CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039065	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 chromosome, complete genome	2 crisprs	csa3,RT,cas3,DEDDh,DinG	1	1	33	32
NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	7	1	0
NZ_CP039069	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039068	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039067	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP039065

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039065_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039065_1
• CRISPR_location: 351531-351660
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039065_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039065_1

>1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039065_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039065_1

>merge|NZ_CP039065|1|351531-351660|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP039065|1|1|351531-351660|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039065.1|WP_016212008.1|352517_353216_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_016212359.1|343141_343360_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_016211271.1|358143_359088_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP039065.1|WP_075273619.1|355358_355934_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_016211268.1|356940_358125_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP039065.1|WP_016212010.1|353232_353529_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_081007059.1|347111_348173_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP039065.1|WP_155046939.1|353709_354498_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_016211795.1|346234_346429_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_016211269.1|359392_360178_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP039065.1|WP_016212044.1|344133_344388_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP039065.1|WP_155046938.1|350664_351240_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039065.1|WP_036794771.1|345110_346097_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039065.1|WP_016211797.1|348334_349738_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP039065.1|WP_016212281.1|340824_342279_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_054300520.1|350309_350624_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_155046940.1|354702_355086_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_075273359.1|349788_350364_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039065.1|WP_054300516.1|355991_356825_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP039065.1|WP_032126227.1|352189_352480_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039065.1|WP_016211268.1|356940_358125_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP039065.1|WP_016211269.1|359392_360178_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP039065.1|WP_016212044.1|344133_344388_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP039065.1|WP_016211271.1|358143_359088_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP039065.1|WP_036794771.1|345110_346097_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP039065.1|WP_016211797.1|348334_349738_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP039065.1|WP_155046938.1|350664_351240_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.44996e-46
NZ_CP039065.1|WP_075273359.1|349788_350364_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP039065.1|WP_081007059.1|347111_348173_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP039065.1|WP_054300516.1|355991_356825_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151

Protein sequences

>NZ_CP039065.1|WP_155046938.1|350664_351240_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGYSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLKPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP039065.1|WP_054300520.1|350309_350624_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP039065.1|WP_075273359.1|349788_350364_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP039065.1|WP_016211797.1|348334_349738_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP039065.1|WP_081007059.1|347111_348173_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP039065.1|WP_016211795.1|346234_346429_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039065.1|WP_036794771.1|345110_346097_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP039065.1|WP_016212044.1|344133_344388_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP039065.1|WP_016212359.1|343141_343360_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP039065.1|WP_016212281.1|340824_342279_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039065.1|WP_032126227.1|352189_352480_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP039065.1|WP_016212008.1|352517_353216_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP039065.1|WP_016212010.1|353232_353529_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP039065.1|WP_155046939.1|353709_354498_+|hypothetical-protein
MTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039065.1|WP_155046940.1|354702_355086_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP039065.1|WP_075273619.1|355358_355934_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP039065.1|WP_054300516.1|355991_356825_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP039065.1|WP_016211268.1|356940_358125_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP039065.1|WP_016211271.1|358143_359088_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP039065.1|WP_016211269.1|359392_360178_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP039065_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039065_2
• CRISPR_location: 516487-516607
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039065_2

Consensus_repeat	Method
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039065_2

>2.1|516524|47|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder
GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039065_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039065_2

>merge|NZ_CP039065|2|516487-516607|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

>NZ_CP039065|2|2|516487-516607|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG
AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039065.1|WP_155046943.1|516878_517019_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_075273327.1|518458_519034_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039065.1|WP_155046942.1|505045_505932_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039065.1|WP_016211756.1|511448_512174_+|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP039065.1|WP_054300492.1|519777_520788_-|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP039065.1|WP_036778297.1|525020_525494_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039065.1|WP_129556490.1|514222_515109_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039065.1|WP_129556590.1|513143_513539_-|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP039065.1|WP_016210671.1|523628_524888_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP039065.1|WP_017375910.1|506317_507046_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039065.1|WP_032126312.1|512352_513147_+|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP039065.1|WP_016212269.1|507790_508474_-|Fic-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376885
NZ_CP039065.1|WP_016212268.1|507202_507787_-|recombinase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239737
NZ_CP039065.1|WP_016211759.1|510015_511203_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP039065.1|WP_054300493.1|519406_519619_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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rpsblast for functional proteins

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NZ_CP039065.1|WP_075273327.1|518458_519034_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP039065.1|WP_155046942.1|505045_505932_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.30804e-44
NZ_CP039065.1|WP_016211756.1|511448_512174_+|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP039065.1|WP_054300492.1|519777_520788_-|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP039065.1|WP_129556490.1|514222_515109_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.49003e-44
NZ_CP039065.1|WP_129556590.1|513143_513539_-|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP039065.1|WP_016210671.1|523628_524888_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP039065.1|WP_017375910.1|506317_507046_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP039065.1|WP_032126312.1|512352_513147_+|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP039065.1|WP_016212269.1|507790_508474_-|Fic-family-protein	gnl|CDD|376885	pfam02661, Fic, Fic/DOC family. This family consists of the Fic (filamentation induced by cAMP) protein and doc (death on curing). The Fic protein is involved in cell division and is suggested to be involved in the synthesis of PAB or folate, indicating that the Fic protein and cAMP are involved in a regulatory mechanism of cell division via folate metabolism. This family contains a central conserved motif HPFXXGNG in most members. The exact molecular function of these proteins is uncertain. P1 lysogens of Escherichia coli carry the prophage as a stable low copy number plasmid. The frequency with which viable cells cured of prophage are produced is about 10(-5) per cell per generation. A significant part of this remarkable stability can be attributed to a plasmid-encoded mechanism that causes death of cells that have lost P1. In other words, the lysogenic cells appear to be addicted to the presence of the prophage. The plasmid withdrawal response depends on a gene named doc (death on curing) that is represented by this family. Doc induces a reversible growth arrest of E. coli cells by targetting the protein synthesis machinery. Doc hosts the C-terminal domain of its antitoxin partner Phd (prevents host death) through fold complementation, a domain that is intrinsically disordered in solution but that folds into an alpha-helix on binding to Doc.This domain forms complexes with Phd antitoxins containing pfam02604.	5.41399e-08
NZ_CP039065.1|WP_016212268.1|507202_507787_-|recombinase-family-protein	gnl|CDD|239737	cd03768, SR_ResInv, Serine Recombinase (SR) family, Resolvase and Invertase subfamily, catalytic domain; members contain a C-terminal DNA binding domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. Resolvases and invertases affect resolution or inversion and comprise a major phylogenic group. Resolvases (e.g. Tn3, gamma-delta, and Tn5044) normally recombine two sites in direct repeat causing deletion of the DNA between the sites. Invertases (e.g. Gin and Hin) recombine sites in inverted repeat to invert the DNA between the sites. Cointegrate resolution with gamma-delta resolvase requires the formation of a synaptosome of three resolvase dimers bound to each of two res sites on the DNA. Also included in this subfamily are some putative integrases including a sequence from bacteriophage phi-FC1.	6.73823e-57
NZ_CP039065.1|WP_016211759.1|510015_511203_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP039065.1|WP_016210676.1|521091_523173_-|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP039065.1|WP_017375910.1|508955_509684_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
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Protein sequences

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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP039065_1	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	23888-23925	0	1.0
NZ_CP039065_1	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
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1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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********************************** ***

127. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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********************************** ***

129. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagagct	Protospacer
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130. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45582 : 58682	17	Moraxella_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	152596 : 201593	57	Bacillus_phage(50.0%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_3	217478 : 271377	44	Acinetobacter_phage(50.0%)	tRNA,tail,transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	434936 : 547188	105	Escherichia_phage(32.14%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_5	555662 : 602551	44	Escherichia_phage(27.27%)	transposase,integrase	attL 560102:560161|attR 572090:572377
DBSCAN-SWA_6	618645 : 651832	34	Escherichia_phage(57.14%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	699599 : 774652	60	Staphylococcus_phage(18.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	841885 : 873648	31	Catovirus(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	879568 : 925375	44	Staphylococcus_phage(41.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	960774 : 997872	35	Bacillus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_11	1000994 : 1044919	45	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1057588 : 1122478	59	Bacillus_phage(30.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1131016 : 1196828	52	uncultured_Mediterranean_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1250250 : 1287547	35	Bacillus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1294303 : 1349894	51	Vibrio_phage(18.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1370680 : 1411138	34	Klosneuvirus(25.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_17	1439059 : 1618013	158	Staphylococcus_phage(17.5%)	tRNA,protease,transposase,integrase	attL 1480366:1480425|attR 1560823:1561788
DBSCAN-SWA_18	1646559 : 1690949	42	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	1701249 : 1770104	58	Cedratvirus(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1798677 : 1842450	40	Escherichia_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	1886854 : 1905636	17	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	1950147 : 1960495	15	Acinetobacter_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2026530 : 2081445	56	Orpheovirus(16.67%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_24	2093981 : 2135795	39	Moraxella_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
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DBSCAN-SWA_28	2482396 : 2524838	47	Synechococcus_phage(50.0%)	tRNA,transposase	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126362.1|46103_46469_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211193.1|46667_47429_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779326.1|47730_49257_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49628_50468_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50507_51815_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51789_52959_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|53013_53739_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54017_54407_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54594_55500_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046697.1|55547_55691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273385.1|55738_56542_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007063.1|56569_57055_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.3e-40	52.0
WP_032126362.1|57092_57458_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|57403_57979_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007062.1|57942_58272_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-08	40.0
WP_017377700.1|58388_58682_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.4e-06	36.5

