Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046726 | Lactobacillus plantarum strain 8P-A3 chromosome, complete genome | 3 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 5 | 1 | 7 | 0 |
NZ_CP046727 | Lactobacillus plantarum strain 8P-A3 plasmid p8P-A3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046726_1 | 1133127-1133353 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046726_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP046726_1
>1.1|1133150|28|NZ_CP046726|PILER-CR CAGTAGTACGAAAAATACTAGTCAGACA >1.2|1133201|28|NZ_CP046726|PILER-CR TAACAGTGCCAAGAGTATTAATCAAGCG >1.3|1133252|28|NZ_CP046726|PILER-CR CAGTAGTGCGAAAAATACTAGTCAGACA >1.4|1133303|28|NZ_CP046726|PILER-CR TAACAGTGCCAAGAGTATTAATCAAGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046726_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046726_1 >merge|NZ_CP046726|1|1133127-1133353|PILER-CR ACCCGTACAAGCAATCAAGAATCCAGTAGTACGAAAAATACTAGTCAGACAACCAGTACAAGCAATCAAGAAGCTAACAGTGCCAAGAGTATTAATCAAGCGACCCGTACAAGCAATCAAGAATCCAGTAGTGCGAAAAATACTAGTCAGACAACCAGTACAAGCAATCAAGAAGCTAACAGTGCCAAGAGTATTAATCAAGCGACCCGTACAAGCAATCAAGAATC >NZ_CP046726|1|1|1133127-1133353|PILER-CR ACCCGTACAAGCAATCAAGAATC CAGTAGTACGAAAAATACTAGTCAGACA ACCAGTACAAGCAATCAAGAAGC TAACAGTGCCAAGAGTATTAATCAAGCG ACCCGTACAAGCAATCAAGAATC CAGTAGTGCGAAAAATACTAGTCAGACA ACCAGTACAAGCAATCAAGAAGC TAACAGTGCCAAGAGTATTAATCAAGCG ACCCGTACAAGCAATCAAGAATC
>NZ_CP046726.1|WP_027822092.1|1131617_1132364_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNIARFTPLRISSSEQEFILNFSLLEHDLIHFFKIRDFDHAISRINKFKEVHPINWIDAEILNQLLLGLIGSLTAASYTHNLNLNDFLKLRLYFFNFIKKSPCTSSTFWPLSNDIITTYFNLLDNFDFHVSYQNLSKQVALTAYYISAHPQELTNSHGVLHTLNLNNDYTQKLFKKELGFSINAYIQHIKLSEAKRLLLQRQLSVGKIASLLHFYDTPTFSKTFKKAVGLSPLKYRELNYLSLTSQSY >NZ_CP046726.1|WP_027822093.1|1130716_1131493_+|DUF4422-domain-containing-protein MKVQIYVAAHKPYQMPQDPTYRPIFVGAAIHGGAPQNYQPDDVGDNISASNPNFNELTAMYWIWKNCHADVKGLNQYRRYLSEAPKRKLAGILSMTEIESLLQQYDVIVPKKRHYYIESNYSHYVHAHHREPLDMMRTVISERHAAYLDDFDQLMHRTSAHMFNMMIMSGPKFDDYAKWVFDILFAVRDRIDIADYDVQEARVFGYLSEFLLDVWINHNQLKYVEVPVMYMEKQQLPAKAYNLLKRKFFPQAAKRTHF >NZ_CP046726.1|WP_046947460.1|1129501_1130581_+|acyltransferase-family-protein MRKRIEWIDIAKGIAILAVVVGHTLGPYNGQFFGSLIFAFHMPIFFMLSGYLYHSRPARQECQRGIINLLLPYLATAVVLLVVSAIARLLPNPLLNAYFPSWRQGLIATAYGAGSAVFNPWHWQVQPIGAVWFLLSMFIALQLFNGVMLLTARRHQRWRQAVVRGGVFAIFAILGGWLGQVAYLPWAVNAALLAQLFLYAGYLVKQTALLSRISSAWYLLFTFMWLVSAFQGYFALTVPTSPNLLISVMGGVAGSLCIIRVSDWLSHYPNARPIKWLKRYGQLSLVVLCFHLIDLNVIGIEGWLTNHLITHMGPLVTTIIAISYRIGFVTVAMLAIPHLPGIRACFLPRQYLFRRLQRR >NZ_CP046726.1|WP_046947459.1|1128408_1129518_+|hypothetical-protein MNHQQAYRVQRLILIIALMLILFGDTGMNAVFSFSHQPQSIWFYPQLVVALITAAGPNLLLMALGAYQLRRTALTVPQLIRRVLWIMGGITLFSLAFYLEDLVTQGSLTSFNIAGFFTALAQAPVGFYDILYELLGFFVTLPLLRVIAHHASVAIQQYLFWAELVFIGMVPILAYFTGLTTISVNPPLAITAGCFFALMGYWLSQTEVLHRITREHLLVAWLLTCGCYAVMVSVTMYQVNLEKNFDLISSQPFAQTFQAIPCLTLWVTIATWMMNRPRSKAVRRHNFVQTVYGDMLVAGLLITPFMVINRLLTPIIGAWWPGWLWSIAVLIVSVELVWLLRHVRWLQRILPDLFGGSQLIGGSVNAQKN >NZ_CP046726.1|WP_046947458.1|1126573_1127206_+|hypothetical-protein MRHMKVQPKERFSLAWRWLPLELLIIMLSVGLGWAGNRWLPKPVYQASVDIQIAQTPRSELSTARLKRQRRQDIKAITQFNVMPHQSAVLTQASTYAYAHYGIWQPIQELSESVQAAPVARRPVLRVTATSSSRQVAQQNAQAFNVAIKANLTGLKNYRVKTVKRTVTRETNVIRGALWKLILVVGGGLALLSPYLVKYGQGWGRHDDET >NZ_CP046726.1|WP_046947457.1|1125443_1126577_+|hypothetical-protein MKMRKRLAIVWGSLALLALLLGYACYALSIQRGQDTVTRIYQTDQNGTPIISPGPITLVGKVNHRNLFQSGINGYVLTNRDPLSTLLPRRNQTVHLKYRSAQTTAELRKTLRQARYLQAGTQNTTTPVFQNRQQRGDATTYGRISTSQDGRIWTKLPISYPHVQLSRPSVWYANGRLTLIDGQDRYWTTNFKDWQHQRLNFNGADFKQGRVQAVFPGTTRSAVVMVRGIDRQSSRAKLYYGQLTKTGRVKAWHALQLGKLPARQIAGMSLIDQHLYLFRQRGTQLAVYRANRLTRPVRLVGRVKLNHAQSQRVTAVNLIPTTKHRYRLIFDLTTAEKVQKQPRYRLLDRRFKAVGQQHLLVTDYLWSQFQISLRGSE >NZ_CP046726.1|WP_003644178.1|1124294_1125428_+|UDP-galactopyranose-mutase MNEQYDYLVVGAGLFGAVFAHEAALRGKRVKVIEKRDHIAGNIYTKEVAGIQVHQYGAHIFHTSDREIWDYVNQFAEFNRYTNSPVANYKGHMYNLPFNMNTFSELWGVRTPAEAAAKIAEQRAAANLGDHQPRNLEEQAIALIGTDIYEKLIKGYTEKQWGQKATDLPAFIIRRLPVRYTYDNNYFNDTYQGIPIGGYTQIVEKMLAHPEITVETNTDFFAHKAEYLAQYPKVVFTGMIDQFFDYQLGELAYRSLRFETETVPVDNYQGNAVVNYTDAETPYTRVIEHKHFEFGKGDADQTVITREFPANWQRGDEPYYPVNNQTNNTLYKQYAKLAAAEPQVIFGGRLGQYRYYDMHQVIHAALVTVASEFATTK >NZ_CP046726.1|WP_046947456.1|1122849_1123782_+|glycosyltransferase MQYGAIVVTFNRKQLLIESITALLNQTVPPAKIIIIDNHSTDGTKAELQTADILANPSVDYRYLTKNIGGAGGFARGMQIVAADPNLDWVSMSDDDAIFEPDYFEKLIAYQQDHPNRQILTGSVYIEDGRLQADQRNRFTNWSTFQAQAVPEREYRGNFEFDQYTFCGVFMSVAVIKQVGVADAGYFIWWDDCEYAVRTAKLSRPVNVSAAKLIHKTALPSLDFKSKFVPDWRLYYGQRNRLITIKRWRANSLVSLGWLLGFYARLAIQLCGPFYRGYRKMVIRVYLEALRDASREREGLNPNFMPGQKF >NZ_CP046726.1|WP_046947455.1|1121855_1122767_+|glycosyltransferase MAKIACVIVTYNRKQLLEEALNSVSIQAEAPEYVFVIDNASTDGTEKYINDKFNFDNRHWHYVRCSQNLGGSAGFAQGMRLALQTDCSWISISDDDALFEPGYFAALREGIKQYPEQSVFSGSVLLPDGKHDMMHREVITNSATLTVKPVTEETYKHDFSYDIFSFVGILLSRQVIEAIGLPEQDYFIRFDDFEYAVRALKFGRFMNLSAAKVLHKTTYTRSAIAPWKEYYVMRNRIALLIKHRGNNHTVRWYCRRFLLRKLLAILLFSNRRRQARSLVNAYVKGYQDGWHARLGRQLAFLPS >NZ_CP046726.1|WP_011101311.1|1120382_1121216_+|hypothetical-protein MPIKYSSQFELLLFYSDAFSNPWFLNQKLILVDHKISKLQASHHEMQFQVETTVIEWQRYRIHVMKELKLSPNTVQEFCQLNRDDLVVSDYFVENCREHNDIERAIMYCRTGIQQAAQDDNSTVMYHCYDQLVSLYRDCGLVNEYRHALFEAITKCDALNSNWYIQLREQYSSADWSNVRRQISASIIPQTDFEWDSFQNVSVRPYVLALQRDVKEATTPESQLSIIKQLDYLQKYHGSTGLEVADWLWQDWYRHYPERKVLIDAFDEWIAQIIEKY >NZ_CP046726.1|WP_003643204.1|1135924_1136365_+|MarR-family-transcriptional-regulator MLNHQQIKAQFESLETLQSIQKQVHQMSIQGLVTTGISMREWEVLVYLEQHEQASASELAKVFKVTRTLISRNTWHLIQDNLIQPQIDQSDRRIVWLSLTTTGQETIGKVARQIQANLQAFDCNHELATLMKQLRYLKQQLIILNN >NZ_CP046726.1|WP_046947462.1|1136494_1137916_-|flippase MRIIRNYFYTAGYNLLILLTPLLTVPYISRVLGPTGVGINATTNSIITYFLLFGTVGITIYGNREIAFIRDNRGQRSQTFWEIEILQLLTISCAYLAFLVFLFFEHQLQIYFFYQSFYIIAGAVDISWYFMGLEDFKKTVLRNMLVKIASVIAIFAFVKTRQDTGIYILILAGSQVLGNLTLWPYLRHSVERPNWRQLNLFRHLRPSLALFVPQIATTVYLALNKTMLWQMDSLTAAGFYDYSDKLIKLVLALVTATGTVMLPHIANLFMKQQLERVKQYLYMSFDFVLAIAIPMALGVAAVATTLAPLFFGRAFWAVDRLLMIEAPVIILIGMSNVLGQQFLLPTKQTKTYTISVTIGALVNIACNIPLIWFWGVAGAMCATLISEVCVTGYQLFITRHVLHAQSLFTGIWKYTLAGGLMFTFVFRLNVTMTASYLNLCLQIGVGVLLYLGLILLLQPPVLRNAIKLRNNLH >NZ_CP046726.1|WP_011101325.1|1138353_1139031_-|sugar-transferase MLLMELKEREIRPITIDAGRQHRRYGYRFIKRVFDFVASLLGLIILSPLFLLIAIAIKVEDPKGAVFYSQTRLGRGEVPFKMYKFRSMVSNADELLEKLLKDNEIDGAMFKMQDDPRVTKIGRFIRKYSIDELPQLLNVLQGSMSLVGPRPPLPREVEEYSDYDKQRLAVKPGCTGLWQATVRNSVGFDEMVKLDLTYISKRSVAFDVYILFKTVVIMFKPNGAY >NZ_CP046726.1|WP_024002857.1|1139898_1140204_+|hypothetical-protein MNDDWITVFPADYNNSYHLILKRGTAHYAYYYFKVDKLDQRVIFYDDIERSGISIKTQITRTFMRALVKAIDWHPVGNSIIIEIYPVDRQETKAIRLSCDI >NZ_CP046726.1|WP_003643208.1|1140305_1140533_-|DUF2922-domain-containing-protein MKTLDLSFKTSTNKVHHLKLHYANDNLSKDVVSKAMADLAATKLFVKDGENLVAEPLAAKYVETIETPIVTAPKA >NZ_CP046726.1|WP_003644190.1|1140562_1140775_-|hypothetical-protein MTKTWLKATLTVQTTTELDEQRKQTFNAIAQDATDEQLAAFGKIVEVLTGDQFTAANLANAYRYDPQPIA >NZ_CP046726.1|WP_024002858.1|1140889_1141084_-|hypothetical-protein MHIWMHTHVLLTVTDSNQRQFHQHWLAGRELTDSDFTSLITILTPLFAEKIISITVRTITEFAD >NZ_CP046726.1|WP_003643211.1|1141119_1141668_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MHADRFDNQMAFDLLARPEHQRLLYGALKAAQVTKYHPQFEDCVTVAHLTWLSAYQNYAPELPANLPDFRKFAFRRIKWRTVDYLRKQTLRTQSQVNLEHALPITIDPMTEQETHWQLTALLTELLVQCRPGERIYLTEFFFEEQTVSSIMRRHQVSRRTVYNWRASLLVKAHKLYQQQTTN >NZ_CP046726.1|WP_003644193.1|1141902_1142661_+|hypothetical-protein MLEINTDFEGDLPSMNQNIDVPHHVNTFWQCHAGTWDTRQPQRLLIIAQRSELATIDVLETLFLLDIKHLTCVENTLIFDRQRGLIKTKLTTRQIMMNYAGRLGLSGTQLIKQLAGELGLSKHKLPVIHGDAILMPLSTAKRGTTSWYNRHYLKHIEAQGFMTALVYDGQITIQVDMSERVATRQLAKAGQLQAALQEHHRRRLVPDQSVPSMADTDHEMMQSYTDQVLKHFGILALPGEISCLTRRFFGKL >NZ_CP046726.1|WP_003645955.1|1142693_1143497_+|recombination-regulator-RecX MTKKVTKIVAQKRAGRYNIYLDEQYAFPISESVMIKFRVFKGMEVDEQLQAAMIAADDVSKAYTRALDYLSHQLRTEKEVHDKLRDEEIDESVIDATMQQLRELRLLNDQQYADAFVRTAKRTSDKGPRVIRQNLRQKGVGEQLIDDALAGQFSAEEQIDNASELARKLAKRYHRQAFKTMQQKVRQGMMTKGFDNDTITAAIASLALEPDEDEQWEALVAQGAKLWQRNRKYAFRERMMRTKRSLFQKGFMMDDINRFIDEQVADE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046726_2 | 2626894-2627119 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046726_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP046726_2
>2.1|2626952|26|NZ_CP046726|PILER-CR CATTCAATGTTCCAAGCCCATTAGTA >2.2|2627036|26|NZ_CP046726|PILER-CR CATTCAACGTTCCTAGCCCATTAGTG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046726_2
The CRISPR arrays of NZ_CP046726_2 >merge|NZ_CP046726|2|2626894-2627119|PILER-CR ACTTGTCCAGAACCATCAGCCAACTGACTGACACCACTAGCCAACGCCCCAGTCTTACCATTCAATGTTCCAAGCCCATTAGTAACTTGTCCAGAACCATCAGCCAACTGACTGACACCACTAGCCAACGCCCCAGTCTTACCATTCAACGTTCCTAGCCCATTAGTGACTTGCCCGGAACCATCAGCCAACTGACTGACACCACTGGCTAACGCCCCGGTCTTAC >NZ_CP046726|2|2|2626894-2627119|PILER-CR ACTTGTCCAGAACCATCAGCCAACTGACTGACACCACTAGCCAACGCCCCAGTCTTAC CATTCAATGTTCCAAGCCCATTAGTA ACTTGTCCAGAACCATCAGCCAACTGACTGACACCACTAGCCAACGCCCCAGTCTTAC CATTCAACGTTCCTAGCCCATTAGTG ACTTGCCCGGAACCATCAGCCAACTGACTGACACCACTGGCTAACGCCCCGGTCTTAC
>NZ_CP046726.1|WP_033617504.1|2623105_2623663_+|hypothetical-protein MNYTSQANIHKFTVSLVIILLSSILISTTITLKISANTTSSSQQAIDCIAQELADVSNSIRYDPQTGLATNLDVNALVSKYGSNNQNQLQHINEIMKYEYKRNLQFNQGKLNSIQTRSFWSCMKNQLLDMIGYQTFQALLRGGIQGLIQRKAWKAAAKLLIRYLGDGIGVGFIAAQLSWYAIRCA >NZ_CP046726.1|WP_033617505.1|2622784_2623012_-|hypothetical-protein MMAVFKSSFKQSMIVFGISVIYFFVLHGGYDLLTQYKYWFTEYCANVLGISIIYFVMSLVFNYAIIIWKLYFRKH >NZ_CP046726.1|WP_046947542.1|2621221_2622616_+|MFS-transporter MSQPSTVTLKTKLAILSVGLLSFVGILVETSMNVTFPTLIKTMRVSLDTVQWLTTGYLLLTTIVMSTTAYVLKRFNPKPLFLFAALVCLLGGILCWLAPNFPILLTGRLLQAVATGISIPLMFQLIFTYVPRNQLGTYTGLASVIVSLAPALGPTYGGILTSVWSWRAIFVGIVPLLALLAILGAFNISGKALGVGDKKFDYLGAILLAITFTSLLFTFNNAGTHGWLSPNFGLWCLWSIVMIGAMVTYAIKGRRQLIDYSILKLPILRLRLFNYFGLQFINIGLSFVLPLFAQTVLGASAMTAGLMMLPGAIVGAITGPIAGRIYDKQGPTTLLTFSAIMASAALLLFWLTTDYFTVIIMAVIYALLRVGFNTGFGTAISDGSTRVPLPQKSDQNSMFSMMQQYAGSIGTSIMSAVIAGYEIHHPTVTGTIMGSKLDFLLLFVLAIAILISVLHVKRLEIGQN >NZ_CP046726.1|WP_003642174.1|2617414_2619202_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAARQSVWARSMPVKEQLTVIRRLLPYAKPFKCFFIAAIVFSGLISVVNIYLPRVLQTFIDHYLKTGHATVPVMWYFAGLYFFGMVVRALMQFVQNFSSTMGAEYMLENVRRQMFAKLHRMGMRYFDQVPGGSILSRLTNDTMSFSNFWALFNTLFTAFFAVISSFVAMYLTDAQIALWLLVFMPFLAVTIWYYQRYSSRVYRRMRERLSELNTKLSEAITGISVIQQFRQEHRINGEFDHTNDAYFKTRQAMIRTNSLLLSPLIDLFYALGTVMVLGIFGVRGLNGYVAAGVVYAFITYLNNFYNPMTSMMDNLSDFQDGVVAGSRVLRVMDDPTIAPAQHVDPTAKITRGKIEFRHVTFAYDGQHPVLKDVSFVAEPGQTVALVGQTGSGKTSTINVLMRFYEFQSGEVLIDDRDIREYPAEELRQKMGLVLQEPFMFYGDINSNIRMFNDQISDEQVQAAARFVKADDFINDLPENYQSRVIERGASYSSGQRQLISFARTIVTDPKILILDEATANVDTETEEMIQTGLDRIQENRTTIAIAHRLSTIQNADLILVLNQGQIVERGSNDELLQQHGYYYDMIQLQNSAHVD >NZ_CP046726.1|WP_003642172.1|2615748_2616777_-|aldo/keto-reductase MQYRQLGTSDLKVSSIALGCMGFGAGTGTALNQRSWAVGQMQANQVLDRAISLGINFFDTAPVYQAGASERVLGQGLKKFQRDQLVLATKFTNRTTQEIENHVSGREHVLRSLDQSLQNLQTDYVDLYIYHIWDWLTPMAEIMAGLNEAVQAGKVRYIGISNAYSWQIAQINALAVRYGYPQFVSIQSHYNLVYREDERELFSYAHENGLATTPYSPLASGRLAHPFGTQTTRRQQDTFADTKYQATSEMDKPIIDRVEELAHQHHVSMAAINLAWLQQRVTAPIIGATKPHHLDAVAEAAGLALTASEIQYLETPYQPHDLEGVMALNRSRTNNWNQYSGQ >NZ_CP046726.1|WP_003642171.1|2614779_2615646_-|DUF3737-family-protein MKTITQQYLTGERALFKAHDLEIDTTTFADGESPLKESRNVTLKQPIFKWKYPLWYSQHVTVDQGLFETMSRSGIWYTKDITITNSTLQAPKLFRRASQVKLAHVHFSDAEETLWNCQDITLNDVQAAGDYFGMNSQNIRIDGFSLVGNYAFDGAKNVEIHHATLMTKDALWNCENVTVYDSQIIGEYLGWNSKNIRFVNCTIESDQGLCYMDNVKLENCTLLNTDLAFEYCRNIDADVVSTIDSVKNPLSGRIHAQAIGEIIMDDPEVDPHQTLISVDHESRAPHAV >NZ_CP046726.1|WP_003642170.1|2613617_2614790_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MPFDFETVLNRRHTNAVKWDVADDELPMWVADMDFETAPVIKQALIKRAQFGVFGYEEVPMAYYEAVADWWATEHNFRPQIEWLMFCTGVVPAISSIVRKMTAAGDNVLVQAPVYNIFYHSIENNGRHTLSSDLVARDASYAIDWDDLTTKLADPLTTMMILCNPQNPIGIVWSRATLQRLGELCLKYHVLVVADEIHCDLTLNGHTYTPFSSLTAPVAHNSISCISPSKTFNVAALHAATLIIPDAHVRALVSRGINNDELAEPNSFAIPASIAAYTEGHDWVAALRTKLAANQRQVQTYLTAELPQVKLVEAQATYLLWLDVRQVTTDSAALAAFIRQRTGLFLSAGDAYRGDGNRFLRLNVACPTTTLTDGLARLKAGITAYQQVQA >NZ_CP046726.1|WP_003642169.1|2612875_2613469_-|NADP-oxidoreductase MKIGIIGAGTVGTVLAKTFARGDHQIKLSRHSGAASLATRRAEFAANVAFVEVAEALQQPLVILAVPFEQAPAVLAQVADYKQRIVVDVTNQFTADFKKIKTAPLTGSEVIARAANNARVIKAFNTIPPEFMDGHVDGPGKRVLFYAGDDVAAKKEFAALVRPLNFRPVNLGKLRHGGSVMQVGGGLGNTHFVQIEE >NZ_CP046726.1|WP_003644771.1|2611509_2612049_-|hypothetical-protein MSSYSNELLMLIFQSTLCKQVLIFFAYSGLYYLVTYFMDKKIQHQKQFLLKLGLVKLKKRNKTRWEKIRLIMQLFLIVSILVLVVSTFVLNPDDQYILLVIYVMKLATFTSFAIAFVDSLGPIKEIQQLIVGAQSSDTLDSDKKVLTVTIFKKIRWMLILYQVLKVPALIILLNLSVDY >NZ_CP046726.1|WP_003642167.1|2610418_2611102_+|noncanonical-pyrimidine-nucleotidase,-YjjG-family MQYAIFDLDNTILDFDRAEAANLAAVFQHHGVTDIRRAENEYQAYNETVWQQIEQGADRDSLLDQRFQVFLGTLGITVDGPAVQQEYDQLLAHSYQVIPGAHELLRTLTNAGLTLLVGTNGIKHTQLSRLAGAHMTPYFDHIFISESIGYAKPNPHFFSAIHDQYPDMNATNTVMIGDSLRSDIVGATTAHLPSIWYNPQHVHNDTTIAPTYTVDNFKQLQKLLLTV >NZ_CP046726.1|WP_033617510.1|2627882_2628437_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MVISIRTELDLQRAMYQLLEQRSISQITVEQICKQAFIHRSSFYRYYTDKFDLLRQMVMHTLDELLAAERTNTVGSAIMSTFIGAHTQVLRHLLVTNNEGDNTRSQQVINDCFVTVAETGADDRVFAMIRQSQHPDLTAYLVSGVVTSIVQWLNNGHRDGQAASTQAMIQGTLATVFSLEQHTV >NZ_CP046726.1|WP_003642181.1|2628535_2628865_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MVSSEEALQEFRETIPIFEVLADERRQQIMIELSQHAQGMTVGELTERMHISQPAVSHQLKTLKERHFVAVEHQGTRNYYRVTFDAPLTQVEHLIHTLKADLELKPYLH >NZ_CP046726.1|WP_024002907.1|2629362_2630307_-|DNA/RNA-non-specific-endonuclease MVKLMRRVGIAGLLSLSLLLGGCSLLTSGTDTTSSTTSQQSESSRNQTTSATGNTQQTYKQLAKMTYQSGSAAAIKVNSGKSTLAASQWKNSKIDYGNLDSLNRTTTDTAYLSKANLGRSEGRTAQTWSPTGWHNQPITVNGKRVYPQNRGHLIAYTLSFNLTSNGQYRAGEDGSLDNPKNLATQTAYSNQKTMQIYEDQVRTALEQGKKVIYRVTTVFRGNELMPRGYWSQAVSTDGSVNFNVYIWNVEPGVSFDYATGRGKADSTMQVAGADKVSSSQNTSASRSSQSTTTSKQVERELVKYGYKYVKKALN >NZ_CP046726.1|WP_003642183.1|2630383_2630929_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTATITIRPLQRAELTTLWQLGFSDPNAEWTRWNGPYFHDQLPTQTDFETIIGPRDWLIRPRNWVITRDGVIVGSVNWHFVDGSLKRWLEVGIIIYNQEHWGEHIGRTALTKWLTHLFQEETTLPHIGLTTWSGNMRMMQLAEAVGLKQEAWIPQVRYWQGQYYDSVKYGILRNDWQVQKD >NZ_CP046726.1|WP_003642184.1|2631191_2631719_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTQFETERLILRPMTAADHDALADMIFDPQVVAYLRYRRVQSPAAFEQLFTTHFLADTTTVFGIERRRDHQLIGFYEFHGSGATGELTYALSPAAWGHGYVAEAGNCLMHYGFETLNYETIEAHYASANPNSGRVMAKMGMQAAGELHTFTSDKGEVIHVMRYLLTKATWRQLSA >NZ_CP046726.1|WP_003644777.1|2632319_2633525_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTPETEQLLRRWYMGQLIVLFGAAFIQLFTFDGGVFFPVGGMQLLIWGLLAWWPAAEEDQAQWRRLRHVNYYVQTVLQFTLLPILLANLVAWLSQLSWLDEQGLIAVGMAYLMVAFVPVAVVVTKPIESVIGRIAVLITAIFSGVVSAQQTFLILPNLQAPSVFEMVSDTGILGALGFVIAVGVLLRGWGLTGPSWRFNRQAQTSLVVGLIVVGTAFSLWNAFSAGGSWATTFTHWDFQLRSATWKMFLSGLEPGIAEEWLYRFAVLTLLLQAFRHRRYQIDWAVWLSGGLFGMWHITNVFAGQPLSATVEQIIFAATLGWFLASTYLYSGSILLPMVIHAAIDILSMMASGSQTMVKPDVFEWQTIGATVIIFVGITIYFLTGSRRQVIQVHVNQRLSAQ >NZ_CP046726.1|WP_003644778.1|2633618_2635241_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLTVNNVSMQFSTRKLYEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILEGKLQPTTGTVSMGPNERMSSLNQNHFAFEDEEVLATVIRGHEKLYEIMTEKDALYAKPDFSDEDGIRAAELEGEFAEMDGWNAESEADQLLQNLGIDESMQHLKMSELTEPQKVKVLLGQALFGSPDVLLLDEPTNGLDVQSISWLEDFLAGYEKTVIVVSHDRHFLNQVCTHMCDVDFGKITLFVGNYDFWMESSQLAAKLQANANAKKADQIKELQEFVARFSANASKSKQATSRKKQLEKITLDDIKPSSRKYPFIKFTPDREIGNDLVKVENVSKSIEGVKILDNISFTLRPNEKTALISRNDLATTTLMQIIAGSMAPDSGTVTWGQTTSRTYLPKDINEEYAGSELPIIDWLRQFASKEESDNTFLRGFLGKMLFSGSDVERPVNVLSGGEKVRGMLSKMMLSRANVLLLDDPTNHLDLESITALNDSLIDFKGAIVFTSHDHEFIQTIADHIVEVSAKGVVDRGDTTYDEYLAHEATQGRVQDLY >NZ_CP046726.1|WP_003644779.1|2635553_2636348_-|HAD-family-hydrolase MTIKLIATDMDGTFLNDHGDYDQERFANDYAALQQRGIQFVIASGHQAAELATTFSAYPEMWLIGGNGAELWQREAGLKAATFSPQATQQVLAALAPYPELQVALCGTQTVHVLAHANPQFVANMRDYYYQLETCADLTTVTDPVVKFDVICPAAMTEQLVYELTPKLAGIAVPASGGQGSMDLIQPGMHKGRALKQLGEQLGILPDEMLVFGDGTNDLEMFHYATHAVAMQNAPENVQANATAVTGTNVDNGVLDYIEQHILS >NZ_CP046726.1|WP_021356587.1|2636434_2638267_-|DUF2207-domain-containing-protein MSKKRRLSWLSVLGLLAGFCWWFSLAMRAAADYDIDQYQVNVAIQRDGSANVTQAMTYQFDDDYHGVFNVQDLKGIQGAQLEGVTTQLNGGTTVTAAPSETGANNTYQLTQNADRMRVKLYRQVQEDDKLRVVYRYRLKGVVTNYADTAELNWKVIGSGWDVPLNNVKIVIQLPAKNVSALQAWTHGPLSGQTKVERAAGRVTMTLGHNPANQFVESHLLFPTTVTATNTRTNTAKRKATVQKQEAKLAQEANEKRRRNQLLRRVIFGAAVAGWLLVMIGYLWWLARHPAKPHQQPIPINHSFDVPPVTPAVAESLWAQRSPNTDALTAEILRAAANQEITIETVAGHRKPDVRLTQLKPVTNSFLAHCFDKIAVDGQFMLTDLKKYGKRDKAGRLGKWFSRWQTEVDQDVAVYQDETNYRLRNQWLMAAVVVSVMGMIATGAGLLVSPKVVTLMVIPAVVAAVAFWIGWIIQRRRIAINTDAGLELRNQINGLRRMLKDIGHFNTAQVGDLILWEQILPYAAAFGLANQVTKQLAIDFGTEALATGMLVYYPLFYANGGLDFDLSGAINDSFSGALDASGSASSASGGSGGFSGGSSGGFGGGSGGGAF >NZ_CP046726.1|WP_003642190.1|2638410_2640918_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MPQTTLPTHIQVRGAHVNNLKNIDIDIPLNEFVAITGRSGSGKSSLAMGVLYAEGARRYLNALSTFTRRRINQVGKASVDSVQYLPSALALRQRPQVPGVRSTVGTMSESLNILRLAFSRLSSAVCPNGHRMPPTLDVAENDGYVTCPTCGAKFRAPGAEDFAFNSGGACPTCGGLGQVRQIDPALIIADENQTIEEGAVASWHLPGRNFMPIVAREIGIPIDIPYKDLSEADKARVLHGPKQTVAINIPSAKGKIFHMDNAVYENAFAAVEDSMATTKNERAITRLNRFYKFDTCPDCHGSRFNPQLFNYELNGQNIATVSDMTVAALHDFAATIVPWLPTKMHHLGQSLVDELLLSLQPMEELGLDYLTLSRPGATLSTGELQRIQLGRTLRSATTGVLYVLDEPSVGLHPANVAGLIKAFRGLVAQGNSVVVVDHDTSIISAADDVIEIGPGAGKHGGTVVGQGTVAAIKQDKESLIAPFLTGTATLRERPVLTDDALWKKGALAIEVAHHFNIQDITARIPKNRFTTVTGMSGAGKTTLVLDSLIPALIATAKKRPLPTHVKAFDNGHIRHVVTVDSVPVGKNVRSTVATYTNILDHLRQLFAATPAAQANGWTASQFSYNVAAGACPTCGGTGQISLDVQYLPDITEVCPQCHGKRYNKQTLTVKWHGYSIADILDLAVDEALPIFKAQSAIANTLQILHDMGLGYLLLGESTPALSGGEAQRLKLTSRIGKRQTGTLFVFDEPSVGLHPLDIQQLVKVFDQLIQQGATVIAIEHDLDVIANADYVIDMGPAGGINGGNIVATGTPLAVSQNPTSVTGQYLKTHLALFHV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046726_3 | 2804888-2804973 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046726_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046726_3
>3.1|2804911|40|NZ_CP046726|CRISPRCasFinder CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046726_3
