Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038925 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 6 |
NZ_CP038923 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 chromosome, complete genome | 2 crisprs | RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 1 | 1 | 34 | 13 |
NZ_CP038926 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 0 | 3 | 2 | 7 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4824 : 28863
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038925|4824:28863|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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33 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37206 : 57887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038925|37206:57887|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038925|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD >NZ_CP038925|37206:57887|47493_47817_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA >NZ_CP038925|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA 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MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ >NZ_CP038925|37206:57887|38358_38637_+|WP_032126476.1|DBSCAN-SWA METWKYSISATPSTVKISSIQDYICPYNTNMSPIDTFYEGRNNLLRAITPENENIYSKITPLIIVGLISQTENYIRDIMAGVIKICPISKKK >NZ_CP038925|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV >NZ_CP038925|37206:57887|42428_43670_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK >NZ_CP038925|37206:57887|52034_52706_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP038925|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL >NZ_CP038925|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN >NZ_CP038925|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI >NZ_CP038925|37206:57887|44346_45540_+|WP_016211140.1|capsid|DBSCAN-SWA MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS >NZ_CP038925|37206:57887|53410_53968_+|WP_016210665.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRQSLTIEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFAQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVATPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP038925|37206:57887|47809_48205_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP038925|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP038925|37206:57887|39129_39495_+|WP_016212235.1|DBSCAN-SWA MHSAGLLAAKNSANLELPTFKGQTKVDLGFAELQDAAAVCTSLVCTLNIELFEDISMRWLDKWEKTLEYKNSDKNKLFKKVWTLFYSNFDSNNGSITSPCSMVKVRNKIKSSRIKNRKHVS |
29 | Pseudomonas_phage(11.76%) | protease,portal,capsid,terminase,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038925.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein |
5761_6361_-
Protein sequences of NZ_CP038925.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein>NZ_CP038925.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD |
199 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038925.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein |
6360_6621_-
Protein sequences of NZ_CP038925.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein>NZ_CP038925.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH |
86 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038925.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein |
9914_10262_+
Protein sequences of NZ_CP038925.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein>NZ_CP038925.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR |
115 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038925.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein |
23884_24064_+
Protein sequences of NZ_CP038925.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein>NZ_CP038925.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA |
59 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038925.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein |
24063_24492_+
Protein sequences of NZ_CP038925.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein>NZ_CP038925.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ |
142 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038925.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein |
24659_25199_-
Protein sequences of NZ_CP038925.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein>NZ_CP038925.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM |
179 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038923_1 | 363251-363380 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038923_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038923_1
>1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038923_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038923_1 >merge|NZ_CP038923|1|363251-363380|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP038923|1|1|363251-363380|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP038923.1|WP_054300520.1|362029_362344_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038923.1|WP_075273359.1|361508_362084_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038923.1|WP_016211797.1|360054_361458_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038923.1|WP_033923850.1|359455_359893_+|hypothetical-protein MIGLFVNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038923.1|WP_080664870.1|358830_359478_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE >NZ_CP038923.1|WP_016211795.1|357953_358148_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038923.1|WP_036794771.1|356829_357816_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038923.1|WP_016212044.1|355852_356107_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038923.1|WP_054300271.1|354339_355314_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038923.1|WP_016212359.1|353753_353972_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP >NZ_CP038923.1|WP_032126227.1|363909_364200_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038923.1|WP_016212008.1|364237_364936_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038923.1|WP_016212010.1|364952_365249_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038923.1|WP_129556446.1|365366_366518_+|hypothetical-protein MSMLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038923.1|WP_075273619.1|366790_367366_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP038923.1|WP_016211273.1|367423_368257_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP038923.1|WP_016211268.1|368372_369557_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP038923.1|WP_016211271.1|369575_370520_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP038923.1|WP_016211269.1|370824_371610_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP >NZ_CP038923.1|WP_016211272.1|371727_372096_-|hypothetical-protein MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038923_2 | 2636411-2636531 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038923_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038923_2
>2.1|2636448|47|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038923_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038923_2 >merge|NZ_CP038923|2|2636411-2636531|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT >NZ_CP038923|2|2|2636411-2636531|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT
>NZ_CP038923.1|WP_075275117.1|2635831_2636254_-|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP038923.1|WP_016211905.1|2635177_2635588_+|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP038923.1|WP_052047041.1|2634645_2634909_+|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP038923.1|WP_098082812.1|2633897_2634413_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038923.1|WP_016210678.1|2632742_2633753_+|protein-kinase MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038923.1|WP_016210676.1|2630357_2632439_+|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP038923.1|WP_016210671.1|2628642_2629902_+|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP038923.1|WP_016210673.1|2628036_2628510_-|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP038923.1|WP_016210672.1|2626645_2628028_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP038923.1|WP_016210677.1|2626038_2626653_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER >NZ_CP038923.1|WP_054300282.1|2637908_2638373_-|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038923.1|WP_081377880.1|2638429_2638909_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038923.1|WP_129556590.1|2639766_2640162_+|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP038923.1|WP_032126312.1|2640158_2640953_-|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP038923.1|WP_016211756.1|2641131_2641857_-|M15-family-metallopeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP038923.1|WP_016211759.1|2642102_2643290_+|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP038923.1|WP_081377344.1|2643644_2644772_-|transposase MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038923.1|WP_016210935.1|2645102_2645645_-|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP038923.1|WP_016210943.1|2645641_2646328_-|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP038923.1|WP_016210942.1|2646331_2646943_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038924.1 | 98297-98334 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038924.1 | 104921-104958 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038924.1 | 74736-74773 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038924.1 | 89480-89517 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038924.1 | 140614-140651 | 1 | 0.974 |
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NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP039213 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence | 30310-30347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 7350-7387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 186740-186777 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 29210-29247 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 13746-13783 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP039215 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence | 120527-120564 | 1 | 0.974 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 94958-94995 | 1 | 0.974 |
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NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP039033 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence | 30949-30986 | 1 | 0.974 |
NZ_CP038923_1 | 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder | 363297-363334 | 38 | NZ_CP038914 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence | 30949-30986 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
74. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
83. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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125. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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126. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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130. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45566 : 89679
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038923|45566:89679|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGGGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAATTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAATATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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46 | Moraxella_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136473 : 178470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038923|136473:178470|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
182276 : 239530
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038923|182276:239530|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(12.5%) | tRNA,tail,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
256927 : 302003
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038923|256927:302003|DBSCAN-SWA 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47 | Acinetobacter_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
329578 : 375133
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038923|329578:375133|DBSCAN-SWA AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGCATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATACAATAGTCAAGTCATATGTAAGTTAAGCCGTTATGTATATTTTATTATTGAATTTGTGAGGCTGCGGCTGCCCCTTCAAGATCCCATGATTGAACTTGAGCCAAGGCAGTCGTACGCCGATCAAAAAGCAGGCACGCTGCTGCTTCTGAAGTTTCGTTTTCGTCTGTTGCCAGTTGCGAGCGGAATTGTTTCAGTAGCTCAGATTGCAAATTAACCCCTTGCAAATCATAAAAACGCTTGATACCGTCTAGCATGTCGGACAATACGAACTCAATATCTTCTTTGGCTTGCTCTTGCTTAAACAATTTTCTAAAACCGCTATAGCTGTCTAGTTGTTTGGCAAAGCTTTTCAGCTCATTAAGCATGTGTTGAATATAGTGTTCGGTTTGGTTTGGCTGATCCAGAATAGTCTTGGTATCTATTAATAAAAGATTATTGATAAGTATTGCAATTTTTTTAAATCGATGGGCTCTACTATTAGTAACTGAAATTTCGAAAAACTCTAGTGTTGTATTATAAAGATCTTTATAAGCATCAAGCCATTTATCTAACGATTGGATTAAAATGTTTTTTAGTAAGAGAACTTCCTCTTGTTGAGGGGTTAAGCCATCGATCTCATTACTGCTTACACGACTAAAATCAGTTAAATATTTCTCTTTAAATTTTCGAGATGGAAGTGAAGTAACGTAGTCATCATAATTATGAAAAGAAACTTTGTTATCGAGTAAACTTTTTACTTTTTTATTTCTCGACCGATCATCACTTTCACTTCTGATATTCACTATTTCAAATTTGTTTTTTCCCTCTTTTATTGCGCCGACTTTATAAATTGCTTCTTTATAATAGATTACAGATGTTTTTTTAAATCCTTTTTTATCTAATTCTTTCATCAAATTTTCTGCAAAATTTTCTGCATAAGATGCTATTAATTTTATCTGTATATTATTTTTAGCATGGTCAGGGAGGCTCTGGCTGAGTAGTTGAGCAATGTCTTGGTAGCTAATATCCAGAGAGGCATTTATTTTCGAATTATAGAAATGATCTCCTGGGTGGAAAATAATCTGTTGCAAATGCTCATCAGTGAAGGCATTGCCTGAGTCAATGTAAATTCGAGTAAATGGCCCAGCTTCATTTAAAGCCTCTTTTACTATATTATCAGCAATTTACTTGTTTGTTTTATCTGGATTGACTTGCCATTCAGCCGGTGCGTTTTCTGTGTAGGGGAAGTTTAGCCGTATAAAAGGAATTTGGTCCTTAAGTAAAGATTTCCTTTTATGCTGGATATACATATCAATGGTATATTTACGACTTAAATCTTTATCTTTTTGTGAAAAAAAAGATTTTTTGAATGAAGTACAGGCAAATAAGGGAGTTTGGATGTTACTGGCAAGAAAAGATAGATAGATCGATTGATGAAACTTAGGCATAGTATTTAAACCTTGATTGAAAATAAAACAAAATAAAATAAATCAATTTAGCTTTTAAAATTAAGATAACGAGTATTTTATTCTTATTTAAAAGTTATAGTAATCTACTAGAAAAGGGTTTAATATAAAACATTTATAACTGTTATTATAGTCTTTTGTTTAACTTTTTTAATTATTTGAGCGTATTATTAATTTTGCTGCAGAATAGAATAAGTACAAGTTACAAGCGAGTATTATTTTAACGAGTAAAGTTATGATGAATAAGACTGGACTGTTGCCAGTCTAGCCTTAAACAAGGTGATTAATAGGGCTTAATTTTGCCGGTAAAATTTTCGCCGGTAATCTTATAGTGTAAAATTCCAGCTTTTAATCATTATTTTGCTTAAAGCCTTTCAGGGAAATAATGCGTGCTGATAACTCTTCTATAGAGCGATGTGTGGTGTCTAAGGATGGGATATTATAGCGTTGAAAAAGTTGATTAGCATAGCGCACCTCTTGACGGCATAAAGCAGGATCGGCATAAGCACGAGTGGAACGGCGCTCTTTGCGGATGGCGTGTAAGCGGCCGGGGTCAATAGTTAAACCGATTAATTTATCTTGATAATCTTTTAATGCATGAGGCAATGAAGTATCGAGAAAATCTTCGGCAACCAGGGGGTAGTTGGCCGCGCGGATACCATATTGCAGAGCAAGATATAAGCAGGTTGGCGTTTTGCCTGAGCGTGAGACACCGACTAGGATAACATCGGCTTTTTTATAATGCTTAAGGTTCGTGCCATCATCACTGAGCATAGAAAAGTCAACAGCTGCAATCCGTTGATTATAGCTCTCTTCAGCCATAGGCTTACGTGCCAAGCCGATGGCATGGGTCGATGTTTGGTGAAAAAATTGCTCAAGTTCAGTCAAATAATGTTCAAATAAATCAAGAACTAAGGCGTCAGCTTGCCGAATAATTTGGCACAGTTCAGGTTGAACCATGCTGGAGAAAATCAGTGCTTTCTGGCCATATTGCTCTGATTTTTGATTGATCAGCTCATAAGTTTGTTGAGCTTTTAAAGGCGTATCAATAAAGGGTAGGGTATACTTATTAAATTCTAAGCCGGGGAACTGGGCGAGTAAGCTTAAGCCCAGGGTTTCTGTTGTGATTGCGGTAGAATCTGAAATAAAAAAGACAGGGTACTTCATTTTTACACCAATTTCGGGTAGTTTTCCCTATGTAACCAATTTCCACGCACAAAAGCAAGGAGACCCCTTAAAATGATGCAGTGCAATTTCGTTGTTCCACTTTCTAAGGTTAACCGTGAAGATGTGGCCCATGTTGGCGGTAAAAATGCCTCACTTGGAGAAATGCTTCAACATCTCACCGGGTTGGGTGTAGAGGTTCCTTCAGGAGTGGCAACGACTGCCGCTGCGTTTCAATACTTTCTCGCTGAAAATGATCTAGCTGAGAAAATTAGTGAAGCGCTCATGGGCTTAAATGTTGATGATGTTGATGAATTAACGCGTGTCGGCAAACAGATTCGTGAGCTGATTTTAGCTGCGCCATTTCCAGCAGCTTTAGAGGAAGAAATATTATCGTCGCTAAAAGTATTTATTGATAGTGAAACGATGCCGGTCGCTGTGCGTTCTTCAGCGACGGCAGAAGATTTGCCGACCGCTTCGTTTGCCGGTCAGCAGGAGACATTTTTAAATGTGCGAGGTTATCAAGAGATTCTCGCGAAAACGAAAGAAGTTTATGCTTCTTTATATAATGACCGAGCGATCGCTTACCGCGTGCATCAAGGTTTTGCTCATGAAGAGGTTTCTATTTCTGTCGGTATTCAACGAATGGTGGAAAGTGAAGTTAGCGGCGTGATGTTTACGCTGGATACTGAAACTGGCTTTGATGATGTGGTCTTGATCAATGGTGCCTATGGTCTGGGGGAAAGCGTGGTACAGGGCAGTGTGAGTCCTGATGAGTTTTATGTTTATAAGAAAAATATTCACGAAGGTCGTCCGGCAGTATTACGGCGGACCTTAGGCAGTAAAGCATTGCAGCTGACCTATAAAGACGGTGGTGGCATCATCGAGTCTGAGGTTGAGCTGGCGCAAAGCCAAGTTTTTTGTTTAACAGATCAAGAAGCCGAAGAGCTCGCGCGTTTTGCTCTGTGCATAGAAAAGCACTATGGTTGCCCGATGGATATCGAATGGGGTAAAGACCAAAACGATGGTAGGTTATATATTTTGCAAGCACGTCCTGAAACGGTGCAAAGCCAGGCGCAAGTGATTGAGCGTTATCAGCTAAAAGAGCAGGGCAACATATTATCTTCTGGGCGCAGTGTGGGTAAAAAGATTGCCTCCGGTCGTGTGCGTTTATTAAAAAGCTTGCAGGATATGAAGAACTTTCAAGCCGGCGATATTCTAGTGACGGATATGACAGATCCTGACTGGGAGCCGATTATGAAGCGCGCAGCGGCAATTGTGACCAATCGTGGTGGGCGCACTTGTCATGCGGCAATTATTGCTCGTGAACTTGGTGTACCGGCAGTGGTTGGTTGTGGTGATGCAACGGCTGAGTTAGTAGAAGGTCAGATTGTCACGGTGAGTTGTGCAGAAGGCGATACCGGTTATATTTATGAGGGGGCTTTAGGCTTTGATGTACAGGAGATTAACTGTGAGGCAATGCCAAAAATCCCTGTCAAGATTATGATGAATGTAGCGCACCCTGAGCGTGCTTTTGCCTTATCACGTCTGCCACATGAAGGGGTGGGTCTGGCACGCTTAGAGTTCGTTATTGGGCGGACTATTGGCATTCACCCACAGGCTTTATTAGAGTACGATCAGCAGCCTGAGGCGGTTAAAGCAGAGATTGATGAGCGTACAGCGGCCTATGGCTCGCCAGTTGACTTTTACGTTGAAAAGATTGTTGAAAGTATTGCAACACTTGCCGCAGCGTTTGCACCGAAGCGAGTGATTGTGCGCTTATCTGACTTTAAATCGAATGAATAT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45 | Hokovirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
447745 : 550159
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038923|447745:550159|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038923|447745:550159|525386_525986_-|WP_016212021.1|DBSCAN-SWA MAQPQLWVIAGPNGSGKTTLAQRYFKDKLPVVNPDEIAKELDPNDPHQLKTATKAGKLAAKQRKDYLDQSKNFAFETTFSGKGELVLMQKAADAGFKVNLVFISTDSPTISRGRIRQRVSEGGHHIPSQDVIRRYHRSLINLPKGLSIADRSFILDNSRSRLRLLLSRENSKVKSLSKSLPQWLKGVNLGFELKKGLQR |
98 | Escherichia_phage(42.86%) | tRNA,transposase,integrase | attL 507616:507675|attR 540795:541175 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
555087 : 612586
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038923|555087:612586|DBSCAN-SWA 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60 | Escherichia_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
635015 : 735644
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038923|635015:735644|DBSCAN-SWA 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104 | Prochlorococcus_phage(17.65%) | plate,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
771062 : 817748
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038923|771062:817748|DBSCAN-SWA 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39 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
834435 : 888690
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038923|834435:888690|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(15.38%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
894940 : 957975
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038923|894940:957975|DBSCAN-SWA 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59 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(14.29%) | transposase,integrase | attL 887300:887359|attR 904584:905023 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
961849 : 1065041
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038923|961849:1065041|DBSCAN-SWA 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111 | uncultured_Mediterranean_phage(11.11%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1094498 : 1137558
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038923|1094498:1137558|DBSCAN-SWA 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40 | Tupanvirus(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1146392 : 1201014
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP038923|1146392:1201014|DBSCAN-SWA 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51 | uncultured_Mediterranean_phage(36.36%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1237828 : 1337964
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038923|1237828:1337964|DBSCAN-SWA 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93 | Bacillus_phage(15.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1358763 : 1397320
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP038923|1358763:1397320|DBSCAN-SWA 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33 | Klosneuvirus(28.57%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1428109 : 1473300
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP038923|1428109:1473300|DBSCAN-SWA 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45 | Tupanvirus(28.57%) | integrase,tRNA,transposase | attL 1435905:1435964|attR 1483710:1484064 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1482426 : 1531912
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP038923|1482426:1531912|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(35.71%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1608845 : 1658355
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP038923|1608845:1658355|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1673206 : 1797591
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP038923|1673206:1797591|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(12.5%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1719656:1719715|attR 1796637:1797600 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1805054 : 1840094
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038923|1805054:1840094|DBSCAN-SWA 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36 | Bodo_saltans_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1882784 : 1899151
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP038923|1882784:1899151|DBSCAN-SWA 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15 | Leptospira_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1943946 : 1985359
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP038923|1943946:1985359|DBSCAN-SWA 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45 | Acinetobacter_phage(25.0%) | transposase,protease,integrase | attL 1934682:1934741|attR 1981041:1981329 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2038478 : 2090644
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP038923|2038478:2090644|DBSCAN-SWA 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52 | Orpheovirus(18.18%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2098488 : 2143194
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038923|2098488:2143194|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2164393 : 2214717
