CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	10
NZ_CP038890	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP038888	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	6
NZ_CP038886	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 chromosome, complete genome	3 crisprs	DEDDh,csa3,RT,DinG,cas3	1	2	29	34
NZ_CP038889	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP038887

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038887_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038887_1
• CRISPR_location: 92177-92400
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038887_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038887_1

>1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038887_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038887_1

>merge|NZ_CP038887|1|92177-92400|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038887|1|1|92177-92400|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038887.1|WP_016211956.1|98312_99041_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_016212168.1|94534_96223_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_016212255.1|82868_83039_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_129556718.1|85392_86579_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP038887.1|WP_032126844.1|102053_102350_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_016211955.1|99497_100478_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_054300202.1|100623_101352_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038887.1|WP_016211953.1|97775_98255_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_032126838.1|82668_82872_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_016211879.1|90945_91965_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038887.1|WP_032126843.1|101655_101835_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_075273820.1|83225_84308_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038887.1|WP_075275149.1|96566_97541_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038887.1|WP_075273822.1|84464_84965_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038887.1|WP_059372616.1|89389_89980_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP038887.1|WP_075274741.1|85066_85324_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_155046769.1|87828_87999_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038887.1|WP_054300202.1|93837_94566_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038887.1|WP_081377350.1|88328_89144_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP038887.1|WP_155046770.1|93614_93782_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038887.1|WP_075273820.1|83225_84308_-|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	4.76533e-23
NZ_CP038887.1|WP_075275149.1|96566_97541_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	3.60259e-75
NZ_CP038887.1|WP_129556718.1|85392_86579_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	5.96251e-84
NZ_CP038887.1|WP_075273822.1|84464_84965_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	3.05671e-28
NZ_CP038887.1|WP_059372616.1|89389_89980_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	6.85681e-23
NZ_CP038887.1|WP_054300202.1|100623_101352_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038887.1|WP_016211879.1|90945_91965_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038887.1|WP_054300202.1|93837_94566_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038887.1|WP_081377350.1|88328_89144_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP038887.1|WP_155046770.1|93614_93782_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538

Protein sequences

>NZ_CP038887.1|WP_016211879.1|90945_91965_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038887.1|WP_059372616.1|89389_89980_+|site-specific-integrase
MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP038887.1|WP_081377350.1|88328_89144_+|hypothetical-protein
MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF
>NZ_CP038887.1|WP_155046769.1|87828_87999_+|hypothetical-protein
MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038887.1|WP_129556718.1|85392_86579_-|IS3-family-transposase
MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP038887.1|WP_075274741.1|85066_85324_-|hypothetical-protein
MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF
>NZ_CP038887.1|WP_075273822.1|84464_84965_+|hypothetical-protein
MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK
>NZ_CP038887.1|WP_075273820.1|83225_84308_-|IS481-family-transposase
MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRRTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR
>NZ_CP038887.1|WP_016212255.1|82868_83039_+|hypothetical-protein
MKKRIKATGAIERAARAAKMGRSRPAWSENFLNEFSEECKSRNSKKPDKYQEVRSK
>NZ_CP038887.1|WP_032126838.1|82668_82872_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI
>NZ_CP038887.1|WP_155046770.1|93614_93782_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP038887.1|WP_054300202.1|93837_94566_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038887.1|WP_016212168.1|94534_96223_-|hypothetical-protein
MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP038887.1|WP_075275149.1|96566_97541_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038887.1|WP_016211953.1|97775_98255_+|hypothetical-protein
MPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC
>NZ_CP038887.1|WP_016211956.1|98312_99041_+|hypothetical-protein
MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL
>NZ_CP038887.1|WP_016211955.1|99497_100478_+|hypothetical-protein
MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF
>NZ_CP038887.1|WP_054300202.1|100623_101352_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038887.1|WP_032126843.1|101655_101835_+|hypothetical-protein
MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE
>NZ_CP038887.1|WP_032126844.1|102053_102350_+|hypothetical-protein
MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT	92202-92243	42	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	106963-107004	0	1.0
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NZ_CP038887_1	1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT	92334-92375	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
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NZ_CP038887_1	1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT	92334-92375	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038887_1	1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT	92334-92375	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

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9. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|92202|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|92269|40|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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135. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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136. spacer 1.3|92334|42|NZ_CP038887|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2323 : 51606	57	Streptococcus_phage(32.0%)	integrase,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	54701 : 101352	55	Streptococcus_phage(22.22%)	integrase,transposase	attL 80648:80707|attR 107126:108234

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038887|2323:51606|DBSCAN-SWA
AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAATTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGCAATGGCTCAACCTTACGTGAAACCACCACGTATTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGTGTAGAACTTTAGATCTAATCTGACACTTGGGCCATATTGAACTAAATTTTCAATATGGATAATTAATCACACAAGGAGTGTTGTGATGACAAGTTTATCAGAAAAAATAATTAAGCCTAAACTAGGAGTTTTAGAATTAGCTAAACAATTAGGTAATGTTTCTAAGGCATGCGAAGTGATGGGGTATTCTCGAGATAGTTTTTATCGCTTCAAAAAGCTTTATGAAACGGGTGGCGAAGAAGCTTTGCAAGAGATTAGCAAGAAGAGGCCAAATGTGAAAAACCGTGTTCCTGAGCATATTGAGCAGGCAGTCATTGATTTAGCCATTGAAAACCCAGCGTTAGGTCAACTCCGTGCATCAAACGAACTGTTACAGAGAGGGGTCATAGTATCGAGTAGTGGTGTGCGATCAGTCTGGTTAAGGAATGGCCTTGAGACGTTCAAGAAGAGGCTCAAAGCGCTTGAAGCCAAATCAGCACAAGATGGAATTTTGCTGACGGAAGAGCAACTGCAAGCACTTGAGAAAGCAAAACAAGAAAAAGAAGCACATGGAGAAATTGAGACTGAACACCCAGGCTATCTCGGCTCCCAAGACACCTATTACGTTGGAACAATGAAAGGTGTTGGAAGAATTTATCAGCAGACATTTGTTGATACCTACAGCAGGGTTGCATTTGCTTGCCTGTATACCGAAAAAAATGCAGTGACGGCAGCTCATGCGCTGAATGAAAGTGTAATCCCCTGGTTTGAAGAGCGAGATACTCCATTGCTACGCATTTTAACTGATCGGGGAACAGAGTATTGCGGCAAGATAGAACATCACGCTTATCAGCTTTATTTAGCGATCGAAGATGTAGATCACACCAGAACAAAAGCCCGTTCACCTCAAACAAATGGTATTTGTGAACGCTTTCATCGCACGATGAAACAAGAGTTTTATGACATTGCTTTTCGTAAAAAAGTCTATAATTCACTTGAGGAGCTGCAAGTTGATGTTGATGAGTGGTTGATAAAGTACAATCAGCATCGGCCACATTCTGGGAAATACTGTTATGGAAAAACACCAATGCAAACATTTCAGGACTCAAAACATTTAGCACAAGAAAAAATAATCAATAAAAATGTGCAATCTGACAGTCTGATCAATCAGACAAATGTTGTCAGATGATTTAAGCTTGTCAGATCATATCTGGAGTTTTACAGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGCAGCGAACATAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCCCTATAACTTTTCGCAACAGTGCCGTTTTTCACATTTGGCTTCTTCTTGCTAATCTCTTGCAAAGCTTCTTCGCCACTCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCTCTTAGTCAGTCATATAATATAAGTAGCAGCCGGATTATCAAACAATTCAATTGGCCGGATATAACGATCTAGTGCAGCGGAACTGTGTTGACTCACCTGGCGTAACTTTTCCCCAGGCGCTCCATTGAGTTTTGCTTGCGTTAAAAAACCAGCTCTAAAACTATGAGGTGTATAACCTGATAAGCCTGAATGATTGAGATATTTATTAAGAATATGATCAACTGCACTACTCGACAGAGGTTTGTATTGCAACTGCTCCCCTTTTTTAATCTCTCTAAAAATGGAGCCTTCTTTAATGTTTGAGCGTTGAAACCAACACTGCATCAATGTTACCGGACAATATCGATAAGTTGGTTGTAATATGATAGGCACTTGCAGCAACTTTTCACCTGCCTGATTAATTTTATTACGCCCAAGATTAAATAGCACACCTTTGCCACTCACCCACTCAAAATCTTCAATATTAGCAGCCACCACTTCAGATTTTCTGAAGGCACCAAACCACAACCAAGATAACAGTGTTACATCACGTAATCCGGTTAATGTATTTTTATCAATCACCGCCAATAATCTCTCGAAGTCATTTTTAAGCAACGGCTTTGCTTGTTTTGGTCTGTAGTTATCATTGCGCTTGATTGCAAATAAGATGGCTTTGACCTGCATTGAGTCACTAAAACTCTTAAATCCCATCTTAATATGCTTGGAATTAATGGCTGCCAATGACTTTTGAATGGTTGTTCTTTTAAGATTTTTTTTCTTATACAGGTAGTGCAAAAAAAGTGCGACCGCTCCTTCATCCGCCGGTAAAGGGACTAAGCCTAATTTATAGCAGTAATTTTCAAAATCTTTCCAGGGCTTTGCATAGGCTGTTTCTGTGCTTTTTGCTGTTTGATTATCTTTAACAAATGCTTCAAGGTCTTTGAGTGATTGCAGTAACTCTGAAGAACTGTCTATTTTCATTAATTTATCCATACTGCAACCACAACCGATCTATACTATAGTTTATTTTTAGAGCCTTTCGATAGACCCACTTTTTTGGTGGTCGTTGTTTTTTTTTCCTTAGGCTTCTTTGCAACTACTTTTTTAGAAGAAGCTTTTTTAGTTGTTGTTTTACTCGTTACTGACTTTTTAGCTGGCTTATCATCATCTAAAATTTCACCCAACTTTTTCCAAGTGATTTTTTTATTGTTTAAGGTGATACCACTACTACTGACTGCTAACGTACCAAACTTTTTAGAACCATCTTTAATCTCAAAAGTCATTCCTTTTGCTTTAACGTCTAAATCGCCTAAGTTCAGTGTTACTTTCATAAAATAGCCTTTTATTTTTAAGTTATTAACCTTAACTCATGTTACGCGCTTAACCTTTAAGCCATACTTCTAAGCTCCTGAAGTGCAATTTGATTAGCCCTTAATATCAGCTTATATTTTATTGCAAAATGGTTTAAAGATTTTTTCAATTTTAATCTTTCCAATCTGCAAAACCCAAGAATACTGTAATAAATATGGTTCAACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300162.1|4369_5452_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_016212151.1|5816_6779_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	NA	NA	NA	NA
WP_016212150.1|6802_7117_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923686.1|7173_8223_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211885.1|8331_9372_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556706.1|9385_10015_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211886.1|10401_10830_-	nucleotidyltransferase substrate-binding, HI0074 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126832.1|12591_13500_+	chemotaxis protein CheV	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|13610_14339_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_075274955.1|24578_25553_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
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WP_105962623.1|27560_28714_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_033923779.1|29142_29979_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_075275144.1|30011_30743_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_016212017.1|31548_31947_+	hypothetical protein	W8VUR5	Pseudomonas_phage	2.3e-06	38.8
WP_047927838.1|31976_32222_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212018.1|32218_32518_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
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WP_016212154.1|35648_36026_+|transposase	IS3 family transposase	Q716C2	Shigella_phage	1.2e-17	46.0
WP_016212152.1|36332_36716_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|37185_37914_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_016211775.1|38367_38736_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	1.2e-25	46.3
WP_016211773.1|38837_39512_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|39964_40330_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|40275_40851_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_016211894.1|43481_44228_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	4.9e-18	29.9
WP_016211897.1|44228_44633_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300202.1|46446_47175_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212298.1|47616_47943_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|48183_48660_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
WP_075275158.1|48774_49068_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377916.1|49184_49709_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.5e-29	46.4
WP_098082791.1|49913_50216_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	8.6e-14	44.6
WP_129556698.1|50224_50926_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_016211912.1|51015_51606_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038887|54701:101352|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016212410.1|57720_57894_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212408.1|58141_58591_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212412.1|58583_58748_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372613.1|59048_59675_+	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	1.8e-21	33.7
WP_054300202.1|59780_60509_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_054300590.1|60538_60763_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|61070_61271_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|61264_61600_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|62165_62429_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211872.1|62983_63787_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307367.1|63907_64432_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|64540_64765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126346.1|64856_65099_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|65165_65906_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|65953_66382_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|66715_67444_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_129556700.1|67620_67866_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|67825_68281_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_054300148.1|68386_69448_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|69487_69991_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126739.1|70305_70638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556701.1|70884_71409_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275159.1|71817_72525_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	3.8e-12	32.0
WP_129556702.1|72545_73698_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273327.1|74682_75258_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|75203_75569_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212398.1|76916_77378_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|77640_78477_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_129556717.1|78802_80029_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
80648:80707	attL	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|80683_81658_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
WP_016212260.1|81815_82088_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212257.1|82107_82332_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126838.1|82668_82872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212255.1|82868_83039_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|83225_84308_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_075273822.1|84464_84965_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274741.1|85066_85324_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|85392_86579_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_155046769.1|87828_87999_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377350.1|88328_89144_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372616.1|89389_89980_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	6.8e-23	38.8
WP_016211879.1|90945_91965_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211878.1|91977_93318_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046770.1|93614_93782_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|93837_94566_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016212168.1|94534_96223_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275149.1|96566_97541_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.9e-25	30.7
WP_016211953.1|97775_98255_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211956.1|98312_99041_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211955.1|99497_100478_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|100623_101352_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
107126:108234	attR	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038887.1|WP_155046766.1|19264_19402_-|hypothetical-protein	19264_19402_-	45 aa aa	NA	HTH_38	NA	2323-51606	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212137.1|21792_22854_-|hypothetical-protein	21792_22854_-	353 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2323-51606	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212139.1|22929_23175_-|hypothetical-protein	22929_23175_-	81 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2323-51606	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212298.1|47616_47943_-|hypothetical-protein	47616_47943_-	108 aa aa	NA	HTH_21	NA	2323-51606	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212499.1|57141_57516_+|hypothetical-protein	57141_57516_+	124 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	54701-101352	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212398.1|76916_77378_-|hypothetical-protein	76916_77378_-	153 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	54701-101352	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212260.1|81815_82088_+|hypothetical-protein	81815_82088_+	90 aa aa	NA	HTH_38	NA	54701-101352	yes
NZ_CP038887.1|WP_016212257.1|82107_82332_+|hypothetical-protein	82107_82332_+	74 aa aa	NA	HTH_38	NA	54701-101352	yes
NZ_CP038887.1|WP_032126838.1|82668_82872_+|hypothetical-protein	82668_82872_+	67 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	54701-101352	yes
NZ_CP038887.1|WP_155046769.1|87828_87999_+|hypothetical-protein	87828_87999_+	56 aa aa	NA	HTH_21	NA	54701-101352	yes