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039065|152596:201593|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300544.1|155435_155882_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210242.1|166058_166397_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|166481_167012_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|167072_169265_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
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WP_032126848.1|178980_179781_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|181125_181701_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|181646_182012_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|182075_182348_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210775.1|185491_186085_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377589.1|186053_186707_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
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WP_016210786.1|188933_189380_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210776.1|191181_191619_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|193547_194942_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209863.1|197510_197933_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|198173_198617_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|198671_198929_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|198906_199533_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|199610_201593_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039065|217478:271377|DBSCAN-SWA
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MKVLVVGQGGREHAMAWKIAQSDQVTAVFVAPGNAGTSLEEKVSNIAIDALDINGLIHFARNNAIDLTVIGPEAPLVAGIVDQFNEAGLRCFGPSQAAAQLEGSKAFSKDFLARFSIPTAEYQVFNEIEPAKQYLQAKGVPIVIKADGLAAGKGVVVAWSTEEATTAIDDMLGANRFGDAGHRIVIEEFLQGEEASFMVMCDGKSIVPFATSQDHKARDDGDQGPNTGGMGAYSPAPVIDEEMHEKIMRTVIEPTIEGLAQEGITYTGFLYAGIMITATGPKVLEFNCRLGDPETQPLLFRLKSDFAKACLAATEQQLTEDALVWDERVALGVVLAAQGYPEQYPTGEVISGLDHTLIQTEAKVFHAGTRLNTEGQVVTAGGRVLCATALGINVKEAQEKAYAASENVTWPNKYQRSDIGYRAINREN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126605.1|236128_236806_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|236795_237632_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|237791_238085_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|238191_238998_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|239302_240157_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_016210082.1|240311_241361_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300536.1|241411_242068_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|242085_243366_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|243639_245001_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046933.1|245274_245952_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|251384_252656_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|252712_253696_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|253692_254478_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|255174_255540_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273371.1|255485_256061_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|256064_256784_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|256928_257129_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211358.1|257176_257638_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|258061_259543_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
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WP_016211354.1|260812_262774_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|263303_263708_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|263760_264822_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046934.1|265185_265356_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|265729_266812_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_105962623.1|268314_269467_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155046935.1|269509_269932_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|270224_271377_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039065|434936:547188|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300513.1|434936_435800_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|436016_437576_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|437597_438632_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|438680_439250_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|439385_440357_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
WP_016210645.1|440368_441946_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556624.1|442011_442998_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210649.1|445806_447795_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|448003_448159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|448416_448716_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300510.1|448986_449169_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|449225_449591_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|450507_451914_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|451931_452918_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|452920_454075_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|454071_454767_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|454901_456392_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|456412_457462_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|457528_458923_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|459801_461733_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|461737_462268_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|462302_462497_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|462539_462899_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|463318_464314_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_036777440.1|464326_466708_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|466713_467001_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|467272_467749_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|467893_468091_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|468215_469190_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|470090_470189_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300507.1|470673_471963_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300575.1|472199_472892_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|472933_473707_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|473708_474650_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|474782_476360_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|476569_478327_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|478875_479634_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|479841_480414_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|480517_481066_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|481367_481613_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|481641_481938_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|482205_483129_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300506.1|483607_484015_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|484086_484815_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_032126799.1|484895_485708_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_129556452.1|486828_487176_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212146.1|487178_488918_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046941.1|489319_489583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300500.1|490254_490983_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	42.7
WP_054300502.1|491012_491690_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.9e-09	30.8
WP_016212477.1|491862_492108_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126794.1|492104_492497_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300501.1|492508_493237_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_016212066.1|493597_494374_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_016212069.1|494585_494753_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212070.1|494727_495327_+	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375910.1|496993_497722_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_016210066.1|546519_547188_-|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039065|555662:602551|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP039065|618645:651832|DBSCAN-SWA
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MSSNNNNPFEKINAHLTEVRKSLAAVNAKVLDEHSLQTHHNKFMKYYDEGLALLDTIAIKSKKPGPKN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036780855.1|619985_620483_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212214.1|620457_620958_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_144019359.1|621989_622187_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300478.1|622348_624085_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_054300477.1|624364_625093_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016211623.1|625815_627456_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_036779883.1|627568_628918_+	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	2.1e-75	37.2
WP_016211625.1|628914_629784_+	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_054300475.1|630267_630996_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016212196.1|631404_631650_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|631646_632033_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212193.1|632100_632439_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|632561_633290_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211949.1|633429_634680_-	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_016211951.1|634713_635811_-	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_054300202.1|635987_636716_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_032126570.1|636932_637232_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211816.1|637244_637598_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211812.1|637639_639253_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_054300202.1|639458_640187_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_144019244.1|640674_641286_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779399.1|641642_641897_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210954.1|641995_643780_-	SLC13 family permease	NA	NA	NA	NA
WP_036779389.1|643868_644588_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|644770_644977_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210948.1|644976_645213_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|645225_645603_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|646109_646928_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210947.1|647021_647219_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|647313_648699_-	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210945.1|648825_649416_-	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|651103_651832_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP039065|699599:774652|DBSCAN-SWA
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MRKNNLLFILAILALPILMINIEYTGITVVTPVIATALAMPLAQANWIALAYLLVFSAFIIAGGRLGDLYSAKLIMILGLVLFIGGSLIGGISVSFWQILIGRGMQGLGAAVAFPNITATAYLCAPGHKKGAALAGLTGVVGLAMAIGPPLAGLLTSYGSWRWFFLINIPIGVVTIFIIWNYLPEINSTSEKLKGKFDTLGVIFLAIFLSSITYGLSCLKNGLNDLMVLCLSFMLAAVSLSLFIYNEKRAEHALICLEHFSNKKLIVSCLVRSGIHFGVYIVLFVIGLYLSFVMGFSADIAGLVLFPMSIAIGLFSFVSGKLVDKYEAYVPTSLGIILLIICYIGFIYLPIQEHVSLIMVLFLLYGIAYTLTSPGLMKMTVSAVDEADKGLASGVFYMMSLFGSTVGLGIAGLVLHCYRGESERLSLILAFPWLMVLCLIITIISFVFLYGFKQSLVCD
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MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVYQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKRVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MPSDRTPPVDDESGSFRERVERLYEVLERLDNFLSRGDIGPKQRKILGKAVNSIQLDNPPYSPERLLVNIAWIIGEGLEARVKRLLLITKEALREGGGIFGLDWFTEIDEKMSRINIFLIDAGHIIEPLVKRENLRMPRPVATLVKDFFMDGNEDVLIQEQGSMCAVL
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MHGREKSISNAFDKQAVFISKQLTIPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MPKYTFVPFEGENKSMPTLARRWRRGQYTIKEGARRSDWPKVRTYDKTSDQLSDIGPGDKLYIYAHGLIGTGQVRSTRHKVAESEYLTPEELADRLITSGLRRDSPQINLFMCESGRTYIGKGHPELEGTSIAGRFAARLSQQGFRNVTVIGYTQPLQPAIGPAVTLAGTTKLCSRYKEIRRTVDDSELVGPLRRAKEVQRRYTIDGDGHVMDSSTGEYSYRNNGPIRLPRHLFSRTFASSPASSSLYDSALRAVKTPLEEQIDKTPEPTTSSTLIFDHVAASDSGLYDSALRAVQTPLEEQIEM
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MQLTQFTDYSLRVLIFLACKKGSSSSIDEISRNYNLSINHLRKVIHKLGQLGYIETSRGKGGGIKLAECPQKINLGVVIRQLEPHFDLVECFTNAKPGCKIAAACRLKGVLAEALNSFLAVFDGYHLADVLGGQQEELVQLFGFSLS
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>NZ_CP039065|699599:774652|772366_773512_-|WP_016212287.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MKIFLVGGAVRDELINYPTEDKDWVVVGSTPEKMIKQGYHPVGKDFPVFLHPQTKEEYALARTERKTAQGYHGFTIHADPSVTLEEDLMRRDLTINAMAKDHHSKIIDPYHGQHDIKNKLLRHVSPAFSEDPVRILRIARFLARYHHLGFTIAAETRTLMAQMVQAGEVNTLVPERVWQELSKALHEKSPSAFFSTLEQCGALKILFPEIAALINQVKDTAWEPQCNLWSHFLNCLDQQEKPQIRFASALKTSYYSKQSNLKSLIQRLRIPKSFSSVMLTTAQLHPIYYSLPKQNAAQILDLLNQLSAFKNTQQLNNFADSCNLNLNLNQLSDHKEKLQHYIKIVESINPDEFIQQGLQGAQIGTAIQEKRLALIKGSRKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300468.1|699599_700256_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.1e-08	34.4
WP_016211761.1|700671_702663_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211760.1|702769_704149_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300467.1|704186_704567_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|704563_705538_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_016211615.1|705772_706489_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211620.1|708032_708557_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211619.1|708624_710445_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210267.1|711299_711806_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210259.1|711869_713288_+	asmA-like family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210248.1|713408_713663_+	DUF493 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210257.1|713809_714082_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777860.1|714653_715229_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210251.1|716299_716542_+	sulfurtransferase TusA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777864.1|716628_717720_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210258.1|717700_718654_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	4.9e-31	27.9
WP_016210253.1|718877_720362_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.8e-46	29.0
WP_032126416.1|720402_720906_+	peptide deformylase	A0A1D8KUY1	Synechococcus_phage	2.8e-09	33.6
WP_016210254.1|721165_722341_+	acyl-CoA desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_016210252.1|723249_723621_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210260.1|726135_726564_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556655.1|726791_727796_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300466.1|727899_729237_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300465.1|729229_730009_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_081007050.1|730230_730758_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|730814_731180_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211061.1|731241_731595_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211058.1|731715_732249_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126660.1|732387_734025_+	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	5.8e-88	38.2
WP_016211065.1|734029_734251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211066.1|734348_735362_+	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211063.1|735524_737753_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.0e-82	35.0
WP_032126658.1|737733_738438_-	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_017377041.1|738672_739002_+	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300464.1|740082_741144_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|741170_741413_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|742131_742815_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|743008_743566_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|744329_745391_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|745463_746417_+	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|749748_750108_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|750104_750422_+	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|750438_751548_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210882.1|751574_752660_-	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210874.1|752782_753823_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210873.1|753837_754488_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210876.1|754555_755398_+	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|755863_756781_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|757799_757994_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|758070_758364_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|758631_759549_+	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|760099_760246_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|760300_761491_-	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211370.1|761623_762067_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|762109_763153_-	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211368.1|763199_764591_-	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|764787_765711_+	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211372.1|765697_766555_+	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|772366_773512_-|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_054300173.1|773590_774652_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP039065|841885:873648|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962625.1|872762_873648_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP039065|879568:925375|DBSCAN-SWA
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MMPKLLEQKQWDKIYLFLKDFPGIYCGSERKCRLFIEAVIWILRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075273313.1|879983_880322_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300449.1|880451_881231_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|881250_882225_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
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WP_054300173.1|884827_885889_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300447.1|886301_888938_+	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	2.0e-98	32.6
WP_080664849.1|888986_890075_+	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	4.9e-75	43.3
WP_016210997.1|890074_890758_+	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126469.1|890817_892479_+	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_016210998.1|892632_892887_+	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211001.1|892964_893270_+	competence protein ComEA	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP039065|1000994:1044919|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126362.1|1042688_1043054_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046958.1|1042999_1043560_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300417.1|1043944_1044919_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP039065|1057588:1122478|DBSCAN-SWA
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MGVVLIMGMLILEAVIIAVLFWFMGMRSRGKKIKLLTEHVQVLKNKNKERLQVLIQFITHKTKFEEPEKVAPQVIQLEGVIYQQIITLLLNFKLEEFVALEKSIERLRFLNQEFNFEEEAVDDSDASLDMSMEEDIEGSE
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MLRYKFLLYPRNLLRKSVLARFVVVLFVVMFISMLGLTYVEYQRQKNNLIMGTEQRVDVFVELLTLVLREPVYNVDEDQIQAVVNSFLKEKMILKISVFGINKDDVLASRWSLSKSFIDLTEEKLRQLGIAKESQSRYFKKQSGENGGWEIIAEQGLLSLPEEARPYLTRQLQEHQQQYGVEVKERPILVDGERIGTVDIVFTLKSMQEGLYTLFLHMLFQNILIIGLVLIVTAVLLYQFIVSPIRELGDKLKDIAEGHGDLTALLVIKSEDEIGEVAQHVNGFIGKLRKMVLVIRGEVDNLASAATGLRKFSDEVNSISARQSTETQHVAMSVHEIVSTMHASTEKCEFAAQVAEDAQNVAEHTSEVMLSSIGAIEELSYEVEDASAAIDSQWKQSQNIESILDVIQEIAEETNMLALNAAIEAARAGEKGRGFAVVASEVRVLAQRTQNSAQEVGEMIHALQSSAQKATDVMKRGVGHARVSAEYATDARESLFVILDAIDMMNDQTQSIATSVYQQNTATQEIDANIRNINYLTQTTETGAQHITRTSVELDGLTKRLLTLMKQFKV
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MKQKRQLRLLTLITCIIAWLPVIICGAEYFFLTEHALAKKSTIAVSLFITAPNALFSTFLCLVFYLIAAPNKQSTLMHYLILWVPTAVTTVSWLSHTLSTNPSATLTQTLTLYLAITASLLSIALRLIRYMNHDKKQH
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVIALD
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYSVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MSILDYFFNSANNKRKRSADVAKERLQIIVAYERNQRQKSPDYLPLLRQEIMAVIKKYVHVDSEQIKVELNQDQERSVLELNIMLPPEEEKAQEENSSNNNEATQTQATEQQKEKNADEALS
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MVTRVSTSSIFNTTVENMAKRQEELAKVQDQIASNKKILTAADDPIDALRTLALKNNIAQKKQFSENMDFSRSRLELEEATLTSLAGLFREVKVRAIEAGNGGYATSDVREVGRSIASLLESIVQQANSRDRNGEYLFSGSKMTQQPFVQDQNGAYLYQGNDTQALARLDENLEVPVSDSGQAVFFSQAMFAKTRAHENNAISVTNNNQQVASISVGYVKDVLKWQKSQEVPESYIIQFEPLTGSAPPGSPTDVDVSPTSNDAQTFSVYSATTGQIVIGEDGQPMTGLAVKRPTSSTDPAEPTVININGLIIEVTMDPNIIDAASGLPRGPQVGDRFIIEPEQQQNVMNVIDDFAKFLLSYVGGEPEGNITLNENIQRMIASIDEAGGTLLSVTTEVGLRQSNIHLQQEVSSHIQLSQNKALGDLSDLDFAKAVGELSILQTTLQATQLAFSRVQNLTLFSFL
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MNSPLYPDNISDSEWTLIRKYLVNSKKLGGRPPKYGKRVMFDATLYLLRTGCSWRHLPKDFPPWKSVYTQYRSWIKCNIFERIHAILRNKLRKLDGKKPTPSAGIADSQSVKITDRGGLHGYDGGKKINGRKRHIITDTSGLLIKAKVTEANLGDRKGLTRLLDSIVGKFHRLKTVYVDMGYNGYKFSNEIKKKFNKIIEVIKRPRKYFWVPSDVTDVASYLESIGYEVVDGFKAQSKRWVVERTFAWIGKYRRLSKDYEYKVNYSESLIYLAMIKNMLGKIIKKGV
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210284.1|1058764_1059286_+	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
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WP_129556492.1|1065242_1065986_+	flagellar basal body rod protein FlgF	NA	NA	NA	NA
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WP_016210272.1|1066838_1067549_+	flagellar basal body L-ring protein FlgH	NA	NA	NA	NA
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WP_016210277.1|1068756_1069590_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210281.1|1072688_1074080_+	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
WP_075273303.1|1074093_1074810_-	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211367.1|1074965_1075748_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126330.1|1075895_1076855_+	TAXI family TRAP transporter solute-binding subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036779263.1|1076909_1078919_+	TRAP transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|1078974_1079262_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126332.1|1079514_1080714_+	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|1081360_1081936_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_144019383.1|1084175_1084394_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126328.1|1084748_1085000_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211589.1|1085128_1086361_-	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	7.4e-96	47.8
WP_016211592.1|1086350_1087013_-	HAD-IB family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556496.1|1087287_1088526_-	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126329.1|1088711_1089341_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211588.1|1089416_1090118_+	cyclase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|1090285_1091438_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
WP_016212343.1|1091677_1092484_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	W8CYX9	Bacillus_phage	7.7e-09	42.9
WP_016209808.1|1093788_1094157_-	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_016209824.1|1094153_1094972_-	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_016209813.1|1095072_1095888_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_016209801.1|1096172_1098227_+	VWA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126324.1|1098226_1098649_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209805.1|1098827_1100321_-	neurotransmitter symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209818.1|1100453_1101269_-	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_016209799.1|1101364_1101781_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209815.1|1102167_1102707_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300409.1|1103024_1104737_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-25	30.2
WP_016209812.1|1105183_1107007_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	9.7e-44	40.5
WP_016209821.1|1107096_1107429_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209800.1|1107459_1108056_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_036777933.1|1108052_1109177_+	2-hydroxyacid dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209822.1|1109312_1109960_+	methyltransferase domain protein	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_016209810.1|1110016_1111930_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-117	38.3
WP_016209803.1|1112134_1113172_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209820.1|1113230_1116530_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209817.1|1117231_1118200_-	plasmid replication region DNA-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209809.1|1118306_1118795_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209823.1|1119219_1119663_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1120884_1121460_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1121405_1121771_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300408.1|1121821_1122478_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.6e-10	31.0

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039065|1131016:1196828|DBSCAN-SWA
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MKKLFAILGLLAVSSASFAADAPAAGATSSLMSFLPLVVIVIIFYFLLIRPQSKRAKEHRKLLSELAKGDEVSTSGGVLGKVIKVDESVVTIEIANDVEIQVQKSAVSAVLPKGTIK
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MSWLEKLLPSAARTESAGNKKGVPEGVWQKCKSCEVVLYLPELNKNLDVCPQCDHHHRISARRRLDIFLDAEGREEIGADVVPADRLKFKDVQRYKDRLTSAEKKTQETDALVVMSGTLEAMPVVAAAMEFGFMGGSMGSVMGERFVQGVNKALAIRAPFVCFSSSGGARMQESLFSLMQMAKTSAALTRLADEGLPFISVLADPTTGGVSASFAMLGDVNVAEPNALICFAGPRVIEQTVREKLPEGFQRSEFLQEHGVVDMIVNRLQMREQLASLLRKLMGLPA
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MKFSLTQTAAHTIKSDCLVVAIFEGTELSETATAIDQATDGLISRFIARGDISGKSGQSLLIPEVSAITAERILLIGAGKKDKLTDLHFKTLHTKAMTKLKELTLNQVTFSTLELAICNNNAADKLSLAMQAIDASYYRVDGLKSQPKEQHIPDEFSFIGQASEADLSNANALLAGIHLTKDLANAPGNICTPSHFAKTAQELAQQYTRITTQIIDEEEGRDIGLNSFLAVGQGSEEPSKFIIMQYQGADNKEEVPIGFVGKGISFDSGGVSIKPGEGMEGMKYDMCGAASVFGVFKAAAQMNLKKNLVGIIVAAENMPDGKALKPGDILTSYSGQTIEVINTDAEGRLALCDGLSYIEKFKPHAVIDIATLTGACVVALGEHNTGLMSNDDTFAKTLLQAGKEAADKAWQLPLDEEYQEQIDSPFADMANIGGRAAGTITAACFLSRFAKNYTWAHLDIAGSAGGVFDKKKGATARPVPLLMRYLSTLT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_155046942.1|1131016_1131902_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273597.1|1131892_1133737_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1134008_1134983_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556498.1|1135162_1135771_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036778626.1|1135767_1137708_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_016210594.1|1137843_1138497_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_016210595.1|1138673_1139852_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210588.1|1140219_1141545_+	fimV domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126176.1|1141635_1142418_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_016210587.1|1142519_1143380_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016210590.1|1143554_1144817_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210593.1|1144896_1145427_+	colicin V production protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210586.1|1145448_1146954_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.7e-86	41.0
WP_016210592.1|1146966_1147623_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212005.1|1148012_1149773_+	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|1150673_1151826_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_032126856.1|1152131_1152473_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1152533_1153595_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300406.1|1153895_1156631_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|1158930_1159746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273595.1|1160154_1161525_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.6e-12	24.3
WP_054300405.1|1161580_1162081_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|1162602_1163265_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_036777555.1|1163291_1164521_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1164677_1167449_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_052104625.1|1167524_1167968_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1168120_1169593_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_016209926.1|1169704_1170766_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209945.1|1170762_1171797_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1171799_1172840_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_036777579.1|1173022_1174138_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
WP_016209930.1|1174176_1174530_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777561.1|1174550_1176419_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1176440_1177385_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1177618_1177897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1178106_1178745_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1178719_1180147_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1180347_1181025_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1181159_1182434_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1182501_1183257_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1183308_1184226_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300404.1|1184334_1185228_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273594.1|1185300_1186671_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	4.2e-39	27.4
WP_054300403.1|1186710_1187685_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.0e-27	32.0
WP_016211771.1|1187977_1188166_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1188179_1189313_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300402.1|1189512_1193658_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211823.1|1193692_1193881_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300401.1|1194260_1194542_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376688.1|1194873_1195227_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107517381.1|1195440_1195635_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007041.1|1196300_1196828_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP039065|1250250:1287547|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212039.1|1284177_1284735_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212040.1|1284911_1286261_+	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP039065|1294303:1349894|DBSCAN-SWA
TATGACAGCAGTGAATCAGGTGGTATTTTTAATGGGGCCGACAGCCTCAGGCAAAACGGATTTGTCAATGGCGTTGGTTGAAACAGGGCGCTATGAGATTATCAGTGTTGATTCGGCGATGGTTTATCGGGGCATGGATATTGGCACAGCGAAACCGAGCCGTGAAGAGTTGGTGCGTGCGCCGCATCGTTTAATTGATTTTTTAGATCCAAGTGTACCGTACTCTGCGGCTGATTTTCGTGAAGATGCCTTAAAACAGATGGATGAAGTGATTAAAGCAGGGAAAATACCCTTACTTGTCGGTGGGACGATGTTGTACTTTAAAGCTTTGCGTGATGGGCTGACTGAATTACCCGCCGCCGATGAGTCTATCCGAATGCAATTGCAGCAGCGTGCGGATCAGCAAGGTTTGGAGCGATTACATCAAGAGCTGGAAAAAATCGACCCAATCTCTGCTCGGCGTATTCACCCTAATGATCCCCAGCGATTATTACGGGCTTTAGAAATCTATCAAATTACCGGTAAAAATCTCACTGAATTATGCCAAGAAAATCAACAAACACCCTGTCCGTATCCGATTACTGCACTGGCTTTAGCACCTGCTGATCGGACGGTTCTGCATGCGCGTATTAAGCTGCGCTTTGAGAAAATGCTCGAGCTTGGTTTTTTAGCTGAAGTGGAAAAACTGTATCAACGTGGCGATTTGACAGAAGATTTACCGGCGATACGTGCGGTGGGTTATCGACAAGCGTGGCAGTACTTAGCGGGCAGATTAAGTTATGATGACATGGTTGAACGTAGCATCATTGCCACACGCCAGTTGGCAAAACGCCAGATGACTTGGCTGCGTAGTTGGCCAGAGTTACAGTGGTTTGATAGTTTATCAAATCGCCTTATGCAGGATGTAAAGGACTTTTTGGCTGCCTATTAGTAGGGCTTTTTATTGAATATTGATGTAACAGTATTGCTTCATGCCCTAAATATTATAATTTTAGGGCATGATGAAATATTATCTTTAGTTTTAAGTTAGGGTGCAGGTGCTGCTCCCTGATTATTGGTATCGGTTTCGTTCATGTCTTGGAAAAGAGAGATGATCTCTTCAGGAGTTGCAGTCGGTGAGGGATTGCCTGCAAAAAGAGCAAATGATGGAATTAAACTATCGCTGTCACTCATGTGCTGTGTAAAGTATAGGCCGTTAAATTCAGCTGTAGTAGGGGTTAGCGGGGCTGGTGGAGCAACAGTTGGTGTAACTCTTAATGCAGGTAATAGAGTGCGGCTTGTAGATATAGGTGCAGTCGTTGGAGCTGTATCTGGGGCGCTAGTTGGTGGAGCAATGACAACATACTTGCCTTTGCACGTAGAGGTAGTATTTGAGCTTGTGGTTACAGTGCTAGATGGTGCTGTTGGAGTTTTCGCTGCAGTTGTTTGAGCTGGGCTTTTACCCGTATAATCTTTTATTAAAGCATCTATAAATCGATTATTGGTATCAATTATGTCTGTTATTTTTTTAGCAGGATCTGTAATAGTCTCTGTAGTAGCTGTTGGAGCGATAGGTGCTGGCTGCGTAGTCGCAGGTAGTGGAGTGGCAGTTGCTTCCATGGCTGGAGCAAGAGGATGATTTAAAGCTGGAGTACGGGTTAGAGTTAGAGCGCCAGTACTTGTAGGGGTGATATTGGGGGCTGTTGTTGAGTCTGCCGGTACTGGTGAGGTAGTAGTGCCTGCTGGAGTGATAGGTGCCGGAGTGGTAGTTGCTCTCATAGCTGGAGTAATGGTTACGTTATTCATTGTAACAGCAGTTGGTTGTGCTGTTGGCTGTGGGGCTGCGGTGGTAGGAGTAGGAACTACTGTTGGTATCGGAGCTGTTACCGGAATCCTAGAAGTATTTTCATAGTAGTGATTAGCTTGTTCTTGCCAGCTATTAGTCCAATAATGTCGTGATAGGGCGATTTCCCAATATCGGTCACTGATGTTAGCTAACTTCCGAGCTTTGTTAAAGTATGGTTCAGCAGCTTTATAAGAGTGTGCTGTGGAGAAGATATTGAAGGCATGCCTTCTGTGGTTAAGTGCTGAAGCTGCACCGTTAAGAATACTTTTTAATCCCGCAAGCTCTGTTTCTGATTGTAGGTGATATTTAAAAAACTCTGAGAGTTTAAGCTTTTCTGTACTGTTCCTTTGCTTGCAGTCTTTAATTGATTCATCTAAACCTGATTCTATTAATATTTTAATAAGCGTAGTGTCGAGAGGAGCTTTGAGTAGACGCTGGATATTATTTGGTGAAGCAAGGTCTAGATCTGAAAGTGATTTAAATAGCCTAACATGTCCTGTGAATGGGTTATATAAATTCGGGGCATCAAGTACTTCTTGAAGGTATACAGCTTTACAGAATTGCTGTTGTTTTAACTCGTTGTACTGTTCTAAAAATCTTGCCGGGTTTTTGAGTGCTTTTTCTAGATTTTTAGCATTTGAGAGGCCATATTTATCTAACGTTAAATATATGATTAAAAGTAGATTGGGATCTATATCTGCTTCTTGATGCCTGGCTAAAGCTGGCGGAGCTGCTGGTACTTGTTGTTGATTTAATTCAGCAAGTTCATCTGCGGGAAGACATTTTGCCATCTCCTCAACAAGGAGATGATAGTCAATGTAAGTTTGTGGGCTATAGTCATTTTGAATGCTATCTTCGTGGATAGCTTGACCTGTAAACGGTGAAACTTCACTGTTAGCTAAATAGTCTTGGAATGCATCGCGATTATAGTTTGCTGATTCTCCAGCAATATGAACAGGAACGCTTATCTCTTCGAGGTTGATACTGCAATCGATTAATCTATCCCTTTCATCGAGGAACTTTGTTCGTTGCTCTTCAGTCAGATATCGAATAAAGTTAGGGACAGTAAACGTGGCATCCCGATCAATTTCTTGAAAATGGATACACTTTTCAAGTATTTTATTTTTAAGATTATTAAAGTCACTGGGTAAAAAGTCTTGGCTTTCAAATTGTGGGTTTTCATCGCGGTTTGTAAAGAGAGGGTCGTCATCTAAGTCCTTCATTGCTTCTTGCAACTCTAGGCTTAAATACTCATAGTAAAAATTACTGTGGTGAATATCTGTATTTCTTAAATCACCAGTGCCAAACCATGCACCGATGGCACAAGACCCTTTAAACCTTGCGCCATTGAATGTCTGTACGTCTCTAAAGTCAACTTTACGCAAGTCCGCATGACAAAAGTTGGTGTCTTCTAAATTAGAGAACTGTAGGTTTGCTCCCTGCAAATATGCACCTGATAAGTTTGTATTTTTTAAATTAGCACAACTAAGATTCGCACCTTTTAAATAGGTTCCAGCTAAATTCGCTCCTTCTAAATTTGCTCCATATAAATCAACATGACTTAAATATAAGCCTGATAAATCTAAACCACTAAGGTCCCAATTACGCAAACTTATATGGCTTTGAGAGTTGGCGTTTGCTTTTTCTATTTTTTGAAGGATGTCGAGTCTAGTTTTTGGCATAGTGTTTTCCCCATACTTTTATCAGGTGTTTAATCAATTAATGGTTGTTGCTGATAGGGATAGGTATTCGTTGGCTCCCTATAGTGATTTGTAAAAATAGATCGTTTTTTAACTATGATATTTATGTTTATAAATTTTTTATTTGTTTAAAGTTATTTTAATGATAACGATAGATTAGTTTAATTTGTTTTTTATTGTCAACTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCATGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATACTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGT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MSDQNDDVVELIKKVKTEQYAKKMTDALHRMTYEQLNEYRERHGDSTGSIFEALVFTQVGALKSILIQLLKTFAMTKGRSISKDSIDDFEDMLMSFFDEDLWDEKQILTKIPANQLN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211415.1|1302138_1303062_-	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211417.1|1303085_1304135_-	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA	NA	NA	NA	NA
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WP_016211422.1|1304887_1305358_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|1307987_1308353_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300162.1|1314595_1315678_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
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WP_032126344.1|1323301_1324390_+	iron-sulfur cluster carrier protein ApbC	NA	NA	NA	NA
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WP_129556499.1|1328910_1330063_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
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WP_016210507.1|1333625_1334174_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210506.1|1342135_1343374_+	lipoprotein-releasing ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016210510.1|1343366_1344095_+	lipoprotein-releasing ABC transporter ATP-binding protein LolD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-32	38.7
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WP_016211831.1|1344919_1346647_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
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WP_155046962.1|1348868_1349315_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1349318_1349894_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP039065|1370680:1411138|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300374.1|1380893_1383464_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	5.1e-30	22.9
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WP_016209844.1|1384229_1385270_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
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WP_016209832.1|1388627_1388891_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
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WP_016209841.1|1390087_1390282_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1390357_1391917_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1392235_1393132_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209830.1|1396699_1398067_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1398302_1398557_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1398572_1399859_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
