Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031989 | Acinetobacter haemolyticus strain 5227 plasmid pAhaem5227b, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP031988 | Acinetobacter haemolyticus strain 5227 chromosome, complete genome | 6 crisprs | csa3,RT,cas3,DEDDh,WYL | 7 | 7 | 24 | 0 |
NZ_CP031990 | Acinetobacter haemolyticus strain 5227 plasmid pAhaem5227a, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031988_1 | 72093-72229 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031988_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP031988_1
>1.1|72119|30|NZ_CP031988|PILER-CR ACTGTAACTAATTGATATATAATTCATGAG >1.2|72175|29|NZ_CP031988|PILER-CR ATGAACTTTATTGCACCTCTTACATTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031988_1
The CRISPR arrays of NZ_CP031988_1 >merge|NZ_CP031988|1|72093-72229|PILER-CR GAACAATAAAGTATCATACTAAAACTACTGTAACTAATTGATATATAATTCATGAGGAACAATAAAGTTTCATACTAAAGATATGAACTTTATTGCACCTCTTACATTTAAGAACAATAAAGTATCATACTAAAATT >NZ_CP031988|1|1|72093-72229|PILER-CR GAACAATAAAGTATCATACTAAAACT ACTGTAACTAATTGATATATAATTCATGAG GAACAATAAAGTTTCATACTAAAGAT ATGAACTTTATTGCACCTCTTACATTTAA GAACAATAAAGTATCATACTAAAATT
>NZ_CP031988.1|WP_005088791.1|71403_72042_+|YitT-family-protein MNTEQNISLVSAVTPVVEQHSKIEDALAMLIGTFILSFAMILLKQAGIMTGGTAGLSLLIHYITDVQFGILFFLINIPFYYFAYKKMGLALVVKTFIAVALLAGFTEIIPHFVQLSTVHPIYATVFANVLMGVSFLILFRHRSSLGGINLLVLYLQERFQLPAGKVQMGIDVAILLTSLFFVEWHLILISILGVVILNSIILLNHKATRYVA >NZ_CP031988.1|WP_017396433.1|70715_71180_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MIEELDEFDRKIIHHLQLNGRLANQELAELVGLSTSQCSRRRIQLEQKKIITGYYAQVALSADPTPIMGIIEVKLQNYNDATHDRFVDFLLHEPAVKDIHKLTGSYDFALKVAVRNLDDMVKLIGTLSSSDFGVSNLNTSIVLEKLKENGIATK >NZ_CP031988.1|WP_005088793.1|69967_70627_+|bifunctional-nicotinamidase/pyrazinamidase MSHQTSKLLKNAALIVVDVQNGFTPGGNLAVADADQIIPLINRLAPQFEHVVLTQDWHPDQHISFAENHENKQPFETIELSYGTQVLWPKHCVQGTHDAEFHSELQIPTAQLIIRKGIHQHIDSYSAFMEADRQTPTGLNGYLKEHQIDTVYIVGIATDFCVAWTAIDAADLGFKTYVIEDACKAIDLNGSLSEAWQQMLAKGVIRIQSGPIFNETRDN >NZ_CP031988.1|WP_005087340.1|68801_69695_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MTQLAQNIQGSIVALVTPMFEDGRVDWKSLEKLVEWHIQQGTHSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEVIRVANKRIPIIAGTGANSTHEAIELTKAAKELGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVDIPQILYNVPGRTGVDMQNETVIRLADVKNIVGIKDATGDVPRGKALIDGLNGKIAVYSGDDETAWELILLGAKGNISVTANVAPKQMSDVCEAALAGDKEKAQSLNQQIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGYIGTGVRLPLTTLAEQYREPLRADLKVAGII >NZ_CP031988.1|WP_005087342.1|68183_68786_-|hypothetical-protein MQLRVGIVLVISALSLAGCGRFALNNHSLDYKKAEALEPLKFPEGATVRPFTPLYPAPTVDPLAIQHAPTFENKTGNRYALPRPESMQTTASNPDDNVVTLGRPQLVMDGNRNPLLKVEGPTAEAWQYTFATLNSLNYKVISQANNGYEATIQVDNQTYVLKLSAVGSNNTIALFKPDATFADQAIATEVLAQIYQNWPA >NZ_CP031988.1|WP_004637244.1|67428_68148_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MLKQTLLYTGKAKSVYETDNADHLILVFRDDASAFNGEKIEQLDRKGKVNNRFNAFIMEKLAEAGIETHFEKLLSPTEVLVKKLQMIPVECVIRNYAAGSLCRRLGVEEGKELTPPTFELFFKDDALGDPMVNESQAIALGWATADQLEKMKELTYQVNDVLKALFDAGNMILVDFKLEFGVFHDRIVLGDEFSPDGCRLWDKDTKKKLDKDRFRQGLGGVVEAYEEVAARLGINLDDL >NZ_CP031988.1|WP_118902036.1|65640_67380_+|amidohydrolase MTFKNLNKLTLAMIIGFTLSGCVTSPNETVSAEKLFYGGPILTMEGMTPEYVEALLVKDGKIVYAGPKKQAESLIEARAQYIDLKNRTLLPSFIDAHSHVNMVGFHQMVANLYPAPDGQVSDIDSLVQVLTQWKKQNPKVIETMGGWILGNGYDDAQLSEQRHPTATDLDRVSKDQPVMVLHQSGHLASVNHKALALSKIDQNTTNPAGGVIRREANSNVPNGVLEESALFTAIGSIFKDVPAEVMFEIARKGLDAYVKNGFTTVQEGRADQGTTEMWQALAKQNQLPIDVVSYPDITTSQDYMLKQGSSLKYHQHFRIGGVKISLDGSPQGKTAWLTQAYVIPPEGKDQNYKGYPAIKDDQQVNQYINLAFEQGWQVLAHANGDAAIDQFIGAVKDATAKQGKADRRSVLIHSQTIRDDQLDQLKALDIIPSFFSLHTYYWGDWHRQQTLGETRAAHISPTATALKKNLIFTEHHDAPVVPPHSMMMIDATVNRLTRTNYVLGKNERVSPYFALKSITDWAAYQYFEEQSKGTLTKGKLADLVILEHNPLTVPNRNIKDIQILATYKEGQLIYTNSKN >NZ_CP031988.1|WP_118902039.1|64579_65461_+|aromatic-amino-acid-DMT-transporter-YddG MNSKKATLIGLVAILLWSLIVALIKDVSTHFGAVGGAALIYTLASIFLFFSVGWSSLRTFPRTYLIWGSFLFVAYEICLSLSIGYSQNNRQAIEVGMVNYLWPTFTMVAAILFNQQKANVLIIPGFAISLLGIGWVLGGEQGFDLPNMWGNIQSNPLSYGLAFVGTLLWAAYCTLTARIAQGANGITLFFVLVAVVLWIKYFLMGGGGLNFDWSSSVSLVMAAAAMGFGYAAWNVGILHGNVTLLAGASYFIPVLSAFFAALILSTPLGLSFWYGAFMVCVGSILCWFSTRAS >NZ_CP031988.1|WP_035374997.1|63302_64580_+|replication-associated-recombination-protein-A MSDTHIPLPERLRPRDLSEIIGQDHLLGDNAPLRQMIDQGHLPSIIFWGPPGVGKTTIALLLAQAVDRPFISLSALNTGVKELREVIAESGDLLTPVVFIDEIHRFNKSQQDALLNAVEKGKITLIGATTENPSFEVNSALLSRCQVYTLNSLDAEAIQTLLNKAIQTDKFLKERFIQIEEYDALIQFAAGDARKALNLIDLIASTFEADVENVVTNAIVVKVAQQNIARYDKSGEQHYDLVSAFIKSIRGSDPDATLYWMARMLKGGEDPVFIARRMLIAASEDIGNSNPNALLLAGECFRSVQAVGMPEARIILGQCAVYLATSPKSNSTYLAINRALELAEKTANLPVPLHLRNAPTKLMKQQGYGVDYLYPHNYPEHFVLQAYLPPELQGTKLYERALNKREVEAERLQQRRWHQEQQQQQ >NZ_CP031988.1|WP_118902042.1|62030_63218_+|class-C-beta-lactamase MTKPNDFSRTFKKLLMVAGLISFSSALWAENLTEQQVKAVIDQQFKPLLAQYKVPGMAVAVTLNGKHYFVNYGLASKQSQQAVNNKTLFELGSVSKVFNATLAGYAQAQGQLSFSDHPAKYFPELKNTAVNQATLLNLGTYNAGGFPLQFPDHVVKQQDMIRYFQEWQSKTKIGAARQYSNPSIGLMGYVTALAMKKPYVELIEQTLFPQLGMTQSFINVPKPYMSQYAWGYKADQAMRVSPGMFDAEAYGVKSSSADMLKFLDAQINVQQLQQPIRKAIEHTHVGYFELGAMTQGLGWEQYAYPVKLETLLEGNSSKMALESHAITPIKQPKIASPATYFNKTGATNGFGAYAAFIPQQKIGMVMLANTNFPNEARITATYQAMQQILKQNAAQ >NZ_CP031988.1|WP_151800532.1|72250_74101_-|hypothetical-protein MKLLDRITQQIINSEELLHSDAIIPQRYILAEDWKYTASYIIPKGTILFAEGSSIRFETTQNISCVEVELSETVQQSIILIAHQVRQILEQQDFSQLPNPLIPSQVFDSTAQLTELESMLDTILEAGHLHQIAHRPRMDMRYDEELVDISRAKKIANNAHRHLAIHSETWQQRTLVGIHPKKILARLSEDEIAIYENKVFVSLLDKLRYFLASRLNELQQQQQNLTDALHLGDASITFYKLRDSLCQLWAENLTDEQSESVLEQLESTIDKNKGLLERIKGLQSFGLYVQIPVNLKRIPDQLHKTNILTHDQHYRHLSRLWSELYSQQRRFPNIEEKLESFIKFQHDYNQYVLLIVLRAFLNLKFSIIEDESDGFIFSRDTLKFTLKFNHLTKMFDIFNQHIDTISLKVIAIANDLTQDLISKLRKDIVIFSPDKKLKERVFIDQNIIWANPFNFRSIEHFTVLLLKWMYQPLLQAYSKNLNLGRIPQSVKTLLNQISALEQRENHYQLIDTLNSDELNQLKNICDKANTLHIYDEVVSHQNILLTFKKCPICTSDTHFEPRPTNQTFIAQCLDPQCAVQYKLVTNKEGVKTFSLDSNEDNLVEAGRWKLNFQLSE >NZ_CP031988.1|WP_151800533.1|74097_76572_-|AAA-family-ATPase MAKKPKTQNRYGSPNIPTPSTTQEKPAISPLMQQVTGEIFNKEQEALLAKEDILREEILVIIERCKQVQEDLQLEKQQYEEKNRTLGEQQTTLNHREHDLIQKEDQLNSDIENITIQQQNLAQDRKQLAIDKQTFSKDMIALKEQHNTLAEQKQNAELGFAVEKQRALDEKRQALDELQAESLKKLSNDSQRLAQKEADLFKREQKLIQDESEAKAGFIELKHELMDAWQQEKHAQEQVLFQNRKALEQKATEIQLAQEALNLEQAQFDAQVTAMRNSIRHDFSVQIAKLKASNESLEQSHNQALDEIEQLTSKLQQYADLERQLSGQGVLSIQEELNTLRVKNRDLKAQLSERYEEGLQEENERLEQQLSDVEEQLFDLRQQNNQLNHEINNNRLSVLDKQHLQQEKRVLEQHKRVLDTSISQLQTQIDDLVEKQQGELPFKALSEMDHLYRDEARSLQSVPELKQFAQIMQANIAKQSNPDGKVIEFSIKDIRLFIAGLAMSKLHLLQGISGTGKTTLARAFAKSINNVSSEDQEKLYCEIVRVQAGWRDREDLLGHFNAFEKRFYTKEALQALYRAQQPKFADTLQIILLDEMNLSQPEQYFADFLSLMETPDRAEINLLDSANKKTPDLFVDHRAIKIPQNVWFIGTANHDETTKEFADKTYDRAHVMEVKRSTEVVDIANANPEQYSYSSLMQRFKQAQQRYKPVVDQIFKQLKESALEKSLHSIGVSWGNRLERQAQVFIPVYIAMGGTTSEALDHLLATKVFRRGKVTGRYDTRDEKIQTILDDLQHIWKELGLSNDLPEISWEILEKDIERLKGNL >NZ_CP031988.1|WP_151800534.1|76578_78081_-|hypothetical-protein MDKFSNQFLSYYDQLPRGEASVFLPVWIWKIFAPVATEQRKINFFQHTILEFLHIDQQDRLTIANWMGVDLELVDLIIDTELEPNGWIQVNHDRLNLTESGLRLLEDEIEQQTDLQPYYLIQDAITGKLWHRLIPNKLYPLQTTEQDGKIQILGSRDSGRYITPFMVEPKNIFIPKAPSHNQILQTIKHHNWAVRGQNVRSHDEQRLYLDQQNLKNYEFYDQSPEAFYILSHIDHNQDSAHICQLQDPCHISQFDDWIQNLHIEIATKHKPFSDKVKRSLGQNIDENETIDEFEERLLQEISFELAIDFPYAHKITNLEKHLSRLLARKKQLEEKGNYYDIDDLINQCQKALEACFKQMLKTWQHKHADTTPKNMRREAIKTALILRSGQYFDERLLEQFCTVNASHVFSANGFSAGRFPNIGVSLKPLIVSSLLCIPDHQPHPLIQRSNAQQDLASLLKMCESRNDSTHDSANEIDIPTALALSQFTLDWVSFFTAIEA >NZ_CP031988.1|WP_151800535.1|78064_81424_-|AAA-family-ATPase MKLHEFKSNNLLVIEVTLTSALHISTLEPVTLFMEREQCYLEYKQQLCLVDIQSTSSISAAWAAERIRKENFFWTVIHQKNQTLCLSGFPVDSLLSLNMDIGVTESFANLLADDAKIASPQIDLAIDWLNEEFFINSDEQNFLAFSAFYQNQKSDIIHFIGRTYTLEISSIHDYWQITKLTQKRPNHNFRLVAIQGDIQFKNSSLAKKLDHITHKTALKEHTEQHGDYIETWKQYSHAQWNHAVQRANQISFLRYVRYEAANKVGHWYIYIEDIEKLREFENNWHKFDRKKDEQIQLGLEIPEWLDNQIEVEETGLKLDNKAWRAEIVRIEINKQRILLKYAKKGDDKPPLDKDNKKGFLFLSIYSIQVQRKRQQEALTRINNRQNPMSGLHSLLQGLSIESIHATKNFRTLKWKSVKTKNLFKGGRPTLKQQKAIELGLNSSDLTIIIGPPGTGKTQVITALQQRIAEESTTAIQRSVLLTSYQHDAVDNVVERSDVLGLAGLRIGGKTKSDDEDQANLDTIAKWAMPIQENIQQEIQSNNFIQLYRALEESCLKLRLGGTQQKAESKVAIQHILDRLEQDYTLSPSLDWKNWWQGFNSTPSYSSSSLTAHLYPLICSIRTTVNGFTDDGIKQCRAVLAALELIQQQHLNTKILSADERDLLKQFSQVDLKQIEQTDFLPLVSLKNTLIDRCLPDFRPLHLQTLLDEQHCQKLDQLLVEITHNARKSKTLGYLMVLDQYHTGLSATTGAIKDAMTHYTAVLAATCQQAAGNAMRDLKRMDSESIIFENVIVDEAARATPLDLMIPMAMAKRRLILVGDHRQLPHMLDDQIEKDLSQQKEWKTVQSEMLKQSLFQRLVENLQHLEQDKQQPQRVIMLDTQFRMHPRLGKFISENFYENHGLPPIKAGRPETDFIHNISGYATAVCTFKHISNEPQQRPNKGSGWHRPAEARWIAQEAKRILDEKPELSVGIISFYRGQVDTLFNEMSDAKIGLTVGDKIAEPYRILETGKNKGDERLRIGTVDAFQGKEFDVVFVSLVRTLPETFQIDELDDQKRDQRLTQAYGFLRIDNRLNVALSRQRSLLIVVGDRQLVQHNATLEAVPALPAFFTLCGGEHGQVL >NZ_CP031988.1|WP_151800536.1|81428_82850_-|protein-kinase MTTETDNAQIVTDDRATCYSLIKKIGEGGQGEVWTTNHTNLVVKLSNSYTNRALLINHVQQVQNVMRLPLRDLKIALPLSLLQSENGGGYVMELMDGLESLSTQIENIQKNGQQLDMFLYRDTGSFGRRLQILKQLAETLAKLHGRGLAFGDLSPNNIFVSQSVEHHQVWLIDADNIHPIEQSDQHHFYTKGYAAPELIRNETGTNCFTDAWSFAVIALQLLTHTHPFNHGIAVEDEDPDVVEVKSERGEFAWVFDIHDDSNELAITGGLPVIQMLNHRLFNLFQRCFGDSRIAENLCQRPSMAEWYYELHRATRLLITCQAEDCRSHFIINKNLICPFCNESLAPEQYVRFSLWLYDTDHLAQDNPWSSCSEQFFLNLNEEQKIYYEPYSYFDMQSLIPWCTLKLTEEGLRITPEHGETVTIQNTEGSKTFDISKSSLLKTNQKGNKHLLLSHSSLQIKENQPFAFFWRFTW >NZ_CP031988.1|WP_151800537.1|82854_83553_-|protein-phosphatase-2C-domain-containing-protein MKLTIYSATVTGPRHRQANQPNQDAILHRIWSQHWLMVVCDGLGSKPFAHIGSHLACKAVHDTLRDCNFTLPERDIAKAVYMTWLGYLKQSNIHPTDAATTCLFAWGNALGEVRLFQLGDGAIYYQTQTFGQVLVKSDHLFSNQTNALGVSKHWEDWGYKMICFTQPDHGVALMTDGISDDLVNEQDFLTTMLRTLKSKNFRQAKKYLQHELHHWQTPQHGDDKSIGLIYWK >NZ_CP031988.1|WP_151800538.1|83555_84233_-|VWA-domain-containing-protein MAMQQFAAATARPLPVIILADISGSMSVDGKIDALNAALKDMLHTFAQESRLNAEIQVAIITFGGNEAKIHIPLTPAWQMKDMDNLIAAGGTPMGSAFQLALEMIENKEILPKRAYQPTIVLVSDGIATDRWQESFTNLKNAERAQKASRMAMAIGRDADKNVLTEFVNDLEAPVFEAHHAKDIHRFFRAVSMSVNTRSSSNAPNQLHKIDLSKLPDDEFDLSNF >NZ_CP031988.1|WP_151800539.1|84255_84549_-|DUF4258-domain-containing-protein MSAYITFHAEMRMCQRGICADTLELILQFGRKIRSKGAIFYVIGKKEIQRYCQVEPKLRDMEGMQVLTTHEGTVITTYRNKNLRSIRPCARKHSHLH >NZ_CP031988.1|WP_004679142.1|84686_84881_-|hypothetical-protein MPKPDGKIIKEYPIKGNLKQFRFENATQFYCCKCEIVKKAKLIAVVGEDWEQLVCNACYGNINS >NZ_CP031988.1|WP_151800540.1|84968_86477_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MNNPMNSKTNKALFTWLGTNDLKDTQRTEEESYGAITSILKDSNIIFNHIVILSNRKNKEVEDYLVWLNSYIKNKRLSTKVDIHYCTKNTNPTDYNFIYQQSELVVKPFDNQYYELYFNITSGTSAMSATWLLLGTSIFKAHLIQSSKERGVEFVFLPYEISLQEKQDKKIQHLSEKSSYSEEFEDIPATSEKMQKVIKLADLIAPRNIPVIIQGETGTGKEVLAKAIHNASPRKNKPFIAVNCGAISEALIDSELFGHKQGSFTGANEDRKGHFESAHGGTLFLDELGELPLNAQVKLLRVLQQKEVVRLGESKPRKIDVRIIAATHRDLHDMVQKGTFREDLFYRLAIGLIYLPSLKERDKDIIYLAKKLITNINHELSDSTFVPKMLSHSALQYIQQQIWSGNVRELHNTLLRAAIWNATRHILEQEHIVEVMFKPTDTPINAYNFTPILPVNLPEKIIEIKRQYIEMALEQTKYNKLQAAKLVGLQNSQTLDNWLKNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031988_2 | 498112-498599 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031988_2
|
8 spacers
spacers of NZ_CP031988_2
>2.1|498147|22|NZ_CP031988|CRT ATAAACCGCCGTCACCACCACC >2.2|498204|19|NZ_CP031988|CRT ATAAACCGCCGTCACCACC >2.3|498258|19|NZ_CP031988|CRT ATAAACCGCCGTCACCACC >2.4|498312|25|NZ_CP031988|CRT GAGGACTACCATCACCGCCAATGCC >2.5|498372|19|NZ_CP031988|CRT GAGGACTACCGTCACCGCC >2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT GCGGACTACCGTCACCGCCAATGCC >2.7|498486|19|NZ_CP031988|CRT GAGGGTTACCATCACCACC >2.8|498540|25|NZ_CP031988|CRT GTGGACTACCATCGCCGCCAATGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031988_2
The CRISPR arrays of NZ_CP031988_2 >merge|NZ_CP031988|2|498112-498599|CRT ACCGATACCACCAATAATGCCAGTGATTGGGCTTAATAAACCGCCGTCACCACCACCACCGATGCCACCAATAATGCCAGTGATTGGATTTAATAAACCGCCGTCACCACCACCGATACCACCAATGATGCCAGTGATTGGACTTAATAAACCGCCGTCACCACCACCGATGCCACCAATAATGCCAGTGATCAGATCAAGAGGACTACCATCACCGCCAATGCCACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATCAGATCAAGAGGACTACCGTCACCGCCACCGATACCACCAATGATGCCAGTGATTAGGTCAAGCGGACTACCGTCACCGCCAATGCCACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATTAGATCAAGAGGGTTACCATCACCACCACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATCAGATCAAGTGGACTACCATCGCCGCCAATGCCACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATTAGATCAA >NZ_CP031988|2|1|498112-498599|CRT ACCGATACCACCAATAATGCCAGTGATTGGGCTTA ATAAACCGCCGTCACCACCACC ACCGATGCCACCAATAATGCCAGTGATTGGATTTA ATAAACCGCCGTCACCACC ACCGATACCACCAATGATGCCAGTGATTGGACTTA ATAAACCGCCGTCACCACC ACCGATGCCACCAATAATGCCAGTGATCAGATCAA GAGGACTACCATCACCGCCAATGCC ACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATCAGATCAA GAGGACTACCGTCACCGCC ACCGATACCACCAATGATGCCAGTGATTAGGTCAA GCGGACTACCGTCACCGCCAATGCC ACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATTAGATCAA GAGGGTTACCATCACCACC ACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATCAGATCAA GTGGACTACCATCGCCGCCAATGCC ACCGATACCGCCAATGATGCCAGTGATTAGATCAA
>NZ_CP031988.1|WP_004640990.1|493671_494781_-|porin MKVNFLIASILTVITSSAIAAPKIYGEIDASLDYLPENNAAKSDRDVWKVNSNSSFLGIKGEEKLTERLSAIYQIEWSFNADGDGTDWSQRDRFVGLKDQKLGTLKIGKNNSPLKKLSTAVDSFNNYVRNTADITSIMPGENRINNSVVYDSPKFSIGEQGNLEFSALLATGEAQGIRNNQGGVTVDGGGLGDAWSTSLTYSDPIFLAAIAYDKAIPSNLLGQGFLNASDTHIDIDKVFAAANTLRLTARIKPIETLSLKALIQKSEIEEAKGNPASAANIDDSVGWLIGAEYRIPNHDKWNIKAQYSQNTTSFKNNDADYDAQQIMAGVDYAFNKQVRAYGYTGYATFKQADAKDKQPVVGTGLEFKF >NZ_CP031988.1|WP_005086808.1|492156_493152_-|tripartite-tricarboxylate-transporter-substrate-binding-protein MLRGIILTSTLVTLGFGLTACGKNKGEVGEPKRPECIAPAKPGGGFDLTCKLAQNAFKETKLLNSPMRVTYMPGGVGAVAYNKIVANDPANDNAIVAFSTGSLLNLAQGKFGQYTEKDVRWLAIVGTDYGVVAVNAESPYKNLNDLVAALKKNPKSVSFGAGGSVGGQDWMQTAMLAKAAGVNPKDMTYIALEGGGEAVTSVLGNHIQVVSAGIAEVIPHIKSGKVRALAVFAPERLPNELANIPTAKEQGYDIQWPVVRGYYVGPKVSDEAYQWWKTSFEKMMQDPKFEQSRQQFELLPLSMTGEELDQFVIQQTNQLRALSKEFDLVTK >NZ_CP031988.1|WP_008941222.1|491616_492060_-|tripartite-tricarboxylate-transporter-TctB-family-protein MSAERIFSGTLGLVSLGLLYLAWGYVAPIAYDPLGPRPYPVLLLLLLISCCLYLTFRPRKLAEFIDLGYTPSVLKKIGLLMLFMLIYAVTFEFLGFPIATAIMFFLVGTLFGGSLKASLITGIVFGCLLYGLFDYILDVPLPLGFFS >NZ_CP031988.1|WP_005086812.1|490105_491602_-|tripartite-tricarboxylate-transporter-permease MDVFEYLMYGFQVALTPQNLFIALIGAFIGTIVGLLPGLGPINGVALLLPFAYALGLPPESALILLAAVYLGCEYGGRISAILINVPGDAAAIMSTMDGYPLAKQGKAGIALSLSAMSSFIGSLIAIIGIVLFAPLLAKWAIVFGPAEYFVLMVFALTCLSGLVGDQPIKTAVAALIGLLFATVGVDAVTGVYRFTFDSVNLSDGVQFTTIVIGFFSISEILIMLEKTAIGQKALGQGKRSLFNLKEFLFTLKTTIRSSLLGFIVGILPGAGATIASAMSYTSERKLAGKDGKFGDGDLRGIAAPEAANNASACGSFIPMLTLGVPGSGTTAVMLGALTLYNITPGPQLFTEQPTIVWGLIASLFIASILLLIMNISLVRFFAKLLSVPNFILLPAIAAVSFVGVYAIHSTVFDLVLMVGLGIFGYILRKLNFPLSALILGFVLGELMESSLRRALSISQGELSILFDGYITKVLWILAGIMIVLPLIRWLRNRHRAI >NZ_CP031988.1|WP_008941221.1|488975_490040_-|AbrB-family-transcriptional-regulator MQLYLKYALSLSLAFLGALVAQWLHLPIPWLLGPLFTTALLKINHAPIECHNSARSIGLSIIGLTLGLYFTPEMIHLIASHWLVLLIGLLFALLLGAIGAFILQRWAKVDFKTAWFASAIGGANEMSHLAEHYQARVDQVASAHTLRVLMVVVIVPFFYQFMGWHGFDTDQIAKHLEVNWFGFFSLVLISYIASRIFIQFKLPNPWTFGALLVAIFFTAQDIHLSAIPTPIIHLGQVLLGWSLGNKFKPGFFKTAPRYLSIVALCNLGALFLTGLLAYTLMQWTDLPIATLGLGLAPGGVAEMTITAKVLQLGVPIVTAFHVVRMVGVLGTVGYLYLFFDKILQKKIQTQKNRN >NZ_CP031988.1|WP_008941219.1|485957_488396_-|ribonuclease-R MTTNWVDPEAKAEAERYDNPIPSRTLILTTLEQLKTAQSHAELVEHFNIQDQKSIDALNHRLSAMVRDGQLMKDGFKYQPSTDAPSYEATVYINSKGLGTANIAGQDDVLLPERELRLVFNGDRVKVRQTSVDRKGKAWGFITEVVQRRVKQIIGKVAEHQGEYFIQPSNPNQHQPITLEKELIEHANAKVGDMLRVAIDDYPTREELATGHVVQSMADKADTEIIIPQTILEFGLPYEFPEAVIKEAESFKEPSAQDIKNRVDLRDLPLVTIDGEDARDFDDAVYAEKRPGGGYRVVVAIADVSHYVRLESPLNEEAEDRGTSVYFPHFVLPMLPEALSNGLCSLNPHVDRLCMVCDLKLSRAGKVTGYEFYPAVMHSKARLTYTQVGQYFEGATDAIPEDKTIHKSLNTLFQLYQTLKGLRAERHAMEFETIETYMTFDELGGIKEILPRTRNDAHKLIEECMLLANVAAAEYCLEHDIPMLYRVHEAPEFSRIQKVRDFVKLLGLPFPEQPTQADYQRVIEATKDRLDAPSIHAVLLRSMMQAYYGAKNSGHYGLAYEAYTHFTSPIRRYPDLLLHRAIKAYLQQKPYPLSGAALDDAGEHFSQTERRADEASRSVTTWLKCHYMQQHLGDEFVGVISAVTEFGLFVTLKDLYVDGMIHVSQLGEDFFLYDQASQSLIGQNRGQSFSLGDEVKIQVAGVNLEERKIDFQLVQQLTHLGRVIRQKAPRTANPSSSNRASTTEEVFGKAPSSTKAKVSEDGEKPVRKKKDKNKPSSYSKKPAKKASAKPDTKEKAKKKVKKKKSNAKAKAE >NZ_CP031988.1|WP_008941218.1|483726_485766_-|M3-family-metallopeptidase MTLQQATLPTPQFNQIQLADLKQQIESTIQNGQNFLNQLNEAPQDIEAQLATLTEVDQLENNMSESWGILSHLNAVMNNAETREVYQSLLPSLSEYYTQLGQHTALYQTYQQIHDSAAFQSLSEAQQSAIKLALRDFKLSGVALEGEAKKRYAEISARLSQLSSDFSNHVLDATQAYFKALTEEQLKGLPQSSIELLKQYGQQRELDQAVATLDFPAYFAIMTYADDRELREELYKAYVTRASEQSDKTEFDNTPVMEEILSLRQEMAQLLGFNNFAEYSLASKMAPNVETVDKFLVDLAEHARTPALAEIAELKAIAQQDGIEELKPWDATYYSEKLKQQQFNLSQEALKPYFPAPKVVDGLFQIVQRLYGIQIVERQAPVWQNDVRYFEIEDQGQVVGGFYFDLYARNGKRGGAWMSGFRSRVQTTNGLQKPICYMVCNFTPPIGDQPALLTHDEVITLFHEFGHGLHHMLTEVDNISVAGTHGVAWDAVELPSQFMEFWAWDNESLDVLSEHIETKQTLPQELLTALLNARFFQSGMQTLRQIEFALFDLTIHRQSPALNSEQIQATLDDIRAKFSVVPTVAYNRFQHSFSHIFAGGYAAGYYSYKWAEVLASDAFDRFENEGIFNTETGKEFRKFILAVGGKDTALDAFRNFRKREPKIDALLRHQGWTKTDKTA >NZ_CP031988.1|WP_005086820.1|483481_483688_-|YheV-family-putative-metal-binding-protein MKRQFIAGAKCPKCGALDRVVKIITVDDEWIECIECAYSEKRPTHVEESQPAEPDEIGVIQFKPRHFD >NZ_CP031988.1|WP_005086822.1|483019_483469_-|hypothetical-protein MTSPAQTSNSKLLWMIIGGISLVVLIFFTAQWLLSNHTAETETAVSQPHPVTTSLENVEAASAAMMSHVNEESDPAPIQLVEESILKAAVPNNESLAKEEIAKLDDIQHQLKDQKQELQAQHHDADTLIKLKEEQIKLLEAQLLQTQAS >NZ_CP031988.1|WP_005088311.1|482070_482958_-|EamA-family-transporter MPIVSQRHPVVLAIACLTFSAFLFSLMGICIRFASHTIDNYTIVFFRNLVGLILFLPFIYRQGTDFVKTEKIWMHTWRSIIGLAAMYGFFYAIAHLELSNAMVFTYSSPIFIPFIAWLFLKERISTLMLCAAALGFIGVFFVAKPDQGLLNWLSIIGITSSLCAAMAFVTVRALTQTEPPERIVFYFCFIGALLSGIPMFWVWRPYQLEELFFLIAAGVLANVSQLFMSHAYRLAPAGQIAPINYVAIIFAGIWGFLLWHELPDTYSLIGFGFILIAIFLCSPLTQTYKKWRFKL >NZ_CP031988.1|WP_005028482.1|502984_503977_+|IS5-like-element-ISAba23-family-transposase MAWKQTGQLSLADSLINAHKAIEELDELHNLIDWQTIEQTLRHVHSSERGESAFHPVIMFKVLLLQKLYNLSDPAMEKQLARDLLFRRFVGLSLTDDVPDHSTIWRYHKHLGELRLIEPLFNQINEQLAQQNIFIKAGSVSIIDASIVEAKNKRPKKGKHTDNTQDNEAAYVSKKDSTGKVKTTYGFKIHLNCDEDSFVKKVETTPANVHDSQCFTTLLTDDESAVYADSAYKSQAHDDYLAEHEPPIKNHIHDRAWRNTPLTEQQKRNNTQKSQTRNTVERVFGHFKLHYGMSKARHLGLMQFHTSTLLASMVHNLKTALSLKRKYGLA >NZ_CP031988.1|WP_076612069.1|504388_505479_+|IS4-like-element-ISAba33-family-transposase MTHFNELYLILNKYLKWNKSHAKCFTLIMLALIVKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRIQRFFAGQYFDYRQISQLIFNIFSFDKVQLTLDRTNWKWGKRDINILMLAIVYRGIAIPIVWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFISIFGKDRIVNVFADREFIGEKWFTWLIENDINFCIRVKKNFIVTNHLAKNHKISDLFRHLQVGQTECRKRRIWVGRVKLYISALRLEDGELLLVVSPMFNASAIRDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAIGFCWCYLTGEWQHDRKKAIKIKKHGRLSVSLFRYGLDYVQMAILRLIGFGKKEEFKKVLAILRKKKPDRTRVL >NZ_CP031988.1|WP_005028482.1|505684_506677_-|IS5-like-element-ISAba23-family-transposase MAWKQTGQLSLADSLINAHKAIEELDELHNLIDWQTIEQTLRHVHSSERGESAFHPVIMFKVLLLQKLYNLSDPAMEKQLARDLLFRRFVGLSLTDDVPDHSTIWRYHKHLGELRLIEPLFNQINEQLAQQNIFIKAGSVSIIDASIVEAKNKRPKKGKHTDNTQDNEAAYVSKKDSTGKVKTTYGFKIHLNCDEDSFVKKVETTPANVHDSQCFTTLLTDDESAVYADSAYKSQAHDDYLAEHEPPIKNHIHDRAWRNTPLTEQQKRNNTQKSQTRNTVERVFGHFKLHYGMSKARHLGLMQFHTSTLLASMVHNLKTALSLKRKYGLA >NZ_CP031988.1|WP_008941224.1|507151_508447_-|hypothetical-protein MSRFITLFTIFLYCSIQYSFAQLITWSDNIPSAIQPFQNQPKTLASYTQNDIFIYGHPAVKTSVPTLKNNPQPTANFTTAAMIVPVNAQQVEKTLTDFHQYVGLFPTLKSAKTLAQSGNITQMKYRVSIPTPIPVLNFNENIIMQHQLTENSISTLVIDAPIPYGVGKFEWFALDENRTLITLTQWGDLNQPQGFLVKKILAAIPEVKLGIPSSGSAFILESLRTRFNTLTPIALPAGQTPSPQLTPAQLVKIAQLSQAAQQPVSFLHSPTTIAYTHGRESMRFTTTYQFYKQSPQQLQKWLAPVTYKELFPRQIKKVSTTPIQNQSQDADIQVNVSLGVINIPFAFKLQFNYPQTTENNFHANGGDLRYIKGRMQINTVNQGSLFKMTTAMKIDEKAPFLLRAMRSLPYHDTLPAVGGNTVFVQKIRTKL >NZ_CP031988.1|WP_004640980.1|508602_509100_+|YcxB-family-protein MSEQRPTISARFYLNLEESQDGFALVTFGKKPITRFLTPAISIAIILWGIYLGFTGVGRYYVALGVFFLIMQAIMRFWLLPLLFKRQFVRYQFGKSEQGIDLYQDYFELYAAGKKQKAQYSEVQSFVIGKLTYMLELKNQTVVIVPKRVFTNPADQNKFENSFKK >NZ_CP031988.1|WP_115736359.1|509141_509783_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MNTQPSKIVCVGRNYAEHAKELGNAVPDRPILFMKPPSSLATLAQGVAWNQALGECHYECEICLQIAHPLSQEIDKNKALEAIGAITLGLDLTLRDLQSELKNKGQPWERAKAFDGACILADWLEADEIGDLQELELVLMINGEQRQHGFSRDMLFDIGALLVEINQSFSLQAGDVIMTGTPAGVGALNPNDQLTMKLITQSGEYDWDTFVKA >NZ_CP031988.1|WP_005086792.1|509853_510750_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MKIGLYLTLFLITSFVHAKQLALSFDDGVNPDLNVQALTINQHILEQLHQHRIKSIIYPSVIKIGDYAGVQLVAEWGKQGHQIGNHSEFHLNLNKDSISSQQYIDGIRRAEQVFQPLQGWVARYRYPFLKEGNTQEKRDAVVGYLKQHDYQSGAVSIDASDWFYNQKYLSYQKHHQSDQLEKLKQAYIYHLLDRADYYDQLAIDTIGYSPKHVLLLHVNAINAAFLDDVVLAFQQQGWQWIDSEKAYTDPLYQLSSTVLPAGESIIWSLAKQQGHADLRYPAEDAPYEQENLKRYGLL >NZ_CP031988.1|WP_005086790.1|510741_511551_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKKSAHRIQDFQELPACDDIPASLWLRIRDAPAETFYPKHAHAWGEFIYTFDGVLEVSIDQIHYLTPPPYGIWLPPHLQHSGINRHEVTHCILYVHENLCQNMPQQAGILLTAPLVPALLEHIRKHPFSEQDPEYLRLLQVLLDALTHAELVGSYLPTTQHPALSKILSHLHAYPADNSTLQQLAEMINMTERTLARYSQKELGMSLHEWRQRLKVMKAMSMLNQGKTIENIALDLGYASSSAFIYMFKRWMHFTPDQFRKLYQGSSLQ >NZ_CP031988.1|WP_008941226.1|511658_512567_+|DMT-family-transporter MDERKTLDARASGLMIGLCMIWGLQQVILKMAAPDISPLMQIALRSGLAAILLLPLLYLDKAAELFNRQNLQAGALVAFLFSLEFFLLAQALQWTSASHAVVLLYTAPIFVALGLHWKLPAERLSWLQWSGIALAFIGIVVTFIREQSGTASAIEQQMLWGDLLALAAGIAWAATTITVRLSSLAQAAVTQTLFYQLAGSFILLFGLAVFLGQASIHFTPLVIGSLAFHTLVVSFASFLAWFWLLRNYLASRLGVFSFLTPLFGIIFGVWLLDERIEPNFVLGSILVLAGIVVVSLQGWLRK >NZ_CP031988.1|WP_004640968.1|512594_513845_-|YihY-family-inner-membrane-protein MILNRYLKKLNFLEKTWFQFIVFVLRRFEADRCREQAGSLTYTTLFAVVPMLTVFLVIISSIKALEPARQQLQQLIYSNFLPKSTIAFDKALSAFTDKSSNLTIIGILFLFVTTVLMLSSIENVFNRIWRVKETRTGLVGFMRYWTIISLGPILLGSAFVLSSTVASMNILSNNFAGYQLNGAFLLWLISFLLTIIGFFILYWTIPNRNVPIYSAMIAACFSATVFEVLKRLFGWIMSNFTSYEIVYGAFAAVPIFLLWIFLSWNIILLGVEISYALTAFHSGKEQKRHPIMMLLDILELFYKKQQVGNSVSEHELLDIVGRGELGRLPSYILQLEAQNLIKRTDNDEYVLVRNLAQVDFWSFFTALPYPLPLRDDVANVHADDEWMEKIGPALIESNDYLAAKLSIPLSTIFEQK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031988_3 | 728046-728143 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031988_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031988_3
>3.1|728072|46|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder CTTGCGGAATATATTCCTCATGCGCAAGACGAGCAGCTATGCTGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031988_3
The CRISPR arrays of NZ_CP031988_3 >merge|NZ_CP031988|3|728046-728143|CRISPRCasFinder AGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCTCTTGCGGAATATATTCCTCATGCGCAAGACGAGCAGCTATGCTGTGAGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCT >NZ_CP031988|3|1|728046-728143|CRISPRCasFinder AGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCT CTTGCGGAATATATTCCTCATGCGCAAGACGAGCAGCTATGCTGTG AGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCT
>NZ_CP031988.1|WP_008941664.1|727633_727999_+|YbaN-family-protein MKILFWRSLVILFVTLGIIGAILPGMPTTVFLIIAAWAASKGWPQMDAWLLNHPKYGTTLRNWRENGTVPRRAKWFASIMMLISGIIMLFTTAPFGVKVFTNTTMLIVAIWLWFRPEPERG >NZ_CP031988.1|WP_008941665.1|726669_727533_-|DUF1853-family-protein MSSVVDSPCFFEPWLKFKNPIVRQLAFAIASPNILSEVPSELIIKNKFCLHDNATWQVLYQNYEKRLYQLDQQPQPLHDFVARLKSTRLGLRFENLLWFWLLDDAYHPYQLLGHSIQKIAGAITLGEIDFLVLNQQTQEIEHWEVALKYYLGEGHLNLARWFGLNREDTLYRKLKHFTDRQFQFSEANGYNIQRKFAVMKGQLYLPAQQLQTLPLPVWINTSRQLGNWGTRIPQQPYYRLQRHEWLCPNQLASSSNAIWWTDGLYHTTEGEPSFYMFRQPALLFNRT >NZ_CP031988.1|WP_004640614.1|726416_726560_-|entericidin-A/B-family-lipoprotein MMKKVLVASIMTAFVLTGCNTFKGFGQDVSKAGDKVTQTAEKTQNKM >NZ_CP031988.1|WP_026070467.1|725157_726291_-|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MNHSDTLELSLQLLRQPSVTPVDHDCQNIMADRLSKIGFNIEKLRFEDVDNLWARRGTENPVFCFAGHTDVVPTGHLDAWNSDPFQPTIRDGKLYGRGSADMKTALAAMVVASERFVAKHPDHKGSIAFLITSDEEGPSINGTVKVVETLEARNEKMTWCLVGEPSSTNQLGDIVKNGRRGSLNAVLTVNGKQGHVAYPHLAENPIHLASKALNELCETVWDNGNEYFPATSFQISNIQAGTGATNVIPGHLKVTFNFRYSTEVTAEILQQRVLEILDKHKLNYDISWTFSGLPFLTPVGELVNAAKTAIKDVTGVETVLSTSGGTSDGRFIAPTGAQVLELGVLNATIHQINEHVNVDDLEPLAEIYEQILVQLLT >NZ_CP031988.1|WP_004640619.1|724653_725109_+|hypothetical-protein MVKKSTNTALGQIDQQELQHLITVSTGFIDAYIIECHQKVPMLLPQNIVLSAMDTPTNVEHIEWHDLKLPVLALHDPMQKQGVALVVEGEDVSQRFALICNEMPESIRLRISEIVDEDGDVEDPKVFKYVKMGEKRYFVPNLQNIETQLGL >NZ_CP031988.1|WP_017396355.1|719555_724637_+|Hpt-domain-containing-protein MKEILKTLVETMTLPEDSYLEQDAEILEIFIEELDEIFVELDPLLVQWIEQPNLQNVLTDIRRHFHTLKGSGRMVGAKSSGELGWTVEDTLNRVLAGTIPLTTEIQRYVQAIFNIYRFKLIHDFKAVRAHLIDLRPLVLLGQQLQQQSVEPALSDLLMLADHLVSEDISTGLELVEEALFVDHLTQTEQLALDNADKVLAEDELLAKETLAIFLEEAEEHLATIDQFLQNDHPTNEHYNHLIRALHTLRGSSAMAHIDQIFDASSKVENLFKTLLHDELDSNSNETALLTHYAQFVRDYLYSLRQLETAQRTDEIHATFNTAWDSYDFQLEDSHGENLRPQGLVSQLLELNIQDLLDVESDFDQRARTEFPQYIQQLSQQAEILLQHTHHHATIGMYQYTSLLRSSYQDLIYKPSLLNLEYGFELYDQVHQQFIQLFDTLAAGQRVTLTKEHEQMLNELSTFTQQNIELLEAELIETNLDQAAPLSEAEVVQDSIVDTSDLAARFALDKQQLSTSESNRDFDPDLLDIFLEEADELLVGIDEDLNTWVADLQNVNALKNLMRYLHTLKGGSNMIHAGHIGLIAHELETIYEKLINQQIQATPSLISVIRSVQDDIADRIQTIRDQQVDYPSTHVLDVLTNLMKSTATTAIKIDKFVVSEDEDIEKAVDLDGTTEIEISTHSDVAEPSIDVTSFAAQLALDKQQLQSEQSNRDFDPDLLDIFLEEADELMVGIDADLNTWTTDRHNVNALKNLMRYLHTLKGGSNMIQARHIGLIAHELETIYEKLINQQIQASPQLVAIIRLVQDDIADRIQTIRDQQTDYPSTHVIQLLQHADQDIDVERYATETEIEQTSAELVNADLEVVAASIDNVESESISAETQLDFVETESLLQIVEADSDKDDVTSSLMQDVVEDDTEEDDVRSLVEQTFLEEAEELLGQAQHLLEQWFEQRGNRSLLLQLQRNAHSLKGGARMAEMDAIAIIAYHLENAFEQFGLHHFSSNVYDNLLNTALAWLNDAIFKRQYANFDGLKQSLENMEFVDVAAQLPQKLSARDIFTPEYTMEFVQGDGTEPPSMLGEWESTERIEQNNEMIRVSAEVIEKMIDLSGENAINRSRIEMDLGQLGGTLTEMELAIKRLADQLRRMEGELESQIIARHGGEDARYADFDPLEMDQYSSLNQLSKSLAESASDLVDFKTTLSEKIRDTEGLLLQQSRIQAEIQESLMRTRLVPFSRLLPRLQRIVRQTASTLNRPTELVVNNTEGELDRSILERLVAPFEHMLRNAIDHGIEDREQRLQAKKPETGHIVLNIGRQGTDVVVTFSDDGKGIDVNRIKEKAIQTGLMTKDQKLDQDEILQFIFHPGFSTAAQVTQISGRGVGLDVVQSDIKALGGHVSVGSILGKGTTFTIRVPTTVAVSDALMVKAGDQQFAFPLAQIDRIVRISPMALEQYFESQDDYFKIDQEDYRLRYLSEFVAGQPIPRLTGIVHSLPVLLIKGAQGQMTALLVDQLIGSRGQIVVKPVGQQFSSIGVIAGATILGDGQVCLILDGQNLARQAQSTARSKQADETYTKQRYDERRLIMIVDDSVTVRKVTSRLLERQGYDVVTAKDGVDAMEQLETVKPDLMLLDIEMPRMDGFEVTNLVRHHEIHRDLPIIMITSRTGEKHRERALSLGVSQYMGKPFQEETLLENIESLLAVR >NZ_CP031988.1|WP_008941668.1|717316_719398_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MGFKLKKKNGSDGAGSKKGEAFLGKIRTQLDQFSRLFGETEKSKPIIYRALIALVLAVILLIYLFVSLPRSNQLTRSLGELRLLSQMISRQATEATASGTSETMNNLVASEKRFAENLEVVEDVYGKSSDEYKKVNELWTNVSKNIDLIASQQAIINQLYDTNISISETIPEIQAEYNLMVDQMVRENMPSSQVIITKNQVFIAERILRSINSVLVGTDNSNASANDFGADIDTFGIYLNAQLNGSSELGVDRISSPDLRESVDSIKSDYDAVLKLAAETVLKNANQIVHVRQASSEIFTQSDALLSSLNALSDKAEGGWGNVLAGIALILALGVLVFSALQLLALRSNTDKERVIRLQDEYDRNQNAILRLLDEIADLADGDLRSYATVSEDFTGAIADSINFAIDQLRDLVSRITDTSQEVARYTQDTQSITNQLAEASEHQAQEIAGASAAMNEMALSIDQVSANASESAEVAKRSVQIATNGAQVVNRSIEGMDHIREQIQETSKRIKRLGESSQEIGNIVSLINDIADQTNILALNAAIQASMAGEAGRGFAVVADEVQRLAERSASATKQIESLVKTIQTDTNEAVISMEQTTSEVVRGANLAKDAGIALDEIQTVSGDLAKLIASISDAAKLQSASASHIATTMNVVQEITSQTTTATFDTARSVSELANMAESLRESVTDFKLPE >NZ_CP031988.1|WP_004640625.1|716732_717269_+|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MAANGFIELLRLSKRGNKQYTATQNEVSRWSGIAFEMLGQYFVAPLGEISEVIYPPKYTPVPNTQAWVRGLANIRGRLLSVTDLSHFISDQRSQFSPTQKVICISHQDHYVGLVVDQVLGIQHFNKKSFFSQSNELDSKLKDYCQGYFHQHNQQWHVFLLSRLLKNPQYMNASIKFIN >NZ_CP031988.1|WP_004640626.1|716321_716684_+|response-regulator MARILIVDDSPTETFRFREILTKHGYEVLEATNGADGVTMAQAELPDLVLMDVVMPGMNGFQATRQISKAKDTQHIPVVIVSTKDQATDRVWGKRQGASDYLTKPVDEQQLIDVIKQLLS >NZ_CP031988.1|WP_004640629.1|715916_716300_+|response-regulator MEDKFQNLKVMVIDDSKTIRRTAETLLQREGCEVITAVDGFEALSKIAEANPDIVFVDIMMPRLDGYQTCALIKNSLNYQNIPVIMLSSKDGLFDQAKGRVVGSDEYLTKPFSKDELLSAIRNHVSA >NZ_CP031988.1|WP_004640609.1|728285_728816_+|L,D-transpeptidase MPYALEQADILIDLAQQTLYLPKHNKFYVISSGKNGIGEQENTGKTPRGWHRIAQKIGDDAPKNSVFIARQATGEIYDQDLAQQFPERDWILSRILWLDGLQAGFNQGDGCDTFKRYIYIHGTPETEPMGIPMSHGCIRMKNDEVIELFELISEQALVYISEHALDESMIKSERSV >NZ_CP031988.1|WP_017396357.1|730370_731156_-|YdcF-family-protein MQISSWLRIFFAVIGFILLIDGAVLITLKKIHIGTVLPLLLGLFFCLYSFFYYHLERFFFYHFRLHSIWRFGWLCFWVWLISLGYFFNYLNKNNSQVEVPTSVAAIIVLGSGIENGQPSATLAKRLDRAAPIALTQPNAKLLLTGGVDFGETESEAIVMSRYLQQQHHIPATQIILEDKSTSTELNLKNSHPLLQAHKISLQQPIAIVTSDFHTLRAAAIAKKQGYSNITTIGSTTPLQTRYNAWLREYFAYVSGWLLNEY >NZ_CP031988.1|WP_008941660.1|731279_733817_-|PepSY-domain-containing-protein MFKKVFFQIHWFLGITAGLILSLMGITGAIYSYDQQILKWINQESYVVEVVNTPKLTPAQLYQHFNQQQPEIEINSITIAANPAASSTVNIKKEGARRGYNMMVNPYTAEILPEVKGREFFQFIQRLHRNLTAGEYGAQITGASTLMLIFFVLSGLYLRFPKKHSLKQWLFIKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVVAFYLLFACTGLYWSYDWWRAGMFKVMGVEQPQRHQQNHDQNKKEQPDLSNQQVNTILTQAWTGVNANIGREYSSLTLNIPKLADQKIEVTFIDPTPQHERARNQAIYNYQSHQFEKLDLYEDKKLNEKIMSSMLPVHRGSFFGSTYQFIAMLASLTMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQSARQTLINQQIDPNATPWLISYASQTGVAEQLAWRTATSLQEAQQPTTVKPIQQLTEQDLQQAQQVLFVVSTYGTGEAPDLATSFSKKLMQQSLDLAHLKYAVLALGSKEYPDSYCRFGYVVDAWLKQCKAQALFDLVEVDNANNEDIQRWNQALSVVTQHELHAMNIEKVFDQWTLTERKLLNPNSLGNAAYNIELRAPYDITWHAGDIAEIQPANSLIEIQNFLIKYQIPAQAEIKSLNLTIEQALWNKNLRIEIDQIDDLETLVAQLPTLPTREYSIASIPSQQLLRLVVRQKYDANGELGLGSGWLTEFAQLKQTIALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLQQRNRQNYTANWLIFGERQHQCDFFYEETIQAWLNMGSLQRLDLAFSRDQEQRRYVQDVLREHADELKNWIEQGAVIYVCGSIEGMATGVDQALNDILGEEAVDELRQTQRYRRDVY >NZ_CP031988.1|WP_008941659.1|733988_734573_-|YcxB-family-protein MTAKTPYAYTLQPVPYEVSEVEQRQAQLMIWRSSNKFSRKAWIIMISLVVLSLVAAGLIKYYSTYSTVICWVVIIGVAFYYLTKKFGLEWYVKRKMKEFPVQEIKGIRLGVQPHGLVMRQKVGLQDGTATISWKDIYEWYASPDFILVNFKVKTPKGDEQQGAYILPKRMDSKNFSFKTIRRHLTETVGAPKSI >NZ_CP031988.1|WP_017396358.1|734705_736886_-|TIGR01666-family-membrane-protein MNSGLKRLKQATYNTTFMYNVRMLIAFTGTAFVPYLLDHQLATIPLTLGVVAAAISDIDDRFSVRLMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPIAFAVGLIASCIGWILLGSLGRRYATIAYGCLVISVYTMLGVHLFEEWYQQPALLVVGAAWYGLLSTISFLLFPVRQLQDQLAASYNALGGFLYAKSNLFDVDMTPPSYQQSMIDLSMENSKLIGLFNNLRVALLTRLKGDRGQKDTRRSLQYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLTKVFQHSDILFRFQRILSIQGKACQDLAQSILSRTRYTHNKRFKHSFENLRLSLEKLRKDGLYDQVRINALFALYQNLKSIDAQLQNLETERNLVLDNAQQPEHQLKDDDLKGMKDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRLSIVLFIGYVFIQMTNIAYGYWILLTALFVCQPNFNATKRRLYLRIIGTLVGIIVGLAIIYFIPSLEGQLVMLVLSGILFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAFAAGFPRFIDTIIGCALAWFGVSFIWPDWKFRRLPRSIQRALQAQCQYLAEVVTQYHQGRNNALNYRVVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPNIDSTQKAQAFEFLCLSHTFLSYIAALGAHREQIQDQEVLDLLDQALDDIQGALLRDEVPDLSAQNMLQTIRQRLTQKESNENDQKSLIILQQLSLMLSILTRLSMLKQSLGHEPSEDGTEFASL >NZ_CP031988.1|WP_008941657.1|737028_738240_+|multidrug-effflux-MFS-transporter MQVEQTNQRQYSTTWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMADEFGVSTQMVANTLPAYFLGLAIGQLFYGPVSDRIGRKTPLYFGLTLYVIASLACVLVTNEWALIIARIFQALGGCVGVVIARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPIFGAWILIFFPWQSIFVCLAMIGVICGLCVHFFFKESLPVERRLKLSTYQVTTLYAAIFKDQSFRLPMLAGCLTGAALFCYISSASAVFMGQYGLSQQHFSYAFAFNAAGIMLMSSLNKHLNTRMGVFPRLVFGGSIQCFGAVCVVSAGLMVNAPLWFLMSGLFLVVSGIGLTGPNAMALAMSEQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVILNFLVWKASLNMGLMMLMFTSLGLLMIFKVGRQQRASV >NZ_CP031988.1|WP_008941656.1|738289_738997_-|nitroreductase MNMEQVRYVDEAIRSRHSVRAFLDRPVEQQIIKDILDVACRAPSGTNTQPWKVYVITGKKRTEMIDRVCTAQVESFQNPALASQYKETFAYYPETWISPFIDRRRENGWGLYGLLGIQKGEKEKMAAQQLRNFQLFDAPVGLYFTVNKIMGIGAKMDISMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPIVLDVLGAPNDEELVCAIALGYADPEHIVNTFITPREPVENFTVFLDE >NZ_CP031988.1|WP_017396360.1|739421_740762_+|porin MSLTLIRKPFVMQSLAIIVATLMMNTAHATSEQEQIQQLRAEVSELRALLEQYVSQPKQENVDSQVVAQPASVTTHNQNIKVVNTEPAKKSPLAIQTASGAQVKLYGFLRGDASYQAKGGDGIFNRINKVDLEGAEKNSDRFYSTATVTRLGLDFKSPVEGTEVGGKLEVDFRGGSNNDTIRIRHAYLTMNDWLFGQTTSTFLATDLQPEMLDFNSPLGIGTYRTPMVRYSNKLNPDISYAIALEKGNDDNRLPALSSKLKYDFAEGKGTTSVRALLTEARSKVAFNKDNMQISRNDSDLGWGVAVGAKYKLTDALQAMVDYSHVKGDSKFLLYTNNAFNVNPNNMGLNLNEFDALTVGTSYQITPKLRSTLAYGAMFADDSNDFAKQAVTDETQNKTLQQGWWNVMYSPVTPITFGLEYIYGERKTFDGQKGKDSRVGAMARYNF >NZ_CP031988.1|WP_008941653.1|740942_742178_+|sodium/glutamate-symporter MEFTFNGFYTLISAVIVLLLGRFLVNKIDFLRRYNIPEPVAGGLVAAVLSLLIHSFFGYSVVFSSELQTSFMLIFFASIGLSANFMKLKEGGIGLVIFLVCVASFIVVQNAVGMSLATLLGIDPLIGLIAGSITLTGGHGTAGAWGEILESQHGIQGALALGMASATFGLIIGGIIGGPLAKLLINRHGLARAKTPAQIEDRDTHPDPHPEDLAPFENPHQVRLITADNAITTLGMFAACLAFAEFMTGYSKGTWFELPTFVWALGGGVILRNILESVLKVDIFDRAIDVFGNASLSLYLAMALLSLKLWQLADLAGPLVVILGAQTLTMALYAAFITFRVMGKNYDAAVLAAGHCGFGMGATPTAVANMQAITNMYGPSHKAFLIVPLCGAFFVDLINATVIQIILKFFA >NZ_CP031988.1|WP_008941652.1|742274_743750_+|alanine:cation-symporter-family-protein MNEQLNTTLMSWVQFLNDPLWSFLIVLLILVGVFFTLITGFVQLRLLCHSLWVMKSSRKESKDDHGITPFQAFVTGLASRVGVGNVAGVAIAIAIGGPGAVFWMWFVAFLGMSSAFVESSLAQLFKIRDNQNKQFRGGPAYYITQGLKQKWLGVVFALTLILAYGFVFNAVQSNSIISATSQAWGWDKANFVLALGGFNLEVSWVGLVLVILTALIIFGGIKRIAKVAESFVPFMAILYLIVALYIAAINYTIIPDIFALIFTKAFAFDAAAGGFFGSMISMAMMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAASDVKHPVNQGLVQMLGVFVDTFIVCSCTAIIILASGLYHDAGFEGVALTQRALESQIGSWGSSFLALILFLFAFSSIIGNYAYAESNVQFINNHPKILFVFRILVLVMVYLGAIMSVPLVWSMADLSMGLMATINLIAILLLTPILLVLLKDYTSQLKNGVKEPEFKIDQYPELKKKVDSDIW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031988_4 | 1145252-1145332 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031988_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031988_4
>4.1|1145280|25|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder GGTAAACTTATTTCAGGACGGGACA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031988_4
The CRISPR arrays of NZ_CP031988_4 >merge|NZ_CP031988|4|1145252-1145332|CRISPRCasFinder CATATTCCATAAAATAAGCCTCTTAAGGGGTAAACTTATTTCAGGACGGGACACATATTCCATAAAATAAGCCTCTTAAGG >NZ_CP031988|4|2|1145252-1145332|CRISPRCasFinder CATATTCCATAAAATAAGCCTCTTAAGG GGTAAACTTATTTCAGGACGGGACA CATATTCCATAAAATAAGCCTCTTAAGG
>NZ_CP031988.1|WP_026070458.1|1143341_1143809_-|copper-resistance-protein-NlpE-N-terminal-domain-containing-protein MKKSIIALSLASVFLVACSKNDNTKNEEQMPTTAASEAIAADNAHTAENSLDWNGTYKGVLPCADCEGIETELELNSDKTYELKETYLGKGDGKPFESKGSFTFNSANTSIIELDQSGDERKYFVAEGYLKALDLEGNEITGELADKYQLKKEAE >NZ_CP031988.1|WP_026070457.1|1141653_1143255_+|isocitrate-lyase MMTYQSALEHVRAVKEKLGGTWGAIRPEDAARMMVQNRFHTGLDIAKYTAAIMRKDMAEYDADNSKYTQSLGCWHGFIAQQKMIANKKYFGTTNKRYIYLSGWMVAALRSEFGPLPDQSMHEKTSVPKLIAEIYTFLRQADAKELNDLFRALQKAEAAGDSAKAAEIISQIDNFESHVVPIIADIDAGFGNEEATYLLTKQMIEAGACAIQIENQVSDAKQCGHQAGKVTVPHEDFLAKINAVRYAFLELGVDEGVIVARTDSEGADLTQKIPVSKEKGDLASQYISYLDTKEIDISEAADDEILIKRDGKLHRPTRLASGLYQFREGTQHDRVVLDCVTSLQNGADMIWIETPTPDVAGIAGFVNDIKKQVPNAKLVYNNSPSFNWTLNFRQQAYDRWVAEGKDVSAYDRAKLMSAEYDNSELAADADEKIRTFQADAAREAGVFHHLITLPTYHTAALSTHELAKGYFGDEGMLAYVAGVQRKEIRGGIACVKHQAMAGSDIGDDHKEIFAGENALKAGDASKNTMNQFGG >NZ_CP031988.1|WP_005084639.1|1140125_1141115_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLERVDLNLLIYLDVLLREKNVTRAAEQLGVTQPAMSNILRRLRNLFNDPLLIRSSEGMTPTERALELQPRIRDALSDLSMILEPRTEFRPYTSNRVFRIMTSDYAEATLVPRLVKALRSEAPNVVLDFLTPSDVSYRDMEQGKVDLAINRFNEIPQSFHQVLVWRDSFSCILNDKHPAVQHLNLKSYLDAQHIWVSKTGMGVGFGVNPDKQAGLGWIDQALERIGQRRKISVFTRHYQMPALLAQNVDLIATLPTRMAQLQTQNPRLVIKDPPFYIPEFELKMAWCPLLHHHPAHRWLRQLILFVARQMIEEENREFLLNNSQFSQY >NZ_CP031988.1|WP_004639956.1|1138691_1140020_-|HlyC/CorC-family-transporter MSLVQNIIIIAMLIIAAGFLSLTEIALAGARKVKLKILAESGEHRAQKVLDLQEQSADFFAASQIGLNAVAILGGILGEAAFRPFFVDLIGRFYTGAWLETIGFALSFTFVTSLFILFADLMPKRLAMIAPEKIAISVIEPIQIFIKVCKPLAWGINAIANLLFRLFKVNTTRDDNITFDDISAVMDAGAQAGVLQKQEHHFIENVFELEERTVPSSMTTRENVVYFTLKENESSIRQKLAEYPYSKFLVCNEHIDQVIGYVDTKDILVRILNNQSLLQLNESTIRNVLIIPDTLTLSELLDRFRSTKEKFAVVINEYALVVGVITLSDIMITVMGDWVTPMEEDQQIIKRDNHSWLIDGSTPIEDVKHVLEIEEFPENENYETIAGFIMYRLRKIPRPADAVEYAGFKFEVVDIDHYKIDQLLVTQILPSQESDSPAIKEE >NZ_CP031988.1|WP_004639957.1|1138388_1138652_+|ribosomal-protein-L7/L12 MNLPHKIPPEALQMLRDGQLIHAIKITREQTGLGLKESKDLIDQYLNDHPQEQTRIQEQLTQRSRSGLKVFVVIFLILVILIWFVMQ >NZ_CP031988.1|WP_004639959.1|1137824_1138340_+|hypothetical-protein MTEQSPESLSDIEILDILQSMKKDELDVEAKEIIRNGGKAGRQEAHKLALVALNTSFEEKFVEAVTLALGLNAGQAKKIRYKKDRIRILKVRGIDYLAIDGAETAQVLAQIAQAITREDAIVTEGLHNIFPFWKEGWPMVQFDNAYKILAEDILIHYQATLDELISLYGGN >NZ_CP031988.1|WP_017396270.1|1136013_1137627_+|sulfate-adenylyltransferase-subunit-CysN MSHQSDLISQDILAYLKQHENKDLLRFLTCGNVDDGKSTLIGRLLYDSKLIYEDQLQAVTRDSKKVGTTGEAPDLALLVDGLQAEREQGITIDVAYRYFSTEKRKFIIADTPGHEQYTRNMATGASTADLAIILIDARYGVQTQTRRHTFIASLLGIKNIVVAINKMDLVEFSEARFNEIQVEYDAFVNQLGNRRPENIVFVPISALNGDNVVNSSVSTPWYKGQTLMDILESVEIKRESNKHEFRFPVQYVNRPNLDFRGFAGTIALGEINVGDEIVALPSGKKSTVKEIVTFDGNLEKAGAGQAVTLTLNDEIDISRGNVLVRTGEQPLISRSVRASVVWMTEHPLVKGKLYNVKIGTQTVPAKVTAINFRVNVNTLEHTQVEELELNAIADVVIEFDAPVVFDQYQDSRYTGSFIFIDRLSNVTVGAGMVEAAVEWAAHSNPVTAEDRAARLGQKPAVIGVSAQLIENAQALESLLIQQGVVAIAKANLTADQINLLRETGVVVITTIVDGTDTDIAAETAEEAADQIVELVRL >NZ_CP031988.1|WP_005089695.1|1135059_1135968_+|sulfate-adenylyltransferase-subunit-CysD MTENRLTHLKQLEAESIHIIREVAAEFENPVMLYSIGKDSAVMLHLALKAFYPAKLPFPLLHVDTGWKFKDMIAFRDNMAKTHGFDLIVHQNVEGREAGINPFDHGSSKYTDIMKTQGLKQALDKYQFDAAFGGARRDEEKSRAKERVYSFRDTKHRWDPKNQRPELWNLYNGKVNKGESIRVFPLSNWTELDIWQYIYLENIQIVPLYFSAVRPVVERSGTLIMVDDERMRLKEGEVPQMKSVRFRTLGCYPLTGAVESEADTLPEIIQEMLLATSSERQGRMIDHDEAGSMEKKKQEGYF >NZ_CP031988.1|WP_017396269.1|1133281_1134733_+|capsule-assembly-Wzi-family-protein MFLKKSLYVALFASLSSAVFAQGIVLNDENLRTDLNWLNQQGVIQISTSTWPMSGDEIKRALSQAQVTNKAQQNVIDSVMHAIAADNATAKVGLHAGTDLKTVPQAFGDSQKSQYQAALEFNAGSENWDAKIRVNGEKDPLIDNGNDVNVEGSYIAGKLWNQWVIAGQIPTYWGPGHDGSLIRGDASRPVYGVTVQRAVQNAFETKWLSWIGPWQYQAFAGQLDDYEAIPDTKLIGLRFTARPFQALEIGASRAIQWGGDGRPESFSSLWDAMLGTRDNGGRDKPDPANQIAGFDARLFLQPLWDVPISVYTQFVGEDEAGGLPAKYLYLGGADFSSSYKNMPYQLYAEWADTRTNGEAKGISYSHTTYKDGYYQHGFPLGHAMGGDGQMYSVGGDIRFDTMNRLSGRVMYANVSQTQRVELNNAAFPKSDKIKGIDITWTHYVKPTIPLKVNGWVSDSDVNGSDGGVSVGVEIPLEKNMFRF >NZ_CP031988.1|WP_004639969.1|1131602_1133129_+|lysine--tRNA-ligase MTQQNAQSTSEQTLSENDLIAQRHAKLKQIQETAKQTGKSPWPNTFKREHYTADLQEQFKDQDKAQIEGAEKVYVKVAGRVMLNRGSFIVIQDMTGRIQLYVDRKGLPVDVLETIKSLDLGDIIAAEGYIGRSGKGDLYVHLEAFELLTKSLRPLPDKFHGLTDTEAKYRKRYLDLIVNEETRKTFEIRAKVVAGIRAFLTNERFMEVETPMMHVIPGGASAKPFVTHHNALDMELYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFEINRNFRNEGVSTRHNPEFTMIEFYQAYADYKDLMELTENMLEKLAIDILGTTDVPYGEEVYSFKGPFKKISMFDAILEHNPDFTPENVNDREFLAKFTQDVLKEKVKPGFGLGKLQTIVFEETVETKLRQPTFITEYPAETSPLARRNDDNPHITDRFEFFIGGRELANGFSELNDPIDQAERFQAQVAEKDAGDDEAMHYDADFIEALEYGLPPTAGEGIGIDRLVMLFANAPSIRDVLLFPHMRRKD >NZ_CP031988.1|WP_125316763.1|1146351_1147517_+|IS3-family-transposase MSKKQKTYTAEFKAEAIKAIEENQGNVSESARQLGISMQTLSNWNNKAKAGTLAGTKQYSPDLNALLEENKKLKQQLKTTEMEREFFKKGSSVLCQRKSVRYAYMKSQSHLFPIILMARLLRVSVSRFYDWLKRGMSKRSIQRNQQTILVKIAHEETKQSYGYVRLTKHLQAQGIKISMYAVRQIKKSNQLYCKRHKRFKRTTNSDHNRSIYDNLLKQQFSMTKLNLAWSSDITYIWTAEGWLYLAAVKDLYTKQVVGYSLNERMTAKLVCDALNMAIRNQKPAKGLIVHSDRGSQYCSNEYRNLLEKFDFQGSMSKKGDCFDNAPIESFWGILKNELVHHRNYKTREEAKVDITKYIELFYNQRRIQKGLDFKTPNQMAEDFYRLAA >NZ_CP031988.1|WP_160124088.1|1147538_1147829_+|4Fe-4S-cluster-binding-domain-containing-protein MLIQHTSYQLEELNDNRFKGASKLLQVTDILVDGEYQQELTENVRNWVGSTNQQFYYLTEFYTDEIETRALNVTNEWRIDRQGSILGNGLPFILRA >NZ_CP031988.1|WP_160123851.1|1149317_1150700_-|sensor-histidine-kinase-N-terminal-domain-containing-protein MFKHSLKWRLAMSLLAVFIVLWSAVFSWLYIDLKQRLQDTLDQRLSASAQMVARLIQQLPLDSLGDATLSKLAKNDDANQLIACEVSLFSSDISLDNQVIAKTRGAPQNLSQRPEGFSTWQQGDTEWRSYVLRRGDIQVVAAERMFLRDTLLQQILQSVLVPLVFSLLICIALIIFIIRRQFRSLDQLSQYLNQKNLSYSEAADFLMQLKPASIPQEVQPFVNNSTQLIQKLNDSLQQEKAFSAYAAHELRSPLTAIKTHVQLAQLIGQQQNLPESIQHNLQQANESIRRYTLLLEQLLLLTQSENSLQEMTEAIWLRPTLEKVLADLGTRYPEMNKKIQVNWESLGEIQLPEFVLYTVLKNLLENALLHAQAEQIWISMHSGCLVIEDNGQQLTAEDIQHLGQRFWRKSAQQHGHGLGLALTANLLKQYGYQLSFNARRPYGGLSIEIKYGVSKRDMQA >NZ_CP031988.1|WP_005093734.1|1150692_1151367_-|response-regulator-transcription-factor MFIVLVEDDPYIAQSICAALNYLNISVEHVSHARAADYFIRHSAVDLCLLDLGLPDQDGLDLLHSWRRDQIDLPVLVLTARLRTDQCVQALNAGADDYLTKPFELEELIARIHALTRRHRGFASNTLQFDDLVLNRDTQTVTYQDQAVSLSRREFSLLETLMSHPNQILKNEQLIDKLYGFQDAIESNALNVHIYHLRQKLHPDLIQTVRGVGYIFKPFEHRHV >NZ_CP031988.1|WP_053579074.1|1151475_1153413_+|protein-disulfide-reductase-DsbD MLKWILGAVIGGGIMTGTAHADFLPPDQAFQFQVVSTSQDQAELSWKIAEGYYLYHDQLKVSHQQTPVKLALPKPEDKDDPNFGLTQVHYGQVKTNMNVQPNQQFAVQWQGCAESGLCYPVQRTTVKTDADGLFPAQNLSKPQKLLASTTQPEANEKILTTQKDELQAIGQTQSTDQALAEEKVEKVQVAAVSDPVVQPEVELTEKNDQLITDPKNQTSSAGMNDQWNNDQYFLSLLSKQGLLINALIFLGLGILLAFLPCSLPLIPILTGILVQQHRGYRAALIALVFVLGMALVYAVIGLAVAQLGYSFQRWFQSPIFISIFSILFVLFALNLFGAFQLSLPQGMLQRLDQWQQKQKGGTLIGAGLMGMIAALIVGPCMSAPLAGALIYVSQLNQPILGASYLFVLGLGLGLPLFIAAVFGSHLLPKPGIWMDRLKFSFGFVMLALALYFARPLLPGILYLSLLGVVLITCSGYFLFKMLPHVHRSVSKIVLMLLSGLLVFAGGMQLYHVWSQVQVAHVESRLEWQKVSTAAELQQVLAKHPAQPVVIDVYADWCVACQPIEKEVIPRSDVQTALQNVVRIKLDLTHYHPSQDELLKEWQILGPPTFIFLNAAHQEQRELRLTGSFSAAHLLGTLQQLQGEQL >NZ_CP031988.1|WP_160123852.1|1153409_1154252_+|redoxin-family-protein MMISSDALHLGPLMLPWTLMIVATGLMLLSAVLFGLARKYSWSKQLLGQSQDLLWSSFLLGMLGARLVFVLLNAELYFVAPIDILKIQDKGFHLWGGVLIGTLWYVIRNRQLQTRFKAILLIIFVLWVGLGLAFKSSLKTEAAFPDLAFAGLEQERLGTDKIPLSQFIGQPTVINLWASWCPPCHREMPILQRAHDQHPDIHFVMLNQGEDVDTVRAYLSKNQFSFKHVMLDTQGEMPQAVNSFGLPTTLFFNAQGELIERHQGELSQAMLQQYLNKINP >NZ_CP031988.1|WP_160123853.1|1154273_1155026_+|thiol:disulfide-interchange-protein-DsbG MNTIFKASVLLGTMLTVACGVNADPNTIKKQLEKDGFEFVKQIPSPEGLTGWVGHEDQYSNTVFISNDDKYYIKGELFDAQGKSLSNEQIEKHMKKAVLDDVWKTLEKSTWIQDGKPDAPRVVYVFSDPNCPYCYKFWQAARPWVESGKVQLRHIQVGVIREESRGQVATLLMSKNPAAVFNDINKNKGKKQLKKMAKIPAEIAAKIDANQALMGKYGFFSTPSMAWKNNQGEFKSTQGLAMDVKEIFEQ >NZ_CP031988.1|WP_005247061.1|1155410_1155719_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDMIAENAKIDFSQVDFVSQCLKVLANPDRLKILCVLVDGEMNVQEIEESTDIHQPTLSQQLTVLRKANMVGTRREGKQIFYRLSDPKVLSLMQKLYELYCA >NZ_CP031988.1|WP_016659403.1|1155839_1156256_+|YeeE/YedE-family-protein MHDFLIAFIGGLMLGLSVVGYLYVNGRIAGISGLIGQVLNSKTMFKTPAIWFLLGLILTPFIYGLFVQPEIELNASPLMMIVAGLLVGFGTRLGSGCTSGHGICGISRLSKRSIIATMTFMFAGFVAVYIIRHITGAF >NZ_CP031988.1|WP_160123854.1|1156257_1156674_+|YeeE/YedE-family-protein MKNVFAFLFGALCSVGLMVSGMSNPEKVLDFLDLFGDWDASLAFVMMGAIAVAFIPFQKALRTAQPKTVFNDPIDLPKNNQIDKKLITGAVLFGAGWGIAGICPAPSFTLIGLGHYQVLYFIVAMLVGVWIHRKWSGA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031988_5 | 2138992-2139143 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP031988_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP031988_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031988_5
The CRISPR arrays of NZ_CP031988_5 >merge|NZ_CP031988|5|2138992-2139143|PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAAGATTATTTTTTCACGGTGTGGGTTTGCTGGTGGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAATGTCTGTTTGTTACATAGATAGCCGCTAGAAAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAAT >NZ_CP031988|5|2|2138992-2139143|PILER-CR ATTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAAG ATTATTTTTTCACGGTGTGGGTTTGCTG GTGGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAAT GTCTGTTTGTTACATAGATAGCCGCTAG AAAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAAT >NZ_CP031988|5|3|2138995-2139142|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAA GATTATTTTTTCACGGTGTGGGTTTGCTGGTG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAA TGTCTGTTTGTTACATAGATAGCCGCTAGAAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAA
>NZ_CP031988.1|WP_160123967.1|2137963_2138749_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSDHLEHTFELTDDEMHLYSRQILLDGWDIEAQEKLKLANVLIVGAGGIGCTSAELLARAGVGKITIVDADTIEMSNLQRQIAFTSNDLGQYKAETLAKHLQEINPHIQVSYQNTRFDETNADELVRHQDVVLDGCDNFTTRYLVNAVCKTHQVPLISASAIGFEGQMFMVESDSACYECLFPKENKTNEGLRCAESGVLATTPVMIASLQAHHTLLFLGLGLTPLKQKLLLWNGLNLTQRILQFEKDVNCPVCQASASVN >NZ_CP031988.1|WP_005081125.1|2136619_2137918_-|AarF/ABC1/UbiB-kinase-family-protein MKRNILVDGLRSVARIGETVIVAAQAGVKYATEKPSNAKLMRETFESLGSTYIKLGQFIASTPSLFPREYVQEFQGCLDQTPTLPFSYIQQVLAEEFEGKDLNSIFSFIDENPLASASIAQVHAAKLVTGEDVVLKVQKPGVETILYTDLNVVHWATKLLEKAVPKIKFASLSEIVDEIKTRMVREVDFIEEAQNLDDFVQYLNISGNQAATAPKVYHQFSTRRVLTMQRLYGVPLTDFDVVKQYAKDPTQVLITAMNTWFGSLMLCKSFHADLHAGNLMLLEDGRVGFIDFGIVGQLNPEVWTACMAFMDALQHTNYIAMAENMLKMGMTNQKIDTQVLAADLERLFSGVLLADPQEILSSNPADLNDIMMDMVAVGERHGIKFPRDFALLFKQMLYFDRFMRVLAPYTDIYADQRLKMVHNIEPASLLKH >NZ_CP031988.1|WP_150026141.1|2136134_2136515_-|dihydroneopterin-aldolase MDAIIIEGLKVDTVVGCFNWERQIIQPLMLDLTIHNDLSQAARSDELDDTLNYAQICEIAAQVIQDAKPKLIEHAAQLVLETLFSTFPSIESICITIRKPAIIAQANAVGIRLERNRNNFCARAGE >NZ_CP031988.1|WP_150026140.1|2135743_2136178_-|2-amino-4-hydroxy-6--hydroxymethyldihydropteridine-diphosphokinase MNATETIFALALASNVQQLENFNFAYTQIASLGAVEFSSIYEIPCRDGVGADYWNSACLLKSHLSVDEIIDLLKKLEQQSGRVRPSHHISLDIDVIAWGESLEHMQFNPKKLPLALDVKIPLYEIWKTQILQYDQKRRFPIIHI >NZ_CP031988.1|WP_004638641.1|2134476_2135112_+|2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone-monooxygenase MRHYTGLDQLINSFDQALRSLVPGATTSQRSNPANDEASQLCVSDARHVAGLMRVNHSGEVCAQALYHGQALTAKLPHVREEMQQAAVEEQDHLAWCEDRLKELDSHTSVLNPIWYGLSYGMGAIAGIAGDKYSLGFVAETERQVSQHLQEHLQQLPEQDQRSRKILEQMNEDELHHRDTALKAGGVDLPVPVRITMTAISKLMTKTSYYI >NZ_CP031988.1|WP_004638642.1|2133150_2134473_+|MFS-transporter MMKQDEQLMTSRRFAPMFFTQFFGALNDNVYKQALLLVITYGWIQQQSAAVSTLNNLAALLFILPYFFFSATAGQVADKYERSQLVRFLKLLEIVIMMIGTAGFLLGNLWLLLFALFLMGTHSTCFGPIKYAILPEILKPQELMSGNALFQSGTSIAILFGMILGGAVIASSAGNLLWISITVLIIACLGYLASRFILPQKVAAPDLKIDWNFFRTSFQTIKYAKSIPIVFTVLLGNSWYWFYGATYLTQIPQLTQQNLHASENVVSLLLTFFSVGIGIGSLLCRRIGGSEINIKMVPYGAIGLTVFAFYLAASLTFVPERTGELLGLGDVFSEGAVYYHVMLAVTLLGISGGFYIVPLYAMMQAYSPRSHRARVVAANNILNAVFMVSSAIFSILILSILKIDIKILFSITAVLSAIFSFWLLTRLKPLLKNAPTTLED >NZ_CP031988.1|WP_160123966.1|2130281_2132987_-|BamA/TamA-family-outer-membrane-protein MPSKSKFKQSTLVHSMHLIFKMQSFPKLICSGFLISYCISVAYADEEAIVVAENSTIERMKDQVKSIPSPEIPYETFNLSSEYYNPAQDSVAALKQQEEAPSQIDALKPIQLDENLEHLPVIALDQNMANEIFQIAEEAKNDALAYRENVAKNPELVVNEASQSELTEISNPPVNIDRLMQEIQADSQIIVEANESGRTLAELQPKTEQVEEKAGFFKRIVNRFRPENLLGAERVPRISADVSGAPPALATNIKAKLSSFTQEAFEDFNIALPQLRSLTNQAAQAVGYYDARFSFEKLSDSRVKVTVEPNEPVKIDKQNIEFTGEGENAPQFQVIRLIPEQDEGDIFNHGKYEATKTKITNAASDNGYFDAYWRLHDVKISQPEKTAEINLKYDTGERYKLKAVEYKMSDPSKPLPLTQKVLDSLAPWKDGDDYAFWRVNVLANNLTNTRYFNYTLVDTIKPDAIQPPLDLPPDLQALVDQQRVEQSQLFSAQQKADIARQQVVSAEEVTQDVVDESQFSGSEPTPAYSLARSMPNIQNDETERQALEEQAWLEKKIPVVVTLNADRLNTIETGVGYGTDTGARIRSQYRRAFVNKHGHSFDANIEVSEIRQSIDGRYSIPYKHPLNDYFNLVGGYERETRDNIGPNVELLVESAVVGGERVIKNPLGDWQHTFGLRYRLDRLTGKGDVDVSELPDAFRSAGTNSEQESLLLGYEISKTNSNTRLNPTKGFKQTYKVELGTESILSDANMAILTAGWRFIYSLGENDNHQFVGRGDASYIFTDDFDKVPYNLRFFTGGDQSLRGFDYKSLSPEEDGYKIGGQALGVGSLEYNYQFKDGWRAAVFSDFGNAFDKQFSNPTEYSVGVGIRWRSPIGPIRLDVASGISNDNRPIRLHFFIGPQL >NZ_CP031988.1|WP_160123965.1|2125725_2130234_-|translocation/assembly-module-TamB-domain-containing-protein MTEEVEQQQTPSTGPKRERRILRSILLMVLIILLLLVSSLLVMMSTDKGSRFLLDRVLQTQKIIHYEYESGNLLRGIILKNVLVQLEAVDVSLDRADVSLGWRAILKKEIHLSHADVANLKIINKKPPSGEPFGFDPIKLPFILRIDEASLDHLEIQTATAKINFDDIYLKDALWSETKLKFKDSRMDMGYLAVKDATAQIDFSGKYPLNAKADLIIPALNSIDIETIKVVATGSLDTLRAGVATLTPDLLTGWVVLHPVRDQVPMQGELFFRNYHLPILKEQKLFAKDGIARFKGNIEKLVLSLDTDLKGEQIPEGKYNALMETDLTDQLNIQDFNGQLMGGAVSLKGLVNWKDHVSWDLKGRLDRLNAKDETLPQIAQDFLPPSLDANISSTGMLKNGMSVNAQLAFDKYETWQVKLNQSEQKNNQPEPMLLDVAWQGIDRAVPYIGWLSSAEGHTNITLKDDQQDIYVATTVRPHEQGLLPAGKYDAHIDLKGSLLNVENFSYVAEKGRLDGQAKVKLPTDKQQLAWQAQLKAKDFNPQTVALAAPVNLLNGEILASGFAKPNQQIIQFERIDLQGQLAQANQKETVVLQGKATTALMFDDVQAGGGFKSFAVDYDGSLNALNQGNGLLKINIAGTPTNIKINELKHDGVAGKLFATGTVDLQDKIGWNIETSLVRFKPQYFVSSLKGEVSGHVKTQGVWSDKVKRIDIRQLNAAGFLNNRPVRGRGNLSLLLDSNQTGFLPQQFEANDLFFAYGQNQLQATGNAQSLRFKVNAPALYELYPGLRGRAYGSLNVQSQPRLSATANLVVDGFAFNDLASVKSLRIQGQLPTSETTPTQLTATIDQLRSGKRELENATLNLTGTRRAHLLKLETKNARTNFYVQLAGGFNQNNDWLGQIQKGKFSSRRVSLVQNQNTPVIYTTARTELYVGQHCWQSAESQLCLDQPARISPEKGNFSFVTKDLDLKDFAAFMPEGIAVTGQLNGYAKASWAKGTRPKLDSRLVTRKGEIGLAAEDPQDPATTVTYDELSLIAKSISDGLLFRVDMKTPDIGTGYANVVIDPFQTGMPMRGEIAFDDVQLKVFKPFIKDVRSMAGTLALAGKINGTLTQPQFTGEMRLKNGAISMISLPVNLTNMQLYSSIRQDTASIDGAFNSGQGVGRIKGRFDWKDNPHLSLTLKGDNLLVRQAPMITAIVQPDLSLDVYPFDQRLSLRGTIDVPRARISMPESSATVVNVSPDVRVVHQGQDLLATLRAAKPWDIRADMTVTLGNQVIFQGFESNIPLVGRLHLSQRGLETAMRANGAIGVSQKVKIEAYGQSLDLNRAIARFNGPLANPTLDIDANKSVQGSMVGVRVAGTATVPNVQIYNDAGLSEQEALNALLTGRINEGGSGLSNTEGFKSDVNNTIAAAGISMGLGGTRALTNQIGRTFGLSGLALDAQGTGDDTQVSLTGYITPDLFIRYGVGVFTPVNKLTLRYQMNRRLYLEASQSLERAIDVFYNWRF >NZ_CP031988.1|WP_004638645.1|2125172_2125559_-|hypothetical-protein MHQINRSMMMKKVLLIAIGLVLVGCADKKPLTPEEKWHGFCVSVGNAARSITLDRQNAIEKQQAIEHAGKIEDKTIHKFILQIIDEVYEIPVDQLKSDPSAIRDEMKQKFTEQCLATPHDELPNYKSF >NZ_CP031988.1|WP_004638647.1|2122273_2124913_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEAYRQHVEERAALGVPPKPLDDAQTAELVALLKNPPAGEEAYLVDLLENRVPAGVDQAAYVKAAFLAAIAKGEATSPLVTKERAVYLLGTMLGGYNVAPLVELLDNAELAELAAEALKKTLLVFDAFHDVADKAKAGNVNAKAVLQSWADAEWFTSRPDVPEEIKITVFKVTGETNTDDLSPAQDAWSRPDIPLHANAMLKNERDGINPEKPGEVGPLSQIKELIAKGNQVAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFFGDELPHIPNKKDGGVCLGSKIAPIFFNTMEDAGALPVEIDVANMNMGDEVVLKIDHTAAKVTAFKDGAQIAESELKTPVLLDEVRAGGRINLIIGRGLTAKAREELGLEPSTLFRTPVQPADTGKGFTQAQKMVGRACGLPEGQGIRPGTYCEPKMTTVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSSDLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVKFKGKMQPGITLRDLVHAIPYYAIQAGDLTVEKKGKKNIFSGRILEIDLTEMENDLTVEQAFELSDASAERSAAGCSITLSEEKVAEYLRSNITMLKWMIAEGYGDARTLARRAENMQKWLDNPSLLKADADAEYTKVYEIDLADIKEPILCCPNDPDDAKLLSDVQGDKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGQLLDKVPSGSLSTRLWLAPPTRMDEHQLMEEGMYNIYGRAGARTEMPGCSLCMGNQARVAPNTTCVSTSTRNFPNRLGQGANVYLASAELASVAAVLGKLPSPEEYQQYASQIDSASADIYKYLNFDKMSEYTKEADQVDTKKIQAAQLT >NZ_CP031988.1|WP_160123968.1|2140259_2141279_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKKKYLNAIVLTTGMLISSGSVVHAGLFSFLSPKASWQNCDVKSCSVGGSTNVTSSYAKTKYPIVLAHGMSGFSAVGPLQYWHGITEDLVSNGANVFVTQQAAFNSSEVRGEQLLLQTKQILAISGAEKVNLVGHSHGTHSIRYVAGLMPDKVASVTAVAGPGKGSNVADVVYDFTQSPVGPIAAPVISAGVNAFGALIGIGSGNYYDQDSLAGLWSLTTAGAAEFNQRFPAGIPTAACGSGRELESNGVRYYSWTGISPFTNALDPFDYALTATSLLIPGDSDGLVPRCSSHLGTVIRDNYAFNHLDEVNQILGLVGFLQNPVTPFRLQANRLKNLNL >NZ_CP031988.1|WP_160124096.1|2141556_2142576_+|AraC-family-transcriptional-regulator-ligand-binding-domain-containing-protein MSIPRLHHPHFISSSYVHLLSEVVARWNISAEELFWGTGVEIEKLHDINYKISLTSFKKVIAKTIDLTQEQGIGFYASTQLKISSHGLLGFTVAIAKNPLDAIQTINQFVSLQCSFVDLHFVVENELAYYNIIYDKSVMDFNDPCDLQAYEFSCVFFLTGFVHLVRFFIPDFKPSIDLQCKCPEYFSRFKNILASSFAEIHYEQPHTRLISSAKFLETPLSMSDPLTSEKFKLLCQKELDELVATQNILHRVKNMIDDPNKGLLNIDQIAQKLNLTKRTLQRMLQEKNVSFQVLYDQVRKAKAQKLLLNPFMTKDEIARNLGYSSLSSFNRAYKRWENQ >NZ_CP031988.1|WP_153568910.1|2142645_2143329_-|superoxide-dismutase MRYLNKGLLTLLVCSSVSISAFANFTQAPLPYKSDALEPAIDQQTMEIHYGKHHKAYVDNLNAQIKTYPELDKLNIEQIQQQISKYNAAVRNNGGGHFNHAFFWESLAPTDKTGKVSPKLLKQINQDFGSFKAFQEQFNQAATSRFGSGWAWLIVNPQGKLEITSTANQDNPLMDIAEKKGQPLLGLDVWEHAYYLKYQNRRADYTNAFWSVVNWNKVNDRYQKASK >NZ_CP031988.1|WP_153568911.1|2143463_2144234_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKIQGKHFVITGGGSGLGAATAEYLVEKGASVTLVDMNAEVGEQQAKAIGDQAEFVKLDVTDEQAAEQFFKDVVEKHGSLHGLINCAGVGPSAKVVGKDGVHDLAMFSKVLHINVTGTFNMLRYAADAMSKNSVEEGDEDRGVIVNTASVAAFDGQIGQAAYSASKGAVVAMTLPIARELARHSIRIMTIAPGIMETPMLKGLPQNVQDALGQMVPYPSRLGRPEEFARLVAHIAENAYLNGEVIRLDGAIRMAAK >NZ_CP031988.1|WP_153568912.1|2144376_2145435_+|AraC-family-transcriptional-regulator-ligand-binding-domain-containing-protein MSKNPPPDLNSAKDTISNALIREALSVAASRGLNIVNIANRAGISAELLTSAKARIPVTQCAQLWVELAESMNDEFLGMDSHPMRRGSYKLLAKLAFEADTLEQAIREILKFLSLVLDDIHGELVQNGSKAYLILHDRDQPKRMFTYSTFLMLVHSLMCWLSDQRIAFLKMSFKCHQPVEIQDYRIRFCENIQFHATQNCIEFDAHYLKHKIKKDKQALNDFLKHTPYNLIVRFKNENSLSLQIRRQLLLQPPSEWAELKDIAQQLNMSTATIQRRLKHEGVSYQQLKNDIRCDIAIERLSKTNDSIQSISDDLNFHDPSAFHRAFKKWSGVSPGSYRKSAPNKQNRLHHLG >NZ_CP031988.1|WP_160123969.1|2145451_2146087_+|FMN-binding-negative-transcriptional-regulator MYIPQIFKETRQDVLHDLIRQYPFATLITQNNAGLDAMHLPIELLVDDEQNVTLVAHIAKNNPLHTQIDSGAEVLVIFQGQQGYISPNWYPSKQQHHQHVPTWNYQVVHVKGKIYFSQDEKVLRGILARLTRTHEAKQDKPWKMSDAPSEYIAEELRHIVAVEIQVSEMVGQFKMSQNRDPIDAIGIVEGLEQQGNTELAQVVKHSTQSNN >NZ_CP031988.1|WP_160123970.1|2146083_2146902_-|peptide-chain-release-factor-N(5)-glutamine-methyltransferase MNIAQALEIKGEIDSYERQEAAWLLEHILGVNSLELKLRLEQELTEIQEQAYLDGLARIEQGEPLAYVTGSQPFWTLDLKVTHDTLVPRPDTEILVETVLKLSLDPQANIVDLGTGTGAIALALASERPQWSVTATDIYQPTLDVAQENSLKHGLSQVKFACGAWFEALEQQQFDLIVSNPPYIDPDDVHMQKLKSEPERALIAANHGLADIEIIIAQGKTWLKAKGWIVLEHGYDQGRAVREIFELHGFEQIQTIKDYGGNDRVSLAQKAG >NZ_CP031988.1|WP_109440294.1|2146901_2147990_-|peptide-chain-release-factor-1 MKASLRLRLDQLCDRHEELTALLADVEVISDNKRFRKLSREHNDLTEITEVWGKYRQAEEDIETAEMMKSDPDFKDMAEEEIKENKALLVELEDQLNVLMIPKDPNDANAAYLEIRAGTGGDEAAIFSGDLFRMYSKYAETQGWRIEVLSENEGEHGGYKEVICRIDGEGVYGRLKFESGAHRVQRVPATESQGRVHTSACTVAILPEVDVDTTVEINPADLRIDTYRASGAGGQHINKTDSAVRITHIPSGVVVECQEERSQHKNKAKAMALLVSRLENAKRAAADAATSEMRRDLVGSGDRSERIRTYNYPQGRMTDHRINLTLYKLDAIMEGDLTELLDSLHREYQADQLAMLAQENGG >NZ_CP031988.1|WP_005081147.1|2148370_2148802_+|hypothetical-protein MKANILLLGAILASSTIATTTYADNATRVAATSALGSVVGTAIGKEIGGHNGALIGSAVGGAGGAAAASSKRTRTEAAIGGGLGGVGGYAVGKNVGGTTGGYIGAAAGAAGGAALGRQVGQDRYYDSRQNQKKKWKKKKHRRH >NZ_CP031988.1|WP_004638623.1|2148954_2150208_-|serine-hydroxymethyltransferase MFANISIAEFDPKLAQAIASEGERQEAHIELIASENYCSPAVMEAQGSKLTNKYAEGYPGKRYYGGCEYVDVIEQLAIDRAKELFGADYANVQPHAGSQANSAVYLALLNPGDTVLGMSLAHGGHLTHGAKVSFSGKTYNAIQYGLNPETGEIDYEEVERLALEHKPRMIVAGFSAYSQVVDWQRFRDIADKVGAYLFVDMAHVAGLVAAGVYPNPVQIADVTTTTTHKTLRGPRSGLILAKANEEIEKKLQSAVFPGNQGGPLMHAIAAKAICFKEAMSEEFKTYQQQVVKNAQAMAEVLMARGYDVVSGGTENHLFLLSLIKQDVTGKDADAWLGAAHITVNKNAVPNDPRSPFVTSGIRIGTPAVTTRGFGEAEVRELAGWIADIIDSKGDEKVIAEVKAKVEAVCAKFPVYAN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031988_6 | 2990420-2990513 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031988_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031988_6
>6.1|2990448|38|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder TAATAGCTGCTGTTCGTGCTGCTGTTTCCGCGGCATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031988_6
The CRISPR arrays of NZ_CP031988_6 >merge|NZ_CP031988|6|2990420-2990513|CRISPRCasFinder GCATCTGCACGGATTTGAGCTTCATTATTAATAGCTGCTGTTCGTGCTGCTGTTTCCGCGGCATCTGCATCTGCACGGATTTGCGCTTCATTAT >NZ_CP031988|6|4|2990420-2990513|CRISPRCasFinder GCATCTGCACGGATTTGAGCTTCATTAT TAATAGCTGCTGTTCGTGCTGCTGTTTCCGCGGCATCT GCATCTGCACGGATTTGCGCTTCATTAT
>NZ_CP031988.1|WP_008942209.1|2988241_2989846_-|YadA-like-family-protein MKKTFQLSIITVALLASHTYAAPVWEGPAGTGTGFSNAMGGETNFANVDPSATGIILGQAIDVSQTSIGIGYNSNAMGNDSFSAGSANNANGDSSVAVGRIANANGDNSIALGATVAAGGTDSIAVGNSQTVNGDNATAVGRGSLVNGSQASSLGHVAWTGGDGATAIGSETWANAENATVLGFNAETGGKNALNIGHDAHGGGLNAIHIGHKTTGSAENTIVIGSNDPTKPGQPWADDKNSVAIGYNADTHNGGGGSTENTVSFGGFFTGAVRTISQVADGINDHDAINVSQLNNAIASLTSGAELIAHADDHLAVEKNQRIAADTDLQAALDNEAQIRADADAAQTAARIAAVDNEAQIRAAADAAEKAARIAGDEALAEARIAGDAAEAAARTAAINTEAQARIAGDAEQRAERIKQVNRLDGRINAEAAERTAEVARLDGRIDHASRRLDDIEKTAYRGVAIALAAQQAVPNIRSGQVALFAGVGHFEGETAGSVGVVTSFISNRVSLSGAVGFAGGNEVGGRVGLSYSF >NZ_CP031988.1|WP_017396682.1|2987080_2987953_-|hypothetical-protein MKSTQYKLSLVLLGAFFFTGCKDENGNFNVGVSLGGTGTGGLSVGTESPVPKPQPDVKPDRMEEDGLLYAVAYPNPITQNCNGIERKIQFVRHYFPHTPMIMGDRVDLYGMKDSSPTRFKLQVIVKNTTSSPIYEYINSCKAAFQLTGTKTAKITQTDYCLNDETVNVYQPDESRTYFYTFNLPNILQNWTANYQAQYSKKFYAETQGSMYDNESIKERTQCDPLSTILLLDEYPSTKDGAPPSSNTGNGNNSGSNNNPPTNTDNPPPIFGGFDLDEDDAEPPIFAGFGL >NZ_CP031988.1|WP_004890115.1|2985312_2986512_-|integrase-arm-type-DNA-binding-domain-containing-protein MPLTDTWLKKNLDRERSAIHTESDQDGLSVRVSQKGKLTFQMRFRYNDKQARLDLGTYPNMSLKEARIELQKMKAILEKGHDPRIHKKVELHKITEAITFEALFREWHAKYSIPNKKNADQYLRSFELYVFPKLGSIPAEQITLHMWLDLLEEQFKQSPSITDRILTNTKQCLDWGINRKLIEQNPIRHITGKRDLNIKKNKTVRVLQDDELSLIFKICDESRTSLRNVLFLKLCLFYGNRYSELRLARKSDFDFSKNTWTVPYENHKTGESKGDIVRPIIDEIKPWLQSAMDLSNSEYIFPHENGKEPMGRSGPTDTPYNFMQFARKNYKIEMDHWSMHDLRRTARTNFSAFTSRDVAELMVGHVMPGEQGTYDYYDYQKEMSKAYKKWWKKLSNLSS >NZ_CP031988.1|WP_005206861.1|2985098_2985320_+|hypothetical-protein MGYLTSKEIRHKLKNCSTSTLWRYQQPNQKMFEQPMPQPIKKCAGSTSLWDEETFNEWLIKYFNNNQMSNLSS >NZ_CP031988.1|WP_005228646.1|2983981_2984884_-|hypothetical-protein MIDKKISSLEQLEQNIWLNFCYYYQCELDDELIATENQSYIDQKEKIIKRMQQNDFSVNEERISFAEMMGSDLNIPFKPSQLAELLTQLNALRVKVNDLPTKIFQRQYSDILIAYVQMLGGVEFIQNRTLAKSAKSIIAVKVRYDKHLYPRREIIYRILREQVVRRGKWDNLNQAVNFVLGDLVKAFEEYDIQWLQSELVLKQKMLIKLEGELLSVKQDKAGQGGIRRKPRTALTSKKIVDLKKELNELNQILRAKYPSKEMEKLKYKIPYSGGYIAETIIHELRNQPDILKEILHKDSC >NZ_CP031988.1|WP_032056213.1|2981212_2983657_-|hypothetical-protein MMKESRYIGILDDFSWNNLKINVEDIFHILKLKKLQMIVPCGDDASGFGHTQQLIDELEKLQYLWCLVEQHSSLTLDQFKHNLMHSTATNWLLKRQEIESLSCDLNLRISPYLKIGDGLYLVLNMLNFLKQSSSNLNHHLYLYPHLNGNANTVLSSGVGDGKHLQPHLYCEVLFWLKQYLSTTNYQPNYVIPNLVHQVTSEQLLDTLLERYQSVFCLTLNIQLPFKSNEMDDYHSFIQDRLMRIPELQQTMQGIAGLLYMMTKVENDLVSGLNLNVVLMLNNQKEQLSTRIIKKLESEFKKILIDRPFHIHPWGEQLAQGLKKDPIDGVIKSTNHRKIKDYKYWILNIFKHVDEVVQFLYTLNNQIYPINQFWYSSELLGERNFPLDLAMMARKSFQDMVRYDDDKIWSVRHQPVLARNRLKISQIFNRELANELGDFQEFIALIQNIEIFMTTVMNTTVGAFDLPIRLGNIELTAEEIEHSITRIGHQLLWIYSHLPDLKLLSISPYLYRLNINVQFFLKNMNLWQVEQQLAEKTSKQGAERFNALVKQLRSDYHSNIRQSKLDVKIWKQVQNSVTVDLDEATTDSHQTTTEVIEYVDYVQTEGVSDEIITTNDHIEACYKKCGLRSTSLETYLKSLLKKECILYRVRFGLASNGAEVNQQIFSKNITEMFLRNRSREPVSSMTGYFGAWREYTGQHTYLDLILVFDARKYEELKSKDDLFGEIWKTQMNTVQQDGFKTLFDTVPLMPSVPELNQQSLLLEIGDQSRRKQVFEVLVNYYSFLELYERQATVRVPKVLVKGSVAKSKVKTKSKA >NZ_CP031988.1|WP_005028482.1|2979934_2980927_+|IS5-like-element-ISAba23-family-transposase 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gaggactaccatcaccgccaatgcc CRISPR spacer gaggactaccatcaccgccaatgcc Protospacer *************************
17. spacer 2.5|498372|19|NZ_CP031988|CRT matches to position: 496875-496893, mismatch: 0, identity: 1.0
gaggactaccgtcaccgcc CRISPR spacer gaggactaccgtcaccgcc Protospacer *******************
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gcggactaccgtcaccgccaatgcc CRISPR spacer gcggactaccgtcaccgccaatgcc Protospacer *************************
19. spacer 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT matches to position: 496317-496341, mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 2.4|498312|25|NZ_CP031988|CRT matches to position: 496875-496899, mismatch: 1, identity: 0.96
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32. spacer 2.3|498258|19|NZ_CP031988|CRT matches to position: 2579460-2579478, mismatch: 2, identity: 0.895
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33. spacer 2.5|498372|19|NZ_CP031988|CRT matches to position: 497358-497376, mismatch: 2, identity: 0.895
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34. spacer 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT matches to position: 496077-496101, mismatch: 2, identity: 0.92
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35. spacer 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT matches to position: 496137-496161, mismatch: 2, identity: 0.92
gcggactaccgtcaccgccaatgcc CRISPR spacer gcggactaccatcgccgccaatgcc Protospacer **********.**.***********
36. spacer 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT matches to position: 496995-497019, mismatch: 2, identity: 0.92
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37. spacer 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT matches to position: 497178-497202, mismatch: 2, identity: 0.92
gcggactaccgtcaccgccaatgcc CRISPR spacer gcggactaccatcgccgccaatgcc Protospacer **********.**.***********
38. spacer 2.7|498486|19|NZ_CP031988|CRT matches to position: 497358-497376, mismatch: 2, identity: 0.895
gagggttaccatcaccacc CRISPR spacer gaggactaccatcaccacc Protospacer ****..*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031988_2 | 2.1|498147|22|NZ_CP031988|CRT | 498147-498168 | 22 | NC_013856 | Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510b, complete sequence | 505168-505189 | 1 | 0.955 |
NZ_CP031988_4 | 4.1|1145280|25|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder | 1145280-1145304 | 25 | NZ_CP018261 | Acinetobacter haemolyticus strain XH900 plasmid pXH901, complete sequence | 44736-44760 | 2 | 0.92 |
NZ_CP031988_4 | 4.1|1145280|25|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder | 1145280-1145304 | 25 | NZ_CP031985 | Acinetobacter haemolyticus strain AN3 plasmid pAhaemAN3c, complete sequence | 21095-21119 | 2 | 0.92 |
NZ_CP031988_2 | 2.4|498312|25|NZ_CP031988|CRT | 498312-498336 | 25 | NC_015156 | Vibrio nigripulchritudo plasmid VIBNI_pA, complete genome | 112719-112743 | 4 | 0.84 |
NZ_CP031988_2 | 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT | 498426-498450 | 25 | NZ_CP020084 | Blastomonas fulva strain T2 plasmid unnamed, complete sequence | 28-52 | 4 | 0.84 |
NZ_CP031988_2 | 2.8|498540|25|NZ_CP031988|CRT | 498540-498564 | 25 | NC_003276 | Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120alpha, complete sequence | 368542-368566 | 4 | 0.84 |
NZ_CP031988_2 | 2.4|498312|25|NZ_CP031988|CRT | 498312-498336 | 25 | NC_003276 | Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120alpha, complete sequence | 368542-368566 | 5 | 0.8 |
NZ_CP031988_1 | 1.1|72119|30|NZ_CP031988|PILER-CR | 72119-72148 | 30 | NZ_CP014200 | Escherichia coli strain MRE600 plasmid pMRE600-2, complete sequence | 41997-42026 | 7 | 0.767 |
NZ_CP031988_1 | 1.1|72119|30|NZ_CP031988|PILER-CR | 72119-72148 | 30 | NZ_CP042885 | Escherichia coli O10:H32 strain NMBU-W12E19 plasmid pNMBU-W12E19_01, complete sequence | 74413-74442 | 7 | 0.767 |
NZ_CP031988_1 | 1.2|72175|29|NZ_CP031988|PILER-CR | 72175-72203 | 29 | MN694624 | Marine virus AFVG_250M250, complete genome | 32833-32861 | 7 | 0.759 |
NZ_CP031988_1 | 1.2|72175|29|NZ_CP031988|PILER-CR | 72175-72203 | 29 | MN693702 | Marine virus AFVG_250M251, complete genome | 32809-32837 | 7 | 0.759 |
1. spacer 2.1|498147|22|NZ_CP031988|CRT matches to NC_013856 (Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510b, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
ataaaccgccgtcaccaccacc CRISPR spacer ataaagcgccgtcaccaccacc Protospacer ***** ****************
2. spacer 4.1|1145280|25|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018261 (Acinetobacter haemolyticus strain XH900 plasmid pXH901, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
ggtaaacttatttcaggacgggaca CRISPR spacer tgtatacttatttcaggacgggaca Protospacer *** ********************
3. spacer 4.1|1145280|25|NZ_CP031988|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031985 (Acinetobacter haemolyticus strain AN3 plasmid pAhaemAN3c, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92
ggtaaacttatttcaggacgggaca CRISPR spacer tgtatacttatttcaggacgggaca Protospacer *** ********************
4. spacer 2.4|498312|25|NZ_CP031988|CRT matches to NC_015156 (Vibrio nigripulchritudo plasmid VIBNI_pA, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gaggactaccatcaccgccaatgcc CRISPR spacer caggactatcatcaccgccaatgtg Protospacer *******.**************.
5. spacer 2.6|498426|25|NZ_CP031988|CRT matches to NZ_CP020084 (Blastomonas fulva strain T2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gcggactaccgtcaccgccaatgcc CRISPR spacer ccggactaccttcatcgccaatgcg Protospacer ********* ***.*********
6. spacer 2.8|498540|25|NZ_CP031988|CRT matches to NC_003276 (Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120alpha, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gtggactaccatcgccgccaatgcc CRISPR spacer ctaaactaccatccccgccaatgcc Protospacer *..********* ***********
7. spacer 2.4|498312|25|NZ_CP031988|CRT matches to NC_003276 (Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120alpha, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
gaggactaccatcaccgccaatgcc CRISPR spacer ctaaactaccatccccgccaatgcc Protospacer ..********* ***********
8. spacer 1.1|72119|30|NZ_CP031988|PILER-CR matches to NZ_CP014200 (Escherichia coli strain MRE600 plasmid pMRE600-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
actgtaactaattgatatataattcatgag CRISPR spacer atattaactaattgatatataatacttgtt Protospacer *. ******************* * **
9. spacer 1.1|72119|30|NZ_CP031988|PILER-CR matches to NZ_CP042885 (Escherichia coli O10:H32 strain NMBU-W12E19 plasmid pNMBU-W12E19_01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
actgtaactaattgatatataattcatgag CRISPR spacer atattaactaattgatatataatacttgtt Protospacer *. ******************* * **
10. spacer 1.2|72175|29|NZ_CP031988|PILER-CR matches to MN694624 (Marine virus AFVG_250M250, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
atgaactttattgcacctcttacatttaa CRISPR spacer catatctttattgcaccatttacatttac Protospacer * ************ .*********
11. spacer 1.2|72175|29|NZ_CP031988|PILER-CR matches to MN693702 (Marine virus AFVG_250M251, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
atgaactttattgcacctcttacatttaa CRISPR spacer catatctttattgcaccatttacatttac Protospacer * ************ .*********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
212671 : 245928
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031988|212671:245928|DBSCAN-SWA CATGATGTCTGTTAAAAGATTTGTAATGAGTAGTGGTGAGAGATTCGCTGTTCTTTTGAATAGTGATGGTGTTCCTATGACTTATCCAAATTTATATACGATCATTCATCTAAGAAATCGTGGTCAATCAATCAATACAATTTCTGCTATTTTGGAAGATATTAAGTTGCTCTTTCAGTTGTTGGATAAGTTAGGAATTGACTTGGAACAAAGGATAAAAAGTAAAGATTTTTTAAAATTAAATGAAATCGAAGCTTTAGTAAATTTAACCAGTTTCAATCGCAGTCGATTAAGTGGGACAGCCTCAAAAACAAAGATCATAAGTTTTCCAAAAAGTAATAACAAAGAGCGAGCTAGAGCAAAATTGGTCGTTACTCAGGACTATGTATCCAAACAATTAATATATCGGCGGTTAACTAATTTTGCTGAATATATTGGATGGTTTGAGACGCATCTTCATTCATCAGCAATAACAAGTACAAAACGGTTGTTAAAATCTCGTAGACCTAGTAAGTCCACGGATATTCAGTATGAGTACAAATCTTTTGATAGTGATCAATTAGATAAAATTTTAAAGGCAGTTGATCCGGATAATCAGAATCGTATCTGGACTTCAGATTACCTTACATATAGAAATGAGCTAATTATCTATTTGTTTTTATATCTTGGATGTCGTAAAGGTGAATTATTAAATTTAAAAATTACAGATATAACTCCCTCTAAAGGCGGTACATCGTATCTTACTATTAAGCGTAATCCTCATGATGGAAGTGATTCTAGGCTATATCAACCTTTGGTTAAAACTAGAAGTCGATCAATTGCAGTCAATCAAAACTTAAAGAAAAAATTAGAAACTTACATTTTAAATTATAGATCAGCCATACCGCATGCAGAGCTAACAGACTTTTTGATTTTATCAAATAAAGGTAAACCTTTATCAATAAAAGCTCTAGATAAAATCTTTTCTGAAATTTCTAAAGTTGTTCTATTCAATGTACATGCACATGCATTTAGACATACTTGGAATGACAAATTTTCTGAGAAATCTCAACTTTTAGTGGCAACAGGTCAAACGACTGAAGCTCAAGTTGAAAATGATCGTGCTTATCTAATGGGGTGGATACCTAACTCACAAAGCGCAAGAAGATATTCAAGACGTGCAGAGAATAAGCGTGCCGTAGAGGTTGGCTTAAGTATCCAAGAAAAATTTGAGGATGAAAATGAATAAATCAATTCGAATCGATAGTTTAGATAAGTCGCAAAATACTTTTACCTCATTCAAAGGTTATGAGTTTAGTATCGATGATCAAAAATGGGTATTAGATATCAATAAAACTATAGATATCTCTCGGATACGAAATTTTGAGTTTTCTGTCCAATCTGATGTAGTCATGACTTTGGTTCATTTTGCTAAGTATAGTTCAAGTTCACATACAGCAAACATGTGCGAATATATTGGTAAATATTTTGATATTACAGGAGAGGATCATTTTTCAATTAAAGGTCTTTTAAATTATAAAAATTTTTATTCGGCAAAAAAAGATGAATACAAAGTAGCTATGCTACGAGTCTTTTTGAAGAAACTATATGATTTAGGTTATTCCTCAGTAGATGATGAAGTTTACGATCTAATGGATTCATGGAGATTGAGTGGCAATGAAAAAGGAGCAGCAGTCCTTTCCCTTGATCCAGATGAAGGCCCATTTAGCCCTTTTGAATTTCAAACAATTATCACTAGAACCAATGAATATTTAGCAGAAAATAAGATTTCCTATTATGAGGCTGCTCTAATTCGTGTTTTTTGTGCGACTGGTAGACGACCAATTCAAATTTCAGGATTAAAGGTGAAAGACCTATATGTGTCGGATAAATATAATTTTAATGATACAAATGCAGTTCATATCCTTAACATTCCGAGAGCTAAAGTTAGAGGTGCTAGTGGATTCCGATTTGCTTTTAATGAAGTGGGAATTCGGGAAAGTATTGCGAAAATCTTATTTGAACATATTCAAATTTTAAAACAGAAATTAGCAAAGCAAATAAAGCGAGAAGTATCGGAACAGGAGCTTGCAGAGTTACCAATTTTCTATGATATTAAGGTGTTAGCCAATCTAGATTGGAGCAATAAAAAAGAAATTTCTCAAATTTTGCCAACAGAAATTATTCATTTACCTACTATCAAATTAACTCAAATATTGAGAGATGCTGTTCAAAAACTTGGTGTCCGTTCAAGAGAAACCGGTAAACCAATACATATCACTGCATATCGGTTTCGCTATACGCTTGGAACAAATGCGGCTAGGCAAAAAGCGGGTGTGAATGTGATTGCAAAGTTGTTAGATCATCATGATACGCAAAATGCTCACTGTTATGTGCAGAGTGTGCCCGAAATTGCACAACAAATCTCATCCATCATGGATGAAAGCTTACGCAAATATGCAGATGCTTTTCAGGGGAAAGTTGTAAAGGATGAGATTGAGGCCCAATCACAAATTAAAGATGCGAATAGAATTTCTTCTGTAGAACAAGATTGTGACGTTGGTTCATGTGGTACAAATCAATACTGCAATGATTATGCACCAATCGCATGTTATCTGTGTAGCAAGTTTATGCCTTGGGCAAATGCACCTCACCATCTAGTTCTAGAGCAATTAATTAAAGAGCGAGATGATCTAATTACGATGGGGTGTAGCCTTGAGGTCGCTGCCGTGAATGACCGAACAATTATTGCCGTTCAGCAAGTAATTGATGCTTGTAAGGAGTTCAACCATGGATAATTTAATATATTTCCCATCTGACAAAGTTCAATCTCCTTACTCCGAAATAAAGCGGTTTATTGATTTTGTTAAACAATTATCTGAATTAAATGAAGATATTAAATTTGATGAGAATTATTGGAAAGGCGAAGTAAACTTTGTCAAAACAGGTATTCCATCCAAAGATAGATCACCTGAAAATCTTTTGCATCATTCAATTCTAGAATTTGCCAAAGCGTATGTTAAGTATCAGAGAATTAAGAGTAAGTTAAAAACCCAAGATACAATTCTTTCAATTCGGGCAATAGAACAAATATGTTTAGACCGATATGGTGAAGTTGATTTAACTAAATTGGTTATTGCAGATTTTGATTTAGCTGCTGAAAATGCAAAGGAAAACTATAAAGCAAGTTCTGCTTATCATGTGGGTAGACACCTAAAGATTCTTTTAGACTTTCTTCGCCAATTAAAAATATTAGCTTTACCAGATTGGAAAAGTCCAATTAAAAAGCCTTCTGAAAAATCAATTGTGTTAGATGCAGAGTCAGAGGAACATCGAGCTTCTAAACTTCCTGATGAGGATGCGATTTTTGCATTAGCTGATATTTTCTCGCGGAAAGATTCAGAACTGTCAGATAGAGATATTTTTGTCACCAGTGCTGTGAGTTTGCTTCTAGCTGCGCCTGAACGAGCATCAGAGCTATTTTTCTTAAAGCATAATTGTATCCATGAGGAAGAAGTCCAAACGCTTTCTAAGAGCAGTTTAGGGCTTATAGCAGATGATTCCAATATAGAGAAAGTATTAGGTATTAGGTGGTATGCTCAGAAAAATTATGGGCATGACATTAAATACATTCCAAGTGCCATGATCCCAACGGTAAAACGGGCTATTGAACGTTTGATTACTATGTCAGAAAAGCCTAGATATTTAGCATATTTACTTGAGACAAGTGAAAAATTTCCTAGGCATGAGTTGTGCCCTGATGTTGCTGATAATAAGTTGCTTAGTTGCGTAGAGGTTTTAAGGGCTATGGGATTTGATGAATCCTTATATTCAACTACTAGAAACGCGCGTATGGCTGCGTTGAGTTTTTTACGAGTTAGGGGAATACCAAGTGAAGACTATGTGGTTAGTTTAGAGGATCTAAACAAAATTCTTCGAAGTAGATTACCGAAAGGTTTCCCTTATGTACCTTTTAGTACGGGTAATGGCGTACAGGTTAAATGGTCAGAAGCTTTGTTTTGTTGTTTCAGAAACCAATTCCATAGTTATTATGCAACTATTTTCTCAGAATTATGGGTACCACATATTAATACTTTAAATGAAGGCTTATCTCCCACCAAAAAAAAGAAGAAAGGACGTGATGAGTTAGCAAATATTCAATCCATTTTCCAACGATGGGGATATGGTGACTACAGTGTGACTACACATCAATTTAGGCATCTTCTCAATACGATAGCAAATACCAATGGAATGGATAGCATGTTACTCGCTAAATGGTCAGGGCGGGCTGATATGAAGCAAAATCGAGTATATGACCATACTTCGGTTGAAGATCGTAATTTTAGCTTAATTGAGATGCAGAAAAATGAGGTTGGTAAAGTAAATACTGATAGTACATTTACATTCCAAATAGCTACACCTCGAACTCTGCAAGAGCTAAATACCAAAACAACATTGTCTATGCACACTACCGAGTTTGGATTTTGTACACATTCTTATATTGATGAACCCTGCCTAAAGTATAGAAATTGTCTTAATTGTACGGAACATGTCTGTATTAAGGGGGATGAAGAAAAGAAAAAACGGCTTCAAGATCGACTTAGAAAAGAAAAAATCTTATGGGCAAAGGATAAGGAAGCTGTTAGTAAAAATGTAACTGGTGCAACGGTCTGGTTGGGGACTAGAGAGCTTACGATTAAACGTTGTGAACAGTTAATTGCCCTACTAGATGATCCAAACATTCTTGATGGAACGCCTTTAAGTTTGCCGCCTTCGGAAGATGTTCCACATCTTGATTTAGCGTATCAAAAAGCAGGTCGTAAACGTATCCCCGTTATTGAGAATACTCAACGGAAAAAGATAGAGGATGAACCACATTTGCTCAGTCCTGCATTGCAAATAGATTTATGGATTTGATATGGCACAGCATTTAACCGATAAAGACATCGAGAATATAGTTGAGCTTCTTGATTATTGGCCTTTAGATCAGAAATTGACTTGGGAGCGGGTATGTCAGGCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031988|212671:245928|227025_227577_-|WP_107908897.1|DBSCAN-SWA MIIGYARVSTHDQNLDSQLDALQKADCEQIFQEKITGKSKDRPELLSCLKALRKGDVLIVWKLDRLARSLKDLVEIITDLNQREIGFKSLTEAIDTTSATGRLVFHIFGALAEFEHSLIRERTIAGLDAARARGRKGGRKPSMSEKDIKKAQAMLRDPQITKTEVAKHFGVSRVTLNNSLNKS >NZ_CP031988|212671:245928|231065_232358_+|WP_008941076.1|DBSCAN-SWA MDAQHSALNIRKQQATPRGVGVMCQWYAEKAENATIWDKEGKPYIDFAGGIAVLNTGHRHPKVIAAVTEQLTKFTHTAYQVTPYESYVALAERINQRAPIAGAAKTAFFTTGAEAVENAVKIARSYTGRHGIITFGNGFHGRSFMTMAMTGKTAPYKRDFGVMPAGVFHARYPVPEKGISVAAAIESVEDIFSEDIAPHDVAAIVLEPVQGEGGFNVVPAEFLKRLRALCDKHGILLVADEVQSGFARTGKLFAMNHYETKADLITMAKSLGGGFPISGVVGRAEVMDAPNPGGLGGTYAGSPIAVAAAHAVIDAIEEENLCERANQLGTALVTVLKEIQQASGEVVTQIRALGSMVAAELETAEQAKAVQSYAMEHGLLILTCGKYGNVIRFLYPLTIPAEQFRQGLDILKQGFAALTADSVQTVEQSA >NZ_CP031988|212671:245928|234869_235496_-|WP_004641467.1|DBSCAN-SWA 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24 | Bodo_saltans_virus(12.5%) | transposase,integrase | attL 207456:207472|attR 239118:239134 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
502984 : 551090
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031988|502984:551090|DBSCAN-SWA 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39 | Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus(16.67%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
711731 : 783842
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031988|711731:783842|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
803113 : 943109
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP031988|803113:943109|DBSCAN-SWA 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115 | Escherichia_phage(18.52%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
952954 : 1011346
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP031988|952954:1011346|DBSCAN-SWA 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47 | Enterobacteria_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 944308:944323|attR 987578:987593 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1027785 : 1068306
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP031988|1027785:1068306|DBSCAN-SWA AATGAAGAAGCCTACACACAAAATCTACCGCACAACCAATTGGCCCGCATATAACCGAGCACTCATGAGTCGCGGAAATATTGCCATTTGGTTTGATCCTGCTACGCAATGGTATGCTCCATCAAAAGGCAAACAAGGGCGAAATCAAACCTACTCCGACGCAGCTATCCAATGCTGCTTAATGATTAAATCCTTATTCCGTCTATCTTTACGTATGGTCACTGGCTTTGTGCAAAGTCTGATTAAACTTTGTGGATTAAATTGGACCGCACCAGATTACAGTACGCTTTGTAGAAGACAAAAGCATATTGATATTGCAATCAGCTACCAAAAAAGTAGCGATGGGCTGCATCTACTCATAGACTCTACAGGCATGAAGTTTCTAGGTGAGGGCGAATGGAAACGCAAGAAACATGGACCTGAATATCGTCGCCAATGGCGTAAACTACATATTGGTATAGATGCTGAAACCCTTCAAATACGCGCTATTCAACTCACTACAAATAATGTCAGTGATTCACAAGTGCTTGGTGATTTACTCGATCAGATTCCACAAGATGAGCAGATTGACTCTGTTTATACCGATGGAGCTTATGACACCAAGCAATGCCGTCAGGTCATTGCAGATCGGCAAGCGCATGCGGTGATTCCACCTAGAAAAAATGCGAAACCATGGAAAGATACAAAGATCAGCTCGCTAGAACGAAATGAATTACTTCGAACAGTTAAACGTTTAGGCAGGAGACTATGGAAAAAATGGTCAGGCTATCATCGACGAAGTTTGGTGGAAACCAAGATGCATTGCATTAAATTATTAGGCGATAAATTAATGGCAAGAAGCTTTCCTAGTCAGGTGAATGAAATTCATGCACGTGTAGCAGTCCTCAACAGGTTTACGGAATTAGGTCGACCACTTACCCAAGTTACGCCTTAAATTTGGCTCAATTAGGGGCGCTTTGCATTTCAAATCTTTGTGCAACAAAACCCATTACGAGTATCATCAGTTGTCGTTGCAGTACTAATCACCTTGACAGTTCCAACATTAGAAATTGCTGGCGTTTGGTCATTATCATACACTTGATAATTAAATGAGAAATTAAATGGGTTAAAAGCATTTGCTTCTTTAATATAAATATTCCCACCATAGCATTTTTCCTGTTGATCTGGCGCAGGACAATTCCCCTCTCGATCAGCAGTAATAATCAAATTACTAGAGACATTTGATAAACGGATAGGTAATTCTATGCCCTCAGCATTACGCCAAAAAGCAGGTTTATTTGGCTTTAACTGAGGACCTGAACCATTTTTACCTGTATCACCATCATCATTTGCAAAATCTAGCAAATTCAATGTCGCAGTTTCACTTTGCTTATATTTCAATGTTACAGAAGTATCGGTTACAACTGGTTTTATATTATTGAATTCTGCCTGAAGCATACCTGATGACGTAACACTTTGATCGGATATAGACGTAATTGTATATTTACAGAATGCTTTATCACCAGATTGAGTAATCAAATCATCAATCCTGTAAATCATAATCTGCTCTAAATCCTCATTCCATTTACAGAATAGATTTTCGTCTGTCTTCAATTGATCTTTTGTCAATCCAGTGCCTAGTGTTTCAACATTGACTTTATATAGGTTTGGATCAAAAAATTCTAAAGCATGCGCGCCATCATCTCTACGTACTTCTTGAGGTAAAGTATCCCGTAAATCCACGTAAATAGCTCTATAGTTTAAGGCATTTTTTCTTGTCTCAGGGTTATTAAAAACGTTTAACTTTTTTTTGTATTGTTCTGCACGAAACTTATAATAAGGTACAAAATCTACATTATTTGGTTTTTTTACCAATTCATCGTATCTATCATATTCTATTTGATAGCTATCTATCATCTGACTGATCGATGAATTTGATAAATCTGGAAAGTCTCTGGCTGTTAATTTCATTAACTCTACAGATCCAATATCACAAGTATTTTTTAATGCAGAACTATCATCAACTATTCTATCAACCTTACGTGCCAACCCTCTTTGATCGAAGTCACTACAGTTTGTATTTGCTCCTGTATCAACCAGAGTTATTACTTTTTCATCTGTGTTTGCTCTATTATTTTTGGGATAATACAACGGAAGAAAAGCTGTATAAGATGAAGCTTCAACACGTGGACTTAATAAGTCAGTTATTAGTTTTCCTGTTATATCAATATTATTTTCTTTTGTAGCATCTGTTTTAAATACTTCATCTGGGAAATCACAAAAATTTGTACCAGAACGAGCAAAAGCATTATAGTTTGCTACTAATCCAACTAGTTTTTCTTCTTTTGCACTCCCTAGCAAATAACGACATGCATAAGTTCCCACCCCACCATTATAAGCAATTACATTAAAATTTAATACTTTTTGTCCAATTTTGTCATATAAAAATGTCGTATATGCATTATTTTCAACAATCGTGTTATTTTTTAGTAGTAATGCACTTTTGTCACTCAAAATACTATTACGGTTATTTTGACCAGATCCAACATCTGTATCGCCTGTAAATTTAATCAAATTCCCATGACTTAAATCTGCATTATTTTGAGAAATTGTATTAGATTCAAATAGAACACTTGGCTTGCCCATAAACTCAAACATACTTTTAGAAATATCTGAGCCATTATTCACAATACTGCTAAACTGAATATTAATATCACGACTGATATATAAATTATCATTAAAGTCATTCATTGCAAGTACACTTCCTATGGGTGCTCTATTGCCCTGAATTAGACTGTTTGATATTGCCAGCTTTGTAGCGTTTGCAGATAAATAAATAGCACCGCCAGCTTGCCCTGCATCCGAATTTAATATATGACTTCTATTTAATACTACATCAGCACCAGCATAAATTGCACCACCTATACTTGCTGTTCTTCCTCCAGTTAAAATCAAATTGTTTAAGTTCAAACTTTTTTGAGAAAAAGCTGTAAGTTGACAAAAATAACTAATCATGCGAAAAAGTTTTTTTAGTTAACAGATGTTCACACATGCCTCGAATTGTTTCTGTACCACTTAGTTTAGAACAGCGAGAACGACTCATTTTTCTGGCCAAGCATGCAAAACATTGGCGTGAAAGACAACGTGCCCAAACTATTCTCTGGCTTTCTGAAGGTAAAAGTGTTGCGGAAGTTGCCACTCTACAAGAACGTATCCCAGAAACCATAAGGCTACAACGCCGACGTTGGGAATTGTATGAGTTTGAATCGATTAAAGAAGGTCATCGCTCAGGTCGGCCCAATACATTGATCTCAGACTATCAGGCGAAAATCCTAGATTGGGTCAATACAAGTCCACTCAATGCAGAACAAATCCGAGTCAAACTACATGAAGAATACGAAGGGCTTTGTTGCACAAACCTATCTGTAAAGGCTTTTTCAGCGATATAATTTTCAAATGAAGAAGCCTACACACAAAATCTACCGCACAACCAATTGGCCCGCATATAACCGAGCACTCATTAATCGCGGAAATATTGCCCTTTGGTTTGATCCTGCTACGCAATGGTATGCTCCATCAAAAGGCAAACAAGGGCGAAATCAAACCTACTCCGACGCAGCCATCCAATGCTGCTTAATGATTAAATCCTTATTCCGTCTATCTTTACGTATGGTCACTGGCTTTGTGCAAAGTCTGATTAAACTTTGCGGATTAAATTGGACCGCACCAGATTACAGTACGCTTTGTAGAAGACAAAAGCATATTGATATTGCAATCAGCTACCAAAAAAGTAGCGATGGGCTGCATCTACTCGTAGACTCTACAGGCATGAAGTTTCTAGGTGAGGGCGAATGGAAACGCAAGAAACATGGAGCTGAATATCGTCGCCAATGGCGTAAACTACATATTGGTATAGATGCCAAAACCCTACAAATACGCGCTATTCAGCTCACAACCAATAATGTCAGTGATTCACAGGTGCTTGGTGATTTACTTAATCAGATTCCACAAGATGAGCAGATTGACTCTGTTTATACCGATGGAGCTTATGACACCAAGCAATGCCGTCAGGTCATTGCAGATCGGCAAGCACATGCGGTGATTCCACCTAGAAAAAATGCGAAACCATGGAAAGATACAAAGAGTAGCTCGCTAGAGCGAAATGAATTACTTCGAACAGTTAAACGTTTAGGCAGGACATTATGGAAAAAATGGTCAGGCTATCATCGCCGCAGTTTGGTGGAAACCAAGATGCATTGCATCAAATTATTAGGCGATAAATTAATGGCAAGAAGCTTTCCTAGTCAGGTGAATGAAATTCATGCACGTGTAGCAGTCCTCAACAGATTTACGGAATTAGGTCGACCACTTACCCAAGTTACGCCTTAAATTTGGCTCAATTAGGGGCGCTTTGCATTTCAAATCTTTGTGCAACAAAGCCCTCGTAATGCCAAAAGTGGAGGAGGAAGTACAACACTTCTATCATTATTTGGTCTACTAGGTTTGTTAGCTTATCGCCGTTTTAGAAAGTAAGATCAATGTAAAAATAGCGCCATATGGCGCTATTCTTTTTTACTAAACAAGAGTTGTTTAGTGTTCAGAATATTTAGTTAAATATTCTTCTCTAATATTTACTCGCTCTTCTAAACTTGCATTTTGCATACGTTTACGTAAGGTGCTGCGTTCTTGTGTGCTCATTCTCTGCCATACATCACGCATTTTTTGTTTTTCATCATCGGGGAGTTGAGTAAACCACTCCATGCGTTGTTGTAGTTGAGAGCTTTGATCGTTAGGAATCTCTTTAAGCGTTTGATATCGCTTTATAAGCGCACGTTGCTCTTCTGGGGATAAATCATCCCATGCTTCTTCTGTCGTTGTTTTAACTGGCTTGGAAAATGGCCAAAAGCGATCTGAGCCAGCAAAACTCGTCTGTAATAAGCCGACTGTACATACAACAAGTGCTAATCTTTTAGCTGCCATGTCGAACCTTATCCTCGCCCAAGACCATTAACATTTCCATA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37 | Enterobacteria_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1097681 : 1147516
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP031988|1097681:1147516|DBSCAN-SWA 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42 | Tupanvirus(27.27%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1164655 : 1229328
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP031988|1164655:1229328|DBSCAN-SWA 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46 | uncultured_Caudovirales_phage(11.11%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1183335:1183394|attR 1231993:1233266 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1273142 : 1335636
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP031988|1273142:1335636|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_virus(22.22%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1301676:1301693|attR 1318420:1318437 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1339302 : 1399765
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP031988|1339302:1399765|DBSCAN-SWA 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52 | Stenotrophomonas_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 1342175:1342199|attR 1362869:1362893 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1558602 : 1618841
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP031988|1558602:1618841|DBSCAN-SWA 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52 | Escherichia_phage(20.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1725998 : 1757930
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP031988|1725998:1757930|DBSCAN-SWA 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33 | uncultured_Mediterranean_phage(12.5%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1775974 : 1861077
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP031988|1775974:1861077|DBSCAN-SWA AATGAAGAAGCCTACACACAAAATCTACCGCACAACCAATTGGCCCGCATATAACCGAGCACTCATGAGTCGCGGAAATATTGCCATTTGGTTTGATCCTGCTACGCAATGGTATGCTCCATCAAAAGGCAAACAAGGGCGAAATCAAACCTACTCCGACGCAGCCATCCAATGCTGCTTAATGATTAAATCCTTATTCCGTCTATCTTTACGTATGGTCACTGGCTTTGTGCAAAGTCTGATTAAACTTTGCGGATTAAATTGGACCGCACCAGATTACAGTACGCTTTGTAGAAGACAAAAGCATATTGATATTGTAATCAGCTACCAAAAAAGTAGCGATGGGCTGCATCTACTCATGGACTCTACAGGCATGAAGTTTCTAGGTGAGGGCGAATGGAAACGCAAGAAACATAGACCTGAATATCGTCGCCAATGGCGTAAACTTCATATTGGTATAGATGCTAAAACCCTACAAATACGAGCAGTTCAGCTTACAACCAATAATGTCAGTGATTCACAGGTGCTTGGTGATTTACTTAATCAGATTCCACAAGATGAGCAGATTAACTCTGTTTATACCGATGGAGCTTATGACACCAAGCAATGCCGTCAGGTCATTGCAGATCGGCAAGCGCATGCGGTGATTCCACCTAGAAAAAATGCGAAACCATGGAAAGATACAAAGAGTAGCTCGCTAGAGCGAAATGAATTACTTCGAGCAATTAAACGTTTAGGCAGGACACTATGGAAAAAATGGTCAGGCTATCATCGGCGAAGTTTGGTTGAAACTAAGATGCATTGCATCAAATTATTAGGAGATAAACTCAGTGCAAGGAGTTTTGATAGCCAAGTGAATGAGATCCATGCACGTGTAGCAGTCCTTAACAGATTTACGGAATTAGGTCGCCCACTTACCCAAGTTACGCCTTAAATTTGGCTCAATTAGGGGCGCTTTGCATTTCAAATCTTTGTGCAACAAAGCCTTTTGAAGGGAAAGATTATACCGTTTTATTCAGTGGAGATACGGTTATTCAAAAGAAGTATTGGGGAACGAGAACACTACAAAGTGCAATGTTGAAGTTTATGATGAAACTTAGGGTTAAATACCCATTTAATGAGTTGTATTGGTTATTGATATCAAAAGGTTATAAAACTTACTTATTATTAGCCAATAACTATTATGTATATTATCCAAATATGCAAGATGATAATCAGCACCTTGCAGCAGTTGTCGATCATTATTGTGAGAATTTCTTTAGTGAGTATTATGATAAAGATATTGGATTATTAAACTTTGGTGAGGATTATCAGCCTTTAAAAGGTGAAGTTGCACCAATTACCGATGAGATGAGAACAAAAAATCCCAAAATTGAATTTTTTGAGCAGCTTAATCCCACATGGACAGCAGGGACTGAATTACCCTGCATAGGAAGGTTAGGTTGGAAAGATTTAGCTCGCTTCCCAGTAAAGTTAATATCCAAGCCGATAAGTAAAGGACGTTGCGAGGCAATTATTACAAAACAAAATATCCAAACTGGAGTTTCAAAATGAGATACGAACAATGGCTAAGCTCAGGATCACATTTTATTTTGAAGCAGTGGTGTAATACGACCGATAGAAAGTTTAAAAAAAACGCCAATCAACTTGAGGTTACCCAACGTAAAATTCTCAGCGCTATTTTACAATCTTCAACTTTAGCGATTGAAAATCGAGTTGTGAATTATGAGCAGTTCGTAAATGCCTTTATGCCAACTCGTTATAGCGCATGGCGAGAAGATATCCATCTATATCGAGAAGAAAAACGTGTACTTTCAAATAGTAAGTTGATTCGTTTTCAACCGACCAGCGGCTCTAGTGAACAAATAAAATTTATTCCCTATACTCAACAATTTTTAAACGAGTTAGATCAAGCCATTGCAACATGGCTGGCAAGCTTATATCGAAAATGCCCTCAGCTCCAATCAGGAACCCATTATTGGTCCGTTTCGTGGTTACCTGAAAGCCAAAGAGAGATTTTAAAAGATAAAAACTTAAATGATGACAGTGCATTGCTAGGATTTGGGAAACGGATTTTATCTAAATTTACGCAGGCAGTTCCCAGTAATGTTGCATTTGCCTCAAATGCAGATGATGCCTTATTTGCCACGATTTGTTATCTCGTCGCAAATCGTAATCTGGCAATGATCTCTGTATGGAGCCCAACATTTGCATTACAACTTCTTGATCGTTTGCAAAATATGCATAAGGAGGTGATGGCTGTATTAGCTACGGGGTCTTGGGGAGGTCGAGCTGTATCTTTACAACAAGTAAAAGCACCCTACTGTCGATATAGTGCTGAGTGTCTAAGCATGAGTATGGTTGATGGGCAGATTGATTTTAAAAAATTATGGCCACGCTTAAGTTTAGTGTCTAGCTGGGATACAGCAGGTTCAAAAGCATGGGCGGACGTATTAAAAGCAAGATTACCTTTTGTACAATTTGAAGGTAAAGGTTTATGGGCAACTGAAGGTGTTGTAACGATACCCTATCAAGGTCAATACCCACTTGCTTATCAAAGTCATTTTTATGAGTTCGAATATTTAGAGGGAGAGCAACGTGGTCAAATTGTACCTTCATGGAAGCTCAAACAAGGTGATATTGTTAGCCCAATCATAAGTTCTGGTAATGGCTTATTAAGATATTGTCTCGATGATTGCATTCGTGTCACAGGCTTTTTAGAACAAGTACCGTGTTTTGAGTTTTTGGGTCGTCGCTTTGGTGTTGATCTCGTGGGTGAGAAACTAGCACCTGAAACTGCCCAACAACTTTTATCTCATCTTAATCAAACGCAATCGAAAGCAATCTCTTTACTGGCAATTGATACACAACAACAGACAAAACCTTTTTATTGTGTTTTGTTTGAGGGGGATATTCATCATCAGATTGATCATGAATATATTGACCAGATCTTACGTCAGAATTTCCATTATGAACTTGCTCGTAATCTAGGGCAACTGGATCAACCGCAAATTCGAAAAGCAGAAAATGGTTGGGATGCTTACAAAAAACTTGTGATGTATGACGGTATTATTGAAGGCAATATTAAGCCTGAACCTTTGAAAAAGATTAGCTTGAATAGTTTAGCGCAGCTATGAAACAAGGGATGAATAGGATGATGCAATTGGGGCATCGAATTGCTCGATATCAGTATTTAATACTTTCCAGTTTTTTAGTGATGAGTAGTCCTCTCAATGCCATGACCTTAGATCAAGCATTGAGTGCCAGTTTAAAGCATGAAAGTCGTCTAGAACTGAGTCGCTTAGATGTAAATCGTTCCACTGCTTGAACCGTACCGGGTTTGTCGGAGGGTCAATATTCTGAGAGACTATTCCGATGAAAAAACCAAACTATACCCCCGAAATTAGAGAAAGAGCGGTTCAATTACTAATTGAATCTGAAAAAGATTATCCTTCTACTTGGGCAGCAATCACAGCTATTGCACCTAAGATTGGTTGTACTCCTGAAACATTGCGTGTTTGGTATTTAAAGCATATGGATCAACTAAATCCTGCCAAAGTACAACAGATATCTGACCAAGAAAAAATGAAGCAAATGGAACGTGAAATTAAAGAATTAAAACGTGCCAATGAAATTCTACGTAAAGCAGCCGCTTTTTTCGCCCAGGCGGAGCTCGACCGCCCACACAAATAATGGTGGATTTTATCCATAACAATAAAGATCGATATGGTGTTGAAGCGATTTGTAGAATTTTACCGATTGCAGCTTCGACCTATTATCGGGCTTTAGATCTCGTTGATAACCCAGAACATCGAGCGAAACGTGCTCAGCATGATTTACATCATGCAGAACAAATCAAACGTATTTGGAAAGAAAGTTCAGGTCGATATGGTGTACGTAAAGTCTGGCAAAAATTGAAACGTGAAGGCTATGTTATTGCACGTTGTACAGTTGCTCGATTGATGCAGAAGCTAGATATACAAGGTGTTTGGCGTGGTAAGAACAAACAAACTACCCGCAGCCGAGATGATCAAAAACGAGCAGATGATTTAGTGAAACGGAATTTTAGTGCTGATCGACCTGACCAATTATGGGTCAGTGACTTTACGTATATTCAAACCAATTCTGGCTGGGTCTACACTGCATTTATTATTGATGTGTTCTCGCGAGCAATTGTTGGATGGAAAGTATCTACACGGATGAATACAGATATGGTGCTCGATGCATTGGAGCAAGCATTGCACGATCGAGGCATGCCAAAGAATGTAATTCATCATTCCGATAGAGGTGTTCAATATCTTTCTATTCGCTATACCAATCGTTTAGAAGCAGCAAATTTACGAGCATCAGTCGGTACGACAGGTGATTCATACGATAATGCTTTGGCTGAAACGGTGAATGGCTTATACAAAACAGAGGTGATTGAATATTTAAAAGCAGATTGGCAAGGTTTAGCGGATGTACAACTTGCGACATTAAATTGGGTAGATTGGTTCAACAAAAAGCGTGTACACAGTGCACTGGGTTATGTATCGCCTTTTGAGTTTGAAGCAATGTACTATGATAAGATTAATCCGTTAGGTCAGGTGGCCTAACTTAAATAAAAAAGTCTCCGACAAACCCGGTACGGTTCAGCTATGTTAGAGCAAGCGAAGCAACGAGATGGTCTAAAAATCAATTTAGTTAGTCAGTTGGACTATGAAAGAATCGAAACACCTGAAACAGTGTTATTTCCCACTGAAGGTAATCGACGAGGGCGTAGCCTACAGTTGCAGTTAGACTATCCGATTTATACTTCTGGTCGACATCGTTTAGGTGTCGATGTTGCTAAAAGCCAAGTTGCTGCTCAACATCAGGCTTTTTCAGACCGTCGATCAGAAACGATCTTAAATACAGTGATGGTTTATACCGATGTATTGAAGAAAAAAGCCATTCTAGACTTGAGAAAGAAAACACTCACAAATTTGCAACGTTCGTTATTCGAATCACAACGTCGGTTT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60 | Enterobacteria_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1869042 : 1925849
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP031988|1869042:1925849|DBSCAN-SWA 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57 | Acinetobacter_phage(40.0%) | transposase,integrase | attL 1859868:1859927|attR 1889077:1890354 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2010962 : 2067296
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP031988|2010962:2067296|DBSCAN-SWA 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52 | Lactococcus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
2260820 : 2323770
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP031988|2260820:2323770|DBSCAN-SWA 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55 | Acinetobacter_phage(41.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
2370671 : 2426915
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP031988|2370671:2426915|DBSCAN-SWA 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48 | uncultured_Mediterranean_phage(20.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
2433763 : 2493949
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP031988|2433763:2493949|DBSCAN-SWA 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52 | uncultured_virus(18.18%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_19 |
2781712 : 2821302
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP031988|2781712:2821302|DBSCAN-SWA 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34 | Enterobacteria_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
2874476 : 2936471
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP031988|2874476:2936471|DBSCAN-SWA 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|
58 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
3143495 : 3209367
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP031988|3143495:3209367|DBSCAN-SWA 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52 | Faecalibacterium_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
3454271 : 3511453
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP031988|3454271:3511453|DBSCAN-SWA 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44 | Erysipelothrix_phage(18.18%) | tRNA,integrase,transposase | attL 3464814:3464839|attR 3521082:3521107 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
3519835 : 3562134
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP031988|3519835:3562134|DBSCAN-SWA 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35 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
3615076 : 3648215
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP031988|3615076:3648215|DBSCAN-SWA 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25 | Klosneuvirus(16.67%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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