Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027 | Cellulophaga sp. L1A9 chromosome, complete genome | 6 crisprs | WYL,DEDDh,cas3 | 0 | 1 | 4 | 0 |
1. NZ_CP047027
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027_2 | 377815-377914 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047027_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047027_2
>2.1|377840|50|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder GTAGAAGCACAAACAGATGCAGGTTTAGTACAACTATCGGGCAACGATGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047027_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047027_2 >merge|NZ_CP047027|2|377815-377914|CRISPRCasFinder TGATAATGATGGGATACAAGATTTAGTAGAAGCACAAACAGATGCAGGTTTAGTACAACTATCGGGCAACGATGCTGATAATGATGGGATTGATGATGCT >NZ_CP047027|2|2|377815-377914|CRISPRCasFinder TGATAATGATGGGATACAAGATTTA GTAGAAGCACAAACAGATGCAGGTTTAGTACAACTATCGGGCAACGATGC TGATAATGATGGGATTGATGATGCT
>NZ_CP047027.1|WP_158973692.1|369295_370723_+|HD-domain-containing-protein MTHTNHEQALKNPIFKTIAAAAKELNLDCYVIGGFVRDYLLDRGTAKDIDIVAIGSGIALAKKVASKLKGKPEVSVFKNFGTAMIKHDDIELEFVGARKESYHEDSRKPVVEDGSLEDDQKRRDFTINALAISLNETNYGTLLDPFNGIQDLADKIIKTPLAPGITYSDDPLRMMRAIRFATQLDFKIEEASLNAITENKDRIKIISKERIVDELHKILASKTPSLGFSLLHKTQLLGYILPELTALQGIEEIEGQRHKDNFWHTLEVVDNIAKNTDNVWLRWAALLHDIGKAPTKRFDKKIGWTFHSHEFIGSKMVYKLFKRLRMPLNDKMKFVQKMVLLSSRPIILSEDFATDSAVRRLIFDAGENIEDLMTLCEADITTKNPKKQKRYQNNFKLVRQKIVEVEERDHVRNFQPPISGEEIMETFNLKPSKEIGIIKEAIKEAILEGEILNEYDAAYQFMLKKGSEIGLSSTK >NZ_CP047027.1|WP_158973691.1|368733_369294_+|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MQEEINKCIEILSKGGLILYPTDTVWGIGCDATNEEAVAKIYALKQRKNTKAMICLVANDFMLEKYIDAVPEVAYDIIDLATKPTTIVYDNPKGVAKNLVAEDNTLAIRVASDKFCQYLITKFKKPIVSTSANVAGEATPQTFKEITSAILKGVDYVVNLHQDQNSGTPSSIIKLGNDGVVKIIRE >NZ_CP047027.1|WP_158973690.1|367791_368562_-|glycosyltransferase MKEKLSVFIITYNEERILDKCLNKLSWADEIIVVDSGSTDATLEICKKYHVKLFHKDFEGFGTQKQFALEKTTNNWVLSLDADEILSEELITEIQENLKPEMNISGFYLKRKHVFLGKVFDYGPDSKEYILRLFNKNMGKFDGKKVHENIILEGESAKLKNNFLHFTTRSLDNYIVKLSNYATIYAEGKYLKNKNYSIATIFIRVKLEFFKKYFVELNFLNGKEGFYWSYLAAYYMGLKYMKTNEQYKQVKKQLMF >NZ_CP047027.1|WP_158973689.1|365968_367795_+|glycosyltransferase MKTVLFCQNAYAFGILAPIRAVLQKESHEYIWYISPKLLDTFPFKKENFTTSILDLQLFESDAIFAPGNEVPYYLRGVKVQIFHGLAGEKKGHFRIRHYFDLYLTQGPYFTQKFNAFKAQYQNFEVVETGWPKLDIYRSEAHDYSTEKETLLNKYNTDKIILYAPTFSPSLTSAPYLLDQIKELALNTGYLVLIKFHDLMDVKWIAAYKKLSEEIPNILFKEDKNIIKYLLLADLMVSDTSSVIYEFLLLNKPVITFKNISENIQWLDAKSYDSLTDKVRTSIANDSFALQRKELCAQYHPYNDGKSAARMVQTTKEYIAKNGVPNERKLSFLRRKKIRKIFGKPTKDICTGPKKEKISALVITYNEEEHINGVLENLQFADEIIVVDSFSTDTTIEKIKAFKNIHLIQRPFKDFTDQKAYALAQAKHNWVLFIDADERLTDALKNEVLKTVNSDQKKAAAYYFLRIFMFEKQRMRFTGTQSDKNYRLFQKSKVKFDTTKTVHETLLVDGESKVLKNKLIHYSYNNYEEFKNKRLKYTSMQAKELLAKNKKPTAFHFVIKPAFRFFKHYVIGLGFLDGKKGIILSYLMALGIHNRYSELKKLRKEKQL >NZ_CP047027.1|WP_158973688.1|365279_365969_+|NTP-transferase-domain-containing-protein MIMKIVILAAGMGSRLGNPFPKPLTPLVNGKSIMQMQVDNIDAYYSIDDISVVVGFKKNLIMERFPDLSYIYNPFFDNTNTSKSLLKALKKFRDKSVLWMNGDVVFDEKLFDVLSPFIKKKQSFVAVNTSKVADEEVKYTLENGFIKKLSKTVTGGLGEAVGINYIASKDINSFIARLEECDANDYFERGIEIAIEKDGLEVCAVDISQYNCMEVDFQEDLDNANKLLE >NZ_CP047027.1|WP_158973687.1|364280_365096_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MTELREQIEKAWDNRDLLKEEKTQTAIRSVIDLLDEGKLRCAEPTTDGWQINEWVKKAVVLYFPIQKMETLEAGIFEYHDKMPLKRGYKEKGIRVVPGATARHGAYISAGTILMPSYVNIGAYVDEGTMVDTWATVGSCAQIGKNVHLSGGVGIGGVLEPLQAAPVIIEDNVFVGSRCIVVEGVRVEKEAVLGANVVLTASTKIIDVTGDTPVERKGLVPARSVVIPGSYTKKFAAGEYNVPCALIIGTRKESTNKKTSLNDALREYDVAV >NZ_CP047027.1|WP_158973686.1|363767_364178_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MARIVAIDYGKVRTGIAVTDELQLIASGLTTVATKELIDFLKNYIATENVELIVVGEPKQMNNQVSESEALILPFIEKLKLSFPSMKIERQDERFTSKMAFQTMIDSGLKKKQRRDKALVDEISATIILQAYLNRI >NZ_CP047027.1|WP_158973685.1|363172_363763_-|peptide-deformylase MILPIIAYGDPVLRKVGTDIAKDYPKLETLVENMWETMYNASGVGLAAPQIGLPIRLFVIDTTPFSEDEDLAPEDQKALDGFKKVFVNAKIEEETGEEWNFNEGCLSIPDIREDVNRKETIKITYLDENFNEKSESYGGLLARVIQHEYDHIEGILFTDKLSSLKKRLLKGKLSNISKGKISADYRMRFPDMKKGR >NZ_CP047027.1|WP_158973684.1|362687_363116_-|hypothetical-protein MSLDKILSIGGKPGLFKLLTQTRAGFVAESLLDGKKITVGFKNNVSVLSEIAIYTLDAEIPLREVFRKIQEKENGEKTPVSHKDDKLKLEEYFFEILPNYDEDRVYASDIKKVIQWYNMLQEQGIADFEAKEETKEEVKEEE >NZ_CP047027.1|WP_158973683.1|361342_362434_-|PAS-domain-containing-protein MVAIEGEYNKEIRSAFFNMAYSPFVILNKDLNFVDVNEAGLKAIKIKREDFIGRNLLDFFPYLKDTERYQMYKDVLLTGEAMGFDELTFHTDKGMLKFMIKAFKIGDYLGMSTLDVTSLTSNIDQLKATKLNLQTVNDNLKRKNQELEEFSYVAAHDLRSPLTNIHSLLDMLQSENAISQEGLPVFEKVQEVAMQMCNKLRALNSVIALKTNMEDKKEVVNFSSIIGKVKVDNSEEIVQSRTIIKEDFVRAPSIIYNLKQIESILQNLISNSIKYRNPNRKPVIIIKTSIIDGKTVLTIKDNGIGFDKDTDPEKIFGLFKRMHSHVEGLGVGLYITNSIITNNGGEITTKSELNKGTQFKIIF >NZ_CP047027.1|WP_158973694.1|385728_386661_+|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKKYLIIALFVFAGTTTLSAQQDAQYTQYMYNTISVNPAYAGSRGVLSIAALHRSQWVGLDGAPTTQTLNLHTPVSRRVGLGLSIVNDEIGNGTNQDTYFDAAFSYTIPTSEEGKLSFGLKAGGHFLNIDFSKLRNYGAESNLPNVDNKFSPNFGAGVYYHTNNFYSGLSVPNFLQTEHFDSAGTNSSSFLAEERLNIYFITGYVFDLNPNLKFKPAALVKAVKGAPLQIDVSANFLINDKFSVGAAYRWDAAVSLLAGFQISEQLMLGLAYDKETTDLGATRFNDGSFEIFLRYEFLTRYKKVITPRFF >NZ_CP047027.1|WP_158973695.1|387088_394927_+|T9SS-type-B-sorting-domain-containing-protein MKTQNQLFKKKLYSMVLLVFAFSSSYAQLSNTHYIPPMYCPEYNANNWGNEELHLSTPSSTAFTVFVEDGAGNPVGAGNNGTLGAYDIVNGAPYVLSLGTAPSGYASALTANLGDVIDGNGSGLKLTASENFYVNFKVNGGSQAASLTSKGTSALGTHFKWAGPPNRTTYAAGGYSVLSIMATQDGTVIDVTDYDTDLLIQRNTDASAITDDALNFTLNAGESYILAVRANTGTANRTGFIGADITSTSPIAVTTGGTLFAIANTGGRDLGIDQLVPIELLGTEYVVIQGNGGSSERVILTGTANGTSVNVNGAFYGTVENGTFLEINGSEFSANENMLIETTGAVYVHHAIIGVNGSANTDGLNFIPPLSCFNDIELNELSSPRVIAGTSYTASSLMVTTIAGSTLLVNGTATTETEKAVPNSTTWVTYKIPIDNDGNYSVSSNNPIAVSLFGGSGNAGFGGYFSSFGSAPYLEANQYLNYCYDELSVISSVPPSGITWYKDGVAIPGETGNTFIPTQSGTYSALIDVAFCQSFTSQFTYVFDDDDLDGLPNDCDPNDDNIDTDGDGIPDGADADVDGDGTLDNGPDCDGDGINDLFDSTPCPGDVADPATDSDGDGITDENDLIDNTVDTDGDGLPDAIDPDNNNPDTDGDGVPDGVDIDPDGDGIANNGTDSDGDGINDFSDIDNNPGAPDSDGDGIIDSEDTIDNTADADGDGLPDHLDPDDGNCDTDGDGIVDGADIDVNGDGTNDNGADTDGDGVNNQFDSDVDGNGTIDNGPDADDNGLNDDKQPLDTDGDGIPDGCDTDPSNPCSPSADSLYVPVDTADCDNDGLTYAEEITAGTDPDLADTDGDGITDGQEVSDGTDPLNDCDSFGGIPLGTSDCDGDGVPNATDVCNGFDDSQDNDNDGIPDGCDQDDDNDGILDSVECSLPEIDQNFNNWSLGSGWTVLGGGSQARNQNNDSDSQICYTVNDVQSIAAASFVKFNFLVRTNGSGNAIVNTGVATLEFQINGTTYTTFYNPGDNSSTNATVNASNGAIASLSSFPISTTSGALTDVSVIIPWSGAATMDICFNYSALQDDWDISAVLIVDADKFACDSDGDEVPDTIDLDADNDGIYDVIEAGGTDTDNNGEADGVVSSSGVPDTAGSGITPIETTSGTPDYLNLDSDADGCSDANEAYDDSTADNSDGFEYSNADNATVSDGSGIILLNGLVSSATYTTGNVAAVTAIGIDIDGDGLIGACDLDDDGDGDPDTTDPDPLDPCIFSTNQNTANVETSWNNLDCDGDGETNGTEISNGTDPTGSCDVTVPSVRTTGDDNYAIWAAADCDGDGNSNGTDPNPFTPTAVDDNTSADVGTPKSYNVVNNDDFLIGSTITIIPSGTTAPTETQQTNGIGPISVDSAKGEITYTADPSEDPGFVYIVYEICNGTICDTAVLSIAIPACSDVDGDNICDIFDSAINDPCEPSSDPDWQPQGTNDCDGDGLTNDEETTGVDDPSTPANPNGNTTDPNLTDTDGDGISDGQEALDGTDPNNDCDSVGGTPLGTSDCDNDGLTEAEEATAGTDPNNPDSDGDGVLDGTEVNIDNTLPLDLCSYIISSATEAPSAAWNTADCDGDGITNGQEIIDGTDSLNPCSPARAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNALWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCNPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYSGYDATNALWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQSAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYSGYDATNALWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGISDSQEMTDGTDPLNDCDSIGGSPLGISDCDMDGLTTDEEVALGTDPNDPDSDGDGILDGQEVLDGTDPLDDCDYNGGKALPDSDCDADGLTTAQEDAIGSDPNNADTDGDTIPDGQEVTDGTDPLDPCDAIGGVPTLAAGCDEEVVSSGIAVANEILTPDGDGVNDFFRIENIESFPNNTVQIYNRWGVVVYEMAGYDNQSNVFRGASNGRVTISTDSELPVGVYFYIIKYVNEGNHLNKAGYLYINR >NZ_CP047027.1|WP_158973696.1|394950_395883_+|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKKYLIIALFVFAGTTTLSAQQDAQYTQYMYNTISVNPAYAGSRGVLSIAALHRSQWVGLDGAPTTQTLNLHTPVSRRVGLGLSIVNDEIGNGTNQDTYIDAAFSYTIPTSEEGKLSFGLKAGGHFLNIDFSKLRNYGAESNLPNVDNKFAPNFGAGIYYHTDKFYSGLSVPNFLQTEHFDSAGTNSSSFLAEERLNIYFITGYVFDLNPNLKFKPAGLVKAVKGAPLQIDVSANFLINDKFSVGAAYRWHAAVSLLAGFQISEQLMLGLAYDKETTDLGATRFNDGSFEVFLRYEFLTRYKKVITPRFF >NZ_CP047027.1|WP_158973697.1|396339_396702_+|hypothetical-protein MIKTNSNISKKNLRTAKLLFLFISLIHLSINAQYPSGTDVSTLTNPFSCTGEAYIVYAPDASTSSTLAFISPSTPSVENSSFVFNNVTVNPLAYNVSVAYGYGFITGDQDTSFGPNRYDI >NZ_CP047027.1|WP_158973698.1|396881_405293_+|T9SS-type-B-sorting-domain-containing-protein MKYKYMYKSFDVDRPSFKIAMTFIIILLNLGQVFSQLDSKHYLPPMRAGADTNVSNIGNAIYLSTPETTPFDVDVYFGDATSPSYTVVGLSNTTPQIMDLFNTDVTGDLVAEGALDEIILMSQAQTGVVQTTAGMRFESQGVNNLFYLNYRVASNNQTGSYTAKGTKALGTEFRWGGLPNNANTTNGSNAVSTSLGIYATQDNTSVTISDYGNTTFRQGALAGVLTTGSLTINLNAGETYVLETICDSGVTNHVANRSEWIGAQISSNLPIAISNGQLVAAAGDSGADAGMDQPVPIDFLGREYVLIRGESTLAANEYAIVVATQNNTEVYVGDPTNPANLVDTIDIGEFARVDSYSGTAVGSNMLITTTKNAYVYQCTAGQQNGPTIGMNFIPPANCLLPNSVNNIPNIQDMAGTTANFSAITVVANESVTQVTITDGTGTPVVLNTFDAILGTSIYKTIYYEPNPNLTGNVSVVADGPVAIGVFGGVGTISGYAGYFSGFDTTPEVTVTVNGPACLEAGFTADLEAPTGYLNYEWFKDGVSVVSSATAGTYTATAAGVYFVRVEQAAGCFFDSPPVDFLNCIEANNDSYATLASGEITPSVILNDSFFGITPPTIGTAVGEVSIVEVGTQANLTLNTDGTITVNPNTPDGTYTLMYEICEADVNYMTNCSTATATILVADADGDGVNDVADLDDDNDGILDTVECPVSALLTFDPTSPPTPVSTGADIANLVAGDVFLFSGGFTDGILSYDVRLNIIEVSGPGETAISATSGRLGISDHNPNDNKFIAFELTVVETATVSAGDLVGIPVSLANANIFIGDLDATTGRDMSDVGGFAVGSGINSRLGALVQGSALTNSGFVLGGPSGSYEYARLSTFGVSNPTNSDPAYGLQANYSYYVTDRMVVGATGVGNAGLRGSFIILTGNAILSCDSDGDTIPDHLDTDSDNDGCNDVLESGGTDDDGDGILGDAPTTVDVNGQVTGGGDISGAYDGVNGDETIAVEASITTAPTDQTEDPSTTATFQVVALATSTTDYTGTAPTTTPDYTGTSATDLSSSFVYQWYLGDPNSGGVLLSDDATYTDTSTNTLNILTNTSLNGNEYFVVVTHPNNLCVSLIDSAILTVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPVGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLTITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDESATIDPAVATNVDVLTGDNDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPVGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDEMVIGATINTDLTVDVLDGDNDPDGDNANLVITEVEGQAISTTSPVTLSDGTVVSLNTDGTLEVTPPTDSTEPIGFDYTVEDEDGLTDTGSVAIAFTQLPPVADDETVTLDPAVATNVDILTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGNVAVTVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDILTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFEYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDEIVALDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFEYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDEIVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFEYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDEIVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDESATIDPAVASNIDVLTGDNDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDETVTGATINTDLTVDALDGDNDPDGDNANLVITEVEGQAISTTSPVTLSDGTIVSLNTDGTLEVTPPTDSTEPISFDYTVADEDGLTGTGSVAIAFTQLPPVADDDSATIDPAVATNIDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTVADEDGLTDTGSVAITVECSDITDTDGDGLTDCEESTGIDNPSTVLIPNGTSDPLNACDPDLNHPLCDSDNDGLTNEEEASLGTDPNNPDSDGDGILDGQEVLDGTNPLDDCDHDDGTALPDSDCDADGLTTAEEDAIGTDPDIADTDGDTISDGQEVSDGTDPLDPCDSIGGVPTLSAGCNEEVVDTGIAISNEVLTPDGDGVNDFFRIENIESFPNNTVQIYNRWGVVVYEMSGYDNVSNVFTGTSNGRVTISTDSELPVGVYFYIVKYVNGDNNLSKSGYLYINR >NZ_CP047027.1|WP_158973699.1|405334_406267_+|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKKYIILVVLVFAGFQLLSAQQDAQYTQYMYNTISVNPAYAGSRGVLSIAALHRSQWVGLDGAPTTQTLNLHTPVSRRVGLGLSIVNDEIGNGTNQDTYFDAAFSYTIPTSEEGKLSFGLKAGGHFLNIDFSKLRNYGAESNLPNVDNKFSPNFGAGVYYHTDNFYSGLSVPNFLQTEHFDSAGTNSSSFLAEERLNIYFITGYVFDLNPNLKFKPAGLVKAVKGAPLQIDVSANFLINDKFSVGAAYRWDAAVSLLAGFQISEQLMLGLAYDKETTDLGATRFNDGSFEVFLRYEFLTRYKKVITPRFF >NZ_CP047027.1|WP_158973700.1|406279_408223_+|OmpA-family-protein MKYKLTHIVLCTAFVSFGLQAQEKQAVKAQSKFNSFDYADAISSYEDLIKEGYSSEDVYKNLGDANYMNAQYKEASTWYQKLFELENTTIDPEYLYRYAQTLKSLKEYDASDAWMEKFEQVKATDGRAEKFNSEKDYLTAIKENSGRYSIKNLPINSKESDFSPAFYENELIFSSARDSGTVTKTIHLWNRKSFLNLYKTAVTEDDNFTTPTKLSKTVNKKAHESSPVFTKDGQTMYFTRNNFKNGSFSRDEEGVSRLKLYKATLQNGAWADITALPFNGEDYSTAHPALNTDETKLYFASDRPGTLGASDIFYVTINSDGSYGSPVNLGASVNTESRETFPNISDTDILYFASDGHPGLGGLDVFGIDLAELERTKAKNLGQPLNSEQDDFSYIINDKTKNGYFASNRENGIGSDDIYGFSESKALDFNCYSNLKGIVKDEKTKEIIADAVLNITNANGEVIGKGISDSEGNFDLDSSCEKGAYSIITLKENYAEATTAIEIGTSLEINDIEILLISNFAPADLGADLAKKLNLEKIYFDFDQSYIRKDAQIIMEKVIAYLNQYPDTKIRIGSHTDARANDAYNSRLSERRAKATYDYLVKKGIDASRLTFKGFGETQLTNECENTVNCSAEKHQQNRRSEFIVVE >NZ_CP047027.1|WP_158973701.1|408364_409399_+|heme-A-synthase MQKYFRKIAQVTLVLVYLVIVAGAVVRMTGSGMGCPDWPKCFGYYIPPTDESVLEWQEGKTFEKGQVIIYSETLKVAKTDFTTSASYNTSNWEEYTKHDYAIFNVWHTWIEYVNRLFGALAGVATLLLAIISFWYWKKSKRITILSWLVVFGMGFQAWLGATVVYSLLEPVKITVHMIMALVIVAMLIYIIYKTSDADKVEHASRKLQKLLGAALIATLIQIIIGTQVRQFVDLQIDYFGEDAKNQWLLNPNIQFYIHRTFSIFVALLNLYIAYLIYKFELGFEKIRWVLLLLLLEIVSGITMYYVHFPFGSQTFHMVVAAILFGVQFYLVLEASKTKTSLNSL >NZ_CP047027.1|WP_158973702.1|409426_409921_+|hypothetical-protein MIYKIRIILDTEEDIFRDIEIEASTTLEDFHNAITQAFGFLGNEMASFYTCDEEWIQDEEIALHDISENGSDIRLMNETFLEDIITENTPKLIYVYDFLSMWTFFVELADIVPKEDGRTYPNMLFSFGELPDSPPEKTFEADPTFDFDDTFDSYDDLDFDENWN >NZ_CP047027.1|WP_158973703.1|409987_411046_+|nucleoid-associated-protein MINLYATQIESISLHRVGNKNKNEAVFLSETPHSLNDETTGLLKEYFFKPFREKEENYFNFSNDVDVEFNEMYKISSEIFADPDSIHANSKKIASYLYEQSNHPHIKSGEVYVAHLSGVLLDNVKVDAIGIFKSELKHDFIQFEEKGSNLDIVIQQGININKLDKGCLIFDTGKEEGYKVLSVDSNRYDSKYWLEEFLGVEPLSDDNFKTKNYLKFCQNFAKDVVLPAEDKQQEVLFMNRAVNHFAKNDSFEESTFLNEVMENPDLIPEFKNYKTEKGPKYSVEDISTFDIANKAVSDARKKIKNVINLDTNIQIKLDFINPESAEKYVEKGWDEEKQMYYYLVYFNKEQKS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP047027_1 | 377419-377591 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047027_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047027_1
>1.1|377444|38|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder TTAGACGCCTGCGAAGGGTTTGATGATGCTATAAATGC >1.2|377507|59|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder TGTGATGAAGATGATGATAATGATGGTATTCCAGATACTGTTGAAGGTACTGGTGATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047027_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047027_1 >merge|NZ_CP047027|1|377419-377591|CRISPRCasFinder TGATGGCGATGGTGTGCAAAATTCTTTAGACGCCTGCGAAGGGTTTGATGATGCTATAAATGCAGATGGTGATGCACTTCCAGATGCTTGTGATGAAGATGATGATAATGATGGTATTCCAGATACTGTTGAAGGTACTGGTGATTTTGATGGTGACGGTGTTCCAGATAGTT >NZ_CP047027|1|1|377419-377591|CRISPRCasFinder TGATGGCGATGGTGTGCAAAATTCT TTAGACGCCTGCGAAGGGTTTGATGATGCTATAAATGC AGATGGTGATGCACTTCCAGATGCT TGTGATGAAGATGATGATAATGATGGTATTCCAGATACTGTTGAAGGTACTGGTGATTT TGATGGTGACGGTGTTCCAGATAGTT
>NZ_CP047027.1|WP_158973692.1|369295_370723_+|HD-domain-containing-protein MTHTNHEQALKNPIFKTIAAAAKELNLDCYVIGGFVRDYLLDRGTAKDIDIVAIGSGIALAKKVASKLKGKPEVSVFKNFGTAMIKHDDIELEFVGARKESYHEDSRKPVVEDGSLEDDQKRRDFTINALAISLNETNYGTLLDPFNGIQDLADKIIKTPLAPGITYSDDPLRMMRAIRFATQLDFKIEEASLNAITENKDRIKIISKERIVDELHKILASKTPSLGFSLLHKTQLLGYILPELTALQGIEEIEGQRHKDNFWHTLEVVDNIAKNTDNVWLRWAALLHDIGKAPTKRFDKKIGWTFHSHEFIGSKMVYKLFKRLRMPLNDKMKFVQKMVLLSSRPIILSEDFATDSAVRRLIFDAGENIEDLMTLCEADITTKNPKKQKRYQNNFKLVRQKIVEVEERDHVRNFQPPISGEEIMETFNLKPSKEIGIIKEAIKEAILEGEILNEYDAAYQFMLKKGSEIGLSSTK >NZ_CP047027.1|WP_158973691.1|368733_369294_+|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MQEEINKCIEILSKGGLILYPTDTVWGIGCDATNEEAVAKIYALKQRKNTKAMICLVANDFMLEKYIDAVPEVAYDIIDLATKPTTIVYDNPKGVAKNLVAEDNTLAIRVASDKFCQYLITKFKKPIVSTSANVAGEATPQTFKEITSAILKGVDYVVNLHQDQNSGTPSSIIKLGNDGVVKIIRE >NZ_CP047027.1|WP_158973690.1|367791_368562_-|glycosyltransferase MKEKLSVFIITYNEERILDKCLNKLSWADEIIVVDSGSTDATLEICKKYHVKLFHKDFEGFGTQKQFALEKTTNNWVLSLDADEILSEELITEIQENLKPEMNISGFYLKRKHVFLGKVFDYGPDSKEYILRLFNKNMGKFDGKKVHENIILEGESAKLKNNFLHFTTRSLDNYIVKLSNYATIYAEGKYLKNKNYSIATIFIRVKLEFFKKYFVELNFLNGKEGFYWSYLAAYYMGLKYMKTNEQYKQVKKQLMF >NZ_CP047027.1|WP_158973689.1|365968_367795_+|glycosyltransferase MKTVLFCQNAYAFGILAPIRAVLQKESHEYIWYISPKLLDTFPFKKENFTTSILDLQLFESDAIFAPGNEVPYYLRGVKVQIFHGLAGEKKGHFRIRHYFDLYLTQGPYFTQKFNAFKAQYQNFEVVETGWPKLDIYRSEAHDYSTEKETLLNKYNTDKIILYAPTFSPSLTSAPYLLDQIKELALNTGYLVLIKFHDLMDVKWIAAYKKLSEEIPNILFKEDKNIIKYLLLADLMVSDTSSVIYEFLLLNKPVITFKNISENIQWLDAKSYDSLTDKVRTSIANDSFALQRKELCAQYHPYNDGKSAARMVQTTKEYIAKNGVPNERKLSFLRRKKIRKIFGKPTKDICTGPKKEKISALVITYNEEEHINGVLENLQFADEIIVVDSFSTDTTIEKIKAFKNIHLIQRPFKDFTDQKAYALAQAKHNWVLFIDADERLTDALKNEVLKTVNSDQKKAAAYYFLRIFMFEKQRMRFTGTQSDKNYRLFQKSKVKFDTTKTVHETLLVDGESKVLKNKLIHYSYNNYEEFKNKRLKYTSMQAKELLAKNKKPTAFHFVIKPAFRFFKHYVIGLGFLDGKKGIILSYLMALGIHNRYSELKKLRKEKQL >NZ_CP047027.1|WP_158973688.1|365279_365969_+|NTP-transferase-domain-containing-protein MIMKIVILAAGMGSRLGNPFPKPLTPLVNGKSIMQMQVDNIDAYYSIDDISVVVGFKKNLIMERFPDLSYIYNPFFDNTNTSKSLLKALKKFRDKSVLWMNGDVVFDEKLFDVLSPFIKKKQSFVAVNTSKVADEEVKYTLENGFIKKLSKTVTGGLGEAVGINYIASKDINSFIARLEECDANDYFERGIEIAIEKDGLEVCAVDISQYNCMEVDFQEDLDNANKLLE >NZ_CP047027.1|WP_158973687.1|364280_365096_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MTELREQIEKAWDNRDLLKEEKTQTAIRSVIDLLDEGKLRCAEPTTDGWQINEWVKKAVVLYFPIQKMETLEAGIFEYHDKMPLKRGYKEKGIRVVPGATARHGAYISAGTILMPSYVNIGAYVDEGTMVDTWATVGSCAQIGKNVHLSGGVGIGGVLEPLQAAPVIIEDNVFVGSRCIVVEGVRVEKEAVLGANVVLTASTKIIDVTGDTPVERKGLVPARSVVIPGSYTKKFAAGEYNVPCALIIGTRKESTNKKTSLNDALREYDVAV >NZ_CP047027.1|WP_158973686.1|363767_364178_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MARIVAIDYGKVRTGIAVTDELQLIASGLTTVATKELIDFLKNYIATENVELIVVGEPKQMNNQVSESEALILPFIEKLKLSFPSMKIERQDERFTSKMAFQTMIDSGLKKKQRRDKALVDEISATIILQAYLNRI >NZ_CP047027.1|WP_158973685.1|363172_363763_-|peptide-deformylase MILPIIAYGDPVLRKVGTDIAKDYPKLETLVENMWETMYNASGVGLAAPQIGLPIRLFVIDTTPFSEDEDLAPEDQKALDGFKKVFVNAKIEEETGEEWNFNEGCLSIPDIREDVNRKETIKITYLDENFNEKSESYGGLLARVIQHEYDHIEGILFTDKLSSLKKRLLKGKLSNISKGKISADYRMRFPDMKKGR >NZ_CP047027.1|WP_158973684.1|362687_363116_-|hypothetical-protein MSLDKILSIGGKPGLFKLLTQTRAGFVAESLLDGKKITVGFKNNVSVLSEIAIYTLDAEIPLREVFRKIQEKENGEKTPVSHKDDKLKLEEYFFEILPNYDEDRVYASDIKKVIQWYNMLQEQGIADFEAKEETKEEVKEEE >NZ_CP047027.1|WP_158973683.1|361342_362434_-|PAS-domain-containing-protein MVAIEGEYNKEIRSAFFNMAYSPFVILNKDLNFVDVNEAGLKAIKIKREDFIGRNLLDFFPYLKDTERYQMYKDVLLTGEAMGFDELTFHTDKGMLKFMIKAFKIGDYLGMSTLDVTSLTSNIDQLKATKLNLQTVNDNLKRKNQELEEFSYVAAHDLRSPLTNIHSLLDMLQSENAISQEGLPVFEKVQEVAMQMCNKLRALNSVIALKTNMEDKKEVVNFSSIIGKVKVDNSEEIVQSRTIIKEDFVRAPSIIYNLKQIESILQNLISNSIKYRNPNRKPVIIIKTSIIDGKTVLTIKDNGIGFDKDTDPEKIFGLFKRMHSHVEGLGVGLYITNSIITNNGGEITTKSELNKGTQFKIIF >NZ_CP047027.1|WP_158973694.1|385728_386661_+|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKKYLIIALFVFAGTTTLSAQQDAQYTQYMYNTISVNPAYAGSRGVLSIAALHRSQWVGLDGAPTTQTLNLHTPVSRRVGLGLSIVNDEIGNGTNQDTYFDAAFSYTIPTSEEGKLSFGLKAGGHFLNIDFSKLRNYGAESNLPNVDNKFSPNFGAGVYYHTNNFYSGLSVPNFLQTEHFDSAGTNSSSFLAEERLNIYFITGYVFDLNPNLKFKPAALVKAVKGAPLQIDVSANFLINDKFSVGAAYRWDAAVSLLAGFQISEQLMLGLAYDKETTDLGATRFNDGSFEIFLRYEFLTRYKKVITPRFF >NZ_CP047027.1|WP_158973695.1|387088_394927_+|T9SS-type-B-sorting-domain-containing-protein MKTQNQLFKKKLYSMVLLVFAFSSSYAQLSNTHYIPPMYCPEYNANNWGNEELHLSTPSSTAFTVFVEDGAGNPVGAGNNGTLGAYDIVNGAPYVLSLGTAPSGYASALTANLGDVIDGNGSGLKLTASENFYVNFKVNGGSQAASLTSKGTSALGTHFKWAGPPNRTTYAAGGYSVLSIMATQDGTVIDVTDYDTDLLIQRNTDASAITDDALNFTLNAGESYILAVRANTGTANRTGFIGADITSTSPIAVTTGGTLFAIANTGGRDLGIDQLVPIELLGTEYVVIQGNGGSSERVILTGTANGTSVNVNGAFYGTVENGTFLEINGSEFSANENMLIETTGAVYVHHAIIGVNGSANTDGLNFIPPLSCFNDIELNELSSPRVIAGTSYTASSLMVTTIAGSTLLVNGTATTETEKAVPNSTTWVTYKIPIDNDGNYSVSSNNPIAVSLFGGSGNAGFGGYFSSFGSAPYLEANQYLNYCYDELSVISSVPPSGITWYKDGVAIPGETGNTFIPTQSGTYSALIDVAFCQSFTSQFTYVFDDDDLDGLPNDCDPNDDNIDTDGDGIPDGADADVDGDGTLDNGPDCDGDGINDLFDSTPCPGDVADPATDSDGDGITDENDLIDNTVDTDGDGLPDAIDPDNNNPDTDGDGVPDGVDIDPDGDGIANNGTDSDGDGINDFSDIDNNPGAPDSDGDGIIDSEDTIDNTADADGDGLPDHLDPDDGNCDTDGDGIVDGADIDVNGDGTNDNGADTDGDGVNNQFDSDVDGNGTIDNGPDADDNGLNDDKQPLDTDGDGIPDGCDTDPSNPCSPSADSLYVPVDTADCDNDGLTYAEEITAGTDPDLADTDGDGITDGQEVSDGTDPLNDCDSFGGIPLGTSDCDGDGVPNATDVCNGFDDSQDNDNDGIPDGCDQDDDNDGILDSVECSLPEIDQNFNNWSLGSGWTVLGGGSQARNQNNDSDSQICYTVNDVQSIAAASFVKFNFLVRTNGSGNAIVNTGVATLEFQINGTTYTTFYNPGDNSSTNATVNASNGAIASLSSFPISTTSGALTDVSVIIPWSGAATMDICFNYSALQDDWDISAVLIVDADKFACDSDGDEVPDTIDLDADNDGIYDVIEAGGTDTDNNGEADGVVSSSGVPDTAGSGITPIETTSGTPDYLNLDSDADGCSDANEAYDDSTADNSDGFEYSNADNATVSDGSGIILLNGLVSSATYTTGNVAAVTAIGIDIDGDGLIGACDLDDDGDGDPDTTDPDPLDPCIFSTNQNTANVETSWNNLDCDGDGETNGTEISNGTDPTGSCDVTVPSVRTTGDDNYAIWAAADCDGDGNSNGTDPNPFTPTAVDDNTSADVGTPKSYNVVNNDDFLIGSTITIIPSGTTAPTETQQTNGIGPISVDSAKGEITYTADPSEDPGFVYIVYEICNGTICDTAVLSIAIPACSDVDGDNICDIFDSAINDPCEPSSDPDWQPQGTNDCDGDGLTNDEETTGVDDPSTPANPNGNTTDPNLTDTDGDGISDGQEALDGTDPNNDCDSVGGTPLGTSDCDNDGLTEAEEATAGTDPNNPDSDGDGVLDGTEVNIDNTLPLDLCSYIISSATEAPSAAWNTADCDGDGITNGQEIIDGTDSLNPCSPARAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNALWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCNPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTENTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYSGYDATNALWAAADCDADGVTNGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQSAGYTGYDATNAIWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGVPDNTDVDPLDPCSPAQAAGYSGYDATNALWAAADCDADGVINGTEDTNGTDPYNTDTDGDGISDSQEMTDGTDPLNDCDSIGGSPLGISDCDMDGLTTDEEVALGTDPNDPDSDGDGILDGQEVLDGTDPLDDCDYNGGKALPDSDCDADGLTTAQEDAIGSDPNNADTDGDTIPDGQEVTDGTDPLDPCDAIGGVPTLAAGCDEEVVSSGIAVANEILTPDGDGVNDFFRIENIESFPNNTVQIYNRWGVVVYEMAGYDNQSNVFRGASNGRVTISTDSELPVGVYFYIIKYVNEGNHLNKAGYLYINR >NZ_CP047027.1|WP_158973696.1|394950_395883_+|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKKYLIIALFVFAGTTTLSAQQDAQYTQYMYNTISVNPAYAGSRGVLSIAALHRSQWVGLDGAPTTQTLNLHTPVSRRVGLGLSIVNDEIGNGTNQDTYIDAAFSYTIPTSEEGKLSFGLKAGGHFLNIDFSKLRNYGAESNLPNVDNKFAPNFGAGIYYHTDKFYSGLSVPNFLQTEHFDSAGTNSSSFLAEERLNIYFITGYVFDLNPNLKFKPAGLVKAVKGAPLQIDVSANFLINDKFSVGAAYRWHAAVSLLAGFQISEQLMLGLAYDKETTDLGATRFNDGSFEVFLRYEFLTRYKKVITPRFF >NZ_CP047027.1|WP_158973697.1|396339_396702_+|hypothetical-protein MIKTNSNISKKNLRTAKLLFLFISLIHLSINAQYPSGTDVSTLTNPFSCTGEAYIVYAPDASTSSTLAFISPSTPSVENSSFVFNNVTVNPLAYNVSVAYGYGFITGDQDTSFGPNRYDI >NZ_CP047027.1|WP_158973698.1|396881_405293_+|T9SS-type-B-sorting-domain-containing-protein MKYKYMYKSFDVDRPSFKIAMTFIIILLNLGQVFSQLDSKHYLPPMRAGADTNVSNIGNAIYLSTPETTPFDVDVYFGDATSPSYTVVGLSNTTPQIMDLFNTDVTGDLVAEGALDEIILMSQAQTGVVQTTAGMRFESQGVNNLFYLNYRVASNNQTGSYTAKGTKALGTEFRWGGLPNNANTTNGSNAVSTSLGIYATQDNTSVTISDYGNTTFRQGALAGVLTTGSLTINLNAGETYVLETICDSGVTNHVANRSEWIGAQISSNLPIAISNGQLVAAAGDSGADAGMDQPVPIDFLGREYVLIRGESTLAANEYAIVVATQNNTEVYVGDPTNPANLVDTIDIGEFARVDSYSGTAVGSNMLITTTKNAYVYQCTAGQQNGPTIGMNFIPPANCLLPNSVNNIPNIQDMAGTTANFSAITVVANESVTQVTITDGTGTPVVLNTFDAILGTSIYKTIYYEPNPNLTGNVSVVADGPVAIGVFGGVGTISGYAGYFSGFDTTPEVTVTVNGPACLEAGFTADLEAPTGYLNYEWFKDGVSVVSSATAGTYTATAAGVYFVRVEQAAGCFFDSPPVDFLNCIEANNDSYATLASGEITPSVILNDSFFGITPPTIGTAVGEVSIVEVGTQANLTLNTDGTITVNPNTPDGTYTLMYEICEADVNYMTNCSTATATILVADADGDGVNDVADLDDDNDGILDTVECPVSALLTFDPTSPPTPVSTGADIANLVAGDVFLFSGGFTDGILSYDVRLNIIEVSGPGETAISATSGRLGISDHNPNDNKFIAFELTVVETATVSAGDLVGIPVSLANANIFIGDLDATTGRDMSDVGGFAVGSGINSRLGALVQGSALTNSGFVLGGPSGSYEYARLSTFGVSNPTNSDPAYGLQANYSYYVTDRMVVGATGVGNAGLRGSFIILTGNAILSCDSDGDTIPDHLDTDSDNDGCNDVLESGGTDDDGDGILGDAPTTVDVNGQVTGGGDISGAYDGVNGDETIAVEASITTAPTDQTEDPSTTATFQVVALATSTTDYTGTAPTTTPDYTGTSATDLSSSFVYQWYLGDPNSGGVLLSDDATYTDTSTNTLNILTNTSLNGNEYFVVVTHPNNLCVSLIDSAILTVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPVGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLTITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDESATIDPAVATNVDVLTGDNDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPVGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDEMVIGATINTDLTVDVLDGDNDPDGDNANLVITEVEGQAISTTSPVTLSDGTVVSLNTDGTLEVTPPTDSTEPIGFDYTVEDEDGLTDTGSVAIAFTQLPPVADDETVTLDPAVATNVDILTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGNVAVTVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDILTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDETVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFEYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDEIVALDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFEYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDEIVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFEYTLEDEDGLTDTGNVAITVNQPPVADDEIVTLDPAVATNVDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADTANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDESATIDPAVASNIDVLTGDNDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTLEDEDGLTDTGSVAITVNQPPVADDETVTGATINTDLTVDALDGDNDPDGDNANLVITEVEGQAISTTSPVTLSDGTIVSLNTDGTLEVTPPTDSTEPISFDYTVADEDGLTGTGSVAIAFTQLPPVADDDSATIDPAVATNIDVLTGDDDPDGDNANLSITEIIDPADVANPLAITPGSSVTLTDGTIVELLTDGTLNVTPPAGSTSTGFDYTVADEDGLTDTGSVAITVECSDITDTDGDGLTDCEESTGIDNPSTVLIPNGTSDPLNACDPDLNHPLCDSDNDGLTNEEEASLGTDPNNPDSDGDGILDGQEVLDGTNPLDDCDHDDGTALPDSDCDADGLTTAEEDAIGTDPDIADTDGDTISDGQEVSDGTDPLDPCDSIGGVPTLSAGCNEEVVDTGIAISNEVLTPDGDGVNDFFRIENIESFPNNTVQIYNRWGVVVYEMSGYDNVSNVFTGTSNGRVTISTDSELPVGVYFYIVKYVNGDNNLSKSGYLYINR >NZ_CP047027.1|WP_158973699.1|405334_406267_+|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKKYIILVVLVFAGFQLLSAQQDAQYTQYMYNTISVNPAYAGSRGVLSIAALHRSQWVGLDGAPTTQTLNLHTPVSRRVGLGLSIVNDEIGNGTNQDTYFDAAFSYTIPTSEEGKLSFGLKAGGHFLNIDFSKLRNYGAESNLPNVDNKFSPNFGAGVYYHTDNFYSGLSVPNFLQTEHFDSAGTNSSSFLAEERLNIYFITGYVFDLNPNLKFKPAGLVKAVKGAPLQIDVSANFLINDKFSVGAAYRWDAAVSLLAGFQISEQLMLGLAYDKETTDLGATRFNDGSFEVFLRYEFLTRYKKVITPRFF >NZ_CP047027.1|WP_158973700.1|406279_408223_+|OmpA-family-protein MKYKLTHIVLCTAFVSFGLQAQEKQAVKAQSKFNSFDYADAISSYEDLIKEGYSSEDVYKNLGDANYMNAQYKEASTWYQKLFELENTTIDPEYLYRYAQTLKSLKEYDASDAWMEKFEQVKATDGRAEKFNSEKDYLTAIKENSGRYSIKNLPINSKESDFSPAFYENELIFSSARDSGTVTKTIHLWNRKSFLNLYKTAVTEDDNFTTPTKLSKTVNKKAHESSPVFTKDGQTMYFTRNNFKNGSFSRDEEGVSRLKLYKATLQNGAWADITALPFNGEDYSTAHPALNTDETKLYFASDRPGTLGASDIFYVTINSDGSYGSPVNLGASVNTESRETFPNISDTDILYFASDGHPGLGGLDVFGIDLAELERTKAKNLGQPLNSEQDDFSYIINDKTKNGYFASNRENGIGSDDIYGFSESKALDFNCYSNLKGIVKDEKTKEIIADAVLNITNANGEVIGKGISDSEGNFDLDSSCEKGAYSIITLKENYAEATTAIEIGTSLEINDIEILLISNFAPADLGADLAKKLNLEKIYFDFDQSYIRKDAQIIMEKVIAYLNQYPDTKIRIGSHTDARANDAYNSRLSERRAKATYDYLVKKGIDASRLTFKGFGETQLTNECENTVNCSAEKHQQNRRSEFIVVE >NZ_CP047027.1|WP_158973701.1|408364_409399_+|heme-A-synthase MQKYFRKIAQVTLVLVYLVIVAGAVVRMTGSGMGCPDWPKCFGYYIPPTDESVLEWQEGKTFEKGQVIIYSETLKVAKTDFTTSASYNTSNWEEYTKHDYAIFNVWHTWIEYVNRLFGALAGVATLLLAIISFWYWKKSKRITILSWLVVFGMGFQAWLGATVVYSLLEPVKITVHMIMALVIVAMLIYIIYKTSDADKVEHASRKLQKLLGAALIATLIQIIIGTQVRQFVDLQIDYFGEDAKNQWLLNPNIQFYIHRTFSIFVALLNLYIAYLIYKFELGFEKIRWVLLLLLLEIVSGITMYYVHFPFGSQTFHMVVAAILFGVQFYLVLEASKTKTSLNSL >NZ_CP047027.1|WP_158973702.1|409426_409921_+|hypothetical-protein MIYKIRIILDTEEDIFRDIEIEASTTLEDFHNAITQAFGFLGNEMASFYTCDEEWIQDEEIALHDISENGSDIRLMNETFLEDIITENTPKLIYVYDFLSMWTFFVELADIVPKEDGRTYPNMLFSFGELPDSPPEKTFEADPTFDFDDTFDSYDDLDFDENWN >NZ_CP047027.1|WP_158973703.1|409987_411046_+|nucleoid-associated-protein MINLYATQIESISLHRVGNKNKNEAVFLSETPHSLNDETTGLLKEYFFKPFREKEENYFNFSNDVDVEFNEMYKISSEIFADPDSIHANSKKIASYLYEQSNHPHIKSGEVYVAHLSGVLLDNVKVDAIGIFKSELKHDFIQFEEKGSNLDIVIQQGININKLDKGCLIFDTGKEEGYKVLSVDSNRYDSKYWLEEFLGVEPLSDDNFKTKNYLKFCQNFAKDVVLPAEDKQQEVLFMNRAVNHFAKNDSFEESTFLNEVMENPDLIPEFKNYKTEKGPKYSVEDISTFDIANKAVSDARKKIKNVINLDTNIQIKLDFINPESAEKYVEKGWDEEKQMYYYLVYFNKEQKS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027_3 | 479756-479856 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047027_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047027_3
>3.1|479779|55|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder AGCTGCTGTTTGCATTCTACCTAAAATAGTGTTGGTAATTTTAGTCACCTGACCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047027_3
The CRISPR arrays of NZ_CP047027_3 >merge|NZ_CP047027|3|479756-479856|CRISPRCasFinder CTACCACCACAAGAGCTACACGTAGCTGCTGTTTGCATTCTACCTAAAATAGTGTTGGTAATTTTAGTCACCTGACCTCTACCACCACAAGTGCTACACGT >NZ_CP047027|3|3|479756-479856|CRISPRCasFinder CTACCACCACAAGAGCTACACGT AGCTGCTGTTTGCATTCTACCTAAAATAGTGTTGGTAATTTTAGTCACCTGACCT CTACCACCACAAGTGCTACACGT
>NZ_CP047027.1|WP_158973770.1|478012_478948_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNHVLVAKEVNKKYGAYTALNNISLEIPENSIYGLLGPNGAGKTSLIRIINQITYPDSGTVLFNGEPLSPKHVAMIGYLPEERGLYKSMKVGEQALYLAQLKGMGKAEAKKKLKYWFDKFEIGDWWNKKVQELSKGMAQKVQFIVTVLHEPKLLIFDEPFSGFDPINANVIKDEILELKNNGTSIIFSTHRMESVEELCEYIALIHKSEKILDGKLTDIKKAYKKNIFEVGMQVFNPSEILPELRDKLGIFDDFYDQIENQLNFKLQLKGKSTQEILTYLATKAPINHFLEKIPSANDIFIQTISSKNSNE >NZ_CP047027.1|WP_158973768.1|476685_478020_-|ABC-transporter-permease MNKLLLIIKREYLAKVRNKSFVIMTFLSPILMVAMVVLIAFLTQLNDSEKQVISILNESDFFHNEFVTTESTSFIEFRNVSLKSAIDSTSNLGYYGLLYIPDANNLEEITNKSFFYTKEAPSTSILDKIEDVFKTRLQQNRLQELGVSNQDFLAVDKAYDINLSTFSGDINIKGFNEIRAFIGGGFGYLIMMFIIIYGGFVMRSVIEEKTSRIIEVIISSVKPFQLMMGKIIGTSLAGLTQFAIWIFSASLLMLVVIFVFDIDPAAFSGANPSMEAMSSVPNVSMMNEKILALGVEIYKIPWLMLISFFLVYFLLGYLIYSSIYAAIGAAVDNETDTQQFILPVITPLMLAIYVGFFSVFNNPHGPIAVAFSLFPLTSPIVMLMRLSSGLGEGGVPIWQVVVSILLLIITFMGIVWVAAKIYRIGILMYGKKPSYKELYKWLKY >NZ_CP047027.1|WP_158973767.1|475797_476682_-|mechanosensitive-ion-channel MIQDHTEKVKEILEEDVWGAIKDVLNLGVHFGKGENEIHITIGLLLLLVLTFVVTSFILKWLRYLFTRNMEVDDKHKFISVFKFIRYVAFLVVIVLTMSAAGINITILLTASAALFVGLGLALQELFQDVIGGIFIIVDKSLSVGDIIEVDDKVGKVFEIKLRTTRCVTRDDKVVIIPNHKFISETIYNYTQNHKTTRETVKVGVAYGSDVTLVTRLLEESVVGQKGILKNPKPFVLFEDFGDSALLFAVNFYIGDSFSDPRIKSAIRYKIDAKFREHNISIPFPQRDVHIKNN >NZ_CP047027.1|WP_158973765.1|474594_475758_-|response-regulator MSRILVIEDEAAIRRVLVKILSEESDTYIVEEAEDGLKGIEAVKKEDYDLVLCDIKMPKMDGVEVLEAAKKIKPEIPFIMISGHGDLDTAVNTMRLGAFDYISKPPDLNRLLTTVRNALDRKELVVENKILKKKVSKNYEMVGESEAIDVIKDIIEKVAPTDARVLITGPNGTGKELVAHWVHEKSQRSSGAFIEVNCAAIPSELIESELFGHVKGAFTSAVKDRAGKFEAANNGTIFLDEIGDMSLSAQAKVLRALQESKISRVGSDKDIKVNVRVVAATNKNLKKEIEDGNFREDLYHRLAVILIKVPALNDRRDDIPLLINHFASKIASEHGTAVKTFSDKAIALLQEYDWTGNIRELRNVVERLIILGNTEVDASDVKLFASK >NZ_CP047027.1|WP_158973764.1|473904_474591_+|hypothetical-protein MKSKYNLLYAILIVVSFSFTTNRDCEYVGSNIEYITSQTKKALVETDLNKTKYQIYKAINAIEKTRTKLNDCGCNYASKNLFDGLDNLILATKTSSLNGAKVLINRALKNTSLSLESLKEHHTHQSKYQPDVLTLNTTDSEKNKFVSEETLERELRQIIDHSLIKFEKSLEDVITTVDCEEAKNFILEIRNKCDQALLNDKLSEGKKYYNLRTKVIATHALDKLSGCN >NZ_CP047027.1|WP_158973762.1|472840_473719_-|polyphosphate-kinase-2-family-protein