Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039173 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP039175 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039172 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP039171 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 36 | 0 |
NZ_CP039174 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-138 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039171_1 | 1537155-1537265 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039171_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039171_1
>1.1|1537182|57|NZ_CP039171|CRISPRCasFinder GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039171_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039171_1 >merge|NZ_CP039171|1|1537155-1537265|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA >NZ_CP039171|1|1|1537155-1537265|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA
>NZ_CP039171.1|WP_144420682.1|1536296_1536458_-|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039171.1|WP_155046588.1|1535552_1535762_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP039171.1|WP_027243099.1|1533123_1534437_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP039171.1|WP_027243098.1|1531742_1532888_-|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP039171.1|WP_027243097.1|1531491_1531677_-|hypothetical-protein MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP039171.1|WP_027243096.1|1530823_1531456_+|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP039171.1|WP_144420683.1|1529990_1530647_-|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP039171.1|WP_027243095.1|1527716_1530002_+|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP039171.1|WP_017376797.1|1527083_1527443_+|hypothetical-protein MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG >NZ_CP039171.1|WP_017376798.1|1526166_1526802_-|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN >NZ_CP039171.1|WP_017376785.1|1537864_1538770_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP039171.1|WP_017376784.1|1539010_1539196_+|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG >NZ_CP039171.1|WP_027242578.1|1539232_1539769_-|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP039171.1|WP_027242577.1|1539786_1541088_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP039171.1|WP_048876008.1|1541084_1542059_-|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039171.1|WP_155046589.1|1542138_1542288_+|hypothetical-protein MTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP039171.1|WP_155046590.1|1542467_1542632_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP039171.1|WP_036774017.1|1542633_1543509_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP039171.1|WP_144420680.1|1543824_1544745_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP039171.1|WP_017375696.1|1544760_1545144_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039171_2 | 2096498-2096593 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039171_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039171_2
>2.1|2096522|48|NZ_CP039171|CRISPRCasFinder GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039171_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039171_2 >merge|NZ_CP039171|2|2096498-2096593|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG >NZ_CP039171|2|2|2096498-2096593|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG
>NZ_CP039171.1|WP_017378007.1|2093495_2095439_+|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP039171.1|WP_048875961.1|2091946_2093350_+|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP039171.1|WP_017378006.1|2091197_2091827_+|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP039171.1|WP_017378005.1|2090239_2090959_+|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP039171.1|WP_017378004.1|2086586_2090126_-|chromosome-segregation-protein-SMC MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE >NZ_CP039171.1|WP_017378003.1|2085689_2086520_-|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP039171.1|WP_036773465.1|2083663_2085703_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP039171.1|WP_027243145.1|2082592_2083648_-|protease-SohB 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>NZ_CP039171.1|WP_017378009.1|2097252_2098998_+|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP039171.1|WP_144420648.1|2099400_2100873_+|hypothetical-protein 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DBSCAN-SWA_1 |