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WP_016209839.1|1402183_1403482_+	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
WP_016209829.1|1404861_1407261_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209834.1|1407257_1408016_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209842.1|1408192_1408582_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300373.1|1409309_1410167_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1410163_1411138_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP039065|1439059:1618013|DBSCAN-SWA
GATGAATATTTGTGTTGTTAGCTTGTTTGCAGAGATGTTTCAAGCGATTACGCATTATGGGGTTACAGGACGCGCAGTGCAGCAGCAGGCAGCCCATGTAAGTACCGTGAATCCGCGTGAGTTTACGCAGGATATTCATCGCACGGTGGATGATCGCCCGTATGGGGGAGGCCCAGGGATGTTGATGAAGGTGCAGCCGTTGCGTGATGCAATCGTTGCTGCGCGTAAAAAAACATCCGCACAGGCTCGAGTGATTTATTTGTCTCCACAAGGAGCACCGTTGACCCAGAGTAAAGTACTTGAACTTGCCAAACAGCCTGAGTTGATTTTATTGGCTGGGCGCTATGAAGGCATTGATGAGCGTGTGATTGAAGCTAATGTTGATGAAGAGATCTCGCTGGGGGATTATGTTCTTAGCGGTGGTGAACTTCCTGCAATGGTTTTAATGGATGCGATTATTCGAGTTTTACCTGGTGTTCTTGGAGATGCAGAGTCTTTTCAACAAGATTCATTTATGGCGGGATTGCTAGATTATCCGCACTATACTCGACCTGAATTGATTGATGGCCGTCAAGTACCTGAGGTACTGATGAGTGGCCATCATGAAAAGATTGAACGTTGGCGCGAACAGCAAGCATTGGGGCGAACGTATTTAAGGCGCCCTGATTTATTTGAGCGTTTAGCGTTGACGGCACAGCAACAGATGTTGCTGGACGAGTATTTGGCTAAAGCAGCCGGGTGCGGCTCTGCTAGTGATCTTGATAAAGTAAGTAATTCTTAATAACAGAGAGGTTCGCCATGAACGATATTATTAAGCAAATTGAACAAGAGCAAATGCGTAAAAATGCATTGCCTGAATTTAGTCCTGGTGACACAGTGGTTGTCCAGGTAAAAGTAAAAGAAGGAACGCGTGAGCGTTTGCAGGCCTTTGAAGGTGTTGTGATTGCTAAGCGCAAACGTGGATTGCATTCTGCTTTTACTGTGCGCAAGATCTCTCATGGTGAGGGTGTTGAGCGGGCATTTCAAACACACAGCCCATTGGTTGACAGTGTTGAAGTGAAGCGCCGTGGTGCGGTACGCCGAGCTAAACTTTACTATCTTCGTGCTTTACGTGGTAAAGCTGCACGTATCAAAGAGAAACTGTAGTTTTCTCATTACCATTCGTGGTAGTTTAAAAGAAGGGGGCATAGCCCCCTTCTTTTTGTTTGTATGATGAAATATGAAAAAAATGAGTGATAGGCGAGTGAGTGTGTGAGTATGTCTTTATTTGGCCAATTGATTGGCACTGTCGGTATGGCTTTAGTGGTTATTGCTTATTTTTTAGTTGTATCACAGCGCGTCACCCCTGGAAGTTTGCCTTTTTCTGTGATTAATTTAATTGGTGCTATTTTGTTATTAATTAGTCTGTGTATACACTTTAACTTAGGCTCATTTATTATCGAAATTTTTTGGATTTTAATTTCTTTGTATGGCATCGTAAAGTGGTGCTTGCAAAAAGCATTGCGCAATCAGAGAAAGAAGGTTGAATAAGGTTTAAAACCACTATATTGAATATCACTTGCTAGAAAGCGATCGGTTAAGAAAAAATTGAGGGATGTGAATATTTGCTAGCCTGGACTAATAATCTGCACTAAGGTTGAGGGTTGGAGTTTAGCTGTCCCTGTCCTTCACTGTTTGCACTGGATAGATACGTATTATAGTACTGAAGAGTTTCTCGGTCTGGTTGTTACTATATTTTACTAAGAAATAGGCTTAATCGTCTTCCTGAGAACATTAGAAAATGATCTATGCCTTAGTTTAAACGTTATGAGAGAAAAGTTCCTGGGCATCATGTACAAGTTGATGTTAAATTCCTATTTTTTAATGATGAAGATGGTAAAAGAATTAAATGTTATCAATATACGGCAATCGATGATGCGACACGTATTAGTGCTTTAAAAATTTACTCAAAACACACCCAAGCTAACGCAATTTATTTTATTAATTATGTGGTTGATAAATTCCCATTTCGAATTAAAGTAATTCGTACCGATAATGGCAGTGAGTTTCAAGCAAAATTTAATTGGCATGTACAAGACCTTGGTATGGACCATGTTTATATTATAGATAAATACTAAATATATGGCATAATAATTTATTGAATAATTGTAGAATTAAATAAGGAATATGTCATGGGATATCCAGTTGAATTCAGACGGAAGGTCTTTAAGTTAAAAGAAAAGAAAGGGCATACAATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGAGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGATTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAGGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAGCTATAAACCAGGAACGCCAAGGCTCAATGGCAAGGTAGAACGCTCATATCGCACTGACAAACAAGAGTTCTATCAATTAATCGATTATAATGGTGATGTTGATTTACATGACAAGCTTGCAGAGTGGGAGGCTTTTTATAACTTTCAGAGGCCCCACTCTGCTCATTCTGGAAAAACCCCTTACGAAATGTTAAAAACTAAGTTAGGATTGTAAAAATTCATGTCAAGCGAAGTTCTGAGTGACACAGTTGTTGCAACAGGAGAAGGTGATATACAGTTGAGTGCTCGTTCATATAATTAATTGTTTAAAAAAAAGTAGTGAAAATTAAGTCTGAAGTAGATTAATCATGTAAATGCGTTATTGTATAAATATTTACTGAAAACTAAAAATATTTGCGAGAGTTATCATTCAAAACTCCATGTTTCTAAGCTCCAATAAATTTATTAGGATGATAATTTTAAGTAGGGGCTTAAAGGAATGCCAGCAAACGAATATCCGCAAAGTCGGCTAATCTCTGTAGGTTTGAGTGGGAGCCGAATAACAGGTGATATTGGTCGCAGTCTATCTCGTTTAGAAGCATGTTTGCAGGGGCTTAATATGTTGGATAATCATAGCCGACTTTTTATTGCTCACTGTGAAAGTCTTTCTCGCTATCTTTTTAGTAATGCGCGTTATCATGATTTTTATTATTCATATCGCAGAAACCCAGCTTTAGAGGCTTTGCATTTTTTGAGGGATCATGTGGCACACTTAGTTGTAAAGTTAGCGCCTTTGCGAGGGTTTGAAGCTAGGGAGGAGTTTCAAGTTGCGCTAAATGGCGTATTTGCAGATTTTAATAATAAACTTGATGAAACAATCATAACAAACCTAACTAAAGAAAAAGAGACGCGCAATGTTTGTTACAAGCTGCGAGATGTAAGTTTATCTATTATCTTTTCACAAAGCCAAACCCACGATAGTGCTGGGGCAGGTGCTAAAGTTCAAAGGATGATCACTAAAATAGAGCAAATGGCTAAGAGTGAAGGGGGGCAGGGCTTTAAGTTCGGTTGGTGGGGCACTTTTCGTTCTATCAAAGTCGATGGAAAAAGCTATGATGTTCCTGGCAGAATAGCGAGTTTGTATAAAGTATTAACTGATGATCGCATAACAAATGCTGATAAATTAAGAGCGGCCTACACTTTAAGTGCGTATAAAGAAAAGTCCAAATTTTTGTTTTTTAGACAGCCACAAGAAGAGACTAACGAGATGATACAGAATTTTAAAAAAGAGCTTTGTGCTGATTTGTAGTGAAATGATCCCCATAACTACCCTTGTTTAAGTCTTTGACAGATAGGCTGCTAGCTGGAATAGTGAATCTCTCAAACCTTGGTCTATGGATTCTGCCATAATAACTCCGTGAATTTGACGGTTACACAGGAGATTAAAAATGACAACATTATACGAGATTTTAAGCCATTCAAAGTGGGACTGCAAATACCATATTGCGTTTTTTCTAAGGTAAAGGAAAAAAGTTCTTTAATGGAAATATAACGAAATTTTAGGTGCTTTATTTAACGAATCAGAGGTAGAGCATGGTTTTAGAAGGTCATAACAGTTTTTAGGTAAGAAGAGGAATTTTAATGGAGGGTTACCATGGGGTATCAGCGGTTGGTTTTGAAGAAGGACAAATTAAGGCGTATATCAAACATTAGGATCAATTGATGGGGTTGGATTTTAATGGAAAGGCTAATTTTTAAATTACAGATTGAACTTTAATACTGCTAACCTTTGGAGCTACTTACAGCCATCAAGCCACCCGCTTTGCGGGTGTGTCATAATTATCGAAATGATTATTTAGTCAATTGATATTAATTAAGGGCTGTAAAAATTGAAATAGTGCGTCGTTAACATATTGAGGTTGCTCTAGCGTTGAAATATGACCGGCGTTCTCAATCGTTATAAAAGAAGCATTAGCTAGTTTTCCCGCCATCAGTTTTCCTTCACTGACAGGTCTTGGGATATCATCTTCCCCAGTGATGATAAGTGTTGGAGTTTGAATATTCGTCAGCTTGTTAAGGCGGTCTTCACGGCCAAAAATCATCCGCCCTAATGGAATAATAGACTGTAATTTTTCAGGGGATAGTTTTTGCAGATGAGCTTGAAAGTTTTCTATTAAATCAGGTTGGGTTTTAAATGTTTTAGGTGAGAAAAATAGTGGGACAATTTTATCTAATAAGGGGGTTGGGATAGCTTGAGCCTGTTCGATAGCGGCAAGCATGGCAAAATATTGCTGATATGATAATTCTGGCTCTTTACCGACAAAGGTGTCCATCAGAGTGAGTGCTAAGATGC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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211289.1|1440315_1440588_+	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
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WP_032126803.1|1444586_1445819_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
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WP_016211806.1|1446981_1447707_-	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_081007037.1|1447749_1449288_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
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WP_032126607.1|1457113_1458397_-	homogentisate 1,2-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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1480366:1480425	attL	NA	NA	NA	NA
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1507026:1507315	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016210103.1|1559120_1560479_+	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
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WP_016211666.1|1599760_1602580_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
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WP_032126677.1|1605364_1605928_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211557.1|1606122_1607352_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.0e-08	22.0
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WP_032126678.1|1608350_1609361_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
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WP_032126362.1|1612773_1613139_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1613084_1613660_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|1617038_1618013_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039065|1646559:1690949|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP039065|1701249:1770104|DBSCAN-SWA
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MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
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MNKELLNIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHTASHGVLSTG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212459.1|1732677_1733058_-	glycine-zipper containing OmpA-like membrane domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046975.1|1733177_1733627_-	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
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WP_016211748.1|1747973_1749578_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211749.1|1749657_1750851_-	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|1751059_1751923_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300318.1|1756105_1757083_-	NAD(P)H-quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211465.1|1757710_1758694_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-34	32.7
WP_016211464.1|1758844_1759192_+	arsenate reductase (glutaredoxin)	NA	NA	NA	NA
WP_032126752.1|1759188_1759791_+	NAD(P)H:quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211466.1|1759878_1761399_+	RsmB/NOP family class I SAM-dependent RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126753.1|1761468_1761933_+	copper chaperone PCu(A)C	NA	NA	NA	NA
WP_054300317.1|1762889_1763423_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036777066.1|1764075_1767132_-	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_016209621.1|1769099_1770104_+|tRNA	tRNA dihydrouridine(20/20a) synthase DusA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039065|1798677:1842450|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211319.1|1803361_1804414_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211316.1|1804946_1805597_+	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211315.1|1805931_1806576_+	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300314.1|1806763_1807099_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273532.1|1807059_1807647_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126997.1|1807864_1808104_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	NA	NA	NA	NA
WP_032126998.1|1808425_1808773_+	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_036774554.1|1808871_1809150_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007020.1|1809202_1809490_+|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|1809493_1810380_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211346.1|1814249_1814891_-	RluA family pseudouridine synthase	A0A2H4UV25	Bodo_saltans_virus	7.4e-07	28.8
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WP_016211347.1|1815132_1816116_-	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	2.1e-53	38.7
WP_016211344.1|1816329_1817148_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300313.1|1817308_1818991_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-32	33.7
WP_054300312.1|1818998_1820021_-	YHYH protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211341.1|1820219_1820390_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556538.1|1820534_1821509_+	D-alanine--D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211940.1|1821622_1821955_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211942.1|1822075_1823335_-	DUF4804 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300310.1|1825136_1825661_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211210.1|1825763_1827245_-	thiamine phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_052104715.1|1827251_1827458_-	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
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WP_016211215.1|1828777_1830748_-	acetate--CoA ligase	A0A2H4PQU7	Staphylococcus_phage	1.5e-77	37.2
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WP_054300308.1|1832962_1833193_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300307.1|1833222_1833951_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.9e-43	41.4
WP_054300306.1|1834053_1834278_+	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016211983.1|1834525_1835185_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_129556643.1|1835280_1836645_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016212551.1|1837102_1837597_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211946.1|1838952_1839708_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556540.1|1839926_1840322_+	ArsC family reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211947.1|1840314_1841460_+	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_033923708.1|1841574_1842450_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP039065|1886854:1905636|DBSCAN-SWA
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MPDSGSDEVNEAKQELFAAKIADGTPGLYLALKNGCHQATESYIDGVFSASLGIALNE

