CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP039212	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP039211	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP039209	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 chromosome, complete genome	3 crisprs	RT,DinG,DEDDh,cas3,csa3	1	2	31	33
NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	1	14
NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP039209

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039209_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039209_1
• CRISPR_location: 360336-360465
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039209_1

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039209_1

>1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039209_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039209_1

>merge|NZ_CP039209|1|360336-360465|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP039209|1|1|360336-360465|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039209.1|WP_036794771.1|353915_354902_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039209.1|WP_016211795.1|355039_355234_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_155047052.1|350355_351084_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_054300520.1|359114_359429_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016212044.1|352938_353193_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP039209.1|WP_036777801.1|351946_352165_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_036777835.1|368485_369271_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_081007059.1|355916_356978_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP039209.1|WP_016212008.1|361610_362309_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_155046940.1|363795_364179_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016211797.1|357139_358543_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP039209.1|WP_075273619.1|364451_365027_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_054300518.1|362745_363591_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016211268.1|366033_367218_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP039209.1|WP_016211271.1|367236_368181_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP039209.1|WP_054300516.1|365084_365918_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP039209.1|WP_155047051.1|349341_350211_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016212010.1|362325_362622_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_075273359.1|358593_359169_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039209.1|WP_032126227.1|361282_361573_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039209.1|WP_036794771.1|353915_354902_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP039209.1|WP_016211268.1|366033_367218_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP039209.1|WP_016211797.1|357139_358543_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP039209.1|WP_016212044.1|352938_353193_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP039209.1|WP_016211271.1|367236_368181_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP039209.1|WP_054300516.1|365084_365918_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP039209.1|WP_081007059.1|355916_356978_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP039209.1|WP_075273359.1|358593_359169_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45

Protein sequences

>NZ_CP039209.1|WP_054300520.1|359114_359429_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP039209.1|WP_075273359.1|358593_359169_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP039209.1|WP_016211797.1|357139_358543_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP039209.1|WP_081007059.1|355916_356978_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP039209.1|WP_016211795.1|355039_355234_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039209.1|WP_036794771.1|353915_354902_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP039209.1|WP_016212044.1|352938_353193_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP039209.1|WP_036777801.1|351946_352165_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPKDKGKPFKP
>NZ_CP039209.1|WP_155047052.1|350355_351084_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP039209.1|WP_155047051.1|349341_350211_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039209.1|WP_032126227.1|361282_361573_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP039209.1|WP_016212008.1|361610_362309_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP039209.1|WP_016212010.1|362325_362622_+|hypothetical-protein
MVQLTLSDFAFLANDVYLNPGLELALPRENSQRCQRLLNNTETVINSDPHGPKANGFFARVYKYKQGNKMSLIVAYRGTSNVEDYLIDAELASGQAIE
>NZ_CP039209.1|WP_054300518.1|362745_363591_+|hypothetical-protein
MLTVDYSQLFGIKPTAFRTVTFNPPGMQGVDPNGRAPHYAEIAHTISQHKIASGKLAAAMVSVAPEVSLVGATAGVEVVVKKIMELLNYQTAIKNRSIALRMGQGALIFLWDLLMPDRNGLSVDKEINNPYPHIYNISSRYDLVHCSGNPGGNLINYDIDPLGKITNGDDDRRAKFKYQFLENYFEARQHYLKHGVNSAKMKSKYEQLSKADNWALYFENPGKEGVHLPTAKDWENYFKDVRNIPEYQQSARKTDRVMQYYTGTLSRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039209.1|WP_155046940.1|363795_364179_+|hypothetical-protein
MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
>NZ_CP039209.1|WP_075273619.1|364451_365027_+|hypothetical-protein
MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP039209.1|WP_054300516.1|365084_365918_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
>NZ_CP039209.1|WP_016211268.1|366033_367218_+|fatty-acid-desaturase
MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP039209.1|WP_016211271.1|367236_368181_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP039209.1|WP_036777835.1|368485_369271_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDVMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Crispr_ID: NZ_CP039209_2

• CRISPR_ID: NZ_CP039209_2
• CRISPR_location: 1399867-1399973
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039209_2

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039209_2

>2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039209_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039209_2

>merge|NZ_CP039209|2|1399867-1399973|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP039209|2|2|1399867-1399973|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039209.1|WP_016210795.1|1409317_1410289_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP039209.1|WP_051307365.1|1397535_1397796_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_052047040.1|1401006_1401945_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP039209.1|WP_016212182.1|1392081_1392267_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016210752.1|1387717_1388515_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368573
NZ_CP039209.1|WP_016211836.1|1397815_1398304_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP039209.1|WP_129556641.1|1384078_1385341_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP039209.1|WP_052104738.1|1408405_1409212_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP039209.1|WP_016210748.1|1389444_1391400_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP039209.1|WP_036778182.1|1403742_1404570_-|thioredoxin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP039209.1|WP_016210751.1|1385428_1387234_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236941
NZ_CP039209.1|WP_016212185.1|1392600_1393590_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP039209.1|WP_016211834.1|1396963_1397278_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016210801.1|1410270_1411242_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP039209.1|WP_155047165.1|1401970_1403536_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP039209.1|WP_129556527.1|1405732_1405993_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_075273540.1|1404936_1405548_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_036777256.1|1407830_1408031_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_155047164.1|1406985_1407408_+|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381151
NZ_CP039209.1|WP_016210749.1|1388684_1389146_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039209.1|WP_016210795.1|1409317_1410289_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP039209.1|WP_016210751.1|1385428_1387234_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236941	PRK11634, PRK11634, ATP-dependent RNA helicase DeaD; Provisional.	0
NZ_CP039209.1|WP_052047040.1|1401006_1401945_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.86095e-24
NZ_CP039209.1|WP_016211836.1|1397815_1398304_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	8.26648e-13
NZ_CP039209.1|WP_016210801.1|1410270_1411242_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	7.8235e-122
NZ_CP039209.1|WP_016210752.1|1387717_1388515_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	2.13986e-06
NZ_CP039209.1|WP_155047165.1|1401970_1403536_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	1.71769e-34
NZ_CP039209.1|WP_129556641.1|1384078_1385341_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	2.59319e-84
NZ_CP039209.1|WP_016210748.1|1389444_1391400_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP039209.1|WP_052104738.1|1408405_1409212_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	1.28417e-38
NZ_CP039209.1|WP_016212185.1|1392600_1393590_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP039209.1|WP_036778182.1|1403742_1404570_-|thioredoxin-domain-containing-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.37155e-43
NZ_CP039209.1|WP_155047164.1|1406985_1407408_+|response-regulator	gnl|CDD|381151	cd19924, REC_CheV-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of chemotaxis protein CheV and similar proteins. This subfamily includes the REC domains of Bacillus subtilis chemotaxis protein CheV, Myxococcus xanthus gliding motility regulatory protein FrzE, and similar proteins. CheV is a hybrid protein with an N-terminal CheW-like domain and a C-terminal CheY-like REC domain. The CheV pathway is one of three systems employed by B. subtilis for sensory adaptation that contribute to chemotaxis. It is involved in the transmission of sensory signals from chemoreceptors to flagellar motors. Together with CheW, it is involved in the coupling of methyl-accepting chemoreceptors to the central two-component histidine kinase CheA. FrzE is a hybrid sensor histidine kinase/response regulator that is part of the Frz pathway that controls cell reversal frequency to support directional motility during swarming and fruiting body formation. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.94615e-31

Protein sequences

>NZ_CP039209.1|WP_016211836.1|1397815_1398304_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGEYYTQLVK
>NZ_CP039209.1|WP_051307365.1|1397535_1397796_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP039209.1|WP_016211834.1|1396963_1397278_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP039209.1|WP_016212185.1|1392600_1393590_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP039209.1|WP_016212182.1|1392081_1392267_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP039209.1|WP_016210748.1|1389444_1391400_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP039209.1|WP_016210749.1|1388684_1389146_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP039209.1|WP_016210752.1|1387717_1388515_-|hypothetical-protein
MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK
>NZ_CP039209.1|WP_016210751.1|1385428_1387234_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS
>NZ_CP039209.1|WP_129556641.1|1384078_1385341_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter
MKFNGLVLIALITGVGLGALARFSLVSDHFAMADLNSVFHLVGEGYIDLLKMLVIPLVFTSLVSALLSLSDKGAANFRLSAIRFVVMLLVLTGISAGIGMLMGMAFNLGTGLVIPGVDLQPGHHYTGVVDTILGMLPTNPIAAMASGNAAALALFSIFIGAAALVVKKSKIADIKPFEGFIQSTFEISKQLARFVVALTPYGVLALIANVASATGASSLLSVLSYLVAIYVAMALVFALHLVILAAQGISPTYYLKHAYKALLVAFTTRSSFGTLPVTEETLRQKFKIHPDLATFAPTIGSSIGFNACAGVFPAMLVVMAMTIMHEPVTWQIIVMVMFINAIASLGISGIPGTASIAAAVTLSTLGLPYAVIAIVQGVDPIVDMGRTATNVNGVMASALTVDKYLATEETQARSIKAEAL
>NZ_CP039209.1|WP_052047040.1|1401006_1401945_+|IS3-family-transposase
MPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP039209.1|WP_155047165.1|1401970_1403536_-|amino-acid-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLIFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP039209.1|WP_036778182.1|1403742_1404570_-|thioredoxin-domain-containing-protein
MKNYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
>NZ_CP039209.1|WP_075273540.1|1404936_1405548_+|hypothetical-protein
MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH
>NZ_CP039209.1|WP_129556527.1|1405732_1405993_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP039209.1|WP_155047164.1|1406985_1407408_+|response-regulator
MIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ
>NZ_CP039209.1|WP_036777256.1|1407830_1408031_-|hypothetical-protein
MTGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM
>NZ_CP039209.1|WP_052104738.1|1408405_1409212_+|methyltransferase-domain-containing-protein
MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK
>NZ_CP039209.1|WP_016210795.1|1409317_1410289_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK
>NZ_CP039209.1|WP_016210801.1|1410270_1411242_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKNTIKNTLVFPALLVFGSSFLQTSIAAKTKEPVRIIVNDWTSQIVLSKITGSILSDMGYQVKYINSKSNGQWFKLKNNQADIQVEVWQGTMAKKYNQLIKTGDIVDAGNHAAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALEKCYKIFATSKTKPKGMYLGGPWEKPDRARIRALKMNFKVIQVKNGDALWVELEKAAKEERPIVLFNWTPNWVEAKYKGKFVEFPKYSPKCISDPKWGKNSKYPWDCGNPKDGWLKKIARTEFSKEQPCAFELLKNISFTNAMISNVAASVDADKMSYDQAAQQWLDSNKKLWHSWIPATCSKVN

Crispr_ID: NZ_CP039209_3

• CRISPR_ID: NZ_CP039209_3
• CRISPR_location: 2626634-2626754
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP039209_3

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP039209_3

>3.1|2626671|47|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039209_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039209_3

>merge|NZ_CP039209|3|2626634-2626754|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP039209|3|3|2626634-2626754|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039209.1|WP_129556590.1|2629989_2630385_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP039209.1|WP_054300492.1|2622677_2623688_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP039209.1|WP_016210935.1|2634089_2634632_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP039209.1|WP_098082812.1|2623832_2624348_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_036778484.1|2635318_2635930_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP039209.1|WP_032126312.1|2630381_2631176_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP039209.1|WP_036778294.1|2616580_2617963_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP039209.1|WP_016211759.1|2632325_2633513_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP039209.1|WP_036778479.1|2631354_2632080_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP039209.1|WP_036778297.1|2617971_2618445_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016211905.1|2625112_2625523_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016210943.1|2634628_2635315_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP039209.1|WP_052047041.1|2624580_2624844_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016210676.1|2620292_2622374_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP039209.1|WP_155047228.1|2628652_2629135_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|279973
NZ_CP039209.1|WP_016210671.1|2618577_2619837_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP039209.1|WP_075275117.1|2625766_2626189_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039209.1|WP_016210944.1|2635976_2636996_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP039209.1|WP_054300282.1|2628131_2628596_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP039209.1|WP_155046943.1|2626221_2626362_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039209.1|WP_129556590.1|2629989_2630385_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP039209.1|WP_054300492.1|2622677_2623688_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP039209.1|WP_054300282.1|2628131_2628596_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.57411e-45
NZ_CP039209.1|WP_036778484.1|2635318_2635930_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP039209.1|WP_032126312.1|2630381_2631176_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP039209.1|WP_155047228.1|2628652_2629135_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|279973	pfam01710, HTH_Tnp_IS630, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family includes insertion sequences from Synechocystis PCC 6803 three of which are characterized as homologous to bacterial IS5- and IS4- and to several members of the IS630-Tc1-mariner superfamily.	4.80837e-07
NZ_CP039209.1|WP_016211759.1|2632325_2633513_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP039209.1|WP_036778479.1|2631354_2632080_-|D-Ala-D-Ala-dipeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	3.8045e-65
NZ_CP039209.1|WP_016210943.1|2634628_2635315_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP039209.1|WP_016210676.1|2620292_2622374_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP039209.1|WP_036778294.1|2616580_2617963_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP039209.1|WP_016210671.1|2618577_2619837_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP039209.1|WP_016210944.1|2635976_2636996_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP039209.1|WP_016210935.1|2634089_2634632_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61

Protein sequences

>NZ_CP039209.1|WP_155046943.1|2626221_2626362_+|hypothetical-protein
MIEDPPALRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039209.1|WP_075275117.1|2625766_2626189_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP039209.1|WP_016211905.1|2625112_2625523_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP039209.1|WP_052047041.1|2624580_2624844_+|hypothetical-protein
MARSVRIVPQGVYHIWREMTDSEGKFKWPSDVCAAINRSKVQAEQRKDYRGLTAVSLFFGSYRDTHTKALYSQISQGFKTNTHQYKD
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MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
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MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039209.1|WP_016210676.1|2620292_2622374_+|kinase-domain-protein
MPKVIWLAQENRTAEQQQAAEWRIAKKHLTGKPPGTQLNPQSGKKVKAYEDPETGEKITLTHRYLIGHEGEIFVKFNGQALGQGICGEVTFGQTEDGHMWAIKESSEKPKNSQEGKIAVDLGKAKNYFKYQGKHYQVYYFLGTPLDKYLKEAKQSLTQAQQYDLAIKMARVIYHLHTGKYSKEKTSYAHLDLKPENFCIDDSGELHLIDYGLSEILPGKLDNEIKGSPAYLPFSVAEASKEELDIIALLRSLYLPLCFKGLGKVRNRGPAAQQLNTQWVFSSTILSQNSTLSQLLDTTKGEVVNLSALDIACQLILLKYGLHSSENLEKVTANPQQFEQDSQLLESLGLNQAAYLKCMLEQRDLVSVFKEYTDKFLILNQFDLNQPIYIKKVLANLEQFSQDYQYLESLGLNQAAYLKCLLEQRESIDLLKEHANKFLTLNQYELNQSIYIGKVLANPEQFNQDYQYLKSFGLNQAAYLKYTLDQHDQFAYNCQRLKDLKLNSRNYIEEIINNPERFEQNYQHLETLGLNQEIYIRPMLNNPQRFGEYCQQLKDLGLNQASDLARALDHPQRFQDDLPSLLKLRKIYDDLSNEIASDRLKVRGLFAGGITVNCQGQSKLVPRGIGSIWLEIIDKQGNFYWMKDVSAALTKSTDQARLRSSSQQQAEGQNSNLFFATYRDPKTQAVYDRISQLP
>NZ_CP039209.1|WP_016210671.1|2618577_2619837_+|6-phosphofructokinase
MNNSKNLFYAQSGGATAVINTTACGVIETARQKEEINNVFVGHDGIIGALAEELIDTSLESAETIRQLYHTPGSAFGSCRYKLPPIGQNDEVYQRLFSVFEAHDIHYFLYNGGGDSQDTTNKVSIMSKKLGYPLKCIGLPKTIDNDLMHTDNCPGFGSAAKYIATSIKEAALDVAGMARTSTKVFLMEIMGRNAGWLAAAAGLAAEQDGDAPHIILFPEIAFNEKRFLQRVKEVVQTHGACTIAISEGLRDEHGDLLIKSSSIDAFGHVQLGGIASKVAALIKHNLGYKYHWALPDYLQRAGRHLGSKADVEQAYAIGQAAVEAVIAEKDNIMLAIERTSNSPYQWQVGEVCLNDIANHEKFMPKEFISEDGYHITEACRDYMSPLIAGECIPPFKNGLPVYARLKKQTIPPKLSPFEI
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MMQIIWRLCTFRAGPQDIVYSVFGLQLICVIHFILQWGWLSLRLPLLHSALVALFSAALLLALPYLVVNSAKYAGRFLQTALALQLVSCVLHILLLALFLLHSPLVLLNYYLIFSFIWGAALFSHIIKEAIVVKLWQAVLIVLIYFIVRTVSVIGLM
>NZ_CP039209.1|WP_036778294.1|2616580_2617963_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039213 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038897 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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134. spacer 2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

135. spacer 2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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136. spacer 2.1|1399905|31|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	45576 : 89169	43	Moraxella_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	127259 : 181534	58	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	200550 : 271547	58	Acinetobacter_phage(25.0%)	transposase,tail,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	300496 : 360356	57	Bodo_saltans_virus(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	444588 : 545060	108	Escherichia_phage(43.75%)	transposase,tRNA,integrase	attL 511375:511434|attR 525586:525759
DBSCAN-SWA_6	552759 : 600712	51	Synechococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	622182 : 724778	108	Prochlorococcus_phage(17.65%)	tRNA,transposase,protease,plate	NA
DBSCAN-SWA_8	760195 : 808120	37	Staphylococcus_phage(42.86%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	824801 : 933585	102	Staphylococcus_phage(26.67%)	transposase,protease,integrase	attL 887266:887325|attR 908460:909562
DBSCAN-SWA_10	954127 : 999250	44	Escherichia_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	1011758 : 1066647	56	Orpheovirus(16.67%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_12	1081685 : 1210901	103	Staphylococcus_phage(21.43%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	1251573 : 1550295	268	Staphylococcus_phage(13.95%)	transposase,tRNA,integrase	attL 1283827:1283886|attR 1359916:1360279
DBSCAN-SWA_14	1568693 : 1612647	48	Staphylococcus_phage(45.45%)	transposase,protease,integrase	attL 1568598:1568657|attR 1595410:1595498
DBSCAN-SWA_15	1621535 : 1668939	42	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1611582:1611641|attR 1654407:1655508
DBSCAN-SWA_16	1695000 : 1739058	39	Staphylococcus_phage(22.22%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_17	1760478 : 1816004	55	Staphylococcus_phage(15.38%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_18	1822769 : 1881686	57	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	1892477 : 1947910	47	uncultured_Mediterranean_phage(30.77%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_20	1952458 : 2066179	107	Staphylococcus_phage(17.65%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_21	2083932 : 2126567	44	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2148272 : 2201278	56	Leptospira_phage(16.67%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_23	2205201 : 2250252	51	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2320440 : 2382783	57	Planktothrix_phage(18.18%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_25	2472676 : 2555387	82	Escherichia_phage(37.93%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_26	2570728 : 2598915	26	Acinetobacter_phage(12.5%)	tRNA,transposase,protease,integrase	attL 2568117:2568176|attR 2585957:2586245
DBSCAN-SWA_27	2628131 : 2680591	56	Microbacterium_phage(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_28	2695363 : 2746382	53	Staphylococcus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_29	2765005 : 2800609	34	Staphylococcus_phage(33.33%)	protease,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_30	2925477 : 2989609	53	Staphylococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_31	2997494 : 3111414	113	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039209|45576:89169|DBSCAN-SWA
CTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCTATCGGTTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGAGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAATTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAAAATATAATTTTTTGTGATGAAATATTTAATCATTGATAATGAGTGATCTCTTTTTTATTGAGTTGGTTAATAATTCTAGGCTGAGATAATTAGGTTTAGATAAAGTACATTTACTTTATCACTGCATCAATTTACTCATGATTGCTTGGTTTGGGCAATAGCCCTAAGCCAGGTAGGATCACTCCCCAAGGTTGCCAAGATAGGCCTAAAGTTAAGCCAAATAAATTAAGTTGCACCCCTTGCCGGTTTGATATAATTAAACCTAAAACTCCCCACAGTGAAAGACGATAGCCAGTTTTATCAGCAAGTCTGGTTATTATTATTTTTAGTGACACATAGTCTTTGCCTAGTGCATTGGCTGGCATGATTGCTCCAAATTCAGGCGTTTGATCTAATATATAGGCAATAAACGTATTGCTATTTGGTCCAGGCCATGCTTGATAAGTGTGTGCATATGGATAGCTTTTAGCTGCTTTAGCGATCTTTGTGATTAATATTTCTGCTTTTTTCCCTGTCAAGCTTTTCACAATGATGGGGGTGTGCCCAAACCATAGACGGTCAGGCGCCCCTGATGAAATATCAACAATAGGACGGTTGTGATACGCATTCCAGCCAGTTACTTGATAGTTTGTATAGTGGGTTGCACCATAAGGTTTTACAGCGATCCAGGTATGCACGGCAAACAAGCCACGCCAATTAAATGCGCGAGCTTCATATAGCTGTACGACGGCTTCTTTAAATTGACCGGCCGTAGGGGCAATTCCAATAGAATGGCGGTCAGCGGTTTGCCAATTTTGACCGAACTGTACTTGACCTGTTACTGCGAGCCAGATTGGCCCGATTAAAAGGGTTATAAGAATGATTATAATTATAAAAAATGTTTTCAAAAGCATACACTATCTTTAATTTGTCTAGATTGCAGTTAGCTTATCAAGAAACTGAAAGGCACAGCAATATACTTGTCTTTTGCTAAACGCTTTTTGTTTTATTAACACTGAGTTTGATGTCATAGACCATGAAAAATCAAGCTTATTGTGTTACTTGGGGTTATTTAATAGAGATGTACTTAAATTTAGGGTTCTGTTAGCGTGAGAGCTGTATGTTAAAATTCAGTGCTTAAACTTTATAGATTTTATGAGTTTTTATGTATCATAACCTAACTGTATTTTAAAGTATTAAAAAGAGAGTGTTGTCGTGAAAAAAACTGTAGTTTTACTTGTACTTGATGGATGGGGCCATTCTACTGATACTAATAGCAATGCGATTTTGAATGCGAATACGCCTGTTTGGGACCACTTAACCGCTACGTATCCGATGACGCTAATCTCCGCATCTGGTACGGATGTAGGCTTACCGGCAGGTCAGATGGGTAATTCTGAAGTCGGTCATTTGAATTTAGGCGCGGGTCGTGTTGTTTATCAAGACTTATTGCGTATCGGCTGTGATATTGAAAGTGGTGCTTTTTTTGATAATAAAACACTGACAGAGGCCGTCGATACGGCGGTGAATCAAGATGCGGCTGTGCACATCATGGGATTGTTATCGCCCGGTGGTGTGCACTCTCATGAAGATCATATTGAGGCGATGATTGATTTAGCTGTGCAACGCGGTGCAGAAAAGATTTATTTGCATGCCTTTTTAGATGGCCGTGATACGGCACCGAAGAGTGCTGAGAGCTCGCTTGCTCGCTTTGAAGAAAAATTCGTCAAGAGTGGCAAAGGCAGGATAGCCAGTATCATCGGCCGTTATTATGCCATGGACAGAGACCAGCGCTGGGAGCGTATAGAAGCGGCTTATCAGCTGATTACAGAGGGTAAAGCAGAGCATCAGGCTAAAAGTGCAGTTGACGCTTTGCAGGCCGCTTATGCACGAGGTGAGCGTGATGAGTTTGTGCAAGCGACATGTATCGGTAAGGCTGTGGCCTTAAATAGTAATGATACTTTGATCTTTATGAACTTTAGAGCCGATCGTGCCCGCCAACTCTCACAGGTGTTCAGTGACGAAAGCTTTGCTGGGTTTGCTCGTGTAGTTCATCCTCGTCTGTCGGCTTTTGTTAATTTAACTGAATATGCAACGAGTATTAATGCACAGGTAGCCTATCCATCATTGACACTCAACAATGTGTTAGGTGAAGTGTTGGCAAAAGCGGGTAAAAAGCAATTGCGTATTGCTGAAACAGAAAAATATGCGCATGTAACGTTCTTTTTTAATGGAGGTATCGAAGAGGTGTTTGCCGGTGAAGAGCGCGTGCTGATTGCCTCACCGAAGGTGGCAACCTATGATTTGCAGCCACAAATGAGCGCACAGGAGTTAACGGATAAGCTGGTCGCTGCAATTGCGAGTCAAGACTTTGATGCGATTATTTGTAATTATGCTAATGCGGATATGGTCGGTCACACGGGGGATTATGCGGCTGCGGTACAGGCGATTGAAGCGCTGGATCACTGCCTTAGTCAGGTTGTTGCAGCTGGGCAGCAAGTAGCTGCGGATATCTTGATTACTGCTGATCATGGTAATGCTGAGCTGATGGAAAATCTTCAAACTGGCCAGCCTCACACGGCCCACACCAGCAATTTAGTACCGCTTGTGTATATAGGCAAAGATGCTACCCTAACTAAAGAAGGTGGTACTTTATCTGATATTGCGCCGACACTATTACAGCTGTTAGATCTTACAGTTCCAGTTGAGATGACCGGCCAATCTTTGGTGTATTTGAAATAGCCAATAAAGTAAGTAAAGATAACGATATAAGATAAAGATGGGCCACTGAATACAGGTGGCCTATTGATATGCAGCGATCGATTCTAATTTTTTTTCTTATCATCTGCGTTTTTTTATTTTTTGTTAGTTTTATAAAGGTGATTAATGCAGCAGATAATCGTTTAGTAAAGCTACGCAAAAAAATTGCAGTACTTGACCAAAGCTTAAGTTTGGACAAAACAAAACGTGCAGATATAGAAAAAAGAATTTTCCTGATTGAGAATCATATTAAACAGGCTAATGTATTGATTATTAATAATCAAAATAATATCAATGATAAAAAGCTAAAATTAATTAATCTAAAAGAAAAACAGCAGCAGCTAAAGAAAAGTTTGTTTAAGCAGCGTCAGGAGATTAATCGATATATTAAAACCATTTTTTTGATGGGTCGAGAGCCTTATTTAAAGTTGATTTTTAGCCAGCAAGATCCGAAACTTTTTGGTAGAATGCAGCACTATTTTCAATATATTATGAAAGCAAATCTTGCGCGTTTAGATCAAGCTGAGCAAACAGAGCAGGCACTGAATGAGACAAAAGCGACCTTGCTTGTAGAAAAAAAACAGTTAGAGCGTTTAATAAAACAGCAAGAAATTGATTTAAAGAAACTTTCTAATGATAAGCAATTGAAAGATCAATTAGTTACTATTATTTCGACCTCTATTAATGAAAAAAGTAAGCGATTGGTTGATTTGTACAAAAATGAAAAGCGCTTATTAGCATTGATAGAGCAGTTAGATCAAGAGAGTTTAAAATTTGTCCAAAGCCAAGTAAAGTCATTTAGTCTTATGAAAAAGCAACTGCTTTGCCCTTTTAATTATATTAATTATGATCAAGCTATTAAAAATTTAGCGATGCTAAGAAAAAACAAGCCTGTATTTATTCCAATAAAGCAAGGCAGTCCAGTGCAGGCGGCATATTATGGCCAGGTTGTTTTTGCTAATCAGTTAAAAGGCTATGGCCAATTGGTTATTATTGATCATGCTGAAGGTTATATGAGTTTATATGGTTATAATCAGAAATTATTGGTGAGCAAGGGGCAATGGATTTCTGCTGGGGACCTGATTGCATTGTCTGGACAGGGCAGTGAGGGTATCGGTATGTATTTTGAATTACGTCATAATAATCAAGTTGTTAGTCTAAAAGATTGGTGCCAGAAAATAAACTTGGCATAAAAATAGCTTATATCCTTTTACGAAAATAAGGGGATATACATGAAGCGTTTATTAAAGTACTTGATGTGCTGCCTGATGCCATCATTATTAATGACATTATCTGTAAGTGCATC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>NZ_CP039209|45576:89169|78396_78765_+|WP_016211108.1|DBSCAN-SWA
MKLNYQQLSDLSEYFTNINNDENIEYSVDSNPLGITKKNHELQFTMEESLSKDDLKEHWEKYCRKYNLSFDESLFIETPSSSPNQPEMKQQSFMEDNNIGEEKERNFQQENSFYTTHLTHRS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036776493.1|46661_47423_-	DUF3750 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779326.1|47724_49251_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_129556617.1|49622_50462_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211200.1|50501_51809_+	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	2.1e-24	28.6
WP_016211199.1|51783_52953_+	glycoside hydrolase family 3 protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211196.1|53007_53733_+	16S rRNA (uracil(1498)-N(3))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211194.1|54011_54401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|54588_55494_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047031.1|55732_56329_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910645.1|56563_57717_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_016210704.1|58611_60558_-	protein kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210702.1|61212_64275_-	efflux RND transporter permease subunit	S5VTK5	Leptospira_phage	1.2e-62	22.9
WP_016210701.1|64271_65336_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016210703.1|65691_66645_-	glutathione synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210700.1|66676_67840_-	radical SAM family heme chaperone HemW	NA	NA	NA	NA
WP_032126484.1|67845_68445_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210697.1|68632_69133_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.0e-19	41.2
WP_016210706.1|69150_70239_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211099.1|70377_71622_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211097.1|71618_72461_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036777711.1|72440_73250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126369.1|73417_73645_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211100.1|73645_74596_+	TonB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126371.1|74651_75203_+	YqgE/AlgH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211105.1|75329_75752_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_016211109.1|75744_76491_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211103.1|76533_77232_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126370.1|77242_78067_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	5.4e-26	35.5
WP_016211108.1|78396_78765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|78759_79821_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126486.1|79870_80101_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211248.1|80230_81445_-	aromatic amino acid transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376242.1|81745_82807_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_036777695.1|82820_84548_+	oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211245.1|84581_85313_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211247.1|85312_86101_+	hydroxyacylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211251.1|86205_86829_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211250.1|87148_87361_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047032.1|87516_88578_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047033.1|88572_89169_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP039209|127259:181534|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MDQVVEDTQESFEFLLKLAKSNKGPALEKFVEKHKKLLKQRGEDQLTPLQLAICSGSIETALLFMQYGGLPALRAKFYSQKNKSSIIHYCLARGWDTIKSEHSKLSFGAFIQAAAPIMGERLFALRDIYGINPLGVAVFSGQAVATKFLLGLEFCKTTMVKHEYELVTKLREAR
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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>NZ_CP039209|127259:181534|170630_171461_-|WP_036778324.1|DBSCAN-SWA
MKLKFTKMHGLGNDFVVLNAIDQDISLNMQQLRQLSDRSLGIGCDQILIVAPAQSNDHNFYYRIFNANGKEVGQCANGARCLMRFIHEQGLSTKKQITIRTQNRLLELTQSTNNMIELKMAAPVFTPKDIPCQAEAQQTAYTLETQYGSLRCYALSVGNPHAVLHVSDIHEAPVATIGEALEKHPFFPERANINFVEKVHRGQLIVRTFERGVGETFACGSGACASMAALRQLNEVDETVDIKLRYGHLKVRWAGNDQPLYLAGPATTIFHGEILL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016209611.1|128482_128674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047035.1|128753_128933_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209580.1|129024_129549_+	ankyrin repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209612.1|129932_130301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209595.1|130338_130611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300576.1|130701_131997_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211692.1|132632_133535_+	LysR family transcriptional regulator	Q6JIH3	Burkholderia_virus	1.6e-18	28.4
WP_051307362.1|133591_134443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211694.1|135022_137032_+	DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	3.0e-110	37.8
WP_054300271.1|137069_138044_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211637.1|138545_139958_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_032126550.1|140450_141458_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_016211636.1|141477_142998_+	AMP-binding protein	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.7e-31	27.1
WP_016211018.1|143948_145265_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_016211015.1|145368_145752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211019.1|145886_148952_-	MMPL family transporter	S5VTK5	Leptospira_phage	5.1e-53	20.6
WP_016211017.1|149020_150124_-	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211016.1|150147_150702_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273381.1|150816_151386_+	PadR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211020.1|151505_152261_+	DUF2076 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047036.1|152427_153327_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047037.1|153471_153777_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_098082829.1|154171_154567_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|154588_154954_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046700.1|155010_155175_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|155164_155464_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300544.1|155554_156001_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126725.1|156496_157063_-	DUF1415 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210241.1|157074_157860_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210235.1|158491_159415_+	two pore domain potassium channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210246.1|159466_160462_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210237.1|160493_160988_-	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_036778333.1|161079_161337_-	glutaredoxin 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210233.1|161426_161849_-	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210236.1|162167_162884_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210247.1|162927_163179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778330.1|163183_164620_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210231.1|164647_166090_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210242.1|166177_166516_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|166600_167131_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|167191_169384_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
WP_016210238.1|169426_169912_-	proQ/FINO family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210226.1|170181_170613_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778324.1|170630_171461_-	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_080664837.1|171475_171619_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_052104672.1|171649_172534_-	formyltetrahydrofolate deformylase	NA	NA	NA	NA
WP_016210244.1|172505_172727_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210225.1|172900_173179_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|174149_175055_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780891.1|175111_176290_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|176286_176862_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155053570.1|176960_177173_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300541.1|177500_178280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126848.1|178813_179614_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_052104671.1|179832_180591_+	ion transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211859.1|180667_180955_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|180958_181534_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP039209|200550:271547|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MIDMIRLLPSVVKLGLCLFALLICITQEIYAAKSAQNTTGIEQQELPPSADQGVVDTALNKVTPDQSSILESRLKKESAIANNSLGIIFYQPNYVLPYYYTGSPYQAIYNGQTPDNQKVMSSEFKAQLSLMVPLWKDMFGNPDYSLNVGYTQLSYWQFYAKSQYFRETNYEPELFVTDHFHRNWQISYGVVHQSNGRGGSLERSWNRAYLNLEASGEHWLASIKPWVLIFKPDSSDLHNPDIAHYLGHERIMFAYVFNNKMQASIALTNIESGMKRGAVELDYSFPLTKHINGFVQYFNGYGQSLIEYDHRTQSVGIGIALSHW
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MIKKVLIANRGEIALRILRACREMGLKTVAVHSTADRDLKHVRLADESVCIGPAPALQSYLKFPAIISAAEVTGADAIHPGYGFLSENADFAEQVESGGFVFIGPRAETIRVMGDKVKAIQAMQKAGVPCVPGSDGPLGNDSAQTKRIAQKIGYPVILKAAGGGGGRGMRAVFEEDELLEALQLVRAEAAAAFGNNMVYMEKYLVKPRHIEIQVIGDGKGAAIHLAERDCSMQRRHQKVVEEAPAPGLTKEEREKIGEQCVKACRELKYRGAGTFEFLYEDGRFYFIEMNTRVQVEHPVTELITGVDIVKEQLRIAGGLGLSKRQKDIHIQGHAIECRINAEDPKTFMPSPGHIDFYHPPGGPGIRVDSHLYSGYSVPPHYDSMVAKVITHGEDRQSAIIRMQGALGETIINGIKTNIPLQQEIMADLNFQAGGTNIHYLEKKLNGQK
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MATMKDVLVPDIGNYSDVDVIEINVAVGDQVSADDALITLETDKATMEVPAPFAGTVKAIKVKEGSKVSEGSLIVQMEGSGDVVESATVPAAVAAPTAVVAPTGPIEVRVPDIGNYSGVDVIEINVAVGDQVSEEDALITLETDKATMEVPSPVAGIVKEIKVAEGSQVSEGDLVLIVEGAGGTSAVAHTPATAQQEVTTISSAVPMAVVATASVQEVHVPDIGNYSGVDVIEINVAVGDCVNEEDPLITLETDKATMEVPSPVAGVVKEIKVAEGSKVSEGDLIVLVESPGASSVVVSSVTSQGAAAVAAPAANQPVTSAASAAAPVLTQASGPSHASPALRRFANELGVDLAKVIGTGRKNRILHEDVTKWVKNALSRPAATASAGGGTGLDLLPVPKVDFAKFGAIEEQSLSRIKKISGANLHRNWVMVPHVTQFDEADITEMEAFRKEQNKLAEKKKADYKFTPLAFLLKASAAALKAFPEFCASLNEAADALVLKKYVHIGVAVDTPNGLVVPVVQNVDQKGLVELSRELGEISKKARAGKLTAVDMQGGCFTISSLGGLGGTAFTPIVNLPEVAILGVSKSSIKPIWNGNDFAPRLMLPLSLSYDHRVIDGAAAARFTTFLAEQLSDLRNMLL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209871.1|200550_202533_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.9e-115	40.9
WP_016209869.1|202742_204086_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_016209874.1|204352_207022_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_016209857.1|207045_208965_+	dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209860.1|209134_210556_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	27.8
WP_016209866.1|210701_211676_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_054300537.1|211707_212115_+	glyoxalase	NA	NA	NA	NA
WP_016209859.1|212393_212615_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209875.1|212778_214440_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	5.3e-182	64.9
WP_016209850.1|214512_214803_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_036776911.1|215028_215484_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209852.1|215548_216013_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209862.1|216105_217452_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209870.1|217451_218357_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209854.1|218418_219405_+|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
WP_016209851.1|219397_219640_+	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209858.1|219761_221306_+	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	6.5e-65	47.8
WP_036776914.1|221352_222639_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209864.1|222681_224076_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209867.1|224099_224279_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307322.1|224275_224455_-	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_054300181.1|224458_224740_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|224796_225162_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210079.1|228167_228665_-	purine-binding chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_016210095.1|228835_229531_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_080664831.1|229633_231196_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210093.1|231511_233305_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	2.6e-118	41.3
WP_016210081.1|233390_233663_+	DUF615 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210094.1|233668_234295_+	DUF938 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210077.1|234281_235712_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_016210086.1|236044_237100_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.3e-28	34.2
WP_032126605.1|237068_237746_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210084.1|237735_238572_+	D-methionine-binding lipoprotein metQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210080.1|238731_239025_-|tail	phage tail assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_122940784.1|239131_239938_-	trfA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210083.1|240242_241097_-	Hsp33 family molecular chaperone HslO	NA	NA	NA	NA
WP_036776920.1|241251_242301_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_036776924.1|242351_243008_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210097.1|243025_244306_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210096.1|244579_245941_+	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126863.1|246340_246892_+	paraquat-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016211802.1|252323_253595_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_036778206.1|253651_254635_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016211800.1|254631_255417_+	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|256113_256479_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|256424_257000_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300535.1|257003_257723_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300534.1|257867_258068_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211358.1|258115_258577_-	DUF1499 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211357.1|259000_260482_+	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.3e-49	28.3
WP_016211355.1|260544_261654_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	E3SJ82	Synechococcus_phage	2.9e-35	29.8
WP_016211354.1|261751_263713_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211359.1|264242_264647_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047045.1|264699_265395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|265371_266346_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_098082809.1|266516_266867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|267809_268892_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_129556499.1|270394_271547_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP039209|300496:360356|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211032.1|305721_306519_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212044.1|352938_353193_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP039209|444588:545060|DBSCAN-SWA
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MALTKAVLMDKLFADLGVNKQDAKMIVDLFFEEIQSALEKGQIVKLSGFGNFMLRDKKERPGRNPKTGDEVAVSARRVVTFRAGQKLRARVNSKL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210649.1|455458_457447_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
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WP_016210501.1|461985_462972_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
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WP_016210500.1|464955_466446_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210496.1|467582_468977_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777444.1|469855_471787_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	1.0e-120	36.6
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WP_016210495.1|472593_472953_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|473372_474368_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_036777440.1|474380_476762_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|476767_477055_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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WP_016210484.1|486624_488382_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212477.1|504622_504868_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|505028_505757_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_016211714.1|505831_509176_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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511375:511434	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_155047064.1|526160_526469_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
525586:525759	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_052104771.1|539291_539630_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	5.4e-25	54.9
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WP_081377363.1|541563_541920_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_075274719.1|542225_543092_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047068.1|543577_543778_+	HNH endonuclease	A0A2H4PHY5	Pseudomonas_phage	3.5e-16	64.3
WP_155047069.1|543865_544219_+	hypothetical protein	Q6DMU4	Streptococcus_phage	8.2e-08	34.8
WP_054300202.1|544331_545060_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP039209|552759:600712|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCTATTCAGATAATATTAGGATTATTTCAAGCAACAGTGATTGTATGATTAAAGCAATAATCATTTAAATAGAGTTTTAATTGATCTTTTGAGTGGAGTGGGCCAACGCCAGCAGGCGTACCGGTCAGAAAGACATCACCAGGTTCTAGGGTAAAAAACTGACTGGCTGTGCTGATTAATTCAGGAATGGTAGTAATCATTTGTTGAGCTAAGCCGTGTTGGCGTATTTCATTATTAATCGATAATTTAAATTCTATATTATCAAGTTGCTTTATTTGGTGGCTGTGCATAAAGGGGCTTAAAACACATGAGCCATCAAAGGATTTGGCTTTTTCCCAAGGGTGACCGTTATCTTTAAGCTGGTTTTGTAAATCGCGTAGGGTTAAATCAATAGCAAGGCCATAGTAAAACGTCTCGAGTTGAATCTCTTCTGGCTGTCGTTTAGAAACTGTTTCAGTGATCAGTAAAGCAAGTTCCAGTTCATAGTGGCAAGAACCATAGGCAGTGGGCCATTGGATGGGGGTAGTTAAATCAATCATAGCTGAGGTCGGTTTCATAAATAATAACGGTGTGGTTGGCGTTGCATTATTAAGCTCGTGAATATGATCAATATAGTTGCGACCAACACACACTACTTTTCCAGGTTGCCATTGAAGGGGATGTTGGTTTATATCCATGTGCTGATACGTCATAGTAAATGCCCTGATAAGATGAGTCTATGGTATGGGCATTAAACCATATTTAGGAATGTTTAGCCTACTGCTTATTTGCTTTATTAATGCGTATTTGAATTTGCTCTTTGACGACATTGTAAATTTTATGTGGGTCGATTTTACCAACAAACTCATTGCAGCCGATTTCTTTGGAATCTGATTCATTAAAAACGCTAGTAATCGATGTGTTGAGCATAATAAACAAATTTTTAAGTCCTGGATGTTCTCGACAGTTTTTTATCAGTGAGTAGCCATCCATTTCTGGCATTTCGACATCGGAAATAAGCATGAGGTATTTACGGCTAACATCACCTGCAGTGCGTGGAATATCATGCTCAAGAATGTCCAGTGCATGTTGTCCATCATCGGTCATAATGACATTAACGCCAATTTGATCTAATACTTGCTTAACATGGCGGCGAGCGACTGAGGAATCATCGGCGACAAGTACGGTGTATTTGTGAGCGACTTTTCTGATCATATCATCAAGATCATCAGTGTTGAATTTTGCTCTAACGTCATGAATATCACCAAGAACACGTTCAACATCGAGTAATTCAACTAAACGGTTGTCTACTTGCGCTAAGTCTTTGGCTATGCCTGTGATATAGTGATCCCGGCCAGTGGCTGGGGGGGGTGGAACAATACTTTCCCAAGACGCATTAACAATGTGATCTACTTTATAAACAACTAAGCCTTGTACACTGCGATTATATTCAGTGATGATTAAAACTTTATCTTCTAGATCATAGGTATATTCATCATTGACGGCTTTATTAAGGTCGATAACGGGCATGGTTGTACCACGAATACTGGTTGCACCAATAACGGCTTTATGCGAGTTAGGTAATTGCGTTAATGGCGGTACATTAATAACCTCTCGAATTTTAAAGACATTAATACCAAACAGCTGACCATCCAGATGAAAGAGTAATATCTCTAGACGATTATGACCGACAAGTTGTGTTCTAGCATCAACACTTGCGAGTATATCTGGCATAACTGACCCTCCCCAGTAATCTCAAGTATAGAGCTTCTTTTTTAAAGTCGCGGTGAAAAAATTAACTTACTATAAAAAAAGCGCTAAAACAGCCTGCTAATTAGTCTGTTAATTAAAATATAAAGTTATGGGGTAAATACTGGTAGTACAGGGGAAATCGCTTTAGGAAAATATGAACCGAGAGTCAGTCAGCTCTTTTTCAAAAACATATCTATTATACTAAAAGCCTATGCTTATTATTTATCTGCAGCTTTAGTTATGAAGATTTTTATTAACCTTATGTTTGTACTTGCTTTATGCGGTTTTAATCTAAATGTTAGTTATAGCGCTGAGCGAGTAATTAAGTTAACCATGGACGATCGGCCACCGTTTCACTATCTTCAAGATGGCAAGTTAAAGGGTCCGGTGATACAAACATTGCAGTGTATCTTTAAGCATATGCAGCAAGCCTATGATGTTGAAGTGGTCTCCTGGTCAAGAGCACAGCATTATGTCAAAGTGGGATATGCTGATGGTTTTTTTGCGGCTAGCCATAATAAAACTCGAGACCAATATGCGACGCTTTCTTATCCATTTGTTGATCAGTACTGGAGTTGGTTTACATTAAAATCTAAAACTATCTCAAAAAAACAACTTGAATCAAAAGCACTAAAGGTGTCTAGTTGGAAAAAATCTAACTCTCAGCATTGGTTAGAAAAAAATAGTTACAATTTTATTAATTACCCACCTCAGGAAATCAGCCATTTGGTGAATATATTAAGAGCAGAGCGTGTAGCGGCTATCTTTGGCAGTAATATCGCAATCTATCAGTATTTAAAGAGGCTGAGGGTTTTTGATCAGGTCAAAGAAATAAAAGTAGTTCATAAGCCGATGGGGCTGTATATGTCTCATCGTTATCTTAAAGAAGATCCAGAATTTTTAAGGGTGTTTAATGAAAAGTCCAAGAAATGCTTGTAGTTAAATTTAAGCAGCCTTCCTAGCGAGGGCTGCCTTATATTATTATTGTTTACGCCCTATCTCTTGTACTTCCATAACCATGACTTTAAAAAAGTCATAGGTCATATAGTAATTACCGTGATCACCTGCATTCTCTCCCCATGAGTTACGCAAGGTTAAAAGACCACATTGTTGCTTGCCACTGCCTACACCAAAGGTAATTTCTGCACAGGCATTATCATTATATCCGGTAATAATCATTTCATGGCCGCCAGAGGACTCTTGTTCAACAAACTCTTTTACTTCAGGAATCATCACCCAGGCATCATCAGGGGCGCCATTATACGAGCCACCAATAACGAGGTCGCCAGGTCTTCCTTTTGTTGATCCTTTGGGCACAACGGCAAGCAGTGAGCCTAATGTGACCCTATGGCCTAAATTAAGAGCTCTTTTTACCATACTCAGCGTAAAACTCCCATAAATCGGAATTTTACGCCAATCTTTGTCTGTAAAGCGTTTATCGCTAAACTGCTGGAAAACCTCAGGTGTCATATCGCTTCCTGTTTCTTTTGCATTATAGGTTGGGTAATGTAATAAACCACCGCAAACATATGCCCCATCAATCATTTGGCTTTGTTGGTCTCTGCTCATAAAACCATATGTAGTGATTTGCCCGAGGACCTTCGTCCCCCACGAGCCTTCCCAGCCACCCATAGCATCTGGGTTGTTAATGTATTTTCCCAGCTCCAGATTGCAAAGTTCACTCATTTGATTGTATGCACTGGTGAGCCCAAAATAAGCATCCACAGCACCTGCATTGGCAAATGTGGCACAGCTGCCGTGTGAGCCTTGGTTATGTACGGGAACGCCTGCCATATCTAATTGTTTTTGTGTGCTATGGCCGATCGCTGGCATATTAAAATTAGGGGTTTGCTGAGTACTTTTTAGTGCCTTCGATATTTTGGAAACTTTCTCAGCTTTTTGCTCTGGTGATAAATTTACCTTCATTAATGTAATTTGTTGAGGCATCATTGTTGAAAATGATGCGTGAGCCCCACGCATCATTGGGCCTCCAGATCCTGGAATGGTAACAAGTAAGGTTTCTGCATGAACTGAAGCTATTGTTAAGCTTAAACTACTGATTAGAAGAAGATGGATATTCTTTTTTTTAAACATAGCGTGGTCTCCCAGAGCGATAATAAAATTGCTTTATAAAAGCAGATAAGGTTAAAAAAATTTAACAAAAATATTTATTTTTTTACTTGGTCTAGTTAATTATCAGAATTAACATATATTGTTAATATGTCAATAATATTTATTAAGATTTTTGTTAATTTTAGTTGGTTTGAAAATTATATGTGCCGATTAATTAATTTATCTCTGGTGTTTTATATTTGATTGGTAAAAGATAATATTATTTGATAATAATATTTTGTGTTTTTTATGATTACATTAATTTTTTGCTGTTTTTTTCATGCTGTTGATATCAGTGTATGATTATATAAATTTTCAATTTTTATATCTTAAAATATAAATCAGTTAGGAAGGAGGGTG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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211661.1|554311_555268_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.4e-33	31.9
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WP_075273327.1|557984_558560_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|558505_558871_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212580.1|558958_559309_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|560044_561106_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|562317_563133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|563223_564207_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|564377_564899_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_036779246.1|564932_565187_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-20	58.8
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WP_016210906.1|567806_570119_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300173.1|571854_572916_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211493.1|573755_575219_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|575221_576274_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_036779281.1|576263_576719_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_155047071.1|576743_577067_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|577414_577726_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300208.1|577855_578647_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779278.1|579804_580758_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|580871_581069_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126198.1|581314_581515_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_142396463.1|581625_581742_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|581828_582050_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|582076_582442_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|582498_582663_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047072.1|582652_582967_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046713.1|583104_583269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126195.1|583563_585000_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_016210532.1|585041_586493_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_016210537.1|586604_586892_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|587081_588125_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210536.1|588140_589040_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_016210528.1|589036_589555_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_016210527.1|589624_590242_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_036776217.1|590251_591739_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_016210534.1|591748_595429_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776215.1|595502_596315_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210530.1|596311_596992_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047260.1|597832_597991_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_155047073.1|598183_598741_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556461.1|598790_599081_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300215.1|599884_600379_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007066.1|600373_600712_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP039209|622182:724778|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209523.1|622182_623532_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
WP_016209510.1|623582_624020_-	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_016209501.1|624281_625793_+	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778935.1|625798_627025_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|627018_628047_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|628024_628717_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049805.1|628718_630191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778941.1|630183_630672_+	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_051307310.1|630677_632150_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|632149_632548_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|632544_634233_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|634214_635171_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|635213_635729_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|635833_636766_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|636985_637372_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|637388_638033_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|638213_639053_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|639128_639731_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|639731_640586_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|640942_641254_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|641278_642670_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|642825_643557_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_129556465.1|643553_644126_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|644112_644670_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|644675_645656_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|645795_646596_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|646599_647367_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|647363_647828_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|647850_648504_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|648507_648855_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|648888_649140_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|649216_650485_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|650487_651246_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|651307_652198_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|652248_652932_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|653017_653275_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047218.1|653547_655716_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|655707_656580_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|656747_658577_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|658739_659381_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|659622_660153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|660170_660344_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|660402_661452_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|661458_662409_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|662462_663407_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|663434_664172_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|664260_664503_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|664577_665801_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|665832_666681_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|666677_667730_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|667850_668471_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_036780649.1|668486_669473_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP039209|760195:808120|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP039209|824801:933585|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046989.1|834310_835375_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209661.1|847909_848785_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
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WP_075273480.1|855752_857651_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|857682_858567_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|858575_858971_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|859398_861546_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|861517_862867_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|862863_864984_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|864980_866684_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209654.1|866802_867945_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|868009_869038_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036776625.1|869164_870679_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_059372266.1|870768_871254_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275067.1|871586_872654_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|873716_874622_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_051307360.1|874738_875668_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780074.1|876759_877566_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211514.1|877908_879801_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	1.4e-80	32.9
WP_032126157.1|880087_880492_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923634.1|880696_881245_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|881234_882121_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212436.1|882459_882870_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047205.1|883044_883266_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|884064_884640_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080664862.1|885813_886512_+	P-loop NTPase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP039209|954127:999250|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017375910.1|962052_962781_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

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>NZ_CP039209|1011758:1066647|1027870_1030144_+|WP_016211262.1|protease|DBSCAN-SWA
MLSKDLEMTLNLAFKVAREKRHEFMTVEHLLLSLLDNTAAASVLQVCGADLERLRHSLSQFLDETTPLIPSNDYDCDTQPTLGFQRVLQRAVFHVQSAGKTEVTGANVLVAIFGEQDSQAVYFLRQQNITRLDVVNYISHGISKIHDDDPSVDYDQPSPQGGGERGEEAEEAMVGPLESFAVNLNEKARQGAIDPLIGRNQELERVVQVLCRRRKNNPLLVGEAGVGKTAIAEGLAWRIIENDVPDVINESVVYSLDLGALLAGTKYRGDFEKRFKSVLRQLQKVKDAILFIDEIHTIIGAGAASGGVMDASNLIKPLLSSGELRCMGSTTYQEYRGIFEKDRALARRFQKIDITEPTEDETYRILKGLKSRFEAHHNIRYSNSALKVAAELSARYIPDRFLPDKAIDVMDEAGAYQRLREQDKRKKVITVTDIEKIIAKMARIPEKRVSASDRKSLENLERDLKILIFGQDEAIEALVSTIKMSRAGLRDEAKPIGSFLFAGPTGVGKTEVSRQLSKLLGVELIRFDMSEYMESHSVARLIGAPPGYVGYDQGGLLTDAVTKQPHCVLLLDEIEKAHPDIFNILLQVMDHGTLTDNNGRQADFRHAIVILTTNAGAFEESRASYGFFEQDHAADGIESVKRAFSPEFRNRLDSIIRFKPLSFDVIKHVVDKLICELQAQLDDKGILLDIDEEARGWLAEHGYDHKMGARPMSRLIQNVLKRPLAEELLFGKLSHGGAVHITQKEGELCLDFQEEKV
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MKRMLINASQPEELRVAMVDGQHLYDLDIETAGYEQKKASVYKGRVTRIEPSLEAAFVEYGADRHGFLPLKEIAPEYYDATANTDKRGRVHIRDAVREGQEVLVQIDKEERGTKGAALSTYITLAGCYLVLMPNNPRAGGISRRIDGEEREELKQILEQLNLPNDMGLIIRTAGIGKNLEEIQWDLSILQKQWQAIRAGFARIAAPSLIYRESDVVLRAIRDYLRPGVNEIVVDDRDVYDRIAHHLKQLRPDYLNCLKHYQDPVPLFSRFNIEGQIESAFEREVRLPSGGAIVIDHTEAMISIDINSARATKGGDIEETAFNTNIEAAEEVARQLRLRDLGGLVVIDFIDMVQPRHQRDVENCLRDALKMDRARVQTGRISRFGLLEMSRQRLRPALGESSQHVCPRCSGHGYIRGIESLALAVMRLLEEEAMKGQQGQIQAQLPVEVATFLLNEKRGILAQIERRHRVSLLLIPNINLQTPHYQVMSVSDHAREDAASYSLVSQVQSVEDLTKAAVKYEEPVVKDLSYGASPKRGLLNKLWQYLSGASHSHSAQASEDTAATVEPIRPVKVHSASSSSSSSSSEGRDRNKRQGSTGGGSGRRSQGGGQLAAAPSKGQSGGGRHRRNEGGTVVKGNLASSGESHERSSNRSNSNKTTDARRKSTGGKSSSVSQQRKSVKSASDVDKDASKKAVTTQRTEAMVEVKAAVEPVSVKVAVEQVSSVVSSSAEAKVTTTGGATTSGQKTETVVVEQAAVMEKVVRAKRPNFTTLESQVETTVISSGVIDRAVPSSYHHGNIGAHRLEPWRSALSAAASSIAEIKQIETIANDESSTESVIVKVVEKLHQGRSPLQWHERLKGSQAAISHSIEHIRQVETKVAVAIAAAENQVKTNIQ
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MSILPKIRIVLVETSHSGNIGAVARAMKNMGLGRLYLVAPNDFPSDQAYALSSHAEDVLDHAVISASLAEAIADCQLVFGTSARERKVPWPLEAPRQMAQRVMSEHSQHEIAVVFGRERTGLTNQELQCCHYHVHIPTNEEYSSLNLAQAVQVIAYELRLAALDHNQNVNNNALNNDNNIGLKTIEQPEKLLASSAQMEGFYLHLEKLLRKIHFLDEAQEGMLMLKLRRLYQRSRVEEAEMHILRGILSKMERRLDEKGKSK
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MKHSSAFLTLVEQARSSVSEISIENVCDYINEHVDFQLIDVRESDEVSVGKIKGARVLSKGIIERDIERLIPDVNTHIVLYCGGGYRSALAAENLQRMGYLHVESMIGGFKAWQQAHYETESTG
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METLLCLTNENFDQTVEDNELTVVEFHADWCEPCRSFDKVFVEVAKEHADVVFAKIDTEKEVELAREFHVRSIPRLMIFKKNVVVADQTGELPFDVVNDLIKQAKSLDMSDIHQHMAKQFLS
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MTARRCLALIFIFTNLLSLMSCTQQTTVLHQSESLYGVSTVKPDKSQAAHYNVQLGLAYLKAGDFRRAQYKLSKAIKLDPHHAEVHYAFAYYLETVGEFEKAQQEYLTALNIAPDDPKVLNNYGAFLCRQGQVDKSLRYLLAAAEHVEYLDRAGSYENAGLCALKIDELKSAQHYLMQALQLAPHNDRVRWALIKISNQQGQDQQTLVLLKRYLLAQPDDSNAQRLLQQLQVKSGSDQPDKR
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MDKAYTVLTVDDSKTIHGIAKNLLSGSEFDIIDVAHNGNDGVEKYKKLKPNFVLMDIVMPELDGMSALKKIIDFDPHAQVVMATSMGQEDTVEQAITIGAKGYLLKPYDKESVLVVLRTLTKL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211932.1|1013055_1014345_-	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|1014540_1015728_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|1016045_1016255_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211473.1|1016238_1016838_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|1016912_1018262_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_032126518.1|1018344_1020546_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211478.1|1020562_1021378_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|1021357_1022077_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_075273327.1|1022244_1022820_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1022765_1023131_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|1023305_1023968_+	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|1023998_1024367_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|1024377_1025694_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|1025976_1026552_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126515.1|1026627_1026807_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|1026979_1027273_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_075273504.1|1027462_1027816_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211262.1|1027870_1030144_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_016211259.1|1030203_1030449_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|1030573_1031449_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211550.1|1031526_1032288_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211548.1|1032271_1033228_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211549.1|1033490_1035995_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211553.1|1035998_1036739_+	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1037078_1037444_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|1037500_1037665_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|1037654_1037954_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126933.1|1037957_1039259_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1039427_1040402_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016209411.1|1040607_1041402_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|1041564_1042353_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_036776605.1|1042349_1043561_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_032126508.1|1043550_1043910_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209444.1|1044004_1044433_+	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	39.4
WP_129556555.1|1044563_1045694_+	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_016209436.1|1045690_1046419_+	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_016209412.1|1046476_1047364_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209433.1|1047448_1047823_+	rhodanese-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209424.1|1047922_1049200_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	6.6e-23	25.1
WP_080664816.1|1049211_1049943_+	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556554.1|1049914_1051180_+	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_016209427.1|1051273_1052677_+	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_016209408.1|1052830_1053001_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209406.1|1053315_1054137_+	ParA family protein	Q8JL10	Natrialba_phage	5.0e-16	32.2
WP_016209405.1|1054133_1055027_+	cheW-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209443.1|1055072_1055594_+	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_036776598.1|1055668_1056154_+	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047194.1|1056442_1057201_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209404.1|1057190_1058054_-	chemotaxis phosphatase CheX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209435.1|1058080_1058452_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.1e-05	29.4
WP_016209445.1|1058552_1059509_-	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_054300277.1|1059991_1062673_+	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016209439.1|1062753_1063380_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556553.1|1063543_1065136_+	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209434.1|1065225_1066647_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP039209|1081685:1210901|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP039209|1251573:1550295|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210106.1|1549203_1550295_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP039209|1568693:1612647|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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MKPFQFIREEYKFLIGLLFVLIFFSPQFSQQLVPHSINFAAIGFIVVFIIMIACAFNVVKHADWLAHRFGEPYGTIILTISVISIEVALISAVMLAGGKSPTLARDTMFAVIIISLNGLVGLSLLLGGIRHHSQRYNLNGANAFLSVLVPLSIICLVSPNYTKAASYGVLSHGQAGFIVIMSLVLYGVFLSIQTVRHKDFFEHPDPTDEQITAAQKDGSLPRKVYFHIAMLFMALIVMVLLSKKLAMYIDFTISALHAPKALSGFIVAILVLTPEGMSAIKSAANNQMQRCVNLCLGSALASISLTIPAVLVISFLTQQTITLGLSSLDVLLLILTLAVSMITFISHRTHILQGVVHLALFFTYIVFIFDLAK
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MQFRPNSNKHKDIILDLAPLIDVVLLVLIFLMVTATFIKVGGVQVNLPSTESASLNEPLQETLVISVDFKGDYYVNSDRVPGGKVALKQSLLKQAKYNKNRLVRIKGDTNAPLQIIVDIMELVQNAGFVKVQILTQVKTS
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MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA
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MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSNAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIAQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL
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MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MERKHLTLRTRIKRLARKTICFSKSEKMHDVVIGLFINKLEFGKAT
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYALRHLKCNTTLY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1568598:1568657	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300353.1|1568693_1568921_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300354.1|1569067_1569586_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.3e-30	42.9
WP_155047155.1|1569531_1569681_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1569724_1570699_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047154.1|1570771_1571152_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1571112_1571478_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1571423_1571999_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300355.1|1571988_1572174_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211563.1|1572384_1572546_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211564.1|1572578_1573454_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104693.1|1573619_1577486_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
WP_080728343.1|1577567_1577708_-	hypothetical protein	A0A0U2RK18	Escherichia_phage	1.6e-07	69.0
WP_081007034.1|1577689_1577974_-|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047153.1|1578238_1579657_+	autotransporter domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211991.1|1580565_1581471_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_032126537.1|1581711_1581897_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211994.1|1581933_1582470_-	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047152.1|1582672_1583395_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1583434_1584409_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_155047150.1|1584994_1586221_+	DUF4131 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047149.1|1586215_1586431_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273474.1|1586454_1587429_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_016212012.1|1587472_1588150_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016212013.1|1588165_1588549_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212011.1|1588770_1589892_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300357.1|1590125_1591001_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211974.1|1591283_1592405_+	alanine dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_075273551.1|1592504_1592807_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556638.1|1592806_1593487_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377865.1|1594831_1595116_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080664876.1|1595474_1597337_-	protein-disulfide reductase DsbD	NA	NA	NA	NA
1595410:1595498	attR	NA	NA	NA	NA
WP_054300359.1|1597561_1598134_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047148.1|1598492_1599530_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047147.1|1600059_1601034_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.2e-29	32.6
WP_054300361.1|1601187_1601484_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377353.1|1601461_1602127_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1602166_1603141_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211144.1|1603697_1604327_+	MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779218.1|1604310_1604733_+	biopolymer transporter ExbD	NA	NA	NA	NA
WP_016211145.1|1604739_1606479_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-53	30.8
WP_016211153.1|1606479_1607544_+	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211147.1|1607547_1607901_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|1608013_1608970_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211151.1|1608979_1609291_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|1609306_1609876_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
WP_016211148.1|1610139_1611468_+	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1611672_1612647_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP039209|1621535:1668939|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300271.1|1654497_1655472_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_036777656.1|1668159_1668939_-|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP039209|1695000:1739058|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP039209|1760478:1816004|DBSCAN-SWA
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVIALNE

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP039209|1822769:1881686|DBSCAN-SWA
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MDYNSTFTKVMRLYVGHRFFWKGDEISHEDVLSLSGHIIETLLRKVNLTYSFLFDSKISYSRKRLEGQSQESIHINSDKETAFILLLIVIDIMEEAVIKSGDDVYLDNYIK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_051307320.1|1864109_1864616_-	DotD/TraH family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016209959.1|1864640_1865048_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556635.1|1865075_1866083_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209971.1|1866141_1867047_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209955.1|1867053_1868247_-	conjugal transfer protein TrbI	NA	NA	NA	NA
WP_155047125.1|1868243_1869170_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211310.1|1870144_1870858_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	A0A1D7SEW9	Cyanophage	2.2e-39	39.1
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WP_016211309.1|1873402_1874197_+	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211305.1|1874199_1874481_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155047124.1|1874477_1875455_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211312.1|1876160_1876907_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1877028_1878090_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780082.1|1878633_1879539_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212000.1|1879669_1880398_-	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_016212002.1|1880517_1880796_+	DNA-J related family protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|1880799_1881686_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP039209|1892477:1947910|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209931.1|1919658_1921131_+	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
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WP_155047119.1|1932186_1933509_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.3e-12	24.3
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WP_075273327.1|1944189_1944765_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP039209|1952458:2066179|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_059372269.1|1967691_1968063_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|1970935_1971511_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1971456_1971822_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP039209|2083932:2126567|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP039209|2148272:2201278|DBSCAN-SWA
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MLQLNTTIYQHLAQYAKQMDLALFHLTLDGYILDISPSSSALFNNNHYYHLINKNIIDVLLYFGIENNLSIKKGKLKTAKKNLFLNLTLIHNSKNQSPYFILSVNIHAIFKSTLSIYTIIDSIPYPVYCKDENSQYIFANPALNSYAGKNIIGLTDFDSPWAATAKSLISNDQLVINNNKAIMVIEKLANYKGNKQITYSIKSPIYNKESNKVIGVFGISIFNCYQTMTNTNGEVSLSIGLDLSVREVECVNLLIQGFSSTEISKKLNISNRTAQDHIKNIKHKMNCPNLFKLGYILGKHFSHLLHY
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962625.1|2153658_2154545_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274681.1|2158212_2159088_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_026063519.1|2159136_2159553_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210465.1|2159839_2160682_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	5.2e-32	35.3
WP_016210463.1|2160732_2161080_-	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
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WP_016210468.1|2162871_2163591_-	TIGR00266 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036777098.1|2165519_2167457_+	AsmA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2170316_2170682_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047103.1|2170797_2171919_-	iron-containing alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_155049817.1|2172713_2173600_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036780722.1|2173661_2174636_-	aldehyde dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210459.1|2174800_2175319_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047101.1|2175523_2176642_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211720.1|2176889_2177813_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211716.1|2177826_2178750_+	PAS and helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211719.1|2179656_2180484_+	class II glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047099.1|2181428_2181584_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126590.1|2181776_2183309_+	nuclease	NA	NA	NA	NA
WP_032126591.1|2183371_2184709_-	N-succinylarginine dihydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210313.1|2184851_2186318_-	succinylglutamate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210314.1|2186314_2187364_-	arginine N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778435.1|2187487_2189602_-	ATP-dependent DNA helicase RecG	NA	NA	NA	NA
WP_016210305.1|2189766_2190171_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210307.1|2191042_2191933_+	YicC family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210316.1|2192882_2195036_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A2I2L310	Orpheovirus	1.1e-12	37.1
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WP_032126362.1|2198303_2198669_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300162.1|2200195_2201278_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP039209|2205201:2250252|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP039209|2320440:2382783|DBSCAN-SWA
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MHIKRWLLPASIAGFFLLVYLLSPILGSFFAAILLAYLGSPWVLRLESYHIPRTLSVLVILFLIGAVLFSLPLIIIPMVEMQVVLLINQLPKINHYLQSHIFPLLSHYLHLDVKTFNLNLPDLTQKFSVLLTQNPDLLKISWNTIFSSGIKIIGWGIQLVLVPVVAFYFLRDWNTILAKGRNLLPRRLEPTLYKLITTCDEVLAAFLRGQLFVMLCLGIFYALGLSIVGLKTAVLIGMLVGIISIVPYLGSIAGIIIAVLSAIAQFQDISHIIYVLIVFILGHALEGWVLTPLLVGDRIGLHPVAVIFAVLAGGQLFGFAGVLLALPAAAVIMVIIRYFYQDYISSHFYQQESQYSSASATDGPGSLEK
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MQKPSLSYRDAGVNIDAGNRLVERIKHVAKATHRPGVMGSLGGFGALFELPTDRYKAPVLVSGTDGVGTKLKLALELGIHDTVGIDLVAMCVNDLIVIGAEPLFFLDYYATGELDVDVAASVIKGIGEGCLQAGAALVGGETAEMPGMYSAGDYDLAGFCVGVVEKERIVDASRVTAGDVLIALGSSGVHSNGYSLVRKILAVAGQGFETVLSESGKTLAELLLAPTRIYIKSLLPLFNQDKIHACAHITGGGLPENLPRVLPAGVSAKINTASWQWPEIFQWLQQQGGVETDEMYRTFNCGVGMVICVAREDVDDCLAQLTASGENAWVVGEMIDGQDQPVIFSE
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MSNQNDRIVVLISGSGSNLQALIDTIHQNPEKVGHIVAVISNNADALGLQRAEQVGIETRVLSHQGFREREAYDTALLELIEYYQPKLIVLAGFMRILSAFFVAHFQGRLLNIHPSLLPKHKGLHTHKRALEAGDTEHGASVHFVSADLDGGPVIAQSYCQINPEDDEASLAQRVQDLEHVLYPQVVSWFIQDQLQWFNGSTLRLHGKELAQPLRI
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MAKNDVGEEVKDREEGVGKLGKKGFASSVDKHDTIQQAVAKVKQHKDITGAEGEAEVRQKETEAALDASSGQAPVGGTGPNPALQQFALLFQQQQQQAAPTQPEQQQQMGL
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MSNPLRQHLIDTNESYFSHMRFALRQCGRLFTAACCLMLHALLPFILTHTASYLIDKINQDLEEKRSRKPQ
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MKRRNISSGSDWEKQIGFSQAVCVGPFIQISALTPVDAEGKVIGIRDAYEQTKQILTNLQATLEHAGAEMADVVRTRIYVKDLRLWQEIGRAHGEAFQDIKPATSMLEVSRMTGPDFLVSIEADAIIDESAERV
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MNDDPGSSTSNRSWLDRLGLGFLGEPKDKEDLFELLKDSVDRKLIDIETMTMMEGVLQVSEMQVRDIMVPRGQVVVVDHDAKPDDFLPTIIKSSHSRFPVIGENKDEVIGLLLAKDLLPYCFCKEEDIELATLLRPVLFVPESIRLDALLNKFRSTRNHIAVVIDEYGGVAGIATIEDILEEIVGEIEDEHDAVADEFIKKQAEDCYIVRALTPIDDFNEFFKAELDDEEFDTIGGLVTHQFGYLPQKGESVIIAQYQFTVLSTSGRRIQLLQAEPVKN
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MLSEHTKTIIKATAPVMKEYGLTITLRMYDIMFARYPKTKTLFNQTHQENKQQPRALANSIYAYAANIDNLDALSDTIELVAHKHASLNIRPEHYDIVAECLIQAVKDILKEAATTEIISAWTEAYTFLANVFINREEELYQYDRNKAGGWNGFRPFIITDKVKESTHVYSFYLRPQDNQPLIDFQPGQYIALRTHLNNTTITRNYSLSATDHSNHYRISVKREEQGQLSPLLHDQLNINDTVELTAPKGNFTLNNLEQTKQPIVFISGGIGITPLFAMLEKTLNTPASPQITFIHATENSKTHTFKNQLADYNSQHANLLKSYTCYHQPLAQDQCDLAGTINQDWLREKLPKSPADYYLCGSPLFMKHIFQQLISLGINEEAIHYEYFGPLEQMN
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MHGREKSISNAFDKQAVFISKQLTIPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYLVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MEQAVAGSVWLVLKQRPQLVSYTLICTVLSLTMAQLIFAFPLYLAALFNAQGAQYYGQIMTANAVIVVIFTPILTVLTRRYSALIGTMIAVIFLGLCYSTLLLNQSLIVIFLAVFFMTVAEVLIVTKSSVFIANHSPSSHRGRITGILPAVISSVNYFSPVMMGGYIDHFGFHALWYLMIILAVLGVCSLGLMSLSELKHSHLYR
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MQGKSMRRFLYRLLFIALLLISQITLPVSFAIFLPNLFQADIPIEHNTQSERDLALGTALFGIITKITPSPLNSEQKKQLQQSPWRFVSSYTVKKATPLNTNTPTHAIEPLIFHVQINQQQLKAWLKEQNIAFWSNYRPLTLVWLSIDNDMQKLIVGDTDQLITQILNKTAKQYGIPLQFPKADVRDLEQVSANDIWNFNTTALKKASKRYRPDIILAGRIFPTTTGWEASWHLITNHHHQALTWRSASEHLSGVLKTATAKLAQTLAKLYQNSQEEHQLTLQVHGIDHLQQYRNLTTYLSQQHMISQVQTRSIAADRVTLSIISNVNPQQLLKTLALSRKLITIEDQASPASWLNFRWQG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_129556571.1|2320440_2321151_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2321179_2321584_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777168.1|2321608_2322568_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209567.1|2322699_2323317_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126712.1|2323751_2324210_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209553.1|2324954_2325965_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	2.9e-58	42.2
WP_016209566.1|2326449_2327361_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209545.1|2327686_2331181_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209551.1|2331218_2332058_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.8e-45	45.0
WP_036777155.1|2332244_2332460_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209547.1|2332508_2333084_-	ribonuclease HI	V9M0C8	Vibrio_phage	1.3e-29	46.6
WP_016209540.1|2333080_2333419_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209568.1|2333587_2334577_-	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-18	32.7
WP_016209572.1|2334577_2335540_-	oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppD	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.7e-16	32.1
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WP_054300455.1|2337934_2338300_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|2338314_2338821_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212572.1|2338878_2339271_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2339400_2339766_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300461.1|2339822_2340131_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2340743_2341109_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|2341261_2341534_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|2342142_2342478_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|2342637_2344170_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|2344202_2345042_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211411.1|2345038_2345536_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_036779082.1|2345539_2346532_-	AAA family ATPase	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_155047091.1|2346646_2347993_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2348216_2349278_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|2349356_2350502_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_016211372.1|2356309_2357167_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|2357153_2358077_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_036778204.1|2358273_2359665_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|2359711_2360755_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|2360797_2361241_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|2361373_2362564_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|2362618_2362765_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|2363315_2364233_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|2364500_2364794_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|2364870_2365065_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|2366083_2367001_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|2367466_2368309_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|2368376_2369027_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|2369041_2370082_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|2370204_2371290_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|2371316_2372426_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|2372442_2372760_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|2372756_2373116_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300463.1|2373218_2375948_-	kinase	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|2376448_2377402_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212048.1|2379299_2379857_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_032126664.1|2380050_2380734_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126663.1|2381452_2381695_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP039209|2472676:2555387|DBSCAN-SWA
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP039209|2472676:2555387|2478929_2479748_+|WP_032126573.1|DBSCAN-SWA
MALQDLKNNIKELLLNIKRHEKSKFVSRDGVERNVNQVVDNATSIANKFAAKAKALGSKFLAKKNVKPEPVPDPSPSIDSAEDVEQIDSRSRVAVIKELLGQVDGLGSGRDSYTFLVGLQQKEAFWGKGSQKAYFHRDGHESLKAELVECLSACKEQILQDIRLSIENQAKSGEFKFGYGGSRYKLEVEGQFFSVSKRALQVCEIIKDPNPDFTVEAKFEAIKKIKAVALTYQPSFPWFRRLTGIGDTKESTNNFLAGLDCAEGCYNEPALG
>NZ_CP039209|2472676:2555387|2488454_2488676_+|WP_075274932.1|DBSCAN-SWA
MVLLNNIIEIFDLDNVYHHSGNTIINSCYIARDNYGIQTGMKLRDAFKICPQLIQRASRPNRYTDISGILPIG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036779389.1|2476688_2477408_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|2477590_2477797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779393.1|2477796_2478033_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|2478045_2478423_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|2478929_2479748_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211812.1|2486619_2488233_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
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WP_054300202.1|2488984_2489713_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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WP_016212195.1|2494107_2494494_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212196.1|2494490_2494736_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_016211051.1|2516091_2516595_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
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WP_016211049.1|2520231_2521194_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_016211056.1|2521237_2521990_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210615.1|2524071_2524542_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
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WP_036777984.1|2524845_2525295_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|2525515_2526940_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
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WP_081007053.1|2534152_2535013_+	HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_016212641.1|2540337_2540784_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155049821.1|2548516_2548705_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047219.1|2548751_2549480_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_032127022.1|2550156_2552343_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	6.6e-47	29.9
WP_087910645.1|2552404_2553558_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_075274943.1|2553843_2554368_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.5e-05	33.1
WP_129556588.1|2554558_2554726_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_075274944.1|2554670_2555387_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	3.2e-43	44.8

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP039209|2570728:2598915|DBSCAN-SWA
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MSQKRKKPSAEFKTKVVLEVIEGDQTLNQICSKYELVGTVAKSYREFQKGYFLVLATLELSS
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MPLLVYTELGDMSISPVFANRPSAKQFANYLNADVEAALAKSSINYVINKSQSVSGYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047224.1|2590657_2591134_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036778088.1|2591118_2592201_-	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.0e-20	27.5
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WP_016210066.1|2595989_2596658_+|protease	modulator of FtsH protease YccA	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-28	44.1
WP_032126425.1|2597101_2597698_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210052.1|2597718_2598915_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	8.2e-07	24.4

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP039209|2628131:2680591|DBSCAN-SWA
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MRTYLDLMQRVLETGAEKTDRTGTGTLSVFGHQMRFDLSAGFPLLTTKKLHLRSIIHELLWFLKGETNIAYLNENKVRIWDEWANAEGDLGPIYGAQWRSWAGADGKTIDQMTQVIEQIKINPDSRRLIVSAWNVAEIEKMALPPCHALFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTLMIAQVTGLEPGDFVHTLGDAHLYSNHLEQVKTQLQRDCRGLSMMKINPEVKDIFDFKYEDFILENYDPHPHIKGAVAV
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MVGKSTFLTVIMLFPLNFISAMAMDMYIPSIPDLLVLWPDKALWVQGSLGIFILAVGLGQIVVGPLSDALGRLKIIYSGFFLYISASVLTALSPSAEWLVGARFIQGMGACCCMVAANAIVRDIYEDERGAQVMSYISSAVALAPVFAPFIGSYLSWQMTFWVLAGCGVLLCLQMLLGLQETCVRRQVNLLNFKSCLAVYRQLIFHRQFFLHSIISLCSFSILFLFFSFSPYLLIDQLGLAKTEFGYWFGLNALVLMVMSFIGGFGVKYVSIRFWMGLGVLCMLVGGFTMMIWLYCSTSVSLTAIMLPMFMISTGIAWTVSPAVVGAMMPFGHIAGSAAALLGCIRFAGSALLVTLMMTLGPSSAVYFASCICSLALIALFGCIFIIKSRQTVVY
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MTETDQSSQELEFNENEHIAQRKAKLAEMRSQGVAFPNDFRPEHHAAQLTAEFDEKTKDELEALAYPVKVAGRIMLRRLMGKASFLHIQDSTARLQVYLRRDDLPEGQYHAFKNWDLGDIVAIEGVMFKTNKGELSVKASNLRLLTKALRPLPDKHHGLAEVETRYRQRYLDLIVNDESRNAFIIRSKVVASIRRFLTERDYMEVETPMLQVIPGGASARPFITHHNSLGLDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFEINRNFRNEGLSTRHNPEFTMLEFYQAHADYHDLMDLTEQMLRTVATEVLGQAQVPYQGEVYDFDQPFVRMSMIDSILHFNQDIHREDLVTLASAIAVAERTGVKLKGHEGRGKVITEIFEATVEEQLRQPTFITEYPAEVSPLARLNDNDPFITDRFEFFCGGREVANGFSELNDPEDQAERFKRQVAEKDAGDAEAMHYDADYITALEHGMPPTAGEGIGIDRLVMLFTDSSSIRDVILFPHMRPQQDLRIDNKI
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MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
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MRKIILFLSIALITSSGWATGSSTDSSKFQQWSEKAKTATENAWEKTKSGSQSLWNKVHPKKSDS
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MQNVRFGRYLFLVIILAAVGQFANTIFVPASSLIANSLHTRPTHVQSLMAAYLLSYGASQFFYGPFADRYGRRPTILLGLLIFAIGTIIATFALNIQTLLLGCFVQGLGIGSAGAMIRTVMRDLFTGKELLKANSIMSATLVIAPIIAPLIGGLIATLIGWRAVFAFLLAFSAVVFALQFKFFAETHPAPDNAPTPFNALIRQYKSMLCHRQFIGYITCLTVSIAGITVFEASAGVLFASTLHYSPNTVSLLFIAPLPGYFIGSYLATHLNHRHSIPHIMKTGISALILGSVSMLALAHFGYFNAYAIVIPMFFYFIGAGLMFPLATTGALIPFGHIAGAAGAFIGAIQNLGSGVFTTLSALIPQNNAEPLAILLCMLTLITITAYYSCIASHQETTEI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556590.1|2629989_2630385_+	nucleic acid-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036778479.1|2631354_2632080_-	D-Ala-D-Ala dipeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211759.1|2632325_2633513_+	S-methyl-5-thioribose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016210935.1|2634089_2634632_-	acireductone dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_036778484.1|2635318_2635930_-	methylthioribulose 1-phosphate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016210944.1|2635976_2636996_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210936.1|2637097_2637892_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	5.3e-103	69.0
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WP_016210937.1|2642130_2642412_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_016210940.1|2642503_2643691_-	multidrug effflux MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	6.4e-20	25.2
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WP_016210981.1|2664321_2664960_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP039209|2695363:2746382|DBSCAN-SWA
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MFTDVFEKTLAESKEAQNWLAEATKEVFSLQQAMMADWAEWTRVSSVRSSSVKTVEEWVDLNLSSISELTQRSSKAMLDSVTMVSTFAAKNPFYQVKGREEKISKKKTS
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MDMSNSKTKKLKTGVIIAGAAAALMLAGCVGPGTKPASQSGPVKCSGINSCKGTSECATAKSACKGQNKCKGTGWVFAKSADLCKKKGGVVLSAGASNSSLAAVDASENLASLDDNKAYRR
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MPKQAPKYPAIVKAIKVLDKYYQVNCPPDQYRALEEAALLLDDKMRHIRDSGKVIGVERIAIMAALNLAHDYLKNMNHRDDYIDDVNQQLEQLEHKVKQALRFSSEKEI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210168.1|2696430_2697114_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210164.1|2697189_2697969_-	DUF2063 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126297.1|2697955_2698816_-	DUF692 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210177.1|2698940_2699306_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210175.1|2699691_2700021_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300188.1|2700334_2701894_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A1B0V854	Salmonella_phage	9.9e-37	50.4
WP_155047232.1|2702139_2703201_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211784.1|2703754_2704477_+	aquaporin family protein	M1HH19	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-26	35.8
WP_016211783.1|2704468_2704834_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126294.1|2705114_2706392_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211782.1|2706991_2707174_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2707235_2707601_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2707546_2708122_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047233.1|2708118_2708760_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210766.1|2708848_2709292_-	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_032126291.1|2709295_2709805_-	lipoprotein signal peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210756.1|2709797_2712611_-|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	A0A167RAL2	Powai_lake_megavirus	1.3e-76	26.5
WP_051307336.1|2712749_2713676_-	bifunctional riboflavin kinase/FAD synthetase	A0A1V0SJE1	Klosneuvirus	9.4e-11	34.5
WP_036778399.1|2713833_2715372_-	murein biosynthesis integral membrane protein MurJ	NA	NA	NA	NA
WP_016210764.1|2715545_2715806_+	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
WP_016210763.1|2716114_2717359_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210755.1|2717462_2718191_+	SIMPL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210761.1|2718294_2719032_+	tryptophan 2,3-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300187.1|2719386_2720169_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307321.1|2720231_2720780_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209980.1|2720866_2722033_-	aspartate aminotransferase family protein	A0A1V0SKB7	Klosneuvirus	1.7e-25	26.7
WP_032126286.1|2722338_2725137_+	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4P767	Pseudomonas_phage	4.9e-180	45.1
WP_016209981.1|2725195_2726416_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta	A0A1V0EEL7	Caulobacter_phage	8.5e-36	28.7
WP_016209998.1|2726445_2726847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209994.1|2727513_2727801_+	4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_016209985.1|2727957_2728296_+	integration host factor subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016209995.1|2728330_2729968_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016209992.1|2730069_2731119_+	WD domain, G-beta repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209988.1|2731191_2731836_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556662.1|2731832_2733080_-	UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_016209986.1|2733085_2734375_-	ubiquinone biosynthesis hydroxylase UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209989.1|2734399_2734990_-	UPF0149 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209996.1|2735134_2735359_+	TIGR02449 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209991.1|2735339_2735669_+	cell division protein ZapA	NA	NA	NA	NA
WP_033923658.1|2735894_2736458_+	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016209997.1|2736492_2736954_+	EVE domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209977.1|2737030_2738716_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-26	29.6
WP_032126288.1|2738765_2739566_-	3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase CysQ	NA	NA	NA	NA
WP_016210000.1|2739592_2740141_-	ADP compounds hydrolase NudE	NA	NA	NA	NA
WP_016209993.1|2740270_2740663_+	ribosome-associated heat shock protein Hsp15	NA	NA	NA	NA
WP_016209990.1|2740719_2741124_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556594.1|2741156_2741924_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047234.1|2742389_2742533_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2742576_2743551_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_155047235.1|2743570_2744557_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212415.1|2744647_2745394_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275004.1|2745518_2746382_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP039209|2765005:2800609|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210577.1|2769020_2769311_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777784.1|2769376_2770975_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-08	64.3
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WP_036777781.1|2771468_2773133_-	ubiquinone biosynthesis regulatory protein kinase UbiB	E5ERK4	Ostreococcus_lucimarinus_virus	5.4e-33	28.5
WP_016210581.1|2773129_2773774_-	SCP-2 sterol transfer family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210572.1|2778080_2779838_-|tRNA	arginine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_032126277.1|2780060_2780651_-	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049840.1|2780739_2781159_-	DksA protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273416.1|2781299_2781914_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212327.1|2781974_2782760_-	extracellular solute-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|2783013_2783352_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007003.1|2783311_2783773_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2784145_2785120_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212084.1|2785401_2786418_+|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_032126534.1|2786417_2786933_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_016212085.1|2786974_2787448_-|tRNA	tRNA (uridine(34)/cytosine(34)/5- carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)- methyltransferase TrmL	NA	NA	NA	NA
WP_155047236.1|2787503_2788046_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212310.1|2788069_2788525_-	DUF21 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046996.1|2790298_2792812_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046997.1|2793746_2796269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|2796843_2797905_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2797931_2798507_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2798452_2798818_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046755.1|2798889_2799066_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|2799456_2800609_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP039209|2925477:2989609|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_30

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MSLNQVNVLEACKSASVLWKNSFNNQDASGCAQQYSEGATMLAKPFGVFEGREQIQLFWQGIIDQGFNNVEYHDTEWLKEGEDGYLLTSKWSMNKAHGLIHKEHWRIQADGAALLEYDEFEVL
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MSNLLQHIQNFLHELRKSERKVGEWVLNNSQAVIHLSITDLARYAEVSEPTVLRFCRNIGCQGYQDFKLKLAQSLVSQPKTPITLTEITAHDTSTSLKEKIFQGAAIALQNAQHDIDASILDEAIATILAARRVGIFGFGASGVVAQDALHKIFRLSIPAIACMDSHMQSMTALMLSQGDVMLAISRSGRTKEIIESVNLAKNAGATVIGITSHGTPLANVATLGLTTAATNDTELYTPMTSRLIHLSIIDALAIGIAIKRKHTISEHLSRVKEASAIKKFQQE
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MPIIKPIKLDEGGVAHQNQDVVFATSGSYGDSLVSHAAIIARSNAGYGLFHTTGTSKESSVEARAALDQWLKELKEVLGSQITFTTMDPHNLSYLYQKGLEESCKKLGVSARFSSEGQVQISPRQPVGIDHSGIMVGGESLLRKIEQGPRQELFYEVEAAKPEGALEQGLRFIAEELVEQAEFSEPDPFAEQEPELPKEIKVDELEADLGQVLAIDNEVEIHQGPRLEGEEELYSSQKSSLVDAAALEEEKAGDLEDSLGQEVGLSEFHQGGDSAGLLGSAERLQKFAPEEEDDVFKSGWLAGDSFSLSLSSDELELQQTDGSELTEEFLESPESLQGDLATEWSGTFEPGRLDDNPFSLSSLSDEPEQCVTAEVSSECSEQLETLQEYVLEDVAVQEKSALVLMEDLLEEAILKEGAGLSAGEEPIIIKEGHFQPVSLELVEITDSCKLVSALSKLTQNTIAELEATVASASYFFSWNDPDSSKGSIKELKAFQMLLNAEGIDGSLNDKPIELIELAVGDYCANKVGCKDTQIISSFLKKVAKVLGNFRVAPCAGTSSVQDEDGGGWTRVGGISEVESAVDGWTNVDVVSSESEPAATGRAVMDEGDEFELVGQIPQSASLFQERHNAVDQQSSASNMSQSYPQ
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MPPFLKTVFLLICSNTIMSFAWYGNLKTEQHKAFWIAILTSWGIAFFEYIFLIPANRTGFLDAHLSLAQLKIIQEVISLSIFVPFAIFYMKQTISWNFLWAGFCLAGAVYFIFK
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MAFAAKQRMILNSEKICDLIITEKMTVDQTLQLKLEQRITLESQAIYELVSRGKITVDQTLQPLRAMEC
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MAKDKENNSDFLSAYEKGALAGNDPRCVPITLDTRMLIGKKFPELEYSVEQHNTWQTLFKRQIKILENRASEDFIKGITALGLPADHLPSVHKINEKLHTFNDWQVGYSPGLLAGAQFIAALAKRVIPSTNYIREPHELDYTPAPDMFHEIFGHMPLITNPYFSEFFQDFGKASLNADEKTALKLERFYWFTVEFGLIQETAGTRIYGAGILSSYNETLHCLSDQVEKKPFKPTDLANQDYDVWHMQPLLFVIESYEQLKTEFHDWAKYELKIL
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MQRNMPKSTPKIIKLKNDQYEKIHHFRFLKNDNKARIWTSKYQVRCSTAQKIISDYCKKKKPLYILSGSHDNKSGENAITNKKLKEQSFFLEDKECYETISPRIKIIDITMLTKKEYKSLIRNTARDALLFYCYSRNDTVVKEALRCASPEALYTRETPPPTP
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MNDTARYQAGRRATLIGAGLNFCLAVLKIVVGLFGRSHALVADGIHSFSDLICDFFVLMAARYGMSEPDQDHPYGHGRIETVATVVLSIFLITLGVGIGIDAFYSLVQGSDARPDSYTLIIAVISIVVNEGLFRYTLKVADQINSDLLRANAWHSRGDSLSSLIVLIGIIGSLLGWSFLDAVAAIIVALMIIKMGMTWGWRALKELIDTALPEDQVADIANAIRAIPHVLAVHDLRTRKMAGYVLLDVHILIHPYISASEGHFIAEQVRAGLMQQFASIRDITVHVDVEEHAHDLNIVKLLSRDQINHDLMPVWQTILGVQQPVDFMLHYLQEKVIIDLYLPNKVIKGADAIIAQLQNSVSNYPDVEKLRAFLKVKA
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MKTVFLDQGSVRPRDLDWSKLNDSIGGQFVSYDHTSAELTVERAQGAEILITNKVILGTDEFKCLPQLKLICVAATGVNNIDLVAAKAAGIAVTNVPAYSTESVVLYTLSLMLSLYSASGRYHKKVMAGAWSSSLHFCLSDFCFSELAHKTLVIFGYGDIGRRVAEVARALLMNVVIAERPGQPVRQGRVRFEEALKLADILSLHCPLTAETKNLITAKEFALMKASSYLINVARGGIVNEVDLAEALIDQKIAGAAIDVLSIEPPPEHHPLVLAAQQLDNLIITPHVAWASMDARQRLIDEIALNIDAFRQGQSRNVVA
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MKQSANTIAAIDLGTNSFHLIIATIADKTGEVEILQRSRERVQLGAGFTAEGHLDSPALQRACQCLKHFNSELKATNVLKVKAVGTSALRDAKNQHEFLIAAERVLGYPIDIISGEEEARLIYLGVLSSFEQNQERLIIDIGGGSTELIAGFGSHIHALTSLDIGCLRYKELFFKDGQLTEQAFQAAIHAAYEQIDPIIDKFHGLNWQGAWGASGTIQSVVQVIKQLNLTEAIDLNALHTLKTLILKHQHVDELQFKGLKPERRTIFPSGLAILIAIFSRLQINHLSTAKGALREGLIHVLRTEVTKATKETNNLH
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MKKSIHPKYENLSVECSCGNTFTTRSTLTKSDLQIEVCSACHPFYTGTQKVLDSGGRVDRFKQRYARFGKKD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211161.1|2927034_2928144_-	histidinol-phosphate transaminase	A0A142C026	Faustovirus	2.5e-18	23.8
WP_016211154.1|2928155_2928800_-	maleylacetoacetate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016211163.1|2928818_2929805_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211162.1|2929884_2930961_-	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211156.1|2931163_2931988_+	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016211160.1|2932304_2933309_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211155.1|2933517_2934483_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047242.1|2934621_2935497_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211700.1|2935793_2936846_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211698.1|2937113_2937542_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923654.1|2937755_2938247_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|2938302_2939553_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|2939655_2939874_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|2940331_2941186_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|2941240_2941711_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|2942098_2943478_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|2943505_2943964_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|2943941_2945159_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|2945350_2945587_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|2945600_2945756_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_016210731.1|2945836_2946799_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|2946958_2948275_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|2948284_2948953_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|2949315_2951130_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|2951247_2952036_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211543.1|2952616_2954368_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|2954378_2955179_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|2955281_2955770_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|2955943_2956258_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|2957278_2957623_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|2963316_2964279_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|2964465_2965725_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|2965948_2966275_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|2966469_2967420_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|2967477_2969544_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|2969549_2970545_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|2971130_2972711_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|2972867_2974277_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|2974336_2975470_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|2975609_2976434_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|2976661_2977291_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|2977627_2977999_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|2978302_2978590_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|2978741_2979590_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|2979717_2980758_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_155047244.1|2980830_2982768_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|2983051_2983711_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2983865_2984840_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|2984915_2985935_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|2986333_2986543_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|2987417_2988500_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_054300161.1|2988547_2989609_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP039209|2997494:3111414|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP039209.1|WP_016209540.1|2333080_2333419_-|hypothetical-protein	2333080_2333419_-	112 aa aa	NA	NA	NA	2320440-2382783	yes
NZ_CP039209.1|WP_016209990.1|2740719_2741124_-|hypothetical-protein	2740719_2741124_-	134 aa aa	NA	NA	NA	2695363-2746382	yes
NZ_CP039209.1|WP_129556594.1|2741156_2741924_-|hypothetical-protein	2741156_2741924_-	255 aa aa	NA	NA	NA	2695363-2746382	yes
NZ_CP039209.1|WP_155047234.1|2742389_2742533_-|hypothetical-protein	2742389_2742533_-	47 aa aa	NA	NA	NA	2695363-2746382	yes
NZ_CP039209.1|WP_016212372.1|3055319_3055541_+|hypothetical-protein	3055319_3055541_+	73 aa aa	NA	NA	NA	2997494-3111414	yes
NZ_CP039209.1|WP_155047252.1|3055656_3056235_+|hypothetical-protein	3055656_3056235_+	192 aa aa	NA	NA	NA	2997494-3111414	yes
NZ_CP039209.1|WP_155047253.1|3056379_3056574_+|hypothetical-protein	3056379_3056574_+	64 aa aa	NA	NA	NA	2997494-3111414	yes
NZ_CP039209.1|WP_155046758.1|3089773_3089905_+|phosphatase	3089773_3089905_+	43 aa aa	NA	NA	NA	2997494-3111414	yes
NZ_CP039209.1|WP_155046759.1|3090049_3090205_+|hypothetical-protein	3090049_3090205_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2997494-3111414	yes
NZ_CP039209.1|WP_155047254.1|3092242_3092380_-|hypothetical-protein	3092242_3092380_-	45 aa aa	NA	NA	NA	2997494-3111414	yes

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_054300283.1|1091657_1092299_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_054300283.1|1091657_1092299_-|hypothetical-protein
MPQAYPTSNNEQQSNNFPPPSSTTSSSATASNLPLEQIKTQPASKTVKNLGDSITYDQLLHLIKQETQKSIFILAKKIKNAKLPFSTLFEDTSGRKTGIQVLEEFIKDILSHSNQGHPHQPLTQALGELVHERVKSFYEDDGKMKGRRKTETISMLFSEIKRMFQNITYANAAVSRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1091443-1091480	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1133394-1133431	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1135955-1135918	1

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1091443-1091480, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1133394-1133431, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1135955-1135918, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_098082828.1|1140274_1140532_+|transposase

>NZ_CP039209.1|WP_098082828.1|1140274_1140532_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1091443-1091480	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1133394-1133431	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1135955-1135918	1

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1091443-1091480, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1133394-1133431, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1135955-1135918, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_098082828.1|1199032_1199290_-|transposase

>NZ_CP039209.1|WP_098082828.1|1199032_1199290_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1091443-1091480	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1133394-1133431	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1135955-1135918	1

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1091443-1091480, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1133394-1133431, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1135955-1135918, mismatch: 1

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttgatccagcgct	Protospacer
***************************.**********

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155046970.1|1433369_1433618_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155046970.1|1433369_1433618_-|hypothetical-protein
MNILTDLLRICYQGFKMHVRNFLQNTIRKLREYENSSPSFLKFLGSDTPELRAARRGYAHDLKVILEATERDCETYGASFFI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1358997-1358960	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1381084-1381047	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1415162-1415125	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1541319-1541282	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1358997-1358960, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1381084-1381047, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1415162-1415125, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1541319-1541282, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_075273543.1|1443746_1443989_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_075273543.1|1443746_1443989_-|hypothetical-protein
MYEYELSTECCTSDDGGRFPISLTLLLPALSFAFTMAPSRIITQNHYKMKKVSAESQSNNPLLREKQRIWFSNIKHPEES

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1358997-1358960	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1381084-1381047	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1415162-1415125	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1541319-1541282	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1358997-1358960, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1381084-1381047, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1415162-1415125, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1541319-1541282, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047156.1|1536253_1536877_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047156.1|1536253_1536877_+|hypothetical-protein
MILTGPIGTAIGASLILITCGIQYWLNHYFLPKKEIQLATDPLELLHLKLDSHIDAQIAKFTKALDQLGEGSEKAQTELKLQTYMAAKAELESWQTMPDRNSHSDKLHQAMSLAMDASKICRRGNGAPSSYKALKAELKYFTVDWQDRYKQTQIKFNPLLKDFLSSSKIKPSAENDRMTSLIFQDSFIADGAVSGASGVFSAPASLV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1358997-1358960	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1381084-1381047	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1415162-1415125	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1541319-1541282	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1358997-1358960, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1381084-1381047, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1415162-1415125, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1541319-1541282, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047155.1|1569531_1569681_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047155.1|1569531_1569681_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSQLRSAKNPNLPRPTHPVLSTPWLAACAGFPG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_032126537.1|1581711_1581897_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_032126537.1|1581711_1581897_+|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGLSGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLDGYLG

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047152.1|1582672_1583395_-|transposase

>NZ_CP039209.1|WP_155047152.1|1582672_1583395_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCLWPVRKVSFRVSCSGIETTFPVITTTWFKTESSKHK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016212013.1|1588165_1588549_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016212013.1|1588165_1588549_-|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_054300361.1|1601187_1601484_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_054300361.1|1601187_1601484_+|hypothetical-protein
MTNNEIEGLTPQQEEVVLLKNLLLESLDKLINSCKKSSVVLDFLGLPDVRHDSRFKRIETLIDNLLEIDTGNIIDHPELTERYIEHSPYAQVINILIA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_081377353.1|1601461_1602127_-|transposase

>NZ_CP039209.1|WP_081377353.1|1601461_1602127_-|transposase
MYEYELSTECCTSDDGGRFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGNGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016211151.1|1608979_1609291_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016211151.1|1608979_1609291_+|hypothetical-protein
MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1571087-1571050	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1571087-1571050, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016210146.1|1694307_1694799_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016210146.1|1694307_1694799_-|hypothetical-protein
MHQKEQITELLECPQELTLVKIVLLAGLEKVIANCLDRQSVVKLKIAEFFRLEVEAITEGSDSDESLSAELASLKMDKLKDILKKAACAFHQKSGLFTAKSYQVAKPYFEVLRELFGISDVEWKGILAHEANLDCEELSLQFYNKYMANKDDMASPGHLPTRP

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155046721.1|1696242_1696410_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155046721.1|1696242_1696410_+|hypothetical-protein
MKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1734748-1734711	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1734748-1734711, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_036781272.1|1780522_1780741_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_036781272.1|1780522_1780741_+|hypothetical-protein
MPMTTKERKRISNLLESWKTGKKKAAPNFDKLNLSEEGLTWAKAELEKLLSQQSKANTDLKQKLITHLTHRS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1801929-1801892	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1801929-1801892, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047136.1|1780833_1781265_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047136.1|1780833_1781265_+|hypothetical-protein
MHIFIDYFFLCYDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1801929-1801892	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1801929-1801892, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016212421.1|1791598_1791781_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016212421.1|1791598_1791781_+|hypothetical-protein
MLLKDLRFSVLRLLSDLYNHEKSKDGSTNDLNFLTKCKREAEEANSKQEIADLLNTHLTH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1801929-1801892	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1801929-1801892, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047131.1|1794349_1795006_+|transposase

>NZ_CP039209.1|WP_155047131.1|1794349_1795006_+|transposase
MARSERKSNISKNEYFRNLINHAINNQVKFDYTVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDSEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1801929-1801892	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1801929-1801892, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155049815.1|1943426_1943579_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155049815.1|1943426_1943579_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAHENILLMLIKIKSINLCYKLNIINNKKRQYHTTFILLLFVK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1943853-1943816	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1931928-1931965	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1943853-1943816, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1931928-1931965, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_032126179.1|1980084_1980336_-|TSUP-family-transporter

>NZ_CP039209.1|WP_032126179.1|1980084_1980336_-|TSUP-family-transporter
MSTALAFPMGLFALTSLLVASAGMAGLPSGSVGYLYLPALIGLLIGSFLGSPLGVWMVKRVSEQTSVWLFRIVLLAVIMQMIH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1981893-1981856	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	1971848-1971885	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2048012-2048049	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2062147-2062184	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1981893-1981856, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 1971848-1971885, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2048012-2048049, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

4. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2062147-2062184, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047097.1|2202661_2203345_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047097.1|2202661_2203345_-|hypothetical-protein
MGEIFVPKFNLLSVTGDQETVDNLLLSVKKRLYDKGTPLKNCYFNLQGQLLAEGWVYDSKTLIEVDLGGELKPEWYNEALSTAIEKIKKTEVSDKNYPAVNAHMLPFLKAYFFSYIEKALAKIDEEEGSLVQKLNAKLSFLSTLKSSFRAKFSGEWAHQFYFDHSSALNEVAGFDSEGECPQSYFALFNAFEAVGNKDRKAVTLALTLDKFSSTQVVCDNREIFSTE

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_129556569.1|2249166_2249376_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_129556569.1|2249166_2249376_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2244361-2244324	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2244361-2244324, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016209540.1|2333080_2333419_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016209540.1|2333080_2333419_-|hypothetical-protein
MSYPALIQQIDKLSKKYGFERHKMRFISGITDAETLAAERKLSHADAEGLIQQHGINGIWLAWLTDDGLLIEDECFKYIDELLAMPSYAEEWFDLVNGHEEIQKKEAQGLDK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2337909-2337872	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2341135-2341172	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2337909-2337872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2341135-2341172, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016209990.1|2740719_2741124_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016209990.1|2740719_2741124_-|hypothetical-protein
MYILVCYGGYPYHAAYVVAIFTGGSFVTQEVYAGDIDSLRLKVKGDFRIYKDLESFFDRSIECMQNKKAQIIILKPAIESNFSNLLIFESVIRKTRQSTLLMYESMEVDEEAPLVAGAEAMLHYYSELLRCTKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2707210-2707173	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2707210-2707173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_129556594.1|2741156_2741924_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_129556594.1|2741156_2741924_-|hypothetical-protein
MRKDGQRALLKNLKELIKEYNIQTIDALEQLKSDLLRESDSREFCKKYGIDYSPIEFTFHQGFYFLFNAANELNDQYPNDRNLIAYFTYRLSSQQQKAFEPVTNMLEIAKLAEDKIEGDCQLLEQGGNQPKAIKTFKEKAIKAVYKYVESTLAGPEHSNKAREEYQQSIKNCSEECKAALDDSSCERLRKVLKVLVNFLTHISLVGIVANIYHKHTTGSWLLFERKKESYDIQENLHGIQKISESAMQVNLYLSA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2707210-2707173	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2707210-2707173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047234.1|2742389_2742533_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047234.1|2742389_2742533_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	2707210-2707173	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 2707210-2707173, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_016212372.1|3055319_3055541_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_016212372.1|3055319_3055541_+|hypothetical-protein
MAKYHALFLQQDKHMHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYQHATNPEPESTTTTGCCAVL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3001564-3001601	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3012424-3012461	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 3001564-3001601, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 3012424-3012461, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047252.1|3055656_3056235_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047252.1|3055656_3056235_+|hypothetical-protein
MNFIIDFFKGQHQDHQKVLLPLASIKEDVVNAVDREKLTISPKDQYEFSLIRTNELFLEKIRALNLFDNIEDYLSAYNNIVAWDPKATESFSPPYLVAIQGAFLECCHESFKKKINISKEHSTEILANKWLYTAIMTVQQQSTAIEENYTTIKQRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3001564-3001601	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3012424-3012461	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 3001564-3001601, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
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**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 3012424-3012461, mismatch: 0

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Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047253.1|3056379_3056574_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047253.1|3056379_3056574_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIVANILRLRHLHSTQTAENQTIINDYSATVFRLFGEYCSKKIDNSALRHLKCNTQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3001564-3001601	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3012424-3012461	0

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Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155046758.1|3089773_3089905_+|phosphatase

>NZ_CP039209.1|WP_155046758.1|3089773_3089905_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3001564-3001601	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3012424-3012461	0

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Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155046759.1|3090049_3090205_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155046759.1|3090049_3090205_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAPEKYSPPSKTCLINSTIKLFQRVKPHWDYNQKNVYTCKAATT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3001564-3001601	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3012424-3012461	0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP039209.1|WP_155047254.1|3092242_3092380_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039209.1|WP_155047254.1|3092242_3092380_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVSYSNLLMSDNFVISYKVYDDFIAVIIIL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3001564-3001601	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	3012424-3012461	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 3001564-3001601, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039209 position: 3012424-3012461, mismatch: 0

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2. NZ_CP039211

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1924 : 46091	55	Streptococcus_phage(18.18%)	capsid,protease,tail,integrase,transposase,head,portal	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039211|1924:46091|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAATCAATGAATGATTGGGTTGTATCTGCATGCTTGGAAAAGTTAAAGCATGATCAAACCGTTAAACGGTGAATTATGTTATGTACAGCTATTAAGAAGTTATGTTTTTGCATTTTTCTTATAAATAAGATAAAACCCTTTTGTTTGGAATTACTTACATTAGGGAATGTTACCCATGTCAAAAAAAATTTATAAAGACGACTGTCAAGAACGACTTGATACACTTCAGAAAATATTTGATCAACAGAGTTTAAAATTTATAACAGATAAGCTTGATAAGAAAAATTTAAAGTTGCTTGAGTTAGGGTGTAGAGGTAATTGTGACTTAATTATCGCACTTGCAAATAAATACCCCAATCTGATCGAGTACACTGGGATTGATGATAATCCAAAGTTTATAAAACAAGCTGAAAAACGCTTAAGTGATATTCCGTTAAAGTCTTTAAAATTAACTCATGCAATGATAACAGATGTTAGTGGTCTTGGGTTTGATCTTTATGATGTAATTTATAGCCGCCTTTATTTTATGTATATTCAAAATTATGTAGAGGCTTTAAAACAAGTTTTAAATCAACTAAAAGTAGGCGGCATTATTATTTGTGAAGAGCCAGATTTAAGAACAAACTTTTGTAACCCTGCGCATGTCGCTTATGATGAATTTCTTAATTTATTTGGAGCTTTAGGTAAAGTTAAAAAAATGAACTTTAAAATTGGCTCTGAGCTACATACAAATTTTCTAGAGCTAGGGTTGAAAATTACTGATATTCAATTTTCTCAGCCGGTTTTAATGGATGAAGAGAGAAAGCGCTTTATGGACCTCAGTATGACAGCTGCTCGTAATGATTGCATTGAGTATGGGTTAATTACGCCGGAAAGATTTGATGTAATGATAAGCTCGTTAAAAAGGCTTTCAGCTGATGAGCGCTACTATTTTGCTATAGCACGTCAAACCCATATTTCTGCAATCAAAGCTTAAAAAGAGTCGAGCAAGCCTAAAGATTTTGCTTTCATTACAGTATGTAGCTTATTTTTGCAAAGCAATCGCTTTTGAGCTGAGGCGAGATATTTTTCTACCACACGGGGAGTTACCCCGATCGCTTTTGAGGTGTCTTTAGCATTTAAGCCATTAGCGGCCCAATATAAAACTTCTTTCTCTCTTGGGGCTAAAGAGTATGAATAGGTTTCTTTCCTAAGAATTTCTTTCATATACGAGTAGTCCTGTATAAATTTTGTTTGCCCTAAATATGCATGTTCATTCGCAATTTTATCTTTAAGGTTATAAATAAAGGTTGATGCAAAAGTAAGGAATTCTTCTTTAGTCTCATTGTAATGTGTTTTTGGATCAATAGGAGCAATAGCTGTATGAGCTAAAATCATAACTTCAATTTCAATAGAAGCTCTAAATATTGCATAACTTTCATGGATGCCGAATTTACTGCAAATGTTGTATATATATTGTTGTTCGGGTGTTAATTGCAATAAGCCTTGAAAATAAACATCTTTGCCGAGTATTAGGTTCGTACGTGGTGATGTTAAAGAGTCAAAGTTGAATAGGTTGTTTTCATAGTAAGGAATGGACCACTCAGACATGTTGGAAATAAAATAAGGACTACCCAGAGCTGGAAATAGACCTACACATATATAATCAACTCCACAATTAGTATGAATATCTGATGTAATATCCTTTATGTATTCATAGTACTTAATACTAGAAATGTGCTTATACTTGTTTAACTCACTTTTTGAGTACTCGCTCAACGACTTGAAATTAATTTTATTATCCATTACTTATGTGATATTAAAGTTCTCTAGCTTTTTAAAGGATTCTTTGTTTGATAAATACCAAACAATAATTATCCCGAAGATAATGGCTAACGATAGGTATGTACCTACAATAGCCGGAGAATGAAACTGATGGAGAAGTAACGTACATACTAATGGGGCGGTCCCTCCGAAAATTGTCATCCCTATGTTCCAAGATACGCCAAGATTTAGAGCTCTACTTTTTTCTGTAAGTTTCATAATAACAATGCTGTTAATCATAGCGGTTGGAGGTGAAAGAAGAAATGTTATTGCAATCATTGAAATTAATGAAGTTGTAAAGCTACCACTCGCTAAGCCAGAGAATAGGCTAGGCATACATAGAGCAAAGGGGGTGGACCATAGCAAGAATAGCTTTGTATTGCCTACCTTACTTGCGACTAATCCAGCTACAGGTTCAATAATAATATCGAGCAATAGCCCAACAGATATAACCAATGAGCTTTTACTTATAGATAAACCATGACTGACCATTAAGCTGGTACCCCAAACATACACACCCCAGCTAGTAATGCCGTTGTATGCTGCTAAAATTAGCGCTTGCAGAGAGGGGAGTGAACAAATATTAAGTTCTCCCCTCAATGAGCCTGATTTATTTTTTATAAAAGTGTAGTTTTTCATGTTACTGCGTAGGTAGTAACATAAGATTGCTGTGATCCCTGAGACAAAAAAAGGAACTCGCCACGCTTCTGGTGGCATATATGATGCAGTAAAAAAGCTTCCAATTGACGCCCCTAGCATCATACCGGCACTGTTAGAAATATTAGGCAAACAGCCGAATAGAGCTTTAAAACGTGGTTTTGCATTCTCAACAAGATAAACTGACGCAGTATTGTATTCAGCACTAGCAGATAAACCTTGTAGAGCTAATGATAAAGCCAAAATAATAGGAGAAAAAGCACCTATTGTTTGATACTTTGGCAAAAAAGCAATAGTTGATGTAGATATAATCATAACCAGCATAGAGCCCATTAAAGCTGATTTTCGACCATATTTATCACCGATATAGCCAAATATAATCCCACCTAGTGGGGAGAATAACCAGGCCAAACCAAAGGTTAACCAGGTAGAAATTAAAGCAATATAAGGTTGATTTTTAGGGAAAAATGAAACTGCAATGATTGGTGATAGAACTGCATAGAGAGAGAATTGATACCATTGCAAAATAGTGCCAAGTACGATTGCACTGTTTGTTTTTATATTGTTCATTGAAGTAGCTATAAGTCCTATTTATGTTGCCTAAGCTGAGATAAACCCAACAGAATGGTGTATTTTTACACTATTGAAAAATATTCATCAACCTGTAAATTAATATCGAACATAAAAGGAGCAGGTTAAAAAAGCAGTTTATAACTAGATATTAAGTAAAAATGGATTTTATATTGATAGCCGTAAGAATTAGCAAAAGGATTAGGTTGCATTTATGAAAATAAGGATTGATGAAGTACCAAAAGAGAAAAAAGAAAAGCACTCATTAAGCGATAATAAAATTATTAAAGACCTTGAGGAATTGAAAAGTCTTATAAACAAGATAAATTTTATTGCTAATAAAAGTGTAAAAAAATAATAAAAACAAACGGATAAATCAAGCGTGAAAAAAGGCATCAAGGGACTGAATGAAAGAATTTTTTTTCTACTAAGAAACTTTGCCTTTAAAAAAATATTAGTTAGTACAAAAGGTACTCAATATCGTTGGAACAAAACAGAGTATGATTATCTATCACGTAGGCATATTATTCACTACACAAAAGGACATGCCCGTGTAACTAAAAAAGATTATGCAGCCCAAATACAAGCTGACTCTGATTTTATTAAGGGGTTTAATTATACTGACAGCCAACTAATTCATTGGTACTCAGGGTATGATATGGGATATCAAAAAGGAAGAGATGAGGGAGTGTTAGAAGGTTGGAATTTATTAGTTAACACATTAAAAACAAAGAAAATTAACAAAGATACTAAGTTGAAAATGACAAGAAGAAAAAAAAGGGTTAAAAAACAAAACAATGAAAGTAATATTTAAGTTTTTATTTAATCAATTTATGAATACAGATAGACGTCCATATAAATTTTATTCTTTATTGGCAATAATTCTTGCTGCGGCTATGATAGCGTCAAATGTTTTAGCAGCTAGATTTATTGAGTTAAATGAAATTTTTGGCATTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYKDLNTQQLNIKNRIAKIEEVEAQEREINSLSSEPLRAGVQSPTDNTPINPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTDSTTELPMADSYGAATWTGDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPIGVTAAAPTSITLDDILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA
>NZ_CP039211|1924:46091|25952_26219_+|WP_016211142.1|DBSCAN-SWA
MNQLSQELSLSEFNEWLAYYSLEPFGVEKDDHRTALMVSAVVNGPLQRKDKTLFTPNDFMPNYSAGDEKKTQSATDMAAILSAIAKRQ
>NZ_CP039211|1924:46091|15442_15844_+|WP_052047121.1|DBSCAN-SWA
MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAVKKQATFRISVAVYNSFLSKGVSYVRGCLNRPPSSEVQHYPTLSGHKIL
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MDNKINFKSLSEYSKSELNKYKHISSIKYYEYIKDITSDIHTNCGVDYICVGLFPALGSPYFISNMSEWSIPYYENNLFNFDSLTSPRTNLILGKDVYFQGLLQLTPEQQYIYNICSKFGIHESYAIFRASIEIEVMILAHTAIAPIDPKTHYNETKEEFLTFASTFIYNLKDKIANEHAYLGQTKFIQDYSYMKEILRKETYSYSLAPREKEVLYWAANGLNAKDTSKAIGVTPRVVEKYLASAQKRLLCKNKLHTVMKAKSLGLLDSF
>NZ_CP039211|1924:46091|31190_31940_-|WP_036780292.1|DBSCAN-SWA
MDLSALLKKTKNKAKKAPVSKRQRVNIAADDRPYDLDIEEKEIQSKLSQHALEVEVKSDLIDENRTQTVHKVNTNHAQEEVVRKTVLSENALEVEVKSNLIDENRTQTVHKVNTSRTQKEVVRKTALVEHASEVEVKADLIDENRTQTVHKVNTNRTQEDIKVSAPDVNLLVGVQKDIFMFIYKQASYHKDRVTRPLTLVEISQKVGCKVGAVKTSVARLKEKNYVMRYEYKNGRGGWTRYKVLSEPRR
>NZ_CP039211|1924:46091|10886_11192_+|WP_016211079.1|DBSCAN-SWA
MDKKQAKTIADAIVNEDVLPFLKSLQPKMVSDEVFLAFCQTTILTLANTMYKFCDDFEEFENKPLWIDSVKKSLHQGIDKFFPASLLISQNYTSDSLQKTH
>NZ_CP039211|1924:46091|6762_7410_+|WP_036780005.1|DBSCAN-SWA
MKVIFKFLFNQFMNTDRRPYKFYSLLAIILAAAMIASNVLAARFIELNEIFGIALPYHMVFPGGIFAFPLTFTIFDIVTQHYGKEYSNALVWYNMIGHGLFVAFISIALHITPMVSHTIDQSFHISMSTLSHLYWAACIASACGYLMNNHLLEWLREKFKRHDDKHEITSFIFRSITSTWIGELTFSIVWTLLFLSRHLSGANLVDILICQTFSA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|1924_2899_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_080664851.1|3101_3911_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211068.1|3907_4720_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211075.1|4723_5965_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047030.1|6179_6323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211069.1|6347_6779_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780005.1|6762_7410_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300594.1|7557_8583_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211077.1|9015_9801_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211067.1|9933_10677_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211079.1|10886_11192_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780299.1|11346_11649_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211080.1|11687_12674_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0S2MVA0	Bacillus_phage	4.3e-14	45.4
WP_036780304.1|12714_13251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047314.1|13219_13582_+	hypothetical protein	R9TNL4	Vibrio_phage	2.9e-24	53.8
WP_155047315.1|13574_13922_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210963.1|13918_14158_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923627.1|14253_14541_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047311.1|14537_14840_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126916.1|14827_15298_+	single-stranded DNA-binding protein	L7TJL2	Pseudomonas_virus	1.5e-33	48.8
WP_052047121.1|15442_15844_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126915.1|16022_16406_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.7e-25	45.5
WP_155047310.1|16492_16975_+	hypothetical protein	Q9B019	Phage_GMSE-1	1.1e-13	33.3
WP_155047309.1|17203_18133_+	hypothetical protein	A0A1W6JP18	Morganella_phage	1.5e-85	52.0
WP_155047308.1|18152_19127_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	8.3e-26	31.5
WP_155047307.1|19170_19767_+	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	2.0e-38	45.3
WP_054300593.1|19763_21005_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.7e-85	43.6
WP_081007077.1|20952_21624_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.5e-45	45.8
WP_155047306.1|21679_22846_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	1.2e-66	38.7
WP_036778347.1|22881_23463_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274765.1|23782_24094_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_075274764.1|24090_24414_+|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274763.1|24406_24802_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
WP_075274762.1|24798_25149_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047305.1|25148_25571_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274761.1|25572_25896_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|25952_26219_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047313.1|27807_28161_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_155047304.1|28887_29019_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|29289_30315_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|30621_30885_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780292.1|31190_31940_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211377.1|31963_32986_-	AAA family ATPase	A0A1V0DZZ0	Clostridioides_phage	3.2e-12	27.5
WP_032126388.1|33746_34772_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212288.1|34866_36117_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|36293_37268_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_027242955.1|37516_37777_+	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_036780061.1|37769_38123_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.1e-12	35.8
WP_017375910.1|38399_39128_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_144420837.1|39514_40447_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|40588_41317_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_036779013.1|41346_43419_-	S9 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_155047303.1|43748_44750_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-29	33.2
WP_081007075.1|45095_45437_-	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126152.1|45500_46091_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	1.4e-20	33.8

3. NZ_CP039212

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	19432 : 32633	15	Erysipelothrix_phage(25.0%)	tail,terminase,head,transposase,protease,capsid,portal	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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>NZ_CP039212|19432:32633|21692_23375_+|WP_155047321.1|terminase|DBSCAN-SWA
MIKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIEDDTFFGIIYTLDKEDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMADDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHSSIYNERELFIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|19432_20407_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047322.1|20741_21134_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.4e-26	47.2
WP_016212234.1|21210_21690_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_155047321.1|21692_23375_+|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.9e-137	45.7
WP_155047320.1|23371_24094_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	2.6e-40	40.8
WP_052104629.1|24224_25250_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047319.1|25452_26073_+|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	5.5e-39	50.9
WP_080664855.1|26020_26692_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.0e-43	44.8
WP_016211140.1|26749_27943_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-66	40.1
WP_155047318.1|28063_29398_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|29588_29900_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|29896_30220_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|30212_30608_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7
WP_155047317.1|30687_31524_-|transposase	IS3 family transposase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.9e-42	36.7
WP_054300271.1|31658_32633_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7

4. NZ_CP039210

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP039210_1

• CRISPR_ID: NZ_CP039210_1
• CRISPR_location: 125192-125415
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers
• Cas_protein_info: RT

Consensus repeat of NZ_CP039210_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP039210_1

>1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039210_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP039210_1

>merge|NZ_CP039210|1|125192-125415|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP039210|1|1|125192-125415|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP039210.1|WP_081377350.1|121354_122170_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP039210.1|WP_155047013.1|120878_121025_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039210.1|WP_155047285.1|130524_130782_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039210.1|WP_155047299.1|135471_136830_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|350771
NZ_CP039210.1|WP_054300202.1|114532_115261_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039210.1|WP_155047284.1|117109_118138_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039210.1|WP_036774631.1|131915_132380_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039210.1|WP_105962623.1|118417_119571_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP039210.1|WP_016212014.1|114021_114435_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP039210.1|WP_105962623.1|115327_116481_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP039210.1|WP_155047286.1|136919_137486_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239737
NZ_CP039210.1|WP_017375910.1|134559_135288_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039210.1|WP_054300202.1|125903_126632_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP039210.1|WP_075273826.1|119530_120658_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP039210.1|WP_080963647.1|132718_132889_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP039210.1|WP_016211890.1|126835_129412_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP039210.1|WP_017377658.1|137489_138176_-|Fic-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225718
NZ_CP039210.1|WP_036780064.1|122415_123006_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP039210.1|WP_036771347.1|129528_130506_-|IS5-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|290455
NZ_CP039210.1|WP_016211879.1|123960_124980_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP039210.1|WP_075273826.1|119530_120658_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	2e-50	166.1	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP039210.1|WP_081377350.1|121354_122170_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP039210.1|WP_105962623.1|115327_116481_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.3205e-84
NZ_CP039210.1|WP_155047299.1|135471_136830_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|350771	cd18013, DEXQc_bact_SNF2, DEXQ-box helicase domain of bacterial SNF2 family proteins. Proteins belonging to the SNF2 family of DNA dependent ATPases are important members of the chromatin remodeling complexes that are implicated in epigenetic control of gene expression. The Snf2 family comprise a large group of ATP-hydrolyzing proteins that are ubiquitous in eukaryotes, but also present in eubacteria and archaea. The bacterial SNF2 present in this family are members of the DEAD-like helicase superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	2.71429e-84
NZ_CP039210.1|WP_054300202.1|114532_115261_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039210.1|WP_105962623.1|118417_119571_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	2.3205e-84
NZ_CP039210.1|WP_155047286.1|136919_137486_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|239737	cd03768, SR_ResInv, Serine Recombinase (SR) family, Resolvase and Invertase subfamily, catalytic domain; members contain a C-terminal DNA binding domain. Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. Resolvases and invertases affect resolution or inversion and comprise a major phylogenic group. Resolvases (e.g. Tn3, gamma-delta, and Tn5044) normally recombine two sites in direct repeat causing deletion of the DNA between the sites. Invertases (e.g. Gin and Hin) recombine sites in inverted repeat to invert the DNA between the sites. Cointegrate resolution with gamma-delta resolvase requires the formation of a synaptosome of three resolvase dimers bound to each of two res sites on the DNA. Also included in this subfamily are some putative integrases including a sequence from bacteriophage phi-FC1.	3.48507e-50
NZ_CP039210.1|WP_017375910.1|134559_135288_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	2.26977e-51
NZ_CP039210.1|WP_054300202.1|125903_126632_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP039210.1|WP_075273826.1|119530_120658_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	4.35291e-98
NZ_CP039210.1|WP_080963647.1|132718_132889_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	4.0743e-09
NZ_CP039210.1|WP_016211890.1|126835_129412_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP039210.1|WP_017377658.1|137489_138176_-|Fic-family-protein	gnl|CDD|225718	COG3177, COG3177, Fic family protein [Function unknown].	9.0877e-19
NZ_CP039210.1|WP_036780064.1|122415_123006_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	2.06134e-23
NZ_CP039210.1|WP_036771347.1|129528_130506_-|IS5-family-transposase	gnl|CDD|290455	pfam13737, DDE_Tnp_1_5, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	3.06507e-32
NZ_CP039210.1|WP_016211879.1|123960_124980_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33

Protein sequences

>NZ_CP039210.1|WP_016211879.1|123960_124980_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP039210.1|WP_036780064.1|122415_123006_+|site-specific-integrase
MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWDMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP039210.1|WP_081377350.1|121354_122170_+|hypothetical-protein
MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF
>NZ_CP039210.1|WP_155047013.1|120878_121025_+|hypothetical-protein
MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP039210.1|WP_075273826.1|119530_120658_-|hypothetical-protein
MEPTETSSSTETKLERIAWLSAVDPGKVFNQVMHHFNLDSLLQCFYELNGKKAPGVDGVTKEQYEENLISNLLDLLDRMKRMAYIPGAVRLVPIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLKMNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFAFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKLIRLPYSGQINYNNPSRRNHNGKASRHQVHRRI
>NZ_CP039210.1|WP_105962623.1|118417_119571_-|IS3-family-transposase
MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP039210.1|WP_155047284.1|117109_118138_+|hypothetical-protein
MLSTPWLAAGVRYMSFFFDKMTIKSIIENNIFSPILELLCMSIMYPGLHISLDTENARFKGNPLYSLSGQSYFFCQEQGMEVDSHYISQQSSYEEIDWDKRYKFSFSEYRALTSTDKLQLTRLHAMRWNYGLLLLENYLPEMSPSNSRLLTEKKFVESPSENELLQKLYAGWFIYQVESQCAGISEATERLFKIEMDLAPNCELSKEKEIARKISLFRKSLNLLKARPENSNPRTIAAINNHELAILTSFIKYQLGQINQGDFEREIQTVEEQCAELLKDAPSKQFLKIAINILITCLTLGVANLVNKALTGEFLFFKNSEAKQLAVSVATSAASHGVLSTG
>NZ_CP039210.1|WP_105962623.1|115327_116481_+|IS3-family-transposase
MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP039210.1|WP_054300202.1|114532_115261_-|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP039210.1|WP_016212014.1|114021_114435_-|hypothetical-protein
MILIPNGYLIPALPQPSPNLFGIAAADLSGSQNAAVSITKDGFTVTAAGKACDGILQNTPKKSEDCEIICSGAVKATAAGAITAGDYVKVASNGQLIQAAAGDTATGAALETAKAAGDLIGIHLIPNGYLILAAPSK
>NZ_CP039210.1|WP_054300202.1|125903_126632_+|IS6-family-transposase
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NZ_CP039210_1	1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT	125349-125390	42	NZ_CP038882	Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence	93293-93334	0	1.0

1. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|125217|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|125284|40|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|125349|42|NZ_CP039210|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2012 : 167666	177	Streptococcus_phage(18.18%)	head,protease,integrase,tail,capsid,transposase	attL 115268:115327|attR 153748:154992

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039210|2012:167666|DBSCAN-SWA
GATGCCTTCTCCTTACAGTTATGACTTAAGAATTCGAGCACTAAAAATGATTGATGAAGGGATACTTATTACACAAGTTTCCAAGCTCTTAAAAATCAGTCGAGATACCCTGCATCGTTGGAAAAATAGGCGTGATCATACAGGAGACGTCAAAGCAAGGTTTGGCTACCAAACGGGCTATAACCATAAAATCAGCGATATGGAAGAATTTCAAAAATTCATTGATCAGAATCCGGGTAAAACTCATCAACAACTCGCTGATCTTTACCCTGTAGAAATGAGTGCAAAAACCATGGGAGTGTGGATTAAAAAATTAGGCTATACCAGAAAAAAAAGAGCTTCAGATACCAAGAACGTGATGCATTAAAGCGGAAAGCCTTCCTGGAAAAAGTCGAGAAAATCGATAACGACAAAATTGTTTATATGGACGAAGCGGGTATGGATGATACTGAGCGTTACGCTTATGGTCACTCTGCTAAAGGTAAACGGTGCTATGCAGAGAAGCCCGGTAAAAAATCAATACGAATTAACTTTATAGGTGGTTTGCGCGGCAAGCAATTTATGGCACCAATGATGGTTGAAGGTTATTGCAATGCTAACGTTTGTCAGGCTTATATCGATCAGTGCTTAATTCCCTGTTTATCTCCTGGAGAGACTGTAATCATGGATAATGCCTCTTTTCACAAATCAAAAGGGGTTAAGGAAGCGATTGAAGATGCGGGTTGTCACTTATTATTTTTACCCCCTTATTCTCCTGATTTAAACCCGATCGAGCATGTATGGTCACCGCTTAAAAATAGGGTTCGCATGAAGCTTGATCAAGATGAAATAAATTTAGAGACAGCGCTTAGTCAAGTAATGAAGTCAATGTCAGAAACTATTCGTTGAGCGCTATATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGCAATGGCTCAACCTTACGTGAAACCACCACGTATTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCGGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAACAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGGTAAAGCGCAAATCCCGTTTCCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGGTTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAACAGGATATCTGTGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGCAGCGAACATAAGAAAATAACCTTTCTGAAGCTCCCTATAACTTTTCGCAACAGTGCCGTTTTTCACATTTGGCTTCTTCTTGCTAATCTCTTGCAAAGCTTCTTCGCCACTCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCTCTTAGTCAGTCATATAATATAAGTAGCAGCCGGATTATCAAACAATTCAATTGGCCGGATATAACGATCTAGTGCAGCGGAACTGTGTTGACTCACCTGGCGTAACTTTTCCCCAGGCGCTCCATTGAGTTTTGCTTGCGTTAAAAAACCAGCTCTAAAACTATGAGGTGTATAACCTGATAAGCCTGAATGATTGAGATATTTATTAAGAATATGATCAACTGCACTACTCGACAGAGGTTTGTATTGCAACTGCTCCCCTTTTTTAATCTCTCTAAAAATGGAGCCTTCTTTAATGTTTGAGCGTTGAAACCAACACTGCATCAATGTTACCGGACAATATCGATAAGTTGGTTGTAATATGATAGGCACTTGCAGCAACTTTTCACCTGCCTGATTAATTTTATTACGCCCAAGATTAAATAGCACACCTTTGCCACTCACCCACTCAAAATCTTCAATATTAGCAGCCACCACTTCAGATTTTCTGAAGGCACCAAACCACAACCAAGATAACAGTGTTACATCACGTAATCCGGTTAATGTATTTTTATCAATCACCGCCAATAATCTCTCGAAGTCATTTTTAAGCAACGGCTTTGCTTGTTTTGGTCTGTAGTTATCATTGCGCTTGATTGCAAATAAGATGGCTTTGACCTGCATTGAGTCACTAAAACTCTTAAATCCCATCTTAATATGCTTGGAATTAATGGCTGCCAATGACTTTTGAATGGTTGTTCTTTTAAGATTTTTTTTCTTATACAGGTAGTGCAAAAAAAGTGCGACCGCTCCTTCATCCGCCGGTAAAGGGACTAAGCCTAATTTATAGCAGTAATTTTCAAAATCTTTCCAGGGCTTTGCATAGGCTGTTTCTGTGCTTTTTGCTGTTTGATTATCTTTAACAAATGCTTCAAGGTCTTTGAGTGATTGCAGTAACTCTGAAGAACTGTCTATTTTCATTAATTTATCCATACTGCAACCACAACCGATCTATACTATAGTTTATTTTTAGAGCCTTTCGATAGACCCACTTTTTTGGTGGTCGTTGTTTTTTTTTCCTTAGGCTTCTTTGCAACTACTTTTTTAGAAGAAGCTTTTTTAGTTGTTGTTTTACTCGTTACTGACTTTTTAGCTGGCTTATCATCATCTAAAATTTCACCCAACTTTTTCCAAGTGATTTTTTTATTGTTTAAGGTGATACCACTACTACTGACTGCTAACGTACCAAACTTTTTAGAACCATCTTTAATCTCAAAAGTCATTCCTTTTGCTTTAACGTCTAAATCGCCTAAGTTCAGTGTTACTTTCATAAAATAGCCTTTTATTTTTAAGTTATTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCCATTAACCTTAACTCATGTTACGCGCTTAACCTTTAAGCCATACTTCTAAGCTCCTGAAGTGCAATTTGATTAGCCCTTAATATCAGCTTATATTTTATTGCAAAATGGTTTAAAGATTTTTTCAATTTTAATCTTTCCAATCTGCAAAACCCAAGAATACTGTAATAAATATGGTTCAACTGAGATGTGACAATCCGCGTAGGCGACTTTTCAAAGCTCGAATTTTGTTTTACTGACTTGTGAAATTCCTCAATACTCCAGCGTTTTTTATAGGTATCCAGGATGGGTTGGCCATCAATACTCAAGTCATTAGTTACTAGATATAAGACACGTTCCTTACCATTTTCGTTTTTGAATGTTTTTTTCATAACCTGTACTTTGAAAGCCATACCTTTTAAGTACACAGTCTGAGGAATGCCGTCTTCTAATGATATTTGCTTTAGTTGTTGATGCTTACCATTCTCTTTATTTTTTTCAGTCAGTGCGACACATCGATTACTTTTGATTCCCATGATAAATTTCTTTCCAGCATTGTGGATATAGCTCATATTTGATTGACTGCTAAACCAGCGATCTGCAAGCACATATGTAAACTTTAAGTCGTTACGAATAGCGACATTCAGAAGTTTTAGAAAAAGGTCATTTTTTGTAAAAGAAGACTTTCTTCGTTCTTTTTTGGTTTGAAGGTCACTATAACGAATCGTTTTCTCTATCACTTCATAAGCGATAGGCAAGCGTACGTCTCCGTAGCGCACCATCGCTGTCAAGATATTAATGCCCTTCACTGTTCGACCTTTACTATGGTCATAATGCCAGGCGATAATATCATTTTCATCGCTGTAGGGTTTTTCAGCAATCATATCATCCAAGGCTAAAACTCCATCATCAAGTCCCTCATACTCACGAACATCAGTCTTAATTTTTAACCAAAGGCCTTTTGATGTTTGTGGGGCTTTATTCAATAAGCGAGTTATCTGATCATGTGACAATTCGTCAGGCATTAAATCTGCTAATCCGGTAGCTGTTGCATGTTTGTTTTGAGCGATTAGATAGTCTGTGTATATGTCAGCAAGGTTTAAC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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211871.1|37267_37603_-	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_129556699.1|37596_37797_-	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300590.1|38104_38329_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_059372613.1|40807_41434_-	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	1.8e-21	33.7
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WP_016212410.1|42588_42762_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556499.1|44339_45492_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
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WP_016211910.1|47779_48052_-	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
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WP_016211912.1|48588_49179_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
WP_129556698.1|49268_49970_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_054300249.1|50083_50449_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126637.1|83719_84013_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
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WP_155047281.1|86340_86670_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	5.5e-06	36.8
WP_155047018.1|86737_87541_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.9e-55	45.2
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WP_075273327.1|87872_88448_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
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WP_016212061.1|89663_91706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274748.1|92475_92676_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047246.1|92816_93791_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.9e-25	30.0
WP_016212579.1|95287_95485_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|96084_97059_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
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WP_129556709.1|102553_102643_-	DUF1891 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274745.1|104720_105449_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.2e-37	42.2
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WP_036781349.1|106405_106732_+	potassium ABC transporter ATPase	A9D9Y1	Lactobacillus_prophage	1.1e-11	36.6
WP_054300202.1|106847_107576_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_016212154.1|108735_109113_-|transposase	IS3 family transposase	Q716C2	Shigella_phage	1.2e-17	46.0
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WP_016212156.1|109562_109715_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047298.1|111107_111293_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212019.1|111679_112375_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.2e-41	42.9
WP_105962690.1|112843_113119_-	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_047927838.1|113115_113361_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047016.1|113390_113618_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300202.1|114532_115261_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
115268:115327	attL	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|115327_116480_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_155047284.1|117109_118138_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|118417_119571_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273826.1|119530_120658_-	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.9e-18	30.3
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WP_081377350.1|121354_122170_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780064.1|122415_123006_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.0e-22	38.3
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WP_075274742.1|124992_125874_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|125903_126632_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_036771347.1|129528_130506_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
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WP_036774631.1|131915_132380_+	hypothetical protein	H6WFS7	Cyanophage	2.9e-21	38.2
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WP_017375910.1|138423_139152_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
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WP_027242576.1|140458_142321_-	AAA family ATPase	A0A088C4M0	Shewanella_sp._phage	1.0e-56	30.9
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WP_155047289.1|143563_143740_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155047291.1|147666_149697_+	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|152593_153747_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273751.1|154096_155827_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
153748:154992	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_155047293.1|156481_157207_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155047014.1|162116_162458_-	hypothetical protein	A0A1B1IQX9	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-21	60.3
WP_054300202.1|162676_163405_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_155047295.1|164519_165581_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|165610_166693_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_032126362.1|166779_167145_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|167090_167666_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6

Anti-CRISPR protein detection

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NZ_CP039210.1|WP_032126838.1|16647_16851_-|hypothetical-protein	16647_16851_-	67 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212257.1|17187_17412_-|hypothetical-protein	17187_17412_-	74 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212260.1|17431_17704_-|hypothetical-protein	17431_17704_-	90 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212398.1|22141_22603_+|hypothetical-protein	22141_22603_+	153 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212408.1|41891_42341_-|hypothetical-protein	41891_42341_-	149 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212499.1|42966_43341_-|hypothetical-protein	42966_43341_-	124 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016211913.1|46332_47454_+|hypothetical-protein	46332_47454_+	373 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212298.1|52922_53249_+|hypothetical-protein	52922_53249_+	108 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212579.1|95287_95485_+|hypothetical-protein	95287_95485_+	65 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_155047016.1|113390_113618_-|hypothetical-protein	113390_113618_-	75 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_016212014.1|114021_114435_-|hypothetical-protein	114021_114435_-	137 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_155047013.1|120878_121025_+|hypothetical-protein	120878_121025_+	48 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes
NZ_CP039210.1|WP_155047019.1|155839_155992_-|hypothetical-protein	155839_155992_-	50 aa aa	NA	NA	NA	2012-167666	yes

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_129556706.1|8175_8805_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_129556706.1|8175_8805_-|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_032126838.1|16647_16851_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_032126838.1|16647_16851_-|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212257.1|17187_17412_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212257.1|17187_17412_-|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212260.1|17431_17704_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212260.1|17431_17704_-|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212398.1|22141_22603_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212398.1|22141_22603_+|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPARLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212408.1|41891_42341_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212408.1|41891_42341_-|hypothetical-protein
MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212499.1|42966_43341_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212499.1|42966_43341_-|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016211913.1|46332_47454_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016211913.1|46332_47454_+|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212298.1|52922_53249_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212298.1|52922_53249_+|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212579.1|95287_95485_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212579.1|95287_95485_+|hypothetical-protein
MFSKTKVPLIISIGSVLVYFTILIFQVYSPPSFAKSYNKNPVGCEKLGKQAEELCVERINTMEEV

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_155047016.1|113390_113618_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_155047016.1|113390_113618_-|hypothetical-protein
MQQRAPGTTAAQADISYNFDNTYKCEQYALLVQAWCLGNTIEVVSDFKNKYLYHIELETKVSKGNHLKHFVLYFI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_016212014.1|114021_114435_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_016212014.1|114021_114435_-|hypothetical-protein
MILIPNGYLIPALPQPSPNLFGIAAADLSGSQNAAVSITKDGFTVTAAGKACDGILQNTPKKSEDCEIICSGAVKATAAGAITAGDYVKVASNGQLIQAAAGDTATGAALETAKAAGDLIGIHLIPNGYLILAAPSK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_155047013.1|120878_121025_+|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_155047013.1|120878_121025_+|hypothetical-protein
MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP039210.1|WP_155047019.1|155839_155992_-|hypothetical-protein

>NZ_CP039210.1|WP_155047019.1|155839_155992_-|hypothetical-protein
MKKTRADVEKALQKSRESGNGVSLSGAKLTDVTVSTTELKYAIFSNNFHN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	23925-23888	0
NZ_CP039209_1	Orphan	1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder	360382-360419	38	166754-166717	0

1. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 23925-23888, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 1.1|360382|38|NZ_CP039209|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 position: 166754-166717, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

5. NZ_CP039213

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	10318 : 26972	20	Indivirus(18.18%)	transposase,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP039213|10318:26972|DBSCAN-SWA
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MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLIVCQKLLIERYKGSSVLYGATKGAIATITKSLAIDFASSNIRVNSVCPGTIETPLYHNAVKSNSHKLNMTNDDLYNILKTSQPIQRVGLPEEVSNVIYFLNSGEASFVTGSLYSVDGGYTAQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036781073.1|10318_10579_+	cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system	A0A1S5NR91	Burkholderia_phage	2.1e-13	48.8
WP_081007079.1|10649_10922_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|11133_12020_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.8e-10	22.4
WP_016212315.1|13558_13993_+	DUF29 domain-containing protein	A0JC30	Ralstonia_phage	9.1e-25	39.7
WP_032126346.1|14092_14335_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047334.1|14401_14842_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	1.1e-06	37.6
WP_054300249.1|14802_15168_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047335.1|15182_15626_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	5.1e-07	25.5
WP_054300271.1|16635_17610_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_155047336.1|17606_17891_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047337.1|17909_18272_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211141.1|18271_18694_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275196.1|18695_19019_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211142.1|19075_19342_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275195.1|19345_21424_+	hypothetical protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	2.5e-56	33.4
WP_036776958.1|21416_21758_+|tail	phage minor tail family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210666.1|21754_22426_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|22394_23141_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|23130_23688_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_075275194.1|23684_26972_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2