Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039233 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed6, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039232 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP039227 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 0 | 2 | 39 | 0 |
NZ_CP039228 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP039230 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039231 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP039229 | Piscirickettsia salmonis strain SR1 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
17451 : 27915
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039233|17451:27915|DBSCAN-SWA AATGAGTGATAATAATGCTACTCGGCATGGAGAGTTTTGGAGAAGAGAGGCTATAGCATTCCTTGCCCTTTCTTATTTACAGGGAGTTGGTTTCTGGACTCTGCATAGGGTGGCAAAATCAGGTAGAAGCTTTCATGAGTTTTTAAAAGTGAGCTCTCCTGATGAATTGTCACGTGACTTAGGGGTAAATGTTAATTCTATCTTGACTGATCAAAGAGAAGGATGTAGCTGGGATGAGTTTTTAGAGCAGTTATGGCATATAGGCTTAGTGTGCGCCAGGGAGCTAAAAAGACAATCAATAGTCATGCTGTTTAGAGGGCAAGATGAGTTTCCGTTGAGTCTAAGAAGTATCGATGATTGTCCTTTTTGGATATTTGTTCAGGGTAATAAAGAGATTTTACACAAAAACGGCGTTGCGGTTGTTGGAACAAGAAAAGCGTCTGATGATGGTATTTTTCTGACTAAGTTGGTTGTTTCGTCTTTAGTAAATAAAAATATACCTATTGTTAGTGGTTTGGCTAAAGGCATAGATCAGGTTGCACATTTTGAAGCTATTAAATTTGGGATTCCAACCATAGCAGTTTTGGGGGCGGGAATTCTCGTTGATTATCCTAAAGGAACCTCCGAATTAAGAAACAGTATCATAGAGGGTGGTGGATGTATAATAACCGAATACCTACCCAAGCAATCATATAGCTCAGAAAATTTTGTGCGTCGAAATAGAATACAAGCGGCTTTGAGTTATGTTTTAGTTCCCACGGAGTGGAATATTAAAAGCGGAACTTCTCACACTGTTGATTATGCTTATAAGTACCAGCGTAAAATAATTAATGTGTTTCTGCCTAACTTTTATAAATTAAGACCAGAAATTGAATTTTCAGAGAAAAAATACAGTGCGGTTAGTTGTGAACTACCTACAGATCTAGATATATTCATAAAATATATTGACGGTGATCTTAGTTACGGTTTTGATAATAGACAGCAAGATTTGAATTTATAAGGGATATTTTATGTTAAAGGGTGTTATTTTTGGTGTAGATGGTGTGATTGTTCCAAATAATAGGTCTTTTGATAAAAATGATAAATTATTCGAAGAAATTAAGAAACTTTTGACTTTTTTAATAGGTAAGGGAATAAAAGTATCTATACTAACAAATAGACCATTTGAATATGTAAAAAAATCATTAGAAAGTAAATTTCCAGATATAAAGTACTACTCTAAAAGTATTGACCAAAATTTTTATGATAAAGCTAGCAAGCAGGCGAGTGAGGCTATTATATCAGAAATGGAGCTTAATAAGAATGAGGTTGTTTATATAGGGGCAAGTAAACAAGATATGCGTTCAGCAGTTAATGGTAACCTACTTTTCTTAAATGTAATGTGGTGGGGTAAAGGCACTGATTATGGATTTGATTTTGGGCAACCAAAAGATGTTGCAAAATTTATAGATATATTTTGTCTAAGAGAACATTTATGGTCATATAGCATTAATGATAAAGGGCTAGAAACTTATGCCCTTGCTCCATATAGTACAATGAAAGACGAGTATAAAAAATACTCTCATGATGCTAGAAATACAGCAAAGCATCAATCAGGAACACCATATTTCTGGGCCAGTGCGATAATTTCTAGTTTATATTTTAGTGGGTTATATGAACGTATTAATATCGTAACAATTTATCCAGGACATCAAAAAGGCTCTAGATCAAAAATACTAGATGAAGAGCTTTTGGCTTTTAGTAAGTGTTTTAGGATGTCATTCATACCAGAGCTAATAGTGAGACATACTACATCTCAAAAGTCTCAACGTGCAAGAAATCAAAACAAATCCCTTAATTTTTCCAATCAGCTTAATAGTATTCACTTACTCAAACTTCCAAAAAAAATTGGCAAGGATAATGATTACTATAAAAACAATCCGTTGAGGCGAAAAAAAGGCTTGAAAAGGGTAGTTCTTGTTATTGATGACATTTGTACAGAAGGCTTTAGTTTAGAGTCTGCAAGAACCTACTTAGAGCAAGCAAACACAGAGGTTATTAGTGTTGCTTGGTTAAAAACAATAAACACAAATATAAAAAGATTAGGTGGACTTAGCAAGTTTGATCCTTATAAGGCCAATCAAATGGATAATACTACAGTATCCCAGGAGTATGCATATCATGACTATTTTCATCATAACTTAGCACCAGAAGAATTAAGCAATATGTTTGAATTATATAATGTAACCTGGGATTGGCCTCAAGACCTAATTGCAAAGGCGAGTTAATGTTTATTTATTCAATGTAACTTTAAGAGTTATTTGACATTTTTCTGCAGATTTTTTATCCTGTATTACATAAATTGGTGGATCTATATCTAATCCACATTGATGATAATCTTCTATAAAGCCAGCTGTTGTTGGTTTTATTATGTCTAAATTTTACTTGATTTTGATAACTCTGTTTGTGAGATTACATATTGCCTAGACGCGCTAAGCAAGTTTGCTGTTATGCCGGATGTCATCACATAACCTATGCACGTTACTGTGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATACCCCACGCAAGACAACTGCCCAGCGTGGTTATGGGGGGCGGTGGCAGCGTGAGCGTAAGATGTTTTTACAAGATCATCCGCTGTGCAAACACTGCTTAAAAGATGACAAATTAATCCCTGCGACTGAAGTGGATCATATTAAACCGCATAACGGTGATCATGATTTGATGTGGAACCAAGGCAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGCCTTGCCACTCACGTAAAACCGTTAATGAAGATGGTGGTTTCGGTCGTAAAAAATCACCCCAGGGGAGGGGTATATAAAATGTCTATGACCTTTGTTTCCTGACCATCCGCCTAGTCAAATTTATGCACCCGCGAAATTAAAAGTAAAAAGTTGGAGCTTTTCATGTCGAGAATGAGAGGTCAAGGCAGAAAGCCAAAACCCACGCGATTAAAGAAAATAACCGGTAATGCAGGTAAGCGAAAACTCAATGAACATGAACCTGAATTAATGGAAGGTCGAGCGATTTGCCCATCTTACTTAAAAGCTGAAAAAGCAAAAGCGTTTCGCTTTGTTGTTGATTGCTTGGAAAACATGCAAATTAAAACCGCTGCATTCCAGTTTATTCTTGAGTCGTTTGCTTTCTCATATGGGGAGTGGCGAACGATGTCTGATATTGTTGATCAGCAGGGCGCTACGTTTGAAACGACGACTCAAGCCGGGGAGACTATGTACCGCAGCCGCCCCGAAGTGGCCCAACGTAATGAGGCATGGAAACAAGTCAAAGCCTCATTAAGTGAATTAGGATTAACACCGACTGCAATTAGTCGGCTCAATGCTCAAGTATCTAATGCTATTGAGTCAGAGATAGATCAAATTCTTGATTAAAAATGACCCGGTAAAAACCGCTCTAACTTACTGCGATAATGTATTAAGCGGCCGCGTCATTGCCTGTGATTATGTAAAAAAAGCCTGTCAGCGCCACTTAAACGATTTAAAGTATGCTGGTGATCGTGGTTTTTACTTTGATAAAGAAGCGGCGTGTAAAGTCGTTAGATTTTTTAGCTACTGCAAACACAGTAAAGGCGAGTGGTATGGTAAGAAAATTACTTTAGAGCCGTGGCAGTTGTTTATTATTACCACCGTATTTGGTTGGAGGCGTGAAGTTGATGGCATGCGGCGCTTTCGTACCGTTTATGAAGAAGTCGCACGTAAAAATGGCAAAAGTACGAAATTATCCGGCACCGGCTTGTATTTATTTTGTGCTGATGAAGAGCCAGGCGCGGAGGTTTATGCCGCGGCAACCAAACGCGATCAAGCAAAAATCGTTTTTGATGATGCGGTCAAAATGGTTAGGGCGTCAAAATCCTTAGCGGGTCGTATTGGTATTTATAAAAATAATATGCATTATCCCAAGGATTTACCGAATAATAAGTTTGAACCGTTATCGAGTGATAGCCAAACTCAAGATGGTTTAAACGTACACTGTAGTATTGTTGATGAGCTGCATGCCCATAAAACAGGCGATCTGTGGCGTGTATTAGAGACGGGTACCGGCTCCAGGCGCCAGCCGTTACTGTATGCGATTACAACCGCCGGCTTTGATCAGACGGGGATTTGTTATAGTTTGCGTGATTATGCGGTTAAAGTGCTGGAAAATATCATTGAGGATGACACGTTTTTCGGCATTATTTACACCCTGGACAAAGAGGACGACTGGACAGACGAGCGTGTTTGGATCAAAGCGAATCCAAATTTAGGCGTCAGCAAAAAGCTTGATGATATGCAGCGCCAATGCGTAAAAGCCCAGCAAATGAAGGGCGAACGCAATGGCTTTTTATGTAAGCATTTAAATATCTGGACGAATGCCGAAACCGCTTGGCTGGATTTAGAGCGTTGGAAAGTTTGCGCCGAATACACTTTTAAACGCGAATCACTGGAAAACAGGCCCTGTTATATAGGCCTGGATTTAGCCAGTACCAACGACATCGCCGCCCTTGTTGCGGCTTTTTTAATGGCGGATGATTCCGTGCGCCTCTTTTGTCGCTTTTACTTACCGAAAGAAACCGTAATGACTCGAGCCAAGCAATCCCCCGTACCCTATCAAACGTGGGCCGATGAGGGCTATTTAACGCTCACTGAAGGTAATGTGATTGATTACAACTATATCAAAGACGATATTTACCAGCTCAATAAAGAATTTGATGTGAAAGAGATTACTTATGACCCGTGGAATGCCACCCAGCTTGCGAATGATTTACTGGAAGAAGGGGCGAATATGGTCGAGTTTCGCCAAGGTTTTTAAGTCCATGACCCCAGCCTTAAAAGAACTGGAGCGCTTGGTAATTTCAACAAAACTTCATCATAACAATAATCCAGTTTTGAACTGGATGGCCTCGAATTTAGTGGTTGTTGAAGATGATGCGGGCAATATGAAACCCTCTAAGCGTAAATCCACCGAGAAGATTGATGGCATGGTGGCCACGGCAATGGCCGTCGGGCGTTTAATTGCTGGGGAAGATCACAACTCGATTTATAACGAGAGAGAGCTACTCGTTTTATGAAGCTATTTAAACGCTGGTTCGGTGCAGCAACGGAGTTAGTCCCTGATACCGAATATGGTGGTTATGAGCTTTTAGATGTTGCGCCCATGAGTGCCAGCGGTCAAAGCATCCATCCCGATAATGCCATGCGCTTAGCAACCGTTTATGCCTGTATTCGTGTATTGGCTGAATCGATTGCGGCTTTGCCTTTGCATGTTTATCGCTATGAAACAGGTGGTGGTAAAGCCTTGGCCACAGATCACCCGTTATATTCTGTTTTGCATGATTTGCCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGACTTACGTGAAAACCTTGTGGGGCACTTATGTTTACGCGGCAATGCCTATTGTCAGATTATTCGCGATGGCGCAGGGCGAGTGCGTGAATTAATCCAATTGCCTACTGATAACACCACAGTGCGTCGTGATGAGAAGAGTAAAAGACTGGTTTATAGCACGATCTTAAACGGTCAAAGCTATGAGCTACGTGACGATCAAGTGTGGCGGCTGAATGCCATGGGCAGTGATGGCATTATTGGCAGCAGTCCGATTACCTTACAACGTGAATCTTTAGGCTTATCTGCGGCAACCCAAGCGCATGGCGCGCAATTATTTGGTAATGGTGCACGCCCCAGCGGTATTTTAACGACAGATAGTGCGTTAAAAAAAGAAGGCCGTGAAAGTCTAGCCGCTTCGTGGAAAAAAGCCCACGGCGGTACAAATGCCAATGGTGTCGCTGTGTTAGAAAATGGCTTGAAATGGCAAACCTTGACGATGAGTAGTGAAGACAGTCAATTTTTAGAAACTCGCAAATACCAGCGTAATGAAATCTGTGGAATTTTCCGGGTGCCGCCGCATATGATTGCTGATTTAGAGCGCGCCACTTTTTCAAATATTGAGCATCAAGATTTAGCCTTTGTTCGCCATAGTTTGGTGCCGTGGCTGGTGAAGATTGAGCAGAGTATTAGCCGTGATCTGTTACTCGCGCATGAGCGCAAAAAATATTTTATAAAATTTAATATCGAGGGCTTATTGCGTGGCGATACGGCCGCTCGGGCGTCTTTTTATAATCGCATGTTTAGCATTGGTGTGATGAGCCAGAATGATATTCGTGAACTAGAAAATATGAACCCAATAGAAGACGGGGACCGTTATTACCGGCCGTTAAATATGACGCCGATTGGTGAGGATGAAGAGCAAACTAATGAACAACTGGTATCAGATCAAAGCACAGGCAAATAAGTCTGCGGATGTGTATATTTACGACTACATCGGCGATTATGGCGTTGAAGCTAAAAGTTTTGTGATGGAATTACAGGCGCTTGATGTAGAGCAAATTAATTTAAGAATTAATTCGCCCGGCGGCTCTGTCACGGATGGCTTTGCTATTTATAATGCCTTGCATCGTCATCCAGCAAAGATTATTGCCCATATTGATAGCCTCGCGGCCTCTATGGCAAGCATTATTGCACTTACCGGTGCAACCGTACATATGGCCGATAATGCCTTTTATATGATCCATCGCCCTTGGGCCTATGCGCTGGGTGATGCTGAAGAGTTGAGTAAAATCATTGAGATTTTAGATAAAAATGAAGCAAAAATGCTGCATATTTATGATCAAAATCGAACTTAGACACCGATACAATAAAAACATGATGAAAGAAACATCTTGGTTGACCGCAGCAGAAGCAAAAGAGCATGGCTTTATTGATGAAATCACCGAAGCTGTGAATATCGCCGCTTGTGTTAAACCTAATCAATATAAAAACACCCCGCAAGCGCTGATTAAACGCCCTGAAAATAATGCAGTAAAGGCGCTGCAACGCCATAAACTCGCACTCAAACGCTCCCTTTTATAATTTTCTCTAACACTTAATTTTTTAAGGCTCTTAATATTCTAGGAGGAATAGACTCATGCCTGATATTTATGAACTTGCCGAGCAACGCGCTGAAGTCATTAACAAGCAGCGCGCTATGCTGGATCATGCAGAAAGCGAAAGCCGTGGCTTTACCGATGAGGAAGACGGGCAATATAACGATTTAAACACCCAGCAATTAAACATTAAAAACCGTATTGCTAAAATTGAAGAGGTTGAAGCCCAGGAACGTGAAATTAATTCGTTAAGTTCTGAGCCGTTGCGCGCCAGTGTACAATCAGCGACTGACAATACACCGATCAATCCACTCGCAACCGAAGAATATGAAAAAAACTTTTTTGCCTATATGCGTGGGCAAACTCAGGCGTTGATATTCGTGCCGGACAAGTTGAAGGGACGGATAATAAGGGCGGCTATTTAGTGCCGACGAAACTACAAACCACCTTAATCGAAGCTCTGGAAGAGCAGACGGTGATGCGTCAAATGTGTCGCATTATTCAAACCGATTCAACCACGGAATTACCCATGGCCGACACCTATGGAGCGGCGACGTGGACCGGTGAAGCCGTCGCTCATACCGCAACTGATGATACTTTTAAGAAAAAATCCATTAAAGCCTATAAGTTGTCACGGATGTTAAAAATCTCCGATGAACTACTGGCTGACAGTGCCATTAACATTCGTGCCCATATTGCTTACTCCTTTGGTCGTAGTTTTGGCGAAGCCCAAGAAAAAGCCTTTTTAACTGGCGACGGCACCGGTAAACCGAATGGCTTATTAAATGTCGCACCGACGGGGGTTACCGCTACCGCACCCACTAGTATTACTCTAGATAATATTTTAGATTTACGCAGCTCCGTCAAAGCCGCTTATCGCCGTAAAGCCTCCTATCTTATGCACGACTCCACTTATGGCTCATTGTTAAAAATGAAAGATGGTAACGGTCAGTATATTATTCAGCCTGATTTTAAAAGCGGCGAAGGCGATTTATTACGTGGTAAGCGTGTGAATACCTCGGATTTTATGGACACCTTAGCCGCCGGAAAATGCGCCGCCTTGTTCGGTGATTTTTCTAATTTTATTATTGCCGACCGGGGCGGTATTTCACTGCGCCGATTAAATGAACTCTATGCTGAAACCGGTGAAGTTGGTTATTTAATGTGGTTACGTGTCGATGCTCTATTGCTTGAGACAGAGGCAATTAAACAACTTAAAACAGCTGTATCTTAAAAAATTAATAAAAATTAGATGCTTTATTTATTAATAAATAAACTTTATATAATTAATTAATATACTATTTTTATTTATAAAATATTACCATGGCAATAATACATTTAAGGTATTATTGCCATGAATGCAAATCAGTTACTCGCAATTGGTGCTGCCTTAGTCACAGCAGTTCGCCGAAATATTAAATATTCAGAAAACCTTTATTTGTTGACAGGAAATTCTTTTTTTGATGAAAGATATAAAAAAGTATACTCGATTAGAGAAGGGATTAATGCTACTAGTGGTAAAATTGATGAGCAAGCTCCCTCAGCATACGCAAAAAGAGCATTAGATCATAGAGTTGGTTTTTGTAGTGAACTAAGTGAAGTTAGTACTTTCTTAGGCTCAATGTTAAATAAATTTGAAGCACCTGTTTATATATCAGTAATTAAAACTCCTCTTCATGCCTTTTGCTTAATTCATCAATCATCAAGTTTGCACCAACAAACAAAATCAAATGTTTATATTTCTGATAATATAAAAGAGCTTAGTGAGAAAACAGAACTAGAAAATGCAATTATCGTTGATACCTGGATTTATAAGGCAACCAAACTTTCCAATTATAAAAGCCATATAAACTATGCAAAAGAATTTGGAAAACAGTTTGATCTTGAAGAGTGTTTTGATGGTGAAATTAAAACAGAAGGCTATTCTGAAGCGTTTGGTACAACTCAACCTATAAAAATCGCAGAAAAAAGACTGTTAAGGGATTTTAATCTAGCTTACCAAGAAGAGAGCAGAAAGCTCTTTACTAAAGAGACATATTCCACCCAAGGTCGTAGACGTAACTCTATCGATACTAATCTAATTTGTGATAGCAAACGATGGGGGCAGTTGAAAGACCTTAAGCTATTTATTGAAAGAATAGCTTCAAAATCGAGTGATTGGTATTCTAGCTCTAGTAATCGAAAAGGTAAGAGCTATCAAGCACTAATAGATAGTTTGGACTTTGCTATCCAAAAATATATGGACATTAGTAATACCGATTTACAAGAAATTTTTAATCGAGCATTGCAGTTAGCACCTATAGTTCGAGGAACGTCTTCCTTTAAAAATCTTTGGGGTTATAGAAATCATATTACAAAAACAACTGAAGGGTTACTCAGTACAGATGTTGTACCAGAAGAATATTATAAATTTGAAACTCTACCACAGATGAATCTTTCTGAAATAAGGAACATTAGGTCTCGCCCAATATCTCAAAATGAAAAATGTACAGCCTTAATCCAATGGATAAAAAAAGAAGGTGCGGATCCTTCTTTTTATAGTGATGCGCAAAAGCGGCTGCTTATAAAGCAGTCGATGATTTTGTCAGTCGCAGCCAAGGAGAAGCAAGCTTGTTATTTTATGACAGAGCGGAAGAAGCACCCCCTCTGGCAGCAGAAGCTTCAGCAGCATCATTTAAATCGTTTTAATTCACATTTAAATCAAATTTAAAAGTAAAAGGGACTTTATGAAAGTTAAAATCTTAGTGCCGCGGGCTGGGATAAATATTTCTTACAATATCGGCGATATTGTTGATTTACCCGAAAAATCGGCAAAAGCCATGATTAAACACGGCGATGCGGCGGCGATTAATGTTAAAACATCGAAGAAAAAATCAAAATGATCGATTTAACACGCTTTAAAAGCCATTTACGCATCGACGATAATAGCGAAGATGATTATTTAGAGTTTATTCTTGCCGCTGCCCTGCAAGCCGCTGAGGATTATCTTGACCGTGCCATTGTAAATAATACGGATGATTTAGAAGCGATTGAAAACAGTGTGTTAATCAATAAATCGATAGAAATCGCCATTTTAATGTCTGCCGGTCACTTTTACGAAAACCGTGAATCAACCAGTACTTTAACGGTGAAAGAGGTGCCGATGAGTACCCATTTTTTACTTAATCCGCATCGGTATTTAAGCGCATGAGAGCCGGCTTGTTACGCCATCGCGTGACCTTACAAAATAATTTAATCGGTGCCAATAATTATGGTGAAGCCCTCGATTATTGGCAGGATATCACCACCGTCTGGGCACGGGTCAGCCCCAGTGCAGGCCGGGAACTTTTTAGTGCACAACAGTTTTATCATGAGATCAGTCAAACGGTGACCCTGCGTTATCGACCTAACGTTACCCCGTCGTTACGACTTGTTTTTGATAGCCGTTATTTTGAGATTTTAAGCGTGATTAATCCAGATGAGCGTAACCGTGAGCTGATTTTAGCCTGCAAGGAATGGGTACATGCCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039233|17451:27915|27591_27915_+|WP_155589681.1|head|DBSCAN-SWA MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEALDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRPNVTPSLRLVFDSRYFEILSVINPDERNRELILACKEWVHA >NZ_CP039233|17451:27915|24145_24391_+|WP_155589676.1|DBSCAN-SWA MIKIELRHRYNKNMMKETSWLTAAEAKEHGFIDEITEAVNIAACVKPNQYKNTPQALIKRPENNAVKALQRHKLALKRSLL >NZ_CP039233|17451:27915|22194_22536_+|WP_155589673.1|DBSCAN-SWA MTRGMPPSLRMIYWKKGRIWSSFAKVFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLVL >NZ_CP039233|17451:27915|20843_22277_+|WP_155589672.1|terminase|DBSCAN-SWA MKFLIKNDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYAGDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKSLAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHCSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIEDDTFFGIIYTLDKEDDWTDERVWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKVCAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMADDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQTWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGF >NZ_CP039233|17451:27915|19908_20292_+|WP_155589670.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQVCCYAGCHHITYARYCEYHEQHGNRYHTPRKTTAQRGYGGRWQRERKMFLQDHPLCKHCLKDDKLIPATEVDHIKPHNGDHDLMWNQGNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGI >NZ_CP039233|17451:27915|20365_20860_+|WP_155589671.1|terminase|DBSCAN-SWA MELFMSRMRGQGRKPKPTRLKKITGNAGKRKLNEHEPELMEGRAICPSYLKAEKAKAFRFVVDCLENMQIKTAAFQFILESFAFSYGEWRTMSDIVDQQGATFETTTQAGETMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSNAIESEIDQILD >NZ_CP039233|17451:27915|22532_23774_+|WP_155589674.1|portal|DBSCAN-SWA MKLFKRWFGAATELVPDTEYGGYELLDVAPMSASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTTVRRDEKSKRLVYSTILNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDSALKKEGRESLAASWKKAHGGTNANGVAVLENGLKWQTLTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARASFYNRMFSIGVMSQNDIRELENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQTNEQLVSDQSTGK >NZ_CP039233|17451:27915|18460_19717_+|WP_155589669.1|DBSCAN-SWA MLKGVIFGVDGVIVPNNRSFDKNDKLFEEIKKLLTFLIGKGIKVSILTNRPFEYVKKSLESKFPDIKYYSKSIDQNFYDKASKQASEAIISEMELNKNEVVYIGASKQDMRSAVNGNLLFLNVMWWGKGTDYGFDFGQPKDVAKFIDIFCLREHLWSYSINDKGLETYALAPYSTMKDEYKKYSHDARNTAKHQSGTPYFWASAIISSLYFSGLYERINIVTIYPGHQKGSRSKILDEELLAFSKCFRMSFIPELIVRHTTSQKSQRARNQNKSLNFSNQLNSIHLLKLPKKIGKDNDYYKNNPLRRKKGLKRVVLVIDDICTEGFSLESARTYLEQANTEVISVAWLKTINTNIKRLGGLSKFDPYKANQMDNTTVSQEYAYHDYFHHNLAPEELSNMFELYNVTWDWPQDLIAKAS >NZ_CP039233|17451:27915|24446_24830_+|WP_155589677.1|DBSCAN-SWA MPDIYELAEQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYNDLNTQQLNIKNRIAKIEEVEAQEREINSLSSEPLRASVQSATDNTPINPLATEEYEKNFFAYMRGQTQALIFVPDKLKGRIIRAAI >NZ_CP039233|17451:27915|24781_25639_+|WP_155589678.1|capsid|DBSCAN-SWA MRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTDSTTELPMADTYGAATWTGEAVAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIRAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPTGVTATAPTSITLDNILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETEAIKQLKTAVS >NZ_CP039233|17451:27915|23721_24165_+|WP_155589675.1|DBSCAN-SWA MKSKLMNNWYQIKAQANKSADVYIYDYIGDYGVEAKSFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIIAHIDSLAASMASIIALTGATVHMADNAFYMIHRPWAYALGDAEELSKIIEILDKNEAKMLHIYDQNRT >NZ_CP039233|17451:27915|25759_27115_+|WP_155589679.1|DBSCAN-SWA MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLSEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKRLLIKQSMILSVAAKEKQACYFMTERKKHPLWQQKLQQHHLNRFNSHLNQI >NZ_CP039233|17451:27915|17451_18450_+|WP_155589668.1|DBSCAN-SWA MSDNNATRHGEFWRREAIAFLALSYLQGVGFWTLHRVAKSGRSFHEFLKVSSPDELSRDLGVNVNSILTDQREGCSWDEFLEQLWHIGLVCARELKRQSIVMLFRGQDEFPLSLRSIDDCPFWIFVQGNKEILHKNGVAVVGTRKASDDGIFLTKLVVSSLVNKNIPIVSGLAKGIDQVAHFEAIKFGIPTIAVLGAGILVDYPKGTSELRNSIIEGGGCIITEYLPKQSYSSENFVRRNRIQAALSYVLVPTEWNIKSGTSHTVDYAYKYQRKIINVFLPNFYKLRPEIEFSEKKYSAVSCELPTDLDIFIKYIDGDLSYGFDNRQQDLNL >NZ_CP039233|17451:27915|27283_27595_+|WP_155589680.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLTRFKSHLRIDDNSEDDYLEFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSA |
14 | Erysipelothrix_phage(30.0%) | portal,head,terminase,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039227_1 | 686736-686835 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039227_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039227_1
>1.1|686759|54|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder AAATTAATATTTTTTAATAATTTATAAAAATTAATTGATAAATAGTAGTTATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039227_1
The CRISPR arrays of NZ_CP039227_1 >merge|NZ_CP039227|1|686736-686835|CRISPRCasFinder AATAAATATTAATTTTTTAAATTAAATTAATATTTTTTAATAATTTATAAAAATTAATTGATAAATAGTAGTTATAAAATAAATATTAAATTTTTAAATT >NZ_CP039227|1|1|686736-686835|CRISPRCasFinder AATAAATATTAATTTTTTAAATT AAATTAATATTTTTTAATAATTTATAAAAATTAATTGATAAATAGTAGTTATAA AATAAATATTAAATTTTTAAATT
>NZ_CP039227.1|WP_155079478.1|685461_686019_+|IS630-family-transposase MKKEPKYKQRRDAERSEFIEKLTGIDLSQLVYLDEVGVDDNIVVEYGWSAAGVRSYAEQAGFKRKRLSLVAGLKYSDKSLVAPFEFSGAMNKDLFLGWFEQELCPKLNPGQVIIMDNASFHKSPELYDMVEAVDCELLYLPAYSPDLNPIEKFWANFKRNIRKVIKKHEHLCNAITDALIKTLPG >NZ_CP039227.1|WP_155079476.1|685091_685478_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDANGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039227.1|WP_155079963.1|684705_685095_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIADTVELTF >NZ_CP039227.1|WP_155079962.1|683368_684427_-|hypothetical-protein MKEIQDKYLILLAEACSTVDECARNRQSIYKPINEPTNKKCKEYVSHKAVEHFFLEESDNEIENAYKELKEKLESSNEKEALYDKFNDFFYKKTAHKIDTARIVGFSKERKFFSKSLYDNLLLNAIEFTASSKLRDSFDLAFKEANILSTHDDGIAFRALTKNLTHVTVMPLEKLDISCHLELFQQLIELGLGNQPSHILDMLDFPQQFKDFNHILQETYNQIKAHVSAQISYSQAQSHPLLSCFFSKKNNVSACFQQYQTNVTRAAFNFLFSKERDLAVLESQLTQHDANFLSSSGLKSSYPNFQGAYPKLLKQIKQPNKAEAISAQLFSQQQTATGASILANMTSDIAPI >NZ_CP039227.1|WP_155079961.1|681932_682586_-|hypothetical-protein MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKYQRKRST >NZ_CP039227.1|WP_155079960.1|680171_681569_+|IS66-family-transposase METAVYPENIEDCYKVIDHVSTERDHYKALYEQLQRYRYGQRSEKLSQDQLDLFAEFLDENAEKESQQEAITVPAHQRQRPKRKPLPEHLPRERIEHDLTEGDKVCACGCAMQRIGEEITEKLEVIPAQFKVIQHVRFKYGCKACETGIKIPSLPPMLIPKSIITPSLLAMIVSDKFESHLPLHRQQQRFEALGIDLPRNTMANWVIVTAMLCESLLELMKQDLLQAKLIHADESPLRVLSEGKQKSYLWYYYGRIAEKQICCIDFQASRHSIHPAKFLKGYTGYMMTDAYSGYGEVIKNEKITSTYCWSHARRKFEAIPQPKKDSKKITLAMEMLNLIKELYRIEKEIKGKSPDIIYQHRQEKSKPILDEIKQWLEHYQPSIPPKVPLGQAMSYLHKNWNEFIRYIDEPFLSIDNNVLERQIRPLAVGRHNWLFSASEAGAQATAAFYSLVATCAASHGVLSTG >NZ_CP039227.1|WP_155079959.1|679778_680129_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MNFPSSIKVHLATTHCDMRKSIDGLAWEVQSRFDMDVLDGAVFVFYNRNKDKLKYIYYDGTGFCLFYKRLAKGRFKIPPLKNDCYQMSEAQLRLLLEGVEWSKIKPNRKQKYSQMF >NZ_CP039227.1|WP_155079958.1|679473_679782_+|hypothetical-protein MIDQTKLPNNREDWLEMVKLWKESGLTKEAFCREMSIKSSQFSYYCKIYREQNKSRLNFAEIKTAPSTTLSLKLCGQHELTIPPDFDEPTLLRLLSIANKVQ >NZ_CP039227.1|WP_155079957.1|679045_679198_-|phosphatase MARSGRSPFVEKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKSSAVRVTQRYVP >NZ_CP039227.1|WP_155079956.1|678267_678756_-|hypothetical-protein MAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSNKFAQNSIYLSSQQATRYFGKLPLRVVMRFVFFRSKLWGIRPLAIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMV >NZ_CP039227.1|WP_155079964.1|687238_688030_-|methyltransferase-domain-containing-protein MAVTFKEHAKEYEERAISQRLAAKTLIKMMDIKKGDQILDVGCGGGGVTSLLADQHNVFIDAIDSCKEIFDEAVKNFGHRKNIQFSNLSANKINYENKYNWIFSNSSAYYLGDLIDIFSKFKKALKPNGKLAIQAQYKTAPQIKRCFDLILSDPLIGAIFKKHKFPVNKLNGKQFAEVLLLASFATPEFKQITHRTMHSVDEIMTIFYSGWHVPWLLNGYSGPINTEYKVNFKNLLYQGLLKQADINNKLWLEVPRVYVIANI >NZ_CP039227.1|WP_155079965.1|688570_689137_+|hypothetical-protein MTVYLSFFKAAVRKQGEFKRFYQDIGQFEKLKEFSDNLLQSLNAVEYKLRQGQAPRLSHLGLWISALDRGDLNLIDYLCSQNKKLDNLLKNTEFHPCIIAWRLKFYGLGQKKVTDLIFASHISLRKSVANIIKTGNITLNDWYRIQGNPLLQKAVNSFAALGKFSRDDWRTVRDNRLLQKAMIAPSVI >NZ_CP039227.1|WP_155079445.1|689805_690780_-|IS30-family-transposase MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039227.1|WP_155079966.1|690839_691238_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSFRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEAAKMLIHQRLRTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYALRHMKCNTQ >NZ_CP039227.1|WP_155079967.1|691283_691913_+|hypothetical-protein MDMNSLLSVALHVTEGVALHKTGVNFKNDWQQLKENAQLQKTVLILNQTGVNFKKQWLKIKGNKQLQETVIENNKKLQKSYYPNLKQYECHLEKNKADYHSKWKDVKKFFKISRKCARNYLMGLKNSFAPLLDTKSNMKAIYQHRRSLKSRVGLTFITSIFSAGLALMFEAGRAAVRKYQGKSFECLFLGATTSQNLAKSVKSAGLALG >NZ_CP039227.1|WP_155079968.1|692279_693920_-|glucose-6-phosphate-isomerase MNTAAWTKLTAHQQEIKHTHLRDLFINDSQRFNHYFKQGPHLSIDFSKNHLTNHTLKLLIALAQEHLLGDKIHALMQGATLNITEKRAAFHSALRVPASKHHQLPKEIAKQITTVHAQMRTLCAKIHSQTPLYSQGQIITDIVNLGIGGSDLGPAMVTTALTPYHKKYLRCHFVSNVDGNQLHNTLKNLKPETTLFIIASKSFTTQETFANAQSARHWLETAQLSTAQINHHFICCTSKPEKAREFGILAEHILPMWDWVGGRYSLWSSIGLPIALATGFDHFEALLTGAHAMDNHFQTASFEDNLPVMLGLIGLWYINFWHTRSHALLPYEQMLALFPNHFQQVDMESNGKHVQINGEPVHWQTAPVIWGQPGTNGQHAYHQMLFQGTEMIPMDFIVGLKTHSPYQQQHNMLVANCFAQTRGLMWGCDEQEVYQQMINQGINQAEAQRLAPHKAIIGNQPSTTILYDKLTPESLGALIALYEHKVFVQGVIWNINSFDQYGVELGKVIGQNVLAQLQGGSNIKNNNIDDYDASTQGLIHYFRNNQ >NZ_CP039227.1|WP_155068160.1|694032_695382_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MRVTVFGAGYVGLVTAACFADLGNQVICVDVDEKKLAQLAEGKSPIYEPGLDELLLRGQESGHLEFTADIQSAVEQGEFIFIAVGTPSEESGSADLQYVLAVAKSIGEYMNGYKLVIDKSTVPLGTADKVRQVISNELGARGVNYEFDVSSNPEFLKEGAAIEDFMYPDRVVIGIDNLRAEKRLKTLYTPLTKKNNCLVVMDARSAELTKYAANAMLATKISFMNEMSQLAERVGADIEMVRQGIGSDSRIGYHFIYPGCGYGGSCFPKDVRALVHTAAEHGFDTKILAAVQEVNEKQKELLLEKVLREFQGDIQGKTFALWGLAFKPKTDDIREAPSRVLMEGLWQHGAKVQAYDPAAMDNIQAVYGARDDLYLATSASSALTGADALIVVTEWTEFRSPDFNVIKKTLNQPLVIDGRNIYDAEHLESLGITYRCIGRGEWLMKDVCR >NZ_CP039227.1|WP_155068159.1|695378_696248_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MSIIKKAVFPVAGMGTRFLPATKATPKEMLPVVDKPLIQYAVEEAIEAGIKELIFVTSSNKRAIEDHFDRHYELEKRLEEAGKAQFLSIVRDILPQGVSCSYVRQAEPLGLGHAVLCAESLVGAEPFAVILADDLIANDGPLCLSQMVEKYNDKDADCVLAVQEVPEGDTHKYGIVATESSDRVIHMVEKPKPENAPSRQAVVGRYILSPEIFTALKNTSQGAGGEIQLTDAIASVLQNQRVLAYPFTGKRYDCGSKLGFLEATLDYALDHPELGLACQEYLQKRFQSN >NZ_CP039227.1|WP_155079969.1|696994_697309_+|transposase MGYPVEFRRKVFKLKEKKGLTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRVINLEELKNDVKNHPDSYQWERAQRFGVSQHCIQHWLNFLAIVKPPFLCQV >NZ_CP039227.1|WP_155079970.1|697305_698013_-|IS3-family-transposase MTKIKKVLTDLAKVHHRWGFDKMMAKIKQNYAWNHKRVYRVYCELKLNLRIKPRKRVSPREAKMLVQPIVSNHCWSLDFMSDTLSNKRKFRTLNVINDYNRECLLIEPAFSLPSMVVTRLLDQVAESKGYPEVIRSDNGPEFISSDFTKWAEQHNILLHHIQPGKPAQNGFIERFNRTYRQDILDAHWFYNLEEVREITEPWVDQYNNERPHESLANLSPINFKKMRDKTTEIPL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP039227_2 | 1059920-1060031 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039227_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP039227_2
>2.1|1059951|50|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder GGGTGTTATCCTTCACTTGCTGCCAATTATCTTTAAGGCTGATCTCTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039227_2
The CRISPR arrays of NZ_CP039227_2 >merge|NZ_CP039227|2|1059920-1060031|CRISPRCasFinder TCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGTTAGGTGGGTGTTATCCTTCACTTGCTGCCAATTATCTTTAAGGCTGATCTCTGCATCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGCTAGGT >NZ_CP039227|2|2|1059920-1060031|CRISPRCasFinder TCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGTTAGGT GGGTGTTATCCTTCACTTGCTGCCAATTATCTTTAAGGCTGATCTCTGCA TCATGAAGTATTAATAATGCTTTTGCTAGGT
>NZ_CP039227.1|WP_155066848.1|1058821_1059361_-|superoxide-dismutase MKHLLLPLKIASLMLFSVTAYHTYANANAHTHKHSAEKVTLYTVAKGTPSHNIGYVLLKDSPNGLLILPHLSHVPAGFHGFHIHVNPSCKDHGMAAGGHYDPTKTGKHLGPYGRGHLGDLPVLYANKKGDINGPVIAPHLTLKQIHGRSLMLHAGGDNYADKPESLGGGGARFACGIIH >NZ_CP039227.1|WP_155080161.1|1058253_1058469_+|hypothetical-protein MDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGSKSIRINFMGGLRGKQFIAPMVVEGYCNNNVCQAYIDQSLRV >NZ_CP039227.1|WP_155079974.1|1057831_1058197_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPSPYSYDLRVRALKMIDEGIPITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNSGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKRLGYTRKKRASDTKNVMH >NZ_CP039227.1|WP_155079445.1|1056644_1057619_+|IS30-family-transposase MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039227.1|WP_155080160.1|1055220_1056447_+|MFS-transporter MNLSLSRRTTAVFLLTFSSSLPLILVGSTLSAWYTVAGVSLLGIGALSMVQQPYIFKFLWTPLMDRFSLFGWCRRRSWILLTQVLLVIGLVLMAYTGPKQYPFGLAMIALILAFFSASQDIAIDAYRIDILHANELGMGAAITSLAGRIAMLFGGAVALVFAAEIGWQNTYLIMAAVMALEILATLAAPALRNEEATPRSLQESIVGPLKDFVRREHALSILIFILTYKMCDALALALNTPFLIRGVGFSLLEMGTIYKTMSLVASLLGTVVGGFFYKRLGLYRTLMCYGILQALSNLAYMGLALASKSYFLMATAVFVEYFCGALSTVAFVAYLMSLCKQRFSATQYAILSAIIAIPRVYFGPLAAIMIDYFGWAQFYLITCLIGFPPLILLFRMKKYLLNYWLDTE >NZ_CP039227.1|WP_155080159.1|1052991_1054632_-|hypothetical-protein MSTIDDLLRDLSASRQRELLEELTAVYNSSSSRQHLNTESREKYRQLLRDFGYMNRLQQFDKTEGEYSSLNHGLGPWPGVQFFPDWNYTRLLLLRFRRQAQAIADAFHSNVFNQNLGHREVGIGFSILGVVWYLPRLLRHTVLSLKHLLTNEKSSSDYFKKHWFQFFNDLIWAATGAITLGIGTGWYLGPWAAALGPGGIILTVALYAFDVVNMVAKAYTKIRKMNRIIAHTNEQIQGVCGELGLLFSTSIDIESLYTYVKEQIQQGATEDELEKLNKLKDLLDIRERMLLRKSYVKYDQFSKVGITVGLLAGMVLMLTGPIGAAVGAGVVLVTCGIQYWLNHYFLPKKEVQLASDPLELLHLKLNSHVDKQIIKLTEELQYLKNGPEKEQTNHKLLMYMRARGALNRWRDRPERNNDSTMLLQAAALTMDASKIRRKGTGAPASYKDLKSALKHFSTPWRDAFNDAQKQFSLLLKNFSASSKVKSSTESPLSRSSTDSQGSSNDENFDKGIFEKAAAQAAAGSDYQPLQSESGITTASSASPALG >NZ_CP039227.1|WP_155079724.1|1051660_1052842_-|transposase MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDLQTKKERRKSSFTKNDLFLKLLNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKENGKYQQLKQISLEDGIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSNKFAQNSIYLSSQQATRYFGKLPLRVVMRFVFFRSKLRGIRPLAIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSQLNHIYYSILGFCRLERLKLKKSLNHFAIKYKLILRANQIALQELRSMA >NZ_CP039227.1|WP_155080158.1|1049766_1050930_+|MFS-transporter MEAIRLVRKSAIFRVVLALSFLESFALMMDFTVLYTVIVYLWKLPLYKVILFSFTVSIPSIIISPFAGRLVDAKGSIICIQYSSILCFFLTIGLIFTNSYFILFTLVFIRSSLKAVFSPALSRIIKLTVDKKQLLSVNSLIQFNANGLLIIAPIIGMVVFSTLGKKWCFLITSILFFLTFSLSFFLKGVSDKRSQVDMGLLLQSDLDIKKLLVPFLGMMIAAFAIYLGDSLFPLLLKSTGLDFKDFALIGSFFGIGGMAASIFCQCYKNSNEVTLIKLGAILVIISMFTYGMFSSMLSQCVFFVFAMLNAGGITLISISSATLLQKNTPAHMMGKVSSINNMIFGLASIIVPAFGLTFSQLVSVKLPFLLLSIITLSLLLTLRAMEC >NZ_CP039227.1|WP_155080157.1|1046829_1049520_+|DUF4135-domain-containing-protein MNKNEAFLDIYRSIIGQFISSKDVQNILDSFPQGKISETILTKSFLKLYSSLLDVTLYRVLEVDSQIYFKENKSNDYNQYLTGFDLNTCLSKYHSTDSFDLQCHFLKDALLQFYLRLAADIREIESHILAGEKIEVITEVSPVGDFHGALECGFCIGFKSQLKESGEFYYKPRLSHLFEKYNNFITWLNEVEHSAMLDNIALKNINKQDYSWIQSVHAILTATADHQRLSPALQGQNDHLAFERFGALLCLAYVFSSCDLHYENIVFNGDYPVIVDIETIFSGKWHKYQEVGHLYDTLMLPRSILNREEEASPLTYDTNRKNAFETHIDDLIVGFEKTYDLIIKIKPDFIIKVNELFSDIDYRVILRGTKTYFNIIKNINHPVTLIKQSQALEINKMYEVDLPTALYQYEAEQLKSASIPIFYAKFDSKKLCSYDGKVLFTKMEKSAKDLFDIKIKLLSNKDKENQINNILVAKKAFVARRDGITLTEISPDINTLKRKDFFDAGVSHIEIIQSTWQRLVNKLCYISSTVHMPTIILENNTWNGLASLDLYNGTPGILLVWHQLHTALKIKKTKHYKAIRNDIKHYFCRERISYEPSLYQGLVGCLYVYIITSENLLEELPVIQVALQKIAYGVAALEVKSVLDLDVIKGLSGIVLGLLTIKSQLQSYHAISKSLGCICQSTVLKIVNALDQHLNDKTLLGFAHGTAGIIAALSAYMNHYGRNIQYIKVINMLMKRERSFFDPSINHWRRPDNGQFDESWCHGSIGIVLSKLYARRYINIDFDKEINTVLTHIELSKSANLNLCHGLAGYLEFLNTILTLSQLDIKEDTRLRCEAVKDNLIKKIDLIYLNYSVLVDNYYHEDELPGLLSGTAGFLLTLLSCYKKNIVDNILSIGVH >NZ_CP039227.1|WP_155080156.1|1045689_1046538_+|hypothetical-protein MEVEMSFSPLRSKIRQWLIELRQVVMDKSGNIYNPAFSIKDYDPLLTIRKTLSAVTTAQSGGDLLDALNYLERDYLKRNSKLSKYLLNIRGSQLIAELYTQLNEYRESCKIYIESGLVTSAEQKQAIAKEEKAVAKEKKFVELRQTLQNFDTSASKQEALGQCQTLQDLCFAASIRQKSGLLHLGNTTATANELVRLLNLPTNGLLRQEICSDGEKVRMRDVRHYARFGVKSSSQRYFLSAEDRENERFFSHLKNEKQSQPMLMFDRYKVAQNQTLEVCLDA >NZ_CP039227.1|WP_155079476.1|1061327_1061714_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDANGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039227.1|WP_155589557.1|1061697_1062216_+|IS630-family-transposase MKKEPKYKQRRDAERSEFIEKLTGIDLSQLVYLDEVGVDDNIVVEYGWSAAGVRSYAEQAGFKRKRLSLVAGLSGAMNKDLFLGWFEQELCPKLNPGQVIIMDNASFHKSPELYDMVEAVDCELLYLPAYSPDLNPIEKFWANFKRNIRKVIKKHEHLCNAITDALIKTLPG >NZ_CP039227.1|WP_155080163.1|1063007_1063517_-|hypothetical-protein MNVTVPARIIFLKFLNLQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIEAYNQVTFVSLMKSNFNYNPLKCILCGSQLRRISTQFGLTLREKYSYYEELATSRFRGF >NZ_CP039227.1|WP_155079445.1|1064193_1065168_-|IS30-family-transposase MAYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSMRSIARALGFAPSTVSRETKRHTPSDFNGLYCHRLASRCAQEKRSNAKQGQDFQKISEKAKVLIHERLSTHTSPDVISKELIQEHNIQVSESTIYRYIHEDREKGGELYKSLPHSGKPYKKKVKSGDKTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHKSYLLTLVDKANKMCCIRKMANKCAETVVETFRSIVASTFFDFKTITSDNGTEFAGHEDISKITDADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDAKIAKIEHTLNARRRASLDYRAPNHVFLENLMAA >NZ_CP039227.1|WP_155066852.1|1066432_1066846_+|hypothetical-protein MTDISTTAAASLVEVSVRKIQRMIKLGEISAIRNSKGSWRIDLSELGRVFGLTIDELSERLSAIEIRKNTSGSDKINTENLENLAVLSQEVELLKSHIFSKDEQITLLTKEKEELMQLLEQLKKQRKKKGFFAKLFS >NZ_CP039227.1|WP_155589558.1|1067463_1068438_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQQPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHPSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKETAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP039227.1|WP_155080165.1|1068624_1069092_+|hypothetical-protein MPKVAWKNKEQEAAEWRVVKRYLGEYAGTQLGSNHNDKTTFIDPLTKKQVYLTHRYLRGADGEIFVKSNGKALGAGTFGKVTFGQTENGQMWAIKKSPTMVILPEKGKVNLLPSLLKESDIAVDLGKARRSFQGKDGSKYYQIYQFLGTPLDKHL >NZ_CP039227.1|WP_155079826.1|1069153_1070040_+|IS630-family-transposase MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNSGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVAKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGSKSIRINFMGGLRGKQFIAPMVVEGYCNNNVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLEAALSQVMKSMSETVR >NZ_CP039227.1|WP_155080166.1|1070036_1071347_+|hypothetical-protein MSAISENALGEEQRFDLAIKIAQAVYHLHVGSYARSKALYAHLDLKPANICVDDQGQVHLIDYGFSESLTGTLSRLKGTLIFLPQQPVGISKEALDVFALLRILYLPELFRTPKDWVSRADSHKEGVVSLFNYDFVEKNNLTLLLDTSDGRANDKSIVFILCKLILLRWNLATDANLKKVLERPQQFNENYECLVALGLNSAEYVQQVMTNPDSIEGFKQEQSNLLKLNQLGLDQAVYINALLASPNLIDQFEQNQGQFLRLNQLGLNQVVYIQQVLEDPGQFDKDYCYLKSFGLDRPETVKKMLDCLESQSALVEILLEAALDKAIEDCRQRGSQKKLTIAKFLKSKISIDPVNLILRNTVNILSHRSGLLKSKSYGVAMPYLLECKRLLEISEQDWNAMLATGYGFAGLHSGHEGTVAKNYSELQKGYFLVLSA >NZ_CP039227.1|WP_155080167.1|1071349_1072078_-|IS6-family-transposase MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRHQNAKAALRFFKKAMAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNYIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKKNICAQNQLIDKLFGLAA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039227_3 | 1435263-1435495 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP039227_3
|
4 spacers
spacers of NZ_CP039227_3
>3.1|1435289|31|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder AAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATA >3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder ATTCTTGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTATTT >3.3|1435406|19|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder GCTTTTGAAGATTCTGCTT >3.4|1435451|19|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder GCTGCTCAGGATTCTGCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP039227_3
The CRISPR arrays of NZ_CP039227_3 >merge|NZ_CP039227|3|1435263-1435495|CRISPRCasFinder TTGAAGAGCCAGGTCTTGAAGGTTCTAAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATACTGCAATTTCTACTTCTCAAGGTTCTATTCTTGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTATTTTTGAGGGTTCTGCTTCTCAGGGTTCTGCTTTTGAAGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTGCTTCTCAAGATTCTGCTGCTCAGGATTCTGCTGCTCAAGGTTCTGCTTCTCAGGATTCT >NZ_CP039227|3|3|1435263-1435495|CRISPRCasFinder TTGAAGAGCCAGGTCTTGAAGGTTCT AAGCTTATAGATTCTTTACCTGGGACTGATA CTGCAATTTCTACTTCTCAAGGTTCT ATTCTTGAGGATTCTGCTTCTCAAGGTTCTATTT TTGAGGGTTCTGCTTCTCAGGGTTCT GCTTTTGAAGATTCTGCTT CTCAAGGTTCTGCTTCTCAAGATTCT GCTGCTCAGGATTCTGCTG CTCAAGGTTCTGCTTCTCAGGATTCT
>NZ_CP039227.1|WP_155080364.1|1433247_1434987_+|hypothetical-protein MKFIELKQKFILVLQLVDGLSGSGATKHQGTAHSTEDKKDLISAVEEILSVRFLEGLSAVLTDSGRPKQAEILTRTQENIVFLLEDPDVKDSLGLLTTAKIAKFEIVYKYLLGEEGEELDALVQALFAQKSTDSQEINVCRYEAIEGFSSYFDLKANIPPREELFGEFHNEMRKINNEIKSAENTILELESKKITADSLARRKINLVTNQSNALTSIAALYIQGDRKLGLKSHSASYFNKIFGPYFEFNGGSPVIAPGYSLVDGKSDFEQILAGIVDNCQRKRTFWARVWGKLQAGKISALLLEAVDKGCSKTALKIHSGNVRTGEAFSSSWIGKKPSECEAEAKALSDEFNKEKYLLELSSTTIEAGEAKKQKLLNDFTQKVTDYGKELKRVFNAIRSFRLLVQKAEKKGAAAGGLDSQVKGAEGGEKLQQETFLPKELRLTGERKVDGAIIVKHIEGITGNEQLLSLYNELREKEYLIKGNLLRIFSHFRTTMSGEAVKCSETWHTIEAAFTNRVRSNHQAMGGSEQDWTQLVTDYPFLRNHMQAQTGVALEALVFGSVLQQSTEVSPEELNCVAHL >NZ_CP039227.1|WP_122942954.1|1432460_1432694_+|hypothetical-protein MKKSFVIILVIIALFSCFMVSFIAGGANGFLKIFSSLLSLLEWGILGFIIFVTGLFVIFGSIVVCAAVWDELFKKQK >NZ_CP039227.1|WP_155081510.1|1431639_1432260_-|hypothetical-protein MIYLTYVGTLIMIKIKKLPCILTLMPPLLSSLSSCSIYPVDLGTDATYKSPVTASALPFPIQVAPIKLTKAGLYKHYRFYSTEHFPAALRLTVQSMLTQANLGSPLNNNTHLKKVSTLKIKLYPIAINDSSKNTVIGTFSFSTTLENNQQTLWSKKLSATITGSSLDHLFNQAAQEIAYAINYTLTQECRFNINTVQCKGERFKIR >NZ_CP039227.1|WP_155067605.1|1430707_1431673_+|PAP2-family-protein MEVTGDKAATCKRNNVLITFISYLNKNFSYLDKATILLSTILILLSFLFSYINCKYTHYLSSVTPPLFIGSILIILAIMLTLLALPLRQALPKISLVFKLIGLYLIAWVAMLLAYNMQFTPFDPLDDYLYHIDLALGFDLGLWMQWLHQHPYIQQSLLYIYDSLEYQAFILPIIACFLVNQQDIELFLAKFAFLNLIGCLIYYFWPTASPASMVNSPYFTQGQLDIALQFKQLHEGIQPSVIGAGLISFPSFHVIWSALFTCLFKKKPYLFWPLLTLNIILWFSTVLLGWHYILDVIVGLILVLFAIAIFDYLILKRSPLH >NZ_CP039227.1|WP_155067606.1|1430306_1430717_+|hypothetical-protein MFKKIVSSFKSAASYSFLKESFSFIFSTSKKILTVSPDNKNGEKTQINELEISNYEIKKAKSVFRFLMWVYFLFFIIIFTYTLVNIVNHSLMTAIIGIAASLACLSLAFKYHFWLTQIKVGQLGITLKEWYESLWK >NZ_CP039227.1|WP_155067607.1|1429964_1430300_+|hypothetical-protein MDYNSTLAKVMRLYMGHRFFWKGDEISHEDVLSLSGNIIETLLRKVNLTYSFLFDSKISYSRKRLEGQSQESIHINSDKETAFILLLIVIDIMEEAVIKSGDDVYLDNYIK >NZ_CP039227.1|WP_155080363.1|1429343_1429964_+|hypothetical-protein MADSALTQVKLRNDFYRDNFRRVSLILLISILINVALLAAFIVSLSSRPEPKYFATTSNGQLIKLHSLSFPVMNDSAVISWLSDIVPNINSLDFLNYRTQIREKRKYFTSYGWEQYLKAFQPIVEKIRDNKYVARAVVSDVPVVIQKGNIDGVYSWRLQVPIIITYQQGASRDTQNVIWTVLIQRSNEHADSLFGIAQIIQKGDET >NZ_CP039227.1|WP_155080362.1|1428274_1429108_+|hypothetical-protein MPSPGNLDDNPNPLDQPAAGPEPASDQPIAQPAAGPEPAYEMAGGQPIAQSAAPAEGQEECDPDAEEQSVQDQAEAAADQERSTAASATEKEKKEKKKRLTEMRDALGKSHEDMGKQPERGRSISKQHRDKGNELTQRMEKLSNTDPKNVTDEEKNQFMDELKALGREANQLAMSDKEKVLLRGGFLGTLVSLFQKFITWDREYKVDFQLEAIKDQAEALKQKFDSELSEYNTAGADGPKPGGTGPKCADDEEDADNQRDEEKKKKQKEEMMKEFAM >NZ_CP039227.1|WP_155080361.1|1425124_1428238_+|DotA/TraY-family-protein MLSLVPGPGNDQSVYFLWQIFGNIIYWVSGQETSESDLTIIHYVISAFNSGLLSLLLVIYALVIFIGTLNTAHQGEFLGRNWSSLWMPIRAIFGPLCVVPVKYGFCLAQVVLLYGVLVGVQLANYVWNSLETDLDGTAIPSVPVSLLNSVKENVGRAVLYRSVQKVSDSLGLKTTDLPSTRLKSSYACDEVQGANQFYNIGNTPTFCANSQSLIPTSLLSKLTSYTSQLCQPNKFDNFIAAMRWFYQDPYNDNGMTIKPAGVPGLSSGTLAQQCVDAVDSLLTGGSSSMEKVYNYNFSVAGKNQVIALKANLGDAYLHDNNENKERYVNAVGHIAFNFENQNYSSGKASDYSKSADEFTRTIVNDLYKNDVKQAHSSLNDYLNELNKNLLNVAGDATNRLVKNTNVPTDVSVRQGTDIVTHSVNCNNYLINGNLSLRYLECLQLKDSGQTFSMYDVSNKDYPFENYIKSWWIGGGSYLAVDKIMNYNLEMVKNKLDQEISYPGMNIVSTVHYEIPLSVNYYPLINGHPPRYQNSEGNTEYASDVKTTIVSANAGVTSVTNTIPDGLSMVSSSWASNVYHAVPACIENSGSQACKDIITLQTQLLNLPSEWRPPFIYLFNLIKSGSKLAMKSISDSPKDVTFLNNVFYFLKQNGIYQSTTTTAVPVYAVIGRIFDQVGGNGLSSDMTAVMNEFYNLGMPSSNLFSKIMQAQQVGADVVQAVIDSFTNIFENYQEQFKDIQSTAESMIADWSWGAGIAGALGGLFGAGSIGTAAAILGQTAVQLYMATQIGNLSMSLAWLPIALVVLGSLFTAAISFVVMMPLIPYFLFWAGTIVWALSILEGLVAAPLVALALVYPEGHEILGHGSPAIKIALNIIFRPVLMVIGVVAAMALTYVLITYSAQGFHLVAPLILNNFSASGMVNGIVSCFLIFIYASFMMMAFSKCFSVIYLIPDKVFDWIGASAGHRAGAEEVQQLQGKTEGMGSQAGQSMGSGVQQGIQAKQTETQSSVQAQSQDIQVAEKAGEAAGSEARSAAEMAT >NZ_CP039227.1|WP_155067611.1|1424300_1425095_+|hypothetical-protein MNIIKKTLIVFAVISSVSLNSIQVVHADAVSLAVLLKELNAIESHQKVGNKELEKANSALNSGFPPDALKSFENLSPEPSLSKFSEYMQDIAHSGSKSKENNSVKAQIKNLPDNKYLMSLVQGQYYDKEVKENLLSAGASPQAVVLATAVLSQVNLNEKTNGQLLKAVQAQLSKNWQDGLRVSTRDQLLRMISLQLSVSNLSQYQQLRTQELMALLQLAGLMDHGVLLGKLTEINNKSIRIDKKLSEVNRQLDIINRHFKKSSN >NZ_CP039227.1|WP_155067602.1|1438257_1439529_+|phosphopentomutase MLKGRVIILLMDSFGVGASEDAEQFGDAGADTFGHIVEHAAHGLADSPERQGALKLPYLASLGLEQAAKQSRGRPIAKTITGDLELPIQGVYGYAIEQSCAKDTTSGHWEITGVPVEFEWDYFHKAAECKTPGQYSSCFPADFMRRFLVETGLTQGVLDAGHASGTEVINRLGDEHCLTGKPIVYTSADSVFQIACHEKSFGLERLYGLCQTARELFDEMGLNIGRVIARPFVGNKAGEYQRTGNRHDYSVPPPQPTLLEYVVKSGGEVISVGKIADIFADRGISHKVKATGITELFDQSLAAFKRSKAGSLVFTNFVDFDSQYGHRRDVAGYAKALEYFDSRLPELMDSMEPGDLMILTADHGCDPTWPGSDHTREHIPVLAWGPGLQSKNIGQRHSFADIGQSIADFMGLAPLAHGQSFLS >NZ_CP039227.1|WP_155080366.1|1439553_1440291_+|deoxyribose-phosphate-aldolase MDKTKKIVMALIDLTSLNLNDNDQMIMDVCAKASNRLGKVAAVCIDPKFVSLAKRLLKNQHIAVASVVNFPLGNDPIETVLADINQVLIDGADEVDLVIPYQDYLQKGGSEWALHLVKASKALCNDKLLKVILETGELKSHALIFKAACDAINAGADFIKTSTGKTAVGATVSAVKAMLDAIQVNLHYHPHVGLKVSGGIKTLAEASQYIHLAKEVYGKEKIQVSSMNLRFGASRLVDDLLSNDS >NZ_CP039227.1|WP_155067596.1|1440543_1441686_-|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIDLPTLQVIGWVIVGATLLAFALTSGFDSGIGILLPFIGRNDTERRLTLNVIGPTWDGNQVWLIAAGGAVFAIWPLVYSTAFSGYYVAMLLILWSLFLRPVGFEYRSKLPNQTWRNNWDVGIFIASFIPILIMGIAFGNLLLGSPFSYDPVFLRMQYTGSFIDLLSPFALLSGVIAIFMVTCHGAAYLNLRTKGIIKTRAQKALRLFAWCYLIAFALAGLLITYKIPGYLLGSQAGSIHDPLINHVNRHVGAWLNNYHTHHWMVLAPVIGFLGAFLAIISTHANRAIWSFIGTSFIQIGTLLTAAFSLFPFIMPSSSDPAHSLTVWNASTSQHTLTIIAIVAVIMVPIIFCYTSFVYIKMWRDGPIHEKDIEKNQHILY >NZ_CP039227.1|WP_155080367.1|1441702_1443304_-|cytochrome-bd-I-ubiquinol-oxidase-subunit-CydA MLPIEHVVELSRWQFGITALYHFIFVPLTLGMTWILFGMECLYVKTGKQVYKDMVRFWGKLFGINFAMGVVTGITMEFEFGVNWAYYSQYVGDIFGAPLAIEGLVAFMLESTFFGIFFFGWDKLSKKQHLFATFCLAIGSMFSALFILIANGWMQHPVGSQFNIDSMRMELTSFYDVLLNPTAQAEFAHTITAGLVTAAMFVTGISSYYLLKGRDIVFAKRSFIYGSFFGLIVLLGVAFFGDHAGLDVDETQPMKMAAIEGLWETPEAPAPWTILALPSNNQLKNLAAIKIPYALSIIATHSLDGTVKGMQEIIADNVVRMTQGRKAYLALIELRTEKNIDGKTLSAEQLTTAKHTLERYKDDLGYGLLLKSYISDIQHASEAQIQHVAKQAIPEVWAVFYSFRLMIGCFGIMLLIVLAAGFFNLRGKLWEQRWLFRTALYAIPLPFLACLFGWFVAEHGRQPWVVQNTLPTAMGTSSVSTGQLTFSLTGFALFYTLLFIIEIYLMFKYARLGPSALHTGCYHFEQPAHVNKS >NZ_CP039227.1|WP_017378241.1|1443774_1443951_+|hypothetical-protein MIDSIDTAMAQLTHNSGSFATFTSAGVVRRALTQAGFVVKKIPGFAGKREMMRGWETI >NZ_CP039227.1|WP_155080368.1|1443947_1445225_+|FAD-dependent-5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34)-oxidoreductase-MnmC MTMLVEGNYAPWNRLAASVTSPNVIVVGAGIAGASTSWALSTQGFNVTLVEKAAEAAQEASGNLAGLMMPALATDQSSFAEYFIQAYLYSIQHAKTLAQSHQFNFSQTGIIQLAFNDRQQKRQKNWLELEHVADLLEWVSQEQVMALSGLDFSCSGVYFKEAAWLSPYLYVKSHIHACKTSINCLFNCYVNQLHYEQGLWKLYDQHQHLIAEAPTLILANASDATRLLGQFSSVLPLSLRTVRGQVSALENHARISQLKLPVCYDGYITPVINGKNYLGATFIDDYQAKCLHQDRVQNIQQLKQVLPGLNIDKREYKDISQDRAALRCITTDYLPVIGPVPDVAFYRQHYSRLIQDRRESRYPSAQYLPGLFMNIGHGSRGMVSAPFATKLLVSELMGKNLKLSKRLREHLHPGRFLIRQLKKGK >NZ_CP039227.1|WP_155080369.1|1445581_1445995_+|hypothetical-protein MPINIKQSLKRFQAQDALQASGSFLKKGLPEGTNQADFIKAVNREIQIVIDGMQSIVRNNQPSASSYRGEDSVSGLLELQFLLSQLIAEPKQAISKAFLTLIASIIYQYYKQTEIYSKKMENEGWLYLRKKYQKKRF >NZ_CP039227.1|WP_155589561.1|1445952_1446225_+|hypothetical-protein MAILKKKISEKKILIPENKEEILFNDLFKSLEKNFYGIGIDSNSGSSGCFLAWVERGEITESEESAGWYNLKCPLPSDKKEPQLRNYFCL >NZ_CP039227.1|WP_155080370.1|1447358_1448039_+|hypothetical-protein MGIISIVRKNPSEPESNEFIFVAATTATASSGQEDHGLLHSSRNFKQENNFSYSGLKGVSSATTQTNSKNLIHIINQKIQSTIDEISEKKVNLCFKTAIRKKSVKELKNLQNVLEIIFTEPEEKLTKEFVQLIQEKISQAYEEKITYKNKRLVCCLFDELKQDLSALHCSIDSLSAGLSVANVSDKSQVQQCESVQSPMLFHQQHEQNLQPVDRDRSCYVMYETSV >NZ_CP039227.1|WP_155080371.1|1448281_1449163_+|hypothetical-protein MDLDENAFSYHKKNKRMDQEVDVGCFHILNVKKMNYHKSSGIFFVDKIAFLEVKKFLDNGHDLQVVTAGAYPPEMISKVFNELGIDIKLQHGENYFNRFDFGVGGSGALNKQEFIDKHLNNNKAMLIDDQFCNQPKAKEGVLFTLTLPSRPFPTLVAIDKQLVLNLQKVGIDYDEIWKHAKDNLELQALAATTVSSVEGWQKAKQFIVVKSALESFNPAQSYQTPFSLITVNKRENLRDLRGLCSAVAASEEHSGLLVGELARLLNLPSNNALKLEICPEGNAVSMNDIVKTL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP039227_3 | 3.1|1435289|31|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435289-1435319 | 31 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 85746-85776 | 0 | 1.0 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83226-83259 | 3 | 0.912 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 84366-84399 | 3 | 0.912 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83076-83109 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83106-83139 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83136-83169 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83166-83199 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83196-83229 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83256-83289 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83286-83319 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83316-83349 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83346-83379 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83376-83409 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83406-83439 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83436-83469 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83466-83499 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83496-83529 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83526-83559 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83556-83589 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83586-83619 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83616-83649 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83646-83679 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83676-83709 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83706-83739 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83736-83769 | 4 | 0.882 |
NZ_CP039227_3 | 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder | 1435346-1435379 | 34 | NZ_CP039048 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-073 plasmid unnamed2, complete sequence | 83766-83799 | 4 | 0.882 |
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90. spacer 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder matches to KU686195 (Synechococcus phage S-CAM1 isolate 0810SB17, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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94. spacer 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder matches to KU686192 (Synechococcus phage S-CAM1 isolate 0309SB33, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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95. spacer 3.2|1435346|34|NZ_CP039227|CRISPRCasFinder matches to HQ634177 (Synechococcus phage S-CAM1 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8320 : 67215
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039227|8320:67215|DBSCAN-SWA 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54 | unidentified_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
75064 : 131164
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039227|75064:131164|DBSCAN-SWA AATGTTAAACCTTGCTGACATATACACAGACTATCTAATCGCTCAAAACAAACATGCAACAGCTACCGGATTAGCAGATTTAATGCCTGACGAATTGTCACATGATCAGATAACTCGCTTATTGAATAAAACCCCACAAACATCAAAAGACCTTTGGTTAAAAATTAAGGCTGATGTTCGTGAGTATGAGGGACTTGATGATGGAGTTTTAGCCTTAGATGATATGATTGCTGAAAAACCCTACAGCGATGAAAATGATATTATCGCCTGGCATTATGACCATAGTAAAGGTCGAACAGTGAAGGGCATTAATATCTTGACAGCGATGGTGCGCTACGGAGACGTACGCTTGCCTATCGCTTATGAAGTGATAGAGAAAACCATTCGTTATAGTGACCTTCAAACCAAAAAAGAACGAAGAAAGTCTTCTTTTACAAAAAATGACCTTTTTCTAAAACTTCTGAATGTCGCTATTCGTAACGACTTAAAGTTTGCATATGTGCTTGCAGATCGCTGGTTTAGCAGTCAATCAAATATGAGCTATATCCACAATGTTGGAAAGAAATTTATCATGGGAATCAAAAGTAATCGATGTGTCGCACTGACTGAAAAAGATAAAGAGAATGGTAAGTATCAACAACTAAAGCAAATATCATTAGAAGACGGCATTCCTCAGACTGTGTACTTAAAAGGTATGGCTTTCAAAGTACAGGTTATGAAAAAAACATTCAAAAACGAAAATGGTAAGGAAAGTGTCTTATATCTAGTAACTAATGACTTGAGTATTGATGGCCAACCCATCCTGGATACCTATAAAAAACGCTGGAGTATTGAGGAATTTCACAAGTCAGTAAAACAAAATTCGAGCTTTGAAAAGTCACCTACGCGGATTGTCACATCTCAGTTGAACCATATTTATTACAGTATTCTTGGGTTTTGCAGATTGGAAAGATTAAAATTGAAAAAATCTTTAAACCATTTTGCAATAAAATATAAGCTGATATTAAGGGCTAATCAAATTGCACTTCAGGAGCTTAGAAGTATGGTTTAAAGGTTAAGCGCGTAACATGAGTAAGTTAAAAGAAAAGAAAGGGCTAACTTATGAGGAAGTTTCAGAGCTCTTTGGCGTTTCAATGAGGACGCTGTTTCGATGGAATACAAGAATAGAAACGCCCTCCGTCACATGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGTCTTTTTGACTTATGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAAGGAGACTCGTTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAGGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGCGGCAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGGACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCAAAGACGGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGACTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCATTGAAGCAGGCTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATATTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAATAAAAAAGAAGGCACCAAAACCTCGAGTGATTAACTTAGAAGAGCTAAAGAATGATGTAAAAAATTATCCGGATAGTTATCAATGGGAACGTGCGCAACGTTTTGGTGTAAGTCAACACTGTATTCAGCATTGGTTGAATTTCCTTGCAATCAGCTGTAAAAAAAACACTAAAACACCCAAAAGCCAACGAAAATACACGTACAAGCTTCCAGAATAAAATCAAGCGCTACGCCGGCTATGGTCGACCCATTGTTTATTTAGATGAAAGTGGTTTTGCAACAGATATGCCAAGAAAGCGAGGCTACTCCCAGAAAGGAACGCGCTGTTATGGTGTTCATAACTGGCATGAAAAGGGTCGTATTAATGTCATTGGTGCCCTCTTAGGGAAGTTATTATTAACAGTCTCTTTATTTACTGGGTCAATTAATTCTGATGTGTTTTATGCATGGCTAGTTAAAGATTTATTGCCTAAATTGCCAGCACATTCAGTAATTGTTATGGATAATGCGCGCTTTCACAAACGCTCTGACATGATTGAAGCGATTGAAGAGCAAGGGCATACACTTGAGTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAAGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAACTATAGTTAGCGTTTACTTGCACAGTGCCATTTTTTTTAGCTTGGTGAGCAAAGTGATAAATGAAAATTTTGTTTTTGTTTTTATATTTTAAATACATATGAAAATATATCTGATATAAATTAATTTATATTTAAATAAATTTTATTTAATCGTTAATTAATGTTATTAATAAGTAAATTAAATGACTGGCTAATGAATAACCAGTCTATTAAAATAGGTTAAAAGTATAGTCTTTATTTAGTTAATTTTTAACTTTTATTTCAATAACATCAAAAAGTGTGGCTAAAATATTATCACTATACTGTGCATCAAGTTGGCGTACACAGGTGGGGCTGGTCACATTAATTTCCGTTAAATAATCACCGATAATATCTAAACCGGCAAATAACACACCTTTTTCTTTGAGCATGGGGCCAATTGTTTGGGCGATTTCTAAATCGCGTTCGCTTAATGCTTGGCCGATACCCGTGCCGCCGGCGGCAAGATTAGCGCGGCTTTTATCATCTTTTGGAATGCGTGCTAGGGCATAAGGGTAAGAGCTGCCATTAATGATTAAAATGCGTTTATCGCCGTATATTACCTCAGGAATAAACTTTTGTACCATTAATGTTGTACTGTGATTTTTGCTAAGGGTGTCTAAAATAACCTCAAGATTAGGATCGCCTTTTTTTACTCTAAAAATAGATTCTCCACCCATTAAATTAAGAGGCTTAATTACTATTTCATCATGTTGATTTGAAAATTTAATAATTTGAAGTTTGTTTTTTGTAATTAATGTTGGTGTGCAGAATTTGGCATAACGGCTGATAGTGAATTTTTCATTCAAATCACGCAGACTTTGTGGTTTATTGACGATCAATACACCTTGAGTTTCTAATTGCTCAAGCATATAGGTGGTATAGATATATTCTAGGTCAAATGGTGGATCTTTACGCATGAGTATAACGTTGAGTGTACTTAAATCCAGTGTTTGCTCTGATTCTATATGATAAAAATCATGAGGCTGATCTTGCACGGTGACTTGCTGACAATGGGCATAGACTTTACCATTAGTACTATAAAGTGCATGTTGTTGAATATAGAAAATATCATACCCTCGTCGTGAGGCTTCTAACATCATGGCAAAACCGGTGTCTTTTTCAGGAATCACCTGATTAATATCATCCATGATAATGCCAAGCTTAATGTTACTCATGAGGGTCTCCTTTTGAAAATGACTGTAGTTTTTATTGCTGTTATTTAAATAAATTTTTCAAGCAGGCTATTTAAAAACTGCCTGCCCTTAAAGCTTGTGCAGATTGTATCTGGATTTGCACTTAATAAACCTTGTGTTTGTAATTGAGTTAATTTGGGTTGAATGGTGCTGAATGCTAATCCTGTACGTGTAGAAAAATAGCGTGTTGGTACACCCGTAGTTAAACGCAGTGCATTCATCATAAATTCAAAAGGTAAATCTTCAGGTTTTATTGTTTGTGATCCTGCCAGTAAATTTTGCTTTGAATCTAGATAGGCTTTGGGGTGTTTTAGTTTCCAGCGTCGTGTAATGTTATTTTGCTTAATTGATGTAATTTTACCATGGGCACCGGCACCGATGCCAAGATAGTCACCAAATTGCCAATAATTAGTATTATGTTTGGCTTGATGTTGATCTTGACTATAAGCAGAGATTTCGTATTGGTGTAACCCTTGCTTTTTTAATAACTCTTGACCTGTTAATTGCATCTGCCAAATGGACTCATCATCAGGTAATTTAGGGGGCCGTGCATGAAATAGCGTATTGGGTTCAAGAGTAAGTTGATACCAAGATAAGTGAAGAGGTTTTAAAGCAATCGCTTGTTTTAAATCAGTTAAGGCTTGATTGTGAGTTTGGTTAGGTAGGCCATACATAATATCGATATTAAAGCTGTTAAAGCCGGATTGATGAGCAATATCGATGGCTGCAAAAGCGTCTTTGCTGTCATGTACTCGCCCTAAATTTTTTAATTGACTATTGTTAAAGCTTTGAATGCCG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56 | Hokovirus(15.38%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
197123 : 240461
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039227|197123:240461|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039227|197123:240461|213600_213951_+|WP_155066936.1|transposase|DBSCAN-SWA MGYPVEFRRKVFKLKEKKGLTYEEVSELFGVSMRTLFRWNTRIEIKKKAPKPRVINLEELKNDVKNYPDSYQWERAQRFGVSQHCIQHWLNFLAISCKKNTKTPKSQRKYTYKLPE >NZ_CP039227|197123:240461|216332_216734_+|WP_155079642.1|DBSCAN-SWA MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMIAEKPYSDENDIIAWHYDHSKGRTVKGINILTAMVRYGDVRLPIAYEVIEKTIRYSDL >NZ_CP039227|197123:240461|215819_216290_+|WP_155079640.1|transposase|DBSCAN-SWA MNVAIRNDLKFAYVLADRWFSSQSNMSYIHNVGKKFIMGIKSNRCVALTEKDKGNGKYQQLKQISLEDGIPQTVYLKGMAFKVQVMKKTFKNENGKESVLYLVTNDLSIDGQPILDTYKKRWSIEEFHKSVKQNSSFEKSPTRIVTSHSCYAARAN >NZ_CP039227|197123:240461|210855_211434_-|WP_155066397.1|DBSCAN-SWA MHSFLISTLTVSTAELGDKTQLLTLLFAARFQKPLPIILAIFIATLLNHGITTWLGVFFSSFFSPIILHSLLMLSFIITAIWALIPDTLDESEPKKTKNKNIFWVVLITFFIAELGDKTQLITLTLSIQYQTIFWVTLGTTLGMMIANIPAVFLGKIWCKRLPLQQIRIASALLFIILASYEAYQLVQLFNS 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50 | unidentified_phage(75.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
280938 : 313241
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039227|280938:313241|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP039227|280938:313241|283615_284866_+|WP_155079703.1|DBSCAN-SWA MSNIESKQAALDYHSKPVPGKLSISVTKSMETQQDLSLAYSPGVAEPVRAIAEDPNAAYRYTSKGNTVAVISNGSAVLGLGNVGALASKPVMEGKAALFKRFANIDAIDIEVDADNPSDLINTIARISPSFGGINLEDIKAPECFQVEHALHERLDIPVFHDDQHGTAITIAAGLLNALKLQGKELKNCNIVCVGAGAAGLTSMRLLTTLGASRDKIFVIDREGVIHSERQRLNPYKYAFAIETDKRSLEDAVRDADIFIGLSAPNILTPEMLATMAAKPIIFALSNPDPEIHPAVAHKVRDDIIMATGRSDFPNQVNNLLVFPFIFRGALDVRAKRVNMEMQIAAVNAIRDLAHKEAPKEVVSAYAKGEILSFGAEYILPKPMDPRLIECVPAAVAKAAIETGVAQLGYPSHYPE >NZ_CP039227|280938:313241|302139_303060_+|WP_155068445.1|DBSCAN-SWA MISGAGIVVIVLVVLAITVILMGVKVVPQGSEWTVERFGRYTHTLKPGLAFIIPMVDSVGAKLNMMERVLDIPSQEIISRDNAMVRVDAVVFFQVIDAAQAAYEVNQLEHAIRNLTMTNIRTVLGAMDLDSMLSKRDGINRKLLTVIDEATGPWGVKVTRIEIKEIAPPSDLVDSMARQMKAERDKRAAILESEGLRQSEILRAEGSKQAVILAAEGEKEQAFRQAEARERLALAEANATETLSNALSTGNVQAINYFIAQKYIEALSTIGSAENQKVIMMPLETSQLIGSVGGIGEIIKSTFKDN >NZ_CP039227|280938:313241|309238_309796_+|WP_155079478.1|transposase|DBSCAN-SWA 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29 | Faustovirus(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
424483 : 486964
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP039227|424483:486964|DBSCAN-SWA 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71 | unidentified_phage(44.44%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
508600 : 593125
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP039227|508600:593125|DBSCAN-SWA 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MGDDFKLSLLSVKKIVDGEDIKVLSENDPKKKGAWFKEFFRDLIRNLLGNTSNNGNEVKELSESTTSLFKDAFSHHQKEPSQPMSSSVAVMVC |
97 | Acinetobacter_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
597788 : 647426
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP039227|597788:647426|DBSCAN-SWA 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56 | unidentified_phage(22.22%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
651145 : 746410
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP039227|651145:746410|DBSCAN-SWA 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108 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,integrase,transposase | attL 646522:646581|attR 698059:698542 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
766584 : 802259
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP039227|766584:802259|DBSCAN-SWA 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41 | unidentified_phage(33.33%) | tRNA,integrase,transposase | attL 771835:771894|attR 802612:802750 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
875485 : 912265
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP039227|875485:912265|DBSCAN-SWA 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42 | unidentified_phage(28.57%) | integrase,transposase | attL 878038:878097|attR 899492:900451 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
932206 : 975528
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP039227|932206:975528|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
989625 : 1228049
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP039227|989625:1228049|DBSCAN-SWA 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236 | unidentified_phage(20.0%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1056724:1056783|attR 1094804:1095430 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1234003 : 1357566
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039227|1234003:1357566|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP039227|1234003:1357566|1255741_1256083_-|WP_155080278.1|DBSCAN-SWA MLNLADIYTDYLIAQNKHATATGLADLMPDELSHDQITRLLNKTPQTSKDLWLKIKADVREYEGLDDGVLALDDMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP039227|1234003:1357566|1248196_1248409_+|WP_155080273.1|DBSCAN-SWA MVYQDLRNKFAQNSIYLSSQQATRYFGKLPLRVVMRFVFFRSKLRGIRPLAIDVTSFHVLKQLSMRKSCL >NZ_CP039227|1234003:1357566|1354178_1355213_+|WP_027242800.1|DBSCAN-SWA MILRRYLAKQCLSMTLLILFALVALDFFFGLIGNLDGNSFIQALVFMLWRLPEDMNQLIPISGLLGSLLALGQMSRNSELVVMRVAGFSMLKIARAVAGAGFLLAIVLFFNMTLIAPWANQQLRSLNHTGKSNQATLTQVWLRSDHGLVNIQAFWPNGVLTGVSRYEFKEGKLDRIELAQKVRYQNNQWHAGDIKTVDISDKKVTYNSTQSALWQSLMAPKLLTLVATPADELNVVGLWRNIIYRVQNSLNSNQYEFVLWQSIFTPVSAILMMLLAVPFIFGAGRNSSLGFKMMLGILVGFGFFIVNQFVGSLSSLIQLSPLLAASFPSILCILLFVYGVQRLG >NZ_CP039227|1234003:1357566|1237196_1237649_-|WP_155068622.1|transposase|DBSCAN-SWA 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115 | Leptospira_phage(21.74%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1361294 : 1402904
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP039227|1361294:1402904|DBSCAN-SWA ACTAAAAGCCTCTAAATCGGCTGGTTGCTAGCTCTTCATAGTAACTGTACTTTTCCCTAAGAGTTAGACCAAATTGGGTGCTTATCCTTCTTAACTGACTGCCGCACAAGATGCATTTAAGAGGGTTGTAGTTGAAATTACTTTTCATCAGTGAAACAAACGTGACCTGGTTATATGCCTCAATAGTTTGCCCGACTAAATCATAAATTTTTGGTAGTATTATTGTCCGAGTGCGATAGCTTAGAAATCCATAGTAGCGGATCATTTTAAAGAACTTGTCCGGGATGTGTTGGGTAAGGCGATCAATAAAATCGTCGATACTCTGCTTTTTCATTTTCTGCTGTTTGGTTTTGTGATCCAGGTAACGAAAGATCACAACATTACCATCATAGTGCTCCATTCTGGCGTTGGCGAGAGCCGGGCGTTTAATGTAGCGGCCGAGGTAATCGACATTGTGCTGGTGATTTTCTTTGGGTTGAGCAAAGTGGACTTTCCAAAATTTCTGGTATTCACGATTTAAAAATCGATTGAAGGTTGTAAGGTCACTGATTTCACTCTGGTATTCATCAGGAATAGTCAACTCCCCAGCTTTGTAGGTTTGCCTAAGCAGGTTGGTGACGGCATAGCGCCACATTGGCATAATAACTTTGCGAGTAAAATAAATCTCACACCAAGAATCATTAGCTTCGTCATAACCTCCACGTGTGACGGAGATATGAACATGTACATTCCATTTCAGATCTCGACCAAATGTATGTAAAGCGGCGAAAATGCCAATGATAAGGCCTTTCTTCTTTGCGGTTTCTAGTAACGTATTGGCTGCAGTCCTAAAGATTATATTGAGTAATTCACGATTGAATAAGAAAAATGCCCAGAATTTTCTAGGCATAGTAAATGTGATGTGTTGCCATTTGCACTGTGGGAGAGTGGCGTTTTGCTCTTCGATCCATTGCTCTGTTGCTTTTTTTCCACAGGTTGAGCAAAAGCGGGACTTGCATGTGAAACAAACGACCTTGGTATGTTCGCAGTTTGGATTGGAACAACCGTAAACATCACACCCCATTAACTTGGTGCGACAACCGAGCACTTTGAGAACATTTTCATCAACGGCAGGTCGAATGGAATCAGCGTGTTTAGCGCGATAGTTCCACCAAGCACTTCGATATTGAAGTACGTGCTTCAGTGTGAATTGAATTTGATAGGTTTCATCTTTCTGCCGCTGGATAACCATTGAGAACAAATTACCATATTAAACAACGAATCAGGATAACAAGGTTAGATCAGATCTAACAAGACTAATGTGAGTTAATAAGCGGTAAAGTGACGGGTGTTAGCAGGGACATCCGAAAGTCGCGAGCTGTGCGAGCCTATTCTTGAAATGTTATGGCATCTGCTATCGAGAGTTGGCAGAAGCCTGGACTTTATTATGTGCTAAGCACTAAATCTTCCCCTTGTCTTTAGGTTTACCAAAACCACCATGATTTTTTCGGTAACGAAGACTCACACTGTATAAGCTGGTGGTAGTAACTATTCGCTTTGCTGCGCACTTGGTGGGCTTTGGCAAGGAGCCAGCGTTTTTTTAGATAAGTGCGTTTACGATAGCCACCATCGCCCTCATGATAGGCAAGGTAGAGTGAATACGCATTATTTTTAGCAATGCCTAAACGTGAATATGAGCGATTGGCATACCAGCCGACAAAGTCAATCGCATCAGCAAAGTCGGTTCGTGAAGCACGGCTATTACCTGTTGATCGTTGATAGGTTGCCCAAGTGCCATCGGTGGCTTGGGCATAGCCATAGGCAGAGGTTGGGCGTGACCAGGGAATAAAGCCCAATAGCGTTGTACGTGGTGGCCTGGCATCATAGCGAAAGTGAGATTCGTAATAAATAATAGCCATTTGGGCGCTGATTGGTACGCCCCATTTTTTACGTGAGTCTTTGGCTGCCCAGTACCATTTAGGGTATTCACGAAATATGCTACAGATATTATTAATATTTTGTGGGGGTGCGGTTGCACAGCCTGCCAGCATGCTTGCCAGTATGCATGGAATAATCAGCAAGCGAGAAAATTTTAATTTAAGGCGAAAGCCCTGATAGTTCATAGAGCGTTTCGTGAATGATCGTAACTTTATCAAAGCTTTCTTGATATTCTTGTTCAAGTTGAGAGTCTGCAACGATACCTCCTCCGGCCCAACAGTATGCATGGTTCTGGTGGCAAATTAGTGTGCGAATGGTAATGTTTGTATCCATATGTCCATCATAGCTAATATAGCCAATACTACCATAGTGAAGACTACGACGATGTGGCTCAAGCTCCTCAATGATTTCCATGGCACGAATTTTAGGTGCGCCGGTGATTGAGCCGCCAGGGAAAGCGAGCTTTAATACATCGGTCGCGTGTGTCTGTTTTGCCAGTGTGCCGCGCACTGTACTGACAAGATGATGAACATTTTTAAAGCTCTCAAGCTCACAGACCTTTGGCGTGATGACTGAGCCTATCTCGCAACTGCGGCCTAGATCATTACGCATTAGGTCAACGATCATGATATTTTCAGCTCGGTCTTTTTCACTATTAAGAAGCTTTTCTTGATAGCTTGCATCTTCTGCAGCTGTTTTGCCTCTGGGAACGGTACCTTTAATTGGCTTGGTTTCGACAATGTTGTGATTGATTTTTAAAAAACGCTCGGGTGAACAGCTTAAAATTTGGTTATCACCGATATCCATATAACAGGCAAATGGCGCTGGATTATGCTGACGTAATTGCAAATAGGCATGCAAGGGGTGTCCAGTAAACGGTGCAACAAAGCGCTGGGTTAAATTAACCTGGTAACAGTCACCGGCATGAATATAGTCTTGGATTTTATTAAAGCGCTCTTTATAGTCATTAAAGCTCAAATTAGAGTTAAATTGGCGTGTTAATTTAAAATCAGTAAAGTGACTGCATATCGCTGTCTTAATATCATTATTAGTAGTACCGTGAATGGGACTTTTTGACAGTTGCTGATAAATATCAAGGCTGTTTGCTTTTTGTTGCAATGGACTGACCCAATAGGCAGCTTGGTTTTGATGGTCAATAATGATGGCCCAATCGTAAAGGCCAACAGCAAGATCGGGTAGGTCTAAGTCATGTTCAGCGTGCTCGGGTAGAGTCTCGAGTATACGTCCCAAGTCATAACCAAAATAGCCTAAAGCCCCGCCGCAAAAAGGCATGTGATAATTTTCTGGTATGGTGATGTGCGTATTGACTTGTTGAAGGTGCTCTTTAATAAAACTAAACGGATCGAGTGTTGTGACTTGAGTCTGGTTGCCTGCTGCATCGGTACTATAGGTTTGATTATGGTGATTGATAATTTTTTTATAGGGGTTTGCAGCAAGAAGATCAAAGCGACCACTGCTTAATGGCGCACAGCTATCTAGCCAGATGGGCCAGTCAAGGTGGGCAATTTTAGAAAACCAGTGTGCCGAGTCTTGAGTATAAGAAAGCGGTTTAATCATCAACATAAGGTATCGGTCTGCTGTATTGTCAATAAAATTGTCCGTTATTCTAGCAAAAAAAAATTAAGAATACAGTAGATGCGCTTGCAGCTGACTTAGGTGCTAAGTTAAGTTAGTTGATATTTTAGTTTATTATAATCTAGGGTAAGTGATTTGGGATCAGTTAAATTTAAGAGTACAGGGTATAAGAAAAAAAATGCATGCGAATATTTATGGTCAAGATGACCAGGACTTAAGAGCATTTAATGCAGATCACCGTTTGCATATGCAAGCAAAATTACCATTATTAAGCTTGATTGAAGCGGCACAGCATACTGGGATTCATTTGGCTTTAATCAGTGCTTATCGTAGCTTTGACCGTCAATTGGCGATTTGGAATGCAAAAGCTTCAGGTGAAAAACCGGTGTTTGATCGAACGGGTCAATATCAAATTCAGATAGATCAGCTGACTCCCAAGGAGCGAGTATTTGCCATTTTAAATTGGTTTGCCTTACCTGGCACCAGTCGACATCACTGGGGAACTGACTTTGATATCTTTGACTTAAATGCGCGGCCACCAGGGTATCATATTCAGTTGGTGCCCAGCGAATATCAGCCAGGAGGGGTATTTTCGAATTTAGGACAGTGGTTAGATAATAATTTGGCTAATACGCCGTTTTTTCGGCCGTTTTGGGGAGAATCCAGTGGTGTCGCTGCAGAGCCTTGGCATATTAGTTATCGACCGTTGGCAACTGAGTTTCAAGCCTTATTTTGCATTGATGATTTGACTAAGGTGATTGAGCAAGCGCCTATTTTATTAAAAGATGAGATTCTAGCTGAGCTGGATGAGATTGTTAGTCGTTTTGTTTTGGCGATTGATGATGTAAGGCGATAGCCTGAGGTATACATGGGTTAGGGCGAGGGCGTTATGTGCTAAATACTAGGCATTTTGTCAGTATGCCTTTATTATATGGGCATTGATTTTGAAAGAACGAGTACAAAGGTAAGAGGAAACATGCTTGATCCAAAACATTTACGTACTGATTTAGATGATGTGGCTAGGACGCTAAGAAAAAGAGGCTTTGAGCTGGATACGGCTAAACTAATCTTTTTAGAAGAACAACGCAAAAGCTTGCAGAGTGCAACCCAAGAATTGCAAAACGAGCGTAATTCCCGTTCTAAGTCGATTGGTCAAGCAAAAGCGCGCGGTGAAGAGATTGCGCCTTTAGTTGCTGCGATTGGTGACTTAGGTGAGCAATTAAATGATGTTAGTGCCAAGCTTCATTTGGTTCAACAAGAGCTTGATGAGTTATTGCTGGGTATTCCAAATTTGCCTCATGAGTCTGTGCCTGCAGGCAAAAATGAAGATGACAATGTCGAAGTGCGGTGTTGGGGGGCGGTGCCTGAGTTTAGCTTTACACCAAAAGACCATGCTGAACTAGGTGAGTCATTGGGCGGTTTGGATTTTGAGCTGGCAGTCAAGCTCACCGGCTCACGTTTTGTGGTGATGCGTGGGCAGATGGCAC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38 | Acinetobacter_phage(37.5%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1377912:1377971|attR 1383232:1383329 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1449157 : 1484679
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP039227|1449157:1484679|DBSCAN-SWA 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33 | unidentified_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1489767 : 1549358
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP039227|1489767:1549358|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1553559 : 1666069
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP039227|1553559:1666069|DBSCAN-SWA 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113 | Acinetobacter_phage(15.38%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1686574 : 1738408
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP039227|1686574:1738408|DBSCAN-SWA 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52 | Adoxophyes_honmai_entomopoxvirus(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_19 |
1743820 : 1792479
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP039227|1743820:1792479|DBSCAN-SWA 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58 | unidentified_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1801395 : 1825586
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP039227|1801395:1825586|DBSCAN-SWA 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27 | Hokovirus(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1851520 : 1905194
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP039227|1851520:1905194|DBSCAN-SWA 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52 | unidentified_phage(45.45%) | integrase,transposase | attL 1862239:1862298|attR 1910707:1911151 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1916537 : 1963156
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP039227|1916537:1963156|DBSCAN-SWA 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52 | unidentified_phage(36.36%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1966367 : 2004573
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP039227|1966367:2004573|DBSCAN-SWA 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47 | Leptospira_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2022566 : 2254558
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP039227|2022566:2254558|DBSCAN-SWA 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229 | unidentified_phage(15.38%) | tRNA,integrase,protease,transposase | attL 2097188:2097247|attR 2129332:2130291 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2274582 : 2322469
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP039227|2274582:2322469|DBSCAN-SWA TATGCCAAGAAAGCGAGGCTACTCCCAAAAAGGAACGCGCTGTTATGGTGTTCATAACTGGCATGAAAAGGGTCGTATTAATGTCATTGGTGCCCTCTTAGGGAAGTTATTATTAACAGTCTCTTTATTTACTGGGTCAATTAATTCTGATGTGTTTTATGCATGGCTAGTTAAAGATTTATTGCCTAAATTGCCAGCACATTCAGTAATTGTTATGGATAATGCGCGCTTTCACAAACGCTCTGACATGATTGAAGCGATTGAAGGGCAAGGGCATACACTTGAGTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAAGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAACTATAAAATTAAATCTTTCGTCCATTTATGAATAATTTTTGCCATCATATAAGCCTCATCATTCGGACTATAACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAATCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGACCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGATAGCGAGTGGTAAATCTCTTAACTCATAAGCAATACAATAAGGACAATGAAAAATATTATGAGGCCAAAACGGCTGAATCCCTTCAATATTAGGCAATAAATCTGTCACTCCCGTTGCGAGTATAACCCGTTTAACAATCAGTGAGCCGCATCGCTTAAAGTCATTAAAAAATCGTCACAACCTTCACGCTGCATGATCCTATTAACCTGTAAATAGCAGCGTTTTACCTTACTAAATCTATCAATCTGTTGATTCGTCTCTGCAATAATCTGATGTGGCGACTTGTTTCCATACCCGACGACATTATAAGCTTTCAGCGCGTGATGATTCCTTGTTCCTTGTTGTGAATCTACTAACAGTACACGCCGATTTGCATTAGCTAAAAATAACGTTGCCGCTAATCCTGAAAACCCCGCACCAATCACCACAACATCATAATCACAATAACTCACATCATCACCTTCAAAGTTAATCAATAATCACTGTTTTAATATTCATAAACTCGTGCAAGCCCTCAGCAGCCAGCTCACGGCCAAACCCTGATTGCTTAATACCACCAAAAGGTAATCTCGGATCAGAAACAACCAATGTATTAACCGCACAGGTTCCTGCCTTAATTTTATCACGCGCAATCTTCTCACCTCGTTTAATATCACGAGTAAATACTGCAGCTCCTAAACCAAAGGGCGTGTCATTCGCAATATTAATAGCCGCAGCTTCATCTTGGGCTGATAAAATACTTACAACAGGGCCAAACAACTCTTCATCATAAGCTGGCGTGCCTTTTTTCACATCAACCAAAATGGTCGGCTCATAATAATAGCCCTCGCCCTCTGCACGTTTGCCACCTAAAATACACTTTACTCCTGCTGCAATACTCCGTTGCACTTGCTGATCCAGCTGTTCTAATAAATCTAAACGTGCCAGCGGGCCCATCTTTGTTGACGCTCTCATAGGATCCGCACAGTGATAAGTTTTTACACACTCGATAACCTTACCAACAAATTCATCATAAATTGCATCAACAGCAATAATACGCTTAGCAGCAATACAAACCTGCCCAGTATTATTTAAACGCGACGTCACGCATTGCTCTGCCGCTAAATCCAGATCCGCATCTGCTAGAATAAGATAAGGGTCACTACCACCTAACTCTAATACTATTTTTTTCAATGCATGTGCTGTTTGTGCACCTACAGCTCTACCCGCCCGACTACTACCAGTTAACGTTACACCTGCAACATATTCATGCTCTATCACGGTAGAAACTAAATCAACATCTATCACCAAACTACGAAATAAATGCTTAGGAAAACCAGCGTTAACAAATAATTTCTCAAGCGCAAGCGCCGCACCTGTTGAATTCGGAGCATGCTTTAACAATACAGCATTTGCCCCCATAATATTGGGCACAGCAAAACGCAAGACCTGCCAAAAAGGAAAGTTCCAAGGCATAATTCCAAAAATAACCCCTAAAGGCTCATAACAACGATAGCTTTTAACTCGTCCAGCATCGATTAATTCAGGTTGTAACTGGCCCTCAGCAGACTCTGCATAATACTCACAAAGTACCGCACATTTTTCAATTTCTGCTTGCGCCTGAGTCACCGGCTTACCCATCTCTTCGGTAATAATGCGTGCACAAGCCGCTTTTTCCTGACGCAATAAAGCAGCAAGCTGATGCATTAAACTCTTACGCTCACGCCAACTGGACCTTTCCCAACGCTGTCGAGCTGATGCAGCATCATCAATAATTGAGAGAATCTCTTCTCTGGACATTGTTTCGTATTGATGAAGCAATACGCCTGTCGCAGGGTTTATTACCTTTAGTATAGCCATGCCCTTCTTTTCCTAATGATCTTAAAAACTAAAAGCTAGCTTATATAGTATTATTTTTTTAACTCGAGCTTTATTAAATCAAACCATATAAAATCATATGGAGAGTATGATTCTATAACTCTAAGTAGGTTATTCTTCATTAGATAGCTCGACAAACAATCCAACTATAAACCATAGCAAGAATAACACCACCGATGAAGCCCATAATAAACCACCAATAAGCTCTTTAAAAGAAAATTGGACCATAGCCTAGGTACACAGATGAAATTAATTTTACCACAGGCCACAGCCAACCAAGCTAAGATAACTACAGTCATCCCCCAAACAATACCAATCGCCCACCCTAAGCCATAGACACTTAATCCCTGGTTTTTCCTGGCCATTTATTCCATCCTAAGTTTATACCTAGATACGAAATAACAATGAAACTCATGTTACGCAGCAAGAGCTAATTGATACTATAATGTTTTGTTCAACAACTTGATTTTTTTGGTAATAATGTTAAACCTTGCTGACATATACACAGACTATCTAATCGCTCAAAACAAACATGCAACAGCTACCGGATTAGCAGATTTAATGCCTGACGAATTGTCACATGATCAGATATAGCGCTCAACGAACAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGCCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCCTATTGTGGTTCAATGAAACTGGACACTTAGGTGGGAGATTAAATATTATGATCCATCGAGGTGTTTATGAAGCAGAAGAAACAAAGCAAAAGTTACCCTAAAGAATTCAAGGAAGAAGCTGTTGCTTTAGTGACAGAACAAGGCTACAGCGTTCAAAAAGCGGCAGATTCTTTAGGAATTAGAGCCAACTTGCTCTATCGCTGGAAAGATCAGCAAGAAAAACAGGCGAAGTCTACAATGAGTCCAGATGAAAAAGAAGAGCTAAAAGCCTTACGTAAAGAAGTGAAGCAGCTCCGTATGGAGAAAGAAATTTTAAAAAAGGCCAGTGCCTTCTTCGCGAAAGAAATGAAGTAAAGTTTAACTTTATTAGAGATAACAAAGACTTATGCCCTGTTAATTTGATGTGTAAAATTATGAAGGTGAGCACATCAGCCTTCTATAGTTGGCAAGAGCGCCCTGCCAAAGTAATCTCAGTAGAGGAGCTGCAACTATACAGGCGATGCAAAGAGCTATTTAAACAGAGTCGTGAAAGCTTGGGATCTCGTATGATGGCTAAAAAACTTCAAGAAGAAGGCGTTACTGTTGGGCGCTATCGAGCGAGAAGCTTGATGCGAAAGCTTGGGCTGAAAGTTAGGCAGCGTATTGCTTATAAAGTGACAACAAAGCGTAAACATCACCACGAAATCGCTGATAATTTACTTAATCAGCAGTTTAACCCAACGACTCCAAATGTGGCTTGGGCGGGTGATGTGACCTATTTGAGAACAAATGAAGGCTGGATGTACCTTGCTATTGTGATGGATTTATATTCTAGAAAAATCATTGGTTGTTCAATTAACAAGAGAATGACCACTCCATTAGTAATGAGTGCTATGGAAATGGCAATTAATTTACGTCAACCTGGCGAAGGTGTTCTTTTTCATAGTGATCGTGGCTCACAGTATACCAGCAAAAAGTATAGAAAACTGCTTTCAAAACACAAAAATAAATTTGCGCAAAACTCAATTTACCTATCCTCGCAGCAAGCTACGAGGTATTTCGGAAAATTACCCCTTCGGGTCGTAATGCGCTTTGTTTTTTTTCGCAGCAAGCTGCGGGGAATCAGACCCTTAGCGATTGAAGCTTCCATGAGTAGTGTTGGTGCGTGTTTAGATAATGCGCCTGTTGAGCGTTTTTTTGGTAGCTTGAAGAATGAATGGTTGCTAAATGTTGTGCATTTAACAAGGGAATCTATGGCAGAAGATGTAAAAGCTTATATTCGTTATTACAATCATGACAGGCTTCATACAGCAAATGAATATAGCGCTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCATGCGAACTCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGATTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAA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39 | unidentified_phage(50.0%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_26 |
2337007 : 2389675
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP039227|2337007:2389675|DBSCAN-SWA 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53 | unidentified_phage(21.43%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2404407 : 2444832
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP039227|2404407:2444832|DBSCAN-SWA 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44 | unidentified_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2453451 : 2503801
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP039227|2453451:2503801|DBSCAN-SWA 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52 | Acinetobacter_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2525844 : 2568666
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP039227|2525844:2568666|DBSCAN-SWA 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42 | unidentified_phage(16.67%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2594753 : 2625136
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP039227|2594753:2625136|DBSCAN-SWA 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35 | Burkholderia_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2633977 : 2744200
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP039227|2633977:2744200|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCATTTGGATATTACGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACGCGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGATTTAATAAATTTTAAATTAAAATATTAAATACCGTTTTAATTCTTAACCAGCGCTTGCTGAAGTATAAAGTTAAATCGTACCAACTCTTCCCAAAGGTGCTCCATACTATGCAAAAAAGCATAAAGATGGATATGGTGTTGAGCAGACTGATTCGCTGCTTGCTGCTGAATCACCTGGCGTAAACGAACCAATTTATTGTCATCAAACACAAATCCATCTTCAATAGGATCAGGGTAACACTTAAGCTGCTCCGACCAACAATGCAATAATGCAATGACATGCTGAGCAAGCGCTTGTGTATCAGTATGGCCTCGTAACCACACGGTATCGTCCCTTGATAAACTTAAGCTATAGCGGGTTTCTAAAATCTGCCGAAAAACTCGCTTTAACTGAACCAAGCTATCTTTACATAAACCCAAATCAAAAGATAGCTTTTTACGCTCAAGCCAAGCCTTACTTTCCTCAGCAAGTTTATTTTGCTCAGCAAAAGACTGACTAATTACAGCAATTTTGTCTATTTCAAATGCTGAATTTTCAAGTCGAGTGAAAACTGTATGCTTAGAAAAACTATCCTCACACAGCAGCACTAAGTCCCTTAATGTTACTGATATAGAAAGTAACAACTCTCGCCGCGCATAAATGGGTAAGCATATTTTTGAAATAACAAGACTAATCAACACCCCAATCAAAATATCCACAGCTCTTAACATGCCTTCAGCCACTCCAAGTTTAATAGAGCCTGTAAGCGCAATAATCGCAAATGTTACAGTTCCCAATACTCCAACATAAGAGTAGCGCTTACTTCCTGCTAAATAAGCAAAGCCGAATGCAACAATAAATAATATCAACATTTCAGCAATAAAGTTTCCACCCCAGCCGGTCAACAAAAATAAGCCAGCAGCAACCGCCCCAATCACCGTTGCAGCACTACGCGCAATTGACTTATCTTCTGCGGCACCCACAGTAACCTGTGCCCCCATAACAACAGCAACAGTAATAATCACCCATTGACCATGATCTAAATTAAAAGCACGAAAAACAATCAAAGCAATCAAACAGGCAAGTGCTGTTTTAAATGCATGGATCACCCGGTAAGAGGCTAAAAGGTCAATCCACCACTTTACTTTCATTAACACTTTTATCTCCTTTTATAATTTGCTATAAACTATAACAAAATAAGAGGTTAAAAGCCTATTGATATACGCTAGGCCTAATTTAAACTTTCAATAATCAATCATTAATTAAGGTGACTGTATGTTAAGTCGTCAAATACGAAAATTCCAAGATACTTTCGAACTTTTCTTAAGCAACCAGGCCAGTGGCGGTATATTACTCATACTCTGCACTATAATTGCCTTAATTGCTGCAAATTTACCACTAACACAACCTATTTATACCCTATTACATGATTTGCCCTTAGGCATTCAAATTGGCCAATACACACTGATTAAGCCAACCTACCATTGGGTGAATGATGGCTTAATGGCAATTTTCTTTCTTCTTGCCGGCCTTGAAATTAAACGTGAGATTATGGCAGGGGAACTTAGTCAATTTAATAAAGCACTGTTACCGGTCAGTGCTGCAATCGGTGGTATGATTGTCCCCGCACTGATTTTCATCAGCTTAAACTCAACAGGTATTGCAGCCAAAGGCTGGGCAATCCCCATGGCAACGGACATCGCTTTCGCCATAGGCGTCCTGTCCTTACTGGGCAACCGCATCCCCCGCAGCTTGATTATCCTGCTCACCGCAATTGCCATTGTCGATGATTTAGGTGCAGTCACAGTTATTGCTCTTTTTTATACAAAAAAAATTGCGGCGGACTACCTAATTTATGCCGCCTTCTCCTTTGTTATTTTGTTATTAATAAACTTAGCGGGCATTCGCAAACTCTCTATTTATCTGATAATCGGTGCTATTTTATGGCTTTTTTTATTAAAATCTGGTATACACGCTACAGTTGCCGGAGTCTTGCTTGCGTTTACTATCCCTGGGAAAAATAAGCCGTTACCAAAAAACTTTACAAAATTATCCCAAAACACACTGGATGAAGTTAAAAGTAATGCTTTAAGAAACCAAGGACAAAACAATGAACATATAAAAGCATTAATACACTATCTAGAAGACCTTATTCACCATGCAAAAACACCATTACAACGCTTAGAACATGCACTACATAAGCCTGTTATGTTCATTATTGTTCCTATTTTTGTATTAATTAATGCAGGAATTTCTTTTAACCACTTAAATATAAAACATGCTTTAACTTCACCCTTAACCATAGGAATTATTCTCGGGCTTATTTTAGGAAAAGTCATCGGCATATTTGGCACTGTATTTTGCCTAGTAAAAGCAAAGCAAATAAAACTTCCTCAGGGCGTTCAACTACAACATATGTTTGCCTTAAGTCTACTTGCCGGCATTGGTTTTACCATGTCTATATTTATTGCTGACCTCGCTTTAAGTAATCAACCAACATTACTAAACTCTGCCAAGCTTGGCATTTTAATCGCATCAATTATTGCCGGCAGCTTAGGTTACTTTTTATTACGCCAAATAAGTAAAAAATAAGCGCTAGAGCTAGCGCTTATTTTTATCAAGTAAATTAAAATATAAAAGCAGGTGTTAATTGGAGCCTGCTTCAGCCTCCAATTCAAGCTGTGATTGTGATGTCGACTGCGAGATATCAATCAATTCACGCATCGCGACAAAAAACATAACAAAGTCACGAACATTGCTCGCACGCAAATCACTCACCATGCTATTCCAACGATCAATCATATGCTCATATTCAGCAATCCAACCATCTAAACGCTCATTGATCTCATCAGAGCCCTCTTCAAAGCTCATCACACCGATAGTCAAGCCACGTTGCTGCCAATCCAGATCATCACGCAAGGCGGCTCGAGCAAGTGCTTCCCAATAGTTTTGCACCAAATGTTCACCAAGAATAAAGCGGAACCAACCCAAACTTAAGCGATGATTCAAGATAAAGTAAACTCGCGCTACTTCCTCTACAGTAAAATTATGGATATTAGCCGCTTCAACAATATCCAATGCAGAATACATAAAGCGCAACCCAGCCATCTTCATAGCCAAATGCTCAGGTACGCCCTCTTCAATAAAGCTTGCCAGCTTATTATTAAAGTACTGCGCATCCTCACCATCTAATAAGGTTGGCAATGCGGTAAACAAGCCTTCAACTTCAGAATAAAACTGAGTTGATGCTTTAACAATATCCAAGTTCTTACGGCGATTACGCAAAAACCAACGAGTACCCCGACGAATCACTCGAGTAACCTCACGCATCATTTCCATCTGCAACTTCGGATCCACTTGACCATCTAGCTCTTCAATGGCTGCCCACGTGCCATCAACATCAAATACACGTGCCGCCACCATATAAGCCCGCGTGATTTCAGAAATCTGACTGCCTGTTTCATCACGTAAACGACTAACAAATGTCACACCCATATAATTAGTCATTGAATTGGCTAATTGTGTGGCAACAATCTCACGGGCCAAACGATGCTCGCGCATTTGTTTACTGTAAGATTTACATAACACTTGAGGAAAAGCCGCTTCTAAACATTTAAAAAATGCAGGGTCGTCAACAACATCAGAAGCAACTAGCTCTTGTTTGAGCACATTTTTGCTATATGCGAGAACAACCGCAAACTCGGCAAAGGTTAAACCTTTTTGCTCTGCTTTACGCTCTTGTAAGGCTTCATCATCCGGTAAAAATTCAATTTCCCGGTTCAAATGCCCTTGACGTTCTAAATCACGAATCTGCCGAACATATAAATCTAAAGCCTCAATGCCTTGCCTCACTGCCACATTAATCGCTTGCGTTTGACGATAATTATTATGTAAACATAGCTCGCCCACTTCATCTGTCATCTGAGCTAACAGTTCATTACGTTGCTTTT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113 | unidentified_phage(21.74%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2694180:2694239|attR 2731399:2732504 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2749388 : 2797869
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039227|2749388:2797869|DBSCAN-SWA CATGGGATATCCAGTTGAATTCAGACGGAAGGTCTTTAAGTTAAAAGAAAAGAAAGGGCTAACTTATGAGGAAGTTTCAGAGCTCTTTGGCGTTTCAATGAGGACGCTGTTTCGATGGAATACAAGAATAGAAATAAAAAAGAAGGCACCAAAACCTCGAGTGATTAACTTAGAAGAGCTAAAGAATGATGTAAAAAATTATCCGGATAGTTATCAATGGGAACGTGCGCAACGTTTTGGTGTAAGTCAACACTGTATTCAGCATTGGTTGAATTTCCTTGCAATCAGCTGTAAAAAAAACACTAAAACACCCAAAAGCCAACGAAAATACACGTACAAGCTTCCAGAATAAAATCAAGCGCTACGCCGGCTATGGTCGACCCATTGTTTATTTAGATGAAAGTGGTTTTGCAACAGATATGCCAAGAAAGCGAGGCTACTCCCAGAAAGGAACGCGCTGTTATGGTGTTCATAACTGGCATGAAAAGGGTCGTATTAATGTCATTGGTGCCCTCTTAGGGAAGTTATTATTAACAGTCTCTTTATTTACTGGGTCAATTAATTCTGATGTGTTTTATGCATGGCTAGTTAAAGATTTATTGCCTAAATTGCCAGCACATTCAGTAATTGTTATGGATAATGCGCGCTTTCACAAACGCTCTGACATGATTGAAGCGATTGAAGAGCAAGGGCATACACTTGAGTATTTACCATCTTATAGCCCTGACCTTAACCCGATTGAGAGAAAATGGGCAGAAGCTAAAGCCATTCGAAGAAAGTATCACTGTAGTATCGAAGATCTTTTTTTAGAACATCTACATTATGTCAATTTATAAGGTTTTAACTATATTTATAAAATCATTCTAATTTTTTATTTTAATTATTTTAGCACAGATTATCTTTACAAATTATTTTCAGTTTTTCCAGTTGACTCTCATATTGTTCTGTTAAATCCATCACACAATAAATGGATTTTAATATACTAATAACTAAAGCATCCTGGTTATATTTTTTCTGATAAATCACCCAGCGACCCTCTTTATAGGAATCGACCAAGTCCAAATCTGATAACATACGCAAGTGATTTGATATGGTTGGCTGACTAATAGGTAATAATTGCTCTAACTCACAAACACATAACTCACGTTTTTGTAAAAACCATAAGATTAACCTTCTATTCTCATCAGAAAATGCTTTTAATATTTTAGATAGTTTTTTATTTGTCATCACTACGCTACCACTTAATTTATACTTTCTATTTTCACTATGTTTTATCATTTACTTAAATATACTTATATTGATAGAAATATTTTTTCTTCAACCAAAGTGCAACATTAACCAGACTAACCAGCACAGGCACCTCAACAAGTGGACCGATTACTCCAACAAAAGCCTGATCGGAGTTAACTCCAAACATCGCGATAGCAACAGCAATTGCAAGCTCAAAATTATTTGAAGCGGCAGTAAAACTTAATGATGCAGCTTGCTCATATGGTGCTTTTGCTTTAAACGATAAGTAAAAAGAGATAAAAAACATAATAATAAAATAAATCAATAAAGGAATAGCAATATTCACAACGTGCAATGGCAAATTAATCACACTCTTACTTTTCAAAATAAACATAACAATAATCGTAAACAACAGAGCCAATAAAGTCAGCGGTGAAATTGCAGGAATGAATTTATTTTTGTACCAACTGATAGATTTTATATGAGTTAAAATCAACCGGCTCAAGAAACCAAGAATAAAAGGCACTCCTAAATAAATCAATACAGTTTGTCCAATCGCGAACAATAAATTTGCGCAAAACTCAATTTACCTATCCTCGCAGCAAGCTACGAGGTATTTCGGAAAATTACCCCTTCGGGTCGTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGCTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCACTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGAATGCGCTTTGTTTTTTTTCGCAGCAAGCTGCGGGGAATCAGACCCTTAGCGATTGAGATGTGAATAGCATTACTTTCTAAGCCAAATAATTTTGGTAATAGTGTAATAAACAAGTAAGCGTACGCTGAATAAAAGATTACAGTAAAAATAGCGTTAAATGCCACAAGTCCTGCACAATACTCTCGACTACCTTCCGCTAAATCATTCCAGACAATAACCATCGCCACGCAGCGAGCAATTCCAATTAAAATTAAGCCGATCATCAATCCAGGCTGATTATGAAAAAAGGCAAGTGCAAGAACAAACATTAACACCGGACCGATAAGCCAATTTTGCAATAAAGATAGGCTTAATATAGCTGACACGGTTGAGTTAACCTTTTGATTTTGCTATTATTCTTACATGAAAAATATAGCAGGATTTTAGAATTGCAAGCTTATAGTCAGGATTTGCGAGAGCGCGTTATTGAAGCTTATAAAGATGGGCTTAGCCGAAGAGAAATATCCACTCTTTTCAAGGTGCATTATGATACAGCTTGTGAATGGATTCGACGTTATTTATCAACAGGTGACTACTCTTCAAAACAAGGAGTTGGCTGTGGCGCACAAATAAGGTTTAATGACAAACAAACTATTCTAGATTTCATAAAGAAAAATCCAGATGCAAATGGGATTGCCATTCGTGATGGCATTGCTCCTGACCTCCCTATGTCAACCTTTTATGACGCATTGAAACGATTAAAAGTCACATATAAAAAAAGAGCCTAAGTATAAGCAAAGACGTGACGCCGAAAGATCTGAATTTATAGAAAAGCTAACAGGAATTGATTTGAGCCAATTAGTTTATCTTGATGAGGTTGGCGTTGATGATAATATCGTTGTTGAATATGGCTGGTCAGCTGCCGGAGTGCGAAGTTATGCTGAACAAGCAGGCTTCAAGAGGAAAAGGTTAAGCCTTGTTGCTGGCTTGAAGTATAGTGATAAAAGTTTGGTTGCTCCTTTCGAATTTTCAGGTGCAATGAATAAGGATTTGTTTTTAGGCTGGTTTGAACAGGAATTATGTCCGAAGCTAAATCCTGGGCAAGTAATTATCATGGATAATGCAAGCTTCCATAAAAGCCCTGAACTTTATGATATGGTTGAAGCTGTTGATTGTGAACTATTATACTTGCCAGCCTACTCACCAGACTTAAATCCAATTGAAAAATTCTGGGCTAATTTTAAACGAAATATAAGAAAGGTGATTAAAAAACATGAGCATCTTTGCAACGCAATTACTGACGCATTAATTAAGACTCTTCCGGGTTAGCTATACCTTCTTGTTTTTAAAAACTCTTGGAAGATTACTATAATCTATTTTTGCTAATGGTGGATACATCATAACAACCAAGCCAAGGGCAATAAGCAAATTTGTTGCGCCATATGCAAAGTGGCCAATAAACTGACTACTGCCAGGCAAATAATAGCCAATAAGCAAACCCGTAGCAATTGCTACAAATATCCACACGGTTAAGTAACGATCTAAAAAGCCCAGACTCTTCAACAATAACTCCGATATATATCAATATATTTATATATACCAATGTAACAATATAATTATTCATTTACAAGGTTGATACAGACAATCGTTATTACATTATATAAAATAACCTGTAAAAAACTCAATTTAGCATAAAAAATAAAACCAAATCAGATAAATATCGAGCAATATTAAAGGCCACTTCCTTGCACTAAAGAGATCCATGAAAAAATAGAACACTTTTTATGTAGAAAAAAAATATTTTTTGCATTACAATAGGTAAAAATACATTTACAAACTCACTAAGTCATAGGCGGCTCTAATCATCGGCCAGCCCAATATATCCGCATTTTAAAAGAGAATATGTTACAATACTTTAAATTTGAAACTGTTTTTATAAAAACAGCCTTTATTGCTATAATCTCACTCATTTTTGCTGTGACAAACTTTGTGCATGCGAGTGAGTTTACCTTTCAACAAGATGATGGCTTAATTAATGGTGACTGGGTCCGTCTTGTACAACCCAGCCTGCCTCTTGGTACTCAAATCAACTCACTTGCCTTAACACAAGCAGGCGACATTCTATATATCAACACTCAATCTGTCGGTAGTTTCCTTTGTCAAGGAGATACCTGTAATCAACTAAAGCACACCTTGCCACAATTTAATCACTCTTCTCACATTAACTTTATTGCAATGTTGCAAAAATCGAACCTTATAAAAATTATTAAAGAATTACCTAGTGATGTAAGTATATTTTCAGCGAGAGTTATTCACAGCACAAAAAAAATATTTGTTGGCACACGCGCTCATAGCGCCTATCTCTATGATAAAGGAGCTTGGCAACACCTCAGCGCGTCAACAAAATCACCATCATTGCCTAAAAATTCATGGGTCTACACCATAGCAAGTTCTCACAATGGTGATAAAGTACTTATTGGCACAATGAACCATGGTGCTTATCTATGGAGTAATAACCACTGGAAGCATTTAACCATTGCTACAGAACATCCACTGACTAAATATAGCTGGATTTATAAAAGCAGCATTTCAAAAGATGGCGGGACAATCGTTATCGCCACCCACAGTAATGGTGTCTTTCTTTACCAAAATAAACATTGGCAACATTTAGATAACCCTAATCAATCAGGTCTACAAAAAAACACACTTGTTAACTCTATTTCAATGTCAGACAATGGTAAAACCATTTTATTAGGTACATTACTAGGCGCTTACCTTTATCAACAAGGCCATTGGTCACGCATCCACAAGCATCATCATAACCTTAAACTCAAAACGATCACAGCTACCTATGTCTCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP039227|2749388:2797869|2773941_2774328_-|WP_155079476.1|DBSCAN-SWA MILLLFLHEKYSRILELQAYSQDLRERVIEAYKDGLSRREISTLFKVHYDTACEWIRRYLSTGDYSSKQGVGCGAQIRFNDKQTILDFIKKNPDANGIAIRDGIAPDLPMSTFYDALKRLKVTYKKRA >NZ_CP039227|2749388:2797869|2767936_2768812_+|WP_155081050.1|DBSCAN-SWA MFKKLTYKKSIYFSLFTLLAITFSLKSQATSASITNKINNNIQANLAGLHISYKETLNGSIFNEEQGNVPGLNISLSKTVKNLYLHANVSLYSGKYTYDGGYSSGGSTVPFSFKYNRPLYNLSGRLGYRIKMNPHLHITPYGEFGYYQWDRHLIAPPVANGIAIDEIYRHYFAGIGAKLDIQIGSRFILSPHASLGSTLNPVMDFSAVEPATHIEDTLALGQKPYYQLGIDMMYLLSDHFSITGFIRYKSFEYGESSTTVVTLAPSTQALAAEPDSVTRLLTFGIGASYNF >NZ_CP039227|2749388:2797869|2750272_2750617_-|WP_155067895.1|DBSCAN-SWA MMTNKKLSKILKAFSDENRRLILWFLQKRELCVCELEQLLPISQPTISNHLRMLSDLDLVDSYKEGRWVIYQKKYNQDALVISILKSIYCVMDLTEQYESQLEKLKIICKDNLC >NZ_CP039227|2749388:2797869|2763629_2766218_-|WP_155081049.1|DBSCAN-SWA 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53 | Halovirus(16.67%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2795506:2795565|attR 2796512:2796904 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2810550 : 2852742
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP039227|2810550:2852742|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATTAAATTCTCTAAAAAAACATGATTAGGTGCGCGATAATCTAAACTCGCCCTTCTTCTCGCATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTTAGCATCACTTATTTCATTAAAGTCTGTTCCTTTAGGAAGAAAACGCCTAATCAAACCATTCGTGTGCTCATTTAGGCCTCTGTCGCAAGAGCGATAAGGTCTAGCAAAGTAGAAATCAGCATCAGTAATCTTTGAAATATCCTCATGACCAGCGAATTCTGTCCCGTTATCTGAGGTAATCGTTTTAAAGTCAAAGAAAGTTGAGGCGACTATACTTCTGAAGGTCTCAACAACGGTTTCTGCACATTTGTTAGCCATTTTCCTTATACAACACATCTTATTGGCTTTATCAACAAGGGTTAACAAGTAAGATTTGTGATCTCGACCTACTATGGTATCAATTTCAAAATGTCCAAATTCAGTCTTTTCGTCAGCAATAGCGGGCCTTTGTTCAATACCAACGCGGTTCGGTATTTTAGTTTTATCACCACTTTTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCAGAGTGGGGCAGGCTTTTGTAAAGCTCTCCTCCTTTCTCTCGATCCTCATGAATATAACGGTAGATGGTGCTCTCACTCACTTGGATATTATGCTCCTGTATAAGCTCTTTACTAATAACATCGGGTGACGTATGGGTGCTTAACCGCTCATGAATTAATACTTTTGCTTTCTCTGAAATTTTCTGAAAATCCTGCCCTTGCTTAGCATTAGACCGTTTTTCTTGCGCACAACACGAGGCCAAGCGATGGCAATAAAGACCGTTAAAATCGCTTGGGGTATGCCGTTTAGTCTCACGACTGACTGTGCTAGGAGCAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTCATGGAGTCCCCTTCTGATAAACGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAGCCATTTGTACCCTCTAAGTCAAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTTTATGGGAGTGAACTCTCTACTGGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGGTACTATACTTGACTCGACTTGACTTGGCCTGGCTTAACTCAAGATAATAAAAAAAGGGCTATTTAGCCCTTTTTAAATCACTACCTTGTCTAAAGCGATGAATTAGCCAACTTTTTTAGTTGCTTCTTTCTTTGCATCTTCTTTAGCAATTTTCATTAAATCAACTTTGAAGACCAGTGTTTCATTAGGTCCAATCGGAGAACCTGGAATGCCTTGTTCACCATAAGCAAGCTTGGCTGGAACAACCACTTCCCAAACACCACCTGTGCGCATTAATGGCAATGCCTCTTGCCAGCCTTTAATCACCCCATTAACAGGGAAAGTCGCTGGCTCTTTACGCGCATAAGAGCTATCAAACGGCGAACTACACCACTTCCCTGCGGACTTTTTAATCTCATTTTTCCAGTTCTTAGATAAATTCTTAACTAAACAACCTTCATAGTTAACAGTTACTTTATCTGTCACTAACGGCTTTTCACCTTTTCCAGGCTTAATTACTTCATATTGAATGCCATTTTTCGCAACAACACCCGATGCCTGTTTATTCTGTGCTAAAAAAGTATCACCCGCTTTTTTATTCTCATCTGCGGTTTTTTTCAACGCCACTTCTTGCTTTTTCATCTGCTCTTTTTGATAAGCTACGATAACTTGGCGCGCTTCCTCTTTGGTCATCAAGGGTTTGCCTTCACCCATGCCTGCTTTAAAGCCATCAGAAAATGCATCTGGCGTGATAGACAGCGACTGAGCTTTGACGTTCTCACCCATTTGCAAACCAAAGGCATAACTTAGCTTATCTTCTTGATTTTTAAACTGAGAAGTAGCAAATGCAGTAGTTGAAACTGCGACTGCACCGATAACAAGCGCTAAAGCCCGTAATTTCATTTATTGTCTCCTAATTAATACAGCATTTTATGCTGCCTAATACTATACCCGAAAGCATAAATCCTAGCCAACTATAACGTAATGAACTTAAGACAAACTGAAAAATAATCAAGAAAAAGACAATAAAAAACCCCGATCTTATTTTATTTAAATTTAAGATCGAGGTTTAAGAATAAGGTGTTTGGTGATGTCCTACTTTCACATGGCAAAAACCACACTATCATCGGCGCTAAGGTGTTTCACTACTGAGTTCGGGATGGGATCAGGTGGGACCACCTTGCTATGGTCACCAAACAAAACTGGTAAAATCTGTTTTGTTGTCTGCTTTTAATTATTTTTTAAAAGCATTTAAACTATCAATCATGCTGATTATATCAACATGTTCGTTAATTAACAATTCTGGTAAAAAGTATGTTTTGATTATTTAATAGTTGTTTAATTAACGGGTCTGGTTGTCTTTTTAAAAACCGGTATTCAGGTTTAAAACCCCTTGGGGTTATATGACCAAGCCTCACGGCGAATTAGTATTGGTTAGCTTCATACATTACTGCACTTCCACATCCAACCTATCAACGTCTTAGTCTTAGACGAGCCTTTAGGAGGGTCAAGCCCTCAGGGAGATCTCATCTTGAGGCTAGCTTCCCGCTTAGATGCTTTCAGCGGTTATCTATTCCGAACATAGCTACCCGGCAATGCGTCTGGCGACACAACCGGAACACCAGAGGTTCGTTCACTCCGGTCCTCTCGTACTAGGAGCAACCCCTCTCAAATCTCCAACGTCCACGGCAGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTAAACCCAGCTCGCGTACCTCTTTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTGCTACAGCCCCAGGATGAGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCACCGTCGATATGAACTCTTGGGTGGTATCAGCCTGTTATCCCCGGAGTACCTTTTATCCGTTGAGCGATGGCCCTTCCATACAGAACCACCGGATCACTAAGACCTACTTTCGTACCTGCTCGACATGTCCGTCTCGCAGTCAAGCGTGCTTTTGCCTTTATACTAACCGCATGATGTCCGACCATGCTTAGCACACCTTCGTACTCCTCCGTTACTCTTTCGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCATACGCTGTCCCCAACCCGGTTAACGGGCCTAGGTTAGAACCTCAAGAATACCAGGGTGGTATTTCAAGGACGGCTCCATGCAAACTAGCGTTCACATTTCATAGCCTCCCACCTATCCTACACAGATAGTCTCAAAGTCCAGCGCAAAGCTGTAGTAAAGGTTCACGGGGTCTTTCCGTCTAGCCGCGGATACACTGCATCTTCACAGCGATTTCAATTTCACTGAGTCTCAGGTGGAGACAGCTTGGCCATCGTTACGCCATTCGTGCAGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTACCTTAGGACCGTTATAGTTACGGCCGCCGTTTACCGGGGCTTCGATCAAGAGCTTCGCTTACGCTAACCCCATCAATTAACCTTCCGGCACCGGGCAGGCGTCACACCGTATACATCCTCTTTCGAGTTCGCACAGTGCTATGTTTTTAATAAACAGTCGCAGCCAACTGGTCTCTGCGGCCCCAACCAGCTTAGGACGTAAAGTCCATCACCAGCCAGGGCGTACCTTCTCCCGAAGTTACGGTACCATTTTGCCTAGTTCCTTCACCTGAGTTCTCTCACGCGCCTTGGTATTCTCTACCTGTCCACCTGTGTCGGTTTCGGGTACGGTTTCTTACAATCTGAAGCTTAGAGGATTTTCCTGGAAGCAGGGCATCAACCACTTCACCACTAAAAGTGGCTTCGTCATCAGCTCTCAGCATTAAGTACCCGGATTTGCCTAAGTACTCTGCCTACCACCTTAAACGCAGATAACCATCACTGCGCTGGCCTAGCCTTCTCCGTCTCCACATCGCAATTGTAAGAAGTTCAGGAATATTAACCTGATTCCCATCGACTACGCATTTCTGCCTCGCCTTAGGGGCCGACTCACTCTACGTCGACGAACGTTGCGTAGAAAACCTTGGACTTCCGGCGAGGGGGATTCTCACCCCCTTTATCGTTACTCATGTCAGCATTCTCACTTCTGATACCTCCAGCAACCCTCTCAGGTCACCTTCACCGGCCTACAGAACGCTTCGCTACCGCTCATAATAAATTATGAACCCGCAGTTTCGGTATATTACTTAGCCCCGTTAAATCTTCCGCGCAGGCCGACTCGACTAGTGAGCTATTACGCTTTCTTTAAAGGATGGCTGCTTCTAAGCCAACCTCCTAGCTGTCTAAGCCTTCCCACATCGTTTACCACTTAGTAATATTTAGGGACCTTAACTGGCGGTCTGGGCTGTTTCCCTCTCCACGACGGACCTTATCACCCGCCGTGTGTCTCCCGTAAAACAACTTTCTGGTATTCGGAGTTTGCATCGGGTTGGTAACCCGGGATGGGCCCCTAGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCAGAAGTCTATTACGAGGCGCTACCTCAATAGCTTTCGCGAAGAACCAGCTATCTCCGAGTTTGATTAGCCTTTCACTCCTATCCACAGGTCATCCCCTGGCTTTTCAACGACAGTGGGTTCGGTCCTCCAGTTGATGTTACTCAACCTTCAACCTGCCCATGGATAGATCACTCGGTTTCGGGTCTATTCCTAGCGACTAACGCCCTATTCAGACTCGGTTTCCCTACGGCTCCGCTATGCGCTTAACCTCGCCACTAAAAATAACTCGCTGACCCATTATACAAAAGGTACGCAGTCACATCACAAAAAGGATGCTCCCACTGCTTGTATGCATACGGTTTTAGGTTCTATTTCACTCCCCTAAACGGGGTTCTTTTCGCCTTTCCCTCACGGTACTAGTTCACTATCGGTCAGTTAGGAGTATTTAGCCTTGGAGGATGGTCCCCCCATCTTCAATCAGGATAACACGTGTCCCGACCTACTCTTGTTTCATCTACTAT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36 | Planktothrix_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
2868165 : 2924588
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039227|2868165:2924588|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP039227|2868165:2924588|2875322_2876960_-|WP_155066764.1|DBSCAN-SWA MQTLRIAMAQLSLHVGAIEEKATRIIQLAVSLDGQADAVVFPEMTLTGYPAEDLLLRMDVHERIESALKMIVEASLDINLDILVGAPVFDQGQMYNALIQIRQGVEVKRYYKRCLPNYSVFDEKRYFGPGQQDCLTEIAGVTVALAICEDLWSDEVMAEAVINQAKLMISTNASPYHLRKQQQRVQVVKERAQQGNMPLLYVHWAGAQDDLIFDGCSFVVDATGRLTEQAAAFREDVRIVELRCGEHDEYIPYAQALPPALSEDAEIYQAITLGLRDYVCKNNFNGVVLGLSGGIDSALSLAIAVDALGAEAVEAIMLPSEYTSQMSLDDARAQAKMLGVNYHVLPITDSYQALQQALVPALGEGRPFGVTDENLQARSRGVLLMAVSNATGKMLLTTGNKSEMAVGYATLYGDMCGGYNALKDVLKTRVFKLAHYRNTLSPAIPEQVISRPPSAELAPNQKDEDSLPPYEVLDQIIERYVDYDQSAIDIISAGFNDVDVKRILRLIGQNEYKRRQSAPGPRISQRAFTRERRYPLTSAFDRDLG >NZ_CP039227|2868165:2924588|2893592_2893931_-|WP_155068647.1|DBSCAN-SWA MSQSMTEKSLSGHWRIVWMALWDQEYVDLIEPGYIKIDEEGQGEFQFGVVRGFFGNVAGIYFDSLWEGSQECDEAHGEIDGALDKEDRVGELYGRIAFLQGDESEYRAIRLG >NZ_CP039227|2868165:2924588|2897401_2897626_-|WP_155081103.1|DBSCAN-SWA MKAVLYIKSITARELLQQYPWLKAKLWGAEFWSKGYFASTVGKHGDEKMLKNYVRNQGVAKDYQPLHQSQLRLL 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52 | Bacillus_virus(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
2930258 : 3039640
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP039227|2930258:3039640|DBSCAN-SWA 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118 | unidentified_phage(35.71%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_36 |
3060799 : 3106210
Sequences of DBSCAN-SWA_36
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_36 >NZ_CP039227|3060799:3106210|DBSCAN-SWA 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61 | Acinetobacter_phage(23.08%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_37 |
3181284 : 3215277
Sequences of DBSCAN-SWA_37
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_37 >NZ_CP039227|3181284:3215277|DBSCAN-SWA 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31 | unidentified_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_38 |
3221621 : 3429655
Sequences of DBSCAN-SWA_38
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_38 >NZ_CP039227|3221621:3429655|DBSCAN-SWA 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219 | unidentified_phage(23.08%) | tRNA,protease,transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_39 |
3451920 : 3504132
Sequences of DBSCAN-SWA_39
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_39 >NZ_CP039227|3451920:3504132|DBSCAN-SWA 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52 | Acinetobacter_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3613 : 43804
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039230|3613:43804|DBSCAN-SWA ACTAAAAGCCTCTAAATCGGCTGGTTGCTAGCTCTTCATAGTAACTGTACTTTTCCCTAAGAGTCAGACCAAATTGGGTGCTTATCCTTCTTAACTGACTGCCGCACAAGATGCATTTAAGAGGGTTGTAGTTGAAATTACTTTTCATCAGTGAAACAAACGTGACCTGGTTATATGCCTCAATAGTTTGCCCGACTAAATCATAAATTTTTGGTAGTATTATTGTCCGAGTGCGATAGCTTAGAAATCCATAGTAGCGGATCATTTTAAAGAACTTGTCCGGGATGTGTTGGGTAAGGCGATCAATAAAATCGTCGATACTCTGCTTTTTCATTTTCTGCTGTTTGGTTTTGTGATCCAGGTAACGAAAGATCACAACATTACCATCATAGTGCTCCATTCTGGCGTTGGCGAGAGCCGGGCGTTTAATGTAGCGGCCGAGGTAATCGACATTGTGCTGGTGATTTTCTTTGGGTTGAGCAAAGTGGACTTTCCAAAATTTCTGGTATTCACGATTTAAAAATCGATTGAAGGTTGTAAGGTCACTGATTTCACTCTGGTATTCATCAGGAATAGTCAACTCCCCAGCTTTGTAGGTTTGCCTAAGCAGGTTGGTGACGGCATAGCGCCACATTGGCATAATAACTTTGCGAGTAAAATAAATCTCACACCAAGAATCATTAGCTTCGTCATAACCTCCACGTGTGACGGAGATATGAACATGTACATTCCATTTCAGATCTCGACCAAATGTATGTAAAGCGGCGAAAATGCCAATGATAAGGCCTTTCTTCTTTGCGGTTTCTAGTAACGTATTGGCTGCAGTCCTAAAGATTATATTGAGTAATTCACGATTGAATAAGAAAAATGCCCAGAATTTTCTAGGCATAGTAAATGTGATGTGTTGCCATTTGCACTGTGGGAGAGTGGCGTTTTGCTCTTCGATCCATTGCTCTGTTGCTTTTTTTCCACAGGTTGAGCAAAAGCGGGACTTGCATGTGAAACAAACGACCTTGGTATGTTCGCAGTTTGGATTGGAACAACCGTAAACATCATACCCCATTAACTTGGTGCGACAACCGAGCACTTTGAGAACATTTTCATCAACGGCAGGTCGAATGGAATCAGCGTGTTTAGCGCGATAGTTCCACCAAGCACTTCGATATTGAAGTACGTGCTTCAGTGTGAATTGAATTTGATAGGTTTCATCTTTCTGCCGCTGGATCACCATTGAGAACAAATTACCATATTAAACAACGAATCAGGATAACAAGGTTAGATCAGATCTAACAAGACTAATGTGAGTTAATAAGCGGTAAAGTGACGGGTGTTAGCAGGGACATCCGAAAGTCGCGAGCTGTGCGAGCCTATTCTTGGAGAACATTTTCATCAACGGCAGGTCGAATGGAATCAGCGTGTTTAGCGCGATAGTTCCACCAAGCACTTCGATATTGAAGTACGTGCTTCAGTGTGAATTGAATTTGATAGGTTTCATCTTTCTGCCGCTGGATAACCATTGAGAACAAATTACCATATTAAACAACGAATCAGGATAACAAGGTTAGATCAGATCTAACAAGACTAATGTGAGTTAATAAGCGGTAAAGTGACGGGTGTTAGCAGGGACATCCGAAAGTCGCGAGCTGTGCGAGCCTATTCTTGTAACAGAAAACGCATTCACTCAGCTAATGATTATTTATCACCTGAGGAATACGAGCATAATCAAAAAATCAGTTAAAAATTTGTCTAGAAAAAGGTTGCCAGATCACTGATGCAGTTTACCATTTCTTTTGCGGGCTTTGAAAGTTCGCGTTTTTTATGATAAATACAGACGAGATCAGCATAAAAACGTTTTTTTACAAAGGATATTTCACGTAAGTTTTGATCAATTAAGTGTTTAGGAAAAATGCTCCAGCCAATTTCAGCCTCAACCATTTTTTTTATCGTCTCCAGCATATTAATATTTGATATTATTTTTGACTCTATTCCGTAATCATTGCGAATATCATTGAGTATATCATAGTAGATATTTACTTTTTCAGGTGCAATCAATGGAATTTGAGACAATCTAGTAATTTCTTTACCTTTTTGTCTGAAAAATGGATGAGTGGGGCTTAATACGACACGCATATCATTTTTCCAAAATTTTTTTACAATGATATCACTTAGAGTTTCTCTAGGCAGAGAGATAAAACCAATGTCTATATTATAATTAATAATAAGATCAATAATTTCACTTGATGTACGAAAAATAAAATTATAATCAACCTCTGGAAATTTATTTTTATAGTTTTTAATAAGTCCAGGGAGTTGATGGGTTGCAATATGGTTGTTGCAGCCAATCGTTAAGGTTCCACAGACTGTTTGGCTAAAGTTGGCAATCTGATGAAGACCATTTTGCCACTCAGTGTAGATAGTACGAGCGCGAGGTAAAAAGGCTTGACCTGCTTCTGTCAATACAATACGGTGGCCAATGCGTTCAAATAGCTTAATTTTAAATTGGCTTTCTAAATTGGCAATGCGTTTAGTGACTGCAGGTTGAGTTAAATGTATGTATTCACTGGCTTTGGTAAACGACTTTGTGTCAGCTACGGCCAGAAAAGCGGTAATATTCTTCATTACAATCCATATATTCCAAAAAGCTATCATTTTTATAAAAATAATTCATTTGAGCCATCATTGTCAATACTTTAAAGTTACATAACTTTAATAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGAGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCAGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTGGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGCAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTACAAGGGTTGTTCAATGATATTAGTACCTTATATTGTTGCTGGTGTTTTTACAGGAATTCTTTCAGGGTGGGTAGGCGCTGGTGGCGGCATTGTTATTGTCCCCGTGATGTTATGGCTGGCAGCACAACAAGGAATAAATACGACATTGGCTATGCATCTTGCAGTAACAACATCACTTGGTTTTATCATGGTTAATTCATTGTATACAACTTTTCATCACTATCGAAGTAATAACTTAGTGATTCCTTTATTTAAGGGTATTGTTATTTTTACAGTTATTGGCGCTTTAATCGGTGGGCAGCTTGATAAAATTATTCCTGTTGCTTTTGTGAAAATATTATTTACTGTAATTATTATCAGTGTGTTAGTTCAAAGTTTTTTTAATCGTATCAACCAGGTCGGGAGGTTTGAATGTCAGCCGGTGTATCCAGGATTTTTATCACGGTCAATAATGGGATTCTCTGTTGGTATTCTTGCTTCTTTAGTTGGTATTGGTGGATCAGCGATTACTAATCCGTATATGCAATACCATCGTTATCCAATGAAAAAAAGCGCGGCGATGTCAACAGCGCTGGCTTTTCCTATGGGTTTATTTGCACTTGCCAGTTTATTGGCTTCAAGTGTAGGTATGGTTGGTCTACCTTATGGCAGTGTAGGCTATTTGTATCTCCCGGCTTTTACTGGTTTATTGATCGGGTCACTCTTAGGCTCACCTCTTGGAGTGTGGCTGGTTAAGCGCGCTTCCGAACAAATTTCCGTTTGGGTATTTCGTATTATATTATTAGCAGTGGTTATTCAGATGGTTCGCTGATATGGCACTGTTGCGACAAAATCAGAAAATTACCTTAGAACCGTGGCAGCTGTTTATTATGGTTCTGTCTCAATTTGAGCTGATGGTATAATGCTGGTTTTTGTTTAAGGTGGAGTCATGATCAATTTCAGCGGCCGTCATTTTAAGAAAGACCTGATCATGATGGCCATTCGGTGGTACATCGCTTATACGTTGAGCTATCGTGACATCGAAGAACTTATGGCTGAGCGTGGTATTCCAGTTGATCATTCAACGATTCATCGTTGGGTTGTTGAGTATACTCCACAGCTAGAGGGACGATTTAAGAAGCGCTATAAGCGCCAACCTGGGGCTAGTTGGCGTCTGGGATGAGACTTACATTAAGATCAAAGGCTGAAATGATCCCCAAAATTTAATGTCTAAGTTAAGGCATACTTTTGGAGATTTTTACATGAGCAGACAGCAGTATTCAGGCAGCAAAAAGTTCCAGATTACACTTGAAGCAATAAAGGGCAAAGAGACCATTGCAGCTCTCAGCACCAAGCACGGCATTGCACCCACATTAATTTCAAAGTGGAAGAAAGACTTGCTTGAACGAGGCTGTGAACTTTTTGAAAAAGGCTATAAAACCGCCGATGTTCGTTTAGAGCATGAACGCGACCAGCTGTTTAAAAAAGTTGGCGAGCTGAGCCTAGAGGTGGATTACTTAAAAAAGGGCTTCGCGAGCATTTAACCTCTAAAGAACGTCGATTGCTCGTGAATCCAGAGTTGAAAATTACGGTCGCCCGCCAGTGTGAGTTGCTTAGTGTTGAGCGCAGTGGGCTTTATTATAAGCCGGTGCCAAAAGTTGATGATACGGTGATGATGAATCGTATTTATGACATTTGGTACCAAAGTCCTTGTTTTGGTTATCGTCGCGTGACAAAAGTTCTGCGCCGTGAAGGCATGCGAGTGAATCGTAAGAAAGTGAAGCGCCTGATGAATTTAATGGGGTTAAAAGCCATTTTCCCAGGGCCAAAGACCTCATTAAAAGGAGAAAATCATAAAATTTATGATTATTTACTGGACGGACTTCACATCGTGCGACCCAATCAAGTTTGGCAGGTGGATATTACCTATATTCGCACACGTAAAGGCTTTGCTTATCTTACGGCCTTAATCGATGTCTACAGTCGTTATATTGTAGGCTGGGCGCTGT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51 | unidentified_phage(25.0%) | transposase,integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1560 : 50364
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039229|1560:50364|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
54569 : 108561
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039229|54569:108561|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(30.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
112097 : 162375
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039229|112097:162375|DBSCAN-SWA 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59 | Indivirus(19.05%) | integrase,transposase | attL 129375:129434|attR 159485:160477 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
12693 : 46861
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039231|12693:46861|DBSCAN-SWA 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38 | unidentified_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1087 : 48885
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP039228|1087:48885|DBSCAN-SWA AATGGTTATCCAGCGGCAGAAAGATGAAACCTATCAAATTCAATTCACACTGAAGCACGTACTTCAATATCGAAGTGCTTGGTGGAACTATCGCGCTAAACACGCTGATTCCATTCGACCTGCCGTTGATGAAAATGTTCTCAAAGTGCTCGGTTGTCGCACCAAGTTAATGGGGTGTGATGTTTACGGTTGTTCCAATCCAAACTGCGAACATACCAAGGTCGTTTGTTTCACATGCAAGTCCCGCTTTTGCTCAACCTGTGGAAAAAAAGCAACAGAGCAATGGATCGAAGAGCAAAACGCCACTCTCCCACAGTGCAAATGGCAACACATCACATTTACTATGCCTAGAAAATTCTGGGCATTTTTCTTATTCAATCGTGAATTACTCAATATAATCTTTAGGACTGCAGCCAATACGTTACTAGAAACCGCAAAGAAGAAAGGCCTTATCATTGGCATTTTCGCCGCTTTACATACATTTGGTCGAGATCTGAAATGGAATGTACATGTTCATATCTCCGTCACACGTGGAGGTTATGACGAAGCTAATGATTCTTGGTGTGAGATTTATTTTACTCGCAAAGTTATTATGCCAATGTGGCGCTATGCCGTCACCAACCTGCTTAGGCAAACCTACAAAGCTGGGGAGTTGACTATTCCTGATGAATACCAGAGTGAAATCAGTGACCTTACAACCTTCAATCGATTTTTAAATCGTGAATACCAGAAATTTTGGAAAGTCCACTTTGCTCAACCCAAAGAAAATCACCAGCACAATGTCGATTACCTCGGCCGCTACATTAAACGCCCGGCTCTCGCCAACGCCAGAATGGAGCACTATGATGGTAATGTTGTGATCTTTCGTTACCTGGATCACAAAACCAAACAGCAGAAAATGAAAAAGCAGAGTATCGACGATTTTATTGATCGCCTTACCCAACACATCCCGGACAAGTTCTTTAAAATGATCCGCTACTATGGATTTCGCCCTCCGTCATATGAAGTGCAACACCCAGTAGAGAGTTCACTCCCATAAAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTTGACTTAGAGGGTACAAATGGCTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGTTTATCAGAAGGGGACTCCATGAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTGCTCCTAGCACAGTCAGTCGTGAGACTAAACGGCATACCCCAAGCGATTTTAACGGTCTTTATTGCCATCGCTTGGCCTCGCGTTGTGCGCAAGAAAAACGGTCTAATGCTAAGCAAGGGCAGGATTTTCAGAAAATTTCAGAGAAAGCAAAAGTATTAATTCATGAGCGGTTAAGCACCCATACGTCACCCGATGTTATTAGTAAAGAGCTTATACAGGAGCATAATATCCAAGTGAGTGAGAGCACCATCTACCGTTATATTCATGAGGATCGAGAGAAAGGAGGAGAGCTTTACAAAAGCCTGCCCCACTCTGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAAAAGTGGTGATAAAACTAAAATACCGAACCGCGTTGGTATTGAACAAAGGCCCGCTATTGCTGACGAAAAGACTGAATTTGGACATTTTGAAATTGATACCATAGTAGGTCGAGATCACAAATCTTACTTGTTAACCCTTGTTGATAAAGCCAATAAGATGTGTTGTATAAGGAAAATGGCTAACAAATGTGCAGAAACCGTTGTTGAGACCTTCAGAAGTATAGTCGCCTCAACTTTCTTTGACTTTAAAACGATTACCTCAGATAACGGGACAGAATTCGCTGGTCATGAGGATATTTCAAAGATTACTGATGCTGATTTCTACTTTGCTAGACCTTATCGCTCTTGCGACAGAGGCCTAAATGAGCACACGAATGGTTTGATTAGGCGTTTTCTTCCTAAAGGAACAGACTTTAATGAAATAAGTGATGCTAAAATAGCAAAAATAGAGCATATAGCGCTCAACGAACAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGTGCTGCCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCGAGCTTCACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTGCGTGCCTTGAATCGGCACACTCCACCACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGTGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTCACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCATTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTATTATTGCAATAACCTTCAACCACCATCGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCCATAAAGTTAATTCGTATCGATTTGCTGCCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTTGCGACTTTCTCCAGGAAGGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATCTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGAATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCCTCCATATCGCTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAATCTTGCTTTAACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTGTCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAGGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTCCTAATATTATGTCAGAAACTGTTGACCGAGCGCTATACATTGAATGCGAGAAGAAGGGCGAGTTTAGATTATCGCGCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGAATTTAATGGCGGCTTAGTGTAGAGTGGTGTTGCACTTCATATGACGGAGGGCGTTCTAAGCTATCGCACTCGGACAATAATACTACCAAAAATTTATGATTTAGTCGGGCAAACTATTGAGGCATATAACCAGGTCACGTTTGTTTCACTGATGAAAAGTAATTTCAACTACAACCCTCTTAAATGCATCTTGTGCGGCAGTCAGTTAAGAAGGATAAGCACCCAATTTGGTCTGACTCTTAGGGAAAAGTACAGTTACTATGAAGAGCTAGCAACCAGCCGATTTAGAGGCTTTTAGTAGGATAACTCCGCCAGAAATTAGAGAATTCGCCTATTTTCACCTAAAAAACCGCCTGCAGGCATTATATTCGGTAATGGCCACAGCAATACTGACCAGAATTTAACATCCTCCTAAACATTGCCGCCAAGATCATTTTTTTGAAATTCCTGAATCTTCAACTACTCAGTTTAATATTGCTAGTCTTTATTCTATAGCTAACCCGGAAGAGTCTTAATTAATGCGTCAGTAATTGCGTTGCAAAGATGCTCATGTTTTTTAATCACCTTTCTTATATTTCGTTTAAAATTAGCCCAGAATTTTTCAATTGGATTTAAGTCTGGTGAGTAGGCTGGCAAGTATAATAGTTCACAATCAACAGCTTCAACCATATCATAAAGTTCAGGGCTTTTATGGAAGCTTGCATTATCCATGATAATTACTTGCCCAGGATTTAGCTTCGGACATAATTCCTGTTCAAACCAGCCTAAAAACAAATCCTTATTCATTGCACCTGAAAATTCGAAAGGAGCAACCAAACTTTTATCACTATACTTCAAGCCAGCAACAAGGCTTAACCTTTTCCTCTTGAAGCCTGCTTGTTCAGCATAACTTCGCACTCCGGCAGCTGACCAGCCATATTCAACAACGATATTATCATCAACGCCAACCTCATCAAGATAAACTAATTGGCTCAAATCAATTCCTGTTAGCTTTTCTATAAATTCAGATCTTTCGGCGTCACGTCTTTGCTTATACTTAGGCTCTTTTTTTATATGTGACTTTTAATCGTTTCAATGCGTCATAAAAGGTTGACATAGGGAGGTCAGGAGCAATGCCATCACGAATGGCAATCCCATTTGCATCTGGATTTTTCTTTATGAAATCTAGAATAGTTTGTTTGTCATTAAACCTTATTTGTGCGCCACAGCCAACTCCTTGTTTTGAAGAGTAGTCACCTGTTGATAAATAACGTCGAATCCATTCACAAGCTGTATCATAATGCACCTTGAAAAGAGTGGATATTTCTCTTCGGCTAAGCCCATCTTTATAAGCTTCAATAACGCGCTCTCGCAAATCCTGACTATAAGCTTGCAATTCTAAAATCCTGCTATATTTTTCATGTAAGAATAATAGCAAAATCAAAAGGTTAACTCAACCGTGTCAGCTATATACAGAAACAAAAAACTGTTAGACTACTGCAATACTCGGTGAAATATCAAATGCAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAAAATGGTGAAATATCAAATGCAATGGTGAAATATCAA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58 | Indivirus(23.53%) | transposase,integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
52377 : 98744
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP039228|52377:98744|DBSCAN-SWA 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55 | Acinetobacter_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 58047:58106|attR 85555:87087 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
102644 : 195298
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP039228|102644:195298|DBSCAN-SWA 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121 | unidentified_phage(21.74%) | capsid,tail,head,transposase,integrase | attL 128625:128684|attR 175127:176236 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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