTTTGAAAAAGAGAAAATGGATGAAACTGCCACAATTGTAAGGAGTGAATACATTGAATTATCCGATTAAATACATTGAAAACAACCTCGTATTCAATCACGAAGGCGAATGTTTTGCCTATTTTGAATTGTTGCCCTATAACTATTCCTTTTTGACCCCTGAACAGAAACTTCAAGTCCACACGAATTTTCGACAACTCATTGCACAAAATCGTGAAGGTAAGATTCATGCCTTACAAATAAGTACCGAACGATCGATTCGTTCGATTCAAGAAAAAAGTAAAGAAACGGTCACTGGTCGGTTGAAAGACATTGCTTTTCAGCGGATTGATGAACAAACCGAAGCGTTAGTAAACATGATTGGTGACAATCAAGTGGACTATCGCTTTTTTATTGGCTTTAAATTACTGGTCAATGAAGAGGAAGTTTCCTTAAAGAATTTGAAAAAATCTGCCAAAAATACACTCACTACATTTTTTAGAGAAGTGAATCAAAAATGGATGGGTGATTTTGTCGTGATGCCACAAGATGAGGTCCGTCGTTACACAAAAATGGCTGACCTCTTACAAGCAAAGATTGAACGACGTTTCCATATCAGACCCTTAGATAAAAATGATTTTGGCTATTTGATTGAACATCTGTATGGCAAAGAAACAAGTTCTTTTGAGGAATACGAATTCCCTTTACCTCTCAAAAAATTGAAACACCAAACACTCGTAAAACGATATGATTTACTGAAACCCACTCGTTCCTTGATTGAAGAAAACCAACGCTATTTGAAAATTCAAAATGAAGAAACGACGTCTTATGTTGCTTACTTTACGATTGATTCGATTGTGGGCGAATTGGATTTTCCTTCCAATGAGATTTTCTATTACCAGCAACAACAATTCGACTTCCCCATTGATACCAATATGAACATTGAAATTGTTGCCAATAAAAAAGCCTTGTCTACTGTTCGGAACAAGAAAAAAGAACTCAAAGACTTGGACGATCATGCGTGGAATAGTGACAATGAAACAGGAAACAACGTTTTGGAAGCCTTAGAAGATGTCAATGAGTTAGAAGCTGAATTAGACCAGACCAAAGAAGCCATGTACAAACTAAGCTATGTTATTCGAGTGGCAGCTTCTTCCTATGAAGAATTAAAACGTCGTTGCAATGAGATCAAAGATTTCTATGACGATTGGAGTATTAAATTGGTTCGTCCCTTTGGCGATATGTTGGGCTTACATTATGAATTTCTTCCTTCAAGCAAACGATACATCAACGACTATGTGCAATATGTGACTTCTGACTTTCTAGCTGGCTTAGGTTTTGGTGCTTCCCAAATGTTAGGAGAAACAGAAGGAATTTACATTGGCTACAACATCGAGACTGGAAAAAATGTGTATCTTAAACCTAGTTTAGCTAGTCAAGGTGTCAAAGGTTCGGTGACGAATGCTCTGGCTTCGGCTTTTCTTGGTTCTTTAGGTGGTGGAAAATCCTTCTCTAATAACTTGTTGGTGTATTACTCGGTTTTATTTGGGGCACAAGCGTTAATTGTTGATCCAAAGGCCGAACGTGGCAATTGGAAAGAAACCTTGCCAGACATGGCCGATGAAATTAATATTGTCAATTTAACCAGTGAAGAGAAAAATCAAGGCTTGCTTGATCCCTATGTTCTCATGAAACGGAAGAAAGACGCTGAAAGTTTAGCGATTGATATTCTCACTTTTCTAACTGGAATTTCTAGTCGAGATGGGGAACGTTTCCCTCTTTTACGAAAAGCGATTCGATCCGTCACTCAAAAAGAGATTCGTGGTTTGTGGTTAGTCATTGATGAATTACGAGAAGATGACAACCCACTATCGCATTCGATTGCGGATCACATTGAAAGTTTTACCGATTATGACTTTGCCCATTTACTATTTAGTGATGGGACAACGGAAAACTCGATTAGTTTAGAGAAACAGTTAAATATTATTCAAGTGGCAGATTTGGTTTTACCAGACGCCCAATCTAATTTTTCAGATTACACCACTCTTGAATTATTGAGTGTGGCTATGTTAATTGTCATTTCGACTTTTGCTTTGGATTTCATTCATTCTGATCGAACCAAATTTAAAATTGTGGATTTGGACGAAGCGTGGTCGTTTTTACAAGTAGCTCAAGGAAAAACCTTGTCGAATCGCTTAGTTCGTGCAGGACGTGCAATGAATGCGGGTGTTTATTTTGTCACGCAAAATGCGGACGACTTAATCGATGAAAAATTGAAAAACAATATTGGCTTAAAGTTTGCCTTTCGTTCAACGGATAGTCAGGAAATCAAAAAAACATTGACTTTCTTTGGTGTGGATCCCAACGACGAGGACAATCAAAAACGGTTGCGAGAATTAGAAAATGGCCAATGCTTGATTCAAGATTTATATGGGCGTGTTGGTACAATTCAAGTCCATCCAGTCTTTGAAGATTTATTCCATGCCTTTGATACTCGTCCCCCCGTCCATCAAGAAGAGTGAGGTGTATACATTGAAACCAAAATTGAAAAAAATGCTAGGTGTCATTCTTCTAATTGGAGGAATGACTTTTTTATTTCTCTTACTTTTTGGTACTGTCGCTCAGGCGATTGGACTAGTTGATGATACCGTGGACGTACAAAATTTGTATTCACAATATCCTTTGTCTCATTATCAATTGGATTTCTACGTTGATACCGATTGGGACTGGTTGCCTTGGAATTGGAAAGATGGCATTGGCAATCAAGTGCAATATGGCTTATATGCTATGTCTGATTTTATTTGGACCATTAGTTTGTACCTCTCCAATGCGACGGGTTACTTGATCAAACAAGCTTACAAACTGGATTTCATCTCAGACACAGCGAATCAAATTGGTGAAAATATTCAAATATTAGCAGGCATATCAGAAAATGGCTTTTCGACTTCTGGCTTTTATGTTGGCTTTCTGTTGTTGTTTATTCTGATTCTAGGGGCCTATGTTGCCTATGTCGGCTTGCTCAAACGAGAGACATCCAAAGCAATTCAAGCAGTCACGAATTTTCTTGTGGTGTTTGTTTTGTCGGCCGGCTTTATTGCTTTTGCCCCTTCGTACATTCAACGAATTAATGAATTTTCTGCCGATATTTCGCAAGCCAGTTTGGATTTAGGGGGGCAAATTATTTTTCCTCATTCCTCTTCACAAGGAACAGATAGTGTAGACAGTATTCGAGATACCTTGTTTTCGGTACAAGTCGAACAACCTTGGCTTTTACTACAATTTGATAACTCTAATAAAGAAGAAATTGGCGAAAGTCGGGTCAATGACCTGTTGGCAATCAATCCTGATACCAATAATGGGAAAGATCGTGAGGAAGCAGTAAAAAATGAAATTGAAGAACACGACAACCAACAACTAACCTTAACAAAAACAGTCAATCGATTAGGGACGGTTAGTTTTTTAGTCTTGTTTAACATTGGGATTTCCATTTTCGTTTTCTTATTGACTGGCATTATGATTTTCAGTCAAATTCTGTTTATTCTCTATGCAATGTTCTTGCCTATTATTTTCTTGTTGGCTATGTTGCCAACCTTTAGTGGCATGGGAAAAGCGGCATTGATGAAACTCTTTAATACCATTATGTTGCGAGCTGGAATCACGTTGATTATTACGGTGGCGTTTAGTTTATCCACCATGTTGTATAGCCTAACCACCAGTTATCCCTTTTTCCTAGTTGCCTTTTTACAGATTGTGACTTTTGCGGGTATCTACTTAAAGATGGGCGATATTATGAGTTTGTTTAATCTTCAAGCCAACGATTCCCAACAAATTAGTCGAGGGGTTATGAGACGACCAAAACAATATATGCACCGAGGAGCACGACGACTTCAACGAACCATTAGTCGAACCATGATCGGTGGTTCTCTTGGGTATTTGGCAGGCAAAACCAAAGGAAGAAAAAATGCCAAGCAACTTCCTTCAATTGCAGGTACAACGCCTTCCAATGCTCGTGCGTCTGTCCCTTCCAATCAACAAAAAAATGATCGCACACAACGACCAACCACTCGAAGTTATCAGACTGGGCAACAAATTGGGAAAGTCTTGGATAGTAAAAATCGAGCGAGCAATTTTGTGGCTCAAAAGAAACAACAAGTCAAAGAGTTACCTAAAACAGTTACAGGGAATCTTCATCAAACCATTTCTGATTTTAAACAAGGGATGTCAGATGAACGAACGGAATCAGTAACAAGTAAAAACAGACCGGTTGTACAATCTCGAAAAACAAAACAAGAAAAAAAGCGAGGAACAACAAATCCTACGACTGACAAAAACCATCAACGACCAGCTGTTGATTCGGTTCAAGCAGTGAATAAGATACAACAAGCAAGTACGTCAAACAAACGAATAGATTCAGTATCGAGAAAAAATAGACCGGTTATTCAATCTCGAAAAACAAATCGAGAAATGAAACCAATTCGTTCTACTGTTACTCGTCCACCTGTACAACACAGACCATCGAATAAGATCCAAACAGTATCGCAAGAAGTACCACAAGGACAGACAGCTTCCAAAGTACAAGAGCGAATAACCAAACAAAGGAACCGCTCGATAAAACAACAACCTTCTATCAAGCAACAAGCTCCTATTTCTCGCAAGCAACCAACAAGGTACATGACAAATCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP046123|3042738:3054636|3043120_3045577_+|WP_033593701.1|DBSCAN-SWA MNTLNYPIKYIENNLVFNHEGECFAYFELLPYNYSFLTPEQKLQVHTNFRQLIAQNREGKIHALQISTERSIRSIQEKSKETVTGRLKDIAFQRIDEQTEALVNMIGDNQVDYRFFIGFKLLVNEEEVSLKNLKKSAKNTLTTFFREVNQKWMGDFVVMPQDEVRRYTKMADLLQAKIERRFHIRPLDKNDFGYLIEHLYGKETSSFEEYEFPLPLKKLKHQTLVKRYDLLKPTRSLIEENQRYLKIQNEETTSYVAYFTIDSIVGELDFPSNEIFYYQQQQFDFPIDTNMNIEIVANKKALSTVRNKKKELKDLDDHAWNSDNETGNNVLEALEDVNELEAELDQTKEAMYKLSYVIRVAASSYEELKRRCNEIKDFYDDWSIKLVRPFGDMLGLHYEFLPSSKRYINDYVQYVTSDFLAGLGFGASQMLGETEGIYIGYNIETGKNVYLKPSLASQGVKGSVTNALASAFLGSLGGGKSFSNNLLVYYSVLFGAQALIVDPKAERGNWKETLPDMADEINIVNLTSEEKNQGLLDPYVLMKRKKDAESLAIDILTFLTGISSRDGERFPLLRKAIRSVTQKEIRGLWLVIDELREDDNPLSHSIADHIESFTDYDFAHLLFSDGTTENSISLEKQLNIIQVADLVLPDAQSNFSDYTTLELLSVAMLIVISTFALDFIHSDRTKFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSNRLVRAGRAMNAGVYFVTQNADDLIDEKLKNNIGLKFAFRSTDSQEIKKTLTFFGVDPNDEDNQKRLRELENGQCLIQDLYGRVGTIQVHPVFEDLFHAFDTRPPVHQEE >NZ_CP046123|3042738:3054636|3048871_3049789_+|WP_002405436.1|DBSCAN-SWA MKIHIEHKPKKEKANRQKKVKTIHLGTHKKSVLFLWLLLIGSFSFGLYKNFTAIDTHTIHETTVIEPVLVDTHAIESFTLNFIQEYYSWENNKEAIEQRPERINRYLTSELQELNVDTIRTDIPTSSSVSDCKIWQIQSIDEQNFVVVYTVKQQIKEGEETKNVASTYRITIHQDKNNNLVITSNPTVWAAPNPSEFQPDTLVNDNNIDEQTKLEILDFLETFFKLYPNATKNELDYYMMEDVLPIISQNFIYSELVNPIIQKKEKQYLVKIAVRYLDNETKIENISQYQLTLEKKDNWKIIMNE >NZ_CP046123|3042738:3054636|3047835_3048855_+|WP_154694618.1|DBSCAN-SWA MKWKLKIMVALTLFLSFFGLLSFVAIFVADEPQGNSSDSIVIQGSGLSVSPEVLKYRSLVEKYAKQENIEDYIHILLAIIQVESGGTLKDVMQSSESKGLPPNTITDPEESIKQGVSYFAGLVRSAESLGVDQQSVIQAYNYGGSFLNYVAKNGKTYSFELAESFSNEHAKGQRVTYKNALSTPKNGGWRYNYGNMFYVLLVIQYLETASQKFDNQTVQIIMDEALKYQGYPYVFGGSNPNTSFDCSGITQWTFQKAGIILPRTAQAQYEVMDHLPLSQAEPGDLIFFHSTYATADYVTHVGIYVGDMRMYHAGDPIGYTDLNENYWQQHLIGAGRIKQ >NZ_CP046123|3042738:3054636|3052645_3052813_+|WP_005228365.1|DBSCAN-SWA MCPICGNKTRLKMREDTELKNFPLFCPKCRQEILIEITKFRITVITEPDAKTQSR >NZ_CP046123|3042738:3054636|3053327_3053687_-|WP_002405438.1|DBSCAN-SWA MMDRKKHRTFDFKPLGLAIKEARLSKGLTREQVGSMIQIAPRYLTNIENKGQQPSFHVVYDLVTLLNISLDGFILGEENSHKSSKRLQVEAQLDCLDEDELVTIGKVIQAIYGEKCKFN >NZ_CP046123|3042738:3054636|3050617_3052558_+|WP_002405437.1|DBSCAN-SWA MEEIKLKIINIGILAHVDAGKTTLTESLLYSSGAIKELGSVDSGTTKTDTMFLERQRGITIQTAITSFQRENVKVNIVDTPGHMDFLADVYRSLSVLDGAILLISAKDGVQSQTRILFHALRKMNIPIIFFINKIDQNGINLPDVYQDIKDKLSDDIIIKQTVNLNLKPYVIDYTEPEQWETVIVGNDYLLEKYTIGKTLNIAELEKEENERIQSCSLYPVYHGSAKNNIGIKQLIEVITSKLFSPTQLNSDKLCGNVFKVEYSDDGQRLVYVRLYSGTLHLRDSVNISEKEKIKVTEMYTSINGELRQIDKAEPGEIIILKNELLKLNNVLGDKKRLPHREILENPLPMLQTTIEPCKSVQREKLLDALFEISDSDPLLQYYVDTVTHEIVLSFLGEVQMEVTCTLIQEKYHIEIETRKPTVIYMERPLKKSEFTIDIEVPPNPFWASIGLSVTPLPLGSGIQYESLVSLGYLNQSFQNAVMEGIRYGCEQGLYGWKLTDCKICFKYGLYYSPVSTPADFRMLAPIVLEQAFRKSGTELLEPYLSFEIYVPQEYLSRAYNDASKYCANILNTKLKGNEVILIGEIPARCIQEYRNSLTFFTNGRSVCLTELKGYQVTNIKSAFQPRRPNNRIDKVRHMFNKINLH >NZ_CP046123|3042738:3054636|3054162_3054636_+|WP_002405439.1|DBSCAN-SWA