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_155046766.1|19264_19402_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_155046766.1|19264_19402_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVIKKSVKNLSRKRLPDQRPRLQVLNSTAC

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	39939-39902	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 39939-39902, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212137.1|21792_22854_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212137.1|21792_22854_-|hypothetical-protein
MPKFIEINKTQLETKIKEFYNEVDPKNKEKYKYIRSNIDFTLEALKKTCDTSLTELFMEHYFNPESVSDPTLQVAQCKNTLLTQLNDMLKSKKSKDKGKAPAIVSYITLIMKDVIALNFTLALDEFNKLYSWDKVKKLNLSKEYFNKILCNPSCFKDAIKLDFNQEYIEKSLDHPGFLKAALEDLTSKNNIQTILDALTLEKNNICEDISFSEAKSFLQHHKGCIARKCKNHPDKIAFGHIDEKGLIQQHLIEFKVDSWILKSGPEAQLGTKLGVTLTDIARNEGSLLHSSDSVKHWQSKREQMANSPSTCFFFDTKDLSYDNFKSSDEPEFIYHKSLEKKNSSSGQSNSVKL

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	39939-39902	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 39939-39902, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212139.1|22929_23175_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212139.1|22929_23175_-|hypothetical-protein
MQKERELVLNKYKQEHKQEKNEIFLKIKESFKSLDIPEHKKLVIGDCQTLRDLCSAVSCQETHNYDATGSQDRKFMQLIPE

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	39939-39902	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 39939-39902, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212298.1|47616_47943_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212298.1|47616_47943_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	39939-39902	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 39939-39902, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212499.1|57141_57516_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212499.1|57141_57516_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	75595-75632	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 75595-75632, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212398.1|76916_77378_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212398.1|76916_77378_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	75595-75632	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 75595-75632, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212260.1|81815_82088_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212260.1|81815_82088_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	75595-75632	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 75595-75632, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_016212257.1|82107_82332_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_016212257.1|82107_82332_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	75595-75632	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 75595-75632, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_032126838.1|82668_82872_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_032126838.1|82668_82872_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	75595-75632	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 75595-75632, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038887.1|WP_155046769.1|87828_87999_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038887.1|WP_155046769.1|87828_87999_+|hypothetical-protein
MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	75595-75632	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 position: 75595-75632, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

2. NZ_CP038888

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4824 : 28863	33	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	37207 : 57888	29	Pseudomonas_phage(11.76%)	portal,head,protease,terminase,tail,capsid	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038888|4824:28863|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|6750_7903_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212392.1|7931_8939_-	hypothetical protein	W6E8G0	Rhizobium_phage	1.2e-06	26.4
WP_075273802.1|9002_9731_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
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WP_016212135.1|10700_11885_+	3-methylitaconate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_075275202.1|12128_12830_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.0e-10	31.2
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WP_016212164.1|13689_14718_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211443.1|15741_16428_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211439.1|16431_16986_+	recombinase family protein	M9Q1K0	Clostridium_phage	1.0e-20	40.6
WP_016211436.1|17030_17969_+	fic/DOC family protein	S4TP71	Salmonella_phage	5.2e-25	37.2
WP_016211434.1|17941_18133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211445.1|18310_18661_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211437.1|18677_19304_-	zinc-ribbon domain-containing protein	A0A1S5XYQ1	Kurlavirus	4.4e-12	28.2
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WP_016211440.1|19713_20628_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211444.1|20897_21404_+	antirestriction protein ArdA	A0A222YZE5	Mycobacterium_phage	2.8e-17	33.7
WP_051307358.1|21552_21936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036771330.1|22866_23841_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
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WP_016212087.1|24063_24492_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104629.1|27271_28297_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275198.1|28323_28863_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.4e-12	40.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038888|37207:57888|DBSCAN-SWA
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MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI
>NZ_CP038888|37207:57888|45661_46996_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP038888|37207:57888|40975_41332_+|WP_080743047.1|DBSCAN-SWA
MTLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDS
>NZ_CP038888|37207:57888|44347_45541_+|WP_016211140.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS
>NZ_CP038888|37207:57888|40750_40960_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA
MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG
>NZ_CP038888|37207:57888|37207_37888_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA
MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN
>NZ_CP038888|37207:57888|39178_39496_+|WP_129556723.1|DBSCAN-SWA
MPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS
>NZ_CP038888|37207:57888|54252_54507_-|WP_016210670.1|DBSCAN-SWA
MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNAPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLNSPDCDFIDVDVDDL
>NZ_CP038888|37207:57888|48202_48553_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA
MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP038888|37207:57888|47186_47498_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP038888|37207:57888|49626_51705_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038888|37207:57888|40267_40747_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA
MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD
>NZ_CP038888|37207:57888|39796_40180_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA
MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI
>NZ_CP038888|37207:57888|53411_53969_+|WP_016210665.1|tail|DBSCAN-SWA
MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRQSLTIEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFAQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVATPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL
>NZ_CP038888|37207:57888|41350_42433_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA
MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL
>NZ_CP038888|37207:57888|43618_44290_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP038888|37207:57888|47810_48206_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP038888|37207:57888|54600_57888_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA
MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|37207_37888_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|38066_38360_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|38577_38760_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|38904_39084_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556723.1|39178_39496_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|39796_40180_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|40267_40747_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|40750_40960_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_080743047.1|40975_41332_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	5.4e-23	61.3
WP_081377926.1|41350_42433_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|42429_43671_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_080664855.1|43618_44290_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_016211140.1|44347_45541_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|45661_46996_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|47186_47498_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|47494_47818_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|47810_48206_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|48202_48553_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|48552_48975_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|48976_49300_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|49356_49623_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|49626_51705_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|51697_52039_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|52035_52707_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|52675_53422_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|53411_53969_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|53975_54263_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|54252_54507_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|54600_57888_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038888.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein	5761_6361_-	199 aa aa	NA	HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038888.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein	6360_6594_-	77 aa aa	NA	HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038888.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein	9914_10262_+	115 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038888.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein	23884_24064_+	59 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038888.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein	24063_24492_+	142 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038888.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein	24659_25199_-	179 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes

Protein sequences of NZ_CP038888.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038888.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038888.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038888.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein
MPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038888.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038888.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038888.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038888.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038888.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038888.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein
MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038888.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038888.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein
MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP038886

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038886_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038886_1
• CRISPR_location: 363130-363259
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038886_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038886_1

>1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038886_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038886_1

>merge|NZ_CP038886|1|363130-363259|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038886|1|1|363130-363259|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038886.1|WP_016212010.1|364831_365128_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016212044.1|355731_355986_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038886.1|WP_075273359.1|361387_361963_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038886.1|WP_075273619.1|366669_367245_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016212008.1|364116_364815_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016211268.1|368251_369436_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038886.1|WP_036794771.1|356708_357695_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038886.1|WP_080664870.1|358709_359357_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038886.1|WP_016212359.1|353632_353851_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016211273.1|367302_368136_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038886.1|WP_054300520.1|361908_362223_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_129556444.1|359349_359772_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016211795.1|357832_358027_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016211271.1|369454_370399_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038886.1|WP_016211797.1|359933_361337_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038886.1|WP_016211272.1|371606_371975_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP038886.1|WP_016211269.1|370703_371489_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP038886.1|WP_054300271.1|354218_355193_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038886.1|WP_032126227.1|363788_364079_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_129556446.1|365245_366397_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038886.1|WP_016212044.1|355731_355986_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038886.1|WP_016211268.1|368251_369436_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038886.1|WP_075273359.1|361387_361963_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038886.1|WP_054300271.1|354218_355193_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038886.1|WP_016211797.1|359933_361337_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038886.1|WP_016211272.1|371606_371975_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038886.1|WP_016211269.1|370703_371489_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038886.1|WP_036794771.1|356708_357695_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038886.1|WP_080664870.1|358709_359357_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06
NZ_CP038886.1|WP_016211271.1|369454_370399_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038886.1|WP_016211273.1|367302_368136_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151

Protein sequences

>NZ_CP038886.1|WP_054300520.1|361908_362223_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038886.1|WP_075273359.1|361387_361963_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038886.1|WP_016211797.1|359933_361337_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038886.1|WP_129556444.1|359349_359772_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038886.1|WP_080664870.1|358709_359357_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038886.1|WP_016211795.1|357832_358027_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038886.1|WP_036794771.1|356708_357695_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038886.1|WP_016212044.1|355731_355986_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038886.1|WP_054300271.1|354218_355193_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038886.1|WP_016212359.1|353632_353851_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038886.1|WP_032126227.1|363788_364079_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038886.1|WP_016212008.1|364116_364815_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038886.1|WP_016212010.1|364831_365128_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038886.1|WP_129556446.1|365245_366397_+|hypothetical-protein
MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038886.1|WP_075273619.1|366669_367245_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038886.1|WP_016211273.1|367302_368136_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038886.1|WP_016211268.1|368251_369436_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038886.1|WP_016211271.1|369454_370399_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038886.1|WP_016211269.1|370703_371489_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038886.1|WP_016211272.1|371606_371975_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038886_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038886_2
• CRISPR_location: 680166-680286
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038886_2

Consensus_repeat	Method
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038886_2

>2.1|680203|47|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder
GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038886_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038886_2

>merge|NZ_CP038886|2|680166-680286|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

>NZ_CP038886|2|2|680166-680286|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG
AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038886.1|WP_054300282.1|678323_678788_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038886.1|WP_075275117.1|680442_680865_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210936.1|667791_668586_+|thymidylate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234984
NZ_CP038886.1|WP_098082812.1|682283_682799_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210935.1|671051_671594_+|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038886.1|WP_016210672.1|688668_690051_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038886.1|WP_052047041.1|681787_682051_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016211759.1|673406_674594_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038886.1|WP_016210678.1|682943_683954_-|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP038886.1|WP_016210942.1|669753_670365_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038886.1|WP_032126312.1|675743_676538_+|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038886.1|WP_016211756.1|674839_675565_+|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038886.1|WP_129556590.1|676534_676930_-|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP038886.1|WP_016210944.1|668687_669707_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038886.1|WP_016210673.1|688186_688660_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210671.1|686794_688054_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038886.1|WP_016210943.1|670368_671055_+|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038886.1|WP_016211905.1|681108_681519_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210676.1|684257_686339_-|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038886.1|WP_016210677.1|690043_690658_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|180312

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038886.1|WP_054300282.1|678323_678788_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038886.1|WP_016210936.1|667791_668586_+|thymidylate-synthase	gnl|CDD|234984	PRK01827, thyA, thymidylate synthase; Reviewed.	0
NZ_CP038886.1|WP_016210935.1|671051_671594_+|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038886.1|WP_016210672.1|688668_690051_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038886.1|WP_016210677.1|690043_690658_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP038886.1|WP_016211759.1|673406_674594_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038886.1|WP_016210678.1|682943_683954_-|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP038886.1|WP_016210942.1|669753_670365_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038886.1|WP_032126312.1|675743_676538_+|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038886.1|WP_016211756.1|674839_675565_+|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038886.1|WP_129556590.1|676534_676930_-|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038886.1|WP_016210944.1|668687_669707_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038886.1|WP_016210671.1|686794_688054_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038886.1|WP_016210943.1|670368_671055_+|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038886.1|WP_016210676.1|684257_686339_-|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09

