CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038955	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038954	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	1	11
NZ_CP038956	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038952	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 chromosome, complete genome	3 crisprs	RT,DinG,DEDDh,cas3,csa3	1	2	30	32

1. NZ_CP038952

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038952_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038952_1
• CRISPR_location: 359999-360128
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038952_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038952_1

>1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038952_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038952_1

>merge|NZ_CP038952|1|359999-360128|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038952|1|1|359999-360128|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038952.1|WP_016211268.1|365696_366881_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038952.1|WP_054300516.1|364747_365581_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038952.1|WP_016211795.1|354702_354897_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_054300518.1|362408_363254_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_075273359.1|358256_358832_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038952.1|WP_016211271.1|366899_367844_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038952.1|WP_075273619.1|364114_364690_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016212044.1|352601_352856_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038952.1|WP_036777801.1|351609_351828_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016212008.1|361273_361972_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_036777835.1|368148_368934_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_155047052.1|350018_350747_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_155047051.1|349004_349874_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_054300520.1|358777_359092_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_036794771.1|353578_354565_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038952.1|WP_032126227.1|360945_361236_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016212010.1|361988_362285_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016211797.1|356802_358206_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038952.1|WP_081007059.1|355579_356641_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038952.1|WP_155046940.1|363458_363842_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038952.1|WP_054300516.1|364747_365581_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP038952.1|WP_016212044.1|352601_352856_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038952.1|WP_016211268.1|365696_366881_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038952.1|WP_075273359.1|358256_358832_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP038952.1|WP_036794771.1|353578_354565_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038952.1|WP_016211797.1|356802_358206_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038952.1|WP_081007059.1|355579_356641_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP038952.1|WP_016211271.1|366899_367844_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37

Protein sequences

>NZ_CP038952.1|WP_054300520.1|358777_359092_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038952.1|WP_075273359.1|358256_358832_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038952.1|WP_016211797.1|356802_358206_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038952.1|WP_081007059.1|355579_356641_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038952.1|WP_016211795.1|354702_354897_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038952.1|WP_036794771.1|353578_354565_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038952.1|WP_016212044.1|352601_352856_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038952.1|WP_036777801.1|351609_351828_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP
>NZ_CP038952.1|WP_155047052.1|350018_350747_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038952.1|WP_155047051.1|349004_349874_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038952.1|WP_032126227.1|360945_361236_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038952.1|WP_016212008.1|361273_361972_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038952.1|WP_016212010.1|361988_362285_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038952.1|WP_054300518.1|362408_363254_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP038952.1|WP_155046940.1|363458_363842_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038952.1|WP_075273619.1|364114_364690_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038952.1|WP_054300516.1|364747_365581_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038952.1|WP_016211268.1|365696_366881_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038952.1|WP_016211271.1|366899_367844_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038952.1|WP_036777835.1|368148_368934_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP038952_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038952_2
• CRISPR_location: 1403016-1403122
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038952_2

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038952_2

>2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038952_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038952_2

>merge|NZ_CP038952|2|1403016-1403122|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP038952|2|2|1403016-1403122|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038952.1|WP_036778182.1|1406891_1407719_-|thioredoxin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP038952.1|WP_051307365.1|1400684_1400945_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016210748.1|1392593_1394549_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP038952.1|WP_016210801.1|1413419_1414391_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP038952.1|WP_052104738.1|1411554_1412361_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP038952.1|WP_016211836.1|1400964_1401453_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038952.1|WP_052047040.1|1404155_1405094_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP038952.1|WP_036777256.1|1410979_1411180_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016210795.1|1412466_1413438_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP038952.1|WP_016210751.1|1388577_1390383_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236941
NZ_CP038952.1|WP_155047165.1|1405119_1406685_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038952.1|WP_129556527.1|1408881_1409142_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016212185.1|1395749_1396739_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP038952.1|WP_016210752.1|1390866_1391664_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368573
NZ_CP038952.1|WP_016212182.1|1395230_1395416_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_075273540.1|1408085_1408697_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016210749.1|1391833_1392295_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016211834.1|1400112_1400427_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_129556641.1|1387227_1388490_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP038952.1|WP_155047164.1|1410134_1410557_+|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381151

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038952.1|WP_036778182.1|1406891_1407719_-|thioredoxin-domain-containing-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.37155e-43
NZ_CP038952.1|WP_016210748.1|1392593_1394549_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP038952.1|WP_016210801.1|1413419_1414391_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	7.8235e-122
NZ_CP038952.1|WP_016211836.1|1400964_1401453_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP038952.1|WP_052047040.1|1404155_1405094_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24
NZ_CP038952.1|WP_016210795.1|1412466_1413438_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP038952.1|WP_016210751.1|1388577_1390383_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236941	PRK11634, PRK11634, ATP-dependent RNA helicase DeaD; Provisional.	0
NZ_CP038952.1|WP_155047165.1|1405119_1406685_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.71769e-34
NZ_CP038952.1|WP_016212185.1|1395749_1396739_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP038952.1|WP_016210752.1|1390866_1391664_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	2.13986e-06
NZ_CP038952.1|WP_052104738.1|1411554_1412361_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	1.28417e-38
NZ_CP038952.1|WP_129556641.1|1387227_1388490_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	2.59319e-84
NZ_CP038952.1|WP_155047164.1|1410134_1410557_+|response-regulator	gnl|CDD|381151	cd19924, REC_CheV-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of chemotaxis protein CheV and similar proteins. This subfamily includes the REC domains of Bacillus subtilis chemotaxis protein CheV, Myxococcus xanthus gliding motility regulatory protein FrzE, and similar proteins. CheV is a hybrid protein with an N-terminal CheW-like domain and a C-terminal CheY-like REC domain. The CheV pathway is one of three systems employed by B. subtilis for sensory adaptation that contribute to chemotaxis. It is involved in the transmission of sensory signals from chemoreceptors to flagellar motors. Together with CheW, it is involved in the coupling of methyl-accepting chemoreceptors to the central two-component histidine kinase CheA. FrzE is a hybrid sensor histidine kinase/response regulator that is part of the Frz pathway that controls cell reversal frequency to support directional motility during swarming and fruiting body formation. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.94615e-31

Protein sequences

>NZ_CP038952.1|WP_016211836.1|1400964_1401453_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP038952.1|WP_051307365.1|1400684_1400945_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP038952.1|WP_016211834.1|1400112_1400427_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP038952.1|WP_016212185.1|1395749_1396739_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP038952.1|WP_016212182.1|1395230_1395416_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP038952.1|WP_016210748.1|1392593_1394549_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP038952.1|WP_016210749.1|1391833_1392295_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP038952.1|WP_016210752.1|1390866_1391664_-|hypothetical-protein
MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK
>NZ_CP038952.1|WP_016210751.1|1388577_1390383_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS
>NZ_CP038952.1|WP_129556641.1|1387227_1388490_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter
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>NZ_CP038952.1|WP_052047040.1|1404155_1405094_+|IS3-family-transposase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP038952.1|WP_155047165.1|1405119_1406685_-|amino-acid-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP038952.1|WP_036778182.1|1406891_1407719_-|thioredoxin-domain-containing-protein
MKNYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
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>NZ_CP038952.1|WP_129556527.1|1408881_1409142_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP038952.1|WP_155047164.1|1410134_1410557_+|response-regulator
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>NZ_CP038952.1|WP_036777256.1|1410979_1411180_-|hypothetical-protein
MTGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM
>NZ_CP038952.1|WP_052104738.1|1411554_1412361_+|methyltransferase-domain-containing-protein
MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK
>NZ_CP038952.1|WP_016210795.1|1412466_1413438_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK
>NZ_CP038952.1|WP_016210801.1|1413419_1414391_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKNTIKNTLVFPALLVFGSSFLQTSIAAKTKEPVRIIVNDWTSQIVLSKITGSILSDMGYQVKYINSKSNGQWFKLKNNQADIQVEVWQGTMAKKYNQLIKTGDIVDAGNHAAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALEKCYKIFATSKTKPKGMYLGGPWEKPDRARIRALKMNFKVIQVKNGDALWVELEKAAKEERPIVLFNWTPNWVEAKYKGKFVEFPKYSPKCISDPKWGKNSKYPWDCGNPKDGWLKKIARTEFSKEQPCAFELLKNISFTNAMISNVAASVDADKMSYDQAAQQWLDSNKKLWHSWIPATCSKVN

Crispr_ID: NZ_CP038952_3

• CRISPR_ID: NZ_CP038952_3
• CRISPR_location: 2643109-2643229
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038952_3

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038952_3

>3.1|2643146|47|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038952_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038952_3

>merge|NZ_CP038952|3|2643109-2643229|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038952|3|3|2643109-2643229|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038952.1|WP_036778297.1|2634446_2634920_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_054300282.1|2644606_2645071_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038952.1|WP_098082812.1|2640307_2640823_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_016210671.1|2635052_2636312_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038952.1|WP_016211905.1|2641587_2641998_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_032126312.1|2646856_2647651_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP038952.1|WP_075275117.1|2642241_2642664_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_036778294.1|2633055_2634438_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038952.1|WP_016210676.1|2636767_2638849_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038952.1|WP_016210943.1|2651103_2651790_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038952.1|WP_016211759.1|2648800_2649988_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038952.1|WP_054300492.1|2639152_2640163_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP038952.1|WP_155047228.1|2645127_2645610_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038952.1|WP_016210935.1|2650564_2651107_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038952.1|WP_016210944.1|2652451_2653471_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038952.1|WP_036778479.1|2647829_2648555_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038952.1|WP_036778484.1|2651793_2652405_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038952.1|WP_155046943.1|2642696_2642837_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_052047041.1|2641055_2641319_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038952.1|WP_129556590.1|2646464_2646860_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038952.1|WP_036778484.1|2651793_2652405_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP038952.1|WP_054300282.1|2644606_2645071_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038952.1|WP_036778294.1|2633055_2634438_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038952.1|WP_016210943.1|2651103_2651790_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038952.1|WP_036778479.1|2647829_2648555_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	3.8045e-65
NZ_CP038952.1|WP_016210671.1|2635052_2636312_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038952.1|WP_016210935.1|2650564_2651107_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038952.1|WP_016210944.1|2652451_2653471_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038952.1|WP_016211759.1|2648800_2649988_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038952.1|WP_054300492.1|2639152_2640163_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP038952.1|WP_155047228.1|2645127_2645610_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.80837e-07
NZ_CP038952.1|WP_016210676.1|2636767_2638849_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038952.1|WP_032126312.1|2646856_2647651_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP038952.1|WP_129556590.1|2646464_2646860_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47

