CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038815	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	1	0
NZ_CP038814	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	0
NZ_CP038813	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	6
NZ_CP038811	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 chromosome, complete genome	2 crisprs	RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3	1	1	28	32

1. NZ_CP038812

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038812_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038812_1
• CRISPR_location: 134110-134333
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038812_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038812_1

>1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038812_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038812_1

>merge|NZ_CP038812|1|134110-134333|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038812|1|1|134110-134333|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038812.1|WP_016212255.1|124801_124972_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_129556718.1|127325_128512_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP038812.1|WP_075275149.1|138499_139474_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038812.1|WP_075273820.1|125158_126241_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038812.1|WP_016211879.1|132878_133898_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038812.1|WP_016212168.1|136467_138156_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_059372616.1|131322_131913_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP038812.1|WP_032126838.1|124601_124805_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_054300202.1|142556_143285_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038812.1|WP_032126843.1|143588_143768_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_032126844.1|143986_144283_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_075273822.1|126397_126898_+|transposase-zinc-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038812.1|WP_155047013.1|129785_129932_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_129556703.1|139699_140188_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_016211956.1|140245_140974_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_054300202.1|135770_136499_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038812.1|WP_016211955.1|141430_142411_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038812.1|WP_081377350.1|130261_131077_+|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP038812.1|WP_155046770.1|135547_135715_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP038812.1|WP_075274741.1|126999_127257_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038812.1|WP_075273822.1|126397_126898_+|transposase-zinc-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	3.05671e-28
NZ_CP038812.1|WP_129556718.1|127325_128512_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	5.96251e-84
NZ_CP038812.1|WP_075275149.1|138499_139474_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	3.60259e-75
NZ_CP038812.1|WP_075273820.1|125158_126241_-|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	4.76533e-23
NZ_CP038812.1|WP_016211879.1|132878_133898_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038812.1|WP_054300202.1|135770_136499_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038812.1|WP_081377350.1|130261_131077_+|transposase	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP038812.1|WP_054300202.1|142556_143285_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038812.1|WP_155046770.1|135547_135715_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP038812.1|WP_059372616.1|131322_131913_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	6.85681e-23

Protein sequences

>NZ_CP038812.1|WP_016211879.1|132878_133898_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038812.1|WP_059372616.1|131322_131913_+|site-specific-integrase
MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP038812.1|WP_081377350.1|130261_131077_+|transposase
MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF
>NZ_CP038812.1|WP_155047013.1|129785_129932_+|hypothetical-protein
MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038812.1|WP_129556718.1|127325_128512_-|IS3-family-transposase
MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP038812.1|WP_075274741.1|126999_127257_-|hypothetical-protein
MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF
>NZ_CP038812.1|WP_075273822.1|126397_126898_+|transposase-zinc-binding-domain-containing-protein
MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK
>NZ_CP038812.1|WP_075273820.1|125158_126241_-|IS481-family-transposase
MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRRTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR
>NZ_CP038812.1|WP_016212255.1|124801_124972_+|hypothetical-protein
MKKRIKATGAIERAARAAKMGRSRPAWSENFLNEFSEECKSRNSKKPDKYQEVRSK
>NZ_CP038812.1|WP_032126838.1|124601_124805_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI
>NZ_CP038812.1|WP_155046770.1|135547_135715_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP038812.1|WP_054300202.1|135770_136499_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038812.1|WP_016212168.1|136467_138156_-|hypothetical-protein
MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP038812.1|WP_075275149.1|138499_139474_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038812.1|WP_129556703.1|139699_140188_+|hypothetical-protein
MLNMPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC
>NZ_CP038812.1|WP_016211956.1|140245_140974_+|hypothetical-protein
MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL
>NZ_CP038812.1|WP_016211955.1|141430_142411_+|hypothetical-protein
MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF
>NZ_CP038812.1|WP_054300202.1|142556_143285_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038812.1|WP_032126843.1|143588_143768_+|hypothetical-protein
MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE
>NZ_CP038812.1|WP_032126844.1|143986_144283_+|hypothetical-protein
MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP038812_1	1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT	134135-134176	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
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NZ_CP038812_1	1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT	134267-134308	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
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3. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|134135|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|134202|40|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|134267|42|NZ_CP038812|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2331 : 101127	114	Streptococcus_phage(21.74%)	head,transposase,protease,integrase,capsid,tail	attL 91366:91425|attR 104700:105562

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038812|2331:101127|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016212151.1|5815_6778_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	NA	NA	NA	NA
WP_016212150.1|6801_7116_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923686.1|7172_8222_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300202.1|15530_16259_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016211890.1|16462_19039_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046766.1|19263_19401_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212139.1|22928_23174_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307371.1|23145_23760_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|24577_25552_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
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WP_033923779.1|29141_29978_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
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WP_016212014.1|30839_31253_+	DUF2190 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212017.1|31547_31946_+	hypothetical protein	W8VUR5	Pseudomonas_phage	2.3e-06	38.8
WP_047927838.1|31975_32221_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212018.1|32217_32517_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212019.1|32673_33369_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.2e-41	42.9
WP_081377351.1|34182_34962_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212154.1|35646_36024_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	Q716C2	Shigella_phage	1.2e-17	46.0
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WP_054300202.1|37183_37912_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_129556708.1|38027_38363_-	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	A9D9Y1	Lactobacillus_prophage	2.6e-11	35.6
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WP_054300271.1|38806_39781_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
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WP_075275139.1|45479_45710_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052047124.1|47779_49441_+	AAA family ATPase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	9.1e-65	31.5
WP_016212457.1|49450_49852_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A222YXG1	Escherichia_phage	3.9e-22	47.0
WP_016212456.1|49848_50136_-	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
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WP_016212579.1|52699_52897_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211937.1|62761_63151_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556711.1|63637_64663_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307369.1|65193_65718_+|transposase	transposase zinc-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|68532_69108_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_075275128.1|78324_78690_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|78635_79211_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126790.1|79681_80587_+|transposase	IS481 family transposase	A8RHK4	Spiroplasma_virus	6.8e-14	26.0
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WP_016211776.1|81846_83184_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211775.1|83351_83720_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	1.2e-25	46.3
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WP_032126362.1|84948_85314_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|85259_85835_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_081007042.1|90010_90826_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
91366:91425	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_016212298.1|92600_92927_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|93167_93644_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
WP_075275158.1|93758_94052_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_098082791.1|94897_95200_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	8.6e-14	44.6
WP_129556698.1|95208_95910_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_016211912.1|95999_96590_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
WP_032126795.1|96862_97123_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211910.1|97126_97399_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211913.1|97724_98846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273786.1|99278_99677_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377915.1|99685_100243_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-47	51.5
WP_081377914.1|100387_100717_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|100833_101127_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
104700:105562	attR	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP038814

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3171 : 10881	10	Caulobacter_phage(33.33%)	transposase,integrase	attL 4777:4794|attR 8766:8783
DBSCAN-SWA_2	14076 : 21799	10	unidentified_phage(33.33%)	transposase,integrase	attL 7682:7741|attR 21121:21312