Protein sequences

>NZ_CP038886.1|WP_054300282.1|678323_678788_+|IS630-family-transposase
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038886.1|WP_129556590.1|676534_676930_-|nucleic-acid-binding-protein
MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
>NZ_CP038886.1|WP_032126312.1|675743_676538_+|M48-family-metallopeptidase
MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL
>NZ_CP038886.1|WP_016211756.1|674839_675565_+|M15-family-metallopeptidase
MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN
>NZ_CP038886.1|WP_016211759.1|673406_674594_-|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP038886.1|WP_016210935.1|671051_671594_+|acireductone-dioxygenase
MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD
>NZ_CP038886.1|WP_016210943.1|670368_671055_+|acireductone-synthase
MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP038886.1|WP_016210942.1|669753_670365_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG
>NZ_CP038886.1|WP_016210944.1|668687_669707_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
>NZ_CP038886.1|WP_016210936.1|667791_668586_+|thymidylate-synthase
MRTYLDLMQRVLETGAEKTDRTGTGTLSVFGHQMRFDLSAGFPLLTTKKLHLRSIIHELLWFLKGETNIAYLNENKVRIWDEWANAEGDLGPIYGAQWRSWAGADGKTIDQMTQVIEQIKINPDSRRLIVSAWNVAEIEKMALPPCHALFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTLMIAQVTGLEPGDFVHTLGDAHLYSNHLEQVKTQLQRDCRGLSMMKINPEVKDIFDFKYEDFILENYDPHPHIKGAVAV
>NZ_CP038886.1|WP_075275117.1|680442_680865_+|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038886.1|WP_016211905.1|681108_681519_-|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038886.1|WP_052047041.1|681787_682051_-|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038886.1|WP_098082812.1|682283_682799_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038886.1|WP_016210678.1|682943_683954_-|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038886.1|WP_016210676.1|684257_686339_-|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038886.1|WP_016210671.1|686794_688054_-|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038886.1|WP_016210673.1|688186_688660_+|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038886.1|WP_016210672.1|688668_690051_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
>NZ_CP038886.1|WP_016210677.1|690043_690658_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase
MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER

Crispr_ID: NZ_CP038886_3

• CRISPR_ID: NZ_CP038886_3
• CRISPR_location: 1612449-1612555
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038886_3

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038886_3

>3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038886_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038886_3

>merge|NZ_CP038886|3|1612449-1612555|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP038886|3|3|1612449-1612555|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038886.1|WP_016210800.1|1616325_1617153_-|DsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP038886.1|WP_051307339.1|1620992_1621799_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP038886.1|WP_032126362.1|1607036_1607402_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
NZ_CP038886.1|WP_016211834.1|1609546_1609861_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210749.1|1601518_1601980_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210799.1|1619037_1619991_+|chemotaxis-protein-CheV	unknown	unknown	gnl|CDD|223905
NZ_CP038886.1|WP_016212182.1|1604913_1605099_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_075273540.1|1617519_1618131_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_016210791.1|1620417_1620618_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038886.1|WP_051307365.1|1610117_1610378_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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NZ_CP038886.1|WP_080664871.1|1607833_1609456_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223732
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NZ_CP038886.1|WP_016212185.1|1605432_1606422_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038886.1|WP_016210800.1|1616325_1617153_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.60773e-43
NZ_CP038886.1|WP_032126362.1|1607036_1607402_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08
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NZ_CP038886.1|WP_016212185.1|1605432_1606422_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP038886.1|WP_051307339.1|1620992_1621799_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	3.41626e-38
NZ_CP038886.1|WP_080664871.1|1607833_1609456_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	gnl|CDD|223732	COG0659, SUL1, Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) [Inorganic ion transport and metabolism].	7.37206e-122
NZ_CP038886.1|WP_016210748.1|1602278_1604234_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP038886.1|WP_016210795.1|1621904_1622876_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP038886.1|WP_051307338.1|1614550_1616116_-|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.15465e-34
NZ_CP038886.1|WP_075273327.1|1606515_1607091_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP038886.1|WP_016211836.1|1610397_1610886_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP038886.1|WP_052047040.1|1613586_1614525_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24

Protein sequences

>NZ_CP038886.1|WP_016211836.1|1610397_1610886_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP038886.1|WP_051307365.1|1610117_1610378_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP038886.1|WP_016211834.1|1609546_1609861_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP038886.1|WP_080664871.1|1607833_1609456_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter
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>NZ_CP038886.1|WP_032126362.1|1607036_1607402_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038886.1|WP_075273327.1|1606515_1607091_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038886.1|WP_016212185.1|1605432_1606422_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP038886.1|WP_016212182.1|1604913_1605099_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP038886.1|WP_016210748.1|1602278_1604234_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP038886.1|WP_016210749.1|1601518_1601980_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
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MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
>NZ_CP038886.1|WP_052047040.1|1613586_1614525_+|IS3-family-transposase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
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MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSKFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP038886.1|WP_016210800.1|1616325_1617153_-|DsbA-family-protein
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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NZ_CP038886_1	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
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NZ_CP038886_3	3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	1612487-1612517	31	NZ_CP054613	Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence	817611-817641	7	0.774
NZ_CP038886_3	3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	1612487-1612517	31	NZ_CP016317	Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence	195628-195658	8	0.742
NZ_CP038886_3	3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	1612487-1612517	31	CP020755	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence	498805-498835	8	0.742
NZ_CP038886_3	3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	1612487-1612517	31	NZ_CP021062	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence	129826-129856	8	0.742
NZ_CP038886_3	3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	1612487-1612517	31	NC_020385	Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence	309123-309153	8	0.742
NZ_CP038886_3	3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	1612487-1612517	31	NC_018492	Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence	56616-56646	8	0.742

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

134. spacer 3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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135. spacer 3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 3.1|1612487|31|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	46	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	tRNA,transposase,tail,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 301882	48	Acinetobacter_phage(40.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	329457 : 375012	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447624 : 560127	108	Escherichia_phage(28.57%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_7	585116 : 636261	52	Staphylococcus_phage(37.5%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	644348 : 678788	36	Catovirus(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	707428 : 821708	110	Escherichia_phage(36.59%)	tRNA,transposase,integrase,protease	attL 724042:724101|attR 730270:730557
DBSCAN-SWA_10	904114 : 956173	45	Agrobacterium_phage(12.5%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	1018084 : 1099692	82	Staphylococcus_phage(35.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1120362 : 1247711	119	Staphylococcus_phage(17.65%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_13	1290431 : 1473639	176	Leptospira_phage(12.5%)	tRNA,transposase,integrase,protease	attL 1356116:1356175|attR 1424655:1425884
DBSCAN-SWA_14	1478080 : 1522211	46	Escherichia_phage(16.67%)	transposase,integrase	attL 1493206:1493265|attR 1522978:1523268
DBSCAN-SWA_15	1551833 : 1607091	47	Bacillus_thuringiensis_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1613259 : 1669052	57	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_17	1697078 : 1735920	31	Staphylococcus_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_18	1746185 : 1846080	96	Staphylococcus_phage(20.0%)	tRNA,transposase,integrase,protease	attL 1816596:1816655|attR 1851080:1851160
DBSCAN-SWA_19	1872930 : 1932040	55	uncultured_Mediterranean_phage(30.77%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1968854 : 2055276	83	Bacillus_phage(15.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	2091121 : 2204426	94	Vibrio_phage(13.33%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_22	2233882 : 2341999	115	Acinetobacter_phage(11.11%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2356428 : 2403972	48	Bacillus_phage(16.67%)	transposase,integrase	attL 2393890:2393949|attR 2411174:2411613
DBSCAN-SWA_24	2410222 : 2464675	45	Bacillus_phage(15.38%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_25	2481362 : 2528030	39	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2563460 : 2616644	52	Prochlorococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_27	2653723 : 2792707	140	Escherichia_phage(32.14%)	tRNA,transposase,integrase,plate	attL 2758663:2758722|attR 2772448:2772639
DBSCAN-SWA_28	2905269 : 2948667	41	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_29	2980352 : 3100259	113	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038886|45566:89679|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
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WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
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WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038886|136473:178470|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|136473_137448_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|137949_139362_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
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WP_016211636.1|140881_142402_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038886|182276:239530|DBSCAN-SWA
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MAWLELKVITTRQHAELIGDYLNEVGALAITLRDGKDQPILEPGVGETPLWQDVHVIALFDAGIELEPVREQLLVQFDELNDISVKIDPLEDQDWTATWREHFEPMLFADRLWVHADWHEVNARENQVKMLLNPGLAFGTGTHPTTAMCLNWLAGHLNPGSRVIDFGCGSGILAIAALKLGAHYVHCIDIDPQALEAMHYNAKQNELDPSCYQAVLPEQFTISDITSTGADVLVANILANPLIGLAPQFASLVKAGGMLVLSGILVEQAERVQTAYLDHFDLVELQQDDEWVCVIAQRKAY
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MSKKLPSERFFYIRLDLAIIALFGIILLIGVSNWFDRYLYQCVTLLAYSGVAVLWLLCRIKRQLNQLKCIKNANAEDVDGKEVEK
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MPNCQSDYLDLIYQKILNTQRTGIGNCVQAANRVSHLLNTGTDLTESYLQRLPRISKKQFFYHFKDGEAPLKALMHTLNEGQHVQVSADIAHLTCINHVFNAIKLEGEIKLIDNYQTWPNPPWLQQAWYHPKEFLTHLTH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016210779.1|186290_187220_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210775.1|187512_188106_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
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WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|229340_230036_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|234173_234800_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038886|256927:301882|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MRKTRSDVIKEINKAAAVNGSGSVNLRYWDLRGANLSGLYLLGADLEGANLEGANLSKSYLKNAYLSRICLKNANLSGALLYQANLRGSNLEGADFS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556436.1|258122_259009_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211358.1|259577_260039_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|260462_261944_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
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WP_155046702.1|267348_267504_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|270449_271602_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_129556438.1|272336_273803_-	signal recognition particle-docking protein FtsY	NA	NA	NA	NA
WP_032126861.1|274006_274321_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|274655_275542_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212538.1|275713_276154_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210630.1|276683_277799_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210128.1|331204_331468_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210132.1|331834_332653_-	kinase/pyrophosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556442.1|332725_335098_+	phosphoenolpyruvate synthase	A0A1V0SGR7	Hokovirus	2.8e-160	35.3
WP_016210125.1|335810_337238_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210131.1|337272_338295_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038886|447624:560127|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275004.1|447624_448488_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|448704_450264_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|450285_451320_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|451368_451938_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|452073_453045_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
WP_016210645.1|453056_454634_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556624.1|454699_455686_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210646.1|456017_457127_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210650.1|457232_458417_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210649.1|458494_460483_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|460691_460847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|461104_461404_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461562_461898_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|462814_464221_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|464238_465225_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465227_466382_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466378_467074_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467208_468699_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468719_469769_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469835_471230_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472108_474040_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|474044_474575_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|474609_474804_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|474846_475206_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475625_476621_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476633_479015_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|479020_479308_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|479579_480056_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|480200_480398_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|480522_481497_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|483605_483704_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210477.1|484188_485478_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126626.1|485714_486407_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|486448_487222_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|487223_488165_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|488297_489875_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|490084_491842_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|492390_493149_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|493356_493929_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|494032_494581_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|494882_495128_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|495156_495453_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|495720_496644_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275008.1|497443_498172_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.3e-43	41.8
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WP_016210376.1|538484_540965_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	4.1e-194	44.3
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WP_080664840.1|542477_543194_+	nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210374.1|543206_543542_+	ribosome silencing factor	NA	NA	NA	NA
WP_016210381.1|543578_544049_+	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
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WP_016212038.1|554699_555611_-	polysaccharide deacetylase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274953.1|559263_560127_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038886|585116:636261|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038886|644348:678788|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126310.1|664362_665622_-	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
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WP_016210942.1|669753_670365_+	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210943.1|670368_671055_+	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211756.1|674839_675565_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_129556590.1|676534_676930_-	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300282.1|678323_678788_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038886|707428:821708|DBSCAN-SWA
CATGTCTGAGGTGGCCCAGGCGTTAGAAATTATCAAACGCGGTGTAGATGAGATCATTGTTGAAGATGAGTTAGTTAAAAAATTAGCAGCAGGGACGCCTTTGCGAGTGAAATTGGGTATGGATCCAACAGCAGCCGACTTACACTTAGGCCATACGGTGGTGTTAAATAAAATGCGTCAGCTGCAAGATCTCGGGCATGAAATTTTATTTTTAATTGGTGATTTTACTGCAACTATTGGTGACCCGACAGGTAAAAATATCACTCGCCAGCCCTTATCTGCTGAGCAAGTTGAAAAAAACGCAGCGACGTATACATCACAAGTATTTAAAATCCTTGATGAAGATAAAACACAGATTCTGTTTAATTCAGAATGGATGGGCCAAAAAACTGCAGCGGATATGATCGCGTTAGCCTCAAGTTATACGGTGGCGCGTATGCTTGAGCGTGATGATTTTGCTAAGCGCTATGGCAATAATCAACCGATTGCGATTCATGAGTTTATTTATCCTTTGGTTCAGGGCTATGACTCTGTTGCTATGAAAGCAGATATTGAGCTTGGTGGCACGGATCAGAAATTTAATTTATTGATGGGACGTGAATTGCAACGACAATATGGTCAGCGCCCGCAGACAATCATTACCATGCCATTACTGGAAGGTTTGGATGGTGTGAAAAAAATGTCTAAATCTTTAGGGAATTATATTGGTATAGCAGAATCGGCCAGTGAGATGTTTGGCAAAATGATGTCTGTTTCTGATGAGTTAATGTGGCGCTATTATGAATTGCTGAGTTTTAAGCCGATGGCAGAGATTAAAGCCTTAGAGCAAGCTGTGGCAGAAGGCATGAATCCACGTGATGCAAAAGTTGCTTTGGCCAAAGAGATAGTCGCGCGTTTTCATTCAGAACACGCTGCAGCGGCGGCGTATGATGAATTTGTCAATCGTTTTAAAAAAGGGGTGTTGCCTGAAGATATGCCAGAAGTGACTGTCGCTACCGGTGGTGAGATGGCAATTGGCAATATATTAAAAGCGGCAAACCTCGTGGGCAGTACGTCTGAAGCGATACGGATGATTCAGCAAGGGGCTGTACGCATTGATGGTGAGCGTGTTGAAGATAAGAGCCTTGTTATGCTTGCAGGTGCAGCTTATGTTATGCAAGTGGGCAAACGCCGTTTTGCCCGTGTTAGCTTAATTTAGAATGAGACGAGGAGGCTGTGATGAAAAAGTGGCTAGGAATCTACGCTTTTTTTATGATGGCACCTATATTTGCTAGTACTGGCCCTTATGTGCAGAGCCAGGTTGGTTATGGCAAATTGGCAACTGGCTCGGCGAATGGATTAGACCATCATTATGGTGGCTTGTCAGGTCGTTTATCTGCAGGGTATTTATTTGGTGGACGACAATTACGCTATGGTGCTGAGCTTGGTTTGGCGAGTTATGCGAGTAGTTGTTATCAATCTGCAAATACCAGCTTAACTTATCAAGGTGCCTCGGCAGATTTATTAGGCGTGTTATCTTATCAATTGGGTGCACGTTGGAATGTTTTTGGCAAGTTGGGCTTGGCTTATATCGACCAGCAAACAGAGGGCAATTTATTTCCCAATCAGTTGGATTCTAGTAATGCGCTACAGCCTAAAGTTGCTTTAGGCTTGGGTTATTCGTTGACAGCTGCGATTGGTGTCAATCTATCTTATAGCCATACTTTTGGTGATCAGCCGGAAGGGTTAGCTAAAAACGCTGAACCAACACCTGTGATGTTAAATAAGGTGGCTAGCACGGATTTATTATCATTTGGTTTATCCTATCGGTTTTAATCGCTTTAGTATTTAAAAATAATGATCAGCAAAAAGTAGAATATTTTGGTTAAGCGTTTTTGCTTTAGGGTATGAAAAAGAAGAAGCGACCTTGGGGTAGAAGATCGCTCCGTCTAGGGGTGTACGGCTTTGAGTGATAAAGCCTATATCTAAACAATAATCATTATCATTTATTCTGTCAAGACTTTTTGTTAAATATGCTAAATATAAGTTACAAAGTATAATGATCCTAATAGCAATTTTTCTGCCTTCATAAAAATAGAGCCTTATATTTCAAATAATTATATAAATAATTTTAAATAGGTTATATAAAGAGGCTATAAATAAATTGCTACTTTGATGAGCTGAGTAGCACTGTATAGCTGAGTGAAACCATAAAAAAGCCCCGATAATCTAGGGGCTTTATTTGTCAATATTGATCGTAATAATAATGAAATTGTGATTTAGTCGCGGCCAGAGAATGCAGCAAATATTTGCAGAAGGCTCATAAAGAGATTCACAATATTTAAGTACAGGCTCATGGTAGCCATAATATAATTAGTCTCACCACCTGAGATAATACGTTGGGTATCCCAAGCAATAAAGCCAGCAAAAACTAATGCGGCGATGATGCTAATGGCTAACTGTAGGGCAGGTAAGTGTAAAAACAGGTTAAGCAAGCTGGCAATGACAACGACGATTAGCCCTGCCATCAAGACGCCACCTAAGCGTGTAACGGCTTGAGGTTTGGCGATTGCAAGGGCTGACATTACAAAGAAAGTCACTCCTGTTGTTGCCAAGGCACTTAAGACTAAGGCGCTGCCATTACTGAATTGGGTGATATAAAAATTAAGTACAGGGCCAAGTGCATAGCCAAAAAAGCCAGTAAAGCCAAATAAAGTGACGATACCCCAGCTGCTATTACGTAGTTTCATCGTTGCAAACAGCAAGGCGAAACTGACAATTAAATTTAGAATTGGATTGACGGGAGTTGCATGGTTCACTAAAGCCCAGCCAGCGGTTGCGGCACTGAACAATAGTGTTAAAGAAAGCAAAAAGTAGGTGCTTCTTAATACCTTATGGTTGGCTAACAGCGAGGTATTGCGCTGAACTGTTGACTGCTGTTGATACATATAAGATCCTCTGTTTTAGTCATCACCCTATAAGATAAGGGCGTAAATATAAAAAGCAAGAGATAGATAAGCTGACGTGTTAGGTTAAGTTTATAATTGAAAGATTGAGAGTTAGGCTGTTGATGGGGCTTGGGAAGGCGGTTAGCGTTCCCAATAACTTTCCTCGAGGCTATCTTCACGGTCAGGAAGACCACGTGAGAGTCGCGTAGCATTTTGCGCAAGGACCTCATAACTTACACGGTTCGCATATTTGCAGACTTGGGAGAAGGATGAATAGGTCAGATAAGGTCGATCGTGTTTGCTTGAATTAGGCAATACGGTGTGATGGTAATGATTGGCAGCAATATCATGAAAGAGCGCAGCTAAGGCACCATCTCCAGCCCCATTGGTATTGTGAATTTTTTCAGGACCGCCCATATAGGGATTAATATGCGCGAAGACTTGTAATGGGTTTTGGCAGTCGGCTTGACGCATTGGGCGGCTGAATTCATATTCGTTAAAGTTGCTGATGGTGCCAGAAAGAAGTGGGTTGGAGGTGCGACGTGCTGTAGCTTGATCCGTATAACCGCTTAGGTATAAGCCTTGTGGGCCAACCGTGGTGAGGACTAAGTCAGTAATCTCTAGGGCTGCTCGACTGGCGAGTAAGGGGTCTTTATGGCCGGTGAGAGCATAACCTTCATCTTCATTCATGGCGATAATAGAGACATAGTCTTTAATAAAATCATAGAAAAATGATTGTTTTTCATTAATTAAAAACTGGGTGCCTAAGGTTAAGACAGCCGGAATGTGGTGCTTTTTAGCAAGTTCTACCGCCTTGAGTGTCGCTTTGAATATGGGTAGGCTCTCATCACGCAGAATATAACTAGAAATGCCTAATAGGACCGTCTTTTGAATGATTTCTTCATTAATATAGTCGGCAGTCAGCTGATTCATGACGCCGGAGTTAATACCAAAACTGCGCTCACCATCGGGGGTGATCAGTGTGATACAACGGCCAATGGGTCCATCAACAGGTTGTAAGTGGGTTAGATCAACACGACTGCTAGTGTTACACAAGTAGCGATAGGCAGGATCTTGCATGCTAATGGTTTTACTCATAACGCCGAGCTGCACAGAGATATCATCAGCGAGAACCGAATAATTATGCAGACTATTGCCGATGGTGCCACCAGCGTATTCGCTGATAATTAATTTATTACTTTTTAAATAATTGTATAAGTTGTCGGCGGTTTGGTCATCAATGAGGAGAGATTCGCCTTTTTGTAGGCCATACTCGCCCAGTAATGATTCATCGACATGGGCTTCAATATCGACAAGCACTTGTGCGATACCGGTGATATAGGTATTACCACGCTTGCTAAAGGACGGGTGCTCACAATTGGTTTTGCCACGAGAGTTGATAGGAAAGTAATGTTTAATTTTGCGTTTGCCTGGAAAGCGCATGTGCTTCCACCCTTAATCTATTTAATCTTAACTATGGAGTTATGTGCATAAAAGCTAGGCATTTTATAATGATTTGGCCAACTTGAGAAGGGATATTGAAAATACTTGGTCAGAGGTTATGCGTTGGAGCTGACTATAACCTCTTTAAATTATTTATTTTTCTATTTTGATTTTAGTGTGCTGGTCTTTAAATACTTATGTTAAAGGCGTAATATTATTTGAGGAATGGAATCTTAAATTAGGAGATGAAGGATTTATGCTTCATTTTATTCGAAAAATTGATTCTGGTCGGTTTGGTAAGGTCGTTTTGGTTGGTGGTAGCGCTGGAGGCCAATTTGCAGTGAAATTATTTCGCCAGCAACATGATCAGCCTGGTCGCGTGAGCACCTCGGCGCAACTTGAGGTCGCTAATTTCAATAGTTTCTCTCATAGAATTCAAGATATTGGGCGGGCAGAGGTGGTAGATCTGACTGACATCCAAGGCTTAACCGCTGGTGATCTTGATAACTATTGCTTAGAAGCTATGCTGATGCCACTTTTTCAAAACGAACGTGAAGTCCGTTATGAAGAAATACAGCCATACCTTGCTAATTTAGCCGAGCGTAATTTTTTTATGGGTGACCCTAAGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126389.1|726845_727034_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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730270:730557	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016212294.1|730974_731319_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211326.1|733322_734063_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211322.1|735649_736240_+	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
WP_016211325.1|736302_737823_+	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.3e-85	38.9
WP_016211323.1|737812_738910_+	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	1.0e-27	28.3
WP_016211321.1|739083_740244_+	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
WP_016211722.1|740624_743927_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
WP_032126817.1|743936_744758_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|745114_745831_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8
WP_129556588.1|745775_745943_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274943.1|746133_746658_-	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_087910645.1|746943_748096_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_032127022.1|748158_750345_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
WP_075274942.1|751021_751750_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	43.1
WP_016212339.1|751768_752515_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275114.1|752667_753030_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274941.1|753059_753788_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.8
WP_016211996.1|754171_755119_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211997.1|755120_756230_-	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	4.4e-07	24.5
WP_075274940.1|756585_757266_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.0e-42	44.3
WP_087910645.1|757293_758447_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274939.1|758559_759288_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-42	41.4
WP_016212238.1|759317_760607_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212264.1|761122_761716_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.4e-28	44.6
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WP_080664881.1|762517_762724_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|762813_763542_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
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WP_016210625.1|767453_768200_+	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
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WP_051307334.1|769204_769984_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210618.1|770250_771300_+	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|771364_772789_-	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
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WP_016210615.1|773762_774233_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
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WP_016211051.1|782003_782507_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
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WP_016211053.1|784590_785157_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|785199_785928_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_036780855.1|786693_787191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049879.1|787165_787567_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|787535_788264_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211625.1|788747_789617_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_016211621.1|789613_790963_-	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	4.6e-75	37.0
WP_016211623.1|791075_792716_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211987.1|794537_796274_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_144019359.1|796435_796633_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556671.1|796777_797506_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_098082825.1|797569_797878_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211657.1|797870_798203_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211654.1|798206_798776_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211655.1|798904_799318_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211652.1|799577_800783_+	glycine C-acetyltransferase	V5LQ39	Emiliania_huxleyi_virus	2.5e-35	26.6
WP_016211653.1|800890_801916_+	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	2.3e-18	78.8
WP_054300202.1|802007_802736_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_054300202.1|803166_803895_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016212196.1|804303_804549_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|804545_804932_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212193.1|804999_805338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274934.1|805460_806129_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.8e-41	44.0
WP_016211949.1|806616_807867_-	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_016211951.1|807900_808998_-	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_075274933.1|809614_810343_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_075274932.1|810651_810873_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211812.1|811094_812708_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_016211816.1|812749_813103_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|814172_814901_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_075274930.1|814930_815350_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210945.1|816160_816751_+	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|816877_818263_+	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210947.1|818357_818555_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|818648_819467_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|819973_820351_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210948.1|820363_820600_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|820599_820806_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210956.1|820988_821708_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038886|904114:956173|DBSCAN-SWA
TTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGTGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCACCTTCAATCGCTTCCTTAACCCTTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGATAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTAGTATAGCCTAGTTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGATTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTCCTGATATTATGTCAGAAACTATTGATCGAGCGCTATAACAGAATAACGATATGATCATAGGGCTTATTTGGGAAATAATTGCGGGTGCAAGATTCCTGGTAACAAGAGAGTTTGGGTAGTGCGGTAAAGCGTGCAAGATAGCGATTGTTAAGATAGCGTGCAAGTGAGCGAATAAAACCGCTGGTTGCATAGACAGTAAAGTAAATTACGAGAATAAATAATAAGATGCGAAAATGGTGGTCTTGAATAATATCCGGGTCGCGTAGAATTTTAAAATCGATGGCCAAAATGAAAAGCGTGGCTAAGCTAAAAAAGGTCAGGCCAATTAAAATTCCCCAACGGACCAGGTGATTACGTTCTTGGAGGTCTTTTACTATATTTGTCATAAGCGCTGCTCAACATATCCATATGTATGTTTAATATTTTTTTAAAACTTGGGCGGGCTGTCAATGCAAAACGATGAGTTTGAGATAATTTGTTTTTCATCAGCATGTGAGGGCGTTATTTTAGAAGGTGCAGGGCTGTGTGGTTTGGCGTAAGCGACCTTGGCGGTTGAGAATAAATTGTCGGCTTAGCTGAGGTGTGCAAAAACTTAATGTGCCATTGCTTGCTGCAATCCCACTTGCACCATAAAAGCTTAAATGATTACCGCGGTTCCAGGTGAGCTGAATAGAATGAGGTAAGGTGAATGTTGTAATCATCGGCTCTTCATGATCACGTTGATTGTTTTGATTTTGATCGAGAAAAAGCATTAAGGGGAGTTGCCAGTTTGTGTGGCAGTGAGTTTGGTTAGCCGTTGGGCACAAGGTGACTGTGTTTTGCTGATACAGGGCCTGTTCACGGCCCAGCTTAATCAGCTGCTCTAGCTGGGATGCGGCTTGTTGGTGTATTTGCTGCTCTTTGAGGTGGAATAAAGTGGGTAAGCTTAATAGAATAAGTGAGCTGAGCAGGGTCAGGACGATGAGCACCTCGATCAGACTAAAGCCCTGTAACGATGAATTTGGCGCAGCTTGTGAGTCTCGGGTATAATCTGCAATCATTGTTTGCCCTGTAGCTAATTTAGCGGGTGTTAGTCTAGTGTAGAAGGTTTAGCCAGCGTTGAAAATGGTGTGTTGAGAATGCATTTTAGGGCAAATTGTGGTGTAAAAACAAAAGTAAAAAGAAAGTAGGTAAGCTTCATGCAGACATTATGTATTGCAATGGCTCAGTTGTCGTTGCATGTGGGAGCCATTGAGGAAAAAGCAACGCGTATTATTCAATTGGCGGTCAGTCTTGACGGCCAAGCGGATGCGGTGGTGTTTCCGGAGATGACATTAACGGGTTACCCCGCAGAGGATTTATTATTACGAATGGATGTGCATGAACGTATTGAATCCGCATTAAAAATGATTGTTGAAGCCTCTTTGGATATTAACCTAGATATTCTTGTTGGTGCACCGGTATTTGATCAGGGGCAGATGTATAATGCCTTGATTCAAATTCGCCAAGGGGCGGAAGTGAAGCGTTATTACAAACGCTGTTTGCCAAATTATAGTGTGTTTGATGAAAAGCGTTACTTTGGGCCCGGTCAGCAAGATTGCCTCACTGAAATTGCAGGTGTGCCGGTGGCCTTGGCAATTTGTGAAGACCTTTGGTCTGATGAGGTCATGGCTGAAGCAGTGATAAGTCAAGCTAAGCTAATGATTAGTACCAATGCATCGCCGTATCATTTGAGAAAACAGCAGCAGCGTGTGCAGGTTGTCAAAGAGCGTGCTCAGCAAGGCAACATGCCATTGCTTTATGTACATTGGGCTGGCGCTCAGGATGATTTGATTTTCGATGGTTGCTCGTTTGTTGTCGATGCGACAGGCCGCTTGACAGAACAGGCTGCAGCGTTTCGTGAAGATGTGCGTATCGTTGAATTGCGCTGTGGGGAACATGACGAGTATATCCCGTATGCGCAAGCTTTGCCTCCAGTGTTAAGTGAAGACGCTGAAATTTATCAAGCCATTACTTTAGGCTTGCGTGATTATGTGCGTAAAAATAATTTTAATGGTGTGGTGCTCGGTTTATCCGGAGGAATTGATTCGGCCTTAAGTTTGGCGATTGCCGTTGATGCTTTAGGCGCTGAGGCGGTTGAAGCGATCATGTTGCCTTCTGAATATACCAGTCAGATAAGTTTAGATGATGCAAGAGCACAGGCGCAGATGCTTGGGGTAAACTACCATGTGTTGCCGATTACTGATAGTTATCAGGCTTTACAACAGGCGCTTGTGCCCGCACTTGGTGAGGGGCGACCATTTGGGGTGACCGATGAGAATTTACAAGCGCGTAGTCGGGGAGTCTTGCTGATGGCCGTGTCGAATGCGACAGGAAAAATGCTGTTGACTACGGGCAATAAAAGTGAAATGGCGGTGGGCTATGCGACTTTATATGGTGATATGTGTGGTGGCTACAATGCCTTAAAAGATGTGTTGAAAACGCGTGTATTTAAATTGGCCCATTATCGCAACACCTTATCGCTTGCGATTCCTGAGCGGGTGATTAGCCGGCCGCCGTCGGCAGAGCTTGCGCCGAATCAAAAAGATGAGGATAGCTTGCCGCCTTATGAAGTACTTGATCAAATTATTGAGCGTTATGTCGACTATGATCAAAGTGCCGTTGATATTATTAGCGCCGGCTTTAATGATGTTGATGTGAAGCGTATTTTGCGTTTGATTGGCCAAAATGAGTATAAGCGCCGACAGTCGGCGCCGGGGCCGCGTATTTCACAGCGAGCGTTTACACGTGAGCGTCGTTATCCATTGACTTCTGCGTTTGATCGAGATTTAGGGTAGCGCTATGTGGATTGCAATCACGGTTATTATTCTTGTTGTATTATTACTTGGGTTTGTGATTATTCGTCTGTTGCAGGCGCCGGCAGCAAATTTAGCTCTGGAGGTGGGAGAGCCGTTGGCAGGTGCGGAGACTGTATTTATGCATCAATTTGATAGGCGCATGAAAAAGCTTTTAGATGAATTAAAAGAGTTGCCTGCAGTCAATGATGCAGATTATCCAAAATGAAAAATAACGTATAAGAAAGGAGCTGGCGCTCCTTTTTTTATAGAATGCTATTGTATTAAATTTTTAAGCCATTTTAAGTAAAAATTAAGGGGAACCTGTGTCAGCTTACTCATTGCTTCGGCCTTTATTGTTTGCACTGCCAGCAGAAACAGCGCACCACCTCTCACTGTCATCAGCAAAGTGGTTAAATCACTTAGGTTTACTAACCGAGGTGAAAATCCGTCCGCAGCCGTGTCAGGTGATGGGTTTAGATTTTCCAAATCCGGTGGGTCTTGCCGCCGGCCTTGATAAAAATGCTGAATATATCGATGCACTGGCAACGCTGGGTTTCGGCTTTTTAGAAGTGGGAACGGTGACGCCAAAAGCGCAATTGGGTAACCCCAAGCCGCGTTTATTTAGAGTGAAAGAATATCAAGCTGTGATTAATCGTATGGGCTTTAATAATAAAGGTGTTGATTATTTAGTGGAGCAGGTCAAACATGCTAAATATACCGGTATTTTGGGGATTAATATCGGTAAAAATAAAGATACATCTTTAGAGTTAGCACATGAAGATTATTGCTTTTGCATGCGTAAAGTCTATGCTTATGCGAGTTATATTACTATTAATATCTCATCGCCGAATACGCCTGAATTAAGAAAGTTGCAAAATAAAGAATTTTTAGCAAAGTTACTTGAGTCTATTAAAGAGGAGCAGGCGGCTTTGGCAATAGCGCATAAACGCTTAGTGCCTGTGGTATTAAAACTAGACTCTGATATGGATGAGCCGGCCTTAATAAATGTGGCTGAATTGGTCTGTGAATATCAGTTTGATGGCGTGATTATCTCTAATACAACGGTCAGTCGTGATGAGATTATTGCTTCGCCGTTAGCGAAAGAAGTCGGTGGGGTCAGCGGTGCGCCTTTATTAGCGCGCTCAACGACGGTATTAAAACGCTTTGCTGAGCTTGTCGAGGGCAAAGTACCTTTAATTGGTGT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>NZ_CP038886|904114:956173|939583_940441_+|WP_016211372.1|DBSCAN-SWA
MIKFSEPGADLFIPGGGSIANALSRTSHLAIAAHQDDIEILAFHGIAECYQQAERGFCGVVVTDGAGSPRAGDYAEYTDKKMQEVRAEEQRAAAKLGEYSAQFQLAYPSHQVKNTSALPLVDELEEILIKTQPEVVYLHNPMDKHDTHVAVFLKSLAALRRLPEKIRPKVVYACEVWRDLDWVCDKEKIALKSDEPRELALALLQVFDSQVSGGKRYDQAVLGRRLAHATFSHSHAVDDVKGVTYAIDVMPLLENPMLTVEDYVRGFVERFAHSLTTTLTALSQD
>NZ_CP038886|904114:956173|915054_915297_+|WP_032126663.1|DBSCAN-SWA
MNITKDQVTPDALRSIAVYDSIREGSMQEHFSAQRICKEGYATVDIFFDAAKREENPTFIFHEHCNTIKGGSAELALELA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300249.1|904698_905064_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211061.1|905125_905479_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211058.1|905599_906133_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126660.1|906271_907909_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	5.8e-88	38.2
WP_016211065.1|907913_908135_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211066.1|908232_909246_+	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211063.1|909408_911637_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.0e-82	35.0
WP_032126658.1|911617_912322_-	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_017377041.1|912556_912886_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|913966_915028_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|915054_915297_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|916015_916699_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|916892_917450_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_075274927.1|918213_919275_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|919347_920301_+	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210878.1|920801_923531_+	kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|923633_923993_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|923989_924307_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|924323_925433_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210882.1|925459_926545_-	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210874.1|926667_927708_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210873.1|927722_928373_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210876.1|928440_929283_+	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016212197.1|929748_930666_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|931684_931879_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|931955_932249_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|932516_933434_+	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|933985_934132_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|934186_935377_-	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211370.1|935509_935953_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|935995_937039_-	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211368.1|937085_938477_-	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|938673_939597_+	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211372.1|939583_940441_+	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|946537_947683_-|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_054300173.1|947761_948823_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211408.1|949046_950393_+|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_016211412.1|950507_951500_+	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_016211411.1|951503_952001_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|951997_952837_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|952869_954402_+	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|954561_954897_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|955052_955325_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|955336_956173_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP038886|1018084:1099692|DBSCAN-SWA
ATTATTTTACACGCATGCCGGGCAGTGCGCCCTCATCGGGGTTAAGAATCCAGAGGTCCTGACCACCAGGCCCTGCGGCAAGGACCATGCCTTCTGAAACACCAAAACGCATTTTGCGTGGCGCCAAATTGGCAACCATGACAGTGAGCTTACCTTCCAGCGCTTCGGGCTGGTAGGCTGATTTAATACCGGCGAAGACCTGACGAGTTTCACCGCCTAAATCGAGGGTGAGTTGTAATAATTTATTGGCTTCTTTGACATGCTCGGCTTTAATAATTTTGGCAATGCGCAGGTCAATTTTGGCAAAGTCCTCAATCGTAATTGTGTCTGCAATCGGTTCTTTATGTAATGGGTTGTCTTTTGGGTTATTTTTATCACTGTTAATTGCAGCCGCTGTGTTTGCAGTAATATTCGCTTCTTTGGCGAGCTCTTGCTTGGTTTCTTCAATGATCTTGTCGATTTGAGCAGTTTCAATACGTTTCATCAATGGCTTAAAGGTGTTGATGGGATGATTTAATAACGGCTGTTGGCTGTCTGCCCAGCTGAGTGAATCGATATTTAAAAACTCTTCTGCATGTTGGCTTAATTCCGGTAGAACCGGTTTTAAATACAAGGTTAGCAAGCGGAACAGGTTAATTCCCATCGAGCAGACTAAATGGACTTTGTCTTCTTGACCGTCTTCTTTAATTAGTTGCCACGGCTTATAGTGATCGATGTATTGGTTGGCTTTGTCAGCTAAGGCCATAATTTCACGCATGGCAAAAGCAAAATCACGTGATTCATAGTACTTGGCAATTTTTTCAGCCTGAGCACTAAATTCATTAAATAAATCAAGATTATCGAGCGTTGTCGCCAGTTGGTTGTCAAAGCGCTTTTTAATAAAGCCAGCACAGCGGCTAGCGATATTAACGACTTTGCCGACTAAGTCTGAATTAATCCGTTGCGTAAAGTCTTCCAGGTTTAAATCAATATCATCAATACGACGACTCAGCTTTGCGGCGAAATAATAGCGCAAATATTCGGAGCTTAGGTGATTTAGATAGGTTCTGGCTTTAATAAAGGTGCCGCGTGATTTAGACATTTTCTGGCCATCCACGGTGAGCATGCCGTGAACAAAAATATTACTGGGTTTACGAAAGCCTGCGCCTTCGAGCATTGCTGGCCAAAATAAGCTATGAAAGTAGACGATGTCTTTACCGATAAAGTGATAAAGCTCAGCCTGGTCGTCGTGCTTCCAAAACTGATCAAATTCCAGATTTTTTTTCTTGGCAAAATCCATAAAACTCGCCATATAGCCGACAGGTGCGTCGAGCCACACATAAAAATATTTACCCGGTGCGTTAGGGATTTCAAAGCCAAAATAAGGCGCATCGCGCGAGATATCCCAATCATTTAAGCCACTGTCAAACCATTCGTTAAGCTTATTGGTAATTTCTTCTTGCAGGTGGCCTTGTTGAATCCAGTCTTTGAGCATATTTTCATAATGAGTGAGCTTAAAGAAATAATGCTCAGATTCTTTTTCTATCGGTGTGGCGCCAGAGACTACAGAAACAGCATTAGTTAAGTCACAGGGGCTATAGGTTGCCCCGCAGACCTCGCAAGAATCACCGTATTGATCTGCCGCATTACATTTAGGGCATTCACCTTTGACAAAACGGTCGGGCAAGAACATGTTTTTCTCAGGGTCGAAGGCTTGGGTAATCGTCCGCTTTTCTATGTCGCCATTGCGTTCTAATTGATTATAGATTTCAAAGACCAGTTCTTTGTTCTCAGCGCTATGGGTGGTGTAGAAATTATCAAAGCTGATATTAAAGTCGTTAAAGTCTTGCTCGTGTTCTTTGGCAAAACGAGTGATTAATTCTTCTGGGGCAATGCCTTCTTTTTCTGCTCGTAGCATAATCGGTGTGCCGTGAGCGTCGCTGCCACTGATTAAATAGCACTCATGGCCACGCATACGTTGGAATCTAGTCCAAATATCTGCTTGAATTGCTTCGATAATGTGACCTAAGTGAAGTGAACCATTGGCATAGTATAGAGCAGTAGTTGCTAATATTTTGCGTTGCATGACGTTGTGGCACCTAAATGAAATTTGAAATTATGCGTAAATTTGTTCATATTGTTTTAAAATTGCAAGGCACAATATAGCATGTTTTTAGTTAGGCGATAAGCCTCCGACTAAGCGTGCTGTTGCTTAGAATCAATTTAGAATCAATGAATTTTAACTGAACCAGTATTTTGCTCGCTTATAGTTTTTCGTAATAACAAGCTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCATGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATACTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCGACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTAACAAGGACTAATTGTTGTATGGGCTTTATTGACCCGCAAACTTTAGATTAGCAAGCTCTAGTTTTAAAGTTATATGTTGAGTTTTTGCTTATATTTTGTTAGGGTTTGGCCGTTTGTGTCAAAAATAAGGTCGCCTGTACGATGAGTGATTTATCTGTGTCTTCTGAGTCTATTGCCTTGTCCACAAGAGCTCGGCCTATAAAAGCGTGGGCTATTAGTTTGGTGGGAGGCTTATTCTTTTTTTATGAATTTATTCAGATGAATATGTTTAACTCGCTGGCAGGAAGCTTAGCTGCTACGTTTCATTTATCGGCTTTTCAAATTGGTTTAGTCTCAGCATTTTATTTTTTGGCTGATTCGATATTGCTTTATCCTGCGGGTGTGTTAGTTGATCGGCTCTCCTCACGCCGTGTGATTATTTATGGTATGGTCATGTGTATTATTGGCACCTTATTGATTGCCAGTGCCAGTAGTTCTTGGTTTTTAGTGGTGGCGCGCTTTTTAGAAGGCATTTCGGCCGCTTTTTGCTTACTTAGCATCTTGCGATTGGCCTCTCAATGGCTGCCTGAAAACCGTATGGCAACCGCATCAGGTTTGATTGTTACGATTGGTATGTTGGGTGGCGCCGTTTCACAAACGCCTTTAACGATGATGATTGAACAGTGGGGGTGGCGTGAGGCGCTTTATGTGGTTGCATTGATCGGTGTGATCTTGCTTGTGGTTGTTGTTATTGTTGTTAAAGATGCGCCAACCGCTAAGCAGCATGCTAAGTTGCAAACGGCAGCAGATAAGGTTGGCTTTTGGCAAACACTGGTTATTTTGGTTAAAAACCCACAGAACTGGCTGATCGGTTTGTATATTGCTCTTATGAACTTGCCAATTATGTTGCTGGGTGGCTTATTTGGTTCTCACTTTATGCAACAAGGTCATGGCTTTTCGGCCACTGAGGCGGCAACCATCAATATGATGATTTTTATTGGCACGATTGTTGGTTCAACGGTAGTTGGCTTTGTGTCTGATTTTTTAAAGCAGCGGCGTTTGCCGATGATTGTAGCCGCAGTGGTTTCATTGGTTATTTTCCTGATTATTCTTTATGCGCATGGTTTAACTTATGCAGATTATATCAGTTTATTTTTCTTGCTTGGCTTTTTTACTGCCGCCCAAATTTTGGGTTATCCAGCTGCACAAGCCTCAAATCCGGCGAAGATTGTTGGCTCAGCACTTGGCTTTGTTTCGGTGATTATCATGACTGCACCGACTTTGCTACAGCCTTTAACCGGTTGGTTGATGGGACTAGCGGGAGGACATCTGATAAATGGAGTGATGCAATACTCATTAATTAGCTATCAATATGCATTACAAATTCTTGTTATAGGCTTTGTGATTAGTATTTTTTGTGCTTATAAATTACCTGAAACGTATAAAAAATAATTGATTTATTGCGCGAAGGTATGGCTTGAGTGATTGTTAGGCGATGTTATTCGTTCATGCCTCTCCGTTTCTTAATAAAAACTTTGATGCTTCTTTCATTTGTTGTCTTTCGGCTGTGTGTTCGAAGAAAAACCAATTGCCTGTTTTGTGTTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038886|1120362:1247711|DBSCAN-SWA
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MSIYHLIALILTRLRENGQKLKPFEESITRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209878.1|1162456_1163395_+	signal peptide peptidase SppA	A0A2I6UGK8	Salinibacter_virus	1.9e-14	29.6
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WP_016211042.1|1209555_1210572_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
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WP_016211474.1|1241803_1243153_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038886|1290431:1473639|DBSCAN-SWA
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MSFNYRRRKFCRFTAEDIKEIDYKDTVMLRNYVTESGKIVPSRITGTRARYQRQLATAIKRARFVALLPYTDRHQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209437.1|1291883_1292405_+	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	G3MA90	Bacillus_virus	2.0e-10	34.2
WP_016209438.1|1292401_1293001_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_016209440.1|1293078_1294089_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.5e-06	29.9
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WP_016209407.1|1294942_1295374_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
WP_016209428.1|1295376_1296471_+	cell envelope integrity protein TolA	NA	NA	NA	NA
WP_129556552.1|1296506_1297874_+	Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB	NA	NA	NA	NA
WP_016209425.1|1297909_1298551_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126507.1|1298593_1299523_+	tol-pal system protein YbgF	NA	NA	NA	NA
WP_016209451.1|1299525_1300173_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	J9PV61	Bacillus_phage	1.2e-36	37.9
WP_032126506.1|1300223_1301027_-	AAA family ATPase	A0A0E3G5H5	Synechococcus_phage	8.9e-42	43.1
WP_016209417.1|1301208_1301421_+	SlyX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209423.1|1301424_1301658_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209422.1|1301719_1303300_-	exodeoxyribonuclease VII large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209426.1|1303501_1304431_+	ABC transporter ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	1.6e-13	30.3
WP_016209420.1|1304432_1305200_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126509.1|1305604_1306321_+	gamma-glutamylcyclotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209442.1|1306358_1306721_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209432.1|1306892_1308602_-|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209448.1|1308859_1310191_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209449.1|1310632_1312105_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1312278_1313253_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300152.1|1313926_1314292_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274897.1|1314532_1315399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273512.1|1315911_1316256_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210519.1|1316245_1317013_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210521.1|1317248_1319186_-	his Kinase A domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210517.1|1320199_1320919_-	sulfate transporter CysZ	NA	NA	NA	NA
WP_032126504.1|1321032_1324572_+	chromosome segregation protein SMC	NA	NA	NA	NA
WP_016210525.1|1324638_1325457_+	ZipA protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210518.1|1325443_1327483_+	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	3.0e-126	40.8
WP_016210522.1|1327498_1328551_+|protease	protease SohB	NA	NA	NA	NA
WP_016210524.1|1328561_1329092_+	exsB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556549.1|1329630_1330516_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046739.1|1331401_1331542_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210010.1|1333186_1333363_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210017.1|1333538_1333922_+	hpt domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273518.1|1333997_1334291_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210016.1|1334457_1335417_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210020.1|1336017_1336173_+	putative membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210025.1|1336437_1337808_+	NAD-dependent succinate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210009.1|1337800_1338007_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210012.1|1338082_1338754_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210005.1|1338734_1341539_-	response regulator	A0A1V0SGX0	Hokovirus	2.4e-57	32.2
WP_016210027.1|1341618_1342215_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210008.1|1342604_1343360_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210004.1|1343559_1344201_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210021.1|1344461_1345787_+	acetyl-CoA C-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210023.1|1345783_1347841_+	enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210007.1|1347818_1348391_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126616.1|1348446_1348806_+	DUF1820 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210019.1|1348870_1349905_+	beta-N-acetylhexosaminidase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP038886|1478080:1522211|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038886|1551833:1607091|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211456.1|1586676_1587255_+	nucleoside deaminase	A0A0B5J096	Pandoravirus	2.2e-13	36.3
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WP_016210748.1|1602278_1604234_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	K4NWI2	Pseudomonas_phage	9.2e-16	39.7
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WP_016212185.1|1605432_1606422_+	rhodanese-related sulfurtransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1606515_1607091_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038886|1613259:1669052|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038886|1697078:1735920|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300271.1|1700988_1701963_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273327.1|1702653_1703229_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1703174_1703540_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274858.1|1703676_1704762_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274857.1|1706341_1707217_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126678.1|1707227_1708238_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
WP_016211554.1|1708564_1709191_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_016211557.1|1709236_1710466_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_032126677.1|1710660_1711224_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211555.1|1711298_1712657_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211664.1|1713193_1713922_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|1714294_1717114_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211669.1|1717268_1717619_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556522.1|1720727_1721960_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211405.1|1722166_1723939_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_016211403.1|1724074_1725118_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_016211399.1|1725131_1725875_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211398.1|1726021_1726309_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211732.1|1726913_1727612_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211731.1|1728318_1729425_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1729480_1730305_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
WP_075274856.1|1732060_1733086_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046730.1|1733304_1733445_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212266.1|1733712_1734360_-	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_016212267.1|1734640_1735000_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|1735166_1735622_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273804.1|1735581_1735920_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP038886|1746185:1846080|DBSCAN-SWA
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MSHLWGVDSYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556520.1|1747744_1748641_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.8e-54	45.1
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WP_075273327.1|1748912_1749488_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_081377868.1|1754848_1755505_+|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210103.1|1755580_1756939_-	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
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WP_016210111.1|1758000_1759635_+	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	9.7e-144	49.9
WP_017377579.1|1759641_1760478_+	3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase	E3T537	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.7e-51	41.3
WP_016210099.1|1760499_1761777_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.5e-139	60.9
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WP_016210106.1|1762200_1763292_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA
WP_016210102.1|1763474_1765064_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210110.1|1765124_1765880_+	5'/3'-nucleotidase SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-65	52.0
WP_016210113.1|1766067_1767117_+	RNA polymerase sigma factor RpoS	M4SMP8	Cyanophage	7.9e-30	31.5
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WP_016210114.1|1769669_1770929_-	calcineurin-like phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210108.1|1771021_1772287_-	sodium:proton antiporter	A0A2H4J178	uncultured_Caudovirales_phage	9.1e-49	42.8
WP_122943012.1|1772472_1772928_+	DUF4442 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210112.1|1773044_1774472_+	YdiU family protein	A0A075BSJ0	Microcystis_phage	2.5e-55	35.0
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WP_016211561.1|1785182_1789049_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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WP_081007034.1|1789252_1789537_-|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126538.1|1789801_1791220_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038886|1872930:1932040|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19

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MLDPKHLRTDLDDVARTLRKRGFELDTAKLISLEEQRKHLQTATQELQNERNSRSKSIGQAKARGEEIAPLVAAIGDLGEQLNDVSAKLHLVQQELDELLLGIPNLPHESVPAGKNEDDNVEVRCWGTVPEFSFAAKDHTELGESLGGLDFELAVKLTGSRFVVMRGQMARLHRALAQFMLDVQTEQHGYQEMYVPYLVNHESLQGTGQLPKFGEDLFHLQGEHEYCLIPTSEVPLTNTVRDVILEEAVLPLRLTAQTPCFRSEAGSYGRDTRGMIRHHQFEKVEMVQIVHPDKSYQALEDMVTHAEKILQLLELPYRVMALCGGDIGTSAAKTYDLEVWLPAQGKYREISSVSNCEAYQARRMKARWRNSQTGKPELVHTLNGSGLAVGRALIAVLENYQQADGRIRVPNVLMPYMAGLEWIG
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211805.1|1874322_1875861_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211806.1|1875903_1876629_+	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1877418_1877691_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1877702_1878539_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_129556510.1|1879062_1880166_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	7.3e-10	24.8
WP_054300405.1|1880267_1880768_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|1881289_1881952_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_016209946.1|1881978_1883208_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1883364_1886136_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_016209937.1|1886211_1886655_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1886807_1888280_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_016209926.1|1888391_1889453_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209945.1|1889449_1890484_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1890486_1891527_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209936.1|1891709_1892825_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-93	48.6
WP_016209930.1|1892863_1893217_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_032126634.1|1893237_1895106_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1895127_1896072_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1896305_1896584_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1896793_1897432_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1897406_1898834_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1899034_1899712_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1899846_1901121_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1901188_1901944_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1901995_1902913_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209929.1|1903021_1903915_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274822.1|1905373_1906348_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_016211771.1|1906640_1906829_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274823.1|1908175_1912186_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211823.1|1912220_1912409_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376688.1|1913401_1913755_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107517381.1|1913968_1914163_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007041.1|1914828_1915356_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210885.1|1916407_1917289_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210891.1|1917975_1918749_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126206.1|1919282_1919579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210888.1|1919601_1919853_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155053505.1|1919798_1920521_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210886.1|1920589_1921369_-	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
WP_016210887.1|1921451_1922402_+	23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD	NA	NA	NA	NA
WP_016210889.1|1922911_1925758_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556636.1|1925775_1926084_-	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212002.1|1927037_1927316_-	DNA-J related family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212000.1|1927435_1928164_+	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_016211998.1|1928294_1928858_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211999.1|1928847_1929201_-	ras family protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1929580_1930417_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|1930428_1930701_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274825.1|1930978_1932040_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038886|1968854:2055276|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211223.1|1973461_1975063_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038886|2091121:2204426|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209845.1|2098743_2100219_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
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WP_016209834.1|2112652_2113411_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
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WP_016212367.1|2114704_2115562_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046721.1|2116703_2116871_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274836.1|2117051_2117942_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210154.1|2119215_2119908_+	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210155.1|2119946_2120756_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SE00	Indivirus	3.8e-16	30.9
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WP_080664836.1|2125114_2126965_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210150.1|2126949_2128155_-	ATP-grasp domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210144.1|2128166_2130356_-	TonB-dependent siderophore receptor	NA	NA	NA	NA
WP_016210157.1|2130898_2131528_+	MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273564.1|2131550_2131970_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_016210153.1|2131962_2132367_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_032126761.1|2132420_2133242_+	energy transducer TonB	NA	NA	NA	NA
WP_016210142.1|2133301_2134282_+	iron-siderophore ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210160.1|2134262_2136260_+	iron ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210147.1|2136272_2137445_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210148.1|2138305_2138524_-	DUF2158 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126762.1|2139359_2141387_+	NADPH-dependent 2,4-dienoyl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211282.1|2141468_2142719_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211281.1|2143013_2143349_-	ferredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211283.1|2143660_2143909_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
WP_016211280.1|2143944_2144454_+	ribosome maturation factor RimM	NA	NA	NA	NA
WP_016211285.1|2144453_2145233_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_016211286.1|2145250_2145598_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|2145709_2145982_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|2147310_2148120_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|2148670_2149492_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|2149692_2150925_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_081377862.1|2151411_2152248_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2152259_2152532_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046719.1|2152550_2152709_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038886|2233882:2341999|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210284.1|2267012_2267534_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
WP_016210280.1|2267615_2268710_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_054300412.1|2268946_2269261_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273307.1|2269405_2269816_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556631.1|2271580_2271748_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075275089.1|2271892_2272225_+	dual specificity protein phosphatase family protein	A0A068QKX9	Armadillidium_vulgare_iridescent_virus	8.0e-05	37.3
WP_032126500.1|2272358_2273075_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211118.1|2273211_2274459_-	NADP-dependent isocitrate dehydrogenase	Q77Z09	Phage_21	1.1e-14	72.2
WP_032126499.1|2274837_2275449_-	PilZ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038886|2356428:2403972|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038886|2410222:2464675|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_24

