CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039181	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 chromosome, complete genome	2 crisprs	csa3,RT,cas3,DEDDh,DinG	1	1	33	32
NZ_CP039184	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039185	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039183	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	7	1	13

1. NZ_CP039181

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039181_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039181_1
• CRISPR_location: 351555-351684
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039181_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039181_1

>1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039181_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039181_1

>merge|NZ_CP039181|1|351555-351684|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP039181|1|1|351555-351684|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039181.1|WP_081007059.1|347135_348197_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP039181.1|WP_075273619.1|355382_355958_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016212008.1|352541_353240_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_054300516.1|356015_356849_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP039181.1|WP_155046938.1|350688_351264_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039181.1|WP_016211271.1|358167_359112_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP039181.1|WP_054300520.1|350333_350648_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016212359.1|343165_343384_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_155046940.1|354726_355110_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016211268.1|356964_358149_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP039181.1|WP_016212044.1|344157_344412_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP039181.1|WP_075273359.1|349812_350388_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039181.1|WP_016212281.1|340848_342303_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016211795.1|346258_346453_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016211797.1|348358_349762_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP039181.1|WP_054300518.1|353676_354522_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_036794771.1|345134_346121_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039181.1|WP_032126227.1|352213_352504_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016211269.1|359416_360202_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP039181.1|WP_016212010.1|353256_353553_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039181.1|WP_081007059.1|347135_348197_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP039181.1|WP_016212044.1|344157_344412_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP039181.1|WP_075273359.1|349812_350388_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP039181.1|WP_016211797.1|348358_349762_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP039181.1|WP_054300516.1|356015_356849_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP039181.1|WP_155046938.1|350688_351264_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.44996e-46
NZ_CP039181.1|WP_036794771.1|345134_346121_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP039181.1|WP_016211269.1|359416_360202_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP039181.1|WP_016211268.1|356964_358149_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP039181.1|WP_016211271.1|358167_359112_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37

Protein sequences

>NZ_CP039181.1|WP_155046938.1|350688_351264_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGYSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLKPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP039181.1|WP_054300520.1|350333_350648_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP039181.1|WP_075273359.1|349812_350388_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP039181.1|WP_016211797.1|348358_349762_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP039181.1|WP_081007059.1|347135_348197_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP039181.1|WP_016211795.1|346258_346453_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039181.1|WP_036794771.1|345134_346121_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP039181.1|WP_016212044.1|344157_344412_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP039181.1|WP_016212359.1|343165_343384_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP039181.1|WP_016212281.1|340848_342303_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039181.1|WP_032126227.1|352213_352504_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP039181.1|WP_016212008.1|352541_353240_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP039181.1|WP_016212010.1|353256_353553_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP039181.1|WP_054300518.1|353676_354522_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039181.1|WP_155046940.1|354726_355110_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP039181.1|WP_075273619.1|355382_355958_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP039181.1|WP_054300516.1|356015_356849_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP039181.1|WP_016211268.1|356964_358149_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP039181.1|WP_016211271.1|358167_359112_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP039181.1|WP_016211269.1|359416_360202_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP039181_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039181_2
• CRISPR_location: 516511-516631
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039181_2

Consensus_repeat	Method
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039181_2

>2.1|516548|47|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder
GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039181_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039181_2

>merge|NZ_CP039181|2|516511-516631|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAAGCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCGAGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

>NZ_CP039181|2|2|516511-516631|CRISPRCasFinder
AGCTTATCAATGGTTAGTAGCCCTTGGACTTAATCAA	GCAAAGTATGTCCAGCACGTACTTACTGACCCTAAACGATTTGAGCG
AGCTTATCAATGGTTAGCAGCCCTTGGACTTAATCAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039181.1|WP_054300493.1|519430_519643_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_032126312.1|512376_513171_+|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP039181.1|WP_051307363.1|513839_514022_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_017375910.1|508979_509708_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039181.1|WP_016212269.1|507814_508498_-|Fic-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376885
NZ_CP039181.1|WP_155046943.1|516902_517043_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_017375910.1|506341_507070_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039181.1|WP_016211759.1|510039_511227_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP039181.1|WP_129556490.1|514246_515133_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039181.1|WP_036778297.1|525044_525518_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016211905.1|517741_518152_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_016210676.1|521115_523197_-|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP039181.1|WP_075275117.1|517075_517498_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039181.1|WP_032126362.1|519003_519369_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
NZ_CP039181.1|WP_054300492.1|519801_520812_-|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP039181.1|WP_129556590.1|513167_513563_-|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP039181.1|WP_016212268.1|507226_507811_-|recombinase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239737
NZ_CP039181.1|WP_016210671.1|523652_524912_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP039181.1|WP_016211756.1|511472_512198_+|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP039181.1|WP_075273327.1|518482_519058_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039181.1|WP_032126312.1|512376_513171_+|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP039181.1|WP_129556490.1|514246_515133_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.49003e-44
NZ_CP039181.1|WP_017375910.1|508979_509708_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP039181.1|WP_016212269.1|507814_508498_-|Fic-family-protein	gnl|CDD|376885	pfam02661, Fic, Fic/DOC family. This family consists of the Fic (filamentation induced by cAMP) protein and doc (death on curing). The Fic protein is involved in cell division and is suggested to be involved in the synthesis of PAB or folate, indicating that the Fic protein and cAMP are involved in a regulatory mechanism of cell division via folate metabolism. This family contains a central conserved motif HPFXXGNG in most members. The exact molecular function of these proteins is uncertain. P1 lysogens of Escherichia coli carry the prophage as a stable low copy number plasmid. The frequency with which viable cells cured of prophage are produced is about 10(-5) per cell per generation. A significant part of this remarkable stability can be attributed to a plasmid-encoded mechanism that causes death of cells that have lost P1. In other words, the lysogenic cells appear to be addicted to the presence of the prophage. The plasmid withdrawal response depends on a gene named doc (death on curing) that is represented by this family. Doc induces a reversible growth arrest of E. coli cells by targetting the protein synthesis machinery. Doc hosts the C-terminal domain of its antitoxin partner Phd (prevents host death) through fold complementation, a domain that is intrinsically disordered in solution but that folds into an alpha-helix on binding to Doc.This domain forms complexes with Phd antitoxins containing pfam02604.	5.41399e-08
NZ_CP039181.1|WP_017375910.1|506341_507070_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP039181.1|WP_016211759.1|510039_511227_-|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP039181.1|WP_075273327.1|518482_519058_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP039181.1|WP_016210676.1|521115_523197_-|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP039181.1|WP_054300492.1|519801_520812_-|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP039181.1|WP_032126362.1|519003_519369_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08
NZ_CP039181.1|WP_129556590.1|513167_513563_-|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP039181.1|WP_016212268.1|507226_507811_-|recombinase-family-protein	gnl|CDD|239737	cd03768, SR_ResInv, Serine Recombinase (SR) family, Resolvase and Invertase subfamily, catalytic domain; members contain a C-terminal DNA binding domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. Resolvases and invertases affect resolution or inversion and comprise a major phylogenic group. Resolvases (e.g. Tn3, gamma-delta, and Tn5044) normally recombine two sites in direct repeat causing deletion of the DNA between the sites. Invertases (e.g. Gin and Hin) recombine sites in inverted repeat to invert the DNA between the sites. Cointegrate resolution with gamma-delta resolvase requires the formation of a synaptosome of three resolvase dimers bound to each of two res sites on the DNA. Also included in this subfamily are some putative integrases including a sequence from bacteriophage phi-FC1.	6.73823e-57
NZ_CP039181.1|WP_016210671.1|523652_524912_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP039181.1|WP_016211756.1|511472_512198_+|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66

Protein sequences

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38. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to position: 2914874-2914911, mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to position: 602913-602950, mismatch: 1, identity: 0.974

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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP039181_1	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	23888-23925	0	1.0
NZ_CP039181_1	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP039181_1	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP039181_1	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
NZ_CP039181_1	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	186740-186777	0	1.0
NZ_CP039181_1	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	NZ_CP038894	Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence	23887-23924	0	1.0
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1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45582 : 58682	17	Moraxella_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	152596 : 201593	57	Bacillus_phage(50.0%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_3	217478 : 271377	44	Acinetobacter_phage(50.0%)	tRNA,transposase,tail	NA
DBSCAN-SWA_4	434960 : 547212	106	Escherichia_phage(32.14%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_5	555686 : 602576	43	Escherichia_phage(27.27%)	integrase,transposase	attL 560126:560185|attR 572114:572401
DBSCAN-SWA_6	618670 : 651857	34	Escherichia_phage(57.14%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	730255 : 784937	50	Agrobacterium_phage(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	841911 : 873674	32	Catovirus(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	879594 : 925401	44	Staphylococcus_phage(41.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	960800 : 997898	35	Bacillus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_11	1001020 : 1044945	45	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1057614 : 1122504	58	Bacillus_phage(30.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1131042 : 1198637	54	uncultured_Mediterranean_phage(26.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1250276 : 1287573	35	Bacillus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1294329 : 1349920	51	Vibrio_phage(18.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1370706 : 1411164	34	Klosneuvirus(25.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_17	1439085 : 1618039	158	Staphylococcus_phage(17.5%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 1480392:1480451|attR 1560849:1561814
DBSCAN-SWA_18	1646584 : 1690974	42	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	1701274 : 1770129	59	Cedratvirus(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1798702 : 1842475	40	Escherichia_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	1886879 : 1905661	17	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	1950172 : 1960520	15	Acinetobacter_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2026555 : 2081470	56	Orpheovirus(16.67%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_24	2094006 : 2135820	39	Moraxella_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_25	2156669 : 2284243	117	Staphylococcus_phage(12.5%)	integrase,tRNA,transposase,protease	attL 2184871:2184930|attR 2214099:2214688
DBSCAN-SWA_26	2291052 : 2362213	57	Staphylococcus_phage(42.86%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	2367077 : 2413588	48	Prochlorococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_28	2482421 : 2524863	47	Synechococcus_phage(50.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_29	2529359 : 2576912	53	Escherichia_phage(47.06%)	integrase,transposase	attL 2539240:2539299|attR 2551975:2552235
DBSCAN-SWA_30	2580124 : 2632334	52	Staphylococcus_phage(22.22%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_31	2662400 : 2698729	37	Stx2-converting_phage(20.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
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DBSCAN-SWA_33	2924665 : 3025537	103	Staphylococcus_phage(35.71%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211200.1|50507_51815_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
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WP_016211196.1|53013_53739_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54017_54407_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54594_55500_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046697.1|55547_55691_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273385.1|55738_56542_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007063.1|56569_57055_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.3e-40	52.0
WP_032126362.1|57092_57458_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|57403_57979_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007062.1|57942_58272_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-08	40.0
WP_017377700.1|58388_58682_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.4e-06	36.5

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039181|152596:201593|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MKLGILVAICLGVLTLPSVQAAPLAVVDLVQVNKESSLIIAKNNKLVAAEKAKSAKLLKMRNALIDLSAQEKKAIAAISDENKRAEAIKTAQLKITLAEEKLKKEALELQKAQLEEQRDAQRSINHMLNVTVAKLAQSKEAPFDLLMNKQAVLYAGGRVTDLTPQLIIALQKAPTK
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MAEKQFAVTGYIVNLARNIPTVWQDTTVTSAAASIEVYGDDTRLILYFVHTNDPLGDCAYLPEQNVGVSFMTMDQLPYYLKLLESRHVMAYLDSKMPEQNGLFMSVNYSKSC

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300544.1|155435_155882_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126725.1|156377_156944_-	DUF1415 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210241.1|156955_157741_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210235.1|158372_159296_+	two pore domain potassium channel family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210242.1|166058_166397_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|166481_167012_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|167072_169265_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
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WP_016210225.1|172781_173060_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300541.1|177667_178447_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126848.1|178980_179781_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|181125_181701_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|181646_182012_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|182075_182348_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300540.1|182615_182840_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300539.1|183855_185199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377589.1|186053_186707_-	epoxyqueuosine reductase QueH	NA	NA	NA	NA
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WP_016210782.1|187878_188775_-	branched-chain amino acid transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_016210786.1|188933_189380_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210789.1|190127_190706_-	TMEM165/GDT1 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210776.1|191181_191619_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210785.1|193547_194942_+	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300538.1|196390_197458_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016209863.1|197510_197933_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|198173_198617_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|198671_198929_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|198906_199533_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|199610_201593_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039181|217478:271377|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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>NZ_CP039181|217478:271377|265729_266812_+|WP_054300162.1|transposase|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075273327.1|223335_223911_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210080.1|237791_238085_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|238191_238998_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|239302_240157_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_016210082.1|240311_241361_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300536.1|241411_242068_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210096.1|243639_245001_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211802.1|251384_252656_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|252712_253696_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|255174_255540_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273371.1|255485_256061_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211358.1|257176_257638_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211354.1|260812_262774_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|263303_263708_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|263760_264822_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046934.1|265185_265356_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|265729_266812_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_105962623.1|268314_269467_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155046935.1|269509_269932_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|270224_271377_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039181|434960:547212|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300513.1|434960_435824_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|436040_437600_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|437621_438656_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|438704_439274_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|439409_440381_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
WP_016210645.1|440392_441970_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556624.1|442035_443022_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300512.1|443353_444463_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210650.1|444568_445753_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210649.1|445830_447819_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|448027_448183_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|448440_448740_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300510.1|449010_449193_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|449249_449615_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|450531_451938_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|451955_452942_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|452944_454099_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|454095_454791_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|454925_456416_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|456436_457486_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|457552_458947_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|459825_461757_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|461761_462292_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|462326_462521_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|462563_462923_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|463342_464338_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_036777440.1|464350_466732_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|466737_467025_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|467296_467773_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|467917_468115_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|468239_469214_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|470114_470213_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300507.1|470697_471987_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300575.1|472223_472916_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|472957_473731_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|473732_474674_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|474806_476384_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|476593_478351_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210486.1|478899_479658_-	oxidoreductase NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|479865_480438_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|480541_481090_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|481391_481637_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|481665_481962_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|482229_483153_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300481.1|484110_484839_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
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WP_016210672.1|525526_526909_+	UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126423.1|535845_536109_-	BolA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016210060.1|536105_536408_-	YciI family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210053.1|536491_537034_-	septation protein A	NA	NA	NA	NA
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WP_036778098.1|537827_538667_+	segregation/condensation protein A	A0A1B1IVW1	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-08	23.3
WP_016210061.1|538656_539301_+	SMC-Scp complex subunit ScpB	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	3.8e-19	33.5
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WP_016210075.1|541709_542801_-	anhydro-N-acetylmuramic acid kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210064.1|542797_544162_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	A0A088FRM7	Mycobacterium_phage	2.6e-17	52.2
WP_016210052.1|544286_545483_+|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	8.2e-07	24.4
WP_032126425.1|545503_546100_+	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210066.1|546543_547212_-|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039181|555686:602576|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP039181|618670:651857|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036780855.1|620010_620508_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212214.1|620482_620983_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|621141_621870_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_144019359.1|622014_622212_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300478.1|622373_624110_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_054300477.1|624389_625118_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016211623.1|625840_627481_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_036779883.1|627593_628943_+	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	2.1e-75	37.2
WP_016211625.1|628939_629809_+	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_054300475.1|630292_631021_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016212196.1|631429_631675_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|631671_632058_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212193.1|632125_632464_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|632586_633315_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211949.1|633454_634705_-	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_016211951.1|634738_635836_-	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_054300202.1|636012_636741_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_032126570.1|636957_637257_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211816.1|637269_637623_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211812.1|637664_639278_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_054300202.1|639483_640212_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_144019244.1|640699_641311_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779399.1|641667_641922_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210954.1|642020_643805_-	SLC13 family permease	NA	NA	NA	NA
WP_036779389.1|643893_644613_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|644795_645002_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210948.1|645001_645238_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|645250_645628_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|646134_646953_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210947.1|647046_647244_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|647338_648724_-	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210945.1|648850_649441_-	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|651128_651857_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP039181|730255:784937|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP039181|841911:873674|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126472.1|859013_859664_+	DUF1669 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778866.1|860126_862715_+	ATP-dependent chaperone ClpB	K4FB40	Cronobacter_phage	3.3e-122	36.9
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WP_105962625.1|872788_873674_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP039181|879594:925401|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300276.1|881276_882251_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
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WP_054300173.1|884853_885915_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300447.1|886327_888964_+	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	2.0e-98	32.6
WP_080664849.1|889012_890101_+	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	4.9e-75	43.3
WP_016210997.1|890100_890784_+	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126469.1|890843_892505_+	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
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WP_016211001.1|892990_893296_+	competence protein ComEA	NA	NA	NA	NA
WP_016211002.1|893459_893858_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_081007044.1|997580_997898_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP039181|1001020:1044945|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYESCVSAFPKNMAFPFYGQHTRESAAGSHEIQSMR
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MARSGGHFKWMPDPLPTLKKLEVLTKERSGSRKLTMVSIFFGSYRDAQTKAAYANLHQKITSLL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556559.1|1005277_1005706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212093.1|1005862_1006792_+	response regulator	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	3.7e-31	30.1
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WP_016212098.1|1009365_1010217_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	2.7e-12	28.4
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WP_032126778.1|1036376_1036571_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046957.1|1036785_1037637_+	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212519.1|1039793_1040174_+	taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300422.1|1040444_1040882_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300421.1|1040932_1041778_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274673.1|1041755_1042754_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1042714_1043080_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046958.1|1043025_1043586_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300417.1|1043970_1044945_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP039181|1057614:1122504|DBSCAN-SWA
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MFNLDEYDLVDLTHFLDEAVPCWEGGCGFSQAVTLDYSEGCRVHSLSMRAGIGTHMDAPRHFYSEGPGLDQLKLETLIVPVCVVDVRRQAEADYLIHVDDIHAFEAVYGKISQGCFVIGLTGWGQYWHDPRQYRNADEAAQLHFPGFSPEAAQLLLTRKIVGIGIDTLSPDGGNTAFPVHHLVLGAGCYIVENLAYCEQLPAMGAHISLLPLNVRDGTESPLRAIAAVPKAKV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016210280.1|1057614_1058709_+|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_016210284.1|1058790_1059312_+	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
WP_016210276.1|1059366_1059843_-	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_016210275.1|1059898_1060201_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210273.1|1060265_1060973_-	flagellar basal body P-ring formation protein FlgA	NA	NA	NA	NA
WP_016210274.1|1061345_1061744_+	flagellar basal body rod protein FlgB	NA	NA	NA	NA
WP_032126334.1|1061783_1062215_+	flagellar basal body rod protein FlgC	NA	NA	NA	NA
WP_016210271.1|1062225_1062909_+	flagellar hook assembly protein FlgD	NA	NA	NA	NA
WP_016210285.1|1062975_1065171_+	flagellar hook-basal body complex protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556492.1|1065268_1066012_+	flagellar basal body rod protein FlgF	NA	NA	NA	NA
WP_016210283.1|1066039_1066825_+	flagellar basal-body rod protein FlgG	NA	NA	NA	NA
WP_016210272.1|1066864_1067575_+	flagellar basal body L-ring protein FlgH	NA	NA	NA	NA
WP_016210279.1|1067562_1068729_+	flagellar basal body P-ring protein FlgI	NA	NA	NA	NA
WP_016210277.1|1068782_1069616_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210270.1|1069685_1072673_+	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
WP_016210281.1|1072714_1074106_+	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
WP_075273303.1|1074119_1074836_-	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211367.1|1074991_1075774_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126330.1|1075921_1076881_+	TAXI family TRAP transporter solute-binding subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036779263.1|1076935_1078945_+	TRAP transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|1079000_1079288_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126332.1|1079540_1080740_+	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|1081386_1081962_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300410.1|1081907_1082273_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|1082406_1083270_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126328.1|1084774_1085026_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211589.1|1085154_1086387_-	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	7.4e-96	47.8
WP_016211592.1|1086376_1087039_-	HAD-IB family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556496.1|1087313_1088552_-	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126329.1|1088737_1089367_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211588.1|1089442_1090144_+	cyclase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|1090311_1091464_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
WP_016212343.1|1091703_1092510_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	W8CYX9	Bacillus_phage	7.7e-09	42.9
WP_016209808.1|1093814_1094183_-	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_016209824.1|1094179_1094998_-	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_016209813.1|1095098_1095914_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_016209801.1|1096198_1098253_+	VWA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126324.1|1098252_1098675_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209805.1|1098853_1100347_-	neurotransmitter symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209818.1|1100479_1101295_-	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_016209799.1|1101390_1101807_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209815.1|1102193_1102733_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300409.1|1103050_1104763_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-25	30.2
WP_016209812.1|1105209_1107033_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	9.7e-44	40.5
WP_016209821.1|1107122_1107455_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209800.1|1107485_1108082_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_036777933.1|1108078_1109203_+	2-hydroxyacid dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209822.1|1109338_1109986_+	methyltransferase domain protein	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_016209810.1|1110042_1111956_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-117	38.3
WP_016209803.1|1112160_1113198_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209820.1|1113256_1116556_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209817.1|1117257_1118226_-	plasmid replication region DNA-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209809.1|1118332_1118821_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209823.1|1119245_1119689_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1120910_1121486_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1121431_1121797_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300408.1|1121847_1122504_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.6e-10	31.0

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039181|1131042:1198637|DBSCAN-SWA
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MFNTKQKLLITLLDMTKKDPLSVQTKACAYIFGLALLLAWTYVLISSGLIISLILAVIFVAGLYFQVNRYASKLINSSSTQKPRIEDIRLLVVSSKSMILFCIGALVAYVAMLFNGG
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MDVVIIGATGLIGSALILKLYRQHEITAVGRDVRVVRQQFPFCKSLALQDLGLEDLAACDVVINLAGENIGQGRWNEARRAKIINSRISVTQQVVTLCRKLGHEAPRVFNASAIGVYGLQETSVSVSPQLTEESPLPSPPTDFLSEVAIDWENVLKFLDPEKVVQLRFAVVLAGNGGALPKLALPFYFGCGGKIASGQQMVSWVALKDVVAAIVFLLERPLLWGAFNIVAPEGVHQYQFAGVLANVLKRPNLMWTPGFLLQLVYGQMAKELILKGQYVVPKRLLDVGFQFQYGDLARALQDIYSE
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MRLMLKFVIPVEKGNQAAADGSMMQVIQELIGKLQPESTYFYLQEGKRAGTIIFKATDQSQMVVINEPLFAKLHAEIEIQPALDLEDLTRAL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_155046942.1|1131042_1131928_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273597.1|1131918_1133763_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1134034_1135009_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_129556498.1|1135188_1135797_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_036778626.1|1135793_1137734_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_016210594.1|1137869_1138523_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_016210595.1|1138699_1139878_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210588.1|1140245_1141571_+	fimV domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126176.1|1141661_1142444_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_016210587.1|1142545_1143406_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016210590.1|1143580_1144843_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210593.1|1144922_1145453_+	colicin V production protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210586.1|1145474_1146980_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.7e-86	41.0
WP_016210592.1|1146992_1147649_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016212005.1|1148038_1149799_+	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|1150699_1151852_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_032126856.1|1152157_1152499_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1152559_1153621_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300406.1|1153921_1156657_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|1158956_1159772_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273595.1|1160180_1161551_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.6e-12	24.3
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WP_016209947.1|1162628_1163291_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_036777555.1|1163317_1164547_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|1164703_1167475_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_052104625.1|1167550_1167994_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|1168146_1169619_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
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WP_016209945.1|1170788_1171823_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209932.1|1171825_1172866_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_036777579.1|1173048_1174164_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
WP_016209930.1|1174202_1174556_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777561.1|1174576_1176445_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|1176466_1177411_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_016209925.1|1177644_1177923_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1178132_1178771_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|1178745_1180173_-	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209927.1|1180373_1181051_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|1181185_1182460_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209943.1|1182527_1183283_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|1183334_1184252_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300404.1|1184360_1185254_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273594.1|1185326_1186697_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	4.2e-39	27.4
WP_054300403.1|1186736_1187711_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.0e-27	32.0
WP_016211771.1|1188003_1188192_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|1188205_1189339_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300402.1|1189538_1193684_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300401.1|1194286_1194568_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376688.1|1194899_1195253_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_107517381.1|1195466_1195661_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007041.1|1196326_1196854_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300400.1|1196910_1197153_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300399.1|1197297_1197564_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273592.1|1197662_1198637_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.3e-30	33.2

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP039181|1250276:1287573|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212039.1|1284203_1284761_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212040.1|1284937_1286287_+	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP039181|1294329:1349920|DBSCAN-SWA
TATGACAGCAGTGAATCAGGTGGTATTTTTAATGGGGCCGACAGCCTCAGGCAAAACGGATTTGTCAATGGCGTTGGTTGAAACAGGGCGCTATGAGATTATCAGTGTTGATTCGGCGATGGTTTATCGGGGCATGGATATTGGCACAGCGAAACCGAGCCGTGAAGAGTTGGTGCGTGCGCCGCATCGTTTAATTGATTTTTTAGATCCAAGTGTACCGTACTCTGCGGCTGATTTTCGTGAAGATGCCTTAAAACAGATGGATGAAGTGATTAAAGCAGGGAAAATACCCTTACTTGTCGGTGGGACGATGTTGTACTTTAAAGCTTTGCGTGATGGGCTGACTGAATTACCCGCCGCCGATGAGTCTATCCGAATGCAATTGCAGCAGCGTGCGGATCAGCAAGGTTTGGAGCGATTACATCAAGAGCTGGAAAAAATCGACCCAATCTCTGCTCGGCGTATTCACCCTAATGATCCCCAGCGATTATTACGGGCTTTAGAAATCTATCAAATTACCGGTAAAAATCTCACTGAATTATGCCAAGAAAATCAACAAACACCCTGTCCGTATCCGATTACTGCACTGGCTTTAGCACCTGCTGATCGGACGGTTCTGCATGCGCGTATTAAGCTGCGCTTTGAGAAAATGCTCGAGCTTGGTTTTTTAGCTGAAGTGGAAAAACTGTATCAACGTGGCGATTTGACAGAAGATTTACCGGCGATACGTGCGGTGGGTTATCGACAAGCGTGGCAGTACTTAGCGGGCAGATTAAGTTATGATGACATGGTTGAACGTAGCATCATTGCCACACGCCAGTTGGCAAAACGCCAGATGACTTGGCTGCGTAGTTGGCCAGAGTTACAGTGGTTTGATAGTTTATCAAATCGCCTTATGCAGGATGTAAAGGACTTTTTGGCTGCCTATTAGTAGGGCTTTTTATTGAATATTGATGTAACAGTATTGCTTCATGCCCTAAATATTATAATTTTAGGGCATGATGAAATATTATCTTTAGTTTTAAGTTAGGGTGCAGGTGCTGCTCCCTGATTATTGGTATCGGTTTCGTTCATGTCTTGGAAAAGAGAGATGATCTCTTCAGGAGTTGCAGTCGGTGAGGGATTGCCTGCAAAAAGAGCAAATGATGGAATTAAACTATCGCTGTCACTCATGTGCTGTGTAAAGTATAGGCCGTTAAATTCAGCTGTAGTAGGGGTTAGCGGGGCTGGTGGAGCAACAGTTGGTGTAACTCTTAATGCAGGTAATAGAGTGCGGCTTGTAGATATAGGTGCAGTCGTTGGAGCTGTATCTGGGGCGCTAGTTGGTGGAGCAATGACAACATACTTGCCTTTGCACGTAGAGGTAGTATTTGAGCTTGTGGTTACAGTGCTAGATGGTGCTGTTGGAGTTTTCGCTGCAGTTGTTTGAGCTGGGCTTTTACCCGTATAATCTTTTATTAAAGCATCTATAAATCGATTATTGGTATCAATTATGTCTGTTATTTTTTTAGCAGGATCTGTAATAGTCTCTGTAGTAGCTGTTGGAGCGATAGGTGCTGGCTGCGTAGTCGCAGGTAGTGGAGTGGCAGTTGCTTCCATGGCTGGAGCAAGAGGATGATTTAAAGCTGGAGTACGGGTTAGAGTTAGAGCGCCAGTACTTGTAGGGGTGATATTGGGGGCTGTTGTTGAGTCTGCCGGTACTGGTGAGGTAGTAGTGCCTGCTGGAGTGATAGGTGCCGGAGTGGTAGTTGCTCTCATAGCTGGAGTAATGGTTACGTTATTCATTGTAACAGCAGTTGGTTGTGCTGTTGGCTGTGGGGCTGCGGTGGTAGGAGTAGGAACTACTGTTGGTATCGGAGCTGTTACCGGAATCCTAGAAGTATTTTCATAGTAGTGATTAGCTTGTTCTTGCCAGCTATTAGTCCAATAATGTCGTGATAGGGCGATTTCCCAATATCGGTCACTGATGTTAGCTAACTTCCGAGCTTTGTTAAAGTATGGTTCAGCAGCTTTATAAGAGTGTGCTGTGGAGAAGATATTGAAGGCATGCCTTCTGTGGTTAAGTGCTGAAGCTGCACCGTTAAGAATACTTTTTAATCCCGCAAGCTCTGTTTCTGATTGTAGGTGATATTTAAAAAACTCTGAGAGTTTAAGCTTTTCTGTACTGTTCCTTTGCTTGCAGTCTTTAATTGATTCATCTAAACCTGATTCTATTAATATTTTAATAAGCGTAGTGTCGAGAGGAGCTTTGAGTAGACGCTGGATATTATTTGGTGAAGCAAGGTCTAGATCTGAAAGTGATTTAAATAGCCTAACATGTCCTGTGAATGGGTTATATAAATTCGGGGCATCAAGTACTTCTTGAAGGTATACAGCTTTACAGAATTGCTGTTGTTTTAACTCGTTGTACTGTTCTAAAAATCTTGCCGGGTTTTTGAGTGCTTTTTCTAGATTTTTAGCATTTGAGAGGCCATATTTATCTAACGTTAAATATATGATTAAAAGTAGATTGGGATCTATATCTGCTTCTTGATGCCTGGCTAAAGCTGGCGGAGCTGCTGGTACTTGTTGTTGATTTAATTCAGCAAGTTCATCTGCGGGAAGACATTTTGCCATCTCCTCAACAAGGAGATGATAGTCAATGTAAGTTTGTGGGCTATAGTCATTTTGAATGCTATCTTCGTGGATAGCTTGACCTGTAAACGGTGAAACTTCACTGTTAGCTAAATAGTCTTGGAATGCATCGCGATTATAGTTTGCTGATTCTCCAGCAATATGAACAGGAACGCTTATCTCTTCGAGGTTGATACTGCAATCGATTAATCTATCCCTTTCATCGAGGAACTTTGTTCGTTGCTCTTCAGTCAGATATCGAATAAAGTTAGGGACAGTAAACGTGGCATCCCGATCAATTTCTTGAAAATGGATACACTTTTCAAGTATTTTATTTTTAAGATTATTAAAGTCACTGGGTAAAAAGTCTTGGCTTTCAAATTGTGGGTTTTCATCGCGGTTTGTAAAGAGAGGGTCGTCATCTAAGTCCTTCATTGCTTCTTGCAACTCTAGGCTTAAATACTCATAGTAAAAATTACTGTGGTGAATATCTGTATTTCTTAAATCACCAGTGCCAAACCATGCACCGATGGCACAAGACCCTTTAAACCTTGCGCCATTGAATGTCTGTACGTCTCTAAAGTCAACTTTACGCAAGTCCGCATGACAAAAGTTGGTGTCTTCTAAATTAGAGAACTGTAGGTTTGCTCCCTGCAAATATGCACCTGATAAGTTTGTATTTTTTAAATTAGCACAACTAAGATTCGCACCTTTTAAATAGGTTCCAGCTAAATTCGCTCCTTCTAAATTTGCTCCATATAAATCAACATGACTTAAATATAAGCCTGATAAATCTAAACCACTAAGGTCCCAATTACGCAAACTTATATGGCTTTGAGAGTTGGCGTTTGCTTTTTCTATTTTTTGAAGGATGTCGAGTCTAGTTTTTGGCATAGTGTTTTCCCCATACTTTTATCAGGTGTTTAATCAATTAATGGTTGTTGCTGATAGGGATAGGTATTCGTTGGCTCCCTATAGTGATTTGTAAAAATAGATCGTTTTTTAACTATGATATTTATGTTTATAAATTTTTTATTTGTTTAAAGTTATTTTAATGATAACGATAGATTAGTTTAATTTGTTTTTTATTGTCAACTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCATGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATACTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211415.1|1302164_1303088_-	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211417.1|1303111_1304161_-	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA	NA	NA	NA	NA
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WP_016211422.1|1304913_1305384_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|1308013_1308379_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211840.1|1309732_1310197_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	4.7e-19	32.9
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WP_016211831.1|1344945_1346673_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|1349344_1349920_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP039181|1370706:1411164|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211651.1|1374599_1376135_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126643.1|1380146_1380353_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126642.1|1380422_1380884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300374.1|1380919_1383490_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	5.1e-30	22.9
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WP_016209844.1|1384255_1385296_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209835.1|1385273_1385756_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209848.1|1385752_1388347_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209832.1|1388653_1388917_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209831.1|1389195_1389894_-	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1390113_1390308_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1390383_1391943_-	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1392261_1393158_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1393374_1394850_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1395372_1396395_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209830.1|1396725_1398093_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1398328_1398583_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1398598_1399885_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209836.1|1399904_1401119_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_016209838.1|1401118_1402012_+|protease	protease modulator HflC	NA	NA	NA	NA
WP_016209839.1|1402209_1403508_+	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
WP_016209829.1|1404887_1407287_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209834.1|1407283_1408042_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209842.1|1408218_1408608_+	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300373.1|1409335_1410193_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1410189_1411164_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP039181|1439085:1618039|DBSCAN-SWA
GATGAATATTTGTGTTGTTAGCTTGTTTGCAGAGATGTTTCAAGCGATTACGCATTATGGGGTTACAGGACGCGCAGTGCAGCAGCAGGCAGCCCATGTAAGTACCGTGAATCCGCGTGAGTTTACGCAGGATATTCATCGCACGGTGGATGATCGCCCGTATGGGGGAGGCCCAGGGATGTTGATGAAGGTGCAGCCGTTGCGTGATGCAATCGTTGCTGCGCGTAAAAAAACATCCGCACAGGCTCGAGTGATTTATTTGTCTCCACAAGGAGCACCGTTGACCCAGAGTAAAGTACTTGAACTTGCCAAACAGCCTGAGTTGATTTTATTGGCTGGGCGCTATGAAGGCATTGATGAGCGTGTGATTGAAGCTAATGTTGATGAAGAGATCTCGCTGGGGGATTATGTTCTTAGCGGTGGTGAACTTCCTGCAATGGTTTTAATGGATGCGATTATTCGAGTTTTACCTGGTGTTCTTGGAGATGCAGAGTCTTTTCAACAAGATTCATTTATGGCGGGATTGCTAGATTATCCGCACTATACTCGACCTGAATTGATTGATGGCCGTCAAGTACCTGAGGTACTGATGAGTGGCCATCATGAAAAGATTGAACGTTGGCGCGAACAGCAAGCATTGGGGCGAACGTATTTAAGGCGCCCTGATTTATTTGAGCGTTTAGCGTTGACGGCACAGCAACAGATGTTGCTGGACGAGTATTTGGCTAAAGCAGCCGGGTGCGGCTCTGCTAGTGATCTTGATAAAGTAAGTAATTCTTAATAACAGAGAGGTTCGCCATGAACGATATTATTAAGCAAATTGAACAAGAGCAAATGCGTAAAAATGCATTGCCTGAATTTAGTCCTGGTGACACAGTGGTTGTCCAGGTAAAAGTAAAAGAAGGAACGCGTGAGCGTTTGCAGGCCTTTGAAGGTGTTGTGATTGCTAAGCGCAAACGTGGATTGCATTCTGCTTTTACTGTGCGCAAGATCTCTCATGGTGAGGGTGTTGAGCGGGCATTTCAAACACACAGCCCATTGGTTGACAGTGTTGAAGTGAAGCGCCGTGGTGCGGTACGCCGAGCTAAACTTTACTATCTTCGTGCTTTACGTGGTAAAGCTGCACGTATCAAAGAGAAACTGTAGTTTTCTCATTACCATTCGTGGTAGTTTAAAAGAAGGGGGCATAGCCCCCTTCTTTTTGTTTGTATGATGAAATATGAAAAAAATGAGTGATAGGCGAGTGAGTGTGTGAGTATGTCTTTATTTGGCCAATTGATTGGCACTGTCGGTATGGCTTTAGTGGTTATTGCTTATTTTTTAGTTGTATCACAGCGCGTCACCCCTGGAAGTTTGCCTTTTTCTGTGATTAATTTAATTGGTGCTATTTTGTTATTAATTAGTCTGTGTATACACTTTAACTTAGGCTCATTTATTATCGAAATTTTTTGGATTTTAATTTCTTTGTATGGCATCGTAAAGTGGTGCTTGCAAAAAGCATTGCGCAATCAGAGAAAGAAGGTTGAATAAGGTTTAAAACCACTATATTGAATATCACTTGCTAGAAAGCGATCGGTTAAGAAAAAATTGAGGGATGTGAATATTTGCTAGCCTGGACTAATAATCTGCACTAAGGTTGAGGGTTGGAGTTTAGCTGTCCCTGTCCTTCACTGTTTGCACTGGATAGATACGTATTATAGTACTGAAGAGTTTCTCGGTCTGGTTGTTACTATATTTTACTAAGAAATAGGCTTAATCGTCTTCCTGAGAACATTAGAAAATGATCTATGCCTTAGTTTAAACGTTATGAGAGAAAAGTTCCTGGGCATCATGTACAAGTTGATGTTAAATTCCTATTTTTTAATGATGAAGATGGTAAAAGAATTAAATGTTATCAATATACGGCAATCGATGATGCGACACGTATTAGTGCTTTAAAAATTTACTCAAAACACACCCAAGCTAACGCAATTTATTTTATTAATTATGTGGTTGATAAATTCCCATTTCGAATTAAAGTAATTCGTACCGATAATGGCAGTGAGTTTCAAGCAAAATTTAATTGGCATGTACAAGACCTTGGTATGGACCATGTTTATATTATAGATAAATACTAAATATATGGCATAATAATTTATTGAATAATTGTAGAATTAAATAAGGAATATGTCATGGGATATCCAGTTGAATTCAGACGGAAGGTCTTTAAGTTAAAAGAAAAGAAAGGGCATACAATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGAGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGATTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAGGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAGCTATAAACCAGGAACGCCAAGGCTCAATGGCAAGGTAGAACGCTCATATCGCACTGACAAACAAGAGTTCTATCAATTAATCGATTATAATGGTGATGTTGATTTACATGACAAGCTTGCAGAGTGGGAGGCTTTTTATAACTTTCAGAGGCCCCACTCTGCTCATTCTGGAAAAACCCCTTACGAAATGTTAAAAACTAAGTTAGGATTGTAAAAATTCATGTCAAGCGAAGTTCTGAGTGACACAGTTGTTGCAACAGGAGAAGGTGATATACAGTTGAGTGCTCGTTCATATAATTAATTGTTTAAAAAAAAGTAGTGAAAATTAAGTCTGAAGTAGATTAATCATGTAAATGCGTTATTGTATAAATATTTACTGAAAACTAAAAATATTTGCGAGAGTTATCATTCAAAACTCCATGTTTCTAAGCTCCAATAAATTTATTAGGATGATAATTTTAAGTAGGGGCTTAAAGGAATGCCAGCAAACGAATATCCGCAAAGTCGGCTAATCTCTGTAGGTTTGAGTGGGAGCCGAATAACAGGTGATATTGGTCGCAGTCTATCTCGTTTAGAAGCATGTTTGCAGGGGCTTAATATGTTGGATAATCATAGCCGACTTTTTATTGCTCACTGTGAAAGTCTTTCTCGCTATCTTTTTAGTAATGCGCGTTATCATGATTTTTATTATTCATATCGCAGAAACCCAGCTTTAGAGGCTTTGCATTTTTTGAGGGATCATGTGGCACACTTAGTTGTAAAGTTAGCGCCTTTGCGAGGGTTTGAAGCTAGGGAGGAGTTTCAAGTTGCGCTAAATGGCGTATTTGCAGATTTTAATAATAAACTTGATGAAACAATCATAACAAACCTAACTAAAGAAAAAGAGACGCGCAATGTTTGTTACAAGCTGCGAGATGTAAGTTTATCTATTATCTTTTCACAAAGCCAAACCCACGATAGTGCTGGGGCAGGTGCTAAAGTTCAAAGGATGATCACTAAAATAGAGCAAATGGCTAAGAGTGAAGGGGGGCAGGGCTTTAAGTTCGGTTGGTGGGGCACTTTTCGTTCTATCAAAGTCGATGGAAAAAGCTATGATGTTCCTGGCAGAATAGCGAGTTTGTATAAAGTATTAACTGATGATCGCATAACAAATGCTGATAAATTAAGAGCGGCCTACACTTTAAGTGCGTATAAAGAAAAGTCCAAATTTTTGTTTTTTAGACAGCCACAAGAAGAGACTAACGAGATGATACAGAATTTTAAAAAAGAGCTTTGTGCTGATTTGTAGTGAAATGATCCCCATAACTACCCTTGTTTAAGTCTTTGACAGATAGGCTGCTAGCTGGAATAGTGAATCTCTCAAACCTTGGTCTATGGATTCTGCCATAATAACTCCGTGAATTTGACGGTTACACAGGAGATTAAAAATGACAACATTATACGAGATTTTAAGCCATTCAAAGTGGGACTGCAAATACCATATTGCGTTTTTTCTAAGGTAAAGGAAAAAAGTTCTTTAATGGAAATATAACGAAATTTTAGGTGCTTTATTTAACGAATCAGAGGTAGAGCATGGTTTTAGAAGGTCATAACAGTTTTTAGGTAAGAAGAGGAATTTTAATGGAGGGTTACCATGGGGTATCAGCGGTTGGTTTTGAAGAAGGACAAATTAAGGCGTATATCAAACATTAGGATCAATTGATGGGGTTGGATTTTAATGGAAAGGCTAATTTTTAAATTACAGATTGAACTTTAATACTGCTAACCTTTGGAGCTACTTACAGCCATCAAGCCACCCGCTTTGCGGGTGTGTCATAATTATCGAAATGATTATTTAGTCAATTGATATTAATTAAGGGCTGTAAAAATTGAAATAGTGCGTCGTTAACATATTGAGGTTGCTCTAGCGTTGAAATATGACCGGCGTTCTCAATCGTTATAAAAGAAGCATTAGCTAGTTTTCCCGCCATCAGTTTTCCTTCACTGACAGGTCTTGGGATATCATCTTCCCCAGTGATGATAAGTGTTGGAGTTTGAATATTCGTCAGCTTGTTAAGGCGGTCTTCACGGCCAAAAATCATCCGCCCTAATGGAATAATAGACTGTAATTTTTCAGGGGATAGTTTTTGCAGATGAGCTTGAAAGTTTTCTATTAAATCAGGTTGGGTTTTAAATGTTTTAGGTGAGAAAAATAGTGGGACAATTTTATCTAATAAGGGGGTTGGGATAGCTTGAGCCTGTTCGATAGCGGCAAGCATGGCAAAATATTGCTGATATGATAATTCTGGCTCTTTACCGACAAAGGTGTCCATCAGAGTGAGTGCTAAGATGC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Homologous phage analysis in the prophage region

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1480392:1480451	attL	NA	NA	NA	NA
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1507052:1507341	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016210103.1|1559146_1560505_+	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	7.7e-70	37.2
WP_075273327.1|1560857_1561433_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211666.1|1599786_1602606_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
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WP_032126678.1|1608376_1609387_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-22	40.6
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WP_032126362.1|1612799_1613165_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|1617064_1618039_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039181|1646584:1690974|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP039181|1701274:1770129|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19

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MPHIEVNCPQCSENDVIKFGRNASGNQRYKCKNTGCDKDTFLLNYKRPGDLPETKEKIIDSPYAQVINILIA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211748.1|1747998_1749603_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211749.1|1749682_1750876_-	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|1751084_1751948_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212346.1|1752181_1752328_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300318.1|1756130_1757108_-	NAD(P)H-quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211465.1|1757735_1758719_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-34	32.7
WP_016211464.1|1758869_1759217_+	arsenate reductase (glutaredoxin)	NA	NA	NA	NA
WP_032126752.1|1759213_1759816_+	NAD(P)H:quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211466.1|1759903_1761424_+	RsmB/NOP family class I SAM-dependent RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126753.1|1761493_1761958_+	copper chaperone PCu(A)C	NA	NA	NA	NA
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WP_081007073.1|1763947_1764118_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777066.1|1764100_1767157_-	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209619.1|1767243_1768692_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209621.1|1769124_1770129_+|tRNA	tRNA dihydrouridine(20/20a) synthase DusA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039181|1798702:1842475|DBSCAN-SWA
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MNSLALMQQVLLEAPALMLTGLNPERSLEERADMVSAQSLADFEALLKNQTLGEAVAPGIVLAVEIARKKKLV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211946.1|1838977_1839733_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211947.1|1840339_1841485_+	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP039181|1886879:1905661|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016212058.1|1892291_1893842_-	dolichyl-phosphate-mannose-mannosyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212247.1|1897973_1898729_+	ZIP zinc transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1899356_1900331_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300162.1|1900670_1901753_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_016212246.1|1901856_1902513_-	AT hook motif family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300297.1|1903448_1904516_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1904578_1905661_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP039181|2026555:2081470|DBSCAN-SWA
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MDKAYTVLTVDDSKTIHGIAKNLLSGSEFDIIDVAHNGNDGVEKYKKLKPNFVLMDIVMPELDGMSALKKIIDFDPHAQVVMATSMGQEDTVEQAITIGAKGYLLKPYDKESVLVVLRTLTKL
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MQPIINIATRAARRAGALMLQRIDRLDTLKVAEKGIGNYVSDVDKSAESTIIETIQKAYPEHTILSEESGQTPQESDYLWIIDPLDGTNNFIHGNPNFCISIAIQYRGRTEHAVIYDAIRDELFSATRGQGAKLNDHRIRVSQRNKLEGATISTSLTHATDQYAAAFFASQHSLYEQHVALRRSGSIALDLAYVAAGRLDASYTLGAQRWDIEAGLLLVREAGGLASDLNGGESNISEGELLAGNPKSLKHLLQTLRPHYTKKS
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MATGFVKWFNNAKGYGFIRPAEGGADLFAHFSSIDMDGYRTLKTGQPVSYETNQGTKGLYATNIYVDRGLDDQMFSHNFSTETSIRPSANTPKGSSS
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MARRRHKPVPKEPVQVVIDKIDHEGRGIAYHDGRTVFVDGALPKEEVVFQYVSRRAKVAEARTLDVIQASRERVDAKCAHFYLCGGCSLQHMSPEAQIDFKQHTLLEQLKHFGQIQPEQVLAPLVNTMPWAYRRRARLGVRYVHKKEQVLVGFREKHSSFLADLSSCQVLTANVGEHLEAFKVMFSSLDAKETIPQVEVVVGDDQTALIIRHLEPLSDHDLKALIEFCQRLNFELYLQPKGPLTIHRIYPEPVSGRLPGQERLSYCLPDFNLEFKFHVSDFTQVNSEINRQMVPLAVNLLAPGDDDKVLDLFCGLGNFTLPIATRAKEVVGVEGSERMVERGYENAKHNNLNNVRFYAADLSQPEHKASWYDEQYDLILLDPARSGADVLLNHIERFSARRIVYVSCNPATLSRDAGILAQKGYQLKKAGVMDMFPHTVHVESIALFEK
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MTARRCLALIFIFTNLLSLMSCTQQTTVLHQSESLYGVSTVKPDKSQAAHYNVQLGLAYLKAGDFRRAQYKLSKAIKLDPHHAEVHYAFAYYLETVGEFEKAQQEYLTALNIAPDDPKVLNNYGAFLCRQGQVDKSLRYLLAAAEHVEYLDRAGSYENAGLCALKIDELKSAQHYLMQALQLAPHNDRVRWALIKISNQQGQDQQTLVLLKRYLLAQPDDSNAQRLLQQLQVKSGSDQPDKR
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MLNKAILYYLQQDQFVGELAESSHTVKVYLGRPEADCFVLSLQHDSNHVTAIRFLAQGSPVLIASCAYVSEQLHEGALELLNTLDSKQLVAYFSLDNKDISKAVLVENALKQLYRQLAL
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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556553.1|2028066_2029659_-	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209439.1|2029822_2030449_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300277.1|2030529_2033211_-	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016209445.1|2033693_2034650_+	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_016209435.1|2034750_2035122_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-05	29.4
WP_016209404.1|2035148_2036012_+	chemotaxis phosphatase CheX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209416.1|2036001_2036787_-	plasmid replication region DNA-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209413.1|2037075_2037561_-	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209443.1|2037635_2038157_-	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016209405.1|2038202_2039096_-	cheW-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209406.1|2039092_2039914_-	ParA family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	5.0e-16	32.2
WP_016209408.1|2040228_2040399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209436.1|2046810_2047539_-	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
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WP_016209447.1|2049668_2050880_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|2050876_2051665_-|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209411.1|2051827_2052622_+	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|2052827_2053802_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
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WP_081007013.1|2055275_2055575_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2055564_2055729_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2055785_2056151_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211553.1|2056490_2057231_-	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211549.1|2057234_2059739_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211548.1|2060001_2060958_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211550.1|2060941_2061703_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|2061780_2062656_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211259.1|2062780_2063026_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_016211262.1|2063085_2065359_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_075273504.1|2065413_2065767_-|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211261.1|2065956_2066250_+	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
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WP_051307354.1|2066677_2067253_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|2067535_2068852_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|2068862_2069231_-	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|2069261_2069924_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_054300274.1|2070098_2070464_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2070409_2070985_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|2071152_2071872_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_016211478.1|2071851_2072667_-	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126518.1|2072683_2074885_-	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|2074967_2076317_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_016211473.1|2076391_2076991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|2076974_2077184_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|2077501_2078689_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|2078884_2080174_+	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|2080584_2081470_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP039181|2094006:2135820|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047009.1|2101458_2101632_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_052104774.1|2101776_2102409_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2102456_2103518_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126170.1|2103681_2103954_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|2104181_2105393_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211037.1|2105743_2106373_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
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WP_016211035.1|2107684_2107900_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210746.1|2279764_2283661_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase	A9YX36	Burkholderia_phage	4.4e-118	54.4
WP_054300242.1|2283706_2284243_-|tRNA	tRNA adenosine(34) deaminase TadA	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039181|2291052:2362213|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556472.1|2332590_2334984_-	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
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WP_016209393.1|2340644_2341184_+	isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016209400.1|2341728_2343690_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300230.1|2344127_2345759_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209397.1|2345879_2346755_-	bacterial lipid A biosynthesis acyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209379.1|2346842_2347649_-	cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209396.1|2348410_2348968_-	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209399.1|2348971_2349709_-	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209372.1|2349712_2350591_-	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
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WP_016209375.1|2351955_2352765_+	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209387.1|2357490_2358375_+	DUF2608 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2358512_2359088_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2359033_2359399_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300228.1|2360304_2361558_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_155046990.1|2361535_2362213_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039181|2367077:2413588|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP039181|2482421:2524863|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_28

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>NZ_CP039181|2482421:2524863|2517663_2517915_-|WP_016210914.1|DBSCAN-SWA
MALKIFDECINCDVCEPECPNEAIYQGEDIYEIDPDKCTHCLGHFKTQQCVEVCPVDCIIIDPENPENEETLWARYHRLTENK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210908.1|2519714_2520530_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2521741_2522803_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|2523538_2523889_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2523976_2524342_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273438.1|2524287_2524863_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP039181|2529359:2576912|DBSCAN-SWA
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MISLWKTYQALKTKGILGINQRNADFIIRYNQRKYYPLVDDKIMTKTLAIKDGIAVPKLYATLKTDHDTHHLEQILANRTDFVIKPARGAGGDGILVITNRHGERFRKVSGALLHLDDIRHHISNILSGVYSLGGQRDQAMIEYRVQFDPLFKKISYQGVPDIRIIVLKGYPAMAMVRLPTRLSDGKANLHQGAIGVGIDLTTGITLEGVWMNDPIHEHPDTGYAVPGLQIPHWDHFLNLAARCYELTQLGYLGVDIILDKDKGPLMLELNARPGLNIQIANNSGLLHRLRFIEQQNQQRTADERIAFIKHQFAKI
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MSQKRKKPSAEFKTKVVLEVIEGDQTLNQICSKYELVPKTVQNWKKVFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYKSVRCTKDKMELLRAIDRIYTETPFYGYRKVHQQLIEGGYSVGLNRVRNYMNELGLKVIYPTKKVCTTLAHPEHKKYPYLLRDLEVYKPNQVWSTDITYIRLDGGFVYLAAVIDWHSKAILSHKISTTMDSSLVINVLKQALERYGTPEIFNTDQGSQYTSHDHTQLLIDRGIKISALLRKVIGSFRKVIFVCSRP
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211244.1|2530489_2531185_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W5SAS9	Pithovirus	2.7e-10	27.4
WP_016211242.1|2531138_2532107_+	FtsX-like permease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556456.1|2532150_2532900_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211238.1|2533101_2534595_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_129556626.1|2535037_2536426_-	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016211235.1|2536855_2537293_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|2537787_2538516_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_054300206.1|2538801_2539038_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2539240:2539299	attL	NA	NA	NA	NA
WP_155046992.1|2539504_2540044_-	queuosine precursor transporter	A0A2H4J2N7	uncultured_Caudovirales_phage	8.7e-09	30.5
WP_032126362.1|2540004_2540370_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2540315_2540891_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300203.1|2541373_2541832_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556455.1|2541836_2542439_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211642.1|2542739_2543093_-	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211646.1|2543085_2543325_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211918.1|2543696_2544665_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307368.1|2544664_2545945_-	AAA family ATPase	Q7Y3Y6	Yersinia_phage	7.3e-38	33.5
WP_054300202.1|2546651_2547380_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_075273432.1|2547690_2548425_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.7e-43	41.8
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WP_054300200.1|2550839_2551418_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	3.9e-47	51.5
WP_155046993.1|2551410_2551773_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A2L1IV36	Escherichia_phage	1.3e-13	37.6
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WP_036780881.1|2552162_2552762_-	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
2551975:2552235	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016212022.1|2552761_2552980_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300198.1|2554349_2554679_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|2554829_2555558_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_016210943.1|2556483_2557170_-	acireductone synthase	NA	NA	NA	NA
WP_036778484.1|2557173_2557785_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2557831_2558851_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2558952_2559747_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
WP_016210931.1|2559768_2560575_-	prolipoprotein diacylglyceryl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210941.1|2560653_2561703_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126310.1|2561900_2563160_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
WP_032126309.1|2563206_2563884_+	TIGR00153 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210937.1|2563969_2564251_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_155046994.1|2564342_2565497_-	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	2.1e-20	25.6
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WP_016210818.1|2567211_2567436_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210811.1|2567727_2568432_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300196.1|2568846_2569485_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377821.1|2569819_2570350_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300195.1|2570346_2571879_+	inactive transglutaminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210815.1|2571875_2572826_+	alpha-L-glutamate ligase-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210817.1|2573246_2573879_+	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-13	32.8
WP_016210814.1|2574121_2574319_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210813.1|2574668_2575097_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300194.1|2575174_2575873_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|2575850_2576912_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP039181|2580124:2632334|DBSCAN-SWA
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MTIRVAINGYGRIGRNVLRALYESNRRDEIQIVAINDLGDASINAHLTQYDTAHGRFNADVAVDGTHMIVNGDSIQILSERNPESLPWDTMNIDVVYECTGLFTKREKAAMHITAGAKKVIISAPGTDVDATIVYGVNDKTLKASDQIISNASCTTNCLAPLVKPLYETVGIEQGLMTTIHAYTNDQKLTDVYHSDVRRARSATQSMIPTSTGAAKAVGLVLPELAGRLDGFAMRVPTINVSVVDLTFTASRDTTVDEVNQILKSAAEGELNGILDYNTAPLVSVDFNHCPASSTFDATQTRVSGRLVKVLSWYDNEWGFSNRMLDTTMALMNAK
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MIKMLSKHIADYMFIAPEEAAIAITSAGLLPKNFKLIKIIDILPGNKRHIICSQKVPLPLITKLNQAIKSNIP
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MLSRSYLAAAIRVLSMDAVQQANSGHPGMPMGMADIAEVLWNSFLKHNPQNPTWPNRDRFILSNGHGSMLHYALLHLAGYDLPIENIKNFRQLHSKTAGHPEYGHTPGVETTTGPLGQGIANAVGMALAEKMLAAQFNRPNFSIIDHYTYAFLGDGCLMEGISHEVCSFAGTQKLGKLIAFWDDNGISIDGEVVNWFSDDTVARFQAYGWQVIAAVDGHDPAAIEAAINQAQADERPSLICCKTVIGFGSPNKAGSASSHGAALGAEEVQKTRQAIGWEHAAFDIPKDVYAAFDAKAQGTEQEQVWQQLFDEYKQTFPELATDLERRLSGQLPSDWPAIAERLVNETVAEAKTVATRKASLSVLEKISLELPELLGGSADLSGSNCTQIKNAQVIRPDDAGGNYLQYGVREFGMSAIMNGMALYGGFIPFGGTFLTFMDYARNAVRMAALMKQRVIFVYSHDSIGLGEDGPTHQPIEHLASLRSMPNIHTWRPADTVETTVAWATAVASSTTPSALVLSRQDLPFLERDSHTVANVARGGYILHDCTQTPQLILIATGSEVQLALNAAKTLDLQGVAVRVVSMPSTEVFDAQDAAYKEQVLPSNVRARLAIEAASPESWYKYVGLDGQVIGMESYGDSAPAEVLFEHFGFTEANVVATATGLLKRVD
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MPKHHAAAGHANAIDVHDDYILKKASDSEILAYQLFCFKGQPLSNVVANFEIVNYNLLKL
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MPSARPSKGRGQLCYLWLSVLALGLDFATKWWAQAALHYAMPKPVLPFLNWTLLYNPGAAFSFLSNQGGWQRWLFSAIALIIAIIIVRLLAKIPRQQHMAAIGLSLILAGALGNVIDRLRFGYVIDFIDVHVAGYHWPAFNIADSVICIGAVLLIWQQLRKSDKSSDKK
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MDMSNSKTKKLKTGVIIAGAAAALMLAGCVGPGTKPASQSGPVKCSGINSCKGTSECATAKSACKGQNKCKGTGWVFAKSADLCKKKGGVVLSAGASNSSLAAVDASENLASLDDNKAYRR
>NZ_CP039181|2580124:2632334|2594356_2595016_+|WP_016211963.1|DBSCAN-SWA
MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155082339.1|2580539_2580887_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036778253.1|2580935_2582474_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	3.5e-87	36.5
WP_098082804.1|2582585_2583684_-	peptide chain release factor 2	A0A0S4KWG0	Pseudomonas_phage	1.1e-05	43.1
WP_016210987.1|2583921_2585121_+	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210981.1|2585150_2585789_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
WP_016210983.1|2585804_2587988_-	protein kinase family protein	A0A1S5XZ05	Kurlavirus	1.1e-06	34.9
WP_032126304.1|2588225_2588570_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300193.1|2589615_2589822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212033.1|2592283_2592946_-	O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211965.1|2595117_2595768_+	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
WP_016211964.1|2595880_2596201_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2596259_2597234_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300190.1|2599445_2600408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210162.1|2602105_2603143_-	fructose-bisphosphate aldolase class II	NA	NA	NA	NA
WP_032126295.1|2603173_2604628_-	pyruvate kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210176.1|2605895_2606903_-	type I glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210183.1|2606971_2608975_-	transketolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210174.1|2609425_2610586_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	8.2e-121	58.5
WP_036776947.1|2610822_2611938_+	DSD1 family PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016210172.1|2612100_2612625_+	inorganic diphosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	6.9e-51	59.6
WP_016210163.1|2612624_2613155_+	ferric uptake regulator family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210178.1|2613244_2613712_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210161.1|2614213_2614468_-	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210179.1|2614668_2615172_-	RNA pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_129556592.1|2615462_2615993_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210168.1|2616153_2616837_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210164.1|2616912_2617692_-	DUF2063 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126297.1|2617678_2618539_-	DUF692 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210177.1|2618663_2619029_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210175.1|2619414_2619744_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300188.1|2620057_2621617_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A1B0V854	Salmonella_phage	9.9e-37	50.4
WP_054300148.1|2621862_2622924_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211784.1|2623477_2624200_+	aquaporin family protein	M1HH19	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-26	35.8
WP_016211783.1|2624191_2624557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126294.1|2624837_2626115_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211782.1|2626714_2626897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2626958_2627324_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273426.1|2627269_2627845_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273424.1|2627859_2628483_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210766.1|2628571_2629015_-	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_032126291.1|2629018_2629528_-	lipoprotein signal peptidase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP039181|2662400:2698729|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

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MSRICQITGKGPMTGNNVSHANNKTRRRFLPNLHTHRFWVESEQRFVRLRVSSKGMRIIDKKGIDSVLAEVRARGEKV
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MTIIDDIRHAYRLTVGYRWKFWMAFLPVLFLLTASQLITVQKVHNPSISLNVLQILIQAIVAFAVVGLYRFGLLRAREQACGAFRTVWDVSQWRAGLAYIGASIILTVIVTLGMVLIGLLGHIVPISVVMVLSLFYLFFIFLGTVFIPLIILDGQLPWYKAVFGSFVLIRYGFSEFAQLVVAALILMIVSILTLGILFVWVLPLLFVLTSGTYLRLLNHAKR
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MILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC
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MGNNIVYSQCLSNGCNRRRGDNLLYIQQRNKLNFILVIFGVIAAQAAVSLYLPSLPAIDHEWHLASGQAQLTLSAFFLTFGVSQLFYGALSDHFGRKPLLLMGLVILVLSSVWAIYATSFHSLLAARLVQGVGGGALSVLARAIIRDLFHGDELRKAISILAIAASFTPALAPSLGGWLEDHFDWRSSFVILTAYSIILLVTIFSLFTETNQYQRQPNESIDFSKVVASYYSVTKNKLFWCYGFAILIGYLSLVICLANASFLLEKKFGLSAEITGYLMFVQPGFFLVGNLLQHKLTDKISGDLFLKFGMVILGVIGLSFLFQGVFHSATLINVLLTLALAGFATSLILVNALAGVLLPFTENAGAAAALSGVLQMVGASFITALISNLHWTSIIDLGWIYLALFVVLYISLLFLHRIRLYSPCYKSA
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MEDTMFCNILNLIVIGAGIGFLSGLLGSGGTTFLIPVLAAFFTYIIALHSASVHFAVFTALAISALTSLSSMAAYVKQKLIKKNHVRSIIPALLIANIIGLCCAIKISAFMSAILFAIFLLYLSYSIFFDKKQGIIMRYLPLMSGWVGFQSGLLGISGGSIAFSYLAKMPMEFEQSTALSTLITFSISLIGLIIGLCSHSNIKLAWATGFIYWPAVVLVTPVSSIMARLGMRTAKVLPLLLLKLIFALMMLSAALYMLSSVI
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MSSYPYTRLRRLRTQAFSRDLTQEHHLHVNDLVLPVFVQEGVRKRTAVAAMPGVERLSLDELLHEVELLAALGIRAINLYANVAEDKKNNQGSEAYNDQGLAQQAIRAIKARFPMMGVMPDVALDPYTSHGQDGIIDEYGRILNDESVVAMTRQALSLVEAGADMIAPSDMMDGSTLSMREALEQAGHVDVGILAYAAKYASNFYGPFREAVGSLNNLGKADKRTYQMNPANSDEALREVQLDLEEGADIIMVKPCMPYLDIVHRVKTEFGVPVAVYQVSGEYAMFKAASQNGWLDEKFTVLEAVLGMKRAGADMIFTYYAKDIARWLKEN
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MRITTTNIEINKLVRSWQKQGLSVGLIPTMGCLHQGHMSLVHHSQATMDKTLVYIFTNPMQFNDWNDYLNYPKTPEADLALLESTHVDAVFMPSEQEVYPHGFDNITQVHPNIASDTHHLESDCRLGHFTGVLTILTKMFSIIQADQAFLGEKDYDQLTLVRNMAEDLNLYTQVIGVATVREKSGLAMSSRNTLLNQQQKAIAPTIYQTLTQAACALKEGANIQQVEQQSEQTLNQAGFNSEYFRVLTPKLKIPTAADKQLTLLTAAYLGNIRLIDNLSCSR
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MKEIDLSDPELYLDRELSFIEFNQRVVQQAADEAVPLLERLHFLSIASSNLDEFFEIRVAGVKQRLNYNAQMQNDAGLLPQELIKNISVQTHALVKEQYRLFYEELIPKLAKENIEFHFAVDGLAESKQAWLKRYFRNEILPVVSPIGLDYAHPFPRLVNKSLNFIVSLEGKDAFGRDSGLAIVHVPRALPQLIEVPDKEDEKKTGLIFLSSIVQEYIGDLFPGMTAMGCYPFRLTRNSDLFLDEEDVDDLAHALQGELLSRRYGEAVRLEVAENCPEEIQAFLLRQYVLTTDDLYFIHGPATLLSLSAVIGILDRPDLMYPPFVPLLPKGLRNKNLFDMVSEKDILLLHPFESFKPIVDLVLQAARDPNVMVIKQTLYRSEATSKMVDALVEAARAGKAVTAVVELRARFNEEDNISLANRLQQAGALVVYGVVGYKTHAKMTLIVRREGRKFKHYVHLGTGNYHEKNALVYTDYSLFSHNQELAEDVHRVFQQLTGMGKTTKLKKLIQSPFTMHKTLIKFIQREVEFVNAGKPGKIIAKMNALTEQELIRELYRASQAGVEIELIVRGVCCLRPGIKGVSDNIKVKSIVGRFLEHSRIYYFRNGGEAEVYCSSADWMERNLFSRVEVCFPIQDTKLKQRVISDGLTTYLSDNSQSWLLNADGSYTRSVPRSQEPRSAQQQLLDKYS
>NZ_CP039181|2848965:2914537|2913961_2914537_-|WP_075273327.1|transposase|DBSCAN-SWA
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300168.1|2848965_2849829_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155046999.1|2851466_2851874_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923654.1|2852087_2852579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|2852634_2853885_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|2853987_2854206_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|2854663_2855518_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2855572_2856043_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2856367_2857747_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|2857774_2858233_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|2858210_2859428_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|2859619_2859856_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|2859869_2860025_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_016210731.1|2860105_2861068_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2861227_2862544_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2862553_2863222_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2863584_2865399_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2865516_2866305_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211543.1|2866885_2868637_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|2868647_2869448_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2869550_2870039_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_017375799.1|2871547_2871892_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|2877585_2878548_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|2878734_2879994_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2880217_2880544_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2880738_2881689_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2881746_2883813_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|2883818_2884814_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2885399_2886980_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2887136_2888546_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210033.1|2889878_2890703_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|2890930_2891560_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|2891896_2892268_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|2892571_2892859_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|2893010_2893859_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|2893986_2895027_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556667.1|2895099_2896677_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|2897320_2897980_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2898134_2899109_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|2899184_2900204_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047000.1|2900251_2900398_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047001.1|2900602_2900788_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|2901686_2902769_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300161.1|2902816_2903878_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|2903958_2904267_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|2904381_2905698_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_081007001.1|2906159_2907446_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211205.1|2907518_2908415_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211203.1|2908501_2909500_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126430.1|2909608_2910133_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|2910380_2911619_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
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WP_129556669.1|2912636_2913032_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2913961_2914537_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

>NZ_CP039181|2924665:3025537|DBSCAN-SWA
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MYEYELSTECCTSDDGGRGQGLITTACQKFIEYGFNALNLKCVEIHCAINNIKSQNIPIRLGFTKTDDRQEEIKLADNQYADAIIYSLVKH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046758.1|2999801_2999933_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|3002661_3003636_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212335.1|3004730_3005069_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007065.1|3005085_3005925_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155047004.1|3006137_3006644_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300144.1|3006658_3007024_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3008328_3009024_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3009020_3010448_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3010473_3010737_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3010809_3011784_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047005.1|3011842_3012693_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3012891_3013866_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_081007064.1|3013905_3014181_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3014177_3015014_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3015014_3015356_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3015357_3015963_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3015959_3017954_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3017973_3018915_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_052104719.1|3019142_3020567_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047006.1|3020973_3021114_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3021367_3022342_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_080743040.1|3022400_3023057_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126480.1|3023103_3023787_-	methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080664873.1|3024332_3024647_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556613.1|3024541_3025537_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP039181.1|WP_155046705.1|1002279_1002447_+|hypothetical-protein	1002279_1002447_+	55 aa aa	NA	NA	NA	1001020-1044945	yes
NZ_CP039181.1|WP_016211126.1|1046754_1047144_-|lipoprotein	1046754_1047144_-	129 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039181.1|WP_032126179.1|1123379_1123631_+|TSUP-family-transporter	1123379_1123631_+	83 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039181.1|WP_054300381.1|1315714_1316362_-|hypothetical-protein	1315714_1316362_-	215 aa aa	NA	NA	NA	1294329-1349920	yes
NZ_CP039181.1|WP_054300380.1|1316825_1317482_-|transposase	1316825_1317482_-	218 aa aa	NA	NA	NA	1294329-1349920	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046961.1|1327310_1327715_-|hypothetical-protein	1327310_1327715_-	134 aa aa	NA	NA	NA	1294329-1349920	yes
NZ_CP039181.1|WP_032127044.1|1327834_1328035_-|hypothetical-protein	1327834_1328035_-	66 aa aa	NA	NA	NA	1294329-1349920	yes
NZ_CP039181.1|WP_016212482.1|1328249_1328393_+|hypothetical-protein	1328249_1328393_+	47 aa aa	NA	NA	NA	1294329-1349920	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046721.1|1411335_1411503_-|hypothetical-protein	1411335_1411503_-	55 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039181.1|WP_155046720.1|1412711_1412885_-|phosphatase	1412711_1412885_-	57 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039181.1|WP_016211151.1|1494246_1494558_-|hypothetical-protein	1494246_1494558_-	103 aa aa	NA	NA	NA	1439085-1618039	yes
NZ_CP039181.1|WP_081007035.1|1501410_1502076_+|transposase	1501410_1502076_+	221 aa aa	NA	NA	NA	1439085-1618039	yes
NZ_CP039181.1|WP_054300359.1|1504297_1504870_-|hypothetical-protein	1504297_1504870_-	190 aa aa	NA	NA	NA	1439085-1618039	yes
NZ_CP039181.1|WP_016212013.1|1514840_1515224_+|hypothetical-protein	1514840_1515224_+	127 aa aa	NA	NA	NA	1439085-1618039	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046729.1|1568418_1569465_-|hypothetical-protein	1568418_1569465_-	348 aa aa	NA	NA	NA	1439085-1618039	yes
NZ_CP039181.1|WP_098082828.1|1955098_1955356_-|transposase	1955098_1955356_-	85 aa aa	NA	NA	NA	1950172-1960520	yes
NZ_CP039181.1|WP_016212461.1|2159569_2159944_+|hypothetical-protein	2159569_2159944_+	124 aa aa	NA	NA	NA	2156669-2284243	yes
NZ_CP039181.1|WP_016211584.1|2179111_2179465_-|hypothetical-protein	2179111_2179465_-	117 aa aa	NA	NA	NA	2156669-2284243	yes
NZ_CP039181.1|WP_054300258.1|2179562_2180342_-|hypothetical-protein	2179562_2180342_-	259 aa aa	NA	NA	NA	2156669-2284243	yes
NZ_CP039181.1|WP_016209640.1|2246843_2247863_+|hypothetical-protein	2246843_2247863_+	339 aa aa	NA	NA	NA	2156669-2284243	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046989.1|2250307_2251372_+|hypothetical-protein	2250307_2251372_+	354 aa aa	NA	NA	NA	2156669-2284243	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046989.1|2252671_2253736_+|hypothetical-protein	2252671_2253736_+	354 aa aa	NA	NA	NA	2156669-2284243	yes
NZ_CP039181.1|WP_016210742.1|2290626_2290902_-|hypothetical-protein	2290626_2290902_-	91 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039181.1|WP_054300240.1|2295095_2295299_+|hypothetical-protein	2295095_2295299_+	67 aa aa	NA	NA	NA	2291052-2362213	yes
NZ_CP039181.1|WP_054300559.1|2303284_2303833_-|hypothetical-protein	2303284_2303833_-	182 aa aa	NA	NA	NA	2291052-2362213	yes
NZ_CP039181.1|WP_054300218.1|2413631_2414663_+|hypothetical-protein	2413631_2414663_+	343 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039181.1|WP_016211963.1|2594356_2595016_+|hypothetical-protein	2594356_2595016_+	219 aa aa	NA	NA	NA	2580124-2632334	yes
NZ_CP039181.1|WP_016211964.1|2595880_2596201_+|hypothetical-protein	2595880_2596201_+	106 aa aa	NA	NA	NA	2580124-2632334	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046757.1|2963633_2963789_+|hypothetical-protein	2963633_2963789_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2924665-3025537	yes
NZ_CP039181.1|WP_155046758.1|2999801_2999933_+|phosphatase	2999801_2999933_+	43 aa aa	NA	NA	NA	2924665-3025537	yes
NZ_CP039181.1|WP_032126148.1|3001875_3002058_-|hypothetical-protein	3001875_3002058_-	60 aa aa	NA	NA	NA	2924665-3025537	yes
NZ_CP039181.1|WP_155047006.1|3020973_3021114_-|hypothetical-protein	3020973_3021114_-	46 aa aa	NA	NA	NA	2924665-3025537	yes

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046705.1|1002279_1002447_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046705.1|1002279_1002447_+|hypothetical-protein
MEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1042689-1042652	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1042689-1042652, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016211126.1|1046754_1047144_-|lipoprotein

>NZ_CP039181.1|WP_016211126.1|1046754_1047144_-|lipoprotein
MKIFVVLFTLILLSGCATTAKYRAQVERWKGHDVNDLIQAWGPPDTTFKMPNGNLYYSYRVNNINRLPSYYVPGNTTVSDRDGKTYITTSGGYQTGGGTIKSNCTTSFQVNKKDIIIGTHFQGNACVSN

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_032126179.1|1123379_1123631_+|TSUP-family-transporter

>NZ_CP039181.1|WP_032126179.1|1123379_1123631_+|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300381.1|1315714_1316362_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_054300381.1|1315714_1316362_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAEAVELFRREALWFTETVPESALTLESTQKVLQSSQATLSLAQAALESAQAVASTQTMPSTSEPESKSEQSLQEPPQESSAGAQATLAAEKIALTQQQLLAIKQALKASGTSASKQHIIDKCQTLQQLCFAASVQQKGGLFHPTHTTTTGHLLLQLLKRPENRELKQEIFPGNTSASMRGIRHYGRYGQQVLQQHGYLLSCKTPDMI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1308405-1308442	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1308405-1308442, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300380.1|1316825_1317482_-|transposase

>NZ_CP039181.1|WP_054300380.1|1316825_1317482_-|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1308405-1308442	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1308405-1308442, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046961.1|1327310_1327715_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046961.1|1327310_1327715_-|hypothetical-protein
MCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1308405-1308442	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1308405-1308442, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_032127044.1|1327834_1328035_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_032127044.1|1327834_1328035_-|hypothetical-protein
MARSVSNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1308405-1308442	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1308405-1308442, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016212482.1|1328249_1328393_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016212482.1|1328249_1328393_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLFLSFVVIGIFTFSYSFNLDSVLGLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1308405-1308442	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1308405-1308442, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046721.1|1411335_1411503_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046721.1|1411335_1411503_-|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046720.1|1412711_1412885_-|phosphatase

>NZ_CP039181.1|WP_155046720.1|1412711_1412885_-|phosphatase
MHCDRTVLVGDFAKLAFCLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016211151.1|1494246_1494558_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016211151.1|1494246_1494558_-|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1563921-1563884	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1612774-1612737	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1529797-1529834	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1561770-1561807	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1563921-1563884, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1612774-1612737, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1529797-1529834, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1561770-1561807, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_081007035.1|1501410_1502076_+|transposase

>NZ_CP039181.1|WP_081007035.1|1501410_1502076_+|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1563921-1563884	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1612774-1612737	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1529797-1529834	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1561770-1561807	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1563921-1563884, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1612774-1612737, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1529797-1529834, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1561770-1561807, mismatch: 0

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Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300359.1|1504297_1504870_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_054300359.1|1504297_1504870_-|hypothetical-protein
MPKFHQSFYIAFLADAPKRQLFGLDSYKNSFFLQKDKDLSREYTINMHTMHRRKSLLKDEIPFVRINFPYKEDLSREWRVSLDKTNKQVADEMVKAVLSKAEPFTRIYLDINRVSIDCFQQVTYHRRGNSSHEVSTKQVAELLAQSIPEYAKNNLQIKLVVSYAEIFAESLMKELDLQGFKKTSVTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1563921-1563884	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1612774-1612737	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1529797-1529834	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1561770-1561807	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1563921-1563884, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1612774-1612737, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1529797-1529834, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1561770-1561807, mismatch: 0

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Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016212013.1|1514840_1515224_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016212013.1|1514840_1515224_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1563921-1563884	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1612774-1612737	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1529797-1529834	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1561770-1561807	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1563921-1563884, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1612774-1612737, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1529797-1529834, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1561770-1561807, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046729.1|1568418_1569465_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046729.1|1568418_1569465_-|hypothetical-protein
MALGPGGIILTIAMCGFDVLNMAAKAYTKMRKMNRIIAHVNKEIKEICTGLGLAYSADIEALHANIEKREQELIELIASRVSGQSNPDLALVDGIQKEQAAIEKIKDLVDIKERILLKKAYLEYDQFIGIGTSIGFLVGLALILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1563921-1563884	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1612774-1612737	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1529797-1529834	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1561770-1561807	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1563921-1563884, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1612774-1612737, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1529797-1529834, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1561770-1561807, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_098082828.1|1955098_1955356_-|transposase

>NZ_CP039181.1|WP_098082828.1|1955098_1955356_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	1959071-1959034	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 1959071-1959034, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016212461.1|2159569_2159944_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016212461.1|2159569_2159944_+|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2177509-2177472	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2160860-2160897	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2177509-2177472, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2160860-2160897, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016211584.1|2179111_2179465_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016211584.1|2179111_2179465_-|hypothetical-protein
MKTTFSFKHANAKKNRDVNIDGAISLSDGAEIFRKAFSIEKKNFSVLNRVSFILANIDAMNSQKEDYLYHLAANNSLTIFKDFEVIYRGFVWDFVGEYTNEMPAALASLKEGLGVAF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2177509-2177472	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2160860-2160897	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2177509-2177472, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
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**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2160860-2160897, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300258.1|2179562_2180342_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_054300258.1|2179562_2180342_-|hypothetical-protein
MTIKQIQLSEENRGNPKRGRKANLLSNMWQDIEASEVERLIDLNRDRHQENKDTEATITLSKYIPHKSYSAKELLHYPELTMLLRKEKQYLVKDYLLTGPLFELRTPLFMIEAGKQLLQIENDFRESLASEQKRLNNLMFLAKNKVKNIRVTGGKPSCQWSAGTIELNGVSWRVNKDSPAYLGPTGGIEALSFSYCEEIGQMDSFKIETAHIGTSIVELKVRNKGHNKGRRAFLNIEKLGLVPTAEAKALIKKQRGQAN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2177509-2177472	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2160860-2160897	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2177509-2177472, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2160860-2160897, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
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Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016209640.1|2246843_2247863_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016209640.1|2246843_2247863_+|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2177509-2177472	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2160860-2160897	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2177509-2177472, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2160860-2160897, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046989.1|2250307_2251372_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046989.1|2250307_2251372_+|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2177509-2177472	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2160860-2160897	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2177509-2177472, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2160860-2160897, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
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Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046989.1|2252671_2253736_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046989.1|2252671_2253736_+|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2177509-2177472	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2160860-2160897	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2177509-2177472, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2160860-2160897, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016210742.1|2290626_2290902_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016210742.1|2290626_2290902_-|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300240.1|2295095_2295299_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_054300240.1|2295095_2295299_+|hypothetical-protein
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2302595-2302632	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2359425-2359462	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2302595-2302632, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2359425-2359462, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300559.1|2303284_2303833_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_054300559.1|2303284_2303833_-|hypothetical-protein
MVNSALFTQGYECLKALELNQPENIDKLLGGLALFAGNYQRLEKLGFSLNPERVKKMLDNLESFDQDYPSLQKLHAVYDGLTAKIENNQLKVHGLTGGSSIMFKGQLRCVPKGVSKIWEQVADDEGNFKWMDDADVALTQAKAQADQRQGFRGLTAVSMFFGSYRDSETKELYKEISGLLAS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2302595-2302632	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2359425-2359462	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2302595-2302632, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2359425-2359462, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_054300218.1|2413631_2414663_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_054300218.1|2413631_2414663_+|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFKCPVTLEYLDETKIQIYAVKDNSKYAIHAIEKNSFSNLDKCPLTRSQLYISLTFEEYLIFNKNRHHASEFEVKVLPKAEFEEKLPNKVLLPFKTSHLASAIRRLRSDLITSENIQFIAQHANNALNLTIAINRLRTNLAIAENIQLLAQNIEDAYELASAMSELRENLAIPENLQLLTQHSRHALQLVLAINNLKENLATSTTLQLLAQNLASAAHLTAAINELKENLATAENIQLLAQHPSHALQLALAMNYLNEGLATAENLQLLAQHAENAFDLTLSINQKSAANLNVSLSAEQTEHTSLIFQNHLQDSNNEELSFASSLSN

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016211963.1|2594356_2595016_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016211963.1|2594356_2595016_+|hypothetical-protein
MLLSLITAITLIISLLFFAYAIKCLLHKRLTATFLYIFLGSTTTLITTCSALLLLNNLTLDHVTKNIPIAMLSLNQLPPLASKHYQATLSLPSGQIKTFKLIGDDWQLSAQIIVWQDWLHALGLTNRYRFDRIQSRYDNINAEQHAIHSIYPLNPPNTANSFWQWAKHHLIQRYFIKTIYGNAIFMPMRDGASFTIALTNNGLIATPINLAAKQSIGLA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2626933-2626896	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2626933-2626896, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_016211964.1|2595880_2596201_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_016211964.1|2595880_2596201_+|hypothetical-protein
MHALSIFFMFFMISHTSHSLTMLYNERPPYLKTESKQQVLGLTGTFITQVFKTAKTPLHWKKTPAKRHLLLIKKNAEPLCAAGWFKNPQREKYAQYALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2626933-2626896	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2626933-2626896, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046757.1|2963633_2963789_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155046757.1|2963633_2963789_+|hypothetical-protein
MDEAGMDDTERYARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2928065-2928028	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2924628-2924665	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2928065-2928028, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2924628-2924665, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155046758.1|2999801_2999933_+|phosphatase

>NZ_CP039181.1|WP_155046758.1|2999801_2999933_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2928065-2928028	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2924628-2924665	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2928065-2928028, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2924628-2924665, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_032126148.1|3001875_3002058_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_032126148.1|3001875_3002058_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2928065-2928028	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2924628-2924665	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2928065-2928028, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2924628-2924665, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039181.1|WP_155047006.1|3020973_3021114_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039181.1|WP_155047006.1|3020973_3021114_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYAREFICMNMNSLLSVALQMTEGALLL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2928065-2928028	0
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	2924628-2924665	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2928065-2928028, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039181 position: 2924628-2924665, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP039182

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039182_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039182_1
• CRISPR_location: 1232-1743
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 7 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039182_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP039182_1

>1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
>1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT
CGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACAC
>1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039182_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039182_1

>merge|NZ_CP039182|1|1232-1743|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP039182|1|1|1232-1743|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACAC
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039182.1|WP_054300202.1|2231_2960_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039182.1|WP_075273836.1|9715_10777_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039182.1|WP_054300162.1|10806_11889_-|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP039182.1|WP_075273830.1|6971_7304_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039182.1|WP_155047021.1|6034_6190_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP039182.1|WP_016211890.1|3163_5740_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP039182.1|WP_054300202.1|6213_6942_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039182.1|WP_155047014.1|7374_7716_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227633
NZ_CP039182.1|WP_075273834.1|8806_9373_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143503
NZ_CP039182.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP039182.1|WP_054300202.1|7871_8600_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039182.1|WP_054300202.1|2231_2960_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039182.1|WP_054300162.1|10806_11889_-|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	1.72286e-24
NZ_CP039182.1|WP_155047021.1|6034_6190_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	0.000140996
NZ_CP039182.1|WP_016211890.1|3163_5740_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP039182.1|WP_054300202.1|6213_6942_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039182.1|WP_155047014.1|7374_7716_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227633	COG5323, COG5323, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	1.27873e-32
NZ_CP039182.1|WP_075273834.1|8806_9373_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|143503	cd06830, PLPDE_III_ADC, Type III Pyridoxal 5-phosphate (PLP)-Dependent Enzyme Arginine Decarboxylase. This subfamily includes plants and biosynthetic prokaryotic arginine decarboxylases (ADC, EC 4.1.1.19). ADC is involved in the biosynthesis of putrescine, which is the precursor of aliphatic polyamines in many organisms. It catalyzes the decarboxylation of L-arginine to agmatine, which is then hydrolyzed to putrescine by agmatinase. ADC is homologous to eukaryotic ornithine decarboxylase (ODC) and diaminopimelate decarboxylase (DapDC), which are fold type III PLP-dependent enzymes that contain an N-terminal PLP-binding TIM-barrel domain and a C-terminal beta-sandwich domain, similar to bacterial alanine racemases. Homodimer formation and the presence of both PLP and Mg2+ cofactors may be required for catalytic activity. Prokaryotic ADCs (biodegradative), which are fold type I PLP-dependent enzymes, are not included in this family.	0.00873389
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Protein sequences

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MGE targeting detection<

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NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1588-1651	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128606-128669	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039182	Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039187	Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038948	Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038933	Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence	197184-197247	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038973	Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039036	Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence	128606-128669	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1456-1519	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1666-1729	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92323-92386	4	0.938
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NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1378-1441	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128606-128669	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137256-137319	4	0.938
NZ_CP039182_1	1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT	1456-1519	64	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93282-93345	4	0.938

1. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1257|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1324|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|1389|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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137. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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138. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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139. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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140. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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141. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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142. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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143. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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144. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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145. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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146. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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147. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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148. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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149. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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150. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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151. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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152. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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153. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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154. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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155. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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156. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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157. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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158. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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159. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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160. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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161. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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162. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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163. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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164. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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165. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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166. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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167. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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168. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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169. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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170. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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171. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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172. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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173. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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174. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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175. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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176. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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177. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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178. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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179. spacer 1.5|1545|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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180. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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181. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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182. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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183. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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184. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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185. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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186. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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187. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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188. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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189. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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190. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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191. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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192. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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193. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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194. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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195. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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196. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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197. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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198. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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199. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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200. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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201. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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202. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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203. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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204. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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205. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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206. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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207. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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208. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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209. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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210. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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211. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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212. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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213. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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214. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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215. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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216. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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217. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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218. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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219. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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220. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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221. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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222. spacer 1.6|1612|40|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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223. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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224. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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225. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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226. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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227. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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228. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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229. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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230. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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231. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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232. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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233. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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234. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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235. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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236. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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237. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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238. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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239. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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240. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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241. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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242. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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243. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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244. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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245. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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246. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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247. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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248. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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249. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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250. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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251. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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252. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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253. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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254. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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255. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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256. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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257. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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258. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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259. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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260. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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261. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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262. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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263. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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264. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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265. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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266. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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267. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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268. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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269. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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270. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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271. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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272. spacer 1.7|1677|42|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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273. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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274. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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275. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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276. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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277. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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278. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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279. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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280. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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281. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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282. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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283. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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284. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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285. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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286. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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287. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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288. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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289. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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290. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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291. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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292. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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293. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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294. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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295. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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296. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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297. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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298. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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299. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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300. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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301. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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302. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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303. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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304. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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305. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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306. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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307. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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308. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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309. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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310. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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311. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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312. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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313. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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314. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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315. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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316. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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317. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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318. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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319. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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320. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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321. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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322. spacer 1.4|1456|64|NZ_CP039182|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.938

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2231 : 110548	117	Streptococcus_phage(26.19%)	integrase,protease,transposase	attL 75788:75847|attR 86689:88152

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039182|2231:110548|DBSCAN-SWA
TGTGGGTAGACGTAAACGATTTAAGAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCATTATTCCGGTGAGATCATTCTTTGGCTGGTGCGTTGGTATGGCCGCTATGCCTTATCTTACCGTGATCTCAAAGAAATAGCAGCTGAAAGAGGTCTTGAGATTGAGCGTTCAACCATTTGTCGCTGGGTGCACGAGTATGGCTCGCAGATCGCCAAACGGCTGAGGCCCCACTTTCGTCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGTTAGATGAAACGTTGGTGAAAATCAAAGGTCGTTGGTATTACCTTTATCGAGCCATTGATAAATATGGCCATACTTTGGACTGGATGCTCAGCCGACAGCAAAATGCCAAAGCGGCGATGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATCGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGACAAGCACGCTTCATTTCCACCCGCTCACCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGTCAGTGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGGCCTACCATTGACATAATGGAAGCGATGCGCATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGAATATCTGTGCCCAAAATCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGCAGAGAGCACAAGAAAATAACCTTTCTGAAGTTCACTATAATTTTTCGCAACAGTGCCCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTTTTACCTATTATAAGTAGTTTTTTTTATCTTTTAGCTATTAAGCTCTTAGTTATAAACGCCTAGTCTATTAATTAATAGTATTATTGAAAGGAATAAATAGACTATGCCAGTACGATTTAATCCAATAAAAAAAGTATCTCTTAATGGTAAGGTTTTTAATGTTCCTAAAGAGGTTCCGAATAAAGCTTTAGTTAAGTTGGGTCAGCAGCAGCCAGATGTTGTTGAGATCTTGGCAGATTTTTTTCGAACAAATCCTAAGCAAGAATTTTTTAGTAAATTATTTCTGGGTGACCGCTATCAGATTAGTGCAATGTATGTGTCGCTAAGGAATATTGGGCTGAATCAACGAATATATATTCAAAAGGTATTTGATGATCCTGAAGGATTCAGCGATATTATACAACGCCTAAGCAATATTGAATTATGTCAATCTGTATACGTGCAAGCAGCGTTTGAGAATCCTGACCTAATTGCAGTTTTTGAAAAACATAAAGATAAGTTCACATCTCTTAATCAGTTTGAGTTGAATCAATGGGTTTATGTTAAAGCAGTTCTTGGTGATCCTGATAGATTCGATGATATTTTGCAGCGTCTAAGGGATATTGCATTATGTGAGCCTGTCTATGTCCAAGCCGCGCTTAAGAGTCCTCAGAGAGTGGTTGAATTTGCAAAACATACGCATCGGCTTGTCACTCTTAATGCACTTGAGCCGAATCAATTTGTCTATGTTCAAAAAGTACTTGATGATCCTGAAGGATTTGATGCTATTTTACAGCAGCTAAGTGATATTGAATTATGTCAACTTCCATATATTCAAGCAGCACTTGATTACCCGGATCGAGTCGATGTTTTTAAAGCTCATCAAGACAAGTTTGCACTTTTTAATCACCTTAAATTGAGTCAGCTCACAAATATTGAGGCAGTTCTTGGTAATTTAGAGGGCTTCGATGAAGGTTATCGGAGTCTAAAAGCAGTTGGACTGGATCAGCCAAAAAATATCCAAGCAATGCTCGATAACATTGAAAAGTTCAATGAAAACCTTCAGAATTTAAGAGAAGTTGGACTGGATCAGCCAAAAAATATCCAAGCAATGCTCGATAATATTGAAAAGTTCAATGAAAATCTTCAAAATTTAAGAAAAGTTGAGTCAGATCAGTCGGATAATATCCAATTAATGCTCGATAATATTGAAGAGTTTAACGAAAACTTTCAAATTTTGAGGCAATTTGGACTGAGCCAACAATTATATATAGAATCGATACTCAAGTCCCCTAATGTGATTGTTAATATTTCTGACTGCTCTGACGAACTTTTAATGCTTGAAGAGCTAGGTTTGGGGCAAACAGTATATCTCCAAAAAGTGCTTGATCACCCTGATCGCTCCAAAGCAAATCTTTACCGCTTAATACGTATGGGGCTCGATCAACCAGTATACGTCCAATCAGCGCTTAAGGATCTTGATAGATTTGATGATGTTTGCCAGCGCTTAAATGATATTGAGTTATGCGAATCTGCCTATGTCCAAGCAGTACTTGATGATCCTAATCGAATTGCAGTTTTTGAAAGACATAAAGATAAGTTCACATCTCTTAATCAGTTTGGGTTGAATCAATGGATCTACGTTAAAGCAGTGCTTGATGATCCTAAAGGATTCGATGATATTTTGCAGCGTCTAAGGGATATTGCATTATGTGCGCCTGTCTATGTCCAAGCCGCGCTTCAGGACCCTCAGAGAGTGGCTGAATTTGCAAAACATACACATCGGCTTGTCACTCTTAATGCACTTGAGCCGAATCAATTTGTCTATGTTCAAAAAGTACTTGATAATCCTGAAGGATTCGATGCTATTTTACAGCAACTAAGTGATATTGAATTATGTCAATCAGTATACGTACAAGCAGTACTTGATGACCCAAATATAATTACTAAGCTTAAAGAACATCAAAAGAAGCTTGTAAAGCTAAATCAGCTTGGCTTAAGCCAACCAAAGTATATTCAAGCAGTATTTGATCATCCGGAGGATTTCGAGAGGAATTTGCAAACTCTAGAAATCTTAGGACTGAATAAAACAGAATATGTCCAAGCAATATTTGATGATCCTACTAGGATAGATAAGCTTCATAAGTACCATCATTTGTTTTTTAGGCTACATATGCTTGGGTTAAGTCAACCTATATGTGTTGATGCAGTCTTTAATAACACTGAAAAATATGCTCAAATTTGCTCTTGTTTGGAAGAGGTGAAAGATAGAATTGAAACAGTGGAGGATACTATTCAACAAAGTTCACTTGGCCAAAGCAGGGAACAAGGCTTTAAAAGTCATTACCCTGTATATAAATCGAAAGTTATACAATCGTCTTTTGATTTTCTCATTTCTGAGAGAAAAGATCCAGCTGAGATGAAGGCTCACCTCTTTGAGCATGAGCGTGAGTTTTTATGTAACTCTAATATTAAGAGTGATCGCTCATCTTTTGGAGCTATTTGTCGTAGTGCAATGAGAGCTTTAACAAATACTATTTTTATAATAGTAGCACCGGTTGTAGGATATAAAAGAAATTGGCATAAGAAAAATATGTCTATAACTGAGAAGTGCTTACCATTTTATAATCATACGGAGTCCACTAATAAAGTTATGGACCTTACTTGTGATATACAACATACTTTAGTTGCTGATTTTTAGATCGTGTACAAGGATAGGTTCTGTCGCAATTCAAGCATAGGCCCGCTTTGCGGGCGACTTTGTTGAAGCCTTCCCATTGTTAATCGTTACCGGTATTATTAAGGATTTTGTCGCAATTTGAGATTTACAGCTAAAAACACTTTCCTTTGGACGCAGTTAAGCTGCGAGCAAGTAAAATTGCTCGTATGCTGCCTTATCATGGTGGCAGTGCATCTGTTTTTTCTTCAGCATGCGGTAGAGTTCAACACCTGCAATCGTGGCCTTTGATCTGGCAACCTTTTTCTAGACAAATTTTTAACTGATTTTTTGATTATGCTCGTATTCCTCAGGTGATAAATAATCATTAGCTGAGTGAATGCGTTTTCTGTTATAAAAAACTTCGATATACTCAAAGATCGCTGATTTAGCGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAACTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCAATATAACCGCTATCTCTTTCTAAATTATGATTCAATCCTTTAAATCCTGAATCATGCAAAAATGATATAAATGAATGCTTATGCTTACCCGTTGCCCTTATGCAGTCTTTTACATCCTCTATTGTGTATGTACTGTCCTCAACTTTACCCTTCAAAGCAATTAATGCACTCAATTCACTTTTAAAGTCATGGCTTCTATGAGAAATTGAATACCAATTT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047014.1|7374_7716_-	hypothetical protein	A0A1B1IQX9	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-21	60.3
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WP_155047015.1|14198_14522_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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75788:75847	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_016212410.1|84056_84230_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212408.1|84477_84927_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212412.1|84919_85084_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049901.1|85489_86011_+	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	6.9e-19	34.4
WP_075273790.1|86000_86303_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|86847_87873_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300590.1|88489_88714_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
86689:88152	attR	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|89021_89222_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|89215_89551_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|90116_90380_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273796.1|90934_91738_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307367.1|91858_92383_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|92491_92716_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|93116_93857_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|93904_94333_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273802.1|94666_95395_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
WP_075273804.1|95479_95818_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|95777_96233_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_075273806.1|96338_96902_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273808.1|97163_97688_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|97727_98231_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_081377348.1|98545_99295_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273810.1|99602_100310_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.4e-11	34.2
WP_129556718.1|100296_101482_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_054300271.1|102619_103594_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_075273812.1|103590_104148_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.6e-08	26.6
WP_032126362.1|104093_104459_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273814.1|105806_106268_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273816.1|106530_107367_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.9e-20	32.6
WP_129556717.1|107692_108919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|109573_110548_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.4e-25	30.8

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP039182.1|WP_129556706.1|24680_25310_-|hypothetical-protein	24680_25310_-	209 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_016212014.1|31807_32221_+|hypothetical-protein	31807_32221_+	137 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_155047016.1|32624_32852_+|hypothetical-protein	32624_32852_+	75 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_155046767.1|60943_61105_-|hypothetical-protein	60943_61105_-	53 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_075274752.1|57311_57611_+|hypothetical-protein	57311_57611_+	99 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_016212298.1|72780_73107_-|hypothetical-protein	72780_73107_-	108 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_016211913.1|79364_80486_-|hypothetical-protein	79364_80486_-	373 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_016212499.1|83477_83852_+|hypothetical-protein	83477_83852_+	124 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_016212408.1|84477_84927_+|hypothetical-protein	84477_84927_+	149 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_075273814.1|105806_106268_-|hypothetical-protein	105806_106268_-	153 aa aa	NA	NA	NA	2231-110548	yes
NZ_CP039182.1|WP_016212260.1|110705_110978_+|hypothetical-protein	110705_110978_+	90 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039182.1|WP_016212257.1|110997_111222_+|hypothetical-protein	110997_111222_+	74 aa aa	NA	NA	NA	No	NA
NZ_CP039182.1|WP_032126838.1|111558_111762_+|hypothetical-protein	111558_111762_+	67 aa aa	NA	NA	NA	No	NA

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_129556706.1|24680_25310_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_129556706.1|24680_25310_-|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016212014.1|31807_32221_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016212014.1|31807_32221_+|hypothetical-protein
MILIPNGYLIPALPQPSPNLFGIAAADLSGSQNAAVSITKDGFTVTAAGKACDGILQNTPKKSEDCEIICSGAVKATAAGAITAGDYVKVASNGQLIQAAAGDTATGAALETAKAAGDLIGIHLIPNGYLILAAPSK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_155047016.1|32624_32852_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_155047016.1|32624_32852_+|hypothetical-protein
MQQRAPGTTAAQADISYNFDNTYKCEQYALLVQAWCLGNTIEVVSDFKNKYLYHIELETKVSKGNHLKHFVLYFI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_155046767.1|60943_61105_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_155046767.1|60943_61105_-|hypothetical-protein
MRTNYHIKQRIRITRRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_075274752.1|57311_57611_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_075274752.1|57311_57611_+|hypothetical-protein
MSAITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKPPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKARLNYFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016212298.1|72780_73107_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016212298.1|72780_73107_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016211913.1|79364_80486_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016211913.1|79364_80486_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016212499.1|83477_83852_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016212499.1|83477_83852_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016212408.1|84477_84927_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016212408.1|84477_84927_+|hypothetical-protein
MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_075273814.1|105806_106268_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_075273814.1|105806_106268_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPTRLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039181_1	Orphan	1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder	351601-351638	38	104485-104522	0

1. spacer 1.1|351601|38|NZ_CP039181|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 position: 104485-104522, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016212260.1|110705_110978_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016212260.1|110705_110978_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_016212257.1|110997_111222_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_016212257.1|110997_111222_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Protein sequences of NZ_CP039182.1|WP_032126838.1|111558_111762_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039182.1|WP_032126838.1|111558_111762_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI