CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038883	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	6
NZ_CP038881	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 chromosome, complete genome	3 crisprs	DEDDh,csa3,RT,DinG,cas3	1	2	31	37
NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	10
NZ_CP038884	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038885	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP038882

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038882_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038882_1
• CRISPR_location: 93136-93359
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038882_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038882_1

>1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038882_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038882_1

>merge|NZ_CP038882|1|93136-93359|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038882|1|1|93136-93359|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038882.1|WP_016212168.1|95493_97182_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_016211955.1|100456_101437_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_075275149.1|97525_98500_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038882.1|WP_032126838.1|83627_83831_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_129556703.1|98725_99214_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_016211956.1|99271_100000_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_155046769.1|88787_88958_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_129556718.1|86351_87538_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP038882.1|WP_016211879.1|91904_92924_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038882.1|WP_075273822.1|85423_85924_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038882.1|WP_054300202.1|94796_95525_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038882.1|WP_075274741.1|86025_86283_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_032126844.1|103012_103309_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_016212255.1|83827_83998_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_155046770.1|94573_94741_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP038882.1|WP_054300202.1|101582_102311_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038882.1|WP_075273820.1|84184_85267_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038882.1|WP_059372616.1|90348_90939_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP038882.1|WP_032126843.1|102614_102794_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038882.1|WP_081377350.1|89287_90103_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038882.1|WP_075273822.1|85423_85924_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	3.05671e-28
NZ_CP038882.1|WP_054300202.1|94796_95525_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038882.1|WP_054300202.1|101582_102311_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038882.1|WP_075275149.1|97525_98500_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	3.60259e-75
NZ_CP038882.1|WP_155046770.1|94573_94741_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP038882.1|WP_075273820.1|84184_85267_-|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	4.76533e-23
NZ_CP038882.1|WP_059372616.1|90348_90939_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	6.85681e-23
NZ_CP038882.1|WP_129556718.1|86351_87538_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	5.96251e-84
NZ_CP038882.1|WP_016211879.1|91904_92924_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038882.1|WP_081377350.1|89287_90103_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44

Protein sequences

>NZ_CP038882.1|WP_016211879.1|91904_92924_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038882.1|WP_059372616.1|90348_90939_+|site-specific-integrase
MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP038882.1|WP_081377350.1|89287_90103_+|hypothetical-protein
MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF
>NZ_CP038882.1|WP_155046769.1|88787_88958_+|hypothetical-protein
MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038882.1|WP_129556718.1|86351_87538_-|IS3-family-transposase
MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP038882.1|WP_075274741.1|86025_86283_-|hypothetical-protein
MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF
>NZ_CP038882.1|WP_075273822.1|85423_85924_+|hypothetical-protein
MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK
>NZ_CP038882.1|WP_075273820.1|84184_85267_-|IS481-family-transposase
MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRRTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR
>NZ_CP038882.1|WP_016212255.1|83827_83998_+|hypothetical-protein
MKKRIKATGAIERAARAAKMGRSRPAWSENFLNEFSEECKSRNSKKPDKYQEVRSK
>NZ_CP038882.1|WP_032126838.1|83627_83831_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI
>NZ_CP038882.1|WP_155046770.1|94573_94741_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP038882.1|WP_054300202.1|94796_95525_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038882.1|WP_016212168.1|95493_97182_-|hypothetical-protein
MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP038882.1|WP_075275149.1|97525_98500_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038882.1|WP_129556703.1|98725_99214_+|hypothetical-protein
MLNMPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC
>NZ_CP038882.1|WP_016211956.1|99271_100000_+|hypothetical-protein
MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL
>NZ_CP038882.1|WP_016211955.1|100456_101437_+|hypothetical-protein
MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF
>NZ_CP038882.1|WP_054300202.1|101582_102311_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038882.1|WP_032126843.1|102614_102794_+|hypothetical-protein
MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE
>NZ_CP038882.1|WP_032126844.1|103012_103309_+|hypothetical-protein
MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT	93161-93202	42	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	106963-107004	0	1.0
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NZ_CP038882_1	1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT	93293-93334	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
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NZ_CP038882_1	1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT	93293-93334	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038882_1	1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT	93293-93334	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|93161|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|93228|40|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
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136. spacer 1.3|93293|42|NZ_CP038882|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2323 : 52565	57	Streptococcus_phage(30.77%)	transposase,protease,integrase	NA
DBSCAN-SWA_2	55660 : 102311	55	Streptococcus_phage(22.22%)	transposase,integrase	attL 81607:81666|attR 108085:109193

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038882|2323:52565|DBSCAN-SWA
AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAATTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGCAATGGCTCAACCTTACGTGAAACCACCACGTATTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGTGTAGAACTTTAGATCTAATCTGACACTTGGGCCATATTGAACTAAATTTTCAATATGGATAATTAATCACACAAGGAGTGTTGTGATGACAAGTTTATCAGAAAAAATAATTAAGCCTAAACTAGGAGTTTTAGAATTAGCTAAACAATTAGGTAATGTTTCTAAGGCATGCGAAGTGATGGGGTATTCTCGAGATAGTTTTTATCGCTTCAAAAAGCTTTATGAAACGGGTGGCGAAGAAGCTTTGCAAGAGATTAGCAAGAAGAGGCCAAATGTGAAAAACCGTGTTCCTGAGCATATTGAGCAGGCAGTCATTGATTTAGCCATTGAAAACCCAGCGTTAGGTCAACTCCGTGCATCAAACGAACTGTTACAGAGAGGGGTCATAGTATCGAGTAGTGGTGTGCGATCAGTCTGGTTAAGGAATGGCCTTGAGACGTTCAAGAAGAGGCTCAAAGCGCTTGAAGCCAAATCAGCACAAGATGGAATTTTGCTGACGGAAGAGCAACTGCAAGCACTTGAGAAAGCAAAACAAGAAAAAGAAGCACATGGAGAAATTGAGACTGAACACCCAGGCTATCTCGGCTCCCAAGACACCTATTACGTTGGAACAATGAAAGGTGTTGGAAGAATTTATCAGCAGACATTTGTTGATACCTACAGCAGGGTTGCATTTGCTTGCCTGTATACCGAAAAAAATGCAGTGACGGCAGCTCATGCGCTGAATGAAAGTGTAATCCCCTGGTTTGAAGAGCGAGATACTCCATTGCTACGCATTTTAACTGATCGGGGAACAGAGTATTGCGGCAAGATAGAACATCACGCTTATCAGCTTTATTTAGCGATCGAAGATGTAGATCACACCAGAACAAAAGCCCGTTCACCTCAAACAAATGGTATTTGTGAACGCTTTCATCGCACGATGAAACAAGAGTTTTATGACATTGCTTTTCGTAAAAAAGTCTATAATTCACTTGAGGAGCTGCAAGTTGATGTTGATGAGTGGTTGATAAAGTACAATCAGCATCGGCCACATTCTGGGAAATACTGTTATGGAAAAACACCAATGCAAACATTTCAGGACTCAAAACATTTAGCACAAGAAAAAATAATCAATAAAAATGTGCAATCTGACAGTCTGATCAATCAGACAAATGTTGTCAGATGATTTAAGCTTGTCAGATCATATCTGGAGTTTTACAGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGCAGCGAACATAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCCCTATAACTTTTCGCAACAGTGCCGTTTTTCACATTTGGCTTCTTCTTGCTAATCTCTTGCAAAGCTTCTTCGCCACTCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCTCTTAGTCAGTCATATAATATAAGTAGCAGCCGGATTATCAAACAATTCAATTGGCCGGATATAACGATCTAGTGCAGCGGAACTGTGTTGACTCACCTGGCGTAACTTTTCCCCAGGCGCTCCATTGAGTTTTGCTTGCGTTAAAAAACCAGCTCTAAAACTATGAGGTGTATAACCTGATAAGCCTGAATGATTGAGATATTTATTAAGAATATGATCAACTGCACTACTCGACAGAGGTTTGTATTGCAACTGCTCCCCTTTTTTAATCTCTCTAAAAATGGAGCCTTCTTTAATGTTTGAGCGTTGAAACCAACACTGCATCAATGTTACCGGACAATATCGATAAGTTGGTTGTAATATGATAGGCACTTGCAGCAACTTTTCACCTGCCTGATTAATTTTATTACGCCCAAGATTAAATAGCACACCTTTGCCACTCACCCACTCAAAATCTTCAATATTAGCAGCCACCACTTCAGATTTTCTGAAGGCACCAAACCACAACCAAGATAACAGTGTTACATCACGTAATCCGGTTAATGTATTTTTATCAATCACCGCCAATAATCTCTCGAAGTCATTTTTAAGCAACGGCTTTGCTTGTTTTGGTCTGTAGTTATCATTGCGCTTGATTGCAAATAAGATGGCTTTGACCTGCATTGAGTCACTAAAACTCTTAAATCCCATCTTAATATGCTTGGAATTAATGGCTGCCAATGACTTTTGAATGGTTGTTCTTTTAAGATTTTTTTTCTTATACAGGTAGTGCAAAAAAAGTGCGACCGCTCCTTCATCCGCCGGTAAAGGGACTAAGCCTAATTTATAGCAGTAATTTTCAAAATCTTTCCAGGGCTTTGCATAGGCTGTTTCTGTGCTTTTTGCTGTTTGATTATCTTTAACAAATGCTTCAAGGTCTTTGAGTGATTGCAGTAACTCTGAAGAACTGTCTATTTTCATTAATTTATCCATACTGCAACCACAACCGATCTATACTATAGTTTATTTTTAGAGCCTTTCGATAGACCCACTTTTTTGGTGGTCGTTGTTTTTTTTTCCTTAGGCTTCTTTGCAACTACTTTTTTAGAAGAAGCTTTTTTAGTTGTTGTTTTACTCGTTACTGACTTTTTAGCTGGCTTATCATCATCTAAAATTTCACCCAACTTTTTCCAAGTGATTTTTTTATTGTTTAAGGTGATACCACTACTACTGACTGCTAACGTACCAAACTTTTTAGAACCATCTTTAATCTCAAAAGTCATTCCTTTTGCTTTAACGTCTAAATCGCCTAAGTTCAGTGTTACTTTCATAAAATAGCCTTTTATTTTTAAGTTATTAACCTTAACTCATGTTACGCGCTTAACCTTTAAGCCATACTTCTAAGCTCCTGAAGTGCAATTTGATTAGCCCTTAATATCAGCTTATATTTTATTGCAAAATGGTTTAAAGATTTTTTCAATTTTAATCTTTCCAATCTGCAAAACCCAAGAATACTGTAATAAATATGGTTCAACT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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038882|55660:102311|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_081377915.1|55660_56218_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-47	51.5
WP_081377914.1|56362_56692_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|56808_57102_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_016212499.1|58100_58475_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212410.1|58679_58853_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212408.1|59100_59550_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212412.1|59542_59707_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372613.1|60007_60634_+	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	1.8e-21	33.7
WP_054300202.1|60739_61468_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_054300590.1|61497_61722_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|62029_62230_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|62223_62559_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|63124_63388_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211872.1|63942_64746_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307367.1|64866_65391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|65499_65724_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126346.1|65815_66058_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|66124_66865_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|66912_67341_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|67674_68403_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_129556700.1|68579_68825_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|68784_69240_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_054300148.1|69345_70407_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|70446_70950_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126739.1|71264_71597_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556701.1|71843_72368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275159.1|72776_73484_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	3.8e-12	32.0
WP_129556702.1|73504_74657_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273327.1|75641_76217_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|76162_76528_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212398.1|77875_78337_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|78599_79436_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_129556717.1|79761_80988_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
81607:81666	attL	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|81642_82617_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
WP_016212260.1|82774_83047_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212257.1|83066_83291_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126838.1|83627_83831_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212255.1|83827_83998_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|84184_85267_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_075273822.1|85423_85924_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274741.1|86025_86283_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|86351_87538_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_155046769.1|88787_88958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377350.1|89287_90103_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372616.1|90348_90939_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	6.8e-23	38.8
WP_016211879.1|91904_92924_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211878.1|92936_94277_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046770.1|94573_94741_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|94796_95525_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212168.1|95493_97182_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275149.1|97525_98500_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.9e-25	30.7
WP_129556703.1|98725_99214_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211956.1|99271_100000_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211955.1|100456_101437_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|101582_102311_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
108085:109193	attR	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038882.1|WP_155046765.1|14450_14645_-|hypothetical-protein	14450_14645_-	64 aa aa	NA	NA	NA	2323-52565	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212137.1|21792_22854_-|hypothetical-protein	21792_22854_-	353 aa aa	NA	NA	NA	2323-52565	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212139.1|22929_23175_-|hypothetical-protein	22929_23175_-	81 aa aa	NA	NA	NA	2323-52565	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212298.1|48575_48902_-|hypothetical-protein	48575_48902_-	108 aa aa	NA	NA	NA	2323-52565	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212499.1|58100_58475_+|hypothetical-protein	58100_58475_+	124 aa aa	NA	NA	NA	55660-102311	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212398.1|77875_78337_-|hypothetical-protein	77875_78337_-	153 aa aa	NA	NA	NA	55660-102311	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212260.1|82774_83047_+|hypothetical-protein	82774_83047_+	90 aa aa	NA	NA	NA	55660-102311	yes
NZ_CP038882.1|WP_016212257.1|83066_83291_+|hypothetical-protein	83066_83291_+	74 aa aa	NA	NA	NA	55660-102311	yes
NZ_CP038882.1|WP_032126838.1|83627_83831_+|hypothetical-protein	83627_83831_+	67 aa aa	NA	NA	NA	55660-102311	yes
NZ_CP038882.1|WP_155046769.1|88787_88958_+|hypothetical-protein	88787_88958_+	56 aa aa	NA	NA	NA	55660-102311	yes