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP038923|2164393:2214717|DBSCAN-SWA CATGATAGAACATTTAAATACAGCCCTTATTCTGGTGATTCCCATCCTAACTGCAATTATCTTCCATGAAATCGGCCATGGCTATATGGCAAAACTCTTGGGTGATCCAACGGCTGCTCAACAAGGGCGTTTAAGCTTGAATCCCTTTGCTCACATCGACCCTGTCGGTACCATATTAGTTCCAGTGCTACTTTACCTAGCCGGTGGTTTTATTTTTGGCTGGGCAAAGCCTGTACCAGTCAATTACAGCCAGCTATATTCCCCACGGCGTGACAGTGCCTTAGTCGCCATCGCAGGTCCTGCCATAAACTTTATCTTTCTTTTTATCTGGTCTGCTTTATTTGCAATAACAAGAGCACACTCCCCTGTACTCTACGCAATGAGTCTTGTAGGCATTCAAATTAATATTATTTTAATCGCTTTAAACTTATTGCCGATCCCACCTTTGGATGGCAGCCATGTTATCAGCAGTCTTCTGCCAACTCAACTTGCTTACTATTATGAACGCCTTTCTTTTCTTGGCTTTACTCTCATCATTTTGCTCGTTGCTTCAGGAATTTTTGGCCAGTACCTTCAGCCATTATTAACCGATGGCACTCAATTTTTCTCCCAACTCTTTATATAAAGATATATAAAAAACAGAGGGTCTTTTATATATTACCGACCATATTCTCATCATCATACCTTACAAAATTAAGACATTAAGCGTACAAGTCAACACGAGCAATCTGGCTCACGCCATGCTCTTGCTCTTTTTCTTTATTAGATACACACTGTTGATATGCTGCGACAGCACGCTCTGAATGAAGGTTAGGCTGAACTTGCCAATATTGATAATTTGCATAGTTCTCATGTTGTTGATGATTATCTTGCCTTTGCTTTTGAACCGAAGTAACTACCACTCCACGCACCTGAGTAGCAGAAGTCTGCACTACTGGAAAATAAGATGAGTGGGCAAGCCCAAGCACAGACATAAACATCCCTTTTTAGATTCTTAACTTTAAGCTAAGTACAATAAAATTTTAAAGTCAAATTTCACTAATTTAAAACAAGCATTTCGTTGATTTTTTAGCAATATTATCACGCAAGTAAACAGGCAGAGCATCTTCTAATGCAATCGTTTTTCCCTGTACCCATAAACTAGATGCTATTGGCAAAATATCCATCGCATGAGGCAGTGCATCATTAACCACGTTTATCAAAATATGACCTAACCGTTCATTAAGTACTTGCGAGTAACTTGCAAAGCCAGTACCAGCGCCATACCATTGCCTTGTTTCATCTATAGGCAACTCAATATGATCAGGCACACACACTCTCTCTATAATCAATTCTTGAGCACACTGCTTTTGATCAATTTCAAATCCGGCATAATACACCTCACCCATACGTGCATCAATTGCGGTGATCACTTTCCTCGAGCCATATTGGCGATAAGCTCCTTGCGCCAAAACTTTTAATGTGGATACTGAAATAAGCGGTACCTCTGCACCTAATGCTAAACCTTGCGCAAGACCACACGCAATGCGCACACCTGTAAAGGCGCCTGGACCGCGACCAAAAGCAACCGCATCTAACTCTTTGGCTTGAATACCTACCTGCGCTAAAATCTCTTTAATCATAGGTAATACCAACTCAGTATGTTGGCGTGGGGCGATACGGTGATCTACGATCACCTCATTATCTATTTGTAAAGCAACGGAACATGCTTCAGTTGCTGTTTCTAAGGCTAAGATTTTCATTATTCTTCCACCCGACTTTGCCACTCAATATCAAAATAACCGCCCTTATTCTAGCGTATAAAAAAAAGCCTGCAACTGCAGGCTGTTTCACTCTCGAAGATCTATAAATAAACAATACATAATGTACAAGTTACTGCAATTAGTATTTAGAATGTATATCTAACTCCAGCAAACACACTATCAATGCTAGGCACACCTTGGGTTGTCCCATTATCCATATCTTCACCAAAGACATGCTGATACGTTAAATTCACCTGCAAAGCCGGTGTTAGATTATAGCCCCCACCTAAGCCTGCCAACACTTTGGTGCCCGTATCACCGATTGCATCACCGGAAAGCTTTTGACGCATCAAACCTGCTTTTGCAAACACATCAAACTGTGAGTTAATATGCCATGTTGGCACAACAACAACATCTATTCCTGTTGACTTGTAATCTTTATCAACTCCACCAACCTTAAAGCTAGTCTTGCCATAATAGCCATAACCTAGCTCTGCACCCAAACCAAACATATCGTTAATATCATAATTATAACCGACAGCAACACGGCCACCGATTTTATTACGGTCTTTATCTGTACCACCAGATAAACCTAATTTACGCTGTAAGGTATAACCTGCTTGACCTTCAACATATACACCCGTTTGCGCAAAAGCGACTGCAGTTGCACCCATGCAACCGATAACAGCAGCAGCAAGCAATGTTTTTTTAATCATAACCACTCTCTCTTAACTAGATTGTTTTTTTAATCGTAAGGTCATGATGAAAGGTTTGAAAAATAAAGTCAACTACCCAGCATTAAGCCTGATGTTATAAGCTTTTAGAAAAAAAACATAAGGTCTTTTCCATTAAGATAAAATTAATGTGCCAACACCAATTATAGAAAATATAATTAAAAAACAAGTCGTCTGCTCTATAATTTTTATATAATCTCAAGCATACCAGCGATTAATCAAAATAAATTATCCTTAGATCACAAAAAAGCCTACGATTGTAGGCTTTTAATTTTAAAAAATAATACTAAATTATCCTAGAATGTATAACGCAGACCTAATAAGACCGAATTAATTGTAGCCACATCATTGTCACCAATATTATTAGAACTCAGATCATCACCAAAAATATGGGTATAAGTTAGGTTAACCTGCAAATTAGGTGTAAAATTATAACCAGCTCCTATGGCTAACAGCGGTTTCCACTCTTTATTATCTCCACTAATAGTTTGTCCATTCAATGTCAAACTTCCATTAAGATCTTCATACGCCATACCCGCTTTAGCAAAAAGATCAAACTGAGGATTAATATGCCAAGTGCCTACAGCAGAAATATCCCAAGCAGTTGACTTCACATTAAATGATTCTCCCCCAAAACTATACTCAGTTTTTCCATAGTAACCCCAGCCTAGCTCAGCACCGATGCCCCACATTGGATCAATATCATACATGTAGCCAACTGCCACACGACCGCCAATATTTTTATCATCTCTTGATACTAGTGCTAAATCTGGCAAGTCTTGCTGATTAACATAACCTAAAGCACCTTCTACATAAATACTATGGCCTGCTGGCATACTTAAAGGGCCACCACCAGCGATTGCTGTTCCAGATAAACCCAAGGCAGCTGTAACACTTGCAGCAATTAATATTTTTTTCATCATGAAAACTCTCTCCGTAAGATTTTTAGAATTTTTATTCTAACGCCGGCTTACTTTAACAAAGCTTATTAAGCTAAGTCAAACAACTAAAATAATAGAAGATAGTGCATCTTATTGATTGCTTTGATGAAATATCAAAAAATAGCCCGCTAAGCGGGCGACATGGTTATGTAAATGCATTCCTTGTTAATCAACATAAGGGCAATAGCTATAATTCATCAATATAACGTTGTTCAGTATCATCATTATCCATATAATGATCTCTAGTCCTCGTATGGTTAGGTTCATTACAGTACTCCCAACCAATTTTAGGGCATGATTTACTTCTTTTAGTAACTGGGTCCACACAAGAGCACTCGTACTCTCTGACAATACATACTCCATATCGTTTAGTGAAGGAAAAATAAGTAGTCCGATCATCTGGATGTACGGCCGGTCCCTTATCTTTTTCACCATAAAAACAACCAAAATAGTAGCCAAAACTAACATGTAAAAAGTAGCCATTTTTATTTTTAAGTCTTACAGAAAATATAGGATCAACGGATATCTTGTCAGTGTAAACAAGAGACCAGTCCATTGTTCTATGGACAGCAGTATCTGGAAATATAGGACAGTCTGCAAAATAAGTCCACTGCCATGGTCTCGAACCACTACTAGTATCTGCTAAACATTTCAGGCCCCATTTTAGCTTGCTAGGTTCATATATTATAAGGAACCTAGAATTTTTTAAATCATAATACGTTCTATTGTCCCCATATTGAGTGGTATAAATTTGATTGTAGCCTGGGTAATAAAAAGAGCCTATGCCCATGCTATTATAGCGCTCGATCAACAGTTTCTGACATACTATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAGTTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACTTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGATACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGATTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAAGAATTTCAAAAATTCATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAACTAGGCTATACTAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGGTAACCCTCCCTTAAAATAGTACAAGTGATAAGTGGAATCTTCTGTTAAATTAACTTAGACAGGAGAGAGAAGATGAAACGATCAAAACTAACAGAATCACAAATTGTAGCCATGCTTAATGAAGGCCAAGCGGGTGTTAAAGTTG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49 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2221446 : 2267369
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP038923|2221446:2267369|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2336572 : 2396184
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP038923|2336572:2396184|DBSCAN-SWA 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57 | Planktothrix_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2434169 : 2497797
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP038923|2434169:2497797|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2501432 : 2609268
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP038923|2501432:2609268|DBSCAN-SWA 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|
102 | Escherichia_phage(34.15%) | tRNA,transposase,protease,integrase | attL 2584127:2584186|attR 2592368:2592655 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2637908 : 2672362
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP038923|2637908:2672362|DBSCAN-SWA 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38 | Microbacterium_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2730310 : 2813628
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP038923|2730310:2813628|DBSCAN-SWA 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82 | unidentified_phage(21.43%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2926190 : 2970536
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP038923|2926190:2970536|DBSCAN-SWA 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43 | Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
3002220 : 3119647