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038814|3171:10881|DBSCAN-SWA
CTTAAATTAAATCCACAATTCTCTTTTTAGCCTCACTATCACCTTCTATATAGCGCTGAGTGGTTTGTAGTGTTGTATGTCCCGCGAGTTGTTGAACATCACGAAGGGAACCACCAGCTTTGATGATATTCTTAGCTGCACGGGTAACAAAGGTACGGCGACCACTATGGCTACTACAGCCTTCAAAGCCTAAATTTTTGTAGAGTTCGGCAAACCAGTTAACCACCGTTTGGGCCGGAAAGTGCGAATTGCGACGCGAGAGAATTACTGGCCTTTGTCCATGCTTTGGCTTTGACTCGTCTAATAGCTGGGATAGGACCTGTTTTAATTGTTTGTTGAGTGGGATGACTCGCCCCCCTTGCTTGCCTTTGCTGGCTGTGTTGCGTAGATGGATCGCTTCACAAAGTTCACTTTCAGGAGTCAGTAGCATCTCCCAGGTGAGTGCTGCAATTTCTTTTGCTCTTAAGCCTGCTTTGATAGAGAGCAGGAACATCGCAGTGTTGCGGGTTGGGTAGGTGGTTGATTGTAGTGAGCTTAGCACCGTTTTTTCTTGCCTCTCGCTTAAAATTTTCGCTTGCTTATTGAGTCCCATTTTTTAGTCTTCATATCAGTATAATAAGTTTATATGTTAAGATATTATACTGATTGTGTTTGTGTTTTTGTTCGTTTATATTGGTTGGTGAGATTCTTTGATTTATCATTAGCTTTAGCTATATATTGGTAAAAATATACAGTTTTTTACGGTTTGACCAGCATTTCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCGCGTATAAGTAGAGTTTGTTTCCAAGCTCTACTAAGGGTACTAGCTAATAAAAATTAAAATCAACTTTTCCTGACAAGCATGCCTGATAAGTATAAATGAATCACACTAGTTAATAATGTTTGATAAGCCACTCCTTCTTCCAAAGCCTTAGCATGAGCTTTGGTAAAATCACTTTCAGTTAACCTTAGGCTAACTGGTTTACTTTTCTTGCCCGTATTTTTGGCAGCTTCAATCAAGGCTGCTGCATCTAGGCTACCCCCCTGTAAAAAGGCATCAAAAGAATCTTCAATAGCTTGTTCTTCATTATCAAGTTTAATGTTTTTTTTAATCATCGCCTTCTCCTAAGTAGTGCTTAGTTGCTTTCCTAGATGGATAAGCTGTTTTCAAAAACAAGGTGCCGTCCTCTTTAGTCACATAAGGAACCATGACCGCATACCCTTCAATATTAACTACAGCAATATTTTGATGTTGATACTCTGGATTAGGATGCGCCCGATTATCTAACAACTTACCCAGGCTAATCGCTGCAACAACATCTTCAAAACTAAATCCGCGCTCAGCTTTTAATTTCTTGTTCTTCTCTTCAGACCACTCAATGTGCATATCGTTTTACTTTTGTAGTGTATTGTATATACGATAGCACACTCTCGCAAATATGTATATACAAATCATTACAATAAAACTTGTTATATATTATACAATATATACTAAAGTCAATAAAATCAACGGATCGCAACTAGACGCAAAAACACAATCAGTATATTATCTTAATATAACAATACTTTATACTAAAAAAGGCTAAAAAAATGGGGCTTCACAAACAAGCCAAGATTTTAAGCGAACGCCAAGAAAAGGCCGTTTTAAGTGCGTTCCAATCAACGACCTACCCTACTCGCAATACTACGATGTTCCTCCTCTCAATCAAAGCCGGTTTACGCGCTAAAGAAATTGCCGCACTCACCTGGGACATGGTACTAACACCTGAAGGTGAGCTATGTGAGTCTATCCGTCTACGTAACACTGCCAGCAAGGGCAAACAAGGCGGCCGGGTCATCCCTCTCAACAAACAATTAAAACAGGCATTATCCCAACTATTAGACGAGTCACAACCAAAGCATGGACAAAGGCCCGTGATTCTCTCACGCCGCAACTCACACTTTCCAGCGCAAACCATAGTGAACTGGTTTGCCGAACTCTACAAAAATTTAGGCTTTGAAGGTTGTAGTAGCCACAGCGGTCGCCGTACCTTTGTGACAAGGGCAGCTAAAAATATTATCAAAGCTGGCGGCTCTTTGCGTGATGTTCAGCAACTTGCTGGGCACACAACACTTCAAACCACCCAACGTTATATCGAAGGTGATAACGAAGCGAAGAAGAAAATTGTAGATTTAATCTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTCTTTCAAGTTAACTTTTCAGAAATATGCGAGTAAATCAATTTTTCCAATTCATCCATATTGATTTGAGAATATACTGACTTTGATATTTTTATATCTCCTCCATTAATACTGAATACTTTTTTATTATTAATAAAAATCTCTTTTTTATTATTCGTTATTTCAGGGTTAGATAGTAATTTATCTATAGTTTTCTCTAATGATTTCGCTCCCATACCTTCCTTTATTTTTGAGGCCATAGATATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTTCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAACACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCGCTTTAAGCCTGATTTTTGCTATTTCATCACTTAATTAGCACCTATGCTTTGGGTGCTGGAAGTAATTTTTAGTCGAATTATTTCAATTTCATGATATGGCTGATTTTCAGAGTATTGTAATTCCTAAGCGCTAAACAAGACATAGGCCCAATTGCCGCCGTATTCGCAACGGTGAAGTTCCTCGGAAAATGCACACAAGACCAAGTGCTAGATCGTCTACGCTCTCAAAAAGTAGAGTACAGTAGTTTGCAGCCAGTATTGCAAGAGTTGATTAGGAAGAGGAAAGTGGATTCTGATGGTTTTTATTATTGGGAAAGGTTGTAATTGATCAATATTTGTACAGCATTAAAATGGTTTATATTTTGAGCTGATTTAAGTGATTATCCACACGGTTATGCACTGAAATTGTGGGTTAGTTTTGGGGGTGGTGTTGATTGTTGATGTGAGGGTATCAGAGTATAATCTAGTAAGCATGGTGTAGTTTTCATCGTTGCAAGTATTGAGTGAGGAAGGTGATGGCAAGAGCTGAGCATGATTTAGACATTTATGCATGGGCACATGAGAATGCTGAATTGTTGAAACAAGGTAAGTTCAATGAGGTTGATATGGTGAATGTGATCGAGGAGTTAGAAGACTTGGGTAATAGTAAACGCGACCAGCTCACTGCTCGATTAAAGTTGATTATTCAGCATTTATTAAAATGGCAATACCAGCCTTCTCACCGTGGTCGCTCATGGTCGCTTACAATTCAAAACAATCGTGATGATGTTGAGGATTTATTCGAAGATGTCCCCAGTTTAAAAAGCAAGCTTGATGAATGCTTTGATAAAGCATATAAACGGGGTGTAAAAGCTGCATCTAATGAAACTGATATACCGATTAAAACATTCCCTAAATCATGCCCGTACACGTTAGAGCAAGTATTAAATCCTGAGTTTATGCCAGAGTAGTTTTATATACGCAAGAAGGCATATCAAGCAGCAGTGATCTGGAGCTAGGTTAAAATTCGCTGCTTGAGGCTGCCATATGGTGAGTATGGTCCTTGCGTTTTAAAAATCAAAAGTAAGCTGTTTGACTTCAAACAAATCGGATTGGACTTGCTTTCGAGTATCAAGCTGATAATGGTAGTAGCCCTTTTCCCCCTTCCATGAACGTATATTATAGCCTTCCTTGCGGAGTTGACAGATAAAGGTAGGTAAACAATGGCCGAAACCCAACTTGTAAGCCTTGGGGCGTGTCAGTTCTTCGCCTGATTTGAGGAGTTCGAGGATTTTGTGGGTGGTTGAGGGCATAGTAAAGCTCTTTAGTATTCAATTTGAATCTACTGTAAAGAGCTAGATTAGTCAAAGTAGAAAAAGTTACTGTGCTGTATAACCTCCATCCACAGAGTATAAAGAGCCAGTTACAAATGATGCTTCACCTGAATTTAGGAAATAAATGACATTTGATACTTCTTCTGGTAACCCTACTCGTTGGATAGGCTGAGAGGTTTTGAGGATATTATATAGATCATCATTAGTCATGTTTAATTTGTGCGAATTAGATTTCACCGCGTTATGGTATAAAGGTGTTTCAATGGTTCCAGGACAAACAGAATTAACCCTGATATTACTTGATGCGAAATCAATAGCCAATGATTTTGTTATTGTTGCTATTGCTCCTTTTGTTGCACCGTAAAGGACACTAGAGCCTTTACCTACAAATGATTGATCTGAACCCACTAAACAAATGGATCCACCATAGTTATTTTCAATTAAAGTAACAAAATTTTGGATGAAAAATAGGGTGCCTTTTACATTAATGTTAAAAATAATTTCATATTTTTCTTCTGTTAAATCTTTTAACGAGCCAAAGCTGTGCACCCCAGCATTTGAAACTAAGTGATCGACTTTTTTTGTAAAGCTATCAACTTCTAATCTTGCTTTTTTGATTGAGCTTACACTTGATATATCACAGTTTATATGGAAGAAATTATTATGGGTTACTTCTGGTTTATTAATATCTAAACCAAAAACTATATAACCTTCTTTTAGATATTTTGATACAGTTGATGATCCAATGCCTGTAGAAGAGCCTGTTATAGCAACATATTTAGACAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038814|3171:10881|9297_9732_+|WP_016212315.1|DBSCAN-SWA
MARAEHDLDIYAWAHENAELLKQGKFNEVDMVNVIEELEDLGNSKRDQLTARLKLIIQHLLKWQYQPSHRGRSWSLTIQNNRDDVEDLFEDVPSLKSKLDECFDKAYKRGVKAASNETDIPIKTFPKSCPYTLEQVLNPEFMPE
>NZ_CP038814|3171:10881|10140_10881_-|WP_032126347.1|DBSCAN-SWA
MSKYVAITGSSTGIGSSTVSKYLKEGYIVFGLDINKPEVTHNNFFHINCDISSVSSIKKARLEVDSFTKKVDHLVSNAGVHSFGSLKDLTEEKYEIIFNINVKGTLFFIQNFVTLIENNYGGSICLVGSDQSFVGKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ
>NZ_CP038814|3171:10881|3997_4726_+|WP_032126737.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038814|3171:10881|9831_10074_-|WP_032126346.1|DBSCAN-SWA
MPSTTHKILELLKSGEELTRPKAYKLGFGHCLPTFICQLRKEGYNIRSWKGEKGYYHYQLDTRKQVQSDLFEVKQLTFDF
>NZ_CP038814|3171:10881|5599_6190_+|WP_016212425.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLHKQAKILSERQEKAVLSAFQSTTYPTRNTTMFLLSIKAGLRAKEIAALTWDMVLTPEGELCESIRLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESQPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTIVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDNEAKKKIVDLI
>NZ_CP038814|3171:10881|6670_7645_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038814|3171:10881|6338_6572_-|WP_032126150.1|DBSCAN-SWA
MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT
>NZ_CP038814|3171:10881|3171_3762_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP038814|3171:10881|5117_5396_-|WP_016212424.1|DBSCAN-SWA
MHIEWSEEKNKKLKAERGFSFEDVVAAISLGKLLDNRAHPNPEYQHQNIAVVNIEGYAVMVPYVTKEDGTLFLKTAYPSRKATKHYLGEGDD
>NZ_CP038814|3171:10881|4852_5125_-|WP_032126738.1|DBSCAN-SWA
MIKKNIKLDNEEQAIEDSFDAFLQGGSLDAAALIEAAKNTGKKSKPVSLRLTESDFTKAHAKALEEGVAYQTLLTSVIHLYLSGMLVRKS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016212329.1|3171_3762_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	3.2e-20	35.3
WP_032126737.1|3997_4726_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
4777:4794	attL	NA	NA	NA	NA
WP_032126738.1|4852_5125_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212424.1|5117_5396_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212425.1|5599_6190_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.1e-20	34.4
WP_032126150.1|6338_6572_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|6670_7645_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_016212315.1|9297_9732_+	DUF29 domain-containing protein	A0JC30	Ralstonia_phage	9.1e-25	39.7
8766:8783	attR	NA	NA	NA	NA
WP_032126346.1|9831_10074_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126347.1|10140_10881_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	6.0e-08	28.0

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038814|14076:21799|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038814|14076:21799|15598_15793_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA
MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE
>NZ_CP038814|14076:21799|14076_14748_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG
>NZ_CP038814|14076:21799|16662_17031_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA
MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038814|14076:21799|15123_15588_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA
MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA
>NZ_CP038814|14076:21799|16008_16599_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI
>NZ_CP038814|14076:21799|21070_21799_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038814|14076:21799|17242_17419_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG
>NZ_CP038814|14076:21799|17637_18639_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038814|14076:21799|14769_15051_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038814|14076:21799|18968_21041_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA
MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
7682:7741	attL	NA	NA	NA	NA
WP_129556741.1|14076_14748_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.4e-10	30.4
WP_052133268.1|14769_15051_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-11	38.7
WP_016212274.1|15123_15588_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|15598_15793_-	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|16008_16599_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_129556740.1|16662_17031_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046774.1|17242_17419_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300579.1|17637_18639_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.0
WP_016211990.1|18968_21041_+	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556739.1|21070_21799_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
21121:21312	attR	NA	NA	NA	NA

3. NZ_CP038813

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4824 : 28863	33	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	37205 : 57886	30	Pseudomonas_phage(11.76%)	tail,portal,capsid,protease,head,terminase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038813|4824:28863|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|6750_7903_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212392.1|7931_8939_-	hypothetical protein	W6E8G0	Rhizobium_phage	1.2e-06	26.4
WP_075273802.1|9002_9731_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
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WP_016212135.1|10700_11885_+	3-methylitaconate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_075275202.1|12128_12830_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.0e-10	31.2
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WP_016212164.1|13689_14718_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211443.1|15741_16428_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211439.1|16431_16986_+	recombinase family protein	M9Q1K0	Clostridium_phage	1.0e-20	40.6
WP_016211436.1|17030_17969_+	Fic family protein	S4TP71	Salmonella_phage	5.2e-25	37.2
WP_016211434.1|17941_18133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211445.1|18310_18661_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211437.1|18677_19304_-	zinc-ribbon domain-containing protein	A0A1S5XYQ1	Kurlavirus	4.4e-12	28.2
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WP_016211440.1|19713_20628_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211444.1|20897_21404_+	antirestriction protein ArdA	A0A222YZE5	Mycobacterium_phage	2.8e-17	33.7
WP_051307358.1|21552_21936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036771330.1|22866_23841_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
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WP_016212087.1|24063_24492_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104629.1|27271_28297_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275198.1|28323_28863_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.4e-12	40.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038813|37205:57886|DBSCAN-SWA
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MNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP038813|37205:57886|47032_47188_+|WP_016211131.1|DBSCAN-SWA
MKVKILVPRAGINISYNIGDIIDLPDKTAKAMMKHGDAEAVNVKTSKKKPK
>NZ_CP038813|37205:57886|52673_53420_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP038813|37205:57886|54250_54505_-|WP_016210670.1|DBSCAN-SWA
MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNAPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLNSPDCDFIDVDVDDL
>NZ_CP038813|37205:57886|54598_57886_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA
MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP038813|37205:57886|53973_54261_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA
MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL
>NZ_CP038813|37205:57886|52033_52705_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP038813|37205:57886|48974_49298_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP038813|37205:57886|53409_53967_+|WP_016210665.1|tail|DBSCAN-SWA
MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRQSLTIEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFAQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVATPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL
>NZ_CP038813|37205:57886|40265_40745_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA
MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD
>NZ_CP038813|37205:57886|41348_42431_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA
MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL
>NZ_CP038813|37205:57886|38902_39082_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA
MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038813|37205:57886|47184_47496_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP038813|37205:57886|49354_49621_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP038813|37205:57886|47808_48204_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP038813|37205:57886|47492_47816_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA
MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA
>NZ_CP038813|37205:57886|49624_51703_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038813|37205:57886|41012_41330_+|WP_164997282.1|DBSCAN-SWA
MFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDS
>NZ_CP038813|37205:57886|45659_46994_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP038813|37205:57886|51695_52037_+|WP_016210657.1|tail|DBSCAN-SWA
MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|37205_37886_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|38064_38358_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|38575_38758_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|38902_39082_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556723.1|39176_39494_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|39794_40178_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|40265_40745_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|40748_40958_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_164997282.1|41012_41330_+	hypothetical protein	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	1.1e-19	56.8
WP_081377926.1|41348_42431_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|42427_43669_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_016211130.1|43631_44288_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.9e-43	44.9
WP_016211140.1|44345_45539_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|45659_46994_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211131.1|47032_47188_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|47184_47496_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|47492_47816_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|47808_48204_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|48200_48551_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|48550_48973_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|48974_49298_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|49354_49621_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|49624_51703_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|51695_52037_+|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|52033_52705_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|52673_53420_+	C40 family peptidase	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|53409_53967_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|53973_54261_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|54250_54505_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|54598_57886_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038813.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein	5761_6361_-	199 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038813.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein	6360_6621_-	86 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038813.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein	9914_10262_+	115 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038813.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein	23884_24064_+	59 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038813.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein	24063_24492_+	142 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038813.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein	24659_25199_-	179 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes

Protein sequences of NZ_CP038813.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038813.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038813.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038813.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein
MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038813.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038813.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038813.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038813.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038813.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038813.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein
MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038813.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038813.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein
MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. NZ_CP038811

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038811_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038811_1
• CRISPR_location: 363129-363258
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038811_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038811_1

>1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038811_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038811_1

