Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046531 | Mannheimia sp. ZY170218 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,cas2,DEDDh,DinG | 0 | 1 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP046531_1 | 1661235-1661309 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP046531_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP046531_1
>1.1|1661258|29|NZ_CP046531|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP046531_1
The CRISPR arrays of NZ_CP046531_1 >merge|NZ_CP046531|1|1661235-1661309|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NZ_CP046531|1|1|1661235-1661309|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NZ_CP046531.1|WP_159630333.1|1659876_1661118_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HipA-family-toxin MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVKLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEVNNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NZ_CP046531.1|WP_006250513.1|1659673_1659877_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NZ_CP046531.1|WP_159630331.1|1658260_1659118_+|DUF2877-domain-containing-protein MTEKEQTIHISLLKISQYAQLSIGYNCVATIHSIYNNTINLLINNQLFSLQPKESYLSPISLITNLSQVQQLRLEPHRAYQLHFNYQDCTIFCTKLTACIPSLNHQLNHYASLSKKILQQSDKKGLNLLFQKKNDDLILSAFKQYLIKAEHFYHMNDEENACNMLSKLIGLGIGLTPSGDDFLCGLLATLQHSNATQSHFYQRLSQQIKQHLTNTNLISSRFLECALQQQFSAPVLAFFENINKQNAEIEQLIKLFENIGHSSGIDTLFGIYYGYILLLNENEYC >NZ_CP046531.1|WP_159630329.1|1656755_1658162_-|allantoinase-AllB MYDLIVKNGQLVTPDRIYPATIAVKEGKFAGFLAPDIEIQAKEVVDAKGHLVYPGIIDCHAHLNEPGFDYREDFETGSRAAVAAGCTTLIDMPLNNDPSLINKDVFKLKHDNVSKHSFIDFALWGGIVGDYDDSPNSIKSNSADLVELEACGVAAFKGFTCPNGDLFPTVNLGNVRKALEILKPFNALSGFHCEEYGQVKERVKEAKAKTGLTNQEKIREFLDAHDVWVEYVATKNIIDMSRATGGRVHICHVTHPMVAQLVKDAIYEGLPVSGETCPHYLGFTEDFVFEKGGPAKCTPPLRKKEDMEKLWDYVIDGTLSCVGSDHSPAADEEKNNDTHDIWEAWGGLNGIQFFLPMMFDMVVHQRKLSPSLIAKVMGVNPAKLFGLYGRKGAFEIGFDADIVIVDPEKPWKVEQEKLFTKGHVTCFNGLEGKGAATHTFIRGRLVAENGMYKQDAIGYGEFIRPVKR >NZ_CP046531.1|WP_159630327.1|1655331_1656660_-|transporter MSENTNLQPIPANKRIMDLLSYLFLWLGGCVSIGTFALGSGQLEKGLNLTQAFVAMLIGSLLLIICLCLNDQMSYKSGVPYAVQLKSAFGTKGGILPAMLRGVPAIVWYGVQSWLGGSAINQISILLFGYDNLVLYFLLFQALQIWISTTGFHGLKWLENIGAVVIIASLAYMFYVCMTKFGGRIEENLINKEGTWGLPFVSAIVAFFGVNVLVMLNVGDYVRELKAGYSTTKRGVVYFLAMVPTTVFMGIIGLMISSATGIANPINAFAQAADNKFLVVITLVFILFAQMTTNLASNVVPPAYALMDAFKIKHKTSVVLIGLLAIATCPWLITSDASSKGVDIFVLTYTVFFGPIFAVLLVDYYILRKQKVDIAELYDENGNRRGVNWAAILAISVGAVIGLFNADISFLTATIPTGLVYYFGMKYMASSARFRKGTILEK >NZ_CP046531.1|WP_159630325.1|1654372_1655227_+|alpha/beta-hydrolase-fold-domain-containing-protein MLKATQITLNTVQVQDTALVIEATHYLDDNIAPKANLIYLHGGGLLYGTKEDLPQRHLETFTQAGLQIFAINYPLAPQAQIEEIISSIQQSIKHLQNQLHLELPYFLFGRSAGAYLALLTAVRLSQQIEIEKPKGVISYYGYGFLKDGWFDSPSPHYLKLPLVIENTVQSLIATPKQAADLNTHFSCYIYARQTGKWKSLIYQGRDKFFYLDYSLRLAELNLPVFAAHATNDPDVPFAEFQALCEKFNPTKFVIAAELHDFDRDEQSKDTEELIQATIKFIQST >NZ_CP046531.1|WP_006252405.1|1653513_1654299_-|(S)-ureidoglycine-aminohydrolase MGYLNGQTGYRQGLLETRSVIRKHNFVILETDGLVRNSIPNYHNCDISILSSPALGASFVDYIAVVHPNGGCTQLGGNGIEVFVYLISGQLAVKNGDTDVVLESGGYIFSPADQVLSFINKSEHATKIYIHRRRYTALEGHQAITYVGNVNEIDYVEYEGMKTCLIKDLLPSATDFGFDMNMHILLFKPGASHGYIETHFQEHGMLFLSGKGMYRLDDEWIPVKKDDYVFMDSYCPQACYAVGDEDFVYIYSKECNRDVEL >NZ_CP046531.1|WP_006252406.1|1652439_1653492_-|ureidoglycolate-dehydrogenase MKLSREELKGLMKAKLMKAGLNDQHADITAEILTWSDERGYHSHGAVRMEYYCERIFKGGITHNPKFEWKETGPASAIFEGDNGCGYVAATFAMEKAIEMAKKSGIAIVGIRNISHSGAIGYYTEMAAKEGLLSISFCQSDPMAVPYGGSEPYYGTNPISFAAPADEGRNVVFDMATTVQAWGKILDKRSRGESIPPDWAVDVDGNPVTDPNKVNALVPISGAKGYGLMMMVDIFSGILLGVPFGKHVSSMYHDLSEGRRLGQMHIVIDPACFCGAEQFRENMAQSINELNEMSPAPGNDKVYYPGQRAEMRRDKYAATGGIEIVDKVYEYLISDDIHFDRYDHKNRFAD >NZ_CP046531.1|WP_159630323.1|1649358_1652358_-|acyl-CoA-synthetase-FdrA MLKTVVKKGSYQDSVVLMLLTNAISGLEGVNKVSVMMATPANKDIFAQSGLDTAELLEATANDMVVVADVDQEDVINVVMEKVEAFLKQKSQASSSHSGTEVVKSWNKATASLPGANLAVISIPGAYAALEANRALDEGLNVFMFSDNVSVEDEKALKEKAHRKGLVVMGPDCGTGIIQGVPIAFTNSVTPGSIGIIGASGTGIQELTTIIDRLGEGVENAIGTGGRDLYEDIGGITMLDAIEAMEQNDKVKVLIVISKPPAKAVREKISARLSRYSKPVITLFLGEKPTFHEENFYHAYTLDEAARLAVALVRQEPIPTFAKNSTNSTACGKTLKAYYSGGTLAGEAAMLLKDALRIEGSGSKADGFMFKQDGHIVVDLGDDIYTQGKPHPMIDPAKRIESMRDAVDDATTGVILFDIVLGYGSHEDMATALIPTIQELQQKAKAQSRDVAFVATVCGTRSDYQGYDETVRKLVEAGVEVCETNKAAVEKSLDLLGLPFDEPTKPIQPKTVVQGENSPASEQLLRLLSEKPKIINIGLKSFADVAEKFGCQVVQFNWQPPAGGNIQLIKALNFLNEYEAVDIDEANRKVIAKVVAATPIIRDNVLAKTVIKELNDGKVILHAGPPIQYKDMPNTVQGSCVGAVLFEKWATDEASARALLENGDITFMPCHHVNAVGPMGGITTANMPVWVVENATDGNFAYCTMNEGIGKVLRFGAYSDEVVKRLEWMRDVLGPTLGKAIRSMENGLAVNPLVAKAIAMGDEFHQRNIAASMSFFKEVAPRITAMSDLAENDKYDVIKFLADTDQFFLNIMMASCKAIMDGARTITEGTVVTAMCRNGVHFGIRIAGMGDEWFVGPVNTPQGLYFTGYDGEDACPDIGDSAITETLGVGGLAMIAAPAVTRFVGAGGYEDALRTSNDMMEICIDRNPNYVVPNWNFQGACLGVDARLVVEKGITPVINTGIAHKVAGFGQIGAGTVRPPLACFEKAVLAYARKLGFNE >NZ_CP046531.1|WP_159630321.1|1648291_1649224_-|carbamate-kinase MSKQTIVLALGGNALGNNLVEQREAVAKTAKVIVDILQQGKNIVITHGNGPQVGMIQRAMDDFAKSSGDEIPLPTSVAMSQGYIGIDLQNAIKYELVTRGIEQKVSTILSQIAVDPKDAAFQNPDKPIGRFLTKEEADELEAKGIRTMEDAGRGYRIVVPSPKPKRICELETIKTLVEAGHIVITCGGGGIPVVADENGRLVGVNAVIDKDNASSLLAEKLNADYLVILTAVEKVAINWGKPNQEWLSELSTEQARQYIAEEQFAKGSMLPKVEAALKFAESGEGRRALITLLDKAAEGIAGETGTVIYS >NZ_CP046531.1|WP_159630335.1|1661533_1662298_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MLIEWRNQVVGNKIKAVTWNNYVRHLKALYNFGISQGLLNINRNPFNQLFIQESKRRKKTYSTEQLHKIDHILNNNVVLPDFLKPSWFVLAIIMTLRYTGIRRGQLVKLKIGDVDLSNRTIYISPEINKNHDYHIVPISDSLYIHIERLITELKIRKQTDNCQLFNLNLFSRCSRRRGQPMSQNQLTHIFRHISDLVGFTSSPHRFRHTVATQLMKKPENVYVVQKLLGHKDISVTLGYIEHDVEMLRETVNLL >NZ_CP046531.1|WP_159630337.1|1662453_1664439_-|DNA-binding-domain-containing-protein MHSILKKILGKSKSSSQSSVKSDNVFAIEQDSEGWLYPKNASQLLNTELRQKYLGLLWQQVSMNRQMFEALYQQPIERYAEMVQLLPASESHHHSHIGGMLDHGLEVIAFSAKVRQNYILPPNVAPEEQSKQRDAWTAAAIYLALVHDIGKVVVDIEITLKDGSRWFAWNGLPPQPYKFKYIKGRDYHLHPVLGGFLANQLIPKSAFDWLGQYPEVISSLMYAMSGHNDKAGLLSEIVQKADQHSVTLALGGDVNKLVQRPVNSLSKQLVLALRYLLEQKIKLNTPKGPADGWFTEEGLWLVSKTAADNIRAYLLGQGISVPKDNPKLFDEMQSLGIVEESPAGGAIWSCRIQADSGWTPANTFTLLRIKPEVAWENINDRPNYFAGKVKIVEQITEESNIETQSTLVDGTTKPAPLPSVQTGGIIASKEVEISQVETNSDNAPSSEIIINDENDLTSFVLNMFAPTENSEPSLDDISIGKGQEIASMPSKQKVQDKSTTKKLKVTQSAVETPETLTLSELQLQNKENSITGDNFVKWLKSGIATNKFAINKPTAKLHIVEDHLFLVTPVIFEMYLQESGQPYDKEAINNLQYDFQGLAIHSLKNTMINGKPDTINFWKCDVIGPRKTSSLTGYLIKNTRLFFGDKVLLNNHCLTLQKEET >NZ_CP046531.1|WP_159630339.1|1665243_1666227_-|DUF1738-domain-containing-protein MNTQSNTQPKFDLYQEVTDKIIAALEQGTTPWLKPWDSVIPYGGMPCNAISGRLYSGINVLLLWLSAAEHGYIQRKWITAKAAIEAGGHVRKGEKATLAVSYRPYDREKTDDDGNLVLDDDGNPVIEHLASIKKHCLFNIEQCEKLPQDWYETVETPEQPTDENQYAIFEEIRLMLKGMDLQVMVKPSNQAYYHPRNDHIVMPEMKQFHSPQKFHSVLLHEMTHATGHQSRLARDGIVSGKARFGNKVYAFEELVAEMGCAFLCSHLGFADVPQNASYIESWIKVLREDKRAIFRASGKAREACQYMLDALNIAQLADKYEVFEEAA >NZ_CP046531.1|WP_159630341.1|1666475_1666889_-|hemophilus-specific-protein MKNEHNLEQLKYIWDNRNLENKVYQYLFHICIEPMKKGDWNRYTVWLNFHGNLINVSDVVYRVVESQKLKDDIKIWYDKQYYCRPTKVETTGFISIFLHLFYEGIARILLEQGMITETEAAEKSYNFRAANCFQRLL >NZ_CP046531.1|WP_159630343.1|1667003_1667849_-|hypothetical-protein MSDSVLNTYFKHALVKAGFPDTLNIEYSLNHCQGDGVAFYGWLDTDDLINLFNVLNPKQKRKQKMFANLLNHIESWEFSYDLNVEIVRNRFGHRYSHWNTMDLSAKTSDWLAFFEDCEARKDWYFPATKVGKYKMLWDGFIEGLEQHIKDTSRKMESVGYKIVGATPYETETVFKFNTENYLVELQRKPSEFYADPADWVFGDTGDFEAMIEEIRQGKICYADFEATVTDKATGIELGNECITTLSYSPNDRLLDGYRKGVISAAIADARRNVARFAYLHA >NZ_CP046531.1|WP_159630345.1|1668130_1668376_-|hemophilus-specific-protein MSVHIKLSCIGDILPVKLNEWTPEYRALHHEISHKALEAWKHRDKGTQSVRFMQQMPARQGLHFRFLSVSEQDGKLIVSRS >NZ_CP046531.1|WP_159630347.1|1668448_1668802_-|hypothetical-protein MSQQTAGWDVIPFESSKTVKPSLFWKLGNKLGNIFVSAKHKAKSKYVEVTKGINQRIAEEDEMRALELQMCLDEQAAEYEQEISRIKRKMFFWTLLAAIIAFVCGMVAVFGTQLSLI >NZ_CP046531.1|WP_159630349.1|1669174_1669618_+|TIGR03757-family-integrating-conjugative-element-protein MKASRFLGYCSIVTGVFSPLAQAQPNIIVYTTKMYPIQNSQLASQIYYLDQVENFEESISRNLSKSPEIAEQEMRAFFNSADWKAQEQQLKDAYQGVISGWQNGIKKVPAVFFDNPQSSPSVIYGTTDVQKALDEWHKWVKQQGESK >NZ_CP046531.1|WP_159630351.1|1669614_1670556_+|TIGR03756-family-integrating-conjugative-element-protein MKKTFLTILISASLAVPTTLYPQPARASLNTASIAASSASTSCLEYKVVGTCFWLFCTYFGCKVRTSTKIKHYLPEMVVSSYNQDGQTPWTELQALNPGVKGGEYRSPQRQYSQLTFKNADAFGHPQGAIGQLLGNTGYYCKTQTTPFMPYFLSGLDFFAWRENMPEMFYPEALTPGMREVGRVGDSWGNIYPRSGWVTQAHDYKASATIVQRVADIVSRTAQPHIYFPAAKTGGAGEWPPGPVEEGQARTHKWQMLYPQMSNTCSVFPNGGQTDTYSSQISNQGDYAWALWRPYSCCKRRGQTFLYSIDWSH >NZ_CP046531.1|WP_159630353.1|1670573_1672586_+|integrating-conjugative-element-protein MKSHFNFKKSHLLITTALLSSVSGLSYADSITDKLEFSKSDSIISDRVFYQIGGGTGYMAPPSRGNTKVVDLGIGWKANLTCGNFDIKTTIKNDLNGLKDGFKDLMGNVIDSAKGAVASMPAMVLQRANPQLYDLLTNGMYQGKLDFNRLKTSCEEMSKVLADHTLGGKWGQAADLESYKQITSSQPDAKQAQKDLEDKKGKDGRVWIGGQKKGGENQEAINVVGDVVKAGFNLLNKRNALDTSTISGSSCDGNLCQTWDNPQTAADFLTKIIGEQSISTCKEDCGTKTSSKAGVGLSPEIEEEHVRTIVKLENVLNMDVPKAELLADLSSTTVPVTRGLIESLRDDPDVEVLSQRLSAEIATSKIMEKMLLARRAVLAGMREPNVAQNADAQVELERVLNIIDREISQVKLEMDMQKMITGNTASVILQSKSEREALAGAHSLSQDSLDKRVQGLENGNVALTDLETGSNINLSRRNIALSIPNIPNVVALIPTLPNRGGSGVGGNFPSLAQISGSTMDQATGLLRNFEGFISKAQWDVNAHRVGYGSDTITRADGTIVKVTKDTVITKEDAERDLARRTAIFANNVRKELGDSNWNALPPNAQAVLVSYAYNYGSLAKTKSVLDAARRSAQTGDMTALATAVRNRQVDNNGINARRRNQEADYILGKN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP046531_1 | 1.1|1661258|29|NZ_CP046531|CRISPRCasFinder | 1661258-1661286 | 29 | MH791397 | UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome | 22354-22382 | 5 | 0.828 |
1. spacer 1.1|1661258|29|NZ_CP046531|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
209542 : 255570
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP046531|209542:255570|DBSCAN-SWA AATGACTCAATCTATCGAATCAACACTTGCTGAGCTTAAACGCGGTGTAGAAAATATTTATTCAGAAGAAGATTTAATTACAAAGCTAAAAGAAAATCGTCCATTGCGTATTAAATTAGGTGCAGATCCAACTGCACCCGATATCCACTTAGGTCACACCGTTGTGTTAAATAAACTTCGTCAATTCCAACAATTTGGGCACGAAGTTTATTTCTTAATTGGCGATTTCACTGGTATGGTAGGCGATCCTTCAGGTAAAAATTCAACCCGTCCACCATTAAGCCGTGAAGATGTGTTACGCAATGCCGAAACTTATAAAGAGCAGATCTTCAAAATTTTAGATCCGCAAAAAACAAAGATCGTATTCAACTCCGATTGGTTAGGAAAGCTAGGAACAGAAGGTATGATTCGCTTAGCAAGCAACTACACCGTTGCTCGTATGCTTGAGCGTGAAGATTTCAAAAACCGCTTCACCAACCAACAGCCAATCGCCATTCACGAGTTTATCTACCCATTACTACAAGGCTACGACTCAGTTGAACTAAAAGCAGATGTAGAACTTGGCGGCACAGACCAAACATTCAATCTGTTAGTTGGACGTGAATTACAAAAATCTGCCGGTCAAAAACCGCAAGTCGCAATGACACTGCCGCTTTTAGTTGGCTTAGATGGCGAGAAAAAAATGTCGAAATCACTCGGCAACTACATTGGTGTAACTGAAGCACCAAACGAAATGTTCGGCAAAATTATGTCAATTTCAGACGATTTAATGTGGGATTGGTACAACCTACTTTCATTCCGCCCATTAGATGAAATTACCCAATTAAAAGCGGATGTTGAAAAGGGCAAAAATCCACGTGATGTTAAAATTCTACTTGCGAAAGAAATTATCGCTCGCTTCCATAATCATGCAGCAGCTGATGCAGCAGAGCAAGAATTCATAAACCGCTTCCAAAAAAGGGCAATGCCCGATGAAATGCCTGAGTTAACGTTTGAAGGTGAAATTGGTCTAGCCGCACTTCTCAAAGAGGCGGGGCTTGTTCCATCAACATCTGAAGCCATTCGTTCCGCACAACAAGGCGGGGTTAAAATTGACGGCGAAAAAATAGACGATGTGAGACAAAACGCACAAAAAGGCACTTTTGTTTACCAAGTTGGTAAACGTAAATTTGCACGCATTACGGTGAAATAATCCTATTAATCGGCAAGCGGTCATCATTGGCAAAAAATTGGCAGATTATGACCGCTTGTAATGTAACATCTAGAAAAACTAAAGAAGAGATACATTCAAATCTGAACTCGATCCAACAATTCTCACGCGTTTTCCTGGCACAAAACCATCTTCTTTCTTCTGAACCACCACGATTTCTTTACCATCATCTTTGCGAATGACCATTTCTAATGAAGAAACTTGGCTCGCTTTATGTTCTACTTGATTACCAATTACCGAACCAGCAATCGCACCTACTGCTGTTGCAATCGCCTGACCAGTGCCACCCCCAACACCGCTGCCAGCAATACCACCTAACACACCACCGCCAAGCGTTCCGATCACGCCTTGACTATCTGCTTGAATTTTAACATCACGCACAGACAAAATCGTTCCATACGAAATAGAACGAGCCTCTTTGGCTTGCGTTCCAGAGTAAACGCTACCGCTATAAATATCAGTATTGGCACAGCCAACTAACGCAAAACCTGAGATTAACGCGGTTGCTAAACCTAATTTTTTCATTTTAATTCTCCGAAATACCTAAATTACATCTCTGACATAATTATGCTATTTATGTCATAAGGATGGAGCTTTAGACAATAAGAATGACCAAAAGTTACATCGCTCAAGGTGATCGCAATGCTGGGATTTGGCAAACGCTCTCCCTCCACCTTTGGCTGGCTTATTTTAAGCTTGAGCTCTGGATTTTCCGATAAATTAAAGCACGACAACACTCTCTCAACCCACTGTTCTGAGCTTTCCCCGCCTAAAATTGGAAAAACCACTTCAATATGCTCCCAGCCTTCTTGCGGATAAATTTTATCTTTCGGAAATGGCAACTCAATAATTTTTACATTTTGTCCGCAAAATTTCACCGCTTGTGTCAGGGTAAATAATCCGATCGGTCTGCCATTCACTTCACTTTCTTTGAGCAACGTTGAGCACTCGAGTAAGAACGTTCGCCACTGCTCTGCGGTTTCTATTTTGTTCATACGAACGGCGAGGTGATCGATTTCATAATGCGATAAATCAATCCCTGCAATCTCCGCAATTTGTTGAATTTTTTGCTCAAATTGAGATAAATCACCAAAACAAGCGGTCATTTTCTCGAAAAATTTTGCATTTCCTGCTACAATCTTGTCCATTTTTGTGAATCAAATTTAATAGGTTAAATCGGTGAATATTCAACAAATTTTATCAGATAAAATTAAACAGGCAATGGTGGCAAGCGGTGCAGAGAGCGATGTTGATCCATTAGTTCGCCAATCAGGCAAACCAGAATTTGGCGATTATCAAGCCAATGGAGCGATGGGTGCGGCGAAAAAATTAGGAATGAACCCACGAGAGTTCGCTCAAAAAATCTTAGATAACGCCAATTTAAACGGTATTGCCGATAAATTAGACATTGCAGGCCCGGGCTTTATCAATATTTTCTTAAACCAAGAATGGCTGGCTCAAAGTGCCAATAATGCGTTACAAGCGGTCGATTTTGATATAAAAACGGCAAATCCACAAACGATTGTGATCGACTACTCTTCGCCAAACGTGGCAAAAGAAATGCACGTGGGGCATTTACGTTCAACTATTATTGGCGATGCTGTCGTTCGCACTTTAGCATTTTTAGGCAACCACGTTATTCGTGCCAACCACGTGGGCGACTGGGGAACGCAATTCGGTATGCTCATTGCTTACCTCGAAAAAATGGAAAACGAACACGCCAGCGAACTGGAGTTAAGCGATTTAGAAGCCTTCTATCGTGCAGCAAAAGAACATTACGATTCTGATGACGTATTCGCAGAAAAAGCCCGTAACTATGTGGTGAAATTACAAAGTGGTGATGAGTATTGCTTAACTATGTGGAAAAAGCTCGTTGACATCACGATGCACCACAACCAAGAAAACTATAACCGCCTAAACGTAACCTTAACGGAAAAAGATGTAATGGGTGAGAGCCTTTACAACCCAATGTTGCCTGAAATTGTTGCTGACCTCAAATCCAAAGGTTTAGCGGTCGAAGATGATGGTGCACTGGTGGTGTTCTTAGACGAATTCAAAAACAAAGACGGCGATCCGATGGGCGTGATTGTGCAGAAAAAAGATGGCGGTTTTTTATATACCACCACCGATATCGCCGCTGCAAAATATCGTTATGAAACACTAAAAGCTGACAGAGCTTTAGTCTTCTCCGACAGCCGCCAAGCACAACATATGCAACAAGCGTGGCTAATTACCCGAAAAGCAGGCTATGTGCCAGATTCATTCAGCCTTGAGCACCCATTCTTTGGTATGATGTTAGGCAAAGACGGGAAACCGTTCAAAACCCGTAGCGGCGGTACAGTGAAACTGAAAAATCTATTAGATGAAGCTGTAGAGCGTGCAGATAAGTTAATTTCAGAGCGTTCTACCAACTTAACCGCAGAAGAAAAAGCGGCAGTGGTGGAAGCTGTGGCAATCGGCTCGGTGAAATATTCCGATCTCTCGAAAAATCGCACCACTGACTATGTCTTCGATTGGGACAATATGCTGACGTTTGAAGGCAACACGGCCCCTTATATGCAGTATGCCTACACCAGAATACGCTCAATCTTTGCACGTGCAAGCATTGATGAAAATGCGTTAAGTGGCACTATTCAACTAAAAGAACCTAAAGAACGTGCTTTGGCAGTGAAATTACTGCAGTTTGAAGAAGCTCTAAATGGTGTAGCAAAAGACGGTATGCCGCATATTCTATGCCAATACTTATATGAATTAGCTGGCACATTCTCCAGTTTCTACGAGGCTTGCCCTATTTTAAATTCCGAAGAAGACACCAAAAACAGCCGTTTAAAACTTGCCGCATTAACTGCAAAAACCTTAAAACAAGGTTTGGATTTGTTAGGCATTAAAACAATTGAGAAGATGTAAGAATAGTTCCCCTTTTTAGCAAAGAGGGGAGATGTTTATAAGGAACAATGTAAAATGAAATTTATTGATGAAGCTCTGATTCGTGTAGAAGCAGGCGATGGCGGAAACGGCTGTGTGAGTTTTCGCCGTGAAAAATATATCCCAAAAGGTGGGCCAGACGGTGGTGATGGGGGTGACGGCGGCGATGTGTATTTAATTGCAGACGAAAACCTCAATACACTCATAGACTATCGTTTTGAAAAGCGTTATACCGCAGGGCGTGGCGAAAACGGCCGCAGTGCAGGCTGTACAGGGCACCGTGGAAATGACATCACCTTGCGTGTTCCCGTCGGAACTCGTGCCATAGACAACGACACCCAAGAAGTGCTTGGTGATTTAACCCAGCACGGAATGAAAATGCTAGTAGCAAAAGGTGGCTACCACGGTTTAGGTAATACTCGCTTTAAATCATCGGTAAACCGTGCTCCACGCCAAAAAACCAATGGGACATTGGGCGAAAAACGTGATTTGCTGTTGGAATTAATGTTGCTTGCCGATGTAGGGATGTTAGGTTTACCAAATGCGGGGAAATCGACCTTTATCCGCAGTGTCTCTGCCGCTAAACCCAAAGTGGCGGACTACCCATTCACAACCCTTGTGCCAAGTTTAGGCGTAGCTCGTGTTGCCTCAGATCGCAGCTTTGTGGTTGCCGATATTCCAGGCTTGATCGAAGGGGCGGCGGAAGGCGCTGGTTTAGGCATTCGTTTCCTCAAACACTTGGAACGTTGCCGAATTCTCATTCACTTAGTGGATATTATGCCTATTGATGAAAGCGATCCCGCTCACAACATTTCAGTGATTGAATCGGAACTTTACCAATACAGCGAAAAGCTCTCTGAAAAAC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41 | Bodo_saltans_virus(22.22%) | transposase,protease,integrase,tRNA | attL 204067:204084|attR 230040:230057 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
767241 : 838028
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP046531|767241:838028|DBSCAN-SWA 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56 | Mannheimia_phage(14.29%) | transposase,protease,integrase,tRNA | attL 787025:787042|attR 817698:817715 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1204332 : 1212821
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046531|1204332:1212821|DBSCAN-SWA TATGCAAGTTAAAAAATTTAGTCAAAAATATGTGAATTGGGTATTAAGGCTCGGGCGATTAAGAGCCTCGCTTCTTGGTTTTTTTATGGTTGCGGCATCAGCAATTGCCATTCAAAGCGGATTAACGTATCTGTTTATTGGCAAAATAGTTGTGGTAGATATTTTACGCTCCATTGCTTTTGGATTAATTTCCGCCCCCTTTGTCCTCTATTTTTTCACATTATTGGTTGAAAAGTTAGAACGCTCCCGTTTAATGTTAGAGAAGGCAGTTAAAGATTTAGAAGAATTAAGAGAACAAGATGCTTATCTCCACGCTAAATTAGAAAAGAACAACCGTGATAAAACTATCTTGATGGCAACGATTAGCCATGAATTACGCACACCGCTCAATGGCATTATCGGCTTAAGTCAAATTTTGCTTGATGAGGAGCTAAATGAAAAGCAGCAGGAATATCTTAAAACGATCAATATGAGTGCAACCGCATTAGCTCATATTTTTGGCGACATTATTGACTTAGAAAAAATTGACAGCAGTCGTATTGAACTATTTAGGAAAGAAGTAGAATTTGAGCGATTTATTCGAGATATTACCAATTTCGGCCATTTTATGGCGGGAAATAAAAATATTGATTTTGAATTAAAGTACCCGAAGAATTTACCTAAATATATTTATATTGACTATGCACGCCTAAGTCAGATTTTATGGAACTTAATCAGCAATGCGGTGAAATTTACCCCTGCAAGCGGTCGAATTTTGCTAGAAATTTGCCAACTGGATAAAGAGCAATTTAGTTTTAGTGTCGCAGACTCAGGCATTGGTATTCCTGAAAAAGAGTTACGCAAAATTTTTGATATGTTCTACCAAGCTGAAAATTCAAAAGAGAAAAAGGCACAAGGGAGTGGCATTGGGTTGTCCGTTTCAAAACGGATTGCAAAATTAATGGGGGGAGACCTAGTCGCTAAAAGTCAAGAAAATCAGGGCTCAACGTTTACGCTCACTGTTCAAGCAGAAAGTACAGAAACAAAGCCAGAGCTAGAGATTCAACATCACGCGTTAAAAGTGCTTCTTGTTGAAGATATTGAAATGAATGTGGTTGTTGCTCGTGCCATTCTAGAAAAAGTCGGTTGTGATGTTGATGTAGCGATGAGCGGGGCAGAAGCGTTCAAATATTTTGAACAAAATAGTTACGATTTAATTTTATTAGATATTCAGTTGCCTGATACCACTGGTTTTGAGATTGCACAAACATTAAGAAATCGTTATGAAAATGAAGAAATTGATTATCTTCCCTTACTGATTGCATTAACGGCGAATGTGATTCAAAGTCAACAATCTTATCAAGCACAGGGTATGGACGATGTACTGCATAAACCACTCTCCTTAGAGGCGTTAGTCAATTGTTTAAATCATTACTTCGATAATAGCTTTTTGCAAAAAGAGAAGGAAAAACAACCGCTTGCAGCTAATAAATTATCTGAAGAGCCTTATAATATTTCAATGTTAAATGAACTTACTGAAGTAATGGGAAAAGACGCCGTGCTGGCCAATATGGATCTATTTGCTGATTTAATGCCAACGTATTTAGACAATCTACAACGTTATTTAAGTGATTGGCAAGCAACATCGGATCCTCAAAGTCGAAAATTAGTGGCAGAAGAAGCACACAAAATCAAAGGTGCTTTATCATCTATAGGTTTAGAGCAATTACAACAAGTTGCTCAACAAGCTCAATCGGATAATGGCAAGCAATGGGAAGAAAATATTACCTCTTGGGCAGAAAGGATTCAGTCAATATGGCAGACCGATTTGCAAGCCGCGAGAGAATATATCAATATGTTAGATAAAGTGTAGTTATTTACCACTTCTTTATTTTCGGATTCACAAATTCAATCCCTTTATCTTGATAGCTTATGCCTTCCAGCTCTAGCAGAAAACGCTTATTCGGTAAGCCGCCCCCAAAACCAGTTAGCGTTTGATTTTTACCGAGCACTCGGTGGCAGGGAATAAGAATAGAGATAGGGTTACGCCCCACTGCACCACCTACCGCTCGCATAGCATTCGGATTGCCTAACTTGTTTGCTATTTCTCCATAGGTTGTGGTGTTACCATAAGGAATTTTACGCAGGATTTCCCAGACAGATTGCTGAAAATCGGTGCCTTGTGGAGAAAGAAAATCCAAAGGCTGGAATGCAATTTTTTCTCCTGCGAAATAGCGGTCTAAAATTGCTTTTGTTTTGCAAAAAATGTCTAAAACTGCACCGCTTGTTTGGGGTGCTTTAATAAAGTGTTCTACCGACGTTGAGCGTTGTTCTTGCTCAAATTCAACATAAATTAACCCATCTTCTTGGGCAAGTAAAAGCAATTTGCCTACATGGCTTTGGTAATAATCGTAGTAAATTTGTGATTTCATTGAATATTAAAATAGAGTGACACCATAAATGGCGATGGCTGGAAAGTATAATGGACTTTGTTGCACCAATCAAATTTTATCCAATTTCAATTGTTGCGAACTGTTGAACGCCAAGCTGATGAAATGATGTACGCCATAATGGAGTTTGTTTTGGTATTTTGGACTATTTTTTCGTATAATTGATTTTCTTTTTTAATATATAAAACCTTTCACATTAATTAGTGCTAAATGATTGACTAAATTAGTGGGTTATATAGAATTTAGCACATTGTTCTGGATGATTTTCTGGAAAACTATGAGGATATTTTATGAAACTTACCTCAAAAGGGCGTTATGCGGTAACCGCTATTTTAGATATTGCTTTACACGGTAAATCAGAGCCAGTGAGTTTAGCCGATATTTCAGATCGCCAAGCGATTTCCCTTTCCTATTTAGAACAGCTTTTTGCACAGCTTCGTCGTGACGGCATTGTGCAAAGTATTCGAGGTCCAGGTGGCGGTTATCAATTAGGCAAAAAGCCAGAGTACATTAGCATAGGAATGATTATTTCTGCAGTTAATGAAAATATTGATGTCACCAAATGTAAAGGGAGCGGCAACTGCCGGAAAGATTCTCAATGTTTAACGCATTCTTTGTGGGAGCGATTAGAAGATCAAATTGAGCAGTTTTTAGGGACAATTTCAGTGGCAGACTTAGCCGCAGAACACGCTGATCACGATTGTGAAAAAGCCCATTGTCACGAACATTCTCATCATCACTAATTGCAAAATTTTTAATAAAAACAACCGCTTTTGAGTTGTTTTAACTAGGAGTAACAATGAAATTACCAATTTATTTGGACTATGCCGCAACCACACCAATGGACGAACGTGTTGCGAAAAAAATGATGGAATATATGACCAAAGACGGTATCTTTGGTAACCCAGCTTCTCGCTCTCACAAATTCGGTTGGGAAGCAGAAGAAGCGGTTGATGTAGCTCGTAATCAAATCGCAGATTTAATTGGGGCAGATAGCCGTGAAATCGTTTTCACTTCAGGTGCAACAGAGTCTGATAATCTTGCAATTAAAGGTGCGGCTCACTTCTACCAAACAAAAGGTAAGCATATCATCACGGTTAAAACGGAACACAAAGCGGTATTAGATACTTGCCGTCAGTTAGAGCGTGAAGGTTTTGAAGTGACTTACTTAGATCCTGAAGAGGACGGTTTAGTCGATTTAGCGAAATTTGAAGCAGCAATTCGCCCAGATACAATTTTAGTGTCCATAATGCACGTGAATAACGAAATGGGCGTTATTCAGCCAATCAAAGAGATTGGTGAAATTTGTCGTGCGAAGAAAATTATTTTCCACGTAGATGCAACGCAGTCTGTTGGTAAAATCGAAGTGAATGTACAAGACTTAAACGTTGATTTAATGTCTTTCTCTAGCCATAAATTATACGGACCAAAAGGTATCGGTGGTTTATATGTTTGCCGTAAACCTCGTGTACGTTTAGAAGCGATTATTCACGGTGGTGGTCACGAGCGTGGTATGCGTGCAGGAACATTACCTGTTCACCAAATCGTGGGTATGGGCGAAGCTTATCGTATTGCGAAAGAAGAAATGGCAACAGAAATGCCTCGCTTAAAAGCACTTCGCGATCGTTTATACAACGGCTTCAAAGATATTGAAGAAGTTTACGTAAACGGTTCAATGGAAGAAGGTAAACGTATTGATTCAAACTTAAACATCAGCTTTAATTTTGTTGAAGGTGAATCTTTAATGATGTCATTGCGTGATATCGCCGTATCATCAGGTTCAGCTTGTACTTCTGCAAGTTTAGAGCCATCTTATGTGTTACGTGCTATCGGTCGTGACGATGAATTAGCCCATAGTTCAATTCGTTTTACGTTAGGCCGTTGGACAACGGAAGAAGAGATCGATCACACTATCGAAATTGTGAAAAAAGCAATCGTGAAATTGCGTGAGCTTTCTCCACTTTGGGAAATGTTTAAAGAAGGCGTGGATCTCTCTAAAATTGAGTGGAATCACCACTAATGCAGAAAAATTTTGCCGTGCGAGGTAGTCTTTAATGCAAGGCTTTGCAATCGCAGGCAAAATTTTCCTAATCTAACAAATAATTTGGAAGGAATACAAAATGGCATATAGCGAAAAAGTAATTGATCACTACGAGAACCCTCGTAATGTAGGTACATTTGATAAAGAAGCTTCAGATGTGGGAACGGGTATGGTGGGAGCACCTGCGTGTGGTGATATTTTACGTTTACAAATTAAAGTAAACGATCAGGGTATTATTGAAGATGCACGCTTTAAAGCGTACGGTTGTGGTTCTGCCATCGCATCAAGCTCGTTAATTACCGAATGGGTAAAAGGCAAGTCTTTAGATGAAGCGGGCGCAATCAAAAACAGCGACATTGCAGAAGAGCTTGAATTACCACCGGTAAAAGTTCACTGCTCAATTCTTGCAGAAGATGCGATTAAAGCAGCAATCGCAGACTACAAAGAAAAACAAGCGAAGTAATATGATACAATCAATGCAAGCGGTCGATTTTTGCAAAAAATTTGCAAAATTTCACCGCTTGCATTTGCTATTTCTATCTTGATTTAATCCATTCACATACAATATCCATAAGGACAGTACAGATATGAGTATTACCTTAACTGAACCAGCAGCAAACCGAGTTCGTACATTTCTAGAAAACCGTGGAAAGGGCATTGGCTTAAGGCTTGGCGTGAAAACCTCAGGGTGTTCAGGCTTGGCGTATGTGCTGGAATTTGTTGATGTATTAAATGAAGACGATCACGTATTTGAGCAACACGGAGTAAAAGTGATTGTGGACGAAAAAAGCCTCGTTTATCTCAATGGTACAGAGCTTGATTTTGTCAAAGAAGGCTTAAACGAAGGCTTTAAATACAACAATCCGAATGTGAAAAATGAATGCGGTTGTGGCGAAAGCTTTAATGTTTAAGGAGCAAAAATGAGTAATCCATTTATACTATTTGACTTACCCGTTCAATTTCAACTTGATAATGCCCAGCTTTCTGAGCGTTATCTAGCTTTACAAAAACAGCTTCACCCTGATAATTTTGCTAGCCATTCAACTGCAGAACAACTTGAAGCGGTGCAAAAATCCGCAGATGTGAACGATGCGTTAAATATTCTTAAAGATCCGATTTTACGAGCAGAAGCGATTATTGAAATTCACACAGGTGAAGCTAAAAACCTGGAAGAAAAAAGTATGCGAGATGTGGATTTCTTAATGCAACAGCTCGAATGGCACGAAAAGCTCGAAACCATCGAACACCGGCAAGACGAAACCGAATTAACGGTGTTCTTAAAACAGATTAAAACCGAGCAAAAATCGGTACTTCAACAGCTTGAAACAGAATTAAACGCACAGCAATGGCAAAAAGCAAATGCCTTAACCGATAAATTACGCTACTTCAAAAAGTTGATTATTCAAATTGAGAAAGTAGAAGAAAAATTGTTTGAAATGTAAATACAAGCGGTCATATTTTATCGGGGTTTTGCAAATGAAAAGTTTAGACGTGTTACTAGATAAACAATCCGCTTGGTTAATTTTAAGAGACTGGTTTACCCAAGCAAAAAATCCTTACGAGATTTTGGCCAGATATCCAGAAGATGCAGGCTCGGCATTAGTCGGAATGCAACTTTCCACTCGCTCACCGCTTGGAGCAATGCTGTATGAAACAGGTGGAGTACTGATTGACCACGGTTGGCTACGTATTTTAGGCTCGGGTAATGAAAAATTGCCTCGAGGTTTATTTGATTGGAACTTTGGCAAAACTTTCAAGCAGTCGGGCGAGCAGCCAAGCTATTTATTGATTGCAGATGATGCAATTGGTGGTTATTTTGCAATTAATGCGGGTGGAATTGGGGCTGATATCGGCCAAGTGTATTACCATCACCCGAAAAGCCAACAATGGAAAACTCTTAATTTTGGCTATTCTGAATTTTTAGGCTGGGCATTATCTAGCGATTTAGACGAGTTTTACCAAGACCTCCGCTGGGAAAATTGGCAAGCCGATGTTAGAAAATTGCAAGGTCATCAAATTTTAGATTTAAACAGCAAAATTGCCATACCGATTGAACGCCACTACCAAAGCGTTTTTGCCCCTGAAAATATGGGATATTCGGTGGCTTAAAAATTTTTCTCTCTCCCACAAGGGGAGAGAGGGATAGATTAGAGAGATAAAAATATAATGGCATTATTACAAATTTCTGAACCCGGTCAAACCGCTGCACCACATCAACACAGATTAGCAGTTGGCATTGATTTAGGCACAACAAATTCATTGGTTGCGACTGTTCGTAGCGGGCAGGTGCAAGTGTTGTTAGATGAACAAGAAAGAGCATTAGTGCCATCGGTCGTGCATTACAGCGAAACTGAAAAAACAGTCGGTGTTGAGGCTCTTGCAAAAGCAGCACTTGATCCACAAAATACGGTTATTTCCGCCAAGCGTTTAATTGGGCGTTCGCTTGCTGATGTTGAGCAACGTTATACCAATTTACCTTATCAATTTAATGCGAGCGAAAATGGCTTGCCACTCATTCAAACGGCACAAGGGAATAAAAGCCCGATTGAAGTTTCAGCAGATATTTTAAGCCACTTGGCACAATTCGCAGAAAAACGTTTAGGTGGAGAATTATCGGGCGTAGTTATTACTGTGCCTGCCTATTTTGATGATGCCCAACGCCAAAGCACTAAAGATGCGGCACGTTTAGCTGGCTTAAATGTATTACGTTTATTAAATGAGCCAACGGCGGCGGCAATTGCCTATGGTTTAGACAGTGTCCAAGAAGGCGTAATTGCTGTTTACGACTTAGGTGGTGGCACGTTTGATTTATCCATTTTGCGTTTACGCAAAGGCGTGTTTGAAGTATTGGCAACGGGAGGCGATACCGCTCTTGGCGGCGATGATTTCGATCATTTATTAGCCGATTGGATAGTCGAACAAGCTAATTACAAACCACAAACTGCTAGCGAACAGCGCGAATTATTAACTTTAGCAACTCAAGCAAAAATTGCTCTTTCACAAGCGGCCGAATTTGAGGTAAATTTTGCAAATTGGACAGGTACTGTGAGCCGTTTGCAATTTAATGAGCTAATTCAACCGCTTGTAAGACGTTCTTTAATGGCTTGCCGCCGTGCGTTAAAAGATGCGGGTGTGGAAGCTGAAGACGTGCGTGAAGTGGTAATGGTAGGCGGTTCAACCCGAGTGCCTTTTGTGCGTGAGCAAGTGGGTGAGTTTTTCGGCAAAACGCCATTAACTTCTATTGATCCAGACAAAGTGGTGGCGATTGGCGCGGCGGTTCAGGCGGATATTTTAGTGGGTAATAAGCCTGATTCTGATATGTTGTTATTAGATGTTGTCCCTCTTTCATTAGGCATTGAAACAATGGGCGGATTGGTGGAAAAAATTATTCCACGCAATACTACTATTCCTGTTGCTCGAGCCCAAGAATTTACCACTGGCAAAGACGGGCAAACAGCAATGACTATTCACGTGCTACAAGGCGAGCGTGAGCTGGTGGAGGATTGCCGTTCATTAGGTAAAATCAGCCTGCGTGGTATTCCTGCAATGGCAGCTGGTGTGGCACAGGTTCGAGTCACTTATCAAGTTGATGCAGATGGTTTATTAAATGTAACGGCAATGGAGAAATCAACAAAAGTTCAGGCATCGATTCAAATTAAGCCATCTTACGGTTTAACTGATGAAGAAGTTACCCAAATGATTAAATCTTCTATGAGCAATGCCAAAGAAGATATGGCAGTTCGTCAACTCGTTGAGCAAAAAGTGGAAGCAGACCGTGTGATTGATAGTGTCGAGATTGCATTGAAAGAAGATGGCTCAGAGGTATTGAACATCGAAGAATTTAAGGCGATTGAAGCTCAATTAGCCCGTTTAATTGAATTAAAAGCAGGAACAGATCGCCTAGCTATTCAGCAAGGCATTAAAGATTTAGATTTAGCCACACAAGAATTTGCCGCACGCCGTATGAATTTATCTATTCAAAAAGCATTAGCGGGTAAAAAAATGGACGATCTTGCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP046531|1204332:1212821|1206187_1206742_-|WP_159629555.1|DBSCAN-SWA MKSQIYYDYYQSHVGKLLLLAQEDGLIYVEFEQEQRSTSVEHFIKAPQTSGAVLDIFCKTKAILDRYFAGEKIAFQPLDFLSPQGTDFQQSVWEILRKIPYGNTTTYGEIANKLGNPNAMRAVGGAVGRNPISILIPCHRVLGKNQTLTGFGGGLPNKRFLLELEGISYQDKGIEFVNPKIKKW >NZ_CP046531|1204332:1212821|1207559_1208780_+|WP_159629559.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYAATTPMDERVAKKMMEYMTKDGIFGNPASRSHKFGWEAEEAVDVARNQIADLIGADSREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYQTKGKHIITVKTEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLDPEEDGLVDLAKFEAAIRPDTILVSIMHVNNEMGVIQPIKEIGEICRAKKIIFHVDATQSVGKIEVNVQDLNVDLMSFSSHKLYGPKGIGGLYVCRKPRVRLEAIIHGGGHERGMRAGTLPVHQIVGMGEAYRIAKEEMATEMPRLKALRDRLYNGFKDIEEVYVNGSMEEGKRIDSNLNISFNFVEGESLMMSLRDIAVSSGSACTSASLEPSYVLRAIGRDDELAHSSIRFTLGRWTTEEEIDHTIEIVKKAIVKLRELSPLWEMFKEGVDLSKIEWNHH >NZ_CP046531|1204332:1212821|1209388_1209712_+|WP_159629561.1|DBSCAN-SWA MSITLTEPAANRVRTFLENRGKGIGLRLGVKTSGCSGLAYVLEFVDVLNEDDHVFEQHGVKVIVDEKSLVYLNGTELDFVKEGLNEGFKYNNPNVKNECGCGESFNV >NZ_CP046531|1204332:1212821|1210967_1212821_+|WP_159629567.1|DBSCAN-SWA MALLQISEPGQTAAPHQHRLAVGIDLGTTNSLVATVRSGQVQVLLDEQERALVPSVVHYSETEKTVGVEALAKAALDPQNTVISAKRLIGRSLADVEQRYTNLPYQFNASENGLPLIQTAQGNKSPIEVSADILSHLAQFAEKRLGGELSGVVITVPAYFDDAQRQSTKDAARLAGLNVLRLLNEPTAAAIAYGLDSVQEGVIAVYDLGGGTFDLSILRLRKGVFEVLATGGDTALGGDDFDHLLADWIVEQANYKPQTASEQRELLTLATQAKIALSQAAEFEVNFANWTGTVSRLQFNELIQPLVRRSLMACRRALKDAGVEAEDVREVVMVGGSTRVPFVREQVGEFFGKTPLTSIDPDKVVAIGAAVQADILVGNKPDSDMLLLDVVPLSLGIETMGGLVEKIIPRNTTIPVARAQEFTTGKDGQTAMTIHVLQGERELVEDCRSLGKISLRGIPAMAAGVAQVRVTYQVDADGLLNVTAMEKSTKVQASIQIKPSYGLTDEEVTQMIKSSMSNAKEDMAVRQLVEQKVEADRVIDSVEIALKEDGSEVLNIEEFKAIEAQLARLIELKAGTDRLAIQQGIKDLDLATQEFAARRMNLSIQKALAGKKMDDLA >NZ_CP046531|1204332:1212821|1208880_1209264_+|WP_018651776.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGTFDKEASDVGTGMVGAPACGDILRLQIKVNDQGIIEDARFKAYGCGSAIASSSLITEWVKGKSLDEAGAIKNSDIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAIADYKEKQAK >NZ_CP046531|1204332:1212821|1210277_1210910_+|WP_159629565.1|DBSCAN-SWA MKSLDVLLDKQSAWLILRDWFTQAKNPYEILARYPEDAGSALVGMQLSTRSPLGAMLYETGGVLIDHGWLRILGSGNEKLPRGLFDWNFGKTFKQSGEQPSYLLIADDAIGGYFAINAGGIGADIGQVYYHHPKSQQWKTLNFGYSEFLGWALSSDLDEFYQDLRWENWQADVRKLQGHQILDLNSKIAIPIERHYQSVFAPENMGYSVA >NZ_CP046531|1204332:1212821|1207050_1207503_+|WP_159629557.1|DBSCAN-SWA MKLTSKGRYAVTAILDIALHGKSEPVSLADISDRQAISLSYLEQLFAQLRRDGIVQSIRGPGGGYQLGKKPEYISIGMIISAVNENIDVTKCKGSGNCRKDSQCLTHSLWERLEDQIEQFLGTISVADLAAEHADHDCEKAHCHEHSHHH >NZ_CP046531|1204332:1212821|1204332_1206183_+|WP_159629553.1|DBSCAN-SWA MQVKKFSQKYVNWVLRLGRLRASLLGFFMVAASAIAIQSGLTYLFIGKIVVVDILRSIAFGLISAPFVLYFFTLLVEKLERSRLMLEKAVKDLEELREQDAYLHAKLEKNNRDKTILMATISHELRTPLNGIIGLSQILLDEELNEKQQEYLKTINMSATALAHIFGDIIDLEKIDSSRIELFRKEVEFERFIRDITNFGHFMAGNKNIDFELKYPKNLPKYIYIDYARLSQILWNLISNAVKFTPASGRILLEICQLDKEQFSFSVADSGIGIPEKELRKIFDMFYQAENSKEKKAQGSGIGLSVSKRIAKLMGGDLVAKSQENQGSTFTLTVQAESTETKPELEIQHHALKVLLVEDIEMNVVVARAILEKVGCDVDVAMSGAEAFKYFEQNSYDLILLDIQLPDTTGFEIAQTLRNRYENEEIDYLPLLIALTANVIQSQQSYQAQGMDDVLHKPLSLEALVNCLNHYFDNSFLQKEKEKQPLAANKLSEEPYNISMLNELTEVMGKDAVLANMDLFADLMPTYLDNLQRYLSDWQATSDPQSRKLVAEEAHKIKGALSSIGLEQLQQVAQQAQSDNGKQWEENITSWAERIQSIWQTDLQAAREYINMLDKV >NZ_CP046531|1204332:1212821|1209721_1210243_+|WP_159629563.1|DBSCAN-SWA MSNPFILFDLPVQFQLDNAQLSERYLALQKQLHPDNFASHSTAEQLEAVQKSADVNDALNILKDPILRAEAIIEIHTGEAKNLEEKSMRDVDFLMQQLEWHEKLETIEHRQDETELTVFLKQIKTEQKSVLQQLETELNAQQWQKANALTDKLRYFKKLIIQIEKVEEKLFEM |
9 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1440731 : 1533012
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP046531|1440731:1533012|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP046531|1440731:1533012|1517986_1518319_+|WP_159630135.1|DBSCAN-SWA MSNVIKCAYTHIHPSWQAPSGKTYHIERYELKRRYALFCEGEIVVLYQDRKQANKNVESHIESDVLLLWLLKNELGWSGELKKPFSLQDVENIRLLEQAFCLTYLGTFIK |
109 | Mannheimia_phage(64.91%) | integrase,transposase,protease,capsid,tail,holin,head,plate,terminase,portal,tRNA | attL 1439087:1439106|attR 1536344:1536363 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1596772 : 1607408
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046531|1596772:1607408|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP046531|1596772:1607408|1596772_1599205_-|WP_159630265.1|DBSCAN-SWA MSEQTQPTSYDSSSIKVLRGLDAVRKRPGMYIGDTDDGTGLHHMVFEVVDNAIDEALAGHCKDIIVTIHSDNSISVQDDGRGIPVGIHLEEGVSAAEVIMTVLHAGGKFDDNSYKVSGGLHGVGVSVVNALSSKLQLTIRREGHVHEQFYSLGEPDAPLTIIGNTDKTGTSVRFWPSLDIFKNKTEFEYKILSKRLRELSFLNSGVSIKLIDERDGKEEHFKYEGGIKAYVEYLNEGKTHIHNTPFYLTTEKDGIGVEISLQWNDSYNESVYCFTNNIPQRDGGTHLAGFRGALTRALKNYMDNSGVLKKADANIDASGDDAREGLVAVISVKVPDPKFSSQTKDKLVSSEVRGAVESSMNEALSDYLAENPDDAKNIVTKIIDAARAREAARKAREMTRRKGALDLGGLPGKLADCQEKDPALSELYLVEGDSAGGSAKQGRDRKNQAILPLKGKILNVEKARFDKMLSSQEVATLITALGTGIGRDDYNIEKLRYHKIIIMTDADVDGAHIRTLLLTFFYRQMPELIENGYIYIAQPPLYKVKKGKQERYIQDNDEMAQYEIDIALEGAGLYVSKDAPALSGVALENLISQYNHVQKLIGRLSRRYPILLLNELIYSKPLSVEFAKNEANMTAWSEAFVANLMEKEIGGSFYRIHTVFNEERQIHEPHIIVTTHGMDTTYRLDYNFINGNEYAHIVALGNELNDLFSDSAYVVRGERRQDISSFAEALDWLVKESRKGLTIQRYKGLGEMNPEQLWETTMDPVARKMLQVNISDAIAADKLFSTLMGDEVEPRRDFIETNALYAQIDV >NZ_CP046531|1596772:1607408|1603974_1605642_-|WP_159630273.1|DBSCAN-SWA MKALFPFFSLYQTHFGRLLLGIVLAIVGLAASIGLLSLSGWFLSASFLAGNAIIFNFFYPASGVRGLAIFRTASRYFEKLVTHDATFRVLANLRVSVFKKLIPLSPSGLNRFRNSELLNRLVADVDALDTIYLNLISPFVSAVMVILFMAIGLSFVSVPLMLIICGSLLALLVIIPIVFYRLGLNLGKKAVENRANYRSQFIEWVQLNAEFLLFGQLNQASEKLQHVERQWLNAQSKESQLAGVSNSIVMLSNGVLTCVILYLVSTAINVPSAKYPEALIALVVFCVMASAEILTPIGMAFLHLGQVITAAERINEITGQKPSVEFNGSAEWQNLSQNQPLVRFEKANFAYLNGEQQVLNNLSFEVLKGQKVAILGKTGSGKSTIFQLLNRNYDPTSGQIWLNNCKIEDFSEQTLRSKLVTLSQRVHIFSQTLRDNLLMGNSAATDEQMIEVIKKVGLGYLLETESLMLWLGEGGRPLSGGEQRRLGLARLLLSSAELVLLDEPTEGLDRETEQHILNLILTHCANRTLLMITHRQRGLERFDVIYRMDNGRLVG >NZ_CP046531|1596772:1607408|1603236_1603647_-|WP_159631281.1|DBSCAN-SWA MLYPIAIEMGNEKQAYGVIVPDVEGCFSAGDTLEEAFNNAKEAISFHIETLIEDGEAIPQPTALENHKNNPEYKDFIFALVDVDLTHLMGKTEKINVTLPSLLIRRIDEIVAQNPAYKTRSGFLAQVASERILTNY >NZ_CP046531|1596772:1607408|1601088_1602456_-|WP_159630269.1|DBSCAN-SWA MELTALTALSPIDGRYQDKVARLRPIFSEFGLLKFRVEVEVRWLQKLASHPQLNEVPPFSEIANDYLDQIVANFSLEDANRIKTIERTTNHDVKAVEYFLKEKCEALPELQAVNEFIHFACTSEDINNTSHALMLKTARAEVLLPEWKKVIDAVVELAQRYQYIPLLSRTHGQPASPTTMGKEMANVAYRLQRQYKQLENLEILAKINGAVGNYNAHLSAYPDIDWHTFSQEFVESLGVTWNPYTTQIEPHDYIAEFFDCVARFNTILIDFDRDMWGYIALNHFKQRTIAGEIGSSTMPHKVNPIDFENSEGNLGLANAVMAHLGQKLPISRWQRDLTDSTVLRNLGVGLGYALIAYASTLKGISKLEVNEQHLRDELNQNWEVLAEPIQTVMRRYGIEKPYEKLKELTRGKRVDETAMREFIDKLDIPENEKNRLKEMTPATYIGYAVELVEKL >NZ_CP046531|1596772:1607408|1605641_1607408_-|WP_159630275.1|DBSCAN-SWA MEKQRQRELQEWLKSQQKVIKKYIHLNVLLGIFGSLCMIGQMWLLATMLQKMIVEKLSPNTFINEIILLFGCFIARALLIFLRERIGFKAGQTLRLHLRKQILAKLEAVGPMSIQQKPAGSWAILMLEQVENLHNFYARYLPQQFLLLIIPLVILCFVFPINWAAGVILFATMPLLPLFMILAGMKAVEANQRNIGILSRISGQFLDKLKGLETIRLFGQSEKQTHQIHQSTEDFRTSTMDVLKMAFLSSAVLEFFTSISIAVMAVYFGFIFLGELDFGYYNTGVTLFIGFFCLMLAPEFYQPMRELGVFYHDKAAAIGAADSIEKFLNEEVKTQSGNLQKSMENRPLVIEGNACIILSPQGKTLTKPLNFKINANKHIALVGQSGAGKSSLMNMLLGFLPYEGSVKINGTELRELNLSEWRAKLAWVGQNPQLMRGTLKENILMGNAEATEDEIARALRLSKADEFVSRLGLEHQVQDSNIGISGGQAQRIAIARALLRPYELLLLDEPTASLDMDSEQQVLEALHHLSREQTTLMITHRVEDLTQCDEIWVMKQGQIIQQGSFSELEHTGFFAELLRNELVHQGEI >NZ_CP046531|1596772:1607408|1599392_1600268_-|WP_159630267.1|DBSCAN-SWA MNKESLFSKKKWIAYAQLMRFDKPIGTLLLLHPTLWALFVAADGMPPFSILLIFTLGVIVMRAAGCVINDYADREIDGHVKRTSQRPLATGRVTITEAKIIFVILLLFAFMLNLMLNRYTFLLSFVAVFLAVIYPFMKRFTHLPQVVLGVAFGWSIPMAFGAVSEALPLECWLLFFANLAWTVAYDTQYAMVDRDDDLRIGVKSTAILFAQYDNKIIALLQLITLILLTLMGIVQEYNIGYFIVLALSATLFIYQCWLTKKRERSECFKAFLNNHYFGLGVFIAILVGIYF >NZ_CP046531|1596772:1607408|1600260_1601022_-|WP_159630268.1|DBSCAN-SWA MKQANRHKKIIELVNQLGYVSTEELVAQMKVSPQTIRRDLNEMAENNLIRRHHGGAAAPSNNENSDYTHRKQFFSQEKNAIAQQVAKLIPNGASVFLDIGTTSEAVALALLSHKNLKVVTNNLNAAHILMKNPECQITVAGGNLRSDGGLIGEETVRFINQFRLDFCILGISAVDLDGSMLDYDYHEVQVKRALMECARQVVLVADHSKFSRNAIVRLGNIKEVNYLFTDTDLPLELQHHLSQSDVIIKICNE >NZ_CP046531|1596772:1607408|1603650_1603836_-|WP_159631283.1|DBSCAN-SWA MDSRSLVKLIVADGWFLVGIKGSHHQYKHPTKKGRVTIPHPKKDLPTATVKSILKQAAIKE >NZ_CP046531|1596772:1607408|1602489_1603119_-|WP_159630271.1|DBSCAN-SWA MADYHDITIAYAGVCQAANLIQQFAYKGTADRDVFRQSIRSLLVTQPESTLSVFGDDLSHLKIGLETALSQTGGGNGKLDTEVGRYWISLIALSQKLDKNPEAKQQLAQRLQQIERQLPLYEDNILADQTIANLAAIYSDIISPLGTKIHVMGMQDYLVRPDIQHKIRASLLAGIRAAILWQQVGGSRWQFLFSRKKILHQARQLYRQI |
9 | Bacillus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1893570 : 2001270
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP046531|1893570:2001270|DBSCAN-SWA 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104 | Mannheimia_phage(20.83%) | integrase,transposase,holin,protease,capsid,tail,head,terminase,portal,tRNA | attL 1915368:1915414|attR 1955819:1955865 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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