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MSDQKKYGGLAQALFLAVTNNHNFKGCKSANERFSYVENLNALLFAFKAGTLQGETPSVI
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209662.1|2434819_2436967_-	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209657.1|2437394_2437790_+	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126162.1|2438714_2440592_-	SurA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209655.1|2440695_2440968_-	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126161.1|2441071_2443504_-	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209663.1|2443571_2444873_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_016209647.1|2444954_2445560_-	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209645.1|2445672_2446977_-	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|2447580_2448456_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_075273478.1|2448571_2449243_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|2449419_2450775_-	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|2450895_2451633_-	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209651.1|2453052_2454327_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209646.1|2454357_2454933_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209649.1|2454977_2455943_-	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209640.1|2456401_2457421_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273474.1|2457839_2458814_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_129556476.1|2458909_2459920_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|2460464_2461040_-	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211685.1|2461063_2462869_-	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038886|2481362:2528030|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038886|2563460:2616644|DBSCAN-SWA
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MSVQPIVWQHNATVIGASCLYQPWLERPYCLTSAIKRATCRFSVRVLSESSKPLQSLYQSDDMIYQENQVWEREVYLCGDDTPWVYASVVFSSAHPPEILTTLGSRPLGETLFFHPDGRDVARSKMEYAGIDRSCDVYLPAFDLSSQDRLYARRSVFSPYWGQVLVTEIFLDTLPDYPLEERTLECKN
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MINQQPKGLYLLCFTELWERFGFYTVQTILILYMSKGLLFSDYRAYLLYGTFSALLYLTPVLGGFVADRYIGFQRSIILGGLLFVLSYLLCALPGQAAFFWGLTFLIIGNGFLKPNVSSIVGELYEKDDPRRDGGFTLFYMGINIGALIPPIFAGDLVHQHGWHSGFLLAAVGMFIGLISFIYGRYRLQGKGGVPKGSPLYRQLLTYLNRIHFLLACTIVICAFIIHALFKIPTITSTVLIIASILIVLWVLIIALRESDDIRNKMIAALILTVISVGFWALYNQTFTSLMLFAERNMQPNFLGMTINAEFTHAASHGVLSTG
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MTIAILVAMEEEVQLLKEHTTGITHEINNILFHEAKIYNQDALIVQTNIGKVNAAMATTLLIERFKPSLVINTGTAGGFHQDLTIGDIIIADKVLHNDVDVTGFGYAYGQIPGLPTHFEPDEHAKIHAEITCQQANLTYYIGTIATGDSFLSTPFLIDRAKTNINNLYAGEMEAAAVAQVCFHANVPALFIRAISDIAGTDDQEKDFSANIQTASKKYTHFISEFFKQHANPLKIKL
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MLSTPWLAATDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MLTEFKIETDFGTLAAKRWGVGTHKVLVMHGWLDNAASFDVLAPLLPDTECVVIDFLGHGLSDHLPGQRLYSLDLHIQGIEEVIDFLGWATFSVLGHSLGAIVGSCIAADSRFSKRVDSLISLDALGPLSAELMASDHPVAETVDKMRSRRHRAPRIYASVEQMYQSRAHANQLDAKFIKGLVERGAKAINGGWLWCFDPKLLVKTKLKYAGETAVLAVLKKIICPVALIRAKHGILPKNAGFNQRLAMVNMLYSYELDGGHHVHLEVPRQVANCIQEFWQKVHLV
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MSQVNNELKYTKSHEWVRVEADGSVVIGISDHAQSLLGDVVFVELPEIDAEYDAGTEVGVIESVKAAADAYNPIAGKVLAVNEALLDSPELINESPFDDGWMYRLAPHSAADLDGLMNAEAYAALLAEEE
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MKNILIVGPSWVGDMMMSQSLLKVLKQQHAEVNIDVLAPNWTFALLARMPQVREAISAPFAHGQFAFKERMRLGQSLQEKHYDQVIVLPNSWKSAVVPWAAKIPQRTGWLGEFRYGLLNDGRKLDKVKYPLMVQRMVALAYPKGKEILPSMCPNPELIADENNVKQALEKFNLNMQSGSILALSPGAEFGPSKKWSPDYFAHVALEKIQAGWQVWLFGSKKDEAVAQEVLAKAPGCIDLVGKTNLEEAVDLLSATDQVVSNDSGLMHIAASLGKPTVAIYGSTDPGFTPPLGKKVRVLEKELDCRPCFKRECPLEHHHCMDSIKPDEVLHALDQLP
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MVFFNLLIVCQKLLIERYINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFVRPYRSCDRGLNEHTLRAMEC
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MKTSIQEKLLTVQERYQELEVLLGDPGVISQQETFRDYSKEYAQLEPIVKCFEDYLQAQDSRETAEQMLLDDDPDMREMAQEEVKASNERCELLALELQKLMLPQDPHDSSNVFLEVRAGTGGDEAAIFAGDLFRMYSRYAENNRWQVELISEREGDHGGYKEIIVRIIGTGVYSKLKFESGAHRVQRVPATESQGRVHTSACTVAIMPEVDAVNEIEINTNDLRIDTFRASGAGGQHVNKTDSAIRITHLPTGVVVECQDERSQHKNKAKALALLQSRLLTAEQSRQQAEQAEERRNLVGSGDRSERIRTYNYPQGRITDHRINLTLYKLDDVMEGDLTEIIGSLIQEHQADLLASMEGA
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MSNQKPVRACAVPRYDVTKKDLPLSCPMPQMEIWDAHPRVYLPIEETGTATCPYCGAEFHLTNKS
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MTARIMIIDDEAPIRDMVRFALELSHFEVIEAETAKEGQRKIIEKTPDLLLLDWMLPDQAGIELAQTLKVQYPALPIIMLTARAEEESRVLGLEQADDYVIKPFSPRELIARIKAVLRRSQTNAGENTEPAQFISLGSLCVNQDSQQVFINDQAVKTGPIEYKLICFFITHPNKVFSREQLLNRVWGPQVYVSERTVDVHIRRLRKILESAGSYNYIHTTRGSGYSLRLPAEDDPA
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MTVTTPCNRAKLTLFVSVIAVIAAAIETDLFIPSLPAMQHYYLASSNQIQLLISMNFLGLCISSLFYGPLADSYGRKPILLTGLVIFVFGAVGCVFSLSLSNIIFWRFIEGIGSGACFVIPGTVIFDLYSKEAAARILGILNSITTIAMAASPLAGGFIHTQFGWRANFLFLAFVAILALLLAIFLIKESLPKKSRVPLHIKSITHGYYRLITHTESLSYLLIICCVFGAYMVYISGLSLIFVNHLHISESAFPYYQGAVLLAFAAISMACGRIIHLLGMKKALHYSTITMAIGAILLLFTGLFFADSALLITITMSIFAAGVALMLTIIFGNYMEVIPEIRGIASALCNALRLCAAALFVGLAGLLFTGTITPIAIFIFTLAIISTVILAWLQRKKLHQQSKHPSHSHQSSHSTT
>NZ_CP038886|2563460:2616644|2566483_2567527_-|WP_075275125.1|transposase|DBSCAN-SWA
MCKIPTEVATLTYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075273327.1|2563460_2564036_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2563981_2564347_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275125.1|2566483_2567527_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210612.1|2569118_2570369_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210605.1|2570357_2571239_-	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210611.1|2571231_2572317_-	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	4.3e-07	41.2
WP_016210607.1|2572313_2573573_-|tRNA	glutamyl-tRNA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210598.1|2573741_2574401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556471.1|2574542_2575214_+	outer membrane lipoprotein LolB	NA	NA	NA	NA
WP_016210609.1|2575573_2576509_+	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A1V0SHF7	Hokovirus	6.3e-39	34.4
WP_016210606.1|2576605_2577232_+	50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc	NA	NA	NA	NA
WP_016210603.1|2577237_2577819_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210601.1|2577890_2578982_+	redox-regulated ATPase YchF	NA	NA	NA	NA
WP_016210599.1|2579064_2579778_+	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	NA	NA	NA	NA
WP_122940948.1|2579871_2580576_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|2580898_2581960_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126800.1|2582084_2582819_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046715.1|2583367_2583613_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556470.1|2583912_2584798_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209916.1|2585035_2586007_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.7e-34	32.9
WP_016209900.1|2586198_2587668_-	glycine dehydrogenase subunit 2	M4QFZ1	Prochlorococcus_phage	2.7e-84	41.9
WP_016209924.1|2587661_2589038_-	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
WP_016209906.1|2589049_2589442_-	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
WP_016209919.1|2589438_2590542_-	glycine cleavage system aminomethyltransferase GcvT	NA	NA	NA	NA
WP_032126654.1|2590720_2592022_-	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209907.1|2592029_2592977_-	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-37	37.9
WP_016209913.1|2592988_2593807_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126655.1|2593809_2594610_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209910.1|2594603_2595662_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209903.1|2595658_2596669_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|2596675_2596873_-	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209914.1|2596933_2599840_-	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209918.1|2599881_2600736_-	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126652.1|2600768_2601335_-	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016209915.1|2601417_2602278_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209922.1|2602369_2602786_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|2602845_2603343_+|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209920.1|2603388_2606343_+	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|2606372_2606705_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209923.1|2606822_2607341_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209908.1|2607815_2608526_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209899.1|2608522_2609557_+	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_032126651.1|2609660_2609846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275054.1|2609966_2610332_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2610277_2610853_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212369.1|2610856_2611303_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212599.1|2612537_2612747_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275052.1|2612796_2613306_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275050.1|2613450_2614146_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|2614221_2615127_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556469.1|2615920_2616229_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080743011.1|2616188_2616644_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038886|2653723:2792707|DBSCAN-SWA
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MQKLKLHGFNNLTKSLSFNIYDICYAKTPEEQQQYLEYIDEAYSASRITELMNQVTETIGAHVLNIAYQDYEPQGASVTMLIAEGPVMLPTKTITPDAVVAHLDKSHIAVHTYPEMHPDNEHGICTFRADIDVSTCGLISPLKALNLLIDSFECDIATVDYRTRGFTRDIYGNKLYMDTPINSIQNFFTEEVRRCYEMIDVNIYQENIFHTKMLLKEFDLDNYLFGATTKELSSGNEQLIRSRIKREMLEIFYGRNMADVPIDGCY
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MHTQDTNPARSSLTITTPSNHQTIHHASGRLTVTVRPKPGIQYYHYYIDGRLIKRSTQPSVTLYHLDRGQHQLKVIATNKLHTLTSNTLIFYLHRTSILNNNLPNHH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209516.1|2656080_2657550_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|2657554_2658247_-	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|2658224_2659253_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126188.1|2659246_2660473_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209501.1|2660478_2661990_-	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209510.1|2662251_2662689_+	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209523.1|2662739_2664089_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
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WP_016209536.1|2664816_2667987_+	intracellular multiplication and macrophage-killing family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209533.1|2669848_2670169_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126191.1|2670313_2670835_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376335.1|2670967_2671768_-	adenosylmethionine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210437.1|2671866_2672442_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.7e-58	50.5
WP_016210432.1|2672500_2673172_-	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210440.1|2674662_2675139_-	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923648.1|2675138_2675420_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210439.1|2675416_2676127_-	nucleotidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210436.1|2676123_2677149_-	phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080664841.1|2677278_2679783_+	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
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WP_016210429.1|2681062_2682046_+	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA	NA	NA	NA	NA
WP_016210434.1|2682058_2682877_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_016210431.1|2682921_2683314_+	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_016210435.1|2683373_2684180_+	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556462.1|2684410_2685256_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.4e-24	33.8
WP_105962625.1|2685252_2686139_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|2686518_2686857_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275039.1|2686851_2687346_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|2688149_2688440_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007010.1|2688489_2689110_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|2689950_2690631_-	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210535.1|2690627_2691440_-	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|2691513_2695194_-	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210531.1|2695203_2696691_-	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|2696700_2697318_-	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|2697387_2697906_-	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|2697902_2698802_-	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|2698817_2699861_-	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|2700050_2700338_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|2700449_2701901_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
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WP_075275038.1|2703975_2704566_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2704511_2704877_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|2704903_2705125_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_052047032.1|2705438_2705672_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|2705884_2706082_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126197.1|2706195_2707149_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2707289_2708264_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300148.1|2708374_2709436_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|2709457_2710204_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|2710333_2710645_+	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211487.1|2710992_2711316_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211494.1|2711340_2711796_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|2711785_2712838_-	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_016211493.1|2712840_2714304_-	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|2714586_2714883_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275036.1|2715143_2716205_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|2716334_2716799_-	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|2716996_2717812_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|2717940_2720253_+	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|2720372_2720900_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210909.1|2721592_2722870_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210914.1|2722875_2723127_-	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-20	58.8
WP_016210913.1|2723160_2723682_-	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_032126716.1|2723852_2724836_-	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210908.1|2724926_2725742_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556458.1|2726633_2726867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2727242_2728304_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038886|2905269:2948667|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_052104629.1|2947641_2948667_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038886|2980352:3100259|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080664857.1|2988364_2989651_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_129556668.1|2992585_2993824_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|2994371_2994845_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|2994841_2995237_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2996166_2996742_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2996687_2997053_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211610.1|2997317_2999648_+	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
WP_129556603.1|2999768_3001784_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274967.1|3001967_3005360_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212386.1|3005424_3005730_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274968.1|3005899_3007000_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049897.1|3007247_3008504_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209721.1|3009442_3010840_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.3e-77	34.4
WP_051307313.1|3010959_3011907_-	P-type conjugative transfer ATPase TrbB	NA	NA	NA	NA
WP_032126703.1|3011903_3012419_-	signal peptidase peptidase S26 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209698.1|3012405_3013605_-	trbL/VirB6 plasmid conjugal transfer family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209707.1|3013601_3013925_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209703.1|3013926_3015156_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209722.1|3015155_3016199_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556606.1|3016198_3016882_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209720.1|3016878_3019368_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377396.1|3019384_3019639_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209715.1|3019639_3019996_-	trbC/VIRB2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664821.1|3020775_3021939_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209727.1|3021958_3025066_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209723.1|3025067_3026573_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016209714.1|3026600_3026882_-	accessory factor UbiK family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209717.1|3036733_3037732_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3037733_3038312_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3038308_3039778_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274971.1|3041942_3042395_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211228.1|3054620_3055136_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3055144_3055708_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3055688_3056435_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3056574_3057027_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210351.1|3057450_3058287_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210345.1|3059212_3060280_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210336.1|3062150_3063530_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3063570_3064902_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3064873_3065833_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3065925_3066429_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3066563_3067715_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3067711_3068191_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3068337_3070659_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
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WP_129556610.1|3072206_3072785_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556611.1|3073351_3074505_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_155046759.1|3075917_3076073_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3076400_3077174_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3078501_3079476_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016212337.1|3080925_3081636_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_051307375.1|3081623_3081815_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046696.1|3082265_3082430_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|3082486_3082852_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3084156_3084852_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211298.1|3090367_3090973_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211299.1|3092983_3093925_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3094152_3095577_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_080664873.1|3099054_3099369_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556613.1|3099263_3100259_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038886.1|WP_075275039.1|2686851_2687346_-|hypothetical-protein	2686851_2687346_-	164 aa aa	NA	HTH_21	NA	2653723-2792707	yes
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NZ_CP038886.1|WP_016212024.1|2771621_2771870_+|hypothetical-protein	2771621_2771870_+	82 aa aa	NA	HTH_21	NA	2653723-2792707	yes
NZ_CP038886.1|WP_129556602.1|2982820_2983030_-|hypothetical-protein	2982820_2983030_-	69 aa aa	NA	HTH_1,HTH_38	NA	2980352-3100259	yes
NZ_CP038886.1|WP_016211201.1|2986163_2986472_-|hypothetical-protein	2986163_2986472_-	102 aa aa	NA	HTH_1,HTH_38	NA	2980352-3100259	yes
NZ_CP038886.1|WP_155046758.1|3075641_3075773_+|phosphatase	3075641_3075773_+	43 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2980352-3100259	yes
NZ_CP038886.1|WP_155046759.1|3075917_3076073_+|hypothetical-protein	3075917_3076073_+	51 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2980352-3100259	yes

