CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP038932	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 chromosome, complete genome	2 crisprs	RT,cas3,DEDDh,DinG,csa3	1	1	32	20
NZ_CP038934	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	6
NZ_CP038935	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP038936	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	3	11

1. NZ_CP038932

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038932_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038932_1
• CRISPR_location: 363227-363356
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038932_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038932_1

>1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038932_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038932_1

>merge|NZ_CP038932|1|363227-363356|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP038932|1|1|363227-363356|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038932.1|WP_016211271.1|369551_370496_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP038932.1|WP_080664870.1|358806_359454_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP038932.1|WP_016211273.1|367399_368233_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP038932.1|WP_129556444.1|359446_359869_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016211268.1|368348_369533_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP038932.1|WP_075273619.1|366766_367342_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016212008.1|364213_364912_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_032126227.1|363885_364176_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016212010.1|364928_365225_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016211269.1|370800_371586_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP038932.1|WP_054300520.1|362005_362320_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016212359.1|353729_353948_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016211795.1|357929_358124_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_036794771.1|356805_357792_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP038932.1|WP_016212007.1|365348_366494_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016211272.1|371703_372072_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226131
NZ_CP038932.1|WP_016211797.1|360030_361434_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP038932.1|WP_054300271.1|354315_355290_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP038932.1|WP_016212044.1|355828_356083_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP038932.1|WP_075273359.1|361484_362060_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038932.1|WP_054300271.1|354315_355290_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.97286e-78
NZ_CP038932.1|WP_016211272.1|371703_372072_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226131	COG3603, COG3603, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.57105e-07
NZ_CP038932.1|WP_016211273.1|367399_368233_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP038932.1|WP_036794771.1|356805_357792_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP038932.1|WP_016211268.1|368348_369533_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP038932.1|WP_016211797.1|360030_361434_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP038932.1|WP_080664870.1|358806_359454_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06
NZ_CP038932.1|WP_016211271.1|369551_370496_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP038932.1|WP_016212044.1|355828_356083_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP038932.1|WP_016211269.1|370800_371586_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP038932.1|WP_075273359.1|361484_362060_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45

Protein sequences

>NZ_CP038932.1|WP_054300520.1|362005_362320_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP038932.1|WP_075273359.1|361484_362060_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP038932.1|WP_016211797.1|360030_361434_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP038932.1|WP_129556444.1|359446_359869_+|hypothetical-protein
MNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP038932.1|WP_080664870.1|358806_359454_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP038932.1|WP_016211795.1|357929_358124_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP038932.1|WP_036794771.1|356805_357792_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP038932.1|WP_016212044.1|355828_356083_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP038932.1|WP_054300271.1|354315_355290_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038932.1|WP_016212359.1|353729_353948_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP038932.1|WP_032126227.1|363885_364176_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP038932.1|WP_016212008.1|364213_364912_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP038932.1|WP_016212010.1|364928_365225_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP038932.1|WP_016212007.1|365348_366494_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP038932.1|WP_075273619.1|366766_367342_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP038932.1|WP_016211273.1|367399_368233_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP038932.1|WP_016211268.1|368348_369533_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP038932.1|WP_016211271.1|369551_370496_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP038932.1|WP_016211269.1|370800_371586_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP
>NZ_CP038932.1|WP_016211272.1|371703_372072_-|hypothetical-protein
MKIHCLPTHFSVCRFKVGTPLPALKNLSFYSLSSDSEGLRLVLKEQDMPKRIRGVDHGWCALHFTDEDDNSEQCLNLLCSRLNSEQIESFVAPTYEMNFLFVQQHNLEAALDVIEDLEYQWA

Crispr_ID: NZ_CP038932_2

• CRISPR_ID: NZ_CP038932_2
• CRISPR_location: 2640800-2640920
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038932_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP038932_2

>2.1|2640837|47|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038932_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038932_2

>merge|NZ_CP038932|2|2640800-2640920|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP038932|2|2|2640800-2640920|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038932.1|WP_016210672.1|2631034_2632417_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP038932.1|WP_016210677.1|2630427_2631042_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|180312
NZ_CP038932.1|WP_016210673.1|2632425_2632899_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016210935.1|2649490_2650033_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP038932.1|WP_016211756.1|2645519_2646245_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP038932.1|WP_016210943.1|2650029_2650716_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP038932.1|WP_016210944.1|2651377_2652397_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP038932.1|WP_016211905.1|2639566_2639977_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_052047041.1|2639034_2639298_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_098082812.1|2638286_2638802_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_081377344.1|2648032_2649160_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP038932.1|WP_075275117.1|2640220_2640643_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038932.1|WP_016210942.1|2650719_2651331_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP038932.1|WP_081377880.1|2642818_2643298_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP038932.1|WP_016210678.1|2637131_2638142_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270622
NZ_CP038932.1|WP_016210676.1|2634746_2636828_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP038932.1|WP_016211759.1|2646490_2647678_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP038932.1|WP_016210671.1|2633031_2634291_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP038932.1|WP_054300282.1|2642297_2642762_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP038932.1|WP_129556590.1|2644155_2644551_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038932.1|WP_016210672.1|2631034_2632417_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP038932.1|WP_016210677.1|2630427_2631042_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP038932.1|WP_016210935.1|2649490_2650033_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP038932.1|WP_016211756.1|2645519_2646245_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP038932.1|WP_016210943.1|2650029_2650716_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP038932.1|WP_129556590.1|2644155_2644551_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP038932.1|WP_016210944.1|2651377_2652397_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP038932.1|WP_016210942.1|2650719_2651331_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP038932.1|WP_081377880.1|2642818_2643298_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	6.67359e-07
NZ_CP038932.1|WP_016210678.1|2637131_2638142_+|protein-kinase	gnl|CDD|270622	cd00180, PKc, Catalytic domain of Protein Kinases. PKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine or tyrosine residues on protein substrates. PKs make up a large family of serine/threonine kinases (STKs), protein tyrosine kinases (PTKs), and dual-specificity PKs that phosphorylate both serine/threonine and tyrosine residues of target proteins. Majority of protein phosphorylation occurs on serine residues while only 1% occurs on tyrosine residues. Protein phosphorylation is a mechanism by which a wide variety of cellular proteins, such as enzymes and membrane channels, are reversibly regulated in response to certain stimuli. PKs often function as components of signal transduction pathways in which one kinase activates a second kinase, which in turn, may act on other kinases; this sequential action transmits a signal from the cell surface to target proteins, which results in cellular responses. The PK family is one of the largest known protein families with more than 100 homologous yeast enzymes and more than 500 human proteins. A fraction of PK family members are pseudokinases that lack crucial residues for catalytic activity. The mutiplicity of kinases allows for specific regulation according to substrate, tissue distribution, and cellular localization. PKs regulate many cellular processes including proliferation, division, differentiation, motility, survival, metabolism, cell-cycle progression, cytoskeletal rearrangement, immunity, and neuronal functions. Many kinases are implicated in the development of various human diseases including different types of cancer. The PK family is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and actin-fragmin kinase.	5.43866e-14
NZ_CP038932.1|WP_016210676.1|2634746_2636828_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP038932.1|WP_016211759.1|2646490_2647678_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP038932.1|WP_016210671.1|2633031_2634291_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP038932.1|WP_054300282.1|2642297_2642762_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP038932.1|WP_081377344.1|2648032_2649160_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.01965e-11

Protein sequences

>NZ_CP038932.1|WP_075275117.1|2640220_2640643_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP038932.1|WP_016211905.1|2639566_2639977_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP038932.1|WP_052047041.1|2639034_2639298_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP038932.1|WP_098082812.1|2638286_2638802_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP038932.1|WP_016210676.1|2634746_2636828_+|kinase-domain-protein
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>NZ_CP038932.1|WP_016210671.1|2633031_2634291_+|6-phosphofructokinase
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>NZ_CP038932.1|WP_016210673.1|2632425_2632899_-|hypothetical-protein
MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFISQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
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MHIHILGIAGTFMGGVAQLARAKGVTVTGADLNVYPPMSTQLAQAGIAVTAGYDDEFLKLTKRPDCVVIGNALSRGNPAVEATLNENMPYCSGPEWLAREVLHGRHVLAVAGTHGKTTTSSMLTWILEHAGLQPGFLIGGVPKNFGVSARLGQGEYFVVEADEYDSAFFDKRSKFVHYQPKTLVLNNLEYDHADIFDDLQAIMRQFHHLVRTVPSNGKIIVNSIDENLHTVLEMGCWSPRVSVGLQAGDITAEVIQADGSHFEVICHGMRYEVNWSLIGQHNVMNGLAAIGAALQVGVDLKHACEALTLFQGVERRLQVFGQSQGVTVYDDFAHHPTAIATTLEGLRHRVGTEGRVIAVFEPRSNTFKMGVHQDNLAAAFSCADRVYFYQPTGLSWQIADNLKKEEQFNYRVRHSIDELLQALTDDGLKDHDHVVVMSNGSFEQFHQRLLNQLELECENA
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	23888-23925	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038897	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence	30307-30344	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	98297-98334	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	104921-104958	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	74736-74773	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038924	Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence	89480-89517	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038953	Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence	91559-91596	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038958	Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence	45769-45806	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	48741-48778	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	38038-38075	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	78262-78299	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	84886-84923	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	55526-55563	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	69445-69482	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	100110-100147	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	89408-89445	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033938	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence	7974-8011	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033938	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence	11226-11263	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	1087-1124	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	3391-3428	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	24828-24865	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033940	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence	29210-29247	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	13746-13783	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	20370-20407	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	167516-167553	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	4929-4966	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	144791-144828	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033942	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence	158710-158747	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP033943	Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence	75017-75054	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	85712-85749	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	75009-75046	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	103207-103244	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013761	Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence	92504-92541	0	1.0
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP013774	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence	38441-38478	0	1.0
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NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038892	Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence	140900-140937	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038968	Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence	117530-117567	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	91917-91954	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	91919-91956	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	180456-180493	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	140902-140939	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	91919-91956	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	75595-75632	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	120527-120564	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	94958-94995	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	120528-120565	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	76554-76591	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP039033	Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974
NZ_CP038932_1	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	NZ_CP038914	Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence	30949-30986	1	0.974

