CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038891	Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 chromosome, complete genome	2 crisprs	RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3	1	1	32	19
NZ_CP038892	Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	4

1. NZ_CP038891

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038891_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038891_1
• CRISPR_location: 363251-363380
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038891_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038891_1

>1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038891_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038891_1

>merge|NZ_CP038891|1|363251-363380|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038891|1|1|363251-363380|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038891.1|WP_016211271.1|369575_370520_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038891.1|WP_016212010.1|364952_365249_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_075273619.1|366790_367366_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016212359.1|353753_353972_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016211795.1|357953_358148_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016212007.1|365372_366518_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016212044.1|355852_356107_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038891.1|WP_016211269.1|370824_371610_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP038891.1|WP_036794771.1|356829_357816_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038891.1|WP_016211273.1|367423_368257_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038891.1|WP_129556444.1|359470_359893_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_080664870.1|358830_359478_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038891.1|WP_075273359.1|361508_362084_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038891.1|WP_016212008.1|364237_364936_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_054300271.1|354339_355314_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038891.1|WP_016211797.1|360054_361458_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038891.1|WP_032126227.1|363909_364200_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016211272.1|371727_372096_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP038891.1|WP_054300520.1|362029_362344_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016211268.1|368372_369557_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038891.1|WP_075273359.1|361508_362084_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038891.1|WP_016211273.1|367423_368257_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP038891.1|WP_016211268.1|368372_369557_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038891.1|WP_016212044.1|355852_356107_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038891.1|WP_016211272.1|371727_372096_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038891.1|WP_016211797.1|360054_361458_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038891.1|WP_016211269.1|370824_371610_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038891.1|WP_036794771.1|356829_357816_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038891.1|WP_016211271.1|369575_370520_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038891.1|WP_054300271.1|354339_355314_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038891.1|WP_080664870.1|358830_359478_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06

Protein sequences

>NZ_CP038891.1|WP_054300520.1|362029_362344_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038891.1|WP_075273359.1|361508_362084_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038891.1|WP_016211797.1|360054_361458_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038891.1|WP_129556444.1|359470_359893_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038891.1|WP_080664870.1|358830_359478_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038891.1|WP_016211795.1|357953_358148_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038891.1|WP_036794771.1|356829_357816_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038891.1|WP_016212044.1|355852_356107_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038891.1|WP_054300271.1|354339_355314_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038891.1|WP_016212359.1|353753_353972_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038891.1|WP_032126227.1|363909_364200_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038891.1|WP_016212008.1|364237_364936_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038891.1|WP_016212010.1|364952_365249_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038891.1|WP_016212007.1|365372_366518_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038891.1|WP_075273619.1|366790_367366_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038891.1|WP_016211273.1|367423_368257_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038891.1|WP_016211268.1|368372_369557_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038891.1|WP_016211271.1|369575_370520_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038891.1|WP_016211269.1|370824_371610_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038891.1|WP_016211272.1|371727_372096_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038891_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038891_2
• CRISPR_location: 2649703-2649823
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038891_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038891_2

>2.1|2649740|47|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038891_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038891_2

>merge|NZ_CP038891|2|2649703-2649823|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038891|2|2|2649703-2649823|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038891.1|WP_081377344.1|2656936_2658064_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP038891.1|WP_129556590.1|2653058_2653454_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP038891.1|WP_016210943.1|2658933_2659620_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038891.1|WP_032126312.1|2653450_2654245_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038891.1|WP_016210671.1|2641934_2643194_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038891.1|WP_016210676.1|2643649_2645731_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038891.1|WP_098082812.1|2647189_2647705_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_075275117.1|2649123_2649546_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_081377880.1|2651721_2652201_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038891.1|WP_052047041.1|2647937_2648201_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_054300282.1|2651200_2651665_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038891.1|WP_016210935.1|2658394_2658937_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038891.1|WP_016210672.1|2639937_2641320_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038891.1|WP_016211756.1|2654423_2655149_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038891.1|WP_016211905.1|2648469_2648880_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038891.1|WP_016210677.1|2639330_2639945_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|180312
NZ_CP038891.1|WP_016210678.1|2646034_2647045_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP038891.1|WP_016211759.1|2655394_2656582_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038891.1|WP_016210942.1|2659623_2660235_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038891.1|WP_016210673.1|2641328_2641802_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038891.1|WP_081377344.1|2656936_2658064_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.01965e-11
NZ_CP038891.1|WP_129556590.1|2653058_2653454_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038891.1|WP_016210943.1|2658933_2659620_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038891.1|WP_016210671.1|2641934_2643194_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038891.1|WP_032126312.1|2653450_2654245_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038891.1|WP_016211756.1|2654423_2655149_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038891.1|WP_054300282.1|2651200_2651665_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038891.1|WP_016210935.1|2658394_2658937_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038891.1|WP_016210672.1|2639937_2641320_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038891.1|WP_016211759.1|2655394_2656582_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038891.1|WP_016210676.1|2643649_2645731_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038891.1|WP_016210677.1|2639330_2639945_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP038891.1|WP_016210678.1|2646034_2647045_+|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP038891.1|WP_016210942.1|2659623_2660235_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038891.1|WP_081377880.1|2651721_2652201_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	6.67359e-07