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212247.1|1897948_1898704_+	ZIP zinc transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1899331_1900306_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300162.1|1900645_1901728_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_016212246.1|1901831_1902488_-	AT hook motif family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300297.1|1903423_1904491_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1904553_1905636_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP039065|2026530:2081445|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_23

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MVYWHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MSDEVKRKTELNLGELLQRARCNKNLTREQAARQLHIQPQILMLFEHNDFKQFNLPEHFIIEYLTNYASLLDLDAKAVAAIYRQGGVVDLAAAPVDKKPVTDLSVGVKSAVNHQRNNTINEKSDVKSPTRTPSESALSIANKKNLKQSERPKLSAHKSQHTERLLSPHEKISAHCQEQSFEGLAMQSEVRKTDSARKGRSALSWGMNLLILIIVITVAFLWYKNQISQLSPAAAVSSKKINQAANQLAPFAKPSLAEQQAAEEAQLEQRLHSNEAMAAQYKILKVPPQAQEQEQS
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MKHSSAFLTLVEQARSSVSEISIENVCDYINEHVDFQLIDVRESDEVSVGKIKGARVLSKGIIERDIERLIPDVNTHIVLYCGGGYRSALAAENLQRMGYLHVESMIGGFKAWQQAHYETESTG
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MAANFFGQWLLERGLITPEALIDAVEYQKKHNISLGEVAIEKSWLTENQVASINAEQQRSDRKFGEIATDLKLINDEQVQELLNTQKARRIFFGEALLALGHIQQDVLDKEIQAHKKAQEEHEELLKANLDNIPEAITVKAMLDHTLKMFLRIAREMVKITEVSTEANAISTDQNHYTFAQEITGEKNFYYALTMPEALVINVAGKLLMDDNHNEITPLSLDAASEYVNIIIGHGCGKLGTLDCMVHANPPFAYKKSEEKNPDCKHQVTVELASAHGDLMVEFLFKK
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MIYLDYAATTPVDPEVIQAMQECLGLEGDFANPSSLHRLGWLAAEKIKHARGQIARLVGADSKAIIFTSGATEANNLAIKGVCEAYQKRGRHIITSKAEHKSVLDVFAVLEKQGFEVTYLTPNKQGLIDPEILQTAMHEQTILVSLMHVNNELGVAHDLVALGTIVKAHGAIFHVDAVQALGKLPIDLAELPVDLMSFSAHKCYGPKGVGTLFVRRRPKVRLHAQQHGGGHELGLRSGTLATHQIVGFGRACELAEEKLNEEPQRVMALRDRLWQGLSQYDQVYWNGQGALTQAPGILSVSFAGVDGESLLACLPELAVSQGSACNSTTVEISHVLAAIGMPAERAHSTLRFSLGRYSTLAEVDQVIEQVGRALTHLRKLSPTWQVQQAGADPALLPWGRYVE
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MAKGIQAIRGMNDILPTESAYWQWLEVAVRDTVNAYGYQEIRFPIVEKTELFVRSIGEATDVVEKEMYMFEDKGGESITLRPEGTASCVRAALQHGLLYNQQQKLWYLGPMFRYERPQKGRYRQFHQFGVEVFGYCQAELDAEVILLSAHLFKRVGVFDQLTLHINSLGTPAERLAHRVALVNYLKENQAVLDEDSQQRLAKNPLRILDSKNPLMQEMIAAAPRLLDYLGEESLAHFERLKELLTVAGLSYQVNPCLVRGLDYYSRTVFEWMTDHLGAQATICAGGRYDGLVEQFGGKATPAVGFGLGIERLLLLIETLGKKPEVLASPHIYCIATGKREMAQVVILAERLRSQLPDLRILSHGDQGSLKSQFKKADKSMAQLALIIGEDELAKECVTIKFLREPREQVSCAQGELMTTIETLLK
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MLSKDLEMTLNLAFKVAREKRHEFMTVEHLLLSLLDNTAAASVLQVCGADLERLRHSLSQFLDETTPLIPSNDYDCDTQPTLGFQRVLQRAVFHVQSAGKTEVTGANVLVAIFGEQDSQAVYFLRQQNITRLDVVNYISHGISKIHDDDPSVDYDQPSPQGGGERGEEAEEAMVGPLESFAVNLNEKARQGAIDPLIGRNQELERVVQVLCRRRKNNPLLVGEAGVGKTAIAEGLAWRIIENDVPDVINESVVYSLDLGALLAGTKYRGDFEKRFKSVLRQLQKVKDAILFIDEIHTIIGAGAASGGVMDASNLIKPLLSSGELRCMGSTTYQEYRGIFEKDRALARRFQKIDITEPTEDETYRILKGLKSRFEAHHNIRYSNSALKVAAELSARYIPDRFLPDKAIDVMDEAGAYQRLREQDKRKKVITVTDIEKIIAKMARIPEKRVSASDRKSLENLERDLKILIFGQDEAIEALVSTIKMSRAGLRDEAKPIGSFLFAGPTGVGKTEVSRQLSKLLGVELIRFDMSEYMESHSVARLIGAPPGYVGYDQGGLLTDAVTKQPHCVLLLDEIEKAHPDIFNILLQVMDHGTLTDNNGRQADFRHAIVILTTNAGAFEESRASYGFFEQDHAADGIESVKRAFSPEFRNRLDSIIRFKPLSFDVIKHVVDKLICELQAQLDDKGILLDIDEEARGWLAEHGYDHKMGARPMSRLIQNVLKRPLAEELLFGKLSHGGAVHITQKEGELCLDFQEEKV
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MITIAKKPISNKIPINPFIIKYSPSKFSLTYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MARRRHKPVPKEPVQVVIDKIDHEGRGIAYHDGRTVFVDGALPKEEVVFQYVSRRAKVAEARTLDVIQASRERVDAKCAHFYLCGGCSLQHMSPEAQIDFKQHTLLEQLKHFGQIQPEQVLAPLVNTMPWAYRRRARLGVRYVHKKEQVLVGFREKHSSFLADLSSCQVLTANVGEHLEAFKVMFSSLDAKETIPQVEVVVGDDQTALIIRHLEPLSDHDLKALIEFCQRLNFELYLQPKGPLTIHRIYPEPVSGRLPGQERLSYCLPDFNLEFKFHVSDFTQVNSEINRQMVPLAVNLLAPGDDDKVLDLFCGLGNFTLPIATRAKEVVGVEGSERMVERGYENAKHNNLNNVRFYAADLSQPEHKASWYDEQYDLILLDPARSGADVLLNHIERFSARRIVYVSCNPATLSRDAGILAQKGYQLKKAGVMDMFPHTVHVESIALFEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209434.1|2026530_2027952_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_129556553.1|2028041_2029634_-	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209439.1|2029797_2030424_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300277.1|2030504_2033186_-	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016209445.1|2033668_2034625_+	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_016209435.1|2034725_2035097_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-05	29.4
WP_016209404.1|2035123_2035987_+	chemotaxis phosphatase CheX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209416.1|2035976_2036762_-	plasmid replication region DNA-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209413.1|2037050_2037536_-	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209443.1|2037610_2038132_-	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016209405.1|2038177_2039071_-	cheW-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209406.1|2039067_2039889_-	ParA family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	5.0e-16	32.2
WP_016209408.1|2040203_2040374_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209427.1|2040527_2041931_-	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_052047073.1|2042024_2043275_-	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_080664816.1|2043261_2043993_-	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|2044004_2045282_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_016209433.1|2045381_2045756_-	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|2045840_2046728_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|2046785_2047514_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_129556555.1|2047510_2048641_-	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|2048771_2049200_-	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_032126508.1|2049294_2049654_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209447.1|2049643_2050855_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2050851_2051640_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2051802_2052597_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|2052802_2053777_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
WP_155049809.1|2053951_2055247_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|2055250_2055550_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2055539_2055704_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2055760_2056126_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2056465_2057206_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2057209_2059714_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2059976_2060933_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2060916_2061678_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|2061755_2062631_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2062755_2063001_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2063060_2065334_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2065388_2065742_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2065931_2066225_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_032126515.1|2066397_2066577_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|2066652_2067228_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2067510_2068827_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2068837_2069206_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2069236_2069899_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_054300274.1|2070073_2070439_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2070384_2070960_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2071127_2071847_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2071826_2072642_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2072658_2074860_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2074942_2076292_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2076366_2076966_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2076949_2077159_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|2077476_2078664_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2078859_2080149_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|2080559_2081445_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP039065|2093981:2135795|DBSCAN-SWA
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MYEITYGVNIADLSIAALTDSMPTSSSAQQKTTGNYFLWAYLAKTQGTIKKLIPPSLSNKFDIHWQVDVGQEILNSTSIIDRIGILTSTSNNLDTIQQDFEYLRQYCPLVVEQSK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036776407.1|2095291_2096428_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211446.1|2096611_2098339_+	glycoside hydrolase family 32 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211448.1|2098328_2099537_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211450.1|2099635_2100658_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047009.1|2101433_2101607_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_052104774.1|2101751_2102384_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2102431_2103493_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126170.1|2103656_2103929_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|2104156_2105368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211037.1|2105718_2106348_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_016211042.1|2106396_2107413_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
WP_016211035.1|2107659_2107875_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_016211043.1|2107927_2108377_+	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP039065|2156653:2284218|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039065|2291027:2362188|DBSCAN-SWA
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MVNSALFTQGYECLKALELNQPENIDKLLGGLALFAGNYQRLEKLGFSLNPERVKKMLDNLESFDQDYPSLQKLHAVYDGLTAKIENNQLKVHGLTGGSSIMFKGQLRCVPKGVSKIWEQVADDEGNFKWMDDADVALTQAKAQADQRQGFRGLTAVSMFFGSYRDSETKELYKEISGLLAS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300271.1|2293796_2294771_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_081007011.1|2310781_2312002_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016209384.1|2315232_2316048_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300234.1|2316398_2317340_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300233.1|2317881_2319525_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209368.1|2320100_2321630_-	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-84	42.2
WP_054300232.1|2321665_2323117_-|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
WP_016209366.1|2323091_2324051_-	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016209365.1|2324128_2327635_-	DNA polymerase III subunit alpha	A0A291AVA6	Streptomyces_phage	4.9e-193	38.5
WP_032126583.1|2327658_2328228_-	ribonuclease HII	V5LS49	Emiliania_huxleyi_virus	5.7e-27	42.9
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WP_016209377.1|2329613_2330387_-	acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209390.1|2330386_2330824_-	3-hydroxyacyl-ACP dehydratase FabZ	NA	NA	NA	NA
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WP_016209381.1|2331951_2332485_-	OmpH family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556472.1|2332565_2334959_-	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
WP_051307309.1|2335297_2336338_+	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209394.1|2338540_2339605_+	GHMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209364.1|2339594_2340623_+	diphosphomevalonate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016209393.1|2340619_2341159_+	isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016209400.1|2341703_2343665_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300230.1|2344102_2345734_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209397.1|2345854_2346730_-	bacterial lipid A biosynthesis acyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209379.1|2346817_2347624_-	cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126580.1|2347631_2348369_-	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	7.2e-22	42.5
WP_016209396.1|2348385_2348943_-	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209399.1|2348946_2349684_-	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209372.1|2349687_2350566_-	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
WP_032126579.1|2350740_2351508_-	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
WP_016209375.1|2351930_2352740_+	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300229.1|2352817_2355475_+	[protein-PII] uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209389.1|2355475_2356513_+	asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_016209373.1|2356514_2357336_+	2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209387.1|2357465_2358350_+	DUF2608 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2358487_2359063_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2359008_2359374_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300228.1|2360279_2361533_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_155046990.1|2361510_2362188_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039065|2367052:2413563|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300222.1|2393012_2395919_-	bifunctional [glutamate--ammonia ligase]-adenylyl-L-tyrosine phosphorylase/[glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2406045_2406411_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP039065|2482396:2524838|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP039065|2529334:2576887|DBSCAN-SWA
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MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
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MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211242.1|2531113_2532082_+	FtsX-like permease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556456.1|2532125_2532875_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211238.1|2533076_2534570_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_129556626.1|2535012_2536401_-	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016211235.1|2536830_2537268_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2537762_2538491_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_054300206.1|2538776_2539013_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2539215:2539274	attL	NA	NA	NA	NA
WP_155046992.1|2539479_2540019_-	queuosine precursor transporter	A0A2H4J2N7	uncultured_Caudovirales_phage	8.7e-09	30.5
WP_032126362.1|2539979_2540345_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2540290_2540866_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_129556455.1|2541811_2542414_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211642.1|2542714_2543068_-	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211646.1|2543060_2543300_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211918.1|2543671_2544640_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307368.1|2544639_2545920_-	AAA family ATPase	Q7Y3Y6	Yersinia_phage	7.3e-38	33.5
WP_054300202.1|2546626_2547355_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_054300200.1|2550814_2551393_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	3.9e-47	51.5
WP_155046993.1|2551385_2551748_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A2L1IV36	Escherichia_phage	1.3e-13	37.6
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WP_036780881.1|2552137_2552737_-	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
2551950:2552210	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016212022.1|2552736_2552955_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300198.1|2554324_2554654_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|2554804_2555533_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_036778484.1|2557148_2557760_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2557806_2558826_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2558927_2559722_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
WP_016210931.1|2559743_2560550_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210941.1|2560628_2561678_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126310.1|2561875_2563135_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_032126309.1|2563181_2563859_+	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210937.1|2563944_2564226_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_155046994.1|2564317_2565472_-	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	2.1e-20	25.6
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WP_016210818.1|2567186_2567411_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210811.1|2567702_2568407_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300196.1|2568821_2569460_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377821.1|2569794_2570325_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300195.1|2570321_2571854_+	inactive transglutaminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210815.1|2571850_2572801_+	alpha-L-glutamate ligase-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210817.1|2573221_2573854_+	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-13	32.8
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WP_016210813.1|2574643_2575072_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300148.1|2575825_2576887_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP039065|2580099:2632309|DBSCAN-SWA
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MIKMLSKHIADYMFIAPEEAAIAITSAGLLPKNFKLIKIIDILPGNKRHIICSQKVPLPLITKLNQAIKSNIP
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGYSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKVQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MSVKKIVDGEEIKVLSENDPRKKGEWFKEFVKNLVRNLFGNNSKEVKKLSESTTSLFKDALSNHHKEPLQPVPGSVVVMAC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_075273313.1|2580514_2580853_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036778253.1|2580910_2582449_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	3.5e-87	36.5
WP_098082804.1|2582560_2583659_-	peptide chain release factor 2	A0A0S4KWG0	Pseudomonas_phage	1.1e-05	43.1
WP_016210987.1|2583896_2585096_+	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210981.1|2585125_2585764_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
WP_016210983.1|2585779_2587963_-	protein kinase family protein	A0A1S5XZ05	Kurlavirus	1.1e-06	34.9
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WP_054300193.1|2589590_2589797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212033.1|2592258_2592921_-	O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211963.1|2594331_2594991_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211965.1|2595092_2595743_+	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
WP_016211964.1|2595855_2596176_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2596234_2597209_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300190.1|2599420_2600383_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046995.1|2600509_2601395_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210162.1|2602080_2603118_-	fructose-bisphosphate aldolase class II	NA	NA	NA	NA
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WP_016210183.1|2606946_2608950_-	transketolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210174.1|2609400_2610561_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	8.2e-121	58.5
WP_036776947.1|2610797_2611913_+	DSD1 family PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016210172.1|2612075_2612600_+	inorganic diphosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	6.9e-51	59.6
WP_016210163.1|2612599_2613130_+	ferric uptake regulator family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210178.1|2613219_2613687_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210161.1|2614188_2614443_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210179.1|2614643_2615147_-	RNA pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_129556592.1|2615437_2615968_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210168.1|2616128_2616812_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210164.1|2616887_2617667_-	DUF2063 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126297.1|2617653_2618514_-	DUF692 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210177.1|2618638_2619004_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210175.1|2619389_2619719_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300188.1|2620032_2621592_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A1B0V854	Salmonella_phage	9.9e-37	50.4
WP_054300148.1|2621837_2622899_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211784.1|2623452_2624175_+	aquaporin family protein	M1HH19	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-26	35.8
WP_016211783.1|2624166_2624532_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126294.1|2624812_2626090_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211782.1|2626689_2626872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2626933_2627299_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273426.1|2627244_2627820_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273424.1|2627834_2628458_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210766.1|2628546_2628990_-	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_032126291.1|2628993_2629503_-	lipoprotein signal peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210756.1|2629495_2632309_-|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	A0A167RAL2	Powai_lake_megavirus	1.3e-76	26.5

Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP039065|2662375:2698704|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP039065|2848940:2914512|DBSCAN-SWA
CTCAACTGGTCAATAGGTTACGCTGGATATTAAGCGATGGCTTCTTCTCCTGAAGACAGTAGGCTGCTAATCCAGCAAGAATATTGACCATAAAGTTGTTGACACTACGATGCCTAGAGTGCTCGATTTGTGAGATGTTTTTAAGTTGATCAAATACACTTTCAATAATTCCACGTTTTCTGAGTAAAATTTTATCGATGATAGGCATGAGCCTATTTTTCATATTCTTGCGAATTTTATTGATTAATTGCAGTCCTTTTTCATAAAGCCTGTTAAATAAATCTTGTGAAATGTAACCTTTATCACCAATAATCTTACCTGTCAGACCTTGAGCAATTTCAGATACATCCGTTGTTGCCTGACTGAGTTTAAAGGCCATCAACTCCCCCATATCATTTACAATTAGATGAAGCTTAAAGCCATAGAACCAGCCCATCGTTGAACCACATTTTTTAGCCAGTCCTTTAAAGACTCTATTTTGATGACTGCGTTTATGATGACAGACTCGTAGTACGGTTGAATCAACAAAATAGATTCCCGTAGGTGTTTTTCTTTGAGCGGCAATAAAAAAACACAGAGGGAGTAATATAGTTGGCATTAATTCAACAAATCGGTTATAGCTCACTGCCTTGGGAAAGTATTTTTTCAAATGGCCCTGGACTTCCCTTTGATAGTAATGTTTGAAGTTACGATAGTGGGATTGATGAAAATAAATCATGATGGTCATTATTTCGCTCGTTGACATGCGGCTTGGTTTATTGCGCTGCTTATCTTGGTGCTCAAGTAATGAGGCTTTCCAGTGAGGCAAGAAAACCTGACAAAAGTCATCGACAATACAAAACAAACCGATTAAGCTGGTATCCATAAGTAGCTCCTTGCAATGGATTTAGACTTTGAGAACCTAAATATTAATTGCAAACGGGCTGCTTTTTCAATAGGACCTTATATCGAACTCACGTTAATTTAATTAGTTTCACCAAATTTCTTATCTAGAATCACAAATAATAATATTTAAAAAATTTTAAGCTGATACGGTTAAAACCAAGAATTTTTTTAGTTATATCTAAAACATTCACATGTTACTTTTGTTTCATTATTAACTAAATAATTACAGATTAAGCCTAAATAAATTACCGTTAAAATTAAGACAAAGGAAAAAGTATGCCATCAAGCAGATTCGATCCACAAGCACTGAAAGAGATTGCAACTCTCTATATGCAAGCCTATCAACATGATAGCGACTACCAAGATCCTGATAATGAATATGGAGAACTATATGGTGCTGCCCAACAGCTTAAGAGACAAGCAAGAGCAGGTCATTTTTCCGAGGAAGAAAGCGCTCGAGTCTTAAGAGCATTATTAGAAAGAATTAATAATAGTTTAAAATTTTCCTTACAAACATCCGATCTTGGCTATAAAATTCGAGAAACTCTACGTCAATTTTATGGTCTTAGTCCAACTCATGTCAATCCATCCGAGCCCTCTGTAGGTCACATAGCTCAACGAGGACTTAATGGGCCATACCTGCCTGCCCTCAAAGCATATGAGTTACAAGAAAGTTACCTAGGCAAAAACTTAAATGGTTTATTCACTTTATTTGAAAGACGCAAACAAAAAACAAAAGGCCACTCTGAGTTTACCAACTCCAAACATAGAACTGCAATTAAAAAAGAAATACTAAGACAAATAGAAACTTATGGTATTGAACAAAGTCTGACCGAACAAGCTACCAAGGTCTTAGCACACCACTCTGATTTTCTCCATGGAAGAAAAACAAGTTCTATAAAAGAAAGCCTAACAAGCCCAAAAGTATTTGCTGCGCTTTATGCTCCTGAAATTCTAACCATGAACCAAAGACAGTTAGTAGATAAATTTAATGCGATTAAAGACGGGACACAACCACCTTATAATAAGGATAAATCACACTCATTAAAAGCACTTAAATATGCGCTAATTGATCACATTGAACAATCAGGTCAATTAGATGATGGCGTTGCAGTTCACGAGGTGAATCAAGTAATCGATCATAGACGTGGCTTTTTCACTCCGATGACAAATACAAGAGACCGCGTTAACAGTACTCCACTGCTAGCACAACTATTGCCAAAATCAAAAAACCCTCAACAACCCATGTTTGACCAAGCGAAGGCCGACGCTCAACAACAAGAACAAACACCCACAGCTACAATCAGTAGCGGACAGGAGCCAGGTTAAATTTATATATGATCAAATTAATACAAATAATATGAATTCTTTATAATTTGTCTAGCCGATAATCAAGCTGCATATCTGTTGATATTTTTTTATTTACATAAACAATATGCAGCAACACTAAATTTTAATAAATAATTCTAAACAATCATAAACAATTATTATTAACAAATAAACCAATAAAGATTTTATCTCATTATTATTTATTGATAAAAGAATAATAATTCAATAAGCTGGATTATATATAAATCATATGAATTCATTCACATTATGAAAATTTATATTTTTCTAATGATTTTAATTATACCTTACATTGCTTCAGCTATGCCTTTAGAGAATACGAAGGTCAATATGAAAGTGATGGTTACTATCATTCCCCCGTTAAAACTCAAGGTAGGCAATCTTAATTTTGATACCCTCGTTAAACCTATTACTGGAAAGAAAATGTATCAAGCAGATACGGAGTTATACCTCTACGGTGCTCCAAAACAATCAGTTAAAATCACGCTTGCTAAACAAGTAACTATTGAAAATAAAAAAAATAAATTAATAGTATGGCTATCTCTTGTAAATAAAAAAGTAATATTAAATAGAAAAGGTAAAGCTTATTCAGTTATTACCGGAGCGATAAAACTGACTCCATTGACAAAAACAGGTAATTACTCAGGTCAAACAATAATTACTGCATCTTATTTTTAATAAAAAATAGCATTTAACTTGACTATAATTCCATTATTCCTATTGATTTCTTTAAAAAGACATATATAAATTAATAAAAATTATAAACCTATATAAACTGTAAATTTGCATATATTTAAAAAATAAATATCAAGCATAAAACTATTTGAATTTCGTCTATTACTTAATAGATATTTCTTAATGTATAACTCTATAAGAGTTAATTTAATATAGATGCAGAGGAATATGCCAAAAAGCACCCCTAAAATTATAAAGTTAAAAAATGATCAATACGAAAAAATACATCATTTTCGATTTTTAAAAAATGACAACAAAGCGAGAATATGGACATCGAAGTATCAAGTCAGATGCTCTACAGCACAAAAAATAATCTCTGATTACTGTAAAAAGAAAAAGCCTCTTTATATTCTAAGCGGATCACATGATAATAAATCAGGAGAGAATGCAATCACCAATAAAAAACTTAAAGAGCAATCATTTTTTCTTGAAGATAAAGAGTGCTATGAAACAATCAGCCCGCGCATTAAAATTATCGATATCACAATGCTAACTAAGAAAGAATATAAGTCACTAATCAGAAATACCGCAAGAGATGCTCTACTTTTCTATTGCTACAGCAGAAACGACACAGTCGTCAAAGAGGCACTACGTTGCGCCTCCCCAGAGGCTTTATATACAAGAGAAACGCCACCACCTACGCCTTAAAGTTTTCCCCTGACTGTTAATTAACTTACAGTCAGGAGAATTAAATAAATAATAATTACTCAGGGTAATGCGATGGGTAGCCTAGTTGGGCAACGCCCGTTTCAATTGCCGCTTTAGCAACTGCCGCCGGTACACATTCGATTAAGCGCGGATCCATCGGTTTAGGTAGGATATATTCAGCGCCAAAGCTTAATACCTCACCTTTGGCATAGGCACTGACCACTTCTTTGGGTGCCTCTTTATGCGCTAAATCACGAATAGCATTGACCGCAGCAATTTGCATCTCCATATTGACACGCTTAGCACGGACATCCAATGCACCACGGAAAATAAAAGGAAAGACTAATAAATTATTCACTTGGTTAGGAAAATCACTGCGACCGGTTGCCATAATAATATCATCACGCACTTTGTGAGCAACCGCTGGATGAATTTCAGGGTCAGGATTAGACAGTGCAAAAATAATTGGTTTTGCTGCCATCGTCGCAAGCATTTCCGGTGTTAAAATATTCGGTGCAGATAAGCCAATAAAGATATCCGCATCACGCACTGCATCTTCTAAACTGCGTTTATCTGTTTCAATGGCAAAGGCGTATTTATATGGATTCAAACGCTGACGTTCAGAGTGTATCACCCCCTCGCGATCAATCACAAAAATCTTATCACGCGAAGCACCCAATGTAGTTAATAAGCGCATTGAAGTTAAACCTGCAGCACCTGCGCCAACACAGACGATATTGCAGTTTTTTAACTCCTTGCCTTGTAACTTAAGAGCATTTAACAAACCCGCGGCAATCGTAATGGCTGTGCCATGCTGATCATCATGAAATACCGGGATATCCAAACGCTCATGCAAAGCATGCTCAACCTGAAAACACTCAGGTGCTTTAATATCTTCTAAATTAATACCGCCAAAACTTGGCGAAATACGGGCAATCGTATTAATTAAATCCGAAGGGTTATCCGCATCGACTTCTATATCAATCGCATCGATATTGGCAAAACGCTTAAATAACGCAGCCTTACCTTCCATCACCGGTTTGCTGGCTAATGCGCCCACATTACCAAGGCCGAGCACGGCACTGCCATTACTAATCACTGCCACCGTATTGCCTTTTGAGGTATAACGATAAGCTGCATTTGGGTCCTCAGCAATCGCACGCACCGGCTCGGCAACACCCGGACTATACGCCAATGATAAATCCTGCTGAGTTTCCATTGATTTTGTAACTGAAATGCTTAGCTTCCCTGGAACAGGTTTAGAGTGATAATCTAAAGCCGCTTGCTTTGATTCAATATTGCTCATTACATCCTCGCTTAGTCGAACAATTTCACATGCCCACTATCATGCCATAAAAAAAGCGCCAAGATGGCGCTTTTTTAAC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MSLEAVLATIKDHGVKFVDLRFTDTLGKEQHLSIPASAVDEELFEVGKMFDGSSIAGWKGIDESDMILMPDSSTAVLDPFCSEPTLNIRCDIVEPTLMSGYERDPRSIAKRAESYLQSTGIADQCLFGPEPEFFLLDDVRWGIDMHGAHYSIDSEEGAWNSAKRSEKGNIGHRPRVKGGYFPVPPVDSSHDIRSAMCQVMEKMGLTIEAHHHEVATANQNEIATGCNTLVLKADEMQILKYVVHNVAHEYGQTATFMPKPIVGDNGSGMHCHQSLSKNGQNIFAGNQYGGLSEEALFYVGGIIKHAKALNAFTNASTNSYKRLVPGFEAPVLLAYSARNRSASIRIPYVMTDKARRIEVRFPDPTANPYLAFAAMLMAGLDGIKNRIHPGDAMDKDLYDLPPEETKDIPRVAASLEEALAALDQDREFLTVGDVFTHSFIDSYITLKQRDVERLNMTTHPVEFDMYYSV
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MPSSRFDPQALKEIATLYMQAYQHDSDYQDPDNEYGELYGAAQQLKRQARAGHFSEEESARVLRALLERINNSLKFSLQTSDLGYKIRETLRQFYGLSPTHVNPSEPSVGHIAQRGLNGPYLPALKAYELQESYLGKNLNGLFTLFERRKQKTKGHSEFTNSKHRTAIKKEILRQIETYGIEQSLTEQATKVLAHHSDFLHGRKTSSIKESLTSPKVFAALYAPEILTMNQRQLVDKFNAIKDGTQPPYNKDKSHSLKALKYALIDHIEQSGQLDDGVAVHEVNQVIDHRRGFFTPMTNTRDRVNSTPLLAQLLPKSKNPQQPMFDQAKADAQQQEQTPTATISSGQEPG
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MPPFLKTVFLLICSNTIMSFAWYGNLKTEQHKAFWIAILTSWGIAFFEYIFLIPANRTGFLDAHLSLAQLKIIQEVISLSIFVPFAIFYMKQTISWNFLWAGFCLAGAVYFIFK
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MNDTARYQAGRRATLIGAGLNFCLAVLKIVVGLFGRSHALVADGIHSFSDLICDFFVLMAARYGMSEPDQDHPYGHGRIETVATVVLSIFLITLGVGIGIDAFYSLVQGSDARPDSYTLIIAVISIVVNEGLFRYTLKVADQINSDLLRANAWHSRGDSLSSLIVLIGIIGSLLGWSFLDAVAAIIVALMIIKMGMTWGWRALKELIDTALPEDQVADIANAIRAIPHVLAVHDLRTRKMAGYVLLDVHILIHPYISASEGHFIAEQVRAGLMQQFASIRDITVHVDVEEHAHDLNIVKLLSRDQINHDLMPVWQTILGVQQPVDFMLHYLQEKVIIDLYLPNKVIKGADAIIAQLQNSVSNYPDVEKLRAFLKVKA
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MSSYPYTRLRRLRTQAFSRDLTQEHHLHVNDLVLPVFVQEGVRKRTAVAAMPGVERLSLDELLHEVELLAALGIRAINLYANVAEDKKNNQGSEAYNDQGLAQQAIRAIKARFPMMGVMPDVALDPYTSHGQDGIIDEYGRILNDESVVAMTRQALSLVEAGADMIAPSDMMDGSTLSMREALEQAGHVDVGILAYAAKYASNFYGPFREAVGSLNNLGKADKRTYQMNPANSDEALREVQLDLEEGADIIMVKPCMPYLDIVHRVKTEFGVPVAVYQVSGEYAMFKAASQNGWLDEKFTVLEAVLGMKRAGADMIFTYYAKDIARWLKEN
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MYESNSLSTQTIRLADKSHHLNLRLNKYDVIALIFIGLFSGFCYIGWHDMHAQFHNIKSIAVISLNPEQLPYYSLRTTMRLLIGMLFSFIFSLIIGYACAKNKHVARILLPLINFLESAPLIGFLTFTTALFLFLFPKSMMGLEAAAIFAVFTSQAWNMALIFYQALRIIPDELIAASRAFHLNAWQHFWRIELPYAIPGLLWNVMVSQSSAWFALVATEAIPLNGHTVMLPGVGSYIQTALTHANIKAIFYAVLAIAVNVIIFDQLLFRPLVKWSEKLKYENVQSLVHHRSWFYSLIQKGLFIHTLNKLFSTMRHLFINFPTYIAKTFDLKPVYLPKILIQSITALCYGLIAISCIYAGTRLWNFYPDGSMLYLIPLMLKTTLRVAIAMLLSVMIFTPIGIYIGLNTRLTQRLQPIIQIMAALPANIFFPIVTIILIATHQSLNLWTIPLIMLGTQWYVLFNVIAGASALPQDMLEMAKSFHSRGWHWWFKFIIPALFPYIVTGIISAAGGAWNAAIAGEFLQWHNQTISANGLGALIAQTANNHQLPQAALAVTALCLLVSLCVIFIWQPLYRLAETRYKI
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MSNLLQHIQNFLHELRKSERKVGEWVLNNSQAVIHLSITDLARYAEVSEPTVLRFCRNIGCQGYQDFKLKLAQSLVSQPKTPITLTEITAHDTSTSLKEKIFQGAAIALQNAQHDIDASILDEAIATILAARRVGIFGFGASGVVAQDALHKIFRLSIPAIACMDSHMQSMTALMLSQGDVMLAISRSGRTKEIIESVNLAKNAGATVIGITSHGTPLANVATLGLTTAATNDTELYTPMTSRLIHLSIIDALAIGIAIKRKHTISEHLSRVKEASAIKKFQQE
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MSPRQPVGIDHSGIMVGGESLLRKIEQGPRQELFYEVEAAKPEGALEQGLRFIAEELVEQAEFSEPDPFAEQEPELPKEIKVDELEADLGQVLAIDNEVEIHQGPRLEGEEELYSSQKSSLVDAAALEEEKAGDLEDSLGQEVGLSEFHQGGDSAGLLGSAERLQKFAPEEEDDVFKSGWLAGDSFSLSLSSDELELQQTDGSELTEEFLESPESLQGDLATEWSGTFEPGRLDDNPFSLSSLSDEPEQCVTAEVSSECSEQLETLQEYVLEDVAVQEKSALVLMEDLLEEAILKEGAGLSAGEEPIIIKEGHFQPVSLELVEITDSCKLVSALSKLTQNTIAELEATVASASYFFSWNDPDSSKGSIKELKAFQMLLNAEGIDGSLNDKPIELIELAVGDYCANKVGCKDTQIISSFLKKVAKVLGNFRVAPCAGTSSVQDEDGGGWTRVGGISEVESAVDGWTNVDVVSSESEPAATGRAVMDEGDEFELVGQIPQSASLFQERHNAVDQQSSASNMSQSYPQ
>NZ_CP039065|2848940:2914512|2893961_2895002_+|WP_016210037.1|DBSCAN-SWA
MEPLQQLLNTQDFITTTLEHIHSDFPPASTTLNNQTQVTLIDNGILAFEPLNNTKSQDKYDLILSSGIHGNETAPIELCNILVKELLSENLTAQTRTLFILGNPLAMQAEQRFVEHNLNRLFCGAYKNINDCYEKNRAQCLEKHVQNFYQNTHSLRLHYDLHTAIRPSHFEKFAIYPYLGTQQSYSKEQIAFLLDSDIHTLLLSHTPTTTFSFHTSNHFNAHGFTLELGKVRPFGQNDPNKLTRLKNNLTALISTGKLNQAASLDSLNAFTVHHALIKTSDDFKLHLGKDIENFSLLPSGATISSDKHDKYQVKNDDERIVFPNPNVPIGDWSGLILRPCELENKL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300168.1|2848940_2849804_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211700.1|2850100_2851153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300167.1|2851501_2851849_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923654.1|2852062_2852554_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|2852609_2853860_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|2853962_2854181_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|2854638_2855493_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2855547_2856018_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2856342_2857722_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|2857749_2858208_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|2858185_2859403_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|2859594_2859831_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|2859844_2860000_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_016210731.1|2860080_2861043_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2861202_2862519_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2862528_2863197_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2863559_2865374_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2865491_2866280_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211543.1|2866860_2868612_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|2868622_2869423_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2869525_2870014_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_017375799.1|2871522_2871867_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|2877560_2878523_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|2878709_2879969_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2880192_2880519_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2880713_2881664_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2881721_2883788_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|2883793_2884789_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2885374_2886955_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2887111_2888521_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|2888580_2889714_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|2889853_2890678_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|2890905_2891535_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|2891871_2892243_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|2892546_2892834_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|2892985_2893834_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|2893961_2895002_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556667.1|2895074_2896652_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|2897295_2897955_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2898109_2899084_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|2899159_2900179_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047000.1|2900226_2900373_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|2900577_2900787_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|2901661_2902744_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300161.1|2902791_2903853_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|2903933_2904242_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|2904356_2905673_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_081007001.1|2906134_2907421_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211205.1|2907493_2908390_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211203.1|2908476_2909475_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126430.1|2909583_2910108_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|2910355_2911594_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|2912141_2912615_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|2912611_2913007_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2913936_2914512_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

