CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039046	Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 chromosome, complete genome	2 crisprs	DEDDh,DinG,csa3	0	0	29	0
NZ_CP039049	Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP039047	Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	3	0
NZ_CP039048	Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP039046

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039046_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039046_1
• CRISPR_location: 1084776-1084871
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039046_1

Consensus_repeat	Method
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039046_1

>1.1|1084800|48|NZ_CP039046|CRISPRCasFinder
ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039046_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039046_1

>merge|NZ_CP039046|1|1084776-1084871|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

>NZ_CP039046|1|1|1084776-1084871|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC
CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039046.1|WP_017377998.1|1098786_1099317_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|284031
NZ_CP039046.1|WP_017378004.1|1091242_1094782_+|chromosome-segregation-protein-SMC	unknown	unknown	gnl|CDD|274008
NZ_CP039046.1|WP_155046604.1|1079325_1079466_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_155069527.1|1101216_1102104_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_155069525.1|1088018_1089422_-|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP039046.1|WP_027243145.1|1097720_1098776_+|protease-SohB	unknown	unknown	gnl|CDD|236978
NZ_CP039046.1|WP_017378003.1|1094848_1095679_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367907
NZ_CP039046.1|WP_048875964.1|1078478_1079258_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP039046.1|WP_027242834.1|1075223_1076531_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_017378005.1|1090409_1091129_-|sulfate-transporter-CysZ	unknown	unknown	gnl|CDD|179898
NZ_CP039046.1|WP_155069524.1|1079722_1080313_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP039046.1|WP_017378009.1|1082370_1084116_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP039046.1|WP_036773465.1|1095665_1097705_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	unknown	unknown	gnl|CDD|236137
NZ_CP039046.1|WP_144420648.1|1080495_1081968_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP039046.1|WP_036773793.1|1076990_1077368_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_017378007.1|1085929_1087873_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226654
NZ_CP039046.1|WP_155069522.1|1073083_1074166_+|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP039046.1|WP_017376708.1|1077512_1077914_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP039046.1|WP_017378006.1|1089541_1090171_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381113
NZ_CP039046.1|WP_146619530.1|1074217_1074475_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039046.1|WP_017377998.1|1098786_1099317_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|284031	pfam06508, QueC, Queuosine biosynthesis protein QueC. This family of proteins participate in the biosynthesis of 7-carboxy-7-deazaguanine. They catalyze the conversion of 7-deaza-7-carboxyguanine to preQ0.	1.95217e-24
NZ_CP039046.1|WP_017378004.1|1091242_1094782_+|chromosome-segregation-protein-SMC	gnl|CDD|274008	TIGR02168, Chromosome_partition_protein_Smc, chromosome segregation protein SMC, common bacterial type. SMC (structural maintenance of chromosomes) proteins bind DNA and act in organizing and segregating chromosomes for partition. SMC proteins are found in bacteria, archaea, and eukaryotes. This family represents the SMC protein of most bacteria. The smc gene is often associated with scpB (TIGR00281) and scpA genes, where scp stands for segregation and condensation protein. SMC was shown (in Caulobacter crescentus) to be induced early in S phase but present and bound to DNA throughout the cell cycle. [Cellular processes, Cell division, DNA metabolism, Chromosome-associated proteins].	0
NZ_CP039046.1|WP_155069524.1|1079722_1080313_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.79703e-09
NZ_CP039046.1|WP_155069525.1|1088018_1089422_-|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	2.07153e-13
NZ_CP039046.1|WP_027243145.1|1097720_1098776_+|protease-SohB	gnl|CDD|236978	PRK11778, PRK11778, putative inner membrane peptidase; Provisional.	0
NZ_CP039046.1|WP_017378003.1|1094848_1095679_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|367907	pfam04354, ZipA_C, ZipA, C-terminal FtsZ-binding domain. This family represents the ZipA C-terminal domain. ZipA is involved in septum formation in bacterial cell division. Its C-terminal domain binds FtsZ, a major component of the bacterial septal ring. The structure of this domain is an alpha-beta fold with three alpha helices and a beta sheet of six antiparallel beta strands. The major loops protruding from the beta sheet surface are thought to form a binding site for FtsZ.	1.17377e-13
NZ_CP039046.1|WP_048875964.1|1078478_1079258_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00345182
NZ_CP039046.1|WP_017378005.1|1090409_1091129_-|sulfate-transporter-CysZ	gnl|CDD|179898	PRK04949, PRK04949, putative sulfate transport protein CysZ; Validated.	2.22151e-69
NZ_CP039046.1|WP_017378009.1|1082370_1084116_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	0.000214736
NZ_CP039046.1|WP_036773465.1|1095665_1097705_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	gnl|CDD|236137	PRK07956, ligA, NAD-dependent DNA ligase LigA; Validated.	0
NZ_CP039046.1|WP_144420648.1|1080495_1081968_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	9.17808e-06
NZ_CP039046.1|WP_017378006.1|1089541_1090171_-|response-regulator	gnl|CDD|381113	cd17569, REC_HupR-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of hydrogen uptake protein regulator (HupR) and similar domains. This family is composed of mostly uncharacterized response regulators with similarity to the REC domains of response regulator components of two-component systems that regulates hydrogenase activity, including HupR and HoxA. HupR is part of the HupT/HupR system that controls the synthesis of the membrane-bound [NiFe]hydrogenase, HupSL, of the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus. It contains an N-terminal REC domain, a central sigma-54 interaction domain that lacks ATPase activity, and a C-terminal DNA-binding domain. Members of this family contain a REC domain and various output domains including the cyclase homology domain (CHD) and the c-di-GMP phosphodiesterase domains, HD-GYP and EAL. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	1.63665e-55
NZ_CP039046.1|WP_017378007.1|1085929_1087873_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226654	COG4191, COG4191, Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system [Signal transduction mechanisms].	6.24409e-47
NZ_CP039046.1|WP_155069522.1|1073083_1074166_+|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	4.83225e-13
NZ_CP039046.1|WP_017376708.1|1077512_1077914_-|transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00109659

Protein sequences

>NZ_CP039046.1|WP_017378009.1|1082370_1084116_-|hypothetical-protein
MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP
>NZ_CP039046.1|WP_144420648.1|1080495_1081968_-|hypothetical-protein
MPTTMIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN
>NZ_CP039046.1|WP_155069524.1|1079722_1080313_-|hypothetical-protein
MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTGDCWYSSIENLKFIRKYNLGMLFAIENNRIISSET
>NZ_CP039046.1|WP_155046604.1|1079325_1079466_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ
>NZ_CP039046.1|WP_048875964.1|1078478_1079258_-|hypothetical-protein
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP039046.1|WP_017376708.1|1077512_1077914_-|transposase
MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039046.1|WP_036773793.1|1076990_1077368_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS
>NZ_CP039046.1|WP_146619530.1|1074217_1074475_+|hypothetical-protein
MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039046.1|WP_155069522.1|1073083_1074166_+|IS4-family-transposase
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>NZ_CP039046.1|WP_017378007.1|1085929_1087873_-|hypothetical-protein
MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS
>NZ_CP039046.1|WP_155069525.1|1088018_1089422_-|IS4-family-transposase
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEEDQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMLHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP039046.1|WP_017378006.1|1089541_1090171_-|response-regulator
MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD
>NZ_CP039046.1|WP_017378005.1|1090409_1091129_-|sulfate-transporter-CysZ
MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK
>NZ_CP039046.1|WP_017378004.1|1091242_1094782_+|chromosome-segregation-protein-SMC
MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE
>NZ_CP039046.1|WP_017378003.1|1094848_1095679_+|hypothetical-protein
METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG
>NZ_CP039046.1|WP_036773465.1|1095665_1097705_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA
MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN
>NZ_CP039046.1|WP_027243145.1|1097720_1098776_+|protease-SohB
MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR
>NZ_CP039046.1|WP_017377998.1|1098786_1099317_+|hypothetical-protein
MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE
>NZ_CP039046.1|WP_155069527.1|1101216_1102104_-|hypothetical-protein
MTKKRFISLDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSLQG

Crispr_ID: NZ_CP039046_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039046_2
• CRISPR_location: 1551931-1552041
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039046_2

Consensus_repeat	Method
AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039046_2

>2.1|1551958|57|NZ_CP039046|CRISPRCasFinder
GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039046_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039046_2

>merge|NZ_CP039046|2|1551931-1552041|CRISPRCasFinder
AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA

>NZ_CP039046|2|2|1551931-1552041|CRISPRCasFinder
AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA	GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC
GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039046.1|WP_027243096.1|1545599_1546232_+|MarC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225006
NZ_CP039046.1|WP_155046590.1|1557531_1557696_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_017375696.1|1559779_1560163_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_036774017.1|1557697_1558573_-|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NZ_CP039046.1|WP_027243098.1|1546518_1547664_-|carboxypeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|349453
NZ_CP039046.1|WP_144420683.1|1544766_1545423_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_036774259.1|1555860_1556835_-|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP039046.1|WP_017376798.1|1540942_1541578_-|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP039046.1|WP_155046588.1|1550328_1550538_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_027243095.1|1542492_1544778_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_144420681.1|1557166_1557352_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_017377787.1|1561363_1561591_+|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP039046.1|WP_027243097.1|1546267_1546453_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_027242577.1|1554562_1555864_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273036
NZ_CP039046.1|WP_155069598.1|1558888_1559764_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	unknown	unknown	gnl|CDD|225212
NZ_CP039046.1|WP_027243099.1|1547899_1549213_+|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236722
NZ_CP039046.1|WP_144420682.1|1551072_1551234_-|phosphatase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_017376797.1|1541859_1542219_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039046.1|WP_027242578.1|1554008_1554545_-|DUF2062-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378263
NZ_CP039046.1|WP_017376785.1|1552640_1553546_+|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|182768

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039046.1|WP_027243096.1|1545599_1546232_+|MarC-family-protein	gnl|CDD|225006	COG2095, MarC, Multiple antibiotic transporter [Intracellular trafficking and secretion].	1.76545e-45
NZ_CP039046.1|WP_017377787.1|1561363_1561591_+|transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	1.04645e-12
NZ_CP039046.1|WP_155069598.1|1558888_1559764_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	gnl|CDD|225212	COG2333, ComEC, Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) [General function prediction only].	1.33568e-72
NZ_CP039046.1|WP_027242577.1|1554562_1555864_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein	gnl|CDD|273036	TIGR00361, Recombination_protein_2, DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2. Apparant orthologs are found in 5 species so far (Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus pneumoniae), of which all but E. coli are model systems for the study of competence for natural transformation. This protein is a predicted multiple membrane-spanning protein likely to be involved in DNA internalization. In a large number of bacterial species not known to exhibit competence, this protein is replaced by a half-length N-terminal homolog of unknown function, modelled by the related model ComEC_N-term. The role for this protein in species that are not naturally transformable is unknown. [Cellular processes, DNA transformation].	2.99327e-41
NZ_CP039046.1|WP_036774017.1|1557697_1558573_-|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.54754e-84
NZ_CP039046.1|WP_027243099.1|1547899_1549213_+|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236722	PRK10590, PRK10590, ATP-dependent RNA helicase RhlE; Provisional.	0
NZ_CP039046.1|WP_027242578.1|1554008_1554545_-|DUF2062-domain-containing-protein	gnl|CDD|378263	pfam09835, DUF2062, Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062). This domain, found in various prokaryotic proteins, has no known function.	2.12897e-42
NZ_CP039046.1|WP_036774259.1|1555860_1556835_-|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	2.90621e-79
NZ_CP039046.1|WP_027243098.1|1546518_1547664_-|carboxypeptidase-family-protein	gnl|CDD|349453	cd06234, M14_PaCCP-like, Peptidase M14-like domain of ATP/GTP binding proteins and cytosolic carboxypeptidases similar to Pseudomonas aerugnosa CCP (PaCCP). A bacterial subgroup of the Peptidase M14-like domain of Nna-1 (Nervous system Nuclear protein induced by Axotomy), also known as ATP/GTP binding protein (AGTPBP-1) and cytosolic carboxypeptidase (CCP)-like proteins. This subgroup includes PaCCP from Pseudomonas aeruginosa, a carboxypeptidase homologous to M14D subfamily of human CCPs. Structural complexes with well-known inhibitors of metallocarboxypeptidases indicate that PaCCP might only possess C-terminal hydrolase activity against cellular substrates of particular specificity. The Peptidase M14 family of metallocarboxypeptidases are zinc-binding carboxypeptidases (CPs) which hydrolyze single, C-terminal amino acids from polypeptide chains, and have a recognition site for the free C-terminal carboxyl group, which is a key determinant of specificity. Nna1-like proteins are active metallopeptidases that are thought to act on cytosolic proteins (such as alpha-tubulin in eukaryotes) to remove a C-terminal tyrosine. Nna1-like proteins from the different phyla are highly diverse, but they all contain a unique N-terminal conserved domain right before the CP domain. It has been suggested that this N-terminal domain might act as a folding domain.	9.10914e-164
NZ_CP039046.1|WP_017376798.1|1540942_1541578_-|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.53606e-35
NZ_CP039046.1|WP_017376785.1|1552640_1553546_+|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|182768	PRK10837, PRK10837, putative DNA-binding transcriptional regulator; Provisional.	3.43302e-86

