Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046114 | Glaesserella parasuis strain SCW0912 chromosome, complete genome | 7 crisprs | DinG,PD-DExK,DEDDh,WYL,cas3,cas2 | 8 | 3 | 13 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046114_1 | 9209-9334 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046114_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046114_1
>1.1|9251|42|NZ_CP046114|CRISPRCasFinder TGAATCTATTGCCTTAGGCGGACAAGCCAATTCGACAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_1 >merge|NZ_CP046114|1|9209-9334|CRISPRCasFinder TCAAACAATTGCCATCGGGAGTGATTCAAAAGCGAGCGGAGATGAATCTATTGCCTTAGGCGGACAAGCCAATTCGACAAATAATCAAACAATTGCCATCGGGAGTGATTCAAAAGCGAGCGGAGA >NZ_CP046114|1|1|9209-9334|CRISPRCasFinder TCAAACAATTGCCATCGGGAGTGATTCAAAAGCGAGCGGAGA TGAATCTATTGCCTTAGGCGGACAAGCCAATTCGACAAATAA TCAAACAATTGCCATCGGGAGTGATTCAAAAGCGAGCGGAGA
>NZ_CP046114.1|WP_005711085.1|7690_8134_+|FMN-binding-protein-MioC MSKSICIITGSTLGGAEYVADHLNDVLTEQGYQVGLFNQAELADIQHQTALLVVTSTHGAGELPENIQPLFQQLAESNLDLSQMKFGVVGLGSSDYDTFCNAVNLVEQGLTAKGATQVCESLRIDVVNNFDHDGSAEEWLPAFTSTL >NZ_CP046114.1|WP_021110083.1|5943_7326_-|signal-recognition-particle-protein MFENLSDRLSKTLKNITGKGRLTEDNIKDTLREVRIALLEADVALPVVREFINKVKERAIGEEVNKSLTPGQEFLKIVQTELEKAMGEANEGLNLATQPPAVILMAGLQGAGKTTSVGKLAKFLKERHKKKVLVVSADVYRPAAIKQLQTLAEALKVDFFPTETSQKPVDIAEAALKHAKLNFFDVLIVDTAGRLHVDGEMMEEIQQIHSVLNPIETLFTVDAMTGQDAANTAKAFNEALPLTGVILTKVDGDARGGAALSIRQITGKPIKFLGVGEKTDALEPFHPDRIASRILGMGDVLSLIEDLQRSVDQEKAEKMAAKFKKGDDFTLDDFREQLVEMKKMGGMMSMLDKLPGAKNLPDHVKNQVDDKMFIKMEAIINSMTLKERANPDIIKGSRRRRIALGSGTQVQDVNKLLKQFDEMQRMMKKMRKGGMAKMMRGMKGMMGGGLGGLGGMFGKR >NZ_CP046114.1|WP_131317520.1|4272_5535_+|HlyC/CorC-family-transporter MDTIPLSSLFITLAILLLLSAFFSGSETGLMSLNRYRMRHLADKGHKGAKLAEKLLSRTDVLLSLILICNNLVNIAASAIATMIGMQLSGEAGVAIATGLLTFVMLVFSEILPKTIAALYPERVGFLVSYVLVPLQKVLMPVVFFMNVIINGLMKLFRIRKSEKSGLSAEELRGVVLEAGKFIPTAHQEMLVSILDMEKVTVDDIMVPRNDIGSIDIDDDWKSIMRQLTGAAHAHVVIYKSDMDKNLLGMLRVREAFRLMLERNEFTKEQLIRAVDEIYFIPEGTPLNTQLMNFKNNKKRIGLVVDEYGDIKGLITLEDILEEIVGEFTTSTAPSLEEEVKPQSDGSVLIEGSANLRNLNKLFDWNLPLDEARTFNGLILEHLEKIPDEDTQFTLLNLKVTVLEVSDNMVKLARVEPISK >NZ_CP046114.1|WP_005711091.1|3401_4181_+|ABC-transporter-permease MLFAVLTIVAYLGALLWIMPTLAHLDTDKQPNIRAVLLLGLAAVLCHIISISQHLVVNGGQNFTIVNVASLISVIISAVATFALTRWKTVWFPLSVIYPLGIVTVTLSTFVAGSFIKQLSENLGLMLHLGIAIASYALFFIALLYAAQLKWLDKNLKSKKMAFSPVVPPLMTVERHFFTLTMVAQGLLTVALVTGMIYLHNFFAPEHIHKAIFSFIAWIVYNILLLGQWKLRWRGNRVLIYSISGMILLSVAYFGSRMV >NZ_CP046114.1|WP_005711093.1|3012_3306_+|YggU-family-protein MQAVEFCENPQGIRLRIFLQPKASRDQIVGLHDNELKIAITAPPIDGQANAHLLKYLSKLFKVPKSSIVLEKGELQRHKQIFVPEPKLIPKEIEVLG >NZ_CP046114.1|WP_010786429.1|2479_3013_+|YggT-family-protein MEYLAPFIQIVVGFFSFMLVLRTWLQFCRVDPYMPISQTLMRLTNPVLNPLSKLIPTVKGINFAALLLAAGIVALQFVLFGVDVPRAVLIGLLSIVKTFGQILFFTTLIRALMSWVTQGNHPLDYTVAQITEPVLGIIRKILPKTGMLDFSVMVLGFALLFINSLFYQIFGQLWAVA >NZ_CP046114.1|WP_015939808.1|1344_2448_+|DNA-polymerase-III-subunit-beta MQFTITREQLLKPLQQVCGVLTSRPTLPVINNILLEIEGSRLSLTGTDLEVELTTQAELFEAVSFSGKFTIPAKKFLDICRSLPDDSVISVQFDEDRVFIRADRSKFNLATLPASDYPSLMDWKPEVDFTIEQATLARLIEATQFSMANQDARYFLNGMKFETEGNLLRSVATDGHRLAVCTMALNQELLTHSVIVPRKAVLELVRLVGHNNESVRLEIGTSNLRVSMNGIVFTSKLIDGRFPDYRRVLPRNADRILEADAEVLKHALVRAAILSNERFRGVRLALNQNLLKITANNPEQEEAEEIIDVSYQSAEMEVGFNVSYLLDVLNTLKCQRVRISLVDASSSCLIEDCDNATAEYVIMPMRL >NZ_CP046114.1|WP_016528640.1|0_1335_+|chromosomal-replication-initiator-protein-DnaA MSSLWSDCLTHLQAKVSPTDYSTWLRPLQASATSSELVLYAHNQFVATWVKDKFLGEIVTLARSLSKNEQLQVEMRVGIKPAEQAVTSVTPTATPPQETQATALRSGLTETLTFDNFVQGKSNQLAKAVAQQVASNPGESHCNPFSLYGGTGLGKTHLLHAIGNEILKQNPNARVVYIHSERFVQDMVKAIKANTIENFKKFYRSLDVLMIDDIQFFANKEATQEEFFHTFNSLFERSKQIIVTSDVFPKNIENIEERIRSRLSWGVNAAIEPPELETRVAILMKKAEERGIELSEDVAFFLGQKLRTNVRELEGALNRAIAWSNFTSRQITIDAVREALKDLIASYDHLITIENIQKTVAEYYNIKMADLKSKSRTRSVARPRQMAMALAKELTNHSLPEIGREFGGRDHTTVMHACKTINELRDTDNSIQEDYTNLTRKLSS >NZ_CP046114.1|WP_015939814.1|16107_16914_-|serine-O-acetyltransferase MTNQPLDLIWQNIRNEAQELVNSEPMLASFFHATILKHHHLGDALSYILANKLANAIMPAIALKEIIEEAYQADPQIIASAACDIEAVRTRDPAVDKWSTPLLYLKGYHALQSYRVTHYLWQQGRKALAIYLQNEISVAFDVDIHPAARVGCGIMLDHATGIVVGETAVIENDVSILQGVTLGGTGKEHGDRHPKIREGVMIGAGAKILGNIEIGRYSKIGANSVVLQAVPEYATAAGVPARIIGHSQQQKPAFEMNQYFDDTNKEIN >NZ_CP046114.1|WP_010786424.1|16916_17927_-|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MEKIYSAPITVLGAGSYGTALAIALSRNGHKTYLWGHNPQKMAQMAVRRMSEEFLPDIPFPEALEIESDLATALTRSKDILIVVPSHVFSEVLQQIQPLLTSEHRIMWATKGLERDTGRLLQEVALQILGDRYPLAVLSGPTFAKELAQGLPTAIALSSTDPQFADEMQQRIHCSKAFRVYLNSDMVGVQLGGAIKNVIAIGTGISDGMGFGANARTALITRGLAEISRLGLSLGANPTTFIGMAGLGDLVLTCTDNQSRNRRFGLMLGQGRNAQEAMAEIGQVVEGFYNTKEAYLLAQKQGIEMPIVEQIYQILFCGKHASDVAKTLLGRERKGE >NZ_CP046114.1|WP_021110147.1|18265_18982_-|two-component-system-response-regulator-ArcA MQNPQILIVEDEAVTRSTLKSIFEAEGYDVFEATDGNEMNTILDNHEINLVIMDINLPGKNGLMLARELRENTDIALMFLTGRDNEVDKILGLEIGADDYITKPFNPRELTIRARNLLQRTMAEKDKTVKDPHNTESYRFNGWTLDVNSRSLINPENEVIKLPRSEFRALLHFCKNPGKIQTREDLLKQMKGRELKPHDRTVDVTIRRIRKHFEDHPNTPEIIVTIHGEGYRFCGELV >NZ_CP046114.1|WP_021110148.1|19159_20053_-|cytidine-deaminase MPTMIDIQERLIELVAEKQNPVVQAVVEQLIRQNNKAYFSAEQVTTFCQTFNLSPVELALECLPIAACYARVPVSHFFVGAVAIGKSGNFYFGANQEFESDAMQQTVHAEQSAVSHAWIAGETALTDMVVNYTPCGHCRQFMNELNSAKQLKIHLPHSQNNLLHSYLPDAFGPKDLQIDKVLFDPQQNSFEASGDALQQAAISAANLAYAPYSKAVSGVALQCGEQIITGRYAENAAFNPSFLPLQSALNFRRMQGLEGVVISRVILAEKYAVLSHRAMTESLVKNLLNLPLEYVKL >NZ_CP046114.1|WP_021110149.1|20151_20499_-|dihydroneopterin-aldolase MTDKVFIHELTAFASIGAYEWEHTIKQRLVFNIEMAWDFSRAVADDDVQYCLNYAEVSQKILDFVENTPFKLVETVAYRVAELLQHEFGVKSLRIELHKPKAVAQSSSVGVIVER >NZ_CP046114.1|WP_021110150.1|20575_21187_+|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MSVIAYLLILGAYLLGSISSAVIFCRLAGLPDPREHGSHNPGATNVLRIGGKLSALGVLMADILKGMLPVSLGFYLELPISVIGFIALAACLGHIFPVFFKFRGGKGVATAFGAIIPMGYSVAGLAVGTWLFVFLISGYSSLSAVITALIVPLYIWWFSSELTFPVALVCCLLVYRHHDNIQRLWRGQEDRGWKKKHSRQNGY >NZ_CP046114.1|WP_021110151.1|21270_21882_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MLAKLDRLLSQANIPLTDQQKQQLVDFVKLLDKWNKAYNLTSVRNPDEMLVKHIMDSLVVSQHLQGQQFIDVGTGPGLPGIPLAIANPDKQFVLLDSLGKRITFIKNAIRELKLTNVTPVLSRVEEYQEQQFDGVLSRAFASLNDMVDWCYHLPNTSGHFYALKGQYQPEELAEVGKPIELVDIIKLNVPELVGERHLVVLNR >NZ_CP046114.1|WP_021110152.1|21892_23440_-|type-I-restriction-modification-system-subunit-M MTNNEIVQKLWNLCDVLRDDGINYNDYLTELVMLLFIKMVHEKEQLFIEEKTEFKPLLPEGCRWEDLSGKSGINLLDNYRRMLLVLSTGKENDEIVHNNPLLLAIYANAKTSLTQPKHLEQSVRNFDEMDWFSAQKDGLGDLYEGLLEKNATETKSGAGQYFTPRALINSMVRCINPVVGEVIQDPAAGTAGFLIAADQYMRNKTDDYFDLSEQDRHFQIHEAFKGVELVTNTRRLALMNCLLHGIEGGSEGAVIQGNSLGDVGKNLKPADIILANPPFGTSKGGDAVITRDDLTFETTNKQLAFLQHIYRNLKEGGRAAVVLPDNVLFEAGKGTDIRKDLMDKCHLHTILRLPTGIFYAQGVKTNVLFFDKVSNDAENSTQKTWVYDLRTNMPSFGKRTPFTEKYLEAFEKVFNPTELDVNKANITMILSARQEGEWSYTEGEQTAENSRWKCFDRTYIRDVKGDSLDISWLKDNAAVSSEDLPEPEELIAEAKAELEAALAGLDELFAELTTK >NZ_CP046114.1|WP_021110153.1|23448_23940_-|hypothetical-protein MKKRTTIQFLVEGQTEREFIKALNLLGKVQLINLWDKDIFSILARLRADEIYIIYDTDVIHNIERFTRNLRVLKQQKIKFFLLQQTKNLEDEIVRCSNCQTIKDVFGTGIKEFKEQFLACNNLEYKLAEIGIKHLDLWQGKHLEQLSEWKNLRRKFSDLASSK >NZ_CP046114.1|WP_005710902.1|23950_25129_-|ATP-binding-protein MLFTYLFIDNIYNFSNAVIDFTLKRKILHSAIDGEFLDERPNFRFKRVCILSGANASGKTSLGKIMRYIQHFILFPNSNLLKQINDKEKNGLIKVEFVLPENNTIHYLEIVQSIARKSEYPLIKYASIPILDKDTSTSARKRLMEFFAKKGNSNIKNGNYYETEDNNPIFLFDNIRQKIAENLCFYYMFSDNTDKSQLSIQDGHLNAGILETVLKTFDPSIVSVNELRNQDELEGYSIRFSNKDSVLIDKNGDIPNKDRLSKGTFDAIQVADFIAFILQNAEQNKSLKSVCAIYFLDEKMAYSHSEIEQAIVNLISQKMMRYAQFIYTTHNYDVLDLNLPIHSFVFLHKTGDKAEFIQPEQKFKKNDRSLLNYVQNNVFYTIPDTSLLDELL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046114_2 | 941909-942007 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046114_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046114_2
>2.1|941939|39|NZ_CP046114|CRISPRCasFinder ACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_2
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_2 >merge|NZ_CP046114|2|941909-942007|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATTACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAGCGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT >NZ_CP046114|2|2|941909-942007|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT ACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAG CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT
>NZ_CP046114.1|WP_021109626.1|940815_941598_+|Rha-family-transcriptional-regulator MLLENKNPRWNVGNGEIMFMKTELLSTNQRENATLTMSSREIARITESRHRDVCLSIRNLMNKGVIGGYAESPYTHEQNGQVYYEYHINKRDTYVIVAQFSPEFTARLVDRWQELEQKQVQQLPSYSEALRQLADKIEESEQKSLQIASMESYFRNGISPFEFVKGLNGVNALKIGAFLVDKNWLYQDGNHKRVKSYARDQYLTEETTEISQHGKDPFVAYKPVLLKKGAAKLYEWYTKRELPMKANWNGVFTQDKVVGL >NZ_CP046114.1|WP_021109614.1|940556_940832_+|bacteriophage-CII-family-protein MARNELSKSAMKIADLIRQKASETKDAQAAEYVGVDASTICRFKAEHLDKFCAYLDFLELEVSEKGLNRLTDSELDALKLFAEKGVHAIGK >NZ_CP046114.1|WP_016527563.1|940335_940536_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MDLTSYLSDRPRGFKTTFAKKLGISKSYLRQVETGYSPMPAYLAKKIEEVTNGEVAKSELRPDLWD >NZ_CP046114.1|WP_021109615.1|939521_940205_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIKNMTLPEIRRKKLTEWFSTRDIPEKEKSYISQLKSGKSSFGERAARRLESEYGMPSFYLDYDEETESAIVSAISIQETHSHQYPIHLINFKAKAGETGFINTNYPEIIQSIYFSLDGLLEIVGRKSSNGIEMITIPTDSMAPTINKGDVVFIDTTINYYDNEGVYIFAIDDEVYIKRLQKIPGGVYRALSDNQTYEPFDIKREILDTAIILGKFIRVLPINPKDL >NZ_CP046114.1|WP_005714534.1|938573_939422_-|KilA-N-domain-containing-protein MVPNDVIIVQETEIRVTERNGEDYISLTDMCKAFGDGDQLIKNWLQNKNTIEFLQVWEEINNPNFNLVELHQIKNNIGLNRFVMSVKKWSATNAIGLIAKTGRYGSGTYAHKDIALEFGSWLSPEFKLYLIKEFQRLKQKEAQENKTEWNVKRILSKANYRIHTDAIQAHLIPRLLNSTQPIFVYSAEADILNQAMFGLTAKQWREQNPTLKGNIRDYASVEQLTVLAALESQNALLIEQGVSQKERLTILNRLAIQQMQSLLKSKSLEPLKDKPLLIEDRE >NZ_CP046114.1|WP_005714536.1|937553_938393_-|DUF3800-domain-containing-protein MHPSRTYIVYLDEFGHVGPYVSVDHPTHKTHPVFGLGGFVLPIEEVRPFSSFFFNLKQYLFENYDIPQARKEAKEQGQVFKLSTWEKKGSKQYSVANLQRYTIHITRSTNRIINQITERGGFLFYVGEAKQKDVDKHDAQRVYLSSLKEIIKRLDDEFKNQEDQFLIFMDDSESSASIVKNAIYEMHQNSKFQLIEAPVQVDSKLYQTIQCADWLCAIYGKLSFYEIEPESKPDYEIFKRYFGDRIAKAQKRSNVRNNLPKKASEKSLKKLCDKFNNHN >NZ_CP046114.1|WP_005714537.1|937235_937526_+|putative-addiction-module-antidote-protein MVELQDFDMAEHLRSEEEIQLYLNEVLKEDDVDLILSALGDIAKARNMSQIAREAGVSREGLYKAFSGKGNPTFSTVLKVMRALNLTFEVKQAVHT >NZ_CP046114.1|WP_005714539.1|936729_937176_-|hypothetical-protein MPLYENAKALIRQNLTEISQGKKAKLQVIGSFTDKQFLDINQHRKKAELPPLECNEIVYIGRHHYQSRSKDGYNINDMVKQAESALSVHSCLVPSNRATALENPHQRHDGYGNLVNDRAILELTSKKPRAELFSVIPKGDSIKPNDDQ >NZ_CP046114.1|WP_012621801.1|935838_936126_-|hypothetical-protein MTKIIIERNPTSNKYCEKAEVRTTGKAGRLARMFAKNRKKQTANTLSRVDIACLERPSKKMIDIANYACNKGKIKPTTVRAKEKIRRSCRELIRI >NZ_CP046114.1|WP_020997221.1|935627_935813_+|YegP-family-protein MYFQIFQGVNGQWYWRLCRVLSSGLIDIIATSHQAYSDKSVCEIDIMNVKLTNATTPIRYI >NZ_CP046114.1|WP_051502669.1|942424_943099_+|hypothetical-protein MQNVASMNLKSLVGQEPNYQVPAKTTAIPDGAIRTVNQLFIQLRAIFPAWKNSFPDADSYREAKRIWLETLVNEKITTIEQLQNGIERAKKSKNPFWPSVGEFVEWCKTVDYEALGLPDEDKLYKRLQAFMAFGMEEIQQFKFVSTVEYYLITDLYVRCRTGEWSDKQLKDEIKKSLVKMSKRLKTGEVLPEPKLALPQEVKAVNSEKVRAFWGGLLKQVRGRR >NZ_CP046114.1|WP_080691023.1|943172_943622_+|recombination-protein-NinB MEQRLVGMEHKQKYFLRTEKIKNNALEFVKALPIDEKKPLVVEVKPITRNLEQNAKFHAMCGDIAKQVQFNGEWLPLEAWKVLLISAHAEATKEGSRLVTGLEGELVNIRESTAEMGVKRMASLIEYTTAWGVSHGVHFNDRWNFWGVK >NZ_CP046114.1|WP_005715065.1|943655_944069_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MLYPIAIEPGDETHAYGVIVPDIPGCFSAGDTLEEAYQNVKEAIVFHLEGLVEDGEEIPMPTSIDNHRKNPDFAEYDFFFGFVDVDISHLLGKAERINITLPSYLIKRIDDFVAVHKEYKNRSNFLAKIAADKILTA >NZ_CP046114.1|WP_005715063.1|944095_944278_-|addiction-module-toxin,-HicA-family MDSKTIIKMIEADGWYLVATSGSHHQFKHPTKQGRVTVPHPKKDLKKGTELSILKQAGLK >NZ_CP046114.1|WP_035497972.1|944524_945094_+|NinG-recombination-protein MIKPKVKKRKCKCCGGEFKSADSFRKWCSAECGVKLAKIAQEKARQKAIEKRNREERAKIKATRERLKSRSEWLKDAQAIFNEYIRLRDKDEPCISCRRFHQGQYHAGHYRTVKAMPELRFNEDNVHKQCSACNNHLSGNITEYRINLVRKIGAERVEALESYHPPVKWSVEDCKEIIKTYRAKIKELK >NZ_CP046114.1|WP_021109463.1|945195_946404_+|IS256-family-transposase MNEKQLHALAAEFAKNLKTPEDLNQFSRMLKKITVEAALNGELTDHLGYEKHQPRKGKNARNGYTSKTVICDEGEIEIETPRDRDGTFEPQLIKKNQTRITGMDEQIIALYAKGLSNQEIVEMFKELYDADVSSSLISRVTDAVKERVMEWQNRPLDAVYPIVYLDCIVVKVRQDGRIINKSVFVALGVNLEGHKELLGLWIAENEGAKFWANVLTELQNRGLKDIFIACVDGLKGFPEAINAVYPKTKIQLCIVHLVRNSLKFVSWKDYKAVTADLKQVYQAPTEAQARENLTALSQKWQAKYPLVAKGWEDNWANIATFFDYPADIRKAIYTTNAVESLNSVIRRVIKKRNVFPTDDSVFKVIWLAIKDASKKWTMPIQNWKLAMNRFMIDFGDRLDDHR >NZ_CP046114.1|WP_035498288.1|946410_946791_+|antitermination-protein MGVYTEFGIGSILRVWVRRWASHRGCRGYPSLQSFMREATAQITKYSIDELSEEHYLKLDEAVMTLHDLNLEAYQVLMAVFLQGQDKKNICLEMHISPRTFDRRLRTARDFMEGAVFGSGLIRLKF >NZ_CP046114.1|WP_035498286.1|946975_948184_-|IS256-family-transposase MNEKQLHALEAEFAKNLKTPEDLNQFSRMLKKITVEAALNGELTDHLGYEKHQPRKGKNARNGYTSKTVICDEGEIEIETPRDRDGTFEPQLIKKNQTRITGMDEQIIALYAKGLSNQEIVEMFKELYDADVSTSLISRVTDAVKERVMAWQNRPLDAVYPIVYLDCIVVKVRQDGRIINKSVFVALGVNLEGHKELLGLWIAENEGAKFWANVLTELQNRGLKDIFIACVDGLKGFPEAINAVYPKTKIQLCIVHLVRNSLKFVSWKDYKAVTADLKQVYQAPTEAQARENLTALSQKWQAKYPLVAKGWEDNWANIATFFDYPADIRKAIYTTNAVESLNSVIRRVIKKRNVFPTDDSVFKVIWLAIKDASKKWTMPIQNWKLAMNRFMIDFGDRLDDHR >NZ_CP046114.1|WP_021110051.1|948228_948573_-|hypothetical-protein MLFTVGVETPHNENEAFGLCVPALFTDEYSCFSAADAIDEIIPNVKDAIHTMLEMMVEDEFDISTLQDKGFVHYKQQEDFSHCDSWLLVDIDISAFLGKKQRVNIVLEPLPQFV >NZ_CP046114.1|WP_005714898.1|948602_948788_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MHSSDLIKELKEAGCFFVRHGKGDHQIWQSPITGKRFPVPHPKQDLPIGTSRSIKKSAGLL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046114_3 | 990712-990810 | Orphan |
NA
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1 spacers
spacers of NZ_CP046114_3
>3.1|990742|39|NZ_CP046114|CRISPRCasFinder ACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_3
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_3 >merge|NZ_CP046114|3|990712-990810|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATTACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAGCGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT >NZ_CP046114|3|3|990712-990810|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT ACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAG CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT
>NZ_CP046114.1|WP_021109626.1|989618_990401_+|Rha-family-transcriptional-regulator MLLENKNPRWNVGNGEIMFMKTELLSTNQRENATLTMSSREIARITESRHRDVCLSIRNLMNKGVIGGYAESPYTHEQNGQVYYEYHINKRDTYVIVAQFSPEFTARLVDRWQELEQKQVQQLPSYSEALRQLADKIEESEQKSLQIASMESYFRNGISPFEFVKGLNGVNALKIGAFLVDKNWLYQDGNHKRVKSYARDQYLTEETTEISQHGKDPFVAYKPVLLKKGAAKLYEWYTKRELPMKANWNGVFTQDKVVGL >NZ_CP046114.1|WP_035498095.1|989121_989346_+|antirepressor-protein-Cro MEELKHFLNSLSLKEQRDFAERCGTTLGYLRKSISKKSILGAEICVAIERESKGEVTRKHLVPHWEYRWPELIE >NZ_CP046114.1|WP_035498097.1|988307_989000_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MRNIREIRRKKLKDLIDDVSGGNIADFARKIDKEPSYVARMLYPEGKPGAKPIGEKMAHHILHKFVLPLDWFNRDYDDEGKLIPFEEPSIVIDVLNVEASAGNGSTGDLVEIVSKLHYVPEQFYLYFRGIDPENIRVINIKGDSMAPTFSSGDMIFIDISIPYFDGDGVYVFTYKNNLYVKRLQMAGDHLIVISDNETYKEWEINEESIEQLYIHGKVKVHQSQKLNFIG >NZ_CP046114.1|WP_005714821.1|987294_988242_-|hypothetical-protein MNKQVKLRAFEIVNNTVSKPLQIAVLLKQKLDNSQSSNERRMLLSEDDPKKEEDLISHFNTEKDQLVFATMLRIAPGDNVQHIDEKLFQKANFSISDLLNTKLNTSAIYKNHYYFLLSNRFVVTNLPGRTTITRLQTYLNWLLNELIELNPVIELKEEYDLSNIRSFVIQDPNNDNSVNLDATQQDNSGSSMVSRFKDITHLAVEHIKEFFVDAEDFDDIDFSQLVSAKLLIQIKKPTKNSPDQIKKVFSAMLKPVSDLDNISFKTRNGTSVTGSELQRTKQVEVDTTDTGKLNEQTLFQQMELFIKELENAGKN >NZ_CP046114.1|WP_005714819.1|986846_987311_-|hypothetical-protein MQVKIKWIVVSLTTLVGALVLSSLYTPEEGVYKAVVPTIYTLSGIMFSIGMGIVCTFNPSAIKNPQIFKRVKENIANVRNSFLMYFSLATITFLISQIVHSHTLSAIELTIIFNPETVALLFSLISLIYFIINFLTIQKLIFDIAEKVMKEEQT >NZ_CP046114.1|WP_012621801.1|986037_986325_-|hypothetical-protein MTKIIIERNPTSNKYCEKAEVRTTGKAGRLARMFAKNRKKQTANTLSRVDIACLERPSKKMIDIANYACNKGKIKPTTVRAKEKIRRSCRELIRI >NZ_CP046114.1|WP_020997221.1|985826_986012_+|YegP-family-protein MYFQIFQGVNGQWYWRLCRVLSSGLIDIIATSHQAYSDKSVCEIDIMNVKLTNATTPIRYI >NZ_CP046114.1|WP_020997039.1|985590_985812_-|hypothetical-protein MHEKMKCYAVSYSFGGKKWATEIYANSFEEAQEKVKAMSQATVDGEIHLSVYIPENPLSKIARLMRRLLQKGG >NZ_CP046114.1|WP_005713710.1|985004_985247_-|hypothetical-protein MNTENYSKAESVTSSTVNLVQKHQIIEAVLSSIKITPYYDGLELKACKAISAINKYSDAEVISEITNNETVARFLKSSSD >NZ_CP046114.1|WP_010786726.1|984215_984749_-|hypothetical-protein MNLPDDYFLDVDDEMLEYLEKQALQSYDDVKKSNENNREKAYRLLNYLLLGIGSISLLLINSIDKIHPIIIVNAILLMAGWTISAFMLTHYVLLSKIRQMGTNIPQNLYNESFKNSQDKNKLGILRRYELHNINQAILSLLNTNAIYRKYTDRAIMTAISLPILLMVISSSLLHYLP >NZ_CP046114.1|WP_021109624.1|991227_991902_+|replication-P-family-protein MQNVASMNLKSLVGQEPNYQVPAKTTAIPDGAIRAVNQLFIQLRAIFPAWKNSFPDADSYREAKRIWLETLVNEKITTIEQLQNGIARAKKSKNPFWPSVGEFVEWCKAVDYEALGLPDEDKLYKRLQAFMAFGMEEIQQFKFVSTAEYYLITDLYVRCRTGEWSDKQLKDEIKKSLVKMSKRLKTREVLPEPKLALPQEVKAVDREKVRAFWGGLLKQVRGRR >NZ_CP046114.1|WP_080691024.1|991975_992425_+|recombination-protein-NinB MEQRLVGMEHKQKYFLRTEKIKNNALEFVKALPIDEKKPLVVEVKPITRNLEQNAKFHAMCGDIAKQVQFNGEWLPLETWKVLLISAHAEATKEGSCLVTGLEGELVNIRESTAQMSVKRMASLIEYATSWGVSNGVHFNDRWNFWGVK >NZ_CP046114.1|WP_035498288.1|993758_994139_+|antitermination-protein MGVYTEFGIGSILRVWVRRWASHRGCRGYPSLQSFMREATAQITKYSIDELSEEHYLKLDEAVMTLHDLNLEAYQVLMAVFLQGQDKKNICLEMHISPRTFDRRLRTARDFMEGAVFGSGLIRLKF >NZ_CP046114.1|WP_012621837.1|994147_994366_-|hypothetical-protein MANSMTEHSRKLRSKTANEYNKRMLAEGKVKQFSVRMETPVADEFVAILAEIGGKKAEAIKKLCEIYRQHQA >NZ_CP046114.1|WP_005714778.1|995220_995784_-|hypothetical-protein MYFREGYTKFPYRPSNGSEDCQNPTPNAGGIDLVNHPEKIDEILEIAQLPELKTTLIELNKPDSPFITLGCSHWIGKYDNSHFSYIEFTFKDAKIANNFNFLVQLEKDLHLFFIEKLTTGFTKEQRDSYATYLKDQVQVYFRKIQYQDDLELRNLLGLEFHFQDRQMVDFHHKALRHFLTQYLVLPL >NZ_CP046114.1|WP_035494894.1|995909_996173_+|hypothetical-protein MRDMGTQTYIWSGFSGIIAWLSEQQNLMILSLAIGIVTACANLYQRCDEGKAKRRERERAEEAHQIRMQIYRVRAERLSNEQAKKTR >NZ_CP046114.1|WP_035498439.1|996147_996693_+|lysozyme MSKLRKLGKVGGGVCAVSAIIAVLNTDFHGQFRTSQQGLEIIGDAEGCKREPYLCPANVLTVGIGSTEASSGKIERKVYTDKEIAERWLVDIQHAEKCVNRYANGGDIPQSVFDVATSLTFNAGCGTVSKSTFFRKIKSGDYVGACNELPKWVYSGGKKLRGLEIRREKEKALCLAGLIKS >NZ_CP046114.1|WP_080691046.1|996692_997010_+|DUF2570-domain-containing-protein MALILGLCAWLWGQSQRIDSLKAENQTQAQTIEQQQKANHKLTMQLQQERQAVEYQQNVANKLRKQVEQSNEQIKAILQKEPCSVTALPRPVVDELKRLHNKDKD >NZ_CP046114.1|WP_035500817.1|997038_997188_+|hypothetical-protein MPCERSEFGGTTYGDAIEYLVKVMGERDLCAGQIDSIREWQARTKQGFK >NZ_CP046114.1|WP_020997291.1|997356_997809_+|terminase-small-subunit MTKKDEGKSTSKGRGLTPKQEKFCQLYIELGNASEAYRQAYDCSKMSNETINTKAKELLKNGPITVRLDELRSSHQQRHNITVDNLLGKLERIYNEAMERDTPQFSSAVNAVMGQAKLLGFDKQVIDHTSSDGSLRPTVIELVAPNENTA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046114_4 | 1031080-1031597 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046114_4
|
7 spacers
spacers of NZ_CP046114_4
>4.1|1031103|67|NZ_CP046114|CRT AGCAGGGGCTGCTGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCTAGTAGGACCAATGGGCCCTCAAGGTCCTGCG >4.2|1031193|49|NZ_CP046114|CRT AGCAGGGGCTGCTGGTCCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGACAAGCG >4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT ACCAGGACAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGA >4.4|1031319|40|NZ_CP046114|CRT TGCAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTCAGAGAGGTGAAACT >4.5|1031382|40|NZ_CP046114|CRT AAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCA >4.6|1031445|40|NZ_CP046114|CRT TAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACAA >4.7|1031508|67|NZ_CP046114|CRT ACAAGGCCCTGCGGGTCCAGCAGGGGCTAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_4
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_4 >merge|NZ_CP046114|4|1031080-1031597|CRT GGTCCACCTGGTCCTATGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCTAGTAGGACCAATGGGCCCTCAAGGTCCTGCGGGTCCACCTGGTCCTGTGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGACAAGCGGGTCCAGCAGGTCCTAGAGGTGAACCAGGACAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGGCCCTGCGGGTCCTAAAGGAGATGCAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTCAGAGAGGTGAAACTGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCAAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCCCTGCGGGTCCAACGGGACCTAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCCCTGCGGGTCCAACGGGACCACAAGGCCCTGCGGGTCCAGCAGGGGCTAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACAAGGACCTACGGGTCCAACGGGATC >NZ_CP046114|4|1|1031080-1031597|CRT GGTCCACCTGGTCCTATGGGTCC AGCAGGGGCTGCTGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCTAGTAGGACCAATGGGCCCTCAAGGTCCTGCG GGTCCACCTGGTCCTGTGGGTCC AGCAGGGGCTGCTGGTCCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGACAAGCG GGTCCAGCAGGTCCTAGAGGTGA ACCAGGACAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGA GGCCCTGCGGGTCCTAAAGGAGA TGCAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTCAGAGAGGTGAAACT GGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACC AAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCA GGCCCTGCGGGTCCAACGGGACC TAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACAA GGCCCTGCGGGTCCAACGGGACC ACAAGGCCCTGCGGGTCCAGCAGGGGCTAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACAA GGACCTACGGGTCCAACGGGATC