The CRISPR arrays of NZ_CP046726_3 >merge|NZ_CP046726|3|2804888-2804973|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT >NZ_CP046726|3|1|2804888-2804973|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT
>NZ_CP046726.1|WP_003643397.1|2803394_2804873_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALVLFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAGTYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK >NZ_CP046726.1|WP_003643396.1|2802324_2803278_-|aldo/keto-reductase MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATIDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQAAGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAISQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDMTLTRQEWYDVYFAAGNDLP >NZ_CP046726.1|WP_003643395.1|2801538_2802105_-|DUF1211-domain-containing-protein MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFGANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF >NZ_CP046726.1|WP_003643394.1|2800352_2801390_+|aldehyde-reductase MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTISNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP >NZ_CP046726.1|WP_003643393.1|2799659_2800226_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTMIHELLATLQTATMQALTQAQK >NZ_CP046726.1|WP_046947556.1|2798772_2799501_+|SDR-family-oxidoreductase MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKPFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA >NZ_CP046726.1|WP_003643392.1|2798274_2798640_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLKERVTAQPRYRNEFDATMQLIRGKWKIMILFELAEVKVSRFADLQHHIQAVSHKTLASQLKKLEQDELIERHDFKTAQPHVEYRLTAKGQSLIPILDAICTWGDQHVDPALIERSLCDE >NZ_CP046726.1|WP_003642340.1|2797706_2797991_+|DUF1905-domain-containing-protein MKTYQFDAPIQAATIGKGGAYVACPFDIRDLFGKGRVKVHATFDEVPYNGSIVNMGVKNLDGSICYILGIRKDIRAKLHKSIGDVVAVTVTAID >NZ_CP046726.1|WP_003643391.1|2794838_2797421_-|glycoside-hydrolase-family-25 MNFKSQNPIDASQSERFKLYKSGKLWLVAGLTFFSFLGGSVLNNTNVHADVTTATTTSSSAASTASSASVATSSAASDATTKATSVSSSATTQVTSAATTKTTSQAATASSSAATSQSTSTASSSTSQATKTASSAAASTSATATSQATSVASSTATTTQVSRTASSTAASAASSTATVKAVTPASSTVSSAATTAIKATAKVAAVAYTAATTSSTDVWTIGDTTRPRVDVVDVASYQSTMTQSDFNKLKAAGVKTVIVKSTEGTDYTNPAALNQAKMANKAGLNVDFYHYATFSTADAAKSEATNMAGFLVKNNVSTKVLLFADMEDSSSYSVNATANLNAFWSTLDSFGYKNHGVYTSNSYLYRDAVVKTVGQSRVWRAQYPYTPSANNLWNTNDGAWQFSDTALLPSGSDYTGYIDVSIDYNGLTEDSAGTNTFVTTTSSNDTTTSEVTTDTSATTNTSTSSTTKKASGWYTFTKNTAIKSAASDSAKTVGTYSKGNRVYYNAEVTTNGETWLRYLSYSGSEHFVKIAAAKTTTTKPAASTSKTVTKNETGTYKFTKTTAIKGSVSDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGETWLRYLSYSGAQHYVKISGAATSTTTTKPATSSSKTVTKAETGTYKFTGTTAIKGSVNDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGQTWLRYLSYSGAQHYVKISGAATTTTTSSKSTATASAKTVAQSGTYKFAKTTAIKSSASDAASTVGTYYKGNTVNYNAKVTTNGQTWLRYTSYSGAQHYVKVSGGAATTTSSSASKTTAAAGTYTFKTTTNIRTAASLNASVVGQYSAGESVYYIGTVSADGYQWLKYLSNSGAYHYVAKIG >NZ_CP046726.1|WP_046947555.1|2793155_2794568_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase MAYQTINPYTNEVVKTYDNATTDQIEQALTTGDALYHQWRHEPVSSRAASLHKIAALLREHKDELAKIATIDMGKLLSESQGEVELCAMIADYYADHGAELLAPTPISTQATGDAEIEKQATGVLMLVEPWNFPYYQIMRVFAPNYMVGNPMILKHASNTPGSAAAFAKIVEEAGAPAGSLTNLFLNYDQVSDIIADPRIQGVALTGSKRGGQAVAKAAGANLKKSSMELGGSDAFVVLADADIDEAVNLAWRVRLYNAGQVCTSSKRFIVAADVYDDFLAKLKERFAKLVPGDPMDPQTTLAPMNSKRAKEKLQDQVDRAIAGGATVAYGNEPIDLPGQFFQPTILTDIDQDNPLFYEEMFGPVAQVFKVDSEQAAIDLANNSELGLGGIVFAGTAAHGKAVAQQIETGMVFVNTFLSSLPELPFGGVKGSGYGRELSSLGLMAFVNEKLVVTAQKPDYDSGAGGLVVL >NZ_CP046726.1|WP_046947557.1|2804989_2805589_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTKTRRRGAELENAIYQAVRDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG >NZ_CP046726.1|WP_027821734.1|2805709_2806639_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MTKRWQIVKLGLVLGLMGSLLLGACGAKQPTSTTVTRTDYLKHKVKVPKHPKRIVASYLEDDLVALGIKPVVQWSVKNGSGTQAYLKEQLKGVPLIDYSLPYEAVTKAKPDLILIGTSSTVANGKYAQYNKIAPTYVVKNGTTVTWRQTFLDVAKVVNRQAKAKKVLAKYDKQVQTTRQALKKSGQHKVAVLWVTNNTAYMVNDNSASGALLYQDLQLGEPSLVKQVSKSATADWSAVSLEKLAKLDADDIFLVNSQKSASLFKDPLWKNIKAVKNNHLYQYGDSSSWQYSGPIAYSQMIDMVKTDLLK >NZ_CP046726.1|WP_003642350.1|2806875_2807670_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNTIEAQNISIGYGDKVIVDQLSITIPHGQITTLIGPNGSGKSTLIRAIAHLLPPTTGVILLDHQNIQQIKSKTFAKKIAVLPQTNQTANDLTVEELVSFGRLPYRRPLSGLTTTDHQKIEWALTQASLQDLRQRPLSTLSGGQRQRAWIAMAVAQDTDTIILDEPTTYLDLTHQLEVMQLVKKLNEQAHRTIIMALHDLNHAARISDQLIALKDGHVLAHGPVSTVMTAANLKTIFNIDATLVDYHGTPLILTYNGCQEVAPA >NZ_CP046726.1|WP_003643400.1|2807666_2808665_+|iron-ABC-transporter-permease MKSTSRYWGWLALSTGVLILVMGLSLRFGADQMRTATVWHALTTTHTGNLDQQIIRHIRVPRVLGAALIGAALAGSGALMQAVTRNPLADSGLLGINAGAGLMLTLCLAFFPKLSTLQTTGWAIIGAAASAGLIFSISTARHVQLDPTILVLAGIAISSLLTALSEGLALVLQLKQDLAFWYFGGLGAVSWTQLKFLGPGLVLGLLLTLLLAPQLNLAYLTDDNAQSLGKSLPLLRGLALICAVILSGISVALVGTITFVGLMIPHMARWLVGANYRNSMPLTLILGATLTVGADLIARLVNPPHETPFGIIISLIGVPCFIYLARKEPMKA >NZ_CP046726.1|WP_003642352.1|2808661_2809657_+|iron-ABC-transporter-permease MSPNRRLIIWSLLLTASMLGLAILNLSTGTMTISWPALLGILTGRGNATDMLVLVNFRLPRIVLAIMVGWALALSGNVLQTVTNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIIGAGTNASLTLSLPIVALAGAWLSTALIFLLANQRQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWSYIGWALPWLAVGSGILFIQLPVLDAFTLGTTTAQTLGINLKRQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGAPYFIYLLVRR >NZ_CP046726.1|WP_003643401.1|2809900_2810413_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MANQRNQRMQATILLAYENLLSDKPFRKITVQDISDAALVHRSTFYKHFQDQYDLLEALFEQKRQQSKLTIDQIFTHPFETLNSFGNARFQETLRHQFNDDAFRDAFLNYLIHLCKDTVDDDQRLVRFLAVGRIKGLTLWITVGNAPYNIFTDTATLDNIFSNPLNTVNY >NZ_CP046726.1|WP_003643402.1|2810393_2811287_-|SDR-family-oxidoreductase MKVFITGGTGFVGSAVVQELVANGFEVVGLARSETSAQKLISWGAQPVRGSLTSLSTLATAAAQADAIIHLGFNNDFRHFFQAGAMDRRAIETMGRAISGTNKPLVVTYGTTGIRKHVETEHEVADTGLLKWLTPRKSEIVARQLMAQNINAFVVRLSPAVHGAGDKGFTRTVIERAKKSHRAEYFGLGTHAWSAVHRLDAAHLFYLVTMYGLEHPTTNERVFNAVAEESITTAAIARTISRKLNVPLKAKYNPLSFGDTAMLYLINCPTSSQLTRQILGWVPVQPDLLTDISSSRY >NZ_CP046726.1|WP_003642355.1|2811580_2812327_-|SDR-family-oxidoreductase MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV >NZ_CP046726.1|WP_003643403.1|2812343_2812850_-|acetyltransferase MQTIQPIVDANQRRIQALNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIELADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD >NZ_CP046726.1|WP_003642357.1|2813108_2813945_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVMLPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046726_1 | 1.2|1133201|28|NZ_CP046726|PILER-CR | 1133201-1133228 | 28 | NZ_CP046726.1 | 1133099-1133126 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046726_1 | 1.3|1133252|28|NZ_CP046726|PILER-CR | 1133252-1133279 | 28 | NZ_CP046726.1 | 1133354-1133381 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046726_1 | 1.4|1133303|28|NZ_CP046726|PILER-CR | 1133303-1133330 | 28 | NZ_CP046726.1 | 1133099-1133126 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046726_2 | 2.1|2626952|26|NZ_CP046726|PILER-CR | 2626952-2626977 | 26 | NZ_CP046726.1 | 2626868-2626893 | 0 | 1.0 |
NZ_CP046726_1 | 1.1|1133150|28|NZ_CP046726|PILER-CR | 1133150-1133177 | 28 | NZ_CP046726.1 | 1133354-1133381 | 1 | 0.964 |
NZ_CP046726_1 | 1.3|1133252|28|NZ_CP046726|PILER-CR | 1133252-1133279 | 28 | NZ_CP046726.1 | 1133048-1133075 | 1 | 0.964 |
NZ_CP046726_1 | 1.1|1133150|28|NZ_CP046726|PILER-CR | 1133150-1133177 | 28 | NZ_CP046726.1 | 1133048-1133075 | 2 | 0.929 |
1. spacer 1.2|1133201|28|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 1133099-1133126, mismatch: 0, identity: 1.0
taacagtgccaagagtattaatcaagcg CRISPR spacer taacagtgccaagagtattaatcaagcg Protospacer ****************************
2. spacer 1.3|1133252|28|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 1133354-1133381, mismatch: 0, identity: 1.0
cagtagtgcgaaaaatactagtcagaca CRISPR spacer cagtagtgcgaaaaatactagtcagaca Protospacer ****************************
3. spacer 1.4|1133303|28|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 1133099-1133126, mismatch: 0, identity: 1.0
taacagtgccaagagtattaatcaagcg CRISPR spacer taacagtgccaagagtattaatcaagcg Protospacer ****************************
4. spacer 2.1|2626952|26|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 2626868-2626893, mismatch: 0, identity: 1.0
cattcaatgttccaagcccattagta CRISPR spacer cattcaatgttccaagcccattagta Protospacer **************************
5. spacer 1.1|1133150|28|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 1133354-1133381, mismatch: 1, identity: 0.964
cagtagtacgaaaaatactagtcagaca CRISPR spacer cagtagtgcgaaaaatactagtcagaca Protospacer *******.********************
6. spacer 1.3|1133252|28|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 1133048-1133075, mismatch: 1, identity: 0.964
cagtagtgcgaaaaatactagtcagaca CRISPR spacer cagtagtgcgaaaaatactagtcaggca Protospacer *************************.**
7. spacer 1.1|1133150|28|NZ_CP046726|PILER-CR matches to position: 1133048-1133075, mismatch: 2, identity: 0.929
cagtagtacgaaaaatactagtcagaca CRISPR spacer cagtagtgcgaaaaatactagtcaggca Protospacer *******.*****************.**
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 2.1|2626952|26|NZ_CP046726|PILER-CR matches to AP014283 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S23-C59, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
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DBSCAN-SWA_1 |
37991 : 55022
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046726|37991:55022|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046726|37991:55022|40604_41405_+|WP_046947481.1|DBSCAN-SWA MNEFATLDKAIELAQQGYSVYPLIENMKKPPKGVSGYKAATNDQNTILAWFENHPYYNLGLRLDTSHLLVVDVDIHDSTKNGKDSLMKLQCQGKTLSPDTYIEKTAGGGLHYFFKYTGDKVRKIDVWPGVDLLSDFTVISPSEINGKMYQPLDGRTLADIKPAPQWLVDKLAGQKVNWPSERAYTTHQKKYTGRLLDEMVTGTTQGDRNAWLTKIAGRMFGVGASPKTVYNMLSVINDSFVDPALPSKEVNVIFQSILKRESKGVH >NZ_CP046726|37991:55022|48688_50269_+|WP_046947490.1|capsid|DBSCAN-SWA MKNKQRFTLAAELKAEKRDAVPTEPENQDQSNSGEPATQAQQVDGKPVISGYAVVFNSPSLKMSTNDGTEFVEMIDPAALDGLDLSKLVLLNSHNWAQPLARADNGTLTTSVDDTGLKFTAELDPSVSYAMDTYNNIKNGVIGGCSFTFDLDNGDDTWTQDTASGQVTRTVNHIKDLYELTTTAIPSYGQSSVQQVIQIESRSYEKFINQAKEPDNMAKQTIIDPNTNDNGNENKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGASAVIPKELITPVFQLKQSNYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSQQSAVLATKDELADIADVDANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDAEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMGLLTGSNFAKATATNIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDSEGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPVVMISDKLLANNADGTFPMIAGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK 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20 | Lactococcus_phage(27.27%) | tail,head,terminase,capsid,integrase,portal | attL 31918:31931|attR 41480:41493 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
333163 : 379423
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046726|333163:379423|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_virus(50.0%) | protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
556203 : 604472
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046726|556203:604472|DBSCAN-SWA 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59 | Lactobacillus_phage(43.48%) | tail,tRNA,terminase,capsid,integrase,protease,portal | attL 550958:550972|attR 577074:577088 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
628518 : 637142
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046726|628518:637142|DBSCAN-SWA CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCAAAGATTTTTGCCAAGGCAATTAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGCGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCTCCAACGCAAGCGGACTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCGGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACAGCTAAGGATAGCTACGATCGGATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGGGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGCTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCAATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTATCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGTTAGCTCAGTTGGATGGTCAAGCGGCCGTTCAACCGGTAGCTGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTGCAAAGCGAGGTCAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCCGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAACATTTTGAGTGTGACGCAGCGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCACCAGCCAGGAGGTGCAACATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAACATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGCAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTCACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGCTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACGCGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTAATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACCAACGCTACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGAATCAAAGTGACCCGATTGGCGCACGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTCAAAGCCGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTGTTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTACGGCGTGCGTTTTTGATTTAGAACCCTAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATAGAAGATGTGTATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATCATCAAAACCACAATTGGTAGTAGCCGACCCACGTAAAAATCGTGAAAAAGTACCCTCACTAGTGGTAACCGTATTAGACAGGTACTCAAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGGAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGGGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGTTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTTCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTCACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGGGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGCGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAACAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCACAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAGCGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTGTTAAGGGTGACCCACGGAGTTTTGTGGCTGTGCAGGTCAATTTAGTTGGTTTGGCTAAGGACGCTGATCATCAGCTGGTTATGTTGGATTTAATTGCGGCCTTGTTCCAAGATCTATTGCAATTACATTTTGAGGTGGCAACGACAGCGTTAACCTTTGGTCAGTACCAAAAAGAATTGGCCGGGTTAACGGCTGAAGTCAGCGATGAGCAGTTGATTGCGGCGACAGAACTAGCTTTAACGGCCAAGCGCCAGCTAGCTAGCAATATTAGTTTTCAAAATGTCTTAGAAGGCTTAACGTTAAAGTTATGGCCGATTTTTCAAACAAACGCTTAAATAAAGGAAAACGAGGGTGAGCGCGTGGATAAGCGTGATTTATACGATAGTTTCGGTGAAATGGAACAACAGATGCAACAAATGCTAGACAAAATGGCTAAGTTACGCGCCGATATGACAACGGTGTTAGAGAAAAACGCGGAATTGGTCATTGAAAATGAACATTTACGTGAACACATGGTCGAAATTGAAAATGAATTGCCGAAAAAAGCGGCTAGCACGACCACGCTCTCAAAGTCACGGCAAAACTTGGAAAAACTCTATGATGAGGGCTTCCACGTCTGCAACCAGTTTTACGGCAAACGGCGTGACGATGACGAATCCTGCGTTTTTTGTTTGGAAGTCATTTATGGTGAACGTGAACGCGCATAGTCGAAAAAGTCTGGGAGTAGTCCCAGACTTTTTGTGCTTTTCACCACGAGTCACTCATAGGAACAAGTCACGGTCGAGAGGATTGTTAGGAGGACGTTTTGGAAACACAACAAAGTTTTGCAGATCATGCGGGTATCGGGACCTTGTACTTAGTACCGACGCCAATTGGCAACTTACAGGATATGACTTATCGGGCAGTGGCGATGCTTAAAACGGTTGACCTAATTGCCGCAGAAGATACCCGGAATACCCAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATTACAACGAAACAAATTAGCTTTCATGAACATAACACCCAAGAACGGATTCCCCAGTTAATTGAAAAATTACAGACGGGCGTTAACTTAGCACAAGTTAGCGATGCGGGGATGCCGTCAATCAGTGATCCCGGCAAAGAACTTGTGGCAGCCTGCATTGCCGCGAATATTCCAGTCGTGCCGCTACCAGGTGCCAATGCCGGCCTGACTGCGCTGATTGCTTCTGGCCTAGTGCCACAGCCATTTTATTTCTACGGCTTTTTACCGCGTAAGAAGAATGAACAAAAAGCTGATTTGGCTAAATTGGCTCGGCGACATGAAACAGTGGTCTTGTACGAATCGCCATTCCGTGTTGCCAAGACCTTGACCCTCCTAGCGACCGTCTGTGAAGGGACGCGGCCAATTGTGGCGTGCCGGGAATTGACTAAGCGTTACGAGGAATTCGCGCGTGGAACCTTGGCTGAAATGGTGACGTGGGCGCAGGATCATCAGTTAAAGGGCGAATTTGTCCTTTTGATCGGTGGTAATCCGGATAAGGATGAACCAGAAACAACGGATGAATTGGCACAGTTGCCAGTCAAAGCCCAAGTCGAAGCGTTGATTGCAGCCGGAGATAAGCCCAACGTGGCCATTAAGACGATTGCGAAGCGACGAAATATTCCCCGGCAAAGCGTTTATAATCAATTTCATGAACTAAATACCAACGATGAGGAGTCTTGATGAATGGCAACTTTAGGCGCAAATGCGAGTCTTTACAGTGAACAGCACCGGATTACGTATTATGAATGTGACCGCACTGGTCGCGCAACCTTAACGACATTAATTGATATTGCTGTACTGGCATCAGAGGATCAAAGCGACGCCCTTGGTTTAACGACGGAAATGGTGCAAAGCCATGGTGTCGGTTGGGTCGTCACGCAATATGCCATCGATATTACACGGATGCCCCGCCAAGACGAAGTCGTTACGATTGCCGTTCGGGGTAGTGCTTATAATCCATATTTTGCTTACCGTGAATTTTGGATTCGGGACGCAGATGGTCAACAGTTGGCCTATATTACGAGTATCTGGGTCATGATGAGTCAAACGACCCGGCGAATCGTAAAAATTTTACCAGAACTGGTCGCGCCGTATCAGTCGGAAGTCGTCAAGCGTATTCCGCGCTTGCCACGACCGATTAGTTTTGAAGCGACCGATACAACGATTACGAAGCCGTACCATGTCCGCTTCTTTGACATTGATCCCAACCGGCATGTTAATAATGCACACTATTTTGATTGGCTCGTAGATACGCTACCCGCGACGTTCTTGCTTCAACATGATTTAGTTCACGTTGACGTTCGCTATGAAAATGAAGTCAAGTACGGGCAAACGGTGACTGCTCATGCGAACATCTTACCGAGCGAAGTGGCCGATCAGGTCACGACGAGTCATTTGATCGAAGTTGATGATGAGAAGTGTTGTGAGGTCACGATTCAATGGCGGACTTTACCAGAGCCGATTCAGTAATTTGCTGGGTTGGTATTTACACTAGTGTGTTAATGATGTGGTCATGAGCGACTTGGTCGATTAGAACGCACGTTTTTATTAGAGTCGCTAGCGATTCAGTATGCTATGATTAATACATCCATACAGGGGAGGTTCATTATGTCAATTTTAGTTTTAGGGGGAGCTGGCTACATTGGTTCTCACATGGTTGATCGGTTAGTAGAACACGGTACGGACGTCGTGGTCGTTGATAATTTGGTCACGGGACACCGTGCTGCTGTTAATTCGGCGGCCAAGTTTTATCAGGGTGATTTGCGGGATGCGGATTTTTTGAATCACGTTTTTGATACTGAGGATATTGAAGCTGTCGTGCATTTTGCCGCCTTTTCAATCGTACCAGAATCAATGAGTAAGCCACTGAAGTACTTTGATAACAATACTGGTGGGATGATCACGTTACTTGAAACGATGCAGGCCCATAATGTGAAGCAAATCGTCTTCTCATCAACGGCCGCTACTTATGGGACACCTAAGCAGATTCCAATTAAAGAAACTGATCCACAGTTACCAATCAACCCGTATGGCGCCAGCAAGTTAATGATGGAACAGATTATGCACTGGGCGGACGTCGCCTATGGCATTAAGTTTGTCGCGTTACGTTACTTTAACGTTGCGGGTGCCAAGCCAGATGGCAGTATTGGCGAAGATCATGGCCCCGAAACACATCTGGTTCCAATCATTTTACAAGTTGCGCAAGGAAAACGCGATGAACTTAAAATCTTCGGCGATGACTATAATACGCCGGATGGGACGAATGTGCGTGACTATGTGCATGTTGTCGACTTAGCTGATGCACATATCTTGGCTTTGAAGTACTTGGCTGCAGGAAATGACAGCAATGCCTTTAACCTGGGTTCTTCAACTGGTTTCTCTAACAAACAAATGTTAGCGGCTGCTCGTGAAGTTACCGGGCAACCAATTCCAGCTAAGCTAGCACCACGGCGGCCTGGTGATCCAGACTCATTGGTTGCGGCGAGTGATAAGGCGCGTGACGTGCTAGGTTGGCAACCAAATTATGACAATGTTAACGATATTATTGAAACAGCGTGGGCTTGGACGCAGAAGCATCCCAATGGCTACGATGATCGTGACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046726|628518:637142|630237_630546_+|WP_003640956.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVAAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >NZ_CP046726|628518:637142|633876_634224_+|WP_003640967.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >NZ_CP046726|628518:637142|632832_633852_+|WP_003640966.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLADDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >NZ_CP046726|628518:637142|631824_632490_+|WP_011101140.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMASQLPTYVASKGGEDQ >NZ_CP046726|628518:637142|631175_631427_+|WP_003640957.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >NZ_CP046726|628518:637142|635222_636008_+|WP_003640969.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVKRIPRLPRPISFEATDTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ >NZ_CP046726|628518:637142|634322_635219_+|WP_013355239.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVAMLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >NZ_CP046726|628518:637142|628518_630216_+|WP_003644909.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >NZ_CP046726|628518:637142|632486_632816_+|WP_003640965.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >NZ_CP046726|628518:637142|636146_637142_+|WP_013355240.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHNVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVVDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >NZ_CP046726|628518:637142|630561_631161_+|WP_003637790.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1258583 : 1366070
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046726|1258583:1366070|DBSCAN-SWA GTCAATGCAGTAACATGATGGTAATTGCTAGGCTATTGATCACAAAGTGGAGCGCAATGGCCGCGCGAATTTTACGGGTCAGCCGATAAACAATAGCTAGCACGAGTCCCATGGTGACGTATATGAGGAAGCTCGGTAAGGTTGAACTACTATGGAGACTACCGAAAACAATCCCGCTGAGCCCGACCTTGAGCCATTCTTGTTGAAAGAAAAGGTTAGTCAGAACGCCACGAAAAACTAACTCTTCAACAATTGGAGTCAAAAAAACGGCGCTCAACGCCATAAGCCAAAGCGACAGAGGACTGCCGGCCATTAAATTTTTAATGGCGGCGTTATTTTGTGTTTGATTCTGGTGATACAGAAGCTGGTTTATAAATTGAAAGCCGCCCTCAAAAATTAAGATGGTGAGATAGGCCATTCCAATAATTTGCCAGTCATGGTGTTGTAAGTTTTCTGATTGATAGTTGCCGGTATAGTGCCGCATTAGGGCGGTTGCCGCCAGTGCTAGGATCACAAAAATTAACAGATAGACACCTGCCAGGGTGATCTGCCAGGCTGTGAGCTGATGCTGGCGATATAATTGGTTAATTAATTTAAGTAACATTGGTGGGATCACGACCCCAACAATTAGGCCAGCAGTGAGCAACACGCGTCCGAGCCACCCCAAGCCGCGGTCAATAATTTCCATCGGACTTCACCTCCCATGGTTGATTTTACCGCAGTGTTCAGGTTTCGACACGGATTTGCAAATCTGAGAAAGGCATCGATGCCAGGCACAAGCGGATGATATTAATCTGGTTGAATGCTAAAAATATAATAATTGTAGAAATAATGGTTGATGCTCTATAAAAATAAAGAATAAAAAAGCATAATTCGGACAAATCTTCACACTTTCTTCACAATTATGTAATAGTATATACTTGTACCTAATAGTTATACACTTGTTCATTTTACTCCCCCAAAGTGGATGGACGAGCAAGTACAATCCCCCATATTGTACTTAAACCTAACTCTTTGGCCCTACTGCTACTAAGCGGTAGAGTCATTTTTTTGTTGCACGTCCCCAAAGTCACCGAATACAGTACCTGCAAAAAATCGTCCCTTAATACATACTTAAATTATTTTTAGCGGTCTAAACTATCAAATTCAACTGGGTTTTATCATTTGATTTATTTTTTGCGGAATTAATGTGGCTGCAAACACCCATAATTATTTGATTGGTGCTAGCTAACGATTGTTCATATTAGCCTTGAACGGGCTAGTCTCAAAACAAAGTGACGCTAGTGTCAAAAATCAATTGGTTTAATCGCAACAAAAAAGGCCGAGGTTAGAAAAACCTCGACCTAGTTAAGCAGTCAGTTAGAATGCTTCACCAGAATAGTCGACCTTTTTAGGATCGGCATTTTTGATGTGTTCGGAAGCAAAGTTAACCGTTTCGCGAATCTGGTTATAGGTTGCTTCATCTAAACCAAGTAAATCCATGCAAGAATTAACGTGGGCAAAAATCTCTGGTTTAGCATCGATGGCTTTTTGCGACAACGAGATGTTGACTTGGCGTTCATCGTCCGTATCGCGCTTGCGTTCGACCCAGCCTTGGGTTTGCATCCGTTTCAATAACGGGGTCAGAGTCCCGCTATCAAGGTTAACGTGTGAACCAAGTTCCCGGACCGTCATCGGACTCTTTTCCCAGAGTGCCAATAAAGTGATGTACTGCGGATAAGTCAGCTTGAAAGGTGCTAAAGCTTCGGAATAAAAATGATTATATCGTTTGCTGGCGGTGTAGAGCGCAAAACAGAGCTGTTCGTCGAGCAAAATGTTTTTTGTTGGGGTTGCCATCAAACCGCCTCCTTTACTATCTATTTTAGTACATTGTACGCAATTAATTCGCCAAATGCAATTAATATTGCGCAAATACATTGTTTTCGAACGATTTATTTATAAAAGCGGGTTAATTAATTGACCTGTTGGCGTTGTTGGGACTTAATGCATGTCAGGAATAACTGGGCCATGGCCTGCTGATTGATGGCAAGTTGATGGTTGTCCGTGAACGCATAAAGTGGAACTTGTGCTGGCAATGTTTTGGCCGCGTGATCACCAACTGGAATCAGGCAGGCGATTTTTGTTTTGTCATGTACAAATTCATGAGCGTCACGTGGGGCGGCCTTAATCGTCAGTGATGCCAATACGTGATAACCGGTCGGCATCATGTGTTGTGCATGTTTGACATGCACCCCGTGTAGTCGGGAACGTAACTGGAACCCAGACGTGGTGGTCAACTGTAACGCTTGCTTTAATTCCAATAAATAAGTTTGTTGATTATCAATATTTTTCAACCGGATCTTGAAGTGTCCGAATGGAATGGCGCGATCCTGATGTTGGACGGCTAAGGCGTGTTGTTCGACCCGCATTTTATCCTTAACGGGCTCAAAGGTATATTGTTGTAAAAGTTGTGTTGCTGTTTTCAAACTATCACTCCCTACGATTAATTTAGTCCTTTAAAAACTTGTGGTCAAATAATTGGTTACGTTTGCGAGTGACGTCGTTTTCAAGTAAAATTAAAGTGATAGGGGGTTGGAAAAATGTTTATGACAACTGGTGATTTACAGCGCTCCCATATGATTAAGGGCGTCGTCTCCGTCACAAAACACCTGATGTTTGAATCTGATGGTGTTGATCAGTTTGAACGGTTTGACGATTTAATCGAGCAAGTCAAGCCACTACTGCTACAAAAGGCAGAGGATCAAGGTGGCGACGGGTTAATTTATGTGAACTTCAATACTGAAGTCGCTCAGATGAGTGTTGCACCACGGTTTTTGATCGTAACCGGCTATGGGACGGTCGTCAAGCTCGTTGATGAATCAGTCTGATACTTAGGATCTGAATTTTCAGGTCCTTTTTTGATAGCAAACAAGTGATAGAAAGGAAGGTTTGATGACCAGTTATTCATTTCCACATGGCGCCATTGACGTATACGACGCTACCCAAAACAATTTAAAGCACGTTAGTCTTCGCGTTCCTAAATATGCAACCACGGTGTTCGTGGGCTTGTCAGGTTCCGGTAAGTCGTCACTCGTTTTTGATACGATTGCAGCGGCGTCACGGCGCGAACTGAATGAAACGTTTCCCAGTTTTACGCAACAATATTTACCGAAGTATGGTCAACCACACGTCGGGCATATCGAGCACTTGCCCGTTGCGATTGTGATTGCTCAACAACGCCTCGGCAAGAATGCGCGTTCAACCTTGGCAACCTATACTGGGATTTATTCGTTACTGCGGCTCTTGTTTTCACGGGTTGGGGAACCGTTTATCGGGTATTCGGACAGTTTTTCGTTTAACTTACCCCAAGGCATGTGCCCAACCTGCCAAGGTTTAGGTTATGTTGACGATATTGATGAGCAGCAATTGATTGATCCTGAGAAATCATTAAATGAGGGGGCCATCACGTTTGTGAGTTTTGCACCGGATACGTGGCGTTGGCGCCGTTATGCGACGAGTGGTTTGTTTGACAATGATAAACCCATCAAGGATTATAGTGCTGCGGAATACGATTTACTGATGCACGCACCGCAACAGAAATTAGCCCATCCTGGAGAAGGTTTTCCTAGAACGGCCCTGTATGAAGGTGTTGTTCCGCGGATCAAGCGCTCGATTATTGGTAAGAAGGAAGCCGAACACCATCGCGATGCGATTGCGGCGATCGTCACGCGCAAACCGTGCCCAACGTGTGATGGCACACGACTCAAACCGGTCGTGTTGACCAATCATATTAACGGGGTCAACATTGCTCAGGTGACGGCTATGGATTTAAAGCATGTTCTGGCATTTTTACAAGCGATTGATGCGCCGTTAGCCCAAGATATTGTGCGGGAGCTGACGACCAAGATCCAATCGTTGGTCGATATTGGCCTGGGCTATCTGACATTGGATCGTGGGACCAGTTCTTTATCTGGTGGTGAAGCGCAACGGATTAAGATTGCCAAATACTTGACCAGCGCCTTAGTAGATATGGTCTACATTTTGGACGAGCCAAGCGTTGGGCTGCACCCACATGATATTCAGTTAATCAAGCAAGCGTTAACGAAGCTGAAGGATAAGGGTAACACAATTCTGATTGTTGAACACAATCCAGCCATGTTTACGTTAGCCGACTATGTTGTCGAGATGGGGCCTGCAGCTGGTCGCACTGGTGGAAACGTGACCTTTACCGGGACTTATGACGAGTTACTGGCTTCTGATACGTTGACGGGCCGGTGGTTGCGACAATCGCATAAATGGGGTCAAGAACGACCAGTCCAGGCCCACTTGGCATTACACCATATTAATGAAAATAACCTGCACGATGTCAGTGTCGACATGCCCCTCGGTGTGATGACGGTCGTCTCGGGGGTGGCCGGTTCAGGGAAGAGTTCGCTGGTTACCGCGCTAAAACGGCAATTAAAGACGGCTTATATTGATTTAGCCCAGACACCAGTGGGCCTGAATATTCGCTCAACACCGGCGACTTACTTAGGAGTGCTCGACCAAATCCGACAACTATTCGCGAAAGCCAATGGCGTGGCAACTAGTTGGTTCAGCTATAATGGTAAGGGTGCTTGTCCGCGGTGTAAGGGTAAAGGCGTGACCATCACGAATATGGCCTTTATGGATCCCGTTGTGCAGACATGTGAATTGTGTCATGGGCTGCGGTATAATGAAACGGCGCTCAGCTATGCTTACCAGGGTAAGACGATTGCCGACGTGCTCCAGATGTCAGTCACAGCGGCGTTAGCTTTTTTTGCCACGATGGACAAAGTGGCTCAGCCATTGAAGAATTTAGACCGGGTCGGTTTGGGTTACCTAACATTGGCGCAACCGCTCACCACTTTGTCGGGTGGTGAACTGCAACGGTTGAAGCTGGCGGTTGAGCTAGGCAAGCAGGGAACGGTGTACTTGTTAGATGAACCGACTGCCGGTCTGCATTTGCAAGACACACAACGCTTATTAAAATTATTCGATGC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100 | Lactobacillus_phage(82.14%) | tail,holin,head,terminase,tRNA,capsid,integrase,transposase,protease,portal | attL 1251395:1251412|attR 1357725:1357742 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2222205 : 2258281
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP046726|2222205:2258281|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP046726|2222205:2258281|2222575_2222872_-|WP_015380597.1|DBSCAN-SWA MHTLLGLGWDEWGSIVAIVTSICVLANWILNKTVRIPLNDLGKRLSRFTDESLKVRQQNADTMNAIENRVIKVEGRLDGHDIEFKHLYEKEAKGNEKN >NZ_CP046726|2222205:2258281|2237626_2237890_-|WP_031275283.1|DBSCAN-SWA MVQVIANNRNRIDDMRMRAVMDHKQAEMMAFALNDPSKMPSVEEAYPFIKTATSTSSDSVPEWKRDQLLLMQQSQKIKTARKFKKTT >NZ_CP046726|2222205:2258281|2249318_2249516_-|WP_015380624.1|DBSCAN-SWA MQKSFNYQDGFGEELSLAINPSSGFLLATDDVGGDSVAMSISFDELRRLAKLIDDEVPHGENDKK >NZ_CP046726|2222205:2258281|2243546_2245232_-|WP_046947684.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP046726|2222205:2258281|2247124_2248363_-|WP_046947682.1|terminase|DBSCAN-SWA MAISELYTPKQVQVLKTLRRTDWRLLINYGAVRSGKTVVDNDAFLMELRRVRQVADKLGVKEPMYILAGYSSKSLQNNVLQELTNKYDIKFQFDKHNSFTLFGVKIVQTFTGSIAGLGAIRGMTSFGAYINEASLANEEVFNEILNRCSAQGARIICDTNPDVPTHYLKASYIDNDDPKAGIVSFHFTIDDNTFLPPQYVEHQKAGTPSGMFYDRAILGLWVSGEGMVYKDFNKDEMIIPRAQLPADLTYYAGVDWGYEHKGTIVVMADDRVGNTYLIEEHTRQFEEIDYWVEIAKDIQHRYGRNVKFWADSARPEHVARFQREGLKAFNAKKSVLSGIESVAKCMKQGHFFVIKEAIDAFLDEIYQYVWDEATGLPVKLNDDVMDALRYAVYNTHERLKARTIKKPKGLRG >NZ_CP046726|2222205:2258281|2240245_2240578_-|WP_024971556.1|DBSCAN-SWA MAKPSPPDKAGQLTRLYTRLGVEKDTPDAAVVDDIFDDAVQTCLDYTRSSLSTPILIQAKRLAIIMYNEQGTEGEASRSEGGVSQSFELGLPNIIKTALAPYRVAKTRRF >NZ_CP046726|2222205:2258281|2254003_2254969_-|WP_052751304.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP046726|2222205:2258281|2222872_2223988_-|WP_046947698.1|DBSCAN-SWA MAFLMVNVTSQAARMDMVDVSNNNGYMSTAEYTSMRNEFGVKALTVKISEGTTFKDGYAASNIANGQAAGLYVNGYHFAHYKTRAQAIAEADFAGQAAKAAGLPVGAVLATDVESAEEQGILSQATNDRNNAAFMREIQKFGYRADIYTSGSWANNKMTIKGKTGWVAGYPYVMSGQKWYTNNNAWQWSGSARFRISYGGFDVSQLYTDYYTAGQKSTVKPTDKDAVKANNQEANKNTSKPSTSAKWVKESKIYTLKTAVKLRIGASTSSSVITTLPAGTTVKTDQAIIQGGYRWARQPRFNGYGYLATGPASNTLEYVNSGATHMYYTVKSGDSWWSIAQRNGLSMTTLASQNGKTIYITIYPGQRLVVR >NZ_CP046726|2222205:2258281|2240589_2240766_-|WP_003642820.1|DBSCAN-SWA MKVRVKDYPIRYKDTRYKKGDELSITQDAFNDELFVCLDKQKDEKTADNAQLETDDEE >NZ_CP046726|2222205:2258281|2222205_2222589_-|WP_046947690.1|holin|DBSCAN-SWA MKKISFKNADGSLNGKLIAGIISLLIVLIQQVFAMFGVKFTGDWSAVVAVINTVLTILGMLGVITDVQTVAAPTVDSNEKIQVEATTNKVADEVQGPASTAAVADSSASSDTETTSESASQSGEKVV >NZ_CP046726|2222205:2258281|2240778_2241801_-|WP_003642819.1|DBSCAN-SWA MAQISDLFTQHDLIDFSLNRQYPAMQGDELFPAIKVNSLTVDILKRQNRIPVIASYAAFDSEAEIGSRSASGAAIELALIKRKMQIKEKDLYAMLNPRTPAEASYLQQHVYNDFDVLNQGVLARIEKTAMDVLATGKTILPDESGKLAVQLDYQVPTEHQEALTGAATWDNGDADILGDITRWCDKMDITPTRALTSRKIYRLITTNTKVLQAVYGNSTRALGQADFDTFMQAQGLPIFRTYDQKYTQVGKDGKITKSRYFPENRLVLMNDDPIGNKVFGPTPEELAQFSGPAQINAVGNVYDMIYTETNDPIGTWEKASAVALPAFAAADEVFQAQVLA >NZ_CP046726|2222205:2258281|2255528_2255642_-|WP_046947676.1|DBSCAN-SWA MNGYDSWLVDQEEAAEGWRDDVPTEEELIESGVIADY |
42 | Oenococcus_phage(43.33%) | tail,holin,terminase,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2456738 : 2465252
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP046726|2456738:2465252|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP046726|2456738:2465252|2459770_2461990_-|WP_003642590.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEANFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >NZ_CP046726|2456738:2465252|2461982_2462663_-|WP_003644726.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEVGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >NZ_CP046726|2456738:2465252|2456738_2457317_-|WP_003642593.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANIPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIKLVLLAGYMRIIGPTLLNAYSHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFDAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >NZ_CP046726|2456738:2465252|2462918_2463650_-|WP_003642587.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >NZ_CP046726|2456738:2465252|2462662_2462917_-|WP_003642588.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >NZ_CP046726|2456738:2465252|2464766_2465252_-|WP_003642585.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >NZ_CP046726|2456738:2465252|2457309_2458335_-|WP_003642592.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLVVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTAPVVFEEAEHA >NZ_CP046726|2456738:2465252|2458331_2459786_-|WP_003642591.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >NZ_CP046726|2456738:2465252|2463652_2464783_-|WP_003644727.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAAVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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