MFIGIIFFLNGKGGVNDMSSSLFQAAIEMQFDYICKRSIDDERKDYLKSLSRISKKEVAFSELDDYVVEQFASIDQYPSDFSYFELEGAEIAVKSMSLGEALERLPKKKRNIILFYYFIEMNDAEIANLMGLSRSTVNEHRHKALHLIRKFMKEDAQ >NZ_CP046123|3042738:3054636|3042738_3043146_+|WP_005228382.1|DBSCAN-SWA MEVFKLKKLKSYTSIWSVEKVIYAINDFKLPFPISFSQMAWFVCSLFTVILLADIPPLSLIEGALLKYVGIPVGLTWFMSQKTFDGKKPYRFIQTVVTYAFRPKRTYAGKKVTFEKEKMDETATIVRSEYIELSD >NZ_CP046123|3042738:3054636|3045638_3047825_+|WP_154694617.1|DBSCAN-SWA MTFLFLLLFGTVAQAIGLVDDTVDVQNLYSQYPLSHYQLDFYVDTDWDWLPWNWKDGIGNQVQYGLYAMSDFIWTISLYLSNATGYLIKQAYKLDFISDTANQIGENIQILAGISENGFSTSGFYVGFLLLFILILGAYVAYVGLLKRETSKAIQAVTNFLVVFVLSAGFIAFAPSYIQRINEFSADISQASLDLGGQIIFPHSSSQGTDSVDSIRDTLFSVQVEQPWLLLQFDNSNKEEIGESRVNDLLAINPDTNNGKDREEAVKNEIEEHDNQQLTLTKTVNRLGTVSFLVLFNIGISIFVFLLTGIMIFSQILFILYAMFLPIIFLLAMLPTFSGMGKAALMKLFNTIMLRAGITLIITVAFSLSTMLYSLTTSYPFFLVAFLQIVTFAGIYLKMGDIMSLFNLQANDSQQISRGVMRRPKQYMHRGARRLQRTISRTMIGGSLGYLAGKTKGRKNAKQLPSIAGTTPSNARASVPSNQQKNDRTQRPTTRSYQTGQQIGKVLDSKNRASNFVAQKKQQVKELPKTVTGNLHQTISDFKQGMSDERTESVTSKNRPVVQSRKTKQEKKRGTTNPTTDKNHQRPAVDSVQAVNKIQQASTSNKRIDSVSRKNRPVIQSRKTNREMKPIRSTVTRPPVQHRPSNKIQTVSQEVPQGQTASKVQERITKQRNRSIKQQPSIKQQAPISRKQPTRYMTNQKQTTSTVRYSQNNRQKKNVRFTRPMKRK |
9 | Streptococcus_phage(88.89%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3412066 : 3422971
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP046123|3412066:3422971|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP046123|3412066:3422971|3420146_3420311_-|WP_154694629.1|DBSCAN-SWA MYFFSGKIALLQLRKMAERQGISAVAALGLPKEKTKRNSYRLVIRPIDKQKWSG >NZ_CP046123|3412066:3422971|3418228_3418816_-|WP_005230617.1|DBSCAN-SWA MFTGLIQEKGRIKEIRKQSRTIQLTCSASEGLLADYQIGDSMAINGTCLTAIAKQATTFTVDIMPETFQRTTFKQLSVGAEVNLERAMAATQRFEGHFVAGHIDVTTRLIQKKQLENALILTFAYPVSVQGEIIPQGSIAINGVSLTVTQTTAQAFSVSLIPHSKDQTTLGQLKQGEWVNIETDMIGKYVKYQRK >NZ_CP046123|3412066:3422971|3420322_3422971_-|WP_010748952.1|DBSCAN-SWA