>NZ_CP046114.1|WP_005714340.1|1027938_1028535_+|DedA-family-protein MELLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGLPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLFVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILQFPLIRRIATPERFATVQERFEKQGWKLLFVARFLPGLRAVVYLVSGITRRVTFTRFVLVDFFAAIISVPIWVYLGDFGAKNLDWLHQQIQKGQMAIWLMLLIGVAIVFWKWKKSHKVN >NZ_CP046114.1|WP_021109591.1|1026905_1027928_+|HTH-type-transcriptional-repressor-PurR MATIKDVAKLAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWDAIASLNYSPSAVARSLKVNTTKSIGMIITTSEAPYFAEIVLAVEEYCYRQGYSLFLCNTQNDAEKVQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTENSLALFNGTNVPMVVMDWGPNDGKSDRIIDHSLDGGYMATKHLIDNGHCDIAIIAGYLYKTTAKARYDGFVKAMTEAGLLIRKEWIFENDFQPEGGYESMNNLLKQDKLPTAVICGCDAMALGVISAITEKGLSVPQDISVIGYDNIHSSRFYAPPLTTIHQSKTRLGQMAIDTLLERIQQHNEQPSEPVTPKVLEFYPELVVRSSVRNLNQ >NZ_CP046114.1|WP_021109592.1|1025846_1026791_+|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MYEHNLELLDEIASSPVADDLATILDMMRWAYSYFNASDLYYGHGHDNAWDEANQLVLTALALPMDVPETLYASRLTCVEKERIIEMVEQRLGLRKPVAYLTNSAWFSGLEFYVDERVIVPRSPIGELIQQGFTGILRAEPKRILDMCTGSGCIAIACADKFPNAEIDAVDLSVDALNVAEINIERHNMAHRVFPFQSDLFNDLPQDRYDLIVTNPPYVDQEDLDDMPEEFHHEPEMALGSGADGLDITKRILAQAADFLSDHGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFHWLEFKNGGLGVFSLTREQLVANRHLFF >NZ_CP046114.1|WP_005714346.1|1025229_1025760_-|endonuclease-SmrB MLENDELALFREAIKGTKKIKQDTFVPKVEPRKKINEIRELKEKADTLFYFSDEYEPLLTEENDKVKYRREDVDPYILKQLRRGDFHPELFLDLHGLTKENAKKELASLILACEREGIYCASIMTGYGTRALKYQIPRWLVQHPKVIALHQAPREWGGNSAILILIEQPEKLDKKR >NZ_CP046114.1|WP_021109593.1|1023870_1025088_+|aromatic-amino-acid-transport-family-protein MKNKILGSALMIAGTTIGAGMLAMPLTSAGMGFGMTLVLLVGLWLLLTYTGLLFMEVYQTAAQQDVGVATLAEQYFGMPGRVLATVSLLVLLYALLAAYITGGGSLVSGLLPEMGEGDTTLKVSILLFTFILGAFVVVGIKGVDGLTRVLFIGKIVAFVFVLLMMFPKAKLENLTAVPLDNLLVISAIPIFFTSYGFHVIMGSINSYLDADIRKIRIAVIIGTVIPLGAYLLWQLATHGVLSQGEFVTLLNQDPTLNGLVKATSQITGSTILGEMVRIFSALALITSFLGVAMGIFEGVGDLLKRVNLPANRAILTPLTFIPPLAFALFYPNGFIAALGYAGLLFAFYGLILPIGLVWKARQAHPNLPYRVAGGSIGLILAFIMGIVIIVIPFLMQNGILPTVAG >NZ_CP046114.1|WP_021110888.1|1022508_1023723_+|amino-acid-permease MKNKTLGSTLIVAGTTIGAGMLAMPLTSAGIGFGFTFLLLVALWLLLCFSALLFVEVYQTVDSDAGLGTLAEKYYGTFGRVVSTTVLIVFLYAILSAYVSGGSSLLAAFLPTIIDAETTTRISGVIFTLVFGVFIILGTTSVDAVNRLLFTTKILAFILVLFLLLPKVSIDNLMAIPIDNALLISVSPIFFTAFGFHGSIPSLNKYLEGNVKALRISIVVGTSIPLIAYILWQLATHGVLTQTEFLQILEKDPTLNGLAEAARQITGSSIIGAMVRIFSALALITSFLGVALGLFEALEDLLKRVNINAGRVSLGALTFIPPMLFAFFYPQGFIAALGYAGQMFAFYAIVLPIAMVWKLRRQNLNLPYQVKGGSISLLLALVIGVFIVMVPFLIESGWLPKVVG >NZ_CP046114.1|WP_010786761.1|1021231_1021711_+|redoxin-family-protein MKKIMGLLLMLFSFNAFAEENKNLADIQFKDLDNNIVSLEKYKGKNVYVKMWASWCPICLAGLAEIDDLSADQNKNFEVITIVSPDKKGEKSTEKFIEWYKGLDYKNVVVLLDEQGEVLKRAKVRGYPSNVFLDSELNVKKVVPGHLSTTQITESINSK >NZ_CP046114.1|WP_005713980.1|1020563_1021214_+|cytochrome-c-biogenesis-protein-CcdA MFDQNLLISSVFLAGLASFLSPCIFPIVPIYFGILSKGGKKVLNTLLFIMGLSLTFVSLGFSFGFLGDLLLNDITRVIAGIIVIILGIHQLGIIKINFLEQTKLVEIKTNGKSASVEAFVLGLTFSLGWTPCIGPILASVLALSGDEGSALYGGAMMFVYVLGLALPFIIFSFFSDELLKRAKSLNKHLDKFKIIGGTLIILMGLLLITNNLHSFM >NZ_CP046114.1|WP_035494346.1|1019491_1020562_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MKSHKTVLFTLIMSAISNNSLAINHTNNSSKEMSKMTQTQNENIREIYLAGGCFWGIEAYMERIYGVKNATSGYANGKTDKTHYHIIGKTDHAETVHITYDANKISLEKLLKYYFQVIDPTSLNKQGNDRGRQYRTGIYYQNEQDKAIILKEIEALQTKYKDKIQVEVEPLKHYILAEEYHQDYLKKNPNGYCHIDLEQANNIIIDPKDYPKPSDEELKAKLTPLQYSVTQKKNTERSFSNEYWDNKKDGLYVDITTGEPLFSSRDKYDSGCGWPSFTKPIDKNVVTYQKDTSFNMIRTEVLSRSGKAHLGHVFDDGPQDKGGLRYCINSAAIKFIPLEQMEKENYGYLINLIKGK >NZ_CP046114.1|WP_005713977.1|1019025_1019388_+|hypothetical-protein MKTLLKVLMTTSLVSIATINTANAEMMDDCKNKMRADCQTMENMKHSEMKKNHMMKSDDMKKDGMMKSDDMKKDGMMKSDDMKKDGMMKSDDMKKDGMMKSDDMKKDHMMKSDKMKEEKM >NZ_CP046114.1|WP_021109715.1|1033369_1034461_-|murein-transglycosylase-A MFYKTYSKIILLSTLTLFTACSTKISEQPNTEITKLGAKFHQRKFIPSNVPLVNISDIQINNNIVNQKDFLQQLAHIQNHSTNLMKHHVKTYNKLFTWLSHGGKIKDLKHYGVQIQQMRGQDGYQNVLMTGYYIPVIPARIRPEGEFHHPLYAIPKGNKKYSRAQIYRGALAGKGLELAYTNSMLENFLMEVQGSGFVDIGGGRLHHLAYGDKNGYAYTSIGRLLVEDGEIAKENISIQAIRKWSKENPHRLQSLLERNNSFVYFRRDPTLEVKGSARVPLVPLASVASDKRLIPTGSVLLIEMPILDHNGNWNGHHEFRLMVALDVGGAVKGQHFDLYQGIGHQAGQKAGHMKHYGRAWLLN >NZ_CP046114.1|WP_021109714.1|1034571_1036551_-|exoribonuclease-II MFQNNPLLAQLKQQIEASKEYVEGVVKTSDKSYGFLECEKNSYFIPPAEMKKVMHGDKVKAVVKRDGDKEQVEIDSLLEPMLERFIAQVRFNKDGKLQLAVDHPSINNFIPANTQKKVTETLENGDWVVAQLKTHPLRDDRFFFAQVTQFICKADDNFAPWWVTLARHEQPREPVANEKSYELQDQVDREDLTHLYFTTIDSASTKDMDDALYVEPISENGTQTGWRLVVAIADPTAYIPEQSAIEKAARQRCFTNYLPGFNIPMLPRELSDDLCSLVPNEKRPALVGYIETDLSGNVVGEARFVSAWVQSKARLVYDEVSDYLEKVENHWTPDCAETAQQIDWLHQFTLARIDWRSKNALLFKEQGDYSFELAEDGAVKAIHIEYRRIANQMIEEAMIIANICAAQFLDKYAHTGVFNTHSGFDSKNLEPARKFLLDTLANDENRESLSERYSPERLSTLEGYCEMRRDIEQFPENFLEMRLRRYLTFAEFKATSAPHLGLGISHYATWTSPIRKYGDMVNHRLIKQVLANQTAKPVEETVLTRLQEARKQNRMVERDIADWLYARYLAPMVEQNVEFDGEIQDVSRGGLRVKVIENGASVFVPFSTLHNNKEEMLFSPEEIALYIKGEKAYQIGQAVKVKLKEVRVETRSVVGDVLI >NZ_CP046114.1|WP_021109713.1|1036765_1037110_+|hypothetical-protein METEEYLTFIKTKVFEEDRKALMSDDEYQKFQAYLLESHELGDFIQNTGGCQKIRWKLESNNKGKSGGVRVIYYVVTKQGKLLLMMMYAKSKQDNMSDKQKAMLKAVVSQLSEE >NZ_CP046114.1|WP_021109712.1|1037112_1037409_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEKELFERLMESAREMVAIEKGEIEVPPHRIHIHKIPNVKAIRTLHQMKQAEFASLLGVSQNLVQSWEIGRRTPNGAARKLLAIIEQQPNLVPVLQNL >NZ_CP046114.1|WP_021109711.1|1037466_1038129_-|Fic-family-protein MTNEQKKALFSSTRMHSELVYNMTKLEGNPYTYSEVKTLLDGITVGGRKLSDQEQVLRVSHAWEELRSQIAQNTFTLTKENFIHFNQIVAENEALMVGSFRTGQVYIAGVEKYTPPKAEYLDDIFTQMLNDFHQLDLNTHDKAFWLFLQCARHQFFYDGNKRTAQLMMNGFLLTNGLAVVSIPARLKHSYDRKMTRFYDTNKMEPMMNFLRKLAASGRYE >NZ_CP046114.1|WP_005714049.1|1038208_1038997_-|SDR-family-oxidoreductase MGFLAGKRILVTGLASNRSIAYGIAKAMKAQGAELAFTYLNDKLQPRVEEFAKEFGSDIVLPLDVATDESITNCFAELSKKWEKFDGFVHAIAFAPGDQLDGDYVNAATREGYRIAHDISAYSFVAMAQAARPFLNKDAALLTLSYLGAERAIPNYNVMCLAKASLEAATRVMAADLGKEGIRVNAISAGPIRTLAASGIKNFKKMLAAFEQTAALRRTVTIEDVGNSAAFLCSDLASGVTGEVLHVDAGFSITAMGELGEE >NZ_CP046114.1|WP_010786866.1|1039239_1039866_+|23S-rRNA-(uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase-RlmE MGRKRSASSSRWLAEHFKDQFVQKAHKQKLRSRAYFKLDEIQQTDRLFKHGMTVVDLGAAPGGWSQYVVTQIGDKGRVIACDILDMNPIVGVDFLQGDFCEESVLNALLERVGEGKVDVVMSDMAPNFSGMSSVDIPRAMYLVELALDMCRQVLAPKGSFVVKVFQGEGFDDYLREIRSLFNVVKVRKPEASRDRSREVYIVATGYKG >NZ_CP046114.1|WP_021109710.1|1039939_1041868_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MFKNILLWAVIGITLMTAFQGFESNFNSANTVEYSTFIDDLKQNRLREVNFKSNNETITVAKVDGSEYQTVMPMYDRDLLNDLLNKNVKVIGEPAERRGLLSQILISWFPMIMLIGFWVFYMRQMQGGGGRGAMGFGKSKAKMIAPDQIKTRLTDVAGCDEAKEEVAEVVDFLRDPTKFQKLGGRIPKGILMVGPPGTGKTLLAKAIAGEANVPFFTMAGSDFVEMFVGVGASRVRDLFDQAKKNAPCIIFIDEIDAVGRKRGGAGFSGGHDEREQTLNQMLVEMDGFEGSEGIIIIAATNRADVLDNALTRPGRFDRQVTVDLPNVKGREQILKVHMKKVPLAADVDPMVVARGTPGYSGAQLANLVNEAALFAARQNKRVVTMDDFEKARDKINMGPERRSNTMTEKEIINTAYHEAGHVIVGYLMPEHDPLNKVTIVPRGQALGFAQFLPEGDRVSETFTKLESQLSTLFAGRIAEGIIFGEDKITTGASSDIHRATQIARAMVTQWGFSKELGPLFYQNEDGMGAIKGVSEASQNLIDQEMRKIIDRNYERAKQTLLDNIDILHAMKDALLKYETLDRKQIDDLMNRRPVGEPSGWSNSGNDDEDKASTVQDDKPEEKSVDNQDLGDAVASREAEGKL >NZ_CP046114.1|WP_021109709.1|1041836_1042079_+|hypothetical-protein MQAEKQKANCSFLIKAEGIFCLYYSQIVLSFGIVDKIVAGSVKTKPLKKALVVRRRQLVDMRVAELNRLQQSHETQLDVE >NZ_CP046114.1|WP_021109708.1|1042199_1044113_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIFFTDLTLKRGQTILLEQANATIHTGQKVGLIGKNGCGKSSLFALLKNELQAEGGDASYPKNWSIAWVNQETPALDISALDYVIQGDREYTQLTAQLEQANLENNGNLIATLHAQLDTIDAWTIQSRAATLLNGLSFSTEQLQLPVKSFSGGWRMRLNLAQALICRSDLLLLDEPTNHLDLDAVIWLERWLSNYRGTLLLISHDRDFLDPIIDRILHIEQQKLFDYTGNYSSFEIQRATKLAQQNAAYQQQQQKIAHLQKFIDRFKAKATKAKQAQSRVKALEKMELIAPAYADSPFSFEFREPLSLPNPLLMMEKVSAGYGERTVLQSVKLNLVPGSRIGLLGRNGAGKSTLIKLLAGEIQAQSGHTQLAKGVQLGYFAQHQLDTLRADESALWHLARLAPEKTEQELRNYLGGFAFHSDKVKQAVSSFSGGEKARLVLALIVWQRPNLLLLDEPTNHLDLDMRQALTEALTQYEGSLVIVSHDRHLLRSTVDEFYLVHDGKVEEFNGDLEDYQKWLNELNAQLEFAKKADNPTACHNENSAVNRKEQKRQEAELRQQAAPLRKKLTQLEKELEKLTASLTTLEETLASPEIYDVENKAKLTDTLAKRVATKKQLEEVEMEWLEVQEQLEVLMNG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046114_5 | 1162658-1162756 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046114_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046114_5
>5.1|1162688|39|NZ_CP046114|CRISPRCasFinder ACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_5
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_5 >merge|NZ_CP046114|5|1162658-1162756|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATTACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAGCGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT >NZ_CP046114|5|4|1162658-1162756|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT ACCCAATGTCACTAATGAACATTACCCAATGGCGGAAAG CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT
>NZ_CP046114.1|WP_021109626.1|1161564_1162347_+|Rha-family-transcriptional-regulator MLLENKNPRWNVGNGEIMFMKTELLSTNQRENATLTMSSREIARITESRHRDVCLSIRNLMNKGVIGGYAESPYTHEQNGQVYYEYHINKRDTYVIVAQFSPEFTARLVDRWQELEQKQVQQLPSYSEALRQLADKIEESEQKSLQIASMESYFRNGISPFEFVKGLNGVNALKIGAFLVDKNWLYQDGNHKRVKSYARDQYLTEETTEISQHGKDPFVAYKPVLLKKGAAKLYEWYTKRELPMKANWNGVFTQDKVVGL >NZ_CP046114.1|WP_035500508.1|1161069_1161285_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNQNIELAIKTLGSQVKVANACGVSQNAVSKWLNGSSKVSLEHALKLEKATNGKVRAEDFDLSYADLLSRT >NZ_CP046114.1|WP_021109628.1|1160259_1160925_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSNLAERLKTARKSAGLTQNQLAEKIGVSQNTIQKIESGGDTKYIIKLADALNVKAYWLQTGEGEMRNHVDDVDVIDKDKDYSNTHINIDMYDIKLSAGNGKPVIEWVPRKSDEPLLFREAWFKVKRLSPKNCKAMYVRGHSMAPVLEDWDTVIVDISDTEIADGEVYAVVYNKHFYIKQIIRTGKGIQLVSFNPEYYPIDVMDDDLNNLQIIGRKVWRGG >NZ_CP046114.1|WP_021109629.1|1159716_1160208_-|hypothetical-protein MKLNEHRNCLENDEANELINILKSYDKELIWSMKPTNALWRVVTFQPLDREFEIAGTKIPQTTVQLEFRINKRIKGTGKCLLTLFKTKQQTKFRAYQLETEEEHKVTSHNGSELIMGCHEHIGKDVFKITPIYPIEDITSWFSHFCDKINLEFTGRPIEPPRT >NZ_CP046114.1|WP_021109630.1|1158925_1159717_-|DUF1828-domain-containing-protein MIKLNCEWLHSQAYLNCYAVETINGEQAICVQTHHRWLDNTPLTFYISPYGDKLLISDEGETLFHFNSVGLLSNKRSWRKVRELLSYTQSDVVLEDDGEILCMTTPENVAIALADYTAALCALLCYEQEISQLPTEVVDFADEVEFYLKAWKPNQTLISSPKIKGISGHEYLFDFQLGNQLILAINPTPNAVGSAMRRIGDVLSGGELDNRKILVIVDNRSDQLFEQQKAEEEISIISTLAKAVPFTNLIATVEKHQPTNTTH >NZ_CP046114.1|WP_012621798.1|1158622_1158805_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MKYSEFLRYLLAQGCEIETQKRGSHRKVTLNGKQSVFPYHGSKEIGTGLVNKIKKDLDLK >NZ_CP046114.1|WP_021109631.1|1158163_1158583_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MLRYPVEITKDDNNTYLVTCPDIPEMASVGEDIEEALLEAKDGLAAALEFYFDDRRTIPLPSPVKEGQHTVDLSILQSMKVFLLNEMIKQDVRKAEMARRLDVHLPQIDRLLDFKHATKVEFVEKAYSKLNRHFTILPH >NZ_CP046114.1|WP_012621801.1|1157348_1157636_-|hypothetical-protein MTKIIIERNPTSNKYCEKAEVRTTGKAGRLARMFAKNRKKQTANTLSRVDIACLERPSKKMIDIANYACNKGKIKPTTVRAKEKIRRSCRELIRI >NZ_CP046114.1|WP_020997221.1|1157137_1157323_+|YegP-family-protein MYFQIFQGVNGQWYWRLCRVLSSGLIDIIATSHQAYSDKSVCEIDIMNVKLTNATTPIRYI >NZ_CP046114.1|WP_020997039.1|1156901_1157123_-|hypothetical-protein MHEKMKCYAVSYSFGGKKWATEIYANSFEEAQEKVKAMSQATVDGEIHLSVYIPENPLSKIARLMRRLLQKGG >NZ_CP046114.1|WP_021109624.1|1163173_1163848_+|replication-P-family-protein MQNVASMNLKSLVGQEPNYQVPAKTTAIPDGAIRAVNQLFIQLRAIFPAWKNSFPDADSYREAKRIWLETLVNEKITTIEQLQNGIARAKKSKNPFWPSVGEFVEWCKAVDYEALGLPDEDKLYKRLQAFMAFGMEEIQQFKFVSTAEYYLITDLYVRCRTGEWSDKQLKDEIKKSLVKMSKRLKTREVLPEPKLALPQEVKAVDREKVRAFWGGLLKQVRGRR >NZ_CP046114.1|WP_080691024.1|1163921_1164371_+|recombination-protein-NinB MEQRLVGMEHKQKYFLRTEKIKNNALEFVKALPIDEKKPLVVEVKPITRNLEQNAKFHAMCGDIAKQVQFNGEWLPLETWKVLLISAHAEATKEGSCLVTGLEGELVNIRESTAQMSVKRMASLIEYATSWGVSNGVHFNDRWNFWGVK >NZ_CP046114.1|WP_035490314.1|1164367_1164721_+|hypothetical-protein MMEIKSFSFGKLIADLAIVGGFVYSHLYLTDSAVVNVYIWAFWAFSILTLMSAFIKPTKFLFTENRAKQMIISELTISLVLVYFGYPVLATVGFISTLAYAGCRTVKNNKKTGKHNE >NZ_CP046114.1|WP_026916882.1|1164865_1165435_+|hypothetical-protein MIKPKVKTRKCKCCGGEFKSADSFRKWCSAECGVKLAKIAQEKARQKAIEKRNREERAKIKATRERLKSRSEWLKDAQAVFNEYIRLRDKDEPCISCQRFHQGQYHAGHYRTVKAMPELRFNEDNVHKQCSACNNHLSGNITEYRINLVRKIGAERVEALESYHPPVKWSAEDCKEIIKTYRAKIKELK >NZ_CP046114.1|WP_021109611.1|1165431_1165809_+|ECF-sigma-factor-family-protein MIRLHISIDDILNVWVRRWASHRGCRGYPSLQSFMPEATVKITKYSIDELSEEHYLKLDEAVMTLHDLNLEAYQVLMAVFLQGQDKKNICLEMQISPRTYDNRLRTARDFMEGAVFGSGLIRLKF >NZ_CP046114.1|WP_021109610.1|1165817_1166003_-|hypothetical-protein MALTKKEIQEKSDKKRGVRMVGFKLHEDVIALLTELSEQSGLSKTQIVTQGIKLFAEQNKA >NZ_CP046114.1|WP_021109607.1|1167897_1168077_+|hypothetical-protein MEITLGDKIKINGEEVPEYLLKALYEDLKMKFKSDEIEVSDIIHGQHIASSGIKTSSFT >NZ_CP046114.1|WP_005714705.1|1168069_1168534_-|hypothetical-protein MIKARISRQQILNNIPEQYRHYFNIAISDIDQDLYPLFKNFTDAANILCKFAHINKKIDIVFYTELEPTLKTKTASLNIALINKDTIHFYVGQTIFYNLDKAIQYPNEVQITAYLEELVHVFMNVNDEVLVKEIVSSMYEGVTYNKEKDIYKFK >NZ_CP046114.1|WP_020996994.1|1168649_1168913_+|hypothetical-protein MRDMGTQTYIWSGFSGIIAWLSEQQNLMILSLAIGIVTACANLYQRCDEGKAKRRERERAEEAHQIRMQIYRVRAERLSNEQAKKTG >NZ_CP046114.1|WP_035498038.1|1168887_1169433_+|lysozyme MSKLRKLGKVGGGVCFVSAIIAVLNTDFHGQFRTSKQGLEIIGDAEGCKREPYLCPANVLTVGIGSTEASSGKIERKVYTDKEIAERWLVDIQHAEKCVKRYANGGDIPQSVFDVATSLTFNAGCGTVSKSTFFRKIKSGDYVGACNELPKWVYSGGKKLRGLEIRREKEKALCLAGLIKS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046114_6 | 1631175-1631388 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046114_6
|
3 spacers
spacers of NZ_CP046114_6
>6.1|1631200|38|NZ_CP046114|CRT GCAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTCAGAGAGGTGAAAC >6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT AAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCC >6.3|1631326|38|NZ_CP046114|CRT AAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCGGGACCACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_6
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_6 >merge|NZ_CP046114|6|1631175-1631388|CRT AGGCCCTGCGGGTCCTAAAGGAGATGCAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTCAGAGAGGTGAAACTGGCTCTGCGGGTCCAACGGGACCTAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCTAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCGGGACCACAAGGTCCTGCGGGTCCAACGGGACCA >NZ_CP046114|6|2|1631175-1631388|CRT AGGCCCTGCGGGTCCTAAAGGAGAT GCAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTCAGAGAGGTGAAAC TGGCTCTGCGGGTCCAACGGGACCT AAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCC AGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCT AAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCGGGACCACA AGGTCCTGCGGGTCCAACGGGACCA
>NZ_CP046114.1|WP_021110419.1|1626208_1627993_-|fumarate-reductase-(quinol)-flavoprotein-subunit MQTVNVDVAIVGAGGGGLRAAIAAAEANPNLKIALISKVYPMRSHTVAAEGGAAAVAKEEDSYDKHFHDTVAGGDWLCEQDVVEYFVEHSPVEMTQLERWGCPWSRKADGDVNVRRFGGMKIERTWFAADKTGFHLLHTLFQTSIKYPQIIRFDEHFVVDILVDEGQARGCVAMNMMEGTFVQINANAVVIATGGGCRAYRFNTNGGIVTGDGLSMAYRHGVPLRDMEFVQYHPTGLPNTGILMTEGCRGEGGILVNKDGYRYLQDYGLGPETPVGKPENKYMELGPRDKVSQAFWQEWRKGNTLKTAKGVDVVHLDLRHLGEKYLHERLPFICELAQAYEGVDPAKAPIPVRPVVHYTMGGIEVDQHAETCIKGLFAVGECASSGLHGANRLGSNSLAELVVFGKVAGEMAAKRAVEATARNQAVIDAQAKDVLERVYALARQEGEESWSQIRNEMGDSMEEGCGIYRTQESMEKTVAKIAELKERYKRIKVKDSSSVFNTDLLYKIELGYILDVAQSISSSAVERKESRGAHQRLDYVERDDVNYLKHTLAFYNADGAPTIKYSDVKITTSQPAKRVYGAEAEAQEKAAKKE >NZ_CP046114.1|WP_005712724.1|1625431_1626202_-|succinate-dehydrogenase/fumarate-reductase-iron-sulfur-subunit MTNQSKMTVEVLRYNPEQDNEPYLSKYEVPYDSQTSLLDALGYIKDELEPELSYRWSCRMAICGSCGMMVNGKPKLACKTFLRDYSGYMRIEPLANFPIERDLVVDLSHFIESLESIKPYIIDNKAPELDGKPHPSAELAKSRTKQTPAQLEKYRTFSMCINCGLCYAACPQFGLNPEFVGPAALTLAHRYNLDNRDNGKAERMKIINGKNGVWSCTFVGYCSEVCPKHVGPASAVNQGKIESAKDYVFAMLKPQK >NZ_CP046114.1|WP_021110418.1|1625026_1625419_-|fumarate-reductase-subunit-FrdC MTTAASKRKKYVREVKPTWWKALDFYKFYVLRESTSVPTVWFCLVLFYGLVCLGNGTFATTFVGFLQNPVVVILNIITLGAVLLNSFTFFGMAPQMMNVIVKNERIDVKLVSRVFWGITAFVSLLALILV >NZ_CP046114.1|WP_005712720.1|1624668_1625013_-|fumarate-reductase-subunit-FrdD MDKLNPPRSNEPAVWLLFGAGGAISAIFFPVLVLILGFLLPFGLITPDNIIAFAHTWIGKLAILALLIFPMWCGMHRIHLGLHDFKVHVPAGGWIFYGLSALYSVLVIFAVINL >NZ_CP046114.1|WP_021110417.1|1623594_1624350_+|sulfate-transporter-CysZ MSSLFSTPETQIGAGFHYFIYGWRLMLQRQLMPFIIFPVIINAVLMISLIWLFFANVGGMLDSLLPSWLEWLSFILIPLAFLMVLVAFYFAFTTLANFIAAPFNALLAEKVEQQLTGENLTEMSFNEMLKDVPRMLKREWQKMWYSIPRLVALFLLGFIPVLGQTIIPILAFIFGAWLIAIQYCDYPFDNHKIQFQRMRNALAQYRTMNFTFGALVSIFTMLPFINLVVMPVAVCGATAMWVNEYKRALHD >NZ_CP046114.1|WP_016528235.1|1622666_1623485_-|cell-division-protein-ZipA METHILFFILAGLLIAVLIGYSIWSARREKSRIFSNTFSTRPPSSPINNEITADIPTTLNPQGVVAQQPFNTETPADFIQSQQEVENSVKNIRISLQTQEISQPLYQESMPESQSEAYQQNQIQEQTVQVEQVETIEQTTEHNIITLYVVAPEGVQFQGNAIVQNLEMLGFHFGEYQIFHRHLDNPASPVLFSVANMMQPGVFDLARMEQFSTVGLVFFMHLPSVGNDLANLKLMIRTVESFAQSVGGFVLDEQHQIFNEESRQNYLLRVAN >NZ_CP046114.1|WP_021110416.1|1620575_1622603_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MPHSIETQLEHLREKLREYEYHYHVLDNPLVPDAEYDRLMNELKNLEWQHPELITSDSPTQRVGAKPLDGFAQITHETPMLSLDNAFSDDDLTGFLRRIEDRIAINSNQIEFCCEPKLDGLAVSILYVDGVLTQAATRGDGTTGEDITANIRTIRNIPLKLKSSNPPHRLEVRGEVFMPQQGFEQLNEKALAKGEKTFANPRNAAAGSLRQLDPKITRQRPLMLNAYNIGVYESDDELPTTHFDRLQWLKTLGIPVNAEITLATGSQALTAFYQKIQAKRSSLGYDIDGTVLKVNKIVLQEQLGFISKAPRWAIAYKFPAQEEMTILNDVEFQVGRTGAITPVAKLEPVFVAGVTVSNATLHNGDEIERLGIAIGDTVIIRRAGDVIPQIVGVVAERRLDNAKKIAFPTACPVCNSAVVRVEGEAVARCTGGLFCGAQRKEALKHFVSRKAMDIDGVGEKLIEQLMERELIRTPADLFKLDHTILMRLERMGEKSANNALQSIEKAKNTTLARFLFALGIRDVGESTAQNLANHFGTLDAIRQADLDTLKQVQDVGEVVANRLFQFWQEPHNVEVVEDLIAQGVKWQDVVPQEIADNPLKDKTVVLTGTLTQLTRDQAKALLQQLGCKVSGSVSSKTDYLIAGEKAGSKLAKAQELGVKILSEDELIGYFTTIVS >NZ_CP046114.1|WP_021110415.1|1618688_1620518_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecQ MSVTPLAKAETVLHNVFGYQSFRQGQSEVIEAILSGKDCLVIMTTGGGKSLCYQVPALCFEGITLVISPLISLMKDQVDQLLTNGVEAGYINSTQTIEEQQAVEQKAISGQLKLLYLSPEKVMTSNFFQFISLCKISLIAVDEAHCVSQWGHDFRPEYTLLGGLRKTFPNIPLVALTATADPTTRFDIIHHLKLEDPHTYLGSFDRPNIRYTVQEKFKPVDQLIKFISSQQGKSGIVYCNSRKKVEELTEKLSSHRFSVMGYHAGMTVQQRETVQNAFQRDNIQIVVATVAFGMGINKSNVRFVVHFDLPRSIEAYYQETGRAGRDDLPAEAVLFYDPADYGWLHKVLLEKPESEQRQIEQHKLQAIGAFAESQTCRRLVLLNYFGETRQVACQNCDICLDPPKKYDGLVDAQKVMSVIYRTGQRFGLHHIIAVLRGLNQQKIREYQHDTLSVYGIGKDKSQEYWISVTRQLIHLGFIRQNIVNHSALQLTEQARPILRGETALALASPRLSFSATTYVQKQQTSKRYDKDLFARLRFLRKQIADKENIPPYVVFNDATLQEMAEFMPTTADEMLSINGVGERKLERFGEAFLGLIREHLYHIESIACD >NZ_CP046114.1|WP_020996917.1|1618380_1618689_+|iron-donor-protein-CyaY MNLAEFHQAIEQVWEHIEEQLEEQGCDVDCETQGAVFTITFDDDSQIVINKQEAMLELWLASKLGGYHFAYRDGDWVSAEGRSFWTHLEEAVARHGETISFS >NZ_CP046114.1|WP_012621497.1|1617668_1618298_+|repressor-LexA MKRQHLTARQQEIFEFVKNHIESTGMPPTRVEIAREIGFKSPNAAEEHLKALARKGYIEMLSGTSRGIRILVEDEAANDEEGLPLIGKVAAGTPIEAIEHIEKHYPVNGAMFSPAADYLLKVNGNSMEKIGILDGDLLAVHKTKSVRNGQVVVARVDDEVTVKRLEKKGDLIYLHPENDELEPIVVDPRQSYIEIEGIAVGVIRSNAWM >NZ_CP046114.1|WP_021110500.1|1632599_1635266_-|DNA-topoisomerase-(ATP-hydrolyzing)-subunit-A MSELAKDIIPISIEEELKNSYLDYAMSVIVGRALPDVRDGLKPVHRRVLFSMDQSGNVSSKPYVKSARVVGDVIGKYHPHGDSAVYDTIVRMAQPFSLRYMLVDGQGNFGSIDGDAPAAMRYTEVRMQKITQELLTDLDKETVDFSPNYDGKEMIPDVLPTKIPALLVNGSSGIAVGMATNIPPHNLNEVLNGCLAYIENEQITIEELMQHIPGPDFPTAAIINGRKGIEDAYRTGRGKVYVRAKASVETTSKGREQIVVTELPYQVNKKNLIEKIAELVRDKRIEGISSIEDYSDKKGISIVIEIKNNAVGEVVLNNLYALTQMQVTFGINMVALDHGQPKIFNLKQIIEAFVMHRREVVTRRTVFELRKARERAHILEGLAIALANIDPVIELIRNSKTADEAREGLLDRPWSLGNVAPMLEAAGVDASRPEDLASEFGVRDGQYYLSEGQARAILELRLHRLTGLEHEKIVDEYKELLVEISELLHILNSSERLMEVIREELEKIKAEFGDERRTEITAASGDINLEDLIAQEDVVVTLSHAGYVKYQPLSDYEAQRRGGKGKSATKMKEDDFIEKLLVANTHDTILCFSSCGRLYQLKVYQLPQASRGARGTPIVNILPLVKEENERITAILPVPNGEFSADKFIFMATASGTVKKVSLDAFSNVRSSGLIALKLREGDELIGVDITNGESEIMLFSAQGRVVRFAETAVRGMGRVATGVRGIKLATTEISVDDAEEVDIETVENEEAEEASTVNLTTDKVVSLVIPHTQGEILTVTQNGYGKRTALGEYPVKSRATKGVVSIKVNERNGKVVAAVQVEENDQIMLITDAGTLVRTRVNEVSLVGRNTQGVRIIRTAEDEHVVSLERICEIEDDGIENLSVEEA >NZ_CP046114.1|WP_005714125.1|1635608_1635860_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MSFPEYKTLCDYLKEYNLRYYFIVRFLGSTGARISELVKFTIQDLEKGYAECHSKGKFRRINIPQSLINESREFFKIIKKNYS >NZ_CP046114.1|WP_080691052.1|1635826_1636120_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MFQNHKKELFLNRYGAPISARGIAHNLKIYAEKCGIRKDVVHPHNFRHFFAIQFLKKNNNIALLADLLGHSNVNMTALSLRLSHSEQREAINNSVNW >NZ_CP046114.1|WP_021110499.1|1636211_1637231_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAIKIGINGFGRIGRIVFRAAQKRDDIEVVGINDLIDVEYMAYMLKYDSTHGRFDGTVEVKDGKLVVNGKEIRVTSERDPANLKWNEIGVDIAVEATGLFLDDTTARKHIEAGAKKVVLTGPSKDSTPMFVNGVNFNAYAGQDIVSNASCTTNCLAPLARVIHETFGIKEGLMTTVHATTATQKTVDGPSAKDWRGGRGAAQNIIPSSTGAAKAVGKVLPALNGKLTGMAFRVPTANVSVVDLTVNLEKPASYEEIKKAIKDAAEGKTFNGELKGVLGYTEDAVVSTDFNGAVETSVFDADAGIALTDTFVKLVSWYDNETGYSNKVLDLVAHIYNYKD >NZ_CP046114.1|WP_005714128.1|1637460_1637856_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MIKDISELTEEQIEICLNAGTEKPFSGKFLKENRVGTYRCVRCHNALFRSDAKFDAGCGWPSFYETISESSLRYVDDYSLGRHRVEIRCGNCDAHMGHVFKDGPQPTGLRFCLNSIALNFKWDQTGEEIDG >NZ_CP046114.1|WP_005714134.1|1637937_1639041_-|porin-OmpA MKKSLIALAVSGLAVASVAQAAPQANTFYVGAKAGWATFHNDINQLNSKYKNDARYATSANGYVINRNSVTYGVFGGYQIIDNLAVELGYDYFGRVRGNKQEFRAFKHSAHGTHLSLKPSYEVLNGLDVYGKVGAALVRNDYKRYSQTAGVQTQKAHNLKTSLVLGAGVEYAILPELAFRVEYQWLSNVGNFTKAEAKENRRATYNYSPDSHSVTAGISYRFGQGAAPVAAAPEVVTKNFAFSSDVLFDFGKANLKPAAAQTLDAVHTEIVNLGLANPAVQVNGYTDRIGKDAANLTLSQKRAETVANYIVSKGVNPANVTAVGYGEANPVTGNTCDAVKGRKALITCLAPDRRVEIQVQGSKEVSM >NZ_CP046114.1|WP_021110498.1|1639443_1642536_+|FAD-binding-oxidoreductase MIPRLANIPQLNPLVQKYLAELKQQHFSGDIASNYADRLSLATDNSVYQQLPRAILFPKSVADVVILTKLAQKTAFQALTFTPRGGGTGTNGQSLNNNIIVDLSRHLTQILELNVQERWVRVQAGVVKDQLNQFLKPHGLFFSPELSTSNRATLGGMINTDASGQGSLQYGKTSDHILAIKAVLMNGDILETQAVKTDDFFANVDQLNLTANGKKLHSEIFQRCQALRPTVLKELPQLNRFLTGYDLKNVFNDVLSEFNLTRILTGSEGSLAFICEAKLNLLPLPEYRTLINIKYNSFDAALRSAPFMLQAQALSVETVDSKVLNLAKQDIVWHSVSDLLTEDEHNPILGINIVEYASNDKAQNEARIAKLCQALDEKIQDGTSGIIGYQLCNDLASIEKIYAMRKKAVGLLGNAKGWAKPIAFVEDTCVPPEHLADYIVEFRQLLDDHGLDYGMFGHVDAGVLHVRPALDLCDKSQVAKFKAISDQVVELTAKYGGLIWGEHGKGMRSAYGERFFGETLWKELRYIKQLFDPQNRLNPGKICTPLDSQASLYSIDSQMRADLDRQIPIQVREAFKGAMNCNGNGLCFNFDVHSTMCPSMKVSGNRLFSPKGRATLVREWLRLLAEQNVSPDELIFEKQQTSAKLVDFAKKIRNQWRKSQEYDFSHEVKSAMDTCLACKACASQCPIKIDVPTFRSQFNELYHRRYLRPLKDYVVANLEFIAPIMAKQPKLFNFFSANKLAETVASKTIGMVDLPALSVPTLQQQLIEIGYQGKTLEELEQLATSGQLDTEICKYVLVVQDPFTSYYDAKVVADFVQLAQKLGFKAIVLPFNPTGKAQHIKGFLHKFANTARTQAELLNRVAKLGIAMVGVDPALTLIYREEYRQILKDDCGEFKVLLAHEWLLAQLKNGTLDHCKKSAETDRLPWHLFAHCTESTSLPNSLKEWQQIFAHFGETLTAENIGCCGMAGTFGHETKHLAMSKGIYAQSWQVKLQGKTLSRCLATGYSCRSQVKRMEHQLLKHPVQALLEVI >NZ_CP046114.1|WP_005714137.1|1642868_1643288_+|hotdog-fold-thioesterase MIWKKNTTIEQLNQLCQHSAISHLGIEFTAQQNDSLEATVPVDHRTTQPFGLLHGGISATLAETLGSAAALLCCEENQIPVGTELNISHLKAIKSGKATGRATPLHLGKESQVWQIEIRDDAQQLCAVARLSTKLLSQR >NZ_CP046114.1|WP_005712493.1|1644671_1644986_-|thioredoxin MSRVIHTTDASFEQDVLKSDVPVLLDFWAPWCGPCRAIGPVLDDLAINLGNKARIVKMNVDENQQIPAEFGVRSIPFLLIFKNGEVVAQQVGAQNLPAFLEHLS >NZ_CP046114.1|WP_010785950.1|1645282_1645912_-|threonine-efflux-protein,-RhtB-family-homoserine/threonine-resistance-transporter MWTIFFVQLLGLISPGPDFFYVSRKAMADTRRNAILGAIGISIGVAFWALLTLFGLAFLNKHFPSFQFVLMICGGSYLAYSGIQMVQITKNAEIGSATSTSQATSTVKEILKGLMINLANPKIVVFFSSVLAGYVANLSALADLLAVLAILVGSAVVYFWLVALLFSRPAIRYFYAKYNRYLDNFAGAVFILFGGKLVYEGVFSLWIFS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046114_7 | 1908030-1908111 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046114_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046114_7
>7.1|1908058|26|NZ_CP046114|CRISPRCasFinder AAGCGAGGAGACATCCCCCATAAATA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046114_7
The CRISPR arrays of NZ_CP046114_7 >merge|NZ_CP046114|7|1908030-1908111|CRISPRCasFinder GGGGAAGAATTTAAAATCCTTCCCCCGCAAGCGAGGAGACATCCCCCATAAATAGGGGAAGAATTTAAAATTCTTCCCCCGC >NZ_CP046114|7|5|1908030-1908111|CRISPRCasFinder GGGGAAGAATTTAAAATCCTTCCCCCGC AAGCGAGGAGACATCCCCCATAAATA GGGGAAGAATTTAAAATTCTTCCCCCGC
