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NZ_CP039081 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 37 | 0 |
NZ_CP039082 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 9 | 0 |
NZ_CP039085 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-110 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
3402 : 19424
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039085|3402:19424|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039085|3402:19424|4912_5503_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP039085|3402:19424|5733_5994_+|WP_027242955.1|DBSCAN-SWA MNNKHRKTLRDIFHNPIKASIVWADIEKLLLALGAEVIERDGSRVAVILNQVKTTFHRPHPEKTTDKGAVKSIRLFLKNAGVDKNA >NZ_CP039085|3402:19424|13064_14039_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039085|3402:19424|14563_15145_-|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA 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21 | unidentified_phage(35.71%) | terminase,capsid,integrase,tail,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
2917 : 16713
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039084|2917:16713|DBSCAN-SWA 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18 | Moraxella_phage(18.18%) | head,transposase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 42185
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039082|0:42185|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039082|0:42185|26618_27434_+|WP_036775032.1|DBSCAN-SWA MRLKITIYHDEIWYAKNSESDSIFHVMPSIITSNIGDVIPVFELTPGQINFPNYDILFEIIYKDGNVDLVTPESFIGRRLMLFLSKLRGDSGKSIYCCIDFINELMFGRGNVPFNTSPQSNWTNLSMTENDDKKVIIRQNFNDVTTYNKDNIVFFVDDNNIFCHAALKIKHDIYLSLFGNSGGLMFSNRQEMLKAFSATKSFIAKKNQEADKEHIDISYLPAKIIKLINSYLDGESKLSFQQTSPFIFLKLNEGKNCLISNTESHEVQSTR >NZ_CP039082|0:42185|22866_23844_+|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS >NZ_CP039082|0:42185|15673_15838_+|WP_155046630.1|DBSCAN-SWA MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVHSKQRAQENNLSEAPYNFSQQCLNFSIDGKKLK >NZ_CP039082|0:42185|35492_35963_-|WP_036771289.1|DBSCAN-SWA 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39 | Streptococcus_phage(53.85%) | transposase,integrase | attL 15447:15506|attR 36451:36740 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
48424 : 53195
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039082|48424:53195|DBSCAN-SWA TTTATCCGGCAGCATAGAAATCAGCTCGAGTAGCAAATGCTTCTTTTCCACCCTCCATTATCGATTCAATCATATCTCTGATTGCATCATCTTCTATACTCCCCGCATATTTTACAAAACCTTTTTTACCATTTGATTCCAAGCTAACTACTCTATTAGCCTGACCAAGAACCGGAATATTAGCATTATGGCTTGAAACTATAGTTTGAGCTTTATTTGCTCTCTCAGTTAGAGATTTTATGAGAGTGCCTGCTATGTATTCATTATCTAAATGGTCCTCTGGCTGATCCACAACCAATACTCTATTTGGGTTTTCTAAAATAACAGATAATGAAACAGTACATCTCTGCCCAATTGAAAGTTCCTCAACCAGCTTATAGCTTCCGTGATCAAGCAGAGAAAATTGAACACTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCTTCGATTTCCGAGGTGAGAACAGAGCCTAAATCTATATCACTCAAGTACCCCAAAACCCGTGTAGCTCTATCAATAGGTATTCCCAATGCAGCAGAAAAATCATCGTATTTCAAATGGCTAGTGTAGTAAAGCAGCCATTGAGGGTTAACTTTCTGGACCATTTCTGGAACTAGCCCCTTATACTTTAAACTTGATCCTCTAAAAGAGCTTTCCAGGTTCTCCATATAGCTCTGTAAGTCAGTTTGGTGTGTTAGTTCCGTTCGTATGGAGGGAGACAAACTTTGATTCAATTGAGTTACAACCGAATTACGCGATAGAAAAATCTTCTGTCTCAGCTCAGCTAAACTCACCAAGGCTTTTTGGCAAAGCGCATATTGCTCGTTAAGTTGTGATGATTTTTCAGCGCCTATTTGCTCTAAATTCACAAATTGAGCAATGCTTTCTCTAACTCGACCTAATTCACCGAGAACAATACCCGCTCCCTCAGTGAAATTTTCAACTTCAGCCCTGTTTTTTCTAGCCCGCTCTTCCAATAATGAACGGTTGGCACATAACCTTTCAGCCTCTAAATTAATAGATTGAAGCACTTGCTGGTCATTAGTAATAACAGACTGTATATACCCATCATCGTCTGCGATACCCTGCCGAATGATACGATTCATTTCGTTGGAGTTTTCGCCCTTCAATAAAGGCAGCTGCTCTCCATTTAGAAATAAAGATAATTCAGTAACCCGCCTCTCAAAATACTGTTTAATTGTACTCAAATTTTGAGAATTAACAGAAATGATACTTAGTTCATGTTGCACTTTGTTAATGCTCTCTTGATTTACACTAATCACATCATTTTGTTTCTGGAAATCACGTTGTTTCTCTATCAACTCCTTTTCTTTTAGCCTTAGACTTGGCAAATCAGAGGTTTTTTCTACAAGCTCTGCACGCTCTTTTTTTAATGATGCCATTGTTGTGCAAATTGCACTTACCTCACTCATAAGGACTTGCAACAAAGCCTTCTTTTCATTTATATTCGGGATGAAACTGTCGATCAAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTATAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTCCCTCAGCGTTAAGGCTGATCGTTTCTATTTCTTTTTGAGAGAAAATTATTGGCGGAGTAAATTGTTTAACAGGAGCTGTTTCAAATGCAGACCTAGAGATTGTCATATCAACACCATTTTCAACAATATCAATTACCACTCTTCCCGATGATTGTAAAATAGATAAAGCATGCATCATAGACTCTTTGTTGTTGCTTTGGGATAAATTTCCTGCACCAAGACCAAAACGAAGCAACTCAATAATTGATGTTTTTCCGACCCCCCTTCCACCAATTAGTACATTGAGACCAGGTGAAAATTCTAGATCTAGAGCATTAAAGAAACCTTCTTCAACTCGTAATCTTTTAATTAGCAAAACGCCCTCTCCCTAGTCCAAATTTATTAAAATCACTACAAATATTCACAAAAAACATTGAAAGGTTAATAACACTCACACTTCCAGATTAAACCCATAATCGAGCACTATTTCATAGACTTCATATCAATAACAAAACGATATTTCACATCCGACTTCATCACTCTCTCATATGCTGTGTTGATGTCTTCTATATCAATAGTTTCAACATCAGAAACGATATTATGCTCCGCACAGAAATCAAGCATTTCTTGAGTTTCTTTAATGCCACCAATTAGAGATCCTGCAATTATTTTACGGCCAAATACTAGCCCCATTGTATTTAATTCTATTGGCGTGGCTCCTACCACAGCCATTGTTTTTCCCAGCTTTAAAAGCGGCACATAAGGGTCTATATTATGGGCTACAGGAATTGTGTTCAACAAAAAGTCAAAGGTGCCTACGTGTGCTGACATTTGCTCTTCATTTTTGGAAACAAGCACATCACTTGCACCTAATCTTTTAGCATCCTCACCTTTTTCAGGCGAAGTCGTTATCATCACTACATGTGCGCCCATGGCTGAGGCTAGTTTAACCCCCATATGGCCAAGACCACCCAAACCTATAACACCTACCTTATCGCCAGACTTAACATTCCACTGACGTAAGGGGGAATATGTTGTAATACCGGCACATAAAAGAGGTGCAACTGATTTTGAGTCTAGGTTTTCAGACACTTTCAACACAAAATCTTGATCCACAACAATTCGAGTAGAATAGCCACCTTGCGTAATAGCATCTGCATTATGAGAATCAGGGCTGCCATAAGTCATCACCATACCCTTATCACAATGTTGTTCAACATCTTGTTTGCATGGTTCACATTTTCGGCAAGAATCAACCATACAGCCAACGCCAACAAGCTGACCTTCGGAGAAACCTTGCGCATCTGCACCTAATTTTTTCACACGGCCAATGATTTCATGACCAGGTACAAGAGGATAGGCTGACATACCCCAATCATTACGTACCATATGAATATCACTGTGACAGACTCCACAATATAAAATATCAATTTCTATATCTTTTGGGCCAACCTCGCGACGATTGAATTCATAGGACTTTAGCTCGTCTTTATCATTATATGCTGCATAAGATTTTGTGCTGTACATACGTTACTCTTTTGATGTGCCGTTGTTTCCAGATTCAACATACTTTATAACACAGATAGCTACCGCTCTCTTGAAAAACTGTTATTGCTTTACCTGTTTTTGCTAATTTTTCATGATATAAATCTGTTGAGTAAACTGCATCGGCCCTAAAGTTATCTATAGTTGTCACACGAAAACGTAGATACCGCCAGGATTTCTACGTTAATTACTGTCATTAACCTATAATCAAATGATGAGCCTTGTTTACAATATGTAAATGTTTATATATAATAAACGAGTTGTAATAAAGTAGTCTAAACTAATGATTAAGACTTGGAAGCACAAAGGTCTAAAAAAGTTCTTTGAATCAGGCAGTACTGCTGGTATTCAAGCTAGACATAAAACAATTCTAGCTAAGCAATTGGACTTCTTAGATTCTATGAGTGACCCCCAAGAACTTTGGATTTTTGAGAGTTGGGGAGCCCATAAACTTACTGGTAACTATAAAGAGCACTGGGCTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCACCGTAAAAGCGAATTGGCGCTTATTTTTCAAGATAGAAGATGGCGATGTAGTTTTACTTAATTATGGCGACTACCACGGGAAATAATGAGGAGTACATGATGACCACTAAAACACGCAAACCGACACATCCAGGGGCGTATATTGCTGATATATTTGATAACCTGAAAGAGAATGGTGGCATGTCTCGTAATCAAATTGCCAAGCACCTTGGTATATCGCCGTCTACCCTTTGCAATATCATTGCAGAGAAGACACGGGTTAATGCTGATATGGCAGTAGTCTTTGAGAAGGCGTTAGGTGTTAAGGCTGATACCTGGTTAAGGCTACAGATGTCATATGACCTATGGGAAGCGAACAAGAAAAAGAAAAGCTTTTTAGCAAAAGTTAAATCATTGATTAATAATCCTGCCATTAAAATTGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039082|48424:53195|50419_50827_-|WP_036817201.1|DBSCAN-SWA