Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038969 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 6 |
NZ_CP038970 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_CP038967 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 chromosome, complete genome | 2 crisprs | RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 1 | 1 | 30 | 24 |
NZ_CP038971 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP038968 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | RT | 0 | 3 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4824 : 28863
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038969|4824:28863|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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33 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
37206 : 57887
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038969|37206:57887|DBSCAN-SWA 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MLNFPSLLPTKIAMDKLKPRLRITPLGDGYVQREADGLNTLRHYFTVSFVGLSEIEKDSIISFIADRAGLEPFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVVLRFEEDFNPV >NZ_CP038969|37206:57887|52034_52706_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP038969|37206:57887|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD >NZ_CP038969|37206:57887|52674_53421_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP038969|37206:57887|49625_51704_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA >NZ_CP038969|37206:57887|48975_49299_+|WP_032126913.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQRYQELHPSLSETEANLLLICLSLCDHQGVKIFDVSEYKKLAELPLGVIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP038969|37206:57887|48201_48552_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA 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MTNPIHGAGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLAHGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKATSFTYPYTLKVERVTEDADSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLNYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTSERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIIKIFDPNMDQEQGAAGVITAVNNNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVLYHFTAPKQWRITAITEEDDGTYTVNAITHDPDKYQKIDEERALGVSKENTVIPSLKAPSNYRVEQSVSYHSGTAESLLIVAFDGDPNAAYYEYQLRSNEGNYSDVKTTHLNHIELSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYRCSASLEQQIPENVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFYHTAVNNNNYIRLFSYYSWGGMTQPWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLDKIMRCRVYADMQISQSNDDLSWDNMQQAWEHYTLEHNWSWLGSPESCGFEVQFSTSNDNQNWSEFMPLSASFSHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELTCTFDVPETIYNVDNFPVSAAGSTYIFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQVNKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH >NZ_CP038969|37206:57887|49355_49622_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ >NZ_CP038969|37206:57887|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038969|37206:57887|40749_40959_+|WP_016212231.1|DBSCAN-SWA MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKG >NZ_CP038969|37206:57887|45660_46995_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF >NZ_CP038969|37206:57887|43617_44289_+|WP_080664855.1|protease|DBSCAN-SWA MKSKIMNNWYQIKAQANKHADVYIYDYIGDYGVEAKRFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL >NZ_CP038969|37206:57887|38576_38759_-|WP_129556724.1|DBSCAN-SWA MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI >NZ_CP038969|37206:57887|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL >NZ_CP038969|37206:57887|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN >NZ_CP038969|37206:57887|53974_54262_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL >NZ_CP038969|37206:57887|39795_40179_+|WP_032126134.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPATEVDHIKPHDGDHDLMWNQSNWQALCKSCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI |
29 | Pseudomonas_phage(11.76%) | portal,protease,head,terminase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038969.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein |
5761_6361_-
Protein sequences of NZ_CP038969.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein>NZ_CP038969.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD |
199 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038969 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038969.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein |
6360_6621_-
Protein sequences of NZ_CP038969.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein>NZ_CP038969.1|WP_016212399.1|6360_6621_-|hypothetical-protein MQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH |
86 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038969 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038969.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein |
9914_10262_+
Protein sequences of NZ_CP038969.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein>NZ_CP038969.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR |
115 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038969 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038969.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein |
23884_24064_+
Protein sequences of NZ_CP038969.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein>NZ_CP038969.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA |
59 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038969 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038969.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein |
24063_24492_+
Protein sequences of NZ_CP038969.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein>NZ_CP038969.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ |
142 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038969 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
||||||||||||||||||
NZ_CP038969.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein |
24659_25199_-
Protein sequences of NZ_CP038969.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein>NZ_CP038969.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM |
179 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 4824-28863 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038969 position: 5737-5774, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038967_1 | 363106-363235 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038967_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038967_1
>1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038967_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038967_1 >merge|NZ_CP038967|1|363106-363235|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA >NZ_CP038967|1|1|363106-363235|CRISPRCasFinder ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA
>NZ_CP038967.1|WP_054300520.1|361884_362199_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038967.1|WP_075273359.1|361363_361939_-|IS630-family-transposase MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR >NZ_CP038967.1|WP_016211797.1|359909_361313_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY >NZ_CP038967.1|WP_129556444.1|359325_359748_+|hypothetical-protein MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN >NZ_CP038967.1|WP_080664870.1|358685_359333_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE >NZ_CP038967.1|WP_016211795.1|357808_358003_-|hypothetical-protein MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP038967.1|WP_036794771.1|356684_357671_+|APC-family-permease MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG >NZ_CP038967.1|WP_016212044.1|355707_355962_+|hypothetical-protein MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS >NZ_CP038967.1|WP_054300271.1|354194_355169_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038967.1|WP_016212359.1|353608_353827_-|hypothetical-protein MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP >NZ_CP038967.1|WP_032126227.1|363764_364055_+|hypothetical-protein MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS >NZ_CP038967.1|WP_016212008.1|364092_364791_+|hypothetical-protein MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN >NZ_CP038967.1|WP_016212010.1|364807_365104_+|hypothetical-protein MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE >NZ_CP038967.1|WP_016212007.1|365227_366373_+|hypothetical-protein MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG >NZ_CP038967.1|WP_075273619.1|366645_367221_+|hypothetical-protein MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA >NZ_CP038967.1|WP_016211273.1|367278_368112_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM >NZ_CP038967.1|WP_016211268.1|368227_369412_+|fatty-acid-desaturase MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH >NZ_CP038967.1|WP_016211271.1|369430_370375_-|L,D-transpeptidase-family-protein MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY >NZ_CP038967.1|WP_016211269.1|370679_371465_+|hypothetical-protein MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP >NZ_CP038967.1|WP_016211272.1|371582_371951_-|hypothetical-protein MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038967_2 | 2598447-2598567 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038967_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038967_2
>2.1|2598484|47|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038967_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038967_2 >merge|NZ_CP038967|2|2598447-2598567|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT >NZ_CP038967|2|2|2598447-2598567|CRISPRCasFinder TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT
>NZ_CP038967.1|WP_075275117.1|2597867_2598290_-|hypothetical-protein MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL >NZ_CP038967.1|WP_016211905.1|2597213_2597624_+|hypothetical-protein MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN >NZ_CP038967.1|WP_052047041.1|2596681_2596945_+|hypothetical-protein MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD >NZ_CP038967.1|WP_098082812.1|2595933_2596449_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038967.1|WP_155046751.1|2595156_2595789_+|protein-kinase MFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038967.1|WP_036771330.1|2593956_2594931_+|IS30-family-transposase MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038967.1|WP_016210676.1|2591286_2593368_+|kinase-domain-protein MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP >NZ_CP038967.1|WP_016210671.1|2589571_2590831_+|6-phosphofructokinase MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI >NZ_CP038967.1|WP_016210673.1|2588965_2589439_-|hypothetical-protein MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM >NZ_CP038967.1|WP_016210672.1|2587574_2588957_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA >NZ_CP038967.1|WP_054300282.1|2599944_2600409_-|IS630-family-transposase MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038967.1|WP_081377880.1|2600465_2600945_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038967.1|WP_129556590.1|2601802_2602198_+|nucleic-acid-binding-protein MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH >NZ_CP038967.1|WP_032126312.1|2602194_2602989_-|M48-family-metallopeptidase MIVLIFALCTLEHLGYDGAMKIVKKLKQLKTYQLTVDNIDYRISHTGRTKTYGLSIRDGKVHMNVPKRMSKQRVCQAIDDNQAWVRENIRFSLASTKQHQSLSSGSLISYLGKQYSLKLTYVNQSVVFYDDAFLMGVPARVKSENHQAYIRDKLSAWFKEQALLRFEQRTFFIANRMQLKPTKVSVRSYKARWGSCSSSGCLSFDWKLLQAPEFIIDYVIVHELSHLKHFDHSPAFWQLVSLYYPEHKVARQWLKNNQTSLARL >NZ_CP038967.1|WP_016211756.1|2603167_2603893_-|M15-family-metallopeptidase MLPDLPICHNYKTVDKQALNELQQQAACVELKPSSRIMCLNEYYQQKLPGALSVMYTRQSVYLKLLAVLENLAPHFAFAIFDAYRSVACQKTLFEQIYRELYQRHPGRSKEWLEIEVRKYVSHPHEPSRFAVPPHNSGGAIDLTLMDLRTNTALDFGTEFDNTTTLSQTDYFERDYSANLGISSERWLLIRQNRRLLFNTMKQEGFTNFVSEWWHYDLGDCLWADAVGSSWFYDSMEAEVN >NZ_CP038967.1|WP_016211759.1|2604138_2605326_+|S-methyl-5-thioribose-kinase MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL >NZ_CP038967.1|WP_081377344.1|2605680_2606808_-|transposase MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP038967.1|WP_016210935.1|2607138_2607681_-|acireductone-dioxygenase MSQLTIFHANNSHQMIFQSSNQREISSQLAHVGIRFEQWQAHAKVSAEDSEEHILTMYAEDIHRLKKQGGYQAVDVISLDSSHPDKALLRQKFLSEHTHSEDEVRFFVKGKGLFCLHIDDKVYQVLCEQNDLISVPDHVAHWFDMGSEPEFTAIRLFNNTEGWVAELTGSNIAKRFPLLD >NZ_CP038967.1|WP_016210943.1|2607677_2608364_-|acireductone-synthase MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS >NZ_CP038967.1|WP_016210942.1|2608367_2608979_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLANGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038968.1 | 78264-78301 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038968.1 | 84888-84925 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038968.1 | 55528-55565 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP039213 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence | 30310-30347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 7350-7387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP048067 | Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence | 186740-186777 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038894 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence | 23887-23924 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 74736-74773 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038924 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence | 89480-89517 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038953 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence | 91559-91596 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038958 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence | 45769-45806 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP039196 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence | 48741-48778 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 55526-55563 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038812 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence | 69445-69482 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP013769 | Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence | 89408-89445 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033938 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence | 7974-8011 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033938 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence | 11226-11263 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 1087-1124 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033940 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence | 29210-29247 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 13746-13783 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 167516-167553 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 144791-144828 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP033942 | Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence | 158710-158747 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 94958-94995 | 1 | 0.974 |
NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 120528-120565 | 1 | 0.974 |
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NZ_CP038967_1 | 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder | 363152-363189 | 38 | NZ_CP038914 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence | 30949-30986 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
75. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
83. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
84. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
85. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer **************************************
86. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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112. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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113. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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114. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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119. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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120. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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121. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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122. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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123. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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124. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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125. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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126. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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127. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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128. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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129. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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130. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
45566 : 89679
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038967|45566:89679|DBSCAN-SWA CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGGGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAATTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAATATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038967|45566:89679|72651_73461_-|WP_016211096.1|DBSCAN-SWA MNISTLSHLKIKPIKIIIKITTLIAINTNLVLAKAQLLNFTTGKFPPYSTGSTDRPEGPMHDVILATCTQMRKDCFFHFVPWNFSIMMTQNNRTTGFFPTVKNSSSENWLKFSKPIINSEFGFFTYKSKKNIDSTRNLQGFKLATHGPSELMRQLVQLSQDIPNSILYIDQDIENSFKRFSDSNKNNFKNYAVLADKITGEYLINSLKLKNVHYRLKVADIQYSVGFPKKSVKAATIAQFNASLATVLNDQTFTEQVEKKYGVLLASKK >NZ_CP038967|45566:89679|73867_74818_+|WP_016211100.1|DBSCAN-SWA MPYAYSARVASRVLLACDHHVSARLLYAFAVAIFVFTALSMLFFTAVVDVKTRQPPAKILDISLVAEPIKRLEKEQKKPVTPIKAQAVARELLSGKVKRAAGNATAQMGVAMKKKSLAEQPSERPQPIRRAPTALSEAEHVAKQQAQTLVSKPKSSSQLAAKNKLNSNNQHKVTRQAKARLKKSQINSSSSVPVVKQMRGLQHNLPVATLKDEDALYLLAWRHQVEAVGNRLYARTRHPGLAGKLRLLVAINHNGGLRHVVVKQSSGNQALDDFAIEIVERSAPFAPLTANMRQHTDILEITRLWRFELGDRLNMQ >NZ_CP038967|45566:89679|88515_89088_+|WP_155046699.1|DBSCAN-SWA 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46 | Moraxella_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
136473 : 178470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038967|136473:178470|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
182276 : 239530
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038967|182276:239530|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(12.5%) | tail,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
256927 : 301858
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038967|256927:301858|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
329433 : 374988
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038967|329433:374988|DBSCAN-SWA AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGCATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATACAATAGTCAAGTCATATGTAAGTTAAGCCGTTATGTATATTTTATTATTGAATTTGTGAGGCTGCGGCTGCCCCTTCAAGATCCCATGATTGAACTTGAGCCAAGGCAGTCGTACGCCGATCAAAAAGCAGGCACGCTGCTGCTTCTGAAGTTTCGTTTTCGTCTGTTGCCAGTTGCGAGCGGAATTGTTTCAGTAGCTCAGATTGCAAATTAACCCCTTGCAAATCATAAAAACGCTTGATACCGTCTAGCATGTCGGACAATACGAACTCAATATCTTCTTTGGCTTGCTCTTGCTTAAACAATTTTCTAAAACCGCTATAGCTGTCTAGTTGTTTGGCAAAGCTTTTCAGCTCATTAAGCATGTGTTGAATATAGTGTTCGGTTTGGTTTGGCTGATCCAGAATAGTCTTGGTATCTATTAATAAAAGATTATTGATAAGTATTGCAATTTTTTTAAATCGATGGGCTCTACTATTAGTAACTGAAATTTCGAAAAACTCTAGTGTTGTATTATAAAGATCTTTATAAGCATCAAGCCATTTATCTAACGATTGGATTAAAATGTTTTTTAGTAAGAGAACTTCCTCTTGTTGAGGGGTTAAGCCATCGATCTCATTACTGCTTACACGACTAAAATCAGTTAAATATTTCTCTTTAAATTTTCGAGATGGAAGTGAAGTAACGTAGTCATCATAATTATGAAAAGAAACTTTGTTATCGAGTAAACTTTTTACTTTTTTATTTCTCGACCGATCATCACTTTCACTTCTGATATTCACTATTTCAAATTTGTTTTTTCCCTCTTTTATTGCGCCGACTTTATAAATTGCTTCTTTATAATAGATTACAGATGTTTTTTTAAATCCTTTTTTATCTAATTCTTTCATCAAATTTTCTGCAAAATTTTCTGCATAAGATGCTATTAATTTTATCTGTATATTATTTTTAGCATGGTCAGGGAGGCTCTGGCTGAGTAGTTGAGCAATGTCTTGGTAGCTAATATCCAGAGAGGCATTTATTTTCGAATTATAGAAATGATCTCCTGGGTGGAAAATAATCTGTTGCAAATGCTCATCAGTGAAGGCATTGCCTGAGTCAATGTAAATTCGAGTAAATGGCCCAGCTTCATTTAAAGCCTCTTTTACTATATTATCAGCAATTTACTTGTTTGTTTTATCTGGATTGACTTGCCATTCAGCCGGTGCGTTTTCTGTGTAGGGGAAGTTTAGCCGTATAAAAGGAATTTGGTCCTTAAGTAAAGATTTCCTTTTATGCTGGATATACATATCAATGGTATATTTACGACTTAAATCTTTATCTTTTTGTGAAAAAAAAGATTTTTTGAATGAAGTACAGGCAAATAAGGGAGTTTGGATGTTACTGGCAAGAAAAGATAGATAGATCGATTGATGAAACTTAGGCATAGTATTTAAACCTTGATTGAAAATAAAACAAAATAAAATAAATCAATTTAGCTTTTAAAATTAAGATAACGAGTATTTTATTCTTATTTAAAAGTTATAGTAATCTACTAGAAAAGGGTTTAATATAAAACATTTATAACTGTTATTATAGTCTTTTGTTTAACTTTTTTAATTATTTGAGCGTATTATTAATTTTGCTGCAGAATAGAATAAGTACAAGTTACAAGCGAGTATTATTTTAACGAGTAAAGTTATGATGAATAAGACTGGACTGTTGCCAGTCTAGCCTTAAACAAGGTGATTAATAGGGCTTAATTTTGCCGGTAAAATTTTCGCCGGTAATCTTATAGTGTAAAATTCCAGCTTTTAATCATTATTTTGCTTAAAGCCTTTCAGGGAAATAATGCGTGCTGATAACTCTTCTATAGAGCGATGTGTGGTGTCTAAGGATGGGATATTATAGCGTTGAAAAAGTTGATTAGCATAGCGCACCTCTTGACGGCATAAAGCAGGATCGGCATAAGCACGAGTGGAACGGCGCTCTTTGCGGATGGCGTGTAAGCGGCCGGGGTCAATAGTTAAACCGATTAATTTATCTTGATAATCTTTTAATGCATGAGGCAATGAAGTATCGAGAAAATCTTCGGCAACCAGGGGGTAGTTGGCCGCGCGGATACCATATTGCAGAGCAAGATATAAGCAGGTTGGCGTTTTGCCTGAGCGTGAGACACCGACTAGGATAACATCGGCTTTTTTATAATGCTTAAGGTTCGTGCCATCATCACTGAGCATAGAAAAGTCAACAGCTGCAATCCGTTGATTATAGCTCTCTTCAGCCATAGGCTTACGTGCCAAGCCGATGGCATGGGTCGATGTTTGGTGAAAAAATTGCTCAAGTTCAGTCAAATAATGTTCAAATAAATCAAGAACTAAGGCGTCAGCTTGCCGAATAATTTGGCACAGTTCAGGTTGAACCATGCTGGAGAAAATCAGTGCTTTCTGGCCATATTGCTCTGATTTTTGATTGATCAGCTCATAAGTTTGTTGAGCTTTTAAAGGCGTATCAATAAAGGGTAGGGTATACTTATTAAATTCTAAGCCGGGGAACTGGGCGAGTAAGCTTAAGCCCAGGGTTTCTGTTGTGATTGCGGTAGAATCTGAAATAAAAAAGACAGGGTACTTCATTTTTACACCAATTTCGGGTAGTTTTCCCTATGTAACCAATTTCCACGCACAAAAGCAAGGAGACCCCTTAAAATGATGCAGTGCAATTTCGTTGTTCCACTTTCTAAGGTTAACCGTGAAGATGTGGCCCATGTTGGCGGTAAAAATGCCTCACTTGGAGAAATGCTTCAACATCTCACCGGGTTGGGTGTAGAGGTTCCTTCAGGAGTGGCAACGACTGCCGCTGCGTTTCAATACTTTCTCGCTGAAAATGATCTAGCTGAGAAAATTAGTGAAGCGCTCATGGGCTTAAATGTTGATGATGTTGATGAATTAACGCGTGTCGGCAAACAGATTCGTGAGCTGATTTTAGCTGCGCCATTTCCAGCAGCTTTAGAGGAAGAAATATTATCGTCGCTAAAAGTATTTATTGATAGTGAAACGATGCCGGTCGCTGTGCGTTCTTCAGCGACGGCAGAAGATTTGCCGACCGCTTCGTTTGCCGGTCAGCAGGAGACATTTTTAAATGTGCGAGGTTATCAAGAGATTCTCGCGAAAACGAAAGAAGTTTATGCTTCTTTATATAATGACCGAGCGATCGCTTACCGCGTGCATCAAGGTTTTGCTCATGAAGAGGTTTCTATTTCTGTCGGTATTCAACGAATGGTGGAAAGTGAAGTTAGCGGCGTGATGTTTACGCTGGATACTGAAACTGGCTTTGATGATGTGGTCTTGATCAATGGTGCCTATGGTCTGGGGGAAAGCGTGGTACAGGGCAGTGTGAGTCCTGATGAGTTTTATGTTTATAAGAAAAATATTCACGAAGGTCGTCCGGCAGTATTACGGCGGACCTTAGGCAGTAAAGCATTGCAGCTGACCTATAAAGACGGTGGTGGCATCATCGAGTCTGAGGTTGAGCTGGCGCAAAGCCAAGTTTTTTGTTTAACAGATCAAGAAGCCGAAGAGCTCGCGCGTTTTGCTCTGTGCATAGAAAAGCACTATGGTTGCCCGATGGATATCGAATGGGGTAAAGACCAAAACGATGGTAGGTTATATATTTTGCAAGCACGTCCTGAAACGGTGCAAAGCCAGGCGCAAGTGATTGAGCGTTATCAGCTAAAAGAGCAGGGCAACATATTATCTTCTGGGCGCAGTGTGGGTAAAAAGATTGCCTCCGGTCGTGTGCGTTTATTAAAAAGCTTGCAGGATATGAAGAACTTTCAAGCCGGCGATATTCTAGTGACGGATATGACAGATCCTGACTGGGAGCCGATTATGAAGCGCGCAGCGGCAATTGTGACCAATCGTGGTGGGCGCACTTGTCATGCGGCAATTATTGCTCGTGAACTTGGTGTACCGGCAGTGGTTGGTTGTGGTGATGCAACGGCTGAGTTAGTAGAAGGTCAGATTGTCACGGTGAGTTGTGCAGAAGGCGATACCGGTTATATTTATGAGGGGGCTTTAGGCTTTGATGTACAGGAGATTAACTGTGAGGCAATGCCAAAAATCCCTGTCAAGATTATGATGAATGTAGCGCACCCTGAGCGTGCTTTTGCCTTATCACGTCTGCCACATGAAGGGGTGGGTCTGGCACGCTTAGAGTTCGTTATTGGGCGGACTATTGGCATTCACCCACAGGCTTTATTAGAGTACGATCAGCAGCCTGAGGCGGTTAAAGCAGAGATTGATGAGCGTACAGCGGCCTATGGCTCGCCAGTTGACTTTTACGTTGAAAAGATTGTTGAAAGTATTGCAACACTTGCCGCAGCGTTTGCACCGAAGCGAGTGATTGTGCGCTTATCTGACTTTAAATCGAATGAATAT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46 | Hokovirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
447600 : 550003
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038967|447600:550003|DBSCAN-SWA 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103 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
561040 : 592835
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038967|561040:592835|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038967|561040:592835|562362_562659_-|WP_016211491.1|DBSCAN-SWA MHEYEISLEQLPLCTQFIVSLPKVNQANWYFRCERSLLIVDFYLQEDNEYIMLSRPMAMAKNLIVITLDSHQKQVQTLANVSYSMIKNSGALKSLSSS >NZ_CP038967|561040:592835|575344_576796_-|WP_016210532.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSGHTLAEHIQALKSKTISSLELTQSYIDQIKATDQTLNNFITLTEDHALQAAKQADEKLAKSSDLSPLTGVPIAYKDIFCTDGIKTSCGSKMLDNFIAPYDATVVTQLKNAGTVMLGKTNMDEFAMGSSNETSFYGTSKNPWDINKVPGGSSGGSASAVAARQTPAALGTDTGGSIRQPASLCGITGLKPTYGRISRFGMVAYASSLDQAGPMTHTAEDAAIMLNAMAGFDPKDSTSVDHPVEDYTKNLNQSLEGIRIGLPKEYFSDGLDSQVEKQIQLAIAEYEKLGAKICEVSLPTTQFAVPAYYVIAPAECSSNLARMDGVRFGHRAEHPADLIDLYKRSRAEGFSDEVKRRIMVGTYALSAGYYDAYYNKAQQVRQLISDDFKRVFNEVDIIAGPTAPTTAFDFGSKKDPVTMYLSDIYTIAVNLAGLPGLSHPAGFVNQLPVGLQLIGNHFDESRLLNLAHRYQQVTDHHTAMPTAF >NZ_CP038967|561040:592835|586614_587295_+|WP_016210530.1|DBSCAN-SWA 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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR >NZ_CP038967|561040:592835|562941_564405_+|WP_016211493.1|DBSCAN-SWA MQYRDLRDFIEQLEVIGELKRIRPEINPYLEMTEVSQRVLHAEGPALLFERPTNSSIPALTNLFGTVKRVALGMGAEDTQALREIGQLLAFLKEPEPPKGLKEAWASLPIFKKILTMAPKKVNNAPCQQIVLEGSEVDLSALPIQTCWPDDAGPLITWGLVTTRGPYKPRMNMGIYRQQVIGSNRVIMRWLSHRGGALDFQEWCKAHPGEKFPVAVTLGCDPATILAAVTPIPDTLSEYAFAGLLRGHKTELVKCLGNDLEVPARAEIVLEGYIDPEDAAPEGPFGDHTGYYNEVESFPVFTVERITMREQPIYHTTYTGRPPDEPAILGVALNEVFVPLIQKQFPEIVDFYLPPEGCSYRLAIVSIKKQYPGHAKRVMMGVWSFLRQFMYTKWVIVVDDDINVRDWQDVIWAMTTRMDPVRDTTMIDHTPIDYLDFASPISGLGSKMGSDATNKWPGETSREWGVPIIMSDAVVNKIDCLWADLGL >NZ_CP038967|561040:592835|585805_586618_+|WP_016210535.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP038967|561040:592835|588805_589096_+|WP_129556461.1|DBSCAN-SWA MSVRKVSYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTG >NZ_CP038967|561040:592835|572368_572734_+|WP_054300209.1|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038967|561040:592835|573866_575303_-|WP_032126195.1|tRNA|DBSCAN-SWA MEWETVIGLEVHIQLATQSKIFSGASTAYGALPNTQACAIDLGLPGVLPVLNQEAIKMAVKFALASDSKVNPRSIFSRKHYFYADLPKGYQISQYDQPIVHDGHLNVRLDNDEIKRIGITRAHLEEDAGKSLHEDFQGLSGIDLNRAGTPLLEIVSEPDMRSAEEAVAYLKTLHSLVRYLEICDGNMQEGSFRVDVNVSVRPKGQAEFGTRTETKNLNSFRFIDRAIHFEVERQIQVLESGGIINQETRLFDAMKGETRPLRSKEDAHDYRYFPDPDLLPVAIEANFIDEIQATMPELPEQKRLRFVEEYQLNDYDADVLTANRDMANFYEQAVNTAGGHAKLVANFIMGDFSAALNKELLDVTQSPISASGLGGLIARVGDNTISGKIAKEIFIAMWEGQGDADSIIDKKGLKQITDPTAIAAIVDDVIAANPTQLEQYRSGKDKLFGFFVGQAMKASKGKANPAELNKVLKHKLSS >NZ_CP038967|561040:592835|591989_592835_+|WP_129556462.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSIAASHGVLSTG |
35 | Synechococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
613156 : 666968
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038967|613156:666968|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_thuringiensis_phage(12.5%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
692446 : 833680
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038967|692446:833680|DBSCAN-SWA 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119 | Staphylococcus_phage(15.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
852472 : 894242
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP038967|852472:894242|DBSCAN-SWA AATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTATAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCGTGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATGCTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAGTCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGATGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGTGTAAAACTCCAGATATGATCTGACAAGCTTAAATCATCTGACAACATTTGTCTGATTGATCAGACTGTCAGATTGCACATTTTTATTGATTATTTTTTCTTGTGCTAAATGTTTTGAGTCCTGAAATGTTTGCATTGGTGTTTTTCCATAACAGTATTTCCCAGAATGTGGCCGATGCTGATTGTACTTTATCAACCACTCATCAACATCAACTTGCAGCTCCTCAAGTGAATTATAGACTTTTTTACGAAAAGCAATGTCATAAAACTCTTGTTTCATCGTGCGATGAAAGCGTTCACAAATACCATTTGTTTGAGGTGAACGGGCTTTTGTTCTGGTGTGATCTACATCTTCGATCGCTAAATAAAGCTGATAAGCGTGATGTTCTATCTTGCCGCAATACTCTGTTCCCCGATCAGTTAAAATGCGTAGCAATGGAGTATCTCGCTCTTCAAACCAGGGGATTACACTTTCATTCAGCGCATGAGCTGCCGTCACTGCATTTTTTTCGGTATACAGGCAAGCAAATGCAACCCTGCTGTAGGTATCAACAAATGTCTGCTGATAAATTCTTCCAACACCTTTCATTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTATAGCACTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGGTTCCAACGTAATAGGTGTCTTGGGAGCCGAGATAGCCTGGGTGTTCAGTCTCAATTTCTCCATGTGCTTCTTTTTCTTGTTTTGCTTTCTCAAGTGCTTGCAGTTGCTCTTCCGTCAGCAAAATTCCATCTTGTGCTGATTTGGCTTCAAGCGCTTTGAGCCTCTTCTTGAACGTCTCAAGGCCATTCCTTAACCAGACTGATCGCACACCACTACTCGATACTATGACCCCTCTCTGTAACAGTTCGTTTGATGCACGGAGTTGACCTAACGCTGGGTTTTCAATGGCTAAATCAATGACTGCCTGCTCAATATGCTCAGGAACACGGTTTTTCACATTTGGCCTCTTCTTGCTAATCTCTTGCAAAGCTTCTTCGCCACCCGTTTCATAAAGCTTTTTGAAGCGATAAAAACTATCTCGAGAATACCCCATCACTTCGCATGCCTTAGAAACATTACCTAATTGTTTAGCTAATTCTAAAACTCCTAGTTTAGGCTTAATTATTTTTTCTGATAAACTTGTCATCACAACACTCCTTGTGTGATTAATTATCCATATTGAAAATTTAGTTCAATATGGCCCAAGTGTCAGATTAGATCTAAAGCTCTACAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTGGTTAATTTGATCTATAGTGCTAATTTTTGCTCCTGCTCTTGCTCTGGCTCCTGATCTGGTTCCTGCTTTAGTTCTGGCTCTGATGAGGTATAGCCCTCGGCACCTTGCTGCTGAGTTTGAAAAGGAGTGGTATTTGGTAATAAATGTGAATAATCAAATACCTGATTATTAAATGAGAGGTGTTGTAGTTGTTTTAGCAAGACACGCTGTTGTAGTGCACAGATAAATGCTTGAGCTAATGGAGAAACTTCATGCTCTTCGGCTTGAACGTTCAGGCGGACTGGACAGCGTTTGGCTTGATTCATAGTACACACTGATTCGACGAGCTGAGCAAGAGTGGTGGCTTGTTTATTTT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>NZ_CP038967|852472:894242|859148_859955_-|WP_016211512.1|DBSCAN-SWA MPTTSKLKAYLNEPNSTNKKHALEEMFPLLNEAYENVKKQRPNKPFGADEIWPEIQIIFSAHYGELSSQLSILQYFNLYTLFDDLTESSCDKIQHISHGEFCQPVVQVINLTTPYLSTKAIPQFIENSNQCIDEFTKWGVTHDNDEITRAAHVLATKLAGCRDEFIQRIIQNKETNQGYKITDDVPNYRRKIREIIESSTETKLLSSQQDWQGIIGNVLIGLTGIGLVALAVKAAHSQATTGQASLFFDTNAAQKAEQLGEDLLLMER >NZ_CP038967|852472:894242|885419_886502_-|WP_054300162.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRGTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR >NZ_CP038967|852472:894242|884246_884546_-|WP_016212302.1|DBSCAN-SWA MSESKKPVGKIDLAKCLVEKEHYSSVKDATKAIDAVLDGLETSLKDGGKVSLVGFGNFEVKHRPERQGRNPSNGAPMVIKASNSVNFKVSKGLKEAVNQ >NZ_CP038967|852472:894242|865472_865655_+|WP_129556479.1|DBSCAN-SWA MSDQKKYGGLAQALFLAVTNNHNFKGCKSANERFSYVENLNALLFAFKAGTLQGETPSVI |
42 | Staphylococcus_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 854741:854800|attR 882923:884026 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
910080 : 1009636
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP038967|910080:1009636|DBSCAN-SWA AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCTTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAAACCGATAGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGTGCTATATGCTTAAAAGACGAGCGATTTTTCCATCGCTACCATGGTGAAAATAAATGTTATTTGGCTGCAAGGAGATGCCATATTTATCAGTGCACAGCCTTAAAAACTCTGCTTTTTCTGTTTGCTCTTTTTCTTTCTCTTCCCTCGTATTATTTTTTGTTGTTTTTGCTCTTTCTTGTAGGAAGACGATTTGATCTCCATTTGCTAAAATTGCTTGCATTATTTTGGCGATCTTTTCTTGATTAATAATATGAATATTATCACATCCATAAAATGGCCAAGTTGATTGAGTAGGTACTTGGTTTATGGTTCTTGGATGCTCTTCAGCCCATAGTAATGTTTTATTAATATTAAATACAAAAATATTTTTTGGCATAAGTTTGGCTTCTTAGATTTTTGGTATAAATATTATTGTAGAATATAAGATATATATTTATATCAAAAAATATAAAAATCAATGTTTTTTTTGATAAATAAATTGACTTGTTATTTTGCGGTGTGTTTTTTATTTTAGAGGGTGGAGATTTAAGTTTTTTATATATGATTTAGTGTAGCTTTATTGATCTTCTTGAAATTAATTACAAGGACTCTTTCCTAATGAAGTTTAAAAGTGTTGTACGCTTTAATGGGAGATGATAGCGTATTGATATGATAAACTACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAAGGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGACGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGATATCGTAATAGTGCGACCGCTTAATGCATAAAAATATGAGTTAAAAACTAGGCTCCGTTGACATTTCACCTTAACCATAAGATAGTGCTTGCAATTTTCAAAAAGGATAAATATCTGCAAGCCCTTTTTTCAAAACGTGAAAAAACTCTTCTAAATTGTTTTAACTTGCCAATGCAGCACTCTATCAAATGCCTTTCCTTGTAAACATGCTGATCGTGGTCAAATTTATTAATCCTATTTGATTTAGAAGGAATAATACACTTAGCCCCCTTTTTGACAACTAACTCTCTTATCTTTATGTCATCATAAGCTTTATCGGCAATAATTTGATCAAACGCCACTGAAGTGAGTAACCCCTGAGCCTGAGGAGCATCATGCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGCTTGCCCTCGTGTCAGTACAAAATCTACAGGATAACCCAACCCCTCTGTTAAAATATGGACTTTTGTACTAAAGCCTCCACAGCTACGATCTAAGGCTTGGTTAATCCCTTTGTCTTTTTTTATATCCCGCAGAGCACGCATGAGCTCGAATCACTGTTGAATCAACCATACCTGAGTCTAGTTCAGGTGTTTGCACAGATGTAAAAAGAGCATCCCAAACGCCTCGGTTATCCCAACGACTAAACCGTTTATAAACACTATTCCAATATCCATAATCTTCCGGTAGGTAACGCCATTGGGAGCCTGTACGGAGAACCATATAACGGCTTCGATAAATAAACGACATTTCCTTTCTGAGCCACAGTAAATCCCTGGAAAGTCTTTTAAGAATAAGTAGATTTTGTCCCACTGCTTTTGTTCTAATAATTTTGGCATCATTGCCTCCAAGCAAAATACTACTTATTCTCAGGATTTATATGGAAATGTCAACGGAGCCTAATAAAAGCAATAAAGTATATAACTTATTAAACACAGTCACCTCTAAATTAAATGCTTTTATAATGAAAATATTTGGTTATTATACTCCTGATAACAAGGAGATCAATATTAATTATTTATTATGCATCACATTTTCAGTCCTTACTTTTAGGTGTATTTTTAAGTGTTAAATATATGTAATTTTTTAATTTGTCTTGAATAAAGTAAGCTGTTTAAAGTTAATGAAAAAAGTAGCTTTTAGTGCTTGTGGTGTGACTTAATATTAGAAATTATTGTTATTAGGACTTACGTATGGTGTTTTTTAACGATACGCTTACATATAGCAGGCGAATACTAGTGCTTTTATTTAATATCCATCAGTGAAAGATTAAAGAGGAGCGTTAGCTCCCCTTATTGGTTATTTATCATATGGTTAAGTGATAGGTTTAGAAAACAAGTCAGCATTTAAGTAGAGGTGGCAAATAATTGAGGCAATATAGCCTAGGGCAATGGCCCAGGTCCACTTTAAATGACTGAAGAAAGTGTAGGCACCTTTGGCTTGACCCATTAGTGCAACGCCAGCGGCTGAGCCAATAGAGAGCATACTGCCACCAACTCCTGCAGTGAGAGTGACTAATAGCCATTGGCCGTGTGACATCTCAGGCTGCATGGTAAGCACAGCAAACATCACGGGGATATTGTCAACGATGGCAGAAAGGACACCGACGAAGATATTCGCAGGTGTTGCATTATGAATCGCGGCAAGCCCAAGTGCTTGACCCCATTGGCTGTACATCGCCTCTGAGAGGATGCTAAGGTAGCCGATGGTAGATAGACCGCCGACACAGAGAATAATACCGTAGAAAAAAAGCAAAGTATCCCACTCGGCGCGTTGCACTTTCTTAAAGATGTCAAAGACGTAGTTATCCGTTGTATTTCCTAAATGCTTCATTTTGCGCTCTTCAACGATTTTGAGGTAATAGCCAAAAAACTGTAGATAACCAAGACCGAGCATCATACCGGCCGCAGGCGGTAGGTGTAGGAAGTTATGAAAGCTAACAGCAGTTACAATGGTCAGTAAAAATAATACCATGATTCTGCGTGCACCGACCTTCATACTGATTGACTCTTCATGTGCCTTTGGTTGTACTTTGGGCACTGCGAAGGTCATAATCACTGCAGGAACTAGATAGTTGATGACTGAAGGTAAGAAAATCGCAAAAAAATCTGCAAAATCAAGAATGCCTTTTTGCCAGACCATCAACGTCGTAATATCACCAAATGGGCTAAATGCACCGCCAGCGTTGGCAGCAACAACAATGTTAATACAGCCTATAGCAACAAACTTTTTATTATCACTGCCAACCGCCATGACCACTGCACACATGACCAGTGCGGTGGTTAAGTTATCCGCAATTGGTGAGATAAAAAAAGCCAGAATCCCTGTGATCCAAAATAGCTGCCGGTAGGTAAAGCCACGCTGGGTTAGCCAGACCCTGAGCGCTTCAAAGAC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99 | unidentified_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1025763 : 1132798
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP038967|1025763:1132798|DBSCAN-SWA 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94 | Bacillus_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1169870 : 1222550
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP038967|1169870:1222550|DBSCAN-SWA 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48 | Klosneuvirus(28.57%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1227086 : 1283946
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP038967|1227086:1283946|DBSCAN-SWA 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57 | Acinetobacter_phage(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1290702 : 1467689
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038967|1290702:1467689|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP038967|1290702:1467689|1290702_1291785_-|WP_054300162.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRGTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR >NZ_CP038967|1290702:1467689|1356729_1357437_-|WP_016210883.1|DBSCAN-SWA MVRHPKCRAAPGLDAYGRPLLPLERFLLEEAPIILATQQRGEIFQKLLQGKMTDYAQFASLPCGLMYDLASLKPALNFKAYGIDLDQAALDLAVKVAQAYSIDAELVCEDAWQLSLSNTLDVLCSNGLTIYEPDDDRVQVFYQKCYQALKPNGCLIVSFLTFPLAYPDSEWVIDEVNVAAAQKQRIVFSDIIGTQFQCYRSYATTYQQLEEVGFSQIEFIDGYAKIFPTVVAYKI >NZ_CP038967|1290702:1467689|1455724_1456354_-|WP_016211144.1|DBSCAN-SWA 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174 | Leptospira_phage(18.52%) | integrase,protease,transposase,tRNA | attL 1398151:1398210|attR 1411856:1412144 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1471519 : 1531065
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP038967|1471519:1531065|DBSCAN-SWA CTCAGTTGGTCAATAGGTTACGCTGGATATTAAGCGATGGCTTCTTCTCCTGAAGACAGTAGGCTGCTAATCCAGCAAGAATATTGACCATAAAGTTGTTGACACTACGATGCCTAGAGTGCTCGATTTGTGAGATGTTTTTAAGTTGATCAAATACACTTTCAATAATTCCACGTCTTCTGAGTAAAATTTTATCGATGATAGGCATGAGCCTATTTTTCATATTCTTGCGAATTTTATTGATTAATTGCAGTCCTTTTTCATAAAGCCTGTTAAATAAATCTTGTGAAATGTAACCTTTATCACCAATAATCTTACCTGTCAGACCTTGAGCAATTTCAGGTAATACAACGCGATCATCCGTTGTTGCCTGACTGAGTTTAAAGGCCATCAACTCCCCCATATCATTTACAATTAGATGAAGCTTAAAGCCATAGAACCAGCCCATCGTTGAACCACATTTTTTAGCCAGTCCTTTAAAGACTCTATTTTGATGACTGCGTTTATGATGACAGACTCGTAGTACGGTTGAATCAACAAAATAGATTCCCGTAGGTGTTTTTCTTTGAGCGGCAATAAAAAAACACAGAGGGAGTAATATAGTTGGCATTAATTCAACAAATCGGTTATAGCTCACTGCCTTGGGAAAGTATTTTTTCAAATGGCCCTGGACTTCCCTTTGATAGTAATGTTTGAAGTTACGATAGTGGGATTGATGAAAATAAATCATGATGGTCATTATTTCGCTCGTTGACATGCGGCTTGGTTTATTGCGCTGCTTATCTTGGTGCTCAAGTAATGAGGCTTTCCAGTGAGGCAAGAAAACCTGACAAAAGTCATCGACAATACAAAACAAACCAATTAAGCTGGTATCCATAAGTAGCTCCTTGCAATGGATTTAGACTTTGAGAACCTAAATATTAATTGCAAACGGGCTGCTTTTTCAATAGGACCTTATATCGAACTCACGTAAAATAGCTTTAAAAGCACTTAACATCGAGTAAAAATTGTTTAATACGGCAATCACTTGATATACAGTATCATGTCAAAGATTACTAAAAGTAATAATTAACATTCAGCTAACCAAATTTAAGTAAAAGAGCACACTATATGAAGCCATTTCAATTTATCCGTGAAGAGTATAAATTTCTCATCGGACTACTATTTGTTCTCATCTTTTTTTCTCCTCAATTTAGTCAACAACTTGTTCCTCACAGTATAAACTTTGCCGCGATCGGATTTATTGTTGTATTTATTATTATGATTGCTTGTGCTTTTAATGTCGTAAAACATGCTGACTGGCTGGCCCACCGCTTTGGTGAACCTTATGGGACCATTATTCTCACCATTTCTGTCATCTCTATTGAAGTTGCCTTAATTTCTGCGGTGATGCTTGCAGGTGGAAAAAGTCCAACATTGGCACGCGATACCATGTTTGCAGTCATCATCATCTCTTTAAACGGTCTAGTCGGACTCAGTTTATTACTTGGCGGCATTCGCCATCACTCACAACGCTACAACTTGAATGGAGCGAATGCATTTCTATCTGTCCTGGTGCCTTTATCTATTATTTGTCTAGTCTCTCCCAACTACACAAAAGCTGCCAGCTATGGTGTACTTTCTCACGGCCAAGCAGGCTTTATCGTTATCATGAGTTTGGTCCTTTATGGTGTTTTTCTATCGATTCAAACCGTGCGTCACAAAGATTTTTTTGAACACCCAGACCCAACTGACGAACAAATTACAGCCGCACAAAAAGATGGCAGCTTACCTCGAAAAGTTTATTTTCATATCGCCATGCTGTTTATGGCACTTATCGTCATGGTTTTGCTCTCCAAAAAACTTGCCATGTATATCGATTTTACTATTTCTGCCCTACACGCACCTAAAGCATTAAGCGGCTTCATTGTTGCTATTCTTGTGCTAACTCCAGAGGGCATGAGTGCAATTAAGTCAGCCGCAAATAACCAAATGCAACGCTGTGTTAATCTTTGCTTGGGCTCAGCTTTAGCTTCTATCAGCTTAACCATTCCTGCAGTACTGGTAATTAGTTTTCTTACCCAACAAACTATTACGTTAGGCTTGTCTAGCCTTGATGTATTACTTCTTATACTCACCCTCGCAGTCAGCATGATTACTTTTATCAGCCATCGAACCCATATCCTTCAAGGGGTCGTTCACCTTGCTTTATTTTTTACTTATATTGTCTTTATCTTTGATTTAGCCAAATAGCAAGTATCGCTATTTTCTATCGGTGTAGTGTCACTAACTTAAGAGACTAAGCAACTAGACATAATTTTTATAAATATCCACGGCTAAAGCCGTGGTGTTTTGTCTGCGACCGTATCAAAGTTACAGCCTTAGAAGATCACACATGAAAATGAATTTAACCAATCAGATGTGCTAGAATACTCGTTACTTTTGACCTAAATTAACACAACAAGGCAGCAATAATGACAATAAATAAAAGAGATTTTTTTGATGCAATTAACTACGCTGATACAGCTGTTCAGATTCATGAATATCTTCTCAACATTCTAGAAAAACAGCAAAAAGATTTTGCTGAAAACTGTAATAATGATAACGACAGTGAGAAAAGCAAAGCCTTAGCGAGTATTAGTGATGTCGAATTACGTTTTGCTCAGCTTGATATGCTAAGTGCAATCTATCGTAAAATACTTTTAAATACGTTAAATGAAATAGAAGGTTGCAATGATCAAGAACTCAAGACCATTAAAAATGGTTTACTGCATATGGTCGCCACCACGCTGGAAGCCTGTGTTAATGACTTTACTATTGAAGCAAAAATAACGATTGATATTAAAGAAGAGCAATAGCCCCTCTTGCGAACTTTAAACACCAGCTCCTGCAAAAGTAAACAAAGGCTCTTTATTACCAGATAATTGAAAGTCAATCGCCCCCACTTGCCCGGTATTTAAAATAGCAATATGCTGTGATTGATAACGATGAAGCACTTTTACATGAGGCAATCGGTAGGCATTATAACGCCCTGCACTGATGATCACCGTATGAGGAGATACCGCTTTAATAAATGGCGACGTCGATGAACTATTACCACCATGATGAGGTGCAAAAAGAATATCACTTTTTAAGCTTAAAGGCGCTTGAAGCAGCAGCTTTTTCTCTTGGCGTTTTTCTATATCTCCAGTGAGCAGCATACTACTTCCTTCTTCATTAACACTCACCTTAAGCACACATGATTGATTATTACGGCCATAAGGAAAAGGATAAGTTGGTGACAAAAACTCAAAGGTCACACCATCCCACAACCAACGATCTCCTGCAACACACGCCTGAGTCTTTGTATAAGGTAACAAAGGGCTGGAACTAACAACTCGTGTTTTTGGATAAGCAGCCAATACACTGGCTAACCCACCACTATGATCAGAATCAATATGGCTAATTACAAGTTTATCAATATGCTGAATGCCCATGGCATATAGGTTAGGGACCACTACCACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAAGGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAGTAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAG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52 | Staphylococcus_phage(18.75%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1541330 : 1663992
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP038967|1541330:1663992|DBSCAN-SWA 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115 | Staphylococcus_phage(22.73%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1670160 : 1725426
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP038967|1670160:1725426|DBSCAN-SWA 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46 | Pseudomonas_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1755048 : 1804496
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP038967|1755048:1804496|DBSCAN-SWA CCTATTTTTGTACACCCTGAATAATCACTGTCTGAGGAGGATTAATATACGCAGGCTTCAGAATCTTGCGTACAGGCGGTTTGTTATTAAACCGTGATGGGTTTTCGATATAAGCAGACATTAGGGTGTCGTGACGCTTATCTAAAATTCCATCGCTTAATCCATAATGCACAGACTCTGGTGTCAAAAAGCATCTGCCAGAATGATAATGCATTGAATTATACCATTTGAAAAAATCCTGAGAAAACAACTCTGCCTCCTTAATGTTATCAAATCGTTTTGGAAACTGCGGGCAATACTTCAGAGTTTTGAATTGTGACTCTGAAAATGGGTTGTCATTACTTGTATAGGGCCTGTTATGTGATTTTATTATCCCCATGTTCTCCAAGAGGTCTCCCACAGTGCCAGAAGTCATACTTGGCCCATTATCTGCGTGCAACGTTAAACTTCCCTTCTGAACGCCTTGTCGTAAGGCTGTAGCTTCTATCAATTGATAGGCAAGGTCTTGGCACTCACGGTCAGCGATAAGCCACCCAACCGCATAGCGGCTGAATATATCTAAAATCACATACAGATGATAATAGACAAGGCGTTTTGTACTCAATAGCTTCGTTATATCCCAAGACCATACTTGGTTTGGTGTTGTAGCTATTAACTCTGGTTTAATGGCGTTTCTATGATTACGTTGAATCCTTCTATCTTTAGTCCCGCTGTGTTCTGTTAGCAATCGGTACATTGTTCTTATTGAGCAGTAATAATGGCCTTCGTCTAAAAGCGTATAAAATGTTTGGTAAGGCGTACTATCGATAAAGCGCTCACTATGGAGTATAGCGCTCGATCAACAGTTTCTGACATACTATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAGTTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACTTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGATACCCTGCATCGTTGGAAAAATATGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGATTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAAGAATTTCAAAAATTCATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATCGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATAACTCAATTATTTGATCTTTTTCTTGATTATCAATAGCATTGCTTGGTTTGAAGGCAGGTTTTTTTTCAAGTGTACCTTTCTTTTGTTGACGATAGTAAGTTGCTCTAGGCATTGATACTGCTTTACATAGGGCTATTGCTGTGACATTTTTTTTCCTTGCTCAACTTATTGATTTCATCCATTAATTTGACTCGCTCAGCTCTGTCGGGAGGATATGCTCCCCAAGCAGATCTGAGACTTTTTTTTGCAAATCAATAATTGCCTCAGCCTGAGCTAACTTCTTCTTAAGTCGAATATTTTCTTGAGACAGCAGCTTCATTTTTTTATCGGACTTATTTTTATATTTTCCCCCAAGTTTCCCAGTCTCTCGTTCCTTTTTCCAGGTAGAAATTCTGGATGAATACAGTCCTTCTTTACGCAGTAATTCACCACGTGCCAGTTGATTACTGCATGCATCATACTCTGCTAAGATTCTGATTTTATAAGCCGTCTTGAATGAGCGACGAGGTGAAGATTGCTTTTCCTTTACCTGGGGGTTAGGTATTTCAGATGTGCTGGAACTATCGTCACTGACAATCAAAGACTTGCTGGGGTTTTGTGAGTTCATATCGCATATTCCTCACCGCCTAAATGTTCTTATCTTTTAGCACATTTTTGTCTCACTTTGGCTGGCACAGAGGGCCTTAAGCTTTGAGCAAAATATTTCCCAAAGTTTCCGTAGCGGATATTTATTGCGGTTCTTCTTCATCCATTCTGATATTTTCTTCAGTTTGGATCTTAGGCGTTTTCCACTCGACTTCAGCTTGGGAATAATAGCTCTCCCACTAACTGAAACCCCTAGATAAAAGGTAAAGCCGAGAAAATCAAACGCGCCCTGTCGTATCCCTCGAGCTGCATCTTGCTTTGAAAATGCAATTTCTCGGGTCTTATCCTCATTCATTTTTAACCTGAACTTTGATAATCTCTTGGCTAACGCTTTCTTTATTCGGCCAGCATCATTTCTGAACTGACAGCAGATAACCATGTCATCTGCATATCGAAACATTTCTACTTTACCTTGACAGTGCTTCTTCACCACCTTTTCAAACCAGTCATCTATCACATAGTGTGCAAATATATTTGAAATTATCGGGCTACACACTGAGCCTTGGGGAACTCCCTCATCGCTCATTGTCAACTCACCTTTTGATAAAATCCCAGCTTTGAACATCCGAATAATATATCGGATAAAGCGCTGGTCTTTAATCTTAGTTTCTAACATATCTATCAACAGATTGTGATCAATTGTGCCAAAGTAGTTTTCTAAATTGATCTGGCAACCTTTTTCTAGACAAATTTTTAACTGATTTTTTGATTATGCTCGTATTCCTCAGGTGATAAATAATCATTAGCTGAGTGAATGCGTTTTCTGTTATAAAAAACTTCGATATACTCAAAGATCGCTGATTTAGCCTCCTGTCGATTTTTAAAATTCATGTGATGAACTAACTCCGTTTTTAAGGTATGAAAGAAACTCTCTGAAACAGCGTTATCCCAGCAGTCTCCCTTACGACTCATACTTTGCTTAATTTGATGATCTTTAAGAATCTCACGATGACTTTCTGAAGCATATTGGCTTCCGCGATCTGAATGCCAAATTAACCCAGCTTTAGGCTTTCGTTTCCATAAGGCCATCAACAGAGCATCATTGACGAGTGATGCTTCCATATGATCCTCCATGGCCCAGCCAACAACTTTTCGTGAGAATAAGTCAATCACAACAGCCAAGTACAACCAGCCTTGTTGGGTCCGTATGTAGGTAATATCACCAACATATTTTTGGTTAGGGCCTGTTGCTGAAAAATTCCGGTCCAACACGTTTTTCGCAATTGGCAATCGATGTTTAGAATCCGTAGTTACTTTGAATTTACGCTTTATCTTGCAGCAAAGCTGGTTCTGCTTCATTAAACGGCCAACTCGCTTACGGCTTACAGAAATTTCCTGTGTTGCCAACTGTTTTCTAATTCTTCGAGTACCATAGGTTGCACGGCTTTCGATGAATATTTCCTTGATTCGCCTAGCTAATTTTTGGTTCTCTATCATTCGCTTGGAAGGCTGTACCTTTAACCAACTGTAATAACCTGATCGGCTAACACCTAAGATTGAGCACACCCTATCTACTGGAAAAACACATTTATTTTCTTTGATCCAGGCATACTTTACTGTGTTTCGCTTGCAAAGTACGCCGCCGCTTTTTTTAGTATTTCACGTTCCTGTGTCACTCTAGCCAACTCTTTTTTTAACTGTTTTATTTCAGCAGCCATATCACTAACTTCATCTTTAACAGTATTTGGACTGTTTGGATGATATTTATTGACCCAACCATGCAGTGTACTTGAGTGAATACCCAATTCCTGTGCTGTATGACTGATTGCTTGATTTGAATCGACTGCAAGCTTGGTAGATGATTTTTTAAATTCTTCGGTGTACTTGGTGACGTGACGCTTTCCCATTGTGATTCCTCCGGCTCGGATTATTGTAATTTATTTGTCCGGAATAGGGTAGCCTGATCAAATCTACATCAATAATACTTTCGATTCGATTTGAAAACAGATAGTAATCCAGTGCTCTGATAGCATTATGACAGCTTTTTCCAGGCCTAAAGCCATAAGAGTTTCCTAGAAAAATAGGATCATAAATGCTTTCTAGCACTTTCTGTGTCATCTTCTGGATAATTTTATCTTCGAAATTACTAATACCCAGTGGACGCATTGCTCCTGGCCTTCCTTCTTTGGGAATCAGTACTAAGCGTACCGCTCCTGGAATGTAGGCCATTCGTTTCATGCGGTCCAGCAAGTCGAGTAAATTCGGAATTAAATTCTCCTCGTATTGCTCTTTCGTGACTCCATCAACTCCTAGAGCCTTCTTTCCATTCAGCTCATGGAA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51 | Acinetobacter_phage(16.67%) | integrase,transposase | attL 1753992:1754051|attR 1783764:1784054 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1847185 : 1863552
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP038967|1847185:1863552|DBSCAN-SWA 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15 | Leptospira_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1908347 : 1923157
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP038967|1908347:1923157|DBSCAN-SWA 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22 | Acinetobacter_phage(50.0%) | integrase,transposase | attL 1913403:1913462|attR 1917105:1917343 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_22 |
1985405 : 2158129
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP038967|1985405:2158129|DBSCAN-SWA 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166 | Staphylococcus_phage(14.81%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2178799 : 2260407
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP038967|2178799:2260407|DBSCAN-SWA 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83 | Staphylococcus_phage(35.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2300670 : 2360282
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP038967|2300670:2360282|DBSCAN-SWA 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57 | Planktothrix_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2447339 : 2532511
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP038967|2447339:2532511|DBSCAN-SWA 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86 | Escherichia_phage(41.18%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2547329 : 2594931
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP038967|2547329:2594931|DBSCAN-SWA 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43 | uncultured_Caudovirales_phage(18.18%) | integrase,protease,transposase,tRNA | attL 2545054:2545113|attR 2595671:2595965 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2599944 : 2653537
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP038967|2599944:2653537|DBSCAN-SWA 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58 | Microbacterium_phage(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2693040 : 2776359
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP038967|2693040:2776359|DBSCAN-SWA 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82 | unidentified_phage(23.08%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2888921 : 2932319
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP038967|2888921:2932319|DBSCAN-SWA 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41 | Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2964004 : 3081431
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP038967|2964004:3081431|DBSCAN-SWA 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MIKESVLDVLMYLFDQNSETEQSLSSDQAALSAELEKAGFAKDEVERAFHWLEGLVDTSQRPKHFEPSMTTRAFAAKELSVIGSEHLSYILYLEHIGILNVELRELVIDRIMALGIDEIDLSHVKWVALMVLNNHYEDGFETEWFEEMILTDPKTEVQH >NZ_CP038967|2964004:3081431|3050215_3051367_+|WP_016210346.1|DBSCAN-SWA MNQEQAACIALYHTRHIGSQRLYRLLEHFQTASAILASSVDELQSLNFSKALIQAILNPNWRMADKAATWLLEPSHHIVFFNEPNYPMQLSHINTPPALLYIIGNPELLHKPQLAMVGTRKPTPSGQEAAYQFAYEAAYHQLCITSGLAIGIDTISHQTIIDNQGQTIAVLGCGVDTIYPAQNNKLYQRISEHGALVSEFALGAQPTARHFPQRNRIIAGLSLGTLVVEAAVKSGSLITAQYAIEANRDVFAIPGSIHNQQARGCHALIKQGATLVENFADIATQLQTNHFTYCDNPTLTASQPPVTQENCQPQQPALDLTEIDPTSVCMLEHLSFEATAVDQLVESTGLAVEVISSALLNLELAGYIATIPGGYIRTKGKRR >NZ_CP038967|2964004:3081431|3061367_3061550_-|WP_032126148.1|DBSCAN-SWA MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI >NZ_CP038967|2964004:3081431|3024767_3025238_+|WP_075274970.1|DBSCAN-SWA MECADSRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTRVRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038967|2964004:3081431|3054255_3054882_+|WP_080664839.1|DBSCAN-SWA MNCPNQSKQNSKAQKKKNKVSKKEVSSSLSKAAQCIQQGGIIALPTEGIMGLSCDPHNDTAIKRLLAIKQRPEHKGLILVAADLTQLRPFIQRLSVELLDKLTTIRKQPTTWITPAHPEISKLITGSFSGVAVRLTTHPLVKALCLACDHALISTSANISTEPNTRDLATLNPALTVQLDYLLDGQVGTHQGPSEIRDLLTDTILRQG >NZ_CP038967|2964004:3081431|3026569_3027202_+|WP_016212371.1|DBSCAN-SWA MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSPYAQVINILIA >NZ_CP038967|2964004:3081431|3056737_3056995_+|WP_016210347.1|DBSCAN-SWA MPRDSIGFSQTSLKRLALTELKELEKQLNLSLHKLLASQQSLELAVGLDQSKFVVSNPDKPSLTNKKLNNLRAKQKRTNDLATFF >NZ_CP038967|2964004:3081431|3032143_3032611_+|WP_075274973.1|DBSCAN-SWA MKTYRHMLKLAFSTMFKKKVPIKEVNIKTHKIRNSLYFYLSTPFEKCKYTPIELYRSAYFNNLSEEAQDSIIREVFELYQVTSKMNYNLIHVQHNIYQVVYQSNQELITEDNAFNLMKDYDIIQNLDENSYSQLFNSAFKNNSRKIIHRNFSVKN >NZ_CP038967|2964004:3081431|2980339_2980705_-|WP_032126362.1|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038967|2964004:3081431|2972016_2973303_-|WP_080664857.1|DBSCAN-SWA MGNNIVYSQCLSNGCNRRRGDNLLYIQQRNKLNFILVIFGVIAAQAAVSLYLPSLPAIDHEWHLASGQAQLTLSAFFLTFGVSQLFYGALSDHFGRKPLLLMGLVILVLSSVWAIYATSFHSLLAARLVQGVGGGALSVLARAIIRDLFHGDELRKAISILAIAASFTPALAPSLGGWLEDHFDWRSSFVILTAYSIILLVTIFSLFTETNQYQRQPNESIDFSKVVASYYSVTKNKLFWCYGFAILIGYLSLVICLANAPFLLEKKFGLSAEITGYLMFVQPGFFLVGNLLQHKLTDKISGDLFLKFGMVILGVIGLSFLFQGVFHSATLINVLLTLALAGFATSLILVNALAGVLLPFTENAGAAAALSGVLQMVVASFITALISNLHWTSIIDLGWIYLALFVVLYISLLFLHRIRLYSPCYKSA >NZ_CP038967|2964004:3081431|3073676_3074018_-|WP_016211294.1|DBSCAN-SWA MSGHYEVATNEKKNLGKSLRNYALGFILSAVLFAVATLLVSKQALSSTGVTLVLLIILAVLLLVQLVCFFGLNTRTENARWDMLTFAFTILVTVVVIGGSLWIMYNLNYYMVH >NZ_CP038967|2964004:3081431|3066138_3066504_-|WP_054300550.1|DBSCAN-SWA MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKAMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP038967|2964004:3081431|3031244_3031553_+|WP_032126698.1|DBSCAN-SWA MPALASLKDIHERRVKKLNILIKERNIPSLRSLCKNVGIQPSVLSRMLSNNTLAEKHARAIEQYYYLPELWLDIEEETQSWNVPGFFLMIIKKTTLHLPHFI >NZ_CP038967|2964004:3081431|3049577_3050081_-|WP_016210340.1|DBSCAN-SWA MALLNILQYPDPRLRLQAKPVTVFDDALAQTVQDMYETMYESSGIGLAATQVNIQQQILVMDLSENRSDPLCVINPEILETFDHAEHDEGCLSFPGVFAKVERAARIKIAAFDQRGEKFELEAEGLLAVCLQHEIDHLEGKVFIDYLSPLKRKRLEKKLLKQRRQVL >NZ_CP038967|2964004:3081431|3025594_3026047_+|WP_075274971.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR |
111 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038967.1|WP_032126179.1|1075294_1075546_+|TSUP-family-transporter |
1075294_1075546_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_032126179.1|1075294_1075546_+|TSUP-family-transporter>NZ_CP038967.1|WP_032126179.1|1075294_1075546_+|TSUP-family-transporter MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH |
83 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1025763-1132798 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1083917-1083880, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1083783-1083746, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** 3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1073738-1073775, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_155049815.1|1112340_1112493_-|hypothetical-protein |
1112340_1112493_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_155049815.1|1112340_1112493_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_155049815.1|1112340_1112493_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK |
50 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1025763-1132798 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1083917-1083880, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1083783-1083746, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** 3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1073738-1073775, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct Protospacer ****************************.********* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016210918.1|1208193_1208943_-|hypothetical-protein |
1208193_1208943_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016210918.1|1208193_1208943_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016210918.1|1208193_1208943_-|hypothetical-protein MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS |
249 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1169870-1222550 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1197490-1197453, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1221638-1221601, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_032127044.1|1243392_1243593_+|hypothetical-protein |
1243392_1243593_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_032127044.1|1243392_1243593_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_032127044.1|1243392_1243593_+|hypothetical-protein MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS |
66 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1227086-1283946 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1255966-1255929, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1259472-1259435, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016212421.1|1255317_1255500_+|hypothetical-protein |
1255317_1255500_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016212421.1|1255317_1255500_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016212421.1|1255317_1255500_+|hypothetical-protein MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH |
60 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1227086-1283946 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1255966-1255929, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1259472-1259435, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_054300380.1|1258739_1259396_+|transposase |
1258739_1259396_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_054300380.1|1258739_1259396_+|transposase>NZ_CP038967.1|WP_054300380.1|1258739_1259396_+|transposase MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
218 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1227086-1283946 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1255966-1255929, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1259472-1259435, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_081377858.1|1276477_1277188_-|transposase |
1276477_1277188_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_081377858.1|1276477_1277188_-|transposase>NZ_CP038967.1|WP_081377858.1|1276477_1277188_-|transposase MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL |
236 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1227086-1283946 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1255966-1255929, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1259472-1259435, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_155046725.1|1278045_1278186_-|hypothetical-protein |
1278045_1278186_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_155046725.1|1278045_1278186_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_155046725.1|1278045_1278186_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP |
46 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1227086-1283946 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1255966-1255929, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1259472-1259435, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_129556517.1|1478278_1478566_+|hypothetical-protein |
1478278_1478566_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_129556517.1|1478278_1478566_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_129556517.1|1478278_1478566_+|hypothetical-protein MLSTPWLAASDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVLSTPHK |
95 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1471519-1531065 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1528675-1528712, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016212013.1|1473971_1474355_+|hypothetical-protein |
1473971_1474355_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016212013.1|1473971_1474355_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016212013.1|1473971_1474355_+|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
127 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 1471519-1531065 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1528675-1528712, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016211563.1|1493140_1493302_+|hypothetical-protein |
1493140_1493302_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016211563.1|1493140_1493302_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016211563.1|1493140_1493302_+|hypothetical-protein MLPSFQTEQFNDLFLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSTVRVTQRYVP |
53 aa aa | NA |
HTH_38,HTH_Tnp_1
HTH_38,HTH_Tnp_1 HTH domain information
|
NA | 1471519-1531065 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1528675-1528712, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016211736.1|1633406_1633607_+|hypothetical-protein |
1633406_1633607_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016211736.1|1633406_1633607_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016211736.1|1633406_1633607_+|hypothetical-protein MTEGDFLQNTIRKLREYENSSPSFLKFLGSDTPELRAARRGYAHDLKVILEATERDCETYGASFFI |
66 aa aa | NA |
HTH_38,HTH_ARAC
HTH_38,HTH_ARAC HTH domain information
|
NA | 1541330-1663992 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1573685-1573648, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1579260-1579223, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_098082828.1|1914392_1914650_-|transposase |
1914392_1914650_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_098082828.1|1914392_1914650_-|transposase>NZ_CP038967.1|WP_098082828.1|1914392_1914650_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN |
85 aa aa | NA |
HTH_21
HTH_21 HTH domain information
|
NA | 1908347-1923157 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 1918653-1918616, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_033923740.1|2158187_2158475_-|hypothetical-protein |
2158187_2158475_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_033923740.1|2158187_2158475_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_033923740.1|2158187_2158475_-|hypothetical-protein MPRYQLLEKMNGEKILDFDQESYILMNRKVRQHAKAHPGSLIAHIAGGMELISVVWHGACAAINIELLNFLADAEKGGIARVREFALRHLKCNTQ |
95 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016212614.1|2179942_2180149_+|hypothetical-protein |
2179942_2180149_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016212614.1|2179942_2180149_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016212614.1|2179942_2180149_+|hypothetical-protein MRLKELRRQIFAFLQLNDLIQDAQTAQDVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
68 aa aa | NA |
HTH_Tnp_IS1,HTH_38
HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2178799-2260407 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2191055-2191092, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2222934-2222971, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2231804-2231841, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2223068-2223105, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016211536.1|2183876_2184110_-|hypothetical-protein |
2183876_2184110_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016211536.1|2183876_2184110_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016211536.1|2183876_2184110_-|hypothetical-protein MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN |
77 aa aa | NA |
HTH_Tnp_IS1,HTH_38
HTH_Tnp_IS1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2178799-2260407 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2191055-2191092, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2222934-2222971, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2231804-2231841, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2223068-2223105, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016212450.1|2223063_2223966_-|hypothetical-protein |
2223063_2223966_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016212450.1|2223063_2223966_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016212450.1|2223063_2223966_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG |
300 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2178799-2260407 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2191055-2191092, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2222934-2222971, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2231804-2231841, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2223068-2223105, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_129556569.1|2230692_2230902_+|hypothetical-protein |
2230692_2230902_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_129556569.1|2230692_2230902_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_129556569.1|2230692_2230902_+|hypothetical-protein MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE |
69 aa aa | NA |
HTH_ARSR
HTH_ARSR HTH domain information
|
NA | 2178799-2260407 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2191055-2191092, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 2. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2222934-2222971, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 3. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2231804-2231841, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** 4. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2223068-2223105, mismatch: 1 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ********** *************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016210580.1|2754060_2754321_+|methyltransferase |
2754060_2754321_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016210580.1|2754060_2754321_+|methyltransferase>NZ_CP038967.1|WP_016210580.1|2754060_2754321_+|methyltransferase MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI |
86 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2693040-2776359 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2774594-2774631, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_129556602.1|2966472_2966682_-|hypothetical-protein |
2966472_2966682_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_129556602.1|2966472_2966682_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_129556602.1|2966472_2966682_-|hypothetical-protein MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC |
69 aa aa | NA |
HTH_1,HTH_38
HTH_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2964004-3081431 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2980731-2980768, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_016211201.1|2969815_2970124_-|hypothetical-protein |
2969815_2970124_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_016211201.1|2969815_2970124_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_016211201.1|2969815_2970124_-|hypothetical-protein MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA |
102 aa aa | NA |
HTH_1,HTH_38
HTH_1,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2964004-3081431 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2980731-2980768, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_155046758.1|3059293_3059425_+|phosphatase |
3059293_3059425_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_155046758.1|3059293_3059425_+|phosphatase>NZ_CP038967.1|WP_155046758.1|3059293_3059425_+|phosphatase MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP |
43 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2964004-3081431 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2980731-2980768, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_155046759.1|3059569_3059725_+|hypothetical-protein |
3059569_3059725_+
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_155046759.1|3059569_3059725_+|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_155046759.1|3059569_3059725_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT |
51 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2964004-3081431 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2980731-2980768, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NZ_CP038967.1|WP_032126148.1|3061367_3061550_-|hypothetical-protein |
3061367_3061550_-
Protein sequences of NZ_CP038967.1|WP_032126148.1|3061367_3061550_-|hypothetical-protein>NZ_CP038967.1|WP_032126148.1|3061367_3061550_-|hypothetical-protein MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI |
60 aa aa | NA |
HTH_21,HTH_38
HTH_21,HTH_38 HTH domain information
|
NA | 2964004-3081431 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|363152|38|NZ_CP038967|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038967 position: 2980731-2980768, mismatch: 0 cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct CRISPR spacer cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct Protospacer ************************************** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
3171 : 10860
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038970|3171:10860|DBSCAN-SWA CTTAAATTAAATCCACAATTCTCTTTTTAGCCTCACTATCACCTTCTATATAGCGCTGAGTGGTTTGTAGTGTTGTATGTCCCGCGAGTTGTTGAACATCACGAAGGGAACCACCAGCTTTGATGATATTCTTAGCTGCACGGGTAACAAAGGTACGGCGACCACTATGGCTACTACAGCCTTCAAAGCCTAAATTTTTGTAGAGTTCGGCAAACCAGTTAACCACCGTTTGGGCCGGAAAGTGCGAATTGCGACGCGAGAGAATTACTGGCCTTTGTCCATGCTTTGGCTTTGACTCGTCTAATAGCTGGGATAGGACCTGTTTTAATTGTTTGTTGAGTGGGATGACTCGCCCCCCTTGCTTGCCTTTGCTGGCTGTGTTGCGTAGATGGATCGCTTCACAAAGTTCACTTTCAGGAGTCAGTAGCATCTCCCAGGTGAGTGCTGCAATTTCTTTTGCTCTTAAGCCTGCTTTGATAGAGAGCAGGAACATCGCAGTGTTGCGGGTTGGGTAGGTGGTTGATTGTAGTGAGCTTAGCACCGTTTTTTCTTGCCTCTCGCTTAAAATTTTCGCTTGCTTATTGAGTCCCATTTTTTAGTCTTCATATCAGTATAATAAGTTTATATGTTAAGATATTATACTGATTGTGTTTTGTCGTTTATTGGTGAGTCTTTGATTTTATTAGCTTTAGTATATATTGGTAAAAATATACTGTTTTTAGTTTGACCAGCATTTCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCGCGTATAAGTAGAGTTTGTTTCCAAGCTCTACTAAGGGTACTAGCTAATAAAAATTAAAATCAACTTTTCCTGACAAGCATGCCTGATAAGTATAAATGAATCACACTAGTTAATAATGTTTGATAAGCCACTCCTTCTTCCAAAGCCTTAGCATGAGCTTTGGTAAAATCACTTTCAGTTAACCTTAGGCTAACTGGTTTACTTTTCTTGCCCGTATTTTTGGCAGCTTCAATCAAGGCTGCTGCATCTAGGCTACCCCCCTGTAAAAAGGCATCAAAAGAATCTTCAATAGCTTGTTCTTCATTATCAAGTTTAATGTTTTTTTTAATCATCGCCTTCTCCTAAGTAGTGCTTAGTTGCTTTCCTAGATGGATAAGCTGTTTTCAAAAACAAGGTGCCGTCCTCTTTAGTCACATAAGGAACCATGACCGCATACCCTTCAATATTAACTACAGCAATATTTTGATGTTGATACTCTGGATTAGGATGCGCCCGATTATCTAACAACTTACCCAGGCTAATCGCTGCAACAACATCTTCAAAACTAAATCCGCGCTCAGCTTTTAATTTCTTGTTCTTCTCTTCAGACCACTCAATGTGCATATCGTTTTACTTTTGTAGTGTATTGTATATACGATAGCACACTCTCGCAAATATGTATATACAAATCATTACAATAAAACTTGTTATATATTATACAATATATACTAAAGTCAATAAAATCAACGGATCGCAACTAGACGCAAAAACACAATCAGTATATTATCTTAATATAACAATACTTTATACTAAAAAAGGCTAAAAAAATGGGGCTTCACAAACAAGCCAAGATTTTAAGCGAACGCCAAGAAAAGGCCGTTTTAAGTGCGTTCCAATCAACGACCTACCCTACTCGCAATACTACGATGTTCCTCCTCTCAATCAAAGCCGGTTTACGCGCTAAAGAAATTGCCGCACTCACCTGGGACATGGTACTAACACCTGAAGGTGAGCTATGTGAGTCTATCCGTCTACGTAACACTGCCAGCAAGGGCAAACAAGGCGGCCGGGTCATCCCTCTCAACAAACAATTAAAACAGGCATTATCCCAACTATTAGACGAGTCACAACCAAAGCATGGACAAAGGCCCGTGATTCTCTCACGCCGCAACTCACACTTTCCAGCGCAAACCATAGTGAACTGGTTTGCCGAACTCTACAAAAATTTAGGCTTTGAAGGTTGTAGTAGCCACAGCGGTCGCCGTACCTTTGTGACAAGGGCAGCTAAAAATATTATCAAAGCTGGCGGCTCTTTGCGTGATGTTCAGCAACTTGCTGGGCACACAACACTTCAAACCACCCAACGTTATATCGAAGGTGATAACGAAGCGAAGAAGAAAATTGTAGATTTAATCTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTAAAAACAGCTACTCACACCGTGAGCAGTCTTTCAAGTTAACTTTTCAGAAATATGCGAGTAAATCAATTTTTCCAATTCATCCATATTGATTTGAGAATATACTGACTTTGATATTTTTATATCTCCTCCATTAATACTGAATACTTTTTTATTATTAATAAAAATCTCTTTTTTATTATTCGTTATTTCAGGGTTAGATAGTAATTTATCTATAGTTTTCTCTAATGATTTCGCTCCCATACCTTCCTTTATTTTTGAGGCCATAGATATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTTCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAACACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCGCTTTAAGCCTGATTTTTGCTATTTCATCACTTAATTAGCACCTATGCTTTGGGTGCTGGAAGTAATTTTTAGTCGAATTATTTCAATTTCATGATATGGCTGATTTTCAGAGTATTGTAATTCCTAAGCGCTAAACAAGACATAGGCCCAATTGCCGCCGTATTCGCAACGGTGAAGTTCCTCGGAAAATGCACACAAGACCAAGTGCTAGATCGTCTACGCTCTCAAAAAGTAGAGTACAGTAGTTTGCAGCCAGTATTGCAAGAGTTGATTAGGAAGAGGAAAGTGGATTCTGATGGTTTTTATTATTGGGAAAGGTTGTAATTGATCAATATTTGTACAGCATTAAAATGGTTTATATTTTGAGCTGATTTAAGTGATTATCCACACGGTTATGCACTGAAATTGTGGGTTAGTTTTGGGGGTGGTGTTGATTGTTGATGTGAGGGTATCAGAGTATAATCTAGTAAGCATGGTGTAGTTTTCATCGTTGCAAGTATTGAGTGAGGAAGGTGATGGCAAGAGCTGAGCATGATTTAGACATTTATGCATGGGCACATGAGAATGCTGAATTGTTGAAACAAGGTAAGTTCAATGAGGTTGATATGGTGAATGTGATCGAGGAGTTAGAAGACTTGGGTAATAGTAAACGCGACCAGCTCACTGCTCGATTAAAGTTGATTATTCAGCATTTATTAAAATGGCAATACCAGCCTTCTCACCGTGGTCGCTCATGGTCGCTTACAATTCAAAACAATCGTGATGATGTTGAGGATTTATTCGAAGATGTCCCCAGTTTAAAAAGCAAGCTTGATGAATGCTTTGATAAAGCATATAAACGGGGTGTAAAAGCTGCATCTAATGAAACTGATATACCGATTAAAACATTCCCTAAATCATGCCCGTACACGTTAGAGCAAGTATTAAATCCTGAGTTTATGCCAGAGTAGTTTTATATACGCAAGAAGGCATATCAAGCAGCAGTGATCTGGAGCTAGGTTAAAATTCGCTGCTTGAGGCTGCCATATGGTGAGTATGGTCCTTGCGTTTTAAAAATCAAAAGTAAGCTGTTTGACTTCAAACAAATCGGATTGGACTTGCTTTCGAGTATCAAGCTGATAATGGTAGTAGCCCTTTTCCCCCTTCCATGAACGTATATTATAGCCTTCCTTGCGGAGTTGACAGATAAAGGTAGGTAAACAATGGCCGAAACCCAACTTGTAAGCCTTGGGGCGTGTCAGTTCTTCGCCTGATTTGAGGAGTTCGAGGATTTTGTGGGTGGTTGAGGGCATAGTAAAGCTCTTTAGTATTCAATTTGAATCTACTGTAAAGAGCTAGATTAGTCAAAGTAGAAAAAGTTACTGTGCTGTATAACCTCCATCCACAGAGTATAAAGAGCCAGTTACAAATGATGCTTCACCTGAATTTAGGAAATAAATGACATTTGATACTTCTTCTGGTAACCCTACTCGTTGGATAGGCTGAGAGGTTTTGAGGATATTATATAGATCATCATTAGTCATGTTTAATTTGTGCGAATTAGATTTCACCGCGTTATGGTATAAAGGTGTTTCAATGGTTCCAGGACAAACAGAATTAACCCTGATATTACTTGATGCGAAATCAATAGCCAATGATTTTGTTATTGTTGCTATTGCTCCTTTTGTTGCACCGTAAAGGACACTAGAGCCTTTACCTACAAATGATTGATCTGAACCCACTAAACAAATGGATCCACCATAGTTATTTTCAATTAAAGTAACAAAATTTTGGATGAAAAATAGGGTGCCTTTTACATTAATGTTAAAAATAATTTCATATTTTTCTTCTGTTAAATCTTTTAACGAGCCAAAGCTGTGCACCCCAGCATTTGAAACTAAGTGATCGACTTTTTTTGTAAAGCTATCAACTTCTAATCTTGCTTTTTTGATTGAGCTTACACTTGATATATCACAGTTTATATGGAAGAAATTATTATGGGTTACTTCTGGTTTATTAATATCTAAACCAAAAACTATATAACCTTCTTTTAGATATTTTGATACAGTTGATGATCCAATGCCTGTAGAAGAGCCTGTTATAGCAACATATTTAGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038970|3171:10860|9276_9711_+|WP_016212315.1|DBSCAN-SWA MARAEHDLDIYAWAHENAELLKQGKFNEVDMVNVIEELEDLGNSKRDQLTARLKLIIQHLLKWQYQPSHRGRSWSLTIQNNRDDVEDLFEDVPSLKSKLDECFDKAYKRGVKAASNETDIPIKTFPKSCPYTLEQVLNPEFMPE >NZ_CP038970|3171:10860|10119_10860_-|WP_032126347.1|DBSCAN-SWA MSKYVAITGSSTGIGSSTVSKYLKEGYIVFGLDINKPEVTHNNFFHINCDISSVSSIKKARLEVDSFTKKVDHLVSNAGVHSFGSLKDLTEEKYEIIFNINVKGTLFFIQNFVTLIENNYGGSICLVGSDQSFVGKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ >NZ_CP038970|3171:10860|6316_6550_-|WP_032126150.1|DBSCAN-SWA MASKIKEGMGAKSLEKTIDKLLSNPEITNNKKEIFINNKKVFSINGGDIKISKSVYSQINMDELEKLIYSHISEKLT >NZ_CP038970|3171:10860|3975_4704_+|WP_032126737.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038970|3171:10860|4830_5103_-|WP_032126738.1|DBSCAN-SWA MIKKNIKLDNEEQAIEDSFDAFLQGGSLDAAALIEAAKNTGKKSKPVSLRLTESDFTKAHAKALEEGVAYQTLLTSVIHLYLSGMLVRKS >NZ_CP038970|3171:10860|9810_10053_-|WP_032126346.1|DBSCAN-SWA MPSTTHKILELLKSGEELTRPKAYKLGFGHCLPTFICQLRKEGYNIRSWKGEKGYYHYQLDTRKQVQSDLFEVKQLTFDF >NZ_CP038970|3171:10860|5095_5374_-|WP_016212424.1|DBSCAN-SWA MHIEWSEEKNKKLKAERGFSFEDVVAAISLGKLLDNRAHPNPEYQHQNIAVVNIEGYAVMVPYVTKEDGTLFLKTAYPSRKATKHYLGEGDD >NZ_CP038970|3171:10860|3171_3762_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP038970|3171:10860|6648_7623_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP038970|3171:10860|5577_6168_+|WP_016212425.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLHKQAKILSERQEKAVLSAFQSTTYPTRNTTMFLLSIKAGLRAKEIAALTWDMVLTPEGELCESIRLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESQPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTIVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDNEAKKKIVDLI |
10 | Caulobacter_phage(33.33%) | integrase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
14055 : 21777
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038970|14055:21777|DBSCAN-SWA GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAATTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038970|14055:21777|17615_18617_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038970|14055:21777|15986_16577_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI >NZ_CP038970|14055:21777|21048_21777_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038970|14055:21777|15101_15566_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA >NZ_CP038970|14055:21777|18946_21019_+|WP_016211990.1|DBSCAN-SWA MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV >NZ_CP038970|14055:21777|15576_15771_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE >NZ_CP038970|14055:21777|17220_17397_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG >NZ_CP038970|14055:21777|14748_15009_+|WP_155097790.1|transposase|DBSCAN-SWA MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVF >NZ_CP038970|14055:21777|16640_17009_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ >NZ_CP038970|14055:21777|14055_14727_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG |
10 | unidentified_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 7660:7719|attR 21099:21290 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP038968_1 | 134112-134335 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038968_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP038968_1
>1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG >1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA >1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038968_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038968_1 >merge|NZ_CP038968|1|134112-134335|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA >NZ_CP038968|1|1|134112-134335|CRT AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG AAATGGAACACAAACGGAATACAAG TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA AAACGGAACACAAACGGAACACAAA
>NZ_CP038968.1|WP_016211879.1|132880_133900_+|ParA-family-protein MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS >NZ_CP038968.1|WP_059372616.1|131324_131915_+|site-specific-integrase MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWNMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP038968.1|WP_081377350.1|130263_131079_+|hypothetical-protein MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF >NZ_CP038968.1|WP_155046769.1|129763_129934_+|hypothetical-protein MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP >NZ_CP038968.1|WP_129556718.1|127327_128514_-|IS3-family-transposase MNYNNPSRRNHNGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP038968.1|WP_075274741.1|127001_127259_-|hypothetical-protein MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF >NZ_CP038968.1|WP_075273822.1|126399_126900_+|hypothetical-protein MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK >NZ_CP038968.1|WP_075273820.1|125160_126243_-|IS481-family-transposase MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRRTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR >NZ_CP038968.1|WP_016212255.1|124803_124974_+|hypothetical-protein MKKRIKATGAIERAARAAKMGRSRPAWSENFLNEFSEECKSRNSKKPDKYQEVRSK >NZ_CP038968.1|WP_032126838.1|124603_124807_+|hypothetical-protein MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI >NZ_CP038968.1|WP_155046770.1|135549_135717_-|hypothetical-protein MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ >NZ_CP038968.1|WP_054300202.1|135772_136501_+|IS6-family-transposase MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP038968.1|WP_016212168.1|136469_138158_-|hypothetical-protein MPELTFLKIEGNHSSPIQLARLVQEAAGNPAQKLGKHYFDLQGQALAEGQFEDKDGPRKVLVAVDLVERAAGESEEDKAEALARTKAKLDFFYQQLADTLPSPLLRDKLRANFDRLTCSNQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARTAFKFAYNYVYQLINADIAAFLNDCEDIGVGEINRFIDQQRVKYATVAESMVMSHLLSPPAATPRENSRKWLKTHTAADMDYLATNQLTGVLTYVRGAEKQQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALVRSDDAKERFDDAKPSQSQVKVPSLKEFKAQGRSITISQQIRDFMVGYNLQGSDAPPVVYNLLTSLPRGQDSCEQEASAKKIFKGAHHYNATRDNRPLFYVMNLPINQHTQFLHYDGSKTQKEALLLADLAMVHTVLKDLLTPGNSFVANIDSLYQNYLRNRSSDKESEGGYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSASDDATRDVLLEKALLKLYASKYPGNKVGDQKEYASLVQALFLAATNNHNFKGCKRALLRKIIVNFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ >NZ_CP038968.1|WP_075275149.1|138501_139476_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMLNKQAKAVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRSLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEDTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA 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NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP039066 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence | 1467-1508 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP039066 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence | 1677-1718 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP038887 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence | 92334-92375 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP038938 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence | 1389-1430 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP038963 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence | 128617-128658 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP038877 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence | 137267-137308 | 0 | 1.0 |
NZ_CP038968_1 | 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT | 134269-134310 | 42 | NZ_CP038882 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence | 93293-93334 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.1|134137|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|134204|40|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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117. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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120. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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121. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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126. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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127. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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128. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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129. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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130. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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131. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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132. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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133. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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134. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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135. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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136. spacer 1.3|134269|42|NZ_CP038968|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2323 : 101129
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038968|2323:101129|DBSCAN-SWA 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116 | Streptococcus_phage(21.28%) | head,tail,protease,transposase,capsid,integrase | attL 91368:91427|attR 104702:105564 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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