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_155046765.1|14450_14645_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_155046765.1|14450_14645_-|hypothetical-protein
MCRLISRLIVLGEKPSALAIDLSESPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	40898-40861	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 40898-40861, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212137.1|21792_22854_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212137.1|21792_22854_-|hypothetical-protein
MPKFIEINKTQLETKIKEFYNEVDPKNKEKYKYIRSNIDFTLEALKKTCDTSLTELFMEHYFNPESVSDPTLQVAQCKNTLLTQLNDMLKSKKSKDKGKAPAIVSYITLIMKDVIALNFTLALDEFNKLYSWDKVKKLNLSKEYFNKILCNPSCFKDAIKLDFNQEYIEKSLDHPGFLKAALEDLTSKNNIQTILDALTLEKNNICEDISFSEAKSFLQHHKGCIARKCKNHPDKIAFGHIDEKGLIQQHLIEFKVDSWILKSGPEAQLGTKLGVTLTDIARNEGSLLHSSDSVKHWQSKREQMANSPSTCFFFDTKDLSYDNFKSSDEPEFIYHKSLEKKNSSSGQSNSVKL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	40898-40861	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 40898-40861, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212139.1|22929_23175_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212139.1|22929_23175_-|hypothetical-protein
MQKERELVLNKYKQEHKQEKNEIFLKIKESFKSLDIPEHKKLVIGDCQTLRDLCSAVSCQETHNYDATGSQDRKFMQLIPE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	40898-40861	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 40898-40861, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212298.1|48575_48902_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212298.1|48575_48902_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	40898-40861	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 40898-40861, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212499.1|58100_58475_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212499.1|58100_58475_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	76554-76591	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 76554-76591, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212398.1|77875_78337_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212398.1|77875_78337_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	76554-76591	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 76554-76591, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212260.1|82774_83047_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212260.1|82774_83047_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	76554-76591	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 76554-76591, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_016212257.1|83066_83291_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_016212257.1|83066_83291_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	76554-76591	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 76554-76591, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_032126838.1|83627_83831_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_032126838.1|83627_83831_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	76554-76591	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 76554-76591, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038882.1|WP_155046769.1|88787_88958_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038882.1|WP_155046769.1|88787_88958_+|hypothetical-protein
MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	76554-76591	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 position: 76554-76591, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

2. NZ_CP038881

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038881_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038881_1
• CRISPR_location: 363106-363235
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038881_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038881_1

>1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038881_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038881_1

>merge|NZ_CP038881|1|363106-363235|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038881|1|1|363106-363235|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038881.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038881.1|WP_016212007.1|365227_366373_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
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NZ_CP038881.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
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NZ_CP038881.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
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NZ_CP038881.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038881.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038881.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038881.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038881.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038881.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038881.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038881.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038881.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038881.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038881.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP038881.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038881.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038881.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06

Protein sequences

>NZ_CP038881.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038881.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038881.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038881.1|WP_129556444.1|359325_359748_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038881.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038881.1|WP_016211795.1|357808_358003_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038881.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038881.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038881.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038881.1|WP_016212359.1|353608_353827_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038881.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038881.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038881.1|WP_016212010.1|364807_365104_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038881.1|WP_016212007.1|365227_366373_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038881.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038881.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038881.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038881.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038881.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038881.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038881_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038881_2
• CRISPR_location: 680144-680264
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038881_2

Consensus_repeat	Method
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038881_2

>2.1|680181|47|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder
GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038881_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038881_2

>merge|NZ_CP038881|2|680144-680264|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

>NZ_CP038881|2|2|680144-680264|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG
AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038881.1|WP_016210936.1|667769_668564_+|thymidylate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234984
NZ_CP038881.1|WP_054300282.1|678301_678766_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038881.1|WP_129556590.1|676512_676908_-|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP038881.1|WP_016211905.1|681086_681497_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_098082812.1|682261_682777_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016210676.1|684235_686317_-|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038881.1|WP_016210943.1|670346_671033_+|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038881.1|WP_016210944.1|668665_669685_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038881.1|WP_016210935.1|671029_671572_+|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038881.1|WP_016210678.1|682921_683932_-|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP038881.1|WP_016211756.1|674817_675543_+|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038881.1|WP_052047041.1|681765_682029_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016211759.1|673384_674572_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038881.1|WP_016210671.1|686772_688032_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038881.1|WP_016210677.1|690021_690636_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|180312
NZ_CP038881.1|WP_016210942.1|669731_670343_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038881.1|WP_016210672.1|688646_690029_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038881.1|WP_075275117.1|680420_680843_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016210673.1|688164_688638_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_032126312.1|675721_676516_+|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038881.1|WP_016210936.1|667769_668564_+|thymidylate-synthase	gnl|CDD|234984	PRK01827, thyA, thymidylate synthase; Reviewed.	0
NZ_CP038881.1|WP_054300282.1|678301_678766_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038881.1|WP_129556590.1|676512_676908_-|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038881.1|WP_016210678.1|682921_683932_-|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP038881.1|WP_016210671.1|686772_688032_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038881.1|WP_016210676.1|684235_686317_-|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038881.1|WP_016210943.1|670346_671033_+|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038881.1|WP_016210944.1|668665_669685_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038881.1|WP_016210935.1|671029_671572_+|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038881.1|WP_016211756.1|674817_675543_+|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038881.1|WP_016211759.1|673384_674572_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038881.1|WP_016210677.1|690021_690636_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP038881.1|WP_016210942.1|669731_670343_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038881.1|WP_016210672.1|688646_690029_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038881.1|WP_032126312.1|675721_676516_+|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55

Protein sequences

>NZ_CP038881.1|WP_054300282.1|678301_678766_+|IS630-family-transposase
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038881.1|WP_129556590.1|676512_676908_-|nucleic-acid-binding-protein
MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
>NZ_CP038881.1|WP_032126312.1|675721_676516_+|M48-family-metallopeptidase
MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL
>NZ_CP038881.1|WP_016211756.1|674817_675543_+|M15-family-metallopeptidase
MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN
>NZ_CP038881.1|WP_016211759.1|673384_674572_-|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP038881.1|WP_016210935.1|671029_671572_+|acireductone-dioxygenase
MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD
>NZ_CP038881.1|WP_016210943.1|670346_671033_+|acireductone-synthase
MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP038881.1|WP_016210942.1|669731_670343_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG
>NZ_CP038881.1|WP_016210944.1|668665_669685_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
>NZ_CP038881.1|WP_016210936.1|667769_668564_+|thymidylate-synthase
MRTYLDLMQRVLETGAEKTDRTGTGTLSVFGHQMRFDLSAGFPLLTTKKLHLRSIIHELLWFLKGETNIAYLNENKVRIWDEWANAEGDLGPIYGAQWRSWAGADGKTIDQMTQVIEQIKINPDSRRLIVSAWNVAEIEKMALPPCHALFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTLMIAQVTGLEPGDFVHTLGDAHLYSNHLEQVKTQLQRDCRGLSMMKINPEVKDIFDFKYEDFILENYDPHPHIKGAVAV
>NZ_CP038881.1|WP_075275117.1|680420_680843_+|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
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MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038881.1|WP_052047041.1|681765_682029_-|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038881.1|WP_098082812.1|682261_682777_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038881.1|WP_016210678.1|682921_683932_-|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038881.1|WP_016210676.1|684235_686317_-|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038881.1|WP_016210671.1|686772_688032_-|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038881.1|WP_016210673.1|688164_688638_+|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038881.1|WP_016210672.1|688646_690029_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
>NZ_CP038881.1|WP_016210677.1|690021_690636_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase
MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER

Crispr_ID: NZ_CP038881_3

• CRISPR_ID: NZ_CP038881_3
• CRISPR_location: 1612436-1612542
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038881_3

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038881_3

>3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038881_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038881_3