MNKIDIDSYRVKESITLSTAATFENFDADDNKLKKTLEKVRRELGDFQDILYAHGKYSVLMCLQGMDTSGKDSLIREVFKDFNARGVVVHSFKVPTELELKHDYLWRHYIALPAKGKVGVFNRTHYENVLVTRVHPEYVMGEHIPGIHKVEDLNEDFWEKRFEQINNFEKHIAANGTIIFKFFLHLSKEEQRQRLLRRLELKRKNWKFSPGDLKERKLWDSYQKCYEDAINKTSKTHAPWFVIPADNKKAARLIVAETLLKELKKYKDIKEPELDDKIKANLEDYKNQLEKE >NZ_CP047027.1|WP_158973760.1|471452_472838_-|M20/M25/M40-family-metallo-hydrolase MKKAIYLLSLFIITAVSAQKTDEEQLKTIYTTALTKSKAYDWLNYLSNQVGGRLSGSVQAQQAVDYTKAQLEELGLDKVWLQPVMVPKWNRGLPEFAYFESDPGVTTNVPICALGGSVATPLGGLKANVVEVKSLDDLAILGKQRLEGRIVFFNRPMDPANISTFESYSGCVDQRYAGAAEASKYGAVGIIVRSMNLRLDDFPHTGAMSYGDVAVDKRIPAAAISTNAADLLSISLRLNPDITFYFKQNCEQFDDVQSYNVIGEIKGTMYPDEIMVVGGHLDSWDLGDGSHDDGAGCVQSMEVLHLLKESGYKPKRTIRVVLFMNEENGLRGGNKYAEVAKTKKEQHVFALESDSGGFTPRGFSFDCSDANFAQVNSWKPLFEPYLIHMFVKGHSGADIGPLKDGDMVLAGLRPDSQRYFDHHHAANDTFEHVNKRELELGAASMTSLIYLFDKYGIAPTK >NZ_CP047027.1|WP_158973759.1|468234_469167_-|peptidylprolyl-isomerase MKDGIYAKFNTSKGEILVKLTHDKTPGTVGNFVALAEGNLENKVKPQGTPYYDGLKFHRVIPDFMVQGGCPQGTGTGDAGYKFDDEFHVDLKHDGPGVLSMANAGPGTNGSQFFITHIATPWLDNKHTVFGNVVEGQDIVDAIKQGDKIDSLEIVRVGAEAEAFNAVEAFRTFEGSRAKRIEEERAKKSSELDEVSAGFEETKSGLRYKIIQKGNGKKAEAGMQVSVHYEGSLIDGTVFDSSYKRKEPIDFQVGVGQVIAGWDEGICLLQVGDKARFVIPSDLGYGSAGAGGVIPPDATLIFDVELMKVS >NZ_CP047027.1|WP_013549199.1|467516_467708_+|cold-shock-protein MNKGTVKFFNDSKGFGFITEEGSSEDHFVHISGLVDEIREGDVVEFELQQGKKGLNAVNVRVL >NZ_CP047027.1|WP_158973757.1|466759_467398_+|peroxiredoxin MATIRLGDVAPDFTVDSSMGMINLYDYLGDSWGILFSHPADFTPVCTTELGTAAKFKDEFDKRNVKMLALSVDSAASHAEWIKDINEVENTEVNFPILADVDHKVSDLYDMIHPNANDTLTVRSVFIISPDKTIKLILTYPASTGRNFYELVRVIDSLQLTAYHKVATPANWKNGDDVVVSPAIKTEDAKKIFTKGVEEIKPYLRMTPQPNL >NZ_CP047027.1|WP_158973774.1|480345_480897_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MSDINNTEDIQEENLDQQDGSGQQNNSSEHAEELSVEEQLREDLAKEKDKFLRLFAEFENYKKRTSKERMDLFKTAGQEVIVALLPVSDDFDRAMQELAKSDDKETFKGVELIKIKFEQVLKSKGLEEVEAKAGDVFNADIHEAITQIPAPDKKMKGKIIDVIEKGFKLGDKIIRHPKVVVGN >NZ_CP047027.1|WP_158973776.1|481065_481980_-|TIGR01777-family-protein MKVLITGATGLVGNAIVTECHKNKIAVNYLTTRKSKIVDNENYSGFFWNPDKGEIDVNCFTGVTAIINLAGASISKRWTSSYKKEILSSRINSLRTLNAGLSKVDCASITSFVSASAIGIYPDSIKKFYSEDDEFKTEGFLSEVVKAWENEIDTFERFNFSLSKIRIGLVMSNVGGALPEMVKPIKFFVGSAFGSGKQWQSWIHIKDLAKLFVFAINNELNGVYNGVASNPVTNEKLVIKIASVLDKPLILPKIPASVLKLILGEMSALLLDSQRVSNKKILEEGFVFKYLNVCPALDSLYAKK >NZ_CP047027.1|WP_158973778.1|482072_482735_-|tRNA-(5-methylaminomethyl-2-thiouridine)(34)-methyltransferase-MnmD MERKIITTSDGSTTIQIVDWNEQYHSIHGAIQEAYHVFIKNGLSLYKDRDVSILEIGFGTGLNALITFIEAQKINLNIQYTGVEAYPVNPLEIKQLNYVEQLKAQEYEKIFLKMHESDWEKSCKLSSTFELVKQQKDFMHIKDEAAFDLIYFDAFGARVQPELWTEDIFNIMYRALKKNGVLVTYAAKGSVRRAMLAVGFEVERLEGPPGKREMLRAVKK >NZ_CP047027.1|WP_158973780.1|482736_483240_-|DUF4920-domain-containing-protein MKRINILLVIIVCFFSCKGQDKQTESEPTTEVTTGFSSFGAEIGVDNALNVSDMTLKYQNLKVADTITTKFTGTVIDVCQAKGCWMNVELENGAQAMVKFKDYGFFMPKDIAGKQVVVNGLAFVEEMSVEEQRHYAEDGGESEEAIAAIVSPKKTLRFEADGVLLKQ >NZ_CP047027.1|WP_158973782.1|483346_484414_+|branched-chain-amino-acid-aminotransferase METTANSLVTVEKSKTSKIDQVDFDNLSFGSIFSDHMLVCDYKNGAWENPKVVPYGPVSLDPSAKIFHYGQSIFEGMKAYKDSEDSAWLFRPLDNHKRLNISAKRLAIPEIPEDYFMEGLKTLLKVDEKWIPKNEGSSMYIRPFIFASGNGFHASPANEYKFMICLAPSGSYFSGKVKVLIEEKYSRSANGGVGFAKAGGNYAGQFYPTQLAVAKGYNQVIWTDDNTHEYIEEAGAMNIFVRINDTLITGPTSDRILDGITRKSIIEIAKDENINVEVRKLTVAEVVSAAKEGSLKEMFGAGTAAVISPISAFGYKETDYDLPEIKDSYASLLKKRITDIQYNKAEDKFGWRYKL >NZ_CP047027.1|WP_158973784.1|484453_484840_-|hypothetical-protein MENKLKAVALFHETFGMGVSKSMQANLGSRKNLLRFNLMDEENKEYLEAAENNDLIEVADALGDMLYILCGTILEHGMQHKIEEVFNEIQRSNMSKLGADGKPIYREDGKVLKGPNYFVPNIDKILNK >NZ_CP047027.1|WP_158973786.1|485372_485744_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MKQILLVFLGGGLGSVLRYLISKPLNFYFTNFYLGTFIVNIIGCLIIGFILGISLKNSYFNENQILFLATGFCGGFTTFSTFALENNSLLKNGDLLAFALYTTLSITVGIFAVSLGIWLTKLS >NZ_CP047027.1|WP_013549220.1|486074_486413_+|P-II-family-nitrogen-regulator MKKIEAIIRKSKFDEVKKALHQIEVNFFSYWDVTGVGNEKQGHVYRGISYSTSDIQRRYLTIVVSDEFLEKTVSTILEASSTGNVGDGKIFVSDVSEAYRIRTKESGQAGIN >NZ_CP047027.1|WP_158973787.1|486439_487756_+|ammonium-transporter MSEVQQEAISKVAEGVSQETLDQAIQSINGDMGALWIIVAAILVFFMQAGFTLVEVGFTRSKNSGNIIMKNIMDLCIGSLLFWAVGYGIMYGSDTVLGGFFRTSPSDQGYFFFSATDWYNLLFQTVFCATAATIVSGAIAERTKFSTYLIFSAVLTTIIYPISGSWYWPFDDSAWLNVAGFVDFAGSSVVHAVGGAAALVAAILVGPRIGKYKDGKVNAIPGHNMTYGALGVLILWLGWFGFNGGSQLAFGGDDTIAVGSVIINTNIAAAMGAVAAMVLTWIRYGKPDISMTLNGALAGLVGITAGCGAVNVWGALAIGLICGIVVVLSIEIIDKKLKIDDPVGAISVHGVCGFLGTVLVGVFALDGGLLSGGGAGLLWVQFYGSLAYIVWAAVASFIVLFILKKTIGLRVTQEEEMDGLDIHEHDSSAYPEFTINDK >NZ_CP047027.1|WP_158973789.1|487877_488909_+|outer-membrane-beta-barrel-protein MKAITKTNYVKNIFLLGLLFAGTSLIAQEEMEEKSKVKISGSADAYFRTNLSATDEADGDGAFINPGSSFAEETGFALGMANLIASYDMGKTGVVADLVFGPRGEAATFNQNVINQLYAYWNVSEGTTITAGRFNTFLGYEVISPVANMNYSTSYLFSSGPFSHVGVKADFALSEDFSLMLAVTNVADVNNNFTGVYALGAQLGYSGQFLNFYYDGGEFLGLEVDYTGGFDLSEDFFLGINAAYADSDGAGFAGAALYPQLATSDSFKLGLRGEYFSTFDGVDGTDDPSVFAATLTGSYSIENLTIKPEVRLDSWSDNEPYFDNDGAASKSLSSFLVAAIYSF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027_4 | 1887265-1887364 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047027_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047027_4
>4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder TAACTGTCATTGAAAAATCAACAACTGTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047027_4
The CRISPR arrays of NZ_CP047027_4 >merge|NZ_CP047027|4|1887265-1887364|CRISPRCasFinder TTGAAATTGTACTTGCTATGATCTTGAAAAATCAATAACTGTCATTGAAAAATCAACAACTGTCATTGAAATTGTACTTGCTATGATGTTGAAAAATCAA >NZ_CP047027|4|4|1887265-1887364|CRISPRCasFinder TTGAAATTGTACTTGCTATGATCTTGAAAAATCAA TAACTGTCATTGAAAAATCAACAACTGTCA TTGAAATTGTACTTGCTATGATGTTGAAAAATCAA
>NZ_CP047027.1|WP_158975026.1|1886363_1887008_-|hypothetical-protein MKKILIILILLAIYQPVVSQSTPCVKGDSASCLSLKDRGEIVITPLNKLSCKKQKAHLYAKFPKVTSYAGYLFKKINACTATDIDPYHGQLKFTYCLPETCQELRVTIFDFNDPYFKTESGSIHKEMYLMAFDATPASVIIGAHLATSINHFDKEIIISPRFGSMGGSSDTVGYLAYDSSRYLISIEVDDENKKFTAPSQVEQFIADYVQQIKK >NZ_CP047027.1|WP_158975025.1|1885923_1886298_+|hypothetical-protein MIESEKLENKNLIEKSVTHLQATGFEHIKADIEGYETPKSYTRKGHDSKITPDIVAIKNGRKYFFDISLKSKKPRLLKTKWLFLDTISRMRSERFRIITTKGHYKFTEDMLEDINLANKQPIKL >NZ_CP047027.1|WP_158975024.1|1884533_1885739_-|SH3-domain-containing-protein MKKISSIITFPFLLFTLFSCSSDDKNDAVLVDDIATIRSEYAPDKRVALFDVSAYRIKNNYTLYGESNLPEAVTALRERLTAEGIEFVDDIKILPEEDLKDKTFGLVTISVANLRSNPKHSAELGTQATLGTPVKIIKKDGSWSLIQTPDQYLSWVDDGGIVAMNAADYQHWKDAQKIIYTKISGNTYTMPDENSQVVSDIVAGGILELLVTDEDEESDFFMVKYPDGREAYVAKTEASWYREWLATAEPSQENLVATSKQLMGVPYLWGGTSTKGVDCSGFTKTIYFLNGMIIPRDASQQVHTGELIDTKENFKKLLPGDLLFFGKPATDDKTEIVVHVGMWIGNNEFIHSSGQVHISSMDKKADNYDEANHDRFLRAKRVAKSTVGALVNLKQTPVFND >NZ_CP047027.1|WP_158979545.1|1883623_1884460_+|hypothetical-protein MKKNFPVLLGAFLVTTMMGLTAQEIPVENLNTLLPQYSQQYAKTILADEIKGIHVEHIALTGKNTVLDATADGNKLIYLFFKGNGTVTAAGTEYAIVPETILLPNAIEEIQLKTSANDTLHYLRIASKLSKQDLIDLETFPKENTQQVYYKKFTDCEPYTEPIKSPNTVSRTIMPNKIIPRIAMGTVQTTGPDKVDPHEHPMLEQLFLGLSENDVIVYADDEHTPLEEYALLHIPLGSSHSVTVAKEKVMYYVWMDFFLDAKGEEWLKTHQVIEKENE >NZ_CP047027.1|WP_158975023.1|1882755_1883466_+|hypothetical-protein MKAIIITLLSLTFLASCTQEKKPKVVYTDQEAKTLVKDTSVIVVADLPILIDSTNFLMHPIGELQLYAKDRKLSSSSWSYAAGTNFSIAEYNNYTLNGTLKNIKFEEAGTNKLVPLTDKNMVITSAHFLWDLYEKTGKQLFIYDVIDADTNNDGALDGMDIKTLYISKIDGSSFKRLMPKNHELLEWKIIPEIDRLYVKSIEDTNKDGNFDKNDKLHYNYVYLVDEALEVIDYYPN >NZ_CP047027.1|WP_158975022.1|1882051_1882510_+|hypothetical-protein MKTLDENLHLEIEKLSEQGDAFAETGNYSDALTAYWNAYDLVPEPKTDWEATTWILVAIGDANFLGADFQAGVENLSNAMHCPNGIGNPFIHLRLGQCQFETGNLDRAADELTRAYALEGEELFADDDPKYFEFLKTKITLEKPKKKPWWKF >NZ_CP047027.1|WP_158975021.1|1881156_1882044_+|prolyl-oligopeptidase-family-serine-peptidase MKDLKKEAISQEVFDLYDDYAHNKLDRRQFAEKLSLYAVGGLTVASLLSFMSPNYKDTLLVQPNDPSLDSDYITYDSPKGGGTIKGLLSKPKDIKTKLPGVIVVHENRGLNPYIEDVGRRVAVADFISLAPDALTPLGGYPGNDDDGRALQKERNQAEMLEDFIAAYEYLKAHKDCNGHIGVVGFCFGGWIANMMAVRIPELGAAVPYYGRQPEAEDVAKIKAPLLLQYGELDERVNAGIPAYEAELKANAIPYQVYIYPKVNHGFHNNTTPRFDKEAADLSWSRTIAFFKEHLK >NZ_CP047027.1|WP_158975020.1|1880632_1880851_-|hypothetical-protein MKTLLITIFLIFIGVTAQAQETTKEVKVETTTKTIVTTTNYETSTARLYMHKNSRVKKELSFTTKANKTKLS >NZ_CP047027.1|WP_158975019.1|1879792_1880536_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSFFGKNIKKIRGIKGLSQEAFANVFHLKRATLGAYEEGRSEPKIDTIIKVANYFSISIDDMLTKDITVNQLLRFDSDITTDVNQIVKAGFSEVPFVNALNRKIFIEEFKSSQSYSSLPKIKIPVEASVHLLAYTVQDLFMESNGEGLFLNDVVVGEHVAPKDLVQGDVVIVLLDEELFIRRFDSSDTGYNLLADHINIPPLLIPYSVSVYFWKVSYVFLKQYPKFASKLEARINQLDAELKRLSSK >NZ_CP047027.1|WP_158975018.1|1879240_1879636_-|molecular-chaperone-Tir MKKQFKIIKNYLLELNYNITHENEKDGILMIQNEDEGINNLIIGIASPILIIEQYIFKITKPSEDIFKQLLQKNRDIIHGAFVLDETGEKVIFRDTLQIENLDLNELEGSINSLSLLLSEYSENIIQFSKA >NZ_CP047027.1|WP_158975027.1|1890361_1890805_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MLKVQVKKFEELSTTELYAILQLRSEVFVVEQDCVYQDVDGKDFKSLHVIGYKDADVAAYTRIFNAGDYFDEASIGRVVVSPKYRKDGFGKEIMNASIAAVKRAYGEDTIRISAQKYLLKFYTSLGFNVVGEEYLEDGIPHMNMIKN >NZ_CP047027.1|WP_158975028.1|1890808_1891729_-|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MGHNHAHGHQHNHPDLKGRNLLISILLNIIITVAQVIGGLVSGSLSLLSDALHNFSDVLSLIVSYIATLFAKKEASTNKTFGYKRAEIIAAFVNAASLIVIAIILIKEAVERFFEAQPIIQSNIVIWLSLLGIVANGLSVLLLKKDADSNMNMKSAYLHLLTDMLASVAVLIGGLVMKFYELYWVDALLTLIIAFYLIYVGYDLLKSSTRVLMLFTPNTIEVNKIVEALQKIDTIKNVHHVHIWQLNEDEIHLEAHIDFDTDIRLSEFDVILEKIEEEVFHKFGINHVNIQPEYDKIDNKQIIVQD >NZ_CP047027.1|WP_158975029.1|1891737_1892169_-|RpiB/LacA/LacB-family-sugar-phosphate-isomerase MKIAIGNDHAGTDYKLAIVGMLKSMHIEVKNYGTDSFDSVDYPDFVHPVAEDVASNAVDFGIIICGSGNGASITANKHQQVRSALCWTNEIVALARQHNDANILSLPARYISLPQALEMVKTFLDTKFEGGRHEGRVEKIPCK >NZ_CP047027.1|WP_158975030.1|1892777_1894967_+|ribonuclease-R MSKKKKRSSGQKKNEITRGIFTVLEKEPNKSFNYKEIAAKIQISDANDRNDLIKRLVQLKEKRRIVETSPGKYKAIENTKTYHTGTVDITGRGNAYIIIDGMDDDVFVPVNKINKAFHKDTVEIYIYPRRKGKKLEGEVTKIVKRFKTSFVGILDMQKSFAFVRVGDFRMYTDFFIPKDKINNAQDGDKVIVEFNEWPDKTDSPYGTITQVLGKPGEHNTEIHSILAEYGLPYEFPVEVEQFANDLDTSIKPEEIAKRRDMRDTLTFTIDPRDAKDFDDALSFEVLDNGNFEIGIHIADVSHYLLPDTVMDDEAYERATSVYLVDRVVPMLPEVLSNNACSLRPHEEKYTFSAIFEIDKKAHVINEWFGRTVINSNERFSYEEAQHIIENKVNSIPEDISIRDAAYEVSDAVVNATLKLDELAKIMRARRMNAGAISFDKLEVRFNLTPEGEPESVYFKEAKDANKLIEEFMLLANRKVAEFIGKQKPEKTFVYRVHDEPNEEKLMALNGIISRFGHKLDFKNKKTISSSLNQLLEDVKGKGEQNMVDTLAIRTMSKAIYTTDNIGHYGLAFDYYTHFTSPIRRYPDVMVHRLLQHYLDHGASAKKEVYEEKCKHSSDMEGLASSAERDSIKYMQIKFMEDHQDREFIGVISGVTEWGIYVEIIENKCEGMVRISDIKGDYYNFDEKEYAIIGERTKKVYQLGDEVKVMVKNTDLVKRHLDFTLIGKAE >NZ_CP047027.1|WP_158975031.1|1895032_1895713_+|DUF2807-domain-containing-protein MKQYFIVTFLVFVLINGHAQTEKVTQDLDKFTTVKAFDGLSINLIKSTVNKAVITGANTSKVAIINNDGVLKLRMEIGKIFSGYRTFVDLYYTDELITIDVNEDARITSKEVIKQDLLELKAQEGGELIINTQVEQLLIKTVTGGIITTTGFSDNQDVMINTGGIYQGKSFKTNFTTVNVNAGSKAEIYAINYVKASVKAGGEVLVYGNPKKMDEKTVFGGTITRM >NZ_CP047027.1|WP_158975032.1|1895719_1896397_+|LysE-family-transporter MIEDIQAAIPLGFFLSFMIGPVFFVLLETSATKGFRAALIFDLGVILADILFITAAYFSSFQLLENLSNQPGLYVFGGAILLVYGIITFKTKQVKLRDEAVKVTSGHYLSLFVKGFLLNFINIGVLVFWLGIIIIVGPSLDNNSDRILVFFGAMIGAYFVTDIFKMLLAKQLRKKLTPKRIFLVKKVLGIILIICGLVLITKGFLPKDKLNLQEGIELIREAEQQ >NZ_CP047027.1|WP_158975033.1|1896494_1897076_+|cyclic-nucleotide-binding-domain-containing-protein MEKSKINTYFHSLFPIPEPVVEKITATFCPFTLEKNTILLDKNTISTKTYFLEQGYVRSYILNEDNEEVTTNIYAAPCFVNDFLSFFKKQPTKEVYQTLTDCSFWETNFDNVQANFHNITEFREFSRLLFVINYYKLNDRLIEMASQKAETRYLNLLKVQPHIFQHVPLKIIASYLGITDSTLSRIRKEISKM >NZ_CP047027.1|WP_158979547.1|1897143_1898091_+|2-dehydropantoate-2-reductase MNKKHIVIIGLGGVGGYFGFKINQANEKNKQYKISFVARANTYATVKEKGLTLLSSEYENSSTYPDAIYEHISAIKDPDLILICVKEYDLEDVCTQLSNTITPNTILLPMMNGADIYDRIRALAPNTTILPSCVYVASHIKEKGIVAHKGAAGKLILGKDEAHNSENLEWIVALLENSKIDFELKENAQTAIWSKFIFIASFGLVTAKHNSSIGAVCTVASQKEEATQIMLEIKTIAAKKGILLAEDIIQKTFEKAGTFPPTTPTSLQLDVHSGKNKTELELFAGAVITYGILENSATVCTKRIYDEIKAAHKNL >NZ_CP047027.1|WP_158975034.1|1898255_1898864_+|hypothetical-protein MEEIFLNLFRKYTNDDLYATACWKALELKYSATSRHYHNLEHLAYMFALLETVKSKVEHLDALLFAIYYHDSIYSITKSDNEHQSALYFKKMISKTSFDAITEVMDLIEATKEHKLSKDHDTNVLLDLDLAVLGEKPENYLIYAKAILKEYYIYPDFMYRKGRKKVLMNMLNLEGIYKTDFFKTQFEATARENLSAELKRLD >NZ_CP047027.1|WP_158975035.1|1899484_1899841_-|dihydroneopterin-aldolase MGKISVSNIRVYAYHGCLREESINGSDYRVDVEVEADLAKASVSDNLKDTVNYVVINYIVKEEMAIKSKLLEHVAKRILDRIFKECPTVNSGNVTVSKINPPINGDVEMVSINLQLSR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027_5 | 2735677-2735826 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047027_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047027_5
>5.1|2735722|60|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder AAGGGATCAACGCAGTTCATCCTTTATTCGTGAAAATGTTGAATATGGTTTTAATGTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047027_5
The CRISPR arrays of NZ_CP047027_5 >merge|NZ_CP047027|5|2735677-2735826|CRISPRCasFinder CTTGCGTATATTTTGTGAGACTTTTTATTTTCAAAGCGGAGCTTTAAGGGATCAACGCAGTTCATCCTTTATTCGTGAAAATGTTGAATATGGTTTTAATGTTTACTTGCGTATATTTTATGAGACTTTTTATTTTCAAAGCGGAGCTTT >NZ_CP047027|5|5|2735677-2735826|CRISPRCasFinder CTTGCGTATATTTTGTGAGACTTTTTATTTTCAAAGCGGAGCTTT AAGGGATCAACGCAGTTCATCCTTTATTCGTGAAAATGTTGAATATGGTTTTAATGTTTA CTTGCGTATATTTTATGAGACTTTTTATTTTCAAAGCGGAGCTTT
>NZ_CP047027.1|WP_158975707.1|2735027_2735276_+|GIY-YIG-nuclease-family-protein MKYYVYVLESEKDKRWYKGHTADLDKRIKEHNSGKTKSTKGFVPWRLVYFELFETRKEAIQREKYFKTGSGREFLKKIITAA >NZ_CP047027.1|WP_158975706.1|2734503_2734953_+|GatB/YqeY-domain-containing-protein MSLQDQVMTEIKTAMKAKDKVALESLRAIKSALLLMQTDNGSGEAITEEAEIQLIQKLVKQRKDSAAIFIEQGREDLAEPELAQVAVIEKFLPEQLTEEEIEKVVLQTIETTGADGMKDMGKVMGMVSKALAGQADGKTISMIVKKKLA >NZ_CP047027.1|WP_158975705.1|2732475_2734416_+|cell-division-protein-FtsZ MSNSNEFGSISFDLPKNQSNVIKVIGVGGGGSNAINHMYLAGINGVDFIICNTDSQALDNSTVPNKIQLGVSLTEGLGAGANPEVGEQSAIESMEEIKNMLGTNTKMVFITAGMGGGTGTGAAPMIAKQAKELDILTVGIVTIPFQFEGQMRTKQAQAGIEKLRNNVDSLIVINNNKLREVYGNLGFKAGFSKADEVLATAARGIAEVITHHYTQNIDLRDAKTVLSNSGTAIMGSSTSSGSNRANEAIMSALDSPLLNDNKISGAKNVLLLIVSGTKEITIDEIGEINDHIQSEAGHSANIIMGVGEDETLGEAIAVTVIATGFNIDQQDTIVNTESKKIIHTLEDSQKAEQLLMGSENVVFQLVEEEEKVKEVVKEEPKIVKHILEEDKPEMDLIPTSSYIKNFNVFYDEVIAENVGDDFIIVDSKTQIDNFEVIDPITVSSVKIEDDQFLFSFDGPEAEKMKENKKDNVVMFSLDDEVRDMDVKDPIEVIPVVEYNKDGEKRYSLDDYMELEGKLNEAKSKAEKVEPKVLEEEMRFEQKTVEKETKHVEEAAHVDPMDMPLEELLRSRSEERKRKLKDFNYKFQNNNAKHIDEIEKHPAYKRQGVHLNEVNRENKISRTSLSEDSNDDIQIRTNNSFLHDNVD >NZ_CP047027.1|WP_158975704.1|2731087_2732434_+|cell-division-protein-FtsA MEQGKYSVGLDIGTTKIVAIIGKENEYGKIEILGIGKSKSLGVHRGVVNNITQTIQSIQQAVEQAESNSGLKIGSVVVGIAGQHIRSLQHSDYITRDDSEQVINEDDVDKLCNQVYKLIMLPGEEIIHVLPQEYKIDGQAEIKEPMGMYGARLEANFHVVVGQVSSIKNVGRCIKSAGLDLGSITLEPLASANAVLSQEEKEAGVALIDIGGGTTDLAIFKDGIIRHTAVIPFGGNVITEDIKEGCSIIEKQAELLKIKFGSAWPGENKENEIVSIPGLRGREPKEITLKNLSKIIHARVVEIVEQVYVEIKNYGHDEQKKKLIAGIVLTGGGSQLKHLKQLVEYITGMDTRIGYPNEHLAGDSDEEIASPLYATAVGLLMNALKTKAKSEAIEAEEEELQSQLPENEMNDDTTDGETTVVQPEIHRERKSIFDKWSDKLKDFLDNAE >NZ_CP047027.1|WP_158975703.1|2730364_2731084_+|hypothetical-protein MKINWNIVKAIILLLTVTGLFAFSNNRHSKKPISELDVMFTDENNLYVTTGMVNKLLIQSFQGFDMVPKENLVLNNMEKAIEANEMVKKAQVYLTVNGKLTTKIAQRNPIGRVESGTIYYLDDEGKRMPLSRNHSARVPVITGNITDDSLKEVHFILDYINGDDFLHKNVIGIQVLNNRKYQLKFRTESFVVNLGKAEELSQKFNKFRAFYKKGKKDNSLAQYSLVSLEYNNQVVCTKI >NZ_CP047027.1|WP_158975702.1|2729022_2730375_+|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MNMNQIHSVYFLGIGGIGMSALARYFVYLGKIVGGYDKTASPLTLELEAAGMAVHYEDDVTLIAPNFLDKETCLIVYTPAVPQDHSELNYFIDHKFEIKKRSEVLGLVTNETFCLAVAGTHGKTTTSSILAHILKEAQLPMTAFLGGISEDFGSNFYFQGAEFSVVEADEFDRSFLRLSPDIACITSMDADHLDIYGTGEELEKSFREFAARLKVGGKLFIRKGLPIEGITYGIEDDADYCAKNVAIVNGVYVFDLQTPTVLYKGIRFKKPGRHNLLNAIVALGMALEANAKPEKLFPALESFKGVKRRFSYRIKNGNFVFIDDYAHHPTEINAVFEAVTEMHPNKKVLAVFQPHLFSRTRDFADDFAKSLSKFANVLLLDIYPAREKPITGITSEWLLQKITCQNKKVIKKTELITEIQKQAPEVLIVMGAGDIGLEVVKIQKAIANEN >NZ_CP047027.1|WP_158975701.1|2727899_2728991_+|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MGNYKFILSGGGTGGHIYPAVAIANELKRRHPSAEFLFVGAKDRMEMEKVPNAGYKIEGLWISGLQRKLTFRNLMFPFKLISSLVKAGGIVEKFKPDVVIGTGGFASGPLLKRASGKGVPCVLQEQNSFAGITNKLLAEKSRKICVAYDGMEKFFPADKIVKTGNPVREDLVTMAATQKEALAFFGLEESKPTLVVLGGSLGARRINQLIEKELRFFEELGIQLVWQCGKLYYEEYKKYQSDSVKVFDFLNRMDFAYAAANFVISRAGAGSVSELCIVGKPVIYIPSPNVAEDHQTKNAMALVEKDAALMVRESDLASQFESIFSVLFKDEEKQKELSVNSKKMAMPNATSDIVDEIEKLLKK >NZ_CP047027.1|WP_158975700.1|2726710_2727913_+|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MEFFNKISGDKAIWAIVALLALFSFLPVYSASSNLVYVVGNGTGTTLSFLFKHGLLLALGFGIIYGVHKIPTHFFKGLSLIAMPIVLLLLVYTLAQGTTIGGANASRWIRLPLVGFTFQTSNLAAVVLMAYVARYLTKIKDKTIGFKESILPLWLPVFLVLILILPANFSTAAIIFFMVMVLCFLGGYPIKYLLGIIGSGILTLTLFILVAKAAPDLFPNRVNTWQNRIENFANDEDSDADYQIEKAKIAIATGGIIGKGAGKSIQKNFLPQSSSDFIFAIIVEEYGLVGGMVLVFFYLLLLFRIVVVANGNTTIFGKLLVVGVGLPIVFQAFINMAVAVELFPVTGQTLPLISSGGTSTWMTCLAIGIILSASNKETIEESSSAEIDDTNPLEVLSGQL >NZ_CP047027.1|WP_158975699.1|2725369_2726704_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MQRLVILGGGESGVGTAILGKKKGYEVFVSDKGTIKDNYRKVLEHFEIEWEDQQHTEEKILNADVVMKSPGIPDKIALIQKLKEKGVPVISEIEFAYKYTDAKIIGITGSNGKTTTTMLVNHLLKSEGLHVGMAGNIGDSYAKMVAENDFEYYVLEISSFQLDGIVDFKPHIAILTNISPDHLDRYEYKYENYIASKFRIAENQTEDDYFIYDADDKDLTDWLEKHPVKAKLMPYSIERTIEEGAFSTNEDITITTNNDTLKMKTDSLSLEGKHNLKNTMAASTASKLIGIRKETIRNSVANFQGAEHRLEKVLKIHHVEYINDSKATNVNATYYALDSVRTPTVWIVGGVDKGNDYKSLMPLVREKVKAIICLGKDNTKIIEAFGNVVDLIVEAYDMSETVKIAYKMAERGDTVLLSPACASFDLFDNYEDRGNQFKAAVKNL >NZ_CP047027.1|WP_158975698.1|2724147_2725368_+|phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide--transferase MLYYLFEFLEKNYQIPGAGLFQFITFRAALAVLTSLLIATVYGKKIILFLQKKQIGETVRDLGLDGQKQKAGTPTMGGLIIILATLIPVLLFAKLDNIYVILLIVTTIWMGIIGFIDDYIKIFKKDKEGLQGKFKILGQVVLGLIVGTTLYFHPEVTMKERSQSVITTAYTLEKVAGAEVKSVRTTVPFFKNNELDYTSFIGWMGDGAKEYAWLIFIPVVIIIVTAVSNGANLTDGIDGLAAGSSAIIVLTLGIFTWISGNIIFSNYLDIMFIPRAGELVVFVAAFVGALVGFLWYNAFPAQVFMGDTGSLTIGGVIAVIAIIIRKELLIPVLCGIFFAESISVMLQVGYFKYTKKKFGEGKRVFLMAPLHHHYQKKGYHESKIVTRFWIVGILLAVITVVTLKVR >NZ_CP047027.1|WP_158975708.1|2735960_2736701_+|hypothetical-protein MHFFKDSIKLLTVFIAFFCSIIVASQEIPHLETILNQLELDLSECKTDLIVAKVKPDNSEETIVVIPEIVQEDEDYFELNSHILIIETNTGKIKSRYFEGSLTNEWYSDAVRLAEIKIDTAPYLLSEDTRAFGIRVYYYNNSHPNPYSHETISLYFDENNTLKQVLKNFEMMSYGGEVNSECEADLSGVEKVLILKETKTNGYFDILVKSTVKTTTRKEASNGDCIEEKKITNLDQVLKFKNGKYQ >NZ_CP047027.1|WP_158975709.1|2736708_2737662_-|hypothetical-protein MNELIVCLGFFIAAYSVIANDVIQTLGTFISSNSKTKWWYLWAFAGTILTVTLFFGWYFNNGDVSYGRLSQIPLPDPLPWWYLLAPLSLLIITRFGIPVSTTFMILSVFSSGQLIEKMILKSIFGYVLAFAAALILYLIIAKKLESKAAIRLMDKKKQKPYWLVAQWFSTGFLWSQWLIQDFANIFVFLPRQLTISELGIALIVILSIMAYIFNVKGGNIQKIVNQKSNTQHIRSATIIDACYGVLLYLFTILNDVPMSTTWTFVGILAGREIAIKYLLEKKQLKTTYTLIIKDLAKVNIGLMISILIAYLIQFLKA >NZ_CP047027.1|WP_158975710.1|2737814_2738183_+|hypothetical-protein MSKMLWYRSLLFILLCSSFQGSFAAVEIEAKHDNLDVAIILDQTAVQDRFTINADGLNVIWENTTSSNADTTVNLVFGSSLNPIQYLCARKNQIALLYISSSGFIDLKFDTHRIAYHFHSFP >NZ_CP047027.1|WP_158975711.1|2738318_2738822_+|hypothetical-protein MDTSVLIMCLILVGIIFIPFFLFNISGKSTSKKVKEAAQAVSAKNQLNISQSELWGNSYIGIDENERKLLFLKFSEKEMYERMVVISAIKECTILEQRKFFKVKDKKDSHLEKLDLKITLKSGKHFELNFYDETLNYSEDFEVKRIEKWKLLIHQLITTENNVKQVA >NZ_CP047027.1|WP_158975712.1|2739033_2741424_+|penicillin-binding-protein MEKITSLKNTLTAKAKKVLRFARKHPFKSFFYFMGLGFLLGLVFLLLIYFGAFGKLPTKEYLKQLENPITSTIYASNNEPIGYYFLQNRSNADSTQISKHLKEALVATEDSRFYTHGGIDYKSYGRVFVKSIVLGQNAGGGSTVTQQVAKNIFGRQKQFFLSTPINKIRELFIAKRLESIYSKDEILLLYFNTVSFGENIYGIEKAAYRFFNKPPEKLSLEECATLVGVLKAPSYYNPRINPERATNRRNVVLSQMAKYGYITELEMEAAKKPLVLDYQLPKKTSAFSSYFKDLVAEEFAQWAELNPAEDGHIYDLEADGLSVYTTLNTSIQEYAEKALNRQIESLQKLMDQYWDAATIEGGKEALLQQITDQTKEVKRLKAEGKNEEEISSFINKKKKRNYWEIGKGYEEKMMSLEDSIAKSINRLHASLFVMSTTSGRIMGYVGGIDYGFSQTDNIRTPRQVGSTFKPITYLAALEVGQDVCSYYNNNLVTYAEYEDWQPRNASGGYGGSYSMHGALANSVNTVSVNIQLKVGVERVLEQAKKMGIEAPLPEVPSIVLGTADISLLEMATAYASISNGGNKIKPFTIERIINEDGVIVYEAKPEYQGRVAGYTHVKQLQKMMEGVVTSGTGVRLMGYGIPYNLIGKTGTTQNNGDGWFIGASPELVIGAWVGTYDKRVQFSTTRMGSGSNTALPMVASVFRDLSTWKRPILTNFKYDFDHFPCPPYLEMNAKEAFEFAKADTLYLQNLRIQDSLKILSQLPVPIDSLQGIVPATIKTDSTVLDSLPANLSDILK >NZ_CP047027.1|WP_158975713.1|2741430_2742036_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIYGTRSAHLHSVQKATPVCPNCEEKGSLLISIYRKHAHIFWVPIFPMGKSGVSHCKNCKQALRSNEMPEPLKKEYQIIKNETKGPIWQFSGVFIAFFFLIFAGFTSQNNKKLEQEYLNQPMAGDIYEYKIANKQFSTMKVIQVDSDSLFIALNDFEISEASRIYKIDTPENYPNVVYGYSKKEITAMYTSGKIFDINRN >NZ_CP047027.1|WP_158975714.1|2742058_2742472_-|hypothetical-protein MKHKIILIALTTLFISCSNDKKTSETAKHVAIIKSDLLLTNSAVKAFSGQNNTDTLTILINGKSLLQSTATLKVTNDKGEELLCDTLATTRLLNPDYRTANSALKDAQIRETVSNLFTTNEYLKYFKQKEIASNQIK >NZ_CP047027.1|WP_158975715.1|2742610_2743255_-|response-regulator MNYNLIIADDHKMFIDGLISILNEAPEFSVILTAKNGAQVEKYLSINGAENIHLLITDLTMPEMGGIELNKIVKSKYPALKTLVVSMHIDGMMIDKLIKNNVDGYVPKNAEKEELLTAIRSIIKGDKYFSPEIKKAYTDAMFENKKMEEISLTDREKEVLKLIAEENTTQEIADKLFLSKHTIESYRKNLISKLNVKNLAGLTKHALKMGLLDE >NZ_CP047027.1|WP_158975716.1|2743244_2745221_-|histidine-kinase MHSNYQGFTGQSLFLFFSLLFLNAAIGISQGKNKDTSNIAPLVYFGWAQRTTPKSLDPYYKELKTAEYGIQRFSIIDQLLDFHIRKTNTDSVVHYANLYLKEVNNWSQTPKIKKRYSSKANYYLGKGNLMNGLYDNAIKWFLQGLKEAEETNYTEFKYKHKLGLARSYISQGNIDKGISLLEKSLSEFTPEFPSLKTQNFILLGKAYRFNENYTQAQRYYDEASKLSKTLDDEETLLTIRLEIAKLKEAQNDFKGAFPEYETTRNEAKEKGFDAIYFEGSLLISRLYYKQGFYDIAVLGLTTAYINAIDSDNLQFQRESLILQSRCFQEQGDFENAYASMTQLFSVIGEINERQQKAIIKELEVQYETIEKEKEINTLEEDKLLKEAELSRQKTIKNAFLIGFLIILIPIIALLFVYYQKLQTQSELSKKQEEINTQKVKSLIQEQELNLIKASVEGQDEERKRIAQELHDSIGGNLAGIKLQLSSLAKDSDALKTINIQIDETYQLVRDISHTLIPKKFKQNVFTDLVQEFVNSISRTNTIQVAFHPHPKENINKIDEKIQVELFKILQELMTNTLKHAKAKNVDIHLNLIGDELSLLFEDNGKGFNTLEKETGIGLKNITSRIKKLKGTLHIDSSENRGTVIALEIPDLKKTVHEL >NZ_CP047027.1|WP_158975717.1|2745342_2746305_-|YpdA-family-putative-bacillithiol-disulfide-reductase MNKFDVIIVGGGPIGIACGLEAKKKGLSYLIIEKGPIVNSLFHYPSNMQFFSSSEKLEIDEIPFISKEPKPKRDEALEYYRRIVTSNHLNIQLFEKVENVVKTDTYFEVTTNKKSYSAKNVVIATGFYDLPNTLNIPGEQLEKVKHYYDNPHYYAQQKVAVIGASNSAIDAALECYRKGAEVTLIIRGTEVGQRVKYWVRPDIINRLEEGSISVFYNATLKEIKHNEVVINTPEGVKTIENDFVLALTGYKPNFEFLENLGVALSNDEKRLPNYDQETMETNVPNLYLAGVICGGMETHKWFIENSRVHAKMIMDSILKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027_6 | 4036862-4037056 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047027_6
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047027_6
>6.1|4036889|60|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder CAGCTCTTGTATTTGCTTTTCTAGTAGTTGTACTGGTTCTGCTCGTTACACCTCTTGTAT >6.2|4036976|54|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder TAGATCTAGTCGTTCCTTTAGATGATCTTGGTGAAGTATAACTTTTAGAATGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047027_6
The CRISPR arrays of NZ_CP047027_6 >merge|NZ_CP047027|6|4036862-4037056|CRISPRCasFinder TACTTCTTGTCGCAGGACTTCTATAATCAGCTCTTGTATTTGCTTTTCTAGTAGTTGTACTGGTTCTGCTCGTTACACCTCTTGTATTACTTCTTGTCGCAGGAGTTCTATAATTAGATCTAGTCGTTCCTTTAGATGATCTTGGTGAAGTATAACTTTTAGAATGTGTAGTTCTTTGCGCTACTCTTCTATCAT >NZ_CP047027|6|6|4036862-4037056|CRISPRCasFinder TACTTCTTGTCGCAGGACTTCTATAAT CAGCTCTTGTATTTGCTTTTCTAGTAGTTGTACTGGTTCTGCTCGTTACACCTCTTGTAT TACTTCTTGTCGCAGGAGTTCTATAAT TAGATCTAGTCGTTCCTTTAGATGATCTTGGTGAAGTATAACTTTTAGAATGTG TAGTTCTTTGCGCTACTCTTCTATCAT
>NZ_CP047027.1|WP_158977702.1|4034960_4036418_+|oligosaccharide-flippase-family-protein MGIVLKQSLNNTIITYLGFAVGAVNTLFLYTRFLTDEYYGLVGVILSASAVLMPLLAFGIPNTLVKYFSGFKESTYKNGFLTLMLVLPLFLILPVALISYVAYDAIGNFLAKENPIVKGYVWYIFIIGMSMAYFEIFYAWAKVHMKSIFGNFLKEVFTRLGVTILLVMVYFNWISIDTFLISLVVLYILRMLIMKFYAYSLQMPVISFKFPANTKTIIQYSALIILGGSAAVVLLEVDKVMINQYIKIENVAYYSVAIFIATVISVPSRAMHQIVYPLTAEILTKNDTDSLKNLYHRSALTLFIISGLIYLLIILNLGDLYTLLSDDYSKGFSVVLLIGLAKVYDAVLGNNNAILYNSDYYKMLLILGVFLAIITILFNMWLIPEYELIGAAIASFSAIFIYNTLKIVFVKVRFGILPFSIAMFKVLLVLIVLGIAFYFITIPFHPILSIIIKSILIVVLYTWVLYRFKLSEDVSGVLHKFLKNK >NZ_CP047027.1|WP_158977699.1|4033689_4034961_+|glycosyltransferase MKKVLIITYYWPPAGGPGVQRWLKFVKYLRDFNIEPVLFIPENPNYPIRDTAFLKEIPEGIKTVKQTIFEPYQLASFLSSKKTKRISSGIIQTKNQSTLEKILLWIRGNLFIPDARKYWIKPSVKAITKLLQEENIETIITTGPPHSVHLIGLALKEKLGITWLADFRDPWTSIGYHKKLKLTAAAKKRHKFLEKRVLNTADTILVTSPTTKKEFEALTSQPITVITNGFDVQENQGNTLDSAFTIVHIGSLLSGRNPENLWRILSELIASNAEFKKVFKLKLIGVVSEDVLDTIYAHHLKPYVELVGYVAHDIALQLQKQSQILLLTEINAKETQGIIPGKLFEYLAANRPILAIGPENWDVSTILEDTKAGKTFDYTEDIRIKELLLEWFEAYKTSNLKIASTNIAKYSRRELTRKLAAII >NZ_CP047027.1|WP_158977696.1|4031257_4033690_+|hypothetical-protein MKSNLRAFLIHFFAIAIFIVAAVAFFTPVLQGKVIFQSDIAQYTGMAKEQTDFKEKTGEEPYWTNSAFGGMPTYQLGAHYPYNFVKQVDLALRFLPRPADYLFLYLLGFYILLSCLKVDYRLAVLGALAFGFSTYLIIILGVGHNAKAHAIAYLPMLLGGIILVFRRNYVWGFILTAIAMALEINANHYQMTYYFMLLVLILGVVYLIDAILKKELKHFFTAVGVLLIAVLLGIATNATSLMATKEYADWSTRGKSNLTINPDGTPKESTGGLSKEYITQYSYGITESLNLFVPRLFGGSNSEDLGKKSNTYDFLVERNISPSQALEFSKGMPLYWGDQPGTSAPAYIGAVLFFLFFLGLFLVKSNIKWWLLGGVIMSLFLSWGKNFSFLTDFMIDYFPLYDKFRAVSSIQVILELCVPILAILALNSLLDSKVDKARKITALKISFGISIGLGILLLLTKSLFHFEGASDPYLEKNYGNELMTMIRLDREAVYTNDTLRSLLFVFLAATVLWFFIKEKINKNVFVLLVGLLILFDLVGVAKRYVNDDDFVRQRAMTTPFPETEVDKLIKQDDGVFRVYNPAEGLNGASTSYYHQSIGGYHAAKPAKIQDLFDFYIYTGNLNVLNMLNVKYIIQQDEKGSFPAQNPDANGNAWFISTLEKERTSSDEILALKDLDTKNKAVINNENYPKITEFQYKKDSLATIQLTAYQPNKISYVSDNANKGFAVFSEMYYENGWNAYIDGQLKPHMCVDYALRGLVVPAGQHTIVFKFEPEVIKKGSTIVLFSSGVLGLLILAAIGFTFSRTRKQEKE >NZ_CP047027.1|WP_158977693.1|4030890_4031157_+|DUF4834-family-protein MAFLKTILIILLVYYLFKILIKLFAPKILNYAGKKAEQHFREKLEGFNTQQQPQKSTEQGDVIIDKNTTRKSNSSKKVGEYIDFEEID >NZ_CP047027.1|WP_158977691.1|4029716_4030778_-|transporter MKNFLLLAIFLYSIIASSQYTDVINSNRPGQSVSAYAVGKNVIQAEFGIGYEQQDHVLLNSESNILSTELALRYGLLFEKLEITYEGVYQKENITYSNSFPDQTITDFSRNRLGLKYLIYDPFKNPERNKPNLMSWKANHKFQWRNLLPAVSLYAGATFNLGDNPYYIGDGTVTPRVMLATQSKISPRVVFITNIAYDRIGSEFPEWSYIMSLTHAFRNPKWSIFLEQQGIKSDRYADALYRTGIAHLFTKNMQADITFGGSFKDTPTRMFGTLGLSYRIDKHQDKIVPIDEQKGGENGQIGKKDMKKKAKKAKKEDGSGAEDVDLGPTKKQLKKLKKAEKKKKKEDNGAIDF >NZ_CP047027.1|WP_158977688.1|4028496_4029615_-|GTP-cyclohydrolase MITVSEVKTTADLKKFVKFPFTLYKDSKYWVPPIIADEMETFNKDKNPAFKDAEATLFLAYKDNEIVGRIVAIVNWIEIKQQKVSKMRFGWFDFIDDLAVSKALIEKVQEIGTKNNLEYMEGPVGFSNLDKVGVLTEGFDEIGTMITWYNHAYYVNHYENLGFAKEKEYMENRFPFANADPKFYAKANVLIKKRYNLRPLNFTKTKDVMPMADKMFDLFNESYASLSSFVPITEIQKAYFKKKYISFINPEYIKFVVDKDDKLVAFSIVMPSFSEALQKSKGKLFPTGLFHLLKAKKQSKEVIFYLIGVHPDYQNKGVTAIIFNEYYETFTARGILSCVRTPELEENIAIKQLWKNFNPEIYKRRRTYRKNL >NZ_CP047027.1|WP_158977685.1|4027154_4028414_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MRDLFERIIENKGPLGKWASQAEGYFVFPKLEGPISNRMKFQGKEVLTWSINDYLGLANLPEIKKVDGETAAEYGAAYPMGARMMSGHTDFHEQLEQELATFVSKETAYLLNFGYQGIMSAIDALVGKDDIIVYDVDSHACIIDGVRLHMGKRFTFKHNDIESLEKNLERAVKMADQTGGGILVITEGVFGMRGEQGRLKEIVALKEKYNFRLLVDDAHGFGTLGKTGAGAGEEQGVQDGIDVYFATFAKSMAGIGAFLAADKGIIDYLKYNLRSQMFAKSLPMIYVKGALKRLDMLRTMPELKNKLWENVNALQGGLKERGFDIGTTTSCVTPVYLNGSIPEAMALVKDLRENHGIFCSIVVYPVIPKGLILLRMIPTATHTLEDVSVTLEAFSEIRERLENGTYKRLSAAVAAAMGE >NZ_CP047027.1|WP_158977682.1|4025990_4027031_+|pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MENKINAHNNVLELIGNTPLVKLNRVAESLTGNFYAKVEAFNPGHSSKDRIANFIIEEAEHKGLLKPGSTIIETTSGNTGFSIAMVSIIKGYKCILAVSSKSSLDKIDMLRSMGAEVYVCPAHVAPEDPRSYYQVAKRLHEETKDSIYINQYFNKLNTEAHYRSTGPEIWKQTNGQITHLVACSGTGGTISGTAAYLKEQNPNVKIIAVDAYGSVLKKYHETREFDSKEIYPYRIEGLGKNLIPDSIDFDVIDKFIKVTDEESAHTAREISRKEGMFVGYTSGAALQAIKQLDAEGEFTENSNVVVIFPDHGSRYMSKVYSDKWMSDQGFTSAKSTEEIPEVQYIK >NZ_CP047027.1|WP_158977679.1|4023762_4025901_+|prolyl-oligopeptidase-family-serine-peptidase MICTVKKAFIFLLSLSFVASCKSDKKIMSQNIVPVAKKMPKSLEIHGDTRIDDYYWLNDREDEEVLAYLNEEKSYYEKMMQHTVSFQNTLFDEMKSRIKEDDSSVPYRQNGYWYSTRYELGKEYPIYSRKADMDNAISKELFDCNTMAEGFDYFKLGGIAVSPNNELAVFGVDNVSRREYTLKIKNLTTGEVYDDIIEQTTGGAVWAGDNKTFFYSKKDPITLRSDKIYKHVLGTAAADDTMVYHEEDETYDCFVYKTKSKKYIIIGSTSTLTTEYRFINSDAPDSNFTIFSERERGVEYSLAHYKDDFYILTNKDDATNFKLMKTSEHKTNSKYWEDFIAHRSDVLLEDIEIFKEFYVISERENGLAKIKIVRWDSNESYFLPFHDETYTAYVSTNPDFDTEVMRYGYNSLTTPSSVIDFNMRTKEKDIKKEQEVLGGKFHKENYTSERIWATARDGVKIPMSVVYHKDTKLDGSSPLLQYGYGSYGYTLDPNFSTVRLSLLDRGFIYVIAHVRGSEYLGRQWYEDGKLLKKQHSFTDFIDCSKYLIANKYTSPEHLYAEGGSAGGLLMGGIVNMEPSLYHGVIAAVPFVDVVTTMLDDTIPLTTGEYDEWGNPNEKEYYDYMKSYSPYDNVKAIAYPNLLITTGLHDSQVQYWEPAKWVAKLRDLKKDSNLLLFDINMDAGHGGASGRFEALKEVAKEYAFLIDLEKKID >NZ_CP047027.1|WP_158977676.1|4023372_4023699_-|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MFGDIMGMMGKLKETQEKIKLTKERMNTILIDEQSSDGKLKVTLNANRVIKEISINEELLADKEQLEDYLLLVLNKAIEKASSVNEAELSAVAKDGMPNIPEMDSLFK >NZ_CP047027.1|WP_158977708.1|4037930_4040708_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MNSILDVNPKENIIIKGAKLHNLKNIDVVIPRNKLVVVTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSSYARQFLGKLDKPKVDYIKGIAPAIAIEQKVNSTNPRSTVGTTTEIYDYLKLVYARIGRTISPISGNEVKKHTVTDVINFVKTFPEGTKLLLLAPITIREDRDALKSLQIFSQQGYARIKYKGEVIRIDDTITEIDKEFSLVVDRIITKDDEDFLNRLANAVDTAFFEGKGDCIIESLTTGEQTPFSNKFELDGMKFLEPNVHLFSFNNPYGACPTCEGYGDVIGIDEDLVVPNTALSVYENGVFPWRGDSMGWYRDQLVNSAYKFDFPIHKPWFQLTDEQKQLVWDGNEYFTGISDFFSALEEKSYKIQNRVMLSRYRGKTRCTTCKGKRLRKETDYVKVDGKSISDLVEQPIEDLIAFFETISLNETDKKIASRLLIEIKSRLGFLYKVGLTYLTLNRKSNTLSGGESQRINLATSLGSSLVGSMYILDEPSIGLHPKDTENLIEVLKSLRDLGNTVIVVEHDEDIMKAADEIIDIGPEAGTQGGHVVAHGTMEDILNSSSLTAGYLNGTLEIEVPKKRRTSKNYIEILGARENNLKNIDVTFPLNMLTVITGVSGSGKSTLIKKILYPIILKEIGGYGEKAGQFTGVKGKYSEIKHVEFVDQNPIGRSSRSNPVTYIKAYDDIRALYAAQKLSKLRNYQTKHFSFNVDGGRCEKCKGEGEITVEMQFMADVHLECETCKGKRFKKEVLEVKFEEANIDDLLNMTIDDALAFFEKHQQTKIYRKLKPLQDVGLGYVTLGQSSSTLSGGEAQRIKLASFLVKGTTKEKALFIFDEPTTGLHFHDIKKLLKSFNALIDKGHSIVVIEHNIDLIKCADYIIDLGLEGGSKGGALIAAGTPEEIAKNKVSYTAKYLKEKL >NZ_CP047027.1|WP_158977711.1|4040967_4041549_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MELQIEDSVLVKSYINGEEKALEILINRHNQRISSFIYSKVLDRDITEDIFQDTFIKVIKTLRKGSYSEEGKFLPWVMRIAHNLVIDHFRKNKRMPMFEGSDDFNIFSVIGDDQLNVEKQLIKDQIDNDLNLLIEELPEDQKEVLMMRIYKDMSFKEISENTGVSINTALGRMRYALINLRKVIEKNNIVLTN >NZ_CP047027.1|WP_158977714.1|4042381_4042963_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MELQIDDSVLVRNYINGEEKALEVLINRHNQRISSFIYSKVLDRDITEDIFQDTFIKVIKTLRKGSYSEEGKFLPWVMRIAHNLVIDHFRKNKRMPMFEGSDDFNIFSVIGDDQLNVEKQLIKDQIDSDLNLLIEELPEDQKEVLMMRIYKDMSFKEISENTGVSINTALGRMRYALINLRKVIEKNNIVLTN >NZ_CP047027.1|WP_158977716.1|4043198_4043861_-|endonuclease-III MTKSEKIDFTIEKLKELYPTIPVPLDHKDPYTLLIAVLMSAQCTDVRVNQITPLLFAKADNPYDMIKLTVEEIRAIIRPVGLSPMKAKGIHGLSQMLVDKYNGIVPQELELLEEFPAVGHKTASVVVSQAFGIPAFPVDTHIHRLMYRWGFTNGKNVVQTEKDAKRLFPKEIWNDLHLQIIWYGREYSPARGWNLEEDIITKTIGRKTVLEAYYKTKKSR >NZ_CP047027.1|WP_158977718.1|4043965_4044418_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MQTLKIGDKVPSFSVNDQDGNIINLSDYSGKKLIVFFYPKASTPGCTAEACNLRDNYTELKSQGYELLGVSADSEKRQANFKNKYEFPFPLLADEDHTVINAFGVWGPKKFMGKTYDGIHRMTFVVDENGVVSNVIEKVKTKDHAAQLLA >NZ_CP047027.1|WP_158977721.1|4044460_4045924_-|TonB-dependent-receptor MTSVLRKDTAFENIPSIKSKTLRINLNPDIYGTFSEIGAGQETSGHFFRSGGASGTIAKAMSAYDKDFSDAIYGIEEDGRYVTQSRLKKMLTHEMMNMEDRISRKKHPERLFFSYANTVATIDFSKRYKGHGWLGIRYQLDPTQKEYDEIIIHVRFKQNEARLQQETLGILGVNLIYGAFYKHDQPRKILKYLYDHLDKDTLEVDMINFSGPNFKNVDNRLMSLQLIKNDMTDAVMFGPDGNNLLPAAVLYKKNILALRGSFRPVTKVNMDMLKKSHDIFIRETSVEEKNTIVIFEITLSNLKASGEIDEQDFMDRAELLCSLGHTVMISKFQEYFKLVEYFNNYTKAKIGLTMGVNNLVDIFDEKYYRHLSGGILEAFGKLFFKDLKVYLYPMKNEETGQIMTSNNVKVHPRMKELYKFFKYNGKVMDIIDYDPDILHIFSRDVLKKIINNEEGWEEVLPEGIAEIIKKRSLFKRKKIDAEKENEV >NZ_CP047027.1|WP_158977724.1|4046010_4046775_+|MBL-fold-metallo-hydrolase 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>NZ_CP047027.1|WP_158977730.1|4048653_4049307_-|phospholipase MQTKSLSLYHIIRPSSIDKNAPVLFMLHGYGSNEEDLFSFAAELPEEYFIISVRAPYPLQPSGNAWYAINFDAEKGKWSDDVQAIESRDKIASFITEACEAYELNTNNVNLLGFSQGTILSYAVALSYPEKISRVIALSGYINENILKEGYEKNDFSSLKIYASHGSVDQVIPVDWASKAPKFLDKLGVENTYEEFPVGHGVAPQNFFSFKTWLAKN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047027_4 | 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder | 1887300-1887329 | 30 | MT764206 | Escherichia phage JEP6, complete genome | 167152-167181 | 10 | 0.667 |
| NZ_CP047027_4 | 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder | 1887300-1887329 | 30 | MF001354 | Salmonella phage SG1, partial genome | 35877-35906 | 10 | 0.667 |
| NZ_CP047027_4 | 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder | 1887300-1887329 | 30 | NC_025829 | Shigella phage pSs-1, complete genome | 94235-94264 | 10 | 0.667 |
| NZ_CP047027_4 | 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder | 1887300-1887329 | 30 | KR269718 | Escherichia phage HY03, complete genome | 22420-22449 | 10 | 0.667 |
| NZ_CP047027_4 | 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder | 1887300-1887329 | 30 | KX452694 | UNVERIFIED: Escherichia phage KPN1 genomic sequence | 82078-82107 | 10 | 0.667 |
| NZ_CP047027_4 | 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder | 1887300-1887329 | 30 | KX452698 | UNVERIFIED: Shigella phage KPN5 genomic sequence | 93461-93490 | 10 | 0.667 |
1. spacer 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder matches to MT764206 (Escherichia phage JEP6, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
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2. spacer 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder matches to MF001354 (Salmonella phage SG1, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
taactgtcattgaaaaatcaacaactgtca CRISPR spacer taactgtcattgaaacatcaattggctcag Protospacer *************** *****. . . . .
3. spacer 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder matches to NC_025829 (Shigella phage pSs-1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
taactgtcattgaaaaatcaacaactgtca CRISPR spacer taactgtcattgaaacatcaattggctcag Protospacer *************** *****. . . . .
4. spacer 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder matches to KR269718 (Escherichia phage HY03, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
taactgtcattgaaaaatcaacaactgtca CRISPR spacer taactgtcattgaaacatcaattggctcag Protospacer *************** *****. . . . .
5. spacer 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder matches to KX452694 (UNVERIFIED: Escherichia phage KPN1 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
taactgtcattgaaaaatcaacaactgtca CRISPR spacer taactgtcattgaaacatcaattggctcag Protospacer *************** *****. . . . .
6. spacer 4.1|1887300|30|NZ_CP047027|CRISPRCasFinder matches to KX452698 (UNVERIFIED: Shigella phage KPN5 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
taactgtcattgaaaaatcaacaactgtca CRISPR spacer taactgtcattgaaacatcaattggctcag Protospacer *************** *****. . . . .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
231138 : 264816
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047027|231138:264816|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047027|231138:264816|231138_231489_-|WP_158973598.1|transposase|DBSCAN-SWA MIIERNKKKEYRARKHVCVACPMRSSCLGKSAQEKKFSVTYYREEYERNNARVHSPQGRYMKGKRQSTVEPVFGTLTQFMGLRKINTLGLKQANKVMHLSAIAYNLKTCLPADRST >NZ_CP047027|231138:264816|245051_245732_+|WP_158979432.1|DBSCAN-SWA MRPSSTCICEHISSFQTKTRFIILMHPKEYKKEKNGTGHMTHLQLDNSEIIVGVDFTNNNRVNELLTQENSSSFLLYPGKENFNLSLRNSSEINSFMGTNPHIFLIDGTWPCARKILKLSKNLQKLKRVSFDNKIKSKFIIKQQPESLCLSTIESVYTVLNLLKEGDLEQCETKDFLIPFEKMIAYQLEYMLNPSNKNYSSTAIRTVIPKNMYKKVTERNIIFELE >NZ_CP047027|231138:264816|256806_260034_+|WP_158973617.1|DBSCAN-SWA 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28 | Acinetobacter_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
2015143 : 2021340
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047027|2015143:2021340|DBSCAN-SWA ATTATAAATAGTTGAAAATTGATGTAGTTTCTAAATTTTTATATTTTGTCGGGGTAATTGATTTTGTGGTTATTTTCTCCAATTTTACCACGTCATTTATGATGGATTGATTTTCATTAGCTAAATTAAATTGAGTTTGATCAATTTTATCCATGTTATAGCCATCGAATCCTGCTAATAGTATTTCTTCTACCCCCAAGTCTATGGCTGCTTGGACCGCTACAACCATTGGTGAATCTTCTGAACTTTGTGTAAAATTTAATTTATCTAATTCGAAACTAATATTTTTTATCTTATCGAGAATTATTGTTCCCATTTTTCTAGGATATGGTGGGTATATACAAATCTGCGAAACTAGTTGCTTGTTTCCCAATTGTTTAAGTAGTTTTTCGCTTTCAAAACCAACTAAAGCGTAAAATTGTTTAATTTCATTATTTATATATTTTTCAACATGTTTAACACCTGCGTGTATAATACAAGTATTCTCTGATTGCTTTAGATAGGCTTCTAAGGCCTTATCTATTTTAATAACAGAATCACCTCCACCAAGTATTATTGCTTTTTTAAATTTATGCTGAGTATCTAGTTTTGGTAATTTTAAATTGTCTTTGACATCCTCTTTCTGATTATTTAAAGCATTTACAATATTACTAATCGGGTATCTGTTCATTCCAACCCATTCCATAACTTGTTTTTGAGGTAATGAATAAGCTCCTGAGAACATGTACGGAAGATTTGTTCCCCACTCATAGCTTTTTTTAAGTGTTTCAAAATTAGATACTGTTTTACCTAAATGAAAAAACTTAATGTCTTTGTTATCAATACTATTTAAATATGTCAAGAATAGTTCAGTTCTTAGATTTCCTGCTCCTCTTCCCATTCCCGTAATTGTGCAATCTATAAGCTCGACCCCATTTTCTATTGCTGTTAAGGAATTGATCAGTGCCATTTCTAAGTTGTTGTGCCCATGAAAACCAATAGGAACTGTTAATTTAGGTTTAATTATATTTAGGATATCTATAACATCATTAGGAAGAACAGCACCAAAAGAATCGACCATGTAGAAATAGTCTATGTGATCATTCAGTTCATGAAGTGATTCAATGAATTCTGGATTGTTTTTCCAGTCTGACATATACATTACATTAAAAGCAACCTCAAATCCTAACTTTTTAATTGCAATGGCAAGTTTTACGGCATTTTTAACCCTTAGTGGACTTACTGCTAACCTAACTAAACTAATGTATGGTTTACAAGGCTCCATTAGTTTATTAATATCTGATTCTTTTATGTTTTTTTCATCTAGTATTATTACTAGTTTTTTGTTTGGCATTTTGGATTTTAGATCCTTCATTAAATAATCGGGACAATAAAAATATTCTCCTAGATAACCATTGAGTGTAGTACTTCTGTAACCTATTTCAACGTAGTCTATTGGCAAATCTTCCATGGCAGTACAATAATCATCTACCAACGATCTGTCAAAGTCCCAATTTGTATAATAACCCCCATCTCTCAAAGTGCAATCAAGAATCTGAAATTTTTTATTTTTTATTGACATAATATTTTCTCTTTATAAACAAGTTAAACAATTTTCTATCAATTTTAGGCTTAGACTTCCCTTTTTGACATTTTATTAATTAATATTTTTTTTTAGTTCAATAACCGCCATTTTATAAAAATCCTTAATTTTTAAGAACAGATTTTTCTCATTAGAAGTATGGTCTCTTAAATAGGTCATTGGGTTTTCGAAATATTTGAAGAGAAGTATGGATAAAAGAATTGTGGAAGATAAATAAAAAATAAAGTAAATTATACCTGTAAAAAGGTTTGTATTATGGTTGGTAAATAGATTCATACCCTTTAGAATAAAAGAAAAATGTATTAGATACATTGAATACGATATTAATGATATAAGTGTGATTGATTTATTTATTAAAGTTGTAGGTCTTTTTGCTTTGTTGTAGCTTGAAAATGGCAATAATAGACCAAACCCAATACTTGTTATAGAAAAGTAAAATGTCTTGCTGAAAATTGAAGAATAATTTAGTCCATTATTCATTACGTCGTTAAAATATATATAACAAGAAAAAATAATGAGAAAAAAGCTAAAAAACAGCATTGGTAATCGGTATTTATTAAATTTCGTTCTGTAATAAAATTTTAACCAAGCGAAAAATACTCCTGTCAATATAGAGTCTAGTCTTAATGGAGTTATTTTTCTTATTCCTGAATCCCAATTAGGATTTAGTTCTAATGCTGAATATATACGTAGAAGAAGGCAAACTATAAAAATGCTTAATATTGAAACTAATAAAAGGTTTTTTTTGTTTTTTATCCCCTTAATAAATCTGGTTAAGCAGTAGAGTATTATTGGAAAACTTAAGTAAAACCACTCCTCTACAGCTAAACTCCAGGCTTCTTCAAAAAAATGTGGATGTTGAGTAACGAAATTTTGAAAAAAAATTATAAATGCATAGTTTCTCCAATCACTAAAATCAAATGATTTTAGTGATATTGCTATGATTATATTTAAGAGTAAAATTAAATAGTAGTTTGGTAAGGTTCTAAACCATCGTCTTTTCCAAAAATTGATTAGTACAGTTTTATTGAAGGATTCCCCATTGTCATATATTTTTATTAAAATACCTCCTATTAAAAAACCGCTTAAAACAAAAAATAATTCAACACCCCAAAAACCACCAATCGACATAAACTCAGTGGGTATTTTCAATGAATTTAGAAGGTGTCTGCCATGTGATAAAATTACCATTATAATTGCTAAAAAACGTAATAGATCTAATCCGAAAATTCGTTCTTGTGAAAAATTAACTTTAAAAATTTTCATGGTTATTCTTTAAATGTTTTTAAGCATTCTTTCAAGCTAATTTTCCAATTATTGATTTTTACATTAAAATTATTTTTAGCTTTTGTTTTATCCATAACACTATATAGTGGGCGGGTAGCTGGAGTTATATAATTCTTTGATTTAACAGTGTTTAAATCAATTATTATATTTTTTTGTTTAAATATTTCTTTAGCAAAATCATACCAGCTTATTTCTCCTTCATTGCTATAGTTATAAATTCCATAATTGGTTGAATTATTTGTTACTATATGCAGTATAAAACTAGCTAGATCTGCTGCATATGTTGGGGATCCAATTTGATCATCTACAACACTTAATTCATTTCTTTCTTTTCCTAAACGCAACATGGTTTTAACAAAATTATTCCCATGTTCTGAAAAAACCCATGATGTCCTAATGATAAAATATTTACTTATTGTGGTTTGTATGTAGTTTTCTCCTTTTAATTTTGATGAGCCGTATACATTTAATGGGGCACCGTTGGCCTCTTCGGTATAAGGGGTTGTATTAGTCCCGTCAAAAACAAAATCGGTGGAAATGTGGATTAAGGTGCTTTTAAATTGCTTACAAGCTTCTGCTAAGTGTTTAACAGCTTCTGAATTTACTAAGTAAGCTTTTTCTGGCTCATTTTCAGCCTTATCAACTGCTGTATAAGCGGCACAGTTTATGCAATAATTGTATTTTTCTTTTTGGAAAAAATGATTTATTTGTTTTGCATCTGTAATATTTAAATCAGAAGATGATTTGAAGTAAAATTTATATTGTGGATATTCGATAGAAATGTTTTTTAAACATTTTCCTAATTGCCCATTGGCTCCTGTTACTAAAATATGTAATATTTTGTTACTCATTAAAGTTTGGCATTTTGTAATGTAGGTAATTCCAGGTCCTTTTTGGAAACATTAATATGATTTACACTTACTTTCCAATCTATCTGTAGAGTCGGGTCATTATAAATTATTCCACCTTCAGATTCTTTGTTGTAAAAGTTGTCACATTTATAAAAAAATTCAGCTGTTTCACTTAAAACTGAGAATCCATGACCAAAACCTCTTGGTATAAATAATTGCTTTTTATTTTCTTCAGATAGCTCTATTGCAAAGTGTTCTCCAAATGTTGGAGAGCCTTCTCTTAAATCTACTGCAACATCTAGAACTCTTCCTTTAATAACACGTACTAATTTTGCTTGAGCATGATGTCCTATTTGGTAATGAATAGCTCTTATGACTCCTTTAGTTGAGTAGGATTGATTGTCTTGAACAAAGTGCGCTTTATTTCCTGTTAATTCGGTAAATTGGTTCTCGTTAAAACTTTCGAAAAAATAGCCACGATCATCTTCAAAAACTTTTGGATCTAGCACGAAACAGCCTTTTAAGTAGGTTTCTTTTACTTGCATTATTTATTTTTTAGTATACCAAGAAGATTTTTACCATAACCACTTTTCATTAATGGCTTAGCTAATTCTATTAGTTGTTCTTCGTTTATAAGTCCCATTTCGTAGGCTGCACCTTCAATAGTTCCAATCTTTAATCCTTGACGTTCTTCAATAACTTCAACAAATTGTGATGCTTGCATAAGTGATTGGAAGGTGCCAGTATCTAGCCAGGCAGTTCCTCTATCTAGAATACTAACACTTAATTTATTTTTCTCTAGATACACTTTATTGATATCTGTAATTTCTAATTCGCCTCTGTGGCTAGGTGCGATATTTTTTGCAATTTTCACGACTTCATTGTCATAAAAATAGATTCCTGGTACAGCAAAATTTGATTTTGGTTCTAGGGGCTTTTCTTCGATAGATATTGCTTTTCCATTATTATCGAACTCTACAACGCCATAGCGCTCAGGATCATGTACTCTATACGCATAGATGATACCGCCATCAGGATCGTTGTTGGATTGTAGTAAATTAGCTAAGCCAGAACCATAAAATATATTATCTCCTAAAATTAACGCTACTTTGTCTTGCCCAATAAAGTTTTCACCTATAATAAAGGCTTCAGCAAGTCCATTAGGATTTTCTTGGACAGCATATTCAAATCTACAACCAAATTTACTGCCATCACCCAATAAATCCTCAAATAATGGAAGATCTTTTGGTGTTGAAATAATTAATATTTCATTTATTCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047027|2015143:2021340|2018861_2019407_-|WP_158975129.1|DBSCAN-SWA MQVKETYLKGCFVLDPKVFEDDRGYFFESFNENQFTELTGNKAHFVQDNQSYSTKGVIRAIHYQIGHHAQAKLVRVIKGRVLDVAVDLREGSPTFGEHFAIELSEENKKQLFIPRGFGHGFSVLSETAEFFYKCDNFYNKESEGGIIYNDPTLQIDWKVSVNHINVSKKDLELPTLQNAKL >NZ_CP047027|2015143:2021340|2016778_2017990_-|WP_158975127.1|DBSCAN-SWA MKIFKVNFSQERIFGLDLLRFLAIIMVILSHGRHLLNSLKIPTEFMSIGGFWGVELFFVLSGFLIGGILIKIYDNGESFNKTVLINFWKRRWFRTLPNYYLILLLNIIIAISLKSFDFSDWRNYAFIIFFQNFVTQHPHFFEEAWSLAVEEWFYLSFPIILYCLTRFIKGIKNKKNLLLVSILSIFIVCLLLRIYSALELNPNWDSGIRKITPLRLDSILTGVFFAWLKFYYRTKFNKYRLPMLFFSFFLIIFSCYIYFNDVMNNGLNYSSIFSKTFYFSITSIGFGLLLPFSSYNKAKRPTTLINKSITLISLISYSMYLIHFSFILKGMNLFTNHNTNLFTGIIYFIFYLSSTILLSILLFKYFENPMTYLRDHTSNEKNLFLKIKDFYKMAVIELKKNIN >NZ_CP047027|2015143:2021340|2017992_2018862_-|WP_158975128.1|DBSCAN-SWA MSNKILHILVTGANGQLGKCLKNISIEYPQYKFYFKSSSDLNITDAKQINHFFQKEKYNYCINCAAYTAVDKAENEPEKAYLVNSEAVKHLAEACKQFKSTLIHISTDFVFDGTNTTPYTEEANGAPLNVYGSSKLKGENYIQTTISKYFIIRTSWVFSEHGNNFVKTMLRLGKERNELSVVDDQIGSPTYAADLASFILHIVTNNSTNYGIYNYSNEGEISWYDFAKEIFKQKNIIIDLNTVKSKNYITPATRPLYSVMDKTKAKNNFNVKINNWKISLKECLKTFKE >NZ_CP047027|2015143:2021340|2020296_2021340_-|WP_158975131.1|DBSCAN-SWA MNILITGGAGFIGSHVIRRMVQNYPNYNIYNLDALTYAGNLENLKDIEHLENYTFLKGDITDAPFIDLIFNKYKFDRVIHLAAESHVDRSITDPLSFVKTNVIGTVNLLNASKELWKENLEGKLFYHVSTDEVYGSLGATGLFTETTSYDPNSPYSASKASSDHFVRAYGETYNLPFIISNCSNNYGPNHFPEKLIPLFINNIINNKSLPVYGDGNYTRDWLYVEDHATAIDLAFHEGKNHETYNIGGFNEWKNLDLVKLLCKLMDSKLKRPTGDSEKLITYVKDRPGHDLRYAIDASKINKELGWKPSVTFEEGLSKTIDWFLNNRDWLENVTSGSYKDYYTNMYQ >NZ_CP047027|2015143:2021340|2015143_2016703_-|WP_158975126.1|DBSCAN-SWA MSIKNKKFQILDCTLRDGGYYTNWDFDRSLVDDYCTAMEDLPIDYVEIGYRSTTLNGYLGEYFYCPDYLMKDLKSKMPNKKLVIILDEKNIKESDINKLMEPCKPYISLVRLAVSPLRVKNAVKLAIAIKKLGFEVAFNVMYMSDWKNNPEFIESLHELNDHIDYFYMVDSFGAVLPNDVIDILNIIKPKLTVPIGFHGHNNLEMALINSLTAIENGVELIDCTITGMGRGAGNLRTELFLTYLNSIDNKDIKFFHLGKTVSNFETLKKSYEWGTNLPYMFSGAYSLPQKQVMEWVGMNRYPISNIVNALNNQKEDVKDNLKLPKLDTQHKFKKAIILGGGDSVIKIDKALEAYLKQSENTCIIHAGVKHVEKYINNEIKQFYALVGFESEKLLKQLGNKQLVSQICIYPPYPRKMGTIILDKIKNISFELDKLNFTQSSEDSPMVVAVQAAIDLGVEEILLAGFDGYNMDKIDQTQFNLANENQSIINDVVKLEKITTKSITPTKYKNLETTSIFNYL >NZ_CP047027|2015143:2021340|2019406_2020273_-|WP_158975130.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLHPLTLSVSKQLMPIYDKPMIYYPLSTLIYAGINEILIISTPKDLPLFEDLLGDGSKFGCRFEYAVQENPNGLAEAFIIGENFIGQDKVALILGDNIFYGSGLANLLQSNNDPDGGIIYAYRVHDPERYGVVEFDNNGKAISIEEKPLEPKSNFAVPGIYFYDNEVVKIAKNIAPSHRGELEITDINKVYLEKNKLSVSILDRGTAWLDTGTFQSLMQASQFVEVIEERQGLKIGTIEGAAYEMGLINEEQLIELAKPLMKSGYGKNLLGILKNK |
6 | Enterobacteria_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
3729799 : 3871688
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047027|3729799:3871688|DBSCAN-SWA TATCCCAAATACAAAAGGCAGGTTATTTCAGACGATCTCTAATCAAAAGCTGAATTCCTATTTAAAGGAAATAGTGGATTTCACAGGAATAAATAAATACCTTACCTTTCATCTAGCGCAACATACTTTTGCGGCTACGGGTAGCTTAATTACTAGTGTACCAATAGAAACGGTATCTAAATTATTAGGGTATTCAAAAATTACCACCACTTAGATTTATGCTAAAGTAATAGAAAGAAAAGTGAGCGAAGATATGCAGAAACTTAAGGAACGCTTTTTAGCTTAAAAATAAGATTGTTAAATCATTTAAGTTTTAATTCGTTTTTTTGTAGTCAAAGACATTAGTAAGCCAAGTGTATTCTATGAAATTTTTTTGAATTTTCACTGAAATTAATAGCGTTAATTATTCTTTTAAAAAGGTTCATGTTTGTTTGATTTTAGTTATTAATTTGAAATAGTGTAAACGTAAAGGGAATGAATTAAAAAGAGTTTCTAGAGCAAAATCAAACACAACCGGTAAAAAATATAGATTTATTTTAGAACTTACTCTTATACGATAAAATTATAAGTACAAGTTCTGTTGCAGCAGCTATCGGTAGCGAGTATTTAGTTGATTATCCTGATATTTGAAGCACTCAATTTTTTCGGATGATATTCCTAATCACGAAAAATTTCCTTTTAACGCAAACTGAAAGTAAAAAATTGAATAGTTGTTTTTAGCAATTGCAAATGCTAAGCATATTGTCCGTTCAAGTAGCGCATTAATCATCATAAATTAAGTTTTTATTGATAATTTAAATTTAAATGAACATGAATATATTTTCTTACATATTGGCTTTATTTACTTCCGTAGGGGCTATGACTATGTTTAGCTTAATAATGAGTGTTATTTCAAACTGTGAATTTAGAGAGAATATTTTGCTTTCTAAATTAATGAGTGGCCATTCTCTGAATGAAAAAGAAAGTCTAAAGTATGTAATTTTAGGCTGGTTAGCACATTTTTTTTTGGGAGGATTCTTTTTAGTGATTTATACTTATTTGTGGTATAATACAGCGTTATTGCAACATGCATTAGGTTCTATTTTATTTGGCATTATTATCGGTATACTAGGAATATTAGGTTGGACTATGCTTTTTAAAATGGCATCTAATCCTCCGCAAATCAATTATAAAATATATTATATTCAACTCATTGTGGCTCACATACATTTTAGTTTGGGTAATTTTCTAATTTTTTCTCTGTTGGGTTATGAGCCGTCTATGCTATTTTAAAGCAAAAAAGTCAAATAATTTAAAAAAATTAAGGTCATATTCTAACATAATGCATTACACGGTCACTGTAAGTCCAATTGAATTATATATTTTAGATCATTTACTTTTTTCAGAGTCCTTTGATTACCTTTTTTAGTCGACTTTCTTTCTGGATTTGAAGATAGAAAAGGGTTATAAATAGGAATGCAGGACAATCCGTTTTATGTGCCCGCTAATTTTAAATACTGGTCTTTTACTATCAAAAAGGGAAGGGACTCAAAGAAGACTAAGCGACAAGTTATTGAAATGCAAAACGTATAAAGTTCACTAAAAAGTTGATTGAGCGAATAGTTTAGCCCCTAATAAGTTCGGAGTGATCTTTTAAATTTCAAACTTAATATATTTGAGATATGAAATACAAGAAATGGACCTTAGATCAGAAGTTAGAAATTCTCTCTATTTCAGAAGAGATCGGCATCATAGAAGCCTGTCGTAAATACGGAGTTAGTACAGGTACTTTTTATAGTTGGAAGACGAAACATGAGAGTCAAGGAGAAGCAGGCTTAAAAGTCATCTATGATACTAAAAGTAAAGAACACAAGCAGGCAGAAGAAGAAAACCGAATACTACGTAAGCTTCTAACCAATAAGGAAATTGAATTAGAAGTACAACGAGAACTTTTAAAAAAAAAGTTTGGAACGTCCGATCCAAGAAAGATTTAGTGAACTGTTTATAGCAAGCATAAAATTAGTAAAACCAACATAATTAATATGGTAGGGATGGTTCATAGTAGCTATTACCGTACTCCAAGTTTTGGTAAAAAGGGTAATACTCCTAGTAAACTCACCTATCATAAATCTAGAGGTTGGGTTAATCAAGACGCTCTTATTGCTTCTATAAAGAGATTTTAAGTCATGAATTTATAGATTGTGGTTACCGATTAATGACTTCTTACTTAAAAAAAGAAGCATACCTGATTAATCATAAAAAGCTCTACAGAATTATGAAAGAACAGGGAATGCTAAAACTAGAGAATCGGATAAACAGGAGTGGTTCTGGGCGTAAATTTGTAAAATTCAGAAAAGTAAATACCTCAAGACCAATGGAATGTTTAGAGATGGATATAAAGATGGTATGGATTCCTAATGTGGGTAAAAACGCTTATTTATTATCCATCATAGACGTACATACTCGTAGAATATTAAAAGACTATTTTTCTTTTTCTATTAAACAGGATAAGGTGATAGCGTTTTTATCAGAGTTGTTTGCAGAATACCAATACCCTGATAACGTTGTTATTAGAAGTGACAACGGTAGTCAGTTTATTGCAAATAATGTACGTGAATATCTTGGACTAATTGGGGTTCAGCAAGAATTTGCACATATAGCCACACCAGAAGAAAATGCGCATATAGAAGCCTATCATGGAATACTAAAAAAAGAAATTTTTAAAAGAGTGGATTACACATGTTTTGGGCAAATTGAACAAATCTTAAAAAGGTATGTGACTTTTTACAACAATACTAGGTTACATGGGCTCTTAGGGCGTATTACACCAATGGAAAAATGGAACGCTGATAAACACCTAATTCTAATGAAAAAAATAACAGCTTAAGCTATAATCGAAATTTAAAAGATTACTCTTGTTTTATAGGGGTCAAAACAAGTGGTTGGATTGTATAAGGGTTAAATTCTACTAATAATTTGATTAGGCGAACGTAAGTCAAAAAGAACTTTCAAAAAAATCAACTTTAATTACTTTATGGCTTTTGTTCAAGACTACTAAACGCCGCATTTTTCCGGAAAAGTAATGTAAGGAAATGGGGTAAATTTACTAGATAATGACCGCGTAATCAGGATTTAATAGCTAACTATTTTTGGTAAAAGAGAGGGGTTAATTCTTTAATTTACCGTAAAAGTGTGTCATTTTATTGAGGTTTCAAGCTGATTTGGCTTAAATTAAAAGGAATAACTAGGGTTAAAAACACTTGAAAAACTGTATTTCAATAAGTTAAAATTTTGTTACATCCCACTGCGTGTCACCTTCTTGCCATTCGTTACCAGGATTAATTCAGGCTTTTAGTGAATGAATAATATAAAAGAGCCACTTGTTATCAGGTGGCTCTTTTACTATTGTATTTGTTAAAGAATTTATTTATCTATCACTATAAACTCTGATCGTCTATTTTCCTGGTGCATTACCTCAGAACAATCTACACCATTAATACAATCATTGAGTAAATTAGACTCTCCAAATCCATTACTCTTTATCCTCTCTGCTTTTATCCCATTAAGTGTTAAATAAGATTTTGTAGCGTCGGCTCTTTTTTCAGAGAGTTTTTGATTGAATTTCTCACCTCCACGGGAATCAGAATAAGATTTCACCTGAATATTTAAATCTGGATATAAATTTAAATATTCTACTATTTCATTCAATTTTTCTTCTTGATCTTTACGTATATTCCATTTATTATAATCAAAGTATAAATTATCTAGCTGCAATAGTTTAAATAAATCATTACCTACAATTGCTTTTTCAATAGGTACAGAGTTTAGCTTTATGATTAAGTTTAGTTCTTTATCTGTTGGTTTTACTGTAATTGAAGTTGTATCATTTACAAATTCTTCTTTTTTTGTAATTAATTTATAGTTCCCTTCTTTTAAGGGTAAACTAAAATTGAAGTCTCCATTAACACTTGACACAGTGCTTTTTATTTTCTCATTATTTAAATCAACCAAATCTACATTAACAGAAGTAATAATTGAATCTAAATGTTCATGCTTCACAATACCATTAATAATTTTAGTCCTAATTAATTCAAGTCTTTTTGACTGTGTAAAACTATAAATATCATCACCTCCTTTACCCCCCTCACGATTAGATGAGAAAAATCCTTTTTGATTATTTATTATAAATCCAAAATCATCAGAAGGACCATTTATTGGTTTACCTACATTTTGAACATAAAAATCATTAGATATATTTAGCTTAGTCACAAATACGTCTAAGCCTCCCAAACCTGGGTGCCCATCCGAAGCAAAATACATAACATTATCATCTGTTATAAATGGGAATGTTTCTCTACTCTCTGTGTTAATTGAAGGTCCTAAATTTACCGGAGTACCAAAACTACCTTCAGCCCCAATACTTACAACAAAAATATCAGATAACCCTAAAGAACCAGGCATGTCTGATACAAAATATAGTTTTGATTCATCTGAACTCAAAGCTGGGTGAGCAGCAGAATAATCATCTCCATTAAAGGGTAACTCTTTAATATTTGTCCATTCATTATTTACAAGATTAGCAGAATAGATTTTAAGTCTACTAACTCCATCTTCATCTCTTTTAAAATTTTTCTTGTCAAAATTATTTCTTGTAAAGTAGATAGTTTTACCATCTTTAGTGAAAACAGAAGAAGTCTCTTCAGATTTCGAATTTAATAACTTTGAAAACAATTCTGAATTTGTAAAATCGCCATCGTCAGACTTATCTGTGGCTATATATAAATCATTAAAAGATCCGTTATCCCATAAATGAATATTTTTTTTAACTAAACCTGTATCCCTCGCTGAAGAAAAAATTAATTTTTCACCATAATAAGAAGGTGAAAAATCTTCGTAACTGCTATTAATAGCACTATTTTTAATTGTAAATCTACCTGAATTATTATCTATGTCATTTAAATAATTTGGCTGTGCTTTAAGTAAATTTGCTCGATTATCAGATTTACTTAAATCTAAAAAAG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96 | Streptococcus_phage(30.0%) | transposase,integrase | attL 3729473:3729489|attR 3740729:3740745 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
3885693 : 3908230
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047027|3885693:3908230|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047027|3885693:3908230|3896752_3898270_-|WP_158977392.1|DBSCAN-SWA MKENELLAIAIDLYHKEGKELDAIPAFKELLKAYPKNLDGWTHLSTIQNKIADFDGAIESINHAIKIDPNNSWTIQQKCTTLSLISKFSSEGQMYFNENTKEAYEIKTFNSKVELFQDLNKSITKVIQLEGGDEKKKYDYSWKLANNKNKLGQFENAIGILTKLKKQIPKTISSSKKENEITKIENGITKNLIGLKKYEEVIKRLKKSLVNQSDDYFIGIQLAEIYSEINDTNSKENTLQKVLQNNDKKLREKPELAFLSRKFEILKKLNRQDKMKEVISDFELIENQNEFTITRKNEIKKKINEYLAKHEEKVALDNPKPSTNFEILPLTSAELDILNRKYEKRYTKFKSVSVVASLLGILALFTPPKIWNFIKYFDKKQSIRNLEDVNEYMFQNPTMVIIVILSVIAVVFFSHFIYIRPLKKDLNDKLKTRGKFKVIRIENISKRVSEKLDGLDTLLHFEKNNSKIKKHLFKKADNPELIHAKEIVIEQSKHTGIIFSETIIE >NZ_CP047027|3885693:3908230|3907282_3908230_-|WP_158977418.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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26 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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