>merge|NZ_CP038811|1|363129-363258|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038811|1|1|363129-363258|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038811.1|WP_032126227.1|363787_364078_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016211797.1|359932_361336_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038811.1|WP_016212010.1|364830_365127_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_054300520.1|361907_362222_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_075273359.1|361386_361962_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038811.1|WP_036794771.1|356707_357694_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038811.1|WP_129556444.1|359348_359771_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016211795.1|357831_358026_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016211794.1|358711_359356_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038811.1|WP_016212359.1|353631_353850_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_129556446.1|365244_366396_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016212044.1|355730_355985_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038811.1|WP_016211273.1|367301_368135_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038811.1|WP_016211269.1|370702_371488_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP038811.1|WP_075273619.1|366668_367244_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016211272.1|371605_371974_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP038811.1|WP_016211271.1|369453_370398_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038811.1|WP_016212008.1|364115_364814_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_054300271.1|354217_355192_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038811.1|WP_016211268.1|368250_369435_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038811.1|WP_016212044.1|355730_355985_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038811.1|WP_016211271.1|369453_370398_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038811.1|WP_016211269.1|370702_371488_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038811.1|WP_075273359.1|361386_361962_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038811.1|WP_036794771.1|356707_357694_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038811.1|WP_016211797.1|359932_361336_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038811.1|WP_016211273.1|367301_368135_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP038811.1|WP_016211794.1|358711_359356_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	1.63554e-06
NZ_CP038811.1|WP_016211272.1|371605_371974_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038811.1|WP_054300271.1|354217_355192_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038811.1|WP_016211268.1|368250_369435_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82

Protein sequences

>NZ_CP038811.1|WP_054300520.1|361907_362222_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038811.1|WP_075273359.1|361386_361962_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038811.1|WP_016211797.1|359932_361336_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038811.1|WP_129556444.1|359348_359771_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038811.1|WP_016211794.1|358711_359356_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038811.1|WP_016211795.1|357831_358026_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038811.1|WP_036794771.1|356707_357694_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038811.1|WP_016212044.1|355730_355985_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038811.1|WP_054300271.1|354217_355192_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038811.1|WP_016212359.1|353631_353850_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038811.1|WP_032126227.1|363787_364078_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038811.1|WP_016212008.1|364115_364814_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038811.1|WP_016212010.1|364830_365127_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038811.1|WP_129556446.1|365244_366396_+|hypothetical-protein
MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038811.1|WP_075273619.1|366668_367244_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038811.1|WP_016211273.1|367301_368135_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038811.1|WP_016211268.1|368250_369435_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038811.1|WP_016211271.1|369453_370398_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038811.1|WP_016211269.1|370702_371488_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038811.1|WP_016211272.1|371605_371974_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038811_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038811_2
• CRISPR_location: 2600770-2600890
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038811_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038811_2

>2.1|2600807|47|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038811_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038811_2

>merge|NZ_CP038811|2|2600770-2600890|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038811|2|2|2600770-2600890|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038811.1|WP_016210935.1|2609461_2610004_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038811.1|WP_081377880.1|2602788_2603268_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038811.1|WP_098082812.1|2598256_2598772_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016210942.1|2610690_2611302_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038811.1|WP_052047041.1|2599004_2599268_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_081377344.1|2608003_2609131_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP038811.1|WP_016211905.1|2599536_2599947_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_036771330.1|2596279_2597254_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038811.1|WP_016210671.1|2591894_2593154_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038811.1|WP_075273298.1|2602267_2602843_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038811.1|WP_016210673.1|2591288_2591762_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_173018590.1|2595994_2596204_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_016211756.1|2605490_2606216_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038811.1|WP_016210676.1|2593609_2595691_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038811.1|WP_075275117.1|2600190_2600613_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038811.1|WP_155046751.1|2597479_2598112_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038811.1|WP_016211759.1|2606461_2607649_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038811.1|WP_016210943.1|2610000_2610687_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038811.1|WP_032126312.1|2604517_2605312_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038811.1|WP_129556590.1|2604125_2604521_+|SEC-C-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038811.1|WP_016210935.1|2609461_2610004_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038811.1|WP_081377880.1|2602788_2603268_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	6.67359e-07
NZ_CP038811.1|WP_129556590.1|2604125_2604521_+|SEC-C-domain-containing-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038811.1|WP_081377344.1|2608003_2609131_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.01965e-11
NZ_CP038811.1|WP_075273298.1|2602267_2602843_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	9.17211e-46
NZ_CP038811.1|WP_036771330.1|2596279_2597254_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	4.05404e-79
NZ_CP038811.1|WP_016210942.1|2610690_2611302_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038811.1|WP_016211756.1|2605490_2606216_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038811.1|WP_016210676.1|2593609_2595691_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038811.1|WP_016210671.1|2591894_2593154_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038811.1|WP_155046751.1|2597479_2598112_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	5.03722e-14
NZ_CP038811.1|WP_016211759.1|2606461_2607649_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038811.1|WP_016210943.1|2610000_2610687_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038811.1|WP_032126312.1|2604517_2605312_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55

Protein sequences

>NZ_CP038811.1|WP_075275117.1|2600190_2600613_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038811.1|WP_016211905.1|2599536_2599947_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038811.1|WP_052047041.1|2599004_2599268_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038811.1|WP_098082812.1|2598256_2598772_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038811.1|WP_155046751.1|2597479_2598112_+|protein-kinase
MFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038811.1|WP_036771330.1|2596279_2597254_+|IS30-family-transposase
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038811.1|WP_173018590.1|2595994_2596204_+|hypothetical-protein
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYSPSVI
>NZ_CP038811.1|WP_016210676.1|2593609_2595691_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038811.1|WP_016210671.1|2591894_2593154_+|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038811.1|WP_016210673.1|2591288_2591762_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038811.1|WP_075273298.1|2602267_2602843_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038811.1|WP_081377880.1|2602788_2603268_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038811.1|WP_129556590.1|2604125_2604521_+|SEC-C-domain-containing-protein
MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
>NZ_CP038811.1|WP_032126312.1|2604517_2605312_-|M48-family-metallopeptidase
MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL
>NZ_CP038811.1|WP_016211756.1|2605490_2606216_-|M15-family-metallopeptidase
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>NZ_CP038811.1|WP_016211759.1|2606461_2607649_+|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP038811.1|WP_081377344.1|2608003_2609131_-|transposase
MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR
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MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP038811.1|WP_016210942.1|2610690_2611302_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
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NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038897	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence	30307-30344	0	1.0
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NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	74736-74773	0	1.0
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NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	75595-75632	1	0.974
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	120527-120564	1	0.974
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	94958-94995	1	0.974
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	120528-120565	1	0.974
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	76554-76591	1	0.974
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974
NZ_CP038811_1	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	39929 : 57640	20	uncultured_Caudovirales_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136472 : 225643	94	Staphylococcus_phage(20.0%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	239235 : 295551	54	Acinetobacter_phage(50.0%)	tRNA,transposase,tail	NA
DBSCAN-SWA_4	329456 : 375011	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	461099 : 550022	91	Escherichia_phage(35.48%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	561059 : 614483	54	Synechococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_7	623142 : 666972	52	Bacillus_thuringiensis_phage(12.5%)	transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_8	692450 : 833678	118	Staphylococcus_phage(15.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_9	852470 : 894240	42	Staphylococcus_phage(20.0%)	integrase,transposase	attL 854739:854798|attR 882921:884024
DBSCAN-SWA_10	910078 : 1009633	99	unidentified_phage(12.5%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	1025759 : 1132793	96	Bacillus_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1159304 : 1222544	55	Klosneuvirus(22.22%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1227080 : 1280343	56	Bacillus_phage(13.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1290697 : 1582506	279	Staphylococcus_phage(15.79%)	tRNA,integrase,transposase,protease	attL 1398147:1398206|attR 1411852:1412140
DBSCAN-SWA_15	1610532 : 1654751	46	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1665061 : 1721749	51	Cedratvirus(14.29%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_17	1726755 : 1775111	43	Acinetobacter_phage(100.0%)	integrase,tRNA,plate,transposase	attL 1718544:1718603|attR 1763374:1764335
DBSCAN-SWA_18	1795310 : 1972699	164	Leptospira_phage(15.0%)	protease,tRNA,integrase,transposase	attL 1854880:1854939|attR 1923417:1924646
DBSCAN-SWA_19	1987738 : 2033891	50	Orpheovirus(18.18%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	2057550 : 2160460	101	Staphylococcus_phage(20.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_21	2181130 : 2224093	43	Staphylococcus_phage(45.45%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2303030 : 2325764	29	Planktothrix_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2449663 : 2534834	86	Escherichia_phage(41.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2549652 : 2597254	44	uncultured_Caudovirales_phage(18.18%)	tRNA,integrase,transposase	attL 2547377:2547436|attR 2597994:2598288
DBSCAN-SWA_25	2602267 : 2655859	58	Microbacterium_phage(12.5%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2676613 : 2780292	104	Staphylococcus_phage(12.5%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_27	2891240 : 2934638	41	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_28	2966323 : 3086228	114	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038811|39929:57640|DBSCAN-SWA
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MLSYLCKHQNAELAKEIWDRLKLKNFDRAQLNKMAKNRSALLSIYNQKYIIRILAPELRQNNIKNILKQFNERPTSDENDYYQVLLWKIKKTIRGKLSFSQRFLIDAGKGDEGGIFSETEILKSSGVVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080664863.1|43938_44979_+	beta-eliminating lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016211572.1|45100_45325_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556427.1|45566_46142_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|46087_46453_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211193.1|46651_47413_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211195.1|47714_49241_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49612_50452_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50491_51799_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51773_52943_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|52997_53723_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54001_54391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54550_55456_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046697.1|55531_55675_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274979.1|55722_56562_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375632.1|56554_56890_-|transposase	transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.3e-23	51.5
WP_155046698.1|57068_57230_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377700.1|57346_57640_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.4e-06	36.5