>NZ_CP046114.1|WP_021110348.1|1907817_1907964_+|hypothetical-protein MISIAATAVKGNTNVTAIGSGSYEYTIAVGYSKEAGFIPDVDRYVSIV >NZ_CP046114.1|WP_010787261.1|1906598_1907273_+|cAMP-activated-global-transcriptional-regulator-CRP MQDVSISTAQLEDVSPLPSIHDPSVEWFLTHCHIHRYPAKYTLIHAGEDAESLFYIVSGAVSVFIKDEEGKEMLLTNLGQGEFVGEISLFEEKAQPRTAWVRTKGNCEIAEISYKKFKQLVHLNPDILMYLSAQMARRLRMTSRQVSNLAFLDVTGRIAQTLMNLAKMPDAMTHPQGMQIKITRQEIGQMVGCSRETVGRILKMLEDEGLISAHGKTIVVYGTR >NZ_CP046114.1|WP_005713165.1|1906307_1906532_+|YheU-family-protein MIIPWQELEESTLYNVLDSFILREGTDYGERELTLAEKRERLLAQLKADKVVIVWSELHESIDIKDKKSFLGNL >NZ_CP046114.1|WP_005713169.1|1905694_1906300_+|nucleoid-occlusion-factor-SlmA MTEPVIKMPKKSVKERQQQVLEVLIGLLNSEEGMQRVTTERLSKAVGVSEGALYRYFPSKTKMFEALIERIEMTLTSYINASKRQENTELAVKAILQTILEFAQKNPGVTRILTGHALMFEDELLKARVAKFFEGLELQFMNLLQMRKLREGRAFADERALAGYLVNFCEGQFLRLVRSNFGFNQHQHFEKQWQLIKPLFY >NZ_CP046114.1|WP_021110349.1|1905230_1905686_+|dUTP-diphosphatase MKQIDLKILDKRIGTEFPLPTYATTGSAGLDLRALIEQPLTVEAGHTVLIPTGISVYIADPNLAAVILPRSGLGHKNGIVLGNLVGLIDSDYQGPLMVSLWNRSDKPFTVEVGDRIAQLVFVPVVQAQFNIVEEFTATDRGEGGFGHSGKQ >NZ_CP046114.1|WP_005713172.1|1904878_1905205_+|hypothetical-protein MKLQVTTSYTIEEGIFPTFVKGTEIKALTPCRKYPNWYACEIEGYHTYVPEHFVRANHLVTDYNPTELAVVKGDIVELLELHYQWALVSKGKEIGWLPCEILVTSGQL >NZ_CP046114.1|WP_021110350.1|1903666_1904869_+|bifunctional-phosphopantothenoylcysteine-decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine-ligase-CoaBC MLKDKKILIGITGGIAAYKTIELIRLLKTAGAEVRVAMTPAAEAFVTPLTLQAISGNAVSTSLLDPQAELAMGHIELAKWADLVVIAPATADFIARLRIGMGNDLLSTICLATASPILLAPAMNQQMYKRSIVQENLQSLTEQGVSIIGPNAGFQACGDIGKGRMSEPSEIFQAIEDHFTQSQDLADLSVVITAGPTREAIDPVRYISNHSSGKMGFAIAEAFAKRGAKVTLIAGPVNLATPQNVSRIDVISAQQMAEQAVSLVQKNAIFIGCAAVADYRVEQVAEQKIKKTGDNDELTLKLVKNPDIIATVAHLTQNRPFVVGFAAETQNVADYAKDKLQRKNLDLICANDVSGGQVFGQDQNTLHLFWQNGEKILPLAEKGKLAEKLVDEIVEHYRHL >NZ_CP046114.1|WP_005713175.1|1902780_1903497_-|JAB-domain-containing-protein MNESSSELMPREKLLKFGAEALSDAELLAIFLRTGIKGIPVMDLSESVLTAFGSLRGLLSATLEDFCKIKGLGQIQYIQLQATKEMTKRYLSQQMKVNEMVDSPYLAVMYFQSELESWEREVFMVIFLDNQNRLIKTEKMFYGTINQASVHPREIIKEALKCNAAAILVAHNHPSGNCNPSEADRFLTRKIEMACDLVDIRFVDHIIVGKGDYFSFEEEKFEQENSEFSPCLDELKQV >NZ_CP046114.1|WP_006251446.1|1902418_1902655_-|50S-ribosomal-protein-L28 MSRVCQVTGKRPAVGNNRSHAMNATKRRFLPNLHTHRFWVESENRFVTLRLTAKGMRIIDKKGIDAVLAEIRARGEKI >NZ_CP046114.1|WP_005624479.1|1902236_1902407_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAAKGNREKIKLVSTAETGHFYTTTKNKRNMPEKMEIKKFDPVVRKHVVYKEAKIK >NZ_CP046114.1|WP_021110347.1|1908171_1909179_-|quinone-dependent-dihydroorotate-dehydrogenase MYPLIKKAFFNLDAENAHQFAIQSLKLFGKTPFSLACSLPDNPTEVMGLRFKNPIGLAAGADKNGEAIDGFAKLGFSFIEVGTVTPVAQDGNPRPRQFRILEAEGIINRNGFNNLGVDVLIENVKKAKYNGILGINIGKNAITPIEHSLDDYQICLRKVYPHASYVTVNISSPNTKNLRSLQYGEALDDLLRSLKAEQAQLSQKFGGYKPLVLKIAPDLTAEEIASVADSLVRHQIDGVIAGNTTLSRDSIAGLPFADQQGGLSGKPLNALSTQLISQLSQELNGKLPIIGSGGIHSVQSGQEKINAGASLLQLYSAMIYQGPDLVRQLVRKISI >NZ_CP046114.1|WP_005713153.1|1909428_1910379_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MPDIKLFAGNATPELAKRIAERLYISLGDATVGRFSDGEIQVQINENVRGGDIFIVQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLIEDILKKTDLVNPIVVSPDIGGVVRARAIAKLLNDADMAIIDKRRPKANVAQVMHIIGDVADRDCILVDDMIDTGGTLVKAAEALKERGARRVFAYATHAVFSGSAAKNLANDALDEVIVTDTIPLSAEIRALNKVRVLTLSGMLAEAIRRISNEESISAMFSH >NZ_CP046114.1|WP_021110346.1|1910406_1911252_-|4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol-kinase MATFTFPSPAKLNLFLYITGKRSDGYHELQTLFQFVDFGDEIEIELRQDPIIHLTNQIDGVAVEQNLIYRAAKLLQEKTACPLGANIGVTKRLPMGGGVGGGSSNAATVLVALNELWQTWLSLEQLAEMGLTLGADVPIFVRGIAAFAEGVGEKLTPCQPKEKWYVVLKPDEAIATASIFKHPDLTRDTPKRTLAELLDAPFANDCEKIVRDLYSKVDDLLNWLVQYAPSRLTGTGACVFAEFDCEDEARRVFALKPENVEGFVAQGRNVSPLHKTLNLYP >NZ_CP046114.1|WP_021110345.1|1911253_1911886_-|lipoprotein-localization-protein-LolB MKKLTKLLSLTLLFALAGCHSVLDAPTEITQPTVAIPHNDAKWQQHLAQLTQINAYSAKGQFGYISPEERFSSHFDWQYKTPTNFGLTMSSNLSSKSLKLQRNVYGMTISDSEGRSRTEADVAMLMEEIIGVSFPIDQFAYWVKGQPEQQSNYVVNEKRQLAQFDYAVNGTLWKVRFVEYHEDRQPNLPKLIVLENGSQTLKIRIDHWAY >NZ_CP046114.1|WP_021110344.1|1912006_1913332_-|ATP-dependent-RNA-helicase-SrmB MNELTTFEELDLSPELLQALEKKGYKRPTAIQQETIPPAMEGRDVLGSAPTGTGKTAAFLLPALQHLLDHPRRNPGPPRILILTPTRELAMQVAEQAEELAQFTNLKIATITGGVAYQNHGEVFNTNQDLVVATPGRLQQYIQEENFDCRSVEILIFDEADRMLQMGFGQDAEKIAAETRWRKYTWLFSATLEGELLVDFAERILNDPVQIDAEPSRRERKKIQQWYYHADNLEHKTKLLARLISEFEIERSIVFVRRRESVRELSETLRKRGIRSTYLEGEMAQTQRNQAIARLKDGVVNMLVATDVAARGIDIDDVDFVINFDLPYSADTYLHRIGRTARAGKKGSAVSLVEAHDYKLLGKIKRYTEEPLKPRIIEGLAPRTKAPKDGEVNTVSKKEKARIKKKKEEKKESLKKKVKVRHKDTKNIGKRRKPTGEQGES >NZ_CP046114.1|WP_015940035.1|1913360_1913705_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEEIKQARASKSKKTLDIYQRATVRDEIARKLLLNEMSLGQALKYLRLHLLAMKQERYAEIVKVSRKTLSDLENDKGNYSIDIINQVLRPFELQLGVVPMNKTLLRQVLNEQAV >NZ_CP046114.1|WP_021110343.1|1913704_1915048_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HipA-family-toxin MQIEPLTLQAYIADRWQDIAILTFQADYSLNDFSYLYDLAEILSDNDKAVSFNYPVEFFPYRSVSGWFAFLDDIVPSGASRRYWLQKLDIAHLPTAQQNYLLLKQGTIAPVGHLRVKQAVSSFIENEPPRLFEIDDVINRQADFLEYANQRGAMAGGATGAGGEAPKLLLRQTATQQVWIDNLQQGDAADDFYLVKFPRGKRSAIDCDILRAEFHYYHELASMGFDTIDTTKMRLEEGERYPSLWLPRFDVYRNEQGKMARYAVESVYAMLEKGAGSLLDHEKVIRQLIAKIENSHLVETGMAFDKQAFVIEWVRRDLLNIAFGNSDNHGRNTAFLRNQNRIWLAPIYDFAPMKADPEGIPRTTMWDSKSHPALELGGEYRFDLIAEQLDDLCPADKLLDALRQTAQQLVGLKARLEARGVPTAILTYPSISLDYLPEKLKRWQLLS >NZ_CP046114.1|WP_021110342.1|1915161_1915599_-|ribosomal-protein-alanine-N-acetyltransferase MIEPILENDFDRLFEIEQQAHLVPWAKGTLLNSQGERYLNLKLSVENRIVAFAICQFVLDEVTLFNIAVDPAYQGKGYGKQLLQALIAQLQQKQITTLWLEVRASNTTAQKLYFSLGFNEVTVRKNYYPTQDGGRENAVVMALYL >NZ_CP046114.1|WP_016528419.1|1915840_1916281_-|M23-family-metallopeptidase MKTLVKYITVLGILFSFFIACIYLFKPPYFYAYACWLPTLLQGTPTEQSLPNPVPNQRFADTWHGMRSGGQNKLGGKVVSVMTGWTVHYYAHLEEYGDIKRHQWIEQGAVIGTVGDSGNAKGTPPHLHYGIYTPTGAVNPYPLIKQ >NZ_CP046114.1|WP_005713136.1|1916282_1916696_-|DNA-polymerase-III-subunit-psi MNRRDLLLTEMNIPQWILVKPQVLKGDAQIRLADNIKLVVICEEDHQQTGLFQDVLRALQLNHEQYQWISLEQAMRLQFDHQPIFWLIQPEEQAVQFTKKFANQTAWQCESWQMLSQATQKRELWQQMQLFCKDMAE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046114_4 | 4.2|1031193|49|NZ_CP046114|CRT | 1031193-1031241 | 49 | NZ_CP046114.1 | 655266-655314 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.2|1031193|49|NZ_CP046114|CRT | 1031193-1031241 | 49 | NZ_CP046114.1 | 1630893-1630941 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NZ_CP046114.1 | 196281-196311 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NZ_CP046114.1 | 1630929-1630959 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NZ_CP046114.1 | 1892285-1892315 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.4|1031319|40|NZ_CP046114|CRT | 1031319-1031358 | 40 | NZ_CP046114.1 | 196218-196257 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.4|1031319|40|NZ_CP046114|CRT | 1031319-1031358 | 40 | NZ_CP046114.1 | 655356-655395 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.4|1031319|40|NZ_CP046114|CRT | 1031319-1031358 | 40 | NZ_CP046114.1 | 1892339-1892378 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP046114_6 | 6.1|1631200|38|NZ_CP046114|CRT | 1631200-1631237 | 38 | NZ_CP046114.1 | 1892340-1892377 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_6 | 6.1|1631200|38|NZ_CP046114|CRT | 1631200-1631237 | 38 | NZ_CP046114.1 | 196219-196256 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_6 | 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT | 1631263-1631300 | 38 | NZ_CP046114.1 | 1631029-1631066 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NZ_CP046114.1 | 1631145-1631175 | 1 | 0.968 |
NZ_CP046114_4 | 4.4|1031319|40|NZ_CP046114|CRT | 1031319-1031358 | 40 | NZ_CP046114.1 | 1630965-1631004 | 1 | 0.975 |
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NZ_CP046114_4 | 4.6|1031445|40|NZ_CP046114|CRT | 1031445-1031484 | 40 | NZ_CP046114.1 | 1194791-1194830 | 1 | 0.975 |
NZ_CP046114_4 | 4.6|1031445|40|NZ_CP046114|CRT | 1031445-1031484 | 40 | NZ_CP046114.1 | 1892537-1892576 | 1 | 0.975 |
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NZ_CP046114_6 | 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT | 1631263-1631300 | 38 | NZ_CP046114.1 | 1410962-1410999 | 1 | 0.974 |
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agcaggggctgctggtcctaagggggataaaggcgaaccaggacaagcg CRISPR spacer agcaggggctgctggtcctaagggggataaaggcgaaccaggacaagcg Protospacer *************************************************
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agcaggggctgctggtcctaagggggataaaggcgaaccaggacaagcg CRISPR spacer agcaggggctgctggtcctaagggggataaaggcgaaccaggacaagcg Protospacer *************************************************
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tgcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaact CRISPR spacer tgcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaact Protospacer ****************************************
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aaagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcca CRISPR spacer aaagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcca Protospacer ****************************************
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taagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggaccacaa CRISPR spacer taagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggaccacaa Protospacer ****************************************
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12. spacer 6.1|1631200|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1892340-1892377, mismatch: 0, identity: 1.0
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tgcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaact CRISPR spacer tgcgggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaact Protospacer ***.************************************
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19. spacer 4.6|1031445|40|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1892537-1892576, mismatch: 1, identity: 0.975
taagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggaccacaa CRISPR spacer taagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggatcacaa Protospacer **********************************.*****
20. spacer 6.1|1631200|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1630966-1631003, mismatch: 1, identity: 0.974
gcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaac CRISPR spacer gcgggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaac Protospacer **.***********************************
21. spacer 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1410962-1410999, mismatch: 1, identity: 0.974
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcc CRISPR spacer aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtcttcc Protospacer ********************************* ****
22. spacer 6.3|1631326|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1410899-1410936, mismatch: 1, identity: 0.974
aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcgggaccaca CRISPR spacer aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggaccaca Protospacer *****************************.********
23. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to position: 655302-655332, mismatch: 2, identity: 0.935
accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer accaggacaagcgggtccaactggaccacga Protospacer *******************.* *********
24. spacer 6.3|1631326|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 196030-196067, mismatch: 2, identity: 0.947
aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcgggaccaca CRISPR spacer aagggtgacaaaggtgatacgggtccaacgggatcaca Protospacer ***************************.*****.****