Protein sequences

>NZ_CP039046.1|WP_144420682.1|1551072_1551234_-|phosphatase
MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039046.1|WP_155046588.1|1550328_1550538_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP
>NZ_CP039046.1|WP_027243099.1|1547899_1549213_+|DEAD/DEAH-box-helicase
MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK
>NZ_CP039046.1|WP_027243098.1|1546518_1547664_-|carboxypeptidase-family-protein
MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR
>NZ_CP039046.1|WP_027243097.1|1546267_1546453_-|hypothetical-protein
MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE
>NZ_CP039046.1|WP_027243096.1|1545599_1546232_+|MarC-family-protein
MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA
>NZ_CP039046.1|WP_144420683.1|1544766_1545423_-|hypothetical-protein
MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP
>NZ_CP039046.1|WP_027243095.1|1542492_1544778_+|hypothetical-protein
MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV
>NZ_CP039046.1|WP_017376797.1|1541859_1542219_+|hypothetical-protein
MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG
>NZ_CP039046.1|WP_017376798.1|1540942_1541578_-|LysE-family-translocator
MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN
>NZ_CP039046.1|WP_017376785.1|1552640_1553546_+|LysR-family-transcriptional-regulator
MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL
>NZ_CP039046.1|WP_027242578.1|1554008_1554545_-|DUF2062-domain-containing-protein
MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER
>NZ_CP039046.1|WP_027242577.1|1554562_1555864_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein
MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY
>NZ_CP039046.1|WP_036774259.1|1555860_1556835_-|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039046.1|WP_144420681.1|1557166_1557352_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039046.1|WP_155046590.1|1557531_1557696_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP039046.1|WP_036774017.1|1557697_1558573_-|IS982-family-transposase
MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
>NZ_CP039046.1|WP_155069598.1|1558888_1559764_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2
MCKIPTEVATLTLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV
>NZ_CP039046.1|WP_017375696.1|1559779_1560163_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ
>NZ_CP039046.1|WP_017377787.1|1561363_1561591_+|transposase
MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	31810 : 93955	54	uncultured_Caudovirales_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	123133 : 183712	53	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	196314 : 245908	52	Streptococcus_phage(12.5%)	protease,transposase	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039046|31810:93955|DBSCAN-SWA
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MIKKLILVDGSSYLFRAFHIPSLQELTNQAGEPTGVIYGVINMLRKLSDDFPDYQPIIIFDAKGKTFRHELYPEYKANRNSMPEELACQIKPLHDIITAMGLPLIIIEGVEADDVIGTLAKQAEYKNISVLISTGDKDMAQLVTDKIHLIDTMKDSYSDINKITEKFGVKPSQIIDYLSLIGDTSDNVPGIPSVGPKTAAKWLAQYETLENLIHHAKDIKGKVGERLRENINQLELAKKLVTIDCKVKLLSDFESIILYKNRNKEKLIKYFSHFEFKRWLAELNEDNQNKSNLNSQANYHTILTDQQLQDCIKRLKQATLFAIDTETTSLDSMQAKIVGLSVSTGADYSAYIPLAHDYIDAPDQLNQEETLLKLKPILEDNNQIKIGQNIKYDMNVLGQYNINLQGVQFDTMLESYLINSTATRHNLDALALLYLNHKTIHFEDIAGKGAKQLTFNQINIDQASHYAAEDADITLQLHKKIWPELESNKDLIDIYLNKEQPLIKVLSHMEQTGVLIDSNKLKLQSEAVTTRIHEIAEEVYTIADSTFNLSSTKQLQEILFDKLNLPVIKKTPKGKPSTAEDVLQELALDYELPKLILEHRSLSKLKSTYLDKLPLQVNPNTNRIHTSYHQAVTATGRLSSSNPNLQNIPIRTTEGRRIRDAFIAPTGYQLIAADYSQIELRIMAHLSGDESLIYAFENDLDIHTATASEVFNIEISQVTSEQRRRAKAVNFGLIYGMSAFGLAKQLGVERQEAQDYIDIYFARYPKVAEYMDNIRTQAKVDGYVKTVCGRRLHLPEINARNAIRRKAAERTAINAPMQGTAADIIKQAMINIHNWLQTSSLDVKMLMQVHDELVFEVAEKDREIAQKEIKNMMENAIQLTVPLIVETGYGYTWSEAH
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MVARFKDFFNASHAIEISHKKTPEYSATITQLPETRHLTKKDCWRQQKSQYPQGFPEKIKNKLEKLKENPEISAEDILYLECELLATPMAIYSQDSKKLNNHLFLTQGFCLENYINERIIAIYQDMLSHIEHHYHLQEQRRAIKLLELLI
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MINAADGRLVKVRKKIAVLDQSLSLDKLKRADIEKRIFLIESNIKQANVLIINNQNNINDKKLKLINLKEKQQQLKKNLFKQRQEINRYIKTIFLMGREPYLKLIFSQQDPKLFGRMQHYFQYIMKANLARLEQAEQTEQALNETKATLLVEKKQLERLIKQQEIDLKKLSHDKQLKDQLVTIISTSIDEKSKRLVDLYKNEKRLLALIEQLDQESLKFVQSQVKSFSLMKKQLLCPFNYINYDQAIKNLVMLRKNKPVFIPIKKGSQVQAAYYGQIVFANQLKGYGQLVIIDHAEGYMSLYGYNQKLLVSKGQWISAGDLIALSGQGSEGIGMYFELRHNNQVVSLKDWCQKINLA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_027242742.1|52093_53401_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	1.2e-24	28.4
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WP_027242741.1|54599_55325_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155069407.1|55790_57896_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378426.1|58110_58575_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420739.1|58594_59104_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420738.1|59488_60430_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|60471_61875_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017378420.1|63909_64287_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378416.1|66871_67771_-	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_080963576.1|67775_68402_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242705.1|68346_70668_-	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	7.9e-99	35.9
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WP_017378414.1|71290_72442_-	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
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WP_026063734.1|73173_74148_+|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	1.3e-10	35.9
WP_036773239.1|74137_75451_+	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_017378410.1|75491_76871_+	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_080963575.1|76877_78329_+	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|78354_78723_+	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017378407.1|78741_79809_-	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_027242707.1|79841_80738_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047927132.1|80734_81571_-	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378404.1|81706_82159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378403.1|82297_83044_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378402.1|83024_83588_-	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017378401.1|83596_84112_-	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
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WP_017378398.1|88149_88548_+	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275373.1|88773_89103_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046560.1|92252_92426_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376171.1|92980_93955_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039046|123133:183712|DBSCAN-SWA
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MSLEAVLATIKDHGVKFVDLRFTDTLGKEQHLSIPASAVDEELFEVGKMFDGSSIAGWKGIDESDMILMPDSSTAVLDPFCSEPTLNIRCDIVEPTLMSGYERDPRSIAKRAESYLQSTGIADQCLFGPEPEFFLLDDVRWGIDMHGAHYSIDSEEGAWNSAKRSEKGNIGHRPRVKGGYFPVPPVDSSHDIRSAMCQVMEKMGLTIEAHHHEVATANQNEIATGCNTLVLKADEMQILKYVVHNVAHEYGQTATFMPKPIVGDNGSGMHCHQSLSKNGQNIFAGNQYGGLSEEALFYVGGIIKHAKALNAFTNASTNSYKRLVPGFEAPVLLAYSARNRSASIRIPYVMTDKARRIEVRFPDPTANPYLAFAAMLMAGLDGIKNRIHPGDAMDKDLYDLPPEETKDIPRVAASLEEALAALDQDREFLTVGDVFTHSFIDSYITLKQRDVERLNMTTHPVEFDMYYSV
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MKFKRNISTLGMLFTALSGIIGSGWLFGPYFASQIAGPAAIFGWALAGILMIIIALNFTELATMYPEAGGLARFAHKSHGPIVGFTMAWVVWISSVIVAPIETLAALQYLATYVPSLMKQTGNSHKLSAMGIVFAAIVMFALCLINALGVKSAAKTNTVIVFFKFAIPLLTAIILLSHSFHTTNFTSHQFLPTGVHGVLAALPAAGIAFSFMGWSAAIQMAGEAKNPQRSLPIALIGAICIGIIIYSIIQVSFIGALPADALSHGWANLSFKGDMGPFAGLLTAIGLGAFVIMIYADAVYSPLGTVLVYTTATARVTHALASHRYVPTVLTKLSSRGVPVYALAINFIVGMCFFLPFPGWQAMAEFIVSAFIISYAIGPTALIVLRDTQPEQPRPFKLPAYKAFSMLAFYVCNMLLFWTGWYTVSKLIIIIIIGYGVYFSYFKFSKQRLDAGALFKAIWLIPYLIGVTVISYLGSYGGGHDFIHFGADFFIIALFSFIIFTLAYWCGIHGVKRSQSGTTSCQPQQV
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MRITTINIEINKLVRSWQKQGLSVGLIPTMGCLHQGHMSLVHHSQTTMDKTLVYIFTNPMQFNDWNDYLNYPKTSEADLALLESTQVDAVFMPSEQEVYPHGFDNITQVHPNIAPDTHHLESDCRLGHFTGVLTVLTKMFSIIQADQAFLGEKDYDQLTLVRNMAEDLNLYTQVIGVPTVREKSGLAMSSRNTLLNQQQKAIAPVIYQTLTQAAYALKEGASIQKIEQQSEQTLNQAGFKSEYFRVLTPKLKIPTAADKQLTLLTAAYLGNIRLIDNLSCSR
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MLKKAQIEKESSVEAEFPGGASGGDSISTGDKVSEEGVYGVVGNNTPSEMLVSQLAELAQEEIAELEEKVNAEGSFAASHGVLSTG
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MFNIAEYRKKPDRITDLLPWAALIAPGVVLNKDGSYQRTLRFRGPDLESSTDAELVATTARLNNALKRLGSGWALYIEARRSQAQRYSEESRFEDPVSWLVDLERHELFKRGGENFESHYYLTLQFMPPSEAVGKLSEAMIKRESDGQAVKNKKLSQKKQVKQKAAQAEKLDSYQSQLSFFNVSCERLFDIIKDFMFDAGFLDDDQTLTYLHQCISEKEHPVKKPQIPVYLDAILADTPLLAGLEPQLGQSHLRTVSILGFPSTSAPALLDQLNHLPIEYRWVTRFLPLDKTEAEKELKAYRKRWFAKRKGLGTMLMEMMTKSESAMVDQASVNKSRDADQAIQELEDDHVAFGYYTATITVWDKDPQVVTQKIREVERVVNGLGFTTILETLNAVEAWLSSLPGHANANIRAPLMHTLNLAHLIPFSAIWAGPERNQHLNGPPLLHARTRGNTPFRLVNHIGDVGHQMVLGPTGAGKSVLLNLMALQFRRYQDAQVFIFDKGGSFLASTLGVGGHYYEVGQPENKDLVFQPLAHVDKEAERIWATEWLLGLLQHEKIEVTPHVKDMLWQAMTGLAAVPENQRTLTGLKALLQDHQLRQALDHYTLGGPYGDILDADHELFTTGAWQCFDLEALMETPAIIPPVLDYIFHVLQQRFTGVPSLLILDEAWLFLDHPIFAAKIREWLKTLRKLNVSVIFTTQSVDDILESEITNSLLESCPSRIFLPNNRALEPSVYSAYEQLGLNTRQIQMLSSAMPKRQYYYESTQGNCMFDLSLGPIALAFAGVSRPEDKQKIHALYRRYEYREFIEHYLRECHLDWAISLLEQWSPYE
>NZ_CP039046|123133:183712|165128_166100_-|WP_048875849.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSRHKCTKEIYKAFLQASSVRYSGLALSEVSPKPLSHDSVSRWLQSQQYRPRDIWHIVKDLINTEEPCLLVVDDTVLDKHRSKQIDLVHHQYSGNAHDVIAGIGLVNLVWYGLERQHSIPIDYRVYDKDTDGKTKNDHFRDMLKLGKNRGMTPSAVVFDAWYSSLNNLKAARDLHWNWVAELKKNRKVNRNETLEMLDFPDEGLKLHLRGYGWITVFRFVAKNGRTDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKARWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISLYQQDWDVIKVGISCSIQKILAAT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_051929698.1|124317_124611_+	conjugal transfer protein TrbC	NA	NA	NA	NA
WP_017377396.1|124611_124866_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242714.1|124882_127375_+	conjugal transfer protein TrbE	NA	NA	NA	NA
WP_017377399.1|127367_128051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377400.1|128050_129094_+	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069411.1|129093_130323_+	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_017377402.1|130324_130654_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377403.1|130650_131850_+	type IV secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420824.1|131962_132352_+	signal peptidase, peptidase S26 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063632.1|132351_133296_+	P-type conjugative transfer ATPase TrbB	NA	NA	NA	NA
WP_017377406.1|133415_134813_+|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A2K9KZD3	Tupanvirus	3.9e-77	36.2
WP_017377407.1|135138_135660_+	phospholipase D family protein	E9P5Z4	Wolbachia_endosymbiont_wVitA_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.7e-30	46.2
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WP_048875847.1|136106_141329_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242717.1|141719_143726_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377568.1|143856_146187_-	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
WP_144420823.1|146362_147193_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773453.1|147309_147705_+	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069413.1|147701_147977_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|147987_149391_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155069415.1|149544_149784_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242720.1|149780_150182_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069417.1|150441_150897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377563.1|150906_151863_+	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	1.0e-12	24.5
WP_155068500.1|152372_152897_+	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_017377561.1|152997_153996_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242721.1|154084_154981_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_080963593.1|155054_156341_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377557.1|156800_158117_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_017377551.1|159521_159782_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377550.1|160049_160340_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|162809_163784_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017377545.1|163985_165026_-	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_048875849.1|165128_166100_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377543.1|166222_167071_-	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377542.1|167222_167510_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|167820_168192_+	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_155052673.1|168964_169189_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046561.1|169326_169464_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377539.1|169477_169690_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377537.1|170213_171038_+	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_017377536.1|171176_172310_+	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|172369_173779_+	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_027242724.1|173926_175507_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_017377534.1|176210_177206_+	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242725.1|177211_179278_+	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_048875850.1|179335_180286_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|180480_180807_+	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_026063646.1|181317_182577_+	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_036772169.1|182836_183712_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039046|196314:245908|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039046|319671:361151|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039046|367631:424418|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MKKLVKCIVRVFYLFMLTYSSLWALAPVETLVPTAFSQVQSSHAADLADQTASMPRLNSQSVSVETSPSLNLNSLKVSSELKSSALSSQTTRQVNPGFVRYLQIAAFKQYDDAMTTIAGLRPLIGSYQAYIKRKNGFNIIRVGPLMSLKETLALQIKLSRNGYQGTMIVMT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376970.1|374333_375998_+	ubiquinone biosynthesis regulatory protein kinase UbiB	E5ERK4	Ostreococcus_lucimarinus_virus	6.4e-34	28.8
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WP_036772765.1|378675_379107_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376964.1|379169_381650_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	3.8e-192	43.8
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WP_080963574.1|383165_383882_+	nicotinate-nucleotide adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210381.1|384266_384737_+	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376959.1|384779_386615_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
WP_036818645.1|386659_387748_+	rod shape-determining protein RodA	NA	NA	NA	NA
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WP_017376956.1|388908_389424_+	SPOR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209991.1|405635_405965_-	cell division protein ZapA	NA	NA	NA	NA
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WP_017376925.1|414851_416072_-	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta	A0A1V0EEL7	Caulobacter_phage	4.2e-35	28.7
WP_017376924.1|416130_418929_-	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4P767	Pseudomonas_phage	1.1e-179	45.1
WP_017376923.1|419234_420401_+	aspartate aminotransferase family protein	A0A1V0SKB7	Klosneuvirus	1.3e-25	26.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP039046|500875:535013|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MLSKHHNLSEEFAPYKETCNQLKQQDLEFHQLWQQFHHIDKEINKTISVITASQLKRQRLKIQDAIYSLMALP
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>NZ_CP039046|500875:535013|522374_523061_+|WP_017375807.1|DBSCAN-SWA
MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHSFFETPEVSAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPIYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEIKSYQNIISKLNTQTEDVLFLSDTAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017375825.1|506330_507824_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_036773936.1|508018_508774_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375821.1|511615_511837_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_026063480.1|514024_514423_+	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	1.2e-07	31.4
WP_075275366.1|514362_515217_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017375815.1|515308_515590_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242634.1|515675_516353_-	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063478.1|516398_517679_-	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	4.6e-24	34.7
WP_017375812.1|517854_518904_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375811.1|518982_519783_+	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_017375810.1|519796_520591_+	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	1.1e-103	69.0
WP_017375809.1|520693_521713_+	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_017375808.1|521759_522371_+	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_017375807.1|522374_523061_+	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017375806.1|523057_523600_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375805.1|523892_525080_-	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017375804.1|525324_526050_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_144420816.1|526235_527024_+	DUF45 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927106.1|527020_527416_-	YchJ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375801.1|527808_528849_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876012.1|528845_530249_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155069451.1|531094_531802_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|532613_533588_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_155069453.1|533627_535013_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP039046|585339:698662|DBSCAN-SWA
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MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHVDAEGLIQQYGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLATPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027242611.1|606973_608065_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_155069455.1|615102_617148_+	cadmium-translocating P-type ATPase	A0A218MNH6	uncultured_virus	2.9e-81	33.3
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WP_036772661.1|618354_619491_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242608.1|619477_620800_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377046.1|622703_624341_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	3.4e-88	37.8
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WP_017377043.1|625969_628198_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.7e-82	34.8
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WP_017377041.1|629117_629447_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_017377039.1|631135_631354_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772169.1|631412_632288_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377037.1|632280_633147_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	6.3e-25	31.1
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WP_155069457.1|635003_635627_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375592.1|635831_636902_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875859.1|637176_637971_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376605.1|646771_647347_-	ribonuclease HI	M4QMN0	Micromonas_pusilla_virus	1.1e-33	55.1
WP_017376606.1|647343_647682_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376607.1|647850_648840_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.5e-19	32.4
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WP_017376610.1|652736_653747_-	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	9.5e-57	40.6
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WP_017376613.1|656015_656363_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275357.1|656507_657467_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0N7C035	Escherichia_phage	1.2e-13	34.3
WP_017376616.1|657568_658351_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_027243116.1|658483_659443_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|659467_659872_-	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063546.1|659900_660575_-|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_027243117.1|660674_662390_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209558.1|662386_662749_+	small Multidrug Resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063550.1|662763_663918_+	DegT/DnrJ/EryC1/StrS family aminotransferase	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	3.9e-38	33.0
WP_017376622.1|663921_664929_+	glycosyltransferase	B9UDL7	Salmonella_phage	2.2e-37	34.4
WP_017376623.1|664931_665948_+	bifunctional UDP-4-keto-pentose/UDP-xylose synthase	D5GW02	Campylobacter_virus	1.9e-12	28.7
WP_017376624.1|666163_667249_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376625.1|667355_667748_-	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243118.1|667880_669164_+	diaminopimelate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_027243119.1|669179_670481_+	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_036772145.1|670498_672301_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420721.1|672305_673298_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017376630.1|673378_674455_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_017376631.1|674552_675527_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.3e-14	31.3
WP_144420813.1|675594_676566_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.0e-15	29.3
WP_017376633.1|676749_677019_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376634.1|677620_678907_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772149.1|678971_679652_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155052676.1|685307_685595_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375775.1|685633_685828_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275355.1|685875_686850_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.3e-30	33.2
WP_027242570.1|687063_688203_-	hypothetical protein	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	9.3e-61	41.7
WP_017376020.1|688411_689782_+|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_017376019.1|690160_691153_+	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_155069757.1|691240_691672_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_017376017.1|691668_692508_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242569.1|692540_694091_+	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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813887:813946	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_017377301.1|826109_827465_+	O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377304.1|829907_831212_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|831324_831930_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_017377305.1|832011_833313_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	6.5e-135	57.3
WP_017377306.1|833380_835813_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	1.2e-219	52.7
WP_016209655.1|835916_836189_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_075275280.1|836271_838170_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377308.1|838201_839086_+	hypothetical protein	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.2e-41	35.7
WP_017377309.1|839094_839490_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875932.1|839913_842061_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	3.1e-25	36.2
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WP_036771709.1|1017172_1017934_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376076.1|1017917_1018874_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_155069518.1|1019136_1021635_+	cell division protein FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	1.4e-85	42.9
WP_017376078.1|1021638_1022379_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1022587_1023562_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP039046|1179629:1278448|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVTHGQVTLPTLELLKAGCILRSLLIYTLEK
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MRVDFYILNTPSKQAQYHFACRLAEKAVSQNTTVYIHTHSQADAEQLDDLLWSFNDTSFVPHAIVGHPMADEDVKVLIGFGEQHSPAGLLIKLAALKHDNHLYSRIAEIVSQDKKSLQASRQAYRHYQQAGFTVHHHNSPSSNNSLA
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNMVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSLRAMEC
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036773116.1|1186272_1187247_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
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WP_017376411.1|1205868_1207293_-	aminodeoxychorismate synthase component I	A0A0B5J984	Pandoravirus	3.9e-40	33.4
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WP_017376418.1|1236313_1236853_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420656.1|1237769_1237931_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_144420657.1|1238642_1239704_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_027242803.1|1241756_1243469_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-25	29.9
WP_155069550.1|1243915_1245769_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	2.2e-43	40.5
WP_016209821.1|1245871_1246204_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377485.1|1246234_1246831_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_017377486.1|1246827_1247952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377487.1|1248063_1248711_+	hypothetical protein	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_017377488.1|1248762_1250676_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-117	38.6
WP_017377489.1|1250880_1251918_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242805.1|1251976_1255303_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242806.1|1256009_1256978_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155069552.1|1258019_1258481_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017375667.1|1258969_1259455_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275301.1|1259725_1259995_+	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377496.1|1260029_1261355_-	ribonuclease HI	G3MB70	Bacillus_virus	1.3e-37	36.3
WP_144420783.1|1261410_1262058_-	TetR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_027242809.1|1262251_1264210_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.5e-45	28.2
WP_155069554.1|1264353_1267284_+	peptidase M16	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|1267380_1268358_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_036771347.1|1268467_1269445_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_036771347.1|1269955_1270933_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_155069555.1|1271012_1271606_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376680.1|1271737_1272970_-	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	8.2e-95	47.3
WP_017376681.1|1272959_1273622_-	HAD-IB family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_026063554.1|1273896_1275153_-	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910647.1|1275290_1275950_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017376683.1|1276024_1276726_+	cyclase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1277473_1278448_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP039046|1292859:1504079|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_026063558.1|1305865_1306432_+	dCTP deaminase	S5VM63	Pseudomonas_phage	2.8e-74	77.8
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WP_017375867.1|1314386_1315640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375866.1|1315749_1316652_-	carbon-nitrogen hydrolase	M1HCD5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	3.2e-56	40.7
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WP_017375861.1|1322731_1323232_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876023.1|1323571_1324675_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	8.0e-25	31.1
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WP_155069562.1|1326331_1327207_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377952.1|1327806_1330173_+	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377953.1|1330220_1331417_+	acetyl-CoA C-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027242965.1|1331985_1334418_+	acyl-CoA dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036773041.1|1334739_1336239_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242964.1|1336347_1336920_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069564.1|1337234_1338704_+	type VI secretion system tip protein VgrG	NA	NA	NA	NA
WP_017377960.1|1338776_1339526_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876021.1|1339529_1340303_-	enoyl-CoA hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_027242961.1|1340401_1341352_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377963.1|1341491_1342934_+	PLP-dependent aminotransferase family protein	A0A1X9I5H2	Streptococcus_phage	3.5e-20	24.2
WP_027242960.1|1343149_1344334_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017377966.1|1344457_1345144_+	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	2.8e-28	36.0
WP_026063694.1|1345279_1345864_+	superoxide dismutase	NA	NA	NA	NA
WP_144420699.1|1345953_1346283_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_017377969.1|1346618_1346858_+	membrane protein insertion efficiency factor YidD	NA	NA	NA	NA
WP_017377970.1|1346906_1347098_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275334.1|1347872_1348166_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069566.1|1348370_1348619_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069568.1|1348756_1348933_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378162.1|1349278_1349818_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378161.1|1350156_1350801_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378160.1|1351134_1351785_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378159.1|1352308_1353361_+	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017378158.1|1353378_1356459_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_027242571.1|1356624_1356873_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|1356938_1357814_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772025.1|1358736_1359243_+	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_027243218.1|1359260_1359458_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420794.1|1359476_1359620_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP039046|1517134:1639677|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155069594.1|1520853_1521336_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.3e-32	47.0
WP_036771330.1|1523691_1524666_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017376814.1|1525315_1526041_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_026063564.1|1526415_1529235_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	5.2e-312	55.3
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WP_027243093.1|1535263_1535581_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619422.1|1535642_1535822_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376801.1|1538930_1539755_-	hypothetical protein	X2KR27	Campylobacter_phage	6.2e-06	28.3
WP_017376798.1|1540942_1541578_-	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_017376797.1|1541859_1542219_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243095.1|1542492_1544778_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420683.1|1544766_1545423_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243096.1|1545599_1546232_+	MarC family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027243099.1|1547899_1549213_+	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	7.7e-51	32.0
WP_155046588.1|1550328_1550538_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420682.1|1551072_1551234_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376785.1|1552640_1553546_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_027242578.1|1554008_1554545_-	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242577.1|1554562_1555864_+	ComEC/Rec2 family competence protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774259.1|1555860_1556835_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_144420681.1|1557166_1557352_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046590.1|1557531_1557696_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774017.1|1557697_1558573_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155069598.1|1558888_1559764_+	DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2	NA	NA	NA	NA
WP_017375696.1|1559779_1560163_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|1561363_1561591_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_027243017.1|1562347_1563691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378522.1|1563864_1564044_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|1564087_1565062_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP039046|1698012:1794228|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376476.1|1770993_1771752_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039046|1799894:1867768|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_144420785.1|1828657_1829908_-	AMIN domain-containing protein	A0A067ZJB6	Vibrio_phage	1.7e-15	27.4
WP_017378219.1|1830017_1830488_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
WP_047927040.1|1830510_1831104_-	oligoribonuclease	A0A1B3B0T8	Gordonia_phage	1.2e-14	29.6
WP_027242798.1|1831241_1832291_+	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA	NA	NA	NA	NA
WP_017378221.1|1832314_1833238_+	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211418.1|1833254_1833716_+	YaiI/YqxD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378223.1|1833823_1834642_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046600.1|1835251_1835395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075278722.1|1835412_1836288_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017378228.1|1839270_1840191_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
WP_017378229.1|1840197_1842090_-	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	9.7e-87	34.8
WP_027242797.1|1842154_1843705_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_017378231.1|1843829_1844501_-	pyrimidine 5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_017378232.1|1844509_1845361_-	pyridoxal kinase PdxY	NA	NA	NA	NA
WP_017378233.1|1845537_1846836_+	PAS domain-containing protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.5e-14	52.3
WP_017378234.1|1846973_1848320_-	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
WP_036771503.1|1848497_1849601_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771505.1|1849761_1850262_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378239.1|1850466_1850736_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378240.1|1851084_1852362_-	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
WP_017378241.1|1852358_1852535_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378242.1|1853005_1854607_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378243.1|1854623_1855766_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_017378245.1|1856028_1856757_-	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
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WP_155069635.1|1858723_1864033_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378250.1|1866409_1866643_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1866793_1867768_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP039046|1904051:1924366|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

