Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP039105 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
| NZ_CP039103 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 7 | 0 |
| NZ_CP039104 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP039102 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 37 | 0 |
| NZ_CP039106 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-118 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NZ_CP039105
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
32440 : 46235
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039105|32440:46235|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039105|32440:46235|45257_46235_-|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS >NZ_CP039105|32440:46235|40724_41510_+|WP_144420832.1|DBSCAN-SWA MAWRASATDTLCPLKDSRALNLFKAYALEQYPKEAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPTQLIDTPSGTLLIHSHPDGTVEPSLADMVGQRDTGLLWGIVALNQHAITDVIVFGEQLFTQQLLERPFLHGIFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTDASFIEVDKASPLHRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDRNAVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP039105|32440:46235|36290_36641_+|WP_017375781.1|DBSCAN-SWA MIEDIYFALLGTGWPVFPMVLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDNITEQLNGYHNENIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFHLTGVV 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17 | Moraxella_phage(18.18%) | capsid,transposase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
2. NZ_CP039103
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
0 : 117510
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039103|0:117510|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039103|0:117510|103073_106415_+|WP_051929623.1|DBSCAN-SWA 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120 | Streptococcus_phage(40.0%) | integrase,terminase,transposase,portal | attL 11253:11312|attR 117876:119611 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
123457 : 125079
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039103|123457:125079|DBSCAN-SWA GATGGCTTTATGGAAAAGAAAACCTAAAACTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATTATAAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACACTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAGTATTAATAATTCATGTGTGGTGGAGTTCAATTTATTCGCGACAATAAAATCATCAAAAGTTATTTTTTAAATCCACAAGCAGTACTGCCCGTGTTAAAAAAAGTGGAGATGTTGAATAAAAACATTTAAATCTAAAGTGTTACATAAAAATAGAGAGAAAACAATGGTGACATTAACCGTAACTGATATTCATGATTTAACAGTAATGCTAGGTATGTTAGAAGATATTTATCAATATGAAATCCCTGCGGCGCAACGAATTTTAAAAAAAATTGCTGATAAACCTGAATCTAAAAGCTATCACATTGTTCCAACAGGACTAAGTTCAGAAAAAAGTATACACTACGTAAATAAGTTAAGAGACTGAAGTATATATTTCATAGTATTTTTCTGCAAATAATATAATGGTTACTTCTCATTAAAAAAGTGCTTTTAATAAATTTTATTAAGAAGAATTAAAATGAAACAAAAAAAATCGATAATAACTGGGCTATTTTTTAGTTTTTTTATTGTGTCTATAAATGCGGTAGTACCAGCAAAGCCGATAAGTAAAGCGTTTCATTGTAATGGCTTTATGAAATATGGTGTTCCTGGTAAAACCGATCAGTATTTATGTCGTGAAGGATATAGTGTTGGCTATGACTATAAAACAAAACAGCCGAAGTGGGTTGCCTATCATTTAACCAGTCAAAGCGTTTCTAAACGAATTAAACGCCATGATGAGTTTAGACCAGATTCTGAGATTCCTTATAAATACCAAGCACAGCTGTCAGACTACAAGCAATCTGGTTATGATCGTGGGCACTTAGCCCCTTACGCTGCTATGGACTTTGATAAGAAGTCGGCGTCTCAATCCTTCTTATTATCGAACATGAGTCCTCAAAAGGCTGGTTTAAATCGGCAAGGTTGGGCGAAGCTAGAGTCAAATGTACGGTTTTGGGCCAAATATAAGAAGGAAGTGTATGTTTATACAGGGCCTATTTTTGAAGGAAAAAATATCAAAACAATCGGTAAAGGTAAGGTTGCCGTACCAACTGCATTCTTTAAAGTTATATTTGCACCTGAGAAAAAGCAAGTATTGGCGTTCGTAATGCCTAATAAGCGTGTTGCTAAAAATAAAGTTGCTGAGTATAGAACAAATATGAATCATATTGAAAAATTAACCGGGTTAAATTTTTTAAATCAATTACCTTTGATTGAAAGAGAAAACCTTGTTACAAAAACAGAAAAAATGTGGCGTACTCACTACAGTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039103|123457:125079|123457_123793_+|WP_017375632.1|transposase|DBSCAN-SWA MALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP039103|123457:125079|123987_124191_+|WP_017375836.1|DBSCAN-SWA MVTLTVTDIHDLTVMLGMLEDIYQYEIPAAQRILKKIADKPESKSYHIVPTGLSSEKSIHYVNKLRD >NZ_CP039103|123457:125079|124284_125079_+|WP_027243203.1|DBSCAN-SWA MKQKKSIITGLFFSFFIVSINAVVPAKPISKAFHCNGFMKYGVPGKTDQYLCREGYSVGYDYKTKQPKWVAYHLTSQSVSKRIKRHDEFRPDSEIPYKYQAQLSDYKQSGYDRGHLAPYAAMDFDKKSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKKEVYVYTGPIFEGKNIKTIGKGKVAVPTAFFKVIFAPEKKQVLAFVMPNKRVAKNKVAEYRTNMNHIEKLTGLNFLNQLPLIERENLVTKTEKMWRTHYS |
3 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
131449 : 133867
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039103|131449:133867|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAATCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCATGTGACGGAGGGCGTAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCATAAACACAATCATCTTATTCAGGACTTACGCATTGACAACAAAATCTAGTTACGCCCTCCGTCTTCTATTGGGTTCATATTTTCTAGTTCGCGAATATCATTTTGACTCATTACACCAATGCTAAACATGCGATTATAAAAAGAGGCGCGAGCGGCCGTATCACCGCGTAATAAGCCCTCAATATTAAATTTTACAAAGTATTTTTTACGCTCATGGGCAAGTAATAAGTCACGGCTAATACTCTGCTCGATTTTAACCAGCCAGGGCACCAAACTATGACGAACAAAGGCTAAATCTTGATGCTCAATATTTGAAAAAGTGGCGCGTTCTAAATCGGCAATCATATGCGGCGGCACCCGGAAAATGCCACAGATTTCATTGCGCTGGTATTTACGTGTTTCTAAAAACTGACTGTCTTCACTGCTCATGGTCAGCGTTTGCCATTTCAAGCCATTCTCTAAAACAGCCACCCCGTTCGAATTTTTACCGCCGTGGGCTTTTTTCCAAGACTCCGCTAAGTTTTCACGGCCTTCTTTTTTTAACTGGCCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTCTGTGGTTAAGATGCCGCTGGGGCGTGCACCATTACCGAATAATTGGGCGCCATGCGCTTGGGTTGCCGCAGATAAGCCGAGTGATTCGCGTTGTAAGGTAATTGGACTGCTGCCGATAATCCCGTCACTACCCATCGCATTCAGCCGCCACACTTGATCATCGCGGAGTTCATAGCTTTGACCGTTTAACATCGTGCTATAGATGAGCTTTTTTGTTTTTTCATCACGGCGCACCGTGGTGCTATCAGTGGGCAGTTGGATTAATTCACGCACTCGCCCTGCAGCATCGCGAATAACCTGACAATAAGCATTGCCACGTAGACATAAATGGCCCACAAGGTTTTCACGTAAATCAAAACTAGTCACTTCACCATTCGGTAAATCATGCAAGACAGAATATAACGGGTGATCTGTGGCCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039103|131449:133867|131449_132424_-|WP_048875857.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039103|131449:133867|133411_133867_-|WP_048876221.1|portal|DBSCAN-SWA MATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQVIRDAAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLIYSTMLNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDAASHGVLSTG |
2 | unidentified_phage(50.0%) | transposase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
138585 : 145553
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039103|138585:145553|DBSCAN-SWA TGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGTTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTTGGCTCGCAGCGTATGATGTTTTAATAAGATAAGCAATTAAAATAGAGGTCTGTGGGCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAAGTTTGAAGACCGTGGATACACACATTATATACAAACATGTTCTTTTGAAGGGAAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAACGACTCTTCAACCTCTTCCCTATTGTTCGAAGCATTTAATCTACTTTCTTTGAAAGTCTTAGGGCTTGCTATACCCGACACTATTCATTTAGTCCAAGATCAAGAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGGCTTTAAAGTTTATCGACTTTGCAGAAGATCTTGCAAGAATAAGCCTTACTCGACTAATTTTGGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGGAATATATTAATGACTAAGAGTCAGTTGATTTCTATTGATGTGCCATTCTTTGATCTTGCACCTGAATTCGTACCTAATAAATATCAAGATCATATTGAATTGTTTTCCGAAGTATTTCTGGATAAAAATTCACTTAGCCATTTATCTAAAAATGTAATCAATCATTTTTATAATAATATAGGATTAATAAGCTATAAGCTTTCTAGACTATATCTTGATAATGTAATTTCTGAAGTAGAAAAAAATGATTACCTAAAAAAATTAATAGGCAATATATCAAGCTTTTATGGACTTATTTCAATATTGAAAGAAAAGAAAAATCCTCACGATTCTCTCACGGACTCTGAGTATGAATTATACTTTGCAAATAGACTTGAGCATATCCAACAACTAAATACTATAGTCGTTGAACAGGATTTATCAGCCCAAAAAGATCATGTATCTGAAAATCTATTTTTCGATGCAAATGAACACTTAGAAAATATCGATACTTCTGAACTGCTATTTTTTGATGCAAAAGATACGTTAGAGAGTTGTTCCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCTAAATTAGTGTGATAGAGATCTGCTCCTCTTAAGTTCACGCCCTCTAAGTTAGCTTTATGTAAATTAGCTTCTCTTAAATTGGCTCCATCTAAATTTAAACCTCTAAGGTCAACTCCTTCAAGATTCCACCCATATAAGTTAATCACATCACCAGTTTCTATTGACTTTTGAATCGCTTTCTGTACATCTGCACGAGTTTTTTTTGTCATAATTTAATCAACGCTTTAAATTTAAAAAAAATTTATATAACAAATATTTAGATTTTACAATCTTAAAATTTTTTACCAATTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGACAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTAATTTAAGTTACGCTAATTTATCAAAAGCAAATTTAAGTAGTATGGGTTGGGGAAGTGCTATAGTTGCTGGAGCTGCTTATGGAGGATTTGTTGCTGCAATCTCCAAAAATATAGCAGGAATGAGCGTGGGAACATCTGTTTTAACTGGTGCAACAGTAGCTGCAATGGTTACATTCACTAAAAAACTTGAAGGCGCTAATGTAAAAGTTACAAATTTATTTGGTGCAAATTTATCTGGTGCAAATTTAACTCATACAAACTGTACGGGAGCATACTTTATAGATACAGATCTAACTAATGCGAAAGTAAGCAAAACTGATTTAAAATATGCGATGTTTTCCAAAATAAGCTTAGAAGGGACAGGTCTGAATTTTAAAGATTTAGTTGGCGATGCCACACCTAAATCTGAAGGCTTAATGGAGCTTCCTTCTGTAATTTACATTCCTAAAGTTACAGGCTCATATCAATATTACGAAAGAAATCACGGTTACTTATCTGCTCATTTGCCACAAGAAGAATCTACTTTGAATACACCAAGGCTATTTGAAGGTTCTCAACAGCAGGAATGTCAAGAACAATCATCAAGTGTCAATTTAACTCATTAAATTTCATATCCACGGACGTAAGCGTCGCTTGCTATAGACCTACGGTCTTTCGCGACTTCGCTCGGTTCTGTCTCAATTTGAGCTGATGGTATAATGCTGGTTTTTGTTTAAGGTGTAGTCATGATCAATTTCAGCGGCCGTCATTTTAAGAAAGACCTGATCATGATGGCCATTCGGTGGTACATCGCTTATACGTTGAGCTATCGTGACATCGAAGAACTTATGGCTGAGCGTGGTATTCAAGTTGATCATTCAACGATTCATCGTTGAGTTGTTGAGTATACTCCACAGCTAGAGGGACGATTTAAGAAGCGCTATAAGCACCAACCTGGGGCTAGTTGGCGTCTGGATGAGACTTACATTAAGATCAAAGGCCAATGGTATTATTTATATCGAGCCATTGATAAACATGGGGATACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAATCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039103|138585:145553|144824_145553_-|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039103|138585:145553|139455_140388_+|WP_144420837.1|DBSCAN-SWA MSELKNKEKFEDRGYTHYIQTCSFEGKKCYVKLSYKNDSSTSSLLFEAFNLLSLKVLGLAIPDTIHLVQDQESNKCIGYLTSEVILDKALKFIDFAEDLARISLTRLILGDNAATEDGNILMTKSQLISIDVPFFDLAPEFVPNKYQDHIELFSEVFLDKNSLSHLSKNVINHFYNNIGLISYKLSRLYLDNVISEVEKNDYLKKLIGNISSFYGLISILKEKKNPHDSLTDSEYELYFANRLEHIQQLNTIVVEQDLSAQKDHVSENLFFDANEHLENIDTSELLFFDAKDTLESCSGTVAKNLDLSRV >NZ_CP039103|138585:145553|140417_141146_+|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039103|138585:145553|143055_143676_+|WP_144420838.1|DBSCAN-SWA MQQCPNLSYANLSKANLSSMGWGSAIVAGAAYGGFVAAISKNIAGMSVGTSVLTGATVAAMVTFTKKLEGANVKVTNLFGANLSGANLTHTNCTGAYFIDTDLTNAKVSKTDLKYAMFSKISLEGTGLNFKDLVGDATPKSEGLMELPSVIYIPKVTGSYQYYERNHGYLSAHLPQEESTLNTPRLFEGSQQQECQEQSSSVNLTH >NZ_CP039103|138585:145553|141148_141421_-|WP_017377512.1|DBSCAN-SWA MTKKTRADVQKAIQKSIETGDVINLYGWNLEGVDLRGLNLDGANLREANLHKANLEGVNLRGADLYHTNLGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039103|138585:145553|138585_139314_+|WP_017377509.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPVHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039103|138585:145553|142271_143000_-|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA |
7 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
151588 : 152323
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039103|151588:152323|DBSCAN-SWA CTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGCCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATCCGTATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTTCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATTGACATTCACAACACCTGGTGATTTCACATAAGGTTGGCCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTGGCATTTTGATGACGACTGAGCATCCCATCCAAAGTATGACCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGGAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGTGATTTCAGCTCTATACTCATGAACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAAGCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAACGGCCATACCAACGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAATAAGGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTAGCCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039103|151588:152323|151588_152323_-|WP_027243210.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKPYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYRAEITKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDGMLSRHQNAKAALRFFKKAIGQPYVKSPGVVNVNKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAIRMVQKGQLRYIKKQDICGQNQLIDKLFGLAASF |
1 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
155540 : 160533
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039103|155540:160533|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039103|155540:160533|155540_156515_+|WP_075275471.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYQHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPRTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039103|155540:160533|157286_158015_-|WP_048876214.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039103|155540:160533|158523_158877_-|WP_017377521.1|DBSCAN-SWA MYKDSHKVIGYFSYSEEGDVFCDKDACVISGSSESLHGYIDAMLPDRETSGIVKKTRFEEIMQGISRGAAYAFDQESYTRFLPLAEKNGMSDLPALSEFEKHQPEENTPQFIRISQS >NZ_CP039103|155540:160533|157150_157318_+|WP_155046640.1|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILALLRKIIVSFRKVIFLCSLLRIKQLIQIIYQ >NZ_CP039103|155540:160533|159804_160533_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA |
5 | Streptococcus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
166896 : 172799
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039103|166896:172799|DBSCAN-SWA TATGTTAGTTTTAACACGTAAAAGCGGACAAGAAATTTTTGTCGGTAAAGATATTACTATTAAGGTTTTATCTGTAGTAAATGGTCAAGTAAGAATAGGCATTGATGCGCCTCAAGAGGTACAAATACAGAGGGATGACGTTAAGAAAAGACCGGAGTTGATTAAAGCTGTTGTGTGATTAAGGGCTTCGGCCCTTTTTTCTTAAGAGTGAATAAGAAATATTTTTAATTTGGTTTAATTTTTTTCTGAGAATGAGTGATACTATTAGTAGAAATTTTAATGCTGGGGAAATAAATGCCAATTGTTCAAATAGCAAATTCTAAGGGTGGAGTTGGAAAGAGCACAATAGCGTGTAATTTAGCAACAGCACTTGTTCATGCTGGTTTTTCGGTTGTTATAGCTGATTGTGATCCCCAGTTTTCTTCTTCAAGTTGGGCAGATGAAAGGCAAGACAATGGTAAGTTGCTTAATGTTGATATAGTGCAAAAAACAGGCAAGATTATCCCAGCACTACGGCAGTTAACAAAAAAATATGATTTTGTAGTTGTAGATACAGCAGGGCATGATTCTGTAGAAATGCGTGCGGCTTTAACTGTTTCTGATTTAACTATTGTCCCTTTTAAGCCAAGCCAGCTTGATATTGATGTGCTAGGGGCTATGCAAGAGTTAATAGAAAATGCACAAGATGCTGGAAATGATAAAATGCAGGTTGCTTGGATTATTAATATGGCGGCACCCAATCCACGGAGTAAGAAGCTAAAAGAAACTCAAGATGCTTTGAATGATGCAGAGGGCTTTAACCTTCTTAAGTCTGTCTTACATAATAGGGATGCTTATGTAGAGTCTATGTCTGAAGGTTGTGGTGTAGTCGAATTGAAAGATAAAAAAGCTAAAACTGAGATAGAAGCTTTAGTTAAAGAAGTGTTGAAATTAACGGGCAAGAAGGCAGTGCGTCATGGCATTAAAGCTAAAAAAACAGTCAAAGCAAAAAAATCAGCGTAAAGCAAACAAGAACGATTTTATATACGCTTTCAAAGGAAGTGAGCACCTAAAAGAAAAGTTCGACAGTGGTGATAAGTGGGTAGATACAGAGCAGTGTTACATTGCCGAGATTAAAATAGACCGTAAAACTAAAGATCAGGACTACCTTAATGAACTTGCTGCATCCATGAGCGGCAAGAAACAAATTAATGCGGCGATAGTTCGTAAAGCAAAGGATGGTCGTTATGAATTGATTAACGGTGAGTGTCGTTATGATGCTGCAAAAATCAATAATGAGCCTTTGCTTGTTCGGGTTGTTGATTATGATGATGATGAAGCAATCGGTGCCATCATTGCTGAAAATGACAAGCGTAAAGATTTGTGTGACTACGATAAAGCCTTAGCATATCTTGAGTATAAAAGTGATTTGAGTATTCGTGCATTTGCGGAAAAATATAATCTTAACAGAAACTATGTTAATCGACTTTTTAAAGTTGATAAGATACCTGAGTCAGTTGTATTGGCCCTACCTATGATTGAATTGAGTGCATCTCAATTTGAAGAAATTGCTATAAGAATCAAGGATAATCAGCTTTATACCGACGTATTTATAGAGCTTGCTCCACTACTGTCTCAAATTGAGACACCTGTTACATGGAAAGACTTCTTAAGCCGCATAGACCGCAAGGTTAATCCACCAGAGAAGCAGCCTCAAAAGAAAATCGAGCGCTATGTTTTCAGCTCTGAAAAAGCTAATCTGAGATACACAGATAGTGGCTTTATAGTGAAGTCCGAAAAGCTCACACGAAAGCAAAAAGAGCAAATACAAGAAGCGTTAGACTCGATTTTATAATGTAGGCCCAGAGGGGCCTTTTTTTAGTTCTTATGCTGTTCGCTCCCAGACAATCACACCAGAACGGGCAGGGTCGAGGTCGTGAGAGTGCGGTTTTCCGCCGCCAGTATTGAATGTGTAGTCATTGCTTTTATTTGTTGTTGTTGGCGTAACTACTCCAACATCTGCGCCACCTCTTTGAATTGCTGACTCGTTCGGAATTCCGTGATTGTGCTCGGGCATTTCATCAATAGAAAGAGTGTGATCATTTGTTCTTGTAGAGCCTGCTTTTGCTCCGGCATCTATTGTAAAGTTACTTGAGCCTGCGACTGTAAGTAAGCGGCCGGCATGGTCTGCATCGATGTCAGTGATTTTTTTCCAAGTTGCCCCTTTTCCTTGAAATGGTGGGATATAGTTTTCGTCAAAAGTTAGTTCTATCTTTCCGACCGGGTAGAGTTGATCTATGAGTAGTTCGATTTGCAAAGAGCCGTCAGCGTTTTGTTTCCGGCTTAGTGTTTCACTTTGAATCGAGTCGGGTGTGTTATCTATGCGATTCCACGATGTCCAGCCAGAGCTTTCTGTATAGATACGCACAAAAGTAGGGGATGTGCCGTCTACGGCTAAGCCTGTGATGGTCTGTGTTAAGTCAGGCGAATTAGGAACACGAACAACGTTAGCCGTCCACCAATGATCTTTTGTAGTTTCTAAGCTGGGTGAGTTTTTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGCCTTATGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACGGCACTGTTGCGAAAAGTTATCGTGAGTTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTAGCTACCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCGCAGATATCCTGCTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAATCATACGCATTGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGAAAACGGGATTTGCGCTTTATCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTATTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGTTTATCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCTATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCAAGGCCGCTTTAGCATTTTGCTGACGACTGAGCATCCAATCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATCGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTAACCAGCGTTTCATCCAGCCGCCAAGAGGCACACGTTTGGCGAAAGTGGGGCCGTAACCGTTTAGCGATTTCAGGTCCATATTCATGAACCCAACGACAGATTGTTGAACGTTCAAGCTCAAGACCTCTTTCACCTGTCATTTCTTTGAGGTCACGATAAGACAAAGCATAGCGGCCATACCAGCGCACCAACCAAAGAATGATCTCACCAGAGTAGTGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTTTTAAATCGTTTACGTCTAGCCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCCTTACGACCAAACTTTATACCTTTTTCTCTGGCTATTCTGATTCCATCAGCTTGGCGTTCCTTGCGTATATTATTTTCAAATTCAGCAAAAACGCCCAATAATTGATACATCATTTTACCTAGTGCGCTGCGTGTATCTATTTTTTGGTCTAAAACAATCAGATTTACATCAGCAGCCATCAAACCTTCGACGATTTGGTTTAAATGAGTATTTGAGCGTGCAAGGCGATCAAGTTTAGTCACAACCAAAGTATCTTCGTCACGTAAATAATCTAAGCAATTTTTTAGCTCTTTACGGTTTTGGTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039103|166896:172799|166896_167073_+|WP_075275473.1|DBSCAN-SWA MLVLTRKSGQEIFVGKDITIKVLSVVNGQVRIGIDAPQEVQIQRDDVKKRPELIKAVV >NZ_CP039103|166896:172799|167850_168729_+|WP_048876212.1|DBSCAN-SWA MALKLKKQSKQKNQRKANKNDFIYAFKGSEHLKEKFDSGDKWVDTEQCYIAEIKIDRKTKDQDYLNELAASMSGKKQINAAIVRKAKDGRYELINGECRYDAAKINNEPLLVRVVDYDDDEAIGAIIAENDKRKDLCDYDKALAYLEYKSDLSIRAFAEKYNLNRNYVNRLFKVDKIPESVVLALPMIELSASQFEEIAIRIKDNQLYTDVFIELAPLLSQIETPVTWKDFLSRIDRKVNPPEKQPQKKIERYVFSSEKANLRYTDSGFIVKSEKLTRKQKEQIQEALDSIL >NZ_CP039103|166896:172799|169573_170278_+|WP_048876211.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTALLRKVIVSFRKVIFLC >NZ_CP039103|166896:172799|170289_171018_-|WP_036772541.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039103|166896:172799|168759_169191_-|WP_144420840.1|DBSCAN-SWA MQIELLIDQLYPVGKIELTFDENYIPPFQGKGATWKKITDIDADHAGRLLTVAGSSNFTIDAGAKAGSTRTNDHTLSIDEMPEHNHGIPNESAIQRGGADVGVVTPTTTNKSNDYTFNTGGGKPHSHDLDPARSGVIVWERTA >NZ_CP039103|166896:172799|171047_171437_-|WP_051929563.1|DBSCAN-SWA MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLDLSMV >NZ_CP039103|166896:172799|167189_167897_+|WP_027243191.1|DBSCAN-SWA MPIVQIANSKGGVGKSTIACNLATALVHAGFSVVIADCDPQFSSSSWADERQDNGKLLNVDIVQKTGKIIPALRQLTKKYDFVVVDTAGHDSVEMRAALTVSDLTIVPFKPSQLDIDVLGAMQELIENAQDAGNDKMQVAWIINMAAPNPRSKKLKETQDALNDAEGFNLLKSVLHNRDAYVESMSEGCGVVELKDKKAKTEIEALVKEVLKLTGKKAVRHGIKAKKTVKAKKSA >NZ_CP039103|166896:172799|172190_172799_-|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039103|166896:172799|171459_172188_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
3. NZ_CP039106
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
3373 : 19395
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039106|3373:19395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039106|3373:19395|12830_13016_+|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI >NZ_CP039106|3373:19395|5704_5965_+|WP_027242955.1|DBSCAN-SWA MNNKHRKTLRDIFHNPIKASIVWADIEKLLLALGAEVIERDGSRVAVILNQVKTTFHRPHPEKTTDKGAVKSIRLFLKNAGVDKNA >NZ_CP039106|3373:19395|13035_14010_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039106|3373:19395|6487_7462_+|WP_069971681.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MKTKIYLHGRLGRICGPFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP039106|3373:19395|15496_16471_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039106|3373:19395|9196_10171_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039106|3373:19395|10796_11663_+|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG >NZ_CP039106|3373:19395|14534_15116_-|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG >NZ_CP039106|3373:19395|5957_6311_+|WP_016211078.1|DBSCAN-SWA MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR >NZ_CP039106|3373:19395|4883_5474_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP039106|3373:19395|8742_9099_+|WP_080963620.1|DBSCAN-SWA MAYMLRYKGYAAVVNFDDHDKILHGEILNIRDMVTFECEDLQGIELAFHNAVDDYVAMCKEKGRTPNKPYSGTTNLRLGTVLHEMCALAAAENDQSLNDWIIQQLNNSLHENNNASKN >NZ_CP039106|3373:19395|12345_12828_+|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP039106|3373:19395|16544_16760_+|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039106|3373:19395|7994_8360_+|WP_027242954.1|DBSCAN-SWA MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA >NZ_CP039106|3373:19395|14106_14499_+|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA >NZ_CP039106|3373:19395|3373_4348_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039106|3373:19395|11875_12259_+|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV |
21 | unidentified_phage(35.71%) | terminase,head,transposase,capsid,tail,integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
4. NZ_CP039102
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP039102_1 | 1525909-1526019 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039102_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039102_1
>1.1|1525936|57|NZ_CP039102|CRISPRCasFinder GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039102_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039102_1 >merge|NZ_CP039102|1|1525909-1526019|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA >NZ_CP039102|1|1|1525909-1526019|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA
>NZ_CP039102.1|WP_144420682.1|1525050_1525212_-|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039102.1|WP_155046588.1|1524306_1524516_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP039102.1|WP_027243099.1|1521877_1523191_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP039102.1|WP_027243098.1|1520496_1521642_-|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP039102.1|WP_027243097.1|1520245_1520431_-|hypothetical-protein MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP039102.1|WP_027243096.1|1519577_1520210_+|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP039102.1|WP_144420683.1|1518744_1519401_-|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP039102.1|WP_027243095.1|1516470_1518756_+|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP039102.1|WP_017376797.1|1515837_1516197_+|hypothetical-protein MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG >NZ_CP039102.1|WP_017376798.1|1514920_1515556_-|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN >NZ_CP039102.1|WP_017376785.1|1526618_1527524_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP039102.1|WP_027242578.1|1527986_1528523_-|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP039102.1|WP_027242577.1|1528540_1529842_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP039102.1|WP_048876008.1|1529838_1530813_-|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039102.1|WP_144420681.1|1530856_1531042_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP039102.1|WP_155046590.1|1531221_1531386_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP039102.1|WP_036774017.1|1531387_1532263_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP039102.1|WP_144420680.1|1532578_1533499_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP039102.1|WP_017375696.1|1533514_1533898_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ >NZ_CP039102.1|WP_144420679.1|1534224_1535181_+|IS3-family-transposase MPAKESKATADGERNFKKGECLLRERNEVKFNFIRKNKVLYPINLTCKVMKVSRSAFYAWDKRPAKVISIEELQLYRRCKELFKESRGSLGSRMMAYKLQEEGFQVGRYRARSLMQKLGLKVLQRKAYKVTTKRKHHHAVADNVLNQQFNPVIANHSWAGDITYLRTAEGWLYLAVVIDLYSRKVIGWAMNKRMSENLVCRAMDMAIHLRQPTEHLLFHSDRGSQYTSKKYRKLLKKHKITASMSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP039102_2 | 2093574-2093669 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039102_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039102_2
>2.1|2093598|48|NZ_CP039102|CRISPRCasFinder GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039102_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039102_2 >merge|NZ_CP039102|2|2093574-2093669|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG >NZ_CP039102|2|2|2093574-2093669|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG
>NZ_CP039102.1|WP_017378007.1|2090571_2092515_+|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP039102.1|WP_048875961.1|2089022_2090426_+|IS4-family-transposase 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>NZ_CP039102.1|WP_017378003.1|2082765_2083596_-|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP039102.1|WP_036773465.1|2080739_2082779_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA 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>NZ_CP039102.1|WP_017378009.1|2094328_2096074_+|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP039102.1|WP_144420648.1|2096476_2097949_+|hypothetical-protein 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
31805 : 91601
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039102|31805:91601|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
123083 : 241151
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039102|123083:241151|DBSCAN-SWA 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106 | Staphylococcus_phage(12.5%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
314954 : 357313
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039102|314954:357313|DBSCAN-SWA 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54 | Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
366736 : 421649