>merge|NZ_CP038881|3|1612436-1612542|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP038881|3|3|1612436-1612542|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038881.1|WP_080664871.1|1607820_1609443_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223732
NZ_CP038881.1|WP_032126362.1|1607023_1607389_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
NZ_CP038881.1|WP_052047040.1|1613573_1614512_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038881.1|WP_016211834.1|1609533_1609848_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016210748.1|1602265_1604221_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP038881.1|WP_016210799.1|1619024_1619978_+|chemotaxis-protein-CheV	unknown	unknown	gnl|CDD|223905
NZ_CP038881.1|WP_016211836.1|1610384_1610873_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038881.1|WP_129556527.1|1618302_1618563_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_075273327.1|1606502_1607078_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038881.1|WP_051307338.1|1614537_1616103_-|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038881.1|WP_016212182.1|1604900_1605086_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016210800.1|1616312_1617140_-|DsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP038881.1|WP_016210795.1|1621891_1622863_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP038881.1|WP_075273540.1|1617506_1618118_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_051307365.1|1610104_1610365_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_098082828.1|1613246_1613504_+|transposase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016212185.1|1605419_1606409_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP038881.1|WP_016210749.1|1601505_1601967_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_016210791.1|1620404_1620605_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038881.1|WP_051307339.1|1620979_1621786_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038881.1|WP_080664871.1|1607820_1609443_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	gnl|CDD|223732	COG0659, SUL1, Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) [Inorganic ion transport and metabolism].	7.37206e-122
NZ_CP038881.1|WP_032126362.1|1607023_1607389_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08
NZ_CP038881.1|WP_052047040.1|1613573_1614512_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24
NZ_CP038881.1|WP_016210748.1|1602265_1604221_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP038881.1|WP_016210799.1|1619024_1619978_+|chemotaxis-protein-CheV	gnl|CDD|223905	COG0835, CheW, Chemotaxis signal transduction protein [Cell motility and secretion / Signal transduction mechanisms].	4.08417e-34
NZ_CP038881.1|WP_016211836.1|1610384_1610873_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP038881.1|WP_075273327.1|1606502_1607078_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP038881.1|WP_016210800.1|1616312_1617140_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.60773e-43
NZ_CP038881.1|WP_016210795.1|1621891_1622863_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP038881.1|WP_051307338.1|1614537_1616103_-|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.15465e-34
NZ_CP038881.1|WP_016212185.1|1605419_1606409_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP038881.1|WP_051307339.1|1620979_1621786_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	3.41626e-38

Protein sequences

>NZ_CP038881.1|WP_016211836.1|1610384_1610873_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP038881.1|WP_051307365.1|1610104_1610365_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP038881.1|WP_016211834.1|1609533_1609848_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP038881.1|WP_080664871.1|1607820_1609443_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter
MKSKFLNNVKGNVFGGITAAIIALPVALAFGLSSGMGPMAGLYSAVCVGLFAALFDGTPAQISGPTGPMTVVMAATLINLNDVDAEAGLAMGFTVVVLAGCFQILFGLAKLGRYITLVPYPVISGFMSGVGVIIIILQLPPLFGYPLLANLWQTVLNITDMLAAPNYTTFYIGLIVLVIAFFWQGRLNQFFPAYLLALIVGTVIYLIIFKNNADMISVIGNIPSGIPKLHWPTFDIPHLRVIITSALLLAVLGAVDSLFTSLVANNITHEHHHSDRELIGQGLGNMASGLIGGLPGAGATMRTVASIQAGGSTSLAGIVHSLILLAVVLGAGHYFSSIPHAVLAGILIKVGTDIIDWKFIVRLYRLPIFSSILMLIVLLLTVFVDLISAVFVGVFIANLVTIDRLSHIQLDGISLSDGIKNRHDLLSSEADKLRKKRGQIVLFRLVGAISFGVARQIKKQISDFKEHQMLVLDLSRVSLVGVTSIIMIDDIVQAELNKNNKVYIIMDEEGVDENLEKISILKKLKQEYFVKSLDEVLRKC
>NZ_CP038881.1|WP_032126362.1|1607023_1607389_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
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>NZ_CP038881.1|WP_075273327.1|1606502_1607078_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038881.1|WP_016212185.1|1605419_1606409_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
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>NZ_CP038881.1|WP_016212182.1|1604900_1605086_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP038881.1|WP_016210748.1|1602265_1604221_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP038881.1|WP_016210749.1|1601505_1601967_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP038881.1|WP_098082828.1|1613246_1613504_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
>NZ_CP038881.1|WP_052047040.1|1613573_1614512_+|IS3-family-transposase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP038881.1|WP_051307338.1|1614537_1616103_-|APC-family-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSKFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP038881.1|WP_016210800.1|1616312_1617140_-|DsbA-family-protein
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>NZ_CP038881.1|WP_051307339.1|1620979_1621786_+|methyltransferase-domain-containing-protein
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>NZ_CP038881.1|WP_016210795.1|1621891_1622863_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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NZ_CP038881_3	3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	1612474-1612504	31	CP020755	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence	498805-498835	8	0.742
NZ_CP038881_3	3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	1612474-1612504	31	NZ_CP021062	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence	129826-129856	8	0.742
NZ_CP038881_3	3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	1612474-1612504	31	NC_020385	Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence	309123-309153	8	0.742
NZ_CP038881_3	3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	1612474-1612504	31	NC_018492	Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence	56616-56646	8	0.742

