Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038916 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP038915 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 6 |
NZ_CP038913 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,csa3,RT,DinG,cas3 | 1 | 2 | 28 | 40 |
NZ_CP038914 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 0 | 3 | 1 | 13 |
NZ_CP038917 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
14423 : 22146
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038916|14423:22146|DBSCAN-SWA GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038916|14423:22146|19315_21388_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV >NZ_CP038916|14423:22146|14423_15095_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG >NZ_CP038916|14423:22146|17009_17378_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038916|14423:22146|15116_15398_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038916|14423:22146|17984_18986_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038916|14423:22146|15470_15935_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA >NZ_CP038916|14423:22146|15945_16140_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE >NZ_CP038916|14423:22146|21417_22146_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038916|14423:22146|17589_17766_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG >NZ_CP038916|14423:22146|16355_16946_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI |
10 | unidentified_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 8028:8087|attR 21468:21659 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4824 : 28863
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038915|4824:28863|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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33 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37206 : 57887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038915|37206:57887|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038915|37206:57887|47809_48205_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP038915|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF >NZ_CP038915|37206:57887|54599_57887_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH >NZ_CP038915|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL >NZ_CP038915|37206:57887|39129_39495_+|WP_016212235.1|DBSCAN-SWA MHSAGLLAAKNSANLELPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS >NZ_CP038915|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD >NZ_CP038915|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI >NZ_CP038915|37206:57887|47493_47817_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA >NZ_CP038915|37206:57887|42428_43670_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK >NZ_CP038915|37206:57887|40974_41331_+|WP_080743047.1|DBSCAN-SWA MTLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDS >NZ_CP038915|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA >NZ_CP038915|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP038915|37206:57887|54251_54506_-|WP_016210670.1|DBSCAN-SWA MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNAPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLNSPDCDFIDVDVDDL >NZ_CP038915|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ >NZ_CP038915|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN >NZ_CP038915|37206:57887|48551_48974_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP038915|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038915|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN |
29 | Pseudomonas_phage(11.76%) | capsid,terminase,tail,protease,head,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038915.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein |
5761_6361_-
Protein sequences of NZ_CP038915.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein>NZ_CP038915.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD |
199 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038915.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein |
6360_6621_-
Protein sequences of NZ_CP038915.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein>NZ_CP038915.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH |
86 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038915.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein |
9914_10262_+
Protein sequences of NZ_CP038915.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein>NZ_CP038915.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR |
115 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038915.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein |
23884_24064_+
Protein sequences of NZ_CP038915.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein>NZ_CP038915.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA |
59 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038915.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein |
24063_24492_+
Protein sequences of NZ_CP038915.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein>NZ_CP038915.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ |
142 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038915.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein |
24659_25199_-
Protein sequences of NZ_CP038915.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein>NZ_CP038915.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM |
179 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038913_1 | 363129-363258 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038913_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038913_1
>1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038913_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038913_1 >merge|NZ_CP038913|1|363129-363258|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP038913|1|1|363129-363258|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP038913.1|WP_054300520.1|361907_362222_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038913.1|WP_075273359.1|361386_361962_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038913.1|WP_016211797.1|359932_361336_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038913.1|WP_129556444.1|359348_359771_+|hypothetical-protein MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038913.1|WP_080664870.1|358708_359356_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE >NZ_CP038913.1|WP_016211795.1|357831_358026_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038913.1|WP_036794771.1|356707_357694_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038913.1|WP_016212044.1|355730_355985_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038913.1|WP_054300271.1|354217_355192_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038913.1|WP_016212359.1|353631_353850_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP >NZ_CP038913.1|WP_032126227.1|363787_364078_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038913.1|WP_016212008.1|364115_364814_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038913.1|WP_016212010.1|364830_365127_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038913.1|WP_129556446.1|365244_366396_+|hypothetical-protein MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038913.1|WP_075273619.1|366668_367244_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP038913.1|WP_016211273.1|367301_368135_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP038913.1|WP_016211268.1|368250_369435_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP038913.1|WP_016211271.1|369453_370398_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP038913.1|WP_016211269.1|370702_371488_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP >NZ_CP038913.1|WP_016211272.1|371605_371974_-|hypothetical-protein MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038913_2 | 685144-685264 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038913_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038913_2
>2.1|685181|47|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038913_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038913_2 >merge|NZ_CP038913|2|685144-685264|CRISPRCasFinder AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA >NZ_CP038913|2|2|685144-685264|CRISPRCasFinder AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA
>NZ_CP038913.1|WP_054300282.1|683301_683766_+|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038913.1|WP_129556590.1|681512_681908_-|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP038913.1|WP_032126312.1|680721_681516_+|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP038913.1|WP_016211756.1|679817_680543_+|M15-family-metallopeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP038913.1|WP_016211759.1|678384_679572_-|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP038913.1|WP_016210935.1|676029_676572_+|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP038913.1|WP_016210943.1|675346_676033_+|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP038913.1|WP_016210942.1|674731_675343_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG >NZ_CP038913.1|WP_016210944.1|673665_674685_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK >NZ_CP038913.1|WP_016210936.1|672769_673564_+|thymidylate-synthase MRTYLDLMQRVLETGAEKTDRTGTGTLSVFGHQMRFDLSAGFPLLTTKKLHLRSIIHELLWFLKGETNIAYLNENKVRIWDEWANAEGDLGPIYGAQWRSWAGADGKTIDQMTQVIEQIKINPDSRRLIVSAWNVAEIEKMALPPCHALFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTLMIAQVTGLEPGDFVHTLGDAHLYSNHLEQVKTQLQRDCRGLSMMKINPEVKDIFDFKYEDFILENYDPHPHIKGAVAV >NZ_CP038913.1|WP_075275117.1|685420_685843_+|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP038913.1|WP_016211905.1|686086_686497_-|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP038913.1|WP_052047041.1|686765_687029_-|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP038913.1|WP_098082812.1|687261_687777_-|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038913.1|WP_016210678.1|687921_688932_-|protein-kinase MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038913.1|WP_016210676.1|689235_691317_-|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP038913.1|WP_016210671.1|691772_693032_-|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP038913.1|WP_016210673.1|693164_693638_+|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP038913.1|WP_016210672.1|693646_695029_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP038913.1|WP_016210677.1|695021_695636_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP038913_3 | 1617715-1617821 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038913_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038913_3