Protein sequences

>NZ_CP038952.1|WP_155046943.1|2642696_2642837_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP038952.1|WP_075275117.1|2642241_2642664_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP038952.1|WP_016211905.1|2641587_2641998_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038952.1|WP_052047041.1|2641055_2641319_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP038952.1|WP_098082812.1|2640307_2640823_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
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MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038952.1|WP_016210676.1|2636767_2638849_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP038952.1|WP_016210671.1|2635052_2636312_+|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
>NZ_CP038952.1|WP_036778297.1|2634446_2634920_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP038952.1|WP_036778294.1|2633055_2634438_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKKEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
>NZ_CP038952.1|WP_054300282.1|2644606_2645071_-|IS630-family-transposase
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MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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134. spacer 2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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135. spacer 2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 2.1|1403054|31|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45576 : 89169	43	Moraxella_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	118870 : 176861	60	Staphylococcus_phage(37.5%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	200549 : 271546	58	Acinetobacter_phage(25.0%)	protease,tRNA,transposase,tail	NA
DBSCAN-SWA_4	300159 : 360019	56	Bodo_saltans_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	444251 : 544723	109	Escherichia_phage(43.75%)	integrase,tRNA,transposase	attL 511038:511097|attR 525249:525422
DBSCAN-SWA_6	552422 : 600375	51	Synechococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	621845 : 724426	108	Prochlorococcus_phage(17.65%)	protease,tRNA,transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_8	759843 : 807780	37	Staphylococcus_phage(42.86%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	824461 : 937875	107	Staphylococcus_phage(30.3%)	protease,transposase,integrase	attL 886926:886985|attR 908120:909222
DBSCAN-SWA_10	958417 : 1002385	43	Escherichia_phage(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	1014923 : 1052365	40	Orpheovirus(20.0%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1084851 : 1214067	104	Staphylococcus_phage(21.43%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1254739 : 1430603	153	Staphylococcus_phage(17.65%)	integrase,tRNA,transposase	attL 1286993:1287052|attR 1363065:1363428
DBSCAN-SWA_14	1446218 : 1552484	102	Staphylococcus_phage(14.81%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1570882 : 1614836	48	Staphylococcus_phage(45.45%)	protease,integrase,transposase	attL 1570787:1570846|attR 1597599:1597687
DBSCAN-SWA_16	1623724 : 1671128	43	Staphylococcus_phage(25.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1613771:1613830|attR 1656596:1657697
DBSCAN-SWA_17	1697189 : 1741247	39	Staphylococcus_phage(22.22%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_18	1762667 : 1818193	55	Staphylococcus_phage(15.38%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	1892930 : 1998707	96	uncultured_Mediterranean_phage(21.05%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	2028441 : 2137820	111	Acinetobacter_phage(18.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	2141836 : 2189498	46	Salinibacter_virus(16.67%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2213680 : 2257138	45	Staphylococcus_phage(41.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2260883 : 2296356	36	Halovirus(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2336626 : 2398969	55	Acinetobacter_phage(10.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_25	2488862 : 2571573	82	Escherichia_phage(37.93%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2587203 : 2615390	27	Acinetobacter_phage(12.5%)	protease,integrase,tRNA,transposase	attL 2584592:2584651|attR 2602432:2602720
DBSCAN-SWA_27	2644606 : 2697347	57	Microbacterium_phage(12.5%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_28	2758226 : 2816258	56	Staphylococcus_phage(37.5%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_29	2941126 : 3005258	53	Staphylococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_30	3013143 : 3127063	113	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038952|45576:89169|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGTTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAGTTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAAGATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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MKLNYQQLSDLSEYFTNINNDENIEYSVDSNPLGITKKNHELQFTMEESLSKDDLKEHWEKYCRKYNLSFDESLFIETPSSSPNQPEMKQQSFMEDNNIGEEKERNFQQENSFYTTHLTHRS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036776493.1|46661_47423_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779326.1|47724_49251_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49622_50462_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50501_51809_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51783_52953_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|53007_53733_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54011_54401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54588_55494_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_087910645.1|56563_57717_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
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WP_016210702.1|61212_64275_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
WP_016210701.1|64271_65336_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016210703.1|65691_66645_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66676_67840_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|67845_68445_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210697.1|68632_69133_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
WP_016210706.1|69150_70239_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211099.1|70377_71622_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211097.1|71618_72461_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036777711.1|72440_73250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73417_73645_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73645_74596_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74651_75203_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75329_75752_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_016211109.1|75744_76491_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211103.1|76533_77232_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77242_78067_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|78396_78765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|78759_79821_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126486.1|79870_80101_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211248.1|80230_81445_-	aromatic amino acid transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|81745_82807_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_036777695.1|82820_84548_+	oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211245.1|84581_85313_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211247.1|85312_86101_+	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211251.1|86205_86829_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211250.1|87148_87361_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047032.1|87516_88578_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047033.1|88572_89169_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038952|118870:176861|DBSCAN-SWA
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MKVNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MKNLIYAQRLLYFAVLIAVIVTFVQPFLMPIKLADVPLMPLVVASIYSLIFAAALALAAYKLPSKAGWPRFLLVILFIGDAMPAVKNWLVLWHTTELFAIIYLMKLMLMLAAILLSLSKLARDFYKC
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MHKVLMVDDDQELCQLVQTFFTKHFLDIDAVHTGAAAVEKVKQGQYDAMILDQNLPDIHGLELCEKLRKHYQGPVLILSGEGGEVARVLGLRAGADDYLEKPFSRHELLERMRKLIERCGRSAHALRAAPEEGTYRFADFEGYTLDFYERMLRPHDNQEKSIQLTDVEFKILSSLVMRNNALVRREDIEQLTIENDDNSRSFDVHISRIRKKLGNNAMIKTIHGHGYMMVGACQFS
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MDAVLDDWFWDYKKGQIVLRNESGDISVETKVSIRREDWSWPYPVDSEEWSRVCVGCFRMHGKIANSTLQKWLHSEEGERLIRRLVAQQKFG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556618.1|118870_119968_+|protease	trypsin-like serine protease	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	5.3e-21	28.1
WP_016209581.1|120033_120744_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_129556619.1|120826_122035_+	HAMP domain-containing histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209598.1|122101_122686_+	YggT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126223.1|122751_123411_+	alpha/beta hydrolase fold domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209604.1|123414_124341_+	hydroxymethylbilane synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209605.1|124337_125129_+	uroporphyrinogen-III synthase	NA	NA	NA	NA
WP_129556620.1|125209_126094_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047034.1|126095_127283_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|127259_128234_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_155047035.1|128753_128933_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209580.1|129024_129549_+	ankyrin repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209612.1|129932_130301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209595.1|130338_130611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300576.1|130701_131997_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211692.1|132632_133535_+	LysR family transcriptional regulator	Q6JIH3	Burkholderia_virus	1.6e-18	28.4
WP_051307362.1|133591_134443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211694.1|135022_137032_+	DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	3.0e-110	37.8
WP_054300271.1|137069_138044_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|138545_139958_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126550.1|140450_141458_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_016211636.1|141477_142998_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
WP_016211018.1|143948_145265_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_016211015.1|145368_145752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211019.1|145886_148952_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	5.1e-53	20.6
WP_016211017.1|149020_150124_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211016.1|150147_150702_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273381.1|150816_151386_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155047036.1|152426_153326_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047037.1|153470_153776_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_098082829.1|154170_154566_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|154587_154953_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046700.1|155009_155174_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|155163_155463_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300544.1|155553_156000_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126725.1|156495_157062_-	DUF1415 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210241.1|157073_157859_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210235.1|158490_159414_+	two pore domain potassium channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210246.1|159465_160461_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210237.1|160492_160987_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_036778333.1|161078_161336_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|161425_161848_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210236.1|162166_162883_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210247.1|162926_163178_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778330.1|163182_164619_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210231.1|164646_166089_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210242.1|166176_166515_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|166599_167130_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|167190_169383_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
WP_016210238.1|169425_169911_-	proQ/FINO family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210226.1|170180_170612_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778324.1|170629_171460_-	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_080664837.1|171474_171618_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_052104672.1|171648_172533_-	formyltetrahydrofolate deformylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210244.1|172504_172726_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210225.1|172899_173178_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036780891.1|175110_176289_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|176285_176861_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038952|200549:271546|DBSCAN-SWA
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MRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MFQSLSDRLGATLKKIRGQGRLTEDNVKDAVRDVRMALLEADVALLVVKDFVKRVREKAVGHEVLKSLTPGQAFVGIVKNELTHLMGEENADLNLNAQPPAVILMAGLQGAGKTTTVAKLARFLKTEKKKSVLVASADVYRPAAIKQLETLAGQVEADFFPSHANEDPVRIAENAISEAKRQFKDVVIIDTAGRLAIDDQMMDEIRRVHDAINPIETLFVVDCMQGQDAANVAKAFNDALPLTGVILTKVDGDARGGAALSVRHITGKPIKFLGMGEKTEALDPFHPERMASRILGMGDVVSLVEQAEKSIDKAQAEKLAKKIRTGKKFDLDDFRDQLKQMEKMGGVSGLIDKLPGMGNMSEKIKSQVDDNSFKRLEAIINSMTKGERQKPEIIKGSRKRRIAAGSGTQVQEVNRLLKQFAQMQKMMKKMSGKGGMMKMMRSMKGMMPPGTGV
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MAEPTLLYINQATALHSNTITHLQQHFKITHADDCQHALHLAAKTPPDLILIEINLAEDSTINIIPSFREWTQTPILVYSDNDNINDKLHAFSLGANDYILKSCHPQELLARLHAAFRISKKLQKSLSTSTLKIGHLEVDLLQRKVALKGTPLSLSQKEYNLLKVLSIHHGKVVTQSQLLKEVWGKEYQSKLQYLRVYIGQLRKKLKSRKNSPHLIHTISGVGYRLEPPQA
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MFKIQVLHGPNLNLLGLREPDQYGLMNLTELDAELARRAGVAGVALESFQSNVEHELLGMIHQMAHKDHIVDFIIFNPAAFTHTSIALRDALTAVQIPFIEVHLSNVHAREKFRQHSYFSDIAQGVITGLGAHSYFCALEAAIAYCQQAKV
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MQKYLLKHPLHSRGKKITCVNIRRAKVADLQEARYSENKLDNIIQLVSKLCNLPTPQVLELDQEDFSKITLLIIEHLCISHGGDSHFYQELWGPCIP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209871.1|200549_202532_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|202741_204085_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|204351_207021_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|207044_208964_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|209133_210555_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|210700_211675_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_054300537.1|211706_212114_+	glyoxalase	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|212392_212614_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|212777_214439_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|214511_214802_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_036776911.1|215027_215483_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|215547_216012_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216104_217451_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|217450_218356_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|218417_219404_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|219396_219639_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|219760_221305_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_036776914.1|221351_222638_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|222680_224075_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224098_224278_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|224274_224454_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300181.1|224457_224739_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|224795_225161_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228166_228664_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|228834_229530_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|229632_231195_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|231510_233304_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233389_233662_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|233667_234294_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234280_235711_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236043_237099_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237067_237745_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|237734_238571_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|238730_239024_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|239130_239937_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|240241_241096_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_036776920.1|241250_242300_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_036776924.1|242350_243007_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|243024_244305_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|244578_245940_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126863.1|246339_246891_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|252322_253594_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|253650_254634_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|254630_255416_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|256112_256478_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|256423_256999_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|257002_257722_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|257866_258067_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211358.1|258114_258576_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|258999_260481_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|260543_261653_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|261750_263712_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|264241_264646_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047045.1|264698_265394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|265370_266345_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_098082809.1|266515_266866_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|267808_268891_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_129556499.1|270393_271546_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038952|300159:360019|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP038952|444251:544723|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210501.1|461648_462635_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|462637_463792_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|463788_464484_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|464618_466109_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_036777447.1|466129_467179_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|467245_468640_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210495.1|472256_472616_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|473035_474031_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
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WP_016211707.1|476430_476718_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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WP_016212477.1|504285_504531_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
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511038:511097	attL	NA	NA	NA	NA
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525249:525422	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_017375910.1|529789_530518_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_052104771.1|538954_539293_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	5.4e-25	54.9
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WP_036780395.1|540988_541243_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377363.1|541226_541583_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_075274719.1|541888_542755_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047068.1|543240_543441_+	HNH endonuclease	A0A2H4PHY5	Pseudomonas_phage	3.5e-16	64.3
WP_155047069.1|543528_543882_+	hypothetical protein	Q6DMU4	Streptococcus_phage	8.2e-08	34.8
WP_054300202.1|543994_544723_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP038952|552422:600375|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTATTCAGATAATATTAGGATTATTTCAAGCAACAGTGATTGTATGATTAAAGCAATAATCATTTAAATAGAGTTTTAATTGATCTTTTGAGTGGAGTGGGCCAACGCCAGCAGGCGTACCGGTCAGAAAGACATCACCAGGTTCTAGGGTAAAAAACTGACTGGCTGTGCTGATTAATTCAGGAATGGTAGTAATCATTTGTTGAGCTAAGCCGTGTTGGCGTATTTCATTATTAATCGATAATTTAAATTCTATATTATCAAGTTGCTTTATTTGGTGGCTGTGCATAAAGGGGCTTAAAACACATGAGCCATCAAAGGATTTGGCTTTTTCCCAAGGGTGACCGTTATCTTTAAGCTGGTTTTGTAAATCGCGTAGGGTTAAATCAATAGCAAGGCCATAGTAAAACGTCTCGAGTTGAATCTCTTCTGGCTGTCGTTTAGAAACTGTTTCAGTGATCAGTAAAGCAAGTTCCAGTTCATAGTGGCAAGAACCATAGGCAGTGGGCCATTGGATGGGGGTAGTTAAATCAATCATAGCTGAGGTCGGTTTCATAAATAATAACGGTGTGGTTGGCGTTGCATTATTAAGCTCGTGAATATGATCAATATAGTTGCGACCAACACACACTACTTTTCCAGGTTGCCATTGAAGGGGATGTTGGTTTATATCCATGTGCTGATACGTCATAGTAAATGCCCTGATAAGATGAGTCTATGGTATGGGCATTAAACCATATTTAGGAATGTTTAGCCTACTGCTTATTTGCTTTATTAATGCGTATTTGAATTTGCTCTTTGACGACATTGTAAATTTTATGTGGGTCGATTTTACCAACAAACTCATTGCAGCCGATTTCTTTGGAATCTGATTCATTAAAAACGCTAGTAATCGATGTGTTGAGCATAATAAACAAATTTTTAAGTCCTGGATGTTCTCGACAGTTTTTTATCAGTGAGTAGCCATCCATTTCTGGCATTTCGACATCGGAAATAAGCATGAGGTATTTACGGCTAACATCACCTGCAGTGCGTGGAATATCATGCTCAAGAATGTCCAGTGCATGTTGTCCATCATCGGTCATAATGACATTAACGCCAATTTGATCTAATACTTGCTTAACATGGCGGCGAGCGACTGAGGAATCATCGGCGACAAGTACGGTGTATTTGTGAGCGACTTTTCTGATCATATCATCAAGATCATCAGTGTTGAATTTTGCTCTAACGTCATGAATATCACCAAGAACACGTTCAACATCGAGTAATTCAACTAAACGGTTGTCTACTTGCGCTAAGTCTTTGGCTATGCCTGTGATATAGTGATCCCGGCCAGTGGCTGGGGGGGGTGGAACAATACTTTCCCAAGACGCATTAACAATGTGATCTACTTTATAAACAACTAAGCCTTGTACACTGCGATTATATTCAGTGATGATTAAAACTTTATCTTCTAGATCATAGGTATATTCATCATTGACGGCTTTATTAAGGTCGATAACGGGCATGGTTGTACCACGAATACTGGTTGCACCAATAACGGCTTTATGCGAGTTAGGTAATTGCGTTAATGGCGGTACATTAATAACCTCTCGAATTTTAAAGACATTAATACCAAACAGCTGACCATCCAGATGAAAGAGTAATATCTCTAGACGATTATGACCGACAAGTTGTGTTCTAGCATCAACACTTGCGAGTATATCTGGCATAACTGACCCTCCCCAGTAATCTCAAGTATAGAGCTTCTTTTTTAAAGTCGCGGTGAAAAAATTAACTTACTATAAAAAAAGCGCTAAAACAGCCTGCTAATTAGTCTGTTAATTAAAATATAAAGTTATGGGGTAAATACTGGTAGTACAGGGGAAATCGCTTTAGGAAAATATGAACCGAGAGTCAGTCAGCTCTTTTTCAAAAACATATCTATTATACTAAAAGCCTATGCTTATTATTTATCTGCAGCTTTAGTTATGAAGATTTTTATTAACCTTATGTTTGTACTTGCTTTATGCGGTTTTAATCTAAATGTTAGTTATAGCGCTGAGCGAGTAATTAAGTTAACCATGGACGATCGGCCACCGTTTCACTATCTTCAAGATGGCAAGTTAAAGGGTCCGGTGATACAAACATTGCAGTGTATCTTTAAGCATATGCAGCAAGCCTATGATGTTGAAGTGGTCTCCTGGTCAAGAGCACAGCATTATGTCAAAGTGGGATATGCTGATGGTTTTTTTGCGGCTAGCCATAATAAAACTCGAGACCAATATGCGACGCTTTCTTATCCATTTGTTGATCAGTACTGGAGTTGGTTTACATTAAAATCTAAAACTATCTCAAAAAAACAACTTGAATCAAAAGCACTAAAGGTGTCTAGTTGGAAAAAATCTAACTCTCAGCATTGGTTAGAAAAAAATAGTTACAATTTTATTAATTACCCACCTCAGGAAATCAGCCATTTGGTGAATATATTAAGAGCAGAGCGTGTAGCGGCTATCTTTGGCAGTAATATCGCAATCTATCAGTATTTAAAGAGGCTGAGGGTTTTTGATCAGGTCAAAGAAATAAAAGTAGTTCATAAGCCGATGGGGCTGTATATGTCTCATCGTTATCTTAAAGAAGATCCAGAATTTTTAAGGGTGTTTAATGAAAAGTCCAAGAAATGCTTGTAGTTAAATTTAAGCAGCCTTCCTAGCGAGGGCTGCCTTATATTATTATTGTTTACGCCCTATCTCTTGTACTTCCATAACCATGACTTTAAAAAAGTCATAGGTCATATAGTAATTACCGTGATCACCTGCATTCTCTCCCCATGAGTTACGCAAGGTTAAAAGACCACATTGTTGCTTGCCACTGCCTACACCAAAGGTAATTTCTGCACAGGCATTATCATTATATCCGGTAATAATCATTTCATGGCCGCCAGAGGACTCTTGTTCAACAAACTCTTTTACTTCAGGAATCATCACCCAGGCATCATCAGGGGCGCCATTATACGAGCCACCAATAACGAGGTCGCCAGGTCTTCCTTTTGTTGATCCTTTGGGCACAACGGCAAGCAGTGAGCCTAATGTGACCCTATGGCCTAAATTAAGAGCTCTTTTTACCATACTCAGCGTAAAACTCCCATAAATCGGAATTTTACGCCAATCTTTGTCTGTAAAGCGTTTATCGCTAAACTGCTGGAAAACCTCAGGTGTCATATCGCTTCCTGTTTCTTTTGCATTATAGGTTGGGTAATGTAATAAACCACCGCAAACATATGCCCCATCAATCATTTGGCTTTGTTGGTCTCTGCTCATAAAACCATATGTAGTGATTTGCCCGAGGACCTTCGTCCCCCACGAGCCTTCCCAGCCACCCATAGCATCTGGGTTGTTAATGTATTTTCCCAGCTCCAGATTGCAAAGTTCACTCATTTGATTGTATGCACTGGTGAGCCCAAAATAAGCATCCACAGCACCTGCATTGGCAAATGTGGCACAGCTGCCGTGTGAGCCTTGGTTATGTACGGGAACGCCTGCCATATCTAATTGTTTTTGTGTGCTATGGCCGATCGCTGGCATATTAAAATTAGGGGTTTGCTGAGTACTTTTTAGTGCCTTCGATATTTTGGAAACTTTCTCAGCTTTTTGCTCTGGTGATAAATTTACCTTCATTAATGTAATTTGTTGAGGCATCATTGTTGAAAATGATGCGTGAGCCCCACGCATCATTGGGCCTCCAGATCCTGGAATGGTAACAAGTAAGGTTTCTGCATGAACTGAAGCTATTGTTAAGCTTAAACTACTGATTAGAAGAAGATGGATATTCTTTTTTTTAAACATAGCGTGGTCTCCCAGAGCGATAATAAAATTGCTTTATAAAAGCAGATAAGGTTAAAAAAATTTAACAAAAATATTTATTTTTTTACTTGGTCTAGTTAATTATCAGAATTAACATATATTGTTAATATGTCAATAATATTTATTAAGATTTTTGTTAATTTTAGTTGGTTTGAAAATTATATGTGCCGATTAATTAATTTATCTCTGGTGTTTTATATTTGATTGGTAAAAGATAATATTATTTGATAATAATATTTTGTGTTTTTTATGATTACATTAATTTTTTGCTGTTTTTTTCATGCTGTTGATATCAGTGTATGATTATATAAATTTTCAATTTTTATATCTTAAAATATAAATCAGTTAGGAAGGAGGGTG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MRWRLLAWICIDLLLVFALLLGAGAFYIYIEFAHPKVWLERLAKRQGVTLRAVNVRTVENNIFSPAFEIKNLVMSNKSQGWSAEVKYYYVHFNLLKSIWHWRLSTDDIAMRGATIDFDIEQAHFNQQNKHSLLTVFPWLNAQEKVQLSDIRLNLQQGKIKDHLFLNALWQSSAESMSTLTLRARGERDEKLIVNAEVKKTKLGGFQSAHIDLRTQKLLLSWLNLAKVKVAKQDYRLDMDAKFSGSLDQSQFFSKFSLQGARVNVLQSLDGEFSAKAHDGKAQLSLPKLNINGQAYPQPIELNLNYNRLNRQLHASGLVLKPLVPLMYLLDTTSFGYPRELDRLSSLQGHLTEIHGYWQSAERWQLAMGLVDLGVKPTITEPGITGVSGELVVKPNQLRFDLDSPNLHWLWPDTDKRQTPVLNTQAKIQVKQLKPGIKLSVSHIKVNHPQAHLAGKVSVIFRQQAAPVVTSRLDYTLATPEFVKKFLPHQGVNPEFFTWLQKALLAGKTQGIAILNGALSDFPFTDGQGQFFVQFDVRDGQLDTNRGWPIIRQGDARVTFAGPQLTITANKVLMAGLWLHDIRLKMADIMPGVPTELNIQGQSEFNLKKGMALIAKSPLKALVEKIKVSSGQGKINLNLKIPFGYVDKNKLTTVNGMLNVKNTSVDFTGKKVALTKLAGTFNFDEQGLVFAKDAKALIYGEPVNFSVTSQLQKQEPITTINFNSWLSAAVIKGLADIDLGSFIKGRTPIIGTYRFGEHSGNLSVNSKLQGLSSSLPAPFNKAINSQALLSLQEKKANNEQAIALTYGDQVKLEGHLNQEKKSTPALFLQANLKTLNLNEWGKTIQRLFSRELKSTNKDIIGSLNLTLDKLIIDEKSLSDVSLKVDRQASGVSIDVTSSVLSGVVHYQQGVNIPELSLDFSKADLNIAQSIYHWYQTDFSGGNQSAGVLKRTKHLPKVTATLNNVNYKNYQFKSVNLTLTPVNYGYQLDSLQLTDPNYTVHATGELNLIQRQNPSFIKGNVHFSNVGKGLDALGINNLIGGGRGSLFFDLEWLGLLTDVKPETLLGRIKVNLVNGHITKVNPGLISLINVFNVDSFWQRIKFDSSGVLQKGLAFSELTGLLSIFHGNLFTNDMVVKGPDLQLSIGGRVGFANKDVDLLVGAVPQVSGSIPVIALAAGGLSFAPIAGALWLFEKALSSEVSNPFVFQYHVYGPWDDVQTKAVNSNNNEK
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MTYQHMDINQHPLQWQPGKVVCVGRNYIDHIHELNNATPTTPLLFMKPTSAMIDLTTPIQWPTAYGSCHYELELALLITETVSKRQPEEIQLETFYYGLAIDLTLRDLQNQLKDNGHPWEKAKSFDGSCVLSPFMHSHQIKQLDNIEFKLSINNEIRQHGLAQQMITTIPELISTASQFFTLEPGDVFLTGTPAGVGPLHSKDQLKLYLNDYCFNHTITVA
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MNKIHSGLLFILALTASKPAFSLIESHTIAYEYNWPPYSYQLDSGKLEGIIIDIVRIALSRADLQSEATSFPLDQAKALVKENIISGLITTADKIPAPTISSPNEKENKSKNQASNITVLISSEPIITIRSKAFVLKKNKNLTNLKKISSFNDLETLKICIDQNNIWAKQQFKSHQIKALFSKNQADCFRKIALNRYDLTITQETLGKQLLTMMELEKNFTLLPYNYRTLHIVLATHQQSELAESLPKFNTVIKEMRKDGTIQNIIQTYAR
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MNRAINNQVKFDYARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MYDYHIHLYYDMSTRSVAKLLRNNLHTMLEGVAKVSLLHDKPPYPHPQPMFEIAFPKDLLPKLTQWFKAHRNGLSVLLHPVQNSETDAYHSKGRWMGQPLISG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211663.1|553244_553910_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211661.1|553974_554931_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