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45566 : 89679	45	Moraxella_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	136473 : 178470	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	182276 : 239530	56	Escherichia_phage(12.5%)	tail,transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	256927 : 301979	48	Acinetobacter_phage(40.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	329554 : 375109	46	Hokovirus(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	447721 : 555318	103	Escherichia_phage(45.95%)	integrase,transposase,tRNA	attL 512831:512890|attR 545954:546334
DBSCAN-SWA_7	560246 : 604213	47	Escherichia_phage(22.22%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	640174 : 740803	104	Prochlorococcus_phage(17.65%)	transposase,plate,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_9	776233 : 822913	39	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	839600 : 896162	46	Staphylococcus_phage(21.43%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_11	901409 : 964246	58	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(14.29%)	integrase,transposase	attL 895150:895209|attR 940493:941597
DBSCAN-SWA_12	968318 : 1073021	113	uncultured_Mediterranean_phage(10.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1102478 : 1208994	96	uncultured_Mediterranean_phage(22.22%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_14	1245808 : 1340832	90	Bacillus_phage(15.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_15	1345368 : 1398049	48	Klosneuvirus(28.57%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_16	1435121 : 1480312	45	Tupanvirus(28.57%)	integrase,transposase,tRNA	attL 1442917:1442976|attR 1490722:1491076
DBSCAN-SWA_17	1489438 : 1533453	49	Staphylococcus_phage(38.46%)	integrase,transposase,protease	attL 1489401:1489460|attR 1519597:1520623
DBSCAN-SWA_18	1617944 : 1667454	47	Staphylococcus_phage(27.27%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	1682277 : 1849198	151	Staphylococcus_phage(15.38%)	integrase,transposase,tRNA	attL 1728754:1728813|attR 1805742:1806705
DBSCAN-SWA_20	1891888 : 1908255	15	Leptospira_phage(40.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	1953050 : 1994463	45	Acinetobacter_phage(25.0%)	integrase,transposase,protease	attL 1943786:1943845|attR 1990145:1990433
DBSCAN-SWA_22	2047582 : 2099748	52	Orpheovirus(18.18%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_23	2107592 : 2152297	46	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_24	2173487 : 2223233	47	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_25	2229425 : 2274926	52	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2344129 : 2403741	56	Planktothrix_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_27	2490798 : 2575971	87	Escherichia_phage(42.86%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_28	2590789 : 2613657	20	Bacillus_phage(16.67%)	integrase,transposase,tRNA,protease	attL 2588516:2588575|attR 2596757:2597044
DBSCAN-SWA_29	2642297 : 2694930	56	Microbacterium_phage(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_30	2734433 : 2817752	83	unidentified_phage(21.43%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_31	2930314 : 2973712	41	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus(14.29%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_32	3005396 : 3122823	112	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038932|45566:89679|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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>NZ_CP038932|45566:89679|78618_78987_+|WP_016211108.1|DBSCAN-SWA
MKLNYQQLSDLSEYFTNINNDENIEYSVDSNPLGITKKNHELQFTMEESLSKDDLKEHWEKYCRKYNLSFDESLFIETPSSSPNQPEMKQQSFMEDNNIGEEKERNFQQENSFYTTHLTHRS
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211193.1|46651_47413_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211195.1|47714_49241_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49612_50452_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50491_51799_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51773_52943_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|52997_53723_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54001_54391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54550_55456_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274979.1|55722_56562_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377700.1|57346_57640_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.4e-06	36.5
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WP_016210702.1|61135_64198_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
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WP_016210703.1|65614_66568_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66599_67763_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|67768_68368_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210697.1|68555_69056_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
WP_016210706.1|69073_70162_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211099.1|70588_71833_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211097.1|71829_72672_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211096.1|72651_73461_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73639_73867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73867_74818_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74873_75425_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75551_75974_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_016211109.1|75966_76713_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211103.1|76755_77454_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77464_78289_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|78618_78987_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274980.1|78981_80043_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126486.1|80092_80323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211248.1|80452_81667_-	aromatic amino acid transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|81967_83029_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211249.1|83042_84770_+	NAD-dependent malic enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016211245.1|84803_85535_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211247.1|85534_86323_+	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211251.1|86427_87051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273383.1|87738_88311_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046699.1|88515_89088_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274981.1|89082_89679_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038932|136473:178470|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211636.1|140881_142402_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
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WP_016211018.1|143640_144957_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
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WP_155069049.1|145578_148644_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	1.1e-52	20.6
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WP_075273381.1|150508_151078_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|156452_157028_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|156973_157339_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210241.1|158396_159182_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210237.1|161815_162310_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_032126724.1|162401_162659_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|162748_163171_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210247.1|164249_164501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210231.1|165969_167412_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210228.1|168513_170706_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
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WP_016210226.1|171503_171935_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210245.1|171952_172783_-	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210225.1|174222_174501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|175471_176377_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556686.1|176779_177661_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273371.1|177894_178470_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP038932|182276:239530|DBSCAN-SWA
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MFKIQVLHGPNLNLLGLREPDQYGLMNLTELDAELARRAGVAGVALESFQSNVEHELLGMIHQMAHKDHIVDFIIFNPAAFTHTSIALRDALTAVQIPFIEIHLSNVHAREKFRQHSYFSDIAQGVITGLGAHSYFCALEAAIAYCQQAKV
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MAWLELKVITTRQHAELIGDYLNEVGALAITLRDGKDQPILEPGVGETPLWQDVHVIALFDAGIELEPVREQLLVQFDELNDISVKIDPLEDQDWTATWREHFEPMLFADRLWVHADWHEVNARENQVKMLLNPGLAFGTGTHPTTAMCLNWLAGHLNPGSRVIDFGCGSGILAIAALKLGAHYVHCIDIDPQALEAMHYNAKQNELDPSCYQAVLPEQFTISDITSTGADVLVANILANPLIGLAPQFASLVKAGGMLVLSGILVEQAERVQTAYLDHFDLVELQQDDEWVCVIAQRKAY
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MAVIDFVKFLHAELSNLNEMIENDEEVEQSEFLVERLTDVEALYYDFVKSNKTIISSEKEAEETEEEASYYLFATWLYLEQQQRGKIPADEESFNFDNVQTVTEDDERIDNAFFIVGMFEQHLEDMEMLDDEPDLHIEEDDDDDEPRH
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MFSKAKAPLIISISCVIIYFAVLVIQIYSPATFEKNHTEVLIGCEKLGKQAKELCIERVDVMANQSKQATKIKD
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MHSFLISTLTVSTAELGDKTQLLTLLFAARFQKPLPIILAIFIATLLNHGITTWLGVFFSSFFSPIILHSLLMLSFIITAVWALIPDTLDESEPKKTKNKNIFWVVLITFFIAELGDKTQLITLTLSIQYQTIFWVTLGTTLGMMIANIPAVFLGKIWCKKLPLQQIRIASALLFIILASYEAYQLVQLFNS
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MIDMIRLLPSVVKLGLCLFALLICITQEIYAAKSAQNTTGIEQQELPPSADQGVVDTALNKVTPDQSSILESRLKKESAIANNSLGIIFYQPNYVLPYYYTGSPYQAIYNGQTPDNQKVMSSEFKAQLSLMVPLWKDMFGNPDYSLNVGYTQLSYWQFYAKSQYFRETNYEPELFVTDHFHRNWQISYGVVHQSNGRGGSLERSWNRAYLNLEASGEHWLASIKPWVLIFKPDSSDLHNPDIAHYLGHERIMFAYVFNNKMQASIALTNIESGMKRGAVELDYSFPLTKHINGFVQYFNGYGQSLIEYDHRTQSVGIGIALSHW
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MSDETEKTLRHHVEDAVAKFLADSEGCHLTNLYEVILKEVEIPLIETALAFTAGNQSETARMLGINRGTLRKKIRQYSIE
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075273327.1|182276_182852_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274985.1|182797_183163_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|183226_183499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212441.1|183766_183991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372761.1|185006_185456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|185519_186248_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016210779.1|186290_187220_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210775.1|187512_188106_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377589.1|188074_188728_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
WP_016210784.1|188905_189877_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210782.1|189899_190796_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|190954_191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210787.1|191397_192039_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210789.1|192148_192727_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|193202_193640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047085.1|193964_195305_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210785.1|195568_196963_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274986.1|198411_199479_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|199531_199954_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|200194_200638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|200692_200950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200927_201554_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|201631_203614_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|203823_205167_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|205433_208103_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|208126_210046_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|210215_211637_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|211782_212757_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|212788_213184_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|213186_213408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|213571_215233_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|215305_215596_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|215821_216277_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|216341_216806_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216898_218245_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|218244_219150_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|219211_220198_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|220190_220433_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|220554_222099_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|222145_223432_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|223474_224869_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224892_225072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|225068_225644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|225589_225955_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274988.1|226016_228251_-	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228672_229170_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|229340_230036_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|230138_231701_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|232016_233810_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233895_234168_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|234173_234800_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234786_236217_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236549_237605_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237573_238251_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|238240_239077_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|239236_239530_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP038932|256927:301979|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075274991.1|256927_257503_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377888.1|257506_258067_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556436.1|258122_259009_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046701.1|259035_259185_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|259329_259530_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211358.1|259577_260039_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|260462_261944_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|262006_263116_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|263213_265175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|265704_266109_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300237.1|266161_267223_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046702.1|267348_267504_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|270449_271602_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126492.1|340946_341921_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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>NZ_CP038932|447721:555318|529232_529961_-|WP_054300201.1|transposase|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275004.1|447721_448585_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|448801_450361_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|450382_451417_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|451465_452035_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|452170_453142_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
WP_016210645.1|453153_454731_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556624.1|454796_455783_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210646.1|456114_457224_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210650.1|457329_458514_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210649.1|458591_460580_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|460788_460944_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|461201_461501_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461659_461995_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|462911_464318_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|464335_465322_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465324_466479_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466475_467171_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467305_468796_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468816_469866_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469932_471327_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472205_474137_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|474141_474672_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|474706_474901_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|474943_475303_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475722_476718_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476730_479112_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|479117_479405_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|479676_480153_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|480297_480495_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|480619_481594_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|482494_482593_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210477.1|483077_484367_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126626.1|484603_485296_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|485337_486111_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|486112_487054_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|487186_488764_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|488973_490731_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|491279_492038_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|492245_492818_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|492921_493470_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|493771_494017_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|494045_494342_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|494609_495533_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556451.1|496011_496269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275008.1|496332_497061_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.3e-43	41.8
WP_098082828.1|497375_497633_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275009.1|497764_498472_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.3e-44	45.8
WP_075275011.1|498515_499244_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-42	41.4
WP_032126799.1|499435_500248_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_155047058.1|501309_501672_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212146.1|501674_503414_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300501.1|503918_504647_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_016212066.1|505007_505784_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_016212069.1|505995_506163_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212070.1|506137_506737_+	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300500.1|507146_507875_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	42.7
WP_054300501.1|508223_508952_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_032126794.1|508963_509356_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212477.1|509352_509598_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300307.1|510701_511430_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
WP_054300307.1|512036_512765_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
512831:512890	attL	NA	NA	NA	NA
WP_016212268.1|513409_513994_-	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_016212269.1|513997_514681_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|514963_515692_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_052104629.1|516028_517054_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212159.1|517197_517395_-	antirestriction family protein	A0A222Z017	Rhodococcus_phage	4.1e-09	55.7
WP_016212158.1|517662_518577_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275019.1|518686_519391_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.2e-43	44.3
WP_105962625.1|519354_520241_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211714.1|520615_523960_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019196.1|523992_524649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300201.1|524704_525433_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPISYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211244.1|567577_568273_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W5SAS9	Pithovirus	2.7e-10	27.4
WP_036776715.1|568674_569403_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_016211661.1|570226_571183_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
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WP_016210908.1|578521_579337_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|579427_580411_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|580581_581103_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_016210914.1|581136_581388_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-20	58.8
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WP_075275036.1|588058_589120_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|589380_589677_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211493.1|589959_591423_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|591425_592478_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_016211494.1|592467_592923_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016211487.1|592947_593271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|593618_593930_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_032126201.1|594059_594806_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|594827_595889_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|595999_596974_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016212075.1|598181_598379_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126198.1|598624_598825_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212072.1|598854_599052_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|599138_599360_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|599386_599752_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275038.1|599697_600288_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|600425_600590_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|600884_602321_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP038932|640174:740803|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155049805.1|646710_648183_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126187.1|650141_650540_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
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WP_016209506.1|652206_653163_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|653205_653721_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|653825_654758_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|654977_655364_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|655380_656025_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|656205_657045_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|657120_657723_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|657723_658578_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|658934_659246_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|659270_660662_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|660817_661549_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
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WP_016209499.1|662104_662662_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|662667_663648_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|663787_664588_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|664591_665359_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|665355_665820_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|665842_666496_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|666499_666847_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|666880_667132_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|667206_668475_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|668477_669236_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|669297_670188_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|670238_670922_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|671007_671265_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275046.1|671537_673751_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|673742_674615_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|674782_676612_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|676775_677417_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|677658_678189_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|678206_678380_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|678438_679488_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|679494_680445_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|680498_681443_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|681470_682208_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|682296_682539_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|682613_683837_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|683868_684717_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|684713_685766_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|685886_686507_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_016210407.1|686522_687509_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080743011.1|687619_688075_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075275052.1|690957_691467_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|693410_693986_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275054.1|693931_694297_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126651.1|694417_694603_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209899.1|694706_695741_-	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_016209908.1|695737_696448_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_016209923.1|696922_697441_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209901.1|697558_697891_-	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
WP_016209920.1|697920_700875_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209912.1|700920_701418_-|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209922.1|701477_701894_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209915.1|701985_702846_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126652.1|702928_703495_+	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016209918.1|703527_704382_+	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209914.1|704423_707330_+	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|707390_707588_+	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209903.1|707594_708605_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209910.1|708601_709660_+	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_032126655.1|709653_710454_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209913.1|710456_711275_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209907.1|711286_712234_+	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-37	37.9
WP_032126654.1|712241_713543_+	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209906.1|714821_715214_+	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
WP_016209924.1|715225_716602_+	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
WP_016209900.1|716595_718065_+	glycine dehydrogenase subunit 2	M4QFZ1	Prochlorococcus_phage	2.7e-84	41.9
WP_016209916.1|718256_719228_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.7e-34	32.9
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WP_032126800.1|721444_722179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|722303_723365_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210605.1|733024_733906_+	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209374.1|776233_777685_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP038932|839600:896162|DBSCAN-SWA
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MIKVLIVDDHELIRVGIKRLLSDVQGIEVIGEAESGEEALQFIRQSRPDVVLMDVNMPGMGGLEATRRLLRIDQDIQVLAVTVYGGEPYPSRVLQAGAAGYITKGTNIDEMVRAIRKVHVGQRYISPDVAQQLALKHLTDDDTPFDQLSEREMQVMIMITSGQKVQEISDQLCLSPKTVNSYRYRLFEKLNVNSDVELTHLAIRHGMLDPSVPV
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MDFNESLVCRESIHCQDQVVDCDKVQPHLLDVNIESKFQNLLSELQQCSTTVEEENNCYRKFEEFFLKKTNYTLDIRRVLAFFKNTHFPIHTLHQTLLLEAIHFNTVAKLTTFFNPALIDAANSESEDSLCKVLQNQFREATISHLSKLNFSYHPKAFKQLDKIGLGKLSSCIQEVLEKPQRFKSYHLTLKDVSDELQQICKNIQPHLSAQNLSADSNSFLSLFRCFNPKAIDLEACFNQYQLASMQAVFNYAMSEEQSIEQLESQLSQHEIELLSTSNLKINYPDFQSPCARLLSKINIQANQSPSSQLLFTYQQQAETPDFAIAERKTYIPLPK
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MSSALTAQEHNIRTAFINSLEPLLTALGWQGDQRALNENLPHFTEGLDLSSFRQVMLNLRYSCTTMRTQLNKIDNRLLPCLFISDEGRVLIVISVNQFNQYTVFDGAANIQLTLPELVISGMSYFFKAIGAEEELANKGQTPTAKNWFINILGQNKKLMYHTFFISFLLNFLAIATPLFIMSVYDRVISTHSISMLSSFSIGVSIALISIGILYLLRSHILAFISARLDRDIGNAIFEHLLYLSPSYTESATVGAQVARLKDFDNIREFLTGSLVSILFELPFILIFLVIIAILGQWLAIVPIVMGILLFVVGVLIHTKAKAQIKDTAQSNSERQEFLLESLRLMRTIKYTGAQKIWCERYRELSGLATLDNLKNTVITATAQAIADNIMIASGLAILFFGVFMVFNGTLSVGALIAVMILTWKILSPIKTLFTTLPRLEQLIVSIRQINLLMKLELESKPGTISTNEQHHFKGNITFNRVSIRYAPTLDPALIGASFTVQAGQVVGIIGRNGSGKSTILKLIPGLYQPQAGSVLIDNCDIRQINPISLRQAIAYVPQEPQLFYGSIAQNLRLSCSGASDSDLYQAAKEAGVIDDILSLPKQFDSPIRDGAHLASSFQQRLSLARAYLKKAPILLLDEPANGLDYEADQCFIETIKKLRGRTTVILITHRPSHLKLADHVLLLDHGQIIRQGPPDDVLPSVPKDLL
>NZ_CP038932|839600:896162|893477_894053_+|WP_075273327.1|transposase|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP038932|839600:896162|855819_856695_-|WP_016209661.1|DBSCAN-SWA
MAKIIDGKQIAEDVRTTLAKRINQRLGQGLRAPGLAVILIGSDPASEVYVNNKKKACDAVGILSKEYRLSTKTSEQELTTLIQQLNTDPMIDGILIQLPLPNHINSDAILELIHPDKDVDGFHPYNLGRLTQKRPLLRPCTPYGVVTLLKKTLGESLHGLHAVVVGASNLVGRPMSLELLLAGCTVTTCHRFTKDLQTQVGRADILVVAVGKPEFIPGQWIKSGATVIDVGINRLEDGRLVGDVDFNRALEQAAHITPVPGGVGPMTVTTLLENTLYACENLHSTNTSVPK
>NZ_CP038932|839600:896162|884151_885081_-|WP_051307360.1|DBSCAN-SWA
MTLEQWWNSRTPAEKSIVAAIIAGFNLQIIEKNILAAQKAIFLDYLREQLANYNIEVPDLDEEEAEEAADKIQKLLEEEELNLQLEKKPKQSLPAEGFSFSDLEPKTLTAMSREEFHQLLLSPRQIGIIVTVGEILKKEDGFNIFDYQVNNGPKLDAQLTQIAPGTPTPDTPIKIQAQFHCPLRQSIPLEEQEEEKNKQATTLAQLVESVCTMNQAKRCPVRLNVQAEEHEVSPLAQAFICALQQRVLLKQLQHLSFNNQVFDYSHLLPNTTPFQTQQQGAEGYTSSEPELKQEPDQEPEQEQEQKLAL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211687.1|840731_841376_+	UvrY/SirA/GacA family response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_016211685.1|841406_843212_+	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|843235_843811_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556476.1|844355_845366_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273474.1|845461_846436_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_016209640.1|846854_847874_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209649.1|848332_849298_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209646.1|849342_849918_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209651.1|849948_851223_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126159.1|851849_852563_+	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|852642_853380_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|853500_854856_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|855032_855704_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|855819_856695_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|857298_858603_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|858715_859321_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|859402_860704_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|860771_863204_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|863307_863580_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_032126162.1|863683_865561_+	SurA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|865592_866477_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|866485_866881_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|867308_869456_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|869427_870777_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|870773_872894_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|872890_874594_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209654.1|874712_875855_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|875919_876948_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556477.1|877107_878589_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_059372266.1|878678_879164_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275067.1|879496_880564_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|882946_883312_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307360.1|884151_885081_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780074.1|886172_886979_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211514.1|887321_889214_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	1.4e-80	32.9
WP_032126157.1|889500_889905_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923634.1|890109_890658_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|890647_891534_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212436.1|891872_892283_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274918.1|893166_893532_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|893477_894053_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|895187_896162_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP038932|901409:964246|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKVQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MPNIKIPEQERIQRVCDKLNRLASVASKITLKQKSDLDKLLLSIPHNDFTSILSTIKQIWPEPNIEHPRLKIYFLKRFIAKMVDDFATLKKYGHPIDKHSSTDEHFYSELIKLFESIEHVLNDEHRYYYNGADIVITPLLEKKAPEVIWEVATLIKDHVMGKEGDLVIPATDLDSITLKKGWAP
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MTEGEMNEKGVPQNMDHSTNTQLNDNFAFDSLQSIRNRLLDLTGRNRLLNFKHGRSGFIRVIDEMPDQLAENILESYKFTFIPIDEPLREELIEHGYIVIDDDGQEVKVKADPSAKEWAKVKGFNTNYELPLSIKPRDSKHNDTNIQSLLYPRELEAQLRNIRTKANTAIEETGANILYLAFGFLEWFEDENSSVARQAPLYLIPVKIDRASLNKDLGTYNYTIEYTGEDIISNLSLREKLRHDFHLDLPELTEDVLPEEYLKKVESQFLRHKPQWKVKRFSTLSMFDFGKLLMYLDLDPERWPPGANNIQNHSILQKFFAKQGFDDDNGSNTSFGEEYLIDKLDEVHNQYPLIDDADSSQHSALVDAIQGKNLVIEGPPGSGKSQTITNLIAAAISQGKKVLFVAEKMAALQVVKSRLTRAGLGDFCLELHSHKTQKKHVYENIKKRINNQGDYRYPSSIDIDIQMYEEKKEALTHYANLINSTWKSTGRTIHQIFSTATRYREEFANISLDDIKPDHIDGQSFDEISSRRTTDELRKYTDVFDGVKKQLGSVAELSDHPWFGVYNKSIQQFDCDDVCNLLIAWNNTITALEQASKPFNEQLNSVVVSDISSLKQVLADNSNIPKLKGTEHLQALNLITSQKGDELTEYIKQYKATSKLLESLEDLFERTVLNDGESLEHLKKSNNNLQRECKSLELKLTNIFQQLQLLKTFRDVSLSLSDDLKTLTEQDNSLSDLLSPSYNGFLECKQYFEYINALDITLISRRHELFDNELLDPHLANLEELLPKIQLLHKSLEQHFNLENLPTVNELKEIDSIIKNAGVFCWFSSEWRAAKSKLIMYAKGLKPKVKKLAPLIAKLTSYRQLIDQLNKESAYQSLLQHEFKGIDTPISELISLKSWYKDIRASYGVGFGKKVSFANSLFSIDSELFKGLKHLAASKSLAEFEQFSQLFPQLENVFSHPLFDDKNTNLSADVGISSFVDEIENDIKTLQSLSRKDFTLSQLTIGIDQVSSLVNTERLLDENDISRELFDEKTQLSIRSDSRSQLIKIKSTLELSRAIDLLESEPLKYYLLNNFSVEALSLITSHLDNISVSFNSCQQTLQKFAHKVDLDENAWFKGTNGKFTLLQERNNKAISQPRWLSTWVDFIRIRSSLSDKGLENLLRYTETGALNLENIKQIYVYSVFDILAREIINENQELAYFSGADQNAIRKQFQEYDNKLKTLQQEKIAYQVAQAGINSTVSGVSSGMVSSYTEMGLINNEVGKKTRHAPIRQLVRRAGKSLVALKPCFMMGPHSVAQYLAPGQLEFDLVVMDEASQIKPQDALGTIARGKQLVVVGDPKQLPPTSFFDKAVDNDEEDTTAIEQSESILDVSFPMFNARRLRWHYRSRHESLIAFSNQEFYDSNLVVFPSPSSKSDEFGIKFTHVKSGRFVNQHNIEEAKVIAEAVRNHLLHRPHESLGVVAMSSKQREQIERCVEELSKDDPQFRDTLADNANIEEALFLKNLENVQGDERDVIYISCTYGPQEAGAAQMPQRFGPINSAAGGRRLNVLFTRSKKRMHVFSSMTESHIVASETSSPGVQALKSFLIFAQTGKLQQQKHTGKQPDSDFEISVMNALKLEGFNCVPQVGVAGYFIDLAIQDPGQPGRYLMGVECDGATYHSGKSARDRDRLRQSVLERLGWNIKRIWSTDWFKNPQAQLKPIIEVLHQLKTEVTEQTVVHSEVEEIEDVVEHENQVLHELDKFIHTDDSLEAKLQKFAQEVISSTDGIPLANRLLRPAMIAAFCEFKPISKSEFLEVIPPYLRSATSTAHGKYLEQVLNIIAEDEAEIAQ
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MSKEKQLKKIANNIKKIMEHQDPPINKQQLADRSNISYPTLVPILQGVRDFGITKLINIAEALNVSPNEILNKTYTERDTTSKKLSNNIEYYGIFISSADSTYCYFYNKITDETSYFVTEFIISCSLNYIDIIDNIKSTIEKTINSNFKNMAIFCSVQEYEFSKKRELLISYGKKHFNFFAAYPDWKTNYHANFNNESGICIVINDGLSISYKEKNKNQIFKTQGLGFPIADEGGNLWLGWQAIRYAIKVRENLKNRSKLSDKILAVFNFNLYEISEQISNTPNKTYNKAANILKNQYFQECQEAKSIINLGGEKIQEYILEIDNKIEDKLPVCITGDLSYLYQKYIPNDRLALSNKDQEELIRDYAIDVLNKAQKSI
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MSFYNKHVQIITEKTCYSGFLPIKKYQLNHAIFNGTTLKSVEREVMVRRNAVAAIVYDPHEKLVVLLEQFRAGAINDAQTPWLLEIIAGLIEAGENNEDVARREIHEEAGLTNIKNLHLVQSFYTSPGSSSEHVYLFAATAKLKGQAKEAIYGLDSEQEDIKRHIISFNDCFKLLQQGAIRNSIAIIAVQWLQQQVYLNRL
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MLFLCAIGVTVTTYANEKASCQQFLKYGNPGGVDQYLCREGYVVGYNYATKQPRWVAYRLTRSSVSHAFLQKEAFYADDDVPSSFRVILKDYSKSGYSYVQFAPQASMDFNKLSLKQSFLLSNTSPQNKQLSRLAWRKLEKDVRNWTNRYGEVYVYTGPTIDGDHLKKIGNGIFVPTGFFKIIYAPKQEKALAFWVPNKKVAPRKIGLYLTTVKVIEEKTGLRFLSKLNSSSQDHINIAYNKLWPSYN