MLIKRLRVEEGFFNALDLEFSPGLNVLIGGRGVGKTSIIELLRFGLGAGNLSQSNNKESMMHALSILQSSGRVVIDIVENGVDMTISRSAFETAPVKQFTPPIIFSQKEIETISLNAEGKLNVSVATSVGILHIQ >NZ_CP039082|48424:53195|52279_52513_+|WP_017375959.1|DBSCAN-SWA MIKTWKHKGLKKFFESGSTAGIQARHKTILAKQLDFLDSMSDPQELWIFESWGAHKLTGNYKEHWAIAASHGVLSTG >NZ_CP039082|48424:53195|49120_50116_-|WP_036817204.1|DBSCAN-SWA MSEVSAICTTMASLKKERAELVEKTSDLPSLRLKEKELIEKQRDFQKQNDVISVNQESINKVQHELSIISVNSQNLSTIKQYFERRVTELSLFLNGEQLPLLKGENSNEMNRIIRQGIADDDGYIQSVITNDQQVLQSINLEAERLCANRSLLEERARKNRAEVENFTEGAGIVLGELGRVRESIAQFVNLEQIGAEKSSQLNEQYALCQKALVSLAELRQKIFLSRNSVVTQLNQSLSPSIRTELTHQTDLQSYMENLESSFRGSSLKYKGLVPEMVQKVNPQWLLYYTSHLKYDDFSAALGIPIDRATRVLGYLSDIDLGSVLTSEIEA >NZ_CP039082|48424:53195|52832_53195_+|WP_081078123.1|DBSCAN-SWA MATTTGNNEEYMMTTKTRKPTHPGAYIADIFDNLKENGGMSRNQIAKHLGISPSTLCNIIAEKTRVNADMAVVFEKALGVKADTWLRLQMSYDLWEANKKKKSFLAKVKSLINNPAIKIA >NZ_CP039082|48424:53195|48424_48850_-|WP_017375964.1|DBSCAN-SWA MARSDSVQFSLLDHGSYKLVEELSIGQRCTVSLSVILENPNRVLVVDQPEDHLDNEYIAGTLIKSLTERANKAQTIVSSHNANIPVLGQANRVVSLESNGKKGFVKYAGSIEDDAIRDMIESIMEGGKEAFATRADFYAAG >NZ_CP039082|48424:53195|52650_52803_-|WP_146619517.1|DBSCAN-SWA MLKNKRQFAFTVRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039082|48424:53195|50934_51978_-|WP_017375960.1|DBSCAN-SWA MYSTKSYAAYNDKDELKSYEFNRREVGPKDIEIDILYCGVCHSDIHMVRNDWGMSAYPLVPGHEIIGRVKKLGADAQGFSEGQLVGVGCMVDSCRKCEPCKQDVEQHCDKGMVMTYGSPDSHNADAITQGGYSTRIVVDQDFVLKVSENLDSKSVAPLLCAGITTYSPLRQWNVKSGDKVGVIGLGGLGHMGVKLASAMGAHVVMITTSPEKGEDAKRLGASDVLVSKNEEQMSAHVGTFDFLLNTIPVAHNIDPYVPLLKLGKTMAVVGATPIELNTMGLVFGRKIIAGSLIGGIKETQEMLDFCAEHNIVSDVETIDIEDINTAYERVMKSDVKYRFVIDMKSMK |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
57331 : 119132
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039082|57331:119132|DBSCAN-SWA ATTGCCTAGACGTGCGAAACAGATTTGCTGTTATGCCGGATGTCATAACACAACCTATGCACGCTACTGCGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATGCCCCACGTAAGACAACAGCCCAGCGTGGCTATGGGGGGCGGTGGCAACGTGAACGTAAGATATTTTTACAAGATCATCCACTGTGCAAGCAGTGCTTACAAGATGACAAATTAATCCCAGTGACTGAAGTGGATCACATTAAACCGCATGATGGTGATCATGATTTAATGTGGAACCAACGCAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGCCCTGTCACTCACGTAAAACAGTGAATGATGATGGTGGCTTCGGTCGTAAAAGATCACCCCAGGGGAGGGGTATATAAAATGTCTATGACCTTTATTTCCTGACCACCCGCCTAGTCGAATTTTTACGCATGCGAAATTAGAACTAAAAACTTGGAGGTTTTTGATGTCGAGAATGAGAGGTCAAGGCAGAAAGCCAAAACCAACAAAAATTAAGAAAATTACAGGGAATCCTGGATGTAGAAAACTAAATGAGCATGAGCCAAAACCACAGGATGGGGTTGCCATTTGTCCAGGTTATTTTGATGAAATAGCAAAAGGAGCCTTTGATTCAGCCGTCTCTGATCTTGAATATATGCACATCAAAACAGCCTCTTTTCAAAAACAACTAGAAATTTATGCGAGTGCTTATTCTGACTGGCGGCAGCTATCCGCTGTCATAGAACAAAAGGGCCGTACGTTTGAAACGACGACGCAAGCCGGGGATACCATGTACCGCAGCCGCCCCGAAGTGGCTCAACGCAATGAAGCCTGGAAACAAGTCAAAGCCTCATTAAGTGAGCTTGGATTAACACCAACCGCGATTAGTCGGCTCAATGCTCAAGTATCTAGTGCTATTGAGTCAGAGATAGATAAAATTTTGGATTAACTATGATTAAAAGCGACCCGGTAAAAACCGCCCTCACCTACTGCGATAATGTACTAAGCGGCCGCGTCATTGCCTGTGATTATGTAAAAAAAGCCTGTCAGCGTCATTTAAACGATTTAAAGTATGCTGGTGATCCCGGTTTTTACTTTGATAAAGAAGCGGCCTGTAAAGTCGTTAGATTTTTTAGTTACTGCAAACACAGCAAAGGTGAGTGGTATGGGAAGAAAATTACTTTAGAGCCTTGGCAACTATTTATTATTACTACCGTGTTTGGTTGGAGGCGTGAAGTTGATGGTATGCGGCGTTTTCGTACCGTTTATGAGGAAGTCGCACGTAAAAATGGCAAGAGTACGAAATTATCAGGCACTGGCTTGTATTTATTTTGTGCTGATGAAGAGCCGGGTGCAGAAGTCTATGCCGCGGCAACCAAACGCGATCAAGCAAAAATCGTTTTTGATGATGCGGTCAAAATGGTTAGAGCCTCTAAAGCCTTAGCTTCTCGCATCGGTATTTATAAAAATAATATGCATTATCCCAAGGATTTACCGAATAATAAGTTTGAACCGTTATCGAGCGATAGCCAGACACAAGATGGCTTAAATGTGCATAGTAGTATTGTAGATGAGTTGCATGCCCATAAAACCGGCGATTTGTGGCGGGTATTAGAGACGGGCACCGGCTCCAGGCGTCAACCGTTGCTGTATGCGATTACAACCGCCGGCTTTGATCAGACGGGGATTTGTTATAGTTTGCGTGATTATGCGGTTAAAGTGCTGGAAAATATCATTGAAGATGATACCTTTTTCGGCATTATTTACACCCTCGATAAAGAGGACGATTGGACAGACGAGCGTGTTTGGATCAAAGCCAATCCAAATTTAGGCATTAGTAAAAAGCTTGATGACATGCAACGCCAGTGCGTAAAAGCTCAACAAATGAAGGGTGAACGCAATGGCTTTTTATGTAAGCATTTAAATATCTGGACGAATGCCGAAACCGCTTGGTTAGATTTAGAACGCTGGAAAACTTGCGCTGAATATACCTTTAAACGTGAATCACTGGAAAATCGGCCCTGTTATATAGGTCTGGACTTAGCCAGTACCAACGATATCGCCGCCTTAGTTGCGGCTTTTTTAATGCCAGATGATTCAGTACGTTTATTTTGTCGCTTTTACTTACCTAAAGAAACCGTAATGACTCGAGCCAAGCAATCCCCCGTGCCCTATCAGCTATGGTCAGATGAGGGCTATTTAACCCTCACTGAGGGTAATGTGATCGATTACAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACATATATCAAAGACGATATTTACCAGCTCAATAAAGAATTTGATGTGAAAGAGATTACTTATGACCCGTGGAATGCCACCCAGCTGGCCAATGATTTACTCGAAGAAGGCGCGAATATGGTGGAGTTTCGCCAAGATTTTAAGTCCATGACCCCAGCATTAAAAGAACTTGAGCGCTTGGTAATTTCAACAAAGCTCCATCATAACAATAACCCCGTGTTGAACTGGATGGCCTCGAATTTAGTCGTTGTTGAAGATGATGCGGGGAATATGAAACCTTCTAAGCGTAAATCCACAGAGAAGATTGACGGTATGGTGGCCATTGCGATGGCCGTCGGGCGTTTAATTGCTGGGGAAGATCATAATTCGATTTATAACGAGAGAGAACTGCTCATTTTATGAAGTTATTTAAACGCTGGTTTGGTGCGGCAACGGAGCTTGAGCCAAGTAGCGAATATGGTGGTTATGAGCTTTTAGATACTGCGCCCATGAGTGCCAGCGGTCAAAGCATCCACCCCGATAATGCCATGCGCTTAGCAACGGTTTATGCCTGCATTCGTGTATTAGCCGAATCGATTGCGGCTTTGCCTTTGCATGTGTATCGCTATGAAACAGATGGTGGTAAAGCCTTGGCTACAGATCACCCGTTATATTCTGTCTTGCATGATCTGCCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGATTTACGTGAAAACCTCGTCGGCCATTTATGTTTACGTGGTAATGCCTATTGTCAGATTATTCGCGATGGTGCAGGGCGGGTACGTGAATTAATCCAACTGCCCACTGATAACACCAGCGTCCGCCGTGATGAAAAAACTAAAAAGCTCATTTATAGGCACTGTTGCGAAAAGTTATAGGGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTCGCGGCCTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACTGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAATTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATCGACATTCACAATACGTGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGATGTCGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTG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61 | Streptococcus_phage(41.18%) | transposase,integrase,portal,terminase | attL 78607:78666|attR 118249:119169 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
125082 : 126704