WP_032126810.1|555189_555888_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211662.1|555930_557043_-	C1 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|557647_558223_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|558168_558534_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|558621_558972_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|559707_560769_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|561980_562796_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|562886_563870_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|564040_564562_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_036779246.1|564595_564850_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-20	58.8
WP_016210909.1|564852_566130_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|566822_567350_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|567469_569782_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|569910_570726_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|570923_571388_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|571517_572579_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|572839_573136_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|573418_574882_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|574884_575937_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_036779281.1|575926_576382_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_155047071.1|576406_576730_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|577077_577389_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300208.1|577518_578310_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779278.1|579467_580421_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|580534_580732_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126198.1|580977_581178_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_142396463.1|581288_581405_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|581491_581713_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|581739_582105_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|582161_582326_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047072.1|582315_582630_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|582767_582932_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|583226_584663_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|584704_586156_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|586267_586555_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|586744_587788_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|587803_588703_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|588699_589218_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|589287_589905_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_036776217.1|589914_591402_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|591411_595092_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776215.1|595165_595978_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|595974_596655_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047260.1|597495_597654_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155047073.1|597846_598404_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|598453_598744_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300215.1|599547_600042_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|600036_600375_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP038952|621845:724426|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209523.1|621845_623195_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
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WP_016209501.1|623944_625456_+	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778935.1|625461_626688_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|626681_627710_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|627687_628380_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049805.1|628381_629854_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778941.1|629846_630335_+	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_051307310.1|630340_631813_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|631812_632211_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|632207_633896_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|633877_634834_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|634876_635392_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|635496_636429_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|636648_637035_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|637051_637696_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|637876_638716_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|638791_639394_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|639394_640249_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|640605_640917_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|640941_642333_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|642488_643220_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_129556465.1|643216_643789_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|643775_644333_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|644338_645319_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|645458_646259_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|646262_647030_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|647026_647491_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|647513_648167_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|648170_648518_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|648551_648803_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|648879_650148_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|650150_650909_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|650970_651861_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|651911_652595_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|652680_652938_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049806.1|653210_655364_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|655355_656228_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|656395_658225_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|658387_659029_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|659270_659801_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|659818_659992_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|660050_661100_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|661106_662057_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|662110_663055_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|663082_663820_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|663908_664151_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|664225_665449_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|665480_666329_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|666325_667378_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|667498_668119_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
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WP_054300225.1|704429_704849_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046954.1|704955_705129_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126800.1|705355_706090_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|706214_707276_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047215.1|721380_722634_-	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038952|759843:807780|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP038952|824461:937875|DBSCAN-SWA
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MRALRDIKKDKGINQALDRSCGGFSTKVHILTEGLGYPVDFVLTRGQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_033923708.1|824461_825337_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211687.1|825592_826237_+	UvrY/SirA/GacA family response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_016211685.1|826267_828073_+	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|828096_828672_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556476.1|829216_830227_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|830399_831374_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046989.1|831606_832671_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|832763_833738_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046989.1|833970_835035_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|835525_835891_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047206.1|835905_836415_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|836450_837425_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300250.1|837507_838167_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-09	31.0
WP_016209640.1|838585_839605_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209649.1|840063_841029_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209646.1|841073_841649_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209651.1|841679_842954_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126159.1|843599_844313_+	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|844392_845130_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|845250_846606_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|846782_847454_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|847569_848445_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|849048_850353_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|850465_851071_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|851152_852454_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|852521_854954_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|855057_855330_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_075273480.1|855412_857311_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|857342_858227_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|858235_858631_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|859058_861206_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|861177_862527_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|862523_864644_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|864640_866344_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209654.1|866462_867605_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|867669_868698_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036776625.1|868824_870339_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038952|958417:1002385|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP038952|1014923:1052365|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211478.1|1023727_1024543_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|1024522_1025242_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_075273327.1|1025409_1025985_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1025930_1026296_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126514.1|1027542_1028859_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|1029141_1029717_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126515.1|1029792_1029972_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|1030144_1030438_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_075273504.1|1030627_1030981_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211262.1|1031035_1033309_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
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WP_054300275.1|1033738_1034614_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211550.1|1034691_1035453_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211548.1|1035436_1036393_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211549.1|1036655_1039160_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211553.1|1039163_1039904_+	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1040243_1040609_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|1040665_1040830_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|1040819_1041119_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049809.1|1041122_1042418_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1042592_1043567_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016209411.1|1043772_1044567_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|1044729_1045518_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_036776605.1|1045514_1046726_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126508.1|1046715_1047075_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|1047169_1047598_+	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_129556555.1|1047728_1048859_+	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|1048855_1049584_+	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|1049641_1050529_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209433.1|1050613_1050988_+	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|1051087_1052365_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038952|1084851:1214067|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038952|1254739:1430603|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300189.1|1267138_1267504_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211215.1|1269718_1271689_+	acetate--CoA ligase	A0A2H4PQU7	Staphylococcus_phage	1.5e-77	37.2
WP_016211211.1|1271880_1272960_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_052104715.1|1273008_1273215_+	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
WP_155049811.1|1273221_1274703_+	thiamine phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211942.1|1277130_1278390_+	DUF4804 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211940.1|1278510_1278843_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556538.1|1278956_1279931_-	D-alanine--D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_155047176.1|1280075_1280228_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300312.1|1280445_1281468_+	YHYH protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778055.1|1281475_1283158_-	HAMP domain-containing protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-32	33.5
WP_016211344.1|1283318_1284137_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP038952|1446218:1552484|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556639.1|1466231_1466642_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209775.1|1466658_1467114_+	flagellar motor switch protein FliN	NA	NA	NA	NA
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WP_129556524.1|1474194_1475082_+	MinD/ParA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051307317.1|1479154_1479448_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209791.1|1479584_1480307_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209771.1|1480471_1481194_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126436.1|1481900_1482356_+	SUF system Fe-S cluster assembly regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209793.1|1482371_1483820_+	Fe-S cluster assembly protein SufB	NA	NA	NA	NA
WP_016209795.1|1483860_1484616_+	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.3e-10	24.6
WP_080664823.1|1484596_1485997_+	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_016209796.1|1486020_1487238_+	cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	2.9e-92	42.0
WP_016209778.1|1487268_1487643_+	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A218MM00	uncultured_virus	1.7e-11	38.5
WP_016209772.1|1487661_1488213_+	putative Fe-S cluster assembly protein SufT	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|1492182_1493157_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212424.1|1493500_1493779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036781387.1|1493771_1494044_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1494161_1495244_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300346.1|1495390_1496266_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126678.1|1496276_1497287_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
WP_016211554.1|1497613_1498240_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.6e-33	41.3
WP_016211557.1|1498285_1499515_+	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
WP_032126677.1|1499709_1500273_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211555.1|1500347_1501706_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211664.1|1502242_1502971_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|1503343_1506163_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
WP_016211669.1|1506317_1506668_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1507492_1508467_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556522.1|1509777_1511010_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	9.0e-17	23.2
WP_016211405.1|1511216_1512989_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	4.9e-08	41.9
WP_016211403.1|1513124_1514168_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_036777261.1|1514181_1514925_+	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155047160.1|1515059_1515359_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211732.1|1515963_1516662_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047159.1|1517083_1518475_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211733.1|1518530_1519355_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038952|1570882:1614836|DBSCAN-SWA
CATGCTTAATGAAGGCCAAGCGGGTGTTAAAGTTGAAGATATTTGTCGCCAGTATGGTATTGCTAAAAGCAGCTACTACAAACTCAGGTCCAAATATCAAGGCATGGGCGTTTCAGATCTACAGCGTTTAAAAGAGCTTGAAGACGAAAATCGGCGTTTGAAACAGATGTACGCAGACATTAGCCTAGAGCACAAAGTGCTCAAGGATATTGTTGAAAAAAAGCTATAACCGCAGCGAGTCGGCTTGACTTAGTTGATTATGCTGTCAAAACTCATGCATTGAGCGGGAATAAAGCATGCAAGATATGCAGTATTGGCCGATCAGTTTATCGGTATCAACCTAAAAAGCAGGTTACTGATACTAAAATTAAAAAGGTGCTGACAGATTTAGCTAAGGTACATCATCGCTGGGGTTTTGACAAAATGATGGCTAAAATCAAGCAAAACTACGCTTGGAACCATAAGCGTGTTTACCGTGTCTATTGTGAGCTCAAGCTTAATTTGAGGGTCAAGCCTAGAAAAAGACGTTCACCACGGCAAGCAAAAATGTTAGTTCAGCCTATTGTACCAAACTACTGTTGGTCACTTGATTTTATGAGTGACACGCTATCGAATAAGCGCAAGTTTAGAACCTTAAATGTGATCGATGATTATAATCGTGAGTATTTATTGATTGAGCCTGCTTTTCCCTTGCCATCAATGGTTGTCACTCGACTGCTTGATCAGGTTGCCGAGTCAAAAGGTTATCCTGAAGTGATTCGCAGTGACAATGGCCCAGAGTTTATTTCAAGTGATTTTACAAAATGGGCAGAGCAGCACAACATATTGCTCCATCATATTCAGCCTGGGAAGCCCGCACACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCTCTATAATAACAATTGCTGCGATTAAAATTTATTAATTCACATTGCCTTGTAACTGGAATATTTTTCGGCTCAGACTCAATAAGGCACTTTCTTGTTTCATAGTCCAAGCTCTTCAACTTTTTTGCAGCCCACTCCAACTCTGCTGTGCGTTTGCCCAGTTGACGGTGAAGTTCATTCACTTCTTTTTCTTTGGTTTTGATTTCATCCTTAAACTCCGCCACAGCGCTATCGATATTATAGCGCTGGATTAACAGTTTCTGACATAATATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAATTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACCTATTACACAAATTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGACACTCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGGTTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGTGATATGAAAGAATTTCAAAAATTTATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCTTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGTGCTATAAAAGCCAGGCTTGCATTTGCTAAAAACACCTTTTTCCAGTTTTGAACAGTTTTAGGGACTAGCTCATATTTCGAGCATATTTGGTTGAGCGTCTGATCTCCTTCGATGACCTCTAAGACAACTTTAGTTTTAAATTCAGCGCTTGGCTTCTTTCTTTTTTGACTCATGTCATAGCTCCTAAAATGTTAAGCATCATTTTAACCTTTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGTCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCAGGAATAAATCGTTAAACTGTTCTGTCTGAAAACTCGGGAGCATTATAGCTTTCGCTGCACTTATTTTATTTAATTTTAAGAAACAATCTCTAGATCTAAAGGTGTTTTGTGTTTAGACTTTCTTGAGTGATTAATCATTGATTTTTGGGCGTTTGGTTTAAATTGTGGAATAAAGTCTTGTACATTAATCCGTGGGTGAATATTTTGAAAAACCTGCAAAAATTCTTGGGTGAGTTTATGACTTGGATACAGCTGGATTAATGGCTCTGCTTTTTTATGAGATTCTTTCATTTTTATAGAAGATGATAAGTAGGGCTCTATAACGTTGAGCTGGTCATCTAGCAACTCTTGAACCACTTGTTGGGGCAGCTTGCTGGTGGGCTGGTATTGATTAATGACAATGCCTTCTATGGCTAAATTTGGATTATGATCACTACTGATCTCATGAATATTGTGAGTTAGTGTGTATAAGCCTTGGCGGGAGAATTCATCGCAATCAAAAGGAATGAGGCAGTGTGAGGCGGCGATGAGGGCAGAGCGACTAAAAAAATTAAAGGCCGGGGGAGTGTCGATATACACGGCATCATAATCGAGCTGGTCAAGCGTTTCTTTGAGTTTATAAATTTTATGGCGTGATTCTAGTTTGCTGTGTAGGGTTTCTAATTCAAGATTTGAAGGGATGATGACTAGGTTTTGTATTGCTGTGGGTTGAATACACTCAGCCAGAGGGCTGCTTGAATAATTAAACGATAAAATATTACTAAAAAAGTCGGTAATAGTATGTTCACATTCGGTGTATTGTTGGCCTAATAAATAAAAGCTTGAATTCGCTTGTGGATCAAGATCAATAACTAGAGTTTTCAGGCCACAGAGTGCGCTGATCGCCGCAAGATTGCAAGTAATACTGGATTTGCCAACCCCACCTTTTTGATTAAAAACGACACGCTTCATGATGATACTTTCCTTGAGATCGATAGAGTGTATTTGCTAAGTCTAACGAAACATTGACTGAAGGTCGAGAAAGTTACGATTTTCCTTTTCCCCTCCGGGTGTTTTGCAAAATTTGTTTGATGCTGTGCTATGATGCTGCTGCACGACAGTGGAGAAGAGAACAGCATGCAGCAAATGATATTTGACCAATTAATGCAAGAATGTACGGTAAAAGAGGCGTGGCAGTTACGTAAAGCCT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MCKIPTEVATLTYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLT
>NZ_CP038952|1570882:1614836|1609736_1610090_-|WP_016211147.1|DBSCAN-SWA
MHRRELNQAFDRSFALLIEEENCQHITDLLEQLCCDHHDLLIETKYDDVEVCFKYQAQENYIEMVVYQDKVLLEDYHIAIEKVCEKQKIEELHHMCHLIRKTLNDLPLHKNKPCLPD
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MSKTYGVVLVNLGTPCAPTAEAIKEYLQEFLSDPYVVQLPAWLWQPLLRYVILPKRSQRLVESYQLIWQKGDSPLRSYMQELAAKLEFELEDEDHRVVVAMRYGQPSFQVAYDEIQAFVDEVIVIPLYPQYSMATTLTVTEKIKELSWQKPLKVIESYHNRPSYINALASTILPKINQHFDALLLMSFHGLPQKMVKMGDPYEVQCHETAALLAEKLGLTKQQWAISFQSRFGLQKWLQPYTHDLLTALPKKGIKKVYVVCPGFSVECLETLEEINEQSKAMFFAVGGEFFEYIPALNDLPEHVEILKDMLHSVHNNQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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1570787:1570846	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_054300354.1|1571256_1571775_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.3e-30	42.9
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WP_054300271.1|1571913_1572888_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_032126362.1|1573301_1573667_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1573612_1574188_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211564.1|1574767_1575643_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104693.1|1575808_1579675_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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WP_155047153.1|1580427_1581846_+	autotransporter domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211991.1|1582754_1583660_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_016211994.1|1584122_1584659_-	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047150.1|1587183_1588410_+	DUF4131 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273474.1|1588643_1589618_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_016212012.1|1589661_1590339_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016212013.1|1590354_1590738_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212011.1|1590959_1592081_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
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1597599:1597687	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_155047147.1|1602248_1603223_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.2e-29	32.6
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WP_081377353.1|1603650_1604316_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1604355_1605330_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211144.1|1605886_1606516_+	MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779218.1|1606499_1606922_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_016211145.1|1606928_1608668_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-53	30.8
WP_016211153.1|1608668_1609733_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211147.1|1609736_1610090_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|1610202_1611159_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211151.1|1611168_1611480_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1611495_1612065_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
WP_016211148.1|1612328_1613657_+	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1613861_1614836_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038952|1623724:1671128|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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1613771:1613830	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|1656686_1657661_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_036777656.1|1670348_1671128_-|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP038952|1697189:1741247|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300271.1|1698770_1699745_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016209842.1|1701326_1701716_-	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209834.1|1701892_1702651_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209829.1|1702647_1705047_-	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209839.1|1706426_1707725_-	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
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WP_016209826.1|1713539_1714562_+	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1715084_1716560_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1716799_1717774_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556633.1|1717882_1718779_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1719097_1720657_+	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273569.1|1720732_1720939_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209831.1|1721146_1721845_+	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|1722123_1722387_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_036777412.1|1722693_1725288_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209835.1|1725284_1725767_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209844.1|1725744_1726785_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209840.1|1726957_1727443_-	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_032126641.1|1727550_1730121_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_032126642.1|1730156_1730618_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047141.1|1730687_1730894_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211650.1|1733584_1735069_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|1736962_1737328_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046723.1|1740001_1740157_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|1740671_1741247_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP038952|1762667:1818193|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211414.1|1810943_1811762_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300383.1|1814687_1817168_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126139.1|1817263_1818193_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038952|1892930:1998707|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036777561.1|1928734_1930603_-	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
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WP_036777579.1|1931015_1932131_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
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WP_016209926.1|1934387_1935449_-	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1935560_1937033_+	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_052104625.1|1937185_1937629_+	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1937704_1940476_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_036777555.1|1940632_1941862_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|1941888_1942551_-	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_054300405.1|1943072_1943573_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047121.1|1943674_1944778_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.5e-10	24.8
WP_075274669.1|1944982_1945285_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|1946297_1947450_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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WP_155047119.1|1948088_1949411_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.3e-12	24.3
WP_081007042.1|1949819_1950635_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038952|2028441:2137820|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_20