>3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038913_3
The CRISPR arrays of NZ_CP038913_3 >merge|NZ_CP038913|3|1617715-1617821|CRISPRCasFinder GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA >NZ_CP038913|3|3|1617715-1617821|CRISPRCasFinder GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA
>NZ_CP038913.1|WP_016211836.1|1615663_1616152_+|protein-kinase MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK >NZ_CP038913.1|WP_051307365.1|1615383_1615644_+|hypothetical-protein MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF >NZ_CP038913.1|WP_016211834.1|1614812_1615127_-|hypothetical-protein MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH >NZ_CP038913.1|WP_080664871.1|1613099_1614722_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter MKSKFLNNVKGNVFGGITAAIIALPVALAFGLSSGMGPMAGLYSAVCVGLFAALFDGTPAQISGPTGPMTVVMAATLINLNDVDAEAGLAMGFTVVVLAGCFQILFGLAKLGRYITLVPYPVISGFMSGVGVIIIILQLPPLFGYPLLANLWQTVLNITDMLAAPNYTTFYIGLIVLVIAFFWQGRLNQFFPAYLLALIVGTVIYLIIFKNNADMISVIGNIPSGIPKLHWPTFDIPHLRVIITSALLLAVLGAVDSLFTSLVANNITHEHHHSDRELIGQGLGNMASGLIGGLPGAGATMRTVASIQAGGSTSLAGIVHSLILLAVVLGAGHYFSSIPHAVLAGILIKVGTDIIDWKFIVRLYRLPIFSSILMLIVLLLTVFVDLISAVFVGVFIANLVTIDRLSHIQLDGISLSDGIKNRHDLLSSEADKLRKKRGQIVLFRLVGAISFGVARQIKKQISDFKEHQMLVLDLSRVSLVGVTSIIMIDDIVQAELNKNNKVYIIMDEEGVDENLEKISILKKLKQEYFVKSLDEVLRKC >NZ_CP038913.1|WP_032126362.1|1612302_1612668_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038913.1|WP_075273327.1|1611781_1612357_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038913.1|WP_016212185.1|1610698_1611688_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK >NZ_CP038913.1|WP_016212182.1|1610179_1610365_+|hypothetical-protein MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF >NZ_CP038913.1|WP_016210748.1|1607544_1609500_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS >NZ_CP038913.1|WP_016210749.1|1606784_1607246_+|hypothetical-protein MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL >NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1618525_1618783_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN >NZ_CP038913.1|WP_052047040.1|1618852_1619791_+|IS3-family-transposase MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK >NZ_CP038913.1|WP_051307338.1|1619816_1621382_-|APC-family-permease MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSKFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS >NZ_CP038913.1|WP_016210800.1|1621591_1622419_-|DsbA-family-protein MKKYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ >NZ_CP038913.1|WP_075273540.1|1622785_1623397_+|hypothetical-protein MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH >NZ_CP038913.1|WP_129556527.1|1623581_1623842_+|hypothetical-protein MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN >NZ_CP038913.1|WP_016210799.1|1624303_1625257_+|chemotaxis-protein-CheV MRANLLENIDSRTKLVGRNRFEALVFSIHGRQYAINVFKVREVLHLPELTVLPESHPAVLGVVHIRNQSLAVIDTCQAIFAKKTLDPLSGILIVTEYNHSVQGFLVHEIHHIINATWENVIAAPEATGKDKYITSVLKINEEGATSLIQVIDVEKVIYEIHPAQYDIKVSTNTLENVVIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ >NZ_CP038913.1|WP_016210791.1|1625683_1625884_-|hypothetical-protein MPGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM >NZ_CP038913.1|WP_051307339.1|1626258_1627065_+|methyltransferase-domain-containing-protein MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVMHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK >NZ_CP038913.1|WP_016210795.1|1627170_1628142_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 155057-155094 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 256553-256590 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 962079-962116 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1051629-1051666 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1060499-1060536 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1092378-1092415 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1174268-1174305 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1183569-1183606 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1482839-1482876 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1482973-1483010 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1753805-1753842 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2299521-2299558 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2403094-2403131 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2439873-2439910 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2628870-2628907 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2748381-2748418 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 46478-46515 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 157364-157401 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 178806-178843 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 183188-183225 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 225980-226017 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 461923-461960 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 603555-603592 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 965331-965368 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1253026-1253063 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1363872-1363909 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1521445-1521482 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1566267-1566304 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1598330-1598367 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1612694-1612731 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1703257-1703294 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 1708832-1708869 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2036750-2036787 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP038913.1 | 2212306-2212343 | 0 | 1.0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP039210 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence | 166717-166754 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038913_1 | 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder | 363175-363212 | 38 | NZ_CP039213 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence | 30310-30347 | 0 | 1.0 |
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5. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
30. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
32. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
34. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
35. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
36. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
37. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
38. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
39. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
40. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
41. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
42. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
43. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
44. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
49. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
50. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
51. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
52. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
53. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
54. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
55. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
56. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
57. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
58. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
59. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
60. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
61. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
62. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
63. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
65. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
66. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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125. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** ***
126. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** ***
130. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** ***
131. spacer 3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa CRISPR spacer tataggattaagttagaatcgaattcagtaa Protospacer . ***********.******* *** *. **
132. spacer 3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa CRISPR spacer atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa Protospacer . ..***************.* *******
133. spacer 3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa CRISPR spacer atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa Protospacer . ..***************.* *******
134. spacer 3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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135. spacer 3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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136. spacer 3.1|1617753|31|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45565 : 89678
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038913|45565:89678|DBSCAN-SWA 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46 | Moraxella_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136472 : 178469
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038913|136472:178469|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038913|136472:178469|149838_150393_-|WP_016211016.1|DBSCAN-SWA MINTNNSLYLALVHTPLWVYLLLVAFLKRGINALSPSTHSIYRLTIIPALFLFSSLHTLTTSSQSLSNTLILWSLGLSAGLVIACFNTPRAHIQPDYKQRTVTVPGSPYMLILLLCAFITKYTVFYQITIAPQIIYDFTFSVILLTTTGLFTGLSIGRNLCLSYRYCNNSNSYFKESMQTSIYP >NZ_CP038913|136472:178469|137948_139361_-|WP_016211637.1|DBSCAN-SWA MTLTKNPPKISFFLLVLLITGSIDSIRNLPSAALFGSELPFFFILGALTFLLPTAFISAELSSRCPDHSGIYGWTRTAFGKKWAFLAIWLQWVNTMVWYPTILSFIAATTAHIFAPTLANNKFYMVSMILTIFWLMTFVNLKGLRTSARFASICTLIGTLLPMLMILILALIWVIKGNPSQVNFHHWVPNLHHQDGWISLTAIMASFLGMELATVHTRYVDKPRKTVPKALLTTVVIIAFTMLLGSLAIAMVLPGQEIALVDGIMQAFSRFLDHYHLAWAMPIIGILIVIGSLGSMINWMLSPATGLLQAAQDGFVPSFLAKTNKVKAPANLLILQAIVVSAVCSAFLLMPSISGSYWLLTALSTELYMLMYVMMFCAAIKIRYQQQKQTPEFVIPGKTVGFSLISLLGFIGCGITLFVGFIPPGNINTGNHYAVIFTTGLITMILPVILFYIYHRRTSITPTAFMTKYS >NZ_CP038913|136472:178469|148711_149815_-|WP_016211017.1|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
182275 : 239529
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038913|182275:239529|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(12.5%) | tail,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
256926 : 301881
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038913|256926:301881|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_5 |
329456 : 375011
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038913|329456:375011|DBSCAN-SWA 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46 | Hokovirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
447623 : 545943
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038913|447623:545943|DBSCAN-SWA 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93 | Escherichia_phage(32.14%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
590094 : 641239
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038913|590094:641239|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
649326 : 683766
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038913|649326:683766|DBSCAN-SWA 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36 | Catovirus(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
712406 : 819879
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038913|712406:819879|DBSCAN-SWA 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102 | Escherichia_phage(36.59%) | integrase,transposase,tRNA,protease | attL 729020:729079|attR 735248:735535 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
909091 : 961150
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038913|909091:961150|DBSCAN-SWA 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45 | Agrobacterium_phage(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1023062 : 1104670
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038913|1023062:1104670|DBSCAN-SWA 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83 | Staphylococcus_phage(35.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1125340 : 1252689
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038913|1125340:1252689|DBSCAN-SWA 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119 | Staphylococcus_phage(17.65%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1295697 : 1478905
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038913|1295697:1478905|DBSCAN-SWA 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176 | Leptospira_phage(12.5%) | integrase,transposase,tRNA,protease | attL 1361382:1361441|attR 1429921:1431150 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1483346 : 1527477
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP038913|1483346:1527477|DBSCAN-SWA 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46 | Escherichia_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 1498472:1498531|attR 1528244:1528534 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1557099 : 1674318
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038913|1557099:1674318|DBSCAN-SWA 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108 | Staphylococcus_phage(21.43%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1702344 : 1741186
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP038913|1702344:1741186|DBSCAN-SWA 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31 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1751451 : 1851347
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP038913|1751451:1851347|DBSCAN-SWA 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96 | Staphylococcus_phage(20.0%) | integrase,transposase,protease,tRNA | attL 1821863:1821922|attR 1856347:1856427 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1878197 : 1937307
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP038913|1878197:1937307|DBSCAN-SWA ACTATTTTCTCTTCCAACTAGTCCCTGCCGCATTATCTTCAAGAATAATGCCTTGCTCGAGCAATTCATCACGCACCCGATCCGCCTCAAGCCAGTTACGCTCATCACGTGCCTGATTGCGTTGTACAATCAACGCTTCAATCTCTGTGGTATCAAACTCACTACCATATTGCCCACCCTGTAAAAAAGCTTCAGGCTGACTCTGCGCAATGCCTAAAACACCGGCCAGCTGTTTTAATAAACCAGCATAAGGCGCAGCTTTCTCCAGTGACTCTTCTCGCAAACGATTAATTTCACGTACTAACTCAAATAAAACAGCTAAGGCTTCAGGCACATTAAAATCATCATCCATAGCCTGATAGAAACGTGCTTCAAAACTAGTGCCAGCCAATGCAGGATTATTCTCTGGTATGCCCTTTAATGCTGTATATATCCGCGTTAATGCACTGCGTGCACCCATCACCGTTTCTTTAGAATAATTCAAGACACTACGATAATGTGATGAAATTAAGAAATAACGCAAGGTTTCGGCATCAATTTCCTTGAGCACATCACGAATCGTAAAAAAATTGCCCAATGACTTCGACATTTTTTCTTTATTGATCTGTAACATGCCCGTATGTAGCCAATAATTGGCATATGGCTGATTATTAGCCACTTCAGATTGCGCAATTTCATTTTCATGATGTGGAAAGCTTAAATCTCCGCCGCCACCATGAATGTCAAAGTTCAGACCTAAAGCTTCACGCGACATCGCCGAACACTCAATATGCCAGCCTGGACGTCCCCGCCCCCAGGGAGACTCCCAAAACGGCTCATCCGGTTTTGCTGCTTTCCACAGGACAAAATCCAGCGGATTTTCTTTGATCTCACCCATCTCAACCCGAGCACCACAGCGTAAGTCCTCAATTGACTGATTCGATAATTTGCCATATTCCGCAAATTTTTCTACGCGATAATAAACATCACCATTATCCGCCACATAAGCCATATCTTTATTAATCAGTTCACTAATTAGCACCTGCATCTGTGTAATCGTTTGGGTAGCCCGTGGCTCTTGATCCGGCGCCAACATGCCCAAGCAAGCAAAATCCTCCTGCATTGCCGTAACAAAACGATCCGCTAAGGCAATCGCGTTCTCACCATTCTCATTAGCGCGCTTAATAATCTTATCGTCCACATCGGTAATATTACGCACATAAGTAAGCTTATAACCTTTCGCGCGCAAATAACGAGTAATCACATCAAAAGCCAAAAAGGTCCGAGCATGGCCAACATGACAATAATCATAAACCGTCATACCACACACATACATGCCAACTTTGCCTGCAACAATTGTCTTAAATTCTTCTTTTTTTCGCGTTAAACTGTTATAGACCTGCAACATAATACCTCAAGCTCCCTCAATAAAATTAACCGCATTAATCAAGCGATGAATTAACTGCTCTTTACCCAATAAATTCACCACCGGGCCCAGCTCTGGACCATGCAACTGACCGGTTAACGCAATGCGCAAGGGCTGAAATAACTGTTTACCTTTTACACCCGTTTGCTCTTTAATTGCCGCCGTTAAGCTTTTCCAAGTGCCATCACTATTTTCTGCACAAGAAACTGCAATATTAAAAAATTCCAGGCCCGCACCTTTGAATACTTCTAATATATTTGCTTCCAGTGTATTAAGCATTATTCCAGAAAAAATCATTTTCGCCAGTGTCAGCGCATCGTTTGGAAAGACAATATTTGGACGCACAGTATCAATAAAAAGAGACTTTACAGCCTCTGGTACCTGGCTGTGGACTTGGTCTCCCATCCACTGCCATAACACATCAGCATCACTGTGCAATACGGCTTCCTTTTGCCAATATTTTAATTGCTCTTCATCATAGCGCGCAGCGGATTTAGACAGTGATTCTATGTTAAAGTGCTCGGCAAGCTCATCAATATCAACAAAACCTAAATCACCAAAATAATGACCAAGACGTGCCATATAATTGACCACCGCCGCCGGCAAATAACCAGCTTCGCGCAAATCACGAATGCTAAAACTCCCTTCACGCTTCGAGAGTTTATTACCCTCTTTGCTAGTAATCATTGAAATATGGCCATAGCTTAACTCTGGTAAACCTAGGGCTTTTAAAATCATTAATTGACGTGGTGAGTTGGTGAGGTGGTCTTCCCCACGCAGAACGTGAGTGACTTTCATTAAAGAGTCATCAATGGCATTACAAAACATAAACGACGGTGTGCCATTGGAGCGACGAATAATAAAATCACCAATATCATCACTATTAAAACGCTGTAGCCCTTTTACTGCATCAATAAAGTCAATCGTTTCACCCCGTGGCAGACTAAAGCGTAAAGAAGCCTGCTGACCTTCTGCCAATTTTTCTGCAACTTCCTCAGCGGTTAAACTACGACAGGTGCCTGGGTAACGTGGTGGCTGACCTGCAGCACGCTGTGCTTTTCTGACCATTTCCAGTTTTTTTTCAGAGCAAAAGCAGGGATAGGCTAATTTTTTATCAATTAATTGCTGATAATAACGATCATAAATCTCCTGGCGCTCTGATTGAAAATATGGTCCATAGTCACCATTCACGCCAGGCCCCTCTTCCCACTGCATACCTAGCCATTGTAAGTCTTCCTGTACTGCATCCACATAGTGCAACTCAGAACGTTCTTCATCGGTATCTTCTATGCGTAAAACAAAACAACCCTCACGATCACTGTGGGCTAATAACGCGCTAAATAACGCTGTACGAACATTGCCTAAATGCATCAAACCGGTTGGGCTAGGAGCAAAGCGTGTTTTCATGTCGATACCACTATCACCTTGTATTCTTAAATTATTCTTCAAATTCTTTTTACTAAAATCAAAATCAACGATCGCTATCGCCAAACAGCCATTATAACGTAAAATAACCAAATAGTTCATAGCGAGTTAACAACCATCATATTACAGGCAAGCTTAAACCCGATGACAACACCAGATTATCAAGCACTTTTTATTTCTGATTTACATCTAAGTCCCGAGCAGCCCAAATTAATCACACTGTTCTTAGACTATTTATCAAAGACAGCAATACATAGCCAAACCCTTTATATTTTGGGTGATTTTTTTGAATTTTGGATCGGGGATGATGACCCTGAGCCGCTTTACCAAGAGATTCAACAAGCACTACAACAAGCCAGCCAAACAACAACTATCTATTTTATGCCGGGTAATCGTGACTTTTTATTAGGCTCAACATGGTGCCAAAGCGCAGGCATGACCTTGCTTGCCGATCCAAGCGTAATCACGATCAATGATCAGGCTATTTTGCTAAGCCATGGTGATCTATATTGTACAGAAGATACCAGCTATCAGCGTTATCGCTATTGGGTGAGAAAACTCTGGCTACAACGTTGCTTTTTATCTCTGCCACTGACTTGGCGCTTAAAAATCGCCAGTAATATTCACCAGGCAGGCCGTCAAAAACAAGCAACTTATGCAAAGCCGATTGATATCCATGCAGAAACAATTAAACACTATAGCCAAAAATACCAAAGCAATCGACTGATTCATGGACACACGCACCGCCTCGGCTGGCATAATCATAGCTACTGTCAGCGTTGGGTTCTTGGCGATTGGCGTGATAAGGCTACTGATTTATGTGTATTTCCTAGTGGGAAATGGCAATTACGTGACCATCAACCCACATAAGGTCAGCTACAATTAGAGTCATATCTTAGCCAATCCTATCCAACCCATAACACCAGACAAAGCTAACCTAACGTGAGTTCGATATAAGGTCCTATTGAAAAAGCAGCCCGTTTGCAATTAATATTTAGGTTCTCAAAGTCTAAATCCATTGCAAGGAGCTACTTATGGATACCAGCTTAATCGGTTTGTTTTGTATTGTCGATGACTTTTGTCAGGTTTTCTTGCCTCACTGGAAAGCCTCATTACTTGAGCACCAAGATAAGCAGCGCAATAAACCAAGCCGCATGTCAACGAGCGAAATAATGACCATCATGATTTATTTTCATCAATCCCACTATCGTAACTTCAAACATTACTATCAAAGGGAAGTCCAGGGCCATTTGAAAAAATACTTTCCCAAGGCAGTGAGCTATAACCGATTTGTTGAATTAATGCCAACTATATTACTCCCTCTGTGTTTTTTTATTGCCGCTCAAAGAAAAACACCTACGGGAATCTATTTTGTTGATTCAATCGTACTACGAGTCTGTCATCATAAACGCAGTCATCAAAATAGAGTCTTTAAAGGACTGGCTAAAAAATGTGGTTCAACGATGGGCTGGTTCTATGGCTTTAAGCTTCATCTAATTGTAAATGATATGGGGGAGTTGATGGCCTTTAAACTCAGTCAGGCAACAACGGATGATCGCGTTGTATTACCTGAAATTGCTCAAGGTCTGGTAACCCTCCCTTAAAATGAGACAACTCATAACTGGAATCTTCTGTTAACATTTTCAAACAGGAGAGCATATGAAAAAGAGCAAATTAAGTGAATCAAAAATCGTAGAGTTGCTTAAGCGTGTTGAGGCTGGAGCAGATATAGAAACCACAGCAAGAGACTACGGAATCTCAACTAGCACGTATTACACCTTAAAAGAACGTTATGGGGCAATGGATATCTCTCAGCTAAAAAGGCTAAAACAATTAGAGAAAGAGAACCAGCAACTTAAGAGAATGTATGCTGATTCTCAAATAGAAATTGAGGCTTTGAAAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATAATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCAT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55 | uncultured_Mediterranean_phage(30.77%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1974121 : 2069135