>NZ_CP039065|2924640:3025512|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_081006998.1|2998062_2998518_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.3e-21	41.0
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WP_155046758.1|2999776_2999908_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3000535_3001309_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126148.1|3001850_3002033_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3002636_3003611_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3004705_3005044_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007065.1|3005060_3005900_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047004.1|3006112_3006619_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300144.1|3006633_3006999_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3008303_3008999_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3008995_3010423_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3010448_3010712_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3010784_3011759_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047005.1|3011817_3012668_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3012866_3013841_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_081007064.1|3013880_3014156_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3014152_3014989_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3014989_3015331_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3015332_3015938_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3015934_3017929_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3017948_3018890_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_052104719.1|3019117_3020542_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047006.1|3020948_3021089_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3021342_3022317_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080743040.1|3022375_3023032_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126480.1|3023078_3023762_-	methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080664873.1|3024307_3024622_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019150.1|3024531_3025512_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP039065.1|WP_155046705.1|1002253_1002421_+|hypothetical-protein	1002253_1002421_+	55 aa aa	NA	NA	NA	1000994-1044919	yes
NZ_CP039065.1|WP_016211126.1|1046728_1047118_-|lipoprotein	1046728_1047118_-	129 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039065.1|WP_032126179.1|1123353_1123605_+|TSUP-family-transporter	1123353_1123605_+	83 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039065.1|WP_054300381.1|1315688_1316336_-|hypothetical-protein	1315688_1316336_-	215 aa aa	NA	NA	NA	1294303-1349894	yes
NZ_CP039065.1|WP_054300380.1|1316799_1317456_-|transposase	1316799_1317456_-	218 aa aa	NA	NA	NA	1294303-1349894	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046961.1|1327284_1327689_-|hypothetical-protein	1327284_1327689_-	134 aa aa	NA	NA	NA	1294303-1349894	yes
NZ_CP039065.1|WP_032127044.1|1327808_1328009_-|hypothetical-protein	1327808_1328009_-	66 aa aa	NA	NA	NA	1294303-1349894	yes
NZ_CP039065.1|WP_016212482.1|1328223_1328367_+|hypothetical-protein	1328223_1328367_+	47 aa aa	NA	NA	NA	1294303-1349894	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046721.1|1411309_1411477_-|hypothetical-protein	1411309_1411477_-	55 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039065.1|WP_155046720.1|1412685_1412859_-|phosphatase	1412685_1412859_-	57 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039065.1|WP_016211151.1|1494220_1494532_-|hypothetical-protein	1494220_1494532_-	103 aa aa	NA	NA	NA	1439059-1618013	yes
NZ_CP039065.1|WP_081007035.1|1501384_1502050_+|transposase	1501384_1502050_+	221 aa aa	NA	NA	NA	1439059-1618013	yes
NZ_CP039065.1|WP_054300359.1|1504271_1504844_-|hypothetical-protein	1504271_1504844_-	190 aa aa	NA	NA	NA	1439059-1618013	yes
NZ_CP039065.1|WP_016212013.1|1514814_1515198_+|hypothetical-protein	1514814_1515198_+	127 aa aa	NA	NA	NA	1439059-1618013	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046729.1|1568392_1569439_-|hypothetical-protein	1568392_1569439_-	348 aa aa	NA	NA	NA	1439059-1618013	yes
NZ_CP039065.1|WP_098082828.1|1955073_1955331_-|transposase	1955073_1955331_-	85 aa aa	NA	NA	NA	1950147-1960495	yes
NZ_CP039065.1|WP_016212461.1|2159544_2159919_+|hypothetical-protein	2159544_2159919_+	124 aa aa	NA	NA	NA	2156653-2284218	yes
NZ_CP039065.1|WP_016211584.1|2179086_2179440_-|hypothetical-protein	2179086_2179440_-	117 aa aa	NA	NA	NA	2156653-2284218	yes
NZ_CP039065.1|WP_054300258.1|2179537_2180317_-|hypothetical-protein	2179537_2180317_-	259 aa aa	NA	NA	NA	2156653-2284218	yes
NZ_CP039065.1|WP_016209640.1|2246818_2247838_+|hypothetical-protein	2246818_2247838_+	339 aa aa	NA	NA	NA	2156653-2284218	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046989.1|2250282_2251347_+|hypothetical-protein	2250282_2251347_+	354 aa aa	NA	NA	NA	2156653-2284218	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046989.1|2252646_2253711_+|hypothetical-protein	2252646_2253711_+	354 aa aa	NA	NA	NA	2156653-2284218	yes
NZ_CP039065.1|WP_129556474.1|2290601_2290823_-|hypothetical-protein	2290601_2290823_-	73 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039065.1|WP_054300240.1|2295070_2295274_+|hypothetical-protein	2295070_2295274_+	67 aa aa	NA	NA	NA	2291027-2362188	yes
NZ_CP039065.1|WP_054300559.1|2303259_2303808_-|hypothetical-protein	2303259_2303808_-	182 aa aa	NA	NA	NA	2291027-2362188	yes
NZ_CP039065.1|WP_054300218.1|2413606_2414638_+|hypothetical-protein	2413606_2414638_+	343 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039065.1|WP_016211963.1|2594331_2594991_+|hypothetical-protein	2594331_2594991_+	219 aa aa	NA	NA	NA	2580099-2632309	yes
NZ_CP039065.1|WP_016211964.1|2595855_2596176_+|hypothetical-protein	2595855_2596176_+	106 aa aa	NA	NA	NA	2580099-2632309	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046757.1|2963608_2963764_+|hypothetical-protein	2963608_2963764_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2924640-3025512	yes
NZ_CP039065.1|WP_155046758.1|2999776_2999908_+|phosphatase	2999776_2999908_+	43 aa aa	NA	NA	NA	2924640-3025512	yes
NZ_CP039065.1|WP_032126148.1|3001850_3002033_-|hypothetical-protein	3001850_3002033_-	60 aa aa	NA	NA	NA	2924640-3025512	yes
NZ_CP039065.1|WP_155047006.1|3020948_3021089_-|hypothetical-protein	3020948_3021089_-	46 aa aa	NA	NA	NA	2924640-3025512	yes

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046705.1|1002253_1002421_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046705.1|1002253_1002421_+|hypothetical-protein
MEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1042663-1042626	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1042663-1042626, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016211126.1|1046728_1047118_-|lipoprotein

>NZ_CP039065.1|WP_016211126.1|1046728_1047118_-|lipoprotein
MKIFVVLFTLILLSGCATTAKYRAQVERWKGHDVNDLIQAWGPPDTTFKMPNGNLYYSYRVNNINRLPSYYVPGNTTVSDRDGKTYITTSGGYQTGGGTIKSNCTTSFQVNKKDIIIGTHFQGNACVSN

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_032126179.1|1123353_1123605_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP039065.1|WP_032126179.1|1123353_1123605_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300381.1|1315688_1316336_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_054300381.1|1315688_1316336_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAEAVELFRREALWFTETVPESALTLESTQKVLQSSQATLSLAQAALESAQAVASTQTMPSTSEPESKSEQSLQEPPQESSAGAQATLAAEKIALTQQQLLAIKQALKASGTSASKQHIIDKCQTLQQLCFAASVQQKGGLFHPTHTTTTGHLLLQLLKRPENRELKQEIFPGNTSASMRGIRHYGRYGQQVLQQHGYLLSCKTPDMI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1308379-1308416	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1308379-1308416, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300380.1|1316799_1317456_-|transposase

>NZ_CP039065.1|WP_054300380.1|1316799_1317456_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1308379-1308416	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1308379-1308416, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046961.1|1327284_1327689_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046961.1|1327284_1327689_-|hypothetical-protein
MCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1308379-1308416	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1308379-1308416, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_032127044.1|1327808_1328009_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_032127044.1|1327808_1328009_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1308379-1308416	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1308379-1308416, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016212482.1|1328223_1328367_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016212482.1|1328223_1328367_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1308379-1308416	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1308379-1308416, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046721.1|1411309_1411477_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046721.1|1411309_1411477_-|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046720.1|1412685_1412859_-|phosphatase

>NZ_CP039065.1|WP_155046720.1|1412685_1412859_-|phosphatase
MHCDRTVLVGDFAKLAFCLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016211151.1|1494220_1494532_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016211151.1|1494220_1494532_-|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1563895-1563858	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1612748-1612711	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1529771-1529808	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1561744-1561781	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1563895-1563858, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1612748-1612711, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1529771-1529808, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
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**************************************

4. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1561744-1561781, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_081007035.1|1501384_1502050_+|transposase

>NZ_CP039065.1|WP_081007035.1|1501384_1502050_+|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1563895-1563858	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1612748-1612711	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1529771-1529808	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1561744-1561781	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1563895-1563858, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1612748-1612711, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1529771-1529808, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1561744-1561781, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300359.1|1504271_1504844_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_054300359.1|1504271_1504844_-|hypothetical-protein
MPKFHQSFYIAFLADAPKRQLFGLDSYKNSFFLQKDKDLSREYTINMHTMHRRKSLLKDEIPFVRINFPYKEDLSREWRVSLDKTNKQVADEMVKAVLSKAEPFTRIYLDINRVSIDCFQQVTYHRRGNSSHEVSTKQVAELLAQSIPEYAKNNLQIKLVVSYAEIFAESLMKELDLQGFKKTSVTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1563895-1563858	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1612748-1612711	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1529771-1529808	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1561744-1561781	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1563895-1563858, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1612748-1612711, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1529771-1529808, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1561744-1561781, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016212013.1|1514814_1515198_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016212013.1|1514814_1515198_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1563895-1563858	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1612748-1612711	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1529771-1529808	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1561744-1561781	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1563895-1563858, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1612748-1612711, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1529771-1529808, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1561744-1561781, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046729.1|1568392_1569439_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046729.1|1568392_1569439_-|hypothetical-protein
MALGPGGIILTIAMCGFDVLNMAAKAYTKMRKMNRIIAHVNKEIKEICTGLGLAYSADIEALHANIEKREQELIELIASRVSGQSNPDLALVDGIQKEQAAIEKIKDLVDIKERILLKKAYLEYDQFIGIGTSIGFLVGLALILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1563895-1563858	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1612748-1612711	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1529771-1529808	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1561744-1561781	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1563895-1563858, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1612748-1612711, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1529771-1529808, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1561744-1561781, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_098082828.1|1955073_1955331_-|transposase

>NZ_CP039065.1|WP_098082828.1|1955073_1955331_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	1959046-1959009	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 1959046-1959009, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016212461.1|2159544_2159919_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016212461.1|2159544_2159919_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2177484-2177447	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2160835-2160872	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2177484-2177447, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2160835-2160872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016211584.1|2179086_2179440_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016211584.1|2179086_2179440_-|hypothetical-protein
MKTTFSFKHANAKKNRDVNIDGAISLSDGAEIFRKAFSIEKKNFSVLNRVSFILANIDAMNSQKEDYLYHLAANNSLTIFKDFEVIYRGFVWDFVGEYTNEMPAALASLKEGLGVAF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2177484-2177447	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2160835-2160872	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2177484-2177447, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
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**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2160835-2160872, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300258.1|2179537_2180317_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_054300258.1|2179537_2180317_-|hypothetical-protein
MTIKQIQLSEENRGNPKRGRKANLLSNMWQDIEASEVERLIDLNRDRHQENKDTEATITLSKYIPHKSYSAKELLHYPELTMLLRKEKQYLVKDYLLTGPLFELRTPLFMIEAGKQLLQIENDFRESLASEQKRLNNLMFLAKNKVKNIRVTGGKPSCQWSAGTIELNGVSWRVNKDSPAYLGPTGGIEALSFSYCEEIGQMDSFKIETAHIGTSIVELKVRNKGHNKGRRAFLNIEKLGLVPTAEAKALIKKQRGQAN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2177484-2177447	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2160835-2160872	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2177484-2177447, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
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**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2160835-2160872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016209640.1|2246818_2247838_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016209640.1|2246818_2247838_+|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2177484-2177447	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2160835-2160872	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2177484-2177447, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2160835-2160872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046989.1|2250282_2251347_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046989.1|2250282_2251347_+|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2177484-2177447	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2160835-2160872	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2177484-2177447, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2160835-2160872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046989.1|2252646_2253711_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046989.1|2252646_2253711_+|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2177484-2177447	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2160835-2160872	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2177484-2177447, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2160835-2160872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_129556474.1|2290601_2290823_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_129556474.1|2290601_2290823_-|hypothetical-protein
MKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300240.1|2295070_2295274_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_054300240.1|2295070_2295274_+|hypothetical-protein
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2302570-2302607	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2359400-2359437	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2302570-2302607, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2359400-2359437, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300559.1|2303259_2303808_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_054300559.1|2303259_2303808_-|hypothetical-protein
MVNSALFTQGYECLKALELNQPENIDKLLGGLALFAGNYQRLEKLGFSLNPERVKKMLDNLESFDQDYPSLQKLHAVYDGLTAKIENNQLKVHGLTGGSSIMFKGQLRCVPKGVSKIWEQVADDEGNFKWMDDADVALTQAKAQADQRQGFRGLTAVSMFFGSYRDSETKELYKEISGLLAS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2302570-2302607	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2359400-2359437	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2302570-2302607, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2359400-2359437, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_054300218.1|2413606_2414638_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_054300218.1|2413606_2414638_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFKCPVTLEYLDETKIQIYAVKDNSKYAIHAIEKNSFSNLDKCPLTRSQLYISLTFEEYLIFNKNRHHASEFEVKVLPKAEFEEKLPNKVLLPFKTSHLASAIRRLRSDLITSENIQFIAQHANNALNLTIAINRLRTNLAIAENIQLLAQNIEDAYELASAMSELRENLAIPENLQLLTQHSRHALQLVLAINNLKENLATSTTLQLLAQNLASAAHLTAAINELKENLATAENIQLLAQHPSHALQLALAMNYLNEGLATAENLQLLAQHAENAFDLTLSINQKSAANLNVSLSAEQTEHTSLIFQNHLQDSNNEELSFASSLSN

