CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038941	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP038937	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 chromosome, complete genome	3 crisprs	DEDDh,csa3,RT,DinG,cas3	1	2	27	34
NZ_CP038940	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	1	13
NZ_CP038939	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	6

1. NZ_CP038937

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038937_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038937_1
• CRISPR_location: 363106-363235
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038937_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038937_1

>1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038937_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038937_1

>merge|NZ_CP038937|1|363106-363235|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038937|1|1|363106-363235|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038937.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038937.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016212007.1|365227_366373_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038937.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038937.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038937.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038937.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038937.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016212010.1|364807_365104_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016212359.1|353608_353827_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_129556444.1|359325_359748_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP038937.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP038937.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038937.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038937.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038937.1|WP_016211795.1|357808_358003_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038937.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038937.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06
NZ_CP038937.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038937.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP038937.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038937.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038937.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038937.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038937.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038937.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038937.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37

Protein sequences

>NZ_CP038937.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038937.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038937.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038937.1|WP_129556444.1|359325_359748_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038937.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038937.1|WP_016211795.1|357808_358003_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038937.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038937.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038937.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038937.1|WP_016212359.1|353608_353827_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038937.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038937.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038937.1|WP_016212010.1|364807_365104_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038937.1|WP_016212007.1|365227_366373_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038937.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038937.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038937.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038937.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038937.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038937.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038937_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038937_2
• CRISPR_location: 689312-689432
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038937_2

Consensus_repeat	Method
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038937_2

>2.1|689349|47|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder
GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038937_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038937_2

>merge|NZ_CP038937|2|689312-689432|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

>NZ_CP038937|2|2|689312-689432|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG
AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038937.1|WP_016210671.1|695940_697200_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038937.1|WP_016210672.1|697814_699197_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038937.1|WP_016211759.1|682552_683740_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038937.1|WP_016210943.1|679514_680201_+|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038937.1|WP_016210944.1|677833_678853_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038937.1|WP_016210677.1|699189_699804_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|180312
NZ_CP038937.1|WP_032126312.1|684889_685684_+|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038937.1|WP_016210676.1|693403_695485_-|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038937.1|WP_052047041.1|690933_691197_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016210942.1|678899_679511_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038937.1|WP_098082812.1|691429_691945_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_051307363.1|686352_686535_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_016211756.1|683985_684711_+|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038937.1|WP_016211905.1|690254_690665_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_054300282.1|687469_687934_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038937.1|WP_016210935.1|680197_680740_+|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038937.1|WP_016210678.1|692089_693100_-|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP038937.1|WP_016210673.1|697332_697806_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_075275117.1|689588_690011_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_129556590.1|685680_686076_-|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038937.1|WP_016211759.1|682552_683740_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038937.1|WP_016210943.1|679514_680201_+|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038937.1|WP_016210944.1|677833_678853_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038937.1|WP_016210677.1|699189_699804_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP038937.1|WP_032126312.1|684889_685684_+|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038937.1|WP_016210672.1|697814_699197_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038937.1|WP_016210942.1|678899_679511_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038937.1|WP_016210671.1|695940_697200_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038937.1|WP_016210676.1|693403_695485_-|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038937.1|WP_016211756.1|683985_684711_+|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038937.1|WP_054300282.1|687469_687934_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038937.1|WP_016210935.1|680197_680740_+|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038937.1|WP_016210678.1|692089_693100_-|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP038937.1|WP_129556590.1|685680_686076_-|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47

Protein sequences

>NZ_CP038937.1|WP_054300282.1|687469_687934_+|IS630-family-transposase
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038937.1|WP_051307363.1|686352_686535_+|hypothetical-protein
MYIKHCKLPENKQIELMKYFIADSTTRTAADLADIHRNTAIRFFHKLREKIALKQQNRSE
>NZ_CP038937.1|WP_129556590.1|685680_686076_-|nucleic-acid-binding-protein
MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
>NZ_CP038937.1|WP_032126312.1|684889_685684_+|M48-family-metallopeptidase
MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL
>NZ_CP038937.1|WP_016211756.1|683985_684711_+|M15-family-metallopeptidase
MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN
>NZ_CP038937.1|WP_016211759.1|682552_683740_-|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP038937.1|WP_016210935.1|680197_680740_+|acireductone-dioxygenase
MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD
>NZ_CP038937.1|WP_016210943.1|679514_680201_+|acireductone-synthase
MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP038937.1|WP_016210942.1|678899_679511_+|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG
>NZ_CP038937.1|WP_016210944.1|677833_678853_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
>NZ_CP038937.1|WP_075275117.1|689588_690011_+|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038937.1|WP_016211905.1|690254_690665_-|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038937.1|WP_052047041.1|690933_691197_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP038937.1|WP_098082812.1|691429_691945_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038937.1|WP_016210678.1|692089_693100_-|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038937.1|WP_016210676.1|693403_695485_-|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038937.1|WP_016210671.1|695940_697200_-|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038937.1|WP_016210673.1|697332_697806_+|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038937.1|WP_016210672.1|697814_699197_+|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
>NZ_CP038937.1|WP_016210677.1|699189_699804_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase
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Crispr_ID: NZ_CP038937_3

• CRISPR_ID: NZ_CP038937_3
• CRISPR_location: 1621590-1621696
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038937_3

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038937_3

>3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038937_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038937_3

>merge|NZ_CP038937|3|1621590-1621696|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP038937|3|3|1621590-1621696|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

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NZ_CP038937.1|WP_016210748.1|1611419_1613375_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP038937.1|WP_052047040.1|1622727_1623666_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038937.1|WP_016210749.1|1610659_1611121_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_098082828.1|1622400_1622658_+|transposase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038937.1|WP_032126362.1|1616177_1616543_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
NZ_CP038937.1|WP_016211834.1|1618687_1619002_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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NZ_CP038937.1|WP_080664871.1|1616974_1618597_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223732
NZ_CP038937.1|WP_016212182.1|1614054_1614240_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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NZ_CP038937.1|WP_051307338.1|1623691_1625257_-|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038937.1|WP_016210799.1|1628178_1629132_+|chemotaxis-protein-CheV	gnl|CDD|223905	COG0835, CheW, Chemotaxis signal transduction protein [Cell motility and secretion / Signal transduction mechanisms].	4.08417e-34
NZ_CP038937.1|WP_016210748.1|1611419_1613375_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP038937.1|WP_052047040.1|1622727_1623666_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24
NZ_CP038937.1|WP_032126362.1|1616177_1616543_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08
NZ_CP038937.1|WP_016210795.1|1631045_1632017_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP038937.1|WP_080664871.1|1616974_1618597_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	gnl|CDD|223732	COG0659, SUL1, Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) [Inorganic ion transport and metabolism].	7.37206e-122
NZ_CP038937.1|WP_016211836.1|1619538_1620027_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP038937.1|WP_051307338.1|1623691_1625257_-|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.15465e-34
NZ_CP038937.1|WP_075273327.1|1615656_1616232_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP038937.1|WP_016212185.1|1614573_1615563_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP038937.1|WP_016210800.1|1625466_1626294_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.60773e-43
NZ_CP038937.1|WP_051307339.1|1630133_1630940_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	3.41626e-38

Protein sequences

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>NZ_CP038937.1|WP_051307365.1|1619258_1619519_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP038937.1|WP_016212185.1|1614573_1615563_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
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>NZ_CP038937.1|WP_016212182.1|1614054_1614240_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP038937.1|WP_016210748.1|1611419_1613375_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
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>NZ_CP038937.1|WP_016210749.1|1610659_1611121_+|hypothetical-protein
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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NZ_CP038937_3	3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	1621628-1621658	31	CP020755	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence	498805-498835	8	0.742
NZ_CP038937_3	3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	1621628-1621658	31	NZ_CP021062	Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence	129826-129856	8	0.742
NZ_CP038937_3	3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	1621628-1621658	31	NC_020385	Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence	309123-309153	8	0.742
NZ_CP038937_3	3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	1621628-1621658	31	NC_018492	Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence	56616-56646	8	0.742

