Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038944 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-027 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 6 |
NZ_CP038943 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-027 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 0 | 3 | 1 | 0 |
NZ_CP038946 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-027 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP038945 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-027 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP038942 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-027 chromosome, complete genome | 2 crisprs | RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 1 | 1 | 33 | 25 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4824 : 28863
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038944|4824:28863|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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33 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37206 : 57887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038944|37206:57887|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038944|37206:57887|47809_48205_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP038944|37206:57887|48551_48974_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP038944|37206:57887|42428_43670_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK >NZ_CP038944|37206:57887|40974_41331_+|WP_080743047.1|DBSCAN-SWA 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MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS >NZ_CP038944|37206:57887|51696_52038_+|WP_016210657.1|tail|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV >NZ_CP038944|37206:57887|52034_52706_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP038944|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD >NZ_CP038944|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP038944|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA >NZ_CP038944|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP038944|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV >NZ_CP038944|37206:57887|38065_38359_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS >NZ_CP038944|37206:57887|54599_57887_+|WP_016210653.1|DBSCAN-SWA MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH >NZ_CP038944|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ >NZ_CP038944|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038944|37206:57887|40749_40959_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG >NZ_CP038944|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF >NZ_CP038944|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL >NZ_CP038944|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI >NZ_CP038944|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL >NZ_CP038944|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN >NZ_CP038944|37206:57887|53974_54262_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL >NZ_CP038944|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI >NZ_CP038944|37206:57887|47493_47817_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA |
29 | Pseudomonas_phage(11.76%) | head,portal,tail,capsid,terminase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038944.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein |
5761_6361_-
Protein sequences of NZ_CP038944.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein>NZ_CP038944.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD |
199 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038944 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038944.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein |
6360_6621_-
Protein sequences of NZ_CP038944.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein>NZ_CP038944.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH |
86 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038944 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038944.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein |
9914_10262_+
Protein sequences of NZ_CP038944.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein>NZ_CP038944.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR |
115 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038944 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038944.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein |
23884_24064_+
Protein sequences of NZ_CP038944.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein>NZ_CP038944.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA |
59 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038944 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038944.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein |
24063_24492_+
Protein sequences of NZ_CP038944.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein>NZ_CP038944.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ |
142 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038944 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||
NZ_CP038944.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein |
24659_25199_-
Protein sequences of NZ_CP038944.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein>NZ_CP038944.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM |
179 aa aa | NA | NA | NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038944 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038943_1 | 137110-137333 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038943_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP038943_1
>1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038943_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038943_1 >merge|NZ_CP038943|1|137110-137333|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP038943|1|1|137110-137333|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP038943.1|WP_016211879.1|135878_136898_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP038943.1|WP_059372616.1|134322_134913_+|site-specific-integrase MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP038943.1|WP_081377350.1|133261_134077_+|hypothetical-protein 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MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI >NZ_CP038943.1|WP_155046770.1|138547_138715_-|hypothetical-protein MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ >NZ_CP038943.1|WP_054300202.1|138770_139499_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038943.1|WP_016212168.1|139467_141156_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP038943.1|WP_129556703.1|142699_143188_+|hypothetical-protein MLNMPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC >NZ_CP038943.1|WP_016211956.1|143245_143974_+|hypothetical-protein MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL >NZ_CP038943.1|WP_016211955.1|144430_145411_+|hypothetical-protein MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF >NZ_CP038943.1|WP_054300202.1|145556_146285_-|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038943.1|WP_032126843.1|146588_146768_+|hypothetical-protein MKKSKPNKTNSKKNRKVAPNARKRKSSNAKLLSSQKKSLDISDEELQFPESKPPREAEE >NZ_CP038943.1|WP_032126844.1|146986_147283_+|hypothetical-protein MNGSNAPEWEHLRLWLEDHKNQPCVLGFGKAIEYEVNHNKSCLEITYKLSRLKIHFKYVPIHSNSFDIIKNHLISKSNQDNWFIYDGKKFKEINESQF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 