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP038923|3002220:3119647|DBSCAN-SWA 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MVQVKICGIKTMKDAKVAIAAGARYIGLNFEEKSPRYVTMQEAIDLSSLIIGENAIPVGVFTHHHAEQIADIVRACNLTAVQLHGERARLACDDLAIDLKRIYVVEFDQAGNIHVGADQEIDDCLKKLDKNRDYLLFDSTLPGRGQETNINKKNSLININGFRYFIAGGLNINNIQEKICEYQPYGVDVASGVESVRGVKSQTLIKQFIYLAQFQGEPHVANA >NZ_CP038923|3002220:3119647|3070377_3070827_+|WP_129556607.1|DBSCAN-SWA MLKLAFSTMFKKKVPIKEVNIKTHKIRNSLYFYLSTPFEKCKYTPIELYRSAYFNNLSEEAQDSIIREVFELYQVTSKMNYNLIHVQHNIYQVVYQSNQELITEDNAFNLMKDYDIIQNLDENSYSQLFNSAFKNNSRKIIHRNFSVKN >NZ_CP038923|3002220:3119647|3071109_3071820_+|WP_129556608.1|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAGAIKVIGKHLKKEVHISAISLLMAYMAVKLTCNILFFYHIQLNLGGATLKLTYSAILYPLVYVLMDWMVICYGTIWTMFLILFGVLLDGFSSGMISSTQFITIPHSLGSNELMLTQSVHNLSQGIWSLYWHGLAGSIIAYISELLLFSWLYNRLFNKSFWLSSIASICTTLAIHNAICDYQMFAGSPDRLDLILSNYGVNLIVIIAYTTFISVLRKKFNSSASNQLS >NZ_CP038923|3002220:3119647|3013681_3014206_-|WP_032126430.1|DBSCAN-SWA MSRPNNIFLIGPMGAGKSTIGRHLAQMLRMEFVDSDQELEDRTGVGIDWIYDVEGEDGLRAREQDVIADLSLRSGIVLATGGGAINSAENRKCLAGRGTVVYLYASVEQQLNRTAYDRGRPSLQYAKNRRELLEQMMDEYDKLYRSIADCTVATDARTVRSVANEIIQALATEA >NZ_CP038923|3002220:3119647|3066896_3067436_+|WP_016211865.1|DBSCAN-SWA MISVGQKLPEFNVKATVSNTLNDNAFTEITEKSYAGKWKVLFFWPKDFTFVCPTEIAAFNDLYSDFDDRDTILLGGSTDSEFVHLAWRQNKEELYDLRFPMLADVKRELSAKLGILDSEEGVSQRATLIIDPENIIRFVMVTDLNVGRNPQEVIRVLDALQTDELCPCNWQAGDQTIKV >NZ_CP038923|3002220:3119647|3098268_3099042_+|WP_016212051.1|DBSCAN-SWA MSTICITGASNGIGEALAYSYARPDNHLILIARNAERLEQVKAQCEKYGSKTTIAIINVCNHQALHDFLIDIDNQDPIHLVIANAGPSLKQLTHETTNYFSAQRLMVDTHINGTFNSIYPLIQRMQQRRSGQIAIMSSMNAKIFLPGRSIYGAVKAALLHFGLALRQQLKSDNIQVSVICPGWVKTPRTDLNQFSMPFKISAKKAALTIQKGLIQNKAIIQFPWQLSLITGIYSYLPLKIKEWVSQKLYFTNSKDND >NZ_CP038923|3002220:3119647|3038746_3041236_-|WP_016209720.1|DBSCAN-SWA MFNIAEYRKKPDRITDLLPWAALIAPGVVLNKDGSYQRTLRFRGPDLESSTDAELVATTARLNNALKRLGSGWALYIEARRSQAQRYSEESRFEDPVSWLVDLERHELFKRGGENFESHYYLTLQFMPPSEAVGKLSEAMIKRESDGQTVKNKKLSQKKQVKQKAAQAEKLDSYQSQLSFFNVSCERLFDIIKDFMFDAEFLDDDQTLTYLHQCISEKEHPVKKPQIPVYLDAILADTPLLAGLEPQLGQSHLRTVSILGFPSTSAPALLDQLNHLPIEYRWVTRFLPLDKTEAEKELKAYRKRWFAKRKGLGTMLMEMMTKSESAMVDQASVNKSRDADQAIQELEDDHVAFGYYTATITVWDKDPQVVTQKIREVERVVNGLGFTTILETLNAVEAWLSSLPGHANANIRAPLMHTLNLAHLIPFSAIWAGPERNQHLNGPPLLHARTRGNTPFRLVNHIGDVGHQMVLGPTGAGKSVLLNLMALQFRRYQDAQVFIFDKGGSFLASTLGVGGHYYEVGQPENKDLVFQPLAHVDKEAERIWATEWLLGLLQHEKIEVTPHVKDMLWQAMTGLAAVPENQRTLTGLKALLQDHQLRQALDHYTLGGPYGDILDADHELFTTGAWQCFDLEALMETPAIIPPVLDYIFHVLQQRFTGVPSLLILDEAWLFLDHPIFAAKIREWLKTLRKLNVSVIFTTQSVDDILESEITNSLLESCPSRIFLPNNRALEPSVYSAYEQLGLNTRQIQMLSSAMPKRQYYYESTQGNCMFDLSLGPIALAFAGVSRPEDKQKIHALYRRYEYREFIEHYLRECHLDWAISLLEQWSPL >NZ_CP038923|3002220:3119647|3081080_3082148_+|WP_016210345.1|DBSCAN-SWA MKTIPCILMRGGTSKGPFFLASDLPSDPQERDQVLLKIMGSPHQAQIDGIGGGSSVSSKVAIVSPSARDGIDVDYLFCQVVVGESRVDSSLNCGNMLSGVGPFAITKGLVKAQDQETTVRIYNKNTDVVVEAKVQTPNGELSFEGEATIDGVPGHSAPIELSFLDSVGAKTGKLLPTGQAVNIIDDIEVSCIDVSVPVVMMLAASLGKSGYETKQELDQDKNLIKKMEMIRQKAALLMGMGDVSHSVTPKMALLAEPHCNGHITSRYFTPTDCHPSHAVTGAICIASACLIPGSVANQVAHNIHIQDAESDIIVEHPAGTIDAVIHKEVTGKTIEIPKVSFIRTARPLFSGEVII >NZ_CP038923|3002220:3119647|3077556_3078303_+|WP_016211229.1|DBSCAN-SWA MQIQQPSFFLKATSLIRSIVYYLIVGIVTLFISITSIITLLLPFKVRYRYIMAFCPIALFCARWICGIRYEIQGQKHLANEKVAVIISNHQSAWETFLFPAMFPPLAIIIKQSLLKIPFWGWSFASLEPIAINRHDGKKALLQILRQSKAAVAKGRWIVIYPEGTRSEPGQLATFKKGSGVLAASLHQPIFPIAHDAGKCWPKNSFIKYPGTIHVRIGKKIDTADKTHEQINTECYSWIKEQLQRFKN >NZ_CP038923|3002220:3119647|3052940_3054056_-|WP_051307314.1|DBSCAN-SWA MKKIVIIIPVHNECLCLTRTVRQLQNEIVKVTYWDIRIIIFDSASTDGTDKISQILQKKYNNIDLLTELSKTGLGSAYVQAMRYALDHLQAEIVFEYDADGSHQPCYLIKMLELFDQGADVVVGSRYIQGGSVDSSWPWQRRLVSKFGNFIAGLFLTFRYKDLTSGFRGTRALYLRRFLAKRLLSKDYAYKLQLFWQLHKMRAKIIEYPIHFIDRAKGVSKSPKGNIKDSLKVVALLRLLEIKRYIKMSVAGCASMILQITLYNILHGFTSFDLASLISIECAIVMNFILNNFIVFKDKNYNKERIFFKFIRFNVFSCLSVLIQMIMLHWLHNINDSSLIVMDLFIFISIVLGSVINYFLFSRLIWRVSTK >NZ_CP038923|3002220:3119647|3082560_3084009_-|WP_129556609.1|DBSCAN-SWA MQEKAILKIIGILLMLFSFSMLPPVYVSWLYQDYDATPFLISFCLAFFSGFLVWLPARDYKVDLKARDGFIIVFLFWLVLGVYSALPFMLSYHPHMVLSEAVFEAVSGFTTTGGTVLSHIENLPPSILYYRQQLQFLGGMGIIVLAIAVLPMMGVGGMQLYRAEVTGPVKDKLTPRITETAKTLWYIYVGLTVICIMTFWLFGMDLFNAICYGFGTISTGGYAPHDASAAFYSSSLIQYAMIFFMLIGGTNFSLHFIMLRKGDIRTYWREPEFRMYISLFFIASIAIMAWLCLSGTEVSISKAIRDSMFQVSSFMTTAGFGSVNLGSWPQLIQLGLLFLGAIGGCAGSTSGGVKIIRLILLGKQSQREIQRLVHPNGVFHIKLGGFPVPVNVINATWGFLAAYVMSFIILMLLLMATGLDQVTAFSTLLACISNTGPALGEAINNYGNLNNSALWLLSFAMLLGRLEVFTVLVLFSRTFWRV >NZ_CP038923|3002220:3119647|3085438_3086770_-|WP_051307328.1|DBSCAN-SWA MQWGVVLASKLTNIRALASAVLADVSHQGMSLPAALLKHNELLDEGDKSLLQELCFGSIRWYQRLDAICDQLLNRPLRRREASLKMLLIVGLYQLLFMRIKPYAVISETVDAVNDLKKPHAKGLVNAVLRSAQRQDYPLLTQEIAIYSHPNWLIKRCKRAWPESWQDILKANNERPPMSLRVNQRWGTRQAYLQLLKQHDIVAEAVNIQDCAHAIRLGKPSSVAVLPQFSEGACSVQNEAAQLAAPLLDLKAGLRVLDACAAPGGKSCHILELADAIDLVAVDVDGRRLQRVQENLSRLKLSAKLVEAAVENIDDWWDGVPFDRILLDAPCSGTGVIRRHPDIKLLRTLEDISQLHHLQLQLLTALWPCLKPGGVLIYATCSILPEENEAVIKKFLAEQAGKAQEVKLSAEWGMLRPFGRQIFPEVGGMDGFYYAKLRKIANS >NZ_CP038923|3002220:3119647|3046935_3048441_-|WP_016209723.1|DBSCAN-SWA MKLAIVYSRAQVAVAAPQVTVEVHISNGLPGFTIVGLPDAAVKESRERVRSAIQNSGFNFPQRRITVNLAPADLPKDGGRFDLAIAIGILASSGQIDADILNGYEFIGELALSGEVRSVTGALTSAKAVKECQRKLIIADDNANLAALVEGLSVYRANNLASISAFLKGEGDLEQAHFQVDTGQTHYLDMADVKGQAHAKRALEIAAAGRHHLLFVGPPGTGKTMLASRLPGVLPALSNQEALESAAVHSLTSAEVDLSCWFIPKFASPHHTASSIAMVGGGSVPKPGEISRAHHGVLFLDELPEFDRKVLEVLREPLESGQVDIIRASHRASFPASFQLIAAMNPCPCGHLGSQEQRCRCSQLQIKRYLNKLSGPLLERIDLQIEVPRLLQHELSSTQVAESSVVIRQRVEVARQLQLKRQQCPNAGLMPRQIEVFCSLGQQESNLLTRAIEKFGLSARVYYRLLKVARTIADLEQSTDIKLQHVQESLAYRSLDRRQSE |
112 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038923.1|WP_032126179.1|1096967_1097219_+|TSUP-family-transporter |
1096967_1097219_+
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_032126179.1|1096967_1097219_+|TSUP-family-transporter>NZ_CP038923.1|WP_032126179.1|1096967_1097219_+|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA | NA | NA | 1094498-1137558 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1105590-1105553, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1105456-1105419, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** 3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1095411-1095448, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_081377858.1|1282749_1283460_+|transposase |
1282749_1283460_+
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_081377858.1|1282749_1283460_+|transposase>NZ_CP038923.1|WP_081377858.1|1282749_1283460_+|transposase MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
236 aa aa | NA | NA | NA | 1237828-1337964 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1300467-1300504, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1303973-1304010, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_054300380.1|1300542_1301199_-|transposase |
1300542_1301199_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_054300380.1|1300542_1301199_-|transposase>NZ_CP038923.1|WP_054300380.1|1300542_1301199_-|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA | NA | NA | 1237828-1337964 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1300467-1300504, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1303973-1304010, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_016212421.1|1304438_1304621_-|hypothetical-protein |
1304438_1304621_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_016212421.1|1304438_1304621_-|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_016212421.1|1304438_1304621_-|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA | NA | NA | 1237828-1337964 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1300467-1300504, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1303973-1304010, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_032127044.1|1316345_1316546_-|hypothetical-protein |
1316345_1316546_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_032127044.1|1316345_1316546_-|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_032127044.1|1316345_1316546_-|hypothetical-protein MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
66 aa aa | NA | NA | NA | 1237828-1337964 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1300467-1300504, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1303973-1304010, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_098082828.1|1949991_1950249_-|transposase |
1949991_1950249_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_098082828.1|1949991_1950249_-|transposase>NZ_CP038923.1|WP_098082828.1|1949991_1950249_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1943946-1985359 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 1954252-1954215, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_016212450.1|2258965_2259868_-|hypothetical-protein |
2258965_2259868_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_016212450.1|2258965_2259868_-|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_016212450.1|2258965_2259868_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG |
300 aa aa | NA | NA | NA | 2221446-2267369 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2225036-2225073, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2226957-2226994, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2258836-2258873, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2258970-2259007, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_016211504.1|2266519_2266804_+|hypothetical-protein |
2266519_2266804_+
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_016211504.1|2266519_2266804_+|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_016211504.1|2266519_2266804_+|hypothetical-protein MLQYFKFETVFIKTAFIAIISLIFAVTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
94 aa aa | NA | NA | NA | 2221446-2267369 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2225036-2225073, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2226957-2226994, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2258836-2258873, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2258970-2259007, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_016210580.1|2791329_2791590_+|methyltransferase |
2791329_2791590_+
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_016210580.1|2791329_2791590_+|methyltransferase>NZ_CP038923.1|WP_016210580.1|2791329_2791590_+|methyltransferase MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI |
86 aa aa | NA | NA | NA | 2730310-2813628 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 2811863-2811900, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_129556602.1|3004688_3004898_-|hypothetical-protein |
3004688_3004898_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_129556602.1|3004688_3004898_-|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_129556602.1|3004688_3004898_-|hypothetical-protein MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC |
69 aa aa | NA | NA | NA | 3002220-3119647 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 3018947-3018984, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_016211201.1|3008031_3008340_-|hypothetical-protein |
3008031_3008340_-
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_016211201.1|3008031_3008340_-|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_016211201.1|3008031_3008340_-|hypothetical-protein MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA |
102 aa aa | NA | NA | NA | 3002220-3119647 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 3018947-3018984, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_155046758.1|3097509_3097641_+|phosphatase |
3097509_3097641_+
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_155046758.1|3097509_3097641_+|phosphatase>NZ_CP038923.1|WP_155046758.1|3097509_3097641_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA | NA | NA | 3002220-3119647 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 3018947-3018984, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038923.1|WP_155046759.1|3097785_3097941_+|hypothetical-protein |
3097785_3097941_+
Protein sequences of NZ_CP038923.1|WP_155046759.1|3097785_3097941_+|hypothetical-protein>NZ_CP038923.1|WP_155046759.1|3097785_3097941_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA | NA | NA | 3002220-3119647 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038923 position: 3018947-3018984, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 12994
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038926|0:12994|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038926|0:12994|6964_7237_-|WP_032126738.1|DBSCAN-SWA MIKKNIKLDNEEQAIEDSFDAFLQGGSLDAAALIEAAKNTGKKSKPVSLRLTESDFTKAHAKALEEGVAYQTLLTSVIHLYLSGMLVRKS >NZ_CP038926|0:12994|932_1916_+|WP_016211499.1|DBSCAN-SWA MSTVAKKNKQRKNSSKREQMLEAAKIAAFQKRDSVSDYKEIIDDKNKEIDSLKAKVDILGSIETNLKSSLIYVDPAECVNWLYADRQNFELGDLQELAEDIEKNGQVQPCILRLLKKSENQKEKYEVIAGERRWRACSLFRINLLAEVRELTDAEALVVQKSENRKKDICPHSEARQYYLALKNNVISQNELAAKLGYSSSSFSNLLSFMHVDDRVWKAVGDTSRVSPRSAKLIKQYCDKGEEHIKALISIAPKIKEGMGAKSLEKTIDRLLSNPEVSNNKKEIFINNKKAFSINGGDIKISKSIYSQINMDELEKLIYSHLSEKLI >NZ_CP038926|0:12994|8782_9757_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038926|0:12994|7711_8302_+|WP_016212425.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLHKQAKILSERQEKAVLSAFQSTTYPTRNTTMFLLSIKAGLRAKEIAALTWDMVLTPEGELCESIRLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESQPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTIVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDNEAKKKIVDLI >NZ_CP038926|0:12994|12253_12994_-|WP_032126347.1|DBSCAN-SWA MSKYVAITGSSTGIGSSTVSKYLKEGYIVFGLDINKPEVTHNNFFHINCDISSVSSIKKARLEVDSFTKKVDHLVSNAGVHSFGSLKDLTEEKYEIIFNINVKGTLFFIQNFVTLIENNYGGSICLVGSDQSFVGKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ >NZ_CP038926|0:12994|2073_3045_+|WP_032126374.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRHKCTKEIYKAFLQASSVRYSGLALSEVSPKPLSHDSVSRWLQSQQYRPRDIWHIVKDLINTEEPCLLVVDDTVLDKHRSKQIDLVHHQYSGNAHDVIAGIGLVNLVWYGLERQHSIPIDYRVYDKDTDGKTKNDHFRDMLKLGKNRGMTPSAVVFDAWYSSLNNLKAARDLHWNWVAGLKKNRKVNRNETLEMLDFPDEGLKLHLRGYGWITVFRFVAKNGRTDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKARWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISLYQQDWDVIKVGISCSIQKILAAT >NZ_CP038926|0:12994|6035_6764_+|WP_032126737.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038926|0:12994|7229_7508_-|WP_016212424.1|DBSCAN-SWA MHIEWSEEKNKKLKAERGFSFEDVVAAISLGKLLDNRAHPNPEYQHQNIAVVNIEGYAVMVPYVTKEDGTLFLKTAYPSRKATKHYLGEGDD >NZ_CP038926|0:12994|3110_3701_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP038926|0:12994|11944_12187_-|WP_032126346.1|DBSCAN-SWA MPSTTHKILELLKSGEELTRPKAYKLGFGHCLPTFICQLRKEGYNIRSWKGEKGYYHYQLDTRKQVQSDLFEVKQLTFDF >NZ_CP038926|0:12994|11410_11845_+|WP_016212315.1|DBSCAN-SWA MARAEHDLDIYAWAHENAELLKQGKFNEVDMVNVIEELEDLGNSKRDQLTARLKLIIQHLLKWQYQPSHRGRSWSLTIQNNRDDVEDLFEDVPSLKSKLDECFDKAYKRGVKAASNETDIPIKTFPKSCPYTLEQVLNPEFMPE >NZ_CP038926|0:12994|8450_8684_-|WP_032126150.1|DBSCAN-SWA MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT |
12 | Caulobacter_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 5754:5813|attR 9734:9947 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
16189 : 24563
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038926|16189:24563|DBSCAN-SWA GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAATCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAATAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTGGTAACCCTCCCTTAAAATGAGACAACTCATAACTGGAATCTTCTGTTAACATTTTCAAACAGGAGAGCATATGAAAAAGAGCAAATTAAGTGAATCAAAAATCGTAGAGTTGCTTAAGCGTGTTGAGGCTGGAGCAGATATAGAAACCACAGCAAGAGACTACGGAATCTCAACTAGCACGTATTACACCTTAAAAGAACGTTATGGGGCAATGGATATCTCTCAGCTAAAAAGGCTAAAACAATTAGAGAAAGAGAACCAGCAACTTAAGAGAATGTATGCTGATTCTCAAATAGAAATTGAGGCTTTGAAAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATAATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACATCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCGGCTGGAGCGTTACGAGCAGTTATAATGGCCGTACACACGATTTTTTTTAAAATCACTATCTTTTTCGGCTTTTTTTTCTTCCATTTTTTGTATCATCGATAATTTTTTAAATAAATCTATTAATGGGCCTTCTTTGTGAGGGATATCTACTTTTTGAACTTCATGAGCATGAAAATCTTTTAAATCATTTGTTTTTTGAAGAACGCTTTCAGCTTCGTCATCTGCAATGACACCATCAAAGTCAAAAGCAACTCTTAACTCGCTACCTGCATCATCGCATATATCACCATATATAATTAAACCTGCTGGATAACCGAAATTAATTGCTTTTTTCACATCACTTTCATCCCCAGATAGAAAAAGTGAAGCATTAAATGCGGGGATATAATTATATGGTGAGCTTCCACCCATAAATGCAGCTCTTGATATATTTAAGTCGTAATGCTGAATAGACCTAAAAACTCTTTTCCCCGTCGCAGGAGAGTTTCTTGAAAGCAAAACTACCTCCACAGGCTCGTCATCTGGGAATGACTGGTTGATCGATAAAAATCTTTTGATAAAAGGAAAAGCAACACCTTTTTGTAAGGTATTATTTAAATTATCTTCTTGGAATTTTTTATATTCATTCTTACCTTTATTGGTAAAAACTTCATGTGCTTCAGACAAATCGAATAAGGCGCTAGAGGATACGGCAATCACAAGCTTATTTTCGATAGGGTAAGACATTAAAGAAACTCCATTTCTGTGCGCTCTTACAACTATAACTCAACATCAAAGTAACTTTCCATCATGTACTGTTTTATTGGCTTTAGTAATATACTACTCATGTCTTACCTTTAACCCTAAGACTTTAGGATAATGTGCTCATGAACTACTTTTTGGCAGCACTCAAGCGCTGATTACCAAAAAGTATAATATTTGACACATATAGCTAAGCTACCTCGTATATGAGTAAAGGAGATTTATAACCCATATTAGTATAAGGTTCCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAATTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038926|16189:24563|21051_21888_+|WP_033923779.1|transposase|DBSCAN-SWA MLATYLKDEHKLSLVVACNLVTLPRASYYRKKQHQSDNAEIISELKTLASKHKRWGCDKMVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG >NZ_CP038926|16189:24563|19356_20085_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038926|16189:24563|20767_21040_+|WP_032126239.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI >NZ_CP038926|16189:24563|23588_24563_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038926|16189:24563|16189_16861_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG >NZ_CP038926|16189:24563|16882_17164_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038926|16189:24563|21901_22141_+|WP_081377864.1|transposase|DBSCAN-SWA MSHLWGVDSYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG >NZ_CP038926|16189:24563|17254_19327_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV |
8 | unidentified_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
29285 : 30014
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038926|29285:30014|DBSCAN-SWA ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCAAGGATAGGCTCGCTGAGTACAGCTCGCGACTTTAGGAGGGCCGTTGTATAGTTTATCGTTGTCTGTATGATTAATCGCTTGTTAATCAACACAATGAGATAGTTAGTTTGATTCAATTCACGCTTAAACATCTTTTCCAAACTGGCAGAGTTTGGTGGCGCTACTATGTGGCCAATCGCGATAATATTCCTCGCTCTGTGGTTGAAGTCGTCGTGAAAATGCTCAGCTGTAGAACTAAGTTTGCAGGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038926|29285:30014|29285_30014_-|WP_080728333.1|transposase|DBSCAN-SWA MTCKLSSTAEHFHDDFNHRARNIIAIGHIVAPPNSASLEKMFKRELNQTNYLIVLINKRLIIQTTINYTTALLKSRAVLSEPILDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA |
1 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038924_1 | 1232-1455 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038924_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP038924_1
>1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038924_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038924_1 >merge|NZ_CP038924|1|1232-1455|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP038924|1|1|1232-1455|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP038924.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP038924.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ >NZ_CP038924.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038924.1|WP_155049199.1|3589_3835_-|hypothetical-protein MDKHRDVVVENVIKVLACGTTIMGHSKYCCSNSECSHTKVVPYTCKSRFWALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ >NZ_CP038924.1|WP_155047019.1|4324_4477_+|hypothetical-protein MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN >NZ_CP038924.1|WP_075273751.1|4489_6220_+|PLD-like-domain-protein MKIKVFIILSIIFYSKLIYASPLNEIYKDIILKTDPTRSQDGITYSFTEKNLLKDDFLIQFPGKGVWGKSAKDYPGFAFHVGLDHDFGLPHCQTDSQCITNSTCSNLFSFNNEEHHKHIKMCNGYTEKNLDRFYNIIIRAEKFVDITTLEPMPDLRFRSTLRNALTFLARTGKHITIRILSGSYQTMPSKGLSNEQHKNKSLLGGYPTWYFLNDLIRDIKNIPGSNLNLYVSSMRSCSGKCGSDFLMSLSWNHSKIIDVDGKYIISGGVNMYDSYYLGKHPVFDLMIELEGPAATQAIRFTNLLWRFVRNNIKLYLYYPFNVIEYSATKNNNYAIVSNDLLGHDLYAAPHTTSGNAEVLAIGRTGYGLYKDDSAKNNNNSDYALYRLLTSAKKRIYIAQQSLKAHFNTWPYDTTKEQHTNLISALAKLLMEAGHVYIVQSPYSDATMMESGYLSLATDEEVWSKIKSEAMAMYPALKEDTINLKLCNKLHISTIRFNEYDDLWTDNEKITGHYKFMMVDKGMFYVGSQNFYPSGLQNYGHIINSKKASNIIRNSFWRPLWKYSSRTEYIPDLCKQN >NZ_CP038924.1|WP_054300477.1|6379_7108_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVNRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038924.1|WP_155047020.1|7264_8188_+|hypothetical-protein MSELKNKENFEDRGYAHYIQTCYFEEQKCYVKLSYKKDSSTSLLLFEALNLLSLKILGFAIPSTIHLIQDHKSNKCIGYLTSEVILDKTLKFIDFAEDISRITLTRLILGDNAATEDGNILMTRSQLISIDVPCFRLAPELVPSKYQDHLELFSKVFSNKDLLSHVSENTINHFYNNIGLISYELSRLYLDNVIDKIEKDGYLKKLINNIASFYGLISILKEKEYPHEFLSDFEDKLYFANRLEYIQQLNAIVVEQGLAAEKDHVSENLFFDANEYLEDIDTSELLFFDAKDTLEDTVAKNLDLSRV >NZ_CP038924.1|WP_075275154.1|8428_9085_-|IS6-family-transposase MINFSGRHFKKDLIMMAIRWYVAYTLSYRDIEELMAERGIQVDHSTIHRWVVKDTSQLEEHFKKRYKRQPGTSWRLDETYIDKYGDTIDFTLSKYRDEEAVYTFLKKATGSSNVIPDKIVIDQSGANTAGIMMFNYLLFILGLWFLMIEIIQIKYLNNIIEQDHRPVKKKMKAALGFKSTQGAKATISGVEFYRMLKKKQMHCHQDKPAYEQFYLLAA >NZ_CP038924.1|WP_054300202.1|9214_9943_-|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038924.1|WP_155049201.1|10187_10808_-|TSUP-family-transporter MFRNSATFHHYRSNNLVIPLFKGIVIFTVIGAVIGGQLDKIIPVAFVKILFTVIIISVLVQSFFHRINQVGKLEYQPVYPGFLSRSIMGFSVGILASLVGIGGSAITNPYMQYHRYPMKKSAAMSTALAFPMGLFALASLLASSVGMVGLPYGSLGYLYLPAFTGLLIGSLLGSPLGVWLVKRASEQTSVWVFRIILLAVIIQMVR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP038924_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 129443-129484 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038924_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038924_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 55882-55923 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038924_1 | 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT | 1257-1298 | 42 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 134135-134176 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038924_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038963 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence | 128617-128658 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038924_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 137267-137308 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038924_1 | 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT | 1389-1430 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93293-93334 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038924|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa CRISPR spacer attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa Protospacer ******************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2892 : 100622
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038924|2892:100622|DBSCAN-SWA TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCAAAAACGTGACTTACAGGTATAAGGTACAACTTTGGTATGAGAGCATTCAGAGTTGCTACAACAATATTTTGAGTGACCCATAATGGTTGTGCCGCATGCAAGTACTTTAATCACGTTTTCCACAACGACATCACGGTGCTTATCCATGTTAGCTATGAAGTCACGCCACCAATTATCGGCAGTTTGAAGAAGATGTTTGACTGTGTTGAGCAATTATTTTTCTCTTAAAAACTATGCTCTATAGTAGCGATTACGTTGAGTTTAGCAAGGCCCTCCTAAAGCTGCCGACGCAGGAGGCCTCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTAATTGCAAAAAATAACTTTTTGTTATATAAGTATTTTTTAATCATGAAAAAAACTCGTGCAGATGTAGAGAAGGCGCTTCAAAAATCAAGAGAAAGTGGTAATGGGGTTAGTTTATCTGGTGCAAAATTAACTGATGTCACTGTAAGCACAACTGAGCTTAAATATGCGATATTTTCCAACAATTTTCATAATTAATGTGGTATAACCATGAAAATAAAAGTTTTTATTATTTTATCTATTATTTTTTACTCTAAGTTAATATATGCATCTCCTTTAAATGAAATATATAAAGATATTATATTAAAAACCGACCCAACCCGTAGTCAAGACGGCATTACCTATAGTTTCACGGAAAAAAATCTATTAAAAGACGATTTTCTAATTCAATTTCCTGGTAAAGGTGTTTGGGGTAAAAGCGCGAAAGATTACCCTGGATTTGCCTTTCATGTCGGTCTAGATCATGATTTTGGCTTACCTCATTGCCAGACTGATTCTCAGTGCATAACTAATAGCACTTGTTCAAATTTATTCTCATTTAATAATGAAGAGCACCATAAACATATTAAAATGTGCAATGGATATACTGAAAAAAATTTAGATCGTTTTTATAATATAATTATACGTGCCGAAAAATTTGTTGATATAACAACATTGGAACCGATGCCTGATTTAAGATTTAGATCAACTCTTCGCAATGCACTTACTTTTCTAGCAAGAACAGGAAAACATATCACGATTCGTATTTTATCTGGCTCATATCAAACTATGCCTAGTAAAGGACTTTCAAATGAACAACATAAAAATAAATCTCTCCTTGGTGGTTATCCAACTTGGTATTTTTTAAATGATTTAATCCGTGATATAAAAAACATCCCAGGATCTAATTTAAATTTATATGTTTCTTCTATGCGAAGTTGTTCTGGTAAGTGTGGCTCAGATTTTCTAATGTCTTTATCTTGGAACCATTCAAAAATAATTGATGTTGATGGTAAATATATTATTAGTGGTGGGGTAAACATGTATGACAGTTACTATTTGGGGAAACACCCAGTTTTTGATCTCATGATTGAGTTAGAAGGCCCAGCAGCAACTCAAGCAATTAGATTTACAAATTTGCTGTGGAGGTTTGTAAGGAATAATATTAAACTTTATCTTTACTATCCTTTTAATGTTATTGAGTATTCCGCAACAAAAAATAACAATTATGCTATTGTGAGTAATGATTTGCTAGGACATGATTTATATGCTGCACCTCATACTACTTCTGGAAATGCAGAAGTTCTTGCAATCGGTCGCACTGGTTATGGTTTATATAAGGATGATTCAGCTAAAAATAATAATAATTCAGACTATGCTTTGTATCGGTTATTAACTTCAGCAAAAAAAAGGATTTATATAGCACAACAGAGCCTTAAAGCACACTTTAATACTTGGCCTTATGATACTACAAAGGAACAACACACTAACCTTATTAGTGCCCTAGCTAAACTTCTCATGGAAGCAGGCCATGTATATATTGTCCAATCTCCTTACAGTGATGCAACTATGATGGAATCAGGTTATTTATCTTTAGCCACCGATGAAGAAGTATGGAGTAAAATAAAAAGTGAAGCGATGGCAATGTATCCAGCATTAAAAGAAGATACTATTAATTTAAAACTATGCAATAAATTGCATATTTCTACAATTAGGTTCAATGAATATGATGACTTATGGACTGATAATGAAAAAATAACAGGCCATTATAAATTTATGATGGTAGACAAAGGGATGTTTTATGTAGGATCACAAAACTTTTACCCATCAGGATTACAAAACTATGGTCATATCATTAATAGCAAGAAAGCATCTAACATTATTAGAAATAGTTTCTGGCGCCCTCTTTGGAAATATTCATCTAGAACAGAATATATACCTGATCTGTGCAAACAAAATTAATAACTTCTGAGGCATATAGTCTTCGCCCTCCGTCACATGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAATCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTATCCTTGTATGACGTCTTGTGTTGCACTGCAAATTACGGAGGGCGAACATAATTAAAATAGAGGTCTGCGGTCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAATTTTGAAGACCGTGGGTACGCACATTATATACAAACATGTTATTTTGAAGAACAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAAAGACTCTTCAACCTCTTTACTATTGTTCGAAGCATTGAACCTACTTTCTTTGAAAATTTTAGGATTTGCTATACCCAGTACTATTCATCTCATCCAAGATCACAAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGACTTTAAAGTTTATCGACTTTGCCGAAGATATTTCAAGAATAACCCTTACTCGACTAATTTTAGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGAAATATATTAATGACTAGGAGTCAATTGATCTCTATTGATGTACCATGCTTTCGTCTTGCGCCTGAACTCGTACCCAGTAAATATCAAGATCACCTTGAGTTATTTTCCAAAGTATTTTCAAATAAAGATTTGCTTAGCCATGTATCTGAAAATACAATCAACCATTTTTATAATAATATAGGCTTAATAAGCTATGAGCTTTCTAGGCTATATCTTGATAATGTAATTGACAAAATAGAAAAAGATGGCTATCTAAAAAAATTAATAAACAAT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112 | Streptococcus_phage(26.67%) | tail,integrase,transposase,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
105294 : 151598
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038924|105294:151598|DBSCAN-SWA 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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038924|105294:151598|126089_126290_+|WP_129556699.1|DBSCAN-SWA MRKNLSFGDSYELIERPDGILIRPAKPIRAGWLEAAQTLKAEGMTEEEKMWANDGNNNDLEDEWEW >NZ_CP038924|105294:151598|133405_134467_+|WP_054300148.1|transposase|DBSCAN-SWA MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKVQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL >NZ_CP038924|105294:151598|119720_120278_-|WP_081377915.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038924|105294:151598|124799_125528_-|WP_054300202.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038924|105294:151598|108500_109247_+|WP_016211894.1|DBSCAN-SWA MAVILCGGEKGGTGKSTTSVNLAVMASLIGRNVALLDCDKQGTSRNFIDRRRDKGTLPTPDCYQISGKHVYKEIASLAERYDDVIIDAGGQDSVELRSSMVASELTLMISPVQASAFDLETLIKMDELVETSQVYNPKLNCKVLITRASTHVKIKKTDDAIAFVDELENINRCNSVVCERVAYQYASNNANAVVEYEKDLYSAMPAYKKKSYTPKASIEMCSLFKEAFGIEFNLNEFIDLEVPIKEAI >NZ_CP038924|105294:151598|123160_123610_+|WP_016212408.1|DBSCAN-SWA MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE |
60 | Streptococcus_phage(18.18%) | protease,transposase,integrase | attL 113734:113793|attR 137505:138476 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038924.1|WP_016212298.1|112635_112962_-|hypothetical-protein |
112635_112962_-
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_016212298.1|112635_112962_-|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_016212298.1|112635_112962_-|hypothetical-protein MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL |
108 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
||||||||||||||
NZ_CP038924.1|WP_016211913.1|117759_118881_-|hypothetical-protein |
117759_118881_-
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_016211913.1|117759_118881_-|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_016211913.1|117759_118881_-|hypothetical-protein MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS |
373 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
||||||||||||||
NZ_CP038924.1|WP_016212499.1|122160_122535_+|hypothetical-protein |
122160_122535_+
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_016212499.1|122160_122535_+|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_016212499.1|122160_122535_+|hypothetical-protein MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR |
124 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
||||||||||||||
NZ_CP038924.1|WP_016212398.1|141935_142397_-|hypothetical-protein |
141935_142397_-
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_016212398.1|141935_142397_-|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_016212398.1|141935_142397_-|hypothetical-protein MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF |
153 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
||||||||||||||
NZ_CP038924.1|WP_016212260.1|146834_147107_+|hypothetical-protein |
146834_147107_+
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_016212260.1|146834_147107_+|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_016212260.1|146834_147107_+|hypothetical-protein MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH |
90 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
||||||||||||||
NZ_CP038924.1|WP_016212257.1|147126_147351_+|hypothetical-protein |
147126_147351_+
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_016212257.1|147126_147351_+|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_016212257.1|147126_147351_+|hypothetical-protein MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK |
74 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |
||||||||||||||
NZ_CP038924.1|WP_032126838.1|147687_147891_+|hypothetical-protein |
147687_147891_+
Protein sequences of NZ_CP038924.1|WP_032126838.1|147687_147891_+|hypothetical-protein>NZ_CP038924.1|WP_032126838.1|147687_147891_+|hypothetical-protein MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI |
67 aa aa | NA | NA | NA | 105294-151598 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363297|38|NZ_CP038923|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 position: 140614-140651, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct Protospacer ********************************** *** |