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

134. spacer 3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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135. spacer 3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 3.1|1621628|31|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	46	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	tRNA,tail,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 301858	49	Acinetobacter_phage(40.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	329433 : 374988	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447599 : 550111	97	Escherichia_phage(36.67%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	594262 : 645407	52	Staphylococcus_phage(37.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	653494 : 687934	37	Catovirus(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	716574 : 824046	101	Escherichia_phage(35.0%)	integrase,protease,transposase,tRNA	attL 733188:733247|attR 739416:739703
DBSCAN-SWA_10	913258 : 965317	45	Agrobacterium_phage(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	1027227 : 1108834	82	Staphylococcus_phage(35.29%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_12	1129504 : 1256853	119	Staphylococcus_phage(17.65%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1299573 : 1531352	224	Staphylococcus_phage(10.34%)	integrase,protease,transposase,tRNA	attL 1365258:1365317|attR 1532119:1532409
DBSCAN-SWA_14	1560974 : 1623666	55	Bacillus_thuringiensis_phage(14.29%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_15	1633974 : 1678193	45	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1706219 : 1745061	31	Staphylococcus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_17	1755326 : 1855222	96	Staphylococcus_phage(20.0%)	integrase,protease,transposase,tRNA	attL 1825738:1825797|attR 1860222:1860302
DBSCAN-SWA_18	1882072 : 1941182	55	uncultured_Mediterranean_phage(30.77%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_19	1977996 : 2064419	84	Bacillus_phage(15.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_20	2100264 : 2213569	94	Vibrio_phage(13.33%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_21	2243025 : 2351142	115	Acinetobacter_phage(11.11%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_22	2365571 : 2484250	107	Bacillus_phage(13.33%)	integrase,transposase,protease	attL 2393262:2393321|attR 2430040:2430550
DBSCAN-SWA_23	2492111 : 2539640	41	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_24	2575070 : 2628254	52	Prochlorococcus_phage(33.33%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_25	2665333 : 2804317	139	Escherichia_phage(32.14%)	integrase,transposase,plate,tRNA	attL 2770273:2770332|attR 2784058:2784249
DBSCAN-SWA_26	2916879 : 2960277	41	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_27	2991962 : 3109388	111	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038937|45566:89679|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGGGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAATTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAATATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
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WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
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WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038937|136473:178470|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211637.1|137949_139362_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126550.1|139854_140862_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038937|182276:239530|DBSCAN-SWA
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MAWLELKVITTRQHAELIGDYLNEVGALAITLRDGKDQPILEPGVGETPLWQDVHVIALFDAGIELEPVREQLLVQFDELNDISVKIDPLEDQDWTATWREHFEPMLFADRLWVHADWHEVNARENQVKMLLNPGLAFGTGTHPTTAMCLNWLAGHLNPGSRVIDFGCGSGILAIAALKLGAHYVHCIDIDPQALEAMHYNAKQNELDPSCYQAVLPEQFTISDITSTGADVLVANILANPLIGLAPQFASLVKAGGMLVLSGILVEQAERVQTAYLDHFDLVELQQDDEWVCVIAQRKAY
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MPNCQSDYLDLIYQKILNTQRTGIGNCVQAANRVSHLLNTGTDLTESYLQRLPRISKKQFFYHFKDGEAPLKALMHTLNEGQHVQVSADIAHLTCINHVFNAIKLEGEIKLIDNYQTWPNPPWLQQAWYHPKEFLTHLTH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016210779.1|186290_187220_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210775.1|187512_188106_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
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WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|229340_230036_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038937|256927:301858|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211358.1|259577_260039_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|260462_261944_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
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WP_016211354.1|263213_265175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|265704_266109_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|270449_271602_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210128.1|331180_331444_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210132.1|331810_332629_-	kinase/pyrophosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556442.1|332701_335074_+	phosphoenolpyruvate synthase	A0A1V0SGR7	Hokovirus	2.8e-160	35.3
WP_016210125.1|335786_337214_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210131.1|337248_338271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210140.1|338287_338665_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126491.1|339022_339340_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210122.1|339506_340199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038937|447599:550111|DBSCAN-SWA
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MFKIGNYEISRENKPFIIAEMSGNHNNSLDRALEIVEAAAKAGADAIKLQTYTADTMTLDVDKDDFKIMDKNSLWYGQHLYELYQQANTPWEWHETIFNKAKELGILCFSSPFDSTAVDFLEELNAPAYKIASFENKDVNLIRKVAKTGKPVIISTGMASLADLHLITETLRESGCTNFILLKCTSAYPASPADANLVMMARMGEIFDCQVGLSDHTMGVGVPIAAVALGATVIEKHFCLSRKEGGVDADFSLEPHEFSVLVEEAKKAWQSIGSISYQLPVAEEKSKQFRRSIYFVKDMQSGEVITEECVRCIRPGYGLEPQYWDKVIGCKVRRKVVTGDRVEWECLEF
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_122940481.1|452048_453020_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
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WP_016210649.1|458469_460458_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|460666_460822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|461079_461379_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461537_461873_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210501.1|464213_465200_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465202_466357_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466353_467049_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467183_468674_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468694_469744_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469810_471205_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472083_474015_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
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WP_016210495.1|474821_475181_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475600_476596_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476608_478990_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|478995_479283_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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WP_032126626.1|485689_486382_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
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WP_016210484.1|490059_491817_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|492365_493124_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|493331_493904_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|494007_494556_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556451.1|497097_497355_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556452.1|502454_502802_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212146.1|502804_504544_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212070.1|507267_507867_+	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275013.1|509047_509269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300501.1|509353_510082_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_032126794.1|510093_510486_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212477.1|510482_510728_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300307.1|511831_512560_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
WP_054300307.1|513166_513895_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
WP_016212268.1|514539_515124_-	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_016212269.1|515127_515811_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|516093_516822_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_052104629.1|517158_518184_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212159.1|518327_518525_-	antirestriction family protein	A0A222Z017	Rhodococcus_phage	4.1e-09	55.7
WP_016212158.1|518792_519707_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275019.1|519816_520521_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.2e-43	44.3
WP_105962625.1|520484_521371_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126534.1|527077_527593_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_016212084.1|527592_528609_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|528890_529865_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	5.2e-28	31.9
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WP_075274956.1|532096_532465_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210580.1|533557_533818_-	methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210574.1|533958_534378_+	prokaryotic dksA/traR C4-type zinc finger family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126278.1|537157_538141_+	SPOR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126276.1|538783_540151_+|protease	ATP-dependent protease ATPase subunit HslU	A0A173GFL6	Erwinia_phage	9.5e-44	30.1
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WP_016210578.1|541983_543648_+	ubiquinone biosynthesis regulatory protein kinase UbiB	E5ERK4	Ostreococcus_lucimarinus_virus	7.1e-33	28.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038937|594262:645407|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038937|653494:687934|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556590.1|685680_686076_-	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038937|716574:824046|DBSCAN-SWA
CATGTCTGAGGTGGCCCAGGCGTTAGAAATTATCAAACGCGGTGTAGATGAGATCATTGTTGAAGATGAGTTAGTTAAAAAATTAGCAGCAGGGACGCCTTTGCGAGTGAAATTGGGTATGGATCCAACAGCAGCCGACTTACACTTAGGCCATACGGTGGTGTTAAATAAAATGCGTCAGCTGCAAGATCTCGGGCATGAAATTTTATTTTTAATTGGTGATTTTACTGCAACTATTGGTGACCCGACAGGTAAAAATATCACTCGCCAGCCCTTATCTGCTGAGCAAGTTGAAAAAAACGCAGCGACGTATACATCACAAGTATTTAAAATCCTTGATGAAGATAAAACACAGATTCTGTTTAATTCAGAATGGATGGGCCAAAAAACTGCAGCGGATATGATCGCGTTAGCCTCAAGTTATACGGTGGCGCGTATGCTTGAGCGTGATGATTTTGCTAAGCGCTATGGCAATAATCAACCGATTGCGATTCATGAGTTTATTTATCCTTTGGTTCAGGGCTATGACTCTGTTGCTATGAAAGCAGATATTGAGCTTGGTGGCACGGATCAGAAATTTAATTTATTGATGGGACGTGAATTGCAACGACAATATGGTCAGCGCCCGCAGACAATCATTACCATGCCATTACTGGAAGGTTTGGATGGTGTGAAAAAAATGTCTAAATCTTTAGGGAATTATATTGGTATAGCAGAATCGGCCAGTGAGATGTTTGGCAAAATGATGTCTGTTTCTGATGAGTTAATGTGGCGCTATTATGAATTGCTGAGTTTTAAGCCGATGGCAGAGATTAAAGCCTTAGAGCAAGCTGTGGCAGAAGGCATGAATCCACGTGATGCAAAAGTTGCTTTGGCCAAAGAGATAGTCGCGCGTTTTCATTCAGAACACGCTGCAGCGGCGGCGTATGATGAATTTGTCAATCGTTTTAAAAAAGGGGTGTTGCCTGAAGATATGCCAGAAGTGACTGTCGCTACCGGTGGTGAGATGGCAATTGGCAATATATTAAAAGCGGCAAACCTCGTGGGCAGTACGTCTGAAGCGATACGGATGATTCAGCAAGGGGCTGTACGCATTGATGGTGAGCGTGTTGAAGATAAGAGCCTTGTTATGCTTGCAGGTGCAGCTTATGTTATGCAAGTGGGCAAACGCCGTTTTGCCCGTGTTAGCTTAATTTAGAATGAGACGAGGAGGCTGTGATGAAAAAGTGGCTAGGAATCTACGCTTTTTTTATGATGGCACCTATATTTGCTAGTACTGGCCCTTATGTGCAGAGCCAGGTTGGTTATGGCAAATTGGCAACTGGCTCGGCGAATGGATTAGACCATCATTATGGTGGCTTGTCAGGTCGTTTATCTGCAGGGTATTTATTTGGTGGACGACAATTACGCTATGGTGCTGAGCTTGGTTTGGCGAGTTATGCGAGTAGTTGTTATCAATCTGCAAATACCAGCTTAACTTATCAAGGTGCCTCGGCAGATTTATTAGGCGTGTTATCTTATCAATTGGGTGCACGTTGGAATGTTTTTGGCAAGTTGGGCTTGGCTTATATCGACCAGCAAACAGAGGGCAATTTATTTCCCAATCAGTTGGATTCTAGTAATGCGCTACAGCCTAAAGTTGCTTTAGGCTTGGGTTATTCGTTGACAGCTGCGATTGGTGTCAATCTATCTTATAGCCATACTTTTGGTGATCAGCCGGAAGGGTTAGCTAAAAACGCTGAACCAACACCTGTGATGTTAAATAAGGTGGCTAGCACGGATTTATTATCATTTGGTTTATCCTATCGGTTTTAATCGCTTTAGTATTTAAAAATAATGATCAGCAAAAAGTAGAATATTTTGGTTAAGCGTTTTTGCTTTAGGGTATGAAAAAGAAGAAGCGACCTTGGGGTAGAAGATCGCTCCGTCTAGGGGTGTACGGCTTTGAGTGATAAAGCCTATATCTAAACAATAATCATTATCATTTATTCTGTCAAGACTTTTTGTTAAATATGCTAAATATAAGTTACAAAGTATAATGATCCTAATAGCAATTTTTCTGCCTTCATAAAAATAGAGCCTTATATTTCAAATAATTATATAAATAATTTTAAATAGGTTATATAAAGAGGCTATAAATAAATTGCTACTTTGATGAGCTGAGTAGCACTGTATAGCTGAGTGAAACCATAAAAAAGCCCCGATAATCTAGGGGCTTTATTTGTCAATATTGATCGTAATAATAATGAAATTGTGATTTAGTCGCGGCCAGAGAATGCAGCAAATATTTGCAGAAGGCTCATAAAGAGATTCACAATATTTAAGTACAGGCTCATGGTAGCCATAATATAATTAGTCTCACCACCTGAGATAATACGTTGGGTATCCCAAGCAATAAAGCCAGCAAAAACTAATGCGGCGATGATGCTAATGGCTAACTGTAGGGCAGGTAAGTGTAAAAACAGGTTAAGCAAGCTGGCAATGACAACGACGATTAGCCCTGCCATCAAGACGCCACCTAAGCGTGTAACGGCTTGAGGTTTGGCGATTGCAAGGGCTGACATTACAAAGAAAGTCACTCCTGTTGTTGCCAAGGCACTTAAGACTAAGGCGCTGCCATTACTGAATTGGGTGATATAAAAATTAAGTACAGGGCCAAGTGCATAGCCAAAAAAGCCAGTAAAGCCAAATAAAGTGACGATACCCCAGCTGCTATTACGTAGTTTCATCGTTGCAAACAGCAAGGCGAAACTGACAATTAAATTTAGAATTGGATTGACGGGAGTTGCATGGTTCACTAAAGCCCAGCCAGCGGTTGCGGCACTGAACAATAGTGTTAAAGAAAGCAAAAAGTAGGTGCTTCTTAATACCTTATGGTTGGCTAACAGCGAGGTATTGCGCTGAACTGTTGACTGCTGTTGATACATATAAGATCCTCTGTTTTAGTCATCACCCTATAAGATAAGGGCGTAAATATAAAAAGCAAGAGATAGATAAGCTGACGTGTTAGGTTAAGTTTATAATTGAAAGATTGAGAGTTAGGCTGTTGATGGGGCTTGGGAAGGCGGTTAGCGTTCCCAATAACTTTCCTCGAGGCTATCTTCACGGTCAGGAAGACCACGTGAGAGTCGCGTAGCATTTTGCGCAAGGACCTCATAACTTACACGGTTCGCATATTTGCAGACTTGGGAGAAGGATGAATAGGTCAGATAAGGTCGATCGTGTTTGCTTGAATTAGGCAATACGGTGTGATGGTAATGATTGGCAGCAATATCATGAAAGAGCGCAGCTAAGGCACCATCTCCAGCCCCATTGGTATTGTGAATTTTTTCAGGACCGCCCATATAGGGATTAATATGCGCGAAGACTTGTAATGGGTTTTGGCAGTCGGCTTGACGCATTGGGCGGCTGAATTCATATTCGTTAAAGTTGCTGATGGTGCCAGAAAGAAGTGGGTTGGAGGTGCGACGTGCTGTAGCTTGATCCGTATAACCGCTTAGGTATAAGCCTTGTGGGCCAACCGTGGTGAGGACTAAGTCAGTAATCTCTAGGGCTGCTCGACTGGCGAGTAAGGGGTCTTTATGGCCGGTGAGAGCATAACCTTCATCTTCATTCATGGCGATAATAGAGACATAGTCTTTAATAAAATCATAGAAAAATGATTGTTTTTCATTAATTAAAAACTGGGTGCCTAAGGTTAAGACAGCCGGAATGTGGTGCTTTTTAGCAAGTTCTACCGCCTTGAGTGTCGCTTTGAATATGGGTAGGCTCTCATCACGCAGAATATAACTAGAAATGCCTAATAGGACCGTCTTTTGAATGATTTCTTCATTAATATAGTCGGCAGTCAGCTGATTCATGACGCCGGAGTTAATACCAAAACTGCGCTCACCATCGGGGGTGATCAGTGTGATACAACGGCCAATGGGTCCATCAACAGGTTGTAAGTGGGTTAGATCAACACGACTGCTAGTGTTACACAAGTAGCGATAGGCAGGATCTTGCATGCTAATGGTTTTACTCATAACGCCGAGCTGCACAGAGATATCATCAGCGAGAACCGAATAATTATGCAGACTATTGCCGATGGTGCCACCAGCGTATTCGCTGATAATTAATTTATTACTTTTTAAATAATTGTATAAGTTGTCGGCGGTTTGGTCATCAATGAGGAGAGATTCGCCTTTTTGTAGGCCATACTCGCCCAGTAATGATTCATCGACATGGGCTTCAATATCGACAAGCACTTGTGCGATACCGGTGATATAGGTATTACCACGCTTGCTAAAGGACGGGTGCTCACAATTGGTTTTGCCACGAGAGTTGATAGGAAAGTAATGTTTAATTTTGCGTTTGCCTGGAAAGCGCATGTGCTTCCACCCTTAATCTATTTAATCTTAACTATGGAGTTATGTGCATAAAAGCTAGGCATTTTATAATGATTTGGCCAACTTGAGAAGGGATATTGAAAATACTTGGTCAGAGGTTATGCGTTGGAGCTGACTATAACCTCTTTAAATTATTTATTTTTCTATTTTGATTTTAGTGTGCTGGTCTTTAAATACTTATGTTAAAGGCGTAATATTATTTGAGGAATGGAATCTTAAATTAGGAGATGAAGGATTTATGCTTCATTTTATTCGAAAAATTGATTCTGGTCGGTTTGGTAAGGTCGTTTTGGTTGGTGGTAGCGCTGGAGGCCAATTTGCAGTGAAATTATTTCGCCAGCAACATGATCAGCCTGGTCGCGTGAGCACCTCGGCGCAACTTGAGGTCGCTAATTTCAATAGTTTCTCTCATAGAATTCAAGATATTGGGCGGGCAGAGGTGGTAGATCTGACTGACATCCAAGGCTTAACCGCTGGTGATCTTGATAACTATTGCTTAGAAGCTATGCTGATGCCACTTTTTCAAAACGAACGTGAAGTCCGTTATGAAGAAATACAGCCATACCTTGCTAATTTAGCCGAGCGTAATTTTTTTATGGGTGACCCTAAGGC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MLSTPWLAAWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210073.1|721199_721931_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210051.1|722355_722760_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210069.1|723000_724083_+	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.6e-20	27.5
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WP_016211874.1|729697_731416_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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733188:733247	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_032126389.1|735991_736180_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212230.1|737713_739162_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377879.1|739217_739442_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.2e-07	46.2
WP_075274946.1|739663_740107_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
739416:739703	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016211326.1|742468_743209_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211325.1|745448_746969_+	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.3e-85	38.9
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WP_016211722.1|749770_753073_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
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WP_075274943.1|755279_755804_-	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
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WP_032127022.1|757304_759491_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
WP_075274942.1|760167_760896_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	43.1
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WP_016210616.1|773539_776350_-	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210625.1|776598_777345_+	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
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WP_051307334.1|778349_779129_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210618.1|779395_780445_+	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|780509_781934_-	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
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WP_016211050.1|790478_791186_+	dethiobiotin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211051.1|791148_791652_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
WP_016211047.1|792013_793648_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049878.1|793726_794302_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|794344_795073_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_155049879.1|796310_796712_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|796680_797409_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211625.1|797892_798762_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_016211621.1|798758_800108_-	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	4.6e-75	37.0
WP_016211623.1|800220_801861_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211987.1|803682_805419_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
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WP_129556671.1|805922_806651_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_098082825.1|806714_807023_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MKIFLVGGAVRDELINYPTEDKDWVVVGSTPEKMIKQGYHPVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKTAQGYHGFTIHADPSVTLEEDLMRRDLTINAMAKDHHSKIIDPYHGQHDIKNKLLRHVSPAFSEDPVRILRIARFLARYHHLGFTIAAETRTLMAQMVQAGEVNTLVPERVWQELSKALHEKSPSAFFSTLEQCGALKILFPEIAALINQVKDTAWEPQCNLWSHFLNCLDQQEKPQIRFASALKTSYYSKQSNLKSLIQRLRIPKSFSSVMLTTAQLHPIYYSLPKQNAAQILDLLNQLSAFKNTQQLNNFADSCNLNLNLNQLSDHKEKLQHYIKIVESINPDEFIQQGLQGAQIGTAIQEKRLALIKGSRKK
>NZ_CP038937|913258:965317|941660_942578_+|WP_016212140.1|DBSCAN-SWA
MSTDVKTKQGIIYAILGYGLWGLSPIYYKQIMQIPALEILANRIIWSCVLLAIISLLLKQLTEVRKVLTQKNKVIFLFFSTLFLACNWLIYIWAVNNDHVLETSLGYYVNPILNIILAMVILKERLRVWQWFAVALVVMGVLIQIIHYGSLPWVSLGLAFTFGCYGMLRKKLGLAAVTGLLCETALLTPFALIYLHFFDYSATANFIENTTSMNVLLMLAGVVTVIPLLGFTAAATRLKFSILSFFQYLTPTILFIIAVTLYGEKLTLSLIITFFFIWLALVVLAIEGLARSRARGGLSQSKSAV
>NZ_CP038937|913258:965317|933133_933451_+|WP_016210871.1|DBSCAN-SWA
MSAWGFLFLGGLLEISGIICLKLSDGFKKRLPTLLMVIQMGLSLYVLSHVFGVIPVGTAYAVWTGIGAVGIALVGMVYFNESKDWPRLVCIALIISGVIGLKLTS
>NZ_CP038937|913258:965317|914743_915277_-|WP_016211058.1|DBSCAN-SWA
MIADYTRDSQAAPNSSLQGFSLIEVLIVLTLLSSLILLSLPTLFHLKEQQIHQQAASQLEQLIKLGREQALYQQNTVTLCPTANQTHCHTNWQLPLMLFLDQNQNNQRDHEEPMITTFTLPHSIQLTWNRGNHLSFYGASGIAASNGTLSFCTPQLSRQFILNRQGRLRQTTQPCTF
>NZ_CP038937|913258:965317|943129_943276_-|WP_016211373.1|DBSCAN-SWA
MFFSTVSKEGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_081007050.1|913258_913786_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|913842_914208_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211061.1|914269_914623_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211058.1|914743_915277_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126660.1|915415_917053_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	5.8e-88	38.2
WP_016211065.1|917057_917279_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211066.1|917376_918390_+	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211063.1|918552_920781_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.0e-82	35.0
WP_032126658.1|920761_921466_-	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_017377041.1|921700_922030_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|923110_924172_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|924198_924441_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|925159_925843_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|926036_926594_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_075274927.1|927357_928419_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|928491_929445_+	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210878.1|929945_932675_+	kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|932777_933137_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|933133_933451_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|933467_934577_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210882.1|934603_935689_-	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210874.1|935811_936852_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210873.1|936866_937517_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210876.1|937584_938427_+	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016212197.1|938892_939810_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|940828_941023_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|941099_941393_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|941660_942578_+	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|943129_943276_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|943330_944521_-	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211370.1|944653_945097_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|945139_946183_-	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211368.1|946229_947621_-	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|947817_948741_+	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211372.1|948727_949585_+	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|955681_956827_-|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_054300173.1|956905_957967_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211408.1|958190_959537_+|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_016211412.1|959651_960644_+	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_016211411.1|960647_961145_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|961141_961981_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|962013_963546_+	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|963705_964041_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|964196_964469_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|964480_965317_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP038937|1027227:1108834|DBSCAN-SWA
ATTATTTTACACGCATGCCGGGCAGTGCGCCCTCATCGGGGTTAAGAATCCAGAGGTCCTGACCACCAGGCCCTGCGGCAAGGACCATGCCTTCTGAAACACCAAAACGCATTTTGCGTGGCGCCAAATTGGCAACCATGACAGTGAGCTTACCTTCCAGCGCTTCGGGCTGGTAGGCTGATTTAATACCGGCGAAGACCTGACGAGTTTCACCGCCTAAATCGAGGGTGAGTTGTAATAATTTATTGGCTTCTTTGACATGCTCGGCTTTAATAATTTTGGCAATGCGCAGGTCAATTTTGGCAAAGTCCTCAATCGTAATTGTGTCTGCAATCGGTTCTTTATGTAATGGGTTGTCTTTTGGGTTATTTTTATCACTGTTAATTGCAGCCGCTGTGTTTGCAGTAATATTCGCTTCTTTGGCGAGCTCTTGCTTGGTTTCTTCAATGATCTTGTCGATTTGAGCAGTTTCAATACGTTTCATCAATGGCTTAAAGGTGTTGATGGGATGATTTAATAACGGCTGTTGGCTGTCTGCCCAGCTGAGTGAATCGATATTTAAAAACTCTTCTGCATGTTGGCTTAATTCCGGTAGAACCGGTTTTAAATACAAGGTTAGCAAGCGGAACAGGTTAATTCCCATCGAGCAGACTAAATGGACTTTGTCTTCTTGACCGTCTTCTTTAATTAGTTGCCACGGCTTATAGTGATCGATGTATTGGTTGGCTTTGTCAGCTAAGGCCATAATTTCACGCATGGCAAAAGCAAAATCACGTGATTCATAGTACTTGGCAATTTTTTCAGCCTGAGCACTAAATTCATTAAATAAATCAAGATTATCGAGCGTTGTCGCCAGTTGGTTGTCAAAGCGCTTTTTAATAAAGCCAGCACAGCGGCTAGCGATATTAACGACTTTGCCGACTAAGTCTGAATTAATCCGTTGCGTAAAGTCTTCCAGGTTTAAATCAATATCATCAATACGACGACTCAGCTTTGCGGCGAAATAATAGCGCAAATATTCGGAGCTTAGGTGATTTAGATAGGTTCTGGCTTTAATAAAGGTGCCGCGTGATTTAGACATTTTCTGGCCATCCACGGTGAGCATGCCGTGAACAAAAATATTACTGGGTTTACGAAAGCCTGCGCCTTCGAGCATTGCTGGCCAAAATAAGCTATGAAAGTAGACGATGTCTTTACCGATAAAGTGATAAAGCTCAGCCTGGTCGTCGTGCTTCCAAAACTGATCAAATTCCAGATTTTTTTTCTTGGCAAAATCCATAAAACTCGCCATATAGCCGACAGGTGCGTCGAGCCACACATAAAAATATTTACCCGGTGCGTTAGGGATTTCAAAGCCAAAATAAGGCGCATCGCGCGAGATATCCCAATCATTTAAGCCACTGTCAAACCATTCGTTAAGCTTATTGGTAATTTCTTCTTGCAGGTGGCCTTGTTGAATCCAGTCTTTGAGCATATTTTCATAATGAGTGAGCTTAAAGAAATAATGCTCAGATTCTTTTTCTATCGGTGTGGCGCCAGAGACTACAGAAACAGCATTAGTTAAGTCACAGGGGCTATAGGTTGCCCCGCAGACCTCGCAAGAATCACCGTATTGATCTGCCGCATTACATTTAGGGCATTCACCTTTGACAAAACGGTCGGGCAAGAACATGTTTTTCTCAGGGTCGAAGGCTTGGGTAATCGTCCGCTTTTCTATGTCGCCATTGCGTTCTAATTGATTATAGATTTCAAAGACCAGTTCTTTGTTCTCAGCGCTATGGGTGGTGTAGAAATTATCAAAGCTGATATTAAAGTCGTTAAAGTCTTGCTCGTGTTCTTTGGCAAAACGAGTGATTAATTCTTCTGGGGCAATGCCTTCTTTTTCTGCTCGTAGCATAATCGGTGTGCCGTGAGCGTCGCTGCCACTGATTAAATAGCACTCATGGCCACGCATACGTTGGAATCTAGTCCAAATATCTGCTTGAATTGCTTCGATAATGTGACCTAAGTGAAGTGAACCATTGGCATAGTATAGAGCAGTAGTTGCTAATATTTTGCGTTGCATGACGTTGTGGCACCTAAATGAAATTTGAAATTATGCGTAAATTTGTTCATATTGTTTTAAAATTGCAAGGCACAATATAGCATGTTTTTAGTTAGGCGATAAGCCTCCGACTAAGCGTGCTGTTGCTTAGAATCAATTTAGAATCAATGAATTTTAACTGAACCAGTATTTTGCTCGCTTATAGTTTTTCGTAATAACAAGCTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCATGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATACTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCGACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTAACAAGGACTAATTGTTGTATGGGCTTTATTGACCCGCAAACTTTAGATTAGCAAGCTCTAGTTTTAAAGTTATATGTTGAGTTTTTGCTTATATTTTGTTAGGGTTTGGCCGTTTGTGTCAAAAATAAGGTCGCCTGTACGATGAGTGATTTATCTGTGTCTTCTGAGTCTATTGCCTTGTCCACAAGAGCTCGGCCTATAAAAGCGTGGGCTATTAGTTTGGTGGGAGGCTTATTCTTTTTTTATGAATTTATTCAGATGAATATGTTTAACTCGCTGGCAGGAAGCTTAGCTGCTACGTTTCATTTATCGGCTTTTCAAATTGGTTTAGTCTCAGCATTTTATTTTTTGGCTGATTCGATATTGCTTTATCCTGCGGGTGTGTTAGTTGATCGGCTCTCCTCACGCCGTGTGATTATTTATGGTATGGTCATGTGTATTATTGGCACCTTATTGATTGCCAGTGCCAGTAGTTCTTGGTTTTTAGTGGTGGCGCGCTTTTTAGAAGGCATTTCGGCCGCTTTTTGCTTACTTAGCATCTTGCGATTGGCCTCTCAATGGCTGCCTGAAAACCGTATGGCAACCGCATCAGGTTTGATTGTTACGATTGGTATGTTGGGTGGCGCCGTTTCACAAACGCCTTTAACGATGATGATTGAACAGTGGGGGTGGCGTGAGGCGCTTTATGTGGTTGCATTGATCGGTGTGATCTTGCTTGTGGTTGTTGTTATTGTTGTTAAAGATGCGCCAACCGCTAAGCAGCATGCTAAGTTGCAAACGGCAGCAGATAAGGTTGGCTTTTGGCAAACACTGGTTATTTTGGTTAAAAACCCACAGAACTGGCTGATCGGTTTGTATATTGCTCTTATGAACTTGCCAATTATGTTGCTGGGTGGCTTATTTGGTTCTCACTTTATGCAACAAGGTCATGGCTTTTCGGCCACTGAGGCGGCAACCATCAATATGATGATTTTTATTGGCACGATTGTTGGTTCAACGGTAGTTGGCTTTGTGTCTGATTTTTTAAAGCAGCGGCGTTTGCCGATGATTGTAGCCGCAGTGGTTTCATTGGTTATTTTCCTGATTATTCTTTATGCGCATGGTTTAACTTATGCAGATTATATCAGTTTATTTTTCTTGCTTGGCTTTTTTACTGCCGCCCAAATTTTGGGTTATCCAGCTGCACAAGCCTCAAATCCGGCGAAGATTGTTGGCTCAGCACTTGGCTTTGTTTCGGTGATTATCATGACTGCACCGACTTTGCTACAGCCTTTAACCGGTTGGTTGATGGGACTAGCGGGAGGACATCTGATAAATGGAGTGATGCAATACTCATTAATTAGCTATCAATATGCATTACAAATTCTTGTTATAGGCTTTGTGATTAGTATTTTTTGTGCTTATAAATTACCTGAAACGTATAAAAAATAATTGATTTATTGCGCGAAGGTATGGCTTGAGTGATTGTTAGGCGATGTTATTCGTTCATGCCTCTCCGTTTCTTAATAAAAACTTTGATGCTTCTTTCATTTGTTGTCTTTCGGCTGTGTGTTCGAAGAAAAACCAATTGCCTGTTTTGTGTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038937|1129504:1256853|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075275113.1|1139333_1141043_+	ABC transporter ATP-binding protein/permease	NA	NA	NA	NA
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WP_016210463.1|1143622_1143970_+	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
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WP_129556565.1|1149382_1149778_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300152.1|1152963_1153329_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209891.1|1155865_1156564_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
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WP_016209883.1|1169011_1170328_-	Na+/H+ antiporter NhaA	A0A2H4J5W3	uncultured_Caudovirales_phage	9.4e-65	39.9
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WP_016209878.1|1171598_1172537_+	signal peptide peptidase SppA	A0A2I6UGK8	Salinibacter_virus	1.9e-14	29.6
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WP_016209877.1|1173405_1174296_-	Rossmann-like and DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209894.1|1175133_1175625_-	Spy/CpxP family protein refolding chaperone	NA	NA	NA	NA