111946-111987 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP039033 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 129443-129484 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP038958 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 55594-55635 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP039042 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence | 128485-128526 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038943_1 | 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT | 137135-137176 | 42 | NZ_CP038948 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence | 1257-1298 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038943_1 | 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT | 137267-137308 | 42 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 137267-137308 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038943_1 | 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT | 137267-137308 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93293-93334 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag CRISPR spacer attaggctttaactccgaaaataaacagacgataaaaaatag Protospacer ******************************************
42. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|137135|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|137202|40|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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115. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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116. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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117. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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118. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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119. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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120. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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121. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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122. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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123. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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124. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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125. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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126. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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127. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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128. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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129. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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130. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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131. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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132. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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133. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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134. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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135. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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136. spacer 1.3|137267|42|NZ_CP038943|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2323 : 101076
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038943|2323:101076|DBSCAN-SWA 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116 | Streptococcus_phage(21.28%) | tail,transposase,protease,capsid,integrase,head | attL 91315:91374|attR 104649:105511 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
11559 : 19100
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038945|11559:19100|DBSCAN-SWA 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CAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038945|11559:19100|15120_16122_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038945|11559:19100|13491_14082_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI >NZ_CP038945|11559:19100|12606_13071_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA >NZ_CP038945|11559:19100|18371_19100_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038945|11559:19100|11559_12231_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG >NZ_CP038945|11559:19100|16269_18342_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV >NZ_CP038945|11559:19100|14725_14902_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG >NZ_CP038945|11559:19100|14145_14514_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038945|11559:19100|13081_13276_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE >NZ_CP038945|11559:19100|12252_12534_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA |
10 | unidentified_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 5164:5223|attR 18422:18613 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038942_1 | 363130-363259 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038942_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038942_1
>1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038942_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038942_1 >merge|NZ_CP038942|1|363130-363259|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP038942|1|1|363130-363259|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP038942.1|WP_054300520.1|361908_362223_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038942.1|WP_075273359.1|361387_361963_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038942.1|WP_016211797.1|359933_361337_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038942.1|WP_129556444.1|359349_359772_+|hypothetical-protein MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038942.1|WP_080664870.1|358709_359357_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE >NZ_CP038942.1|WP_016211795.1|357832_358027_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038942.1|WP_036794771.1|356708_357695_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038942.1|WP_016212044.1|355731_355986_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038942.1|WP_054300271.1|354218_355193_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038942.1|WP_016212359.1|353632_353851_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP >NZ_CP038942.1|WP_032126227.1|363788_364079_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038942.1|WP_016212008.1|364116_364815_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038942.1|WP_016212010.1|364831_365128_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038942.1|WP_016212007.1|365251_366397_+|hypothetical-protein MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038942.1|WP_075273619.1|366669_367245_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP038942.1|WP_016211273.1|367302_368136_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP038942.1|WP_016211268.1|368251_369436_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP038942.1|WP_016211271.1|369454_370399_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP038942.1|WP_016211269.1|370703_371489_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP >NZ_CP038942.1|WP_016211272.1|371606_371975_-|hypothetical-protein MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038942_2 | 2626132-2626252 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038942_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038942_2