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039082|125082:126704|DBSCAN-SWA GATGGCTTTATGGAAAAGAAAACCTAAAACTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATTATAAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACACTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAGTATTAATAATTCATGTGTGGTGGAGTTCAATTTATTCGCGACAATAAAATCATCAAAAGTTATTTTTTAAATCCACAAGCAGTACTGCCCGTGTTAAAAAAAGTGGAGATGTTGAATAAAAACATTTAAATCTAAAGTGTTACATAAAAATAGAGAGAAAACAATGGTGACATTAACCGTAACTGATATTCATGATTTAACAGTAATGCTAGGTATGTTAGAAGATATTTATCAATATGAAATCCCTGCGGCGCAACGAATTTTAAAAAAAATTGCTGATAAACCTGAATCTAAAAGCTATCACATTGTTCCAACAGGACTAAGTTCAGAAAAAAGTATACACTACGTAAATAAGTTAAGAGACTGAAGTATATATTTCATAGTATTTTTCTGCAAATAATATAATGGTTACTTCTCATTAAAAAAGTGCTTTTAATAAATTTTATTAAGAAGAATTAAAATGAAACAAAAAAAATCGATAATAACTGGGCTATTTTTTAGTTTTTTTATTGTGTCTATAAATGCGGTAGTACCAGCAAAGCCGATAAGTAAAGCGTTTCATTGTAATGGCTTTATGAAATATGGTGTTCCTGGTAAAACCGATCAGTATTTATGTCGTGAAGGATATAGTGTTGGCTATGACTATAAAACAAAACAGCCGAAGTGGGTTGCCTATCATTTAACCAGTCAAAGCGTTTCTAAACGAATTAAACGCCATGATGAGTTTAGACCAGATTCTGAGATTCCTTATAAATACCAAGCACAGCTGTCAGACTACAAGCAATCTGGTTATGATCGTGGGCACTTAGCCCCTTACGCTGCTATGGACTTTGATAAGAAGTCGGCGTCTCAATCCTTCTTATTATCGAACATGAGTCCTCAAAAGGCTGGTTTAAATCGGCAAGGTTGGGCGAAGCTAGAGTCAAATGTACGGTTTTGGGCCAAATATAAGAAGGAAGTGTATGTTTATACAGGGCCTATTTTTGAAGGAAAAAATATCAAAACAATCGGTAAAGGTAAGGTTGCCGTACCAACTGCATTCTTTAAAGTTATATTTGCACCTGAGAAAAAGCAAGTATTGGCGTTCGTAATGCCTAATAAGCGTGTTGCTAAAAATAAAGTTGCTGAGTATAGAACAAATATGAATCATATTGAAAAATTAACCGGGTTAAATTTTTTAAATCAATTACCTTTGATTGAAAGAGAAAACCTTGTTACAAAAACAGAAAAAATGTGGCGTACTCACTACAGTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039082|125082:126704|125612_125816_+|WP_017375836.1|DBSCAN-SWA MVTLTVTDIHDLTVMLGMLEDIYQYEIPAAQRILKKIADKPESKSYHIVPTGLSSEKSIHYVNKLRD >NZ_CP039082|125082:126704|125909_126704_+|WP_027243203.1|DBSCAN-SWA MKQKKSIITGLFFSFFIVSINAVVPAKPISKAFHCNGFMKYGVPGKTDQYLCREGYSVGYDYKTKQPKWVAYHLTSQSVSKRIKRHDEFRPDSEIPYKYQAQLSDYKQSGYDRGHLAPYAAMDFDKKSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKKEVYVYTGPIFEGKNIKTIGKGKVAVPTAFFKVIFAPEKKQVLAFVMPNKRVAKNKVAEYRTNMNHIEKLTGLNFLNQLPLIERENLVTKTEKMWRTHYS >NZ_CP039082|125082:126704|125082_125418_+|WP_017375632.1|transposase|DBSCAN-SWA MALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS |
3 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
133200 : 135618
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039082|133200:135618|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAATCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCATGTGACGGAGGGCGTAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCATAAACACAATCATCTTATTCAGGACTTACGCATTGACAACAAAATCTAGTTACGCCCTCCGTCTTCTATTGGGTTCATATTTTCTAGTTCGCGAATATCATTTTGACTCATTACACCAATGCTAAACATGCGATTATAAAAAGAGGCGCGAGCGGCCGTATCACCGCGTAATAAGCCCTCAATATTAAATTTTACAAAGTATTTTTTACGCTCATGGGCAAGTAATAAGTCACGGCTAATACTCTGCTCGATTTTAACCAGCCAGGGCACCAAACTATGACGAACAAAGGCTAAATCTTGATGCTCAATATTTGAAAAAGTGGCGCGTTCTAAATCGGCAATCATATGCGGCGGCACCCGGAAAATGCCACAGATTTCATTGCGCTGGTATTTACGTGTTTCTAAAAACTGACTGTCTTCACTGCTCATGGTCAGCGTTTGCCATTTCAAGCCATTCTCTAAAACAGCCACCCCGTTCGAATTTTTACCGCCGTGGGCTTTTTTCCAAGACTCCGCTAAGTTTTCACGGCCTTCTTTTTTTAACTGGCCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTCTGTGGTTAAGATGCCGCTGGGGCGTGCACCATTACCGAATAATTGGGCGCCATGCGCTTGGGTTGCCGCAGATAAGCCGAGTGATTCGCGTTGTAAGGTAATTGGACTGCTGCCGATAATCCCGTCACTACCCATCGCATTCAGCCGCCACACTTGATCATCGCGGAGTTCATAGCTTTGACCGTTTAACATCGTGCTATAGATGAGCTTTTTTGTTTTTTCATCACGGCGCACCGTGGTGCTATCAGTGGGCAGTTGGATTAATTCACGCACTCGCCCTGCAGCATCGCGAATAACCTGACAATAAGCATTGCCACGTAGACATAAATGGCCCACAAGGTTTTCACGTAAATCAAAACTAGTCACTTCACCATTCGGTAAATCATGCAAGACAGAATATAACGGGTGATCTGTGGCCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039082|133200:135618|133200_134175_-|WP_048875857.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039082|133200:135618|135162_135618_-|WP_048876221.1|portal|DBSCAN-SWA MATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQVIRDAAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLIYSTMLNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDAASHGVLSTG |
2 | unidentified_phage(50.0%) | transposase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
140336 : 147304
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039082|140336:147304|DBSCAN-SWA TGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGTTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTTGGCTCGCAGCGTATGATGTTTTAATAAGATAAGCAATTAAAATAGAGGTCTGTGGGCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAAGTTTGAAGACCGTGGATACACACATTATATACAAACATGTTCTTTTGAAGGGAAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAACGACTCTTCAACCTCTTCCCTATTGTTCGAAGCATTTAATCTACTTTCTTTGAAAGTCTTAGGGCTTGCTATACCCGACACTATTCATTTAGTCCAAGATCAAGAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGGCTTTAAAGTTTATCGACTTTGCAGAAGATCTTGCAAGAATAAGCCTTACTCGACTAATTTTGGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGGAATATATTAATGACTAAGAGTCAGTTGATTTCTATTGATGTGCCATTCTTTGATCTTGCACCTGAATTCGTACCTAATAAATATCAAGATCATATTGAATTGTTTTCCGAAGTATTTCTGGATAAAAATTCACTTAGCCATTTATCTAAAAATGTAATCAATCATTTTTATAATAATATAGGATTAATAAGCTATAAGCTTTCTAGACTATATCTTGATAATGTAATTTCTGAAGTAGAAAAAAATGATTACCTAAAAAAATTAATAGGCAATATATCAAGCTTTTATGGACTTATTTCAATATTGAAAGAAAAGAAAAATCCTCACGATTCTCTCACGGACTCTGAGTATGAATTATACTTTGCAAATAGACTTGAGCATATCCAACAACTAAATACTATAGTCGTTGAACAGGATTTATCAGCCCAAAAAGATCATGTATCTGAAAATCTATTTTTCGATGCAAATGAACACTTAGAAAATATCGATACTTCTGAACTGCTATTTTTTGATGCAAAAGATACGTTAGAGAGTTGTTCCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCTAAATTAGTGTGATAGAGATCTGCTCCTCTTAAGTTCACGCCCTCTAAGTTAGCTTTATGTAAATTAGCTTCTCTTAAATTGGCTCCATCTAAATTTAAACCTCTAAGGTCAACTCCTTCAAGATTCCACCCATATAAGTTAATCACATCACCAGTTTCTATTGACTTTTGAATCGCTTTCTGTACATCTGCACGAGTTTTTTTTGTCATAATTTAATCAACGCTTTAAATTTAAAAAAAATTTATATAACAAATATTTAGATTTTACAATCTTAAAATTTTTTACCAATTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGACAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTAATTTAAGTTACGCTAATTTATCAAAAGCAAATTTAAGTAGTATGGGTTGGGGAAGTGCTATAGTTGCTGGAGCTGCTTATGGAGGATTTGTTGCTGCAATCTCCAAAAATATAGCAGGAATGAGCGTGGGAACATCTGTTTTAACTGGTGCAACAGTAGCTGCAATGGTTACATTCACTAAAAAACTTGAAGGCGCTAATGTAAAAGTTACAAATTTATTTGGTGCAAATTTATCTGGTGCAAATTTAACTCATACAAACTGTACGGGAGCATACTTTATAGATACAGATCTAACTAATGCGAAAGTAAGCAAAACTGATTTAAAATATGCGATGTTTTCCAAAATAAGCTTAGAAGGGACAGGTCTGAATTTTAAAGATTTAGTTGGCGATGCCACACCTAAATCTGAAGGCTTAATGGAGCTTCCTTCTGTAATTTACATTCCTAAAGTTACAGGCTCATATCAATATTACGAAAGAAATCACGGTTACTTATCTGCTCATTTGCCACAAGAAGAATCTACTTTGAATACACCAAGGCTATTTGAAGGTTCTCAACAGCAGGAATGTCAAGAACAATCATCAAGTGTCAATTTAACTCATTAAATTTCATATCCACGGACGTAAGCGTCGCTTGCTATAGACCTACGGTCTTTCGCGACTTCGCTCGGTTCTGTCTCAATTTGAGCTGATGGTATAATGCTGGTTTTTGTTTAAGGTGTAGTCATGATCAATTTCAGCGGCCGTCATTTTAAGAAAGACCTGATCATGATGGCCATTCGGTGGTACATCGCTTATACGTTGAGCTATCGTGACATCGAAGAACTTATGGCTGAGCGTGGTATTCAAGTTGATCATTCAACGATTCATCGTTGAGTTGTTGAGTATACTCCACAGCTAGAGGGACGATTTAAGAAGCGCTATAAGCACCAACCTGGGGCTAGTTGGCGTCTGGATGAGACTTACATTAAGATCAAAGGCCAATGGTATTATTTATATCGAGCCATTGATAAACATGGGGATACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAATCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039082|140336:147304|142168_142897_+|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|140336:147304|146575_147304_-|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|140336:147304|144022_144751_-|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|140336:147304|144806_145427_+|WP_144420838.1|DBSCAN-SWA MQQCPNLSYANLSKANLSSMGWGSAIVAGAAYGGFVAAISKNIAGMSVGTSVLTGATVAAMVTFTKKLEGANVKVTNLFGANLSGANLTHTNCTGAYFIDTDLTNAKVSKTDLKYAMFSKISLEGTGLNFKDLVGDATPKSEGLMELPSVIYIPKVTGSYQYYERNHGYLSAHLPQEESTLNTPRLFEGSQQQECQEQSSSVNLTH >NZ_CP039082|140336:147304|140336_141065_+|WP_017377509.