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039102|366736:421649|DBSCAN-SWA 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60 | uncultured_Caudovirales_phage(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
451086 : 499225
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039102|451086:499225|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
504029 : 558712
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039102|504029:558712|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
590503 : 723897
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039102|590503:723897|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039102|590503:723897|633333_634038_-|WP_026063593.1|DBSCAN-SWA MSIHIDANNEQIADNILLPGDPLRAELIANEFLENTECYNKVRGMLGFTGIYQGKRVSVQGTGMGMPSMSIYAKELLDDYQVKKLIRVGTAGALQAHINMGELILAQGACTDSHINQLTFQSIDYAPIASFNLLCRAHQAAQTSQKICHIGNILTTDRFYVEDQPLYNTLKEHGILAVDMETAALYTLAARYQAQALAIMTISDQLITGERASSEQRQHQFLDMVETALNCFVD |
111 | Staphylococcus_phage(13.64%) | tRNA,transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
732539 : 778841
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039102|732539:778841|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(21.43%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
787001 : 841312
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039102|787001:841312|DBSCAN-SWA 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49 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
884992 : 947786
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039102|884992:947786|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
951688 : 1018651
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039102|951688:1018651|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1024264 : 1159013
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039102|1024264:1159013|DBSCAN-SWA 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115 | Staphylococcus_phage(17.39%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1165138 : 1214687
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039102|1165138:1214687|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
1230929 : 1278653
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039102|1230929:1278653|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_15 |
1302472 : 1343682
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039102|1302472:1343682|DBSCAN-SWA 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MAIVDQIPKSRIKIHYQTEVNGKKKDKELPFKLLVIGDLSLGSSKDRQVDLDEREVREIGANASLDSLMGDMEMSLKIDVDNKINPSGQSEISVDLPINSMKSLRPESIAKEIPEIQSLLIMKRMVKELESYVDNNKKFRGAILDLMKNKEQLKSFKATLPELEKFKV |
37 | Enterobacteria_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_16 |
1374899 : 1428633
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039102|1374899:1428633|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_17 |
1447568 : 1507478
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039102|1447568:1507478|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(17.65%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_18 |
1529838 : 1572135
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039102|1529838:1572135|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(30.0%) | protease,transposase,integrase | attL 1551179:1551238|attR 1561640:1561930 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_19 |
1582129 : 1613950
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039102|1582129:1613950|DBSCAN-SWA 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30 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_20 |
1672285 : 1762600
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039102|1672285:1762600|DBSCAN-SWA 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82 | Burkholderia_phage(14.29%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_21 |
1773299 : 1823784
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039102|1773299:1823784|DBSCAN-SWA 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46 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_22 |
1894140 : 1902983
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039102|1894140:1902983|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039102|1894140:1902983|1894140_1894362_+|WP_017378288.1|transposase|DBSCAN-SWA MKDKKQYKRYSTAFKEEAVALVTEQGYSAQQAADAVGVRTNMIYRWKDQHDKEANSTLTPDENALRHLKCNTQ >NZ_CP039102|1894140:1902983|1901579_1902983_-|WP_048876031.1|transposase|DBSCAN-SWA MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP039102|1894140:1902983|1895754_1896390_-|WP_048875973.1|transposase|DBSCAN-SWA MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP039102|1894140:1902983|1897478_1898240_+|WP_144420658.1|transposase|DBSCAN-SWA MYNLIRLLTSSDYCAKVRFCSDLALKVVPLAYKLQEEGFQVGRYRARSLMQKLGLKVLQRKAYKVTTKRKHHHAVADNVLNQQFNPVIANHSWAGDITYLRTAEGWLYLAVVIDLYSRKVIGWAMNKRMSENLVCRAMDMAIHLRQPTEHLLFHSDRGSQYTSKKYRKLLKKHKITASMSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT >NZ_CP039102|1894140:1902983|1898216_1899206_-|WP_075275303.1|transposase|DBSCAN-SWA MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKLFWSSHIGHF >NZ_CP039102|1894140:1902983|1900924_1901131_+|WP_017378292.1|DBSCAN-SWA MDSKNFNGISEQFKELSKLSQLNCHSLTTDLRLILLQLERRINEKNITLTEAYTLINQAEYIIEASLR >NZ_CP039102|1894140:1902983|1894420_1895395_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039102|1894140:1902983|1900235_1900895_+|WP_027242792.1|DBSCAN-SWA MNFMMYWHPIADIIQKTEELKHSNQLSKEQYMESLVCSRHAIRKTSKKLKEYLDSKFNSRISYLIHFPILAYFDEAVNSANQYKDVQWPLLQQEFYNTTNGGEDFFIALDDALQQNCTPAVYEIFFFLLKSGFKGQLIDDEIKRDDYIKQLEVNLKEQDNYQDTTTKELIDLSSIKASEEIITKMIKHNPLRHIKQYLFFYTGSLILFIYFVYLSILSF >NZ_CP039102|1894140:1902983|1901136_1901583_+|WP_047927801.1|DBSCAN-SWA MNNFFTYLNNPIIIGAIGLGIFYLCFQIVRRLYSLLKRFKPKNSKFQLSFNIKRNPYKKIIKQFKSKLPFIIRLSLARRQKYLYLNTANDSLIQELTDYKRYSYHFYDEYKQQPEMGVYLTSKYFITEVKNEPLHNHSKENNRLMALP >NZ_CP039102|1894140:1902983|1895593_1895758_+|WP_155046582.1|DBSCAN-SWA MKVSRSAFYAWDKRPAKVISIEELQLYRRCKELFKESRGSLGSRMMAYKLMALP >NZ_CP039102|1894140:1902983|1896666_1897446_-|WP_155046602.1|DBSCAN-SWA MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIIRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP039102|1894140:1902983|1899341_1900217_+|WP_017378290.1|DBSCAN-SWA MNFPELSNFINIYFNQLPTFEIDRIKINIKLNQQNKNNISSTLSQEFYINTIPFTNTSSEHALPIDVQGFRETYPIIHPNIQGKFQLSAIKKAYYKEHGKTIDLLPKHLTADNLPSYELIQQFTGEGYSELRFHFYENLIQPRTVFIDADWFQLDHFRISDLKLSFYNRSEDYFKIKPVSSQPTILSNERLKVTELIELANIKNHRIIKYDDLKLIISSLVPKHSIFHKAIQHIENISVINNNNFYNYSIETFSLIPEQKVVLQILLSHIQCLLQQLLPVGSQIKLSLKSN |
12 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_23 |
1908052 : 1970388
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039102|1908052:1970388|DBSCAN-SWA 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51 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_24 |
1977545 : 2040299
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039102|1977545:2040299|DBSCAN-SWA 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55 | Klosneuvirus(18.18%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_25 |
2059999 : 2109822
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039102|2059999:2109822|DBSCAN-SWA TATGAGCAGTGTCGGTGCTTGCGTTGACAATGCGGTTGTCGAGCGTTTTTTTGGCAGCCTAAAGCACGAATGGCTGTTGAATGTGATTCACTTAACCCGTGATACTATGAAGGAGGATGTTGAGGCCTATATTCGATATTACAATCATGATCGGTTGCATACAGCCAATGGTAACCTATCGCCTATTAATTTTGAAAAGTCTCAATTAAAAGTGTCCAATATGACTTGACCAGAACAGGACTTCATAACCAATGTTTCAAAACCAACTACCCTTTAATAAGCTAATCTCTAAATAATCTCACCGTAGGAGTAGCCAAGATGAAACGTTTTCAACAGCTTATTGCTATAGTCAGCATGATCATCTTCAGCTTTTCTAGTTACGGCCTAGAAAAATTGCGTATCATGACTGAAGACTACCCACCTTTTAATTATCTTGATAAAGATAAACAGCTTAAAGGCTATGCCGTTGAATTGCTTACTGAAGTTATTAAAAAAATTGATGCTCCCCAAGATATAGCCGCTATCAAAGTCGCCCCATGGGCACGTGGTTACTCTCAAGCGCAAAAACCTGGATTAAAGAACATGCTATTCGCAACAACACGCACTGAGGAACGTGAAATTCTGTTTAAGTGGGTAGGCCCAATTGCTCAAACTAAAATTGTTGTCTTCGCCTCTACAGATAACCCCATTACTATTAACAGTGCCGAAGACCTAAAAAAATATAAATTTGCGGCAATTCGGGGCGATATCGGTGCTATTTTACTAGGCAGCAATAAGGTACCCACTGCAAATATTCATCAGCTTAATAAATTTAGTTTATTAACGCGCATGGTTGAGAAAAAACGTGTTGATATGTTCGCTTATGAACAAAGTGGCGCGATTGACTTGATGAAGAAAAATAATATTGATACAAGCAAGTTTAAAATAGCTTATGTCTTGAAAAAAGGTGAGCTATATTATGCATTTAACCTTTCTGTCGATGAAAAAACCATTAACGCCTATCAACAAGGCCTTGAAGACGTTAAAAAAGACAGTATCTTTATCAAAACAATCACTGATAAATATTTAAAATAAAACTTCAACTGACTGGGCTAGATTACTCTTTAATCTAGCCTAATTTAATAATACATATCATTAATAAACTGCAGGGTTAAGTAACTTAACACCGGCCTATATATCTAAAATCTATATCGTAAGTGACAAATGCTAGAAAAACGCCGATACTTTTAACACAACATTCAAGCGTTGACCTTTGATCTTTGATCTTTGATCTTTGATCTTTACCAAAATATTCGTTAGATGAAAATAAAGAAACCCGCCATCAAGTACACCTAGCTACCGGACTTAAATATATAATCATACTAACAGCAACAGTAAGTATAACTAACTTGCTGAAACTATAGAGGCAAGATACACTGTTGGCATAAAAACAGGCTCTTATTCCTAAGACATAAACACAAAAAGACCCTGATCAAGGAGTTGGTTTAATGACGCATAATTATGCTATCTTGCAAACAAGTAGTGCAAGTTGTCCTGAAGATTTCTATCATGCCCCATGCTTAACAGAGGTCGTCAACCTTGATACTCCTGCTGTTGAGGCTTTCATTGATTTTAAAAACAATCCGCCACTCTCGATTTTTGCCGACGCCAAGCTCGATGATGCAATCAAGGAAGCGAACTACTCAGTCGCTCATACCCTTATCGTTAAAAATCAAGATATTAAAATGCTTGGTTTGGTTTCTTCTCGCCAATTACACGGTGAGTTGCCAGTGCGAATTAGCCAAGACCGTGGCACACCTCGTTCCAATATTGCCGTTAACCTCGTCATGTTCCCCATTGAAGAATTATTATGTATCGACTATAAATTAATCACAGGCGCACGTGTTGGCCATATCGTTGACACACTACACGACAAGCGGACCCCTTATCTTCTCGTCCGTGATAACGAGAAACCCCATATTATTCGTGGCATGTTTTCAGCGTGGCAACTTAGCAAACAGATCGGTACACCCAGCGTTGCTAATCACCTCTCTGAAGCATCATCTTTAGCAGAGCTTAGTCGCATTAGCCGCAGAAGCTCTTAATTTACTTCACTTTTTGCTCCTGCACCCTCACTCCATTCAATGCTATACTAAGCGCTTAGGTTATTCTAGGAGCTAGTCGATGAAAGAATGGGGTATTAAAACACGTGTCACCCTGCTCACCCTCGTCCCAACACTGACCATATCAATTTTGCTAGGCAGCTACTTTATTAGTATTCGCTTGCAATCTTTAGAGCAAACATTGCAACAACGTGGTAATGCCTATATCAGTCAACTATTACTTGATACACAAGCACGTTTACTAACTCACCAAGGTTCACTCAAAGAAGTGACTGATGCTGCTGTTACCTATAGTGATGTCGAAGGTGCCTCAGTCTTTGATAGCAACGGACACTTACTCGCTCACACGGGTAAAAATATTAACCTTGATGATATGGAATTATTCTCACCCAATACACTCAGTCATCTAGAACAACGCACCATGACTAGCGGCACCAATCTTGTTTTTCTTGTGCCAATCACACCCAATCATGCAAGTACCAGCTATAGCAACACCAAACCAATTGGCTGGCTCGCATTACAAATGACACGTATTCCGACCATTTTAAACCAATACCAAACTTTTTTTGTTACTTTGTTTATCATCTGCATCGGCTTAACGATTAGCGCACTCTTTGGTTTACGGCTTGGCAAAGATGTCACCGATCCTATATTACAACTGGTCAACGCCATTAAAAAATTAAAAGATGGCCAGTTTGACACACGGGTACATACCGGTTCGGGTGGCGAACTAAAAGCTCTAGAAACTGGCATCAATAGCATGGCTATCTCGCTTAATCGCTCTCATGAAGAGCTACAACAAAGTATCGAACAGGCCACCGCAGATCTTCGTGAAACACTTGAAACCATCGAAGTACAAAACATAGAGTTAGACATCGCAAGAAAGCAAGCCCTAGAAGCCAGTCGTGTAAAGTCTGAGTTTTTAGCCAATATGAGTCATGAGCTACGTACTCCACTCAATGGCATTATCGGCTTTACTAACTTATTGCTCAAAGCCAAGCTCACAACACGCCAAGCCGATTACACCTCAACTATCCATCGCTCAGCAGATCGTCTACTGCGTATTATTAATGACATTCTTGATTTTTCTAAGATCGAAGCCGGCAAAATGCAGCTTGAGCCCCATATGATGGCATCGCGTGATTGCTTTGAAGAAGCCTTAATGTTACTTGCTCCAAGCGCCCATGAGAAGCGTCTAGAGCTTGCATTTATCATGTATAACGATGTCCCCAATCAGATTATTGCTGACCCCCTGCGTTTAAATCAGATCGCAACTAATCTGATTGCAAACGCAATTAAATTCACTCACAAAGGACGCATAGTCGCCCGTCTTTCTCTGGAAGATGAACAAGATAATTACGTCACACTATGCTTTGAAGTTGCAGACACCGGTATCGGTCTTTCAAAACAGCAACAACGCAATTTATTTCAAGCCTTTACTCAAGCAGATGCAAGTACCACGCGAAAATACGGTGGCACTGGTCTCGGCCTTGCTATCTGTAAACGCTTAGCAGAGCAGATGGGTGGCAATATCAACGTAAGCAGTGAAGAAGGACAAGGCGCCAGATTTTGGTTTACATTTAAAGCTAAACGCGTCACAGAAATGCCATCTCAACCGGCGCTATTTATCAACAAACACGCATTACTTTATGAGCCTTATGAGGCTACTCGAACATCCCTACGCCATTTATTACAGTTATGGGGATTTCAAGTGACCTATACCGAGCACTTACAACGCTTAACCGCATTGGCCCAAGAGATGCAAGCCGATATCATCCTCATCGGTACCAATACAATTGAAGAATCAAGAAAATTACAAAAAGAAACGCTACCACAAATCAGTCGCTCTTGCCAAAGTCCTATTATTCTTCTCGCCAACTGCTCAGAAGAAATGCTCTATAGTAGTTCAAAGCCGATTGAAGCCTCGGCATTGATTGCCAAACCTATACGTCATCTTTATTTACTACAACAAATTAGCGCTTTGTTAGACTCAGATAAAGAACAACCTCCTTTGATCAAATCAAACCGCGCTTTACAACTACCAACCCCCACGGAATATCATAATATTCATATTCTTGCTGTCGATGATAATAGTGCAAATTTAAAGCTAGTCTCTACATTATTAGAACAAATTGGCGTGCAAGTCGCTACTGCAACCAATGGTATAGAGGCCATCGAATTATTTAAGAAAAAGCACGTTGACTTGATCTTAATGGATATCCAAATGCCTATTATGGATGGCATACAGGCCTGCAAAGAAATCCGCAAAATTGAAGCTCCCCTGGGCAAGCATACCGCAATTGTTGCCTTGAGTGCTGATGCAACAGACCATAAAGAAATTATGGCTGAGGCTGGCTTAGATGACTATCAAACCAAGCCCATTAATGAAAATCAACTCAGAGCGCTGATTTCACGTTGGACAGGCACGGATATTAAAACTCATTCAGCCACCTTCTTCTCCACTTATCAACCGATTGAGCATAGCTGGCCTAGCCTTGAGCATATTGATATTCATGAGGGCATTAAACTCACTAGTGGTAGTGAAGCGCTTTTCTTTGAATTGCTAGAATTACTCATTAAACGTTTACCTGAAGATCTTCAAGCCATCAAAACAGCTTTCAATAATCAAGCTTTTGATGAACTTAGCCACTGTGTTCATAAACTTCATGGTGCCAGTTGTTACTGCGGAACACTAAAATTAAAAACAATCTCAGCCGAACTAGAAAAACAGCTGAAACACACCCAAGAACATCATCAGCTCGAGTCTGCTATCAACCAGCTCCTCACTGCCATTCAAGGTGTTTTAAACGATGCAAAACAACTTACAATAAAACACCCCAATTATTTCAATAGTAAGGCATCATAGCCAACTCATGGTCAAGATGAAATGCGGCCATA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42 | Burkholderia_virus(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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| DBSCAN-SWA_26 |
2124391 : 2173085
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039102|2124391:2173085|DBSCAN-SWA 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50 | unidentified_phage(15.38%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_27 |
2180030 : 2237548
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039102|2180030:2237548|DBSCAN-SWA 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51 | Burkholderia_virus(18.18%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_28 |
2244353 : 2325046
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039102|2244353:2325046|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 2271931:2271990|attR 2322352:2323112 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_29 |
2345888 : 2373541
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039102|2345888:2373541|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_30 |
2412786 : 2446523
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039102|2412786:2446523|DBSCAN-SWA 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24 | Burkholderia_virus(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_31 |
2481974 : 2585773
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039102|2481974:2585773|DBSCAN-SWA 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101 | Bacillus_phage(18.52%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_32 |
2600698 : 2654682
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039102|2600698:2654682|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_33 |
2669359 : 2726487
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039102|2669359:2726487|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(30.77%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_34 |
2767494 : 2820522
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039102|2767494:2820522|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_35 |
2835088 : 2889349
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039102|2835088:2889349|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_36 |
2896935 : 2946593
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039102|2896935:2946593|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039102|2896935:2946593|2920099_2920387_+|WP_016210632.1|DBSCAN-SWA MTEDTSKNTRIVIEGVTHEGKTFRPSDWAERMSGALSTFRDKRIIYSPMLQPAVKDGNKCIILDESLKESNPELYRYILEFAETNRLKICPAEDD |
43 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_37 |
3074275 : 3139524
Sequences of DBSCAN-SWA_37
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_37 >NZ_CP039102|3074275:3139524|DBSCAN-SWA 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55 | Hokovirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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