>2.1|2626169|47|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038942_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038942_2 >merge|NZ_CP038942|2|2626132-2626252|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT >NZ_CP038942|2|2|2626132-2626252|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT
>NZ_CP038942.1|WP_075275117.1|2625552_2625975_-|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP038942.1|WP_016211905.1|2624898_2625309_+|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP038942.1|WP_052047041.1|2624366_2624630_+|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP038942.1|WP_098082812.1|2623618_2624134_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038942.1|WP_016210678.1|2622463_2623474_+|protein-kinase MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTKDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038942.1|WP_016210676.1|2620078_2622160_+|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP038942.1|WP_016210671.1|2618363_2619623_+|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP038942.1|WP_016210673.1|2617757_2618231_-|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP038942.1|WP_016210672.1|2616366_2617749_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP038942.1|WP_016210677.1|2615759_2616374_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MLNFKKKIILAVTGASGAPYALRLLEHLVLSGVQVSFLISPAGALTIKEECDIHLPAKPEVLQQRLTELTGATAQQILCYGRNDWFAPMASGSAAFDAMIICPCTMRALAAVAMGLSDSLIERAADVMLKERRQLILVPREMPLSVIHLENMLKLARAGAEIIPPMPGFYYRPDSVDDLIDFVVARLLDRLGLAHSLGQRWGER >NZ_CP038942.1|WP_054300282.1|2627629_2628094_-|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038942.1|WP_081377880.1|2628150_2628630_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038942.1|WP_129556590.1|2629487_2629883_+|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP038942.1|WP_032126312.1|2629879_2630674_-|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP038942.1|WP_016211756.1|2630852_2631578_-|M15-family-metallopeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP038942.1|WP_016211759.1|2631823_2633011_+|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP038942.1|WP_081377344.1|2633365_2634493_-|transposase MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038942.1|WP_016210935.1|2634823_2635366_-|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP038942.1|WP_016210943.1|2635362_2636049_-|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP038942.1|WP_016210942.1|2636052_2636664_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038943.1 | 78211-78248 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038943.1 | 84835-84872 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038943.1 | 55475-55512 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038943.1 | 69394-69431 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038943.1 | 120528-120565 | 1 | 0.974 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039213 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence | 30310-30347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 7350-7387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 186740-186777 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 23887-23924 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038897 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence | 30307-30344 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 98297-98334 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 104921-104958 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 74736-74773 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 89480-89517 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038953 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence | 91559-91596 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038958 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence | 45769-45806 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 48741-48778 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 38038-38075 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 84886-84923 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 55526-55563 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 69445-69482 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP013769 | Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence | 100110-100147 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP013769 | Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence | 89408-89445 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033938 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence | 7974-8011 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033938 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence | 11226-11263 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 29210-29247 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 13746-13783 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 167516-167553 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 144791-144828 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 158710-158747 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP033943 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence | 75017-75054 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP013763 | Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence | 75009-75046 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 94958-94995 | 1 | 0.974 |
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NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP039033 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence | 30949-30986 | 1 | 0.974 |
NZ_CP038942_1 | 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder | 363176-363213 | 38 | NZ_CP038914 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence | 30949-30986 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
86. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
87. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
95. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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125. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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126. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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130. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45566 : 89679