25. spacer 6.3|1631326|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1194792-1194829, mismatch: 2, identity: 0.947
aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcgggaccaca CRISPR spacer aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggatcaca Protospacer *****************************.***.****
26. spacer 6.3|1631326|38|NZ_CP046114|CRT matches to position: 1892538-1892575, mismatch: 2, identity: 0.947
aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcgggaccaca CRISPR spacer aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggatcaca Protospacer *****************************.***.****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NC_014811 | Mycolicibacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101, complete sequence | 202275-202305 | 7 | 0.774 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | CP006880 | Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602c, complete sequence | 2289465-2289495 | 7 | 0.774 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | MH045567 | Microbacterium phage Elva, complete genome | 980-1010 | 7 | 0.774 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NZ_CP035092 | Paracoccus denitrificans strain ATCC 19367 plasmid unnamed1, complete sequence | 159389-159419 | 8 | 0.742 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NC_008688 | Paracoccus denitrificans PD1222 plasmid 1, complete sequence | 406736-406766 | 8 | 0.742 |
NZ_CP046114_4 | 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT | 1031265-1031295 | 31 | NZ_CP010864 | Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD9, complete sequence | 29051-29081 | 8 | 0.742 |
NZ_CP046114_6 | 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT | 1631263-1631300 | 38 | MT774376 | CrAssphage cr55_1, complete genome | 95723-95760 | 9 | 0.763 |
NZ_CP046114_6 | 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT | 1631263-1631300 | 38 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 20-57 | 9 | 0.763 |
NZ_CP046114_4 | 4.5|1031382|40|NZ_CP046114|CRT | 1031382-1031421 | 40 | MT774376 | CrAssphage cr55_1, complete genome | 95722-95761 | 11 | 0.725 |
1. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to NC_014811 (Mycolicibacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
accaggacaagcgggtccagcaggac-cacga CRISPR spacer gtcaggacgagcgtgtccagcaggacatatg- Protospacer ..******.**** ************ .*.*
2. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to CP006880 (Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602c, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer accaggacaagcgcgaccagcagcgtcgaga Protospacer ************* * ******* ..*. **
3. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to MH045567 (Microbacterium phage Elva, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer accaggcgaagcgggtccagcagaaggagta Protospacer ****** ***************.* * *
4. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP035092 (Paracoccus denitrificans strain ATCC 19367 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer gtcggtgaaagcgggtccggcaagaccacga Protospacer ..*.* . **********.***.********
5. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to NC_008688 (Paracoccus denitrificans PD1222 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer gtcggtgaaagcgggtccggcaagaccacga Protospacer ..*.* . **********.***.********
6. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP010864 (Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer gccaggacatccgggtccagcaggttccagt Protospacer .******** ************* .* *
7. spacer 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcc CRISPR spacer aagggggaacctggtcctaaaggtgaaccgggagctga Protospacer ***** ***** **************** .** ..*
8. spacer 6.2|1631263|38|NZ_CP046114|CRT matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
aagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcc CRISPR spacer cagggagaacctggtcctaaaggtgaaccgggagaacc Protospacer **** ***** **************** .** . **
9. spacer 4.5|1031382|40|NZ_CP046114|CRT matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.725
aaagggtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattcca CRISPR spacer taagggggaacctggtcctaaaggtgaaccgggagctgat Protospacer ***** ***** **************** .** ..*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
541386 : 657886
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046114|541386:657886|DBSCAN-SWA CTTAACGGTGATCGTCTAGGCGATCACCAAAATCAATCATCAATCGATTCATCGCCGGTTTCCGGTTCTGAATCGGCATTGTCCATTTTTTTGATGCATCTTTAATCGCAAGCCAAATCACTTTGAAAACTGAATCATCCGTCGGGAATACATTTCGTTTTTTAATCACGCGACAAATCACGCTATTGAGCGATTCCACGGCATTCGTGGTATAAATCGCTTTACGAATGTCAGCCGGATAATCAAAAAATGTGGCAATATTTGCCCAGTTATCTTCCCAGCCTTTCGCCACAAGCGGGTATTTTGCCTGCCATTTTTGCGAAAGTGCGGTCAGATTTTCGCGAGCCTGTGCTTCCGTCGGGGCCTGATAAACCTGCTTTAAATCTGCGGTGACGGCTTTGTAATCTTTCCACGAAACGAATTTCAAGCTGTTACGCACTAAATGCACAATGCAAAGCTGAATCTTCGTTTTAGGATAGACTGCATTGATGGCTTCTGGGAAGCCTTTTAAACCGTCTACACAGGCAATAAAAATGTCTTTTAAGCCTCGATTTTGAAGCTCTGTCAGCACATTTGCCCAGAACTTCGCACCTTCATTTTCAGCAATCCAAAGCCCCAATAACTCTTTATGTCCTTCAAGATTCACACCCAAGGCAACAAACACGGATTTGTTGATAATTCGTCCATCTTGGCGTACTTTCACTACGATACAATCTAGGTAAACAATTGGATAAACCGCATCAAGTGGGCGATTTTGCCATGCCATTACGCGCTCTTTCACGGCGTCGGTAACGCGAGAAATCAGGCTGCTTGACACATCCGCATCATAGAGTTCTTTGAACATTTCAACGATTTCCTGATTACTTAACCCTTTGGAATATAAGGCAATAATCTGCTCATCCATTCCTGTGATGCGGGTTTGATTTTTCTTGATAAGTTGCGGTTCAAAGGTGCCGTCACGGTCACGAGGCGTCTCAATTTCTATCTCACCTTCATCACAAATGACGGTCTTAGATGTGTAACCGTTACGTGCATTTTTACCTTTTCTAGGCTGATGTTTTTCATAACCAAGATGGTCGGTCAGTTCACCATTTAACGCAGCCTCGACGGTGATTTTCTTGAGCATCCGTGAAAATTGATTGAGGTCTTCTGGTGTTTTTAGGTTTTTGGCAAATTCCGCTGCCAAGGCGTGAAGTTGTTTTTCGTTCATAATAAAATACCTGTGTCTGAATGTATTATCTCAGAAACAGGTATTTACACAAATTGTGGGAGAGGCTCATTTATTGAAATTTAATTATATTTCCATTCATTGATGATAGTTTTATACTTTCAATAACCTCTATTGATTCTATTGCCGTTTTTATATTTGATACAGGTTGTTTTCCTGTTTCAATACCTTCAATTAGACTTAAAATGGCATCTATCATTCTTTCATTTGGAGTAGTATTGTGTTTTGAATAGACTAAATCTAAATGTTCATACTTGCTACCTGATGAATTTTCACTACTTGAAAATTTATATAAATCATAAGATGATCCATTGTTGTATAATCTTATTCGCCCATTTTCGCCAAGTATGTCTAATTCAAACATATATTTCATTGGGGAAGAACTAGTACCTTTAATGAACCCAATAGAATTAGACTTAAACTTTATCATTCCTGTTCCTCCGACATCAGAAATACCGTGAACATTTCTCACAAAATCTTTTTGAATATCTCCAACAACATATTCAATATCTGAACCAGAAAAATAAAGCAATAAATCTATTAAATGGCTTGTACTCGTATGTAAAGCAGTTGCACCATAACCAACTAAAGAATAAATATTCCCTATAGCATTTGAATCTAATAGTCCCTTGATTTCTTGAATAAGATTATCCCAACGAAAAATGTAATTAACAGCGATAATAACATTATGCTTATCGCATAACTCAACTATTTCCTTAGATTCTTCTAGAGAATAAGAAATAGTCTTTTCACAGAAAATCACTTTAACTCCATTCTTAATACACTCTTTGATGATATCAAAATGTGTTTGAATAGGTGTACATATACTGACAATATCAAATTTATTAGATTTCAGCATTTCTTTATAATCTGTATATCCATTTGGTATATCACATTCTTTTTGGATAGAATCTACCAAAGATTTCTTAACATCACATACTGATGATATTCGTATATTTTCAATACTTTTATATGCTTTAATATGACTCCATATGATTTTTCTGTTTGGATCTTTATCTATACCATAAGCAATCAAGCCTAATCCTATAACACCCACATTATACATATTAATCTCCATGGGATTTTTTCCTCAATGAAATAACACATCCTACAATAACGATTGCAGCACCAAAACCTTGATAAATAGAAATAGTTTCACCTAAAGTAAAGTAACCAATAAACGCAGTAGATAAGGGAACTGTTAATTGAATAATATTGAAAACAACTACCCCTTGTTTTTGAACAATATAAAATGCAAATAACATACCTGTTAGCACTCCATACATTCCAGCAAAGATTAATCCGATCAGCAAGCCTGAACTAATATCTTGTAATTGATAAATAACACCTGTATTACTTGCTAAAAGTAGATAAACAAGTCCAGATAAAGTAGCAGTGGATGCACTGATAACGATGGCATTTAATTTTTTTGCGACCTTTTTAACGAAAAGGTTTTGAATAGATTGAATAAATATAGCTGTCCCCAAAAAGAGTGACCCTGTTATAAAATCATTACCCCCACCAGTTTTGTTGCTATAAATTACAAATATCAAAGAACCAATTACAGATAAGACGCTACCAATATAAAAGCTCTTTTGTTTTACTTTTTCCCTTTCATCTTGAAAGAAAATTGCGGCCATAATAACAGCTAAAGGCATAGACATAATGCCAAAAATACTGCCTGCTAAAGCTGAAGTATATTTAAGACCATTAATAAAAAAATACATATTACCAGTCATAAAAATAGCTAACAAAAGAAGATATAAGATGATTGAAGGTTCTCTGAGCAACTTAAGTAGTTCTGTTCTATATTTTAATATACAAATAAAAACGAATAACAACCCACCAGAGAGAAATCGAACAGCATTATTATTTAAAGTATCAAAATGAATACTCATATAACGCATAATAGGAAAACCAAAACCCATTAACAAAACATAAGAAAATCTTATAAAAGAATCATTACCCATACGACTAAGCCCCATACCTAAAAGGTAAGTAAGATTAGGTAATTATAAAATATTTGTATTGTTTCTCATAGAAAAAGAGCATAGATTTTGACATCTATGCCCTTTTCCTATAATCTGTTTCGTGCGTTCTTTGCTAAGATAACACTAAGATAACAGACCCTAGACAAGTCATATCTTAGCAAAGGGTAGCTAGTAATGCGACCCTATCCCAAATTCTGTGTAAACACCCATTTCAACTTAACGGTGATCGTCTAGGCGATCACCAAAATCAATCATAAATCGATTCATCGCCAGTTTCCAGTTCTGAATCGGCATTGTCCATTTTTTTGATGCATCTTTAATCGCAAGCCAAATCACTTTGAAAACGGAATCATCCGTCGGGAATACATTTCGTTTTTTAATCACGCGACGAATCACGCTATTAAGCGATTCCACGGCATTCGTGGTATAAATCGCTTTACGAATATCAGCCGGATAATCAAAAAATGTGGCAATATTTGCCCAGTTATCTTCCCAGCCCTTCGCCACAAGCGGGTATTTTGCCTGCCATTTTTGCGAAAGTGCGGTCAGATTTTCGCGAGCCTGTGCTTCCGTCGGGGCCTGATAAACCTGCTTTAAATCTGCGGTGACGGCTTTGTAATCTTTCCACGAAACGAATTTCAAGCTGTTACGCACTAAATGCACAATGCAAAGCTGAAACTACGATACAATCTAGGTAAACAATTGGATAAACCGCATCAAGTGGGCGATTTTGCCATTCCATTACGCGTTCTTTCACGGCGTCGGTAACGCGAGAAATCAGGCTGCTTGACACATCCGCATCATAGAGTTCTTTGAACATTTCAACGATTTCCTGATTACTTAACCCTTTGGAATATAAGGCAATAATCTGCTCATCCATTCCTGTGATGCGGGTTTGATTTTTCTTGATAAGTTGCGGTTCAAAGGTGCCGTCACGGTCACGAGGCGTCTCAATTTCTATCTCACCTTCATCACAAATGACGGTCTTAGATGTGTAACCGTTACGTGCATTTTTACCTTTTCTAGGCTGATGTTTTTAGGTTTTTGGCAAATTCCGCTGCCAAGGCGTGAAGTTGTTTTTCGTTCATAATAAAATACCTGTGTCTGAATGTATTATCTCAGAAACAGGTATTTACACAAATTGTGGGAGAGGCTCCAAATCGACGGCAGCAATTATTTTTTCATCTACTTCAGACCATTTTTTCTTTAACGACTTCCCATTCCATTTCATTGAAATTCAAAAAGTATCGCCATCAATTCTAGTCTGAATTTCTGTTAGATAAAGTGTATTTGTGAGAGGTATAGCTTGTTTAAGTAGCTTGCCTCCCCCAATAGTCATGATTTCATTGCTACTATAAAAGCCTATTCCCATTGTTGCCGTGCAAGCGAACATCAGAAAGCCCATTATTTGGTAACGCTGTTCATCACTAGACTTGGACTATAAAGAGAAAATAACAGCGCATATAATGTATTTCCTTCATAATAAAAAGAAATGCGCCTACTAACGACTACTTAAACAGTCATAGATAGACGCATAATTAAACTATAATAACGACGGCGCTGCATCTAATAGAATTTTGGTGTACTCTTCTTTTGGTGTGTCGAATACATCGGCGGCATTACCTTGCTCAACAATTAATCCACCATTCATTACCACAATTCTATCTGAAACTTGGCGGACGGTTTGTAAATCGTGAGAGATAAACACCATCGCAAGATTTAACTCTTTTTTCAGATCGGCTAACAGGTTTAGTACCTGCGCACGAACGGATACGTCAAGT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115 | Mannheimia_phage(22.92%) | protease,transposase,portal,integrase,terminase,tRNA,tail | attL 578592:578641|attR 613845:613894 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
735144 : 785886
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046114|735144:785886|DBSCAN-SWA 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52 | Pseudomonas_phage(13.33%) | terminase,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
868159 : 877957
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046114|868159:877957|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046114|868159:877957|872124_874512_-|WP_021109665.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKFSESWLREWVNPAITTEQLCDQITMLGLEVDAVEAVAGEFNGVVIGEVVECAQHPDADKLRVTKVNVGGERLLDIVCGAPNCRQGLKVACATEGAVLPGDFKIKKTKLRGQPSEGMLCSFSELGIKEDHSGIIELPADAPVGLDVRDYLKLNDRAIEISLTPNRADCLSIAGIAREVGVVNQLAVNAPEIQAVPATISDKVAIELQAPEACPRYLGRVVKNVNVKAQSPLWLQEKLRRCGIRSIDPIVDITNLSLLELGQPMHAFDAAKINGAIQVRMAKEGEELVLLDGTTAKLQPNTLLIADQNGPLAMAGIFGGEASGVSAETKDVVLEAAFFAPLAITGRARQYGLHTDASHRFERGVDPELTRKAMERVTALLLEICGGEAGEIVEAVSSAHLPTSKQVVLRRSKLDSLLGHHIETETVTDILARLGLNLSYADESWTVQSPSWRFDIEIEEDLVEEVARIYGYNSIPNNAPLAHLQMKGFPEKILEAIRVRTALVDSDYQEVITYSFVDPKVQELLHPSQEALILPNPISSEMSAMRVSLLTGLLETVAYNQNRQQNRVRIFESGLRFIPDANAENGVRQEFVLGAVIVGDKRPAHWEHKAENVDFFDLKGDLERVLSLTNASNRLRFVAKLYPAFHPGQSAAILLDDQEIGYIGTIHPKVVQKLGLSGKPVAFELLWSAIAERSVPNAKEISHFPANKRDIAVVVDSNVPAGDLLDVARQAGGAKLVAVNLFDVYQGTNLPEGKKSLAISLTIQDTEKTLEEEEINAVLQAVLETLAQRFNAYLRD >NZ_CP046114|868159:877957|874701_875685_-|WP_012621869.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQNLENIVAEALQAVEKASDVASLEALRVEYFGKKGHFTLLMQGLRDVPADERPAVGAKINEAKQKAQDALNGKKEQLETEELNAKLASESIDVSLPGRKTELGGLHPVSITIERVVKFFSELGFSVEKGPEIETDYYNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDAERLLRTQTSGVQIRTMEKMQPPIRIMAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQIELLYVDKKANFTELKGLLHDFLRAFFEEDLQVRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPDEYTGFAVGMGVERLTMLRYNVTDLRSFFENDLRFLKQFK >NZ_CP046114|868159:877957|870405_871059_-|WP_010786629.1|DBSCAN-SWA MSNTTQKESCIVIAIAGASASGKSLIASTIYKELQAELGQDDIGIISEDAYYRDQSHLAMEERVKTNYDHPNSMDHELLVTHLKSLKQGQAVDIPEYDYAEHNRKETVTHFTPKKIIILEGILLLTDEKIRDEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMEERGRTMESIVNQYRKTVRPMFLQFVEPSKQYADIIIPKGGKNRIAINILKAQIKQLLGHS >NZ_CP046114|868159:877957|875994_876675_+|WP_021109664.1|DBSCAN-SWA MAKNNILGLFAQSPLKPLQKHSKKVTECCGLLIPFFEASFQNNWEVAEDIRRQIIDLENRADTLKREIRLKSPRGLFMPVERTDLLELVTQLDKLANYAKDISGRAIGRQLNIPEEIQPIFQQFLTRSLDATVHVDKVINEMDHLLETGFRGRELNFVNNMILELDVIEDDTDQLQIVLRRAMLAIEQQYNPIDIMFLYKIIEWVGVLADQAQRIGSRIELMLARS >NZ_CP046114|868159:877957|869804_870389_-|WP_005710639.1|DBSCAN-SWA MRLCDKDIERYLDEGIISLTPRPSNEKISGATIDVRLGNSFRVFREHSTPYIDLSGPREEMTAQLNRVMSDEILIADDEAFFLHPGELALATTLESVKLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGYAEHPYNARKDAKYKNQQSAVFSRIDKDE >NZ_CP046114|868159:877957|871246_871759_-|WP_005710634.1|DBSCAN-SWA MFYQLIKKHFSLCTMLLCAFLLSACVSKTSTVQDKSGNKHKGQLSDSIFVISSLSEHQREWKGTRYRLGGITKSGIDCSGFVQLTFRELFGIDLPRITVDQAKAGIQISKSELRTGDLVFFKTGRGPNGRHVGIYVKNGQFLHASTKGGVIYSDINSPYWSRSFWQARRL >NZ_CP046114|868159:877957|871811_872108_-|WP_005710633.1|DBSCAN-SWA MALTKIEIAENLVERCGLDKRIAKQFVEDFFEEIRRSLESGEEVKLSGFGNFTVRDKKARPGRNPKTGEDVAVSARRVVVFKAGQKLRERVENAKVKA >NZ_CP046114|868159:877957|876694_877957_+|WP_021109663.1|DBSCAN-SWA MELIQEYGSMIVLITAVFGFFMAFGIGANDVSNAMGTSVGSGTITAKQAILVAMVFEFAGAYLAGGEVTETIKSGIIDIHHFSGRPDTLVLGMMSALFAAGTWLLLASKMGWPVSTTHSIIGAIIGFALVTVGAEAVHWGDLSGIVGSWFVTPVVSGIIAYAIFTSTQKLIFDTDNPMKNAQKYGPFYMGLTTFILSIVTMTKGLKHVGLQLTMTETLVISSAISITSIITCFFYFRSQSFANRVQGGAFGGVEKVFSILMLLTACSMAFAHGSNDVANAIGPLSAVVSIVENGGVIEAKSILAPWILPLGATGIVAGLAVMGYKVMGTIGTGITDLTPSRGFSAEFATAMTVVVASGTGLPISTTQTLVGAVLGVGFARGIAALNLTVIRNIVASWVVTLPAGAFFSILIFYILNAIFY >NZ_CP046114|868159:877957|868159_869674_+|WP_021109666.1|DBSCAN-SWA MCGIVGIIGQTPVNQALYDGLTLLQHRGQDAAGIVTIDDENRFRLRKANGLVSDVFRQEHMLRLQGNVGIGHVRYPTAGCSSVSEAQPFYVNSPYGLTLVHNGNLTNNAELKRLLFNLAKRHVNTNSDSESLLNIFAYYLDQYPHEPLTPENIFESVRKTNQVIRGAYACLAMIIGHGMVAFRDPLGIRPLVLGKREIDGKTEYMFASESVALDVVGFEYVRDIQAGEAIYITFDGQFYSAICADNPKLNPCIFEYVYFARPDSVIDGVSVYAARVHMGKFLGEKIAKEWTDILADIDVVIPIPETSTDIALQIATVLKKTYRQGFVKNRYVARTFIMPGQAQRKNSVRRKLNAIASEFKGKNVLLVDDSIVRGTTSEQIVEMARQAGANKVYFASAAPEVRYPNVYGIDMPTCEELVAYNRSVEQVAEMIGVDRLIFQDLSALFKSVQLENPDIHNFDASVFTGEYITGDVSCEYLNAIAQARNDKAKTAQAKQAGNLEIHNE |
9 | Mollivirus(12.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
934805 : 974965
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046114|934805:974965|DBSCAN-SWA 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56 | Acinetobacter_phage(20.0%) | terminase,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
978195 : 982611
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046114|978195:982611|DBSCAN-SWA TATGCAAACTGAAAAACGCTCTCGTGGTCGCCCAAAATCTGGTTTAACTCTTCAGGAACTGCAAGCAAGAAGCGAGGCTAAGCGTGGGGTTAAGCTCAAAGGCTTTAAACTTCATCAAGAAACGATTGAGCTTATTGAACGCCTTGCCGAGCAACACGGTATTTCACAAACACAGGTGATTGTGCAAGCGGTTGAGTTATTTAATCAGAAAGGGGCGTAATGCCCCTTATTCTTTCATTAGTGCCATAATTTCTTCAGGGCTTTCATAAACTAAAAATCTTATATATCCCTCGGTACCATTTTTTTCTCTTTGTGGATTGTAAGCTGAGTTTATCCAGATAAAACTATTAAGCATATCGGCAAAATAGTCTTTAAAATAAATAATACTGGTCGCCTCTTTAAAATCACTAGGGCTGTATGTAGCAAAATTATCTACAACAAACTCCATTGCATCATTTTTGTTATCCACTTCTTCAGTATTAAAAATAGATAACTTTGGAACATTTAGCTCGTCATCTATATTTCGTTTAAAACTCCATATTTGATCAACAGAAATATAAATCTTGTCGAAAAGAACGGTATCAATGTATGGTCGATATATGCCGTTTTCATCTTTAAAACCTTCATCAACAAATCCAATAAAGTGAAGGGGAATAAATTTAGTCATAATTTCTCTCCAATTAAACGCCCTCAAAATAGAGGGCGTTAATTATATGTAACTCAAAACGGAAGATCGTCATCAAAGTTATCTACTGGTGGCTGTTGCGGTGAGTTGGGCGGTGTTGCCTGCGGTTGCCCGTAGAATTGATGTTGGGCTTGGTAGCCTTGCTGTTGGTTTTGTTGCTTGTCTCGCTCGTCCTTATCTTTCGTATGCTCAACAAGCCATTGAATACGTTCTGCCGGTTTGTTTTCGATGTGTTCTGATAAGGTTTTTTGGTTTTTTATGAAGTATGGGCAGAGAATACTAAATCCGTAGGTGTCTGAGCCGTTTTGTTTGGTGCGTAAGACTTTTTGTAACATCAAGCCCACATACTTACCGCTTAATTCAGGGGCATAGGCTCTGCCGTCTTTGAATTGTTGTGTTAATACTTGAACACCGGTACAGCCCATAATTGCCTGTATCATATTTTGACCGCCTTGCAGTGGTTGTCCGTCTTTGCCTTGATAATAAACTGAGAGATAATTGCCTTTTAAGCCTTCTTGCGTTTCTACGCTAAATTCAAGGGATAATGCACCGCCTTGTGATTGGACGTATTCCGCACTAATGATTTTGCAGTTATAAGCCCCTGTTTCGCTGATAAAGGCTGAATTACCTGCTTTAACGGCTTGCTCTTGGTTGTAAGTGAAAATAGGTTGGGTCATCTTATTGCTCCTGTGTTTTATGAATACCGTAGTAGTCGCAGATTTTGTCATCTACGAGTTTTAAATCGTTGTCGATAAACTGTGTTTCAAATAATCCCATTGGACTTTTTACGGTGTCAGAACCGTTATTTTGAGTGGAAAACTGATATTGCCCGTCATTAACGTGCGTGCGTAGGCAAATTGTTACCATACCTTCAAGGGTAATTTTTTCATCTAACATTTTGCCGATGGTTTTAATTTTGGTTTTGCCAAAAGGATCGGTTTCTGTGTGTGCCAGAATATAAACACGTTTGTTCATTGGCAGATTTAGCGCTTGATTGAACACTGCCCAAGCTCTTTCTCCAATGTCGGTAAATTTGTCATAACCTTTTTCTTTGGCTCTTCGCATAAATTCATTTGCCATAATATATTGGTAGTCATCAATAATGATGATCTCTCGCTTGGTTCTAGCGAGTATGGTGCAAATGGTTTCTGCGTTATCACAAATAAAAATTGAACCCGTAGGATTATCTTTTGTGATGATTTGCCATTCTTTCGCTCTGAAAGGTAGTGGCTTTCCGATGGATTGAATAAGAAGTGTTTTTGTTGGGTCAAGATTGCGTAAACTGGTGGATTTACCTGTTCCAGATTCGCCTAAGATAAGAATTGCCACGCTCATAACATTTCCTCTAGATATAAAAACCGCTTGGAGTACAAGCGGTTAGTCAATATCACTTAACAAATTATCTAATCGCTAAATAAGGGCTATCAACAAGAGCCACACCTTCAATAATTGCCCCTGATTTAATGGCTTTTTTGAGTTCGGCTTTCATTGGTTCAATGCTGATTTTTTGATATTCGAGCGGTAGATGTTCAACGGGAACTGAGACATCTACCGACTGTGTTTTAGCAACCGAAATAGTGAAAAGCTCTGTTTTGATTTTCAGGTCGGTCATATTATCTAGCAGATAGGCTTTTAGGCGTTTGGCAAGGTTCTCTCTTGCTCGCTTGCGTGCTGTTAGGCGTTTGAGTTCGGGGTCAATGGCATTTGCTTCAGCTTCTGCTGTTTTAATAAGTCGAACCACGCTATCCGCCTTTTTGCCGAACTCTTCTTGGATTTTTTCAATCGCATTGATGATGTCCTCGTTGTCTTGGTATTCTTCTTGGTCTAGTAGGTCAAGTAGGTTTTGATAACCTTCGCTTAATTCGTAAAGTTTCATTTTCCGCTCCGTTGTTTTTGGTGATGTTGGTCGTTGCCGTTGTGGTATTCTTCGTAGTCGTTGTCGGGGTTTGTGCCTGTCATACGTCTTTTCTCCCAAATAGCCAAGTTTGGTCTTGGTAATCTCGCTCTCTTGGATTGCAGATGAGAACTTCTTCGCAAAACTCGTCCCATTCATCAGGGGCGATTTCATCGTTATATTTCGCTTGTTGATGTGCTTCAAACTTTTCTAGTGCGTCGTAGTAATCATCTTTGGTTTCGTATCGCATTGGGTCAGGTACTCGCATTTTGTTGCTCCTGAGTTTTCTTCACCATTTCCGCTAATGCTCCGAACATCTGCGGTTCAAGTACAATCGTGTTGGCGTTGGCTCTTCTGTCTAGCATTAGGCGGACATTGCCGTTTTTATCTACCAGATAGCCTTTTAAGCCGTAAGGGGTAAATGGTTTGCGTTTGGGCTGTGATGGCTTCGGCTTCGGCTCAACTTGTTCTGTTGGTGCTGTTTCAATCTCAACTTGTTCCGTCGGTGCTATTTGCTCAACCTGCTCTGCTTCTATAATTGTTACTTTTAGCCCAACTTTTTTAGCTTGCTCAATTACAATCGGATTATGCCCTTCGATTTCAGGGTAGTGAGGGATAGCTCTTTTACCGACTAAGCCTTTTTGACTGTTATATCTATCAATGGCTTTGTTTAAATTTCGGATAGCAATAATTTCCGATGTCATTGGTATGCCTTGAAACACTAGATGTTTATCCACCCACATTTCACCGAAGTATTTTTTATTTGGGTTTTGTAAAATTTGAAGTTTGATCATCTTTTTGCTCCTACAATCAGTTTGTTAAGTTGGTTTTGGTTATGTTGTTTAATCAGCTTCACATCTTCACCTGTAACGTTATCAGGCGGTGGAAGATGTAGGGCTAATGCGTTGTAATTTACCTCTTCAGGGGTGATTTCAGCTTGTTTGAAGTCATCTTCCGTCCAAATCTTCTCTGCTTGGAAATTGCTTTCTACGGGGAGAGTAGAGACAAGCTCAGGCTCTTCACAGCCAGTTAAACTTCCGCCTGTCACAAAGGCGATAAGCAAGGCACCGAGTAGGTATTTCAGGTTGAATTTTTTAATAAGTGTCTTCATTTTTTATTCCTTTTGTTGAATTTTGGGTGTGAGAAACCACCGCAGGCTTTCGGGGAAAGTGCGGTGGGGTTGGGTTTTGGGTTTAATTAAGTTTTAATCGTGATTTGATACGCTCAAATTCAATCGGGTTACTTTCCTTAAACGGTTCGATAAGGCGTTTAAGGATTGGTAAGTTTTCATCAATGAGGCGTTTGTACTCTCGATGATGGCTGTACACCGCAGGGTGGAAGTTTGAGCCGATGGCTGCTAGGGGTTGTTCGAGTTCGCCTAGTAGGTCGTTCATATTGCGGTGTGAGATAAGTAACCAAACGAGGCTGTAGATTTCCGCACCGGTAAACGATGCCGGATAGCGGACTTCGGGTTTTACAAGCGGTTGGTTTTGTTGTTCGTTTTGCAAAATCTCACGGTCGAGAATATCCAGCACCCATTTGCGAAAATCTTTAGCTACTGACGTTCTAGCGAACATTGCGATAAGGTGCGCTCCACGCAGACTGAAAATTCTCTGTTCAATTTGGCGGTTAGAACCGTTAATTCCATTCGTAGTCAATTTGACTACGGTTGTCATATCGGCAGTAAATTCATCAGCATTTCTTTCATAAATTTTAGCAATAGAATTAGTATGTTGATATTGTAAAGCTAATGCTAAATCACTTGATGAAATATAAGTTTGGTTGTTACGTTGGATCGCAGTTAATGCTACGTTTTGGAAAGTAAGTTGATTTGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046114|978195:982611|981966_982611_-|WP_035498099.1|DBSCAN-SWA MSNQLTFQNVALTAIQRNNQTYISSSDLALALQYQHTNSIAKIYERNADEFTADMTTVVKLTTNGINGSNRQIEQRIFSLRGAHLIAMFARTSVAKDFRKWVLDILDREILQNEQQNQPLVKPEVRYPASFTGAEIYSLVWLLISHRNMNDLLGELEQPLAAIGSNFHPAVYSHHREYKRLIDENLPILKRLIEPFKESNPIEFERIKSRLKLN >NZ_CP046114|978195:982611|979557_980214_-|WP_021110503.1|DBSCAN-SWA MSVAILILGESGTGKSTSLRNLDPTKTLLIQSIGKPLPFRAKEWQIITKDNPTGSIFICDNAETICTILARTKREIIIIDDYQYIMANEFMRRAKEKGYDKFTDIGERAWAVFNQALNLPMNKRVYILAHTETDPFGKTKIKTIGKMLDEKITLEGMVTICLRTHVNDGQYQFSTQNNGSDTVKSPMGLFETQFIDNDLKLVDDKICDYYGIHKTQEQ >NZ_CP046114|978195:982611|981563_981884_-|WP_021109602.1|DBSCAN-SWA MKTLIKKFNLKYLLGALLIAFVTGGSLTGCEEPELVSTLPVESNFQAEKIWTEDDFKQAEITPEEVNYNALALHLPPPDNVTGEDVKLIKQHNQNQLNKLIVGAKR >NZ_CP046114|978195:982611|978914_979556_-|WP_035498115.1|DBSCAN-SWA MTQPIFTYNQEQAVKAGNSAFISETGAYNCKIISAEYVQSQGGALSLEFSVETQEGLKGNYLSVYYQGKDGQPLQGGQNMIQAIMGCTGVQVLTQQFKDGRAYAPELSGKYVGLMLQKVLRTKQNGSDTYGFSILCPYFIKNQKTLSEHIENKPAERIQWLVEHTKDKDERDKQQNQQQGYQAQHQFYGQPQATPPNSPQQPPVDNFDDDLPF >NZ_CP046114|978195:982611|980278_980947_-|WP_080691028.1|DBSCAN-SWA MKSPLMNGTSFAKKFSSAIQESEITKTKLGYLGEKTYDRHKPRQRLRRIPQRQRPTSPKTTERKMKLYELSEGYQNLLDLLDQEEYQDNEDIINAIEKIQEEFGKKADSVVRLIKTAEAEANAIDPELKRLTARKRARENLAKRLKAYLLDNMTDLKIKTELFTISVAKTQSVDVSVPVEHLPLEYQKISIEPMKAELKKAIKSGAIIEGVALVDSPYLAIR >NZ_CP046114|978195:982611|978195_978414_+|WP_012621817.1|DBSCAN-SWA MQTEKRSRGRPKSGLTLQELQARSEAKRGVKLKGFKLHQETIELIERLAEQHGISQTQVIVQAVELFNQKGA >NZ_CP046114|978195:982611|978420_978861_-|WP_035498117.1|DBSCAN-SWA MTKFIPLHFIGFVDEGFKDENGIYRPYIDTVLFDKIYISVDQIWSFKRNIDDELNVPKLSIFNTEEVDNKNDAMEFVVDNFATYSPSDFKEATSIIYFKDYFADMLNSFIWINSAYNPQREKNGTEGYIRFLVYESPEEIMALMKE >NZ_CP046114|978195:982611|981027_981567_-|WP_035498100.1|DBSCAN-SWA MIKLQILQNPNKKYFGEMWVDKHLVFQGIPMTSEIIAIRNLNKAIDRYNSQKGLVGKRAIPHYPEIEGHNPIVIEQAKKVGLKVTIIEAEQVEQIAPTEQVEIETAPTEQVEPKPKPSQPKRKPFTPYGLKGYLVDKNGNVRLMLDRRANANTIVLEPQMFGALAEMVKKTQEQQNAST |
8 | Mannheimia_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
988307 : 1016976
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP046114|988307:1016976|DBSCAN-SWA 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41 | Mannheimia_phage(66.67%) | terminase,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1146620 : 1187090
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP046114|1146620:1187090|DBSCAN-SWA 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61 | Mannheimia_phage(65.12%) | terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1218718 : 1232520
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP046114|1218718:1232520|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP046114|1218718:1232520|1218718_1220962_+|WP_021109503.1|DBSCAN-SWA MTTEINYEGVEQMPIKRFTEDAYLNYSMYVIMDRALPFIGDGLKPVQRRIIYAMSELGLNAAAKYKKSARTVGDVLGKFHPHGDSACYEAMVLMAQPFSYRYPLIDGQGNWGAPDDPKSFAAMRYTESKLSKMAEILLGELGQGTVDYQPNFDGSLEEPKYLPARLPHILLNGTTGIAVGMATDIPPHNINELAAASVKLLDNPTASLSDILDVVQGPDYPTEAEIITPRSEIAKIYEQGRGSIKMRAVWKREENNIVINALPHQASPSKVIEQIATQMRNKKLPMVDDIRDESDHENPIRIVLEPRSNRIDYDGLMDHLFATTDLEKSYRINMNMIGLDGKPAVKNLLTILTEWLAFRRTTVTRRLNFRLDKIISRLHILEGLMIAFLNIDEVIEIIRNEDNPKAELIARFQLSDEQAEAILNLRLRHLAKLEEHELKAEQQKLEEEREHLQGILGSERRLNNLIKKEIEADAKAFASPRRSPLVERAEAKAISESDLTPTEPVTVILSEKGWVRCAKGHDIDVQNLSYKAGDSYLAHAYGKSNQPVVFIDSTGRSYALDPLSLPSARSQGEPITGKISLPDGATVQCVLMAEESRKVLMASDSGYGFICQFEDLVSRNKAGKAVISLTENAKVLPPQLLKEGEENLLVAMSNTGRVLVFPVSELPELSKGKGNKIINISAQAAKERAELLSRLLIINLTSSLVFVSGKRKITLKPTDIEHYRGERARKGTQLRGLSGNVEVEIVD >NZ_CP046114|1218718:1232520|1228870_1229389_-|WP_012621700.1|DBSCAN-SWA MAGVNKVIIVGNLGNDPDMRTMPNGDAVATLSVATSESWNDKMTGERREVTEWHRIVFFRRQAEVAGQYLRKGSKVYVEGKLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLDSRSGDQGGGWNQTQTNYNQDGYTDSYAQNNNFNGGNATRPQPAQKPAAQAEPPMDNFDDDIPF >NZ_CP046114|1218718:1232520|1225838_1227059_+|WP_005712618.1|DBSCAN-SWA MSKHLTEQRFIDFPIHDSVLAALDSKGFEFCTPIQAKTLPYTLIRQDIAGQAQTGTGKTLAFLVATFHHLLNHDIPTKHNQPRALILAPTRELAVQIASDASILTQYADLRLALAYGGDGYDKQLKEIERGVDILIGTTGRVIDYVKQGIIDLDKIQVVVLDEADRMFDLGFIKDIRYLMRKCPKPEERFTMLFSATLSHRVRELAFEDMHNAEYVEIEPLQRTGHRIKEELFYPSNEDKMALLLTLMEEEWPDRCIVFANTKHKCEEIWSYLSADGHRVGLLTGDIPQKKRLALLDSFTQGELDILVATDVAARGLHIPDVTHVFNYDLPDDREDYVHRIGRTGRAGESGVSISFACERYAVNLPAIEEYIGHAIPVSQYDSEVLLALPKPQKAKTRTPQGKKYK >NZ_CP046114|1218718:1232520|1224054_1225065_-|WP_021109500.1|DBSCAN-SWA MSANTINLKNRHFLRLMDFTPNEIQYLLDLSVKLKADKKAGREVPTMQGKNIALIFEKSSTRTRCAFEVAAFDQGANVSYIGPSGSQIGHKESMKDTARVLGRMYDGIQYRGYGQVLVQTLADYSGVPVWNGLTDEFHPTQILADFLTMIEHSNKPLNQIKLAYLGDARNNMGNSFVEGAALMGVDLRLVAPKQFFPEQTLLDEVAEMATKTGAKITCTEDVAEGVKGVDFVYTDVWVSMGEPESTWEARINLMKPYQVNAELMKLTGNPNVKFLHCLPAFHDDQTLVGKEIAEKYGMNGLEVTDEVFESEASIVFDEAENRMHTIKAVMVATLAG >NZ_CP046114|1218718:1232520|1222437_1223700_-|WP_021109501.1|DBSCAN-SWA MLRRDMNIADYDPELWQAIQGENRRQEEHIELIASENYASPRVMEAQGSQFTNKYAEGYPGKRYYGGCEYADIVEQLAIERAKELFGADYANVQPHSGSQANAAVYGALLMPGDTILGMSLAHGGHLTHGASVSFSGKVYHAEQYGITAEGVIDYDALRKQAHEVKPKMIVGGFSAYSQIVDWAKMREIADEVGAYLFVDMAHVAGLIAAGVYPSPLPHAHVVTTTTHKTLAGPRGGLILSNAKDEEIYKKLQNAVFPREQGGPLVHIIAAKAVCFKEALEPEYKVYQQQVVKNAKAMVEVFKQRGYNVVSNGTENHLFLVDLVSHGLTGKAADVALGKANITVNKNAVPNDPQKPFITSGIRVGTPSVTRRGFKEAEVRELAGWMCDVLDNIGKDNEAAVIEVTKVKVLDICKRLPVYP >NZ_CP046114|1218718:1232520|1227448_1228663_-|WP_021109499.1|DBSCAN-SWA MKKDLVYRQKYLETVRPFMGKRLIKVFTGQRRVGKSYLLFQIMQEIQTADENAHIIYINKEDLAFSHITTAESLNDFVQEQKKSGQKNYIFIDEIQEITDFEQALRSLLLDDELDLYCTGSNAHLLSRDIAGSLSGRAIEINVHSLSYFEFLEFMKLDDSDKSMSLFLKYGGLPYLKDLPLQDNIVFEYLRNIYSTIAIQDIVNRYALRNVQFLEQLTQFLASNIGNLFSAKKISDFLKSQKITTSSTQVQNYAEYLANAFLIHKVPRYDIEGKRIFEIGEKYYFEDLGLRNALIGYRVQDRGKLLENCIFNHLQIAGYDVKIGGLNSQEIDFVAEKNGERIYVQATLTINEEKTLEREFGNLLKIQDNYPKYVVTMDEFEGNTFEGVQCLSLREFLKEILGQM >NZ_CP046114|1218718:1232520|1225502_1225775_+|WP_005712616.1|DBSCAN-SWA MKMYNPAHPGLILREYIEGYNVTEVAKRLGVTRVTLSRILNGKAAISPEMALRLSQLLKTSPELWLGLQSQYDLWQLEQRPSFNIQPLFA >NZ_CP046114|1218718:1232520|1229691_1232520_+|WP_021109498.1|DBSCAN-SWA MQHIDIRGARTHNLKNVNLVLPRDKFIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPDHDVPLAAQTISQMVDRVLEEPEGKRLMLLSPVVKDRKGEHAKLLENLTANGYIRARIDGEICDLSDPPKLELQKKHTIEVVIDRFKVRNDIATRLAQSFETALELSGSTAIIADMDDPNAEELVFSSSFACSHCGYSLTELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVQQYFDERKVVQNPDVSLASGAIKGWDRRSFYYFGLLKSVAKHYDFDIEMPFNQLPKKIQNIILNGSKDEIEFVYVNDRGDSVKRVHTFEGVLNNMARRYKETESNAVREELAKYINNRVCTDCEGSRLRREARYVFLEKTNLPMVSEKSIGEALEFFEGLHLSGQKAQIAEKILKEIRERLSFLVNVGLNYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLIHLRNLGNTVIVVEHDEDAIMVADHIVDIGPGAGVHGGQIIAQGTAQEIMQNEASITGKFLSGKEKIEIPKQRTPRDESKQLVLKGASGNNLKEVDLAIPVGLFTCITGVSGSGKSTLINDTLFPIAQNALNRAENSDVAPYKSIDGLAHFDKVIDINQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIRELFAGTQEARARGYTVGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCDHCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLDMTVEEAREFFDAVPMIARKLQTLIDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLAAELSKRDTGKTLYILDEPTTGLHFADIKQLLTVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIVDLGPEGGSGGGQIIAEGTPEEVAKDKKSHTARFLKEILKKG >NZ_CP046114|1218718:1232520|1225213_1225492_+|WP_010786777.1|DBSCAN-SWA MIISFKHKGLKLFFETGSTAGIQANHASKLAFQLATLNQAKSALDMNAPSWNLHQLQGNLAGHWSIKVSGNWRLTFKVQNGHAEVVDYQDYH >NZ_CP046114|1218718:1232520|1220995_1222324_-|WP_021109502.1|DBSCAN-SWA MKNHILTISQLNYSVKQMLEVEFGSVWLIGEISNFSQPVSGHWYLTLKDEQAQVRCAMFRMKNMRVNFRPQNGMQVLVRANVSLYEPRGDYQVIIETMQPAGDGLLQQQFEQLKMKLAGLGLFAQEHKKPIPTFVKRVGIVTSSSGAALQDILHILQRRDPTLEIVIYPTLVQGKEATADIVQMIELANRRQECDVLIVGRGGGSLEDLWCFNEEAVAWAIYHSQIPIISAVGHETDVTIADFVADLRAPTPSAAAELVSRDQQELLRQLQHHADKVNLAFDRLWSEKLARFDRLQLRLQAQHPQRQLQQRVQQLSHLEKQLKQQMEQLLLRKQQRWKNTLQRMERNPLPYRISAQTQHLHKLEQRLSYAIEKNISQRRQQFQTLCTQLDGLSPLAILARGYSVTQNQQGKALLSTQDISIGETIVTRLAQGNVVSQVVGIL |
10 | Bacillus_virus(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1784288 : 1893975
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP046114|1784288:1893975|DBSCAN-SWA 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94 | uncultured_Caudovirales_phage(22.73%) | head,protease,transposase,portal,integrase,terminase,tRNA,tail | attL 1831520:1831579|attR 1893476:1893540 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1997472 : 2113809
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP046114|1997472:2113809|DBSCAN-SWA 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107 | Haemophilus_phage(14.89%) | plate,transposase,terminase,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2117780 : 2169858
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP046114|2117780:2169858|DBSCAN-SWA 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60 | Haemophilus_phage(84.62%) | head,plate,protease,transposase,integrase,terminase,tail | attL 2139200:2139222|attR 2178498:2178520 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2177211 : 2222407
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP046114|2177211:2222407|DBSCAN-SWA 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50 | Vibrio_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2231094 : 2300323
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP046114|2231094:2300323|DBSCAN-SWA 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METIVIVGGGAGGLELATYLGNKLGKKKKANIILVDKNISHLWKPLLHEVATGSLDDGTDALSYRAHAKNHHFEFRQGTLTQVKPAEKIIVLAPIYDEAGELLVAERTIVYDKLVLAIGSRSNDFNTPGVAEHCIFLDSSEQAKVFHKRMMELFLKFSNNNEKEVHIAVVGGGATGIELSAELYNAVKHLNSYGYGKLDNTSLKVTLLEAGERLLPALPERVSASAIKELRALGVDVLTNTPVIRATAEGLVTKYDENFKADLMVWAAGVKAPEITKTFGFETNRINQIAIKDTLQTLTDENVYVIGDCAFLLQADGKPVPPRAQSAHQMAAVCGKNILAQLENKPLKAFIFDDKGSLISFSRFGTVGSLMGNLTKGSMFIEGKIARMAYLSLYRMHQVALHGCVKTGLIMLVGRINRFLRPTMKLH >NZ_CP046114|2231094:2300323|2258754_2260050_+|WP_005712834.1|DBSCAN-SWA MLERLFQLKEKGSNVKTEIVAGITTFFTMVYIVFVNPSILGVAGMDTQVVFVTTCLIAAFGTIAMGLFSNLPIALAPAMGLNAFFAFVVVQKLGYTWQTGMGAIFWGSVGLFILTILQVRYWFMSAIPLGLRVGIGAGIGLFIALIGFKNMGLVVANPATLVALGELHDPKVLMGILGFFIIVVLAAKGIHSGVLISIVVVTALALIFDPDVKFSGVISIPPSLEAVVGQVDIAGALDTALLGIIFSFMLVNLFDSSGTLIAVTNKAGIADEQGRFPKMKQALYVDSVSAMAGSYMGTSAISTYIESGSGVSVGGRTGLTAVVVGVLFLLTIFFSPLAAVVPTYATAGALVFVGILMASSLIEVKWDDLTEATPAFITTAMMPFTYSITEGIAFGFISYCIMKLCTGRVKEINPAVAVVSLLFIAKFVWVG >NZ_CP046114|2231094:2300323|2292613_2293480_-|WP_015939855.1|DBSCAN-SWA MAGAKEIRTKIASVRNTQKITKAMEMVAASKMRKTQERMSASRPYSDAIRKVISHIAKGSIDYKHPFLTEREVKKVGFIVVSTDRGLCGGLNINLFKTVLNELKTRKDKGVDSVLGLVGNKAVSFFQSMGVEIKAQVTGLGDTPAMEDLVGIVNGMIENYRNGEVDEVYIIYNRFVNTMSQKPTVQKLLPLPELEDDDLENKGSWDYIYEPNPKVLLDSLLVRYLESQVYQAIVDNLASEQAARMVAMKAATDNAGNLINELQLVYNKARQASITNELNEIVAGAAAI >NZ_CP046114|2231094:2300323|2289712_2290702_-|WP_021110140.1|DBSCAN-SWA MATMKDIARIAGVSLSTVSHVVNNSRFVSEEITLKVKKVIEELNYRPSLVARSLKIKETNTIGMIVTTSNNPFFAEVVRHVERYCERHHYHLILVNTDGNSQNLQQHLERLLLKQVDGLLLMCAEPQNFDLSAITHLTLPMVVIDWWQQPLNADIIHENSELGGYLATKALIDAGYHDIAIITGELSKPLAQNRLAGYKRVLLENNLQIRPEWIIESHFHYDGGVEAMTKLLVLENRPRAVFAMSDSIAIGAYQMIQRAGLRIPQDIAIIGYDNIELAQYLYPPLSTIHQPKARLAKAAVEKLILRIQQPQTEIETIKLTPELIIRESF >NZ_CP046114|2231094:2300323|2283035_2284463_-|WP_020457503.1|DBSCAN-SWA MSNTNAIANVAKLIRENDIKFVLLKFTDIKGKEHGVSMPVSLVADDLEDLFEEGRMFDGSSVEGWRAINKADMLLMPIPETAVVDPFARIPTLTIRCSIFDPNTMQSYDRDPRSIAIRAENYLKSTGIADSVMFGPEPEFFLFDDVRFSTEMNNVSYHIDDIEAAWNTNRKYEDGNNAYRPLKKGGYCAVAPIDTAHDIRSEMCLILEEMGLVIEAHHHEVATAGQNEIASRFNSLTLKADETQIYKYVVQNVALEHGKTACFMPKPFAGDNGSGMHCNMSLSKDGKNVFMGDKYAGLSETALYYIGGIIKHAKALNAFTNPTTNSYKRLVPGFEAPVLLAYSASNRSASIRIPAVTSPKATRIEARFPDPMANPYLCFAALLMAGLDGVINKIHPGDAMDKNLYDLPPEELKEIPAVSSSLGEALDNLEKDYEFLTQGGVFTKEFIDAFIAMKRKEVERLNMTPHPVEFEMYYA >NZ_CP046114|2231094:2300323|2290776_2291193_-|WP_005713627.1|DBSCAN-SWA MTSFELTVVSAERKIFEGQVTSVRVSGVDGELGVYAGHTPLLTAIKPGMVKFTLEDNKEEYIYVSGGFLEVQPTVVTVLADVAIRGEELDEQRILAAKRKAEETISKTNEADMTAKLAREIAKLHVYELTKTKLANRR >NZ_CP046114|2231094:2300323|2271360_2273133_+|WP_035498763.1|tRNA|DBSCAN-SWA MMRSHYCGVLNRTHVGEQVTLSGWVHRVRNLGRFIFMQIRDREGIVQVFFDEKDEALFKQASALRAEACVQIKGEVIARDTSQINKEMATGEIEVLVKELVVYNNSDVLPLDFNQNNTEEQRLKYRYLDLRRPEMAERLKTRAKITSFVRRYMDDNGFLDIETPMLTKATPEGARDYLVPSRVHKGKFYALPQSPQLFKQLLMMSGFDRYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQIDVETTFMTAPEVRAMMEKMIRGLWLDRLNVDLGEFPQMTFAEAMRRYGSDKPDLRNPLELVDVADILKDVEFKVFSGPANDPEGRVAVIRVPNGAEITRKQIDEYTQFVGNYGAKGLAWAKVNDVNAGLEGLQSPIAKFLTDDVVKALLARVNAQNGDIIFFGADSEKVVTDAMGALRLKVGRDLGLTDLTAWKPLWVVDFPMFEKDDEGNWSAMHHPFTAPKDLSPEELVQNPKGAVANAYDMVINGYEVGGGSVRIFDPKMQQTVFGILDINEEEQKEKFGFLLDALKFGTPPHAGLAFGLDRLTMLITGTENIRDVIAFPKTTAAACLMTDAPSFGNPKALAELAIQTTLEKES >NZ_CP046114|2231094:2300323|2278767_2279658_-|WP_021110297.1|DBSCAN-SWA MDKLTAIKVFLTVAETGSFTATAERLEISKPMISRYVALMEEWLNARLFQRSTRKVALTDAGEQAVLFCQRIANLTAEMEQEMMAQQGELRGALRVTSSQTFGAYHLVQMVNRFLQLHPKLNIQLLLNDQTMDLISERIDLAIRITNTPDPNFIARKLADCHSLLVATPEYLTKFGTPTQPEDLYQHHYLSHHNINRKAWKCTQGEQEVLLDLNSRFTTNDTQALLNSVLDSNGIAMLPKYMLEPELQQGKLQAVLTDWQLPTFSIYAMYPSRDKLPLAVRKLIDFLLESFEGKAW |
59 | Shigella_phage(12.5%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2222305:2222364|attR 2273391:2273531 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046114.1|WP_005710423.1|1789431_1789806_+|Soluble-cytochrome-b562 |
1789431_1789806_+
Protein sequences of NZ_CP046114.1|WP_005710423.1|1789431_1789806_+|Soluble-cytochrome-b562>NZ_CP046114.1|WP_005710423.1|1789431_1789806_+|Soluble-cytochrome-b562 MLKFKHLLSILVLAVSANVVASGVSMEMFQMKRQINLLTNAQTAEEFTQNADKFIEVSKKAQATMPNSLDGDQEKFKGYQQGMQEVIDVVAQAKNLASQGNLTEAKTVIARLDSLRKLYHSTYK |
124 aa aa | NA | NA | NA | 1784288-1893975 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.3|1031265|31|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP046114 position: 1892285-1892315, mismatch: 0 accaggacaagcgggtccagcaggaccacga CRISPR spacer accaggacaagcgggtccagcaggaccacga Protospacer ******************************* 2. spacer 4.4|1031319|40|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP046114 position: 1892339-1892378, mismatch: 0 tgcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaact CRISPR spacer tgcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaact Protospacer **************************************** 3. spacer 4.6|1031445|40|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP046114 position: 1892537-1892576, mismatch: 1 taagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggaccacaa CRISPR spacer taagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggatcacaa Protospacer **********************************.***** 4. spacer 6.1|1631200|38|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP046114 position: 1892340-1892377, mismatch: 0 gcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaac CRISPR spacer gcaggtccaaaaggtgatacaggtcagagaggtgaaac Protospacer ************************************** 5. spacer 6.3|1631326|38|NZ_CP046114|CRT matches to NZ_CP046114 position: 1892538-1892575, mismatch: 2 aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcgggaccaca CRISPR spacer aagggtgacaaaggtgatacgggtccagcaggatcaca Protospacer *****************************.***.**** |