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPVHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|140336:147304|142899_143172_-|WP_017377512.1|DBSCAN-SWA MTKKTRADVQKAIQKSIETGDVINLYGWNLEGVDLRGLNLDGANLREANLHKANLEGVNLRGADLYHTNLGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039082|140336:147304|141206_142139_+|WP_144420837.1|DBSCAN-SWA MSELKNKEKFEDRGYTHYIQTCSFEGKKCYVKLSYKNDSSTSSLLFEAFNLLSLKVLGLAIPDTIHLVQDQESNKCIGYLTSEVILDKALKFIDFAEDLARISLTRLILGDNAATEDGNILMTKSQLISIDVPFFDLAPEFVPNKYQDHIELFSEVFLDKNSLSHLSKNVINHFYNNIGLISYKLSRLYLDNVISEVEKNDYLKKLIGNISSFYGLISILKEKKNPHDSLTDSEYELYFANRLEHIQQLNTIVVEQDLSAQKDHVSENLFFDANEHLENIDTSELLFFDAKDTLESCSGTVAKNLDLSRV |
7 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
153339 : 154074
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039082|153339:154074|DBSCAN-SWA CTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGCCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATCCGTATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTTCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATTGACATTCACAACACCTGGTGATTTCACATAAGGTTGGCCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTGGCATTTTGATGACGACTGAGCATCCCATCCAAAGTATGACCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGGAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGTGATTTCAGCTCTATACTCATGAACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAAGCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAACGGCCATACCAACGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAATAAGGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTAGCCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039082|153339:154074|153339_154074_-|WP_027243210.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKPYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYRAEITKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDGMLSRHQNAKAALRFFKKAIGQPYVKSPGVVNVNKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAIRMVQKGQLRYIKKQDICGQNQLIDKLFGLAASF |
1 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
157284 : 162277
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039082|157284:162277|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039082|157284:162277|157284_158259_+|WP_075275471.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYQHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPRTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039082|157284:162277|159030_159759_-|WP_048876214.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|157284:162277|161548_162277_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|157284:162277|158894_159062_+|WP_155046640.1|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILALLRKIIVSFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ >NZ_CP039082|157284:162277|160267_160621_-|WP_017377521.1|DBSCAN-SWA MYKDSHKVIGYFSYSEEGDVFCDKDACVISGSSESLHGYIDAMLPDRETSGIVKKTRFEEIMQGISRGAAYAFDQESYTRFLPLAEKNGMSDLPALSEFEKHQPEENTPQFIRISQS |
5 | Streptococcus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_9 |
168641 : 174544
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039082|168641:174544|DBSCAN-SWA TATGTTAGTTTTAACACGTAAAAGCGGACAAGAAATTTTTGTCGGTAAAGATATTACTATTAAGGTTTTATCTGTAGTAAATGGTCAAGTAAGAATAGGCATTGATGCGCCTCAAGAGGTACAAATACAGAGGGATGACGTTAAGAAAAGACCGGAGTTGATTAAAGCTGTTGTGTGATTAAGGGCTTCGGCCCTTTTTTCTTAAGAGTGAATAAGAAATATTTTTAATTTGGTTTAATTTTTTTCTGAGAATGAGTGATACTATTAGTAGAAATTTTAATGCTGGGGAAATAAATGCCAATTGTTCAAATAGCAAATTCTAAGGGTGGAGTTGGAAAGAGCACAATAGCGTGTAATTTAGCAACAGCACTTGTTCATGCTGGTTTTTCGGTTGTTATAGCTGATTGTGATCCCCAGTTTTCTTCTTCAAGTTGGGCAGATGAAAGGCAAGACAATGGTAAGTTGCTTAATGTTGATATAGTGCAAAAAACAGGCAAGATTATCCCAGCACTACGGCAGTTAACAAAAAAATATGATTTTGTAGTTGTAGATACAGCAGGGCATGATTCTGTAGAAATGCGTGCGGCTTTAACTGTTTCTGATTTAACTATTGTCCCTTTTAAGCCAAGCCAGCTTGATATTGATGTGCTAGGGGCTATGCAAGAGTTAATAGAAAATGCACAAGATGCTGGAAATGATAAAATGCAGGTTGCTTGGATTATTAATATGGCGGCACCCAATCCACGGAGTAAGAAGCTAAAAGAAACTCAAGATGCTTTGAATGATGCAGAGGGCTTTAACCTTCTTAAGTCTGTCTTACATAATAGGGATGCTTATGTAGAGTCTATGTCTGAAGGTTGTGGTGTAGTCGAATTGAAAGATAAAAAAGCTAAAACTGAGATAGAAGCTTTAGTTAAAGAAGTGTTGAAATTAACGGGCAAGAAGGCAGTGCGTCATGGCATTAAAGCTAAAAAAACAGTCAAAGCAAAAAAATCAGCGTAAAGCAAACAAGAACGATTTTATATACGCTTTCAAAGGAAGTGAGCACCTAAAAGAAAAGTTCGACAGTGGTGATAAGTGGGTAGATACAGAGCAGTGTTACATTGCCGAGATTAAAATAGACCGTAAAACTAAAGATCAGGACTACCTTAATGAACTTGCTGCATCCATGAGCGGCAAGAAACAAATTAATGCGGCGATAGTTCGTAAAGCAAAGGATGGTCGTTATGAATTGATTAACGGTGAGTGTCGTTATGATGCTGCAAAAATCAATAATGAGCCTTTGCTTGTTCGGGTTGTTGATTATGATGATGATGAAGCAATCGGTGCCATCATTGCTGAAAATGACAAGCGTAAAGATTTGTGTGACTACGATAAAGCCTTAGCATATCTTGAGTATAAAAGTGATTTGAGTATTCGTGCATTTGCGGAAAAATATAATCTTAACAGAAACTATGTTAATCGACTTTTTAAAGTTGATAAGATACCTGAGTCAGTTGTATTGGCCCTACCTATGATTGAATTGAGTGCATCTCAATTTGAAGAAATTGCTATAAGAATCAAGGATAATCAGCTTTATACCGACGTATTTATAGAGCTTGCTCCACTACTGTCTCAAATTGAGACACCTGTTACATGGAAAGACTTCTTAAGCCGCATAGACCGCAAGGTTAATCCACCAGAGAAGCAGCCTCAAAAGAAAATCGAGCGCTATGTTTTCAGCTCTGAAAAAGCTAATCTGAGATACACAGATAGTGGCTTTATAGTGAAGTCCGAAAAGCTCACACGAAAGCAAAAAGAGCAAATACAAGAAGCGTTAGACTCGATTTTATAATGTAGGCCCAGAGGGGCCTTTTTTTAGTTCTTATGCTGTTCGCTCCCAGACAATCACACCAGAACGGGCAGGGTCGAGGTCGTGAGAGTGCGGTTTTCCGCCGCCAGTATTGAATGTGTAGTCATTGCTTTTATTTGTTGTTGTTGGCGTAACTACTCCAACATCTGCGCCACCTCTTTGAATTGCTGACTCGTTCGGAATTCCGTGATTGTGCTCGGGCATTTCATCAATAGAAAGAGTGTGATCATTTGTTCTTGTAGAGCCTGCTTTTGCTCCGGCATCTATTGTAAAGTTACTTGAGCCTGCGACTGTAAGTAAGCGGCCGGCATGGTCTGCATCGATGTCAGTGATTTTTTTCCAAGTTGCCCCTTTTCCTTGAAATGGTGGGATATAGTTTTCGTCAAAAGTTAGTTCTATCTTTCCGACCGGGTAGAGTTGATCTATGAGTAGTTCGATTTGCAAAGAGCCGTCAGCGTTTTGTTTCCGGCTTAGTGTTTCACTTTGAATCGAGTCGGGTGTGTTATCTATGCGATTCCACGATGTCCAGCCAGAGCTTTCTGTATAGATACGCACAAAAGTAGGGGATGTGCCGTCTACGGCTAAGCCTGTGATGGTCTGTGTTAAGTCAGGCGAATTAGGAACACGAACAACGTTAGCCGTCCACCAATGATCTTTTGTAGTTTCTAAGCTGGGTGAGTTTTTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGCCTTATGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACGGCACTGTTGCGAAAAGTTATCGTGAGTTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTAGCTACCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAATCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTTTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCTTACGACCAAACTTTATACCTTTTTCTCTGGCTATTCTGATTCCATCAGCTTGGCGTTCCTTGCGTATATTATTTTCAAATTCAGCAAAAACGCCCAATAATTGATACATCATTTTACCTAGTGCGCTGCGTGTATCTATTTTTTGGTCTAAAACAATCAGATTTACATCAGCAGCCATCAAACCTTCGACGATTTGGTTTAAATGAGTATTTGAGCGTGCAAGGCGATCAAGTTTAGTCACAACCAAAGTATCTTCGTCACGTAAATAATCTAAGCAATTTTTTAGCTCTTTACGGTTTTGGTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039082|168641:174544|170504_170936_-|WP_144420840.1|DBSCAN-SWA