Homologous phage analysis in the prophage region

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895150:895209	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_129556629.1|927264_928011_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.6e-29	33.0
WP_026063577.1|928237_928531_+	HU family DNA-binding protein	A3E2K9	Sodalis_phage	4.7e-17	52.8
WP_129556482.1|928602_929208_-	NUDIX domain-containing protein	A0A1S6L1P8	Vibrio_phage	1.2e-17	30.9
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WP_051307331.1|933598_935377_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	1.5e-33	30.6
WP_016210542.1|935448_937155_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	2.5e-25	26.9
WP_054300262.1|937146_937437_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|937899_938265_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212461.1|938789_939164_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|939539_940514_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300264.1|940616_940955_-|transposase	IS5/IS1182 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300265.1|941099_941360_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556469.1|941319_941628_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
940493:941597	attR	NA	NA	NA	NA
WP_129556484.1|942129_943590_-	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211426.1|943933_945376_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075273490.1|946358_947651_+	outer membrane transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|947891_948953_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556485.1|949105_951664_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HX51	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	6.3e-73	30.6
WP_032126554.1|951683_952769_-	competence/damage-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016210417.1|953210_953648_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210423.1|953644_954529_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210416.1|954618_955149_+	prokaryotic cytochrome b561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210420.1|955219_956398_-	mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein	Q6A202	Oenococcus_phage	2.0e-50	32.1
WP_016210425.1|956546_960395_-	bifunctional proline dehydrogenase/L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase PutA	NA	NA	NA	NA
WP_016210422.1|960381_961884_-	sodium/proline symporter PutP	NA	NA	NA	NA
WP_016210418.1|962434_963070_+	peroxiredoxin C	NA	NA	NA	NA
WP_081377899.1|963382_964246_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP038932|968318:1073021|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210279.1|1048160_1049327_+	flagellar basal body P-ring protein FlgI	NA	NA	NA	NA
WP_016210277.1|1049380_1050214_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210270.1|1050283_1053271_+	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
WP_016210281.1|1053312_1054704_+	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210269.1|1054717_1055068_-	L,D-transpeptidase catalytic domain protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080664860.1|1055955_1056393_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211367.1|1056548_1057331_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126330.1|1057478_1058438_+	TAXI family TRAP transporter solute-binding subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126331.1|1058492_1060502_+	TRAP transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|1060557_1060845_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126332.1|1061097_1062297_+	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1062943_1063519_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1063464_1063830_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|1063963_1064827_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211589.1|1066711_1067944_-	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	7.4e-96	47.8
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WP_032126329.1|1070294_1070924_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211588.1|1070999_1071701_+	cyclase family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP038932|1102478:1208994|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTGCAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAGTCCAGCGCTATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGTTAAGTGAATGCTCTCACTTGCCTTGGTAAAGGACTTTGCCTGAGTGACGGCTAGAAAGGCGATAATGTTTTTCATTGATTTTAATTATTCCAAAAAGTTATTAATTTTATAAATATAATTCATTTTAGTTATATAGATCAATGTTTTAAATTGAAGAGAACGTTGATAGCCTGATTAATTCTCTCTTGATATTAAGATATTAATTTTAAATATATTTATTTTTTTAAGGATTATTCTATGATATTTATAGCTTAATTGTTGCTGGTATTTTTACAGGAATCCTTTCTGGTTGGATTGGCGCCGGCGGTGGTATTATTATTGTGCCAGTAATGCTCTGGTTGACCGCACAACAAGGAGTGAGTGCAACGCTTAGTATGCACTTGGCAGTAACAACATCACTCGGTTTTATTATGGTTAATTCATTGTATACGACTTTTCACCATCACCGGAGTCATAATTTGGTGGTTTCTTTATTTAAACGCATTGTTATATTTACAATCATTGGTGCATTAATTGGTGGTCAACTTGATAAAGTTATTCTCGTTTTTTTTGTAAAAACATTATTTATAATAGTTATTATTAGCGTTTTAATTCAGAGTTTTTTTAATCGTATAAGTCAAGCAGGGCAGCGGAGAACTCAGCCGACTTATCCTAGTTTTTTATCACGAGCAATACTTGGATTTTCTGTTGGTATTCTGTCTTCTTTAGTTGGGATTGGTGGCTCAGCGATGACTAATCCGTACATGCAATACCATCGTTATCCCATGAAAAAAGCGCAGCGATGTCAACGGCATTGGCATTTCCCATGGGTTTGTTTGCACTGACCAGCTTGCTGGTTGCAAGTGCTGGTATGGCAGGATTACCCTCTGGGAGCGTTGGGTATTTGTATCTTCCTGCATTGATTGGTTTATTAATAGGTTCGTTCTTAGGTTCACCTCTAGGCGTGTGGATGGTCAAGCGCGTTTCAGAGCAAACGTCGGTTTGGCTATTTCGTATTGTATTATTGGCGGTAATTATGCAGATGATTCATTAACTAAAACTAATCTTTACTCAGGGAATATATTATGAATGATGATGTTGCAAGCGCTCGAGCCAGGTATTAAATTCAAAACGTTCAAATAGTGTTACAAGTTGATGGATATTGATGCTTTTTCTTTTTAAATCGCTAAGTGTATAAGGAAGCTCCAGGTCACGATAAATGGTGACTAAGCGCTGGCTTAATTGCAGTTGCTTGATGCTGCTGCGTAAATTTTCGCCGACTTTGCCCTTAATTTGATCCGCCTGTTGAATGACGGTCTCAAGGTTATGATATTGGGCAAGCCAACGCTGAGCCGTTTTAGGGCCGACTTTATCAATGCCAGGGACATCATCGACTTTATCACCAATGAGGGCAAGATAGTCAGGAATTTGTTCGGGGCGTAAACCAAAGCGTTTTTCAACACATTCTGGGGTAGTTAACGTGCCTTTCATGGTATCGAGTAGCGAGATATACGGGGTGATCAGTTGCGCCATATCTTTATCACTACTGGCAATTAATGTCGCCTGCTTGGCTTGATGAGCTTGGGTGGCCAGAGTGCCGATAATATCATCTGCTTCGATGCCGGGAATACTCAGGCGAGGAATGCCGAGGGCGTCTATGCATTCACGAATGAGGGGAATTTGGATTTTTAACTCTTCTGGCATGGGCGGCCGGCTGGACTTATAGGCGGGGTAAATATGGTGGCGTAGCGTTTTGCCCGCAGGGTCTAGCACTACCAGCATGTGTTTGGGTTTATAGGTTTTTAATAATTTACGTAACAGTGAAATTGTGCCGTAAATTGCGGCAGTGGGTTCACCTGCATGGTTATGGCGCGCTGGAATGCCATGAAAAGCACGGTAGATAAAGGAGGAGCCATCAACAAGTAACAAGGGAGGTTGCTTGTGTTTACGCTTAAGCTTGTGCTCTTTATAAGGGTGACGGTTGCTGATCGCTGCTGCGGCCATCCGGTCACAGCGTTCATTGTAGAGGTTGCCATCATGGCCTTTGACCCAGTGCCACTGAATGGGGTGGGTATGCTCATGGAGTAATTGATCGAGCTGCTGCCAGAGATCTTGATTGGCAATACTCTCGCCAAAGGCATTGCACCAATTTTGTCGGCGCCATTTTTTAAGCCAGTTTTGTGCGCCTTGAATCAGATACATCGAATCTGTATAGAGGCGAATGTGGCTGGTTTTGGGCGCGTATGCGAGCGCTTTAATTGCGGCGGTAATTTCCATGCGGTTATTGGTTGAATGAGTAACAAAGCCAGACAATTCAATTTCCTGATCATGGTTAAGCACTAAGGTGGCCCAGCCGCCTAAACCGCTTTGTGGTTGGCAGCTGCCATCGGTATAAATATCGTACTGCATATTATAACTATATTGAGCTAGGTTAAATTAAAAGCTTAGTTTTAATTTAACAAGGTTAAGGTGGAGTCGGAGTAGAGGCTAAGGACTGATAGACCGCAGTGATAATAAAATCAGCATATTGTCTGTGAAATTCTTCGGTCATCTCGTCTTTATTAAACCAAGCACCATATAGGCTGGTAAACAGTGATGAGGCATTGGTGAAAATATAAAATAACAGTTGAGACGCTGTGTAATTTATATAACGGGGATGGATTTTACCCGCGTTTTTAAATTGGGTAATGCAATCGAGTATTGTTATTATCATCGGGCTACTATCTTCTAATAGAGGCTTGTCATCGTTGAATTCGAGGCGTTGCCAAAGCAGCATGCGCCCCATATCTGGGTTATGTTTATAAATATTAAAGCGGATCGTGATAATGGTTTTAATAAAGTCATATAAAGTAAGTGACTGTAGTTGTGTGTTTGGGGGGCTTTCTTTAGACAAGTCAGGGGCGATAAGTTCTTTTTTTACCTTACACCATAAATCATGTTTATTAGTAAAATGATGGTAGATTAAGCTTTGGTTAATATTGGCTTTTTTTGCAATCATGCTGATTGATGTACCAGCAAAGCCATGGCTGGCAAACAGCTTCTGTGCAGCTTGTAGGATATTAGAGCGTGTTATATCTGCACTGGGGCGTTGTTTTTTTGTGGCTGTGGTCATTATGCTTTTATTATGGGTTGTTCTATCTATTAAGTCGTTAAATTATCATACTTGCCTTGATCCATTGCTGGCAAGTGCTTTTAGTTAATCTAGAACGCTTGTTTGCTCATTGTTGAGTTTAGGGAAAATCTTAGCTTTAAGCTACAATAAGGCCAATTTTGAATTAAAGTTTGAATTAACGTTGGAGTTATTATGCCGCTTTTAACCTTACGCGAGGTGT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209947.1|1158243_1158906_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209926.1|1165345_1166407_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
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WP_016209932.1|1167440_1168481_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209936.1|1168663_1169779_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-93	48.6
WP_016209930.1|1169817_1170171_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_032126634.1|1170191_1172060_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1172081_1173026_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1173259_1173538_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1173747_1174386_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069063.1|1174360_1175788_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	1.9e-42	30.0
WP_016209927.1|1175988_1176666_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1176800_1178075_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1178142_1178898_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1178949_1179867_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274822.1|1182327_1183302_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_016211771.1|1183594_1183783_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1183796_1184930_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274823.1|1185129_1189140_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211422.1|1296898_1297369_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
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WP_081007040.1|1340175_1340832_+|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP038932|1345368:1398049|DBSCAN-SWA
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MSHYMQHINIKVKIALIITIILWSSAFISIRIGLEAYTPGPLALLRYLVASLCMLFFYLRLKKRSTLTFFDYGRAITCGILGFGVYNVALNMGEVTTNAAISSFIISQVPLITVLCASYFLKEKLSLTNKLGLLISFIGICVILSSQYSGTTFNYGLIDVIIATLAMSLYNILQKPLLQRMSAIEFTSIAMWSGTAMMLIFTPDLMYEIQQAPIWITINVIYMGIFPAAIAYFLWSYALSKVPTCYAAFYFYCIPLITTMMSIALLGETLSTIGFLGGLIALFGVVVAQRKNKTEKEQKSQTTLTTTQVSMAKEPS
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MKKTILTLTFIQFILLFKFLYATTLTCPDASTLHWQDSAWQAPQGWSLINDPAFSPTIKFATVQYGAKYHKAGEAFNGSVQCYYELTSGSLLMLKLTSKLAFNLPPPGGAGWRMNIVYPPLNKNPGYLSGYCGSYNQTLAKSCILAKNREIYS
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MEIAQMDCHSYIQRKLENNILTLQINRPDKKNAINQQMYQTLVTELDIASQDDTIKAILFTGTAETFTSGNDLNDFAKLRSAEDLKDVVNFLHRISTHKKPLIAAVNGLAIGIGTTLLLHCDLAFSTTESHFQLPFIHLGLCPEGASSVLLVQAAGYKKAAELLMTGKAFTGQEALEMNIINQLFPKETLLEKTHEYLDILAQQPAQALQITKQLLKRPQAQTITEAIEVECTHFINQLQNKETQTIIKNKLTPVKK
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MTQQQMNKINQACKKVDEKVAAEYAERGLKFISDRQGDLGGGHFSNVYPLKVKAGTNKEIFGSTHYSP
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>NZ_CP038932|1345368:1398049|1369516_1370092_-|WP_129556501.1|transposase|DBSCAN-SWA
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTEPYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKETIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP038932|1345368:1398049|1386150_1386345_+|WP_016209841.1|DBSCAN-SWA
MQKFMPCEEDDDFFGLSSNHHQLLQASFAFTESIQLNQPALFFDQKRAQKEALRAVLSCEGTIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|1345889_1346255_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126565.1|1346465_1346738_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211013.1|1347055_1349422_+	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211011.1|1349482_1350679_+	acetyl-CoA C-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211010.1|1350957_1353387_+	acyl-CoA dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211008.1|1353479_1354982_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211012.1|1355090_1355663_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273571.1|1355812_1356490_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556502.1|1356598_1357162_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210926.1|1357421_1358891_+	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_016210918.1|1358975_1359725_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210930.1|1359728_1360502_-	enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210927.1|1360562_1361513_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210917.1|1361637_1363080_+	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	5.4e-21	24.5
WP_032126561.1|1363293_1364478_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016210925.1|1364601_1365288_+	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.7e-29	36.5
WP_016210921.1|1365379_1365964_+	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
WP_155046724.1|1366188_1366356_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210929.1|1366352_1366709_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210928.1|1366743_1367049_-|transposase	ISAs1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300375.1|1367263_1367464_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728346.1|1368270_1368603_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372539.1|1368620_1369484_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556501.1|1369516_1370092_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1370037_1370403_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211651.1|1370636_1372172_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|1372296_1373781_+	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_016211648.1|1374440_1374980_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126643.1|1376183_1376390_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126642.1|1376459_1376921_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126641.1|1376956_1379527_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_016209840.1|1379634_1380120_+	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_016209844.1|1380292_1381333_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209835.1|1381310_1381793_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209848.1|1381789_1384384_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209832.1|1384690_1384954_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209831.1|1385232_1385931_-	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1386150_1386345_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1386420_1387980_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1388298_1389195_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1389411_1390887_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1391409_1392432_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209830.1|1392762_1394130_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1394365_1394620_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1394635_1395922_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209836.1|1395941_1397156_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_016209838.1|1397155_1398049_+|protease	protease modulator HflC	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP038932|1435121:1480312|DBSCAN-SWA
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MSLFGQLIGTVGMALVVIAYFLVVSQRVTPGSLPFSVINLIGAILLLISLCIHFNLGSFIIEIFWILISLYGIVKWCLQKALRNQRKKVE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211285.1|1435121_1435901_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_016211286.1|1435918_1436266_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|1436377_1436650_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211767.1|1437978_1438788_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211764.1|1439338_1440160_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126803.1|1440360_1441593_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_081377862.1|1442079_1442916_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3
1442917:1442976	attL	NA	NA	NA	NA
WP_032126239.1|1442927_1443200_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211806.1|1443989_1444715_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211805.1|1444757_1446296_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211804.1|1446302_1447688_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	2.5e-47	32.1
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WP_016212498.1|1450365_1451049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAGTAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGGTAACCCTCCCTTAAAATGAGACAACTCATAACTGGAATCTTCTGTTAACATTTTCAAACAGGAGAGCATATGAAAAAGAGCAAATTAAGTGAATCAAAAATCGTAGAGTTGCTTAAGCGTGTTGAGGCTGGAGCAGATATAGAAACCACAGCAAGAGACTACGGAATCTCAACTAGCACGTATTACACCTTAAAAGAACGTTATGGGGCAATGGATATCTCTCAGCTAAAAAGGCTAAAACAATTAGAGAAAGAGAACCAGCAACTTAAGAGAATGTATGCTGATTCTCAAATAGAAATTGAGGCTTTGAAAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATAATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACATCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTAGGTAACCCTCCCTTAAAATGAGACAACTCATAACTGGAATCTTCTGTTAACATTTTCAAACAGGAGAGCATATGAAAAAGAGCAAATTAAGTGAATCAAAAATCGTAGAGTTGCTTAAGCGTGTTGAGGCTGGAGCAGATATAGAAACCACAGCAAGAGACTACGGAATCTCAACTAGCACGTATTACACCTTAAAAGAACGTTATGGGGCAATGGATATCTCTCAGCTAAAAAGGCTAAAACAATTAGAGAAAGAGAACCAGCAACTTAAGAGAATGTATGCTGATTCTCAAATAGAAATTGAGGCTTTGAAAGATGTTGTGGAAAAAAAGCTACCGATATAGAGGATAAACGAATGCTCGCTACTTACCTCAAAGATGAACATAAGCTAAGCCTCGTGGTTGCTTGTAATTTAGTCACTCTTCCAAGAGCAAGCTATTACCGAAAAAAACAGCATCAATCTGATAATGCTGAAATAATTTCAGAGCTAAAGACGTTAGCGAGCAAACACAAACGCTGGGGTTGCGACAAAATGGTCGCATATTTAAAAAACAAAGGTAAGCCTTGGAACCATAAGCGCATTCGTCGAGTCTATATTGAAATGGGCTTAAACATAAGCTGTAAACCAAAGCATCACTACGTCAAAAACGAGCCTGAATATTTATTTCAGCCTATCTACAAAAATGTTTGTTGGTCATTAGATTTTATGAGTGACGCCCTTCTGAGCGGTACGAAATTTAGAACGATGAACCTCATTGATGATTACAACCGTAAGGCTTTAGGCATCGCTATCGATTTTTCAATGCCTGCTGTTTTTGTCACATCCAAACTTGATGAGTGGTGCAAAGTGCATGGCTACCCTGAAATGCTGCGGACTGACAATGGGCCTGAATTCATTTCTTCCCATTTCCAAGAATGGGCTGAAGGGCATGGAATTCAACTGCGTCGGATACAACCAGGAAAACCTGCTCAAAATGGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAGTTATATTGAACGATTTAACCGCACTTATCGTGGTGATATTTTAGATTGCAATCAATTTACTTCATTGCAGCAAGTTCAGAAACTTAGCGATGACTGGATCGTTGAATATAATACGATCAGACCACATCAATCTTTAAAGAATCTTTCACCAGACACATTTGCTGAGAAACGTGAAAAACAGTTAGAAAAAATTTCGACAAAAACAGAGGGATAATTCCAGTTTTAAACTGTCTCACTTATGGGGGGTTGACAAAAGTATAGTCAAATTTAATAGCGCTAAAATGAAATAACGAGACTATGAACCTTCATAATCCCTAGTCAACTTAACAACTATAGGTGCTAACAATATTAAAGCAATCAGATTAGGAATAGCCATCAACGCATTTAAAATATCTGCAACTAGCCACAATAAATTTAGATTAGCGACAGCACCTAAAACAATCACAATTACCCATAGAATACGATAGGGAATAATGATTTTAGTACCAAATAAATAGCTCGCACAGCGTTCCCCATAATAACTCCAACCAAGCAAAGTAGTGAAAGCAAAAATAACGAGTCCCACCGTAACAACCAAGCCACCGCCATTAAAAGCAACCTGAAAAGCATCTGAAGAAAGCGCAGCCCCTGTCTCGCCAGATGTCCATAACCCACTTAATAAGATAACAAAGGCAGTAATACTACAAAGAATCATTGTATCAAAAAAGGTCCCGGTCATTGCGATTAATCCCTGGCGAACTGGGCTATTTGTTTTTGCTGCTGCATGAGCAATCGGTGCTGTGCCTAAACCCGCCTCATTTGAAAAAACACCGCGCGCAACACCAAAGCGAATCGCAGCCATTATCGTTGCACCAGCAAACCCTCCTGCTGCTGCTGCGCCACTAAACGCACTATTAATAATCAACATAAATACACTGGATAGGTGGTGAATATTAAGCCCAATAACAACCAGGCCGCCGATAATATAAAAAACAGCCATAATAGGAACCAAATAGCTAGTCACACGCCCAATCCAACGAATTCCTCCGAACAGTACTAAGCCCACCAAAACAGCACTGACTCCACCGACTAACCAAGGTGAAATACCAAAGTGATTATTTAATACGTGCGCCATCGAGTTACTTTGAACACTGTTGCCTATACCAAACGCTGCAATCGTTCCAAAAATAGCAAAGGCAACCCCTAAGCCTCGCCAGCGAGAGCCTAACCCATTTTTAATGTAATACATTGGACCACCAACGAAATTACCATTCGCATCCGTTTCCCGATATTTTACGGCAAGAACGGCTTCAGCATACTTTGTCACCATACCAATTAGTGCGGTCATCCACATCCAAAAAACAGCACCTGGCCCTCCTAAGACAATTGCAGTTGCAACGCCTGCAATATTTCCTGTACCTACCGTTGCAGCCATTGCTGTAGTCAATGCTTTAAAGCCACTGATTTCTCCTTTTGCTTGTTTTGAGTCTTTTTTAACAATTAGTTTAAGTGCTACACCCAGTTTTCTAAGCTGCAATAACCGTAAGCGTATCGTTAAATAAAGACCACAACCTAAAAGCAAAATCAGCATAACCGGGCCCCAAACAAAGCCACTTAATGCATTTAAAAATGATGCTATTTCCATATTAAAACTCACTCCTTGATTTACCTCTTTACTAGTGTAACAAAAAAGGCATAAGTAAAAGCAAGAGAAAAAATATTTTGGCTCGATTAATTATTTTTATAAACCTTTTAATAAAGTTAGGTTTAAGCATAATAGCTAGTCATAGCTCTACATGATTATTTCAAATAAAGGCAAC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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP038932|1617944:1667454|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209785.1|1650307_1652251_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A1U9WQS3	Geobacillus_phage	1.1e-05	23.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP038932|1682277:1849198|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211857.1|1686636_1687515_+	endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211855.1|1687511_1687979_-	bacterioferritin	NA	NA	NA	NA
WP_016211856.1|1688105_1688291_-	(2Fe-2S)-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1688506_1689481_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556640.1|1689747_1690974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211351.1|1691049_1691388_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit IV	NA	NA	NA	NA
WP_032127067.1|1691384_1691987_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III	NA	NA	NA	NA
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1805742:1806705	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_075274878.1|1848322_1849198_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP038932|1891888:1908255|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212246.1|1904450_1905107_-	AT hook motif family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300162.1|1907172_1908255_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP038932|1953050:1994463|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