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038811|136472:225643|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210242.1|167498_167837_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|167921_168452_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664837.1|172796_172940_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210244.1|173826_174048_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210225.1|174221_174500_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|175470_176376_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211858.1|181149_181908_+	ion transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|182275_182851_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212441.1|183765_183990_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185005_185455_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185518_186247_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_016210784.1|188904_189876_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189898_190795_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190953_191400_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|195567_196962_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209853.1|200193_200637_-	YhbY family RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200691_200949_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200926_201553_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201630_203613_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
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WP_016209874.1|205432_208102_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208125_210045_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210214_211636_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
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WP_016209859.1|213185_213407_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213570_215232_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215304_215595_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215820_216276_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216340_216805_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216897_218244_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218243_219149_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219210_220197_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
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WP_016209858.1|220553_222098_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222144_223431_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223473_224868_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224891_225071_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225067_225643_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038811|239235:295551|DBSCAN-SWA
TTTAAGGAATACAAGGTCCCCAGAGCTCTTGATAAAAGTGTGAATCGCCGCCGTGGCTGATGCACAGGTGTTCAATAATAAGCAATGTGATTTTGCTAAAGTCTTCTTGGTCTAATTCTAATACTTGAGGTGTGGGTAAATTACATAACTTAGAGACCAATTGAATAATATTATCAAGTTTATTCTCAGAGTAACGTGCTTCTTGAAGGTCTGCGACTTTAGCACGGCGGATATTTACACAGGTGATTTTTTTGCCACGAGAGTGTAATGGATGCTTGAGTAAGTATTTTTGCATGGTTCCCTACAATACAATTAAAAAGACTGAAATAAAAAGCAAGCACTTTTATTTTTCCTAAACGAAAGTGCTTGCCTGGTTAGTGAGAGTAAGTTATTTTTAAAACTTAGGCAATAACCTCTTCTTCTGTTTTTGGTGTAGGTGTTATGCTTGGTGTGGTTAATGTTTTGCTTGCAAAAATAAAACCAGGCTTAGAGATATTCCAATTAGGCTGAATAAAACCAATGTTTTCAAGTGTGCTAAGTGCCATGGTTAAAGAGCGTTTAAATGTGCTCATATTGCTGCTGGCAGAGCCACATAATTTATAAAGCTCATCAATTTGTAGTGGTGGGAGCTGATTGAAGGTTGACCAATAGCCATAGAGCCAACTTGTCAAACCTTGTGGTAGGCTATTACGTTCTTTAATGTTGAGTGTTGTTAATGCATCGGCGGCACAGAGATTTGCATATTCATCGCTAAAAATTAAGGTAAATGCCTTGGTTTTTGCGCTATAATCAAACGAGTTAAGCTGTGTTGTGGTAAATTTTTTATGGCCGAAGACAATATCAAAAGTGACCTCAGTAAAGCGCTGAAAACTATTATTAATTGCACGGCGTTGTGAAGAGCCATCGGTAGTATTAAGGCCGCGAAGAATCTGCTGTAGGCTAACAACGAGTTCTTGGTTATGACCTTGATTATTATCTTTTGTTAAAAGTGCACTAAATAAAACAGCCATGTCATGTTGGTCAAGCTGCTCACCCGTGATTTTCATAGTGTAGTGATCTGTTGCAATAAGGTTTTCGCTGGTGTATTGCTTACGTTTTTGTGAGCGGTTACGTACACTAAATAAAGAAGAACGCAAATAAAATTCAGGGGTTTGAATTATTGCTTTAAGGTTTGGGGTGTTGGTGTATTTTTTTTCTGCTGCTTCCATATCCATAATCCTATTTTATTGTTATGAAGCCATCGCTTCCTGTTGCTTGGGTTTTAATTGTTCAATATCGTACAGCAAAATGACGATTAACAAGTAGCTTAACATATCATGAAAGGCATTATTTTGCACGTAAATATCCACAGATTAATCCCTTTGTTTTTATATATCCCATTGACTTTAAATTAGTTATTTTTTTGGTCTGTCATATTGCAATGTTTTTGGCTTATTTTCTTAGAAGCTTAGCATTAACTTGATCGTTATGCTTTATCTAAATGAAAATAAACCAGAGAATTTTTAGAGCGTTTTAATGTGTATTGATTTTTAAATCATCAGCACTAAAGCGATATTGTTGATTACAATAATCGCAGGTCATTTTAATGTGGCCATCTTGCTCTAATAAATCATGACATTCTTGAGCGGGCAATGTTTTAATTGCCGCAATAAAATTTGTTTTTGAACATTGGCATTTAAAGTTGACTTTTTGGGCTGGAAATAAGCGGGCTTGCTCTTGGTGGAAGAGACGGTAAAGTAATGTTTCATTATTCAGCGTTAATAATTCTTTATCGGCAATAGTGTGTGCAAGGGTTGTTAAATGTTCCCATAAATGCAGAGATTCTTGGTTATTATCATGTGGGAGTTGTTGTAATAATAAAGCGCTAATATGATTAGTGTCACTGGCTAACCAAATACGTGTGGCAAGTTGTTCTGAGCTGGCAAAATAATGCTCGATGCAGGTGCTTAGTGTATCGCCGGTTAGAGCGACAACTCCCTGATGGCGTTGTGTGCTGTCATCAGGCTCCATGGTGATAACGCAGTGGCCTTGTCCGACTAGCTCAGAAAGTTTTGCTGCGTTTATAGCTTGAATAGATTGTTCATCAAAGTGAGCAACACCACGAAATTCGAGTTTATCATTGCATTGGGCGACCAGCATTTTTAATGGGCCATTGCCCTGTAGTTGTAAAGTAATTTTCCCAGTAAACTTAACGATGTTGCGCATTAATACTGTTACTGCTAAGGCTTCACCTAACAAGTTGCGAATAATAGCCGGGTAGCTGTGTTGTTGAACAACCTGGCGAAAGCTTTGGTTTAAATGGACGAGCTGACCTCGAACTGGGCAATTATTAAATAAAAAGCGTTGTACCGAATCATACTGGTGCATGCGCGATTCCTACTTATCCTAAATCATTAGTATTAATATTATGAATAGTTTTTAACTTGCAACTGTTATTTTATAATAATGTAAAAAAGTGCATTTTAGCAAAACATACCTGAAAATGCACATTATTTGGGTATGAGTATTTCTTTTATATAAGCTATGTTGATTGCGTTAATTTGTTTATTAATGCGCTTACTGAAGTTTTATGACAGTGATGGACGGATTGACCCGCCCAAAGTGATAGATAGTCAGTGTTGTTTTGACTACCTGCTAATTTACGTAATGGTTGGGTCAGTGCATTTTGTACCGGGTAGGGCAGTGGTTGAATGTTTTCTAATTCTTCAAGTTGTTTTAACTGTTCGATAAATGAATTAGCAATTCCTCGTGCGAGTTTGCCTGAAAAAGCACGTGTTAAAACCGTACAGTCATGTTTAGCTTGGATGAGGGCGTTTTTATAGCAAGGTGCAATGCCGGATTCATCACAGCTTAAAAACAGGGTGCCGATTTGTGCGGCGATCGCACCACTGGCTATGACCTGCTTGATATCGCTGTGGTCGGCGATACCGCCTGAGGCAATCAATGGTCGTTTAATTTTTGCACTGTGTACTTGCCGAATCAGTTTTAATATGGGCGTTAATGAATTTTCTTCAGAGCCAATAAACGTGCTACGATGCCCTCCGGCTTCAGAGCCTTGTAAAACGATGGCGTCAACACACTCAGCGAGTAATGCTGCTTCCTCAATAGAGGTGGCGGTACCTAAGATAATCGTCCCTTGTTGCCTAAATTCTTTTAAAATTTCACTGTCTGGGATGCCAAAAGTAAAGCTAAATACGGGAACTTTTTCACGTAATAAAGTTTCCACTTGATGATAAAAGTGTTGTGCGAATTGCGTTGGAAGCTCACTGGGTACTGTTTGGCCGAGCTGCTGATACAAGGGTATTAAGGCATGTTGCATTTTTTGCAGTTGCTGAGGATTGATAGTAACGCTATTTGGCACAAATAAATTAATGTTAAATGGGCGTTCGGTCTGTTGCTTAATGAGTTGAATCTGTTCGCCAATTGCTGTGGCCGAGAGATAACCTGCACCCATAGAACCTAAGGCGCCCTGGTTGCAAACGCCACAGATCAGTTCAACGGTTGTCGCCCCTCCTGCCATCGGTGCTTGAATAATTGGGTATTTGAGCTTGAGAATGTCAAGGATATCCATATTGATTAATCCTGATTATTGAGTTGAGTTAATTTGACTTTTTGAGTGGTTTATTGGGCTTTTTTTTTATACTGTTTATGTTTGTGTTTTAACCACTCTATCAGCATCGGTGATACCGATAGAACAATGATGGCCAAGATAACGATAGAAAAGTGCTGCTTGACAGCAGGGATATTGCCAAACCAAAAGCCTGCGTAGGTTAGTGAGGTAATCCATAACAGGGCGCCGATAACACTGTAGCTGAGAAAATAGCGATAACTCATGCTGCCGACACCGGCAGCAAAAGGTGCATAGGTTCTAATTATTGGGATAAAGCGGGCGAGAATAATAGTTTTGCCACCGTATTTTTCGTAAAATCCATGGGTTTTATCAAGGTAGGCTTTTTTGAAAAAACGGCTATTTTCATATTGAAAGACTTTGGGGCCGATGAGCTGGCCGATAAAGTAATTGGTATTATCCCCTAAGAAAGCCGCAGTGACGAGTAATGGAACTAAGAGGTGAACATTCATACTGCCAAGTGCGGCCACAGAGCCTGCGGCAAATAATAATGAGTCGCCAGGCAAAAATGGCGTGACAACTAGGCCGGTTTCACAGTAAATAATCAAGAAAAGAATGGCATAGATCCAAAGTCCATACTCGGCTGAAATTTGCGCGAGATGGTCGCTCAGATGGAGTAGAACATTAAGAAGCTGTTGAAAATCCATAACGGTCAAACCTAATATTAATATGCAGAAACAAGTGTTTTCGGTGGTGAGTATACCTTGATACTCTTAATTAGGTTATCTTGAATAGAGAGGATTTCAAGGGGGTAGCCTTTAATATTAACACAGGCCGGCGCGCTTGGAATATCTTCTAAATACTCGACGACGAGGCCGCTTAACGTTCTCGGTCCATCGGTAGGAAGTTCTATATTAAGTAACTTATTCAGCTCGCGAACACTCATGCTACCTTCGACAAGATAGCTATTCGTATTATCTTTGCTGTGATGGACTTGTTTATGTTTAGCAAGGGCTTCTTTGGAAAAATCGCCGACAATTTCATCAAGAATATGATTGAGCGTAATCAGGCCGATAATATCACCATATTCATCAATGACGAGGCCAATATGTTTTTTAGTCTGTTGGAAATTAATGAGCTGGCTATATAAAGGTGAGCCTTCTGGGATAAAATAAGGAGGTTCGGCAAGCTGTTCGAGGTTGTCTTTAGAAAATTGATCTTGGGCGAGTAAAGACAGTGATTTTCTGACTGGCAGAATGCCGATGATATTGTCTATATCATCACGGTATAAAGGTAAGTAATTATGTTTGCTTTGTAGTAATTCGAGCTTAATGTGTGCCAGCGTGTCTTCTAGATCAATGCCGATAATCTCATTACGTGGTTCCATCACATCATCGACATCGATTTTTTCAAGATCGAGTACGCTAAGTAG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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038811|329456:375011|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP038811|461099:550022|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038811|561059:614483|DBSCAN-SWA
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MYDYHIHLYYDMSTRSVAKLLRNNLHTMLEGVAKVSLLHDKPPYPHPQPMFEIAFPKDLLPKLTQWFKAHRNGLSVLLHPVQNSETDAYHSKGRWMGQPLISG
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MLVVIDNYDSFTYNLVQYLAKLGADVRVFRNDQITLSELIALDPRHIVISPGPCTPNESGISLEVISYYTGKIPILGVCLGHQALGQCLGARVERAPYVMHGKTSEIWHTQQGLFKTLPRRFFVTRYHSLIVAEESLPECLEAVAWCKNKGSGRLIMAMQHKEYPLYGVQFHPEAVLTEYGYELLAQFLMQ
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MWQLKQLMFTPQALPLEQLIHQLRPLLLKQLEWRQLTLQALCMSCYLSERGRKHRIARFRYLSERLGYSQAEISAVETAFATSAEHRCRHKRHKSTVKTELGWAYRQLELLPGATMQEIKVAYRRLMSRYHPDKLVARGLGPIEIAQSTQKAQRIQQAYRQLLSS
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MNLAAELFNTPESNNSIIVSDNLLIQASSPIFSLLFEINYDKKFDIYSLRNRVISNLNAYIEQCNKSSISQEKIKASTYILCCIIDETILLHSWSQKIEWDKASALHFFFNESWGGEKFYKIHQHCLDKIDSFNDILDLIQLAINFGFKGRYGSQTDGDIQLAKINHHLKEKLDKYHPKETNIKANIINKKPKKTILIKKTIISSLLFLIIFYIILTVTLYEYSSPTYKLLSTLMH
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MKILIADDSMTMRRIIINALVDHGAASDNILEAEDGERALARWQAEGDEVGLALLDWNMPKMNGLDTLHLIRDVDKKTPIIMVTTHSEKTDVVSAISEGATNYIIKPFEADTLIAKISQFIDINELA
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MNEPEGGIISFMEVIKSGHSVYRLQYHIVWVCKYRGRVLNSGVCEYLKKVLGKLLRSMPGVEIETIDFDGDHLHMAG
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MGGLAVYYSAQRIVSDRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MHTQDTNPARSSLTITTPSNHQTIHHASGRLTVTVRPKPGIQYYHYYIDGRLIKRSTQPSVTLYHLDRGQHQLKVIATNKLHTLTSNTLIFYLHRTSILNNNLPNHH
>NZ_CP038811|561059:614483|594387_595206_-|WP_016210434.1|DBSCAN-SWA
MKSLQGHTARKRFGQNFLHNHHIIRQIIDAISPQDTDHIVEIGPGLGAITEYLVAGCQKLDVIEIDRDLIPKLQDKFQAQNNFKIHEADALKFNFAALQNNNQSNNPVLPLRIVGNLPYNISTPLLFHLFSFPRLIQDMHFMLQKEVVERMAAPAGSTDYGRLSVMAQYHSQVDMLFTVPPSAFIPAPKVESAIVRLTPYKQPKITAYNLKHFEQLVTQAFTQRRKTIRNSLKKMATADQLEQAGITAELRPEMIPLTQYVILSNLLQQEHK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275036.1|561059_562121_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|562381_562678_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|562960_564424_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|564426_565479_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
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WP_016211487.1|565948_566272_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|566619_566931_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|567060_567807_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|569000_569975_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016212072.1|571855_572053_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|572139_572361_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075275038.1|572698_573289_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|573426_573591_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|573885_575322_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
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WP_016210537.1|576926_577214_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|577403_578447_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|578462_579362_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|579358_579877_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|579946_580564_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_016210531.1|580573_582061_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|582070_585751_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210535.1|585824_586637_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|586633_587314_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007010.1|588154_588775_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|588824_589115_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275039.1|589918_590413_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|590407_590746_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126205.1|591125_591491_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210435.1|593084_593891_-	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210431.1|593950_594343_-	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_016210434.1|594387_595206_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_016210429.1|595218_596202_-	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA	NA	NA	NA	NA
WP_016210428.1|596203_597475_-	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA	NA	NA	NA	NA
WP_032126192.1|597481_599983_-	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_016210436.1|600115_601141_+	phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_033923648.1|601844_602126_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556463.1|602104_602602_+	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210438.1|602729_603113_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_162034439.1|603147_604011_-	DUF3530 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210432.1|604092_604764_+	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210437.1|604822_605398_+	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.7e-58	50.5