31805 : 91594
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039171|31805:91594|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
123076 : 241144
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039171|123076:241144|DBSCAN-SWA 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105 | Staphylococcus_phage(12.5%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
314947 : 357306
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039171|314947:357306|DBSCAN-SWA 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54 | Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
375324 : 425007
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039171|375324:425007|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
451079 : 499218
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039171|451079:499218|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
504022 : 558705
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039171|504022:558705|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
590496 : 723890
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039171|590496:723890|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(13.64%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
732532 : 778848
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039171|732532:778848|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(21.43%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
787008 : 841319
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039171|787008:841319|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039171|787008:841319|814177_814435_+|WP_017377920.1|DBSCAN-SWA MELNKLIVQLEEKMKTMRVNDVQPYDATKLMRIANLFISAVVVKHANEINAREWIQKFSVEFEASLTQSVDRCFKCEYYHVNMVN |
49 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
884999 : 947540
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039171|884999:947540|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
951442 : 1018405
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039171|951442:1018405|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1024018 : 1086545
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039171|1024018:1086545|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1095245 : 1144813
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039171|1095245:1144813|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_14 |
1169536 : 1225932
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039171|1169536:1225932|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1242174 : 1289899
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039171|1242174:1289899|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1313718 : 1354928
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039171|1313718:1354928|DBSCAN-SWA 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MKAIIKLTAITALLISASTLATKPGAYIGLNLGYGGMDTPNLDLTKINNIANDSHSTRGLAGSINAGYLWNKGALNYGFELGYSTYANNQYTAVSVGKKYNFTYSGSSLDLLGVVQYNINPNWNIFGKAGLSYVSQKTTGDGILSLAADSKSKMRPKFALGAGYGFDNGIGLNVMASHTFGTKPQVSNNIISIKDDVNKVAPIDMITVGITYNF |
37 | Enterobacteria_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1386145 : 1439879
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039171|1386145:1439879|DBSCAN-SWA 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46 | Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1458814 : 1508233
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039171|1458814:1508233|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(23.08%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1516954 : 1576525
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039171|1516954:1576525|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,tRNA,transposase,integrase | attL 1505805:1505864|attR 1576230:1576840 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1581977 : 1624908
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039171|1581977:1624908|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1683243 : 1773558