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_129556569.1|1047589_1047799_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_129556569.1|1047589_1047799_-|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

HTH_ARSR HTH domain information

• Identity: 0.46774193548387094
• Hit_domain_coverage: 0.7948717948717948

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1046688-1046651	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055558-1055521	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1087437-1087400	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055424-1055387	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1046688-1046651, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055558-1055521, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1087437-1087400, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055424-1055387, mismatch: 1

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********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212450.1|1054525_1055428_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212450.1|1054525_1055428_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1046688-1046651	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055558-1055521	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1087437-1087400	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055424-1055387	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1046688-1046651, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055558-1055521, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1087437-1087400, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055424-1055387, mismatch: 1

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cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016211536.1|1094381_1094615_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016211536.1|1094381_1094615_+|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN

HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5555555555555556
• Hit_domain_coverage: 0.9782608695652174

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1046688-1046651	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055558-1055521	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1087437-1087400	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055424-1055387	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1046688-1046651, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055558-1055521, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1087437-1087400, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055424-1055387, mismatch: 1

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cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212614.1|1098342_1098549_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212614.1|1098342_1098549_-|hypothetical-protein
MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1046688-1046651	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055558-1055521	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1087437-1087400	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1055424-1055387	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1046688-1046651, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055558-1055521, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1087437-1087400, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1055424-1055387, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_033923740.1|1120016_1120304_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_033923740.1|1120016_1120304_+|hypothetical-protein
MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_098082828.1|1362608_1362866_+|transposase

>NZ_CP038886.1|WP_098082828.1|1362608_1362866_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1358606-1358643	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1358606-1358643, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_098082828.1|1422767_1423025_-|transposase

>NZ_CP038886.1|WP_098082828.1|1422767_1423025_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1358606-1358643	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1358606-1358643, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_155049900.1|1783293_1783599_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_155049900.1|1783293_1783599_-|hypothetical-protein
MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT

HTH_38,HTH_Tnp_1 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016211563.1|1783947_1784109_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016211563.1|1783947_1784109_-|hypothetical-protein
MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP

HTH_38,HTH_Tnp_1 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212013.1|1802894_1803278_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212013.1|1802894_1803278_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_129556517.1|1798683_1798971_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_129556517.1|1798683_1798971_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_155046727.1|1816255_1816600_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_155046727.1|1816255_1816600_+|hypothetical-protein
MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_129556515.1|1817425_1817785_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_129556515.1|1817425_1817785_-|hypothetical-protein
MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_075274844.1|1818932_1819184_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_075274844.1|1818932_1819184_-|hypothetical-protein
MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6097560975609756
• Hit_domain_coverage: 0.9318181818181818

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	1748576-1748539	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 1748576-1748539, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_155046725.1|1999064_1999205_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_155046725.1|1999064_1999205_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2017780-2017817	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2021286-2021323	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2017780-2017817, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2021286-2021323, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_081377858.1|2000062_2000773_+|transposase

>NZ_CP038886.1|WP_081377858.1|2000062_2000773_+|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2017780-2017817	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2021286-2021323	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2017780-2017817, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2021286-2021323, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_054300380.1|2017855_2018512_-|transposase

>NZ_CP038886.1|WP_054300380.1|2017855_2018512_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2017780-2017817	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2021286-2021323	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2017780-2017817, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2021286-2021323, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212421.1|2021751_2021934_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212421.1|2021751_2021934_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2017780-2017817	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2021286-2021323	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2017780-2017817, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2021286-2021323, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_032127044.1|2033657_2033858_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_032127044.1|2033657_2033858_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2017780-2017817	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2021286-2021323	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2017780-2017817, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2021286-2021323, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_032126179.1|2201705_2201957_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038886.1|WP_032126179.1|2201705_2201957_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2193335-2193372	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2203514-2203477	1
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2193469-2193506	1

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2193335-2193372, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2203514-2203477, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2193469-2193506, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212461.1|2366217_2366592_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212461.1|2366217_2366592_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6097560975609756
• Hit_domain_coverage: 0.9318181818181818

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2384159-2384122	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2367508-2367545	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2384159-2384122, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2367508-2367545, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016211512.1|2417296_2418103_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016211512.1|2417296_2418103_+|hypothetical-protein
MPTTSKLKAYLNEPNSTNKKHALEEMFPLLNEAYENVKKQRPNKPFGADEIWPEIQIIFSAHYGELSSQLSILQYFNLYTLFDDLTESSCDKIQHISHGEFCQPVVQVINLTTPYLSTKAIPQFIENSNQCIDEFTKWGVTHDNDEITRAAHVLATKLAGCRDEFIQRIIQNKETNQGYKITDDVPNYRRKIREIIESSTETKLLSSQQDWQGIIGNVLIGLTGIGLVALAVKAAHSQATTGQASLFFDTNAAQKAEQLGEDLLLMER

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2420938-2420901	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2411135-2411172	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2420938-2420901, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2411135-2411172, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_051307360.1|2419194_2420124_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_051307360.1|2419194_2420124_+|hypothetical-protein
MTLEQWWNSRTPAEKSIVAAIIAGFNLQIIEKNILAAQKAIFLDYLREQLANYNIEVPDLDEEEAEEAADKIQKLLEEEELNLQLEKKPKQSLPAEGFSFSDLEPKTLTAMSREEFHQLLLSPRQIGIIVTVGEILKKEDGFNIFDYQVNNGPKLDAQLTQIAPGTPTPDTPIKIQAQFHCPLRQSIPLEEQEEEKNKQATTLAQLVESVCTMNQAKRCPVRLNVQAEEHEVSPLAQAFICALQQRVLLKQLQHLSFNNQVFDYSHLLPNTTPFQTQQQGAEGYTSSEPELKQEPDQEPEQEQEQKLAL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2420938-2420901	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2411135-2411172	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2420938-2420901, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2411135-2411172, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016209640.1|2456401_2457421_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016209640.1|2456401_2457421_+|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6097560975609756
• Hit_domain_coverage: 0.9318181818181818

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2420938-2420901	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2411135-2411172	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2420938-2420901, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2411135-2411172, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016210742.1|2494301_2494577_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016210742.1|2494301_2494577_-|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2506563-2506600	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2508715-2508752	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2506563-2506600, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2508715-2508752, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212416.1|2509108_2509639_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212416.1|2509108_2509639_-|hypothetical-protein
MSTEPSIDDKNKIESLTKDFCSALVISPNLIKGLTKGKYYKIVEALDVAVEELKVLAEQPLLDLYKSHYLKKHSVTSLDVKFAQIDSVFSSQVKWGLAIKKDSEQKRQAEKIGQELKALSTAIVRSFEENSTAFYRKYRWAEITKLKLSEKYIDKVVANPGQFRENYCRLEELGPH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2506563-2506600	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2508715-2508752	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2506563-2506600, mismatch: 0

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**************************************

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_075275039.1|2686851_2687346_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_075275039.1|2686851_2687346_-|hypothetical-protein
MAINKIHHHRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKARLNYFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.46296296296296297
• Hit_domain_coverage: 0.9152542372881356

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2729452-2729415	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2790942-2790979	0

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**************************************

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_032126150.1|2759963_2760197_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_032126150.1|2759963_2760197_+|hypothetical-protein
MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2729452-2729415	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2790942-2790979	0

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**************************************

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212022.1|2770807_2771026_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212022.1|2770807_2771026_+|hypothetical-protein
MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4107142857142857
• Hit_domain_coverage: 0.9491525423728814

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2729452-2729415	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2790942-2790979	0

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**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2790942-2790979, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016212024.1|2771621_2771870_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016212024.1|2771621_2771870_+|hypothetical-protein
MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4107142857142857
• Hit_domain_coverage: 0.9491525423728814

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2729452-2729415	0
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2790942-2790979	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2729452-2729415, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2790942-2790979, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_129556602.1|2982820_2983030_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_129556602.1|2982820_2983030_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

HTH_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2997079-2997116	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2997079-2997116, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_016211201.1|2986163_2986472_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_016211201.1|2986163_2986472_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

HTH_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5178571428571429
• Hit_domain_coverage: 0.9333333333333333

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2997079-2997116	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2997079-2997116, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_155046758.1|3075641_3075773_+|phosphatase

>NZ_CP038886.1|WP_155046758.1|3075641_3075773_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2997079-2997116	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2997079-2997116, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038886.1|WP_155046759.1|3075917_3076073_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038886.1|WP_155046759.1|3075917_3076073_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038886_1	Orphan	1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder	363176-363213	38	2997079-2997116	0

1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038886|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038886 position: 2997079-2997116, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. NZ_CP038889

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	14424 : 22147	10	unidentified_phage(33.33%)	integrase,transposase	attL 8029:8088|attR 21469:21660

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038889|14424:22147|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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8029:8088	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_032126152.1|16356_16947_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_129556740.1|17010_17379_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046774.1|17590_17767_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300579.1|17985_18987_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.0
WP_016211990.1|19316_21389_+	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556739.1|21418_22147_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
21469:21660	attR	NA	NA	NA	NA