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MTTILITNATIINEGQKTEADLFIKNGRIEHIDSDLSHKPAKQVIDAKNKWLIPGMIDDQVHFREPGLTHKGEMRTESRAAAAGGITSVMEMPNVSPPTTTIQALRDKFNHAANRFSTNYSFYLGTTNDNLEQIKQLNPNEACGVKVFMGASTGNMLVDDPKILDALFKSCPTLLATHCENTPMILANEQKYREQFGEEVPIGCHPAIRSEAACYASSSLAVDLAKRHDTRLHVLHLTTAKELELFTQGNHNKKRITAEACVHHLFFNDNDYDTLGTLIKCNPAIKTENDRLSILNAINDDLIDVIATDHAPHTWQEKQNSYFNAPSGLPLVQHALLSLLEHQKRGIFSIESIVKKTSHAVADIYQIKERGYIREGYHADITLIDPNTPHEVSTDNILYKCAWSPFNGYKFNHSIMSTIINGKLVYHHGQFYEENVGVPLEFDR
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MEYDYQSIQHSFLWQRLREGGLILLVAIGVFLCIALVTFDVADPGWLSSGMNATTIANAGGRVGAWCADVLFGLLGYFAYTIPLFIFYAVYRLYRDLRATFDPPLFILRVAGGLIALLSGSALLALFVAPAHSVLPQGAGGILGMLVGKGVMSAFNLTGATVLLITAFLIAMTLYSGISWIRLVLGLKAMIAYGVSALRDNLQLQMARLESFRAERLLKRQQAKQEKMALKAAAKEKKNTAKISGGDKNQQGSRKTPLLPVLRKEKAINSPMIDNCSIENVYTESDQGDKNEKDELEQAHFDFAVRSELQGKVSSAEQPVTLSQSKAKTKVKAEIIERGPLDLPDLALLDEGNQDKKDLYSAAALEEMSRLVEGRLADFGVQAEVVDVCPGPVVTRYELELSPGIKASRVSNLAQDLARSLLARSVRVVEVIPGKSTIGVEIPNAKRELVRFREVLEADVFQQASSSLVLALGRDIAGEVVVADLARMPHLLVAGTTGSGKSVGMNAMVLSLLYRATPADVRMVMIDPKMLELSVYEGIPHLLTPVVTDMKEAASALRWCVGEMERRYRLLAALGVRNIKGYNDKVIAAQKAGTPLVNPLKIKAEGAEPELLAKLPFIVVFIDEFADMMMIVGKKVEELIARIAQKARAAGIHLVLATQRPSVDVVTGLIKANIPTRMAFQVSSKIDSRTIIDQAGAEQLLGHGDMLYLPPGSGVPTRVHGAFIDDHEVHAVVRQLKTQGVPDYIADLIDHGSGLDDYGQQAGEENAEEQDELYDQAVEFIIDQQKVSASLIQRRFRIGYNRASRLVETMEAAGLVSDGQHGPREVLVSSQEGV
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MSDEVKRKTELNLGELLQRARCNKNLTREQAARQLHIQPQILMLFEHNDFKQFNLPEHFIIEYLTNYASLLDLDAKAVAAIYRQGGVVDLAAAPVDKKPVTDLSVGVKSAVNHQRNNTINEKSDVKSPTRTPSESALSIANKKNLKQSERPKLSAHKSQHTERLLSPHEKISAHCQEQSFEGLAMQSEVRKTDSARKGRSALSWGMNLLILIIVITVAFLWYKNQISQLSPAAAVSSKKINQAANQLAPFAKPSLAEQQAAEEAQLEQRLHSNEAMAAQYKILKVPPQAQEQEQS
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MIYLDYAATTPVDPEVIQAMQECLGLEGDFANPSSLHRLGWLAAEKIKHARGQIARLVGADSKAIIFTSGATEANNLAIKGVCEAYQKRGRHIITSKAEHKSVLDVFAVLEKQGFEVTYLTPNKQGLIDPEILQTAMHEQTILVSLMHVNNELGVAHDLVALGTIVKAHGAIFHVDAVQALGKLPIDLAELPVDLMSFSAHKCYGPKGVGTLFVRRRPKVRLHAQQHGGGHELGLRSGTLATHQIVGFGRACELAEEKLNEEPQRVMALRDRLWQGLSQYDQVYWNGQGALTQAPGILSVSFAGVDGESLLACLPELAVSQGSACNSTTVEISHVLAAIGMPAERAHSTLRFSLGRYSTLAEVDQVIEQVGRALTHLRKLSPTWQVQQAGADPALLPWGRYVE
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MINNRVDGTREIKANTGVKKQAKSWQTEAALRMLANNLDAAVAENPVELVVYGGIGRAARNWLCFDKIVETLKRLENNETLLIQSGKPVGVFKTHEYAPRVIIANSNLVPAWSSWETFNKLDQKGLMMYGQMTAGSWIYIGSQGIVQGTYETFVNAAKKHYQGKILGRWILTAGLGGMGGAQPLAATMAGASLLAIECDPGRIEKRLGSGYLDIKTENLNEALTLIERACKEKKALSVGLLGNAAEVLPELVKRGVQPDFVTDQTSAHDPLNGYLPMGWSLAQAQKMRVENPEQVVKAAKESMAVHVKAMLEFHKLGIPTFDYGNNLQQMALEAGVSDAFAFPGFVPAYIRPLFCEGIGPFRWVALSGDPEDIYKTDEKVKALLPDNTHLHQWLDMAREKIQFQGLPARICWVGLKERMRLGLAFNDMVKSGELSAPIVIGRDHLDAGSVASPNRETEGMQDGSDAVSDWPLLNALLNTASGATWVSLHHGGGVGMGFSQHAGMVVVADGSDRAYKSLSKVLWNDPATGVMRHADAGYQQALACARAQSLDLPMMNMNNKNYQGRD
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMTIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSIVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDDRVVLPEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNKLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAGLAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTS
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MKHSSAFLTLVEQARSSVSEISIENVCDYINEHVDFQLIDVRESDEVSVGKIKGARVLSKGIIERDIERLIPDVNTHIVLYCGGGYRSALAAENLQRMGYLHVESMIGGFKAWQQAHYETESTG
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MSERKHFNLLILGSGPAGYTAAVYAARANLKPVIITGMQQGGQLTTTTDVDNWPGDDQGVQGPELMERMQKHAERFGTDVIFDHIQSVDLKQRPLLLNGDFGQYSCDALIICTGASAKYLGLASEEAYKGRGVSACATCDGFFYRDQDVVVIGGGNTAVEEALYLSNIAKTVTLVHRRDSLRAEKILIDKLMAKTEGGNVTIEWNATLDEVLGNEQGVTGVRLKHMQDQSTKELATNGVFIAIGHTPNTAIFQDQLDMESGYITIKGGLSGNATATSTPGVFAAGDVADSIYRQAVTSAGTGCMAALDAERYLDEFKH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209424.1|2047582_2048860_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|2048959_2049334_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|2049418_2050306_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|2050363_2051092_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_129556555.1|2051088_2052219_-	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|2052349_2052778_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|2052872_2053232_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209447.1|2053221_2054433_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2054429_2055218_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2055380_2056175_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2056380_2057355_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155046761.1|2057781_2057955_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274901.1|2058099_2059113_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|2059116_2059416_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2059405_2059570_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|2059626_2059992_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2060331_2061072_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2061075_2063580_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2063842_2064799_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2064782_2065544_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274903.1|2065621_2066497_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2066621_2066867_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2066926_2069200_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2069254_2069608_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2069797_2070091_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|2070263_2070443_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|2070518_2071094_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2071376_2072693_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2072703_2073072_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2073102_2073765_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2073939_2074305_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2074250_2074826_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2074993_2075713_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2075692_2076508_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2076524_2078726_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2078808_2080158_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2080232_2080832_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2080815_2081025_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211931.1|2081342_2082530_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2082725_2084015_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300152.1|2084425_2084791_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|2086427_2087183_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210562.1|2087256_2088909_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300273.1|2088937_2090476_-	histidine ammonia-lyase	A0A1V0S940	Catovirus	5.1e-70	37.2
WP_016210560.1|2090475_2092176_-	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_081007068.1|2092264_2093440_-	imidazolonepropionase	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|2093478_2094441_-	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|2094801_2095224_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210568.1|2095529_2096171_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210561.1|2096298_2097633_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_032126397.1|2097747_2098338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2098686_2099748_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP038932|2107592:2152297|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126170.1|2108649_2108922_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|2109149_2110361_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211037.1|2110711_2111341_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_016211042.1|2111389_2112406_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
WP_016211035.1|2112652_2112868_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_016211043.1|2112920_2113370_+	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
WP_016211039.1|2113449_2115195_+	DNA primase	A0A1S5RGL3	Helicobacter_phage	2.6e-46	37.1
WP_016211036.1|2115286_2117158_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.7e-33	30.7
WP_054300271.1|2117505_2118480_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211094.1|2118499_2118823_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211091.1|2119887_2122368_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211092.1|2122411_2123704_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211519.1|2127851_2128271_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