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP038913|1974121:2069135|DBSCAN-SWA 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86 | Bacillus_phage(15.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
2073671 : 2126352
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP038913|2073671:2126352|DBSCAN-SWA 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48 | Klosneuvirus(28.57%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
2163424 : 2270459
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038913|2163424:2270459|DBSCAN-SWA 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95 | Bacillus_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2286586 : 2386143
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP038913|2286586:2386143|DBSCAN-SWA 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99 | Armadillidium_vulgare_iridescent_virus(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2401981 : 2443751
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP038913|2401981:2443751|DBSCAN-SWA 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42 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 2412198:2412257|attR 2440380:2441483 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2462543 : 2603764
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP038913|2462543:2603764|DBSCAN-SWA 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119 | Staphylococcus_phage(15.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2621811 : 2635610
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038913|2621811:2635610|DBSCAN-SWA TATGAAAATCTCTCAACTCATCCGCCATAACCGCTTTGTTATTAGCATCAGTACCTGCTGCCTGTTATTGTCTTTTTTAGCAACAAGTTCGGCCAATTATGCTGCAACAGCAAATACGAATACAAATACTCGCCAGTCATTCACCCAGGCATTTAACAACAGCAAAGCTCTCGCTGTTTCCAAGCTCGGACAAACCTTTGAAATTAAAGTCCCTGCCAACCCAACCACTGGCTTTTCATGGTTTTTAAAGTCCTATGACCATGATCTTTTGGACGTCGTTAACCAACGTTATAATGCACCTAAAACCAATATGATCGGCGCTCCCGGCAAAGATATTTGGACATTTAAAGCCAAGCCCATGTTTTTCACTGCCCCACAAATCACGGTCATTGAGTTATATAGCGCACGTCCGTTTGATATTCGTAAAGGCCAGGTATTAAAGCTCGCTGTAGTCTCACAGCCATCTGCACCTAACCTAGTAAAAAATAATCTAAAATAATTAATAAAATAAAATTTAATATACTACTTTAAGGGAACCTAAACGTTGTATTCTCTACATACTAATTACCAACAATTTATTGATGAGCTAAAAAAAAGCCCATTCTCTGGCGATATCAATACGGATTTTGGTAGCCGTATTGTCTTTGCCACAGATAACAGCATTTATCAAAACTTGCCCCAAGCGGTCATTGCCCCGCGTCACCATCAAGATATCCTTTGTATAACAAAATTACTTACTCAGACTAAATTTCGCCATATCGCTTTAAGTGCACGCGGTGGCGGCACTGGCACCAACGGCCAATCTTTAAGTGCTAGTATTATTCTTGATACAACAAAATACCTAACTCAAATCCTTGAAATTAATCCAAAAGAGCGCTGGGTACGTGTACAATCGGGTGTCATTCGCGATCAACTCAATGATGCCTTAAAACAATACGGTCTTTTTTTTGCACCGAGCTTATCCACTAGTAATCGGGCAACTTTAGGGGGCATGACCAATACGGACGCCTGCGGACAAGGATCACGCATTTATGGCCATACCAGCGATCATATTCTCGAAAGTACCTGTATCTTTGCTGATGGTAGTCAGCACACCATTCAATCCCACCCCTCAGCACAAGATCTCAAAAAAAACTCACCGCGGCTACAGGCATTATCTAATCAACTATCAAATAAACTAACAGCGCATCAACAGGAAATTAACCAATACTTTCCTAAATTAAGCCGCTATATGACCGGCTATAACCTTGCCCAATGCCAAAACAACCATAACAACAATCATCACGCGCTGAACCTCAATAAACTGATTGCAGGCTCAGAAGGTACTCTAGCCATTGTCACTGAACTGAAATTAAACTTAATGCCGATTCCAAAGTTCAAGCAGGTGTTCGCCTTATTTTATACTGATTTTCAAGATGCCTTAAAAAGTGCTCACCAGTTGCTCGCAATCAACCCAACCTCAATCGAAAGCATCGATGATAATGTACTAAATCTTGCTAAACAAGATCCAATTTACACTGAACTTGAGGATTTTTTTCAAGGCAAGCTCCCTGAGAATTTAAGCGCACTTAACCTCATTGAATTTACAGCCAACACACTTGAAGAATTACAAGATAAAATCAAGCCATTACAAGCCCAACTACATAATAAAACCGGGAAAATTATTCCCACAGGTTATACTAACACCCAAGATCCTAAGCAAATTGAAACCCTCTGGAATCTACGGAAAAAAAGTGTTGGCTTACTAGGGAATACCCCAGGTGAACGTCGACCCTTACCCTTCATTGAAGATACTGTTGTTCCTCCCGAACATTTGGCTGACTATATTTTTGAATTACGTCAATTGCTGGAACAGCATGGACTCACCTATGGCATGTTTGGCCATGTTGATGTCGGCTGTTTACACGTCCGTCCAGCGTTAGATTTAAAGCAAGAACATGACGTTACACTCATAACAACACTGACTGAAGAAACAGCAAAACTGGTTAAAAAGTACCATGGCCTCCTCTGGGGTGAGCATGGTAAAGGCTATCGTGGCCACTATATTAAGGATTACATTGGCGACAATCTCTATAGTCTCATGGCTGAAATTAAAAGCTTATTTGATCCTTTTAATCAACTCAATCCCGGAAAATTAGTTTCCTCGCCTTATAAACCACAAGCATTATTACCGATTCGCAGCACCTTGCGTGGTGATTATGACAAGCACATCAATCTAACTCATCAAAATAACTATCAAACTATTTTACGCTGTAATGGCAATGGTGCCTGCTTTACCTATCAGAAAGATCAGGTGATTTGTCCCTCCTATAAAGTCACAAATAACCGTTTACATTCTCCTAAAGGTCGTGCCAATTTATTACGTGAATGGAGCCGGCAAGACTCAACGGGTGAGCTCACCTCTACATTTGAAAAAGAAGTGTATCATGCCCTACATGGCTGTCTCGGCTGCAAAGGCTGTGCAACTGCCTGCCCCGTACAAGTGAATATTCCAAATAGCAAAGCAAAATTTTTAAACCATTACTATCAAAAAAATAAACGGCCATTAAAAGATTATCTCATTGCCAATATCGAATCTTTATTACCACTACAAGCTACCATTCCTAGATTCTTTAATACGTTATCCCATAACCCAATCAGCACTTACCTTATAAAGCAGTTAGGCTTAGCGGATCTACCCAGATTAAGCACACCCAGTTTAAGTGCCAGGCTAAAAAAAGCGCAGATTCCTCTTTATAACCTAAATGACTTACATCAACTTTCCAGAGCCGATAGAGAAAAAGCGGTAATTCTCGTACAAGATCCATTTACCAGCTTTTATGAAGCTGAGCTTATCACTGACGCTTATGACCTTATTAAAAAACTGGGTTATCAACCATTGATTCTGCCTTTTAAAAAAAATGGTAAGGCCATGCATGTAAAAGGGTTTTTAACTAGCTTTAATCAGCTTGTCGAAGAAAACAGTCAATTTTTTAATCAAATTGCTAACACCGGCATTCCCATGATCGGCCTCGATGCCAGCACCGTGCTCTGCTATCGCGATGAATACCAGGACTACAGTAATCAATCCAATCTACAGCCAGAGTTTAATATTTTATTAATTTCAGAATGGCTAAAATCTATTAATATTGATTCTAGTATTACTAAAAAATATCACTCTGCCATTGAATATACACTATTGCAGCACTGCACAGAAAAGTCACTATTGCCTGAAAGCACGAAACAATGGCTGAATGTTTTCAAGCAATTTAATTTAACATTAAATATTATTCCAAGCGGCTGCTGCGGCATGGCCGGCACCTACGGCCATGAAACTGAACATGTAGAAAACTCAGGGAAATTATTTCGACAAAATTGGCAGGAAACTATCGAGCAATATAGCAAAGAGCAAATTCTAGCGACCGGATTTTCTTGCCGTTGCCAAACCAAACGTTTCAAAGGTTTTAAACCTAAACACCCGTTAAGCGCTTTACTGCATGCTCTACAAGAAAAAACCTAGGCCATAAATCATAAAAATATAAAATAATTATGGCGGTTTACTATATTTATATCTTAGAGTGCAATAATGGTGCGTTTTATACTGGCTATACCACCAATATAAAGCGCCGCTATCAAGAGCATTTACAAGGCAGCCCTAAATGCAAATACACCCGTGCATTCCCACCCAAACAATTAGCCGTTTGCTGGCAAATTCATAGTACTTTGTCTCATACTTTAAAAATAGAAGCCTTTATTAAAAAATTACCACGCTCAAAAAAACTACAGCTCATTCATTTTCCAGAGCAATTATTAACACAGTGCCAACATATTACCGATGCTATTGTTCTATTTCATTTTCAGCACCAACAGCAACCAACTTAATAAATTTTTTACATTTTAATTTAAAAAAATAACAAAATTACACATAGAGCTACGACTGGTACTTTGCTAGAGTCACAGCTGAAACTATATTTTATTAAAGGACTAAAGTGAAATACCATGGCAAACAAACTAACACGTTTTATTGCGCAAGAAATACGGCAACTAAGAGATACCATTCAAAATAAACAAGAAAATGAACGATGGTGCTGGCCAGTAACAGGAACTAAGCGTGCTATACGTATTTGGCTACTTAATGAAATGGAAAAAGAGCTTTTAGAGCATAATTTTAGCCGTCCTGAGGATTTAGAAATCTTTTTAAGTCAATGGAGTGATAAAATTGAAAACTTTACTGCCATCCCACCAAACAGCAAAGGCATTGGCAAAGGTCAAACTATCCGTGATTTTTTTAATCGGAAAAAAGATAGTAGTATTTTTAGTGAACTTAAGCAATATTGCCTAACAGAAGGCATTCCTTTGGTGACCTACACATCCTTGGCGGATCATATGGCCTTTGCAGGTCAGGGCGCACGATACAGCAAAGCTACTCCTTTTTTTAATCACACATCCACATTAACAAGCCCCACGCCAGAAGAACACTATGTATCATTATCCGACACTGAAATTTATGAAGCATAAAGCAGCCCAGCAGACAGCTCCTCTAAACCTTCCTCCCTCTTTTCACCCGAAGATAACCATTAGCGACTTTTTTCTTTAGTCTACTTTTTACATTCTGGTGAAAGCGATTAACAATATTACTAACCATAAAAAGTTAAACATTTGTCACATAACCCACAAGTTGACACCTTTTTTGTTGAGACCCAACATATTGTAAGCCTCTAAATTTTGCTGATTCAGCTGAAAGTAACCCATAAAGTAACAAAAAATAAAGTTTTATGAGTGGCACTATATTCTGGTCTGATCAATGTGTTACAAATATTATAATCCCCACTAAAATATTACTATTTTTAATAAAAGCATTCAGTTAACAATATTAGCATAGTAGGATGATCAGCACTTTTCTTGATTAGCCTCAAAAAAGCTAGGAGTTCAGTCGAAACTTATGGTATACCAATGAGGCTAAAGCTATTCAACCGTGAGGAAGATTAATTTATGACTGCCCGTATTATGATCATTGATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038913|2621811:2635610|2632416_2633112_+|WP_075275050.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSTPWLAATDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL >NZ_CP038913|2621811:2635610|2621811_2622309_+|WP_016209912.1|protease|DBSCAN-SWA MKISQLIRHNRFVISISTCCLLLSFLATSSANYAATANTNTNTRQSFTQAFNNSKALAVSKLGQTFEIKVPANPTTGFSWFLKSYDHDLLDVVNQRYNAPKTNMIGAPGKDIWTFKAKPMFFTAPQITVIELYSARPFDIRKGQVLKLAVVSQPSAPNLVKNNLK >NZ_CP038913|2621811:2635610|2631762_2632272_+|WP_075275052.1|transposase|DBSCAN-SWA MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038913|2621811:2635610|2635154_2635610_+|WP_080743011.1|transposase|DBSCAN-SWA MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQAHDAPQAQGLLTSVAFDQIIADKAYDDIKIRELVVKKGAKCIIPSKSNRINKFDHDQHVYKERHLIECCIGKLKQFRRVFSRFEKRAYRYLSFLKIASTILWLR >NZ_CP038913|2621811:2635610|2628626_2628812_-|WP_032126651.1|DBSCAN-SWA MKRVFKNGQDYAIETETACPMDLYASKVESIGIISSLDSEKKMLQKILNIDQEIALSMQLV >NZ_CP038913|2621811:2635610|2627488_2628523_+|WP_016209899.1|DBSCAN-SWA MSIGLHYNNPLIASLSDAIVGLDQDFLIKWWNPAARKLLRLKSQHKHQTITSVISHPDFVEFLKDPQDSVQCTLKNNKAITAMLLPVESGERLLVAKDISQSYFLDKMRQDFVANVSHELRTPLTVIHGYLETLIDFSESSTDQKTSPYLHIYNQMQQQTKRMESIVADLLLLSRLEGQAPNKDEDEVIALASILQGVYQDTLTLSQQAHDIQLEIDEQIKLKGNRSELRSAFTNLSYNAVRYTPKGGKISIIAYKNDHGIHVLVKDTGIGVPKKYIQRLTERFYRVDKGRSRDVGGTGLGLAIVKHVLLRHEGELTIKSTEQQGSEFTCSFPLYKEVKETIKT >NZ_CP038913|2621811:2635610|2625338_2625671_+|WP_016209901.1|DBSCAN-SWA MAVYYIYILECNNGAFYTGYTTNIKRRYQEHLQGSPKCKYTRAFPPKQLAVCWQIHSTLSHTLKIEAFIKKLPRSKKLQLIHFPEQLLTQCQHITDAIVLFHFQHQQQPT >NZ_CP038913|2621811:2635610|2631503_2631713_-|WP_016212599.1|DBSCAN-SWA MSVRKVSILDKTVEEIDKKSYSKVSGTIKKIKENNKNQGKSNTYNTFQLEQINTSEQEPSQTTSHELIS >NZ_CP038913|2621811:2635610|2622354_2625309_+|WP_016209920.1|DBSCAN-SWA MYSLHTNYQQFIDELKKSPFSGDINTDFGSRIVFATDNSIYQNLPQAVIAPRHHQDILCITKLLTQTKFRHIALSARGGGTGTNGQSLSASIILDTTKYLTQILEINPKERWVRVQSGVIRDQLNDALKQYGLFFAPSLSTSNRATLGGMTNTDACGQGSRIYGHTSDHILESTCIFADGSQHTIQSHPSAQDLKKNSPRLQALSNQLSNKLTAHQQEINQYFPKLSRYMTGYNLAQCQNNHNNNHHALNLNKLIAGSEGTLAIVTELKLNLMPIPKFKQVFALFYTDFQDALKSAHQLLAINPTSIESIDDNVLNLAKQDPIYTELEDFFQGKLPENLSALNLIEFTANTLEELQDKIKPLQAQLHNKTGKIIPTGYTNTQDPKQIETLWNLRKKSVGLLGNTPGERRPLPFIEDTVVPPEHLADYIFELRQLLEQHGLTYGMFGHVDVGCLHVRPALDLKQEHDVTLITTLTEETAKLVKKYHGLLWGEHGKGYRGHYIKDYIGDNLYSLMAEIKSLFDPFNQLNPGKLVSSPYKPQALLPIRSTLRGDYDKHINLTHQNNYQTILRCNGNGACFTYQKDQVICPSYKVTNNRLHSPKGRANLLREWSRQDSTGELTSTFEKEVYHALHGCLGCKGCATACPVQVNIPNSKAKFLNHYYQKNKRPLKDYLIANIESLLPLQATIPRFFNTLSHNPISTYLIKQLGLADLPRLSTPSLSARLKKAQIPLYNLNDLHQLSRADREKAVILVQDPFTSFYEAELITDAYDLIKKLGYQPLILPFKKNGKAMHVKGFLTSFNQLVEENSQFFNQIANTGIPMIGLDASTVLCYRDEYQDYSNQSNLQPEFNILLISEWLKSINIDSSITKKYHSAIEYTLLQHCTEKSLLPESTKQWLNVFKQFNLTLNIIPSGCCGMAGTYGHETEHVENSGKLFRQNWQETIEQYSKEQILATGFSCRCQTKRFKGFKPKHPLSALLHALQEKT >NZ_CP038913|2621811:2635610|2633187_2634093_+|WP_032126790.1|transposase|DBSCAN-SWA MNLKAKRDISRKLKVLNHALESKNVSRTCRYFGVSRESFYTWRRAYEQDGEEGLINNKPCPENPNLRIDKAIEEKIVYLRTTYHFGPLKISWYLERFHDIKVSRSGCYYILLRNRLNRLPENIRKRSMPQFKRYEKKVPGHHVQVDVKFLFFNDEDGKRIKRYQYTAIDDATRIRALKIYSKHTQANAIDFINYVVDKFPFRIKVIRTDNGSEFQAKFNWHVQDLGMDHVYIKPGTPRLNGKVERSHRTDKQEFYQLIDYNGDVDLHDKLAEWEAFYNFQRPHSAHSGKTPYEMLKTKLGL >NZ_CP038913|2621811:2635610|2626781_2627492_+|WP_016209908.1|DBSCAN-SWA MTARIMIIDDEAPIRDMVRFALELSHFEVIEAETAKEGQRKIIEKTPDLLLLDWMLPDQAGIELAQTLKVQYPALPIIMLTARAEEESRVLGLEQADDYVIKPFSPRELIARIKAVLRRSQTNAGENTEPAQFISLGSLCVNQDSQQVFINDQAVKTGPIEYKLICFFITHPNKVFSREQLLNRVWGPQVYVSERTVDVHIRRLRKILESAGSYNYIHTTRGSGYSLRLPAEDDPA >NZ_CP038913|2621811:2635610|2629822_2630269_-|WP_016212369.1|DBSCAN-SWA MRKYLALLLLPTVFAGCATTHQYKQGLAKCGSSQCYTAPVSQHGSYYTTGMDMYFKVPGEYLQGDSKITLAVETTFSAVSPSPNLINDHTLDVNSVRMLRNEANYYMDTNISALLDSNPRDRVRLINDGVKNNLLTNFAIKGVKNVEL >NZ_CP038913|2621811:2635610|2625788_2626307_+|WP_016209923.1|DBSCAN-SWA MANKLTRFIAQEIRQLRDTIQNKQENERWCWPVTGTKRAIRIWLLNEMEKELLEHNFSRPEDLEIFLSQWSDKIENFTAIPPNSKGIGKGQTIRDFFNRKKDSSIFSELKQYCLTEGIPLVTYTSLADHMAFAGQGARYSKATPFFNHTSTLTSPTPEEHYVSLSDTEIYEA >NZ_CP038913|2621811:2635610|2629243_2629819_+|WP_075273327.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038913|2621811:2635610|2628932_2629298_+|WP_075275054.1|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHCWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038913|2621811:2635610|2634949_2635195_+|WP_129556700.1|transposase|DBSCAN-SWA MSFIYRSRYMVLRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD |
16 | Bacillus_phage(66.67%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2672689 : 2811673
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP038913|2672689:2811673|DBSCAN-SWA 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MIKKNIKLDNEEQAIEDSFDAFLQGGSLDAAALIEAAKNTGKKSKPVSLRLTESDFTKAHAKALEEGVAYQTLLTSVIHLYLSGMLVRKS |
141 | Escherichia_phage(32.14%) | transposase,integrase,plate,tRNA | attL 2777629:2777688|attR 2791414:2791605 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2924235 : 2967633
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP038913|2924235:2967633|DBSCAN-SWA 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41 | Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2999318 : 3116745
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP038913|2999318:3116745|DBSCAN-SWA 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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGVHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038913|2999318:3116745|3086677_3087157_+|WP_016210342.1|DBSCAN-SWA MIKESVLDVLMYLFDQNSETEQSLSSDQAALSAELEKAGFAKDEVERAFHWLEGLVDTSQRPKHFEPSMTTRAFAAKELSVIGSEHLSYILYLEHIGILNVELRELVIDRIMALGIDEIDLSHVKWVALMVLNNHYEDGFETEWFEEMILTDPKTEVQH >NZ_CP038913|2999318:3116745|3059275_3059872_+|WP_016209699.1|DBSCAN-SWA MRQNPSLSIILLVLAQLMTGMNITTSKYLVTHLPILLLMQVRFSLDALILLFCLCLSKKSTPIYTPLTKLKHKDWLIIFAQACCAGVLFNLLMLWGVRYTSASIAGIITSALPALITVFSLLLLKEILNKFKLLCISFATVGLLVINIQGLHFNQHSHLALWGDFLIILALIPEALYYILTKSNHSIALDQQFLTYYQ >NZ_CP038913|2999318:3116745|3077249_3078146_+|WP_016210335.1|DBSCAN-SWA MKALKLIKGALPKHTAIIYMVISAVCIASAGFFAKIAMQYTSVQITLLARFGVPLLLLILFFSFYQRWKQLKFTYAKTHFIRAFFLTLAQFLLFISIIHLSLAEATVLYSTGPIFIAIFSFFKNKKINLQSLIAVLLGAVGVALMMHIENGIINPYVIVGLLSGFCLSASQLLLHSATKKEKNSHVMLFVYLFSTLLSLIYFGLINIEEELKTLTPMLSFSIPIIGILILVGLASLGNQFFRGKAYQQVKDPASIAPLIYISILVAGLYDIFFYNHLPNIEVIIGAILIVTSALFSKK >NZ_CP038913|2999318:3116745|3094155_3094299_-|WP_155049899.1|DBSCAN-SWA MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGFSRQELRNFLPICELSFSHNTSTSGS >NZ_CP038913|2999318:3116745|3053043_3054243_-|WP_016209702.1|DBSCAN-SWA MLRTLKAVDHYFGEFGGQFIPEILVDPVNEINDLFNQVMSDSVFTNDLLQMLREYAGRPTPLTYAGRFSEFLGHNLQVYLKREDLLHTGAHKLNNALGQCLFAKKLGKKRIIAETGAGQHGVATATACARLGLECIIYMGVVDMVRQAPNVQRMKLLGATVIGVETGTKTLKDAVNAALRDWAASFDHTHYCLGSALGPAPFPEMVATFQAIIGQEVHEQALKALGQRPDAIVACVGGGSNAIGIFAEFIPYDEVALIGVEAGGVGKLAGEHAARFFDKQVGVLHGVKSYVLQDNDGQISETHSISAGLDYPSIAPQHAYLQDSGRAQYSFANDDEALAAMQNLARLEGIIPALESSHALAYVTREKEQLAGQQVVINLSGRGDKDLGQVEQYLSQEEV >NZ_CP038913|2999318:3116745|3040924_3044032_+|WP_016209727.1|DBSCAN-SWA MKLPELCIKRPVLAVVISLIFILLGILGYLQLTLRDQPKVFKPGIAIRVTAPGSSPQYIEQNIIIPLENNLQAVSYLSYTHSESDQDYAQIDLNFKDITPAQFLTAQSQVQQAVNATDLPDNANTPVIDLRGSNTEQALLISLSDPNMKQHALVDYVANHVVKCLQQVPGVGQVQQMSAIDALRINLSPNNMALLGVSVEEVIAALKNNNSAIQAGQVTNSDQTISINLDARLTSIDQFKTIIVKHQGNHFIYLKDVATLSIDNVSYTGAYTFYNGMQGVAVRVRAADGANPIALGKHLHTALKHLQNQLPPGMQLHILWNQSKLIQHAVSEVFYTLLESMILVALVTLLFLGNWRFAIIPIVTIPVCMIASFAIMWLFGFSINLMTLLALVLAIGLVIDDAIIVLENSHRYVERGDQPMTATLKSMQQIVFPVIGMTLSIIAVYIPTAFLSGKTAVYFQQFAFTLAGATLISGVIALTLIPMMCARLLKANTKGSYTDKLEHAFLTLTHYYKQSLSWVISHRWLPISLFITLLIAGAIIFKSLPSTMIPKEYAGYVFIGIQAPDSASVAYTERAAKPIIAKIANMPEVAAIMSFGGGTGSSGNFGFNFAKLKPAYTRSVENAKVATKITTMFKHLKNVTVFSSPINIMSHNNDNSPGEINFYITGYANYNQIVTASQSFEKALKELPMFEKVNNNSRYSNQQYNIKVKRQLANELGISIDTINTAIGTYLGGYKFSHGYQFDGVEYPLYLQLAKNGLHDLNVLKHIFLTNNQGSPIALSRLVTIDYTTSLPQYIHIDSMRAGAMSVVPKSNYTNGQVINQLEAVAKQILPKDMSLQYDQHTREMLSGNHTIILIFSLGLIFIYLVLAALFESFIDPLIILLTVPLCIIGALAALKLIGGSLNIYTSIGLITLIGLIAKHGVLITHFANELYKQQNKQQDTSITTAIITAASMRLRPILMTTATMILGAVPLIFSNGVGANSRIQLGTVIIAGLAIGTIFSLFIVPIAYILFASLKIKINQNRKKATQTTVISDP >NZ_CP038913|2999318:3116745|3058787_3059075_-|WP_016209719.1|DBSCAN-SWA MNQATEEGWWRFIDLCAGLEKDQLSQVLKIFLTAAEVDDVSMRTLLVGELLAGKKTQRQIAADLAISITKITRGSNELKRVDSHLRAMLEEALIQ >NZ_CP038913|2999318:3116745|3016283_3018614_+|WP_016211610.1|DBSCAN-SWA MKALRVFTWFAISLLLIVMLVTASLLYYMVNNLPDVSTLRSVQLQEPLRIYSADDKLIAEIGNKRRIPVSLAEIPQDLIHAILATEDHRFYQHSGVDIKGLARAVIGLITTGEKRQGGSTITMQVARNFFLSRKKTYLRKFNEILLAFKIEHELTKNEILSLYLNKIYLGQRAYGVGAAAKIYYGETVSQLDLAEIAMIAGLPQAPSAINPIYNPNAAKKRRSHVLTRMLRYGYINHAQYQKAMAAPIKTKFHRTKTAVYAPHVAEMVRRYITELFPKIAYTGGFKVYTTIDSSLQTAINHALENGLTAYDRRHGYRGPISWINLQQRSPTDLLKQFNHFPSIKNKPTAIVTTMTDNSAEALLKDGQKITIPWQGLAWARRYINEKRRGPAPKQTVDILKAGDVILVQYQKDHWQLTQKPAIEGAAVSLNSNNGAVLALIGGLPFTQSNFNRAIQAERQPGSSFKPFVYSAALEKGYTAASIINDSPIVLPGNETYELWRPQNDNRRFRGATRLRTGLTHSMNLISIRLLQDIGIDYTHQYVQRFGFAAQSLPQNLSLALGTNTLTPLQLAAAYSSFANSGYRVIPFYIDRIVNSNHNILFQAAPPTVPRYQQGDQPQAPRIISAQNAYIMTSIMQDVARLGTAKRTQELKRQDIAGKTGTTSEQQDGWFAGFTPDVVTTVWVGFDSPQPTGEYSSTLALPIWIDYMKTALNYYPERRWPRPDNLVTLRIDPNTGQLAHDWQKETIFETFRKKYAPKHYSNQANTHLPGDLAQDLF >NZ_CP038913|2999318:3116745|3101231_3101396_-|WP_155046696.1|DBSCAN-SWA MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEG >NZ_CP038913|2999318:3116745|3116088_3116745_-|WP_080743040.1|transposase|DBSCAN-SWA MYIKHCKLPKNKQIELMKYFIAGSTARTAADLTDIHRNTATRFFHKLREKIALKQQSRSEQFCGKIELDESYFGGARKGKRGRGAAGKVAVFGLLKRGGKVYTQVILDAKSDTLMPIIRQKIQPDSIVYTDCWRAYNALDISEFKHYRINHNKRFAENQNHINGIENFWNQTKRHMRKFNGVPRQHFNFFLKEAEWRFNMGSPKELLADLKKLLKELY |
113 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038913.1|WP_129556569.1|1052567_1052777_-|hypothetical-protein |
1052567_1052777_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_129556569.1|1052567_1052777_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_129556569.1|1052567_1052777_-|hypothetical-protein MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
69 aa aa | NA | NA | NA | 1023062-1104670 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1051666-1051629, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060536-1060499, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1092415-1092378, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060402-1060365, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212450.1|1059503_1060406_+|hypothetical-protein |
1059503_1060406_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212450.1|1059503_1060406_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212450.1|1059503_1060406_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG |
300 aa aa | NA | NA | NA | 1023062-1104670 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1051666-1051629, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060536-1060499, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1092415-1092378, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060402-1060365, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016211536.1|1099359_1099593_+|hypothetical-protein |
1099359_1099593_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016211536.1|1099359_1099593_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016211536.1|1099359_1099593_+|hypothetical-protein MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN |
77 aa aa | NA | NA | NA | 1023062-1104670 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1051666-1051629, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060536-1060499, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1092415-1092378, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060402-1060365, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212614.1|1103320_1103527_-|hypothetical-protein |
1103320_1103527_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212614.1|1103320_1103527_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212614.1|1103320_1103527_-|hypothetical-protein MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
68 aa aa | NA | NA | NA | 1023062-1104670 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1051666-1051629, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060536-1060499, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1092415-1092378, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1060402-1060365, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_033923740.1|1124994_1125282_+|hypothetical-protein |
1124994_1125282_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_033923740.1|1124994_1125282_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_033923740.1|1124994_1125282_+|hypothetical-protein MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ |
95 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1367874_1368132_+|transposase |
1367874_1368132_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1367874_1368132_+|transposase>NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1367874_1368132_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1295697-1478905 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1363872-1363909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1428033_1428291_-|transposase |
1428033_1428291_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1428033_1428291_-|transposase>NZ_CP038913.1|WP_098082828.1|1428033_1428291_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1295697-1478905 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1363872-1363909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155049900.1|1788560_1788866_-|hypothetical-protein |