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039171|1683243:1773558|DBSCAN-SWA 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82 | Burkholderia_phage(14.29%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1784257 : 1834742
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039171|1784257:1834742|DBSCAN-SWA 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46 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1897064 : 1912380
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039171|1897064:1912380|DBSCAN-SWA 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15 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_24 |
1941053 : 1982810
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039171|1941053:1982810|DBSCAN-SWA 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38 | uncultured_Mediterranean_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
1987153 : 2043223
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039171|1987153:2043223|DBSCAN-SWA CATGGATAAGACTTATCAACCTGAACTCATCGAAAAAAAGCATTACCAATCCTGGGAAAAAAATGGTTATTTCCCCCCCAAAGGCACAGGTATTCCCTACGCGATTACACTCCCGCCACCCAATGTCACCGGCACCTTGCACATGGGACATGGTTTTCAGCACACTCTGATGGATGCACTGATTCGTTATCACCGCATGCAAGGCGATCAAACACTATGGCAACCCGGTACAGACCATGCAGGCATCGCCACCCAAATGGTAGTCGAGCGCCAATTAAGTGCTGAAAACATCTCACGCCATGACCTAGGCCGTGAGGCATTTACCAAGAGAGTATGGCAATGGAAAGAACAATCTGGTGGTACGATTACTCAGCAAATGCGCCGCATGGGCACTTCACCGGACTGGTCACGCGAACGCTTTACTATGGATAAAGGCCCCTCTGATGCCGTACAAAAAGCCTTTATTGATTTATACAATGAGGATTTAATTTACCGCGGTAAACGCCTGGTCAATTGGGACCCTAACTTACTGACCGCAATTTCTGACCTGGAGGTCATTTCTACAGAAGAACAAGGTTCACTCTGGCACCTGCGTTACCCCCTTGCTGATGGTTCTGATTATCTGATCGTTGCCACCACACGCCCGGAAACCATGCTTGGTGATACTGCAGTCGCGGTCCACCCTGAGGATGGGCGTTATCAACATTTAATTGGCAAGACCCTTAAGCTACCGCTAACTGACCGCGAAATTCCAATTATTGCCGATGACTATGTTGATAAAGACTTTGGCAGCGGCTGCGTTAAAATCACTCCCGCGCATGATTTTAATGACTATGAGATGGGCCAGCGCCATCAATTAGAGATGATTAATATCCTAACGCCAAACGCATATATTAATGATAATGCCCCTGAGAAATACCAAGGCTTAGAACGTTTTGCCGCCCGCAAACAGATTGTCAGCGATTTTGAAACCGCTGACTTACTGGAAAAAATCGAACCACATACACTGAAAATCCCACGCAGTGAACGTGGTAATACCATCGTCGAACCTTATCTAACCGACCAATGGTATGTTAAAACTACCCCACTTGCTAAACCTGCCATCGATGCAGTTAAAAACGGTGAGATTCGCTTTGTGCCAGAAAACTGGAGTAAAACCTATTATCAATGGATGGATAATATTCAAGACTGGTGCATCAGTCGTCAATTATGGTGGGGGCATCGCATTCCTGCTTGGTATGATGACCATGGCAAAATCTATGTTGGCGAAAGTGAACAGGCAGTGCGCCAAACCCATCAATTAGCTGATAGTTTAACCCTCACTCAAGATACAGACGTATTAGATACTTGGTTTTCTTCAGCACTTTGGCCTTTTTCAACACTCGGCTGGCCTGAAAAGACACTCGAACTCGATAAATTCCTACCAACCTCAACCCTTGTCACAGGCTTTGATATTATATTCTTCTGGGTTGCTCGCATGATCATGATGAGTTTAAAATTTACCGGTAAAGTACCTTTTAAAGAAGTCTATGTCACCGGACTCATTCGTGACCATGAAGGTCAGAAAATGTCAAAATCCAAAGGCAATACCCTCGATCCAATTGACCTCATTGATGGCATCAGCTTAGAAAAACTATTAGACAAACGCACATATGGCATGATGCTACCTAAGCTAAAAACTAAGATTGAAAAAGCAACGAAAAAGCAATTCCCCGAAGGCATTCCCGCCTTTGGTACCGATGCCCTACGCTTTACCTTCTGTGCACTTGCCACCAATGGCCGTGATATTAACTTTGATCTAAAACGTGTTGAAGGCTATCGTAATTTCTGTAATAAGCTTTGGAATGCTGGGCGCTACGTCTTAATGAACACAGAAGACCAAAGCCTCGAACTGGACCTAAACAAACTTGAATTTAGCCTAGCCGATCGCTGGATCTATTCACGTCTACAAGAGACAATTGCTGAGGTTCACAAGCAGTTTAACCAATATCGTTTTGATTTAGCGACTCAAGCACTCTACGAATTCACTTGGAATGAGTATTGCGATTGGTATTTAGAGCTGTCTAAACCCGTGCTTTGGAGTGACTCTGCAACACCAGCCCACAAGCAAGCGACCCTTTATACACTGGTCACAGTACTTGAGCAACTAACACGCTTATTGCACCCAATCATCCCTTTTATTACTGAAGAAATTTGGCAGGCAATCACTCCCCTACTTGATAAAGCCACAGGTGCTAATTCCATCATGACCACGTCTTTTCCTCATATTAACCAGGCAATGATCGACCCTCAAGCAGAACAAGATATCAACTGGATTAAAGCCATTGTCATTGGCATTCGTACCATTCGTGCGGAAATGAATCTATCACCCAATAAAGCCTTACCTGTCATTTTCCACCAAGGTAGCGCTAAAGATCAGCAACGCCTAAAAGAAAACAAAGCCTTTTTAACTGCACTCGCTAAATTAGAAAGCATTCAATGGCTTTCTTCTGATCAAGAGCCACCGCCTTCCGCAACTGCACCTGTTGGCAACATGGTGATTCACATTCCGATGGCAGGACTGATTGATAAAACAGCAGAACTTGCCCGTTTAGCCAAAGAAGAGGCCAAGCTTCAAAAAGAACTGGAGCGTTTTAGTAAAAAACTGGCCAATGAAAGTTATATTAATAAAGCCCCTGCAGCTGTCATCGCCAAAGAACGCGAAAAAGAAGCGGAAGTAAAACAGCGTTTTGACCATTTAAATAGTCAAATAACTAAAATTAAAACGCTTTAAATTTTAATATTTAAATAATGTGCTCATTAGAAACAGATAAAACTCGGTGGCAAACTTAATTAGTCACCGAGTTTTTTATTTAAATACTCTTTAATTTCGCCTATAACAGGCCATAAACTTAAATTAGATAGAAGCGAGACCTAGGAATAGTACCCCATGCAAACAATGCGATTTAAAAGCTCTGGGCTAATTATTTATTTATCATTATTAGCCGCAATCACCCCCTTTTCAACGGATATCTACCTCGCCTCTATGCCCACCATTGCTAGAGAATTTCACTCAAGCTCACTGTTACTACAGCTCACTTTATCACTGTTTTTTCTCGGCTTTGCGCTTGGCCAACTCTTTTGGGGCCCACTCTCGGACAAAATCGGCAGAAAGCCCACAGCAATCATTGGCATTAGTGTTTATTTTATCGCCTCTGTACTCTGTGCATTTTCAGTAAATATTAACCAGCTTATTATTTTTCGCTTACTGCAAGCTCTAGGCGCATGTGCCGGTGTTGTCGTTGCCATGGCAATGGTTAAAGATATTTTCACAGAGCACAACCGTATGACCAAAACTCTCAGCTTTATTATTACAATTTTGACTCTAACACCACTCATTGCACCCATCATTGGTAGCTATTTACTGATTCATTTTAACTGGCCATCAAATTTCTATTTTTTAGCCGGCTATGGGTTATTCTTAATTTTTGCCATGTGCTTTATTCAAGAAAGCCACCCTTATCAAACACGTAAACCTCTGCCGATAAATAAACTCGCACGTACCTATTTAGAGCAAATACAACATAAACCCTTTTTACTAATCACTATTGCGGTGAGTGCTAACTTTTGCACTATGTTTGCTTTTATTTCTTCATCACCTTTTATTTATATTGATATTTACCATGTTTCTACTGCTCAGTTTGGTTATTTATTTGCTCTAAACGCCTTAGCGTTGATTATCGGCAGCTTTATTCTTAATCATTTAAAAAAACGCTTAGCTGATCAAGCAATCATGACAATAGGTACATTAGGCGCTTTGATCACCGCACTTATCATGTCTGTGCTCTTGACTGTCAATCCAACGAACATCATCAATATGATTATCCCATCATTTATGATCACATTTTTTGTTGGCATGCTTATGCCACTTCTTATGTCCCTTGCTTTAAAAAATGTTATTCACTACGCGGGGCTCGCCTCTGCACTCGTTGGCGCCTTGCGTTTTAGCGCTGCTGCACTAATTAGCGCATTCATCGGCGTTTTAATTGCCAATAACCCTGCCCCACTCCCTTATACAATGTCCATACTATGCCTTATTACATTGTTTTTTAGCCAATGCTACTGTAAATGCTATTATAGCAACGCTAAAATATTAAAAACAAATCATAACATGGCCAATTAATTACATTATTAAAAAAACTATTACAGGACTTACGCATTGACAACAAAATCTAGTTATGCACCCACAAAAAATTGGTATTTTCAGTACATTTTTTTCATAACTTGTATGAACTCTTGTCATAAACTCATACTTTTGTTCTCTTCAGAGAGTTTGTAAAAAAGTGATTAAAAGGCTAGATCTATTGATGTCACTAGCTTTCATGTTTTAAAACAGCTATCAATGCGTAAGTCCTGTATTATTATTAATCTAATTTTAAAAAGCTATTTTTCTTCTCATCAAATCGAGTAATATCACCCGTTGGAATATCAAAATGCCAACCATGTAGTTGCAAGGTATGATTATCAACACGCTCTTTAACCCAGGGAAATGTCAATAAGTTCTTCAAAGACACTTTGACTCCTTCTCGCTCACAATGATGACATTGCTCATCAACCGTCGCATCTGGAAAATCACGTTGTACATTTTGCTTCGCTGCATCCAAAATACGTACCCACTGATCAACAAAAGTCGGCTTAAACGGCAACTCCCCTTCTACCAAAGAACGAATGCCACCACAACCACTATGACCATAGACGATAATATGCTCAACGTTCAGCCCCAATACAGCAAACTCAATCGCAGCACTGGTGCCATGATGTGAATCTGCACCTAATTTACCTGGCTGATAAGGAGGCACGGTATTCGCCACATTTTGAATAGAAAACACTTGGCCTAAATTAATATGATTTACAATCACTGGATTCACACGCGAGTCTGAGCAAGAAATAATCAACACTTTAGGGTGCTGACCCTGTGCAGCCTCCTTACGATAGCGCTCATTTTCTTCACTTAAGTACTC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49 | Klosneuvirus(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2062923 : 2112458
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039171|2062923:2112458|DBSCAN-SWA 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41 | Burkholderia_virus(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_27 |
2127027 : 2253865
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039171|2127027:2253865|DBSCAN-SWA 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116 | Staphylococcus_phage(14.81%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2266714 : 2327682
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039171|2266714:2327682|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(30.0%) | transposase,integrase | attL 2274567:2274626|attR 2324988:2325748 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2348524 : 2376177
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039171|2348524:2376177|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2415422 : 2542886
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039171|2415422:2542886|DBSCAN-SWA 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105 | Burkholderia_virus(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2552607 : 2604021
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039171|2552607:2604021|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2613315 : 2731776
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039171|2613315:2731776|DBSCAN-SWA 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108 | Staphylococcus_phage(29.63%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2769554 : 2822583
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039171|2769554:2822583|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2837149 : 2891410
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039171|2837149:2891410|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
2898996 : 2948673
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039171|2898996:2948673|DBSCAN-SWA 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43 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_36 |
3076355 : 3141604
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039171|3076355:3141604|DBSCAN-SWA 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57 | Hokovirus(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 117511
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039172|0:117511|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039172|0:117511|83304_85170_-|WP_027243206.1|DBSCAN-SWA MKPTEEQYKIINAVKSENNLHVAAFAGTGKTTTLELIGRQYSTKQGLYLAYNRAILDDSKGKFPKNITCKTTHSLAYATYGRDYREKLNNRITSMKVADHLEISLLRHHINGKIVQATSRNIAACATRIVAHYCNSADTEIGIQHLSMFHIKMLQNRYKKEEIELELDKSRINKPKNFLECYARICLQEAERLWQCMVDLKNHTIGITHDGYLKLYQLSKPILNQYDFIMLDEAQDANPAILDIFERQTAQRIYVGDQHQQIYSWRGSINAMEQMSGEKHYLTQSFRFGQPIADFANEILKKLGESQQIQANPNITSKLDVIDPSQPFTTLCRTNAGLLTCCLQHIELGRRVACVGGIKEALSDFTAAYYLWRNELDKVISNKIKLYQTWQNLVDEASLTGDRELKGIIKFILEHDEYSLEVIGKIKEAVEMDESKADVILSTAHKAKGRQWSQVLIHNDFEDYKSCSGEELNLWYVAATRAIHILDFSEISKQEDLDKPKNQPKQVAVATEQKLEEFVDLAEESKAASIIQNNPNKSSQWLKLKMHQKGIATNIAAKLLPDCASHDREVALCLAHKKWPKVKAKDTRQRISKLAGFLGRQGFSADLCWEVASLQEKLNVP >NZ_CP039172|0:117511|44731_44965_+|WP_017375959.1|DBSCAN-SWA MIKTWKHKGLKKFFESGSTAGIQARHKTILAKQLDFLDSMSDPQELWIFESWGAHKLTGNYKEHWAIAASHGVLSTG >NZ_CP039172|0:117511|45284_45647_+|WP_081078123.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039172|0:117511|96236_96428_-|WP_144420833.1|DBSCAN-SWA MCKIPTEVATLTYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCRYLFDQDNNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ >NZ_CP039172|0:117511|66955_67117_+|WP_155046636.1|DBSCAN-SWA MGPEVTQQRRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS |
121 | Streptococcus_phage(40.0%) | transposase,integrase,terminase,portal | attL 11253:11312|attR 117877:119612 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
123458 : 125080
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039172|123458:125080|DBSCAN-SWA GATGGCTTTATGGAAAAGAAAACCTAAAACTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATTATAAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACACTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAGTATTAATAATTCATGTGTGGTGGAGTTCAATTTATTCGCGACAATAAAATCATCAAAAGTTATTTTTTAAATCCACAAGCAGTACTGCCCGTGTTAAAAAAAGTGGAGATGTTGAATAAAAACATTTAAATCTAAAGTGTTACATAAAAATAGAGAGAAAACAATGGTGACATTAACCGTAACTGATATTCATGATTTAACAGTAATGCTAGGTATGTTAGAAGATATTTATCAATATGAAATCCCTGCGGCGCAACGAATTTTAAAAAAAATTGCTGATAAACCTGAATCTAAAAGCTATCACATTGTTCCAACAGGACTAAGTTCAGAAAAAAGTATACACTACGTAAATAAGTTAAGAGACTGAAGTATATATTTCATAGTATTTTTCTGCAAATAATATAATGGTTACTTCTCATTAAAAAAGTGCTTTTAATAAATTTTATTAAGAAGAATTAAAATGAAACAAAAAAAATCGATAATAACTGGGCTATTTTTTAGTTTTTTTATTGTGTCTATAAATGCGGTAGTACCAGCAAAGCCGATAAGTAAAGCGTTTCATTGTAATGGCTTTATGAAATATGGTGTTCCTGGTAAAACCGATCAGTATTTATGTCGTGAAGGATATAGTGTTGGCTATGACTATAAAACAAAACAGCCGAAGTGGGTTGCCTATCATTTAACCAGTCAAAGCGTTTCTAAACGAATTAAACGCCATGATGAGTTTAGACCAGATTCTGAGATTCCTTATAAATACCAAGCACAGCTGTCAGACTACAAGCAATCTGGTTATGATCGTGGGCACTTAGCCCCTTACGCTGCTATGGACTTTGATAAGAAGTCGGCGTCTCAATCCTTCTTATTATCGAACATGAGTCCTCAAAAGGCTGGTTTAAATCGGCAAGGTTGGGCGAAGCTAGAGTCAAATGTACGGTTTTGGGCCAAATATAAGAAGGAAGTGTATGTTTATACAGGGCCTATTTTTGAAGGAAAAAATATCAAAACAATCGGTAAAGGTAAGGTTGCCGTACCAACTGCATTCTTTAAAGTTATATTTGCACCTGAGAAAAAGCAAGTATTGGCGTTCGTAATGCCTAATAAGCGTGTTGCTAAAAATAAAGTTGCTGAGTATAGAACAAATATGAATCATATTGAAAAATTAACCGGGTTAAATTTTTTAAATCAATTACCTTTGATTGAAAGAGAAAACCTTGTTACAAAAACAGAAAAAATGTGGCGTACTCACTACAGTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039172|123458:125080|123988_124192_+|WP_017375836.1|DBSCAN-SWA MVTLTVTDIHDLTVMLGMLEDIYQYEIPAAQRILKKIADKPESKSYHIVPTGLSSEKSIHYVNKLRD >NZ_CP039172|123458:125080|123458_123794_+|WP_017375632.1|transposase|DBSCAN-SWA MALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP039172|123458:125080|124285_125080_+|WP_027243203.1|DBSCAN-SWA MKQKKSIITGLFFSFFIVSINAVVPAKPISKAFHCNGFMKYGVPGKTDQYLCREGYSVGYDYKTKQPKWVAYHLTSQSVSKRIKRHDEFRPDSEIPYKYQAQLSDYKQSGYDRGHLAPYAAMDFDKKSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKKEVYVYTGPIFEGKNIKTIGKGKVAVPTAFFKVIFAPEKKQVLAFVMPNKRVAKNKVAEYRTNMNHIEKLTGLNFLNQLPLIERENLVTKTEKMWRTHYS |
3 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
131450 : 133868
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039172|131450:133868|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAATCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCATGTGACGGAGGGCGTAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCATAAACACAATCATCTTATTCAGGACTTACGCATTGACAACAAAATCTAGTTACGCCCTCCGTCTTCTATTGGGTTCATATTTTCTAGTTCGCGAATATCATTTTGACTCATTACACCAATGCTAAACATGCGATTATAAAAAGAGGCGCGAGCGGCCGTATCACCGCGTAATAAGCCCTCAATATTAAATTTTACAAAGTATTTTTTACGCTCATGGGCAAGTAATAAGTCACGGCTAATACTCTGCTCGATTTTAACCAGCCAGGGCACCAAACTATGACGAACAAAGGCTAAATCTTGATGCTCAATATTTGAAAAAGTGGCGCGTTCTAAATCGGCAATCATATGCGGCGGCACCCGGAAAATGCCACAGATTTCATTGCGCTGGTATTTACGTGTTTCTAAAAACTGACTGTCTTCACTGCTCATGGTCAGCGTTTGCCATTTCAAGCCATTCTCTAAAACAGCCACCCCGTTCGAATTTTTACCGCCGTGGGCTTTTTTCCAAGACTCCGCTAAGTTTTCACGGCCTTCTTTTTTTAACTGGCCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTCTGTGGTTAAGATGCCGCTGGGGCGTGCACCATTACCGAATAATTGGGCGCCATGCGCTTGGGTTGCCGCAGATAAGCCGAGTGATTCGCGTTGTAAGGTAATTGGACTGCTGCCGATAATCCCGTCACTACCCATCGCATTCAGCCGCCACACTTGATCATCGCGGAGTTCATAGCTTTGACCGTTTAACATCGTGCTATAGATGAGCTTTTTTGTTTTTTCATCACGGCGCACCGTGGTGCTATCAGTGGGCAGTTGGATTAATTCACGCACTCGCCCTGCAGCATCGCGAATAACCTGACAATAAGCATTGCCACGTAGACATAAATGGCCCACAAGGTTTTCACGTAAATCAAAACTAGTCACTTCACCATTCGGTAAATCATGCAAGACAGAATATAACGGGTGATCTGTGGCCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039172|131450:133868|131450_132425_-|WP_048875857.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039172|131450:133868|133412_133868_-|WP_048876221.1|portal|DBSCAN-SWA MATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQVIRDAAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLIYSTMLNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDAASHGVLSTG |
2 | unidentified_phage(50.0%) | transposase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
138586 : 145554
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039172|138586:145554|DBSCAN-SWA TGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGTTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTTGGCTCGCAGCGTATGATGTTTTAATAAGATAAGCAATTAAAATAGAGGTCTGTGGGCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAAGTTTGAAGACCGTGGATACACACATTATATACAAACATGTTCTTTTGAAGGGAAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAACGACTCTTCAACCTCTTCCCTATTGTTCGAAGCATTTAATCTACTTTCTTTGAAAGTCTTAGGGCTTGCTATACCCGACACTATTCATTTAGTCCAAGATCAAGAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGGCTTTAAAGTTTATCGACTTTGCAGAAGATCTTGCAAGAATAAGCCTTACTCGACTAATTTTGGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGGAATATATTAATGACTAAGAGTCAGTTGATTTCTATTGATGTGCCATTCTTTGATCTTGCACCTGAATTCGTACCTAATAAATATCAAGATCATATTGAATTGTTTTCCGAAGTATTTCTGGATAAAAATTCACTTAGCCATTTATCTAAAAATGTAATCAATCATTTTTATAATAATATAGGATTAATAAGCTATAAGCTTTCTAGACTATATCTTGATAATGTAATTTCTGAAGTAGAAAAAAATGATTACCTAAAAAAATTAATAGGCAATATATCAAGCTTTTATGGACTTATTTCAATATTGAAAGAAAAGAAAAATCCTCACGATTCTCTCACGGACTCTGAGTATGAATTATACTTTGCAAATAGACTTGAGCATATCCAACAACTAAATACTATAGTCGTTGAACAGGATTTATCAGCCCAAAAAGATCATGTATCTGAAAATCTATTTTTCGATGCAAATGAACACTTAGAAAATATCGATACTTCTGAACTGCTATTTTTTGATGCAAAAGATACGTTAGAGAGTTGTTCCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCTAAATTAGTGTGATAGAGATCTGCTCCTCTTAAGTTCACGCCCTCTAAGTTAGCTTTATGTAAATTAGCTTCTCTTAAATTGGCTCCATCTAAATTTAAACCTCTAAGGTCAACTCCTTCAAGATTCCACCCATATAAGTTAATCACATCACCAGTTTCTATTGACTTTTGAATCGCTTTCTGTACATCTGCACGAGTTTTTTTTGTCATAATTTAATCAACGCTTTAAATTTAAAAAAAATTTATATAACAAATATTTAGATTTTACAATCTTAAAATTTTTTACCAATTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGACAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTAATTTAAGTTACGCTAATTTATCAAAAGCAAATTTAAGTAGTATGGGTTGGGGAAGTGCTATAGTTGCTGGAGCTGCTTATGGAGGATTTGTTGCTGCAATCTCCAAAAATATAGCAGGAATGAGCGTGGGAACATCTGTTTTAACTGGTGCAACAGTAGCTGCAATGGTTACATTCACTAAAAAACTTGAAGGCGCTAATGTAAAAGTTACAAATTTATTTGGTGCAAATTTATCTGGTGCAAATTTAACTCATACAAACTGTACGGGAGCATACTTTATAGATACAGATCTAACTAATGCGAAAGTAAGCAAAACTGATTTAAAATATGCGATGTTTTCCAAAATAAGCTTAGAAGGGACAGGTCTGAATTTTAAAGATTTAGTTGGCGATGCCACACCTAAATCTGAAGGCTTAATGGAGCTTCCTTCTGTAATTTACATTCCTAAAGTTACAGGCTCATATCAATATTACGAAAGAAATCACGGTTACTTATCTGCTCATTTGCCACAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039172|138586:145554|144825_145554_-|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039172|138586:145554|139456_140389_+|WP_144420837.1|DBSCAN-SWA MSELKNKEKFEDRGYTHYIQTCSFEGKKCYVKLSYKNDSSTSSLLFEAFNLLSLKVLGLAIPDTIHLVQDQESNKCIGYLTSEVILDKALKFIDFAEDLARISLTRLILGDNAATEDGNILMTKSQLISIDVPFFDLAPEFVPNKYQDHIELFSEVFLDKNSLSHLSKNVINHFYNNIGLISYKLSRLYLDNVISEVEKNDYLKKLIGNISSFYGLISILKEKKNPHDSLTDSEYELYFANRLEHIQQLNTIVVEQDLSAQKDHVSENLFFDANEHLENIDTSELLFFDAKDTLESCSGTVAKNLDLSRV >NZ_CP039172|138586:145554|143056_143677_+|WP_144420838.1|DBSCAN-SWA MQQCPNLSYANLSKANLSSMGWGSAIVAGAAYGGFVAAISKNIAGMSVGTSVLTGATVAAMVTFTKKLEGANVKVTNLFGANLSGANLTHTNCTGAYFIDTDLTNAKVSKTDLKYAMFSKISLEGTGLNFKDLVGDATPKSEGLMELPSVIYIPKVTGSYQYYERNHGYLSAHLPQEESTLNTPRLFEGSQQQECQEQSSSVNLTH >NZ_CP039172|138586:145554|142272_143001_-|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039172|138586:145554|140418_141147_+|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039172|138586:145554|141149_141422_-|WP_017377512.1|DBSCAN-SWA MTKKTRADVQKAIQKSIETGDVINLYGWNLEGVDLRGLNLDGANLREANLHKANLEGVNLRGADLYHTNLGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039172|138586:145554|138586_139315_+|WP_017377509.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPVHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA |
7 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
154421 : 158061
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039172|154421:158061|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAACATAAAGCTAAACTTCAAAAATAATGATAAATAAATTGAGTATTGAAAATGGGACAGTTAACAATGCTAAAAGATTTTAAATCACTGCCTGCAATAGAGAAGGCAATACGCCTTGCCGGAGGCATCTCTACGCTAGCTAATGAGCTCAGTGTAACTAATACAACAATCTATAACTGGAGAAAAAAGCCTGAGTCAATCCCTCCTGAGAGAGCTAAACAAATCGAGGACTTTTCTGGTGGCCTTGTTACTAGAACAGAATTACGACCAGACTTATTCGCTTAACTTTAAACATTTGGAGAAAGTAAATGATAATTGTATATGGTGGACGAAAAGGCGGCGTAGGTAAAAGTTCAGGAGCTATAAACTTTGCAGCTGGATTGCAAGAACAGGGTAAAGATGTATTGTTATTTGATGCGGATAGAACAGAAAACTCATCTTCTTGGAATCATATTCGCAATGAAAATAAAACTCTTAAAAGAGTTAACAGTGTTCAAGGTTATGGCAATATTTTAACGCAGCTAGCCGACCTATCAGAACGTTACGATGATATCGTAATTGATACGGCAGGAAAAGACTCTCAAGAATTTCGCTATGCTTTAGCTGTTGCCGACATAGCTCTTATTCCATTCAGATGTTCAATGTTTGATCTTAAAACATTACCACAAGTGTCAGATATAATTTCAACAATGCGCCCAACGAACCCAAAACTTCAATGCTTTTGCTATATTTCGATGGCAACAACTAACCCAATAATGAAAGAAGTATTTCAAACATCTCAAAGGGTGGAGAAATTAAAAAGAGACGGGTTAATTGACGAGTTAACTTTTTTGGATTCAATAATCTCAGACAGAGTTGCTTTTAGAAATGTTTTATTTGAAGGAAAGTCTATCTATGAAAATGACGACAAAAAGGCAATTCAAGAAATTGAGGATATTATCCACGAAATTTTAAATTTACACAGGACAGCTCTTGATAAACAAGGTAGTCAACATGCCCAAGAAGCTTAATTTAGATGATATTGACCTTTCATTAGTTCAAGAATTAGCAACACAAGCAGATATGACTAATGACGAAATTAATATAAGACAAAAGAAACAAAAAGAATCTCCAAAAGTTGTAATTAATGGATATATGAATCGTGCTAAATGTGTGACTTCTTCCTCATGCATAAAAAAAGAACTAGTTAGCGATATTGAAGCTCTATGCAAAGGCAATAAGTGGGCTGCTATAAACTATGTTTTAAAGCTAGGTTTAGAAGAATTAAAAAAAGAAAAAGAAGTGGTTTTTATTGAAGCATCAGACTTATAACGTAAAAGTAGTACGAGGTAGTACGAGGTAGTATCACATTTATTTTCAAATAGGTATGGATTTTTACATCATTACGATGAACAATATTATCAGATAAAAGAATTAGGTAAGATATTTCGAAAGTGATTAAATAAAATAAAGCCCTCCTGCAAGAGGGCTAACAACTGGCCGGCGTAGAAACCTAACCAAGACATCCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039172|154421:158061|156481_156799_+|WP_036773107.1|DBSCAN-SWA MPKKLNLDDIDLSLVQELATQADMTNDEINIRQKKQKESPKVVINGYMNRAKCVTSSSCIKKELVSDIEALCKGNKWAAINYVLKLGLEELKKEKEVVFIEASDL >NZ_CP039172|154421:158061|155539_155773_+|WP_017375692.1|DBSCAN-SWA MGQLTMLKDFKSLPAIEKAIRLAGGISTLANELSVTNTTIYNWRKKPESIPPERAKQIEDFSGGLVTRTELRPDLFA >NZ_CP039172|154421:158061|157086_158061_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039172|154421:158061|154421_155396_-|WP_036773116.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039172|154421:158061|155796_156498_+|WP_017375691.1|DBSCAN-SWA MIIVYGGRKGGVGKSSGAINFAAGLQEQGKDVLLFDADRTENSSSWNHIRNENKTLKRVNSVQGYGNILTQLADLSERYDDIVIDTAGKDSQEFRYALAVADIALIPFRCSMFDLKTLPQVSDIISTMRPTNPKLQCFCYISMATTNPIMKEVFQTSQRVEKLKRDGLIDELTFLDSIISDRVAFRNVLFEGKSIYENDDKKAIQEIEDIIHEILNLHRTALDKQGSQHAQEA |
5 | unidentified_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
161511 : 172973
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039172|161511:172973|DBSCAN-SWA 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GTATCTTCGTCACGTAAATAATCTAAGCAATTTTTTAGCTCTTTACGGTTTTGGTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039172|161511:172973|166135_166459_+|WP_017375783.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQYYQQQHADLSETEASLLLICLSLCDLQGAKVFDVSEYKKLAELPLGIIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP039172|161511:172973|170463_171192_-|WP_036772541.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039172|161511:172973|168856_169198_+|WP_017375786.1|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIDADKVKPRLRITPLGDGYMQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERTGLEAFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVILRFEEDFNPL >NZ_CP039172|161511:172973|161511_162486_+|WP_036771639.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039172|161511:172973|165711_166134_+|WP_017375782.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNGGNYVKLANITNIGEISSSRDKVDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDAGVERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP039172|161511:172973|169194_169866_+|WP_017375787.1|tail|DBSCAN-SWA MSLIESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCHSPDGNQAVSFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPLLLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVKHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQVWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLANCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP039172|161511:172973|171633_172362_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039172|161511:172973|172364_172973_-|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039172|161511:172973|166515_166782_+|WP_017375784.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYALEPFGVEKDDHRTALLVSAVVNGPLQRKDKTLFTPDDFMPNYSAGDEKKAQSATDMAAILSAIAKRK >NZ_CP039172|161511:172973|162535_163075_+|WP_075275454.1|capsid|DBSCAN-SWA MAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTATAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAS >NZ_CP039172|161511:172973|164365_164791_+|WP_017375779.1|head|DBSCAN-SWA MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEALDYWQDITTVWARVSPNAGRELFSAQQFYHEVSQTVTLRYRPNVTPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACRERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039172|161511:172973|166785_168864_+|WP_036771950.1|tail|DBSCAN-SWA MATIGSLVVNLSANSAELVKSLSKAELASKNFSKKVQRNLKKTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQTKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAAGEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFCVVAKSFAIVGDGVHYINIGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAKGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIADAGATLPIVGNKFERLGQSIARMKASVSERFTLDTSGLKIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDDIAKKAAALDEKIRTSQPEKSALMGASLHVQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIQHSYDKQKRIILDATREGSEERAKLLEKIEVQKNTKLKNLAQKQAKELNGIGHQAKELAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASKGIFKSILGGVISSVGGSSFASWFGGGSTAAGAKASGGTVAAGQLYRVNEQGAEIFSSGGKDYLMTGKKSGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSADVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA >NZ_CP039172|161511:172973|164969_165365_+|WP_017375780.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEKQLKQLAPKKIRNLNRRALRKAAEPVETQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTVVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQKSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP039172|161511:172973|164057_164369_+|WP_017375778.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLTRLKSHLRIEDHSEDDYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSV >NZ_CP039172|161511:172973|171221_171611_-|WP_051929563.1|DBSCAN-SWA MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLDLSMV >NZ_CP039172|161511:172973|165361_165712_+|WP_017375781.1|DBSCAN-SWA MIEDIYFALLGTGWPVFPMVLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDNITEQLNGYHNENIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFHLTGVV >NZ_CP039172|161511:172973|163088_163673_-|WP_027242598.1|DBSCAN-SWA MPTQKYLKKTRDLIGKFDSRIAHLQEEIDICAKYDHDLHRCLQEQKTQNLPLHQQYENLKEFSKSNYNPIAQSASRKLALLCKFRGILEKSTYDIGTAKKGLGSLNAIFSICRFSGGKYHYPKVFEAIGCGLFSKTKKLCSQARELLKERISVEAEAAQSAGKWRTASPVLNALQSFQVTSSAPSPEANVPGQP |
17 | Streptococcus_phage(18.18%) | transposase,head,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
3315 : 19337
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039175|3315:19337|DBSCAN-SWA 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21 | unidentified_phage(35.71%) | transposase,integrase,terminase,capsid,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
5716 : 19512
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039174|5716:19512|DBSCAN-SWA 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18 | Moraxella_phage(18.18%) | capsid,tail,head,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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