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NZ_CP039178 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP039177 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-139 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 6 | 0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
5714 : 19511
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039179|5714:19511|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039179|5714:19511|9915_10338_+|WP_017375782.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNGGNYVKLANITNIGEISSSRDKVDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDAGVERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP039179|5714:19511|10719_10986_+|WP_017375784.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYALEPFGVEKDDHRTALLVSAVVNGPLQRKDKTLFTPDDFMPNYSAGDEKKAQSATDMAAILSAIAKRK >NZ_CP039179|5714:19511|14774_15332_+|WP_017375789.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGSFFELKINHAREAIYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRKSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLVYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP039179|5714:19511|8569_8995_+|WP_017375779.1|head|DBSCAN-SWA MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEALDYWQDITTVWARVSPNAGRELFSAQQFYHEVSQTVTLRYRPNVTPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACRERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039179|5714:19511|18077_18506_+|WP_017375652.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGVVA >NZ_CP039179|5714:19511|6372_6690_+|WP_155082337.1|transposase|DBSCAN-SWA MWLAQLSLILKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039179|5714:19511|5714_6419_+|WP_155082336.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKNHHF >NZ_CP039179|5714:19511|15328_18019_+|WP_027242568.1|DBSCAN-SWA MKKTIHGAGGGGGKGGGSTHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNPDGSYNFEGVTLKSNHGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRLYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKVSPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKPTHFAYPYTLKVERVTEDTDSSRVQNSIYLTSITDVIDTKLSYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQIPTNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLINERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSEMISYKATQDHIHSLPSDIVKIFDPDMDQEQGVAGVITAVADHVITLDREVSLSSQNTLMIFSTEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVVYHSTPPKQWRITAITEEDDGTYTVNAIAHDPDKYQKIDEERALGVSKENTPIPSLKAPSNYRVEQSLSYHGGMVEAVLIVAFDGDPNAAYYEYQVRSNDGNYSDVKTTHLNHIELNSTGATYTFRVRAMGWFGQRSGYSTYRCSASLEQQIPDNVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRQGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASALELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFHHTAVNNNNHIRLFSYYSWGGMTQSWEDYALRHLKCNTQ >NZ_CP039179|5714:19511|8261_8573_+|WP_017375778.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLTRLKSHLRIEDHSEDDYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSV >NZ_CP039179|5714:19511|13999_14785_+|WP_144420832.1|DBSCAN-SWA MAWRASATDTLCPLKDSRALNLFKAYALEQYPKEAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPTQLIDTPSGTLLIHSHPDGTVEPSLADMVGQRDTGLLWGIVALNQHAITDVIVFGEQLFTQQLLERPFLHGIFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTDASFIEVDKASPLHRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDRNAVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP039179|5714:19511|10339_10663_+|WP_017375783.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQYYQQQHADLSETEASLLLICLSLCDLQGAKVFDVSEYKKLAELPLGIIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP039179|5714:19511|6739_7279_+|WP_075275454.1|capsid|DBSCAN-SWA MAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTATAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAS |
19 | Moraxella_phage(16.67%) | tail,head,capsid,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039176_1 | 1537154-1537264 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039176_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039176_1
>1.1|1537181|57|NZ_CP039176|CRISPRCasFinder GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039176_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039176_1 >merge|NZ_CP039176|1|1537154-1537264|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA >NZ_CP039176|1|1|1537154-1537264|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA
>NZ_CP039176.1|WP_144420682.1|1536295_1536457_-|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039176.1|WP_155046588.1|1535551_1535761_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP039176.1|WP_027243099.1|1533122_1534436_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP039176.1|WP_027243098.1|1531741_1532887_-|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP039176.1|WP_027243097.1|1531490_1531676_-|hypothetical-protein MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP039176.1|WP_027243096.1|1530822_1531455_+|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP039176.1|WP_144420683.1|1529989_1530646_-|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP039176.1|WP_027243095.1|1527715_1530001_+|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP039176.1|WP_017376797.1|1527082_1527442_+|hypothetical-protein MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG >NZ_CP039176.1|WP_017376798.1|1526165_1526801_-|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN >NZ_CP039176.1|WP_017376785.1|1537863_1538769_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP039176.1|WP_027242578.1|1539231_1539768_-|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP039176.1|WP_027242577.1|1539785_1541087_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP039176.1|WP_048876008.1|1541083_1542058_-|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039176.1|WP_144420681.1|1542101_1542287_+|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP039176.1|WP_155046590.1|1542466_1542631_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP039176.1|WP_036774017.1|1542632_1543508_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP039176.1|WP_144420680.1|1543823_1544744_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP039176.1|WP_017375696.1|1544759_1545143_-|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ >NZ_CP039176.1|WP_144420679.1|1545469_1546426_+|IS3-family-transposase MPAKESKATADGERNFKKGECLLRERNEVKFNFIRKNKVLYPINLTCKVMKVSRSAFYAWDKRPAKVISIEELQLYRRCKELFKESRGSLGSRMMAYKLQEEGFQVGRYRARSLMQKLGLKVLQRKAYKVTTKRKHHHAVADNVLNQQFNPVIANHSWAGDITYLRTAEGWLYLAVVIDLYSRKVIGWAMNKRMSENLVCRAMDMAIHLRQPTEHLLFHSDRGSQYTSKKYRKLLKKHKITASMSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039176_2 | 2096472-2096567 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039176_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039176_2
>2.1|2096496|48|NZ_CP039176|CRISPRCasFinder GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039176_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039176_2 >merge|NZ_CP039176|2|2096472-2096567|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG >NZ_CP039176|2|2|2096472-2096567|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG
>NZ_CP039176.1|WP_017378007.1|2093469_2095413_+|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP039176.1|WP_048875961.1|2091920_2093324_+|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP039176.1|WP_017378006.1|2091171_2091801_+|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP039176.1|WP_017378005.1|2090213_2090933_+|sulfate-transporter-CysZ 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
31805 : 91594
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039176|31805:91594|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
123076 : 241144
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039176|123076:241144|DBSCAN-SWA 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106 | Staphylococcus_phage(12.5%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
314947 : 357306
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039176|314947:357306|DBSCAN-SWA 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54 | Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
366729 : 421642
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039176|366729:421642|DBSCAN-SWA 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60 | uncultured_Caudovirales_phage(20.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
451079 : 499218
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039176|451079:499218|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCTCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGTCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTTCTCTCTGGGGAAGAAGGATTTCCAGCAGACTATTTCGCTCAGTTAGAAAGGCTGTTGGGGCGAAATTGTACCGGTAGAAGTCGTAAATATGGCAAAACAAATTATGATTCACATACGCAGCTACAGGCGATCTGTGAGTATGTACTATGCCTCTTAGTAGGTTTAAATGACGATGAACTGCATCAGATAACAAAAGCAGCACTGGAAAATTATAATAGTGGCTGTGCTGCGGGAGCAGACGGAACTTGCTATATGAGGAATAATTCTTTTGCTAAATTTGTATTAGCACAGGAGTTGAGAAGAAATCCAGCAAGTGCAGAGCAACATTTTTCTGACGGTAGTATTCCTGCTAAATATAGTGGTGAAGCCGATCCCTTTAGAGCACAATTACTGGAAGAATCAAAGGGCTCCTTACAAAACCATGAACAATATGTACAAGCTAGCCAAAAAAATAAACAGGCTGTGGCTTTAAATGTAAATGAGAAGCATAAAGAATGGTTAGGGAATCTTCTAAAGGCTGCTGATTTTCAAGCGACTAAGTATGGTAAGCATGTGAGCTTGGGCAGTGATGTGTACTGTATTCCTAAACACTTAGCGAAAATACTGGAGTCACAGAGTAATAGTGGTTTATTCAGTACAGAGCATGCAGCAGTGGAGGCTACAAAGAATATTCTTGCTCTAGCTATTCAGAGCACTAGAGTGTCAAAATTTAGTTTTGGCAGGACGCAATGGACCAAAATATTATATGAAGGGCAGTCGACAGGAGTGTCTGGTGCTGATTTTATTGATTATATGACGAGAGTAGGTCTTGGGGACGTCATGATTTCCAAATTTAAAAATAATCCTGAGAGTATTCGCGCAAACCAACAAAGTAGAGGGCCTATGCGGTAATGGCACTACCTTAAGAGCTAGATCTGAACAAAAACGCACTTTAGCGCAATAATCACTTGAAGTCAGCAACCGTATAAGGTTGTATATTTTCGTCTAACAACTCAGACGGAAACTGACAGATGCATTATGTAATTAATAAACTAAAATCACAAATTGAAAAACAAAAAGCAACCCTTTTAGATGATGAAGGAAGTCTAAGCATTGAAAGCCTTCTGTCCTCCGATAAGTTTCAAAGCATCATCAACAATTGCCGAAGCTTTAGATCGCGTTTTTATACGCCATTTGTAACACTCATACTATTTATACGGCAAGTACTCTCTCCAGATAAATCATGCAAAAATACGGTTGCTACTTTCCTTGCATCAGTGTCGACAGAGGATAATAATAACATCCCATCAAGCAATACAGGACCTTACTGTAAAGCACGTCAAAAGTTACCAATAGAAACGCTTGAATCACTCGTTAAACTCAGTGGAGATAGTTTATCTAAAAGCAGTAATGCACGTTGGAAGATTTATAATCGAGAGGTGAAGCTTATTGATGGGACAAGCCTTACGATGGCAGATAGCGAGGAAAATCAATCACGTTATCCTCAACATGATGCTCAAAAGGCAGGCGCAGGCTTCCCTATTATGCGACTTGTTGCCATTATGTCACTTACAACGGGAGGCATTATTGATTATGCAGTTGGCGCTTATAAAGGTAAAGGAACGGGTGAACACGCGCTGTTAAGACAAATTAAGGACAGCATTCATAAGGATGATATTGTGATGGGTGATCGGTATTTCCCTTGTTTTTTCGTGATGGGTGATTTGCAGTCAATAGGTGCTGATGGTATTTTTAAAGCACATTCACAGAGGAAGTATGACTTTCGTAAAGGAAGGAAGTTGGGTTCAAAAAATCACCTTGTCATTTGGAAAAAGCCTCACAAACCTGACTGGATGACACAAGAAACATACGATAGTTATCCTGATCAAATGACGGTAAGAGAGTTCAAAATCAAAGGGGAGGTTTATGTAACAACTTTTCAAGATCATAAAAAATACAATAAAGTTGCATTGGCTAATCATTACAAACAAAGGTGGCACATTGAAATCAATTTCAACAGCTTAAAAAGCATTATGTCAATGGATCATTTAAGAAGTAAGACACCTGACATGGTACATAAAGAAATTGCAGTACACTTTTTAGCATACAACTTAATTAGAACGCTTATTGCAGAAGCTTGTCGTAATACTGAACGCCTTCCTATACAGGTTAGTTTCAAGGGTGTAATACAGTTATTTAATAGCTTTGTGTCATTACTCAGTTTCTCGGCAGACTGTAATAAAGCCCATGCAATATTGTTGCATGCAATCATAAAAAACAAGGTTGGGAATAGGCCTGGACGGATTGAACCTCGGGCTGTTAAAAAACGTCCCAAAGCATTCAGGCGACTGAATAAAAGCAGGGAATTGGAAAAGGCAGAAATAACTAAAAGAATGAAGAAAAATAGCAATAAAAAATGTTCATCCGCTCCTTAAGGTAGTGCCATTAGCCTATGCGGCTTTTTGAATGCCTTCGCATGCAAAATGACACTGATGCTGCTATAGCGGCTGCTGCTTCTGTTTATCTTGAGATATAGTCAATGGCAATTTTAAAAAAATGACTTAAAGGGGTCCTCCCTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGGTTAAGTCGTTTTAAGTCAGCATAATAGGGTGTTATATCGAAGGGTGTTTGTCTGTTGCTGAAAATTTAGTTGTTTCTTATTATTTAAATAATAGATTTTTTAATTATTTTTATTAATATTACAATAAAAATATCAGTAAAATTTTTACATGAGATATAGTATTAGTTCTTACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGCAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGAGAAAGATTATTTTTAGTATTTCTTTCATTTTTAGTTGATTTTTAAATAAAATTGATTAGTAAAACTTTTTACTTTAATTTCATTCTTAACATACACATGATTCTCTCCATATGGTAAATTTTGGTTACGATTAACCATGCATAAAATTTTATAGTTTTTATCAATGGTGTTGTTTTATTTGAGTGATAAAGTTACAAGCAACACAGTTAATGAAATCATGTTGGTAAGTCTATGAGTAATTTATCTATTTAAAATAATAAACCATTAAAATATAAAAATCTTTATAAAGTTTATGCAGATTAATATTCTGCATTAATGATAGAAAGTTTTTTATAGCTTAATTTAAATAAATAGATCACTGTACTGTTAATTTAAATACCAGACTTTGCATGATTTAAATCATATGCAGTTTTAATTATTGTTAATAAAGTTATTGTTAAGGGGATACTTATGCCTTTAGATGATCTAATTAAACTTAGTGAAAGTAAGCGCAAAAGTTTAGAGGTTGGGCTTGATTCAGAAGTGTTAGATAAAACCGATGAAAAATTTCATAAATCTTTAAAATATTTGGCTGCATATCTTTCTCAGAAAAATCGTATTGCTTATCAACTTGCAATCGAAAA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42 | Staphylococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
504022 : 558705
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039176|504022:558705|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
590496 : 723890
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039176|590496:723890|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(13.64%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
732532 : 778848
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039176|732532:778848|DBSCAN-SWA AATGAGCTTTCTTGATAAGATTATGCAGTCAAGTGATATGGAGAGTCGTTCTCCATATCAAAAAAATATTTATGATGATATTCAGATGTCTTTAATTAATTTATTAAATACACGAGAAAACAGTTCAAAGCTATTTAGAAATTATGGCGTCAAAAATATTGCAGATATTATTCATGGTGATCAAATTGAGCTTAATCATTTTTGTCGAGATATAGAAAGACTTATTTGTGAGTATGAGCCACGTATCCGTCATGTTACTGTTGACTTGGCTGAAGAACATGTGATGAATAGTCGATTTGAACTGATTATCAGTGGTGAGGTTTATTATGAAAATAAACCTAGAAAGGTAAATTATAGAACTGCGATTTATCCAAATGGTGTGACTAAGGTGATGAAGTGACTGTATTTGATGATTATTTAAATAAGCATCTCTCTGAAGTTGATAAAGCCAGAGCTGATTTTTTACGCTTACATCCATCTCTTGAAAGTGTGATGGGGCGTGATGTGACTAGCCCTGAAGTTGATGTGCTAAATAAAAGCTTAGCTTATTTAGCTGCTAAGGTTGAGCAGAAAATTGATCAGTCTTATCCTGATGTAATATTGAAAATATTTGACTTATTAGCGCCTGAGTTTATTCGCCCACAGCCAAGTGCAACTATCTTGAATTTTACTCCAAAAGAAAGAGTGATGCTGTCGGCAGTTACTATTAATAAAGGGACGCAGGTACTTAGTAGTCAAGAAGGTGCAAATCGAAATATTATTTTTGCAACGACAGACTTAATAAAAGTTCCACCGTTAAGTCTTACTGAGGTAGCAACAGAAAGAAAAAATCATAAAGTTAAAGTTATTTTGGATTATGATGTATTAGAAGGTGCAGTCTTTTCTTTTGCTGATGTTGATATGAGATTTTTTATTAATAGACAGTTAAGTCAAGCATACAGCCTTTATTATGCACTTTTTAATAAAGCTGTTTCGGTTTGCTATATTATCAATGGCAAAAAAATTCATGCAAAAATAAAAGATTATGGTTCTAATCGGTTTAATTTAAAGTATTTAGACCGAGAGTGTTCAAGAATTAATTTATTTCAGGAGTTCATCTCATTTCCCGAGCGATTTTTATTTTTTGAAATTATTGCTGGCAGTAAAAATATTACTATAGATAAAAATTTCTATATAGAAATTATATTTGATGATAGAAATAATGACGTCGTTGATATAGATATAGATACTTTTATTTTGGGATGTGTCACAGGGATTAACCTAGAAAAGGCAACAGCCATTCCGATTAAAAGAAAACCAGGGACATCACAGTATCCGCTTTATATTGATAGCTATGATGAGAGTTACTCAATTTGTGATATAAAACGAGTGAGAAGCTTTACCGTTACAGATGGGGTAAAAAAAGATTATCAGGCTATTTCTCTAATAGGAGATAAAGTTGGTGGTGCTTATGAAAAAGTAACTGCGTTAGCAGATAAGTGCAATGAGCTAAAATTTGCGCTACGCTTTCCCTCCGATGATTTAAGTGAAAAAGATGAAGAAGAGATTATTTTCACAGATTTGGAAGTATTTCATACAACAGCTTATGAGCGCATGGCATTATCTTCTGTTAATAAATTAGGTGATGGTGCGCCGGCCTGTTTCAATGTGAAAAATATAACACGTATTTCTGAACCGTTGCTGCCTGATTTATCTGGAGACTCACTTTGGAAATTATCTGGTTGTTTTAGTGGTCAATATTTTAATATTGAAACAAAAGATGGGTTATCAAAATCTATTCAGTCTTGGAAGAGCTTTATTTATCATGGCAGTAAATATCAGGCGATTATTAATAGGTTTGTTGATAGTATAAAATCAGTTAATCGCAAGTTATCTGCTTTTCCATATAAGGATGTTATCTTAAATGGTGTTGATATTAAAATAGAAGTAAATGGCAGTAAATTTTCTGATAAAGGAGAAATGTATTTATTTTTTAATATATTAAAAGAAATTATGTTTGATCGGGTTGACCTGGGCAGCTTGTATCGCTTGTTAATTACTGATGTAGATAATATGGTTGATATGCTATGGACAAATATAAAGTAAGTCCGTTGGCTCAAATTGTACTTGCTAGAGCTAAAAAAGTTGATCTTAATGGTTTATGTGATATAGCTAGATTATTAAAGAAAAATAGTTTAAAAAATAGGTTGTTTTTTTATTCTAAACCGAGCTTATCTAATGATATTTTAGATATTGATAATGAAAAGATTATTTCTTTTGGTAAAGAGTCACTGTTTTTAACGGCAAATGTTAATTTCTTTGGTTTGACAAATATTACATCACCGTTACCTGAGCACTATATAGAGTCGGCTTTAGCAGATGACTCAGGGAATATTAATAATCTCTTTTCTTTTTATTCATCTTACTTTTTTGAAATTTTATTAAAATTTATAGAAAAAGAAAGCTACTCACTGATAGGACCTATTAATAAAAAAAGTCATATTTTTAGTTATGTATCATTAATTTCTAACTTTCCTCAAGATGCTTTAACTGTTAATAAAGAATCATTTTTTCTGGCAAGTTTAATTTCTTCAGGCAAGAGCCGCTCAGCGATGTGTTTTTTTATTAAAGCTGTTTTTTATTTTGAATCTGTGAGCTTTGATGAATTTATTTTATCTTATGTAACACTTGAACCTGAGTTTAGAGCCTGTTTAGGAAGAAGTAATGCGACGTTACATAAAGATAGTTACATTGGATCTAGGAAAAAAAGCTATCAATCATTAATTCATATTAATATTATTTGTCAAAATAGTCATGAGTTTTATCCAGGGTCAAGATTAACGTGTTCTTTATTTAATGTTATTAGACAAGTGATTCATTCTCCGGTTAATTTTGAAGTTTATATGCTAGAGAGTCAAGCTAGCTGCACACCGTCGATTTTAGGCAAGAAAACCACAGCTTTAGGGTGGAATAGTGTTTTATTTTCTAATGAGAGTGCAGGAGGTAAAGCAATTAAGAAAAAACTGATTTTAAAGGCGAGATGAGTATTAAATTTTAAAAATTTACGATTTAAATGAGGAAAAGCCATGTCTATAGCATCTTTACAGTCTAATTCAGTTTCTACGAATAAACAGTCGAATTTTAACTGCGCGATACAAGTCAAGCTTGAAGGTAATGTCATTACTAATGCAGATGGTGGAGATCCTGTGCATAATGCGGAGTTTGTGCCTTGTAAAGATTATAAGCTTTCTATTCAGCATAGTTTTGCGGCATTTGGAACAACTCAAGCAACGGATAATCGTTCTGAGCAGCATTCGTTTGATTTTTCTGCGAAGTTAAGTAATGATTTGATTGCAGGTCTTATGAACGCAATGCACGGCCAAGAAACCGTTGATATTACGTTGGTGACTTATCGCCGTGTAAAAGGTAATCTTGAAGTCAGTGCGACTTACACGATTGATAAGGCGCTAATTTTGAATCTTAATATTGTCAGTGAGCAAGAAAGTGATTCTTATGTCCACTTTGTTGTTGCCGCACCTACTTATCAGTTTGATGGTGGGCAAAAGTCAGGTGAATATACGACTAAGATTGCTTCAAGCTAAGTCGATATAGTTTCTTGATTTAAATATTACATGATTTGACATAAATTCAAGCCAGATGTTCATGTCTGGCTTTAATAGTTATTAGTGGTTGAGTTGATATGAAATTAAGATAATGCTGCGATTTTTCTTCTTTCACAAATAACGTTGGCAATTTCATCACCATTAATTTTTGCTAAAAACTGATCGGCTTTAACACGCTTAGCCATTTGTTGGTTAAACTCGCCTGAAATTGAAGTATTAAGCACAATATAAAGATCTTTGAGTTTAGGGTGTTCTCTGCACTTTGAAGTTAAGGTATAGCCGTCCATATTGGGCATTTCAATATCAGAGAGCATCATTAATAACTTTGAGTTGATATTATCTGTACCTTCTACCATCTTAGTTAGCATTTCAAATGCTTCGATACCATCGCTTGCCGTAATATATTGAACTTTCAGCTGATCGAGAATATTCGCGATTTGTCTTTTTGCAACTCGCGAGTCATCAACAAGGAGGACGGTATGTTGTGTGGTAGTGTGGTGATGTTTGGATTTTGCACTTTCAGATACGGTGAGATTTGGCGGCATGACAGTTTCTAAGATTTTTTCTATATCAAGAATTTCAATGATTTTTTTATCATGCTGGGTAATCGCTGTTAAAAAATGGGTATTATTAAGCCCTTTAGGAGGACTGTGTATCTTTTGCCATGATGTTTGAATGATTTGATCAACCTCGCTGACCAAAAGACCAATCAAACGCCGGTTATATTCTGCAATCATTAATGTGTTCAAGGATTTATGGTCTAAAAACTCATCATGCAGTATTTTGTTTAAGCTGATAACAGCTAAGCTATGAAAGCCTCTGATTTTTACAATGCCACGAATCGCTTCATGACTATCTGGGACTTTAGTGAGTTTTGGGCACGTCATAATTTCTCTGACTTTAAAAACATTAATGCCATAAAACTGATTTCGAGAAACTTTAAAGAGTAATAATTCAACCCGATTTTTTCCTGCGATGTCTGTGCGCATATCAACGGTTTCAATAAGATCAGTCATATTAATGCTTTTCCTGTGCTTAAGTGATAGTTTGTCCTTACTCCTTATATATAATCTTAGTCGATCAGTAATTATCAACCATTTTATTAAGATATAAAAATTTAGATATTTTAGATAGTAAAGTTTAAATCGATGGCAAAGTCATTAAGGTATGGATAACAGAAATTATAGATAGTGGCATGGATTAATGGCTTTTTTAGCCAGACTAACCAGTTAATCCTAGCCTTTAATAATGGTTAGCTGCCCTGGCGTTACTGTTGCACCGATGGGAACATTAATTAAATTTTGCATCGTTTGATCACCGGGTGAGGTTGCGGCAGGTGCACCACCAATAATGAGGGTGGCATTGGCAGGATTTGGAAGCCGTGATGCTGGACCACAG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51 | Staphylococcus_phage(21.43%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
787008 : 841319
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039176|787008:841319|DBSCAN-SWA 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49 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
884999 : 947540
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039176|884999:947540|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
951442 : 1018405
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039176|951442:1018405|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(20.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1024018 : 1086545
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039176|1024018:1086545|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1095245 : 1144813
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039176|1095245:1144813|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_14 |
1169536 : 1225932
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039176|1169536:1225932|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1242174 : 1289899
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039176|1242174:1289899|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1313718 : 1354927
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039176|1313718:1354927|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039176|1313718:1354927|1327668_1329138_+|WP_027242963.1|DBSCAN-SWA MNNYSLDLAYIEINSEKYLNVISYQEKLSLSSLPEIALEFLVEKKINIDEILYAKAAFVKNNLKITGFIGQVKQVTCSEKYYNYSVGLQHEVYQLNENRKSRIFSNITINDLIHTLFSKQGIAYDLRLNAAYNQEKIFHQYQETDWSFLSRHLERHGIYYYFDYSEDGKIVFIDDKSLHQLLTDKVFISNDFAEKRSRQCLILNESVFTVPNQVIIQSYNPLNAEQLLTATIQVTDHGHSDHYHYIAGAGSQEELERLGNVYAQSLGCLRHTYTLCGEIINVYPGKLINVIEQGGGKAPQKYLVYAMKVCGKQKATTLIQNEEVSPIYECSLYLIPADIQYRSKMSSTVPNIAGFIHASAHGNCDSEYAHLDDSGYYEVTLRANYEKPTPFKARKVEVFAGKNYGMHFPIKVGTELLVGFIHGYPESPIIIGSGYNSDHVNVVNSQNSYDHIIRSESGSEIRLSDQAGSAGFEISHPGYSLKVTTSRES |
36 | Enterobacteria_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1386144 : 1439878
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039176|1386144:1439878|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1458813 : 1518723
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039176|1458813:1518723|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(17.65%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1541083 : 1576523
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039176|1541083:1576523|DBSCAN-SWA 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36 | Staphylococcus_phage(33.33%) | integrase,transposase,protease | attL 1562424:1562483|attR 1572884:1573174 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1581975 : 1624906
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039176|1581975:1624906|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1683241 : 1773556
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039176|1683241:1773556|DBSCAN-SWA 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82 | Burkholderia_phage(14.29%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1784255 : 1834740
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039176|1784255:1834740|DBSCAN-SWA 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46 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1897038 : 1912354
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039176|1897038:1912354|DBSCAN-SWA 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16 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_24 |
1941027 : 1982784
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039176|1941027:1982784|DBSCAN-SWA 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39 | uncultured_Mediterranean_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
1987127 : 2043197
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039176|1987127:2043197|DBSCAN-SWA 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49 | Klosneuvirus(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2062897 : 2112432
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039176|2062897:2112432|DBSCAN-SWA 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41 | Burkholderia_virus(20.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_27 |
2127001 : 2253839
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039176|2127001:2253839|DBSCAN-SWA 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116 | Staphylococcus_phage(14.81%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2266688 : 2327656
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039176|2266688:2327656|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 2274541:2274600|attR 2324962:2325722 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2348498 : 2376151
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039176|2348498:2376151|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2415396 : 2448845
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039176|2415396:2448845|DBSCAN-SWA 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23 | Burkholderia_virus(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2484296 : 2542860
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039176|2484296:2542860|DBSCAN-SWA 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55 | Burkholderia_virus(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2552581 : 2603995
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039176|2552581:2603995|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2613289 : 2657004
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039176|2613289:2657004|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(30.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2671681 : 2731750
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039176|2671681:2731750|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(26.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
2769528 : 2822557
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039176|2769528:2822557|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_36 |
2837123 : 2891384
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039176|2837123:2891384|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_37 |
2898970 : 2948616
Sequences of DBSCAN-SWA_37
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_37 >NZ_CP039176|2898970:2948616|DBSCAN-SWA 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43 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_38 |
3076298 : 3141547
Sequences of DBSCAN-SWA_38
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_38 >NZ_CP039176|3076298:3141547|DBSCAN-SWA 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55 | Hokovirus(14.29%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
3344 : 19366
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039180|3344:19366|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039180|3344:19366|8475_8730_+|WP_027242953.1|DBSCAN-SWA MNNKHKKTLREIYTDPIKVNIVWSDVEKMLIAAGATIEERSGSAIAIFLGDEYLGIHRPHPERTAQRYVVKKVRELLKRNGIHA >NZ_CP039180|3344:19366|16515_16731_+|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039180|3344:19366|7965_8331_+|WP_027242954.1|DBSCAN-SWA MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA >NZ_CP039180|3344:19366|18395_18953_+|WP_027242944.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGPFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP039180|3344:19366|12316_12799_+|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP039180|3344:19366|14077_14470_+|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA >NZ_CP039180|3344:19366|6458_7433_+|WP_069971681.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039180|3344:19366|11846_12230_+|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP039180|3344:19366|12801_12987_+|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI |
21 | unidentified_phage(35.71%) | integrase,head,capsid,terminase,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 117510
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039177|0:117510|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039177|0:117510|2835_3456_+|WP_080963659.1|DBSCAN-SWA MIWISCLILSREHKKITFLKLTIIFRNSAVSSLFGARYQGFIEEMLVSPMHPGTILLGYIIGGMARGLVVGSLVLLVALFFTSMTIQHIFLTFIIAIITNVLFSAAGFINATLSKKFDDVTIIPTFILTPLTYLGGVFYSVDYLPESLRWLCYLDPIYYIINEFRYAILDIREVNFWLNMSVLCIFTFLFTGIAYYLLSKGKVQSI >NZ_CP039177|0:117510|49782_50166_+|WP_027242929.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPVTEVDHIKPHDGDHDLMWNQRNWQALCKPCHSRKTVNDDGGFGRKRSPQGRGI >NZ_CP039177|0:117510|49383_49587_+|WP_017375952.1|DBSCAN-SWA MMRLSEFSFLVALGLLLASQCYGLAFFLIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039177|0:117510|10152_10881_+|WP_048876210.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDFKKIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQCYQSLSTARPIIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|0:117510|36688_36907_+|WP_027242937.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP039177|0:117510|82964_83231_+|WP_080963664.1|portal|DBSCAN-SWA MLKTRTYLGLLTPCLALHGSQRQSISRDLLLAHERKKYFVKFNIEGLLRGDTAARASFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGGRN >NZ_CP039177|0:117510|31610_32387_-|WP_017375850.1|DBSCAN-SWA MNINYNFSRSKSYNERARFLILHYTAGNFEISLKELTTNVSSHYLVPLNKKDDPSYPLNEVQIMNIVDEKNRAWHAGVSAFQDRVNLNDSSIGIEIVNLTKTIENFLPYPDYQINLIIELCQNILARHQDIIPQRVLGHSDIAFDRKSDPGPLFPWKRLYDSGIGAWFDDDTVLQYKQALQKGLVTLDTAYEKIQEYGYCVDRHNTYCKKINKNKLVRAFQMHFRSSKYDGILDEETASIMLALWTKYTASGRFAFDM >NZ_CP039177|0:117510|96235_96427_-|WP_144420833.1|DBSCAN-SWA MCKIPTEVATLTYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCRYLFDQDNNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ >NZ_CP039177|0:117510|1654_2041_+|WP_017377656.1|DBSCAN-SWA MKYILDTHVLLWTASDSPKLSSEVRLLLNERGNELFFSAASLWEIAIKNSLGRKDFKVEPHLLRRGLLDNGYSELVITSEHAVGVSGLPSIHKDPFDRILIAQAISEGFTLLTADELVAQYPGPIMKT >NZ_CP039177|0:117510|35419_35728_+|WP_017375972.1|DBSCAN-SWA MSEIIESVLDDIERMHKAGVINTVTVQKFKKLANVPEPKHLSQKKIQAIRKKTHLSQAMFARFLNVTVSTVQKWEQGVNEPAGPALVLLNLVDKQGIKAVAL 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120 | Streptococcus_phage(40.0%) | terminase,transposase,portal,integrase | attL 11253:11312|attR 117876:119611 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
123457 : 125079
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039177|123457:125079|DBSCAN-SWA GATGGCTTTATGGAAAAGAAAACCTAAAACTGGGTTAATTTGGCATTCAGATCGCGGAAGCCAATATGCTTCAGAAAGTCATCGTGAGATTCTTAAAGATTATAAAATTAAGCAAAGTATGAGTCGTAAGGGAGACTGCTGGGATAACGCTGTTTCAGAGAGTTTCTTTCATACACTAAAAACGGAGTTAGTTCATCACATGAATTTTAAAAATCGACAGGAGGCTAAATCAGCGATCTTTGAGTATATCGAAGTTTTTTATAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCAGTATTAATAATTCATGTGTGGTGGAGTTCAATTTATTCGCGACAATAAAATCATCAAAAGTTATTTTTTAAATCCACAAGCAGTACTGCCCGTGTTAAAAAAAGTGGAGATGTTGAATAAAAACATTTAAATCTAAAGTGTTACATAAAAATAGAGAGAAAACAATGGTGACATTAACCGTAACTGATATTCATGATTTAACAGTAATGCTAGGTATGTTAGAAGATATTTATCAATATGAAATCCCTGCGGCGCAACGAATTTTAAAAAAAATTGCTGATAAACCTGAATCTAAAAGCTATCACATTGTTCCAACAGGACTAAGTTCAGAAAAAAGTATACACTACGTAAATAAGTTAAGAGACTGAAGTATATATTTCATAGTATTTTTCTGCAAATAATATAATGGTTACTTCTCATTAAAAAAGTGCTTTTAATAAATTTTATTAAGAAGAATTAAAATGAAACAAAAAAAATCGATAATAACTGGGCTATTTTTTAGTTTTTTTATTGTGTCTATAAATGCGGTAGTACCAGCAAAGCCGATAAGTAAAGCGTTTCATTGTAATGGCTTTATGAAATATGGTGTTCCTGGTAAAACCGATCAGTATTTATGTCGTGAAGGATATAGTGTTGGCTATGACTATAAAACAAAACAGCCGAAGTGGGTTGCCTATCATTTAACCAGTCAAAGCGTTTCTAAACGAATTAAACGCCATGATGAGTTTAGACCAGATTCTGAGATTCCTTATAAATACCAAGCACAGCTGTCAGACTACAAGCAATCTGGTTATGATCGTGGGCACTTAGCCCCTTACGCTGCTATGGACTTTGATAAGAAGTCGGCGTCTCAATCCTTCTTATTATCGAACATGAGTCCTCAAAAGGCTGGTTTAAATCGGCAAGGTTGGGCGAAGCTAGAGTCAAATGTACGGTTTTGGGCCAAATATAAGAAGGAAGTGTATGTTTATACAGGGCCTATTTTTGAAGGAAAAAATATCAAAACAATCGGTAAAGGTAAGGTTGCCGTACCAACTGCATTCTTTAAAGTTATATTTGCACCTGAGAAAAAGCAAGTATTGGCGTTCGTAATGCCTAATAAGCGTGTTGCTAAAAATAAAGTTGCTGAGTATAGAACAAATATGAATCATATTGAAAAATTAACCGGGTTAAATTTTTTAAATCAATTACCTTTGATTGAAAGAGAAAACCTTGTTACAAAAACAGAAAAAATGTGGCGTACTCACTACAGTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039177|123457:125079|123987_124191_+|WP_017375836.1|DBSCAN-SWA MVTLTVTDIHDLTVMLGMLEDIYQYEIPAAQRILKKIADKPESKSYHIVPTGLSSEKSIHYVNKLRD >NZ_CP039177|123457:125079|123457_123793_+|WP_017375632.1|transposase|DBSCAN-SWA MALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS >NZ_CP039177|123457:125079|124284_125079_+|WP_027243203.1|DBSCAN-SWA MKQKKSIITGLFFSFFIVSINAVVPAKPISKAFHCNGFMKYGVPGKTDQYLCREGYSVGYDYKTKQPKWVAYHLTSQSVSKRIKRHDEFRPDSEIPYKYQAQLSDYKQSGYDRGHLAPYAAMDFDKKSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKKEVYVYTGPIFEGKNIKTIGKGKVAVPTAFFKVIFAPEKKQVLAFVMPNKRVAKNKVAEYRTNMNHIEKLTGLNFLNQLPLIERENLVTKTEKMWRTHYS |
3 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
131449 : 133867
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039177|131449:133867|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAATCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCATGTGACGGAGGGCGTAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCATAAACACAATCATCTTATTCAGGACTTACGCATTGACAACAAAATCTAGTTACGCCCTCCGTCTTCTATTGGGTTCATATTTTCTAGTTCGCGAATATCATTTTGACTCATTACACCAATGCTAAACATGCGATTATAAAAAGAGGCGCGAGCGGCCGTATCACCGCGTAATAAGCCCTCAATATTAAATTTTACAAAGTATTTTTTACGCTCATGGGCAAGTAATAAGTCACGGCTAATACTCTGCTCGATTTTAACCAGCCAGGGCACCAAACTATGACGAACAAAGGCTAAATCTTGATGCTCAATATTTGAAAAAGTGGCGCGTTCTAAATCGGCAATCATATGCGGCGGCACCCGGAAAATGCCACAGATTTCATTGCGCTGGTATTTACGTGTTTCTAAAAACTGACTGTCTTCACTGCTCATGGTCAGCGTTTGCCATTTCAAGCCATTCTCTAAAACAGCCACCCCGTTCGAATTTTTACCGCCGTGGGCTTTTTTCCAAGACTCCGCTAAGTTTTCACGGCCTTCTTTTTTTAACTGGCCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTCTGTGGTTAAGATGCCGCTGGGGCGTGCACCATTACCGAATAATTGGGCGCCATGCGCTTGGGTTGCCGCAGATAAGCCGAGTGATTCGCGTTGTAAGGTAATTGGACTGCTGCCGATAATCCCGTCACTACCCATCGCATTCAGCCGCCACACTTGATCATCGCGGAGTTCATAGCTTTGACCGTTTAACATCGTGCTATAGATGAGCTTTTTTGTTTTTTCATCACGGCGCACCGTGGTGCTATCAGTGGGCAGTTGGATTAATTCACGCACTCGCCCTGCAGCATCGCGAATAACCTGACAATAAGCATTGCCACGTAGACATAAATGGCCCACAAGGTTTTCACGTAAATCAAAACTAGTCACTTCACCATTCGGTAAATCATGCAAGACAGAATATAACGGGTGATCTGTGGCCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039177|131449:133867|133411_133867_-|WP_048876221.1|portal|DBSCAN-SWA MATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQVIRDAAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLIYSTMLNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDAASHGVLSTG >NZ_CP039177|131449:133867|131449_132424_-|WP_048875857.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA |
2 | unidentified_phage(50.0%) | transposase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
138585 : 145553
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039177|138585:145553|DBSCAN-SWA TGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGTTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCCTTGGCTCGCAGCGTATGATGTTTTAATAAGATAAGCAATTAAAATAGAGGTCTGTGGGCATGAGAAGAGTTAACTTGTCAGAGCTTAAAAATAAAGAAAAGTTTGAAGACCGTGGATACACACATTATATACAAACATGTTCTTTTGAAGGGAAGAAGTGTTATGTAAAGCTCTCTTATAAAAACGACTCTTCAACCTCTTCCCTATTGTTCGAAGCATTTAATCTACTTTCTTTGAAAGTCTTAGGGCTTGCTATACCCGACACTATTCATTTAGTCCAAGATCAAGAAAGTAATAAGTGTATTGGGTACTTAACTTCTGAAGTTATCTTAGATAAGGCTTTAAAGTTTATCGACTTTGCAGAAGATCTTGCAAGAATAAGCCTTACTCGACTAATTTTGGGTGATAACGCGGCTACAGAAGATGGGAATATATTAATGACTAAGAGTCAGTTGATTTCTATTGATGTGCCATTCTTTGATCTTGCACCTGAATTCGTACCTAATAAATATCAAGATCATATTGAATTGTTTTCCGAAGTATTTCTGGATAAAAATTCACTTAGCCATTTATCTAAAAATGTAATCAATCATTTTTATAATAATATAGGATTAATAAGCTATAAGCTTTCTAGACTATATCTTGATAATGTAATTTCTGAAGTAGAAAAAAATGATTACCTAAAAAAATTAATAGGCAATATATCAAGCTTTTATGGACTTATTTCAATATTGAAAGAAAAGAAAAATCCTCACGATTCTCTCACGGACTCTGAGTATGAATTATACTTTGCAAATAGACTTGAGCATATCCAACAACTAAATACTATAGTCGTTGAACAGGATTTATCAGCCCAAAAAGATCATGTATCTGAAAATCTATTTTTCGATGCAAATGAACACTTAGAAAATATCGATACTTCTGAACTGCTATTTTTTGATGCAAAAGATACGTTAGAGAGTTGTTCCGGCACTGTTGCAAAAAATTTAGATTTGAGTAGGGTGTAGCAATCAACGGAAGTTAAGAGTGAATTGCTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCTAAATTAGTGTGATAGAGATCTGCTCCTCTTAAGTTCACGCCCTCTAAGTTAGCTTTATGTAAATTAGCTTCTCTTAAATTGGCTCCATCTAAATTTAAACCTCTAAGGTCAACTCCTTCAAGATTCCACCCATATAAGTTAATCACATCACCAGTTTCTATTGACTTTTGAATCGCTTTCTGTACATCTGCACGAGTTTTTTTTGTCATAATTTAATCAACGCTTTAAATTTAAAAAAAATTTATATAACAAATATTTAGATTTTACAATCTTAAAATTTTTTACCAATTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGACAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTAATTTAAGTTACGCTAATTTATCAAAAGCAAATTTAAGTAGTATGGGTTGGGGAAGTGCTATAGTTGCTGGAGCTGCTTATGGAGGATTTGTTGCTGCAATCTCCAAAAATATAGCAGGAATGAGCGTGGGAACATCTGTTTTAACTGGTGCAACAGTAGCTGCAATGGTTACATTCACTAAAAAACTTGAAGGCGCTAATGTAAAAGTTACAAATTTATTTGGTGCAAATTTATCTGGTGCAAATTTAACTCATACAAACTGTACGGGAGCATACTTTATAGATACAGATCTAACTAATGCGAAAGTAAGCAAAACTGATTTAAAATATGCGATGTTTTCCAAAATAAGCTTAGAAGGGACAGGTCTGAATTTTAAAGATTTAGTTGGCGATGCCACACCTAAATCTGAAGGCTTAATGGAGCTTCCTTCTGTAATTTACATTCCTAAAGTTACAGGCTCATATCAATATTACGAAAGAAATCACGGTTACTTATCTGCTCATTTGCCACAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039177|138585:145553|142271_143000_-|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|138585:145553|139455_140388_+|WP_144420837.1|DBSCAN-SWA MSELKNKEKFEDRGYTHYIQTCSFEGKKCYVKLSYKNDSSTSSLLFEAFNLLSLKVLGLAIPDTIHLVQDQESNKCIGYLTSEVILDKALKFIDFAEDLARISLTRLILGDNAATEDGNILMTKSQLISIDVPFFDLAPEFVPNKYQDHIELFSEVFLDKNSLSHLSKNVINHFYNNIGLISYKLSRLYLDNVISEVEKNDYLKKLIGNISSFYGLISILKEKKNPHDSLTDSEYELYFANRLEHIQQLNTIVVEQDLSAQKDHVSENLFFDANEHLENIDTSELLFFDAKDTLESCSGTVAKNLDLSRV >NZ_CP039177|138585:145553|138585_139314_+|WP_017377509.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPVHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|138585:145553|140417_141146_+|WP_017377511.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|138585:145553|141148_141421_-|WP_017377512.1|DBSCAN-SWA MTKKTRADVQKAIQKSIETGDVINLYGWNLEGVDLRGLNLDGANLREANLHKANLEGVNLRGADLYHTNLGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039177|138585:145553|144824_145553_-|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|138585:145553|143055_143676_+|WP_144420838.1|DBSCAN-SWA MQQCPNLSYANLSKANLSSMGWGSAIVAGAAYGGFVAAISKNIAGMSVGTSVLTGATVAAMVTFTKKLEGANVKVTNLFGANLSGANLTHTNCTGAYFIDTDLTNAKVSKTDLKYAMFSKISLEGTGLNFKDLVGDATPKSEGLMELPSVIYIPKVTGSYQYYERNHGYLSAHLPQEESTLNTPRLFEGSQQQECQEQSSSVNLTH |
7 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
154420 : 158060
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039177|154420:158060|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAACATAAAGCTAAACTTCAAAAATAATGATAAATAAATTGAGTATTGAAAATGGGACAGTTAACAATGCTAAAAGATTTTAAATCACTGCCTGCAATAGAGAAGGCAATACGCCTTGCCGGAGGCATCTCTACGCTAGCTAATGAGCTCAGTGTAACTAATACAACAATCTATAACTGGAGAAAAAAGCCTGAGTCAATCCCTCCTGAGAGAGCTAAACAAATCGAGGACTTTTCTGGTGGCCTTGTTACTAGAACAGAATTACGACCAGACTTATTCGCTTAACTTTAAACATTTGGAGAAAGTAAATGATAATTGTATATGGTGGACGAAAAGGCGGCGTAGGTAAAAGTTCAGGAGCTATAAACTTTGCAGCTGGATTGCAAGAACAGGGTAAAGATGTATTGTTATTTGATGCGGATAGAACAGAAAACTCATCTTCTTGGAATCATATTCGCAATGAAAATAAAACTCTTAAAAGAGTTAACAGTGTTCAAGGTTATGGCAATATTTTAACGCAGCTAGCCGACCTATCAGAACGTTACGATGATATCGTAATTGATACGGCAGGAAAAGACTCTCAAGAATTTCGCTATGCTTTAGCTGTTGCCGACATAGCTCTTATTCCATTCAGATGTTCAATGTTTGATCTTAAAACATTACCACAAGTGTCAGATATAATTTCAACAATGCGCCCAACGAACCCAAAACTTCAATGCTTTTGCTATATTTCGATGGCAACAACTAACCCAATAATGAAAGAAGTATTTCAAACATCTCAAAGGGTGGAGAAATTAAAAAGAGACGGGTTAATTGACGAGTTAACTTTTTTGGATTCAATAATCTCAGACAGAGTTGCTTTTAGAAATGTTTTATTTGAAGGAAAGTCTATCTATGAAAATGACGACAAAAAGGCAATTCAAGAAATTGAGGATATTATCCACGAAATTTTAAATTTACACAGGACAGCTCTTGATAAACAAGGTAGTCAACATGCCCAAGAAGCTTAATTTAGATGATATTGACCTTTCATTAGTTCAAGAATTAGCAACACAAGCAGATATGACTAATGACGAAATTAATATAAGACAAAAGAAACAAAAAGAATCTCCAAAAGTTGTAATTAATGGATATATGAATCGTGCTAAATGTGTGACTTCTTCCTCATGCATAAAAAAAGAACTAGTTAGCGATATTGAAGCTCTATGCAAAGGCAATAAGTGGGCTGCTATAAACTATGTTTTAAAGCTAGGTTTAGAAGAATTAAAAAAAGAAAAAGAAGTGGTTTTTATTGAAGCATCAGACTTATAACGTAAAAGTAGTACGAGGTAGTACGAGGTAGTATCACATTTATTTTCAAATAGGTATGGATTTTTACATCATTACGATGAACAATATTATCAGATAAAAGAATTAGGTAAGATATTTCGAAAGTGATTAAATAAAATAAAGCCCTCCTGCAAGAGGGCTAACAACTGGCCGGCGTAGAAACCTAACCAAGACATCCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039177|154420:158060|156480_156798_+|WP_036773107.1|DBSCAN-SWA MPKKLNLDDIDLSLVQELATQADMTNDEINIRQKKQKESPKVVINGYMNRAKCVTSSSCIKKELVSDIEALCKGNKWAAINYVLKLGLEELKKEKEVVFIEASDL >NZ_CP039177|154420:158060|155538_155772_+|WP_017375692.1|DBSCAN-SWA MGQLTMLKDFKSLPAIEKAIRLAGGISTLANELSVTNTTIYNWRKKPESIPPERAKQIEDFSGGLVTRTELRPDLFA >NZ_CP039177|154420:158060|157085_158060_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039177|154420:158060|154420_155395_-|WP_036773116.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039177|154420:158060|155795_156497_+|WP_017375691.1|DBSCAN-SWA MIIVYGGRKGGVGKSSGAINFAAGLQEQGKDVLLFDADRTENSSSWNHIRNENKTLKRVNSVQGYGNILTQLADLSERYDDIVIDTAGKDSQEFRYALAVADIALIPFRCSMFDLKTLPQVSDIISTMRPTNPKLQCFCYISMATTNPIMKEVFQTSQRVEKLKRDGLIDELTFLDSIISDRVAFRNVLFEGKSIYENDDKKAIQEIEDIIHEILNLHRTALDKQGSQHAQEA |
5 | unidentified_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
161510 : 172972
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039177|161510:172972|DBSCAN-SWA 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GTATCTTCGTCACGTAAATAATCTAAGCAATTTTTTAGCTCTTTACGGTTTTGGTGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGTAAAACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATTATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGTTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATTAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCAATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTCTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039177|161510:172972|170462_171191_-|WP_036772541.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|161510:172972|162534_163074_+|WP_075275454.1|capsid|DBSCAN-SWA MAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTATAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAS >NZ_CP039177|161510:172972|161510_162485_+|WP_036771639.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039177|161510:172972|164364_164790_+|WP_017375779.1|head|DBSCAN-SWA MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEALDYWQDITTVWARVSPNAGRELFSAQQFYHEVSQTVTLRYRPNVTPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACRERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039177|161510:172972|171632_172361_+|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA >NZ_CP039177|161510:172972|164968_165364_+|WP_017375780.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEKQLKQLAPKKIRNLNRRALRKAAEPVETQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTVVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQKSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP039177|161510:172972|165710_166133_+|WP_017375782.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNGGNYVKLANITNIGEISSSRDKVDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDAGVERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVIVQSDEV >NZ_CP039177|161510:172972|169193_169865_+|WP_017375787.1|tail|DBSCAN-SWA MSLIESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCHSPDGNQAVSFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPLLLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVKHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQVWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLANCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP039177|161510:172972|164056_164368_+|WP_017375778.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLTRLKSHLRIEDHSEDDYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSV >NZ_CP039177|161510:172972|172363_172972_-|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039177|161510:172972|166514_166781_+|WP_017375784.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYALEPFGVEKDDHRTALLVSAVVNGPLQRKDKTLFTPDDFMPNYSAGDEKKAQSATDMAAILSAIAKRK >NZ_CP039177|161510:172972|166134_166458_+|WP_017375783.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQYYQQQHADLSETEASLLLICLSLCDLQGAKVFDVSEYKKLAELPLGIIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP039177|161510:172972|165360_165711_+|WP_017375781.1|DBSCAN-SWA MIEDIYFALLGTGWPVFPMVLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDNITEQLNGYHNENIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFHLTGVV >NZ_CP039177|161510:172972|163087_163672_-|WP_027242598.1|DBSCAN-SWA MPTQKYLKKTRDLIGKFDSRIAHLQEEIDICAKYDHDLHRCLQEQKTQNLPLHQQYENLKEFSKSNYNPIAQSASRKLALLCKFRGILEKSTYDIGTAKKGLGSLNAIFSICRFSGGKYHYPKVFEAIGCGLFSKTKKLCSQARELLKERISVEAEAAQSAGKWRTASPVLNALQSFQVTSSAPSPEANVPGQP >NZ_CP039177|161510:172972|171220_171610_-|WP_051929563.1|DBSCAN-SWA MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLDLSMV >NZ_CP039177|161510:172972|168855_169197_+|WP_017375786.1|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIDADKVKPRLRITPLGDGYMQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERTGLEAFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVILRFEEDFNPL >NZ_CP039177|161510:172972|166784_168863_+|WP_036771950.1|tail|DBSCAN-SWA MATIGSLVVNLSANSAELVKSLSKAELASKNFSKKVQRNLKKTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQTKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAAGEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFCVVAKSFAIVGDGVHYINIGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAKGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIADAGATLPIVGNKFERLGQSIARMKASVSERFTLDTSGLKIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDDIAKKAAALDEKIRTSQPEKSALMGASLHVQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIQHSYDKQKRIILDATREGSEERAKLLEKIEVQKNTKLKNLAQKQAKELNGIGHQAKELAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASKGIFKSILGGVISSVGGSSFASWFGGGSTAAGAKASGGTVAAGQLYRVNEQGAEIFSSGGKDYLMTGKKSGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSADVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA |
17 | Streptococcus_phage(18.18%) | head,capsid,transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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