1788560_1788866_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155049900.1|1788560_1788866_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155049900.1|1788560_1788866_-|hypothetical-protein MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT |
101 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016211563.1|1789214_1789376_-|hypothetical-protein |
1789214_1789376_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016211563.1|1789214_1789376_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016211563.1|1789214_1789376_-|hypothetical-protein MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP |
53 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212013.1|1808161_1808545_-|hypothetical-protein |
1808161_1808545_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212013.1|1808161_1808545_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212013.1|1808161_1808545_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
127 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_129556517.1|1803950_1804238_-|hypothetical-protein |
1803950_1804238_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_129556517.1|1803950_1804238_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_129556517.1|1803950_1804238_-|hypothetical-protein MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK |
95 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155046727.1|1821522_1821867_+|hypothetical-protein |
1821522_1821867_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155046727.1|1821522_1821867_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155046727.1|1821522_1821867_+|hypothetical-protein MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT |
114 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_129556515.1|1822692_1823052_-|hypothetical-protein |
1822692_1823052_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_129556515.1|1822692_1823052_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_129556515.1|1822692_1823052_-|hypothetical-protein MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
119 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_075274844.1|1824199_1824451_-|hypothetical-protein |
1824199_1824451_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_075274844.1|1824199_1824451_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_075274844.1|1824199_1824451_-|hypothetical-protein MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV |
83 aa aa | NA | NA | NA | 1751451-1851347 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 1753842-1753805, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155046725.1|2018034_2018175_+|hypothetical-protein |
2018034_2018175_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155046725.1|2018034_2018175_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155046725.1|2018034_2018175_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP |
46 aa aa | NA | NA | NA | 1974121-2069135 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2036750-2036787, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2040256-2040293, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_081377858.1|2019032_2019743_+|transposase |
2019032_2019743_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_081377858.1|2019032_2019743_+|transposase>NZ_CP038913.1|WP_081377858.1|2019032_2019743_+|transposase MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
236 aa aa | NA | NA | NA | 1974121-2069135 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2036750-2036787, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2040256-2040293, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_054300380.1|2036825_2037482_-|transposase |
2036825_2037482_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_054300380.1|2036825_2037482_-|transposase>NZ_CP038913.1|WP_054300380.1|2036825_2037482_-|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA | NA | NA | 1974121-2069135 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2036750-2036787, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2040256-2040293, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212421.1|2040721_2040904_-|hypothetical-protein |
2040721_2040904_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212421.1|2040721_2040904_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212421.1|2040721_2040904_-|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA | NA | NA | 1974121-2069135 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2036750-2036787, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2040256-2040293, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_032127044.1|2052628_2052829_-|hypothetical-protein |
2052628_2052829_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_032127044.1|2052628_2052829_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_032127044.1|2052628_2052829_-|hypothetical-protein MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
66 aa aa | NA | NA | NA | 1974121-2069135 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2036750-2036787, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2040256-2040293, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212482.1|2053043_2053187_+|hypothetical-protein |
2053043_2053187_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212482.1|2053043_2053187_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212482.1|2053043_2053187_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG |
47 aa aa | NA | NA | NA | 1974121-2069135 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2036750-2036787, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2040256-2040293, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016210918.1|2087278_2088028_+|hypothetical-protein |
2087278_2088028_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016210918.1|2087278_2088028_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016210918.1|2087278_2088028_+|hypothetical-protein MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS |
249 aa aa | NA | NA | NA | 2073671-2126352 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2074584-2074621, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2098732-2098769, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155049815.1|2183729_2183882_+|hypothetical-protein |
2183729_2183882_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155049815.1|2183729_2183882_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155049815.1|2183729_2183882_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK |
50 aa aa | NA | NA | NA | 2163424-2270459 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2212306-2212343, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2222485-2222448, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2212440-2212477, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_032126179.1|2220676_2220928_-|TSUP-family-transporter |
2220676_2220928_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_032126179.1|2220676_2220928_-|TSUP-family-transporter>NZ_CP038913.1|WP_032126179.1|2220676_2220928_-|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA | NA | NA | 2163424-2270459 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2212306-2212343, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2222485-2222448, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2212440-2212477, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212461.1|2385189_2385564_+|hypothetical-protein |
2385189_2385564_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212461.1|2385189_2385564_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212461.1|2385189_2385564_+|hypothetical-protein MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI |
124 aa aa | NA | NA | NA | 2286586-2386143 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2299558-2299521, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2303854-2303891, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2330452-2330489, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2331569-2331606, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016211512.1|2436268_2437075_+|hypothetical-protein |
2436268_2437075_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016211512.1|2436268_2437075_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016211512.1|2436268_2437075_+|hypothetical-protein MPTTSKLKAYLNEPNSTNKKHALEEMFPLLNEAYENVKKQRPNKPFGADEIWPEIQIIFSAHYGELSSQLSILQYFNLYTLFDDLTESSCDKIQHISHGEFCQPVVQVINLTTPYLSTKAIPQFIENSNQCIDEFTKWGVTHDNDEITRAAHVLATKLAGCRDEFIQRIIQNKETNQGYKITDDVPNYRRKIREIIESSTETKLLSSQQDWQGIIGNVLIGLTGIGLVALAVKAAHSQATTGQASLFFDTNAAQKAEQLGEDLLLMER |
268 aa aa | NA | NA | NA | 2401981-2443751 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2403131-2403094, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2439910-2439873, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2430107-2430144, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_051307360.1|2438166_2439096_+|hypothetical-protein |
2438166_2439096_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_051307360.1|2438166_2439096_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_051307360.1|2438166_2439096_+|hypothetical-protein MTLEQWWNSRTPAEKSIVAAIIAGFNLQIIEKNILAAQKAIFLDYLREQLANYNIEVPDLDEEEAEEAADKIQKLLEEEELNLQLEKKPKQSLPAEGFSFSDLEPKTLTAMSREEFHQLLLSPRQIGIIVTVGEILKKEDGFNIFDYQVNNGPKLDAQLTQIAPGTPTPDTPIKIQAQFHCPLRQSIPLEEQEEEKNKQATTLAQLVESVCTMNQAKRCPVRLNVQAEEHEVSPLAQAFICALQQRVLLKQLQHLSFNNQVFDYSHLLPNTTPFQTQQQGAEGYTSSEPELKQEPDQEPEQEQEQKLAL |
309 aa aa | NA | NA | NA | 2401981-2443751 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2403131-2403094, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2439910-2439873, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2430107-2430144, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016209640.1|2475373_2476393_+|hypothetical-protein |