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WP_155046743.1|1182727_1182913_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126649.1|1184437_1185634_+	site-specific DNA-methyltransferase	A0A2L1IZ21	Streptomyces_phage	1.2e-42	33.5
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WP_032126840.1|1198952_1200950_+	flavohemoglobin expression-modulating QEGLA motif protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211036.1|1213945_1215817_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.7e-33	30.7
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WP_016211042.1|1218697_1219714_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
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WP_016210562.1|1242194_1243847_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|1243920_1244676_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300152.1|1246312_1246678_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|1247088_1248378_-	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211931.1|1248573_1249761_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016211473.1|1250271_1250871_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|1250945_1252295_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_032126518.1|1252377_1254579_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211478.1|1254595_1255411_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|1255390_1256110_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_129556556.1|1256277_1256853_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038937|1299573:1531352|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209437.1|1301025_1301547_+	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	G3MA90	Bacillus_virus	2.0e-10	34.2
WP_016209438.1|1301543_1302143_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_016209440.1|1302220_1303231_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.5e-06	29.9
WP_016209415.1|1303343_1304048_+	protein TolQ	NA	NA	NA	NA
WP_016209407.1|1304084_1304516_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
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WP_016209425.1|1307051_1307693_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126507.1|1307735_1308665_+	tol-pal system protein YbgF	NA	NA	NA	NA
WP_016209451.1|1308667_1309315_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	J9PV61	Bacillus_phage	1.2e-36	37.9
WP_032126506.1|1309365_1310169_-	AAA family ATPase	A0A0E3G5H5	Synechococcus_phage	8.9e-42	43.1
WP_016209417.1|1310350_1310563_+	SlyX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209423.1|1310566_1310800_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209422.1|1310861_1312442_-	exodeoxyribonuclease VII large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209426.1|1312643_1313573_+	ABC transporter ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	1.6e-13	30.3
WP_016209420.1|1313574_1314342_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126509.1|1314746_1315463_+	gamma-glutamylcyclotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209442.1|1315500_1315863_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209432.1|1316034_1317744_-|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209448.1|1318001_1319333_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209449.1|1319774_1321247_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1321420_1322395_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300152.1|1323068_1323434_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274897.1|1323674_1324541_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273512.1|1325053_1325398_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210519.1|1325387_1326155_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210521.1|1326390_1328328_-	his Kinase A domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210517.1|1329341_1330061_-	sulfate transporter CysZ	NA	NA	NA	NA
WP_032126504.1|1330174_1333714_+	chromosome segregation protein SMC	NA	NA	NA	NA
WP_016210525.1|1333780_1334599_+	ZipA protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210518.1|1334585_1336625_+	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	3.0e-126	40.8
WP_016210522.1|1336640_1337693_+|protease	protease SohB	NA	NA	NA	NA
WP_016210524.1|1337703_1338234_+	exsB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556549.1|1338772_1339658_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046739.1|1340543_1340684_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210010.1|1342328_1342505_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210017.1|1342680_1343064_+	hpt domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273518.1|1343139_1343433_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210016.1|1343599_1344559_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210020.1|1345159_1345315_+	putative membrane protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212485.1|1567943_1568477_-	IQ calmodulin-binding motif family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1569229_1569805_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211464.1|1572949_1573297_-	arsenate reductase (glutaredoxin)	NA	NA	NA	NA
WP_016211465.1|1573447_1574431_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-34	32.7
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WP_032126540.1|1580835_1581699_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211749.1|1581907_1583101_+	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_016211748.1|1583180_1584785_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211752.1|1584800_1585946_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
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WP_075273313.1|1586310_1586649_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211726.1|1593083_1593677_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274862.1|1593848_1594445_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046732.1|1594559_1594730_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300325.1|1594923_1595196_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211456.1|1595817_1596396_+	nucleoside deaminase	A0A0B5J096	Pandoravirus	2.2e-13	36.3
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WP_016211455.1|1596924_1598382_-	hypothetical protein	A0A1C3NFI8	Phage_NCTB	4.3e-10	24.8
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WP_016211454.1|1600681_1601152_+	DUF1289 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556641.1|1606053_1607316_+	cation:dicarboxylase symporter family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210751.1|1607403_1609209_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	5.8e-57	34.9
WP_016210752.1|1609692_1610490_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210749.1|1610659_1611121_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210748.1|1611419_1613375_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	K4NWI2	Pseudomonas_phage	9.2e-16	39.7
WP_016212182.1|1614054_1614240_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664871.1|1616974_1618597_+	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	1.9e-27	25.9
WP_016211834.1|1618687_1619002_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307365.1|1619258_1619519_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211836.1|1619538_1620027_+	protein kinase	A0A285PXS3	Cedratvirus	5.3e-05	32.2
WP_129556528.1|1621550_1621979_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_098082828.1|1622400_1622658_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_052047040.1|1622727_1623666_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038937|1633974:1678193|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038937|1706219:1745061|DBSCAN-SWA
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MPKLQWGSVEQESKEWEIAKLHLEGRSDGIKLKRSKEGAGQALYTDKDGKKHPLSHSFMNINGQIFALAGKGRILGQGTFGKVKLAEDE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075274822.1|1707441_1708416_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
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WP_075273327.1|1711794_1712370_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1712315_1712681_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274858.1|1712817_1713903_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274857.1|1715482_1716358_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126678.1|1716368_1717379_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
WP_016211554.1|1717705_1718332_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_016211557.1|1718377_1719607_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_032126677.1|1719801_1720365_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211555.1|1720439_1721798_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211664.1|1722334_1723063_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|1723435_1726255_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211669.1|1726409_1726760_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556522.1|1729868_1731101_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211405.1|1731307_1733080_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_016211403.1|1733215_1734259_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_016211399.1|1734272_1735016_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211398.1|1735162_1735450_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211732.1|1736054_1736753_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211734.1|1737174_1737444_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211731.1|1737459_1738566_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1738621_1739446_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
WP_075274856.1|1741201_1742227_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046730.1|1742445_1742586_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MLSTPWLAATESQIVAMLNEGQAGVKVEDICRQYGIAKSSYYKLRSKYQGMGVSDLQRLKELEDENRRLKQMYADISLEHNEMTPSLPTKTNLN
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MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075273327.1|1758053_1758629_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210103.1|1764721_1766080_-	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
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WP_016210111.1|1767141_1768776_+	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	9.7e-144	49.9
WP_017377579.1|1768782_1769619_+	3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase	E3T537	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.7e-51	41.3
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WP_016210106.1|1771341_1772433_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA
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WP_016210110.1|1774265_1775021_+	5'/3'-nucleotidase SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-65	52.0
WP_016210113.1|1775208_1776258_+	RNA polymerase sigma factor RpoS	M4SMP8	Cyanophage	7.9e-30	31.5
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WP_016211561.1|1794324_1798191_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP038937|1882072:1941182|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYTLKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDVVEKKLPI
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MFNTKQKLLITLLDMTKKDPLSVQTKACAYIFGLALLLAWTYVLISSGLIISLILAVIFVAGLYFQVNRYASKLINSSSTQKPRIEDIRLLVVSSKSMILFCIGALVAYVAMLFNGG
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MPALYDPLRDYYLNLNHLHHTSKGDVNDLIQKFWQRYKNQADYNDNKHSALKQLGLDHTANKLTIKKRFNQLRSQHHPDHGGNPEHFQRIEQAGKTLLNIYK
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MLQVYNSLTRKKEEFKTIVAGKVGMYVCGMTVYDYCHVGHARTFLAFDVITRYLRAKGYKLTYVRNITDVDDKIIKRANENGENAIALADRFVTAMQEDFACLGMLAPDQEPRATQTITQMQVLISELINKDMAYVADNGDVYYRVEKFAEYGKLSNQSIEDLRCGARVEMGEIKENPLDFVLWKAAKPDEPFWESPWGRGRPGWHIECSAMSREALGLNFDIHGGGGDLSFPHHENEIAQSEVANNQPYANYWLHTGMLQINKEKMSKSLGNFFTIRDVLKEIDAETLRYFLISSHYRSVLNYSKETVMGARSALTRIYTALKGIPENNPALAGTSFEARFYQAMDDDFNVPEALAVLFELVREINRLREESLEKAAPYAGLLKQLAGVLGIAQSQPEAFLQGGQYGSEFDTTEIEALIVQRNQARDERNWLEADRVRDELLEQGIILEDNAAGTSWKRK
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MKFFIKIIMAVGSLILLSACAGEPTNSLMANQCRSDLQQAYQDLDYAQANNFESTVNYTQAMTLLSAAKVQQEFNQFSSCVAKVKQARSYITMYGSAD
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MEALTRGFQFAASVVAAVITASIGIPLAGYKMYKNHGKFFLYKHHTDSELAALKVIDAANNL
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MVKRDSWWKVFLLLLTIVIGTIYAIPNLFGDDPAVQVIGRRGFDVTQVQEQLVKAALASEQIGYRDLSWAKDGMLLRFYTQDSQLKAKDAIENALGSHYVTALDLVPATPMWLASLGATPMKLGLDLRGGIHFVLQVDMQTVLRNQAGSFLQEIKMKLANKHIAYTDMRLAPEQAEVEAPELIIQAADTATVKRLVSQELGSQLLLLPESGRNTLYYKLSDETIAQAKKSALSQTETVMRNRVNELGVAEASVASQGKNRVVVELPGVQDAAQAKELIGGTATLKFMLVDQAHSVDAALKGQGPAGSTIYWNDKERPVLLKNQVILTGKAVVGATVGFDQNNRPAVNVRLTGNEVSNFSKVTRDNVGKGMAVVLVQTTLSSKKINGKDIFQRKTSERVISIATIQQALGNSFQITGIGEVKDAQSLAIQIRAGALPAPVQIVEDQVIGPTLGAQNIHIGLVSLAAAMIVTLLFMLVYYRAFGIYANIALILNMIFLFAIMSVMGATMSLPGIAAAVLHIGMAVDANVLIFERIREELRAGISPHKAISQGFDRALATIIDSNLTTLIVAVVLFAIGTGSVKGFAVVLIIGIVTSLLTAVTMTRGMVNFVYGNRPIKKLSIGI
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MTTAQVNYFDEVVYLFQGGGAMGAFQVGVYEALMEEMYSPDWIVGISIGAINASLIAGNPPGEGIAKLEEFWSRITRRHYPLPVTDYFGIRKLYNYWSAQTTLLFGQPNFFEPHWLSPLLLTPKTPDLISFYSTLPLKQTLIDLIDFDYLNRAYMRLSIGAVDLETGEQVFFDNTKHTLTPEHIMASCALPPGFPAIKIDGHYYWDGGLYSNTPILAVTNESEHKNRLCFLVNLFNPKGVPPHSLDGVQERAKDIEYASHLRTIIEQYDSKQYLQGIIAQLAEHIPEEIKHKENLQELLKYGDSHKLHVAQINYKSKQGTELHSKDYEFSELSADDHRSQGYKNALALVKNPDWFYEHHIESKTVVHKLDDQDHPHQ
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MCKIPTEVATLTPGAVRLVLIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLKMNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFTFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKRLRSKLKKISEWMKKNRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFFF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211805.1|1883464_1885003_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211806.1|1885045_1885771_+	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1886560_1886833_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1886844_1887681_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_129556510.1|1888204_1889308_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	7.3e-10	24.8