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MGILGISVAGLNAARTQLDTTSHNIANASTPGYTRQRVLQSSVLGDTASGQYVGAGVQIDAIQRMADRFAVEQLRDSTTAFAESDIFHSISSRVDNLASNDATSLSTSLSGYFETLNEGVNEPTSIALRQSILGEANNLTTRFHTIERELSQLRVEINRDLDDAALNLTQLGKRVAIINDQISRAVGSAGGAIPNDLLDDRDRALKEIAEFANISVFEHTDGSVDVSIGSGQSLVAGTNSLTIVAEPNAEDASKSNLFVKDLNKNIRFDITNEIQSGRVKGLIDVRDNVIDQSLRQLGLVAVGLIQTTNEQHKLGMDFNSALGGDFFNDLNKSVLIAQRYLPNSANAGNAALTVELGEFAADTIALPNKPATGIKDLEAEEYNLIITGTSYELIRQSDQASMASGAIADFPIQINGMRISLSSGGFADQDSYVIRPLQGLARGIDVQITDPKKLALAWPVAASENEANLGSGKLTVSDMVSTNQPINFSDLSTAANTVTSFQPNLVSQLTDLKTPLAGDLLFSVAGGTPDDVATPIAIADSSARALFDGIALNVTGVAPTASTTLDLGAYSDGIWGGTGSDVTFESFGGTGVNLPSTALGIAAGTRNADEVVTAITALSGNISARAEVVIKSTVGENLAISLGASATAAGLALNSVAQDEMNLGDFIEGSTINAGDLVINGQSISGTFVTTTALRDAIRTAGSNNTITNKFSADAHIIVTENQGKTIQISTTGDNGGTGAANFEDFSLSGAAHEGYQKGQVTVTAANVTDSLLISGSNPEHGGFLAGLSLNVAKNAFHPDRPGQLDPPIQIEFLSQTRYQVYLRSGTLKPIGGPQPYDPLNPDVFPLVDTTTAPPTDYDPGYRMQISGTPEKGDIFNIEYNTNGFGDNSNAIKLAKIEQQAVLTADTSGNPTSSISQGYESLVASVASETETSIIDLNASETLKRQAQQKRDSIMGVNLDEEAANLIQFQQAYQASARVITVAQTLFSSLLQAVG
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MYLSEYTNIKELKAGVTEYIEFYNNKRFHQTLDYKKPMDVYCNLQPQLLLEAA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036772169.1|1934967_1935843_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_080963581.1|1936193_1936655_+	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242986.1|1938101_1941089_-	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
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WP_027242998.1|1951476_1951998_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	3.8e-25	53.4
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WP_048875973.1|1958697_1959333_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155069654.1|1976157_1977033_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.4e-19	33.3
WP_036771330.1|1977076_1978051_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_047927692.1|1978070_1978259_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP039046|1995761:2062048|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP039046|2072067:2134280|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039046|2142087:2197027|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027242880.1|2173632_2174928_+	YeaH/YhbH family protein	A0A219UQP6	Bacillus_phage	1.2e-06	32.8
WP_017377006.1|2174924_2176535_+	SpoVR family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052106204.1|2176641_2177535_-	thiol:disulfide interchange protein DsbG	NA	NA	NA	NA
WP_017377003.1|2177644_2178268_+|protease	site-2 protease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377001.1|2178974_2179673_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_017377000.1|2179816_2180386_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063589.1|2180701_2181328_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376998.1|2181524_2182271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376997.1|2182366_2183206_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	1.0e-32	35.3
WP_016210463.1|2183256_2183604_-	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
WP_017376996.1|2183794_2184682_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376995.1|2184796_2185399_-	HAD family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376994.1|2185395_2186115_-	TIGR00266 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963631.1|2186183_2187896_-	ABC transporter ATP-binding protein/permease	NA	NA	NA	NA
WP_017376991.1|2188043_2189981_+	AsmA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376989.1|2191498_2192047_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|2192371_2192599_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_155069763.1|2193600_2193951_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_027243109.1|2194351_2195008_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2193952:2194122	attR	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|2195623_2197027_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP039046|2219095:2265149|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080963604.1|2225410_2225611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377826.1|2225851_2227297_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_017376520.1|2233911_2234334_-	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
WP_017376521.1|2234335_2234809_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	2.4e-26	43.4
WP_017376522.1|2234942_2235599_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	6.8e-40	44.2
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WP_017376524.1|2236275_2237424_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	4.7e-44	34.8
WP_017376525.1|2237420_2237882_-	transcriptional regulator NrdR	NA	NA	NA	NA
WP_017376526.1|2237957_2239208_-	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	2.4e-102	54.4
WP_017376527.1|2239334_2241014_+	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.0e-39	26.6
WP_027243172.1|2241125_2242007_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772261.1|2243444_2244038_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155069682.1|2247495_2248311_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.2e-15	31.6
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WP_017377746.1|2250026_2250344_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377747.1|2250422_2250677_-	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377751.1|2254349_2256986_-	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	6.9e-99	32.6
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WP_017377755.1|2260005_2260722_+	bifunctional 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase/3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase UbiG	NA	NA	NA	NA
WP_017377756.1|2260718_2261360_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_027242981.1|2261735_2262191_-	glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_027242980.1|2262282_2262627_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039046|2280650:2345395|DBSCAN-SWA
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MIKFSEPGADLFIPGGGSIANALSRTSHLAIAAHQDDIEILAFHGIAECYQQAERGFCGVVVTDGAGSPRAGDYAEYTDEKMQEIRAEEQRAAAKLGKYSAQFQLAYPSHQVKNTPALSLVDELEEILIKTQPEVVYLHNPMDKHDTHVAVFLKSLAALRRLPEKNRPKVVYACEVWRDLDWVCDKEKIALKSDEPRELALALLQVFDSQVSGGKRYDQAVLGRRLAHATFSHSHVVDDVKGVTYAIDVMPLLEDSMLTVEAYVQGFVERFAYSLTTTLAALSQD
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MTTFMAEETRYTPLCIESQLKENNTLWQEIAAIIKKRQPQFAMTIGRGSSDHACTFAKYLLETQYNLVTASAAPSTRTLYQANLQLKHALVIAISQSGQSVDLCEMMTHAKKQGATTIAIVNQTESPLADLAEFVIPIHAGEEKSVAATKSYIGALAALLQLTNTLSPHIDLPLSALPEYLRLALDSDWNQSLPIFKDAKTTLIVGRGYQFPIAQEAALKCKETAILHAEAFSGAEVLHGPFALVQNNYPVLSFIHKDASQQQMVDLIGRIQQTGAQPITAAAGNLSHLNQLKTHSKEVILLPHSLHPLLDPLITIQSFYVFIEQLARLRGFNPDEPLNLSKVTSTK
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MTLHFNQQTIQTDSHGYLKNPTDWQPELAQILAKQEGISLTKNHWEIIHFVRNFYQKYHTSPAIRMLVKALKEEYGAEKGNSLYLIKLFPQGAAKQATKIAGLPKPARCI
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MQKPSLSYRDAGVNIDAGNRLVERIKHVAKATHRPGVMGSLGGFGALFELPTDRYKAPVLVSGTDGVGTKLKLALELGIHDTVGIDLVAMCVNDLIVIGAEPLFFLDYYATGELDVDVAASVIKGIGEGCLQAGAALVGGETAEMPGMYSAGDYDLAGFCVGVVEKERIVDASRVTAGDVLIALGSSGVHSNGYSLVRKILAVAGQGFETVLPESGKTLAELLLAPTRIYIKSLLPLFNQDKIHACAHITGGGLPENLPRVLPAGVSAKINTASWWWPEIFQWLQQQGGVATDEMYRTFNCGVGMVICVAREDVDDCLAQLTASGESAWVLGEMIEGQDQPVIFSE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_051929647.1|2281370_2281652_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	9.1e-10	39.2
WP_027242974.1|2282902_2283559_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069688.1|2283575_2285786_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242972.1|2286462_2287755_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_027242971.1|2288081_2290145_+|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0S905	Catovirus	5.5e-35	26.2
WP_017376742.1|2290147_2290795_+	RnfABCDGE type electron transport complex subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_017376743.1|2290810_2291443_+	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_017376744.1|2291503_2291941_+	DUF1841 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|2292197_2293073_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_027242567.1|2294923_2295706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376750.1|2296013_2296652_-	DUF4937 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376751.1|2297126_2297801_+	Bax inhibitor-1/YccA family protein	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	8.9e-35	45.4
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WP_017376754.1|2298657_2298954_+	sulfurtransferase complex subunit TusB	NA	NA	NA	NA
WP_017376755.1|2298961_2299294_+	TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048876062.1|2302005_2302761_+	phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376759.1|2302862_2303081_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036773673.1|2305932_2306748_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377992.1|2314196_2315120_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377991.1|2315316_2316708_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377990.1|2316754_2317798_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	3.1e-18	27.6
WP_017377989.1|2317810_2318281_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017377988.1|2318413_2319604_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_144420806.1|2319962_2320214_-	DNA-binding response regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_017377984.1|2322630_2322924_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377983.1|2324126_2325050_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377982.1|2325185_2326028_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_017377981.1|2326115_2326766_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	2.7e-20	34.6
WP_017377980.1|2326779_2327820_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A1D7SR00	Cyanophage	2.9e-69	45.3
WP_036773623.1|2327942_2329028_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243121.1|2329054_2330164_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377976.1|2330468_2330786_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377975.1|2330782_2331142_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377974.1|2331244_2333977_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420807.1|2336390_2336609_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420716.1|2336753_2337962_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049740.1|2337972_2338344_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155069764.1|2339601_2340393_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2340389_2341364_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_155049735.1|2341475_2342111_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_065653755.1|2342826_2344284_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375695.1|2345119_2345395_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP039046|2348944:2463738|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377929.1|2377761_2379231_-	glycine dehydrogenase subunit 2	M4QFZ1	Prochlorococcus_phage	2.7e-84	41.7
WP_027243054.1|2379224_2380601_-	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	4.2e-47	34.6
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WP_017377931.1|2381002_2382106_-	glycine cleavage system aminomethyltransferase GcvT	NA	NA	NA	NA
WP_144420809.1|2382284_2383577_-	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_017377933.1|2383587_2384535_-	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	3.5e-37	37.6
WP_027243055.1|2384546_2385359_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_087910662.1|2385361_2386141_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377934.1|2386155_2387214_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_017377935.1|2387210_2388221_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
WP_016209904.1|2388227_2388425_-	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069694.1|2388485_2391392_-	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017377937.1|2391433_2392285_-	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_144420810.1|2392367_2392913_-	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_027243057.1|2393010_2393871_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_027243058.1|2393962_2394379_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027243059.1|2395012_2397964_+	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376362.1|2446913_2447753_-	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.9e-16	26.6
WP_017376361.1|2447903_2448548_+	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_017376360.1|2448565_2448952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376359.1|2449171_2450104_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209515.1|2450208_2450724_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242850.1|2450766_2451723_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242854.1|2457220_2457913_-	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242858.1|2462430_2463738_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP039046|2484655:2525880|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027242903.1|2487761_2491442_-	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063524.1|2491451_2492939_-	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_017376313.1|2492948_2493566_-	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_017376312.1|2493635_2494154_-	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_017376311.1|2494150_2495050_-	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|2495065_2496109_-	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376309.1|2496306_2496594_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_017376308.1|2496723_2498184_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_027242902.1|2498263_2499700_+|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_036771325.1|2499824_2500799_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_144420621.1|2502989_2503751_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|2504908_2505136_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_017377706.1|2506089_2506302_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875919.1|2506319_2506637_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242901.1|2506663_2507353_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377709.1|2507693_2507897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420768.1|2508028_2508964_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047927332.1|2508976_2509759_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_017377712.1|2509888_2510200_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242900.1|2510543_2510870_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377714.1|2510894_2511350_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
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WP_017377716.1|2512394_2513858_-	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377724.1|2521987_2522239_-	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	3.9e-20	57.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP039046|2600153:2653202|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039046|2600153:2653202|2625956_2626601_-|WP_017377818.1|DBSCAN-SWA
MVIKFSILSVIISMLVSICSYGKGIDQQDTNISPVLADSRLGVYFGGQIVPYGHDLPEGASISDTLFGSRSIGLGAVLGYQFNRYFSLEGSFYYYNGSSGNTYSGDTSIGPEHHYLYSGAINAKFLYPVSRRFTVFGLTGIALTHEDTYNKVIYSPSSSTVMVDQQNNRLMPQVGVGMEFYLTPGFSLSSSMIYMFKNNINSITYFPIGVNYHF
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>NZ_CP039046|2600153:2653202|2609300_2610011_+|WP_017376564.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039046|2600153:2653202|2600153_2601128_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376571.1|2601294_2603619_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.6e-25	49.7
WP_017376570.1|2603793_2604510_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063542.1|2604589_2605204_-	UbiX family flavin prenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376568.1|2605196_2606579_-	UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017376567.1|2606587_2607061_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376566.1|2607193_2608453_+	6-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
WP_144420761.1|2608976_2609156_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376564.1|2609300_2610011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856766.1|2610078_2611482_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242585.1|2611779_2612337_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376558.1|2612430_2612937_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376557.1|2613441_2614137_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W5SAS9	Pithovirus	1.2e-10	27.4
WP_144420615.1|2614267_2615056_+	FtsX-like permease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856766.1|2615089_2616493_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|2617790_2618018_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
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WP_017377820.1|2619632_2621165_+	inactive transglutaminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210815.1|2621161_2622112_+	alpha-L-glutamate ligase-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210817.1|2622532_2623165_+	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-13	32.8
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WP_016210813.1|2623954_2624383_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377819.1|2624460_2625456_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856754.1|2625600_2625852_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377818.1|2625956_2626601_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377817.1|2626836_2627334_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|2627845_2628820_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_017377700.1|2629190_2629484_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.4e-06	36.5
WP_017375632.1|2630296_2630632_+|transposase	transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.3e-23	51.5
WP_017377815.1|2630952_2632491_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	3.5e-87	36.5
WP_144420614.1|2632643_2633742_-	peptide chain release factor 2	A0A0S4KWG0	Pseudomonas_phage	1.1e-05	43.1
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WP_027243005.1|2635210_2635837_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
WP_017377811.1|2635865_2636750_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275272.1|2636883_2637114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243006.1|2637251_2638493_-	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420613.1|2638772_2639144_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377802.1|2641524_2642652_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377801.1|2642768_2643431_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377800.1|2643516_2643777_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875907.1|2644195_2644957_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377799.1|2647018_2647678_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377798.1|2647778_2648429_+	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
WP_075275388.1|2648576_2649266_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046691.1|2651431_2652028_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|2652227_2653202_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP039046|2667879:2723601|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039046|2764608:2832838|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027242732.1|2782731_2783253_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378320.1|2793468_2794965_-	sigma-54-dependent Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_144420755.1|2797115_2797493_-	DUF1425 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242736.1|2797543_2798950_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378315.1|2798943_2800011_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378314.1|2800117_2801719_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_027242737.1|2801967_2802885_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242738.1|2802953_2804648_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	5.3e-20	29.3
WP_155069719.1|2804882_2805812_+	alpha/beta hydrolase fold domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856766.1|2805842_2807246_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017378308.1|2807476_2808181_+	CoA transferase subunit A	NA	NA	NA	NA
WP_017378307.1|2808247_2808904_+	CoA transferase subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_036774478.1|2808914_2809796_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069721.1|2809966_2812636_+	aminopeptidase N	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	5.5e-19	24.5
WP_036771639.1|2812996_2813971_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_036771744.1|2814050_2815022_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420754.1|2815348_2815657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772743.1|2815581_2816553_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377642.1|2817120_2817378_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069723.1|2817550_2817742_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377643.1|2817886_2818114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_065653746.1|2818318_2819842_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420753.1|2819978_2824403_-	autotransporter domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377646.1|2825186_2826764_+	HAMP domain-containing histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017377647.1|2826992_2827361_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243069.1|2827474_2828260_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377650.1|2829528_2830713_-	acyl-CoA desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_155069725.1|2830828_2831662_+	bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase	A0A127AWE5	Bacillus_phage	2.1e-17	29.2
WP_026063658.1|2832109_2832838_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.3e-44	42.7