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038942|45566:89679|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038942|45566:89679|72651_73461_-|WP_016211096.1|DBSCAN-SWA MNISTLSHLKIKPIKIIIKITTLIAINTNLVLAKAQLLNFTTGKFPPYSTGSTDRPEGPMHDVILATCTQMRKDCFFHFVPWNFSIMMTQNNRTTGFFPTVKNSSSENWLKFSKPIINSEFGFFTYKSKKNIDSTRNLQGFKLATHGPSELMRQLVQLSQDIPNSILYIDQDIENSFKRFSDSNKNNFKNYAVLADKITGEYLINSLKLKNVHYRLKVADIQYSVGFPKKSVKAATIAQFNASLATVLNDQTFTEQVEKKYGVLLASKK >NZ_CP038942|45566:89679|73867_74818_+|WP_016211100.1|DBSCAN-SWA MPYAYSARVASRVLLACDHHVSARLLYAFAVAIFVFTALSMLFFTAVVDVKTRQPPAKILDISLVAEPIKRLEKEQKKPVTPIKAQAVARELLSGKVKRAAGNATAQMGVAMKKKSLAEQPSERPQPIRRAPTALSEAEHVAKQQAQTLVSKPKSSSQLAAKNKLNSNNQHKVTRQAKARLKKSQINSSSSVPVVKQMRGLQHNLPVATLKDEDALYLLAWRHQVEAVGNRLYARTRHPGLAGKLRLLVAINHNGGLRHVVVKQSSGNQALDDFAIEIVERSAPFAPLTANMRQHTDILEITRLWRFELGDRLNMQ >NZ_CP038942|45566:89679|88515_89088_+|WP_155046699.1|DBSCAN-SWA 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46 | Moraxella_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136473 : 178470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038942|136473:178470|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
182276 : 239530
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038942|182276:239530|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
256927 : 301882
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038942|256927:301882|DBSCAN-SWA 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48 | Acinetobacter_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
329457 : 375012
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038942|329457:375012|DBSCAN-SWA 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46 | Hokovirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
447625 : 555266
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038942|447625:555266|DBSCAN-SWA 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103 | Escherichia_phage(45.95%) | transposase,integrase,tRNA | attL 512779:512838|attR 545902:546282 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
560194 : 604161
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038942|560194:604161|DBSCAN-SWA TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCGCTTCATGATTAGTTCGGCCTGATTGAGGTTTGATAAGCGTACCAAACTCGAGTTGCTCTATTTCTAAGGTAATTGGAGCAATAATGTGGGCAGAAGTGTTTAGAGAAATGTTAGTATTTGCAAAAGTAAAAGCTGGGCTGAATGTAAATAGCAATAGGCTGGATAGGATGCTTGATTTTTTCATGATAACTTTCCTTTTATCATAACTATCATTGATCTTATTGCATGCAGGCTCTATGCCTATTTTTCTATAATATTTGCTTAGACTAATAATAAACACTGAAATTATTTGGCTTTTTTTTGAAAAATTGTTTGGAATTGATTAAAACTGAGATAATTGCGCCATAGCTTAAGAGGTAAGCTATGGCGCGGCTTAGTCATTGTCATTTAGATTAAATATAATCTTGAGTGGTTAGAATCGATCATGCTTATAAGTAGCTTGCCGTTACCACGGTTGAGCCAACATAACGTCCCTTAGCCGTTGTACTTGCCACAGTGACAGAACCGCCAATTGCTTTAGTCATTGCACCACTGGCAGGTAGTCGGCTGGTACCAGCGCCACTTAAACGGACAGTGAGTCGATTAGGACCATTGGCGATGATTGCCGCTGGTGCATGGCTGATGCGGACATTGGCATTGCCTTCACCGGTGACTCTAAAGAGTGCAGCTGATCGTTTTGTTGCTGTGCCTGAAGCGGGTTTATAGATGTAACCAAAGTTCATCGCACGGGTTTGGACAATATTCAATGGCGTGATAACAATTGCACTCATAGTTAAGTTAGTACGGTCAGCAGCAATGGCGGGTGTTAATGTCGCTGCGGTTGTGATTGCAAGAATAGACGATAGGGCTAGTGCTAGTTTTCTCATTTAGAGGTCTCCATACCAATAATTTTTTAAGGAACCTTGTGTTTATTTTTCTTAAGGTTCACTTAAGGAATAGCTGTGGTTTTACAGAAATAAAAAAGAGAATTGATCTGTGTTGTGTGTGAGATCTCTGTTTTTTTGTCATCTATAACAAAAAAATGCGCTTTATAACTATTTGGAATTAAAGAAATAAACTTGTGGGAGAGGGGCTTGGCGGTAAAAGTCCTCCCCATATTGAGGGGAGGTAAAATCTCTACCTGCATGATAGAGCTGCCGTTGAACAGTTGCAATATTAATATAAATGATAATCATTATCAAGTTATTTGTGATAATTATTTTTTGCTGAACTGTGTTGGGTTGAATTTATAGGCGGTGCGCTTTACTCTAGGCAGAGTTTATATAAATCAACGCTGAAAAAAGGTGATAAAAATGATAAAAGCAGTGCGTATAGAAACCGATAGCATGGGTGAGATTGAGGTTGCAAGCGATAAGTATTGGGGGGCTCAGACCGAGCGCTCGTTACATCACTTTGCCATTGGTCACGATATTATGCCACGGGCGATGATTCGTGCGCTTGGCGTATTAAAAAAAGCGGCGGCGCTGACGAATGAATCCTTAGATAAATTGCCAGCAGAAAAAGCCAAGTTAATTGTCCAAGCCGCAGATGAGGTGATCAGTGGCCAGCTTGACGCTCATTTTCCTCTACGCGTATGGCAAACCGGTAGTGGCACACAGACCAATATGAACAGTAATGAAGTAATTGCTAATCGAGCGATAGAAATCGCGGGTGGAGAAAAGGGCAGTAAAGATCCGGTTCACCCCAATGATCATGTCAATATGTCTCAATCATCGAATGATACCTTTCCAACAGCGATGTATATTGCGACAGTAGAGACCATTGTTCATCACCTGCTTCCTGAAATAAAAGCGCTGCGTGATGCGATTGCTGATAAGCAAACAGAATATCAACATATTATTAAAATTGGCCGTACCCACTTGCAAGATGCTGTGCCGTTAACCTTAGGTCAAGAGTTTTCAGGTTATGTAACGCAGCTTAATCAGGCGATTGGTTATATTGAAAATAACTTAACTCATTTATATGAGCTTGCATTGGGGGGCACTGCTGTTGGCACGGGCTTAAATACTCACCCTAAATTTGCAAAGAAAGCCGCTAAGTTTATTGCTAAAGAAACCGGTTTAAAATTTAGTTCAGCTGAGAATAAGTTTGCTGTGCTTGCCGCGCATGATGCAATGGTACAAATCAGTGGTTCTTTGAAGACATTGGCCGCTGCATTGATGAAAATTGCCAATGATGTACGTTGGTTAGGTTCTGGCCCGCGCTGTGGTTTGGGTGAGTTAATTTTGCCTGAAAATGAGCCTGGTTCATCGATTATGCCTGGTAAAGTCAATCCGACTCAATGTGAGGCGATGACCATGGTGTGTGTGCAGGTGATGGGCAATGATGCGGCAGTTGGCTTTGCGGGTAGCCAAGGTAATTTTGAGTTAAATGTCTTTAAACCGGTGATGGTCCATAATGTACTTCATTCAATTCAGTTGCTGGCCGATGCATCACGCAGCTTCAAAGAGTTCTGTATCGAAGGGCTTCAGGCAAATAATGAACGGATTGACTACTTCTTGAAGCACTCTTTAATGCTTGTGACGGCACTGAATCAGGTGATCGGTTATGACAAGGCGGCTATGATTGCTAAAACAGCACATAAAGAAGGCAGTAGCTTAAAAGAAGCTTGTTTGAAACTGGGTTATTTAAATGCAGATGAATTTGACCAGGCGGTTAATCCTGCCAACATGATTGCGCCTTAGGGCTCAATCACCTCTTGCACCCATGAAGCCTTTTCGCTAGTATGAGGAGCTGTATAGCGTTTTTATTAATAATACTAATACATAGAGCAAGACTTAAGAAAAGGCTTTAACAATGAGAAGCAGAGACCCTCAAAACACCAGTATCACTCCCATCTTAGCTGTTGTTCCTTCTCATCATCATTATCTTCATCCTTATCCTTCCCTGTCTTTGCATCGACATCACTCTCATTATCATTGCGACTAAATCGCTTATCTTTTTATCGACTAGCTTTTAAAGACCGAAAACCCGAGAGCCATAATAAGGGTGAAGGATTAAATACTTTTTTAGTTGATATCTGATTTTATCCATTGTTTTTAGTTTAGTTATTATTACAGCGATTATTTTTACTAAATTTACTTTTTTGTTTTGCATTTTTCATTTTTTTATTGAATAGGGTATTGCATGGAAACGAATCAAACATTGCAACGAAACTTAAAGCCTCGCCACTTAATTATGTTGGCACTGGGGGGAACGATAGGAACGGGGTTATTATTGGCGAGCGGGGGGGCGGTTCATAGTGGTGGCCCGGGAGGCGCTATATTGGGTTATTTGCTGGTTGCTGTCATTGTATTATTTGTCATGACCAGCTTGGGTGAGCTAACCGCATTTTCACCAACGACAGGGTCATTTTGCGATGATGCTGCCAGATATGTAGACCCTTCGTTTGGCTTTGCTATGAGTTGGAACTATTGGCTTAACTGGGTGTTTGTGGTGGCCTCAGAAGTGATTGCTGCCGGTTTGGTCATGCAGTTTTGGTTTCCGCATGTTGATGTATGGATTTGGAGTGCGCTATTTTTCTTGCTGATTTTGGCGATTAACCTTGTGGCAGTGAAGCTATATGGTGAAGTTGAATACTGGATTGCTTTTATTAAAGTGGCTGCGGTGATTATTTTTATTACTGTGGGGACGTTAATGATTTTTGGTTTAGTTGGCTCACAGGGGAGCGTAGGCTTTGATAATATTACCTTAGGTGATGCGCCGTTTCATCATGGTCTGTTTGGCTTTTTCAGTGTCTTTTTAATTGCAGGATATTCGTTTCAAGGGGTTGAGCTGATGGGGGTTGCTGCAGGAGAAGCCGATGAGCCGAAGAAAACCATTCCCAAAGCGGTAAAAACCGTGTTTTGGCGTATCGTTTTATTTTATATTCTTGCGATTGCAGTGATTAGCTTTTTGATTCCTTATACGGATAGCAATCTAGTGAATGCTCACTCTAGTGTTGCAAGTAGTCCGTTTACAATTGTATTTGAAAATGCAGGAATTAAGTTTGCCGCATCGTTAATGAATCTTGTGGTGATTACAGCGATTTTATCTGCAGCCAATGCCAGTATGTATACAGCGTCACGGATGTTATGGCATATGGGTAAAGCGAAGGAAGCTTCAGGGTCTTTTCAGCGGGTGAATAAATATGGTGTGCCGGTTATCGGTGTGATTGTAACCGCTTTAATTAGTGTGGTGTTGATTTTAGCGTCAACTTATCATG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47 | Escherichia_phage(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
640122 : 740751
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038942|640122:740751|DBSCAN-SWA 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104 | Prochlorococcus_phage(17.65%) | protease,plate,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
776181 : 822867
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038942|776181:822867|DBSCAN-SWA 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39 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
839554 : 894007
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038942|839554:894007|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(15.38%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
900257 : 963094
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038942|900257:963094|DBSCAN-SWA 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58 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(14.29%) | transposase,integrase | attL 892617:892676|attR 909901:910340 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
967166 : 1070347