Protein sequences

>NZ_CP038891.1|WP_075275117.1|2649123_2649546_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038891.1|WP_016211905.1|2648469_2648880_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038891.1|WP_052047041.1|2647937_2648201_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038891.1|WP_098082812.1|2647189_2647705_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
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>NZ_CP038891.1|WP_016210676.1|2643649_2645731_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038891.1|WP_016210671.1|2641934_2643194_+|6-phosphofructokinase
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>NZ_CP038891.1|WP_016210673.1|2641328_2641802_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP038891.1|WP_016210672.1|2639937_2641320_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	23888-23925	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038897	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence	30307-30344	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	98297-98334	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	104921-104958	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	74736-74773	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	89480-89517	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	91559-91596	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	45769-45806	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	48741-48778	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	38038-38075	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	78262-78299	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	84886-84923	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	55526-55563	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	69445-69482	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	100110-100147	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	89408-89445	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033938	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence	7974-8011	0	1.0
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NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	1087-1124	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	3391-3428	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	24828-24865	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	29210-29247	0	1.0
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NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	20370-20407	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	167516-167553	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	4929-4966	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	144791-144828	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	158710-158747	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP033943	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence	75017-75054	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	85712-85749	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	75009-75046	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	103207-103244	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	92504-92541	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013774	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence	38441-38478	0	1.0
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP013774	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence	27738-27775	0	1.0
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NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038892	Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence	140900-140937	1	0.974
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NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	91919-91956	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	180456-180493	1	0.974
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NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	75595-75632	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	120527-120564	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	94958-94995	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	120528-120565	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	76554-76591	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974
NZ_CP038891_1	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	46	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	tail,tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 302003	48	Acinetobacter_phage(40.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	329578 : 375133	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447745 : 555814	107	Escherichia_phage(43.24%)	tRNA,transposase,integrase	attL 507616:507675|attR 540794:541174
DBSCAN-SWA_7	563513 : 614692	54	Synechococcus_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	635013 : 735642	105	Prochlorococcus_phage(17.65%)	tRNA,transposase,plate,protease	NA
DBSCAN-SWA_9	771060 : 817740	39	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	834427 : 888880	45	Staphylococcus_phage(15.38%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_11	895130 : 942674	49	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(16.67%)	integrase,transposase	attL 887490:887549|attR 904774:905213
DBSCAN-SWA_12	957103 : 1065229	114	uncultured_Mediterranean_phage(11.11%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1094686 : 1201200	94	uncultured_Mediterranean_phage(23.53%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1238014 : 1283106	35	Bacillus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1289862 : 1333539	46	Staphylococcus_phage(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1346065 : 1411189	58	Klosneuvirus(22.22%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_17	1441978 : 1487168	45	Tupanvirus(28.57%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1449774:1449833|attR 1497578:1497932
DBSCAN-SWA_18	1496294 : 1545779	51	Staphylococcus_phage(30.77%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_19	1564182 : 1749458	169	Staphylococcus_phage(12.12%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1754069 : 1821359	59	Bacillus_thuringiensis_phage(50.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1765586:1765645|attR 1810512:1811473
DBSCAN-SWA_21	1842448 : 2019836	168	Leptospira_phage(15.0%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 1962874:1962933|attR 1966576:1966814
DBSCAN-SWA_22	2052349 : 2104515	52	Orpheovirus(18.18%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_23	2112359 : 2157065	47	Staphylococcus_phage(22.22%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2178264 : 2228011	47	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_25	2234740 : 2280663	52	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2349866 : 2409477	57	Planktothrix_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	2447461 : 2511089	60	Staphylococcus_phage(37.5%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_28	2514724 : 2622560	102	Escherichia_phage(34.15%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 2597419:2597478|attR 2605660:2605947
DBSCAN-SWA_29	2651200 : 2685654	38	Microbacterium_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_30	2743350 : 2826669	82	unidentified_phage(21.43%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_31	2939230 : 2983576	43	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_32	3015260 : 3132687	112	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038891|45566:89679|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MKLNYQQLSDLSEYFTNINNDENIEYSVDSNPLGITKKNHELQFTMEESLSKDDLKEHWEKYCRKYNLSFDESLFIETPSSSPNQPEMKQQSFMEDNNIGEEKERNFQQENSFYTTHLTHRS
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211193.1|46651_47413_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211195.1|47714_49241_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49612_50452_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50491_51799_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51773_52943_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|52997_53723_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54001_54391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54550_55456_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274979.1|55722_56562_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377700.1|57346_57640_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.4e-06	36.5
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WP_016210702.1|61135_64198_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
WP_016210701.1|64194_65259_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016210703.1|65614_66568_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|67768_68368_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210697.1|68555_69056_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
WP_016210706.1|69073_70162_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211099.1|70588_71833_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211097.1|71829_72672_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211096.1|72651_73461_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73639_73867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74873_75425_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75551_75974_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_016211109.1|75966_76713_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211103.1|76755_77454_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|78618_78987_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274980.1|78981_80043_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126486.1|80092_80323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211248.1|80452_81667_-	aromatic amino acid transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|81967_83029_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211249.1|83042_84770_+	NAD-dependent malic enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016211245.1|84803_85535_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211247.1|85534_86323_+	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211251.1|86427_87051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211250.1|87370_87583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273383.1|87738_88311_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046699.1|88515_89088_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038891|136473:178470|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126550.1|139854_140862_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_016211636.1|140881_142402_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
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WP_016211018.1|143640_144957_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
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WP_016211019.1|145578_148644_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	5.1e-53	20.6
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WP_075273381.1|150508_151078_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_155047004.1|156452_156959_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|156973_157339_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210241.1|158396_159182_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210237.1|161815_162310_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_032126724.1|162401_162659_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|162748_163171_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210247.1|164249_164501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210231.1|165969_167412_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210228.1|168513_170706_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
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WP_016210226.1|171503_171935_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210245.1|171952_172783_-	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210225.1|174222_174501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|175471_176377_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212383.1|176779_177898_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273371.1|177894_178470_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038891|182276:239530|DBSCAN-SWA
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MFKIQVLHGPNLNLLGLREPDQYGLMNLTELDAELARRAGVAGVALESFQSNVEHELLGMIHQMAHKDHIVDFIIFNPAAFTHTSIALRDALTAVQIPFIEIHLSNVHAREKFRQHSYFSDIAQGVITGLGAHSYFCALEAAIAYCQQAKV
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MAWLELKVITTRQHAELIGDYLNEVGALAITLRDGKDQPILEPGVGETPLWQDVHVIALFDAGIELEPVREQLLVQFDELNDISVKIDPLEDQDWTATWREHFEPMLFADRLWVHADWHEVNARENQVKMLLNPGLAFGTGTHPTTAMCLNWLAGHLNPGSRVIDFGCGSGILAIAALKLGAHYVHCIDIDPQALEAMHYNAKQNELDPSCYQAVLPEQFTISDITSTGADVLVANILANPLIGLAPQFASLVKAGGMLVLSGILVEQAERVQTAYLDHFDLVELQQDDEWVCVIAQRKAY
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MAVIDFVKFLHAELSNLNEMIENDEEVEQSEFLVERLTDVEALYYDFVKSNKTIISSEKEAEETEEEASYYLFATWLYLEQQQRGKIPADEESFNFDNVQTVTEDDERIDNAFFIVGMFEQHLEDMEMLDDEPDLHIEEDDDDDEPRH
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MFSKAKAPLIISISCVIIYFAVLVIQIYSPATFEKNHTEVLIGCEKLGKQAKELCIERVDVMANQSKQATKIKD
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MHSFLISTLTVSTAELGDKTQLLTLLFAARFQKPLPIILAIFIATLLNHGITTWLGVFFSSFFSPIILHSLLMLSFIITAVWALIPDTLDESEPKKTKNKNIFWVVLITFFIAELGDKTQLITLTLSIQYQTIFWVTLGTTLGMMIANIPAVFLGKIWCKKLPLQQIRIASALLFIILASYEAYQLVQLFNS
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MIDMIRLLPSVVKLGLCLFALLICITQEIYAAKSAQNTTGIEQQELPPSADQGVVDTALNKVTPDQSSILESRLKKESAIANNSLGIIFYQPNYVLPYYYTGSPYQAIYNGQTPDNQKVMSSEFKAQLSLMVPLWKDMFGNPDYSLNVGYTQLSYWQFYAKSQYFRETNYEPELFVTDHFHRNWQISYGVVHQSNGRGGSLERSWNRAYLNLEASGEHWLASIKPWVLIFKPDSSDLHNPDIAHYLGHERIMFAYVFNNKMQASIALTNIESGMKRGAVELDYSFPLTKHINGFVQYFNGYGQSLIEYDHRTQSVGIGIALSHW
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MSDETEKTLRHHVEDAVAKFLADSEGCHLTNLYEVILKEVEIPLIETALAFTAGNQSETARMLGINRGTLRKKIRQYSIE
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075273327.1|182276_182852_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274985.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016210779.1|186290_187220_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210775.1|187512_188106_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047085.1|193964_195305_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|203823_205167_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|229340_230036_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|234173_234800_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038891|256927:302003|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210131.1|337393_338416_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038891|447745:555814|DBSCAN-SWA
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MRVMEVAAGYGYISEKVYPFSKRLTINDLDEKPLISFKSKFSDTSKLCIVSGNILDCSFEENSLDAIFCSRLIHFFNPDEVKVFFENCHKWLSQHGKLFLTCETPYLNNWKSFIPVFELKKNNGIKFPGYVTQISDYESLGHSENLPKYMNFFDDDVLETVVNQFNFKVDECFLFSRKGFLPDEITFDGRESVGLIAEKV
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMIIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSTVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDVSEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNRLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAGLAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTS
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MERYLFDLIDGFRAAGDTVDLYVYKRDKNLEIPEGLTVKQTKLGWLPRKLKKYVFTLLMKRVEWLEYDLSISLMASWGQDLMVCGGSHLAYLRDLNKKPGPWGWMRLYFEQRGFNEAKYIVAHSKRIAEDLLALYPLAVDKVKMLYPPIDAGRFNRLQYAQRKGLRITFGCTVGKVTLVIPSTGHKRKGTYELIEAMKLLPEEQFELLIAGDPIETVAGNIRSLGFVDDMPGLYTAADFMVLPSHSEPFGLVVPEALACGTPVIISNRVGAKELITDDLGVVIDEVTPTAIARAIQQAAQRKFNISNAFIHHYQLARQAHIEQLKCLL
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275004.1|447745_448609_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|448825_450385_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|450406_451441_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|451489_452059_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|452194_453166_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
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WP_129556624.1|454820_455807_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210649.1|458615_460604_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|460812_460968_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|461225_461525_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461683_462019_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|462935_464342_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|464359_465346_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465348_466503_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466499_467195_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467329_468820_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468840_469890_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469956_471351_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472229_474161_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|474165_474696_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|474730_474925_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|474967_475327_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475746_476742_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476754_479136_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|479141_479429_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|479700_480177_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|480321_480519_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|480643_481618_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|482518_482617_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210477.1|483101_484391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126626.1|484627_485320_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|485361_486135_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|486136_487078_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|487210_488788_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|488997_490755_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|491303_492062_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|492269_492842_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|492945_493494_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|493795_494041_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|494069_494366_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|494633_495557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556451.1|496035_496293_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275008.1|496356_497085_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.3e-43	41.8
WP_098082828.1|497399_497657_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275009.1|497788_498496_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.3e-44	45.8
WP_075275011.1|498539_499268_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.4
WP_032126799.1|499459_500272_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_129556452.1|501392_501740_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049103.1|501742_503059_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300501.1|503008_503737_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_032126794.1|503748_504141_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212477.1|504137_504383_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300307.1|505486_506215_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
WP_054300307.1|506821_507550_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
507616:507675	attL	NA	NA	NA	NA
WP_016212268.1|508194_508779_-	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_016212269.1|508782_509466_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|509748_510477_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_052104629.1|510813_511839_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212159.1|511982_512180_-	antirestriction family protein	A0A222Z017	Rhodococcus_phage	4.1e-09	55.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038891|563513:614692|DBSCAN-SWA
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSIAASHGVLSTG
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MPDILASVDARTQLVGHNRLEILLFHLDGQLFGINVFKIREVINVPPLTQLPNSHKAVIGATSIRGTTMPVIDLNKAVNDEYTYDLEDKVLIITEYNRSVQGLVVYKVDHIVNASWESIVPPPPATGRDHYITGIAKDLAQVDNRLVELLDVERVLGDIHDVRAKFNTDDLDDMIRKVAHKYTVLVADDSSVARRHVKQVLDQIGVNVIMTDDGQHALDILEHDIPRTAGDVSRKYLMLISDVEMPEMDGYSLIKNCREHPGLKNLFIMLNTSITSVFNESDSKEIGCNEFVGKIDPHKIYNVVKEQIQIRINKANKQ
>NZ_CP038891|563513:614692|564335_565001_-|WP_016211663.1|DBSCAN-SWA
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MRYLAFFLAVILLVSGCASTVPTVAPYSDYPHVYACPNKLSTLCYRTAIAQVGRRFQYSQLSFQLPIALQAPLRQGKLELQEYYVKSLVFPSSLPLSGLGLLTSYLYPFGLYATKIIRLENLTDQRLDIVNVHVVTRLQQSQSLLAVLNQMQAQPAHYFGNSATESVKLLASGTRSLMVSVGVGGQSEPVAIIYMLVDLKLYNGNQGYLLYSLARKSIGPTFVLNVEKKLFSENKNILKKVITSDFFL
>NZ_CP038891|563513:614692|598764_599052_-|WP_016210537.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MSISLTDVEKIAHLARLHLNKDDAERYQHDLSNILTLVEQLNTADTQGITPMAHPLDATQRLRSDNATESDQHEKFQAFAPQTEAGLYLVPKVIE
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MALKIFDECINCDVCEPECPNEAIYQGEDIYEIDPDKCTHCLGHFKTQQCVEVCPVDCIIIDPENPENEETLWARYHRLTENK
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MQTIPLVYLLRNQSIFDKLILTIGVIFISFSSVFVHIISAGPATIGVYRMAIGAVILLIVTLLRKERLFIVNRFTLSALLAGFFFCLDLVTWHQSILYVGPGLATILNSCQIFFLLLISFFLLKERVNKYQMIALAGILPGGLLLCLTDWLTLDPHYHWGVIIGLLSGLCYSGYIYALRYANSQDSINTESNIENNNKKPTNTLSILTTATVSATLFLTLIAIFTGESLALHPHANYAWVTLYALISQVIGWGLISYALPKINISVAAFILILQPTLSFIWDVLFFSRPTPWFQWLGVIIILGAVFLANYKKTSQLN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211663.1|564335_565001_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|565065_566022_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
WP_032126810.1|566280_566979_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211662.1|567021_568134_-	C1 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|568738_569314_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|569259_569625_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|569712_570063_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|570798_571860_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556458.1|572235_572469_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|573360_574176_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|574266_575250_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|575420_575942_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_016210914.1|575975_576227_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-20	58.8
WP_016210909.1|576232_577510_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155097710.1|578280_578730_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|578849_581162_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|581290_582106_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|582303_582768_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275036.1|582897_583959_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|584219_584516_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|584798_586262_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|586264_587317_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_016211494.1|587306_587762_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016211487.1|587786_588110_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|588457_588769_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|588898_589645_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|589666_590728_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|590838_591813_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_032126197.1|591953_592907_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|593020_593218_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047032.1|593430_593664_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212072.1|593693_593891_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|593977_594199_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|594225_594591_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275038.1|594536_595127_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|595264_595429_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|595723_597160_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|597201_598653_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|598764_599052_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
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WP_016210536.1|600300_601200_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|601196_601715_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|601784_602402_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_016210531.1|602411_603899_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|603908_607589_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210535.1|607662_608475_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|608471_609152_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007010.1|609992_610613_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|610662_610953_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275039.1|611756_612251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|612245_612584_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|612963_613849_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556462.1|613846_614692_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.4e-24	33.8

