Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712 | Staphylococcus aureus strain Tokyo12480 | 14 crisprs | RT,cas3,casR,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 7 | 3 | 12 | 2 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_1 | 638122-638230 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_1
>1.1|638161|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_1
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_1 >merge|NZ_AP019712|1|638122-638230|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTTAAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA >NZ_AP019712|1|1|638122-638230|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA
>NZ_AP019712.1|WP_000901759.1|637316_637952_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLTLKGIGSETADVLLVYIFERIEFIPDSYTRKIYNKLGYENTKSYDQLKKVITLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_AP019712.1|WP_155977980.1|635385_637047_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNILLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQISNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_AP019712.1|WP_070974226.1|634972_635389_+|DUF1934-domain-containing-protein MDKKVSIYTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_AP019712.1|WP_001200750.1|633686_634697_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADVIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_AP019712.1|WP_001788287.1|632666_633188_+|YwhD-family-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_AP019712.1|WP_070974225.1|631343_632639_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQFIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRRVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAAGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGSIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPKEMVAKIDDKTIREAIENLINELN >NZ_AP019712.1|WP_000477505.1|630827_631304_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYQPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_AP019712.1|WP_155977978.1|630122_630659_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTPETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_AP019712.1|WP_155977976.1|628974_629913_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKANGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >NZ_AP019712.1|WP_155977974.1|627891_628521_+|DUF443-family-protein MLCESRVINKNPKYRIIKYNDEYLMVNIINNWLVLFIPLLNWLTPKRYIKISQEELESLNTFKPAKNNAFWPALGSSVLFSVTFRKYMPLFNVRLEKTIVIAIFFVVFLGILLFYLNLNRRLALSVFTMNKEKSQKMILLPNLKHFFFIIFAYFYFGGFSFFTLYALITIDVQNIIIFICWGAITMFFFFINIVPIGIKKAHVILLKKS >NZ_AP019712.1|WP_029550269.1|638281_639169_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQSSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHEKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_AP019712.1|WP_010922824.1|639319_640270_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_AP019712.1|WP_000365352.1|640324_641044_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKIDNKGENYGSIY >NZ_AP019712.1|WP_000362963.1|641027_641828_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_AP019712.1|WP_000735556.1|641963_642470_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNENGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_AP019712.1|WP_001222140.1|642631_643348_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFILNFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQTFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_AP019712.1|WP_001045424.1|643516_644305_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLESHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >NZ_AP019712.1|WP_001018677.1|644555_644930_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_AP019712.1|WP_089535955.1|645877_646807_-|DMT-family-transporter MLILYFIGVIVGMFIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFNYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIVTVAGQIIMGVIIDTFGLFGATVHEFNLIKAIGVLLLIVGIITMNQINKCNLLLTNQKHLIFWLLLGFTFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_AP019712.1|WP_000169038.1|646996_647221_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNIVTEQVARDSMNALVDLNILKSNSGAITKVHSAQIIDKTTTVLFEAKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_2 | 702755-702866 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_2
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_2
>2.1|702798|26|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_2
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_2 >merge|NZ_AP019712|2|702755-702866|CRISPRCasFinder GCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NZ_AP019712|2|2|702755-702866|CRISPRCasFinder GCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAAC GCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NZ_AP019712.1|WP_000687413.1|701816_702683_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISKEQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMTSFVEEPKA >NZ_AP019712.1|WP_000865619.1|701055_701700_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKIHQKPQNKTNFEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NZ_AP019712.1|WP_000833486.1|700230_700704_+|cupin-domain-containing-protein MKSAEQWIDELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGRRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGEYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIEISNTYSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELITQYPHLKSVIEKYALK >NZ_AP019712.1|WP_000532965.1|699514_700231_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKSVDDILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEADQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NZ_AP019712.1|WP_001805574.1|698965_699325_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKYCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNDDDISKFNALFEDVEQFLNI >NZ_AP019712.1|WP_070974236.1|696669_698820_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPLNDADIRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNANQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKFNKSIMLNPEPLVGGMAQEVKDVILNYIDHYKNHLTDVIHIDEDKFEIPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGLFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFTIIKTIIESDLKIAFNINDIETTYYVEEAFMNVIRQLSPNEINHHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFDKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIAQEKLIFLNVENHKLLNNKERDLSNSAPLIYKTLSALYHNFDGFGLNIFDNHQTFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDENSGNINHLISKELRDKYEWNPSLLSKIDNYLKPAIEIKEHNFSNNSLNINVTFNALYIIKIGKK >NZ_AP019712.1|WP_000081602.1|695343_695988_+|Bax-inhibitor-1-family-protein MSQNTNHSYYHQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NZ_AP019712.1|WP_000731644.1|694185_694983_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NZ_AP019712.1|WP_000120368.1|692596_693604_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF >NZ_AP019712.1|WP_000491755.1|691963_692581_+|DUF47-domain-containing-protein MFSKKKDKFMVQLEEMVFNLDRAAIEFGKMDFNTHLDLKAYSDNIKTYESHGDELVHQVITDLNQTFITPIEREDILSLCDAIDDVLDAIEETAAMFEMYSIEYTDEYMAEFVDNIQKAVAEMKLAVGLLVDKKLSHMRIHSINIKEFETNCDGILRQSIKHIFNSETDPITLIKIKDIYESMEEIADKCQIVANNFETIIMKNS >NZ_AP019712.1|WP_155977988.1|702883_704104_+|MFS-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAASIMLGMILVFFTKNQKITKEDVIST >NZ_AP019712.1|WP_070974237.1|704100_704589_+|DUF456-domain-containing-protein MTIVLWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWIGFLIYQFGFHNQHLSWLFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NZ_AP019712.1|WP_000842865.1|704687_705377_-|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKSGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >NZ_AP019712.1|WP_029550281.1|705503_705947_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIANIHETLLSQAESNYKCTKLSIALRYEMICSRLKHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKRISSTIHKSNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NZ_AP019712.1|WP_155977990.1|706014_706410_+|hypothetical-protein MKKLIISIMSVMILLAGCGKSEEKATLEKDIDKLEKENKELKDKKEKLKQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKDDKKDDKKDEDKNKDKDKDKEASQDKQSKDQTKSSDKDNHKKPTSTDKDQKANDKHQS >NZ_AP019712.1|WP_000545113.1|706547_706847_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGKELENITGRTITDSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRTRLKEVPVHVELISYISKSK >NZ_AP019712.1|WP_000638622.1|706926_707469_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNANYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDSVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSDYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGAKATLKLAEQHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NZ_AP019712.1|WP_000820892.1|707563_708130_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYVQKAYDLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >NZ_AP019712.1|WP_000148823.1|708131_708590_-|YaiI/YqxD-family-protein MTHIIIDGDACPVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVITQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYMNAQIRKQGGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLRVIHRIKELD >NZ_AP019712.1|WP_000358503.1|708592_709276_-|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNEIQRIKDMKNSQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_3 | 755468-755552 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_3
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_3
>3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder GCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_3
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_3 >merge|NZ_AP019712|3|755468-755552|CRISPRCasFinder TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGG >NZ_AP019712|3|3|755468-755552|CRISPRCasFinder TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGG GCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAA TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGG
>NZ_AP019712.1|WP_000197271.1|754843_755386_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_AP019712.1|WP_000663034.1|753626_754685_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFIPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_AP019712.1|WP_000180989.1|751872_753387_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYDQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKEKGLIK >NZ_AP019712.1|WP_155978011.1|750902_751880_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLDMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIERKDIFKYLSQKKEVAQHD >NZ_AP019712.1|WP_029550202.1|748900_750682_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNLLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIDSVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRALFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NZ_AP019712.1|WP_155978009.1|747005_748889_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYVKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYDQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKERLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NZ_AP019712.1|WP_000098285.1|744794_746735_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NZ_AP019712.1|WP_000022329.1|743316_744321_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEQMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NZ_AP019712.1|WP_000708692.1|742622_743333_+|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >NZ_AP019712.1|WP_001807803.1|742329_742536_+|hypothetical-protein MIIVYIVLLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFIIVYALIRELMPFVVRAMDLMYHQ >NZ_AP019712.1|WP_155978013.1|755971_756889_-|YegS/Rv2252/BmrU-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKVKDYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTYDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_AP019712.1|WP_031788440.1|756979_757081_+|hypothetical-protein MVITEIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILIS >NZ_AP019712.1|WP_072511937.1|757158_758664_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALVGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVILAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_AP019712.1|WP_000930016.1|759003_759504_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEQMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_AP019712.1|WP_070004807.1|759523_760390_-|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQTQMLYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >NZ_AP019712.1|WP_000692521.1|761191_761590_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_AP019712.1|WP_000855505.1|761552_763658_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_AP019712.1|WP_000562498.1|763777_764749_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_AP019712.1|WP_155978015.1|765118_766090_+|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSINDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_AP019712.1|WP_070974043.1|766076_767033_+|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit MRNNNKKIMLLIAVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVIILVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_4 | 801766-801848 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_4
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_4
>4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_4
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_4 >merge|NZ_AP019712|4|801766-801848|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAA >NZ_AP019712|4|4|801766-801848|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAA TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAA
>NZ_AP019712.1|WP_000134963.1|800413_801349_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_AP019712.1|WP_000057561.1|798907_800347_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVIENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_AP019712.1|WP_001224800.1|798414_798900_+|acetyltransferase MRKFLSKTYHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_AP019712.1|WP_000513301.1|797567_798407_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_AP019712.1|WP_000958224.1|796629_797562_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_AP019712.1|WP_072511933.1|793160_796007_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEERTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYNNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKINRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDN >NZ_AP019712.1|WP_072511934.1|791167_793153_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEKKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_AP019712.1|WP_000638419.1|790662_790899_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_AP019712.1|WP_000538141.1|790015_790666_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_AP019712.1|WP_070974039.1|789002_789842_+|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKTVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKEVVVKQTPKQTVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_AP019712.1|WP_000369722.1|802116_803028_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_AP019712.1|WP_001248939.1|803024_804020_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_AP019712.1|WP_000006551.1|804128_805073_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_AP019712.1|WP_001049165.1|805642_806230_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_AP019712.1|WP_155978372.1|806779_808066_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MYRESPSMMELVVREHNIQKAIKKVKKNKGAPGIDGMKVSEIQGHFAQYFPEIKQKLLEGTYKPQAVKKVEIPKANGKKRVLGIPVVRDRVIQQAIKQVIEPSIDRTFSKHSHGFRPNRSTGTALKECASYYEAGYTIAVDCDLKQCFDNINHDKLMYLFERHIKDKAVSTFIRRSLQVGAIDLSGEVAERKIGAPQGGVISPLLCNIYLHELDKELEKRNHRFVRYADDFVIFVKTKRAGGRVMDSIKTFIHKTLKLEVNNDKSKVGSPTRLKFLSCLMSKVNGTYRFRPTTEAKRNLKRNLKWLTRRSRPGSFQDIITEINRVTRGWINYFGKGFIKRFLQELEPWLNRRIRQLILKRWKKTKTKYKMLRKYGLDHDSAMRIASSRKKYWRLSSTHEVHRALTTKRLHKWGLLSLTQLAETAYARY >NZ_AP019712.1|WP_155978025.1|808282_809917_+|oxaloacetate-decarboxylating-malate-dehydrogenase MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLKDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLKEVNENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMLKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNAVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASKAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPKYKSYI >NZ_AP019712.1|WP_000816293.1|810123_811026_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQKIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_AP019712.1|WP_000070836.1|811728_812358_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQNQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_AP019712.1|WP_000654030.1|813358_814372_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_AP019712.1|WP_000279414.1|814424_815435_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_5 | 812714-812872 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_5
|
2 spacers
spacers of NZ_AP019712_5
>5.1|812763|8|NZ_AP019712|PILER-CR TTTCCGCC >5.2|812820|8|NZ_AP019712|PILER-CR TTTCCGCC |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_5
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_5 >merge|NZ_AP019712|5|812714-812872|PILER-CR TCTATGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGAC >NZ_AP019712|5|1|812714-812872|PILER-CR TCTATGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTC CGCCAGCT TCTATGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTC CGCCAGCT TCTATGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGAC
>NZ_AP019712.1|WP_000070836.1|811728_812358_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQNQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_AP019712.1|WP_000816293.1|810123_811026_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQKIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_AP019712.1|WP_155978025.1|808282_809917_+|oxaloacetate-decarboxylating-malate-dehydrogenase MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLKDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLKEVNENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMLKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNAVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASKAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPKYKSYI >NZ_AP019712.1|WP_155978372.1|806779_808066_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MYRESPSMMELVVREHNIQKAIKKVKKNKGAPGIDGMKVSEIQGHFAQYFPEIKQKLLEGTYKPQAVKKVEIPKANGKKRVLGIPVVRDRVIQQAIKQVIEPSIDRTFSKHSHGFRPNRSTGTALKECASYYEAGYTIAVDCDLKQCFDNINHDKLMYLFERHIKDKAVSTFIRRSLQVGAIDLSGEVAERKIGAPQGGVISPLLCNIYLHELDKELEKRNHRFVRYADDFVIFVKTKRAGGRVMDSIKTFIHKTLKLEVNNDKSKVGSPTRLKFLSCLMSKVNGTYRFRPTTEAKRNLKRNLKWLTRRSRPGSFQDIITEINRVTRGWINYFGKGFIKRFLQELEPWLNRRIRQLILKRWKKTKTKYKMLRKYGLDHDSAMRIASSRKKYWRLSSTHEVHRALTTKRLHKWGLLSLTQLAETAYARY >NZ_AP019712.1|WP_001049165.1|805642_806230_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_AP019712.1|WP_000006551.1|804128_805073_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_AP019712.1|WP_001248939.1|803024_804020_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_AP019712.1|WP_000369722.1|802116_803028_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_AP019712.1|WP_000134963.1|800413_801349_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_AP019712.1|WP_000057561.1|798907_800347_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVIENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_AP019712.1|WP_000654030.1|813358_814372_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_AP019712.1|WP_000279414.1|814424_815435_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_AP019712.1|WP_001074749.1|815573_816764_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_AP019712.1|WP_001260092.1|816885_817647_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEEQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_AP019712.1|WP_155978026.1|817649_819167_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGEPLIKH >NZ_AP019712.1|WP_001121760.1|819296_820601_+|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_AP019712.1|WP_000785252.1|820939_821398_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_AP019712.1|WP_000556760.1|821464_821698_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_AP019712.1|WP_001165970.1|821826_822567_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILQSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGAIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMHHFKPTETLKELSEALDTIKDQVDEVFDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYEHVDSDEKDIKWYSQSGHVITIDKEKEQVFDDIYQFLESLDWSE >NZ_AP019712.1|WP_155978028.1|822600_824973_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERSKTDRYQKKHSSKGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDKDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSQARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLHEAEATPDNIEDSEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEGSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDDSGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPTIREQYNEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRMYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFQGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGHKKKGRQRKGKNERKNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_6 | 874610-874690 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_6
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_6
>6.1|874635|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder AAGAACCATTACATAATAAAGCATAAGTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_6
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_6 >merge|NZ_AP019712|6|874610-874690|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCAAGAACCATTACATAATAAAGCATAAGTGATTCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC >NZ_AP019712|6|5|874610-874690|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCC AAGAACCATTACATAATAAAGCATAAGTGAT TCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC
>NZ_AP019712.1|WP_031765336.1|872731_873289_-|DUF4888-domain-containing-protein MNKKLLTKTLIASALVLTTVGSGFHSSSNYNGINNVAKAAETTDGQLWKNVRDALKEANIIDNTANETVGVTYNLNNGGEHSITGTANLDKLSTSNNSTVNTDSVNTVDITRVNPNGKTIDANEAWKKLTDKLKEKNIVKNGDTVTIHSKDENDPPISAKVGSDYNGNKRFMLNQRDITKITITK >NZ_AP019712.1|WP_154275548.1|872220_872376_+|hypothetical-protein MKENDLAHGDFRLWLEKIGLSKSSANRFMKIAENPELNVPPVGHMGASVLY >NZ_AP019712.1|WP_070058952.1|870165_871260_+|hypothetical-protein MAKRKVKFKIFKISNLITDTIKNSTTYNYYNHRIIDFILLNILSHKKKDRKKTYNYKTETVYLLNYNPYFNSEYSHGQIVTIRHGKEQRNVNVEDLSLAGLIKTNQGIEYTIDFFINKQKGYIFVEQDENYVLTISKLRTLLRLFTKEARQYVKYLNTLEGNYLIEDKPIIDIEIIKPLNIKEQIKLLTSVKSVSLFDKDQTQDRDIEDIDFDNESNDNNFFKLASETISEYDIGDYDTILKLTNFKKRRFAGDLEKFINYVIESERFGGYSIEGTDAYGVNRVFTPDMLTRDIQFEDEADSNGIVNINKKIDFIQKYLSDNSDNMPKTVIRTEPDYKDIKNFLKEFLKFKGDCTEVDKKEKEE >NZ_AP019712.1|WP_155978052.1|869380_869950_+|terminase-small-subunit MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELVEVPIKPSDRLKARDMLGKYYKLFTDKHDINGDVPIFINIGEWDGDDEELDKTVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >NZ_AP019712.1|WP_025173847.1|869171_869384_+|hypothetical-protein MADDNIDDHIVKNHLEMIVDRVATDKEFYIFDSLIQGRSYQDISGVLDCSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE >NZ_AP019712.1|WP_000771367.1|868512_869040_+|spore-coat-protein MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNMALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNAYHQSSHVKVV >NZ_AP019712.1|WP_000448773.1|868243_868462_+|hypothetical-protein METKYELNNTKKVANAFGLNEEDTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQLGTTLQNLAKQNRIIK >NZ_AP019712.1|WP_000846285.1|867647_868226_+|hypothetical-protein MKTESYFKEYNQFVIDQQKAIQELKQERNALESKIKIDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >NZ_AP019712.1|WP_001190615.1|867294_867636_+|hypothetical-protein MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >NZ_AP019712.1|WP_001047696.1|866117_866759_+|hypothetical-protein MNLETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMAYVMMNSKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKHLSISDMMASHLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPEPELVEGLKLVTEFIQDENATQEDYKALEHKLTELKSSYYSLNK >NZ_AP019712.1|WP_000752917.1|874832_875027_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_AP019712.1|WP_001183849.1|875260_876112_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEFVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_AP019712.1|WP_000168845.1|876439_877201_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_AP019712.1|WP_000205572.1|877298_878606_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_AP019712.1|WP_072435157.1|878711_879962_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFEAIHKYEQELTIYAYEQMSTIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >NZ_AP019712.1|WP_001010508.1|879951_880416_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >NZ_AP019712.1|WP_001074405.1|880566_881964_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >NZ_AP019712.1|WP_000274033.1|882292_882607_-|hypothetical-protein MYFVLAIFTIISASVSLGYSIQACASSHNINAYYALSRSLPLFLLAIFSLVIHSAIFLITISIAMILVQFLDAIVGYKSNDVFKTYGPLATSVVNLILLIVFLF >NZ_AP019712.1|WP_000582326.1|882975_884016_+|HlyC/CorC-family-transporter MIIAIIILIFISFFFSGSETALTAANKTKFKTEADKGDKKAKGIVKLLEKPSEFITTILIGNNVANILLPTLVTIMALRWGISVGIASAVLTVVIILISEVIPKSVAATFPDKITRLVYPIINICVIVFRPITLLLNKLTDSINRSLSKGQPQEHQFSKEEFKTMLAIAGHEGALNEIETSRLEGVINFENLKVKDVDTTPRINVTAFASNATYEEVYETVMNKPYTRYPVYEGDIDNIIGVFHSKYLLAWSNKKEDQITNYSAKPLFVNEHNKAEWVLRKMTISRKHLAIVLDEFGGTEAIVSHEDLIEELLGMEIEDEMDKKEKEKLSQQQIQFQQRKNRNVSI >NZ_AP019712.1|WP_000267243.1|884029_885097_+|nitronate-monooxygenase MWNKNRLTQMLSIEYPIIQAGMAGSTTPKLVASVSNSGGLGTIGAGYFNTQQLEDEIDYVRQLTSNSFGVNVFVPSQQSYTSSQIENMNAWLKPYRRALHLEEPVVKITEEQQFKCHIDTIIKKQVPVCCFTFGIPNESIIKRLKEANIKLIGTATSVDEAIANEKAGMDAIVAQGSEAGGHRGSFLKPKNQLPMVGTISLVPQIVDVVSIPVIAAGGIMDGRGVLASIVLGAEGVQMGTAFLTSQDSNASELLRDAIINSKETDTVVTKAFSGKLARGINNRFIEEMSQYEGDIPDYPIQNELTSSIRKAAANIGDKELTHMWSGQSPRLATTHPANTIMSNIINQINQIMQYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_7 | 1136791-1136871 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_7
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_7
>7.1|1136815|33|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder GACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAG |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_7
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_7 >merge|NZ_AP019712|7|1136791-1136871|CRISPRCasFinder AGAATTTCGAATAGAAATTCTACAGACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAATAGAAATTCTACA >NZ_AP019712|7|6|1136791-1136871|CRISPRCasFinder AGAATTTCGAATAGAAATTCTACA GACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAG AGAATTTCGAATAGAAATTCTACA
>NZ_AP019712.1|WP_075773743.1|1136368_1136596_+|hypothetical-protein MLIEERGLKMTELNEIINAIQSLFESQSGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKIEDARFRTIIKLYSYYTSLKERS >NZ_AP019712.1|WP_072511819.1|1134638_1135598_-|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKILVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDSGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_AP019712.1|WP_000231333.1|1133952_1134186_-|hypothetical-protein MVFKDWEINVVYSGKHEVVTNENSLFVIDEDYDVAIAINYLDNKLKVSHVNYGSEFTIDASNKVLELMIHNPNIDEN >NZ_AP019712.1|WP_001032820.1|1133157_1133343_-|hypothetical-protein MNKHINKKTTKHLEDYKKVQQRNSEETNRGCLKSAAMLIVLFLFIIFGIVACSTHVNFFFQ >NZ_AP019712.1|WP_155978372.1|1131595_1132882_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MYRESPSMMELVVREHNIQKAIKKVKKNKGAPGIDGMKVSEIQGHFAQYFPEIKQKLLEGTYKPQAVKKVEIPKANGKKRVLGIPVVRDRVIQQAIKQVIEPSIDRTFSKHSHGFRPNRSTGTALKECASYYEAGYTIAVDCDLKQCFDNINHDKLMYLFERHIKDKAVSTFIRRSLQVGAIDLSGEVAERKIGAPQGGVISPLLCNIYLHELDKELEKRNHRFVRYADDFVIFVKTKRAGGRVMDSIKTFIHKTLKLEVNNDKSKVGSPTRLKFLSCLMSKVNGTYRFRPTTEAKRNLKRNLKWLTRRSRPGSFQDIITEINRVTRGWINYFGKGFIKRFLQELEPWLNRRIRQLILKRWKKTKTKYKMLRKYGLDHDSAMRIASSRKKYWRLSSTHEVHRALTTKRLHKWGLLSLTQLAETAYARY >NZ_AP019712.1|WP_089535844.1|1130689_1131040_+|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MKIKKYLVAGTLAVLLSTTAVSTLDGNKADASSHGNYLTQSEYHDKKIAEELKSLLDQSNVYDLAAGSLNRYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFKSMAEAKVGLENIYKEIDEIINR >NZ_AP019712.1|WP_089535845.1|1130040_1130538_+|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLAIASIGITTTTLASTADASEGYGPREKKPISINNNIVEYNDGTYKYQSRPKFNTTPKYIKFRHDYNIVEYNDGTFEYGARPQFNKPAAKTEATIKKEQKLIQAQNIVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYNVKKMILQERIDQVLKQGLVR >NZ_AP019712.1|WP_000584395.1|1129276_1129783_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNKKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_AP019712.1|WP_155978087.1|1128198_1128603_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKVIIASTVIATGLLTHSTDAKAFFSYEWKGLEIAKKLADEAKQEEERIDKLMKEADKNQKPYKGETVNDLYLIVKKLSKGDVKKAVVKIKDGGSNGYYTFDLTHPLEKNRKNIKVVADGEIESITWDQ >NZ_AP019712.1|WP_000739210.1|1127520_1127850_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_AP019712.1|WP_155978088.1|1137054_1137771_-|superantigen-like-protein-SSL12 MRKRIMKKLIFMTTLLLLGTTATQTPNSPLNVSTDAKAYHIGQDETNINELIKYYTQLPLTFSNRWLYQYDDGNIYVEFKRYSWSAHIRLWGAESWGNVNQLRDRYVDVFGLKDEDTSQLWWVYRDTFTGGVTPAASPSDKPYSLFVQYKDKLQTIIGAHKMYQGNKPILTLKEIDFRARETLIKNKILYHENRNKGKLKITGGGNDFTIDLSKRLHSDLANVYVKNPQKITVEVLID >NZ_AP019712.1|WP_155978089.1|1137879_1138605_-|superantigen-like-protein-SSL13 MKNNLTKKIILSIALTMIGTATSQSPHSPISMSSEAKAYNISESETNVNELTKYYTQRHLTFSNKWLWQKDNGTIHATLLQLSWFSHIQVFGPESWGNINQLRNKYVDIFALKDYETWRTYMLAQETFTGGVTPAAKPSDKYYKLNVTYKDKAGTFIGEYQFYTGNKPVLTLKEVDFRIRQTLIKNQKLYNGDYNKGHIKITGGSNNYTIDLSKRLKSTDANRYVKNPQTAHIEILLEKSS >NZ_AP019712.1|WP_072511821.1|1138714_1139440_-|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNITNKIVLSTALLLLGTTSTQPPKAPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPNLSFSGKWLWQNPNGTIHATLQTWVWYTHIQVFGPESWGNINQLRDKYVDIFGTKDEDTIEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYKLFLKYKDKQQTMIGGLEFYQGNKPVITLKELDFRVRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIRITGGGNHYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRHAEIEVILEKSH >NZ_AP019712.1|WP_155978090.1|1139869_1140871_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTVKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDNIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_AP019712.1|WP_070004098.1|1140893_1141826_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPSFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEKIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_AP019712.1|WP_173020049.1|1141996_1143553_+|YfcC-family-protein MENTNNESEKKKRFKLKMPGAFMILFILTVVAVMATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIELLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYA >NZ_AP019712.1|WP_000149423.1|1143860_1144088_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_AP019712.1|WP_155978091.1|1144404_1145352_-|permease MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTILKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINNLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLVNVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIVFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEMLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NZ_AP019712.1|WP_001245801.1|1145599_1145788_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANGIFSNEN >NZ_AP019712.1|WP_000398672.1|1146697_1146832_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_8 | 1219954-1220101 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_8
|
2 spacers
spacers of NZ_AP019712_8
>8.1|1219991|39|NZ_AP019712|PILER-CR GAATTTCGAAATGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGG >8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR CTTACAATAATGTGCAAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_8
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_8 >merge|NZ_AP019712|8|1219954-1220101|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAATGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAG >NZ_AP019712|8|2|1219954-1220101|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAATGAAATTCTA CAGGCAATGCGAGTTGGGGGGCGGGGCCCCAACATAGAA GCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTG GCGGGGCCCCAACATAGAAG CTGGCGGAAAGTCAG
>NZ_AP019712.1|WP_000181404.1|1219320_1219671_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_AP019712.1|WP_000687328.1|1218480_1219218_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_AP019712.1|WP_001261987.1|1217977_1218481_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_AP019712.1|WP_000268754.1|1217514_1217790_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_AP019712.1|WP_072511836.1|1215712_1217080_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTQLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEIKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_AP019712.1|WP_000531320.1|1215354_1215687_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_AP019712.1|WP_072511835.1|1214117_1215368_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDELEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NZ_AP019712.1|WP_000262716.1|1210551_1214118_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGQRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_AP019712.1|WP_000043237.1|1209673_1210405_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_AP019712.1|WP_000426914.1|1209324_1209558_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_AP019712.1|WP_155978102.1|1220196_1222803_-|lipoteichoic-acid-specific-glycosyltransferase-YfhO MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVSRTQKFICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVCIIALLYVLLSPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSISTLKQHDYHSNYVNQLIKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYGFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLTYKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVGQVNGIMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYFYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK >NZ_AP019712.1|WP_000236716.1|1223203_1224088_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MVIQWYPGHMAKAKREVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDEVINQKPRVVILNKKDMSNLNEMSKWEQFFIDKGYYPVSVDAKHGKNLKKVEAAAIKATAEKFEREKAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGNALQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFLIQNDLARLKAHYKIEVPDDAEIIAWFDAIGKKRGLIRRGNEIDYEAVIELIIYDIRNAKIGNYCFDIFKDMTEELANDANN >NZ_AP019712.1|WP_072511838.1|1224071_1224839_+|ribonuclease-HII MTLTIKEVTQLINAVNTIEELENHECFLDERKGVQNAIARRRKALEKEQALKEKYVEMTYFENEILKEHPNAIICGIDEVGRGPLAGPVVACATILNSNHNYLGLDDSKKVPVTKRLELNEALKNEVTAFAYGIATAEEIDEFNIYKATQIAMQRAIDGLSVQPTHLLIDAMTLDNALPQVSLIKGDARSVSIAAASIMAKVFRDDYMTQLSKNYPEYGFEKNAGYGTKQHLLAIDDIGIMKEHRKSFEPIKTLL >NZ_AP019712.1|WP_155978103.1|1224947_1226114_+|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYAKELLGKTLVTHQTGPEGKEIKRLYIEEGCAIQKEYYVGFVIDRATDQVTLMASEEGGTEIEEVAAKTPEKIFKETIDPVIGLSPFQARRIAFNINIPKESVNKAAKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTADGDVLALDAKINFDDNALFRHKDVVELRDLEEEDPKEIEASKHDLSYIALDGDIGCMINGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDAGGSATREKVTEAFKIILGDENVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVEAVKEVDLTLPLVVRLEGTNVELGKKILKDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_AP019712.1|WP_000110253.1|1226135_1227044_+|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTKIVAGVTPGKGGQVVEGVPVFNTVEEAKNETGATVSVIYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVLDMVKVKRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNEDDETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAEEKIKTLNSCGVKTAATPSEIGSTLIEAAKEAGIYESLLTVNK >NZ_AP019712.1|WP_070974504.1|1228761_1229997_+|IS21-family-transposase MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIELVDDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNFFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKDKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI >NZ_AP019712.1|WP_072460618.1|1230008_1230776_+|ATP-binding-protein MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKTLNIRQS >NZ_AP019712.1|WP_001807811.1|1232192_1234268_+|type-I-DNA-topoisomerase MTLADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDTEDNYEPKYITIRGKGPVVKELKKHAKKAKNVFLASDPDREGEAIAWHLSKILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKNPREIEMNLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYKKSKFNAKFLHYKNKPFKLKTKKDVEKITAALDGDQFEITNVTKKEKTRNPANPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMVAQQLYEGIDLKKQGTIGLITYMRTDSTRISDTAKAEAKQYITNKYGESYTSKRKASGKQGDQDAHEAIRPSSTMRTPDDMKSFLTKDQYRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVSLDITQGDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVETKDDSDSEKENKLPKLEQGDKVTATQIEPAQHYTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLESKRFVPTELGEIVHEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDITWRKVIDGFFSSFKQDVERAEEEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKSIGVKCPKCNDGDVVERKSKKNRVFYGCSKYPECDFISWDKPIGRDCPKCNQYLVENKKGKTTQVICSNCDYKEAAQK >NZ_AP019712.1|WP_000195254.1|1234423_1235731_+|methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)--C(5))-methyltransferase-(FADH(2)-oxidizing)-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAERGIKVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNGVGVLKEEMRRLNSIIIEAADKARVPAGGALAVDRHDFSGYITETLKNHENITVINEEINAIPDGYTIIATGPLTTETLAQEIVDITGKDQLYFYDAAAPIIEKESIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEDEFNRFYDAVLEAEVAPVNSFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPYAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIKLIPGLENVDIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELISQPNIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINLAHKILGKGEVVFPRETMIGSMAYYISHAKNNKNFQPMNANFGLLPSLETRIKDKKERYEAQANRALDYLENFKKTL >NZ_AP019712.1|WP_029550241.1|1236147_1237044_+|tyrosine-recombinase-XerC MNHIQEAFLNTLKVERNFSEHTLKSYQDDLIQFNQFLEQEHLQLNTFEYRDARNYLSYLYSNHLKRTSVSRKISTLRTFYEYWMTLDENIINPFVQLVHPKKEKYLPQFFYEEEMEALFKTVEEDTSKSLRDRVILELLYATGIRVSELVNIKKQDIDFYANGVTVLGKGSKERFVPFGAYCRQSIENYLEHFKPIQSCNHDFLIVNMKGEAITERGVRYVLNNIVKRTAGVSEIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGKYTHVSNQQLRKVYLNAHPRAKKENET |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_9 | 1442995-1443078 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_9
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_9
>9.1|1443021|32|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_9
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_9 >merge|NZ_AP019712|9|1442995-1443078|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA >NZ_AP019712|9|7|1442995-1443078|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCA CACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_AP019712.1|WP_072511908.1|1441822_1442482_-|response-regulator-transcription-factor-ArlR MTQILIVEDEQNLARFLELELTHENYNVDTEYDGQDGLDKALSHYYDLIILDLMLPSINGLEICRKIRQQQSTPIIIITAKSDTYDKVAGLDYGADDYIVKPFDIEELLARIRAILRRQPQKDIIDVNGITIDKNAFKVTVNGAEIELTKTEYDLLYLLAENKNHVMQREQILNHVWGYNSEVETNVVDVYIRYLRNKLKPYNRDKMIETVRGVGYVIR >NZ_AP019712.1|WP_000166793.1|1440470_1441826_-|sensor-histidine-kinase-ArlS MTKRKLRNNWIIVTTMITFVTIFLFCLIIIFFLKDTLHNSELDDAERSSSDINNLFHSKPVKDISALDLNASLGNFQEIIIYDEHNNKLFETSNDNTVRVEPGYEHRYFDRVIKKRYKGIDYLIIKEPITTQDFKGYSLLIHSLENYDNIVKSLYIIALAFGVIATIITATISYVFSTQITKPLVSLSNKMIEIRRDGFQNKLQLNTNYEEIDNLANTFNEMMSQIEESFNQQRQFVEDASHELRTPLQIIQGHLNLIQRWGKKDPAVLEESLNISIEEMNRIIKLVEELLELTKGDVNDISSEAQTVHINDEIRSRIHSLKQLHPDYQFDTDLTSKNLEIKMKPHQFEQLFLIFIDNAIKYDVKNKKIKVKTRLKNKQKIIEITDHGIGIPEEDQDFIFDRFYRVDKSRSRSQGGNGLGLSIAQKIIQLNGGSIKIKSEINKGTTFKIIF >NZ_AP019712.1|WP_072511906.1|1437140_1439939_-|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MTNERKEVSEAPVNFGANLGLMLDLYDDFLQDPSSVPEDLQVLFSTIKNDDSIVPALKSTSSQNSDGTIKRVMRLIDNIRQYGHLKADIYPVNPPKRKHVPKLEIEDFDLDQQTLEGISAGIVSDHFADIYDNAYEAILRMEKRYKGPIAFEYTHINNNTERGWLKRRIETPYKVTLNNNEKRALFKQLAYVEGFEKYLHKNFVGAKRFSIEGVDALVPMLQRTITIAAKEGIKNIQIGMAHRGRLNVLTHVLEKPYEMMISEFMHTDPMKFLPEDGSLQLTAGWTGDVKYHLGGIKTTDSYGTMQRIALANNPSHLEIVAPVVEGRTRAAQDDTQRAGAPTTDHHKAMPIIIHGDAAYPGQGINFETMNLGNLKGYSTGGSLHIITNNRIGFTTEPIDARSTTYSTDVAKGYDVPIFHVNADDVEATIEAIDIAMEFRKEFHKDVVIDLVGYRRFGHNEMDEPSITNPVPYQNIRKHDSVEYVFGKKLVNEGVISEDEMHSFIEQVQKELRQAHDKINKADKMDNPDMEKPADLALPLQADEQSFTFDHLKEINDALLTYPDGFNILKKLNKVLEKRHEPFNKEDGLVDWAQAEQLAFATILQDGTPIRLTGQDSERGTFSHRHAVLHDEQTGETYTPLHHVPDQKATFDIHNSPLSEAAVVGFEYGYNVENKKSFNIWEAQYGDFANMSQMIFDNFLFSSRSKWGERSGLTLFLPHSYEGQGPEHSSARLERFLQLAAENNCTVVNLSSSSNYFHLLRAQAASLDSEQMRPLVVMSPKSLLRNKTVAKPIDEFTSGGFEPILTESYQADKVTKVILATGKMFIDLKEALAKNPDESVLLVAIERLYPFPEEEIQALLAQLPNLEEVSWVQEEPKNQGAWLYVYPYVKVLVADKYDLSYHGRIQRAAPAEGDGEIHKLVQNKIIENALKNN >NZ_AP019712.1|WP_001115448.1|1435855_1437127_-|dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MPEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLSEQLASEGDTVEVGQAIAVIGEGSGNASKENSNDNTPQQNDETTNNKKEETTNKSADKAEVNQTNDDNQQRVNATPSARRYARENGVNLAEVSPKTNDVVRKEDIDKKQQAPASTQTTQQAPAKEEKKYNQYPTKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDMTNVMELRKRKKEQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDGDDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDCDKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRPMMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES >NZ_AP019712.1|WP_000334521.1|1434466_1435276_-|hypothetical-protein MCGLRSITLGTTNIEQTKHFMVDILGLNYEELLENSIRFGDADISPGTRLQFIQVPSEQLEESHFVGIGLRTPTDSGLEEYAEILSSKDIPFTTVKELNGNKYFSLEDNNGHIFSIYSNENNYGVGLGMPSFESAVNPLHQVQGLGPVILKVNHVDITGQILTNIFGLEVFAEYQPFDNADYHVQVFKIGTGGLGGEIHLMPVETEMTMPEYGAVDQVEFETKDADFFNQAKSRLDEVEIPYQTLEQDDIESIRITENSGLSFIFTLQK >NZ_AP019712.1|WP_000902175.1|1434234_1434438_-|hypothetical-protein MLHETWKERTPIKKVEVINTDAKKFTVSDMLTVGKQYDVINETEEYYQIIDNSGLVGGYYKTYFKEV >NZ_AP019712.1|WP_001185421.1|1433262_1434054_-|MoxR-family-ATPase MALKHYKNSDSTVFNDAKALFDLNKNILLKGPTGSGKTKLAETLSEVVDTPMHQVNCSVDLDTESLLGFKTIKTNAEGQQEIVFVDGPVIKAMKEGHILYIDEINMAKPETLPVLNGVLDYRRQITNPYTGEVIKAVPGFNVIAAINEGYVGTLPMNEALKNRFVVIHVDYIDGDILKNVIKEQSLLQDDKQIEQIIKFNEDLRTMSKQGQISEEAASIRALLDLCDLITVMPVERAIKRTIIDKLEDEREQQAIYNAVELNF >NZ_AP019712.1|WP_070974308.1|1431362_1433249_-|nitric-oxide-reductase-activation-protein-NorD MSDRFIKFNDEQLDAKQVMMLQDLARLLLKNEQTQVKIQKFPYYNPVQNVLITSWFWSHRPSHIEMAGLKTDVMLAAYGYHMMDVQIVNEVVQDKTFKHPKFYQQLFKLLEDMRVLNSIKVERPSTAKLIDLRLDTRISYTESQIKVYRTKTQYTDLLFLYLEHAFLSQDFFDIPSIHSDLDDILVNMFLYLPNFFQNQNSEDNLYLAQRIMYQVDDILKEDMLNEYYYLPKTLYNTLASPEFEDLKRTDASQVDGQDDTSEDDDNESEKADSKSADSESKGGAYLEMELHEGQNSETLGNDEAREGDATDDMTDMMTKKGKGSNDTLNREEGDAVGQSQAFQLDGVNKNVEIKWQIPEIEPQYVLEYQELKQDVQYEIKDLIQIIKKTIEREQRDARFNLTKGRLQKDLINWFIDDQYKLFYKKQDLSKSFDATFTLLIDASASMHDKMAETKKGVVLFHETLKALNIKHEILSFSEDAFDSDEHAQPNIINEIINYDYSTFEKDGPRIMALEPQDDNRDGVAIRVASERLMRRNQHQRFLIVFSDGEPSAFNYSQDGIIDTYEAVEMSRKFGIEVFNVFLSQDPITEDVEQTIHNIYGQYAIFVEGVAHLPGHLSPLLKKLLLKSL >NZ_AP019712.1|WP_155978148.1|1429794_1431138_-|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MNKNTWVIGFTLFAMFFGAGNLIFPPNLGLDSGQFFWPAILAFVLTGIGLPLLGVIVGALDKEGYIGALNKISPKFSILFLIIIYLTIGPLFAIPRTASTSFEMTITPIIHSNSSIALFIFTIIYFIVVLYICLNPSKLIDRIGSLLTPLLFITILAMIIKGYLDFSGNSAGKGNEALYHSNFSSFAEGFTQGYLTMDAIAAIAFSMIVVNAVKLTGITKTNQIFKQTLTAGLIAAVALIFIYISLGYIGNHMPVSDMTLDQLKSKDRNIGTYLLTTMASTGFGSFGKYLLGIIVALACLTTACGLIVAVSEYFHRIVPKVSYKAFVLVFILMSFIIANQGLNAVISMSIPVLSIVYPVAITVVLLILIAKFIPTKRITQQIPVIIIFILSIFSVISKLGWLKINFIESLPLRAYSLEWFPVAIIATILGYLVGIFVKQDPIKYQQE >NZ_AP019712.1|WP_029549980.1|1428584_1429721_+|toxic-anion-resistance-protein MTENKIFKESHPLDDFISDKELSNTTIQKEKLTIEQQKQVDTISKQINPLDNEGLLAFGSDLQKQMSQFSHQMLDEVQSKDVGPIGDTLSDLMSKLKSVNPNELNTDKPSMLKRIFSRAKSSINEIFSRMQSVSAQVDRITIQLQKHQTHLTRDIELLDTLYDKNKQYFDDLSLHIIAAQQKKLQLENEKLPQLQQQAQQSTNQMDIQQVADMQQFIDRLDKRIYDLQLSRQIALQTAPQIRMIQNVNQALAEKIQSSILTSIPLWKNQMAIALTLMRQRNAVAAQRAVTDTTNDLLTANAEMLKQNAIETATENERGIVDLDTLKRTQSNIIETIEETLIIQQHGREERQLAEKELQQLEQDLKSHLVNIKGPNKQS >NZ_AP019712.1|WP_084989754.1|1443313_1443511_-|hypothetical-protein MTNPTRTKRCGGDVLCGIDNHFQLLLYISENHCQLETKTFFEYFLRIVNKTHDYAILENKKICIS >NZ_AP019712.1|WP_000084773.1|1443627_1444242_-|phosphatase-PAP2-family-protein MSQWKRISLLIVFTLVFGIIAFFHESRLGKWIDNEVYEFIYSSESFITTSIMLGATKVGEVWAMLCISLLLVAYLMLKRHKIEALFFALTMALSGILNPALKNIFDRERPTLLRLIDITGFSFPSGHAMGSTAYFGSGIYLLNRLNQGNSKGILIGLCAAMILLISISRVYLGVHYPTDIIAGIIGGVFCIILSTLLLRNKLIN >NZ_AP019712.1|WP_000160904.1|1444258_1445329_-|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MTKIAFTGGGTVGHVSVNLSLIPTALSQGYEALYIGSKNGIEREMIESQLPEIKYYPISSGKLRRYISLENAKDVFKVLKGILDARKVLKKEKPDLLFSKGGFVSVPVVIAAKSLNIPTIIHESDLTPGLANKIALKFAKKIYTTFEETLNYLPKEKADFIGATIREDLKNGNAHNGYQLTGFNENKKVLLVMGGSLGSKKLNSIIRENLDALLQQYQVIHLTGKGLKDAQVKKSGYIQYEFVKEDLTDLLAITDTVISRAGSNAIYEFLTLRIPMLLVPLGLDQSRGDQIDNANHFADKGYAKAIDEEQLTAQILLQELNEMEQERTRIINNMKSYEQSYTKEALFDKMIKDALN >NZ_AP019712.1|WP_000620199.1|1445340_1445850_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLGKMSDLDQILNLVEEAKELMKEHDNEQWDDQYPLLEHFEEDIAKDYLYVLEENNKIYGFIVVDQDQAEWYDDIDWPVNREGAFVIHRLTGSKEYKGAATELFNYVIDVVKARGAEVILTDTFALNKPAQGLFAKFGFHKVGEQLMEYPPYDKGEPFYAYYKNLKE >NZ_AP019712.1|WP_155978149.1|1446248_1447739_-|PDZ-domain-containing-protein MDDKQHTSSSDDERAEIATSNQDQQTNSSKRVHLKRWQFISILIGTILITAVITVVAYIFINQKISGLNKTDQANLNKIENVYKILNSDYYKKQNSDKLSKAAIDGIVKELKDPYSEYLTKEQTKSFNEGVSGDFVGIGAEMQKKNDQIMVTSPMKGSPAERAGIRPKDVITKVNGKSIKGKALDEVVKDVRGKENTEVTLTVQRGSEEKDVKIKREKIHVKSVEYKKKGKVGVITINKFQNDTSGELKDAVLKAHKDGLKKIVLDLRNNPGGLLDEAVKMANIFIDKGKTVVKLEKGKDTEAIQTSNDALKEAKDMDISILVNEGSASASEVFTGALKDYNKAKVYGSKTFGKGVVQTTREFKDGSLLKYTEMKWLTPDGHYIHGKGIKPDVTIDTPKYQSLNVIPNTKTFKVGDDDKNIKTIKIGLSALGYNVDNESTQFDQALENQVKAFQQANKLEVTGEFNKETNNKFTELLVEKANKHDDVLDKLINILK >NZ_AP019712.1|WP_000801007.1|1447930_1448152_-|hypothetical-protein MKNYSFYQFVMTVRGRHDDKGRLAEEIFDDLAFPKHDDDFNILSDYIETHGDFTLPMSVFDDLYEEYTEWLKF >NZ_AP019712.1|WP_000473656.1|1448151_1448652_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFKKLFGKGKEVQKDIAIYAPLTGEYVKIEDIPDPVFAQKMMGEGFGINPTEGEVVSPIAGRVDNVFPTKHAIGLKADNGLELLVHIGLDTVQLDGEGFEVLVSSGDEVNVGDPLVRFNLEYINNNAKSVISPIIITNTDQATSINIYDENAVIKGETKVIDVTMN >NZ_AP019712.1|WP_000913317.1|1448663_1449092_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MLKKDKSELTDIEYIVTQENGTEPPFMNEYWNHFAKGIYVDKISGKPLFTSEEKFHSECGWPSFSKALDDDEIIELVDKSFGMVRTEVRSEESNSHLGHVFNDGPKESGGLRYCINSAAIQFIPYEKLEELGYGDLISHFDK >NZ_AP019712.1|WP_000159902.1|1449084_1449618_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA MTKEYATLAGGCFWCMVKPFTSYPGIKSVVSGYSGGHVDNPTYEQVCTNQTGHVEAVQITFDPEVTSFENILDIYFKTFDPTDDQGQFFDRGESYQPVIFYHDEHQKKAAEFKKQQLNEQGIFKKPVITPIKPYKNFYPAEDYHQDYYKKNPVHYYQYQRGSGRKAFIESHWGNQNA >NZ_AP019712.1|WP_000166057.1|1449699_1450539_-|fatty-acid-kinase-FakB2 MTKQIIVTDSTSDLSKEYLEANNIHVIPLSLTIEGASYVDQVDITSEEFINHIENDEDVKTSQPAIGEFISAYEELGKDGSEIISIHLSSGLSGTFNTAYQASQMVDANVTVIDSKSISFGLGYQIQHLVELVKEGVSTSEIVKKLNHLRENIKLFVVIGQLNQLIKGGRISKTKGLIGNLMKIKPIGTLDDGRLELVHNARTQNSSIQYLKKEIAEFIGDHEIKSVGVAHANVIEYVDKLKKVFNEAFHVNNYDINVTTPVISAHTGQGAIGLVVLKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_10 | 1753220-1753353 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_10
|
2 spacers
spacers of NZ_AP019712_10
>10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA >10.2|1753309|29|NZ_AP019712|PILER-CR AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_10
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_10 >merge|NZ_AP019712|10|1753220-1753353|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGGGTCCCAACATAGAGAA >NZ_AP019712|10|3|1753220-1753353|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAA TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGT GGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCA GCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGG GTCCCAACATAGAGAA
>NZ_AP019712.1|WP_070973918.1|1752130_1753072_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRKKLN >NZ_AP019712.1|WP_155978198.1|1748912_1752110_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKNNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKKVGDQHRDIVQVFETHNDTYMDHLSISIQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIHQLDVNPEYFTQADRIAKKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDFRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMVKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_AP019712.1|WP_155978197.1|1747234_1748464_-|NAD-dependent-malic-enzyme MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADIFIGVSVANALSQEMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_AP019712.1|WP_000471571.1|1746182_1747040_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_AP019712.1|WP_155978196.1|1745238_1746183_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVELLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_AP019712.1|WP_000717561.1|1744001_1744970_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_AP019712.1|WP_001232654.1|1742222_1743980_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_AP019712.1|WP_000818532.1|1740517_1741879_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >NZ_AP019712.1|WP_000829167.1|1739048_1740170_-|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >NZ_AP019712.1|WP_000123169.1|1737731_1739000_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >NZ_AP019712.1|WP_000160430.1|1753441_1754740_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_AP019712.1|WP_000277602.1|1754944_1755358_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_AP019712.1|WP_000777188.1|1755863_1756553_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_AP019712.1|WP_000161656.1|1756727_1757783_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_AP019712.1|WP_029549618.1|1758097_1759216_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPFFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVNSIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_AP019712.1|WP_000634175.1|1759356_1759857_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_AP019712.1|WP_043856148.1|1760103_1761306_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKKYNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESAAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLQRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTYGGLK >NZ_AP019712.1|WP_000840583.1|1761393_1762341_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSRDFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_AP019712.1|WP_000136251.1|1762463_1762958_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQLINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >NZ_AP019712.1|WP_000365308.1|1763055_1763826_-|TSUP-family-transporter MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP019712_11 | 1755684-1755766 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_11
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_11
>11.1|1755709|33|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_11
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_11 >merge|NZ_AP019712|11|1755684-1755766|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC >NZ_AP019712|11|8|1755684-1755766|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC
>NZ_AP019712.1|WP_000277602.1|1754944_1755358_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_AP019712.1|WP_000160430.1|1753441_1754740_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_AP019712.1|WP_070973918.1|1752130_1753072_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRKKLN >NZ_AP019712.1|WP_155978198.1|1748912_1752110_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKNNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKKVGDQHRDIVQVFETHNDTYMDHLSISIQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIHQLDVNPEYFTQADRIAKKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDFRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMVKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_AP019712.1|WP_155978197.1|1747234_1748464_-|NAD-dependent-malic-enzyme MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADIFIGVSVANALSQEMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_AP019712.1|WP_000471571.1|1746182_1747040_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_AP019712.1|WP_155978196.1|1745238_1746183_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVELLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_AP019712.1|WP_000717561.1|1744001_1744970_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_AP019712.1|WP_001232654.1|1742222_1743980_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_AP019712.1|WP_000818532.1|1740517_1741879_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >NZ_AP019712.1|WP_000777188.1|1755863_1756553_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_AP019712.1|WP_000161656.1|1756727_1757783_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_AP019712.1|WP_029549618.1|1758097_1759216_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPFFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVNSIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_AP019712.1|WP_000634175.1|1759356_1759857_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_AP019712.1|WP_043856148.1|1760103_1761306_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKKYNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESAAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLQRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTYGGLK >NZ_AP019712.1|WP_000840583.1|1761393_1762341_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSRDFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_AP019712.1|WP_000136251.1|1762463_1762958_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQLINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >NZ_AP019712.1|WP_000365308.1|1763055_1763826_-|TSUP-family-transporter MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV >NZ_AP019712.1|WP_029549616.1|1763869_1765093_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MKYDHLLVRYGELTLKGSNRKKFVNQLRNNVNKSLKGLDGFVVKGKRDRMYIELEDHADINEITYRLSKIFGIKSISPVLKVEKTLEAMSAAAIKFAQQFEENSTFKIDVKRADKNYPMDTYELQRELGGAVLKHFDNISVNVKRPDHEIRVEVRLDAIYMYEEVVQGAGGLPVGTGGKTLLMLSGGIDSPVAGMEVMRRGVTIEAIHFHSPPFTSDQAKEKVIELTRILAERVGPIKLHIVPFTELQKQVNKVVHPRYTMTSTRRMMMRVADKLVHQIGAYAIVNGENLGQVASQTLHSMYAINNVTSTPVLRPLLTYDKEEIIIKSKEIGTFETSIQPFEDCCTIFTPKNPVTEPNFDKVVQYESVFDFEEMINRAVENIETLEITSDYKTIKEQQTNQLINDFL >NZ_AP019712.1|WP_155978391.1|1765092_1766241_-|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MFILIYLDNAATTKAFEEVLDTYLKVNQSMYYNPNSPHKAGLQANQLLQQAKVQINDMVNTNMTYDVVFTSGATESNNIALKGVAYRKFDTAREIITSVLEHPSVLEVVRYLEEREGFKVKYVDVTKDGSINLEHFKELMSDKVGLVTCMYVNNVTGQIQPIPQMADVIKNYPKAHFHVDAVQAFGKISMDFNNVDSISLSGHKFNGLKGQGVLLVNHIQNVEPTVHGGGQEYGVRSGTVNLPNDIAMVKAMKIANENLEALNAFVTELNNDVRQFLNKYHGVYINSSTSGSPFVLNVSFPGVKGEVLVNAFSKYDIMISTTSACSSKRNKLNEVLTAMGLSDKAIEGSIRLSFGAMTTKEDITKFKETFTIIYEEIKELLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_12 | 1844009-1844098 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_12
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_12
>12.1|1844040|28|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder GTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_12
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_12 >merge|NZ_AP019712|12|1844009-1844098|CRISPRCasFinder AAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGACAAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGT >NZ_AP019712|12|9|1844009-1844098|CRISPRCasFinder AAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGT GTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAC AAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGT
>NZ_AP019712.1|WP_000492903.1|1843094_1843715_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >NZ_AP019712.1|WP_155978210.1|1842292_1842928_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFTINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILIWG >NZ_AP019712.1|WP_001030475.1|1841551_1841995_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANTYLRENVFRSKETKSYSIFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVDLSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >NZ_AP019712.1|WP_001153741.1|1841121_1841565_+|competence-protein-ComK MQDNSTKYLLYIQTATSNHLETNCVFLHCDYILKVPINKLVSYYAKLHLSSQSVLIETAKNILNINKLVPIYINAKTILFPLKHKRAPIQIYINAHYIVGMTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTNDH >NZ_AP019712.1|WP_000671058.1|1840538_1841009_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >NZ_AP019712.1|WP_000384171.1|1840115_1840340_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >NZ_AP019712.1|WP_001032832.1|1838985_1839840_-|glucosaminidase-domain-containing-protein MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >NZ_AP019712.1|WP_155978209.1|1837606_1838899_+|arsenite-efflux-transporter-membrane-subunit-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFNKRTIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVIFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLLGLYLTLILF >NZ_AP019712.1|WP_000221190.1|1837292_1837607_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >NZ_AP019712.1|WP_155978208.1|1835147_1836650_-|FAD/NAD(P)-binding-protein MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTIYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTKSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFEKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSIIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYNVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQQQRSDNQ >NZ_AP019712.1|WP_001096494.1|1844277_1844991_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >NZ_AP019712.1|WP_155978211.1|1845249_1845552_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKALKPDADWIRITSKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >NZ_AP019712.1|WP_001200542.1|1845806_1846172_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIAFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDHQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >NZ_AP019712.1|WP_029550372.1|1846168_1846522_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTLGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFDIKLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NZ_AP019712.1|WP_155978212.1|1846771_1847605_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRVNVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAVMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDGLNQDKRIGPDPKTFEG >NZ_AP019712.1|WP_000366165.1|1847816_1848725_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMVSTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >NZ_AP019712.1|WP_000933822.1|1848849_1850043_-|methionine-adenosyltransferase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >NZ_AP019712.1|WP_000109913.1|1850413_1852006_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAKYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >NZ_AP019712.1|WP_072460538.1|1852300_1853047_-|S9-family-peptidase MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGATHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHS >NZ_AP019712.1|WP_000672013.1|1853051_1853525_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_13 | 2178835-2178985 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_13
|
2 spacers
spacers of NZ_AP019712_13
>13.1|2178863|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >13.2|2178920|38|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder GTTGATGCGCAGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_13
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_13 >merge|NZ_AP019712|13|2178835-2178985|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGCAGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA >NZ_AP019712|13|10|2178835-2178985|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCGCAGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA
>NZ_AP019712.1|WP_000495673.1|2177725_2178817_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPGDAYLKVIALLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLVGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPVFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILYVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_AP019712.1|WP_029550399.1|2176479_2177460_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVIATIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_AP019712.1|WP_000003759.1|2176157_2176478_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_AP019712.1|WP_001024099.1|2175340_2176006_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_AP019712.1|WP_155978398.1|2173968_2174907_-|mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNYRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_AP019712.1|WP_000808818.1|2173707_2173938_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQTSASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_AP019712.1|WP_000123402.1|2171662_2173036_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_AP019712.1|WP_001123309.1|2170791_2171205_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQQPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_AP019712.1|WP_000070865.1|2170147_2170591_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_AP019712.1|WP_155978264.1|2169316_2170027_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNAADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_AP019712.1|WP_001802298.1|2179315_2179420_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_AP019712.1|WP_001792784.1|2180099_2180258_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_AP019712.1|WP_029550401.1|2180915_2181773_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPEDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFESNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_AP019712.1|WP_155978265.1|2181840_2182623_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLIQLDQVGRMKQGKSILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGSVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDTYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGECVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_AP019712.1|WP_000334469.1|2182854_2184660_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKGADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDRDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVTLQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_AP019712.1|WP_029550403.1|2185340_2186879_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWFPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFFGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTKEPKQDLEAATAQMETTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSLDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_AP019712.1|WP_046472715.1|2186913_2189046_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRITGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVKKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQKTHDKSSNMIDKDDVHVETKDIDDNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPSSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLISDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_AP019712.1|WP_001292149.1|2189057_2189492_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_AP019712.1|WP_000648723.1|2189491_2190598_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_AP019712.1|WP_000521495.1|2198593_2199949_-|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_14 | 2445173-2445267 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP019712_14
|
1 spacers
spacers of NZ_AP019712_14
>14.1|2445200|41|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder TTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTTCGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP019712_14
The CRISPR arrays of NZ_AP019712_14 >merge|NZ_AP019712|14|2445173-2445267|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTTCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGC >NZ_AP019712|14|11|2445173-2445267|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGC TTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTTCGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGC
>NZ_AP019712.1|WP_000019127.1|2444165_2445032_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_AP019712.1|WP_001125208.1|2443152_2443839_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_AP019712.1|WP_000762708.1|2442894_2442999_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_AP019712.1|WP_000038955.1|2441281_2442721_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ >NZ_AP019712.1|WP_000825936.1|2440381_2441161_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVVIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKAEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSKSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_AP019712.1|WP_000479573.1|2439681_2440401_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_AP019712.1|WP_029550213.1|2438953_2439685_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVFVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKRAEAREKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAREVSNNIVFIHEGVIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE >NZ_AP019712.1|WP_155978301.1|2437606_2438857_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGTYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESAEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPILYKLQTYLKHKRR >NZ_AP019712.1|WP_000819843.1|2436989_2437352_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_AP019712.1|WP_070974178.1|2436371_2436971_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQKDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_AP019712.1|WP_001807892.1|2445445_2445565_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYEEMQYFANK >NZ_AP019712.1|WP_155978302.1|2445659_2446970_+|B-domain-containing-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAITKLQKNDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPKVVKAAITTAETASSIKNIFSSFTSFFK >NZ_AP019712.1|WP_000594523.1|2447460_2448390_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFTEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_AP019712.1|WP_000916697.1|2448957_2449905_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_AP019712.1|WP_001056917.1|2449906_2450884_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_AP019712.1|WP_000200954.1|2450935_2451403_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_AP019712.1|WP_000286872.1|2451413_2452106_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIDDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVIYETV >NZ_AP019712.1|WP_155978303.1|2452116_2453232_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDQVDFESFMRKYSYHLSSSRLISGSSTVYEEIESMLADWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAEYPNQNIPKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGIDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFNDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHAEQDIDRLFEILHQED >NZ_AP019712.1|WP_001046647.1|2453209_2454217_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYGTCENKENKNDVSRAN >NZ_AP019712.1|WP_155978304.1|2454218_2455577_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGLSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMAAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEGVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIETTSSILEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRKCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 248402-248430 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 248460-248488 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 248518-248546 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 2283478-2283506 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 940690-940720 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 1945571-1945601 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 919300-919330 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 248323-248342 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 266545-266564 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 852012-852031 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 919390-919409 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 1059780-1059799 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 1220102-1220121 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 1352449-1352468 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 1633565-1633584 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 1956117-1956136 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 2075447-2075466 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 2134350-2134369 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 2460536-2460555 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_8 | 8.2|1220067|20|NZ_AP019712|PILER-CR | 1220067-1220086 | 20 | NZ_AP019712.1 | 2730884-2730903 | 0 | 1.0 |
NZ_AP019712_10 | 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR | 1753252-1753276 | 25 | NZ_AP019712.1 | 874377-874401 | 0 | 1.0 |
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NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 919302-919330 | 1 | 0.966 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 851976-852004 | 1 | 0.966 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 940690-940718 | 1 | 0.966 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | NZ_AP019712.1 | 1945571-1945599 | 1 | 0.966 |
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NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 248460-248490 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 248518-248548 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 851976-852006 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 2283478-2283508 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 874256-874286 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 874359-874389 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 2328463-2328493 | 1 | 0.968 |
NZ_AP019712_4 | 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 801792-801822 | 31 | NZ_AP019712.1 | 2497289-2497319 | 1 | 0.968 |
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cttacaataatgtgcaagtt CRISPR spacer cttacaataatgtgccggtt Protospacer *************** .***
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tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaa Protospacer ********************..***
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85. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to position: 1956009-1956033, mismatch: 2, identity: 0.92
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86. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to position: 2050039-2050063, mismatch: 2, identity: 0.92
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87. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to position: 2283466-2283490, mismatch: 2, identity: 0.92
tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaa Protospacer ********************..***
88. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to position: 2294214-2294238, mismatch: 2, identity: 0.92
tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcaaaaagaaattctacagacaa Protospacer ****.***************.****
89. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to position: 2731004-2731028, mismatch: 2, identity: 0.92
tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaa Protospacer ********************..***
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712_2 | 2.1|702798|26|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 702798-702823 | 26 | MN657034 | Psychrobacter sp. strain ANT_P15B plasmid pA15BP4, complete sequence | 7362-7387 | 5 | 0.808 |
NZ_AP019712_3 | 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 755496-755524 | 29 | LC371242 | Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence | 15447-15475 | 5 | 0.828 |
NZ_AP019712_6 | 6.1|874635|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder | 874635-874665 | 31 | NC_041878 | Pectobacterium phage CBB, complete genome | 74842-74872 | 8 | 0.742 |
1. spacer 2.1|702798|26|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder matches to MN657034 (Psychrobacter sp. strain ANT_P15B plasmid pA15BP4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
acaaaggaatacagttggatgctaac CRISPR spacer gtaaaggaatatggttggatgctaaa Protospacer ..*********..************
2. spacer 3.1|755496|29|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder matches to LC371242 (Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
gccccaacaaagagaatttcgaaaagaaa CRISPR spacer tcgtcaacaaaaagaatttcgtaaagaaa Protospacer * .*******.********* *******
3. spacer 6.1|874635|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder matches to NC_041878 (Pectobacterium phage CBB, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
aagaaccattacataataaagcataagtgat CRISPR spacer aagaaacattacataaaaaagcacgagaaga Protospacer ***** ********** ******..** ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
259231 : 306573
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP019712|259231:306573|DBSCAN-SWA 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41 | Lactococcus_phage(22.22%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
396906 : 408232
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019712|396906:408232|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP019712|396906:408232|407542_408232_+|WP_000416469.1|DBSCAN-SWA MEKVAILVDGGYYRKISAKVYGKVTAKERADELYSYCNRHLKETHFKEEIYNKLYRIFYYDCPPIDKIVYHPLLKKNVNFSNTDTKKWTEDFFKEMSKKRKVALRLGELSEYSVEYNLKYSITKKLLNGSIDLNDLKEKDFSLSLQQKGVDMKIGLDIASLSFKHQVDKIILIAGDSDFVPAAKLARTEGIDFVLDSLGADIRNNLSLHIDGRRTCDEKFKFYLNQLFK >NZ_AP019712|396906:408232|398397_399939_+|WP_000424968.1|DBSCAN-SWA MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCECKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_AP019712|396906:408232|406406_406814_+|WP_072512400.1|DBSCAN-SWA MELSIFYNGQFFVALVEYKMENKSKFIQYTFGNEPDDKEVLDFIHHQLMKMIDDVQTIVYTKNISRKVNPKRLQRQIAKEQKKPKYSTQAQIAIKKELELKKKQKRKNYKEKRDAFQKRKREIKKVKAKEKHKGH >NZ_AP019712|396906:408232|401531_402767_-|WP_070974504.1|transposase|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIELVDDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNFFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKDKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI >NZ_AP019712|396906:408232|404256_404961_-|WP_072512401.1|DBSCAN-SWA MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATHLKKQIIDISSKVQALAQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >NZ_AP019712|396906:408232|406860_407343_+|WP_072512399.1|DBSCAN-SWA MILISSCLIGENVRYDGGNQLDVRLKKLIDSGKAIHACPELLGGLLIPREPAEIIGGDGFDVWNNAAKVVTISNKDVTDDYKNGAIVTLKILKKYQCDTVILKANSPSCGSQEIYDGNFTGNKKKGVGVVTALLINEGINVYDENTFFDQNMIETIVHEK >NZ_AP019712|396906:408232|400051_400588_-|WP_072512224.1|DBSCAN-SWA MHNNNEFNKKLKDFIGRDKRMVLVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >NZ_AP019712|396906:408232|405892_406045_-|WP_000248841.1|DBSCAN-SWA MVPEEKGSITLSKEAAIIFATAKFKPFHNRIKNNPQKTNPFLKLHENKKT >NZ_AP019712|396906:408232|400752_401520_-|WP_155977748.1|DBSCAN-SWA MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDWLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >NZ_AP019712|396906:408232|396906_398373_+|WP_000264071.1|DBSCAN-SWA MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_AP019712|396906:408232|403162_404110_+|WP_155977865.1|transposase|DBSCAN-SWA MSYNHLTLTERARIEVLRQENYSLRSIARKLKRSVSTISREISRNNLNQLYQAETAQKNYETKRKLCGRPTRFTPELGNIIKYYLKCHWSPEQIVGRLLQNQICFKTIYRWINSNMINFELISCLRQKGKRQKPKETRGKFNIGRPISQRPKEVKKRNTFGHWEADTIVSSRGKSKGCIATFAERKSRYYYCVLMPDRSSNSMETAINNLIKHLPKDAVKTITVDRGKEFSCYQNIENQFNINVYFADPYSAWQRGTNENTNGLLREFFPKKTDLAKVNQEQLNYALDSINYRPRKCLNWKFPYEVLCDELLHLN >NZ_AP019712|396906:408232|405359_405632_-|WP_000159786.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIFSNSIKQHQNTGSFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILELI |
12 | Lactococcus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
733846 : 741656
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP019712|733846:741656|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP019712|733846:741656|733846_734902_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_AP019712|733846:741656|737780_738494_-|WP_001062968.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_AP019712|733846:741656|738918_739587_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_AP019712|733846:741656|734901_735588_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_AP019712|733846:741656|739927_740521_+|WP_072460485.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVIKMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAVEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_AP019712|733846:741656|737097_737682_-|WP_000637686.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_AP019712|733846:741656|740504_741656_+|WP_001217786.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCSHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_AP019712|733846:741656|735562_736036_-|WP_155978007.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNNDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_AP019712|733846:741656|738497_738917_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_AP019712|733846:741656|736376_736817_-|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
753626 : 767791
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP019712|753626:767791|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACGTATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCATCACATGTTCCGGTACTCATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGCGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCCCCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCATACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGCACCACATGGTATGAATATGTGACAAAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGCATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAGCATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTAAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACACCTTAAAGTGATGCCGTATGCACAAGAAGTTGTAAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTCAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTCTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAGCATTTCATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTTTGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATTTCTGTTTTTGAAACAGGATAATAGCTTAAAGCTCATAACAACGAATATTAGGTACGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCGCGTTAATATCATTCTGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGCAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATACGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAATCTTTAACTTTAATTTCTTGGCAATATTTAATTATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCCGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTGTATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGAAATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCAATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAAGAAGATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAATGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGAGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCAAAGTTCACCGATAACACAGATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTCACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGATAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACAGCTGCAATCAAGAATCCACCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATCGATGTGAATAAGCCGACTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGCCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP019712|753626:767791|759523_760390_-|WP_070004807.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQTQMLYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >NZ_AP019712|753626:767791|761191_761590_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_AP019712|753626:767791|753626_754685_+|WP_000663034.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFIPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_AP019712|753626:767791|756979_757081_+|WP_031788440.1|DBSCAN-SWA MVITEIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILIS >NZ_AP019712|753626:767791|759003_759504_-|WP_000930016.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEQMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_AP019712|753626:767791|754843_755386_+|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_AP019712|753626:767791|765118_766090_+|WP_155978015.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSINDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_AP019712|753626:767791|755971_756889_-|WP_155978013.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKVKDYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTYDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_AP019712|753626:767791|766076_767033_+|WP_070974043.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVIILVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_AP019712|753626:767791|767029_767791_+|WP_000616865.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVAMKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_AP019712|753626:767791|761552_763658_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_AP019712|753626:767791|763777_764749_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_AP019712|753626:767791|757158_758664_-|WP_072511937.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALVGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVILAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
800413 : 808066
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP019712|800413:808066|DBSCAN-SWA AATGACTGAAATAGATTTTGATATAGCAATTATCGGTGCAGGTCCAGCTGGTATGACTGCTGCAGTATACGCATCACGTGCTAATTTAAAAACAGTTATGATTGAAAGAGGTATTCCAGGCGGTCAAATGGCTAATACAGAAGAAGTAGAGAACTTCCCTGGTTTCGAAATGATTACAGGTCCAGATTTATCTACAAAAATGTTTGAACACGCTAAAAAGTTTGGTGCAGTTTATCAATATGGAGATATTAAATCTGTAGAAGATAAAGGCGAATATAAAGTGATTAACTTTGGTAACAAAGAATTAACAGCTAAAGCGGTCATTATTGCTACAGGTGCAGAATACAAGAAAATTGGTGTTCCGGGTGAACAAGAACTTGGTGGACGCGGTGTAAGTTATTGTGCAGTATGTGATGGTGCATTCTTTAAAAACAAGCGCCTATTCGTTATCGGTGGTGGTGATTCAGCAGTAGAAGAGGGAACATTCTTAACTAAATTTGCTGACAAAGTAACAATCGTTCACCGTCGTGATGAGTTACGTGCACAGCGTATTTTGCAAGATAGAGCATTCAAAAATGATAAAATCGACTTTATTTGGAGTCATACTTTGAAATCAATTAATGAAAAAGACGGCAAAGTGGGTTCTGTGACATTAACGTCTACAAAAGATGGTTCAGAAGAAACACACGAGGCTGATGGTGTATTCATCTATATTGGTATGAAACCATTAACAGCGCCATTTAAAGACTTAGGTATTACAAATGATGTTGGTTATATTGTGACAAAAGATGATATGACAACATCAGTACCAGGTATTTTTGCAGCAGGAGATGTTCGCGACAAAGGTTTACGCCAAATTGTCACTGCTACTGGCGATGGTAGTATTGCAGCGCAAAGTGCAGCGGAATATATTGAACATTTAAACGATCAAGCTTAATTCGAAGTCGAATTAAGATGTTGAGCTGTAAATTATTTGGATATTTATTTTAATAGTGTTATCACATTGTTAAAATAATGTCTTAATTTTAAATTAAAGCAAATTATATAGAAAACTAGAACTTAGTACGTATCATTTGTGCGTTTTAATGAGTTCTAGTTTTTTAATATGTTATATTAAACTTATAACTTTATGGGAGTGGGACAGAAATGATAAAGAGCCACTAATGATTTATTATGTAGTGGTTCTTACACATTAGCCACAGCTAATGTGTACTTAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGCATAAGAAATACTAATTTCTATAGAAAAAGTATTTCTTTATCGTTGTCCGGCCCCAACTTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAAAGCTTGTTGCAAGCGCATTTTCATTCGGTCAACTACTAGCAATATAATATTATAGACCCTAGGACATTGATTTATGTCCCAAGCTCCTTTTAAATGATGTATATTTTTAGAAATTTAATCTAGACATAGTTAAAAATAAATATAAAACATCGTTGCTTAATTTTGTCATAGAACATTTAAATTAACATCATGAAATTCGTTTTGGCGGTGAAAAAATAATGGATAATAATGAAAAAGAAAAAAGTAAAAGTGAACTATTAGTTGTTACAGGTTTATCTGGCGCAGGTAAATCTTTGGTTATTCAATGTTTAGAAGACATGGGATATTTTTGTGTAGATAATCTACCACCAGTGCTATTGCCTAAATTTGTAGAGTTGATGGAACAAGGAAATCCTTCCTTAAGAAAAGTGGCAATTGCAATTGATTTAAGAGGTAAGGAACTATTTAATTCATTAGTTGCAGTAGTGGATAAAGTCAAAAGTGAAAGTGACGTCATCATTGATGTTATGTTTTTAGAAGCTAGTACTGAAAAATTAATTTCAAGATATAAGGAAACGCGTCGTGCACATCCTTTGATGGAACAAGGTAAAAGATCGTTAATCAATGCAATTAATGATGAGCGAGAGCATTTGTCTCAAATTAGAAGTATAGCTAATTTTGTTATAGATACTACAAAGTTATCACCTAAAGAATTAAAAGAACGCATTCGTCGATACTATGAAGATGAAGAGTTTGAAACTTTTACAATTAATGTCACAAGTTTCGGTTTTAAACATGGGATTCAGATGGATGCAGATTTAGTATTTGATGTACGATTTTTACCAAATCCATATTATGTAGTAGATTTAAGACCTTTAACAGGATTAGATAAAGACGTTTATAATTATGTTATGAAATGGAAAGAGACAGAGATTTTCTTTGAAAAATTAACTGATTTGTTAGATTTTATGATACCCGGGTATAAAAAAGAAGGGAAATCTCAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATAGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGAGACGCACATATTGAAAGTGGCGAGAAAAAATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTCATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACAGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAGGGAAAATCAGAGATGAAATGGATATACCAGCACCAGGAGACATCAGAAATGTGATTGCAGCTTTAAGTGATTCTGAGTCAGTTTTAAGCCAACTTTTTCAGTATCGTTTTGAAGAAAATCAAATTAGCGGTCACTCATTAGGTAATTTATTAATCGCAGGTATGACTAATATTACGAATGATTTCGGACATGCCATTAAAGCATTAAGTAAAATTTTAAATATTAAAGGTAGAGTCATTCCATCTACAAATACAAGTGTGCAATTAAATGCTGTTATGGAAGATGGAGAAATTGTTTTTGGAGAAACAAATATTCCTAAAAAACATAAAAAAATTGATCGTGTGTTTTTAGAACCTAACGATGTGCAACCAATGGAAGAAGCAATCGATGCTTTAAGGGAAGCAGATTTAATCGTTCTTGGACCAGGGTCATTATATACGAGCGTTATTTCTAACTTATGTGTCAATGGTATTTCAGATGCGTTAATTCATTCTGATGCGCCTAAGCTATATGTATCTAATGTGATGACGCAACCTGGGGAAACAGATGGTTATAGCGTGAAAGATCATATCGACGCGATTCATAGACAAGCTGGACAACCGTTTATTGATTATGTCATTTGTAGTACTCAAACTTTCAATGCTCAAGTTTTGAAAAAATATGAAGAAAAACATTCTAAACCAGTTGAAGTTAATAAGGCTGAACTTGAAAAAGAAAGCATAAATGTAAAAACATCTTCTAATTTAGTTGAAATTTCTGAAAATCATTTAGTAAGACATAATACTAAAGTGTTATCGACAATGATTTATGACATAGCTTTAGAATTAATTAGTACTATTCCTTTCGTACCAAGTGATAAACGTAAATAATATAGAACGTAATCATATTATGATATGATAATAGAGCTGTATAAAAATGAAAATAGACAGTGGTTCTAAGGTGAATCATGTTTTAAATAAGAAAGGAATGACTGTACGATGAGCTTTGCATCAGAAATGAAAAATGAATTAACTAGAATAGACGTCGATGAAATGAATGCAAAAGCAGAGCTCAGTGCACTGATTCGAATGAATGGTGCACTTAGTCTTTCAAATCAACAATTTGTTATAAATGTTCAAACGGAAAATGCAACAACGGCAAGACGTATTTATTCGTTGATTAAACGTGTATTTAATGTGGAAGTTGAAATATTAGTCCGTAAAAAAATGAAACTTAAAAAAAATAATATTTATATTTGTCGTACAAAGATGAAAGCGAAAGAAATTCTTGATGAATTAGGAATTTTAAAAGACGGCATTTTTACGCATGAAATTGATCATTCAATGATTCAAGATGACGAAATGAGACGCAGTTACTTGAGAGGAGCTTTTCTGGCAGGTGGCTCAGTGAATAACCCTGAAACATCTTCGTATCATTTGGAAATTTTTTCTCAAAATGAGAGTCATGCAGAAGGCTTAACGAAACTAATGAATAGTTATGAGTTGAATGCCAAACATTTAGAGCGAAAAAAAGGAAGTATTACGTATTTAAAAGAAGCGGAAAAGATTTCGGATTTTCTTAGTTTGATAGGTGGCTATCAAGCGTTATTAAAATTTGAAGACGTACGCATTGTAAGAGATATGCGTAATTCTGTTAACCGACTCGTTAATTGTGAAACGGCAAATCTAAATAAAACTGTTAGTGCTGCGATGAAACAAGTGGAGAGCATTAAATTAATTGATAAAGAAATTGGTATTGAAAATTTACCAGACAGGTTGAGAGAGATTGCTAGAATTCGAGTAGAACATCAAGAAATTTCGTTGAAAGAGCTTGGAGAAATGGTGTCAACTGGTCCAATTTCAAAATCAGGTGTAAATCATCGATTAAGAAAACTTAATGATTTAGCCGATAAGATTAGAAATGGTGAACAAATAGAATTATAAGTAAGAAGGTGTTTTTGGTAGTGAATTATCAAAAATACCTTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTAATGAATAATAGTCGACTAACTATTAAATTGAGCTGGAAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGCGTTACCTAATTTTCTCATTAAGTAGCATCATATTTATCAATTTGGTCATAAGAAAATACGAATGTGATAATTAATTGAATCCCTGAAAGTCCCTGATTATAGACAAAAAAATCAGCATAAAAAGAATCCCGACATTGCGGGATTCTCTGTATTGAAAAGTATTGTATTTTATTTAAATGCCTCCTTGAAGGGAATCGAACCCCTATCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP019712|800413:808066|804128_805073_+|WP_000006551.1|DBSCAN-SWA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_AP019712|800413:808066|805642_806230_+|WP_001049165.1|DBSCAN-SWA MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_AP019712|800413:808066|802116_803028_+|WP_000369722.1|DBSCAN-SWA MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_AP019712|800413:808066|806779_808066_+|WP_155978372.1|DBSCAN-SWA MYRESPSMMELVVREHNIQKAIKKVKKNKGAPGIDGMKVSEIQGHFAQYFPEIKQKLLEGTYKPQAVKKVEIPKANGKKRVLGIPVVRDRVIQQAIKQVIEPSIDRTFSKHSHGFRPNRSTGTALKECASYYEAGYTIAVDCDLKQCFDNINHDKLMYLFERHIKDKAVSTFIRRSLQVGAIDLSGEVAERKIGAPQGGVISPLLCNIYLHELDKELEKRNHRFVRYADDFVIFVKTKRAGGRVMDSIKTFIHKTLKLEVNNDKSKVGSPTRLKFLSCLMSKVNGTYRFRPTTEAKRNLKRNLKWLTRRSRPGSFQDIITEINRVTRGWINYFGKGFIKRFLQELEPWLNRRIRQLILKRWKKTKTKYKMLRKYGLDHDSAMRIASSRKKYWRLSSTHEVHRALTTKRLHKWGLLSLTQLAETAYARY >NZ_AP019712|800413:808066|800413_801349_+|WP_000134963.1|DBSCAN-SWA MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_AP019712|800413:808066|803024_804020_+|WP_001248939.1|DBSCAN-SWA MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK |
6 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
853722 : 873289
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP019712|853722:873289|DBSCAN-SWA AATGTATCGTGAGTCTCCATCGATGATGGAGCTTGTTGTAAGAGAACACAACATTCAAAAGGCAATTAAGAAAGTTAAAAAGAATAAAGGTGCCCCTGGCATTGATGGCATGAAAGTGAGTGAAATACAAGGTCACTTCGCGCAGTACTTTCCAGAAATAAAACAAAAACTGCTTGAAGGTACATACAAACCTCAAGCAGTTAAGAAAGTCGAAATTCCCAAAGCAAATGGGAAAAAGCGTGTGCTTGGTATTCCTGTCGTAAGAGACAGAGTGATACAACAAGCAATTAAACAAGTGATTGAACCTAGTATCGATCGTACCTTCTCTAAACACAGTCATGGCTTTAGACCTAATCGTAGTACAGGAACAGCACTGAAAGAATGTGCGTCTTACTATGAAGCAGGTTACACCATAGCCGTAGATTGTGATTTAAAACAATGCTTTGACAACATAAATCATGATAAACTCATGTATTTATTTGAGCGCCATATCAAAGATAAAGCAGTATCGACATTTATCCGTAGAAGTTTACAAGTTGGTGCCATTGACCTATCTGGCGAAGTCGCAGAAAGAAAGATAGGTGCACCGCAAGGTGGTGTGATATCACCACTACTTTGTAACATATATCTACATGAACTGGATAAAGAGCTCGAAAAACGTAATCATCGTTTTGTGAGATATGCAGATGACTTCGTCATCTTTGTCAAAACGAAACGTGCAGGTGGACGTGTGATGGATAGTATTAAAACATTCATACACAAAACCCTCAAACTTGAAGTCAATAATGATAAAAGTAAGGTGGGTTCTCCTACCCGTTTAAAGTTCTTGAGTTGTCTAATGAGCAAAGTAAATGGCACTTATCGTTTCAGACCCACTACGGAAGCAAAAAGAAATTTAAAACGCAACTTAAAGTGGTTAACCAGACGAAGTAGACCAGGTTCATTCCAAGATATTATAACAGAAATTAATCGTGTGACACGAGGATGGATTAACTATTTTGGAAAAGGATTCATAAAAAGATTTCTTCAAGAATTAGAACCTTGGCTAAATCGCCGCATTAGGCAACTCATACTCAAAAGATGGAAGAAGACTAAAACAAAATATAAGATGTTGCGCAAGTATGGTCTAGACCACGATAGCGCAATGAGAATCGCGAGCTCAAGAAAGAAATACTGGCGTTTATCATCTACGCATGAGGTTCATCGTGCACTTACAACAAAACGTCTCCACAAGTGGGGGTTACTATCACTAACCCAACTCGCAGAGACGGCTTACGCAAGATATTGAACCGCCGAGTACGGAACCGTACGCTCGGTGGTGTGAGAGGACGAATAATCAAGTAATGATTATTCTCCTACTCGATTTTTATTAAGCAACACAGGGAGGAATCAACGTGATTGAATTAAAAGAAGTTGTTAAAGAATATCGGACTAAAAATAAAGAAGTCCTTGCTGTAGATCACGTTAATTTATCGATTCGAGCAGGATCGATTTATGGCGTCATTGGTTTTTCTGGAGCAGGAAAAAGTACTTTGATTCGAATGTTTAATCATCTAGAAGCGCCTACATCAGGTGAAGTTATTATAGATGGAGACCATATAGGCCAATTGTCCAAAAATGGATTAAGAGCAAAAAGACAAAAAGTAAGTATGATCTTCCAACATTTTAATTTGTTATGGTCAAGGACTGTGTTAAAAAATATTATGTTTCCGCTTGAAATTGCAGGTGTCCCTAGAAGGAGAGCAAAGCAAAAAGCATTAGAACTTGTCGAACTCGTCGGTTTAAAAGGTAGAGAAAAGGCTTATCCATCAGAGTTATCAGGCGGACAAAAGCAACGTGTTGGAATTGCACGAGCGTTAGCTAATGATCCAACGGTCTTACTTTGTGATGAGGCAACAAGTGCACTTGATCCGCAAACAACAGATGAAATTTTAGATCTACTACTAAAAATTAGAGAACAACAAAATTTAACAATTGTACTAATTACGCATGAAATGCATGTCATTCGTCGTATTTGTGATGAAGTTGCAGTTATGGAAAGTGGTAAAGTGATAGAACATGGACCGGTGACACAGGTTTTTGAAAATCCGCAACACACTGTGACAAAACGATTTGTGAAAGAAGATTTAAATGATGATTTCGAAACATCTTTAACAGAATTAGAGCCATTAGAAAAAGATGCTTATATCGTTAGATTAGTTTTCGCTGGATCAACAACAACCGAGCCCATTGTATCGAGTCTATCAACTGCCTATGATATTAAAATTAATATTTTAGAAGCAAATATTAAAAATACAAAAAATGGAACAGTCGGCTTTTTAGTTCTGCATATTCCATATATTTCAAGTGTAGATTTCGGAAAATTCGAAAAAGAGTTAATTGAGCGACAAGTTAAAATGGAGGTGTTAAGACATGGGTAAATCATTTAGTGAAATTATAAATGAAATGATTACAATGCCTAATATTCAGTGGCCAGAAGTTTGGACTGCAATAGTCGAAACACTATACATGACAGTCGTCTCAACTATATTTGCATTTATACTCGGTCTTATTTTAGGTGTGTTATTATTCTTGTCTGCTAAAGGTAAGTCTATCGGTGCAAGGTTATTTTATTCTATCGTTTCTTTCATTGTTAACTTATTTAGAGCGATACCATTTATTATTTTAATTTTATTATTAATACCATTTACAAGTTTGATACTTGGAACGATAAGTGGTCCGACAGGTGCGTTACCAGCCTTGATCATTGGCGCAGCGCCGTTTTATGCAAGGCTCGTAGAAATTGCTTTTAAAGAAATTGATAAAGGTGTCATCGAAGCGGCCTGGTCAATGGGGGCTAATACTTGGACAGTAATTCGTAAAGTCCTCTTACCTGAAGCCATGCCAGCGCTAGTGTCTGGCATTACAGTTACAGCAATCGCTTTAGTTGGTTCAACGGCAGTTGCAGGTGTAATTGGTGCCGGTGGTTTAGGAAATTTAGCATACTTAACAGGTTTCACTCGAAATCAAAATGATGTCATTTTAGTATCAACAGTTTTTATTTTAATTATTGTATTTATAATCCAATTCATTGGGGATTGGCTTACAAATAAACTTGATAAACGATAAATTGGGGGTTTCATTTTATGAAAAAATTATTTGGTCTTATTTTAGTATTAACATTTGCAGTTGTATTAGCAGCTTGCGGTAATGGAAGCAAAAGTGGCAGTGACGACAAGAAAATAACAGTAGGTGCTTCACCAGCACCACATGCTGAAATTTTAGAAAAAGCAAAACCATTATTAGAGAAAAAAGGTTATGAACTAGATATTAAAACAATTAACGATTACACTACGCCTAATAAATTACTAGACAAAGGTGAAATTGACGCAAACTATTTCCAACATACACCATATTTAAACACAGAGAAAAAGGATAAAGGTTACAAAATCGTAAGTGCCGGTAATGTTCACTTAGAACCTATGGCTGTATACTCTAAAAAGTATAAAAGTTTAAAAGAATTACCAAAAGGTGCAACAGTTTATGTGTCTAATAATCCAGCTGAACAAGGACGCTTCTTAAAATTCTTCGTTGATGCAGGTTTAATTAAGATCAAAAAAGGCGTAAAAATTGAAGATGCTAAGTTTAGTGATATTACAGAGAATAAAAAAGATATTAAGTTTAATAATAAACAATCAGCAGAATTCTTACCTAAAATTTATCAAAATGAAGACGCGGATGCTGTTATCATTAATTCAAACTTTGCAATCGAACAAAAACTAAATCCTAAAAAAGATTCTATTGCTGTAGAAAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAACGGTGCAGTTATTCCTGCTAATTAATTGCAATTAAATAATAAAACCCTTTAACAACAATAGTTAAGGGGCTTTTTATGGTGTTGGAAATAGAAAAAGGGCATAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAATACGCTCAGATTTGAGCGTATTATCCAAGCTTTACCTGTTCAAGTTTGTTCATCATATCCTTATCCATCTGTTTAGTAACGTGTGAATAAATAGAAAGTGTTGTACGGTGGTCGGAATGGCCTACACGATCCATAATAGCTTTAAGTGACACTCCTTGTTGAGAGAGTAATGATATGTGGCTATGTCTTAATATATGTGAAGAAATTTCTTTTTCAATACCCACATCTTTAGCTGATTCCCTAAGGATTTTATTGAATCTTTCAGTCTGCATTGGGTTGCCTTTATGATTAGTAAATACAAAATTTCTATTTAGATATCCATCATTCCATTTTGAATCCTTTTTGTTCTCCAGTATTGCTTTCTTTAATATCTCGCAACTTCTGCTACTCAATCCAATTGTTCTATAACTAGACTCTGTTTTAGTGGTATCTTTTACACCGAATCCACCAGATTCATCGTGAAACCAATGGATGGTTCCGTTAATATTTAAACTCTTATTATCAAAGTCTATATCTTCATTTTTAATGGCTAACATTTCACCAATACGCATACCATTTAAGGCTTGGAATTCTGTCATGAGTGCAACGAATAAATAAAACCGCTTATGGATACCTGAGTGCATCTTCTGAGCCTTCATATTAATATCTTTGATGATAGATTGTATTTCATTTAATTCGAGGTATTTATTACGTTTAGCTTTCACTTCATCATAAGACTTAATCCTTTTATTTAACGTTATATCTTTTAAAAATTCTAAATCTTGCAGTTTGTAGATGCGTCTAGTGTATTCAAATACATTTTTGAATATGCTTAACGCATCTTTGTTTACTTGATATACATAACCTTTACTATCCATTTCATCGAAAACTTGTTGTGCATATGAAAGTGTTATTTTATTGATTAAAATATCTTCATCTACAAATTTCTTCAA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26 | Staphylococcus_phage(78.95%) | coat,integrase,terminase | attL 851936:851954|attR 874356:874374 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1035100 : 1043573
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP019712|1035100:1043573|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP019712|1035100:1043573|1035100_1035583_+|WP_001807816.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILATRMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_AP019712|1035100:1043573|1037401_1037665_+|WP_000848351.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >NZ_AP019712|1035100:1043573|1036697_1037402_+|WP_000174055.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_AP019712|1035100:1043573|1035569_1036694_+|WP_070973835.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNHLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKIAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_AP019712|1035100:1043573|1043006_1043573_+|WP_000238668.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLDSFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_AP019712|1035100:1043573|1041975_1043004_+|WP_000030815.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_AP019712|1035100:1043573|1038330_1040520_+|WP_000032750.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_AP019712|1035100:1043573|1040498_1041983_+|WP_000483707.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_AP019712|1035100:1043573|1037666_1038338_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1303645 : 1320584
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP019712|1303645:1320584|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP019712|1303645:1320584|1319107_1319302_+|WP_000780597.1|DBSCAN-SWA MKLWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NZ_AP019712|1303645:1320584|1306850_1307132_+|WP_155978114.1|DBSCAN-SWA MKNICIEINNDYLNGLVQKKIDEILSTYKRQVATVDIKDLVEITGLSKATLIQKIVCEPEIVAVTRRVGTRVLYLYPQVLDAYQTLINRIGGH >NZ_AP019712|1303645:1320584|1314615_1315044_+|WP_000090969.1|DBSCAN-SWA MARIELYEKLDIVNKLGLVEGWKRDGLTDEQIARNLGVSKHTLIKWKKNIPDFLDAIKKGKEVSDYELENALHKRAVGYYYEEETVTNKGEVVKIKKYEHANPTSLIFALKNRLPHKYRDKVEQEITNRNIEINIGDYVDDD >NZ_AP019712|1303645:1320584|1307302_1307464_+|WP_033857663.1|DBSCAN-SWA MSNTYKSYIIAVLCFTVLAICLMPFLYFTTAWVIAASTGIAIFIFYDEYFFRE >NZ_AP019712|1303645:1320584|1311896_1312187_+|WP_078101312.1|DBSCAN-SWA MLRQNNICEDASTNRQYTLRKNKSLIKQFFDSKQYLYQADRKVAHVHVVNDIYLIHGHHKTMFKGVKKKFNNKLEFASYIESNELYFEKAKQLSLF >NZ_AP019712|1303645:1320584|1316317_1317766_+|WP_155978117.1|portal|DBSCAN-SWA 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MTTIKINIKEPNKIFNKNIFEIINDYSHFTEVHYGGGSSGKSHGVVQKVVLKALKKWKYPRKVLWLRKVQATITDSLFEDVRSCLISFKIWDLCKWNKTDNKLVLPNGAIFLFKGLDNPEKIKSIKAVSDIVMEESSEFTLDDYTQLTLRLRERKHESKQIFLMFNPVSKLNWVYKYFFANGVQMEGVLIRQSSYKDNKFLDKMTKNNLEELANRNPAYYKIYALGEFATLDKLVFPKYEKRIINTDEIRHLPSYFGLDFGYINDPSAFIHVKVDVENEKLYVISEYVKKGMLNDEIAKLIKNLGFSKEVISADSAEQKSIAEIRKHGIGRIKPAIKGKDSIMAGIQFISQFEIIVDERCFKTIEELDNYTWKKDKNTGEYYNEPVDTYNHCIDALRYSVCNLIFKDKKTENKIDDLTRIRNMF >NZ_AP019712|1303645:1320584|1317755_1319108_+|WP_155978118.1|capsid|DBSCAN-SWA MSDNLKYWLERAKNVMDAESLVDAQAIIEIERIILLMYAEITKELLAFYAKYTKDTGLSIQEVKKMADSFDVLAFSNKAKQFVERKDFSEEANQSLKQYNLTMKISREKLLKQQLDLIVKDTSLNLQNKIEDKLSDAVNREVKRQAHILGEHVQIDDTEVKAVVNSNFKGAKWSTRLWNDMELVQKEVERVTSHVVIRGRHPNEFVSEFKKQTNSTSYNASRLLVTESARVQTESQKIAYLKDLGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPYVGNWRDKFFKEREGKYQVEVKEAKLQEKAKNQMKEMIESGKIKIEINPEKQNRHSLGHRLYEEYKKKNLLKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENEKKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK >NZ_AP019712|1303645:1320584|1303645_1304773_-|WP_000135759.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFEKRGNKWRYKVQYKDSLGTKKIISKSGFRTKAEAKKAALEVELNIKNGYKENMNYTLEKWLDYYLETWRKDKVNDSTYNIELYSKKRLLDIYDPNINIKNITPSMHQKFINTLIQRGYSKSTLSKTHHLMKRAMERAKYDRIIYFNPCDGISLQHKNLKEKVKAKYLPSDKINLFLEMVKKRDIYQYFLFRTLIETGIRIGEANALNWNDYDKKLKTLSITKSYDQKRKKFGTTKNKENRIIFISDKLAKELFKLRTLQNANKIANSELYYTDYDFMFCNEFGDPLPRSTTHNTMKYVTGKILGKGNELSIHKLRHTHATLLLESNVPMKVIQERLGHKSEFITSNIYSHVTEKMNNTAKENFEKYIRDIF >NZ_AP019712|1303645:1320584|1306589_1306826_+|WP_000842950.1|DBSCAN-SWA MKSTFDYNLLMDRMNEYRYSQNSLANAIPISRTSINHKLKGKNLFTQWEIKRICELLDIPPNKVGQYFFKVKVRKTVQ >NZ_AP019712|1303645:1320584|1308128_1308665_+|WP_001004327.1|DBSCAN-SWA MNELQARELETFEQDDRFQVTDLNSANWVFKKLDAITTKENEINELASSEIERINLWRDKEIEKLQSNKEYLQSLVIEYFRIEKEKDKKFKLNTPYGKVTSRKGAKVIQVSNENKVIEQLEQRGLNDYVKLTKKLSQSEIKKDFNVTENGTLIDVNGEILEGVRIIEKPTSYTVKVGE |
29 | Staphylococcus_phage(59.09%) | capsid,portal,integrase,terminase | attL 1297368:1297385|attR 1322562:1322579 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1605076 : 1613388
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP019712|1605076:1613388|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGACTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTGGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATCTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGTGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCTGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCGATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACCACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTTCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATATTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAAAATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGACCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTAGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCGAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCTATCGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATAATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTTATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAATAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACATCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGACCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCAATCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATCTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTAGTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGCCGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGACTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTATCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGGCAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP019712|1605076:1613388|1611588_1613388_-|WP_029549652.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPVNYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_AP019712|1605076:1613388|1605076_1605862_-|WP_070004449.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHSRECCN >NZ_AP019712|1605076:1613388|1608347_1609448_-|WP_000683941.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDYHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGSIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_AP019712|1605076:1613388|1610258_1611365_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_AP019712|1605076:1613388|1606887_1608234_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_AP019712|1605076:1613388|1605987_1606878_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_AP019712|1605076:1613388|1609450_1610128_-|WP_155978176.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINNEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1682812 : 1691855
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP019712|1682812:1691855|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTCACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACATTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCTCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTCAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTATCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTAATGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATCGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAAATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAATAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAATATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCTTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAAAGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTCGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGTACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATGGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATTCTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGATTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATAGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCAGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATACGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGTCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGCTGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTGGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCTAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTTACTTCCATTTCATTGGCAATAATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP019712|1682812:1691855|1682812_1683331_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_AP019712|1682812:1691855|1685828_1688108_-|WP_155978184.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVIIYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_AP019712|1682812:1691855|1689823_1690849_-|WP_155978185.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNDKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSNRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_AP019712|1682812:1691855|1688661_1689801_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_AP019712|1682812:1691855|1683352_1685626_-|WP_070973931.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPMSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCEHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_AP019712|1682812:1691855|1688382_1688643_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_AP019712|1682812:1691855|1690850_1691855_-|WP_064271420.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTQRGRKATPLAYEHFAKSNEERE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1815323 : 1876374
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP019712|1815323:1876374|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(83.33%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1956662 : 2056266
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP019712|1956662:2056266|DBSCAN-SWA 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MKINKLTISNFAGIKEVTFNFDGKDAKIYGNNATGKTTTATALQWLLFDKGLDGSTKSFNPVPLNEKNAENYELIPTVFAEFEIDGKITTFKKESHPKYTINQKTNRKEYSRSRTKKQYINDESIKVKDYKARIDELIDEDVFKLITNPQAFNLLDWKKRRSLLFEIAKPINDEDVIKTNDDFKELNNILGDHEIETKKKILTDKIKQINKDIKDIPIRINQTQQNKQDVPEFDNDRYAIIKQEIEQLENERIDIQNGKEEINLRNQLADKQSELKRIEDNNSASNENKIHALTNELHVENGTVANLKTRLKQNKQQITHEENRRNQLLENHKGLKSDLEKSKNQKFEHLDDNVCSCCGQQLPTEQVNEAREKALQKFNVKKSKELETIQTSINHIISEGKKIKPIIEKLEDDNNNLQIKINEAEERSARIQNKINKLKTTHVDVTQTDEYKAVMLEINEINQKRSNIRKTIQDKVSGIDDKISELTQEKSEIEVSRSIEKSNKHLDDVISELRNEEDRLLDEKEKYSHDLYILKEFTTTKVKMLTENINNEFDIAEFKLFNTLVNGELEETCSTTVNGVEYDSGLNNASRINVGLDIINTLSKHFKVTAPIFIDNAESVTELIKTESQQIQLIVNEQDKKLRMETI >NZ_AP019712|1956662:2056266|2019439_2019664_-|WP_071621395.1|DBSCAN-SWA MPDSIKTLKVGDTYDLNVVVEPSNQSKLLKYTTDQTNIVSINSDGQVTAEAQGIATVKATVGNMSDTITINVEA >NZ_AP019712|1956662:2056266|2006851_2007226_-|WP_000340977.1|DBSCAN-SWA MDDIQKIKKELSELVERVDDVEILANETADHVLELREEHKQHHNELRESHKELKDKQDKVVDENLEQTKILNRIEERYQTQVDVAQKNEEKTLAQNKWLVGAIWALVTIVMIAVITASITALLP >NZ_AP019712|1956662:2056266|2037115_2037442_-|WP_000165375.1|DBSCAN-SWA MTKNYKDMTQEELRDLLAEKNGELFEVVNEINKETEFAVLLFSTVGVSNGDTTSSSHCALGDIVGLANLLNNENDYHDIANVIEMYKLKKLLGLADNKEDENDVLQNG >NZ_AP019712|1956662:2056266|2000893_2001244_-|WP_000702263.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGQKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NZ_AP019712|1956662:2056266|1983266_1984646_+|WP_001021224.1|DBSCAN-SWA MNIIEQKFYDSKAFFNTQQTKDISFRKEQLKKLSKAIKSYESDILEALYTDLGKNKVEAYATEIGITLKSIKNARKELKNWTKTKNVDTPLYLFPTKSYIKKEPYGTVLIIAPFNYPFQLVFEPLIGAIAAGNTAIIKPSELTPNVARVIKRLINETFDANYIEVIEGGIEETQTLIHLPFDYVFFTGSENVGKIVYQAASENLVPVTLEMGGKSPVIVDETANIKVASERICFGKFTNAGQTCVAPDYILVHESVKDDLITALSKTLREFYGQNIQQSPDYGRIVNLKHYHRLTSLLNSAQMNIVFGGHSDEDERYIEPTLLDHVTNDSAIMQEEIFGPILPILTYQSLDEAIAFIHQRPKPLSLYLFSEDENATQRVINELSFGGGAINDTLMHLANPKLPFGGVGASGMGRYHGKYSFDTFTHEKSYIFKSTRLESGVHLPPYKGKFKYIKAFFKN >NZ_AP019712|1956662:2056266|1997063_1999133_-|WP_000669728.1|DBSCAN-SWA MKFKSLITTTLALGVLASTGANFNTNEASAAAKQIDKSSSSLHHGYSKIQIPYTITVNGTSQNILSSLTFNKNQQISYKDIENKVKSVLYFNRGISDIDLRLSKQAKYTVHFKNGTKRVVDLKAGIHTADLINTSDIKAISVNVDTKKQVKDKEAKANVQVPYTITVNGTSQNILSNLTFKKNQQISYKDLENNVKSVLKSNRGITDVDLRLSKQAKFTVNFKNGTKKVIDLKAGIYTANLINTGDIKNININVETKKQAKDKEAKANNQVPYSINLNGTTTNIQSNLAFSNKPWTNYKNLTAKVKSVLKSDRGVSERDLKHAKKAYYTVYFKNGGKRVIHLNSNIYTANLVHAKDIKKIEVTVKTGSKANAERYVPYTIAVNGTSTPNLSDLKFKGDSRVSYSDITKKVKSVLKYDRGIGERELKYAKKATYTVHFKNGTKKVINLNSKISQLNLLFVKDIKKIDVDVKTGSKAKADSYVPYTIAVNGTSTPIASKLKLSNKQLIGYQDLNKKVKSVLKHDRGINDIELKFAKQAKYTVHFKNGKTQVVDLKSDIFTRNLFSVKDIKKIDIDVKQHTKSNKALNKVANIATKVKFPVTINGFSNVVSNEFAFLHPHKITTNDLNAKLRLALASDQGITKHDIGLSERTVYKVYFKDGSSKFVDLKAAKQDSKVFKATDIKKVDIEIKF >NZ_AP019712|1956662:2056266|2028478_2028628_-|WP_000595265.1|DBSCAN-SWA MIKQILRLLFLLAMYELGKYVTEQVYIMMTANDDVEAPSDYVFRAEVSE >NZ_AP019712|1956662:2056266|2025171_2026833_-|WP_000625088.1|terminase|DBSCAN-SWA MISNKYVDEYINLWKQGKIILNKERIDLFNYLQKHIYSRDDVYFDEQKIEDCIKFIEKWYFPTLPFQRFIIANIFLIDKNTDEAFFTEFAIFMGRGGGKNGLISAISDFLSTPLHGVKEYHISIVANSEDQAKTSFDEIRTVLMDNKRNKTGKTPKAPYEVSKAKIINRATKSVIRYNTSNTKTKDGGREGCVIFDEIHYFFGPEMVNVKRGGLGKKKNRRTFYISTDGFVREGYIDAMKHKIASVLSGKVKNSRLFAFYCKLDDPKEVDDRQTWEKANPMLHKPLSEYAKTLLSTIEEEYNDLPFNRSNKPEFMTKRMNLPEVDLEKVIAPWKEILATNREIPNLDNQMCIGGLDFANIRDFASVGLLFRKNDDYIWLGHSFVRQGFLDDVKLEPPIKEWEKMGLLTIVDDDVIEIEYIVDWFLKAREKYGLEKVIADNYRTDIVRRAFEDAGIKLEVLRNPKAIHGLLAPRIDTMFAKHNVIYGDNPLMRWFTNNVAVKVKPDGNKEYIKKDENRRKTDGFMAFVHALYRADDIVDKDMSKALDALMSIDF >NZ_AP019712|1956662:2056266|2005657_2006431_-|WP_000750406.1|DBSCAN-SWA MKKTAFILLLFIALTWTTSPLVNGSEKSEEINEKDLRKKSELQGAALGNLKQIYYYNEKAKTENKESHDQFLQHTILFKGFFTNHSWYNDLLVDFDSKDIVDKYKGKKVDLYGAYYGYQCAGGTPNKTACMYGGVTLHDNNRLTEEKKVPINLWLDGKQNTVPLETVKTNKKNVTVQELDLQARRYLQEKYNLYNSDVFDGKVQRGLIVFHTSTEPSVNYDLFGAQGQNSNTLLRIYRDNKTINSENMHIDIYLYTS >NZ_AP019712|1956662:2056266|2041581_2042514_+|WP_000759682.1|DBSCAN-SWA MKKYDIAVLDFETMNEHMNSPCEVAVSLIKDLSIVKVYSSYINPPNNRYNLKNAKIHKIPEDVILKAPKYPDIYQEILYLLKESHLIIAHNALFDISVLKNTNNYYDLPVPNFMYVDSINIFRSFHAISSFKLENLCSLYDIDKEKLHSAKFDVLALSKMLISLAKNNQHYSVLKLIHYMPKQYIRFSKYSNSPTKLFDSGFQKIHMKISEINKIEVESVIPILKDKNVVFTGNFDTEKQDLMILTRKKGAYIRSDVTAKTDILVEGVQDDKYKDVNGLVSKQRKAREYVGNGAKIQFLNEEDLINLIKE |
119 | Staphylococcus_phage(87.8%) | transposase,holin,integrase,tRNA,portal,capsid,tail,head,protease,terminase | attL 2021401:2021418|attR 2046127:2046144 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP019712.1|WP_000681966.1|1994791_1994968_-|hypothetical-protein |
1994791_1994968_-
Protein sequences of NZ_AP019712.1|WP_000681966.1|1994791_1994968_-|hypothetical-protein>NZ_AP019712.1|WP_000681966.1|1994791_1994968_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK |
58 aa aa | NA | NA | NA | 1956662-2056266 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019712 position: 2050051-2050081, mismatch: 2 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttttcgaaattctctatgttgggtccc Protospacer *******************.******* *** 2. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to NZ_AP019712 position: 2050063-2050039, mismatch: 2 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctgcgaacaa Protospacer *****************.*.***** |
|||||||||||||||||||||
NZ_AP019712.1|WP_000990056.1|1995209_1995308_-|hypothetical-protein |
1995209_1995308_-
Protein sequences of NZ_AP019712.1|WP_000990056.1|1995209_1995308_-|hypothetical-protein>NZ_AP019712.1|WP_000990056.1|1995209_1995308_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA | NA | NA | 1956662-2056266 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.1|801792|31|NZ_AP019712|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019712 position: 2050051-2050081, mismatch: 2 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttttcgaaattctctatgttgggtccc Protospacer *******************.******* *** 2. spacer 10.1|1753252|25|NZ_AP019712|PILER-CR matches to NZ_AP019712 position: 2050063-2050039, mismatch: 2 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctgcgaacaa Protospacer *****************.*.***** |