CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	1	12
NZ_CP038949	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038951	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038950	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038947	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 chromosome, complete genome	3 crisprs	RT,DinG,DEDDh,cas3,csa3	1	2	29	29

1. NZ_CP038948

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038948_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038948_1
• CRISPR_location: 1232-1455
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038948_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038948_1

>1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038948_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038948_1

>merge|NZ_CP038948|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038948|1|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038948.1|WP_155047299.1|11511_12870_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|350771
NZ_CP038948.1|WP_016211890.1|2875_5452_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP038948.1|WP_017375910.1|10599_11328_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038948.1|WP_155047286.1|12959_13526_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239737
NZ_CP038948.1|WP_036774631.1|7955_8420_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038948.1|WP_036771347.1|5568_6546_-|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP038948.1|WP_054300202.1|1943_2672_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038948.1|WP_017377658.1|13529_14216_-|Fic-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225718
NZ_CP038948.1|WP_155047285.1|6564_6822_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038948.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038948.1|WP_080963647.1|8758_8929_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038948.1|WP_155047299.1|11511_12870_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|350771	cd18013, DEXQc_bact_SNF2, DEXQ-box helicase domain of bacterial SNF2 family proteins. Proteins belonging to the SNF2 family of DNA dependent ATPases are important members of the chromatin remodeling complexes that are implicated in epigenetic control of gene expression. The Snf2 family comprise a large group of ATP-hydrolyzing proteins that are ubiquitous in eukaryotes, but also present in eubacteria and archaea. The bacterial SNF2 present in this family are members of the DEAD-like helicase superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	2.71429e-84
NZ_CP038948.1|WP_016211890.1|2875_5452_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP038948.1|WP_155047286.1|12959_13526_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|239737	cd03768, SR_ResInv, Serine Recombinase (SR) family, Resolvase and Invertase subfamily, catalytic domain; members contain a C-terminal DNA binding domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. Resolvases and invertases affect resolution or inversion and comprise a major phylogenic group. Resolvases (e.g. Tn3, gamma-delta, and Tn5044) normally recombine two sites in direct repeat causing deletion of the DNA between the sites. Invertases (e.g. Gin and Hin) recombine sites in inverted repeat to invert the DNA between the sites. Cointegrate resolution with gamma-delta resolvase requires the formation of a synaptosome of three resolvase dimers bound to each of two res sites on the DNA. Also included in this subfamily are some putative integrases including a sequence from bacteriophage phi-FC1.	3.48507e-50
NZ_CP038948.1|WP_080963647.1|8758_8929_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	4.0743e-09
NZ_CP038948.1|WP_036771347.1|5568_6546_-|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP038948.1|WP_017377658.1|13529_14216_-|Fic-family-protein	gnl|CDD|225718	COG3177, COG3177, Fic family protein [Function unknown].	9.0877e-19
NZ_CP038948.1|WP_054300202.1|1943_2672_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038948.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038948.1|WP_017375910.1|10599_11328_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51

Protein sequences

>NZ_CP038948.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038948.1|WP_054300202.1|1943_2672_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038948.1|WP_016211890.1|2875_5452_+|hypothetical-protein
MPVRFNPIKKVSLNGKVFNVPKEVPNKALVKLGQQQPDVVEILADFFRTNPKQEFFSKLFLGDRYQISAMYVSLRNIGLNQRIYIQKVFDDPEGFSDIIQRLSNIELCQSVYVQAAFENPDLIAVFEKHKDKFTSLNQFELNQWVYVKAVLGDPDRFDDILQRLRDIALCEPVYVQAALKSPQRVVEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDDPEGFDAILQQLSDIELCQLPYIQAALDYPDRVDVFKAHQDKFALFNHLKLSQLTNIEAVLGNLEGFDEGYRSLKAVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLREVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLRKVESDQSDNIQLMLDNIEEFNENFQILRQFGLSQQLYIESILKSPNVIVNISDCSDELLMLEELGLGQTVYLQKVLDHPDRSKANLYRLIRMGLDQPVYVQSALKDLDRFDDVCQRLNDIELCESAYVQAVLDDPNRIAVFERHKDKFTSLNQFGLNQWIYVKAVLDDPKGFDDILQRLRDIALCAPVYVQAALQDPQRVAEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDNPEGFDAILQQLSDIELCQSVYVQAVLDDPNIITKLKEHQKKLVKLNQLGLSQPKYIQAVFDHPEDFERNLQTLEILGLNKTEYVQAIFDDPTRIDKLHKYHHLFFRLHMLGLSQPICVDAVFNNTEKYAQICSCLEEVKDRIETVEDTIQQSSLGQSREQGFKSHYPVYKSKVIQSSFDFLISERKDPAEMKAHLFEHEREFLCNSNIKSDRSSFGAICRSAMRALTNTIFIIVAPVVGYKRNWHKKNMSITEKCLPFYNHTESTNKVMDLTCDIQHTLVADF
>NZ_CP038948.1|WP_036771347.1|5568_6546_-|IS5-family-transposase
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP038948.1|WP_155047285.1|6564_6822_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGDWLIYYEKTFPTPNLDFCFTGCWFSNEPNHKIQRGNVVSGFAKITALLHSSKSDQFWRFAYPAATLTSN
>NZ_CP038948.1|WP_036774631.1|7955_8420_+|hypothetical-protein
MNIFYLDHNIKKCAQYHCDTHVVKMILESTQILCTVLAKTGVDTPYRPTHKNHPCTLWAEESLDNWLWLLDLTMALNSEYMYRFNRKTPHKSAIVAQSLVFPEITPIGLTERPQAMPEKYRIPDDPVCAYRQYYLAEKNHLFKYTKRNKPIWQL
>NZ_CP038948.1|WP_080963647.1|8758_8929_+|hypothetical-protein
MKTQSAKLVPYTCKSCFCSACGKKATEIWIEKQNAVLPQCEYQHISSQKNLVTKSL
>NZ_CP038948.1|WP_017375910.1|10599_11328_-|IS6-family-transposase
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038948.1|WP_155047299.1|11511_12870_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MLHEYQHDAVNFIIENPSCALFLECGLGKTITTLTALSSLVNQYEIIKTLVVAPKRVVATVWAQEAQKWTHTDYLTFSSVIGSPAQRERALEKKADVYLINYENLVWLIEHKTIDFDFDALIFDEFSKMKAFNSKRFKAVKKVLPCVNRVIGLTGTPAPNSLLDLWSLSYILDRGKRLGKAYTGFRERYFQSDYMGYNWKPHAGSATEIHSLLEDICLTLTADEYLKLPRRIDNIIEVELPSAARHEYDELESDCLIKFEGQSLAVQNPAILTNKLLQFSNGAVYTDDEGTYKIVHDAKLEALDDIIQEAVGNPVLVAYNYKSDLSRLRERFPKAEHINDAPDTIERWNKGEIDILLAHPASAGHGLNLQDGGNTIVWFGLNWSLELYLQFNARLYRQRQTKPVFIHHIVTKDSVDQSVIESLQNKDQTQQALLDALKWGMSQRMKRKKVVT
>NZ_CP038948.1|WP_155047286.1|12959_13526_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MALVGYARVSSYGQNLESQTKKLQEYGCKKIYKEKISGVDQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKRKYSDTEVDSMIKDRESGMTIKLITEKYDISKASFYRLCSSRMENSI
>NZ_CP038948.1|WP_017377658.1|13529_14216_-|Fic-family-protein
MIALSKLTTIERNDLFSRLRTSFTHHSNAIEGISLTFGETKRLLESGMTAGDKPLHEQLVVMGFADAFDFVIREANNTSSELDDDFIKDIHAILFAKAMKICPERLEKPIGAWRTDERYIKGVDIKLSQPRMIDQDTNNLLYQVKDKALSLTDIADFHITFERIHPFADGNGRVGRLLIAYQAIKSDCIPPLILNDHREEYLQSLSETSKLTEFLIKAIDNSYALVKG

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	125217-125258	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	111946-111987	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	129443-129484	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55594-55635	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55882-55923	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134135-134176	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	106963-107004	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	72670-72711	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	110060-110101	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	110348-110389	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP013774	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence	45294-45335	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038892	Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038968	Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence	134137-134178	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128485-128526	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1545-1586	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1257-1298	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT	1257-1298	42	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197063-197104	0	1.0
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NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1599-1640	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197195-197236	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
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NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137266-137307	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128617-128658	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038948_1	1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT	1389-1430	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038948|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1943 : 170497	177	Streptococcus_phage(20.0%)	protease,integrase,tail,transposase,capsid,head	attL 87927:87986|attR 116024:117199

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038948|1943:170497|DBSCAN-SWA
TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTTTTACCTATTATAAGTAGTTTTTTTTATCTTTTAGCTATTAAGCTCTTAGTTATAAACGCCTAGTCTATTAATTAATAGTATTATTGAAAGGAATAAATAGACTATGCCAGTACGATTTAATCCAATAAAAAAAGTATCTCTTAATGGTAAGGTTTTTAATGTTCCTAAAGAGGTTCCGAATAAAGCTTTAGTTAAGTTGGGTCAGCAGCAGCCAGATGTTGTTGAGATCTTGGCAGATTTTTTTCGAACAAATCCTAAGCAAGAATTTTTTAGTAAATTATTTCTGGGTGACCGCTATCAGATTAGTGCAATGTATGTGTCGCTAAGGAATATTGGGCTGAATCAACGAATATATATTCAAAAGGTATTTGATGATCCTGAAGGATTCAGCGATATTATACAACGCCTAAGCAATATTGAATTATGTCAATCTGTATACGTGCAAGCAGCGTTTGAGAATCCTGACCTAATTGCAGTTTTTGAAAAACATAAAGATAAGTTCACATCTCTTAATCAGTTTGAGTTGAATCAATGGGTTTATGTTAAAGCAGTTCTTGGTGATCCTGATAGATTCGATGATATTTTGCAGCGTCTAAGGGATATTGCATTATGTGAGCCTGTCTATGTCCAAGCCGCGCTTAAGAGTCCTCAGAGAGTGGTTGAATTTGCAAAACATACGCATCGGCTTGTCACTCTTAATGCACTTGAGCCGAATCAATTTGTCTATGTTCAAAAAGTACTTGATGATCCTGAAGGATTTGATGCTATTTTACAGCAGCTAAGTGATATTGAATTATGTCAACTTCCATATATTCAAGCAGCACTTGATTACCCGGATCGAGTCGATGTTTTTAAAGCTCATCAAGACAAGTTTGCACTTTTTAATCACCTTAAATTGAGTCAGCTCACAAATATTGAGGCAGTTCTTGGTAATTTAGAGGGCTTCGATGAAGGTTATCGGAGTCTAAAAGCAGTTGGACTGGATCAGCCAAAAAATATCCAAGCAATGCTCGATAACATTGAAAAGTTCAATGAAAACCTTCAGAATTTAAGAGAAGTTGGACTGGATCAGCCAAAAAATATCCAAGCAATGCTCGATAATATTGAAAAGTTCAATGAAAATCTTCAAAATTTAAGAAAAGTTGAGTCAGATCAGTCGGATAATATCCAATTAATGCTCGATAATATTGAAGAGTTTAACGAAAACTTTCAAATTTTGAGGCAATTTGGACTGAGCCAACAATTATATATAGAATCGATACTCAAGTCCCCTAATGTGATTGTTAATATTTCTGACTGCTCTGACGAACTTTTAATGCTTGAAGAGCTAGGTTTGGGGCAAACAGTATATCTCCAAAAAGTGCTTGATCACCCTGATCGCTCCAAAGCAAATCTTTACCGCTTAATACGTATGGGGCTCGATCAACCAGTATACGTCCAATCAGCGCTTAAGGATCTTGATAGATTTGATGATGTTTGCCAGCGCTTAAATGATATTGAGTTATGCGAATCTGCCTATGTCCAAGCAGTACTTGATGATCCTAATCGAATTGCAGTTTTTGAAAGACATAAAGATAAGTTCACATCTCTTAATCAGTTTGGGTTGAATCAATGGATCTACGTTAAAGCAGTGCTTGATGATCCTAAAGGATTCGATGATATTTTGCAGCGTCTAAGGGATATTGCATTATGTGCGCCTGTCTATGTCCAAGCCGCGCTTCAGGACCCTCAGAGAGTGGCTGAATTTGCAAAACATACACATCGGCTTGTCACTCTTAATGCACTTGAGCCGAATCAATTTGTCTATGTTCAAAAAGTACTTGATAATCCTGAAGGATTCGATGCTATTTTACAGCAACTAAGTGATATTGAATTATGTCAATCAGTATACGTACAAGCAGTACTTGATGACCCAAATATAATTACTAAGCTTAAAGAACATCAAAAGAAGCTTGTAAAGCTAAATCAGCTTGGCTTAAGCCAACCAAAGTATATTCAAGCAGTATTTGATCATCCGGAGGATTTCGAGAGGAATTTGCAAACTCTAGAAATCTTAGGACTGAATAAAACAGAATATGTCCAAGCAATATTTGATGATCCTACTAGGATAGATAAGCTTCATAAGTACCATCATTTGTTTTTTAGGCTACATATGCTTGGGTTAAGTCAACCTATATGTGTTGATGCAGTCTTTAATAACACTGAAAAATATGCTCAAATTTGCTCTTGTTTGGAAGAGGTGAAAGATAGAATTGAAACAGTGGAGGATACTATTCAACAAAGTTCACTTGGCCAAAGCAGGGAACAAGGCTTTAAAAGTCATTACCCTGTATATAAATCGAAAGTTATACAATCGTCTTTTGATTTTCTCATTTCTGAGAGAAAAGATCCAGCTGAGATGAAGGCTCACCTCTTTGAGCATGAGCGTGAGTTTTTATGTAACTCTAATATTAAGAGTGATCGCTCATCTTTTGGAGCTATTTGTCGTAGTGCAATGAGAGCTTTAACAAATACTATTTTTATAATAGTAGCACCGGTTGTAGGATATAAAAGAAATTGGCATAAGAAAAATATGTCTATAACTGAGAAGTGCTTACCATTTTATAATCATACGGAGTCCACTAATAAAGTTATGGACCTTACTTGTGATATACAACATACTTTAGTTGCTGATTTTTAGATCGTGTACAAGGATAGGTTCTGTCGCAATTCAAGCATAGGCCCGCTTTGCGGGCGACTTTGTTGAAGCCTTCCGGCGTTGTTGCGTAACCTCTGGTCCCATATTCCAGGCACAATTCAGCTGCGTCTAAAACTATCCGGCATGCCGAGACTGGTCATCTTATTTAAAATACCCGCGCCAATTAGTCCTTCATTTTTCTGACGCGATATCTCTCTGGACTGCATCGTGTTGCCCAAAATGCGTTTGTAACGCTGAATCGCCAACTCAGAATAATTACGCTTGCCGTATTGTCGTGTCTTTTGCCAGTGCATTCTACCATGATCTTTAATCTCATTAAAATTTATGTTTCTAATCGCGTGGTTATTTTCATCAAATACGGCATTTTTAGGAGGAGGGATAACAACATCAGCATTAGGTGAGTGGTTTAAAACGGAATCGTAAACATCATGGCTATCGTAGGCTCCGTCTGCAGTGAAGCGATCAAACGGCTCATCAATTTGCTCCAGTAGCTCATCCACAACCTCCTCATCTGCTTCATAGCGATCGGTGATGAGTGCGGCTTGAATATAGTGATCATCATCAACGGCCACATGAAGTTTACGCCAGCTGCGCTTTGCTGATATCTTGTATTTTTCTTGGTGCCACTCGTCACGGCCAAAACGCTTAAGGCCTGTAGAATCAATGGCTATTCCCGCAATATCATCATCTGGCTTATCTGTTTTGCGATAGCGTGGGACCTTAATATCGAGCTCCGCTAACCTTTTTGATAACACCGTATAGTCAGGGCATTTGATCGGCAGTCCTTGGGATTCAAAGAAGGAATCAATTAGGCCCTGAGTCTGGCGTAATGGCTGTTTAAACACTTTACGAATTTCATGACAGGTGATGATCGCCAGGTCTGAGTATAGAAACGGCGTGCCTGTACCATCATAAACTCGGTCTTTTTTGTACCAACCTTCAATGGCTTTCTCTGAAATCCAAACATCAATACGGCCACGATTACGCAGGCTATCGGTGTACTTTGCCCAGTTTGTAACGCCATATTTTTGTTTAGGGATATCCCACCCTTTTCCTTTTGGATATTTATATGGCACTGCAACTCATCACAACTATTAGTTTGATGTTAATGTAGCAGCAGGGTAGGCAAACCTCCAGAATTGATCACTTTTTGAGCTATGCAACAAAGCCGTGATTTTTGCAAAGCCTGATACCACGTTTCCACGTTGAATTTTGTGATTTGGCTCATTAGAAAACCAACAACCTGTAAAACAAAAATCCAAATTAGGAGTTGGGAAAGTTTTCTCATAATAGATTAGCCAATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATC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MNMNSLLSVALQMTEGVTAWYSDTKKAEWNAPQDIKNVYANASFVANNRIVFNLGDNKYRLITAINYDYKIVYVKFIGTHAQYDKVDAATVELRR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300202.1|1943_2672_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_016211890.1|2875_5452_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|5568_6546_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155047285.1|6564_6822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774631.1|7955_8420_+	hypothetical protein	H6WFS7	Cyanophage	2.9e-21	38.2
WP_080963647.1|8758_8929_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|10599_11328_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_155047299.1|11511_12870_-	DEAD/DEAH box helicase	D2J050	Enterococcus_phage	2.6e-126	50.5
WP_155047286.1|12959_13526_-	helix-turn-helix domain-containing protein	I1ZBD6	Salisaeta_icosahedral_phage	1.4e-20	35.0
WP_017377658.1|13529_14216_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|14463_15192_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_155049831.1|15221_15761_-	helix-turn-helix domain-containing protein	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.0e-04	34.9
WP_032126239.1|16342_16615_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049830.1|16689_17271_-|transposase	transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	4.2e-33	43.6
WP_155049829.1|17326_18061_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_054300202.1|19096_19825_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_155047021.1|19848_20004_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273760.1|20106_22509_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273757.1|22852_23302_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556703.1|25782_26271_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211956.1|26328_27057_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211955.1|27513_28494_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275154.1|28630_29287_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.6e-31	40.7
WP_036771347.1|29649_30627_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155046642.1|31256_31748_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242576.1|31775_33638_-	AAA family ATPase	A0A088C4M0	Shewanella_sp._phage	1.0e-56	30.9
WP_036771347.1|33830_34808_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155047288.1|34822_34948_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047289.1|34880_35057_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275025.1|35306_37322_+	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047291.1|38983_41014_+	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|41148_42126_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
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WP_129556709.1|167601_167691_-	DUF1891 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274745.1|169768_170497_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.2e-37	42.2

Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038948.1|WP_129556706.1|69955_70585_-|hypothetical-protein	69955_70585_-	209 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_155067971.1|73663_73834_+|hypothetical-protein	73663_73834_+	56 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_032126838.1|78427_78631_-|hypothetical-protein	78427_78631_-	67 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212257.1|78967_79192_-|hypothetical-protein	78967_79192_-	74 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212260.1|79211_79484_-|hypothetical-protein	79211_79484_-	90 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212398.1|83921_84383_+|hypothetical-protein	83921_84383_+	153 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212408.1|106939_107389_-|hypothetical-protein	106939_107389_-	149 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212499.1|108014_108389_-|hypothetical-protein	108014_108389_-	124 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016211913.1|111380_112502_+|hypothetical-protein	111380_112502_+	373 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212298.1|117970_118297_+|hypothetical-protein	117970_118297_+	108 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes
NZ_CP038948.1|WP_016212579.1|160335_160533_+|hypothetical-protein	160335_160533_+	65 aa aa	NA	NA	NA	1943-170497	yes

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_155047019.1|47129_47282_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_155047019.1|47129_47282_-|hypothetical-protein
MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_129556706.1|69955_70585_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_129556706.1|69955_70585_-|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_155067971.1|73663_73834_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_155067971.1|73663_73834_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYDATTMALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_032126838.1|78427_78631_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_032126838.1|78427_78631_-|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212257.1|78967_79192_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212257.1|78967_79192_-|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212260.1|79211_79484_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212260.1|79211_79484_-|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212398.1|83921_84383_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212398.1|83921_84383_+|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212408.1|106939_107389_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212408.1|106939_107389_-|hypothetical-protein
MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212499.1|108014_108389_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212499.1|108014_108389_-|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016211913.1|111380_112502_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016211913.1|111380_112502_+|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212298.1|117970_118297_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212298.1|117970_118297_+|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038948.1|WP_016212579.1|160335_160533_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038948.1|WP_016212579.1|160335_160533_+|hypothetical-protein
MFSKTKVPLIISIGSVLVYFTILIFQVYSPPSFAKSYNKNPVGCEKLGKQAEELCVERINTMEEV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	85705-85668	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 position: 85705-85668, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP038947

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038947_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038947_1
• CRISPR_location: 360528-360657
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038947_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038947_1

>1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038947_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038947_1

>merge|NZ_CP038947|1|360528-360657|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038947|1|1|360528-360657|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038947.1|WP_016211797.1|357331_358735_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038947.1|WP_016212044.1|353130_353385_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038947.1|WP_016211268.1|366225_367410_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038947.1|WP_155047051.1|349533_350403_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016212010.1|362517_362814_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_155046940.1|363987_364371_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_054300516.1|365276_366110_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038947.1|WP_054300520.1|359306_359621_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_036777801.1|352138_352357_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016211271.1|367428_368373_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038947.1|WP_155047052.1|350547_351276_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_036777835.1|368677_369463_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_032126227.1|361474_361765_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_036794771.1|354107_355094_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038947.1|WP_075273359.1|358785_359361_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038947.1|WP_054300518.1|362937_363783_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_081007059.1|356108_357170_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038947.1|WP_016211795.1|355231_355426_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016212008.1|361802_362501_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_075273619.1|364643_365219_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038947.1|WP_016211797.1|357331_358735_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038947.1|WP_016212044.1|353130_353385_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038947.1|WP_016211268.1|366225_367410_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038947.1|WP_036794771.1|354107_355094_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038947.1|WP_075273359.1|358785_359361_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038947.1|WP_054300516.1|365276_366110_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP038947.1|WP_081007059.1|356108_357170_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP038947.1|WP_016211271.1|367428_368373_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37

Protein sequences

>NZ_CP038947.1|WP_054300520.1|359306_359621_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038947.1|WP_075273359.1|358785_359361_-|IS630-family-transposase
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>NZ_CP038947.1|WP_016211797.1|357331_358735_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038947.1|WP_081007059.1|356108_357170_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
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MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038947.1|WP_036794771.1|354107_355094_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038947.1|WP_016212044.1|353130_353385_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
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MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP
>NZ_CP038947.1|WP_155047052.1|350547_351276_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038947.1|WP_155047051.1|349533_350403_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038947.1|WP_032126227.1|361474_361765_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038947.1|WP_016212008.1|361802_362501_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038947.1|WP_016212010.1|362517_362814_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038947.1|WP_054300518.1|362937_363783_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP038947.1|WP_155046940.1|363987_364371_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038947.1|WP_075273619.1|364643_365219_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038947.1|WP_054300516.1|365276_366110_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038947.1|WP_016211268.1|366225_367410_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038947.1|WP_016211271.1|367428_368373_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038947.1|WP_036777835.1|368677_369463_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP038947_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038947_2
• CRISPR_location: 1404994-1405100
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038947_2

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038947_2

>2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038947_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038947_2

>merge|NZ_CP038947|2|1404994-1405100|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP038947|2|2|1404994-1405100|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038947.1|WP_016210748.1|1394571_1396527_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP038947.1|WP_016212185.1|1397727_1398717_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP038947.1|WP_052104738.1|1413532_1414339_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP038947.1|WP_075273540.1|1410063_1410675_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016212182.1|1397208_1397394_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016210751.1|1390555_1392361_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236941
NZ_CP038947.1|WP_016210752.1|1392844_1393642_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368573
NZ_CP038947.1|WP_016210795.1|1414444_1415416_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP038947.1|WP_016211834.1|1402090_1402405_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016210749.1|1393811_1394273_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_129556527.1|1410859_1411120_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_155047165.1|1407097_1408663_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038947.1|WP_129556641.1|1389205_1390468_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP038947.1|WP_155047164.1|1412112_1412535_+|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381151
NZ_CP038947.1|WP_036778182.1|1408869_1409697_-|thioredoxin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP038947.1|WP_051307365.1|1402662_1402923_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_036777256.1|1412957_1413158_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_052047040.1|1406133_1407072_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038947.1|WP_016211836.1|1402942_1403431_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038947.1|WP_016210801.1|1415397_1416369_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038947.1|WP_016210748.1|1394571_1396527_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP038947.1|WP_016212185.1|1397727_1398717_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP038947.1|WP_052104738.1|1413532_1414339_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	1.28417e-38
NZ_CP038947.1|WP_016210801.1|1415397_1416369_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	7.8235e-122
NZ_CP038947.1|WP_155047164.1|1412112_1412535_+|response-regulator	gnl|CDD|381151	cd19924, REC_CheV-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of chemotaxis protein CheV and similar proteins. This subfamily includes the REC domains of Bacillus subtilis chemotaxis protein CheV, Myxococcus xanthus gliding motility regulatory protein FrzE, and similar proteins. CheV is a hybrid protein with an N-terminal CheW-like domain and a C-terminal CheY-like REC domain. The CheV pathway is one of three systems employed by B. subtilis for sensory adaptation that contribute to chemotaxis. It is involved in the transmission of sensory signals from chemoreceptors to flagellar motors. Together with CheW, it is involved in the coupling of methyl-accepting chemoreceptors to the central two-component histidine kinase CheA. FrzE is a hybrid sensor histidine kinase/response regulator that is part of the Frz pathway that controls cell reversal frequency to support directional motility during swarming and fruiting body formation. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.94615e-31
NZ_CP038947.1|WP_016210751.1|1390555_1392361_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236941	PRK11634, PRK11634, ATP-dependent RNA helicase DeaD; Provisional.	0
NZ_CP038947.1|WP_016210752.1|1392844_1393642_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	2.13986e-06
NZ_CP038947.1|WP_016210795.1|1414444_1415416_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP038947.1|WP_155047165.1|1407097_1408663_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.71769e-34
NZ_CP038947.1|WP_129556641.1|1389205_1390468_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	2.59319e-84
NZ_CP038947.1|WP_036778182.1|1408869_1409697_-|thioredoxin-domain-containing-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.37155e-43
NZ_CP038947.1|WP_052047040.1|1406133_1407072_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24
NZ_CP038947.1|WP_016211836.1|1402942_1403431_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13