WP_017376335.1|605496_606297_+	adenosylmethionine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_032126191.1|606429_606951_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209533.1|607095_607416_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209536.1|609277_612448_-	intracellular multiplication and macrophage-killing family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209529.1|612460_613171_-	DotU family type IV/VI secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126189.1|613175_614483_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038811|623142:666972|DBSCAN-SWA
AATGAGCTTTCTTGATAAGATTATACAGTCCAGTGATATGGAGAGTTGTTCTCCATATCAAAAAAATATTTATGATGATATTCAGATGTCTTTAATTAATTTATTAAATACACGAGAAAACAGTTCAAAGCTATTTAGAAACTACGGCGTCAAAAATATTGCAGATATTATTCATGGTGATCAAATTGAGCTTAATCATTTTTGTCGAGATATAGAAAGACTTATTTGTGAGTATGAGCCACGTATTCGCCATGTTATTGTTGGCTTGGCTGAAGAGCATGTGATAAATAGTCGATTTGAATTGATTATCAGTGGCGAGGTTTATTATGAAAATAAATCGAGAAAGGTAAATTATAGAACTGCGATTTATCCAAATGGTGTGACTAAGGTGATGAAGTGACGGTATTTGATGATTATTTAAATAAGCATCTCTCTGAAGTTGATAAAGCCAGAGCTGATTTTTTACGTCTACATCCATCTCTTGAAAATGTGATGGGGCGTGATGTGATTAGCCCTGAAGTTGATGTGCTAAATAAAAGCTTAGCTTATTTAGCTGCTAAGGTTGAGCAGAAAATTGATCAGTCTTATCCTGATGTAATATTGAAAATATTTGACTTATTAGCGCCTGAGTTTATTCGCCCACAGCCAAGTGCAACCATCTTGAACTTTACTCCAAAAGAAAGAGTGATGCTGTCGGCAGTTACTATTAATAAGGGAACTCAGGTATTTAGTAGTCAAGAAGGTGCAAATCGAAATGTTATTTTTACAACGACAGACTTAATAAAGGTTCCACCGTTAAGTCTTGCTGAGGTAGCAACAGAAAGAAAAAATCATAAAGTTAAAGTTGTGTTGGATTACGATGTATTAGAAGGCGCAGTTTTTTCTCTTGCTGATGCTGATATGCGATTTTTTATTAATAGACAGTTAAGTCAAGCATACAGCCTTTATTATGCACTTTTTAATAAATCTGTTTCGGTTTGCTATATTATCAATGGCAAAAAAATTCCTGCAACAATAAAAGATTATGGTTCTAATCGCTTTAATTTAAAGTATTTAGACCGAGAGTGTTCAAGAATTAATTTATTTCAGGAGTTTATCTCATTTCCCGAGCGATTTTTATTTTTTGAAATTATTGCTGGCGGTAAAAATATTACTATAGATAAAAATTTCTATATAGAAATTATATTTGATGATAGAAATAATGACGTCGTTGATATAGATATAGATACTTTTATTTTGGGATGTGTTGCAGGAATTAATCTAGAAAAGGCAACAGCCATTCCGATTAAAAGAAAACCAGGGACATCACAGTATCCGCTTTATATTGATAGCTATGATGAGAGTTACTCAATTTGTGATATAAAACGAGTGAGAAGCTTTACTGTTACAGATGGGGTAAAAAAAGATTATCAGGCTATTTCTCTAATAGGAGATAAAGTTGGTGGTGCTTATGAAAAAGTAACTGCGCTAGCAGATAAGTGCAATCAGCTAAAATTTTCGCTACGCTTCCCCTCTGATGATTTAAGTGACAAAGATGAAGAAGAGATTATTTTCACAGATTTGGAAGTATTTCATACAACAGCTTATGAGCGCATGGCATTATCTTCTGTTAATAAATTAGGTGATGGTGCGCCGGCCTGTTTCAATGTGAAAAATATAACACGTATTTCTGAACCGTTGCTGCCTGATTTATCTGGAGATTCACTTTGGAAATTATCTGGTTGTTTTAGTGGTCAATATTTTAATATTGAAACAAAAGATGGACTATCAAAATCTATTCAGTCTTGGAAGAGTTTTATTTATCATGGCAGCAAATATCAGGCGATTATTAATAGGTTTGTTGATAGTATAAAATCAGTTAATCGCAAGTTATCTGCTTTTCCATATAAAGATGTTATCTTAAATGGTGTTGATATTAAAATAGAAGTAAATGGCAGTAAATTTTCTGACAAGGGAGAAATGTATTTATTTTTTAATATATTAAAAGAAATTATGTTTGATCGGGTTGACCTGGGTAGCCTGTATCGCTTGTTAATTACTGATGTAGATAATATGGTTGATATGCTATGGACAAATATCAAGTAAGTCAGTTGGTTCAAACTATACTTGCTAGAGCTAAAAAAATTGATCTTAATGGTTTATGTGATATAGCTAGATTATTAAAGAAAAATAGTGGAAAAAATAGGTCATTTTTTTATTCTAAACCTAGTTTATCTAATGATATTTTAGATATTGATAATGAAAATATTACTTCTTTTGGTAAAGACTCACTATTTTTAACGGCAAATGTTAATTTCTTTGGTTTGACAAATATTACATCACCGTTGCCTGAGCACTATATAGAGTCGGCTTTAGCAGATGATTCAGGAAATATTAATAATCTCTTTTCTTTTTATTCATCTTACTTTTTTGAAATTTTATTAAAATTTATAGAAAAAGAAAGCTACTCATTGATAGGGCCTATTAATAGAAAAAGCCATATTTTTAGTTATATATCATTAATTTCTAACTTTCCTCAAGATGCTTTAACTGTTAATAAAGAATCATTTTTTCTGGCAAGTTTAATTTCTTCAGGCAAGAGCCGCTCAGCGATGTGTTTTTTTATTAAAACTGTTTTTTCTTTTGAGTCTGTGAGCTTTGATGAATTTATTTTATCTTATGTAACACTTGAACCTGAGTTTAGAGCCTGTTTAGGAAGAAACAATGCGACGTTACATAAAGATAGCTATATTGGATCTAGGAAAAAAAGCTATCAATCATTAATTCATATTAATATTATTTGTCAAAATAGTCATGAGTTTTACCCAGGGTCAAGATTAACGTGTTCTTTATTTAATGTTATTAGACAAGTGATTCATTCTCCGATTAATTTTGAAATTTACATGCTAGAGAGTCAAGCTAGCTGTACACCGTCGATTTTAGGTAAGAAAACCACAGCTTTAGGGTGGAATAGTGTTTTATTTTCTAATGAGAGTGCAGGAGGTAAAGCAATTAAGAAAAAACTGATTTTAAAGGCGAGATGAGTATTAAATTTTCAAAATTTACGATTTAAATGAGGAAAAGCCATGTCTATAGCATCTTTACAGTCTAATTCAGTTTCTACGAATAAACAGTCGAATTTTAACTGCGCGATACAAGTCAAGCTTGAAGGTAATGTCATTACTAATGCAGATGGTGGGGATCCTGTTCACAATGCAGAGTTTGTGCCTTGTAAAGATTATAAGCTTTCTATTCAGCACAGTTTTGCGGCATTTGGAACAACTCAAGCAACGGATAATCGTTCTGAGCAGCATTCGTTTGATTTTTCTGCGAAGTTAAGTAATGATTTGATTGCAGGTCTTATGAATGCAATGCACGGCCAAGAAACCGTTGATATTACATTGGTGACTTATCGCCGTGTAAAAGGTAATCTTGAAGTCAGTGCGACTTACACGATTGATAAGGCGCTAATTTTGAATCTTAATATTGTCAGTGAGCAAGAAAGTGATTCTTATGTCCACTTTGTTGTTGCCGCACCTACTTATCAGTTTGATGGTGGGCAAAAATCAGGTGAATATACGACTAAGATTGCTTCAAGCTAAGTCGAGATAGTTTCTTGATTTAAATATTACATGATTTGACATAAATTCAAGCCAGACGTTGATGTCTGGCTTTAATAGTTATTAGTGGTTGAGTTGATATGAAATTAAGATAATGCTGCGATTTTTCTTCTTTCACAAATAACGTTGGCAATTTCATCGCCATTAATTTTTGCTAAAAACTGATCGGCTTTAACACGCTTAGCCATTTGTTGGTTAAACTCGCCTGAAATTGAAGTATTAAGCACAATATAAAGATCTTTGAGTTTAGGGTGTTCTCTGCACTTTGAAGTTAAGGTATAGCCGTCCATATTGGGCATTTCAATATCAGAGAGCATCATTAATAATTTTGAGTTGATATTATCTGTACCTTCTACCATCTTAGTTAGCATTTCAAATGCTTCGATACCATCGCTTGCCGTAATATATTGAACTTTCAGCTGATCGAGAATATTCGCGATTTGTCTTTTTGCAACGCGCGAGTCATCAACAAGGAGGACGGTATGTTGTGTGGTAGTGTGGTGATGTTTGGATTTTGCACTTTCAGATACGGTGAGATTTGGCGGCATGACAGTTTCTAAGATTTTTTCTATATCAAGAATTTCAATGATCTTTTTATCATGTTGAGTAATCGCTGTTAAAAAATGAGTATTATTAAGGCCTTTGGGAGGGCTGTGTATTTTTTGCCACGATGTTTGAATGATTTGATCAACCTCGCTGACCAAAAGACCAATCAAACGCCGGTTATATTCTGCAATCATTAATGTGTTCAAGGATTCATGGTCTAAAAACTCATCATGTAGTATTTTGTTTAAGCTGATAACCGCTAAGCTATGAAAGCCTCTGATTTTTACAATGCCACGAATCGCTTCATGACTATCTGGAACTTTAGTGAGTTTAGGGCAGGTCATAATTTCTCTGACTTTAAAAACATTAATGCCATAAAACTGATTTCGAGAAACTTTAAAGAGTAATAATTCAACCCGATTTTTTCCTGCGATGTCTGTGCGCATATCAACGGTTTCAATAAGATCAGTCATATTAATGCTTTTCCTGTGCCTAAGTGATAGTTTGTCCTTACTCCTTATATATAATCTTAGTCGATCAGTAACTATCAACCATTTTATTAAGATATAAAAGTTTAGATATTTTAGATAGTAAAGTTTAAATCGATGGCAAAGTCATTAAGGTATGGATAACAGAAATTATAGATAGTGACATGGATTAATGGCTTTTTTAGCCAGACTAACCAGTTAATCCTAGCCTTTAATGATGGTTAACTGCCCTGGCGTTACTGTTGCACCGATGGGAACATTAATTAAATTTTGCATCGTTTGATCACCGGGTGAGGTTGCGGCAGGTGCACCACCAATAATGAGGGTGGCATTGGCAGGATTTGGAATCCGCGATGCTGGACCACAG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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209524.1|623537_625226_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssF	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|625207_626164_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssG	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|626206_626722_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|626826_627759_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|627978_628365_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164997271.1|628381_629029_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|629206_630046_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|630121_630724_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|630724_631579_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
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WP_016209538.1|633818_634550_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
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WP_016209499.1|635105_635663_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|635668_636649_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|636788_637589_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_033923645.1|637592_638360_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|638356_638821_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|638843_639497_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|639500_639848_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|639881_640133_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|640207_641476_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|641478_642237_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|642298_643189_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|643239_643923_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
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WP_155046714.1|644538_646737_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|646728_647601_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|647768_649598_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|649761_650403_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|650644_651175_+	DUF177 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|651192_651366_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
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WP_016210406.1|653484_654429_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|654456_655194_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|655282_655525_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|655599_656823_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|656854_657703_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|657699_658752_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|666396_666972_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038811|692450:833678|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126159.1|824823_825537_+	class II aldolase/adducin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|825616_826354_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|826474_827830_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|828006_828678_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_032126160.1|828793_829672_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|830272_831577_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|831689_832295_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|832376_833678_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038811|852470:894240|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211514.1|860295_862188_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	1.4e-80	32.9
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WP_129556478.1|863621_864508_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_080664862.1|868200_868899_+	P-loop NTPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211528.1|868879_869185_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211532.1|869831_870782_+	dCTP deaminase	I4AZP2	Saccharomonospora_phage	1.8e-09	35.8
WP_016211534.1|870768_871278_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211530.1|871283_872180_-	Abi family protein	A3QSC6	Clostridium_virus	5.3e-35	32.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP038811|1025759:1132793|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556496.1|1039212_1040451_-	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209815.1|1054091_1054631_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126326.1|1055398_1056661_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.1e-25	30.2
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WP_016209821.1|1059026_1059359_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209800.1|1059389_1059986_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
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WP_016209822.1|1061242_1061890_+	class I SAM-dependent methyltransferase	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_016209810.1|1061951_1063865_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-117	38.3
WP_016209803.1|1064069_1065107_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209820.1|1065165_1068465_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209817.1|1069166_1070135_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209809.1|1070241_1070730_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664854.1|1074750_1075332_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126179.1|1075289_1075541_+	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211113.1|1075570_1076896_-	ribonuclease HI	G3MB70	Bacillus_virus	1.7e-37	36.3
WP_016211112.1|1076951_1077599_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211115.1|1077791_1079744_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.7e-44	28.0
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WP_075273327.1|1085073_1085649_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212466.1|1087591_1088317_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372269.1|1088521_1088893_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211395.1|1089249_1089585_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779999.1|1089500_1089932_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211393.1|1089951_1091508_+	DUF2974 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211391.1|1091519_1092095_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728317.1|1092161_1095527_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075275098.1|1095717_1096647_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.1e-24	31.9
WP_016210591.1|1096805_1096961_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556498.1|1097159_1097768_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016210596.1|1097764_1099705_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.1e-72	33.0
WP_016210594.1|1099840_1100494_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_016210595.1|1100670_1101849_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210587.1|1104516_1105377_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016210590.1|1105551_1106814_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210593.1|1106893_1107424_+	CvpA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210592.1|1108963_1109620_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
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WP_081377862.1|1124998_1125835_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
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WP_016211289.1|1131264_1131537_-	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

