Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031984 | Acinetobacter haemolyticus strain AN3 chromosome, complete genome | 4 crisprs | RT,cas3,csa3,DEDDh,WYL,PrimPol | 2 | 7 | 4 | 0 |
NZ_CP031985 | Acinetobacter haemolyticus strain AN3 plasmid pAhaemAN3c, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP031987 | Acinetobacter haemolyticus strain AN3 plasmid pAhaemAN3a, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP031986 | Acinetobacter haemolyticus strain AN3 plasmid pAhaemAN3b, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031984_1 | 699773-699870 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031984_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP031984_1
>1.1|699799|46|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder CTTGCGGAATATATTCCTCATGCGCAAGACGAGCAGCTATGCTGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031984_1
The CRISPR arrays of NZ_CP031984_1 >merge|NZ_CP031984|1|699773-699870|CRISPRCasFinder AGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCTCTTGCGGAATATATTCCTCATGCGCAAGACGAGCAGCTATGCTGTGAGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCT >NZ_CP031984|1|1|699773-699870|CRISPRCasFinder AGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCT CTTGCGGAATATATTCCTCATGCGCAAGACGAGCAGCTATGCTGTG AGTGGCGAGTTAAGAAAAGCAACGCT
>NZ_CP031984.1|WP_109439698.1|699360_699726_+|YbaN-family-protein MKILFWRSLVILFVTLGIIGAILPGMPTTVFLIIAAWAASKGWPQMDAWLLNHPKYGPTLRNWRENGTVPRRAKWLASIMMLISGILMLFTNAPFLVKVFTNTTMFIVAVWLWFRPEPERG >NZ_CP031984.1|WP_160126917.1|698396_699260_-|DUF1853-family-protein MFSVADRPCFFEPWLKFKNPIVRQLAFAIASPNILSAVPSELMIKNKFDLHDNATWQILYQNYEKRLYQLDQQPQPLHDFLARLKSTRLGLRFENLLWFWLLDDEYHPYKLLGHSIQKIAGAITLGEIDFLVLNQLTQEVEHWEVALKYYLGEGHLNLAHWYGLNREDTLHRKLKHFTDRQFQFSEANGYNIQRKFAVMKGQLYLPAQQLQTLPLPVWINTSRQLGTWGTSIPQQTYYRLQRHEWLCPNQIATSSNAIWWTDGLYHTTESDPAFYMFRQPALLFNQT >NZ_CP031984.1|WP_161401361.1|698143_698287_-|entericidin-A/B-family-lipoprotein MMKKVLFASIMTAFVLTGCNTFKGFGQDVSKAGDKVTQTAEKTQNKM >NZ_CP031984.1|WP_160126916.1|696884_698018_-|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MNHSDTLELSLQLLRQPSVTPVDHDCQNIMADRLSKIGFNIEKLRFEDVDNLWARRGTENPVFCFAGHTDVVPTGHLDAWNSDPFQPTIRDGKLYGRGSADMKTALAAMVVASERFVAKHPDHKGSIAFLITSDEEGPSINGTVKVVETLEARNEKMTWCLVGEPSSTNQLGDIVKNGRRGSLNAVLTVNGKQGHVAYPHLAENPIHLASKALNELCETVWDTGNEYFPATSFQISNIQAGTGATNVIPGHLKVTFNFRYSTEVTAEILQQRVLEILDKHKLNYDISWTFSGLPFLTPVGELVNAAKTAIKDVTGVETVLSTSGGTSDGRFIAPTGAQVLELGVLNATIHQINEHVNVDDLEPLAEIYEQILVQLLT >NZ_CP031984.1|WP_004640619.1|696380_696836_+|hypothetical-protein MVKKSTNTALGQIDQQELQHLITVSTGFIDAYIIECHQKVPMLLPQNIVLSAMDTPTNVEHIEWHDLKLPVLALHDPMQKQGVALVVEGEDVSQRFALICNEMPESIRLRISEIVDEDGDVEDPKVFKYVKMGEKRYFVPNLQNIETQLGL >NZ_CP031984.1|WP_160126915.1|691282_696364_+|Hpt-domain-containing-protein MKEILKTLVETMTLPEDSYLEQDAEILEIFIEELDEIFVELDPLLVQWIEQPNLQNVLTDIRRHFHTLKGSGRMVGAKSSGELGWTVEDTLNRVLAGTIPLTTEIQRYVQAIFNIYRFKLIHDFKAVRAHLIDLRPLVLLGQQLQQQSVEPALSDLLMLADHLVSEDISTGLELVEEALFVDHLTQTEQLALDNADKVLAEDELLAKETLAIFLEEAEEHLATIDQFLQNDHPTNEHYNHLIRALHTLRGSSAMAHIDQIFDASSKVENLFKTLLHDELDSNSNETALLTHYAQFVRDYLYSLRQLETAQRTDEIHATFNTAWDSYDFQLEDSHGENLRPQGLVSQLLELNIQDLLDVESDFDQRARTEFPQYIQQLSQQAEILLQHTHHHATIGMYQYTSLLRSSYQDLIYKPSLLNLEYGFELYDQVHQQFIQLFDTLAAGQRVTLTKEHEQMLNELSTFTQQNIELLEAELIETNLDQAAPLSEAEVVQDSIVDTSDLAARFALDKQQLSTSESNRDFDPDLLDIFLEEADELLVGIDEDLNTWVADLQNVNALKNLMRYLHTLKGGSNMIHAGHIGLIAHELETIYEKLINQQIQATPSLISVIRLVQDDIADRIQTIRDQQVDYPSTHVLDVLTNLMKSTATTAIQIDKFVVSEDEDIEKAVDLDGTTEIEISTHSDVAEPSIDVTSFAAQLALDKQQLQSEQSNRDFDPDLLDIFLEEADELMVGIDADLNTWTTDRHNVNALKNLMRYLHTLKGGSNMIQARHIGLIAHELETIYEKLINQQIQASPQLVAIIRLVQDDIADRIQTIRDQQTDYPSTHVIQLLQHADQDIDVERYATETEIEQTSAELVNADLEVVAASIDNVESESISAETQLDFVETESLLQIVEADSDKDDVTSSLMQDVVEDDTEEDDVRSLVEQTFLEEAEELLGQAQHLLEQWFEQRGNRSLLLQLQRNAHSLKGGARMAEMDAIAIIAYHLENAFEQFGLHHFSSNVYDNLLNTALAWLNDAIFKRQYANFDGLKQSLENMEFVDVAAQLPQKLSARDIFTPEYTMEFVQGDGTEPPSMLGEWESTERIEQNNEMIRVSAEVIEKMIDLSGENAINRSRIEMDLGQLGGTLTEMELAIKRLADQLRRMEGELESQIIARHGGEDARYADFDPLEMDQYSSLNQLSKSLAESASDLVDFKTTLSEKIRDTEGLLLQQSRIQAEIQESLMRTRLVPFSRLLPRLQRIVRQTASTLNRPTELVVNNTEGELDRSILERLVAPFEHMLRNAIDHGIEDREQRLQAKKPETGHIVLNIGRQGTDVVVTFSDDGKGIDVNRIKEKAIQTGLMTKDQKLDQDEILQFIFHPGFSTAAQVTQISGRGVGLDVVQSDIKALGGHVSVGSILGKGTTFTIRVPTTVAVSDALMVKAGDQQFAFPLAQIDRIVRISPMALEQYFESQDDYFKIDQEDYRLRYLSEFVAGQPIPRLTGIVHSLPVLLIKGAQGQMTALLVDQLIGSRGQIVVKPVGQQFSSIGVIAGATILGDGQVCLILDGQNLARQAQSTARSKQADETYTKQRYDERRLIMIVDDSVTVRKVTSRLLERQGYDVVTAKDGVDAMEQLETVKPDLMLLDIEMPRMDGFEVTNLVRHHEIHRDLPIIMITSRTGEKHRERALSLGVSQYMGKPFQEETLLENIESLLAVR >NZ_CP031984.1|WP_160126914.1|689043_691125_+|chemotaxis-protein MGFKLKKKNGSDGAGSKKGGAFLGKIRTQLDQFSRLFGETEKSKPIIYRALIALVLAVILLIYLFVSLPRSNQLTRSLGELRLLSQMISRQATEATASGTSETMNNLVASEKRFAENLEVVEDVYGKSSDEYKKVNELWTNVSKNIDLIASQQAIINQLYDTNISISETIPEIQAEYNLMVDQMVRENMPSSQVIITKNQVFIAERILRSINSVLVGTDNSNASANDFGADIDTFGIYLNAQLNGSSELGVDRISSPDLRESVDSIKSDYDAVLKLAAETVLKNANQIVHVRQASSEIFTQSDALLSSLNALSDKAEGGWGNVLAGIALILALGVLVFSALQLLALRSNTDKERVIRLQDEYDRNQNAILRLLDEIADLADGDLRSYATVSEDFTGAIADSINFAIDQLRDLVSRITDTSQEVARYTQDTQSITNQLAEASEHQAQEIAGASAAMNEMALSIDQVSANASESAEVAKRSVQIATNGAQVVNRSIEGMDHIREQIQETSKRIKRLGESSQEIGNIVSLINDIADQTNILALNAAIQASMAGEAGRGFAVVADEVQRLAERSASATKQIESLVKTIQTDTNEAVISMEQTTSEVVRGANLAKDAGIALDEIQTVSGDLAKLIASISDAAKLQSASASHIATTMNVVQEITSQTTTATFDTARSVSELANMAESLRESVTDFKLPE >NZ_CP031984.1|WP_004640625.1|688459_688996_+|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MAANGFIELLRLSKRGNKQYTATQNEVSRWSGIAFEMLGQYFVAPLGEISEVIYPPKYTPVPNTQAWVRGLANIRGRLLSVTDLSHFISDQRSQFSPTQKVICISHQDHYVGLVVDQVLGIQHFNKKSFFSQSNELDSKLKDYCQGYFHQHNQQWHVFLLSRLLKNPQYMNASIKFIN >NZ_CP031984.1|WP_004640626.1|688048_688411_+|response-regulator MARILIVDDSPTETFRFREILTKHGYEVLEATNGADGVTMAQAELPDLVLMDVVMPGMNGFQATRQISKAKDTQHIPVVIVSTKDQATDRVWGKRQGASDYLTKPVDEQQLIDVIKQLLS >NZ_CP031984.1|WP_004640629.1|687643_688027_+|response-regulator MEDKFQNLKVMVIDDSKTIRRTAETLLQREGCEVITAVDGFEALSKIAEANPDIVFVDIMMPRLDGYQTCALIKNSLNYQNIPVIMLSSKDGLFDQAKGRVVGSDEYLTKPFSKDELLSAIRNHVSA >NZ_CP031984.1|WP_004640609.1|700012_700543_+|L,D-transpeptidase MPYALEQADILIDLAQQTLYLPKHNKFYVISSGKNGIGEQENTGKTPRGWHRIAQKIGDDAPKNSVFIARQATGEIYDQDLAQQFPERDWILSRILWLDGLQAGFNQGDGCDTFKRYIYIHGTPETEPMGIPMSHGCIRMKNDEVIELFELISEQALVYISEHALDESMIKSERSV >NZ_CP031984.1|WP_160126918.1|701584_702142_+|DUF2750-domain-containing-protein MRNPYQRKAASKSQTTTSNTSSKDAYRQFIENIILQRQVIALYHDGWALCSTPSGQHALAVWQNKSLAKLLIKDNWVKYDLQEVPLLDFVGKMIPFLRENNTILSLDLTPEGNNLLVTPDTLLLDIKNFLYQIYLQRPDIFAELKLPLPRDIRIHQYFFLDLAIAARNIDWVFPNQYSLSNQPLT >NZ_CP031984.1|WP_160126919.1|702108_702894_-|YdcF-family-protein MQISSWLRIFFAVIGFILLIDGAVLIALKKIHIGTVLPLLLGLFFCLYSFFYYHLERFFFYHFRLHSIWRFGWLCFWVWLISLGYFFNYLNKNNSQVEVPTSVAAIIVLGSGIENGQPSATLAKRLDRAAPIALTQPNAKLLLTGGVDFGETESEAIVMSRYLQQQHHIPATQIILEDKSTSTELNLKNSHPLLQAHKISLQQPIAIVTSDFHTLRAAAIAKKQGYSNITTIGSTTPLQTRYNAWLREYFAYVSGWLLNEY >NZ_CP031984.1|WP_160126920.1|703017_705555_-|PepSY-domain-containing-protein MFKKVFFQIHWFLGITAGLILSLMGITGAIYSYDQQILKWINQESYVVEVVNTPKLTPAQLYQHFNQQQPEIEINSITIAADPAASSTVNIKKEGARRGYNMMVNPYTAEILPEVKGREFFQFIQRLHRNLTAGEYGAQITGASTLMLIFFVLSGLYLRFPKKHSLKQWLFIKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIAFYLLFACTGLYWSYDWWRAGMFKVMGVEQPQRHQQNHDQNKKEQPDLSNQQVNTILTQAWTGVNANIGREYSSLTLNIPKLADQKIELTFIDPTPQHERARNQAIYNYQSHQFEKLDLYEDKKLNEKIMSSMLPVHRGSFFGSTYQFIAMLASLTMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQSARQTLINQQIDPNATPWLISYASQTGVAEQLAWRTSTSLQEAQQPTTVKPIQQLTEQDLQQAQQVLFVVSTYGTGEAPDLATSFSKKLMQQSLDLAHLKYAVLALGSKEYPDSYCRFGYVVDAWLKQCKAQALFDLVEVDNANNEDIQRWNQALSVVTQHELHAMNIEKVFDQWTLTERKLLNPNSLGNAAYNIELRAPYDITWHAGDIAEIQPANSLIEIQNFLIKYQIPAQAEIKSLNLTIEQALWNKNLRIEIDQIDDLETLVAQLPTLPTREYSIASIPSQQLLRLVVRQKYDANGELGLGSGWLTEFAQLKQTIALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLQQRNRQNYTANWLIFGERQHQCDFFYEETIQAWLNMGSLQRLDLAFSRDQEQRRYVQDVLREHADELKNWIEQGAVIYVCGSIEGMATGVDQALNDILGEEAVDELRQTQRYRRDVY >NZ_CP031984.1|WP_160126921.1|705726_706311_-|YcxB-family-protein MTAKTPYAYTLQPVPYEVSEVEQRQAQLMIWRSSNKFSRKAWIIMISLVVLSLVAAGLIKYYSTYSTVICWVVIIGVAFYYLTKKFGLEWYVKRKMKEFPVQEIKGIRLGVQPHGLVMRQKVGLQDGTATISWKDIYEWYASPDFILVNFKVKTPKGDEQQGAYILPKRMDSKNFSFKTIRRHLTETVGAPKTL >NZ_CP031984.1|WP_160126922.1|706443_708624_-|TIGR01666-family-membrane-protein MNPGFKRLKQATYNTTFMYNVRMLIAFTGTAFVPYLMDYQLATIPLTLGVVAAAISDIDDRFSVRLMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPIAFAIGLIASCIGWILLGSLGRRYATIAYGCLVISVYTMLGVHLFEQWYIQPALLVVGAAWYGLLSTISFLLFPVRQLQDQLSASYSALGSFLYAKSNLFDVDMTPPSYQQSMIDISMENSKLIALFNNLRVALLTRLKGDRGQKDTRRSLQYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLTKVFQHSDILFRFQRILSIQGKACQDLAQSILSRTRYTHNKRFKHSFENLRLSLEKLRKDGLYDQVRINALFALYQNLKSIDAQLQNLETERNLVLDNAQQPEHQLKDDDLKGMKDIVVRIKQNLTPESVLFRHAVRLSIVLFIGYLFIQMTNIAYGYWILLTALFVCQPNFNATKRRLYLRIIGTLVGIIVGLAIIYFIPSLEGQLVMLVLSGILFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAFAAGFPRFIDTIIGCALAWFGVSFIWPDWKFRRLPRSIQRALQAQCQYLAEVVTQYHQGHNNALNYRVVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPNIDSTQKAQAFEFLCLSHTFLSYIAALGAHREQIQDQEVLDLLDQALDDIQGALLRDEVPDLSAQNMLQTIRQRLTQKESNENDQKSLIILQQLSLMLSILTRLSMLKQSLGHEPSEDGTEFASL >NZ_CP031984.1|WP_160126923.1|708766_709978_+|Bcr/CflA-family-efflux-MFS-transporter MQVEPTNQRQYSTTWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMADEFGVSTQMVANTLPAYFLGLAIGQLFYGPVSDRIGRKTPLYFGLTLYVIASLACVLVTNEWALIIARIFQALGGCVGVVIARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPIFGAWILIFFPWQSIFVCLAMIGVICGLCVHFFFKESLPVERRLKLSTYQVTTLYAAIFKDQSFRLPMLAGCLTGAALFCYISSASAVFMGQYGLSQQHFSYAFAFNAAGIMLMSSLNKHLNTRMGVFPRLVLGGSIQCFGAVCVVSAGLMVNASLWFLMSGLFLVVSGIGLTGPNAMALAMSEQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVILNFLVWKASLNMGLMMLMFTSLGLLMIFKVGRQQRASV >NZ_CP031984.1|WP_160126924.1|710023_710731_-|nitroreductase-family-protein MNMEQIRYVDEAIRSRHSVRAFLDRPVEQQIIKDILDVACRAPSGTNTQPWKVYVITGKKRTEMIDRVCTAQVESFQNPALASQYKETFAYYPETWISPFIDRRRENGWGLYGLLGIQKGEKEKMAAQQLRNFQLFNAPVGLYFTVNKVMGIGAKMDISMMIQNVMIAAKARGLDTCPQAAWNHFHPIVLDVLGAPDDEELVCAIALGYADPEHIVNTFITPREPVENFTVFLDE >NZ_CP031984.1|WP_160126925.1|711155_712496_+|DcaP-like-protein MSLTLIRKPFVMQGLAIVVANLMMNTAHATSEQEQIQQLRAEVSELRALLEQYGSQPKQENVAPQVIAQPASVTTQNQNIKVVNTEPAKKSPLTMQTASGTQVQLYGFLRGDASYQAKGGDGIFNRINKVDLDGAEKNRDRFYSTATVTRLGLDFKAPVEGTDVGGKLEVDFRGGSNNDTIRIRHAYLTMNDWLFGQTTSTFLATDLQPEMLDFNSPLGIGTYRTPMVRYSNKLNPDISYAIALEKGNDDNRVPALSSKLKYDFAEGKGSTSVRALLTEARSKVAFNKDNMQISRNDSDLGWGVAVGAKYKFTDALQAMVDYSHVKGDSKFLLYTNNAFNVNPNNMGLNLNEFDALTVGTSYQITPKLRSTLAYGAMFADDSNDFAKQAVTDETQNKTLQQGWWNVMYSPVTPITFGLEYIYGERKTFDGQKGKDSRVGAMARYNF >NZ_CP031984.1|WP_160126926.1|712676_713912_+|sodium/glutamate-symporter MEFTFNGFYTLISAVIVLLLGRLLVNKIDFLKRYNIPEPVAGGLVAAILSLLVHSFLGYSITFSSQLQTSFMLIFFASIGLSANFMKLKEGGIGLVLFLGCVAAYIVVQNAVGMSLATLLGVDPLIGLIAGSVTLTGGHGTAGAWGEIFETQYGIQGALALGMASATFGLIIGGIIGGPLAKLLINRHSLARAKTPAQIEDRDTHPDPHPEHLAPFENPHQVRLITADNAITTLGMFAACLAFAEFMTGYSKGTWFELPTFVWALGGGVILRNILESVLKVDIFDRAIDVFGNASLSLYLAMALLSLKLWQLADLAGPLVIILTAQTLVMALYAAFITFRIMGKNYDAAVLAAGHCGFGMGATPTAVANMQAITNMYGPSHKAFLIVPLCGAFFVDLINATVIQVILKFFA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP031984_2 | 1853940-1854808 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP031984_2
|
14 spacers
spacers of NZ_CP031984_2
>2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCGCAAGGAGAAGTTTATGAACATTCTCCA >2.2|1854028|33|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATATACAGCATCTTTGGATATTCACGCATTTC >2.3|1854089|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGCAAGTGATTTGTTCAAGTTGTCTGTGAT >2.4|1854149|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAACGCGACAATGTGGATACGTTACGCGCT >2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGAAAGAATTTGCCGTTGTAATGACTTTCA >2.6|1854269|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTGTGGGTTTTGTCAATGCTGGAGCTTACA >2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAATGCGAAAAAGAGAAGCAGCAGCGCAAA >2.8|1854389|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGATGTTGTTTTTGCCACAGAAGGCACATGG >2.9|1854449|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGGATACGCTCGCCAAAGAAGCAATGGACG >2.10|1854509|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTCTTTAGCATAGTACAGTGTCGGTTTGA >2.11|1854569|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGACTGGAGAAACCTTTTGCTCTAACTGT >2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATTTTATTTAAACTTTCTAATGTGTAGCC >2.13|1854689|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAGCAATAGTTGGCTTACCGATACTATCTC >2.14|1854749|32|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder,CRT GCGATGAAGAAAACCCAAATGGCCTATCAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031984_2
The CRISPR arrays of NZ_CP031984_2 >merge|NZ_CP031984|2|1853940-1854808|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAACCGCAAGGAGAAGTTTATGAACATTCTCCAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAGATATACAGCATCTTTGGATATTCACGCATTTCGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATGAGCAAGTGATTTGTTCAAGTTGTCTGTGATGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTCAACGCGACAATGTGGATACGTTACGCGCTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTGGAAAGAATTTGCCGTTGTAATGACTTTCAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATCCTGTGGGTTTTGTCAATGCTGGAGCTTACAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAGGAATGCGAAAAAGAGAAGCAGCAGCGCAAAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAATGATGTTGTTTTTGCCACAGAAGGCACATGGGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAGTGGATACGCTCGCCAAAGAAGCAATGGACGGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATGATTCTTTAGCATAGTACAGTGTCGGTTTGAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAAAAGACTGGAGAAACCTTTTGCTCTAACTGTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTCATTTTATTTAAACTTTCTAATGTGTAGCCGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAACAGCAATAGTTGGCTTACCGATACTATCTCGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAGCGATGAAGAAAACCCAAATGGCCTATCAAACGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAA >NZ_CP031984|2|1|1853940-1854748|PILER-CR GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AACCGCAAGGAGAAGTTTATGAACATTCTCCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GATATACAGCATCTTTGGATATTCACGCATTTC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGAGCAAGTGATTTGTTCAAGTTGTCTGTGAT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTCAACGCGACAATGTGGATACGTTACGCGCT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTGGAAAGAATTTGCCGTTGTAATGACTTTCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TCCTGTGGGTTTTGTCAATGCTGGAGCTTACA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AGGAATGCGAAAAAGAGAAGCAGCAGCGCAAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATGATGTTGTTTTTGCCACAGAAGGCACATGG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AGTGGATACGCTCGCCAAAGAAGCAATGGACG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGATTCTTTAGCATAGTACAGTGTCGGTTTGA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGACTGGAGAAACCTTTTGCTCTAACTGT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTCATTTTATTTAAACTTTCTAATGTGTAGCC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AACAGCAATAGTTGGCTTACCGATACTATCTC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA >NZ_CP031984|2|2|1853940-1854808|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AACCGCAAGGAGAAGTTTATGAACATTCTCCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GATATACAGCATCTTTGGATATTCACGCATTTC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGAGCAAGTGATTTGTTCAAGTTGTCTGTGAT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTCAACGCGACAATGTGGATACGTTACGCGCT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTGGAAAGAATTTGCCGTTGTAATGACTTTCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TCCTGTGGGTTTTGTCAATGCTGGAGCTTACA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AGGAATGCGAAAAAGAGAAGCAGCAGCGCAAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATGATGTTGTTTTTGCCACAGAAGGCACATGG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AGTGGATACGCTCGCCAAAGAAGCAATGGACG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGATTCTTTAGCATAGTACAGTGTCGGTTTGA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGACTGGAGAAACCTTTTGCTCTAACTGT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTCATTTTATTTAAACTTTCTAATGTGTAGCC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AACAGCAATAGTTGGCTTACCGATACTATCTC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GCGATGAAGAAAACCCAAATGGCCTATCAAAC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAA >NZ_CP031984|2|1|1853940-1854808|CRT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AACCGCAAGGAGAAGTTTATGAACATTCTCCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GATATACAGCATCTTTGGATATTCACGCATTTC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGAGCAAGTGATTTGTTCAAGTTGTCTGTGAT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTCAACGCGACAATGTGGATACGTTACGCGCT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTGGAAAGAATTTGCCGTTGTAATGACTTTCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TCCTGTGGGTTTTGTCAATGCTGGAGCTTACA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AGGAATGCGAAAAAGAGAAGCAGCAGCGCAAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATGATGTTGTTTTTGCCACAGAAGGCACATGG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AGTGGATACGCTCGCCAAAGAAGCAATGGACG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGATTCTTTAGCATAGTACAGTGTCGGTTTGA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGACTGGAGAAACCTTTTGCTCTAACTGT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTCATTTTATTTAAACTTTCTAATGTGTAGCC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AACAGCAATAGTTGGCTTACCGATACTATCTC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GCGATGAAGAAAACCCAAATGGCCTATCAAAC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTTTCAA
>NZ_CP031984.1|WP_160127147.1|1852908_1853694_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSDHLEHTFELTDDEMHLYSRQILLDGWDIEAQEKLKLANVLIVGAGGIGCTSAELLARAGVGKITIVDADTIEMSNLQRQIAFTSNDLGQYKAETLAKHLQEINPHIQVSYQNTRFDETNADELVQHQDVVLDGCDNFTTRYLVNVVCKTHQVPLISASAIGFEGQMFMVESDSACYECLFPKENQTNEGLRCAESGVLATTPVMIASLQAHHTLLFLGLGLTPLKQKLLLWNGLNLTQRILQFEKDVNCPVCQASASVN >NZ_CP031984.1|WP_160127146.1|1851564_1852863_-|AarF/ABC1/UbiB-kinase-family-protein MKRNILVDGLRSVARIGETVIVAAQAGVKYATEKPSNAKLMRETFESLGSTYIKLGQFIASTPSLFPREYVQEFQGCLDQTPTLPFSYIQQVLAEEFEGKDLNSIFSFIDENPLASASIAQVHAAKLVTGEDVVLKVQKPGVETILYTDLNVVHWATKLLEKAVPKIKFASLSEIVDEIKTRMVREVDFIEEAQNLDDFVQYLNISGNQAATAPKVYHQFSTRRVLTMQRLYGVPLTDFDVVKQYAKDPTQVLITAMNTWFGSLMLCKSFHADLHAGNLMLLEDGRVGFIDFGIVGQLNPEVWTACMAFMDALQHTNYIAMAENMLKMGMTNQKINTQVLAADLERLFSGVLLADPQEILSSNPADLNDIMMDMVAVGERHGIKFPRDFALLFKQMLYFDRFMRVLAPYTDIYADQRLKMVHNIEPASLLKH >NZ_CP031984.1|WP_160127145.1|1851078_1851459_-|dihydroneopterin-aldolase MDAIIIEGLKVDTVIGCFNWERQIIQPLMLDLTIHNDLSQAARSDELEDTLNYAQICEIAAQVIQDAKPKLIEHVAQLVLEVLFNTFPSIDSISITIRKPAIIAQANAVGIRLDRNRNDFCARAGE >NZ_CP031984.1|WP_160127144.1|1850687_1851122_-|2-amino-4-hydroxy-6--hydroxymethyldihydropteridine-diphosphokinase MIATETIFALALASNVQQLENFNFAYAQIMSLGTVEFSSIYEIPCRDGVGADYWNSACLLKSHFSADEIVDILKNLEQQSGRVRPSHHISLDIDVIAWGESLDQMQFNPKKLPLALDVKIPLYELWPNQILQYDQNRKYPIITL >NZ_CP031984.1|WP_160127143.1|1850096_1850648_-|DUF2799-domain-containing-protein MKTLVSISIMAVLLSGCAAMSVEQCKTANWLSVGEKDGSAGYESRLDKYYSSCQKANVVPNQTLYEKGYQKGLGYYCRPESIFNEALEGRGDYRVCSIEKRETLRPYYQVAHEYYQANSEFNRSQSDVSHYLRELERKDLSAKDRDEYKKRLSDLRSNRNRVQFRYQDAVRNLERFKAEHGLP >NZ_CP031984.1|WP_075315736.1|1849417_1850053_+|2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone-monooxygenase MRHYTGLDQLINSFDQALRSLVPGATTSQRSNPANDEASQLCVSDARHVAGLMRVNHSGEVCAQALYHGQALTAKLPHVREEMQQAAIEEQDHLAWCEDRLKELDSHTSVLNPIWYGLSYGMGAIAGIAGDKYSLGFVAETERQVSQHLQEHLQQLPEQDQRSRKILEQMNEDELHHRDTALKAGGVDLPVPVRITMTAISKLMTKTSYYI >NZ_CP031984.1|WP_005081122.1|1848091_1849414_+|MFS-transporter MMKQDEQLMTSRRFAPMFFTQFFGALNDNVYKQALLLVITYGWIQQQSAAVSTLNNLAALLFILPYFFFSATAGQVADKYERSQLVRFLKLLEIVIMMIGTAGFLLGNLWLLLFALFLMGTHSTCFGPIKYAILPEILKPQELMSGNALFQSGTSIAILFGMILGGAVIASSAGNLLWISITVLIIACLGYLASRFILPQKVAAPDLKIDWNFFRTSFQTIKYAKSIPIVFTVLLGNSWYWFYGATYLTQIPQLTQQNLHASENVVSLLLTFFSVGIGIGSLLCRRIGGSEINIKMVPYGAIGLTVFAFYLAASLTFVPERTGELLSLGDVFSEGAVYYHVMLAVTLLGISGGFYIVPLYAMMQAYSPRSHRARVVAANNILNAVFMVSSAIFSILILSILKIDIKILFSITAVLSAIFSFWLLTRLKPLLKNAPTTLED >NZ_CP031984.1|WP_160127142.1|1845222_1847928_-|BamA/TamA-family-outer-membrane-protein MPSKSKFKQSTLVHSMHLIFKMQSFPKLICSGFLISYCISVAYADEEAVVVAENSTIERMKDQVKSIPSPEIPYETFNLSSEYYNPAQDSVAALKQQEEAPSQIDTLKPIQLDENLEHLPVIAVDQNMANEIFQIAEEAKNDALAYRENVAKNPELVVNEASQSELTEISNPPVNIDRLMQEIQADSQIIVEANESGRTLAELQPKTEQVEEKAGFFKRIVNRFRPENLLGAERVPRISADVSGAPLALATNIKAKLSSFTQEAFEDFNVALPQLRSLTNQAAQAVGYYDARFSFEKLSDSRVKVTVEPNEPVKIDKQNIEFTGEGENAPQFQVIRLIPEQDEGDIFNHGKYEATKTKITNAASDNGYFDAYWRLHDVKISQPEKTAEINLKYDTGERYKLKAVEYKMSDPSKPLPLTQKVLDSLAPWKDGDDYAFWRVNVLANNLTNTRYFNYTLVDTIKPDAIQPPLDLPPDLQALVDQQRVEQSQLFSAQQKADIARQQVVSAEEVTQDVVDESQFSGSEPTPAYSLARSMPNIQNDETERQALEEQARLEKKIPVVVTLNADRLNTIETGVGYGTDTGARIRSQYRRAFVNKHGHSFDANIEVSEIRQSIDGRYSIPYKHPLNDYFNLVGGYERETRDNIGPNVELLVESAVVGGERVIKNPLGDWQHTFGLRYRLDRLTGKGDVDVSELPDAFRSAGTNSEQESLLLGYEISKTNSNTRLNPTKGFKQTYKVELGTESILSDANMAILTAGWRFIYSLGENDNHQFVGRGDASYIFTDDFDKVPYNLRFFTGGDQSLRGFDYKSLSPEEDGYKIGGQALGVGSLEYNYQFKDGWRAAVFSDFGNAFDKQFSNPTEYSVGVGIRWRSPIGPIRLDVASGISNDNRPIRLHFFIGPQL >NZ_CP031984.1|WP_160127141.1|1840667_1845176_-|translocation/assembly-module-TamB-domain-containing-protein MTEEVEQQQTPSTGPKRERRILRSILLMVLIILLLLVSSLLVMMSTDKGSRFLLDRVLQTQKIIHYEYESGNLLRGIILKNVLVQLEAVDVSLDRADVSLGWRAILKKEIHLSHADVANLKIINKKPPSGEPFGFDPIKLPFILRIDEASLDHLEIQTATAKINFDDIYLKDALWSETKLKFKDSRMDMGYLAVKDATGQIDFSGKYPLNAKADLIIPALNSIDIETIKVVATGSLDTLRAGVATLTPDLLTGWAVLHPVRDQVPMQGELFFRNYHLPIFKEQKLFAKDGIARFKGNIEKLVLSLDTDLKGEQIPEGKYNALMETDLTDQLNIQDFNGQLMGGAVSLKGLVNWKDHVSWDLKGRLDRLNAKDETLPQIAQDFLPPSLDANISSTGMLKNGMSVNAQLAFDKYETWQVKLNQSEQKNNQPEPMLLDVAWQGIDRAVPYIGWLSSAEGHTNITLKDDQQDIYVATTVRPHEQGLLPAGKYDAHIDLKGSLLNVENFSYVAEKGRLDGQAKVKLPTDKQQLAWQAQLKAKDFNPQTVALAAPVNLLNGEILASGFAKPNQQIIQFERIDLQGQLAQANQKETVVLQGKATTALMFDDVQAGGGFKSFAVDYDGSLNALNQGNGLLKINIAGTPTNIKINELKHDGVAGKLFATGTVDLQDKIGWNIETSLVRFKPQYFVSSLKGEVSGHVKTQGVWSDKVKRIDIRQLNAAGFLNNRPVRGRGNLSLLLDSNQTGFLPQQFEANDLFFAYGQNQLQATGNAQSLRFKVNAPALYELYPGLRGRAYGSLNVQSQPRLSATANLVVDGFAFNDLASVKSLRIQGQLPTSETTPTQLTATIDQLRSGKRELENATLNLTGTRRAHLLKLETKNARTNFYVQLAGGFNQNNDWLGQIQKGKFSSRRVSLVQNQNTPVIYTTARTELYVGQHCWQSAESQLCLDQPARISPEKGNFSFITKDLDLKDFAAFMPEGIAVTGQLNGYAKASWAKGTRPKLDSRLVTRKGEIGLAAEDPQDPATTVTYDELSLIAKSISDGLLFRVDMKTPDIGTGYANVVIDPFQTGMPMRGEIAFDDVQLKVFKPFIKDVRSMAGTLALAGKINGTLTQPQFTGEMRLKNGAISMISLPVNLTNMQLYSSIRQDTASIDGAFNSGQGVGRIKGRFDWKDNPHLSLTLKGDNLLVRQAPMITAIVQPDLSLDVYPFDQRLSLRGTIDVPRARISMPESSATVVNVSPDVRVVHQGQDLLATLRAAKPWDIRADMTVTLGNQVIFQGFESNIPLVGRLHLSQRGLETAMRANGAIGVSQKVKIEAYGQSLDLNRAIARFNGPLANPTLDIDANKSVQGSMVGVRVAGTATVPNVQIYNDAGLSEQEALNALLTGRINEGGSGLSNTEGFKSDVNNTIAAAGISMGLGGTRALTNQIGRTFGLSGLALDAQGTGDDTQVSLTGYITPDLFIRYGVGVFTPVNKLTLRYQMNRRLYLEASQSLERAIDVFYNWRF >NZ_CP031984.1|WP_004638645.1|1840114_1840501_-|hypothetical-protein MHQINRSMMMKKVLLIAIGLVLVGCADKKPLTPEEKWHGFCVSVGNAARSITLDRQNAIEKQQAIEHAGKIEDKTIHKFILQIIDEVYEIPVDQLKSDPSAIRDEMKQKFTEQCLATPHDELPNYKSF >NZ_CP031984.1|WP_160127149.1|1855925_1856945_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKKKYLNAIVLTTGMLISGGSVVHAGLFSFLSPKASWQNCDVKSCSVGGSTNVTSSYAKTKYPIVLAHGMSGFSAVGPLQYWHGITEDLVSNGANVFVTQQAAFNSSEVRGEQLLLQTKQILAISGAEKVNLVGHSHGTHSIRYVAGLMPEKVASVTAVAGPGKGSDVADAVYDFTQSPVGPIAAPVISAGVNAFGALIGIGSGNYYDQDSLAGLWSLTTAGAAEFNQRFPAGIPMTACGSGRELESNGVRYYSWTGISPFTNALDPFDYALTATSLLIPGDSDGLVPRCSSHLGTVIRDNYAFNHLDEVNQVLGLVGFLQNPVTPFRLQANRLKNLNL >NZ_CP031984.1|WP_160127426.1|1857222_1858242_+|AraC-family-transcriptional-regulator-ligand-binding-domain-containing-protein MSIPRLHHPHFISSSYVHLLSEVVARWNISAEELFWGTGVEIEKLHDINYKISLTSFKKVIARTIDLTQEQGIGFYASTQLKISSHGLLGFTVAIAKNPLDAILTINQFVSLQCSFVDLHFVVENELAYYNIIYDKSVMDFNDPCDLQAYEFSCVFFLTGFVHLVRFFIPDFKPSIDLQCKCPEYFSRFKHILASSFAEIHYEQPHTRLISSAKFLETPLSMSDPLTSEKFKLLCQKELDELVATQDILYRVKNLIDDQHEGLLNIDQVAQKLNLTKRTLQRMLQEQNVSFQILYDQVRKAKAQKLLLNPFITKDEIARNLGYSSLSSFNRAYKRWENQ >NZ_CP031984.1|WP_001223318.1|1858352_1859054_-|IS1-like-element-ISPa14-family-transposase MRITLEIKCPTCLSDSIKKNGIKVDGKQNYQCKDCKRQFIGDHALSYLGCNSGITRKILQLMVRGSGIRDIAEVERISIGKVLRTLTESTYQIQPKQSHYESLEVDEFWTFVGNKNNKQWLIYAYHRETGEIVAYVWGKRDLATVQRLKTKLKQLGIHYTRIASDHWDSFITAFKNCKQSIGKFFTVGIEGNNCKIRHRIRRGFRRSCNFSKKIENHFKAFDLTFFYINNGFI >NZ_CP031984.1|WP_160127150.1|1859066_1859792_-|superoxide-dismutase MRYLNKGLLTLLVCSSVSISAFANFTQAPLPYKSDALEPAIDQQTMEIHYGKHHKAYVDNLNAQIKTYPELDKLNIEQIQQQISKYNAAVRNNGGGHFNHAFFWESLAPADKTGKVSPKLLKQINQDFGSFKAFQEQFNQAATSRFGSGWAWLIVNPQGKLEITSTANQDNPLMDIAEKKGQPLLGLDVWEHAYYLKYQNRRADYTNAFWSVVNWNKVNDRYQKAIRWCFKKYAETKQVEF >NZ_CP031984.1|WP_004638629.1|1859923_1860694_-|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase MKIQGKHFVITGGGSGLGAATAEYLVEKGASVTLVDMNAEVGEQQAKAIGDQAEFVKLDVTDEQAAEQFFKEVVEKHGSLHGLINCAGVGPSAKVVGKDGVHDLAMFSKVLHINVTGTFNMLRYAADAMSKNSVEEGDEDRGVIVNTASVAAFDGQIGQAAYSASKGAVVAMTLPIARELARHSIRIMTIAPGIMETPMLKGLPQNVQDALGQMVPYPSRLGRPEEFARLVAHIAENAYLNGEVIRLDGAIRMAAK >NZ_CP031984.1|WP_125502386.1|1860836_1861895_+|AraC-family-transcriptional-regulator MSKNPPLDLNSAKDTISNALIREALSVAASRGLNIVNIANRASISAELLTSPKARIPVTQCAQLWVELAESMNDEFLGMDSHPMRRGSYKLLAKLAFEADTLEQAIREILKFLSLVLDDIHGELVQNGSKAYLILHDRDQPKRMFTYSTFLMLVHSLMCWLSDQRIAFQKMSFKCHQPVEIQDYRIRFCENIQFHATQNCIEFDAHYLKHKIKKDKQALNDFLRHTPYNLIVRFKNENSLSLQIRRQLLLQPPSEWAELKDIAQQLNMSTATIQRRLKHEGVSYQQLKNDIRCDIAIERLSKTNDSIQSISDDLNFHDPSAFHRAFKKWSGVSPGSYRKSAPNKQNRLHHLG >NZ_CP031984.1|WP_125502388.1|1861911_1862544_+|FMN-binding-negative-transcriptional-regulator MYIPQIFKETRQDVLHDLIRQYPFATLITQNNAGLDAMHLPIELLVNDEQNATLVAHIANNNPLHTQIDNGAEVLVIFQGQQGYISPNWYPSKQQHHQHVPTWNYQVVHVKGKIYFSQDEKVLRGILARLTRTHEAKQDKPWKISDAPSEYIAEELRHIVAVEIQVSGMVGQFKMSQNRDPIDAIGIVEGLEQQGNTELAQVVKHSTQSN >NZ_CP031984.1|WP_125502390.1|1862540_1863359_-|peptide-chain-release-factor-N(5)-glutamine-methyltransferase MNIAQALEIKGEIDSYERQEAAWLLEHILGVNSLELKLRLEQELTEIQEQAYLDGLARIEQGEPLAYVTGSQPFWTLDLKVTHDTLVPRPDTEILVETVLKLSLDPQANIVDLGTGTGAIALALASERPQWSVTATDIYQPTLEVAQENALKHGLSQVKFACGAWFEALEQQQFDLIVSNPPYIDPDDVHMQKLKSEPERALIAANHGLADIEIIIAQGKAWLKAKGWIALEHGYDQGRVVREIFELHGFEQIQTIKDYGGNDRVSLAQKAG >NZ_CP031984.1|WP_075315748.1|1863358_1864447_-|peptide-chain-release-factor-1 MKASLRLRLDQLCDRHEELTALLADVEVISDNKRFRKLSREHNDLTEITEVWGKYRQAEEDIETAEMMKSDPDFKDMAEEEIRENKARLVELEDQLNVLMIPKDPNDANAAYLEIRAGTGGDEAAIFSGDLFRMYSKYAETQGWRIEVLSENEGEHGGYKEVICRIDGEGVYGRLKFESGAHRVQRVPATESQGRVHTSACTVAILPEVDVDTTVEINPADLRIDTYRASGAGGQHINKTDSAVRITHIPSGVVVECQEERSQHKNKAKAMALLVSRLENAKRAAADAATSEMRRDLVGSGDRSERIRTYNYPQGRMTDHRINLTLYKLDAIMEGDLTELLDSLHREYQADQLAMLAQENGG >NZ_CP031984.1|WP_042874246.1|1864827_1865259_+|hypothetical-protein MKANILLLGAILASSTVATTTYADNATRVAATSALGSVVGTAIGKEIGGHNGALIGSAVGGAGGAAAASSKRTRTEAAIGGGLGGVGGYAVGKNVGGTTGGYIGAAAGAAGGAALGRQVGQDRYYDSRQNQKKKWKKKKHRRH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031984_3 | 2152072-2152258 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031984_3
|
4 spacers
spacers of NZ_CP031984_3
>3.1|2152091|23|NZ_CP031984|CRT TTTTGACCCGATGTGGTATTGAA >3.2|2152133|23|NZ_CP031984|CRT TATCGACCCGATGCAGTATTGCT >3.3|2152175|23|NZ_CP031984|CRT GCAAAACCCGATGCTTCATTGAA >3.4|2152217|23|NZ_CP031984|CRT CCAAGACTCGATGCGGTATTTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031984_3
The CRISPR arrays of NZ_CP031984_3 >merge|NZ_CP031984|3|2152072-2152258|CRT ATTACCGACTGCACTGCTATTTTGACCCGATGTGGTATTGAAATAACCGACTGCACTGCTATATCGACCCGATGCAGTATTGCTAACACCGACTGCACTGCTAGCAAAACCCGATGCTTCATTGAAATAACCGACTGCACTACTACCAAGACTCGATGCGGTATTTTCATAACCGACTGCACTGCTT >NZ_CP031984|3|2|2152072-2152258|CRT ATTACCGACTGCACTGCTA TTTTGACCCGATGTGGTATTGAA ATAACCGACTGCACTGCTA TATCGACCCGATGCAGTATTGCT AACACCGACTGCACTGCTA GCAAAACCCGATGCTTCATTGAA ATAACCGACTGCACTACTA CCAAGACTCGATGCGGTATTTTC ATAACCGACTGCACTGCTT
>NZ_CP031984.1|WP_160127430.1|2145702_2146956_-|YadA-like-family-protein MSDAFIAVDQQLGAIKTSVSDLKTHTDQQAVSNLNDAKNYADQQTTTALNNAKGYTDQKTTSTLNDAKSYADQKAADGKAYTDQQTASTLNSAKNYADQKAADGKAYTDQQTASVLNDAKSYTDQKAASSLSGAKDYTDQQTASALSSANSYTDGKIADVQTQIIASNQFVQVNGVTDAQAASATGENSVAIGTNTVVTGHRSTAVGVGNQVSGNGSGAFGDPNTVSGNGSYVVGNDNKVTGDHTFVLGNNVDTQAKNAVVLGNDSASDRDNTVSVGAKGKERQIIHVANAVEDTDAVNYQQLKAAEKSTNNYTNERVNALNSAFNDYRMETEQRFHKVDERFNRQGAMTAAMMNMSSSAASVKGQNRVGVGAGFQGQEQAVSIGYQRIINDNTSLTIGGAFTKEESSGGVGVGFGW >NZ_CP031984.1|WP_160127429.1|2144598_2145642_+|nitronate-monooxygenase MSILELLEIKHPIFLAPMAGVSTPELAAEVSNQGAFGSLGLGANTPETAKAEILKTQKLTDKPFQVNFFCHQPERLDPQKAQQWIEYIRPQFAKFGTEPPSELRCIYPSFLDNDDFLNVVLETRPKAVSFHFGIPHPRQIQALKDAGIVTLVSATNLIEAQQIEAAGIDIIIAQGIEAGGHRGIFNQTFDAAIKTSDLVQLISTHCKLPVVAAGGIMNGDQAKSMLKLGAAAVQLGTAFVQCKSSSANAAYRKALFSQSITQISSSLSGRPARGLFGAWHKFVDAPQRPNLPEYPYTYDIAKQLISIANQQQDTSYGAFWAGSNVGQIRELEAADLINQLVLEIKTH >NZ_CP031984.1|WP_004763941.1|2143778_2144480_+|VIT-family-protein MSFSHHAEPHVIQRSGWLRAAVLGANDGIISVTSLIMGMAASGASSHTLLITCIAGLISGATSMAAGEYISVKSQEDIEKSDLRFEARELEKNPHAELGELTQIYISRGLNPELAHEVAKQLTEHDALGAHARDEIGIHENTAANPVQAALSSAASFSCGAALPMLAILLSPDAFISHAVLVTGIISLGILGALSSYFAHTSILKGSLRIMLWGILAMAFSSWVGSLFNVTTI >NZ_CP031984.1|WP_160127207.1|2142012_2143449_+|deoxyribodipyrimidine-photo-lyase MQSDYQLIWFRQDLRIHDHAALWHATQTGPTVALVILSPEQWQLHDDAPIKIDFYLRQLQQLQIALQSLNIPLIVQHLPFWKDITQLFADLMQNIPIQQVYANIELGVNELKRDNEVQKLLHQQNKELVLFHDRTLFPVASIRNQSHQPYQVFSAFKKVCYQRLQQSLPQCYPVPDVQQPINIDPYYSLEDFKELQLKYTQQLNHLTQQWPVGEPYALTLLDQFIYDRLDDYKNARDFPAQAGTSQLSAYLNIGILSIRQCLQALFRKQHGDFVIESEGQQTWLDELLWREFYQHILFDYPRVSKHLPFQLSTQKINWRDDPVALQQWQQGHTGIPIVDAGMRQLLATGWMHNRVRMICAMFLSKNLLIDWRKGEQWFMQHLIDGDLAANNGGWQWCASTGTDAVPYFRVFNPISQSLKFDPNGDYIRQWVPELTDLDAKTINEPYANTKIQNLDYPMPIVELKSSRTRAIETFKTYL >NZ_CP031984.1|WP_004638347.1|2141411_2141894_+|peptidylprolyl-isomerase MTAIANNHVVSFHYTLTNAEGETLDKSQGEPLAYLHGAGNIIPGLENALTGKTVGEKFTVNVPAAEGYGEYNPELVQEVPAQMFQGVDNIQPGMQFQAQTDDGVQIVTVKAIEGDNVVVDANFPLAGQDLTFEVEIVEIRDASQEELDHGHVHGAGGHHH >NZ_CP031984.1|WP_004638348.1|2140003_2141290_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MSKTLHHIVIVGGGAGGLELATQLGERFGKHKKAKITLVDQNLTHIWKPLLHEIAAGSLNPHEEQTNYFAHAEKHHFEFVLGTLIAVNKDQKQITLSPPQLSKEHTPAIQSLSYDTLVIAVGSVSNDFGTEGVREHCHFLDSRQQADIFQQDLFHLYIEAQNQSTERALNIGIVGAGATGVELAAELIETTKNFYRYGLKKINPKQVKITLIEASDRILPALNEKTAAHSAKQLQKMGIEILTQHKVQKVDDSNVYFSNGNVIHSDITVWAAGVKAPKILEALNDFKRDKINRLMVYATLQTYSDPNVFAFGDCAHCQLDARQPPLGPRAQVASQQASFLVDAMAARLNHSPQPMFVFNDKGSLVSLSRNQAVGELLGDVSVQGFIAKTMYVSLYRLHQANIHGYTQAGMLTMKDLLTRRVRPKIKLY >NZ_CP031984.1|WP_005081819.1|2138593_2139910_+|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase-PBP6B MKFFLSLFTLLSLFCANLAHATLLNISPETVEAQAWSIVDAQSGQIIAEHNSHVQRAPASLTKMMVAYVALKEIKAGKLRKEDVLTATPVVNTVMWDESQMYLKEGEQISVDQLLAGLIVMSANDAALTLAEKISGSVPQFIIRMNQEAQALGMKDTHFSNPAGITMPDHYSTAADLGLLAQAIVTKTPEYLYYSKMPSFSYNQRFHRATNLALKMDPTADGLKTGFTKAAGYNLALTAERPTLNPHIDKRRLIVIVLGTPNAIKRAEVANKLMNLAYAYTRDEEVIPKHQLIAELPVIRSTLKIFKVETQQPTIVTTSLYDQATPIDLNQFDALTQRLQVVDENGVKIIEPLQNTHTRVNIELNEQRLTAPLTQAMNLATVSIYQNNQLLRSLQIENEVQIEEANIFQKIMLWFSNLFSFFSTNDTKAAKLYPLNQG >NZ_CP031984.1|WP_075315929.1|2136455_2138159_-|M61-family-metallopeptidase MLHYQIEFDDYRQHLIHVTLRFLANPNQELWLPTWIPGSYLIREFSKHIESVKASDEAGRLLSIKKTEKNRWRLFNTDHELITVEYDVYAYDLSVRGAYVDQTRLYVNPACVCLGLQDQEQAPCEVELFLPDELKHFQIATGLTSKSLVKGRFTLKADNYDQLIDSPFELAEQSRFSFEAKGIPHEFVISGKHNTNLERMQADIEKICRTEIEMFGSAPFQNYTFMTIATGNSYGGLEHCNSTSLITPRDDLPKLDEAEEPSKDYQRFLGLCSHEYFHSWLVKFIRPDNFANYDLHKEGYTSLLWIFEGFTSYYDDLILLRSGVISQKSYLDLLKGQIDRYLQNPGRFIQTVSESSFDAWIKFYRQDENSNNAGTSYYNKGSLVALCLDLGLRLRGSSLDALMRRLYENTQQGIQVNERTIFDLCKALTGDDWIEQINHLINTTDELPLDQLLPEFGLSYVLKNEKALPFGLKLSDKAEGVVVQQVRRESAAAQAGLSANDVIIAIDGIKASEKLLANYAKQQGTFTVYAFRRDELLTFELNGGENSLTTVDLNVEDQAKLDTWLAS >NZ_CP031984.1|WP_005091139.1|2135890_2136289_+|hydroxyisourate-hydrolase MMKVFVPLVAMTLSSFSFAQNPLSVHVLNLENGLPSAGVKVILEKQENNQWKVLNNNITNQQGRITDLYPKDSPLQKGIYKVTFKTGEWFEQHKQISFFPEVPVIFAIDGKLEHYHIPLLISPYGYSTYRGN >NZ_CP031984.1|WP_100833444.1|2133181_2135413_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MASGKSTIIYTLTDEAPLLATYSLLPIIETFTKPAGIEIVKSDISVAARVLAEFSDYLNDEQKVTNNLAELGRRTQDPDTNIIKLPNISASVAQLTSCIKELQSKGYAIPDYPENPTTEEEKEIKARYGKCLGSAVNPVLREGNSDRRAPAAVKNYAKKHPHSMSEWKQWSQTHVSHMDEGDFYHGEKSMTLDRARNVKMELITKSGETIVLKPKVALQDGEIIDSMFMSKKALCDFYEKELEDCREAGILFSLHVKATMMKVSHPIVFGHCVKIYYKDAFEKHGKLFDELGINVNNGMAGLYEKIETLPTSLREEIIEDLHACQEHRPALAMVDSAKGITNFHSPNDVIVDASMPAMIRGGGKMWGADGKPYDCKAVMPESTFARIYQEMINFCKWNGNFDPRTMGTVPNVGLMAQKAEEYGSHDKTFEIAEAGVANITDLETGEVLMSQNVEEGDIWRMCQVKDAPIRDWVKLAVTRARNSGMPAIFWLDPYRPHENELIKKVEKYLKDHDTEGLDIQIMSQVRAMRYTLERVARGLDTISVTGNILRDYLTDLFPIMELGTSAKMLSIVPLMAGGGMYETGAGGSAPKHVQQLVEENHLRWDSLGEFLALAVSLEELGIKEDNNRAKLLAKTLDQATGKLLDNDKSPSRRTGELDNRGSHFYLALYWSEALAAQDEDAELKAKFAPLAKALAENEQKILAELSEVQGKAADIGGYYAVDPAKVSAVMRPSATLNSTLETI >NZ_CP031984.1|WP_160127208.1|2156354_2157074_+|response-regulator MLETGNHFLSLIMIHVSQNELILPVPVFILEDDAIMQQRLKRILLEIGYAEDALIFAQTLSQAKDMLQQYPISFSLVDLGLPDGNGIDFIENLRQTDEVSPILVISAWSTQETILKAIQAGATGYLLKERDDFEIMLSIRSILRGGAPIDPFIAQQILSKITFEQKVKDVAVAEQNNLLSTREFEILQLVAQGMSNREIADFLHLSKYTIECHIKHIYRKLSVSSRSKAINTARSLGIL >NZ_CP031984.1|WP_160127209.1|2157178_2158924_+|histidine-kinase MAKAIGQDGTQRPETGWQNVKLPDQWDKRKFYYTGSTWYKIVWDYQCPTTTKTPITIVISYINMTGQVFINNDLLWQDQSLVEPLSRSWNMPRYWNLPVSSLKQGENILWVRVVGVKSQNSGLGQVLVGNADQVRPKFQMFWNQQRVLVFLNLITSLTLGVIAFLVWIFHRKDQIFGWFTLAALMWSMVMFNTIMLEAPFGLTTLQIARISIVCFFAYSLFSCFYAWRLAQRKFPRLEKILLLMLFIAIGMAILLPDTALYNFISGTFSLGLLVLLINFISYQWIAYFSKLLEAYLLAAVFLFFIIVCIHDTFQIMQSNNSFLWMSYTAPLTSLLIAIILALRLAKNLRAIENFNQTLKQNILEAKNELTLSLNTQHQLELDNAKLQERLQLAHDLHDGLGGSLVRSMVTVDQSQINLSNQQFLSMLKILRDDLRQVIDSGSSTGAKVPDTPILWGAPLRYRFTQLFDELNITTKWSFPESWQKQPTPLVCLTLLRVAEEALTNILKHSQATSVKCALFFSKGQLVLDIEDNGIGFDVEAVKNAGMSVGLRSMQTRLERLGGHLTVQSEAGRTCLKACLPV >NZ_CP031984.1|WP_004681408.1|2158975_2161054_-|polyphosphate-kinase-1 MNTAVATTTPIEYSYNDRYINRELSILDFHLRVLEQAVDPLHPLLERMNFLLIFSRNLDEFFEIRVAGMMEQLTLGNESRSPDGLTPKQVLEQISKTAHAAIERQYRILNEEILPKLREEDICFLRRGELTPAQSAWIKKYFQEQVAPVLTPISLDPAHPFPRLVNKSLNFIVTLEGKDAFGRQIDLAVVPAPRSLPRVVRLPNELTGGKEHHVMLSAIIHEHVSDLFPGMTATGCYQFRVTRNADLALNEDVEDLAKALKGELSSRRFGRAVRLEVTHNCPKHIYEYLLDEFDLNEEQLYRVDGPVNLARLLSNFKRPHLRYDSHTPVIPKVFKKTESIFSAMQKQDILLHHPFESFAPVIQLLREAARDPQVLAIKQTLYRSGADSEIVQVLAEAARNGKEVTAVIELRARFDEESNIEVANVLQEAGAVVVYGIVGYKTHAKMILVVRRENNKLVRYVHLGTGNYHATNARIYTDYGLMTTDKDICEDVHRIFQELTGMGKMAKPKKLLHAPFTLHAQLINYIDEEIANAKAGKPAQIIVKVNALTEVQLINKLYEASQAGVQIDLIIRSICCLRPGLPNLSENIRVRSIVGRFLEHTRVYYFSNNGNPRIYCSSADWMDRNLFNRVEACFPIEDPASKKRIYQLGLLNYLKDNQQAWLLQSDGVWERDKPAAGEEPHNAQQTLLDAIK >NZ_CP031984.1|WP_004638331.1|2161209_2161881_-|monofunctional-biosynthetic-peptidoglycan-transglycosylase MKALFARIVMLIIGVILLIQLWIFSSLVWWRTHPVNTTMFMRLDYWSDLKPIQHHWRDYDEISDNFKHAVLAGEDAKFIHHHGFDWAGIQHALERNNKKGEVVAGGSTISQQLAKNLFLYNKRSFVRKGQEAIATWMMERMWSKRRILEVYMNSVEFGQNIYGVEAAAQFYYGKSAKSLTREQAAFLAALLPNPKYYQNNRNDRKLQYRKRVILKYMNGTQKP >NZ_CP031984.1|WP_160127210.1|2161978_2162782_+|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MTETTPPQITQKLHVHTWWFTAALIAVNVSLFGWQILTGVDITDPSPVDAIAWGADFTPLTFLGQPERLFSSMFFHFGMIHLMLNMWALYIFGSIAEQLFGRRYYIALYFLAGLMGSVLSSYLSILDGYQLLQHFDPKYLPKISAGASGAVMGLGAALTIISVLPMLPRQRFLLDKKSLLLIMAINLIFGFTVSGINNAAHIGGMLMGVVLATAWYLSQKTGKKIMFQLGAVLIATLLLYGLYVYCTALGQTLHPLWYEILMQNKLN >NZ_CP031984.1|WP_160127211.1|2163043_2163472_+|VOC-family-protein MKPHISILTLGVTDLEQSLIFYRDGLGLQTEGIVGQEFEHGAVAFFDLQRGLKLAIFAQEDLAIDAGLIQQPISSTAMSIGHNVSNKSEVDEIMETAKKAGAVIVKQSQNTFYGGYAGYFLDPNGHLWEIVWNPQIMPPSDC >NZ_CP031984.1|WP_160127212.1|2163554_2166041_-|FtsX-like-permease-family-protein MNSIVRPLLLQSFRTGGLYLLIIALSLAISATTALKFSNTQVQNAVTLQAAEMLGADLVLSDHEPIQADWYQQAEKLDMKQSAVTVFGSMAHTDDQFVMVNVKAVDENFPLRGKLEISPVAQTIQSGQVWLSPRAMDLLQVKIGDQVAIADGQFKVSGQIEHDSNQELGFSGFSPTVIIHQTDIAKTNAVQVGSRIEYRLLMAGTSAQVNTFQQQFELQNKQDHPEVQTDDPTMSNQETSSLKLRDASQSNTRLMKPIENLDTFLQLANLLTILLCGIAIALTSQRYVQQNQDHIALLRCMGASKKQIIVAYCVLLAVVSALSIMVGSLIGVGLGYGLLQLMLQLIPQLQLSFAIGDLFYALPVAIFTSVMVLIGFILPSIWELLNTPPIRVIRQQERSRKSYVAMFAVGVTSLVIFSLVLSDNLTLSLLVLTAILFLCAVLYVLIWLLLKAIKQLKHPISAYVRIPHQTALQITALALGLSLITVLSVLRTDLLQRWQQQLPEGTPNQFVYGLPPFDMPLLKQQIEQNGWQSTPLYPNIRGRLIAKNGEAFSPELVEQNNSLRRELNLTQASDFPNDNIITSGERVFTKTHQVSVEEKLAAELGIQIGDELSFSLPEGTLQATVINLRSVEWESFSPNFFFIFSPNSMDENAGSYLGSFYVPPTDQAKMVSLIQQFSNTVFIDVGRVLDEVKRLMNVLVQIVTVLAMLVGLSGLLVLIACLNVLMDERRKEVALMRSFGIAKNKLKRMLSLEIGFIGALAGVVACLFAEVISAIASYKMQMAIQWHLEIWLILPLSMLLVCTLIGRYRLSYLCDIPPLQSLREINQS >NZ_CP031984.1|WP_075315942.1|2166037_2166742_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPQPIISAQKVTQNIQINQQSLTILREIDLEIYQGEQIAITGRSGSGKSTLLGILATLDRPSSGELWVCGQAVHTLTEEQRAQVRLENIGFVFQSFQLLPQLSALENVMLPLRLQPNFNFKQAEQKALAWLERVGLVRQAQQTPKVLSGGEQQRVAIARALIAEPKIIFADEPTGNLDGQTAEEIEQLLFDLNKALGTTLVLVTHDQNLAAMCQRHVRLVDGQVQDVIKVGEGI >NZ_CP031984.1|WP_160126732.1|2166785_2167409_+|arylesterase MSRVILSISKPLIIIGVFLSPMLASAKTILILGDSLSAGYGIETKQGWVHLLQQRLDQHYPKQHKVVNASVSGETTSGALARLPKLLQTYQPEVVVIELGGNDGLRGQPPQLIQKNLAQLVQLSQKQKATVLLFGMKIPPNYGTAYSRAFENNYKVVSQQYRIKLLPFFLEGVAGNKSLMQNDQIHPNAKAQPIMLNLAYPYIRGAL >NZ_CP031984.1|WP_100833441.1|2167430_2167868_-|AAC(6')-Ighjkrstuvwx-family-aminoglycoside-N-acetyltransferase MNIKPASEASLKDWLELRNKLWSDSESSHLQEMHQLLTEKYALQLLAYSEHQAIAMLEASIRFEYVNGTETSPVGFLEGIYVLPEQRRSGVATMLIRQAEVWAKQFSCTEFASDAALDNVISHAMHRSLGFQETEKVVYFSKKID |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031984_4 | 3200443-3200783 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP031984_4
|
7 spacers
spacers of NZ_CP031984_4
>4.1|3200469|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder CGCATTAACACCTGTT >4.2|3200511|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder GGCATTATCAGCTGCA >4.3|3200553|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder ACTGCTTGTGCTTGTT >4.4|3200595|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder GGCATTACCAGCAGTC >4.5|3200637|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder GGCGCTTGTTCCACTT >4.6|3200679|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder AGCACTTACTGCAGTT >4.7|3200721|37|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder CGCATTTTCTTTTGCTGCTCGTGACTCATGGCCAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP031984_4
The CRISPR arrays of NZ_CP031984_4 >merge|NZ_CP031984|4|3200443-3200783|CRISPRCasFinder GCTTTTGCACCCTTACCCATAGCATTCGCATTAACACCTGTTGCTCGCGCATTGGTACCAATTGCACTGGCATTATCAGCTGCAGCTTTTGCATTATCACCAATTGCATTACTGCTTGTGCTTGTTGCTTCTGCACTTTTACCCATCGCATTGGCATTACCAGCAGTCGCTTTTGCATTATCACCAATTGCATTGGCGCTTGTTCCACTTGCTGTTGCATAGTTACCAATAGCATTAGCACTTACTGCAGTTGCTTTAGCAAAATTACCCAATGCACTCGCATTTTCTTTTGCTGCTCGTGACTCATGGCCAATTGCTGTTCCATTATCGCCCTGTACAAT >NZ_CP031984|4|3|3200443-3200783|CRISPRCasFinder GCTTTTGCACCCTTACCCATAGCATT CGCATTAACACCTGTT GCTCGCGCATTGGTACCAATTGCACT GGCATTATCAGCTGCA GCTTTTGCATTATCACCAATTGCATT ACTGCTTGTGCTTGTT GCTTCTGCACTTTTACCCATCGCATT GGCATTACCAGCAGTC GCTTTTGCATTATCACCAATTGCATT GGCGCTTGTTCCACTT GCTGTTGCATAGTTACCAATAGCATT AGCACTTACTGCAGTT GCTTTAGCAAAATTACCCAATGCACT CGCATTTTCTTTTGCTGCTCGTGACTCATGGCCAATT GCTGTTCCATTATCGCCCTGTACAAT
>NZ_CP031984.1|WP_004681119.1|3186866_3187682_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamE MKTLLKTIVSCVFLTGVLSGLTHAKEQINLQMADESVSFPEVKKSYLDQVHRYEYDQVLRLENGLTKDQIRYILGHPHFSEGVFGVREWNYVLDIRVPETQQYKRCQLRIDFDKDYLAKAYYWKGEACQGLAQYGANNQPVDKNALVVGGLNAQVAQASVLFAFDRYDESAINRDFSRVEEIAEAIKQSGSQRVTVTGYADKLGNFNYNQVLSAQRANTVAYLLAQLGIDPNYIKVDANGTTRIYKECEGQTKSTSTVECLAPNRRVNVNW >NZ_CP031984.1|WP_100834160.1|3183611_3184871_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HipA-family-toxin MLKKLNVYYNGWGEYWLWGTLVSSTAITGRPLIAFEYSAEAISKGLELSSYLLPLKGDPLRTNFPAHQMGLPSPIYDALPDGWGMLLMDRLFKKNGFNPARIGPLERLTYINTHAMGALSFEPSAPELALTKNIPLIKLAQEVQEVLKGEGAEFLQHLLIMGGSPQGARPKALVYRDPVTNEFSTVSSHQHEAWLIKFPAQQEHPEVCAIEAVYAECLRHCDIDTPDTQYFTLPNGLTAFASKRFDRHDGMRIPMQSLAAFTGADFKSPGSLDYSNFLRAAHFCTNDVREKAIAFKRAVFNVVFNNRDDHCKNFSFLMSHNGQWKLAPAYDVTFCEGPGGYHQMDIMGEALDIPRQALVKLGTQEAELSAQEVDEIISSICKVAIRFSNIAHDLLPGQIQAETLQMIQNRIEHNIHLLN >NZ_CP031984.1|WP_087539453.1|3183304_3183607_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDLKFKKPEEVVTLLCERLRKERLYLEMTQADVATRAGISVNTVSNLEAGRNVSFENLVRVAMVLGRLKEVEELFKPHLNSVNDILRYESNTARQRIKRK >NZ_CP031984.1|WP_000033773.1|3179735_3182699_+|site-specific-integrase MSKHPHSLKRLKKQREKKKFFLQLFSEKFTELTPENYPEIFRQVDDRLLEHCKSNIRSYQIARIEFAKYIKRFNLSSNHHYPVPAAPVRYERSLPLQNIETLKHGKKVTQFAKNLIAHWTEHNDFSPTQSLAFCLISSILFNGIYNHAELQFFLKIILKTKKFQSFLNLNHMVTLEIPNRNFGNQRINDPDFSVSYTKTFVLHDIVKCWIYRLKHQKFDLFSDIEDAEHLINACIIECFPEEKLRCKDLLKYGFYYTQFLKNSGLDQMSICILKNEIYSSSPLEKQLEAYFVQFEQKHTNNIKVENTCENHQAHSRVNIASDIAETLVEIRQAIRAKNYKDQLIGLYSRELSPALERLLLWSILRSKLTEPQLDLLNHIIQQQQRFKRKLIRADFQPLKQSSLKTMFSQFAVHWLQATQDKDISSFSNADFEDLYGEMLLLRKETTRETLQKRLQEFHHKQTLFFNAPTVDLDSLIQVKICRTALISPHIFYRMLEQLENTQDISIQDKNIFKLIFILGFRVGLRINETLNIFVRDLFIGADAVILTIRNNRNKNQKSYSAYRKIPLHHLLKADELHAFKTYSQNRKRLLKEQRKSVTQPLFLKQSLEETHENEVNALLKQLIQSASGEHSFTYHTLRHSAFNHLYLVLKHSPLADAFTDYTPNDQLRIRYALLRNKNTQQTWYALSHFAGHLTPETTCSSYLHLMHLAISYQLNQMHSPLPKEAYFNILKHDDSIKYPVQQRAIKQFLFEQLTKDRYRQHDHQFQLGQQKSPDSLMLGAHDSEMTFELLHHILAVEKEQDLMLPEAIPLQIAQKLRARAQHLKTSCVNQKKSSRLFTTDFLRKTPNALVTMLPTNQEEKKVIQHVQERYANVQSKYKKQLHTIYSIYLEKVQPNSAQLIFELNEKRQLKKLLSFIHSLFPKKYLHLELSQQSKTELKSTLQDLALRTENFSLNEEEERIKFSFKYKDAKALGVFKLLMYLMIVSHL >NZ_CP031984.1|WP_160127372.1|3177558_3179739_+|hypothetical-protein MNGYSYLEDTQELKLESFRNFYRALAEVKLESFQNSIKLNDFIKPTEIVELNNIINQQLAEKSISEYPLVHYLIAVINTPSAYQANALKWAIFNTQCIELLDSKEHATTVANLCMRFRLASTKREYHWLYNFLPALPIEWKDLYEFLNLAETENKKLLERSTPNLTTKQIGQLADIRVIYTYAHTQADRQKRHRESRPSTQETLQTDVRKASKITLDDEITYQTHFERCEAKLPIEETMQETVEDHNFEFNALEQHSITAQINNLKNRVLHKYKNELMNKPNPRVFDLPTARYIMGILFEQAENSPIHALLLFSALSFTHYEELLVFRTRFLLSSKSKEIRFSHENCFFRQSIDSSKFKDTFLKEYMLNIGNSFTIPLPKVYLDRIFQLKNWDKADIASDVQDYLRRINNDLTFPLTTQNLPRLISDITLNELGYELESKLFAGENVNNYTPCHYFSTKIIDILDIYIQTLDLVCPQLDTGYIEEFKSPITFGSQQVPNLPFVQSFFYQLDHKVRNNLNPFQTLNHYSMWLWHICMLTTSARPSESFPPSLDYIDLDNKLMAVADKEQRYSGTIGRYLPFNNFLRDEIQHYLKYLKYFLQLAKAYLTQEQVQAIQEVFDGERLLLLFYDSKGYVRNLELSDIQKYCTEIALQRNWTRHFARYFFAQYCNEDLINGIFGHDEAMQELFDRYSGFKTIDYDQIRAAQDKLVEILALKSMSTFTGMTIA >NZ_CP031984.1|WP_000543471.1|3177064_3177562_+|hypothetical-protein MHAYQIWIALFLQLSDKQQNYHLDLAFKQNIDIPLITTNTLGHYFFSSHFSWIYAYFYNKNKNEFTFRAYEKNNSYEFTIQALSEVMALLCSGLHHSIHGLDIIAHWLNEQYLAAHLQEVFGQEVLTINHLRELSGLSKSQSPVSSISNYAGPLSLEKILAGISS >NZ_CP031984.1|WP_010326927.1|3175449_3176475_+|IS30-family-transposase MEYIKLSYHHLNFEDRTALMLESRKEGFSARKFAELIKRHPSTIYRELKRNSINDVYQARYASDNTFARRRRGHRKLKIDSILWKFIVEAIRCLWSPQQIAKRLKTFPDLDQTMNVSHTTIYSTIRALPKGELKKDLLSCLRHENKKRKANGEPKKDSILQDIKTIHERPAEVQERKIPGHWEADLIKGKDNKSSIATLIERNTRLCILATLPDAKAESVRKALTEALKYLPAELRKTLTYDRGREMAEHKILEEDLGIDVYFCDPHSPWQKGTCENMNGLIRQYLPKGIDLNQADQHYLNQVAMSLNTRPRKALDWLTPLEKFAQLVDYHKTFQTVAPHV >NZ_CP031984.1|WP_000693745.1|3173095_3175051_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKIKFLTVSLMLILPFSVFAANTVVEKAVIESNNTYKAKYNLEDMTEFNQAQKGFIAKPTGQIKSEKGNVIWDFDAFSFLQDQAPNTVNPTLWRQAKLNNNVGLFKVTDRVWQIRGFDLANMTIIQGDTGWIIVDTLTSKETAEAALKFARQHLGEQKISAIIFTHSHIDHFGGALGVLSSEEINARKTPIIAPKGFMEEATSENVMAGSAMIRRATYMYGTFLPKNAEGLVDTGLGKAVAVGKMGILEPTQLITQPEQKMTVDGLDFVFYNVPGSEAPAELTFSIPSLKLYNGAEILSHTMHNLYTLRGAKVRDALKWVGYLDQAMQHAKASDVLIAQHHWPVWGNDNIQDFIKTQRDVYKFTHDQTVRYMNSGFNGAEIAEKIKLPAALDQKLYAHGYYGTLKHNVKAVYQYYMGWFDAHPSNLDPLPPKAVAKKYIELAGGENNALKNARDAYAQADYRWAAEILKHIVLNNPQNQQAKDLLANTYRQLGYAAEASTWRNFFLVGAQELQNNVPLQNTSDPSDLLIHTPTERFLEAMATNLDVENLKNENQCINLVLSDTKEHFSLWVENSVMQFKRYDESKDLALDCPTLTLTKPLYLKMITGQIEGVKVLLSKDSKVKGNPLKIGKFFAMFKRPDSIFPIVTRPNG >NZ_CP031984.1|WP_010326927.1|3171712_3172738_+|IS30-family-transposase MEYIKLSYHHLNFEDRTALMLESRKEGFSARKFAELIKRHPSTIYRELKRNSINDVYQARYASDNTFARRRRGHRKLKIDSILWKFIVEAIRCLWSPQQIAKRLKTFPDLDQTMNVSHTTIYSTIRALPKGELKKDLLSCLRHENKKRKANGEPKKDSILQDIKTIHERPAEVQERKIPGHWEADLIKGKDNKSSIATLIERNTRLCILATLPDAKAESVRKALTEALKYLPAELRKTLTYDRGREMAEHKILEEDLGIDVYFCDPHSPWQKGTCENMNGLIRQYLPKGIDLNQADQHYLNQVAMSLNTRPRKALDWLTPLEKFAQLVDYHKTFQTVAPHV >NZ_CP031984.1|WP_002159601.1|3170569_3171178_-|hypothetical-protein MTELSKPKIIPIEHRPQKSKLFIKCVVLPIVIFLIVAKIFSFGAFGYIFFGFDLFWFVILYYLYEYGNTYFDGMTEQLKRQGETFNYQNRGVWINSQDKTIILFDQPDQRLVKYPFDYITSVGHYNLVEDNFRTTTTVISNPMMGTHVNQQVHRTPMKREFQVNIGTRDPFKPNYSLKVLFPWRSPQMASEIRQLLSADHYQ >NZ_CP031984.1|WP_160127374.1|3205630_3208978_-|SWIM-zinc-finger-family-protein MSSLINFLSRFSTATLQRSLSYAKHIDRETIEFFEDKDGVTMYAQIEGTDYYDTAITYNPQKDRLIDDDCTCPVGYNCKHAAALARLFFQEYRQEFQQRYADSQSPQGIAKRRWGDDQAQRWLNDFKRYLQQTEPEQSVKTNNYLIYLLDQSISLKKLTVDVQKARRNKNGSIAGESYYTQYENITRKHLTLPEQKRQLFNQIYYYAKINSDERFYQSNLDISSILLEHFKSFIQSGDVYWQKKSHTALKWSEQGYHIELIWQQGINKQTEHLNIELVNGDIRLDLKSNPHIQILASQPPCYVDIQQNTVGQLYGEYTANLLYHFLQMPDLPSMLLPEFEKLTHQYSDVKNLPQPESIQHIDVLEGSPQPILRFGVLDKFDWKWEESVCAEIEFSYAGGRIKAGTSGDSFIGEQHDKMVRQLRDLVQEQQSIQRLQLLVESLKWVKDLSYDHQLKLDKQRLDSMVFAFYGDWIKQLMPINQIELMGWQIEHLKNSPFNLQYVENLNISITESEGQQDWFNIGATVQDSAGNSYNLLDALVALVRVNPDLLDPRTFIHLHDSQIFTVKTAVDQPDLALSARDIKPVLLHLQSILQQEERSIDRYDASQLLELQHNLGMTWQVSDRLQQFVQKFKQGYQQQLPTPQGFQGELRPYQQQGLGWLQFLRETQHGGILADDMGLGKTAQTLAHLLMEKQAGYLQDSPALIVAPTSLMHNWFKEAEKFTPELKVLLLQGPDRHQYFEQIPHYDIVLTTYPLLARDEEQLKQYEYHQLILDEAQNIKNPRAKAAQVVRQLTARHRLCLTGTPMENHLGELWALFYFLMPGFLYSQEIFNKKYRHPIEKRGDQQLRQKLVNRIKPFILRRLKTDVAKELPEKTTIEVNIDMNDQQSKLYEAVRATMQASIQKIVAEKGFKRSQIQILDALLKLRQVCCHPSLLKLDSVKIGQANSAKLEQLMDMVVPMVEEGRKILIFSQFTSMLELIEQHLHHAEIGYVKLTGKTKKRDEVITAFQSGQVPIFLISLKAGGVGLNLTAADTVIHYDPWWNPAAEDQASDRAWRIGQDKPVFVYKLITNKSIEEKILALQQNKAELAQSILSTDHEGEAKLTENDVMNLFEKF >NZ_CP031984.1|WP_000557943.1|3209393_3209657_+|type-II-toxin-antitoxin-system-prevent-host-death-family-antitoxin MHVFTYTDARNNLKSVLDKVIDDADVAFITRKEGGHAVVMGQDHYDSLMETLYLLSSPNNTTRLNESIAQLRAGKTKQRELIKDDES >NZ_CP031984.1|WP_043975117.1|3209643_3209907_+|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MTSRNVEWTENAWDEYIYWQTQDKKILKRINTLIRECQRTPFEGTGKPEPLKANLSGFWSRRIDEKHRLVYEVTDERISIVQCWFHY >NZ_CP031984.1|WP_075316396.1|3210834_3212187_-|MHS-family-MFS-transporter MQTTDGNGSSPKKSSHRLAGISSMVGTTIEWYDFFIYGAAAALIFNKLFFPNLDPLTGVLAAFGTYAVGFIGRPLGGLVFGHFGDKIGRKSMLLLTLMLMGIPTILIGLLPTYETIGYWAAICLVILRFIQGMAMGGEWGGAVLMAVEHAPDGKKGFWGSLPQASTGGGLMLASIALGLVSLLPEQALFSWGWRIPFLASIVLLGVGWYIRVKVPESPDFEKVKHQAENIKVPALKVFKQHPKQLFTIIVARAAENAWFYIASTFTLAYTTTQLGIPRQDILFATICGAAVILFMTPLCGHLSDKVGQRNMFMFGLCVLAVFSYPFFSMLNTKDPVLVWTAIVLAIGVVFPIMYAPQAQLFARQFPAEIRYSGISISVQLAGVLGGGIAPLIATKLLSVGGGNPYLIMIYIGSMAMIAIVATTFMPRDRIAQTYQQSNELDLKTKITDQS >NZ_CP031984.1|WP_075316397.1|3212305_3213331_-|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MNKENHLMIEQQGGLGMISLDRVTHLNALSLEMIEGIRAQLELWRDDAAIQAILIKSNSPKAFCAGGDIRYLYDSYKLGTTDHQGYFSAEYKMLTTIREYQKPVIVLLDGYVLGGGFGLAQACHIIVSSEKSRFAMPETAIGFFPDVGATHFLSRLDDIGVYMAITGEQISSSDALYLDLIDYHVPSEKLQALQEALVETSSLSKEEIEHIIAQFITRPAESELKQHAEAIRKHFGFQHLDEIEQSLANEQDEQLNAWASKLLHLLQQRSFVAKQTSLKLQHLGRGLSLQQCMQLERDLQDIWFEHGDFIEGVRALIVDKDKQPQWKQANPELEQILEQLS >NZ_CP031984.1|WP_075316398.1|3213343_3214117_-|enoyl-CoA-hydratase MQWQTILLEKRNGVGLITLNRPKALNALNSELISEVNQALDQLEKDGEIGCTVLAGSEKAFAAGADIKEMAQLNFPDIYFDDFFHLADRIAQRRKPLIAAVSGYALGGGCELALMCDFIYCAENAKFGLPEVTLGVIPGIGGTQRLTHAIGKAKAMEMCLTARQMGAVEAELSGLVARVFNKEDLLEQTLKAAEQIATRSLTANMMLKETINRAFEVNLTEGLRFERRMFHSIFATADQKEGMQAFVEKRQANFKNQ >NZ_CP031984.1|WP_004956740.1|3214138_3215266_-|acyl-CoA-dehydrogenase-family-protein MQFTEEQLLIRDMAKSFAQEQIKPNASDWDRDGTFPKAALAQMGQLGFMGMLVPEQWGGSDTGNLAYVLALEEVAAADGATSTIMSVHNSVGCVPILKFGNDEQKERFLKPLAQGEMIGAFALTEPHTGSDAAAIKTRAVKDGDDYILNGAKQFITSGHNAGVIIVFAVTDPSAGKKGISAFLVPRDTPGYEVIRVEEKLGLHASDTCQIALTDVRVHKSLMLGKEGEGLKIALANLEGGRIGIAAQAVGLARAALEEATHYAKERLTFGKPIFEHQAIAFRLASMATEIEAARQLVHYAARLKEAGQPCLNEASMAKLFASEMSERVCSSALQVFGGYGYLKDFPIERIYRDARICQIYEGTSDIQRLVIARSL >NZ_CP031984.1|WP_160127375.1|3215277_3216927_-|AMP-binding-protein MLNYKDVANAFDFENTAQHMLSGSLDALNACYECCDRHVDGEKVALYWQGKDGRKEQYSFAQFKQWSSQFANFLKSQDVQAGDRISGLLPRTPELIVTILAAWRIGAVYQPLFTAFGPKAIEHRIQLAQSKLVVTDVGNRSKLDEVEQCPAIVTVADAEGSVLKASDFNFWQELNQQSDQCELVMRNLHDPFLLMFTSGTTGPAKPLEVPLKALIAFGRYMQDAIGLTEDDAFWNIADPGWAYGLYYAITGPLFLGHATLFYEGGFSTDSLCQIVKDYQITNLAGAPTAYRMMMAADPAQMAPLKGQFRVVSSAGEPLNPEVIRWFKQVLDAPIYDHYGQTEVGMVVCNHHGLSHEIRAGAAGFPSPGYRVAVVNEQGEELPPDTAGILAVDISQSPMMWFGGYKESRKSPFVGNYYLTGDTAELHSDGSMSFVGRSDDVITTSGYRIGPFDVESALLEHDAVIEAAVIGVPDPDRTELVKAFVILAAGVQSTVALAEELSQFVKKRLSAHAYPRLVEFVTELPKTPSGKIQRFLLRNQEIAKQQAKAV >NZ_CP031984.1|WP_160127376.1|3217009_3217900_-|3-hydroxyisobutyrate-dehydrogenase MNIAFIGLGNMGGRMAHNLLKAGLTVYGYDLSEVANQHFAEAGGVVCDSPQAAAQQADVVITMLPATKHVKEVYLGEEGVLEVLKAGALCIDSSTIDPQTIKDIAALAQSKNIHICDAPVSGGTIGAQAGTLTFMVGANDQTFEEVKPVLSHMGKNVIHCGEVGAGQIAKICNNLILGISMAAVAEGMALGAKLGIDPQALAGVVNTSSGRCWSSEICNPWPHINENAPASRGYQDGFATQLMLKDLGLAVEAAGQVKQPILLGGIVQQMYQQMCMRGNAHLDFSSIIQQYLPDQV >NZ_CP031984.1|WP_160127377.1|3217913_3219431_-|CoA-acylating-methylmalonate-semialdehyde-dehydrogenase MNTIQKIELETAKLLINGQFIESDTQQWQDIVNPATQEVIGRVPFATVQEVDAAIQAAQDAFATWRQTPIQARMRIMLKLQDLIRANMKEIAKVLTAEQGKTLADAEGDIQRGLEVVEHACSVGTLQMGEYIEGVARGVDTYTLQQPLGVCAGITPFNFPAMIPLWMFPMAIVCGNTFVLKPSEQDPLTTMMLVELAIQAGVPAGVLNVVHGGKEVVDRLCTHHHIKAISFVGSTAVGTHVYNLAGQHGKRVQSMMGAKNHVVVMPDANKEQTLNALVGAAFGAAGQRCMALSVAVMVGESKQWVQELVEKAKTLKVNAGHEPNTDIGPVISQRAKARVIDLINSGVEQGAELLLDGRDVQVKGYESGNFVGATIFNGVTTDMRIYKEEIFGPVLAIISVDTLEEAIELINANPFGNGVGLFTQSGATARNFQNLIDIGQVGINIPIPVPVPFFSFTGSRGSKLGDLGPYGKQAVQFYTQTKTITSRWFEDSHEVGSVNTTISLR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031984_4 | 4.2|3200511|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder | 3200511-3200526 | 16 | NZ_CP031984.1 | 1942317-1942332 | 1 | 0.938 |
NZ_CP031984_4 | 4.3|3200553|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder | 3200553-3200568 | 16 | NZ_CP031984.1 | 3004574-3004589 | 1 | 0.938 |
NZ_CP031984_4 | 4.3|3200553|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder | 3200553-3200568 | 16 | NZ_CP031984.1 | 3215282-3215297 | 1 | 0.938 |
1. spacer 4.2|3200511|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder matches to position: 1942317-1942332, mismatch: 1, identity: 0.938
ggcattatcagctgca CRISPR spacer ggcattatcagttgca Protospacer ***********.****
2. spacer 4.3|3200553|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder matches to position: 3004574-3004589, mismatch: 1, identity: 0.938
actgcttgtgcttgtt CRISPR spacer actggttgtgcttgtt Protospacer **** ***********
3. spacer 4.3|3200553|16|NZ_CP031984|CRISPRCasFinder matches to position: 3215282-3215297, mismatch: 1, identity: 0.938
actgcttgtgcttgtt CRISPR spacer actgcttttgcttgtt Protospacer ******* ********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP031984_3 | 3.3|2152175|23|NZ_CP031984|CRT | 2152175-2152197 | 23 | NZ_CP025513 | Neorhizobium sp. SOG26 plasmid unnamed2, complete sequence | 811729-811751 | 2 | 0.913 |
NZ_CP031984_2 | 2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854329-1854360 | 32 | MN694265 | Marine virus AFVG_250M803, complete genome | 48567-48598 | 5 | 0.844 |
NZ_CP031984_2 | 2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1853968-1853999 | 32 | NC_009956 | Dinoroseobacter shibae DFL 12 = DSM 16493 plasmid pDSHI02, complete sequence | 143761-143792 | 6 | 0.812 |
NZ_CP031984_2 | 2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1853968-1853999 | 32 | DQ123818 | Actinomyces phage Av-1, complete genome | 6033-6064 | 7 | 0.781 |
NZ_CP031984_2 | 2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854329-1854360 | 32 | MN694731 | Marine virus AFVG_250M1191, complete genome | 30775-30806 | 7 | 0.781 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 251764-251795 | 7 | 0.781 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 78192-78223 | 7 | 0.781 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 35560-35591 | 7 | 0.781 |
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NZ_CP031984_2 | 2.2|1854028|33|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854028-1854060 | 33 | NZ_CP034475 | Pantoea agglomerans strain CFSAN047154 plasmid pCFSAN047154_1, complete sequence | 171601-171633 | 8 | 0.758 |
NZ_CP031984_2 | 2.8|1854389|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854389-1854420 | 32 | MT325768 | Psychrobacillus phage Perkons, complete genome | 104560-104591 | 8 | 0.75 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 350082-350113 | 8 | 0.75 |
NZ_CP031984_2 | 2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1853968-1853999 | 32 | NZ_CP022416 | Sulfitobacter pseudonitzschiae strain SMR1 plasmid pSMR1-1, complete sequence | 386176-386207 | 9 | 0.719 |
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NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | KJ477684 | Enterobacteria phage T4 strain wild, complete genome | 65916-65947 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | HM137666 | Enterobacteria phage T4T, complete genome | 65915-65946 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | NC_000866 | Enterobacteria phage T4, complete genome | 65935-65966 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | KP007359 | Enterobacteria phage vB_EcoM_VR5, complete genome | 59233-59264 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | X04567 | Bacteriophage T4 DNA for 58.3 to 65.5 kb early region | 1166-1197 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | Z35078 | Bacteriophage Pol DNA for Ip10, Ip3 | 889-920 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | KJ477686 | Enterobacteria phage T4 strain GT7, complete genome | 65914-65945 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | NC_012741 | Enterobacteria phage JS10, complete genome | 58898-58929 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | KU867876 | Escherichia phage vB_EcoM-UFV13, complete genome | 61807-61838 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | MK327939 | Escherichia phage vB_EcoM_G4498, complete genome | 63732-63763 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | MK310184 | Phage NC-G, complete genome | 2584-2615 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | EU863409 | Enterobacteria phage JS10, complete sequence | 58898-58929 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | KJ477685 | Enterobacteria phage T4 strain 147, complete genome | 63809-63840 | 9 | 0.719 |
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NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | Z35075 | Bacteriophage K3 DNA for Ip3 and Ip4 | 555-586 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | NC_015457 | Shigella phage Shfl2, complete genome | 61873-61904 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | MK327928 | Escherichia phage vB_EcoM_G2133, complete genome | 63451-63482 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854209-1854240 | 32 | KM607003 | Enterobacteria phage RB59, complete genome | 65892-65923 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854329-1854360 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2308638-2308669 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NC_008573 | Shewanella sp. ANA-3 plasmid unnamed1, complete sequence | 90617-90648 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | MN693285 | Marine virus AFVG_25M368, complete genome | 25310-25341 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | JN638751 | Bacillus phage G, complete genome | 28053-28084 | 9 | 0.719 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NZ_CP044166 | Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416 | 6220-6251 | 11 | 0.656 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NZ_CP044166 | Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416 | 138806-138837 | 11 | 0.656 |
NZ_CP031984_2 | 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1854629-1854660 | 32 | NZ_CP044166 | Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416 | 182626-182657 | 11 | 0.656 |
1. spacer 3.3|2152175|23|NZ_CP031984|CRT matches to NZ_CP025513 (Neorhizobium sp. SOG26 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.913
gcaaaacccgatgcttcattgaa CRISPR spacer gcaaaacccggtgcttccttgaa Protospacer **********.****** *****
2. spacer 2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694265 (Marine virus AFVG_250M803, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aggaatgcgaaaaagagaagcagcagcgcaaa CRISPR spacer agcaatgcgagaaagagaagcagcagccttaa Protospacer ** *******.**************** . **
3. spacer 2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009956 (Dinoroseobacter shibae DFL 12 = DSM 16493 plasmid pDSHI02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aaccgc-aaggagaagtttatgaacattctcca CRISPR spacer -actgcaaaggagacgtttatggacattctgcg Protospacer **.** ******* *******.******* *.
4. spacer 2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ123818 (Actinomyces phage Av-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aaccgcaaggagaagtttatgaacattctcca CRISPR spacer aaccgcaaggagaagtttaagatcacggttaa Protospacer ******************* ** **. *. *
5. spacer 2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694731 (Marine virus AFVG_250M1191, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggaatgcgaaaaagagaagcagcagcgcaaa CRISPR spacer acggatgcaaaaaagagaggcagcagcaaaca Protospacer * *.****.*********.********. * *
6. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer ttcattttatttaatgtttctaatgtacatat Protospacer ************** **********..* .
7. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer ttcattttatttaatgtttctaatgtacatat Protospacer ************** **********..* .
8. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer ttcattttatttaatgtttctaatgtacatat Protospacer ************** **********..* .
9. spacer 2.2|1854028|33|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034470 (Pantoea agglomerans strain CFSAN047153 plasmid pCFSAN047153_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gatatacagcatctttggatattcacgcatttc CRISPR spacer cttatacagcatcgttcgatattcaccctatcc Protospacer *********** ** ********* * *.*
10. spacer 2.2|1854028|33|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034475 (Pantoea agglomerans strain CFSAN047154 plasmid pCFSAN047154_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gatatacagcatctttggatattcacgcatttc CRISPR spacer cttatacagcatcgttcgatattcaccctatcc Protospacer *********** ** ********* * *.*
11. spacer 2.8|1854389|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT325768 (Psychrobacillus phage Perkons, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atgatgttgtttttgccacagaaggcacatgg CRISPR spacer atgatgttgtttttgcaacagatggtagtgta Protospacer **************** ***** **.* .
12. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer accattatatttaaacgttctaatgtaaattc Protospacer .**** ********* *********. * .*
13. spacer 2.1|1853968|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022416 (Sulfitobacter pseudonitzschiae strain SMR1 plasmid pSMR1-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaccgcaaggagaagtttatgaacattctcca CRISPR spacer cgccgcaaggagatgttcatgaacaaagatca Protospacer .*********** ***.******* .**
14. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010105 (Enterobacteria phage JS98, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaagg Protospacer ..* ************* *** ****** .
15. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM607002 (Enterobacteria phage RB55, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
16. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ477684 (Enterobacteria phage T4 strain wild, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
17. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM137666 (Enterobacteria phage T4T, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
18. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_000866 (Enterobacteria phage T4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
19. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP007359 (Enterobacteria phage vB_EcoM_VR5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
20. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to X04567 (Bacteriophage T4 DNA for 58.3 to 65.5 kb early region) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
21. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to Z35078 (Bacteriophage Pol DNA for Ip10, Ip3) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
22. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ477686 (Enterobacteria phage T4 strain GT7, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
23. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012741 (Enterobacteria phage JS10, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
24. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU867876 (Escherichia phage vB_EcoM-UFV13, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
25. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327939 (Escherichia phage vB_EcoM_G4498, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
26. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK310184 (Phage NC-G, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
27. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to EU863409 (Enterobacteria phage JS10, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
28. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ477685 (Enterobacteria phage T4 strain 147, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
29. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_027404 (Yersinia phage PST, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
30. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to Z35075 (Bacteriophage K3 DNA for Ip3 and Ip4) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
31. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015457 (Shigella phage Shfl2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
32. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK327928 (Escherichia phage vB_EcoM_G2133, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
33. spacer 2.5|1854209|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM607003 (Enterobacteria phage RB59, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttggaaagaatttgccgttgtaatgactttca CRISPR spacer ccgtaaagaatttgccgatgttatgactaaag Protospacer ..* ************* *** ****** .
34. spacer 2.7|1854329|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aggaatgcgaaaaagagaagcagcagcgcaaa CRISPR spacer aggaatgcgaaagagagaatcagcgaataatg Protospacer ************.****** ****.. * .
35. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008573 (Shewanella sp. ANA-3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer ccgctttcatttaaactttcaaatgtggggac Protospacer .. ***.************ ****** .* *
36. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693285 (Marine virus AFVG_25M368, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer tttattttatttaaactttcaaaattactatc Protospacer **.***************** ** *.. ..*
37. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer atcattttcttttaactttctaatttcttcaa Protospacer ******* *** *********** * *
38. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer cctatttcatttaaagtttctaatgttctaag Protospacer ...****.******* ********** . .
39. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer cctatttcatttaaagtttctaatgttctaag Protospacer ...****.******* ********** . .
40. spacer 2.12|1854629|32|NZ_CP031984|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttcattttatttaaactttctaatgtgtagcc CRISPR spacer cctatttcatttaaagtttctaatgttctaag Protospacer ...****.******* ********** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1045195 : 1056403
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031984|1045195:1056403|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP031984|1045195:1056403|1052536_1052866_-|WP_004639922.1|DBSCAN-SWA MTFVVTENCIKCKYQDCVEVCPVDCFYEGPNFLVINPDECIDCALCEPECPANAIFSEDELPEGQEVFIELNAELSEKWAGNNITQIGEQPADREEWNGKPNKLQYLEK >NZ_CP031984|1045195:1056403|1053114_1053654_-|WP_160126991.1|DBSCAN-SWA MLNIVLRELHTSEIDLIWQQISRRELITQMYVQQRQDLGLIDCFYDVENWDAYHLENDPPLLKQICQQDGLCIGAFNSDHQLVGVQVVSNRMIVDYPDAKLLQYFYVDADHQGQGIGAQLMYSAIVSAKRLGAKQLYISATPSKRTVDFYLRHGAKLLTQPDHHLWELEPEDIHLIYLI >NZ_CP031984|1045195:1056403|1051704_1052361_-|WP_171061203.1|DBSCAN-SWA MMVGCVSSKTQVNQAKRIYIPQEQVTLTRPAPDKVEPASYRQWLGQGDNYARVREYEQYLARNQVAHIIPSFELLRTARDWQKCGRSEYAVPNRELWGNSLSTLRVFKYLISAKILTDFEVTSVYRDLPLNECAGGASSSRHLFNSAIDFRIGPQYPQPQDYAYIEQTKFKLCQFWAQHGQSLNLGIGLYRSGQIHIDTQGYRTWGPDLSRNSSMCNL >NZ_CP031984|1045195:1056403|1049938_1050781_+|WP_004639928.1|DBSCAN-SWA MKRVIACIDSSPCIDAVAEAAVWVAKQTQRELVLLQILDYYPASYHLGEISGVIGFESNAMLLKELAELEQKQSELALDYSNNLLNHISDLIEKQYGLTSSKIQEKGDFLEQSFNLLNENDVVIIGRVGERAAEKNKPIGSNVENFIRGANCTVITVGEHFEPPRRFIFAYEYSPTCQKMLQRIAQSDLLKKLQCHLLYVGDHPEMLAEPEKYLTDAGLEVMSIYRYGDVAQNILEYQREHNIQLIVLGAFSHSKIHQFFLGSITTTIFRNANVPLLVAK >NZ_CP031984|1045195:1056403|1045195_1047319_+|WP_005084655.1|DBSCAN-SWA MITKVDYQPWLQAILTIAKHYRIEPSEERVRLQLDWNQNQNLDEVLTLIGRQVGLSIRRVKFSNDVINPWRLPVLVELADGQVGVIDKADGTGHVSIQLSGDQGLAQKFAVGALKHIVKNVFILRPEKSVPDARIDEYIKPYQPSWFWSIVLSDWKRYIDIMFASMIANVLALATIVFSMQVYDRVVPSQSIPTLWVLAGGVLIAAIFEFVLRISRVYISDIIGKRADLRISDRVFGHALRIKNSERSKSTGTFISQIRELEGVRELVTSTTLGAIADLPFFFLFLFIFAIIGGNLFWVMLAIVPLMILPGILVQKKLAKLAQEGMRESSIRNAILVEAVQGIEDIKLLRAESRFQNQWNHMNEVSADISMQQRKIVGVLTAWTQKLQGLTYAIVVLVGCFAVMEGEMTTGALVACSILSSRMLAPISQITGILGRLQQAKVAKQSLDELMQRPVDQADHAHLVHKEVLHGDYELKNVVFQYGEDDPRPSLMIPHLKIRAGERIAILGRNGAGKSTLLQILSAMQTPNSGSVHLDELDISLIDPADVRRDMGLLNQNAHLFYGTIRENLTLGAPLARDEDILKALKVTGALSFVHEKKEGLDHLVLEGGVGFSGGQRQALLLARLLIRQPNILLLDEPTAAIDDVAEKQLIDHLRGWLGYRTLIVATHRRAVLELVDRIIVMNDGKIVMDGPADKVLQQSAAKQKTV >NZ_CP031984|1045195:1056403|1049261_1049822_+|WP_160127419.1|DBSCAN-SWA MPWLYWSLKPKHREWAEVWQAEYQAYLMEMETVEIGKNCFISPLAHIFAEPGRKISIGDNTFIAADCTLHGPLEIGNEVAINHHCILDGGRAGIKLHDQVRIAAYSHLYAFDHGMEMDRAIYQQPVTSKGIEVGRDVWLGAHVGIKDGIKIGHHAVIGMNSMVTKDVADFAIMAGNPAKLIRYRTE >NZ_CP031984|1045195:1056403|1047331_1048522_+|WP_004639933.1|DBSCAN-SWA MSDQEQTSSRPMNVTYKEPKLPSSSIIVWLIGIGLVVLLVWAWVFSLEEVSTGTGKVIPSSKEQIIQSLEGGILTKLDVKEGDIVESGQILAQLDPTRFASNVGESQSLLMSAMATAARLRAEVNGTALTFPEEVLKEPKLVKEETALYYSRRANLEESIAGNQQALRLVQQELAMTEPLVAKGAASEVEVLRLRREANDLQNRINDIRNQYYVKAREELSKANTDIQTQQQVVKGRTDSLQRAVFRAPVRGIVKEIDVTTLGGVVPQNGKLMTIVPLEDKLLIEARISPRDIAFIRPNQEALVKITAYDYAIYGGLEGKVTVISPDTIRDEVKQDQFYYRVYIRTDSDRLYNKSGKEFSITPGMVATVDIRTGQKTVLDYLLKPFNKAKEALRER >NZ_CP031984|1045195:1056403|1050900_1051569_-|WP_160126990.1|DBSCAN-SWA MQQLWTDIDDYINSHLIPTDPKLQHALDNTDTQGFSNHLAVAPNQGMFLQMLIQMNQCKRVLELGTFAAYSTIWLAKALPKDGYLLTVEGRDTHVVIAQENIDFANMPTNIELKKGRGADVMNQLITENSEPFDLIFIDADKQSYPEYLELSLQLAHSGTILVLDNVIRAGDILDDNNKKPSIEGIRETFTALKNHPKLLSCTALQTVGSKGHDGFAIAIVK >NZ_CP031984|1045195:1056403|1053763_1056403_-|WP_160126992.1|DBSCAN-SWA MNSDTVMADLSSHTPMMQQYLKVKMEYSHALLFYRMGDFYELFFEDAHLAAKLLGITLTHRGKANGQPIPMAGVPYHSAEGYLARLVKAGRTVAICEQVGEVTGKGPVERKVVRVLTPGTLTDDALLGSYQSSNLVALCIQQNQIGIALLDLSASIFKVQQQDYKPEQLAIELARLMPSEILIDEDLIDQNIIEHIKKNLDCSVTKRPNVDFNLNNAQKTLCDQFAVSTLSGFGLDSLPLAKAAAAALIHYAKETQKTALPHIRSIQIEQSTDFIALDPITRRNLEIIEPLFEHGTSLFQLINNCQTAMGGRLLSRTLMQPIRDTAILDARLDATEQLLKGYHESPVRLVLKEIGDIERVLSRVALGSARPRDLVQLRQACAQIPFLRHALAPVLKIQQSKLLLQLDQELGDFKSLHEHLMAAIVESPPVLLRDGNVIAEGYDDELDELRKIRDHAGQFLIDLEIKERERTGINTLKIGYNRVSGYYIELSRAQAEQAPADYIRRQTLKNAERYITPELKSFEDKVLSSESRALTREKLLFESLLDELRQNIAQLQMMSAAIAYIDVLANFAHQARLNNWARPEFTPETCIKIHAGRHPVVEALNKAPFTPNDTFLDPQHRMAIITGPNMGGKSTFMRQTALISLLAYCGSYVPAKSAKLGSIDRIFTRIGSADDLSTGKSTFMVEMTETSQILHHATSQSLVLMDEVGRGTSTYDGLSLAWACVLDLTKRVKCLCLFATHYFELTELSSETGIDNYHVTAQELNGNLILLHKVQQGPASQSHGLQVAKLAGIPANVIKEAQKRLKILEKQQHQHFQNTVQNDLFSSIEHEIETQVVEKIVEVEVASPALALLHQIDVDDLTPRQALEQLYSLKAALKS >NZ_CP031984|1045195:1056403|1048615_1049215_+|WP_160126989.1|DBSCAN-SWA MPFTIATSVTFEEEIKKSRFQAIAAIVENEQQVKNFLEENKDLSTTHQCWAWKIGHNVRFNDDGEPSGTAGRPILATIEGNDLTNVIVLVNRWYGGVKLGTGGLVRAYGGCAGQCLMLAEKIELIQKKQIQFACWFNEWAILQYELTQQQIDYQESYNETGILVEARLQIHQIDALKSKLQDITRGREQLKIIEEQREE |
10 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1132061 : 1171183
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP031984|1132061:1171183|DBSCAN-SWA 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34 | Stenotrophomonas_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 1124995:1125011|attR 1149615:1149631 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1339108 : 1400351
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP031984|1339108:1400351|DBSCAN-SWA 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58 | Mollivirus(11.11%) | capsid,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3112927 : 3182699
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP031984|3112927:3182699|DBSCAN-SWA 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59 | uncultured_Caudovirales_phage(12.5%) | tRNA,transposase,integrase | attL 3131444:3131489|attR 3210731:3210776 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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