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CATGATAGAACATTTAAATACAGCCCTTATTCTGGTGATTCCCATCCTAACTGCAATTATCTTCCATGAAATCGGCCATGGCTATATGGCAAAACTCTTGGGTGATCCAACGGCTGCTCAACAAGGGCGTTTAAGCTTGAATCCCTTTGCTCACATCGACCCTGTCGGTACCATATTAGTTCCAGTGCTACTTTACCTAGCCGGTGGTTTTATTTTTGGCTGGGCAAAGCCTGTACCAGTCAATTACAGCCAGCTATATTCCCCACGGCGTGACAGTGCCTTAGTCGCCATCGCAGGTCCTGCCATAAACTTTATCTTTCTTTTTATCTGGTCTGCTTTATTTGCAATAACAAGAGCACACTCCCCTGTACTCTACGCAATGAGTCTTGTAGGCATTCAAATTAATATTATTTTAATCGCTTTAAACTTATTGCCGATCCCACCTTTGGATGGCAGCCATGTTATCAGCAGTCTTCTGCCAACTCAACTTGCTTACTATTATGAACGCCTTTCTTTTCTTGGCTTTACTCTCATCATTTTGCTCGTTGCTTCAGGAATTTTTGGCCAGTACCTTCAGCCATTATTAACCGATGGCACTCAATTTTTCTCCCAACTCTTTATATAAAGATATATAAAAAACAGAGGGTCTTTTATATATTACCGACCATATTCTCATCATCATACCTTACAAAATTAAGACATTAAGCGTACAAGTCAACACGAGCAATCTGGCTCACGCCATGCTCTTGCTCTTTTTCTTTATTAGATACACACTGTTGATATGCTGCGACAGCACGCTCTGAATGAAGGTTAGGCTGAACTTGCCAATATTGATAATTTGCATAGTTCTCATGTTGTTGATGATTATCTTGCCTTTGCTTTTGAACCGAAGTAACTACCACTCCACGCACCTGAGTAGCAGAAGTCTGCACTACTGGAAAATAAGATGAGTGGGCAAGCCCAAGCACAGACATAAACATCCCTTTTTAGATTCTTAACTTTAAGCTAAGTACAATAAAATTTTAAAGTCAAATTTCACTAATTTAAAACAAGCATTTCGTTGATTTTTTAGCAATATTATCACGCAAGTAAACAGGCAGAGCATCTTCTAATGCAATCGTTTTTCCCTGTACCCATAAACTAGATGCTATTGGCAAAATATCCATCGCATGAGGCAGTGCATCATTAACCACGTTTATCAAAATATGACCTAACCGTTCATTAAGTACTTGCGAGTAACTTGCAAAGCCAGTACCAGCGCCATACCATTGCCTTGTTTCATCTATAGGCAACTCAATATGATCAGGCACACACACTCTCTCTATAATCAATTCTTGAGCACACTGCTTTTGATCAATTTCAAATCCGGCATAATACACCTCACCCATACGTGCATCAATTGCGGTGATCACTTTCCTCGAGCCATATTGGCGATAAGCTCCTTGCGCCAAAACTTTTAATGTGGATACTGAAATAAGCGGTACCTCTGCACCTAATGCTAAACCTTGCGCAAGACCACACGCAATGCGCACACCTGTAAAGGCGCCTGGACCGCGACCAAAAGCAACCGCATCTAACTCTTTGGCTTGAATACCTACCTGCGCTAAAATCTCTTTAATCATAGGTAATACCAACTCAGTATGTTGGCGTGGGGCGATACGGTGATCTACGATCACCTCATTATCTATTTGTAAAGCAACGGAACATGCTTCAGTTGCTGTTTCTAAGGCTAAGATTTTCATTATTCTTCCACCCGACTTTGCCACTCAATATCAAAATAACCGCCCTTATTCTAGCGTATAAAAAAAAGCCTGCAACTGCAGGCTGTTTCACTCTCGAAGATCTATAAATAAACAATACATAATGTACAAGTTACTGCAATTAGTATTTAGAATGTATATCTAACTCCAGCAAACACACTATCAATGCTAGGCACACCTTGGGTTGTCCCATTATCCATATCTTCACCAAAGACATGCTGATACGTTAAATTCACCTGCAAAGCCGGTGTTAGATTATAGCCCCCACCTAAGCCTGCCAACACTTTGGTGCCCGTATCACCGATTGCATCACCGGAAAGCTTTTGACGCATCAAACCTGCTTTTGCAAACACATCAAACTGTGAGTTAATATGCCATGTTGGCACAACAACAACATCTATTCCTGTTGACTTGTAATCTTTATCAACTCCACCAACCTTAAAGCTAGTCTTGCCATAATAGCCATAACCTAGCTCTGCACCCAAACCAAACATATCGTTAATATCATAATTATAACCGACAGCAACACGGCCACCGATTTTATTACGGTCTTTATCTGTACCACCAGATAAACCTAATTTACGCTGTAAGGTATAACCTGCTTGACCTTCAACATATACACCCGTTTGCGCAAAAGCGACTGCAGTTGCACCCATGCAACCGATAACAGCAGCAGCAAGCAATGTTTTTTTAATCATAACCACTCTCTCTTAACTAGATTGTTTTTTTAATCGTAAGGTCATGATGAAAGGTTTGAAAAATAAAGTCAACTACCCAGCATTAAGCCTGATGTTATAAGCTTTTAGAAAAAAAACATAAGGTCTTTTCCATTAAGATAAAATTAATGTGCCAACACCAATTATAGAAAATATAATTAAAAAACAAGTCGTCTGCTCTATAATTTTTATATAATCTCAAGCATACCAGCGATTAATCAAAATAAATTATCCTTAGATCACAAAAAAGCCTACGATTGTAGGCTTTTAATTTTAAAAAATAATACTAAATTATCCTAGAATGTATAACGCAGACCTAATAAGACCGAATTAATTGTAGCCACATCATTGTCACCAATATTATTAGAACTCAGATCATCACCAAAAATATGGGTATAAGTTAGGTTAACCTGCAAATTAGGTGTAAAATTATAACCAGCTCCTATGGCTAACAGCGGTTTCCACTCTTTATTATCTCCACTAATAGTTTGTCCATTCAATGTCAAACTTCCATTAAGATCTTCATACGCCATACCCGCTTTAGCAAAAAGATCAAACTGAGGATTAATATGCCAAGTGCCTACAGCAGAAATATCCCAAGCAGTTGACTTCACATTAAATGATTCTCCCCCAAAACTATACTCAGTTTTTCCATAGTAACCCCAGCCTAGCTCAGCACCGATGCCCCACATTGGATCAATATCATACATGTAGCCAACTGCCACACGACCGCCAATATTTTTATCATCTCTTGATACTAGTGCTAAATCTGGCAAGTCTTGCTGATTAACATAACCTAAAGCACCTTCTACATAAATACTATGGCCTGCTGGCATACTTAAAGGGCCACCACCAGCGATTGCTGTTCCAGATAAACCCAAGGCAGCTGTAACACTTGCAGCAATTAATATTTTTTTCATCATGAAAACTCTCTCCGTAAGATTTTTAGAATTTTTATTCTAACGCCGGCTTACTTTAACAAAGCTTATTAAGCTAAGTCAAACAACTAAAATAATAGAAGATAGTGCATCTTATTGATTGCTTTGATGAAATATCAAAAAATAGCCCGCTAAGCGGGCGACATGGTTATGTAAATGCATTCCTTGTTAATCAACATAAGGGCAATAGCTATAATTCATCAATATAACGTTGTTCAGTATCATCATTATCCATATAATGATCTCTAGTCCTCGTATGGTTAGGTTCATTACAGTACTCCCAACCAATTTTAGGGCATGATTTACTTCTTTTAGTAACTGGGTCCACACAAGAGCACTCGTACTCTCTGACAATACATACTCCATATCGTTTAGTGAAGGAAAAATAAGTAGTCCGATCATCTGGATGTACGGCCGGTCCCTTATCTTTTTCACCATAAAAACAACCAAAATAGTAGCCAAAACTAACATGTAAAAAGTAGCCATTTTTATTTTTAAGTCTTACAGAAAATATAGGATCAACGGATATCTTGTCAGTGTAAACAAGAGACCAGTCCATTGTTCTATGGACAGCAGTATCTGGAAATATAGGACAGTCTGCAAAATAAGTCCACTGCCATGGTCTCGAACCACTACTAGTATCTGCTAAACATTTCAGGCCCCATTTTAGCTTGCTAGGTTCATATATTATAAGGAACCTAGAATTTTTTAAATCATAATACGTTCTATTGTCCCCATATTGAGTGGTATAAATTTGATTGTAGCCTGGGTAATAAAAAGAGCCTATGCCCATGCTATTATAGCGCTCGATCAACAGTTTCTGACATACTATCAGTAGGTTAAAAAATACAATAAGGAAAAACGATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAGTTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACTTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGATACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGATTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAAGAATTTCAAAAATTCATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAACTAGGCTATACTAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGCCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCAGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGGTAACCCTCCCTTAAAATAGTACAAGTGATAAGTGGAATCTTCTGTTAAATTAACTTAGACAGGAGAGAGAAGATGAAACGATCAAAACTAACAGAATCACAAATTGTAGCCATGCTTAATGAAGGCCAAGCGGGTGTTAAAGTTG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MSRTIHCQKLNKNAEGLDRPTYPGELGQRIFDNISKEAWDMWLTHQTMLINEYRLSMIDPKARSMLVEEMEKFLFSNSETEKPDGYTAPEE

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126592.1|2216971_2217592_+	guanylate kinase	A0A143DIC6	Abalone_herpesvirus	2.5e-20	36.3
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WP_036771330.1|2222258_2223233_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP038932|2229425:2274926|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP038932|2344129:2403741|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP038932|2490798:2575971|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556577.1|2492334_2493363_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.8e-16	27.7
WP_016211744.1|2493340_2493745_-	glycine-rich domain-containing protein-like	NA	NA	NA	NA
WP_016211742.1|2493975_2495955_+	TonB-dependent receptor	NA	NA	NA	NA
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WP_144019244.1|2497052_2497664_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210625.1|2552885_2553632_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
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WP_075274943.1|2574427_2574952_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_129556588.1|2575142_2575310_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP038932|2590789:2613657|DBSCAN-SWA
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MLSTPWLAAWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
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MSQKRKKPSAEFKTKVVLEVIEGDQTLNQICSKYELVGTVAKSYREFQKGYFLVLATLELSS
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MNQQQGELELLLHSQVTDYASEWMSGYDAAQNEQLEADNPNDPDQETTAFDAWTEGWWAGFYNEPPLYQKNAPVDNVAAARSQAANENSLQSNKSNNDNNSEEHQEKGFEKALLGVGVAFACVVCYELIVTMVA
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MMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYTALRALKRHTPLLCSHMTLRFL
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MPLLVYTELGDMSISPVFANRPSAKQFANYLNADVEAALAKSSINYVINKSQSVSGYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MGGFILRPLTQENNLSEAPYNFSQQCLENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
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MGLSIINHSCDQLSLRLLETGDAEDLANLLTENQFLYQEKRAARIGCYLGQRLIGMCHIAQVLVEPICQAEIGYHIDADHSRQGLMFEALCLLIPWAFHYFKLERLVALAMLDNQPSQLLLKKLGFMQEGCLREYLLMRGQRVDHLLFALLREDLNHYRHFVSDCSRLDKPLE
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MARKTQAHLSRDALLHNLNHIRAHAPGCQVVGVVKANAYGHGLEDASRVLASYVDYLGVATIEEAMTLVRMAVKTIVLLMEGIFQDSELELVAKHGLEMVLHEEGQILALERVQLNAPITVWLKLDTGLGRLGFPAQLASILYQRLTRCVNVKKIKLMSHFSASDTNFSYTQKQLKHFMDVTRELVAEKSIANGAAIFNCPESCVDIVRPGGLLYGVGLWQGKKSGIDEGLRPVMSLRSHLISVKDYQAGDYIGYGRCWQCSGPMRVGVVAIGYGDGYPVTAPDGTPTLVCGVEAPLIGRVSMDMITIDLELCPDAKVGDEVVLWGDDLPVERVAHHVGVVPYALLCAVAPRVKLVWDYQ
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MSEVAQALEIIKRGVDEIIVEDELVKKLAAGTPLRVKLGMDPTAADLHLGHTVVLNKMRQLQDLGHEILFLIGDFTATIGDPTGKNITRQPLSAEQVEKNAATYTSQVFKILDEDKTQILFNSEWMGQKTAADMIALASSYTVARMLERDDFAKRYGNNQPIAIHEFIYPLVQGYDSVAMKADIELGGTDQKFNLLMGRELQRQYGQRPQTIITMPLLEGLDGVKKMSKSLGNYIGIAESASEMFGKMMSVSDELMWRYYELLSFKPMAEIKALEQAVAEGMNPRDAKVALAKEIVARFHSEHAAAAAYDEFVNRFKKGVLPEDMPEVTVATGGEMAIGNILKAANLVGSTSEAIRMIQQGAVRIDGERVEDKSLVMLAGAAYVMQVGKRRFARVSLI
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MYQQQSTVQRNTSLLANHKVLRSTYFLLSLTLLFSAATAGWALVNHATPVNPILNLIVSFALLFATMKLRNSSWGIVTLFGFTGFFGYALGPVLNFYITQFSNGSALVLSALATTGVTFFVMSALAIAKPQAVTRLGGVLMAGLIVVVIASLLNLFLHLPALQLAISIIAALVFAGFIAWDTQRIISGGETNYIMATMSLYLNIVNLFMSLLQIFAAFSGRD

Homologous phage analysis in the prophage region

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2588516:2588575	attL	NA	NA	NA	NA
WP_081377879.1|2590789_2591014_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.2e-07	46.2
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WP_054300489.1|2595919_2596522_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	6.5e-37	46.2
WP_155046749.1|2596585_2596873_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211876.1|2597417_2598497_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2596757:2597044	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016211874.1|2598815_2600534_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|2600577_2601483_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046750.1|2602727_2602865_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210068.1|2604051_2604627_-	spermidine N1-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210050.1|2604702_2605578_-	6-pyruvoyltetrahydropterin synthase	A0A140B3P3	Vibrio_phage	8.0e-12	24.0
WP_016210054.1|2605642_2606164_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210069.1|2606148_2607231_-	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.6e-20	27.5
WP_016210051.1|2607471_2607876_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210073.1|2608300_2609032_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210076.1|2609288_2610590_+	inosine/guanosine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210066.1|2610731_2611400_+|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1
WP_032126425.1|2611843_2612440_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210052.1|2612460_2613657_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	8.2e-07	24.4

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP038932|2642297:2694930|DBSCAN-SWA
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MPTPSISIAQRFRGFLPIIIDVETGGLNAATDALLEIAAVIVDFNDEEQLVPIKTISTHVQPFAGANIDPEALKINKIDPDSPLRGAINEAEALKKIFTPIREKLKESDCNRAILTGHNPILDLNFLNKAVSRSGIKRNPFHPFSSFDTATLAGLAVGQTVLAISCKAAGIEFDYTKAHGAHYDAEKTAELFCLIVNRWQALGGWPLVNSHH
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MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA
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MMPKLLEQKQWDKIYLFLKDFPGIYCGSERKCRLFIEAVIWILRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD
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MFDLIELWSGNVQPELESKSYPRAINPSSVTAKFDAKTSQSSFEFTDGSPTVVFVSDKKTLHPVNRYRDLPTIELTDSERRAVAKKLRQLAENPKFYDGKQMVITAALYDPGTNTMYMEAKQVPYSVLATLRSREFAQESELYKLTLFQTGVLSPLVTKDDCLVLMERSQFGLMSQPGGFLEPVKGRLNFSRGDLVVRTAIAEITQEIAGIAGSCENRLLFTLPTISAVSIRMTEGRGMGTIEFIAPVYVNAHSHYLQQVIADNLAVDRDEHTGKSMVVSLDERDRGVLVDQVLTGSAVPPGQPLYLPMLISAARLVNPGNSVPRALPSSHSMAIPVSAMTPAVERPLPLTLFQHFEEKTGQIPDRSQAALSSEM

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211756.1|2645519_2646245_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2646490_2647678_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210935.1|2649490_2650033_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210942.1|2650719_2651331_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2651377_2652397_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126310.1|2655462_2656722_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
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WP_016210937.1|2657531_2657813_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
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WP_129556549.1|2659199_2660086_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377821.1|2664375_2664906_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779158.1|2664902_2666435_+	inactive transglutaminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210815.1|2666431_2667382_+	alpha-L-glutamate ligase-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210817.1|2667801_2668434_+	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-13	32.8
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WP_051307340.1|2669729_2670428_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126306.1|2671691_2671988_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556591.1|2672092_2672749_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210986.1|2675197_2676736_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	1.3e-86	36.3
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WP_016210987.1|2678183_2679383_+	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP038932|2734433:2817752|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP038932|2930314:2973712|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_052104629.1|2972686_2973712_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP038932|3005396:3122823|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126430.1|3016857_3017382_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|3017629_3018868_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|3019415_3019889_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|3019885_3020281_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|3021210_3021786_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|3021731_3022097_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211610.1|3022361_3024692_+	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
WP_129556603.1|3024812_3026828_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274967.1|3027011_3030404_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212386.1|3030468_3030774_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274968.1|3030943_3032044_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049897.1|3032291_3033548_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209721.1|3034486_3035884_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.3e-77	34.4
WP_051307313.1|3036003_3036951_-	P-type conjugative transfer ATPase TrbB	NA	NA	NA	NA
WP_032126703.1|3036947_3037463_-	signal peptidase peptidase S26 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209698.1|3037449_3038649_-	trbL/VirB6 plasmid conjugal transfer family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209707.1|3038645_3038969_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209703.1|3038970_3040200_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_016209722.1|3040199_3041243_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556606.1|3041242_3041926_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209720.1|3041922_3044412_-	cagE, TrbE, VirB, component of type IV transporter system family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377396.1|3044428_3044683_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209715.1|3044683_3045040_-	trbC/VIRB2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664821.1|3045819_3046983_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209727.1|3047002_3050110_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209723.1|3050111_3051617_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016209714.1|3051644_3051926_-	accessory factor UbiK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209709.1|3052074_3052416_+	P-II family nitrogen regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209712.1|3052535_3054416_+	biosynthetic arginine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_059372650.1|3054500_3056099_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307314.1|3056116_3057232_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155069083.1|3057359_3058358_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209700.1|3058361_3059120_-	tryptophan synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016209702.1|3059121_3060321_-	tryptophan synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016209711.1|3060304_3060976_-	phosphoribosylanthranilate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016209710.1|3060997_3061774_-	indole-3-glycerol-phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016209717.1|3061777_3062776_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|3062777_3063356_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|3063352_3064822_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|3064865_3065153_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_016209699.1|3065353_3065950_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075274970.1|3066159_3066630_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046757.1|3066686_3066842_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274971.1|3066986_3067439_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|3067624_3067846_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212371.1|3067961_3068594_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274972.1|3068571_3069633_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211865.1|3070072_3070612_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126699.1|3070696_3071233_+	alkyl hydroperoxide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211866.1|3071884_3072187_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126698.1|3072636_3072945_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274973.1|3073535_3074003_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556608.1|3074285_3074996_+	VUT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211232.1|3075222_3075621_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211231.1|3076488_3077439_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016211227.1|3077438_3079517_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3079664_3080180_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3080188_3080752_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3080732_3081479_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3081618_3082071_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210351.1|3082494_3083331_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3083327_3084224_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3084256_3085324_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3085342_3085711_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3085736_3087185_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3087194_3088574_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3088614_3089946_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_032126694.1|3089917_3090877_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|3090969_3091473_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3091607_3092759_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3092755_3093235_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3093381_3095703_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_080664839.1|3095647_3096274_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|3096278_3097178_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3097250_3097829_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3098129_3098387_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556611.1|3098395_3099549_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155046758.1|3100685_3100817_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155046759.1|3100961_3101117_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3101444_3102218_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126148.1|3102759_3102942_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3103545_3104520_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3105614_3105953_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212337.1|3105969_3106680_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_051307375.1|3106667_3106859_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|3107020_3107320_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|3107309_3107474_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|3107530_3107896_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3109200_3109896_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3109892_3111320_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3111345_3111609_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3111969_3112944_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556612.1|3113002_3113853_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211291.1|3113890_3114235_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3114231_3115068_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3115068_3115410_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3115411_3116017_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3116013_3118008_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3118027_3118969_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211292.1|3119196_3120621_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3121133_3122108_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080743040.1|3122166_3122823_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038932.1|WP_032126179.1|1104947_1105199_+|TSUP-family-transporter	1104947_1105199_+	83 aa aa	NA	HTH_38	NA	1102478-1208994	yes
NZ_CP038932.1|WP_155049815.1|1141993_1142146_-|hypothetical-protein	1141993_1142146_-	50 aa aa	NA	HTH_21	NA	1102478-1208994	yes
NZ_CP038932.1|WP_155046725.1|1289731_1289872_+|hypothetical-protein	1289731_1289872_+	46 aa aa	NA	HTH_38	NA	1245808-1340832	yes
NZ_CP038932.1|WP_081377858.1|1290729_1291440_+|transposase	1290729_1291440_+	236 aa aa	NA	HTH_38	NA	1245808-1340832	yes
NZ_CP038932.1|WP_054300380.1|1308522_1309179_-|transposase	1308522_1309179_-	218 aa aa	NA	HTH_21	NA	1245808-1340832	yes
NZ_CP038932.1|WP_016212421.1|1312418_1312601_-|hypothetical-protein	1312418_1312601_-	60 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	1245808-1340832	yes
NZ_CP038932.1|WP_032127044.1|1324325_1324526_-|hypothetical-protein	1324325_1324526_-	66 aa aa	NA	HTH_21	NA	1245808-1340832	yes
NZ_CP038932.1|WP_016212482.1|1324740_1324884_+|hypothetical-protein	1324740_1324884_+	47 aa aa	NA	HTH_21	NA	1245808-1340832	yes
NZ_CP038932.1|WP_016210918.1|1358975_1359725_+|hypothetical-protein	1358975_1359725_+	249 aa aa	NA	WHTH_GntR	NA	1345368-1398049	yes
NZ_CP038932.1|WP_098082828.1|1959095_1959353_-|transposase	1959095_1959353_-	85 aa aa	NA	HTH_21	NA	1953050-1994463	yes
NZ_CP038932.1|WP_016211536.1|2227335_2227569_-|hypothetical-protein	2227335_2227569_-	77 aa aa	NA	HTH_38,HTH_Tnp_IS1	NA	No	NA
NZ_CP038932.1|WP_016212450.1|2266522_2267425_-|hypothetical-protein	2266522_2267425_-	300 aa aa	NA	HTH_38	NA	2229425-2274926	yes
NZ_CP038932.1|WP_129556569.1|2274151_2274361_+|hypothetical-protein	2274151_2274361_+	69 aa aa	NA	HTH_ARSR	NA	2229425-2274926	yes
NZ_CP038932.1|WP_016210580.1|2795453_2795714_+|methyltransferase	2795453_2795714_+	86 aa aa	NA	HTH_38	NA	2734433-2817752	yes
NZ_CP038932.1|WP_155047000.1|3007513_3007660_-|hypothetical-protein	3007513_3007660_-	48 aa aa	NA	HTH_38	NA	3005396-3122823	yes
NZ_CP038932.1|WP_129556602.1|3007864_3008074_-|hypothetical-protein	3007864_3008074_-	69 aa aa	NA	HTH_38,HTH_1	NA	3005396-3122823	yes
NZ_CP038932.1|WP_016211201.1|3011207_3011516_-|hypothetical-protein	3011207_3011516_-	102 aa aa	NA	HTH_38,HTH_1	NA	3005396-3122823	yes
NZ_CP038932.1|WP_155046758.1|3100685_3100817_+|phosphatase	3100685_3100817_+	43 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	3005396-3122823	yes
NZ_CP038932.1|WP_155046759.1|3100961_3101117_+|hypothetical-protein	3100961_3101117_+	51 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	3005396-3122823	yes
NZ_CP038932.1|WP_032126148.1|3102759_3102942_-|hypothetical-protein	3102759_3102942_-	60 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	3005396-3122823	yes