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CTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGATCGACTTATGATATTCTTCAATTTTCCATCGTTTTTGATAGATTTTGTAAAGCCCATCACCATCCGTCTCTAAATCATTTGTTATTAAATAGAGGTGACCTGTTGACCCGTCTTCGTTTGTGAAGATCTTTTTCATTAATCGCACTGGGAAATTAATTCCCTGAAGATATACATCTATGGCCTCACCATCTTTTAAATCAAGAGATTTGACTGGCTGGTAATTTCTATTGATTTTATCATCTAAACTGCAAGCAACTATTCGATTAGATTTTATTCCTAAAATAAACAACTTATTTAACTTGGCATGAATATAATTCATGTTTTCTTTTGAACTGAACCAGTTATCTGCAACAGCATAATCAAATTTAACCTGGTTATTAATTGCACGATTTATAAGGTTACGAAAGTACTCATTCTTCGATATATTAGATTTTCTCTTTTCTTTTCGGTCCTTTAAATCAGTAAACTTGATGTCTTTTAATACAGTTTCATAACCAATAGGTACGGACGTTTTCTTGTAAGTCACCATACTTGTCAAAATATTAATTCCCTTTACATGAGCGCTTTTGTTGTGTGAATAATGCCAACAAACCACATCATTCTCATCTGTATAAGGCTTTTCTTCCACGGTATCATCCAGACTTAAAACGCCTCCAACTTCTTCTTCATACTGACGAACATGCTTTTTAACATAGCTCCAGAGCTCTTTTGATCCAAAGTGGTTTTTATTTAAAAAGCGTGTGACTTTATCATGGCTGATACTTCCTTCCAGTAAATCTGAAAGTCCTGTTGCCGTTGCATAATGGTTCTGGCTAATTAAATAGTCGCTATAAATATCCAGTAGCTCTTTATTCATTCCTGATGAAATCCCTGTATCTATCAGATTTCATTATACATCGTTTATCATGTCAGTGCGTAAGGTGAGTTAAAAATCAGTCGAGACACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGATTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGTGATATGAAAGAATTTCAAAAATTTATTGATCAGAATCCGGGTAAAAATCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAGTTTTTACAGTCATAATGTTGTTTCTCTTTTCCAATGGTCACAGGAGTGATGATTTCATCATGGCTGATGCCACAGCAAGTAATTAACTCTCTTTTTTTAATAAATTCCGCTTGCTGCTCTTCACTCAGGCCAGCAAAGAATCGAGGCAGCGGAAATACAGTATTTACATCAACTGCTGAAAACATCGATAACTTTTCAAGGCTTTCTCTGAGTGGCATAGCCGCTAATGATTCAAAACCTCTTATTGATCGAAACCTTGGTGAAAATCCATCTGGAAACTGTGCAGCTTGAAATGTTGTATAAGAGTCTCCAACAATAAGAGGCACATTAGGCTGCGGCCGCCCCATGATAAAGCTTCTTAATTCATAAGATAAATCAGCCAATCTAAAAACAGCATCGCTAACATTCGTTTGCCTTAAATCAGCACGCCCTAAACGTGCATCAATAAGAATTGTATGATCAAACTCTGCTCTATGAAAGCTAACAACATCACTTAAATCTGCTTTATATAAATTCGTATAATTAAAGTTTACCTCCTCTAAATTCGCACCTATCAGCCTCGCTTGATGTAAATCTGCAGCAGATAAATTTGCACCGGACAAATCAGCACCGCTTAAGCCAATTTGCTTTAAATAACTTCCTGATAAATTGGCAAAACACAACTTAGCGCCACACAACCTAGCACCGGATAAATTTAAACCCGATAAGTTTACACTCTCCAAATTCCAACCAGTTAGATTAATCCGAGCCGCGCTGCCTAAACTATTGCGAGCACGCTCAATTTCGCGAACAACTTCTTCTCTTGTCCTCACCATATCATAGCCTACCTTAATATAGATAAACAGCTAATCACGCACCATGATAACATCATATTTTCTAACATAATTCTTAGAAAAAAATGATACAAATAATATTATTTTTACTATAAAGAAAAGAAAAATATCATCAAATCAAATAAAGAGTAATCTAATTTACTTTTTCTTGTCAATTTTTTAATCTTAACTTTTAACGGCCATAACCATCATTAATTTATTAAAAAACAAATAGTTAAATAATAAAGTAAATAAAGCAGGTCTACAAGTCAGCTACACAGATTACAATTAAGATTACTGCATGACGCTGTCAGACTTTATTTATTCCAATTAGCTTATGCAATTAAATCAATTAATATGTTGACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCTCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGATTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCACAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTTTGTTAAATAATTATTATTTCCAACTAATAACCAGAAAGAAAATCCATTAAAAATCTACTAATTTAAAAATATAATGTTAGTTATAATTAAATTTAGTAAACAATACACGCTTAATATCTACATTTTGTGCATTTTCAGTTAAAACACGAGTAATTGTTTTTAATGCTTCGGACTGCAACCCATTCACACCCCTTTTCTTAGAAAGTTTTTTCAAGGTCTGCTGGCTAAATAGGTCAACCAAAGCACTACGAATTAACGGCATATTATTATTAATGACCTCTTCAACTGAAGCATCTTTAGGAATTAATAATGTCACTTCAACATATAAATGCTTTGTTGTCCCTTGCAGATTAGTTAAAAACTGTGGGCGAATATGTACATAAGCCAATTCAGCTGCCAAACAAAATGAGCTAAATAACAACAATATAATAACCAATAAACAGCGCTTAACTACATGTAATTGCATAATCAAGCTCCCTCTTTAATTACCCTAACTATAGATGATCACTTAATGATTACCACTCACATCACACCCTAGACATTCCCATGTTGCAAGAACACAAATTAAAACACTCCTGAGGTAGCGCTGTCATCAAACCAATAAAACAAAACCGGCAATTGAGTTATCGTTCAATATTCTTCCTAGCGCTTTTCCTGCAGCTGACGCTGACGCACAGCCTCAAACAAGCATATTCCTGTTGCCACAGATACATTTAAACTCGATACCGCCCCAGCCATTGGGATATGCGCTAAAAAATCGCAATGCTCTCGTGTTAAGCGACGCATACCCGCACCTTCTGCACCCAGGATAATCACTTGACGTCCCGAAAATTCAACATCATAAACGCTTTTTTCTGCTTCACCGGCCATGCCAGTCACCCAAAAGCCCAACTGCTGCAGATTTTCTATGGTTCTGGATAAATTAGTCACCAACACCAAAGGCAGTGTTTCTGCGGCGCCACAGGCGACCTTGCGTGCCGTTGCACTTAAAGGAGCTGAACGATTTTTTTGCGTAATCACCGCAGTAACGCCCGCAGCTTCTGCAGTACGCAGGCAAGCACCTAAATTATGCGGGTCTTCCACACCATCGAGAATTAATAACCAGGTGTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209834.1|1163835_1164594_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
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WP_016209836.1|1170758_1171973_-|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
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WP_164997259.1|1176597_1176744_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1177027_1178503_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_161625459.1|1178743_1179616_+	endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1179934_1181494_+	SH3 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209831.1|1181983_1182682_+	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|1182960_1183224_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
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WP_016209835.1|1186121_1186604_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209844.1|1186581_1187622_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
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WP_032126641.1|1188387_1190958_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_075278621.1|1190993_1191335_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046722.1|1198429_1199305_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728346.1|1199309_1199642_+	ester cyclase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210928.1|1200863_1201169_+|transposase	ISAs1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210929.1|1201203_1201560_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046724.1|1201556_1201724_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210921.1|1201948_1202533_-	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
WP_032126562.1|1202624_1203332_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	1.7e-28	36.1
WP_032126561.1|1203434_1204619_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210917.1|1204832_1206275_-	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	5.4e-21	24.5
WP_161625467.1|1206411_1207350_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210930.1|1207410_1208184_+	enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210918.1|1208187_1208937_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210926.1|1209021_1210491_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_075273571.1|1211422_1212100_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211012.1|1212249_1212822_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211013.1|1218490_1220857_-	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|1221657_1222023_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1221968_1222544_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038811|1227080:1280343|DBSCAN-SWA
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MAKPILPLSSSAASAVPPDAARLLEIAALAAAEIRMEARIIARQAQAQLDDTTEGEP
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MIKLFYIKKRVIFYPLFIILIFIICFILYYGYNLYLNNNFHVVIPGQIYRSAQPTPNDLNKYMKQYHIKSIINLRGQQIGSDWYDDEVSFAKMYHINHFNVALDAHKVPSLNTLHYLIYLIENAPRPLLFHCRAGADRTGLASALSIILNGNSSLDDLEDQASWQYAALSPTTIGYQVLKNYLDWLSENHKTNSKANFLVWDRSLKELKSYKGWFFT
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSTDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MSAITQDTIEAAKVALERSKKALQLSQTTIETSQSPSQINLAAPKTALTASQAAVDLSKEAVELFRREALWFTETVPESALTLESTQKVLQSSQATLSLAQAALESAQAVASTQTMPSTSEPESKSEQSLQEPPQESSAGAQATLAAEKIALTQQQLLAIKQALKASGTSASKQHIIDKCQTLQQLCFAASVQQKGGLFHPTHTTTTGHLLLQLLKRPENRELKQEIFPGNTSASMRGIRHYGRYGQQVLQQHGYLLSCKTPDMI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210512.1|1229862_1230900_+	agmatine deiminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_172673419.1|1230980_1231856_+	carbon-nitrogen hydrolase	M1HCD5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	2.6e-55	40.7
WP_016210514.1|1231964_1233218_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210509.1|1233275_1236773_+	transcription-repair coupling factor	NA	NA	NA	NA
WP_075273576.1|1236832_1237561_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210507.1|1237688_1238237_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210508.1|1238557_1240255_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032127044.1|1243386_1243587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052047029.1|1244924_1245266_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|1245433_1245799_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|1245744_1246320_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211467.1|1246394_1246961_-	dCTP deaminase	S5VM63	Pseudomonas_phage	1.6e-74	77.8
WP_032126344.1|1246963_1248052_-	iron-sulfur cluster carrier protein ApbC	NA	NA	NA	NA
WP_032126343.1|1248172_1248985_-	undecaprenyl-diphosphate phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211471.1|1249115_1251101_+	cation:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211470.1|1251160_1251814_-	tyrosine-protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|1256296_1256872_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|1257664_1257958_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
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WP_032126362.1|1259491_1259857_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1259802_1260378_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300162.1|1261182_1262265_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
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WP_016211841.1|1264488_1264941_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211840.1|1266689_1267154_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	4.7e-19	32.9
WP_016211838.1|1267624_1267798_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274832.1|1268109_1269084_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	6.8e-28	30.8
WP_032126143.1|1269183_1270455_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A067ZJB6	Vibrio_phage	9.6e-14	25.5
WP_016211422.1|1270543_1271014_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
WP_051307357.1|1271036_1271630_-	oligoribonuclease	M4M9I5	Vibrio_phage	7.1e-20	34.1
WP_016211417.1|1271766_1272816_+	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA	NA	NA	NA	NA
WP_016211415.1|1272839_1273763_+	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211418.1|1273779_1274241_+	YaiI/YqxD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211414.1|1274348_1275167_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300209.1|1275903_1276269_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046725.1|1278040_1278181_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1278224_1279199_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075274829.1|1279222_1279495_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1279506_1280343_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP038811|1290697:1582506|DBSCAN-SWA
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038811|1610532:1654751|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038811|1665061:1721749|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038811|1726755:1775111|DBSCAN-SWA
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MLYYDHKEKKHKNYECSVEAFIERLTQHIPEKFFKMIRYYGFLANRVRKTLLPKVYDLLDQTIEAAQSVTYSSLMKANYAVDPLICILCGSEMRLSGFTNSTPLSKLRQHHEKLAKMKEVRL
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