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038891|635013:735642|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126188.1|638629_639856_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209514.1|640855_641548_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209516.1|641552_643022_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126187.1|644980_645379_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|645375_647064_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|647045_648002_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|648044_648560_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|648664_649597_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|649816_650203_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|650219_650864_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|651044_651884_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|651959_652562_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|652562_653417_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
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WP_016209538.1|655656_656388_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
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WP_016209499.1|656943_657501_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
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WP_016209539.1|658626_659427_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|659430_660198_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|660194_660659_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|660681_661335_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|661338_661686_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|661719_661971_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|662045_663314_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|663316_664075_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|664136_665027_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|665077_665761_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
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WP_075275046.1|666376_668590_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|668581_669454_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|669621_671451_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|671614_672256_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|672497_673028_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|673045_673219_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|673277_674327_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|674333_675284_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|675337_676282_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|676309_677047_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|677135_677378_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
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WP_016210401.1|679552_680605_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|680725_681346_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_036780649.1|681361_682348_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|688249_688825_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275054.1|688770_689136_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126651.1|689256_689442_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209899.1|689545_690580_-	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_016209908.1|690576_691287_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209923.1|691761_692280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|692397_692730_-	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209920.1|692759_695714_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|695759_696257_-|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209922.1|696316_696733_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209915.1|696824_697685_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126652.1|697767_698334_+	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016209918.1|698366_699221_+	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209914.1|699262_702169_+	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|702229_702427_+	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209903.1|702433_703444_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209910.1|703440_704499_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_032126655.1|704492_705293_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209913.1|705295_706114_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209907.1|706125_707073_+	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-37	37.9
WP_032126654.1|707080_708382_+	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209919.1|708560_709664_+	glycine cleavage system aminomethyltransferase GcvT	NA	NA	NA	NA
WP_016209906.1|709660_710053_+	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
WP_016209924.1|710064_711441_+	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
WP_016209900.1|711434_712904_+	glycine dehydrogenase subunit 2	M4QFZ1	Prochlorococcus_phage	2.7e-84	41.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038891|834427:888880|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209658.1|848327_849683_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|849859_850531_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|850646_851522_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
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WP_016209647.1|853542_854148_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|854229_855531_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|855598_858031_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|858134_858407_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126162.1|858510_860388_+	SurA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|860419_861304_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|861312_861708_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|862135_864283_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|864254_865604_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|865600_867721_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|867717_869421_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_155049178.1|869539_870682_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|870746_871775_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556477.1|871934_873416_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_059372266.1|873505_873991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275067.1|874323_875391_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273512.1|876146_876491_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038891|957103:1065229|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126332.1|1053305_1054505_+	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038891|1094686:1201200|DBSCAN-SWA
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLNLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVSKDIKFTDLKDRKDVSVATSVGILHIQ
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210586.1|1129310_1130816_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.7e-86	41.0
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WP_155046719.1|1146401_1146560_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_033923779.1|1146862_1147699_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
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WP_016209940.1|1152524_1155296_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
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WP_016209931.1|1155967_1157440_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
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WP_016209945.1|1158609_1159644_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1159646_1160687_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209936.1|1160869_1161985_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-93	48.6
WP_016209930.1|1162023_1162377_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_032126634.1|1162397_1164266_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1164287_1165232_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1165465_1165744_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1165953_1166592_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1166566_1167994_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1168194_1168872_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1169006_1170281_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1170348_1171104_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1171155_1172073_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209929.1|1172181_1173075_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274822.1|1174533_1175508_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_016211771.1|1175800_1175989_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1176002_1177136_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274823.1|1177335_1181346_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
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WP_081007041.1|1183988_1184516_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_052133287.1|1279149_1279548_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212039.1|1279736_1280294_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212040.1|1280470_1281820_+	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1282023_1283106_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038891|1289862:1333539|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038891|1346065:1411189|DBSCAN-SWA
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MLILTRRIGETLMIGDDVTVTVLGIRGNQVRIGVNAPKEVSVHREEIYLRIQEEKDGGQSQAGHSSGSEMNGNRVPFPGSDDIDGNR
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211833.1|1349656_1350157_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|1351779_1352145_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126565.1|1352355_1352628_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273571.1|1361702_1362380_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556502.1|1362488_1363052_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210926.1|1363311_1364781_+	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
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WP_016210930.1|1365618_1366392_-	enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210917.1|1367527_1368970_+	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	5.4e-21	24.5
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WP_155046724.1|1372078_1372246_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556501.1|1375406_1375982_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211651.1|1376526_1378062_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|1378186_1379671_+	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
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WP_032126643.1|1382073_1382280_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075278621.1|1382468_1382810_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126641.1|1382845_1385416_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_016209840.1|1385523_1386009_+	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_016209844.1|1386181_1387222_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209835.1|1387199_1387682_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209848.1|1387678_1390273_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209832.1|1390579_1390843_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209831.1|1391121_1391820_-	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1392039_1392234_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1392309_1393869_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1394187_1395084_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1395300_1396776_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1397298_1398321_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209830.1|1398651_1400019_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_032126639.1|1400524_1401811_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209836.1|1401830_1403045_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
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WP_016209839.1|1404135_1405434_+	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
WP_016209829.1|1406813_1409213_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209834.1|1409209_1409968_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209842.1|1410144_1410534_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1410613_1411189_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038891|1441978:1487168|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP038891|1441978:1487168|1446195_1447017_-|WP_016211764.1|DBSCAN-SWA
MATITINNEPLYYQDQGQGFPLLFGHSYLWDHTMWSPQIQALSQNFRCITPDLWGHGQSGSLPKNTKTLTDLAGEMLALMDALHIDQFTVIGLSVGGMWATELALQAPERILALTLMDTFVGKEPELSYQQYFAMLAAIEQAQAIPTPLLDKIVPLFFSPKTFKTQPDLIENFQAHLQKLSPEKLQSIIPLGRMIFGREDRLNKLTNIQTPTLIITGEDDIPRPVSEGKLMAGKLANASFITIENAGHISTLEQPQYVNDALFQFLQPLININ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211285.1|1441978_1442758_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_016211286.1|1442775_1443123_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|1443234_1443507_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|1444835_1445645_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|1446195_1447017_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|1447217_1448450_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_081377862.1|1448936_1449773_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
1449774:1449833	attL	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1449784_1450057_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211806.1|1450846_1451572_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211804.1|1453159_1454545_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	2.5e-47	32.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