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_032126179.1|1104947_1105199_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP038932.1|WP_032126179.1|1104947_1105199_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1113570-1113533	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1113436-1113399	1
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1103391-1103428	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1113570-1113533, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1113436-1113399, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1103391-1103428, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_155049815.1|1141993_1142146_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_155049815.1|1141993_1142146_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1113570-1113533	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1113436-1113399	1
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1103391-1103428	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1113570-1113533, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1113436-1113399, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1103391-1103428, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttagtccagcgct	Protospacer
****************************.*********

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_155046725.1|1289731_1289872_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_155046725.1|1289731_1289872_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFALFHMLSCLKMLTEDSSYELSHFKGGLP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1308447-1308484	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1311953-1311990	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1308447-1308484, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1311953-1311990, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_081377858.1|1290729_1291440_+|transposase

>NZ_CP038932.1|WP_081377858.1|1290729_1291440_+|transposase
MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKFLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1308447-1308484	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1311953-1311990	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1308447-1308484, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1311953-1311990, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_054300380.1|1308522_1309179_-|transposase

>NZ_CP038932.1|WP_054300380.1|1308522_1309179_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1308447-1308484	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1311953-1311990	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1308447-1308484, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1311953-1311990, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016212421.1|1312418_1312601_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_016212421.1|1312418_1312601_-|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1308447-1308484	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1311953-1311990	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1308447-1308484, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1311953-1311990, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_032127044.1|1324325_1324526_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_032127044.1|1324325_1324526_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1308447-1308484	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1311953-1311990	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1308447-1308484, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1311953-1311990, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016212482.1|1324740_1324884_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_016212482.1|1324740_1324884_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1308447-1308484	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1311953-1311990	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1308447-1308484, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1311953-1311990, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016210918.1|1358975_1359725_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_016210918.1|1358975_1359725_+|hypothetical-protein
MLSDKARIAALEEKLANIEHEIKAHNSHIKRNIVNHTETTKINNSVLAENIDNETLKKTIGSSSSTANINSNTSHVSYVTNTGYTQTAAQANYEIMGATVSGNTYGAIATTKIAATAKASLETGGLSNITDIAATKLTLEMIPNKTNMKLSTIEETVSTAVATEINNVRSEVALATTAAIASSTKTIASDVKIAMSRIDTVESQVDLVASKVTNVAQQTHRGLYATACALTEQKTHSMIITNAAMQVLS

WHTH_GntR HTH domain information

• Identity: 0.47692307692307695
• Hit_domain_coverage: 0.9848484848484849

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1346281-1346318	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1370429-1370466	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1346281-1346318, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1370429-1370466, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_098082828.1|1959095_1959353_-|transposase

>NZ_CP038932.1|WP_098082828.1|1959095_1959353_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	1963356-1963319	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 1963356-1963319, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016211536.1|2227335_2227569_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_016211536.1|2227335_2227569_-|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYN

HTH_38,HTH_Tnp_IS1 HTH domain information

• Identity: 0.5555555555555556
• Hit_domain_coverage: 0.9782608695652174

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016212450.1|2266522_2267425_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_016212450.1|2266522_2267425_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGELIKDGQITFEQALEFTYDQQSVCESDAIRALIQQGILSFDLSLKLTGCQQRNLEAPVIAELLRSKDQRCRLTLEQALALDSVQRDNIKSKTVRALLQEGILPSIEKALSLTEEQRRSLVRPTVGKLLRSKDHFLHLTLEQALNIKSEQELTLASKDIRQLIQDRQITLEQALAFTSEQQRSCESGVIRALVQEGILSFDLSLKLTGCQQRNLEEPRVAELLRSKDEHCRLTLDQALRLMSWHKEFLQSKLTFKLIKDKKLTMEQALTLSYSAGLTVSDILSVG

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2234514-2234551	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2266393-2266430	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2266527-2266564	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2234514-2234551, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2266393-2266430, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2266527-2266564, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_129556569.1|2274151_2274361_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_129556569.1|2274151_2274361_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

HTH_ARSR HTH domain information

• Identity: 0.46774193548387094
• Hit_domain_coverage: 0.7948717948717948

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2234514-2234551	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2266393-2266430	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2266527-2266564	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2234514-2234551, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2266393-2266430, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2266527-2266564, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016210580.1|2795453_2795714_+|methyltransferase

>NZ_CP038932.1|WP_016210580.1|2795453_2795714_+|methyltransferase
MKMRNYHSHILKIHEKEQGWRKLKTPNMPLDIEIGCGVGMHPLLYASAYPERFLIAIEKTREKFGKFAKKNNTIGPYQNLLAPSVI

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	2815987-2816024	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 2815987-2816024, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_155047000.1|3007513_3007660_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_155047000.1|3007513_3007660_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	3022123-3022160	0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_129556602.1|3007864_3008074_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_129556602.1|3007864_3008074_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

HTH_38,HTH_1 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	3022123-3022160	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_016211201.1|3011207_3011516_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_016211201.1|3011207_3011516_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

HTH_38,HTH_1 HTH domain information

• Identity: 0.5178571428571429
• Hit_domain_coverage: 0.9333333333333333

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	3022123-3022160	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_155046758.1|3100685_3100817_+|phosphatase

>NZ_CP038932.1|WP_155046758.1|3100685_3100817_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	3022123-3022160	0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_155046759.1|3100961_3101117_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_155046759.1|3100961_3101117_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	3022123-3022160	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 3022123-3022160, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038932.1|WP_032126148.1|3102759_3102942_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038932.1|WP_032126148.1|3102759_3102942_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	3022123-3022160	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038932 position: 3022123-3022160, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP038934

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4824 : 28863	33	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	37206 : 58175	30	Pseudomonas_phage(11.11%)	terminase,portal,head,capsid,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038934|4824:28863|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACATGAATCAAGCAGCCACTGGTGACATACGAATGTGCAGCAACAAAGGCACGTTGATTTAAGCTAAAGCTGCCGCTGCCGGCTTGTAAAGTGACTTTCAGCACGCGGCAATCATAACCGATGCGATTAATATCACTACCAACAAGTTTAAGTAGCTCATATGCTTGATATTCGTCGCTGTCTTCAGCGGCGGAAGGACTCGGGGCAATGCGTTCAAACTCAGCACTTAAAGCTGAGGAGTTGTAATACGTATAAAAATAGCGTGGCAGGGTTCGCTCATCATCCCAGTCACGAAACGTACTGTTTAAATATAAATTAGGCCCACCGGCATAAGATTGTGCATCCTCATCCGTTGCTAACTGGCTATCAATCGGCCCTTTATTGATCCACTCGGTATTATCAAGACTGCGCTGCCAGAGTATTGCATTTTGCGTATCCGCCCAAAACATACAGGCCACCGGGTTACTCGGTGGAGTATCGCCGGCAAAATTGCTTTGATTGGCTAAGATAGAATTGACAATTTTTTCACGACTGACCGCGGGGCTCGAGGTGCCAACCACTTCATTAATTTTAAACTCCTGCATTAATGCCCTCCTATATATAAATCGACTTCGCCTGTTTTTGCTGTGCCGTCTTTATCAAAAATATTGACGGTCGCTTGAGTTAAACTTTTATTGATCTGCACTTGATCCCCCGCCGCGCCGCTTTGAATGGTCGCAATCACAATGACTTTTTGCTGCATCGGTTCGGGGAAAACATAGGTAGAACCGGCTGCACTGACCGGAAAATTATCAACGTTATACACGGTTTCCGGCACATCAAAGGTGCATATTAATTCTTGCAATTCCGGGGTATATTGCGCATCAAAGCGTTTTAAAATGACTTTAAATCGAGCATAACGAAAATGCCTAAATGATCAGGCTACCCTATTCCGGACAAATAAATTACAATAATCCGAGCCGGAGGAATCACAATGGGAAAGCGTCACGTCACCAAGTACACCGAAGAATTTAAAAAATCATCTGCCAAGCTTGCAGTCGATTCAAATCAAGCAATCAGTCATACAGCACAGGAATTGGGTATTCACTCAAGTACACTGCATGGTTGGGTCAATAAATATCATCCAAACAGTCCAAATACTGTTAAAGATGAAGTTAGTGATATGGCTGCTGAAATAAAACAGTTAAAAAAAGAGTTGGCTAGAGTGACACAGGAACGTGAAATACTAAAAAAAGCGGCGGCGTACTTTGCAAGCGAAACACAGTAAAGTATGCCTGGATCAAAGAAAATAAATGTGTTTTTCCAGTAGATAGGGTGTGCTCAATCTTAGGTGTTAGCCGATCAGGTTATTACAGTTGGTTAAAGGTACAGCCTTCCAAGCGAATGATAGAGAACCAAAAATTAGCTAGGCGAATCAAGGAAATATTCATCGAAAGCCGTGCAACCTATGGTACTCGAAGAATTAGAAAACAGTTGGCAACACAGGAAATTTCTGTAAGCCGTAAGCGAGTTGGCCGTTTAATGAAGCAGAACCAGCTTTGCTGCAAGATAAAGCGTAAATTCAAAGTAACTACGGATTCTAAACATCGATTGCCAATTGCGAAAAACGTGTTGGACCGGAATTTTTCAGCAACAGGCCCTAACCAAAAATATGTTGGTGATATTACCTACATACGGACCCAACAAGGCTGGTTGTACTTGGCTGTTGTGATTGACTTATTCTCACGAAAAGTTGTTGGCTGGGCCATGGAGGATCATATGGAAGCATCACTCGTCAATGATGCTCTGTTGATGGCCTTATGGAAACGAAAGCCTAAAGCTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATCATCAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACCTTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAAAAGGATGCGGTGAGCGGTATAAACTCCGTCCAGTTTTGATTATCCTCTGACGTTGAACATTGCACTTCAAAGCCACAGGCTTCCGGTGATCCTAACCACGACCAATTATTTTCTAGCGTGTAATGGCTCCACGCGTTCTGCATATTATCAAAGGATAAATCATCATTGCTTTGACTGATTTGCATATCCGCATAGACACGGCAGCGCATGATTTTACCTAGATCATAAACAGCACTCAGGTAGTATCCTTCACTAATGTCCGTCGCTAAGGTTCCGCTTTTGGTGTTTTCCCAACTGTCACTATAATCCTCCCAGGATTGAGTCATACCGCCCCAAGAGTAGTATAAAAATAAACGAATATGGTTATTATTATTAACCGCGGTGTGATGAAACTCACCCGGCCAATCATTAGCGGCATAATCATATTCTTGAATAATATTTAACGGCGTTAAATCAGTCAGTTCTAACACACTCGCTTCAGCTGATTTAATCCCCCATTGACTCACCGCTTTAATCAAATAAAAGCCAGGTCTGGCCTGTGTTAGATGCAGTGTAGTGCTATTAAGTTCTGCAATTAAAATGGAGTTTTCCCAAGCGGTGCCGTGCCTGATCTCGTAGTGTTTAACATACAACTCTGGATTTTTCGCCCATTCTAAAACGGCGATTTTATCGCTATACGAGGAGACAAAACGGCTGACATTCTGAGGAATCTGCTGCTCGAGTGATGCGCTACAGTGGTATGTTGAATAATGGCTACGTTGCCCAAACCAGCCCATCGCACGCACTCGAAACGTGTAGGTTGCACCTGTGCTACTGAACTCAATATGATTTAAATGGGTGGTTTTAACGTCGGAATAATTACCGTCATTGCTACGCACTTGATACTCGTAATACGCCGCATTTGGATCGCCATCAAAGGCAACAATCAAGACCGCTTCGGCGATGCCGCCGTGATAACTTACGCTTTGTTCAACGCGGTAATTACTCGGTGCTTTTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGTTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|6750_7903_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212392.1|7931_8939_-	hypothetical protein	W6E8G0	Rhizobium_phage	1.2e-06	26.4
WP_075273802.1|9002_9731_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
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WP_016212135.1|10700_11885_+	3-methylitaconate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_075275202.1|12128_12830_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.0e-10	31.2
WP_075275201.1|12832_13561_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_016212164.1|13689_14718_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211443.1|15741_16428_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211439.1|16431_16986_+	recombinase family protein	M9Q1K0	Clostridium_phage	1.0e-20	40.6
WP_016211436.1|17030_17969_+	fic/DOC family protein	S4TP71	Salmonella_phage	5.2e-25	37.2
WP_016211434.1|17941_18133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211445.1|18310_18661_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126541.1|19310_19703_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211440.1|19713_20628_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211444.1|20897_21404_+	antirestriction protein ArdA	A0A222YZE5	Mycobacterium_phage	2.8e-17	33.7
WP_051307358.1|21552_21936_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212087.1|24063_24492_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126714.1|24659_25199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212089.1|25435_25666_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104629.1|27271_28297_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275198.1|28323_28863_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.4e-12	40.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038934|37206:58175|DBSCAN-SWA
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MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP038934|37206:58175|45948_47283_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP038934|37206:58175|40266_40746_+|WP_016212234.1|terminase|DBSCAN-SWA
MGVKGSGRKRKPTRLKKITGNAGKRKLNHYEPELIEGRAACPHYFKGEAAKAFRFAVDCLENMQIKTAAFQLMLESFAFSYGEWRALSELVDQHGRTFETITQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDQILD
>NZ_CP038934|37206:58175|42428_43670_+|WP_016211136.1|portal|DBSCAN-SWA
MTLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDAAPISASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDERTKKLIYSTISNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQEHGAKLFGNGARPSGILTTDSHLKKEGRENLAESWKKAHGGKNSNGVAVLENGLRWQALTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARAAFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK
>NZ_CP038934|37206:58175|41349_42432_+|WP_081377926.1|terminase|DBSCAN-SWA
MHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL
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MSESIGALSEIYRDSDNAGNYVKLANITNIGEISSSRDKIDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDTGIERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLSEVISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP038934|37206:58175|48489_48840_+|WP_016211129.1|DBSCAN-SWA
MIEDVYFALLSTGWPVFPIMLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDSITEILNGYHSEKIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFTLTGVV
>NZ_CP038934|37206:58175|48097_48493_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
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MPCTPWLAASEEMEKEIFSKDAFSKEVQLNHTVARLSVCFDHFFLEIGHIFITPAIISLI
>NZ_CP038934|37206:58175|44121_44577_+|WP_155069103.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAIDSLAASMASIIALTGETVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAAYVKPNQYKNTPQTLIKHSENNTVNALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP038934|37206:58175|54262_54550_-|WP_016210662.1|DBSCAN-SWA
MTYKLQFHKEAYKEWKKLNPTTQQQFQKVLKKRLINPHIPSAVCGGDLKGCYKIKLRALGYRLIYTVKEDKVVVQVLAIGSRNRLEAYRLAASRL
>NZ_CP038934|37206:58175|44634_45828_+|WP_016211140.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKAEEVEAQERELNTLTSEPLRSSVQSPTENKATSPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTSSTTDLPMADSYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTAAAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS
>NZ_CP038934|37206:58175|40974_41331_+|WP_080743047.1|DBSCAN-SWA
MTLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDS
>NZ_CP038934|37206:58175|54539_54794_-|WP_016210670.1|DBSCAN-SWA
MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNAPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLNSPDCDFIDVDVDDL
>NZ_CP038934|37206:58175|53698_54256_+|WP_016210665.1|tail|DBSCAN-SWA
MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRQSLTIEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFAQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVATPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL
>NZ_CP038934|37206:58175|49643_49910_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP038934|37206:58175|38065_38359_+|WP_016210977.1|DBSCAN-SWA
MPPCRSCNTERSNEQARFCSNCGASLETRSTYEEIINKDISVLSLTKDRISSIKNNSKIRNIKDILHDLSHKELRSIPQVGEYWAKRIFNLAEEYIS
>NZ_CP038934|37206:58175|52962_53709_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP038934|37206:58175|37206_37887_+|WP_129556725.1|DBSCAN-SWA
MKYGIPGKADQYLCREGYSVGYNYKTKQPRWVAYHLTSKSVSKRIKRHDDFRPDPAIPYQYQAQLSDYKRSGYDRGHLAPYAAMDFDKNSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKSEVYVYTGPIFQGKNIKTIGKNKVAVPTAFFKIIFAPQQKQALAFVMPNKRVAKNKVSEYRTNIAHIEKLTGLKFLSQLTSSEREKLVIKTDTMWRTRYN
>NZ_CP038934|37206:58175|38903_39083_-|WP_155046773.1|DBSCAN-SWA
MLSWLDSLTLKGIRVSSFFLIRKRRYLGRYFAHPMIQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP038934|37206:58175|49913_51992_+|WP_032126912.1|DBSCAN-SWA
MATIGSLVVNLSANSAQLVKSLTKAELASKNFSKKVQRNLKNTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQNKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAASEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFRVVAKSFAIVGDGVHYINVGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAQGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIAKAGAILPIVGNKFERLGQSIARMKSSVYERFTLDTSGLNIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDEIEQKAAALDEKIRAAQPEKSALMGASLRAQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIKHSYDKQKRIILDATREGSEERIKLLEKIEVQKNTKLKDLAQKQAKELNGVGHQAKEFAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASRGIFKSILGGVIGSVGGSSFASWFSGGATAAGAKASGGSVAAGQLYRVNEHGAELFSSGGKDYLMTGKKAGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSQEVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA
>NZ_CP038934|37206:58175|52322_52994_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556725.1|37206_37887_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|38065_38359_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556724.1|38576_38759_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|38903_39083_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556723.1|39177_39495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|39795_40179_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_016212234.1|40266_40746_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016212231.1|40749_40959_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	1.3e-08	43.1
WP_080743047.1|40974_41331_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	5.4e-23	61.3
WP_081377926.1|41349_42432_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.2e-89	46.3
WP_016211136.1|42428_43670_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	3.1e-86	46.0
WP_155069102.1|43632_43977_+	hypothetical protein	K7PKX4	Enterobacterial_phage	1.2e-16	57.9
WP_155069103.1|44121_44577_+	hypothetical protein	A0A2I7SCY8	Paenibacillus_phage	4.9e-21	43.0
WP_016211140.1|44634_45828_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_016211133.1|45948_47283_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|47473_47785_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|47781_48105_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|48097_48493_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|48489_48840_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|48839_49262_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|49263_49587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|49643_49910_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126912.1|49913_51992_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_016210657.1|51984_52326_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|52322_52994_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|52962_53709_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_016210665.1|53698_54256_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_016210662.1|54262_54550_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-15	50.5
WP_016210670.1|54539_54794_-	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016210653.1|54887_58175_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.2e-112	33.5