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Homologous phage analysis in the prophage region

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1854880:1854939	attL	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038811|1987738:2033891|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274903.1|2023251_2024127_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038811|2057550:2160460|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080664826.1|2116748_2117348_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
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WP_016209883.1|2119637_2120954_+	Na+/H+ antiporter NhaA	A0A2H4J5W3	uncultured_Caudovirales_phage	9.4e-65	39.9
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WP_016209882.1|2131356_2132250_-	thiol:disulfide interchange protein DsbG	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038811|2303030:2325764|DBSCAN-SWA
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MAYINGEKNEHLESSGIFAQQITQRKSELKALTNRQLVSSIKHMDLASAMHHLQQHSNKSLSTNDQTPEPQAETQEKMPLNNSVASSFTAASHTSSPQQSCLFQQQQAEPTRDEAHQTKDKATKKCCTIM
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MPVISYLGPAMAAVITGSVVVEQIFGLPGIGTLLVQAATNRDYTTVLGLTILFGAMIVFFNFLVDILYAFLDPKIRY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376619.1|2303733_2304138_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209553.1|2307508_2308519_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
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WP_016209551.1|2313772_2314612_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_016209564.1|2314798_2315014_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2315062_2315638_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2315634_2315973_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2316141_2317131_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
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WP_016209559.1|2318103_2319006_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2319049_2320024_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300455.1|2320488_2320854_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2320910_2321075_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212572.1|2321421_2321814_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|2321943_2322309_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300461.1|2322365_2322674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2322765_2323341_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2323286_2323652_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273331.1|2323777_2324077_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212514.1|2324487_2324625_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|2324643_2325480_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2325491_2325764_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038811|2449663:2534834|DBSCAN-SWA
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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKGNTVKYAWIKENKCVFPIGRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLAKRIKGIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQSQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPVAKNVLDRDFSATRPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126239.1|2450511_2450784_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211743.1|2450850_2451213_-	ABC transporter membrane domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211747.1|2451199_2452222_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.8e-16	27.7
WP_016211744.1|2452205_2452610_-	glycine-rich domain-containing protein-like	NA	NA	NA	NA
WP_016211742.1|2452840_2454820_+	TonB-dependent receptor	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2455099_2455828_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_144019244.1|2455917_2456529_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210955.1|2456885_2457140_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210956.1|2459111_2459831_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
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WP_016211051.1|2497441_2497945_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
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WP_075274938.1|2506489_2506996_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|2507159_2508584_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
WP_032126482.1|2508648_2509686_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210625.1|2511748_2512495_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
WP_016210616.1|2512743_2515554_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556661.1|2515854_2516418_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|2516406_2517135_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
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WP_016212238.1|2519341_2520631_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274939.1|2520660_2521389_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-42	41.4
WP_087910645.1|2521501_2522654_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274940.1|2522682_2523363_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.0e-42	44.3
WP_016211997.1|2523718_2524828_+	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	4.4e-07	24.5
WP_016211996.1|2524829_2525777_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274941.1|2526160_2526889_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.8
WP_075275114.1|2526918_2527281_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212339.1|2527433_2528180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274942.1|2528198_2528927_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	43.1
WP_032127022.1|2529603_2531790_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
WP_087910645.1|2531851_2533005_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274943.1|2533290_2533815_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_173018589.1|2534005_2534152_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|2534117_2534834_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038811|2549652:2597254|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126423.1|2580697_2580961_+	BolA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_016210673.1|2591288_2591762_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210671.1|2591894_2593154_+	6-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210676.1|2593609_2595691_+	kinase domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_173018590.1|2595994_2596204_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2596279_2597254_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
2597994:2598288	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038811|2602267:2655859|DBSCAN-SWA
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MPTPSISIAQRFRGFLPIIIDVETGGLNAATDALLEIAAVIVDFNDEEQLVPIKTISTHVQPFAGANIDPEALKINKIDPDSPLRGAINEAEALKKIFTPIREKLKESDCNRAILTGHNPILDLNFLNKAVSRSGIKRNPFHPFSSFDTATLAGLAVGQTVLAISCKAAGIEFDYTKAHGAHYDAEKTAELFCLIVNRWQALGGWPLVNSHH
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MRISTNLHFKLLVAALFIIGIFITCYQIKTLNTPMTPSTETSVWTVEAKVQFQPEKNKPIKAELTLPNTYQDNMKILNEKFISRNYGYSTAKSNDNVRVVTWSIRRAKGLQALYYHFVVHQQHQPGKIAAPSQTIEAYPFVNSQKVAADALLAPIRQQSADIASFTQETIRLLNQKDDHNATLLLKDADSSLKRAVVITRLLSLAKIPAKVIYDIYLLPGTTQPVPWIASFNGKKWLYFNPVTGTAGLPDNVMLWSQGEEPLFKISGANQAKITFTVSESHLNALAFLQPDHSEKATNFINFTLLSLPLQTQEIYKILMTVPIGVLIILLLRSFVGVTTLGTFMPVLIALAFRETHIVWGVVLFTLVTSIGLLARGYLNQLQLLLVPRLAVILTLVIIMMAMISIFSYKLGFERGLSIALFPMVILTMTIERVSILWDERGPQEALIAATGSLITAILAYLTMTNSLITYWAFAFPGLTLIIIAIMLLIGRYTGYRLSELLRFKAFASKL
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MGDGPESEQKSGCLAKVACLTEVPYVELDIPEVELGTPVSGCSPCLFMAVKGQGASNDVAGNKDNSNGTREEREELQMVTSL
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MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSK
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MLFPLNFISAMAMDMYIPSIPDLLVLWPDKALWVQGSLGIFILAVGLGQIVVGPLSDALGRLKIIYSGFFLYISASVLTALSPSAEWLVGARFIQGMGACCCMVAANAIVRDIYEDERGAQVMSYISSAVALAPVFAPFIGSYLSWQMTFWVLAGCGVLLCLQMLLGLQETCVRRQVNLLNFKSCLAVYRQLIFHRQFFLHSIISLCSFSILFLFFSFSPYLLIDQLGLAKTEFGYWFGLNALVLMVMSFIGGFGVKYVSIRFWMGLGVLCMLVGGFTMMIWLYCSTSVSLTAIMLPMFMISTGIAWTVSPAVVGAMMPFGHIAGSAAALLGCIRFAGSALLVTLMMTLGPSSAVYFASCICSLALIALFGCIFIIKSRQTVVY
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MPKLLEQKQWDKIYLFLKDFPGIYCGSERKCRLFIEAVIWILRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD
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MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
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MLIYPQIDPIAVSLGPIKVHWYGLMYLFGFVMAWLLCNYRTKRSHGCWSKEQVGDVIFYGALGVILGGRIGYILFYDFGHFIDHPLVIFQVWDGGMSFHGGLIGVILALVLCGRKFNKTLFELTDFVAPVVPIGLGAGRIGNFINDELWGRVTDSPLGMVFPSGGPLPRYPSQLIEFLFEGVILFVILWLYSSKSRPRMAVSALFLLFYGLFRFGAEFFRQPDPQMGYIAFDWLTMGQLLSAPMIILGVLLYGFAHYRAKQSSNQVIK
>NZ_CP038811|2602267:2655859|2642816_2643767_-|WP_016210984.1|DBSCAN-SWA
MAGVLDTVDARTQLVGKNRLESLLFKLYADKTYAMNVFKIREVLQPIALTNIPESHPFVLGVAYIRGQAVPVIDLGRAVGMQSLVGRKDAVVVISEYYGSTQGFLVGSVEKIINIEWSDIREPPDGLGPSHYLTATLLVDEEIVEVIDVEKVYADIVNPTIDYRDMQLDDNLNTEGMAILVADDSSFARSHICKILSKIDIEVITKNSGAAAFEFLREEAYKNNVDVAKKYPLAITDAEMPEMDGYTLTVNCRNDPKLQDLYIVLHTSLSGGFNKSMVEKVGCDGFIPKFNPKETVELAVKRIHALKASPSTQVSD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556590.1|2604125_2604521_+	SEC-C domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211756.1|2605490_2606216_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2606461_2607649_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_081377344.1|2608003_2609131_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210943.1|2610000_2610687_-	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210942.1|2610690_2611302_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2611348_2612368_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2612469_2613264_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
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WP_016210941.1|2614186_2615236_-	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126310.1|2615433_2616693_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_032126309.1|2616739_2617417_+	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210937.1|2617502_2617784_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_155046994.1|2617875_2619030_-	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	2.1e-20	25.6
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WP_016210820.1|2620258_2621200_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210818.1|2621703_2621928_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210811.1|2622219_2622924_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210823.1|2623373_2624012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377821.1|2624346_2624877_+|protease	ATP-dependent zinc protease	NA	NA	NA	NA
WP_016210821.1|2624873_2626406_+	inactive transglutaminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210815.1|2626402_2627353_+	alpha-L-glutamate ligase-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210817.1|2627772_2628405_+	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-13	32.8
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WP_016210813.1|2629194_2629623_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046752.1|2629661_2630399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274949.1|2630376_2631438_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126306.1|2631662_2631959_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556591.1|2632063_2632720_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377817.1|2632943_2633441_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164997268.1|2634357_2634480_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377882.1|2634531_2634813_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_059372279.1|2634772_2635108_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210986.1|2635168_2636707_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	1.3e-86	36.3
WP_098082804.1|2636818_2637917_-	peptide chain release factor 2	A0A0S4KWG0	Pseudomonas_phage	1.1e-05	43.1
WP_016210987.1|2638154_2639354_+	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210981.1|2639383_2640022_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
WP_016210983.1|2640037_2642221_-	protein kinase family protein	A0A1S5XZ05	Kurlavirus	1.1e-06	34.9
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WP_016210984.1|2642816_2643767_-	chemotaxis protein CheV	NA	NA	NA	NA
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WP_016211962.1|2648484_2649000_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211963.1|2649548_2650208_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211965.1|2650309_2650960_+	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
WP_016211964.1|2651072_2651393_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2651451_2652426_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_032126299.1|2652676_2652898_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038811|2676613:2780292|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126294.1|2680382_2681660_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211782.1|2682259_2682442_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051307336.1|2688017_2688944_-	bifunctional riboflavin kinase/FAD synthetase	A0A1V0SJE1	Klosneuvirus	9.4e-11	34.5
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WP_016210763.1|2691382_2692627_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210761.1|2693562_2694300_+	tryptophan 2,3-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_081377880.1|2694937_2695417_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|2695362_2695938_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209980.1|2697381_2698548_-	aspartate aminotransferase family protein	A0A1V0SKB7	Klosneuvirus	1.7e-25	26.7
WP_032126286.1|2698853_2701652_+	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4P767	Pseudomonas_phage	4.9e-180	45.1
WP_016209981.1|2701710_2702931_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta	A0A1V0EEL7	Caulobacter_phage	8.5e-36	28.7
WP_016209998.1|2702960_2703362_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210001.1|2703832_2703994_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209994.1|2704028_2704316_+	4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209985.1|2704472_2704811_+	integration host factor subunit beta	NA	NA	NA	NA
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WP_016209992.1|2706584_2707634_+	WD domain, G-beta repeat family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556662.1|2708347_2709595_-	UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016209986.1|2709600_2710890_-	FAD-dependent monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209989.1|2710914_2711505_-	UPF0149 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209996.1|2711649_2711874_+	TIGR02449 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209991.1|2711854_2712184_+	cell division protein ZapA	NA	NA	NA	NA
WP_033923658.1|2712409_2712973_+	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209997.1|2713007_2713469_+	EVE domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209977.1|2713545_2715231_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-26	29.6
WP_032126288.1|2715280_2716081_-	3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase CysQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210000.1|2716107_2716656_-	ADP compounds hydrolase NudE	NA	NA	NA	NA
WP_016209993.1|2716785_2717178_+	ribosome-associated heat shock protein Hsp15	NA	NA	NA	NA
WP_016209990.1|2717234_2717639_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019123.1|2717671_2718415_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212415.1|2720056_2720803_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274953.1|2720927_2721791_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274954.1|2722541_2723111_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556595.1|2723255_2723672_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212038.1|2725443_2726355_+	polysaccharide deacetylase family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038811|2891240:2934638|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_052104629.1|2933612_2934638_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038811|2966323:3086228|DBSCAN-SWA
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MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274968.1|2991870_2992971_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556605.1|2993365_2994475_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209721.1|2995413_2996811_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.3e-77	34.4
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WP_016209698.1|2998376_2999576_-	type IV secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209707.1|2999572_2999896_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209703.1|2999897_3001127_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209722.1|3001126_3002170_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556606.1|3002169_3002853_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209720.1|3002849_3005339_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377396.1|3005355_3005610_-	VirB3 family type IV secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209715.1|3005610_3005967_-	TrbC/VIRB2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_164997270.1|3006926_3007910_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209727.1|3007929_3011037_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209723.1|3011038_3012544_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016209714.1|3012571_3012853_-	accessory factor UbiK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209709.1|3013001_3013343_+	P-II family nitrogen regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209712.1|3013462_3015343_+	biosynthetic arginine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_059372650.1|3015427_3017026_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307314.1|3017043_3018159_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209706.1|3018286_3019285_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209700.1|3019288_3020047_-	tryptophan synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016209702.1|3020048_3021248_-	tryptophan synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016209711.1|3021231_3021903_-	phosphoribosylanthranilate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016209710.1|3021924_3022701_-	indole-3-glycerol-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209717.1|3022704_3023703_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3023704_3024283_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3024279_3025749_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|3025792_3026080_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016209699.1|3026280_3026877_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_173018591.1|3027182_3027557_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046757.1|3027613_3027769_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274971.1|3027913_3028366_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|3028551_3028773_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212371.1|3028888_3029521_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274972.1|3029498_3030560_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211865.1|3030999_3031539_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126699.1|3031623_3032160_+	carboxymuconolactone decarboxylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211866.1|3032811_3033114_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126698.1|3033563_3033872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274973.1|3034462_3034930_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556608.1|3035212_3035923_+	VUT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211232.1|3036149_3036548_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211231.1|3037415_3038366_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016211227.1|3038365_3040444_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3040591_3041107_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3041115_3041679_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3041659_3042406_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3042545_3042998_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_162034456.1|3043610_3044258_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3044254_3045151_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3045183_3046251_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3046269_3046638_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3046663_3048112_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3048121_3049501_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3049541_3050873_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3050844_3051804_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3051896_3052400_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3052534_3053686_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3053682_3054162_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3054308_3056630_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_016210343.1|3056631_3057201_+	Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|3057205_3058105_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3058177_3058756_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3059056_3059314_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556611.1|3059322_3060476_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155046759.1|3061888_3062044_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3062371_3063145_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126148.1|3063686_3063869_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3064472_3065447_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3066541_3066880_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212337.1|3066896_3067607_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_051307375.1|3067594_3067786_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|3067947_3068247_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|3068236_3068401_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274902.1|3068465_3068822_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3070126_3070822_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3070818_3072246_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3072271_3072535_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3072895_3073870_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556612.1|3073928_3074779_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211291.1|3074816_3075161_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3075993_3076335_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3076336_3076942_-	cytochrome c oxidase subunit 3	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3076938_3078933_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3078952_3079894_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3080121_3081546_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3082058_3083033_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080743040.1|3083091_3083748_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212448.1|3083794_3084574_-	O-methyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_157883632.1|3085092_3085338_+|transposase	transposase zinc-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211923.1|3085256_3086228_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038811.1|WP_032126179.1|1075289_1075541_+|TSUP-family-transporter	1075289_1075541_+	83 aa aa	NA	NA	NA	1025759-1132793	yes
NZ_CP038811.1|WP_016210918.1|1208187_1208937_-|hypothetical-protein	1208187_1208937_-	249 aa aa	NA	NA	NA	1159304-1222544	yes
NZ_CP038811.1|WP_016212482.1|1243028_1243172_-|hypothetical-protein	1243028_1243172_-	47 aa aa	NA	NA	NA	1227080-1280343	yes
NZ_CP038811.1|WP_032127044.1|1243386_1243587_+|hypothetical-protein	1243386_1243587_+	66 aa aa	NA	NA	NA	1227080-1280343	yes
NZ_CP038811.1|WP_016212421.1|1255311_1255494_+|hypothetical-protein	1255311_1255494_+	60 aa aa	NA	NA	NA	1227080-1280343	yes
NZ_CP038811.1|WP_081377858.1|1276472_1277183_-|transposase	1276472_1277183_-	236 aa aa	NA	NA	NA	1227080-1280343	yes
NZ_CP038811.1|WP_155046725.1|1278040_1278181_-|hypothetical-protein	1278040_1278181_-	46 aa aa	NA	NA	NA	1227080-1280343	yes
NZ_CP038811.1|WP_155046726.1|1446227_1446386_+|hypothetical-protein	1446227_1446386_+	52 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_075274844.1|1460402_1460654_+|hypothetical-protein	1460402_1460654_+	83 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_129556515.1|1461801_1462161_+|hypothetical-protein	1461801_1462161_+	119 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_155046727.1|1462986_1463331_-|hypothetical-protein	1462986_1463331_-	114 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_164997262.1|1480327_1480471_+|hypothetical-protein	1480327_1480471_+	47 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_129556517.1|1480615_1480903_+|hypothetical-protein	1480615_1480903_+	95 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_016212013.1|1476308_1476692_+|hypothetical-protein	1476308_1476692_+	127 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_016212220.1|1489685_1489841_+|hypothetical-protein	1489685_1489841_+	51 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_016211563.1|1495477_1495639_+|hypothetical-protein	1495477_1495639_+	53 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_155049900.1|1495987_1496293_+|hypothetical-protein	1495987_1496293_+	101 aa aa	NA	NA	NA	1290697-1582506	yes
NZ_CP038811.1|WP_098082828.1|1856568_1856826_+|transposase	1856568_1856826_+	85 aa aa	NA	NA	NA	1795310-1972699	yes
NZ_CP038811.1|WP_155046760.1|1916740_1916983_-|transposase	1916740_1916983_-	80 aa aa	NA	NA	NA	1795310-1972699	yes
NZ_CP038811.1|WP_033923740.1|2160518_2160806_-|hypothetical-protein	2160518_2160806_-	95 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038811.1|WP_016212614.1|2182273_2182480_+|hypothetical-protein	2182273_2182480_+	68 aa aa	NA	NA	NA	2181130-2224093	yes
NZ_CP038811.1|WP_016211536.1|2186207_2186441_-|hypothetical-protein	2186207_2186441_-	77 aa aa	NA	NA	NA	2181130-2224093	yes
NZ_CP038811.1|WP_016210177.1|2673102_2673468_-|hypothetical-protein	2673102_2673468_-	121 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038811.1|WP_016210175.1|2673853_2674183_-|hypothetical-protein	2673853_2674183_-	109 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038811.1|WP_016210580.1|2756381_2756642_+|methyltransferase	2756381_2756642_+	86 aa aa	NA	NA	NA	2676613-2780292	yes
NZ_CP038811.1|WP_164997248.1|2767040_2767178_+|hypothetical-protein	2767040_2767178_+	45 aa aa	NA	NA	NA	2676613-2780292	yes
NZ_CP038811.1|WP_155046755.1|2776959_2777136_-|hypothetical-protein	2776959_2777136_-	58 aa aa	NA	NA	NA	2676613-2780292	yes
NZ_CP038811.1|WP_155047000.1|2968440_2968587_-|hypothetical-protein	2968440_2968587_-	48 aa aa	NA	NA	NA	2966323-3086228	yes
NZ_CP038811.1|WP_155047001.1|2968791_2968977_-|hypothetical-protein	2968791_2968977_-	61 aa aa	NA	NA	NA	2966323-3086228	yes
NZ_CP038811.1|WP_016211201.1|2972134_2972443_-|hypothetical-protein	2972134_2972443_-	102 aa aa	NA	NA	NA	2966323-3086228	yes
NZ_CP038811.1|WP_155046759.1|3061888_3062044_+|hypothetical-protein	3061888_3062044_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2966323-3086228	yes
NZ_CP038811.1|WP_032126148.1|3063686_3063869_-|hypothetical-protein	3063686_3063869_-	60 aa aa	NA	NA	NA	2966323-3086228	yes

