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DBSCAN-SWA_1 |
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58 | Streptococcus_phage(47.37%) | transposase,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
57501 : 183403
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039113|57501:183403|DBSCAN-SWA 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120 | Streptococcus_phage(31.67%) | portal,head,integrase,capsid,tail,transposase | attL 70525:70584|attR 122790:123304 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
2917 : 16713
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039115|2917:16713|DBSCAN-SWA 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18 | Moraxella_phage(18.18%) | capsid,transposase,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3315 : 19337
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039116|3315:19337|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039116|3315:19337|11817_12201_+|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP039116|3315:19337|16486_16702_+|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039116|3315:19337|10738_11605_+|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG >NZ_CP039116|3315:19337|6429_7404_+|WP_069971681.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039116|3315:19337|9138_10113_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039116|3315:19337|4825_5416_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP039116|3315:19337|17505_18021_-|WP_027242945.1|DBSCAN-SWA MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS >NZ_CP039116|3315:19337|12772_12958_+|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI >NZ_CP039116|3315:19337|14476_15058_-|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG >NZ_CP039116|3315:19337|8684_9041_+|WP_080963620.1|DBSCAN-SWA MAYMLRYKGYAAVVNFDDHDKILHGEILNIRDMVTFECEDLQGIELAFHNAVDDYVAMCKEKGRTPNKPYSGTTNLRLGTVLHEMCALAAAENDQSLNDWIIQQLNNSLHENNNASKN >NZ_CP039116|3315:19337|12287_12770_+|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP039116|3315:19337|18920_19337_+|WP_027242943.1|DBSCAN-SWA MKKTIHGTGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVIHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANT >NZ_CP039116|3315:19337|8446_8701_+|WP_027242953.1|DBSCAN-SWA MNNKHKKTLREIYTDPIKVNIVWSDVEKMLIAAGATIEERSGSAIAIFLGDEYLGIHRPHPERTAQRYVVKKVRELLKRNGIHA >NZ_CP039116|3315:19337|7936_8302_+|WP_027242954.1|DBSCAN-SWA MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA >NZ_CP039116|3315:19337|12977_13952_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039116|3315:19337|3315_4290_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039116|3315:19337|18366_18924_+|WP_027242944.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGPFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL |
21 | unidentified_phage(35.71%) | transposase,capsid,integrase,head,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039112_1 | 1537433-1537543 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039112_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039112_1
>1.1|1537460|57|NZ_CP039112|CRISPRCasFinder GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039112_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039112_1 >merge|NZ_CP039112|1|1537433-1537543|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA >NZ_CP039112|1|1|1537433-1537543|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA
>NZ_CP039112.1|WP_144420682.1|1536574_1536736_-|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039112.1|WP_155046588.1|1535830_1536040_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP039112.1|WP_027243099.1|1533401_1534715_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP039112.1|WP_027243098.1|1532020_1533166_-|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP039112.1|WP_155049745.1|1531769_1531946_-|DUF1508-domain-containing-protein MSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP039112.1|WP_027243096.1|1531101_1531734_+|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP039112.1|WP_144420683.1|1530268_1530925_-|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP039112.1|WP_027243095.1|1527994_1530280_+|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP039112.1|WP_017376797.1|1527361_1527721_+|hypothetical-protein MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG >NZ_CP039112.1|WP_017376798.1|1526444_1527080_-|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN >NZ_CP039112.1|WP_017376785.1|1538142_1539048_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP039112.1|WP_027242578.1|1539510_1540047_-|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP039112.1|WP_027242577.1|1540064_1541366_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP039112.1|WP_048876008.1|1541362_1542337_-|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039112.1|WP_144420681.1|1542380_1542566_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP039112.1|WP_155046590.1|1542745_1542910_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP039112.1|WP_036774017.1|1542911_1543787_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP039112.1|WP_144420680.1|1544102_1545023_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP039112.1|WP_017375696.1|1545038_1545422_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ >NZ_CP039112.1|WP_144420679.1|1545748_1546705_+|IS3-family-transposase MPAKESKATADGERNFKKGECLLRERNEVKFNFIRKNKVLYPINLTCKVMKVSRSAFYAWDKRPAKVISIEELQLYRRCKELFKESRGSLGSRMMAYKLQEEGFQVGRYRARSLMQKLGLKVLQRKAYKVTTKRKHHHAVADNVLNQQFNPVIANHSWAGDITYLRTAEGWLYLAVVIDLYSRKVIGWAMNKRMSENLVCRAMDMAIHLRQPTEHLLFHSDRGSQYTSKKYRKLLKKHKITASMSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039112_2 | 2096747-2096842 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039112_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039112_2
>2.1|2096771|48|NZ_CP039112|CRISPRCasFinder GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039112_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039112_2 >merge|NZ_CP039112|2|2096747-2096842|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG >NZ_CP039112|2|2|2096747-2096842|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG
>NZ_CP039112.1|WP_017378007.1|2093744_2095688_+|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP039112.1|WP_048875961.1|2092195_2093599_+|IS4-family-transposase 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>NZ_CP039112.1|WP_017378009.1|2097501_2099247_+|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP039112.1|WP_144420648.1|2099649_2101122_+|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
31805 : 91594
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039112|31805:91594|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
123076 : 241144
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039112|123076:241144|DBSCAN-SWA 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105 | Staphylococcus_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
314947 : 357306
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039112|314947:357306|DBSCAN-SWA 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54 | Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
366729 : 421642
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039112|366729:421642|DBSCAN-SWA 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59 | uncultured_Caudovirales_phage(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
451079 : 499218
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039112|451079:499218|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
504022 : 558705
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039112|504022:558705|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
590496 : 723890
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039112|590496:723890|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(13.64%) | transposase,plate,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
732532 : 778848
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039112|732532:778848|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(21.43%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
787008 : 841319
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039112|787008:841319|DBSCAN-SWA 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49 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
884999 : 947519
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039112|884999:947519|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
951421 : 1018384
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039112|951421:1018384|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1023997 : 1086524
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039112|1023997:1086524|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1095224 : 1144792
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039112|1095224:1144792|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_14 |
1169515 : 1226210
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039112|1169515:1226210|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1242452 : 1290177
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039112|1242452:1290177|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1313996 : 1355206
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039112|1313996:1355206|DBSCAN-SWA 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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKGNTVKYAWIKENKCVFPIGRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLAKRIKGIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQSQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPVAKNVLDRDFSATRPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS |
37 | Enterobacteria_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1386423 : 1440157
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039112|1386423:1440157|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1459092 : 1508511
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039112|1459092:1508511|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(23.08%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1517232 : 1576803
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039112|1517232:1576803|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase,integrase,tRNA | attL 1506083:1506142|attR 1576508:1577118 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1582255 : 1625186
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039112|1582255:1625186|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1683521 : 1773836
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039112|1683521:1773836|DBSCAN-SWA 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82 | Burkholderia_phage(14.29%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1784535 : 1835020
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039112|1784535:1835020|DBSCAN-SWA 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46 | Vibrio_phage(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1897313 : 1912629
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039112|1897313:1912629|DBSCAN-SWA 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16 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_24 |
1941302 : 1983059
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039112|1941302:1983059|DBSCAN-SWA 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39 | uncultured_Mediterranean_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
1987402 : 2043472
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039112|1987402:2043472|DBSCAN-SWA 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49 | Klosneuvirus(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2063172 : 2112707
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039112|2063172:2112707|DBSCAN-SWA 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41 | Burkholderia_virus(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_27 |
2127276 : 2254114
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039112|2127276:2254114|DBSCAN-SWA 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116 | Staphylococcus_phage(14.81%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2266963 : 2327931
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039112|2266963:2327931|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 2274816:2274875|attR 2325237:2325997 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2348773 : 2376426
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039112|2348773:2376426|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2415670 : 2543134
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039112|2415670:2543134|DBSCAN-SWA 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106 | Burkholderia_virus(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2552855 : 2604269
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039112|2552855:2604269|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2613563 : 2732024
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039112|2613563:2732024|DBSCAN-SWA 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107 | Staphylococcus_phage(29.63%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2769802 : 2822831
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039112|2769802:2822831|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2837397 : 2891658
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039112|2837397:2891658|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
2899244 : 2948945
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039112|2899244:2948945|DBSCAN-SWA 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43 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_36 |
3076627 : 3141876
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039112|3076627:3141876|DBSCAN-SWA 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55 | Hokovirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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