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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134. spacer 3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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135. spacer 3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 3.1|1612474|31|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	46	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	protease,transposase,tail,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 301858	49	Acinetobacter_phage(40.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	329433 : 374988	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447600 : 560105	108	Escherichia_phage(28.57%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	585094 : 636239	52	Staphylococcus_phage(37.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	644326 : 678766	36	Catovirus(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	707406 : 821686	110	Escherichia_phage(36.59%)	protease,transposase,integrase,tRNA	attL 724020:724079|attR 730248:730535
DBSCAN-SWA_10	904100 : 956160	44	Agrobacterium_phage(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	1018072 : 1099680	83	Staphylococcus_phage(35.29%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_12	1120350 : 1247699	119	Staphylococcus_phage(17.65%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1290419 : 1418685	118	Bacillus_phage(12.5%)	protease,transposase,integrase,tRNA	attL 1356104:1356163|attR 1424642:1425871
DBSCAN-SWA_14	1421747 : 1522198	104	Leptospira_phage(15.38%)	transposase,integrase	attL 1493193:1493252|attR 1522965:1523255
DBSCAN-SWA_15	1551820 : 1614512	55	Bacillus_thuringiensis_phage(14.29%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_16	1624820 : 1669039	45	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_17	1697065 : 1735907	31	Staphylococcus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_18	1746172 : 1846068	97	Staphylococcus_phage(20.0%)	protease,transposase,integrase,tRNA	attL 1816584:1816643|attR 1851068:1851148
DBSCAN-SWA_19	1872918 : 1932028	55	uncultured_Mediterranean_phage(30.77%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_20	1968842 : 2055265	84	Bacillus_phage(15.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_21	2069436 : 2108329	36	Klosneuvirus(28.57%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_22	2145401 : 2195022	42	Vibrio_phage(14.29%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_23	2203780 : 2252436	45	Bacillus_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2268563 : 2368119	99	Armadillidium_vulgare_iridescent_virus(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_25	2383957 : 2445821	56	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(11.76%)	protease,transposase,integrase	attL 2394174:2394233|attR 2422356:2423459
DBSCAN-SWA_26	2458787 : 2512400	50	unidentified_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_27	2564408 : 2665037	104	Prochlorococcus_phage(17.65%)	protease,transposase,plate,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_28	2685358 : 2717153	35	Enterobacteria_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_29	2728190 : 2778470	57	Escherichia_phage(47.37%)	transposase,integrase	attL 2744171:2744230|attR 2766875:2767738
DBSCAN-SWA_30	2906217 : 2949615	41	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_31	2981300 : 3098565	113	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038881|45566:89679|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
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WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
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WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038881|136473:178470|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|136473_137448_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|137949_139362_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
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WP_016211636.1|140881_142402_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038881|182276:239530|DBSCAN-SWA
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MAWLELKVITTRQHAELIGDYLNEVGALAITLRDGKDQPILEPGVGETPLWQDVHVIALFDAGIELEPVREQLLVQFDELNDISVKIDPLEDQDWTATWREHFEPMLFADRLWVHADWHEVNARENQVKMLLNPGLAFGTGTHPTTAMCLNWLAGHLNPGSRVIDFGCGSGILAIAALKLGAHYVHCIDIDPQALEAMHYNAKQNELDPSCYQAVLPEQFTISDITSTGADVLVANILANPLIGLAPQFASLVKAGGMLVLSGILVEQAERVQTAYLDHFDLVELQQDDEWVCVIAQRKAY
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MSKKLPSERFFYIRLDLAIIALFGIILLIGVSNWFDRYLYQCVTLLAYSGVAVLWLLCRIKRQLNQLKCIKNANAEDVDGKEVEK
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MPNCQSDYLDLIYQKILNTQRTGIGNCVQAANRVSHLLNTGTDLTESYLQRLPRISKKQFFYHFKDGEAPLKALMHTLNEGQHVQVSADIAHLTCINHVFNAIKLEGEIKLIDNYQTWPNPPWLQQAWYHPKEFLTHLTH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016210779.1|186290_187220_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210775.1|187512_188106_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
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WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
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WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038881|256927:301858|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211358.1|259577_260039_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|260462_261944_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|262006_263116_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|263213_265175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|265704_266109_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|270449_271602_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210128.1|331180_331444_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210132.1|331810_332629_-	kinase/pyrophosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556442.1|332701_335074_+	phosphoenolpyruvate synthase	A0A1V0SGR7	Hokovirus	2.8e-160	35.3
WP_016210125.1|335786_337214_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210131.1|337248_338271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210140.1|338287_338665_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126491.1|339022_339340_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210122.1|339506_340199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038881|447600:560105|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300511.1|461080_461380_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461538_461874_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210501.1|464214_465201_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465203_466358_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466354_467050_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467184_468675_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468695_469745_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469811_471206_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472084_474016_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|474020_474551_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|474585_474780_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|474822_475182_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475601_476597_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476609_478991_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|478996_479284_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|479555_480032_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|480176_480374_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|480498_481473_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|483581_483680_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210477.1|484164_485454_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126626.1|485690_486383_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|486424_487198_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|487199_488141_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|488273_489851_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|490060_491818_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|492366_493125_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|493332_493905_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|494008_494557_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|494858_495104_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210376.1|538462_540943_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	4.1e-194	44.3
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WP_075274953.1|559241_560105_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038881|585094:636239|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038881|644326:678766|DBSCAN-SWA
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MQAAFDYLMAKEPSLQQLTEQLSQYESDLITSTSLKSLYSGSTSVCAKILEKIRTRSHEQTTADTPEPSELPFFSQQQANTSAASPVESMENRPPHQP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126310.1|664340_665600_-	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_016210941.1|665797_666847_+	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210931.1|666925_667732_+	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|667769_668564_+	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
WP_016210944.1|668665_669685_+	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210942.1|669731_670343_+	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210943.1|670346_671033_+	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|671029_671572_+	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|673384_674572_-	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211756.1|674817_675543_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_129556590.1|676512_676908_-	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300282.1|678301_678766_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038881|707406:821686|DBSCAN-SWA
CATGTCTGAGGTGGCCCAGGCGTTAGAAATTATCAAACGCGGTGTAGATGAGATCATTGTTGAAGATGAGTTAGTTAAAAAATTAGCAGCAGGGACGCCTTTGCGAGTGAAATTGGGTATGGATCCAACAGCAGCCGACTTACACTTAGGCCATACGGTGGTGTTAAATAAAATGCGTCAGCTGCAAGATCTCGGGCATGAAATTTTATTTTTAATTGGTGATTTTACTGCAACTATTGGTGACCCGACAGGTAAAAATATCACTCGCCAGCCCTTATCTGCTGAGCAAGTTGAAAAAAACGCAGCGACGTATACATCACAAGTATTTAAAATCCTTGATGAAGATAAAACACAGATTCTGTTTAATTCAGAATGGATGGGCCAAAAAACTGCAGCGGATATGATCGCGTTAGCCTCAAGTTATACGGTGGCGCGTATGCTTGAGCGTGATGATTTTGCTAAGCGCTATGGCAATAATCAACCGATTGCGATTCATGAGTTTATTTATCCTTTGGTTCAGGGCTATGACTCTGTTGCTATGAAAGCAGATATTGAGCTTGGTGGCACGGATCAGAAATTTAATTTATTGATGGGACGTGAATTGCAACGACAATATGGTCAGCGCCCGCAGACAATCATTACCATGCCATTACTGGAAGGTTTGGATGGTGTGAAAAAAATGTCTAAATCTTTAGGGAATTATATTGGTATAGCAGAATCGGCCAGTGAGATGTTTGGCAAAATGATGTCTGTTTCTGATGAGTTAATGTGGCGCTATTATGAATTGCTGAGTTTTAAGCCGATGGCAGAGATTAAAGCCTTAGAGCAAGCTGTGGCAGAAGGCATGAATCCACGTGATGCAAAAGTTGCTTTGGCCAAAGAGATAGTCGCGCGTTTTCATTCAGAACACGCTGCAGCGGCGGCGTATGATGAATTTGTCAATCGTTTTAAAAAAGGGGTGTTGCCTGAAGATATGCCAGAAGTGACTGTCGCTACCGGTGGTGAGATGGCAATTGGCAATATATTAAAAGCGGCAAACCTCGTGGGCAGTACGTCTGAAGCGATACGGATGATTCAGCAAGGGGCTGTACGCATTGATGGTGAGCGTGTTGAAGATAAGAGCCTTGTTATGCTTGCAGGTGCAGCTTATGTTATGCAAGTGGGCAAACGCCGTTTTGCCCGTGTTAGCTTAATTTAGAATGAGACGAGGAGGCTGTGATGAAAAAGTGGCTAGGAATCTACGCTTTTTTTATGATGGCACCTATATTTGCTAGTACTGGCCCTTATGTGCAGAGCCAGGTTGGTTATGGCAAATTGGCAACTGGCTCGGCGAATGGATTAGACCATCATTATGGTGGCTTGTCAGGTCGTTTATCTGCAGGGTATTTATTTGGTGGACGACAATTACGCTATGGTGCTGAGCTTGGTTTGGCGAGTTATGCGAGTAGTTGTTATCAATCTGCAAATACCAGCTTAACTTATCAAGGTGCCTCGGCAGATTTATTAGGCGTGTTATCTTATCAATTGGGTGCACGTTGGAATGTTTTTGGCAAGTTGGGCTTGGCTTATATCGACCAGCAAACAGAGGGCAATTTATTTCCCAATCAGTTGGATTCTAGTAATGCGCTACAGCCTAAAGTTGCTTTAGGCTTGGGTTATTCGTTGACAGCTGCGATTGGTGTCAATCTATCTTATAGCCATACTTTTGGTGATCAGCCGGAAGGGTTAGCTAAAAACGCTGAACCAACACCTGTGATGTTAAATAAGGTGGCTAGCACGGATTTATTATCATTTGGTTTATCCTATCGGTTTTAATCGCTTTAGTATTTAAAAATAATGATCAGCAAAAAGTAGAATATTTTGGTTAAGCGTTTTTGCTTTAGGGTATGAAAAAGAAGAAGCGACCTTGGGGTAGAAGATCGCTCCGTCTAGGGGTGTACGGCTTTGAGTGATAAAGCCTATATCTAAACAATAATCATTATCATTTATTCTGTCAAGACTTTTTGTTAAATATGCTAAATATAAGTTACAAAGTATAATGATCCTAATAGCAATTTTTCTGCCTTCATAAAAATAGAGCCTTATATTTCAAATAATTATATAAATAATTTTAAATAGGTTATATAAAGAGGCTATAAATAAATTGCTACTTTGATGAGCTGAGTAGCACTGTATAGCTGAGTGAAACCATAAAAAAGCCCCGATAATCTAGGGGCTTTATTTGTCAATATTGATCGTAATAATAATGAAATTGTGATTTAGTCGCGGCCAGAGAATGCAGCAAATATTTGCAGAAGGCTCATAAAGAGATTCACAATATTTAAGTACAGGCTCATGGTAGCCATAATATAATTAGTCTCACCACCTGAGATAATACGTTGGGTATCCCAAGCAATAAAGCCAGCAAAAACTAATGCGGCGATGATGCTAATGGCTAACTGTAGGGCAGGTAAGTGTAAAAACAGGTTAAGCAAGCTGGCAATGACAACGACGATTAGCCCTGCCATCAAGACGCCACCTAAGCGTGTAACGGCTTGAGGTTTGGCGATTGCAAGGGCTGACATTACAAAGAAAGTCACTCCTGTTGTTGCCAAGGCACTTAAGACTAAGGCGCTGCCATTACTGAATTGGGTGATATAAAAATTAAGTACAGGGCCAAGTGCATAGCCAAAAAAGCCAGTAAAGCCAAATAAAGTGACGATACCCCAGCTGCTATTACGTAGTTTCATCGTTGCAAACAGCAAGGCGAAACTGACAATTAAATTTAGAATTGGATTGACGGGAGTTGCATGGTTCACTAAAGCCCAGCCAGCGGTTGCGGCACTGAACAATAGTGTTAAAGAAAGCAAAAAGTAGGTGCTTCTTAATACCTTATGGTTGGCTAACAGCGAGGTATTGCGCTGAACTGTTGACTGCTGTTGATACATATAAGATCCTCTGTTTTAGTCATCACCCTATAAGATAAGGGCGTAAATATAAAAAGCAAGAGATAGATAAGCTGACGTGTTAGGTTAAGTTTATAATTGAAAGATTGAGAGTTAGGCTGTTGATGGGGCTTGGGAAGGCGGTTAGCGTTCCCAATAACTTTCCTCGAGGCTATCTTCACGGTCAGGAAGACCACGTGAGAGTCGCGTAGCATTTTGCGCAAGGACCTCATAACTTACACGGTTCGCATATTTGCAGACTTGGGAGAAGGATGAATAGGTCAGATAAGGTCGATCGTGTTTGCTTGAATTAGGCAATACGGTGTGATGGTAATGATTGGCAGCAATATCATGAAAGAGCGCAGCTAAGGCACCATCTCCAGCCCCATTGGTATTGTGAATTTTTTCAGGACCGCCCATATAGGGATTAATATGCGCGAAGACTTGTAATGGGTTTTGGCAGTCGGCTTGACGCATTGGGCGGCTGAATTCATATTCGTTAAAGTTGCTGATGGTGCCAGAAAGAAGTGGGTTGGAGGTGCGACGTGCTGTAGCTTGATCCGTATAACCGCTTAGGTATAAGCCTTGTGGGCCAACCGTGGTGAGGACTAAGTCAGTAATCTCTAGGGCTGCTCGACTGGCGAGTAAGGGGTCTTTATGGCCGGTGAGAGCATAACCTTCATCTTCATTCATGGCGATAATAGAGACATAGTCTTTAATAAAATCATAGAAAAATGATTGTTTTTCATTAATTAAAAACTGGGTGCCTAAGGTTAAGACAGCCGGAATGTGGTGCTTTTTAGCAAGTTCTACCGCCTTGAGTGTCGCTTTGAATATGGGTAGGCTCTCATCACGCAGAATATAACTAGAAATGCCTAATAGGACCGTCTTTTGAATGATTTCTTCATTAATATAGTCGGCAGTCAGCTGATTCATGACGCCGGAGTTAATACCAAAACTGCGCTCACCATCGGGGGTGATCAGTGTGATACAACGGCCAATGGGTCCATCAACAGGTTGTAAGTGGGTTAGATCAACACGACTGCTAGTGTTACACAAGTAGCGATAGGCAGGATCTTGCATGCTAATGGTTTTACTCATAACGCCGAGCTGCACAGAGATATCATCAGCGAGAACCGAATAATTATGCAGACTATTGCCGATGGTGCCACCAGCGTATTCGCTGATAATTAATTTATTACTTTTTAAATAATTGTATAAGTTGTCGGCGGTTTGGTCATCAATGAGGAGAGATTCGCCTTTTTGTAGGCCATACTCGCCCAGTAATGATTCATCGACATGGGCTTCAATATCGACAAGCACTTGTGCGATACCGGTGATATAGGTATTACCACGCTTGCTAAAGGACGGGTGCTCACAATTGGTTTTGCCACGAGAGTTGATAGGAAAGTAATGTTTAATTTTGCGTTTGCCTGGAAAGCGCATGTGCTTCCACCCTTAATCTATTTAATCTTAACTATGGAGTTATGTGCATAAAAGCTAGGCATTTTATAATGATTTGGCCAACTTGAGAAGGGATATTGAAAATACTTGGTCAGAGGTTATGCGTTGGAGCTGACTATAACCTCTTTAAATTATTTATTTTTCTATTTTGATTTTAGTGTGCTGGTCTTTAAATACTTATGTTAAAGGCGTAATATTATTTGAGGAATGGAATCTTAAATTAGGAGATGAAGGATTTATGCTTCATTTTATTCGAAAAATTGATTCTGGTCGGTTTGGTAAGGTCGTTTTGGTTGGTGGTAGCGCTGGAGGCCAATTTGCAGTGAAATTATTTCGCCAGCAACATGATCAGCCTGGTCGCGTGAGCACCTCGGCGCAACTTGAGGTCGCTAATTTCAATAGTTTCTCTCATAGAATTCAAGATATTGGGCGGGCAGAGGTGGTAGATCTGACTGACATCCAAGGCTTAACCGCTGGTGATCTTGATAACTATTGCTTAGAAGCTATGCTGATGCCACTTTTTCAAAACGAACGTGAAGTCCGTTATGAAGAAATACAGCCATACCTTGCTAATTTAGCCGAGCGTAATTTTTTTATGGGTGACCCTAAGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211325.1|736280_737801_+	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.3e-85	38.9
WP_016211323.1|737790_738888_+	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	1.0e-27	28.3
WP_016211321.1|739061_740222_+	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
WP_016211722.1|740602_743905_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
WP_032126817.1|743914_744736_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|745092_745809_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8
WP_129556588.1|745753_745921_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274943.1|746111_746636_-	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_087910645.1|746921_748074_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_032127022.1|748136_750323_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
WP_075274942.1|750999_751728_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	43.1
WP_016212339.1|751746_752493_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275114.1|752645_753008_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274941.1|753037_753766_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.8
WP_016211996.1|754149_755097_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211997.1|755098_756208_-	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	4.4e-07	24.5
WP_075274940.1|756563_757244_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.0e-42	44.3
WP_087910645.1|757271_758425_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274939.1|758537_759266_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-42	41.4
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WP_016212264.1|761100_761694_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.4e-28	44.6
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WP_080664881.1|762495_762702_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|762791_763520_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
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WP_016210625.1|767431_768178_+	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
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WP_051307334.1|769182_769962_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210618.1|770228_771278_+	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|771342_772767_-	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
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WP_016210615.1|773740_774211_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
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WP_016211051.1|781981_782485_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
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WP_155049879.1|787143_787545_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|787513_788242_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211625.1|788725_789595_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_016211621.1|789591_790941_-	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	4.6e-75	37.0
WP_016211623.1|791053_792694_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211987.1|794515_796252_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_129556671.1|796755_797484_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_098082825.1|797547_797856_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211657.1|797848_798181_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211654.1|798184_798754_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211655.1|798882_799296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211652.1|799555_800761_+	glycine C-acetyltransferase	V5LQ39	Emiliania_huxleyi_virus	2.5e-35	26.6