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039046|2842815:2896384|DBSCAN-SWA
TGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAGATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGCCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCTCAACCTTACGTGAAACCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACGGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGAATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTGGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCGAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACAATAACTTTTCGCAACAGTGCCAACATGAGTGCCAAAAAATTTATAGGCAGAACACGCCAAAAAATCGCAATCAATTTTTTTTACATCGATACTACAATGCGGTGCAAAATGCACAGCATCCACATAAACCAATGCACCTAGTGCATGGGCAAGCGCAGTTATTTTTTCAACATCAACTAAAGTCCCAGCCAAATGTGATGCATGTGTCACGGCAACCAAGCGTGTTTTTTCATTTAGTAAAGACTTAAAGTGTTCCATATCTAATCGACATTCTGGAAAAATCGCTTTGGCAACCCGTACCTTCACCCCTGCATCACGCGCTGCTTGCTGCCATGTCGATGTATTCGCAGCATGATCAAGCTCAGTAATAATAATTTCATCACCCCTTTGCCAAGTCTGTGCAAGTGCGCGACTCATTGAGAACGTTAAACTCGTCATATTCGCACCAAAGAACACCTCATTGCTTTGAGCATTAAATAAATCAGCTGCCGCGTCTCGTGCCTTAGCTAATACATCAACAGTTTCCTGACTAGTGATATAAGCTCCACCTAAATTACTATTAGAATGTGTTAAATAACTGGACATTGCCGCTATAACTGTTTGCGGTACTTGTGTGCCACCTGGTCCATCAAAAAAGATAATTTCCCGACCATTGTGCTGACGAGATAGTGCTGGAAATTTTTTACGTAATGATTGAACATCCAAAGCATGTTGCATTATTTCCTCCTTAAATTGAAAATACACTTGCCTTATCTACCTATGCATAAGAGCATATCACCTGTATAGATGCAAGCGCTTTATATTATCTCTATCATGGCCTATTATAGTTTAATTTTATTCAACTGTTTTAAGCCAATAATCTTGCAGTTTTAACGCAATTTCCATAAAATACCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGACAGAATATTAAGATTAATGGCACTACCTTAAGAGCTAGATCTGAACAAAAACGCACTTTAGCGCAATAATCACTTGAAGTCAGCAACCGTATAAGGTTGTATATTTTCGTCTAACAACTCAGACGGAAACTGACAGATGCATTATGTAATTAATAAACTAAAATCACAAATTGAAAAACAAAAAGCAACCCTTTTAGATGATGAAGGAAGTCTAAGCCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGATTGAAAGCCTTCTGTCCTCCGATAAGTTTCAAAGCATCATCAACAATTGCCGAAGCTTTAGATCGCGTTTTTATACGCCATTTGTAACACTCATACTATTTATACGGCAAGTACTCTCTCCAGATAAATCATGCAAAAATACGGTTGCTACTTTCCTTGCATCAGTGTCGACAGAGGATAATAATAACATCCCATCAAGCAATACAGGACCTTACTGTAAAGCACGTCAAAAGTTACCAATAGAAACGCTTGAATCACTCGTTAAACTCAGTGGAGATAGTTTATCTAAAAGCAGTAATGCACGTTGGAAGATTTATAATCGAGAGGTGAAGCTTATTGATGGGACAAGCCTTACGATGGCAGATAGCGAGGAAAATCAATCACGTTATCCTCAACATGATGCTCAAAAGGCAGGCGCAGGCTTCCCTATTATGCGACTTGTTGCCATTATGTCACTTACAACGGGAGGCATTATTGATTATGCAGTTGGCGCTTATAAAGGTAAAGGAACGGGTGAACACGCGCTGTTAAGACAAATTAAGGACAGCATTCATAAGGATGATATTGTGATGGGTGATCGGTATTTCCCTTGTTTTTTCGTGATGGGTGATTTGCAGTCAATAGGTGCTGATGGTATTTTTAAAGCACATTCACAGAGGAAGTATGACTTTCGTAAAGGAAGGAAGTTGGGTTCAAAAAATCACCTTGTCATTTGGAAAAAGCCTCACAAACCTGACTGGATGACACAAGAAACACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTACGATAGTTATCCTGATCAAATGACGGTAAGAGAGTTCAAAATCAAAGGGGAGGTTTATGTAACAACTTTTCAAGATCATAAAAAATACAATAAAGTTGCATTGGCTAATCATTACAAACAAAGGTGGCACATTGAAATCAATTTCAACAGCTTAAAAACCATTATGTCAATGGATCATTTAAGAAGTAAGACACCTGACATGGTACATAAAGAAATTGCAGTACACTTTTTAACGTGAGTTCGACATAAGAAGTATTTGAAAAACCAGTGATTTTGCGGCTAAATAGAGTCTAAATTTAGTTCTAAAGAAGCAATAAAATGGACTTAACATTGATTTCTCTCTTTTGTGTAATAGATGATTTCTGCCAAGAGTTATTACCTCAATGGAATGCTATTTTGCTAGAAGATACGAATAAAAAACGTAATAAGCCTTCACAAATGTCAACAAGTGAAATAATGACAATTATGATTTATTTTCACAAATCTAATTACCGAAATTTTAAGATGTATTATCTTCATGTAATAAAAGGTAGCATGGTAAAATACTTTCCAAACAGCGTTAGCTACAACAGATTCGTTGAACTCATGCCGAGCATCTTATTGCCTCTGTGTTTTTTCATTGCGGCCCAAGGTAAAACAGCAACAGGGATTTATTTTGTTGATTCGACAATACTCCGTGTTTGTCATGAAAAACGTGCGTCTCAAAATAGAGTTTTCAAGGGATTAGCTAAAAAATCTAAGTCAACGATGGGGTGGTACTACGGCTTTAAGCTCCACATTATTGTGAATGATATGGGAGAGTTAATGGCCTTTAAAATGAGTAAAGCTACTACAGATGACCGTGTCGTATTACCTAAAATGGCCGAGAACTTAACAGGTAAAATTATTGGTGATAAAGGCTATATTTCACAAAAATTATTTGATCAATTGTATGAAAAAGGACTTCAACTTATCACAAAGATTCGTAAAAACATGAAAAATAAGCTGGTTTTAATGATTGATAAAATTCTATTAAGAAAAAGGGGGATTATAGAAAGTGTTTTTGACCAATTGAAAAATATTTCTCAAATTGAGCACTCCCAACATCGTAGTGCTGATAACTTTATGGTGAATATTGTTGCTGGCTTAGCAGCCTACTGTTTACAGGAAAAGAAGCCTTCTCTTGGCATAAAATATAACCTGCTAAATGGTTGAGTTATATCGAACTCACGTTTTTTAGCATACAACTTAATTAGAACGCTTATTGCAGAAGCTTGTCGTAATACTGAACGCCTTCCTATACAGGTTAGTTTCAAGGGTGTAATACAGTTATTTAATAGCTTTGTGTCATTACTCAGTTTCTCGGCAGACTGTAATAAAGCCCATGCAATATTGTTGCATGCAATCATAAAAAACAAGGTTGGGAATAGGCCTGGACGGATTGAACCTCGGGCTGTTAAAAAACGTCCCAAAGCATTCAGGCGACTGAATAAAAGCAGGGAATTGGAAAAGGC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MSFEQARIALQQAGINFQGKEKELEESEKLQEAVIALAQIGALNTNIWQKVLSNPDIREPITTMIKYAVLRVGVTGELQPTPVDPKYRQASSIIANMVIDNFRQYFSTGLIADRTARAWERIQDDERFRDTVLTTYKAGSLSPNVLKIMHTDREAVQAITTLNQAGLLPLPEEIPGPFQDHEALLENANYLRENHILSRAEHQKYQAIFALHEVNKLSQETFKQICDSDHPINTASKILLHEALDQAKTCAQRLAKPTRQRLIDHLKHTVDEETLSPDRLTLNIVRVLSHPLKRLKSRATQNKEASQIAETYQVAEPALRAMQKLHNISEEDFQETLVGTPKKHRGLFGKPKESGNPYSTYSTIKETMGKAKKSPQLVPYSTGDNDDVASPIG
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKSIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVRPPSSEVQHYSILSRHQIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036815640.1|2847938_2848133_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774259.1|2848191_2849166_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_017376778.1|2849392_2851165_-	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	NA	NA	NA	NA
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WP_027243188.1|2867151_2867697_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376548.1|2875226_2875949_-	putative N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase	NA	NA	NA	NA
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WP_155069734.1|2877626_2877848_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376543.1|2878283_2879063_-	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_047927468.1|2879088_2879394_-	pilus assembly protein PilZ	NA	NA	NA	NA
WP_144420752.1|2879390_2880284_-	DNA polymerase III subunit delta'	S5WKH4	Pseudomonas_phage	2.3e-14	33.8
WP_027243035.1|2880639_2881938_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017376538.1|2884540_2885722_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069736.1|2886015_2887122_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155069738.1|2887118_2887430_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376537.1|2888153_2889779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376536.1|2889948_2890308_-	iron-sulfur cluster insertion protein ErpA	A0A2H4N7M3	Lake_Baikal_phage	4.4e-25	50.5
WP_017376535.1|2890520_2890952_+	protoporphyrinogen oxidase HemJ	NA	NA	NA	NA
WP_017376534.1|2890963_2891143_-	rubredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_144420597.1|2891259_2892246_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243034.1|2892426_2893716_+	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase	NA	NA	NA	NA
WP_017376531.1|2893827_2894625_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312049.1|2895016_2896384_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP039046|2902783:2961426|DBSCAN-SWA
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MTEDTSKNTRIVIEGVTHEGKTFRPSDWAERMSGALSTFRDKRIIYSPMLQPAVKDGNKCIILDESLKESNPELYRYILEFAETNRLKICPAEDD
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017378284.1|2908914_2909070_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875887.1|2910472_2911348_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376851.1|2913977_2914742_-	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017376850.1|2914744_2916322_-	peptide chain release factor 3	A0A2K9L6L3	Tupanvirus	3.6e-10	31.4
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WP_017376847.1|2917244_2918000_-	CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376838.1|2930641_2931466_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875886.1|2931721_2932078_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|2932074_2933478_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027243085.1|2933597_2934158_-	YbfB/YjiJ family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017376236.1|2934315_2934882_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069742.1|2935084_2936959_+	signal recognition particle-docking protein FtsY	NA	NA	NA	NA
WP_027243087.1|2937222_2937918_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376234.1|2937958_2938171_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376229.1|2939743_2940853_+	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	1.7e-35	29.8
WP_017376228.1|2940908_2942390_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	5.3e-48	28.8
WP_048876012.1|2942827_2944231_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376227.1|2944324_2944774_+	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243088.1|2945081_2945867_-	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376226.1|2945863_2946847_-	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017376225.1|2946903_2948175_-	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036772069.1|2953605_2954157_-	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_017377639.1|2954217_2955579_-	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377638.1|2955852_2957133_+	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377637.1|2957150_2957807_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377636.1|2957852_2958902_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377635.1|2959055_2959910_+	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_036772063.1|2960208_2961021_+	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|2961132_2961426_+|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP039046|3071049:3136292|DBSCAN-SWA
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MKNTLGSILIIAGTAIGGGMLALPLASAGPGFSASITLLAMIWLGLLASAFVLLEAVLAFPKGTNFSTIARLTLGLPGQIAMWISMLMLLYALDAAYISGGSSLIVAALSQAFNLPISAHLSACLFLLILGSIVWYSTRAVDRVNSILFSLKGVAFILLLSLFAPHVNLTQLLDSGNSHYLLYAIPIFFTSFGFHPVIPTIASYNDLDPKRCRRIILIGGSLPIIIYLVWEISTLGIIPRTGDNSFHSILNQQGSVGEMMIAFHHILNNKLITLTANAFSDIAVTTSFLGVSLALFDFIADATKRPNTIKGRSQTAFMAFLPPLAFALFYPNGFILALSNAAIVFAITLAVPVLSAWRLRITGKTGAYKVAGGYILFTSLLIYYLVICIIQICSDCGMLAQFGH
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MQQVVLASSNLGKIREIKPLLSDLPLQIIPQSHFNLTDAIEDATTFVENALIKARHACQHTRLPAIADDSGLAIAALNGAPGIITARYAGAARSDKANIDKVLAKLADESKRQAEFHSVMVYMEHAEDPCPIICHGRWSGSILYQRQGTGGFGYDPIFWVPTHQCSAAELPAEIKQKISHRGHALTDLVNALKKKYSNN
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MKVIRKAVLPVAGLGTRFLPATKATPKEMLPVVDKPLIQYAVEEAVAAGITEIIFVTSSNKRAIEDHFDKSFELESRLERAGKDKLLHTVKNILPAGVSVSYIRQSEPLGLGHAVLCAKPLVGEEPFAVLLADDLIDGGIQPCLAQMLEVYQQAANVLAVQPVAMTEVDQYGVVATDHQQHIQAIIEKPTQEKAPSNLAVVGRYILSHRIFSYLERTQKGAGGEIQLTDAIAALLAEQSILAYEFTGKRYDCGSKAGFLEATIAYALKHPELAEQAKLSLKGYKHL
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MNESQALVGVIMGSSSDWETMQHTVQILQKLGVRHEYRIVSAHRTPDLLFDYASTAKKRGLHVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTSLPVLGVPVQSKALNGMDSLLSIAQMPAGIPVGTLAIGKAGAINAALLAASILANHDEKIADALTAFRHQQTANVLADSLPQEV
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MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMGWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSQHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
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MIKNILYMLISNFVKLASTAVIFFILARVWGVEAFGQFTYCFAMIAIVQVILDYGFNLQVVKDISEDKKKAIDIIQKSLTVKHIITFTVYIFSWLMLVFYNKSSSFNFLYLLLLISVTLNSYANYFLYPSQAEEEFKVVSLVMLAYNISFVVIIGLALLFGYRTLTDIAAVFALARLVPFLICVCLIKKHYPAVQLLALRTKGSWQYFKKSLSYGILVFFGMAYFQMDTLFINHFLGAREVGLYQAGVRILVASAFIVDVFNSVYLPKTISLKNNINKLIEYQSKTTHYFSLISLAVVSVCVLFPKIITMILYGKEYIELANYLPLFSLLITLRYIGSSYGLLVTVFDAQRLRCLLVGGALLVNVLLSIILIPRCFLYGGLLAALMTLIFLNFGYFMFSLYRVKSIYLKADTLLVLTALMASVFAFYFGLGGWLVALSLFLGWVAAIRKKDILFISRRLSLI
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MKMRSGLGTLQVAMIALMVFNLMLPKAGIYMGKVPLTVGYLIIPIALLILFPFVCMQRHLVIDRRKLVIFFLLCSFFLFTVTSLTFSQTSIQNIFIWAASSFIVPLSTLVLLSYLVRVNENIFEKILIYSFYFVCLFGIIQFVLLNAVHLNIQIPYLTVTGADPGIIFDKDNNRGFIVKFMSSYSNGNIFGIAVLMWFPLVAFSLIGSRKSIWLYRVCVFLSFSRTAWFMMFIVETLLMIKRKKGIYLVIFFFIMFIILLIVFSYGFGDFVFNYQLGGRLDQITSLSFSDIFSFGNDFSLREMVYPGMLKTFGIFGLLLFVVVYLYPVISTWSQVLTDRAWFARIGIISYIFAMFIDGAYILMPIQFIYWLMVAALFHYSKKPELVK
>NZ_CP039046|3071049:3136292|3115676_3115892_-|WP_144420746.1|DBSCAN-SWA
MGFAMLLQERIGHIKSEILWIKNVDNVLMEVQDYKDWLLNQGYEIIGTEPLQARLNREGRSYVEVIVRKVK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017376170.1|3071049_3072150_-|protease	trypsin-like serine protease	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-21	28.3
WP_017376171.1|3072507_3073482_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036771588.1|3073618_3074497_+	RNA polymerase sigma factor RpoH	A0A248SJA5	Salicola_phage	2.0e-39	40.9
WP_016209597.1|3074504_3074735_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	1.0e-06	40.7
WP_036771607.1|3074788_3075793_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771589.1|3076005_3076833_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420747.1|3076914_3078303_-	undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155069748.1|3078590_3079991_+	mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase	A0A1V0SH58	Hokovirus	2.3e-53	31.3
WP_017376177.1|3080085_3081012_-	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	A0A2K9L4U8	Tupanvirus	3.0e-57	44.2
WP_027242699.1|3081008_3082145_-	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242700.1|3082141_3083149_-	glycosyltransferase family 4 protein	B6EFC4	Stygiolobus_rod-shaped_virus	3.4e-06	35.1
WP_027242701.1|3083145_3084309_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376183.1|3084318_3085170_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242702.1|3085201_3086374_-	glycerophosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_065653741.1|3086370_3087759_-	oligosaccharide flippase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376186.1|3087787_3088195_-	adenylyltransferase/cytidyltransferase family protein	A0A1V0SGE7	Hokovirus	1.3e-28	50.4
WP_017376187.1|3088214_3089222_-	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	A0A1D7XFE8	Escherichia_phage	3.0e-79	49.7
WP_017376188.1|3089218_3090091_-	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	A0A291LA53	Escherichia_phage	1.6e-92	58.7
WP_036771610.1|3090087_3090948_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.3e-67	51.1
WP_065653742.1|3090949_3093220_-	polysaccharide biosynthesis tyrosine autokinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376192.1|3093221_3094367_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376193.1|3094413_3094899_-	low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_027242703.1|3094938_3095562_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376237.1|3101241_3101994_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_027243062.1|3103325_3103949_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243063.1|3104053_3104842_-	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_027243064.1|3104841_3105573_-	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017376241.1|3105606_3107334_-	NAD-dependent malic enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|3107347_3108409_-	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376243.1|3108723_3109938_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376244.1|3110070_3110595_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063518.1|3111212_3112061_-	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	4.3e-26	35.5
WP_017376247.1|3112047_3112746_-	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017376248.1|3112800_3113562_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376249.1|3113554_3113977_-	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_017376250.1|3114106_3114658_-	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376251.1|3114713_3115676_-	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420746.1|3115676_3115892_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069749.1|3116078_3116888_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376254.1|3116867_3117710_-	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017376255.1|3117706_3118951_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376256.1|3119089_3120178_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376257.1|3120195_3120696_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.2e-20	42.5
WP_017376258.1|3120883_3121483_+	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376259.1|3121488_3122652_+	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_017376260.1|3122684_3123638_+	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376261.1|3124001_3125066_+	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_027243065.1|3125062_3128125_+	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.0e-61	22.3
WP_144420745.1|3128277_3128730_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027243066.1|3128761_3129118_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772645.1|3129536_3130310_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017376269.1|3132933_3133224_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772663.1|3133448_3134324_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876179.1|3134320_3134878_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|3134888_3136292_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP039047