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036778365.1|2032867_2033530_+	HAD-IB family phosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_129556495.1|2034874_2035132_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126332.1|2039165_2040365_-	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|2040617_2040905_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779263.1|2040960_2042970_-	TRAP transporter permease	NA	NA	NA	NA
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WP_016211367.1|2044419_2045202_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273303.1|2045357_2046074_+	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210281.1|2046087_2047479_-	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210270.1|2047520_2050508_-	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
WP_016210277.1|2050577_2051411_-	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210279.1|2051464_2052631_-	flagellar basal body P-ring protein FlgI	NA	NA	NA	NA
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WP_036778186.1|2058459_2058858_-	flagellar basal body rod protein FlgB	NA	NA	NA	NA
WP_016210273.1|2059230_2059938_+	flagellar basal body P-ring formation protein FlgA	NA	NA	NA	NA
WP_016210275.1|2060002_2060305_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210276.1|2060360_2060837_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_016210284.1|2060891_2061413_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
WP_016210280.1|2061494_2062589_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2063000_2063576_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2063521_2063887_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047116.1|2063847_2064099_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300415.1|2064688_2065390_+	dual specificity protein phosphatase family protein	A0A068QKX9	Armadillidium_vulgare_iridescent_virus	1.6e-07	33.0
WP_032126500.1|2065523_2066240_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038952|2141836:2189498|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209877.1|2147182_2148073_+	Rossmann-like and DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104599.1|2151161_2152478_+	Na+/H+ antiporter NhaA	A0A2H4J5W3	uncultured_Caudovirales_phage	3.2e-65	40.1
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WP_016209884.1|2164171_2164795_+|protease	site-2 protease family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274681.1|2174110_2174986_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210465.1|2175737_2176580_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	5.2e-32	35.3
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WP_155049817.1|2188611_2189498_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP038952|2213680:2257138|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038952|2260883:2296356|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_23