2475373_2476393_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016209640.1|2475373_2476393_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016209640.1|2475373_2476393_+|hypothetical-protein MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ |
339 aa aa | NA | NA | NA | 2462543-2603764 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2525535-2525572, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2527687-2527724, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2583339-2583376, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016210742.1|2513273_2513549_-|hypothetical-protein |
2513273_2513549_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016210742.1|2513273_2513549_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016210742.1|2513273_2513549_-|hypothetical-protein MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ |
91 aa aa | NA | NA | NA | 2462543-2603764 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2525535-2525572, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2527687-2527724, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2583339-2583376, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212416.1|2528080_2528611_-|hypothetical-protein |
2528080_2528611_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212416.1|2528080_2528611_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212416.1|2528080_2528611_-|hypothetical-protein MSTEPSIDDKNKIESLTKDFCSALVISPNLIKGLTKGKYYKIVEALDVAVEELKVLAEQPLLDLYKSHYLKKHSVTSLDVKFAQIDSVFSSQVKWGLAIKKDSEQKRQAEKIGQELKALSTAIVRSFEENSTAFYRKYRWAEITKLKLSEKYIDKVVANPGQFRENYCRLEELGPH |
176 aa aa | NA | NA | NA | 2462543-2603764 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2525535-2525572, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2527687-2527724, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2583339-2583376, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_075275039.1|2705817_2706312_-|hypothetical-protein |
2705817_2706312_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_075275039.1|2705817_2706312_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_075275039.1|2705817_2706312_-|hypothetical-protein MAINKIHHHRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKARLNYFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
164 aa aa | NA | NA | NA | 2672689-2811673 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2748418-2748381, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2809908-2809945, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_032126150.1|2778929_2779163_+|hypothetical-protein |
2778929_2779163_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_032126150.1|2778929_2779163_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_032126150.1|2778929_2779163_+|hypothetical-protein MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT |
77 aa aa | NA | NA | NA | 2672689-2811673 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2748418-2748381, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2809908-2809945, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212022.1|2789773_2789992_+|hypothetical-protein |
2789773_2789992_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212022.1|2789773_2789992_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212022.1|2789773_2789992_+|hypothetical-protein MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL |
72 aa aa | NA | NA | NA | 2672689-2811673 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2748418-2748381, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2809908-2809945, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016212024.1|2790587_2790836_+|hypothetical-protein |
2790587_2790836_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016212024.1|2790587_2790836_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016212024.1|2790587_2790836_+|hypothetical-protein MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
82 aa aa | NA | NA | NA | 2672689-2811673 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2748418-2748381, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 2809908-2809945, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155047000.1|3001435_3001582_-|hypothetical-protein |
3001435_3001582_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155047000.1|3001435_3001582_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155047000.1|3001435_3001582_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT |
48 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155047001.1|3001786_3001972_-|hypothetical-protein |
3001786_3001972_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155047001.1|3001786_3001972_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155047001.1|3001786_3001972_-|hypothetical-protein MILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC |
61 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_016211201.1|3005129_3005438_-|hypothetical-protein |
3005129_3005438_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_016211201.1|3005129_3005438_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_016211201.1|3005129_3005438_-|hypothetical-protein MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA |
102 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155049899.1|3094155_3094299_-|hypothetical-protein |
3094155_3094299_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155049899.1|3094155_3094299_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155049899.1|3094155_3094299_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGFSRQELRNFLPICELSFSHNTSTSGS |
47 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155046758.1|3094607_3094739_+|phosphatase |
3094607_3094739_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155046758.1|3094607_3094739_+|phosphatase>NZ_CP038913.1|WP_155046758.1|3094607_3094739_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_155046759.1|3094883_3095039_+|hypothetical-protein |
3094883_3095039_+
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_155046759.1|3094883_3095039_+|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_155046759.1|3094883_3095039_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038913.1|WP_032126148.1|3096681_3096864_-|hypothetical-protein |
3096681_3096864_-
Protein sequences of NZ_CP038913.1|WP_032126148.1|3096681_3096864_-|hypothetical-protein>NZ_CP038913.1|WP_032126148.1|3096681_3096864_-|hypothetical-protein MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI |
60 aa aa | NA | NA | NA | 2999318-3116745 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038913 position: 3016045-3016082, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038914_1 | 1232-1455 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038914_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP038914_1
>1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|1324|40|NZ_CP038914|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038914_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038914_1 >merge|NZ_CP038914|1|1232-1455|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP038914|1|1|1232-1455|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP038914.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP038914.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ >NZ_CP038914.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038914.1|WP_016212168.1|3589_5278_-|hypothetical-protein MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ >NZ_CP038914.1|WP_075275149.1|5621_6596_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038914.1|WP_129556703.1|6821_7310_+|hypothetical-protein MLNMPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC >NZ_CP038914.1|WP_016211956.1|7367_8096_+|hypothetical-protein MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL >NZ_CP038914.1|WP_016211955.1|8552_9533_+|hypothetical-protein MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF >NZ_CP038914.1|WP_054300202.1|9678_10407_-|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038914.1|WP_032126843.1|10710_10890_+|hypothetical-protein MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE >NZ_CP038914.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP038914_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 111946-111987 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038914_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 129443-129484 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038914_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038958 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038914_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 55882-55923 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038914_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 134135-134176 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038914_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 72670-72711 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038914_1 | 1.2|1324|40|NZ_CP038914|CRT | 1324-1363 | 40 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 112013-112052 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038914_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 1389-1430 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038914_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038963 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence | 128617-128658 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038914_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 137267-137308 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038914_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93293-93334 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038914|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2892 : 102210