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 179345	179	Streptococcus_phage(32.43%)	tail,portal,integrase,transposase,terminase,head	attL 6659:6718|attR 167847:168961
DBSCAN-SWA_2	184063 : 193760	8	Streptococcus_phage(40.0%)	transposase,portal	NA
DBSCAN-SWA_3	198401 : 205458	9	Streptococcus_phage(28.57%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039047|0:179345|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039047|0:179345|35250_36228_+|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039047|0:179345|50118_50370_+|WP_081000017.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA
MRKSCLGLWSMMIDIIQIKYLNNIIEQDHRPVKKKMNAALGFKSVQGAKATIAGVELYRMLKKKQMHCHHDKAAYEQFYLLAA
>NZ_CP039047|0:179345|134531_135014_-|WP_075278733.1|terminase|DBSCAN-SWA
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MKQLYAQQSVTITELRKSPTSVINEANGEPVVILNHNVPAAYMVPPELFEAMLDSYEDRQLEGIVKKRLHSPDRDFIDVDVDDL
>NZ_CP039047|0:179345|150621_151221_+|WP_027242940.1|DBSCAN-SWA
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MKLSKEEAALIIWNFFKNSKIRKNFKKPNSDFLVKYPTFAVGNDPLLQTKKLIKPQKYFAVVGTGGLRNVFLAKELTSERLTLNPHIFIVDNSSDVHEFWNLTKKLFIKSESCDDFFENYKNSELIKSNCFRKFSNLKNENLYFNKMGIDSESYHNNEITNFFKNFFNDKEENFKWIKNSIVNRLILIRQSWISHETFKFIKNICDYHSYDVYCYPSNIAEFLNNDDDIKKFHENINYLNPKAVIETSGCHQTGVPHKVHHYIQGVHSLVLDTKVELNKKIKLIKIKEYLQNSMTTEFKQILFDKCKNLKDLCFVSSLRQSDFFSQQSTTTGKELKRLLNLNENYLLKLEIHPNGDSVRMRDIRNYALYEQKSNSNYFFNNQDKENIKEFSFSKDKQEPTLIFTNNLKRLTSNVTLATAASQGVQGTR
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MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPVTEVDHIKPHDGDHDLMWNQRNWQALCKPCHSRKTVNDDGGFGRKRSPQGRGI
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MREELIALIEAADRDRDIHKSHELYTQVLGTELLETHLSLREIANVYYNRSLNHTRLYQHFISSERKESQPTRALTHMEEAIADMERAMLGYTSEVDIDACRNCLDEYQSKLTFAMNALENRAAVIPPLQSGLFQAQLQDQAGAASLPSTSRDPHH
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MKMLSCKTKFTGHDEYSCSNPDCKHTKTVAYTCKSRLCSSCGKKPQSNGLLHKMSYYQSANINTSH
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MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
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MLSTPWLAATVVKMLSCKTKFTGHDEYSCSNPDCKHTKTVAYTCKSRLCSSCGKKPQSNGLLHKMSYYQSANINTSH
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYDAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQKSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP039047|0:179345|101315_101741_+|WP_155069794.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377664.1|6881_7418_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
6659:6718	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_036771347.1|11506_12484_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
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WP_036816420.1|13730_14363_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929651.1|14366_15419_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|15580_16558_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
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WP_017375933.1|18596_19589_-	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	5.0e-10	28.9
WP_017375932.1|20234_20465_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375931.1|20560_20989_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375930.1|20988_21426_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375928.1|22088_23228_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|23407_24382_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
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WP_155069785.1|25425_27912_-	hypothetical protein	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	5.7e-111	32.9
WP_017375789.1|27908_28466_-|tail	tail assembly protein	K7PM97	Enterobacterial_phage	2.7e-21	35.6
WP_144420832.1|28455_29241_-	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	5.1e-42	41.1
WP_017375787.1|29170_29842_-|tail	phage minor tail protein L	W6EC15	Rhizobium_phage	1.4e-27	33.6
WP_017375786.1|29838_30180_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771950.1|30172_32251_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	1.6e-50	31.2
WP_017375784.1|32254_32521_-	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375783.1|32577_32901_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039047|184063:193760|DBSCAN-SWA
CTTGGCCACAGATCACCCGTTATATTCTGTCTTGCATGATTTACCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGATTTACGTGAAAACCTTGTGGGCCATTTATGTCTACGTGGCAATGCTTATTGTCAGGTTATTCGCGATGCTGCAGGGCGAGTGCGTGAATTAATCCAACTGCCCACTGATAGCACCACGGTGCGCCGTGATGAAAAAACAAAAAAGCTCATCTATAGCACGATGTTAAACGGTCAAAGCTATGAACTCCGCGATGATCAAGTGTGGCGGCTGAATGCGATGGGTAGTGACGGGATTATCGGCAGCAGTCCAATTACCTTACAACGCGAATCACTCGGCTTATCTGCGGCAACCCAAGCGCATGGCGCCCAATTATTCGGTAATGGTGCACGCCCCAGCGGCATCTTAACCACAGACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGGCCAGTTAAAAAAAGAAGGCCGTGAAAACTTAGCGGAGTCTTGGAAAAAAGCCCACGGCGGTAAAAATTCGAACGGGGTGGCTGTTTTAGAGAATGGCTTGAAATGGCAAACGCTGACCATGAGCAGTGAAGACAGTCAGTTTTTAGAAACACGTAAATACCAGCGCAATGAAATCTGTGGCATTTTCCGGGTGCCGCCGCATATGATTGCCGATTTAGAACGCGCCACTTTTTCAAATATTGAGCATCAAGATTTAGCCTTTGTTCGTCATAGTTTGGTGCCCTGGCTGGTTAAAATCGAGCAGAGTATTAGCCGTGACTTATTACTTGCCCATGAGCGTAAAAAATACTTTGTAAAATTTAATATTGAGGGCTTATTACGCGGTGATACGGCCGCTCGCGCCTCTTTTTATAATCGCATGTTTAGCATTGGTGTAATGAGTCAAAATGATATTCGCGAACTAGAAAATATGAACCCAATAGAAGACGGAGGGCGTAACTAGATTTTGTTGTCAATGCGTAAGTCCTGAATAAGATGATTGTGTTTATGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTACGCCCTCCGTCACATGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGGCGTTGTTGCGTAACCTCTGGTCCCATATTCCAGGCACAATTCAGCTGCGTCTAAAACTATCCGGCATGCCGAGACTGGTCATCTTATTTAAAATACCCGCGCCAATTAGTCCTTCATTTTTCTGACGCGATATCTCTCTGGACTGCATCGTGTTGCCCAAAATGCGTTTGTAACGCTGAATCGCCAACTCAGAATAATTACGCTTGCCGTATTGTCGTGTCTTTTGCCAGTGCATTCTACCATGATCTTTAATCTCATTAAAATTTATGTTTCTAATCGCGTGGTTATTTTCATCAAATACGGCATTTTTAGGAGGAGGGATAACAACATCAGCATTAGGTGAGTGGTTTAAAACGGAATCGTAAACATCATGGCTATCGTAGGCTCCGTCTGCAGTGAAGCGATCAAACGGCTCATCAATTTGCTCCAGTAGCTCATCCACAACCTCCTCATCTGCTTCATAGCGATCGGTGATGAGTGCGGCTTGAATATAGTGATCATCATCAACGGCCACATGAAGTTTACGCCAGCTGCGCTTTGCTGATATCTTGTATTTTTCTTGGTGCCACTCGTCACGGCCAAAACGCTTAAGGCCTGTAGAATCAATGGCTATTCCCGCAATATCATCATCTGGCTTATCTGTTTTGCGATAGCGTGGGACCTTAATATCGAGCTCCGCTAACCTTTTTGATAACACCGTATAGTCAGGGCATTTGATCGGCAGTCCTTGGGATTCAAAGAAGGAATCAATTAGGCCCTGAGTCTGGCGTAATGGCTGTTTAAACACTTTACGAATTTCATGACAGGTGATGATCGCCAGGTCTGAGTATAGAAACGGCGTGCCTGTACCATCATAAACTCGGTCTTTTTTGTACCAACCTTCAATGGCTTTCTCTGAAATCCAAACATCAATACGGCCACGATTACGCAGGCTATCGGTGTACTTTGCCCAGTTTGTAACGCCATATTTTTGTTTAGGGATATCCCACCCTTTTCCTTTTGGATATTTATATGGCACTGCAACTCATCACAACTATTAGTTTGATGTTAATGTAGCAGCAGGGTAGGCAAACCTCCAGAATTGATCACTTTTTGAGCTATGCAACAAAGCCAAGTCCAGGGAGTTGATGGGTTGCAATATGGTTGTTGCAGCCAATCGTTAAGGTTCCACAGACTGTTTGGCTAAAGTTGGCAATCTGATGAAGACCATTTTGCCACTCAGTGTAGATAGTACGAGCGCGAGGTAAAAAGGCTTGACCTGCTTCTGTCAATACAATACGGTGGCCAATGCGTTCAAATAGCTTAATTTTAAATTGGCTTTCTAAATTGGCAATGCGTTTAGTGACTGCAGGTTGAGTTAAATGTATGTATTCACTGGCTTTGGTAAACGACTTTGTGTCAGCTACGGCCAGAAAAGCGGTAATATTCTTCATTACAATCCATATATTCCAAAAAGCTATCATTTTTATAAAAATAATTTATTTGAGCTATCATTGTCAATACTTTAAAGTTACATAACTTCGCCCTCCGTCATATGGAATGCTAAGCACGAGGTGAGTGGGCTGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCAGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACCAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTACAAGGGTTATTCAATGATATTAGTACCTTATATTGTTGCTGGTGTTTTTACAGGAATTCTTTCAGGGTGGGTAGGTGCTGGTGGCGGCATTGTTATTGTCCCCGTGATGTTATGGCTGGCAGCACAACAAGGAATAAATACGACATTGGCTATGCATCTTGCAGTAACAACATCACTTGGTTTTATCATGGTTAATTCATTGTATACAACTTTTCATCACTATCGAAGTAATAACTTAGTGATTCCTTTATTTAAGGGTACTGTTATTTTTACAGTTATTGGCGCTTTAATCGGTGGGCAGCTTGATAAAATTATTCCTGTTGCTTTTGTGAAAATATTATTTACTGTAATTATTATCAGTGTGTTAGTTCAAAGTTTTTTTAATCGTATCAACCAGGTCGGGAGGTTTGAATGTCAGCCGATGTATCCAGGATTTTTATCACGGTCAATAATGGGATTCTCTGTTGGTATTCTTGCTTCTTTAGTTGGTATTGGTGGATCAGCGATTACTAATCCGTATATGCAATACCATCGTTATCCAATGAAAAAAAGCGCGGCGATGTCAACAGCGCTGGCTTTTCCTATGGGTTTATTTGCACTTGCCAGTTTATTGGCTTCAAGTGTAGGTATGGTTGGTCTACCTTATGGCAGTGTAGGCTATTTGTATCTCCCGGCTTTTACTGGTTTATTGATCGGGTCACTCTTAGGCTCACCTCTTGGAGTGTGGCTGGTTAAGCGCGCTTCCGAACAAATTTCCGTTTGGGTATTTCGTATTATATTATTAGCAGTGGTTATTCAGATGGTTCGCTGATATGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCCGCCCTCCGTCAAGTATGATGAATTTAAGCCCCTTACGTTACCATTGAAGTCTGGGCGAGGGTAAGGAGAGCGATAGCGTCAAAGCTTTCGAGGCTGTTCAGATGAATGCTCCCTTACCTGTTTTAGTCCATTAACTTCGAATAGAAGGGTGTGCCAAGAGCACGAATACTTGACTGAAGCGGAGGACGAAAAATGGGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACCGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCAGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGAACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAAGAGGCAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAAGACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGTCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATATATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGGTCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGTCGTTATGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAACTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATGAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACGCTCGGTGATTTCACATAAGGTTGAGCCATTGCTTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTGGCATTTTGATGACGACTGAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGTCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCAATTTTCCAGCACCAACGCTAGCAAAAATCAAGCAGGGCTCTTCATTTTCTCTAAACCAATTCGCTACGGCTGTAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCGGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTCGCTTCTTTTTGGTAAGTCCTTAGTGCGAACATCTTAAATATCTCTTAACTTGCTACCGTGTTAAAAACACTTGTTATGATTGAGAAATACGAATGAATTGCGGAGTATTTTCCTCTGGTTGATGTTTTTCAAACTCTGAAAGTGCAGGTAGGTCGCTCATACCATTTTTCTCGGCAAGAGGTAAAAATCGTGTGTATGACTCTTGATCAAAAGCGTATGCAGCACCTCGGCTAATGCCTTGCATGATTTCTTCAAAACGTGTTTTCTTAACAATGCCACTGGTTTCTCGATCAGGCAGCATAGCATCAATGTACCCATGCAAACTTTCTGAAGAACCTGAAATAACGCAGGCATCCTTATCACAAAAGACATCCCCTTCTTCACTGTACGAAAAATATCCAATAACTTTATGTGAATCTTTATACATTGCATATCCTCACTAACAATTAAACGAGCCGACGTTGAAAAATGTAAAACAAACTTTCTTAGATAGTCCAAATCTCTCATCGATGCGGCTCGTAACAACGGGCCCAGTTCGGACTTCAGAGTCATCAATGACGCCTAACATTTCGTTAATTAACTCTTTAGTATTATAAAAATTAAGATAGCTCTTAGCATTGATACACATAATACAACAGCCTTTTTTCATTGTGATAAGTAATGTGCTCTACAGAGCTACTGATTAAGGACTGATCTTTTCATCTGTTTTCAGGATCAAAGAATAATCGATCGCTCTTGTATAATGTTGAAATCGACTTACTTTAAACACAGAAAATAACCTTTGCTTGATGTTAAATATAAGGCGCTATTATAACGCTTTAAAAGAAAGCTTACTATGCCGGCCGAATGAAAATTAGATCAGTATTAGATTATGGGTGAGCTAGTTAATGAAATGATCCCCAAAATTTAATGTCTAAATTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAAGGCATACTTTTGGAGATTTTTACATGAGCAGACAGCAGTATTCAAGCAGCAAAAAGTTCCAGATTGCGCTTGAAGCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039047|184063:193760|184063_184519_+|WP_048876221.1|portal|DBSCAN-SWA
MATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQVIRDAAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLIYSTMLNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDAASHGVLSTG
>NZ_CP039047|184063:193760|190377_190545_+|WP_155046640.1|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILALLRKIIVSFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ
>NZ_CP039047|184063:193760|193031_193760_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039047|184063:193760|188767_189742_+|WP_155069826.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYQHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPRTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039047|184063:193760|185635_186613_-|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP039047|184063:193760|187429_188227_+|WP_017377525.1|DBSCAN-SWA
MILVPYIVAGVFTGILSGWVGAGGGIVIVPVMLWLAAQQGINTTLAMHLAVTTSLGFIMVNSLYTTFHHYRSNNLVIPLFKGTVIFTVIGALIGGQLDKIIPVAFVKILFTVIIISVLVQSFFNRINQVGRFECQPMYPGFLSRSIMGFSVGILASLVGIGGSAITNPYMQYHRYPMKKSAAMSTALAFPMGLFALASLLASSVGMVGLPYGSVGYLYLPAFTGLLIGSLLGSPLGVWLVKRASEQISVWVFRIILLAVVIQMVR
>NZ_CP039047|184063:193760|191750_192104_-|WP_017377521.1|DBSCAN-SWA
MYKDSHKVIGYFSYSEEGDVFCDKDACVISGSSESLHGYIDAMLPDRETSGIVKKTRFEEIMQGISRGAAYAFDQESYTRFLPLAEKNGMSDLPALSEFEKHQPEENTPQFIRISQS
>NZ_CP039047|184063:193760|190513_191242_-|WP_155069828.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYDRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_048876221.1|184063_184519_+|portal	phage portal protein	Q8W629	Enterobacteria_phage	4.3e-17	34.8
WP_036771347.1|185635_186613_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_017377525.1|187429_188227_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069826.1|188767_189742_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.2e-26	31.2
WP_155046640.1|190377_190545_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069828.1|190513_191242_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_017377521.1|191750_192104_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|193031_193760_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039047|198401:205458|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAATCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCCTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTTTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCAGAGACCCAACAAAGTAATGTCACCGACCTTAATTTAATTCTTGAACAAGTTTAATAAGGAGATAGCTATGTTAGTTTTAACACGTAAAAGCGGACAAGAAATTTTTGTCGGTAAAGATATTACTATTAAGGTTTTATCTGTAGTAAATGGTCAAGTAAGAATAGGCATTGATGCGCCTCAAGAGGTACAAATACAGAGGGATGACGTTAAGAAAAGACCGGAGTTGATTAAAGCTGTTGTGTGATTAAGGGCTTCGGCCCTTTTTTCTTAAGAGTGAATAAGAAATATTTTTAATTTGGTTTAATTTTTTTCTGAGAATGAGTGATACTATTAGTAGAAATTTTAATGCTGGGGAAATAAATGCCAATTGTTCAAATAGCAAATTCTAAGGGTGGAGTTGGAAAGAGCACAATAGCGTGTAATTTAGCAACAGCACTTGTTCATGCTGGTTTTTCGGTTGTTATAGCTGATTGTGATCCCCAGTTTTCTTCTTCAAGTTGGGCAGATGAAAGGCAAGACAATGGTAAGTTGCTTAATGTTGATATAGTGCAAAAAACAGGCAAGATTATCCCAGCACTACGGCAGTTAACAAAAAAATATGATTTTGTAGTTGTAGATACAGCAGGGCATGATTCTGTAGAAATGCGTGCGGCTTTAACTGTTTCTGATTTAACTATTGTCCCTTTTAAGCCAAGCCAGCTTGATATTGATGTGCTAGGGGCTATGCAAGAGTTAATAGAAAATGCACAAGATGCTGGAAATGATAAAATGCAGGTTGCTTGGATTATTAATATGGCGGCACCCAATCCACGGAGTAAGAAGCTAAAAGAAACTCAAGATGCTTTGAATGATGCAGAGGGCTTTAACCTTCTTAAGTCTGTCTTACATAATAGGGATGCTTATGTAGAGTCTATGTCTGAAGGTTGTGGTGTAGTCGAATTGAAAGATAAAAAAGCTAAAACTGAGATAGAAGCTTTAGTTAAAGAAGTGTTGAAATTAACGGGCAAGAAGGCAGTGCGTCATGGCATTAAAGCTAAAAAAACAGTCAAAGCAAAAAAATCAGCGTAAAGCAAACAAGAACGATTTTATATACGCTTTCAAAGGAAGTGAGCACCTAAAAGAAAAGTTCGACAGTGGTGATAAGTGGGTAGATACAGAGCAGTGTTACATTGCCGAGATTAAAATAGACCGTAAAACTAAAGATCAGGACTACCTTAATGAACTTGCTGCATCCATGAGCGGCAAGAAACAAATTAATGCGGCGATAGTTCGTAAAGCAAAGGATGGTCGTTATGAATTGATTAACGGTGAGTGTCGTTATGATGCTGCAAAAATCAATAATGAGCCTTTGCTTGTTCGGGTTGTTGATTATGATGATGATGAAGCAATCGGTGCCATCATTGCTGAAAATGACAAGCGTAAAGATTTGTGTGACTACGATAAAGCCTTAGCATATCTTGAGTATAAAAGTGATTTGAGTATTCGTGCATTTGCGGAAAAATATAATCTTAACAGAAACTATGTTAATCGACTTTTTAAAGTTGATAAGATACCTGAGTCAGTTGTATTGGCCCTACCTATGATTGAATTGAGTGCATCTCAATTTGAAGAAATTGCTATAAGAATCAAGGATAATCAGCTTTATACCGACGTATTTATAGAGCTTGCTCCACTACTGTCTCAAATTGAGACACCTGTTACATGGAAAGACTTCTTAAGCCGCATAGACCGCAAGGTTAATCCACCAGAGAAGCAGCCTCAAAAGAAAATCGAGCGCTATGTTTTCAGCTCTGAAAAAGCTAATCTGAGATACACAGATAGTGGCTTTATAGTGAAGTCCGAAAAGCTCACACGAAAGCAAAAAGAGCAAATACAAGAAGCGTTAGACTCGATTTTATAATGTAGGCCCAGAGGGGCCTTTTTTTAGTTCTTATGCTGTTCGCTCCCAGACAATCACACCAGAACGGGCAGGGTCGAGGTCGTGAGAGTGCGGTTTTCCGCCGCCAGTATTGAATGTGTAGTCATTGCTTTTATTTGTTGTTGTTGGCGTAACTACTCCAACATCTGCGCCACCTCTTTGAATTGCTGACTCGTTCGGAATTCCGTGATTGTGCTCGGGCATTTCATCAATAGAAAGAGTGTGATCATTTGTTCTTGTAGAGCCTGCTTTTGCTCCGGCATCTATTGTAAAGTTACTTGAGCCTGCGACTGTAAGTAAGCGGCCGGCATGGTCTGCATCGATGTCAGTGATTTTTTTCCAAGTTGCCCCTTTTCCTTGAAATGGTGGGATATAGTTTTCGTCAAAAGTTAGTTCTATCTTTCCGACCGGGTAGAGTTGATCTATGAGTAGTTCGATTTGCAAAGAGCCGTCAGCGTTTTGTTTCCGGCTTAGTGTTTCACTTTGAATCGAGTCGGGTGTGTTATCTATGCGATTCCACGATGTCCAGCCAGAGCTTTCTGTATAGATACGCACAAAAGTAGGGGATGTGCCGTCTACGGCTAAGCCTGTGATGGTCTGTGTTAAGTCAGGCGAATTAGGAACACGAACAACGTTAGCCGTCCACCAATGATCTTTTGTAGTTTCTAAGCTGGGTGAGTTTTTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGCCTTATGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACGGCACTGTTGCGAAAAGTTATCGTGAGTTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTAGCTACCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAATCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTTTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATTTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCTTACGACCAAACTTTATACCTTTTTCTCTGGCTATTCTGATTCCATCAGCTTGGCGTTCCTTGCGTATATTATTTTCAAATTCAGCAAAAACGCCCAATAATTGATACATCATTTTACCTAGTGCGCTGCGTGTATCTATTTTTTGGTCTAAAACAATCAGATTTACATCAGCAGCCATCAAACCTTCGACGATTTGGTTTAAATGAGTATTTGAGCGTGCAAGGCGATCAAGTTTAGTCACAACCAAAGTATCTTCGTCACGTAAATAATCTAAGCAATTTTTTAGCTCTTTACGGTTTTGGTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039047|198401:205458|198401_199130_-|WP_155069829.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKQASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039047|198401:205458|199560_200268_+|WP_027243191.1|DBSCAN-SWA
MPIVQIANSKGGVGKSTIACNLATALVHAGFSVVIADCDPQFSSSSWADERQDNGKLLNVDIVQKTGKIIPALRQLTKKYDFVVVDTAGHDSVEMRAALTVSDLTIVPFKPSQLDIDVLGAMQELIENAQDAGNDKMQVAWIINMAAPNPRSKKLKETQDALNDAEGFNLLKSVLHNRDAYVESMSEGCGVVELKDKKAKTEIEALVKEVLKLTGKKAVRHGIKAKKTVKAKKSA
>NZ_CP039047|198401:205458|204849_205458_-|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA
>NZ_CP039047|198401:205458|203706_204096_-|WP_155069831.1|DBSCAN-SWA
MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLNLSMV
>NZ_CP039047|198401:205458|201130_201562_-|WP_144420840.1|DBSCAN-SWA
MQIELLIDQLYPVGKIELTFDENYIPPFQGKGATWKKITDIDADHAGRLLTVAGSSNFTIDAGAKAGSTRTNDHTLSIDEMPEHNHGIPNESAIQRGGADVGVVTPTTTNKSNDYTFNTGGGKPHSHDLDPARSGVIVWERTA
>NZ_CP039047|198401:205458|204118_204847_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039047|198401:205458|199267_199444_+|WP_075275473.1|DBSCAN-SWA
MLVLTRKSGQEIFVGKDITIKVLSVVNGQVRIGIDAPQEVQIQRDDVKKRPELIKAVV
>NZ_CP039047|198401:205458|200221_201100_+|WP_048876212.1|DBSCAN-SWA
MALKLKKQSKQKNQRKANKNDFIYAFKGSEHLKEKFDSGDKWVDTEQCYIAEIKIDRKTKDQDYLNELAASMSGKKQINAAIVRKAKDGRYELINGECRYDAAKINNEPLLVRVVDYDDDEAIGAIIAENDKRKDLCDYDKALAYLEYKSDLSIRAFAEKYNLNRNYVNRLFKVDKIPESVVLALPMIELSASQFEEIAIRIKDNQLYTDVFIELAPLLSQIETPVTWKDFLSRIDRKVNPPEKQPQKKIERYVFSSEKANLRYTDSGFIVKSEKLTRKQKEQIQEALDSIL
>NZ_CP039047|198401:205458|201944_202649_+|WP_048876211.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTALLRKVIVSFRKVIFLC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_155069829.1|198401_199130_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	5.4e-38	42.2
WP_075275473.1|199267_199444_+	carbon storage regulator	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	1.7e-06	46.0
WP_027243191.1|199560_200268_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	1.2e-34	40.0
WP_048876212.1|200221_201100_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420840.1|201130_201562_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876211.1|201944_202649_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.9e-10	31.7
WP_155069831.1|203706_204096_-	hypothetical protein	A0A219Y912	Aeromonas_phage	1.1e-10	40.0
WP_017375910.1|204118_204847_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_036815979.1|204849_205458_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-10	34.6