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038942|967166:1070347|DBSCAN-SWA 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110 | uncultured_Mediterranean_phage(11.11%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1099804 : 1142864
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038942|1099804:1142864|DBSCAN-SWA 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40 | Tupanvirus(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1196849 : 1249530
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP038942|1196849:1249530|DBSCAN-SWA 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48 | Klosneuvirus(28.57%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1254066 : 1431301
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038942|1254066:1431301|DBSCAN-SWA 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169 | Bacillus_phage(11.76%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1458151 : 1494671
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP038942|1458151:1494671|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038942|1458151:1494671|1485307_1486144_-|WP_033923779.1|transposase|DBSCAN-SWA MLATYLKDEHKLSLVVACNLVTLPRASYYRKKQHQSDNAEIISELKTLASKHKRWGCDKMVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG >NZ_CP038942|1458151:1494671|1460941_1461517_-|WP_129556512.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKMDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKLMSETIR >NZ_CP038942|1458151:1494671|1487631_1487976_-|WP_155046727.1|DBSCAN-SWA MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT >NZ_CP038942|1458151:1494671|1491016_1491853_+|WP_033923779.1|transposase|DBSCAN-SWA MLATYLKDEHKLSLVVACNLVTLPRASYYRKKQHQSDNAEIISELKTLASKHKRWGCDKMVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG |
41 | Leptospira_phage(33.33%) | protease,transposase,integrase | attL 1450689:1450748|attR 1504999:1505256 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1498501 : 1558047
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP038942|1498501:1558047|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(18.75%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1568312 : 1624449
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP038942|1568312:1624449|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(13.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1636414 : 1692207
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP038942|1636414:1692207|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1698375 : 1753633
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP038942|1698375:1753633|DBSCAN-SWA 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45 | Pseudomonas_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1783255 : 1827386
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038942|1783255:1827386|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 1782199:1782258|attR 1811971:1812261 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1831827 : 1951365
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP038942|1831827:1951365|DBSCAN-SWA 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119 | Leptospira_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 1880823:1880882|attR 1949222:1950381 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2031087 : 2082965
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP038942|2031087:2082965|DBSCAN-SWA 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51 | Orpheovirus(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2090809 : 2135515
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP038942|2090809:2135515|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2156714 : 2206462
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038942|2156714:2206462|DBSCAN-SWA CATGATAGAACATTTAAATACAGCCCTTATTCTGGTGATTCCCATCCTAACTGCAATTATCTTCCATGAAATCGGCCATGGCTATATGGCAAAACTCTTGGGTGATCCAACGGCTGCTCAACAAGGGCGTTTAAGCTTGAATCCCTTTGCTCACATCGACCCTGTCGGTACCATATTAGTTCCAGTGCTACTTTACCTAGCCGGTGGTTTTATTTTTGGCTGGGCAAAGCCTGTACCAGTCAATTACAGCCAGCTATATTCCCCACGGCGTGACAGTGCCTTAGTCGCCATCGCAGGTCCTGCCATAAACTTTATCTTTCTTTTTATCTGGTCTGCTTTATTTGCAATAACAAGAGCACACTCCCCTGTACTCTACGCAATGAGTCTTGTAGGCATTCAAATTAATATTATTTTAATCGCTTTAAACTTATTGCCGATCCCACCTTTGGATGGCAGCCATGTTATCAGCAGTCTTCTGCCAACTCAACTTGCTTACTATTATGAACGCCTTTCTTTTCTTGGCTTTACTCTCATCATTTTGCTCGTTGCTTCAGGAATTTTTGGCCAGTACCTTCAGCCATTATTAACCGATGGCACTCAATTTTTCTCCCAACTCTTTATATAAAGATATATAAAAAACAGAGGGTCTTTTATATATTACCGACCATATTCTCATCATCATACCTTACAAAATTAAGACATTAAGCGTACAAGTCAACACGAGCAATCTGGCTCACGCCATGCTCTTGCTCTTTTTCTTTATTAGATACACACTGTTGATATGCTGCGACAGCACGCTCTGAATGAAGGTTAGGCTGAACTTGCCAATATTGATAATTTGCATAGTTCTCATGTTGTTGATGATTATCTTGCCTTTGCTTTTGAACCGAAGTAACTACCACTCCACGCACCTGAGTAGCAGAAGTCTGCACTACTGGAAAATAAGATGAGTGGGCAAGCCCAAGCACAGACATAAACATCCCTTTTTAGATTCTTAACTTTAAGCTAAGTACAATAAAATTTTAAAGTCAAATTTCACTAATTTAAAACAAGCATTTCGTTGATTTTTTAGCAATATTATCACGCAAGTAAACAGGCAGAGCATCTTCTAATGCAATCGTTTTTCCCTGTACCCATAAACTAGATGCTATTGGCAAAATATCCATCGCATGAGGCAGTGCATCATTAACCACGTTTATCAAAATATGACCTAACCGTTCATTAAGTACTTGCGAGTAACTTGCAAAGCCAGTACCAGCGCCATACCATTGCCTTGTTTCATCTATAGGCAACTCAATATGATCAGGCACACACACTCTCTCTATAATCAATTCTTGAGCACACTGCTTTTGATCAATTTCAAATCCGGCATAATACACCTCACCCATACGTGCATCAATTGCGGTGATCACTTTCCTCGAGCCATATTGGCGATAAGCTCCTTGCGCCAAAACTTTTAATGTGGATACTGAAATAAGCGGTACCTCTGCACCTAATGCTAAACCTTGCGCAAGACCACACGCAATGCGCACACCTGTAAAGGCGCCTGGACCGCGACCAAAAGCAACCGCATCTAACTCTTTGGCTTGAATACCTACCTGCGCTAAAATCTCTTTAATCATAGGTAATACCAACTCAGTATGTTGGCGTGGGGCGATACGGTGATCTACGATCACCTCATTATCTATTTGTAAAGCAACGGAACATGCTTCAGTTGCTGTTTCTAAGGCTAAGATTTTCATTATTCTTCCACCCGACTTTGCCACTCAATATCAAAATAACCGCCCTTATTCTAGCGTATAAAAAAAAGCCTGCAACTGCAGGCTGTTTCACTCTCGAAGATCTATAAATAAACAATACATAATGTACAAGTTACTGCAATTAGTATTTAGAATGTATATCTAACTCCAGCAAACACACTATCAATGCTAGGCACACCTTGGGTTGTCCCATTATCCATATCTTCACCAAAGACATGCTGATACGTTAAATTCACCTGCAAAGCCGGTGTTAGATTATAGCCCCCACCTAAGCCTGCCAACACTTTGGTGCCCGTATCACCGATTGCATCACCGGAAAGCTTTTGACGCATCAAACCTGCTTTTGCAAACACATCAAACTGTGAGTTAATATGCCATGTTGGCACAACAACAACATCTATTCCTGTTGACTTGTAATCTTTATCAACTCCACCAACCTTAAAGCTAGTCTTGCCATAATAGCCATAACCTAGCTCTGCACCCAAACCAAACATATCGTTAATATCATAATTATAACCGACAGCAACACGGCCACCGATTTTATTACGGTCTTTATCTGTACCACCAGATAAACCTAATTTACGCTGTAAGGTATAACCTGCTTGACCTTCAACATATACACCCGTTTGCGCAAAAGCGACTGCAGTTGCACCCATGCAACCGATAACAGCAGCAGCAAGCAATGTTTTTTTAATCATAACCACTCTCTCTTAACTAGATTGTTTTTTTAATCGTAAGGTCATGATGAAAGGTTTGAAAAATAAAGTCAACTACCCAGCATTAAGCCTGATGTTATAAGCTTTTAGAAAAAAAACATAAGGTCTTTTCCATTAAGATAAAATTAATGTGCCAACACCAATTATAGAAAATATAATTAAAAAACAAGTCGTCTGCTCTATAATTTTTATATAATCTCAAGCATACCAGCGATTAATCAAAATAAATTATCCTTAGATCACAAAAAAGCCTACGATTGTAGGCTTTTAATTTTAAAAAATAATACTAAATTATCCTAGAATGTATAACGCAGACCTAATAAGACCGAATTAATTGTAGCCACATCATTGTCACCAATATTATTAGAACTCAGATCATCACCAAAAATATGGGTATAAGTTAGGTTAACCTGCAAATTAGGTGTAAAATTATAACCAGCTCCTATGGCTAACAGCGGTTTCCACTCTTTATTATCTCCACTAATAGTTTGTCCATTCAATGTCAAACTTCCATTAAGATCTTCATACGCCATACCCGCTTTAGCAAAAAGATCAAACTGAGGATTAATATGCCAAGTGCCTACAGCAGAAATATCCCAAGCAGTTGACTTCACATTAAATGATTCTCCCCCAAAACTATACTCAGTTTTTCCATAGTAACCCCAGCCTAGCTCAGCACCGATGCCCCACATTGGATCAATATCATACATGTAGCCAACTGCCACACGACCGCCAATATTTTTATCATCTCTTGATACTAGTGCTAAATCTGGCAAGTCTTGCTGATTAACATAACCTAAAGCACCTTCTACATAAATACTATGGCCTGCTGGCATACTTAAAGGGCCACCACCAGCGATTGCTGTTCCAGATAAACCCAAGGCAGCTGTAACACTTGCAGCAATTAATATTTTTTTCATCATGAAAACTCTCTCCGTAAGATTTTTAGAATTTTTATTCTAACGCCGGCTTACTTTAACAAAGCTTATTAAGCTAAGTCAAACAACTAAAATAATAGAAGATAGTGCATCTTATTGATTGCTTTGATGAAATATCAAAAAATAGCCCGCTAAGCGGGCGACATGGTTATGTAAATGCATTCCTTGTTAATCAACATAAGGGCAATAGCTATAATTCATCAATATAACGTTGTTCAGTATCATCATTATCCATATAATGATCTCTAGTCCTCGTATGGTTAGGTTCATTACAGTACTCCCAACCAATTTTAGGGCATGATTTACTTCTTTTAGTAACTGGGTCCACACAAGAGCACTCGTACTCTCTGACAATACATACTCCATATCGTTTAGTGAAGGAAAAATAAGTAGTCCGATCATCTGGATGTACGGCCGGTCCCTTATCTTTTTCACCATAAAAACAACCAAAATAGTAGCCAAAACTAACATGTAAAAAGTAGCCATTTTTATTTTTAAGTCTTACAGAAAATATAGGATCAACGGATATCTTGTCAGTGTAAACAAGAGACCAGTCCATTGTTCTATGGACAGCAGTATCTGGAAATATAGGACAGTCTGCAAAATAAGTCCACTGCCATGGTCTCGAACCACTACTAGTATCTGCTAAACATTTCAGGCCCCATTTTAGCTTGCTAGGTTCATATATTATAAGGAACCTAGAATTTTTTAAATCATAATACGTTCTATTGTCCCCATATTGAGTGGTATAAATTTGATTGTAGCCTGGGTAATAAAAAGAGCCTATGCCCATGCTATTATAGCGCTCGATCAACAGTTTCTGACATACTATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAGTTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACTTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGATACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGATTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAAGAATTTCAAAAATTCATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAACTAGGCTATACTAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGGTAACCCTCCCTTAAAATAGTACAAGTGATAAGTGGAATCTTCTGTTAAATTAACTTAGACAGGAGAGAGAAGATGAAACGATCAAAACTAACAGAATCACAAATTGTAGCCATGCTTAATGAAGGCCAAGCGGGTGTTAAAGTTG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>NZ_CP038942|2156714:2206462|2188177_2189005_+|WP_016211719.1|DBSCAN-SWA MCRWLAYQGPEIYLDTLIAKPINSLINQSISSGGNITTHGDGFGIGWYSQHKQPGLYRDLYPAWNDTNLQEIAHHISSPLFFSHVRASTGNASASRQNSHPFRYQNWLFMHNGDIGGFPIIRKDLESLINNDYYMHKEGNTDSEALFYLMLSNGLARNPIAAIQTSINQLHSLLKQHSVHLPARMTICITDGATLYALRHSNDQQSPTLFYRSGESVYVDELGICQFIQGKGATLILSEPLDDQEHWISIEEDSLLTIHQGDIQRIPFSLLPRLE |
48 | Staphylococcus_phage(33.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2212654 : 2258155
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP038942|2212654:2258155|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2327358 : 2386969
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP038942|2327358:2386969|DBSCAN-SWA 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56 | Planktothrix_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2424954 : 2598989
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP038942|2424954:2598989|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038942|2424954:2598989|2439547_2439988_-|WP_129556657.1|DBSCAN-SWA MFASHGRTMTITNNTKAKVMLYFDSFDCMYPSHGSSDERYSMDGLKNYVLDADDSVQVYEEMDASFASCYVGYHYYKFHAMFYAAPYIQASIKGKIHMNAGSVSSRTYYSQASTLSQYLKISESGSTFCIKGPKDPSQPDVVDDKC |
163 | Escherichia_phage(32.65%) | protease,transposase,integrase,tRNA | attL 2572613:2572672|attR 2580854:2581141 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2627629 : 2662069
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP038942|2627629:2662069|DBSCAN-SWA 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38 | Microbacterium_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2670155 : 2721301
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP038942|2670155:2721301|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATGAATTTTTGAAATTCTTCCATATCGCTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATAATTAACTAGCTTTTAGCAATACATTATAAATTTCTTTAGTGGCTGACACCTAATATTTGATTTGTTAAGGTGTCATATGTACATAAAACACTGTAACTTAGCAAAAAATAAGCAAATTGAACTGATGAAATATTTCATTGCAAATTCAACCATCAAAACAAAAGTTACTCAAAGAAATTAAAAAATAAGGCTACATCTCACTTGATAGCGCTGCCTGACTTCTATCAGGAATTTGCCCTGTTTTTTCTTCAAAATGTTGAAATAATGTCAAAGGCAATGGTCGTTCAACTGCGGGCGTCATCGCACTTACAGGAATGGCCATAGAATGACTACTGGGTAATGCCCGAGGCACAGAGTTCCCAGGATTCACTAACCTTGCAGCACTGATTAGCATAGGCAGATAAAGAGGCTGGCCAGGCGGTACGGCACTGCCCGTTAATACCTGATCAACAAGCACACCACGATCTCTTTCATCTAAGCTTACCACCATGGATTTACCCGTATGTTCGTCTCTATCAACCGCTAAATTATCGGCAATCACTTGCTGTAGATAGTGGCTATGAGCATTAACATACACTGGAGCAATAAACTCAATGGTCCCCATGCCTCGCCCTTCTGTCATACGTATTGAAACAGCACTGATTGTAGGCAAGGTAAATAACAGTCTATTTTCACAACTCCCGGCTATGCCTGCTATTTCTTGAGTGATTTCTGCAATCGCCGTTCTCACCACCAAATCACCACGACTAAAGTTTAGCCTGCCTTTAACCGGCTCTAAAAAACCACCGGGTTGTGACATCAGGCCAAACTGGCTTCTTTCCATTAATACCAGGCAATCATCTTTAGTCACTAAAGGAGAAAGCACTCCGGTTTGAAATAATGTTAATTTATACAATTCACTTTCTTGAGCAAACTCTCTACTTCTAAGCGTTGCCAATACCGAGTAAGGCACTTGCTTCGCTTCCATATACATAGTGTTTGTGCCAGGGTCATAGAGCGCTGCAGTAATAACCATTTGTTTACCGTCATAAAACTTTGGATTTTCTGCTAACTGCCTTAATTTTTTCGCTACAGCACGTCTTTCAGAATCAGTAAGCTCAATCGTCGGCAAATCCCTATAGCGGTTAACTGGATGCAACGTTTTTTTATCACTAACAAATACAACAGTTGGTGAACCATCAGTAAACTCAAAACTGGATTGAGAGGTTTTCGCATCGAACTTTGCAGTCACAGAGCTTGGATTGATTGCGCGAGGGTAAGATTTACTCTCCAGCTCTGGCTGTACATTACCGGACCATAGTTCAATTAAATCAAACATTAAAATTACATTCCCTTGTTATTATCATAATATTTATTTATTAATTAATTATTAACAAATATCAACTTTATCCAATTAATTTTTCCTGTTAAACCTTAAAGTTGAGCCTTAAACTACTGCTCATTATGCTTTATAAGCCAACGTCACGCCATCACTCAAAGGTAACATGCACATTTTAACGCGTGTATCATTAAAAATAAAATCATTAAACTCTCGAATCGCTAACGTCTCTTTATCAGTAATTGCACTGTCAGCAACCTTACCGCCCCACAGCACATTATCAATCATAATAGCGCCGCCTTGTCTTAATAGTTTTAATGATAATTCATAATAGTTTTTATAATTAATTTTATCAGCATCAATAAATACCATATCAAATGTTTGACTATTGCCATCTTCAATTAATTTTTTTAGTGTTGTTATTGCTTGACCTAAGCGCAAATCAATTTTATCAGTGACGTTTGCCATCTGCCAATATTCTTTGGCGATATTTGTCCATGTTTCACTGACATCACAGGCGATTAATTGGCCATCTTCAGGTAAAACCTCTGCAACACATAAACTGCTATAACCAGTAAAGGTTCCAATTTCTAGCACTTTTTTGGCTGAAATTAAGCGTGCTAAAACTGCCATAAATTGGCCTTGCTCAGGTGAAATCTGCATGTTAGATTCAGCCAGATCAGACGTTCTATGCTTTAGTTCCTGTTTAACGGTGCACGCTTTAACAGTATGTGAAATTAAATAATTATGTACCACAGCTGATAATGATAAACTCTGCCTTGACATATTTACTATCCCTATTTTATTAATAACCCATCTAACACTACATCTAAATTTCAATAACACAAAACGAAAGACTAATCATCATGCATTAGCATTAACACGCCATCACGACTACAGAACCTGGCACCGGTTGTAGAGGCTCTTTGTGATGATTGCTTAAAGCATCTTTAAAAAGAGAAGTTGTACTTTCAGATAGTTTTTTAACTTCTTTGCTATTATTACCAAACAGATTTCTAACTAAATTTTTAACAAACTCTTTAAACCATTCCCCTTTTTTTCTCGGATCATTTTCAGAAAGTACTTTAATCTCCTCGCCATCGACAATTTTCTTAACTGACAATAATGCTTTTTTTAAGTTACAGTTTACCTGAACAGGTGCGGTTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTCAGTCTCTATTCTCTGAAGAACAGCAACTTTTCTAGTTAGACAGTCAATTGCATCATCCTGCAAACCTCCTCCCTTAGAGTCTGGCTGCTGAAAGCGCTCAAGCTCAGCTTGATAATAGGCTTTATGCTCTTTTGCTTTTTCATGCAGTACCAATAACCCGGATTGAATCTGAAGTAACGTTGTTGTTTCTTGTTCAATCTCCTGACCACTAAATTGCGTAATATGACGTAAATTACCAATAGATAAAGCGCCTCTGTTATGTAAATCTTGAATACTCCATAGAAGAAATTGAGCACTTTCTCCTTTAGCTTGGTGTAATAACTGCCAATAATTTTTTGGGTCAATCCCAACATCATATAAAATTAAAAATGATTGTTTAAAATTATCACTATATTTTTCTAAAATCGTAGCCCACTCTTGGTAAAATCTTCCGTGCCTATCTTTTAAGTCCTGTAATTCTAACGATCCACTTCCAGGCATAATCCCTCCCCAGACTAATTAATCTCTACTTTCTGAGCCCATATCCTAAAAATCAGGCTTAATGCCTTATTAATAAATCAAGAGTAGTATTTTTATAATTTAGAAAAAGCACTAAAACTTTAGTTAAGTCAGAAAATAATGTAAATTGTTTATAATGCATACAATATATAAATTATATATAACCAGTAAAAATACACATAAAATTATAATAATCTAAAAATAAAACATATTAACTCTCATTGATAATAAATAATTTAACAATAAGAAATAAATATTAACCAGTATATATAACTTACAGCATAAAATGCTAGATTATTTTCCATATCAAAACAACGTCATTTACATGCCAACCCAACACTTAACCAACTGATTTAGTAATGGAAACACATCCAACACCTCCTCAAGCCCTGGCTTGCTGTAACATCAATAATCATTTAACGATAGTCCAAGTAACAAAAACTATTTCAATTTAATGATTAACTCCCTATCATAATCTTAGATTTTAAAATATAGCTATATTTCTAAATACCGAACACTGGAGCAACATAGTGCTACTTAGCCTTATTACAGCAATAACATTGATAATCAGCCTGTTATTTTTTGCATATGCAATAAAGTGCTTATTACATAAACGCCTTACTGCAACGTTCCTCTATATTTTCCTAGGCTCAACCACAACCTTAATAACCACTTGTAGTGCACTACTATTGCTTAATAACCTTACCTTAGACCACGTGACTAAAAATATCCCGATTGCCATGCTAAGCCTTAATCAATTACCGCCGCTCGCAT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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2744267 : 2804044
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP038942|2744267:2804044|DBSCAN-SWA 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57 | unidentified_phage(33.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2917841 : 2961239
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP038942|2917841:2961239|DBSCAN-SWA 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41 | Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2992924 : 3109635
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP038942|2992924:3109635|DBSCAN-SWA 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MRQNPSLSIILLVLAQLMTGMNITTSKYLVTHLPILLLMQVRFSLDALILLFCLCLSKKSTPIYTPLTKLKHKDWLIIFAQACCAGVLFNLLMLWGVRYTSASIAGIITSALPALITVFSLLLLKEILNKFKLLCISFATVGLLVINIQGLHFNQHSHLALWGDFLIILALIPEALYYILTKSNHSIALDQQFLTYYQ >NZ_CP038942|2992924:3109635|3022014_3023412_-|WP_016209721.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTMSVKAILAGAAKVGDRVTVKGWVRTKRDSKAGISFVAINDGSCFDSVQVIAANSLTNYESEIAKLTKDCAVIASGELVESPGQGQSFEVQATDIQVVGWVEKPESYPVSPKRHTVEYLREVAHLRPRTNLFAAVTRVRNCISQAIHRFLSQEGFAWVHTPLITASDCEGAGEMFRVSTLDMLNLPRTDKGAIDYSQDFFGQESFLTVSGQLNVEAYCLAMSKVYTFGPTFRAENSNTSRHLAEFWMIEPEIAFADLNDNAALAERMLKFVSTTLLEQCADDMAFFAARVDKQALTRLETISQSNFEIMDYTTAIEQLLKADKSFEFPVAWGVDLASEHERYLCEELVGKPVTVMNYPKDIKSFYMRLNEDGRTVAAMDVLAPGVGEIIGGSQREERLDVLKARMQEIGVSEQHLDWYLDLRRYGTVPHAGFGLGLERLVSYVTGVANVRDVIPFPRTPGNIPF >NZ_CP038942|2992924:3109635|3078497_3079001_-|WP_016210340.1|DBSCAN-SWA MALLNILQYPDPRLRLQAKPVTVFDDALAQTVQDMYETMYESSGIGLAATQVNIQQQILVMDLSENRSDPLCVINPEILETFDHAEHDEGCLSFPGVFAKVERAARIKIAAFDQRGEKFELEAEGLLAVCLQHEIDHLEGKVFIDYLSPLKRKRLEKKLLKQRRQVL >NZ_CP038942|2992924:3109635|3055152_3055374_+|WP_016212372.1|DBSCAN-SWA MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL >NZ_CP038942|2992924:3109635|3061813_3062524_+|WP_129556608.1|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAGAIKVIGKHLKKEVHISAISLLMAYMAVKLTCNILFFYHIQLNLGGATLKLTYSAILYPLVYVLMDWMVICYGTIWTMFLILFGVLLDGFSSGMISSTQFITIPHSLGSNELMLTQSVHNLSQGIWSLYWHGLAGSIIAYISELLLFSWLYNRLFNKSFWLSSIASICTTLAIHNAICDYQMFAGSPDRLDLILSNYGVNLIVIIAYTTFISVLRKKFNSSASNQLS >NZ_CP038942|2992924:3109635|3072870_3073239_-|WP_016210352.1|DBSCAN-SWA MILIFNFIKKEVIRLIGAVGYSWAGLVATLKSEAAFRLELLIAVILIPSACFLSVTIIARVLMITSILLVLIIELINTAIEAIVDRISMEHHSLSKKAKDIGSAAVLVAMINAVFTWIVILI >NZ_CP038942|2992924:3109635|3080283_3080763_+|WP_016210342.1|DBSCAN-SWA MIKESVLDVLMYLFDQNSETEQSLSSDQAALSAELEKAGFAKDEVERAFHWLEGLVDTSQRPKHFEPSMTTRAFAAKELSVIGSEHLSYILYLEHIGILNVELRELVIDRIMALGIDEIDLSHVKWVALMVLNNHYEDGFETEWFEEMILTDPKTEVQH |
109 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038942.1|WP_032126179.1|1102273_1102525_+|TSUP-family-transporter |
1102273_1102525_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_032126179.1|1102273_1102525_+|TSUP-family-transporter>NZ_CP038942.1|WP_032126179.1|1102273_1102525_+|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA | NA | NA | 1099804-1142864 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1110896-1110859, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1110762-1110725, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1100717-1100754, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016210918.1|1235173_1235923_-|hypothetical-protein |
1235173_1235923_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016210918.1|1235173_1235923_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016210918.1|1235173_1235923_-|hypothetical-protein MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS |
249 aa aa | NA | NA | NA | 1196849-1249530 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1224470-1224433, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1248618-1248581, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_032127044.1|1270372_1270573_+|hypothetical-protein |
1270372_1270573_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_032127044.1|1270372_1270573_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_032127044.1|1270372_1270573_+|hypothetical-protein MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
66 aa aa | NA | NA | NA | 1254066-1431301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1282946-1282909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1286452-1286415, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016212421.1|1282297_1282480_+|hypothetical-protein |
1282297_1282480_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016212421.1|1282297_1282480_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016212421.1|1282297_1282480_+|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA | NA | NA | 1254066-1431301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1282946-1282909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1286452-1286415, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_054300380.1|1285719_1286376_+|transposase |
1285719_1286376_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_054300380.1|1285719_1286376_+|transposase>NZ_CP038942.1|WP_054300380.1|1285719_1286376_+|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA | NA | NA | 1254066-1431301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1282946-1282909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1286452-1286415, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_081377858.1|1303458_1304169_-|transposase |
1303458_1304169_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_081377858.1|1303458_1304169_-|transposase>NZ_CP038942.1|WP_081377858.1|1303458_1304169_-|transposase MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
236 aa aa | NA | NA | NA | 1254066-1431301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1282946-1282909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1286452-1286415, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_155046725.1|1305026_1305167_-|hypothetical-protein |
1305026_1305167_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_155046725.1|1305026_1305167_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_155046725.1|1305026_1305167_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP |
46 aa aa | NA | NA | NA | 1254066-1431301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1282946-1282909, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1286452-1286415, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_129556517.1|1505260_1505548_+|hypothetical-protein |
1505260_1505548_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_129556517.1|1505260_1505548_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_129556517.1|1505260_1505548_+|hypothetical-protein MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK |
95 aa aa | NA | NA | NA | 1498501-1558047 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1555657-1555694, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016212013.1|1500953_1501337_+|hypothetical-protein |
1500953_1501337_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016212013.1|1500953_1501337_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016212013.1|1500953_1501337_+|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
127 aa aa | NA | NA | NA | 1498501-1558047 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1555657-1555694, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016211563.1|1520122_1520284_+|hypothetical-protein |
1520122_1520284_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016211563.1|1520122_1520284_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016211563.1|1520122_1520284_+|hypothetical-protein MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP |
53 aa aa | NA | NA | NA | 1498501-1558047 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1555657-1555694, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_098082828.1|1882441_1882699_+|transposase |