WP_016211653.1|800868_801894_+	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	2.3e-18	78.8
WP_054300202.1|801985_802714_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_054300202.1|803144_803873_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016212196.1|804281_804527_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|804523_804910_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212193.1|804977_805316_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274934.1|805438_806107_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-41	44.0
WP_016211949.1|806594_807845_-	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_016211951.1|807878_808976_-	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_075274933.1|809592_810321_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_075274932.1|810629_810851_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211812.1|811072_812686_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_016211816.1|812727_813081_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126570.1|813093_813393_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|814150_814879_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_075274930.1|814908_815328_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210945.1|816138_816729_+	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|816855_818241_+	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210947.1|818335_818533_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|818626_819445_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|819951_820329_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210948.1|820341_820578_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|820577_820784_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210956.1|820966_821686_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038881|904100:956160|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126660.1|906257_907895_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	5.8e-88	38.2
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WP_016211066.1|908218_909232_+	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211063.1|909394_911623_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.0e-82	35.0
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WP_016210871.1|923976_924294_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016210874.1|926654_927695_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210873.1|927709_928360_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210876.1|928427_929270_+	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212140.1|932503_933421_+	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|933972_934119_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|934173_935364_-	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211370.1|935496_935940_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|935982_937026_-	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211368.1|937072_938464_-	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|938660_939584_+	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211372.1|939570_940428_+	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|946524_947670_-|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_054300173.1|947748_948810_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211408.1|949033_950380_+|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_016211412.1|950494_951487_+	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_016211411.1|951490_951988_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|951984_952824_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|952856_954389_+	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|954548_954884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|955039_955312_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|955323_956160_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP038881|1018072:1099680|DBSCAN-SWA
ATTATTTTACACGCATGCCGGGCAGTGCGCCCTCATCGGGGTTAAGAATCCAGAGGTCCTGACCACCAGGCCCTGCGGCAAGGACCATGCCTTCTGAAACACCAAAACGCATTTTGCGTGGCGCCAAATTGGCAACCATGACAGTGAGCTTACCTTCCAGCGCTTCGGGCTGGTAGGCTGATTTAATACCGGCGAAGACCTGACGAGTTTCACCGCCTAAATCGAGGGTGAGTTGTAATAATTTATTGGCTTCTTTGACATGCTCGGCTTTAATAATTTTGGCAATGCGCAGGTCAATTTTGGCAAAGTCCTCAATCGTAATTGTGTCTGCAATCGGTTCTTTATGTAATGGGTTGTCTTTTGGGTTATTTTTATCACTGTTAATTGCAGCCGCTGTGTTTGCAGTAATATTCGCTTCTTTGGCGAGCTCTTGCTTGGTTTCTTCAATGATCTTGTCGATTTGAGCAGTTTCAATACGTTTCATCAATGGCTTAAAGGTGTTGATGGGATGATTTAATAACGGCTGTTGGCTGTCTGCCCAGCTGAGTGAATCGATATTTAAAAACTCTTCTGCATGTTGGCTTAATTCCGGTAGAACCGGTTTTAAATACAAGGTTAGCAAGCGGAACAGGTTAATTCCCATCGAGCAGACTAAATGGACTTTGTCTTCTTGACCGTCTTCTTTAATTAGTTGCCACGGCTTATAGTGATCGATGTATTGGTTGGCTTTGTCAGCTAAGGCCATAATTTCACGCATGGCAAAAGCAAAATCACGTGATTCATAGTACTTGGCAATTTTTTCAGCCTGAGCACTAAATTCATTAAATAAATCAAGATTATCGAGCGTTGTCGCCAGTTGGTTGTCAAAGCGCTTTTTAATAAAGCCAGCACAGCGGCTAGCGATATTAACGACTTTGCCGACTAAGTCTGAATTAATCCGTTGCGTAAAGTCTTCCAGGTTTAAATCAATATCATCAATACGACGACTCAGCTTTGCGGCGAAATAATAGCGCAAATATTCGGAGCTTAGGTGATTTAGATAGGTTCTGGCTTTAATAAAGGTGCCGCGTGATTTAGACATTTTCTGGCCATCCACGGTGAGCATGCCGTGAACAAAAATATTACTGGGTTTACGAAAGCCTGCGCCTTCGAGCATTGCTGGCCAAAATAAGCTATGAAAGTAGACGATGTCTTTACCGATAAAGTGATAAAGCTCAGCCTGGTCGTCGTGCTTCCAAAACTGATCAAATTCCAGATTTTTTTTCTTGGCAAAATCCATAAAACTCGCCATATAGCCGACAGGTGCGTCGAGCCACACATAAAAATATTTACCCGGTGCGTTAGGGATTTCAAAGCCAAAATAAGGCGCATCGCGCGAGATATCCCAATCATTTAAGCCACTGTCAAACCATTCGTTAAGCTTATTGGTAATTTCTTCTTGCAGGTGGCCTTGTTGAATCCAGTCTTTGAGCATATTTTCATAATGAGTGAGCTTAAAGAAATAATGCTCAGATTCTTTTTCTATCGGTGTGGCGCCAGAGACTACAGAAACAGCATTAGTTAAGTCACAGGGGCTATAGGTTGCCCCGCAGACCTCGCAAGAATCACCGTATTGATCTGCCGCATTACATTTAGGGCATTCACCTTTGACAAAACGGTCGGGCAAGAACATGTTTTTCTCAGGGTCGAAGGCTTGGGTAATCGTCCGCTTTTCTATGTCGCCATTGCGTTCTAATTGATTATAGATTTCAAAGACCAGTTCTTTGTTCTCAGCGCTATGGGTGGTGTAGAAATTATCAAAGCTGATATTAAAGTCGTTAAAGTCTTGCTCGTGTTCTTTGGCAAAACGAGTGATTAATTCTTCTGGGGCAATGCCTTCTTTTTCTGCTCGTAGCATAATCGGTGTGCCGTGAGCGTCGCTGCCACTGATTAAATAGCACTCATGGCCACGCATACGTTGGAATCTAGTCCAAATATCTGCTTGAATTGCTTCGATAATGTGACCTAAGTGAAGTGAACCATTGGCATAGTATAGAGCAGTAGTTGCTAATATTTTGCGTTGCATGACGTTGTGGCACCTAAATGAAATTTGAAATTATGCGTAAATTTGTTCATATTGTTTTAAAATTGCAAGGCACAATATAGCATGTTTTTAGTTAGGCGATAAGCCTCCGACTAAGCGTGCTGTTGCTTAGAATCAATTTAGAATCAATGAATTTTAACTGAACCAGTATTTTGCTCGCTTATAGTTTTTCGTAATAACAAGCTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCATGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATACTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCGACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTAACAAGGACTAATTGTTGTATGGGCTTTATTGACCCGCAAACTTTAGATTAGCAAGCTCTAGTTTTAAAGTTATATGTTGAGTTTTTGCTTATATTTTGTTAGGGTTTGGCCGTTTGTGTCAAAAATAAGGTCGCCTGTACGATGAGTGATTTATCTGTGTCTTCTGAGTCTATTGCCTTGTCCACAAGAGCTCGGCCTATAAAAGCGTGGGCTATTAGTTTGGTGGGAGGCTTATTCTTTTTTTATGAATTTATTCAGATGAATATGTTTAACTCGCTGGCAGGAAGCTTAGCTGCTACGTTTCATTTATCGGCTTTTCAAATTGGTTTAGTCTCAGCATTTTATTTTTTGGCTGATTCGATATTGCTTTATCCTGCGGGTGTGTTAGTTGATCGGCTCTCCTCACGCCGTGTGATTATTTATGGTATGGTCATGTGTATTATTGGCACCTTATTGATTGCCAGTGCCAGTAGTTCTTGGTTTTTAGTGGTGGCGCGCTTTTTAGAAGGCATTTCGGCCGCTTTTTGCTTACTTAGCATCTTGCGATTGGCCTCTCAATGGCTGCCTGAAAACCGTATGGCAACCGCATCAGGTTTGATTGTTACGATTGGTATGTTGGGTGGCGCCGTTTCACAAACGCCTTTAACGATGATGATTGAACAGTGGGGGTGGCGTGAGGCGCTTTATGTGGTTGCATTGATCGGTGTGATCTTGCTTGTGGTTGTTGTTATTGTTGTTAAAGATGCGCCAACCGCTAAGCAGCATGCTAAGTTGCAAACGGCAGCAGATAAGGTTGGCTTTTGGCAAACACTGGTTATTTTGGTTAAAAACCCACAGAACTGGCTGATCGGTTTGTATATTGCTCTTATGAACTTGCCAATTATGTTGCTGGGTGGCTTATTTGGTTCTCACTTTATGCAACAAGGTCATGGCTTTTCGGCCACTGAGGCGGCAACCATCAATATGATGATTTTTATTGGCACGATTGTTGGTTCAACGGTAGTTGGCTTTGTGTCTGATTTTTTAAAGCAGCGGCGTTTGCCGATGATTGTAGCCGCAGTGGTTTCATTGGTTATTTTCCTGATTATTCTTTATGCGCATGGTTTAACTTATGCAGATTATATCAGTTTATTTTTCTTGCTTGGCTTTTTTACTGCCGCCCAAATTTTGGGTTATCCAGCTGCACAAGCCTCAAATCCGGCGAAGATTGTTGGCTCAGCACTTGGCTTTGTTTCGGTGATTATCATGACTGCACCGACTTTGCTACAGCCTTTAACCGGTTGGTTGATGGGACTAGCGGGAGGACATCTGATAAATGGAGTGATGCAATACTCATTAATTAGCTATCAATATGCATTACAAATTCTTGTTATAGGCTTTGTGATTAGTATTTTTTGTGCTTATAAATTACCTGAAACGTATAAAAAATAATTGATTTATTGCGCGAAGGTATGGCTTGAGTGATTGTTAGGCGATGTTATTCGTTCATGCCTCTCCGTTTCTTAATAAAAACTTTGATGCTTCTTTCATTTGTTGTCTTTCGGCTGTGTGTTCGAAGAAAAACCAATTGCCTGTTTTGTGTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038881|1120350:1247699|DBSCAN-SWA
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MFIGIALVIFAYLLGSISTGIVTCKLMGLPDPRTDGSGNPGATNVLRVGGKKAAIITLVGDALKGIIPVALAHALNQHTLLGHTLQLTEAGLGIIAFAAFFGHLYPIFFKFQGGKGVATGFGAVIALSWPLGLTLLITWLIMAFLFRISSLAALTASVLAPLYSYWLGTEGYIMPLIIMAIFTLYRHKANIVRLIHGAEPKIGQKNSAP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210459.1|1122433_1122952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210458.1|1126026_1126575_-	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210461.1|1126655_1126931_-	oxidative damage protection protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126596.1|1126930_1127983_-	A/G-specific adenine glycosylase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209878.1|1162444_1163383_+	signal peptide peptidase SppA	A0A2I6UGK8	Salinibacter_virus	1.9e-14	29.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038881|1290419:1418685|DBSCAN-SWA
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MVRKNQRLSVYGLGLAIGIVCGVTLVILAWLAAAYGYAGPVVIYLGYANFL
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MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209440.1|1293066_1294077_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.5e-06	29.9
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WP_016209407.1|1294930_1295362_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
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WP_032126507.1|1298581_1299511_+	tol-pal system protein YbgF	NA	NA	NA	NA
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WP_016210518.1|1325431_1327471_+	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	3.0e-126	40.8
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1356104:1356163	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_080664856.1|1381405_1382470_+	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126667.1|1404234_1405044_+	DUF1338 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923762.1|1405171_1405405_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210769.1|1405705_1407208_-	sugar porter family MFS transporter	O13311	Aichi_virus	2.2e-33	28.1
WP_016210773.1|1407511_1410205_+	DNA repair family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210771.1|1410201_1413603_+	AAA family ATPase	S5M596	Bacillus_phage	2.2e-09	23.1
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WP_075274882.1|1415310_1415907_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP038881|1421747:1522198|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_098082828.1|1422754_1423012_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1423509_1424346_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
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WP_075274880.1|1425625_1426591_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212058.1|1426746_1428297_+	dolichyl-phosphate-mannose-mannosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_081377873.1|1428939_1429776_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	4.6e-41	35.9
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WP_016209460.1|1435026_1436109_+	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	1.0e-72	42.1
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WP_016209475.1|1440103_1441525_+	replicative DNA helicase	A0A077SK18	Escherichia_phage	1.7e-152	62.1
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WP_016209456.1|1442679_1443411_-	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase family protein	M1IDP9	Pelagibacter_phage	5.3e-09	35.8
WP_016209472.1|1443524_1444895_+	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
WP_032126730.1|1444997_1445486_+	glycine zipper 2TM domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209463.1|1445840_1446224_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209490.1|1446650_1446974_+	YqcC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556645.1|1447064_1449014_-	DEAD/DEAH box helicase	NA	NA	NA	NA
WP_016209478.1|1449105_1450059_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209459.1|1450222_1451389_-	rasGEF domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273528.1|1451648_1452614_-	glycosyl hydrolase family 17	NA	NA	NA	NA
WP_016209455.1|1452794_1453841_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209471.1|1458684_1459011_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664819.1|1459157_1460195_-	folate-binding protein YgfZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209486.1|1460236_1460488_+	succinate dehydrogenase assembly factor 2	NA	NA	NA	NA
WP_129556541.1|1460612_1460927_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209457.1|1462652_1463234_+	RNA polymerase sigma factor RpoE	NA	NA	NA	NA
WP_016209482.1|1463533_1465336_+	elongation factor 4	A0A2K9L2P9	Tupanvirus	5.1e-21	39.2
WP_129556644.1|1465386_1466274_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209466.1|1466679_1467354_+	ribonuclease III	E5EQH1	Micromonas_sp._RCC1109_virus	8.9e-27	34.5
WP_016209492.1|1467359_1468259_+	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_016209497.1|1468272_1469016_+	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
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WP_016209473.1|1469746_1470130_+	holo-ACP synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016212202.1|1471091_1472339_-	glutaminase	NA	NA	NA	NA
WP_075274878.1|1472750_1473626_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211947.1|1474028_1475174_-	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556540.1|1475166_1475562_-	ArsC family reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211946.1|1475780_1476536_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273371.1|1478892_1479468_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212551.1|1479809_1480304_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211213.1|1490111_1490318_+	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
WP_016211210.1|1490324_1491806_+	thiamine phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211214.1|1491908_1492472_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1493193:1493252	attL	NA	NA	NA	NA
WP_016211942.1|1494234_1495494_+	DUF4804 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211940.1|1495614_1495947_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211343.1|1497548_1498571_+	YHYH protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211342.1|1498578_1500261_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.1e-32	33.5
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WP_016211347.1|1501453_1502437_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	2.1e-53	38.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211749.1|1572753_1573947_+	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_016211748.1|1574026_1575631_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211752.1|1575646_1576792_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
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WP_016211456.1|1586663_1587242_+	nucleoside deaminase	A0A0B5J096	Pandoravirus	2.2e-13	36.3
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WP_129556641.1|1596899_1598162_+	cation:dicarboxylase symporter family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016211836.1|1610384_1610873_+	protein kinase	A0A285PXS3	Cedratvirus	5.3e-05	32.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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MKRSKLTESQIVAMLNEGQAGVKVEDICRQYGIAKSSYYKLRSKYQGMGVSDLQRLKELEDENRRLKQMYADISLEHKVLKDIVEKKL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126446.1|1663020_1663575_+	hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SEQ1	Hokovirus	3.2e-06	25.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038881|1697065:1735907|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300271.1|1700975_1701950_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273327.1|1702640_1703216_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1703161_1703527_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274858.1|1703663_1704749_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274857.1|1706328_1707204_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126678.1|1707214_1708225_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
WP_016211554.1|1708551_1709178_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_016211557.1|1709223_1710453_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_032126677.1|1710647_1711211_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211555.1|1711285_1712644_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211664.1|1713180_1713909_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|1714281_1717101_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211669.1|1717255_1717606_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556522.1|1720714_1721947_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211405.1|1722153_1723926_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_016211403.1|1724061_1725105_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_016211399.1|1725118_1725862_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211398.1|1726008_1726296_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211732.1|1726900_1727599_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211734.1|1728020_1728290_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211731.1|1728305_1729412_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1729467_1730292_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
WP_075274856.1|1732047_1733073_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046730.1|1733291_1733432_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212266.1|1733699_1734347_-	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_016212267.1|1734627_1734987_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|1735153_1735609_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