3. NZ_CP039048

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	521 : 55803	53	Acinetobacter_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039048|521:55803|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039048|521:55803|16528_17647_+|WP_144420796.1|transposase|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080963581.1|32663_33125_+	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242987.1|37628_38462_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242989.1|39685_40390_-	flagellar basal body L-ring protein FlgH	NA	NA	NA	NA
WP_027242990.1|40435_41221_-	flagellar basal-body rod protein FlgG	NA	NA	NA	NA
WP_027242991.1|41248_41986_-	flagellar basal body rod protein FlgF	NA	NA	NA	NA
WP_016210285.1|42090_44286_-	flagellar hook-basal body complex protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242994.1|45531_45930_-	flagellar basal body rod protein FlgB	NA	NA	NA	NA
WP_027242995.1|46306_47014_+	flagellar basal body P-ring formation protein FlgA	NA	NA	NA	NA
WP_027242996.1|47078_47375_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619421.1|47413_47893_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_027242998.1|47946_48468_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	3.8e-25	53.4
WP_027242999.1|48549_49644_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|50610_52014_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155069834.1|52102_52831_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	2.4e-38	43.1
WP_032126374.1|52988_53960_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420659.1|54111_54891_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875973.1|55167_55803_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

4. NZ_CP039049

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4042 : 16054	15	unidentified_phage(30.0%)	transposase,terminase,capsid,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039049|4042:16054|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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