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038914|2892:102210|DBSCAN-SWA TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCTCTTACAGCCCTTAAAATTATGATTATTTGTCGCTGCTAAAAATAGTGCTTGAACTAAGCTTGCATATTCTTTTTGGTCACCAACTTTATTGCCGGGATATTTACTTGCATATAGTTTTAAAAGCGCCTTTTCCAGCAATACATCTCGAGTAGCATCATCACTAGCACTAAAATCAATCACCTTACCATGATTAATCCCTTCTTTGAGTGCTCGTAGTAATTTAATCGCCTGCTTGCCTTCAAGAGATTTAGAAAAATAGCCCCCTTCAGATTCTTTATCGCTAGATCTATTACGTAAATAGTTTTGATACAGGCTGTCAATGTTTGCAACAAATGAATTACCCGGGGTAAGAAGGTCTTTCAGCACCGTATGCACCATAGCTAAATCAGCCAGCAACAAAGCTTCTTTTTGTGTCTTACTGCCATCATAGTGTAAAAATTGTGTATGCTGATTAATAGGCAAGTTCATTACATAAAACAGCGGTCTATTGTCACGAGTTGCATTATAATGATGCGCGCCCTTAAATATTTTTTTAGCACTAGCCTCTTGTTCACACGAATCCTGCCCTCGAGGTAAAGAGGTCAATAAATTGTAAACCACGGGAGGGGCATCGCTACCCTGTAAATTATAGCCAACCATAAAGTCTCGAATTTGCTGGCTAATCGTAATACTGCGACCTTGGGCTTTAAACTCCTTTAAAGATGGCACTTTAACTTGAGACTGCGATGGCTTAGCATCATCAAACCTCTCTTTGGCATCATCAGATCGCACTAAAGCATAGCGGTCTATGGCCATCATCGCCGCAGGCTGGTCTTTCTTACTATGTGAGGACTGCTGTTTCTCGGCACCTCTGACATAAGTCAACACGCCTGTCAGCTGATTAGTTGCAAGGTAGTCCATATCCGCGGCCGTGTGTGTTTTTAACCACTTACGACTGTTTTCTCTCGGCGTTGCTGCAGGAGGCGATAATAAATGGCTCATCACCATACTTTCTGCAACCGTTGCATATTTAACGCGCTGCTGATCAATAAATCGATTGATCTCCCCTACACCAATATCCTCACAATCATTCAAAAAGGCTGCAATATCCGCATTGATCAACTGATAAACATAATTATAAGCAAACTTAAATGCAGTACGTGCTCTATCTTGATCTATCGTTACCGCATTAACACAGCGCAATACATGAAAATACATTTCTTTATGAATCGGAATAATACTAAAGCGCTGATTTGAACACGTAAGACGATCAAAGTTAGCTCTTAACTTATCTCTTAATAATGGTGATGGAAGCGTATCTGCTAACTGTTGATAAAAAAAATCCAACTTAGCCTTAGTTCTAGCTAAAGCCTCAGCTTTATCTTCTTCACTCTCTCCTGCTGCGCGCTCAACCAGATCAACGGCCACTAATACCTTTCTAGGTCCGTCTTTATCCTCAAACTGACCTTCTGCCAACGCTTGCCCTTGCAGATCAAAATAATGCTTGCCAAGCTTTTGAGCTGGATTACCTGCTGCTTCTTGCACCAAGCGAGCTAACTGAATAGGAGAGGAGTGATTGCCTTCTATTTTTAAGAATGTAAGCTCTGGCATAACAACTCTCCCGACCACAACAACAAAGTTATACTATTTATTAATTTAGCAAAGCTAATATCCAATCAACAGCCAGACAACATGATATTCATCTACTATGTCATCGATGCAGAAACTTAGCTCCATACTTAAAAAATAATCGAAAGTTGTTTTTAGTAATATTGAGAATATTTTCAAAAATAGAAAAAAATCGCTAGTAAAGTGTAAGTGTTAACTCATGTTACGCAGCAAGAGCTAATTGATACTATAATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAATTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCGGATGAAAAGACAGAATTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGAGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCAAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCTTAACAAACAAGCCAAGGCGGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAAGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGGATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTTTTCTCTTAAAATAATGCCCTATAGTAGCGATTACGTTGAATTTAGCAAGGCCTTCCTAAAGCTGCCGACGCAGGAGGCCTCTTTTAATTCATATTAACAAAATACGATAATTTTCAGAAAATCTGTAGATTATGTTATCTCGTTATTTGTGATTAATTAACACCATCAAAAACATTTTAAATGTGATTGCTAAATATGCCTAAACCGAGATATGCCTTAGTTGATAATAGTAAAGAAAGAAGTATTAAAAATGGTAATTGTGGTTATTATGCCTATGCTTTAGGCCTGATGAGTTACCTTTGTAAAGATCATAAGATTAATTTAGCAAAGGAAATATGGCAACGGTTCGATTTAGGTGAAAAGGATAAGTCATCCTTAAATAGCATTATTGAAGAAAAAAATGCCTTTATGTCGCTGAAAAATCAGCGAACAATTACGCGATTGTTAAGACCTGTTTTACGAGAAAAAAATATAGAAAATATTATAAATATATTTAGTGACCAAGACTGTAAAGATAGTGCGTATCATTCCCCATTAATTTGGAAAATAAAAAAAATGATTGCAGGTCAGCTGCTACGCCCACAAAGGTGGTTGCTCGGTGAAGCTTTTGACCCTGATGGTATTTTTTCTGGAACAGAGTTACTTAGGGCCCCAGGGATTTATGATCAGTGCTAAAAAATGCCAAGCTAAAGTAGCAAGGCTTGATAGGCAGCTATTAAGAAATAAAGCCATATGACTCAGCAATTTATCAACTCATATCAGGAAACAGCAGCAGAGTATACTCGTTTAAATTTATTAATACAGGAAAAACAGGCATCTGAGGATGGCCAGAAAAAAGCATCAAAGTATTATGCGTTTACTCAGCGAAATCTTGGCATTTATAATAGGTTAACTCACACTCGTAGAAGGACAATTTCTAGAGACTTTGAACCTGAAAAAGTCGTCTGGTCACGCTTAAAGGAAGAGGCTTTAGTTAAGGTAGAAAATTTAGTAAATGAAGCATATGAGGCTTTAGTTAAAAGTGATGAATTTCAGAAATGGTTTCGGACTCAGTTTACACAAGATGGTGTTTGGGCAGGTGATGTTGAGTTAAATGGATGTTTACATCCCTTTGTTCAAGGTGAACATGATATACCTTTTGGCTATGTTGCAGGCAATGGTAAGTCGACACCTTATTTGCTTCATGATGAAGGAATTCTTTTAAGCCGAAGATCAAGATTCCAGCGCTTGAAATCCGGCCATACGACAAGCCATCA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>NZ_CP038914|2892:102210|85230_85959_+|WP_075274931.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMIQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038914|2892:102210|42148_42673_-|WP_051307367.1|DBSCAN-SWA MFEIDSDCNLLQGFNFNRNNQNRIMHVKSLTIGTITLSPDFEVIDPTTGDKSSVVGVGSYLGWRQQKTSPLFMRFYSSHTNTADLSSYVSNSMDNTSVSFEVEMFEYDPNAKQYFKAFHCDAQSMKGEILCDSRGKLAGFIEKEPSKLVQSPLNYQINFRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038914|2892:102210|95749_96178_+|WP_016211886.1|DBSCAN-SWA MTQNQNRPRWVESLENYSKALDSLNKVVELSQQKTLSEFERDSLIKRFEFTYEEAVKTLTRYLEYEGHHDLKGSRTAFRRGVKINLLTDGQDWMDMIECRNAGAHNYSDIKAEKNSEKVLKTFYPMLVDFKKKLSDLMEDKG >NZ_CP038914|2892:102210|67067_67742_-|WP_016211773.1|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPIINFCGKKMKKVSFVILAAALSINAYASNSDSPYFPYAPSGHSTLGDYTLTMPECTLKFTVEKELCEKYPSNVASICTSDSKIQGNIKFTSESGCSDLGSLEVQANDFYPFGSQQPVPSQDTNKAISVYLTSKSGIENVWSYPDSTVPSTSLPFSSWSVLFPATIPISSNATYPINLTTPA |
116 | Streptococcus_phage(27.27%) | protease,integrase,transposase | attL 84782:84841|attR 101093:101473 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038914.1|WP_129556704.1|16697_17027_-|hypothetical-protein |
16697_17027_-
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_129556704.1|16697_17027_-|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_129556704.1|16697_17027_-|hypothetical-protein MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYEKRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYKGTVAKNYSELQKGYFLVLSA |
109 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein |
11108_11405_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_032126844.1|11108_11405_+|hypothetical-protein MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF |
98 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212118.1|11499_11961_+|hypothetical-protein |
11499_11961_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212118.1|11499_11961_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212118.1|11499_11961_+|hypothetical-protein MILTAEQLEIIEMVLKKQLQNDPDYLFNHINLTVSQNTAEELEVTIQQRRPVITNIAHPAIERIMGINNSDPMDAGRKEYDENFTKKPRENRSEVERCKETIIYTPAYTAKIFLQCRSTLLHQRGTTSLFSDHQANISPERTTSVDNESCSVL |
153 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_032126838.1|23708_23912_-|hypothetical-protein |
23708_23912_-
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_032126838.1|23708_23912_-|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_032126838.1|23708_23912_-|hypothetical-protein MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI |
67 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212257.1|24248_24473_-|hypothetical-protein |
24248_24473_-
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212257.1|24248_24473_-|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212257.1|24248_24473_-|hypothetical-protein MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK |
74 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212260.1|24492_24765_-|hypothetical-protein |
24492_24765_-
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212260.1|24492_24765_-|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212260.1|24492_24765_-|hypothetical-protein MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH |
90 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212398.1|29202_29664_+|hypothetical-protein |
29202_29664_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212398.1|29202_29664_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212398.1|29202_29664_+|hypothetical-protein MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF |
153 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212499.1|49064_49439_-|hypothetical-protein |
49064_49439_-
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212499.1|49064_49439_-|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212499.1|49064_49439_-|hypothetical-protein MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR |
124 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016211913.1|52718_53840_+|hypothetical-protein |
52718_53840_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016211913.1|52718_53840_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016211913.1|52718_53840_+|hypothetical-protein MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS |
373 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212298.1|58637_58964_+|hypothetical-protein |
58637_58964_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212298.1|58637_58964_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212298.1|58637_58964_+|hypothetical-protein MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL |
108 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212139.1|83404_83650_+|hypothetical-protein |
83404_83650_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212139.1|83404_83650_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212139.1|83404_83650_+|hypothetical-protein MQKERELVLNKYKQEHKQEKNEIFLKIKESFKSLDIPEHKKLVIGDCQTLRDLCSAVSCQETHNYDATGSQDRKFMQLIPE |
81 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_016212137.1|83725_84787_+|hypothetical-protein |
83725_84787_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_016212137.1|83725_84787_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_016212137.1|83725_84787_+|hypothetical-protein MPKFIEINKTQLETKIKEFYNEVDPKNKEKYKYIRSNIDFTLEALKKTCDTSLTELFMEHYFNPESVSDPTLQVAQCKNTLLTQLNDMLKSKKSKDKGKAPAIVSYITLIMKDVIALNFTLALDEFNKLYSWDKVKKLNLSKEYFNKILCNPSCFKDAIKLDFNQEYIEKSLDHPGFLKAALEDLTSKNNIQTILDALTLEKNNICEDISFSEAKSFLQHHKGCIARKCKNHPDKIAFGHIDEKGLIQQHLIEFKVDSWILKSGPEAQLGTKLGVTLTDIARNEGSLLHSSDSVKHWQSKREQMANSPSTCFFFDTKDLSYDNFKSSDEPEFIYHKSLEKKNSSSGQSNSVKL |
353 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
|||||||||||||||||||||
NZ_CP038914.1|WP_155046765.1|91934_92129_+|hypothetical-protein |
91934_92129_+
Protein sequences of NZ_CP038914.1|WP_155046765.1|91934_92129_+|hypothetical-protein>NZ_CP038914.1|WP_155046765.1|91934_92129_+|hypothetical-protein MCRLISRLIVLGEKPSALAIDLSESPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP |
64 aa aa | NA | NA | NA | 2892-102210 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 66641-66678, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363175|38|NZ_CP038913|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 position: 30986-30949, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |