CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039208	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039204	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 chromosome, complete genome	3 crisprs	RT,DinG,DEDDh,cas3,csa3	1	2	27	19
NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	6	1	0
NZ_CP039207	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP039206	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP039204

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039204_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039204_1
• CRISPR_location: 361821-361950
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039204_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039204_1

>1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039204_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039204_1

>merge|NZ_CP039204|1|361821-361950|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP039204|1|1|361821-361950|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039204.1|WP_016212008.1|362807_363506_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_032126227.1|362479_362770_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016211269.1|369682_370468_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP039204.1|WP_016211271.1|368433_369378_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP039204.1|WP_054300518.1|363942_364788_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_155049101.1|351073_352315_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_033923850.1|357985_358423_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016211797.1|358584_359988_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP039204.1|WP_016211268.1|367230_368415_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP039204.1|WP_036794771.1|355359_356346_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039204.1|WP_075273619.1|365648_366224_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_155046940.1|364992_365376_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_155084812.1|360546_361275_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039204.1|WP_155084811.1|360038_360554_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039204.1|WP_016211795.1|356483_356678_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016211273.1|366281_367115_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP039204.1|WP_016212044.1|354382_354637_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP039204.1|WP_080664870.1|357360_358008_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP039204.1|WP_016212010.1|363522_363819_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016212359.1|353390_353609_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039204.1|WP_155084812.1|360546_361275_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	5.10802e-51
NZ_CP039204.1|WP_016211271.1|368433_369378_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP039204.1|WP_016211269.1|369682_370468_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP039204.1|WP_155084811.1|360038_360554_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	8.9189e-41
NZ_CP039204.1|WP_016211273.1|366281_367115_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	1.71098e-151
NZ_CP039204.1|WP_016212044.1|354382_354637_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP039204.1|WP_080664870.1|357360_358008_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	6.77127e-06
NZ_CP039204.1|WP_016211268.1|367230_368415_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP039204.1|WP_036794771.1|355359_356346_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP039204.1|WP_016211797.1|358584_359988_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0

Protein sequences

>NZ_CP039204.1|WP_155084812.1|360546_361275_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDESVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039204.1|WP_155084811.1|360038_360554_-|IS630-family-transposase
MLNSKQRAQENNLSEVHYNFSQQCHTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP039204.1|WP_016211797.1|358584_359988_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP039204.1|WP_033923850.1|357985_358423_+|hypothetical-protein
MIGLFVNKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP039204.1|WP_080664870.1|357360_358008_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKAQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRE
>NZ_CP039204.1|WP_016211795.1|356483_356678_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039204.1|WP_036794771.1|355359_356346_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP039204.1|WP_016212044.1|354382_354637_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP039204.1|WP_016212359.1|353390_353609_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP039204.1|WP_155049101.1|351073_352315_-|hypothetical-protein
MQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039204.1|WP_032126227.1|362479_362770_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP039204.1|WP_016212008.1|362807_363506_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP039204.1|WP_016212010.1|363522_363819_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP039204.1|WP_054300518.1|363942_364788_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039204.1|WP_155046940.1|364992_365376_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP039204.1|WP_075273619.1|365648_366224_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP039204.1|WP_016211273.1|366281_367115_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQKVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP039204.1|WP_016211268.1|367230_368415_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP039204.1|WP_016211271.1|368433_369378_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP039204.1|WP_016211269.1|369682_370468_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP039204_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039204_2
• CRISPR_location: 1395205-1395311
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039204_2

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039204_2

>2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039204_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039204_2

>merge|NZ_CP039204|2|1395205-1395311|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP039204|2|2|1395205-1395311|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039204.1|WP_016211836.1|1393153_1393642_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP039204.1|WP_016210799.1|1401503_1402457_+|chemotaxis-protein-CheV	unknown	unknown	gnl|CDD|223905
NZ_CP039204.1|WP_016210748.1|1384744_1386700_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP039204.1|WP_155084873.1|1397306_1398944_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039204.1|WP_016210800.1|1399079_1399907_-|DsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP039204.1|WP_075273540.1|1400273_1400885_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_051307365.1|1392873_1393134_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016210791.1|1402883_1403084_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_155084872.1|1396342_1397281_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP039204.1|WP_016210749.1|1383984_1384446_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016212185.1|1387900_1388890_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1396015_1396273_+|transposase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_032126362.1|1389504_1389870_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
NZ_CP039204.1|WP_155084874.1|1404370_1405342_-|glycine/betaine-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP039204.1|WP_129556527.1|1401069_1401330_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_129556556.1|1388983_1389559_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039204.1|WP_155046973.1|1386866_1387025_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_080664871.1|1390301_1391924_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223732
NZ_CP039204.1|WP_016212182.1|1387381_1387567_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_051307339.1|1403458_1404265_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039204.1|WP_016210799.1|1401503_1402457_+|chemotaxis-protein-CheV	gnl|CDD|223905	COG0835, CheW, Chemotaxis signal transduction protein [Cell motility and secretion / Signal transduction mechanisms].	4.08417e-34
NZ_CP039204.1|WP_016210748.1|1384744_1386700_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP039204.1|WP_155084873.1|1397306_1398944_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	6.18807e-38
NZ_CP039204.1|WP_155084872.1|1396342_1397281_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	5.31337e-23
NZ_CP039204.1|WP_016211836.1|1393153_1393642_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP039204.1|WP_016212185.1|1387900_1388890_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP039204.1|WP_080664871.1|1390301_1391924_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter	gnl|CDD|223732	COG0659, SUL1, Sulfate permease and related transporters (MFS superfamily) [Inorganic ion transport and metabolism].	7.37206e-122
NZ_CP039204.1|WP_155084874.1|1404370_1405342_-|glycine/betaine-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	8.78052e-119
NZ_CP039204.1|WP_129556556.1|1388983_1389559_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.62371e-46
NZ_CP039204.1|WP_016210800.1|1399079_1399907_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.60773e-43
NZ_CP039204.1|WP_032126362.1|1389504_1389870_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08
NZ_CP039204.1|WP_051307339.1|1403458_1404265_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	3.41626e-38

Protein sequences

>NZ_CP039204.1|WP_016211836.1|1393153_1393642_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP039204.1|WP_051307365.1|1392873_1393134_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP039204.1|WP_080664871.1|1390301_1391924_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter
MKSKFLNNVKGNVFGGITAAIIALPVALAFGLSSGMGPMAGLYSAVCVGLFAALFDGTPAQISGPTGPMTVVMAATLINLNDVDAEAGLAMGFTVVVLAGCFQILFGLAKLGRYITLVPYPVISGFMSGVGVIIIILQLPPLFGYPLLANLWQTVLNITDMLAAPNYTTFYIGLIVLVIAFFWQGRLNQFFPAYLLALIVGTVIYLIIFKNNADMISVIGNIPSGIPKLHWPTFDIPHLRVIITSALLLAVLGAVDSLFTSLVANNITHEHHHSDRELIGQGLGNMASGLIGGLPGAGATMRTVASIQAGGSTSLAGIVHSLILLAVVLGAGHYFSSIPHAVLAGILIKVGTDIIDWKFIVRLYRLPIFSSILMLIVLLLTVFVDLISAVFVGVFIANLVTIDRLSHIQLDGISLSDGIKNRHDLLSSEADKLRKKRGQIVLFRLVGAISFGVARQIKKQISDFKEHQMLVLDLSRVSLVGVTSIIMIDDIVQAELNKNNKVYIIMDEEGVDENLEKISILKKLKQEYFVKSLDEVLRKC
>NZ_CP039204.1|WP_032126362.1|1389504_1389870_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP039204.1|WP_129556556.1|1388983_1389559_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTEPYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP039204.1|WP_016212185.1|1387900_1388890_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP039204.1|WP_016212182.1|1387381_1387567_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP039204.1|WP_155046973.1|1386866_1387025_-|hypothetical-protein
MARSVRTTPPQYGSYSKQSECQNQACFLGYLIKLIIALQNNTLLLFKSLNNK
>NZ_CP039204.1|WP_016210748.1|1384744_1386700_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP039204.1|WP_016210749.1|1383984_1384446_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1396015_1396273_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
>NZ_CP039204.1|WP_155084872.1|1396342_1397281_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLTYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHDRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP039204.1|WP_155084873.1|1397306_1398944_-|amino-acid-permease
MHTEPPHTPHKIGVIGLTAIGVGTMIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSKFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP039204.1|WP_016210800.1|1399079_1399907_-|DsbA-family-protein
MKKYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
>NZ_CP039204.1|WP_075273540.1|1400273_1400885_+|hypothetical-protein
MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH
>NZ_CP039204.1|WP_129556527.1|1401069_1401330_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP039204.1|WP_016210799.1|1401503_1402457_+|chemotaxis-protein-CheV
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>NZ_CP039204.1|WP_016210791.1|1402883_1403084_-|hypothetical-protein
MPGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM
>NZ_CP039204.1|WP_051307339.1|1403458_1404265_+|methyltransferase-domain-containing-protein
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>NZ_CP039204.1|WP_155084874.1|1404370_1405342_-|glycine/betaine-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNIVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK

Crispr_ID: NZ_CP039204_3

• CRISPR_ID: NZ_CP039204_3
• CRISPR_location: 2613373-2613493
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039204_3

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039204_3

>3.1|2613410|47|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039204_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039204_3

>merge|NZ_CP039204|3|2613373-2613493|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP039204|3|3|2613373-2613493|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039204.1|WP_016210943.1|2621367_2622054_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
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NZ_CP039204.1|WP_016211756.1|2618093_2618819_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
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NZ_CP039204.1|WP_054300282.1|2614870_2615335_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039204.1|WP_054300492.1|2609704_2610715_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP039204.1|WP_016210676.1|2607319_2609401_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP039204.1|WP_016210942.1|2622057_2622669_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP039204.1|WP_016210935.1|2620828_2621371_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP039204.1|WP_016210673.1|2604998_2605472_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_032126312.1|2617120_2617915_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP039204.1|WP_016210671.1|2605604_2606864_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP039204.1|WP_098082812.1|2610859_2611375_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_016211759.1|2619064_2620252_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP039204.1|WP_016210944.1|2622715_2623735_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP039204.1|WP_129556590.1|2616728_2617124_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP039204.1|WP_075275117.1|2612793_2613216_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039204.1|WP_155084957.1|2615391_2615871_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP039204.1|WP_016210672.1|2603607_2604990_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP039204.1|WP_016211905.1|2612139_2612550_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039204.1|WP_016210943.1|2621367_2622054_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP039204.1|WP_016210677.1|2603000_2603615_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase	gnl|CDD|180312	PRK05920, PRK05920, aromatic acid decarboxylase; Validated.	1.18434e-110
NZ_CP039204.1|WP_016211756.1|2618093_2618819_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP039204.1|WP_054300282.1|2614870_2615335_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP039204.1|WP_054300492.1|2609704_2610715_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP039204.1|WP_016210676.1|2607319_2609401_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP039204.1|WP_016210942.1|2622057_2622669_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	1.82603e-94
NZ_CP039204.1|WP_016210935.1|2620828_2621371_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP039204.1|WP_032126312.1|2617120_2617915_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP039204.1|WP_016210671.1|2605604_2606864_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP039204.1|WP_016211759.1|2619064_2620252_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP039204.1|WP_016210944.1|2622715_2623735_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP039204.1|WP_129556590.1|2616728_2617124_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP039204.1|WP_155084957.1|2615391_2615871_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.91038e-07
NZ_CP039204.1|WP_016210672.1|2603607_2604990_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0

Protein sequences

>NZ_CP039204.1|WP_075275117.1|2612793_2613216_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP039204.1|WP_016211905.1|2612139_2612550_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP039204.1|WP_052047041.1|2611607_2611871_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
>NZ_CP039204.1|WP_098082812.1|2610859_2611375_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP039204.1|WP_054300492.1|2609704_2610715_+|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039204.1|WP_016210676.1|2607319_2609401_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP039204.1|WP_016210671.1|2605604_2606864_+|6-phosphofructokinase
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>NZ_CP039204.1|WP_016210673.1|2604998_2605472_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP039204.1|WP_016210672.1|2603607_2604990_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
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>NZ_CP039204.1|WP_016210677.1|2603000_2603615_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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NZ_CP039204_2	2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	1395243-1395273	31	NC_018492	Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence	56616-56646	8	0.742

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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134. spacer 2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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135. spacer 2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 2.1|1395243|31|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45582 : 80415	35	Acinetobacter_phage(28.57%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	137133 : 178990	45	Staphylococcus_phage(60.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	197517 : 258116	51	Ostreococcus_lucimarinus_virus(14.29%)	tRNA,tail,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	265268 : 301651	36	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	446890 : 607383	171	Escherichia_phage(27.91%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	617873 : 655023	38	Escherichia_phage(50.0%)	plate,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	692102 : 864965	148	Staphylococcus_phage(18.52%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_8	883757 : 933443	51	Bacillus_phage(23.08%)	integrase,transposase	attL 884802:884861|attR 907107:907696
DBSCAN-SWA_9	947872 : 1003400	50	uncultured_Mediterranean_phage(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	1072755 : 1200926	114	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA,integrase,transposase,protease	attL 1125335:1125394|attR 1145097:1145386
DBSCAN-SWA_11	1253934 : 1298972	45	Escherichia_phage(14.29%)	integrase,transposase	attL 1267664:1267723|attR 1300151:1300442
DBSCAN-SWA_12	1329010 : 1375193	46	Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1388983 : 1439907	50	uncultured_Caudovirales_phage(33.33%)	integrase,transposase	attL 1387013:1387072|attR 1450316:1450604
DBSCAN-SWA_14	1593460 : 1651974	56	Staphylococcus_phage(20.0%)	tRNA,integrase,transposase,protease	attL 1595019:1595078|attR 1625384:1625464
DBSCAN-SWA_15	1657788 : 1726950	60	Klosneuvirus(22.22%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_16	1747749 : 1792729	41	Acinetobacter_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_17	1797097 : 1827745	27	Wolbachia_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_18	1864279 : 1970425	92	uncultured_Mediterranean_phage(21.05%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	2000169 : 2174550	174	Staphylococcus_phage(20.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_20	2197022 : 2239934	46	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	2311387 : 2370446	55	Planktothrix_phage(18.18%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2462654 : 2486948	27	Escherichia_phage(50.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2492214 : 2586465	93	Escherichia_phage(31.25%)	tRNA,integrase,transposase,protease	attL 2560991:2561050|attR 2569232:2569519
DBSCAN-SWA_24	2614870 : 2666518	56	Microbacterium_phage(11.11%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_25	2727210 : 2760596	34	Stx2-converting_phage(20.0%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_26	2910907 : 3037849	110	Erwinia_phage(13.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	3044704 : 3093232	51	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039204|45582:80415|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGGGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAATTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAAGATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210702.1|61507_64570_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
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WP_016210700.1|66971_68135_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|68140_68740_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211099.1|70960_72205_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211097.1|72201_73044_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211096.1|73023_73833_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|74011_74239_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|74239_75190_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|75245_75797_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211109.1|76338_77085_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211103.1|77127_77826_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77836_78661_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|78990_79359_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274980.1|79353_80415_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039204|137133:178990|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039204|197517:258116|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209853.1|199300_199744_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209873.1|199798_200056_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209868.1|200033_200660_+	23S rRNA (uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase RlmE	NA	NA	NA	NA
WP_016209871.1|200737_202720_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
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WP_016209874.1|204539_207209_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|207232_209152_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|209321_210743_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|210888_211863_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_016209855.1|211894_212290_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|212292_212514_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|212677_214339_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|214411_214702_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_016209861.1|214927_215383_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|215447_215912_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216004_217351_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|217350_218256_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|218317_219304_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|219296_219539_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|219660_221205_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_032126611.1|221251_222538_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|222580_223975_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|224174_224750_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|224695_225061_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228066_228564_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
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WP_016210093.1|231410_233204_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
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WP_016210094.1|233567_234194_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234180_235611_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|235943_236999_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|236967_237645_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|237634_238471_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|238630_238924_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|239030_239837_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|240141_240996_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_016210082.1|241150_242200_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_155084803.1|242215_242905_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|242922_244203_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|244476_245838_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126863.1|245949_246501_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|251933_253205_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211801.1|253261_254245_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|254241_255027_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274991.1|256034_256610_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_129556436.1|257229_258116_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039204|265268:301651|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962625.1|291845_292732_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211609.1|296383_296692_+	double zinc ribbon family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039204|446890:607383|DBSCAN-SWA
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MALKIFDECINCDVCEPECPNEAIYQGEDIYEIDPDKCTHCLGHFKTQQCVEVCPVDCIIIDPENPENEETLWARYHRLTENK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275004.1|446890_447754_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556623.1|447970_449530_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|449551_450586_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|450634_451204_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|451339_452311_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
WP_016210645.1|452322_453900_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556624.1|453965_454952_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300512.1|455283_456393_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210650.1|456498_457683_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210649.1|457760_459749_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_016210644.1|459957_460113_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300511.1|460370_460670_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300510.1|460940_461123_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155084814.1|461179_461353_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275005.1|461497_461833_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|462749_464156_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|464173_465160_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|465162_466317_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|466313_467009_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|467143_468634_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|468654_469704_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|469770_471165_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|472043_473975_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|473979_474510_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|474544_474739_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|474781_475141_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|475560_476556_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_032126132.1|476568_478950_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|478955_479243_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|479514_479991_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|480135_480333_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP039204|617873:655023|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300202.1|617873_618602_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_155047260.1|618695_618854_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|619018_619747_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_155084826.1|619789_620257_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|620306_620597_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275039.1|621400_621895_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|621889_622228_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|622607_623493_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556462.1|623490_624336_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.4e-24	33.8
WP_016210435.1|624566_625373_-	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210431.1|625432_625825_-	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_016210434.1|625869_626688_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_016210429.1|626700_627684_-	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA	NA	NA	NA	NA
WP_016210428.1|627685_628957_-	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA	NA	NA	NA	NA
WP_080664841.1|628963_631468_-	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_016210436.1|631597_632623_+	phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210439.1|632619_633330_+	nucleotidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210440.1|633607_634084_+	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209901.1|701752_702085_-	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	8.0e-05	34.2
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WP_016209913.1|714650_715469_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016209906.1|719015_719408_+	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
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WP_155084830.1|738558_739440_+	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210743.1|819248_820829_+	glutamine-hydrolyzing GMP synthase	A0A1V0SH76	Hokovirus	8.8e-17	27.3
WP_016210744.1|820869_821355_+|tRNA	tRNA adenosine(34) deaminase TadA	NA	NA	NA	NA
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WP_016210297.1|841621_843001_+	leucyl aminopeptidase family protein	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	2.4e-34	35.8
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WP_016211684.1|847741_848317_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556476.1|848861_849872_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|849967_850942_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016209640.1|851096_852116_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209649.1|852574_853540_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
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WP_016209641.1|856903_857641_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|857761_859117_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|859293_859965_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|860080_860956_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|861559_862864_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|862976_863582_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|863663_864965_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP039204|883757:933443|DBSCAN-SWA
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MRISFQGRIFNYHSKVRVFTKKELLVFRDEQDQLQFPLQIGLVYAQKDIIRYIKSCYRRGFKRLNLNHYLCQIPA

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP039204|947872:1003400|DBSCAN-SWA
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MKLRRLLFGAPLSTEKMADVRLSKKMALAIFSSDALSSVAYATEEILGALMIAGSAAFSFTLPISLAICLLILIVGASYRQTITAYPNGGGAFAVAKENLGNRAGLLAAAALIIDYILTVAVSVSAGIRAMTSAFPELMPHAVALSVFAIIVITWLNLRGLHETAGIFAAPTYIFIGLIYLLIFIGLWRLLNGFHHDYVSLNPVPVGGFDASSIGIILILRAFSSGCSALTGIEAVSNGVQMFKVPCAKNANRTLMAMALILMTMFLGVTVLADSLHIYPNNTQSVLSQIAHLVFGEGAIGIGLYYALQVATALILLLAANTSFSGFPRLASVLAEHNYLPRQLRNIGDRLAYSNGIIMLAIIAIVLVIAFQANTHSLIPLYSIGVFLAFSLSQAGVARYFIKRRLTGWLWKSGVSIVGCITTSIAFIVIAESKFTSGAWVVFLIAPLLLCLFYKVHSHYREVDQELAVENIYDDDLLSYDDPLLKVIVPISKLHRGTMTALHFARSLSDDVTAVVVDTHDHDNGERIDKLKEDWKELQIPERLVVLDSPYRATISPLLRYIKRIDLREPERGCAVIVIPEAVPTRWWHHFLHNRKAMLLRAALMYNPITRYGSTRVFVGVPYRLER
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556487.1|958815_960153_-	Do family serine endopeptidase	A0A1B1IRD3	uncultured_Mediterranean_phage	9.4e-12	34.8
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WP_032126790.1|965103_966009_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211043.1|975290_975740_-	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
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WP_016211042.1|976254_977271_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
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WP_016211446.1|985616_987344_-	glycoside hydrolase family 32 protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556648.1|987527_988499_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155084844.1|992489_993131_-	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|993436_993859_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|994219_995182_+	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_081007068.1|995220_996396_+	imidazolonepropionase	NA	NA	NA	NA
WP_155084845.1|996484_998185_+	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_054300273.1|998184_999723_+	histidine ammonia-lyase	A0A1V0S940	Catovirus	5.1e-70	37.2
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WP_016210558.1|1001477_1002233_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|1002513_1003400_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP039204|1072755:1200926|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP039204|1253934:1298972|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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MCVNDIELDEMWSFVGHKKNQRWLWHAIDHSTRKILAYHFGRRKDEALIALKSKLSSFNIRYYYTDDWGSYQRIVPEDSHFIGKKNTQAIERKHL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300189.1|1254912_1255278_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779232.1|1255560_1257120_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016211215.1|1257480_1259451_+	acetate--CoA ligase	A0A2H4PQU7	Staphylococcus_phage	1.5e-77	37.2
WP_016211211.1|1259642_1260722_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211213.1|1260770_1260977_+	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
WP_016211210.1|1260983_1262465_+	thiamine phosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_155084862.1|1262567_1263131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211942.1|1264893_1266153_+	DUF4804 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211940.1|1266273_1266606_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556538.1|1266719_1267694_-	D-alanine--D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
1267664:1267723	attL	NA	NA	NA	NA
WP_016211341.1|1267838_1268009_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211343.1|1268207_1269230_+	YHYH protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211342.1|1269237_1270920_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.1e-32	33.5
WP_016211344.1|1271080_1271899_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211340.1|1273088_1273310_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

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ATTAAGATTGTGGGTCAGGTTCAATCAGTGCGAGTGCATGCTCGACTGTTGTGGTATCTGCACCTTTCAGGTGAGCATGTTCGCTTAAGTGGCGTCGCCAACGTTTTGCGCCCCCCACACCTTGAAAAAGATTAAGCATGTGGCGAGTAATATGATTGAGGCGTGTACCCAGGCGTAGTTCTTTCTCTATGTAGGGAAGCATTTGCTTGACTGTTGTAATGGCTGTTTCAACTGCTGTTGTTGCTAAGTTAACGTTGTTTGGCTGATGGTAAATTTCTTGGTCAATATGGCTAAGCAGTAAAGGCTGGTGATATACTGCCCGCCCGACCATGACACCGTCGACGTGGTTAAGGTGATGTTGGGTCTGAGTTATTGTTTCTATACCGCCGTTAATTGATATGGTTAAATTTGGGAAATCTTGCTTTATTTGATAGACGTAATCGTAATTTAAGGGCGGTATCTCACGATTTTGCTTTGGGCTTAAGCCTTGAAGCCAGGCTTTGCGTGCATGCACAATAAAATGTTTACAGCCTGCCTGACGCACCGTATCAACAAATTGATAGAGTGAGTCATAGCCTTCTTGATTATCAATACCAATACGGTGCTTTACTGTGATAGGAATAGTTACTTTTGCTGTCATGGTTGCAATACACTCTGCCACAAGTGTGGGCTCTGCCATTAAGCAGGCGCCAAAGCGGCCATTTTGTACACGATTGCTTGGGCAACCGACGTTTAAATTGATTTCGCTATAACCATAGTGATCTGCAAGCTCGGCACATTCGGCTAAGGCATGTGGATCACTGCCACCTAATTGCAAAACAACCGGAGTGCTAAGGCTATCACAGTGTAAAAAGCGTTTGGGATCATTGTGTAGAAGTGCCCCTGTGGTCACCATTTCTGTATATAAAACAGCATGTTTTGAAAGTAAGCGAAATAAATAACGACAATGACGGTCAGTCCAGTCCAGCATCGGAGCGACTGAAAATCGATGGGTAACAGCAGACATGTTAAACTACCAAGTTTTATTATTAATTAAATAAAGTAATAAAAGCGCTAGATTATCGCTAAATTGAGCGTAAGGTGCAAGCTCGAATGTGTTTATACGTGTGTACTATCTTGTCATTTAAGGTAAAAAAGTTTAATGTTGTTGATTTAACAATAAGACTTATAGCACTTTAGAAAACCTGAATTGAACACGCGTGTAGAGAGTGAATAGGGCATTGAGGCATAACGTTTGCTTAATGTTTGTTTGTTACTATGATCGTCGTTGTTTTAGAGTGAGTTGGCGTTTTTTAGTGTGTTTATTGATTTTGCATAAACGAAGTTTAAGCTCTAGCTATATATATGAAGTTGTAGTGAGTTGTAATGATTTTTTAAGTTTAGTCACTAGGTTTGTTGTTAGATGTAGTATCGAGATATTTAAGTAGTAAGCGTAATAATGAATAAAAATAGCAAGGTAAAGTTCCCACAGCAGTATTATCGACGGGTTATATTAGGCAGTATTATTTTGCCTGTATGGTGTATAAGTGCTGTTTTTGCAGGTTCTGTGAGTCCGAGTAGTCAGCAGGACAGTTCACATAACCTAAATCGTGAAGTTTCTGCGCAAATGATAAAAACTCCGATTGTTTCTGTGCAAACTCAGACAGTAAAGGAAGTGATTGTTGAAGACTCTCTGCAGGCATTGGGCACATTGGCACCCTCACAAGAGGTGACGCTAAGCTTTGATGCTGCTGGGCATATCACCAAAATTAACTATAAAAATGGTCAGTATGTTAAAAAGGGAGCGATTATTGCTGAATTGAATAATGCCAGTGAAAAGGCTGAATTAAAGTCACTGCTTGCCGATGCGCAAGTGAAAGCACTTGATTATCAGCGCTATTTAAAGCTCAGCAAAATTGGCGGTGTATCAGAGCAAATGTTGGACAAAGAGCATGCGAGTATGGTGCAGGCGTCAGCAAAAGTGGAAGGGAAAAAGGTAGAGTTGGCACAGCGTCAGTTGGTTGCGCCGTTTACTGGTTTTTTAGGTGAATTTAATATTAATCTGGGTGCGTATGTTGGTACGGGGCAAGCGATTGTCCGTCTGGTTGCAATTTCCCCGTTAAAAGTCGCTTATTCGGTTCCTCAAGGGCAAAAATCCAAGTTGTTACTTGGCCAGAGTGTCAATGTCAAATCAGATGCGAGTAACCAGTTGGTCAGTGGCTTGGTTCAATTTATTTCACCGACGGTCAATACAGATACCGGTACTATTGCATTAGAGGCAGAAATACAAAATAAAGACTATAAACTCTCCCCGGGGATGTATGTGAGTGTGAAACAGTTGCTCGGTAATCAGCATCGGGTGTTGATTGTTCCTGAAACAGCAGTGAGTGTGAATGAGAAGGGAGCAAGTGTTTATATTGTCAAAAATAACATTGCTCATTTGGTAAAAGTGACGTTGGGGAGCCGGGACCAGGGTAATGTGGAAGTGTTAACAGGGTTAACTGCAGATCAGCAGGTGGTTGTTGCAGGGACACAAAAGTTAAAAGATGGCGTGTCGGTTAAGGTGATAGCTGCGGCGCCTGTATCTGTACAGGACAGAGTAACAGCACCCAAGTCAAAGTCGCCTGTGATTAGTTCAGATAAGAATCAAGAGAGCAAGAGCAAGCCAGGCCAAGAAAATAAAAAAGACAATAAAACTGAAGCTGAAATTAAAACTAAAGTTGAGAGTAAGAATAAGAATGAGAATAAGCAAAATGGTAATAATCTGCAGAGCCGACAGCAAAGCAGTAAACGAGAGTCAGCATTAGCATTAAAGGATGATAGAACGATAGCAAAAGTAATGCCTCAAGCATCCACGTCGAATCAAGCTAAGTTGACTTTAGATCATCAGGACCATAAAACGAACTAATTTAAAATTTAATTTAATTTTATTTAATTTAGATTAGTAAAAGAATGAAAGATTAAAAGTAAAGGTTAAAGTTAAGGTGCTGATTAATGCAATTACCTGAAATATGCATTCGCCATCCTGTTTTTGCGGCGGTTTTAAGTATTATGCTGATGATTGTCGGTGTTGTAAGTTTTAATAGTTTAGAGATGACTTACTTTCCCCGTTTTGATTCACCCACTGTGCAAATCAGCGCGTCTTTAGATGGTGCATCGCCTGAAAGCATGGCCAAGGATGTAGCAAGCAAAATTGAAAATGCGATTCAAAGTAGTGCTAGTGGCATTGTTGACATAAAAAGTACCAGTAAAATTGGTTCAACGACGATTACTGTTACTTTTAATAATCAGGTTAATTACTATGCCCAGGTGAATAATATTCGTGGTGCAATTGCCGGCATTCAGGGTACACAATTGCCTGCAGGGATGGATCCACCAACGGTATCGACAGAGTTTGTGTTAACGCCGACATTAAATCTTGCTTTTATTGATCCAAGTATGAGCCAGGATGACTTGAATCAATTTGTCAATGATAAGATAAAGCATTATTTCGAAAATTTACCCGGTGTCGGTGCGGTGTGGGTTTTTGGTGGATCGTCACGGGCGTTGAGGGTGTGGCTAGATCCCGTGCGCATGGCCGCCTTAAAAATTACTGCCAGTGATGTGGTGAATGCCTTAGGTGAGGACAATGTAGATTTTCCAGCTGGAGTGATTCAAGGGGAAAATCGTAATTTTACTTTGGTTACCCATGTACGCTTTACCAGCCCTGAGCAGTTTGCTGCATTAATTTTGCGTGATAGTAATGGCCAAACCGTACGCCTTGGAGATGTAGCAAAAGTGGCACTGGGTGAAAATTCATTAACACCATCGCCGATGAAAATTAATGGAAAAAATGGCATCGTTATGGAGATTCGCCCAACGACAACGGCAAATCCGATTGATGTAGCTAAAGAGGCGCGCGCGCAAATTGCGAAATTGCAAAGTAGCCTACCTAAAGGCATGGAGTTAAAAATAGCCTATGATCAATCGGTTTTTTTATTGGATGCAATTCATGCGTGTTTTGAGGCGATTATTGAAGCTGTAATCTTAGTGATTTTGGTTATTGTACTGTTTTTAGGTTCACTTCGGGCAGCGATTATTCCGATTGTGACGATTCCTGTGTGTATTGTCTCTGTGTTTACAGTCATGTTGTTATTTGGCTTTACGATTAATATTATGACCTTGCTCGCTGTCGTGCTGGCGATTGGTTTGGTGGTTGATGATGCGATTGTTGTTGTTGAAAATGTTTATCGCCATATTGAAAAAGGTTTGTCGCCATTTGAAGCGGCTTTAGCGGGCAGCCGAGAAATCGTTTTTGCTGTTATTGCTATGACCTTAACGCTGGCCGCTGTGTATATTCCCATTGGTTTAAGTTCAGGCTTTACAGCCACTGTGTTTCGTGAATTTGCCTTTACTTTAGCAGGTGCTGTGGTGATTTCTGGCTTTGTTGCGTTAACCTTATCGCCGATGATGAGTGCAAAACTATTGCAACCAATAGAGCGTACTTCAAGTATGATGCGGCGTATTGAGGGTTTTTTAGATGCATTGGCGATGCGTTATAAAGCGCTTTTAGTGCGGGTATTAAAAATACGCGTATGGATTATCGTTGGGCTTATTGCCTTATCTGGTGCAGGTTATTGGGTGTATTTACATACGTCTCAAGAGCTTGTGCCTAAGGAAGATATTGGGTATTTTAATACAGTGATTACACCACCACCGGGATCGAATACGGCGTATGTGGGCCGCTATATGACACAATTATCCGAGCAAATGACAAAAGTACCTGGAATTGCCTATGATCTGGCATTCTCTATTGCAGGTGGTCCGGTTAATTTTGTCACGATGAAGCCGTGGGGCAGTGAGCGCCATTTAACGACGCAGCAAATTATTGAGCATTTACGCCCGCTGACTGATGAAAATGTTCCAGGGCTCTTAGTCAGTTATGATATTCCCGACCCGGTGTCGTATGGAACCTCAGAGACAGGGTTAGATTTAAAGATTATTCAGCAAAATGATAATTTAACTGAGCTTAAGTCAACATC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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126753.1|1337210_1337675_-	copper chaperone PCu(A)C	NA	NA	NA	NA
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WP_016211455.1|1370249_1371707_-	hypothetical protein	A0A1C3NFI8	Phage_NCTB	4.3e-10	24.8
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WP_016211454.1|1374006_1374477_+	DUF1289 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039204|1388983:1439907|DBSCAN-SWA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP039204|1593460:1651974|DBSCAN-SWA
ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAATAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACTAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGATGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTCTGTAATCGCTTATAGCGGTACAGTTTATAAATTTGGAGAAGGGCAAGATAGTAAAAACAAGTTTTCAATATCAGATATTCGTGCTGAAAGTGACTATAGTCTGACAGATAGAAAAATAAAAAAAATAAAAACAAAAAGTTTAATTGATAATAAAATTACTTATCATAACTATGATGGTTATGTTAACTCTCTTCCTTCGCGAAGATTTAAAGAGAAATATTTAACTGACTTTAGTCGTGTGACGAATAATGAGATCGAAGGCTTAACTCCTCAACAAGAGGAGGTTGTTTTATTAAAAAACCTATTGCTTGAATCATTAGATAAATTGATTAATTCTTGCAAGAAATCTAGCGTTGTACTAGATTTTTTAGGTCTTCCAGATGTTCGTCATGACAGTAGGTTTAAAAGGATTGAGACTCTTATTGATAACCTGTTAGAGATCGATACTGGGAATATTATAGATCACCCAGAGTTAACAGAGCGATATATTGAGCACTCACCTTACGCACAGGTCATAAACATTTTAATCGCCTAAGCTCTTCAAAAGCTATTTGATTTGACCGCACAAGTAATTTATATTTGAGTGCAAAGTGGTTAAGTTGTGCTTTTACACTCAATGTTTCTAGTTTACAAAATGCCACGATTGATGCAAAAATATGATTGCATTGTGACCGAACAGTTTTAGTTGGTGATTTTGCTAAACTTGCATTTTGTTTAATCGACTTATGATATTCTTCAATTTTCCATCGTTTTTGATAGATTTTGTAAAGCCCATTACCATCCGTCTCTAAATCATTTGTTATTAAATAGAGGTGACCTGTTGACCCGTCTTCGTTTGTGAAGATCTTTTTCATTAATCGCACTGGGAAATTAATTCCCTGAAGATATACATCTATGGCTTCACCATCTTTTAAATCAAGAGATTTGACTGGCTGGTAATTTCTATTGATTTTATCATCTAAACTGCAAGCAACTATTCGATTAGATTTTATTCCTAAAATAAACAACTTATTTAACTTGGCATGAATATAATTCATGTTTTCTTTTGAACTGAACCAGTTATCTGCAACAGCATAATCAAATTTAACCTGGTTATTAATTGCACGATTTATAAGGTTACGAAAGCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTGGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAATTTGATAAAACGGTGAGTTATTTTTTGCCCTCTGTTAATTATCAATGGCTCAAGCTGCTTTTTATCAGTGTACTGTGGTGAGCATCGGTTTCAGGTCAGTCGTTTTATTCAGGTGTTTATTTAAGTCAAAACGAAGAAGGGCTTGCAAAAAAGCTGATTTGGTCCGAGAGCCCAGGAGTTGTTGATGAATTTAGCTTTATGTTATCAAAATTTGACTCAGAAGAAGGCTGTTGCATTTTAGATCCACATAAAGATAAGCTATATGGGGTTAATTATTATCGGTTTTATCTGTATGGCTATATTGCTTATATCAAAGTTGACTCTCAGTCGACCCCGGGTGCTTTTAAGCATTTAACCTTGACTCATGATGGACAGCTAAATATTACTATTAGAAAGTTTTATAATTCTAGTGAATATTCTTTATTGCAGCTACTTTTATTTAGTCAGTGATTATAAACTAAGTCGCATGATGGTTGATTTAAGCCTAAGCTTTTTACAAAAAGCCAGGAGAATTTATCATGCTCTCTTTACTTGCAACCGGTGGCTGGCTGATGGCGCCAATACTGGTTTTAGCTGTAATCGCAGTTGCGATTATTCTTGAGCGATTTTGGTACTTACGAGCGAACTATGTCTTAGCTGAGCCTATTTTTGACCAGGCCTTTGATTTACTTGAACACCCAGCGAAGAAACTTGTGCAATGGCGTGATAAAGTGAGCCATAGTCCACTTGGTTATATGTTGGTGGAAGGTTTAGAAGCAAAGGGGCAAGGGCGTTTGGCTATGGAAGAGCGTATGGAAACTGCGGGACGTCATGCTGTACTTGCACTGGAACGCCATTTAGGCACACTTGGAACAATTGCAGCCGTTTCGCCGTTATTGGGCTTATTGGGCACT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MRQESQLINGRPVSVATLRRRLAAIKYAHKLNKIEPSPTDTAEVRETLKGIRRTLGAKPNAKSALMSQDIQLLMRYIPETITGQRDRAILLLGFAGALRRSELTSLELSDIEVQENGMLVYIRSSKTDQEQQGQVIGIARSENKANCPVGAIEQWLQSSMILSGPIFRRIFANGKIAITTLSDRTIYNIVKNYCQLAGLDASRFGAHSLRRGFVTSAAKAKVDPFRIMAVTRHKRLETVKRYVDEANLINDYPGADLLK
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MHRRELNQAFDRSFALLIEEENCQHITDLLEQLCCDHHDLLIETKYDDVEVCFKYQAQENYIEMVVYQDKVLLEDYHIAIEKVCEKQKIEELHHMCHLIRKTLNDLPLHKNKPCLPD
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MLSTPWLAAIDNTACTNNIMLETASTHPYRRFQGMENSVTYLLNKTKMTAIMAAILANGDEIAFVTEGLLTKDEMRSFCRVELGIELPENIQYYNNTQDTTSKLQQIAHDLQAEYKDVILIDNGHDHIRDAKDAGFATIPVDMSYAPSDLVKIDVDSANGTLYIKKLEEMIARQAHALKHQQGEKKLAWFKKASLRVANESVNQVTLILDLDVILSKGRQPLRAMEC
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MPIYPKEGEQPRPDIITKETTHQLSLELPEQAFYPVNSIKTKPVAIKNYFITDNTMYSIQLAAPDPMLWLNQTKKIELMDINGLYLVEFQEIRYHYSSERVHFEYHIKPYQQSIFFSLYYYLY
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MQFTLNRPLTITVPQNINSSTIMAGPETAYSAQIKMEGSKNEDVSFTIVGASQTVKLRNANNKQLTLNGLRLIPEQSRLNNQGLILIQLGGAVHLRSNQAPGRYQGQAMLQARYTNNPNMQPENYPVRIIVNVFARIRANVLRNLDFGQIISGDIQNQVRVRASSNDTRAGCVAINGERRNNVKISYPVQAVMTKRSNSLAVTVSSSIDGQGKVLQLNNRGRGQICFGGVLTVPEHTAPGKYRGNIDVQMFYP
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MPGRLTRPTNKKTISSLLFSAVRSSHARRIERIQKYLDSGVDPNARYLVEGISYNSIDAAIKWGGSPDIVRLLLNKGGNPYLHTRGVQWPDDNRIKKQMMAALLEYSQFKIPAHVLGRLLFWGVEHNHIDIVQKTLEMGADPNTYCYLQGSHHKKSLTPFQLAVKLKSREMIPLLLQYGADFDLNFHEENGKDPLTYARSNDDDGQFFDFLLDQYHRQIGACKQVQAGIGLEQVRVKLGPEQTQGRPLNAELDHLVAGFLVGKDHQFDFSEFQKQIEIDKSQSKSLEEQRKEENRENWGYFCSKVAGSGNSPKTQALRNFKKCEPTKRAMKGLIATAAQRRGDDEWRPNSLKRLCKMLKKENYSFLLDLLGIKKDQVTADNLRSIAIYDCIGKVDSSGYAYDYFSIKRMGKPREGYICADQTKFFNNIRDKKHPHFLFQDRYNIIEECEIGPALEPIW

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155046727.1|1594678_1595023_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1595019:1595078	attL	NA	NA	NA	NA
WP_081377353.1|1595848_1596514_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274955.1|1596553_1597528_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	5.2e-28	31.9
WP_016211144.1|1598084_1598714_+	MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211152.1|1598697_1599120_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_016211145.1|1599126_1600866_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-53	30.8
WP_016211153.1|1600866_1601931_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211147.1|1601934_1602288_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|1602410_1603367_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211151.1|1603376_1603688_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1603703_1604273_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
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WP_054300271.1|1606069_1607044_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016210841.1|1607265_1607637_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210839.1|1607695_1608469_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_129556514.1|1608620_1611077_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126340.1|1611356_1612118_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941824.1|1612198_1613935_-	sodium:proton exchanger	NA	NA	NA	NA
WP_016210844.1|1614119_1615247_-	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	5.7e-10	23.2
WP_016210843.1|1615333_1615564_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556637.1|1616178_1616958_+|integrase	site-specific integrase	NA	NA	NA	NA
WP_016212589.1|1617432_1617870_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_129556512.1|1618586_1619162_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212275.1|1619151_1620135_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016211335.1|1621238_1621556_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126267.1|1621549_1621792_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211330.1|1622139_1623240_-	carbohydrate kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_098082827.1|1623414_1624716_+	aminopeptidase PepB	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	4.1e-28	36.9
WP_052104656.1|1624792_1625296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126265.1|1625619_1626537_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
1625384:1625464	attR	NA	NA	NA	NA
WP_016211336.1|1626602_1627217_-	chorismate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016211334.1|1627265_1627454_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210322.1|1628071_1628968_+	rasGEF domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210320.1|1629104_1630178_+	flagellar motor switch protein FliM	NA	NA	NA	NA
WP_054300366.1|1630327_1630741_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300568.1|1630761_1631472_-	DNA polymerase III subunit epsilon	A0A1X9SH08	Bradyrhizobium_phage	4.1e-38	39.3
WP_129556511.1|1631654_1633091_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210321.1|1633287_1634256_+	threonine/serine dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_155084882.1|1634304_1634823_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210327.1|1634883_1636215_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210325.1|1636350_1637727_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210326.1|1637880_1639179_-	ankyrin repeats family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126607.1|1639518_1640802_+	homogentisate 1,2-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210333.1|1640875_1641505_-	thioredoxin fold domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210330.1|1641708_1642092_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210332.1|1642189_1642933_+	ribonuclease T2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273555.1|1643063_1643597_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212498.1|1643874_1644558_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126599.1|1645197_1646541_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211804.1|1647235_1648621_-|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9L6B7	Tupanvirus	2.5e-47	32.1
WP_016211805.1|1648627_1650166_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	7.5e-05	36.9
WP_016211806.1|1650208_1650934_+	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155084883.1|1651098_1651974_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP039204|1657788:1726950|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080664836.1|1676059_1677910_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210149.1|1681018_1682263_+	type III PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_016210155.1|1682268_1683078_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SE00	Indivirus	3.8e-16	30.9
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WP_016210146.1|1683930_1684422_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046720.1|1684771_1684945_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075273565.1|1685082_1685973_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046721.1|1686153_1686321_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1686492_1687467_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212367.1|1687463_1688321_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209842.1|1689048_1689438_-	flagellar basal body-associated FliL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209834.1|1689614_1690373_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209829.1|1690369_1692769_-	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209839.1|1694148_1695447_-	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
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WP_016209836.1|1696537_1697752_-|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|1697771_1699058_-	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|1699073_1699328_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_016209830.1|1699563_1700931_-	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|1701261_1702284_+	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|1702806_1704282_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|1704498_1705395_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|1705713_1707273_+	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|1707348_1707543_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209831.1|1707762_1708461_+	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|1708739_1709003_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209848.1|1709309_1711904_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
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WP_016209844.1|1712360_1713401_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210510.1|1753548_1754277_-	lipoprotein-releasing ABC transporter ATP-binding protein LolD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-32	38.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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ATCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTAGTATAGCCTAGTTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGATTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATACAATATTTTTTTCTGGTGGCCACACTACATTAGTAGTTAGTATACTGATCACAGCCTCTTTAGTCTTAACACACTCAAATATCTCATAAAATTAAAAACAAGATAAAAAACAATTGACAACTCACCTTACGCACAGGTCATAAACATTTTAATCGCCTAAGCTCTTCAAAAGCTATTTGATTTGACCGCACAAGTAATTTATATTTGAGTGCAAAGTGGTTAAGTTGTGCTTTTACACTCAATGTTTCTAGTTTACAAAATGCCACGATTGATGCAAAAATATGATTGCATTGTGACCGAACAGTTTTAGTTGGTGATTTTGCTAAACTTGCATTTTGTTTAATCGACTTATGATATTCTTCAATTTTCCATCGTTTTTGATAGATTTTGTAAAGCCCATCACCATCCGTCTCTAAATCATTTGTTATTAAATAGAGGTGACCTGTTGACCCGTCTTCGTTTGTGAAGATCTTTTTCATTAATCGCACTGGGAAATTAATTCCCTGAAGATATACATCTATGGCCTCACCATCTTTTAAATCAAGAGATTTGACTGGCTGGTAATTTCTATTGATTTTATCATCTAAACTGCAAGCAACTGTTCGATTAGATTTTATTCCTAAAATAAACAACTTATTTAACTTGGCATGAATATAATTCATGTTTTCTTTTGAACTGAACCAGTTATCTGCAACAGTATAATCAAATTTAACCTGGTTATTAATTGCATGATTTATAAGGTTACGAAAGTACTCATTCTTCGATATATTAGATTTTCTCTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAAGTAGCGACGCTTACGTTTCTTTTCGGTCCTTTAAATCAGTAAACTTGATGTCTTTTAATACAGTTTCATAACCAATAGGTGCGGACGTTTTCTTGTAAGTCACCATACTTGTCAAAATATTAATTCCCTTTACATGAGCGCTTTTGCTGTGTGAATAATGCCAACAAACCACATCATTCTCATCTGTATAAGGCTTTTCTTCCACGGTATCATCCAGACTTAAAACGCCTCCAACTTCTTCTTCATACTGACGAACATGCTTTTTAACATAGCTCCAGAGCTCTTTTGATCCAAAGTGGTTTTTATTTAAAAAGCGTGTGACTTTATCATGGCTGATACTTCCTTCCAGTAAATCTGAAAGTCCTGTTGCCGTTGCATAATGGTTCTGGCTAATTAAATAGTCGCTATAAATATCCAGTAGCTCTTTATTCATTCCTGATGAAATCCCTGTATCTATCAGATTTCATTATACATTGTTTATCATGTCAGTGCGTAAGGTGAGTTGACAATAAAAAACAAATTAAACTAATCTATCGTTATCATTAAAATAACTTTAAACAAATAAAAAATTTATAAACATAAATATCATAGTTAAAAAACGATCTATTTTTACAAATCACTATAGGGAGCCAACGAATACCTATCCCTATCAGCAACAACCATTAATTGATTAAACACCTGATAAAAGTATGGGGAAAACACTATGCCAAAAACTAGACTCGACATCCTTCAAAAAATAGAAAAAGCAAACGCCAACTCTCAAAGCCATATAAGTTTGCGTAATTGGGACCTTAGTGGTTTAGATTTATCAGGCTTATATTTAAGTCATGTTGATTTATATGGAGCAAATTTAGAAGGAGCGAATTTAGCTGGAACCTATTTAAAAGGTGCGAATCTTAGTTGTGCTAATTTAAAAAATACAAACTTATCAGGTGCATATTTGCAGGGAGCAAACCTACAGTTCTCTAATTTAGAAGACACCAACTTTTGTCATGCGGACTTGCGTAAAGTTGACTTTAGAGACGTACAGACATTCAATGGCGCAAGGTTTAAAGGGTCTTGTGCCATCGGTGCATGGTTTGGCACTGGTGATTTAAGAAATACAGATATTCACCACAGTAATTTTTACTATGAGTATTTAAGCCTAGAGTTGCAAGAAGCAATGAAGGACTTAGATGACGACCCTCTCTTTACAAACCGCGATGAAAACCCACAATTTGAAAGCCAAGACTTTTTACCCAGTGACTTTAATAATCTTAAAAATAAAATACTTGAAAAGTGTATCCATTTTCAAGAAATTGATCGGGATGCCACGTTTACTGTCCCTAACTTTATTCGATATCTGACTGAAGAGCAACGAACAAAGTTCCTCGATGAAAGGGATAGATTAATCGATTGCAGTATCAACCTCGAAGAGATAAGCGTTCCTGTTCATATTGCTGGAGAATCAGCAAACTATAATCGCGATGCATTCCAAGACTATTTAGCTAACAGTGAAGTTTCACCGTTTACAGGTCAAGCTATCCACGAAGATAGCATTCAAAATGACTATAGCCCACAAACTTACATTGACTATCATCTCCTTGTTGAGGAGATGGCAAAATGTCTTCCCGCAGATGAACTTGCTGAATTAAATCAACAACAAGTACCAGCAGCTCCGCCAGCTTTAGCCAGGCATCAAGAAGCAGATATAGATCCCAATCTACTTTTAATCATATATTTAACGTTAGATAAATATGGCCTCTCAAATGCTAAAAATCTAGAAAAAGCACTCAAAAACCCGGCAAGATTTTTAGAACAGTACAACGAGTTAAAACAACAGCAATTCTGTAAAGCTGTATACCTTCAAGAAGTACTTGATGCCCCGAATTTATATAACCCATTCACAGGACATGTTAGGCTATTTAAATCACTTTCAGATCTAGACCTTGCTTCACCAAATAATATCCAGCGTCTACTCAAAGCTCCTCTCGACACTACGCTTATTAAAATATTAATAGAATCAGGTTTAGATGAATCAATTAAAGACTGCAAGCAAAGGAACAGTACAGAAAAGCTTAAACTCTCAGAGTTTTTTAAATATCACCTACAATCAGAAACAGAGCTTGCGGGATTAAAAAGTATTCTTAACGGTGCAGCTTCAGCACTTAACCACAGAAGGCATGCCTTCAATATCTTCTCCACAGCACACTCTTATAAAGCTGCTGAACCATACTTTAACAAAGCTCGGAAGTTAGCTAACATCAGTGACCGATATTGGGAAATCGCCCTATCACGACATTATTGGACTAATAGCTGGCAAGAACAAGCTAATCACTACTATGAAAATACTTCTAGGATTCCGGTAACAGCTCCGATACCAACAGTAGTTCCTACTCCTACCACCGCAGCCCCAGAGCCAACAGCACAACCAACTGCTGTTACAATGAATAACGTAACCATTACTCCAGCTATGAGAGCAACTACCACTCCGGCACCTATCACTCCAGCAGGCACTACTACCTCACCAGTACCGGCAGACTCAACAACAGCCCCCAATATCACCCCTACAAGTACTGGCGCTCTAACTCTAACCCGTACTCCAGCTTTAAATCATCCTCTTGCTCCAGCCATGGAAGCAACTGCCACTCCACTACCTGCGACTACGCAGCCAGCACCTATCGCTCCAACAGCTACTACAGAGACTATTACAGATCCTGCTAAAAAAATAACAGACATAATTGATACCAATAATCGATTTATAGATGCTTTAATAAAAGATTATACGGGTAAAAGCCCAGCTCAAACAACTGCAGCGAAAACTCCAACAGCACCATCTAGCACTGTAACCACAAGCTCAAATACTACCTCTACGTGCAAAGGCAAGTATGTTGTCATTGCTCCACCAACTAGCGCCCCAGATACAGCTCCAACGACTGCACCTATATCTACAAGCCGCACTCTATTACCTGCATTAAGAGTTACACCAACTGTTGCTCCACCAGCCCCGCTA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MKVVVFATFTSAGVVRRALTQAGFVVKKIPSFAGKREMMRGWKKI
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSAPIGYETVLKDIKFTDLKDRKET
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MLKGRVIILLMDSFGVGASEDAEQFGDAGADTFGHIVEHAAHGLADSPERQGALKLPYLASLGLEQAAKQSRGRPIAKTITGDLELPIQGVYGYAIEQSCAKDTTSGHWEITGVPVEFEWDYFHKAAECKTPGQYSSCFPADFMRRFLAETGLTQGVLDAGHASGTEVINRLGDEHCLTGKPIVYTSADSVFQIACHEKSFGLERLYGLCQTARELFDEMGLNIGRVIARPFVGNKAGEYQRTGNRHDYSVPPPQPTLLEYVVKGGGEVISVGKIADIFADRGISHKVKATGITELFDQSLATFKRSKAGSLVFTNFVDFDSEYGHRRDVAGYAKALEYFDSRLPELMDSMEPGDLMILTADHGCDPTWPGSDHTREHIPILAWGPGLQSKNIGQRHSFADIGQSIADFMGLAALAHGQSFLS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300209.1|1797618_1797984_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300380.1|1798187_1798844_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155084894.1|1799114_1799537_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126139.1|1802383_1803313_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
WP_016210804.1|1803319_1805239_-	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	4.5e-84	34.0
WP_032126141.1|1805303_1806578_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016210805.1|1806987_1807659_-	pyrimidine 5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_036776426.1|1807667_1808519_-	pyridoxal kinase PdxY	NA	NA	NA	NA
WP_016210803.1|1808696_1809995_+	PAS domain S-box protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	7.5e-14	52.3
WP_054300162.1|1810069_1811152_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_016212040.1|1811355_1812705_-	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
WP_016212039.1|1812881_1813439_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052133287.1|1813627_1814026_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155084895.1|1814127_1815450_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	2.7e-11	24.3
WP_054300384.1|1815858_1816674_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212251.1|1816835_1817372_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212250.1|1817533_1818184_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155084896.1|1818306_1818783_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069065.1|1819010_1819223_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211219.1|1819613_1820891_-	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
WP_080664858.1|1820887_1821025_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211223.1|1821536_1823138_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211221.1|1823154_1824297_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_016211218.1|1824549_1825287_-	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211224.1|1825311_1826583_-	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|1826839_1827745_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039204|1864279:1970425|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962623.1|2173397_2174550_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039204|2197022:2239934|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP039204|2197022:2239934|2220149_2220836_-|WP_051307345.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211505.1|2235087_2235804_+	bifunctional 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase/3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase UbiG	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP039204|2311387:2370446|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21

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MSKKLYIQTYGCQMNEYDSAKMAELLGESEGFIKTDTPDDADVLLVNTCSIREKAQEKVFHQLGRWRKFKEKNPNVIIGVGGCVASQEGENIVKRAPFVDLVFGPQTLHRLPEMMQESKNDKRSVVDISFPEVEKFDNLPEPKADGPTAFVSIMEGCSKYCTFCVVPYTRGDEISRPLDDVLAEVVSLAEQGVREINFLGQNVNAYRGVMHDTAEKADLAMLISYTAAIDGIDRIRFTTSHPVEFTDSLIEAYATVPELASFLHLPVQAGSDRILAAMKRGHTTLEYKSKIRKLRKARPDLCLSSDFIIGFPGETDKDFEDTMNLIADIGFDNSFSFIYSRRPGTPASDLPDDIAMEVKRARLERLQERIKQQTMAISRRMLGNVENVLVTGVSKKNPDELQGRTENNRVVNFIAPIAAIGGFAKVKVTKVLGFSLRGELVSLENKLN
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MSKRCYISVDGGGTSTRARVYNDEGGVLGESVQGASNISICVDQAMQALILAINQAKSQAGFAKSDQLPIGIGIAGLEIPKARHSFLEQVSRLGSDVVVQSDAHTACLGGHDGDDGAILILGTGCIGWLIDKEEVQHVGGYGFPLDDRAGGAGIGLAALQVTLRFLDGRQSCSYLLERLAEKFDQNIARLAEFGVSASKTEFARFAPDVFDAFDHGDVYAKQIIEAAVSDIEMMIGRLYQGNNEALPLCLLGGLAHKFKPLLSYAIQERLVEPCGDALWGGYKMIKNYVELGDSTVIGLLGIEHDKI
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MKKIALPDSLPKDTIGLDPIRGSDYTYPTRDDMELHTLTDNSTSEDKQVNILPLSFDFKYELAGKISEEAALLFLEEMTRSSIAPDACKETISFIPE
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MFFSTVSKEGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MKRRNISSGSDWEKQIGFSQAVCVGPFIQISALTPVDAEGKVIGIRDAYEQTKQILTNLQATLEHAGAEMADVVRTRIYVKDLRLWQEIGRAHGEAFQDIKPATSMLEVSRMTGPDFLVSIEADAIIDESAERV
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MQLTQFTDYSLRVLIFLACKKGSSSSIDEISRNYNLSINHLRKVIHKLGQLGYIETSRGKGGGIKLAECPQKINLGVVIRQLEPHFDLVECFTNAKPGCKIAAACRLKGVLAEALNSFLAVFDGYHLADVLGGQQEELVQLFGFSLS
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MQKPSLSYRDAGVNIDAGNRLVERIKHVAKATHRPGVMGSLGGFGALFELPTDRYKAPVLVSGTDGVGTKLKLALELGIHDTVGIDLVAMCVNDLIVIGAEPLFFLDYYATGELDVDVAASVIKGIGEGCLQAGAALVGGETAEMPGMYSAGDYDLAGFCVGVVEKERIVDASRVTAGDVLIALGSSGVHSNGYSLVRKILAVAGQGFETVLSESGKTLAELLLAPTRIYIKSLLPLFNQDKIHACAHITGGGLPENLPRVLPAGVSAKINTASWQWPEIFQWLQQQGGVETDEMYRTFNCGVGMVICVAREDVDDCLAQLTASGENAWVVGEMIDGQDQPVIFSE
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MHGREKSISNAFDKQAVFISKQLTIPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MDTATHSKSSSFSLFITFFAAIGGILYGYDIGIINGALLYIQHDIHMSAAQTSFIVAAVLGGGALSTLITGYLADRFGRKHMMITAVAIFLVGVAFLATAHNYNVLLVGRLIQGIGIGIITIIIPLYLSEVAPKHLRGRGVCSFQVLLSAGILLANVIAYFFAKAGISWHMMFLSSGIPAVILGTGLLFLPKSPRWLVFKGHIQQARQTLEHVYPKETASQELELICSSHNKNNSASISALFQRKFIYPLTLVFSIAILNQLTGINSILQFSATLLKGAGLQSDLVAILGSIWITVVNFIITIIAMLLVDKVGRKPLLTIGTAGVTVALLLSGIAFIYLPEGITKGLLIGIGLLVYVFFFALGPGIVVWIALSELLPNSIRSIGMAVALSLNSLASTLLASSFLPLVNHIGYGGIFILCGFFTAIYFYLAYFKMPESKGKSLEEIESSYNAAAQPATATPHIK
>NZ_CP039204|2311387:2370446|2331306_2331672_+|WP_054300550.1|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKAMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP039204|2311387:2370446|2331728_2332037_+|WP_054300461.1|DBSCAN-SWA
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2311387_2312098_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2312126_2312531_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209567.1|2313646_2314264_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155084936.1|2314334_2314478_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126712.1|2314698_2315157_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2315901_2316912_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
WP_016209566.1|2317396_2318308_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209545.1|2318633_2322128_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2322165_2323005_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_016209564.1|2323191_2323407_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2323455_2324031_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2324027_2324366_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2324534_2325524_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
WP_016209572.1|2325524_2326487_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
WP_016209559.1|2326496_2327399_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155084937.1|2327442_2328417_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212612.1|2328554_2328788_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_054300455.1|2328881_2329247_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|2329261_2329768_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2330133_2330499_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2330444_2331020_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|2332128_2332704_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2332649_2333015_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|2333167_2333440_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|2334048_2334384_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211407.1|2336108_2336948_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211411.1|2336944_2337442_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_016211412.1|2337445_2338438_-	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_016211408.1|2338552_2339899_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2340122_2341184_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|2341262_2342408_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_016211372.1|2348219_2349077_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|2349063_2349987_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211368.1|2350183_2351575_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2351621_2352665_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2352707_2353151_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2353283_2354474_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2354528_2354675_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155084938.1|2354855_2355170_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|2355226_2356144_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|2356411_2356705_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2356781_2356976_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212197.1|2357994_2358912_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2359377_2360220_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2360287_2360938_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2360952_2361993_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2362115_2363201_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2363227_2364337_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|2364353_2364671_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|2364667_2365027_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_054300173.1|2369384_2370446_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP039204|2462654:2486948|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMIQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075273327.1|2479262_2479838_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2479783_2480149_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211949.1|2482535_2483786_+	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_054300202.1|2483925_2484654_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016212193.1|2484776_2485115_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212196.1|2485565_2485811_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300475.1|2486219_2486948_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP039204|2492214:2586465|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_23

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211987.1|2493222_2494959_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_144019359.1|2495120_2495318_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|2496179_2496908_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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WP_016212214.1|2497883_2498384_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274931.1|2498900_2499629_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_016211653.1|2499884_2500910_-	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	2.3e-18	78.8
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WP_016211051.1|2506845_2507349_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
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WP_016211044.1|2508087_2508948_-	malonyl-ACP O-methyltransferase BioC	NA	NA	NA	NA
WP_016211045.1|2508928_2509702_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211052.1|2509732_2510986_-	8-amino-7-oxononanoate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211049.1|2510985_2511948_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_016211056.1|2511991_2512744_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155084947.1|2512797_2514678_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210615.1|2514825_2515296_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
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WP_036777984.1|2515599_2516049_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|2516269_2517694_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
WP_016210618.1|2517758_2518808_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_051307334.1|2519074_2519854_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556587.1|2519897_2520800_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210625.1|2520858_2521605_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
WP_016210616.1|2521853_2524664_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_081007053.1|2524898_2525759_+	HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2526114_2526480_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2526425_2527001_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155084948.1|2527071_2527509_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211722.1|2527598_2530901_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
WP_036780093.1|2530910_2531732_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|2532088_2532805_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8
WP_129556588.1|2532749_2532917_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274943.1|2533107_2533632_-	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
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WP_016211325.1|2556025_2557546_-	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.3e-85	38.9
WP_016211322.1|2557608_2558199_-	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
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2569232:2569519	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_155084955.1|2573609_2574584_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.5e-27	31.6
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WP_016210066.1|2583539_2584208_+|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP039204|2614870:2666518|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATGAATTTTTGAAATTCTTCCATATCGCTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGTCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATACAATGCTATCGGGCTGGACTTTTTGCCTAACTATTGGGAATCACTTGTGTATACACTTTACCACCTCGCTTGAGAACCCATCCTGCAGCATCTCGGCCTCGCTTACCTTTGCGTGCGTCACCAAAGTAGCTTTCATCGAATTCAATTTTCCCACAAAATTATTCACTACGGTTCTGTTGTTTTAGGGCGATTTTTTCTCGTAACTTATGAAAGAATCGGATGGCTGTATTTCGGTGAATATCGGCCAAATCTGCCGCTGTTCTGGTGGTTGAATCTGCAATGAAATATTTCATCAATTCAATTTGCTTATTCTCTGGCAATTTACAGTGTTTTATGTACATATGATATCCTAACAAATCAAATATTAGGTGTCAGCCTCTATTTATTAAAAATAATAAAATCTAAATAAAAGTCCAATTTGATTAGACCAGAACAACTATTGAGCTTGATCAAATGGAAAAATATGGCAAAAAATCCTCTTTCCTCTATCCCTGCCATCTACTAGCCATAATAACAAAAAGCCCTGACCTAACACTCTATCACTGTTATAATCAAGCTTCATTAAAAAATAATGCTAGACAATGCTATATCACCAAATAAAAAAGAGATAAGAAATAATGACAGAATTATGCCCTTGCTGTAGCCAAAAGCCCTATTCCTCGTGTTGTCAACCTTTCGTGAGTGGCCAAACTCTTCCCGCAACACCCGAGCAGCTAATGCGCTCACGCTATACGGCCTACACTCAGGCAAATATTGACTATATTATTGCAACAATGCAAGGTGAAGCATTAAATGGATTTAACCGCAACAGCGCCACAACCTGGGCCAAGCAGTCCACCTGGTTAAACCTACAAGTCTTATCAGCACCAGCGGTCAAACAAGATGGTCAAGAAGGCTTTGTTGAGTTTATTGCTTCCTTACAAAATCAAGGCAAAATAGAATGCTTACATGAGAAAAGTCGCTTTATCAAAAATAAAGACCAATGGTTTTATGTCGACGGTCAGCAGCATTAAAGCCGTGCTAAGCTAGTCTGATTATTTTTTAACCACTGCCGAGCGACTTTGTGTTCAGGGTAATACAAAGAGACCAACTGCCAAAATGCCGGAGAATGATCAAAGTGCTTTAAATGACTCAACTCATGAACAATCACATAATCAATGATAAATTCAGGTGCTTGCAATAACTTCCAGTCAAAGCTCAAGCAACCGCTGCTTGAACAGCTTCCCCAACGTGCCTTATAAGAACGCACGCTGACTTTAGTCGGCTTGAGCTGCATGCGATTAGCAATAAAAAAAGTACGCTGTTCAAACCTTAACAAAGCTTGCTCCTTAAACCAAGCGGATAACTTGTCTCTGATGTAGGCTTGATGGTTTTCACTCTTTACCCGAGCCGGCACTCCCATTAAAAACGCATCATCATAAAATACAACTGATTGATTAACATAGGTTAATTTTAAAGAGTATTGCTTTCCTAGATAAGAAATAAGTGAACCTGAACTTAAGCTCTGATGCTGTTTAGTCGATGCAAGAGAAAAACGAATATTTTCTCTAACCCAAGCCTGGTTATCATCAATCGCCTGACAAACCCGCTGCTTTGACATACGCTTAGGGACGTTCATATGGACCTTACCATCACGAATGCTGAGGCCATATGTTTTCGTCCGGCCAGTGTGACTAATCCTGTAATCAATATTATCCACAGTCAACTGGTAGGTTTTTAGCTGCTTTAGTTTCTTGACAATCTTCATAGCGCCATCATAGCCTAAGTGCTCAAGAGTGCAAAGAGCAAAAATCAACACGATCATCAGCGTAAACTTAACCCTTTTGTTTTAATCGTTATTTAGTAGACATTGCTACTGAGCTAGAGCAAGCATCGCTAGCCATTGGCTAGCGCTTTCGGCCATCTAAAATTGTCAAATTTTGATAATGGTATAAAAAGTAAAAATAAATAAATCAAATAAGTAAAGGACCTTAATCTAACAACTAATTGACCTCTGCCTCCATCGAATCATAAAACCAAGAGCTCCCTACCGCATCAGCCCATAGACAATCACCTAAATCATAATGCCACCACTCTGATACAAAATTAGTAAAGCCCTCTTGCTTCATCGTATTAAAAAGCAAGCGCCTATTTTGACGAATCAGCAGCCAACGCTCGCTACTGATACCGAGGTTCGCCGAATAATCACGCTCAAAATAATCCGTTTGAGACAGCGTTGTTGTATTATCAAATTCAGTACCAAAATCCAGTGCAGTATTGGTCCTTAGGTCCATTAACGTCAAATCAATCGCACCACCTGAATTATGTGGAGGCACAGCAAAGCGAGATGGCTCATGTGGATGTGAGACATACTTCCTAACTTCAATCTCTAACCACTCTTTTGATCTACCCGGATGCCTTTGGTAAAGTTCACGATAAATTTGCTCAAATAATGTCTTCTGGCAGGCTACTGAACGATAGGCATCAAAAATAGCAAAGGCAAAATGTGGCGCTAAATTCTCTAATACAGCTAACAGCTTTAAATAAACGGACTGACGTGTATACATGACTGACAAAGCACCAGGTAATTTTTGCTGGTAATACTCATTTAAGCACATAATTCGAGAACTCGGCTTTAACTCAACACAAGCCGCTTGCTGCTGCAACTCGTTCAATGCCTGTTTATCTACTGTTTTATAATTATGGCAAATCGGCAGATCAGGCAGCATATTTTTTCCTACTTAATTTAACCAGGGGTTTCCCTTGACTATTTTAATGACCTGTAGCGCTTTAGCAACCGTAACCTGTCCGAATTAAACCAAGCGAAATATCTTTCATCCTCACTTTCAAACTATCAGGCTCCCTGTTATTGCCTCCAGACAATCTATCGTTCTTTAGGAGCTACCATTTAGCTTAATTAACAGTTAAAATGGCCAATTATTAATATTTAAAAAATATTTTATTTAAAAACATTATGAATAAATATCAAAAACTTAATGCAGAAAAAGCCATTGAATACGTTAAACAATACAATATATTCTTTACGCACTATGAGCACCTACGCTGTGAAGAAATTGGTGATGGCAACCTCAACCTCGTCTTTCGACTCATTAATGACAATGATAACAAAAGCTTAATTATAAAACAGGCTTTACCCTACGCTCGCTGTGTCGGTGAATCCTGGCCTTTATCGCTTGATAGAGCACGCATTGAAGCTGAAAGCACACAAATTCAAGCTAATATTTGCCCAGGCTATGTACCTAAGATTTACCATACCGATAACACACTGGCTCTCACTATCATGGAAGACCTCTCTGACCATGTAGTATTGCGCAACGGTTTAATCTCGGGGCAGTCTTATCCAGAGCTCCCACAACAAATCGGCTCTTTTCTAGCACACACACTATTTTATACATCAAATTTATATTTAGACTCCCACCTAAAAAAACAGTACCTTCGCCAATTTATTAACCCCGACCTGTGTAAAATTACTGAAGACCTGGTTTTAACTGATCCATTCTTTGGTTCAGAACGTAACCATTATGACCAAGATATTCAAACTCAAGTTACTGAACTGCAAAATAACCAACAATTACAACTTAACGTCGCTGCATTGAAATTAAAATTTCTTTCATCTACAGAAGCGCTCTTACATGGCGATGTCCATACCGGCAGTATTTTTGTAACAAAAAACTCAATGAAAGTGTTTGACTCTGAATTCGCCTATTATGGCCCCATGGGCTTTGATATTGGCCTGATTATTGGCAATATGGTATTAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_24

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MNKYQKLNAEKAIEYVKQYNIFFTHYEHLRCEEIGDGNLNLVFRLINDNDNKSLIIKQALPYARCVGESWPLSLDRARIEAESTQIQANICPGYVPKIYHTDNTLALTIMEDLSDHVVLRNGLISGQSYPELPQQIGSFLAHTLFYTSNLYLDSHLKKQYLRQFINPDLCKITEDLVLTDPFFGSERNHYDQDIQTQVTELQNNQQLQLNVAALKLKFLSSTEALLHGDVHTGSIFVTKNSMKVFDSEFAYYGPMGFDIGLIIGNMVLSLCSHFIQNNLNSVNYCLNAIEIIWQTFESKFTTLAKEHTQDLAFKNDIYINHTIKNIFADTLGYTGCEVIRRIIGLAHVEDLDGMENKTLKNKAEILALTIGQQFILEQNQLHTIDNVIQKLQGHL
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MDKINIKNKLLEEMAIEQHAIVMAEFISTVLCEQLEDIVKKRPKVKETPVLMTLTAECQVRTLTSACLKALGALANRFVDEDDLEEMFLSMLEVHSDFCLQTLQHAVKEKEQLE
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MISLWKTYQALKTKGILGINQRNADFIIRYNQRKYYPLVDDKIMTKTLAIKDGIAVPKLYATLKTDHDTHHLEQILANRTDFVIKPARGAGGDGILVITNRHGERFRKVSGALLHLDDIRHHISNILSGVYSLGGQRDQAMIEYRVQFDPLFKKISYQGVPDIRIIVLKGYPAMAMVRLPTRLSDGKANLHQGAIGVGIDLTTGITLEGVWMNDPIHEHPDTGYAVPGLQIPHWDHFLNLAARCYELTQLGYLGVDIILDKDKGPLMLELNARPGLNIQIANNSGLLHRLRFIEQQNQQRTADERIAFIKHQFAKI
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MTELCPCCSQKPYSSCCQPFVSGQTLPATPEQLMRSRYTAYTQANIDYIIATMQGEALNGFNRNSATTWAKQSTWLNLQVLSAPAVKQDGQEGFVEFIASLQNQGKIECLHEKSRFIKNKDQWFYVDGQQH
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MRISTNLHFKLLVAALFIIGIFITCYQIKTLNTPMTPSTETSVWTVEAKVQFQPEKNKPIKAELTLPNTYQDNMKILNEKFISRNYGYSTAKSNDNVRVVTWSIRRAKGLQALYYHFVVHQQHQPGKIAAPSQTIEAYPFVNSQKVAADALLAPIRQQSADIASFTQETIRLLNQKDDHNATLLLKDADSSLKRAVVITRLLSLAKIPAKVIYGIYLLPGTTQPVPWIASFNGKKWLYFNPVTGTAGLPDNVMLWSQGEEPLFKISGANQAKITFTVSESHLNALAFLQPDHSEKATNFINFTLLSLPLQTQEIYKILMTVPIGVLIILLLRSFVGVTTLGTFMPVLIALAFRETHIVWGVVLFTLVTSIGLLARGYLNQLQLLLVPRLAVILTLVIIMMAMISIFSYKLGFERGLSIALFPMVILTMTIERVSILWDERGPQEALIAATGSLITAILAYLTMTNSLITYWAFAFPGLTLIIIAIMLLIGRYTGYRLSELLRFKAFASKL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556590.1|2616728_2617124_+	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126312.1|2617120_2617915_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211756.1|2618093_2618819_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2619064_2620252_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|2620828_2621371_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210944.1|2622715_2623735_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210940.1|2629242_2630430_-	multidrug effflux MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	6.4e-20	25.2
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WP_036779158.1|2635282_2636815_+	inactive transglutaminase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273313.1|2646677_2647016_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036778253.1|2647073_2648612_-|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	3.5e-87	36.5
WP_098082804.1|2648723_2649822_-	peptide chain release factor 2	A0A0S4KWG0	Pseudomonas_phage	1.1e-05	43.1
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WP_016210981.1|2651288_2651927_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP039204|2727210:2760596|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039204|2910907:3037849|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCTGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCCATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCGGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGACCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGATTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTAGGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATATTTTTTAAAAAATAAACATTAATATTAAAAAAATATAAAATAAACTATTTTTTTCAGTAGCACAAATAATATTTATTAATTATAAATAGTTAGACTAATGGTTTTTAAAAACTAAAAGCATAAATTAATGCCTATAAATAAAATATAAATAGAGAAATAAAGTTATTTATTTTTTATTGTAAGTACATTATAAAATATGGAGATTTTATGCCTAAATTCATGATACGTAATTATGATTTTTACAAAAATAAAGAGTTCCAGTCTGCTTATATTAATTATTCAGGAAAACAGTCTTTTTTTGAAAATTTAGCATTTTTAAAAGATGTAAATGATTATGTCAATAATAAGCTAGTTTTTAGTGATAAAATCAGCGAATATAATAATTGCAAAATCAATGGAGTTAATTTAACACAAGCGACTGAGTTTGATATTAGAAGGTATTTCTATACGACTTATTTTAGTGATAATGCTAAATATCAAATTAATATAAGTAATAATGCAAAAAGGCATTCATCTTCAAATATAATCAATCTAGAAAATCAATCAACTTCAAATAAGCATTCATCTTTAAAAATAACAAATACAGAAAGTAATTCACTTTCAAACATTAAATTATTTGTGCAAGATAATAACGAATTAGGAATTATGAATCCCAATGTAGACTTAATAGAGTATCTAAATAGAAGCAGAAAAGAGATAGAGCGTATAGTTCAATCAACAGAATTAACTACAGGAGATTTTTTTAAAAATAACTGCAAATTTCCTATAATAAAAAATAATATCAGTACGACAATTATGATAGATCATATACGAAGTGAAATCAGTCATAAAAATAAAAAATGTTGCAGTGACTGCACCATACTATAGAAAAGATATACTAAATTACTTTATAAGTTTACACTATTAAATAGTGTCAAAAAATAAAAGAGAGAATAGACGAGAATCCTCTCTTTTATAACTTTATATAAATTTCATTACAATATTTCTTTTAATACTTTTTCAAGCTTATTAATAAAAACTTGATTTTCCTCAGGCAAACCGATACTTATTCGCAAAAACTCTGGTAAGCCATCTGCGACTGTAGGCCGAACAATCACTCCTTCTTTGAGTAAATCATTAAAAATGTTCATTGCGTGCTCACCAACTTTTACCAAAATAAAATTAGTTACAGAAGGCAGATATTCTAGTCCTAGCTTATCAAAACAAGATTTTAAATAAATCATTCCTTGTTTATTATTTGCAAGGTTTTTCTGAAGGTGCTCTTGATCATCCAAAGCAGCTAAAGCAGCTGCAACTGACATACTACTACAATTAAAGCTATAGCGTACTCGCATCATATAATTAACGATATCTTGAGAGCTGATACTATAACCAATACGCAAACCACCTAAACCATACGCTTTAGAAAAAGTTCGGGTAATAATCAAATTATCGTATTGACCTAATAAACTCACTGCCGATTGATAATTTACACCTTCAACATATTCATAGTAAGCTTCATCCAAAACAACCAAAACATTCTCTGGCACTTCTTTTAAAAATTTTTGAATATCACTAAAATCAAGCCAGGTACCTGTTGGATTATTAGGGTTGGCAATAAAAATAATTTTTGTTTTCTCTGTTATTGCTGCAAGCATAGCAGTCAGATCATGACCATAGTTCTTAGCTGGTGCTTGAATAATACTAGCGCCTGACATTTTACTAAAAATATGGTAAAGAGAAAAGGCATGCTCTGAGATAATAACTTCATCATCTGCGTGAATAAAACAACGAATTAACATTCCTAAATTTTCAGAGGATCCTGCACCAACTAAAATTTGTTCAGGGGTTACTTTCTCTTTTTCTGCCAAACGTACACGTAATAATGGTGCAGTATCTTCAGAGTAACGGGTAATATTTCCAATCGCTGACTCTATCGCCGTAACTACCTTCTTAGAGGGGGCTAAAGGGCACTCATTACTTGCTAACTTAATAATATTCTTAAGGCCATACTCTCGCTTTATCTCATCTATACTTTTGCCTGGCTGATACGGAACAACCTCACGAATAAAATCAGGTACCAATTCATTTAATCTTAACGTCATACTTCATCCTACTACATTGGACTATCAGGTTGATTTTCAGGGGCTGCTTGAACAAATGCAGCATGTTCCATACAGTGCTCATAAATTGCTAATATTTGCGGAAATCTTGTTAAATCGCAATTAAAGCGTTTTGCATTATAAACCTGTGGAATTAAGCAAATATCAGCCAAACTTAAGTGATTATCTAGACAGTATTCACCCGCTGTTTCAACCAATATTTTCTCAAGTGCAGTAAAGCCAGCCAATACCCAATGCTGGTACCAAATATTTTTGGCTTGGTCATCAATATTTAGCTCATTTTGTAAATACTGTAATACGCGCAAATTATTCAGCGGATGAATATCACAGGCAATTGCATAAGCAATTTGGCGAGCTTTTGCTGCAAGGCAAATATCTTTAGGAATAAGTAGTGAATTATCTGGATATTTAGCATCTAAGTACTCAATGATTGCTAATGATTGAGTAATGACTATATCACCATCAACCAAGCTAGGTACTAGCTGCTGTGGATTAATCTGCGTATAATCTGCCTGGTACTGCTCACCGCCATTATTTAATAAATGCACTGGCATATAATCATATTCAATCGCTTTTAAAGCCAGAGCAATTCTTACCCGAAAGCTTGCCGAAGAGCGAAAATAGCCATAAAGCTTCATAGTTACAGTCCTTTATTCTTATTTGTCATATTTTATAACCCGCTGATTAATTGCACCAAATAAACTTTGGCCTTGTGAATTAAACATTTCTATTCGGACTCTATCACCAAATTGCATAAAGTCTGTTTTAGCTTCACCTTGATCAATAATTTCTAACATACGCTTTTCTGCTAGACAGCAATAACCCACGCTACGATCAACATTCGATACCGTGCCAGAGCCAACAATAGCGCCAGCTGCCAACGCTCGGGTTTTAGCCGCATGTGAGACTAATTCAGGAAAATTAAAAGTCATATCAACCCCAGCATTCGGCTGACCAAATAACTCATCATTTAAATGCACAGTCATCGGCAGGTGAACTTTTTCACCATCCCAAGCATCAGCTAATTCATCAGCGGTAATCGCAACCGGTGAAAAACTGCTGGATGGCTTAGATTGAAAAAAGCCAAAGCCTTTTGCCAGCTCTGCGGGAATTAAATTACGCAGTGAAACATCATTCACCAACATAAATAAACGTATGTTTTCTTTCGCCGTTTTAGCATCTGCTGCCATTGCAACATCACCGGTAATCACTGCGAGTTCAGCTTCAAAATCAATACCAAAATCAGTACGTTCAACCAAAATATCATCGCAAGGGCCAATAAAAGCATCACTGCCACCTTGGTACATTAGCGGATCATGCCAAAAACTCTCAGGCATCTTCACACCTCGTGCCTGACGTACTAGCTCCACATGGTTAACATAGGCACTACCATCGGCCCATTGATAAGCGCGTGGCAAAGGTGACATGCAAGCACTGGCATTAAAGTCAAAACTATCGGCAACTTCATTTTGATTAAGGCCAATATAGACTTCTTGCAATTTTGGCTCAATATCTTGCCAATTATCCAAGGCAACTTGCATAGTTTTGGCGATACCACTTGCAATAATACATTTTTTTAAATCACGACTGACAACGACTAACTTACCATCACGACTACCATCTTTTAAGGTTGCTAACTTCATTCTGGTTTAACCTCTTAATTTAAAATAAAATCATCCAAATATTATAAAAACAAAAGGACCCTAACCTAAGGTCCCTTTTTTATCTAGCTTTTAAAACACCACGCCTTACCTGATCTAGCTCAATAGAATCAAATAAAGCCTGGAAATTACCCTCACCAAATCCTTCATCACCCTTACGCTGAATAATTTCAAAAAATGCTGGGCCGATGACAGTATCGGTAAAAATTTGTAATAATAATCCACCCTCTGCTGTTGGTGCGCCGTCAATTAAAATTTTATTTTCATGTAAATCTTTAATAGA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046757.1|3032157_3032313_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039204|3044704:3093232|DBSCAN-SWA
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MPHIELKYSDDLIIDTNKIFEAIENTINEYDSSSGVCKSRAYATSLYKHSHILVSVFLLKKPHRDDNFSQGLTYSLEQVVKEFIQQECHFSLSLEYNSDFYITNQYSVEKNC
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3092027_3092342_+|WP_080664873.1|DBSCAN-SWA
MVSLIQFTLKHLFQTGRAWWRYYVANRENIPRSVVETVVKMLSCKTKFAGHDEYSCSNPDCKHTKTVAYTCKSRLCSSCGKKPQSNGLLHKMSYYQSANINTSH
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3075526_3075691_-|WP_155046696.1|DBSCAN-SWA
MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEG
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3090798_3091482_-|WP_032126480.1|DBSCAN-SWA
MCKIPTEVATLTFSITFGYDYFEYLKKDPVKFELFNKSMAAHTKRDIPTIIDALNLDSHKSIIDIGGGTGELLSGIVKHRNITGVLYDLGQVIKHAKANLADDILEKLDLVSGDFISSIPSGIDYHILKFILHDWTDEIAIKILKNSRASINPGGKLFIIEAIVDTKQHDSSAVWHDLHMFSLFNSKEREKKDFEYLLRESDFEINKIITLPRNGLLKLSVIECNPI
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3092251_3093232_+|WP_144019150.1|transposase|DBSCAN-SWA
MLLLWKKATEQWIAAQNELLPKCEYQHITLTMPEALWPFFLANRDLLNELSRLAADILLKTAKKKKVKIGIFTMLHTFGQDLKWNTHIHLSVTRGGLSECEAIWKKIYFTKRKTMRMWRYAIINLLRDAYKAGKLVIPHQYQNRIIDLTSFNRFINPEYNKLWHVHFSDVQPSHHQNVDYLGRYLKRPPLSNSRILYYDGEKVAFRYIDRETGKQDEYHCTASEFIDRLIPHIPEKSFKMVRYYGFLSFRTRGKLLPKIYEILDQTVEPIKKITYASLLKGFINTDPFECILCGSKMVLTGGRPKQRLSVIMKYHKALATMQIIKF
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3048404_3048968_+|WP_016211234.1|DBSCAN-SWA
MQIKPLIILDRDGVINEDSEHYIKSAAEWQPIEHSLTAIAKLNTAHIKVAIATNQSGIYRGYFTLATLHTMHKKMAHLLAEQHGHIDRIEYCPHGPTEGCSCRKPAPGMLKTIITHFQLTPEHAYFVGDSFKDIQAAQAIGCTPILVLSGKGGDTLKKHPELEKQIKIFHTLNHFVNELLANANTTA
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3052472_3053540_+|WP_016210345.1|DBSCAN-SWA
MKTIPCILMRGGTSKGPFFLASDLPSDPQERDQVLLKIMGSPHQAQIDGIGGGSSVSSKVAIVSPSARDGIDVDYLFCQVVVGESRVDSSLNCGNMLSGVGPFAITKGLVKAQDQETTVRIYNKNTDVVVEAKVQTPNGELSFEGEATIDGVPGHSAPIELSFLDSVGAKTGKLLPTGQAVNIIDDIEVSCIDVSVPVVMMLAASLGKSGYETKQELDQDKNLIKKMEMIRQKAALLMGMGDVSHSVTPKMALLAEPHCNGHITSRYFTPTDCHPSHAVTGAICIASACLIPGSVANQVAHNIHIQDAESDIIVEHPAGTIDAVIHKEVTGKTIEIPKVSFIRTARPLFSGEVII
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3047880_3048396_+|WP_016211228.1|DBSCAN-SWA
MSEPILPAKTVDASAVHEHVYKIFPNDLNAHRTVFGGLIMATLDRIALVVAERHSGHVCVTVSVDAMHFLAPAKDGDTLIFKAAVNRAWGSSMEIGTKVIAENSYTGNQRHILSSYFTFVALDENEQSAKIPAIIAKTMDEQRRFNEAQLRRDLRLQNKQTIATSRQQKTG
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3082997_3083339_-|WP_016211294.1|DBSCAN-SWA
MSGHYEVATNEKKNLGKSLRNYALGFILSAVLFAVATLLVSKQALSSTGVTLVLLIILAVLLLVQLVCFFGLNTRTENARWDMLTFAFTILVTVVVIGGSLWIMYNLNYYMVH
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3089062_3090037_+|WP_155047187.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHWPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP039204|3044704:3093232|3063863_3064490_+|WP_080664839.1|DBSCAN-SWA
MNCPNQSKQNSKAQKKKNKVSKKEVSSSLSKAAQCIQQGGIIALPTEGIMGLSCDPHNDTAIKRLLAIKQRPEHKGLILVAADLTQLRPFIQRLSVELLDKLTTIRKQPTTWITPAHPEISKLITGSFSGVAVRLTTHPLVKALCLACDHALISTSANISTEPNTRDLATLNPALTVQLDYLLDGQVGTHQGPSEIRDLLTDTILRQG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211231.1|3044704_3045655_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_016211227.1|3045654_3047733_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211228.1|3047880_3048396_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016211234.1|3048404_3048968_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211229.1|3048948_3049695_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211230.1|3049834_3050287_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210351.1|3050710_3051547_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210335.1|3051543_3052440_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210345.1|3052472_3053540_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3053558_3053927_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556609.1|3053952_3055401_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210336.1|3055410_3056790_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_051307328.1|3056830_3058162_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_155084983.1|3058133_3059090_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.7
WP_016210340.1|3059185_3059689_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|3059823_3060975_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3060971_3061451_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|3061597_3063919_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_080664839.1|3063863_3064490_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|3064494_3065394_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|3065466_3066045_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|3066345_3066603_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081006999.1|3066611_3066983_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.4e-20	52.2
WP_081006998.1|3067187_3067643_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.3e-21	41.0
WP_032126637.1|3067759_3068053_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_155046758.1|3068901_3069033_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016212051.1|3069660_3070434_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3071761_3072736_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155049176.1|3073502_3073649_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016212335.1|3073830_3074169_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007065.1|3074185_3075025_-	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|3075237_3075537_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|3075526_3075691_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300550.1|3075747_3076113_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211790.1|3077417_3078113_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211793.1|3078109_3079537_+	FAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211791.1|3079562_3079826_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3079898_3080873_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047005.1|3080931_3081782_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211291.1|3081819_3082164_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211297.1|3082160_3082997_-	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|3082997_3083339_-	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211298.1|3083340_3083946_-	cytochrome c oxidase subunit III family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126720.1|3083942_3085937_-	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_016211299.1|3085956_3086898_-	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_052104719.1|3087125_3088550_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047187.1|3089062_3090037_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-28	32.0
WP_080743040.1|3090095_3090752_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126480.1|3090798_3091482_-	methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080664873.1|3092027_3092342_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019150.1|3092251_3093232_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP039204.1|WP_054300283.1|1083833_1084475_-|hypothetical-protein	1083833_1084475_-	213 aa aa	NA	HTH_38	NA	1072755-1200926	yes
NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1131334_1131592_+|transposase	1131334_1131592_+	85 aa aa	NA	HTH_21	NA	1072755-1200926	yes
NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1191205_1191463_-|transposase	1191205_1191463_-	85 aa aa	NA	HTH_38	NA	1072755-1200926	yes
NZ_CP039204.1|WP_155046970.1|1427262_1427511_-|hypothetical-protein	1427262_1427511_-	82 aa aa	NA	HTH_ARAC	NA	1388983-1439907	yes
NZ_CP039204.1|WP_155046720.1|1684771_1684945_+|phosphatase	1684771_1684945_+	57 aa aa	NA	HTH_38	NA	1657788-1726950	yes
NZ_CP039204.1|WP_155046721.1|1686153_1686321_+|hypothetical-protein	1686153_1686321_+	55 aa aa	NA	HTH_38	NA	1657788-1726950	yes
NZ_CP039204.1|WP_155049815.1|1930767_1930920_+|hypothetical-protein	1930767_1930920_+	50 aa aa	NA	HTH_21	NA	1864279-1970425	yes
NZ_CP039204.1|WP_155084903.1|1953323_1954007_-|hypothetical-protein	1953323_1954007_-	227 aa aa	NA	HTH_21	NA	1864279-1970425	yes
NZ_CP039204.1|WP_155084904.1|1954363_1954708_-|hypothetical-protein	1954363_1954708_-	114 aa aa	NA	HTH_21	NA	1864279-1970425	yes
NZ_CP039204.1|WP_155084905.1|1954939_1955503_-|hypothetical-protein	1954939_1955503_-	187 aa aa	NA	HTH_21	NA	1864279-1970425	yes
NZ_CP039204.1|WP_032126179.1|1967704_1967956_-|TSUP-family-transporter	1967704_1967956_-	83 aa aa	NA	HTH_38	NA	1864279-1970425	yes
NZ_CP039204.1|WP_016211367.1|2016148_2016931_+|hypothetical-protein	2016148_2016931_+	260 aa aa	NA	HTH_38	NA	2000169-2174550	yes
NZ_CP039204.1|WP_016211126.1|2047140_2047530_+|lipoprotein	2047140_2047530_+	129 aa aa	NA	HTH_38	NA	2000169-2174550	yes
NZ_CP039204.1|WP_032126801.1|2085657_2086167_-|hypothetical-protein	2085657_2086167_-	169 aa aa	NA	HTH_38	NA	2000169-2174550	yes
NZ_CP039204.1|WP_129556588.1|2532749_2532917_+|phosphatase	2532749_2532917_+	55 aa aa	NA	HTH_38,HTH_21	NA	2492214-2586465	yes
NZ_CP039204.1|WP_155046749.1|2569060_2569348_+|hypothetical-protein	2569060_2569348_+	95 aa aa	NA	HTH_38	NA	2492214-2586465	yes
NZ_CP039204.1|WP_155046945.1|2569898_2570972_+|hypothetical-protein	2569898_2570972_+	357 aa aa	NA	HTH_38	NA	2492214-2586465	yes
NZ_CP039204.1|WP_129556602.1|2973610_2973820_-|hypothetical-protein	2973610_2973820_-	69 aa aa	NA	HTH_38	NA	2910907-3037849	yes
NZ_CP039204.1|WP_016211201.1|2976966_2977275_-|hypothetical-protein	2976966_2977275_-	102 aa aa	NA	HTH_38,HTH_1	NA	2910907-3037849	yes

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_054300283.1|1083833_1084475_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_054300283.1|1083833_1084475_-|hypothetical-protein
MPQAYPTSNNEQQSNNFPPPSSTTSSSATASNLPLEQIKTQPASKTVKNLGDSITYDQLLHLIKQETQKSIFILAKKIKNAKLPFSTLFEDTSGRKTGIQVLEEFIKDILSHSNQGHPHQPLTQALGELVHERVKSFYEDDGKMKGRRKTETISMLFSEIKRMFQNITYANAAVSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1083619-1083656	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1126755-1126792	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1083619-1083656, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1126755-1126792, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1131334_1131592_+|transposase

>NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1131334_1131592_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1083619-1083656	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1126755-1126792	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1083619-1083656, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1126755-1126792, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1191205_1191463_-|transposase

>NZ_CP039204.1|WP_098082828.1|1191205_1191463_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1083619-1083656	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1126755-1126792	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1083619-1083656, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1126755-1126792, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155046970.1|1427262_1427511_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155046970.1|1427262_1427511_-|hypothetical-protein
MNILTDLLRICYQGFKMHVRNFLQNTIRKLREYENSSPSFLKFLGSDTPELRAARRGYAHDLKVILEATERDCETYGASFFI

HTH_ARAC HTH domain information

• Identity: 0.46835443037974683
• Hit_domain_coverage: 0.9404761904761905

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1389896-1389933	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1389896-1389933, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155046720.1|1684771_1684945_+|phosphatase

>NZ_CP039204.1|WP_155046720.1|1684771_1684945_+|phosphatase
MHCDRTVLVGDFAKLAFCLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1723265-1723228	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1723265-1723228, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155046721.1|1686153_1686321_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155046721.1|1686153_1686321_+|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1723265-1723228	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1723265-1723228, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155049815.1|1930767_1930920_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155049815.1|1930767_1930920_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1969513-1969476	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1919263-1919300	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1959479-1959516	1

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1969513-1969476, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1919263-1919300, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1959479-1959516, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155084903.1|1953323_1954007_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155084903.1|1953323_1954007_-|hypothetical-protein
MLKKRLKPILATLGILLTVTSATEVSALTAAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDAGKAVELSKGLEAIKLILYKKHYPEGGGMVAFDVYKCSAELYVDKGLDIWWPRDELKASSVRTGETGLKAFFASDLLIKYGERIGPERYAAIRYTGFDRTKSPIFDQIMLDTGCTSYPRTPISFSLWLEKKGNIDYSAQSVAYVPTPNDFYQFRLPKALLNSFIPYTNKVS

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1969513-1969476	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1919263-1919300	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1959479-1959516	1

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1969513-1969476, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1919263-1919300, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1959479-1959516, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155084904.1|1954363_1954708_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155084904.1|1954363_1954708_-|hypothetical-protein
MQNTYRGSDAYDKALLLSRYLEQQLASFNPFEYFEEELSGLACLKAVLMPYEAEIESARQSNAMVWQRAGEVCDISISTFIEQVDDNVLAAQERREREDKTMSIAASHGVLSTG

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1969513-1969476	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1919263-1919300	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1959479-1959516	1

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1969513-1969476, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1919263-1919300, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1959479-1959516, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155084905.1|1954939_1955503_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155084905.1|1954939_1955503_-|hypothetical-protein
MSLIDAQEYVAPIEKQDKKNSNVIRWLNKRLFPRIVAILENKPEQGLAMADGRCAKQVILEAIAQYIKVIEEKLPSYKDMALVFKIRNFFSEKLPSYIPEPEPEVKVAADMALDENKQEQGKLQPTKKAVTGLQSRQASGSIAIPAGVNLEPGAVLGSSKWQKLLQAIEQAKQLYADQQLTLRAMEC

HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.4406779661016949
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1969513-1969476	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1919263-1919300	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1959479-1959516	1

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1969513-1969476, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1919263-1919300, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1959479-1959516, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_032126179.1|1967704_1967956_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP039204.1|WP_032126179.1|1967704_1967956_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1969513-1969476	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1919263-1919300	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	1959479-1959516	1

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1969513-1969476, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1919263-1919300, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 1959479-1959516, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ***************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_016211367.1|2016148_2016931_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_016211367.1|2016148_2016931_+|hypothetical-protein
MYNQWPYSVDFISFNIPTINIDLCYYYIPNSSNKAAIQIQLKPTQQPLFINLHDNEKTSVQAALDCIQQHSYGHLLELSHKKNRLISLLINNYPCQFDPNRIFTDTGIKNTLKKYHCFSEKNFFIAKQFSDIILQQINTHNFPLLIALHNNEDKAGDKENYNILSYYPHGDEAENTEDLYHNQAHCPDDFFITTERSLFNYIKNKKFNIILHKTTGVNDGSLSYYCALNKISYINVEARHGHYHQQQQMISLLFQYLESK

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2079581-2079544	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2019506-2019543	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2051884-2051921	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2078460-2078497	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2111365-2111402	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2079581-2079544, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2019506-2019543, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2051884-2051921, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2078460-2078497, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

5. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2111365-2111402, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_016211126.1|2047140_2047530_+|lipoprotein

>NZ_CP039204.1|WP_016211126.1|2047140_2047530_+|lipoprotein
MKIFVVLFTLILLSGCATTAKYRAQVERWKGHDVNDLIQAWGPPDTTFKMPNGNLYYSYRVNNINRLPSYYVPGNTTVSDRDGKTYITTSGGYQTGGGTIKSNCTTSFQVNKKDIIIGTHFQGNACVSN

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2079581-2079544	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2019506-2019543	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2051884-2051921	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2078460-2078497	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2111365-2111402	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2079581-2079544, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2019506-2019543, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2051884-2051921, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2078460-2078497, mismatch: 0

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**************************************

5. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2111365-2111402, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_032126801.1|2085657_2086167_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_032126801.1|2085657_2086167_-|hypothetical-protein
MILQRYIDRGYLTTAKAEQLELDSFQSDVLNSETISQLIFSDFISVDEVLQLSLREQSNLKLHSICRLITSGLITIKDALAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQLDLEQRIALESQVIYELVSRDNSPYALT

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2079581-2079544	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2019506-2019543	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2051884-2051921	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2078460-2078497	0
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2111365-2111402	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2079581-2079544, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2019506-2019543, mismatch: 0

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**************************************

3. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2051884-2051921, mismatch: 0

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**************************************

4. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2078460-2078497, mismatch: 0

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**************************************

5. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2111365-2111402, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_129556588.1|2532749_2532917_+|phosphatase

>NZ_CP039204.1|WP_129556588.1|2532749_2532917_+|phosphatase
MLKNRISVPKISSLINYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

HTH_38,HTH_21 HTH domain information

• Identity: 0.423728813559322
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2526089-2526052	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2526089-2526052, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155046749.1|2569060_2569348_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155046749.1|2569060_2569348_+|hypothetical-protein
MPLLVYTELGDMSISPVFANRPSAKQFANYLNADVEAALAKSSINYVINKSQSVSGYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2526089-2526052	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2526089-2526052, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_155046945.1|2569898_2570972_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_155046945.1|2569898_2570972_+|hypothetical-protein
MPKLKEIQDKYLILLAEACSKVDECVRDRQSIHKPINESTNKKCKEYVSHKAVEHFFLEESDNEIENAYKELKEELESSNEKEALYDRFNDFFYKKTAHKIDTARIVGFSKERKFLSKSLYDNLLLNAIEFTASSKLRDSFNLAFKEADILATHDDGIAFTALNKNLTHVTVMPLEKLDISCHLELFQQLIELGLGNQPSHILDMLDFPQQFKDFNHILQETYNQIEAHVSAQTSDSQAQSHPLLSCFFPKKNNVSACFQQYQTNVTRAAFNFLFSRERDLAVLESQLTQHDANFLSSSGLKNSYPDFQGPYPKLLKQIKQSDNAEVKTISAQLFSQQQIATSASILANMTSDIAPV

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.5813953488372093
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2526089-2526052	0

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2526089-2526052, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_129556602.1|2973610_2973820_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_129556602.1|2973610_2973820_-|hypothetical-protein
MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC

HTH_38 HTH domain information

• Identity: 0.6046511627906976
• Hit_domain_coverage: 0.9772727272727273

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2987882-2987919	2

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2987882-2987919, mismatch: 2

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtaggtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ** ************************

Protein sequences of NZ_CP039204.1|WP_016211201.1|2976966_2977275_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039204.1|WP_016211201.1|2976966_2977275_-|hypothetical-protein
MQAIGAFQAGLAAINAGAGELREHANEIAHFSIPRGTVAEQEHRPAVVAVNELTQTERPAHFGQNMVRPMVGLLEASNQAQVGAKVLQIASDTLGSLIDIRA

HTH_38,HTH_1 HTH domain information

• Identity: 0.5178571428571429
• Hit_domain_coverage: 0.9333333333333333

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039204_1	Orphan	1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder	361867-361904	38	2987882-2987919	2

1. spacer 1.1|361867|38|NZ_CP039204|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039204 position: 2987882-2987919, mismatch: 2

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatagtaggtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
********** ** ************************

2. NZ_CP039205

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039205_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039205_1
• CRISPR_location: 1232-1664
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 6 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039205_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAA	CRT

spacers of NZ_CP039205_1

>1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT
AATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT
GTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT
AATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACAC
>1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT
AATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT
GTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT
AATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039205_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039205_1

>merge|NZ_CP039205|1|1232-1664|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAA

>NZ_CP039205|1|1|1232-1664|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAA	AATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAA	GTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAA	AATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACAC
AAACGGAACACAAACGGAACACAA	AATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAA	GTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAA	AATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039205.1|WP_016212150.1|8453_8768_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237855
NZ_CP039205.1|WP_016211886.1|4740_5169_+|nucleotidyltransferase-substrate-binding,-HI0074-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378048
NZ_CP039205.1|WP_155046770.1|2879_3047_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235600
NZ_CP039205.1|WP_016211885.1|6198_7239_+|DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378704
NZ_CP039205.1|WP_105962625.1|10355_11242_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039205.1|WP_129556706.1|5555_6185_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039205.1|WP_033923686.1|7347_8397_+|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP039205.1|WP_016212151.1|8791_9754_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271180
NZ_CP039205.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP039205.1|WP_016211884.1|5165_5465_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376187
NZ_CP039205.1|WP_054300202.1|3102_3831_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039205.1|WP_016212150.1|8453_8768_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|237855	PRK14900, valS, valyl-tRNA synthetase; Provisional.	0.000951386
NZ_CP039205.1|WP_016211886.1|4740_5169_+|nucleotidyltransferase-substrate-binding,-HI0074-family-protein	gnl|CDD|378048	pfam08780, NTase_sub_bind, Nucleotidyltransferase substrate binding protein like. Nucleotidyltransferases (EC 2.7.7) comprise a large enzyme family with diverse roles in polynucleotide synthesis and modification. This domain is structurally related to kanamycin nucleotidyltransferase (KNTase) and forms a complex with HI0073, a sequence homolog of the nucleotide-binding domain of this nucleotidyltransferase superfamily.	3.33162e-36
NZ_CP039205.1|WP_155046770.1|2879_3047_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|235600	PRK05771, PRK05771, V-type ATP synthase subunit I; Validated.	0.00878538
NZ_CP039205.1|WP_016211885.1|6198_7239_+|DNA-binding-protein	gnl|CDD|378704	pfam11740, KfrA_N, Plasmid replication region DNA-binding N-term. The broad host-range plasmid RK2 is able to replicate in and be inherited in a stable manner in diverse Gram-negative bacterial species. It encodes a number of co-ordinately regulated operons including a central control korF1 operon that represses the kfrA operon. The KfrA polypeptide is a site-specific DNA-binding protein whose operator overlaps the kfrA promoter. The N-terminus, containing an helix-turn-helix motif, is essential for function. Downstream from this family is an extended coiled-coil domain containing a heptad repeat segment which is probably responsible for formation of multimers, and may provide an example of a bridge to host structures required for plasmid partitioning.	5.71735e-06
NZ_CP039205.1|WP_105962625.1|10355_11242_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	9.72465e-44
NZ_CP039205.1|WP_033923686.1|7347_8397_+|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	4.06123e-07
NZ_CP039205.1|WP_016212151.1|8791_9754_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	gnl|CDD|271180	cd00799, INT_Cre_C, C-terminal catalytic domain of Cre recombinase (also called integrase). Cre-like recombinases are tyrosine based site specific recombinases. They belong to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The bacteriophage P1 Cre recombinase maintains the circular phage replicon in a monomeric state by catalyzing a site-specific recombination between two loxP sites. The catalytic core domain of Cre recombinase is linked to a more divergent helical N-terminal domain, which interacts primarily with the DNA major groove proximal to the crossover region.	5.48584e-41
NZ_CP039205.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP039205.1|WP_016211884.1|5165_5465_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|376187	pfam18765, Polbeta, Polymerase beta, Nucleotidyltransferase. A member of the nucleotidyltransferase fold found in polymorphic toxins (NTox45) and polyvalent proteins.	5.28316e-15
NZ_CP039205.1|WP_054300202.1|3102_3831_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51

Protein sequences

>NZ_CP039205.1|WP_016211879.1|0_1020_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP039205.1|WP_155046770.1|2879_3047_-|hypothetical-protein
MQQCHKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAAYFASETQ
>NZ_CP039205.1|WP_054300202.1|3102_3831_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039205.1|WP_016211886.1|4740_5169_+|nucleotidyltransferase-substrate-binding,-HI0074-family-protein
MTQNQNRPRWVESLENYSKALDSLNKVVELSQQKTLSEFERDSLIKRFEFTYEEAVKTLTRYLEYEGHHDLKGSRTAFRRGVKINLLTDGQDWMDMIECRNAGAHNYSDIKAEKNSEKVLKTFYPMLVDFKKKLSDLMEDKG
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NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039196	Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence	56013-56055	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP038812	Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence	134266-134308	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	107094-107136	0	1.0
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NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1466-1508	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039202	Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence	1676-1718	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1388-1430	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039205	Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence	1598-1640	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039042	Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence	128616-128658	0	1.0
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NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039066	Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence	1676-1718	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP038887	Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence	92333-92375	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP039215	Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence	137265-137307	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP038938	Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence	1388-1430	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP038963	Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence	128616-128658	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP038877	Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence	137266-137308	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93292-93334	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	67732-67774	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	67942-67984	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP013763	Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence	68020-68062	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP013779	Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence	120012-120054	0	1.0
NZ_CP039205_1	1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT	1598-1640	43	NZ_CP050945	Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence	99373-99415	0	1.0

1. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|1256|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|1323|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|1388|54|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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137. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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138. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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139. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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140. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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141. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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142. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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143. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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144. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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145. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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146. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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147. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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148. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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149. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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150. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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151. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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152. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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153. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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154. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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155. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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156. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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157. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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158. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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159. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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160. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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161. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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162. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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163. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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164. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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165. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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166. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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167. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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168. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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169. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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170. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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171. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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172. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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173. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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174. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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175. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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176. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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177. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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178. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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179. spacer 1.4|1466|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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180. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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181. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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182. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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183. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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184. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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185. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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186. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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187. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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188. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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189. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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190. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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191. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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192. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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193. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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194. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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195. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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196. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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197. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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198. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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199. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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200. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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201. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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202. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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203. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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204. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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205. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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206. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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207. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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208. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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209. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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210. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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211. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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212. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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213. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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214. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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215. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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216. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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217. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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218. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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219. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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220. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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221. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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222. spacer 1.5|1533|41|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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223. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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224. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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225. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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226. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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227. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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228. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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229. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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230. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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231. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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232. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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233. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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234. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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235. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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236. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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237. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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238. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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239. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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240. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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241. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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242. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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243. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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244. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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245. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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246. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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247. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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248. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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249. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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250. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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251. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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252. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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253. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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254. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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255. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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256. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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257. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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258. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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259. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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260. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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261. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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262. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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263. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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264. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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265. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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266. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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267. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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268. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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aattaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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269. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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270. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

aattaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
aattaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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271. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

aattaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
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272. spacer 1.6|1598|43|NZ_CP039205|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3102 : 107386	117	Streptococcus_phage(32.65%)	protease,transposase,integrase,head,capsid,tail	attL 74069:74128|attR 105914:106475

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039205|3102:107386|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126790.1|86649_87555_+|transposase	IS481 family transposase	A8RHK4	Spiroplasma_virus	6.8e-14	26.0
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WP_016211776.1|88814_90152_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211775.1|90319_90688_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	1.2e-25	46.3
WP_016211773.1|90789_91464_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126360.1|92050_92785_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211895.1|92907_93966_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211894.1|94474_95221_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	4.9e-18	29.9
WP_016211897.1|95221_95626_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007042.1|96019_96835_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|97439_98168_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_051307374.1|99176_99653_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
WP_032126637.1|99767_100061_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_081377916.1|100177_100702_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.5e-29	46.4
WP_155085002.1|100933_101209_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.0e-13	44.6
WP_155085003.1|101217_101919_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_016211912.1|102008_102599_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
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WP_016211910.1|103135_103408_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211913.1|103733_104855_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155085004.1|105287_105548_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|105568_105862_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_081377915.1|105944_106502_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-47	51.5
105914:106475	attR	NA	NA	NA	NA
WP_081377914.1|106646_106976_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155085005.1|107092_107386_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

3. NZ_CP039207

4. NZ_CP039206

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3915 : 46714	60	Streptococcus_phage(14.29%)	transposase,head,tail,capsid	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039206|3915:46714|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTATATTGTTAAAAATGTACTGTTAGTTTTTGTCGCCTAAATTTTATTTTTTTGCAATTGAGTCGAAAAAGACAAAATTGTTTACAAAAAATTAACATACTTGTTTTATCTATTTGATATATAAGTACTTTATAAAAATAAGAAAAAGTTAACTAAAATTTAAAAGGTAAATGTTATGGCTATCATAAATGATGTAGAGAAAGATATCTATTGTAGTGATCTGGTTTTGCAAAGACAGAAAGAGCTAAAAGAAGAGTTATTAAAATTATCTTCAAATCAAACTAGTACCCCCGTTCCCTGTTTGGATCAAAATAATATAGCTAAGGGTAAAGATCTTGGAAAACTAGATACATTAGGTCAATTATCATCTTTTTGCTGGAAACCTGGAGAAAATAATCAAGGCAGCCAACAAGCCACTCCATTTCAAAGACAATCTGAATCTAGATCAGATCAAGAACACCAAGAAAATGAGAGAGCCACTAAAAAGTGCTGTACTATAATGTAAAATCAAAATAATCTCTTTAATCTTCGATTCGAGTTATGGAATTCTAAGCACTCCATAGCTCGAAGCGCTTCAAACTATATTCTCCCTCTAAAAGTATAATTTGTATAAAATATACTATTTATTTTTAAGCTATATTAAAATCAACTATATGGTGTCATATTTGACACCATTTTGAAGATAAACTATCATTCCAATATGACACCAAAAACGGCACTATAATTAAGATGAATAATAAACATCGTAAGACACTAAGAGATATTTTTCATAACCCGATCAAAGCAAGCATTGTTTGGGCTGATATAGAAAAGCTTCTTTTAGCGTTAGGGGCTGAAGTAATAGAGCGTGATGGTTCAAGGGTTGCTGTAATTTTGAATCAAGTGAAAACAACATTTCATAGACCGCACCCTGAAAAAACAACAGACAAGGGGGCGGTTAAGTCAATAAGGTTGTTTTTAAAAAATGCTGGAGTAGATAAAAATGCTTAAATACAAAGGTTATATTGGAAAAGTTGAAGAGATTCATGAAGGTGATGAATATATTTATGGGATTGTTCCAAATATTAAAGATGTTATTTCTTTTAGAGGTAAAAATATAAAAGAGTTAACGAAAGACTTTAAGCTGGCTATTGATGATTATTTGGCTTTATGTGATGAGCGTGAAGAAGAACCCGATAAACCATTTTCTGGTAGATTTATGACTAGATTAGGTAGTGATTTGCATGAAGAGGTTTTTTTAGCTTCTATGAATGATTCAGGTGCAAAATCAATGAATGATTGGGTTGTATCTGCATGCTTGGAAAAGTTAAAGCATGATCAAACCGTTAAACGGTGAATTATGTTATGTACAGCTATTAAGAAGTTATGTTTTTGCATTTTTCTTATAAATAAGATAAAACCCTTTTGTTTGGAATTACTTACATTAGGGAATGTTACCCATGTCAAAAAAAATTTATAAAGACGACTGTCAAGAACGACTTGATACACTTCAGAAAATATTTGATCAACAGAGTTTAAAATTTATAACAGATAAGCTTGATAAGAAAAATTTAAAGTTGCTTGAGTTAGGGTGTAGAGGTAATTGTGACTTAATTATCGCACTTGCAAATAAATACCCCAATCTGATCGAGTACACTGGGATTGATGATAATCCAAAGTTTATAAAACAAGCTGAAAAACGCTTAAGTGATATTCCGTTAAAGTCTTTAAAATTAACTCATGCAATGATAACAGATGTTAGTGGTCTTGGGTTTGATCTTTATGATGTAATTTATAGCCGCCTTTATTTTATGTATATTCAAAATTATGTAGAGGCTTTAAAACAAGTTTTAAATCAACTAAAAGTAGGCGGCATTATTATTTGTGAAGAGCCAGATTTAAGAACAAACTTTTGTAACCCTGCGCATGTCGCTTATGATGAATTTCTTAATTTATTTGGAGCTTTAGGTAAAGTTAAAAAAATGAACTTTAAAATTGGCTCTGAGCTACATACAAATTTTCTAGAGCTAGGGTTGAAAATTACTGATATTCAATTTTCTCAGCCGGTTTTAATGGATGAAGAGAGAAAGCGCTTTATGGACCTCAGTATGACAGCTGCTCGTAATGATTGCATTGAGTATGGGTTAATTACGCCGGAAAGATTTGATGTAATGATAAGCTCGTTAAAAAGGCTTTCAGCTGATGAGCGCTACTATTTTGCTATAGCACGTCAAACCCATATTTCTGCAATCAAAGCTTAAAAAGAGTCGAGCAAGCCTAAAGATTTTGCTTTCATTACAGTATGTAGCTTATTTTTGCAAAGCAATCGCTTTTGAGCTGAGGCGAGATATTTTTCTACCACACGGGGAGTTACCCCGATCGCTTTTGAGGTGTCTTTAGCATTTAAGCCATTAGCGGCCCAATATAAAACTTCTTTCTCTCTTGGGGCTAAAGAGTATGAATAGGTTTCTTTCCTAAGAATTTCTTTCATATACGAGTAGTCCTGTATAAATTTTGTTTGCCCTAAATATGCATGTTCATTCGCAATTTTATCTTTAAGGTTATAAATAAAGGTTGATGCAAAAGTAAGGAATTCTTCTTTAGTCTCATTGTAATGTGTTTTTGGATCAATAGGAGCAATAGCTGTATGAGCTAAAATCATAACTTCAATTTCAATAGAAGCTCTAAATATTGCATAACTTTCATGGATGCCGAATTTACTGCAAATGTTGTATATATATTGTTGTTCGGGTGTTAATTGCAATAAGCCTTGAAAATAAACATCTTTGCCGAGTATTAGGTTCGTACGTGGTGATGTTAAAGAGTCAAAGTTGAATAGGTTGTTTTCATAGTAAGGAATGGACCACTCAGACATGTTGGAAATAAAATAAGGACTACCCAGAGCTGGAAATAGACCTACACATATATAATCAACTCCACAATTAGTATGAATATCTGATGTAATATCCTTTATGTATTCATAGTACTTAATACTAGAAATGTGCTTATACTTGTTTAACTCACTTTTTGAGTACTCGCTCAACGACTTGAAATTAATTTTATTATCCATTACTTATGTGATATTAAAGTTCTCTAGCTTTTTAAAGGATTCTTTGTTTGATAAATACCAAACAATAATTATCCCGAAGATAATGGCTAACGATAGGTATGTACCTACAATAGCCGGAGAATGAAACTGATGGAGAAGTAACGTACATACTAATGGGGCGGTCCCTCCGAAAATTGTCATCCCTATGTTCCAAGATACGCCAAGATTTAGAGCTCTACTTTTTTCTGTAAGTTTCATAATAACAATGCTGTTAATCATAGCGGTTGGAGGTGAAAGAAGAAATGTTATTGCAATCATTGAAATTAATGAAGTTGTAAAGCTACCACTCGCTAAGCCAGAGAATAGGCTAGGCATACATAGAGCAAAGGGGGTGGACCATAGCAAGAATAGCTTTGTATTGCCTACCTTACTTGCGACTAATCCAGCTACAGGTTCAATAATAATATCGAGCAATAGCCCAACAGATATAACCAATGAGCTTTTACTTATAGATAAACCATGACTGACCATTAAGCTGGTACCCCAAACATACACACCCCAGCTAGTAATGCCGTTGTATGCTGCTAAAATTAGCGCTTGCAGAGAGGGGAGTGAACAAATATTAAGTTCTCCCCTCAATGAGCCTGATTTATTTTTTATAAAAGTGTAGTTTTTCATGTTACTGCGTAGGTAGTAACATAAGATTGCTGTGATCCCTGAGACAAAAAAAGGAACTCGCCACGCTTCTGGTGGCATATATGATGCAGTAAAAAAGCTTCCAATTGACGCCCCTAGCATCATACCGGCACTGTTAGAAATATTAGGCAAACAGCCGAATAGAGCTTTAAAACGTGGTTTTGCATTCTCAACAAGATAAACTGACGCAGTATTGTATTCAGCACTAGCAGATAAACCTTGTAGAGCTAATGATAAAGCCAAAATAATAGGAGAAAAAGCACCT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MLPMSKKIYKDDCQERLDTLQKIFDQQSLKFITDKLDKKNLKLLELGCRGNCDLIIALANKYPNLIEYTGIDDNPKFIKQAEKRLSDIPLKSLKLTHAMITDVSGLGFDLYDVIYSRLYFMYIQNYVEALKQVLNQLKVGGIIICEEPDLRTNFCNPAHVAYDEFLNLFGALGKVKKMNFKIGSELHTNFLELGLKITDIQFSQPVLMDEERKRFMDLSMTAARNDCIEYGLITPERFDVMISSLKRLSADERYYFAIARQTHISAIKA
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MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR
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MEKARVNTTAMQKGGVGKTTYVFNLAHGLASKGYRILVVDNDPQGDLTQAMLGHDVSPQCHTIELYDNKKTTPQAIKENIHLIGADIELALAQERSFEIMFDFADQIQRLKKKYDYILIDSLPSFGTMHTASLLAADTITIPTKAAPFSLKAVKMLMETINKVKRPRMNPQLEILGILINYVEGSQTSLGRELEKTLRDHYGETIFKNKLTRTVKIEESPGFHESIMDYSPNSKAAEEFNLIVDEFLIRDKQAFERVTHYA
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>NZ_CP039206|3915:46714|16047_16335_+|WP_155085013.1|DBSCAN-SWA
MDLNNKIQSRINRHIKIILLGIFTIFICNVIAAVSLWFGVVFVALFLCAIWLSVTNDVKTQMLILDEAEENLQANEQINQLIHAEIKNKAMEIIK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|3915_4890_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155085011.1|5100_5430_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242955.1|5654_5915_+	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211078.1|5907_6261_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	6.5e-13	34.8
WP_080664851.1|6355_7165_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211068.1|7161_7974_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211075.1|7977_9219_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047030.1|9433_9577_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211069.1|9601_10033_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155085012.1|10016_10802_+	queuosine precursor transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211077.1|10809_11595_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036780299.1|13140_13443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211080.1|13481_14468_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0S2MVA0	Bacillus_phage	4.3e-14	45.4
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WP_016210959.1|15013_15376_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
WP_016210966.1|15368_15716_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210963.1|15712_15952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155085013.1|16047_16335_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036794070.1|16331_16616_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210960.1|16617_17091_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A220NRQ8	Escherichia_phage	4.9e-32	63.4
WP_129556726.1|17205_17598_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210972.1|17745_17973_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210974.1|17981_18389_+	DUF4411 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556725.1|18505_19186_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.3e-37	39.3
WP_016210977.1|19364_19658_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047026.1|19875_20058_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046773.1|20202_20382_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_129556723.1|20476_20794_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126134.1|21094_21478_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	5.6e-26	47.2
WP_155085014.1|21565_22018_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556745.1|22927_23206_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|23249_24224_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_032126136.1|24277_24823_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212186.1|24879_25110_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212188.1|25287_26028_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126137.1|26091_27141_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|27906_28170_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211928.1|28720_29161_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211925.1|29153_29939_-	ParA family protein	A0A0K2FLP4	Brevibacillus_phage	9.7e-17	28.7
WP_032126737.1|32686_33415_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_155085015.1|33455_33608_-|capsid	phage major capsid protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126737.1|33703_34432_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_155085016.1|34495_35002_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.5e-34	47.9
WP_155085017.1|35122_36457_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|36647_36959_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_155085018.1|36955_37279_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	3.0e-12	39.8
WP_016211139.1|37271_37667_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_016211129.1|37663_38014_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|38013_38436_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126913.1|38437_38761_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|38817_39084_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155085019.1|39087_41166_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.0
WP_036776958.1|41158_41500_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|41496_42168_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|42136_42883_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|42872_43430_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_075275194.1|43426_46714_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2