MQIELLIDQLYPVGKIELTFDENYIPPFQGKGATWKKITDIDADHAGRLLTVAGSSNFTIDAGAKAGSTRTNDHTLSIDEMPEHNHGIPNESAIQRGGADVGVVTPTTTNKSNDYTFNTGGGKPHSHDLDPARSGVIVWERTA >NZ_CP039082|168641:174544|172792_173182_-|WP_051929563.1|DBSCAN-SWA MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLDLSMV >NZ_CP039082|168641:174544|173204_173933_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|168641:174544|171318_172023_+|WP_048876211.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTALLRKVIVSFRKVIFLC >NZ_CP039082|168641:174544|172034_172763_-|WP_036772541.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039082|168641:174544|173935_174544_-|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039082|168641:174544|168641_168818_+|WP_075275473.1|DBSCAN-SWA MLVLTRKSGQEIFVGKDITIKVLSVVNGQVRIGIDAPQEVQIQRDDVKKRPELIKAVV >NZ_CP039082|168641:174544|168934_169642_+|WP_027243191.1|DBSCAN-SWA MPIVQIANSKGGVGKSTIACNLATALVHAGFSVVIADCDPQFSSSSWADERQDNGKLLNVDIVQKTGKIIPALRQLTKKYDFVVVDTAGHDSVEMRAALTVSDLTIVPFKPSQLDIDVLGAMQELIENAQDAGNDKMQVAWIINMAAPNPRSKKLKETQDALNDAEGFNLLKSVLHNRDAYVESMSEGCGVVELKDKKAKTEIEALVKEVLKLTGKKAVRHGIKAKKTVKAKKSA >NZ_CP039082|168641:174544|169595_170474_+|WP_048876212.1|DBSCAN-SWA MALKLKKQSKQKNQRKANKNDFIYAFKGSEHLKEKFDSGDKWVDTEQCYIAEIKIDRKTKDQDYLNELAASMSGKKQINAAIVRKAKDGRYELINGECRYDAAKINNEPLLVRVVDYDDDEAIGAIIAENDKRKDLCDYDKALAYLEYKSDLSIRAFAEKYNLNRNYVNRLFKVDKIPESVVLALPMIELSASQFEEIAIRIKDNQLYTDVFIELAPLLSQIETPVTWKDFLSRIDRKVNPPEKQPQKKIERYVFSSEKANLRYTDSGFIVKSEKLTRKQKEQIQEALDSIL |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039081_1 | 1532291-1532401 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039081_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039081_1
>1.1|1532318|57|NZ_CP039081|CRISPRCasFinder GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039081_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039081_1 >merge|NZ_CP039081|1|1532291-1532401|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA >NZ_CP039081|1|1|1532291-1532401|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA
>NZ_CP039081.1|WP_098082828.1|1531195_1531453_-|transposase MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN >NZ_CP039081.1|WP_036774189.1|1530188_1531196_-|IS3-family-transposase MDEINKLSKEKNVTAIALCKAVSMPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK >NZ_CP039081.1|WP_144420682.1|1529854_1530016_-|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039081.1|WP_155046588.1|1529110_1529320_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP039081.1|WP_027243099.1|1526681_1527995_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP039081.1|WP_027243098.1|1525300_1526446_-|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP039081.1|WP_027243097.1|1525049_1525235_-|hypothetical-protein MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP039081.1|WP_027243096.1|1524381_1525014_+|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP039081.1|WP_144420683.1|1523548_1524205_-|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP039081.1|WP_027243095.1|1521274_1523560_+|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP039081.1|WP_017376785.1|1533000_1533906_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP039081.1|WP_017376784.1|1534146_1534332_+|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG >NZ_CP039081.1|WP_027242578.1|1534368_1534905_-|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP039081.1|WP_027242577.1|1534922_1536224_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP039081.1|WP_048876008.1|1536220_1537195_-|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039081.1|WP_155046589.1|1537274_1537424_+|hypothetical-protein MTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP039081.1|WP_155046590.1|1537603_1537768_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP039081.1|WP_036774017.1|1537769_1538645_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP039081.1|WP_144420680.1|1538960_1539881_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP039081.1|WP_017375696.1|1539896_1540280_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039081_2 | 2091575-2091670 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039081_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039081_2
>2.1|2091599|48|NZ_CP039081|CRISPRCasFinder GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039081_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039081_2 >merge|NZ_CP039081|2|2091575-2091670|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG >NZ_CP039081|2|2|2091575-2091670|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG
>NZ_CP039081.1|WP_017378007.1|2088572_2090516_+|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP039081.1|WP_048875961.1|2087023_2088427_+|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP039081.1|WP_017378006.1|2086274_2086904_+|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP039081.1|WP_017378005.1|2085316_2086036_+|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP039081.1|WP_017378004.1|2081663_2085203_-|chromosome-segregation-protein-SMC MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE >NZ_CP039081.1|WP_017378003.1|2080766_2081597_-|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP039081.1|WP_036773465.1|2078740_2080780_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP039081.1|WP_027243145.1|2077669_2078725_-|protease-SohB MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR >NZ_CP039081.1|WP_017377998.1|2077128_2077659_-|hypothetical-protein MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE >NZ_CP039081.1|WP_048875965.1|2074050_2074971_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ >NZ_CP039081.1|WP_017378009.1|2092329_2094075_+|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP039081.1|WP_144420648.1|2094477_2095950_+|hypothetical-protein MPTTMIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN >NZ_CP039081.1|WP_053093668.1|2096132_2096732_+|hypothetical-protein MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039081.1|WP_144420647.1|2096869_2097067_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG >NZ_CP039081.1|WP_155046604.1|2097267_2097408_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ >NZ_CP039081.1|WP_048875964.1|2097475_2098255_+|hypothetical-protein MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP039081.1|WP_017376708.1|2098819_2099221_+|transposase MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039081.1|WP_036773793.1|2099365_2099743_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP039081.1|WP_027242834.1|2100202_2101510_-|hypothetical-protein MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS >NZ_CP039081.1|WP_146619530.1|2102258_2102516_-|hypothetical-protein MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
31805 : 91601
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039081|31805:91601|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
123725 : 241661
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039081|123725:241661|DBSCAN-SWA 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105 | Staphylococcus_phage(12.5%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
316578 : 358937
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039081|316578:358937|DBSCAN-SWA 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54 | Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
376955 : 426638
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039081|376955:426638|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
497564 : 544532
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039081|497564:544532|DBSCAN-SWA 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44 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
584038 : 717432
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039081|584038:717432|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(13.64%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
726074 : 772391
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039081|726074:772391|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(21.43%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
780551 : 834862
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039081|780551:834862|DBSCAN-SWA 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49 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
878542 : 941090
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039081|878542:941090|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
944992 : 1011955
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039081|944992:1011955|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1017568 : 1080105
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039081|1017568:1080105|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1088805 : 1138373
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039081|1088805:1138373|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_13 |
1163096 : 1219490
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039081|1163096:1219490|DBSCAN-SWA CTTACGCTATAATCCCCCTTTTTTTTAATAGAATTTTATCAATCATTAAAACCAGCTTATTTTTCATGTTTTTACGAATCTTTGTGATAAGTTGAAGTCCTTTTTCATACAATTGATCAAATAATTTTTGTGAAATATAGCCTTTATCACCAATAATTTTACCTGTTAAGTTCTCGGCCATTTTAGGTAATACGACACGGTCATCTGTAGTAGCTTTACTCATTTTAAAGGCCATTAACTCTCCCATATCATTCACAATAATGTGGAGCTTAAAGCCGTAGTACCACCCCATCGTTGACTTAGATTTTTTAGCTAATCCCTTGAAAGCTCTATTTTGAGACGCACGTTTTTCATGACAAACACGGAGTATTGTCGAATCAACAAAATAAATCCCTGTTGCTGTTTTACCTTGGGCCGCAATGAAAAAACACAGAGGCAATAAGATGCTCGGCATGAGTTCAACGAATCTGTTGTAGCTAACGCTGTTTGGAAAGTATTTTACCATGCTACCTTTTATTACATGAAGATAATACATCTTAAAATTTCGGTAATTAGATTTGTGAAAATAAATCATAATTGTCATTATTTCACTTGTTGACATTTGTGAAGGCTTATTACGTTTTTTATTCGTATCTTCTAGCAAAATAGCATTCCATTGAGGTAATAACTCTTGGCAGAAATCATCTATTACACAAAAGAGAGAAATCAATGTTAAGTCCATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTATTGCTTCTTTAGAACTAAATTTAGACTCTATTTAGCCGCAAAACCACTGGTTTTTCAAATACTTCTTATGTCGAACTCACGTTGTTTAGCTAAAATAAAGATAATTGGATAAATTTGTGTAAACGATAATCTCAGGACAGATATGAAGATGGTGCGAGAGGAGAGACTCGAACTCTCACGGGTCGCCCCACTGGAACCTAAATCCAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACACTCGCACTTGGCTATACTGCTAGGCTTACGCCCTGCAACGAGGACCTATTATGCGGATTTTGAAATAGAAGTCAACAACTTTATAATGTATTTGGAAATTTTTTTAGTTTTTTAGTGAGTTGATAAAAACAATGAATCAAACTACCTGTATAGCGATTGCGAGCTTGTTGCAAGAATTAGAAAAAACTTTGCGTGAGCAACGCCTTTGGGAGGCAGAGGCACCTTGCAAGAGCGCATTGTTAAGCCAAGAGCCCTTTTGTGTGGATACACTACATTTTAGTCAATGGGTGCAGTGGATTTTTTTACCGCGAATGAAGGTGATTATAGCAGCAGGCGAGGATTTGCCTTTAGCACCTGGTATTGCGCCGATGGCAGAAGCAGGTCTGAAAGCTCAAGGAGTAAGGGGGCAAGAGATTATACGAATTTTCAAGCAATTTGATCAGCTACTGGCTTAATTGCGCTTCACATTTTTGTGATCTTTACTGTCTTGATAATTATCAGTTCTAAAAAAATGAGGGCAGCTTATTGAGTAATGAGCAAGGTTTAAATCACTAGCTCAACAGTTTCTTGCCATGAGGCTGGATGATGGACCTCAAATGCGGGCAAGGAGGCCAGGAGTTTTTTACCATAAGCTTTGTAAATAATACGGTCATCGAAAAGCACCAATTTACCCTGGTCTGATTCAGTACGAATCAGCCTGCCTGTCCATTGAATTAACCTTAAGTGAGCTTCAGGTAGAGTATGTTCGATAAATACATTTTTGTTTTGTAGCTTTAGAGCATGCTCACGTGTTTGTGCTTGTGGGGTGTTTGGCATCGCAAATGGAATTTTTTGAATAATGAGTGTTTTGCAGTAATGGCCAGGCAGATCTAGGCCTTCGGCGAGTGATTGCAAGCCAAAGAGCGCATGGGGTTTTCCTTGGTCAATAGCGTGCTTAAATTTTTTAATCAGCTGCTGTTTAGGTAGATCACCTTGGCAGGTCACTTTATTTTGTAAGCCCTTAGGTAGCATGCCAAAGGTGTTTTCTAGGCTCTTTTGACTGGTAAATAGTACGAGACAGCCTTGACTAAACTCTTGTAATAGTGCTTTTAAAAATGTTTGAAACTCTTGCAAGTGCTGGTCATTGGTATGTGTTGGTGCTGACTTTAGTTTTGGAATAATCAGTTGGGATTGCGCATAGGCAAAGGGTGAAGGGCAGCTGATTGATTTGACGGTATGGCTATTTTGTAAATGTAGGCCGATTTTTCGGGCAAAGTGCTGAAATTGACCTGATATTTTAAGTGTGGCCGAACATAGGGTAATGGCTTCAGGTGCCCGTTGCCAAAATAGCTCAGCAAGTTTGTGACTGGTGTCAATCAAGCTTAGGTGAAACCGGTAATCGTCTGGTTCTTTATTTTGTTTTAAGGTGATCCACCGCGCTTGTCGGGCACCTTGGTTATCTTCTTTGTTTGGGAAGTGTTGCCAGATTGTTAACATGGTTTCTAGTATATTAATAATAAATTCTAAGCGACTTTGATATTGCTGTTTCCTTTCTAAAGAATCAATATGTGTGCTTTCAAAGTATTCGGAAAATAATGAAACTTGTGTGAGACAGGTTCGTGTTAAGTTGGCTAGGTGATTGAATTCTTCAGCTAGGCTCTTTGGGAAATCATCCAAGAAAACCCACTCTTTTCCTGTCGCACGGTCTTTAAAGTTAAGCTGTAGAATTTTTTTCAATGAAGTTAATCGATCGATAATTTGCTCACTAAGGTCAAAGGCACTGAAGAAACTTTTTGGAGGGTCATCAAAAAGAGGTTTGCACTTTAACAGTAGTTGCTTTGTTTCTTGGATATATTCTTTACTTGAATGAAGAGACAGTTCTTGGGCTAAGCTATTAATCGATTGTTCGGGAAGATGATGGGCCTCATCGATGATATAAGTTGACTTTTCGGGTTCAGGAAGAATTTTACCAAGGCCGAGCCAAATATCCGCCAATAAGGTCGCATGGTTAGTAATAATAATATCAGCGGATTTTTGGCGTTCACGCGCACTGAAAAAAGCACATTCTTTAAAAAAATGACAACGATGATTTAAACAGCCTGCTCGATCGGTGGATATTTTTTGCCATAAGTCATCATCAATTTTAACGTTTAAGCTGTCTCTGTCGCCAGACCAATTTTCTTTTTCTAAGGCATTATGCAAAGGTGTTAAGCGCTCTAACATCAGTAAATCATCCAGAGCATAAAATTTATGATGGCAAATATAGCGTCGGCGCCCTTTGGCAATTTCTATATTTAAAGAGAGACCGAGTAATTTTTCAACCTGGGGAATATCTTTATTGGCTAATTGCTCCATCAACTGAATGGTTGCTGTTGCAATAATTAATGTGTGCTTTTTTGCTTGTGCTTGTGACAGTGCACCTAATAGGTAGCCAAAACTTTTACCAATGCCGGTGCCACCTTCACAGAGTAAAATATAACGGTGATGGATGCTGGCAGCAATCGCTTGAATCATACGTTGTTGGCTTGGGCGGCAAGAGAATCCAGCATCTTGCAAGCGCTGAGTGATATCGGTGATTTGCATAATGAATTATTGTGTAGTTATTTTAAGGGTTATTTTTAAGCAATGATTTGGGCACTTCGTCGATAAATTCTTGCGCTGTCTTAAGTAGCCATTGACGTAGTGGTGCGACTTTATTGCGTGTTAAATAATTATTAGGATAGGTTAGATACAGATCATGAATGCCTGGAACTGTTTCTTGTGTGGGAATGATTAAATGGCCTAATTTAAGTAAGTTTGCAACCAGTGGCAGGTGGGTGACTAAAATGCCGAGGCCATTGAGAGCGGCTTGAATACCTTGAATTGTATGCTCAAAGATTAAGCGCTCTTCGATTTGAGGCTCTGAACATTGGTAGTGTTGGCACCAGTTTTCTAGGTCATTGGTGCGTACGGTGTGGCGAATATTAATAAAGGGATATTGATCAATCAGCAAGTTTGCATTTAATTTAGTTGCTTGTCGATCTTGAAAGAGTGCTGGACTGCATACTGGAACCAGGCGGTCTTGTAAGAGAAAGTCGCTGCAATAGTCTTTTTGGTGATCTTGTGAGTTATACTGGATGGCCGCATCGATGTCATTAAATTGCAATGAGTTGGGCCGTAATGGCGTTGCTAAGCGTAGCTCAAAGCCGGGTGATGAGGCTTGAAAGTCTGCTAAGCGTGGGATTAGCCAGTATGTTGCCATGCTTGATGAGAGGTTTAAGTGAATAATAGTGGCGTGTTGATCTTGGGTCAGTTCAACCGTGGCATCATTAATAATGCGCAAGGATTTATGAATATGTTCAGCATAGCGCTGGCCTTCTTCAGTAAGAGCAAGACGATTACCGGGTTTTCGTAAAAATAAGGTTTTGGCAAGATAGCCTTCGAGGCGTTTGATATGTTGGCTGACGGCTGAATGAGTCATATTAAGCTCCTCACCCGTGCGTGAAAAATTAAGTAGCTCAGCTGCAACATCAAAAACTTTTAGTGCATTTAATGGGGGCAGGTGTTTTTTAATTGGCATAAGGTAATTGACTGTATAATGAGTATTTAGTGTAAGAAATACTAACAATCTAACATAGTTTAGTTGTCCAGCATAGTCACGAATTAAGAATGCGACTACATTCTTAGATGATTTTAAAACCTTTCTTTGTCTTAGGCTACGTAGCTTATACTTTGCACGTTATAGTTAGTGATCGTGAGAAGGTAGTGTTTCTGCTGCCCTTGCCGCTTTTTCAACTTGG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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1235732 : 1283457
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039081|1235732:1283457|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1307276 : 1348486
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039081|1307276:1348486|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039081|1307276:1348486|1323522_1324296_-|WP_048876021.1|DBSCAN-SWA MEIAQMDCHSYIQRKLENNILTLQINRPDKKNAINQQMYQTLVTELDIANQDDTIKAILFTGTADTFTSGNDLNDFAKLRSAEDLKDVVNFLHRISTHKKPLIAAVNGLAIGIGTTLLLHCDLAFSTTESRFQLPFIHLGLCPEGASSVLLAQATGYKKAAELLMTGKAFTGQEALEMNIINQLFPKETLLEKTHEYLDILAQQPIQALQITKQLLKRPQAQSITETIEVECAHFINQLQNKETQTIIKNKLTPVKK |
37 | Enterobacteria_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1379703 : 1433437
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039081|1379703:1433437|DBSCAN-SWA 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46 | Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1452372 : 1501791
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039081|1452372:1501791|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(23.08%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1510512 : 1620044
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039081|1510512:1620044|DBSCAN-SWA AATGCGTGATTATTATTGCGGAGAAGTAACAGAAATACTTACAGGTCAACAAGTTACATTGTGTGGTTGGGTGGATCGTTGCCGTAATCACGGCGGCGTTGCGTTTGTGGATTTGCGTGATCGTGAAGGCATTGTTCAGATTGTCATCGACCCGAATAAAGTGAATCTCCCTGATAATAATCAATTAAATTATCGTAATGAAACTGTGTTGCAGGTAACAGGCCAGGTAAATTTGCGCCCAGAGGGTCAAGTCAATGAAAATATTACAACAGGTAAAATTGAGGTTGATGTAAGCTCTGTGGCTGTGCTTAGCGAAGCTGAGCCGTTGCCAATGCAAGTTAATGACCTAAAAGGGGTGGGTGAAGAAACACGTTTACGCTATCGTTATATTGATTTGCGTCGTAATGAAATGGCTAAGCGCCTACGTTTTCGCTCACAAGTGACGGCAAAAGTACGCTGTTTTCTTGAAGAACAAGGTTTTTTAGATATAGAAACACCCATGCTAACGAAAGCGACGCCAGAGGGCGCGCGTGATTATTTAGTGCCTTCACGCACGTATAAAGGCTCATTTTTTGCTTTACCGCAGTCGCCACAGTTATTTAAGCAATTATTAATGGTGTCTGGGTTTGATAAATATTATCAAATTGTTCGCTGCTTTCGTGACGAAGATCTACGTGCTGATCGCCAACCTGAATTTACCCAAATCGATATCGAAGCATCGTTTGTGAATGAAGATGATGTGATGAGTTTAGCTGAAGAGATGATTCGTTCGTTATTTCAGCAAACTTTAAATGTCAACTTGCCAGAGTCTTTTCCAAAAATGAGCTATGCAGAGGCGATGGAGCGTTTTGGTAGTGATAAGCCTGATTTACGTAATCCACTTGAATTAATTACGATTGATGATTTGGTAAAAGAGAGTAGCTTTAAAGTGTTCAGCTCGCCTGCTCAGGCTGTGATGGGACGCGTTGCTGCACTACGAGTACCTGCTGGAGCAAATAAATTAACGCGTAAACAAATTGATAATTATACCCAGTTTGTGAGTATCTATGGAGCAAAAGGCTTAGCTTATATTAAGGTTAATGATGTAAATATAGGTCGTGATGGTTTGCAGTCGCCAATAGTAAAATTACTGAGCGACGAAGAGCTAGCCGCAATTTTAGATCGCACACAAGCCCAAACTGGCGATTTAATTTTCTTTGGTGCGGATAGCCAAAAAACAGTTGCCAGTGCATTAGGTGCACTGAGGTTAAAGTTAGGACAAGACCTTGAGTTATTACAAGGGGACTGGGCGCCGTTGTGGGTGGTCGATTTTCCAATGTTTGAGGAAGAAAATGGCCAATTACAGGCATTACACCACCCATTTACCGCGCCAGCCTCACTTGATGCGCTAAGGGATCGTCCAAAAGAGGCGTTATCGCGCGCTTATGATATGGTATTAAACGGTTATGAGATCGGTGGTGGCTCGATTCGTATTCACCAAGCCAGTGTCCAACAAGAAGTTTTAGAGTTGCTGGGAATTGATGAAGTGACGGCAAGAGAAAAGTTTGGCTTTTTACTTGATGCGTTAAAATATGGTGCGCCTCCACATGGTGGTTTGGCCTTTGGCTTAGACCGTATTATTATGTTGATGACCGGCACTGAAAATATCCGCGATGTGATTGCTTTTCCAAAAACACAAACAGCAAGCTGCCCATTAACCTCTGCGCCAGGAACGGCTGCAGTGGAACAATTGATAGAGCTAGGTATTCGTGTTGTACGTGATAACTCGTAATAGCTAAAGCTTCGCTTAGCCGCACGCGGTTTGCGGCGATTAAGCAGAGGTGTATAATGTACACCTTCTACAGTCAATGATAATCGTCAAATAAATGAAGACGAGCAGATTAAGATAAAAACAGAGTAGTAATATTACATGGCCGTGACAGAGTTTAATGCTGCGATTGAAGCTGCGTTACCGCAAGAAATGCCTACAGGTCCGATGGGGGCAGTCGAAATAGCAGCAGAGCGCGCAAGAATTAAAGCCTTGTTAAAAGAAAAGCAAGCGGTGTTAATTTCGCATTATTATACTGACCCTGAAATTCAGCGTATTACAGAGGCAACCAATGGTTTTATTGGTGACTCACTGGCAATGGCAGAGTTTGGCAAAAAGCACCCTGCGAATACTTTAATTGTTTCGGGAGTGCGCTTTATGGGCGAAAGCTCTAAAGTGTTAAGTCCTGAGAAAACAGTATTAGTTCCTGATTTAAAAGCAGAATGCTCGTTGGATTTGGGCTGCCCTGAAGATGAATTTTCTCAGTTTTGTGATCAACACCCAGATCGGGTAGTGGTGGTGTATGCGAACACCTCCGCAGCGGTGAAAGCACGTGCTGATTGGGTGGTGACGTCCAGTTGTGCGGTTGAAATTGTTGAACACTTGCATGAGCAAGGTAAGAAAATTATTTGGGCCTCTGATCGTTATTTAGGTGGCTATATTAAAGAAAAATCCGGTGCGGACATGCTGTTGTGGCAGGGCGAGTGTATTATTCATGCTGAGTTTAAAGCCAATGCATTAAAAGAACTTAAAGCAATATATCCAGATGCTTCGGTTTTAGTGCATCCTGAATCGCCAGCGGAGGTCGTTGCACTTGCCGATGTAGTTGGGTCAACCTCACAGTTGTTAGCGGCTTCTAAGCACTTAGTCAATAAGACCATGATTGTTGCAACTGAAAGTGGTATTTTTTATAAAATGCAGCAAGCACGTCCTGATGTAAACTTTATTGCTGCACCCACAGGTGGTAAAGGGGCTGAGTGTCGCATGTGTGCGATTTGTCCATGGATGAAGATGAATAATTTAACGAATTTAAGGCAAGTGCTCGAGTCGGGGAGCAATGAAATTACCGTGCCTGAGAATATTCGTCAAAAAGCGGTGATCTCATTGAATCGTATGCTCGATTTTAGTAAAAAGTATTTGAAGTAAAAGGGGAGTCTTTATGGCAGGTCATAGTAAATGGCACAATATTCAACATCGTAAGAATGCACAAGATGCCAAGCGTGGCAAGTTATTTACAAAATTAATTCGAGAGATTGTGGTGGCAGCAAAAATGGGGGAAGGCGATCCTGAGAATAATCCTCGCTTACGTGCTGCCATTGACAAAGGCTTAAGTAATAACATGAAACGTGATGTGGTTGATCGTGCGATTAAGCGCGGTGCCGGTGGTGATGATGCGGATAATTATGATGAAATTCGTTATGAAGGCTATGGCAGCGGCGGCATTGCTGTGATGGTTGACTGCCTAACAGACAATCATAAGCGCACTGTGGCTGAGGTGCGCCATGCGTTTTCTAAGTGTGGTGGTAATTTAGGCACGGACGGCTCCGTCTCTTACATGTTTAATCAGCGTGGTAGCATTAGTTTTGGTCAAGGCCTAAATGAGGACAGCTTAATGGAAGCGGCACTTGAGGCAGGTGCTGAAGATGTGGTGATGGATAATGATGGGAGTTCAGAGGTTATTACTGCACCGAGTGATTTCCTTGAGGTAAAAGAAGCATTGGTAGCGGCAGGGTTTAAAGCGATTGAAGCGGATGTGACGATGGTGGCTGATAATACCACTGAGCTTGATCTGGATGCTGCGCAAAAAGTAATGCGTTTGGTCGACATGCTCGAAGATTTAGATGATGTACAAAAAGTATATACAAATGCAGATATTCCTGAGTCGGTGTTAGTTGAGCTTTAATTTAATGCTTATCTTTTTTATGTAATGTATATTGTGGGTATTTAGGAAGGTCAGCTTAGATTGTTGGCCTTTTTTTATTGCTTGAGGTTAAGGTGAAGTGAAGATAGAGTTAATGAAATTTTTAATAAATCAGGTCATATTGCTGCTTATAGCACTGATTGCTTTTATGACTATGCCGATTGTTGTTGTAGCTTCAGAGCAAACAACAAATATCAGTACAGCTAACATACAAAAAACCACCGTGACTCAAAATAGTAAGCTTATGAGTAAAGATCAAGAAGCTTCTATAGTGAATAATACATCGATTAGTAAACAGCATAAAGAGCGCCCGAGTGGTGGTTTTCTTGCTTTGATTTTATTACTGATTTTTATTTTTGTGAGCACACCGATTTTATTTATTATTTGGTTATCAGCTCGCCGCAATAAATAACATAGCTGTGCAAAAAATAAAGTGCTACTATGGGCGATTAAAATAAATTTTACACGGAGTTATGATGAAGACGATTTTGATTCTGGCGGTATTTCTGTTTTATTTATGCATGGTTATTGGCTTTGAGGCTTATGGCGTAGCAATTTGGTTACGTGTTGCGATTGCAATTATTACGGGTCTGCTTATTTGGTTAATTGCAAAGAAAGTCGGCAGTGGTTCATCTGCAAAACGCAGTGACTGATTGAAAATATAGTATAAAGTTAAGAGGAGTGAGTGGGTACTCCTCAGTTTTGCAGCGTTGATTTAGTTCTGAGTGTGACTGGCTTCTTGCATTATTGTGAGTGTCATTTCTTGATCCGTAACGGCTATAGGCTCTATTTGCACTAATGTGTTTTGATCAAGCCAAGGATAGCGGCTATGCAATTGGTAGCTATAGCGGATAGTCACCGTATGACCCTCTCCTGTTGAAGTGACTTGATAATCTATTAGTTGAGGTGCCGCATAACAAAAGCGTACCTTACTATTTGGTAATGAAGTAAAGTAAGGTTCTCCAAGGCTGGTCGTTGAAAGAGTGACCTGATCATCAAACTGCAGCAGGTTAAGGTAATGCTGATTAACAAGCATTAAAATTATTGGATTTTTTAATAGAACTTGCCTTGAACTTTCGCCAATGGGGATTGTGGTACAGCCAATATTACTTTGCTCAAGTTGTTTTTGAAGTTGCTGTTGAATCGCTTGTTGATTTAATGTACTCAGTGTATTTGCTGTAGGTGTAGCCGTCGTTGCTTTAGTCGCTGATTTTGATTGTTTATCGTTGTTTATGTATTGGCTTGCAAAGGCAACCACTAAAATAAGGATAA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106 | Staphylococcus_phage(21.74%) | transposase,integrase,protease,tRNA | attL 1499363:1499422|attR 1571366:1571976 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1678379 : 1768694
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039081|1678379:1768694|DBSCAN-SWA 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82 | Burkholderia_phage(14.29%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1779393 : 1829878
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039081|1779393:1829878|DBSCAN-SWA 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46 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1892141 : 1907457
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039081|1892141:1907457|DBSCAN-SWA 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15 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_22 |
1936130 : 1985002
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039081|1936130:1985002|DBSCAN-SWA 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43 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1989433 : 2038300
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039081|1989433:2038300|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2058000 : 2107535
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039081|2058000:2107535|DBSCAN-SWA 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41 | Burkholderia_virus(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_25 |
2122104 : 2181657
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039081|2122104:2181657|DBSCAN-SWA 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60 | unidentified_phage(14.29%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2200719 : 2248942
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039081|2200719:2248942|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2261791 : 2322759
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039081|2261791:2322759|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 2269644:2269703|attR 2320065:2320825 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2343601 : 2371254
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039081|2343601:2371254|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2410499 : 2482439
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039081|2410499:2482439|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2493171 : 2548800
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039081|2493171:2548800|DBSCAN-SWA 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53 | Burkholderia_virus(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2552795 : 2598810
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039081|2552795:2598810|DBSCAN-SWA 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50 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2608104 : 2671906
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039081|2608104:2671906|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(38.46%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2681408 : 2726565
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039081|2681408:2726565|DBSCAN-SWA 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MSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRGLEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP |
41 | Staphylococcus_phage(21.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2764343 : 2817372
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039081|2764343:2817372|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
2831938 : 2886199
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039081|2831938:2886199|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_36 |
2893785 : 2943942
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039081|2893785:2943942|DBSCAN-SWA 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43 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_37 |
3071625 : 3136874
Sequences of DBSCAN-SWA_37
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_37 >NZ_CP039081|3071625:3136874|DBSCAN-SWA 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56 | Hokovirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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