WP_054300405.1|1889409_1889910_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|1890431_1891094_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_016209946.1|1891120_1892350_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1892506_1895278_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_016209937.1|1895353_1895797_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1895949_1897422_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_016209926.1|1897533_1898595_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209945.1|1898591_1899626_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1899628_1900669_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209936.1|1900851_1901967_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-93	48.6
WP_016209930.1|1902005_1902359_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_032126634.1|1902379_1904248_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1904269_1905214_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1905447_1905726_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1905935_1906574_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1906548_1907976_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1908176_1908854_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1908988_1910263_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1910330_1911086_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1911137_1912055_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209929.1|1912163_1913057_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274822.1|1914515_1915490_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_016211771.1|1915782_1915971_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1915984_1917118_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274823.1|1917317_1921328_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211823.1|1921362_1921551_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211827.1|1921591_1922212_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376688.1|1922543_1922897_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107517381.1|1923110_1923305_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007041.1|1923970_1924498_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300400.1|1924554_1924797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300399.1|1924941_1925208_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210885.1|1925549_1926431_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210892.1|1926488_1927085_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210891.1|1927117_1927891_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126206.1|1928424_1928721_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210888.1|1928743_1928995_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155053505.1|1928940_1929663_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210886.1|1929731_1930511_-	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
WP_016210887.1|1930593_1931544_+	23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD	NA	NA	NA	NA
WP_016210889.1|1932053_1934900_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556636.1|1934917_1935226_-	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212002.1|1936179_1936458_-	DNA-J related family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212000.1|1936577_1937306_+	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_016211998.1|1937436_1938000_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211999.1|1937989_1938343_-	ras family protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923779.1|1938722_1939559_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|1939570_1939843_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274825.1|1940120_1941182_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038937|1977996:2064419|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038937|2100264:2213569|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212367.1|2123847_2124705_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046721.1|2125846_2126014_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274836.1|2126194_2127085_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210154.1|2128358_2129051_+	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_080664836.1|2134257_2136108_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210153.1|2141105_2141510_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_032126761.1|2141563_2142385_+	energy transducer TonB	NA	NA	NA	NA
WP_016210142.1|2142444_2143425_+	iron-siderophore ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210160.1|2143405_2145403_+	iron ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210147.1|2145415_2146588_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210148.1|2147448_2147667_-	DUF2158 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126762.1|2148502_2150530_+	NADPH-dependent 2,4-dienoyl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211282.1|2150611_2151862_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211281.1|2152156_2152492_-	ferredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211283.1|2152803_2153052_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
WP_016211280.1|2153087_2153597_+	ribosome maturation factor RimM	NA	NA	NA	NA
WP_016211285.1|2153596_2154376_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_016211286.1|2154393_2154741_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|2154852_2155125_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|2156453_2157263_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|2157813_2158635_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|2158835_2160068_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_081377862.1|2160554_2161391_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
WP_032126239.1|2161402_2161675_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046719.1|2161693_2161852_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038937|2243025:2351142|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080664860.1|2259654_2260092_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210281.1|2261343_2262735_-	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
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WP_016210277.1|2265833_2266667_-	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210274.1|2273723_2274122_-	flagellar basal body rod protein FlgB	NA	NA	NA	NA
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WP_016210275.1|2275266_2275569_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210276.1|2275624_2276101_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_016210284.1|2276155_2276677_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
WP_016210280.1|2276758_2277853_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_054300412.1|2278089_2278404_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273307.1|2278548_2278959_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275091.1|2279229_2279715_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556631.1|2280723_2280891_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075275089.1|2281035_2281368_+	dual specificity protein phosphatase family protein	A0A068QKX9	Armadillidium_vulgare_iridescent_virus	8.0e-05	37.3
WP_032126500.1|2281501_2282218_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211118.1|2282354_2283602_-	NADP-dependent isocitrate dehydrogenase	Q77Z09	Phage_21	1.1e-14	72.2
WP_032126499.1|2283980_2284592_-	PilZ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038937|2365571:2484250|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300265.1|2373164_2373425_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300264.1|2373569_2373908_+|transposase	IS5/IS1182 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275071.1|2374010_2374985_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	5.2e-28	31.9
WP_016212461.1|2375360_2375735_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273371.1|2375738_2376314_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2376259_2376625_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300262.1|2377087_2377378_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210542.1|2377369_2379076_-	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	2.5e-25	26.9
WP_051307331.1|2379147_2380926_-	thiol reductant ABC exporter subunit CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	1.5e-33	30.6
WP_016210552.1|2381280_2381847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210553.1|2381971_2382625_+	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038937|2492111:2539640|DBSCAN-SWA
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MDTVYLPYTDEDLENLAIQLVYQEIDEIIKHQLEDFCHCKVCIQDIAAIALNHIPPIYQTSCIEKAKTLAKQGGQLKKLARIEVLKAIRKVKINSHCLDLRQDSMQT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209368.1|2536623_2538153_-	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-84	42.2
WP_016209374.1|2538188_2539640_-|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038937|2575070:2628254|DBSCAN-SWA
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MIIVTGGAGFIGSNLIKQLNEQGHREILVVDDLSDGKKFVNLADCDILDYLDKNQFIEKIKNNDDFSDYVKVVFHQGACSKTTEWDGRYMMDNNYEYSKQLLHYCMARGIAFIYASSAAVYGGSETFKESRQFEKPLNVYGYSKWQFDQYVRQCALSAHSQVVGLRYFNVYGPGEQHKGSMASVAYHLNNQMHETGKINLFAGCDGYEDGEQRRDFVYVGDVVKANLWFLEHADVSGIFNIGTGASQSFNDVARAVIDWHGRGELNYIPFPEHLKGAYQSFTEADIHDLRHVGFDERFLTVEEGVKLYLDWLQAR
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MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNSSFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MRKYLALLLLPTVFAGCATTHQYKQGLAKCGSSQCYTAPVSQHGSYYTTGMDMYFKVPGEYLQGDSKITLAVETTFSAVSPSPNLINDHTLDVNSVRMLRNEANYYMDTNISALLDSNPRDRVRLINDGVKNNLLTNFAIKGVKNVEL
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MKISQLIRHNRFVISISTCCLLLSFLATSSANYAATANTNTNTRQSFTQAFNNSKALAVSKLGQTFEIKVPANPTTGFSWFLKSYDHDLLDVVNQRYNAPKTNMIGAPGKDIWTFKAKPMFFTAPQITVIELYSARPFDIRKGQVLKLAVVSQPSAPNLVKNNLK
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MKRVFKNGQDYAIETETACPMDLYASKVESIGIISSLDSEKKMLQKILNIDQEIALSMQLV
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MVKVSAYVIAYNEEEKIRDCVQTLLWADEIIVADSGSTDRTAAWAEELGANVVQVPFNGFGDLRNQAIVHCTGDWVFSLDADERCTSAVRDEILEIIHRPESERADIYQVPRRNFFLGRWIKHAGWYPNYRQPQLFRRGSMSYDLKPVHEGYIAHSHKPIGELTAAIWQIPFKNLDEVMHKANRYSTLGVDKLVERGKQGSFAKALLHGFWSFFKHYLLKRGFLDGWPGFIIALGNFEGTFYRHAKLTERQASWSLPKSEQVLKKD
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MIKMKIKTLITQLQRAYTKTIKPLYLLACIVLLNACATTTADHSTPPLPKNNNAAWQQYQQQLVTKTHWQLQGIIAVRYAKQAQQANLNWSQQGLDCYQVNLSGPLGIGEIQLTHQQGQYRFTDSHGQTTEANSAQLLMQSLLGWSLPVNGLYYWVRGLASPDMPYQKTLDEYGRLITLSQSGWNISYQRYQWQNGLPLPTLIRLKNQQLWLKIAISDWQQLT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|2575591_2575957_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275125.1|2578093_2579137_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210612.1|2580728_2581979_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210605.1|2581967_2582849_-	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210611.1|2582841_2583927_-	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	4.3e-07	41.2
WP_016210607.1|2583923_2585183_-|tRNA	glutamyl-tRNA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210598.1|2585351_2586011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556471.1|2586152_2586824_+	outer membrane lipoprotein LolB	NA	NA	NA	NA
WP_016210609.1|2587183_2588119_+	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A1V0SHF7	Hokovirus	6.3e-39	34.4
WP_016210606.1|2588215_2588842_+	50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc	NA	NA	NA	NA
WP_016210603.1|2588847_2589429_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210599.1|2590674_2591388_+	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	NA	NA	NA	NA
WP_122940948.1|2591481_2592186_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126800.1|2593694_2594429_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046715.1|2594977_2595223_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556470.1|2595522_2596408_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209916.1|2596645_2597617_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.7e-34	32.9
WP_016209900.1|2597808_2599278_-	glycine dehydrogenase subunit 2	M4QFZ1	Prochlorococcus_phage	2.7e-84	41.9
WP_016209924.1|2599271_2600648_-	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
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WP_032126654.1|2602330_2603632_-	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209907.1|2603639_2604587_-	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-37	37.9
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WP_032126655.1|2605419_2606220_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209903.1|2607268_2608279_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|2608285_2608483_-	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209914.1|2608543_2611450_-	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209918.1|2611491_2612346_-	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126652.1|2612378_2612945_-	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016209915.1|2613027_2613888_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209922.1|2613979_2614396_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|2614455_2614953_+|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209920.1|2614998_2617953_+	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|2617982_2618315_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209923.1|2618432_2618951_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209908.1|2619425_2620136_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209899.1|2620132_2621167_+	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_032126651.1|2621270_2621456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275054.1|2621576_2621942_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2621887_2622463_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212369.1|2622466_2622913_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212599.1|2624147_2624357_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275050.1|2625060_2625756_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|2625831_2626737_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_080743011.1|2627798_2628254_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038937|2665333:2804317|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_25

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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209528.1|2669834_2670863_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126188.1|2670856_2672083_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209510.1|2673861_2674299_+	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209523.1|2674349_2675699_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
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WP_016209536.1|2676426_2679597_+	intracellular multiplication and macrophage-killing family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209533.1|2681458_2681779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126191.1|2681923_2682445_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210437.1|2683476_2684052_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.7e-58	50.5
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WP_033923648.1|2686748_2687030_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210436.1|2687733_2688759_-	phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080664841.1|2688888_2691393_+	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_016210428.1|2691399_2692671_+	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA	NA	NA	NA	NA
WP_016210429.1|2692672_2693656_+	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA	NA	NA	NA	NA
WP_016210434.1|2693668_2694487_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_016210431.1|2694531_2694924_+	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_016210435.1|2694983_2695790_+	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556462.1|2696020_2696866_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.4e-24	33.8
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WP_081007066.1|2698128_2698467_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275039.1|2698461_2698956_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|2699759_2700050_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007010.1|2700099_2700720_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210535.1|2702237_2703050_-	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|2703123_2706804_-	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210531.1|2706813_2708301_-	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
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WP_016210528.1|2708997_2709516_-	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|2709512_2710412_-	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|2710427_2711471_-	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|2711660_2711948_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
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WP_075275038.1|2715585_2716176_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212075.1|2717494_2717692_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126197.1|2717805_2718759_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_054300148.1|2719984_2721046_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|2721067_2721814_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|2721943_2722255_+	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211487.1|2722602_2722926_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211494.1|2722950_2723406_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|2723395_2724448_-	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_016211493.1|2724450_2725914_-	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|2726196_2726493_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275036.1|2726753_2727815_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|2727944_2728409_-	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|2728606_2729422_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|2729550_2731863_+	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|2731982_2732510_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210909.1|2733202_2734480_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210914.1|2734485_2734737_-	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-20	58.8
WP_016210913.1|2734770_2735292_-	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_032126716.1|2735462_2736446_-	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210908.1|2736536_2737352_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556458.1|2738243_2738477_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038937|2916879:2960277|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP038937|2916879:2960277|2952237_2952393_+|WP_016210730.1|DBSCAN-SWA
MRDKIKLVSSAGTGHFYTTDKNKRTTTEKLEFKKYDPVVRKHVLYKEAKIK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211189.1|2923627_2924086_-	NfeD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211187.1|2924110_2925031_-	SPFH/Band 7/PHB domain protein	J3IZE5	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus	2.2e-20	27.5
WP_016211186.1|2925157_2925940_-	exodeoxyribonuclease III	E3T4M6	Cafeteria_roenbergensis_virus	8.2e-32	33.3
WP_016211190.1|2926029_2927529_-	bifunctional ADP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126740.1|2950578_2951796_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
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WP_016210731.1|2952473_2953436_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210727.1|2954921_2955590_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2955952_2957767_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
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WP_052104629.1|2959251_2960277_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038937|2991962:3109388|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211201.1|2997773_2998082_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|2998196_2999513_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080664857.1|2999974_3001261_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211205.1|3001333_3002230_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_129556668.1|3004195_3005434_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|3005981_3006455_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|3006451_3006847_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|3008297_3008663_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209721.1|3021052_3022450_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.3e-77	34.4
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WP_016209720.1|3028488_3030978_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664821.1|3032385_3033549_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_016209717.1|3048343_3049342_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3049343_3049922_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
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WP_155046757.1|3053251_3053407_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212371.1|3054526_3055159_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211227.1|3064003_3066082_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
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WP_016211234.1|3066753_3067317_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3067297_3068044_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210351.1|3069059_3069896_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556610.1|3083815_3084394_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556611.1|3084960_3086114_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_155046759.1|3087526_3087682_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3088009_3088783_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212337.1|3092534_3093245_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211790.1|3095765_3096461_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211291.1|3100455_3100800_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3100796_3101633_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3101633_3101975_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3101976_3102582_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3102578_3104573_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3104592_3105534_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3105761_3107186_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038937.1|WP_129556602.1|2994430_2994640_-|hypothetical-protein	2994430_2994640_-	69 aa aa	NA	HTH_1,HTH_38	NA	2991962-3109388	yes
NZ_CP038937.1|WP_016211201.1|2997773_2998082_-|hypothetical-protein	2997773_2998082_-	102 aa aa	NA	HTH_1,HTH_38	NA	2991962-3109388	yes
NZ_CP038937.1|WP_155046758.1|3087250_3087382_+|phosphatase	3087250_3087382_+	43 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2991962-3109388	yes
NZ_CP038937.1|WP_155046759.1|3087526_3087682_+|hypothetical-protein	3087526_3087682_+	51 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2991962-3109388	yes
NZ_CP038937.1|WP_032126148.1|3089324_3089507_-|hypothetical-protein	3089324_3089507_-	60 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2991962-3109388	yes

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_129556569.1|1056731_1056941_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_129556569.1|1056731_1056941_-|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

HTH_ARSR HTH domain information

• Identity: 0.46774193548387094
• Hit_domain_coverage: 0.7948717948717948

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055830-1055793	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064700-1064663	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1096579-1096542	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064566-1064529	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1055830-1055793, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064700-1064663, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1096579-1096542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064566-1064529, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212450.1|1063667_1064570_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212450.1|1063667_1064570_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055830-1055793	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064700-1064663	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1096579-1096542	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064566-1064529	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1055830-1055793, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064700-1064663, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1096579-1096542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064566-1064529, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016211536.1|1103523_1103757_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016211536.1|1103523_1103757_+|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN

HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5555555555555556
• Hit_domain_coverage: 0.9782608695652174

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055830-1055793	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064700-1064663	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1096579-1096542	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064566-1064529	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1055830-1055793, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064700-1064663, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1096579-1096542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064566-1064529, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212614.1|1107484_1107691_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212614.1|1107484_1107691_-|hypothetical-protein
MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1055830-1055793	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064700-1064663	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1096579-1096542	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1064566-1064529	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1055830-1055793, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064700-1064663, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1096579-1096542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1064566-1064529, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_033923740.1|1129158_1129446_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_033923740.1|1129158_1129446_+|hypothetical-protein
MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_098082828.1|1431908_1432166_-|transposase

>NZ_CP038937.1|WP_098082828.1|1431908_1432166_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1486751-1486714	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1486885-1486848	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1367748-1367785	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1525320-1525357	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1486751-1486714, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1486885-1486848, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1367748-1367785, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1525320-1525357, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_155049900.1|1792435_1792741_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_155049900.1|1792435_1792741_-|hypothetical-protein
MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT

HTH_38,HTH_Tnp_1 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016211563.1|1793089_1793251_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016211563.1|1793089_1793251_-|hypothetical-protein
MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP

HTH_38,HTH_Tnp_1 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212013.1|1812036_1812420_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212013.1|1812036_1812420_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_129556517.1|1807825_1808113_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_129556517.1|1807825_1808113_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_155046727.1|1825397_1825742_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_155046727.1|1825397_1825742_+|hypothetical-protein
MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_129556515.1|1826567_1826927_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_129556515.1|1826567_1826927_-|hypothetical-protein
MLTEDSSYELSHFKGGLPGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_075274844.1|1828074_1828326_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_075274844.1|1828074_1828326_-|hypothetical-protein
MNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGCQPPISETV

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6097560975609756
• Hit_domain_coverage: 0.9318181818181818

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	1757717-1757680	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 1757717-1757680, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_155046725.1|2008206_2008347_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_155046725.1|2008206_2008347_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2026922-2026959	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2030428-2030465	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2026922-2026959, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2030428-2030465, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_081377858.1|2009204_2009915_+|transposase

>NZ_CP038937.1|WP_081377858.1|2009204_2009915_+|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2026922-2026959	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2030428-2030465	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2026922-2026959, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2030428-2030465, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_054300380.1|2026997_2027654_-|transposase

>NZ_CP038937.1|WP_054300380.1|2026997_2027654_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2026922-2026959	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2030428-2030465	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2026922-2026959, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2030428-2030465, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212421.1|2030893_2031076_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212421.1|2030893_2031076_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2026922-2026959	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2030428-2030465	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2026922-2026959, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2030428-2030465, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_032127044.1|2042800_2043001_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_032127044.1|2042800_2043001_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2026922-2026959	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2030428-2030465	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2026922-2026959, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2030428-2030465, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_032126179.1|2210848_2211100_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038937.1|WP_032126179.1|2210848_2211100_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2202478-2202515	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2212657-2212620	1
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2202612-2202649	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2202478-2202515, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2212657-2212620, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2202612-2202649, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212461.1|2375360_2375735_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212461.1|2375360_2375735_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6097560975609756
• Hit_domain_coverage: 0.9318181818181818

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2393302-2393265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2430080-2430043	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2376651-2376688	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2420277-2420314	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2393302-2393265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2430080-2430043, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2376651-2376688, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2420277-2420314, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016211512.1|2426438_2427245_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016211512.1|2426438_2427245_+|hypothetical-protein
MPTTSKLKAYLNEPNSTNKKHALEEMFPLLNEAYENVKKQRPNKPFGADEIWPEIQIIFSAHYGELSSQLSILQYFNLYTLFDDLTESSCDKIQHISHGEFCQPVVQVINLTTPYLSTKAIPQFIENSNQCIDEFTKWGVTHDNDEITRAAHVLATKLAGCRDEFIQRIIQNKETNQGYKITDDVPNYRRKIREIIESSTETKLLSSQQDWQGIIGNVLIGLTGIGLVALAVKAAHSQATTGQASLFFDTNAAQKAEQLGEDLLLMER

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2393302-2393265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2430080-2430043	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2376651-2376688	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2420277-2420314	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2393302-2393265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2430080-2430043, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2376651-2376688, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2420277-2420314, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_051307360.1|2428336_2429266_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_051307360.1|2428336_2429266_+|hypothetical-protein
MTLEQWWNSRTPAEKSIVAAIIAGFNLQIIEKNILAAQKAIFLDYLREQLANYNIEVPDLDEEEAEEAADKIQKLLEEEELNLQLEKKPKQSLPAEGFSFSDLEPKTLTAMSREEFHQLLLSPRQIGIIVTVGEILKKEDGFNIFDYQVNNGPKLDAQLTQIAPGTPTPDTPIKIQAQFHCPLRQSIPLEEQEEEKNKQATTLAQLVESVCTMNQAKRCPVRLNVQAEEHEVSPLAQAFICALQQRVLLKQLQHLSFNNQVFDYSHLLPNTTPFQTQQQGAEGYTSSEPELKQEPDQEPEQEQEQKLAL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2393302-2393265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2430080-2430043	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2376651-2376688	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2420277-2420314	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2393302-2393265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2430080-2430043, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2376651-2376688, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2420277-2420314, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016209640.1|2465543_2466563_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016209640.1|2465543_2466563_+|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6097560975609756
• Hit_domain_coverage: 0.9318181818181818

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2393302-2393265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2430080-2430043	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2376651-2376688	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2420277-2420314	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2393302-2393265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2430080-2430043, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2376651-2376688, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2420277-2420314, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016210742.1|2505911_2506187_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016210742.1|2505911_2506187_-|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2518173-2518210	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2520325-2520362	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2518173-2518210, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2520325-2520362, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212416.1|2520718_2521249_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212416.1|2520718_2521249_-|hypothetical-protein
MSTEPSIDDKNKIESLTKDFCSALVISPNLIKGLTKGKYYKIVEALDVAVEELKVLAEQPLLDLYKSHYLKKHSVTSLDVKFAQIDSVFSSQVKWGLAIKKDSEQKRQAEKIGQELKALSTAIVRSFEENSTAFYRKYRWAEITKLKLSEKYIDKVVANPGQFRENYCRLEELGPH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2518173-2518210	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2520325-2520362	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2518173-2518210, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2520325-2520362, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_075275039.1|2698461_2698956_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_075275039.1|2698461_2698956_-|hypothetical-protein
MAINKIHHHRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKARLNYFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.46296296296296297
• Hit_domain_coverage: 0.9152542372881356

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2741062-2741025	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2802552-2802589	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2741062-2741025, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2802552-2802589, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_032126150.1|2771573_2771807_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_032126150.1|2771573_2771807_+|hypothetical-protein
MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2741062-2741025	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2802552-2802589	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2741062-2741025, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2802552-2802589, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212022.1|2782417_2782636_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212022.1|2782417_2782636_+|hypothetical-protein
MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4107142857142857
• Hit_domain_coverage: 0.9491525423728814