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_032126179.1|1075289_1075541_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038811.1|WP_032126179.1|1075289_1075541_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1083912-1083875	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1083778-1083741	1
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1073733-1073770	1

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1083912-1083875, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1083778-1083741, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1073733-1073770, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016210918.1|1208187_1208937_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016210918.1|1208187_1208937_-|hypothetical-protein
MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1197485-1197448	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1221632-1221595	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1197485-1197448, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1221632-1221595, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016212482.1|1243028_1243172_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016212482.1|1243028_1243172_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1255960-1255923	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1259466-1259429	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1255960-1255923, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1259466-1259429, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_032127044.1|1243386_1243587_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_032127044.1|1243386_1243587_+|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1255960-1255923	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1259466-1259429	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1255960-1255923, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1259466-1259429, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016212421.1|1255311_1255494_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016212421.1|1255311_1255494_+|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1255960-1255923	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1259466-1259429	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1255960-1255923, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1259466-1259429, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_081377858.1|1276472_1277183_-|transposase

>NZ_CP038811.1|WP_081377858.1|1276472_1277183_-|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1255960-1255923	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1259466-1259429	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1255960-1255923, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1259466-1259429, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155046725.1|1278040_1278181_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155046725.1|1278040_1278181_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1255960-1255923	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1259466-1259429	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1255960-1255923, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1259466-1259429, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155046726.1|1446227_1446386_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155046726.1|1446227_1446386_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLPYLKLPQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_075274844.1|1460402_1460654_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_075274844.1|1460402_1460654_+|hypothetical-protein
MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_129556515.1|1461801_1462161_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_129556515.1|1461801_1462161_+|hypothetical-protein
MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155046727.1|1462986_1463331_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155046727.1|1462986_1463331_-|hypothetical-protein
MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_164997262.1|1480327_1480471_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_164997262.1|1480327_1480471_+|hypothetical-protein
MNKELLDIYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_129556517.1|1480615_1480903_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_129556517.1|1480615_1480903_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016212013.1|1476308_1476692_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016212013.1|1476308_1476692_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016212220.1|1489685_1489841_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016212220.1|1489685_1489841_+|hypothetical-protein
MYSLYIFHSPQYYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016211563.1|1495477_1495639_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016211563.1|1495477_1495639_+|hypothetical-protein
MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155049900.1|1495987_1496293_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155049900.1|1495987_1496293_+|hypothetical-protein
MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1576021-1575984	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1581595-1581558	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1531012-1531049	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1576021-1575984, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1581595-1581558, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1531012-1531049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_098082828.1|1856568_1856826_+|transposase

>NZ_CP038811.1|WP_098082828.1|1856568_1856826_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1920986-1920949	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1801850-1801887	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1801984-1802021	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1920986-1920949, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1801850-1801887, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1801984-1802021, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155046760.1|1916740_1916983_-|transposase

>NZ_CP038811.1|WP_155046760.1|1916740_1916983_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKSQICLGSISSRQS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1920986-1920949	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1801850-1801887	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	1801984-1802021	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1920986-1920949, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1801850-1801887, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 1801984-1802021, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_033923740.1|2160518_2160806_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_033923740.1|2160518_2160806_-|hypothetical-protein
MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016212614.1|2182273_2182480_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016212614.1|2182273_2182480_+|hypothetical-protein
MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2193386-2193423	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2193386-2193423, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016211536.1|2186207_2186441_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016211536.1|2186207_2186441_-|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2193386-2193423	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2193386-2193423, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016210177.1|2673102_2673468_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016210177.1|2673102_2673468_-|hypothetical-protein
MDMSNSKTKKLKTGVIIAGAAAALMLAGCVGPGTKPASQSGPVKCSGINSCKGTSECATAKSACKGQNKCKGTGWVFAKSADLCKKKGGVVLSAGASNSSLAAVDASENLASLDDNKAYRR

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016210175.1|2673853_2674183_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016210175.1|2673853_2674183_-|hypothetical-protein
MFTDVFEKTLAESKEAQNWLAEATKEVFSLQQAMMADWAEWTRVSSVRSSSVKTVEEWVDLNLSSISELTQRSSKAMLDSVTMVSTFAAKNPFYQVKGREEKISKKKTS

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016210580.1|2756381_2756642_+|methyltransferase

>NZ_CP038811.1|WP_016210580.1|2756381_2756642_+|methyltransferase
MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2682478-2682441	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2776914-2776951	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2682478-2682441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2776914-2776951, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_164997248.1|2767040_2767178_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_164997248.1|2767040_2767178_+|hypothetical-protein
MKPNQHKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2682478-2682441	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2776914-2776951	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2682478-2682441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2776914-2776951, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155046755.1|2776959_2777136_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155046755.1|2776959_2777136_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVIHIENLVQYGPSVRLDLKFYKLSVKSPFLVFFCYVRGKNGF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2682478-2682441	0
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2776914-2776951	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2682478-2682441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2776914-2776951, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155047000.1|2968440_2968587_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155047000.1|2968440_2968587_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2983050-2983087	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2983050-2983087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155047001.1|2968791_2968977_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155047001.1|2968791_2968977_-|hypothetical-protein
MILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2983050-2983087	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2983050-2983087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_016211201.1|2972134_2972443_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_016211201.1|2972134_2972443_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2983050-2983087	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2983050-2983087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_155046759.1|3061888_3062044_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_155046759.1|3061888_3062044_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2983050-2983087	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2983050-2983087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038811.1|WP_032126148.1|3063686_3063869_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038811.1|WP_032126148.1|3063686_3063869_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038811_1	Orphan	1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder	363175-363212	38	2983050-2983087	0

1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038811|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038811 position: 2983050-2983087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************