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210205.1|2274106_2275063_+	aspartate carbamoyltransferase	M1HWF9	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	5.3e-49	39.6
WP_016210206.1|2275111_2275648_+	orotate phosphoribosyltransferase	A0A1V0SHG3	Hokovirus	8.4e-20	38.4
WP_016210199.1|2275644_2276406_+	orotidine-5'-phosphate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_036778866.1|2276511_2279100_-	ATP-dependent chaperone ClpB	K4FB40	Cronobacter_phage	3.3e-122	36.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP038952|2336626:2398969|DBSCAN-SWA
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MAKNDVGEEVKDREEGVGKLGKKGFASSVDKHDTIQQAVAKVKQHKDITGAEGEAEVRQKETEAALDASSGQAPVGGTGPNPALQQFALLFQQQQQQAAPTQPEQQQQMGL
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MHGREKSISNAFDKQAVFISKQLTIPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MYYKLRMNILIVDDRKNVLHSLKRLILLKFPESKLTLAESGEEAMSLINEGPPFGLIMTDYKMAGINGLEVLAHAHGIHADTVRVLLTGYPNDEGIIAAIANDDINYILAKPWTQEQIVEILNQCAKDYQESEQAIASARVDTDDNTASRGESANDSDPLAKASTIVSLIKEVAYHLTQSEIFLMKKHAVPAYSPKFLSLLWRADGISTSMFTKALKVDDKTAMTALINLLADGLVRIESTQPSASTSASDNGEDMFIYLTAKGKKIEDSIDFMSEMIKKQVVNELIATEQVELSRVLEKIVTNLSMIKNATLAGKKSE
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MDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MDTATHSKSSSFSLFITFFAAIGGILYGYDIGIINGALLYIQHDIHMSAAQTSFIVAAVLGGGALSTLITGYLADRFGRKHMMITAVAIFLVGVAFLATAHNYNVLLVGRLIQGIGIGIITIIIPLYLSEVAPKHLRGRGVCSFQVLLSAGILLANVIAYFFAKAGISWHMMFLSSGIPAVILGTGLLFLPKSPRWLVFKGHIQQARQTLEHVYPKETASQELELICSSHNKNNSASISALFQRKFIYPLTLVFSIAILNQLTGINSILQFSATLLKGAGLQSDLVAILGSIWITVVNFIITIIAMLLVDKVGRKPLLTIGTAGVTVALLLSGIAFIYLPEGITKGLLIGIGLLVYVFFFALGPGIVVWIALSELLPNSIRSIGMAVALSLNSLASTLLASSFLPLVNHIGYGGIFILCGFFTVIYFYLAYFKMPESKGKSLEEIESSYNAAAQPATATPHIK
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MLKAMDKMMAPYFGLSRDIYIIALTEFVLALGRFVFPFLSLLLTQKLGLTIAQAGVWIAVTGLNSLLGSLIGGKLSDHCRRRSIIIVGQACSVMVMFVGGFCTTGLAILPLIFIASFTMGVAMPAVRALLTDLSTPDNRDAVAASHGVLSTG
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MMDICVTGYLKTMSSARLNKVKRVLAARQDNLAVLMDHVHKPHNLSAIARTCDAVGVANLHAVHSEFTDIGIHHHTAAGSKDWVHIIRHESIDMAYQHLRTKTPNVQILATHLSDKAIDFREVDYTRPTVIVLGNELDGASTEACAGADEHIIIPMVGMVQSLNVSVAAATILFEAQRQRQLAGLYKSYESIEKPDTIDKNKVFEWMHPKIAKLYQARNQAYPDLDEDGDILPQSI
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MEQAVAGSVWLVLKQRPQLVSYTLICTVLSLTMAQLIFAFPLYLAALFNAQGAQYYGQIMTANAVIVVIFTPILTVLTRRYSALIGTMIAVIFLGLCYSTLLLNQSLIVIFLAVFFMTVAEVLIVTKSSVFIANHSPSSHRGRITGILPAVISSVNYFSPVMMGGYIDHFGFHALWYLMIILAVLGVCSLGLMSLSELKHSHLYR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2336626_2337337_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2337365_2337770_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777168.1|2337794_2338754_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_032126712.1|2339937_2340396_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2341140_2342151_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
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WP_016209545.1|2343872_2347367_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2347404_2348244_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_036777155.1|2348430_2348646_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2348694_2349270_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
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WP_016209572.1|2350764_2351727_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
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WP_075273327.1|2356409_2356985_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2356930_2357296_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|2357448_2357721_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211411.1|2361225_2361723_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
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WP_155047091.1|2362833_2364180_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2364403_2365465_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|2365543_2366689_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_016211372.1|2372496_2373354_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|2373340_2374264_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_036778204.1|2374460_2375852_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2375898_2376942_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2376984_2377428_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2377560_2378751_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2378805_2378952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|2379502_2380420_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|2380687_2380981_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2381057_2381252_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210876.1|2383653_2384496_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2384563_2385214_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2385228_2386269_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2386391_2387477_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2387503_2388613_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|2388629_2388947_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|2388943_2389303_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|2392634_2393588_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2393660_2394722_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|2395485_2396043_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
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WP_032126663.1|2397638_2397881_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300237.1|2397907_2398969_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038952|2488862:2571573|DBSCAN-SWA
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYRCEPWSAKHGVSRPR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032127022.1|2566342_2568529_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
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WP_075274943.1|2570029_2570554_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_129556588.1|2570744_2570912_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|2570856_2571573_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038952|2587203:2615390|DBSCAN-SWA
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MERFNRTYPGDILDCNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038952|2644606:2697347|DBSCAN-SWA
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MQAAFDYLMAKEPSLQQLTEQLSQYESDLITSTSLKSLYSGSTSVCAKILEKIRTRSHEQTTADTPEPSELPFFSQQQANTSAASPVESMENRPPHQP
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MIKMLSKHIADYMFIAPEEAAIAITSAGLLPKNFKLIKIIDILPGNKRHIICSQKVPLPLITKLNQAIKSNIP
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MRISTNLHFKLLVAALFIIGIFITCYQIKTLNTPMTPSTETSVWTVEAKVQFQPEKNKPIKAELTLPNTYQDNMKILNEKFISRNYGYSTAKSNDNVRVVTWSIRRAKGLQALYYHFVVHQQHQPGKIAAPSQTIEAYPFVNSQKVAADALLAPIRQQSADIASFTQETIRLLNQKDDHNATLLLKDADSSLKRAVVITRLLSLAKIPAKVIYGIYLLPGTTQPVPWIASFNGKKWLYFNPVTGTAGLPDNVMLWSQGEEPLFKISGANQAKITFTVSESHLNALAFLQPDHSEKATNFINFTLLSLPLQTQEIYKILMTVPIGVLIILLLRSFVGVTTLGTFMPVLIALAFRETHIVWGVVLFTLVTSIGLLARGYLNQLQLLLVPRLAVILTLVIIMMAMISIFSYKLGFERGLSIALFPMVILTMTIERVSILWDERGPQEALIAATGSLITAILAYLTMTNSLITYWAFAFPGLTLIIIAIMLLIGRYTGYRLSELLRFKAFASKL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036778479.1|2647829_2648555_-	D-Ala-D-Ala dipeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2648800_2649988_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210944.1|2652451_2653471_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210981.1|2680789_2681428_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
WP_016210983.1|2681443_2683627_-	protein kinase family protein	A0A1S5XZ05	Kurlavirus	1.1e-06	34.9
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WP_016211965.1|2691044_2691695_+	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038952|2758226:2816258|DBSCAN-SWA
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MENLTKGLQIKIYSALTVILTVILVVSGGYNYNQTKDLLESQLTQEASLASSRLASSAAEPLWNADQDQLSALLKSEMLSKSISAIAVSTSDDPVFGFYRTESNKLKALIKPFVMTPQNDVIKQPITYDSDGSSNQLGELHIYTNDGFIRSELATLLTSTIIQIIVLNVVLIGVLAFLLKLMVLKPVTRISDAINDIAAGGGDLTQRVDTGKSQDEISDLGNGFNRFATKIHDIIGHVSSTSKSIAAGAQQISGINGSLADHMDTQTNQISAVGDSVAGIEKSISHVARLAAEAAEKASDSATTAKAGGDIVKYNIESMRDISTSVHASASSIETLGKLGEDINGVIETINTIASQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRKLAIRTAEATNEVAPVIKAIQDEVQNAVEKMNEGVEKVQAGVDEVTKAGEMLDKIQDSAGEVTKATDDIARAVSEQTEATKSVTGYMEKTLDEVESLKNSTHEAFDSAQVLAEDAAQLMGLVNQFTINEKKINKHSKKLVDSSVAS
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MKINLIAIGKKMPAWVKAGFDEYARRLPVSCALQLLEIEAAKRGKRFDVNRALRQEGTAMIEAIPKGNLIVALDVKGKAWSTEQLAGQLEHWQGEGRDVSLLIGGPEGLAAECLAKAEARWSLSALTLPHPLVRIVVAEQLYRAWTVLNHHPYHRA
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MSFIRVEPPKAKFLNRSIIILAVGACALLLVFAFISALQPPVQQVHGYTITTRPIHTEPETNIGQLPNYTEAKRINELLNRHRSPIGRAPAWAHWLELQLQQMTGTQQQMMDQAQSLVLAE
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MMPKLLEQKQWDKIYLFLKDFPGIYCGSERKCRLFIEAVIWILRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126277.1|2795710_2796301_-	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210574.1|2796389_2796809_-	prokaryotic dksA/traR C4-type zinc finger family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038952|2941126:3005258|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_29

