Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046267 | Lactobacillus rhamnosus strain BIO5326 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,WYL,DEDDh,csa3,c2c9_V-U4,cas3,cas14j | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046267_1 | 968972-969117 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046267_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046267_1
>1.1|969015|60|NZ_CP046267|CRISPRCasFinder CGCAGACTTCTGCGCTGGGGAGCGCGTTATGGGCGTAAACCAGAATATAAGCGGCCTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046267_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046267_1 >merge|NZ_CP046267|1|968972-969117|CRISPRCasFinder GCGTGATGGCCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACACGCAGACTTCTGCGCTGGGGAGCGCGTTATGGGCGTAAACCAGAATATAAGCGGCCTTAAGCGTGATGACCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACA >NZ_CP046267|1|1|968972-969117|CRISPRCasFinder GCGTGATGGCCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACA CGCAGACTTCTGCGCTGGGGAGCGCGTTATGGGCGTAAACCAGAATATAAGCGGCCTTAA GCGTGATGACCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACA
>NZ_CP046267.1|WP_005688718.1|968329_968869_+|membrane-protein MLNRKSFGFDWGQFITGILFLIAAFVVLRYPLATLKTVTFIFAVVAIIRGIAILAGYSTLRQFTGKLAWISLLMGIFDLVIGLVFLLNAGFGMATITMMFAIWFLVDSVGSLFNVGHLRIAGTGWFILYLILDILAVIVSLMLFMQPVVAAVTLVTLLAMFFVLFGIECIVIAFARRNI >NZ_CP046267.1|WP_014571226.1|965233_968128_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MANDKIVIHGARAHNLKNIDVTIPRNKLVVMTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMEKPDVDSIDGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVGTVTEINDYLRLLWARVGHPICPNDGTPITSQSVEQMVDRVLALPEKSRIQILSPIVRRKKGSHKKVFAKIMREGYVRMRVDGEVMDATADYELDKNKAHDIDIVIDRIVVKPEARSRLFDSFEAALRLSEGYANVDVIGGDTLRFSEHFACPICGFTIGEMEPRLFSFNAPFGACPECDGLGVKLTVDMDLVVPDPSMTLAQGAIAPWNPISSQYYPELLAQAATAFKVRMDVPFKKLTKRERNVVLNGSDGKPFHFHYENDFGGVRDVDVPFEGVLTNISRRYAETNSDFTRQQMRGYMTALPCPVCHGKRLNRQALAVKISGRDIAEVSDLAIKDALPFFKQVHLSEAETVIAQPIVKEVVDRLTFLVNVGLGYLTLSRSAGTLSGGEAQRIRLATQIGSNLSGVMYVLDEPSIGLHQRDNDRLIASLKKMRDLGNTLIVVEHDEDTMRAADYLIDVGPGAGEHGGRIMASGTPKQVARVRKSITGQYLSGRKFIPVPLKRRPGNGKVIRLEGASDHNLKHINVDFPLGKFIVVSGVSGSGKSTLVNSILRRALAQKLNHNSEKPGPYDKILGYKNIEKLINIDQSPIGRTPRSNPATYTSVFDDIRGLFAETNEAKLRGYKKGRFSFNIKGGRCENCKGDGIIKIEMNFLPDVYVPCEVCHGKRYNSETLEVTYKGKNIAEVLDMTVEEATAFFKNIPKIRRKLQTIVDVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLASELQKLSTGKNFYILDEPTTGLHTDDIKRLLEVLERLVDEGNTVLVIEHNLDVVKTADWVIDLGPEGGDGGGQVIATGTPEEVAEVADSYTGQYLKPVLIRDTKRTKEAAAGSSKQAKATKTSTK >NZ_CP046267.1|WP_005688715.1|963037_965053_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MIERIADRKFDLVSPYKPAGDQPQAIAKLTKGFEEGKKAQILLGATGTGKTFTMSNIIANLNKPTLILSHNKTLAGQLYGEFKEFFPHNAVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTYIEKDSAINDEIDKLRHSATSALLERNDVIVVASVSSIFGLGDPHEYKNHVLSLRTGMTIDRNTLLRQLVDIQFDRNDIDFQRGRFRVRGDVVEIFPASRDDHAIRVEFFGDEIDRITEVDALTGEVIGTRDHVAIFPATHFMTSDEQMERAIKSISAELEDRLKVLRGENKLLEAQRLEQRTNYDIEMMREMGFTSGIENYSRHMDGRKPGEPPYTLLDFFPKDFTIMVDESHVTMPQVKGMYNGDRARKQMLINYGFRLPSALDNRPLKIDEFEKHVKRILYVSATPGPYELSRVPKEDIAEQIIRPTGLLDPKIEVRPVMGQIDDLVGEINKRIDAHERVFITTLTKKMAEDLTDYLKDMGIKVRYLHSDIKTLERTQIIRDLRLGKFDVLIGINLLREGIDVPEVSLIAILDADKEGFLRAERSLIQTIGRASRNEHGKVIMYADKVTDSMKAAIDETRRRRAIQEKFNEEHHIQPKTIIKPIRAAISTYEQSDDEKADAKKTFAEVDYEDMSKADKKELVANLRSQMQAAAKKLDFEQAASLRDTILELQADMS >NZ_CP046267.1|WP_072137695.1|962774_962900_+|IMP-cyclohydrolase MTRSPAQGSACKDLGRNGQERAITSKAAYTPTSNRAGSRSP >NZ_CP046267.1|WP_005688713.1|961997_962645_+|HD-domain-containing-protein MGMHQFIQGLSNLETLRRAPGFFKYQEHSVAAHSFKVAEIAQMLGDVEELAGNKVNWQMLYEKSLNHDYTERFIGDIKTPVKYATPTLRQMLADVEATMTENFIKNEIPHDFQDRYRRRLSEGKDETLEGQILSVADKIDLLYEGFGEIEKGNPEQVFLDIYSESLSTILQFKNRPSVRYFLDEVLPDMLDEKFASRDQLAKLTKETMAEHETGK >NZ_CP046267.1|WP_005688708.1|958374_959040_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAILTARQLTKQYAGEAHPALDHANLTIEQGEFVAIVGPSGSGKSTLLHLLGGIDQPTSGEVRLYDTDIYALNQTQLAIFRRRQVGLIYQFYNLIPNLTVAENITLPADLDGRSIKEAVLTEMLTTLGLVEKASALPNQLSGGQQQRVAIGRALINHPAVILADEPTGNLDRRNSQDVMTLLRQANIKQGQTLVVITHDPDIASQADRIVRIDDGVVSGGR >NZ_CP046267.1|WP_005688706.1|957264_958275_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MVKHAYWTMPETRQVFQLTAILIGILWTVLLLTSITVPDMRIWLVLVGGLATGISVWLTWCWARKFSYHFDQALLQLDMTKETEDNYLIDRNDEGLFSDFNNRLYHYARQMQAEREAIKRDRDHLNEAITDIAHQLRTPLAANSNLLEMMTESNWKTTRLALQAQQQHQAQLIEQLILLAKVDTHTLSQRREIVVLTDLGKAALSPFLRQIADKEITVDWQVPPALTINVNSVLVKEAFANVFKNAVAHTPVGGRMSVRGIGDPVRTRLMIMNTGQPIAAQDLPHLFERFYRGQYATANNVGIGLAIAAGITTANDGRLTAANTANGVQMTFEFFR >NZ_CP046267.1|WP_005688705.1|956624_957272_+|response-regulator-transcription-factor MTYLIIEDEPALGKTLQTYFSRDEEVWLAATLAKATTIVKTEHPALIILDLGMPDGDGLAWLKRWRAYLTAKVIVLTANDDESTTIAGLDLADDYVVKPVSLKVLKARIAKQLPGESQQFGAVALNLRTGQVTKNGKPVRLTSAEQRLLAYFFVNPNQILTREQLLAALWDTREQFVADNTLTVTIKRLREKLEDDPAKPTLIRTVRGMGYFIDG >NZ_CP046267.1|WP_005688704.1|954634_956362_+|phospho-sugar-mutase MSYRDTYQQWVDEPTLDPELKTDLKKMADDETTKEEAFAEPMAFGTAGMRGVLGAGIGRMNIYTVRQATEGLARFMDTLTDETKARGVAISYDSRYMSQEFAYQSAGVLGAHGIKSYVFDQLRPTPELSFAVRHLKTYAGIMITASHNPKQYNGYKIYGPDGGQMPPEESDKITKYARSADDLFAIKALNVHELRAKDLMQPIGEDVDEAYYAEVATVTINHDLIKTVGKNMSLVYSPLHGTGRIPAQMVLRNAGFENFRLVAKQSVADPEFATTPFPNPEFAQVFDLPIELGKKIGADVLIATDPDADRLGTAVKVGDHYQLLTGNQIASVLLHYILEARKQAGTLPKNGAVVKSIVSTELATAIAKDYGVDMINVLTGFKFIGDQIKHFQATGEHEFLFGFEESYGYLIKPFVRDKDAIQSTVLLAEVAAYYQSQGKTLWDGVQELYKKYGYYAEKTVGVDFEGVDGPKQMANLMTKFREEQPDDFAGVKIAKVEDFLSQEAKSADGTVEKLTMPSSNVLKYILADGTWIAIRPSGTEPKVKFYVGTKADTDAKAQEKLDAFEKALDAFRKEA >NZ_CP046267.1|WP_005684511.1|953435_954383_+|thioredoxin-disulfide-reductase MAKKYDVIVIGAGPGGMTAALYASRANLSVLMLDRGVYGGQMNNTAEVENYPGYKSILGPDLGQKMYDGATQFGAEYAYGNVISVQNHGATKLVKTDEDEFEAKAIVIATGAEHKKLGVPGEEAFSGRGVSYCAVCDGAFFKDRELAVIGGGDSAIEEGLYLTQMAKKVTVIHRRDQLRAQQIIQKRAFANDKMHFVWNAQVQEIQGDDMKVTGVKYRDKETGEEHVLPVAGVFIYVGIMPMTEPFQDLGILDDHGWIPTDEHMRTKVPGIFAIGDVRAKDLRQITTAVGEGGTAGQGVFNYIQSLNDTSVEVKA >NZ_CP046267.1|WP_005684522.1|969265_970153_+|RNase-adapter-RapZ MTESLDLVIITGMSGAGKTVAMQAFEDLGYFCVDNMPPALLPKFWELVKESGKISKVALVVDLRSRAFYDQIIDMLANLDNNAYVHSRILFLDATDEELVSRYKETRRSHPLAMEGRLMDGIKKERVLLTELRNRAQVVIDTTTLSPRQLREKIFLNFKENNSQPAFHIEVMSFGFKYGLPIDADIVMDVRFLPNPFYIKAYRPKTGLDPDVYDYVMDNEDAESFYNKFYALLAEIMPKYKAEGKTSVTIAIGCTGGQHRSVAFAERIGKAFSDAYAVDITHRDIKKHKETVNRS >NZ_CP046267.1|WP_005688720.1|970149_971178_+|uridine-diphosphate-N-acetylglucosamine-binding-protein-YvcK MSRETKFIRVIRGRRPKVVVIGGGTGLPVILHSLHEQDADVTAIVTVADDGGSSGTIRNYINVVPPGDIRNVLVALSELPSLYLDIFQYRFNTTDAFFAGHAIGNLIIAALSEMKGGIFPAVQQLSEMMQVDGHVYPASNTPLTLNAEFTDGTKLSGEAEITAAGKNIKHISVSETDPANGEPKAVQEVIDAIMDADVVVLGPGSLFTSILPNLMIGNLGDAVKKTKAEVIYIVNIMTQKGETQNFTDADHVRVLNEQMGENFVDTVLVNIEPVPDNYLDHQKYNEILTPVKHNYQGLRDMGCRVISEDFLKLRDRGVFHDGDKVAKEILNLAFQVSAKTRR >NZ_CP046267.1|WP_005684524.1|971182_972130_+|DNA-binding-protein-WhiA MASFASIVKKELTQLEVHPEHAKAELSALIRMNGSLTLMAHRFVLNIQTENPAIARRIYSLIRQVYHHEANLVVHRKMKLKKNYQYIVRLTEGVNDILSDLAILDPTTMAISTTVPASVLKEPQRMRSYLRGAFLASGSVNNPETSRYHLEIYSLYADHNAGILKMMNHFHLNARTVERRSGYIVYLKEAEKIADFLQVIGATNAMLKFEDIRIVRDMRNSVNRLVNCETANMNKTIDAAQKQIENINYLKDHVGLDNLPTKLREIAVLRLAHPDVSLQELGAMVPGGTISKSGVNHRLRKLNQIAEGYQQPEDA >NZ_CP046267.1|WP_005684526.1|972981_973572_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MLVPTVVEQTSRGERAYDIYSRLLKDRIIMLSGEVNDQMANSVIAQLLFLDAQDSEKDIYLYINSPGGVITSGLAMLDTMNFIKSDVQTIAIGMAASMASVLLAGGTKGKRFALPNSTILIHQPSGGAQGQQTEIEIAAEEILKTRKKMNQILADATGQTVEQIKKDTERDHYMSAQEAKDYGLIDDILVNKNNQK >NZ_CP046267.1|WP_005684527.1|974767_975805_+|SorC-family-transcriptional-regulator MHTELAWLKAIAPDLMGVVTKRYQVLQFINWMAPVGRRTLAEQMKISERALRTETDFLRGQGLLESSKSGMVLTAKGLETFHGLDHLMNQLLGIKDDEKRLATHLEIDHCLVVSGDADQSSRVLDELGKTLNSTLQLLLPPGHLTIAVMGGTTMAHLASQLTFQLSAGRELSFVPARGGLGEAVTIQANSIAAAMAEATDSKYRALYVPENLSSESYESLIKEPSVKEVLTLIDKAQVVIHSVGDALVMAKRRGMSPDTIRMLKAKHAVAEAFGVFYDAEGKVVYKIPQIGLQLADLDHIPYVFAVAAGKSKAKAIAAYMQHAPSRTWLLTDVGATNSILTGATR >NZ_CP046267.1|WP_005684528.1|975841_976864_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTVKIGINGFGRIGRLAFRRIYELGAKSNDIQVVAINDLTSPTMLAHLLKYDSTHGTFPGEVSATDNGIVVDGKEYRVYAEPQAQNIPWVKNDGVDYVLECTGFYTSAEKSQAHLDAGAKRVLISAPAGKIKTIVYNVNDDTLNADDKIVSAGSCTTNCLAPMAYFLNQEFGIEVGTMTTVHAYTSTQMLLDGPVRGGNLRAARSAAANTIPHSTGAAKAIGLVIPELNGKLQGHAQRVSVVDGSLTELVSILKTKNVTADQVNEAIKKHTENNPSFGWNEDEIVSSDVIGTTYGSIFDPTQTEVTTAGDYQLVKTVAWYDNEYGFTCQMIRTLLKFATL >NZ_CP046267.1|WP_005684529.1|977046_978237_+|phosphoglycerate-kinase MAKLIVSDLDVKDKKVLIRVDFNVPIKDGVIGDDNRIVAALPTIQYVIDHGGKAILLSHLGRVKTEEDKAKLTLKPVAERLSELLKKPVTFVPATRGKELEDAIAKLNDGDVLLMENTRFEDLDGKKESGNDPELGKYWASLGDLFVNDAFGTAHRKHASNVGIASNMKQTAAGFLMEKEIKFLGDAVDNPKHPFIAILGGAKVSDKIGVIENLVPKADKILIGGGMTYTFYAAKGMSIGNSLVEKDKIDLAKKIMDQAGDKLLLPVDSVVAPEFSNDAPHKVVEGDIPDGYMALDIGPKTIQEFKDALKGAKTVVWNGPMGVFEMSNYAEGTLEVGRALGDLKDATTIIGGGDSTAAAKQLGIAPKITHISTGGGASLEYLEGKTLPGIAAISDK >NZ_CP046267.1|WP_005684530.1|978314_979070_+|triose-phosphate-isomerase MRTPFIAGNWKMNKNPKETQAFLDAVKGKLPDASKVETVIGAPAIDLTTLVAGAEGTPLKTAAENCYFEDEGAFTGETSPKALKEMGVDYVIIGHSERRGYFHETDEDINKKAKAIFKNNLLPIICCGESLAQREAGQTEDWVASQIEAALAGLSADQVKVSVLAYEPIWAIGTGKTATADQAQEVVAHIRATVEKLYNKDTADAVRILYGGSVKPANVKELMAKPDIDGGLVGGASMDPDSFIALANYQD >NZ_CP046267.1|WP_005684531.1|979117_980422_+|phosphopyruvate-hydratase MSIITDVLAREVLDSRGNPTVEVELYTEDGGFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKDRFGGKGVLKAVDHVNNEIAKAVIGLDVTEQRLIDQTMIDLDGTPNKGKLGANAILGVSLAAARAAADEVGLPLYQYLGGPNAHVLPTPMMNVLNGGAHSTNTVDFQEFMIMPVGAKSVREAVRMGSETFHALQALLKSKGDITAVGDEGGFAPNLKDNEEAFELLVEAIKKAGYKPGDDIALAFDVAASEMYDADTKTYTTKWSNPDKKYTTEEWTNMIDGYINKYPIVSVEDPIDENDWEGWQTFTEKMGDKVQIVGDDLFVTNTDYLKKGIDMGVANSILIKLNQIGTLTETFEAIEMAKEAGYTAVVSHRSGETEDTTIADLVVATNAGEIKTGSMSRTDRIAKYNQLMRIEDQLGAQSQYKGRKSFYNVKAID >NZ_CP046267.1|WP_005715969.1|980590_980965_+|hypothetical-protein MRKFFAIFAWLEIILGLAMLWMTFDVGLRATGPFFGALIVLIGIVLLYGLLIYALVGWFIDRQHWPWYVVTLVVTLIYNVLAWSFPKIMVQRWATYPFPMLTLILGCLMAWIAWREQSVTHKSV |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
837461 : 916285
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046267|837461:916285|DBSCAN-SWA GCTAAAGTCTAGAAAGTGCTTGTAGCGTCTGGGATACCTGCTCTTTTCTTTGATCTTCAAGAAGATGAGCGTAGACTTTTTGAGTGATCATTGTATTGGCATGCCCAAGTCTTTTTGAAATATAGTTAATGTCAACGTGATTGGCAATCAAATAGGAAACGTGAGTGTGTCTAAGCCCGTGGAAAGTAATCGCGGGGGAAATGTCTAGAGCCTTCTCGATCGTCCTTAGATCCTTATTAATTGCCGTGCTCGATAGCATGTTATGCCGTATGCTGCGAAATAATAGTTGTTTGCTATCACGATATCCCTGAGCAACGTATACCTCTTGCTGTTCCTTCTTGAGACGTAAAAGCAAGTCTGCAAGTTCTCTCGTGATGTCGATGTCACGTACACTTGATTTGTTCTTAGTAGCCGCAAAGCCGCTGCCATATCTGTGATCCCACGTTCTAGTAATGTGCACAACGTGTTTTTTAAGATCAACATGATCCCACGTGAGCCCAAGAACTTCAGAATACCTAGCTCCGGTCAGTGCCCCGGTTGCGATGATGTAGTAAGCAATATGCTCGTAGTCTGCAAATTCTAGGCAGTAATTGACGAGCTTGCGCAAATCCTTTACTTGCAAATATTTGATGATTCCTGCTTGGCCTTCATTACCAGTGAGGACAACGTTATGAGTGAAGTTAGTATATATTATTTGGTCATCGACGGCAGAATCAGCCATTGAGCGAACATAGCCATTCAATTTGCTGACTGTATCTTTAGCCCTTTTTTTGCCAAACTCATTGATAAATCCCTGCCAGTCTGATTTTGAAATTGATTTTAGTTCACGGCTTTCGCCCCAGTAGGCTAATAACTGTTTACGAATTGTTTTATACCGGGCTTCGGTGATACGAGAATGCTTACCAGATTTGTACAGCTCAATCCATTTGTCCCAGTAGTCGATTAACGTTATCTTGTTAAGATCCAAATTTGCACCGCGATTATGCTGACGTTCGACTTCGGTTGCCGCTATATCAGCAGCTTTTTTTGAGGGGAAGCCGCCTTTGTTGACATACTTGCGTGTTCCATCATTATCCTTGTAAGAGACACGATATTGCCATTTTTTGCCACGTTTACTAATACTGGCCACATTTACACCTCCTTGTGCTACAATACAGACGGGTGCTATTGCACCTAACCATGCAGTCACGTTCTGTTAGGCGTCTACCCATTCGCTTGGGTAGGCGCTTTTTGTCGTTACTTTCTCCTACTTGCTTTTTTCTTGTTAAGCGCCTCGTTTACGTTACTGAGTGGAATATCTTTGATGAATCGTTTCTCTCTAATTCTAGAAAAGGGGACAACGATCTTGTGGTTTAGTTCTGTTTTTTCTTTATCACTGAAGACTTCGGTGTTTGAAATGTCTAGGAGAACTGAGTGCTCATATTTTTTGATCGGTTCTCCTTCAAAATTTTTCCAGGTTTTTTCGCCAAACTTATAAGAGCTTACTGTAACTGGCTTCATAGGTTTTACCTCCTACAATCTGTGTGGCTTCTTTAATGTTTTGAAGAAGTAGGCGCTTTTCGTGATATAATTAAGTGAATGAAATTCATGAAAAAAGAAATTAGGTGAACCGTAATCATGATAAAGGAGGTTCTCCAAATGGAAAATGGCATATATATCGTTGACGAAAAAGACGAAGTATGGGATATCGACGAAGCATCGGGCATGTATGGCATGTTTTCAAGTAAGCCCAATATTGGGCCAAACGAGGTTGCTGCACTTTTGTCTGGTAAGGCCCTTGTTGATCTTTCAGATGGTGAATATATTCACTGGATTCAGCTAACACCAGATGCTATCAAAACAGCCAGATTGCGACAGTAGTTACGTTTGACAGAAACAACTGTTCCTCGACCACAGCGGCCGGGGCTTTTTTGTATCCAGTTCGCACTCAGTTAAATATTTCAACGTTTTCATCATGACCGGTGTCATCATCGCAAGCGGTTGTTGCGCCAGCCAACAAAACAATAAGTAAGATGGCAACTATCTTTTTTAGCATGATGACTCACATCCTTTACTTGGTATGTGGTACAAGCCCCACTCTCCGGCTTGCACGGGGACGCCGCTTGCGTGGGTTGTTGATGACAGTTGTACCACAGTTAAGTACTACACGAACATTTTCTGGAGATAGGCTTGCTTCAATTTTTTTAACAGTTCAACCTTACGCTGGTTGACTGCGATGAGATTATCAAGTTGCTTAAACATTGTTCCAATCAATTCTTGCTCAGCTTGAGTAGGAGTTGTAACTTCCACGGCATTGATTGTTTGTTTCGACAATGATGGTACACCGGTAGACTCGTCGTATTTCTTCCAGTTAACTCGTTGAAAAATCGCATACAGAAAATTTAGATCTTGTGTCCCCTTAGGTATCACATAGAACAACGTATCTACGGTCCAGTATGGAGCTCTTAGAATGTAGGGGGAGTTAATTGTACCTTTTCGCCCAATGCCAATGCCGTTTTCCTCAGATAAAGCCTGGTCGACACTTAGCATGTATCCGCCAGTTCCATAGACTGGAATGTCACCCTTGTTAAGGTGCTTGTAGTCCTTGCCACCGTTCACGGTAGCGATTTTCTTGATAGGACGCTTTTCCCAAGCGTCAGTAAATCCAGCAAATCTTAATTGTGGGAACTTGCTTCCATTTTTGGGGAACAATTTCTGCAAGTAGCCTTTTTTAAGTTCTTGGAGTTTTTCAAGCTTACGCTGATGAAGAGTGATGAGGTGGTCAAGATTATCGAAAAACTTACCAATTTGAACTTGTTCAGGTAATGTTGGAACTTTAAAATTAATCTTCATCATGACATCGGCGTTTAATTTAGCACGTCCACCGCCGACTAAATATGGTTCTATGTTGGTATGTTTCAATGCGTTCGTCAAAAATTTGTTGTCCACTCTTTCTTCTTTAGCTTGAAGAACGTGGGCATGATTGTTGACCCAAACCTTACCATCAACATATTGAACAGGGTAGTTTTGTAAATCATTCGCACCGTCTTCTGCGACCAAAACAAATTCACCATTATGAGTAAAACCTTCAACATAGTCCTGAATACCATTTGCACCGTAATAAGGTGTTTCCCCAGCTACACGTTCGGATGCTGTAATTGGAACTCGAAGATTATCATAGCGGTCTGCTAGTTCCGAAACCTTACGCTGTTCCCAAGCGTCAGTGAACCCCTTGAAGCGAAGCTCCGGTACCATTTGTTTATTTGTAGTCACGGTTGATTGTCACCTCTAAGCCGTTTATTTGTTGTTGACTAGATTGTATCGCGTAAGTAGGCCGACGCCGCGTCCTGATACTGTTGCGGGTTAGTTGATGACAACGCCTATGATGCTGATATCTTCGGGATCGAGGCATCTGTCGGGATACTTGTCATTCAGTGAGTGTAGAACAATTTTCTTTTGTTGATAATCGCGGGACAGCTGCTTGAATGTGACGCCCTCGTCGGCCACACGGCCAACGCCGAGATCGCCAAGTCCTTGCTTGTTAAGATACTGGGTGGCTTTCTTTGAAGCATTATCAAACATTCCTATGTCGATTTTCCCCCAATTTCCATCAGCTTTTAACGTCGATCAGGGTTTGGACGTAAGATTATTTTTTATAAAACGACTGTGTATACGACAACCTTACCAAATATAGCGACATTGTCTGCATCTTCATAACGATAAACGTATGGTTCAAAACGAGGATCATCACTGTCAGGCTGAAAAGAGACTACTTTAGCTTCATCGTTTTTATAGTAACGTTTGCAAGAAAAATCTTCATTGTCAATTGAGAAGACGACAATGTCTCCATTGCTTAGATCATCTGTCCGCTTTACTGCGAGAAGCGCACCATCAGGGAAAACTCTGTTCATTGATTCGCCGTTGGCATGTATGATAAGAATGTCATCATCACCAGCGTAGCGTCCCATTATGGCATCTGATAATTGGATTTCTTCCAAGTTGTCTTTCGTATAAGCTTCAACTAATTCAGGGGCACCACATGAAACCCCTGCATCTAAGTATTTGTAGGAGTGTACAGGCATAGATGGAGCAATATTTGAGATCTCTTTTTCTCCAGCAATCACAGAAACAGGAACACCGAAGATATCTGCTATGGATTTAGCAGTAGTCATTAATGGATAAGCAGCTCCACGTTCCCAAGAAGACACAGTGGTCGGAGCAACTCCCAATCTGTTAGCCAAATCAGATTGCGTCATCCCGCGGGTTTTTCTTAGCTTTTTTATGGTGTCTCCAGTATTCATTTCGTTTCCTCATTTCCTATTTATGCTGGCTATAATGTACACCTGTTGCGTAGAAAAGTACATACCTAAATACAATTTATTTGCAAAAAGCTATTGCAACTACTAACCATTCGTAGTATATTTAGTTTTGTTGAAAGGAGGAACGAAAATGACAGGAATTGAACCAGCTTTTACGCTTGAAGGAGCACGAAACAACTTGCATTTTTCACAGAAAGAAGTAGCGGAAGCGCTGGGAATGAGCACCAAAACCTATGCTGACTATGAGAAATATCGAAAAGTTTTGCGAACAGATAAAGCTTTTGAGTTTGCAAAGCTAGTTAAACTACCATTTGATTCGATTATTTTTTTGCCCAAAGACTACGAAACATTTGTAGTTGGCAAAAAATATTTGCTTACAAAGGGGGAGACGGTATGAACGAACTACAACTATTTCAGTTCGAGGATAACCAAATTCGGACTGTCAGCTCAAACGGCATTATCTGGTTTTCAGCACCGGATATTACGAATGCGCTGAAACTAACAAACACAACGGTAGCGTTGAAATCATTAGACGGCGATGAGGTGACTAAGTTTAACTTAGGGGGCTTATCAGGCGAGACCAATCTCGCAACTGAAAAAGGAGTCACCAAATTGATGACCCCCGGTGGCAAGCAAGACTTTGTTACCGTCTCATAGTTGAAGAAGAAGACCAGCTGAAGTACCAAATCGGTACCTCAGGTC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89 | Lactobacillus_phage(82.61%) | protease,tail,portal,terminase,holin,tRNA,head,transposase,integrase,capsid | attL 817058:817117|attR 880591:880666 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1003708 : 1059296
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046267|1003708:1059296|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(23.53%) | tail,portal,terminase,tRNA,head,integrase,capsid | attL 997412:997427|attR 1053736:1053751 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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