1882441_1882699_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_098082828.1|1882441_1882699_+|transposase>NZ_CP038942.1|WP_098082828.1|1882441_1882699_+|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1831827-1951365 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1946861-1946824, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_098082828.1|1942600_1942858_-|transposase |
1942600_1942858_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_098082828.1|1942600_1942858_-|transposase>NZ_CP038942.1|WP_098082828.1|1942600_1942858_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA | NA | NA | 1831827-1951365 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 1946861-1946824, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016211536.1|2210564_2210798_-|hypothetical-protein |
2210564_2210798_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016211536.1|2210564_2210798_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016211536.1|2210564_2210798_-|hypothetical-protein MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN |
77 aa aa | NA | NA | NA | No | NA | ||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016212450.1|2249751_2250654_-|hypothetical-protein |
2249751_2250654_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016212450.1|2249751_2250654_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016212450.1|2249751_2250654_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG |
300 aa aa | NA | NA | NA | 2212654-2258155 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2217743-2217780, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2249622-2249659, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2249756-2249793, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_129556569.1|2257380_2257590_+|hypothetical-protein |
2257380_2257590_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_129556569.1|2257380_2257590_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_129556569.1|2257380_2257590_+|hypothetical-protein MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
69 aa aa | NA | NA | NA | 2212654-2258155 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2217743-2217780, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2249622-2249659, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2249756-2249793, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016211963.1|2674910_2675570_+|hypothetical-protein |
2674910_2675570_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016211963.1|2674910_2675570_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016211963.1|2674910_2675570_+|hypothetical-protein MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA |
219 aa aa | NA | NA | NA | 2670155-2721301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2707841-2707804, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016211964.1|2676434_2676755_+|hypothetical-protein |
2676434_2676755_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016211964.1|2676434_2676755_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016211964.1|2676434_2676755_+|hypothetical-protein MHALSIFFMFFMISHTSHSLTMLYNERPPYLKTESKQQVLGLTGTFITQVFKTAKTPLHWKKTPAKRHLLLIKKNAEPLCAAGWFKNPQREKYAQYALRHLKCNTQ |
106 aa aa | NA | NA | NA | 2670155-2721301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2707841-2707804, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016210177.1|2698465_2698831_-|hypothetical-protein |
2698465_2698831_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016210177.1|2698465_2698831_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016210177.1|2698465_2698831_-|hypothetical-protein MDMSNSKTKKLKTGVIIAGAAAALMLAGCVGPGTKPASQSGPVKCSGINSCKGTSECATAKSACKGQNKCKGTGWVFAKSADLCKKKGGVVLSAGASNSSLAAVDASENLASLDDNKAYRR |
121 aa aa | NA | NA | NA | 2670155-2721301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2707841-2707804, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016210175.1|2699216_2699546_-|hypothetical-protein |
2699216_2699546_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016210175.1|2699216_2699546_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016210175.1|2699216_2699546_-|hypothetical-protein MFTDVFEKTLAESKEAQNWLAEATKEVFSLQQAMMADWAEWTRVSSVRSSSVKTVEEWVDLNLSSISELTQRSSKAMLDSVTMVSTFAAKNPFYQVKGREEKISKKKTS |
109 aa aa | NA | NA | NA | 2670155-2721301 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2707841-2707804, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016210580.1|2781745_2782006_+|methyltransferase |
2781745_2782006_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016210580.1|2781745_2782006_+|methyltransferase>NZ_CP038942.1|WP_016210580.1|2781745_2782006_+|methyltransferase MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI |
86 aa aa | NA | NA | NA | 2744267-2804044 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 2802279-2802316, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_129556602.1|2995392_2995602_-|hypothetical-protein |
2995392_2995602_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_129556602.1|2995392_2995602_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_129556602.1|2995392_2995602_-|hypothetical-protein MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC |
69 aa aa | NA | NA | NA | 2992924-3109635 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 3009651-3009688, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_016211201.1|2998735_2999044_-|hypothetical-protein |
2998735_2999044_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_016211201.1|2998735_2999044_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_016211201.1|2998735_2999044_-|hypothetical-protein MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA |
102 aa aa | NA | NA | NA | 2992924-3109635 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 3009651-3009688, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_155046758.1|3088213_3088345_+|phosphatase |
3088213_3088345_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_155046758.1|3088213_3088345_+|phosphatase>NZ_CP038942.1|WP_155046758.1|3088213_3088345_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA | NA | NA | 2992924-3109635 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 3009651-3009688, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_155046759.1|3088489_3088645_+|hypothetical-protein |
3088489_3088645_+
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_155046759.1|3088489_3088645_+|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_155046759.1|3088489_3088645_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA | NA | NA | 2992924-3109635 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 3009651-3009688, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038942.1|WP_032126148.1|3090287_3090470_-|hypothetical-protein |
3090287_3090470_-
Protein sequences of NZ_CP038942.1|WP_032126148.1|3090287_3090470_-|hypothetical-protein>NZ_CP038942.1|WP_032126148.1|3090287_3090470_-|hypothetical-protein MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI |
60 aa aa | NA | NA | NA | 2992924-3109635 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363176|38|NZ_CP038942|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038942 position: 3009651-3009688, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |