Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047165 | Pelistega sp. NLN63 chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,DEDDh,DinG,cas3,WYL,PD-DExK | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047165_1 | 1441217-1441351 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047165_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047165_1
>1.1|1441255|59|NZ_CP047165|CRISPRCasFinder TCAATTTTAACCCTTTATTTTCAATAGGTTATAAAAATACTTTTTCCTTGCTTAGCCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047165_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047165_1 >merge|NZ_CP047165|1|1441217-1441351|CRISPRCasFinder TATTAAATCTTGCTTATTTTACCCTAAAACTTGCTTAATCAATTTTAACCCTTTATTTTCAATAGGTTATAAAAATACTTTTTCCTTGCTTAGCCTGTATTAAATCTTGCTTATTTTACCCTAAAACTTGCTTAA >NZ_CP047165|1|1|1441217-1441351|CRISPRCasFinder TATTAAATCTTGCTTATTTTACCCTAAAACTTGCTTAA TCAATTTTAACCCTTTATTTTCAATAGGTTATAAAAATACTTTTTCCTTGCTTAGCCTG TATTAAATCTTGCTTATTTTACCCTAAAACTTGCTTAA
>NZ_CP047165.1|WP_159991326.1|1440446_1441148_-|restriction-endonuclease-subunit-S MKNDRTFLEKLLDGAKVEWKELGDVVEMKRGQSITAKNVKDGNIPVISGGQKPAYYHNESNRKGRTITVAGSGAYAGFIMFWDKPIFVGDAFSIKSEDSILDLKYVYYFLLQNQQKIYGLKKGSGVPHVYPKDLAKLIIPIPPLEIQQKIVKVLDKFTELEAELALRTKQYEYYRNQLLTFDNISDRGGTRLIQSSKPCKSTVLRWFLRLWERLQKFREGRLLDLFHNILQKI >NZ_CP047165.1|WP_159992135.1|1439940_1440567_-|type-I-restriction-endonuclease-subunit-S MFKTLQINRFEVVFKTLGEVAKIQRGASPRPISQYITEDLMSGIPWIKIGDTMPNSKYVSKTEQRITLKGANKSRLLKRGDFIISNSMSYGRPYILGIDGAIHDGWASISDFANYLNSDYLYHYLSSDKVKKYWEGKINSGSVSNLNSDIIKALPIPIPSFETQQLIVDILDKFETFTNSITEGLPKEIMLRRQQYEYYREQLLRFPQ >NZ_CP047165.1|WP_159991325.1|1436527_1439632_-|HsdR-family-type-I-site-specific-deoxyribonuclease MIQYTSIAETNHFIVLDKYEKLLKEPNAGYQTEASLECEFIEDLQQQGYEYLPKITNHTQLLANLRTQLQTLNQVAFSDAEWKRFLEEYLDKSSDSLIDKTRKIHDDYIYDFVFDNGRIQNIYLLDKQNITRNRVQVINQFEQTGSSINRYDVTILVNGLPLVQVELKKRGVAIREAFNQIHRYSKESFNKDNSLFKYLQIFVISNGTDTRYFANTTKRDKNSYDFTMNWATAKNITIKDLKDFTATFLQKNTLLNILIHYCVFDTSDTLLIMRPYQIAATERILWKIKSSYQSKNWSHKESGGYIWHTTGSGKTLTSFKAARLATALDFIDKVFFVVDRKDLDYQTMKEYQRFSPDSVNGSDSTAGLKRNLEKEDNKIIVTTIQKLNNLMKSEEHLPIYQKQVVFIFDECHRSQFGEAQKNLQRKFKKFYQFGFTGTPIFPENALGAETTQSVFGIQLHSYIITDAIRDEKVLKFKVDYNDVRPQFKAIETEKDNEKLTALEQKQAFLHPKRIEEISTYILTHFNQKTHRLNAVGKGFNAMLAVSSVDAAKLYYETLMRLQKDTAKPLKIATIFSFAANEEQEAVGDIPDEGFDVSAMQLSAKEFLTRAMNDYNAYFATNYSVDSQSFQNYYRDLAKRVKTQEVDLLIVVGMFLTGFDAPSLNTLFVDKNLRYHGLIQAYSRTNRIYNATKTFGNIITFRDLEQNTVDAITLFGDANTRQIVLEKSYQDYMEGYTNAGEARRGFLEIAKELQERFPDPSEIVKEQDKKDFAKLFGEYLKVENILQNYDEFAALQALKQIDPQDKEAMAAFQATYYVSDDDLPQMQALVAVIPTERDVQDYRSTYNDIRDWLRHQQQGEEKSTSTINWDDVVFEVDLLKSQEINLDYILELIFDHHKKVKNKEAVIEEVRRTIRASLGNRAKESLIVNFINQTDLDSIPDKASIIESFFTFAQVEQQREAEELINMESLNEEAAKRYINTSLKREYASENGTDLNNILPKMSPLNPQYLGLKQRVFQKIAAFIEKFSGIGGDIV >NZ_CP047165.1|WP_159991324.1|1435581_1436487_-|DUF91-domain-containing-protein MLILKKTEKELLHLKEKPFKLEKDIQKLFEEHLSLLTPYQLIKSEFTIKNHRIDTLAFDPENKTFVIIEYKRSQNLSVVDQGMAYLSLMLEYKADFIVEYNETQKMTLKREDVDWSQSKVIFVSPAFTDFQIEASNFKDLPIELWQVNQFDHGVLIVNPLKKSKAAPSIKQIKTVPSSALEQLKIEIKVYSEEDHLADKSEEVKELYEDFKQAILRLDSDIEVTAKKVYIAFKKNKNIVDFAIQQRSIKIWINMSKGQLDDPKGLAKDVSQIGHHGNGDYQLIVKDTHYLEYIMSLIKQAL >NZ_CP047165.1|WP_159991323.1|1434809_1435298_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MNYLQYYPVDIVNGEGTRCTLFVSGCIHACKGCYNKKSWSFKAGVEFDQAMEEQILRDLKDTRINRQGLTLSGGDPMHPKNIATLLPLVQRIKRECPDKDIWLWTGYRLSELDDYQQQMLPYIDVLIDGKFEQALADPSLIWRGSSNQVVHRLKVQAASTPS >NZ_CP047165.1|WP_159992134.1|1432574_1434701_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MSTLSVIKRDGSRVVFNFDRILDAIKKAAQAIALKDETFCQKIAGQISHEILASDQQEIDIHQIQQTVENHLMASQYPQIARAYIEYRHDRDLAREKRSQLTKEIKGLIEQSDVQILNENANKDAKVIPTQRDLLAGIVAKHYAKRYILPRDIVQAHEKGEIHYHDLDYAPFFPMFNCMLVDLKGMLTQGFKMGNADIEPPKSINTATAVTAQIIAQVASHIYGGTTINRIDEVLAPYVQLTYDKHLKNAQQWQIADKEGYAKALTEKDCYDAFQSLEYEVNTLHTANGQTPFVTFGFGLGTSWQARLIQQSILRNRIAGLGKNHKTPVFPKLVFTQKRGVNLDPQDPNYDIKQLALECASKRMYPDILNYDQVVKVTGSFKAPMGCRSFLGAYQENDQEIHDGRNNLGVVSINLPRIALEANGDETRFYQLLDERLALVKKALLTRIARLEQTKARVAPILYMDGACGVRLKADDNIAQIFKNGRASISLGYIGIHETINALYRQGHIFDDDTLREKGRQIVEYLHKTAKKWREETGYAFSLYSTPSENLCDRFCRLDSKQFGSIEGVTDKGYYTNSFHLDVEKKVNPFDKLDFEMVYPPLANGGFICYGEYPNIQHNLKALEDVWDYSYERVPYYGTNTPIDECYECGFTGEFECTSKGFTCPKCGNHDSSKVSVTRRVCGYLGSPDTRPFNAGKQEEVKRRVKHL >NZ_CP047165.1|WP_159991322.1|1429651_1432096_+|DNA-topoisomerase-(ATP-hydrolyzing)-subunit-B MTDSINTTNNYGADSIKMLKGLEAVRKRPGMYIGDTSDGTGLHHMVFEVVDNAIDEALAGYCDDIVVTIHADNSISVTDNGRGIPTDIHKDDEYGRSAAEIVMTELHAGGKFDQNSYKVSGGLHGVGVSCVNALSEWLRLTIYRNGQVHQMEFNRGERVEPLKVVGSTDKHGTRVQYLADLEIFGKVEYSYEIFAKRLRELSFLNNGVGIRLVDERQGKEENFSFSGGVKGFVEYINRSKTVLHQNIFYVSNTSSASGTEVGVDVAMQWNDSYGEQVLCFTNNIPQRDGGTHLTGLRAAMTRVINKYIADNELAKKAKVETTGDDMREGLSCVLSVKVPEPKFSSQTKDKLVSSEVRAPVEEVVANALETWLLENPNDAKSICGKIVEAARAREAARKAREQTRRKGILEGAGLPGKLADCQERDPAKCELYIVEGDSAGGSAKQGRNRKFQAILPLRGKVLNVEKARFDKLLASEAITTLITALGTSIGQEFNLEKLRYHRIIIMTDADVDGAHIRTLLLTLLYRQMPKLVEEGHVYIAQPPLYKVKVKGSKLERYLKDEAEEAVFMEEIALKEAGIKQGDRIIENEELKQYFDLYLSADKVIKRLSRVMDEKTLTAISEGILIDISSESAAQASAKALQDTLFDVLNPHAVTVSAEFEEESNSYRLVVRRIHHGNVRLTLLNQEFLNSADYRTLARAAETFDGLIKENAVVFRGKTDKPDSQPVNNFRDAVIWLRKQAESAVSKQRYKGLGEMNAEQLWETTMDPSVRRLLRVRIEDAIAADQIFETLMGDKVEPRREFIENNALSVNDLDI >NZ_CP047165.1|WP_159991321.1|1428458_1429571_+|DNA-polymerase-III-subunit-beta MQLFQASTDALLKPLLTVVGIVERKTTMPILSHVLLRKQGDKMAFVANDMLIQITTHANFGVGDDVEAVTVSARKLQDILRALPPAGQVSANVIDQKMTLQCSGSRFSLQTLPGKDFPSLAEPEQWNHEFTMSQGQLRRLFNMIHYAMAQQDIRYYLNGMLLVLEPGLIHTVATDGHRLAHTAEVVEQVNSEASVIIPRKTVDQMMRLLDDSDQEVAISIADAQIRFRFGDVELISKLVEGKFPDYKRVIPTDYELHLQINREELLRNLQRAAILVTEDKLHSIKLHFGENLLRISSSNLEQEESKMELTLDYQGTPFDIGFNATYLLDVLNMAKTESVIISLKGESNSSVVISLPNNEHFRYVVMPLRI >NZ_CP047165.1|WP_159991320.1|1426769_1428455_+|chromosomal-replication-initiator-protein-DnaA MIEFWQQCTNHLSKGLPPTQIKQWILPLVPLGFNEEETEFHISAPSRLKQKWAQQYYAPVIQQFIKDNFNHDARVVVLINAPEAADIAKTITDSKEASEENTISTVATEQVSSSQTPKTTLDVVETSIAPVEQVYTTKDSSLIAQPNHIELIEGIEVEIDESGIEEPIEQNFSQQISTHSPKQHSGKGKHQPDTKVDFIYKGILDVPASLKSVYDATRLNPNHTFANLVVGHSNELAHATAANVVTHIGQMGYNPLFLYGSTGLGKTHLMHAIGNEIFQKKELRKIRYIHANDYYLDVVRSVKGGGLFEYNTQIMQEYQNLDLLLIDDIQFFQNKKSTQEQFFHLFDLMVSKNKQVVISSDTYPKELADIDARLISRFSSGLTIQIEPPELEMRVAILMRKAENHPIIRLTDEAAFFIAKHIRSNIRELEGGLQRVIATATFKKEHEITVDLCKEVLKDVLRVSNGLLTVENIQKTVADFYKIRVADMYSKTRKANIVRARHIAMYLAKELTRKSLPDLGEAFGGRDHSTVHHAVEKITEHRANDRELNHDLHVLEQTLKG >NZ_CP047165.1|WP_023951589.1|1426064_1426199_-|50S-ribosomal-protein-L34 MKRTFQPSVTRRKRTHGFRVRMKTRGGRAVINARRAKGRKRLAV >NZ_CP047165.1|WP_159990754.1|1442435_1443275_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MNIHKNTRLLPRQREEIWLAYTQNKQNVTSLAKEYKVSRPTIYKILKLARGRLLKPQTSINNRFRQAKFGIKRLAKVEKSIQERLKKQAKRYNKSYPGEMVHVDTKRLPLLKGQHTQSQREYLFVAIDDYSRELYAAIMPDKTAFSAATFLTQHLIDPCPYTIEVIYSDNGTEYKGTKEHEFGKACYQHHINQKFTKVANPKTNGKAERVIRTLMQMWHDKHEFTDSQHRKQELTRFINFYNTVKPHSALVYQDQLGHKRTLTPYEYLEIYFANSVNNA >NZ_CP047165.1|WP_159991327.1|1443622_1444144_+|gamma-glutamylcyclotransferase MKFFQLFVYGTLKKGFRNHAKYCSTAINIELAYGWGRVYSLDEGYPVMEVPSQSILARGTDSPSSDVFLQKHQYFFESPTGDWDMVQGELILFKYPDKEIPPIDALEDFNPEGQKNLYERVLITVKTDNGFVNAWTYIMKGSRHLGKRVPLNKEGVIEWGYSAISNETLSYHS >NZ_CP047165.1|WP_159992136.1|1444210_1444948_+|metallophosphoesterase MNANDILFFGDTHGGFYHCLSVVEQIKPKAIIFLGDLQAQTPLHDILKDVMTLTDVWWIHGNHDTDSVDIYDNLFESQLADKNLHGRVVTIAGWRIAGLGGVFRGKIWTPIQRGWSFFSQQELFEQTSPRTHFRGGIGLKHRSSIFPETYMALRMQKSDILVSHEAPSCNRFGFLAIDRLARQMEVKKIFHGHHHDTYDYSGHFSRMHFEAYAVGYRGVSNLAGEIIRSGEMDGEFSDRVAVYRS >NZ_CP047165.1|WP_159991328.1|1445007_1446024_-|pseudouridine-synthase MNSNPIKSPLPIRDGVSASRLYLPKGDWQYLIDFLLERFPHLSPDIIKVRLQKGDMVNEKGVAYTLNSPYLADTWLWYYREVEQEVEVPFKLTILYQDEYLVAVDKPHFLASIPGGRYLQQTALIRLRKMLGNDEISPLHRLDRDTAGVLLFCVNPAYRGMYQTLFQSRDIDKVYECVAPFCSSINFPLLRESDIEKSTTYFTMQERMARQTPLTQEEKHILLLSSKQKTIARLMGDKSLNSQTIIDVITHYQGMAHYRLIPLSGKKHQLRVHMNGLGLPILNDEFYPTLLPARAEDDFTQPLQLLARSITFIDPITQEKRYFESQQTLDWVKRYFNG >NZ_CP047165.1|WP_159991329.1|1446013_1446793_-|phosphodiester-glycosidase-family-protein MIKHLLCLIILIISSVSVRAEPSISREITPCIHYETRQQGHIHISKIDLSCPSIRLLGTLPHNSDTTSNFAYKNKTTVAINASFFDENRNPLGLNYSHQRTWRTSKKDQKQYSFLACTKENQCLIEPFNQLTPYQKQWDIVISGWQSLQNGLYRCAPSSPAICHRNAKSRHPRTAVGLSQDKRFLYLVVVEGRLDKFKGYTLNQLAQLFKQLNVPHAINLDGGGSSTMVINNKRVNRLPSQQMFFERAVANHLGVVDEQ >NZ_CP047165.1|WP_159991330.1|1446948_1447593_-|isochorismatase-family-protein MMSLAKSALIVVDIQTDFLPGGALACYQADSILKGVKDLVDAQYFDYHIATQDWHPAHHISFASQHEGKKAFDTISLYGHPQVLWPDHCIKGTAGAALDPTINWDNMDLILRKGCHPQVDSYSAFQENFNQKGERPTTGLAGYLKEKEVKNVYTVGLARDVCVLWTAQGAKEQGFNTFLIWDLCAPVTPDHDEITRQLCQEYGIQIIHAADIRY >NZ_CP047165.1|WP_159992137.1|1447890_1448952_-|AAA-family-ATPase MSIYAIWNNKGGVGKSYLTFQIACEYAKQHPSKKVLVVDLCPQANSSSMLLGGIEKGEQELEKIHSQPNKNTISGYISERLISPYKQINSAIKYITQVNQINHYVPDNVYLVVGDEELEIQASGILHATQAPNVSDAWRLVHLWVRDLISDIQKAWNYEDNIVFIDCNPSFTIYTELALSAADRLIIPFSADGSSKRAVRSVLSLVYGVKRHVGDVSSYFYTEALRSKLALPQIYMYVGNRLTTMAKASATAFKTVVEEIGNEIYEVWTKNANLFCIHPEGAGTPTSKSSFKKMFQYEVRDANTASVVSGALGIPIGCLPSGKRNVLGKEVMVNPSQLDAQLPNIQQLVRCIE >NZ_CP047165.1|WP_159991331.1|1449105_1451061_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MKALLVEGVAGSGKTSYIADTVQHSLNPNDALLLTFSRTGYAVLQQYLESRQVKNSTVYTIDGFAMRILRQLGDTRFILRREEVERELLPLLYQQVVAQIMTSSSMDIAPPAPITPSTMQALMSDIDFFRASCAFEYHDDDMLEEILLGKLHHDWRLVRRVFYAYDNYRETWRPSPYQSESVFEHDEISSSYQQGEQGFRLLSESVFDLLQLIEDSEILARIGKKYRLQCIDEFHDTTPLQLKFLLQLNQQAQTVIAVGDRFQNIFAWRGTNTSFVFDQFVRQLNAETEQINRSYRYAQNIANLASSIIHRPIQSLAEHSSTIKTLSVKELTKISKETLIITKDFPTQMRAAFTLFSQTNHKLALGINHSIAPAILNILMVLRYPYLLNTKAPHFSKNLALDLTQFLQLPQCLLDETAKQEILHKPSMESIRMYFDIHLQENRQKAYDEHFRQALLYWCATNQENTPVYEVMQWLEQSARLWQLNTHRIYDQISRASWEGLKADARQYGYTLAQWQERAIALSKRWNEREGLRFATISQAKGREYNQVLFYGVSKEGFDMMDELSQHLFYVGITRAKKTLYFYLDDSVDAKAIPQAITHLSPDTTVIDHRQALSINGITPSVSLSKAEALKQLRQMREALLEKNRIESDEG >NZ_CP047165.1|WP_159991332.1|1451231_1452008_-|ferredoxin--NADP-reductase MASAFLEGKVLSVHHWTDRLFSFTTTRDPSLRFSNGHFTMIGLMVDGKPLLRAYSIASPNYEEHLEFLSIKVPDGPLTSRLQHIKEGDSIIIGRKPTGTLVLDYLLPAKRLYLLGTGTGLAPFLSIARDPETYERYEEVILVHGVRQVNELAYYDMFTKTLKEHEFLGEMVSKQLKYYPTVTREPFYHQGRMTTLIENGKLFEDLGVPPLNPAEDRVMICGSPAMLADLKAICEARGFKEGNTSTPGDFVIERAFVSQ >NZ_CP047165.1|WP_159991333.1|1452184_1453753_-|DUF945-family-protein MRKRYLMGGLAIALIIAYPVASHIHGNTIQARLDSDIQQLNQYIEQELQQSVRFSYEQTQSGIFTSQYMIKFKDEEGKEIPLLQQRIDHGPFPPNALKKGHFLPVNYASKITLINNDLTKAIFTVTQSEQPIVIEYVYGYDSKAKGYVGIAPINISQENLQLGATKISFNAKKDLTDSYFHIEMEPSKFAWLNTSGFIPQEFNHLGKIDMEMHYKLDEKGNLSVETQSDTDYYRFGDKETSIAIHRVKDTQKVTDDGKGLDISATQKAEQVLINDVDLGSYSVDAGYYQLDSGAIKSLGRTIYAIAFNYFNAAIAQKELLSPEPFLESRLFELGMQAIAIFNQNPKLQYGPIQLRNKAGASSVKAELDFVLPKDLNVTSPEEIYLKSLKKLDLQFVLNPAWLKQFTFDVLTVMAKSEKMPLPTDKDKADIDLIIDDMHKSAIESQFFQMKDNDLLFAVTAQAPEGKTIDQVEKISYNEQVYTKEDVEEILTTRGRQFIKLMEERDIESRWDELVERFQNPAE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047165_2 | 1467851-1467944 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047165_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047165_2
>2.1|1467882|32|NZ_CP047165|CRISPRCasFinder CGTTACTTTGTACATGACCACGGATAGTTACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047165_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047165_2 >merge|NZ_CP047165|2|1467851-1467944|CRISPRCasFinder GTATCATCGCCTTCACCAGTTTTGATATTAGCGTTACTTTGTACATGACCACGGATAGTTACAGTATCATCGCCTTCACCAGTATTGATATTAG >NZ_CP047165|2|2|1467851-1467944|CRISPRCasFinder GTATCATCGCCTTCACCAGTTTTGATATTAG CGTTACTTTGTACATGACCACGGATAGTTACA GTATCATCGCCTTCACCAGTATTGATATTAG
>NZ_CP047165.1|WP_159991344.1|1466414_1466594_+|glycosyltransferase MVAFDVRYGPSATIENGYNVFLIESNNSDTFIDKIVELLLNSEMNQLFSENAYASMQKV >NZ_CP047165.1|WP_159991343.1|1464375_1465569_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MIMTTLLTQLSHLGTAVCDEKHPRAPVALPAIRTSTVRFNDIDTLHDTYRRQAAGERIVGYGRMGMETHAAFEEMMCALEGGKRAFLAPSGLNAIAMVLLSLLNAGDHMLVADCVYGPVRQMDETVLKRMNISSTFCSMRDMVELESKIQSNTKILYLESPGSLLFEMLDLPAIAAVAKKHNLLVIADNTWGSGLAYRPLDLGADVSIVAVTKYIGGHSDLLMGAVVAKDDAIIKRIDTNQYALGFSTSADDVWLAIRGVRTLDVRMKRHAENALKICEFFDQQAETLQIYHPAFEKDAHHDLWKRDALGSNGMVSVALNLTKAQTKVFVESLKLFSIGYSWGGYESLIDMVNTDFLKNHAYWNPNYPHLVRMHIGLESPEDLIQDYQQALEKARKV >NZ_CP047165.1|WP_159991342.1|1463802_1464048_+|hypothetical-protein MQNHLSPAFSANGWRHLSNGRLQHISGIEFEKNFNEPVHCVKESLPVFFQNLKQEGVDVVMAEKLFFKLSQQAQEHFIGLH >NZ_CP047165.1|WP_159991341.1|1462576_1463767_+|acetylornithine-transaminase MSSTIPSTHALMDITARPDIIFTKGKGSWLEDHTGKRYLDVIQGWAVNCLGHNPPEIITALEKQSHLLINPSPAFYNEPSLALANRLVNASVFDRVFFANSGAEANEGAIKLARKWGQKYRQGAYKIITMDHGFHGRTLATMSASGKEGWDKKFPPQVDGFPKAILNDIASVQALIDDKTVAIMLEPVQGEAGVIPATVEFMQALQTLCQTHGILLIVDEVQTGYGRCGELFAYQYYGISPDIMTLGKGIGGGVPLSALLAKESVAVFDHGDQGGTYNGNPLMTAVGVAVFDTLMQEGFMSTVRQRAEQLSIGLMALSKYHRLQGERGIGLLRALCLDGNYGNDLVLAAREAIPEGLLLNAPRPNLLRFMPALNITAEEIELLLSRLDTLITTIRT >NZ_CP047165.1|WP_159991340.1|1461364_1462249_-|tRNA-glutamyl-Q(34)-synthetase-GluQRS MTSSNTYAPYIGRFAPSPSGPLHDGSLVAAMASYLDARANNGQWLLRIEDIDTPRVVKGADHIIMQQLQSLGMQWDQSPIWQSQRVSRYEACFVQLKEKGLVYGCACTRKEIADSAIAHQRHEQGQYPYMGTCRVGTNKPIRAWRLIMPDEYIHFEDRYVGLQQQHVQQEIGDIIIKRTDGLFAYQLVVVIDDHDQGVTHIVRGQDLLDSTQRQIVIANYFNFKPFKYLHIPLVLDNEGRKLSKQNHAPAICLDNALSSLEKAWLALGFASFKSHSVDHFWAQAILQWANRFGL >NZ_CP047165.1|WP_159991339.1|1458403_1460953_-|DNA-topoisomerase-III MAKTLIIAEKPSVAQDISRALGGFERHDGYFENDQYVLSSSVGHLLTLFNPDDVVRGKWSFTHLPAIPKNGFDIQPADKKSQDRLKLLVKLLKRKDVDAIINACDAGREGELIFRYIVQYAKVNKPIQRLWLQSMTKQAIVDAFHHLRSDESMKPLEAAARSRAEADWLVGINGTRAMTAFNSKDGGFFKTPIGRVQTPTLAIVYGREQKIRQFQPKDYWEVHASFVAQAGIYEGVYFDKNFKKDPNDPDKKENRLWSEVAAKAIVMACQHKTGHVTEESKPQTSASPLLYDLTSLQREANSRFGFSAKTTLALAQALYERHKVITYPRTDSRYLPEDYINTVNQTLHEIAESTSSINQPHIRFAKQILSKAWVKPNKRIFDNKKVSDHFAIIPTSQVPKELSDAEAKVYDLITKRFMAIFYPPAEYLVTTRITTVGEIPFKTEGKVLVSAGWLEVYGRTTQEGEESLVPVAEHEQVQTEEVRIEAFTTKPPPHYTEATLLSAMEGAGKLVEDDELREAMSERGLGTPATRATIIEGLIADQYLRREGRDLIPTTKTRQLMTLLNGLNIKELTSPELTGEWEHKLKQIEQGTLDRRLFMQEIAQSTQIIVKRAKEYEHDTIPGDYVTLKTPCPVCGHVVKENYRRYACTHCDFSITKNPGGRNFETEEVETLLNERSIGPLSGFISKLGRPFSAILRLTEDNKLEFDFGQSEEDSKEDIDFSALRPLGSCPKCGQGHIFDVGMNYICDQSANTEKPCDFKSSKVILQQEISEEQMSKLLATGKTDLLENFVSNRTNRKFKAYLVLDAKGKIGFEFEERGTASKSARKTVSKTASKTVAKKTTRQSTSKK >NZ_CP047165.1|WP_159991338.1|1456738_1458118_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MSNLPEKTALIRKYNIPGPRYTSYPTVPYWDEKSFSTEAYLKTLKRSFDESNDKEGISLYIHLPFCESLCTFCACHKRITKKHTVEEPYIQAVLKEWQMYLNLFGRKPHIKEIHLGGGTPTFFSEANLKHLLTTIFASAEIDAKPELSFEGHPNNTRRTHLQTLYDLGFRRVSFGVQDYDPIVQRAIHRIQPIENVQSATSAAREIGYTSISHDLVFGLPFQTWKSMESTIRRTIAQKPDRLAFYSYAHVPWIKGVGQRGFDEKDLPSGEEKRALYENGKALLQELGYIEIGMDHFSLPTDDLYQSMINKKIHRNFMGYTSSSTQLMVGLGMSAIGDSWYGFAQNEKELEAYYARLEANELPLFRGHILTEEDLIIRRHILNLMCLLETHWDKPEQQFTALPAVLDRLKEMQQDGLIEIKENALYITELGRVFARNICMAFDLRMLADKPQTRIFSMTV >NZ_CP047165.1|WP_159991337.1|1455888_1456722_-|methyltransferase MNQALIPEIKPEQSIELLKELHILTREGKLNQDTRRKLKQVYHLYQFIEPLMADVIEHKNSLNLVDHGAGKSYLGFILYDLYLKNKANVHVYGIETRADLVKKSQHLAERLGFAQGMSFKAMSVEESMATQDIPDKVDIVTALHACNTATDDAIRFGLARHARYMVLVPCCQAEVASIFRKTKGQTLGKTPLSELWRHPIHTREFGSHLTNVLRCLQLEARGYQVTVTELVGWEHSMKNELIIAKKVGGFKRSARERQLAILEQYHLLALKERFAYD >NZ_CP047165.1|WP_159991336.1|1454976_1455804_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MSAHTTIQRTTIPQIKVMKGQQKIVCLTAYTAPFARMMDEFVDLILVGDSTAMVGYNMENTLAITVEQMTAHALAVTRSSEKACVIVDMPFGSYQESKEQAFRNAAYILKHSNAQGVKMEGGEFLAETVQFLTERGIPVMAHIGLMPQYFNTMGGFKAQGLSPEMADRIYHDAMVHTQAGAFGLLIEGSAEPLARRITENVPIPTIGIGASPDCDGQILVTEDILNLSGPRIPKFAKQFADAQASIRAGFKQYAEEVRAGTFPTLAHCFGVKKDD >NZ_CP047165.1|WP_159991335.1|1454498_1454984_-|SET-domain-containing-protein-lysine-N-methyltransferase MIKTPKLKKIKGYPWHEVKQSTLHGTGVFALKDIPAGTRIMEYGGKRITAEQADALFPVNPDDPFHTFFFSLQNGNVIDGGQAGNDARWINHSCNPNCETQESKKGKRVFIYALRDIQKGEELFYDYCLSIEGRLTQKRKQEYRCLCGSHQCRGTMLALKK >NZ_CP047165.1|WP_159991346.1|1471409_1471751_-|hypothetical-protein MSTTLKVLSAKKVVASHQVNPGETLVINARENSNYQLIDDTTGLGPQNIVTQRDGKDLKIFLEDGDSKEDIIIKDYYQDEMGETSNLLVGQHENGNIYAYVPESGHKRMLLAY >NZ_CP047165.1|WP_159991347.1|1471767_1472643_-|OmpA-family-protein MKRTLVGASLALALTACATSRDMTKPLEVWHNFDAPNISQPQLAENQSMVVFYRQDDVQGPAVNVYVNGDYQASLLPNAYSTVAVCATRNLMTSSFTLPGFGNRTQGVYYTSPVNEVTYVKVSQDVNGELSFVRVEKAIAEQVIAKLPRGTQTLSRVKTHCGEVVLANAELGAGALFKFNKSSYQDILPQGKKEIADFSAKIATLAGATKVVVSGHTDPEGTASYNQRLSQQRAETVKKALQNAGITLPIEAVGYGKNQPVVTHCASLNGVAKQECNQPNRRVEITVYGNK >NZ_CP047165.1|WP_159991348.1|1473477_1473891_-|ClpXP-protease-specificity-enhancing-factor MLPPSMKPYLLRAIYDWCVDQNYTPHIVVRVDEHCRVPMQYVRDGDITLNVGPLATKDFFMDNEWVGFTARFGGVAQMVSFPITAVLAIYARETQEGMGFEVTRYEGNTTAPQEKVEKTPQKDEKTTKRVNPFRLVD >NZ_CP047165.1|WP_159991349.1|1473913_1474525_-|glutathione-S-transferase MMVLYSGTTCPFSQRCRFVLYEKGMDFEIKDIDLFNKPEDIALMNPYGTVPILVERDLILYESNIINEYIDERFPHPQLMPADPIMRARTRLFLHNFERELFVHVSVLEDRSKRTDEALLTKTRAIIRDRLSQIAPLMIKNRFMLGDEFSMLDITMAPLLWRLDYYGIELPKSAAPLQKYAERIFSRPAFIEALTPSEKVMRR >NZ_CP047165.1|WP_159991350.1|1474823_1476347_-|IS1634-family-transposase MFIREKKNKSGSVSIQILSKENGRNVLLKTMGSATKRPEIEALKLQAQHYMDELKHQPSLLMTEQDEQIVKMIQTLSNSDVSMAGPELIFGRIYDWIGFNQIKNDLFRHLVLARLTFPLSKLKTVSYLERYQGVQLEISAIYRFLDQLEDKYKEQLEQISFMHTKRMLDNQIHIVFYDMTTLHFETEDEDDLRRTGFSKVGKHTHPQIYLGLLVGQQGYPIAYDIYEGKSYEGSTLIPFIERIRQKFNLHKPVVVADSGLLSKHNLIHLETLGYPYIIGARIKSENEQLKQAMLAYYPYNDNQIIELDKEGKRLIVHYSHERAYRDADNRRKGLERLEKRIRTGQLTKGHLNKRGYNKYLRLQGELSIEIDYEKFIQDKRWDGLKGFITNTTLPPKELLAHYGQLWQIERAFRISKTDLRIRPIYHRLEHRIRAHIALVFAAYSISKTLETVLKKEHSTLSLKRASEITQTMYQVDIMLPDLKQKQKVLLEMDKEQQELLAICQKYF >NZ_CP047165.1|WP_159991351.1|1476636_1477494_-|cytochrome-c1 MIKKILGALLLVVSVGASPVMASEGGHPWDVAPVKINDQAALQNGAKLFVNYCMNCHSASLLRYNNLTQIGLTENQIVDNLMFTGKKVGDKMTIAMGHNDAKLWFGAAPPDLSLMARAKAENLGQPGTDYIYTYLRTFYRDKSRDLGWNNLVFPNAGMPNPLWERQGPVEVTFTDVHEVEKEDGTKEWHETISKVDTAGYKSVVSDKVLTDFKGHASSHAEITYLDKEKQAQYDKDIADLTAFMGWMAEPQQEFRKTLGIWVLAFLFIFFGVMWQLNKSYWKHVK >NZ_CP047165.1|WP_159991352.1|1477515_1478901_-|cytochrome-bc-complex-cytochrome-b-subunit MAGDKVVETTGLLGWIDQRFPASKLWKEHLSEYYAPKNFNFWYFFGSLALLVLVIQIVTGIFMVMHYKPDADLAFASVEYIMREVPYGWIIRYMHSTGASMFFVVVYLHMLRGMFYGSYRKPRELVWIFGVAIFLCLMAEAFFGYLLPWGQMSFWGAQVIVNLFSAIPFVGESLSVWIRGDFVVSDATLNRFFAFHVIAIPLVLIGLVVAHIIALHEVGSNNPDGIEIKAKKDAHGRPLDGIPFHPYYSVHDMVGVAGFLIVFAAIMFFAPTMGGYFLESNNFLPADPFKTPPHIAPVWYFTPFYSMLRATTDEFTWALVAFALIFAVGIFFSKNVKAPWKFIFSAVLVVVAVALRIFDAKFWGVVVMGGTVVILGFLPWLDKSPVKSIRYRPGWHKLIYGLFIINFVILGIIGTKSPSPMLNIISQVGTILYLAFFFFMPIWSRLGTFKTVPERVTYRPH >NZ_CP047165.1|WP_159991353.1|1478931_1479573_-|ubiquinol-cytochrome-c-reductase-iron-sulfur-subunit MSQDSNLYQQEGQSSPDVLPEDPSRRFWLGTACAVSGVAGVAAAVPFVASMNPSDRAKAAGAPVSVNLSAIPAGTMVTAEWQGKPVWILHRTPEMIAGLSKIDQFLADPNSDRPGYTPEYAKNTHRSRKEQWFVCVGICTHLGCSPSPRFAMGGAEGMPANWEGGFLCPCHGSQFDLAGRVFKNQPAPDNLLVPPYYFVDDNTIMVGLEQAAG >NZ_CP047165.1|WP_159991354.1|1479715_1480168_+|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MSKAKGFLKEFQEFAVKGNMVDLAVGVIIGAAFGKIIDSLVKDIIMPFINFILQGDVDFSNKFMVLSRPEGYTGPETLAALQEAGATVLAYGNFLTILINFILLAFVVFLLVKSIAKARAKFESEQPPAPPAPDSDEVVLLREIRDALKK >NZ_CP047165.1|WP_159991355.1|1480432_1481212_-|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein MSLVSRQTLNQWLNQSLQTDNFKDYAPNGLQLQGKPYIQKIVLGVTASKAFLEKAVEAQADTVIVHHGWFWKNENPCIVQMKYERIAYAIKHELNVFGYHLPLDAHSEWGNNAQLAKVLGMGVNKKDGVPETCGQGNLIWLGTPPEGKEKLDVFLQHIETSLDRKPLFIGNRERSVSRVAWCTGGAQSYFEEAIQAGAEVFITGEASEQVFHIANEYDVAFIGAGHHATERYGVQALGVAIKQQFPTIEIEFIDCPNPI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
332486 : 339467
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047165|332486:339467|DBSCAN-SWA GATGAACAAGACCGAATTAGTAGAAAAAATTGCTGAAAGTGCTGAAATTTCAAAAGCAGCAGCAGCTCGTGCATTAGACGCAACCATTGAAACCGTGAAAAAAACCCTTAAAAAAGGTGATACTGTCACTTTAGTTGGTTTTGGTACTTTCCGTGTTACTGAACGTCAAGCACGTACTGGACGCAATCCACGCACTGGAGAAGAGATCAAAATCAAAAAAGCTAAAGTACCTAAATTTGTACCAGGTAAAGCTTTAAAAGACGCTGTTCAATCAAAGCGTTAATCAAAAAAGCGAAGTAATTTTTCAAAAGACTACTATGAAGACCAGTAACTTAAATTACTGGTTTTTGTTTTTATAACAATACTAGGTAAGGTATCAGTAAATCGTATTTTTATACCTCAATTTATAAAAATAAGGTATCTGCTACTATTGATGGAAGATCACAAAAGTAGTTGATAAGAATATATGTGAATAATGGCTTGTATGCTCACTGTTCATTGTGCGTTATTGAAGTATGACTATTGCTGTTTCATTAGAATAGTCTGAATGACAAATAAAAATCATATATCTATAATACTTTCTATAGATTTTTAAAAATATTTGTAAAAATACAACGAATAATACTTATAAATTATTTGTTTTTATAAAATACTTGCCTAAATGTAAAAAGCTCTTTATAATTCTAATCTTTAACGCATACAACGGGTGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGCGCCCTTACAAGGCGTAGGTCACAGGTTCGACCCCTGTAGCACCCACCACGTTTTATGTGTTACTACCCATTTGATGGGTGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGGCGCCCTTACAAGGCGTAGGTCACAGGTTCGACCCCTGTAGCACCCACCATCAAATCGCATTAACCTCTGATTGTATCAGGGGTTTTTTGTTGTCTTTTATCTCTAGCCTTATGTCAGAAAATATGGTTTTTCTTCTATTTTTTATAATGTGTAGAAAATAGTAGATAAGCAATGTATCTTTTTATTTACATGGTAAAAAATCATTTTATCCATATAATTCTAGTGTAGTATGGTTCTTATGCTTAATAGTTAAGAGCGCTATTTTTATTATTTTTTTATCTCTTATCTGGATTATGCGGTAGATATAAAAAGGGCCTGTTAGCATGATTAAAACCAACAGACCCAAAGGGAGAAAAGGTTTATTTAGCTGCTTGATTGGCTGCTATTTCAGCATGAATTTTTTCCATATCAACTGCTTTAACCTGTGCGATTAAATCATCAAGTGCGGCAGGAGGTAGTGCACCTGATTGATTAACTAATAATACTTTTTCTCTAAAAATCATTAAAGTAGGAATAGAGCGGATATTAAAAGAACTTGCTAGCCCTTGTTCTTCTTCGGTATTTACCTTAGCAAAGGTAATATCACTATGTTTTTCAGCAGCAGCTTCAAAAACAGGTGCAAATTGACGGCAAGGGCCACACCATGGAGCCCAAAAGTCAATAATCACAATATCATTATTGGTAATCGTTTCAGCAAGATTATTTTCGTTAAGTACTTTAACTGTCATAAGATAATTCCTTCCTAAATTATTTGTTTCTATAATATGGAGAAAAAAATAAAGAATTCAAGGGTAAGATGATGGGGATTAGTTATTTTTATATAACTTTATCTTATCTATATGATTGGGTATAAGGCTGAGATCAGGTAGGATAGGCTATTATGAGATAATTAATAAATAAAAGGGGCTATTTTGTATAGCCCCAAGCGTTTTTATAACTCACTGATTTAAATAGATTGCGTGATTAGATGTCTATCTCTATAACCTACTACTTATTTAGACTAAAGCAAAACGTATGATAAATAAGCTTGCTACTAAAACAGTAGCTGGATGAATTTCTTTAATACGTCCTGTACATGTTTTTAGAATAACGTAACTAATAAAACCGAATGCAATACCTTCTGCAATAGAGTAGGTAAATGGGGTGAAGATAACTGTGATAGCAGCAGGTACAACATCAGTCATATCTTTCCAATTAATATCAGTGAGTTCACGTAACATTAAGATAGCAACATATACAAGAGCAGGTGCTGTTGCATAGGGAGGAACAATACCAGCCACTGGTGAGAATAATAAAGAAAGTAGGAAAAGTACACCAATCACAAAAGCAGTTAATCCCGTACGTCCACCTGCTTGCACACCAGCAATACTTTCAACATAGGCTGTTGTACTACTTGTTCCAATTAATGAGCCAGATAAAATAGCGGTTGAATCAGCAAATAAAGCACGTCCTAAATTGTTTCTCTTGCCTGTAGTTACAAGACCTGCTTTTCTGGCAATGCCGATCATCGTACCTGTTGCATCAAAAATTTCAACTAATACAAAAACGAGAATAACATTAAAGAGTCCCTTGTCAAATGCCCCAATAATATCTAACTGTAAGAAAGTAGGTGCAATAGAAGGGGGGAGTGATAAAATAGATTCAGGTGTCGCGGTATGGCCTGTTAAGATGGATAATAGCGTAATACTTAAAATCCCAATAAGAATAGCCCCTTTAATCTGTAATACATCAAGTACCACAATAATGAAAAAACCTAAAAAAGCAAAAAGAACAGGTGCGGATTTTAAATCACCGTGACTTGTAAGGGTGGCAGGATTATCAACAACGATACCAGCAGACTGTAAGCCAATAAAGGCTAAAAATAGACCAATACCTGCTACTATAGCAGAGCGAAGGGAGTGTGGAATACCATCAATTAACCACTTACGTATGCCTGTGATGGTTAGGATTAAGAAAATAATACCTGAAATAAAAACAGCCCCTAATGCTTGTTGCCATGAATAACCCATTGAACCGACTGCAACAAAAGCAAAAAAAGCATTAAGCCCCATTCCCGGTGCCATACCGATTGGCCAATTTGCTACAAATGCCATAATAAATGAGCCTACAGCAGCTGCTAGACATGTTGCAACAAAAATAGAGCCAGTATCCATTCCTGTGGTTTCTAGGATTTTAGGATTAACAAAAATAATATAAGCCATTGTTAAGAAAGTGGTTAACCCAGCTAATACTTCAGTACGAATATCGGTGCCGTTTTCTCGTAGCTTAAATAGAGGTTCTAGCATAGAAATGTTCCAATAGGTTACATGATAAAGTGTATATTTTAGTCTTGCCTAAGTTGCTTATGGGATTTATTCCAACTTACTGATAAAATTATAGGGAATAAAAAAGCGGTTCGTCTTAAATTTACAACAAATGGCTATAGAAAATAATGAAAATTTTAGGAATAGAAAGTTCTTGTGATGAAACAGGTGTCGCTATTGTCGATACTGAACAGGGGTTATTGGCACACGCTTTGCATACGCAAATTGCCATGCATCAGGCTTATGGAGGGGTAGTACCCGAATTGGCTTCTCGGGATCATATTCGCCGTGTTATTCCTTTAATTGAAACGGTGATAAAAGAGGCTAATCTTTCTTTGCAAGACATTGATGCTGTTGCTTATACTGCAGGGCCTGGTTTAGCAGGTGCTTTATTAGTAGGGGCTTCTGTTGCACAGGCATTTGCATGGAGTCATAACTTACCAGCTATTCCTATTCACCACTTAGAAGGGCATTTGCTTTCACCTATGTTGGCGGATCCTGTCCCTGCGTTTCCCTTTATTGCTTTATTGGTATCGGGTGGACATACACAAATTATGCGAGTAGATGGGGTAGGGCAATATGAATTATTAGGAGAAACCTTAGATGATGCTGCTGGCGAGGCTTTTGATAAATCAGCTAAATTGTTAGGATTGCCCTATCCTGGTGGCCCTCATCTTTCTAAGTTAGCTGAACAAGGGGATGAAACCGTTTATTCATTACCTCGTCCTATGAAATATAGTCATGATTTAGATTTTAGCTTTAGTGGGCTTAAAACGGCAGTCCTCACTACTTTACATAAAATAGAAGCAGAAAAGGGTACTCTTGATACTCAAGATAAAGCTAATCTTGCGGCTAGTGTACAAGCTGCTATTGTAGATGTGCTGGGTTTTAAAGCAATTAAAGCCGTTAAAGAGAGTGGATTAAAAAGATTAGTCGTGGCTGGCGGTGTTGGTGCTAATAAACAACTGCGCGCATTTTTAACGGCTGAAATGCAAAAAAGAGGTGGAACGGTATATTTTCCTCCACTTCAACTTTGTACGGATAATGGTGCAATGATTGCTCATGCCACGAGTGAAAGGGTGAAAGCAGGCTTAGTTGATTTGTCTCACAAACAATATGGGGAAAGTGTGCGACCACGTTGGGCTTTAGATGAGTTATAGGTACTGTATTAGTTTTAATATAAGTTAAAATTTCAGTGAGATACCTTCATAAGAAAAGCACTTTTAATTGAAAAAGTGCTTTTTGTGATGGTAGTATTGAGTGTTATTATTTTATTAAAATCTAACACCATTAATGCCGTTTTTTACGAGAAGCTTTTTTTGAAAATTTAGCTTCTTTACCGGTTAATAATTTAGTGATATTCGCTTTATGACGATAAATAAGCAAAATAGAAATCACCAGAATGGCTATAAATAGACTTCCATCGAATCGGTAATCTTGTAGTGATAGAATAAGATATAAAAAAGGTGCATTTAAAGCAGCAATAAGTGCGGCTAGTGATGAATAACGGAATAATAAAAAAACCAGTAACCAGATAATAATAAGAATAATTGCTAGCATAGGGTCGCAGGCTAATAATACACCAATAGCAGTTGCTACGCCTTTACCACCTTTAAATGAAAGGAAAATAGAATAGAGATGACCTAAAAATACAGCGACTGCAACAATAGCAATGCTAGTTGTATGGTGAGGGAAATATTGTTGTGCTAAATAAACGGCGATCCATCCTTTAAAAGCATCACCAAATAGTGTCAATGCCGCTGCAATTTTATGGCCACTTCTGAGTACATTAGTTGCACCAGGATTACCTGAACCAAATTGTCTAGGGTCTTGTAATTTAAATAAACGACTCGTAATGATTGCAAAAGGAATTGAACCAATAAGGTAGGCAATAATGGCAGCAATAATTGTATAAAGCACAAGCATAATAAATATCGAATGAATGGTTAAGGTAAGCAATGATCCTTTGATGAAACATTGATTACCAAGAAAAATTAGTTCATTATATACAGATAAAATAGGGATAGGGTCTATCGTTAAAAATCCTTTTAAAATAAAGTGAATAAAGCGAGAGGATTGTTTTAGATAAGTTGATTTTTTTGCTTTTAGTTTTTGATAAAAAACAGGTAAAATACGGTCTGTTTTGTTTTACTCGTCTAATGAGAGATAAAAATATTTTTGATGTTTTTAGTGTTTATAGTATATTGAGTAAAATTCTGAAAATGGTGATAAATAATGAAAAAGCGTATTTTACTTTCTAATGATGATGGTTATAATGCACTGGGGTTAGAACGCTTATACCATGCTTTGTCAGCGTGGGCAGATGTAACGGTGTTTGCACCCGAAGTTAATCATAGTGGTGCGTCTAATTCGTTAAGTGTTAATCGTCCCCTGTCGGTTAAACAAGCGCCTAATGGTTTTTTTTATGTTAATGGTACACCAAGTGATTGTATCCATGTTGCCTTAACAGGTATATTGGATTTTAAACCTGATTTAGTGGTTTCTGGTATTAATAATGGGGCTAATTTAGGAGAGGATACTTTATATTCTGGTACGGTAGCAGCAGCGACAGAGGGATTTTTATTTGGCTATTCAGCGATTGCTTTTTCTTTAACTGAACGTAATTGGACCAATCTTGATGCTGCTGTTGATATTGCTAATCAAATTGTTCAACACCAAATAGCCTATCCTCATCCTTCTAGTACCTTGTTAAATGTGAATATTCCTCCCTTACCACACCATAATTTTGAAGATATTCAAATTACGCGTTTAGGGCGCCGTCATCCTAGTCAAGATGTTATTAAAAGTCAAAACCCTCATGGCGATCCTATTTACTGGATAGGGCCTGTTGGTGAAATTTTGGATACAAGTGAAGATACGGATTTTATGGCAATCAAAAGAGGGCAAGTGTCTATTACGCCATTACAGCTAGACCTAACACATTTTGAGCTATTGTCTCAGACCAAGCAGTGGATTAAACAATAATGCATAAAAAGGCTAAAATTACGCTAAGTAATAGTAATGCAAGGCTTATACAGGGAAGTAACACCGTTCGTTTTGCTAAGCCAACACTATCTTCTCGAGGTGTTAGTCTTTCTCAAAATAGTAATACAAAGGTGAGAAAAGGAAACCAACAAGAGGGTAGTCCTATTGGTCGTGCTTTACGCGAGCAGGTGCAAAGTGCTTTATTACAAAATAAAGGACTTAATTCAGACCAATTGCGGATTAATATGGTGCATCGGTTAAAGGTGGTCAATGGGATTACAGATGATAGAGTGCTTAAAGCCTTAATGCAAATAAAGCGACATCATTTTATGGATCAAGGAACAGCTGTACGAGCCTATGAAGATGAAGCATTGCCTATTGGTTTTGGTCAAACTATTTCTATGCCATCTGTTGTAGCAAGAATGATTTCTTTACTAATTGAGCAACGTACTGCAAAAAAAGTATTGGAAATCGGCACGGGTTGTGGCTATCAAGCAGCTGTTCTAGCTTGTATTTTCCAAGAAGTGTATTCAATTGAACGAATTGAGGGTTTATATCACTTAGCTAAGCAGAATATTGCTAAAATGATAGGTTTACCGCCTATCCATTCTATATTAGGCGATGGAATGCAAGGTTTACCAACTCATGCCCCTTTTGATGCTATCATTATTGCAGCAGCTGGTTTGAAAATTCCACAAGCCTTATTATCACAGCTTGCTATTGGTGGGCGATTAATAGCACCAGAAGGAACGTCTCAACAACGATTAGTATTGATTGAACGTAAAGGTCAGCAAGATTGGGTACGTACAGAATTGGAAGAAACACGTTTTGTACCGCTCTTAGCAGGGGTACAACGTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047165|332486:339467|337857_338607_+|WP_159990479.1|DBSCAN-SWA MKKRILLSNDDGYNALGLERLYHALSAWADVTVFAPEVNHSGASNSLSVNRPLSVKQAPNGFFYVNGTPSDCIHVALTGILDFKPDLVVSGINNGANLGEDTLYSGTVAAATEGFLFGYSAIAFSLTERNWTNLDAAVDIANQIVQHQIAYPHPSSTLLNVNIPPLPHHNFEDIQITRLGRRHPSQDVIKSQNPHGDPIYWIGPVGEILDTSEDTDFMAIKRGQVSITPLQLDLTHFELLSQTKQWIKQ >NZ_CP047165|332486:339467|334314_335604_-|WP_159990476.1|DBSCAN-SWA MLEPLFKLRENGTDIRTEVLAGLTTFLTMAYIIFVNPKILETTGMDTGSIFVATCLAAAVGSFIMAFVANWPIGMAPGMGLNAFFAFVAVGSMGYSWQQALGAVFISGIIFLILTITGIRKWLIDGIPHSLRSAIVAGIGLFLAFIGLQSAGIVVDNPATLTSHGDLKSAPVLFAFLGFFIIVVLDVLQIKGAILIGILSITLLSILTGHTATPESILSLPPSIAPTFLQLDIIGAFDKGLFNVILVFVLVEIFDATGTMIGIARKAGLVTTGKRNNLGRALFADSTAILSGSLIGTSSTTAYVESIAGVQAGGRTGLTAFVIGVLFLLSLLFSPVAGIVPPYATAPALVYVAILMLRELTDINWKDMTDVVPAAITVIFTPFTYSIAEGIAFGFISYVILKTCTGRIKEIHPATVLVASLFIIRFALV >NZ_CP047165|332486:339467|333678_334047_-|WP_159990475.1|DBSCAN-SWA MTVKVLNENNLAETITNNDIVIIDFWAPWCGPCRQFAPVFEAAAEKHSDITFAKVNTEEEQGLASSFNIRSIPTLMIFREKVLLVNQSGALPPAALDDLIAQVKAVDMEKIHAEIAANQAAK >NZ_CP047165|332486:339467|332486_332768_+|WP_159990474.1|DBSCAN-SWA MNKTELVEKIAESAEISKAAAARALDATIETVKKTLKKGDTVTLVGFGTFRVTERQARTGRNPRTGEEIKIKKAKVPKFVPGKALKDAVQSKR >NZ_CP047165|332486:339467|336912_337548_-|WP_159990478.1|DBSCAN-SWA MLVLYTIIAAIIAYLIGSIPFAIITSRLFKLQDPRQFGSGNPGATNVLRSGHKIAAALTLFGDAFKGWIAVYLAQQYFPHHTTSIAIVAVAVFLGHLYSIFLSFKGGKGVATAIGVLLACDPMLAIILIIIWLLVFLLFRYSSLAALIAALNAPFLYLILSLQDYRFDGSLFIAILVISILLIYRHKANITKLLTGKEAKFSKKASRKKRH >NZ_CP047165|332486:339467|335750_336782_+|WP_159990477.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKILGIESSCDETGVAIVDTEQGLLAHALHTQIAMHQAYGGVVPELASRDHIRRVIPLIETVIKEANLSLQDIDAVAYTAGPGLAGALLVGASVAQAFAWSHNLPAIPIHHLEGHLLSPMLADPVPAFPFIALLVSGGHTQIMRVDGVGQYELLGETLDDAAGEAFDKSAKLLGLPYPGGPHLSKLAEQGDETVYSLPRPMKYSHDLDFSFSGLKTAVLTTLHKIEAEKGTLDTQDKANLAASVQAAIVDVLGFKAIKAVKESGLKRLVVAGGVGANKQLRAFLTAEMQKRGGTVYFPPLQLCTDNGAMIAHATSERVKAGLVDLSHKQYGESVRPRWALDEL >NZ_CP047165|332486:339467|338606_339467_+|WP_159990480.1|DBSCAN-SWA MHKKAKITLSNSNARLIQGSNTVRFAKPTLSSRGVSLSQNSNTKVRKGNQQEGSPIGRALREQVQSALLQNKGLNSDQLRINMVHRLKVVNGITDDRVLKALMQIKRHHFMDQGTAVRAYEDEALPIGFGQTISMPSVVARMISLLIEQRTAKKVLEIGTGCGYQAAVLACIFQEVYSIERIEGLYHLAKQNIAKMIGLPPIHSILGDGMQGLPTHAPFDAIIIAAAGLKIPQALLSQLAIGGRLIAPEGTSQQRLVLIERKGQQDWVRTELEETRFVPLLAGVQR |
7 | Moraxella_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
712064 : 811110
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047165|712064:811110|DBSCAN-SWA CTCAAGCGTTGTTTACACTATTTGCAAAATAAATTTCTAAATATTCGTAAGGTGTCAGTGTCCGTTTATGACCAAGTTGATCTTGGTAAACAAGAGCACTATGTGGTTTTACGGTGTTGTAGAAATTAATAAATCGGGTAAGCTCCTGTTTTCTATGCTGGCTATCGGTAAATTCATGTTTATCATGCCACATTTGCATTAAGGTTCTAATCACCCTTTCTGCTTTTCCATTGGTTTTAGGATTGGCGACTTTAGTAAATTTTTGATTGATATGATGTTGATAACAGGCTTTACCAAACTCATGTTCTTTTGTTCCTTTGTATTCTGTTCCATTATCCGAGTAAATAACCTCTATGGTATAAGGACAAGGGTCTATCAGATGTTGGGTTAAGAACGTAGCTGCGCTAAAGGCGGTTTTATCTGGCATAATAGCCGCATATAATTCACGCGAGTAATCATCGATAGCCACAAACAGATATTCCCTTTGACTTTGCGTGTGTTGTCCTTTCAGTAAAGGCAAGCGTTTTGTATCGACATGAACCATCTCGCCAGGATAGGATTTATTATAGCGTTTGGCTTGTTTTTTTAATCGTTCTTGGATGGACTTTTCTACTTTGGCTAAGCGTTTAATCCCAAATTTAGCCTGTCTAAACCGATTATTGATACTGGTCTGAGGTTTTAATAATCGACCACGAGCGAGTTTGAGTATCTTATAGATGGTGGGGCGAGAAACCTTGTATTCTTTCGCTAAAGAAGTGACATTTTGTTTGTTTTGCGTGTAAGCTAGCCAAATCTCTTCTCTTTGGCGAGGTAATAAGCGAGTGTTTTTGTGTATATTCATCGTACTATTATCTTAAAATAATGTAAACAACGCTAGTTTATTCTACAATTAAAGCCTTTTGCATTTTCATATCCTCTCCAATGAGCTAAATCATATCCTTTAGGTAGACGCATTATTTTTTGCTTACCAAATTTTGTTTTATATTGTAATACACGTCTATATTCATTCTTTAACCAACCTCTTATAAATGATGGTTGTTTATCATCATTCATAATTTCTAATAATTTAATAGTTCTACTAGCATAGCTTCTTAACCCAAACAAATCCACCCAATCTAACGGATTTTGGACATAAAAATACGGCGTGCTACCTCCCTCCAATCCAATCGGATCGGAATTTAGGTAACAAGCCGTTTCAGGATCATAGTATCTAAACCGATTATACGTCAACCCACTTTCTTTATCGTAATATTACCCTGCAAACAACAGATTAGGATCTAGTTGTAAGTTTCGGTTGTAATCGCTAAACGATAATCCCCACAGGCTCTTATTCTGTGCTCTCCGACTTAATTTATATCAATTATTTTTAGTCTTCGATAAATGTTAATAATTCATTAGTATTATCAAGATCTATTACAGACTGTTTAACTTTATTGAGTGCTGAATGTATATCGTATTTTTCAGCGTCCTCTCTTAGAATATCGATAAGTCCTAACTCTACATAATTTAGAAAATAAACAGCTTGTTCTTTAATTTTAGGGATTTTCTTATAGGGTATATTTAAATAAAAATCAATTTCTTGATCTTTTCGATACATTGTTGGACCAGTTACTGTAAATTCATCATTATGACAACTAATATTTAATACTAATGTATAGTCTGTTGTATCTGTTTTCATTCCTTTTCTAAAAGGAATTTTTTCAATATAAAGATTTTTATTTAATTCATTAGTCATAAATATATTTAATTTATAGTGAAAATTAAAAAACATTCCTGGTTCTAGATATACTGTTCTAAAATAAATTTCCTTCATAATTTATCCCTTACATTTTTTTACAACTGGCTCTAGGCTTATTTTTGGTTTATAACTTTTTTGATTGCCTAAAGGTATTTCTCCATATTTACTATAAAAGTTATTTAATTTATTAGTTTCCATCTGTTTTGCTAATTCTGTTGTTTTTATTCCTTTTTCAATTACTTTTTGCTCTACATTTTGTTTCCCATAAATATTTCCTAATTTTCTCACTTGTTGATGTAATCTTGTAGGTAATCCACTAGATTTTGTTACTCGATTTAAATCGGTTTTTCCATATTTATATAATTCCCCATTAACCTTGATTTCGTAAACTCCAAAATTTCCTTTCGAGTTATTGCTATTTAAATGTAAGCCGAGCGGATCTAACCAATCTATTGGATTAAACACATAACCATAAGGTATTTCCCCTCCCAATAATCCTATCGGGTCTGAACTGAGGTAATTCCCACTTTCAGGATCGTAATATCTAAACCTGTTATACGCTAACCCACTTTCTGTATCGAGCCATTGCCCGGCAAACAACATTTGTGGGTCAAGTGGGGTTGTTTTACGGTAATCATTTGGGAAGAGTAAACCCCATAAACTATGCTTTTCTTTACGCCATAGAGTTCTACCTTGCGGATTAAGAAGAGCAAGCACTTGTCCATTCGGTTGGCAGATGGCGTAGCCGGTTTCCTGCTTCCATTCTACAATATTACCATCAATCGTTTGTTTAAGTTGTTGATAGTGGTCTTGTTGAGCAATGAGCTCAAAGCCATTAAAAATACTGTGCCGTTCGCTAACGAGTTCATCATTTTTGAAAGTTCGAGTGAAAGCAAGCTGGTCACCTTCCCACAGGTATTCAATGCGTAGGTGCTGTTGCGGACATTCTTTTGAAATCCGTCTGCCTAAGGCATCGTATTTATAGTGCCAGACTTCACCTTTGGGGGTGGTAATGCCTATTAGTTCGTTTTTGCCGTTCCAGCGGTAATCGGTTTCTTGTTTTCTAAAACCATCCCGTTTTTCAACTTTAGTGACCAACCGCCCGGCTTTGTCGTATTCGTAGTAGTTTTCGTTTAAGCGGTGGAGTTTATGCCCTTTTTGGTAAATATCCTGATGTTGGATGATTTGCCGTTGTGCGTGATATTCAGGGTGGTGAGGGTTTTGAATTAAGCCGTAAGTTTCACTGCCCACATAACGTTGGATGAGGTAGCCACATTCATCATAGGCATAGCGTTCTTGTTCACGGTTTTGATTGTGAACGGCGGTGATTTGGTTATTTCGGTTGAGGGTGAAAAAGTGCTGTTCGCCTTTATCCTTGGTTTCAAGGGTGTTCAGTACCTTGTCATAGCGGTAATGTTGATTGACCTCAGCAAAACTTGGGGTATCAATCCCGGTGGCTCGCAGTTCGTCTTTGTCAAAAAACTGTGTCGGCTCCCAACCTGCCCGTTGTTAAATGAGGCAATCCATTGCATCATAGCATTGTTTGAGGATAAACCCTTGTGGGGAAGTGCGGTCGGTTTCATTGCCGTTTTGGTCGTATTGGAAAAACAGTTGGTTTTTTTGACCGCTTTTTGAGGGAGAAATATATTTTTAAAGAGCAAAATTTATTTTTTGCTTTTGGAATAAAATTCCCAGTATTTTTTATCAAACTCCTTGAAAGCCCGTTTTTTTCCTCGATCATAAGCAATGGAAAAATATTTCATGGCTTCATCATATTCTTCTAGTTCATAACAAACTCGACCTAGTTGAATATATTCATATGAAGAGTAGGGGCTTTTAGCTCTACTTGTGAGCATACCTTTTTCAGCCCACAACTTAGCTTTTGTATAATCATCCAAATCCACTAGTTCTTCAAATATGCAGTATATAATTAATTCTGCAAGTTGTTCAGGTTGATTAAATTTGGGTTCTGGCAATTTTTCCCAATATTCAATGAAATTTTTTAATCGATCGTTAGAGTTCTCAATATTTCCTATTTCTTGCAGTTTAGATACAAATTTTTTAACTTCTTCAGTGGTCATTATAGCCATTTTTAACTCCTATTATTTTAGTGCTGGTAAATATGTTTCTCTGATTTTTGCACCTTCAGAACAGTTAATAGAGAAATATTCAAGTTCATAATATCTTTAGTCTTCCAATGGATTATAAATATAAAAATACAGTACACTACCACCGCCTAGTCCAATCGTATCGGAATTTAGGTAACAAGCCGTTTCAGGATCATAGCACCCAAAACAGCTATACGCTAAGCCGTTTTCTTAATTTTCTAAGTTTAAATTACCTGATTTCCATTCACTTAAAATAGTCTCTGCACCAAGTCCAAATATATCTGAAGTATTAGCTATTTCTGCCAATTTTTCTTGGCTAGTTTCTGAAAAATTTTTACTAAATAATAAATAACTTGCAGCCCAATTTATGACGGAGTTTGACTTGCTATGTAACAATACTTCTAAACTATCTATTTCATCCATAGCAAGAAGATAATTTTTAGCACTCACTATTTTCTTATAGCTACTGTTAGCTAATTTATAGTTTCCTTCTAAAGTTGCTTTTCCATGTATATCAGAATACTTTTCAAAATACTGAATAGCTTGAGCTACATTATTAAACTTCATATTCCTACTCCTAAAATTTCCAACCAAATCGTTCAAGAGCGTTAATGCCGTATTGATACTGTTCATTAAAATTTTTATTTCTCAACCAGTCTAACTCTCCTAGATGATCTACGACGTATAGATGAATAAAATCCAGAAATTTGTAAATGAATAGTTCCCTTACCGTTTGGTAATTTTATCAAGTTGTTTATATTGTTGATACTTAATTATTTTTATATATGTAATGAGATACTTTATCCTCGATAACCTTAATTAATTCATTTATATTTCTAGTTTTAAATTCAAAAATTGGTTTTTCCCAATTAAAATCTTTAATAATAGAAAGAACAAATCTTCCATTTTTATCAAACGATGGATACCAACCGATGTCAATCAAATAATTATTAAATGAAGCTTGATATAAATCTTCTTTTAAATTGTTAATTTGTTCTTCTATTGTTTTTTTTTCATCAAAAATAAAATCATTAAAAGTTACTTTCACAGAATTTGGAATGAATAAATTATTTAAAGTTATCATTTTTTAACCTCAAAAACTTATTTTTAGATATTGAATTATAATACCAATAAGGCAAAGATCTCCCTTTAAT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101 | Burkholderia_phage(10.53%) | transposase,protease,terminase,capsid,portal,head,holin,integrase,tail | attL 735168:735190|attR 811131:811153 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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