Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426 | Wolbachia pipientis strain wIrr chromosome, complete genome | 16 crisprs | RT,cas3 | 9 | 3 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_1 | 223178-223301 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_1
>1.1|223224|32|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder CGCGGTATCTCCAGATCCCGCTAACAAGCAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_1
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_1 >merge|NZ_CP037426|1|223178-223301|CRISPRCasFinder GGGATGACGAGACTTATCTTTATGCCGCCGCGAACCGTCATACCGCCGCGGTATCTCCAGATCCCGCTAACAAGCAGTGGGATGACGAGACTTATCTTTATGCTGCCGCGAACCGTCATACCGC >NZ_CP037426|1|1|223178-223301|CRISPRCasFinder GGGATGACGAGACTTATCTTTATGCCGCCGCGAACCGTCATACCGC CGCGGTATCTCCAGATCCCGCTAACAAGCAGT GGGATGACGAGACTTATCTTTATGCTGCCGCGAACCGTCATACCGC
>NZ_CP037426.1|WP_155968440.1|221702_222959_-|hypothetical-protein MIKEIEELIKIVGKGNLLETLFIFLGSFQHADLDRFMDHRNHFGLSEFIRKKEEPLDKYFNLKFSLQGLFLIYAQAYKILSENNNLNTKDVIDKIYEVIKGSELNEYINEVVDGRKLDLLNILANPKREPIFKTEKDFESKVLIGVRKVLDEETTLNKYDREFALNKCVISSYYSIHQDIKVDKDVVLLFSILVDYHKLSEHHKESIKKENLPIIDNVVFLTYITNLAGLLQSINLKDQNRATKYTLNREKIGSLNRTFNMLADQNNQNFPTFKSIGPTLKQLLKNQNSDEFEQLVTNPKNIYYSVPQKENKCRSNFIVSKKKEKNHKNTACKLILGMFVLSVGLSVADYFLMEQKLFNPIKGVLPQDNFANLVIAAVLTIVIVYALFQLSQEPPLSTVNKMTNENLGQPVQNKLRTT >NZ_CP037426.1|WP_155968438.1|221136_221643_-|inorganic-diphosphatase MDLSKITAVPNAVNVVIEISANAEPVKYEFNKELGLLQVDRFLSTSMTYPCNYGFIPNTCAGDGDPVDVLVLTQFPLASSVLISVRPIGALLTKDEKGEDEKILAVPVSSVDSYYDNIKDYSDLSKSLLDKITHFFSHYKDLEKGKTVAVGEWVGVEEAKKIIEKSRN >NZ_CP037426.1|WP_155968436.1|219341_220487_-|peptidylprolyl-isomerase MYRILILLLIVLPLRLLATEIEIVADVNGEPISNLDIEKRINFINSLFGTQSVNQKEAKPQILRELIDEIIIINEAQRLNIKLSNEELDNAIMLFLTQSFKLKANEVDQYIEKHNIDLGILRKQIKCQLLWSKIIEVRIVPFINISDKEVDDVKRQTEKPDYLITFQEFIIPDQKDKDVYGIAEDLVKKLRNSNNPESPIKMRKATVNLSQLKGKLKSVLEGLETSDIAGPFSFSEGYSVIKVIDKVQLNHALLESTLKLKQIVVEGSESLLDNLKEQKVNCLNFDKLADNFKLPNAKEFEIKMRDLNPDLQILFSKTSVNEIVELRENGTAKLMMLCDIKSNVAGIEAIKQKMYQQKIMIQSNLLLDDMRKNAAISYRYS >NZ_CP037426.1|WP_155968434.1|218617_219238_-|oxidoreductase MKNIMLIGGGVGNAVLFSIGKACLENNNKVLYFAGYKKLSDVFKRALIERASNAVVWACEEGLIETSRDQDKSFHGNIVDAIVSYQQGRLGINLNVIDKIITIGSDKMMKAVNEARKTILKPYLKSSHIAISSVNSPMQCMMKEICAQCVQQHINAKTGERSFVYSCSNQDQDMEFIDFDFLSERLKQNSLQEKLTAKWIDHVQRY >NZ_CP037426.1|WP_155968432.1|218082_218634_-|5-formyltetrahydrofolate-cyclo-ligase MFKDIKQHKKEIREQYRAIRKDIDESYSSYAANSLINLFNQNLSYVKGKTIAAYIPMDEEIDVVPLMHSLLDLDYKVAIPNKNKLLKFEEWNETNEDVIPDTIITPVIAFDDHFNRLGFGGGWYDTMIEKLRPLGKIFIGVAYEKQYCKDLPVEKHDQKLDIIITEMCVRCGSGLLKKVDKKE >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|217440_217788_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|216929_217421_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_083250453.1|215892_216309_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MKIEHTTSPSSKDIEFLLKKINEETVDKGTCNPFAFFIRDDTEQIIVGCSGFVIYGSIYTDLLWVHSDYRRKGMGKQLMEEVHDYGREMHCKIATVATMNFQKAKVFYEKLGYKCDLVRPGYVNMYIFEESVVRCTVK >NZ_CP037426.1|WP_010962525.1|215173_215884_+|heme-exporter-protein-CcmC MFLLKPTNFSYFSKKALPWLGVICFACFLIGMSLALFFSPEDYKQGEIVRIMYIHVPSAWLALGIYGLIASLGFISLVWNNSIASVLAHAAAPAGTVFSAICLITGSIWGKGTWGTWWVWDARLTSMLILFFLYVGYLSLWSAFDNEARAEKSAAVFAIFSAINIPIVKFSVNLWSTLHQPASILRKGGIAIESSLLLPLVAMFMFCATFFLVVWILYSLYLINLYKIKREISMRY >NZ_CP037426.1|WP_006280267.1|214207_215038_-|kinase/pyrophosphorylase MTLKKLNLHLVSDSSGETVISVAKSALKHFRSVETIEYVWSFVKGEEQIDKILEEINRKSDEHNFVICTITDDELRKYLKDNCIKLKIPYRAILSHIIREISSYLEIEKDEKLDLHTEINNEYFQRIEAINYTINHDDGQNIQDIDKADIILVGVSRTSKSPTSTYLAYRGYKVANIPFVSGVPFYVDLAKLKNKLTIGVTIDVSRLIEIRKNRLTSINNEDNNIYANPEKVEKEIKEAEELFKQNNWPIIDVTQKSIEEVSATIIQYFNKMLSID >NZ_CP037426.1|WP_155968442.1|224083_224281_+|hypothetical-protein MSLNYHNLKEHPRNFRDVTGLKIEEFEKVVEKVRPEWEKVQEQKKCHGRTSRLPVLEDKILCIIL >NZ_CP037426.1|WP_155968444.1|224428_225667_+|IS256-family-transposase MSQKIANRTTGLVDYKELETNILSSIREGRPLTGRDGTLTPFIKKLLEVSLEGEIENHLSAESEENNRRNGRNSKTLRTSAGSFELLTPRDREGSFEPQVVRKRQTSLHPELEAKVLSTYASGMGYRDIASHVEEMYDHKISAAEISSITDKLLPIINEWRSRPLQSVYPIVFMDGMFFKVKEDGHCVSKCMYNILGIDQNGRKEVLGFYLAESEGANFWLGVLNDLKERGVDDILIACVDGLKSFPTAINSVFPNAEVQLCIVHQIRNSLKYVSSKDVKVFMNDLKKIYRATSKEIAVNYLLELEERWGEKYPLVVKSWQNNWENLSSYFKYSGPVRKLIYTTNPIEGLHRQIRKFTKTKGSFTSTNALYKQVYCAIKKAGEKWTMPIHDWALTMSQLDIFFPGRLKIELN >NZ_CP037426.1|WP_155968446.1|225937_226837_+|EamA-family-transporter MDYRLRAYLFGVIWFILSLLSSVANDTISKYLSLHLQSFEIIFFRFLFTTITLVPFMFYYGIETFKTSQISTQITRGGLLFCGMTLWTYGLTVFPIVTATIISFSIPLFVILLAIPLLNENIIWQRWIVTVIGFVGIAITTKAHSEDFNPKILIFIVSALIFAILDILNKKLVIKESVISMLFYSALMTTIFSTPPLLFCWRVPSLLELVLLLILGINSNLILLFMLKAFTLTDATALAPYRYIELIISAIVTYIIFNELPDKSALYGTLILILSTLFIAYSEGKAIKKNNVTIKVYNC >NZ_CP037426.1|WP_155968448.1|226884_228192_+|nucleotide-sugar-dehydrogenase MHITIIGVGYVGLVSGTMLSEQGHKVDCIDINTEKIELLKSGKIPLYEPGLADYLENNIKSQRIRFFDSYFQINPNTEVVFITVDTPSDSLGNANLQNVYNAVSEVSERVNQDCLIVIKSTVPPGTAENIYNYLSNKGYNFDLGVNPEFLKQGSAVSDFLYPDRIIIGVKTKLARAKLEVIYRSFIDKNIPLIVTDTVTAEMIKYASNAFLATKVAFINEMAGLCELLGADIDLLANSMGMDHRIGKEFLKAGPGFGGSCFPKDLSALIRLAEDHNVKLQILNSVKESNYNHITNIAKKVEYVLNGVQNKKIAIWGLTFKSGTDDVRNSPAIDIAQLLVNNKAKITAYDPMGMDNARQVLKDIEYADNAIGAARDAEALLLLTEWKELKNQDFASLKSIMAAPNVFDFRNLLDSELLLRYGYHVYSLGKKSIYKV >NZ_CP037426.1|WP_006280071.1|228209_229355_-|MFS-transporter MLLYLSRQSIPIALPLLIDTDHVKLSYFFACFSFFYGVSKFVNGIIMDSKNNPLFMFGLCNIATGLLTIGITLSYNNLTLLLLTLILLAWTQGLGWPAITKFMVTNSSISSIASSWGVMSASQQLGSCITLIVLPSIIKIYNAKSAFLYSGFLCLLFGIYIILKAYYKESANFTTYYKVQKSQIGIKVTSSIWFLCCATFCAYIIKMGIFFWFPIILKNKLQISLVQSSLITGVYDLGGILGTLITGRISDMYFFQNRSLLASLYMLGIALTFIAMNFGQNIILMNLCAILSGFFIFGVQVLTGVIAVEIAPQNNVCAIVSLTGLFGYIASSIFSCVLLGVLVKHCGNSIMFSFFSICSVVALVCFSILSSKDLKKLSKAV >NZ_CP037426.1|WP_006280070.1|229482_230535_-|low-specificity-L-threonine-aldolase MRVKIDFFSDSNTDPSAKMREAMAKAKVGNEAACEDPTVNELVATACKILGKPAGIFLISGTMSNVIAYKVHIQRPGDYLLLDETSHPLIVQSGLIAAQAHATPLPIKGTRGIFTGEQIVEFITRPSLRNIPRVGLVSIEQTTNFGGGAVWPLEYIQEISSLCKENDVFTHLDGARLFNACAHTKISPKEYASYFDSVFIDFSKGLGAPMGAILLGSEDFIEKAWYYKFQIGGGMHQAGIISAACLYALRNNVNSLEEDHKKMQHLIEGLDSIDQVIIDIDLYKTNIAYFSLRTNCISTQELINVLMTNYGIRMANIKGKIRAITHRDISYEDINTTVSAIRKILSNFLH >NZ_CP037426.1|WP_155969545.1|230531_231581_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MEKIIDLRSDTTTLQGSNVIHAISNATVGDFAYGEDKSCNDLSEYCKQLFKVEEALFVTSGMLANRLAIASQTSPGDELITHYNYHVNFFDSAGNAKVNNIVFNCIRNNSGILDVDEVEYAINSKPRYKIFAQVSLVSIENSINGFNGKIYPFEKQVELYHFLKAHNVNLHLDGARIFNAHIETNIALADYAKYVDTMSFSFTKGLGAPFGSMLMGKREIIERAKKLQVWLGSGYHQIGYCANAAKYVLQNNISRLKEDNKLAKLFADKIKEIPHIKLVLPYPETNIVSFSIKALNVTNEVFLSKCQAYGLLLFPWLESHIRAVTHLGTKETDIMKAAEIIKEVVLNLI >NZ_CP037426.1|WP_155968450.1|231582_233358_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNRSRVDSFKCVLMFILNIVSKFKLNVLIMSLVALVVAVDLSFRKYLVKNILDTAVKYQEGNVIENLLLPVSAYLGMALLITTAFRFYGYFVDIRMFTLMRQKIADMSFCRLLQQDHSYYQNNLSGSLVHKASNLMDSVIELIRLLIDCFFGYSIALVLAIYTLSLVNIKFAIATFTWVSIFILVSIFSFRVLTELADNYSKQNSQVIASIADSILNVISVRLFSQQAHERHKFFQICKKRTIAERKLQWAYFCLWFIYGYSFDILQAVNLYFLIYDYQLNKIAIGDIALVLGINISIIEFLNHLTRNLTQFSTHFGKVSDALPILTTVPEIQDKENAKELNLLSGRITFNNVSFSYEGQEPLFQDFSVTINPCEKVGLVGYSGGGKSTFINLILRLFDVKKGNIQIDNQIVSEVTQSSLRQQISVIPQDPLLFHDTILANIIYGRLQSTIAEIMRAAKLAGIHDFIMTLPDQYGTTVGEKGIKLSGGERQRIIIARAFLKNAPILFLDEPTSQLDSITEKTIQMSLFKLMKNKTTITIAHRISTLLHMDRILVFNKGKIVQDGKHAELVSKQGLYKELWNAQIGCLNGKK >NZ_CP037426.1|WP_155969548.1|233358_234348_-|phytanoyl-CoA-dioxygenase MEILQKNGFFIIKNLVPLKLITQSLSDITNKISELSQELSVSTSDYLNCTGRWGTSSQVTRIISQALDEIIKNYLEKSLQCQILQKKSNVICKTADLIDAVPFHQDISYSFNDPYHFSVWLALNNVSETSGALQIIENSHKWEIQPLVDFWYPYFFDQYSNNRENYKIKSLPISAGDAIVFDSRLWHGSDKNTDAKDRFAYVTRWIIKDQDLPYVPKPQPSVFGILNCGELTESVLRECLSLFGYQESVKAKNMEELIKSWLAFITDTTTNISEIDTTEAKRDLYKLLILNRASALHDAGDISGKIYKNLWFSLLVFLNKKVNVVELAL >NZ_CP037426.1|WP_155968452.1|234352_236029_-|hypothetical-protein MQNMQHEKTFDQLIKDNLKSIKISPCERFHELLGNPLYENRFIKVGKFHEPGLAPVYDQTGAYHINVRGEAVYHNRFLKTFGFYFNRAAVEDDTGCYHIDPSGCRVYKQSYQWIGNYQEDACVVRRHDKCFHINLNGNRIYQEEYDYVGDFKDGIAVVYKDSKATHINHHGKLVHNKWYKKLNVFHKGYSIAEDQHGWFHIDINGDPIYQQRFKMVEAFYNGMAKVETFEGVLEQIDITGNVKFSIFDLGKESQVHRISAELSAFWKTYLTSVAIELDLLNILPATMPVLSKKLNIIVPNLERLLRALWEIGFIDYDKDKDLWQLSSKGKCFKEIPFLPKAATMWARVAAEKNWLKIADILKQKSISSFESFKEREASEDKKIAFYQALLGYSRFDTKEFNSRINIDGAKNIFLFGVHSLFLAYSDIHNKGSIGLYNEHKVPRQLVENLKVKLITQEELSVTNYELGVFCRFLQHYDDDKVLSYLKLVKGISRILLIETILDYRSPTGGSVDINVMVETGGKLRTLSDWEKILKQVKGFKIFAVVPLTDYLSVIDVRY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_2 | 262927-263057 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_2
>2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder GGGATGACGAGCTTATCGTCATGCCACCGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_2
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_2 >merge|NZ_CP037426|2|262927-263057|CRISPRCasFinder AACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAGTAGCGGGATGACGAGCTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATGCCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAGTAGC >NZ_CP037426|2|2|262927-263057|CRISPRCasFinder AACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAGTAGC GGGATGACGAGCTTATCGTCATGCCACCGCG AACCGTCATGCCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAGTAGC
>NZ_CP037426.1|WP_155968478.1|262079_262754_+|septal-ring-lytic-transglycosylase-RlpA-family-protein MIKNLAFLCLIFVLMSSCSFSNRFNCTAGHYKIGSSYTINGITYYPKNCKHYEEIGTASWYGIEDHGTLTANGEVFNRHLISAAHKTLPLPCFVLVTNLENGRKLVTRVNDRGPFIEGRIIDLSEKAAQVLGFHKSGLAKVKVQYLRKMSEQLIQNTPHYRKQYEKEMQKRHPKQDSAESKGYVAFFKSAQAAKSAASKLRNQGIKNVRLLFKNDQYCVKVSYR >NZ_CP037426.1|WP_155968476.1|260628_262053_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MRILNYTIINLVMSKHLLLNINKTQEGIIHIIGIGGIGMSAIAEILHNSNCKVQGSDAQSNDNINKLQKLGIEVYIGHNANNISQAQIVVHSSAIESDNVELIAAKNNNKTVLHRSDILAEIMKGKYVIAVSGSSGKTTTTAMIASIFDHSNIDATVIVGGILNSYQSNSKLGKSDTFLIEADESDGTMLKIPANIAVITSINDDHMDHYGTFDNIKNAFFQFISKADFAVLPDSVGINYDASNSITFGFENGSIRASNIEQHNNSMEFDVLIDNNHRIKNVVLSNTIGMHKVSNALAAISVAIKLGISDADIKKGLFEFKGVARRFSLIADIKGVKLIEDYAHHPNEIQATLTAARSITKGKIIGIIEPLRFARIRNFFDEFIRIFMMFDYVILTPVHPPEDKPIPGCGINDIQEALISNGFNNTKIMNDALLISHFISDSTSPGDIVLFIGAGSNIAKLAKETAALIAEVKV >NZ_CP037426.1|WP_155968474.1|259349_260624_-|phosphopyruvate-hydratase MNKIINNVFAREILDSRGYPTVEVEIELCDGAIGRASVPSGASTGKLEALELRDQDEKRYCGKGVLKAVQAVNGIIADEIIGMNAADQNAIDEALIELDGTKNKSKLGANATLGVSLAVAKAAANSFKVPLYRYLGGEQTSVMPVPLINIINGGVHADNKLDFQEFMILPVGAETFSEAIRMSAEVFHNLRSILKKKGYSTNVGDEGGFAPNIESTEEALDLIIYAIESAGYSAQSDFALGLDVASSTFCHNKIYKFENKELTSKELTEYYCDLVEKYPIISIEDAMSEDDYEGWKLLTAKLGNKIQLVGDDLFVTNCELICKGIEEKMANAVLIKPNQIGTLTETFNAIEMAKSNGYKAVISHRSGETEDTTISHIAVASNCGQIKTGSLSRSDRLAKYNELMRIESTLGKDAKYYRGLAWVL >NZ_CP037426.1|WP_155968472.1|258339_259362_-|GTPase-ObgE MGFIDEVKLCFKAGDGGDGCASFRREKFVEFGGPNGGNGGKGGNIVFISDANLNTLLHFRYRRHIKADSGKNGAGRDRSGTAGKDVILKVPVGAQIIDEESEEIIVDLDKPGMEFQVAQGGKGGLGNTNFKSSTNKAPRHFTYGQPGEEKHVLLKLKVLSDVGIIGMPNAGKSKFLTRCSNSDTKVGDYPFTTVRPHLGMVKVDDSEVVIADIPGIITDAHLGVGLGHKFLKHIERCQILLHLIDVTHDDVVSAYSCIHNELELYNSDLVEKEEIVVLNKCDLLREAEILEKKNHLANYLNKEVLCLSINGDLQPILRLLSEKLKKSNSKEIDVYDPFKM >NZ_CP037426.1|WP_141457376.1|258165_258258_+|hypothetical-protein MPVSGHWDDTICHANCLQIAMFVQLCGRCK >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|257596_257944_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968470.1|257084_257396_-|hypothetical-protein MTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968468.1|254391_254949_+|transposase MGNLFVDLCTSLICSARLAAWNIGEQTLAEEQLPEVITQMRSLNQKKLLFIYDRGYPSVKFIQQHYDLEVDFIFRLQKRNYSKLWERIASGELDFDFILENEKLKNKMKGQKVRVIVLTLANGETEVLITSLFDRVKFTLEDISKAYVLRWHIEETTQNRCRIREFFWRKFRGCITRILGKLSHV >NZ_CP037426.1|WP_010962676.1|252610_253783_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-D MPDLKTMMLNFGPQHPAAHGVLRLVLEMDGEVIERADPHIGLLHRGTEKLIEHKTYLQALPYFDRLDYVSPMSQEHAYSLCVEKLLQCEVPIRAKYLRVLFCELTRILNHLLNVSSQALDVGAMTPLLWLFEEREKILEFYERASGARFHAAYIRPGGIAADVPEDLIEDIAKFIEQFPKYIDDVDELLTENRIWKQRTVGISEISIKQALDWGFSGPMLRAAGLAWDLRKSQPYEIYDQLDFDIPIGQNGDCYDRYLVRMAEIRQSISLVKQCIEKMPEGQIKTEDRKISPPSRAEMKKSMEALIHHFKLYSEGYHVPEGEAYAVVEAPKGEFGVYIVSDGTNRPYRCRIRAPGFAHLQALDFMAKGHMLADVAAIIGSLDIVFGEIDR >NZ_CP037426.1|WP_155968466.1|251156_252335_-|acetylornithine/succinylornithine-family-transaminase MDHVVNAYNRLDTPIVRGEGAYLFDKDGKKYLDFAAGISTTSLGHCHPYITDKLKEQSSSLWHCSNIFTIPEQERLAERLTTLTFADKVFFCSSGLEATEAAIKFIRRYFYSKGQAKRNRIITIEGGFHGRSIAAISAGGNEKSREGFAPLLSGFDKVPRNDIKALEEKINNEIAAVFLEPIQSEGGVYPLDVEYLQKVREITKAQGIILCFDEVQCGYGRIGSLFHYQNVGIEPDMLTCAKAMGNGFPVAACLVKDYIAEAITPGTHGSTYGGNPLAMTVGNAVLDIMLKEDFFDHVKRISKYLKEKLLLLAKEFPEMILEVRGEGLLMGIELATLVADKIISRSLDKGLIITRVLNNKVVRVTPPLIIEDEHVNAACNMLYDLFFKIKGI >NZ_CP037426.1|WP_155968480.1|263603_264968_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MAREEDINQLVENGFDINSKDASGITLLHKFTKEGDLVGVKSLLEHEADFNVVDNENRNPLHYAIMHGHKKVAKLFVNQLTINSKDKNGFTPLHLAALQDDTELIDFLITKGAKINEKDVKEGYTPLHIASLYGSKKSVQILIDSGANLECEDNNFRTPLFLTIYQCTAHYDSRAEIIEYLIKKGANIEAKDAENNTTLFLAAYNNKMQIVKLIAKKQQASNDKIKLKEFFCTKNNHGFDALDCAIEHNNRKMVTFLVSKGIEANDQDFNGNARLHKASHNGNTKTVKLLLKLKVNVNAVTKCNRTPLLLAVKKGHTQIVKMLLEVRANMNICEQQGFAPLHLAVQKDYFDIAQLLTEKGADLNIKCNNGHTAIDMFISKAHSKKNIEENYKKFCRFLMLYLKELHSKHKACCILSTLALSLTIIGLPFIFKPIIKYRERSKIYKKIRAMLVYI >NZ_CP037426.1|WP_015588942.1|265102_266590_+|type-II-secretion-system-protein MAIFKCLILLFIISCTHLPTKQYPINIDNYKHDYPLQQYNTSLEINEPAIPEIMPLPIEFPDLTISNQLISINVSEEVSVKDLLIEIGKLSDVNLDMDPKISGNIILKLKDKDINEVIQSIANSAKLRYSTSNGVIRIEQDLPYAQNYYVDFINIQHSAQSSFVINNNITNSDGSNVDRDYNNVMKSQYSSDLWNSLEKGLNAIMDVNGVDDGEFLSSNREAGVIILNARKDIHKAVEEYINKVKKLASSQVMIEAKIVEVVLDDKYLSGMNLNDLQDGTKSIINQDNSIINLAMNFGANDLGDLVKNLDKFGTSTVISSPRVHAINNQQAMISFTKNHIYFTSDIQKDTRNSNQTLITKMNSVPIGVVLIIHPSINIDTSEIFMDIHPTLSRINGYTKDPDIEYVAQQSKMKLNSDIPIVEIREMNSMLKIKSGEIMVIGGLIEHREDKQSLLHQKSKRLANNIRTVETVIFLKATIVPTFGLLDRKDKNLYIY >NZ_CP037426.1|WP_070357048.1|266597_267509_-|P44/Msp2-family-outer-membrane-protein MITRISITLFLIFISCVYFFITYISNDTHIEQVQPLKLETDNNKSVIRSEEVTAKEIPIKYQELESSPPSVFQVADQKNMWSRIADQAEPTKEKSKKLDFYVSANGGKVYHDNSEIFVKGIQEIGKRVLTLVESHYGFIIKNIVADEIKSIQQFDGKIDFQWFSSMSLGYYAGENGKIDFEAAYSIANIEDSNSPPVFDKSASIFAFLLNFYYNPSVQDTQFAPYIGLGIGPTVFRLKRINGSPQNSMPLNVPWFAYQIKLGVDYSIIPEIKTFLGYRYFSVPIPVADDISTHNIEVGLIFNF >NZ_CP037426.1|WP_010082135.1|267575_268802_-|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MNEVITFGCRLNFYESELIKEALKKAKRENVVVVHSCAVTNEAERQVKQKIRKIYKNDPNKEIIVVGCAVQLDPEVYSSIPGVSKVLGNQDKLKAENYLLNDDKILVSDNQVEPVLINGFEDKSRAFIEIQNGCNHSCTFCSITEARGNNRSVPINSIIEQIRIFVENGYQEVVFTGVDITDFGTDLLGKPSLGSMIRRVLKDIPELKRLRLSSIDVAEVDDELMDLIANESRLMPHLHLSLQSGNNLILKRMKRRHNREQVIEFCHKMKSLRPNIAFGADIIAGFPTETDEMFQDTVDLLKKTNIVYLHAFPYSERKNTPAARMPQVPENVRKERVKNLREVNKEIMSSFCQSLINTKQSVLVEQNNVGRAENFALIKLESKAQAKSIVKVNVKGVENNYLIGNIFS >NZ_CP037426.1|WP_155968482.1|269191_270661_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatA MNELRKLSITQMHDGLKKKSFSAVELVEAHISAVENEKLNAFITKTPEIAMKAAKAADEHFSRQKDDLISPLMGVPVGIKDLFCTKGIKTTACSKMLENFVPTYESTVSDLLLKSGAAMLGKLNMDEFAMGSANTNSYFGPVENVWIRKSDGEKVVPGGSSGGSAASVAGFLCAGALGSDTGGSVRQPAAYCGVVGIKPTYGRCSRFGMIAFASSLDQAGVITRSVSDSALMLEAICGYDTKDSMSSEKPVPKFSSFINGDVKGKRIGIPKEYRMDGISEEIVHNWEKVASYLKENGAEVVDVTLPHTKYAIPVYYLICSAETSSNLARYDGVRYGFRVDADTLEEMYSLTRAEGFGKEVKRRILIGAYALSSGHYNEYYEKAQCIRALIRNDFIKAFEKIDYILVPSAPTEAFGLNEKPDPLIMCINDVFTVPASLAGLPAISVPVGLSNEGLPLALQVIGNYYDEAGILNVASVIEQNCGRIIRPLA >NZ_CP037426.1|WP_155968484.1|271520_271823_+|transposase MAREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQPVAKVARDLGIRDSVLGKWMKKYNEKKSAANAFPGRGNMAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFI >NZ_CP037426.1|WP_080717636.1|271807_272161_+|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLAAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNGIQAILRRKFKIKKQQTDSSSQYIRPKLYCRSTK >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|272366_272858_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|272877_273225_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968486.1|273979_274777_-|hypothetical-protein MSNINRIIREVIKEFRSKLPDKEIEEYSGKLNKLHIYQCNKHIIENKKLYHYTINGKTHAMGQHGHNFVKSLEVILRNKPQISLEEVIDFMEKIINFGIDSCYGAFEMIFESRSGVTIDDAVNFVKDSLSSKFYRFHGSGIFKVILELNPESSLEEIEKQFSKVVDPYFLNAWSRESERAFAKICRLCREGHVENMQKFDFSNFNLDQDSAGALRALLQYCVDVSNQKALGDSHELHREEMEGIYKFDDNYDLNLDSDHNDSIWH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_3 | 280194-280477 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP037426_3
>3.1|280241|34|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder CAGCACCATTAAGCCCTGCCATTAGCTCTTTCTT >3.2|280241|38|NZ_CP037426|CRT CAGCACCATTAAGCCCTGCCATTAGCTCTTTCTTTAGC >3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT TTGCAGCATTACCAATCTTTACCTCTAGC >3.4|280394|41|NZ_CP037426|CRT CAGCACCATTAAGCCCTGCCTCTAGCTCTTCTTTTGTTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_3
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_3 >merge|NZ_CP037426|3|280194-280477|CRISPRCasFinder,CRT CCTTTCTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTGCAGCACCATTAAGCCCTGCCATTAGCTCTTTCTTTAGCTTTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTGTTGCAGCATTACCAATCTTTACCTCTAGCTCTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTGCAGCACCATTAAGCCCTGCCTCTAGCTCTTCTTTTGTTGCAGCACTAGCAAACTCTCCTCTTAGCTGTTCAACTTCATCTTTTG >NZ_CP037426|3|3|280194-280321|CRISPRCasFinder CCTTTCTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTG CAGCACCATTAAGCCCTGCCATTAGCTCTTTCTT TAGCTTTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTG >NZ_CP037426|3|1|280198-280477|CRT TCTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTG CAGCACCATTAAGCCCTGCCATTAGCTCTTTCTTTAGC TTTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTG TTGCAGCATTACCAATCTTTACCTCTAGC TCTTCCACTGCATCTTCTATTAACTTTTTCACTTCATCTTTTG CAGCACCATTAAGCCCTGCCTCTAGCTCTTCTTTTGTTGCA GCACTAGCAAACTCTCCTCTTAGCTGTTCAACTTCATCTTTTG
>NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|278653_279001_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|278142_278634_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968492.1|277061_278156_-|hypothetical-protein MIHFRKYYSSLATLTLLTSLALIVTSNVPLPLILALATLSILVLALSCKIISNNVELEAKVKGQLEHKEEMLSLEHQELRDENTRLNERVDSLMEELCQCKLESEKNKLCLKSEYEDELRLRLEYEDELNLELEHKSREASSLRTQLTMLRKKVEVEEVKQLKTLESEEQHESSESDIEELEKKLCQSEKEKKELEGKVSDERQKRTDLESKVDKLCTKEKEYLSKIKELEKESLSLQKEEKESDNTLTTVNDDRDNKVKELNSSLLKQSSQIEQLQKALLEKKKEEVLFLQRMIEYVTDEVEKLVRENEVIRDDDKKVILQVIQATKSVLVEEAAQYLPGETSVPSFVEDPGYTSICSTLINS >NZ_CP037426.1|WP_155968490.1|275531_276890_-|hypothetical-protein MSNLLSEANAFYFVASSLATLTLLTSLALIVISNVPLPLILALATLSILVLALSYKIISNNKKIEVERNKFAQKEQELENKITLEKEAEEAANKEVKNQLHESTREKQNLDKRAKRLDQKVNESEVERESLLEEKKSLEKKLETAKNRTFEIDNELDKTKEEIDKLVAREEELHLKISCLREQLQEKEERITELKGKIDNNQCKELENKKLNEEVEKLRKEIRELYEKEDKFYKERDILRKKEDIFYKERDILYEEEKKLHTKLDDLKCEIRKINKEKENLSKKLEKKFDELDEANGLIENQSFELDGIRKDCNNEVKGLKNLLLERDSQIEQLEEDLLRNAEEKKGYLPEMLESVVDKVEKLVNNNEAIGDRSRKIILQETQKIKFILKEIMQFTLGEDSRCESPSEETFDCLLEDLGYASRSSTPIKLPNSLLTESYERNQSESICKTQQ >NZ_CP037426.1|WP_155968488.1|274826_275501_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MNPIICALDTQDLNKAISLANALRGKVGMVKLGLEFFAAQGLSGVQEVAKCNVPIFLDLKLHDIPNTVAKTVEVIKVLNIEMLTLHISGGTKMLEEALSVVQGTKIKLIGVTVLTSMSNEDLNELGVAREAKSQVILLAKLAKKIGLHGIVCSALEAQEVRRECGEDFKIINPGIRIDPGHDDQKRTATPKEAINSGADYIVIGRPITKTTSSAELILKSMKEF >NZ_CP037426.1|WP_155968486.1|273979_274777_-|hypothetical-protein MSNINRIIREVIKEFRSKLPDKEIEEYSGKLNKLHIYQCNKHIIENKKLYHYTINGKTHAMGQHGHNFVKSLEVILRNKPQISLEEVIDFMEKIINFGIDSCYGAFEMIFESRSGVTIDDAVNFVKDSLSSKFYRFHGSGIFKVILELNPESSLEEIEKQFSKVVDPYFLNAWSRESERAFAKICRLCREGHVENMQKFDFSNFNLDQDSAGALRALLQYCVDVSNQKALGDSHELHREEMEGIYKFDDNYDLNLDSDHNDSIWH >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|272877_273225_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|272366_272858_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_080717636.1|271807_272161_+|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLAAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNGIQAILRRKFKIKKQQTDSSSQYIRPKLYCRSTK >NZ_CP037426.1|WP_155968484.1|271520_271823_+|transposase MAREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQPVAKVARDLGIRDSVLGKWMKKYNEKKSAANAFPGRGNMAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFI >NZ_CP037426.1|WP_155968495.1|281309_283862_-|valine--tRNA-ligase MLKEKYGFKEVEDKCNILWEGSKVYKWNGEKDNTFTIDTPPPTISGKLHIGHIFSYCHTDFIARFQRMLGKDVFYPIGFDDNGLPTERLVEQTYKTRAKEVGREKFIEMCHEVIEKSKQEFKELFKSVGISYDWDLEYHTISKETVTLSQMSFIDLYNKGYAYRKMQPILWDPVDKTAIAQAEIEDKVFESSLNTIVFSTQENEQINIATTRPELLPACVAVFCHPEDARYTHLIGKTAIVPITKEKVPIIADDKVKIDKGTGLVMCCTFGDELDIYWQQKHNLPMKIIIDQDGRMDLDDVIPVLDTGIQEKEPMPAMTEEDIMSAYGQKKEEWIPVSATRMTDDILNEINGLKVTAARKRIIEILTEKGLLVESTNISHSVKCAERSGAPLEILPTYQWFIKTLEQKAQVLDKVKECNWYPSNMRKRMEVWIEGLNWDWCISRQRYFGVPFPAWYSKRKGEEGKIILAEVKDLPIDPLKDLPKGYSKEEVIPDQDVMDTWATSSITPQLSALAVNSEFSLPNHRYDTIFPADLRSQSHEIIRTWAFYTILKAHYHANSLPWKNIMISGWCLADDKKKMSKSKGNIITPHVILETYGADVVRYWAANSRLGVDTVYSENTFKIGKRLVTKLWNASKFVSMFMEKHQVMSINSAHETMDKWILSKLYKVIERATNNLLQFEYCEALGVIEEFFWKDFCDSYLELVKKRAYGSSLSAKQSLAYVLNIILRLFAPFLPYITEEIYHQLYSYNSVHNKSNWPSKEELIYDKYSEEMGDNVIQILNIIRKIKADNNVSVKHLIKKLMIKADLREDKLNQSAQDDLQAVCNAETIEWMQSELETEDGKYIVNIDLY >NZ_CP037426.1|WP_155968497.1|284113_284407_+|hypothetical-protein MSVEINGEIKLVGEEGGQKIQLIIPENDREKFKEYKNIDQNGKVIEGHYASFCLELEDDKEVTCVATSGKDGKFFIDSVKNESDKQSTSVIEERIRS >NZ_CP037426.1|WP_155968499.1|285399_285915_-|gamma-carbonic-anhydrase-family-protein MYHILKYKDYEPKIDESAFIAGGSHIIGKVEIGRDASIWFNCVVRGDVGSIKIGNGTNIQDGTVIHVDRNPGGDTIIGSMVTVGHFCVLHACTVHDKAFIGMGSTVMDHAVVEPEAMVAAGSLVTHGKVIKSGEIWAGRPAKFFKKMSNEEIKHITQSAQNYIMLMKEYKN >NZ_CP037426.1|WP_007548880.1|286059_286380_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MSVAVLSIFQIILVVVLVILVLLQPPGSSSLSGFSNTQQGVNSMIPVKSSENPLSRITAIVAGLFIINTLLLSGLCSKDVHKKSIAEKIILEKKQESESTSVPFEN >NZ_CP037426.1|WP_155968501.1|286379_287984_+|CTP-synthase 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MYKLNLVQTRVLISAILCRIAIWYDHMLFIDLVNIISREFCCAKDVYNRILQLFGIAGLGAMVRPLGAFIFGHIGDRYGRRMALTIAILLISIPSSLVAFIPSYSKIGITSTILLLAIHVTQGIALGAEQGGSSVYLIEHLPNKKKLGMFFGIISFGRSIGILLSVIVVIICKKNTDFNAWGWRLPFTFSFVLGLISAYSVYTLGETPAYEENRKQRNLSDLPIIELIKRYKRALILAILISVPVNVVVGFTIFLRTIAKEIVSVETYVTTYVNEIVLIITSILMPVSSIALGMLADKVGKERTTILFTVITMVLCCPVLSTAYYYKSYLIIMLGVMALSIIERGINPIGIVAAELFPTNVRFSGVSLSRNISYALHGGFTPMICTWFTITFPQVNFAAGLYVVFCLLVSLVAILQIKPQDKKFDWS >NZ_CP037426.1|WP_155968505.1|290280_290874_+|hypothetical-protein MVGVIYLAMLGVAAIIGAIIGTLIGLLLSFTSLSPLIIGGTVGAIYVVPLIAAFITILLYPIPYERHSGLTLKETACLAGLFIGSVAAGVGLVACGLTPIIKVDSLSSLSTTVSSLLAMGATIPVLLIATAIGVAIVIELAKQAKEYISGKIMQAEKEPVTDTHEEPGSKMEEAKEEKTARNKQAVRECSKNSPQPG >NZ_CP037426.1|WP_155968507.1|291227_292325_+|AAA-family-ATPase MKKIEISELLKRISICLLCVATIVSIAFLFAYMHTMLLSKGYELAAHYVSEAMPSVLLVVLLFIVWFVYDQVFSKLKEVELPISIELANSDDKRITFADAIIDDSLKQRLQMICCDQMTEEMRKLFGNKSINSLRGYILYGPPGNGKTLIARAIAGESNMNFISISGPELIGVYIGHGAHAVRELFKIAKKYSPCIVFIDEIDAVAQKRSTANNSAYHCRESLTQLLTEIDGFKSRKDIIVIGATNLIGGIDPALIRPGRLGQKVYVPNPNIEVRQKILALYMRGTKTDEKLSLQDIADKTEGYSGAELEQLVNEAKISAGAQRRLIVSEEDFSYALHRLSPEQERDRIRLVSNVKTQTEVSYSI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_4 | 300026-300477 | Orphan |
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|
5 spacers
spacers of NZ_CP037426_4
>4.1|300064|46|NZ_CP037426|CRT CCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTC >4.2|300148|43|NZ_CP037426|CRT GATGAGATACCGTGAATAAATCACGGCATGACGTAGGATTGCT >4.3|300229|46|NZ_CP037426|CRT CCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTC >4.4|300313|43|NZ_CP037426|CRT GATGAGATACCGTGAATAAATCACGGCATGACGTAGGATTGCT >4.5|300394|46|NZ_CP037426|CRT CCGCGGCAGAATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_4
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_4 >merge|NZ_CP037426|4|300026-300477|CRT GTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGGATGAGATACCGTGAATAAATCACGGCATGACGTAGGATTGCTGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGGATGAGATACCGTGAATAAATCACGGCATGACGTAGGATTGCTGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCAGAATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTCGTCATCCCACTACGTGTTAGCAGCTAAGAGATACCGCG >NZ_CP037426|4|2|300026-300477|CRT GTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCG CCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTC GTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCG GATGAGATACCGTGAATAAATCACGGCATGACGTAGGATTGCT GTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCG CCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTC GTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCG GATGAGATACCGTGAATAAATCACGGCATGACGTAGGATTGCT GTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCG CCGCGGCAGAATGACGGTTCGTGGCGGTATGACGGTTAAGCAATTC GTCATCCCACTACGTGTTAGCAGCTAAGAGATACCGCG
>NZ_CP037426.1|WP_155968519.1|299543_299720_-|hypothetical-protein MKKKAKEAPWLLSALKYWRFLCFKRLTSEIQPLLIATNLRCKCLRNLLSRKKDKESPS >NZ_CP037426.1|WP_155968517.1|297618_299022_-|Malonyl-CoA-decarboxylase MTKESLVKTDIVKVEDKKAVRSFFKILGGVADAVRSWIGNISPDLSNSRDIDSLVLKMNECLNPKGGEVSARKNAVSLGNLYLSLSEKGKIKFLQTLAEKFNPNKAEIDEKIREYKKNQDPELNYKFEQDLIKILESPRSKILKQFISLPEGLKFIVDMRSDVLKLKNQYRSLNPLESELKNILYTWVDVDLLDLRQITWDSPASLLEKLIKYEAVHKISSWGDLKNRLDSDRLCFAFFHYKIPNEPLIFVEVALVDKIADSIQHLLDESVPLNDPSNASTAIFYSISNTQAGLSGISLGNFLIKRVVEKLSQEFKSIKTYATLSPIPGFTKWLKNNLNQDVTLLGKLNIKQSSAEILESAEQLKTNVECTNETKQYMLKLCAYYLLKVNNSNGNTYDPVAHFHLSNGASIKQLNWMADTSEKGISQSAGMMVNYLYELPKIDNNHENYMVNKVISCSKKVSSMLKE >NZ_CP037426.1|WP_155968515.1|295746_297543_-|elongation-factor-4 MNNIRNFAIIAHIDHGKSTLADRLIEECNGLEAREMTNQILDSMDIERERGITIKAQTVKLNYTANDGNQYCLNLMDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGSLLVVDSSQGVEAQTLANVYKAIDNNHEIIVVLNKVDLPAADPEGVKLQVEEIIGIDASESVLISAKTGLGIKDVLEAIVAKLPAPQGDVNAPLQAILVDSWYDTYLGVVILVRVKNGVLKKGMRIVMMSNNATYQIDNIGIFTPKKVMTGELSAGEVGFITASMKEVADCKVGDTITEEKRPCSEALLGFKEVHPVVFCSIFPHKTDDFKYLREALEKLHLNDASFTFEAETSNALGYGFRCGFLGMLHLEVIQERLEREFDLDLTATAPSVIYRVTTRSGEILNIHNPSDMPDPTKIEIVEEPWIIATIMVPDQYLGEILSLCEERRGEQEDLSYIGNTTTALLRYKLPLSEVVFDFYDRLKSISKGYASLDWEISSYLVSQIDKLSFLINGEPVDALACIVHKSRAEKRGREICARLKDLIPRQQYKIAIQAAVGGKIIARETINPYRKDVTAKLYGGDVTRRMKLLEKQKKGKKRLHSIGNVNIPQNAFIQALKISD >NZ_CP037426.1|WP_155968513.1|294380_295136_-|hypothetical-protein MVCDNCSVIKFSGKMIMDIAYLAALISAAIIKIAAVILCAIMCISVFFILFKGIEELLDSKGFLSLLKTVGVISIILSIISLPLIILSLTTPSPLVVGIVGGIVGAISIIPLIVAYILLSITSKGLSQQPENYQHLFLTSLLLFIGNIIAGAFIAASGVFPICKVDSLSSLSAALESLPAVGIHALALTIATAIGVVIVIDLAKQAKEYISGKIMQAEKESVTDTHKEPDSKVDEAKEGNVKNERKVPLLP >NZ_CP037426.1|WP_155968511.1|293613_293967_-|hypothetical-protein MNPTIKRIFNIFLIVLFISFSHVGSAAADTNTDTTAQVICNIIGYVWGIGGPLMTVVIIGAALLAIFGRMPWPALFALGVFCAVFFGAKTIVTKVMGGIGGTGNTSLMDQCGVDKKK >NZ_CP037426.1|WP_155968509.1|292566_293565_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-E1-component-subunit-beta MATLSVREALCTAIREEMQNDSDVLIMGEEVAEYDGAYKVTKGLLKEFGENRVVDTPITEHGFAGLAVGAAFAGLKPIVEFMTFNFSMQAIDQIVNSAAKTNYMSGGQLGCPIVFRGPNGAAARVAAQHSQCFASWYSHIPGLKVIAPYFASDCRGLLKAAIRDLSPVIFLENEIAYGHEHEVSDSELSNKDYLLEIGKAAVIREGKDVTITAFSLKLMDALNAADLLSSKGIEAEVIDLRTLRPLDTQTVINSIQKTNRLVSVEEGWPFAGIGAELSAVVMEQGFDYLDAPVMRVTGKDIPLPYATNLEKKALPQVEDIVEAVHQVCFRKK >NZ_CP037426.1|WP_155968507.1|291227_292325_+|AAA-family-ATPase MKKIEISELLKRISICLLCVATIVSIAFLFAYMHTMLLSKGYELAAHYVSEAMPSVLLVVLLFIVWFVYDQVFSKLKEVELPISIELANSDDKRITFADAIIDDSLKQRLQMICCDQMTEEMRKLFGNKSINSLRGYILYGPPGNGKTLIARAIAGESNMNFISISGPELIGVYIGHGAHAVRELFKIAKKYSPCIVFIDEIDAVAQKRSTANNSAYHCRESLTQLLTEIDGFKSRKDIIVIGATNLIGGIDPALIRPGRLGQKVYVPNPNIEVRQKILALYMRGTKTDEKLSLQDIADKTEGYSGAELEQLVNEAKISAGAQRRLIVSEEDFSYALHRLSPEQERDRIRLVSNVKTQTEVSYSI >NZ_CP037426.1|WP_155968505.1|290280_290874_+|hypothetical-protein MVGVIYLAMLGVAAIIGAIIGTLIGLLLSFTSLSPLIIGGTVGAIYVVPLIAAFITILLYPIPYERHSGLTLKETACLAGLFIGSVAAGVGLVACGLTPIIKVDSLSSLSTTVSSLLAMGATIPVLLIATAIGVAIVIELAKQAKEYISGKIMQAEKEPVTDTHEEPGSKMEEAKEEKTARNKQAVRECSKNSPQPG >NZ_CP037426.1|WP_094189586.1|288885_290169_-|MFS-transporter MYKLNLVQTRVLISAILCRIAIWYDHMLFIDLVNIISREFCCAKDVYNRILQLFGIAGLGAMVRPLGAFIFGHIGDRYGRRMALTIAILLISIPSSLVAFIPSYSKIGITSTILLLAIHVTQGIALGAEQGGSSVYLIEHLPNKKKLGMFFGIISFGRSIGILLSVIVVIICKKNTDFNAWGWRLPFTFSFVLGLISAYSVYTLGETPAYEENRKQRNLSDLPIIELIKRYKRALILAILISVPVNVVVGFTIFLRTIAKEIVSVETYVTTYVNEIVLIITSILMPVSSIALGMLADKVGKERTTILFTVITMVLCCPVLSTAYYYKSYLIIMLGVMALSIIERGINPIGIVAAELFPTNVRFSGVSLSRNISYALHGGFTPMICTWFTITFPQVNFAAGLYVVFCLLVSLVAILQIKPQDKKFDWS >NZ_CP037426.1|WP_155968503.1|288600_288951_+|hypothetical-protein MSSQCPDYLDPEDLILTKWLHNKGWIPVSSTGMTLQGHWDDIILFSGFQTGMTAVLRHTVTVSLDPANKQRDDGCQGVSYLDETLSRSIKSHRRKLRPIKFLILRFYLQYCYQADQ >NZ_CP037426.1|WP_155969550.1|300657_301569_-|SPFH-domain-containing-protein MDKNTINDRNLSQIRFFPALILAVILMAIPLSLLAMYDTLALIHNSLVSMDGTALVLIIPFVILFVILFIILPTGFFINHPNESRVIEFFGHYIGTYFKPGMFITIPFTNKHVISLKFQNINTEKIKVNDANGSPIEISAVIVWRVSSPAKAYYNVNNYHEFVFVQSDSVIRELASNYPYDSESNEESLRKNSDKISDELRSMLQQRLDIAGIEITEARISHLAYSSEIAQAMLRRQQAHAITSARRHIVQNAIGIVEEVIAHFEKNKSLQLDGKQKVQLINNLLVALISEQDAQPTISLDNN >NZ_CP037426.1|WP_155968521.1|301576_302515_-|peptidoglycan-DD-metalloendopeptidase-family-protein MRLVIFVLLCILPAYATETSTDLAQPFQHGIRKKKATLTTESDRKLLFISSTIKSSFFATEGLAPNTVVKLINIYKDFGVDFKKDIVPKSKLEVLFERLPNNQKTEEKILYASLTINKKAISLYHYKSQDGKERYFNKEGISLKNGEIFANPLNGDYRISSKFGNRKHPVRGKIAFHKGVDYAAKLGTPIYAAAEGVIEYIGKNGGYGNYIKIRHKNEYSTCYAHISRFSGDIKLGSKVKQGQIIAYVGSTGVATGPHLHYEVIYNGKHIDPLTIAHKTKVKLPDHELREFKLFVNKINKTINREGSSEKEV >NZ_CP037426.1|WP_155968523.1|302511_303246_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MAGHSQFSNIKHRKGAQDAKRSQKFTKLIREIAVAAKQGLPELNPRLRSAIFAARKENLPKDKIETAIKNATGNVAGENYEEIQYEGHGPSGTALIVHALTNNRNRTASEVRYIFSRKGGNLGETGSVSYLFDHVGLIVYKAEGMNFDDLFSHGIELEVLNVEENDKEGLHVITCEIKDFGKVRDAFYAKFGEPELARLSWQPKDLIEISDKELIDKLSALVEELEDNDDVQYVEGNFTFVDKL >NZ_CP037426.1|WP_155968525.1|303305_304013_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamD MYKTLITCFIFLICSFTQSYADDLEKTETELYEEAVELFDQKKYKQAIRAFHKIEDLYPFSYWAMKAKLLSGVSHYNMGNYSSAASDMADYIYVYSNGEDLPYVYYLRVLSYYMQINKVQLGQQTAYKTLELATEYINLFPGSEYVDEIKERAKLITEHISTKEYSIGKFYLRRGEYLAAIKRFQNMASYKDSKYFSKSINYLVAAHSALGLDLEAEQYESMLLAENLQDAKPEA >NZ_CP037426.1|WP_155968527.1|304073_305015_-|hypothetical-protein MKIPSCKFSSTKKVPGKNKKKRDFEPLEEFFWDFWPTVDKEVKRERLEQELLALKKRELYRKCASLATMVPFTLLMAIELEKTYSDQVLLGVISGALSHTILPFTVLSLICTLYLIYNNRKIAQKERELEIIENGEEVKEKEHNISDIGQCLIYIEAITTALVIVGMIMGETSSLEAAEDAILFLANAIAFLATLVSYIDKHEKNKKKETEKSDLDEKSSKKTSNISVAGLALAGSSVFLIRRIMLIALASSLNPAVGPTLGLVGIAIFMAVQVLTIHSYSKTLKDPKVEGRGESRNAGSSDRSYKEEGPAIA >NZ_CP037426.1|WP_155968529.1|305126_305669_-|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MLKKNVPNLLTISRALAVPAIILSFYIENKYAGLITISIFVFACITDFFDGYLARAWKVQSKFGKLFDPIADKLIVVSTIIMLVYKQKINDFTIVPSIIIICREILVSGLREFLIATNVSLPVSKAGKIKTFLQMVAVVALIMNDYYMIQYTGAICLWVAAIVTVWSGYNYILAGIKQIG >NZ_CP037426.1|WP_155969552.1|305803_307126_+|malate-dehydrogenase MNDDLDSTTKQEALNYHSRGGKPGKISIMPTKPLSTQYDLSLAYSPGVAAPCLEIAKNPEVVYDYTAKSNCVAVISNGTAVLGLGNIGPLAAKPVMEGKAVLFKRFADIDAVDIEVGTENIEDFINAVRYLGPSWGGINLEDIRSPDCFIIEKRLNELMDIPVFHDDQHGTAVVVAAGIENALDIVGKKLEDVKIIMNGAGAAGIACLEILKSMGAKNIVLCDKQGVIYKGRNEDMNEWKEKYAIDTSERSLLDTIKGADVFIGLSAKDVLNEEMLKSMGKDPIIFALANPDPEVRPEFAKSVRPDAIIATGRSDYNNQVNNVMGFPYIFRGALDVHATTINDEMKIAAADAIAKLAREPVPGEISAVYGGRKMGYGREYIIPTPFDPRLISIVAPAVAKAAVDSGVARKAIQDWSKYENQLKSRLSNVLSTLNLLSSHM >NZ_CP037426.1|WP_080717615.1|307140_308013_-|P44/Msp2-family-outer-membrane-protein MLTFSFRCLSYDDKINNLENVYIKANYFGAFFNAIGSLEGKEDAGDNITEGVFSFNKKERIEAGYSPKYVPGFAGSAAIGYLFKNMRVEFEGLYSQTNLYDEDYSDKKKARYIELRRHNDASTGAECNSPWRSGKVDIHIQENCSVEAEFRAAFKMKNEGFNNLAGMVNVYRDFNIAKMPFTPYVGIGAGVTRVKFLGKTRYALAYQAKLGINHQLTAQTQAFAGLRYFGILDNQFKDIVPGIKILAGEGYIPAGGGSKVDETARVESTTATITNRFGIYGLEFGLVYHF >NZ_CP037426.1|WP_015588949.1|308177_308402_+|BolA/IbaG-family-iron-sulfur-metabolism-protein MTIAIHELERIIKQSFPDADIKIHDLAGDDDHYHLKINSKCFLGKTKIEQHKMVYKALEGQSIHALQLETNTLK >NZ_CP037426.1|WP_006280013.1|308411_308735_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MSNFEQIKKDITENDVVLYMKGTSDFPQCGFSGLVVSILKKLNVKFKYINVLENDEIRESIKKFSDWPTIPQLYIKEEFIGGCDITREMYEKGELQSLLKEKKIIAE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_5 | 316882-316985 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_5
>5.1|316906|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder GGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGGTGGTATGACGATAACC |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_5
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_5 >merge|NZ_CP037426|5|316882-316985|CRISPRCasFinder TCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGGTGGTATGACGATAACCTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCG >NZ_CP037426|5|4|316882-316985|CRISPRCasFinder TCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCG GGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGGTGGTATGACGATAACC TCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCG
>NZ_CP037426.1|WP_155968537.1|314561_316277_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MRSNIRQLFYYIKPNLSYFIIAFIAVLFSALTILLFGRGLSNIIDSGTEHDFTTKLLVAILIVLAISLTAFTRLYFIGIGSEKVIARIRYDLYSSITNLQPSFFENTGVQDVISALVTDTSVLQSIINSSLLTILRNFVILIGSVAMLLYTNIQLTAYAAAIIPILLIIMTSLGKKVRSYARFAQDKLSELASFSEENFRSIVTIKSFVLEENEKIRFKEHLNSVSKSYVKLVLLRAILVTLVITCVIGSLVVLLFFGIKEVLSNNITIGELSSFVFYSALAAGAINNLSDNISDLQRGLGIVERLFEFKNMKSSIVDADDPIKIYSVQKGISFNGVTFFYESQLDKPALNNVSFSIEAGQAVSIVGPSGSGKSTILKLLLRFHDPNKGSITIDGHNIKSIALNDLRSLFGLVPQDHMIFSCSIMENILYGKPGAEYEEVKQAAISAYAMEFIDKLPDKFDTFVGKRGLKLSEGQKQRIIIARAILKNPQVLILDEATSALDYKSENLVQKALSKLMQNRTTIVITHRLSTALKTDKIIVINHGKVEEVGTHDSLISKDGLYAKLAKIQWN >NZ_CP037426.1|WP_155968535.1|314129_314366_-|hypothetical-protein MLKHNYSDKINNRYSYTNKFSYSDEGVDETIKDKITTEDQVVTEDQVVTDDVEEPDAGNDGYSEGMAFSYHGYGNDLI >NZ_CP037426.1|WP_155968533.1|312329_314036_-|arginine--tRNA-ligase MNIFKQISSLIFSKLNELKQRGVISTSAANFIIEPPSNRVHGDIYTNVAMVLAKHEKKNPIEIAEVLAKEFELFDEVAKVEIAGPGFINIHLKIKVWHGILKQINELKTEFGTLDIGNNQAINVEFVSANPTGPLHIGHARGAVFGDVLANLLKKVGYKVTKEYYINDAGAQIDTLIKSVYLRYKEALGEKISIEKGLYPGEYLKPIGEELAKKYGKELLKKQDNQIIREYTLSFILELIKEDMNLLGVNHDVFTSEYELQKSGKIEESIKILSDKGLVYEGYLEKPKGKESENWTSRKEMLFRSTKFGDDVDRALKKEDGSWTYFASDIAYHFDKISRGFNNMIVELGSDHGGYVKRLKAVVSALSDDQAKIEVKLHNIVNFFENGKPVKMSKRSGNFLTARDVVEEVGRDITRFIMLTRKNDMVLDFDFAKVKEQSKDNPIFYVQYAHARAHSLMRNAPKELPTADPSLLRTGGELFLIKTLAKWPDVVEIAARLCEPHRITFYLLEVAEAFHVLWGYGKSDLNMRFILEDNLNLTAARMFLVQALAHVIASGLSIFNIEPLEEMS >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|311896_312244_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|311385_311877_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968260.1|310481_311314_-|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155968531.1|308929_310324_-|class-II-fumarate-hydratase MDRKTRIESDSLGEVKVPSEHYWGAQTQRSLENFKIGTEKMPEPLIKALAIVKLAAAHVNMKQGSIDNKVGDAICAAAKEVIDGKFNNEFPLVVWQTGSGTQTNMNMNEVISNRAIEILGGNLGSKSPIHPNDHVNYGQSSNDTFPTAMHIAAADQINRLLIPNLEKLHKVLDNKVQEFKDIIKVGRTHLQDATPLTLGQEFSGYAVQIKKGIERVKSTLSDIYELAQGGTAVGTGLNTKKGFAEDFSSQVAEITNLPFTSAGNKFEALAANDALVELSGTLNTVAVSLMKIANDIRLLGSGPRCGIGEIMLPENEPGSSIMPGKVNPTQCEAVTMVCTQVMGNHVAVTISGSNGHFELNVFKPVIIYNVLQSIRLLADASLNFTEKCVIGIKANEERIKDLLNQSLMLVTILNTHIGYDNAAKIAKLAYKENITLKEAAAKLQLLTEEEFERIVKPEEMVNYL >NZ_CP037426.1|WP_006280013.1|308411_308735_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MSNFEQIKKDITENDVVLYMKGTSDFPQCGFSGLVVSILKKLNVKFKYINVLENDEIRESIKKFSDWPTIPQLYIKEEFIGGCDITREMYEKGELQSLLKEKKIIAE >NZ_CP037426.1|WP_015588949.1|308177_308402_+|BolA/IbaG-family-iron-sulfur-metabolism-protein MTIAIHELERIIKQSFPDADIKIHDLAGDDDHYHLKINSKCFLGKTKIEQHKMVYKALEGQSIHALQLETNTLK >NZ_CP037426.1|WP_080717615.1|307140_308013_-|P44/Msp2-family-outer-membrane-protein MLTFSFRCLSYDDKINNLENVYIKANYFGAFFNAIGSLEGKEDAGDNITEGVFSFNKKERIEAGYSPKYVPGFAGSAAIGYLFKNMRVEFEGLYSQTNLYDEDYSDKKKARYIELRRHNDASTGAECNSPWRSGKVDIHIQENCSVEAEFRAAFKMKNEGFNNLAGMVNVYRDFNIAKMPFTPYVGIGAGVTRVKFLGKTRYALAYQAKLGINHQLTAQTQAFAGLRYFGILDNQFKDIVPGIKILAGEGYIPAGGGSKVDETARVESTTATITNRFGIYGLEFGLVYHF >NZ_CP037426.1|WP_155968539.1|317073_317517_+|hypothetical-protein MALSKFLDPKLDLTFKKIFGTEKNKNILIHFLNDILGCTEVNTIQEVEFLSTIMDPEIASDKQSIVDVLCRDSSGNRYIIEMVRPESLRSYCLKGEEFIQKETERILKLIKPDVLPSESTHQCESGNRLVPSDADNEPPLEKEDAQS >NZ_CP037426.1|WP_155969554.1|317662_317929_+|hypothetical-protein MSGCTQITGIEKPPNPLLYDWRNRVSLYFRLHGKQTARNADGSAGKGEWRKRMPFCNEMDRICNINSRENEQTSIWSLVTRNFVNHLR >NZ_CP037426.1|WP_155968541.1|317937_319485_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MITSKPVSASTESFEAWKQLPWKKCQKVIVRLQRRIVKAVQEGRWGKVKALQHLLTRSFSGKALAVKRVTENQGKTTAGVDRQLWSTCNAKFQGIKLLKQRGYKPSPLKRIYISKSNGKRRPLGIPTIKDRAMQALYLLALEPVAETISDRHSYGFRPKRSCADATVACHLLLASRNQLQWILEGDIKGCFDNINHEWLMKHIPMEKKILHRWLKAGFLESKTLYPTTAGTPQGSIISPILANFTLDGLEQLLESRFGKLGSKRRGKIRSGVNVIRYADDFIISGFTHEVLENEVKPLVSSFLHERGLILSEEKTKITSITTGFDFLGCNVRRYNKKLIIKPSKESIKRLLNKARTLIKANIANTQAIVIKSLNSLLRGWGNYYHHVCAKKAFRKIDNEIWHSLWKWAKKRHPRKGLRWIKNRYFKVMGQRQWVFAAPICKNKPKEIRYLRLLKLIDIPIRRHVKIRADANPLDLKWKKYFDERVKRTRMLASSFSREGSLLLVSPLKLMYSEDL >NZ_CP037426.1|WP_155968543.1|319481_320222_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVRQKKNLDKGLKRSVGKPACCVSKGGSSSNTASLPDQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYVDLKKIFFIAISNCTLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFIFIELPKFPKSREEQLESVVDRWLFFFKYADETTDEDLRKIAEKSPIIKLAYDELDKFHWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLAKEEGRKEREIEVAKNLLKAGVSFNIIAQTTGLSMSEIKELQN >NZ_CP037426.1|WP_155968545.1|320416_321532_-|cell-division-protein-FtsW MNIKLWYRTLDYYLILPVFFLLTISFILVYSASPVIAQRLFLPQDYFIRRHTIYIVLSLITLVTFSFLNTRTILNLSFAGFALFTILVATAIILGIEVKGAKRWLHIVKISVQPSEFVRPFFSVVIASILASEMKFKIHISIIIFLLVFVLLLLQPDFSMSMLLTYSFIGQMFIACIPLLYFLCIIGMATTGTTIAYLCLPHIKQRIYNFVFFTQRDNFQVTKSLEAFKRGQLTGVGPGEGSVKASLPDCHTDFVFSVLAEEFGLITCLATLMLFGIISARLLYVAYRENELFNLLVILGISMQFITQFIINIGVTLSVFPTTGITLPLLSYGGSSLLSSSIALGIMLSFSRNQAIALKFRERVMLGRYMD >NZ_CP037426.1|WP_155968547.1|321528_322245_-|bifunctional-demethylmenaquinone-methyltransferase/2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol-methylase-UbiE MSTIKIKKKSQLVKEVFDSVASRYDTMNDIMSLGMHRLWKDRMVNSVHFTKNSKVLDVAGGTGDIAIRIVRKEPSAKVTVCDINQNMLSRGRDKAINSNQINFDWVCANAESLPFEDSEFDYCTIAFGIRNVSDRKKALNEAHRVLKPHGKFICLEFAPMHYQNEIFTKLYDLYSFKVIPKIGSIVAKDKSSYEYLVKSIREFPTQADFKMEIEEVGFKNVEFHNMSYGIVALHIGTK >NZ_CP037426.1|WP_155968549.1|322298_323162_-|lipoyl-synthase MHNKPQWLRAKAPTGEVFNETLNIVKLHNLHTVCEEAACPNIGECWNKRHATVMILGSVCTRACAFCNVATGIPDKLDPHEPENLAKAIKKLNLKHVVITSVDRDDLPDGGANQFIQCIEEIRKITSETTIEILTPDFLNKKEAFEAIAVASPDVYNHNIETVPRLYAKIRPRARYFHSLYLLKMVKQINPKVFTKSGLMVGLGETKEEIFQVMDDLRSAEVDFITIGQYLQPTPKHAKLDRYVTPEEFEHYKYIAYSKGFLVVASSPLTRSSYHAEEDFNRLKACR >NZ_CP037426.1|WP_155968551.1|323154_323469_-|50S-ribosomal-protein-L28 MSRVCELTNRKKSFGNKVSHSNRKTKRTFLLNLHKITLTSDILNKKFRFRVATRTLRTIDYKGDLDAFLLNTRTIKLSEKAQKIKRRLKKVLVKQEVELAVSDA >NZ_CP037426.1|WP_010082513.1|323506_323848_-|DUF721-domain-containing-protein MLKRSGPKKLKSIIENYALKCMKNKISKNEIRLILNWRNIVGKEIAECTKPKKISYAQNINSGVLHLVVTNGSKALEIQHMISLIIEKITIFFGYKAVYGIKIKQESIDYLTI >NZ_CP037426.1|WP_007552114.1|324303_324504_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-IscX MKWLDIEDIVEALEEKFPNENIISIRFTELKKKVLSLEEFDDDEKRCNEKILEAIQAAWIEERLTA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_6 | 327840-327961 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_6
>6.1|327878|46|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder GTCCTCCCTTATTTTGTGTAGATCCAGTAGGTTGACTACCGTTGCT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_6
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_6 >merge|NZ_CP037426|6|327840-327961|CRISPRCasFinder TACATCAGTTCCTTGTTCTGCACTGGTGGTGCTGGTTTGTCCTCCCTTATTTTGTGTAGATCCAGTAGGTTGACTACCGTTGCTTACACCAGTTCCTTGTTCTGCACTGGTGGTGCTGGTTT >NZ_CP037426|6|5|327840-327961|CRISPRCasFinder TACATCAGTTCCTTGTTCTGCACTGGTGGTGCTGGTTT GTCCTCCCTTATTTTGTGTAGATCCAGTAGGTTGACTACCGTTGCT TACACCAGTTCCTTGTTCTGCACTGGTGGTGCTGGTTT
>NZ_CP037426.1|WP_155968553.1|325358_327401_+|transketolase MNHSHLKSMANAIRFLSIDAVQKANSGHPGMPLGMADVATVLFAKYLNHNPDDSKWFNRDRFVLSNGHGSMLLYSILYLTGYISIDELKNFRQMGSKTPGHPEFGLTSGVEATTGPLGQGFAAAVGMALAESILKKQFRINHYTYVMLGDGCLMEGISHEAASLAGHLKLNKLIALFDDNDISIDGATCLSCSDDVEKRFLAYGWNVDKIDGHDFDAISLAIEQAKKSDKPTMICCKTIIGKFSSRAGTSSVHSGAFSEEDIKQMREKLNWNYEPFHVPEDVKNAWMKTVERAKQNYTMSFQRVTRKEEKEWIPVSSTGMTKSGAGVTGYHVELQRRLDKHLPDNIAGVLADLKKQICELMPNEATRSSFGRVMELLTQHMPELIGGSADLTGSNCTKYKHMQVINSNNYSGSYVHYGVREHAMAACMNGMALHGAILPYGGTFLVFSDYCRPAIRLSALMKQQVMYVMTHDSIGVGEDGPTHQPIEHLASLRAIPNLYVFRPADAVETLECVSIALEKKESPALFALSRQNVSYMRKFYSDIDQSANLSKFGAYILCECSKELKVTIFATGSEVEIAVEAREKLQEKGIGTRIVSMPCWRLFDEQSDEYKAAILNNDSIKVAIEAGSEMGWHKYIGSNGIFIGMKSFGESAPYKTLYEHFNISADHVVKCVCEKLVYIQ >NZ_CP037426.1|WP_010962555.1|324630_325245_-|30S-ribosomal-protein-S4 MTTVITRKYRISRRLGVNLWGRAKDPVNKRKYPPGQHGILGFKKLSDFGKQFAAHKKFKFYYAISSKQLRRTFLDAYNRKGYTADNFIGILESRLSSVLYHSGLVPTIYSAKQLISHKHVTVNDKVVNISSYRVKPGDIIKIRERAAKIPVVVEAEQKQERKAPDYLEADSKEHSVKYLRSPQYSEVPYSADMEVNLVVEFYSR >NZ_CP037426.1|WP_007552114.1|324303_324504_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-IscX MKWLDIEDIVEALEEKFPNENIISIRFTELKKKVLSLEEFDDDEKRCNEKILEAIQAAWIEERLTA >NZ_CP037426.1|WP_010082513.1|323506_323848_-|DUF721-domain-containing-protein MLKRSGPKKLKSIIENYALKCMKNKISKNEIRLILNWRNIVGKEIAECTKPKKISYAQNINSGVLHLVVTNGSKALEIQHMISLIIEKITIFFGYKAVYGIKIKQESIDYLTI >NZ_CP037426.1|WP_155968551.1|323154_323469_-|50S-ribosomal-protein-L28 MSRVCELTNRKKSFGNKVSHSNRKTKRTFLLNLHKITLTSDILNKKFRFRVATRTLRTIDYKGDLDAFLLNTRTIKLSEKAQKIKRRLKKVLVKQEVELAVSDA >NZ_CP037426.1|WP_155968549.1|322298_323162_-|lipoyl-synthase MHNKPQWLRAKAPTGEVFNETLNIVKLHNLHTVCEEAACPNIGECWNKRHATVMILGSVCTRACAFCNVATGIPDKLDPHEPENLAKAIKKLNLKHVVITSVDRDDLPDGGANQFIQCIEEIRKITSETTIEILTPDFLNKKEAFEAIAVASPDVYNHNIETVPRLYAKIRPRARYFHSLYLLKMVKQINPKVFTKSGLMVGLGETKEEIFQVMDDLRSAEVDFITIGQYLQPTPKHAKLDRYVTPEEFEHYKYIAYSKGFLVVASSPLTRSSYHAEEDFNRLKACR >NZ_CP037426.1|WP_155968547.1|321528_322245_-|bifunctional-demethylmenaquinone-methyltransferase/2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol-methylase-UbiE MSTIKIKKKSQLVKEVFDSVASRYDTMNDIMSLGMHRLWKDRMVNSVHFTKNSKVLDVAGGTGDIAIRIVRKEPSAKVTVCDINQNMLSRGRDKAINSNQINFDWVCANAESLPFEDSEFDYCTIAFGIRNVSDRKKALNEAHRVLKPHGKFICLEFAPMHYQNEIFTKLYDLYSFKVIPKIGSIVAKDKSSYEYLVKSIREFPTQADFKMEIEEVGFKNVEFHNMSYGIVALHIGTK >NZ_CP037426.1|WP_155968545.1|320416_321532_-|cell-division-protein-FtsW MNIKLWYRTLDYYLILPVFFLLTISFILVYSASPVIAQRLFLPQDYFIRRHTIYIVLSLITLVTFSFLNTRTILNLSFAGFALFTILVATAIILGIEVKGAKRWLHIVKISVQPSEFVRPFFSVVIASILASEMKFKIHISIIIFLLVFVLLLLQPDFSMSMLLTYSFIGQMFIACIPLLYFLCIIGMATTGTTIAYLCLPHIKQRIYNFVFFTQRDNFQVTKSLEAFKRGQLTGVGPGEGSVKASLPDCHTDFVFSVLAEEFGLITCLATLMLFGIISARLLYVAYRENELFNLLVILGISMQFITQFIINIGVTLSVFPTTGITLPLLSYGGSSLLSSSIALGIMLSFSRNQAIALKFRERVMLGRYMD >NZ_CP037426.1|WP_155968543.1|319481_320222_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKDKPVRQKKNLDKGLKRSVGKPACCVSKGGSSSNTASLPDQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYVDLKKIFFIAISNCTLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFIFIELPKFPKSREEQLESVVDRWLFFFKYADETTDEDLRKIAEKSPIIKLAYDELDKFHWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLAKEEGRKEREIEVAKNLLKAGVSFNIIAQTTGLSMSEIKELQN >NZ_CP037426.1|WP_155968541.1|317937_319485_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MITSKPVSASTESFEAWKQLPWKKCQKVIVRLQRRIVKAVQEGRWGKVKALQHLLTRSFSGKALAVKRVTENQGKTTAGVDRQLWSTCNAKFQGIKLLKQRGYKPSPLKRIYISKSNGKRRPLGIPTIKDRAMQALYLLALEPVAETISDRHSYGFRPKRSCADATVACHLLLASRNQLQWILEGDIKGCFDNINHEWLMKHIPMEKKILHRWLKAGFLESKTLYPTTAGTPQGSIISPILANFTLDGLEQLLESRFGKLGSKRRGKIRSGVNVIRYADDFIISGFTHEVLENEVKPLVSSFLHERGLILSEEKTKITSITTGFDFLGCNVRRYNKKLIIKPSKESIKRLLNKARTLIKANIANTQAIVIKSLNSLLRGWGNYYHHVCAKKAFRKIDNEIWHSLWKWAKKRHPRKGLRWIKNRYFKVMGQRQWVFAAPICKNKPKEIRYLRLLKLIDIPIRRHVKIRADANPLDLKWKKYFDERVKRTRMLASSFSREGSLLLVSPLKLMYSEDL >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|329695_330043_+|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|330062_330554_+|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968260.1|330625_331458_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155969556.1|331579_333400_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIFGVVSSGDSVIPTLLTGLQKLEYRGYDSSGIAIINNEGKIEVKKSEGKVERLCEVVDDSKMSHSTVGIAHTRWATHGVPGLKNAHPIRTNNVVVAHNGIIENYNLLKKGLEERGMSFHTDTDTEIIPNMLTLYLDEGLSPVDSLFKCLNNLHGSFALVLLFAEYPDALFVAKRNLPLAIGYNCNTVFAASDSNALSAFVERISHLEDDDIAVIKSSGVSIYNNGTQVKRSIENSSPSDFLISKNGYPSFMLKEIFEQPRALNKTINQFYKQYKEVIFANKKLFSELSYITIVGCGSSYFAGLIAKYWLENVAQVRVYLETSSEFRYSNVKLEEGSIGLFISQSGETADTIEALRYAKSQKQTIISITNTFSSSIEKISDIVLHTLAGPEIGVASTKTFSAQLATLACFAVELGKIKGILGGERIKQLSNAINSIPKYVEHVLNVMKIQHISGSILEHNNVILIGRGSSYGVAMEGALKIKELSYINTIGIAAGEMKHGSIALIDSTVLVIAIIPYDDLFFKTLSNIQEIIARKGKVIAFSDKQGAPFLRGVCADVVQLPDTDNFISPIIYSVAMQFLAYFTAAKKGLDADCPRNLAKSVTVE >NZ_CP037426.1|WP_155968557.1|333480_333852_-|preprotein-translocase-subunit-YajC MLISEVFAADATSNTSSIGASFASFTPLILIFVVFYFLIIRPQQKKLKEHRKMIDQIKRGDTVITSGGIIGEVNKVDGANAQFIIEIAPKVEIKVLKSAISEVLSKETQKVAAKPIKKVKSKE >NZ_CP037426.1|WP_010962661.1|334257_335106_+|30S-ribosomal-protein-S2 MTNLPKVTVRDLAESGVHFGHKISRWNAKMAPYIYGVHQENRIHIIDLRKTLPLLQVAMKALYDVAFQGGRILFVGTKFQAFDIIASEAIRCGQYYVNHRWLGGMLTNWGTVSSSIKTLMQYEKILNDEDSILTKKELGNIEKKKQKLDKALGGIREMGAIPDILFIIDTNKEHIAVKEAKKLGIPIVAILDTNSDPDGITYLIPGNDDSRKSIELYCKLATDSILAGIESSLAKSGVKIDDIRGDEFIQEKEDGIVQTKRRRSKVYKEEEREVVTNEDESR >NZ_CP037426.1|WP_155968559.1|335086_335947_+|elongation-factor-Ts MKMNPDDIRELRDRTGLGLSDCKKALEECDGDIKKAVDKLRTIGLAKADKKSDRIASDGLVAMCLTENYGALVELNCETDFVARNEKFIELVSNLASIAHQERCTSVDELKNAKYESIGTVQEAIMNGTSVLGEKLELSKLCYLEAKDGVIAGYVHGDVCGLGKIGALIALQSSGDKAKLQEIGKQIAMHVVAMKPEALSIDDLDQMKLKNERSIIEEQVRGLNKPEEVAKKIVDGRMAKYYEEVVLLEQKFIKDDKMKVSDFIKSSELSAVKLSNYKLLVLGGAN >NZ_CP037426.1|WP_155968561.1|335957_336701_+|UMP-kinase MFPSTNEKSEIKYSRVLFKISGEALMGSKQFGHDMETIGELSKGIVEVCNLGVQVCIVVGGGNIFRGTSASLSGCERASSDYIGMLATIINALILQNFLEKNLVASRVLSAIPMATVCEPYIRRKAIRHLEKGRVVIFAAGTGNPFFTTDTAAALRAVEMNCDVILKGTQVSGVYSADPKKNEDAVMYDKLSYTDLLTRDLKVMDASAISLARENSIPIIVFSLKGEKIVNIIKGQGTYTIVSDCKH >NZ_CP037426.1|WP_155968563.1|336708_337266_+|ribosome-recycling-factor MLNEIKAKTKERMLKTIQSFHDDIKGVRTGRASASLLDGIVVNIYGGHQKLNQVAGVSVIDNKTLSIKVWDISVVGEVKNAILNANLNLNPVVEGSTIRIALPDLTQETREKLVKLLHQFAENARIAIRNIRRDIMEETEKMKENKEISEDDFHGAKKEIQNITDNNIKKIDGELSIKEKDILNH >NZ_CP037426.1|WP_155968565.1|337541_338237_+|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MLNQESLPKHLAIIMDGNGRWANNQGRVKIDGYKKGSEVAYDIAKYCTDLTIPYLTLYAFSMENWLRPKNETDCLFDLFYSVLTNEDKVNFICNCNIKLNFIGNLSLLSSKILDQIKKAEEMTHKNDGLLLTLAVSYGAKQEITQAISNIIKENIAYVSEEEFEKFLYTKDLPKLDLLIRTGGEKRLSNFLLWQAAYAELYFCDTLWPDFSCQDLSKALEDYTKREKKYGR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_7 | 547386-547490 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_7
>7.1|547410|57|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder AGCTTATCGTCACGCCGCCACGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_7
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_7 >merge|NZ_CP037426|7|547386-547490|CRISPRCasFinder CCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAGCTTATCGTCACGCCGCCACGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAGCCGCTAACAAGTAGCGGGATGACG >NZ_CP037426|7|6|547386-547490|CRISPRCasFinder CCGCTAACAAGCAGCGGGATGACG AGCTTATCGTCACGCCGCCACGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAG CCGCTAACAAGTAGCGGGATGACG
>NZ_CP037426.1|WP_051062209.1|546147_546555_-|transposase MLKEVDFQYVIKVLYADRAYDREKLYKLCNQYGIKTKIPPKNNAAEHPKLDYMAERNSAVKLIKSYDEDGIKKWKKEMSYGKRSYIEGFFSRLKKTFGFSFRNKSEMNRERELLLKCYLLNKFTEIGMAKFEIAS >NZ_CP037426.1|WP_155968857.1|544667_545846_-|MFS-transporter MESRAKAWFIWLISNLVVIFSNMQIIYTFISVNLEKELGLTIAQVALANSAYTWTFAILQFFSGATFNVFSSKKIYFFSLSTMILGFFVLINSDNFSHLILSQVLIATGASFGFIGAAHTSSICFSAAQFGLMFSLVQTISSLSALVIQILFSNLLAEDAYWKNLIVCIILFGVLIFVLTLFCPNTLPESSSEKRTIKSSMKTVMCSILTVLKLRDIWITSVVGAITFGTFLALNTLWAPRLLGNLELNAMESGIATAILWLGLAVGAPIADRISNLFKNRKHVISAFALLQGVSIIILLYSHLTVHVVYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVKRKYISTSSSIINGFMFIGSGVIVSMLALFTDHKMALFAILIVAGILNYATKETYSKK >NZ_CP037426.1|WP_006279881.1|544301_544607_-|integration-host-factor-subunit-alpha MDHVTTKDTTVTKATIAGDINQEIGLSKEDSVSIIDDILDEIKTSLVKDGIVKISSFGTFLVKKKKERPGNIPNTSEKVMIQARNSVSFRPSKIIKKSINN >NZ_CP037426.1|WP_006279880.1|543975_544302_-|MerR-family-transcriptional-regulator MNKEKLFYTIGEVAEELHLEQHVLRFWEGQFHQIKPTKRKGRRLYDRKCIEAIKKVKYMLYDKGYTIKGVQKEFGNDIKVTKNLLQELTDLRDYLTSKINNEESNKQA >NZ_CP037426.1|WP_006279879.1|543333_543930_-|M23-family-metallopeptidase MWHIASFLMLLAILIGCGLQKPAPVLLKGEEFYGKRDLEYTREYHLIREPSVQKESRKAIINRIYKDNNNTQNVGVNCKFVMPVKGSATSSDEMCKDGIKIAAQNGTNVVSSAPGKVIYVGKGLRWYGNLIIVEHKDNYMTVYSYLKNIHVEIGDKVKQGQVIGSAGKSSTQDKDPQMCFTIRHNGQAVDPLMHMNCN >NZ_CP037426.1|WP_010962340.1|540804_543321_-|leucine--tRNA-ligase MKYDFKSVEKFYQDKWDFSVSKSGKQEKCYVLEMFPYPSGKIHMGHLRNYAIGDVIARYKRANGFEVLHPIGWDAFGLPAENAARDNNISPETWTKENIDNMRTQLKSIGLSYNWERELSTCEPDYYKHEQKFFLDFLKHGLAYRKESWVNWDPVDQTVLANEQVVDGKGWRSGAVVEKRKLSQWFLKITDFAEDLLKCLQSLKNWPEKVKTMQERWIGKSEGATIEFEVVGLNKKLKVFTTYPHTLFGASFCAVAAEHPIVQDLKNGSSVVIPVLDTGIQEIKSKRENDEKIGVYTGLNVKHPFLDKELPLYIANFVLMEYGEGAIFGCPAHDQRDFEFAQKYNLPIIPVISSAHLGVIPARDQNSYNGSQCQATQMTKEAYTGDGTMFNSEFLNGLMVSEAKEAIVKKFEEKKIGKKTINYRLHDWGVSRQRYWGCPIPIIYCKDCGTVPVPEKDLPVVLPIDVEFTSGGNPLDKHPTWKFVDCPKCGKQAERETDTFDTFFESSWYFAAFCSEDKSIDKDACNRFMPVDYYIGGIEHAILHLLYSRFFCRALTKCGYFDIKEPFSTLITQGMVCHATYKDENGKWLFPAEAKELIARGAKVQVGKVEKMSKSKKNTVDPNFIIEKYGADTARLFVLSDTPPEKDMEWSDDGVEGCSRYVNKLWRMVMQLRPVNIHYDNENVTGGLLEYRKKIHKLLHGLTDDLENCRLNCVVAKFREMTNLIAEIDVKTGKSLIDEGICILIRVIEPFIPHLAESLWQEIGGQPWPKADESLLVDDTVTIAVQINGKLRTTIKVAINLPQEELKKIAIDSVSSKIDQSKVRTVYAVPNKIVNIVI >NZ_CP037426.1|WP_155968855.1|540040_540676_-|hypothetical-protein MKIKRLCVLAVLLTSSLAGAASNSASKSEDKYYAGLNFGAGWGGGFKMKPGVVLGYHYDQNSKFELEVLSNIKSLKSIGASLLANYRFYPDLDIDPVKLYVSGGLGGYLQITPFGFGVSDTVDGDGDSSQEEKEKEEETQGAPESGGEAAGSSVVDKILSSISYKLKLGVDYEITPQIIGAVGMTMGGQLSGIKAKQIPDATLEIGVRYNF >NZ_CP037426.1|WP_155968853.1|539403_539568_+|IS3-family-transposase MNHKGCCYDNSVVESFFSSLKREILIDTSQHSAQQTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NZ_CP037426.1|WP_155968462.1|538809_539178_+|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLEAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNDIRAILRRKFKIKKQQTDNRAVAPNILDQNFIVDQPNKV >NZ_CP037426.1|WP_155968430.1|538531_538825_+|transposase MVREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQPVAKVARDLGIRDSVLGKWMKKYNEKKSAANAFPDVAPYDKERFDLQSKSNKGKRHFKKSPGQSKRVKYFFI >NZ_CP037426.1|WP_155968859.1|547628_549167_-|leucyl-aminopeptidase MKNILLMFLLCFMYSLQLFATEMPAMKITISKISPDFKTIVTGLFEDNETVNDGGVLQGKQIMDNIKQFSNFNGSFGEFFSTTLPEEKNVIVVGLGKKDEWNENKELNIGGKIYCELSRLKIKKAAVLIEGSAANVAYGAFLRSFKFDKYKTKKDEKITEVEEITVLVKDEQLSNAERSFEHSRQEGESIFLARSFITEPPNILYPESYADHIKKELTKLGLEIEVLDKKQMEEKKMGALLGVAQGSSKEPKLVVIKWNGAAKEQKPIAFVGKGITFDTGGVSLKPSRGMESMKYDMAGSAAVVGVMHALAGRKAKVNAIGVVALAENAVGGNAQRPSDVVTSMSGQTIEVLNTDAEGRLILADALWYTQERFSPQFMIDLATLTGAIVVALGNNEYAGLFSNNDELANRLIDAGNEVNEKLWRFPMNETYDKIIDSPIADVQNIAPAGSGGDSIMAAQFLQRFVDETCWAHLDIAGTAWHEKGTDICPRGAVGFGVRLLNKLVEKYYEAND >NZ_CP037426.1|WP_155968861.1|549228_549870_-|dioxygenase MNVKNILLALLVQMIFSLPLFAADPVLLNCIKTPEIYDLDARPKNFSSSNNLRRKPGSPNSAIGELIHIVGRITDINCLPIQNAVVSIWHANSRGVNHYDKNIEDDPNFAGSGRFVVNNLGYYNFITIAPGKIGDRAPHINFLVQHPDFPEFTTQMFFVDHNCDNCADPVLGDFVSNGLASLLITPFTYSDQVIKTYTFNITLGGYNKFSNKR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|553125_553617_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|553636_553984_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968260.1|554097_554930_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155968863.1|555414_555582_+|hypothetical-protein MARIIFMGVDVSKEALDISINGKHKRIANVSDAISKFIETNIVDLPIKLCVSWWL >NZ_CP037426.1|WP_155968865.1|555608_556328_+|transposase MTVHKAHPNRVYAFAKACNHFAKTDKLDAKLLEKYAEFVSKDGEVKGCIISQKQEELKELGAVERNLNDAIHANKCRLQSASGKAREYIERQIGFAEKQLKEIRQDIEDAIAELKGKNELLISYKGIGSKTASVLLTEVPELGRLENREIACLVGVAPKTSESGRKVGKAQIKGGRFYARKALYMSALVAMRHNRKMKAFYQRLVDSGKAAKVALVAVMRKIIVCLNAMIKNNNFYLDS >NZ_CP037426.1|WP_151807945.1|556403_557777_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNEYDITVIGSGPGGYIAAIRAAQLGFKTAIVEKEKNLGGICLNWGCIPTKSLLRASEVYRLIKRSKEFGIEVKGANFDIQSIVKYSRNVVDKLSSGVAYLMKKNNIKVHQGFGKLAGNGTIKVVSDKEEQEIVSKHIILATGVRARNLPGIEADGDLIWNAQHAMTPERLPKSLLIIGSGAIGIEFASFYSTLGVDVTIIEIKSTILPLEDKDISDLAQEIFTKQGIEIYTSSSVKALTKSKDSAQVLLSSGESKEFERVIVAVGIQANIENIGLENTKIKLSPSGFIETNEWYETSESNVYAIGDVAGPPCLAHKASHEAVICIEKIAGKNAHALKKECIPNCTYSHPQIASIGLTEEQAIKGGYDIKIGKFHSNFNGKSVALSETEGLVKTIIDKKTGEILGSHMIGAEVTELISNFALAKQLEGTDFDIKSTIFPHPTISEMIHESVLAADVK >NZ_CP037426.1|WP_006279962.1|557782_558175_-|hypothetical-protein MIVELKMPKSNSKKEPNEKNKPQEQREGRSGGFLELLKNIIKILFNSVVDLPEHEQHNKMKSTNLQQGLDTKGKGPEDLHPKAKLEVKEAAKGLKEELQNSDAGGNQSIETKVPNQTTTQDIDNSKTMER >NZ_CP037426.1|WP_155968867.1|558244_559276_+|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MDIILATGGTGGHIFPAITLARALKAQGYSCIVFTDKKTNKNTDVGNYTLPLCKPSSNKFKFFLFLIYSSMLALYQVRKLKPKSVIGFGSYASFPTLLAARVLSIPIILHEQNTVLGRVNRFFFKSAKLIATSFPETKYAEGNKCIFTGNFVDIKAQSHSSTEKILNILVIAGSQGANFFDDVVSSVICDLPIKMKKKIRVTQQCTKKNVNKVKSLYKSEKIDCELSEFFDDMENRLANAHLVISRAGATSIAEITLARRSAIYIPYPYSKDNHQFYNAKYIEDSRAAIIVKQNSEAKKNLTEVLFDLLNNSQKLRDMTNSTEKTGIKNGTTEFVKVIVHRFS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_8 | 572898-573006 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_8
>8.1|572927|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder AGCTTATCGTCACGCCGCCACGAACCGTCATACCGCCGCGGCGCTAACAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_8
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_8 >merge|NZ_CP037426|8|572898-573006|CRISPRCasFinder AGATCCCGCTAACAAGCAGCGGTATGACGAGCTTATCGTCACGCCGCCACGAACCGTCATACCGCCGCGGCGCTAACAAGAGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACG >NZ_CP037426|8|7|572898-573006|CRISPRCasFinder AGATCCCGCTAACAAGCAGCGGTATGACG AGCTTATCGTCACGCCGCCACGAACCGTCATACCGCCGCGGCGCTAACAAG AGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACG
>NZ_CP037426.1|WP_155968875.1|570862_572602_+|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MLLEIEKRSITNALWKLQEADQRQILTLTQRFELPEILARILVTRGVNIENASDFLYPLIRSLLPDPFHLLDMDKAVSRIIRAIKNDENLAIFGDYDVDGATSSALINRYLKAIDIHSIIYIPDRVDEGYGLNTDALLQLKKNGIDLCISVDCGTLAYQPIEDAKAFGLDIIVVDHHLGTEKLPSAVAIVNPNRLDESSPYNNLAAVGVSFLLIVALNKSLREQGFFTNKKEPDLFDLLDLVALGTVCDVMQITGLNRALVSQGLKVMSTRKNVGLRVLFDALGILEKPSVSRLGFSIGPCINAGGRIGEASLGARLLSTDDDEEAHSIALKLIDLNNARKVLENEALLEATAQAEKSAQSGANFIMISGNWHQGIIGIIASRLKEQFHLPTVVISLNNGIGKASCRSILGVDIGAAVLSAKFINLIIEGGGHSVAAGFSIKEDKINDLHDFFTERFSNSINEKTLKADSIVTAKAINLSLWNQLQRLGPFGVGNPEPRFIIQGAKIRKPEVIGVDHIKCFIADDNVMVRAIAFRSANTHLGSAIMQGNVKAILGKISMNYWNGNEFVQFLIEDVLTIS >NZ_CP037426.1|WP_010962507.1|570568_570802_+|hypothetical-protein MTPFFFLDPNSQGTGMTKKGGTGTTKWSVCFCHPMIAKKTWSRAGMTPKGLLPSWMETSVSYLDDTFFLLSLGYAEV >NZ_CP037426.1|WP_155969576.1|568517_569819_+|hypothetical-protein MLNIQDNAPLCRKWMFLAVCALACSGLLSIIVIFLRLPFISSLVPSAQYIFDNALVIHVNLSILVWMCSIISLLFIINLQNTNSWFNFSWVLSTLSMLLMFVSAFVPNTEVIKSNYIPVLQNKLFLLGLSLFIASILINAVLAYMSNKQASYLCVGQIGLVIILVSSFLCFVLAYNNMPPGLYHSDKNLFYEYLFWGGGHLLQFAFTQGMFLVYLIMLSSNDISLASNNKITILPLFINTILAVGAPFVYFVYPVDSAKLIQFFTWHMRIAGAVLPCFLIILVCYNIRTFINDKSNYLLHSFLLFTYGDVLGVLTIEGNVTIPAHYHGSVVGITIAFMNFIYWLLPKLNFKEIKGSMVRLQIYAYSVGHFLHITGLVWLGGYGALRKVADLPSISSMLARTCFIIGGAISVVGGMLFVIIVLLHLLKGKARTN >NZ_CP037426.1|WP_155968873.1|567229_568525_+|sodium:proton-antiporter MFYLTNFLPILLFLFLFVGSGIYFTILGVSNAFYQLSPLVAIVPAIALGWVLYKGNTEEKMYAFLDGVRDRNIITMCIIFLLAGAFSEVTKAIGSADATVNLALSFISTRFLLIGLFFVAAFISTAIGTSMGTIATIAPIAVELTQAGISPSLGVATVVGGAMFGDNLSIISDTTIASVMSQKADIKKKLKLNAKVALIASIFTIIILFYSSSNSAAISVKEYSLLLVAPYIILILLANFGINVFTALVLSITFAGIIGFINNNNHGLLFLSQNITKGFMSMHEIMLLSLMVGGLSGLVGKNSKELADKLSSWVMIQRGGQKTAQLFIAKIVSIFDILLANNTIAIIFSGEIARDIAKKYEIPPHYSAAWLGIFSCVFQGLIPYGAQLLLASTIAGVSPLAVMPHVYYCYVLGIIAVLYIVLNKIEKKDCA >NZ_CP037426.1|WP_155968871.1|564492_566946_+|endopeptidase-La MNIERAVSSSFTALPVLPLRDVVIFPNIMVPLFIGREKSVNALEYAISSSNHQNEIFLVAQKDGSVDNPEPEDLYEVGVLASIVQPLIKLPDNAVKVIIRGIRRGRVVEYISSHTLLQARVELDSHYKEDEDNIDLEALRRSVVDAFDSWCKLNKKNQPEVAINSIDQIKEVDQLVDTVASHLNIKVSDKQSILEAYDPEERLKKAFAFIEREMSILNAQNRLYKTIKSQVESTQKVYYLNEQLKAIQKELGEFENGDEGNILNEFEKKINETKLSQEAREKAITDLKRYKKMNPISPEATVISSYLHWLLELPWGKYKDAKINLNAAKKILDENHYGIEKVKDRIIEFLAVLKRVKEIKGPILCLVGPPGVGKTSLAKSMARAVGRDFVRIALGGVRDESEIRGHRKTYIGSMPGKIIQHMKKANSCNPLFLLDEIDKMGSDSRGDPASALLEVLDTEHNKHFTDHYLEVEFDLSSVMFVATANSLNLPHPLRDRMEIIQLSGYTEDEKISIATHHLIPKLKKEHGLYQKEWDITNEALYELIRLYTRESGVRSMERELAKLMRKAVKEILTDKNKKISVGVDNLQDYLGVRKYTFGIAENESLVGIVTGLAYTETGGDILMIESVLIPGKGEIKYTGKLGEVMQESIKAAYSYIRSNCLFFGIKPEKFQNNDIHLHVPEGAVPKDGPSAGGAVCTSIVSLMTNIPVNKNVAMTGEVTLRGRVLAIGGLREKLLAALRGSIKTVIIPSENEKDMQEIPASIKEGINVVFAKNIDEVMKVALMHPTTPIDGDDNQNSVPSSIESKDDTFPMSETLKH >NZ_CP037426.1|WP_006279985.1|563199_564477_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MDNNNDLHYCSFCNKAQDEVDKLITNSSDGLKVFICNECIELSHKAISQKKDRSFNSDRISDMKLLLKKPEDIKNFLSKHVVGQEHAQHVLSVAMYNHCQSMVQFHAISDIEIEKSNIMLIGPTGSGKTLLAKTLAKVSDVPFAMADATTLTEAGYVGDDVESVLSRLLQAANYDVVKAQRGIVFIDEIDKITRKSESTSITRDVSGEGVQQALLKIMEGTVAYVPPQGGRKHPQQEFIQVDTSNILFICGGAFEGLDKIIEARKKGTSVGFGADISQSKEQKKKNALHDVQPEDLIKFGLIPEFVGRVPITAVLDELDHEDLIHVLTEPRNALIKQYKALLAFSKVNLEFSDEAISAIAKKAISYKTGARMLRAILESLLLDIMYTSGNGGFEGSTIVITKKMVELGKATVNHNNNGNVITVND >NZ_CP037426.1|WP_006280254.1|562573_563200_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MTLIPIVVEQTSRGERAYDIYSRLVKERIIFVTGPIEDNMASVIVAQLLFLESENPDKDICMYINSPGGVVTAGLSIYDTMQYINPDVSTLCIGQAASMGSLLLAAGTKGKRYSLPHSRIMIHQPSGGYHGQATDIEIHANEILRVKKKLNQIYEKHTGNSLKKIEGMMERDKFMDPEEARKIGLIDRVIAERTDIEIENIKVKQKVG >NZ_CP037426.1|WP_155968869.1|561227_562562_+|trigger-factor MSNNIPQNTVEVSSVYTYKELSIDKLKYEYEITVGSDYIKQKVNSRLQEIAENAKSPGFRAGKMPYDLVVANYKNEALEYVINNTIDYCSSDLMKKIEVKSHIYPKVDVISLPDLGKENEEGNFVYKLSFESMPEVPMIDLDKINLKKIEAKIEEEDIKEFIDSIKTKFPNFASVDDASYQAKDGDKLIIDFEGRIRNKLFQGGSSKDFAVNLGSGTFINGFEDQLTGMKKGETKNFKLKFPENYQAISLAGQEADFSVRVNEIQIAKDFENDDEIAKSIGFKDYSLLINHAKKMIGDQCTEMRNLLIKKELFDYLDANYSFDLPTDIVKQEQQRMEGELGAQNDSRKEAEKRVKLAMLFMKFSAEHKISLTQNDVLSVIVNQYVSKDVQFDRVLKHFESNKQFQELVRGQALEYKVTDYIIEKVSKEEQIVSVKELKELFDNI >NZ_CP037426.1|WP_006279461.1|560250_560847_-|BON-domain-containing-protein MRLITSFLLAIFLITQSGCTTLIIGGVVATATATAITMQDKSLGNIIDDTTMVIRINKGLLKHGLFSSIKVKVSEGRVLLIGSVDTPEKQLTAEKIAWQQKEIKEVINEIRVIPIQMASMLDTTVDGMITAEIRTRLLGKRNIKSINYSVNTVDRVVYLMGIAQNKAELKAVIAIARKVKGVKQVVSYVRYRYSKLRH >NZ_CP037426.1|WP_007549071.1|559260_560190_-|glutathione-synthase MKVAFQMDENINFETDTTFVLIKEAQRRKHEVFVYAPNNLALKLNHPIALAQKVSVDDFSFISKEDVAINLNEMDIIFIRQDPPFDMRYITTTYILEKTSALVINNPTEIRNCPEKLITSLFPELIPPTLITENISMIRDFYYNYQDIILKPLYSYGGNDVIRIQDENSIQVVVDLMIAKYECPVIAQSFCKNIDKDKRILLLYGQPIGVMKRIPKISGEIRTNMRLGASFEPAQMNDRNNEICNKIGPELKKRGLIFVGIDIIDDFLLEINTTSPTGVVYINKLYNISLEKDLWDVFEEKASSHQLNL >NZ_CP037426.1|WP_155968877.1|573477_574284_-|folate-binding-protein MSYIPFLSRGVIVLYGPDTRDFLQGIITNDINKLDSQKAIYSLLLSPQGKYLYDFFLIEYGKYTLLECENMHLQQIIEKLDLLKTYLKVKIKDVSALYKVGVLFNTKLAECSGKSQVIFQDPRHKLLGMRIIHKDEIKEPVGDFTQYEKVRIQNLVPDGAKDMVQNSSFPLQFLIDKVNGISFNKGCYIGQEVVNRMSRQEIFRRKLYLVEGDNALPDIGTKVTNENNEEIGELRSSVDNIGFALLNTGKSHANLYADGVRCVKTLKS >NZ_CP037426.1|WP_006279496.1|574461_574752_+|co-chaperone-GroES MSSISLNVLDDSVLIKPISEEKQGGIVLPSSAEKKPTKGEVIAIGEGSRNSSGERVTLTVKAGDKVFYRQWAGTEIEHNNEKLIVMKESDILAVIK >NZ_CP037426.1|WP_155968879.1|574852_576502_+|chaperonin-GroEL MTNVVVSGEQLQEAFREVAAIVDSTVAITAGPRGKTVGINKPYGAPEITKDGYKVMKGIKPEKPLNAVIASIFAQSCSQCNDKVGDGTTTCSILTSNMIMEASKSIAAGNDRVGIKNGIQKAKDVILKEIASMSRTISLEKIDEVAQVAIISANGDKDIGNSIADSVKKVGKEGVITVEESKGSKELEVELTTGMQFDRGYLSPYFITNNEKMIVELDNPYLLITEKKLNIIQPLLPILEAIVKSGKPLVIIAEDIEGEALSTLVINKLRGGLKVAAVKAPGFGDRRKEMLEDIATLTGAKYVIKDELGIKMEDLTLDDLGTAKNVKITKDNTTVVSENSDSDSVKARIEQIKSQIETSTSDYDKEKLRERLAKLSGGVAVLKVGGATEVEVKERRDRVEDALHATRAAIEEGIVPGGGVALLYASSVLDKLKGASDEEQIGINIIKKVLSAPIRRLVKNAGLESAVIIDYLIKQNDKELIYNVEAMNYANAFTAGVIDPAKVVRIAFETAVSVASVLITTESMIVDVPSKENASSPMGAGEMSGMGGF >NZ_CP037426.1|WP_155968881.1|576773_576992_-|hypothetical-protein MDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|577056_577404_+|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968575.1|577423_577915_+|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIRGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968883.1|578226_581340_-|hypothetical-protein MLKKITILFSVALLFILCFFIFFKPLKININYIDFYVKHKISKIFVGSSVNMENTSVVWQKDGKDPYLVITDLAIANPNFTIKVPELFVHFKLSSLFKASTNLSQVSADNVHVCIKREETNVNPQNSLDLLDNHYLSSNRLPSVSFQRVTLESRKKETSSQATWMTRTSAGMTGKKDTGMIGKNFKMTESSAKNLLKTIREFFFDLNADSKIEFTNIAIDKSTEDEFFIDKLYIGKGEDFNVLDIHVNTKDGKGFLDDLSITIKNRNNLLNVYGTFYDLKLGLLSKFSTLVKSYNLDKNIGFKGSFSVKINKKDEIVDGNIYVLNTENYLNKNLALTNVNINLTYSNGIISVKNFHFKLNDTYLSLIGKMNFGTSHALLRINISKFAAKDLCTYIPDSVVNSKFKSWYCDNIDGDVLNTIVSFNGKLVDGDLSDIVIVADIENGSVKFDEDFEQVKELKGDLIIKNNDLKITVNSAKFQSFTINGGDIEMKSLNKENSVLTINGQAVSDAYGLYEPIRFKLDDVVKVERDKVSGMAKSVFSFRIFNLNADDKKVDFSANFHSEIDNLAIYNASLGKYDIKLSFGSDFIDLNGSGMVNNTQLLFDLKSSNRNESFAWNLTGDLPAQILNFDSGYVSANLESVINQDKTGYVNGDIDLSELESRSSYLGWKNRFEDHNKILFSTRLKGAGELLIDKLDVVGNDLDIKFSGRVENGNLYLNSSSFKLPDNDFSIEIESGKEKNAITIYGEEINLSDILGLLGKNSNGLNKDIEISMNVDNVIMKEGIVIKNAKLNVTCTKGNCNGSQFTGQFLEDSSNILAEYSGIGLEIYADNSGMLLRSLGISKSIKNGKLSFYLSPQRESGEHYGTLSISNFYIKDAPLLTTLLSMSSLPGIVNAIKNEGVYFYKCNAPFSYKDGTIEIEESWLEGAELGISTGGKLDIRNYKFQVAGQVIPAYSINKSLLKIPIIGKLLTGGKSRGIVSIDYKASGDDKNNNVSVDLISSLTPNLLKRLLGVFDRIMTKTNESGLKGGVKKKFGSI >NZ_CP037426.1|WP_155968885.1|581332_581770_-|ribonuclease-HI MNKKEVIIYTDGACSGNPGAGGWAAIILFQDYRKDIYGREENTTNNKMELTAVINGLKVLKFSCNINLYTDSLYVKHGITEWINKWKMNGWKTSNKKSVKNMELWKELDNVASQHEIDWKWVKAHSGDKYNEEADSLARKAIIDA >NZ_CP037426.1|WP_155968887.1|581937_582825_-|protoheme-IX-farnesyltransferase MYTSVLLNVESTILDFWRLLKPRIMYLVVFTAVAGMVTAPGSMHPFLALISLICVALGSGSAGAINMWYDRDIDLLMERTKNRPIPSGRVSAESALEFGITLGILSVFIMAIAVNYISAALLAVSILFYVFIYTIWLKRRTPQNIVIGGAAGAFPPMIGWAAVTNSVSWESFILFLVIFMWTPPHFWALSLNKSEDYAKASIPMFNIVYGPEKTRKYILIYSVLLVLTSLLPALFLKKALLYLSMATFEGCVFIWYAVSVMKFKNHSSQKKMFSYSISYLFSLFASIIFCSIDLF >NZ_CP037426.1|WP_155968889.1|582826_584377_-|cytochrome-c-oxidase-subunit-I MSDVPRGIKRWLFSTNHKDIGTLYIIFSILAGIIGGLLSVIIRTQLMHINILNNNYQLYNVMVTGHALIMVFFMVMPALMGGFGNWFVPLMIGAPDMAFPRMNNLSFWLLVSSFILLILSVFIGEGPGTGWTLYPPLSQVMSHPSAGVDIAILALHVAGMSSIVGAINFIVTIFNMRAKGMSLTKMPLFVWSVLLTAFMLIVALPVLAGAITMLLTDRNIGTSFFDPAGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYVIIFPAFGIISQVVSTFSHRPVFGYIGMVYAMIGIAVFGFMVWAHHMFTVGLSADAAAFFSTTTIFIGVITGVKVFSWIATMWGGAIEFKTPMLFALGFIFMFVGGGITGIILSHGGIDKLLHDTYYVVAHFHYVMSLAALFGAFAGFYYWIGKMSGKQYNERLGQIHFWLTFISTNITFLPQHFLGLAGMPRRIPDYPDAFIPWNYISSIGSYMSFVSVMFFVFIVIHLFKWGKKAGDNPWGGDTLEWTVSSPPPFHTFEKPPVVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_9 | 647225-647338 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_9
>9.1|647254|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder GGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGTATCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_9
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_9 >merge|NZ_CP037426|9|647225-647338|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGTATCTAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGAC >NZ_CP037426|9|8|647225-647338|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGAC GGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGTATCTA GAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGAC
>NZ_CP037426.1|WP_155968924.1|646832_647009_-|hypothetical-protein MKKKAKEALGLLSALKYWRFLCFKRLTSKIKLLLIATNLRCKCLRSLLSRKKDKESPS >NZ_CP037426.1|WP_155968260.1|645677_646510_+|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155968922.1|644415_644898_+|hypothetical-protein MDSIFQDGKEVIFDKLHQLSNDKQLLENKKYIEDIGDVQTNQDYSNIVEEIRQNLLAKGVREDTFDRFKSHFDDLGEKVFADYISNVESSLQEKGIAFDRNKFDSAKIKGAKGGKFFSMMAIYDLLDSIGDTATLGRHNNDALKQVFGINRPTAKRYGTN >NZ_CP037426.1|WP_155968920.1|641724_644163_+|hypothetical-protein MLNEERPQDFELMELLIKEASSVKGDGHVNPSTQPSGEFKSFKARFQSYIDQIPSYLHSVGKEGFFPHFFLGSFSALVDTEIATKLDVEKIYFSFDGPRTLKVAVIRKGDIKSKKDVLEKIRLFVISEKGASSATQKFSYGELSDVLGRSQPARFQPVFDNQGELKVKSVIIDKGGINQQGVLVAVEDKKLHEDNASKNKFQKIKCELWNKPESDIENLTNSDVKKVKEPVGNILKKVSEIYSEYKDSLVYADKAREAAHHGFLAGALVNFRYRHNLRVYLEQFAGRGYADIVLVPRGKGRSLNAVPIIIEMRAATKEELKEGKIKESSETTPAAALKQAKDYAKGFQPNTMRVLTVSDNVLCVGLNLDSTESEKFLMHISPREDREIALPTMQALLKEASDWNGRKEAITDIKEKIKQPLERIYHTFPGTPEKGGNYFSRFLLGQLLLADKFKRINLEKSLFLYNEYPLASSTRSGSQSTGSPVTTFMLTKGNQGQDKEVFIFHIREGGKGEFSEKKIPINLPKTGKITEVCISLQEKRKSDFFNVEKIDRYNSLNEYKGGKESFNGEWKNIPYPAKLKETFDKVLEFQLASSQDQFQSISKYKELFGKLGEAVLPFKGLIEKEAHTQAVFHGVFSHYSDIKLGESLESRALVLTEFQTGRGKRIDMIIHGVKFADQARSAGEYDPVGLELKGPREGRTADALKDEANKQIADEYMKGVTYKTLTDGKEVGFIGVVFDKGASNADSLILTSKDGFVRVPVVHSSVLQIHPRGHEGQQPIDRTKGKPLEKIEEVIQVHNIDESLSKTQQSRK >NZ_CP037426.1|WP_155968918.1|640406_641693_+|hypothetical-protein MDLDDLTKAAFSIIKDDDPYKEYKQLQIKNWGRGYLEIINTGNLPFFLDILSDEECWEKTDMIYGVKLNRRAVAKKMIEPKSWNGISNPLDDFDCYQVACWCCLEEDVISLFKHFKQEDKIKDGDSDSLKKLVKSVSGSWCTDAMMELWSHLVGECISDLDLKGQHPYVFGLHRAAIDSNRRRVEAVEFFWNKIKSLPESELSAREKDEVFMKIAVHTARDSGYPDVFEFCLSQINPGKYPELLKRDLEKNGYYGSLNIMNDMLSFDKFQELFDCLKPSDVKEDDYRLWVNFMTRDCPECYLDKGVNVFMHMWTKRGFDDHCVLILEKEMMNDSFFQGRFLVPLIEKDYMEPVWEILDKANPNQIKEFMDSKKDHIRSILLAKGDSNSLNRFLAYGKSVDKGLDQQIRPDPSGELTEVEVRKTHGQSR >NZ_CP037426.1|WP_155968916.1|638752_639058_-|hypothetical-protein MRGAPQERVIKDLNPINRGWSQYYSSVVSCKIFSSLDNIMHRKLWKWAVFRHPNKGRCWIKRKYFKKYNNENWRFMTSNKIRLTIHSDHVIKQSAKNQIPI >NZ_CP037426.1|WP_155968914.1|638065_638521_-|hypothetical-protein MKSTKLERSRMRRKVSRTVLQSSEEGRPSSLRQQYANETSEEDLQKIIGSDVIIGRAYNELDQFNWTEDRRLAYDQSKKRTDDYHSTLSQKFNEGIKIGEERDKAEGIAEGGKQAKIEVAKNLLEDNVPIDVIYRTTGLPIDKIKELASQE >NZ_CP037426.1|WP_155968912.1|636265_637654_-|hypothetical-protein MPKKVSRKAERHAAIVKNLQSNIYEDRNPSITAGRRLAVERWVRTYIRHVEYLEDGELQFLYNVFRDENCWLGARLNNTMLGQKLTEEKVSEIENPFSRYDMACRYCIVDEIQKFFDEQFDSYKQGFSSGLDDDSKPVTDEYIRKELLDYMESQDPVLSFWINKDSGKFQNPQNNEECFQRALELEWSEGLDYFSHRLRQQGKDSTNLLIKTITELSGAQTKESIAAILDFCLRNIGNKNPLLDELSRKDRGVYSLFRILVRWSFFDTIQDIIPIFKDKMLEGKMLSPQDYALLLSLLSDKVIESPTLGSQARKIMMNLIKCGNFSIQEGKEEKAAVFFCGGIVPIDHALSGLIIDWVNDNETDSTRDVKKDEILEILQFAKKFCSDTDFGNFKKSIVNNLNMVSRHGMKDDVNYDKFAEKLFSELEKKVSPYSQGGDFCSSGSPKSVLGGAGVSGFSYHRK >NZ_CP037426.1|WP_155968362.1|632579_633412_-|IS5-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIERHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155968910.1|629486_631127_-|hypothetical-protein MSTLPRVLMPMGGNAIIDVDSEDKFRSILHGAFYTCDNPDKVLTRYKIGQTREFNRREGLQEITEHRLDLLLLRQPTENDSDTHPIGYVLGFANNQRVVARQRSNAKRQIGKLMEKERGYLPVTSGNKVVLSYAVFNRGAQRAEGLISTRQPYVHKLDHRGRDLRPIEHEGIIDESPPADFLSDVTIQNSGNYRQNIRQGDQRKEKILFFQQGDNDNQYIEVRLHECSKEDAIRKRIRSIAHGTIPTTQTVQDVLTQIRRILNNQQIEVSDLLTLEFATSTGYYDYWLQQIDIARAGRLQYQLHTEGNHAFEVVNLARDNQQMTDTLNQFEENAEHQRLTLIITLNNTHWVTLVIERENGNYIGYYANSSGGNVPNNVTGIVRNNLGNNIRINNVSVSQQTDGWNCGLWALENASDINRVLNENPVGQVQNIINIIRDFLGRGHPNRDRNYFQNIRVGISQLFRNDPGFQDVQLQAYIQNREQIDPLLRTYLELGYHRVGGGYGLVEAPISLGVSDSSNFGDLPQSSLEGPEASRVSDLSKGKGGK >NZ_CP037426.1|WP_151808023.1|647428_648772_+|DNA-repair-protein-RadA MKTVYVCQSCGHSTGRWVGKCIACDNWDTIVEEIAVKTGKRSISAPILIKTLSGSEIITPSRFLTGIEELDRVFGGGIVQGASILIGGEPGIGKSTLLLRIAANVVQLSSFECLYVSGEESLEQVSLRAKRLKINEPKIKLLSTVSLTDVVATIKENKSIKFLVIDSIQTMYDSRITSAPGTVTQVRTCAHELTILAKQYGISLLIVGHITKDGQIAGPKTLEHMVDTVLYFEGENSNQYRILRTIKNRFGPANEIGVFEMSEAGLVPVDNPSSLFLMAHDREVVGSAVFAGIEGSRPILMEVQALIAGTNMATPRRAVVGWDINRLAMIIAVLNARCKMFLHDKEVYLNIAGGLKIQEPSADLAVAASLISSVVNLPLPTSSIICGEVALSGEIRNVSHADLRLKEAQKLGFKKAIMPKNGNYSSHDIEIIKLGHVRELREIFNYN >NZ_CP037426.1|WP_155969582.1|648758_649670_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSLFGNLYKGLLKTSSRFSDGVKSIFSGKKKLDQSLLDELEELLISMDIGHKTSKLIIDRLTSIKFDKEVEHNIISQQLMNEIEAILSPVVQPLILNKKPHIIMVCGVNGNGKTTTIGKLAYKYKEMGKSVMLVACDTFRAAASEQLNIWAERSDCLIVTGEYGSDSASVAYRAVSQAIKDNVDVVLIDTAGRLQNNVNLMEELSKIYRTIKKLDDTAPHDVILVLDATTGQNAYSQLEAFSKMVNVTGLIVTKLDGTAKGGVVIGLAEAYKIKLHAIGIGENIEDLREFTSKEFAEALFNCN >NZ_CP037426.1|WP_151808025.1|649850_650234_+|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-IscU 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_10 | 659899-660012 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_10
>10.1|659928|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder AGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCAGCATGACGATAAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_10
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_10 >merge|NZ_CP037426|10|659899-660012|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCAGCATGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACATGTTAGCGGGATCT >NZ_CP037426|10|9|659899-660012|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCT AGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCAGCATGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTACATGTTAGCGGGATCT
>NZ_CP037426.1|WP_155968932.1|658382_659846_+|phage-terminase-large-subunit MNFLKFIELCFQTVVPGCEYNDYQYIKVIADRLEAANVGKMRRIIFNMPPRSMKSLCASVAWPAWILGNQPTARIIVASYSRLLSEKHSLDTRCIMQSSWYRELFPEVELSKDQNTKYKFQTVQRGYRIATSVGGTLTGEGGDFIIVDDPLSPAQALSETFRKRATNWFDQTLVARLNNRKKGVIVLVMHRLHQEDLTGHLLSKPKNIWNHTCLPMISENKEIIYSIKKPAPPFLVPVTRVTTNEYKSWITASSARMTPPVILYSREEGQLLYPLDGGKEEVEMIKVELGSYAFAAQYQQNPLPLSSGIIKREWLKRYRNFPDNLSHVTQSWDTAVSTSNMSNFSVCTTWTKVGNKFYLLDVYRAKLEYPKLKEQVLSLAARWTPHAILIEAKTSGQQLVQELKTNSDLPIIEIVPHDDKLTRFYQIVPIIESGKVFLPHQAVWLNDFEYETLMFPETRHDDQVDSTVQYLQWVRDSSSRVAALRAL >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|657646_657994_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|657135_657627_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_095866589.1|655630_656656_-|extracellular-solute-binding-protein MKKAFIFTSLIAIILIVITYLYRNDGTNDSQVVNVYSSRKEELVRTLFDEFTKNTGIKVRYIIDDYSQLLSRMENGGEADLFLTADAINLILAKKRGLLSQVDSEVLKSVIPARFRDSEDYWFGLTKRARILVYNKESVDPKDLSTYEDLANEKWKGKILVRSSTSPYNRSLIAFMIANNGFEKTKEWVSGIVSNMARKPSGGDTDQIYAVAAGEGDVAIVNSYYFARILLSENKKNVADKLGAFFPNRNDHGVMVNISGAAVTKNAKNRENAIVLLEFLVSKQAQELYAKKNQEYPIIEGVETSDILKSWGNYSQSDLPLSELEKHLFEAVMIADECKWK >NZ_CP037426.1|WP_006280416.1|654539_655427_-|aspartate-carbamoyltransferase MNKRRNLLNISDLTVDDVENITKLANQYLKKEVANSHILENKTVINLFFEDSTRTLASFEIAAKSLGANVVTLPIRSSSINKGEDLKDMIKTLNAMNPDYIIIRHKSSGIINTLAKYVNCSLINAGDGSSEHPTQALADYLVISNHKKQIKDLKVVICGDILHSRVARSNIRLLKMFGAEINLVAPPTLICKHFPEVDSVHYSLIEGIKDADVIMLLRLQKERMNNSSSEKEYFYLYGLDSQKLSYAKPDAIVMHPGPINRGIEISSDVADCVILQQVEFGLAIRKAVLHYYRPC >NZ_CP037426.1|WP_155969584.1|652844_653591_-|signal-peptidase-I 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>NZ_CP037426.1|WP_155968936.1|661100_661718_-|lipoyl(octanoyl)-transferase-LipB MIEWLISNQLIDYNCAVKSMEEKIQQIYNNSADELVWLLQHPPLYTAGISATDDDVVEKLFPIYKTGRGGKYTYHGPGQRIIYLMLNLKKRNKCDIKLYIRDLSKWIINVLKQFNILGEFKEDRIGVWVNNNGVEKKIAAFGIRLRKWVTYHGIALNVSPNLSHYKGIIPCGLQDYGVTSMEELGVKVPLSELDDILKKEFYKIF >NZ_CP037426.1|WP_010081986.1|661969_662203_+|hypothetical-protein MANSKFSITFNNEISECLAGLAKIRNKSIKELTEKLIQEAIENEEDKILIERAAKRNVSGVKKIRSEDVDWNTILSS >NZ_CP037426.1|WP_155969587.1|662178_662442_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MEYNIIFIESVLEKDLPALPKTIRLKIINAINKRLTVDPINLGEPLYYRFKGQRRLRVGDYRVIYSVNIIKYEVVITEIGHRKDIYK >NZ_CP037426.1|WP_155968939.1|662677_663871_+|phage-portal-protein 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_11 | 695394-695490 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_11
>11.1|695418|49|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder AATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCAGCATGAAGATAATCCCGCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_11
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_11 >merge|NZ_CP037426|11|695394-695490|CRISPRCasFinder CTTGTTAGCGGCTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCAGCATGAAGATAATCCCGCTACTTGTTAGCGGCTGAGATACTGCG >NZ_CP037426|11|10|695394-695490|CRISPRCasFinder CTTGTTAGCGGCTGAGATACCGCG AATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCAGCATGAAGATAATCCCGCTA CTTGTTAGCGGCTGAGATACTGCG
>NZ_CP037426.1|WP_155968963.1|692917_694702_+|ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MNNITINYAKDSKLTDFGKAVLSDRYLIENESYQDLFARIANYYSDNKEHAQRLYDYMSNLWFMPSTPILSNGGTKRGLPISCFLNETEDSLQGIVDLWNENVWLAARGGGIGSYWGNLRSIGESVKGSGKTSGIVPFIVVQNALTLAISQGSLRRGSSAVYLPVSHPEIEEFLDLRKPTGGDPNRKALNIHHAVIVTDKFMQAVENDQEWNLISPHNNKVISTVKARDVWIKILTARVETGEPYIIFLDATNNNKPESYKKLNLDIKMSNLCSEITLTTGYDHLNKSRTAVCCLSSVNLEYYEEWKDNKLFIEDIMRFLDNVLEDFINKAPNEMQRAKYSAARERSIGLGVMGFHSFLQSKMVPFESVTAQQWNKKIFKYLREQADIVSKKLAEEKGACSDAKEVDLMERFTHKLAIAPTASISIIAGNTSPGIEPYAANVFIQKTLTGSFVVRNKFLQKLLAEKNQDNDKIWSSISTNEGSVQHLDFLSEHEKLTFKTAYELDQRWIIEHASDRTSYICQSQSVNLFLPANVHKRYLHKIHMLAWKKGLKSLYYCRSQSMQRADKVSHDIFKKSEILQQKTDIDYDECLSCQ >NZ_CP037426.1|WP_155968961.1|691782_692859_+|methyltransferase-domain-containing-protein MKSNLSFIKNVALNCMSKLIGVLNIKKVKHFIVNKYNTLHKEMTVLLKKSKNLLNTNIEIGLYHFYKGSISDGKLRFWLISIFYPHLPIVWYNIGRCHFAVGNTNKAYNYLTRALKLDNDHEEASYYIKKMTNSAPITELPKNLIRQYFDYTGEYFVEHWLIAKQYRGHELVHMIITKIFNNSTSELNILDLGCGTGICGHFLKINSIGNHITGIDISSRMLNIARGCFIKGKPVYNELIHMEMKEFLKQEKNQQYDVIIFAEVLHYLHDFQEELELAKRSTSKKGVIVCLMRRKEGEGIDFVNKGDYFRHSESYVQHVAKEINMQISYMSYCKIYGSQVDGILFALQHQQENPKNLT >NZ_CP037426.1|WP_077188558.1|688159_688423_+|hypothetical-protein MVEHIKEVNNTGFGQMYQFLFLPKGTGTDWRSAFRQQEELFKKVGGNVILPEISNSPSKGNQLGEVGTMLNNVENDQEHIRKKRYRS >NZ_CP037426.1|WP_082860933.1|687934_688072_+|hypothetical-protein MLAKINILNISNIGHYYIILTHRNIMQASYKNLQKDLTICLKKIK >NZ_CP037426.1|WP_006279898.1|687594_687729_+|50S-ribosomal-protein-L34 MKRTFQPKNLIRKRRHGFRSRMATRAGRKILNRRRSLGCNKLCA >NZ_CP037426.1|WP_038199744.1|686398_687487_-|phosphate-ABC-transporter-permease-subunit-PstC MNSVIVIPVLLILLFCFSRFQEVNKVKSYLYLSCVWMLTWLLVFYNNCFVTFISIALLFFMLAFIFKNKRNKIIKLSLFVALAISFFITLFIMLSIFIQSISFFNKVAISEFLFCLKWGHNVVTINEEKIGCFGIAPLLVGTLLITIIAMLVVVPLGLFSAIYISEYASEKVRYIVNTTLQVLSAIPTVVYGYFAVVFLSFFIKQVANFFGLSIHSESALVAGLSIGIMILPFIISLLEDAIRSVPKSLRYGFMALGATPAETIWHITIPYAMPTILSAILLSISRVIGETMIVLMAVGINANLTFNPLNSVTTITVQIATLLTGDQDFNSVQTLAAYALSLVLFIITWLLNAFALFVMKRN >NZ_CP037426.1|WP_155969589.1|684869_686297_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta MNIGRAIKVTQAVVDIKFEGELPKIFNALKSKLKYKDKELVLEVSQHIGDNIVRCIAMDSTDGMSRGDEFVDTGAPISVPIGRSTLGRIFNVVGELIDECGPLKGKYNLEPIHRAPPSFTEQRIQEEVLVTGIKVIDLLAPYLKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHKGFSVFAGVGERTREGNDLYHEMITSNVININEHEKSQAVLVYGQMNEPPGARARVALTALTMAEYFRDRENQDVLFFVDNIFRFTQAGSEISALLGRIPSAVGYQPTLATDMGAMQERIASTTSGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFSHLDATTVLSRQIAEMGIYPAVDPLDSTSQSLSAEIIGEEHYNVASEVKRILQTYKSLQDIIAILGMDELSDEDKIIVDRARKIQKFLSQPFHVAEIFTGMPGKFVSLSDTVSSFKGIVEGKYDHLPEAAFYMVGNIDEAIKKAELIEAEAK >NZ_CP037426.1|WP_006279902.1|684512_684857_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon MNTFKVQFFSPDDQISFSGVVSLSVTGLEGELMILAHHAPYLIYLLPGMITVKMSNQTEKKVVIDSGVLEVANNNCSIITSQIQVFDRAIHDEKSFKNKRISIYLSYLDEKFLS >NZ_CP037426.1|WP_155968959.1|683939_684125_-|hypothetical-protein MISNIIRSIVKYLMRKIIKYISIIGIACLVLLFFISNVETRVKTQEEQLFLAVEDGNAQEV >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|683441_683933_+|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968965.1|695671_697234_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MSAIAIIDFGSQFTQLIARQVRGMGVYCEIFPSNISFETISKFNGFILSGGPQSVNDDCSETSRVVHEIIKLNEATNVPILGICYGQQLICHYFGAKVKESFKQEFGRTKIKILKESPIVKDTWDVNSEVDVLMNHADSVDTIPHGFTVIASGVINQTIAMIVNEQRKIYCTQFHPEVKPTTNGSKLLSNFLDIANCERDWTMKSFIEEQKEKIKNVVGEKKVIAAVSGGVDSSVAAALTHKAIGKQLNCIFIDTGLLRKNQTIAMLKEIPINYVDKSNLFLSRLKGITDPEEKRKIIGNTFIEVFEEEAKKIGDVDFLMQGTIYSDVVESGHASDNTSTIKSHHNVGGLPEKMNLKLVEPLRYLFKDEVRLLGKEIGLSDEIIFQHPFPGPGLAVRIISEVDKEKVQILQEVDEIYINTMKNYDLYDKIWQAFAVLLPIKTVGVMGDGRTYGYVCALRAVTSSDGMTADAFPFEDKDQHLLVFWDFLRNVGSIIVNNVPGVNRVVYDITSKPPATIEWE >NZ_CP037426.1|WP_155968967.1|697262_697985_-|TerC-family-protein MLTDAWTLLTLTLLETILSVDNLIFISLAIDKVPNALRERVRLMGLGLALLMRFVILFFTSSILSMQKPIFHTASARDLLMIAGGLFLIVKSSMELRDDIFVCKKNKKKANVKSKFFLVVLQIILIDLVFSVDSILTAIALTYNMVIIATAFTFSMLAMLFLSSYTAQLIKSNPGLKIIAILFILLVGVYLILHGFHIELPKGYLYSSFMFALLVEIISKIKKINRHTAIHSRYLGNKSR >NZ_CP037426.1|WP_006279522.1|698382_698565_+|hypothetical-protein MVENLGVVFTTAQRAIVKLEDLGIVSQTSQGKRDRVYCATDILNILEEPTKITENFDSTL >NZ_CP037426.1|WP_155968969.1|698750_699569_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MINNLDSIILGIKDGEKAIEDLRVVLKKRKEEVITTQTFNYALQCPQTTKEAIVHEILLHFIQNPGEQSLEQVIQYLDGAIQSRIYAKNNPIRNLDEEFRTHINFKDEEGNTLLHHAVIGNKTEEITTLLVTYSANPLIQNADNKIPLDLAQGETKEVLIKSMKKQANTKKESAMVGSLVPGVIIGGFLGVVLGAGVCVAVSLSGGMILGVMIASSLVASIAIGLAMYFLSQDYEQAKAIEKTISTVSSEISVDDTTAANKNNKEGPQLTYS >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|699673_700021_+|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|700040_700532_+|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968971.1|701492_703988_+|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MSFVKEKNTPVMEQYLNLKAQYKDHLLFYRLGDFYELFFNDAIKAAKLLNIVLTKRGNSCGQDIPMCGVPAHSSESYLHKLIDLGFKVAICDQLETADEAKKRGYKSIVKRDVVRVVTPGTIIEDSLLEDKSNNYLASIVEQNDEYAISWLELSTGKFFHTLTSLKALDSDLLRISPRELLISEKFTEDEKIRSVLKNYKISITQHAQSFFEYSKSHRTLCEFYKIRELGSIGNFSKVEIMACGALLEYVRVTQRGSIPRLEFPKTYKQQNFMLIDASARRNLELFSTQFGEKKGSLISVIDHTVTASGGRLLKQMLASPLACSKAINLRLSTAQFFVNNHEPRRKIREILSNIPDIERSLSRLILGRGSPKDMNLLKIGLGKTLELSEFLCKIESGENGSLPQQYVIQTEIQPASRAGITVKSDESELSTIHKSLGNHKDLFELLNSAILDNNLSSVKEGGFIHSKYNSELSELSYILNNSNKLVTKLRESYRDLTGIAALKILHNNILGYYVEVSANHKITSDIFIHRQSLANSMRYTTNELKELENKILTARDAAIGLEMKIFSELCSEVAKESEKIALAANALAKLDIRTAFAELAVQNNYVKPIIDDSKEFNICSGRHPVVEVNNKFIANSINLAGIHLITGPNMAGKSTFLRQNALIAILAHMGSFVPAESAHIGVIDKIFSRVGATDNITAGYSTFMVEMIETATIVNQATDLSLVILDEIGRGTGVYDGLSIAQAVIEHIHNVNKCRAIFATHYHELTKVSKYLKNVKCFCVKIREWNGEVIFLHEVIEGIADESYGIHVAKLAGFPDSVLNRASEVFEELKA >NZ_CP037426.1|WP_007548550.1|704977_705376_-|hypothetical-protein MVDFIDLFQGSKDFTMCMHNGSGDAIYNRCISAVRMDPPCMHGESIQGLFESSFEQGVVTVRVNLDLETLNVVVYKSPPTSDKLDAFSLAYQIDRYHIDENTIVFDEKVNTIKFDISNPLKHKFITFEIFKR >NZ_CP037426.1|WP_151808068.1|705509_706688_+|ribonuclease-D MLINTTSELEDIGEGLIAKKPKFIAVDTEFIRNNLIYYPKLSLIQISYGEKSFIVDALVPEIDLSFIKKIMLNQGITKVFHSCRQDIESLLTVFKCIPTPIFDTQVAAMFCHYYHDFIGYSKVVEQYQGIALDKIKAKNSDWLRRPLSEDQLDYAVNDVVHLYDLYQILCNKLEENNRMGWFQEEMESIVDINKYLHSPKDAWKRIKFNYEVNPRLILTVKAVSEWQETLAQRYNMNRNKIINNAVIADFIEKNIEHVDEILDDLKRNAKNIKDADLLEFVNIFNENERNWMQQNNTLSSNYDKSVLDILSIILDSKCKESNISRKLVSSKDELTGSISGQTDKLFKGWRYDFFGRSVESFLNTSSKFEISAVKSANNITKIQSNLVENNCC >NZ_CP037426.1|WP_155968973.1|706998_707586_+|dephospho-CoA-kinase MIIGLTGGIGVGKSFVTNCFQEFGAAVFDADSVVHQLYKVDKSIISYAEKNFPGVVVNGEIDRTVLSKYFLAYDENWKQFQSLVHSTVLRELEFFIAKEKKIDRKLLVLDVPLLLETKFYLYCDLIVFVHADSVVQAQRLNERNIDKEKLNLISDVQLSIEEKRKISDFIIDTSVSKEYVFSQVKDIVDSLNLNT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_12 | 1164173-1164269 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_12
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_12
>12.1|1164196|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder AATTACTTGACCGTCATTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_12
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_12 >merge|NZ_CP037426|12|1164173-1164269|CRISPRCasFinder CGCTAACAAGCAGCGGGATAACGAATTACTTGACCGTCATTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCGCTAACAAGCAGCGGGATGACG >NZ_CP037426|12|11|1164173-1164269|CRISPRCasFinder CGCTAACAAGCAGCGGGATAACG AATTACTTGACCGTCATTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCT CGCTAACAAGCAGCGGGATGACG
>NZ_CP037426.1|WP_155969365.1|1163823_1164111_-|hypothetical-protein MSNNFNFKEFFNHYETNSTSDDIQRYYLLWKSVIAQAMIDAASNCKKTESLVEKRKAISWLSDFSQDFVHTCILADCDPIYVKNKIQPTLKSLTR >NZ_CP037426.1|WP_155969363.1|1163241_1163808_+|hypothetical-protein MISLFYKLRLLNYILGSLKDIIVKLFLFTMYLYTFSIVLMFLSNGFWYAVEFCSFKNAFYRLFQYCKWYYENREDLGYGISIRILVAFLTPHFLYKLLLGTGWKSFLKEKIIQILNTRRKKGSEFSNTSGSSYSDKNNYSNNSGNNERQAQDAKRKVNMIKQLLIKDIEATIDRRLNYIFFGKRSKPH >NZ_CP037426.1|WP_155969361.1|1160874_1162398_+|actin-bundler MLHNEKNSNSVGTQQNQPEDSFDLNKTMQNLPNSDIANDPKKLKERITDLLKGDTEFSKMKQGDKILVVSAASGLFTAVLPLLAVGATLAIPGAIVGLALYFAVKVAVKTVQSGYKGLKWSAEKTVDGVKYTAGKVKDASTYAAGKVRDGAVHVKDKVKEGYEHSVDSLKKGASFVGEGVANKFHKASGETDYLDKVKRFTPDAIKKSDEIRNDMKAIFADKGNNSGLVKNVLSGISSEIDLKMAEKAKSGEIEHTSGWQVQKEFINNLNEKSLHNLLTQRSLPKGSYFIDSVFSEHYDEIKKVIKECRENHLYSSVSNMFDRAEKKANRPSVKSLTRSVSSSFSSLGRKGSEQSNSLSKSNSLNSIGTESTATVSDSDSQNFATVRRSNSSSSLTPKLTPVAPPELPRSASLTNLNGQSSFSEDVLSDPIVEQNLDSLSNRTLTHSNSTDSGMGSGSSTLTRKQVLPLKEEFDRELEEKLAKRRASLDQPSAEPVNSRATATPGTV >NZ_CP037426.1|WP_006279848.1|1160503_1160719_-|hypothetical-protein MKYRKRTLIFLAVITLIIIALLFRYNSHFHKDVVHLKSDNKEFKKKPENSIESTILHREKEVYDHVFHPDD >NZ_CP037426.1|WP_010962866.1|1159386_1160421_-|FtsH-protease-activity-modulator-HflK MFDDNNPWNLGKKPVGNKTPNNEDILSKAVSDIRFFLNGLTRNRGKKPYFIIFIILLFYACTGFYIVHPSEESIELTFGKYSNTETPGLRYHFPYPIGKVFKVNVKEVNREEIGVSSSYGRDTDRGEGVMLTGDENIVNVNFEVQWRVRDAKDYLFKVRDYKPGFSVKNAAESAMREIIGKNTISFALGQGRPEISRDTRILLQQILDGYQMGIEILSVQMKKIDPPEKVISSFRDVQSARADKERTINEAYAYNNDIIPRAKGEAIKIKLDAQAYENEIINEAKGNANRFLSLYEEYRQNPSLVKNRIYLETMENIFSKVDKVVVTDDLKGMFSYLPLTNLGK >NZ_CP037426.1|WP_155969359.1|1158511_1159384_-|protease-modulator-HflC MSSNIKIVFVSVFVVLLIALSNSIFVVQETKQAIVIQLGKVVRDVRESGLYFKLPFINSVEFLDKRVLDLSPDKIPREVITADQKRIIVDAYAKYKITNPVTFYQAVRNESGLVRRLYPVIEAHIRENIGRFSLISLLNEKRSEVMQLIQRGVYSEAEKFGIEIIDVRIKRADLPEENSSAIFRRMQTEREKEAKEIRAEGEQAGQEVRSKADKLKREIISSAVKESYEIRGRGYAEATRIYNEAFKVDEEFFNFYRSMSAYSKSFAENNTKFVLSPNNNFLDILNKGWK >NZ_CP037426.1|WP_012673276.1|1157023_1158508_-|DegQ-family-serine-endoprotease MKSKAFILSIFAYFLIAFSSYANMFDWNAKKVVDASTTACNCNQGLADLVEELIPAVVNISSEQIIKQENNSRTRVPSMPGNNFFDDFREFFEHFDQFFMDRGPSVNKEVVLLGSGFIIDKGGTIVTNYHVIKNAKDITVTMNDNTYFKAEVLGYDARTDLAVLKINSDKDLSSVAFGDSDKARVGDTVMAIGNPFGLGGSVSTGIISARSRDISIGTMNEFIQTDAAINRGNSGGPLFDLNGKVIGINTAIYSPSESGGNVGIGFAIPSNLAMSIIDTLKSGKKIKHGWLGVQVQPITKEFAESLGLKDIKGALVASIVKDSPAEKGGIKVGDILLEFDGKKIDRMTQLPQMVSRAGPEKKVQVKLLRKSKEVNIKVVIGESTNDGQDNNQEENKSTSDYVTGLTVSNLPKESKESNPTKGVIVTNVDSNSNATLRGIKKGDIIIQLDGTDIENTNDFQKQVDSAVKKNGKDSIMLLIYRNGNQFFTSIKLKK >NZ_CP037426.1|WP_155969357.1|1153182_1155378_+|hypothetical-protein MPNRETVRALVSAFNVHNYARNTVKTNFTLQSRGKEDYIVVSFDKSMGTYQCRRYLDSIKRKIIREFYGIEKGNKAEILDTAKLIFDVNSFPFENYKDVESFPLKNYKGDWFVDKQGSIKFVTSVDDGVIFNLKSHLASSLAKDIREDMQISSTTVPFNKGKYLCCSKFDNKELSQQFKSKFLSRMRERYENVPKKPLKVKDNSVYIKDVFDDARFIDSVTRYKAWLVGMYLGVESSANYKVKLFKDMIIESIGQATRVTVAGFIRNFPLNEKTAKILIPVVLDNGEPRILASEEALKLSYAFNYAVFNNLYSKVQAELPICGDSGIYGIDFSNKEISHCVITKIIKNSVINKDHELSIDPELRFRALSRSPSTELSGMKLESPTCSQGGVKDSPRQGSEKEEGEEGLRLLNYVNSVRTSDRPLTDLSYATTSCGVPGISRDLSAGEGTLTEANIPDQKRSSSIPSLRAWDSSTFLNSEDSLKDTENICNEEPEKQQVTDESDRKSSDECSKAKPQDSKSPEKKHGDGLLCSNSSIGSMWSKLKGNVLPSLKRNNKGRGSVYSISSSVSAPGGSVPEKLPVSESSSSFPGRIKAKSNPPSAVTSPTHEGVPEWQQRLNPDQREELRPFLSPEERKKLNSNYFSPGEEWHLYLTRTLSGKRELSRFLCESEESQLRRLAEAQLSSPDNSSSKKVDRDSGFCSMGSPAVQHKGSVPSEVKECEVEPVSEALRK >NZ_CP037426.1|WP_155969355.1|1152917_1153139_+|hypothetical-protein MHSGNDKKGFDAEKWKRENTAPGGGKLLSVEKERFDDHRDTARKIEERKRQSEQPSSSMSGSSSSGVGSGNKR >NZ_CP037426.1|WP_155969617.1|1151148_1152591_+|hypothetical-protein MVESFSGNNRGNNFIEEAKIMENFSDNNGNGSSIFQGKLREQDFSAEQKLNELKAAIEELTRQDLLRRLECERQASSCIDEISSQAELHIGEGDDEDYFTGEKGRVLGDFWNFFESLFNLFEVDVDDPKIYQMLKEKKEKNWLLSIIKFLRDKLKELIKKIFARDLSFNQRLDKEIKELQEKLGSGELSEEEFARALERLTALQDLKLRLQMAVVGWIVTMFAEMFGVELAAAVEASTEKEDKKAEKTSLKEENKEVCENVEIKLDEREKPKVPVFLFEISPGFVRPVVLSKPELDLLSNSLKDRVPFVQTHDRGKEDIENLPKQEVNKEDKKAKPEKEVCPPAPKTATNTTGTGQGRKEVYGCNSDWRKMIEQDNNNTYQASSQSAQSFVSDKKASNQSAKSPVPDPRQPDKASGSTPGKSASNIEAKKQPVERLDFTVGFWNGPENESSVNNAQPPKELTNDVKVEKCAEGQSVGKTP >NZ_CP037426.1|WP_038199133.1|1165001_1167023_-|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MSNQIFLNSRLENIPKFHSAILPKLCGGDKVVDLLFYKPLSYVDRSKLLSDARVGEFTTFIAKVYEHQSPTFRGRPYKIVVESESQYIFIVFFNYSVKYLYKLFPIGANVIISGKLEKFAEHWQITHPDYVSLDINQFKEIACIEPVYQLCRGITNKRIGNIISSNLKELPDLPEWIDDTLIKQKKWLSWRESIIKLHRPSSLVEAEVCRKRLAYDELFAYQLALKLARKNHVKERGREFIILSKYKEQVLNELSFQLTNDQTRAIDEISERQKSKYRMISLLQGDVGSGKTVVALFAMINVVENNMQAALMAPTTILAEQHYNWIEEVLSCTDIKVALLTGKTSRKERKIIMNELASGVLNIVIGTHALFQANVTFKNLGLAVIDEQQRFGVMQRNRLVGKGENADILFVTATPIPRTLQQAMYGDVECSILKEKPKSRLPIKTVTMNISRVPDVIEKLKGAINRGEKAYWICPYIEENEETNIAAAEMRFQELQKTFLDKVGIIHGKLTQEQKDQVMFSFKRNEFSLLVATTVIEVGIDVPDATIMIIENAEQFGLSQLHQLRGRVGRGNKPSFCVLLYDNLSKSSSSKLKIMCESQDGFYIAERDMMLRGSGDILGTKQSGCMEFKFADLYQDKELLNLAYNNAKGAMADFELLLDIFEYRSRLHFSKFQ >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|1167230_1167722_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|1167741_1168089_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155969367.1|1169636_1170434_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurQ MKITVLSGYGLNCEKETAFAFMECSRKLGIGNIEVKIVHINDIINNPGELKLSNILAIPGGFSYGDDTGAGNAFALRIKNNLLDEFQEFLSQDKLIIGICNGCQILVKLIPEFSNLALIHNDIGNYQCRWIRVRVNSKSNSVWLRGLSELYLPIAHGEGKFFMDQDILNQLIESNSTALRYIDKNGNYANLQFPYNPNGSTYDLAALSDKSGRVLALMPHPERGIFFTQQDNWPLEKEKSKRLGVAVPKYGDGMLIFENALKYFC >NZ_CP037426.1|WP_007549491.1|1170440_1171691_-|phosphate-ABC-transporter-permease-PstA MSIKKKFLKLLQSRRVHARIKRKNKKNRALRFCSFTALVISLGCPVCILLSILVNSYSALTVTKILLPVEINADLALASNPSDLRYKSIGLLNDSLRKVFGGTDFKDGDEILSRNSYKELEKFFRKKVKDSGEYEIWFTASSIINSINKDKYLNDRYAKLLDWLKEKRRVKKFFNKSLFLKSDSREPENAGILGAFIGSLMTIIVCLALALPIGIMSGICLYEFMPKNRLMTNIVEISINNLAAVPSIIFGVVGLTLYLGIFGLPRSSPLVGGMTLSFMMLPNIIIATKNAFANVPITIKDAAFALGAPHIKVILDHSLPIALPRIIHGTVLAIARILGESSPLLMMGMVAFIADTPTSFFDPATVLPVQIYIWSSNPEIAFVELAAIAIIALLLVLFALNLVANFVKRKFEFFNF >NZ_CP037426.1|WP_010962989.1|1171739_1171922_+|hypothetical-protein MQVADTGIQQALPANNFYIFHESTNQKENNECWIPVSEHWDDTTAGGKHNVRTVVCHALG >NZ_CP037426.1|WP_006279489.1|1171970_1172348_-|50S-ribosomal-protein-L19 MTNLLKKFNEQQMQVLAKEIPEFRPGDDLKVTFKVVDGTSERIQIFEGVCISKRNRGLHSSFAVRKVSHGESIVSQFFVYSPALVSVQVTRKGKVRRAKLYYLCKLFGKAARIKERTTYVKKKSK >NZ_CP037426.1|WP_007549279.1|1172331_1173042_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MAFNVTILTIFPEMFPGFLNYSLAGKALEKKIWNLEVINIRSFAKDKHSTVDDVPYGGGAGMVMRSDVVGDAVDSMLSVHKNTKFIYMTPSGTKFNQNIARELLEFPHITILCGRFEGIDQRIIDAYTPYELSIGDYILSGGEPAAMVVLDACIRLLPGVVNNTDSITEESFNYGGGVLEYPQYTRPEQWKGYKVPEVLLSGNHKKISDWRQKQSHVITKKRRPELLSGEINDKFT >NZ_CP037426.1|WP_155969369.1|1173116_1173839_+|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MSLNKTIYEGKAKAIIETEDLSIVIQHFKDDITAFNKEKYEIIDGKGIINNHISAFIMEKLEKAEISTHFIKTLNEREQLVKKLKIIPLEVVVRNVAAGSFCKRFNIKEGERLASPIIDFFYKNDDLADPMVSENHILYFDWLSSKEMDEVKTTTLKINEILVHLFSNASIYLVDLKLEFGRLINDSTKIVLADEISPDNCRLWDKNTYKKLDKDVFRLNLGDLKEAYLEVAKRLSVKLG >NZ_CP037426.1|WP_007549277.1|1173835_1174873_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MNTYTRSGIDIELYNKLIKEVKPIAQETTREEVISEIGSFSALFDFAALSKKYDHPVLVSSTDGVGTKLLIAQEVNKHDTIGIDLVAMCVNDLLAQGATPLFFLDYFATGVLTKDVLLSVVKGIAEGCKQAKIALVGGETAEMPGMYGNNHYDLAGFVVGVVDRKQILPNCSMMKAGDYIVGLESSGIHSNGFSLVRHVFKSLGINYNDTSLWNNKSWSEILLEPTKIYVDSLLPIMSQVKGIAHITGGGLVDNIPRILPKNLFANIDINSWKWPDIFLWLTKEGKIEKKEMLKTFNCGIGMVLIVSSENMQNVKNHFQKRGEKIEIIGKLDEACNPPLDRVVFS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_13 | 1229908-1230013 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_13
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_13
>13.1|1229933|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder ATCTATGCTGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_13
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_13 >merge|NZ_CP037426|13|1229908-1230013|CRISPRCasFinder CGTCATTCCGCTACTAGTTAGCGGAATCTATGCTGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTAGTTAGCGGA >NZ_CP037426|13|12|1229908-1230013|CRISPRCasFinder CGTCATTCCGCTACTAGTTAGCGGA ATCTATGCTGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGCATGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTACTAGTTAGCGGA
>NZ_CP037426.1|WP_151807997.1|1229476_1229833_+|holo-[acyl-carrier-protein]-synthase MIHGIGTDIVYIPRILRILQKYGEKFLNRIYTEKEIELSRKYNSQEMRARYFAKRFAAKEAFVKARGSGQGITMKDIEIYNDVRGKPYLTVSKDFISKIHLSLSDDGDYATAFVVICV >NZ_CP037426.1|WP_155969413.1|1228211_1229480_+|proline--tRNA-ligase MRLSKYYLPTLKEKPAHAKIISHQYSLRAGLIKQIASGIYTWLPLGLLVLKNIEDIIRDEMNKSGAIEALMPCVQPASLWRESGRYDDYGKEMLRIKDRHEEDMLFGPTHEEIATDLIRDVVKSYKDLPLCLYQIQWKFRDEVRPRYGVMRGREFLMKDAYSFDVDYEGALNSYNLMYKTYIKIFKRMGFTPIGVRADTGPIGGNLSHEFHILANTGESTLYYDNKFSELLESEDIESLKSIYAVADDMHDPETCPISQEQLNVSKGIEIGHIFYFGDKYSKPMKASVTSQDGKNVNIHMGSYGIGVSRLVGAIIEAFHDDKGIIWPESVAPFRIGLINLQTKVTEAADKIYKALKSDEVLYDDTEGSVGVKFSRMDLIGLPWQIIVGKKAVSENIVEVKNRATGEVKEMQIEEAINHFSAK >NZ_CP037426.1|WP_155969411.1|1227563_1228109_+|hypothetical-protein MKAKLESSGGTDKKETPEEFAARIDREQAERKKSDDNDSDWTKRLKERAAVMQLSDSESEHSDSISDSDWTTDESKDTQKEIEQEKEEQTKHTNSPSSKEEGSGGLDSGIGSRATSPIHPEQETEESPVPPSSCVDSPQVNNVDSVDNEVQDSPPLSVEDRIAQFGGKALRCQKENVVQGL >NZ_CP037426.1|WP_010082469.1|1223933_1224461_-|cytochrome-c-family-protein MELNKIAASILLSGLIIMIVSNVVDMLYSPEEYKIEHQTIVAAGSNEFQQKIEQVALDIGALMQNASFEKGKSAAKKCIACHSFEKGGMNKVGPNLWNIVGNKKAHLGNSFNYSKAVLERGGKWGYEELFAFLKNPKAYIKGTRMAFAGISNPQEIADLVSYLHQLSDSPVALPK >NZ_CP037426.1|WP_012673268.1|1223170_1223932_-|alpha/beta-hydrolase MDYCKLFDGNNGHIAYRKLQGKKASVVFFGGFASNMDGTKATAIYKFCQENDVALVLFDYFGHGHSSGNFIDYTISDWQKNCAKVMSELTSDKQIIIGSSMGGWLMLLTALQFPEKIAALIGISSAPDFTEDLIFKQLSGKQKEELDSKGVIDFTSEHCTYKITKNLIEDGRKNLLLNKKTIDINCPVRLLHSINDKDVPYQTSLNLAEKIKSTDVEVHLIKSAEHNMSDNHSLEVLFKTIREFCNQTAFCDF >NZ_CP037426.1|WP_155969409.1|1221996_1222995_+|tryptophan--tRNA-ligase MTSIVFSGIQPSGVLHLGNYLGAIKQWIDLQDKYKSLFCIVDLHAITANKLPASELKSNIFKTAAAYIACGIDTEKSIIFSQSTVSGHAELGWLLGCYTPIGWLNRMTQFKDKAGSDKQKASLGLYSYPVLMAADILLYQTKYVPVGDDQKQHLELARDIASAFNNHYKLDYFIVPEILTSDCTSRIMSLRDGTSKMSKSDPSEHSCINLDDTDDLIVKKIEKAKTDSILGFATLKCRPEISNLINIYSVLSNVNAEKVCEEVNKHDMKHFKKELADLIISVISPIREKMNDLLKDQFHLHEILKKGTKKAAEIATHNIKEIKDIIGFAQYL >NZ_CP037426.1|WP_155969407.1|1221409_1221979_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MSDSSKEKKKKFADMVSRQKGDDQQSDNHKQTDDLNEDLNTLRERAAQLEDHLRRAVADNENVKRIMQKQISDASDYAVTKLARDMIDSCDNLKRVMEILKDGDPVHEGIKVAYQKIINDLKKHGIEEVDPLGELFDSNLHQAVVEREDNEKKPGTIVEVLQTGYTIKNRLLRPAMVILSKKSADCGSD >NZ_CP037426.1|WP_010962840.1|1220361_1221348_+|polyprenyl-synthetase-family-protein MLNTDLTNSDKLDDIVSSDLSAMNDFVFKNVNDEDAKLATDIISHLVRSGGKKIRPKLVFIICKMLNYSGENRINVAASVEFIHNATLLHDDVLDESEARHGVKTANKIWGNKSSILVGDLLLTLAFRWLIECGNLNILSILSKASHLLVKGEIKQMTARFDPHTVRENYFDIIGEKTASLFSACCEAASTVSGATNDETERLKNFGFNFGMAFQIVDDMLDYTANQGTSGKQVGKDFFEGKVTLPAIIAYEKGSPAEQKFWEKCFSSARHNFDQALHYINHHNAIQLSMEKARHYINMAQNDISTFSDSFYKTTLINFLNASIERRM >NZ_CP037426.1|WP_006279266.1|1220030_1220351_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLARFGAKKRPFYRIVVADSRAPRDGRFIEKIGQYDPMLPKDNKNRVVVKADRLKHWLSVGAQATERVLWFIKKGIVTLETEPKKTEKKKVENEKAQGQEA >NZ_CP037426.1|WP_155969405.1|1217820_1219629_+|peptidylprolyl-isomerase MNVKNFFTKITVVLLACLLIFVGVGNLLSGDDEKEEVARVGKEVITSDEYKSLYQNYGKQISGSDASREQVKKLKYDLLNALIEQKLLFNLTSELGLTVGEESIKNHIKNTKYFQNDKGEFDKNKFYETLNDLHMTEKEYIAKLEKVLPAMMLMTSLFKDNYPVTFGEKIDEQIYKSRYQTRVVDIVKITEDAVTNIPEPDDQALLDLYERNKSHFYYPEYRTAQYISLGQKYFEDQIKISDEEVDGIIEQQELKNQRDIFNAIFSTKEEAETARRAFEEGKTSFEQIVEEFGKAKLEETRVNNITKDFLPEDVREKVFALKVGEVSEVLASSFGWHIVKVESAHQISDEDLVDLKKDIKSVLTNQKSFERVNDFINQVNYKIYNGSEIEEILSEYNLPIQTIGPVDASGKDQSGNNVGDSGDLISFIFSREKDQKGYFKGVGDAVVSVKIIDIVPPKSQSFEEGRALAVELWRSEFIKERMFKFGQEVAVQLREKTDLEEIQGVELVKGQQMHRNKVDQQNYPFSFVEEIFNMKTTGSVTDPIQYNNEIIIGVLKEMHSSNGKLNMLDTGKRVMISLKEQLISYLESKYKVEVNHAILDDI >NZ_CP037426.1|WP_155969625.1|1230333_1231830_+|cation:proton-antiporter MDCVLTSLSLPFSITENYLLITALILLLSALVIFFTGKWPGVNNSITVTSSVLLFTYTCLCTLYWVYGDHSQFILMDFGNNLHISLKLESTGVIFSLLISFLWVLTSIYAICYMQNNYADSNHSSFLCFFSISIGCAMFIAFSGDLLTTFVFYELLTISTYPLVTYNSTNESMIAGRYYFGVLFFSSLVLFFPAIGLLYHEFHTLDFVSGGIFKFDTSLITFIAVCFAMLIYGIGKAALMPMHFWLPKAMVAPTPVSALLHAVAVVKSGVFIIIKVILYTFGVDNMQRFVQQNWFAGGWLPYAAGFTIITASLIALKQKELKKLLAYSTISQLSYIILFASIFSDLSMRVAIFQLVCHAFAKITLFFVAGAIITRAGEKYIDKIYGIGRSMPISMTAFAIGALSMIGVPPAPTFWGKFLIFQAVFNSGNVILSVFVTLVLIVSTILNALYFLPIIYNAFFLKPSQNYFIKKTPILLVLPPVITAMCTLVIFFSYQVIF >NZ_CP037426.1|WP_155969417.1|1231826_1232489_-|conjugal-transfer-protein-TraJ MEDKLLESVKNKSYFSKAVEWYCHRYLFCVAERSWMALTVSLLLVCLCLLTLNIYLLFPIKKDLNFVKYMNHTEDEFSAMHKLSFSKKEDEYTSTARYLISKYIEIYESIKIVEPKYQENFIRNNSIHKIYQGFQEKTNNEAGNLSLSKRKIANINVITLSIDRSTKDLVTFAGNATVVFTTEQNKEDTVEISFTLSNIKATLAGIIPFKFIVNGYKYRF >NZ_CP037426.1|WP_022626354.1|1232557_1233352_-|hypothetical-protein MTDNKLTVWQSIEVLTKAILNMQKKLSLIKNIASDQDITLEKGKELLSGIYEANFKLNKTINIATLPKIGYHMLNGELVVRNHITEEEVKIPGDFHYLKVVKSDHDNYKLTFCNFLGNEFFEYKKYDPQYSGISDEYKFVDFGSVKKTHNLKFKEYIGHAPKFFAAEGPIEPGSQNHVIDLFELVKSGKGRKVGTFADEFGYFDDQNKLHYYNYHKSVESNTYDPENFSVKMINIDVSKIDKFYLIAEQGDIIIHPIWENLDIF >NZ_CP037426.1|WP_155969419.1|1233425_1234247_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MKKVIGHNQAKKKIMNNLSVQSWLICGKRGIGKATLAKSFSNWLLIKNYNEVALDLHIVEGDTIGIEKVREMKNFLHLSPIQSEHKIAIIDSLEAMTNHAKNAILKILEEPPKNSKIFIISHKPYDIQTTILCRCFQLNLLPLTYDETKQVASSQCKFDNQTFDEMITLFPGMPGMIINTISSDAYEAYKCFYKFLHDLKNPNMINKVINSEIELELASYIIQAFILESIKREVNGVEILLSQWKKIDELFVAAKQLHLDKKHVLANVVNIMT >NZ_CP037426.1|WP_006280292.1|1234264_1234852_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MVSKIINAIQNNLLVCFPTETVYALACNALDNESIGKIYQIKKRSQNKPLSIFVSDIYNLTKIAKVKERYIDLINHFSPGPITYILPLKNNNILPNEFFKDSIGIRIPEHPIAISILNKLKVPIVATSTNISGKESVCKANDIPQSIKQHLSVVIEDDELVSGIESTIIDLTEDKIKVLREGAISLQTVNNAFSN >NZ_CP037426.1|WP_010082479.1|1234970_1235441_-|hypothetical-protein MAENNDNNSFTKRFTNRTPGGTGEGFSSKYSSQNTKERALGEKGKISELAGKKTESKEAFSESGGIKSKSRTVNERSFADATKRSRSDLIYLVRGKDRGKSAWHYVLVDKEKREMFLAKSRTGSIDVADYGEILYSGWGEDPPQAIIDKVNEEFGL >NZ_CP037426.1|WP_155969421.1|1235516_1236401_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MKNNIVIITGITASGKSELCDNLIEKYGNISIINCDSKQVYEEIPIITAQPPKQEEFYKLYGYVSAKENYSVGLWLEDLEKEVNHALENAQIPIITGGSGLYISSLIKGLSSMPQISQEVRKNVSELRKNLSKEEFYKLALSKDPRIQGKVFMNDSHRLSRALEVITETGKSIFVWQENRQPPLFNNFKIYTILPKREDVYRKINSRFITMIENGAIDEVKKLLSMNLAPHLPAMKAHGVPEIIKYLKGEITLDEAIQIAQTNTRHYAKRQYTWFKKQFLNAEVIDCANKLKIF >NZ_CP037426.1|WP_155969627.1|1236397_1237216_-|hypothetical-protein MNSSTPKEKENPIVTLRAQAEKFGFSRLRAGKDSAEANSGATMYVDLPRMKLVIQNKVITKELVDELYNKHTNLISNDKNKYRQFVKQVFTELFEYAEAEVPNDSILEELITNCNQAAYVGALYGKGGPILHLAETYGLLFQSNHVTHINCSDPSHAAIRIEEKIAVRTFAELEEELCKLDSSLEFTLKSQGDKNVTYEDGKLSLTVPKRLKDYNIGDKNLFDVIKECFQKFCERLGFFKIKIEHGLGDPLEVSDHLENMEPPIRSNEHGLN >NZ_CP037426.1|WP_155968362.1|1237375_1238208_+|IS5-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIERHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|1238244_1238736_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_14 | 1242425-1242550 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_14
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_14
>14.1|1242458|60|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder AAGAAATAGGCACTGGGATGACAGGAGAAGGAGGCTACTTTCATGACACCATTCTTTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_14
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_14 >merge|NZ_CP037426|14|1242425-1242550|CRISPRCasFinder CTGGATCCAAGTAGTCAAGGCACTGGGATGACAAAGAAATAGGCACTGGGATGACAGGAGAAGGAGGCTACTTTCATGACACCATTCTTTTTTCTGGATCCAAGTAGTCAAGGCACTGGGATGACA >NZ_CP037426|14|13|1242425-1242550|CRISPRCasFinder CTGGATCCAAGTAGTCAAGGCACTGGGATGACA AAGAAATAGGCACTGGGATGACAGGAGAAGGAGGCTACTTTCATGACACCATTCTTTTTT CTGGATCCAAGTAGTCAAGGCACTGGGATGACA
>NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|1240957_1241449_+|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|1240590_1240938_+|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968342.1|1238755_1239103_-|transposase MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426.1|WP_155968340.1|1238244_1238736_-|IS630-family-transposase MSKIDHSSILYIDEAGVDNRLYREYGRAPIGKKIYADIPGRKRERISIIGGWIGKRFIAPMTFKGGCDKEVFNTWLEKMLLPKLPHGTTIVMDNATFHKTPKTKELIDNARCRLLYLPTYSPDLNPIEHCWNTIKSRLRPLMHKYTDLQLLVGNTIMEIYHSF >NZ_CP037426.1|WP_155968362.1|1237375_1238208_+|IS5-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIERHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155969627.1|1236397_1237216_-|hypothetical-protein MNSSTPKEKENPIVTLRAQAEKFGFSRLRAGKDSAEANSGATMYVDLPRMKLVIQNKVITKELVDELYNKHTNLISNDKNKYRQFVKQVFTELFEYAEAEVPNDSILEELITNCNQAAYVGALYGKGGPILHLAETYGLLFQSNHVTHINCSDPSHAAIRIEEKIAVRTFAELEEELCKLDSSLEFTLKSQGDKNVTYEDGKLSLTVPKRLKDYNIGDKNLFDVIKECFQKFCERLGFFKIKIEHGLGDPLEVSDHLENMEPPIRSNEHGLN >NZ_CP037426.1|WP_155969421.1|1235516_1236401_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MKNNIVIITGITASGKSELCDNLIEKYGNISIINCDSKQVYEEIPIITAQPPKQEEFYKLYGYVSAKENYSVGLWLEDLEKEVNHALENAQIPIITGGSGLYISSLIKGLSSMPQISQEVRKNVSELRKNLSKEEFYKLALSKDPRIQGKVFMNDSHRLSRALEVITETGKSIFVWQENRQPPLFNNFKIYTILPKREDVYRKINSRFITMIENGAIDEVKKLLSMNLAPHLPAMKAHGVPEIIKYLKGEITLDEAIQIAQTNTRHYAKRQYTWFKKQFLNAEVIDCANKLKIF >NZ_CP037426.1|WP_010082479.1|1234970_1235441_-|hypothetical-protein MAENNDNNSFTKRFTNRTPGGTGEGFSSKYSSQNTKERALGEKGKISELAGKKTESKEAFSESGGIKSKSRTVNERSFADATKRSRSDLIYLVRGKDRGKSAWHYVLVDKEKREMFLAKSRTGSIDVADYGEILYSGWGEDPPQAIIDKVNEEFGL >NZ_CP037426.1|WP_006280292.1|1234264_1234852_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MVSKIINAIQNNLLVCFPTETVYALACNALDNESIGKIYQIKKRSQNKPLSIFVSDIYNLTKIAKVKERYIDLINHFSPGPITYILPLKNNNILPNEFFKDSIGIRIPEHPIAISILNKLKVPIVATSTNISGKESVCKANDIPQSIKQHLSVVIEDDELVSGIESTIIDLTEDKIKVLREGAISLQTVNNAFSN >NZ_CP037426.1|WP_155969419.1|1233425_1234247_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MKKVIGHNQAKKKIMNNLSVQSWLICGKRGIGKATLAKSFSNWLLIKNYNEVALDLHIVEGDTIGIEKVREMKNFLHLSPIQSEHKIAIIDSLEAMTNHAKNAILKILEEPPKNSKIFIISHKPYDIQTTILCRCFQLNLLPLTYDETKQVASSQCKFDNQTFDEMITLFPGMPGMIINTISSDAYEAYKCFYKFLHDLKNPNMINKVINSEIELELASYIIQAFILESIKREVNGVEILLSQWKKIDELFVAAKQLHLDKKHVLANVVNIMT >NZ_CP037426.1|WP_155969425.1|1242847_1243699_-|hypothetical-protein MALGDQLNAKTEQELIDDGAFINALVEKLAAGVGNSGVYTKTAANTAFVKTDGSNISTQADKGKALADAILAVQDNNKKSALVDKLGGFLDAADAVYGASSNQAAKAFLADKYPFVKTADLGAKVAEKAVVDVLVPALATVGTDDTKKVYTKSVADTAFAKIDASNLTEAANKKAFAEAILPAQDGDKSILVDKLGDAIASTDKAEYNVGTEQTAKQFLNSRGLIPSEDAIFTRLTSNDNFKTSVAMNVNASDTGFQNAVREVMSQPRFEIPGEADVPISADW >NZ_CP037426.1|WP_051062209.1|1244569_1244977_+|transposase MLKEVDFQYVIKVLYADRAYDREKLYKLCNQYGIKTKIPPKNNAAEHPKLDYMAERNSAVKLIKSYDEDGIKKWKKEMSYGKRSYIEGFFSRLKKTFGFSFRNKSEMNRERELLLKCYLLNKFTEIGMAKFEIAS >NZ_CP037426.1|WP_155969427.1|1245155_1245887_-|ComF-family-protein MNLLLLKKATNLIFPSVCVSCECIIDENLNLCSECNKKINFLTKHYCNVCGVVISDNIYTCGKCIINPPPFKVLRSVFAYDQHSRNMIINFKFFDNLNYVKIYAKWIHQANQDTFQNAEIIIPIPLHKMRLFKRKYNQAALLAKELSKLSNLSYTPFAIKRLRHTAPQAGLSLKQREKNLKKAFKTSNKKIIENKIVILVDDVVTTGATVRSCSQEILNSGAKEVRVLSLARTVNDWTSCIKN >NZ_CP037426.1|WP_155969429.1|1246002_1246212_-|hypothetical-protein MNLLVSGQPLSYACAAIIWAAASIITPLVWACDKVQSKLSEVQKPEKHQFLSKDNSKTTSVNGIPQTEL >NZ_CP037426.1|WP_155968260.1|1246208_1247041_-|IS5-like-element-ISWpi1-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIEKHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_155969535.1|1247193_1247571_+|transposase MKALYADRACDRHKFYKLCNEYDIKTKIPPINNAAEHPEIDYMSNRNAAIRLIKLYGEDGMKEWKKEVNYGKRSYIEGFFSRLKQIFGFSFRNKSEINREKELLIKCYLLNKFTDIGMAKFEIVT >NZ_CP037426.1|WP_155969431.1|1247687_1250498_-|recombinase-RecB MLLLVGRVFTVNVDESLFDVLVQHIFSEYEREKIPEVKIILPCKRDVIALLSAFKNHNAKKCIILPEIVSLENIDEEDLILNLDRVKVIKPTKRTLLLIQFILEWNRKNNDNFPIDLAYSLPSLLDKIQSTQTTDCYQFDEHSKKIENFISLLTETWSKTLKDLEVVDILKHKSDYINNMIISLQKDQHIIFVGIGKDKSLIKAIYDLPFGEIILPNLNLKIKEKDWKLLDKKHYQYCLKDLLGYLSIGREDVSFLPEACSPVPRHWDPENLTLNERTRWLYNENWIPVSSTGMTEERAGITGSPEEYLDYVFDTTADLSKVSSGHVGNIEVITCDSREEEAQVTSLIIENEGYENISLVVFDKLLAARIACLSRQHSAIPENYPYITLLLYSIEVLTSNWSSVSLLSLLKHRLVTFGYTQEEYTRILSEFEIEILRNFSTNGLSDIINAINAHKKLKHKEDILLIINKLEAIFNPLLNSINYSISDVVATHLQCINILSGINFSELNSEIGNFTCNFLNACEGVEIKCSLELYSQILTLFLEKEFFSVASDLNKFSLYHNKVVILAGFNEAPSFQNPLLNAFTREKFNLPSVQEEQGYFFYTLHNLFCASKVYITRSLSHRKPILLQRLEILLKEGKQPYRDWLRILNTPECIVPCTQPMPKPQTEVRKEKMQVMSCSAIEKLIRNPYSFYVEYILGLKQLRDLNFKPSILEFGTMVHNILARYLRNKKSPMSIAREAFSTSQFNFSNMWWVRLQKIIQSFVEFDETRSNYVELEKNFSCPIFHIPARDTGSCDQYETAWMTNKPQEISLIARCDRVEYLPSGQVAIIDYKLGTPPSNEEVMSGFFPQLILQALAVEHITKREVSELAYWKLDYDKIKVISIQNYRYKMQELKNDLPGFLSNYLSNSTPFIASPYFDKFLRFNSYKQLERVGEWL >NZ_CP037426.1|WP_155969433.1|1250585_1253681_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase MANIRIEVLNKCEQIGRRWLVNVYSIYIRKGLPSKLYEEICGLFYNKVIQDCRYYSYNENLEEVPYDFIEPQAKWGLEISFLPGMTDNVGNTVKQIVREYLINKDYIDENVCIKARSSKLILSQATEDDIKQEFNPITEYCILVYKENGNCYWRHYGKLKGVIPVPRHWDPENFKQLYNENWIPVSSTGMTEGETGMTEGRAGDTHSGVIPARDQEKKEWIPVSSTGMTEESTGMTSSSNGAKSVDLNVSDQELEKISRDGIDGNGTLGLSLAAMKDIKDYFNKLGRNPYDIELESLAQTWSEHCKHNIFCSPIDEIKDGLYAHYIKRATREINSDICVSVFSDNAGGIIFDDDYLIVDKVETHNSPSALDPFGGAMTGVLGVNRDIVGFGKGAEPIMNTYYFCFAKEAKGKFYRDKERTDEILPPKYIMKKVIHGVNVAGNCSGIPTQLGSVYFDDRFCGKPLVFVGSVGIIPRNINNAPSHIKGPKNGDKIVIIGGRVGRDGIHGATFSSEALSGNSPSTIVQIGDPITQKKLSNAVIKARDLGLYNAITDNGAGGLSSSIGEMGKDGFEVDLSKVLLKNDGMAPWEIWISESQERMTLAVPEENLPMFKQIMKKHDVEVCVIGEFNESGKAVVKCPKGTVIMDIGTEFLHDGNPKMHLQTKPWSKGLPAPRAGMTTSSPSLEIELKEMLSRPNICSKEFIVVQYDHEVQGSSVLKPLQGKGRMCSEAIVSRPVLSSNKGVVKSQGFGSSYGEIDTYHMAACAIDTAIRNYVAAGGNINHLALLDNFCWCDAYNPERLWQLKKAAEACYDFATAFKTPFISGKDSMFNDFKGYDENGEKVIISAPPSLLISAIGIIENIENAVSLDVKMPGDLIYVLGETLDELGRSEYQLYSGIGNNNVPKVDAKSARKLYERYNQAIKDGIIASAIAPNLGGLVIALAKSLIAGDLGAEIDLSLVPIGKIQNTDIINKIIMFSESQSRILVTIAPQNQKRFEELFEGAVYSCIGKVTEKKVLNIKDVLKVDLKDVAC >NZ_CP037426.1|WP_155969435.1|1253776_1254289_+|hypothetical-protein MSILSILLFISLSLLNTANKLMICAALFVGAALVVNSMVEFYGRSKATYSLMVCTTLCCVFKLQSFNLMILISYTAILVSLLSSIIIFEKLKSKLNFHMANFITLIIASVVDSAVVCVGLLYKFSAGKCLSIYIRDLIFKFSYVSVLSICLFVGMYLFCLANKKYFKIST >NZ_CP037426.1|WP_155969437.1|1254923_1257719_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MDDFIRVKGAREHNLQGVDVNIPKNKLVVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLNIQDKPDVESITGLSPAISINQKSISKNPRSTVGTVTEIYDYLRLVYARIGVPYSPATGLPITKQTVSQIVDTIIALPLETKIYILAPVVRGRKGEHLKEILEIKRQGYVRFKIDGEVYNVDDLPKLDKNKKHDIFVVADRISILGDIGNRLPSSIESALKLGNGLMYVEIVNLPDNHNSEYKNGQILTFSENFACPESGFTLEEIEPRLFSFNSPYGACGSCNGLGKKLAIDVKLIVPDETLSISEGALKPVGSMFRQVHTGYGFLKSAILSLAENCKFSLDVPWKNIDQEVKDMILFGFGKFQGLVSILENQMDYDETLVERYCSVTHCRECTGYRLRKEALTVKIDSKHIGEISGLSIDESLKWFENLPDKLTEQQKQISSKILNEIIKRLAFLKNVGLNYLTLDRESSTLSGGESQRIRLASQIGSGLTGVLYVLDEPSIGLHQCDNDRLIATLKNLRDMGNTVIVVEHDEDTIMAADYAIDIGPGAGVNGGKVVAEGTPDQVQRNSGSITGQYLSGEKKILIPRRRKQATQFIKVINACENNLKNVNVKFPIGNLICVTGISGGGKSSLVIETLYKYSAHKIHHSSARYGQCDRIEGLEYIDKVIEVDQSPIGRTPASNPATYVGMFTHIRNWFAGLSESKARGYNIGRFSFNTRGGRCEACKGDGHLKIEMHFLPDVYVKCEQCKGRRYNRETLEVTYKEKSISDVLDMTIDQACDFFENLPMVKEKLISLQEVGLGYIKLGQSSTTLSGGEAQRIKLSKELSKRFTGRTLYILDEPTTGLHFEDINNLLKILHRLVDLGNTVIVIEHNLHVIKTADYIIDIGPEGGIKGGEVIATGTPEEVVKIPESVTGRYLKTYLL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_15 | 1296567-1296661 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_15
|
1 spacers
spacers of NZ_CP037426_15
>15.1|1296591|47|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder CTAAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGCGGTGGCATGACCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_15
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_15 >merge|NZ_CP037426|15|1296567-1296661|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGCTAAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGCGGTGGCATGACCTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG >NZ_CP037426|15|14|1296567-1296661|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG CTAAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTTGCGCGGTGGCATGACCT CGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGG
>NZ_CP037426.1|WP_010081939.1|1295171_1295924_-|5'/3'-nucleotidase-SurE MIILITNDDGFGSEGIKLLKEVARNFASEIWIVAPDTDRSGAARSLDYPVKQSIGIKQHSEREFSVSGTPADCVIIALNKVMNKKPDLILSGVNIGSNVGDDICYSGTIGAVMEGAARSIPSIALSQVYHDKIDWHNTKVFAPKVIAKLVKVGWPKNIVMSVNFPATEKVKGVEFAEQGEYNIDGDLTFTENSNGSFSLNWSREHSGSGSINKIKEGFITITPVKLDFTDYDTLNTMKNSCADEFSSIAD >NZ_CP037426.1|WP_155969466.1|1293924_1295151_+|histidine--tRNA-ligase MTNQTVRGTKDLLFDEWYKFKHIEQTASRISNLYGFLPAQTPIFEYTEVFTKTLGDSSDIITKEMYSFNDKGGKSITLRPEFTAAIVRLLIEKKLQTPIKLFSTGPAFRYERPQKGRQRQFHQINFEVFGIEDPKADIELISLAQHLLTEFGINKNVKLEINSLGDGETITKYREALILYFTKYQNDLSEDSKNRLIKNPLRILDSKDEKDKSIISDAPKISNYYTKESSDFFEQILNGLTILDIPYTVNNKLVRGLDYYCHTVFEFVTEDLGAQGAVFAGGRYDNLVSSVGGKHTPAIGFAGGIERIMELINYSPKEERPIYLIPIGREVEEYTLTLANELRRNGLYVIYEYSGTLRTRMKKANQANAKAALIFGDEELSSKTLKIKNMDTGEEKIIARDNTIENIY >NZ_CP037426.1|WP_155969464.1|1293355_1293928_+|NifU-family-protein MFIQIEETPNPNTLKFLPGFAILNEGETADFSNANEIKNSKLAANLFQIEHVVRVFFGHDFISVTKLGGINWDTLKVEILTTIMDHFTSGGKALDKEGVNDNNIPDEEFFDKNDIEIVNRIKELMESYIKPAVAQDGGDIKFRGYKDGIVYVELQGACSGCPSAAITLKQGVQNMLSYHIPEIAGIETTL >NZ_CP037426.1|WP_155969462.1|1292934_1293294_-|DnaJ-domain-containing-protein MSFIFFLFLIFIVVTFVLPSVVVFFLFLTKKNNISFMMNSILSKFLNEFSSSRSYTENYTGDNMSKDEALKILGLNPEASQNEINKAYQNLMKLVHPDKGGSEYFAQKLNAARDKLLKK >NZ_CP037426.1|WP_083250477.1|1291337_1292915_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MILSCKFIQQPYSNYIMKNYLQSVYEDGMKIQLSKVNKYLLVLLITVSAFLISGQVSSSSNIENDFQDLQEKLPLLKDQDLLFLDPASALNYGDRAGKKVLMVIVHHTETSTLKGTKDTLNARGLSVHFIVDRDGSITLMVPLEKEAWHAGISYARVKVDSKLEELRKLNNYSVGIEIVNTGLEPFPEEQMRSVKELILYLMERFKIKRDMIFSHSEIGTIVYDPELGYTMRKPDPHKLFDWELLEKNEIGLHISDRINPKDAKHKMGKTLYKAGDRNEGILKLKQRLNRFFYKIEPWNDKKGNVIFPDNNADYSDEFDENFVWVIYQFSIHNLPREIRKDLPLKLEQADIFPEFFSEYSHGISSSYLTFSEKIKSTLQPCLSKVDYENLLSSLAQYENNISPDASTTLMYKIKLYYDSYLRYRIWSSLYKPFKLNVLEELEILKSGVLSLKSLDSSKAAEVSSLIDSFKVDISLEFQGFEKQWFQEFKNAWRQEFIPSLEEQITWTALHEAILEYLEKAKEEIR >NZ_CP037426.1|WP_010082675.1|1291146_1291317_-|DnaJ-domain-containing-protein MFRDGAFKVLGIDSGANQNEINKAYQNLMKLVHPDKGGSEYFAQKLNAARDRLLKR >NZ_CP037426.1|WP_006280242.1|1289812_1291042_-|cytochrome-b/b6 MQEDNKKETIKEEKGILGWIEYRLPIFSFLRHTASYQVPKNLNYAWNFGSLAGIALILQIITGIFLAMHYTPHVDYAFNSVERIMRDVNYGWLIRYTHAVGASLFFMVVYVHIMRGLYYGSYKRPREMVWFIGIFIFFAMMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPLIGNKIVIWLWGGFSVDNPTLNRFFALHYLLPFVIIALAMLHVIALHRFGSGNPSGVEVKSDKDTIPLYPYYIVKDCITFGLFFVVLFAFVFYAPNYLGHPDNYIEADSMVTPVHIVPEWYFLPFYAMLRSIPDKLTGVLTMFASILVWFLLPWLDKSKVKSGAYRPVFKKFFWVFAINFVLLAWLGGQEVKEPYITMSRLSTLYYFAYFVIVLPLLSKYEKPKEPPKTLSDSVPEMR >NZ_CP037426.1|WP_010963022.1|1288685_1289444_-|cytochrome-c1 MGSNVFAIFCMLFLSSLISAEEFKSSPNKKIDWKFDGIVGSFDRESIQRGYKVYKEVCAACHSMNRVAFRNLQDVGFSEEDVKQIAASYQVKDGPNDLGEMFDRPGVPSDYFIAPFDTKEAAAASNNGAVPPDLSLIIKARHDGANYVYSLLTGYQNGEHDENDLYFNSYFPTGRLAMAPPLSEGMVEYDGARQATVENMAYDVINFLQWAAEPELERRHKLGLKVVAYFIILTVFFVLTNNKVWSKLYKKK >NZ_CP037426.1|WP_155968362.1|1287601_1288434_+|IS5-family-transposase MRKKYPTDLSEREWARIERHFRVSYKKGGRPPKYSKREILEAIFYVLRTGCQWRYLPNDFPLWKTVYEQFRQWKKQGIFEKMNYEITKYSRRKIGRNEQPSACIVDSQSVKTTEKGGSKAMMEGKKVKGRKRHIITDTQGFILGCYVGAANENDRDGIKIALNNMRTKYTKVKKMWADMGYQGRNLKNHIKEEYDIDIEIVKRPPCRFWVHKDTPPELLPTREQGFKVQPRRWFVERTFAWVNRNRRLSKEYDLLTTSTENFIYLAMSRVMLKREYA >NZ_CP037426.1|WP_007550541.1|1287329_1287482_-|transposase MPAAYSYDLRKKAMEALDEGESREAVAARFKIGRTTLWEWQHCRLDHKLC >NZ_CP037426.1|WP_151808007.1|1296857_1298201_-|signal-recognition-particle-protein MFKSLTESLNSVFSKLRGKSIISEDDFNLAMREIRIALIEADVSLEVAKKFINDIKDKVIGEKVIKSVSPAQMIIKIVQDNLVAVLGSEKSDLNLAVKPPAVIMMVGLQGAGKTTTSGKLALKLKKQKKKVMLASLDIYRPAAQKQLEVLGKQIDVQTLPVVIDEKPITITKRALAAAKNDNYDVLILDTAGRLHIDNNMMNELKAVKEIASPAEVILVADAMIGQDAVNIAKSFNEVIGVTGIILTRVDGDARGGAALSMKMIADCPIKFIACGEKLSDLDDFYPDRIAKRILSMGDVVSLVEKAAEIVGQEEIDKLQKKVKKGKFDLNDLVGMLKTLSKMDGISNIMKFIPSSFTKKLSSSVPDDNKVKKYIAIINSMTEKERQNPDILNGKRRLRISKGSGTTVTDINLLIKQYNQMSSMVNKFSKVDHSKLKESDLMDMLSRK >NZ_CP037426.1|WP_155969468.1|1298185_1299745_-|cation:proton-antiporter MQLYKSSLLLLLTVLIVIVLKLPENLSIAVNWSLPILDFDLSFRTILISFLSVAFLAVLPAQNLTFSEMLSFAAYTISSLYAVLSEHMILVIIFCELMTISAFFIIAASCRDSGPAIRYACVHFFVGVILIAGLALQSTNLIILGLLINCACFPFSFWVVDAYPAASLHGTTYLSLFTTKVSFLVMLLHTYNLWQDCTEILALVGAITAIYSIIFASLEQNIRRFLCYNVVGQMGLLIIAGSLLSPSEKAIPILILHIIFSLVYQSLLFVVSNSIISQTKTISFNGVGKLMSVEGMCAIIAILTMAAFPGTVGFISKSYITAEIEMNTVALKGYKNLYKLLNLLLHLSVGLKFLYYLFIAKSKSKPLAERGGKMTMIILAFICVIAGNPYLPIYNKPSIFDFVYNTKNILSQFNLLLCTTLLFIPLRKLFYPRVNFKMDVDWIFRTFISYIVLLFNQLVSKTREMFASVVQNLTNPLTGLYFNNITKLKEVLGYNSVSFVSASSLFLMSILLMLLCLNR >NZ_CP037426.1|WP_155969470.1|1300048_1302922_-|glutamate-synthase-subunit-beta MKLNFKISFSNLYTRDGLTKLDETFLNYIKSCDESLFCSLIEAREKAASSSMSSQCHLPSSQCHPPSSQCLTLGSRKQEGRSATWMTDSQLIIDLSYLLDGFIAKLFNIEKGIEELKKKHNDFAVIYKCKRLFVQRYALKKYTNVANIDITNKLSHFLTLPTTEKNFAEQVMHWFEDKENHKEEIELAAQYAVWRVKNKQSILFSIHKKIDHENLILFSKKEVDKVEVLYSNEVKRRYGFDLTSKKVSLNKALDNAHYCIFCHKQSKDSCSKGLINDDNTFKKSPLRVELHGCPLEQKISEMNLVKSEGYSIASLAIVMIDNPLCAATGHRICNDCMNSCIYQKQEPVNVPAIETRILDDVLSLPYGFEIYSLLSRWNPLNFQRPLPRGNTGKNVLVVGLGPAGFNLAHHLLNDGHNVIAIDGLKIEPLIDNFQLIKDFKHEKLSERVAGGFGGVAEYGITSRWDKNYLKIIRLLLERRENFALYGGIRFGGTINVDDAFNLGFDHIALALGSGKPRMIKIKNILARGVRMASDFLMSLQLTGALKFDSIANLQVRMPIVVIGAGLTAIDTATEALAYYPIQVEKFLLRYEILVDKYGKDCVEKDWTEEEHKIANELISHAKLIQAEQELAKKENREIKILELMQSLGGVKVIYRKELKDSPSYRLNSEEVQNALSEGIYFIENLEPVEVVTDKYNHAESIKLIDTKSGEIKRIKARSIFIAAGTEPNTVIATEDEKHFKLSNGYFTQLNSLGKEIDPIFSPKMQNKERILVYKQGNKTISFFGDLHPSYSGSVVKAMASAKNGYPIISQLLSGVNSFVSVIPVCDVVGQKKNAWSSVEDLANKELFNRIKEQFTAKVIKVQYLTDKVIEIVIKAPLAAKNFKPGQFFRLQNFETNSRKTNLAMEGIAVTGTEVDKKKGIISTIVLEIGGSTNLCRHLREGEQIILMGPTGRPTEVY >NZ_CP037426.1|WP_155969472.1|1302967_1303399_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MQFNISDIIKILPHSYPFLLVDRVIECDPGKSIKAIKNMTFNEPFFIGHFPGHPIMPGVLIIESLAQASAICVLGKETIENKVVYLRSIENAKFRKPVTPGDTLILQANIQSVCLGVHKFRCIASVSEEKVAEATISAVLQNK >NZ_CP037426.1|WP_155969474.1|1303403_1303955_-|OmpH-family-outer-membrane-protein MKYIQLFISVIALIISLFVGYKFVGYQPQNTKAAIIDSDKVINESLALQNIQQQIKEQNSRLQQEFENELEKLKPSKEEFDLLSEEAKKEKTGQFNKHTVNTRDNYAKKMLHLEESYRDAVESVFNKIKEVAKKTAEKNNIDLVLFISKKNQVLYSMDEVDLSDVVLNNINKEIPEFALQSIE >NZ_CP037426.1|WP_155969476.1|1303955_1306292_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamA MKKLFYILVVVFISFPALLVALGTAEKVQVKDVKCIGNERVSNQTIGFYIKLKSGDYINDDDIDSIIKDLYKTKLFASVNAYIDDKKNLVIKIQENPLINKVVLKGNKLFNSKELLSNVIQSKSLTILTETKLQNDLVNLVTTYRNNGKIGVKIEYDLNKLDGNRVNLIFKIKEGKTSKIKDIRFIGNKNFSENELEQVIKRHSNDIFSKLFRAIFKGGNHYSPQYLLINTELLDHFYSSKGYIQNNIQPIVEVDNNNQTELTFLIDEGQQYLFGNNEVNIETEIQDLSLKEEILDFITEENDKIFNRVKINNTVEKINKYLNEKGYIFAKVNPEYAQRDNVVDVTYRVLPGKKIYINQITIDGNDRTLDKVIRSKLSVAEGDAYNISEIQKSRKKLMSSDFFETVKVNSYAVNDNAVNLDLSVKEKNTTSLYLGGGVSLPGGALIKIDLKDRNLFGTGKELSFALEKSQYVFSTDLEFVENNFNDSDTSLGMGVFYEKQDKPNTTFDSCDMGFFTKLSYKVTENLTNSLRYSYKYNHIHMDNKGGQDTDISEIILDRKGKHQISSVGYTLAYNKLDNLYAPKEGYLLRLSQDISGLGGNVNFLKSEFLSFYTHPILSKIDDDITLRFKMAAGHIFSYTDENLNIGQHFFKGGNEIRGFDLSGIGPRAEDKNKSSLGGKTYFNLTQQVDFPLPKLYDYAGIKGSLFVDYATLFGLDDKNKKYEGKYYDSKLVRVSPGFGFSMLSLFGRLRLDFGFPLVKESYDIIPSPNVKFSIEAGI >NZ_CP037426.1|WP_155969478.1|1306300_1307419_-|RIP-metalloprotease-RseP MELISNLIHQFSDGIYYFLSFSLIISVIVFVHEYGHYVVAKACKVKVESFSIGFGPEIFGFNDKSGTRWKLSAVPLGGYVKMLGDTNAASVPADQQELTEEEKLYSFHTKPRHKKAAVVFAGPFANMVLAVIAFTIFFSIAGYYRTPPVIENVIEGSAAKQAGLLPGDTITQINEHKIKYFEDISRVIMSNPKIRMEIEYSRNNEKHRTSLTPLIIKDKDVFGNTIERETIGIISVNTLKQSSFLGAVSLSVSETYHTMCLTIKALFHIIVGKRSINEIGGPIKIAKYSGQSAKKGFVMVVYFMAIISANLAAINLLPIPLLDGGHLFHYIIEAVIRRDLSLKCQKYAAIFGALVLFLLMATGMSNDIRDLF >NZ_CP037426.1|WP_006279484.1|1307518_1307797_+|succinate-dehydrogenase-assembly-factor-2 MTDTSLLRRKLIYRSWHRGCKETDILLGHFALKYLDKFSLSELIEYEKIVDLDDYELYCYITRKTNLPPGLNSQIVNLIACFIEANPLCTQD >NZ_CP037426.1|WP_010082086.1|1307771_1308098_-|cell-division-protein-ZapA MQVVEIVIRNNTYKISCESGKGNHLLRLANSFDKLVSSVSQKTGGKGSDALNFLLAALILEDKILELTKRLDEVNQEREKYRNEKRIEYTEVLDKVNKIITNLECIKD >NZ_CP037426.1|WP_010963035.1|1308170_1308449_-|integration-host-factor-subunit-beta MATKSDIIARVAKRHPFLDKIVIAAIVDRFFGILSSTLKHHNRVEIRGFGSFSVRSYNLKETSHLMLQKFTKNQYFKTYFRSSKKLSDLINE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP037426_16 | 1341033-1341520 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP037426_16
|
6 spacers
spacers of NZ_CP037426_16
>16.1|1341059|59|NZ_CP037426|CRT GACGAGCTTATCGTCATCCTGCCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTC >16.2|1341144|55|NZ_CP037426|CRT ACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAAAGCA >16.3|1341225|47|NZ_CP037426|CRT GACGAGGTCATGCCACCGCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTC >16.4|1341298|55|NZ_CP037426|CRT ACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAAAGCA >16.5|1341379|47|NZ_CP037426|CRT GACGAGGTCATGCCACCGCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTC >16.6|1341452|43|NZ_CP037426|CRT GACGAGGTCATGCCGCCGCAAACCGTCATACCGCCGCGGTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP037426_16
The CRISPR arrays of NZ_CP037426_16 >merge|NZ_CP037426|16|1341033-1341520|CRT TCTTAGCCGCTAACAAGTAGTGGGATGACGAGCTTATCGTCATCCTGCCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAAAGCATAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGAGGTCATGCCACCGCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGATACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAAAGCATAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGAGGTCATGCCACCGCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGGGGAATGACGAGGTCATGCCGCCGCAAACCGTCATACCGCCGCGGTATCTCTTAGCCGCTAACACGTAGCGGGAT >NZ_CP037426|16|3|1341033-1341520|CRT TCTTAGCCGCTAACAAGTAGTGGGAT GACGAGCTTATCGTCATCCTGCCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTC TAGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGAT ACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAAAGCA TAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGAT GACGAGGTCATGCCACCGCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTC TAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGAT ACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCAAAGCA TAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGAT GACGAGGTCATGCCACCGCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTC TAGATCCCGCTAACACGTAGGGGAAT GACGAGGTCATGCCGCCGCAAACCGTCATACCGCCGCGGTATC TCTTAGCCGCTAACACGTAGCGGGAT
>NZ_CP037426.1|WP_155969515.1|1339430_1340909_+|UbiD-family-decarboxylase MYNNLRDFIKALEEKKDLIRIKEEVSTVLEMTEIHRRVLSNKGPAIIFENVVTENGKNSIPVLVNLFGTIKRIALGLNINPDELRDLGKLLAFLQSPEPPKNFKDAIKMFPLLKVVLSMRSKVVSKAPCQEVVLTGDEVDLSLLPIQTCWPNEPAPLITWPIVVTKGPTKEKQDNFNLGIYRMQVIDKKTTLMRWLAHRGGATHHKRWKEEGRNMKFPAAAVIGSDPATIIAAVTPVPETLSEYQFAGLLRKKPLELVNCKTIPLQVPAHAEIVLEGYVSLDRYQDEGPYGDHTGYYNSVEQFPEFNITAITMRKNPIYLSTFTGKPPDEPSILGEALNEIFVPILINQFPEIVDFYLPPEGCSYRIAIVSIKKSYPGQAKRIVMGILSFLKQFLYTKFIIVVDDDINIRDWKEVMWAMSTRMDPVRDTIMIENTPIDYLDFASPESGLGGKMGFDATNKIPPETKREWGKKIKMSEEIVRKVTEKWEEYMD >NZ_CP037426.1|WP_155969513.1|1338263_1339343_+|cell-filamentation-protein-Fic MPMPNYTITSKIANCLMRIEAAKEKVLHLPLTVSMLSSLRETARLYTTHYSTMIEGNRLEPKQIEEVLSGKSHFPKYRRDENEVKGYYAALTQVEQWAARTIPITEKAIQTLHALVMASGKSKVKPTSYCDGQNVIRDSRTRAIIYMPPEAKDVPKLMSSMIDWIRDSEQVPCPIIAGIAHYQFVTIHPYYDGNGRTARLLTTLILHLGGYDLKGLYSLEEYYAKNLGAYYEAISVGPSHNYYMGRAEADITKWVEYFVEGMANSFENVLQRINEEEYHADQTDLIRKLDPKQRKALELFQEFSAITASQVGELFNFKPRTSAQLCKKWVEMGFIKIVDFSNRGRKYKLSKQYEDLISN >NZ_CP037426.1|WP_155969511.1|1337084_1337843_-|thioredoxin-domain-containing-protein MSRISFLLILILAVASLPVINNWLSHRGQTLTDDQISTRLDDYISRNFDKIIKTLKEESIKSSYAARDNVTKSKISQYKDQIFDLTYPYSGNENSSVIAVGFLDYSCGHCKAIKNDIKQLINDGKIKYIFRDAPILGNASLKAAKSALAVYFLDKEKYFDFHHAALSHKGEFSDESILDIVKNIGIDEDDFNDSIKDNADKIEQMINNSRLLVRDLGVGGTPFLIIGDSLFVGATDLNVLRKKVDELSHKQG >NZ_CP037426.1|WP_155969509.1|1336290_1336887_-|TIGR02217-family-protein MSFTEIRFPENISYGSTGGPEFSTDVVTTHNGCEQRNINWSHARTRYNIAYGVRSNEQLLELITFFHARKGKAIGFRFKDWSDFIAISQEIGIGDNKKTTFQLIKTYVSGEDKHIRMIKKPVHGTVKIYLNGKEESEYSVNYSTGEITFMKPPVKDAIITASFEFDVPVRFDTDYLNASIDDYGSNSWNNIPLIEVKF >NZ_CP037426.1|WP_155969507.1|1335378_1336167_+|hypothetical-protein MNTKIFEMLIRRTGLRRDSKAEIIQLNRNEKAFADEDKESIELAEAIFEENNMFHFRKPGPAMDYILHKLINDRKLFEEMKDRGTSIIRLFSLLSMYHGRLNCCVIRKGGCITECGILDYAGTYPELVPLEDFILIEPCSYLEYTVLDNDNIRNRLARDLTEDKTKLDIFVNGILAIKSSDLVLSCINKIEVLNEEDRYFVNRLQKNNMLDYILNKDDTTLAKSTLKELLKLSILQEEKSTELESPQASSVNVSKAQQHCSI >NZ_CP037426.1|WP_155969505.1|1332487_1335133_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MSSLSCLYGDNAEFVEEMYSRYLQGDKSIGEDWNRIFSSNLEVKKTETCSPQHVTKTDDSASGLANFFRSYGHFFADLNPLSPNENQEIDYQKYSNLSPARDAEIYRDIYCKNIGFEFMHISSYEERMWLQEKIENQTYTLSSQDKKEILRHLIESEMFEQFLHMKFPGYKRFSIEGGESAIVAIEKIISDSAGYGIEEVVLGMAHRGRLNVLTKVMGKEYAAMLSEFQGNLAYPSGLEVSGDVKYHLGYSSDRALASGKKIHLSLCPNPSHLEAVNPVLAGRIRAKQNIRSVLGISIHGDAAFIGQGVVAETLTLSNIEGYKVDGIVHIVINNQVGFTANPCCARSSFYCTDIAKSIEAPVFHVNGDNPEVVSFVANLAMEYRQKFKKDVVIDIICYRKYGHNEGDEPNFTQPLMYKAISKHKTLGTLYEEKVIAEKVSSGDEVNKLRSEFRAKLDKSLAESVTYTPKKADWFCGVWSKLRRAKLNDLSEYYTDSGVPPDELKKLGVHINSNIPSSFNINNKVRKILDGRIDSINSGSNIDWATAESFAFASLLTEGIGVRLSGQDSGRGTFSHRHSRLVDQVTEEAFIPLNNINEKQAYFEVIDSALSEYAVMGFEYGYSLDSPYSLVLWEGQFGDFANGAQIMIDQFIASAETKWLRSSGLVLLLPHGYEGQGPEHSSARIERFLQLCAEDNMQVVNCSTPANYFHVLRRQMHRDFRKPLVVFTPKSLLRHKRAVSNLSDFEGKFLTVIPECRTGLVSNDKIRKVVICSGKVYYDICEAQKINDIAVIRLEQFYPFPADKLSNELEKYKNAEIIWCQEEPKNMGGWFFVNPLIEEVLSNLDIQAKRPKCIARLAAASPACGYASVHAQQQEEILRQIA >NZ_CP037426.1|WP_155969503.1|1329466_1331284_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MAIILLDTKTINRIAAGEVIERPASVVKELVENAIDAGSLEIEIKIESGGRNLIIVTDDGNGVEKNDLELAFMRHATSKLSDNELIEIKHLGFRGEALPSIAAVSRIKLSSKAREANEAWSISYEGGEKIGEQTPYSLSQGTHIEVRDLFFATPNRLKFLKTERAETQSIVDIVNNLAMINYHIGFTLTSGNKKLLKYAKQTSLFHRLCEVEEEFQGSSLEINEEEDGIKLTGHICKPTVNRGKSTQIYTFVNGRPIKDNLLIGAVRYAYHDFIPSDRYPFAALHLEIPYDQVDVSVHPNKSEVRFQNKKLIYEIMTRGLIKALSRRIGTFPAHDQKMDSTLPDPFDKPNVQNERRPSPFENQLIKEFASPNERVKSLSEQSKSFDYTGIQKLPSQAETMVLEKKVLEQVDLIESHPLGFARCQVYNTYIIAEVRDKLIIVDQHAAHERLVYECLKQKSNVKRQKLLLPETVEIKNQAGMEMIEIYKDKLFEMGFDIEIKSENKVIVKEIPAILGAIDVKEMLINIIDRLTEIEDTLPVEDKVNKILATIACHGSIRAGRKMRLDEMNELLRQMEKTPYSGQCNHGRPTYIEMKLSDIEKLFERR >NZ_CP037426.1|WP_155969501.1|1328958_1329459_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-mutase MLNMTKIKKDVAVIMGSESDYTTMVHTVDMLKALEASHDIFIISAHRTPERLFNFAKSAQEEGFKVIIAGAGGAAHLPGMVASLTCLPVIGVPVHSKQLNGLDSLLSIVQMPKGVPVATMSIGENGAYNAAITAVSILSISNSEIAGRLKKWREKQTKEVKEKPVS >NZ_CP037426.1|WP_155969499.1|1328234_1328531_-|XRE-family-transcriptional-regulator MEIISLNNLDSAGIKTKLLYTINKIVEKNAWTQAFAAEKLGIDQPKVSQIKNGKIDGFSLERLLGFLKKLDHEITITMTESQEIKSEAEKVKHEVESQ >NZ_CP037426.1|WP_007548528.1|1327766_1328174_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-omega MAESIVEKCIERVSNRFKLVLLASQRTHDLNTGASNPIQAAKFKGHKNTIVSLHEIAGKQVDTHELFSLLVGRCKEYMKGNMNNVYSSNTSKLANLLNFSDNTDLDASQESQDYEVDGEIDDEINDQDGDEEVSV >NZ_CP037426.1|WP_155969517.1|1342060_1342918_-|4-hydroxybenzoate-octaprenyltransferase MYFNHYFSLMRLHSLTGLWLVLFPSLSGILLASTSLSYQVLFLLVLFTIGAFLMRPAGCIINDIFDREIDAHVERTKYRPLASGALNIKQALALLSLLLSIALVILLLTNKTTLILGIISMCMIATYPLLKRYVWWPQLFLGFTFNMGSLMGSAAITNQISIESLLFYIGCVFWTLSYDTIYAHQDKKDDEKLGMKSTALYFGDTTKSWLKRFYLISLMTWLYAGILSSLNNIFYIALLAVGFIFHRQYKNFNPDDPSQCMSIFKNNSYVGLLLFFGILLDRIIT >NZ_CP037426.1|WP_038249615.1|1342921_1343320_-|ribosome-binding-factor-A MKKEIRNLKIASVLHRAISRILMEGKVFNKNVAVSDVKLSKDLKKADVYIVLSSLNIQVADYLDPEKRRTGDPSENNCDINTVVNEMNQSAWSIRKSILCYVDLRFIPELVFKPDLAFDNFVNVSKILHNHT >NZ_CP037426.1|WP_155969519.1|1343329_1345654_-|translation-initiation-factor-IF-2 MNNEDISDKKLTLQGLSKLKLDLNLNSSASPSTGATVVKKRRKKSHDAEEHNLFDESKLGSLTEKEQIFRINAVQNAALLKERNQREEKEKTAKEDSNKEIDEKNEADALSKEINKQVLSNTHLVEPKEDSIDHEDNDKKSFKVNKDIYSKHSKLVIAQAIDEKTEQPPVFKQRFGIRGRKSKFTKGKNISREVIIPDKITIRELSIRMAEDSKSVLKMFKEEVGESYRVDDLVDPDIACEIVEKFNHTAKRVSDTNREKDLFFIEGRESLPKKPKPPIVTFMGHVDHGKTSLLDAFRESNVAERESGGITQHIGAYQIITKDKQKITFIDTPGHEAFTAMRACGANITNIVVIVVAADDGIMKQTVEAINHAKAANVSIIVAINKIDKSEPGDVEKVMSSLPQYDLIPEELGGDVMIVPVSAKKKTNLDKLEETILLIAELMKLEAIEDCRALGWVIESKIDKAKGISATLIVEEGTLKVGDILVVGTTYSKVRSMVNHLGQREKAALPSAPIEITGLNGVPNAGDKFVVVNSEKQAREIVEYRLELIKKKKEDLGDNNLDIFSRNNSETEELSVVLKCDVTGSIEAISSSIDKLGKDQVKLNILHKAVGGITDSDVLLAEASSAVILAFNVKVDSKIRDLAKQKGIEIHTYNIIYELIDDMRMYLTKMLKPVTREVRVGSASVRQIFNVSKAGNIIGCYVSDGVIRKDSLIKVVRGGKLVHEGKLKALRRFKDDVKEVGVNFECGVSLEGNVDIKVGDILEAYQLVQEERVL >NZ_CP037426.1|WP_155969521.1|1345663_1347226_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusA MIANRKSSVKQKSNKNNIVGSLDVIKTAGELSLQKGLDFDVVIKALESAIEAVAHQKYGSKSKIVVDIDRNTGKVTSYRKLKVIDDESNEKENTECESITLTQAKLIKGDAKVGDTVSELLSLNTDLASARIAQQKIAQIIKDEESKKQYEEFKDKVGEIRYGIVKQVEYSDLIIDINGTRAYLPLRNLTGGESFREGDKVKAYIQTVKRSDDGHQIILSRTHEGFLEALLNQEIPEIADGLVTIKGIARDAGSRSKVAVFSPDKNIDPVGACVGVKGDRIKTIIHELNGEKIDVINYSSDLGQFVIKAITPAEVSKVIIDENENCIELIVAEDQLSLAIGKKGQNVRLASELVGWKIEILSTQQESERRSKELSQCSALFAEALNLEEIMGQLLVTEGFSSVEDISSASIKELASIEGFNEDIANELHNRANKYLKAENDRKIEELKSLGMEDDVINLTLSIDNKIALSKHDIKTLEDIADLSSYEFCSILSSSSDSKEDLKDTVDSIIIEARKKLGLI >NZ_CP037426.1|WP_155969523.1|1347314_1350380_-|MMPL-family-transporter MQSLLIERNRAVVLLLIVIFIFGSYVYVKMPRESNPDIQIPIISVFVGLPGISAQDSEKLLVLPIENELRSIEGVRELRAFATNDGAHMILEFGTEYDNKEVLDNVRSKLSNIKSKLPVEAESPIINEINLSLFPILNVGLIGNLPERALTEIARKLKKEIESLPNVLKVEVAGMRKETVEVIIEPTVLTKYNIQSNEIFQAISSNNRLVGAGSLAGKYSIKISGLLKDIEDIMNIPIRSQGDAVLRIKDIAKVYPRFEDHQGFARINGLPSVVLEISKRNGKNIIDTVNQVKYLMDKAKDQLPENLKVVYLNDQSKNVRDVLDDLENGIIFAVLLILIIMMLSMGTRIAILVALSIPGSFLIGIIALYFMGITLNIVVLFSLIMAVGMLVDDAIVISEYADRKMICGMDKVEAFYTSVRDMFYPVLSSTLTKLAVFFPLLFWPDTVGKFMQYIPITIILTLTGSLIMALVFIPTLGAIFGKPSITSKKEIKKMSAIESGEIKNAGPIIRAYVRMLEKVLDHPKKFVCATVFVLFSFSVLYFTFAPGVKFFPKVDSDNILISVKAKESLSAKERDLILKEVEERILSIEKEIHVSYARSGAFSDNVIARIQLELMDWRFRRKAKHILNDIRSSVQDMKGIIINVQEEKPGPSADKPIQINLSGSVSSLNLAAEKILEIMNQPSSGFINIQDSRSAPEIEWNMSVDKSKATSSGVSVATIGDFIKMVTNGVLIGKYRPNNTDEEIDIVLRFPRRDRNMKTIDNLFINTVNGPYPMSNIVKYAPEKKVNKLSRIDGSRTVTISADLDTGYLVDERVKFIQNSIAQDWDKGVKIDFKGDKEDQQKSGAFLLKAFILAITLMILVLVTQFNNVYHTFIVMTAVFLSTTCVFFVFFLIQQVFVVVMCGVGIIALAGIIVNNNILLLDAFHHQIKVHKNDIKRCVINAAISRVRPILLTVATTVLGLIPMITRLNINFFTLQITYDAPSSQWWVDISTTIASGILAATVLTLFFTPALLVIQRHEKT >NZ_CP037426.1|WP_155969525.1|1350555_1351287_+|hypothetical-protein MVAILNVTKGKNKVIVSGLAGALSALIFLTAIHIAAKIAIIVSAAAVTYLLLSLVHKIRTKAEITRVSGDKVSEDEGYSSVDEGEEKDTVKEPKRTETELEEEIIRKRAQERMEKGSLGGPINAFGEPIHVTIDAENSNPVDYTKTMVVPEEIVLSMLNDKTLTQNNSSSIKNQMKPLPEHMDVPGNPLPGQVLSNLELESKSTQKLSALDLLLQCKNVDNDVKKMLKQPITQKGFNGLGFDR >NZ_CP037426.1|WP_006280263.1|1351290_1352028_-|glutamine-synthetase MIILSNLSCYAVFGIELEFYIEGIEKEYLFLNSIKNKIASLEFSCEKENSTHQYEIKSGCYTNSYNLIKHFELAKQSLTETAQKLGGNVSFKAKPYLDRAGSALNVHVNLVNSNNGNLFYINEQKYSDYLIHSIGGLCAMMKKHMLFFAPNDDSYLRFQYPDIHTPTTISWGVNNRTAAIRIPYFGNDFKRCRLEHRVPGADCDLEKVLTAIIEGMVFGIENKIAPPNRVYGIASDPQYEMERLI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_16 | 16.3|1341225|47|NZ_CP037426|CRT | 1341225-1341271 | 47 | NZ_CP037426.1 | 647146-647192 | 0 | 1.0 |
NZ_CP037426_16 | 16.5|1341379|47|NZ_CP037426|CRT | 1341379-1341425 | 47 | NZ_CP037426.1 | 647146-647192 | 0 | 1.0 |
NZ_CP037426_16 | 16.6|1341452|43|NZ_CP037426|CRT | 1341452-1341494 | 43 | NZ_CP037426.1 | 533130-533172 | 0 | 1.0 |
NZ_CP037426_16 | 16.6|1341452|43|NZ_CP037426|CRT | 1341452-1341494 | 43 | NZ_CP037426.1 | 647077-647119 | 0 | 1.0 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | NZ_CP037426.1 | 572815-572845 | 1 | 0.968 |
NZ_CP037426_7 | 7.1|547410|57|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 547410-547466 | 57 | NZ_CP037426.1 | 1331986-1332042 | 1 | 0.982 |
NZ_CP037426_8 | 8.1|572927|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 572927-572977 | 51 | NZ_CP037426.1 | 1331850-1331900 | 1 | 0.98 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | NZ_CP037426.1 | 194168-194198 | 2 | 0.935 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | NZ_CP037426.1 | 300003-300033 | 2 | 0.935 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | NZ_CP037426.1 | 529271-529301 | 2 | 0.935 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | NZ_CP037426.1 | 609897-609927 | 2 | 0.935 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | NZ_CP037426.1 | 768832-768862 | 2 | 0.935 |
NZ_CP037426_3 | 3.4|280394|41|NZ_CP037426|CRT | 280394-280434 | 41 | NZ_CP037426.1 | 280529-280569 | 2 | 0.951 |
NZ_CP037426_7 | 7.1|547410|57|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 547410-547466 | 57 | NZ_CP037426.1 | 947554-947610 | 2 | 0.965 |
NZ_CP037426_8 | 8.1|572927|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 572927-572977 | 51 | NZ_CP037426.1 | 532859-532909 | 2 | 0.961 |
NZ_CP037426_10 | 10.1|659928|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 659928-659983 | 56 | NZ_CP037426.1 | 299969-300024 | 2 | 0.964 |
NZ_CP037426_10 | 10.1|659928|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 659928-659983 | 56 | NZ_CP037426.1 | 609906-609961 | 2 | 0.964 |
NZ_CP037426_12 | 12.1|1164196|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 1164196-1164246 | 51 | NZ_CP037426.1 | 532939-532989 | 2 | 0.961 |
1. spacer 16.3|1341225|47|NZ_CP037426|CRT matches to position: 647146-647192, mismatch: 0, identity: 1.0
gacgaggtcatgccaccgcgcgaaccgtcataccgtcacggtatctc CRISPR spacer gacgaggtcatgccaccgcgcgaaccgtcataccgtcacggtatctc Protospacer ***********************************************
2. spacer 16.5|1341379|47|NZ_CP037426|CRT matches to position: 647146-647192, mismatch: 0, identity: 1.0
gacgaggtcatgccaccgcgcgaaccgtcataccgtcacggtatctc CRISPR spacer gacgaggtcatgccaccgcgcgaaccgtcataccgtcacggtatctc Protospacer ***********************************************
3. spacer 16.6|1341452|43|NZ_CP037426|CRT matches to position: 533130-533172, mismatch: 0, identity: 1.0
gacgaggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgccgcggtatc CRISPR spacer gacgaggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgccgcggtatc Protospacer *******************************************
4. spacer 16.6|1341452|43|NZ_CP037426|CRT matches to position: 647077-647119, mismatch: 0, identity: 1.0
gacgaggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgccgcggtatc CRISPR spacer gacgaggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgccgcggtatc Protospacer *******************************************
5. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 572815-572845, mismatch: 1, identity: 0.968
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer gggatgacgagcttatcgtcatgccactgcg Protospacer ***************************.***
6. spacer 7.1|547410|57|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 1331986-1332042, mismatch: 1, identity: 0.982
agcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccgcgattcattcgcggtatctcag CRISPR spacer agcttatcgtcacgccgccacgaactgtcataccgcgattcattcgcggtatctcag Protospacer *************************.*******************************
7. spacer 8.1|572927|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 1331850-1331900, mismatch: 1, identity: 0.98
agcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccgccgcggcgctaacaag CRISPR spacer agcttatcgtcacgctgccacgaaccgtcataccgccgcggcgctaacaag Protospacer ***************.***********************************
8. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 194168-194198, mismatch: 2, identity: 0.935
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer gggatgacgagcttattgtcatgccgccgcg Protospacer ****************.********.*****
9. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 300003-300033, mismatch: 2, identity: 0.935
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer gggatgacgagcttatcgtcacgccgccgcg Protospacer *********************.***.*****
10. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 529271-529301, mismatch: 2, identity: 0.935
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer gggatgacgagcttatcgtcataccgccgcg Protospacer **********************.**.*****
11. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 609897-609927, mismatch: 2, identity: 0.935
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer gggatgacgagcttatcgttatgccgccgcg Protospacer *******************.*****.*****
12. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 768832-768862, mismatch: 2, identity: 0.935
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer gggatgatgaacttatcgtcatgccaccgcg Protospacer *******.**.********************
13. spacer 3.4|280394|41|NZ_CP037426|CRT matches to position: 280529-280569, mismatch: 2, identity: 0.951
cagcaccattaagccctgcctctagctcttcttttgttgca CRISPR spacer cagtaccattaagccctgcctttagctcttcttttgttgca Protospacer ***.*****************.*******************
14. spacer 7.1|547410|57|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 947554-947610, mismatch: 2, identity: 0.965
agcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccgcgattcattcgcggtatctcag CRISPR spacer agcttatcgtcacgccgtcgcgaaccgtcataccgcgattcattcgcggtatctcag Protospacer *****************.*.*************************************
15. spacer 8.1|572927|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 532859-532909, mismatch: 2, identity: 0.961
agcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccgccgcggcgctaacaag CRISPR spacer agcttatcttcatgccgccacgaaccgtcataccgccgcggcgctaacaag Protospacer ******** ***.**************************************
16. spacer 10.1|659928|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 299969-300024, mismatch: 2, identity: 0.964
agagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgcggcagcatgacgataagct CRISPR spacer agagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgcggcggcgtgacgataagct Protospacer ****************************************.**.************
17. spacer 10.1|659928|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 609906-609961, mismatch: 2, identity: 0.964
agagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgcggcagcatgacgataagct CRISPR spacer agagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgcggcggcataacgataagct Protospacer ****************************************.****.**********
18. spacer 12.1|1164196|51|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to position: 532939-532989, mismatch: 2, identity: 0.961
aattacttgaccgtcattacaccgtcataccgcgattcattcgcggtatct CRISPR spacer aattacttaaccatcattacaccgtcataccgcgattcattcgcggtatct Protospacer ********.***.**************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP037426_3 | 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT | 280322-280350 | 29 | NZ_CP030844 | Acidisarcina polymorpha strain SBC82 plasmid pACPOL3, complete sequence | 46638-46666 | 7 | 0.759 |
NZ_CP037426_3 | 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT | 280322-280350 | 29 | NZ_CP030844 | Acidisarcina polymorpha strain SBC82 plasmid pACPOL3, complete sequence | 71711-71739 | 7 | 0.759 |
NZ_CP037426_3 | 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT | 280322-280350 | 29 | NZ_CP024792 | Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY07, complete sequence | 98715-98743 | 7 | 0.759 |
NZ_CP037426_3 | 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT | 280322-280350 | 29 | NZ_CP030843 | Acidisarcina polymorpha strain SBC82 plasmid pACPOL4, complete sequence | 79359-79387 | 7 | 0.759 |
NZ_CP037426_2 | 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 262977-263007 | 31 | AP014320 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S33-C177, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 3673-3703 | 8 | 0.742 |
NZ_CP037426_13 | 13.1|1229933|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder | 1229933-1229988 | 56 | MN180249 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence | 19773-19828 | 10 | 0.821 |
1. spacer 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT matches to NZ_CP030844 (Acidisarcina polymorpha strain SBC82 plasmid pACPOL3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ttgcagcattaccaatctttacctctagc CRISPR spacer ccgtcacattgccaatctttgcctctagc Protospacer ..*. .****.*********.********
2. spacer 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT matches to NZ_CP030844 (Acidisarcina polymorpha strain SBC82 plasmid pACPOL3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ttgcagcattaccaatctttacctctagc CRISPR spacer ccgtcacattgccaatctttgcctctagc Protospacer ..*. .****.*********.********
3. spacer 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT matches to NZ_CP024792 (Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY07, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ttgcagcattaccaatctttacctctagc CRISPR spacer ttgcagcattagcaatatttaccaaactc Protospacer *********** **** ****** *
4. spacer 3.3|280322|29|NZ_CP037426|CRT matches to NZ_CP030843 (Acidisarcina polymorpha strain SBC82 plasmid pACPOL4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ttgcagcattaccaatctttacctctagc CRISPR spacer ccgtcacattgccaatctttgcctctagc Protospacer ..*. .****.*********.********
5. spacer 2.1|262977|31|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to AP014320 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S33-C177, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gggatgacgagcttatcgtcatgccaccgcg CRISPR spacer aacctgacgtgcttatcgtcacgccactggg Protospacer .. ***** ***********.*****.* *
6. spacer 13.1|1229933|56|NZ_CP037426|CRISPRCasFinder matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.821
atctatgctgagataccgcggcggtatgacggttcgcggtggcatgacgataagct CRISPR spacer agcggctaagagataccgtgacggtatgacggttcgcggtggcatgacgataagcc Protospacer * * .. *********.*.**********************************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
204956 : 257944
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP037426|204956:257944|DBSCAN-SWA 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53 | Leptospira_phage(13.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
267575 : 320222
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP037426|267575:320222|DBSCAN-SWA ATTAAGAAAAAATATTTCCAATTAGATAATTATTTTCCACTCCTTTAACATTAACTTTCACAATACTCTTGGCTTGAGCTTTTGATTCAAGCTTTATTAATGCAAAATTTTCTGCTCTACCGACATTATTTTGCTCAACCAGAACACTTTGCTTAGTGTTGATCAAGGATTGACAAAAACTGCTCATAATTTCTTTATTTACTTCTCTTAAATTTTTTACTCGTTCTTTACGCACATTCTCTGGTACTTGTGGCATTCGTGCAGCAGGTGTATTTTTCCGCTCTGAATATGGAAAAGCATGTAGGTAAACTATATTTGTTTTTTTCAGTAAATCAACTGTATCCTGAAACATTTCATCAGTTTCTGTTGGAAATCCAGCAATAATATCAGCGCCAAATGCTATATTAGGCCTCAAGCTCTTCATTTTATGACAAAATTCTATCACTTGTTCTCTGTTGTGACGACGCTTCATTCTCTTTAGTATTAAATTATTACCAGATTGTAGACTCAAATGTAAATGAGGCATAAGTCTTGACTCATTAGCTATTAAATCCATTAATTCGTCGTCAACTTCAGCAACATCGATAGAGGAAAGTCTTAGCCTCTTCAACTCTGGTATATCCTTTAAAACTCTCCTAATCATTGAACCAAGTGATGGCTTACCCAACAAATCTGTACCAAAGTCAGTAATATCAACCCCTGTAAACACTACTTCTTGATATCCATTTTCTACAAAGATCCTGATTTGCTCTATAATACTGTTTATTGGCACAGATCGATTATTCCCTCTTGCCTCAGTAATTGAACAAAATGTGCAGCTATGATTACAACCATTTTGAATTTCAATAAATGCCCTTGACTTATCTTCAAATCCATTAATTAGAACAGGTTCTACTTGGTTATCACTGACCAAGATTTTATCGTCATTTAGTAAGTAATTTTCAGCTTTTAGCTTATCTTGATTACCGAGCACTTTACTTACACCAGGAATGCTACTGTAAACTTCTGGATCCAACTGAACAGCACAACCAACTACGATAATTTCTTTATTTGGATCATTTTTGTAAATCTTACGTATCTTTTGCTTTACCTGACGTTCTGCTTCGTTTGTCACTGCACAGCTATGCACCACAACAACATTTTCTCTCTTTGCTTTTTTTAATGCTTCTTTGATTAACTCGCTCTCGTAAAAATTTAGACGACAACCAAATGTTATCACTTCATTCATGTTAGTATTTTTTGCTTTAATAGACCTAAATTATATCAAATATCCAAGCAAAGTCTCTTGCATGACTATTTTTTTGTAAATAAATGCTATGCAAGCAGCAGACACTGGGATCTCAACGATTTTCACTCAGACACAGTATCACTCCTTTGCTTATTATAGTCTTTTGACCTTTTTAAGATACAATCCGGATTGGATACTGAGTTGGTGAGTATAAAAGTATAGCTTCTACGTCATACCGCTGCGGTATCTCTTAGCCGCTAACAAGTAGCGGGATGACGATTGTCGGTGAATCTAAGTTACCTTAGCTACATTTCTAGCTGTAACTATAAATGTATGGATTTTTTATCGTGCCATGTTATAATTAACCTCTTGCTAAAAATTAAATATTGATGAATGAACTAAGAAAGTTAAGTATTACACAAATGCATGACGGGCTCAAAAAAAAGAGTTTTTCTGCCGTTGAACTCGTAGAGGCGCACATCAGTGCGGTTGAAAATGAGAAATTAAATGCATTTATAACAAAAACCCCAGAGATAGCAATGAAAGCTGCTAAAGCTGCAGATGAACATTTCTCTAGGCAAAAGGATGATTTAATCTCGCCGCTCATGGGTGTACCAGTTGGCATCAAAGATCTATTCTGTACAAAAGGAATAAAAACAACAGCATGCTCAAAAATGCTGGAAAATTTCGTTCCGACTTACGAATCTACGGTGTCTGACTTGCTTTTAAAAAGTGGAGCAGCCATGCTCGGTAAGCTTAATATGGATGAATTTGCTATGGGTTCTGCGAACACAAATAGCTATTTTGGCCCTGTTGAAAATGTGTGGATTAGAAAAAGCGATGGGGAAAAAGTTGTTCCTGGTGGATCATCTGGTGGATCTGCAGCATCGGTGGCTGGATTTTTATGCGCTGGAGCACTAGGGAGTGACACCGGTGGATCTGTGCGCCAACCAGCAGCTTATTGTGGAGTGGTTGGAATAAAGCCAACTTATGGAAGATGCTCGCGTTTTGGTATGATTGCATTTGCGAGTTCTCTAGATCAAGCAGGAGTCATTACTCGTTCTGTCTCTGATTCAGCATTAATGCTGGAAGCAATCTGTGGCTATGATACAAAAGATTCAATGTCAAGCGAAAAGCCAGTGCCTAAATTTTCTAGCTTTATAAATGGTGATGTCAAGGGTAAGCGTATTGGTATACCAAAAGAATATAGGATGGATGGAATTTCAGAGGAAATAGTCCATAATTGGGAGAAAGTTGCTTCCTATTTAAAAGAAAATGGCGCTGAAGTTGTTGACGTTACTCTGCCACATACTAAATATGCAATACCAGTCTATTATTTAATTTGTTCTGCTGAAACTTCATCCAATCTTGCTCGTTATGACGGTGTGCGTTATGGGTTCAGGGTTGATGCTGATACCCTTGAAGAAATGTATTCACTAACAAGAGCAGAAGGTTTCGGTAAAGAGGTGAAAAGAAGAATTTTAATTGGCGCTTATGCGCTTTCCTCAGGTCATTACAATGAATATTACGAAAAAGCACAGTGTATCAGGGCATTAATCAGAAATGATTTTATAAAAGCGTTTGAAAAAATAGATTACATACTTGTGCCATCTGCTCCAACAGAAGCTTTTGGCTTAAATGAAAAGCCAGATCCGCTAATTATGTGCATCAATGATGTGTTTACTGTGCCGGCAAGTCTGGCAGGATTGCCTGCTATTTCTGTTCCTGTTGGGCTCTCCAATGAGGGTTTACCACTTGCCTTGCAAGTGATTGGAAATTATTATGATGAAGCTGGAATATTAAATGTGGCAAGTGTGATAGAGCAAAATTGCGGCAGAATAATTAGACCTCTTGCATAATCTATTTTTTGATAGTAATTTTTGCATTAAAATTTGCTTACGCTCCTCAACGTACTCTATGGTTCCATTTTTAGATGAATAGCAAAAACAGGGTATATTAATCTGTTTACAAAATTTTCGTGTAACAGTTCACACTTAATTAAACAGACTGAATTCTGTAATTTTGGGATGTTGAAAAATTTACCTCACGTTGTCATTCCAGCGCATAACGCTGAAATCCAGATTTATAGAAACGAAAAAACTTGCTTGACACATTTTGCCAACCCCCTTATTACGATGTGTAGTACAATGATACAAATTAAGAATTCCCCCATCCTGTGCTGGTTCTTCGATCTGAAATCCTACTTCTACCTGATCACAACCAATGTTAATTTGTCCTATTAATGCTTTAATAATGCCGCGCTTAGTTTGCCAATCTAGCTGTTCCAGGTTCGATTTTACACTAGAATAAAAATTCTTTATGCTATTTATAATAAGACTTATTCCTTTTTCTACTGCCTTCTGATCAACTACCTTTTTTTTCTCTTCTTCTATCCCTTGTAAGCGTTCTTTCATTTTTCTCATTGTCTGTTTAAATTCTTCCTCGCTTATATATCCTTTCTCTCCTGCATTTTCTTGACTATAATAATCTTCCATTAATTTTTCGATACCTTCTTTTATTTGATTTTCTCTTCTTGCAAACTTTTTCTCTGATGATTCATCATTTTTATTTTCTAATACTCTACGTTGGTATTCCTTTTTTATCATCTCTGGGTTTTTTAGTACATCTTTCATCTTTTCCCATACTGACCTTACCCAGAAAAAGTGGAGAGAAAGAAAGGAGTTTTTTTGGGTAAAATAAAATTTTGGAGGATTAGAAATGGCAAGAGAATATACGGCAGAATTCAAATTGGAAGCTGTTAAGCTGGCAAATGAACAAAGAAAGGTAGGTCAACCAGTTGCAAAAGTAGCAAGAGATCTAGGAATAAGGGATAGTGTATTAGGAAAATGGATGAAGAAATATAACGAAAAAAAGTCAGCGGCAAATGCATTTCCAGGTAGAGGTAACATGGCTCCTTACGACAAAGAGAGGTTTGATTTACAAAGCAAGAGTAACAAGGGAAAGAGACATTTAAAAAAAAGCCCTGGCCAGTCAAAAAGAGTAAAATATTTTTTTATATAGTAACTGCTATAAAGTACAGGAATTATGTAGGATTTTCTGCTAGTGGCTACTATAAGTGGACCACAAGAAAAATAAGCAGTAGAGAATCAGCAAATAAAGAGCTACTCGCAGCTATTCAAAAAATATATCAAGTTTCTAAATGTAGATATGGAGCTCCTAAAATTCATGCTGAATTGAAGGCTTTGGGTAAAAGTTGCAACTTAAAAACAGTGCAAAGTATTATGCAGAAAAATGGTATTCAGGCTATATTGAGAAGAAAATTTAAAATTAAGAAACAACAAACGGACAGTAGCTCCCAATATATTAGACCAAAACTTTATTGTCGATCAACCAAATAAAGTATGGGATTACTTATATAAAAACCAAAGAAGGATGGCTATATTTGGCAACAATAATCGATCTATATTCACGCATGGTAGTTAATGAGCAGTTCAATAAATAAACAATTGGTTATGGACTCTTTATTAATGGCCGTTAACAAGCGTAAACCTGCCAAAAATCTACTATTACATAGTGATCAAGGTTCACAATATATAGTATTTTCTAAAATGAATGATAAATTTCCATTATGGTATTACCAACCAAAAGTTGTAAGTCTGTATATTTATGCATTAAAGGTCTGAGGCGGCTTTTGATGGTATTCCAACAATGCTCTATAGGGTTCAAATCTGGTGAATATGTTGGTAGATAGAGCAAACGGCATCTAGCATTATCTATTAACTCCTTTGTTTTGGGAGTTTTATGGAATGTG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50 | Leptospira_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
329695 : 468088
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP037426|329695:468088|DBSCAN-SWA AATGGCGTATAGTGTGGATTTAAGGGAAAGGGCAGTATCGATGATAGAAAAAGGGAAGTCAAAGGTTGAGGTGGCAGAGCTTTTGGAGATAGGAATAGCAACTCTGTACCGCTGGTTAAGAAAGAAAGCCGCTGGTGAAAGCCTAAGGCCATCGAAAAACGGCAGCTTTATTCGAAAAATAGACCCAAAAATACTCGAAGAATATGTTAAAAAGAATCCAGATCATACGCTGGCAGAGATGAAACAAAATCTTGGATTTGGAATAAATTCAATTTGGTATAGGCTGAAACAGCTAAGAATTACTTTAAAAAAAAGTTACACTATATCAAGAGCGCAATCAAGAAGATAGGCAGCGATTTACCGATAAAATCTCAAAAATAGACCATTCCAGCATCTTATATATAGATGAAGCAGGAGTTGATAATAGGTTATACCGAGAGTATGGACGTGCTCCAATAGGAAAGAAAATTTATGCAGATATTCCAGGAAGAAAACGAGAGAGAATCAGTATAATAGGCGGGTGGATTGGAAAGAGATTTATTGCACCAATGACTTTCAAAGGTGGGTGTGACAAAGAGGTATTCAATACATGGTTAGAGAAGATGTTATTACCTAAATTGCCACATGGTACTACAATAGTTATGGACAATGCCACATTCCATAAAACTCCCAAAACAAAGGAGTTAATAGATAATGCTAGATGCCGTTTGCTCTATCTACCAACATATTCACCAGATTTGAACCCTATAGAGCATTGTTGGAATACCATCAAAAGCCGCCTCAGACCTTTAATGCATAAATATACAGACTTACAACTTTTGGTTGGTAATACCATAATGGAAATTTATCATTCATTTTAGAAAATACTATAGGAGGTTGTCCGGAAACTAGTAAAAGGCTATAATATCTGAAATTTTAGTACGGGGTAAAGATGAGAAAAAAGTATCCAACAGATCTAAGCGAAAGGGAATGGGCAAGAATAGAAAAACACTTCAGAGTATCATACAAGAAAGGAGGAAGGCCGCCAAAGTATAGCAAAAGAGAAATATTAGAAGCAATTTTCTATGTATTGCGTACAGGGTGTCAATGGCGGTATTTACCAAATGATTTTCCGCTATGGAAGACTGTGTATGAGCAGTTCAGGCAATGGAAGAAGCAGGGAATTTTTGAGAAAATGAATTATGAAATTACAAAATATAGTAGAAGAAAAATAGGAAGGAATGAGCAGCCGAGTGCCTGTATAGTAGATAGTCAATCTGTAAAGACTACAGAAAAGGGGGGATCAAAGGCTATGATGGAAGTAAAAAAGTAAAGGGTAGAAAAAGGCATATAATTACAGACACTCAGGGTTTTATACTAGGTTGTTACGTAGGCGCTGCTAACGAAAATGATAGAGATGGTATTAAAATAGCATTAAACAATATGAGAACAAAATATACTAAAGTTAAAAAAATGTGGGCTGACATGGGATACCAAGGAAGAAATTTAAAGAATCACATAAAGGAAGAATATGACATAGATATTGAAATTGTTAAAAGGCCTCCATGTAGATTTTGGGTGCACAAAGATACGCCACCTGAGCTACTACCAACAAGAGAACAAGGGTTTAAAGTACAGCCAAGAAGATGGTTTGTAGAAAGGACTTTTGCTTGGGTTAATAGGAATAGAAGGCTATCGAAGGAGTATGATTTACTCACAACATCCACTGAGAATTTCATATACCTAGCTATGAGTAGGGTTATGTTAAAGAGGGAATATGCTTGAATTTACTAGTTTCCGGACAACCTCTTAGTAGCGGAATGACGATTGTGTATCGTGTTTTGCTAAAAATCACAGAATGCAGTCTGGTTACCCTATTAGAAGTTTAGCTTTAACTTTAAATGGACTACTCAACCGTGACAGACTTAGCTAAATTTCTTGGACAATCTGCATCTAACCCTTTTTTTGCTGCAGTAAAGTAAGCAAGGAATTGCATAGCAACACTGTAGATGATTGGAGAGATAAAATTATCAGTGTCTGGAAGTTGCACCACATCTGCGCAAACTCCCCTTAGGAATGGCGCTCCTTGTTTATCACTGAAGGCAATTACTTTGCCTTTTCTTGCAATAATCTCTTGTATATTAGATAGCGTTTTAAAGAATAAATCATCATAAGGGATAATTGCTATAACAAGCACAGTAGAGTCTATTAAAGCAATAGAACCGTGCTTCATTTCTCCCGCTGCAATACCAATTGTATTGATGTATGAAAGCTCTTTTATCTTCAATGCACCTTCCATTGCAACTCCGTATGAACTTCCTCTGCCAATTAAAATAACGTTATTGTGTTCTAATATGCTGCCTGATATATGTTGTATTTTCATCACATTTAAAACATGCTCAACATACTTGGGAATAGAGTTAATAGCGTTGCTTAGCTGTTTTATTCTCTCTCCACCCAGTATACCTTTTATTTTTCCAAGCTCCACGGCAAAGCATGCTAAAGTTGCAAGTTGCGCAGAAAAGGTTTTTGTTGAAGCAACACCAATTTCTGGCCCAGCAAGAGTATGTAACACAATATCTGAGATCTTTTCAATGCTGCTGCTAAATGTATTAGTTATACTTATGATTGTTTGCTTCTGTGATTTCGCATAACGCAGCGCTTCTATGGTATCTGCAGTTTCGCCAGATTGAGAGATAAATAACCCAATGCTGCCTTCTTCCAGCTTGACGTTGCTATACCTAAATTCTGATGAGGTTTCTAGATATACTCGAACTTGAGCGACATTTTCCAGCCAATACTTTGCTATTAGCCCAGCAAAATAAGATGACCCGCATCCAACTATAGTAATGTAACTCAGCTCAGAAAACAATTTTTTGTTAGCAAATATTACCTCTTTATATTGCTTGTAAAATTGATTTATTGTTTTGTTTAATGCACGCGGTTGCTCAAAAATCTCCTTTAGCATGAAGCTAGGGTAACCATTTTTGCTAATTAGAAAATCACTTGGACTACTATTTTCTATACTGCGTTTAACTTGTGTACCATTGTTGTATATACTAACTCCACTAGATTTTATCACTGCAATGTCATCATCTTCCAAATGCGATATTCTTTCCACAAATGCACTTAAAGCATTAGAGTCAGATGCAGCAAACACTGTGTTACAGTTATAGCCTATTGCTAAAGGCAAATTTCTCTTCGCAACAAATAAGGCGTCTGGATATTCTGCAAATAATAAGACCAAGGCAAATGAGCCGTGTAGGTTGTTTAAACACTTAAATAGAGAATCAACTGGCGACAATCCTTCATCGAGATATAAGGTTAGCATGTTTGGTATGATCTCTGTGTCAGTGTCAGTATGGAATGACATGCCCCTTTCTTCTAGGCCCTTTTTTAGCAGATTGTAATTCTCAATTATGCCGTTATGAGCAACAACAACGTTATTTGTACGAATGGGGTGAGCATTTTTAAGGCCTGGGACTCCATGTGTAGCCCAGCGAGTATGTGCTATACCAACTGTACTGTGAGACATCTTGCTGTCATCAACAACTTCACATAACCTTTCGACTTTACCTTCTGATTTTTTGACTTCTATCTTACCTTCGTTATTTATGATTGCTATACCTGAGGAATCATATCCCCTATATTCCAATTTTTGTAACCCAGTTAGTAAGGTTGGTATTACTGAATCACCACTACTTACTACACCAAATATTCCGCACACAAATGGATCACCAAACAAACTTTTTTCTAAACATGTTAAGCATTTTTGCCTTTATTACTGGTTGATTTATATTCTTTTTATCATTCTTTCGATTTTACCTTTTTAATTGGTTTAGCTGCTACTTTTTGAGTTTCTTTGCTTAAAACCTCAGATATAGCGGACTTTAGGACTTTTATCTCGACTTTTGGTGCTATTTCTATTATAAATTGTGCATTTGCTCCATCAACCTTGTTAACTTCACCTATTATTCCACCAGAAGTAATGACTGTATCACCACGTTTTATTTGATCTATCATCTTTCTATGTTCTTTTAGTTTTTTTTGTTGCGGGCGAATAATGAGAAAATAAAATACCACAAATATTAAAATCAATGGAGTAAAACTAGCAAAAGATGCGCCGATACTTGATGTATTGCTAGTTGCATCTGCTGCAAAAACTTCAGAAATGAGCATATTTAATCCTAATTGTTAATGATAAAAACAAACCTATTTAAGTATTAATTACAATACCATGCCATGTCAAGTTTGGTGAAGGCGTTTCTCAATACCGGCAATAATACTGCGAATTCTAAGTTATGCTAAAACTAATATGGCGGGAGTGATGAGACTTGAACTCACGACCTCATGCGTGACAGGCATGCGCTCTAACCGACTGAGCTACACCCCCCTAATTTCTTTTTAGCGTTTTCGGGCTTCAACTTTAAAGCTAATAAACATGTTGCCCTTTGTCAATATTTTTTGTTTGCGCTTTGCTGTCTTTTCTATTACTATGTAAATAATTTAATTTCACACATGGCTTGTACAAGTAGTCCCATTAGGGTTATGCCATGGAAGATAAACTATTTGGAGGAATGATATATGACAAATTTGCCTAAAGTCACTGTGCGTGATTTAGCTGAATCTGGTGTACATTTTGGTCACAAAATTAGTCGCTGGAACGCAAAAATGGCTCCATACATATATGGAGTGCATCAAGAAAATCGTATACATATAATTGATTTGCGAAAAACACTACCATTGCTACAGGTGGCCATGAAGGCTTTATATGACGTTGCATTTCAAGGTGGTCGCATTCTATTTGTTGGTACAAAGTTTCAAGCTTTTGATATTATTGCAAGTGAAGCGATTCGTTGTGGTCAATATTATGTGAATCATCGTTGGCTTGGTGGTATGCTTACTAATTGGGGCACTGTTTCTTCTTCGATAAAAACCTTGATGCAATATGAGAAAATATTAAATGACGAGGATAGCATTTTAACAAAGAAAGAATTGGGAAACATTGAAAAGAAAAAGCA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119 | Wolbachia_phage(71.83%) | portal,tail,terminase,transposase,capsid,plate,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
473217 : 715945
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP037426|473217:715945|DBSCAN-SWA AATGGCGTATAGTGTGGATTTAAGGGAAAGGGCAGTATCGATGATAGAAAAAGGGAAGTCAAAGGTTGAGGTGGCAGAGCTTTTGGAGATAGGAATAGCAACTCTGTACCGCTGGTTAAGAAAGAAAGCCGCTGGTGAAAGCCTAAGGCCATCGAAAAACGGCAGCTTTATTCGAAAAATAGACCCAAAAATACTCGAAGAATATGTTAAAAAGAATCCAGATCATACGCTGGCAGAGATGAAACAAAATCTTGGATTTGGAATAAATTCAATTTGGTATAGGCTGAAACAGCTAAGAATTACTTTAAAAAAAAGTTACACTATATCAAGAGCGCAATCAAGAAGATAGGCAGCGATTTACCGATAAAATCTCAAAAATAGACCATTCCAGCATCTTATATATAGATGAAGCAGGAGTTGATAATAGGTTATACCGAGAGTATGGACGTGCTCCAATAGGAAAGAAAATTTATGCAGATATTCCAGGAAGAAAACGAGAGAGAATCAGTATAAGAGGCGGGTGGATTGGAAAGAGATTTATTGCACCAATGACTTTCAAAGGTGGGTGTGACAAAGAGGTATTCAATACATGGTTAGAGAAGATGTTATTACCTAAATTGCCACATGGTACTACAATAGTTATGGACAATGCCACATTCCATAAAACTCCCAAAACAAAGGAGTTAATAGATAATGCTAGATGCCGTTTGCTCTATCTACCAACATATTCACCAGATTTGAACCCTATAGAGCATTGTTGGAATACCATCAAAAGCCGCCTCAGACCTTTAATGCATAAATATACAGACTTACAACTTTTGGTTGGTAATACCATAATGGAAATTTATCATTCATTTTAGAAAATACTATATTGCTGCAGTCTCTCTATTAGCGTCGGCTGGAAATGTTTCAAGCAATGTTTCATCAGATAATAAAGCTCGTTTTCTATCGTTATATAATTTCAAATAGTCTGAAATATTTATACCTGTTTTCTTTATATAAGCGCTTGCTTGGGCTAAAGCTAAAGGTAAATGACCTAATGTCTTTGCTAATGCATCCACTTGAATTATATCTAGCTTTGTTCCTTCCACTTCTAGAGGTTGTCCGGAAACTAGTAAAAGGCTATAATATCTGAAATTTTAGTACGGGGTAAAGATGAGAAAAAAGTATCCAACAGATCTAAGCGAAAGGGAATGGGCAAGAATAGAAAAACACTTCAGAGTATCATACAAGAAAGGAGGAAGGCCGCCAAAGTATAGCAAAAGAGAAATATTAGAAGCAATTTTCTATGTATTGCGTACAGGGTGTCAATGGCGGTATTTACCAAATGATTTTCCGCTATGGAAGACTGTGTATGAGCAGTTCAGGCAATGGAAGAAGCAGGGAATTTTTGAGAAAATGAATTATGAAATTACAAAATATAGTAGAAGAAAAATAGGAAGGAATGAGCAGCCGAGTGCCTGTATAGTAGATAGTCAATCTGTAAAGACTACAGAAAAGGGGGGATCAAAGGCTATGATGGAAGTAAAAAAGTAAAGGGTAGAAAAAGGCATATAATTACAGACACTCAGGGTTTTATACTAGGTTGTTACGTAGGCGCTGCTAACGAAAATGATAGAGATGGTATTAAAATAGCATTAAACAATATGAGAACAAAATATACTAAAGTTAAAAAAATGTGGGCTGACATGGGATACCAAGGAAGAAATTTAAAGAATCACATAAAGGAAGAATATGACATAGATATTGAAATTGTTAAAAGGCCTCCATGTAGATTTTGGGTGCACAAAGATACGCCACCTGAGCTACTACCAACAAGAGAACAAGGGTTTAAAGTACAGCCAAGAAGATGGTTTGTAGAAAGGACTTTTGCTTGGGTTAATAGGAATAGAAGGCTATCGAAGGAGTATGATTTACTCACAACATCCACTGAGAATTTCATATACCTAGCTATGAGTAGGGTTATGTTAAAGAGGGAATATGCTTGAATTTACTAGTTTCCGGACAACCTCTACTAATAAAGTGTGGCACAAACGTCAATGATCATTATGAACGCAATCGTACGCCACTGCATATTGCCATCGGACGCAAACAATTAGAAATAGCAAAATTGCTGATAAAAAATGGAGCAAACGTTAATGCAAAAACTCAAAATCATGGTAAAGATGATCTAACACCAATGCACTTTGCAGTTTTTGCAAATACGCCAGAATTTATAGAATTACTAGCTAGCCATGGTGCATTGATTAATGAAAGAGAAAGCACCGAAGGGTATACTCCTCTTCACTTTGCTGCTTTATATGGGAACAAAAATATAATACAAGCCTTAATTGATAAGGGACAAGATATTGAAGATGTGGACAATAATGGGCGAACAGCTCTGTTTTTAGCTGCTAGGCAGTGCACTGAAGCAGAAGATGATAGCAGAATAGAAATTATCAAGTATTTGATAGACAAGCTCAAAGCAGATGTAACAAAGAAAGACAATAATAACAATGCAGTACTCTTTCCTGCCGCTAATAATTGCCCTGGAAAAGTGGTAGAATTCATCATTGAGCAATATATAAAAATCTTTGAGTTAGAGAATTTTATCAACCACAAAAATAATGATGGAATGGATGCTTTGGATATTGCGCTGAATAGTGGAAACGAGAAAGCTATTGAAGTATTAAGATCATATGGAGCAGATATCAAGAATAAGGTAGATGGTAGCATTCAAAAAATTACTGCAGAAAAACCAAGTAGTACCCTAGACAGAGCAGAAAGTGCAGAGGTAGCGCCTCCAATTAAGCAAAGAGTATAAAGCTTTTTATAAAGCGATTATAAATTTCAGTAAGTTGCAGAGGCTCTACAATGGGAAGTGTAGTATGTTAGCAGATACAAATGACTAGATAAATTATATTTCATTAAAGTCATTTATCTTGAAACATAAGCAGGATTTTGTATAGTTGTTTCAATTTGGGTCTGTATATTGAAACAACGCGTGAAAATGACAGGTCATTGTACAAGAGGTACCTAATTCACCGACAAGAATGCTAGATAAAGACACTTACATTTCAATTATTTCACAATTTCTGTATAATCTTAAAAACTCAATTAGTGCGTTATGAAGATAATAATAGGTAATGCTAGTAAGGAATTAGGGGAATCAGTAGTTAACCGGCTAGATGTTCAACCATCCTCTGCTTGGATATCAAAGTTTACCGATGGTGAGGTAAATGTAGAAGTAGCAAATGATCTATATAATCAAGAAGTATATATAATACAATCTCTTTCTCCCCCTGTGAATGATAACCTTATGGAGCTTCTGCTCATAATTGATGCAGTAAATAGATTAGGAGCCAAAAGGATAGTAGTAATTATTCCTTATTATGGATATAGCAGGCAAGATAGAATTATCAAGAACAATAATGTGCAGTCTGCTTTAAGTGCCAAATTAGTTGCAAATCTTATTCAAACTGCAGGTGCAAGTAGTGTTGCAGTTATTGATTTGCACTCAAGTCAAATTGAAGGATTCTTTGATGTACCGATAACTAATTTGAACTGCTTTGAAGCATTTGTTGACTCTATACACACGGAAAATTTGGCAATTGTTGCACCTGATGTTGGAGCAATTGGTAGAGCACGTGCTTTTGCAAAGACTTTAGAGGAAAAGTACAAGATAGGGTTAAGTGATAAGATTATTGTAGTAGATAAATATAGGGAGAAAGCAGGCACATCTCAAGTAATGAACATAATAGGAGAAGTTGCAAACAAAAATTGTGTCATTGTTGATGATATAGTTGACTCTGGTGGAACGTTGTGTAATGCAGCTCTTGCTTTAAAAAGTTACGGAGCAAAGTCCGTAACTTCATGCATCACACACGGTGTGCTTTCAGGAAGTGCAGTTGAGAAAATCTCTTCCTCTTCTTTAGATAAATTAGTGATTACGGATACCATACTTCACAAACTTGAAAAAACTGGTAAAATAGAAGTTGTTTCGGTTGTAAATATTTTAACTCACTTCATCCAAGGAGGTAGAAATGCCAGCTAAGTCAACAGAAGACGTTATTACTTCACTAATAGAATTTGCAAATAAGAGAAAAATAACAATTACCAAAGAAGAAATGCTTAAAATTGCACAGCTTGTAAGGATTAAGTTATCAAATGACGAGATTGATCACTACTCCAAAGAACTGACAATGCTGGATTGGATACATGATACTTTATTGCAAGTTAATACTGAAGGTGTTTCTCCTATGCGTTATGGCAGCATAGACAAGGACATTCATGTACGCGATGATGTTATAAATTCTCAAAACATTAAAAAAGAGATATTGTCCAATACAAAACCTGAGCATGGGTATTTCGTAGTGCCAAAGGTTATAAGCAATTAAAGTAAAATAAGGCTCATATCAAATCTATAATAGATCTACTTTCAAAAATAAGACCAATCCGGTAAAGAAGCATTTGTGGGAGTGGAAACCATTTTTTGATTTTTCTTTACTAAGTCTACTAAATATAGTTTAGAGTTGCTTGGTGATTCTGTTCTTGTAAAAATGATTTCTCTACCATTTGGTAGCCATGCCGGGGATTCAATTTTATGCCCCTCTGAAAGCAGACGTTCTTCTTTGCCATCTGGCTTCATAACTCCTATGTAAAATTTTCCTGACTGAATCTTTGTAAAAGCTATCAGATCTCCTTTTGGCGACCAAACAGGCGTAGCATATCTTCCACTCCCAAAACTAATTCTTTTAGGTTTTTTACTTTTGTTAGTAAAATCGATAACGTACAGTTGCTGACTCCCACTTATATCAGAACTAAAAGCCATATACTTTTGATCTGGAGAAAAAGAGGGAGAAGTGCTTATAGCTGAACCTTTAGTAATTTTTTTTGTTCGTTTACTACTTAAATCCAAAGATAATATATTCGTTTCACCACCCAATGAGTGGGAAATTAAAAGAGATTTACCATCGGGAGAAAATCTTGGTGCAGAAACAACTCCTTCAAATGCGCTGATT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226 | Leptospira_phage(20.59%) | portal,integrase,tail,protease,terminase,transposase,head,tRNA | attL 659928:659967|attR 724209:724248 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
727775 : 792484
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP037426|727775:792484|DBSCAN-SWA TTCAAGCATATTCCCTCTTTAACATAACCCTACTCATAGCTAGGTATATGAAATTCTCAGTGGATGTTGTGAGTAAATCATACTCCTTCGATAGCCTTCTATTCCTATTAACCCAAGCAAAAGTCCTTTCTACAAACCATCTTCTTGGCTGTACTTTAAACCCTTGTTCTCTTGTTGGTAGTAGCTCAGGTGGCGTATCTTTGTGCACCCAAAATCTACATGGAGGCCTTTTAACAATTTCAATATCTATGTCATATTCTTCCTTTATGTGATTCTTTAAATTTCTTCCTTGGTATCCCATGTCAGCCCACATTTTTTTAACTTTAGTATATTTTGTTCTCATATTGTTTAATGCTATTTTAATACCATCTCTATCATTTTCGTTAGCAGCGCCTACGTAACAACCTAGTATAAAACCCTGAGTGTCTGTAATTATATGCCTTTTTCTACCCTTTACTTTTTTACTTCCATCATAGCCTTTGATCCCCCCTTTTCTGTAGTCTTTACAGATTGACTATCTACTATACAGGCACTCGGCTGCTCATTCCTTCCTATTTTTCTTCTACTATATTTTGTAATTTCATAATTCATTTTCTCAAAAATTCCCTGCTTCTTCCATTGCCTGAACTGCTCATACACAGTCTTCCATAGCGGAAAATCATTTGGTAAATACCGCCATTGACACCCTGTACGCAATACATAGAAAATTGCTTCTAATATTTCTCTTTTGCTATACTTTGGCGGCCTTCCTCCTTTCTTGTATGATACTCTGAAGTGTCTTTCTATTCTTGCCCATTCCCTTTCGCTTAGATCTGTTGGATACTTTTTTCTCATCTTTACCCCGTACTAAAATTTCAGATATTATAGCCTTTTACTAGTTTCCGGACAACCTCTAAGAAGGTGTCCAGTTAAGTCCTCCTGGTGTAGCCTGTGCATTACAAGAACGATGACTCCTTTTTTTCTATCGTTCAGCCTGGTTACTAAAGTCTGATCAAACCAGTTTGTGGCACGCTTTCTAAGCGTTTCACTCAAAGCTTGAGCAGAACTGAGCGGATCGTCCACAATGATAAAATCACCACCTTCACCAGTTAGTGTTCCACCAACTGATGTTGCGATTCTGTATCCTCTCTGCACTGTTTGAAATTTATATTTTGTATTCTGGTCTTTGGATAGTTCTATCTCTGGAAATAGCGCTCTATACCAACTAGACTGCATCACGCACCTGGTGTCGAGCGAGTGCTTTTCGCTGAGCCGCTGAGAATAACTTGCAACTATTATTCTCGCAGTTGGTTGGTTTCCCAGTATCCATGCGGGCCACGCAACGCTTATGCACATGGACTTCATCGAGCGCGGAGGCATATTGAATATTATTCGTTTCACTTCACCAGCGCTCGCCGCTTCCAGCCTATCTGCTATGACTTTTATATACTGATAATCGTTATACTCACACCCCGGCACTACCGTTTGAAAGCACAGTTCAATGAATTTTAGAAAGTTCATGATATAATGTTGAAACCAGCGCGTGACGCTGGGATGACAAAAAAAGGAGCACTGGAATGACACCCTACTTAACCGTCATACCGCCGCGGTATCTCTTAGCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGGTTGTTGTTTAGCTATAAATATTAAGAAATTTACCAAATAAAAAAAAGGCAAAAGAAGCCCCGTGGTTATTATCCGCTTTAAAATATTGGCGTTTTTTATGTTTTAAACGCTTGACAAGCGAGATTCAGCCGCTTTTAATTGCAACTAACCTACGCTGCAAATGTTTAAGAAATTTACTAAGCAGAAAAAAAGACAAAGAATCCCCGAGTTAGCTAGTCTTTTACTATCTCTGTCGAGTATTGGCATTTTTTGATGTCTTGTAACGCTTTATAAGCGCGTTCAGCTTATTTAGATAAAAATCTAGATGTAGATGAAGTTTTGTAAAGACATACAGTATCTATATACTGCAAAAAATTGAACATAAGACGCCGATACATTAAGTAATCCTTACCTTTTAATCTGCAGATTGGCGAAAGCAAATACAATAGCTTCAGTTTCATGATAGGGGGGCTGGCGGAGTTTGTCAAGTAAGTTTTTTCGTTTCTATTTCCAATAAAAGTTCGTTATATGGTTATGCAAGAAGTTTAATACTCATAGTTTCAAGCATATACTGAAATATCTCATTAGCAATTGCAACATCTTGGCGTGGGGCTTTGCCGTGTTCTATAAACACAGAGATTGCATAGCGCGGGTTATGGTAAGGGCCATAGGCGATAAATAACTTATGACTTTCGCCCTTAGAGTTTATTTCTGGTGTACCGGTTTTGCCAGCAATTTGTATACCGCTTAGCCCTTTCTTATAGGTTCCAGTTTTAGAATTCACCACATCAAACATAGCTTTTCGAACTATGCTAAGATGCTCACAATCCACATCAATATCGGGAAAATCTTGTATCGTTTCATTCATCTTAATGCGGGGAATTACCTCTTTTCCTGTTGCAATCCTCGCTGCAAGAACTGCAAGCTGTAGTGGTGTTGTAAGCATATACCCTTGTCCTATAACTAAGTTGATAGTGTCACCTAAATACCACTGCGAATATAGCTTTCGTGTACGCCAATCTCTATCTGGCAACAACCCTGGAGCTTCTTCTTTAAACGTTCCAATCAGTGGCCCACTTCCAATACCAAATTTTCTGGCCATTTCTACTAGAGAGTCTACACTTATTTTTTTCCCTATATTATAAAAGTAAGTGTTGCATGATAATGCCATTGCTTCATTTAAAGATACATATCCATGGACTTTGCTTTTCAGGCAACGAAATTTCCGCTCACCTATTTTCATATAGCCCTTACACGAGAATTTTTCTTCTGGTGTGATTATTCCGTCTTTTAAACCCGCAAGCGCAACTATTACTTTAAATATTGAACCAGGTGGAATTTGATATGATAACGCACGATTCACGAGCGGCAATGAAGGAGCATTCAAGCTCTCCCAAGTCTCATTTGATAGCCTGCTAGCAAAAAGATTATTATCGTAAGAAGGTGAATTATATAATGCTAAAATTTCTCCATTATTTACATCAATTACCACTGCGGAGCCTTGGTGATCTTTAAATACCTCTGCGGTTTTCTCTTGCAGATTAATATCAATTGTCAGTTGTACATCTTGTCCGTCTTGTTGTGGTATGCTTGATAATTCTTTTATGACGCGTTTTTTAGAATTTATTTCCTGCTCAGATTTTCCTGACTTGCCTTTCAATATATGATCATATGTATATTCAATACCGCTGATTCCTACTTCGCTTATGCCTTGCTGTCTTTTTGTATATCCGATTACATGAGAACACATTGAACCAAACGGGTAATAACGTTTATAAAGAGCAGTTATTTTTTCTGACGATTTTGCTATCTTAGACTCGACTTCTGATAATGTCTGCAAATCAACTTCCTTACCAGAACCATCAAACAAAACAACATACGAAATTTTGTTTACCGCAAGTTCAATGCTATTCCTATCTAAAATTTTGCCCCGCTTAGGCATAATAGTAGCAACTCTTATTCTATTACTATTAGATAGTGCTTCGTACTTTTGTCTGTTTCGTATTTGTAAATTATATAACCTGCAACTAAAAACCGCAGAAATGGTAAGCTGAATACCACCTAATATGAATGCTCTGCGGTTAAAGACTTTGTTTTTTGTCCACATAACATTCCTTCAAAACACACTTTTTTCCCCTCTTTTATTGTTACACTTCTGGCTTTTACCGTATTACAAACCCTTTTTTCCCACTCACTTAAGGTCACAAACTTATAACCTGATTTTTTTAGTATTTTAATAATATGAGGTAAAGCTTCAATTGTGTTTGACCTGTTATTGTGATCATGAAACAGTATAACTGCTCCATTATGTACATTACTTAAAACTCTTTCAACTAAAGTTTCTGGCTTATCACCTTGCCAATCTAGCGAATCAACTGTCCATAATATTGAATACATATTTAATTGATCAGTATTTTCAATCAGATTATCGTCATAACATCCATATGGCGGACGAAACCATTTTACATCTTGTTTTATTGCATTTTTAATTGCTGTATTTGTCTTTTCCAATTCTTGCAATTGTTCCTCACTTGAAAGTGATGTCAACTTCCTATGCGACCAAGAGTGATTGCCTAACTCATGACCTGATTCATGAATTTTCTTTACTATTTCAGACGTTTTTTCATTTATACGTTCACCAAGCACAAAAAATGTTGCTTTTGCTTCATAGCTTTCCAGAACATTAATAATATCGTTTATTCTATTGTTGGAAGGTCCATCATCAAACGTAAGCGCAACAAACTTATCGTCGTTATTCAATAATTTTTTTATATTACTTAAATTTCTATATGATAGATCTAGATTACAACTGAGCCCACAGTATGGTAAATTAAAATTACAATCACTACAAAAAGCCGTACTTGAATATAGTAAGAAAAAAGTGATTATCCTTATAAACATTTGTAATCAGCAAAGTGATAGAATACTACACTTTTTTGCTAAGTTAAGCCATCTTTAATTGCTGTAGCCTTTACTTCATCGCTTCTTTAATATATTGTATTAACAATTTTATATAATATATTATGATTGCAAATATAAATACCGTTGCGCTTCAGGGAATTAGCACAGTAAATGTCAATGCACAAATTCATATGGCAAATGGTATTCCAGCTTTTAATATTGTTGGCTTGCCGGATAAAACTGTTGCAGAATCCAGAGAGCGCATCAGAGCAGCGTTAAATTCAATCAATCTACTACTACCTCCAAAAAGAATTACAGTTAATCTCTCCCCTGCGGATTTGCTGAAAGAAGGCAGTCATTATGACTTGGCTATTGCTATTGGACTACTTGTTGTAATGAATGTGATACCAGTTGAAAAAGTTCAGTCTTATATAATCATGGGTGAACTGGCTCTTGATAGCAGAGTTATTCCAGTTTTAGGTGTGCTGCCAACAGC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53 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
800824 : 862681
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP037426|800824:862681|DBSCAN-SWA 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57 | Leptospira_phage(20.0%) | integrase,tail,tRNA,transposase | attL 808532:808591|attR 849556:850478 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
872526 : 995472
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP037426|872526:995472|DBSCAN-SWA AATGGCGTATAGTGTGGATTTAAGGGAAAGGGCAGTATCGATGATAGAAAAAGGGAAGTCAAAGGTTGAGGTGGCAGAGCTTTTGGAGATAGGAATAGCAACTCTGTACCGCTGGTTAAGAAAGAAAGCCGCTGGTGAAAGCCTAAGGCCATCGAAAAACGGCAGCTTTATTCGAAAAATAGACCCAAAAATACTCGAAGAATATGTTAAAAAGAATCCAGATCATACGCTGGCAGAGATGAAACAAAATCTTGGATTTGGAATAAATTCAATTTGGTATAGGCTGAAACAGCTAAGAATTACTTTAAAAAAAAGTTACACTATATCAAGAGCGCAATCAAGAAGATAGGCAGCGATTTACCGATAAAATCTCAAAAATAGACCATTCCAGCATCTTATATATAGATGAAGCAGGAGTTGATAATAGGTTATACCGAGAGTATGGACGTGCTCCAATAGGAAAGAAAATTTATGCAGATATTCCAGGAAGAAAACGAGAGAGAATCAGTATAAGAGGCGGGTGGATTGGAAAGAGATTTATTGCACCAATGACTTTCAAAGGTGGGTGTGACAAAGAGGTATTCAATACATGGTTAGAGAAGATGTTATTACCTAAATTGCCACATGGTACTACAATAGTTATGGACAATGCCACATTCCATAAAACTCCCAAAACAAAGGAGTTAATAGATAATGCTAGATGCCGTTTGCTCTATCTACCAACATATTCACCAGATTTGAACCCTATAGAGCATTGTTGGAATACCATCAAAAGCCGCCTCAGACCTTTAATGCATAAATATACAGACTTACAACTTTTGGTTGGTAATACCATAATGGAAATTTATCATTCATTTTAGAAAATACTATAGTTTTAGGAATAAATCTGAGATAAATCGAGAAAAAGAACTGCTAATCAAATGCTATTTGCTTAATAAATTCACTGATATTGGTATGGCTAAATTTGAGATAGTTACATGAATTTACCATAAATCACCATCTCATAAAGTGTGATGCAACAAAGCCATCCCAGTGTCAGCTACTTGGATGACAAGAAAGGGAACACTGGAATTTTTGTTTCAGCATTAGCCATGCATCTAAACAGATACGTTGCCTTGAGAATCGCAACATCCATGCAGTTATGCGCGTAACACTGAAAATCAAAAAAACAAAGAGGCAGACTTAATCTACCTCTTTTATACTTAGCTGTCTAGTCTGGTACTTTTCCTTTAGCAGCTTGTTCAACAATAGGTGAGCCTAAATAAGTGTTAACCTCTTTAGCACCATCTTTGTCTAAACCTAATGTTTTATTCCACTTTGTTTCATTTACTGCCTCGAACTTACCTTCATCGTTTTTCTCTTTTAGTGAACCTATCTTGAAGAGTAAAGTATTGCCTAGTATACTGGTAAGCTGATTAATATCAACAATAATACGGTAGTTCTTGCCTTCTAAGCTGAAGTCTATATAATATTTATCCTTTTCTACCTTACCTTCTTCATCTTTAACTTGGTTATTCCTTGCAATTTCCCTAAATGCGTCTTTTGTTACTAGCAACCCATCCTTAATAACCTTCAGAGCTTTCAACTCAGATATTTCGTTATTTTTGCTGATAGCATATATTGCTAAATAAGTCAGCGCAGCAGCAACAAATGCTAAAACGCCCATTCCAAGTGGTGTAGCTGCAAAAGCTGCTAGCTTGCAAGTTGAAGGCCTCCAAAGCGGTGTTGAAAGTATTGCTAATCCACCTATAACGTATATAGCAGTAAATGCAACAAATACAGTGTTTGCTTTGTGGAGCTGGCCACAATGATTTTTGAAAGTTAGCATAAACGACTTCATTTAATAAAATATTAATATGCTTAAATTGTGTATAAAAGAACTGTCATAGTTAAGCTTTTTCGTAAGCTACCTGCCGCTTGAGCCAAAGCCCCCTGCATTGCGACCGGTTTCTTCTGCGCAGAATTCTTCTCTGTCATCCCAAATTACCTGAGATACAGGAGAAATAAGGATTTGTGCGATTCTATCTCCTCTTTTTATTTCGTATGGCTGATTACTTAGATTAATTAGACAAATTTTAACTTCACCTCGATAATCAGAGTCTATAGTACCCGGAGAATTTAAGACAGTGATTCCATGTTTTGCAGCAAGACCAGAACGTGGGCGGATTTGCCCCTCAAAACCGTTTGGTATTGCAATCACAATTCCAGTTGGAACAAGTAATCTTTCAAGTGGATTTAAAACAGCAGAATCATTCAATGCAGCATAAAGATCCATGCCAGCACTCTGCGTAGTTGCATAACATGGAAGAGACAAGTCTTCTCCGTGTGATAATCTTTTTATTTCTACTTTAATTTTACTTCTTTGCACTCCAATTTACCATCTATGAAGACTCAATTATAGCATGTAAATTGTATCTGCAAAAGTGATAAATGTAAATGATGTCATTCCAGCGCGTGACGCTAGGCCATAAAATTCCTTGACAAGTTCAGTGCTCCTTTTTTTGTCATCCCAGTGCCTCTATGATGTCATTCCAGTCTGGAATCTAGTCCTTATTATGCAGCCACTTGGTTGAAATTAAGTCTTCTGGATCCCAGTGTCTGGGCACTGGGATGACATCATAAGGGCGCTGGGATGACACCCTGACAACCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGATTCATTCGCGGTATGACGTAGATTGCTGTCATTCCAGTGTCAGCTACTTGAATGACACCCTCTTGGTATTCGTGTAGTTGCAAGCAGTATAGCTATAAATCACTCACAATCGATATGCTTGAATTACTCTCAGTAAATAAATCAAGCATAATGTTAGGTATTCTACCATCAACTATGTGAACAACTCCAGCACATTTCTCCGCCATTTTAACGTATGCCATAAGCCTTTCAATAAATTTTTCCCCTTTAATTTTCCCACAATCAATCGATGCATTTAAATTTTTAACAGATATCTTCCTGCCACCAATTTTATCTATTTCTTCATCTGTGTCACTCAAGATTATCATTTTAGATGCAGAAACTGCGATTGCGATTGCGCTTGCAGTGCTATCGGCATCAATATGATATGTTTCCCCATCTTTTCCATGACCAATTGGTGCAATAACTGGTATAAAATCTGATTCTTCAATAAAAAATAATATATCAGGATTGATTTCAGTGGGTCTACCGATGAACCCCATGTCTAATATCTTTTCGATATTATTTGATCTATCTTCTCTAAGCGTAGCGGTTATTTTTTCGGCTTTAATTAAGTTACCATCTTTTCCACATAATCCAATAGCTGAACCACCAGCAGAATTTATATGCTGAACAATTTTTTTATTAACTGAACCACACAGTGCCATTTCAATGATTTTCATAGTGTCTTTGTCTGTAAGTCTGATACCATTCACAAACTTACTGTTCATATCCAGCATTTTTAACACCGAGTTAATTTCATATTCTCCTTCATGAATTATTACCGGATTTATACCAAGCTGCTTCAACAAGACAACATTATGCACAAAAGTATTAAATAGTGTTTCATTTAAGATTATTGTACCACCGCATTTAATGACAAAAGTCTCGCCTACAAAGCTAGGTATGTTAGATAGCACTTCAAGTAATATTTCTGCTTTTTGTTCAAATGATACCTCACCCTTTAAAAATTCACTACTCTTCATTTTTTTATCTTGTAAACTTGAAAAACTCATCTCTTACCTTGGTTATTTTATGCTTAACACGGATGCTCATTTGATGAATTGACACATTCTCATTATTAATCCATTTTTGAATATCTTCTATAACAGCACCTAAGCTTTTTTGACTTACTTTATCTATTTTTGTTAGCACAATGTTAAAGTTAATGTTATTATATATTAACCAATAAATGAAGTCTTTGTCTATTTCTTTTAATCCTACCTTGCTATCTATCAACACAAACACTCTTCTTAGATTTTCTCTTTGAATTAGATAATACTCAATTAAGTTTAAATATTGTATAATTTCCTCCTTGCCTGCATGAGAGTAGCCATACCCTGGTAGATCAACAAGTCTGAACTTATCATCGTACATAGAGTAAAAATTTATTTGTCTAGTGCATCCAGGTTTAGAGGAAACTCTGGCAGCTTTTTTGCTGTTTATCAGTAAGTTGATCAGACTGGATTTTCCTACATTTGATCTACCAGCAAACGCAATCTCTGGAGCCGACTCATTTGGTAATGATTTTATGTCCGAAGCTCCAAATATGAAATTGCAGTTTGATGTTATCTGTTTTGCCATTATATTCAACTAGAAGGTAGTAGGTATATTATAGTGTTATTGCTTGATATAAGAAATTTTTTATTTCAGTATATATTACTTAGCTAGATCTGTGCTATATGGATATGGAAAATAATTTACAAGACTTAAAGAAAAAATTTAATGATATAGAGAGGAATTTGGAAAATCCTACCAATTTAAGTCAAAAAGAATTCATTACCCTTTCAAAGGAATACTCTGAGCTCAGGCCAATAATCAAGATAATTGATGAATATAACACGCTGAAAGAGGAAATTTCAGACTTAGAAGAAATAATGAAAGATGAAAACAGCGAAGGTGATATAAAAGAGTTAGCAAAAGAAGAATTCTTCGAAAAGCACAAGGTATTATTACCAAAAATAAAAGCAAAATTAAAGTTAGCATTATTGCCCAAAGATGAAGATGACTCAAGGAATGCAATATTAGAAATTAGAGCAGGCACAGGCGGAGAAGAAGCAGCATTATTTGCAGCAATGTTATTTCGTATGTATCAAAAATATGCAGAAAGAAGAAATTGGAAGTTCGAGCCAATAAGCATTTCTAATACAGGTATAGGTGGCTATAAGGAAGCTTCTGCACTCATTAATGGAACAGAAGTTTTTGCAAGGTTGAAATTTGAATCAGGGGTGCACAGAGTACAGAGAGTGCCAGAAACTGAATCTTCAGGAAGGTTGCATACCTCTGCCGCTA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112 | Leptospira_phage(21.43%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1032635 : 1060393
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP037426|1032635:1060393|DBSCAN-SWA 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31 | Leptospira_phage(28.57%) | tRNA,terminase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1065864 : 1123804
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP037426|1065864:1123804|DBSCAN-SWA 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MISSLLFNFFLILWEVFYTFITLPVIFFSECVITIFLVCSVRVVLFMLRLLCGIKYEVRGMENIPKQPFIIASKHQSPFETFIFILLFRKAVFILKRELKWIPFIGLHLIALKMIFINRSDGISSIRHIIKLAKMRIKENRSIIIFPEGTRTTINQNIKYQPGIAALYSVLSVPVLPVALNTGLFWPKSILSLRKNPGKAVIEILPPIYPGLNKNEFLQSLEKIIEERSSRLTIGKTDIAN |
56 | Wolbachia_phage(28.57%) | integrase,tRNA,transposase | attL 1071110:1071169|attR 1091494:1092415 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1140481 : 1182939
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP037426|1140481:1182939|DBSCAN-SWA 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MAYSVDLRERAVSMIEKGKSKVEVAELLEIGIATLYRWLRKKAAGESLRPSKNGSFIRKIDPKILEEYVKKNPDHTLAEMKQNLGFGINSIWYRLKQLRITLKKSYTISRAQSRR >NZ_CP037426|1140481:1182939|1163241_1163808_+|WP_155969363.1|DBSCAN-SWA MISLFYKLRLLNYILGSLKDIIVKLFLFTMYLYTFSIVLMFLSNGFWYAVEFCSFKNAFYRLFQYCKWYYENREDLGYGISIRILVAFLTPHFLYKLLLGTGWKSFLKEKIIQILNTRRKKGSEFSNTSGSSYSDKNNYSNNSGNNERQAQDAKRKVNMIKQLLIKDIEATIDRRLNYIFFGKRSKPH |
39 | Leptospira_phage(42.86%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1202877 : 1314981
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP037426|1202877:1314981|DBSCAN-SWA 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113 | Leptospira_phage(22.73%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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