MNKKEFQLSVSETIEQYQVPSIDQGLDEAQVTERLETYGLNQLAVKKTAKWRLLLRQFHNTIIYILIFSAILTLLMGHFSDAVIIGIVVLVNALIGYYQEANASDALERIKEMLSAEATVYRNGIRQDIPAAEVVPGDVVFLEAGDNVPADLRIIEADNLRIQESALTGEADSVEKITDALMDEATPLAEQRNLAFASTSVTSGSGKGIVIATGVKTEIGKISAEVNQTEERKTPLMKEIDGLGKGITYVIMGVAVLLFVVSLFQQTYAISVLSLAVVTMIVGSIPEGLPATTSVVLAMGVSDMAKNKHTIIKTLPAVETLGSVDVIATDKTGTLTKNEMTVKDIVLAEQEYEVTGDGYAPVGEIRPKQEDVHAQDTLQLFLEAGYEANDTVLVPEGNHWTINGEPTDGSFLTLYHKQFAYPQAPAYQELDMLPFDSDNRYMAKLVANPAGERLLFVKGSPDKLFEMVQKQAAPFDEAYWTGHVRRLSAEGKRVVAVGYQKVSIDHIDETIFEQGLQLLGIAGIIDPPREEVIASLKEMNQAGVQVKMITGDHPLTAKAIGEKLGLADEIHVVTGAELDQMSEAEFQDAALTNQVFARTTPKNKLDIIKALQATGKVTAMTGDGVNDAPALKRADIGVAMGISGTDVAKDSADMILTDDNFGTMSLAIREGRRIYDNIKKSILFLLPTSFAEGLIIAFTIMMQKELPLQATQLLWINMVSAITIQFAFIFEPAESGIMSRKPRKTGNKLLNRHDIWQMAYVSILMAVISLIAHDWLLLQDVSEAVASTMMVNIVVLSKIFYLFNIRTSAPAFSKASFTNPKAFVIIGVMLVLQLLLTYVPFMQSAFHTEDMSLIGWVISAASGMVVLLVTEFDKWLRSRKNI >NZ_CP046123|3412066:3422971|3416544_3417018_-|WP_005230622.1|DBSCAN-SWA MTVFEGTFQGEAVKVGIVVSRFNEFITSKLVEGAKDNLLRHGVKAENIDVYWVPGAYEIPYITKKIVDHKQYDGIVTLGALIRGATTHYELISNEVAKGVAQIGLNADIPIMFGVLTTETIEQAIERAGTKAGNKGSEAAQGLLEMISLNQQILGNA >NZ_CP046123|3412066:3422971|3414211_3414994_-|WP_010748955.1|DBSCAN-SWA MKLAVEKLNLTIGDQQILKDISVQTAQGQFVGLIGSNGSGKSTLLKAIYKTLKPDSGDIYLGEMNILKSSEKKVAQQVSVVSQFNELSFDLTVEQMVLLGRTPHKGLLEQDTKADHELVTEALAKTGLSAYRKRSYLSLSGGEKQRVVLARAITQEPKFMILDEPTNHLDIRYQLEILETVKHLKIGLLAALHNLEQAANYCDIIYALKDGRVVGYGEPETLLTEELIEEIYGVKCSIYHHPITGGLGFHYYFEKEQTDE >NZ_CP046123|3412066:3422971|3412066_3412642_-|WP_080647003.1|DBSCAN-SWA MMESFMKIAVYCGASVGNEPSFATAAQELGQWIASRQNTLVYGGGKAGLMGVLADAVLENGGQVIGVIPTFLKDRELAHPGLTELHVVETMSERKRKMFELSQAFVALPGGPGTLEEITEMISWSRIGQNPNPCAFYDVNNFYHATRALYDNMVENEFLTQADREKIGFAQTTKELEAFIQAYEPPVMRQY >NZ_CP046123|3412066:3422971|3417039_3418251_-|WP_080647004.1|DBSCAN-SWA