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2741062-2741025	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2802552-2802589	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2741062-2741025, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2802552-2802589, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016212024.1|2783231_2783480_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016212024.1|2783231_2783480_+|hypothetical-protein
MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4107142857142857
• Hit_domain_coverage: 0.9491525423728814

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2741062-2741025	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	2802552-2802589	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2741062-2741025, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 2802552-2802589, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_129556602.1|2994430_2994640_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_129556602.1|2994430_2994640_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

HTH_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3008689-3008726	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 3008689-3008726, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_016211201.1|2997773_2998082_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_016211201.1|2997773_2998082_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

HTH_1,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5178571428571429
• Hit_domain_coverage: 0.9333333333333333

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3008689-3008726	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 3008689-3008726, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_155046758.1|3087250_3087382_+|phosphatase

>NZ_CP038937.1|WP_155046758.1|3087250_3087382_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3008689-3008726	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 3008689-3008726, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_155046759.1|3087526_3087682_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_155046759.1|3087526_3087682_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3008689-3008726	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 3008689-3008726, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038937.1|WP_032126148.1|3089324_3089507_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038937.1|WP_032126148.1|3089324_3089507_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	3008689-3008726	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038937 position: 3008689-3008726, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP038940

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	14424 : 22147	10	unidentified_phage(33.33%)	transposase,integrase	attL 8029:8088|attR 21469:21660

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038940|14424:22147|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038940|14424:22147|16356_16947_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI
>NZ_CP038940|14424:22147|17985_18987_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038940|14424:22147|19316_21389_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA
MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV
>NZ_CP038940|14424:22147|17010_17379_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA
MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038940|14424:22147|21418_22147_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038940|14424:22147|17590_17767_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG
>NZ_CP038940|14424:22147|15117_15399_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038940|14424:22147|15946_16141_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA
MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE
>NZ_CP038940|14424:22147|14424_15096_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG
>NZ_CP038940|14424:22147|15471_15936_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA
MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
8029:8088	attL	NA	NA	NA	NA
WP_129556741.1|14424_15096_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.4e-10	30.4
WP_052133268.1|15117_15399_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-11	38.7
WP_016212274.1|15471_15936_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|15946_16141_-	addiction module toxin, HicA family	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|16356_16947_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_129556740.1|17010_17379_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046774.1|17590_17767_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300579.1|17985_18987_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.0
WP_016211990.1|19316_21389_+	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556739.1|21418_22147_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
21469:21660	attR	NA	NA	NA	NA

3. NZ_CP038938

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038938_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038938_1
• CRISPR_location: 1232-1455
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038938_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038938_1

>1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038938_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038938_1

>merge|NZ_CP038938|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038938|1|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038938.1|WP_016212168.1|3589_5278_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038938.1|WP_155063811.1|9356_9557_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038938.1|WP_155063809.1|5621_6596_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038938.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP038938.1|WP_032126843.1|12170_12350_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038938.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038938.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038938.1|WP_080664873.1|8429_8744_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038938.1|WP_016211955.1|10013_10994_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038938.1|WP_144019150.1|7539_8520_-|IS91-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP038938.1|WP_016211953.1|6830_7310_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038938.1|WP_155063809.1|5621_6596_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	2.10472e-76
NZ_CP038938.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP038938.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038938.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038938.1|WP_080664873.1|8429_8744_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	6.64404e-12
NZ_CP038938.1|WP_144019150.1|7539_8520_-|IS91-family-transposase	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	1.07756e-49

Protein sequences

>NZ_CP038938.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038938.1|WP_155046770.1|2669_2837_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP038938.1|WP_054300202.1|2892_3621_+|IS6-family-transposase
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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038938|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2892 : 103671	116	Streptococcus_phage(25.58%)	protease,integrase,transposase	attL 68078:68137|attR 91849:92820

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038938|2892:103671|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038938.1|WP_016212118.1|12959_13421_+|hypothetical-protein	12959_13421_+	153 aa aa	NA	HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_155046765.1|33813_34008_-|hypothetical-protein	33813_34008_-	64 aa aa	NA	HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212137.1|41155_42217_-|hypothetical-protein	41155_42217_-	353 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212139.1|42292_42538_-|hypothetical-protein	42292_42538_-	81 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212298.1|66979_67306_-|hypothetical-protein	66979_67306_-	108 aa aa	NA	HTH_21	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016211913.1|72103_73225_-|hypothetical-protein	72103_73225_-	373 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212499.1|76504_76879_+|hypothetical-protein	76504_76879_+	124 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212398.1|96279_96741_-|hypothetical-protein	96279_96741_-	153 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212260.1|101178_101451_+|hypothetical-protein	101178_101451_+	90 aa aa	NA	HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_016212257.1|101470_101695_+|hypothetical-protein	101470_101695_+	74 aa aa	NA	HTH_38	NA	2892-103671	yes
NZ_CP038938.1|WP_032126838.1|102031_102235_+|hypothetical-protein	102031_102235_+	67 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	2892-103671	yes

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_129556704.1|18157_18487_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_129556704.1|18157_18487_-|hypothetical-protein
MFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYEKRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYKGTVAKNYSELQKGYFLVLSA

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_032126844.1|12568_12865_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_032126844.1|12568_12865_+|hypothetical-protein
MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212118.1|12959_13421_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212118.1|12959_13421_+|hypothetical-protein
MILTAEQLEIIEMVLKKQLQNDPDYLFNHINLTVSQNTAEELEVTIQQRRPVITNIAHPAIERIMGINNSDPMDAGRKEYDENFTKKPRENRSEVERCKETIIYTPAYTAKIFLQCRSTLLHQRGTTSLFSDHQANISPERTTSVDNESCSVL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_155046765.1|33813_34008_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_155046765.1|33813_34008_-|hypothetical-protein
MCRLISRLIVLGEKPSALAIDLSESPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212137.1|41155_42217_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212137.1|41155_42217_-|hypothetical-protein
MPKFIEINKTQLETKIKEFYNEVDPKNKEKYKYIRSNIDFTLEALKKTCDTSLTELFMEHYFNPESVSDPTLQVAQCKNTLLTQLNDMLKSKKSKDKGKAPAIVSYITLIMKDVIALNFTLALDEFNKLYSWDKVKKLNLSKEYFNKILCNPSCFKDAIKLDFNQEYIEKSLDHPGFLKAALEDLTSKNNIQTILDALTLEKNNICEDISFSEAKSFLQHHKGCIARKCKNHPDKIAFGHIDEKGLIQQHLIEFKVDSWILKSGPEAQLGTKLGVTLTDIARNEGSLLHSSDSVKHWQSKREQMANSPSTCFFFDTKDLSYDNFKSSDEPEFIYHKSLEKKNSSSGQSNSVKL

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212139.1|42292_42538_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212139.1|42292_42538_-|hypothetical-protein
MQKERELVLNKYKQEHKQEKNEIFLKIKESFKSLDIPEHKKLVIGDCQTLRDLCSAVSCQETHNYDATGSQDRKFMQLIPE

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212298.1|66979_67306_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212298.1|66979_67306_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016211913.1|72103_73225_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016211913.1|72103_73225_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212499.1|76504_76879_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212499.1|76504_76879_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212398.1|96279_96741_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212398.1|96279_96741_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212260.1|101178_101451_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212260.1|101178_101451_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 59302-59265, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_016212257.1|101470_101695_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_016212257.1|101470_101695_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

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********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038938.1|WP_032126838.1|102031_102235_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038938.1|WP_032126838.1|102031_102235_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	59302-59265	0
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	94958-94995	1

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2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 position: 94958-94995, mismatch: 1

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********************************** ***

4. NZ_CP038939

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4824 : 28863	33	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	37206 : 57887	29	Pseudomonas_phage(11.76%)	terminase,head,portal,capsid,tail,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038939|4824:28863|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|6750_7903_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212392.1|7931_8939_-	hypothetical protein	W6E8G0	Rhizobium_phage	1.2e-06	26.4
WP_075273802.1|9002_9731_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
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WP_016212135.1|10700_11885_+	3-methylitaconate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211443.1|15741_16428_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211436.1|17030_17969_+	fic/DOC family protein	S4TP71	Salmonella_phage	5.2e-25	37.2
WP_016211434.1|17941_18133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211437.1|18677_19304_-	zinc-ribbon domain-containing protein	A0A1S5XYQ1	Kurlavirus	4.4e-12	28.2
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WP_016211440.1|19713_20628_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211444.1|20897_21404_+	antirestriction protein ArdA	A0A222YZE5	Mycobacterium_phage	2.8e-17	33.7
WP_051307358.1|21552_21936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104629.1|27271_28297_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275198.1|28323_28863_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.4e-12	40.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038939|37206:57887|DBSCAN-SWA
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MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP038939|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA
MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD
>NZ_CP038939|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP038939|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038939|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP038939|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA
MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP038939|37206:57887|38065_38359_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA
MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS
>NZ_CP038939|37206:57887|54599_57887_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA
MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP038939|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP038939|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA
MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038939|37206:57887|40749_40959_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA
MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG
>NZ_CP038939|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP038939|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP038939|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA
MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI
>NZ_CP038939|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA
MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL
>NZ_CP038939|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA
MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN
>NZ_CP038939|37206:57887|53974_54262_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA
MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL
>NZ_CP038939|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA
MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI
>NZ_CP038939|37206:57887|47493_47817_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA
MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|37206_37887_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|38065_38359_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|38576_38759_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|38903_39083_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556723.1|39177_39495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|39795_40179_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|40266_40746_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|40749_40959_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_080743047.1|40974_41331_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	5.4e-23	61.3
WP_081377926.1|41349_42432_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|42428_43670_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_080664855.1|43617_44289_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_016211140.1|44346_45540_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|45660_46995_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|47185_47497_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|47493_47817_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|47809_48205_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|48201_48552_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|48551_48974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|48975_49299_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|49355_49622_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|49625_51704_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|51696_52038_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|52034_52706_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|52674_53421_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|53410_53968_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|53974_54262_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|54251_54506_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|54599_57887_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038939.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein	5761_6361_-	199 aa aa	NA	HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038939.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein	6360_6621_-	86 aa aa	NA	HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038939.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein	9914_10262_+	115 aa aa	NA	HTH_21,HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038939.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein	23884_24064_+	59 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038939.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein	24063_24492_+	142 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038939.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein	24659_25199_-	179 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes

Protein sequences of NZ_CP038939.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038939.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038939 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038939.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038939.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein
MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038939 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038939.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038939.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

HTH_21,HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038939 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038939.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038939.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038939 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038939.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038939.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein
MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038939 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038939.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038939.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein
MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038937_1	Orphan	1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder	363152-363189	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038937|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038939 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
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