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MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI
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MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556520.1|1747731_1748628_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.8e-54	45.1
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WP_075273327.1|1748899_1749475_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|1749550_1749844_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
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WP_016211631.1|1751366_1752173_-	DUF2807 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_081377868.1|1754835_1755492_+|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210103.1|1755567_1756926_-	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
WP_016210117.1|1757207_1757567_-	aspartate 1-decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210111.1|1757987_1759622_+	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	9.7e-144	49.9
WP_017377579.1|1759628_1760465_+	3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase	E3T537	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.7e-51	41.3
WP_016210099.1|1760486_1761764_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.5e-139	60.9
WP_016210105.1|1761847_1762168_+	cell division protein FtsB	NA	NA	NA	NA
WP_016210106.1|1762187_1763279_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA
WP_016210102.1|1763461_1765051_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210110.1|1765111_1765867_+	5'/3'-nucleotidase SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-65	52.0
WP_016210113.1|1766054_1767104_+	RNA polymerase sigma factor RpoS	M4SMP8	Cyanophage	7.9e-30	31.5
WP_016210101.1|1767526_1769023_+	flagellin domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210107.1|1769312_1769585_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210114.1|1769656_1770916_-	calcineurin-like phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210108.1|1771008_1772274_-	sodium:proton antiporter	A0A2H4J178	uncultured_Caudovirales_phage	9.1e-49	42.8
WP_122943012.1|1772459_1772915_+	DUF4442 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210112.1|1773031_1774459_+	YdiU family protein	A0A075BSJ0	Microcystis_phage	2.5e-55	35.0
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WP_081007034.1|1789240_1789525_-|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126538.1|1789789_1791208_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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1816584:1816643	attL	NA	NA	NA	NA
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1851068:1851148	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038881|1872918:1932028|DBSCAN-SWA
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MLQVYNSLTRKKEEFKTIVAGKVGMYVCGMTVYDYCHVGHARTFLAFDVITRYLRAKGYKLTYVRNITDVDDKIIKRANENGENAIALADRFVTAMQEDFACLGMLAPDQEPRATQTITQMQVLISELINKDMAYVADNGDVYYRVEKFAEYGKLSNQSIEDLRCGARVEMGEIKENPLDFVLWKAAKPDEPFWESPWGRGRPGWHIECSAMSREALGLNFDIHGGGGDLSFPHHENEIAQSEVANNQPYANYWLHTGMLQINKEKMSKSLGNFFTIRDVLKEIDAETLRYFLISSHYRSVLNYSKETVMGARSALTRIYTALKGIPENNPALAGTSFEARFYQAMDDDFNVPEALAVLFELVREINRLREESLEKAAPYAGLLKQLAGVLGIAQSQPEAFLQGGQYGSEFDTTEIEALIVQRNQARDERNWLEADRVRDELLEQGIILEDNAAGTSWKRK
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MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI
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MLATYLKDEHKLSLVVACNLVTLPRASYYRKKQHQSDNAEIISELKTLASKHKRWGCDKMVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG
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MCKIPTEVATLTPGAVRLVLIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLKMNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFTFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKRLRSKLKKISEWMKKNRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFFF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211805.1|1874310_1875849_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211806.1|1875891_1876617_+	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1877406_1877679_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1877690_1878527_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_129556510.1|1879050_1880154_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	7.3e-10	24.8
WP_054300405.1|1880255_1880756_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|1881277_1881940_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_016209946.1|1881966_1883196_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1883352_1886124_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_016209937.1|1886199_1886643_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1886795_1888268_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_016209926.1|1888379_1889441_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209945.1|1889437_1890472_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1890474_1891515_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209936.1|1891697_1892813_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-93	48.6
WP_016209930.1|1892851_1893205_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_032126634.1|1893225_1895094_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1895115_1896060_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1896293_1896572_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1896781_1897420_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1897394_1898822_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1899022_1899700_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1899834_1901109_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1901176_1901932_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1901983_1902901_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209929.1|1903009_1903903_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274822.1|1905361_1906336_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_016211771.1|1906628_1906817_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1906830_1907964_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274823.1|1908163_1912174_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211823.1|1912208_1912397_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211827.1|1912437_1913058_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376688.1|1913389_1913743_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107517381.1|1913956_1914151_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007041.1|1914816_1915344_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300399.1|1915787_1916054_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210885.1|1916395_1917277_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210892.1|1917334_1917931_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210891.1|1917963_1918737_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126206.1|1919270_1919567_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210888.1|1919589_1919841_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155053505.1|1919786_1920509_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210886.1|1920577_1921357_-	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
WP_016210887.1|1921439_1922390_+	23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD	NA	NA	NA	NA
WP_016210889.1|1922899_1925746_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556636.1|1925763_1926072_-	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212002.1|1927025_1927304_-	DNA-J related family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212000.1|1927423_1928152_+	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_016211998.1|1928282_1928846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211999.1|1928835_1929189_-	ras family protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1929568_1930405_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|1930416_1930689_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274825.1|1930966_1932028_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038881|1968842:2055265|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038881|2069436:2108329|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210925.1|2074881_2075568_+	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.7e-29	36.5
WP_016210921.1|2075659_2076244_+	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

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MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211286.1|2146198_2146546_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|2146657_2146930_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|2148258_2149068_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|2149618_2150440_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|2150640_2151873_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_081377862.1|2152359_2153196_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2153207_2153480_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046719.1|2153498_2153657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|2155875_2156691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211525.1|2158990_2161726_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275102.1|2162314_2162773_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377901.1|2162953_2163664_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126856.1|2163724_2164066_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|2164370_2165524_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126329.1|2236928_2237558_-	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_129556496.1|2237743_2238982_+	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556495.1|2241263_2241521_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|2242501_2242795_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_032126540.1|2243025_2243889_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2244022_2244388_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2244333_2244909_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126332.1|2245555_2246755_-	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|2247007_2247295_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126331.1|2247350_2249360_-	TRAP transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126330.1|2249414_2250374_-	TAXI family TRAP transporter solute-binding subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211367.1|2250521_2251304_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664860.1|2251459_2251897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2251860_2252436_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038881|2268563:2368119|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038881|2383957:2445821|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MEKVTIKQALKIFALTQGCYTAQEIKTTYKRLTLKYHPDRGGEKEVMQAILKAWEILKELQEVNIDDFFGKAELCDDYNDDAMIEKIRAAIVPLKDIKTPDVEVCGIWLYLHTDLRGEEMKKIRESLKEFGWAWGNKKKCWYYNPEPSRVKRSARRTGWGLDKIRGTYGSSKYKGNAGPNHRIGG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036781387.1|2403583_2403856_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212424.1|2403848_2404127_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126152.1|2404329_2404920_+|integrase	site-specific integrase	A0A1B0V4T7	Roseobacter_phage	1.1e-15	32.7
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2422356:2423459	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016209654.1|2429368_2430511_+	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209656.1|2430629_2432333_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209642.1|2432329_2434450_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209652.1|2434446_2435796_+	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|2435767_2437915_-	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209657.1|2438342_2438738_+	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|2438746_2439631_-	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_032126162.1|2439662_2441540_-	SurA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209655.1|2441643_2441916_-	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126161.1|2442019_2444452_-	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209663.1|2444519_2445821_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038881|2458787:2512400|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MKGTIKFFDRKQQYGFIVCDDMNQDIYFKMEDILNVRLIKPGIDVAFDYESLEGDRFRAYDIHPISEEVLAKAVTTNVVGEGVSVQQCVAMAVTSALITFVVGLVVGFAAHQLI
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MIKVLIVDDHELIRVGIKRLLSDVQGIEVIGEAESGEEALQFIRQSRPDVVLMDVNMPGMGGLEATRRLLRIDQDIQVLAVTVYGGEPYPSRVLQAGAAGYITKGTNIDEMVRAIRKVHVGQRYISPDVAQQLALKHLTDDDTPFDQLSEREMQVMIMITSGQKVQEISDQLCLSPKTVNSYRYRLFEKLNVNSDVELTHLAIRHGMLDPSVPV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556476.1|2459857_2460868_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|2461412_2461988_-	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211685.1|2462011_2463817_-	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
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WP_033923708.1|2464747_2465623_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126460.1|2477797_2478235_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210301.1|2478411_2479239_-	bifunctional hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_075273633.1|2479288_2479915_-	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210294.1|2480052_2480397_-	cold shock domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307327.1|2480714_2481746_-	RNA polymerase sigma factor RpoS	F4YCU2	Synechococcus_phage	4.7e-35	35.2
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WP_016210745.1|2494463_2495084_-	DUF2272 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275065.1|2499032_2499707_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.9e-10	31.0
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WP_016211819.1|2504403_2504634_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038881|2564408:2665037|DBSCAN-SWA
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MKIYKGTEHAALTRCYGFDNRLYLTVSIMVPFEISHRQLLHEKIIWKDCLEQLRDFEHLDPYGIAKKNTDILVQGAAYAQESTEQTTVKLHFESIEKTLLVSGDRYWQESTIGSQASEAQKFQRLEVNYRNAFGGEKFSLNPLGKGVAPQKELWHLPNIEYLHDRQLQPSQSVSPASFGPIGALWQPRLDYAGTYNQEWLELHWPYFPADINWQYFNIAPVDQQLPFMLIGNEHFYLQNMNAKYPRLEGQLPGMRVRCFVESLENKDKTYAETPMQLDTCWLFPDLLTGVMVFHGQVAVIDEDASNISFLQIESEFLNNPLDIQDYKKKSTDRVKNPEKYLPKSAHDDFDDFKELESELESLFTKNRKKMDLAKQEYDKTMVDAKKKVVKMHQEIVDHQDLDYIKKMHVLNQPKATGMDMPMFKGDMPTPKGMEQWRGMQLDDFSQHMHESTAKMYEMMGKMNQSVKSLDVNDPTSYDQYKQLMEQYQENMQVLLKSMQKVPG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209922.1|2603317_2603734_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|2603793_2604291_+|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209901.1|2607320_2607653_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209923.1|2607770_2608289_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080743011.1|2617136_2617592_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126181.1|2618704_2619325_-	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
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WP_016210413.1|2622672_2622915_-	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
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WP_016210406.1|2623768_2624713_-	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|2624766_2625717_-	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|2625723_2626773_-	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|2626831_2627005_-	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|2627022_2627553_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|2627794_2628436_+	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|2628599_2630429_-	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|2630596_2631469_+	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273445.1|2633946_2634204_+	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|2634289_2634973_-	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_016209508.1|2635023_2635914_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|2635975_2636734_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|2636736_2638005_-	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|2638079_2638331_-	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|2638364_2638712_-	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|2638715_2639369_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|2639391_2639856_-	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_098082797.1|2639852_2640620_-	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209539.1|2640623_2641424_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_016209498.1|2641563_2642544_+	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209499.1|2642549_2643107_+	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_129556465.1|2643093_2643666_+	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|2643662_2644394_+	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_016209519.1|2644549_2645941_+	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|2645965_2646277_+	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|2646633_2647488_+	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209502.1|2647488_2648091_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|2648166_2649006_-	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209530.1|2649186_2649831_+	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209534.1|2649847_2650234_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|2650453_2651386_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209515.1|2651490_2652006_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|2652048_2653005_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|2652986_2654675_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|2654671_2655070_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
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WP_129556464.1|2656547_2657039_-	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209516.1|2657028_2658498_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|2658502_2659195_-	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|2659172_2660201_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126188.1|2660194_2661421_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209501.1|2661426_2662938_-	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209510.1|2663199_2663637_+	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209523.1|2663687_2665037_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038881|2685358:2717153|DBSCAN-SWA
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MSGHTLAEHIQALKSKTISSLELTQSYIDQIKATDQTLNNFITLTEDHALQAAKQADEKLAKSSDLSPLTGVPIAYKDIFCTDGIKTSCGSKMLDNFIAPYDATVVTQLKNAGTVMLGKTNMDEFAMGSSNETSFYGTSKNPWDINKVPGGSSGGSASAVAARQTPAALGTDTGGSIRQPASLCGITGLKPTYGRISRFGMVAYASSLDQAGPMTHTAEDAAIMLNAMAGFDPKDSTSVDHPVEDYTKNLNQSLEGIRIGLPKEYFSDGLDSQVEKQIQLAIAEYEKLGAKICEVSLPTTQFAVPAYYVIAPAECSSNLARMDGVRFGHRAEHPADLIDLYKRSRAEGFSDEVKRRIMVGTYALSAGYYDAYYNKAQQVRQLISDDFKRVFNEVDIIAGPTAPTTAFDFGSKKDPVTMYLSDIYTIAVNLAGLPGLSHPAGFVNQLPVGLQLIGNHFDESRLLNLAHRYQQVTDHHTAMPTAF
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MNEPEGGIISFMEVIKSGHSVYRLQYHIVWVCKYRGRVLNSGVCEYLKKVLGKLLRSMPGVEIETIDFDGDHLHMAG
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MYDYHIHLYYDMSTRSVAKLLRNNLHTMLEGVAKVSLLHDKPPYPHPQPMFEIAFPKDLLPKLTQWFKAHRNGLSVLLHPVQNSETDAYHSKGRWMGQPLISG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_105962625.1|2686200_2687087_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_129556461.1|2689097_2689388_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007010.1|2689437_2690058_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|2690898_2691579_-	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210535.1|2691575_2692388_-	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|2692461_2696142_-	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210531.1|2696151_2697639_-	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|2697648_2698266_-	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|2698335_2698854_-	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|2698850_2699750_-	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|2699765_2700809_-	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|2700998_2701286_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|2701397_2702849_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|2702890_2704327_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|2704621_2704786_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275038.1|2704923_2705514_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2705459_2705825_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|2705851_2706073_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212072.1|2706159_2706357_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_052047032.1|2706386_2706620_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|2706832_2707030_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126197.1|2707143_2708097_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2708237_2709212_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300148.1|2709322_2710384_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|2710405_2711152_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|2711281_2711593_+	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211487.1|2711940_2712264_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211494.1|2712288_2712744_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|2712733_2713786_-	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_016211493.1|2713788_2715252_-	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|2715534_2715831_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275036.1|2716091_2717153_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038881|2728190:2778470|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP038881|2906217:2949615|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP038881|2981300:3098565|DBSCAN-SWA
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MNQATEEGWWRFIDLCAGLEKDQLSQVLKIFLTAAEVDDVSMRTLLVGELLAGKKTQRQIAADLAISITKITRGSNELKRVDSHLRAMLEEALIQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274966.1|2985969_2987031_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|2987111_2987420_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|2987534_2988851_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_032126430.1|2992761_2993286_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|2993533_2994772_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|2995319_2995793_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|2995789_2996185_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2997635_2998001_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211610.1|2998265_3000596_+	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
WP_129556603.1|3000716_3002732_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155062497.1|3002915_3006146_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274968.1|3006685_3007786_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212051.1|3077186_3077960_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038881.1|WP_155049899.1|3075975_3076119_-|hypothetical-protein	3075975_3076119_-	47 aa aa	NA	NA	NA	2981300-3098565	yes
NZ_CP038881.1|WP_155046758.1|3076427_3076559_+|phosphatase	3076427_3076559_+	43 aa aa	NA	NA	NA	2981300-3098565	yes
NZ_CP038881.1|WP_155046759.1|3076703_3076859_+|hypothetical-protein	3076703_3076859_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2981300-3098565	yes
NZ_CP038881.1|WP_032126148.1|3078501_3078684_-|hypothetical-protein	3078501_3078684_-	60 aa aa	NA	NA	NA	2981300-3098565	yes

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_129556569.1|1047577_1047787_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_129556569.1|1047577_1047787_-|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1046676-1046639	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055546-1055509	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1087425-1087388	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055412-1055375	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1046676-1046639, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055546-1055509, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1087425-1087388, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055412-1055375, mismatch: 1

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cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212450.1|1054513_1055416_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212450.1|1054513_1055416_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1046676-1046639	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055546-1055509	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1087425-1087388	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055412-1055375	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1046676-1046639, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055546-1055509, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1087425-1087388, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055412-1055375, mismatch: 1

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cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016211536.1|1094369_1094603_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016211536.1|1094369_1094603_+|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1046676-1046639	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055546-1055509	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1087425-1087388	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055412-1055375	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1046676-1046639, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055546-1055509, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1087425-1087388, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055412-1055375, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212614.1|1098330_1098537_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212614.1|1098330_1098537_-|hypothetical-protein
MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1046676-1046639	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055546-1055509	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1087425-1087388	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055412-1055375	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1046676-1046639, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055546-1055509, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1087425-1087388, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1055412-1055375, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_033923740.1|1120004_1120292_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_033923740.1|1120004_1120292_+|hypothetical-protein
MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_098082828.1|1362596_1362854_+|transposase

>NZ_CP038881.1|WP_098082828.1|1362596_1362854_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1358594-1358631	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1358594-1358631, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155049900.1|1783281_1783587_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_155049900.1|1783281_1783587_-|hypothetical-protein
MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016211563.1|1783935_1784097_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016211563.1|1783935_1784097_-|hypothetical-protein
MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212013.1|1802882_1803266_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212013.1|1802882_1803266_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_129556517.1|1798671_1798959_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_129556517.1|1798671_1798959_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155046727.1|1816243_1816588_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_155046727.1|1816243_1816588_+|hypothetical-protein
MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212558.1|1817139_1817436_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212558.1|1817139_1817436_+|hypothetical-protein
MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCNKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_129556515.1|1817413_1817773_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_129556515.1|1817413_1817773_-|hypothetical-protein
MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_075274844.1|1818920_1819172_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_075274844.1|1818920_1819172_-|hypothetical-protein
MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1748563-1748526	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 1748563-1748526, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_081377858.1|2000050_2000761_+|transposase

>NZ_CP038881.1|WP_081377858.1|2000050_2000761_+|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2017768-2017805	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2021274-2021311	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2017768-2017805, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2021274-2021311, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_054300380.1|2017843_2018500_-|transposase

>NZ_CP038881.1|WP_054300380.1|2017843_2018500_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2017768-2017805	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2021274-2021311	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2017768-2017805, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2021274-2021311, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212421.1|2021739_2021922_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212421.1|2021739_2021922_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2017768-2017805	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2021274-2021311	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2017768-2017805, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2021274-2021311, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_032127044.1|2033646_2033847_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_032127044.1|2033646_2033847_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2017768-2017805	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2021274-2021311	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2017768-2017805, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2021274-2021311, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212482.1|2034061_2034205_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212482.1|2034061_2034205_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2017768-2017805	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2021274-2021311	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2017768-2017805, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2021274-2021311, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016210918.1|2068296_2069046_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016210918.1|2068296_2069046_+|hypothetical-protein
MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_032126179.1|2202653_2202905_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038881.1|WP_032126179.1|2202653_2202905_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212461.1|2367165_2367540_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212461.1|2367165_2367540_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2281535-2281498	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2285831-2285868	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2312429-2312466	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2313546-2313583	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2281535-2281498, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2285831-2285868, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2312429-2312466, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2313546-2313583, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016211512.1|2418244_2419051_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016211512.1|2418244_2419051_+|hypothetical-protein
MPTTSKLKAYLNEPNSTNKKHALEEMFPLLNEAYENVKKQRPNKPFGADEIWPEIQIIFSAHYGELSSQLSILQYFNLYTLFDDLTESSCDKIQHISHGEFCQPVVQVINLTTPYLSTKAIPQFIENSNQCIDEFTKWGVTHDNDEITRAAHVLATKLAGCRDEFIQRIIQNKETNQGYKITDDVPNYRRKIREIIESSTETKLLSSQQDWQGIIGNVLIGLTGIGLVALAVKAAHSQATTGQASLFFDTNAAQKAEQLGEDLLLMER

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2385107-2385070	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2421886-2421849	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2412083-2412120	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2385107-2385070, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2421886-2421849, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2412083-2412120, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_051307360.1|2420142_2421072_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_051307360.1|2420142_2421072_+|hypothetical-protein
MTLEQWWNSRTPAEKSIVAAIIAGFNLQIIEKNILAAQKAIFLDYLREQLANYNIEVPDLDEEEAEEAADKIQKLLEEEELNLQLEKKPKQSLPAEGFSFSDLEPKTLTAMSREEFHQLLLSPRQIGIIVTVGEILKKEDGFNIFDYQVNNGPKLDAQLTQIAPGTPTPDTPIKIQAQFHCPLRQSIPLEEQEEEKNKQATTLAQLVESVCTMNQAKRCPVRLNVQAEEHEVSPLAQAFICALQQRVLLKQLQHLSFNNQVFDYSHLLPNTTPFQTQQQGAEGYTSSEPELKQEPDQEPEQEQEQKLAL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2385107-2385070	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2421886-2421849	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2412083-2412120	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2385107-2385070, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2421886-2421849, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2412083-2412120, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016209640.1|2457349_2458369_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016209640.1|2457349_2458369_+|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016210742.1|2495249_2495525_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016210742.1|2495249_2495525_-|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2507511-2507548	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2509663-2509700	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2507511-2507548, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2509663-2509700, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212416.1|2510056_2510587_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212416.1|2510056_2510587_-|hypothetical-protein
MSTEPSIDDKNKIESLTKDFCSALVISPNLIKGLTKGKYYKIVEALDVAVEELKVLAEQPLLDLYKSHYLKKHSVTSLDVKFAQIDSVFSSQVKWGLAIKKDSEQKRQAEKIGQELKALSTAIVRSFEENSTAFYRKYRWAEITKLKLSEKYIDKVVANPGQFRENYCRLEELGPH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2507511-2507548	0
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2509663-2509700	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2507511-2507548, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2509663-2509700, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_032126150.1|2760911_2761145_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_032126150.1|2760911_2761145_+|hypothetical-protein
MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2730400-2730363	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2730400-2730363, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212022.1|2771755_2771974_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212022.1|2771755_2771974_+|hypothetical-protein
MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2730400-2730363	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016212024.1|2772569_2772818_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016212024.1|2772569_2772818_+|hypothetical-protein
MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2730400-2730363	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155047000.1|2983417_2983564_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_155047000.1|2983417_2983564_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT

Self-targetings in the prophage

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NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155047001.1|2983768_2983954_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_155047001.1|2983768_2983954_-|hypothetical-protein
MILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

Self-targetings in the prophage

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NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_016211201.1|2987111_2987420_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_016211201.1|2987111_2987420_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155049899.1|3075975_3076119_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_155049899.1|3075975_3076119_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGFSRQELRNFLPICELSFSHNTSTSGS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155046758.1|3076427_3076559_+|phosphatase

>NZ_CP038881.1|WP_155046758.1|3076427_3076559_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_155046759.1|3076703_3076859_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_155046759.1|3076703_3076859_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2998027-2998064, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038881.1|WP_032126148.1|3078501_3078684_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038881.1|WP_032126148.1|3078501_3078684_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2998027-2998064	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038881 position: 2998027-2998064, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP038883

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4824 : 28863	33	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	37206 : 57887	29	Pseudomonas_phage(11.76%)	portal,protease,capsid,terminase,tail,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038883|4824:28863|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|6750_7903_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212392.1|7931_8939_-	hypothetical protein	W6E8G0	Rhizobium_phage	1.2e-06	26.4
WP_075273802.1|9002_9731_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
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WP_016212135.1|10700_11885_+	3-methylitaconate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_075275202.1|12128_12830_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.0e-10	31.2
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WP_016212164.1|13689_14718_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211443.1|15741_16428_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211439.1|16431_16986_+	recombinase family protein	M9Q1K0	Clostridium_phage	1.0e-20	40.6
WP_016211436.1|17030_17969_+	fic/DOC family protein	S4TP71	Salmonella_phage	5.2e-25	37.2
WP_016211434.1|17941_18133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211437.1|18677_19304_-	zinc-ribbon domain-containing protein	A0A1S5XYQ1	Kurlavirus	4.4e-12	28.2
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WP_016211440.1|19713_20628_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211444.1|20897_21404_+	antirestriction protein ArdA	A0A222YZE5	Mycobacterium_phage	2.8e-17	33.7
WP_051307358.1|21552_21936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104629.1|27271_28297_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275198.1|28323_28863_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.4e-12	40.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038883|37206:57887|DBSCAN-SWA
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MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV
>NZ_CP038883|37206:57887|52034_52706_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP038883|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA
MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD
>NZ_CP038883|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP038883|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038883|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP038883|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA
MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP038883|37206:57887|38065_38359_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA
MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS
>NZ_CP038883|37206:57887|54599_57887_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA
MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP038883|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP038883|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA
MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038883|37206:57887|40749_40959_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA
MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG
>NZ_CP038883|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP038883|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP038883|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA
MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI
>NZ_CP038883|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA
MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL
>NZ_CP038883|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA
MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN
>NZ_CP038883|37206:57887|53974_54262_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA
MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL
>NZ_CP038883|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA
MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|37206_37887_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|38065_38359_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|38576_38759_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|38903_39083_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016212235.1|39129_39495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|39795_40179_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|40266_40746_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|40749_40959_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_080743047.1|40974_41331_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	5.4e-23	61.3
WP_081377926.1|41349_42432_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|42428_43670_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_080664855.1|43617_44289_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_016211140.1|44346_45540_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|45660_46995_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|47185_47497_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|47493_47817_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|47809_48205_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|48201_48552_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|48551_48974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|48975_49299_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|49355_49622_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|49625_51704_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|51696_52038_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|52034_52706_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|52674_53421_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|53410_53968_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|53974_54262_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|54251_54506_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|54599_57887_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038883.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein	5761_6361_-	199 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038883.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein	6360_6621_-	86 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038883.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein	9914_10262_+	115 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038883.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein	23884_24064_+	59 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038883.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein	24063_24492_+	142 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038883.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein	24659_25199_-	179 aa aa	NA	NA	NA	4824-28863	yes

Protein sequences of NZ_CP038883.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038883.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038883 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038883.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038883.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein
MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038883 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038883.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038883.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038883 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038883.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038883.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038883 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038883.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038883.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein
MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038883 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038883.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038883.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein
MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038881_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038881|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038883 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. NZ_CP038884

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	14422 : 22145	10	unidentified_phage(33.33%)	integrase,transposase	attL 8028:8087|attR 21467:21658

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038884|14422:22145|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038884|14422:22145|15469_15934_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA
MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA
>NZ_CP038884|14422:22145|15115_15397_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038884|14422:22145|17588_17765_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG
>NZ_CP038884|14422:22145|15944_16139_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA
MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE
>NZ_CP038884|14422:22145|17008_17377_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA
MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038884|14422:22145|14422_15094_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG
>NZ_CP038884|14422:22145|19314_21387_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA
MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV
>NZ_CP038884|14422:22145|17983_18985_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038884|14422:22145|16354_16945_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI
>NZ_CP038884|14422:22145|21416_22145_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
8028:8087	attL	NA	NA	NA	NA
WP_129556741.1|14422_15094_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.4e-10	30.4
WP_052133268.1|15115_15397_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-11	38.7
WP_016212274.1|15469_15934_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|15944_16139_-	addiction module toxin, HicA family	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|16354_16945_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_129556740.1|17008_17377_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046774.1|17588_17765_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300579.1|17983_18985_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.0
WP_016211990.1|19314_21387_+	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556739.1|21416_22145_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
21467:21658	attR	NA	NA	NA	NA