Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235 | Paenibacillus psychroresistens strain ML311-T8 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas3,csa3,WYL,DEDDh,RT,DinG,Cas9_archaeal | 0 | 6 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235_1 | 749512-749661 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034235_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP034235_1
>1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT TCAACGCCAACACCTGTACCAACATCAACG >1.2|749578|18|NZ_CP034235|CRT TCAACGCCAACACCTGTA >1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT TCAACGCCAACATCAACGCCAACATCTACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034235_1
The CRISPR arrays of NZ_CP034235_1 >merge|NZ_CP034235|1|749512-749661|CRT CCAACACCTGTACCAACATCAACGCCAACACCTGTACCAACATCAACGCCAACACCTGTACCAACATCAACGCCAACACCTGTACCAACACCTGTACCAACATCAACGCCAACATCAACGCCAACATCTACACCAACACCTGTACCTAAC >NZ_CP034235|1|1|749512-749661|CRT CCAACACCTGTACCAACA TCAACGCCAACACCTGTACCAACATCAACG CCAACACCTGTACCAACA TCAACGCCAACACCTGTA CCAACACCTGTACCAACA TCAACGCCAACATCAACGCCAACATCTACA CCAACACCTGTACCTAAC
>NZ_CP034235.1|WP_155705211.1|743817_744369_-|VanZ-family-protein MNKREPIKSVFLYGIFICYLFLLIFIFFLSRVSLLELFNSQRTLLRSINLIPFNSISEYISGSSVNLKRFAFSNVVGNIAIFIPFGIYLPLFKNDKRVLTNLLFIFIVSLFVEIIQWLFGIGTSDIDDIILNCLGGWVGILGYKFLLLILRDEKKVRTAITILSAIVGLPVILFLLFFIKLRL >NZ_CP034235.1|WP_155699053.1|742957_743779_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MIRLQTEKLDIAYNERIIVEQLHLTIPEGRITALVGANGSGKSTILKTMARLHKPKGGEVLLDGKSIHKLPTREVAKKLAILPQHPIAPDGLTVEELVSYGRFPHRSGFGSMKSDEKEIVLWALEVTGLSELAERSVQELSGGQRQRAWIAMALAQNTDILFLDEPTTFLDIAHQLEVLKLLRKLNVEQGRTIVMVVHDLNQAARYADHIVAIKNGKIVTQGTPGEVMKKEMLREVFGIEADIIADPRTGLPHCLPYEGTSEKYAKANLVAVR >NZ_CP034235.1|WP_155705210.1|741892_742732_-|SDR-family-oxidoreductase MPTNPPIVLITGTSSGFGLLTAIALGKAGYHVIATMRDLSKQNRLIERATAENIIQNIECMQLDVTDEKSINQTIKTILAKYQRIDVLVNNAGYAVGGCVEDIPLEVWREQFETNFFGLITLTQAVLPIMRQQKQGKIINISSISGRLGFPGYAAYSASKFAVEGFSESLRHEMLPFGVYVVIVEPGSYKTEIWDKGFANMQTSPESAYRTQLEAVLRYSHKAAKTSPDPQLIADLIVRITAKASPKLRYPLGKGARLSIWGKALLPLKWFEWMLHKLL >NZ_CP034235.1|WP_155699052.1|740608_741889_+|beta-N-acetylhexosaminidase MSPNKRISVFLISICVITSGCSSKNNLTTISPRPSATESSSPTQIPSSSPAPTASPTPTPDPIQEQIKLMTLDEKIGQMVIVGVEGTAVSEQTRDLIDHYHVGGIILYSNNIVNKTQTTDFLNELKQANTNLNKVPLWLGVDQEGGRVSRMPNEYTKLPTNRAIGKINKPEFSNKLGNILGKELQSVGFNMDYAPVMDINSNPNNPVIGDRSFGADANLVSKLGVQTMLGIQAQKIAAVVKHFPGHGDTSVDSHLDLPIVQTDLKRLRSFEWLPFEAAIDNNVDAVMVAHILLPKIDPDHPASFSKTVITDYLRNELKFNGVVMTDDMTMGGIVNHYELKDAAAQSINAGSDVIMVAHEYEKAKEVLSNLKSKVETGELPEERINQSVYRILKLKLKYAIQDQALENTDITPINDEIKRVLKQYMK >NZ_CP034235.1|WP_162462938.1|739066_740488_+|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MKNQGKILIVTCLALFMTMLDTLVLGVALPSIQNSFHADMTELEWFLNAYTLTFAVFLIPASLLGERFGRKRMFILGVLLFTIGSILSGFSDSALSLSIARAVQGFGGAFIMPISLTLVYSVFSVEKRAAALGIWSGVSGLGLAIGPLVGGAVIEGFPWQMIFWLNIPIGILVVIFSSLWIPESRGSSKPFDVLGVGLLGIGLFGIVYGLVMGNTEGWGSASVITSIAAGLVLLLIFARRSLKQAEPMINLRFFKNRNYLSFNLAGFWMSAGIFGSIFILTLFLQQGQGFSPLQAGVREMAWTGMTMIMAPLAGLFINRLGSKNILIMGLVLQLFAMLYFAIITLINGAHYPFTTLLPGLMMAGAGMGLSFTPLSHGILTSLAEKDAGEASGVSNAFRELGGVFGVAIAGLIFQMGSAVTSQEQFADHLVPALFVCSAMIAVGLASSLFTRTYKIGASEEKGEYDEKKGVLAN >NZ_CP034235.1|WP_155705209.1|738470_738989_+|TetR-family-transcriptional-regulator MVVRVDKKDLIIDGAVAIFAESGYYKATTAQIAKAAGVTQPYVFHFFANKEALYQAVMDRAFSRIFQVFEEIDAPPDKLYETMGHSFIEVMKSHRDEILMLMQSHTIAEPSIREHVKAKFKLVYDTVLARFQKAGLSDPGIKASEFIGDGMMLTLAEVLGLPELCWFNKSGK >NZ_CP034235.1|WP_155699050.1|737658_738309_+|nitroreductase-family-protein MNQSVASSASFETVIKERRSANNFDETIKITRAELEEIFTLTKLAPSASNLQHAHYVVVDELPLKEELKAAAYNQHKVGTSAAAIVVFGDKFAYKNAPQIYEGLRDLGVLSKQEFDQTIASINSGYENQDAFQRDEAIRNASLSAMLFMLVAKDKGWDTCPMIGFDPAAVSKLLNAPDHLVPVMIITIGVEKTSHKRPRGYRKPLGEFVSYGSFQA >NZ_CP034235.1|WP_155699049.1|736875_737640_+|GTP-cyclohydrolase-II-RibA MLTDQVKLLLKKKIQITQEPGKPALSIVGPIKLPIQLEQQELHFQWYTWLTLENITSDTGALLDILPELDLASMQQSSVLVYGDFQNSDKALIRMHSICHTGDIFGSKRCDCGFQLKESMRMIAEHGSGAIFYLANHEGRGIGLFAKSLAYLLQEEGLDTVEANHSLGFEDDTRSYDEAIRVLHALRQKPVTLITNNPKKIKAMQDKGVLVDSHLPLWGDVSKFNHKYLATKINKSGHIPAASKTMYVQRKVAQ >NZ_CP034235.1|WP_155699048.1|736450_736765_-|transcriptional-regulator MSEFQMCAKFEMAFELLGKKWTGLIINTLLTGPKRFKDITMMIPSMSDRILAERFKELEAAGILERHVFPDIPVRIEYELTKKGRSLQPVMNEVQHWGDQWYGL >NZ_CP034235.1|WP_155699047.1|734524_736372_+|sulfatase-like-hydrolase/transferase MALLKLGNRRFIIFTLILALKGCLAWFVVFEDGPSWGTILTEIPFFWVMFTLIEWFAKERKLFYYLIVNLLITVLYFAVLMYYKYYGIIATYHALNQMDKVTKVGESTYSLLDPYYLLIFIDIIVFAVILLRKRIKLGANPFKLIPMRKSVLSLVFILSITSCLFSILPNKASMNENKKAEEMGILNYELYTVLSDSNQEIETVPMASINLSAIKKLKGIETPLQPQYFGKFKNKNLIIVQLESFQNFLIDLKVDGQEITPNINKLAKENIDFDNFYTMVGQGTTSDAEYVVNTSLYVPEHEAATDHFVDKALPSLPKLLLDNGFTTATFHTNKVEFWNRQELYTSLGWEHYYDQSFFGDDDHIAFGASDEILYSKTVNQLEKMDQSAQPFYAQMITMSAHHPYTIPESKIKMKLPEPFKDNLLGNYLQAQNYADYALGQFIANLKSRGLWDDSIILFYGDHQGLPLHSLSKDELELMHQLLGRAYTNSDMFNIPLIIHTPDVAMHQVIENTGGQIDILPTVANLLGVSLENQIYFGEDLLNQTTNLLPMRHFLPTGSFITDLSLFLPGIAYEDGVNYSLAPVEGSAFPATEQQYENALELLRLSDSYVTQLPDK >NZ_CP034235.1|WP_155699055.1|751162_754777_+|cyclic-nucleotide-binding-domain-containing-protein MKKLGNANIFTNAIQKFGADREEYTKIFLLFGYLFCIVSASTIGRTAADTLFLSRFDSSKLSLMYLPQAAALLLAGFIFQKVCTRLRTDQLVLSVITLVSMLTLGSRLLVDFGFQWVFPVIYVGYDVFNFLMIVCFWQFATAIMDQRKAKRMIGLVGSGGIVGGIVSGFGLKLLVGPLGTENLIFIYAGLQFLCLILVRYHLHKTKDRQQLFSISKAPVKKQASASRPRAEGKEGLFKNVPHLKYVALMAGTLVISLTFIDFQFKVILRESLQNEALAGFMGSFYGFAGLLALFIQFFVSGRLITRFGVMTAILVFPIVLFAGSFAVLLMPVLAMAVMVKGSDKVVGDTIYSSVSQLIMFPISPEWRGRAKGFLDGVVRNGAKGVAAISLIVLTKLLTVHQFSYLILALIACCIFAAIRIKAAYLKMLLATLQTREIDLLDTEQLDLMDPASIQLLINALRSEEKQQAIYAFRMLRGLEQFDLNPYVAELLRHPVVEVRTETLKYIQQTIPPEGEHELEPLLQSPIVKVKSNAIMALSAYAKDDQVERISGFLEEADVRIKAAAIAGLIKYYGIEGMFQAVGTLKSLIESGREEERTAMASLFGKIGIASFYKPLIQLLQDNSAHVQVYALKSAAVLRVPELAPFIIPLMQKAGTRQKAIEALSAYDEAIILPLLEPYLIGEKTILHLPKVFERVGTQRAFDLLLHAYEQVSDELREKILESLVRLHPSLGRTDNRRIENYIMQETSLYWKFTDHGKDLGEEDEFAEVFEAVKQIKAHILIRVFQLLSLIYDPKTVHAIQANWMGGDVRQQANSAEVVDQLMQGGLRTEMTKIMLASPIKRTHTDLSSLGPSLSWLFTQKDAWLNQVIQFAAYQSLNKPQYKEILNLFDVAATKEDQEERVTQLDRVKLLKNVTLFRGLSGKDLSKISEHLLEVSVKKGEAVIREFEDGDSLYLMHKGNAAVFRNNIEVGKLVAGDCFGEMGMLIQSKRTATVIAEEDMHLFRLDSVALYEMIFDQTAIALELMRLLSRRLRSALALVGSTKTNEPEKITPPVNETNNAAITQINNGIILQRMLVLQKISLFAHFAQEDFIRLAHMVEEVIYEPGESICKSGEAGDTMYGIIEGTVQVHRGEEKLAKLSVGQCFGEMAIIDGDPRSADCTAIERTILLQLTKDQVFSFCFQQMNVLKSMMRVLAERLKDMQDRV >NZ_CP034235.1|WP_155699056.1|754961_755357_-|hypothetical-protein MKDMNPVNTTNADHNKKKDAVDPAYLTKDPVRADTLNNVHQTGEAVVEAGAYFCEAGKKQDFAKGATFPVCPVNGSSTVWRHANHQHKTGEAVLETSHYYCTDGQHLDLNKGDHFPVCPNTGEETVWMHSE >NZ_CP034235.1|WP_155699057.1|755546_756407_+|aldose-epimerase MYEISINEGPFPIYEVKDIATNSWFHISPERGGIVTSYGVNGEEQLYLDKPTFDDPKANIRGGIPILFPICGQLVNKAYEWDGQTYIMDNHGVARTNPWEVVATEQQSDYASITIKQASTPETLKAYPFAYELVFTFRLQAQKLHIEQEYRNHSIADMPMYAGFHPYFLVDNKENTVESDASQLIYLTEHKQVPYTGEVEMSKLPDSIAFAKAATQKISFQPKPGHEVHLTYGDEFQYVVIWSLDGKPFMCVEPWMALTNEFNVKQELVYVKPNEPLITFMTIGVN >NZ_CP034235.1|WP_155699058.1|756845_758681_+|amino-acid-permease MTSESLKKFMFGRPLKSSEMESEKMPVWKALPILSSDALSSVTYGTEQILLELALVGVAAFAFSVPVALSIILLIALLVTSYRQVIEAYPQGGGAYMVTKENLGMPWGRLTGVSLLIDYTLTVAVSISASVQAITSAFPSTVPFMVEIAIVLVWIMVWLNLRGTSESGTVFAIPTYFFIFCILLLIGKGVYDLLSGAPNIHETGIIPTAIPSGLTLFIILKAFSSGCSAVTGIEAISDAVPHFKTPSAKNANRTLLSMGVLLAIVFGGVTLLALAYGIRPDPNGHTSVLSLVTEHAFGRGFMYYATQIGTVLILTLAANTSFNGFPILASIMAQDKNFPRMFSFRGDRLSFNYGIVTLGVLASILLVIFQGKTNALIPLYAIGVFLSFTLCQTGLVRKWYKDRVKGWKGKLLINGLGAVVSLIVLLIFSITKFHEGAWLVIIITPLLLWGITKISHHYEDVANELRISLCDEKLVPKESIIIVPVAGIHKAVSATLNYATSLSPNVIAFYVAFSDEDEKHMEEKWEQWNPGVRLIVFKSRYRTFVKPLLEFIERIDSHVAEKQNIMILLPQFIVKRWWHRFLHNQSASRIRNKLQADRDIMVATVPFHLHD >NZ_CP034235.1|WP_155699059.1|758796_760068_+|FAD-dependent-oxidoreductase MEKYDVAVIGGGLSGLITAIYLAKGGKKVVVLEKSSRLGGRAMTNVKNGASFNLGAHALYCGGEAYPTFQQLGLKLPGAKPKAKGEMIWKGKLLTMPTTPIAMLTSSFFTWSAKFELIKLLLGLPKLNLTEMQGISLREWAENKIADPKVRHFFYALCRTGTYACEPDHQLAGPVLKQVAIALKPGVMYLDGGWQTIVDQLQEQAKKLGVGFRSNAHVKGIEQNQSDLKVVFAEGDGLNAASVVSTLAPADTYRLIGETGSPTLKRWQDEARKVTGACLDICLKRLPVANRHFVMGIDQPMYYSNHSNVAKLSEGSSQVIHVMRYHEYGEHNPKADERMLEETMNLVQPGWQKEVVSKQFLPNITVVNDYLHLGKSDLKSGPVVPEISGLYVAGDWASHGEMLTDAAVASGIRAAKQILQETR >NZ_CP034235.1|WP_155699060.1|760074_760986_+|RNA-polymerase-sigma-70-factor MDHEPIDEQLYQAYKPMLFAIAYRMLGSVMDAEDIVQEAFIALHKAALAPIDNIKAYLCKIVTNRSIDRLRQLSRQRKVYVGPWLPEPLLTNEFTESDPSQAFMRKESISTAFLLLLQQLSWVERAVFILREVLEYEYEDIAEIVGKSSTNCRQIYHRAKRSIGKDEEAIGFGHKQVDQPANLGLVEQFVHALISSDMSRLLKLIATDATLYSDGGGKVTAAVRPILGVERIISFFTGILKKQPPDFAFKFCSLNGQTGMVVYGDGRIYSIFTFQIKADQLSDFYLMVNPDKLISFPLQFELM >NZ_CP034235.1|WP_155699061.1|761115_761928_+|prolyl-oligopeptidase-family-serine-peptidase MTIKEEWIKYGKNNEFSGFTARLEGVESLPAIIVIQEIWGVDGHIQDVVRRLAGAGYVAFAPDLFSLEGTYPDPISPERVEGAKQFLNSMPSSSWRNPVEREEALIRLPLGQRTMISESLKSLLGGLNPTDYHNHLTGAAAFLRNTYRYTKGQGVVSVGFCLGGALSAVLASLDPELKGAVIFYGNAPSTEQIANIVCPVLGFHGELDTRLVEGLPAFAAAMKEAGKSFEYTVYPNAQHAFFNDTRPSYQNKASRAAYARLLSFLQEKLG >NZ_CP034235.1|WP_155699062.1|761956_762394_+|MarR-family-transcriptional-regulator MVDKAQLEIFTTHLQKVNRYLRCKTFDNKERIVTRVQWLLLRYLYRKPDRTIGQLAAHLDVRQSTMSQMLDRLEKVDLIMRRTDSQDARIKLVELTAAGILFIRQTEEAWMEALAEPFAHFTPDERQALVDLMEKLSQHLPKEYN >NZ_CP034235.1|WP_155699063.1|762533_764042_+|chemotaxis-protein MGKLTKTTSIAKAKGISAIDSDMVKRNLVVFLAMAFTALLTFSSVLALGKGETDSSIMWLVVIQLINLGIFGFLHFKRIWIHYICYFAVVGSILSSYSSVSQTPSVANTFSIFYLLILSMIFMKLWPTIISVLSGFAMLLYILVGQKDQIHLEPNTETTYYIIYILISILLFALLRVSTQLIKSMEVARSQAEQLSQQQQNQKQLVMDNVTSVTEHLNTVTKAGEENNYSFEEMNSAFQEIANGATDQVDSTLSINDSIQEMNTLVKEMSDSIHILTEKTNEAALLSDQGKSNMEQLSATNADFRVDIESVATVTTDLIDRLAETSQFSATIQDIANQTNLLSLNASIEAARAGEHGRGFAVVAMEIRKLAEMTAQAAIRITEQLEEFTNQSELSQAKMNQAAKRMQQSNEIMDQTKQSFESITDAISQLKLLSNGYSGLMSRISDSSGTIVDSTTNLASISEEASATLEQLSATLQSLLQNNRYSLDRIKEAESSLRLVSN >NZ_CP034235.1|WP_155699064.1|764117_764963_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEHQIRNRFAILSDLLLGLPIYLTSVGGWSNQDKMIRKQGYADFHWIQTISGQGELVTEGQTFTVNQGQGMLLFPDIAHTYYATKEPWEVSWVTFNGKYARSILRAFHWENSQILTISNPLRLLHKMDVIYSLTNSKDTMDSLDASSKIYEVLLDLHVFGSASEVRSKQQHIEHLSPVLNYIDDQYAQPIALSDLASLLSVSPQHVCVLFQQTLGMRPFEYITKQRLRKAKELLLKQTEMEISQIAQNVGYSDASYFIKLFKQQEGLTPKVFRSTHIGLPS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235_2 | 1420644-1420734 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034235_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP034235_2
>2.1|1420669|41|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder TAGCAAGAGTTGCTTCTGGAGATGCAGAAATTGGACCATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034235_2
The CRISPR arrays of NZ_CP034235_2 >merge|NZ_CP034235|2|1420644-1420734|CRISPRCasFinder GCTCCTAAATCAGGCGCTAGTTCTTTAGCAAGAGTTGCTTCTGGAGATGCAGAAATTGGACCATAGGCTCCTAAATCAGGCGCTGGTTCTT >NZ_CP034235|2|1|1420644-1420734|CRISPRCasFinder GCTCCTAAATCAGGCGCTAGTTCTT TAGCAAGAGTTGCTTCTGGAGATGCAGAAATTGGACCATAG GCTCCTAAATCAGGCGCTGGTTCTT
>NZ_CP034235.1|WP_162462983.1|1419054_1419618_+|isocitrate-lyase/phosphoenolpyruvate-mutase-family-protein MLEELKELIRKLISFGVSGVNIEDGKGDKKLQLEDMDYQARKIQLIKETALTCGVSLFVNARTDVYWNVFNESYIQAEEAIKRASAYREAGADGIFVPGVHENNVIDHLIKHIELPVNLLAGKDTPDVKELTKLGVARISSGSGPFRASLSLIRQVGEEFLHQGTYKSFSKNIISYDEMNRLFLEEV >NZ_CP034235.1|WP_155699545.1|1418876_1419116_+|hypothetical-protein MEINEHYEKAVSFKELHHHSLPLLLPNAWDAMSAIVFEQCGFKAIGTTSAGIAASLGYADAGRTEGAYQKANILWSFGS >NZ_CP034235.1|WP_155699544.1|1417766_1418549_-|phytanoyl-CoA-dioxygenase-family-protein MENTEFNNAKLNYDRDGYVAFQNVLDQDLMQEAKAHIEWLIMKNPNVRPEMLGHTLVKNDPFWVRLLSDDRLLNIAEQFIGPDIALFAAHYISKPAFDGKPVLWHQDGSYWPLDPMKVVTLWLAVDDSLQENGCLRVIPGTQTMELQEMRVNTLVDNVLDSEVDPALVDESKAVDIILKSGGVSVHHPNVIHGSEANLSPLRRCGLTIRYIPTSTTITKPNWPCAFLLRGEAIPGINDYLPKPKYVEGEHMRFKGCELWS >NZ_CP034235.1|WP_155699543.1|1416875_1417721_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKQIVPDRLMLEDYMSNEATLRVYHFEIFKTSLLHWHEFYELVLVIAGTATHGLNGKSIPLRRGSLFLLTPADFHEINVTPGESLLFYNVIFSGIRLDEPLINMLFEQDQQHYYDFTEPETKRLEVEFTLMQTEENQQQIGQDRLIQGALERILIELVRAIQVLSVAQISINKPLIQPSIRKAMIYIEHHFRENITLEEVARQAQLVPNYFSTCFRKMTSITFQQYLQDLRIHFAKSLLQASRLLSVTEICYASGFNNLSHFIRVFKQKTGYSPNVFRGHL >NZ_CP034235.1|WP_155699542.1|1414685_1416722_+|DUF5107-domain-containing-protein MNGMKVRMSSLTIEGALIEGENPLPMFRSRDHHREVFVNENYVDEHKLNLGNDTGERYLPYRMQDRYSRAREMLELKTVVLENDHLQAVFLPDYGGRLYSLKDKRTNREILYKNPVFQPANLAILNAWFSGGIEWNIGHLGHTYTTCSPLHAAKLVDDEGNEFLRMYEYERCKNIFWQLDFHLPQGSEQLLLYVRIVNDNNHAVPMYWWTNIAVEETTESRVFSDTKDVIYHDPELKGFGTGQLPYLSSVPDTDVSYPMRFPYSNEYFFQTAESCKSPWEAIVYEDGRVFYERSTALLRYRKMFCWGNHQGGRRWCDFLAKPGEGNYIELQGGFAPTQLHGLEMPAHTIWDFTQIFGVSVVDTKLAYDESWDQAQGYVAAHLNEKLDEAEVYASHNKLQAYADKLPESILHKGSGWGELERIRREQAGERDIPQGILFTDESLGAEQLPWIALMQEGSLPESAVGDIPASWMVQKEWTRLLQMSLKNPDNQNWAAYMHYGVMLYEQELEAEAVDAWETSIKLQPSTWVYRNLAEVMKQRGQREEALACLEQAYNLTNGFPDRAFAEEYLNLIMLGKDYSKAWEVYESLSVQDARCDRIQIIVGKAALELGKYEFVNSLFNKEFAVIREGEVLIIELWFSYQARKLAESRNTSVTQQLIEEAKVMFPPPVNIDFRMVGA >NZ_CP034235.1|WP_155699541.1|1413824_1414670_+|ABC-transporter-permease-subunit MMENRILKTRLSLLLRYIPLMAWLGFTIVIFGYAILASLSTTREIFSNTLLKSGIHFSNYIDLFKNLNMGLYFLNSVIYTVTACIGIIVVVAPAAYILGRVQFRGKRLVNLMFLSALSLPGLLISIPLFSLFIQLKLTGSISTLILIYVFTNVPFGVFLLTGFFSSIPKELEESAAIDGCGPIKAFMKIIMPIAQPGLITLSIFNFMGIWNDYFFALIFANDQKHHTLALALQSIVYGYTNTGNYAGIFAAAMVVFIPTFILYIFVSRKIVAGITVGSVKG >NZ_CP034235.1|WP_155699540.1|1412900_1413812_+|ABC-transporter-permease-subunit MRIKKPIIALFLGPAVIIYFAIFFYPTLRTGLMSFYNVESISSQFSEWSFIGLDNYVDLIHNSYFTGSVWNVLKIWIIGGALVFFFAFLFAVIISSQGVRWKAFWRSLIFLPNTVSAVVLSIVWLQYVYNYDYGFLAKLFKMVGLNSLAEIQWTDDIHLFISMLLAYCFGCIGYFMLILNAGMDRIPQDYYEAALLEGANAFDKFFKITLPLLRDVFRTTLVLWTITSINFFVWSATFGLADPHTMTPGYFMYLRVFGNSRSVYMDDAFNIGSGATVGVLITLAVIVLSSLINLFFRKERLEY >NZ_CP034235.1|WP_155699539.1|1411370_1412795_+|extracellular-solute-binding-protein MKRKPKAIFTLLTVSMLALSLLAGCGGKSATETTSAPTAAPTEAAAPAETPAPTAAATEAPKSTELEGKVVFWSMWSSSEPQSKVIDAAVAEFKAANPKVELEVKFTGRELGKLIKPALDGGQQVDIWEGDPEKLIGNLKDHVLKLDDLIAQPAIGMDGKSVKDSIIPSLMEWTKSLSTVAGIEEGYYAIPQQPFAVLFFYNKALYEAAGITSVPKTWEEFIADAELLKKSGVAPITFDDAYRDLFIGGYLGSAMGSDWVDQLVKDKTGEMWKDPIVLQFAKDIQNLTDKGYFSKKIAGSKYPAAQQDLVLGKSAAYLNGTWLPNEVSETAGADFKWGSYQFPTVSNGNDKGGQQGLNFGAQALLINKDSKNAAAAFELVKYLVGKKAQESMVKDAVAIPATIDTAWPAPLAEAEVAFNNAKVNMPWGFGIDNGGDFSANTVIPVFMELVTGKLKAEAYVAKMADEAKKFYTGK >NZ_CP034235.1|WP_155699538.1|1409342_1411160_-|HAMP-domain-containing-protein MGFLKKLKIRTQILIALSCLLVIMLTIIYSMYIQTSGIVIKDNNQYSEDIIHKFTKATTQNYEEVSQIMLNLGFDPTTQNFLTQTDNVAAYDLSKELDRKIISLKAGRKGIDDIILIGANGTRYSLNGGVGNIQHLENEINHHNNVYVSGIEKFFYSGNKGDYIVFAQNLFSNGLNTMKDGIRIGEIAVIVNVNSMFFNKDLANTEESVGFYLIDRYGHVFPDSNTPDITKNISTLSKDYKPDQKLSGTIGGVQGAVQIEQITQIKATILSFVPEKVLLSELSTVRSRSIMIILIALLLMALPFAVIANNILSPIQMLVKFMNRIKAGNLNDLTMKLQLEGNIEMKVVAEKLNGMLGEINLLTNQLVDTTTNLYEAEIEKEKSASAFLRSQINPHFLYNTLESIKGVAYEEGNSKIVAMTNALGKLFHYSIKGSGFVTLDQELTAIKNYVFLQHIRFEERFDVRYSFTEEALLLPVMKMILQPLVENAIFHGLEPKTSKGMLIIQGEIVAGDTLIIQIRDDGIGVESHKLQEIKNKLLEGTSLAANRDGYITYNDSIGIFNVNNRLRLAYGLGHGLTFESELGIGTCITLTMPTNIMQLGGTTDV >NZ_CP034235.1|WP_155699537.1|1407931_1409350_-|response-regulator MYRVLLVDDENLVLKSLEAGVDWAKSGFTVVGKANNGAQALQLVASLKPHIVFTDIRMPGISGLELIKQIQELDPHIQFIVISGFAEFTYVQQSLKFGVLGYCLKPFDDDEINLLLKKATKLLDEQKQKHEYHLLELFQETPSITTQAAFDAILLDEELNTETLYVLVSIGKGCLPFSQGDRYLRINSGSASFSYIVQFQDDSSYARFIGTNIPAGIKGIGIQQTTRSLENITKSIDIATTKAWKFFIVGQADYFIENDRSLEIKANQLVKQLEKAVIMKDIVLVRKLLDELLLADNKSCLTIFHALKIYNSVYFHTNDDQTQVTSDEYVFSKEQLYYLYLSFEAMVANMKQAIKGTNSQALHQTEHRTKNANLKEIIKYMNENYRNDISIQSISKNFYLNPNYLSQLFTKELQVTFTEYLTKLRLEQAKSLLQTTSLSISEIAEQIGFRDYFYFIRLFKKYTNHTPRQFKQ >NZ_CP034235.1|WP_155705244.1|1421190_1421568_-|hypothetical-protein MNEIYVVNQADDNVSVISGLSNIVIATVTVGTSPIGIGVNPISNRIYVANSLNDNVSVINGSTNTVIATVTVGATPRSVSVNLLMNGIYVVNSTDNSVSVIDGLTNTVIDTILVGATPFEIAVNP >NZ_CP034235.1|WP_155699548.1|1423288_1424011_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MLNIGHRGAAGEAPENTLASFLLAIKQGATAIELDVHVSADGEIVVCHDATIDRTTDSRGAIADLTVEQLKQADAGRWFNKAFTNERIPLLGEVFDAMPVDFPINVEIKSNKHPQVVQKLIALMQNKARTNSVIVSSFGYEVLYALKRAEPEIRIGLLYDKPIDYRALAEWNKVKLYSLHPHYKLVNHDYAKDVIAQGYMLYPWTIDNEVRMKELIENQVSGIITNFPGRLNQLLVASDQ >NZ_CP034235.1|WP_155699549.1|1424125_1424305_+|hypothetical-protein MKYIIKLIGGYHGGVYGVRGLYDIVPIEKAIEFDDLKIATNRLAYLEEKGYKNAALITK >NZ_CP034235.1|WP_155699550.1|1424758_1425076_-|hypothetical-protein MSEYNSSEAMACPIGEVLISRLTEIKEMIDDYKQIKAHKPSKGQESFVKEQSKLYEDQFEACMDDLLLKLEVADKALEALSRPSVVHSSKDVQQLALKALNSLRE >NZ_CP034235.1|WP_155699551.1|1425140_1425371_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEFAEKLKELRQLKGMTLRKLSEKACVSYSIMNAIENGKFQPTKEVVVSIAYALKHDDVKALLLLSGNKADDMENN >NZ_CP034235.1|WP_155699552.1|1425668_1426097_+|MarR-family-transcriptional-regulator MGTEKELFAERFRSALQNLKKKMTHDFANQFNHGLTTPQFYILFMIRENGTCKVTALAEQMGVKPSAISVMIDKMVNQGYVIRLADTSDRRVVLLQITEAGLLVVKEFEQQSNEMIGKYFDKLSVDEIESMIKTFEKMNGTI >NZ_CP034235.1|WP_155699553.1|1426142_1427621_+|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MSTKAAAPEQSVSLRSLIGPLMAVIIGMIMVILDSTVVNVAIPGLQADFNSPLTTIQWTITGYTLALSAVIPLAGWMSDRFGAKRIFLISIVLFTLGSVLCALAQTAEQLIIYRILQGIGGGMVSPIGMAMVFRLAPADKMGSVMGMLGIPMLLAPALGPVLSGWLVEYVTWQWIFLINLPIGIAAVIVGIRLLPQDIINKKVPSLDIWGMLLAPIAFATLAYGVTQGGESWTSRPTIISLSIGAVALILFIIVELRHKQPLLELRAFGSSDFTRGVLISWITLIALFGAILLVPIYLQQIMGYGALKTGLILLPQALASAVMMPIGGKLFDKFGARPVSIIGMIIITAALYMLSRISLDTSIGMIITSIIMMGAGMGLSMMAINTHVLQSVPKKLVTRVTPLTTAAQQVVLSFAVAGLTGYLTSRIVHHSLSITNLSEASTAGYGDTFLVATAIAILGGLLSFTLRKPKKQPEDDADGGDQNPNPVMMMGH >NZ_CP034235.1|WP_155699554.1|1427659_1428634_+|hypothetical-protein MNTKIVPQILETTYKGVAAISLETELMKVIVVPEIGAKIVSLFYKPTQKEWLLDSGQRPFLPLGVDALFEKSDMSGWDECFPTIDACKYPLQGKHYGNLLPDHGEVWSLPWHAAIEPESLNLKVKGSCLPYVFQRKMSFIADGVMRLEYEVTNLSDEDLAMMWTAHPQFIATSDMAIHLPEAIKQMICVHGGNSLVANETVYNWPIASVSGQDKHLDTMDFGVEQDSRKLYYAGEVPEGWSGLSCSKSADYLLFQVSQEQVPYLGIWVDEKHYNDRITCALEPSSGYYDSLAAAVANGKSALVLAGKTLTWQLDVSLGNGDFPI >NZ_CP034235.1|WP_155699555.1|1428708_1429452_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MENKYWVPALEKANIILHAIAEKPYSLRLIDLSKQLNINKSSMYSLLNTLEQLNWIRRDKADTFSLGPSLGSLAGGYYKSNDLISSFHYEAALTKVIFNETIQLAELVGNEVFYLAKEEVPSPVRLASEPGMRFPAHSTALGKVLLSDLAIDQLIELLPDEHFVQATPHTIQTRQALIAELLTVVELGYATDLEEAVLGFCCAAIAIVKQGKVVAAVSCSMPKHHWELKKDQVIIEMKKLAGRLSLS >NZ_CP034235.1|WP_155699556.1|1429662_1430436_+|glucose-1-dehydrogenase MRLADKIIIITGSGSGIGRSSALLFAKEGATVVVNDLHVENGTETVTQIEAAGGTAIFIKADVTEPEEVKALVDQVIAQYGRIDVLFNNAGISNVGALHEVEPEAWDRVMRVNTRGVFLPSKYVLPHMMERKAGSIINMSSCVAEIGLARRAVYAASKGAILALTKAMQVDYASYNIRVNALLPGTILTPFVENYLKTSYDDPIAAMESLKKRQLSGDMGTPEDVAFAALFLASDESRFVMGSPFYIDGGATFGKNA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235_3 | 1790015-1790199 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034235_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP034235_3
>3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder TCTCTTGTTTTTGATTAAAAATTGA >3.2|1790090|35|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder AATGGAAAAAAGTAAAAATAAGGTGAAAGCAATAG >3.3|1790150|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder CACTAAATTTCCGCAATTACTGCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034235_3
The CRISPR arrays of NZ_CP034235_3 >merge|NZ_CP034235|3|1790015-1790199|CRISPRCasFinder ATTAGTTGCTTTTAAAGCAACTAAATCTCTTGTTTTTGATTAAAAATTGATTTAGTTGCTTTTCGAGCAACTAAAAATGGAAAAAAGTAAAAATAAGGTGAAAGCAATAGATTAGTTGCTACAAAAGCAACTAATCACTAAATTTCCGCAATTACTGCTAATTAGTTGCTGCAAAAGCAACTAAT >NZ_CP034235|3|2|1790015-1790199|CRISPRCasFinder ATTAGTTGCTTTTAAAGCAACTAAA TCTCTTGTTTTTGATTAAAAATTGA TTTAGTTGCTTTTCGAGCAACTAAA AATGGAAAAAAGTAAAAATAAGGTGAAAGCAATAG ATTAGTTGCTACAAAAGCAACTAAT CACTAAATTTCCGCAATTACTGCTA ATTAGTTGCTGCAAAAGCAACTAAT
>NZ_CP034235.1|WP_155699848.1|1789332_1790007_+|DNA-binding-response-regulator MDMFEKEYRKWMDVHVAKRKGERRRKLAEGSNHAEKEMLRHIWWAAFGNFEFLHPEYEITDFFQGQRFLDFVYIRGPIRIVFEIDGYGPHLRDISRRQFCDERVRQMHLTNDNWIVIRIGFDDIKERPRLWIGLLQQMMGRLFGNPEQQLTQVDYLEREVIRFAIRENRAIKLRDLEKLFSFRYRAARTVIDRLVAKQWLIPASGGKERVHSWEVNVNNKQLPL >NZ_CP034235.1|WP_155699847.1|1787943_1789197_+|MFS-transporter MFTAFRQQVSKFSNNRRYLWIATVEGIPATIMGTLLGGPFMTGYLLFLGASSGQIGFVFAITTFVNIVQIWMAYQIQTIKNRKLIYVIFASLHRILWASTGLIPLVMAKEWWVLSYIILFTVAFLVNSAAAVVWSTLISDMVLGPIRGRYFGIRNTILNAIGSLTLFIGGLILDKYAGWSGFAILYVVIGICTVLNIIAFLGYPNLPFEKSTESKFLLMLKKPLKDASFMKAVYFIAGWLLIQTITVPFFSYIMLKTLKISYQQVSAITVVQTVIMMMSFYVWGNLNARYSNKRLLFWTLPLVALSCLMWGGLAFLPTLFVLYAAHILLGVGSGGFNQLAFNYLIGDTPKSERSMFIAMYSAITGFATFLGPLLGGWIYGRVAGYPGWVEEYGIAVFIGVILMFGLLIGRVVLRDDK >NZ_CP034235.1|WP_162463001.1|1787022_1787853_+|urease-accessory-protein-UreD MRWWLGSKTNFTMPEFTAELEATFAFEGGRTELQHKFHKSPLKIAKTFMRDDKQLGVCIMDCSPGMMAGDKYRLDWRLLPQSNVFITNQSYTKVHPSAEYPAYQLQSFYVDQGARLEYKPEPIMLYKEASFRADTEIKLEAGAVAFVTEVVCPGRVLRDEVFQYVRYDSQLQVYYENQLIYYNRQNIEPDSTKSDFRRLGSWENYTHQGTFYIFSDQLKSEYLKPIQELLERYPHLHAGASLTYKYGLIISVLGKSVWELQQLLDEAWLMMKLMVA >NZ_CP034235.1|WP_155699845.1|1786373_1787066_+|urease-accessory-protein-UreG MNIEIENRPSNEQRYHKGHHDHWHTPVADRSRPLRFGIGGPVGSGKTALVEKLARRLTGEYSLAVITNDIYTKEDAEILIRSEALPAERIIGVETGGCPHTAIREDASMNFEAIEELEARFADLDIIFIESGGDNLAAAFSPELVDRFIYIIDVAQGEKIPRKGGPGIMRSDLLIINKIDLAPYVGASLEVMEQDTKRMRGDRPFIFSNLMNGDGVDALVAWVEDQFHNA >NZ_CP034235.1|WP_155699844.1|1785628_1786339_+|urease-accessory-protein-UreF MENTSPAAASYSWLRYAQLLDSALPIGGFSHSFGLETAVQSGKVVKIADLREYMHSMITYAWAPMELMAIKAIYTYGPSEQWERIWRIDQIQHVQRIAAETREGTIKMGRRLLKLAHSLYPELLWSPLDNAIQQGECFGSYPIIHGWIAWQLGVPLTQAAEGFLYNGITHGINSALRLMSIGQTEAQALLAELLPQASIAWQRVALLEPEDCYSNSPASDIYMMQHETLYSRLFMS >NZ_CP034235.1|WP_155699843.1|1783895_1785611_+|urease-subunit-alpha MSFMERKAYASMFGPTTGDKIRLADTELWAEIERDYTVYGDEIKFGGGKVIRDGMGQSSSITRADGALDTVITNAIIIDHWGIVKADIGIRDGMIVGIGKAGNPDIMDGIDVNMIVGASTEVIAGEGKIVTAGGVDSHIHFICPQQIEVALASGITTMIGGGTGPATGTNATTCTPGAWHMQRMLEAAEAFPVNLGFLGKGNASFSEPLVEQIIAGAIGLKLHEDWGTTPAAIDMCLTVADQYDVQVAIHTDTLNESGFVEDTLAAIGGRTIHTYHTEGAGGGHAPDIIKAAAELNILPSSTNPTRPFTVNTIEEHLDMLMVCHHLDSRIPEDVAFADSRIRPETIAAEDILHDIGVFSMISSDSQAMGRVGEVVIRTWQTADKMKKQRGPLSPDSTANDNFRIKRYIAKYTINPAITHGISYIVGSVEVGKFADLVFWQPMFFGVKPELVVKGGTIAYAQMGDPNASIPTPQPVMGRKMFGAYGRSLYQSSITFVSEAAFSGQIKQRFQLQKQIMPVRNCRDINKKDMIHNDATPTIEVNPETYEVKVDGAAITCKPATVLPMAQRYFLF >NZ_CP034235.1|WP_155699842.1|1783200_1783899_+|urease-subunit-gamma MHFTEREKEKLLITVAADLARKRLQRGVKLNYPESMALITSEIMEGARDGLSVAELMSMGAEILKAEQVMEGIPEMIAEVQVEATFPDGTKLVTVHQPIRGRIASLSSSSIEPGQYDIAPGQIEMNVNRQTLQLLVGNTGDRPIQVGSHYHFYEVNRALAFSREQAFGMRLDIPAGTAVRFEPGEEKPVQLVELGGSRISHGLNGLSKGEAVPGQMSDEQRQTLREWEAKPE >NZ_CP034235.1|WP_155705272.1|1781632_1782871_-|urea-ABC-transporter-substrate-binding-protein MVICFAIMTIISACGTKDEVVESTAPAASTTASAAPAAAEGDTIPVGILHSLTGTMSISEVAVKEAELMAIDEINAAGGVLGKQIKPIIEDGASDWPNFAEKAKKLLQQDKVATIFGGWTSSSRKAMLPVVEANKGLLWYPVQYEGLESSPNIFYTGATTNQQIIPAVTWLLQNKGKKFFLLGSDYVFPRTANKIIKEQLKAEGGTLVAEEYTPLGHTDYNTIISKIKAEKPDVVFNSLNGDSNTAFFKQLQDAGISAKELTTMSVSIAEEEIRSIGASILEGHYAVWNYFQSTDTPENAKFVAAFKAKYGADRVTDDPIEAGYFAVYLWAEAVKKAGSTDVEAVKAAAKGIEFNAPGGKVKIDGDNQHVYKTVRIGQVLADGQIKEVWNSGEPLKPDPYLKTYPWGAEVTK >NZ_CP034235.1|WP_155699841.1|1780599_1781505_-|urea-ABC-transporter-permease-subunit-UrtB MGLLLLQLFNGISLSSILLLIALGLSITFGLMNVINMAHGEFIMIGAYMAYLSQQFFQKMIPTEYFGYYFIVSIPLAFAMAYAIGWILEVLLIRHLYGRPLDSLLATWGVSLVLQQLARTIFGAQNVAVNAPAWLTGGWDISTDLYLPYKRLFIISLAASCILIIYLYLYRSAGGRRTRAVMQNRNMASCLGISTRKLDAQAFAFGSGMAGIAGCALSLLGPIGPSIGTYYIVDAFMVVVLGGVGNIIGTVAGALGIGVFNTAFEYTTTATLGKVLVFTLIIAFLQWKPSGLVNVKSRTLD >NZ_CP034235.1|WP_155699840.1|1779513_1780584_-|urea-ABC-transporter-permease-subunit-UrtC MLIKRLNIKIILSVVFLLIMALAPLFLSDFRLSLLGKFITYAILAVGLDLIWGFTGILSLGHGVYFGLGAYCMAMHLKLVSSNGELPDFMSWSGVEQLPWFWQPFHSAIFAILMAFVVPMVVAGLLGYLTFRNRIKGAFFSILSQALVIITVTLFVGQQGYTGGTNGLTNFNSFLGMSLGSQDTKLVLFYVSLCVLTLVVLLCLWITSSRLGKILIAIRDGENRVRFTGYNPVVFKVFIYSLSAGLAGLAGVLFVLQEGIISPAQMGIVPSIEMVLWVAIGGRGTIVGAVLGAIVTNSAKTTLSEAFPTLWPIFLGAMFIIVVLFFPKGIVGTALDTRFKWSKKVFTKPVFLRSKP >NZ_CP034235.1|WP_155699849.1|1790532_1793553_-|AcrB/AcrD/AcrF-family-protein MTWFTRWAFGNKAAVIFMVVLIMGSGIFSYFKLPMEFLPSADFPQISVTVVGQGYDAKSMLDNATAPIEKAVSSVTGRKETFSTSADGFMKIDMTFDSDIKMKDAAAGVQEAISSIVLPAGMSKPFVIRLNTSMIPLSMLSLSFKDGITKANMELTEQKIVPDFENINGLASVVLGGKTVSKVFIHPDADKLANAKIPVQALMGVLQGQNLAVSVGEKSIDGKTSGLKVIGNLNDIETLNNLTVAPGVKLKDVATVELSSNNDTLTRVNGKDVLMLVVTKDASSNAVAISDEVAELAAKVETKYPNATAEVVNSTAEIVVTSVNSMMREVLLGALFATIVILLFLRNLRSTLITIVSIPLSLGLTLFLLSKSGVTLNILTLGGVAVAVGRLVDDSIVVIENIFRRTQKAEFSKELIIDATREVARAITASTLTTVAVFLPLGLLQGSLQAFLLPFALTVTYSLLSSLFVALTVVPLMSAWLLRNAKLGEHKSPKRLVNVLTWSLNHKIISIGLSFVLFLGSLIIYFNLPKGAVSDSTASQMEISLSYPPETPITTIRDKAIELEKFIIAQPEVKNSILQQGNSEENAKWGSVTAPTTASFQIMMKKDAKTQEFIDRVNAQKGNYPNAVLDTGANSFSGGSSSAITMDLTGDSAKDLTEAAAQVTAAIKSIAGIAKVTSNQDVTKPGYSITVDPAQANPQEIAMSVRSLLNQTPIGSMKIDGTETPVVLDALINPTTSADLSNIQIMTANGPAALTSVAKIEETNETNSILHKDGKQFLRVSALVDPTKLSEIDKDIKAKTKDLKLPAGVELIQGGAAAQQSSEFMDLFMTIIISIGIVLLIMVVTFKTFRAPIASIFSLPFAAVGAIVAMMITGTSFDVTSIFGFLMLIGIVVTNAIVLIDRVRQNEEKMPIRESLLEAAATRTRPIIMTAVATICAMLPLVISKAEEGSIVSKGLAIVVIGGLSVATVFTLIMVPTIYELLHFVKARRQRKNATVAPAASKTLEA >NZ_CP034235.1|WP_155705273.1|1793725_1794847_-|glycosyltransferase MMRKKRVLLLSEGFGAGHTQAAQGLSMGLRQLSSNVKTRVLELGAFQHPTIAPWIFSAYRKTVTNNPNLIGMLYQSYNSKSLSRLSSLALHRIFYASSANIIKQLEPDLIISTHPFPTVIVSRLKRAGLSTPLCTVITDYDAHGSWVDSAVNSYLVSTAEVKNKLIQRGVTSEVIQVTGIPVHPKFWRLSNREETRNSLGLHNMPTVLIMGGGWGLIDNEEIMAYIARWRNQIQLIFCTGNNEKVMQRLANDPRFQHPNIHLVGFTKDIDKLMDISDLLITKPGGMTCTEAMAKGIPMLFYNPIPGQEEENCQYFSEHGFGETIQSSRTIEAWFRRLLGDEYSSIQQKRYNNQLNIEYNPQYCSESIIKLLQL >NZ_CP034235.1|WP_155705274.1|1795167_1796064_+|protoheme-IX-farnesyltransferase MNSIDKAVVMEPVTWRDFVQLAKPGIIFSNLITAFGGFWVASRWDIDWALLVFMIIGTILVIGSGCVLNNYLDRDMDTKMARTKKRALPTGKMEPNVVLWYGIVMGIVGMSVLWFLVTPLSALLGLLGLFVYVWIYTAWFKRTSVWSTVVGAISGAVPPIIGYCAVNEQLDAGAWILFAILFLWQMPHFWALGIRRMEEYRAAGFPLLPVVRGSFVTKISMMRYVVLLVPTSALLYLYGYVGMIYLVAAIVMGIYWAYLCLKGFSAKDEEAWAKKTFIFSINYLTILFLIIVIDTVHV >NZ_CP034235.1|WP_155699850.1|1796060_1796684_+|redoxin-family-protein MKKQLSEHWFKLATVGLLIVIIAAVAIQMNGKGKPSKLPKYKAAVDFQMSALDGEQVSLQTTSGKARLIYFFYTSCPDVCYPTTQYMSKVQDILAEQGDFPSKAALISITFDPKRDTVERLQSFASQYHPDLTGWKFLRGDEAATKDLALAYRAQVVKDNKGNFVTHTNTIALIDKKGIVRKYYNASDLELTPKIIAAEMTQLINEK >NZ_CP034235.1|WP_155699851.1|1796775_1798401_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MIPHRFNAKLFLLAVIGFILFFGSAQLAAYEKDDSMQPELAKPLVSKAQAIAAATQFLNNKYSALIVTDSSITYESSKALSAYLQKNNLTKSYKIKYNKLIPLDYWQVQIWDELSSTRYIVDVQMDQPRVFGWQTGEVPVLAVDEKADSTSESKARKTAEGFLKQEGYNLSSYEPNPAVINDKEYLLVFEQLKADIGDAKQKLSVRVYANDISAFHISFTIPEQDSSWISNQERYGQIMSLVSLLCMLIFAITALVLSIVRRKLISFSRGWLLTIIFLIISVVGTFNTLPSAGMKLGETNAQVYLIIYLIFTIGVNILLAAAVYFSLVTGVQMWQQQGWNPWPRWKEARFGTDVFYGMGRGYLICIFIIGVQQLLFLIAGKSFHAFAINDPGQSEYNMLWPALFPLLAWMAAISEEIIFRFFGIILFQKLVRFRFLAILIPSVIWALGHTSYSLYPSYTRLIEVTVLGFIFSYTFLRYGLITAIFTHAIMDSLLMGLSLLYSAEDSSYILIGIFYIALPALLAYSIRFLKRRSVPSEAAIP >NZ_CP034235.1|WP_155699852.1|1798998_1799724_+|thioredoxin-domain-containing-protein MEKTVSAHKDKRKNERLAEVARKKKMRSIMLIVVAIIAVAVIVLAIIQANQPKKGFPFDYESQPTIGQANAPLKLVEFGDFKCPICKDFSTKVYPQLKKDFIDTGKAQMSFIDFQIIPGSMPAAIAAKSIFHQNKDAFWTYYDALYEAQQDEHTDWATSEFLTNLAKTKNIPVDYDLLKKDIDDNVYLKEVQEEYRTAQKTKIGGTPALFMNGFEIPLNTVMNYEQLKVILDKELLKLNAE >NZ_CP034235.1|WP_155699853.1|1799713_1800178_+|disulfide-bond-formation-protein-B MQNSGLKPFIQRYSVLLAWIVALVAMLGSLYFSEIKDFEPCKLCWIQRICMYPLALLLGIASYRNERWIIPYALPLSIIGGLFSLYHYLEERVPYLAKVLPCRIGIPCNIPYFEWWGFITIPLMALVAFVLITIILWIGKSHEDYTTSAEEEEI >NZ_CP034235.1|WP_155699854.1|1800149_1801061_-|LysR-family-transcriptional-regulator MDNLIVFALVVEQQSLNRASRQLNLSQPALSRKIMALEDELGVKLFERKGKRLELTLIGHTCYEYALQIRSIARDMQQKINIFKSDDIPSSITIGASLTTLQSTLPDLITFYTAEYPHTDIKALTGKTHEIVTLVKDKKVDIGLIASYIDHPELNCVPLFDDHLCLVLPNGHPYMDRPTINLHDIHDLPMILFSKGTWYRILMDELFQRHAVFPNVKMEIDSFEAILRLVSTTKVATLLPMSYLRHSLLENNDLNMRNVTELEMTKRTTSLIYVEESTTNTTIQAFITKTRQFFPKSLLLQQK >NZ_CP034235.1|WP_155699855.1|1801225_1801930_+|succinate-dehydrogenase MTGNSFYFRKIHSLLGVIPVGFFLIEHLLTNYSAFQGGKEGFNDSIDFLNGLPLVLLLEIVGVWLPLLYHGVYGLYIAYTARNNVSQYGYFRNIMFMMQRTTGVITLIFVAWHFFGTRVQVAVGNVEHSELGGTMHDILTNPYYFAFYVVGVVAATFHFSNGMWSFLVSWGITVGPRAQRISTFVWIGVFLLMTTMFILTLTAFVDPEFASLSSITPSNAYDVGLLEQVLRSVN >NZ_CP034235.1|WP_155699856.1|1801932_1803693_+|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MANSKVIVVGGGLAGLMAVIKAAEAGVAVDLFSLVPVKRSHSVCAQGGINGAVNTKGEGDSPWEHFDDTVYGGDFLGNQPPIKAMCEAAPGIIHLMDRMGVMFSRTSEGLLDFRRFGGTQYHRTAFAGATTGQQLLYALDEQVRRWETAGLVTKYEHWEFTSAIIDDEGICRGITAQDLRSMEMHTFVGDAVILATGGPGIIFGKTTNSVINTGTAASAVYQQGVHYANGEFIQIHPTAIPGDDKLRLMSESARGEGGRIWTYKDGKPWYFLEEKYPAYGNLVPRDIATREIFNVCVEEKLGVNGENMVYLDLSHKDPKELDVKLGGIIEIYEKFMGDDPRKIPMKIFPAVHYSMGGLWVDYNQMTNVPGLFAAGECDYQYHGANRLGANSLLSSIFGGMVAGPKAIEYIKGLKKHAADVAPEIFERENKKQTDKYEGLLKMDGTENAYVIHKELGEWMTNNMTVVRHNKKLQETDDKIQELLARYKNINMTDTARWNNQGVAFTRQLHNMLELARAMTIGALQRDESRGAHYKPEFPERDDDRFMKTTLAKYTPEKPVITYEEIDVSLIKPRKRDYSTDKKKGGA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235_4 | 6324494-6324567 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034235_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP034235_4
>4.1|6324517|28|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder CCATGATCACTCAAGCAAGGTGCAGATT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034235_4
The CRISPR arrays of NZ_CP034235_4 >merge|NZ_CP034235|4|6324494-6324567|CRISPRCasFinder TGCACCTCATTTCGGGGAATGAGCCATGATCACTCAAGCAAGGTGCAGATTTGCACCTCATTTCGGAGAATGAG >NZ_CP034235|4|3|6324494-6324567|CRISPRCasFinder TGCACCTCATTTCGGGGAATGAG CCATGATCACTCAAGCAAGGTGCAGATT TGCACCTCATTTCGGAGAATGAG
>NZ_CP034235.1|WP_155703660.1|6321851_6322871_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLAIDVKNLTKQFKAQRNREGVKGALKDLFRREYNEITAVDDISFQIPKGEICGYIGENGAGKSTTIKMLTGILVPTSGEIHVNGFVPYKEREKFVRGIGVVFGQRSQLWWDIGVIESFQLLRKVYRVSEADYKSRLDELVQRLQLADLLNRPVRKLSLGQRMRCELAASLLHNPAIVFLDEPTIGLDIVVKTEIREFLKSMNQRYETTILLTTHDLQDIEALCSRVIMLDDGKVIYDGGLEELKNRWGKGKEIVFQFTSGQELFALQALTAGLEVAWSQENEYVAKVWVPTEQANLSEVLSRVVGVMPIHDVKIIETNTDDIVREIYKSGSAKGKIEL >NZ_CP034235.1|WP_155703659.1|6321060_6321855_-|daunorubicin-ABC-transporter-permease MMGAYLEMIRMRFLMMLAYRMNYYSGIVIYIVNIGAQYFLWKAIYAGNGSLMGMDMGQMTTYVAVSWMARAFYFNNLDSEIAREIKDGSVAIQFIRPYKYLLVKIFQGMGEGLFRLILFSTPGMIIVCFILPVQLPKDPVIWLIFFAMLLFSYLINSQINILTGLFAFFVENNEGLMRMKRVAVDLFSGLIVPIAFFPLWAERILHWLPFQAISYLPSAVFTGKVAGSAIQQVFAVQIAWFLVLILPIYLIWRRARHRLFVQGG >NZ_CP034235.1|WP_155703658.1|6320268_6321057_-|ABC-transporter-permease MLFYGSLFLDYSKNYMKTKLTYRADLWLEIISDLLFQGMNLFFILVVFLHTQSLAGWSEAQILFIYGYFMIPYGVFTCFFNLWGFADKYIVKGEMDRVLTRPAHNLVQLILENMDPASLVGSLVGAIIMGIAWAQIGLPFHVLDIFVFLLFLLGSVLVYAGVYIILTAISFFVDAQTGILPLVYNIQNYGRYPVKIYNRAIQILLTWILPFAFVGFYPAAYFLDADNWAGFAFITPLIGVLFFTAALLFWNFGVKRYRGAGS >NZ_CP034235.1|WP_155703657.1|6319773_6320238_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MTLEIGKKAPNFKLAATNGEIVKLSDFKGKNVILYFYPKDLTTACINQACDFRDKITEFTDNNTVILGVSMDPVKQHHRFIDKYNLPFMLLADEDHAVCELYEVWLLKKLYGVEYMGIVRSTFLIDKKGILVKEWRNIRVKGHVEAVLGTVRGK >NZ_CP034235.1|WP_155703656.1|6318787_6319699_+|acyl-ACP-desaturase MLPEHYQLNIFDHKLEPYLTELYRQHKERAANIDWSYHEFIPWELGKSFIELPWSIDQRTLPPAIYTAVETSLLTEVNLPFFYHHLATTFKGSLKVLQDFVHTWVSEEDQHSSLLETYLIITRNADPHALHLLRKEVVEGGYAPDFDTAIETMVYTTVQELATLVFYNNVAIACKDHDKMLASLLRRIAKDESLHFAFYRDAVKGYLAVDHNFIYYIHKAMTNFAMPGVSMPQFKDRMEVIAKDANYGPVSYFNQVFEHLIIFWGIEKLQPSRPDAEKAKVDLMTYYHKLKRISERMAAKGSH >NZ_CP034235.1|WP_162463301.1|6317501_6318497_-|polysaccharide-deacetylase-family-protein MFTRLFTFTVRVLIVLLLLLLCQFYLNIHGISAIYAKSSDLSSELYEQLMLGKRIYPANQEKKTYTKPTQPTVYLTFDDGPSIQTPKVLEILKKDKIKATFFMVGKMAEEHPELVKQVFIAGHTIGNHTYNHVYKQLYNRNLLEFWRQIQQTEKILYSICGIKPELVRAPGGTYTHFDAFYYYDMDEAGYTMMDWNMDSSDSSRANVPADEIVAKIKGSTLNHEVILLMHDGTGHGQTVQALPEIIAYFKKLGYAFAPLTTTVKPVQAPLSPNKPKSPYSYEQFIEQEERVKQDILQRLKRPVILPIGASLLGVTAVLLDGTSLLPDLALP >NZ_CP034235.1|WP_155703654.1|6316678_6317581_+|LysR-family-transcriptional-regulator MNLHALKIFAKVALHGSVTQAADELRISQPAVTAQIRNLEKELNTKLISPKGRGIILTSSGEILAKDAIRLFALESEIEARMKAYNLGHLGSLQIVSTYLPANYLLPLWLSQFKQLHALIDCTLTTKNSTDAMESLLHYEAELAVIGGGAVNHPLIHSELLFEDPLWFVVPTKHPYADQAVALDQMMNEPFILREEGSSSRDKLFALCKIQNAPPPRIGLQFNGLSESIRAVIGGYGAIFVSALEVREYIERGELARVYVQDVNLVNPISLCRRAKEELSPAAAKFRQAVLQLHQADLHQ >NZ_CP034235.1|WP_155703653.1|6315362_6316547_-|threonine-synthase MKLICFECKSDYSDKSFQYQCHCGGLFQVVHDFKAVDSEKLRRMFAERLSQRMSMHASGVWRYKELIYPELPEAFVTTKYEGNTGLYASESLQAYTGVRQVWLKAQSENPSGSFKDNGMTVAVSHARSLGKQKLACSSTGNTSSSLAMYAALAGCKAYVYVPERQVSENKIKQTLAYGAEIIRIAGTYDDGIRFLEQNYEELGLYVCNSINPWRIEGQKSMIYEAAQSLNWKIPDWIIVPGGALSNAVSLGKGLNDLYMLGFIDHLPKVAVVQAEGASPFHRMIEGNHPTLIPELQPQTIASAMNIGNLPSWRKAQAMLSQTKGVTVSVTDEEILAAKQLIDRSGIGCEPASAATVAGLRKLTASLIIDPDETALCVLTGHILKDFASFLDYDN >NZ_CP034235.1|WP_155703652.1|6313766_6315305_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MTKPNEIIVVLDFGGQYNQLIARRIRDLGVYSELLPYNVTAEKLTALNPKGIVFSGGPSSVYEDKAPQVDPAIYDLGIPILGICYGMQLMAHQLKGKVERAGKREYGKADVDFAEDNLLIHGLDRKQTVWMSHGDMVSELPEGFVADASTDHAPIAGMSHFDKKMFGVQFHPEVRHSIFGNEIIRNFLYNICDCDGNWSMGTFIEDTIREIREEVGDKKVLCALSGGVDSSVVAILLHKAIGKQLTCMFIDHGLLRKDEGESVMETFVGKFDMKVVKIDAQERFLGKLVGIDDPEQKRKIIGTEFIRVFEEESAQFDDFTFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPKDMKFKLVEPLKALFKDEVRIVGAECGLPDAIVWRQPFPGPGLAIRVLGEVTEEKLKIVRESDAILRDEIAKAGLDREIWQYFTALPNMKSVGVMGDARTYSYTVGLRAVTSIDGMTADWARIPYDVLEKISNRIVNEVENVNRIVYDITSKPPATIEWE >NZ_CP034235.1|WP_155703651.1|6310251_6310455_+|cold-shock-protein MMFAKRTTEIIPEEATSIWACSSESCSGWMRDNFSFKNVPTCPVCKSEMVIGEKMLPFLHNNNKKGL >NZ_CP034235.1|WP_155703661.1|6325218_6326574_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MGKVRKQSEVFYKEALKHIVGGVNSPSRSFKAVGGGAPVFMKRGKGAYFWDVDDNRYIDYLAAYGPIILGHAHPDVTEAICRAAENGLLYGTPTELEVTFAQMLKDAIPSLHQVRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTGRSKIIKFAGCYHGHSDLVLVAAGSGPSTLGIPDSAGVPPSIAQEVITVPFNDLAALETALARWGSETAAVMVEPIVGNFGMVMPKAGYLEGLCSLARQHGALVIYDEVITAFRFQYGAAQTYEELPLLGDAKDAAAWKAVEPDLTALGKIIGGGLPIGAYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPASISAGIACLQALKQPGVYAKLDSMAARLAAGIQTAADKHAIDLTINRIGGAFSTHFCNHPITNYEEAQDTDGEIFAQFFRLMLDQGINLAPSKYEAWFMTIAHSETDLDETLTAVENAFAVMSKTRTI >NZ_CP034235.1|WP_155705545.1|6327040_6331591_+|glutamate-synthase MHNESHFQNLLETEHDSCGIISIIEKNGLPSSDNIAKTINALVKLEHRSGFINGEGDGCGILTDIPRALWEARLQAAGLDGKLAFDSRFTIAHIFVPRKLELSVAEIQTQIRQLFNSHQVTILIEQENQVDSSVLGSNGRLDEPTFWQVAAICEEPNVRTADHLFELHIAIESKFTVHVATLSNTTAAYKVMGAASILPLYFNDTRDPLFAAQVTIGHNRFSTNTLSSFFRVQPFSLLGHNGEINTIKKLRYEADMIGVPLVDGGSDSQDMNRTIETFIHRFDLSLFEAMEIVFPPIISEMKLYRPELQDLYVYFRQIWGHFAQGPAGIVSRYGNECIYSVDALGLRPLWMVESEESLFFSSEQGIISVGEMVSEPKAIAPGEKIGVKLNPGQPVEVVTYPEVQNLVLERASRKIDFTGMRKFLSYTPTGLNESFDDASTITDSLYSAFGWDREGIQMIETMSETGAEPIRSLGHDGPHAALHWERQNIPDFIKESVAVVTNPAIDRDREMEHFSTRIIVGPRPAVFAALDNRLRLELLAPLVLEGVNGLDSEADLSQPSLEQLLGVFQAHSPNAVATLSTTFPKGTTISAALDKLADDAVAAVKQGALLLLLDDKLAHQNDLLWLEPHLAVSKIDIALRSEKLGLGDNLRRQASIVLRSGAIRNLHDIAVACGLGADVISPYLLFGTASSKSGSPAAKKVHSALSKGLEKVISTIGTHELRGYTRFFSSIGLHPEVAEVLDIVNYLGSEKAGTSFAKLEADAEKRYADFSDPKAKAARNFHFFQRMWKSLNEAAAGTSPYSDYTDKLREEEIKNPVSIRHITDFNYTKALQGRSPLNPEQVDISVGDHSLPMLISSMSFGSQNETAFRSYAEAGERLNMVTMNGEGGEIKDMLGRYKKTRGAQVASGRFGINVELANSVAFLEIKIGQGAKPGEGGHLPGSKVTAKIAAARNATIGSDLISPSNNHDIYSIEDLSQIISELREASGRKAKIIVKVPVVPGIGTIVVGVAKAGADVITLSGFDGGTGAARIHSLTHVGLPTEIGTKLAHVALIEAGLRHQVELWSDGGLKSGVDVVKMMMLGANRCGFGSIAMQAIGCTTCRGCHLDTCHVGIATQIDSMEEAEEKGLRRFVPRVLDLAVDGLVRLFGSMGEEVRSIVAELGFKNAQELVGRSDLLVQARCLEQIDLSDILRPAPAQFINVEKPDTAINYDDVAEMATVDIPLAAGAEGQAFYPTAVSFQAPVNRTWSKLSSEARILGARFSSLRVSDHLDGSYDSLPKISLDLTDGSVPGNGLAAFNARGVNITVHGGAEDGVGKMAAGGKVAILKSPSRYNAYINGSVGKSFGYGAQHGLFLIQGNADSRACIRFSGADVVFGGEITTPLQDHLGGIASRANLKGFAFEYMTNGRAVVLGDPGPWICAGMTGGVVYQRLNPEMGLDIAAIERRIAKGAKIKIEPIGAQSLKDLNELLGAYQAELANSGQTDAAAQIESLLNDLVTSFVRIAPVGLQADQSVATE >NZ_CP034235.1|WP_155703662.1|6331678_6332161_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MNIFQKLKEGANKATDYAQQTMKTTKINTQISGLKREIERNNTQIGHAVYEAYKANDLTLAEDAVRKFSKDNMILENEISQLERDIEVIKNEKMCDCGGKASMEARFCPKCGKQFPFEPEVEMEEDEEEEVAQIQTVCNNCGAELAPEAHFCEKCGTVVK >NZ_CP034235.1|WP_162463302.1|6332193_6332784_-|hypothetical-protein MKKFRGFAIGVLVGGILMTTLPSLAATMKYMLVKATYPIYVNNTQYNSPELPILNYEGNTYIPMKAIGELLGGAVQWNADLKRAEIYYGGVEPTENNAFRKIKASGTNGKYSVTGEGRVFEAVMSYAVTDGHTYLLEKNYMLNEGGPAWSAFTLDIQISKDKLPLNGTLSVELFEYSAKDGSKINIITVPLESFKP >NZ_CP034235.1|WP_155703664.1|6332899_6333835_+|WYL-domain-containing-protein MKLDRLLAITMLLLNRKRVGAKELSDRFEVSLRTIYRDLESINQSGIPIISYTGSDGGYEIMDQYRLDRQLLSLEELQSIILALKSMHPSLDEPDIGSLLDKVGTLMSKTEQGAAAAISQQVVIDLNPWHGGDTEKEKLSILKKAARDLQLVRFAYTNSEGSDSERDCEPLGIVMKRYIWYLHGYCRLRKELRIFRLSRIKDLQQLSEAFERRLIPPEDMDYRWERSNRAECVRLVLLFQPKAKAKVQDYYSADKIVVQPDGTILVTTMQPEEPWLYGFLLSYGADLKILEPQSVLQAVMKKAQEIVQLYI >NZ_CP034235.1|WP_155703665.1|6333896_6335462_+|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MKGRMRLAIKKSNMNIVIVGLLLGIFIAAIDNTIVATAMGTIVGDLGGLDKFVWVTSAYMVAEMAGMPIFGKLSDMFGRKRFFVFGILTFLLGSVLCGTAHSIVELSIYRAIQGIGGGALVPIAFSILFDIIPMEKRGKMSGIFGAVFGLSSIFGPLLGAYITDYISWHWIFYINLPLGLLAFVLVAFFYKESLQHAKQKIDWWGSLTLVSSIVALMFAIELGGNKYAWDSFTILGLFAAFFVLLITFLIIETKVEEPIISFNMFKYRLFAGSTLVALFSGAAFVVAVVFIPLYIQGVFGGTATNSGLVLLPMMVSSVITAMIGGMIMNKFSYRNIMLTSLILLVLGIILLTTLTPTTSRFVVTIYMIITGLGIGASFSVLSNAVIHHFDTVQRGSANATFAFVRSLGMTIGITIFGIIQRNIFTSQMSEAFAGQGNTPESIGDPRELLSQAGRAQIPASTLDKITAALSSSIAQTFAWAIIPAGLGFLFVLYMSNERLLTASHDSQAANKDLKNTALIQG >NZ_CP034235.1|WP_155703666.1|6335484_6335985_+|hypothetical-protein MFMTINDFVSSWTQESTGTQRVLNTLTDASLLQQIAPNHRKLGQLAWHITTTVHEMMSRTGLEFPEPAGGELAPDSAALIAAEYNRASQGLILAIQSQWTDASLLQKTNMYGEDWLNGLTLRILCSHEIHHRGQITVVMRQAGLRVPELYGPAREDWIELGMEPHI >NZ_CP034235.1|WP_155703667.1|6335981_6336815_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MQRQSMLPTLQKSTFFIFPESVGYYYELPQHYVERPNGYNSYSLHFIVSGKGFVERDGIVHTLHKGDAFLYTPLQKQHYYSSKDDPWEIRWVHFYGAKLKEFLFEQGFFHNIWTLHRWSELEVAYKELLVSAETYGILHPAKLSAQTYAILAEFMSYAIPHTANRGIESTDRIMNLLPLMRQKACEPFLLEEWAEQVGVGTHYFCKLFRKSTSMTPVSFITLCRMQVAKQLLIEQTDLNIKDIALQAGYISASYFNEQFLKHEGMRPNEYRKLFIEN >NZ_CP034235.1|WP_155703668.1|6336950_6337949_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MHKDKLRWGILGCAGIAIRSAIPGIQQSKTGIVTAIASRSLEKAQKAAEACGIPTVYGSYEELLADKNIDAVYIPLPNHLHKEWTIRAAEAGKHVLCEKPCALNAEEAESMVTACAKAGVQFSEAFMYRHHPRYDRIKAIIKSGEIGEIRGIHGAFTFNNAKDAKNVRYQRSMGGGSLYDVGCYPISAARYLLDEEPQAATVHAFFSPEHDDVDMMASGLIEFSGGVALSFDCGMWADFRNPLEVLGTIGRIEVPSAYVTSGNRGGFVVITPEGRREEEVPDLDQYALQADDLAYAAWGQKPMRFAAEDAHLNMKVLDACLQSARERNRIII >NZ_CP034235.1|WP_155703669.1|6337964_6338897_+|aldo/keto-reductase MKTITIQGLAAPVSQLIMGTDFFRLNNPDEVSDIMDKYLAIGGNTLDTGFIYCGGESEQAIGKWLDENNKHGEINVLTKGAHHDANGPRVNATAIRSDLMISLERLHTDYVALYALHRDDPEVPVGPILEALNEHIEAGRIGAIGASNWSHERLQAAAEYASQHGIIGFSFSSPNLSLAKANEPFWMNCVSIDAEGLKWYEEHQLPLLSWSAQARGFFSGRFTPENRDNADLVRVFYSDENWERLRRAEELAKKKGLSAIQIALAYVLNQPFPTCALIGPRSEEEMRSCQQGAELELTATEMAWLDLSEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235_5 | 7057311-7057456 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP034235_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP034235_5
>5.1|7057335|47|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder GATTTTAAAAAAGAGCTCAAAAACTCTTATTTCAAGAGTTTCTGGAA >5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder CCTCTCTTCAAATCGTTAATTTTGTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP034235_5
The CRISPR arrays of NZ_CP034235_5 >merge|NZ_CP034235|5|7057311-7057456|CRISPRCasFinder AATCTAACTGCAAATCTACAGGCAGATTTTAAAAAAGAGCTCAAAAACTCTTATTTCAAGAGTTTCTGGAAAATCTAAATGGATTTTTGCAGGTACCTCTCTTCAAATCGTTAATTTTGTTCAATCTAAATGGATATTTGCAGGTA >NZ_CP034235|5|4|7057311-7057456|CRISPRCasFinder AATCTAACTGCAAATCTACAGGCA GATTTTAAAAAAGAGCTCAAAAACTCTTATTTCAAGAGTTTCTGGAA AATCTAAATGGATTTTTGCAGGTA CCTCTCTTCAAATCGTTAATTTTGTTC AATCTAAATGGATATTTGCAGGTA
>NZ_CP034235.1|WP_155704213.1|7055546_7057070_+|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MVKGNKMGIILAGLLLAILMASMDNTIVATAIGTIVGDLGGFDKLVWVTSAYLVAEMAGMPIFGKLSDMYGRKRFFIFGIIVFMGGSALCGTADSIVELSIYRAIQGIGGGALMPIAFTIMFDVVPADKRGKMGGLFGAVFGISSIFGPLLGAYLTDYIHWSWIFYINLPLGLIAFVMIAFFYKESVEHSKQKIDYLGAFTLVASIVCLMFALELGGKQYAWDSSMIIGLFTAFAVLVIGFIFIELRAQEPIITFGMFKNRLYATSNAMAIFSGAAFITASIYIPIFMQGVLGGSATNSGLVLLPMMLGTVVTAAGGGSMLAKFKYRSIMIPTLALLVVGIALLTTLTPDSTRFMVTIFMILVGLGIGASFSVLSNAAIHGFTARQRGSASSTLNFMRSLGMTLGITVFGIIQSHVFMNKLGSVFGGGAAVPDGVDLSDPRKILTPETRDLIPTDVLDKITAALSSSLVQTFAWAIIPSVIALVAAIAMSKEQFDPAAEMEEYAASH >NZ_CP034235.1|WP_155704212.1|7054841_7055324_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSSDRHVQPRDLQEQFTLRMRGLGARTVLYQQNVAASLGLYNNDFLSIDILHEKGPITAGELSKLTGLATGSVTTLIDRLEKNGFVRRQNDPNDRRKVIIVPLYENKEEVSRTYLPLHSAMVKLASSYTVEELELITQFLGKASTVLEDQIQQLSSTARN >NZ_CP034235.1|WP_155704211.1|7054544_7054736_-|hypothetical-protein MNDHLEQFAPSTQWIWASPGELGAWWMFRKAFSVAKVQKAELNMTANFYYIVYINGSIVARGP >NZ_CP034235.1|WP_162463348.1|7053435_7054197_-|glucose-1-dehydrogenase MEDLRGKIAIVTGSTSGIGRAAAVDLARNGVKVIVHGMNEERGKQVVDEISLFGGSAVFVRQNLALPEAPSELVKQAISHWGALDILVNNAALICNKPLEEVQHEDWDSLFAVNVKAPFFLTQAALPWLKQSGDGVVINVSSINRLVNSPNNLVYDAMKAALNHMTRGLSLDLRKANIRVNAIMPGGTATPMLNEWLKKVDYSSEEIEQIYRHAPYLATPDQISKVIVFLASKQSDWINGAEIPVDGGYYIGE >NZ_CP034235.1|WP_155704208.1|7051517_7053446_-|hypothetical-protein MENKEKPIQVKATEQLTPPQWALQQQQLFQTLNKAAEEFIARYTHADGTLIWRSDWPGMDGSDDPYEGFMNLALLYVLGGSTELHEKSRKIWEGITWQWTEYGQIHREFDAYYDWMHHGEGYLYLYFLGLAGPATPKDRQRAVRFANMYTGDDPEAPNYDKERLLIRSPLTGSLGPRFEVTEEDWSTHRGILDDYLAPYEDIPGVDFASRKCPWSDDETYKQLIQMMNERMNRGDVPLNLNSTSLLAHAFLHTGEERFRDQIVDYLGAWEERTRQNGGIIPDNIGLSGEIGEYNDGKWWGGYYGWRWPHGFITIIEPLTNACINAVLLTGDMGKLQLAREQLDRNWELRTLQEGRWVVPYKHFDSGWGDFREATPQYPVYLWMISMAAEDLERVERIPKNHDWNEVIVPTMSGTDKKTGRNTKHYIGNTQPWYQYIRGLNPDYPQQILAANYQLIASQLVKMRSADGDPHNWSQKYNEGDYSSIHAWQEMCPLYFEGLAQLTLGAPMHISHGGLQHGRVRYYDVEAKRPGLPAGISALVEKLTADSVTLHLVNTSLFDDRLLIVQAGMFGEHRFLQVELINQQGNITDTVTVNGRWLQVSIPAGTGITLHASMERYVHSPTYDMPWETSDKPLLISGRVKAN >NZ_CP034235.1|WP_155704207.1|7050883_7051360_+|ATPase MTKTTIIAEPGKQEIVITRSFDAARELVFKAFTNPDSISEWWGPRSHTTSVDKMEVRKGGVWRYVSHDSNGNEYAFNGVYHEIASPERIVNTYEFEGLPAVGLVTVTFEEEPGGKTKLTEVSLFPSIEIRDGVIQSGMAEGAIELMDRFEELLAKLQA >NZ_CP034235.1|WP_155704206.1|7050516_7050855_+|metalloregulator-ArsR/SmtB-family-transcription-factor MNTATLSALAEPNRVNIIELLRDAGAHTVGEIAQQLGLRLPQSSKHLRVLTDAGLVQVQAIANRRIYMLRTEQFTELDSWLKTFISVKEEQFERFDAYLNKLKAMDQNQDDK >NZ_CP034235.1|WP_162463347.1|7048686_7050255_-|S-layer-homology-domain-containing-protein MKLFKRISLGFIVFCLSIVVFLPLSPAHADVSLTGFFIESGEKPYLAAGQTISFSFGDDRAIGTSLDYARVFYSIDNGLNWIPVLELHKEEYQGFGEYGTFKLPIDAAVTSARLRLSTSFTPFIGGVSYPKVDVGPFKIMQPGGASDAVATANADGSVTLTWNDNSNMESYYQINRTGGTGGDKTFYVKNTMDHIGPLTYEDKGTNNQETNLYFYTLFPVIDQFALQEDIKPEAQTAIVLIKARPGILIIKDIIKKSDVIDSIATKLPKNYVKVDKGTILKTMPDIIDSDKISAEIKLPGLPGSGDGDGKKPVDPAGSKPDDTKSGSGTMSGTTALTDEKLEELVKGSSGWAKAELKQAITLNLYIDAVIGNYQQPITREHFAGLAVKLYELLSGIIAEEISPNPFTDTTSSDVLKANKAGIVTGISAGIFAPNATITRQEIAVMLMRTVKAAKPMLVLDTSKKFEAADEAKIASWAVEAVNWALNSNIMSGIGENRIDPTGNTTREQAIVLVKRAYVKLLQ >NZ_CP034235.1|WP_155704204.1|7046842_7048675_+|UbiD-family-decarboxylase MYRHLEDCIIDLEKHGHLIRINEEVDPYLEMAAIHMKVYAAGGPALLFENVKGSKFRAVSNLFGTLERSKFIFRSTLDAVQNVMALRNDPTKALKNPFKHISTGLAAWKALPMKKSGSLPAAAQEISIADLPLIQHWPMDGGAFITLPQVYSEDPEKPGIMNSNLGMYRIQLSGNDYEMNQEIGLHYQIHRGIGVHQDKAIKQGKPLKVSCFVGGPPAHTLSAVMPLPEGMSELTFAGLLGGRRFRHSYMDGFCISNDADFVITGEIHPGETKPEGPFGDHLGYYSLTHPFPVMKVHKVYAKPNAIWPFTVVGRPPQEDTSFGELIHELTGDSLKKEIPGVKEVHAVDAAGVHPLLFAIGSERYTPYQPVKQPTEILTIANRILGTGQLSLAKYLFITAEDKQPLDTHDEVGFLTYILARIDLQRDIHFQTNTTIDTLDYSGTGLNQGSKVVFAAYGDVLRELCTEVPEGLNELRGFENARLVMPGVVAIQGAAFTSYTEAQEELQGLSEAIHTKGVLTACPMIILCDDSSFMSATIPNFFWATFTRSNPANDIYGVNSYYAHKHWACDNLIIDARIKPHQAPPLIPDPTVEKKIERLFVSGASLGGIKI >NZ_CP034235.1|WP_155704203.1|7044786_7045752_-|carbohydrate-kinase MMDAVAVGELLIDFVPNGISDNGNVLFERNPGGAPANVLAMLAKLGLHTAFIGKIGNDPFGRFLEETLQLSKINTSGLVFDNDVNTTLAFVHLQENGERSFSFYRKPGADLMLTVEEINVQLIESARLFHFGSVSMTGEPARSATLYAAKHAKQQGKLVSYDPNLRESLWSSLEEAKEIMLQGLVYTDILKVSQEELQFLTGEADLGIASGWIAETYGIELIFVTQGSEGCYYRFHQQVGHVPAFQVNAVDTTGAGDAFFGSILYRILAASTETSLWTVAEIEAAIRFSNAAGALTTLKKGAIPALPILENIVEKLSEVVL >NZ_CP034235.1|WP_162463349.1|7057505_7059038_-|extracellular-solute-binding-protein MKKTTITLLTLLIVGSMLAACTNKPAANTTEHILRIASGYGMDEEYFREQYTELFELANENIKVEIIPTMDYSNTGRYSNGTSNDPNEPLPKTSLEIMMDLMEGPNPPDVVILGAEQMKTVMGKNLLAPLDAQIKSSKFDTTDIVPVVMDSLKSFSEDGQLYALSPNFDSPALIYNKQMFIDAGVTDLPRDKMTWDEVFALAKRLTHDEGVNHKYGFSFSSQAKGGMFYSMKTYTDAFPLQMYDDLGEKMTVDTPEWESVLTKLNQLQKDKIIPSGEDLKSIKEGNVSSDGGGDNQEGPFSYDDFMSGRVAMAIVNYGLLAQLNNANKSADTIKGYTKIEWDVVTAPSFPDAPGVVANIGLSNLMAINAKSTNFDDAWKYLEFINGEKWAQLKSHSTYQMVSLKKYIQPQDGIEFNIKAFYENIKQAPVADYNKLYRDKQNIWTIDQIGQNVLSEVITDKKTVKEALTEWQTKGDLVLQKIKENPNAPIDPSLYQSSGTNSGAPKANYGG >NZ_CP034235.1|WP_155704215.1|7059220_7059427_+|hypothetical-protein MQDSEFVDEYMLIYEYYMDHEITAEERSNLEEQLIQLAEQRMNTLSIKLINEKEQWSMVPSLSSTRLG >NZ_CP034235.1|WP_155704216.1|7059423_7059750_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MSEIAKTPQPPYYAVIFTSERTDGDNRYAEMADEMVKLASIQPGFLGVESAREGLGITVSYWESLEAIQKWKQNERHLAAQSQGISEWYLTYKTRVCKVERDYGFEKV >NZ_CP034235.1|WP_155704217.1|7059746_7061021_-|FAD-binding-protein MENNQNWAGNYKYSALELHVPESVGQVQELVARSSRIKVLGTRHSFNGIADSTGSLLSLQKLNRVIVLDQTNNKVTVEAGIRYGELCQYLHSNGYALHNLASLPHITIAGACATATHGSGNRNGNLATAVHSMEVIKADGETVAFSREQESGVIDGAIVGLGGLGVVTKITLDVIPTFQMSQYVYDNLSLLQLKDHFEEIFSSAYSVSLFTDWKKASFNQVWLKQKITAQASAQLGPEFFGATRASTNRHPIPGHGSENCSEQLGIAGPWYERMPHFRMDFTPSAGNELQSEYFVPRQDAYHALCALDQIREHISPLLLVSEVRTIAEDNLWMSPCYKQDSVAFHFTWKADWDAVQLVLPIIEKVLEPFHVRPHWAKLFTMPSAKLQSLYEKLPDFQGLLRQFDPKGKFSNAFLEEYIMKKNIT >NZ_CP034235.1|WP_155704218.1|7061176_7063009_-|IucA/IucC-family-siderophore-biosynthesis-protein MIRSITQIRNRTAEQRVRKDLMDAWIAEQFFVFDTQTTMKLSDVPELAQQLYPEYERALIYVGKICFLIEDSYRQGYQWMTDSPIYLKVNDSWNEIQSPIELSQVVLREALSEEAYAHPGVTDFLDGLAITIQQLGLSLERASYPSSFTPLSAYDWHVKGEMISSLRDRPFHPLSKAKIGFTPQDYQNYMAEFGKETKLHWVAIAKTMVVIGCPEDEMEALDVLNVQQKKIINNELTQKAISKQQYTIIPVHPWQLAHKILPDFQKELADKTIIILDSQAGDFLATSSMRSFTLPYASTYMLKLPISVKSLGAARYLPVVKLLNGLVGEKMFRQAVACDETLAHKVFLCEEKHWWGYMPTDMGLFDDHPRHLAAQVRVYPQEILQDGYKIIPMASLGVALNEHHFLTEILGGNLSTEDVIDFYTEAAAMFYDITLRLFKVGIVPEIHGQNCCLVLKKNKVSGMLFRDHDSVRLHQPYLDKHQIQDPGYHIRPGYSNSLYNETLEKLVFYIQSLGTQVNLASIMEALSESYHIPEKHFWEITEAKLREALHNIDIPEADKNVLRHALFENEAWPVKLIIRPLLEADGVPGAMPSGKGVGHNPFYSKTPKAE >NZ_CP034235.1|WP_155704219.1|7063010_7064222_-|siderophore-biosynthesis-PLP-dependent-protein MNSHSQIKQWIHWWHNQSEKPICAYVYDLEGIRSHVKNMLSTMPKQTSLFYAIKANPDKKIIEALLPLVKGFEVASIGELLLVRKISESVPILFGGPGKKDDELEMAIRTNVAYIHVESLLELRKIILLAKSWSRHIRILLRINLRTNTLPQTKISMGGKPSQFGLDEAFIEEAIAILRESDNQYVHFSGFHFHSLSNNLQAELHVEMIQFYLQKVEKWKRSYGIDVQVVNAGGGFGVSYDDKPGFDWQLFTSLLAESEGLRALGETQLFFEPGRFIVADYGFYVAEVVDIKQSQDEFFAVLRGGTHHNRLPASWEHNHPFCVVPTTRWPYPFQRTEINNAKVTIVGELCTPKDRLHTDAELEQLRVGDVLLFEKSGAYCWTISHHDFLGHPHPKFYYITEGN >NZ_CP034235.1|WP_155704220.1|7064221_7064998_-|siderophore-biosynthesis-protein-SbnG MRINKLKRKINNNEPVFGLFVSIPHPIMIELIGYAEYDFVIIDYEHAATNMETIENMIRAAELLDITPLVRISKVDRIEILKVLDCGAQGIVIPNVECRDQVEEAVLHTYYHPIGMRSLNSGRAGAYAKYSLTDYIAEVNEELMIIPMIESVEGVNQSEAILSEPYVSFVLEGAADLSQSLAVPWDTDHPEVQRNLELLYEMSQRCKVPYAVVSRSLESHSRWAEKGVNIFVLGDDRNTAFRAYRQKRDDYLSVMEGK >NZ_CP034235.1|WP_155704221.1|7064994_7066773_-|IucA/IucC-family-siderophore-biosynthesis-protein MKQVSYLDKEQRTAFDEVTERIIRQTMESLLFEEIISIVPNEKEWSFTGKTVDGNIVEYSCEAAEKWSFGRVKIVKNSIKRKAEPCTSLYVFLEEVIQNQLAGAHTTSFIHELLETLAKDTQSKEFQPARIPDQDQHYEALESHMVDGHPYHPSYKSRLGFSLKDNYAYGPEFNQEVSLQWIAVSEMWADVSLSDEESLDEIYKQHLTEEDRLKFNLVIKEKGSNDKKYVFFPVHPWQWEHPMQSIFVQHLRDKDILHLGTSSSPYRAQQSIRTLAHRGNAAAAYIKLALSITNTSTSRILAHHTTQNAPRISDWLSKIIQNDRLLQQERVHILKEVMGMSFRYDQLSPIQYRSAYGMLGAIYRENVSTYLDEQEEAWPLNALLLTQKNGVPFIQAAIEQYGVDKWSDALIRTVTLPIIHLLYAHGIALESHAQNIILVVENHFPKSIILKDLHDSVRYVPDKLLQPDWAPKLNPEPETHRKFNRYSFIQAEAVSEVRDYTYDAFFFICMTDICLTFEKFGLSEADFWRKCTATILSYQQDHPEFKDRFEMFDLFGEDALIEEMTKRRIYGDSELYFRKVKNPLLRARDALA >NZ_CP034235.1|WP_155704222.1|7066747_7068436_-|hypothetical-protein MLQTEKTQWLKSQSQANRHTCKTLLNCYIREFCCENTTFFATNLQEMTYVFYFPASEVSLSGKLSYYSAISEHEYEYFSVNHGQGLDYADLVEWIVKEIRQQHSFITDEKASNFSNKMANSFRNMALFLENSIHEPIRDYLSSEQSLLYGHPLHPFPKNTLGFSEDDVRKFCPELHVSFQLCYLAVRKDVFREEWVLGQKRMELHESVLNHAQRKLQEKRDGYEILPIHPWQYEHVQTINAVKDYIQAGKIIFLGSCGPLSYPTSSVRTVFIPAMSCNLKLSLNIQITNMMRNNNREQMRRTLDAANYLLKSNCFDKDRSTRIAYEKGVCTCHFENDEWTKLFAVAYRPIEFDETSTYVLSSLVEAPMQGALPRLFSLMDYRQIDPWFQQYLAISLLPIVRIAEEKGIHFEAHLQNTLLTIQNGMPHTFIIRDLEGVSVNREKVEANLDTTGALFYSKEEAWARTTYYFVVNHLGSLIHAMASGVGVEEEHFWRIVREALEQEYEESRNEYVLHLLTANVFYAKKNLMSCLAGNSEKPSYVQVDNIMKRIGSEANETSKLSR >NZ_CP034235.1|WP_155704223.1|7068404_7069838_-|MFS-transporter MVIVSGLKKHSVLLAVLLGAFSLVLTNSAFNILLPSFVEMYGIPTAFSSWIIILYILAMTITMPLTSLVVDRLGRKKTYIAGIGLYGLFSILGGLFSQYIEIVLLVRVMHGIAAGLMIPLSLVLLFDYYGKEVRGRVVGAWGILLMIAPAIGPTLGGAIIQFGELKYLFWINVPFALFSFLLCCTQIKQYPPVRRKTLHLQGITLMVLGIASLSLGIQMFSNPTVPSWIPYVLLILGAATLVSFIRKENVKEEPLIRYSLLKRNPVYTVALLISAIQDAVMFGVIFVLPLIFQEVLHLSPSMTGAMFIPTALFTSLFVWVGGSLVDSGKSLKFIAYGIGCIAVSVLAFAFVPQGVSFIVLLLLMSLRGIGNGLSDMTVTAIGLNSLQEEDLHEGSALSNTIQRLTSSFAIMLLGLYYDVRWQMVVQSGELAEHAKWTILKEECIILGVLMILTLPLVSLLNRKREDIVVANGKNTVA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP034235_3 | 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 1790040-1790064 | 25 | NZ_CP011513 | Paenibacillus peoriae strain HS311 plasmid unnamed, complete sequence | 1155-1179 | 3 | 0.88 |
NZ_CP034235_3 | 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 1790040-1790064 | 25 | NC_009931 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6, complete sequence | 49522-49546 | 4 | 0.84 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_CP025513 | Neorhizobium sp. SOG26 plasmid unnamed2, complete sequence | 308366-308395 | 5 | 0.833 |
NZ_CP034235_3 | 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 1790040-1790064 | 25 | MH884508 | Bacillus phage vB_BcoS-136, complete genome | 22939-22963 | 5 | 0.8 |
NZ_CP034235_3 | 3.3|1790150|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 1790150-1790174 | 25 | NZ_CP045074 | Paracoccus kondratievae strain BJQ0001 plasmid unnamed1, complete sequence | 443737-443761 | 5 | 0.8 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MH133207 | Acinetobacter phage vB_AbaM_B9, complete genome | 27553-27582 | 6 | 0.8 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | AP018399 | Xanthomonas phage XacN1 DNA, complete genome | 128745-128774 | 6 | 0.8 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MN927225 | Escherichia phage vB_EcoS_XY1, complete genome | 4346-4375 | 6 | 0.8 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_CP033223 | Parasedimentitalea marina strain W43 plasmid pW43D, complete sequence | 9701-9730 | 6 | 0.8 |
NZ_CP034235_3 | 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 1790040-1790064 | 25 | NZ_CP049914 | Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence | 293740-293764 | 6 | 0.76 |
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NZ_CP034235_5 | 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 7057406-7057432 | 27 | HQ632825 | Prochlorococcus phage P-SSM5 genomic sequence | 12843-12869 | 6 | 0.778 |
NZ_CP034235_5 | 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 7057406-7057432 | 27 | AY939844 | Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome | 74460-74486 | 6 | 0.778 |
NZ_CP034235_5 | 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 7057406-7057432 | 27 | MG945169 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 414-1801, partial genome | 5592-5618 | 6 | 0.778 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MF001355 | Proteus phage PM2, partial genome | 14625-14654 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | KP890823 | Proteus phage vB_PmiM_Pm5461, complete genome | 27381-27410 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MH598806 | Pelagibacter phage HTVC119P, complete genome | 23926-23955 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 759465-759494 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MN693109 | Marine virus AFVG_25M321, complete genome | 2131-2160 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_AP014816 | Geminocystis sp. NIES-3708 plasmid pGM01, complete sequence | 32688-32717 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | GU196281 | Escherichia phage K1ind3, complete genome | 18524-18553 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NC_041898 | Escherichia phage K1ind2, complete genome | 17828-17857 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | GU196279 | Escherichia phage K1ind1, complete genome | 17827-17856 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_CP015091 | Pelagibaca abyssi strain JLT2014 plasmid pPABY1, complete sequence | 18215-18244 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_CP013054 | Sinorhizobium americanum CCGM7 plasmid C, complete sequence | 1015588-1015617 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_CP013110 | Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid C, complete sequence | 1395422-1395451 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NZ_CP031083 | Paracoccus yeei strain CCUG 32053 plasmid pYEE5, complete sequence | 21992-22021 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | KY940711 | Bradyrhizobium phage BDU-MI-1, complete genome | 52753-52782 | 7 | 0.767 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | NZ_CP016847 | Carnobacterium maltaromaticum strain TMW 2.1581 plasmid pL21581-3, complete sequence | 65878-65907 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MF285617 | Leclercia phage 10164RH, complete genome | 35607-35636 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MT813197 | Escherichia phage vB_EcoP_Kapi1, complete genome | 30620-30649 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | AP014361 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S40-C80, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 22065-22094 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MF285616 | Leclercia phage 10164-302, complete genome | 35371-35400 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT | 749530-749559 | 30 | MN693215 | Marine virus AFVG_25M456, complete genome | 29159-29188 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MH171096 | Streptomyces phage Eddasa, complete genome | 16417-16446 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MF541410 | Streptomyces phage Ozzie, complete genome | 16234-16263 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MF541407 | Streptomyces phage Esperer, complete genome | 16254-16283 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MF541403 | Streptomyces phage BeardedLady, complete genome | 16501-16530 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MG593802 | Streptomyces phage Omar, complete genome | 17073-17102 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MN586009 | Streptomyces phage Phettuccine, complete genome | 16254-16283 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MN096381 | Streptomyces phage Rusticus, complete genome | 16417-16446 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MF541404 | Streptomyces phage BryanRecycles, complete genome | 16417-16446 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MN096375 | Streptomyces phage Leviticus, complete genome | 16254-16283 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MK433270 | Streptomyces phage Bovely, complete genome | 16260-16289 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NC_028892 | Streptomyces phage Caliburn, complete genome | 16234-16263 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NC_028976 | Streptomyces phage Izzy, complete genome | 16464-16493 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MF541408 | Streptomyces phage Jash, complete genome | 16417-16446 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MK392364 | Streptomyces phage Nishikigoi, complete genome | 16738-16767 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MK433271 | Streptomyces phage Indigo, complete genome | 16254-16283 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MF541409 | Streptomyces phage Oliynyk, complete genome | 16417-16446 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | NC_042051 | Streptomyces phage Aaronocolus, complete genome | 16254-16283 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | MK433278 | Streptomyces phage Nerdos, complete genome | 16254-16283 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | KT124229 | Streptomyces phage Hydra, complete genome | 16782-16811 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_1 | 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT | 749614-749643 | 30 | AP013400 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S30-C37 | 35695-35724 | 8 | 0.733 |
NZ_CP034235_4 | 4.1|6324517|28|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder | 6324517-6324544 | 28 | NZ_CP040989 | Vibrio furnissii strain FDAARGOS_777 plasmid unnamed1, complete sequence | 73776-73803 | 8 | 0.714 |
1. spacer 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011513 (Paenibacillus peoriae strain HS311 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
tctcttgtttttgattaaaaattga CRISPR spacer tctcttggtttggattaaaaattgg Protospacer ******* *** ************.
2. spacer 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to NC_009931 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tctcttgtttttgattaaaaattga CRISPR spacer catcttgattttgaataaaaattga Protospacer . ***** ****** **********
3. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP025513 (Neorhizobium sp. SOG26 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tcaacggcaacatcaacgacaacaccagca Protospacer ****** *********** *****.* .**
4. spacer 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to MH884508 (Bacillus phage vB_BcoS-136, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
tctcttgtttttgattaaaaattga CRISPR spacer aagtttgtttttgattaaaaattca Protospacer .******************* *
5. spacer 3.3|1790150|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045074 (Paracoccus kondratievae strain BJQ0001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
cactaaatttccgcaattactgcta CRISPR spacer ttctgaatttccgcaattactgcgg Protospacer . **.****************** .
6. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MH133207 (Acinetobacter phage vB_AbaM_B9, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer acatagtcaacacctgtaccaccatcaact Protospacer ** *.************** *******
7. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to AP018399 (Xanthomonas phage XacN1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer ccaacgccaacaccagcaccaacagtatcg Protospacer .************* *.******* .* **
8. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MN927225 (Escherichia phage vB_EcoS_XY1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer atgtcgccaacaccaacgctaacatctaca Protospacer .. ********.******.**********
9. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP033223 (Parasedimentitalea marina strain W43 plasmid pW43D, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tcaacgccaacgccaacgccaacgccaacg Protospacer ***********..**********..* **.
10. spacer 3.1|1790040|25|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049914 (Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
tctcttgtttttgattaaaaattga CRISPR spacer agacttgtttttgattaaaaatctt Protospacer *******************.
11. spacer 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to MH319731 (Marine virus AG-345-E02 Ga0172268_11 genomic sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cctctcttcaaatcgttaattttgttc CRISPR spacer tatctcttctaatctttaattttgtaa Protospacer . ******* **** **********
12. spacer 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to HQ632825 (Prochlorococcus phage P-SSM5 genomic sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cctctcttcaaatcgttaattttgttc CRISPR spacer tatctcttctaatctttaattttgtaa Protospacer . ******* **** **********
13. spacer 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to AY939844 (Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cctctcttcaaatcgttaattttgttc CRISPR spacer tatctcttctaatctttaattttgtaa Protospacer . ******* **** **********
14. spacer 5.2|7057406|27|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to MG945169 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 414-1801, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cctctcttcaaatcgttaattttgttc CRISPR spacer gttctcttcaaatggttaattctgtga Protospacer .*********** *******.***
15. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF001355 (Proteus phage PM2, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer actacgccaccacctgtaccaacttcatta Protospacer * ****** ************* *** ..
16. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to KP890823 (Proteus phage vB_PmiM_Pm5461, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer actacgccaccacctgtaccaacttcatta Protospacer * ****** ************* *** ..
17. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MH598806 (Pelagibacter phage HTVC119P, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer tgttcgccaacacctgtaacaaaatcaaaa Protospacer * ************** *** ***** .
18. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer tcaacaccaacacctgaaccaactactcca Protospacer *****.********** ****** * *.
19. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MN693109 (Marine virus AFVG_25M321, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer tcttcgccaacacctgtactaacagcactt Protospacer ** ***************.**** ** .
20. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_AP014816 (Geminocystis sp. NIES-3708 plasmid pGM01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer acgttaccaacatcaacaccaacatcaaca Protospacer *. ..***********.******** ***
21. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to GU196281 (Escherichia phage K1ind3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer atgtctccaacaccaacgctaacatctaca Protospacer .. * ******.******.**********
22. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NC_041898 (Escherichia phage K1ind2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer atgtctccaacaccaacgctaacatctaca Protospacer .. * ******.******.**********
23. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to GU196279 (Escherichia phage K1ind1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer atgtctccaacaccaacgctaacatctaca Protospacer .. * ******.******.**********
24. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP015091 (Pelagibaca abyssi strain JLT2014 plasmid pPABY1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer acaacgccatcgtcaacgccaacaagctca Protospacer ******** *.************ . **
25. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP013054 (Sinorhizobium americanum CCGM7 plasmid C, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer acaacgccatcgtcaacgccaacaagctca Protospacer ******** *.************ . **
26. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP013110 (Sinorhizobium americanum strain CFNEI 73 plasmid C, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer acaacgccatcgtcaacgccaacaagctca Protospacer ******** *.************ . **
27. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP031083 (Paracoccus yeei strain CCUG 32053 plasmid pYEE5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer acaacgccatcgtcaacgccaacaagctca Protospacer ******** *.************ . **
28. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to KY940711 (Bradyrhizobium phage BDU-MI-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tcaacgccaacatcaacg---ccaacatctaca CRISPR spacer ccaacgccaacatcaacgacaccaaggcct--- Protospacer .***************** **** ..**
29. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to NZ_CP016847 (Carnobacterium maltaromaticum strain TMW 2.1581 plasmid pL21581-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer ccaactccaacaccagtaccaacaaaagta Protospacer .**** ******** ********* *...
30. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF285617 (Leclercia phage 10164RH, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer ccatcggcaacacctgtaccaacaataggt Protospacer .** ** ***************** .*.
31. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MT813197 (Escherichia phage vB_EcoP_Kapi1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer aacaggccaacacctttaccaacatccatc Protospacer * ********** ********** *.
32. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to AP014361 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S40-C80, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer gcgggccaaacacctgtgccaacatcaacc Protospacer *.. * *********.***********
33. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF285616 (Leclercia phage 10164-302, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer ccatcggcaacacctgtaccaacaataggt Protospacer .** ** ***************** .*.
34. spacer 1.1|749530|30|NZ_CP034235|CRT matches to MN693215 (Marine virus AFVG_25M456, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacacctgtaccaacatcaacg CRISPR spacer agcccgccaacacctgtatcaacaccagca Protospacer **************.*****.**.*.
35. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MH171096 (Streptomyces phage Eddasa, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
36. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF541410 (Streptomyces phage Ozzie, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcggac Protospacer * ***** **.************** .
37. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF541407 (Streptomyces phage Esperer, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
38. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF541403 (Streptomyces phage BeardedLady, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcggac Protospacer * ***** **.************** .
39. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MG593802 (Streptomyces phage Omar, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcggac Protospacer * ***** **.************** .
40. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MN586009 (Streptomyces phage Phettuccine, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
41. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MN096381 (Streptomyces phage Rusticus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
42. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF541404 (Streptomyces phage BryanRecycles, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
43. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MN096375 (Streptomyces phage Leviticus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
44. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MK433270 (Streptomyces phage Bovely, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
45. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NC_028892 (Streptomyces phage Caliburn, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
46. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NC_028976 (Streptomyces phage Izzy, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
47. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF541408 (Streptomyces phage Jash, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
48. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MK392364 (Streptomyces phage Nishikigoi, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcggtc Protospacer * ***** **.************** ..
49. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MK433271 (Streptomyces phage Indigo, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
50. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MF541409 (Streptomyces phage Oliynyk, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
51. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to NC_042051 (Streptomyces phage Aaronocolus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
52. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to MK433278 (Streptomyces phage Nerdos, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcgggc Protospacer * ***** **.************** .
53. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to KT124229 (Streptomyces phage Hydra, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgccaacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer tgcacgcctacgtcaacgccaacatcggac Protospacer * ***** **.************** .
54. spacer 1.3|749614|30|NZ_CP034235|CRT matches to AP013400 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S30-C37) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tcaacgc-caacatcaacgccaacatctaca CRISPR spacer -tgttgcgcaacatcaactccaacatctaat Protospacer .. .** ********** **********
55. spacer 4.1|6324517|28|NZ_CP034235|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040989 (Vibrio furnissii strain FDAARGOS_777 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.714
ccatgatcactcaagcaaggtgcagatt CRISPR spacer tttcagtcacttaagcaaggtgcagatg Protospacer .. ...*****.***************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
612852 : 625797
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP034235|612852:625797|DBSCAN-SWA 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15 | Brevibacillus_phage(50.0%) | portal,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
834176 : 847610
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP034235|834176:847610|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP034235|834176:847610|840308_842561_+|WP_155699124.1|DBSCAN-SWA MAQQQSVKEPTAQQIAEQKIYKQMGVTDEEFGKIVGFLGRQPNYCEIGVFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPVTGPRVLMGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKIESHNHPSAVEPFQGAATGVGGIIRDIFSMGARPVALLNSLRFGKLDNERSKYLFEHVVSGIASYGNCIGIPTVGGEIMFDESYEGNPLVNAMCVGLIDHDKIQKGVAQGVGNPVFYVGPGTGRDGIHGATFASEEITEKSEANRTAVQVGDPFMEKLVLEACLDLINSGIVIGIQDMGAAGLTCSSAEMASKAGNGMELYLDQVPQREEGMTAYEMMLSESQERMLFVVTPENEAQAVAIFARWGLGCPRVGKVTDDGRLKIIHHGEVVADMPVTALVDDVPQYNKPSIEPAYYAINGAIDTNRYAEVTDLTDALKKVLGSPTVASKEWVYSQYDYMVRTSTVVRPGSDAAVISIPGSRKALAMTTDCNGRYVYLDPEVGGKIAVSEAARNVVCSGAEPIAITDNLNFGSPEKPEIFWQLEKSVDGMAEACRVLNSPVIGGNVSLYNENAKGAIYPTPVVGMVGLIHDLDHITTQGFKNEGDVIILLGNTHAELGGSEFQYILHGVTEGRPPQIDLQVELNLQRTVLAAIQLGLVASAHDLSEGGLAVALAESCISGGLGAEVNFNTVLRSDIALFSESQSRILLSAKESKSQELITWVSQQDVPYQVLGTVKGKELSIRINAQADAALQSPVNQLEKVWKDAIPCLMNA >NZ_CP034235|834176:847610|838161_839046_+|WP_155699121.1|DBSCAN-SWA MSLSTAIATAQPYIKAPLIYKGKVRELYDLGEYYLIAVTDQISAFDYVLNPAVPDKGNVLNMLSRYWFEQTALLQPNHVIHTDVSLLGDIITDPELMKDRIMVTKKAERIDIECVVRGYITGGGWRQYIETGEVNGIKLPEGMHKNERFPQPIFTPAAKNDVGHDEDISVARMKELVGADLTDELEAKSIKLYQFAHDYCEKRGIILADTKFEFGLIDGKVILIDELFTPDSSRFWAKANYALDTEIDSMDKEPVRTYLSGSGWDKNSEPDPLPADVVAATSQRYRDIMNLLIK >NZ_CP034235|834176:847610|834176_834797_+|WP_155699117.1|DBSCAN-SWA MALINEITVFDFETTGLSAEKDQVIEMAAIRVANGQVVGEFSTLIQYDGKLSPKIIELTGIHDEELKHGFDEVTAFKIFNRFIGNSVIVAHNAAFDLGFLHHTLMRLAKRSFNNSFIDTLTISRERTVFPYKLTDLCARYNIELIGAHRALSDVYGCWHLYEALSKEVKIEDYINKLGYMSKYGPPKWAPDYAVLQAQENRYEDRR >NZ_CP034235|834176:847610|846068_847610_+|WP_155699128.1|DBSCAN-SWA MTIKRALISVSDKTGIVEFAAELAKLGVEVISTGGTQSLLKEKGVPVIGISEVTGFPEILDGRVKTLHPAVHSGLLAVRNDPEHVEQMEKLNLDYIDLVVVNLYPFAATIAKPNVSYEDAIENIDIGGPTMLRSAAKNHAFVTVVVDASDYARVLEEIRASQDTTLETRKQLAAKVFRHTGAYDALIGDYLSKQMGEPMPEKYTVTYEKVQDLRYGENPHQKAAFYRKPLADQGNITTAEQLHGKELSYNNINDANTALQIVKEFSEPAVVAVKHMNPCGVGIGANIHEAFQKAYAADPTSIFGGIIAANRTISEETAQLLSEIFLEIIIAPDYTDGALEILQKKKNIRLLKLSSSTAENKSQMVITTVDGGMLVQESDAYQLSENDLKIVSERQPTEAELKQLLFAWKVVKHVKSNAIVLVADDMTVGVGAGQMNRVGAAKIAIEQAGDKAKGSVLASDAFFPMGDTVELAAKAGITAVIQPGGSIKDEDSIKAANANGMVMVMTGVRHFKH >NZ_CP034235|834176:847610|835146_835632_+|WP_155699118.1|DBSCAN-SWA MSARVGVIMGSQSDWETMKLACVILEELNIPFEKKVVSAHRTPDLMFEYAETAIARGIQVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTVLPVIGVPIKSASLNGLDSLLSIVQMPGGVPVATVAIGTAGATNAGLLAAQILGITDSEIQQKLIDRRERTRQTVIESSESL >NZ_CP034235|834176:847610|836832_838128_+|WP_155699120.1|DBSCAN-SWA MIERYSRPEMAAIWTEENKFRAWLEVEILSCEAWSELGVIPKEDVALLREKASFNIDRINEIELETRHDVIAFTRSVSETVGPERKWVHYGLTSTDVVDTAMGYILKQANQIIEQDLLNFIEILKNKAIEFKDTAMMGRTHGVHAEPTTFGLKMALWYEEMKRNLERFRAAAENVEFGKMSGAVGTYANIDPFIEVYVCGKLGTKAAPISTQTLQRDRHAQYVATLALIATSMDKFATEIRALQKSEIREVEEPFGKGQKGSSAMPHKRNPIGCESISGLSRVIRGHMLSAYENVTLWHERDISHSSVERIILPDATILLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNLLSTYGVPFSGRVLTKLIDKGYSREKAYDTVQPKAMMAWEQQRSFREIVEADSEIREQLSLEEIAECFDPSWHLKHVDTIFKRLELI >NZ_CP034235|834176:847610|844159_845200_+|WP_155699126.1|DBSCAN-SWA MSEAYKQAGVDIAAGNEAVERMKKHVKRTFRPEVLTDLGGFGALFGLNKDKYDEPVLVSGTDGVGTKLKIAFAMDKHDTIGIDAVAMCVNDIIVQGAEPLFFLDYLACGQVIPEKIEAIVKGISDGCVQAGCALIGGETAEMPGMYHSGEYDIAGFTVGIVDKKKIIDGSTIAPGDVILGLGSSGIHSNGFSLVRKLLLEDKGYTLQQHFDELGGKLGDVILEPTKIYVKSVLALIEKVKVKGMAHITGGGFLENIPRVLPEGVNAHIEYGSWPILPIFQLMQAAGQITNNDMFRTFNMGIGMVVVVAAGFADEAERIAGELGENVYRIGQVTAGDRIVTFNGAVV >NZ_CP034235|834176:847610|839638_840331_+|WP_155699123.1|DBSCAN-SWA MNFAVLVFPGSNCDIDCFKAVEETIGQPVDYVWHTETDLSKYDAIIVPGGFSYGDYLRCGAIAQFAPVMAALKVAAEAGKYVIGICNGFQVLTEAGLLPGALLRNNSLKFRCHATTLRVESTNNPFTQDYKLGEEINIPIAHGEGNYYCDDATLKELQDNGQIIFRYAGENPNGSVDDIAGISNKAGNVLGMMPHPERAIHELLGSEDGKRMFTSILSTWRDRHGAAAIR >NZ_CP034235|834176:847610|839390_839639_+|WP_155699122.1|DBSCAN-SWA MIKATVYVTIKQSVLDPQGNAVQSALHSMGFNEVEKVRIGKYLEVTLNTADRAEAESRVRAMCEKLLANTVIEDYRFELEGA >NZ_CP034235|834176:847610|845196_845808_+|WP_155699127.1|DBSCAN-SWA MTQPFRIAVFASGSGTNFQAIVDAVASGKLDVIVELLVCDRPQAPVVERANLAGVSTFVFRPKDYASREIYEAEIIAELEARQIDLIIMAGYMRLITDTLVKPYYGRIINIHPSLLPAFPGINGIGQAFEYGVKLTGVTVHFVDGGLDSGPVIAQMSVDVTSDDTEATLAERIHALEHMLYPQVIALIRAGRVRLDGRKVFVE >NZ_CP034235|834176:847610|842542_844072_+|WP_155699125.1|DBSCAN-SWA MSDERLTFRSKRIVQADSPAIDASGNSLWTGQYYNEGVDNDYFDKLKEECGVFGVYGHSEASALSFYGLHALQHRGEESAGICTSDGKNFYYHRDMGLVKEVFDNERIKYLQGPAAIGHVRYSTSGASKLQNAQPLVFKYKGGDLAIATNGNIVNAPEIRAELEELGSIFQTTSDTEVVIHLIARSKQKNINDAVKEALQRIVGGFAFLILVNDRLFVAQDAHGLRPLAIGRLDGAYVFASETCAFETIGATYERDLRPGELLIIDEKGMTEDRFAPLQQRSLCAMEFIYFSRPDSDIDEINLHSARKRMGRQLAMEAFVDADIVTGVPDSSISAAIGFAEQTGIPYELGMIKNRYTGRTFIQPSQELRERGVKMKLSAVRKVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSLRIVNMLREAGAKEVHVRISSPPYKNPCFYGIDTPDRKDLIAHERTVEEIRIAINADSLHFLTKEGLLEAIGRTPDEFNRGMCTACFDNNYPTALSEEMEAVGCGTC >NZ_CP034235|834176:847610|835628_836792_+|WP_155699119.1|DBSCAN-SWA MNKSIEPAKVILPGSTIGVLGGGQLGRMLALAGRHMGYRFITLDPTADSPCGQVADRQIIGEYDDAEAAGQLAALSDVITYEFENIDADVAAKLMTDSYVPQGSQLLYTTQHRIREKRAIEAAGVKVAPYEQIESLAQLQAAIGRFGTPCVLKTATGGYDGKGQWVIRSLDEAGAAFAALSLAKTELVLEQFIRFERELSVIAARNPRGEVKAFPVAENIHVDNILHLSIVPARISDAIRLKAEQLAIRIAASLDVIGLIAVEMFLTEEGELYVNELAPRPHNSGHYTIEACSTSQFEQHVRAICNLPLGATTLLSPVVMVNILGQHVDPVMNWLLEQSEEADGLSVKLHLYGKEEAKHQRKMGHLNLLTNDINQALKWVEDTQIWS |
12 | Synechococcus_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3012034 : 3081682
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP034235|3012034:3081682|DBSCAN-SWA 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76 | Bacteriophage(31.43%) | tail,terminase,portal,transposase,capsid,head,holin,plate,integrase,protease | attL 3007226:3007240|attR 3031159:3031173 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3430550 : 3450932
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP034235|3430550:3450932|DBSCAN-SWA AATGACTATCCCGGCTCCAATACATAAAGTGTTTCATTCTTTGACTCATGCCCAGAAACGGGTTTGGTTTACAGAGCAAATTTACCCTGGACAAGCTTTGCATCATTTGGGCGGTGCTGTAATTATCCATGACAAAATTCAACTTGATTTATTGGAGCAAGCTATTCATGCTTTAATTCATCGTCATGATGCTTTACGTTTAAAGCTGGAGGTGGTGTCTGGAGAAGTGCAGCAATATGTGGGCACTTATGAACCACAGATTTTGAAGAAGGTGGATTTTTCAGCGGCGCTTGATCCACAGACAGCTTATGAAGCATGGTTAAACGAGGAATCAAGGATCCCGTTTGTACTTGAAAATAAGTGGTTATTTGAATTTATCTTGTTTAAATTACAGGATAATAAGAATGGTTATTATGTGAAGCTTCATCATCTAATCTCAGACGGTTGGTCCATCCAGATCATGACAGAACAATTGAGGAAATGTTATGAACAGCTAATTTCAGGCCATTCCATTCATTACGAGAAAGCTCCATCTTATATAGAATATATAGAAAAAGAGAGAGGGTATTTGCATTCAAGCCGTTTTGAGAAAAACAAGACTTTTTGGATGGAGAAGTTTAGGGGAATGCCGGAGGGTCTCTTAGCCGTTAGCTCTGAAGATTGTTCAGCTAAGAGAAAGTCATTTCTAATGGAACAGGAGTTAACCGAACGACTTCAAAAATTTATATTTAAAAAAGGAGTCTCGCTCAATACTTTTTTCGTTGCATTAATGGCAGTCTATCAACAAAAAATGACAGGTCAGAACGATTTGGTAATAGGAAACCCTGTGTTAAATCGCAGTGGCAGGAGAGAGCGTGAGATATTTGGCATGTTTACGAGTACGATGCCGCTTAGAATATCATTAGCGGCAGCAAATACGATTTCAGATGTATTAATAACGATGGTGAAGCTGATTAAAGAATGTATGTTTAATCAAAAATACCCGTATAATTTATTGATAAAGGATCTAAGCAATAATCTAATACCTATTAATGGACTCTTTCAAATTTGTGTGAATTATTATAATACGAAGCTGCCCACTGAATGGAGTGGAGGTGAAATTGAGAATGTTGAATTTCACAGTGGCAGCCAATTGTATGCCTTGCAGTTGGTTGTCAAGGAATGGGAAGATTCCGGAAGGATTCAATTGGATTTCGACTACAAGATAAGTCAATATAATGAGAATGAGATCCATGTAATGTTCGATCGACTTTGTTATCTTCTAGACCAGATAATAAAAGACCCTGATGTACTTTTGTCTCAACTGCAATTGCTCAGTGGGATAGATAGGCAGAAACTTATTTATGACTTTAATCAAACAGCAAATGAGTATCCAAAGAATACAACCATAATTGAGTTATTTGAAGCTCAAGTAAAACGAAGTCCCTTGAATACAGCGGTAATTTTTGAAAATGAACAGCTAACTTACATACAGCTTAATGAAAAAGCCAATCAATTAGCCAGATATTTGCAAAGTATGGGATTTAAAATAAATGATTTTGCTGTAATCGAAGCCACGCATTCAATGGATGTGATTATTGCGATTCTTGCAATATTGAAAGCTGGAGGTGTTTATATCCCCATTGACCCGGATTATCCGGACGAACGAGTTAAGTTTATTCTTAAGGACTCACAGGCTTCATTTCTGCTTACTGATAATCCCGAGCGCTGCAAAGATTTTTACCTGGGAATGATTATCCTTATATCTGATAACTCCTTATATGCAAGTGCTGCAGCATCCAATATTGGAGTTTATCCTTGCTCCAATGATTTGGTTTATATTATGTATACATCCGGATCAACAGGTAAACCAAAAGGAGTAATGGTTGAGCAGCGCGGATTGATTAATTACATTTGGTGGGCAGGAAAAACATATATTCAGGATGAGCAAGATACATTCGCTTTATATTCTTCCCTTGCCTTTGATTTAACGGTTACTTCTATTTTTACCCCGTTACTGTACGGCATTAGAATCATAGTCTATCACGATGGAGGAACCGATAATTTTCTTCATAATATTCTGAGGGATTCCAGGGTTACCATCGTCAAATTAACTCCTGCGCATCTTTCCTTAGTAAAGGATTTGGATTTATCGATCTTTGAAGCATCCAACATTCGTACGTTTATTATCGGGGGAGATGATTTAAAAGTAACAGTAGCAAGGGAGATTGGGAAGTTATTCCCACAAGGCGTATCTCTATTTAACGAATATGGCCCTACAGAAACGGTTGTTGGATGCATGATTTATAAGTATGACATGGATCGTGACTTATCTGGTTCGGTTCCTATTGGAGTTCCTATTGATAATATGCAAATTTATATTCTAGATTCAAATTTACACCTTTCGCCAATTGGAATTGCCGGGGAGCTGTATATTGCGGGTGACGGAGTAGCACGGGGATATTTAAATCAACCCGCTTTGAACAAGGAAAAATTCATCCAGAACCCATTTAACCCAGGATCAATCCTGTATAAATCCGGAGATCTTGCCAGAAGGCGGGAGGGTGGCTGTGTGGAATATCTCGGGAGAAGCGACAATCAAGTGAAAATTCGGGGTTATCGGATTGAACTCGGGGAAATAGAGAATCAAATTCTAAATGAAGAAGGGATTAGTGAAGCCATTGTAATAGATCGTACCCACGAACTGGGAAATAAATCTCTCTATGCCTATTTGATTCTTAAAGAAAACAAGACCTTATTGACGGAACAAAGCATTCGAACGAAGCTGATGAATAAATTGCCAGCTTATATGGTACCTTCTTATATTATTTTTATCGAGCGATTTCCTTTAACCGTCAATGGAAAAATCAATCGAGACAAGCTTTCTAATTTGTGGACAGAGAAGCAGCTTTTGCTTCAAACCTTGCCTGAGAATGAGCAGGAGAGAATTCTGCTAATGGTAGTTCAGGAAATACTGCTTGATAGCGAAATTGGAATGAACAGCAATTTATACCACCTCGGTGGTGATTCAATAACTGCTATCCAGATAGCTACCAAGATAAAAAATAAAGGCTATTCAATAAAAGTCAAAGATATACTTAATTACCCTGTTCTGAAGGAAATGGCAGCAGCTTTAGTAGAGGAGAGTAAGCAGCCCCTGATACCTCAGGAGATTTCTGCGGGGCCGATTGAGTTAACACCAATCACAAAATGGTTCTTCTCGCAAAACTTGCCTGAACCGAATTATTATCACCAAACCATATTGCTGAAAATTAAACATCCTATTACTCAAAAAGGTTTGAAACTGGTTATGGAAAAGATCATTTGTCACCATGATTCTTTGCGAATAAATTATGATCCATCCAAAGATTTACTTTTTTATAATAATCAGCATTTAAATAAGCCGTTTGAAATGGATATTATACATTTAACCCCAGAACCCGCTAAGGTTAACTCAACGATTCTTCATTATAGCTGCTTGCTTAAAGCGAGTTTCAATATAACCTCAGATCTGTTAATTAAAGCTTGTTTGTTTGATTTAGGTGAAGAAGCTGGTGTAAGACTTCTGTTGAGCGCTCATCATTTGGTAATGGATGCAATTTCCTGGAGAATTCTTCTCGAGGATCTGGATAATTCTTTGTCTGCTTGGAAATCGGGGATTGAACATCACCTTCCAGCCAAAACAACATCCTTGCAGGCTTGGGCATCTGGGTTGCAAGCTTATGCCAAGCAAGTTTCAATTGAAGAAGCAGCATATTGGAAATTACTGGATTATTCCAAGAGCGATAGAAATCAAGAGGTCTACACTAATAAAGAAGTCTATACTTTACATTCAACGCAATCATTGATCGCTCTAACTATGGAACAAGCGAATAAAGCATATGGCACGGATTTTCAAGATTTACTCCTTGCAGCTTTAGTAATGGTTATTAGAGAATGGTCGAATAATGAAGAAGAAATTGTAGAACTGGAAGGTCACGGTCGTGAAGAAATATCGTCCCAGATGGATATGACAAGAACGATTGGTTGGTTTACAAGCATCTACCCGGTGAAGGTAGGAGCAAACATTATAGGTACCTCTTTAAATCATCATATTAAGACGGTTAAAGAACTAATTAGAAGAATTCCTAACAGGGGAATTGGATTTGGAGTTTTAAAATATTTGACTGGATTAGAACAGAAGCTAGACTATCAGGCTCCTCCAGCATTTCGGTTAAATTATATTGGAAACGTTGGCCTAGGAATGAATTATAATTTTTTTGACATAGATACTACTGAAGATGTTGGGCCAGAAAGCGCTCCATCCAATCCATTAAGCTGTGGAATGGAGCTGAATGTCCTTATTGTAAACGGACAGCTAGAGATCCGCACATCCTATTCAATCTCTTTATTTCCCGGAAACAGTGCGATACTATTCCTGTTAAACTTTGAAAAAAGAATTACGGAAATAATAACTCACTGCTTGCAAAAGGAGGAGGTAGAGTATACTCCAGCTGATTTTGACGGGGCGGATCTGTCACAGTTTGAGTTGGACGAACTATTCAGTTAGCGCTAAATATCATTAAGAGGTGGGATTAAAATGGAAAAAAGATTACCAGTGACTTATCCTTTAGTTAATACTTGGCCGTATCATTCCTGCTTGATGTCGATTATTTCACAATATGATTATTGCGCTCCATGGATATTTATGAATTACATTCAATTAAAGACACACGCGGAGGTAGGTTCCATTTTTGTCGATTTTTATTTATTTGACTACGACGTTTTTGGAAACAATCCTTGGCTTAAAGATAAAACCTTTAAACTTGATGTTAATACCACAAAAGAATTAGCGAGAGATTCTGGCATTAGCAAGTTTCTAATTAATTTCATTAAAAAAGGATACTATATCTTTTTTAGTGGTTTAAGCGATTATTATATTCCAGATACTATAGCTTTTCAAAAAGACAAAGATTCACTCCATGGTTTTCTCGTTTATGGATATAACTCAAATGAAGGTGTATTTGAAATGGGAGGGCACT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17 | Staphylococcus_phage(36.36%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3479650 : 3486542
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP034235|3479650:3486542|DBSCAN-SWA 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GATCAACGGTGAAATATATAAACTATCATTAAACATATTAATGGTTAACAAAAAAACTAATAAGAATACAAAGATTCCAAATACGATGCGAAACGCTATGTGGTTAAGAAATCGAATAAATGTCGACTTGTCGTTTAGAGCAAGATAATCCAGGCCAAGCCAGTACCCAAGAGTAAGCAAAGATGTTATTGAAATGGTAATCCTATCAGGTATTGTTGTATTAGATATAATCCAAAAATAACTCAAACATAATACTGCAGAAATTATGAAAGTGCTATTAAATAAGTGTTTTTGGCTAAATCCCATTCTTCTAAAAAGAAACTTAACAAATCGCTTTACTGGATAGGTAAAAAGAAGAGAGAAAAGTAGTGCTACTATTAGTATCATATGATTTTTACCATTCGTTCTTCATCGGCTGAAGTATTTGCTGCTAGCTTTGTCAAAAATCAGCTTAACAGAACTGGGTATATTCTACAACTATTAATAACCCCAAAAACAAAATAAACCCTCTATATAAAAGGGTTCACAAGACATCCTATTTCAATTTATATTCGGGCCTCTTTGCAGAGACCCTACATGGGAGAGGAGAAACCGGATGAAAGCTTATGGGGAAACGTAAGCTCTCTCCGCGGTTGTCTACGACATGGTTGATGTCGATAAGATAAGGATTACCCAACTCCAGAAAAATATACATAACCTGCAAATTTTTTCTGAATTTGTTCAGATATTTTGTAAAATTACTTTGAATTTTTGTGAATTTACCTTGGAATATGATACGATAGCAATAAATTGGACATGCAGGGTGACATAAGGTGAGAGTGATTGCAGGAACGGCCAAAGGAAGACTATTAAAAGCTGTTCCAGGCACAGGGACACGCCCGACTACCGACAAAGTAAAGGAAGCGATTTTTAGTATGATCGGGCCTTATTTTGACGGCGGTTTGGGTTTGGATTTGTTCGCTGGGACAGGTGGTTTGGGAATTGAAGCGCTAAGCCGTGGAGTGGATCGAGTCATTTTCGTTGATATGGAGAAAACCAGCATTCAAGTGGTAGAAGACAATCTGAGCGCACTTGGCTTTAAGGAACAAGCAGAGGTCTACCGAAATGAAGCGCAGCGGGCTTTAAAGGTTCTGGGAAGAAGAGGGCTGAAGTTTGATCTGATTTTTCTTGATCCGCCATACAAAATGAAGAATGCTGATGAAATTCTGCTAGAAATGCAGCAGATGGGGATGCTTCATGATCAAGCCGTGGTTCTGGTCGAACATGAATCGAAACATGCCTATGCCGATGAAATTGGTCAACTGCAGGTGCGAAAGCGCACGACATATGGCGAAACCGCGATTACGATTTACCGTTTTTTCGATAATATCAGCATAGGAGGTAAGCTCGATGGGACCGAACACTCATAAATTTACAATTGCCGTCTGCCCAGGTAGCTTTGATCCTGTAACGAACGGGCATTTGGACATCATACATAGAGCTGCCGTGGTCTATGATAAGGTAATTATAGCTGTATTAAAAAATGCCAGCAAAAGTCCATTATTCAGCATTGAAGAGCGTAAACGGATGCTGGAGGAAGTAACGAAGGATTTACCTAATGTCGAAGTGGACAGCTTTGATGATTTACTGATCAATTATATGAATGAAAAGAAAGCTCACGTGATTATAAAAGGCTTGCGAGCGGTATCGGATTTTGAATATGAGCTGCAGATGGCGTCATTGAATCGCAAATTAAGCGATCAAATTGAAACGTTTTTCATGATGTCTAGCACGCAATATTCTTATCTAAGCTCCAGTATTGTCAAGCAAATTGCCCAGTTTGATGGACCGATTGGCGATTTAGTGCCGCCTGAGGTAGAGGTAGCTTTACGCGCAAAGTATAGCCGAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP034235|3479650:3486542|3479650_3480004_+|WP_155698875.1|DBSCAN-SWA MLNASSIERVYLACGNTDLRKSIDGLTVLVKEGFELDPFSSSLFVFCNRNRDKLKILHWDHNGFWLYYRRLERGTFRWPSSNTTPLVVGYRELRWLLDGLSLEQQQAHPSVTERTVI >NZ_CP034235|3479650:3486542|3485461_3486058_+|WP_155701219.1|DBSCAN-SWA MRVIAGTAKGRLLKAVPGTGTRPTTDKVKEAIFSMIGPYFDGGLGLDLFAGTGGLGIEALSRGVDRVIFVDMEKTSIQVVEDNLSALGFKEQAEVYRNEAQRALKVLGRRGLKFDLIFLDPPYKMKNADEILLEMQQMGMLHDQAVVLVEHESKHAYADEIGQLQVRKRTTYGETAITIYRFFDNISIGGKLDGTEHS >NZ_CP034235|3479650:3486542|3481965_3482292_+|WP_155701216.1|DBSCAN-SWA MSKLVAICPGHGPDTPGKRTPLFPDGTFMHENTFNRAVADKLEKHLQRCGFKTLVTTPRENDAPLKTRTDLANKAKADFYISIHANANTGIWGSAHEVDTFLPNTPRE >NZ_CP034235|3479650:3486542|3484063_3484237_-|WP_155701218.1|DBSCAN-SWA MADLWESWTILKEEVKSCTIITTDPNELMLDIQDRMPVILSIEDERKGWTRINQLRN >NZ_CP034235|3479650:3486542|3486038_3486542_+|WP_155701220.1|DBSCAN-SWA MGPNTHKFTIAVCPGSFDPVTNGHLDIIHRAAVVYDKVIIAVLKNASKSPLFSIEERKRMLEEVTKDLPNVEVDSFDDLLINYMNEKKAHVIIKGLRAVSDFEYELQMASLNRKLSDQIETFFMMSSTQYSYLSSSIVKQIAQFDGPIGDLVPPEVEVALRAKYSRK >NZ_CP034235|3479650:3486542|3480081_3481665_+|WP_155701215.1|transposase|DBSCAN-SWA METTTDTSHPTIEELQQQNIKLAKQNAELSAKLAWFEEQFRLSQKKQFGASSERTHPDQLDLFNEAESDANPAAEEPTLESVTYSRKKQSGQREAMVENLPVETIEYRLSEEEQTCSCCGGNLHEMSTETRQELKLIPAEIKLVKHVRFVYACRRCEVEATTTPVVTAPMPRPVYPGSLVSSSMMAYIMSQKYVESMPLYRQEQQFARLGVALSRQTLANWMIHGADTWLRLLVERMHEHLLQKDILHADETTLQVLREPGRSAESQSYLWLYRTGREGPPIIIYEYQPTRAGEHPRKFLTGFKGYLHVDGYSGYHKIMNVTLVGCWAHARRKFDEALQALPDPKRSTPVTASEGLDFCNRLFAIEREIKDFKPEERTTIRMARSRQILDAFSAWLRTQRSRVLPKSKLGEAIIYCQNQWEKLEAFMKDGRLEIDNNRSERSIKPFVIGRKNWMFSNTPRGAKASAMIYSMIETAKENGLNPMIYLTYLFEKLPNLEDPKDTKSLDMLLPWSQTLPLTCRVFNKKTT >NZ_CP034235|3479650:3486542|3482251_3483955_+|WP_162463132.1|DBSCAN-SWA MKWIHSYPTHPESKKAADIIHSFLIQGTTLADRRVQSADFHVLRETKMAAVLVECGFMDNLAEAKLLLTDAYRSECAIEIARGACNYLGVTFIVEEVKPKMDPKTPHIFTGEGLFFCLWRKLLSFVELLACDNKYSVNNALLGENILSLMLESIIINFMFICAPSIVYFLVWIKYGKRSSYPSKIVLFFFLTFSIILCLSFPFHYQDKFMLDFRQVPLVIGVIYGGPLVGGALLVVLVITRYIIVDEGFYYGFIISLCTYVSLVAMTRKHHLGKRSKLIRVLIISTAIIPILIILLGIWVLEFQYQETKIIILHRIIVFVAISATVYLVEFLIGHFKMQKELQEIEKMIVVSQLAASVSHEIRNPLTTVRGLLQVFRERELPLEKRWNLTEVALNELDTAINIISDYLTFAKPQVVKMTFLNISDELQQVTSVLTPYANMLQVTLACVVDTAQPILGDSQQFRQCLINLVKNCIEASPNGRVDIAVLSNREHVLIRIKDNGVGMADEQIQRLGIPYYSTKEKGTGLGMMVVFSIIKAMNGTIKVESEINRGSLFVISFPLTILLKTD |
7 | Leptospira_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3943698 : 4002706
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP034235|3943698:4002706|DBSCAN-SWA AATGCCTGTAAGTGATGAAGAGATCACAGAATGGCTGATGGAATTTATAGCGGGTGAGGGAGCTGCCTATGGCTACCGCAAGCTCACCGTGCTTCTTAAAAGACGCCACAAACTTGTGATTAATAAGAAGAAAGTCTATAGGCTATGCAAGCGTATGAACGTACTACGTCCGCAGCGTAAGCTGAAAAATAAACATCCAAGAAGACTGGTTAACAACCGTTTAATCACCGGCTCTAATCAATTGTGGGAAACGGATATCAAGTATGGTTGGATTGCTGGCGAGCACCGTTTCTTCTTCATAATGAGCATTATAGACGTGTTTGATCGTGCTATTATTTCGTATCATCTTGGCTTAACCTGTGAGGCTAAACACCTGGTTCAGATCACTCAGGAGGCCCTTATGAAGCGGCAATTATTTGGTAAGCCAATGGAAGAGAAACCTTTTATACGCTCCGATAATGGTCCACAATTCATCAGCAACCTGTTTGAAAATGCTTGCGATGACTTTCAATTGATTCATGAGCGAATTCCACCTAGAACACCAAATAAGAATGCTCACATTGAATCATTCCACTCTATCTTGGAAGCTGAATGTTATCAACGCCATGAATTTGAAACGTATCCACAGGTCTATGAGATCGTTTCCCAATTCATAAAAGATTACAATCAACAACGGATTCATGGGAGTATTTATGACCTATCACCCTATGAATATATCGAAGCATTAAAGAATAATCTCGTACAGCCTAAACATATTAAGGTGTAAAACGTGAAACATGGAGCAAATAAGAGCAATATCTAGCAATTCTATGAGATCATTTCGTTAAGAGGTGTAGCGTCCAGCATAAGGGTGTTCAGCCGCTTCTATTGGTGGATATTTTGGTACAAGTTATTCATTTGAAGTCAACTTTGATTACGGAAAGACAATTTGGGAAGCAAGAGAAGAGGGTGTTTTGGAACCAGGATTAACTCTACAAATGGACAATAGGGATATTAATGCATTCAGAGAAGCTCTAAGTAAGTGCGGCATTTTAGAATGGGACAAAGAGTATATCGATCCTGATACGATTGATGGAACACAATGGAGTCTGGACATCGAATTAGAAGATAGATCAATACATATCCATGGCAGCAATGCTTATCCAAAAGAATGGAAAAGATTCTGCAAAGTTATTCAAGTATTGACTGGTAAGCCGTTTTCTTAAGCAAAAGCAATGGAGGGTCTTGAAAATCAGAAAACTAGCAGTAAATAAAAATAATTGTAGTAAATAGGCATGAGCTACTTTTTTAAATTAACTTTGGTATTATCTTCATTTTATTGACTTTATAACATATGTACAAAATCCGAATTTTGTGTATATGTGTACTGTAAAGCAATCCTACCTGTTCGTAAAGAGGAATTTCCGGGTGCGTATCAAGATCCAGATACTGTGTAATTTATTTGTTTTGTACTGATACATAACTGTTAGTTCAAAATGGAATTATTAAAATTGAATGAGACTGTTTAATAAAAAAAAATAATAACCATAGGTTTAATTATTAATAAATTGGCTATAATGAGAGTATAGTAATATAAAATTTGCACCGGTAATTAATGAAACTGATTATTATAAGATCGTAAATTTTTATGAATTTTCTTTAATATAATACCTACTTATAAACTCATTCATATTAAACTTAACACTGTTTTTTATTGAATAGAATAATCGAAATTCATTTTTATGTCTTTCTCATTCGATTTCATTCAATAGTAAGTATAAGACCTTACAAAACCATTAGTTTAAAATTGCACAATACTTTCAATGACTGTTGAAATTGATACCTAAAATCACCTATAAATCTGAGGTCTAAACTCAATTAGATAAAACTTGACGAATCTACTTATGTAGATCGTCTTTTTCTATTTTCGAAACAAAGACAATCAAATATTAACAGGCTTTTATATACCCACATGTCCGCGGACAATTAATAAACGGAGCTGCTAATGTAACTTTTTTTTTTGTAAAGTTAGTACGAAATGAGACTTCGTTGTTTATCGGCCCAAGTTTGTTTATTCGGACATTTACAAAATATGTATAATTCAGTGCCCAGTAAAAAACTTCGATATTTGTTTACATAATATATATTATCGGACTCAAATGGTGAATTTAACTTTAACACCCTTTTAAACCATTTAATTACAAAATACTATTTATTACCTTTTAATCTTCTTTTATATAAATATGTATATACTTCCTCTTTCTATTGGTGACTCACAAATGTTAATTATATATCATCTAGTGTTCTTAAAAACTTTTATTGAAAGCTCGAAATGTGTGTTCAGTTAGATCAAACACGATCTCATTCAAAAAACCGAAATTTGATTTAATAGTGTCTATTGTCATAAATGTCTGACGCTACAATCAATTTATATAGTTTCAGCTTATAAATAACCGACTATAAGCTTACGCTGTTGCTATACTAATCATTATATATCTATACATATAATTAATGTTATTAACAATAAATTCATTATATATCCAATCCCGTGCTTGATCCACCATATTAAGCTTGGTAATTAAGCCGAAATTCTAATAAATCATTTACTATTTAATTGCATAATAAATGCTCATATAGTCATGTAAATACAGATTTTTGTAACACAAATGTGAGCACATAAAAATAAAAAAGCTTGATTTCTCAAGCTTTTCACGAAATATTTATGTCCCCAGATTTGTGTCGCTGGATAACCAATAAAATATTACCACTCTAAATATATTAAACCTATGAATTCATTGACATCTTAATTATTGATTGTTAAAGATAATTCTACGGGTTTGCCCCGCGGCTTCCTTATCACCAATCGGAATCGCTTATTGTTGACTTGCCAAGTAATTGTCAAGTTGCTCGAACGTGCCTTCGAACCCTTGAGCAACCATCGGCGACATCGCATCAAATGCAGCTTGCTCCTCATCGGATGCATTGAGCGGGCCGCCTTGCAGCGTCAGCACAGTTTTTCCTTCGCGCTCTTCAAGTGTCAGGATGTTAAGAATTTCAAGCGGCCAGTTAGGATTAAACGGTGCGCGGACAGTGTTTCCTGTCTCATCAGAGAACGATTGCACCCAAACGAGTTTCTCTGGCGGTTGGACTTCTTGGTAAACGAACTTGCCCCACATCTTGTGCTGCCCGTCTGGAGACTTCTGGCATCCGAGAAACATGCCACCTGACCGGACGTCCATCTTTGTCACTTCCAGCGAAAAGCCCTTGGGACCCCACCAGTTGCCAAAGTGCTTGGGTTCCGTCCACACCTGATACACAAGTTCGCGTGGCGCATTGAACTCACGTCTTAATAAAAGACCTTGTTGACTACTCATTCAAATTCCTCCTTGGATTTTTATGAATCTCTGACCATATTTAAGTTAATCGGAAAGGCGATCGAACCGTTTTCGCCCACGAATTGATTCCAGCTACAGTGTGCTGGAGGCTTGCTTCAGAAGTCCGGACAGCATGGCAAGATCCGGCGTGTCGCCTTCCCGCATTTTGATCCATTTCCGTTCGGCAGGTCCATCAAACCCTTTCGGAAAGTCGATGCCGTTCGCATTCATGACCATAAATGCAATGGCATCTTTGGAAGGTGAAATGACTGCTGCATAATGCCCATTTTTCAGAAAATGCGGCTTCTTGTACTGAATGCGTTCTTCGGCTTCCGGAATCGTCTCATGGACCATGTCCCGCAAGGTCGAACTGATGTCGGTCTGCCATTTGGGCAGGTTTTCGATATAGGCTGTAACTTCCTGATTCATACTTCTTTTCCCTCCAAATTGGATAGTATATTGCTTGTGTTTAAATATACCATTATGAGTATATTCCCGTCAAGGAATGTTGTAATTGATTCTTTTCACAGGAAAAGACAAGATGCTTTTGCCGGAAAACTTCCACTTGCTACCCATAACTCCGAACCGTCTCACGACGTGTTTGCTTGTAGCCTCTTTATTCGGCGTGCCTGCGTTGATCAGCCTTTTGCGTTCTCCTCCCTCATCATCTACGCGCGGTAGTCGGGTGGCGTGCCATCGGCGATCGCAGCTATTCCCGCGGTTCTGCGGCTATTTAATCATTCGTACTGATCAAAGTATTAGAATTTAAATAGATTTTTTTTCAATTACTTTTTTAAAAGAATTTAATTAATACGGTTAAATATATCCAATAAATAACCGAGGAAGCAAAGATTGATACAAAATTTTTTAACTTATTTTAGCAACAATAGAATCATTACCATTCATTCGACGTTGTTCAACATTGCAGAAACTTTCAACTCATTTTCTTTTGCATTAGTTAATGTGATTAAACATTAACTTTAGAACAGTGTGAAAACAATGCACCCGAATTCCCAAGGTACTATTATTGTTTTTATGTAATGGAGGAACATCTTCGGAAACTCACTTACTCAGCAAATCGCTATGTTCAACTACTAGCCCCTTGAGCAGCCCAAAGCGCATATTTCCGGGCTGCGAGGCACCGAAAGGAGTAAGGTATGAAGAGGCAGAGATACTCTCCTAGCCTATCTGATGGTATGTTGGGATGAATTTGTGACCACCTCCTCTCTTAAACTTTTTTAATTCTTGCACCACAACCAACTATCATTTGTTTTAAAAACATTACACAAAAAAAGACCCTCCTAAAGAGAGTCTAGATAGATTTCCTCTAAGTTGACATCAAAGTAATAACAAGTAATTCAAAAAGTACTAACGGAAGAATTACATTATTATACTGATATTGCTGATATAACTGATTAAATAATGGTCGTTGATAAGGAGGTTGGGCTACGCATAGATATAATAAACTACCTTCAATATTTACAATAATACCATCATAAGTCTGACCATCTAACATTTGAACTCTTACGGGTTGGTTAATATATGGCCTTGTTACTGTATGCAATTGATCTCTAATAGATTTTAAAGCTTGCACAGTGTTTGGGGTAGCCTGATATAAAACTTGTTGTTGGGCTGGATTTACACTCA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52 | Bacillus_phage(50.0%) | plate,transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
4407678 : 4457273
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP034235|4407678:4457273|DBSCAN-SWA 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73 | Bacteriophage(27.27%) | tail,terminase,portal,plate,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
5487415 : 5497094
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP034235|5487415:5497094|DBSCAN-SWA ACTAAGTGGTTTTCTTATTGAATACACGACAGGTCAGAGGCAAAGTCTGTGACCAGGGCAATAGCATATCTAAAGCTTTCGTGTCTTTTGGGTCTTCTAAATTGGGGAGTTTCTCAAATAGATAAGTCAGGTAGATCATTGGATTTAATCCATTCTCTTTAGCCGTTTCGATCATACTATAGATCATGGCACTTGCCTTTGCACCGCGAGGCGTATTGCTGAACATCCAGTTTTTTCGACCGATGACAAAGGGCTTAATCGAGCGTTCGCTTCGGTTGTTATCGATCTCTAAGCGACCGTCATTCATGAAAGTCTCGAGCTTCTCCCATTGGTTTTGGCAATAAATAATTGCCTCCCCGAGTTTACTCTTGGGTAAAACGCGAGATCGCTGTGTACGAAGCCATGCTGAAAAAGCATCCAGAATCGGGCGACTACGCGCCATTCGAATGGTTGTACGCTCTTCAGGTGTAGAATCCTTAATCTCTCGCTCAATAGCGAAGAGACGGTTGCAGAAATCTAAACCTTCACTGGCAGTTACAGGAGTGGATCGTTTAGGATCCGGTAATGCCTGCAGGGCCTCATCAAATTTGCGACGGGCGTGAGCCCAGCAACCGACTAAGGTCACATTCATTATCTTGTGGTATCCCGAGTAACCGTCAACATGCAGGTAACCTTTGAAACCCGTTAAAAACTTGCGCGGGTGTTCCCCTGCTCGTGTTGGCTGGTACTCATAGATAATGATAGGCGGACCTTCGCGCCCGGTACGATAAAGCCAAAGATAAGACTGGCTCTCTGCAGATCGACCTGGTTCTCGCAGCACCTGCAAGGTCGTCTCATCTGCATGTAGAATGTCCTTTTGAAGCAGATGCTCGTGCATGCGTTCAACCAGCAATCGCAACCAAGTATCTGCACCATGGATCATCCAATTGGCTAACGTCTGACGGGACAAGGCTACGCCAAGTCGTGCAAACTGCTGCTCCTGACGGTAAAGGGGCATGCTTTCTACATATTTTTGGCTCATGATGTAAGCCATCATCGAGGAAGAGACTAGGCTTCCCGGATAAACCGGACGTGGCATCGGTGCTGTAACCACAGGTGTCGTGGTCGCCTCGACCTCACAGCGACGGCAAGCATAAACGAAACGCACATGCTTCACGAGCTTAATTTCAGCAGGAATAAGCTTCAGTTCTTGGCGCGTTTCAGTGCTCATTTCATGCAAGTTTCCACCGCAGCATGAACAAGTTTGTTCTTCTTCGGACAAGCGGTACTCGATCGTCTCTACAGGTAAATTCTCAACCATGGCCTCTCGTTGTCCGCTTTGTTTCTTGCGGCTGTAGGTAACGGATTCCAACGTTGGTTCTTCTGCAGCGGGATTGGCATCCGACTCGGCTTCGTTAAAGAGATCCAATTGATCCGGATGCGTTCGTTCACTTGATGCACCGAATTGTTTCTTCTGGCTGAGACGGAATTGCTCCTCGAACCAAGCCAGCTTCGCAGACAGTTCGGCGTTTTGTTTGGCCAGTTTTATATTTTGTTGTTGTAACTCTTCTATTGTAGGGTGGGACGTATCCGTTGTGGTTTCCATATCTAACTTTTTCGACCTAGCTCACCGTTTTCCTTTCAACAATTTTGTCAAAATCTCGAACTTCCTGTTCCTTGAAGTTAGATCACGGTGCGTTCGGTAACGGAAGGATGCGCTTGCTGTTGCTCAAGTGAAAGTCCATCCAAAAGCCAGCGCAATTCACGGTAACCGACGACTAAAGGAGTTGTATTCGAAGAAGGCCAACGAAATGTACCGCGTTCCAGCCGACGATAATAGAGCCAAAAGCCATTGTGATCCCAATGCAAAATTTTGAGTTTGTCTCGATTGCGATTACAGAATACGAAGAGGCTGGATGAGAAGGGATCCAACTCAAAGCCTTCTTTAACCAGCACGGTGAGTCCATCAATCGATTTGCGCAGATCTGTATTGCCGCAAGCGAGGTAAACACGTTCGATGCTCGAAGCATTTAGCATGAAGTTAATGTGCGTACAAGGTCACGAAGTAGATTGGCGTTAAAGTCTGCTGGAACCTCAATACTTGCAGAGCCAACTCGAACAACGAGGTTGCCCGTTATATCTACTTTTTGTTTGTTGCTAGCGAGAGTAACCGGCAGCCATTGCGTGGAAGAAGATGAGGAGCTTGGACGTACGGAAATATTCATTTTCTTGAGCCAGTACTTCAATTGATGCATACTTTGCGTATGCGTTTTGCACCATGCTGACATTGTAAGTCCACTGGATTTAAAGTCTGCTATTCTTGTTATCCAATCCTGAGTTCGTTGATTGCTATCCATAAGAGAACCTCCTTCATTAAATCTGAGGAAGATTATCTCATAGAAAAATTCATATTTTTAGGTGGGGAGTATTTTACGCTTACTTATCTAATCCATTCTTATATTGTCTAGTATCTAGGATAGGCATATCAAGTATTACAATGTGTGCAGCAATATTCTGTGTAATGTCCTGCCACTCATGTTTAATCTCATCTGCGTTACGACCTAATCTATCTAATTCCTTCACAAACAATGTATCACCATTTCTAAGCATATGCTTCAAAGCTTGATACTTTGGTCTTATGAAGTCTTTACCGCTTTGCTTCTCTATGATTAGATTCCGTTCATTAATATTCAAATGCTTTAGTGCTTCAATTTGCCTATCTTCACTCTGATCTTTTGATGATACTCTTATATACCCGAACTCTTTTACTTCTCCCACTATTAAAACTCCTCTCCAAATTGATACCTACAATAGATCATTTTTATGTGTCAAAATATATACAACATTATTGAAATGTTTCTAATATATTTAGTATGCATTTTGACACATTAATTCCCCTTTAAACTAGCATCATTTCAATAAGTCAAAAGGTATACTTATTGCAATACTCAAAGGAATAATAATTAATATAAAAGAATAATTGTGATCAATTATAGATAGGTAAGCGTAAAATACTCCCCACCTAAAAATATGAATTTTTCTATGAGATAATCTTCCTCAGATTTAATGAAGGAGGTTCTCTTATGGATAGCAATCAACGAACTCAGGATTGGATAACAAGAATAGCAGACTTTAAATCCAGTGGACTTACAATGTCAGCATGGTGCAAAACGCATACGCAAAGTATGCATCAATTGAAGTACTGGCTCAAGAAAATGAATATTTCCGTACGTCCAAGCTCCTCATCTTCTTCCACGCAATGGCTGCCGGTTACTCTCGCTAGCAACAAACAAAAAGTAGATATAACGGGCAACCTCGTTGTTCGAGTTGGCTCTGCAAGTATTGAGGTTCCAGCAGACTTTAACGCCAATCTACTTCGTGACCTTGTACGCACATTAACTTCATGCTAAATGCTTCGAGCATCGAACGTGTTTACCTCGCTTGCGGCAATACAGATCTGCGCAAATCGATTGATGGACTCACCGTGCTGGTTAAAGAAGGCTTTGAGTTGGATCCCTTCTCATCCAGCCTCTTCGTATTCTGTAATCGCAATCGAGACAAACTCAAAATTTTGCATTGGGATCACAATGGCTTTTGGCTCTATTATCGTCGGCTGGAACGCGGTACATTTCGTTGGCCTTCTTCGAATACAACTCCTTTAGTCGTCGGTTACCGTGAATTGCGCTGGCTTTTGGATGGACTTTCACTTGAGCAACAGCAAGCGCATCCTTCCGTTACCGAACGCACCGTGATCTAACTTCAAGGAACAGGAAGTTCGAGATTTTGACAAAATTGTTGAAAGGAAAACGGTGAGCTAGGTCGAAAAAGTTAGATATGGAAACCACAACGGATACGTCCCACCCTACAATAGAAGAGTTACAACAACAAAATATAAAACTGGCCAAACAAAACGCCGAACTGTCTGCGAAGCTGGCTTGGTTCGAGGAGCAATTCCGTCTCAGCCAGAAGAAACAATTCGGTGCATCAAGTGAACGAACGCATCCGGATCAATTGGATCTCTTTAACGAAGCCGAGTCGGATGCCAATCCCGCTGCAGAAGAACCAACGTTGGAATCCGTTACCTACAGCCGCAAGAAACAAAGCGGACAACGAGAGGCCATGGTTGAGAATTTACCTGTAGAGACGATCGAGTACCGCTTGTCCGAAGAAGAACAAACTTGTTCATACTGCGGTGGAAACTTGCATGAAATGAGCACTGAAACGCGCCAAGAACTGAAGCTTATTCCTGCTGAAATTAAGCTCGTGAAGCATGTGCGTTTCGTTTATGCTTGCCGTCGCTGTGAGGTCGAGGCGACCACGACACCTGTGGTTACAGCACCGATGCCACGTCCGGTTTATCCGGGAAGCCTAGTCTCTTCCTCGATGATGGCTTACATCATGAGCCAAAAATATGTAGAAAGCATGCCCCTTTACCGTCAGGAGCAGCAGTTTGCACGACTTGGCGTAGCCTTGTCCCGTCAGACGTTAGCCAATTGGATGATCCATGGTGCAGATACTTGGTTGCGATTGCTGGTTGAACGCATGCACGAGCATCTGCTTCAAAAGGACATTCTACATGCAGATGAGACGACCTTGCAGGTGCTGCGAGAACCAGGTCGATCTGCAGAGAGCCAGTCTTATCTTTGGCTTTATCGTACCGGGCGCGAAGGTCCGCCTATCATTATCTATGAGTACCAGCCAACACGAGCAGGGGAACACCCGCGCAAGTTTTTAACGGGTTTCAAAGGTTACCTGCATGTTGACGGTTACTCGGGATACCACAAGATAATGAATGTGACCTTAGTCGGTTGCTGGGCTCACGCCCGTCGCAAATTTGATGAGGCCCTGCAGGCATTACCGGATCCTAAACGATCCACTCCTGTAACTGCCAGTGAAGGTTTAGATTTCTGCAACCGTCTCTTCGCTATTGAGCGAGAGATTAAGGATTCTACACCTGAAGAGCGTACAACCATTCGAATGGCGCGTAGTCGCCCGATTCTGGATGCTTTTTCAGCATGGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP034235|5487415:5497094|5495489_5497094_-|WP_155703029.1|DBSCAN-SWA MDESITALYVRVSTTKDSQKDSPEHQKGLCEEKARILGLQILYTYEDRDTGTSIVARTEIQRLITEAKQGKFRTIIFASLSRFSRDTLDSLNLKRILVDALHIRVISIEEGYDSRIDNDELKFQIISAVNQKLSEQISLSSKRGIRQSAMKGNFTGSFAAYGYKKTIIGERKTIVPDEKTKGIVDLIYDLYINHNMGDKSIVNYLNEKKIAAYKGGVWGLSSIQRILTNQVYTGRNIFCKYETTKVYNDINNLSDRSKKQVQRNKSQWESSNEKTHEPIIADELFQKVQAMRLFRGGGKRGGIRASKNVFAGIIFCTHCGCAMVSMKSTSGRTKSAATEYRYLVCSKRRRQGATGCDNSFWLPYKPFRDELINNISEILGRQTSLLNLFEQNKGLILIDADQSMKYITDTEKKIDKYRELLFETRKLLMLGEMDEAQYSFEKQRYEKEIKGLEQHLGELNVKKQKKNDIEDLYEEVRDALDDLISLNYEEEDEFMELKSILVKLIARISVDWEGNIEVKTTFGINLSEIPSLKI >NZ_CP034235|5487415:5497094|5489076_5489430_-|WP_155698875.1|DBSCAN-SWA MLNASSIERVYLACGNTDLRKSIDGLTVLVKEGFELDPFSSSLFVFCNRNRDKLKILHWDHNGFWLYYRRLERGTFRWPSSNTTPLVVGYRELRWLLDGLSLEQQQAHPSVTERTVI >NZ_CP034235|5487415:5497094|5487415_5488999_-|WP_155703026.1|transposase|DBSCAN-SWA METTTDTSHPTIEELQQQNIKLAKQNAELSAKLAWFEEQFRLSQKKQFGASSERTHPDQLDLFNEAESDANPAAEEPTLESVTYSRKKQSGQREAMVENLPVETIEYRLSEEEQTCSCCGGNLHEMSTETRQELKLIPAEIKLVKHVRFVYACRRCEVEATTTPVVTAPMPRPVYPGSLVSSSMMAYIMSQKYVESMPLYRQEQQFARLGVALSRQTLANWMIHGADTWLRLLVERMHEHLLQKDILHADETTLQVLREPGRSAESQSYLWLYRTGREGPPIIIYEYQPTRAGEHPRKFLTGFKGYLHVDGYSGYHKIMNVTLVGCWAHARRKFDEALQALPDPKRSTPVTASEGLDFCNRLFAIEREIKDSTPEERTTIRMARSRPILDAFSAWLRTQRSRVLPKSKLGEAIIYCQNQWEKLETFMNDGRLEIDNNRSERSIKPFVIGRKNWMFSNTPRGAKASAMIYSMIETAKENGLNPMIYLTYLFEKLPNLEDPKDTKALDMLLPWSQTLPLTCRVFNKKTT >NZ_CP034235|5487415:5497094|5489423_5489750_-|WP_155698876.1|DBSCAN-SWA MDSNQRTQDWITRIADFKSSGLTMSAWCKTHTQSMHQLKYWLKKMNISVRPSSSSSSTQWLPVTLASNKQKVDITGNLVVRVGSASIEVPADFNANLLRDLVRTLTSC >NZ_CP034235|5487415:5497094|5493591_5495286_-|WP_155703028.1|DBSCAN-SWA MKYYQDLDKNADVRVMYLPRRNFYNLKDIKTKKILVVHRNLKIFEEMMNLYFENRKKDQLIFENYKVAYGMGTYYEIYLHGKLVWEGKPRLNAVLNAHKISRENNVAYDGSIDFNHVDEGYMNNVDDGIENANLVIALKGNNLYLTPHIGINGISIAKSTQHSHLGHLMIDVKKFHSSMENMYIGTSLPLDMLLRSINAEEYSEALRILLNDITDLSEKDGWGLTIMVHIVRLLPDSLPLLIAALIKGADPIQPYQDIFEESTAFLSLSMEKKLAQKYLPFFIPYVIGREYFTQNGGEGLFLCIAHLNKSIVNLFVEAGFNFKERNFWGNDARAYATSEDTLNYFTKLGLKSSNFRDQVYQWESDPSQITEFEQVFNSLQQSIEEEDEATTLRIIKLFKFLGEIDRLKNYKEKLFGINIFEFALQNTPFIFLIMLDEVGMTVIEAEDTKLIASNYFETVIQMTYDGSLEQCKQLFENGYEYRNTENSRCFFTIQYERDKFSKEKLLFLKEIGCKPLVTHMIGEEKQVEDFDQFYKRMIDIKLSFHNKLKKYYEDYREIFFNDLT >NZ_CP034235|5487415:5497094|5490796_5491150_+|WP_155698875.1|DBSCAN-SWA MLNASSIERVYLACGNTDLRKSIDGLTVLVKEGFELDPFSSSLFVFCNRNRDKLKILHWDHNGFWLYYRRLERGTFRWPSSNTTPLVVGYRELRWLLDGLSLEQQQAHPSVTERTVI >NZ_CP034235|5487415:5497094|5490476_5490803_+|WP_155698876.1|DBSCAN-SWA MDSNQRTQDWITRIADFKSSGLTMSAWCKTHTQSMHQLKYWLKKMNISVRPSSSSSSTQWLPVTLASNKQKVDITGNLVVRVGSASIEVPADFNANLLRDLVRTLTSC >NZ_CP034235|5487415:5497094|5489829_5490171_-|WP_155703027.1|DBSCAN-SWA MGEVKEFGYIRVSSKDQSEDRQIEALKHLNINERNLIIEKQSGKDFIRPKYQALKHMLRNGDTLFVKELDRLGRNADEIKHEWQDITQNIAAHIVILDMPILDTRQYKNGLDK >NZ_CP034235|5487415:5497094|5491227_5492811_+|WP_155698874.1|transposase|DBSCAN-SWA METTTDTSHPTIEELQQQNIKLAKQNAELSAKLAWFEEQFRLSQKKQFGASSERTHPDQLDLFNEAESDANPAAEEPTLESVTYSRKKQSGQREAMVENLPVETIEYRLSEEEQTCSYCGGNLHEMSTETRQELKLIPAEIKLVKHVRFVYACRRCEVEATTTPVVTAPMPRPVYPGSLVSSSMMAYIMSQKYVESMPLYRQEQQFARLGVALSRQTLANWMIHGADTWLRLLVERMHEHLLQKDILHADETTLQVLREPGRSAESQSYLWLYRTGREGPPIIIYEYQPTRAGEHPRKFLTGFKGYLHVDGYSGYHKIMNVTLVGCWAHARRKFDEALQALPDPKRSTPVTASEGLDFCNRLFAIEREIKDSTPEERTTIRMARSRPILDAFSAWLRTQRSRVLPKSKLGEAIIYCQNQWEKLETFMNDGRLEIDNNRSERSIKPFVIGRKNWMFSNTPRGAKASAMIYSMIETAKENGLNPMIYLTYLFEKLPNLEDPKDTKALDMLLPWSQTLPLTCRVFNKKTT |
9 | Leptospira_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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