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211154.1|2943804_2944449_-	maleylacetoacetate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211163.1|2944467_2945454_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211162.1|2945533_2946610_-	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211156.1|2946812_2947637_+	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_155049826.1|2947953_2948958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211155.1|2949166_2950132_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047242.1|2950270_2951146_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211700.1|2951442_2952495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211698.1|2952762_2953191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211702.1|2953951_2955202_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|2955304_2955523_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|2955980_2956835_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2956889_2957360_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2957747_2959127_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|2959154_2959613_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|2959590_2960808_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
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WP_016210731.1|2961485_2962448_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2962607_2963924_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2963933_2964602_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2964964_2966779_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2966896_2967685_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211544.1|2970027_2970828_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2970930_2971419_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|2971592_2971907_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|2972927_2973272_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|2978965_2979928_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|2980114_2981374_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2981597_2981924_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2982118_2983069_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2983126_2985193_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|2985198_2986194_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2986779_2988360_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2988516_2989926_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|2989985_2991119_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|2991258_2992083_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|2992310_2992940_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|2993276_2993648_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|2993951_2994239_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|2994390_2995239_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|2995366_2996407_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_155047244.1|2996479_2998417_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|2998700_2999360_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2999514_3000489_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|3000564_3001584_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|3001982_3002192_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|3003066_3004149_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_054300161.1|3004196_3005258_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP038952|3013143:3127063|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036777721.1|3106181_3106955_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_080743040.1|3126406_3127063_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP038952.1|WP_144019123.1|2756806_2757550_-|hypothetical-protein	2756806_2757550_-	247 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038952.1|WP_155047234.1|2758039_2758183_-|hypothetical-protein	2758039_2758183_-	47 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP038952.1|WP_016212372.1|3070968_3071190_+|hypothetical-protein	3070968_3071190_+	73 aa aa	NA	NA	NA	3013143-3127063	yes
NZ_CP038952.1|WP_155047252.1|3071305_3071884_+|hypothetical-protein	3071305_3071884_+	192 aa aa	NA	NA	NA	3013143-3127063	yes
NZ_CP038952.1|WP_155047253.1|3072028_3072223_+|hypothetical-protein	3072028_3072223_+	64 aa aa	NA	NA	NA	3013143-3127063	yes
NZ_CP038952.1|WP_155046758.1|3105422_3105554_+|phosphatase	3105422_3105554_+	43 aa aa	NA	NA	NA	3013143-3127063	yes
NZ_CP038952.1|WP_155046759.1|3105698_3105854_+|hypothetical-protein	3105698_3105854_+	51 aa aa	NA	NA	NA	3013143-3127063	yes
NZ_CP038952.1|WP_155047254.1|3107891_3108029_-|hypothetical-protein	3107891_3108029_-	45 aa aa	NA	NA	NA	3013143-3127063	yes

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_054300283.1|1094823_1095465_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_054300283.1|1094823_1095465_-|hypothetical-protein
MPQAYPTSNNEQQSNNFPPPSSTTSSSATASNLPLEQIKTQPASKTVKNLGDSITYDQLLHLIKQETQKSIFILAKKIKNAKLPFSTLFEDTSGRKTGIQVLEEFIKDILSHSNQGHPHQPLTQALGELVHERVKSFYEDDGKMKGRRKTETISMLFSEIKRMFQNITYANAAVSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1094609-1094646	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1136560-1136597	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1139121-1139084	1

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1094609-1094646, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1136560-1136597, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1139121-1139084, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_054300290.1|1142444_1142702_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_054300290.1|1142444_1142702_+|hypothetical-protein
MKKKRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1094609-1094646	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1136560-1136597	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1139121-1139084	1

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1094609-1094646, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1136560-1136597, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1139121-1139084, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_098082828.1|1143440_1143698_+|transposase

>NZ_CP038952.1|WP_098082828.1|1143440_1143698_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1094609-1094646	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1136560-1136597	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1139121-1139084	1

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1094609-1094646, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1136560-1136597, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1139121-1139084, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_098082828.1|1202198_1202456_-|transposase

>NZ_CP038952.1|WP_098082828.1|1202198_1202456_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1094609-1094646	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1136560-1136597	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1139121-1139084	1