MSNTNENERRQTMHKVEQAVEWLKKGGLVIVADDENRESEGDLIGIAEYATPESVNFMATYGRGLICAPISQAIAEKLALPEMTANNTDAFGTAFTISVDHVTTSTGISAKDRAVTIEKLADPASQAADFYRPGHIFPLTAQPGGVLERRGHTEAAVDLAKLAGSVEAAYICEILNEDGTMARVPELKKLAEKWQLPFLTIDELAEYLRGTTPITVDLPTAYGAFQLTLFEDEFGNEHLLLAKGEIQHTAEPLLLRIHSECLTGDVFSSHRCDCGEQLQEAMRQIEAKGRGAILYLRQEGRGIGLRNKLRAYQLQEQGMDTYEANIALGFAADARHYTFAADVLRSLEVQEIQLMTNNPDKVKELESLGIKVAERVPLEMPAHKENRSYLKTKKEKFHHYLSI >NZ_CP046123|3412066:3422971|3418800_3419877_-|WP_010748953.1|DBSCAN-SWA MHNEYMRLAIAEANKGRYQTFTNPLVGAVIVKEQRVIAKGAHLVYGQPHAERNAIEQCHSSEDLINSTLYVTLEPCNHQGKQPPCTQLIIDSGIKKVVIGQLDPNPIVAGQGKRFLEEQGIDVLVGIEETAVRRLNPHYNFYHQHQRPYVALKQAITLDGRIAHDALTRSAITGSAVWQNVHQERGDYQGILVGSQTVLTDDPTLLTTVETSFPPIRIVLDRRGRTLSQPHLALFADDSAPVWIFTQQTTVSDLPAHVSVIQLEELTIVSLLKELAERQVQSLYVEGGAAIHDAFLASGLWQESITYVAPKFLGGNSLASFTSERTPKQLQQLTEVTVTAVGEDVCIRGRRPEECSQD >NZ_CP046123|3412066:3422971|3412713_3413055_+|WP_010748957.1|DBSCAN-SWA MNIEEYQRFISDFYKAHNWYQYDPFIRANFLAEEVGEVSRAIRTLEIGRDRPDEQDGLPEEKLANLTEELGDVLDNLFILADKYDISLETIMQKHKEKLLSRYQMDHVTEKNS >NZ_CP046123|3412066:3422971|3414998_3416072_-|WP_005233272.1|DBSCAN-SWA MSVGLIKSNRWMVSTIICCVLVVAILLSAGVALANGQANITLGEVYQILFYKISHGLVGDLSGISDANINIVWFVRAPRVLLSIFVGMGLAISGAVMQAVVQNPLADPYILGISSGASLGATFAILVGFGGSALVLQLGLSFGAFAGAGIATILVLLLASIGGKMTSTKLVLSGTIVSALCSSVSNLIIYLASNAEGMKTVAFWSMGSLASASWNKLGFIVVLVSLITLFFLTQYRVLNTLLLGDEVASTLGVKLTFYRRFYMLLAALLTSIIVANSGMIGFVGLIIPHIVRGVSGSDHRLLMPLTALTGALFLIWADVIARSTLQGVELPIGIITALIGAPIFIYIIVKRQYNFGG >NZ_CP046123|3412066:3422971|3413205_3414219_-|WP_010748956.1|DBSCAN-SWA MNKWGKMIGVGLAVFTLSACGNTKDEGTSASSSQTESTYPLTISNYTKAEGGTQWTAKDQTFNEAPKKVVANTRPAAELLLHLGLKDQIAGVGATFGAADEEVAADYAELNDLGSDYISKETALSVDPDLIFGRGGLFDNQDWGVGTVDSLNEMGIPTYVQETSVTGATFDSVYQDIENLGKLFNVPEAAAAFEKELKDRQSALEEKVADKEEQTFAHLFMSDPSVVSVYAAQDESFFNSNFDMIKLNNVFQDYSGEVSVETLIETDPDVLIVGDWSTIEGSVSGQEIIEGLYKNDKLSSMKAIKNKQVYSMDYNYLFGYGYQALTGLEELVEQMAQ |
11 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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