Protein sequences

>NZ_CP038947.1|WP_016211836.1|1402942_1403431_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP038947.1|WP_051307365.1|1402662_1402923_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP038947.1|WP_016211834.1|1402090_1402405_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP038947.1|WP_016212185.1|1397727_1398717_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP038947.1|WP_016212182.1|1397208_1397394_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP038947.1|WP_016210748.1|1394571_1396527_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP038947.1|WP_016210749.1|1393811_1394273_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP038947.1|WP_016210752.1|1392844_1393642_-|hypothetical-protein
MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK
>NZ_CP038947.1|WP_016210751.1|1390555_1392361_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS
>NZ_CP038947.1|WP_129556641.1|1389205_1390468_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter
MKFNGLVLIALITGVGLGALARFSLVSDHFAMADLNSVFHLVGEGYIDLLKMLVIPLVFTSLVSALLSLSDKGAANFRLSAIRFVVMLLVLTGISAGIGMLMGMAFNLGTGLVIPGVDLQPGHHYTGVVDTILGMLPTNPIAAMASGNAAALALFSIFIGAAALVVKKSKIADIKPFEGFIQSTFEISKQLARFVVALTPYGVLALIANVASATGASSLLSVLSYLVAIYVAMALVFALHLVILAAQGISPTYYLKHAYKALLVAFTTRSSFGTLPVTEETLRQKFKIHPDLATFAPTIGSSIGFNACAGVFPAMLVVMAMTIMHEPVTWQIIVMVMFINAIASLGISGIPGTASIAAAVTLSTLGLPYAVIAIVQGVDPIVDMGRTATNVNGVMASALTVDKYLATEETQARSIKAEAL
>NZ_CP038947.1|WP_052047040.1|1406133_1407072_+|IS3-family-transposase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP038947.1|WP_155047165.1|1407097_1408663_-|amino-acid-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP038947.1|WP_036778182.1|1408869_1409697_-|thioredoxin-domain-containing-protein
MKNYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
>NZ_CP038947.1|WP_075273540.1|1410063_1410675_+|hypothetical-protein
MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH
>NZ_CP038947.1|WP_129556527.1|1410859_1411120_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP038947.1|WP_155047164.1|1412112_1412535_+|response-regulator
MIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ
>NZ_CP038947.1|WP_036777256.1|1412957_1413158_-|hypothetical-protein
MTGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM
>NZ_CP038947.1|WP_052104738.1|1413532_1414339_+|methyltransferase-domain-containing-protein
MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK
>NZ_CP038947.1|WP_016210795.1|1414444_1415416_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK
>NZ_CP038947.1|WP_016210801.1|1415397_1416369_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKNTIKNTLVFPALLVFGSSFLQTSIAAKTKEPVRIIVNDWTSQIVLSKITGSILSDMGYQVKYINSKSNGQWFKLKNNQADIQVEVWQGTMAKKYNQLIKTGDIVDAGNHAAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALEKCYKIFATSKTKPKGMYLGGPWEKPDRARIRALKMNFKVIQVKNGDALWVELEKAAKEERPIVLFNWTPNWVEAKYKGKFVEFPKYSPKCISDPKWGKNSKYPWDCGNPKDGWLKKIARTEFSKEQPCAFELLKNISFTNAMISNVAASVDADKMSYDQAAQQWLDSNKKLWHSWIPATCSKVN

Crispr_ID: NZ_CP038947_3

• CRISPR_ID: NZ_CP038947_3
• CRISPR_location: 2631663-2631783
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038947_3

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038947_3

>3.1|2631700|47|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038947_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038947_3

>merge|NZ_CP038947|3|2631663-2631783|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038947|3|3|2631663-2631783|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038947.1|WP_036778294.1|2621609_2622992_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038947.1|WP_016210944.1|2641005_2642025_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038947.1|WP_036778297.1|2623000_2623474_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_098082812.1|2628861_2629377_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_016210671.1|2623606_2624866_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038947.1|WP_016210676.1|2625321_2627403_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038947.1|WP_016210935.1|2639118_2639661_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038947.1|WP_075275117.1|2630795_2631218_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_036778484.1|2640347_2640959_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038947.1|WP_155046943.1|2631250_2631391_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_032126312.1|2635410_2636205_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038947.1|WP_054300282.1|2633160_2633625_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038947.1|WP_016211759.1|2637354_2638542_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038947.1|WP_016210943.1|2639657_2640344_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038947.1|WP_036778479.1|2636383_2637109_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038947.1|WP_129556590.1|2635018_2635414_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP038947.1|WP_016211905.1|2630141_2630552_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_052047041.1|2629609_2629873_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038947.1|WP_155047228.1|2633681_2634164_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038947.1|WP_054300492.1|2627706_2628717_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038947.1|WP_036778294.1|2621609_2622992_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038947.1|WP_016210676.1|2625321_2627403_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038947.1|WP_016210671.1|2623606_2624866_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038947.1|WP_016210944.1|2641005_2642025_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038947.1|WP_016210935.1|2639118_2639661_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038947.1|WP_129556590.1|2635018_2635414_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038947.1|WP_036778484.1|2640347_2640959_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP038947.1|WP_032126312.1|2635410_2636205_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038947.1|WP_054300282.1|2633160_2633625_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038947.1|WP_016211759.1|2637354_2638542_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038947.1|WP_016210943.1|2639657_2640344_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038947.1|WP_036778479.1|2636383_2637109_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	3.8045e-65
NZ_CP038947.1|WP_155047228.1|2633681_2634164_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.80837e-07
NZ_CP038947.1|WP_054300492.1|2627706_2628717_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14

Protein sequences

>NZ_CP038947.1|WP_155046943.1|2631250_2631391_+|hypothetical-protein
MIEDPPALRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038947.1|WP_075275117.1|2630795_2631218_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038947.1|WP_016211905.1|2630141_2630552_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038947.1|WP_052047041.1|2629609_2629873_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038947.1|WP_098082812.1|2628861_2629377_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038947.1|WP_054300492.1|2627706_2628717_+|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038947.1|WP_016210676.1|2625321_2627403_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038947.1|WP_016210671.1|2623606_2624866_+|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038947.1|WP_036778297.1|2623000_2623474_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038947.1|WP_036778294.1|2621609_2622992_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKKEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
>NZ_CP038947.1|WP_054300282.1|2633160_2633625_-|IS630-family-transposase
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038947.1|WP_155047228.1|2633681_2634164_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MVECADSRHATLCDADSRGFIIVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038947.1|WP_129556590.1|2635018_2635414_+|nucleic-acid-binding-protein
MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
>NZ_CP038947.1|WP_032126312.1|2635410_2636205_-|M48-family-metallopeptidase
MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL
>NZ_CP038947.1|WP_036778479.1|2636383_2637109_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase
MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTDFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN
>NZ_CP038947.1|WP_016211759.1|2637354_2638542_+|S-methyl-5-thioribose-kinase
MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
>NZ_CP038947.1|WP_016210935.1|2639118_2639661_-|acireductone-dioxygenase
MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD
>NZ_CP038947.1|WP_016210943.1|2639657_2640344_-|acireductone-synthase
MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP038947.1|WP_036778484.1|2640347_2640959_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
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>NZ_CP038947.1|WP_016210944.1|2641005_2642025_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK

Self-targeting detection

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49. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to position: 1141029-1141066, mismatch: 1, identity: 0.974

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MGE targeting detection<

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NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP038897	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence	30307-30344	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	98297-98334	0	1.0
NZ_CP038947_1	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	104921-104958	0	1.0
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18. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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. ***********.******* *** *. **

132. spacer 2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

134. spacer 2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

135. spacer 2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

136. spacer 2.1|1405032|31|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45576 : 89169	43	Moraxella_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	127259 : 181534	58	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	200550 : 271835	60	Acinetobacter_phage(25.0%)	protease,transposase,tail,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	300688 : 360548	56	Bodo_saltans_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	444780 : 545540	108	Escherichia_phage(43.75%)	integrase,transposase,tRNA	attL 511567:511626|attR 525778:525951
DBSCAN-SWA_6	553239 : 601192	51	Synechococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	622662 : 725258	108	Prochlorococcus_phage(17.65%)	protease,transposase,plate,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	760675 : 808600	37	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	825281 : 938695	107	Staphylococcus_phage(30.3%)	protease,integrase,transposase	attL 887746:887805|attR 908940:910042
DBSCAN-SWA_10	959237 : 1004360	44	Escherichia_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
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DBSCAN-SWA_25	2575757 : 2603944	26	Acinetobacter_phage(12.5%)	protease,integrase,transposase,tRNA	attL 2573146:2573205|attR 2590986:2591274
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DBSCAN-SWA_29	3001417 : 3115337	113	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038947|45576:89169|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP038947|45576:89169|78396_78765_+|WP_016211108.1|DBSCAN-SWA
MKLNYQQLSDLSEYFTNINNDENIEYSVDSNPLGITKKNHELQFTMEESLSKDDLKEHWEKYCRKYNLSFDESLFIETPSSSPNQPEMKQQSFMEDNNIGEEKERNFQQENSFYTTHLTHRS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036776493.1|46661_47423_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779326.1|47724_49251_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49622_50462_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50501_51809_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51783_52953_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|53007_53733_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54011_54401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54588_55494_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047031.1|55732_56329_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910645.1|56563_57717_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_016210704.1|58611_60558_-	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210702.1|61212_64275_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
WP_016210701.1|64271_65336_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016210703.1|65691_66645_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66676_67840_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|67845_68445_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210697.1|68632_69133_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
WP_016210706.1|69150_70239_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211099.1|70377_71622_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211097.1|71618_72461_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036777711.1|72440_73250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73417_73645_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73645_74596_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74651_75203_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75329_75752_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_016211109.1|75744_76491_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211103.1|76533_77232_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77242_78067_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|78396_78765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|78759_79821_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126486.1|79870_80101_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211248.1|80230_81445_-	aromatic amino acid transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|81745_82807_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_036777695.1|82820_84548_+	oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211245.1|84581_85313_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211247.1|85312_86101_+	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211251.1|86205_86829_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211250.1|87148_87361_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047032.1|87516_88578_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047033.1|88572_89169_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038947|127259:181534|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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>NZ_CP038947|127259:181534|170630_171461_-|WP_036778324.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209611.1|128482_128674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047035.1|128753_128933_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209580.1|129024_129549_+	ankyrin repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209612.1|129932_130301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209595.1|130338_130611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300576.1|130701_131997_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211692.1|132632_133535_+	LysR family transcriptional regulator	Q6JIH3	Burkholderia_virus	1.6e-18	28.4
WP_051307362.1|133591_134443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211694.1|135022_137032_+	DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	3.0e-110	37.8
WP_054300271.1|137069_138044_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|138545_139958_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126550.1|140450_141458_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_016211636.1|141477_142998_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
WP_016211018.1|143948_145265_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_016211015.1|145368_145752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211019.1|145886_148952_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	5.1e-53	20.6
WP_016211017.1|149020_150124_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211016.1|150147_150702_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273381.1|150816_151386_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211020.1|151505_152261_+	DUF2076 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047036.1|152427_153327_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047037.1|153471_153777_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_098082829.1|154171_154567_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|154588_154954_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046700.1|155010_155175_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|155164_155464_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300544.1|155554_156001_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126725.1|156496_157063_-	DUF1415 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210241.1|157074_157860_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210235.1|158491_159415_+	two pore domain potassium channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210246.1|159466_160462_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210237.1|160493_160988_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_036778333.1|161079_161337_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|161426_161849_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210236.1|162167_162884_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210247.1|162927_163179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778330.1|163183_164620_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210231.1|164647_166090_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210242.1|166177_166516_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|166600_167131_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|167191_169384_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
WP_016210238.1|169426_169912_-	proQ/FINO family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210226.1|170181_170613_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778324.1|170630_171461_-	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_080664837.1|171475_171619_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_052104672.1|171649_172534_-	formyltetrahydrofolate deformylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210244.1|172505_172727_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210225.1|172900_173179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|174149_175055_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780891.1|175111_176290_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|176286_176862_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|176807_177173_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300541.1|177500_178280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126848.1|178813_179614_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_052104671.1|179832_180591_+	ion transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211859.1|180667_180955_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|180958_181534_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038947|200550:271835|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MQNIQRALISVSDKTGIVEFARTLAQHKVEILSTGGTAKLLKEHGLAVIDVSDYTGFPELFAGRVKTLHPKVHGGILARRGMDDEAMQANHIPAIDLVIVNLYPFQDTIAKDDCTLAQAIENIDIGGPTMVRAAAKNHQSVFIVVHPEDYARVTDALNNEAGMTERLRFELAVKAFEHTAQYDAAISRYLYKQCHDSDFPETLTLAFEKSGELRYGENPHQQAAVYKESNHTGISVVNAELLQGKALSYNNLADADAALACVKSFKECSCVIVKHANPCGVAHGKTVTEAYQRAFACDSTSAFGGIIAFNQSLTKEAAQTILANQFAEVIIAPYVDKDALEILSSKPNLRVLATGEGELQMGFELKRVAGGLLIQEQDRLSNQFDYAVVTERKPNEEELASLSFAWHVVAAVKSNAIVYAKNSQSIGIGAGQMSRIDSAKIAAIKAKEMGFSLDNAVMASDAFFPFRDSIDAAAQQGIAAIIQPGGSICDEEVIAACNEHGLAMIFTGERHFKH
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MIKKVLIANRGEIALRILRACREMGLKTVAVHSTADRDLKHVRLADESVCIGPAPALQSYLKFPAIISAAEVTGADAIHPGYGFLSENADFAEQVESGGFVFIGPRAETIRVMGDKVKAIQAMQKAGVPCVPGSDGPLGNDSAQTKRIAQKIGYPVILKAAGGGGGRGMRAVFEEDELLEALQLVRAEAAAAFGNNMVYMEKYLVKPRHIEIQVIGDGKGAAIHLAERDCSMQRRHQKVVEEAPAPGLTKEEREKIGEQCVKACRELKYRGAGTFEFLYEDGRFYFIEMNTRVQVEHPVTELITGVDIVKEQLRIAGGLGLSKRQKDIHIQGHAIECRINAEDPKTFMPSPGHIDFYHPPGGPGIRVDSHLYSGYSVPPHYDSMVAKVITHGEDRQSAIIRMQGALGETIINGIKTNIPLQQEIMADLNFQAGGTNIHYLEKKLNGQK
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209871.1|200550_202533_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|202742_204086_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|204352_207022_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|207045_208965_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|209134_210556_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|210701_211676_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_054300537.1|211707_212115_+	glyoxalase	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|212393_212615_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|212778_214440_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|214512_214803_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_036776911.1|215028_215484_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|215548_216013_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216105_217452_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|217451_218357_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|218418_219405_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|219397_219640_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|219761_221306_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_036776914.1|221352_222639_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|222681_224076_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224099_224279_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|224275_224455_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300181.1|224458_224740_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|224796_225162_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228167_228665_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|228835_229531_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|229633_231196_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|231511_233305_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233390_233663_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|233668_234295_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234281_235712_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236044_237100_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237068_237746_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|237735_238572_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|238731_239025_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|239131_239938_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|240242_241097_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_036776920.1|241251_242301_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_036776924.1|242351_243008_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|243025_244306_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|244579_245941_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046933.1|246214_246892_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|252323_253595_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|253651_254635_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_155067943.1|254631_254967_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155067945.1|255171_255705_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|256401_256767_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|256712_257288_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|257291_258011_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|258155_258356_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211358.1|258403_258865_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|259288_260770_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|260832_261942_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|262039_264001_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|264530_264935_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047045.1|264987_265683_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|265659_266634_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_098082809.1|266804_267155_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046934.1|267553_267724_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|268097_269180_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_129556499.1|270682_271835_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038947|300688:360548|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP038947|444780:545540|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210496.1|467774_469169_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210495.1|472785_473145_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|473564_474560_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
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WP_016211707.1|476959_477247_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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525778:525951	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016212268.1|529577_530162_+	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_017375910.1|530318_531047_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_129556455.1|532074_532677_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_052104771.1|539483_539822_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	5.4e-25	54.9
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WP_075274718.1|540392_540863_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A220NRQ8	Escherichia_phage	1.3e-32	64.3
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WP_036780395.1|541805_542060_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274719.1|542705_543572_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047068.1|544057_544258_+	HNH endonuclease	A0A2H4PHY5	Pseudomonas_phage	3.5e-16	64.3
WP_155047069.1|544345_544699_+	hypothetical protein	Q6DMU4	Streptococcus_phage	8.2e-08	34.8
WP_054300202.1|544811_545540_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038947|553239:601192|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTATTCAGATAATATTAGGATTATTTCAAGCAACAGTGATTGTATGATTAAAGCAATAATCATTTAAATAGAGTTTTAATTGATCTTTTGAGTGGAGTGGGCCAACGCCAGCAGGCGTACCGGTCAGAAAGACATCACCAGGTTCTAGGGTAAAAAACTGACTGGCTGTGCTGATTAATTCAGGAATGGTAGTAATCATTTGTTGAGCTAAGCCGTGTTGGCGTATTTCATTATTAATCGATAATTTAAATTCTATATTATCAAGTTGCTTTATTTGGTGGCTGTGCATAAAGGGGCTTAAAACACATGAGCCATCAAAGGATTTGGCTTTTTCCCAAGGGTGACCGTTATCTTTAAGCTGGTTTTGTAAATCGCGTAGGGTTAAATCAATAGCAAGGCCATAGTAAAACGTCTCGAGTTGAATCTCTTCTGGCTGTCGTTTAGAAACTGTTTCAGTGATCAGTAAAGCAAGTTCCAGTTCATAGTGGCAAGAACCATAGGCAGTGGGCCATTGGATGGGGGTAGTTAAATCAATCATAGCTGAGGTCGGTTTCATAAATAATAACGGTGTGGTTGGCGTTGCATTATTAAGCTCGTGAATATGATCAATATAGTTGCGACCAACACACACTACTTTTCCAGGTTGCCATTGAAGGGGATGTTGGTTTATATCCATGTGCTGATACGTCATAGTAAATGCCCTGATAAGATGAGTCTATGGTATGGGCATTAAACCATATTTAGGAATGTTTAGCCTACTGCTTATTTGCTTTATTAATGCGTATTTGAATTTGCTCTTTGACGACATTGTAAATTTTATGTGGGTCGATTTTACCAACAAACTCATTGCAGCCGATTTCTTTGGAATCTGATTCATTAAAAACGCTAGTAATCGATGTGTTGAGCATAATAAACAAATTTTTAAGTCCTGGATGTTCTCGACAGTTTTTTATCAGTGAGTAGCCATCCATTTCTGGCATTTCGACATCGGAAATAAGCATGAGGTATTTACGGCTAACATCACCTGCAGTGCGTGGAATATCATGCTCAAGAATGTCCAGTGCATGTTGTCCATCATCGGTCATAATGACATTAACGCCAATTTGATCTAATACTTGCTTAACATGGCGGCGAGCGACTGAGGAATCATCGGCGACAAGTACGGTGTATTTGTGAGCGACTTTTCTGATCATATCATCAAGATCATCAGTGTTGAATTTTGCTCTAACGTCATGAATATCACCAAGAACACGTTCAACATCGAGTAATTCAACTAAACGGTTGTCTACTTGCGCTAAGTCTTTGGCTATGCCTGTGATATAGTGATCCCGGCCAGTGGCTGGGGGGGGTGGAACAATACTTTCCCAAGACGCATTAACAATGTGATCTACTTTATAAACAACTAAGCCTTGTACACTGCGATTATATTCAGTGATGATTAAAACTTTATCTTCTAGATCATAGGTATATTCATCATTGACGGCTTTATTAAGGTCGATAACGGGCATGGTTGTACCACGAATACTGGTTGCACCAATAACGGCTTTATGCGAGTTAGGTAATTGCGTTAATGGCGGTACATTAATAACCTCTCGAATTTTAAAGACATTAATACCAAACAGCTGACCATCCAGATGAAAGAGTAATATCTCTAGACGATTATGACCGACAAGTTGTGTTCTAGCATCAACACTTGCGAGTATATCTGGCATAACTGACCCTCCCCAGTAATCTCAAGTATAGAGCTTCTTTTTTAAAGTCGCGGTGAAAAAATTAACTTACTATAAAAAAAGCGCTAAAACAGCCTGCTAATTAGTCTGTTAATTAAAATATAAAGTTATGGGGTAAATACTGGTAGTACAGGGGAAATCGCTTTAGGAAAATATGAACCGAGAGTCAGTCAGCTCTTTTTCAAAAACATATCTATTATACTAAAAGCCTATGCTTATTATTTATCTGCAGCTTTAGTTATGAAGATTTTTATTAACCTTATGTTTGTACTTGCTTTATGCGGTTTTAATCTAAATGTTAGTTATAGCGCTGAGCGAGTAATTAAGTTAACCATGGACGATCGGCCACCGTTTCACTATCTTCAAGATGGCAAGTTAAAGGGTCCGGTGATACAAACATTGCAGTGTATCTTTAAGCATATGCAGCAAGCCTATGATGTTGAAGTGGTCTCCTGGTCAAGAGCACAGCATTATGTCAAAGTGGGATATGCTGATGGTTTTTTTGCGGCTAGCCATAATAAAACTCGAGACCAATATGCGACGCTTTCTTATCCATTTGTTGATCAGTACTGGAGTTGGTTTACATTAAAATCTAAAACTATCTCAAAAAAACAACTTGAATCAAAAGCACTAAAGGTGTCTAGTTGGAAAAAATCTAACTCTCAGCATTGGTTAGAAAAAAATAGTTACAATTTTATTAATTACCCACCTCAGGAAATCAGCCATTTGGTGAATATATTAAGAGCAGAGCGTGTAGCGGCTATCTTTGGCAGTAATATCGCAATCTATCAGTATTTAAAGAGGCTGAGGGTTTTTGATCAGGTCAAAGAAATAAAAGTAGTTCATAAGCCGATGGGGCTGTATATGTCTCATCGTTATCTTAAAGAAGATCCAGAATTTTTAAGGGTGTTTAATGAAAAGTCCAAGAAATGCTTGTAGTTAAATTTAAGCAGCCTTCCTAGCGAGGGCTGCCTTATATTATTATTGTTTACGCCCTATCTCTTGTACTTCCATAACCATGACTTTAAAAAAGTCATAGGTCATATAGTAATTACCGTGATCACCTGCATTCTCTCCCCATGAGTTACGCAAGGTTAAAAGACCACATTGTTGCTTGCCACTGCCTACACCAAAGGTAATTTCTGCACAGGCATTATCATTATATCCGGTAATAATCATTTCATGGCCGCCAGAGGACTCTTGTTCAACAAACTCTTTTACTTCAGGAATCATCACCCAGGCATCATCAGGGGCGCCATTATACGAGCCACCAATAACGAGGTCGCCAGGTCTTCCTTTTGTTGATCCTTTGGGCACAACGGCAAGCAGTGAGCCTAATGTGACCCTATGGCCTAAATTAAGAGCTCTTTTTACCATACTCAGCGTAAAACTCCCATAAATCGGAATTTTACGCCAATCTTTGTCTGTAAAGCGTTTATCGCTAAACTGCTGGAAAACCTCAGGTGTCATATCGCTTCCTGTTTCTTTTGCATTATAGGTTGGGTAATGTAATAAACCACCGCAAACATATGCCCCATCAATCATTTGGCTTTGTTGGTCTCTGCTCATAAAACCATATGTAGTGATTTGCCCGAGGACCTTCGTCCCCCACGAGCCTTCCCAGCCACCCATAGCATCTGGGTTGTTAATGTATTTTCCCAGCTCCAGATTGCAAAGTTCACTCATTTGATTGTATGCACTGGTGAGCCCAAAATAAGCATCCACAGCACCTGCATTGGCAAATGTGGCACAGCTGCCGTGTGAGCCTTGGTTATGTACGGGAACGCCTGCCATATCTAATTGTTTTTGTGTGCTATGGCCGATCGCTGGCATATTAAAATTAGGGGTTTGCTGAGTACTTTTTAGTGCCTTCGATATTTTGGAAACTTTCTCAGCTTTTTGCTCTGGTGATAAATTTACCTTCATTAATGTAATTTGTTGAGGCATCATTGTTGAAAATGATGCGTGAGCCCCACGCATCATTGGGCCTCCAGATCCTGGAATGGTAACAAGTAAGGTTTCTGCATGAACTGAAGCTATTGTTAAGCTTAAACTACTGATTAGAAGAAGATGGATATTCTTTTTTTTAAACATAGCGTGGTCTCCCAGAGCGATAATAAAATTGCTTTATAAAAGCAGATAAGGTTAAAAAAATTTAACAAAAATATTTATTTTTTTACTTGGTCTAGTTAATTATCAGAATTAACATATATTGTTAATATGTCAATAATATTTATTAAGATTTTTGTTAATTTTAGTTGGTTTGAAAATTATATGTGCCGATTAATTAATTTATCTCTGGTGTTTTATATTTGATTGGTAAAAGATAATATTATTTGATAATAATATTTTGTGTTTTTTATGATTACATTAATTTTTTGCTGTTTTTTTCATGCTGTTGATATCAGTGTATGATTATATAAATTTTCAATTTTTATATCTTAAAATATAAATCAGTTAGGAAGGAGGGTG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MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEG
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MKVTAIYPGTFDPITNGHTDLVERASRLFSKVVVAVAHVTHPSKTPLFTVDERVHMATEALMHLNNVEVCAFRGLLADYVQKQQVHLLIRGLRAVSDFEYEFQLAAMNRQLAPDVETMFLTPSEKYSFISSTLVREVSSLGGNVSAFVAANVAKALQGKFVETAEKTSDEVKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211663.1|554061_554727_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|554791_555748_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
WP_032126810.1|556006_556705_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211662.1|556747_557860_-	C1 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|558464_559040_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|558985_559351_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|559438_559789_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|560524_561586_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|562797_563613_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|563703_564687_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|564857_565379_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_036779246.1|565412_565667_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-20	58.8
WP_016210909.1|565669_566947_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|567639_568167_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|568286_570599_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|570727_571543_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|571740_572205_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|572334_573396_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|573656_573953_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|574235_575699_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|575701_576754_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_036779281.1|576743_577199_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_155047071.1|577223_577547_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|577894_578206_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300208.1|578335_579127_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779278.1|580284_581238_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|581351_581549_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126198.1|581794_581995_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_142396463.1|582105_582222_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|582308_582530_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|582556_582922_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|582978_583143_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047072.1|583132_583447_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|583584_583749_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|584043_585480_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|585521_586973_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|587084_587372_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|587561_588605_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|588620_589520_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|589516_590035_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|590104_590722_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_036776217.1|590731_592219_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|592228_595909_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776215.1|595982_596795_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|596791_597472_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047260.1|598312_598471_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155047073.1|598663_599221_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|599270_599561_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300215.1|600364_600859_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|600853_601192_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038947|622662:725258|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209523.1|622662_624012_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
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WP_036778935.1|626278_627505_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|627498_628527_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|628504_629197_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049805.1|629198_630671_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051307310.1|631157_632630_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|632629_633028_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|633024_634713_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|634694_635651_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|635693_636209_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|636313_637246_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|637465_637852_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|637868_638513_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|638693_639533_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|639608_640211_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|640211_641066_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|641422_641734_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|641758_643150_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|643305_644037_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_129556465.1|644033_644606_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|644592_645150_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|645155_646136_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|646275_647076_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|647079_647847_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|647843_648308_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|648330_648984_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|648987_649335_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|649368_649620_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|649696_650965_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|650967_651726_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|651787_652678_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|652728_653412_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|653497_653755_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047218.1|654027_656196_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|656187_657060_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|657227_659057_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|659219_659861_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|660102_660633_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|660650_660824_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|660882_661932_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|661938_662889_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|662942_663887_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|663914_664652_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|664740_664983_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|665057_666281_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|666312_667161_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|667157_668210_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|668330_668951_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_036780649.1|668966_669953_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|670063_670519_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038947|760675:808600|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038947|825281:938695|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209658.1|846070_847426_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
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WP_016209661.1|848389_849265_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|849868_851173_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|851285_851891_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|851972_853274_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|853341_855774_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|855877_856150_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_075273480.1|856232_858131_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|858162_859047_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|859055_859451_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038947|959237:1004360|DBSCAN-SWA
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MKVNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLSHLTHRS

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126518.1|1023454_1025656_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211478.1|1025672_1026488_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|1026467_1027187_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
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WP_032126362.1|1027875_1028241_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|1028415_1029078_+	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|1029108_1029477_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|1029487_1030804_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|1031086_1031662_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126515.1|1031737_1031917_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|1032089_1032383_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_075273504.1|1032572_1032926_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211262.1|1032980_1035254_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
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WP_054300275.1|1035683_1036559_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211550.1|1036636_1037398_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211548.1|1037381_1038338_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211549.1|1038600_1041105_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211553.1|1041108_1041849_+	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1042188_1042554_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|1042610_1042775_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|1042764_1043064_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126933.1|1043067_1044369_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1044537_1045512_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016209411.1|1045717_1046512_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|1046674_1047463_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_036776605.1|1047459_1048671_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126508.1|1048660_1049020_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|1049114_1049543_+	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_129556555.1|1049673_1050804_+	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|1050800_1051529_+	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|1051586_1052474_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209433.1|1052558_1052933_+	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|1053032_1054310_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038947|1086796:1216012|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038947|1256684:1432581|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211215.1|1271663_1273634_+	acetate--CoA ligase	A0A2H4PQU7	Staphylococcus_phage	1.5e-77	37.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP038947|1448196:1554463|DBSCAN-SWA
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MIKKNIKLDNEEQAIEDSFDAFLQGGSLDAVALIEAAKNTGKKSKPVSLRLTESDFTKAHAKALEEGVAYQTLLTSVIHLYLSGMLVRKS
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MTFKERCFVTFLGVLLLLLQFNLWFGQGSVANLGELNHKIDIQSDKNKTLSHRNEQLEAEIFTLKQGDASIEARARRELGMIKPGEVYYQFIGDQNKADKVNNIDK
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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
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MKRAEKYAEIQQESLDDLVKKHATLVRRVAHHLKGRLPEAIQVDDLIQAGMIGLIEAAKKYDASKGASFETFAGIRVRGAMLDEVRKNDWVPRSVHRHAREIAEAIQSLEGRFHRDVKDSEVAEFMGLTLSDYHSMLQDSSGSKLLGFDDLGVPLDIAAPVERHHVGPIDKLLYEDFKQRIADQILTLPEREKLVLSLYYDEELNLKEIGQVVGVSESRISQIHSQAMLRLRARLQMNGE
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MDNKWVVDIAIIGTGTAGMAAYREAIKFTKNIVLLEANTYGTTCARVGCMPSKLLIAPAHVCHKVKSMPTLGLQVGPVSIDGQAVMRRVRDERDRFVRFVEEAVAGFDANHLVQQRAKFNSDHELILADGRIIQAERIIIATGSRPYIPDELQAAGSRLMTNDDVFDWQDLPQSTAVFGAGVIGLELGQALHRLGVNVELFGRNNAISLITDPDINCYAVQTFQREFTFHAHADMLAITEKKDHVEVRFNNAENENVEQVRRFEYILAATGRIANVDGLGLETTTLALNHRGVPLYDPLSMRCGDSNIFIAGDACGDLPLLHEAADEGKLAGQNAGRFPEVFKQQRYVPLGIAFTDPQLAVIGQSYRQLSEGSLAFKIGRVLFEDQGRSRVMLVNKGVLHVYGECGTGRLLGAEIFGPNAEHLAHLLAWSIQSHFTVIDILHMPFYHPVIEEGLRSALRDLLHNLQMGPLPPARCIDCGVGA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155047162.1|1449190_1449628_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|1449642_1450008_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210849.1|1451256_1452705_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210851.1|1453760_1454432_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126446.1|1455918_1456473_+	hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SEQ1	Hokovirus	3.2e-06	25.7
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WP_051307341.1|1458407_1460006_+	ABC-F family ATPase	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	1.5e-56	28.9
WP_155047161.1|1460699_1461671_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300343.1|1461706_1461934_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|1461937_1462824_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007031.1|1462911_1463184_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209794.1|1463918_1464542_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776664.1|1464587_1466531_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A1U9WQS3	Geobacillus_phage	1.1e-05	23.9
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WP_016209790.1|1467456_1467915_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556639.1|1468210_1468621_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209775.1|1468637_1469093_+	flagellar motor switch protein FliN	NA	NA	NA	NA
WP_016209797.1|1469089_1469581_+	flagellar biosynthetic protein FliO	NA	NA	NA	NA
WP_080664822.1|1469577_1470327_+	flagellar type III secretion system pore protein FliP	NA	NA	NA	NA
WP_016209776.1|1470356_1470626_+	flagellar biosynthesis protein FliQ	NA	NA	NA	NA
WP_036776670.1|1470641_1471427_+	flagellar biosynthetic protein FliR	NA	NA	NA	NA
WP_016209786.1|1471440_1472574_+	flagellar biosynthesis protein FlhB	NA	NA	NA	NA
WP_016209770.1|1472608_1474702_+	flagellar biosynthesis protein FlhA	NA	NA	NA	NA
WP_016209767.1|1474732_1476193_+	flagellar biosynthesis protein FlhF	NA	NA	NA	NA
WP_129556524.1|1476173_1477061_+	MinD/ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209784.1|1477057_1477780_+	RNA polymerase sigma factor FliA	A0A1B1P7V3	Bacillus_phage	2.7e-05	24.1
WP_017377132.1|1477866_1478250_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036776675.1|1478291_1479035_+	chemotaxis protein CheZ	NA	NA	NA	NA
WP_036776682.1|1479047_1481072_+	chemotaxis protein CheA	NA	NA	NA	NA
WP_051307317.1|1481133_1481427_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209791.1|1481563_1482286_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209771.1|1482450_1483173_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126436.1|1483879_1484335_+	SUF system Fe-S cluster assembly regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209793.1|1484350_1485799_+	Fe-S cluster assembly protein SufB	NA	NA	NA	NA
WP_016209795.1|1485839_1486595_+	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.3e-10	24.6
WP_080664823.1|1486575_1487976_+	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_016209796.1|1487999_1489217_+	cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	2.9e-92	42.0
WP_016209778.1|1489247_1489622_+	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A218MM00	uncultured_virus	1.7e-11	38.5
WP_016209772.1|1489640_1490192_+	putative Fe-S cluster assembly protein SufT	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1491473_1492448_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300148.1|1492545_1493607_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1494161_1495136_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212424.1|1495479_1495758_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036781387.1|1495750_1496023_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1496140_1497223_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300346.1|1497369_1498245_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126678.1|1498255_1499266_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
WP_016211554.1|1499592_1500219_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_016211557.1|1500264_1501494_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_032126677.1|1501688_1502252_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211555.1|1502326_1503685_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211664.1|1504221_1504950_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|1505322_1508142_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211669.1|1508296_1508647_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1509471_1510446_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556522.1|1511756_1512989_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211405.1|1513195_1514968_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_016211403.1|1515103_1516147_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_036777261.1|1516160_1516904_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211398.1|1517050_1517338_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211732.1|1517942_1518641_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047159.1|1519062_1520454_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1520509_1521334_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
WP_054300173.1|1521948_1523010_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046730.1|1523228_1523369_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212266.1|1523636_1524284_-	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_016212267.1|1524564_1524924_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

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CATGCTTAATGAAGGCCAAGCGGGTGTTAAAGTTGAAGATATTTGTCGCCAGTATGGTATTGCTAAAAGCAGCTACTACAAACTCAGGTCCAAATATCAAGGCATGGGCGTTTCAGATCTACAGCGTTTAAAAGAGCTTGAAGACGAAAATCGGCGTTTGAAACAGATGTACGCAGACATTAGCCTAGAGCACAAAGTGCTCAAGGATATTGTTGAAAAAAAGCTATAACCGCAGCGAGTCGGCTTGACTTAGTTGATTATGCTGTCAAAACTCATGCATTGAGCGGGAATAAAGCATGCAAGATATGCAGTATTGGCCGATCAGTTTATCGGTATCAACCTAAAAAGCAGGTTACTGATACTAAAATTAAAAAGGTGCTGACAGATTTAGCTAAGGTACATCATCGCTGGGGTTTTGACAAAATGATGGCTAAAATCAAGCAAAACTACGCTTGGAACCATAAGCGTGTTTACCGTGTCTATTGTGAGCTCAAGCTTAATTTGAGGGTCAAGCCTAGAAAAAGACGTTCACCACGGCAAGCAAAAATGTTAGTTCAGCCTATTGTACCAAACTACTGTTGGTCACTTGATTTTATGAGTGACACGCTATCGAATAAGCGCAAGTTTAGAACCTTAAATGTGATCGATGATTATAATCGTGAGTATTTATTGATTGAGCCTGCTTTTCCCTTGCCATCAATGGTTGTCACTCGACTGCTTGATCAGGTTGCCGAGTCAAAAGGTTATCCTGAAGTGATTCGCAGTGACAATGGCCCAGAGTTTATTTCAAGTGATTTTACAAAATGGGCAGAGCAGCACAACATATTGCTCCATCATATTCAGCCTGGGAAGCCCGCACACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCTCTATAATAACAATTGCTGCGATTAAAATTTATTAATTCACATTGCCTTGTAACTGGAATATTTTTCGGCTCAGACTCAATAAGGCACTTTCTTGTTTCATAGTCCAAGCTCTTCAACTTTTTTGCAGCCCACTCCAACTCTGCTGTGCGTTTGCCCAGTTGACGGTGAAGTTCATTCACTTCTTTTTCTTTGGTTTTGATTTCATCCTTAAACTCCGCCACAGCGCTATCGATATTATAGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAATTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACCTATTACACAAATTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGACACTCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGGTTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGTGATATGAAAGAATTTCAAAAATTTATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCTTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGTGCTATAAAAGCCAGGCTTGCATTTGCTAAAAACACCTTTTTCCAGTTTTGAACAGTTTTAGGGACTAGCTCATATTTCGAGCATATTTGGTTGAGCGTCTGATCTCCTTCGATGACCTCTAAGACAACTTTAGTTTTAAATTCAGCGCTTGGCTTCTTTCTTTTTTGACTCATGTCATAGCTCCTAAAATGTTAAGCATCATTTTAACCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGTCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCAGGAATAAATCGTTAAACTGTTCTGTCTGAAAACTCGGGAGCATTATAGCTTTCGCTGCACTTATTTTATTTAATTTTAAGAAACAATCTCTAGATCTAAAGGTGTTTTGTGTTTAGACTTTCTTGAGTGATTAATCATTGATTTTTGGGCGTTTGGTTTAAATTGTGGAATAAAGTCTTGTACATTAATCCGTGGGTGAATATTTTGAAAAACCTGCAAAAATTCTTGGGTGAGTTTATGACTTGGATACAGCTGGATTAATGGCTCTGCTTTTTTATGAGATTCTTTCATTTTTATAGAAGATGATAAGTAGGGCTCTATAACGTTGAGCTGGTCATCTAGCAACTCTTGAACCACTTGTTGGGGCAGCTTGCTGGTGGGCTGGTATTGATTAATGACAATGCCTTCTATGGCTAAATTTGGATTATGATCACTACTGATCTCATGAATATTGTGAGTTAGTGTGTATAAGCCTTGGCGGGAGAATTCATCGCAATCAAAAGGAATGAGGCAGTGTGAGGCGGCGATGAGGGCAGAGCGACTAAAAAAATTAAAGGCCGGGGGAGTGTCGATATACACGGCATCATAATCGAGCTGGTCAAGCGTTTCTTTGAGTTTATAAATTTTATGGCGTGATTCTAGTTTGCTGTGTAGGGTTTCTAATTCAAGATTTGAAGGGATGATGACTAGGTTTTGTATTGCTGTGGGTTGAATACACTCAGCCAGAGGGCTGCTTGAATAATTAAACGATAAAATATTACTAAAAAAGTCGGTAATAGTATGTTCACATTCGGTGTATTGTTGGCCTAATAAATAAAAGCTTGAATTCGCTTGTGGATCAAGATCAATAACTAGAGTTTTCAGGCCACAGAGTGCGCTGATCGCCGCAAGATTGCAAGTAATACTGGATTTGCCAACCCCACCTTTTTGATTAAAAACGACACGCTTCATGATGATACTTTCCTTGAGATCGATAGAGTGTATTTGCTAAGTCTAACGAAACATTGACTGAAGGTCGAGAAAGTTACGATTTTCCTTTTCCCCTCCGGGTGTTTTGCAAAATTTGTTTGATGCTGTGCTATGATGCTGCTGCACGACAGTGGAGAAGAGAACAGCATGCAGCAAATGATATTTGACCAATTAATGCAAGAATGTACGGTAAAAGAGGCGTGGCAGTTACGTAAAGCCT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MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126362.1|1575280_1575646_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104693.1|1577787_1581654_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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1602408:1602467	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_081377353.1|1605628_1606294_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1606333_1607308_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211144.1|1607864_1608494_+	MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779218.1|1608477_1608900_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_016211145.1|1608906_1610646_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-53	30.8
WP_016211153.1|1610646_1611711_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211147.1|1611714_1612068_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|1612180_1613137_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211151.1|1613146_1613458_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1613473_1614043_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
WP_016211148.1|1614306_1615635_+	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1615839_1616814_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_148037535.1|1616954_1617161_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046965.1|1618144_1620601_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126340.1|1620880_1621642_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047263.1|1621722_1623429_-	sodium:proton exchanger	NA	NA	NA	NA
WP_016210844.1|1623643_1624771_-	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	5.7e-10	23.2
WP_016210843.1|1624857_1625088_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556637.1|1625702_1626482_+|integrase	site-specific integrase	NA	NA	NA	NA
1626786:1627075	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038947|1656172:1702011|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155047144.1|1657182_1658508_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1658952_1659927_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211804.1|1660309_1661695_-|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	2.5e-47	32.1
WP_081007037.1|1661701_1663240_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211806.1|1663282_1664008_+	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126804.1|1664172_1665048_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|1665207_1666113_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|1666346_1667579_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
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WP_155047143.1|1668908_1669136_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211767.1|1669439_1670249_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|1671865_1672138_-	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
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WP_036777656.1|1672614_1673394_-|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
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WP_016211283.1|1673938_1674187_-	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
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WP_016210156.1|1693948_1695817_+	ferric iron reductase FhuF-like transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210149.1|1695850_1697095_+	type III PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
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WP_155046721.1|1700697_1700865_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038947|1710188:1765797|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_17

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MKNFMQKFMPCEEDDDFFGLSSNHHQLLQASFAFTESIQLNQPALFFDQKRAQKEALRAVLSCEGTIL
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MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MIEIIITLILMTFIVGFFNPRMIVWSIAGAILLVIWSYLGISSVLIKTFIWVAFLAIAVIYTFRPIRRRFISSAILKIFKKSLPTVSQTEEEALNAGDSWFEADIFRGQPNWQKLQTLTISKMSTEEQAFFDNETEQLCQMIDDWQATHEDKDLSPKVWQFMKDQGFFGLVIDKKYGGKGFSAYAHSSIVMKVASKSSSAGVTVMVPNSLGPGELLYHYGTDEQKNKFLPELAQGRQIPCFALTAPEAGSDAASIPDKGIVCMGHYQGEETLGIRLTFNKRYITLAPVATLVGLAFHLYDPERLLDGEEAIGITCALMPHDHPGVNIGNRGIPLDMCFMNGTVRGEDVFIPIDWIIGGRARAGQGWKMLVECLSIGRSISLPACATATGALSFVMTGAYALMREQFNTSIGHFEGVEEALARIGGLTYLLDACRRLTVTAVDQGIKPSVASAIAKYHMTEMSRQVINDAMDIHGGRGILLGPRNYLGRAYQSVPIGITVEGANILTRNLILFGQGAMCAHPYLRKEFYAARDGKLAEFDQALFSHGGYLFKNFCRSLWHGLTAGKLIAVPESRLAGYYQQISRMSATFALTADVALLYLGGSLKRKERLSARLGDVMSYLYMASSALKRYTDEGEPQQECIYVEWAVQHCLYQVQVAFDEFYQNFPQRFLASVLRRLTFFWGKPYKMPQDYLDHKIAQDMLKNTEVRRRFAALVYVPEHMPDDAVGRVECAFQLRLEAAAILAKVKQAVKAGEIAKGALKGQIEQLSQRGALSAQELALLKRYEHARWEVIQVDEFSKESLQNNKTRPS
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MKTAIIRQAFLDYFKGKGHSVVPSSSLVPKDDPTLLFTNAGMVQFKDVFLGQEQGDYTRATSSQRCVRAGGKHNDLDNVGYTARHHTFFEMLGNFSFGDYFKREAILFAWEFLTEVMKLPKEKLWVTVYDKDEEAATIWTNDIGLSQERVIRIATKDNFWEMGDTGPCGPCSEIFYDHGPEVFGGLPGTVDEDGDRYIEIWNIVFMQYNRGADGELNPLPKPSVDTGMGLERLAAILQGVHNNYDIDLFQALIRYAADLAHCRDLANPSLRVIADHIRSCSFLIVDGVVPSSESRGYVLRRIIRRAIRHGHKLGIQDAFFCKLVAPLVQQMGEAYPELLQQQAMIERILLQEEEQFAKTLEQGMRVFEQSIADLTSSEIPGETIFKLYDTYGFPVDLTADIARERNLSVDEAGFEVHMEAQRERARAASQFSLDYNELVQLETCSTFNGYDKTQDQVKVTDIILGRVSVEQITSGQEGVLVLDASPFYAESGGQVGDIGIIKAGGAEFLVTDTQKQQEAILHIGRVVKGEFFIGEEVQALVDDKQRQATALNHSATHLLHAALRKVLGEHVMQKGSLVDSGHLRFDFSHFEAINAVQLAEIEGLVNQQIRCNHPIETNIMAIEVAQAQGAMALFGEKYADDVRVLSMGNFSMELCGGTHTKRTGDIGLMKITSESGIAAGVRRIEAVTGEDALVYVTVHEQALQTLAEKFKGNRHTVVEKADQLLLKLRHLEKETERLKAQLARSQGADLASLAVEVKGVKLLATKVEGVEAKGLRDLVDQLKNKLGSAVIILAVVQDSRVYLIAGSTPDCKGKVPAGQLVNFVAEQVGGKGGGRPDMAQAGGREPEKLAQALENVTAWVAERL
>NZ_CP038947|1710188:1765797|1727838_1728321_-|WP_016209835.1|DBSCAN-SWA
MQNTPLVDASSIRVAAIRFLARREYSYCELYERLKPRIDCQLLPLLDVVLSALQAQNLLCDQRFCESYVRVKVAAGQGPLKIKQALFHKGVTESIIITVLADYDEQWYDNAFRVWYKRFGRSGEYLNDQARQIRFLQSRGFEFEHIQAALQQGRQQVSEE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126639.1|1712315_1713602_-	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1713617_1713872_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_036777393.1|1714107_1715475_-	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1715805_1716828_+	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_155064795.1|1717656_1719114_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1719353_1720328_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016209827.1|1721651_1723211_+	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273569.1|1723286_1723493_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209831.1|1723700_1724399_+	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|1724677_1724941_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_036777412.1|1725247_1727842_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209835.1|1727838_1728321_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209844.1|1728298_1729339_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209840.1|1729511_1729997_-	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_032126641.1|1730104_1732675_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_032126642.1|1732710_1733172_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047141.1|1733241_1733448_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211648.1|1734651_1735191_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155067955.1|1735151_1735337_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|1736138_1737623_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_016211651.1|1737747_1739283_+	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1739516_1739882_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047140.1|1739827_1740412_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047139.1|1740435_1740840_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047138.1|1740815_1741298_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728346.1|1741315_1741648_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300375.1|1742454_1742655_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210928.1|1742869_1743175_+|transposase	ISAs1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1743225_1743801_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1743746_1744112_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047261.1|1744165_1744525_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046724.1|1744521_1744689_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210921.1|1744913_1745498_-	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
WP_016210925.1|1745589_1746276_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.7e-29	36.5
WP_036778116.1|1746399_1747584_-	aminoacetone oxidase family FAD-binding enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016210917.1|1747797_1749240_-	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	5.4e-21	24.5
WP_016210927.1|1749364_1750315_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210930.1|1750375_1751149_+	enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210918.1|1751152_1751902_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210926.1|1751986_1753456_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_155046963.1|1753715_1754282_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273571.1|1754387_1755065_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211012.1|1755502_1756075_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778113.1|1756183_1757686_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047137.1|1757778_1760208_-	acyl-CoA dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_036778109.1|1761743_1764110_-	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1764910_1765276_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|1765221_1765797_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP038947|1770333:1831471|DBSCAN-SWA
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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
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MDTSVAKLLNEKNQDILTAAPSMSVYDCTLMMAEKNIGALPIVENNALVGIFTERDLMLKVVKERKNPEALAVNEVMTKEVIYIHKNSSLNEAMAIMTDQRIRHIPLLEDGQLIGMISIGDITHWLSLNYDRQKYELNVLNDYVNNRGYS
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210804.1|1820753_1822673_-	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	4.5e-84	34.0
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WP_016210803.1|1826139_1827438_+	PAS domain S-box protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.5e-14	52.3
WP_054300162.1|1827512_1828595_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_016212040.1|1828800_1830150_-	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
WP_016212039.1|1830326_1830884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038947|1881771:1987548|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556478.1|1885542_1886429_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209944.1|1913847_1915275_+	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
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WP_036777561.1|1917575_1919444_-	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209930.1|1919464_1919818_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777579.1|1919856_1920972_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
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WP_054300406.1|1942029_1944765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126856.1|1946187_1946529_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|1946833_1947987_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
WP_032126362.1|1948621_1948987_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1948932_1949508_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212005.1|1949846_1951607_-	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210592.1|1951996_1952653_-|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210586.1|1952665_1954171_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.7e-86	41.0
WP_016210593.1|1954192_1954723_-	colicin V production protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210590.1|1954802_1956065_-	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210587.1|1956239_1957100_-	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_032126176.1|1957201_1957984_-|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_016210588.1|1958074_1959400_-	fimV domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210595.1|1959767_1960946_-	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210594.1|1961122_1961776_-	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_036778626.1|1961911_1963852_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_129556498.1|1963848_1964457_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1964636_1965611_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080728317.1|1965801_1969167_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_20

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075273303.1|2034199_2034916_+	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210270.1|2036362_2039350_-	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
WP_016210277.1|2039419_2040253_-	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210272.1|2041460_2042171_-	flagellar basal body L-ring protein FlgH	NA	NA	NA	NA
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WP_032126334.1|2046830_2047262_-	flagellar basal body rod protein FlgC	NA	NA	NA	NA
WP_036778186.1|2047301_2047700_-	flagellar basal body rod protein FlgB	NA	NA	NA	NA
WP_016210273.1|2048072_2048780_+	flagellar basal body P-ring formation protein FlgA	NA	NA	NA	NA
WP_016210275.1|2048844_2049147_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210276.1|2049202_2049679_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_016210284.1|2049733_2050255_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21

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MGVINITRPKLDITQSFFTARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209877.1|2136025_2136916_+	Rossmann-like and DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104600.1|2152011_2152905_-	thiol:disulfide interchange protein DsbG	NA	NA	NA	NA
WP_016209884.1|2153014_2153638_+|protease	site-2 protease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777115.1|2153714_2153915_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209891.1|2154056_2154755_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
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WP_122940402.1|2155785_2156409_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274681.1|2162954_2163830_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210465.1|2164581_2165424_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	5.2e-32	35.3
WP_016210463.1|2165474_2165822_-	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
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WP_016210461.1|2173359_2173635_+	oxidative damage protection protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210458.1|2173715_2174264_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2175058_2175424_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047103.1|2175539_2176661_-	iron-containing alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_155049817.1|2177455_2178342_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038947|2202524:2285200|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038947|2325470:2387812|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP038947|2325470:2387812|2366403_2367594_+|WP_016211374.1|DBSCAN-SWA
MLSEHTKTIIKATAPVMKEYGLTITLRMYDIMFARYPKTKTLFNQTHQENKQQPRALANSIYAYAANIDNLDALSDTIELVAHKHASLNIRPEHYDIVAECLIQAVKDILKEAATTEIISAWTEAYTFLANVFINREEELYQYDRNKAGGWNGFRPFIITDKVKESTHVYSFYLRPQDNQPLIDFQPGQYIALRTHLNNTTITRNYSLSATDHSNHYRISVKREEQGQLSPLLHDQLNINDTVELTAPKGNFTLNNLEQTKQPIVFISGGIGITPLFAMLEKTLNTPASPQITFIHATENSKTHTFKNQLADYNSQHANLLKSYTCYHQPLAQDQCDLAGTINQDWLREKLPKSPADYYLCGSPLFMKHIFQQLISLGINEEAIHYEYFGPLEQMN
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MNLLTVNNLQVRFKTPEGIVNAVNKVNFSVEKGKTLGIVGESGSGKSQTVLALMGLLANNGEVLGSIQFKGEELIGLPVARLNKIRGHHMAMIFQDPMTSLNPYLTVAKQMIEVLVLHKGMTKAQAQQEALNMLDAVKIPEASKRLNMYPHEFSGGMRHRVMIAMALLCRPELLIADEPTTALDVTVQAQILALLRELQQDFNTSIIMITHDLGVVAGSCDDVMVMYAGQTMEHAGVNAIFAKPLHPYTQGLLNALPRLDQVDEELVTIPGNPPNLLHLPAGCPFQQRCPVVSPVCAEKPPLLRQFNQRTGACHRIEEVA
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MVKNYTEIKVHIFFNALLLCALSILLIMAFYFQLTHNELPCPLCLLQRVCFIGLGSIALLNIIYGPRPSHYGLMLLTTLLGFSISVRQIFLHIQPRDLGYGHPVFGIHFYTWGAILFFLVAIFIGIGLLLEHIKTNDINKNSVQQLTITGKIISIVFLILIILNLVSVLFECGLSQCPDNPLNYL
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MYYKLRMNILIVDDRKNVLHSLKRLILLKFPESKLTLAESGEEAMSLINEGPPFGLIMTDYKMAGINGLEVLAHAHGIHADTVRVLLTGYPNDEGIIAAIANDDINYILAKPWTQEQIVEILNQCAKDYQESEQAIASARVDTDDNTASRGESANDSDPLAKASTIVSLIKEVAYHLTQSEIFLMKKHAVPAYSPKFLSLLWRADGISTSMFTKALKVDDKTAMTALINLLADGLVRIESTQPSASTSASDNGEDMFIYLTAKGKKIEDSIDFMSEMIKKQVVNELIATEQVELSRVLEKIVTNLSMIKNATLAGKKSE
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MAYINGEKNEHLESSGIFAQQITQRKSELKALTNRQLVSSIKHMDLASAMHHLQQHSNKSLSTNDQTPEPQAETQEKMPLNNSVASSFTAASHTSSPQQSCLFQQQQAEPTRDEAHQTKDKATKKCCTIM
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MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK
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MNDDPGSSTSNRSWLDRLGLGFLGEPKDKEDLFELLKDSVDRKLIDIETMTMMEGVLQVSEMQVRDIMVPRGQVVVVDHDAKPDDFLPTIIKSSHSRFPVIGENKDEVIGLLLAKDLLPYCFCKEEDIELATLLRPVLFVPESIRLDALLNKFRSTRNHIAVVIDEYGGVAGIATIEDILEEIVGEIEDEHDAVADEFIKKQAEDCYIVRALTPIDDFNEFFKAELDDEEFDTIGGLVTHQFGYLPQKGESVIIAQYQFTVLSTSGRRIQLLQAEPVKN
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MKIFLVGGAVRDELINYPTEDKDWVVVGSTPEKMIKQGYHPVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKTAQGYHGFTIHADPSVTLEEDLMRRDLTINAMAKDHHSKIIDPYHGQHDIKNKLLRHVSPAFSEDPVRILRIARFLARYHHLGFTIAAETRTLMAQMVQAGEVNTLVPERVWQELSKALHEKSPSAFFSTLEQCGALKILFPEIAALINQVKDTAWEPQCNLWSHFLNCLDQQEKPQIRFASALKTSYYSKQSNLKSLIQRLRIPKSFSSVMLTTAQLHPIYYSLPKQNAAQILDLLNQLSAFKNTQQLNNFADSCNLNLNLNQLSDHKEKLQHYIKIVESINPDEFIQQGLQGAQIGTAIQEKRLALIKGSRKK
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MTTFMAKETRYTPLCIESQLKENNTLWQEIAATIKKRQPQFAMTIGRGSSDHACTFAKYLLETQYNLVTASAAPSTRTLYQANLQLKHALVVAISQSGQSADLCEMMAHAKKQGATTIAIVNQTASPLADLAEFVIPIHAGEEKSVAATKSYIGALAALLQLTSTLSPHIDLPLSALPEYLRLALDSDWSQSLPIFKDAKTTLIVGRGYQFPIAQEAALKCKETAMLHAEAFSGAEVLHGPFALVQNNYPVLSFIHKDASQQQMVDLIQRIQHTGAQPITATAGNLSHLDQLKTHSKEVILLPHSLHPLLDPLITIQSFYVFIEQLARLRGFNPDEPLNLSKVTSTK
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYLVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038947|2325470:2387812|2367648_2367795_+|WP_016211373.1|DBSCAN-SWA
MFFSTVSKEGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038947|2325470:2387812|2325470_2326181_+|WP_129556571.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MMDICVTGYLKTMSSARLNKVKRVLAARQDNLAVLMDHVHKPHNLSAIARTCDAVGVANLHAVHSEFTDIGIHHHTAAGSKDWVHIIRHESIDMAYQHLRTKTPNVQILATHLSDKAIDFREVDYTRPTVIVLGNELDGASTEACAGADEHIIIPMVGMVQSLNVSVAAATILFEAQRQRQLAGLYKSYESIEKPDTIDKNKVFEWMHPKIAKLYQARNQAYPDLDEDGDILPQSI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2325470_2326181_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2326209_2326614_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777168.1|2326638_2327598_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209567.1|2327729_2328347_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155046949.1|2328417_2328588_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126712.1|2328781_2329240_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2329984_2330995_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
WP_016209566.1|2331479_2332391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209545.1|2332716_2336211_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2336248_2337088_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_036777155.1|2337274_2337490_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2337538_2338114_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2338110_2338449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2338617_2339607_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
WP_016209572.1|2339607_2340570_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
WP_054300271.1|2341525_2342500_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300455.1|2342964_2343330_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|2343344_2343851_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212572.1|2343908_2344301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2344430_2344796_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300461.1|2344852_2345161_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2345252_2345828_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2345773_2346139_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|2346291_2346564_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|2347172_2347508_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|2347667_2349200_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|2349232_2350072_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211411.1|2350068_2350566_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_036779082.1|2350569_2351562_-	AAA family ATPase	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_155047091.1|2351676_2353023_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2353246_2354308_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|2354386_2355532_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_016211372.1|2361339_2362197_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|2362183_2363107_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_036778204.1|2363303_2364695_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2364741_2365785_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2365827_2366271_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2366403_2367594_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2367648_2367795_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|2368345_2369263_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|2369530_2369824_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2369900_2370095_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|2371113_2372031_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2372496_2373339_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2373406_2374057_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2374071_2375112_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2375234_2376320_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2376346_2377456_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|2377472_2377790_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|2377786_2378146_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|2381477_2382431_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2382503_2383565_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|2384328_2384886_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|2385079_2385763_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|2386481_2386724_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300237.1|2386750_2387812_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038947|2477705:2560416|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300202.1|2477705_2478434_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_075274943.1|2558872_2559397_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038947|2575757:2603944|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047224.1|2595686_2596163_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778088.1|2596147_2597230_-	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.0e-20	27.5
WP_036777829.1|2597470_2597875_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210073.1|2598587_2599319_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210066.1|2601018_2601687_+|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1
WP_032126425.1|2602130_2602727_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210052.1|2602747_2603944_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	8.2e-07	24.4

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038947|2633160:2685620|DBSCAN-SWA
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MTAIMQGILANGDKVGFITAGSISKESIKCFCLSEYGIDLSDDFKHYNKALDKMPALKELAESYSVPYSYIVFVDNSLDHIKPAYDAGFNVVYADNNSSDITNGLSYIGQLEIIVAERARQREQELSADSTFIFYRPSDNPDTRFPTIDFDC
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MFSKSCQCVSPDTLKSYPHRTDEVIVAVALELHRLHLLKMQHGDIKFDNIIITEKNGVFDVKFIDFGFAYNIPGLARIITGKCEYFPPERTEATDQTQVVAQFNQDIYSFGFMLEFAKKIIKIPEKFNDFIKATQNKNPTLRPGLQFFLYKNLLPTTLNNRSRNVIIKRPDSYQTMRVIGLTGDDLNHALNHVPQFESCYQKLTELNLSQQACIHKVLNNSPYAQVINILIA
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MAGVLDTVDARTQLVGKNRLESLLFKLYADKTYAMNVFKIREVLQPIALTNIPESHPFAASHGVLSTG
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MIKMLSKHIADYMFIAPEEAAIAITSAGLLPKNFKLIKIIDILPGNKRHIICSQKVPLPLITKLNQAIKSNIP
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKAMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MVIDKLKLSQDVVEKIFADPKPFRESYQFLKEIGLDQKEYVKKVFADPCVFLKNYQYLKDTGLNTKGHVRVMLDEDECFEQKFDSACYLGFKDKSSEISDLKTQLESKDAEIAALKAALEKSKETGADLQKKVAKKIYKF

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556590.1|2635018_2635414_+	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036778479.1|2636383_2637109_-	D-Ala-D-Ala dipeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2637354_2638542_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|2639118_2639661_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_036778484.1|2640347_2640959_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2641005_2642025_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210981.1|2669350_2669989_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038947|2746499:2804532|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038947|2929400:2993532|DBSCAN-SWA
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MNRKHYNGLAVSMLALSAFIVPPLFAASAQMQIHARVIHAQDVNALLQQPIVVQALRSGQANLQQTQLLSSKVAVKVNVRPGVEKGVRQVILINH
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT
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MTYPPFKAHRSLKNSHLQTILANVYRPRAQLQLTYETIDIAHDQLELVWLKQHLSGKSSPQPTLLLIHGLEGSVHSAYIQAMMNQAKHHHDHFNVVTLHFRGCDGRVNQRAEGYHAGRSDDIAFAIHHLKQRGIGPIYAAGFSLGANALLKYLGENPTNPLQGAAAVSTPFDLAMACQQLEHPSNRLYQSRFLHGLKRTIQKKLDHGIALTISNERLQQLTSIRQIDEEVTAPIHGFHSAAHYYQSCSSQQFISAIQTPTLIIHAKDDPMIPLSCIPKQFPTACQTEIYDHGGHVGFLSGRYLPQRWLEKRLLHWFWQLT
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MRDKIKLVSSAGTGHFYTTDKNKRTTTEKLEFKKYDPVVRKHVLYKEAKIK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211161.1|2930957_2932067_-	histidinol-phosphate transaminase	A0A142C026	Faustovirus	2.5e-18	23.8
WP_016211154.1|2932078_2932723_-	maleylacetoacetate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211163.1|2932741_2933728_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211162.1|2933807_2934884_-	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211156.1|2935086_2935911_+	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211160.1|2936227_2937232_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211155.1|2937440_2938406_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047242.1|2938544_2939420_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211700.1|2939716_2940769_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211698.1|2941036_2941465_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923654.1|2941678_2942170_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|2942225_2943476_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|2943578_2943797_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|2944254_2945109_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2945163_2945634_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2946021_2947401_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|2947428_2947887_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|2947864_2949082_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|2949273_2949510_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|2949523_2949679_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_016210731.1|2949759_2950722_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2950881_2952198_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2952207_2952876_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2953238_2955053_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2955170_2955959_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211543.1|2956539_2958291_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|2958301_2959102_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2959204_2959693_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|2959866_2960181_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|2961201_2961546_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|2967239_2968202_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|2968388_2969648_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2969871_2970198_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2970392_2971343_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2971400_2973467_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|2973472_2974468_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2975053_2976634_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2976790_2978200_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|2978259_2979393_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|2979532_2980357_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|2980584_2981214_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|2981550_2981922_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|2982225_2982513_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|2982664_2983513_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|2983640_2984681_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_155047244.1|2984753_2986691_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|2986974_2987634_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2987788_2988763_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|2988838_2989858_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047000.1|2989905_2990052_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|2990256_2990466_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|2991340_2992423_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_054300161.1|2992470_2993532_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038947|3001417:3115337|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075273327.1|3004574_3005150_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_036778680.1|3005725_3008056_+	PBP1A family penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556603.1|3008176_3010192_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212386.1|3013832_3014138_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|3014328_3014508_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_155047245.1|3014511_3014700_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047246.1|3014723_3015698_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.8e-28	32.2
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WP_155047247.1|3016384_3016753_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038947.1|WP_155047254.1|3096165_3096303_-|hypothetical-protein	3096165_3096303_-	45 aa aa	NA	NA	NA	3001417-3115337	yes

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_054300283.1|1096768_1097410_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_054300283.1|1096768_1097410_-|hypothetical-protein
MPQAYPTSNNEQQSNNFPPPSSTTSSSATASNLPLEQIKTQPASKTVKNLGDSITYDQLLHLIKQETQKSIFILAKKIKNAKLPFSTLFEDTSGRKTGIQVLEEFIKDILSHSNQGHPHQPLTQALGELVHERVKSFYEDDGKMKGRRKTETISMLFSEIKRMFQNITYANAAVSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1096554-1096591	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1138505-1138542	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1141066-1141029	1

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1096554-1096591, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1138505-1138542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1141066-1141029, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_054300290.1|1144389_1144647_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_054300290.1|1144389_1144647_+|hypothetical-protein
MKKKRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1096554-1096591	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1138505-1138542	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1141066-1141029	1

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1096554-1096591, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1138505-1138542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1141066-1141029, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_098082828.1|1145385_1145643_+|transposase

>NZ_CP038947.1|WP_098082828.1|1145385_1145643_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1096554-1096591	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1138505-1138542	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1141066-1141029	1

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1096554-1096591, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1138505-1138542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1141066-1141029, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_098082828.1|1204143_1204401_-|transposase

>NZ_CP038947.1|WP_098082828.1|1204143_1204401_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1096554-1096591	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1138505-1138542	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1141066-1141029	1

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1096554-1096591, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1138505-1138542, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1141066-1141029, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_075273543.1|1447914_1448157_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_075273543.1|1447914_1448157_-|hypothetical-protein
MYEYELSTECCTSDDGGRFPISLTLLLPALSFAFTMAPSRIITQNHYKMKKVSAESQSNNPLLREKQRIWFSNIKHPEES

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047156.1|1540421_1541045_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047156.1|1540421_1541045_+|hypothetical-protein
MILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1545487-1545450	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1545487-1545450, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047155.1|1573699_1573849_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047155.1|1573699_1573849_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSQLRSAKNPNLPRPTHPVLSTPWLAACAGFPG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1575255-1575218	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1575255-1575218, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_032126537.1|1585879_1586065_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_032126537.1|1585879_1586065_+|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGLSGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLDGYLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1575255-1575218	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1575255-1575218, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047152.1|1586840_1587563_-|transposase

>NZ_CP038947.1|WP_155047152.1|1586840_1587563_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1575255-1575218	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1575255-1575218, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_054300361.1|1605354_1605651_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_054300361.1|1605354_1605651_+|hypothetical-protein
MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1575255-1575218	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1575255-1575218, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_081377353.1|1605628_1606294_-|transposase

>NZ_CP038947.1|WP_081377353.1|1605628_1606294_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1575255-1575218	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1575255-1575218, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_016211151.1|1613146_1613458_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_016211151.1|1613146_1613458_+|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1575255-1575218	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1575255-1575218, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_016210918.1|1751152_1751902_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_016210918.1|1751152_1751902_-|hypothetical-protein
MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1739491-1739454	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1764885-1764848	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1744138-1744175	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1739491-1739454, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1764885-1764848, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1744138-1744175, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_036781272.1|1785265_1785484_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_036781272.1|1785265_1785484_+|hypothetical-protein
MPMTTKERKRISNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1806672-1806635	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1806672-1806635, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047136.1|1785576_1786008_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047136.1|1785576_1786008_+|hypothetical-protein
MHIFIDYFFLCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1806672-1806635	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1806672-1806635, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_016212421.1|1796341_1796524_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_016212421.1|1796341_1796524_+|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1806672-1806635	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1806672-1806635, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047131.1|1799092_1799749_+|transposase

>NZ_CP038947.1|WP_155047131.1|1799092_1799749_+|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1806672-1806635	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1806672-1806635, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_032126179.1|1984827_1985079_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038947.1|WP_032126179.1|1984827_1985079_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1948596-1948559	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1986636-1986599	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1936671-1936708	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	1976591-1976628	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1948596-1948559, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1986636-1986599, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1936671-1936708, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 1976591-1976628, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047097.1|2207403_2208087_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047097.1|2207403_2208087_-|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYNEALSTAIEKIKKTEVSDKNYPAVNAHMLPFLKAYFFSYIEKALAKIDEEEGSLVQKLNAKLSFLSTLKSSFRAKFSGEWAHQFYFDHSSALNEVAGFDSEGECPQSYFALFNAFEAVGNKDRKAVTLALTLDKFSSTQVVCDNREIFSTE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	2249103-2249066	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	2255308-2255345	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 2249103-2249066, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 2255308-2255345, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_016209540.1|2338110_2338449_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_016209540.1|2338110_2338449_-|hypothetical-protein
MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	2342939-2342902	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	2346165-2346202	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 2342939-2342902, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 2346165-2346202, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_016209990.1|2744642_2745047_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_016209990.1|2744642_2745047_-|hypothetical-protein
MYILVCYGGYPYHAAYVVAIFTGGSFVTQEVYAGDIDSLRLKVKGDFRIYKDLESFFDRSIECMQNKKAQIIILKPAIESNFSNLLIFESVIRKTRQSTLLMYESMEVDEEAPLVAGAEAMLHYYSELLRCTKQ

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_144019123.1|2745079_2745823_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_144019123.1|2745079_2745823_-|hypothetical-protein
MLKNLKELIKEYNIQTIDALEQLKSDLLRESDSREFCKKYGIDYSPIEFTFHQGFYFLFNAANELNDQYPNDRNLIAYFTYRLSSQQQKAFEPVTNMLEIAKLAEDKIEGDCQLLEQGGNQPKAIKTFKEKAIKAVYKYVESTLAGPEHSNKAREEYQQSIKNCSEECKAALDDSSCERLRKVLKVLVNFLTHISLVGIVANIYHKHTTGSWLLFERKKESYDIQENLHGIQKISESAMQVNLYLSA

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047234.1|2746312_2746456_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047234.1|2746312_2746456_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_016212372.1|3059242_3059464_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_016212372.1|3059242_3059464_+|hypothetical-protein
MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3005487-3005524	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3016347-3016384	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3005487-3005524, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3016347-3016384, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047252.1|3059579_3060158_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047252.1|3059579_3060158_+|hypothetical-protein
MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3005487-3005524	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3016347-3016384	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3005487-3005524, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3016347-3016384, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047253.1|3060302_3060497_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047253.1|3060302_3060497_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3005487-3005524	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3016347-3016384	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3005487-3005524, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3016347-3016384, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155046758.1|3093696_3093828_+|phosphatase

>NZ_CP038947.1|WP_155046758.1|3093696_3093828_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3005487-3005524	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3016347-3016384	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3005487-3005524, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3016347-3016384, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155046759.1|3093972_3094128_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155046759.1|3093972_3094128_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3005487-3005524	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3016347-3016384	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3005487-3005524, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3016347-3016384, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038947.1|WP_155047254.1|3096165_3096303_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038947.1|WP_155047254.1|3096165_3096303_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSYSNLLMSDNFVISYKVYDDFIAVIIIL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3005487-3005524	0
NZ_CP038947_1	Orphan	1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder	360574-360611	38	3016347-3016384	0

1. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3005487-3005524, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360574|38|NZ_CP038947|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038947 position: 3016347-3016384, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP038951

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	10315 : 26969	20	Indivirus(18.18%)	tail,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038951|10315:26969|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038951|10315:26969|13555_13990_+|WP_016212315.1|DBSCAN-SWA
MARAEHDLDIYAWAHENAELLKQGKFNEVDMVNVIEELEDLGNSKRDQLTARLKLIIQHLLKWQYQPSHRGRSWSLTIQNNRDDVEDLFEDVPSLKSKLDECFDKAYKRGVKAASNETDIPIKTFPKSCPYTLEQVLNPEFMPE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036781073.1|10315_10576_+	cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system	A0A1S5NR91	Burkholderia_phage	2.1e-13	48.8
WP_081007079.1|10646_10919_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|11130_12017_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.8e-10	22.4
WP_016212315.1|13555_13990_+	DUF29 domain-containing protein	A0JC30	Ralstonia_phage	9.1e-25	39.7
WP_032126346.1|14089_14332_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047334.1|14398_14839_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	1.1e-06	37.6
WP_054300249.1|14799_15165_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047335.1|15179_15623_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.1e-07	25.5
WP_054300271.1|16632_17607_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047336.1|17603_17888_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047337.1|17906_18269_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|18268_18691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275196.1|18692_19016_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|19072_19339_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275195.1|19342_21421_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.4
WP_036776958.1|21413_21755_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|21751_22423_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|22391_23138_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|23127_23685_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_075275194.1|23681_26969_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2

4. NZ_CP038950

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	6445 : 19646	15	Erysipelothrix_phage(25.0%)	transposase,terminase,tail,protease,portal,capsid,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038950|6445:19646|DBSCAN-SWA
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038950|6445:19646|14984_15707_-|WP_155047320.1|portal|DBSCAN-SWA
MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKSLATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWRLGNTIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|6445_7420_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047317.1|7554_8391_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.9e-42	36.7
WP_016211139.1|8470_8866_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211132.1|8858_9182_-|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211137.1|9178_9490_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_155047318.1|9680_11015_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211140.1|11135_12329_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_080664855.1|12386_13058_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_155047319.1|13005_13626_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	5.5e-39	50.9
WP_052104629.1|13828_14854_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047320.1|14984_15707_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	2.6e-40	40.8
WP_155047321.1|15703_17386_-|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.9e-137	45.7
WP_016212234.1|17388_17868_-|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155047322.1|17944_18337_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.4e-26	47.2
WP_054300271.1|18671_19646_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7

5. NZ_CP038949

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2671 : 47757	57	Streptococcus_phage(13.64%)	integrase,portal,tail,transposase,protease,capsid,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038949|2671:47757|DBSCAN-SWA
GTTAGAACTTAATGAGCTGCATGGTCGCTAGGGCTTTGTGGTGCTTCATGATTACTGACAAGCGTTGCTTTGGACGCCCACCGGTTAAAAGCATTTTGCTACCACAAAGGATGCACTCAAACGGGTCAGTGTTGATAAAGCCTTTGAGGAGTGATGCATAAGTGATTTTTTTAACCGGCTCTACCGTCTGGTCCAGTAACTTATAAATTGTTGGCAGCAGCTTTCCGCGGGTGCGAAAGCTCAAGAAGCCGTAATAGCGGATCATCTTAAATGATTTAGTGGGGATGTGACGGATTAGACGCTCAATAAACTCAAATGTTGTACTGGTGTGCTTTTCCTGCTTACCCGTTTTGCGATCAATATAGCGAAAGATCACTTCTTTGCCATCATAGTGCAGTAAGCGTGAATTTGAGAGTGGCGGTCGCTTTAAGTATCGACCTAAATAATCAACGTTTTGGTGGTGTGAAGGCTGAGCTTTTGCAAAATGGACATGCCAGAGTTTATTGTATTCTGGGTTGATGAATCGATTAAATGATGTGAGGTCAGTAATGTGGTTTTGATATTGATGAGGAATCACGAGTTTCCCTGTTTTGTAAGCGGTGCGTAATAAATTAACAATCGAAAACCGCCACATTGGCATCGTTTTTTTCTTTGTGAAATAAACTTTCTTCCAGGTTGTCTTGCACTTAGATAAGCCACCACGTGTCACTGATAAGTGGACGTGCGTATTCCAATTTAAACTCTGGCCGAAAGTATGCAGAGCTGTGAATATACCGATCTTAATTTTTTTCTTCTTTGCAGTTTTGAGCAGAACATTTGCGGCGAGTCGTGATAGATGATTCAGTAGCTCACGATTAGCAAGGAAAAACGGGCAAAGTGCTTTTGGCATGGTGAATGTTATGTGCTGGTATTCGCACTTTGGGAGTAACTTATTCTGTGCAGCAATCCATTGCTCAGTGGCTTTTTTCCACATGAGGAGCATAGCCGTGATTTGCAGGTATAGGTGACGACTTTGGTGTGTTTGCATCCTGAGTTAGAGCAACTGTATTCATCATGACCTGCAAACTTAGTTCTACAGCTGAGCATTTTCACGACGACTTCAACCACAGAGCGAGGAATATTATCGCGATTGGCCACATAGTAGCGCCACCAAGCTCTGCCAGTTTGGAAAAGATGTTTAAGCGTGAATTGAATCAAACTAACTATCTCATTGTGTTGATTAACAAGCGATTAATCATACAGACAACGATAAATTATACAACGGCCCTCCTAAAGTCGCGAGCTGTACTCAGCGAGCCTATCCTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGTAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCATTTAGTTCTTTTGCTTGCTTTTGAGCTAAGTTCTTTAATTTAGTATTTTTTTGCACTTCAATTTTTTCTAATAATTTCGCACGCTCTTCTGAGCCTTTACGCGTGGCGTCTAAAATAATGCGTTTTTGCTTGTCATAGGAGTGTTTAATGGCTTCCTCTTCAGAAAGTAAGCGCTCTTTTAAGCTATCAAGTTGCTTTTGATTGTCCTGAGCGCGCAGCGAGGCGCCCATTAAGGCGGATTTTTCTGGCTGTGATGCTCTTATTTTTGCATCTAAGGCGGCGGCTTTTTCTGCAATGTCATCAAAATAAGCATCAACGCTTTCAGTGGGTCGTTTTGAAAATAGAGTTTGATAAAGCTGTGCGAGCTTTTGATTCACATTATTCGCACTTTCTTCTGCGATGTTTAATCCGGAGGTATCGAGGGTAAAACGTTCGGAGACACTGGCTTTCATGCGCGCTATGGATTGACTAAGGCGCTCAAATTTATTACCAACGATAGGTAATGTGGCTCCGGCTTCTGCTATTTTTTGATATTGAGAGAGAGCGAAATTAATCCCCTCGCCCATTTTTTGATAGAACCAACTTAGCCCCTGAGCAATTGCAGTTAGGGATTGAATGGCCATATTTTTCATTACTGCAAAGCCTGCGCTAATAATATCAAGGCCGAGGTTGATGTAATGCACGCCATCACCGATCACAGCAAAGGACTTAGCTACAACACGAAACCCACTGAGCACATTACTGCTAAAACTACTTGCTGCGGTGCCGGCGTTAGTAAAGCGCGTGGTTAAATCCTCAATAATCGGCGCAAAGGTAATGGCGAGCTGGTGACTGACCCCCACAAAGAGCTGACGCATTTTGTACGCTGCATCATTGGCGGCCTCAACTTTTGCCGCATCAATGCGATTAATCGCAATGCCGAGCCGTGCCGCTTCACTGGCGGCTTGATCCAACCCTTCAGCCCCTAAAGCTAAAGTATTAACGAGGCTCACCCCTTCCGAATCAAACAGCTTAAACGCTAAACGCACTTTATCCGACTGGCCTTCGACATTTTCCATCGCTCGCGCGACTTCTTTAAAGGCGGCATCTGGGGAGAGTTGATTTAAGTGCTCAGCATCTAGTCCTAATTCAACCAAGGCTTTGCGTGCTTCACCCGTGCCTGCCGCCGCTTCAGATAAGCGCCGCGTCATCCGTTGTAAGCCCATATCGAGTTTATTTTGTGATACACCCGTCAGCTCTGCGGCATGGCGTAATCTCGCCAGTGCTTCAGTGGTGACCCCGAGCTTGTCCGAGGTTTTGGCGAGTAAATCAATCGAGTCACTGGACTTACTAATCATCACCGCTACAGCCCCCGTTGCTGCGGTGGAAACGGCGGCAAAGGCCAGCGTTGTCTTTTTCAGATTACGCTGCACTTTTTTAGAAAAGTTCTTGCTGGCAAGTTCTGCTTTGGTTAAAGATTTAACGAGTTGAGCGGAATTTGCACTTAAATTAACAACGAGAGAACCGATTGTTGCCATCGCTTACTGCCTTTTTGCAATTGCGGATAAAATAGCGGCCATGTCTGTCGCGCTTTGTGTTTTTTTCTCATCACCAGCGCTATAGTTCGGCATAAAATCATTAGGGGTAAATAGTGTTTTATCTTTGCGCTGCAAGGGTCCATTCACAACCGCGCTCACCATTAAAGCGGTGCGATGGTCGTCTTTTTCCACGCCAAACGGTTCCAGTGAGTAATACGCCAGCCACTCATTAAATTCAGAAAGACTAAGTTCCTGTGAGAGCTGATTCACCGTTTTGCCTAGCGCTAAAGCTAAACGAAATAAAAACCGTCGCTCATGATCATAAGCTAGTTTTTTTTAAGATCGTGCGCTGCACTTTCATTAAAGCCATTCACTTCAACAATCGCATCGGTGATTTGTTTAATAACGCCGAGCGGTAATTCAGCCAGTTTTTTATATTCACTGACATCAAAGATTTTAACGCCTTGGTGGTCACACAAAGATAAGCAAATTAGTAATAAACTGGCTTCAGTTTCGCTTAAATCAGCATGCTGCTGTTGATAATATTGCTGCTCGGCAATAGAGAGTTCTTTGACCTGTAATTCTAATTCGCCCAAAGTCACCGGGGCAGTTTTAAAGGCAAGATTAAATAAAGCATTACGGAGAGCCATTTTATACCTCATCACTTTGCGTGATCACGCTGGTCGGCTGCAAACTCACGCTCATGCTAATCGCTTCAGTTAATGGGGCGATGATTTTGTGATTGGTAATTAAGGCAGTAAATTCATAAATCTGCCGTTTCGGTTGGGTGGCCAAAATAATTTTAAACTGGCGCTCTATGCCGGTATCATGATCACTAATTAAATTTTTCAGCTCACTATTATCTTGGGCGACATTCATATCGAGCTGAATTTCATCATGATCTTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274763.1|8184_8580_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
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WP_155047306.1|10140_11307_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.2e-66	38.7
WP_081007077.1|11362_12034_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.5e-45	45.8
WP_054300593.1|11981_13223_-|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.7e-85	43.6
WP_155047307.1|13219_13816_-	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	2.0e-38	45.3
WP_155047308.1|13859_14834_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-26	31.5
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