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1094609-1094646, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1136560-1136597, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1139121-1139084, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_075273543.1|1445936_1446179_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_075273543.1|1445936_1446179_-|hypothetical-protein
MYEYELSTECCTSDDGGRFPISLTLLLPALSFAFTMAPSRIITQNHYKMKKVSAESQSNNPLLREKQRIWFSNIKHPEES

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047156.1|1538442_1539066_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047156.1|1538442_1539066_+|hypothetical-protein
MILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1543508-1543471	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1543508-1543471, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047155.1|1571720_1571870_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047155.1|1571720_1571870_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSQLRSAKNPNLPRPTHPVLSTPWLAACAGFPG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_032126537.1|1583900_1584086_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_032126537.1|1583900_1584086_+|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGLSGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLDGYLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047152.1|1584861_1585584_-|transposase

>NZ_CP038952.1|WP_155047152.1|1584861_1585584_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016212013.1|1590354_1590738_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016212013.1|1590354_1590738_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_054300361.1|1603376_1603673_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_054300361.1|1603376_1603673_+|hypothetical-protein
MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_081377353.1|1603650_1604316_-|transposase

>NZ_CP038952.1|WP_081377353.1|1603650_1604316_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016211151.1|1611168_1611480_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016211151.1|1611168_1611480_+|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1573276-1573239	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1573276-1573239, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016210146.1|1696496_1696988_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016210146.1|1696496_1696988_-|hypothetical-protein
MHQKEQITELLECPQELTLVKIVLLAGLEKVIANCLDRQSVVKLKIAEFFRLEVEAITEGSDSDESLSAELASLKMDKLKDILKKAACAFHQKSGLFTAKSYQVAKPYFEVLRELFGISDVEWKGILAHEANLDCEELSLQFYNKYMANKDDMASPGHLPTRP

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155046721.1|1698431_1698599_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155046721.1|1698431_1698599_+|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1736937-1736900	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1736937-1736900, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_036781272.1|1782711_1782930_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_036781272.1|1782711_1782930_+|hypothetical-protein
MPMTTKERKRISNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1804118-1804081	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1804118-1804081, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047136.1|1783022_1783454_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047136.1|1783022_1783454_+|hypothetical-protein
MHIFIDYFFLCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1804118-1804081	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1804118-1804081, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016212421.1|1793787_1793970_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016212421.1|1793787_1793970_+|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1804118-1804081	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1804118-1804081, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047131.1|1796538_1797195_+|transposase

>NZ_CP038952.1|WP_155047131.1|1796538_1797195_+|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1804118-1804081	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1804118-1804081, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155049815.1|1959328_1959481_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155049815.1|1959328_1959481_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1959755-1959718	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1997795-1997758	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1947830-1947867	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1987750-1987787	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1959755-1959718, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1997795-1997758, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1947830-1947867, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1987750-1987787, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_032126179.1|1995986_1996238_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038952.1|WP_032126179.1|1995986_1996238_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1959755-1959718	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1997795-1997758	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1947830-1947867	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	1987750-1987787	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1959755-1959718, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1997795-1997758, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1947830-1947867, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 1987750-1987787, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_129556569.1|2265352_2265562_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_129556569.1|2265352_2265562_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	2266464-2266501	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 2266464-2266501, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016209540.1|2349266_2349605_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016209540.1|2349266_2349605_-|hypothetical-protein
MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	2354096-2354059	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	2357322-2357359	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 2354096-2354059, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 2357322-2357359, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016209990.1|2756369_2756774_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016209990.1|2756369_2756774_-|hypothetical-protein
MYILVCYGGYPYHAAYVVAIFTGGSFVTQEVYAGDIDSLRLKVKGDFRIYKDLESFFDRSIECMQNKKAQIIILKPAIESNFSNLLIFESVIRKTRQSTLLMYESMEVDEEAPLVAGAEAMLHYYSELLRCTKQ

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_144019123.1|2756806_2757550_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_144019123.1|2756806_2757550_-|hypothetical-protein
MLKNLKELIKEYNIQTIDALEQLKSDLLRESDSREFCKKYGIDYSPIEFTFHQGFYFLFNAANELNDQYPNDRNLIAYFTYRLSSQQQKAFEPVTNMLEIAKLAEDKIEGDCQLLEQGGNQPKAIKTFKEKAIKAVYKYVESTLAGPEHSNKAREEYQQSIKNCSEECKAALDDSSCERLRKVLKVLVNFLTHISLVGIVANIYHKHTTGSWLLFERKKESYDIQENLHGIQKISESAMQVNLYLSA

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047234.1|2758039_2758183_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047234.1|2758039_2758183_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_016212372.1|3070968_3071190_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_016212372.1|3070968_3071190_+|hypothetical-protein
MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3017213-3017250	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3028073-3028110	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3017213-3017250, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3028073-3028110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047252.1|3071305_3071884_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047252.1|3071305_3071884_+|hypothetical-protein
MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3017213-3017250	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3028073-3028110	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3017213-3017250, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3028073-3028110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047253.1|3072028_3072223_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047253.1|3072028_3072223_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3017213-3017250	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3028073-3028110	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3017213-3017250, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3028073-3028110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155046758.1|3105422_3105554_+|phosphatase

>NZ_CP038952.1|WP_155046758.1|3105422_3105554_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3017213-3017250	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3028073-3028110	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3017213-3017250, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3028073-3028110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155046759.1|3105698_3105854_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155046759.1|3105698_3105854_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3017213-3017250	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3028073-3028110	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3017213-3017250, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3028073-3028110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038952.1|WP_155047254.1|3107891_3108029_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038952.1|WP_155047254.1|3107891_3108029_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSYSNLLMSDNFVISYKVYDDFIAVIIIL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3017213-3017250	0
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	3028073-3028110	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3017213-3017250, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038952 position: 3028073-3028110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP038955

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	6501 : 21081	17	unidentified_phage(23.08%)	head,terminase,portal,capsid,transposase,protease,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038955|6501:21081|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MNHTDNDKLYNGPPKVASCTQRAYPWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK
>NZ_CP038955|6501:21081|13821_14493_-|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP038955|6501:21081|11115_12450_-|WP_155047318.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIGSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP038955|6501:21081|10293_10617_-|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA
MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA
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MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
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MLATYLKDEHKLSLVVACNLVTLPRASYYRKKQHQSDDAEIISELKTLASKHKRWGCDKMVAYLKNKGKPWNHKRIRRVYIEMGLNISCKPKHHYVKNEPEYLFQPIYKNVCWSLDFMSDALLSGTKFRTMNLIDDYNRKALGIAIDFSMPAVFVTSKLDEWCKVHGYPEMLRTDNGPEFISSHFQEWAEGHGIQLRRIQPGKPAQNGYIERFNRTYRGDILDSNQFTSLQQVQKLSDDWIVEYNTIRPHQSLKNLSPDTFAEKREKQLEKISTKTEG
>NZ_CP038955|6501:21081|7499_7715_+|WP_155047029.1|DBSCAN-SWA
MTEGEVVVKMLSCRTKFAGHDEYSCSNSGCKHTKVVTYTCKSRLCSSCGKKPLSNGLLHRISYSQSANTST
>NZ_CP038955|6501:21081|20106_21081_-|WP_054300271.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|6501_7476_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047029.1|7499_7715_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|7880_8855_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047317.1|8989_9826_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.9e-42	36.7
WP_016211139.1|9905_10301_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211132.1|10293_10617_-|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211137.1|10613_10925_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_155047318.1|11115_12450_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211140.1|12570_13764_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_080664855.1|13821_14493_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_155047319.1|14440_15061_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	5.5e-39	50.9
WP_052104629.1|15263_16289_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047320.1|16419_17142_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	2.6e-40	40.8
WP_155047321.1|17138_18821_-|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.9e-137	45.7
WP_016212234.1|18823_19303_-|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155047322.1|19379_19772_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.4e-26	47.2
WP_054300271.1|20106_21081_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7

3. NZ_CP038954

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2671 : 46650	57	Streptococcus_phage(14.29%)	head,portal,protease,transposase,capsid,integrase,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038954|2671:46650|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211142.1|6767_7034_-	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274762.1|7837_8188_-	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274763.1|8184_8580_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
WP_075274764.1|8572_8896_-|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274765.1|8892_9204_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
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WP_155047307.1|13219_13816_-	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	2.0e-38	45.3
WP_155047308.1|13859_14834_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-26	31.5
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WP_155047310.1|16011_16494_-	hypothetical protein	Q9B019	Phage_GMSE-1	1.1e-13	33.3
WP_032126915.1|16580_16964_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.7e-25	45.5
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WP_032126916.1|17688_18159_-	single-stranded DNA-binding protein	L7TJL2	Pseudomonas_virus	1.5e-33	48.8
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WP_016210963.1|18828_19068_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047314.1|19404_19767_-	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
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WP_016211080.1|20312_21299_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0S2MVA0	Bacillus_phage	4.3e-14	45.4
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WP_016211067.1|22309_23053_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211077.1|23185_23971_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211068.1|28266_29079_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|30087_31062_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
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WP_027242955.1|31431_31692_-	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211925.1|32182_32968_+	ParA family protein	A0A0K2FLP4	Brevibacillus_phage	9.7e-17	28.7
WP_016211928.1|32960_33401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|33951_34215_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126137.1|34989_36039_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212188.1|36102_36843_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155047301.1|37020_37293_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|37913_38489_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	6.0e-08	26.6
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WP_052104629.1|40133_41159_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047302.1|41812_42892_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212274.1|43422_43887_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|43897_44092_-	addiction module toxin, HicA family	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|44307_44898_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_081007075.1|44961_45303_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047303.1|45648_46650_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-29	33.2

4. NZ_CP038956

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	10315 : 26969	19	Indivirus(18.18%)	transposase,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038956|10315:26969|DBSCAN-SWA
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MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKKTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAKGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVSERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038956|10315:26969|18692_19016_+|WP_075275196.1|DBSCAN-SWA
MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKILDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN
>NZ_CP038956|10315:26969|22391_23138_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP038956|10315:26969|14398_14839_-|WP_155047334.1|DBSCAN-SWA
MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLIVCQKLLIERYKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ
>NZ_CP038956|10315:26969|21413_21755_+|WP_036776958.1|tail|DBSCAN-SWA
MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV
>NZ_CP038956|10315:26969|19072_19339_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP038956|10315:26969|17906_18269_+|WP_155047337.1|DBSCAN-SWA
MLTEDSSYELSHFKGGLPPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP038956|10315:26969|16632_17607_+|WP_054300271.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038956|10315:26969|17603_17888_-|WP_155047336.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKKSKLSESKIVELLKRVEAGADIETTARDYGISTSTYYILKERYGAMDISQLKRLKQLEKENQQLKRMYADSQIEIEALKDALRHLKCNTTLY
>NZ_CP038956|10315:26969|18268_18691_+|WP_016211141.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP038956|10315:26969|10315_10576_+|WP_036781073.1|DBSCAN-SWA
MSKNTIEWKLKALKQVKKFPLKSKEKIFSGVESLYDWPSCKDVKKLQNREGYRLRVGQYRVFFDVNQGKINIITIEEVKKRDSKTY
>NZ_CP038956|10315:26969|10646_10919_+|WP_081007079.1|DBSCAN-SWA
MAQVELEEPATKKEPTVPHEVAKLVTLKNYSPVKAWRKYKGITQAELAEKLKLTQPALSQIEKTEKGLQQDTVKKLAKALGIKPDQLAID
>NZ_CP038956|10315:26969|15179_15623_+|WP_155047335.1|transposase|DBSCAN-SWA
MEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLGA
>NZ_CP038956|10315:26969|11130_12017_-|WP_129556478.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038956|10315:26969|13555_13990_+|WP_016212315.1|DBSCAN-SWA
MARAEHDLDIYAWAHENAELLKQGKFNEVDMVNVIEELEDLGNSKRDQLTARLKLIIQHLLKWQYQPSHRGRSWSLTIQNNRDDVEDLFEDVPSLKSKLDECFDKAYKRGVKAASNETDIPIKTFPKSCPYTLEQVLNPEFMPE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036781073.1|10315_10576_+	cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system	A0A1S5NR91	Burkholderia_phage	2.1e-13	48.8
WP_081007079.1|10646_10919_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|11130_12017_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.8e-10	22.4
WP_016212315.1|13555_13990_+	DUF29 domain-containing protein	A0JC30	Ralstonia_phage	9.1e-25	39.7
WP_155047334.1|14398_14839_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	1.1e-06	37.6
WP_054300249.1|14799_15165_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047335.1|15179_15623_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.1e-07	25.5
WP_054300271.1|16632_17607_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047336.1|17603_17888_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047337.1|17906_18269_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|18268_18691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275196.1|18692_19016_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|19072_19339_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275195.1|19342_21421_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.4
WP_036776958.1|21413_21755_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|21751_22423_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|22391_23138_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|23127_23685_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_075275194.1|23681_26969_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2

5. NZ_CP038953

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038953_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038953_1
• CRISPR_location: 1232-1455
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038953_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038953_1

>1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038953_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038953_1

>merge|NZ_CP038953|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038953|1|1|1232-1455|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038953.1|WP_027242576.1|15580_17443_-|AAA-family-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|223288
NZ_CP038953.1|WP_016211890.1|2875_5452_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP038953.1|WP_036771347.1|5568_6546_-|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP038953.1|WP_075275154.1|12435_13092_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038953.1|WP_016211953.1|9596_10076_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038953.1|WP_027242575.1|15061_15547_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038953.1|WP_016211955.1|11318_12299_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038953.1|WP_036771347.1|13454_14432_-|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP038953.1|WP_016211956.1|10133_10862_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038953.1|WP_054300202.1|1943_2672_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038953.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038953.1|WP_016211890.1|2875_5452_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP038953.1|WP_036771347.1|5568_6546_-|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP038953.1|WP_075275154.1|12435_13092_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	8.27093e-49
NZ_CP038953.1|WP_027242576.1|15580_17443_-|AAA-family-ATPase	gnl|CDD|223288	COG0210, UvrD, Superfamily I DNA and RNA helicases [DNA replication, recombination, and repair].	8.4826e-14
NZ_CP038953.1|WP_036771347.1|13454_14432_-|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP038953.1|WP_054300202.1|1943_2672_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038953.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33

Protein sequences

>NZ_CP038953.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP038953.1|WP_054300202.1|1943_2672_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038953.1|WP_016211890.1|2875_5452_+|hypothetical-protein
MPVRFNPIKKVSLNGKVFNVPKEVPNKALVKLGQQQPDVVEILADFFRTNPKQEFFSKLFLGDRYQISAMYVSLRNIGLNQRIYIQKVFDDPEGFSDIIQRLSNIELCQSVYVQAAFENPDLIAVFEKHKDKFTSLNQFELNQWVYVKAVLGDPDRFDDILQRLRDIALCEPVYVQAALKSPQRVVEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDDPEGFDAILQQLSDIELCQLPYIQAALDYPDRVDVFKAHQDKFALFNHLKLSQLTNIEAVLGNLEGFDEGYRSLKAVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLREVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLRKVESDQSDNIQLMLDNIEEFNENFQILRQFGLSQQLYIESILKSPNVIVNISDCSDELLMLEELGLGQTVYLQKVLDHPDRSKANLYRLIRMGLDQPVYVQSALKDLDRFDDVCQRLNDIELCESAYVQAVLDDPNRIAVFERHKDKFTSLNQFGLNQWIYVKAVLDDPKGFDDILQRLRDIALCAPVYVQAALQDPQRVAEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDNPEGFDAILQQLSDIELCQSVYVQAVLDDPNIITKLKEHQKKLVKLNQLGLSQPKYIQAVFDHPEDFERNLQTLEILGLNKTEYVQAIFDDPTRIDKLHKYHHLFFRLHMLGLSQPICVDAVFNNTEKYAQICSCLEEVKDRIETVEDTIQQSSLGQSREQGFKSHYPVYKSKVIQSSFDFLISERKDPAEMKAHLFEHEREFLCNSNIKSDRSSFGAICRSAMRALTNTIFIIVAPVVGYKRNWHKKNMSITEKCLPFYNHTESTNKVMDLTCDIQHTLVADF
>NZ_CP038953.1|WP_036771347.1|5568_6546_-|IS5-family-transposase
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP038953.1|WP_016211953.1|9596_10076_+|hypothetical-protein
MPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC
>NZ_CP038953.1|WP_016211956.1|10133_10862_+|hypothetical-protein
MTQQFINSYQETAAEYTRLNLLIQEKQASEDGQKKASKYYAFTQRNLGIYNRLTHTRRRTISRDFEPEKVVWSRLKEEALVKVENLVNEAYEALVKSDEFQKWFRTQFTQDGVWAGDVELNGCLHPFVQGEHDIPFGYVAGNGKSTPYLLHDEGILLSRRSRFQRLKSGHTTSHHWMALIPKEQFLPESLQEGELDDFNKVYQALVAGQNKMFRTNKGKPVDVDKINEYILKYPASKSAWAL
>NZ_CP038953.1|WP_016211955.1|11318_12299_+|hypothetical-protein
MPNLIKASRAIRNLITDHMAEIGYVGFSIANIFADSNVKNHLFNFRSTITSQQASIIGSVWNHLDAVYSALAAATMIYNMANGNVNKHEMLYQKPQAAVLIASSVALAALTITGIPSWGFAIATYADLINESMNFYKAQKEYSDISYWTQSMVSKLQLIDKKLAETSSGNDKNVLQRQKTDILIDIAARYEFENKKQIPFSIRNKVDSAVKSSGLRLWQLEQRGKGVTHDLKKQRNEKTGQFLLKLGSAIGMTLLAIGSAVHPIGFAITLGIAAGYMGCKFYQAYQSKKEKGKKAKMLFFNYEVEVNKNEDQESYRYGGRHLEAPF
>NZ_CP038953.1|WP_075275154.1|12435_13092_+|IS6-family-transposase
MINFSGRHFKKDLIMMAIRWYVAYTLSYRDIEELMAERGIQVDHSTIHRWVVKDTSQLEEHFKKRYKRQPGTSWRLDETYIDKYGDTIDFTLSKYRDEEAVYTFLKKATGSSNVIPDKIVIDQSGANTAGIMMFNYLLFILGLWFLMIEIIQIKYLNNIIEQDHRPVKKKMKAALGFKSTQGAKATISGVEFYRMLKKKQMHCHQDKPAYEQFYLLAA
>NZ_CP038953.1|WP_036771347.1|13454_14432_-|IS5-family-transposase
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP038953.1|WP_027242575.1|15061_15547_-|hypothetical-protein
MSKSIRLPDVNQVAPIDLLRLRTSIDKKLNDPALLNRSKAQLKAGNIVQFYSSHYDCMRNGTIFELFQKYAGVEDADTKERWKIPYYAIDLSHIQEGQRILTGRDFKIGQKVSFEDKRNHLVYRGMVAKLNQKTATIVTSEGHEFRVSYSGLINCKTPDVI
>NZ_CP038953.1|WP_027242576.1|15580_17443_-|AAA-family-ATPase
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MGE targeting detection<

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP038953|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1943 : 172788	175	Streptococcus_phage(17.91%)	head,protease,tail,integrase,transposase,capsid	attL 93818:93877|attR 121915:123090

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038953|1943:172788|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075275154.1|12435_13092_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.6e-31	40.7
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WP_155047021.1|29043_29199_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075275153.1|30195_30993_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049828.1|31969_33043_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049829.1|33366_34101_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_155049830.1|34156_34738_+|transposase	transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	4.2e-33	43.6
WP_032126239.1|34812_35085_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049831.1|35666_36206_+	helix-turn-helix domain-containing protein	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.0e-04	34.9
WP_017375910.1|36235_36964_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_017377658.1|37211_37898_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047286.1|37901_38468_+	helix-turn-helix domain-containing protein	I1ZBD6	Salisaeta_icosahedral_phage	1.4e-20	35.0
WP_155047299.1|38557_39916_+	DEAD/DEAH box helicase	D2J050	Enterococcus_phage	2.6e-126	50.5
WP_017375910.1|40099_40828_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_080963647.1|42498_42669_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774631.1|43007_43472_-	hypothetical protein	H6WFS7	Cyanophage	2.9e-21	38.2
WP_155047285.1|44605_44863_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|44881_45859_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155049834.1|45871_46867_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155047292.1|47344_48262_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|48339_49317_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_105962623.1|49774_50928_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273751.1|51277_53008_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047019.1|53020_53173_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047293.1|53662_54388_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|54540_55269_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_032126843.1|55645_55825_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211894.1|131743_132490_-	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	4.9e-18	29.9
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WP_016212456.1|168041_168329_+	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
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WP_075273881.1|168736_170923_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	9.2e-73	30.2
WP_016212404.1|171043_171277_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273857.1|172053_172788_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	8.4e-39	43.6

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
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NZ_CP038953.1|WP_129556706.1|75846_76476_-|hypothetical-protein	75846_76476_-	209 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_032126838.1|84318_84522_-|hypothetical-protein	84318_84522_-	67 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212257.1|84858_85083_-|hypothetical-protein	84858_85083_-	74 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212260.1|85102_85375_-|hypothetical-protein	85102_85375_-	90 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212398.1|89812_90274_+|hypothetical-protein	89812_90274_+	153 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212408.1|112830_113280_-|hypothetical-protein	112830_113280_-	149 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212499.1|113905_114280_-|hypothetical-protein	113905_114280_-	124 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016211913.1|117271_118393_+|hypothetical-protein	117271_118393_+	373 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212298.1|123861_124188_+|hypothetical-protein	123861_124188_+	108 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes
NZ_CP038953.1|WP_016212579.1|166226_166424_+|hypothetical-protein	166226_166424_+	65 aa aa	NA	NA	NA	1943-172788	yes

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_155047019.1|53020_53173_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_155047019.1|53020_53173_-|hypothetical-protein
MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_129556706.1|75846_76476_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_129556706.1|75846_76476_-|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_032126838.1|84318_84522_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_032126838.1|84318_84522_-|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212257.1|84858_85083_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212257.1|84858_85083_-|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212260.1|85102_85375_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212260.1|85102_85375_-|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212398.1|89812_90274_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212398.1|89812_90274_+|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212408.1|112830_113280_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212408.1|112830_113280_-|hypothetical-protein
MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212499.1|113905_114280_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212499.1|113905_114280_-|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016211913.1|117271_118393_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016211913.1|117271_118393_+|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212298.1|123861_124188_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212298.1|123861_124188_+|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038953.1|WP_016212579.1|166226_166424_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038953.1|WP_016212579.1|166226_166424_+|hypothetical-protein
MFSKTKVPLIISIGSVLVYFTILIFQVYSPPSFAKSYNKNPVGCEKLGKQAEELCVERINTMEEV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038952_1	Orphan	1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder	360045-360082	38	91596-91559	0

1. spacer 1.1|360045|38|NZ_CP038952|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 position: 91596-91559, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************