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038934.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein	5761_6361_-	199 aa aa	NA	HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038934.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein	6360_6594_-	77 aa aa	NA	HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038934.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein	9914_10262_+	115 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038934.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein	23884_24064_+	59 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038934.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein	24063_24492_+	142 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes
NZ_CP038934.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein	24659_25199_-	179 aa aa	NA	HTH_38	NA	4824-28863	yes

Protein sequences of NZ_CP038934.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038934.1|WP_016212400.1|5761_6361_-|hypothetical-protein
MQEFKINEVVGTSSPAVSREKIVNSILANQSNFAGDTPPSNPVACMFWADTQNAILWQRSLDNTEWINKGPIDSQLATDEDAQSYAGGPNLYLNSTFRDWDDERTLPRYFYTYYNSSALSAEFERIAPSPSAAEDSDEYQAYELLKLVGSDINRIGYDCRVLKVTLQAGSGSFSLNQRAFVAAHSYVTSGCLIHVIALD

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038934.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038934.1|WP_155046771.1|6360_6594_-|hypothetical-protein
MPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038934.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038934.1|WP_016212131.1|9914_10262_+|hypothetical-protein
MTEGDFINELMFGRGNVPLNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNSNDVTTYNKDNIVFFVDDDNMFRHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFGATKSFIAKKPRRR

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038934.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038934.1|WP_016212090.1|23884_24064_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGENNSKGWQCAEFAAQILKRCGLRLPERENLTPIELITLIKQGA

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038934.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038934.1|WP_016212087.1|24063_24492_+|hypothetical-protein
MYSVIKSFWVYGVGGVLVIVIIFVWRYEMRQSAQYELRHEIAQTNWKHNTKTFHLEQQRLKQIQQRYFTKVAATDEEHDDVDHALLESLHASKNWSATDIPNTIFIKLCQAELVDHAQSHRCKSAVQFTQSLQNNKNPRTNQ

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038934.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038934.1|WP_032126714.1|24659_25199_-|hypothetical-protein
MPSKLSLEDRITNVLGKLTRMDNMMLGGNLTPEQKNEIEQVIDSIPHEPDSSSYNPKDSRISNLTVAHVWYGMGSQTGVTSPEWKVRFLKQYVEAVQSNNVDGKRDSALFRSIEKMFNKHEFIYATAEDVTRPLINKEDPKIAPEVATLVKDFVMSGAGDLSITSIDHEEDSSISCLLM

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	5737-5774	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 position: 5737-5774, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP038935

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	17458 : 25469	10	unidentified_phage(33.33%)	transposase,integrase	attL 11063:11122|attR 24791:24982

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038935|17458:25469|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTAAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTCCAGGGCGTTTTTCCTAGAAGGAATAAAAGATTTAAGCACTCGCTAAGTCAATAGAATCTTCATCATCAAACCTTAAGATAATTTCAACTCTAGCGCCCATTGCTTCTGCTGCACGCTCAAAGCGTTTTAAAGTCAAATTTTCACCTTTTTCAATTTGCTGATAATTTTGATATGGTACATTTAGCCTTCTAGCAACTTGAGCCAATGAGTATTCTCTTAATTCCCTTAATTTATGAAGAAGAATGGGCGCTGCTACTTGAGGACTCACAGGAATTAGTATCTCACTTTTACGTATATCAGAAGGTTCAGTAATTGTGTGTTTATCAGCTATCATTTCAGTCAGCAATAAATTCAAAACATCGCGTGCATTATACATCGCCTCTTCGATTGTCTCTCCATCAGTGAAGATATTTGGAAGATCACGGAAGCTGACAACATAACCACCCACTTCGTTATCTTCTTCAAATTTAGCTGGATACGATAACTTCAATTCCATGCTTTTATCCTCACTCAAACGTTACACCTGTTGCTTTTTCAATCTTCTTTAAAATGCCTCTTCCCAAATCTCTATTCGCATGTACTGGTACTGAGATTGGAGGAAGCCCTTGTTTCTTCATGATATGGTGTGAGCCACTAGTTCGTGTATGCTTCCAACCATATTTCTCAAGCTGTCTTATTACGCTCTTTCCACTAATAGGCATAAGCTCAGTCACAATATTTATATTGTAGTCCAATTTATCAGACAACAATAAAAACCACAAGTTTTATTTTGTGTTAGCTTAGAGTAAATTAGCTTGTTATATATGATAGAAACTATAACAACTTTAATAGTATCAAGGCTTTCAGCCTGTACACCTCTACTCACTCGTTATATTATCATTATATAGATCAATAATATAACGAGTTTAAGGTCAAAATGGGCTTAAGCAAGCAGGCACGAATTTTATCTGAAAGACAGGAGCGGATCATCATAACGCACCTCAAAAGCACTATCGCGCCGCAACGAAACCTCGTTTTATTTTTGCTGTCAATAAAAGCCGGACTCCGTGCGAAAGAAATTGCACACATCCAGTGGAAAATGGTTTTTAACTCAGACGGTCAAATCGGAGATTGCATCCACTTGACCAACGATGTGAGTAAAGGTGATCAAGGTGGCCGCATCATCCCTCTTAATCAGCAACTCAAAAAAGCATTGATAACATTATTTCAGTCTAATCCACCGCATCATGAAAATGTCCCTATCATCATTTCACAGCGCAAAGCTGCATTTACTCCACAAACGATCGTTAATTGGTTTAGTCGTTTATATGCTGATTTGGAGTTTAATGGACATTCTAGTCATTCAGGCCGTCGCACCTTTGTCACTCGTGCCGCAAAAAATGTAATCCGTGCTGGTGGGAGTCTACGTGATGTGCAACAATTAGTGGGTCACTCCTCGCTACAAACAACACAGCATTATATTGAAGGTGACAGCGAGGCTAAAAAAAAGCTAGTCGAGCTAATTTAAAGGGGTCTATACACCCCTTTTGACATAAATGGATCATCTAAAACAATCAACAGGGTAGTGATTATGATTTTTAGACAGCTATTTGATAACCAAACATCCACCTATACCTATTTGATTGCCTCAGATTACGGAAAAGAAAGCATTATTATTGACCCAGTTGATAGTAAGATAGATAGTTATATTCAGCTTTTAAGTGAATTATCTTTGAAGCTTGTCTATTCAATTGATACGCATGTTCATGCAGACCATGTGACCGGTTCTGGCTTGCTCATGCAACAGACCAATTGCAAGATTATTATGGGAAAACAAAGTAAAGCTGAAAATATATCATTAAAAGCCAATGAAAATGAGCCAATAAAAATAGATAATCTTACAATTCAACCGGCACTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGACCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGTCAAAAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGTACTTCAGATGACGGAGGGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGATTTTAGTTTTCAAAATTTTAGTAAATTAAGATTTTTAGGAAGATAGATTAAGATGAACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTTTGATATTTATACCAATTTTATTGATGATTTTAATTATGTCACCAGCAATTTCATCAAAAACTGAAAACAAGTTATTTTCTTGGAAACCAGAGCAACTTATGAATATTAAACAAATTTCCGAGCTGGACTTGTCTTCAAGTGCGCCTACTCTTGCTTATGTTGTAGATTTTTACAAAAAGGACAATAAAAATATTTGGACTGAGAAGAGTTCAATCAAAATATTGTCATTAACAACAAAAGAAACCCATAAGGTTGATTATAAAGATGAAGATAGTTGGATGCCAAAATGGTCACCAAATGGTCATTATTTGGCTTTCTTATCTAAGAAGGTCAGTGAAAAATCAAATGATAATGCATTATCATTAATAAAGATATGGTCTAAAAAAACAAATAAAATCTATTTATTAACAGAAACAAAAAATAACATAAAAACACTTTCTTGGTCAAGAAATGGAAATTTTATTGCTTATGTTACTGAAAATAAAAAAGATTTTTATATAGATAAAAATAAATTAAAGATATTTTCATCTTCAGTGCGTAACGATGAAATGCACATTATAGAGATAGATTATAAAAATATCAAAAAAAATAAAGACAAAATAATAATAAGTAAATATATTCAAGGAAACAAATTTTCATATATTGGTAATTTAAGTTGGTCAAAAGATGATAAAGATATTGCATTTAGCCATGATATAGGTGATAGAAATGACCTATGGAATCTCGGTATTATATCAACAATAAACCTAATGACCAATAAAATAAATACAATAAATATCTTTAAACAACGAATGATAATGCAGCAACCTCATTATTCACCTGATGGTCAATATTTACTATTTACTGCAAGCCCTGAACAAGTATGGTCACCTCGATTTTGTATTTATATGCAAAAAATAATAACAAAGAGTGTCACTAAATTAGCCTGTAGCTTCGATCAAGATCCAAAACTTGTTGGTTGGAGTAAAAGTGGTAAAAATATTATTTTTACAGAAAATTTTCATACTTGGCGCAATATTTATAGTCTTTCTACTGACAGAGAAGATATTACTACTAAGGTAGTGAAAATAAATAAGTCAAATTCCCTGATTGATACTGTAAGTATCAATTCTAAAGGCGAAATAGCAATAGTACAGCAAAACAGCAAAAAAGCTGAAGAAATTTACCTAACAAACTTAATCCGCTATCAGCCACAAATCATTACTAATATTAATACGCGCTATACTAAATTTTCAGAGACTTTAGGAAAAACTGAGAAAATCAATTGGAAAAGCAAAGATGGACTAACAATATCAGGCCTACTTACTTATCCTGAAAATTACAATAAATCAAAAAAATATCCGCTGATTATTGAGCTACACGGCGGCCCTGCAGATGTTTTTCAAAACAGATTTATAGGAAGACGCTCTGTTTTTCCTATAGCAACTTTTTCAAAAGAAGGCTATTTTTATTTGAGACCTAATGTAAGAGGCTCATCTGCTTATGGTGTTTACTTTAAAGAATTAAATCATGGTGACTGGGGAGGTAAAGATTACCAAGATATAATGGATGGAATACAATATCTAAATGATAAAAATATCATTGATAGTAAAAAAATCTCTATCATTGGTTGGAGTTATGGAGGCTATTTAACTGCACAAGCGATTACACACAGTCCGCTATTTAAGGCTGCAATTATTGGTGGAGGAATTACAGATTTGGCAAGCTACAGCGTGACGAATGATTTACCAAACTACCTAAAACTTAATTTAGGTGGATACCTTTGGGATAAACCAAAGTTTTATCAAAAACGTTCGCCAATTTATGCTGCTAATCATGTAACAACTCCCACTTTACTAATGTATGGAGAAAACGATATACGAGTTCCTTTATCTCAAGGAGTTGAATTTTTCAATATTTTGAAATTAAGAAACATCCCAAGTATGATGTTGATTTATCCAAAACAGTATCACTCATTATCAGATCCAAACTATATTATCGATGCAGGAATAAGAAATGTATCATGGATTAATAAATATAGCCGAGCAGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTGGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGCCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038935|17458:25469|18151_18433_+|WP_052133268.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP038935|17458:25469|20624_20801_-|WP_155046774.1|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAVVLPFKGLILLKSFTSSHSNSLLISVDCYTILKSKFFATAASHGVLSTG
>NZ_CP038935|17458:25469|20044_20413_+|WP_129556740.1|DBSCAN-SWA
MIFRQLFDNQTSTYTYLIASDYGKESIIIDPVDSKIDSYIQLLSELSLKLVYSIDTHVHADHVTGSGLLMQQTNCKIIMGKQSKAENISLKANENEPIKIDNLTIQPALVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038935|17458:25469|22668_24711_+|WP_155069108.1|DBSCAN-SWA
MILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNIKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSGV
>NZ_CP038935|17458:25469|18505_18970_-|WP_016212274.1|DBSCAN-SWA
MELKLSYPAKFEEDNEVGGYVVSFRDLPNIFTDGETIEEAMYNARDVLNLLLTEMIADKHTITEPSDIRKSEILIPVSPQVAAPILLHKLRELREYSLAQVARRLNVPYQNYQQIEKGENLTLKRFERAAEAMGARVEIILRFDDEDSIDLASA
>NZ_CP038935|17458:25469|18980_19175_-|WP_032126154.1|DBSCAN-SWA
MPISGKSVIRQLEKYGWKHTRTSGSHHIMKKQGLPPISVPVHANRDLGRGILKKIEKATGVTFE
>NZ_CP038935|17458:25469|24740_25469_+|WP_129556739.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKPIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP038935|17458:25469|19390_19981_+|WP_032126152.1|integrase|DBSCAN-SWA
MGLSKQARILSERQERIIITHLKSTIAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFNSDGQIGDCIHLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALITLFQSNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIRAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI
>NZ_CP038935|17458:25469|21019_22021_-|WP_054300579.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP038935|17458:25469|17458_18130_+|WP_129556741.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
11063:11122	attL	NA	NA	NA	NA
WP_129556741.1|17458_18130_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.4e-10	30.4
WP_052133268.1|18151_18433_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-11	38.7
WP_016212274.1|18505_18970_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126154.1|18980_19175_-	addiction module toxin, HicA family	A0A1X9I5T5	Streptococcus_phage	2.8e-10	48.4
WP_032126152.1|19390_19981_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8
WP_129556740.1|20044_20413_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155046774.1|20624_20801_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300579.1|21019_22021_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.0
WP_155069108.1|22668_24711_+	prolyl oligopeptidase family serine peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556739.1|24740_25469_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
24791:24982	attR	NA	NA	NA	NA

4. NZ_CP038933

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP038933_1

• CRISPR_ID: NZ_CP038933_1
• CRISPR_location: 197038-197261
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP038933_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP038933_1

>1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038933_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP038933_1