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ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAGTAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGGTAACCCTCCCTTAAAATGAGACAACTCATAACTGGAATCTTCTGTTAACATTTTCAAACAGGAGAGCATATGAAAAAGAGCAAATTAAGTGAATCAAAAATCGTAGAGTTGCTTAAGCGTGTTGAGGCTGGAGCAGATATAGAAACCACAGCAAGAGACTACGGAATCTCAACTAGCACGTATTACACCTTAAAAGAACGTTATGGGGCAATGGATATCTCTCAGCTAAAAAGGCTAAAACAATTAGAGAAAGAGAACCAGCAACTTAAGAGAATGTATGCTGATTCTCAAATAGAAATTGAGGCTTTGAAAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATAATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACATCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAAAAGTATAGTCAAATTTAATAGCGCTAAAATGAAATAACGAGACTATGAACCTTCATAATCCCTAGTCAACTTAACAACTATAGGTGCTAACAATATTAAAGCAATCAGATTAGGAATAGCCATCAACGCATTTAAAATATCTGCAACTAGCCACAATAAATTTAGATTAGCGACAGCACCTAAAACAATCACAATTACCCATAGAATACGATAGGGAATAATGATTTTAGTACCAAATAAATAGCTCGCACAGCGTTCCCCATAATAACTCCAACCAAGCAAAGTAGTGAAAGCAAAAATAACGAGTCCCACCGTAACAACCAAGCCACCGCCATTAAAAGCAACCTGAAAAGCATCTGAAGAAAGCGCAGCCCCTGTCTCGCCAGATGTCCATAACCCACTTAATAAGATAACAAAGGCAGTAATACTACAAAGAATCATTGTATCAAAAAAGGTCCCGGTCATTGCGATTAATCCCTGGCGAACTGGGCTATTTGTTTTTGCTGCTGCATGAGCAATCGGTGCTGTGCCTAAACCCGCCTCATTTGAAAAAACACCGCGCGCAACACCAAAGCGAATCGCAGCCATTATCGTTGCACCAGCAAACCCTCCTGCTGCTGCTGCGCCACTAAACGCACTATTAATAATCAACATAAATACACTGGATAGGTGGTGAATATTAAGCCCAATAACAACCAGGCCGCCGATAATATAAAAAACAGCCATAATAGGAACCAAATAGCTAGTCACACGCCCAATCCAACGAATTCCTCCGAACAGTACTAAGCCCACCAAAACAGCACTGACTCCACCGACTAACCAAGGTGAAATACCAAAGTGATTATTTAATACGTGCGCCATCGAGTTACTTTGAACACTGTTGCCTATACCAAACGCTGCAATCGTTCCAAAAATAGCAAAGGCAACCCCTAAGCCTCGCCAGCGAGAGCCTAACCCATTTTTAATGTAATACATTGGACCACCAACGAAATTACCATTCGCATCCGTTTCCCGATATTTTACGGCAAGAACGGCTTCAGCATACTTTGTCACCATACCAATTAGTGCGGTCATCCACATCCAAAAAACAGCACCTGGCCCTCCTAAGACAATTGCAGTTGCAACGCCTGCAATATTTCCTGTACCTACCGTTGCAGCCATTGCTGTAGTCAATGCTTTAAAGCCACTGATTTCTCCTTTTGCTTGTTTTGAGTCTTTTTTAACAATTAGTTTAAGTGCTACACCCAGTTTTCTAAGCTGCAATAACCGTAAGCGTATCGTTAAATAAAGACCACAACCTAAAAGCAAAATCAGCATAACCGGGCCCCAAACAAAGCCACTTAATGCATTTAAAAATGATGCTATTTCCATATTAAAACTCACTCCTTGATTTACCTCTTTACTAGTGTAACAAAAAAGGCATAAGTAAAAGCAAGAGAAAAAATATTTTGGCTCGATTAATTATTTTTATAAACCTTTTAATAAAGTTAGGTTTAAGCATAATAGCTAGTCATAGCTCTACATGATTATTTCAAATAAAGGCAACTATAATAAAATTAATTCTGTTTTTTAAAAGCAAGTCAGGCATTTATAACAATATATGCCTGACTATAAAACGGTTATGATGTAATCAATTAAAGCTCACTGGCTGAAGCGATCACTTTATTTACAATGCCATATTCTTTGGCTTCTTCTGCCGTCATCCAGTAATCACGCTCAGTATCTTCTTCGACCTTCTCAAGTACCTGACCCGTACGCTCAGCAATAATAACATTCAAGCGCTTTCTCATTTTAATAATTTCTTTGGCTTGAATTGCTAGGTCCGTTGCCTGGCCACGTGCACCACCACTAGGTTGGTGTAATAAAAAACGTGTATTTGGCAAACAATAACGATCTTCTTTTTCAGCGCCTAGGAAGATTAAACTTCCTGCACTAGCCACCCAGCCGGTGCCAATCACACGAACACGAGGCTTGATAAAACGCATGACATCATGAATTGAATCTCCCGACTCAACATGCCCTCCCGGTGAATTCACATACACAGTAATCTCATCATCGCTCACATGTGCTAAAGCAATAAGTTGAGAAGTTACTTTTTGAGCCAGTTTTTGGTTAATTTCACCAAAAATAAAGACACTGCGCGCTTCAAACAGTTTTTCATCAATTAATGCTGAACCTTGAAGCTGTTGTTCTTGATCACTCATAATTTTATTTCACCTTTATTTCTTTTCTTCATTAACGACAAATTTATAAAATTCGCGGACAACGGTTACATTAATATCCGCAGGTAAATAGTCTTGGCTCAGCCAATCTTCACCATCCAAGCCTTCCATATACAAATTAATAATATGAGGACCGCGTTTTGCCAATTCAAGACGTGCTTGCTCTTCAGTTTGGCAATCAAAGTCTTCATTCTCAATTAACTCTTTTACATCTGTTGCAAAAGCCTCATAGGCCATACGATTGCGATCACAGTCAAACTCTTTAGCAACCTGATCGATGATATCGTCAATGTGCGGGTAATTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211994.1|1533441_1533978_+	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211561.1|1538425_1542292_-	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038891|1564182:1749458|DBSCAN-SWA
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MRWLALIPISLTLLLPALSFAFTMAPSRIITQNHYKMKKVSAESQSNNPLLREKQRIWFSNIKHPEES
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MTPEVTVDLISRAVYVLIIMSSILIVPGLVVGLIIAVFQAATQINEQTLSFVPRLLATFLALVFAGPLLLKIIIGFTEELIKNIPFIIN
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MTNNKRDVESLVKQNYAHGFVTDIDSEAISPGLSEETIRLISAKKNEPAWLLEWRLKAYHDWCEMIEPDWAHVHYESPKFDDIVYYSAPRSQQEGPKSLDEVDPKLLETYSKLGIPLQEQKRLAGVVAVDVVFDSVSIATTFKEKLSEAGVIFCPISEAVRDYPELVKKYLGSVVPRKDNFYAALNSAVFSDGSFVYIPKGVRCPMELSTYFRINAANTGQFERTLIIAEESSYVSYLEGCTAPMRDENQLHAAVVELVALDHAEIKYSTVQNWYPGDEQGQGGIYNFVTKRGVCHKSAKISWTQVETGSAVTWKYPSVVLRGDNSVGEFYSVALTNNYQQADTGTKMIHLGKNTRSTIISKGISAGKSSNSYRGLVRINPMADHARNFTQCDSLLIGGHCAANTFPYIETKSKSAQVEHEATTSKISDDQLFYCLQRGINAEDAVAMIVNGFCKEVFKELPMEFAVEAQKLLEISLEGAVG
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MKNEEQLLTQSTLEKALSLVESLEGGDAKEAARLVAELSQCLEEDFVQEVGKITRDLHNTLVDLSEHKEKNLKDITDELPDAKDRLEHVVKLTEDATNKTIDVVEVCLPLGDRLALRSAQLLTEWDRLQHQEVTPKEFKMLYHGLGDFLAELKGNAEFLNKALNDVLMTQEYQDLTGQLIGHVLNLVNHVETNLVDLVSAAKGAGYNFTEKEKSTVLAEGPVVNVHKRENIVASQDDVDDLLSSLGL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210117.1|1569894_1570254_+	aspartate 1-decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210103.1|1570535_1571894_+	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
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WP_105962625.1|1580402_1581289_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300349.1|1582440_1584165_-	protein kinase	M1I1A9	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.7e-05	25.6
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WP_016211732.1|1599862_1600561_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211398.1|1601165_1601453_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211399.1|1601599_1602343_-	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_016211405.1|1603535_1605308_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
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WP_016211669.1|1609855_1610206_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211666.1|1610360_1613180_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
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WP_032126677.1|1616250_1616814_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211557.1|1617008_1618238_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_016211554.1|1618283_1618910_-	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_032126678.1|1619236_1620247_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
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WP_080664823.1|1633630_1635031_-	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_016209795.1|1635011_1635767_-	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.3e-10	24.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038891|1754069:1821359|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211465.1|1761337_1762321_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-34	32.7
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WP_016211466.1|1763505_1765026_+	RsmB/NOP family class I SAM-dependent RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_081377829.1|1804520_1805255_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556535.1|1805699_1806585_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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1810512:1811473	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016211315.1|1817800_1818445_+	porin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273532.1|1818928_1819516_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126997.1|1819733_1819973_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	NA	NA	NA	NA
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WP_081007020.1|1821071_1821359_+|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038891|1842448:2019836|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209486.1|1866229_1866481_-	succinate dehydrogenase assembly factor 2	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038891|2052349:2104515|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP038891|2052349:2104515|2092023_2093676_-|WP_016210562.1|DBSCAN-SWA
MSIELLQKEAVLLLYDDKANQSPQLAALKYLGMTDIDAIYVGEATWQTRLQSKHYAVIIYDLSHRYTEIQPKVFEDLYRANIIRLSRLFILISELTEFPQIQHFLAKNPPDIILTRPYSLDMYVNKLREQYPTKVRFKSFYESFEKGDYHNVLMACEKRIQGGGDRETLLECFRLQAMSYLFAQQFDAAKKLCNMLSKQQDQLLWLNLVHGLACLESGELGQAKRDFYKVLKQEKDDIKALDGLCEVLVQTKQLSQAHRVLSHRMALTPFDEAKQQQFIDLSLTCGNFAAAEQAIYSMMENHHNRHGSTDPESWLQLLLLLREQIKSDQDVFKAYDRVLEVMSYVDKHEKQNIDIKISQCLVGAEIAESISDIENSERFSKNAKINYDSHLFLLDDQQEVEVGLGFYRNNLLQGQGEEILKSLLWRCKTNDELNGELLVKVCSVFNGQAYLGEEANTRGVEHFYNKQYADASRLLDLATQIRPDNMAIHLNAVQALLSLLDQKKHVNSGVLVNKMAIYLEAIDLNLAQATDKQSQRYHRLLDQYNQLSIT
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MLLINIDHSPLTLAMLKQVIDGPVKLKVTEAVWQDVRKSRAVVMDVIAKEKTVYGINTGFGILAKRSISHHQLETLQKNIILSHAAGVGDYLDDATVRLILVLKLKALLRGYSGISEKVVNALTALVNHEVYPCIRAQGSVGASGDLAPLSYIGAVLLGEGKVRIGGKVLPAGEGLKQLGLEPIALGAKEGLALNNGTQVSTAICLKNYFALEDLLLVSMACGALALDAAGGADSPLDERIHQARGQQGQIDVAEYYRQLLTGSALLELQRRQHGRVQDPYSLRCQPQVLGACLDQLRHAAVILVAEANSVTDNPLIFVDDNEILSGGNFHAEPVAFIADNLALVAAEIGSLSERRLALLMDEHFSGLPAFLVAGNGVHSGFMVAQVTAAALVSENKQLCYPASVDSIPTSASQEDHVSMATHGARRLGKMARNLQYTLAIELLAGCQGIDLRAPLKTSVPLMLLHANLRERVSFYEVDRFFDPDIEQSAQLLQEFVWRDLCQVHLLPSQRE
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METLLCLTNENFDQTVEDNELTVVEFHADWCEPCRSFDKVFVEVAKEHADVVFAKIDTEKEVELAREFHVRSIPRLMIFKKNVVVADQTGELPFDVVNDLIKQAKSLDMSDIHQHMAKQFLS
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTEPYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MNLNTRLPFLLDLNRDDFPSPEQALTHPDGLLAIGGDLSPTRLIKAYYHGIFPWFTEEDPILWWSPSLRAVLAPSDFHLSRSLKKLIKKQAFQVTVNQCFNKVIDRCAKAHAHQGTWITATMIHAYTQLHRAGHAHSIEVWQDQQLVGGLYGVSTGGIFSGESMFQCTSNASKVAFAALIALLKSEHNDNGVLIDCQLLNPHLATLGVHNIARTHYLHLLEQYRDKFHLKPTWAQANKLITNALTSLTNVSSI
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MFKIKQLLIRSVLFLLCYAMAITVSIAANNTSNHGNADHNSDLSTAGSSYLVEFLKAAKTYQADFWQIGEASAGRLECAYGRLLLKQPGQLLWQVKNIDCQQVQALKAPTDQQWDQVILTKQQSVKIYQPLLEQVIERSLGSLDDAVPVKLLTGASLQALAGFDVREQSKSDDQSQLFILSPKNKQSLVSKIEIAFKNKELQQMTVLTPLGQSTKLQFFNIKTNQILPSSLFELKLPKGIDVIKQG
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MVSKSSWQTYLYALTKRRILTVFLLGFSSGLPFALIAGTLQAWFTTAGLDLKTIGAASLIGLPYTLKPFIAPIIDRYRLPLLGRRRGWLLLFQFALLIAILFMSTLKPTHSVLVLGQTVPLLMIIGVCVAFFSTCQDIVINAYQTEVLYENERGLGASLGVTGWRISFILSGSIALILASHLGWHLTYIVMSLCMLIGVFATLFGPNPDNEGQPPMTFVKAIYEPFVDFFSRQKLPTALLVILLILTYKIGDALALALNTTFLIKGVGFSLDAIGVINKNIGIIGSIAGGIIGGLLMLRLSLFRSLMLFGLVQAIANLGYMWLAIVGKNYSVFVITAFSEHFFSGMGTAAFVALLMSQCNLNYTATQYALFTSLSLFGRTWLGPIAASMVDHFGWAQFFFWSFIVSLPCLFFVWLLRHKLEKDHQDRINKQGQEVACS
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MKSLPSILANPFFRKLFCAQILATFGTGLSSIALAQLAYHLSDRHAGKILGIALVLKMVAYIFGAPLMSYLSAKIPSKLFMIIMDLIRMLLLVSMFFVQATWQIYLLIILINLCSAGFTPTFQALIPTLFQKKADYTKALSLSRMAYNLESLLSPLLAALLLFFVSFKLLFALNALTFLISSLLIYSTPLKSSNKTVQSRGFGCLYDYLTIKPLLQGLLFIFIAALAGAMVIINTVVYIQGTYHLSESITALTMAVFGIASLITTISIPALSQYASSNKLMKCGALFCIGGFAIGILTPNLTGIFIIWFILGIGTSLIETLIGLTITENITQEKQNNYFTAYFSLSHACWLSAYFITGWIGNQIAMQSLLLLLFLISVLLYLLATQIKSPTLAKP
>NZ_CP038891|2052349:2104515|2062866_2063880_+|WP_075274901.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAASVEAHSSQLLDAPRSNFIYDLRRQTDKANSTAELSAILTDLHSDETLFKDYFFDPAHTPFRTALKDCLVACSQARILEEKMDKRELNNIEDLRDQALRLLSDVNNISRYESENESKNKAFSTLLGIITPQVHQVQSAEELFATLAKLESNETSKDYFSDPNHSDLNTELYNCLQASVDLKNLNFNYVRNRVLKLLDNVNKHENNQTTPSNGEQTTLLKNVYAQITKSQSERGLICALNNLQEAQTFQNYFSNPKNYYFKAELKYWRARCNQIEILEEQQALKDTDKKKQLLSDIETIIVNQVRGYGFDLGIGGSEHSIRLSERESFQV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209424.1|2052349_2053627_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|2053726_2054101_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|2054185_2055073_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|2055130_2055859_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_129556555.1|2055855_2056986_-	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|2057116_2057545_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|2057639_2057999_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209447.1|2057988_2059200_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2059196_2059985_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2060147_2060942_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2061147_2062122_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046761.1|2062548_2062722_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274901.1|2062866_2063880_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|2063883_2064183_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2064172_2064337_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|2064393_2064759_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2065098_2065839_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2065842_2068347_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2068609_2069566_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2069549_2070311_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274903.1|2070388_2071264_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2071388_2071634_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2071693_2073967_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2074021_2074375_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2074564_2074858_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|2075030_2075210_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|2075285_2075861_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2076143_2077460_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2077470_2077839_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2077869_2078532_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2078706_2079072_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556556.1|2079017_2079593_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2079760_2080480_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2080459_2081275_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2081291_2083493_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2083575_2084925_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2084999_2085599_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2085582_2085792_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211931.1|2086109_2087297_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2087492_2088782_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300152.1|2089192_2089558_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|2091194_2091950_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210562.1|2092023_2093676_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300273.1|2093704_2095243_-	histidine ammonia-lyase	A0A1V0S940	Catovirus	5.1e-70	37.2
WP_016210560.1|2095242_2096943_-	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_081007068.1|2097031_2098207_-	imidazolonepropionase	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|2098245_2099208_-	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|2099568_2099991_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210568.1|2100296_2100938_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210561.1|2101065_2102400_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_032126397.1|2102514_2103105_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2103453_2104515_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038891|2112359:2157065|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126170.1|2113416_2113689_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|2113916_2115128_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211037.1|2115478_2116108_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_016211042.1|2116156_2117173_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
WP_016211035.1|2117419_2117635_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_016211043.1|2117687_2118137_+	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
WP_016211039.1|2118216_2119962_+	DNA primase	A0A1S5RGL3	Helicobacter_phage	2.6e-46	37.1
WP_016211036.1|2120053_2121925_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.7e-33	30.7
WP_054300271.1|2122272_2123247_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211094.1|2123266_2123590_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209891.1|2179306_2180005_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_016209896.1|2180151_2180721_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940402.1|2181035_2181659_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300152.1|2182541_2182907_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038891|2234740:2280663|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038891|2349866:2409477|DBSCAN-SWA
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MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI
>NZ_CP038891|2349866:2409477|2388094_2389018_-|WP_016211371.1|DBSCAN-SWA
MSKRCYISVDGGGTSTRARVYNDEGGVLGESVQGASNISICVDQAMQALILAINQAKSQAGFAKSDQLPIGIGIAGLEIPKARHSFLEQVSRLGSDVVVQSDAHTACLGGHDGDDGAILILGTGCIGWLIDKEEVQHVGGYGFPLDDRAGGAGIGLAALQVTLRFLDGRQSCSYLLERLAEKFDQNIARLAEFGVSASKTEFARFAPDVFDAFDHGDVYAKQIIEAAVSDIEMMIGRLYQGNNEALPLCLLGGLAHKFKPLLSYAIQERLVEPCGDALWGGYKMIKNYVELGDSTVIGLLGIEHDKI
>NZ_CP038891|2349866:2409477|2367782_2367947_+|WP_155046696.1|DBSCAN-SWA
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEG
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKAMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MNKDLLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2349866_2350577_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2350605_2351010_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209567.1|2352125_2352743_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_032126712.1|2353177_2353636_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2354380_2355391_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
WP_016209566.1|2355875_2356787_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209545.1|2357112_2360607_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2360644_2361484_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_016209564.1|2361670_2361886_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2361934_2362510_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2362506_2362845_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2363013_2364003_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
WP_016209572.1|2364003_2364966_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
WP_016209559.1|2364975_2365878_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2365921_2366896_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300455.1|2367360_2367726_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126774.1|2372791_2373127_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300173.1|2378865_2379927_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|2380005_2381151_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
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WP_016211371.1|2388094_2389018_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211368.1|2389214_2390606_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2390652_2391696_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2391738_2392182_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2392314_2393505_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2393559_2393706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036794860.1|2395442_2395736_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2395812_2396007_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212197.1|2397025_2397943_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2398408_2399251_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2399318_2399969_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2399983_2401024_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2401146_2402232_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2402258_2403368_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016210879.1|2403698_2404058_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_075274927.1|2408415_2409477_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038891|2447461:2511089|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211595.1|2494374_2494842_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211599.1|2494854_2495865_-	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_033923779.1|2496533_2497370_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2497381_2497654_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211743.1|2497720_2498083_-	ABC transporter membrane domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556577.1|2498069_2499098_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.8e-16	27.7
WP_016211744.1|2499075_2499480_-	glycine-rich domain-containing protein-like	NA	NA	NA	NA
WP_016211742.1|2499710_2501690_+	TonB-dependent receptor	NA	NA	NA	NA
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WP_144019244.1|2502787_2503399_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210956.1|2505981_2506701_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|2506883_2507090_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274931.1|2510360_2511089_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038891|2514724:2622560|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274933.1|2519281_2520010_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211951.1|2520626_2521724_+	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
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WP_016212195.1|2524692_2525079_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212196.1|2525075_2525321_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_016211047.1|2545485_2547120_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211051.1|2547481_2547985_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
WP_016211050.1|2547947_2548655_-	dethiobiotin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211044.1|2548723_2549584_-	malonyl-ACP O-methyltransferase BioC	NA	NA	NA	NA
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WP_075274938.1|2556529_2557036_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|2557199_2558624_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
WP_016210618.1|2558688_2559738_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_051307334.1|2560004_2560784_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556587.1|2560827_2561730_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210625.1|2561788_2562535_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
WP_016210616.1|2562783_2565594_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556661.1|2565894_2566458_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212263.1|2567633_2568227_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212264.1|2568272_2568866_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.4e-28	44.6
WP_016212238.1|2569381_2570671_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274939.1|2570700_2571429_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-42	41.4
WP_087910645.1|2571541_2572694_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274940.1|2572722_2573403_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.0e-42	44.3
WP_016211997.1|2573758_2574868_+	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	4.4e-07	24.5
WP_016211996.1|2574869_2575817_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274941.1|2576200_2576929_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.8
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WP_016212339.1|2577473_2578220_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274942.1|2578238_2578967_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	43.1
WP_032127022.1|2579643_2581830_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
WP_087910645.1|2581891_2583045_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038891|2651200:2685654|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_29

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MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR
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MNKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRACRYLSFLKIASTILWLR
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MISLWKTYQALKTKGILGINQRNADFIIRYNQRKYYPLVDDKIMTKTLAIKDGIAVPKLYATLKTDHDTHHLEQILANRTDFVIKPARGAGGDGILVITNRHGERFRKVSGALLHLDDIRHHISNILSGVYSLGGQRDQAMIEYRVQFDPLFKKISYQGVPDIRIIVLKGYPAMAMVRLPTRLSDGKANLHQGAIGVGIDLTTGITLEGVWMNDPIHEHPDTGYAVPGLQIPHWDHFLNLAARCYELTQLGYLGVDIILDKDKGPLMLELNARPGLNIQIANNSGLLHRLRFIEQQNQQRTADERIAFIKHQFAKI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_081377880.1|2651721_2652201_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556590.1|2653058_2653454_+	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126312.1|2653450_2654245_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211756.1|2654423_2655149_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2655394_2656582_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_081377344.1|2656936_2658064_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|2658394_2658937_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210943.1|2658933_2659620_-	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210942.1|2659623_2660235_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2660281_2661301_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2661402_2662197_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
WP_016210931.1|2662234_2663041_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210941.1|2663119_2664169_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126310.1|2664366_2665626_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_032126309.1|2665672_2666350_+	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210937.1|2666435_2666717_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
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>NZ_CP038891|2743350:2826669|2785848_2786565_-|WP_080664840.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP038891|2939230:2983576|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_31

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP038891|3015260:3132687|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_32

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274966.1|3019929_3020991_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|3021071_3021380_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|3021494_3022811_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016211205.1|3024631_3025528_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211203.1|3025614_3026613_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126430.1|3026721_3027246_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|3027493_3028732_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|3029279_3029753_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|3029749_3030145_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|3031074_3031650_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|3031595_3031961_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211610.1|3032225_3034556_+	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
WP_129556603.1|3034676_3036692_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274967.1|3036875_3040268_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212386.1|3040332_3040638_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274968.1|3040807_3041908_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556605.1|3042302_3043412_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209721.1|3044350_3045748_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.3e-77	34.4
WP_051307313.1|3045867_3046815_-	P-type conjugative transfer ATPase TrbB	NA	NA	NA	NA
WP_032126703.1|3046811_3047327_-	signal peptidase peptidase S26 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209698.1|3047313_3048513_-	trbL/VirB6 plasmid conjugal transfer family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209707.1|3048509_3048833_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209703.1|3048834_3050064_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209722.1|3050063_3051107_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556606.1|3051106_3051790_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209720.1|3051786_3054276_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377396.1|3054292_3054547_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209715.1|3054547_3054904_-	trbC/VIRB2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664821.1|3055683_3056847_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209727.1|3056866_3059974_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209723.1|3059975_3061481_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016209714.1|3061508_3061790_-	accessory factor UbiK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209709.1|3061938_3062280_+	P-II family nitrogen regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209712.1|3062399_3064280_+	biosynthetic arginine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_059372650.1|3064364_3065963_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307314.1|3065980_3067096_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209706.1|3067223_3068222_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209702.1|3068985_3070185_-	tryptophan synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
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WP_016209717.1|3071641_3072640_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3072641_3073220_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3073216_3074686_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|3074729_3075017_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
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WP_075274970.1|3076023_3076494_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046757.1|3076550_3076706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274971.1|3076850_3077303_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|3077488_3077710_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212371.1|3077825_3078458_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274972.1|3078435_3079497_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211865.1|3079936_3080476_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126699.1|3080560_3081097_+	alkyl hydroperoxide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211866.1|3081748_3082051_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126698.1|3082500_3082809_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274973.1|3083399_3083867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556608.1|3084149_3084860_+	VUT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211232.1|3085086_3085485_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211231.1|3086352_3087303_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016211227.1|3087302_3089381_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3089528_3090044_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3090052_3090616_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3090596_3091343_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3091482_3091935_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210351.1|3092358_3093195_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3093191_3094088_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3094120_3095188_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3095206_3095575_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3095600_3097049_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3097058_3098438_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3098478_3099810_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3099781_3100741_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3100833_3101337_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3101471_3102623_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3102619_3103099_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3103245_3105567_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_080664839.1|3105511_3106138_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|3106142_3107042_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3107114_3107693_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3107993_3108251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556611.1|3108259_3109413_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155049899.1|3110097_3110241_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046758.1|3110549_3110681_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155046759.1|3110825_3110981_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3111308_3112082_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3113409_3114384_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3115478_3115817_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212337.1|3115833_3116544_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_051307375.1|3116531_3116723_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|3116884_3117184_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|3117173_3117338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|3117394_3117760_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3119064_3119760_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3119756_3121184_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3121209_3121473_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3121833_3122808_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556612.1|3122866_3123717_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211291.1|3123754_3124099_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3124095_3124932_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3124932_3125274_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3125275_3125881_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3125877_3127872_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3127891_3128833_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3129060_3130485_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3130997_3131972_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080743040.1|3132030_3132687_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038891.1|WP_032126179.1|1097155_1097407_+|TSUP-family-transporter	1097155_1097407_+	83 aa aa	NA	NA	NA	1094686-1201200	yes
NZ_CP038891.1|WP_081377858.1|1296620_1297331_+|transposase	1296620_1297331_+	236 aa aa	NA	NA	NA	1289862-1333539	yes
NZ_CP038891.1|WP_054300380.1|1314412_1315069_-|transposase	1314412_1315069_-	218 aa aa	NA	NA	NA	1289862-1333539	yes
NZ_CP038891.1|WP_016212421.1|1318308_1318491_-|hypothetical-protein	1318308_1318491_-	60 aa aa	NA	NA	NA	1289862-1333539	yes
NZ_CP038891.1|WP_032127044.1|1330215_1330416_-|hypothetical-protein	1330215_1330416_-	66 aa aa	NA	NA	NA	1289862-1333539	yes
NZ_CP038891.1|WP_016212482.1|1330630_1330774_+|hypothetical-protein	1330630_1330774_+	47 aa aa	NA	NA	NA	1289862-1333539	yes
NZ_CP038891.1|WP_016210918.1|1364865_1365615_+|hypothetical-protein	1364865_1365615_+	249 aa aa	NA	NA	NA	1346065-1411189	yes
NZ_CP038891.1|WP_155046970.1|1682735_1682984_+|hypothetical-protein	1682735_1682984_+	82 aa aa	NA	NA	NA	1564182-1749458	yes
NZ_CP038891.1|WP_155097723.1|1903824_1903962_+|hypothetical-protein	1903824_1903962_+	45 aa aa	NA	NA	NA	1842448-2019836	yes
NZ_CP038891.1|WP_098082828.1|1963863_1964121_-|transposase	1963863_1964121_-	85 aa aa	NA	NA	NA	1842448-2019836	yes
NZ_CP038891.1|WP_016212450.1|2272259_2273162_-|hypothetical-protein	2272259_2273162_-	300 aa aa	NA	NA	NA	2234740-2280663	yes
NZ_CP038891.1|WP_129556569.1|2279888_2280098_+|hypothetical-protein	2279888_2280098_+	69 aa aa	NA	NA	NA	2234740-2280663	yes
NZ_CP038891.1|WP_016210580.1|2804370_2804631_+|methyltransferase	2804370_2804631_+	86 aa aa	NA	NA	NA	2743350-2826669	yes
NZ_CP038891.1|WP_155047000.1|3017377_3017524_-|hypothetical-protein	3017377_3017524_-	48 aa aa	NA	NA	NA	3015260-3132687	yes
NZ_CP038891.1|WP_129556602.1|3017728_3017938_-|hypothetical-protein	3017728_3017938_-	69 aa aa	NA	NA	NA	3015260-3132687	yes
NZ_CP038891.1|WP_016211201.1|3021071_3021380_-|hypothetical-protein	3021071_3021380_-	102 aa aa	NA	NA	NA	3015260-3132687	yes
NZ_CP038891.1|WP_155049899.1|3110097_3110241_-|hypothetical-protein	3110097_3110241_-	47 aa aa	NA	NA	NA	3015260-3132687	yes
NZ_CP038891.1|WP_155046758.1|3110549_3110681_+|phosphatase	3110549_3110681_+	43 aa aa	NA	NA	NA	3015260-3132687	yes
NZ_CP038891.1|WP_155046759.1|3110825_3110981_+|hypothetical-protein	3110825_3110981_+	51 aa aa	NA	NA	NA	3015260-3132687	yes

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_032126179.1|1097155_1097407_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038891.1|WP_032126179.1|1097155_1097407_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1105778-1105741	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1105644-1105607	1
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1095599-1095636	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1105778-1105741, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1105644-1105607, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1095599-1095636, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_081377858.1|1296620_1297331_+|transposase

>NZ_CP038891.1|WP_081377858.1|1296620_1297331_+|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1314337-1314374	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1317843-1317880	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1314337-1314374, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1317843-1317880, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_054300380.1|1314412_1315069_-|transposase

>NZ_CP038891.1|WP_054300380.1|1314412_1315069_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1314337-1314374	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1317843-1317880	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1314337-1314374, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1317843-1317880, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_016212421.1|1318308_1318491_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_016212421.1|1318308_1318491_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1314337-1314374	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1317843-1317880	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1314337-1314374, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1317843-1317880, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_032127044.1|1330215_1330416_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_032127044.1|1330215_1330416_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1314337-1314374	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1317843-1317880	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1314337-1314374, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1317843-1317880, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_016212482.1|1330630_1330774_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_016212482.1|1330630_1330774_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1314337-1314374	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1317843-1317880	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1314337-1314374, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1317843-1317880, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_016210918.1|1364865_1365615_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_016210918.1|1364865_1365615_+|hypothetical-protein
MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1352171-1352208	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1376319-1376356	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1352171-1352208, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1376319-1376356, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_155046970.1|1682735_1682984_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_155046970.1|1682735_1682984_+|hypothetical-protein
MNILTDLLRICYQGFKMHVRNFLQNTIRKLREYENSSPSFLKFLGSDTPELRAARRGYAHDLKVILEATERDCETYGASFFI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1623909-1623872	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1629484-1629447	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1719200-1719163	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1733564-1733527	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1578899-1578936	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1623909-1623872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1629484-1629447, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1719200-1719163, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1733564-1733527, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

5. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1578899-1578936, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_155097723.1|1903824_1903962_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_155097723.1|1903824_1903962_+|hypothetical-protein
MKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1968124-1968087	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1848988-1849025	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1849122-1849159	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1968124-1968087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1848988-1849025, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1849122-1849159, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_098082828.1|1963863_1964121_-|transposase

>NZ_CP038891.1|WP_098082828.1|1963863_1964121_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1968124-1968087	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1848988-1849025	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	1849122-1849159	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1968124-1968087, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1848988-1849025, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 1849122-1849159, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_016212450.1|2272259_2273162_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_016212450.1|2272259_2273162_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2238330-2238367	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2240251-2240288	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2272130-2272167	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2272264-2272301	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2238330-2238367, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2240251-2240288, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2272130-2272167, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2272264-2272301, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_129556569.1|2279888_2280098_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_129556569.1|2279888_2280098_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2238330-2238367	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2240251-2240288	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2272130-2272167	0
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2272264-2272301	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2238330-2238367, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2240251-2240288, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2272130-2272167, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2272264-2272301, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_016210580.1|2804370_2804631_+|methyltransferase

>NZ_CP038891.1|WP_016210580.1|2804370_2804631_+|methyltransferase
MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	2824904-2824941	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 2824904-2824941, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_155047000.1|3017377_3017524_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_155047000.1|3017377_3017524_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	3031987-3032024	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 3031987-3032024, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_129556602.1|3017728_3017938_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_129556602.1|3017728_3017938_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	3031987-3032024	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 3031987-3032024, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_016211201.1|3021071_3021380_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_016211201.1|3021071_3021380_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	3031987-3032024	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 3031987-3032024, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_155049899.1|3110097_3110241_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_155049899.1|3110097_3110241_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGFSRQELRNFLPICELSFSHNTSTSGS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	3031987-3032024	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 3031987-3032024, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_155046758.1|3110549_3110681_+|phosphatase

>NZ_CP038891.1|WP_155046758.1|3110549_3110681_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	3031987-3032024	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 3031987-3032024, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038891.1|WP_155046759.1|3110825_3110981_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038891.1|WP_155046759.1|3110825_3110981_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	3031987-3032024	0

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038891 position: 3031987-3032024, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP038892

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038892_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038892_1
• CRISPR_location: 1232-1455
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038892_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038892_1

>1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038892_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038892_1

>merge|NZ_CP038892|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038892|1|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038892.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038892.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|376667
NZ_CP038892.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP038892.1|WP_155047020.1|7264_8188_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038892.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038892.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038892.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038892.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038892.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|197207
NZ_CP038892.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038892.1|WP_155047019.1|4324_4477_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038892.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	5.15472e-08
NZ_CP038892.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter	gnl|CDD|376667	pfam01925, TauE, Sulfite exporter TauE/SafE. This is a family of integral membrane proteins where the alignment appears to contain two duplicated modules of three transmembrane helices. The proteins are involved in the transport of anions across the cytoplasmic membrane during taurine metabolism as an exporter of sulfoacetate. This family used to be known as DUF81.	5.6898e-18
NZ_CP038892.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP038892.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038892.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.12573e-50
NZ_CP038892.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038892.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein	gnl|CDD|197207	cd09108, PLDc_PMFPLD_like_1, Catalytic domain, repeat 1, of phospholipase D from Streptomyces Sp. Strain PMF and similar proteins. Catalytic domain, repeat 1, of phospholipases D (PLD, EC 3.1.4.4) from Streptomyces Sp. Strain PMF (PMFPLD) and similar proteins, which are generally extracellular and bear N-terminal signal sequences. PMFPLD hydrolyzes the terminal phosphodiester bond of phospholipids with the formation of phosphatidic acid and alcohols. Phosphatidic acid is an essential compound involved in signal transduction. It also catalyzes a transphosphatidylation of phospholipids to acceptor alcohols, by which various phospholipids can be synthesized. In contrast to eukaryotic PLDs, PMFPLD has a compact structure, which consists of two catalytic domains, but lacks the regulatory domains. Each catalytic domain contains one copy of the HKD motif (H-x-K-x(4)-D, where x represents any amino acid residue) that characterizes the PLD superfamily. Two HKD motifs from two domains form a single active site. Like other PLD enzymes, PMFPLD may utilize a common two-step ping-pong catalytic mechanism involving an enzyme-substrate intermediate to cleave phosphodiester bonds. The two histidine residues from the two HKD motifs play key roles in the catalysis. Upon substrate binding, a histidine residue from one HKD motif could function as the nucleophile, attacking the phosphodiester bond to create a covalent phosphohistidine intermediate, while the other histidine residue from the second HKD motif could serve as a general acid, stabilizing the leaving group. A calcium-dependent PLD from Streptomyce chromofuscus is excluded from this family, since it displays very little sequence homology with other Streptomyces PLDs. Moreover, it does not contain the conserved HKD motif and hydrolyzes the phospholipids via a different mechanism.	5.20027e-25
NZ_CP038892.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038892.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	8.27093e-49

Protein sequences

>NZ_CP038892.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038892.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP038892.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038892.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein
MDKHRDVVVENVIKVLACGTTIMGHSKYCCSNSECSHTKVVPYTCKSRFWALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP038892.1|WP_155047019.1|4324_4477_+|hypothetical-protein
MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN
>NZ_CP038892.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein
MKIKVFIILSIIFYSKLIYASPLNEIYKDIILKTDPTRSQDGITYSFTEKNLLKDDFLIQFPGKGVWGKSAKDYPGFAFHVGLDHDFGLPHCQTDSQCITNSTCSNLFSFNNEEHHKHIKMCNGYTEKNLDRFYNIIIRAEKFVDITTLEPMPDLRFRSTLRNALTFLARTGKHITIRILSGSYQTMPSKGLSNEQHKNKSLLGGYPTWYFLNDLIRDIKNIPGSNLNLYVSSMRSCSGKCGSDFLMSLSWNHSKIIDVDGKYIISGGVNMYDSYYLGKHPVFDLMIELEGPAATQAIRFTNLLWRFVRNNIKLYLYYPFNVIEYSATKNNNYAIVSNDLLGHDLYAAPHTTSGNAEVLAIGRTGYGLYKDDSAKNNNNSDYALYRLLTSAKKRIYIAQQSLKAHFNTWPYDTTKEQHTNLISALAKLLMEAGHVYIVQSPYSDATMMESGYLSLATDEEVWSKIKSEAMAMYPALKEDTINLKLCNKLHISTIRFNEYDDLWTDNEKITGHYKFMMVDKGMFYVGSQNFYPSGLQNYGHIINSKKASNIIRNSFWRPLWKYSSRTEYIPDLCKQN
>NZ_CP038892.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVNRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038892.1|WP_155047020.1|7264_8188_+|hypothetical-protein
MSELKNKENFEDRGYAHYIQTCYFEEQKCYVKLSYKKDSSTSLLLFEALNLLSLKILGFAIPSTIHLIQDHKSNKCIGYLTSEVILDKTLKFIDFAEDISRITLTRLILGDNAATEDGNILMTRSQLISIDVPCFRLAPELVPSKYQDHLELFSKVFSNKDLLSHVSENTINHFYNNIGLISYELSRLYLDNVIDKIEKDGYLKKLINNIASFYGLISILKEKEYPHEFLSDFEDKLYFANRLEYIQQLNAIVVEQGLAAEKDHVSENLFFDANEYLEDIDTSELLFFDAKDTLEDTVAKNLDLSRV
>NZ_CP038892.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase
MINFSGRHFKKDLIMMAIRWYVAYTLSYRDIEELMAERGIQVDHSTIHRWVVKDTSQLEEHFKKRYKRQPGTSWRLDETYIDKYGDTIDFTLSKYRDEEAVYTFLKKATGSSNVIPDKIVIDQSGANTAGIMMFNYLLFILGLWFLMIEIIQIKYLNNIIEQDHRPVKKKMKAALGFKSTQGAKATISGVEFYRMLKKKQMHCHQDKPAYEQFYLLAA
>NZ_CP038892.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038892.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter
MFRNSATFHHYRSNNLVIPLFKGIVIFTVIGAVIGGQLDKIIPVAFVKILFTVIIISVLVQSFFHRINQVGKLEYQPVYPGFLSRSIMGFSVGILASLVGIGGSAITNPYMQYHRYPMKKSAAMSTALAFPMGLFALASLLASSVGMVGLPYGSLGYLYLPAFTGLLIGSLLGSPLGVWLVKRASEQTSVWVFRIILLAVIIQMVR

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	106963-107004	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	72670-72711	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	110060-110101	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	110348-110389	0	1.0
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NZ_CP038892_1	1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
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NZ_CP038892_1	1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
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NZ_CP038892_1	1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
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NZ_CP038892_1	1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038892_1	1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038892|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2892 : 100909	112	Streptococcus_phage(26.67%)	capsid,transposase,tail,head,integrase	NA
DBSCAN-SWA_2	105581 : 153740	60	Acinetobacter_phage(14.29%)	transposase,protease,integrase	attL 114020:114079|attR 137791:138762

