Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046528 | Lactobacillus acetotolerans strain CN247 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas1,cas2,csn2,DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,DinG,csa3 | 0 | 12 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046528_1 | 208827-209478 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046528_1
|
9 spacers
spacers of NZ_CP046528_1
>1.1|208863|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACACCTGCTAGAACTATTAATCCTAGT >1.2|208929|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTCCACACCTAACCCGTGCCAGTTATCA >1.3|208995|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTCACTTGGGTCTTTAGTCTTCTGCCCA >1.4|209061|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGCTGTCTAAGCCTTGTTGATAGGCTGCTT >1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAACGAGGCTTATTTAGAAGCCGAGGATC >1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGCTGCAAAAGCTGATACCTATGAAGG >1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCATACCTTTATTACGGAAGAATTTATAC >1.8|209325|52|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT TAAGCACTAAGATTACCTGTTGTACATCATGTTTTAGATGATTGTTAGATCA >1.9|209413|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT CTCGAATAAATTGTCAAATTGTGTAGTAGT |
cas9,cas1,cas2,csn2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046528_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046528_1 >merge|NZ_CP046528|1|208827-209478|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGCTTTACACCTGCTAGAACTATTAATCCTAGTGTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGCCCGTCCACACCTAACCCGTGCCAGTTATCAGTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGCATCTCACTTGGGTCTTTAGTCTTCTGCCCAGTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGCGGCTGTCTAAGCCTTGTTGATAGGCTGCTTGTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGCAAAACGAGGCTTATTTAGAAGCCGAGGATCGTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGCAAAAGCTGCAAAAGCTGATACCTATGAAGGGTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGCTCCATACCTTTATTACGGAAGAATTTATACGTTTTAGATTTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGCTAAGCACTAAGATTACCTGTTGTACATCATGTTTTAGATGATTGTTAGATCAGTTTTAGATGTTTGTTAAAACAATGGAGTTTAAAACCTCGAATAAATTGTCAAATTGTGTAGTAGTGTTTTAGATGTCCGCTAAATCGGTGGAGGTTCAGAT >NZ_CP046528|1|1|208827-209324|PILER-CR GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TTTACACCTGCTAGAACTATTAATCCTAGT GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC CCGTCCACACCTAACCCGTGCCAGTTATCA GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC ATCTCACTTGGGTCTTTAGTCTTCTGCCCA GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC GGCTGTCTAAGCCTTGTTGATAGGCTGCTT GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC AAAACGAGGCTTATTTAGAAGCCGAGGATC GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC AAAAGCTGCAAAAGCTGATACCTATGAAGG GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TCCATACCTTTATTACGGAAGAATTTATAC GTTTTAGATTTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC >NZ_CP046528|1|1|208827-209478|CRISPRCasFinder GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TTTACACCTGCTAGAACTATTAATCCTAGT GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC CCGTCCACACCTAACCCGTGCCAGTTATCA GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC ATCTCACTTGGGTCTTTAGTCTTCTGCCCA GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC GGCTGTCTAAGCCTTGTTGATAGGCTGCTT GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC AAAACGAGGCTTATTTAGAAGCCGAGGATC GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC AAAAGCTGCAAAAGCTGATACCTATGAAGG GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TCCATACCTTTATTACGGAAGAATTTATAC GTTTTAGATTTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TAAGCACTAAGATTACCTGTTGTACATCATGTTTTAGATGATTGTTAGATCA GTTTTAGATGTTTGTTAAAACAATGGAGTTTAAAAC CTCGAATAAATTGTCAAATTGTGTAGTAGT GTTTTAGATGTCCGCTAAATCGGTGGAGGTTCAGAT >NZ_CP046528|1|1|208827-209478|CRT GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TTTACACCTGCTAGAACTATTAATCCTAGT GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC CCGTCCACACCTAACCCGTGCCAGTTATCA GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC ATCTCACTTGGGTCTTTAGTCTTCTGCCCA GTTTTAGATGTCTGCTAAAACGATGAGGTTTAAAGC GGCTGTCTAAGCCTTGTTGATAGGCTGCTT GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC AAAACGAGGCTTATTTAGAAGCCGAGGATC GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC AAAAGCTGCAAAAGCTGATACCTATGAAGG GTTTTAGATGTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TCCATACCTTTATTACGGAAGAATTTATAC GTTTTAGATTTCTGTTAAAACGATGAGGTTTAAAGC TAAGCACTAAGATTACCTGTTGTACATCATGTTTTAGATGATTGTTAGATCA GTTTTAGATGTTTGTTAAAACAATGGAGTTTAAAAC CTCGAATAAATTGTCAAATTGTGTAGTAGT GTTTTAGATGTCCGCTAAATCGGTGGAGGTTCAGAT
>NZ_CP046528.1|WP_063507987.1|207688_208597_+|L-lactate-dehydrogenase MANKIGIIGDGHVGCTVAHQLIISGLVDDLVLIDMNKGKVNADAIDFEDSMANLPYHVNITVNDYSALKDADIVVSTLGKISLETKGDRFAELKYNKEQLKPITDSIKKSGFNGILIVISNPVDAITSLYQQLTGLPKQHVIGTGTLLDTARMQKVVAKKFDVDPRSVSGFNLGEHGNSQFTAWSTVKVLEQPITKLAKDKSWKLEDLNDEIKFGGQQVFKGKHYTNYGVAAAAVRLIQSILNDSRTELPVSSYQAKYGTYMSYPSIVGRDGIVQSIDLQLTDEEEKQLKASAETIKAKSEA >NZ_CP046528.1|WP_156482155.1|206462_207494_-|acyltransferase-family-protein MLQSILALILKISLTHNEQTGIGFTYNLVKFTAPAFIFGILYTTIRTHPHATLKDYPTYMRGQWSALFVPTICWTSIYLLLMPQLQQHNHFHNFINFCWQFINGNAAPHMWYNTMMLQFIILMPIFWYISRYVKNSNRRCWLIITVSTVIYFLWIDLYDKQVFHGPKMRTWYLFDRLFLSFIIYAVLGTLAWNFHKQLGHFLLKFWWSLIIAWITVYYLINHELFSFGFPINLYNAPYYKPSMTVYCLTIIGLIAALAFYQIKKQQIRSLRLFHWLAIYAYKAFLSHIFWLELAWLIFGKQLLKDSNTLVTIIVLYILTWLLSFASAYDLHMIWSKIKNRLLA >NZ_CP046528.1|WP_063507989.1|205978_206251_+|hypothetical-protein MKNEDDLSPGLGLGITFIIIGCIIPWLFSNNFMLLISTLIVAIGIGGTGIEIAKLTQKNEFQYLSVGLAFILISIYFLTIINNSWGEPYS >NZ_CP046528.1|WP_156661157.1|204572_205751_-|IS256-family-transposase MNDFTKNITQALFNQDKINDLLRHEIQQAVNDLLESELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKIDTQFGSIEVQVPRDRNGMFHQHTLPDYKQHTDLLEDMVIKLYSKGVTTREIANLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYIPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTELLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALMQTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVEDREAIMNEFKQVHQQSNKQEGITVLHSFYSKWQKAYQHVIQNVKDIEADLLVFYNYPKQIRSSIYSTNMIESFNNVVKRKAKPKAEFPNEQSLDTFIGIQAMSYNDRYFKRIHKGFGQVQDTLESYFE >NZ_CP046528.1|WP_156171254.1|204380_204524_+|hypothetical-protein MKEKDKNNLKLKFYNNPGIGIDFAILNLYTSFIVLSLAADAFTETVK >NZ_CP046528.1|WP_054682202.1|202897_204181_-|GTPase-HflX MIDNEPHKTKAYIAGVNLNDPNFDYYMTELANLTEANNMEVVGQSRQNTEQIVAGTYFGLGKINEIKSMAHGLKAKVLVLNDELSPVQIRNLEKLTKLRVIDRTELILEIFANRAKTKQAKLQVQLARLQYELPRLHPSENSLDQQRGNGGSTGGGFANRGAGESKLEMNRRTIDKQISAIKKELKKVANQEDIKSKRRNKKQIPKVALVGYTNAGKSTTMNGLLKEFTDESSDKEVFVKNMLFATLDTSVRRIDLNKNFSFILSDTVGFISKLPHNLVESFKATLQEAKDADLLINVVDASDPNMIQMIRTTQSVLREIGIKNIPMITAYNKADKTDRNYPQIEGNDILYSATDEKSIKLLAKLITKRVFANYKKFNLLLPLSDGKTLAYLHEHAQVMKESYENDGVHAEVRLAPENQERFKKYLV >NZ_CP046528.1|WP_063507264.1|201789_202881_-|CAP-domain-containing-protein MKIKKALIAITTSVLLATSIAPTFSVNQSVQAANYSKSEAAQVRKFQTEYKQLNQQTYNQNNLYVKAPNFADPFNPGQLDADYIQTSMDYVNYYRALAGLPNEANNKTINDDAQIGAGVLAAVNAKTSLRAHGLLGYKKPKYISNKDWNTAESATLGNINFLESDDGATAGEIVTDLLQDDNNIAGIGDTGHRALLLSARATRMGIGAAYGRSNGKFYSVQNGVFADDILRKPVKNTVTFPSNGVSPYELLDSDTPWSVYFANQKINRTPKVYITDMTTNKKAQATRVHNFGSDYYGDGYSAALTFMPGKLKLVNTHKYKVQIKGIYTYTFRLFRQNSTLKTSKKKVVKHAKKTANKKHSNHK >NZ_CP046528.1|WP_156661155.1|199604_200519_+|hydrolase MKHKFFKIGAAAALTLTGVSVASALKPVTAASYKTPLKRVEVNYLPGKSIQIWTNYQGGQPIGYRAKNNSKWNVAKIAVDKKGNLWYRVGTNEWIQARYTIEIKKLAPKKTSDKVIKMPKKAKKQKKVNLSNLANQIKKTVNSKTTKTEIPAAKPTATQNTANNTATLPKAPVSQAASLPASTSAQAAAVVNLAEQQVGKGYGWGANGPDNFDCSSLVQYVYQQAAGINLPRTTYDQVKVGEDVPLDQLQPGDLLFWGSTTAPYHVAIYVGNNQYVNAATPEQGVILQTISSYYYPTCARRVLQ >NZ_CP046528.1|WP_063507262.1|198686_199421_+|C40-family-peptidase MDYKHSLIKFTAATAIAITGISAVGAINTNSTTSHVEAATTRVKVNYIPGYGVNIWSNYNHPHFTGKRARHGATYNVISKATDKKGNLWYQIDQGQWIQAQYTVSANKAVKKDKKAKKHSSKQASATAASVVSLAESELGKPYVWGATGPSSFDCSGLTSYVYNKAADKNISRTTYSQVKQGKTVSMDDLQPGDLLFWGSASAPYHVGIYVGNNQYVHAATPSQGVIKRKLSSYFYPSVAKRIL >NZ_CP046528.1|WP_060459757.1|197956_198496_+|AAA-family-ATPase MQKIILIAGPSGAGKTTISEYLTKKFGIPRVITHTTRPMRPGEVANKSYYFENNASFSKLHFFEHVRYGSYKYGSSKEALARAWKKNDIVSLIVNIEGAASYIKQLGKQVFFLYVTTSTRTELKERLLKRGDDPKKIAERLSGNELNLLPDNLKRDAHIILNDNWDKTKKKLNAIIAGL >NZ_CP046528.1|WP_063507970.1|209622_213831_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKVKEDYIIGLDIGTNSCGWVATDKKNNILHLQNKTAIGSHLFEEGHSAADRRLFRGTRRRLNRRKWRLKFLEEIFDPYISKIDPYFFARMKESGLSPKDSRKKARAIIFPTPKEDSDFYYNYPTIYHLRNALMTKNKKFDLREIYLAIHHIVKYRGNFLQNAPVKSFDVSANDSKSTKIDVKEVLQNLNDYFSESSTEDQVEFNIKNSPKIESIIKNKTIRKLDKDKQIGKLLFISSKNKDVDKQNKNIAKQVANAILGYKTQFETIFSKEIDKNDKTTWEFKLSDADADDKLEILLPELDENQQTIIDQIRQLFNSITLSGIVDEGKTLSASMIRKYNDHKKDLVLLKDVIISQDDEKKAKKLALAYDLYVNNRHGKLLEAKKEFKVKGVLSKDDFYKIIKNNLDDSNTAKEILHEIELDSFMSKQRTNQNGVIPYQLHQVELDRIIKKQSKYYSFLAEENPIKEHQKQAPYKLDELVRFRVPYYVGPLITATDQKKSSGKNFAWMIRKAQGQITPWNFDRKVNRMDTANKFIKRMTTKDTYLLGEDVLPANSLLYQKFTVLNELNNIRINDHRISVNVKQDVYENLFKKYKTISLDKLSNYLKENYNLPSVEINGLSDKSNNPKFNSSLTTYYQLKHLDVLSDKIDDSKYRSDLEHIIEWSTIFEDKSIYIEKLKTVNWLTSEQIKALSNLQRYQGWGRLSRKLLTGIHDKHGRTIMKKLWYSQKNFMQIVNEPDFKAAIEKENGSVVQTTSMEDILADAYTSPANKKAVRQVIKVTDDIVKAASGKVPVQFAIEFARETEKNPKLSQVRGSKLRQVYENIFKKTATKLVDVGLKDQLNGAIESRKLVRDKYFLYFMQGGRDAYTGEKIKIDKIDSKYQIDHILPQAFIKDDSFNNRVLTLATKNNEKSDKVPFEYGYNQADKGRLGITIRQMWDKWSEWGLISKRKYNNLILDPNKINKYQKAGFINRQLVETSQIIRLVATILQAKYPKTEIIVVKAGYNHALRDRLQLYKSREVNDYHHAIDAYLTTICGNFLYQVYPDLRPFFVYGEFKKFSSNPDLEKQAFKKYKTFNFIWPLLKKKDAPEKIYQFKNGPLVFNKHKDIFDKLRHAYSFKYMPVSRETTTKNQEMFKMTLYPRADRDTKKSRKLIPKAKGMPTVIYGGYSSNSDAYMALVKIKTSKSFIYKIFGVPMRAISKLKLAKRQGKYNQVLKKILTPAIMLDKNGKPKRGVKKFRILKGKVPYRQVVLDGKKKFMIGSTTYIYNAKELTLSSEAMRIITNNLNTNEDRDKSLIKVYDEILEKVDKYLPLYDIYKSREKLHKGREKFINLSVEEKKNIINQILNGLHDNLVMGNLKNIGFNTPFGQMQMQSGITLTPNAKLIYQSPTGLFEKRVKISDL >NZ_CP046528.1|WP_063507971.1|214057_214966_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLTYSMNMMIVQTRDGINQIPINDINLLLISTSQAVITSALISKLSENQTKVIFVDDKYQPVSETVDYYPGSRDLKKMKCQFTWDAKRKQILWTKIVDLKLKNQIAVLKNYKLDYQKVQNELDQLEVDDITNREAAAARKYFMILFGKNFVRRNSSVINAALDYGYVILLSSFDREIAVNGYLSYIGIHHHSVENQFNLGSDLMEPFRPFVDYWIKAHEKITEFSPDIKYGLVELLSLEINFNGRKTLLTNAISDYVRDCLRFLSDEIDDFDMEMNITNEVPNNALNDNV >NZ_CP046528.1|WP_063507972.1|214943_215249_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVETADERGEYRQFRKKLINEGFLMIQYSVYERVCVTRQTAKFLENRVKKFLPKGGVVQSLMVTEKQYNDMHFLVGNPVDDVRNTSDRTVIL >NZ_CP046528.1|WP_063507973.1|215245_215914_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MILSYLTHKKWQFDSAGMKILATKSPVAYRDLVQGFQGKKQTIICSSDEYETLDINKVFDFVGDPLLSGDIMTKYMCHIIKSYVTNLDEKNRNKILTAFHNLESTLQDSLLLEDLPLEINFDEDLKKLLKMVGLHLDHKMLLEPYDIIEMVLKVHEICNLKIVPVICNVANYLDSQQLNELSKLVKQMNLVLILIEFTDQNFKFIPKNAEFYYIDEDLVDWY >NZ_CP046528.1|WP_063507695.1|218326_219598_+|hypothetical-protein MTKKKIRRTAKWKFWLISLLVIIILFGIFYAWGSVYYQKERQIDRITSSLSNPNANLAEYVTPSDPDIDVTNKSLKPLQSYFKENPRAKKQLVHDLKNGQTSNQITLINSGSHFLLFPKYTIQVQVYCPQIETNHPDSKLQVNGKNLGVMNGSGQNFYQDLGLVFPGRYHIVVNTKVGKRPLTANSVVNIWSDKTVDMTIRTATFQVRSVPKGNIFINDKKVATLDSHGQYVFKNYRLAKNMELYIQSTYKGKKIKSEKVKDIPQSIDKDFSNTDDGINDYGNAPDYQGNQEKDVYQDVDGDYIVNPNWPGLINDKAAAKLIGTNFKKPNKNDFVKGKKNPSFKKLKQQVRKLKFSLPIRKVKIAVDVYQILPAGDNYGDVSYKVVYKYKKNGRNAKKVVSYQHAIFHDVDNKQLIKTLGQRK >NZ_CP046528.1|WP_063507694.1|220498_222298_+|ABC-transporter-permease MIWKLSFTGIKSRLKDYTVLFSGLVVASMIFYMFLSLAINPSFMSKDVNAPSSYLSFIFGFGIVLLAIITLVYLIYANSFLLSMRQHDYGMFMMLGAKSSRIGLLIFCETLITGVLATVLGIIVGFGLTALVAKLLIHNLGLAITHFQVILPNAIIWTLVFFILIFFLAALRNVHKLVHSKVIDLLHESQKPIKISNHPVWRSVEAVLGILLLAAGYYVMGWKNVFIVIPMALVTIVLGSYFTFDAFFTAIIDVLLKNKGFAYHGIRIFTLGQLKFRLRDYTRILTVISLLFALALGAITVGLNFNTIKDQVKGSIYYDAEVVSNSSNVQKNVDKLSIKTKHTYHYKETSHDLYFDKAEFKKNPVKNVRFELKNNLPTYKNETLNTGQISNPGTHANSSFGELVPNGIPKKIHLLPTKEAKNIKGQSKFVTFLSVNNFDKDYPVLLKIEKKQMQENPSLTDTLSGTKPLAYQTMLGLTSGFEFMGFFLGLAFLTMLASTLMFKVLSGAASDKMRYQMLYKIGAREKVLRHSISSEIGTLFVLPGILGIVDVLFGLRMFKLLLPHPYAGLWIPFTIFIILYFFYYVLTVKLYERIVLARK >NZ_CP046528.1|WP_063507693.1|222347_222995_-|histidine-phosphatase-family-protein MKRIYIVRHGQTYINRYNKMQGWCDTPLTQEGIEGAEKVGEALKNVPFDIALSSDLKRACDTCDIIIKHNTNKDELQHIATPFFREQFYGYFEGMDCGVAWRMIGGPHGYSNHYDLLKHEPIDKVKDWIKAADPYHQAENAKEYWARVNKGFKMISEMDGAENILLVTHGFTIRSIANHYSDSIDISNGPRNASITTMTMTDKKMKITSYNKMHL >NZ_CP046528.1|WP_063507696.1|223022_223715_-|matrixin-family-metalloprotease MKKFLRFLRNLIFVVVVVFAVWDYQNNDNVRNATNDSLTALNDRISQMLSTGNLNPPKLGNSDSNTVKNAVKPETTDSNAQKRRWPSPNATVYVNIKKDLQLRSASIDAIKAWNKTQAFTFQETNNKKKAQVIISVTNDSSTNAAGETATSYNPVTGHLINAKVQLNKFYLQNGWYGYSYNRIVNTAEHELGHAIGLNHNKGVSVMYPQGSVYTIQPQDITNVKKLYNEK >NZ_CP046528.1|WP_063507692.1|223866_226161_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MTKVTDEKQYEQKHLDHILELIKTREKNLEKSIKSVRGEARNLNSHFFDDVKLDYDGYSTSMETALSIHQQQQLLSEREHDWQHSAKQLNTVKRLEKHPYFARVDFKEGDEEPETIYIGLGSFADENNHFLIYDWRAPISSIYYDGKLGKVSYNSPDGEITVDMTKKRQFMIKDGKIVNMFDTNESIGDQMLLEVLSEKSSTQMKSIVTTIQREQNKIIRNTSADLLFVQGAAGSGKTSAILQRIAYLLYRYRGNLTSSDVIMFSPNQLFNDYIENVLPEMGEQNMVQMTYWQFVARRLPGMKVENLFNQFEDKAADTNISKLKDSTEFFKLLTRYAKHLNNKGMIFKNIYFRDPKKSYFAKEKIKDIYYSFNPDYKLHNRIDATREKLIKMLNRRINSEIKKPWVSQTIQSLSKEQLNDLYDKPDQEFSSEAKEEQFLGRKIVVKKLSKVYKRIKHNHFINTRAQYLSFLRAIPKMIDLSKWHISQDDWAKHVNSVKESFKKHYIHMNDVSAYLYLYDLITGRYVDYEMRYAFIDEIQDYTPFQLSYLKYNFPRAKFTMLGDLNQAIFTKDESKDLLKQISGLFDPKKTEVVQLTKSYRSTKQLTDFTKQILRQGEKIEAFNREGPKPVIWGRKNDDEAISVLEDILKDNDKNKQTTAIITKDLSSAKYVDKKLKADGVKESLIATANQRLVPGTLVIPSYLAKGLEFDAVVMWGASKANYEQLDETQLVYTITSRAMYKLDIIYTGEKSPLLNVNADTYEEK >NZ_CP046528.1|WP_063507691.1|226595_227243_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MTLKYIEEILPSLINGTWMTIKIFFWTLCLALPIGIIASLCEMSHIKIVKWLVKFYVLIMRGTPLLLQLIFVFYGLPILGVVFPRYQAALFTFVLNYAAYFAEIFRGGMQSIDKGQFEAAQVLRLDRWQTMTKIIIPQVIKIVLPSIGNEVINLVKDSSLVYVIGLGDLLRAGNVAMARDVTLVPLVLVAIIYLILISACSFVQKKLEEYFSYYK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046528_2 | 215947-217038 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046528_2
|
16 spacers
spacers of NZ_CP046528_2
>2.1|215983|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAGCACAATGTTTATACACGAAAAGAA >2.2|216049|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTGCCTGTGAGAGTAAGACAGAGAGAT >2.3|216115|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCAGCAACTCGTAAAGCAAATATGCTTT >2.4|216181|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAATTGAAGAGCATTATGAATCTGAGCTG >2.5|216247|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTTTCCGCTTGTGTTTTGTCATCTGGTG >2.6|216313|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATCTCATTTGAACGCCATCAACTTTGA >2.7|216379|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTCCACATTTAAACCATGCCAATTATCA >2.8|216445|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTTATCAAAAAAGGGAGGACGTACCCTA >2.9|216511|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACGCAGCACATCTTTTATAAACCCGTCAG >2.10|216577|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT TAACTTGACTGCCTTCAAAATCGAACATTT >2.11|216643|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGCTAGCTGCTAAAAACATGGGTACCGC >2.12|216709|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCTAGAAGGTGAAGCATGAAACTATGGA >2.13|216775|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAATCCAGGCATGAAGATGTATCCACACG >2.14|216841|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCAAGCACCTACTTTCATACCATGTGTAG >2.15|216907|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTCTGGAGTTTCTCTAACGTATCCACGTT >2.16|216973|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT TTCCAAAAGAGCCAGTACACGTGCCAACCG |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046528_2
The CRISPR arrays of NZ_CP046528_2 >merge|NZ_CP046528|2|215947-217038|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACATTAAGCACAATGTTTATACACGAAAAGAAGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACTAATTGCCTGTGAGAGTAAGACAGAGAGATGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACATGCAGCAACTCGTAAAGCAAATATGCTTTGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACCTAATTGAAGAGCATTATGAATCTGAGCTGGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACCCGTTTCCGCTTGTGTTTTGTCATCTGGTGGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACAATATCTCATTTGAACGCCATCAACTTTGAGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACCCGTCCACATTTAAACCATGCCAATTATCAGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACAACTTATCAAAAAAGGGAGGACGTACCCTAGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACCACGCAGCACATCTTTTATAAACCCGTCAGGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACTAACTTGACTGCCTTCAAAATCGAACATTTGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACTAAGCTAGCTGCTAAAAACATGGGTACCGCGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACATTCTAGAAGGTGAAGCATGAAACTATGGAGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACCTAATCCAGGCATGAAGATGTATCCACACGGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACATCAAGCACCTACTTTCATACCATGTGTAGGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACGTTCTGGAGTTTCTCTAACGTATCCACGTTGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACTTCCAAAAGAGCCAGTACACGTGCCAACCGGTTTTAGATGTCTGTTAGAACAATTCGATTATGGCG >NZ_CP046528|2|2|215947-216576|PILER-CR GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTAAGCACAATGTTTATACACGAAAAGAA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAATTGCCTGTGAGAGTAAGACAGAGAGAT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATGCAGCAACTCGTAAAGCAAATATGCTTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATTGAAGAGCATTATGAATCTGAGCTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTTTCCGCTTGTGTTTTGTCATCTGGTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AATATCTCATTTGAACGCCATCAACTTTGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTCCACATTTAAACCATGCCAATTATCA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AACTTATCAAAAAAGGGAGGACGTACCCTA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CACGCAGCACATCTTTTATAAACCCGTCAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACTAACTTGACTGCCTTCAAAATCGAACATTTGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAAGCTAGCTGCTAAAAACATGGGTACCGC GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTCTAGAAGGTGAAGCATGAAACTATGGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATCCAGGCATGAAGATGTATCCACACG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATCAAGCACCTACTTTCATACCATGTGTAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC GTTCTGGAGTTTCTCTAACGTATCCACGTT >NZ_CP046528|2|2|215947-217038|CRISPRCasFinder GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTAAGCACAATGTTTATACACGAAAAGAA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAATTGCCTGTGAGAGTAAGACAGAGAGAT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATGCAGCAACTCGTAAAGCAAATATGCTTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATTGAAGAGCATTATGAATCTGAGCTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTTTCCGCTTGTGTTTTGTCATCTGGTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AATATCTCATTTGAACGCCATCAACTTTGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTCCACATTTAAACCATGCCAATTATCA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AACTTATCAAAAAAGGGAGGACGTACCCTA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CACGCAGCACATCTTTTATAAACCCGTCAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAACTTGACTGCCTTCAAAATCGAACATTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAAGCTAGCTGCTAAAAACATGGGTACCGC GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTCTAGAAGGTGAAGCATGAAACTATGGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATCCAGGCATGAAGATGTATCCACACG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATCAAGCACCTACTTTCATACCATGTGTAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC GTTCTGGAGTTTCTCTAACGTATCCACGTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TTCCAAAAGAGCCAGTACACGTGCCAACCG GTTTTAGATGTCTGTTAGAACAATTCGATTATGGCG >NZ_CP046528|2|2|215947-217038|CRT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTAAGCACAATGTTTATACACGAAAAGAA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAATTGCCTGTGAGAGTAAGACAGAGAGAT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATGCAGCAACTCGTAAAGCAAATATGCTTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATTGAAGAGCATTATGAATCTGAGCTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTTTCCGCTTGTGTTTTGTCATCTGGTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AATATCTCATTTGAACGCCATCAACTTTGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTCCACATTTAAACCATGCCAATTATCA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AACTTATCAAAAAAGGGAGGACGTACCCTA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CACGCAGCACATCTTTTATAAACCCGTCAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAACTTGACTGCCTTCAAAATCGAACATTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAAGCTAGCTGCTAAAAACATGGGTACCGC GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTCTAGAAGGTGAAGCATGAAACTATGGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATCCAGGCATGAAGATGTATCCACACG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATCAAGCACCTACTTTCATACCATGTGTAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC GTTCTGGAGTTTCTCTAACGTATCCACGTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TTCCAAAAGAGCCAGTACACGTGCCAACCG GTTTTAGATGTCTGTTAGAACAATTCGATTATGGCG >NZ_CP046528|2|3|216607-216972|PILER-CR ATTAAGCACAATGTTTATACACGAAAAGAA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAATTGCCTGTGAGAGTAAGACAGAGAGAT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATGCAGCAACTCGTAAAGCAAATATGCTTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATTGAAGAGCATTATGAATCTGAGCTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTTTCCGCTTGTGTTTTGTCATCTGGTG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AATATCTCATTTGAACGCCATCAACTTTGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CCGTCCACATTTAAACCATGCCAATTATCA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC AACTTATCAAAAAAGGGAGGACGTACCCTA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CACGCAGCACATCTTTTATAAACCCGTCAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAACTAACTTGACTGCCTTCAAAATCGAACATTTGTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC TAAGCTAGCTGCTAAAAACATGGGTACCGC GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATTCTAGAAGGTGAAGCATGAAACTATGGA GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC CTAATCCAGGCATGAAGATGTATCCACACG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC ATCAAGCACCTACTTTCATACCATGTGTAG GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC GTTCTGGAGTTTCTCTAACGTATCCACGTT GTTTTAGATGTCTGTTAGATCAATGAGGTTTAGAAC
>NZ_CP046528.1|WP_063507973.1|215245_215914_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MILSYLTHKKWQFDSAGMKILATKSPVAYRDLVQGFQGKKQTIICSSDEYETLDINKVFDFVGDPLLSGDIMTKYMCHIIKSYVTNLDEKNRNKILTAFHNLESTLQDSLLLEDLPLEINFDEDLKKLLKMVGLHLDHKMLLEPYDIIEMVLKVHEICNLKIVPVICNVANYLDSQQLNELSKLVKQMNLVLILIEFTDQNFKFIPKNAEFYYIDEDLVDWY >NZ_CP046528.1|WP_063507972.1|214943_215249_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVETADERGEYRQFRKKLINEGFLMIQYSVYERVCVTRQTAKFLENRVKKFLPKGGVVQSLMVTEKQYNDMHFLVGNPVDDVRNTSDRTVIL >NZ_CP046528.1|WP_063507971.1|214057_214966_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLTYSMNMMIVQTRDGINQIPINDINLLLISTSQAVITSALISKLSENQTKVIFVDDKYQPVSETVDYYPGSRDLKKMKCQFTWDAKRKQILWTKIVDLKLKNQIAVLKNYKLDYQKVQNELDQLEVDDITNREAAAARKYFMILFGKNFVRRNSSVINAALDYGYVILLSSFDREIAVNGYLSYIGIHHHSVENQFNLGSDLMEPFRPFVDYWIKAHEKITEFSPDIKYGLVELLSLEINFNGRKTLLTNAISDYVRDCLRFLSDEIDDFDMEMNITNEVPNNALNDNV >NZ_CP046528.1|WP_063507970.1|209622_213831_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKVKEDYIIGLDIGTNSCGWVATDKKNNILHLQNKTAIGSHLFEEGHSAADRRLFRGTRRRLNRRKWRLKFLEEIFDPYISKIDPYFFARMKESGLSPKDSRKKARAIIFPTPKEDSDFYYNYPTIYHLRNALMTKNKKFDLREIYLAIHHIVKYRGNFLQNAPVKSFDVSANDSKSTKIDVKEVLQNLNDYFSESSTEDQVEFNIKNSPKIESIIKNKTIRKLDKDKQIGKLLFISSKNKDVDKQNKNIAKQVANAILGYKTQFETIFSKEIDKNDKTTWEFKLSDADADDKLEILLPELDENQQTIIDQIRQLFNSITLSGIVDEGKTLSASMIRKYNDHKKDLVLLKDVIISQDDEKKAKKLALAYDLYVNNRHGKLLEAKKEFKVKGVLSKDDFYKIIKNNLDDSNTAKEILHEIELDSFMSKQRTNQNGVIPYQLHQVELDRIIKKQSKYYSFLAEENPIKEHQKQAPYKLDELVRFRVPYYVGPLITATDQKKSSGKNFAWMIRKAQGQITPWNFDRKVNRMDTANKFIKRMTTKDTYLLGEDVLPANSLLYQKFTVLNELNNIRINDHRISVNVKQDVYENLFKKYKTISLDKLSNYLKENYNLPSVEINGLSDKSNNPKFNSSLTTYYQLKHLDVLSDKIDDSKYRSDLEHIIEWSTIFEDKSIYIEKLKTVNWLTSEQIKALSNLQRYQGWGRLSRKLLTGIHDKHGRTIMKKLWYSQKNFMQIVNEPDFKAAIEKENGSVVQTTSMEDILADAYTSPANKKAVRQVIKVTDDIVKAASGKVPVQFAIEFARETEKNPKLSQVRGSKLRQVYENIFKKTATKLVDVGLKDQLNGAIESRKLVRDKYFLYFMQGGRDAYTGEKIKIDKIDSKYQIDHILPQAFIKDDSFNNRVLTLATKNNEKSDKVPFEYGYNQADKGRLGITIRQMWDKWSEWGLISKRKYNNLILDPNKINKYQKAGFINRQLVETSQIIRLVATILQAKYPKTEIIVVKAGYNHALRDRLQLYKSREVNDYHHAIDAYLTTICGNFLYQVYPDLRPFFVYGEFKKFSSNPDLEKQAFKKYKTFNFIWPLLKKKDAPEKIYQFKNGPLVFNKHKDIFDKLRHAYSFKYMPVSRETTTKNQEMFKMTLYPRADRDTKKSRKLIPKAKGMPTVIYGGYSSNSDAYMALVKIKTSKSFIYKIFGVPMRAISKLKLAKRQGKYNQVLKKILTPAIMLDKNGKPKRGVKKFRILKGKVPYRQVVLDGKKKFMIGSTTYIYNAKELTLSSEAMRIITNNLNTNEDRDKSLIKVYDEILEKVDKYLPLYDIYKSREKLHKGREKFINLSVEEKKNIINQILNGLHDNLVMGNLKNIGFNTPFGQMQMQSGITLTPNAKLIYQSPTGLFEKRVKISDL >NZ_CP046528.1|WP_063507987.1|207688_208597_+|L-lactate-dehydrogenase MANKIGIIGDGHVGCTVAHQLIISGLVDDLVLIDMNKGKVNADAIDFEDSMANLPYHVNITVNDYSALKDADIVVSTLGKISLETKGDRFAELKYNKEQLKPITDSIKKSGFNGILIVISNPVDAITSLYQQLTGLPKQHVIGTGTLLDTARMQKVVAKKFDVDPRSVSGFNLGEHGNSQFTAWSTVKVLEQPITKLAKDKSWKLEDLNDEIKFGGQQVFKGKHYTNYGVAAAAVRLIQSILNDSRTELPVSSYQAKYGTYMSYPSIVGRDGIVQSIDLQLTDEEEKQLKASAETIKAKSEA >NZ_CP046528.1|WP_156482155.1|206462_207494_-|acyltransferase-family-protein MLQSILALILKISLTHNEQTGIGFTYNLVKFTAPAFIFGILYTTIRTHPHATLKDYPTYMRGQWSALFVPTICWTSIYLLLMPQLQQHNHFHNFINFCWQFINGNAAPHMWYNTMMLQFIILMPIFWYISRYVKNSNRRCWLIITVSTVIYFLWIDLYDKQVFHGPKMRTWYLFDRLFLSFIIYAVLGTLAWNFHKQLGHFLLKFWWSLIIAWITVYYLINHELFSFGFPINLYNAPYYKPSMTVYCLTIIGLIAALAFYQIKKQQIRSLRLFHWLAIYAYKAFLSHIFWLELAWLIFGKQLLKDSNTLVTIIVLYILTWLLSFASAYDLHMIWSKIKNRLLA >NZ_CP046528.1|WP_063507989.1|205978_206251_+|hypothetical-protein MKNEDDLSPGLGLGITFIIIGCIIPWLFSNNFMLLISTLIVAIGIGGTGIEIAKLTQKNEFQYLSVGLAFILISIYFLTIINNSWGEPYS >NZ_CP046528.1|WP_156661157.1|204572_205751_-|IS256-family-transposase MNDFTKNITQALFNQDKINDLLRHEIQQAVNDLLESELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKIDTQFGSIEVQVPRDRNGMFHQHTLPDYKQHTDLLEDMVIKLYSKGVTTREIANLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYIPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTELLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALMQTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVEDREAIMNEFKQVHQQSNKQEGITVLHSFYSKWQKAYQHVIQNVKDIEADLLVFYNYPKQIRSSIYSTNMIESFNNVVKRKAKPKAEFPNEQSLDTFIGIQAMSYNDRYFKRIHKGFGQVQDTLESYFE >NZ_CP046528.1|WP_156171254.1|204380_204524_+|hypothetical-protein MKEKDKNNLKLKFYNNPGIGIDFAILNLYTSFIVLSLAADAFTETVK >NZ_CP046528.1|WP_054682202.1|202897_204181_-|GTPase-HflX MIDNEPHKTKAYIAGVNLNDPNFDYYMTELANLTEANNMEVVGQSRQNTEQIVAGTYFGLGKINEIKSMAHGLKAKVLVLNDELSPVQIRNLEKLTKLRVIDRTELILEIFANRAKTKQAKLQVQLARLQYELPRLHPSENSLDQQRGNGGSTGGGFANRGAGESKLEMNRRTIDKQISAIKKELKKVANQEDIKSKRRNKKQIPKVALVGYTNAGKSTTMNGLLKEFTDESSDKEVFVKNMLFATLDTSVRRIDLNKNFSFILSDTVGFISKLPHNLVESFKATLQEAKDADLLINVVDASDPNMIQMIRTTQSVLREIGIKNIPMITAYNKADKTDRNYPQIEGNDILYSATDEKSIKLLAKLITKRVFANYKKFNLLLPLSDGKTLAYLHEHAQVMKESYENDGVHAEVRLAPENQERFKKYLV >NZ_CP046528.1|WP_063507695.1|218326_219598_+|hypothetical-protein MTKKKIRRTAKWKFWLISLLVIIILFGIFYAWGSVYYQKERQIDRITSSLSNPNANLAEYVTPSDPDIDVTNKSLKPLQSYFKENPRAKKQLVHDLKNGQTSNQITLINSGSHFLLFPKYTIQVQVYCPQIETNHPDSKLQVNGKNLGVMNGSGQNFYQDLGLVFPGRYHIVVNTKVGKRPLTANSVVNIWSDKTVDMTIRTATFQVRSVPKGNIFINDKKVATLDSHGQYVFKNYRLAKNMELYIQSTYKGKKIKSEKVKDIPQSIDKDFSNTDDGINDYGNAPDYQGNQEKDVYQDVDGDYIVNPNWPGLINDKAAAKLIGTNFKKPNKNDFVKGKKNPSFKKLKQQVRKLKFSLPIRKVKIAVDVYQILPAGDNYGDVSYKVVYKYKKNGRNAKKVVSYQHAIFHDVDNKQLIKTLGQRK >NZ_CP046528.1|WP_063507694.1|220498_222298_+|ABC-transporter-permease MIWKLSFTGIKSRLKDYTVLFSGLVVASMIFYMFLSLAINPSFMSKDVNAPSSYLSFIFGFGIVLLAIITLVYLIYANSFLLSMRQHDYGMFMMLGAKSSRIGLLIFCETLITGVLATVLGIIVGFGLTALVAKLLIHNLGLAITHFQVILPNAIIWTLVFFILIFFLAALRNVHKLVHSKVIDLLHESQKPIKISNHPVWRSVEAVLGILLLAAGYYVMGWKNVFIVIPMALVTIVLGSYFTFDAFFTAIIDVLLKNKGFAYHGIRIFTLGQLKFRLRDYTRILTVISLLFALALGAITVGLNFNTIKDQVKGSIYYDAEVVSNSSNVQKNVDKLSIKTKHTYHYKETSHDLYFDKAEFKKNPVKNVRFELKNNLPTYKNETLNTGQISNPGTHANSSFGELVPNGIPKKIHLLPTKEAKNIKGQSKFVTFLSVNNFDKDYPVLLKIEKKQMQENPSLTDTLSGTKPLAYQTMLGLTSGFEFMGFFLGLAFLTMLASTLMFKVLSGAASDKMRYQMLYKIGAREKVLRHSISSEIGTLFVLPGILGIVDVLFGLRMFKLLLPHPYAGLWIPFTIFIILYFFYYVLTVKLYERIVLARK >NZ_CP046528.1|WP_063507693.1|222347_222995_-|histidine-phosphatase-family-protein MKRIYIVRHGQTYINRYNKMQGWCDTPLTQEGIEGAEKVGEALKNVPFDIALSSDLKRACDTCDIIIKHNTNKDELQHIATPFFREQFYGYFEGMDCGVAWRMIGGPHGYSNHYDLLKHEPIDKVKDWIKAADPYHQAENAKEYWARVNKGFKMISEMDGAENILLVTHGFTIRSIANHYSDSIDISNGPRNASITTMTMTDKKMKITSYNKMHL >NZ_CP046528.1|WP_063507696.1|223022_223715_-|matrixin-family-metalloprotease MKKFLRFLRNLIFVVVVVFAVWDYQNNDNVRNATNDSLTALNDRISQMLSTGNLNPPKLGNSDSNTVKNAVKPETTDSNAQKRRWPSPNATVYVNIKKDLQLRSASIDAIKAWNKTQAFTFQETNNKKKAQVIISVTNDSSTNAAGETATSYNPVTGHLINAKVQLNKFYLQNGWYGYSYNRIVNTAEHELGHAIGLNHNKGVSVMYPQGSVYTIQPQDITNVKKLYNEK >NZ_CP046528.1|WP_063507692.1|223866_226161_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MTKVTDEKQYEQKHLDHILELIKTREKNLEKSIKSVRGEARNLNSHFFDDVKLDYDGYSTSMETALSIHQQQQLLSEREHDWQHSAKQLNTVKRLEKHPYFARVDFKEGDEEPETIYIGLGSFADENNHFLIYDWRAPISSIYYDGKLGKVSYNSPDGEITVDMTKKRQFMIKDGKIVNMFDTNESIGDQMLLEVLSEKSSTQMKSIVTTIQREQNKIIRNTSADLLFVQGAAGSGKTSAILQRIAYLLYRYRGNLTSSDVIMFSPNQLFNDYIENVLPEMGEQNMVQMTYWQFVARRLPGMKVENLFNQFEDKAADTNISKLKDSTEFFKLLTRYAKHLNNKGMIFKNIYFRDPKKSYFAKEKIKDIYYSFNPDYKLHNRIDATREKLIKMLNRRINSEIKKPWVSQTIQSLSKEQLNDLYDKPDQEFSSEAKEEQFLGRKIVVKKLSKVYKRIKHNHFINTRAQYLSFLRAIPKMIDLSKWHISQDDWAKHVNSVKESFKKHYIHMNDVSAYLYLYDLITGRYVDYEMRYAFIDEIQDYTPFQLSYLKYNFPRAKFTMLGDLNQAIFTKDESKDLLKQISGLFDPKKTEVVQLTKSYRSTKQLTDFTKQILRQGEKIEAFNREGPKPVIWGRKNDDEAISVLEDILKDNDKNKQTTAIITKDLSSAKYVDKKLKADGVKESLIATANQRLVPGTLVIPSYLAKGLEFDAVVMWGASKANYEQLDETQLVYTITSRAMYKLDIIYTGEKSPLLNVNADTYEEK >NZ_CP046528.1|WP_063507691.1|226595_227243_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MTLKYIEEILPSLINGTWMTIKIFFWTLCLALPIGIIASLCEMSHIKIVKWLVKFYVLIMRGTPLLLQLIFVFYGLPILGVVFPRYQAALFTFVLNYAAYFAEIFRGGMQSIDKGQFEAAQVLRLDRWQTMTKIIIPQVIKIVLPSIGNEVINLVKDSSLVYVIGLGDLLRAGNVAMARDVTLVPLVLVAIIYLILISACSFVQKKLEEYFSYYK >NZ_CP046528.1|WP_060459742.1|227254_227875_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLEVKNLTKKFNGHPVLQNINFTLKDGKILAIVGPSGAGKTTLLRIISGLETKDSGEILLDGQEYNLGKVGIVFQDFNLFPNLSVLDNITLAPELVLKESKQVAEKNAMELLTKLQMGGHEKQYPYQLSGGQKQRVAIARALAMKPKILCYDEPTSALDPNLRHEVEKMILDLKKSGLTQLVITHDFTFAKNISDQMLKIQPLGEA >NZ_CP046528.1|WP_063507690.1|227877_228699_+|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKFWIAILSCFLLLFTAGCENVQEKANTQDTWNKIEQKKQVVIGLDDSFVPMGFEKKDGQLTGYDVDLARAVFKQYGIKVNFQTIDWSMNVTELRNGTIDLLWNGYSITPERKKKVAFSKPYLRNSQVLVVKKGSNINSFTQMKNHALGMQTGSTAEQWYESKQNILHSKDKVLYDTIANSFLDLNAGRIQGILLDDVYANYYISHMANKKEYKIIKDPRVPTDLFAVGIRKGDKTLKRKINKGLDRLQANGKLASLNKKWFGKNNSYLRGD >NZ_CP046528.1|WP_060459901.1|228743_229154_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MTGREFFCVERLRTDSFVTEQKITLPELDDIDLKAIQVYLLNKHKNNALATCRVFQANGKWMLGRVAVAKKMRGQHIGADMMHAVHTFLRQKDVNYLYCHAQLQAKPFYVHLNYHVKGDTFDEGGVQHILMYKNLQ >NZ_CP046528.1|WP_054681967.1|229167_229737_-|arylesterase MKKIILFGDSLFNGYRNGQDTDAITNGLQKVLGNSVKVENLSKSGATTVEGLDYIKQIDPQADLVVLEYGTNDTAAGWGINSERYAKNLDKMVKEIGSNRMIIVGPSYPDPNNKEIMQDYSDESLDRYNAIAKECAQKYHIPFIDLIKVGRKLDNISSYYLADGQHLTDKGNAILINTVAPVIKEKIEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046528_3 | 391517-391730 | TypeI-E |
I-B,III-A,III-B
Consensus repeat of NZ_CP046528_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP046528_3
>3.1|391546|33|NZ_CP046528|PILER-CR,CRT TTGGGTTTGCTAAACAAGGATTTGCCGCCGCTT >3.2|391608|33|NZ_CP046528|PILER-CR,CRT CGAACATGGTTGAATTTGTAAAGCTAATGGCAG >3.3|391670|32|NZ_CP046528|CRT TAATAAATTACCACTCGTTATCCCTGGGTTCA >3.4|391546|34|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder TTGGGTTTGCTAAACAAGGATTTGCCGCCGCTTC >3.5|391608|34|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder CGAACATGGTTGAATTTGTAAAGCTAATGGCAGA >3.6|391670|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder TAATAAATTACCACTCGTTATCCCTGGGTTCAA |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046528_3
The CRISPR arrays of NZ_CP046528_3 >merge|NZ_CP046528|3|391517-391730|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder AGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCCTTGGGTTTGCTAAACAAGGATTTGCCGCCGCTTCGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCCCGAACATGGTTGAATTTGTAAAGCTAATGGCAGAGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCCTAATAAATTACCACTCGTTATCCCTGGGTTCAAGTATTCCCCATGTATATGGGGAAATTTA >NZ_CP046528|3|4|391517-391669|PILER-CR AGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC TTGGGTTTGCTAAACAAGGATTTGCCGCCGCTT CGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC CGAACATGGTTGAATTTGTAAAGCTAATGGCAG AGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC >NZ_CP046528|3|3|391517-391730|CRT AGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC TTGGGTTTGCTAAACAAGGATTTGCCGCCGCTT CGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC CGAACATGGTTGAATTTGTAAAGCTAATGGCAG AGTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC TAATAAATTACCACTCGTTATCCCTGGGTTCA AGTATTCCCCATGTATATGGGGAAATTTA >NZ_CP046528|3|3|391518-391730|CRISPRCasFinder GTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC TTGGGTTTGCTAAACAAGGATTTGCCGCCGCTTC GTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC CGAACATGGTTGAATTTGTAAAGCTAATGGCAGA GTATTCCCCATGCATATGGGGGTGATCC TAATAAATTACCACTCGTTATCCCTGGGTTCAA GTATTCCCCATGTATATGGGGAAATTTA
>NZ_CP046528.1|WP_063507919.1|390688_391039_+|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MKNFHQGDIIWVNLDPTKGNETKKKRPCVVVSNEQYNHYFNTILVIPISSSEKYLSMKKYQVSPLFVHINHHPICGTALLQHIRAIDPEKRTNGRVLAQIFPEEIRTIRQRLVQFF >NZ_CP046528.1|WP_063507918.1|390431_390686_+|AbrB-family-transcriptional-regulator MKTPTKVISKITSKNQVTVPQSIREVLKVGSNDSIQWMIGANGDVTVKNANDNLWGVVKEQEAIYGSVDTPEVDWGPDVESEDL >NZ_CP046528.1|WP_162308305.1|388268_389684_+|plasmid-pRiA4b-ORF-3-family-protein MGFLTKKQQYRIRDQVTDYVQYRYNPDETGPMIAVYKQCIHDHQTELEEGLKNGGRLSENIVMSDLSLALGAMIGEKGSQVLNHFCQIVNEEVPIKVPKPRANAKYCTIKRKFRDPRDWQKYTGEDAADNPAIVTAIKKNNQKMITQFLKSRDGKALASQGPTRDVLDDYLNGYLLHDQIRLVTTNLALLNVYYWFALSAGQDDFPIKVFESFFTFLSHTGIVSQSTIQHVVDNMQDAWEIFNGNIEAAPHELSEDEVKEFLKELEEESHQYEGQPQYVCPERSGLTYEFIVTLNDFKPQISRRFYIAGDQPIVNLQAVIIEIFRGEFEHMYDLVNEQTGDYFILPDFIDEDFMPGGGKYNVIDAEAATVSMLKKGDQLVFHYDYGDSWEFNVTVGKTVANYDGYQPIVVGAHGYGIIEGIGGVSGLETYYRDYQRGQVDSDIKDWLGDQLIDLDKVDINELNHQLRMLEE >NZ_CP046528.1|WP_063507917.1|386984_387716_+|antiholin-LrgB MTTLTNNLALPFTGIFISVAVFLLGQWLFKKSGGFFLFQPLFFGMVAGIIILIVWGKIQGTSTSATYRHFYKPGGDIIFWFINPVTIAFAIPLFKENKVLKKYWLDILLSLIISSVICLFIILGAAKLVGLSHSSAAAMLPQAATTAIAMPVADAIGGNSAITAMACILKAVILYALADSFIKIFRLQHSKIGLGLGLGTGGTVGSAKALKIGALEGAMASVCVVVIGVVINLVAIPFAHLFM >NZ_CP046528.1|WP_063507916.1|386581_387001_+|CidA/LrgA-family-protein MTGKNKSHKSAPVLVQLGIYAGILWISSIISSFFSRDFAVPTPVIGLVLLYLLLTFKIIKLEWVEDFGMFLISIVGFLFVPSGIQIADDLSILKTEGLQVIFVILVATIALLVVTAYVTRVIITIHQKITGGNDHDDVN >NZ_CP046528.1|WP_063507915.1|384829_385030_-|hypothetical-protein MATTTKSTTIRFDEDVLSLIHKQANLDGQTSTEFMRNAVLEKLADIFDYQDAVKNIRESPSQSKGR >NZ_CP046528.1|WP_063507914.1|383789_383987_-|cold-shock-protein MQNGTVKWFNADKGYGFITGPDGDVFVHFSSIKTNGFKSLEEGQKVSYDVEQADRGPQATNVVPQ >NZ_CP046528.1|WP_156661189.1|381229_382153_-|IS30-family-transposase MGTTILSFQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNGEYQAELAQSDFERKVGQRGRKSSLTKNLKHLIEEKLQTQKWSPEQVAHVVGIAYKTIYNWIDQGWLDVQLPDLPDHGIRRHRAKEKRGTFSHGRSIEERPHKIETRQEFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQAIEQLTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSEHQLVQINWYLNSRPLKCLNWRTPIEIFLLNLRH >NZ_CP046528.1|WP_156661187.1|380703_381246_+|hypothetical-protein MKPDNIFNKSNEEKIPFFMVTLPNKTMSVKLNRPLDSEDIELSHTFTESLGVLKQLVQFFYICKDAHDFLIYSINQLENKLESNARAARSIIDFLSDSRLIINFLENWSKSNLSPTYYQEWEAFEHGMYDRFVSYRIAYHLRNIAQHKMFIISKIHERIVDNSKIRQIARNNLNEFSDAD >NZ_CP046528.1|WP_063507697.1|378809_380702_+|DEAD/DEAH-box-helicase MGMKSDNPIIIKNDDGLFQLVDDDHHTLETKVAQRGLVIFAPYFKDPEQRTFKEDLTYIQLLELVKKLNRRLKRKGLPEVKTSSKFNQFVQQRQYYIKEQSQAGLTIKDGDPRWQQEFDNFRAIVSQEITRPLKPEQEKASFFMTIMKRAANFSVPGAGKTAMMYGTFAYLSSPRVDEVDKLLVVSPLNAFAAWRTEFQEVFGPKRELHYLNMRDKKYNNNVGAIKHDWVQADVITINYEALQSKLNTINDLLDSKTMLVFDEVHRVKGVGGQRAKAALSLSKAPHYRYVLTGTPIPNGFRDIYNFLHLMYPDEYSSFFAWDLTTLNNIDPEDVNKKLSPFFWRTNKQDLQVPKPDPDIIKEVAPSKNQELLAQAIYENETGTLATFIRLLQASTNPELLSTNINYKELGLVDADSGVWDKQADTVEKENSSSGETYKKYDLTKIEAPKFEMGIDLIDKLVSQGKKVLVWGMFVGTMQKITDALNGMGIKTTLVYGATPKQDREGMINNFRTGNVQVLVSNPNTLGESISLHQTVHDAVYFEYNFNLTFMLQSRDRINRLGLPANQYTRYYYLMTKGDVAHMGFIDRIVYKKLKDKEKVMLDAIDGQLLVPEYTDDYLQEVKDIVMGRYK >NZ_CP046528.1|WP_156661191.1|391915_394639_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MSIPLSKRAKSLWAKKQNHDGQELWLPLVAHLVDTQNVINWLYQNWLNESQQVIIQRDFTTDDTEKLLKFVGYFHDIGKATPAFQTKQSYNRNQTLDDELMEKLLRNGFTDLNDYEPAMRNESPHALAGETILEVAGLNTSVGAIIGAHHGKPVSEYFNYKCQYYTYISNYIQSERKAELQKNWQQVQQELINYGLQKSGYNSLQDVPEVTEEQAIILTGLLIMADWIASSEYVDNDPSRIMFPLIPLNQGYDNLNMNQRYQNAIETWDISGHWTPQPVTDINNQYQKRWGFSPRVVQQLMSQEIGKIIDPGIIIVEAPTGIGKSEIAMTAAEQLAERTGATGLFMGLPTQATSNAMFSRVNKWVDSLAKEENVNLPIKLMHGKAQFNEENRNLPQAENVGSQDSVVVNSWFSGKKSMLADFSIGTIDHLLLMSLKQKHLFLRHLGLSGKVVIIDEVHAYDTFMNSYLQQALVWLGAYHIPVIALSATLPKAKRTELIESYYFGKYSDDVQNNGGWENSQSYPLLTYLDGKEVKQFTDFPPASKPKVNKVVRLTGDDNELIKKVTDSISDGGVAGVVVNTVKRAQKLSQLIPDSIPKLVLHSAFLAPNREKLEEQLQAAIGKDAHRPEKMIVIGTQVLEQSLDIDFDVLFTDIAPIDLIIQRMGRLHRHQIKRPQKLAEPTTYVMGTNEDGDYGDANEAIYEKYWLMKTDHFLPDAIKIPDDVSRLVQLVYDPATDKVVSGIEGPRHDVEVVEEKERDKASIYQIEVPDPEENLHDWLDRDRRGVENDATAEAAVRDIKESIEVVLVQHTADGDYLLDGRRMEDAQDYEIAQQLIRLPNAITPNIEQSINELENRTEKYYHAWQDSIWLKGMIALPLDEKMTARFNNWQIKYSKNLGLMYKKDGEDE >NZ_CP046528.1|WP_082836719.1|394613_396359_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MKRMGKMSERHFNLVSTPWLKVIDENNQGQMVSMEELFTNTRHYRRLAGEMKSQDLAILRFLLAILTTVYSRFDAHDQSYSWLEIDKKTMKPLAINFQQRRKKKIKNSLMATWEELYRNKSFSEVILDYLHVYSKHFDLFDKDTPFYQVTRDQYDSMVPQNKVVEKGKGTVAIKQINRTISESNNKPDVFSPNAPSHKDDVSLDELARWLITYQNFTAVTDKTKVNSKEKFSVSRGWLYGLNPVFAKGANLFETLMLNLVLAPTFSDLKEKIIRQAPVWEVPVEDYIQTRIDNNFPGNIAQLYTIWSRAIHIEWDGNQPTIFSAGLPKLNNENAFLEPMTTWKLGKKEGDPVKPNLRWLNSLGKAMWRNFGQYVPIHISSSSDSKTEIVPGVVSWLNFLQRNGLIKSDFSIHLATVGLINDGNATSQSPAAEFADEMQINADVLFDDDPVAKIRWPALIENVVQLTIKQGSLLFYFAKSVGELRELGDPGNFANQVTARYYSRLNQPFYEWLAGLKSDDESNTKIKEWRDEARRIVILTASELLNSATPREIRGKMVDDKLENIFIDYRIFRASVAKIWES >NZ_CP046528.1|WP_063507922.1|396371_396968_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MANRIRNITGAIIHQLWTDGGPDKAALAALRSSSNLLNRNATTIWPLMLANLEEGDLSATGQPTYAEKAVYTALRCFALCQHGNDDLTYAPAGKDKEGKTLFAALQQLRQDDATSTAIDRRVQIVLGNSNFESTINAIYHLVTILKGRFPHEEIDFAQLGQDFYFFQLNSEMARQICLKWGQQYYRISKDKDNQKGEK >NZ_CP046528.1|WP_156661192.1|396970_398056_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MKNLYVDINVLQSVPSSNINRDDTGAPKTAIYGGVTRARVSSQSWKRAIRMAFDEQADGADWLKGIRTTRGPLMLAKELQKLNADLSEDDALKMAVGVFDKAKIKLDKKKNQTKALLMVSRGQIEKLAKYVIENDELDGKAIKEALKGEHSLDMALFGRMVADDPSLNVDAACQVAHAISTHEIVPEFDYYTAVDDSKADNESGSAMLGTIEYDSATLYRYANVNVNELLHNLGDVDATTEGLKLFIKDFIMSMPTGKQNTFANKTVPQYVMVTVRQDTPVNLVTAFEKPVKSREGYVKASIKYLEDEYKRTQSFVEKPLATFVLTTYDSEINNQEENIESLVNDTVETIETRVNDEDSSN >NZ_CP046528.1|WP_063507924.1|398036_398732_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTLVIRLTSPLQSYGNEATFNRRTSYHYPSKSAILGMLAAALGYRRDDSRISALNKLQVAVRIDQPGQTLTDFQIIEYDRAHHKRSLSYRDYLQDAIFVVAIGGDDEQIEQVDIALHHPQFQLFLGRRANVPAGPIITKVFENEDPIAVLKKYDWQAAEWYRRSKESYSAEVIADADLLPDRMSALIKDSIGSFSQNHRWHSYRAVTSIHVNLRNEHGNDTDHDIMANVH >NZ_CP046528.1|WP_063507925.1|398746_399376_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MFLSRVEINTQNRQKVRDLTHLGAYHNWVENSFPDEIKQGKRLRHLWRIDQLHGKRYLLIVSQDKPNLKKLEHYGVEGTAVTKQYQRFLDKIQDGEKMRFRLAANPSYRTDGKVYPHITVEQQKNWLLQRTDKAGFAISTRVDGSQEFDIVNREWPILHHKRRIRLSQVSFEGTLTVTNEEKLRITLTHGIGREKAYGMGLLTVIPLRK >NZ_CP046528.1|WP_063507926.1|399378_400329_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKSSYGAPKAELNELGRVQDRITFLYLEHARVNRQDSAVTVTDQRGTAFIPSAMVNVLMLGPGVDITHRAMELIGDSGMAVIWVGERGVREYAHGRPLDHSSRFLEQQAKLVSNRRTRIAVARKMYQMRFPKEDVSKMTMQQLRGKEGARVRNVYLEQSRKTGVQWNKREYKVDDFASSTPINKALTAAHQALYGLCCSVVVALGASPGLGFVHTGHDMSFIYDFADLYKAQYSIPIAFEMTAKHGNNDIADWTRRGMRDAFANGKILVQMVHDLKYLLSIDDDIQARSMHLWDDQQGLQKFGVQYHEFDSEDDEN >NZ_CP046528.1|WP_082836720.1|400325_401201_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVIALTKVPLSLRGDLTRWCQEIQSGVYVGNVSGRIRERLWQRINENIGQGEATLVYNTNNELGYTFRTTRRDKEVIDADGIPLMRSLVQRSDERRHGFSDAYKFHQAKKFSHRKEYQTDFAVLDLETTGLRPTSNQIISIGAVKCVDGHVASFYRLVKLEKGRTVPVNIARVTKLSDALLNREGVETKDAIIDLQHFVKDLPIVGYNLMFDERFLQAAVIKNNLIQFNSKLIDILPLIKRVNKFFDNYRLSTVLKNYGINNESPHNSLSDARATMELANKLIKNRDLRI >NZ_CP046528.1|WP_156661194.1|402110_402311_+|hypothetical-protein MKEKVTAFYESKYFIPAMALVLFIIVTAVIYFVLEELKLWFALFILLCFIIWQIARNNLNEFSDAD >NZ_CP046528.1|WP_156661189.1|402294_403218_-|IS30-family-transposase MGTTILSFQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNGEYQAELAQSDFERKVGQRGRKSSLTKNLKHLIEEKLQTQKWSPEQVAHVVGIAYKTIYNWIDQGWLDVQLPDLPDHGIRRHRAKEKRGTFSHGRSIEERPHKIETRQEFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQAIEQLTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSEHQLVQINWYLNSRPLKCLNWRTPIEIFLLNLRH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046528_4 | 401231-401990 | TypeI-E |
I-B,III-A,III-B
Consensus repeat of NZ_CP046528_4
|
12 spacers
spacers of NZ_CP046528_4
>4.1|401259|34|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAAATATAGTATTGCTGATATGACCAAGTTA >4.2|401321|33|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCCCAACTTAAGCAACAGCTTAAACCAGTTC >4.3|401382|33|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTTTGCCACTTGAAATTTTGGCCAAGTTGGT >4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT TCAAACTAATCAAATTCAATTTGTTGCTTATGA >4.5|401504|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder TCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCAT >4.6|401562|34|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder TAAAGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTC >4.7|401624|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTCAAGATAACGATGGGAATTACCACATTG >4.8|401685|34|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATATATGTTAGCGAGTAACTCATTAGGGCTGC >4.9|401747|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGTTGCAGTGCAATAGCCACCCGGGCATAAA >4.10|401808|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAAACTTAGTTATGGGGAGTGCCACCGGCTG >4.11|401869|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCACGGAGCTTCAATCAACTGACAATACTT >4.12|401930|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTCGACGGTGATTGCTATTCGGCACAACCCG >4.13|401504|33|NZ_CP046528|CRT TCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCATCAA >4.14|401565|31|NZ_CP046528|CRT AGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTC |
DEDDh,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046528_4
The CRISPR arrays of NZ_CP046528_4 >merge|NZ_CP046528|4|401231-401990|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTAACAAATATAGTATTGCTGATATGACCAAGTTAGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTGTCCCAACTTAAGCAACAGCTTAAACCAGTTCGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCAGTTTGCCACTTGAAATTTTGGCCAAGTTGGTGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAAACTAATCAAATTCAATTTGTTGCTTATGAGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCATCAAGTATTCCCCTATGTGGGGGTGATCCTAAAGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTCGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTAATCCTCTTTCAAGATAACGATGGGAATTACCACATTGGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTATATATGTTAGCGAGTAACTCATTAGGGCTGCGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCGTTGTTGCAGTGCAATAGCCACCCGGGCATAAAGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAAAACTTAGTTATGGGGAGTGCCACCGGCTGGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTATCACGGAGCTTCAATCAACTGACAATACTTGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCATTCGACGGTGATTGCTATTCGGCACAACCCGGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATTC >NZ_CP046528|4|5|401231-401442|PILER-CR GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TAACAAATATAGTATTGCTGATATGACCAAGTTA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TGTCCCAACTTAAGCAACAGCTTAAACCAGTTC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CAGTTTGCCACTTGAAATTTTGGCCAAGTTGGT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAAACTAATCAAATTCAATTTGTTGCTTATGAGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCATCAAGTATTCCCCTATGTGGGGGTGATCCTAAAGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTCGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTAATCC TCTTTCAAGATAACGATGGGAATTACCACATTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATATATGTTAGCGAGTAACTCATTAGGGCTGC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC GTTGTTGCAGTGCAATAGCCACCCGGGCATAAA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAAAACTTAGTTATGGGGAGTGCCACCGGCTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATCACGGAGCTTCAATCAACTGACAATACTT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CATTCGACGGTGATTGCTATTCGGCACAACCCG >NZ_CP046528|4|4|401231-401990|CRISPRCasFinder GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TAACAAATATAGTATTGCTGATATGACCAAGTTA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TGTCCCAACTTAAGCAACAGCTTAAACCAGTTC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CAGTTTGCCACTTGAAATTTTGGCCAAGTTGGT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAAACTAATCAAATTCAATTTGTTGCTTATGA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCAT CAAGTATTCCCCTATGTGGGGGTGATCC TAAAGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTAATCC TCTTTCAAGATAACGATGGGAATTACCACATTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATATATGTTAGCGAGTAACTCATTAGGGCTGC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC GTTGTTGCAGTGCAATAGCCACCCGGGCATAAA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAAAACTTAGTTATGGGGAGTGCCACCGGCTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATCACGGAGCTTCAATCAACTGACAATACTT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CATTCGACGGTGATTGCTATTCGGCACAACCCG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATTC >NZ_CP046528|4|4|401231-401990|CRT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TAACAAATATAGTATTGCTGATATGACCAAGTTA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TGTCCCAACTTAAGCAACAGCTTAAACCAGTTC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CAGTTTGCCACTTGAAATTTTGGCCAAGTTGGT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAAACTAATCAAATTCAATTTGTTGCTTATGA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCATCAA GTATTCCCCTATGTGGGGGTGATCCTAA AGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTAATCC TCTTTCAAGATAACGATGGGAATTACCACATTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATATATGTTAGCGAGTAACTCATTAGGGCTGC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC GTTGTTGCAGTGCAATAGCCACCCGGGCATAAA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAAAACTTAGTTATGGGGAGTGCCACCGGCTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATCACGGAGCTTCAATCAACTGACAATACTT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CATTCGACGGTGATTGCTATTCGGCACAACCCG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATTC >NZ_CP046528|4|6|401596-401990|PILER-CR TAACAAATATAGTATTGCTGATATGACCAAGTTA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TGTCCCAACTTAAGCAACAGCTTAAACCAGTTC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CAGTTTGCCACTTGAAATTTTGGCCAAGTTGGT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAAACTAATCAAATTCAATTTGTTGCTTATGAGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAGATGGCGCGGTCAATGAACCAAATCATCAAGTATTCCCCTATGTGGGGGTGATCCTAAAGCATCTTCAAACTGGGTATACTGTGACTTCGTATTCCCCATGTATGTGGGGGTAATCC TCTTTCAAGATAACGATGGGAATTACCACATTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATATATGTTAGCGAGTAACTCATTAGGGCTGC GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC GTTGTTGCAGTGCAATAGCCACCCGGGCATAAA GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TCAAAACTTAGTTATGGGGAGTGCCACCGGCTG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC TTATCACGGAGCTTCAATCAACTGACAATACTT GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCC CATTCGACGGTGATTGCTATTCGGCACAACCCG GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATTC
>NZ_CP046528.1|WP_082836720.1|400325_401201_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVIALTKVPLSLRGDLTRWCQEIQSGVYVGNVSGRIRERLWQRINENIGQGEATLVYNTNNELGYTFRTTRRDKEVIDADGIPLMRSLVQRSDERRHGFSDAYKFHQAKKFSHRKEYQTDFAVLDLETTGLRPTSNQIISIGAVKCVDGHVASFYRLVKLEKGRTVPVNIARVTKLSDALLNREGVETKDAIIDLQHFVKDLPIVGYNLMFDERFLQAAVIKNNLIQFNSKLIDILPLIKRVNKFFDNYRLSTVLKNYGINNESPHNSLSDARATMELANKLIKNRDLRI >NZ_CP046528.1|WP_063507926.1|399378_400329_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKSSYGAPKAELNELGRVQDRITFLYLEHARVNRQDSAVTVTDQRGTAFIPSAMVNVLMLGPGVDITHRAMELIGDSGMAVIWVGERGVREYAHGRPLDHSSRFLEQQAKLVSNRRTRIAVARKMYQMRFPKEDVSKMTMQQLRGKEGARVRNVYLEQSRKTGVQWNKREYKVDDFASSTPINKALTAAHQALYGLCCSVVVALGASPGLGFVHTGHDMSFIYDFADLYKAQYSIPIAFEMTAKHGNNDIADWTRRGMRDAFANGKILVQMVHDLKYLLSIDDDIQARSMHLWDDQQGLQKFGVQYHEFDSEDDEN >NZ_CP046528.1|WP_063507925.1|398746_399376_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MFLSRVEINTQNRQKVRDLTHLGAYHNWVENSFPDEIKQGKRLRHLWRIDQLHGKRYLLIVSQDKPNLKKLEHYGVEGTAVTKQYQRFLDKIQDGEKMRFRLAANPSYRTDGKVYPHITVEQQKNWLLQRTDKAGFAISTRVDGSQEFDIVNREWPILHHKRRIRLSQVSFEGTLTVTNEEKLRITLTHGIGREKAYGMGLLTVIPLRK >NZ_CP046528.1|WP_063507924.1|398036_398732_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTLVIRLTSPLQSYGNEATFNRRTSYHYPSKSAILGMLAAALGYRRDDSRISALNKLQVAVRIDQPGQTLTDFQIIEYDRAHHKRSLSYRDYLQDAIFVVAIGGDDEQIEQVDIALHHPQFQLFLGRRANVPAGPIITKVFENEDPIAVLKKYDWQAAEWYRRSKESYSAEVIADADLLPDRMSALIKDSIGSFSQNHRWHSYRAVTSIHVNLRNEHGNDTDHDIMANVH >NZ_CP046528.1|WP_156661192.1|396970_398056_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MKNLYVDINVLQSVPSSNINRDDTGAPKTAIYGGVTRARVSSQSWKRAIRMAFDEQADGADWLKGIRTTRGPLMLAKELQKLNADLSEDDALKMAVGVFDKAKIKLDKKKNQTKALLMVSRGQIEKLAKYVIENDELDGKAIKEALKGEHSLDMALFGRMVADDPSLNVDAACQVAHAISTHEIVPEFDYYTAVDDSKADNESGSAMLGTIEYDSATLYRYANVNVNELLHNLGDVDATTEGLKLFIKDFIMSMPTGKQNTFANKTVPQYVMVTVRQDTPVNLVTAFEKPVKSREGYVKASIKYLEDEYKRTQSFVEKPLATFVLTTYDSEINNQEENIESLVNDTVETIETRVNDEDSSN >NZ_CP046528.1|WP_063507922.1|396371_396968_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MANRIRNITGAIIHQLWTDGGPDKAALAALRSSSNLLNRNATTIWPLMLANLEEGDLSATGQPTYAEKAVYTALRCFALCQHGNDDLTYAPAGKDKEGKTLFAALQQLRQDDATSTAIDRRVQIVLGNSNFESTINAIYHLVTILKGRFPHEEIDFAQLGQDFYFFQLNSEMARQICLKWGQQYYRISKDKDNQKGEK >NZ_CP046528.1|WP_082836719.1|394613_396359_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MKRMGKMSERHFNLVSTPWLKVIDENNQGQMVSMEELFTNTRHYRRLAGEMKSQDLAILRFLLAILTTVYSRFDAHDQSYSWLEIDKKTMKPLAINFQQRRKKKIKNSLMATWEELYRNKSFSEVILDYLHVYSKHFDLFDKDTPFYQVTRDQYDSMVPQNKVVEKGKGTVAIKQINRTISESNNKPDVFSPNAPSHKDDVSLDELARWLITYQNFTAVTDKTKVNSKEKFSVSRGWLYGLNPVFAKGANLFETLMLNLVLAPTFSDLKEKIIRQAPVWEVPVEDYIQTRIDNNFPGNIAQLYTIWSRAIHIEWDGNQPTIFSAGLPKLNNENAFLEPMTTWKLGKKEGDPVKPNLRWLNSLGKAMWRNFGQYVPIHISSSSDSKTEIVPGVVSWLNFLQRNGLIKSDFSIHLATVGLINDGNATSQSPAAEFADEMQINADVLFDDDPVAKIRWPALIENVVQLTIKQGSLLFYFAKSVGELRELGDPGNFANQVTARYYSRLNQPFYEWLAGLKSDDESNTKIKEWRDEARRIVILTASELLNSATPREIRGKMVDDKLENIFIDYRIFRASVAKIWES >NZ_CP046528.1|WP_156661191.1|391915_394639_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MSIPLSKRAKSLWAKKQNHDGQELWLPLVAHLVDTQNVINWLYQNWLNESQQVIIQRDFTTDDTEKLLKFVGYFHDIGKATPAFQTKQSYNRNQTLDDELMEKLLRNGFTDLNDYEPAMRNESPHALAGETILEVAGLNTSVGAIIGAHHGKPVSEYFNYKCQYYTYISNYIQSERKAELQKNWQQVQQELINYGLQKSGYNSLQDVPEVTEEQAIILTGLLIMADWIASSEYVDNDPSRIMFPLIPLNQGYDNLNMNQRYQNAIETWDISGHWTPQPVTDINNQYQKRWGFSPRVVQQLMSQEIGKIIDPGIIIVEAPTGIGKSEIAMTAAEQLAERTGATGLFMGLPTQATSNAMFSRVNKWVDSLAKEENVNLPIKLMHGKAQFNEENRNLPQAENVGSQDSVVVNSWFSGKKSMLADFSIGTIDHLLLMSLKQKHLFLRHLGLSGKVVIIDEVHAYDTFMNSYLQQALVWLGAYHIPVIALSATLPKAKRTELIESYYFGKYSDDVQNNGGWENSQSYPLLTYLDGKEVKQFTDFPPASKPKVNKVVRLTGDDNELIKKVTDSISDGGVAGVVVNTVKRAQKLSQLIPDSIPKLVLHSAFLAPNREKLEEQLQAAIGKDAHRPEKMIVIGTQVLEQSLDIDFDVLFTDIAPIDLIIQRMGRLHRHQIKRPQKLAEPTTYVMGTNEDGDYGDANEAIYEKYWLMKTDHFLPDAIKIPDDVSRLVQLVYDPATDKVVSGIEGPRHDVEVVEEKERDKASIYQIEVPDPEENLHDWLDRDRRGVENDATAEAAVRDIKESIEVVLVQHTADGDYLLDGRRMEDAQDYEIAQQLIRLPNAITPNIEQSINELENRTEKYYHAWQDSIWLKGMIALPLDEKMTARFNNWQIKYSKNLGLMYKKDGEDE >NZ_CP046528.1|WP_063507919.1|390688_391039_+|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MKNFHQGDIIWVNLDPTKGNETKKKRPCVVVSNEQYNHYFNTILVIPISSSEKYLSMKKYQVSPLFVHINHHPICGTALLQHIRAIDPEKRTNGRVLAQIFPEEIRTIRQRLVQFF >NZ_CP046528.1|WP_063507918.1|390431_390686_+|AbrB-family-transcriptional-regulator MKTPTKVISKITSKNQVTVPQSIREVLKVGSNDSIQWMIGANGDVTVKNANDNLWGVVKEQEAIYGSVDTPEVDWGPDVESEDL >NZ_CP046528.1|WP_156661194.1|402110_402311_+|hypothetical-protein MKEKVTAFYESKYFIPAMALVLFIIVTAVIYFVLEELKLWFALFILLCFIIWQIARNNLNEFSDAD >NZ_CP046528.1|WP_156661189.1|402294_403218_-|IS30-family-transposase MGTTILSFQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNGEYQAELAQSDFERKVGQRGRKSSLTKNLKHLIEEKLQTQKWSPEQVAHVVGIAYKTIYNWIDQGWLDVQLPDLPDHGIRRHRAKEKRGTFSHGRSIEERPHKIETRQEFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQAIEQLTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSEHQLVQINWYLNSRPLKCLNWRTPIEIFLLNLRH >NZ_CP046528.1|WP_156482130.1|403424_403718_+|hypothetical-protein MPHLESYFLGIHYLYLDASRKFFDENKSRINQMVQLCESKGYDSRIYHGFTNSTKINENDWNVDASEIITVPKIVDVLKILDHEKIANINFNVKSNS >NZ_CP046528.1|WP_063507588.1|404216_405110_+|Mrr-restriction-system-protein MVNQQIYIENVTMKEILISMHRLGGQITRKEIRQDIRDNSQAITENQVDMVKTSKRSGNKYKPFDYTFYYAVKYLIVTGYINTDDNYELELSEKGRTVDLNTFDPERDVRTVIRNKKAEKNKLNVNDPGQIETGDAVEDSEDASNQWRKDLLDALIKMNPKKFEIFCRGLLKRMGVEVDNTIGVQYVADGGLDGFGYVRSDDYRTTRVALQAKRWQSKVSAPEIDKFRGAMDKFNAEFGIFITNSDFTREAVKTARQGTRIITLINGDQICDLVAKYNYYVEPVTTYRLKSFYTDND >NZ_CP046528.1|WP_063507589.1|405149_405353_+|hypothetical-protein MKKFFKILASITTIIFIATVIVFIMNGKFWQITPWIAHNRPQGVMGWSFCTIIVLWIIALIIPKKRK >NZ_CP046528.1|WP_063507590.1|405398_406556_-|NADP-dependent-malic-enzyme MSDDVKKLALDQAKKFGGKLEIKSKVKINDKKDLSAAYTPGVAAVSSAIANNKNLAYSLTIKKNTVAIVSDGSAILGLGNIGPEAAMPVMEDKAALFKRFANIDAIPIVLGTQDSEEIIKTVKAIAPTFGGINLEDISAPRCFEIEKRLIDECDIPVFHDDQHGTAIVVLAATYNSLKLIHKKLADIKIVINGAGAAGLSIAKILLAAGAKDITLLNSKGIINEEDPNLRPHLKNIAKKTNRKHISGGLHTALKDTDLFIGVSVADLLKKEWIKDMAGKPIIFAMANPNPEIMPDKAVAGGAYIVGTGRSDFPNQINNVLAFPGIFRGALDARAKEITMKMQIAAAKGIASLIPDNQLTTTNIIPDVFQDGVAKVVAKAVKNARK >NZ_CP046528.1|WP_156661196.1|406783_408058_-|ISL3-family-transposase MTSLNHCIKFQLNIEDPNLFFFDYHEALWQGKQPKVYAAELIQPSCPACHSQALKHNDHYLTRIRYLTSNASTPVLLEIHKQRVICQACGKLSMAQTELVNKSCCISNSSKQKILAALTEDRSMSSIARPNNVSTNTVQRVLQNFDTPFLSSADKLPEHLAFDEFRGVGRKLHFICLDGTSHQIIQILRYRYKKDILKYFNRFTLAARKRVKTVSLDLNAYYQAIVRQMFPNAQIIVDRFHLIQMLNRAFNQLRVRVMKRFKPASYSYRLLKYFWKLYLMPYAKLEKQKPHYNWHLKDQLTQEQIVLDGLDQNPTLKHSYQLVQNFSAALKQQDAHAMKGLINTKTVIGEQLRGILQTFKHNQTAVLNAGKYKYSNGCLEGINRKIKQIERTAYGYSNFDNLLNRIKLEGKHSVLKEKSSNQLV >NZ_CP046528.1|WP_082621121.1|408238_408820_+|hypothetical-protein MFDDYSLISQLVAKERQYRVRHDPKSADCYYSDATVTTSWQKGDLQSFLHGESKEVDHRFPIVCNVSTPVIHLNGKKAYVELPTNTRMRMVVHDILVEIESFRRLIYRVEKRHDNWKISSMISINESDNLRPVIPGQVLKVDPKRLSKYRMSYQFLSYVWEEAGGQISHDLLGIDRPKEVEKIYQDAEKWLKK >NZ_CP046528.1|WP_056970434.1|408938_409322_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MVTNFKIKRITSETELNGTSKVFQKTWQNAYKNMLPANELAKIKPDMWVNRLSRNDRYNLIAINTDNRVLGVVSYGNLRKNGQIVSDCGELMAIYVLPRFQGCGIGSKLLKNAENDLVKMNFKRAAL >NZ_CP046528.1|WP_063507592.1|410341_410608_+|hypothetical-protein MSEDIKNEKFNQLLIIGNGFDLACGLKSRYKDFFKWRFEQLFGKKVDPNDVINELLKDSDVIGPSNNNYYSKFYDFWYGYYRLVWILS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046528_5 | 965746-965847 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046528_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046528_5
>5.1|965770|54|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder GTCTGCCGTCTAATAACACCCAGCATCGACTTCTGAGTTATGGTCATATAACCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046528_5
The CRISPR arrays of NZ_CP046528_5 >merge|NZ_CP046528|5|965746-965847|CRISPRCasFinder CGACCATGACACTTATCACAGGTAGTCTGCCGTCTAATAACACCCAGCATCGACTTCTGAGTTATGGTCATATAACCCGTACCATGACACTTATCACAGGTA >NZ_CP046528|5|5|965746-965847|CRISPRCasFinder CGACCATGACACTTATCACAGGTA GTCTGCCGTCTAATAACACCCAGCATCGACTTCTGAGTTATGGTCATATAACCC GTACCATGACACTTATCACAGGTA
>NZ_CP046528.1|WP_056970111.1|963244_965083_-|elongation-factor-4 MDIKKLKDYQKHIRNFSIVAHIDHGKSTIADRILELTDTVSERQLKNQMLDDMPLERQRGITIKMNSVEVKYHAKNGEDYIFHLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVQAQTLANTYLAIDDDLKILPVINKIDLPSADPEGTKNEIEEMLGLDASGAVEVSGKTGQGIPELLERIVTDIPAPTGDLQAPLKALIFDSKYDDYRGVVLSVRIEDGTVKPGDQIQIMNTGKNYEVTEVGVSSPHPIKKDILVAGDVGYLTANIKSVRETRVGDTITDANKPTAEPLPGYRQIPPMVFSGMYPVDNSKYDELKDALQKLQLNDAALEFEPETSTALGFGFRCGFLGLLHMDVVQERLEQEFGLDLIMTAPSVDYHAIMNDGSTKVIDNPSDLPDAGEYKEVQEPYVKAEIMVPNDYVGPVMELCQHKRGEFVTMDYLDKYRVNVIYNMPLAEIIYDFFDDLKSSTKGYASLDYEITGYKTTDLVKIDILLNKKPVDALSFIAHRDETQPRARQMTSTLKKLIPRQNFEVDIQGAIGSKIISRATVKPYRKDVTWKIHTGDPDRRAKLLEKQKRGKKRMKAVGKVEIPQDAFMAVLKMNDDDIKKK >NZ_CP046528.1|WP_054681588.1|960931_963202_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKWKQRTAEELDPKLIDKYQLSPIAAKLFSLRGINTDEKLNFWFNATEDDLADPSLMHDMDKAVKRINQAIDKGEKITVYGDYDADGITSTTIMTETLSILGADVHYFIPSRFKDGYGPNLERYKQIVADGSKLIITVDNGVTGIDEVAYAKDKGVDTIVTDHHTIQDKLPDAYAIVHCNYPGQKYPFDDYCGAGIAYTICRSLMQDPMPELLDLAMIGTIGDMVKVSGEGHIIVKRGLEVLNQTDRPGLRALIKNAGLTMGSINETDIGFNIAPRLNAVGRLADANLAVELLLSDDDIEAQKLADQVEKLNEKRKKLTTKVYNACLKQVKKNSWQRKNTLVLYDPTFHEGVLGLVANKIVEKLHKPTVILTKNAAGEIKGSGRSIPGFNLFDALNPLKEKLLTKFGGHDFACGLSMTEDKIDALRDAFEKSFYVKGGLETKYYDMELPMKGLATSTIAEVNQAGPFGTDNAQPVFSISDPQIMDFHKIGKDKTHVKFNAVKSDGKLDIVGFNKAFLNNNLLPFVSKIFVQLSLNAYRNRISLQGIMEGVSFAAPKLAVPTKVIDMRSENYVMGFADRYLLFDPKNIAIVKNSLGIDEDKISLAKDYNANGETVVLLDAPHNQVELDHALENNYQQLYLRFLLDQLLVERIPDKSYFGKVLKYIYAHPTLKPEDYRTVAPYLGLNYDSILFILRVFFELGFVQLDNDKLVGKKNPEKKPLTASKYLLATQSQIKFVRELRNMPSQQLLAYVNNLIK >NZ_CP046528.1|WP_054681590.1|960293_960821_-|adenine-phosphoribosyltransferase MANIFKEHIASVPNFPNKGIVYRDVTPIVQDGKLYRLATHKLAEYAKSKKAEVIVGPEARGFIVGCPVATELGLGFVPARKPHKLPRPVVRASYDLEYGSNSLEMHKDAIKPGQRVVVCDDLLATSGTLRATKQLVETLGGEVVGAAFYVVLPDLNGYKKLSDLDIFSLVEFHGA >NZ_CP046528.1|WP_054681592.1|959619_960141_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKLRQATKADFDQIMDILKDGANQLAEHGVDQWQGDYPSPDQVNEDIEKGWAYLAISQDQQTVGAISIVDAPDHSYDKMKGKWLKDTNKYVVIHRVAIHSKHAGNGYATKLLTEVVNYIRDNRKDIDSIRIDTHEDNKAMQHLIDKMGFKRVGSLHGVYCLDETSYVYEMLLH >NZ_CP046528.1|WP_056970112.1|958079_959564_+|cardiolipin-synthase MVWDWNIIRKIIEILWLIDIVLAGWTVFRSHRDIASTWAWLLVLIGIPYIGFLIYLFLGRQISHDDIFAIQNEQKKIQDQYLTKQQEMLKQYDMLPEKEKSERARMLTTLNLNTDSAFITFDNNVKIFIDGTKLFKDIIEKINNAKESINVEFYTFYSDDLGNHVLKALEGAARRGVKVRVIYDASGSLGTKPSYFNNLRKLGGEVQTFISTSSKYWFRTPRLNYHLHRKLVIIDHKIGYIGGFNIGDQYVDKSKKFGHWRDTHLQVVGQAAIMMEIRFAMDWNTSCRKSRLPKYNLKNLDKLKLKRPTSEDQVAMQIVASGPDSQNFAIRRGYEGIIAGARKYVYIQSPYLIPEPSILEALIVSAKSSVDVRIMIPCMADHPFVYRATEYYAKYLTANGIKVYKYNNGFIHAKTMVSGSNICSVGSANQDYRSYMLNFEVNSFNYSPKLAEKLKKIFEDDLEQSTLLTNEYFDEQSHWRKFKQYFSRLLSPIL >NZ_CP046528.1|WP_063507416.1|955702_957976_+|HAD-IC-family-P-type-ATPase MSEKFHGLTQAEADKLLKKNGLNEVPEPKFNFFKEFLSKLWNLSAWILEAALLLECILGKWIQSLFVLLMLLFAAWNGASKKKQSRRVLNNISHKLTPTVSVERDDKWTTIDSKYLVVGDLISIQAGDVLSADTKIISGQLSFDESSITGEAKTVKKSVNDKAYAGTTVMEGSGLAVVTATGADSRSGKTINLINKSAAPGHLQQLLTKIIYYLCILDGILTLVIIIASFFKGGNLNTLVNMLPFLAMMFIASIPVAMPSTFALSNSFEATRLSKQGVLTSDLTGIQDAANLNLILLDKTGTITENKTAVAHWTNFSSLNNDQVLEFASAAIDQRNKKIIDTAIDDYVTAKGLPIKTGDDFTPFTSATGYSMADVDGHNVKLGSFKQLSLIDEDANQKVQDVDFGAGRSVALLIDNKLAGVFILQDKVRKDSKAALAELKKRGVRPIMLTGDNQRTAASVAKQVDLKGNVISIHDFNENTDITKLAGIADVLPEDKLRMVKFFQKKGYIVGMTGDGVNDSPALKQAEVGIAVSNAADVAKRSGKMVLLNDGLTSIVKILDAGHRVYQRMTTWSLTKLARTAELTMLLTFGYLFFNYIPMALNAMVIYTIMNNMVTMMIGTDRTHITYKPENWNMAKLAKIAFSLAAGWTVIGIGFIYYLNTHNWGHGTISTMVYVYLVLSAMLIVLITRTKKYFWQDHPAKLVGMVQIADVVLTFILALFGLAMTQISWANLLITVVIALAAASIIDLFYQPIMKNR >NZ_CP046528.1|WP_056970114.1|954266_955553_+|phosphopyruvate-hydratase MLKSVIENIHALEIFDSRGNPTVEAFVTLSNGIVGKAEVPSGASTGENEAVELRDGGKRLGGKGVTKAVNNVNTKIAKALKGMDPHDQAKIDQTMIDLDGTPNKAKLGANAILGVSMAVAVAAAKDSHEPLYRYLGGTDIEMPQTFHNVINGGEHADNGIDVQEFMITPVNKTSFRDGFEKIVNTYHTLKKVLEGMGFETGLGDEGGFAPNLKSSEEALKALHEAIVKAGYKPGKDIAIAFDCAASYFYNKDDKKYHFEGKVLDDQQLSDYYDKLFKEFPEIISIEDPYDENDIDGMVKFTKSHKDKIQIVLDDFICTNPKLLAKAIKEGAGNAALIKLNQIGTVSETLETVRLSRKNGYNTMISHRSGETGDTFLSDFAVAVKGGQLKAGAPARSERVEKYNRLLEIESELGKGEHIATFPDSIDKD >NZ_CP046528.1|WP_063507428.1|953537_954116_+|phosphatase-PAP2-family-protein MDNWVVVLSSAIILLLLIINIKNSRRFNLYDRWLHHKLIRNHDGFSWQVIAFLNDPKLMVVWAVLLAAFLINEEKNITALWVLATLGFADATGIILKRTIHRRRPFEHSDLESGYSFPSGHVLGATTMALILLQLFGKKLGLSFIIILGVIWVMVIVSRLSLRAHYPSDVIGAASLAILCFSISQQIFLAII >NZ_CP046528.1|WP_056970115.1|952386_953388_-|hypothetical-protein MKRLTNDKFIKKVNYIQHDQYKILSKYRNEYAKITVKCKKCGRKFDETAKTLMTYHIGKNCYHHINGNQESVANRIFKESKGTIIMIGKYNGAKNKTEMQCKVCNYKWSTEPYVVYKGHGCPQCSGKAKITTISFKKYLNRYAKDYKLIGLVISSKKKVKILHKECGNLFYMTPHNFIVSEERCPYSASKRRGDSNAYSFKKMNQILKLTTGNRYKVSSHYTRASKKAVCFDNKCKRHFISIPSMLSRNETGCPFCATSKGEKAIRIYLIDHRVSFKEQVKFSNCRNKRSLPFDFAVYKNNKLLYLIEFQGIQHYKHIELFDKTKCKIVCGNV >NZ_CP046528.1|WP_054682323.1|950876_952283_-|ISLre2-family-transposase MELIVTEIVKIIKSETNIIKREKAIAFFFLNLIRELMSLALERVDQELSGSMKNQGYQIEKKNQRSINMAFGEVTYVRRRYVKAGQESRYPLDKFMGFDKYKHYSVLAVRNILEVSSVATYRNTALAVNCLSGFNISHAQIGNLVKTAGQKIKEQQEADSRYDAQTAKKQVPVLYLEGDGVMIKGTQGRLEFHRYQVCEGLRNVTYKRRERTNAQEFVSLSRLDALNEAKEYIANTYDLANTLIISNADGGAGYAKKDFDEIVGRCAKHEHFLDVFHLNKKIKDRLCFAPELQGKLIYALEFKYDRDLVNIILDTAESKLIDELDTPQNHEHLARLRSYINRRWDDIKPFKMRNLKVTKAIGSCESNHRKYTYRVKGQGKYWSEAGAEGMLRILTCIKNRDLEQWLNSDFEAGKLISLDHKKLLAAARDSLKRRHEIHVGIQHGALTAEVAGGSYLAKLDRMLNHIKY >NZ_CP046528.1|WP_063507418.1|966434_968309_-|molecular-chaperone-DnaK MAKVIGIDLGTTNSAVAVLEGKEPKIITNPEGNRTTPSVVAFKDGEIQVGEVAKRQAITNPNTVSSIKRHMGEKDYKVKIGDKSYTPQEISAMILQYIKKFSEDYLGEKVTDAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLNVKRIINEPTASALAYGLDKDNDDEKVLVYDLGGGTFDVSILQLGDGVFQVLSTNGDTHLGGDDFDKRIMDWLIKNFKDENGVDLSKDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSSTHISLPFISAGESGPLHLEADLTRAKFDELTSDLVDKTKVPFDNALKDADLSVGDIDKVILNGGSTRIPAVQKAVKEWAGKEPDHSINPDEAVADGAAIQGGVISGDVKDIVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDKNTTIPTSKSQIFSTAADNQPAVDVHVLQGERPMAADDKTLGNFQLTDIPAAPRGVPQIKVTFDIDKNGIVNVSAKDMGTGKQQKITIKSSSGLSDAEIKKMQKEAEEHADEDKKKKKEVDLRNDVDQLIFTTEKTLKETKGKVPDADTKKVKDALADLKKAQKDNDLDEMKKKKDALSKVAQDLAVKLYQANGGNQGAAGQAGPQAGPKGPQGPKGPQGGNPNDGNAENGNFHKVDPNK >NZ_CP046528.1|WP_056970108.1|968326_968911_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MSKEEFPSEKDIDKKDVSSKTKKTKAKPDTKKKEETKKDSNEKLDKEIADLKDKNKKLEDKFLRSEAENQNMQNRYAKERSQLIKYQSQDLAKDVLPAMDNLERALNAEVDDKDSKQLKKGVQMTLDSLVKAMKDHGIVEIKAEGVKFDPTLHQAVQTVPAKSDDQKDHVVKVLQKGYQYKDRTLRPAMVVVAQ >NZ_CP046528.1|WP_063507419.1|968923_969973_-|heat-inducible-transcriptional-repressor-HrcA MLTERQELILKTIIKDFTKTHDPVGSKTVMNQLPMKVSSATIRNEMAVLEDKGLIEKTHSSSGRIPSSDGYRYYLDNLVEPLQLPESVYNQIVSELDRPFHQVNEIVQEAAKILSDLTNYTAFAEEPESHDVTVTGFRIVPLSNRQVMAILVTSDGNVQNQVYALPYNVHGDEVEKAVRMIDDELVGKTLKEITPSLLKKKLGVEHGGKHASELVSLVEDVIKDAASEQMYVDGQINLLNNTSKKDVKDLRSLYELVDHDDLISSLMDNCSKSKKGRYPVRVSLGSELPNELLKNYSLLTAEYNVGSHGKGVIALLGPTNMPYSQVIGLLEYFRNELAKKLLDYYGRFQ >NZ_CP046528.1|WP_156661109.1|970199_971570_+|ISNCY-family-transposase MNEQRKYQVIKDLVDQHKNKRRAALTLDITVRQVNRLIRKYQDKGKAAFVHGNRNRQPVNCLTTEINKQIVTLYRSKYQDCNFKHYTELLNRREHLPVSYSSVYSRLTQADIYPPKLWRKTRKKRAKARYRAKHPTAKTKTVKQAVNYQLALEDAHPRRERCKYFGEEIQMDASNIVWFGTKKAALHLAIDDATGNLVGAYFDWQETLNGYYHVFEQILKNYGIPYRFKTDNRTVFNYETAKTKSENKDVLTQFGYACQILGVNLVTTSVSQAKGRIERANQTVQSRLKPELRLAGVTTIEQANHYLTATFIPAFNREFGQDYRQVTSTFEQAPDNRKINYTLAVLSPRVFDSGSTISFKHKYYQAVKASGELVCFMKGTKCLVIEALDGQLLVTVKDQVYALKELAKNAQHSPDLDVAAKPKRPKKKYLPPMSHPWKRASFLAQQRKAHYQHQYA >NZ_CP046528.1|WP_063507420.1|971722_972658_-|riboflavin-biosynthesis-protein-RibF MKIIHLTYPVKENLIPSKIVLALGFFDGVHLGHQHLISVARDVAKKKSLPLAVMTFDRHPKEVYEKKANFAYIDSLDEKAFKMQQLGVDYLLVAAFTKKFSELNAQEFVDNVIVKLRPDTVVAGFDYTYGPKDVANMKNLPKFAQSRFNIIDVPKQTFDGKKIGSTEIKRAVRDGNMELAYELLGSHYVMSGTIGRGLRNGHKLGFPTANLVWKNKKVIPKIGVYATKTKIGGKWYDSMTSVGYNVTLNQSRRIYIESNLFGFNKEAYGQKMIIKWYKYTRGEIKFSGLQALKDQLKRDQKQIKAYFAKND >NZ_CP046528.1|WP_063507421.1|972678_973572_-|tRNA-pseudouridine(55)-synthase-TruB MLNGILVIDKDKGLTSADVVYHLRKALHIKKMGHAGTLDPNVTGVLPIAIGQATKLIELMHTKPKEYTGTGLFGYSTDSYDTDGKVLQEKKLTQPITAEQIKAAMKNFEGKIEQVPPIYSAVKVNGKRLYDYARAGIKVERPKRQVDIFSYKLVNAPRYDQGKVQESFDFVIKCSKGTYIRSLVNDLGVKLGVPAVMTNLRRTASSGFNIDQAVKLNEITTNPDEAAKLIQPIDNFFKDYLTIDLSSGVWMKVKNGVSVPLASDAKKVALRYNNKVKAIYQKQGEVYRPDLMLLQNE >NZ_CP046528.1|WP_054681583.1|973619_973985_-|ribosome-binding-factor-A MKHRIGRVEGEILRELTKILQRDIRDPRLSEVTLTAVECTNDLSYATVYYSLLTEDPKKEKEVKEGLKKAKGMMRHLLGQVLTVYKVPELIFKRDNSVKYGSKIDRLIAEVKKQDAERNNK >NZ_CP046528.1|WP_063507422.1|974003_976637_-|translation-initiation-factor-IF-2 MAKKRIYEIAKELGISNKVVVDKAKDLGFDVKNHMSSLDDSQMNQLKGSFHNSAPAKKQEKSSKKSSKIKISVSSIRKNEKNHENNNNQRRNNRRRNNNNRRSNDRNRGQNENRRGGQPRRAAKPAARNLLKQLKQKQRVEENSLNEQAQETKKQYHQSLKHPEKKTESTKDVKKTVDKKAFKKDTTDNKVIGPKILKPSPARLKKNNEAPHAAVGSKSKAAPAKENNRRGNGHGRSRNMGKPGRKGRNQFFNRGNHSDRRERRKRKNTRRQFKQAPKKQPTKRKSRPLPKVLVFKEGMNAQDIGKLLHREPAEIVKKLFMLGVMTNQNQSLDKDTIELLAADYGIDAKEKVHEDISDIDKLYNKRMAASKKSKNQVKRPPVVTIMGHVDHGKTTLLDRLRHTHVSAHEAGGITQKIGAYQVHLDKHLITFLDTPGHAAFSNMRERGAEITDIVVLVVAADDGVMPQTVEAIDHARSAKVPIIVAINKIDVPGANPKHVTEQLMKYNLIPEKYGGDTIFVNISAKTGENVEDLLQMILLQADVMELKADPKQAAIGTVIEARLSRGRGPVTDVLVQQGTLHDGDPIVVGDRFGKVRVMTNDRGHQVEKATPSMPVEITGLNDVPESADKLVVFNDEKTARNVGEQRAQQALQKSRENVQHVTLDNLFDTMKKENMKEVDIVLKADVQGSVEALQQSLEKIEVKGVRVNIIHSGVGAINESDVTLAGASNAFIIGFDVRPTATAKSQAEEDGVDIRLYSIIYKAIDDVKAAMQGMLEPTYENKVTGNLTVRETWKVSKVGTIAGAFVDSGYITRDSGVNLIRDGVVVYKGKVASLKRFKDDVKKVKQGLDCGLTIDGYNDIKIGDQIEAFEKQEVKPK >NZ_CP046528.1|WP_063507423.1|976641_976953_-|50S-ribosomal-protein-L7 MQSRQKALNLLGLAQRAGELDSGTDIVIAGLRGKQVKVVILANDIHADSSEKVTRVAKQNNVKIIDNFSSEELSHAIGKKRKVLGLTDDGFCKALVKKINEGV >NZ_CP046528.1|WP_056970104.1|976955_977231_-|YlxR-family-protein MRKDLLTDTMQPKKELVRIVIDKEKNVSVDPTGKKPGRGAYVSLDPSKIKMAEDKKVLERSLGTKIPESFYKDLYSYVDHQKARKELFGDK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046528_1 | 1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209127-209156 | 30 | NC_007807 | Pseudomonas phage 119X, complete genome | 42984-43013 | 6 | 0.8 |
NZ_CP046528_1 | 1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209127-209156 | 30 | DQ163914 | Bacteriophage 119X, complete genome | 42984-43013 | 6 | 0.8 |
NZ_CP046528_2 | 2.8|216445|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 216445-216474 | 30 | NZ_CP016317 | Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence | 219440-219469 | 6 | 0.8 |
NZ_CP046528_2 | 2.8|216445|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 216445-216474 | 30 | NC_018492 | Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence | 30841-30870 | 6 | 0.8 |
NZ_CP046528_1 | 1.3|208995|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 208995-209024 | 30 | AP018399 | Xanthomonas phage XacN1 DNA, complete genome | 176263-176292 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_1 | 1.4|209061|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209061-209090 | 30 | MH617278 | Microviridae sp. isolate ctcg764, complete genome | 1178-1207 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_1 | 1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209127-209156 | 30 | AP018320 | Nostoc sp. HK-01 plasmid plasmid2 DNA, complete genome | 307371-307400 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_1 | 1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209259-209288 | 30 | KX507046 | Vibrio phage S4-7, complete genome | 25509-25538 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_2 | 2.2|216049|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 216049-216078 | 30 | NZ_CP022523 | Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence | 1131642-1131671 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_2 | 2.10|216577|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 216577-216606 | 30 | AB711120 | Bacillus phage PM1 DNA, complete genome | 12359-12388 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_2 | 2.16|216973|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 216973-217002 | 30 | MN794232 | Vibrio phage VH1_2019, complete genome | 54333-54362 | 7 | 0.767 |
NZ_CP046528_1 | 1.3|208995|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 208995-209024 | 30 | NC_014535 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782206, complete sequence | 8637-8666 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.4|209061|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209061-209090 | 30 | MH616850 | Microviridae sp. isolate ctch832, complete genome | 1139-1168 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209193-209222 | 30 | NZ_CP017955 | Lactobacillus plantarum strain C410L1 plasmid unnamed1, complete sequence | 61602-61631 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209193-209222 | 30 | NZ_CP025417 | Lactobacillus plantarum strain X7021 plasmid unnamed5, complete sequence | 32435-32464 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209193-209222 | 30 | NZ_CP015858 | Lactobacillus plantarum strain LZ227 plasmid LZ227p1, complete sequence | 51518-51547 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209193-209222 | 30 | NZ_CP017956 | Lactobacillus plantarum strain C410L1 plasmid unnamed2, complete sequence | 29914-29943 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209193-209222 | 30 | MT457553 | Shewanella phage Thanatos-2, complete genome | 60003-60032 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209193-209222 | 30 | MT457552 | Shewanella phage Thanatos-1, complete genome | 56606-56635 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209259-209288 | 30 | NZ_CP054609 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed1, complete sequence | 199627-199656 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_1 | 1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 209259-209288 | 30 | KT895374 | Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome | 198239-198268 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_2 | 2.12|216709|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 216709-216738 | 30 | NZ_CP030855 | Runella sp. HYN0085 plasmid unnamed5, complete sequence | 22309-22338 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_2 | 2.16|216973|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 216973-217002 | 30 | JN849462 | Vibriophage phi-pp2, complete genome | 54933-54962 | 8 | 0.733 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 192530-192562 | 8 | 0.758 |
NZ_CP046528_1 | 1.1|208863|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 208863-208892 | 30 | NZ_CP044263 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-2, complete sequence | 3330-3359 | 9 | 0.7 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | KU599879 | Flavobacterium phage Fpv3, complete genome | 6908-6940 | 9 | 0.727 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | MK764441 | Flavobacterium phage FPSV-F12, complete genome | 8301-8333 | 9 | 0.727 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | KU599886 | Flavobacterium phage Fpv20, complete genome | 7714-7746 | 9 | 0.727 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | KT876726 | Flavobacterium phage FpV21, complete genome | 7715-7747 | 9 | 0.727 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | KT876724 | Flavobacterium phage FpV4, complete genome | 6849-6881 | 9 | 0.727 |
NZ_CP046528_4 | 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT | 401443-401475 | 33 | MK764449 | Flavobacterium phage FPSV-S29, complete genome | 7947-7979 | 9 | 0.727 |
1. spacer 1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007807 (Pseudomonas phage 119X, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaacgaggcttatttagaagccgaggatc CRISPR spacer taaccctggctgatttagaagccgaggttc Protospacer ** * **** *************** **
2. spacer 1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ163914 (Bacteriophage 119X, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaacgaggcttatttagaagccgaggatc CRISPR spacer taaccctggctgatttagaagccgaggttc Protospacer ** * **** *************** **
3. spacer 2.8|216445|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aacttatcaaaaaagggaggacgtacccta---- CRISPR spacer aacttatcaaaaaagtgaggatgt----taaagt Protospacer *************** *****.** **
4. spacer 2.8|216445|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aacttatcaaaaaagggaggacgtacccta---- CRISPR spacer aacttatcaaaaaagtgaggatgt----taaagt Protospacer *************** *****.** **
5. spacer 1.3|208995|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018399 (Xanthomonas phage XacN1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atctcacttgggtctttagtcttctgccca CRISPR spacer ctctcacttgggtctttaatcttgttcgtc Protospacer *****************.**** * * .
6. spacer 1.4|209061|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH617278 (Microviridae sp. isolate ctcg764, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggctgtctaagccttgttgataggctgctt CRISPR spacer ttctgtttaagccttgttgataggttagat Protospacer ****.*****************.*. *
7. spacer 1.5|209127|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018320 (Nostoc sp. HK-01 plasmid plasmid2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaaacgaggcttatttagaagccgaggatc CRISPR spacer atgaggaggctgatttagaagcagaggaat Protospacer * .* ****** ********** ***** .
8. spacer 1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX507046 (Vibrio phage S4-7, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tccatacctttattacggaagaatttatac CRISPR spacer attttatccttattacggaagaatttataa Protospacer .. **.*.********************
9. spacer 2.2|216049|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022523 (Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
taattgcctgtgagagtaagacagagagat CRISPR spacer tgtttccctgtgagagtaagacaaagcggg Protospacer *. ** *****************.** *.
10. spacer 2.10|216577|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to AB711120 (Bacillus phage PM1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
taacttgactgccttcaaaatcgaacattt CRISPR spacer ttacttgactgccttcatattcgaataccc Protospacer * *************** * *****.*...
11. spacer 2.16|216973|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN794232 (Vibrio phage VH1_2019, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttccaaaagagccagtacacgtgccaaccg CRISPR spacer caccaaaagagccagtacccgagccaccaa Protospacer . **************** ** **** * .
12. spacer 1.3|208995|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014535 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782206, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atctcacttgggtctttagtcttctgccca CRISPR spacer ggctcacttgggtctttaatcgtctcgcgt Protospacer . ****************.** *** *
13. spacer 1.4|209061|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH616850 (Microviridae sp. isolate ctch832, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ggctgtctaagccttgttgataggctgctt CRISPR spacer attttggtatgccttgttgataggctgttt Protospacer . .* ** *****************.**
14. spacer 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017955 (Lactobacillus plantarum strain C410L1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaagctgcaaaagctgatacctatgaagg CRISPR spacer gaaagctgcaaaagttgataccagtaagat Protospacer .*************.******* .*.*..
15. spacer 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025417 (Lactobacillus plantarum strain X7021 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaagctgcaaaagctgatacctatgaagg CRISPR spacer gaaagctgcaaaagttgataccagtaagat Protospacer .*************.******* .*.*..
16. spacer 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015858 (Lactobacillus plantarum strain LZ227 plasmid LZ227p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaagctgcaaaagctgatacctatgaagg CRISPR spacer gaaagctgcaaaagttgataccagtaagat Protospacer .*************.******* .*.*..
17. spacer 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017956 (Lactobacillus plantarum strain C410L1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaagctgcaaaagctgatacctatgaagg CRISPR spacer gaaagctgcaaaagttgataccagtaagat Protospacer .*************.******* .*.*..
18. spacer 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT457553 (Shewanella phage Thanatos-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaagctgcaaaagctgatacctatgaagg CRISPR spacer tcgtggtgcaaaaactgatatctatgaaga Protospacer . * *******.******.********.
19. spacer 1.6|209193|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT457552 (Shewanella phage Thanatos-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaagctgcaaaagctgatacctatgaagg CRISPR spacer tcgtggtgcaaaaactgatatctatgaaga Protospacer . * *******.******.********.
20. spacer 1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054609 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tccatacctttattacggaagaatttatac CRISPR spacer tccataccttaattacggaagacgaggaag Protospacer ********** *********** . *
21. spacer 1.7|209259|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT895374 (Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tccatacctttattacggaagaatttatac CRISPR spacer aaattatctttattacgcaagaatttaaaa Protospacer **.********** ********* *
22. spacer 2.12|216709|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP030855 (Runella sp. HYN0085 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attctagaaggtgaagcatgaaactatgga CRISPR spacer gtgaataaaggtgaaggaagaaactatgga Protospacer .* .********* * ***********
23. spacer 2.16|216973|30|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to JN849462 (Vibriophage phi-pp2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttccaaaagagccagtacacgtgccaaccg CRISPR spacer caccaaaagagccagtacccgagccgccaa Protospacer . **************** ** ***. * .
24. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer acatggtgataaaattcaatttgttgtttatgg Protospacer ** . *.** ***************.*****.
25. spacer 1.1|208863|30|NZ_CP046528|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044263 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tttacacctgctagaactattaatcctagt CRISPR spacer attacacctgctataacttttaatatcgaa Protospacer ************ **** ***** ....
26. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU599879 (Flavobacterium phage Fpv3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer tcttgatattctaattcaatttgttgcttaatt Protospacer ** . ** ** ******************
27. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK764441 (Flavobacterium phage FPSV-F12, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer tcttgatattctaattcaatttgttgcttaatt Protospacer ** . ** ** ******************
28. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU599886 (Flavobacterium phage Fpv20, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer tcttgatattctaattcaatttgttgcttaatt Protospacer ** . ** ** ******************
29. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to KT876726 (Flavobacterium phage FpV21, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer tcttgatattctaattcaatttgttgcttaatt Protospacer ** . ** ** ******************
30. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to KT876724 (Flavobacterium phage FpV4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer tcttgatattctaattcaatttgttgcttaatt Protospacer ** . ** ** ******************
31. spacer 4.4|401443|33|NZ_CP046528|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK764449 (Flavobacterium phage FPSV-S29, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaaactaatcaaattcaatttgttgcttatga CRISPR spacer tcttgatattctaattcaatttgttgcttaatt Protospacer ** . ** ** ******************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
18937 : 80730
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046528|18937:80730|DBSCAN-SWA TTTAAGCATACTGATGCTGGTAATGTGCCTTCCTTTGCTGGGCAAGAAATGAAGCTCGTTTCCACGGATGGCTCATTGGCGGCAGGTACTTTTTCTTAGGGCGTTTAGGCTTGGCAGCTACATCTAAATCCGGAGAGTGTTGGGCATTCTTAGCCAGCTCTTTTAAGGCATAGACCTGATCCTTCACGGTAACTAATAATTGTCCGTCTAAAGCTTCAATGACCAGGCATTTGGTGCCTTTCATGAAGCAAACTAATTCACCGGAAGCTTTAACTGCTTGATAGTATTTATGTTTAAAGGAAATTGTCGAGCCACTGTCAAATACCCGGGGTGAAAGCACCGCCAGGGTGTAATTGATTTTGCGGTTATCTGGGGCTTGTTCAAAGGTTGAAGTAACCTGCCGGTAGTCTTGACCAAACTCGCGATTAAAAGCTGGGATAAAGGTTGCAGTTAAATAGTGATTGGCCTGTTCAATGGTAGTCACCCCAGCTAGCCTTAGTTCCGGTTTCAAGCGGCTCTGTACGGTCTGGTTAGCCCGCTCAATTCGGCCTTTAGCTTGGGAGACACTGGTGGTCACTAGGTTAACACCGAGGATTTGGCAGGCATAGCCGAATTGCGTTAAGACATCTTTATTTTCAGACTTGGTTTTAGCAGTTTCATAGTTAAAGACAGTCCGGTTATCGGTCTTAAAGCGGTAAGGGATACCATAGTTTTTGAGGATTTGCTCAAAGACGTGGTAGTAACCGTTCAAAGTTTCCTGCCAGTCAAAGTAAGCACCAACCAGGTTGCCGGTCGCATCATCAATTGCCAGGTGCAGTGCAGCTTTTTTAGTCCCAAACCAAACAATATTTGAGGCATCCATTTGGATCTCCTCACCAAAATATTTACAGCGTTCCCGTCGTGGGTGAGCATCTTCTAAAGCCAGCTGATAGTTAACTGCTTGTTTAACAGTTTTAGTCTTGGCTGTTGGATGCTTGGCCCGATATCTAGCCTTAGCCCGTTTCTTGCGGGTTTTGCGCCAGAGTTTAGGCGGATAGATGTCGGCCTGGGTTAAGCGGCTGTAGACACTGCTATAAGAAACTGGCAGGTGCTCGCGCCGGTTTAATAATTCGGTGTAATGTTTAAAATTACAGTCTTGATATTTAGACCGGTATAAGGTTACAATTTGTTTGTTAATTTCTGTGGTGAGACAATTAACAGGTTGGCGGTTTCTGTTCCCATGAACAAAAGCCGCTTTTCCTTTGTCTTGGTATTTGCGGATGAGCCGGTTCACCTGCCTGACAGTAATGTCTAAGGTGAGGGCGGCTCGTCTTTTATTTTTGTGCTGGTCAACTAAATCTTTAATTACCTGATATTTTCTTTGCTCGTTCATTCTTAACTTAATCCTTCTCATATAGCACAATAACCTCCAATAGAGACTATTATACATATGTTATCTATTAGGACATTTTCCTTTGATAACAGTTAAGACATTATCACTTGTTAATCACACAAAAAACATGAAAAAGTCAAAAAATACTTGCGTGCTACTCGTTTATATGTTTTAATTAATAGCGTTGTCCGATGCGACAAAGTTGCTGACTTAGCTCAGTTGGCAGAGCACGTCATTAGTAATGATGAGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTAGTCAGCACTATAAGGATTCATTTAGTGTTATAAAGCTTTGTTTATCAGCGTTTTGTGAAGATAAATGAAGCTTTATTTTTTTGAATTAAAGTAAATGAAGCACATGATTCTGCACACGTTTTTGACTGTGTGCATGAAAGAAATTTTGAGAATGCTAAGAATGCTATAATGACGCAGTTTATAAGCAATATTTTGTGTGCAACGGCAAAACGTTTTAAGATAATTTGGATAATAGGTTACTTGGAAGATTGAGTAAGTAAGAGTTGAAGTTCAATTTAGAGTAAGAAAAGAAATAATTTCTGTACATGGATTAAATCGTGTGCATGTTAAAGTTTAAGGATAGAATACATGTTGTAATGACGGGCTTTAAGCCCGTTTTTTGTAAGTGTCAATATTTTTGCGGTAGGCTATTAACCATTAGTCTGACCTTAATTTCTTAAATATTTATTTGATTTATTTTTCTGCCGAAATCATCCAAATAGCTATGACCTGCTGTTAAGCTTTCGATTGCTCCATGATGAATGCCTAGATGAGCTTCATGCGTCTTTCTTAGGCTGGCACGAACTGCACCTTTCAATTCTTCCTGATCACCAATATCGAGCTGTCCACCTGCAAATTCACTGCTAAGCCAGTATTCCAGCTCATTGTTTTTAATGCAAGTTAGTACACGCAAAATACCCTCAGCGCCATTCTCTGACCAGTATTTTCCTTGTCCTTTGACGCGATAAGTATACTTGCGGTGATTGCTTTCACAGCAGCCAATTGCTTTAATTACGGACAAATGACGCATTTTGAATGGCTTAATATCCACCCAGCGACGATGAAGATAGCTGCGCAGGCGCCTTAAATTCTCATGATTTTCTGGCGTATTCAGCTCATCAACCAGATTGCTTTCAATCGTGTCTAAAATCACATCAGTTAAGTGACGGTCATATTTAAACTCAACTGCACTGATCAATTTGCTTGGCATAGCCGGCATAAAGCCTAAACGGCCCTTGATCTTTTTATTCAAGTGAAAGACGTCTAAGAAGTGTTCGTGCTGCTTGCAATAGCCAACTATTTCATCAAAGTCTTTCTTGGCATAGCCAGCACCACCATCGGCATTACTGATGATTAAAGTATTGCTTAAGTCATAGGTATTGGCTAAATAAGCTTTAATTTCTGGTAAAGCATCCAAGCGGCTTAAAGAAACAAACTCTTTGGCCTGTACTCTCTTTCTGCGCGTCTTGCTTAAATTAATAATATCCTCGCAGACTTGATAGCGATGAAATTCCAGTCGCTTCTTGGTGCCTTTAATCACAACGCCATCGCCTTCAAGATAAAGCACTGGCACCTTTTTCTTTTGAGTAATGCCATCGTATCTTTCCTCAGACTGCTGCTGTACTTTAATCTGTTTGCCTGCTTGCACAATCAGCTTGCCAACTTGACTATGGCTAATATTGAAACAGGAGAGAGTATTAACAGCTAAAGCAGTATTGCGGTAAGTTGCCACGGCGCTAACCTGCAAAATATTCTTCACTGCCAAAACACTGTAACGCTTATTTTTCTTCTCGATCTGATAGCCTTGCTTTTTAGTCTCTTCAACTAGACCAGCATCAACTTCTTCTAGTGCTGCTGTCATCAATTCTCTAATCAGATCAAAGAAGTAGCACATTAATGCCTTTTCACGGGCAATAACATTATTTTCAGACTGTCAATACTAAGCGAAAATGTCCTAAAAATTGTTAAACATAAGCGGGAACTTTATCCCGCTTTTTTGTTATTTTTTAAGCATACTGATGCTGGTAATGTGCCTTCCTTTGCTGGGCAAGAAATGAAGCTCGTTTCCACGGATGGCTCATTGGCGGCAGGTACTTTTTCTTAGGGCGTTTAGGCTTGGCAGCTACATCTAAATCCGGAGAGTGTTGGGCATTCTTAGCCAGCTCTTTTAAGGCATAGACCTGATCCTTCACGGTAACTAATAATTGTCCGTCTAAAGCTTCAATGACCAGGCATTTGGTGCCTTTCATGAAGCAAACTAATTCACCGGAAGCTTTAACTGCTTGATAGTATTTATGTTTAAAGGAAATTGTCGAGCCACTGTCAAATACCCGGGGTGAAAGCACCGCCAGGGTGTAATTGATTTTGCGGTTATCTGGGGCTTGTTCAAAGGTTGAAGTAACCTGCCGGTAGTCTTGACCAAACTCGCGATTAAAAGCTGGGATAAAGGTTGCAGTTAAATAGTGATTGGCCTGTTCAATGGTAGTCACCCCAGCTAGCCTTAGTTCCGGTTTCAAGCGGCTCTGTACGGTCTGGTTAGCCCGCTCAATTCGGCCTTTAGCTTGGGAGACACTGGTGGTCACTAGGTTAACACCGAGGATTTGGCAGGCATAGCCGAATTGCGTTAAGACATCTTTATTTTCAGACTTGGTTTTAGCAGTTTCATAGTTAAAGACAGTCCGGTTATCGGTCTTAAAGCGGTAAGGGATACCATAGTTTTTGAGGATTTGCTCAAAGACGTGGTAGTAACCGTTCAAAGTTTCCTGCCAGTCAAAGTAAGCACCAACCAGGTTGCCGGTCGCATCATCAATTGCCAGGTGCAGTGCAGCTTTTTTAGTCCCAAACCAAACAATACTTGAGGCATCCATTTGGATCTCCTCACCAAAATATTTACAGCGTTCCCGTCGTGGGTGAGCATCTTCTAAAGCCAGCTGATAGTTAACTGCTTGTTTAACAGTTTTAGTCTTGGCTGTTGGATGCTTGGCCCGATATCTAGCCTTAGCCCGTTTCTTGCGGGTTTTGCGCCAGAGTTTAGGCGGATAGATGTCGGCCTGGGTTAAGCGGCTGTAGACACTGCTATAAGAAACTGGCAGGTGCTCGCGCCGGTTTAATAATTCGGTGTAATGTTTAAAATTACAGTCTTGATATTTAGACCGGTATAAGGTTACAATTTGTTTGTTAATTTCTGTGGTGAGACAATTAACAGGTTGGCGGTTTCTGTTCCCATGAACAAAAGCCGCTTTTCCTTTGTCTTGGTATTTGCGGATGAGCCGGTTCACCTGCCTGACAGTAATGTCTAAGGTGAGGGCGGCTCGTCTTTTATTTTTGTGCTGGTCAACTAAATCTTTAATTACCTGATATTTTCTTTGCTCGTTCATTCTTAACTTAATCCTTCTCATATAGCACAATAACCTCCAATAGAGACTATTATACATATGTTATCTATTAGGACATTTTCCTTTGATAACAGTTAAGACATTATCACTTGTTAATCACAGGTAAGGATTTAATTGTTATAAAGTAATTGACAATAAATATTTATCAGGTTATAAATAAGATAATTATTAAATAATGGTGAATAAATGATAAAAACTAAAAA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43 | Lactobacillus_phage(26.67%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
283113 : 408058
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046528|283113:408058|DBSCAN-SWA 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112 | Erysipelothrix_phage(31.91%) | protease,tRNA,head,tail,holin,capsid,portal,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
868821 : 932877
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046528|868821:932877|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(15.79%) | integrase,transposase | attL 861437:861452|attR 914062:914077 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
997512 : 1006188
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046528|997512:1006188|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046528|997512:1006188|997512_999300_-|WP_063507836.1|DBSCAN-SWA MEDEHTESVWSKEIPVKEQLGIFKRLMHFVMRFKKEMLIALIGAFLVSAINMLLPFGLQYFLDNYLVHLSVPAQIILFAGLLYGVGSLIKAILQFTYEYFFALGSEKSLESVRRALYKKLHTLGMRYFDQTPAGSIVSRVTNDTMTLSNFLTVLGSIVMSFFSIVSAFVAMFTSNFVAGLIMLAFLPIMLFIIWQYSKRSSRLYRNYRERLSRINTDLNESIEGVSLIQQFKQEKRMINYFEGENNSLMKTRFNMINLNSMLLSPLTSMLYSLALAVALMYFGFPLRSTFVPAGVVYAFSQYLSQFFNPISTMMDQMTLFQDGIVAGKRIFKILDATQYEPKQNAQTGLTITKGKIEFKHVSFSYDGKNEILHDISFTVNPGETLGIVGHTGSGKSSIINVMMRFYEFHKGEILIDGVNIKKYPKKELRKKLGLVLQDPFMFYGDISSNIRLYNRNITDKQIKEAAKTVQADSFIEKMPGKYHAKVGEGGSELSQGQRQLISFARTLVSDPKILVLDEATANVDTETEALIQQGLKRLRKGRTTLAIAHRLSTIADADQIIVLDKGRIVERGTHEQLLAQKGYYYKLYTLQKKQK >NZ_CP046528|997512:1006188|999307_1001056_-|WP_063507837.1|DBSCAN-SWA MNIFSKLGWFFKKEKKRYILGITLLALTSFANLVPPRVLGLMADQLDTGHISWGQYVLLILAVIASAIVLYILRYFWRKQIWGGAAELERQLRSKLFRHFMVMDRTFYQRHRTGDLMAHATNDVSAVQNVAGDGIMTSVDSLVMGLSTIIAMIIFVDWRLTLVSLLPLPFLAWGANKVGIRLYDAFDESQAAFSRLNNKTQESVSGIKVIKTFGQGKEDTKAFYGMIDDTIKINKKVFKWDALFDPLGTMIVGLTYTITIIYGGLLVTKKILSIGQLVSFIAYIGNMVWPMFAIGYLFNILERGSASYDRIQDLLDEKPQITDKYADENLKPVDIQGDLKYQIKSFAYPDEKNIPVLKNINFTLKPGQTLGLVGKVGSGKTTIIQLLLREFDKYDGEISLNGHDIRKIPLNILLRQISYVPQNNYLFSTSIQKNISFSKTDATQNQIIAAAKKSDLHNDVLQMPKGYRTLVGENGVSLSGGQKQRMSIARALLKQSQILILDDALSAVDAKTETEILKSLRRERQGKTTMIAAHRLTSVMNADLILVLKNGQIVERGTHKQLLANNGWYADMWRKQELEESR >NZ_CP046528|997512:1006188|1004636_1005401_-|WP_056969707.1|DBSCAN-SWA MMKEPFLVDFDSNSRAVLEPNHEQKDYHFPRKLLYAFVPDDSIQKFLQKYQHKVIGEFLCISFNPKIFEIKIAGAKFTLCQAPLGAPAATQLLDWLIAYGVKQVLAIGSAGVLTAIPENYFLVPIKAIRDEGTSFHYLARSNYVDLRSTFLTKVEKAMKSMHYKVEEIMTWTTDGSFRETPAKVQQAKKLGASTVEMECAAMVACAQFRHVYFAQILFTADSLNDLDTDNERDWGVSSQIKVMNLAINVLKNIH >NZ_CP046528|997512:1006188|1003989_1004148_+|WP_156171240.1|DBSCAN-SWA MLAAMNIASVSFIVLIVVVLLGVVLYEVGLLHTEAENAGIPFHTFIKNLFKF >NZ_CP046528|997512:1006188|1001420_1001669_-|WP_056969699.1|DBSCAN-SWA MDKNEEKKMLNRINELYHKKENEGLTDDEKDERKKLHKKFIENFRSGFKQQLEDTVVLDKNGNEVTSEKAKRAQRKKGLRKD >NZ_CP046528|997512:1006188|1003189_1003843_-|WP_156661338.1|DBSCAN-SWA MKYPNDLISKVKQRSRGMKLEGINEGAGPKSPALMIVGEAPGRKEIQSHIPFHGSSGKELMKSLALIGLKRSDVYITSVVRSRPYAIKKVFSKRENKEVIKYPNRKPTKKEIFAHAPFLDYEIKHVKPKLIVAVGGTAIERLLGPGHSISQEHGKVVKNTSILQLNDKEDDYVWSKQKYTVFFQYHPAAVFYNRKLANDIKEDWLSIKPYLHKEAKK >NZ_CP046528|997512:1006188|1002489_1003188_-|WP_056969701.1|DBSCAN-SWA MSNETFLIPIKQNDDLSDIALDELRADLDDHPLNQRFYSDYAYLPGNAKKYSLNRINTRKSPLMGKKILFFGSSVTFGFGALGESFVDYLWKRDGVAAIKDADSVSHAESYLSRFKDELKEPKPELFTMQISKGNTVSDLKYIVTTAQKEWHCPILLYTNSFFTDPTYDRLVNQINKLAPKLGITVLDLYHNPEFKNQDSLYMIDEINPTRAGYRDKWLPVFERKLTEIFAK >NZ_CP046528|997512:1006188|1001136_1001352_-|WP_054681302.1|DBSCAN-SWA MNMVLAIVLIIIALLLGLVGGFYGARAYMKKYFKDNPPISEDMIVAMMSQMGQKPSAKKVNQVMNMMKHHK >NZ_CP046528|997512:1006188|1005420_1006188_-|WP_056969709.1|DBSCAN-SWA MNKSFILDFDPEPKAVLNPDYEKKDYHFPKKLLYAFIPPKSLRNFLKKYRHKVIGQFLSVSFSPKIYEVEIKNEKFTLCRAPLGAPAATQLLDWLIAYGVKQILAIGSAGVLTDIPENYFLIPTKAIRDEGTSFHYLPSSNFVDLKSSYLQEIENQMVEMHFKVKEVMTWSTDGFFRETPAKVAQFKKLGASTVEMECSAMAACAQFRHINFAQILFTADSLNDLNVHDDRGWGNNSHIRVMDLAANILINLTDK >NZ_CP046528|997512:1006188|1001817_1002441_+|WP_054681303.1|DBSCAN-SWA MNNNHDSKQIEILRYIYETVENRGFPPTVREICAAVHLSSTSTVHGHLSRLERKGLLIKDATKPRAIEVTKKGKEVLGIKPKEIPVVGDVTAGQPILAVEDIEDYFPLPPDLGTDTSDLFMLKVHGESMINAGILNGDNVIVRKQSTANNSEIVVAMTDENEATIKRFYKEKGHYRLQPENDTMAPIILPNVHILGKVVGLYRNSIN |
10 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1462368 : 1542306
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046528|1462368:1542306|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1551393 : 1577692
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP046528|1551393:1577692|DBSCAN-SWA 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26 | Bacillus_phage(57.14%) | protease,head,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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