>merge|NZ_CP038933|1|197038-197261|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP038933|1|1|197038-197261|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP038933.1|WP_016211879.1|195806_196826_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP038933.1|WP_054300202.1|205020_205749_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038933.1|WP_155049199.1|199395_199641_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038933.1|WP_054300477.1|202185_202914_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038933.1|WP_059372616.1|194250_194841_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP038933.1|WP_054300202.1|198698_199427_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038933.1|WP_075273822.1|189325_189826_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP038933.1|WP_075275154.1|204234_204891_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP038933.1|WP_155046769.1|192689_192860_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038933.1|WP_075274741.1|189927_190185_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038933.1|WP_032126838.1|187529_187733_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038933.1|WP_075273751.1|200295_202026_+|PLD-like-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|197207
NZ_CP038933.1|WP_129556718.1|190253_191440_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP038933.1|WP_081377350.1|193189_194005_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP038933.1|WP_155047019.1|200130_200283_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038933.1|WP_155046770.1|198475_198643_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP038933.1|WP_075275153.1|205993_206791_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376667
NZ_CP038933.1|WP_016212255.1|187729_187900_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP038933.1|WP_075273820.1|188086_189169_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP038933.1|WP_016211879.1|195806_196826_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP038933.1|WP_054300202.1|205020_205749_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038933.1|WP_155049199.1|199395_199641_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	5.15472e-08
NZ_CP038933.1|WP_059372616.1|194250_194841_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	6.85681e-23
NZ_CP038933.1|WP_054300202.1|198698_199427_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP038933.1|WP_075273822.1|189325_189826_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	3.05671e-28
NZ_CP038933.1|WP_075273751.1|200295_202026_+|PLD-like-domain-protein	gnl|CDD|197207	cd09108, PLDc_PMFPLD_like_1, Catalytic domain, repeat 1, of phospholipase D from Streptomyces Sp. Strain PMF and similar proteins. Catalytic domain, repeat 1, of phospholipases D (PLD, EC 3.1.4.4) from Streptomyces Sp. Strain PMF (PMFPLD) and similar proteins, which are generally extracellular and bear N-terminal signal sequences. PMFPLD hydrolyzes the terminal phosphodiester bond of phospholipids with the formation of phosphatidic acid and alcohols. Phosphatidic acid is an essential compound involved in signal transduction. It also catalyzes a transphosphatidylation of phospholipids to acceptor alcohols, by which various phospholipids can be synthesized. In contrast to eukaryotic PLDs, PMFPLD has a compact structure, which consists of two catalytic domains, but lacks the regulatory domains. Each catalytic domain contains one copy of the HKD motif (H-x-K-x(4)-D, where x represents any amino acid residue) that characterizes the PLD superfamily. Two HKD motifs from two domains form a single active site. Like other PLD enzymes, PMFPLD may utilize a common two-step ping-pong catalytic mechanism involving an enzyme-substrate intermediate to cleave phosphodiester bonds. The two histidine residues from the two HKD motifs play key roles in the catalysis. Upon substrate binding, a histidine residue from one HKD motif could function as the nucleophile, attacking the phosphodiester bond to create a covalent phosphohistidine intermediate, while the other histidine residue from the second HKD motif could serve as a general acid, stabilizing the leaving group. A calcium-dependent PLD from Streptomyce chromofuscus is excluded from this family, since it displays very little sequence homology with other Streptomyces PLDs. Moreover, it does not contain the conserved HKD motif and hydrolyzes the phospholipids via a different mechanism.	5.20027e-25
NZ_CP038933.1|WP_129556718.1|190253_191440_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	5.96251e-84
NZ_CP038933.1|WP_081377350.1|193189_194005_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP038933.1|WP_054300477.1|202185_202914_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.12573e-50
NZ_CP038933.1|WP_155046770.1|198475_198643_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP038933.1|WP_075275153.1|205993_206791_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein	gnl|CDD|376667	pfam01925, TauE, Sulfite exporter TauE/SafE. This is a family of integral membrane proteins where the alignment appears to contain two duplicated modules of three transmembrane helices. The proteins are involved in the transport of anions across the cytoplasmic membrane during taurine metabolism as an exporter of sulfoacetate. This family used to be known as DUF81.	2.11607e-23
NZ_CP038933.1|WP_075275154.1|204234_204891_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	8.27093e-49
NZ_CP038933.1|WP_075273820.1|188086_189169_-|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	4.76533e-23

Protein sequences

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NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55726-55767	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	55804-55845	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	56014-56055	0	1.0
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NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
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NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1467-1508	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1677-1718	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92334-92375	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137266-137307	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1389-1430	0	1.0
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NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137267-137308	0	1.0
NZ_CP038933_1	1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT	197195-197236	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|197063|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|197130|40|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|197195|42|NZ_CP038933|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2323 : 29979	27	Streptococcus_phage(36.36%)	transposase,integrase	NA
DBSCAN-SWA_2	63202 : 161004	117	Streptococcus_phage(13.04%)	head,integrase,protease,transposase,tail,capsid	attL 63550:63609|attR 164577:165439
DBSCAN-SWA_3	164641 : 211063	55	Streptococcus_phage(26.32%)	transposase,integrase	attL 190513:190572|attR 209993:210947

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP038933|2323:29979|DBSCAN-SWA
AATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAATTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGCAATGGCTCAACCTTACGTGAAACCACCACGTATTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGTGTAGAACTTTAGATCTAATCTGACACTTGGGCCATATTGAACTAAATTTTCAATATGGATAATTAATCACACAAGGAGTGTTGTGATGACAAGTTTATCAGAAAAAATAATTAAGCCTAAACTAGGAGTTTTAGAATTAGCTAAACAATTAGGTAATGTTTCTAAGGCATGCGAAGTGATGGGGTATTCTCGAGATAGTTTTTATCGCTTCAAAAAGCTTTATGAAACGGGTGGCGAAGAAGCTTTGCAAGAGATTAGCAAGAAGAGGCCAAATGTGAAAAACCGTGTTCCTGAGCATATTGAGCAGGCAGTCATTGATTTAGCCATTGAAAACCCAGCGTTAGGTCAACTCCGTGCATCAAACGAACTGTTACAGAGAGGGGTCATAGTATCGAGTAGTGGTGTGCGATCAGTCTGGTTAAGGAATGGCCTTGAGACGTTCAAGAAGAGGCTCAAAGCGCTTGAAGCCAAATCAGCACAAGATGGAATTTTGCTGACGGAAGAGCAACTGCAAGCACTTGAGAAAGCAAAACAAGAAAAAGAAGCACATGGAGAAATTGAGACTGAACACCCAGGCTATCTCGGCTCCCAAGACACCTATTACGTTGGAACAATGAAAGGTGTTGGAAGAATTTATCAGCAGACATTTGTTGATACCTACAGCAGGGTTGCATTTGCTTGCCTGTATACCGAAAAAAATGCAGTGACGGCAGCTCATGCGCTGAATGAAAGTGTAATCCCCTGGTTTGAAGAGCGAGATACTCCATTGCTACGCATTTTAACTGATCGGGGAACAGAGTATTGCGGCAAGATAGAACATCACGCTTATCAGCTTTATTTAGCGATCGAAGATGTAGATCACACCAGAACAAAAGCCCGTTCACCTCAAACAAATGGTATTTGTGAACGCTTTCATCGCACGATGAAACAAGAGTTTTATGACATTGCTTTTCGTAAAAAAGTCTATAATTCACTTGAGGAGCTGCAAGTTGATGTTGATGAGTGGTTGATAAAGTACAATCAGCATCGGCCACATTCTGGGAAATACTGTTATGGAAAAACACCAATGCAAACATTTCAGGACTCAAAACATTTAGCACAAGAAAAAATAATCAATAAAAATGTGCAATCTGACAGTCTGATCAATCAGACAAATGTTGTCAGATGATTTAAGCTTGTCAGATCATATCTGGAGTTTTACAGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGCAGCGAACATAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCCCTATAACTTTTCGCAACAGTGCCGTTTTTCACATTTGGCTTCTTCTTGCTAATCTCTTGCAAAGCTTCTTCGCCACTCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCTCTTAGTCAGTCATATAATATAAGTAGCAGCCGGATTATCAAACAATTCAATTGGCCGGATATAACGATCTAGTGCAGCGGAACTGTGTTGACTCACCTGGCGTAACTTTTCCCCAGGCGCTCCATTGAGTTTTGCTTGCGTTAAAAAACCAGCTCTAAAACTATGAGGTGTATAACCTGATAAGCCTGAATGATTGAGATATTTATTAAGAATATGATCAACTGCACTACTCGACAGAGGTTTGTATTGCAACTGCTCCCCTTTTTTAATCTCTCTAAAAATGGAGCCTTCTTTAATGTTTGAGCGTTGAAACCAACACTGCATCAATGTTACCGGACAATATCGATAAGTTGGTTGTAATATGATAGGCACTTGCAGCAACTTTTCACCTGCCTGATTAATTTTATTACGCCCAAGATTAAATAGCACACCTTTGCCACTCACCCACTCAAAATCTTCAATATTAGCAGCCACCACTTCAGATTTTCTGAAGGCACCAAACCACAACCAAGATAACAGTGTTACATCACGTAATCCGGTTAATGTATTTTTATCAATCACCGCCAATAATCTCTCGAAGTCATTTTTAAGCAACGGCTTTGCTTGTTTTGGTCTGTAGTTATCATTGCGCTTGATTGCAAATAAGATGGCTTTGACCTGCATTGAGTCACTAAAACTCTTAAATCCCATCTTAATATGCTTGGAATTAATGGCTGCCAATGACTTTTGAATGGTTGTTCTTTTAAGATTTTTTTTCTTATACAGGTAGTGCAAAAAAAGTGCGACCGCTCCTTCATCCGCCGGTAAAGGGACTAAGCCTAATTTATAGCAGTAATTTTCAAAATCTTTCCAGGGCTTTGCATAGGCTGTTTCTGTGCTTTTTGCTGTTTGATTATCTTTAACAAATGCTTCAAGGTCTTTGAGTGATTGCAGTAACTCTGAAGAACTGTCTATTTTCATTAATTTATCCATACTGCAACCACAACCGATCTATACTATAGTTTATTTTTAGAGCCTTTCGATAGACCCACTTTTTTGGTGGTCGTTGTTTTTTTTTCCTTAGGCTTCTTTGCAACTACTTTTTTAGAAGAAGCTTTTTTAGTTGTTGTTTTACTCGTTACTGACTTTTTAGCTGGCTTATCATCATCTAAAATTTCACCCAACTTTTTCCAAGTGATTTTTTTATTGTTTAAGGTGATACCACTACTACTGACTGCTAACGTACCAAACTTTTTAGAACCATCTTTAATCTCAAAAGTCATTCCTTTTGCTTTAACGTCTAAATCGCCTAAGTTCAGTGTTACTTTCATAAAATAGCCTTTTATTTTTAAGTTATTAACCTTAACTCATGTTACGCGCTTAACCTTTAAGCCATACTTCTAAGCTCCTGAAGTGCAATTTGATTAGCCCTTAATATCAGCTTATATTTTATTGCAAAATGGTTTAAAGATTTTTTCAATTTTAATCTTTCCAATCTGCAAAACCCAAGAATACTGTAATAAATATGGTTCAACT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212150.1|6802_7117_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923686.1|7173_8223_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211886.1|10401_10830_-	nucleotidyltransferase substrate-binding, HI0074 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211890.1|16463_19040_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274822.1|19445_20420_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_075274931.1|20620_21349_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	43.1
WP_016212137.1|21792_22854_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212139.1|22929_23175_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274955.1|24578_25553_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
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WP_033923779.1|29142_29979_+|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.2e-41	36.3

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP038933|63202:161004|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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63550:63609	attL	NA	NA	NA	NA
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115910:116211	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016211912.1|155876_156467_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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>NZ_CP038933|164641:211063|172418_172727_+|WP_155062493.1|transposase|DBSCAN-SWA
MGQNLLILKRLFRDLLWLRKEMSFIYRSRYMVLRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300202.1|164641_165370_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_054300590.1|165399_165624_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|165931_166132_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|166125_166461_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|167026_167290_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211872.1|167844_168648_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307367.1|168768_169293_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|169401_169626_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126346.1|169717_169960_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|170026_170767_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|170814_171243_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|171576_172305_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_155062493.1|172418_172727_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|172686_173142_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_054300148.1|173247_174309_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|174348_174852_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126739.1|175166_175499_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556701.1|175745_176270_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275159.1|176678_177386_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	3.8e-12	32.0
WP_129556702.1|177406_178559_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273327.1|179543_180119_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_032126362.1|180064_180430_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212398.1|181777_182239_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|182501_183338_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_129556717.1|183663_184890_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|185544_186519_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.4e-25	30.7
WP_016212260.1|186676_186949_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212257.1|186968_187193_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126838.1|187529_187733_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212255.1|187729_187900_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|188086_189169_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_075273822.1|189325_189826_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274741.1|189927_190185_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|190253_191440_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
190513:190572	attL	NA	NA	NA	NA
WP_155046769.1|192689_192860_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377350.1|193189_194005_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372616.1|194250_194841_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	6.8e-23	38.8
WP_016211879.1|195806_196826_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211878.1|196838_198179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046770.1|198475_198643_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|198698_199427_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_155049199.1|199395_199641_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047019.1|200130_200283_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273751.1|200295_202026_+	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300477.1|202185_202914_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.6
WP_155047020.1|203070_203994_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275154.1|204234_204891_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.6e-31	40.7
WP_054300202.1|205020_205749_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_075275153.1|205993_206791_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275152.1|206900_207770_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155069099.1|207766_208351_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275150.1|208551_209040_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377912.1|209088_209451_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	1.3e-05	37.5
WP_081377345.1|209567_210092_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.4e-27	46.5
WP_036774259.1|210088_211063_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
209993:210947	attR	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP038933.1|WP_155046767.1|122207_122369_+|hypothetical-protein	122207_122369_+	53 aa aa	NA	HTH_21	NA	63202-161004	yes
NZ_CP038933.1|WP_016212298.1|152477_152804_-|hypothetical-protein	152477_152804_-	108 aa aa	NA	HTH_21	NA	63202-161004	yes
NZ_CP038933.1|WP_016211913.1|157601_158723_-|hypothetical-protein	157601_158723_-	373 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	63202-161004	yes
NZ_CP038933.1|WP_016212499.1|162002_162377_+|hypothetical-protein	162002_162377_+	124 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	No	NA
NZ_CP038933.1|WP_016212398.1|181777_182239_-|hypothetical-protein	181777_182239_-	153 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	164641-211063	yes
NZ_CP038933.1|WP_016212260.1|186676_186949_+|hypothetical-protein	186676_186949_+	90 aa aa	NA	HTH_38	NA	164641-211063	yes
NZ_CP038933.1|WP_016212257.1|186968_187193_+|hypothetical-protein	186968_187193_+	74 aa aa	NA	HTH_38	NA	164641-211063	yes
NZ_CP038933.1|WP_032126838.1|187529_187733_+|hypothetical-protein	187529_187733_+	67 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	164641-211063	yes
NZ_CP038933.1|WP_155046769.1|192689_192860_+|hypothetical-protein	192689_192860_+	56 aa aa	NA	HTH_21	NA	164641-211063	yes
NZ_CP038933.1|WP_075275150.1|208551_209040_+|hypothetical-protein	208551_209040_+	162 aa aa	NA	HTH_38,HTH_1,HTH_21	NA	164641-211063	yes
NZ_CP038933.1|WP_129556703.1|215347_215836_+|hypothetical-protein	215347_215836_+	162 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	No	NA

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_155046767.1|122207_122369_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_155046767.1|122207_122369_+|hypothetical-protein
MRTNYHIKQRIRITRRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	138176-138139	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	144800-144763	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	115403-115440	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	129322-129359	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 138176-138139, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 144800-144763, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 115403-115440, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 129322-129359, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_016212298.1|152477_152804_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_016212298.1|152477_152804_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	138176-138139	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	144800-144763	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	115403-115440	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	129322-129359	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 138176-138139, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 144800-144763, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 115403-115440, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 129322-129359, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_016211913.1|157601_158723_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_016211913.1|157601_158723_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	138176-138139	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	144800-144763	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	115403-115440	0
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	129322-129359	0

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 138176-138139, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 144800-144763, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 115403-115440, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 129322-129359, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_016212499.1|162002_162377_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_016212499.1|162002_162377_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_016212398.1|181777_182239_-|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_016212398.1|181777_182239_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	180456-180493	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 180456-180493, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_016212260.1|186676_186949_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_016212260.1|186676_186949_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	180456-180493	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 180456-180493, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_016212257.1|186968_187193_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_016212257.1|186968_187193_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	180456-180493	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 180456-180493, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_032126838.1|187529_187733_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_032126838.1|187529_187733_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	180456-180493	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 180456-180493, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_155046769.1|192689_192860_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_155046769.1|192689_192860_+|hypothetical-protein
MPCSKTPEMSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	180456-180493	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 180456-180493, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_075275150.1|208551_209040_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_075275150.1|208551_209040_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

HTH_38,HTH_1,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP038932_1	Orphan	1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder	363273-363310	38	180456-180493	1

1. spacer 1.1|363273|38|NZ_CP038932|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 position: 180456-180493, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
********************************** ***

Protein sequences of NZ_CP038933.1|WP_129556703.1|215347_215836_+|hypothetical-protein

>NZ_CP038933.1|WP_129556703.1|215347_215836_+|hypothetical-protein
MLNMPKPRYALVDNSKERSIKNGNCGYYAYALGLMSYLCKDHKINLAKEIWQRFDLGEKDKSSLNSIIEEKNAFMSLKNQRTITRLLRPVLREKNIENIINIFSDQDCKDSAYHSPLIWKIKKMIAGQLLRPQRWLLGEAFDPDGIFSGTELLRAPGIYDQC

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273