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038892|2892:100909|DBSCAN-SWA
TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCAAAAACGTGACTTACAGGTATAAGGTACAACTTTGGTATGAGAGCATTCAGAGTTGCTACAACAATATTTTGAGTGACCCATAATGGTTGTGCCGCATGCAAGTACTTTAATCACGTTTTCCACAACGACATCACGGTGCTTATCCATGTTAGCTATGAAGTCACGCCACCAATTATCGGCAGTTTGAAGAAGATGTTTGACTGTGTTGAGCAATTATTTTTCTCTTAAAAACTATGCTCTATAGTAGCGATTACGTTGAGTTTAGCAAGGCCCTCCTAAAGCTGCCGACGCAGGAGGCCTCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTAATTGCAAAAAATAACTTTTTGTTATATAAGTATTTTTTAATCATGAAAAAAACTCGTGCAGATGTAGAGAAGGCGCTTCAAAAATCAAGAGAAAGTGGTAATGGGGTTAGTTTATCTGGTGCAAAATTAACTGATGTCACTGTAAGCACAACTGAGCTTAAATATGCGATATTTTCCAACAATTTTCATAATTAATGTGGTATAACCATGAAAATAAAAGTTTTTATTATTTTATCTATTATTTTTTACTCTAAGTTAATATATGCATCTCCTTTAAATGAAATATATAAAGATATTATATTAAAAACCGACCCAACCCGTAGTCAAGACGGCATTACCTATAGTTTCACGGAAAAAAATCTATTAAAAGACGATTTTCTAATTCAATTTCCTGGTAAAGGTGTTTGGGGTAAAAGCGCGAAAGATTACCCTGGATTTGCCTTTCATGTCGGTCTAGATCATGATTTTGGCTTACCTCATTGCCAGACTGATTCTCAGTGCATAACTAATAGCACTTGTTCAAATTTATTCTCATTTAATAATGAAGAGCACCATAAACATATTAAAATGTGCAATGGATATACTGAAAAAAATTTAGATCGTTTTTATAATATAATTATACGTGCCGAAAAATTTGTTGATATAACAACATTGGAACCGATGCCTGATTTAAGATTTAGATCAACTCTTCGCAATGCACTTACTTTTCTAGCAAGAACAGGAAAACATATCACGATTCGTATTTTATCTGGCTCATATCAAACTATGCCTAGTAAAGGACTTTCAAATGAACAACATAAAAATAAATCTCTCCTTGGTGGTTATCCAACTTGGTATTTTTTAAATGATTTAATCCGTGATATAAAAAACATCCCAGGATCTAATTTAAATTTATATGTTTCTTCTATGCGAAGTTGTTCTGGTAAGTGTGGCTCAGATTTTCTAATGTCTTTATCTTGGAACCATTCAAAAATAATTGATGTTGATGGTAAATATATTATTAGTGGTGGGGTAAACATGTATGACAGTTACTATTTGGGGAAACACCCAGTTTTTGATCTCATGATTGAGTTAGAAGGCCCAGCAGCAACTCAAGCAATTAGATTTACAAATTTGCTGTGGAGGTTTGTAAGGAATAATATTAAACTTTATCTTTACTATCCTTTTAATGTTATTGAGTATTCCGCAACAAAAAATAACAATTATGCTATTGTGAGTAATGATTTGCTAGGACATGATTTATATGCTGCACCTCATACTACTTCTGGAAATGCAGAAGTTCTTGCAATCGGTCGCACTGGTTATGGTTTATATAAGGATGATTCAGCTAAAAATAATAATAATTCAGACTATGCTTTGTATCGGTTATTAACTTCAGCAAAAAAAAGGATTTATATAGCACAACAGAGCCTTAAAGCACACTTTAATACTTGGCCTTATGATACTACAAAGGAACAACACACTAACCTTATTAGTGCCCTAGCTAAACTTCTCATGGAAGCAGGCCATGTATATATTGTCCAATCTCCTTACAGTGATGCAACTATGATGGAATCAGGTTATTTATCTTTAGCCACCGATGAAGAAGTATGGAGTAAAATAAAAAGTGAAGCGATGGCAATGTATCCAGCATTAAAAGAAGATACTATTAATTTAAAACTATGCAATAAATTGCATATTTCTACAATTAGGTTCAATGAATATGATGACTTATGGACTGATAATGAAAAAATAACAGGCCATTATAAATTTATGATGGTAGACAAAGGGATGTTTTATGTAGGATCACAAAACTTTTACCCATCAGGATTACAAAACTATGGTCATATCATTAATAGCAAGAAAGCATCTAACATTATTAGAAATAGTTTCTGGCGCCCTCTTTGGAAATATTCATCTAGAACAGAATATATACCTGATCTGTGCAAACAAAATTAATAACTTCTGAGGCATATAGTCTTCGCCCTCCGTCACATGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAATCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTATCCTTGTATGACGTCTTGTGTTGCACTGCAAATTACGGAGGGCGAACATAATTAAAATAGAGGTCTGCGGTCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAATTTTGAAGACCGTGGGTACGCACATTATATACAAACATGTTATTTTGAAGAACAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAAAGACTCTTCAACCTCTTTACTATTGTTCGAAGCATTGAACCTACTTTCTTTGAAAATTTTAGGATTTGCTATACCCAGTACTATTCATCTCATCCAAGATCACAAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGACTTTAAAGTTTATCGACTTTGCCGAAGATATTTCAAGAATAACCCTTACTCGACTAATTTTAGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGAAATATATTAATGACTAGGAGTCAATTGATCTCTATTGATGTACCATGCTTTCGTCTTGCGCCTGAACTCGTACCCAGTAAATATCAAGATCACCTTGAGTTATTTTCCAAAGTATTTTCAAATAAAGATTTGCTTAGCCATGTATCTGAAAATACAATCAACCATTTTTATAATAATATAGGCTTAATAAGCTATGAGCTTTCTAGGCTATATCTTGATAATGTAATTGACAAAATAGAAAAAGATGGCTATCTAAAAAAATTAATAAACAAT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075275128.1|98646_99012_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|98957_99533_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126790.1|100003_100909_+|transposase	IS481 family transposase	A8RHK4	Spiroplasma_virus	6.8e-14	26.0

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038892|105581:153740|DBSCAN-SWA
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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREMLKKASAYFASETQ
>NZ_CP038892|105581:153740|132925_133171_+|WP_129556700.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSFIYRSRYMVLRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD
>NZ_CP038892|105581:153740|133130_133586_+|WP_081007004.1|transposase|DBSCAN-SWA
MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRACRYLSFLKIASTILWLR
>NZ_CP038892|105581:153740|130470_131211_-|WP_033923775.1|DBSCAN-SWA
MSKYVAITGSSTGIGSSTVSKYLKEGYIVFGLDINKPEVTHNNFFHINCDISSVSSIKKARLEVDSFTKKVDHLVSNAGVHSFGSLKDLTEEKYEIIFNINVKGTLFFIQNFVTLIENNYGGSICLVGSDQSFVGKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYHILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ
>NZ_CP038892|105581:153740|147972_148176_+|WP_032126838.1|DBSCAN-SWA
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI
>NZ_CP038892|105581:153740|109534_109939_+|WP_016211897.1|DBSCAN-SWA
MAGQFDHLKKKNKIELTPDSFINEAAGGTVATLDRGNVDTSVAQEKAVDSPEEAKKKGRPRKDMASELLITTKGRHTRKKSEAFNLYLPKELDKEIAEKTAGNKQLVLNYLVKTAWDSIKRKGKMIVVDADEVA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126360.1|106363_107098_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211895.1|107220_108279_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211894.1|108787_109534_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	4.9e-18	29.9
WP_016211897.1|109534_109939_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|110332_111148_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212298.1|112921_113248_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|113488_113965_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
114020:114079	attL	NA	NA	NA	NA
WP_075275158.1|114079_114373_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377916.1|114489_115014_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.5e-29	46.4
WP_098082791.1|115218_115521_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	8.6e-14	44.6
WP_129556698.1|115529_116231_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_016211912.1|116320_116911_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
WP_032126795.1|117183_117444_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211910.1|117447_117720_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211913.1|118045_119167_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273786.1|119599_119998_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377915.1|120006_120564_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-47	51.5
WP_081377914.1|120708_121038_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|121154_121448_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_016212499.1|122446_122821_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212410.1|123025_123199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212408.1|123446_123896_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212412.1|123888_124053_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372613.1|124353_124980_+	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	1.8e-21	33.7
WP_054300202.1|125085_125814_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_054300590.1|125843_126068_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|126375_126576_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|126569_126905_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|127470_127734_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211872.1|128288_129092_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307367.1|129212_129737_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|129845_130070_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126346.1|130161_130404_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|130470_131211_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|131258_131687_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|132020_132749_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_129556700.1|132925_133171_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|133130_133586_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_054300148.1|133691_134753_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|134792_135296_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126739.1|135610_135943_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556701.1|136189_136714_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275159.1|137122_137830_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	3.8e-12	32.0
WP_129556702.1|137850_139003_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
137791:138762	attR	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|139987_140563_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|140508_140874_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212398.1|142221_142683_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|142945_143782_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_129556717.1|144107_145334_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212260.1|147119_147392_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212257.1|147411_147636_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126838.1|147972_148176_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212255.1|148172_148343_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|148529_149612_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_075273822.1|149768_150269_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274741.1|150370_150628_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|150696_151883_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_033923779.1|152619_153456_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|153467_153740_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038892.1|WP_016212298.1|112921_113248_-|hypothetical-protein	112921_113248_-	108 aa aa	NA	NA	NA	105581-153740	yes
NZ_CP038892.1|WP_016211913.1|118045_119167_-|hypothetical-protein	118045_119167_-	373 aa aa	NA	NA	NA	105581-153740	yes
NZ_CP038892.1|WP_016212499.1|122446_122821_+|hypothetical-protein	122446_122821_+	124 aa aa	NA	NA	NA	105581-153740	yes
NZ_CP038892.1|WP_016212398.1|142221_142683_-|hypothetical-protein	142221_142683_-	153 aa aa	NA	NA	NA	105581-153740	yes

Protein sequences of NZ_CP038892.1|WP_016212298.1|112921_113248_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038892.1|WP_016212298.1|112921_113248_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	140900-140937	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 position: 140900-140937, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038892.1|WP_016211913.1|118045_119167_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038892.1|WP_016211913.1|118045_119167_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	140900-140937	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 position: 140900-140937, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038892.1|WP_016212499.1|122446_122821_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038892.1|WP_016212499.1|122446_122821_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	140900-140937	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 position: 140900-140937, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038892.1|WP_016212398.1|142221_142683_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038892.1|WP_016212398.1|142221_142683_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038891_1	Orphan	1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder	363297-363334	38	140900-140937	1

1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038891|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 position: 140900-140937, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***