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016211963.1|2594331_2594991_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016211963.1|2594331_2594991_+|hypothetical-protein
MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2626908-2626871	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2626908-2626871, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_016211964.1|2595855_2596176_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_016211964.1|2595855_2596176_+|hypothetical-protein
MHALSIFFMFFMISHTSHSLTMLYNERPPYLKTESKQQVLGLTGTFITQVFKTAKTPLHWKKTPAKRHLLLIKKNAEPLCAAGWFKNPQREKYAQYALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2626908-2626871	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2626908-2626871, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046757.1|2963608_2963764_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155046757.1|2963608_2963764_+|hypothetical-protein
MDEAGMDDTERYARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2928040-2928003	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2924603-2924640	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2928040-2928003, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2924603-2924640, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155046758.1|2999776_2999908_+|phosphatase

>NZ_CP039065.1|WP_155046758.1|2999776_2999908_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2928040-2928003	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2924603-2924640	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2928040-2928003, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2924603-2924640, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_032126148.1|3001850_3002033_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_032126148.1|3001850_3002033_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2928040-2928003	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2924603-2924640	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2928040-2928003, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2924603-2924640, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039065.1|WP_155047006.1|3020948_3021089_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039065.1|WP_155047006.1|3020948_3021089_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYAREFICMNMNSLLSVALQMTEGALLL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2928040-2928003	0
NZ_CP039065_1	Orphan	1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder	351577-351614	38	2924603-2924640	0

1. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2928040-2928003, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351577|38|NZ_CP039065|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039065 position: 2924603-2924640, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP039066

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039066_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039066_1
• CRISPR_location: 1232-1743
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 7 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039066_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP039066_1

>1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
>1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT
CGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACAC
>1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039066_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039066_1

>merge|NZ_CP039066|1|1232-1743|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP039066|1|1|1232-1743|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACAC
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039066.1|WP_075273836.1|9715_10777_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039066.1|WP_016211890.1|3163_5740_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP039066.1|WP_155047014.1|7374_7716_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227633
NZ_CP039066.1|WP_054300202.1|6213_6942_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039066.1|WP_054300202.1|7871_8600_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039066.1|WP_075273830.1|6971_7304_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039066.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP039066.1|WP_075273834.1|8806_9373_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143503
NZ_CP039066.1|WP_155047021.1|6034_6190_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP039066.1|WP_054300202.1|2231_2960_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039066.1|WP_054300162.1|10806_11889_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039066.1|WP_016211890.1|3163_5740_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP039066.1|WP_155047014.1|7374_7716_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227633	COG5323, COG5323, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	1.27873e-32
NZ_CP039066.1|WP_054300202.1|6213_6942_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039066.1|WP_054300202.1|7871_8600_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039066.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP039066.1|WP_075273834.1|8806_9373_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|143503	cd06830, PLPDE_III_ADC, Type III Pyridoxal 5-phosphate (PLP)-Dependent Enzyme Arginine Decarboxylase. This subfamily includes plants and biosynthetic prokaryotic arginine decarboxylases (ADC, EC 4.1.1.19). ADC is involved in the biosynthesis of putrescine, which is the precursor of aliphatic polyamines in many organisms. It catalyzes the decarboxylation of L-arginine to agmatine, which is then hydrolyzed to putrescine by agmatinase. ADC is homologous to eukaryotic ornithine decarboxylase (ODC) and diaminopimelate decarboxylase (DapDC), which are fold type III PLP-dependent enzymes that contain an N-terminal PLP-binding TIM-barrel domain and a C-terminal beta-sandwich domain, similar to bacterial alanine racemases. Homodimer formation and the presence of both PLP and Mg2+ cofactors may be required for catalytic activity. Prokaryotic ADCs (biodegradative), which are fold type I PLP-dependent enzymes, are not included in this family.	0.00873389
NZ_CP039066.1|WP_155047021.1|6034_6190_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	0.000140996
NZ_CP039066.1|WP_054300202.1|2231_2960_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
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Protein sequences

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MGE targeting detection<

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NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1588-1651	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128606-128669	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197184-197247	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128606-128669	4	0.938
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NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92323-92386	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137255-137318	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128606-128669	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137256-137319	4	0.938
NZ_CP039066_1	1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93282-93345	4	0.938

1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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137. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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138. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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139. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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140. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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141. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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142. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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143. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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144. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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145. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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146. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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147. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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148. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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149. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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150. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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151. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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152. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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153. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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154. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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155. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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156. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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157. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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158. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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159. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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160. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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161. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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162. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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163. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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164. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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165. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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166. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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167. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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168. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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169. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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170. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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171. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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172. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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173. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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174. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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175. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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176. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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177. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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178. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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179. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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180. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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181. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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182. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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183. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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184. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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185. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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186. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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187. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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188. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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189. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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190. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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191. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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192. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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193. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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194. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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195. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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196. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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197. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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198. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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199. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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200. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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201. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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202. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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203. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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204. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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205. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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206. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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207. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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208. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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209. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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210. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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211. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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212. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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213. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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214. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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215. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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216. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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217. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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218. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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219. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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220. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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221. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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222. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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223. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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224. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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225. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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226. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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227. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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228. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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229. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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230. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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231. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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232. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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233. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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234. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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235. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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236. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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237. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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238. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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239. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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240. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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241. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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242. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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243. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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244. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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245. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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246. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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247. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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248. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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249. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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250. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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251. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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252. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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253. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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254. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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255. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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256. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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257. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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258. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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259. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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260. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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261. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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262. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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263. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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264. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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265. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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266. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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267. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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268. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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269. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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270. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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271. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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272. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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273. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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274. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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275. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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276. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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277. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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278. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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279. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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280. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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281. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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282. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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283. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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284. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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285. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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286. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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287. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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288. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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289. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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290. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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291. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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292. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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293. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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294. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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295. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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296. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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297. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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298. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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299. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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300. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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301. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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302. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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303. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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304. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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305. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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306. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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307. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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308. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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309. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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310. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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311. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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312. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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313. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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314. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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315. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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316. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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317. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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318. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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319. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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320. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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321. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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322. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039066|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2231 : 115203	118	Streptococcus_phage(25.0%)	tail,capsid,integrase,head,protease,transposase	attL 49319:49378|attR 119962:120600

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039066|2231:115203|DBSCAN-SWA
TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTTTTACCTATTATAAGTAGTTTTTTTTATCTTTTAGCTATTAAGCTCTTAGTTATAAACGCCTAGTCTATTAATTAATAGTATTATTGAAAGGAATAAATAGACTATGCCAGTACGATTTAATCCAATAAAAAAAGTATCTCTTAATGGTAAGGTTTTTAATGTTCCTAAAGAGGTTCCGAATAAAGCTTTAGTTAAGTTGGGTCAGCAGCAGCCAGATGTTGTTGAGATCTTGGCAGATTTTTTTCGAACAAATCCTAAGCAAGAATTTTTTAGTAAATTATTTCTGGGTGACCGCTATCAGATTAGTGCAATGTATGTGTCGCTAAGGAATATTGGGCTGAATCAACGAATATATATTCAAAAGGTATTTGATGATCCTGAAGGATTCAGCGATATTATACAACGCCTAAGCAATATTGAATTATGTCAATCTGTATACGTGCAAGCAGCGTTTGAGAATCCTGACCTAATTGCAGTTTTTGAAAAACATAAAGATAAGTTCACATCTCTTAATCAGTTTGAGTTGAATCAATGGGTTTATGTTAAAGCAGTTCTTGGTGATCCTGATAGATTCGATGATATTTTGCAGCGTCTAAGGGATATTGCATTATGTGAGCCTGTCTATGTCCAAGCCGCGCTTAAGAGTCCTCAGAGAGTGGTTGAATTTGCAAAACATACGCATCGGCTTGTCACTCTTAATGCACTTGAGCCGAATCAATTTGTCTATGTTCAAAAAGTACTTGATGATCCTGAAGGATTTGATGCTATTTTACAGCAGCTAAGTGATATTGAATTATGTCAACTTCCATATATTCAAGCAGCACTTGATTACCCGGATCGAGTCGATGTTTTTAAAGCTCATCAAGACAAGTTTGCACTTTTTAATCACCTTAAATTGAGTCAGCTCACAAATATTGAGGCAGTTCTTGGTAATTTAGAGGGCTTCGATGAAGGTTATCGGAGTCTAAAAGCAGTTGGACTGGATCAGCCAAAAAATATCCAAGCAATGCTCGATAACATTGAAAAGTTCAATGAAAACCTTCAGAATTTAAGAGAAGTTGGACTGGATCAGCCAAAAAATATCCAAGCAATGCTCGATAATATTGAAAAGTTCAATGAAAATCTTCAAAATTTAAGAAAAGTTGAGTCAGATCAGTCGGATAATATCCAATTAATGCTCGATAATATTGAAGAGTTTAACGAAAACTTTCAAATTTTGAGGCAATTTGGACTGAGCCAACAATTATATATAGAATCGATACTCAAGTCCCCTAATGTGATTGTTAATATTTCTGACTGCTCTGACGAACTTTTAATGCTTGAAGAGCTAGGTTTGGGGCAAACAGTATATCTCCAAAAAGTGCTTGATCACCCTGATCGCTCCAAAGCAAATCTTTACCGCTTAATACGTATGGGGCTCGATCAACCAGTATACGTCCAATCAGCGCTTAAGGATCTTGATAGATTTGATGATGTTTGCCAGCGCTTAAATGATATTGAGTTATGCGAATCTGCCTATGTCCAAGCAGTACTTGATGATCCTAATCGAATTGCAGTTTTTGAAAGACATAAAGATAAGTTCACATCTCTTAATCAGTTTGGGTTGAATCAATGGATCTACGTTAAAGCAGTGCTTGATGATCCTAAAGGATTCGATGATATTTTGCAGCGTCTAAGGGATATTGCATTATGTGCGCCTGTCTATGTCCAAGCCGCGCTTCAGGACCCTCAGAGAGTGGCTGAATTTGCAAAACATACACATCGGCTTGTCACTCTTAATGCACTTGAGCCGAATCAATTTGTCTATGTTCAAAAAGTACTTGATAATCCTGAAGGATTCGATGCTATTTTACAGCAACTAAGTGATATTGAATTATGTCAATCAGTATACGTACAAGCAGTACTTGATGACCCAAATATAATTACTAAGCTTAAAGAACATCAAAAGAAGCTTGTAAAGCTAAATCAGCTTGGCTTAAGCCAACCAAAGTATATTCAAGCAGTATTTGATCATCCGGAGGATTTCGAGAGGAATTTGCAAACTCTAGAAATCTTAGGACTGAATAAAACAGAATATGTCCAAGCAATATTTGATGATCCTACTAGGATAGATAAGCTTCATAAGTACCATCATTTGTTTTTTAGGCTACATATGCTTGGGTTAAGTCAACCTATATGTGTTGATGCAGTCTTTAATAACACTGAAAAATATGCTCAAATTTGCTCTTGTTTGGAAGAGGTGAAAGATAGAATTGAAACAGTGGAGGATACTATTCAACAAAGTTCACTTGGCCAAAGCAGGGAACAAGGCTTTAAAAGTCATTACCCTGTATATAAATCGAAAGTTATACAATCGTCTTTTGATTTTCTCATTTCTGAGAGAAAAGATCCAGCTGAGATGAAGGCTCACCTCTTTGAGCATGAGCGTGAGTTTTTATGTAACTCTAATATTAAGAGTGATCGCTCATCTTTTGGAGCTATTTGTCGTAGTGCAATGAGAGCTTTAACAAATACTATTTTTATAATAGTAGCACCGGTTGTAGGATATAAAAGAAATTGGCATAAGAAAAATATGTCTATAACTGAGAAGTGCTTACCATTTTATAATCATACGGAGTCCACTAATAAAGTTATGGACCTTACTTGTGATATACAACATACTTTAGTTGCTGATTTTTAGATCGTGTACAAGGATAGGTTCTGTCGCAATTCAAGCATAGGCCCGCTTTGCGGGCGACTTTGTTGAAGCCTTCCCATTGTTAATCGTTACCGGTATTATTAAGGATTTTGTCGCAATTTGAGATTTACAGCTAAAAACACTTTCCTTTGGACGCAGTTAAGCTGCGAGCAAGTAAAATTGCTCGTATGCTGCCTTATCATGGTGGCAGTGCATCTGTTTTTTCTTCAGCATGCGGTAGAGTTCAACACCTGCAATCGTGGCCTTTGATCTGGCAACCTTTTTCTAGACAAATTTTTAACTGATTTTTTGATTATGCTCGTATTCCTCAGGTGATAAATAATCATTAGCTGAGTGAATGCGTTTTCTGTTATAAAAAACTTCGATATACTCAAAGATCGCTGATTTAGCGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAACTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCAATATAACCGCTATCTCTTTCTAAATTATGATTCAATCCTTTAAATCCTGAATCATGCAAAAATGATATAAATGAATGCTTATGCTTACCCGTTGCCCTTATGCAGTCTTTTACATCCTCTATTGTGTATGTACTGTCCTCAACTTTACCCTTCAAAGCAATTAATGCACTCAATTCACTTTTAAAGTCATGGCTTCTATGAGAAATTGAATACCAATTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_047927838.1|32881_33127_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212154.1|36553_36931_+|transposase	IS3 family transposase	Q716C2	Shigella_phage	1.2e-17	46.0
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WP_075273857.1|44156_44891_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	8.4e-39	43.6
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WP_016212456.1|48615_48903_-	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
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WP_032126362.1|56428_56794_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274751.1|56739_57315_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.1e-08	26.6
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WP_075273741.1|59878_60613_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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