Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047602 | Thermoanaerobacterium aotearoense strain SCUT27 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csa3,DEDDh,DinG,RT,cas6 | 0 | 6 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047602_1 | 150846-154532 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_1
|
55 spacers
spacers of NZ_CP047602_1
>1.1|150876|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAA >1.2|150943|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGA >1.3|151010|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGA >1.4|151075|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATATATTTTGAAACTTTTTTATTATTTGCATC >1.5|151141|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCCTCTTTTACAATTTCTTTATCTGCATCTGCAAT >1.6|151207|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGGACCTCTGTATAATGCCAAAGGAGCTAAAATACC >1.7|151274|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTTTATCGATGTTTGTACATTATCTGCCAATAT >1.8|151340|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATATCTTGTAAAATATAATAAATTGGATGGAAC >1.9|151406|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGAAAGGTATTCTTGAGCAAGCTTCCATGTTTTT >1.10|151472|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCTAATAAAGCTCGGCTTTGCGCCGAGCCTACTAT >1.11|151538|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>1.22|152274|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTCCTACTTCGTTTGTAGTTTCAACTAGTCTT >1.23|152339|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATATAAATTTAATGAATTGTATGACAATTTAGA >1.24|152405|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAGTTCTATTCTTGTATTAAATTCATCATTTGTA >1.25|152471|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTATTTGACCTGTGCTATTTTTTATAATAAAGG >1.26|152537|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATGAGGAACTGTAACAACTGCGTCTGCTGCCTGA >1.27|152604|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGACTTTGCGTATTGTCTACATTAAACTTCTTGTCT >1.28|152672|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGCAAAAAGCAGTTCAAGGCCTTGCAACAGATAT >1.29|152738|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATTTCTTTGCTAATTTATCACGTTTTTGAAGTTT >1.30|152806|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTAAAACAAAACAAGGAGTGACACAACAACAACT >1.31|152872|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGTAGACAGTGCGGAAATTTAGTTCCAGAGAA >1.32|152937|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>1.43|153668|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTAAAGTTACAGCAATAAATGGTTCAAATATTACTC >1.44|153736|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGTATTTTGTAATTTCACAAAGTACATATCATATT >1.45|153803|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACAAAATTTATTGAATTTGCAATACTTGGACCA >1.46|153869|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAATCAAGCTATTCCATATATCCTCTGCACCTTGG >1.47|153936|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTTATCTATGCTGCCTTTTGCCTTTACTAATTTT >1.48|154004|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAA >1.49|154069|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCAT >1.50|154136|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGG >1.51|154202|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCA >1.52|154269|35|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAA >1.53|154334|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGC >1.54|154401|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAA >1.55|154467|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCT |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_1 >merge|NZ_CP047602|1|150846-154532|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTATATATTTTGAAACTTTTTTATTATTTGCATCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATCCTCTTTTACAATTTCTTTATCTGCATCTGCAATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTGGACCTCTGTATAATGCCAAAGGAGCTAAAATACCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCTTTTTATCGATGTTTGTACATTATCTGCCAATATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTACATATCTTGTAAAATATAATAAATTGGATGGAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTAGAAAGGTATTCTTGAGCAAGCTTCCATGTTTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACCTAATAAAGCTCGGCTTTGCGCCGAGCCTACTATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGCTTACAATCTTTCGCTAATAAATCCTAATTTTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAAATGTTTTTGAAAGTGATTCTTTTAATATTTCTTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATTGGTAGTGAATTTCCTGCTGTTGTTCAGTTAGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGAATACTTTATAGGAAAATTAGCAATAACATATCTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGAATCATAGACACTTACAATTTTTTGAGCATAATTTGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACTACAAATGCTATATATTCTCCAAATTCCTCATTGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGAAATATCAAGTACCCGGAGTAAGCGAAGTATTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATATTAAAGTGGAGGAGAATATGAATTGTTGGAATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGACTGGAATTCTCAGTTTGCAGGGATACAGACGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGAAAATGTCCCAGATGTAGAAGGTATAATTTACCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATTATCAAGGTCAATGGCAATTTCTTTAAAAGCATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTCTCCTACTTCGTTTGTAGTTTCAACTAGTCTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAATATAAATTTAATGAATTGTATGACAATTTAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACAAGTTCTATTCTTGTATTAAATTCATCATTTGTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATTATTTGACCTGTGCTATTTTTTATAATAAAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTATGAGGAACTGTAACAACTGCGTCTGCTGCCTGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGACTTTGCGTATTGTCTACATTAAACTTCTTGTCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGTGCAAAAAGCAGTTCAAGGCCTTGCAACAGATATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTAATTTCTTTGCTAATTTATCACGTTTTTGAAGTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCTTAAAACAAAACAAGGAGTGACACAACAACAACTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTTGTAGACAGTGCGGAAATTTAGTTCCAGAGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCTTAATTATCCTGATATAACACAAGTGACGACGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGGGATGCTATCGCTAACCAATATCGGAAATTGAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTATTTTTGCTTTGCCTCGCTTAAGCAGTTTCCTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAATGCAATTAAAACAATTAAGTTAAATTAAAATTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAGAAATAAATAAGCAAAAGTATAAAAAAAGAAAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTAGATATTTGGGAAAGTCAAAAATTTATAAGGTTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAATAAACAAAAAAATAAAGCAGGCTTAACCTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAACTCCTTTCCTTAACTCTATATATATAATAACATAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGACTGAGAAGTTTCCTTTTAGTTTGCCTTGGGATGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATGTACTATCTGCTTTATCCCAACTATTCATTGGGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGACTATGGATGAGAAAGCAAATATAATTCTTGAACAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGTAAAGTTACAGCAATAAATGGTTCAAATATTACTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTTGTATTTTGTAATTTCACAAAGTACATATCATATTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTACAAAATTTATTGAATTTGCAATACTTGGACCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTTAATCAAGCTATTCCATATATCCTCTGCACCTTGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGTTTTATCTATGCTGCCTTTTGCCTTTACTAATTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP047602|1|1|150846-154532|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTCCAACCCTTTGGCTTTGGCATTTATTTCACCTCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AACAATTAAATGACTTTTACGAATTTAAAATATTCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATTTTCAAGATACAAAGCCATGCATAATACAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTATATATTTTGAAACTTTTTTATTATTTGCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCCTCTTTTACAATTTCTTTATCTGCATCTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGGACCTCTGTATAATGCCAAAGGAGCTAAAATACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTTTTTATCGATGTTTGTACATTATCTGCCAATAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACATATCTTGTAAAATATAATAAATTGGATGGAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAGAAAGGTATTCTTGAGCAAGCTTCCATGTTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCTAATAAAGCTCGGCTTTGCGCCGAGCCTACTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGCTTACAATCTTTCGCTAATAAATCCTAATTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAATGTTTTTGAAAGTGATTCTTTTAATATTTCTTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATATTGGTAGTGAATTTCCTGCTGTTGTTCAGTTAGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAATACTTTATAGGAAAATTAGCAATAACATATCTA 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ATTTGTAGACAGTGCGGAAATTTAGTTCCAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCTTAATTATCCTGATATAACACAAGTGACGACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGGATGCTATCGCTAACCAATATCGGAAATTGAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTATTTTTGCTTTGCCTCGCTTAAGCAGTTTCCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAATGCAATTAAAACAATTAAGTTAAATTAAAATTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGAAATAAATAAGCAAAAGTATAAAAAAAGAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAGATATTTGGGAAAGTCAAAAATTTATAAGGTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAATAAACAAAAAAATAAAGCAGGCTTAACCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAACTCCTTTCCTTAACTCTATATATATAATAACATA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGACTGAGAAGTTTCCTTTTAGTTTGCCTTGGGATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATGTACTATCTGCTTTATCCCAACTATTCATTGGGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACTATGGATGAGAAAGCAAATATAATTCTTGAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTAAAGTTACAGCAATAAATGGTTCAAATATTACTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTGTATTTTGTAATTTCACAAAGTACATATCATATT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTACAAAATTTATTGAATTTGCAATACTTGGACCA 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GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGTTTGCCTAATATGTTTATCCATTCTCTTAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGATAAATTGCTATGAAAGGTTTATTGACATCAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAATATGACATTATTCGTAGCACAAAACAATACGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGAAACTTAGCCAATATTCCATCTTAAGCACCTCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTATAAACAAATTCGGTTATAAAGTGTATGGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCATAATAATGTTAATATTGGTAGTGAATTTTCTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTATTTCACCTCCATATTCTTGAGTTTTTCTAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTAGAAATCTTAATAAAGAAGGTAAATCTGCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
>NZ_CP047602.1|WP_014757341.1|148318_150682_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKTSCFSELYSHPDKYLEEHLARCADLAEKFLDEAKSNLMDEELLSKLVRIVALCHDLGKSTGFFQEYLSSQDDNKKKELKSKKETHHSLISAVVAYFAVKQEVSGLDIDDDIKILLPFISYIAVKKHHGNLNDAATEASLEDRDIEIMKSQLQSIDESKFKILSDNLKKAGLNIDLNKTTVANNIENIKNEMRSIRLYLRKIKQREDLTYYILINYVFSLLIDADKSEVVVGEISPAYVELMPDAVDKYKSQISYKDNRINLLRENAYREVNENEINVDERILSINLPTGLGKTLTSISFALKLKRKLYDVYNKNFRIIYSLPFLSIIEQNYQEFEKILKTNDINVNTSVLLKHHHLSEVKYNDNETELDTEKSKIMIEGWNSEIIVTTFIQLFHTLLSNRNSALRKFHRIANSIIILDEIQSIPFYYWKLVKEILKAVAYKLNSYIIFVTATQPMIFEGDEIRQLTDKRKYFSQMERVVIKPVLQKEMHLDELIDMFDLKDGRSYLFILNTISSARDFYRLLKEKLSDEEIVYMSTHVIPYERLERINLLKKNNIKYAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDLAPLDSINQSAGRCNRNWERKGEVYVVSLIDENNRKYASRIYNKVMLNITERILSQHESISEKDFLDIIDQYYKEVSQNLSSKEAIDILDAVFKLKYDSDDDTPSVSNFKLIDDEYYKVDVFIEYNEEAINLWQRYIDLKKIKNLYKRRSTFDEFKADFYKYVISIPEKTENMPAEVEGFKYVNADSLKDYYDAETGFKPSGVLSIW >NZ_CP047602.1|WP_014757342.1|147627_148341_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKLLIFDVYGDFGHFKKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGLIGAIEGIGKEDYLKVLSSDKCKLAVRILKPVKKIRMGLNLINTKDNFWIPFKKKNHEARTQVKMELLKDPMYRIYFHHTDEDLFDDIVEKVKGHKNVYTVSLGLSEMIADYRFVGVKDAFEVENKEVFVSSVLPYKYILEDKIVFEDGKKYFKEKIPADMDEERIVLDYADVVYEANGKSIRSYVSKSWVIDDENIVLF >NZ_CP047602.1|WP_014757343.1|146652_147564_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MSNVIKNRSEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLSGYKGMDVFILETRDESGKLRTKDDRISDFGSNDDIVNKCIDVRLFGATTAVKDKTMTLTGPVQFGFGRSLHKVNMTYIKGTTVMPSQSGNAQGTFTEKYILPYSLISFYGIVNENAAKNQNIPLTDGDVDLMLEAMWNGTKNLMSNSKMGHMPRFLLQVVMKEENYQIGELNKRIKFTHDVEDEELRDIQDGKIEIKELIESLNANKGKIEKLRYAADERAVFAVDGVVCNFGDVVKDFTVEKLSF >NZ_CP047602.1|WP_014757344.1|144895_146653_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MLDAVKDIGEMSINAGRKSLLDVLIEDPNQNGSYKNIIAINFTVDSGDVKYKDVTIEETDSQKISRYLYSSAGGNGPGYMPAAKITEPDKTFNGKILSWFKILTKKGLNIDEDERRFLENLNSAIHENKDEILGEIVKFRGEFPKKDGLLLMLKFVEGSTYKYIGDIPLFRKLLIDTDNEKYNKLSANDKVCSICGEKKDLVFGKVDTYAFYTIDKTGYIVGGFDEKKSWRNFPVCPDCRLKLEEGKKYIENNLTFKFYGLKYQLIPKFLIGERFVKEEILDIFKETSKLVSLKESTKKRVITDEDDIMYFLKDADDSISLNYLFIEKQNSAERILLLIEDVFPSHIREIFKAKDTVDDIFNENFTFRNIRNFLSKSDMKKRDSDLDGYFLDLTDRIFRGRKIDINLILKFIMKRVRDEFIQDKYYQSAIKDGMMAIKFLQNLGLVEMEVKAMEERPLSDFFKKYDENFETPIKRGLVLLGALTELLLRKQYKDRGAKPFMKNLKSLKMDENDIRGLLPKVQNKLEEYDSFDKGKRLLAKEVSNYLLLAGNNWHMPVDEINFYFACGLNLADEIASIIYSKGEEQ >NZ_CP047602.1|WP_014757346.1|143621_144035_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEIIMEHYENSPNKREMDNPTIKERGHNPLCGDDITLELKMNGDVIEDASFVGHGCAISQASTSMMCDLIKGKDKKEALKLVEKFIDMIHKKDVDIDELGDAQVLQGVSDFPARVKCALLAWKTLEKII >NZ_CP047602.1|WP_014757347.1|142398_143625_+|cysteine-desulfurase MLDVLKIKEDFPVLKTTPHGKKLIYFDNAATTQKPTYVIDAVSKYYKEYNANVYRSPHYLSALSTEAYEEARDAVRKFINARSSESIVFTRNATESINLVAYTWGLKHIGEGDVIVLTIAEHHSNILPWQMVAEKKGAKLRYVHLDEDLRLDLDEFKDILKEGNVKLVALQHSSNVLGIINPVYDIVNLSHENGAKVLIDGAQSIPNMKIDVEKLGCDFYAFSGHKMMAPMGIGVLYIKEDLLSDIPPFLSGGEMIDEVFEDHSTFAPSPLKFEAGTPNVEGAYGLMKAIEYIEKIGLENILEHEQELTEYALEKLTKIDYVKLYGPKGAKDRTGIISFNVENVHPHDVATILDQDGIAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYVYNDKSEVDAFVDGLKDVRKWFR >NZ_CP047602.1|WP_014757348.1|141232_142399_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MIKSLDYNTIQDIIKEGGSGEKELRVKGYEVFSKVPMPMWKRVKLDDVHIPYYKEYKSATIGNDVQEGLVMNPLTKALMDDDLNTIKSALAHNFGVDEKFKNMVLAFYNTGFSIRALPNSNVKLPVTVNYSVVDDDDTIIDLNLIVAERLSNLTVVFDYVSDKKGFHNGLTAVIAKDGASVNIVKIQRFSDDSSNFDNNIIITGNDATVKWTQIDLGGKVDAYDVTAELEGVGSSAYFNSIFLGAYEQSHDMSYRVNHIGMRTGSSVDVKGALKDKSKAVFRGNLDMKRGAKKAKGNESEVVLLLDKTVRSDAIPALWCSEDDVQANHSASAGQIDENKLFYMMSRGLSMEEAKLLMVEASFNPVIDTLPNDVLKEAVKSYIGRRISG >NZ_CP047602.1|WP_014757349.1|139815_141219_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKTIVNDIDFSRYNIKNEVRYSYKTEKGLSKKIVEEISERKNEPKWMRDFRLKSLEIYESKPMPTWGVDLSQLDINSIVAYLSPDTKMKNSWDEVPEDIRNTFEKLGIPEAEKKALSGVGAQYDSEVVYHSIKDNLAKQGVIFEDMDTALKKYPDVIKEYFMTRNVTPNDHKFAALHGAIWSGGTFVYVPENVKVEVPLQAYFRMNAPGTGQFEHTLIIADRGSEVRFIEGCSAPQYAVSNLHAGCVELFVKEGARLIYSTIENWSKNTYNLNTKRALVDKDGVIEWISGSFGSHKTMLYPASVLRGKGAKSEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPYTSSKVLAKSISKDGGITNYRGLLRIGPNAEGAKASVQCEGLMIDEISRSDTMPIIEVLNDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMTRGLSEDEARSMIVRGFVEPVAKSLPLEYAVELNRLIKLELEGTIG >NZ_CP047602.1|WP_014757350.1|139049_139802_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MKDNLLEIKDVKAEVDGKEILKGLNLTIKRGEIHAIMGPNGSGKSTLCNVIMGNPHYKVTDGEILFEGENIVNLKVNERAKKGIFLSFQSPEEIPGITVDNFIRTSLNAVTNKNMPMLQFAKSMKEKMDMLDMKPEYRTRYLNVGFSGGEKKKSEILQMAMLNPKLVMLDEIDSGLDIDALRVVAETVRKLKVEDMSILIITHYNRILDYLEPDVISVLAHGRIVKEGDKNLAKELEKTGYESILDEVLS >NZ_CP047602.1|WP_014757351.1|138511_138808_+|hypothetical-protein MAYVWFFMALVMLIQLIRKVIKKEIDMIGGDFITMLAFVSMGILHLFNLSKDKLNSLEIHIFISYIILIVLFFIYWIHRYNKMNNIKLATKKLSNDKK >NZ_CP047602.1|WP_014757340.1|154544_155291_+|copper-amine-oxidase-N-terminal-domain-containing-protein MFRNKYKLMVSISIIVLFLFVNVYAVPYIKLVINGQQVNTDVPPQIVNGTTLVPIRVISESLGAKVDWDGNTQTVSVTMPRETLEAHTVDTFWEACESDTVTEPIIDDSVTPEFKAVLQKALALLKEKDNTTYKFVCVYIPRIAVQQYKDNIVGSWVDYTTHNVYFNSTNINRITSGGTWGIEYVAITLAHEAYHESTFCSGSSISIYSDVNEDEIQAYAFEYAVAKHLGVSSDLQNWVKQQITSLIN >NZ_CP047602.1|WP_014757339.1|155652_156150_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MYEEVTGSLMQSYNICKRQVWLMAHQIIPDQEHPYIEMGRLIDDMSYDRDRKKINFENVVIDLVRNDNGNLLVGEVKKSSKAIGSARLQLLFYLYKLKQNGIEAKGQLFFPEERKKIDVRLTSESEAEVVSAINEINDIINMDKAPAFEKIPYCKNCGYKEFCLS >NZ_CP047602.1|WP_014757338.1|156146_157139_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKPVYIFSDGELHRKDNTLYFEGESGRKFIPVENTSEIMIFGEVSLNKRFLEFISQSEIILHFFNHYGYYVGSFYPREHLNSGYMILKQAENYIDEKKRLYIAQKFVEGAYRNIRQVLKYYQNRGKNLDDIIYAIERLGDLIAGTSNVNELMAIEGNIREYYYKSFDEILGNCDFEFDARSRRPPKNSLNVLISFGNSLMYTTVLSEIYKTHLDPRIGYLHSTNFRRFTLNLDVSEIFKPIIVDRVIFTVVGKNIIKKDDFDEDAEGLLLKDKGKMAFIEEYENKLKTTINHRSLGNSVSYRRLIRLELYKLEKHLMGEEEYNPFVAQW >NZ_CP047602.1|WP_014757337.1|157148_157412_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFIILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLNWVQNSVLEGEISDANFKKLKSEISRIINKDEDSVIIYILRTTKYSDREIIGLEKGGESLFV >NZ_CP047602.1|WP_084214895.1|158010_158517_+|MarR-family-transcriptional-regulator MLKEGEEFLKEYNERIDVLKTLKSIMNMIHRNMESEFKDLKITGPQGMIIGILMHHGEMKISDLSDKMGLSSSTVSGIVDRLEKQGMVKRIRSSDDRRVVYVKVDEDFKKRSKESFKNIYERFETIMSKATDEEIADIVKGLNTLKKLIESSSGQSSDNFKKGGFDGC >NZ_CP047602.1|WP_014757334.1|158510_160736_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKLRKYFKPYIFITIVAILFIFVQAMSDLSLPDYMSNIVNQGIQQGGIVNAVPDAVRKSTMDKLTLFMNDSDKNNVLNDYALVDKNSSDYDKYVKTYPDLKKEPIYVLKNIDKTEIDKINLPMGKAFLAVSGVEKMKSSAKGGFITFNNMKIPANADLFALFAKLPESERQKITDSMNEKFTSLGDNMVIQAATQSLKSEYKALGVNTDKIQTNYILSTGLIMLLITLLSAACSIMVGFLGSRVAAGFSRDIRKKLFTRVESFSNEEFDKFSTASLITRTTNDITQIQMLIVFMIRMIFYAPMIGIGGVIRAVGKSSSMSWIIALAVIVLLGLVSTVFSIALPKFKSVQKLVDRLNLVARENLAGMMVIRAFNTQEFEENRFDKANRDITNTMLFINRVMITMFPVMMLIMNGITLLIVWVGAHDIANSSMQVGDMMAFMQYAIQIIFAFLMMSMMFIMIPRASVSASRIAEVLETEPTVVDPKESKKFDDTQKGVVEFRNVSYKYHGAEEYAISNISFKAEPGKTTAIIGSTGAGKSTLINLIPRFYDATEGQVLVDGVDVRDVKQHDLREKIGYVPQKISLFKGTVMSNIKFGNENATDEEVKRAAEVAQAAEFIEKLPNGYDSEISQDATNISGGQKQRLSIARALVKKPEIYIFDDSFSALDFKTDRALRKALKEYTGNSTVIIVAQRISTIMNADQIIVLDDGKIAGIGTHEELMKTCETYREIAYSQLSKEELA >NZ_CP047602.1|WP_014757333.1|160735_162607_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDGRNANTPRRPVMRRHGPMGGHGPMVGGEKANDFKGTMKKLMKYLGEYKLSIFLVVLFAAGSAALSIAGPKILSKAITKLYEGVMAKIAGTGNIDFDYIGRIILLLIGLYLLSSGLGYIQGWIMTNVAMKVTYKFRRDIMEKINRMPLKYFDGTNHGEILSRITNDVDTISQTLNQSITQIITSVTSVIGALIMMLTISVEMTGVTFLMIPVSMGIIALIVRFSQKYFREQQDYLGHVNGHVEEMYGGHVVMKAFNYEERSVKKFDEYNNELYNVAWKSQFLTGLMMPIMNSVSNLGYVGVVVLGSYLVINGTIQVGDIQAFIQYVRSFTQPLAQIANISNILQQTAACAERVFEFLDEEEEVPETEHPVKLENVEGHVQFDHVHFGYRPDKIIINDFSADIKPGQKVAIVGPTGAGKTTMVKLLMRFYDVNAGRILIDGYDIREFTRSDLRSLFGMVLQDTWLYNGTIMDNIRYGKLDATDEEVIKAAKAAHVDHFVHTLPDGYNMVLNEEASNVSQGQKQLITIARAILKDPKILILDEATSSVDTRTEILIQKAMDNLMKNRTSFIIAHRLSTIRDADLILVMDHGDIVEQGTHKELLAKGGFYAKLYNSQFEDQEVAS >NZ_CP047602.1|WP_014757332.1|162643_163492_-|2-oxoacid:ferredoxin-oxidoreductase-subunit-beta MNTAFETYETAWCPGCGNFGILNALKDALTELGLKPHQVVIASGIGQAAKMPHYINVNGFNGLHGRALPPATAINIANKDLKVIIDSGDGDTYGEGGNHFIHAIRRNANIAHFVHDNQIYGLTKGQASPTTAKGQKTSLQFDGVILDPVKPIKLALTMGAGFVARSFSGNHEHLKKMMKEAIMYDGYALLDIFQPCVTFNKVNTFKWYNDRVYELPDDYDYTDLDNAFKVADEWGDRIPIGIIYKVEKPTYIDNVSFLKDGPPLVDAKLDPMMAEKYLDDFR >NZ_CP047602.1|WP_014757331.1|163512_165201_-|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase-subunit-alpha MDYNVLIGGAAGQGIDTLSYIIEKTLKRCGLYVFSTKDYMSRVRGGHNFIQVRFGDKPIYSHDEKFNAIIALDEDTVNLHAKSLKTSGKLILDKSISDDSAYLSFDFKAVAKECGNPRVAGTAAVGVLLKLFGIPLDVSHTVLDDEFKGDVLNANIKAIDTGYNMAKQIFNVPLGKKDDNIYISGNEAIALGAIAAGVKFYSGYPMTPSTSVMTYIAKKSHDAGIVVEQVEDEISAINMALGASYAGVRAMTGSSGGGFALMVEGISLAGITEIPIVITEVQRPGPATGFPTRTEQGDLRFIIHSGHGEFPKMVISLRSPEDAFYQTARAFNIADKYQIPVILVSDQYLADSGVTVKPFDFTKVTIERHISGHEALENGVYKRYKLTESGISPRIIPGKVEGATVLIDSDEHDEFGHITESQDVRVKMVNKRMKKFKLLKEEIQEPLFIGAENPDILITCWGSTYGPVKEAVDMLLKDGMSIGALSFGDIWPFPTKLIKKYGKFAKMIIDVEQNATAQLDSLMRENALIKADEHILKYDGRMMSSRYIYERVREMTKASSLY >NZ_CP047602.1|WP_014757330.1|165561_166374_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MEGGSPAFGYFMRFCSLRSGSSGNAAYIGYKDVHILVDAGLSGSTIEKSLLNIDVDPHDISAILITHEHNDHIKGAGILSRRYDIPIYANEATWVSMEGLIGEIEPHNKRFFKTGEDFTLGDVKIRPFKKSHDASEPVGFSFFCGQNKATIATDLGYISRGVAANIMDSDVVLLESNHDVDMLINGTYPWPLKKRILSPHGHLSNKDAAEAIKKFIKLKAVGKIYLGHLSQNNNKPEIAYKTVVDALREEGIDYEINMALRYEESDIVEI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047602_2 | 804017-804227 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047602_2
>2.1|804054|53|NZ_CP047602|PILER-CR GAGGTCGAGGGTTCGAGCCCCTTTTGGGTCGCCATAAAATTTAAAAAGCCTCG >2.2|804144|64|NZ_CP047602|PILER-CR GGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTAAGTTAAGCGGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_2 >merge|NZ_CP047602|2|804017-804227|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTGGAGGTCGAGGGTTCGAGCCCCTTTTGGGTCGCCATAAAATTTAAAAAGCCTCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTAAGTTAAGCGGACATAGCTCAGTTGGTAGAGCATCACCTTGCCAAGGTG >NZ_CP047602|2|2|804017-804227|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTG GAGGTCGAGGGTTCGAGCCCCTTTTGGGTCGCCATAAAATTTAAAAAGCCTCG ATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCT GTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTAAGTTAAGCGGACATAGCTCAGTTGGTAG AGCATCACCTTGCCAAGGTG
>NZ_CP047602.1|WP_013298441.1|803586_803790_+|cold-shock-protein MVRGKVKWFNAEKGYGFIEREGGSDVFVHYSAIEQDGFKTLEEGQEVEFDIVEAEKGPQAANVKKVS >NZ_CP047602.1|WP_014759291.1|802754_803504_+|NAD-dependent-protein-deacylase MAQEDVYEKVARLMENSKKTVILTGAGISTESGIPDFRSPGTGLWEKMDPMEALSTKVLYNDPKKFYKSGFKILLSMKDAKPNKAHYILAQLEQDGFISCVITQNIDNLHQKAGSKKVYEVHGQTRTGSCTNCGEVVSIDLLEAKVSKGEIPPKCDKCNGVLRPDVVMFGDQMPEDFEKAWHEAEDSDLMIVIGSSLTVSPVNFLPGLSKHLVIINKSETPEDRRADAVIRESAGEALSKIVRYLKTVQ >NZ_CP047602.1|WP_014759292.1|802565_802712_+|small,-acid-soluble-spore-protein,-alpha/beta-type MDEKLKIEAAKELGLLDKVHKVGWSNLTAQETGKIGAIVKKKKYKSAM >NZ_CP047602.1|WP_014759293.1|801054_802554_+|hypothetical-protein MIKKFFLLTLTLIMVFSLNVFSYAFPNDIQNQDYLKLLKDKMPFTSDMSVDQIRKNSDGSIEINMKSDGDIYKTLDVVLNDGQIKSADYYVDQMKYLFDKSGKSKIGKDDAEIIGKKLLENVFGEKFEYVSEVNDSTYIDDALERPIIYKFRYKNLVDDVPVYNLDAYVYIDSESGDILKLKGQSIDESSYNKDIKTIGSVDALKAFNSKLNPTLVYLKNNDDDFPKYRLYYALSIDYNLVGVDALNGDLVDFSGDKLYDDVATIKGCTNELKNSGNMVSYDEALKIAMNEMNNFRINDIKVLDSKTIERYFLTEKAAYTFNMNHTDKSLIVNANIAVDKESGIIMSENVDISDDDGLFDTYGNLDRIIDFAKKILRGKDCKLNLLKKPVVGNDDYTYMFYRVYNDAIVLDNYVRIKTDKNGKIINVSLNWDEADKPSTRDILNESIARNILIDEKPSLCYLYTSKYGLKPIYRLPTMDLIVDALTKQKISINEFEKGY >NZ_CP047602.1|WP_013787627.1|800721_800943_+|NifU-family-protein MRERVEEVLKLLRPSLQADGGDVELVDVTDDGVVQVRLTGACGGCPFAVMTLKEGIERAIKEEIPEVKEVVAL >NZ_CP047602.1|WP_014759294.1|799528_800551_-|NADPH-dehydrogenase-NamA MLFTPIKIKDITIKNRIMMSPMCQYSAGKDGLANNWHFVHYVSRAVGGVGLIMIEATAVESRGRITDRDLGIWNDQQVESLKKIVEECKKYGATMGIQLAHAGRKSEVTDETPVAPSSINWSDDYKLPHELTKEEINTIVEKFKDAAARALAAGFDVVEVHAAHGYLLHEFLSPLSNKRSDEYGGDVINRVRVLKEVIEAIKKVWPENKPLFVRVSSDDYIEGGIDIDEMIRILSHIKPLGVDVIDASSGGLLNAKIDLYPGYQVKYSEKIKSQLGFKTAAVGLITKAEMAEQILKDEKADIIALGRELLRNPYWPLYAAHDLKEDVEWPKQYERGKFRV >NZ_CP047602.1|WP_014759295.1|798728_799532_+|hypothetical-protein MLKYAKTLFLLILFSILIFGQIFAATIPSKPSQYDYVYDYANIMNQSDIDTIRSIGKEIESLTGAQIIVVTVDDIGDYQISDYALNLFRSWGIGQKDKNNGVLLLVDKKRLLEGLSGKVFISVGYGLEGAIPDSVAGRILDDYVLPKWNDKDYSGGIVEGYKAIAALVAKEYNVDLKNVDQSQYAQQNDNGSNKAEGIISVIAMIILLIIFSNIRGWWWRGPGGFGPGGFGGFGGFGTGGGGFGGGFGSGGGGSFGGGSTGGGGAGR >NZ_CP047602.1|WP_013787624.1|798146_798716_+|LemA-family-protein MKRSSVVLISVAAVVLLIVVYFFSSYNGLVSQQENVNSKWSQIENQLQRRADLIPNLVETVKGYAAHEQSVFDSVNKAREKLLAANTVQEKANANDELGTALGRLLAISENYPNLKADQNFRQLSDELAGTENRIAVARMDYNNAVQQYNTSIRQFPNVIIARMFGFTEKQYFKAQASASEVPKVDFSK >NZ_CP047602.1|WP_014759296.1|797642_798131_+|GAF-domain-containing-protein MEKKELFKELLSMIEKSSSEIDNLNDFYNEVVKILDSNLPYYNWTGFYFMEDGMLKLGPYIGRPTEHVKIKVGQGICGRAVAENATIVVDDVTKEDNYLACSIETKSEIVVPIRVDDEIIGEIDIDSDEKAAFDDDDRAFLEGVAEIVGKKIKKRTYNIKEN >NZ_CP047602.1|WP_013787622.1|796813_797590_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MYIPSISPYAFKIGPIAVHWYGIFMALSIAAGAYYLYVRSKELNYDEDFLLNLLMIVVISGIVGARLMFVLANDIDWFYKDPIQILKIYQGGLSWHGAVLGGFLAGLYYCHKKNVKINPLEDYAVIGLAIGNMLVRIGNIFNQEVLGRQTDFAFGRWPAQLVGVAMGLILLIRYFYIERKHMPYGYQFWSFIFYYQLMRGLIEETVRDNPLFWPVYLNKHLGIGFFTLTQIATPFILILAYWMMRRVLNDPENKKVNY >NZ_CP047602.1|WP_014759290.1|804437_805568_-|site-specific-integrase MRGHIRKHGDGWQYVVYIGKDPITGKKKYKSKTFKRQSDCEKAMNKLIRELETGQFVDSRTMTLADYLDYWLETYAKVNVTSSTYKRYAEFTTNIKNHIGIAKLQDLKPAHIQQYYSKLVDEGTLSNSTILKIHRMLHLALKHAVGWQMIYNNPSDSVTPPKVAKIEMKVWDEDTAKNFLDFIKDEKIYLPVKIALETGMREGEISALKWENVDLINGIIYVTSNMQYLYGTLTLKEPKTKKSKRKIVLFKTTIEALKAQRKKQIENKLLLGELYNDNNFVCTHENGDPLIPQYISKRFQLYEKAYNKENNKAPIEIIRFHDLRHTHATWLLKKGINPKIVSERLGHANVSITLDTYSHVLPDIQKQAIESIEIMQ >NZ_CP047602.1|WP_014759289.1|805710_806052_-|hypothetical-protein MAIDFLDKPLVKALLNQEIPFYELMTAYDIQVSIANIDTCIYGFTYVSRQGNYYLILNGNTDYETQCKVFIHELKHILEDCPKQSYYIGLDMQYKYIEIEADKVAEDIVKYCR >NZ_CP047602.1|WP_014759288.1|806075_808073_-|hypothetical-protein MGDIKITNSGIKRILNKYTYLKSIAEYIWNGFDAKANCVEINLHKNILKEIDEISIIDNGYGIDRTKLSEKFTPFFDSEKVINPDEKRKVSLMHGKNGVGRLTFFCFASNAKWETIYKDKSTNRNIKYEIYIDDQNLTTYIDKNIQETFENTGTKVTFTNLHNSINENEIIDFIKKEFCWFLELNKERNFNIKVNDKKVDYSDIILDEEKEELIYEKTKINFKIKFVQWRYPLTNEYSRFYFIDSNDIEKYKETTTLNKKADQFYHSIYIKSSLFNNFSFDSDDSQTCLFNSKSSDEYKFLMNSIEKLLKEKRKSFLRKSSEKLIDNLEKANAYPKFDKDNFIDQYKKSQLDDLISALYQAQPKIFTSLNDIQKKTFVHFLNLIMDSDEKEQLFEILNEIIELEEEDKTELLKLLKYSKLTNIIKTIKLIKDRFKAIEELKCLVFNKDLNANEIPHLQAFIESHYWIFGEQYHLVTAAEPNFEEALRRYCYILTGETEKKKIEHENKYKQMDIFAVRQDIQNDIINNIVVELKHPNIKLGTKQFYQVQEYMDVILKQHQFNAPNMFWEFYLVGNDYDNYISGLLKNAQPHGERSLAYKVDNYKIYIKKWSEIIAEFEIKHKFLNEKLELERKKLIDKNYISADEIIDNISNNTAVQPKEIVMPSY >NZ_CP047602.1|WP_014759287.1|808190_808580_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSFAKRLSELRNEFKLTQKELADKLGVSRGTIGMYEIGQRDPDTDTLLKLSELFNVSVDYLLGNTDIRNPVDEITDAVSDDPELAEFWNELKQREDLKLLFKQTRNLSPKAIKQVMRIIKAIEDEESGE >NZ_CP047602.1|WP_038069695.1|808732_808978_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNKLKEIRNSKNISGYELARKVNVTHSLIYMIENGTRNPSIKLAKKIAKVLNTSIDEIFFEEQSHETLHHNTIPDQSESA >NZ_CP047602.1|WP_014759285.1|808993_809239_+|hypothetical-protein MEEIKQRKELLDIHLKEVSKWMEDSNIDPTSEFGQEFLKQTKELIEQFYEIKELKGRVTALEKQIQEFPEQLMRLNNKCFD >NZ_CP047602.1|WP_014759284.1|809215_809572_-|hypothetical-protein MDNLEVFKYRKDALFELIKEAFIEATKAHELLFKEPNGKQNEIIAALYLNKAISLMSAARSLYLSNYEILMRQEIENIFHTFNVFESEFLSNISTGHSHQWTDLEFLKFKESVETFIV >NZ_CP047602.1|WP_014759283.1|809642_809933_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MALVYTTKEAAQLLKVDIKTIYKLKDEHKLQAVKVGSKILITEQSINSYLGIIPAKTENEIRLEEENKRLKEKLRQYERHLSQIKDEILKIDIKAV >NZ_CP047602.1|WP_014759282.1|809946_810159_+|hypothetical-protein MLTWHEQLTLLMVLDEKLNRLKERRQYYIVKLNTQEKLSQTQEDIFKDLQEQIKELESIYHKINSLEIKD >NZ_CP047602.1|WP_014759281.1|810172_810373_+|hypothetical-protein MLIDELDRELATLEMQIEFRYRRIKELQELKRQAEKADMIIKKLRDEIADYNEEYHEKLRLYYSQM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047602_3 | 1071150-1071248 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047602_3
>3.1|1071182|35|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder ATGATTGCGCGTTTGCCGTCAGACCTGGATGTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_3
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_3 >merge|NZ_CP047602|3|1071150-1071248|CRISPRCasFinder GTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGGATGATTGCGCGTTTGCCGTCAGACCTGGATGTGTCGTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGG >NZ_CP047602|3|2|1071150-1071248|CRISPRCasFinder GTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGG ATGATTGCGCGTTTGCCGTCAGACCTGGATGTGTC GTTGAAAAGTATTGATTTTATGGTGAAAAGGG
>NZ_CP047602.1|WP_038069516.1|1068874_1070116_+|MFS-transporter MTAKNREVYKYLNYNIKMNLLNGITFSIGYNMIMPFVGIFAIKLGANNYEVSLINSLPALMALIGILPATIFINKAKNVFKFAYILEYITRSFYLLVALVPFMSKFRPEAVVLFVGLLNLPAIVAGMCWQSFMSDLIPEEFRGKVFADRNIWTGVLGTAAVFITGILLDRIKFPYGYQIMFFIAFLFGILDAYYYSKFHYVSHKKEASASILDSLKTMMQSKKFIYFSLASFIFTFTWMMAWPIFTIYKVDDLHANNMWMSISTIVGSVGSILTYKWWANLADRKGNGIALSISTLLIAIIPALWAKVTSLFVGAVIDFFGGMATAGYTMLSLNWLLELLPDHKEKMNYIAIYTIVTQFAAFLSPIAGTWFYEVVGYEAFMYITTVLRVLSSLLLFAVALYKTEKSVLNKGGV >NZ_CP047602.1|WP_014759045.1|1066868_1068773_+|threonine--tRNA-ligase MKIILKDGTEREYENGMSVYEIAKSLSQKLAKEALGGRLNGRIVELYTPINEDGKLEILTFDDEDGKKIYWHTSSHIMAQAIKRLYKNVKLTIGPAIENGFYYDFDIDEPFKVDDFSKIEDEMNKIIKEDLKLERFVLPREEAIKFMEEKGEPYKVELIKDLPQDATISFYRQGEFTDLCAGPHLPSTGMVKSIKLLSVAGAYWRGDEHNKMLQRIYGISFPKKSMLDEYLNMLEEAKKRDHRKLGKELDLFSIHNEGPGFPFFHPKGMVLRNILEDFWRKEHAKRGYQEIKTPIILNEELWHRSGHWDHYKENMYFTKIDDEDYAIKPMNCPGALLVYNSTMHSYRDLPLRLCELGLVHRHELSGALHGLMRVRSFTQDDAHLFMTPDQVESEILGVIKLIDYFYKIFGFEYFVELSTRPENSIGSDEDWELATNALIKAMEHIGLNYKVNEGDGAFYGPKIDFHLKDSIGRTWQCGTIQLDFQMPERFNCEYVGDDGEKHRPVMLHRVVFGSIERFIAILTENFAGAFPTWLAPVQVKILPISDKHLAYAQNIYERLLENDIRVELDDRNEKIGYKIREAQMQKIPYMLILGDKEVEAGNVSVRSRKEGDLGSKSLQEFLSSILEEIKQKSL >NZ_CP047602.1|WP_014759046.1|1065990_1066590_+|DUF445-family-protein MHFFLQMMFLGVVGAAIGWITNYIAVIMLFKPIKPVKIFGISIQGLIPRRRDEIAASIGKVVEDELVSMDDILDKLLNEDNRNYIIKRILDDVDIAVEKNIPSFIPKTLKSMIVNYVVGIVSKEAEKFLDESAATMLNDMSDKIGIAEIVEEKIKLFELEKLEKIILDVSNKELKMIVVLGGVLGFVIGILQAFVVRML >NZ_CP047602.1|WP_014759047.1|1065037_1065913_+|putative-sporulation-protein-YtxC MQLLSIGIPNALLSGSVFNNELEYMKNEGLDFTVNLDNRGNITFFNIDVEDRVSSKNIVKIKELVSDVISDVIVNQIDKKLIKRIIDKYYYYFDSDEKKKIENIAKSILDNDANKETFKLVKKERIFEEIEDFLKDNETIDIEGFVNFRLRDFIGEISEVVDRAVDEYMMQKEYDEFIGLLKYFVELQDSKVDVLNILIDKSGKFLFFDKEKKPITGKFLSDITIEFTGGELTDDDMLISTLIAMAPSKIYIHSLENIKSKDILDTVEKIFSNKVFICNGCSLCKVNEARK >NZ_CP047602.1|WP_014759048.1|1064242_1064983_+|hypothetical-protein MSLKNPYVPDKKVSHVIIDGRHYDVAESLRKMEIDVIMTKRHGSLYEAISYHPDMIVHNAGDGQIVLAPDVDENFVEEIKKLNLEVIFGKTVLSRNYPDNIAYNVARLGDYAFHNLKYTDPVLRKVLEKKGVKFIHVNQGYTKCNMAIVDNASFITSDAGVYKTASKEGFDCLLIEQGGIKLNGFDYGFIGGASGLIDKDVFCIAGDLRYHGEYKKIIDFMKYKNKEIIFLTSGEVKDIGSIIPLY >NZ_CP047602.1|WP_014759049.1|1063268_1064201_+|response-regulator MNEKSILIVDDDKLSRTILKNILGSAGYKIYESQDGDEALKLYRRILPDMVILDVVMPGLSGFDLLRILRDEEENQLVPVILLTSSDNYEEKLHGLELGADAYITKPFNEKELLAQVKNLFQRIEHNRMANPLTGLRGNIDIKYEIRRRIKNGSLYAVLYIDLDNFKSFNDYYGFSRGDKIIRQTARILKEALFKCGNANDFLGHIGGDDFIIITTPDKIDDVCNYIISTFDEDIKRYYDDEDLANGYIEVINRRGEIQRFPFVSISIAVVTNENRNFDNELQISAVAAEIKRKLKSMEGSKYLKDRRKC >NZ_CP047602.1|WP_014759050.1|1061720_1063055_+|beta-glucosidase MLDFSKDFLFGVATASYQVEGAYNEDGRTMSIWDTFSRQDGKVYKSHNGDVACDHYHLYKDDVKMMKDLGIEAYRFSIAWPRIFPAKGQYNPKGMDFYKRLTDELLKNDIKPFATIYHWDLPQWADDLGGWLNREIVEWYGEYAEKLFSELGGYIKNWITLNEPWCSSFLSYFIGEHAPGHKDLGEALLVSHNLLLSHGKAVEIFRGLNLDDSKIGITLNLNEVFPASDSDDDKVAAQIADGFQNRWFLDPLFKGKYPQDMVEYFGKYAKVDFINDEDLKLISQKLDFLGVNYYTRAVVQKGNDGLLDAVQIDPGNERTEMGWEIYPESLYNILMRLKREYTYDMPLYITENGAAFNDVVEDDGRVHDEKRVEFLKQHFKEAKRFLNDGGNLKGYFVWSLMDNFEWAHGYSKRFGIVYVDYETEKRILKDSALWYKDLISTRTI >NZ_CP047602.1|WP_013787791.1|1061399_1061603_+|4Fe-4S-ferredoxin MRYAYVDQEICDRSPFCPASHSCKFGAFKLSRKGLFQVEINVDKEKCTGCGVCTRYCPHGAIKLVNA >NZ_CP047602.1|WP_038069519.1|1059444_1061286_+|asparagine-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MCGIAGWVSFDEEVINRKNIVVAMGKRLRNRGPDSWGTWFSTHCGFAQTRLIVIDPEGGEQPMIKELGERKCVIIYNGELYNTEEIRDELRSLGYKFNGHSDTEVLLTAYIEWGSDCVHKLNGIYAFAVWDDYENELFLSRDRIGVKPLFYTYKNGSLIFGSEIKAILAHPYAQAEVDEEGLAEIFVMGPTRTPGIGIFRDIYELKPGHSLTFNKGGIKIERYWSLVSKNHEDDLKTTMEKIRFLLDDASKRQLVSDVPLCSLLSGGLDSTAVSAFANEKLKRLGSKLITYSVDYIGNDKYFKPNQFQPNSDSDLVEAVSKEIDTDHNYVYVDNEELADALLPALYARDLPGMADVDSSLYLFLREVKKDVKVALSGEGADEVFGGYPWFRNKDAVESGTFPWIRMVEKRMNLLSQDVVKKIRPTEYLNDRYNEALREVPKLSGEDKTSSRMREIFYLNQTRFLSMLLDRMDRMSMASGLEVRVPFLDHRIVEYVWNIPWDMKNLHNREKGLLREALKGYIPDIVVERKKSPYPKTHNPVFKEKVKSWLQRIIDDPSSPILQLINKKEVQNLIDTDAKDYDPAWFSQLMGGPQLYAYLIQVNEWLLKYKIRIL >NZ_CP047602.1|WP_014759052.1|1057665_1059147_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MVFKDKQLLKLLNIINANNLLDENKDYINFKGIIKDISVSITRLKKKLVKYIFETQVASSRIFSVSEELSITMEENNAFAQQLYAESQEIFSNNSLCYENVENTITEIKKLVEKLENIKNTSGEMYNTGIQSRKLVNESFKEIRLVLDKISNISITTEETLNRINELTKISIQISQILKSIEKIAKETHLLSLNASIESAKAEKYGNGFGVIADGIRKLTLNTNKAVTDIVSLIEKVNNEIENVKKSASENYINVKDSVSSTMNIEKSLSMIEEYNNTVMNMISKIVNVSEDEYKYVKNINEKIESVQNLLKEVSNNFDIMNNSIYHQKENAEKIVFLSDKLKEASNDLKLLSESDEIKNVIRMNFENIKNTAINVIKSIKKEIISDEFLLMNRNFHKEALDAFLKNHKEIEALWTNDIKGRFIYSNPPAGIANANVREWFQKSIKGKEYVSEVYISAITKAPCLTVSIPLIDKNGSCIGVIGADLNIKISDL >NZ_CP047602.1|WP_013787800.1|1071421_1071934_+|translation-initiation-factor-IF-3 MNKELQVNEEIRDKEVRLIDQDGNQLGIMSAKEAYKIALERHIDLVKIAPQANPPVCKLMDFGKYRYEQSKKEKESKKKQKVINIKEIRMTPAIEEHDFGVKVKSAMKFLKDGDKVKVTIRFRGREASHTNLAEELLNRFAKSLEEYGNVEKAPNMEGRNLMMILAPKNV >NZ_CP047602.1|WP_014759041.1|1071951_1072149_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKMKTHSGAAKRFALTKNGKVKRSKAFKRHILTKKTRKTKRNLRKIAYLSSVDAKNIKRLIPYA >NZ_CP047602.1|WP_013787802.1|1072168_1072528_+|50S-ribosomal-protein-L20 MSRVKSGKVTRKRHKKILKLAKGYYGAKSKLFRVANQAVMKSLNYAYIGRKLRKRDFRKLWIARINAAARANGISYSRFINGLKKANIEINRKMLSEMAIHDNKAFAELVNIAKQQLNA >NZ_CP047602.1|WP_014759040.1|1072583_1073354_+|RNA-methyltransferase MVITSEKNEFIKNIKKLSDKKYRYEKKLFFVEGKNSVFEALKSGFEIVHLLLAEDFNVDFQIERDKIVFVDEKVFKKISDTVAPQMIMAVIKMPKWEVNDIVKEGGFYVILDEVQDPGNVGTIIRSADAFNVDGIFTINNTVDIYNPKVLRSTMGSIFHLPVVNDVEPSKLFDVLKRNGIRILSTSLKAEKYIYDFDISKNAALIFGNESRGVNKYLDGFIDDSFKIPMDGMAESLNVSVAASICLYESERQRLIK >NZ_CP047602.1|WP_014759039.1|1073648_1074668_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MEETLRNLLEEAKKELSSAENLKTLEEIRVKYLGKKGELTKILRGMGNLSPEERPIIGKISNDVREEIEKDLTQKREEVLRQEKEKKIKSEYIDITLPGKVHEIGHKHPMTKVLDEIKDIFLGLGFSIAEGPEIELDYYNFEALNTPPDHPARDLQDTFYITKNILLRTQTSPVQVRTMEKSKPPIKVISPGRVYRSDEIDATHSPVFNQIEGLAVDEGITMGDLKGVLNLFAKRLFGSDTKTKFRPHYFPFTEPSAEMDVSCFACGGKGCRVCGYSGWIEILGSGMVHPNVLRMSGIDPEKYSGFAFGMGLDRITMLKYGIDDLRLLYENDLRFIKQF >NZ_CP047602.1|WP_014759038.1|1074680_1077062_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MLISYSWLKDYVDLSVDAKKLADDLTMSGSKVETVKSYGQEIKNVVIGKIVSLEKHPDALKLQIGIVDVGKEKLQIVTGAQNIKVGDYIPVALHGSTLPGGVKIKRGKLRGVESNGMMCSAKELGLDESLLPEYQRNGIFILPELPLGDDVRDALELDDVIEFEITPNRPDCLSVVGIAREAAATYRKSYRMPEIKISEVDDKNPATVTIEADDLCFRYVARVIRNAKIGPSPMWMQMRLLKAGIRPINNIVDVTNYVMMELGQPLHAFDLDKVKNRHIVVRKAKEGERLITLDDKERILDKDMLVIADEEKAIGLAGVMGGQNTEITDDTVNILIESANFKGSNIRYTSRKLGLRSEASSRFEKGLDPEITVLACNRAAQLMAELSGGEILEGLVDVYPKPVTEKVLSVRYERINKLLGTNLSCQEMKEILSFLDFGAICDGKNLIVKVPAFRSDIDSEADIAEEIGRMYGYNNIEDTLLKGTQITAGVKTREQKLEDTVKDVFLSCGLNEVITTSFMGMKDLDKINLPDDSYLRNAVKIMNPLGEDQGYMRTTLLPFMLNVVYTNYSRKVSEFKAFEISKVFVPKSLPLEELPYEIKSGIIAMYGYDADFLTIKGVIEELLDVLNIKNVKYVRSQNPAYHPGRSADVMVGDEKICVFGELNPDVAENYDINKRVYIAEVNLELLFKYANDEKVYKPLPRYPAVERDIAVLVDKNTFVADIENVIRKAGGQLVDDVKLFDVYEGENIPEDKKSVAFSIWYRSYDKTLTDEEVSKVHDKIVNRLSEELGAQLR >NZ_CP047602.1|WP_014759037.1|1077158_1077533_+|cell-division-protein-ZapA MEIRKITVNINGNEYILKTDYPEDYILRLTEHLNGVISGISGSYNRLSNQMVLVLSALNIADELFISREENNALKKEIVSLKSRLSADDERIEELTEEVEKLKEELKAAREELEEYINTFDDVG >NZ_CP047602.1|WP_014759036.1|1077587_1079933_+|U32-family-peptidase MKKIELLAPAGNLKTLKFALDYGADAVYIGGKFFGARAYAANFEEDELKEAVEYAHLRDRKVYVTVNTIVFNKEVELLLKYIDYLYQLNVDAIIVQDFGVVKLLKDFYPELDIHASTQMTLSNLESIKAAYEMGIKRVVMPRELSLKEIKKIKSATGIEVEAFVHGALCVSYSGQCLFSSVIGGRSGNRGRCAGPCRLKYDLLDDRMNTIASNMHLLSMADLCTIDYIKDMIESGIDSFKIEGRMKEKEYVASVVMSYRKAIDAYLSGEKINTDMYKEMMSGIFTRGFSNGYLYEKKPQYMSYTNPKNKGVPLGKVISIDGKKIKVSLLRSLSLGDGISTETGEYGYKVDDIMVEGKKVDEAYKGQVVELKKIPVNCGDALYKTYDAKLNKLFSVSNELKSPVDVFVNMREDKPLNIMIRNNDIFVSKDSKIASVKAMKKAIDKDTLIEKVSSINDTPFYVNDIEVDMDEGLFMPLSEVKETRRKAVEDLIAKKLKYREPKNIHINFHKSINDKIGDLKLSLYTEREEHVKIAYELGVDRVYFNYRLNYDAIKDVICYRDKCEVVPAFPQIMRDELDDFQREMENIKEMGFKKVLVTNLGMYDAAIKLGLDVCVDFNLNVSNNLAADFFDKADTITLSPELNIHQIEDISSRSNAKFEAIAYGRLPLLTMEYCPIKNLKGCDKKGCEEGKYFLKDRKGNLMKIVSDGFCRIKVLNSSVLYMADKMNDSRKIGLSYIRINDTVESDEEIKDAIKEYKNSLKFGTCDLHVKNYTRGHFYRGVL >NZ_CP047602.1|WP_014759035.1|1079932_1082293_+|endonuclease-MutS2 MDERYFKNLEFDKIINRISDLCDSEPGKEAALDIKPYENVEEALKEIEKVNEAVSFIVSYGNMSFSFKKIDDILAKAKIGSSLNPGQLLSLSRFLSLAGKVKAYLRNEKEEGIFPYLREYNMRLTNIRELYDKIDRTVISEDELADDASPALKEIRRQKAHINNKIRDTLNSIIASSSKELQDPIITIRNGRYVVPVKQEYRGTFKGLVHDQSSSGATLFIEPMAVVELNNDLRQLEIKEQHEIERILAELTDEVGEHADEIYENMVALKELDVIFAKAKYSINTDSTKPILNTKGYINIKNARHPLIAKDAVVPISVHLGQSFNTLVITGPNTGGKTVTLKTVGLLTLMSMSGLNIPADDGSDVAFFDNVFVDIGDEQSIEQSLSTFSAHMTNIVKILNNVNSNSLVLLDELGAGTDPTEGAALAMSILDFLHRMNCRTIATTHYSELKQYALKNEGVENASVEFDVETLKPTYRLTIGIPGKSNAFEISKRLGLNDDIIENAKNYITSEELRFEDILRDLENKRTEAENAKQKIEELKRHVESLKDEYEKKVKEAEREREKIIEKAREKAKKILEGTKSTADEIIAKLKEAEKSDRKNKLIEEARLKLKENINEIEENLKRSEIPEYKKIPKNVMPGQTFYIVPLDQTGTALSEPDKDGNVKIQAGILKMNVHISNLREAESSEEKEMEKGFAKYINEKSSNISTSIDLRGKTLEEASIEVDKYLDDAYLAGLKQVTVIHGKGTGILRSGITRLLKMNKHVKSFRLGRYGEGEDGVTIVELKEK >NZ_CP047602.1|WP_014759034.1|1082344_1083055_+|sporulation-protein-YunB MRRKKWGRRRIKIRGINKNFVYILASLLILSLLYMFVTYRLTPALIKASETVAQEVAVKSINKSINEKVLKGIQYSDLINVRTDNSGKVSMLQANTIEMNILSAKITQAVQDNLNSIGSVYVKLPLGSLISKDIFANTGPRIKVGLLPIGSVNVDFESSFEPAGINQTRHIIYLYIKTNIQIIAPLASKQIQVSTHMPIADSIIVGDVPQSFVDVNGNKYTVPVPSGDSKINVESN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047602_4 | 2635195-2635553 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047602_4
|
5 spacers
spacers of NZ_CP047602_4
>4.1|2635226|35|NZ_CP047602|PILER-CR CACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG >4.2|2635292|36|NZ_CP047602|PILER-CR TAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA >4.3|2635359|35|NZ_CP047602|PILER-CR AATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT >4.4|2635425|33|NZ_CP047602|PILER-CR AAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG >4.5|2635221|40|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG >4.6|2635287|41|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA >4.7|2635354|40|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT >4.8|2635420|38|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACGAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG >4.9|2635484|40|NZ_CP047602|CRISPRCasFinder AAACTTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA >4.10|2635225|36|NZ_CP047602|CRT TCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG >4.11|2635291|37|NZ_CP047602|CRT TTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA >4.12|2635358|36|NZ_CP047602|CRT TAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT >4.13|2635424|34|NZ_CP047602|CRT GAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG >4.14|2635488|36|NZ_CP047602|CRT TTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA |
cas3,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047602_4
The CRISPR arrays of NZ_CP047602_4 >merge|NZ_CP047602|4|2635195-2635553|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAGGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAAGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTATGTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTATAAACGAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCGGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACTTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAAGTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATTATA >NZ_CP047602|4|3|2635195-2635488|PILER-CR GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT CACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT TAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT AATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTATAAACG AAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAACT >NZ_CP047602|4|3|2635195-2635549|CRISPRCasFinder GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTAT AAACGAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT AAACTTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTAT >NZ_CP047602|4|2|2635195-2635553|CRT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TCACCAGTAGAGCCGAAACCGGAGAAACCGAAAAAG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TTAGTAAGGCGTGAAAACAATATAGATTTAGGCTCAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TAATGTTTGAGCGTCACTCTCGCCTTCTACAAGTAT GTTTAGGTAGAACCATTGTGGATTATAAAC GAAGTATTCGCTGGAGGATTTGAACTCGTCCCCG GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATAAAC TTGAAATAAACACTCATAGATTTTCACCGCCTTTAA GTTTAGGTAGAACCATTGTGGGTTATTATA
>NZ_CP047602.1|WP_014757523.1|2632713_2635059_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MCISIPRSSSTLANYSCLNDVLAKDDGETLIEHTKKVVKVLIELKNLFENAGSYFGDDLLFEKVYIAGLLHDLGKIMPSFQIAVQNKSHWDLRHEVASLFLIGDIYINGKKLDENEIIDIYTIIVTHHKSLKDLKEKWIGYIEKSFIEVTKGKIEEGIVELAKLLEADRLSARRIYHDIFLEYVDYVKKTYNGLTGNILDLDIIKNYSESRFFQRFDRIYDIVQDSKRKQKLIFMIGLMKSADHLASSGQTEIVKIKIDFKIFEKGIRLYSTQEKASKIKDDVLLIAPTGSGKTEAALSWAKNNMKDSDNDRIFYLLPNIASINKMVERLQNIFGKDKVVPVHSKTAFKIYENFIEEKTFEELSEEEKRKINKNVSQQKSLIKKIHFPVKVATIYQLLKNAYYIGDYEINFAELYNARVIVDEIHAYEKEAVCKLIIFLKFLKENFNTKIMIMSATIPTSLQEFIIKKLGIENVLKMKDEELESFNRHIVFRLPGTLMDYVNEIACKVRNGKKILVVANTVETAQNLYKILKDKLSDNCIKEEGIKLLHSHFTLKDRDKIEEKVGDYKLLVATQIVEVSLNISYDELYTEPAPLDALLQRFGRINRFREKRELAPVFIVEKDINEKGYPYRDREVVEKTLELFKESPVKLEEKAIQKMLDEVYSSYDYEVFLDPRLHNYLNELLTEKYDNKDLRKQFYEEFDGITVYPFAFKDKVIESIDSRDFYELELYKISLNLGTVLGLMKKRLIEQEKINGIPINFVKCYYDSEIGLDKNRPLEIKK >NZ_CP047602.1|WP_014757524.1|2632097_2632754_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVEKAVKIKITGWTATFTNIFFKTGKILAYEMPPLSSLIGLLSAAKGEVIKDVDFKIGYEFTYRAKSWDAETYYKATKRKDAKGESSVWFKNFLYDVELNLYLTDLSFTDYFKKPRYTILLGQSHDLATVEEIKEVDLIKTGKGTINNTAVSVSTKGVSGVPIIMPVKIDLDTREILNQKPFIIIKRPVSIENDNIYMVKGENKDVYLYSPEFINAC >NZ_CP047602.1|WP_014757525.1|2630985_2632029_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNFAQGIFMFNVDAGALNNLKNDKKGDGTTITRTKKIVTYDANGHRKTYVLVSAQSYNHFIQATHMDKFKAKYSIKTKEGKKVNYEVDPVKYVDQDLRGYMETDQGLSRIAPFKFSHLISVNGVEILESFNTTSTEGDNMIYQYEIYKTHFKGKFNIDLDTVGRFEARNKSGYQNINDDLIKKYDEEEEYKEIIHKVDKENKVVVLTAKERAKRISEYLKSLNYIQGGAKLTNNFENIAPQFIILVIVESGNNILANVIHESGEYGSGFKVNFEVLKKMLSAYKDDLKSKVYIGRNEGYLDSLQTEIDRFIKEMSEEKIEVVNDIVKNVIDKFEEEICAFYCHADSN >NZ_CP047602.1|WP_014757526.1|2629445_2630879_+|hypothetical-protein MSIDYSGVYLVDVGIAYFKSWLKAQNGGTITTITGNDVRTFANQIRGHYINNPDDWKTLQKELLFIITRNPIRYKSAENLFKIKNRDLIIDLSEEYAKLLDGNASEESNGTKCSLCGQHEGAYPLDRTFMPYYVSGTNWNAKFFHKKEFLGCTRCTFFLTVMPFGLFKTVMDENNKTTGYAAFHTDDEEIYESIIDIVYTENNNLIKFKNENDLYKVVYKALSEYSQNNQSNRYRTSVDIYIFNNDNRDVGNDLKIIRLPDRNIGFILEVARDIKFKKDISKINTLEYGYFPAYRIFLSDINFLLGKKTLKTFGVWLFKNFSLDFIKLYFKEVLGMPENIIDYGFKLAERLTEFYKKSNANFRKIKYLENADSRHEFAREIVDIYRRTVTEGWKLTKNHGPGEVEKILAELKKPFDSAKEFFDVIMNESYDWRMLKLIVIARIYELLTNEKFVSNIDDLDGEIDNDLEYESADDSVF >NZ_CP047602.1|WP_014757527.1|2628644_2629445_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MQIGDKKSLRITGTAKKEQNILLDEINYSLTKFIYETLASNSPEFSRELHEVGFKKSKKSFKGVCFSRPYFSDFTLKENGIISVGKFVTIKVRSLVKGFLDNFILGLYKNEKIKIGEAEFNFEEVKILPELRFKTEEMFYLDTPLVLSVKDHSTGKAKYLRYLDDREKFKEALKQNLKEKYSAFYGNEIDLNDFDFSFDESYMATAAKHSKLITYCDQRIYGELAPFTIKAPIEVIEMVYYSGIGEKNMMGFGFISKKLKIKGGRV >NZ_CP047602.1|WP_014757528.1|2626818_2628201_-|ATP-binding-protein MFIGREYELNTLNKLYNEDKFHFIVMYGRRRVGKTTLLTEFCKDKPSIFFVAEEYNDKIALESFSDKILSYFGLNEMVSRFESWEKAFLFLGQKAKNERLVLVIDEFPYIVNSNKSIPSILQNLIDHYLKDTKLFLIICGSSMSFIEKEVLSYKSPLYGRRTSQLIVEPFDFFDSRKFFPNYSFEEQVIAYGVLGGIPQYLSIFDDKYNVYENIKTKILDKSSYLYEEPKLLLRQEVREPALYNSIIEAIATGSSKLNEISTKVSVDTDKCSKYISTLIDLKILERITPVELKAKSRKSIYKIKDNFFRFWYRFIFNNKAFIEQGLLDEVIESKIKPSMNDFLGLVYEEICTDYLKILNKNKKLPFIFEEIGKWWGNNPYKKREEEIDIVAINNDNIIFGECKWQNQKIDMAVLNDLIEKSALFDYPNKYYILFSKSGFTSEVANFASYSNNIILIESFD >NZ_CP047602.1|WP_014757529.1|2625989_2626343_-|transposase MFEYLGKLNSKGNYVRKMRIKLQYWAKQKIHEKVCDIAHSYGIRVSWINPKNSSALAFVGIGKVIRSNKKDICEFTTGKKYHADLNALYNIGARYFIREILNPLSEKERSQYQAKDR >NZ_CP047602.1|WP_014757530.1|2624537_2625488_-|DUF4351-domain-containing-protein MNDWHSDFVTAIREELKDEKVEIKQEEYLSKEPLRIDVIIIKKEKDGKINKRVGQIFKRYNILEYKSPDDYISIDDYFKGLGYVYLYKSIMNAYDKSRKEVDDIKIDELTLTFVCSNLPKKLISFLAEHKIKLDNFDNGIYYIDNEWIPVQIIVLSELDNVEENYPLMVLSNNMYFRNAIEKVFSSINEAKEYDNKIRLIEAAFRIDPGIVSEVIKMYADRLSEEQRRYVINNLKEANFKIYTEEELKKSMEEGMEKGIEKGIENLVIRLLKKKFNDIPEKYLRLIENADEKTLLQLADNIFEINKIEDIEKYIVN >NZ_CP047602.1|WP_014757531.1|2623621_2624512_-|DUF4351-domain-containing-protein MKDNNLDISYQNNDIILKSMAWEFKDKSLKFYGINVPKIVTVIPANLPSIEVKEDRLDFIFLLEDDSLLHMEFQTTNKKADIKRFLQYDTRLYSKYEKTIRTVVIYSGKIEEAISRLDIGSIIYNVEQVFLAKYDGDKIYEELNEKIDKKLRLTDIDKLNLIFLPLMGSKKSSDEMAIDAVELAKKIEDEDEKTYIIGALIGISDKFLTEEYKNKLKGAIKMTKIAEMLIQEGKAEGKAEGKAELIIKQLKKRFNKIPEFYVKRMYELNVDKLEKIGENIFDINKIEDLDKYFNDN >NZ_CP047602.1|WP_014757532.1|2622249_2623509_-|O-antigen-polymerase MNKLVNILYFLWVFLMLQADLKVTVNPYIDWFFTFVLFVPVIMFNIKKLKISFKKYYIILLPSNLLIISMLLSSFNSSIQINNIFQSIKLILLFFVIFPILNLDDNYEKISFDAFILSSIVNFGLIIVGKLFLKSVAWEAAYLRYGTIFNMPGSLYKPGIFILPYVLYIILNKFSVNYLILLITACGLIFFDGSRSGFIGLIFATLYIIMIYLSENVKFRSINIKKLNYYIILNTIFIILLIAIINENLIPGLDRIDMFLNKIYNYGLISGTIHSDPVRYQMIQKAINHITSSPIIGNGFGVTNVKGTVIHNTYLQSWADMGILGFISLILLYFSWLLILPKVINKIRYIKDFRYRGLIYNSIFSLFLYDLLGLFHPMSVEPSEWITFFVPYTIFINYYWKEIYDKSSKSINICDSSSI >NZ_CP047602.1|WP_014757522.1|2635847_2636336_-|hypothetical-protein MNRREFEDYLGEKVNSEVSEELSARFGKNNQAQQQAQQQAQQQAQQQAQQFQQQLQSMGINVTPQQFQQLLNQVKAQAQQQQQQTDMQVQQALQQAMAALQQAQQSIQANQVFAQMSKILDSSNQQLQQLTPQLQAQQAQQAQANFLNQQANQQNTTQTGMQ >NZ_CP047602.1|WP_014757521.1|2636412_2636994_-|hypothetical-protein MEILQSELKIENLIKETEHIFEKLMSFNEILLNDATKIEAKLEKSEKEIKEYIESQFEENNDRKYLISYLRKADNRSDSLKEVENMICSNVDELRNDVKTLKDNLDGMKKTLYKLKDLERDISSMKAVIEKDVLLNIELNKESAPEKVEYVYDLPPQLVNNLNTALNNLYIAKDGMNRIKIYEDIVNNLENFQ >NZ_CP047602.1|WP_014757520.1|2637081_2639814_-|UPF0182-family-protein MVICLKRGNLAIIILLISIFLIAALFASLANLIVDIQWFNSLNYLGVFFKKFLTQLTIGVPSFVVIFILSYFYLNRMVKDYAKFAQDIEIKSVRKRFRGVVIGLSIFVSFLISVFISANWWNDFLFYINSANFGVKDPIFNKDISLYMFRLPFLLDVYDLLIVIIPILIVATIIVYGLMYLSDKTRFYEISDRGGFFRAIYNKEILMIAFRQIAVLGFVFFAVLSLGYYLKAYGILYSKSGVVFGAGYTDVHVRLLFYRILMLASIISGVLFMIGAFRQKLKYIIASPVIIVAIMILSTVSQMVVQNFIVAPNELDKEKTYLKYNIDFTQKAFDLNNVEERNYDLSGDIDKKVLDENQDTINNIRINDYRPVSQIYNQLQSIRLYYKFNDIDIDRYMINGNYRQVFISAREMNLDNLASQAKNWINMHLKYTHGYGVVMSTVNDVTATGQPDMVIKNIPPVSSTNIKITRPEIYFGELTNTYAIVNTKTGEFDYPAGDTNKENFYSGKSGIPMTFLNKLLYTIYTGNIKILLSTDITADSRMLLFRNIKDRVQRIAPFLIYDDDPYIVVDNGKLYWMIDAYTYSGNYPYSEPYGDTGINYIRNSVKVVVDAYTGDVKYYISDKNDPIIKVYSRIFPGLFKNIDEMPQGLKAHIRYPQYMFDIQASVYKNYHMSDPQVFYNKEDSWDIAKEKFTGKIEPEESQYVIMKLPGEKTAEYVLMIPYTPATKDNMVAWMAARMDGNNYGKLVVYKFPKSTVVYGPMQIENMIDQDPNISKEMSLWDQKGSSIIRGNLLTLPIDDSMLYVEPIYIQSSNENAIPEVKRVILAYKDKIVMEDTLANALNKLFNLQTPAQPQVPQVQTNETQQELIKKANDIYNNAMNASKNGDWTDFGKNLDELGSVLNDLNNSIKK >NZ_CP047602.1|WP_014757519.1|2639951_2641178_+|LCP-family-protein MKRALKISLLVILGIALSIGTGVFMFYRNLNVVNTEENPVTTNAQVKTSKQSSSSQNKKNILFVGDADGLSDTIFVASFDANKKEIDMLSIPRDTYYPRPGYNAPTEKKINAAYSEQKIDGLKDAVENLLGIKIDNYVILTYDGFKDIIDTIGGVEVNIPFDMKYDDNVANPPLHINLKKGLQVLDGEEALQFVRYRHGYVDGDIGRINAQQEFLKSFIKKVTSPTIITKIPSLAITLSKNLKTDLTAKDITTYALDFVKNKPQNINTSILPGEGGYMGDYSYYFVDQQKAMEVASEMFGNGLSNDSVSTVSQITYSPLNSTISVAVYNGTKVQGLAAKYAEELKSLGFNVIKIANADAKNYDESCVYADTSIDKANKVAGALSIKNVLNGENSSSADVTVIIGNDKK >NZ_CP047602.1|WP_014757518.1|2641526_2642798_-|serine--tRNA-ligase MLDIKRIRNNPDEVKKAIELKKENSNIDEFLEIDEKRREILKELESLKNTRNKESENIAKLKKEGKDAEELIKEMKEISDKIKAMEGEVKQYDEKLEELLWTIPNIPHESVPVGDSDADNVEIRRWGEVREFDFEVKPHWDIGVELGLLDFEAASRVTGSRFTFYKGLGCRLERALINFMMDLHTEKHGYTEVFPPFMVHRRSMFGTGQLPKFEEDAFKVAGTDYFLIPTAEVPVTNMYRETIIDGEKLPIYNCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKITEPEKSYEELEKMVSDAEDVLKTLGIPYRVVSICTGDLGFTAAKKYDLEVWMPSYGRYVEISSCSNCEDFQARRANIKYRPKDGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQKDGSVVVPEALRPYMRCDVIRK >NZ_CP047602.1|WP_013786854.1|2643063_2643600_-|signal-peptidase-I MKSNTKKEIVSWILTIGLAFIIAMFIRTYVFELVDVPTGSMLNTIQLNDKFIELKFIYRFEPIKRGDIVVFKYPDDPSVSFVKRVIGIGGDTIEIKNGILYRNGKPVKEPYLKEPMNKNETFGPYKVPPNHYFMLGDNRNQSLDSRYWKNKYVSKDAIMGKIVFRIWPLSRFGSMIGK >NZ_CP047602.1|WP_014757517.1|2643999_2645064_+|sporulation-integral-membrane-protein-YtvI MKDFLSRYQSTIRNSIAILAIILSFYLFVFKLIPFLMPFAVALFLAILIDPAVEFSEKKLKIPRGLSSAFFILLLIAIIGLLISLLVTQLVFELNTLAEHAPSYTKNFDVVISDLIDRIRRYYVSLPTNISTFLESNLQSILNNISVYAKNFAGWILGLATKLPNFFFMSIITIVSTFFLSKDKWLILNFIKRQFPSNWAFHAENIKGDLFQTLIGFIRAEITIMFITFLEVSIGLTIIGFDYAFLLGLLVSFIDILPVLGSGSVLVPWALYNIFTKNYLIGIYLLIIYAIVTVVRQMIEPKIVGQSIGLHPLVTLLSMFIGARLFGGLGLIMGPVFVVVFKTFQKSGIIPSWK >NZ_CP047602.1|WP_014757516.1|2645107_2645578_-|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MKKYEGKLIGDGLKVGLVVSRFNEFITNKLLDGALDALRRHGIDDESIDIAWTPGAFEIPLISKKMATSKKYDAIIALGAVIRGDTPHFDYVANEVSKGVAKISVDYDVPVIFGVLTTDTVEQAIMRAGTKSGNKGFEAAVTAIEMANLIKEIESL >NZ_CP047602.1|WP_014757515.1|2645601_2646792_-|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MFDTIESAIEDIKNGKMVIVVDDEDRENEGDLVMAAEKVTSDHVNFMIKYGRGLVCVPMMGERLKKLNIGKMVFDNTDKKETAFTVSVDHKNCKTGISAYERALTIKMLIDDESMPDDFTKPGHVFPLEAKEGGVLVRAGHTEAACDLARLAGLKSAGVICEIIKDDGKMARLPELIEFSKKFNLKIISIADLIEYRRKNEKLVKRVAEAYLPTKYGDFTIIGYEEILTGKDHVALVKGDLSDSPTLVRVHSECLTGDIMGSLRCDCGDQLHTAMEKIGKEGGVLLYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDEGLDTVDANIRLGFPADMREYGIGAQILKDLGLKKLRIMTNNPKKLVGISGYGLEIVERVPIEVSINRHNERYLKTKKEKFDHIFTSF >NZ_CP047602.1|WP_014757514.1|2646806_2647427_-|riboflavin-synthase MFTGIIEEVGKVKMIQRGNITKMAVECKKALDGVKIGDSIAVNGVCLTVTNIGKDLFTSDIMYETLKTSNLGSLKIGSIVNLERALSISGRLNGHIVTGHVDTVGAIIEKNKINGTTTFKIKIDERYSKYVADKGSVAVDGISLTVVESSASYFTVSIIPHTEINTTLNIKRIGDTVNIEVDILSKYAERLLTKKNVDEFLIENYL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_CP021429 | Acinetobacter pittii strain HUMV-6483 plasmid p11, complete sequence | 89427-89460 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_CP039041 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence | 61884-61917 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_MG954377 | Acinetobacter baumannii strain SGH9601 plasmid pS21-2, complete sequence | 88661-88694 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NC_009425 | Enterobacter sp. 638 plasmid pENTE01, complete sequence | 6404-6437 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047602_1 | 1.12|151605|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151605-151642 | 38 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 211283-211320 | 9 | 0.763 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NC_031107 | Erwinia phage vB_EamM_Asesino, complete genome | 190888-190921 | 9 | 0.735 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | AP013405 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S42-C63 | 17407-17440 | 9 | 0.735 |
NZ_CP047602_1 | 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153398-153435 | 38 | KX171213 | Staphylococcus phage vB_SscM-2, complete genome | 4870-4907 | 9 | 0.763 |
NZ_CP047602_1 | 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153398-153435 | 38 | NC_047767 | Staphylococcus phage vB_SscM-1, complete genome | 4870-4907 | 9 | 0.763 |
NZ_CP047602_1 | 1.14|151740|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 151740-151775 | 36 | KT997873 | Uncultured Mediterranean phage uvDeep-CGR2-KM21-C368, complete genome | 9652-9687 | 10 | 0.722 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694478 | Marine virus AFVG_250M504, complete genome | 10675-10708 | 10 | 0.706 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694270 | Marine virus AFVG_250M505, complete genome | 10793-10826 | 10 | 0.706 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694656 | Marine virus AFVG_250M501, complete genome | 10405-10438 | 10 | 0.706 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN693919 | Marine virus AFVG_250M503, complete genome | 25482-25515 | 10 | 0.706 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | MN694712 | Marine virus AFVG_250M502, complete genome | 25481-25514 | 10 | 0.706 |
NZ_CP047602_1 | 1.36|153201|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153201-153237 | 37 | NC_048677 | Lactobacillus phage LpeD, complete genome | 79938-79974 | 11 | 0.703 |
NZ_CP047602_1 | 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153334-153367 | 34 | NZ_AP018263 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid8 DNA, complete genome | 3046-3079 | 11 | 0.676 |
NZ_CP047602_1 | 1.43|153668|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 153668-153705 | 38 | MN693779 | Marine virus AFVG_250M346, complete genome | 53552-53589 | 11 | 0.711 |
1. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021429 (Acinetobacter pittii strain HUMV-6483 plasmid p11, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer taagtaagcaaaaaaataaagcaggaccaacttc Protospacer **.***.***************** ..***.*
2. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcag-gcttaacctg CRISPR spacer aaaataaagaaaataataaagcagcgagtaataa- Protospacer ******** **** ********** * ***.
3. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG954377 (Acinetobacter baumannii strain SGH9601 plasmid pS21-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer taagtaagcaaaaaaataaagcaggaccaacttc Protospacer **.***.***************** ..***.*
4. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009425 (Enterobacter sp. 638 plasmid pENTE01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aaaataaacaaaaaaataaagcaggc--ttaacctg CRISPR spacer aaaatatacaataaaataaagcagataagtgacc-- Protospacer ****** **** ************.. *.***
5. spacer 1.12|151605|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ataaatgtttttgaaagtgattcttttaatatttcttc CRISPR spacer aatgaagtttttgaaggtgatacttttaatatttatgg Protospacer * .* *********.***** ************ *
6. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031107 (Erwinia phage vB_EamM_Asesino, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaaagaaagcagtacccactcc Protospacer **************** ******* .. **..
7. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013405 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S42-C63) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer taaataaacataataataaagcaggcagatacgt Protospacer ********* ** ************ * *
8. spacer 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX171213 (Staphylococcus phage vB_SscM-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ataactcctttccttaactctatatatataataacata CRISPR spacer ttgtggctgttccttaactctatatatagaataacatg Protospacer *. *. ******************* ********.
9. spacer 1.39|153398|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047767 (Staphylococcus phage vB_SscM-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
ataactcctttccttaactctatatatataataacata CRISPR spacer ttgtggctgttccttaactctatatatagaataacatg Protospacer *. *. ******************* ********.
10. spacer 1.14|151740|36|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT997873 (Uncultured Mediterranean phage uvDeep-CGR2-KM21-C368, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gaatactttataggaaaattagcaataacatatcta CRISPR spacer aaatactttatagaaaaatttgcaatagatgattct Protospacer .************.****** ******. **..
11. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694478 (Marine virus AFVG_250M504, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
12. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694270 (Marine virus AFVG_250M505, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
13. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694656 (Marine virus AFVG_250M501, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
14. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693919 (Marine virus AFVG_250M503, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
15. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694712 (Marine virus AFVG_250M502, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaacaaaaaactaaagaagaaaaaatgaa Protospacer *************** ***** **. **. .
16. spacer 1.36|153201|37|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048677 (Lactobacillus phage LpeD, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aaagaaataaataagcaaaagtataaaaaaagaaaaa CRISPR spacer tatcaattaaataagcaaaaggataaaaaattatccg Protospacer * ** ************** ******** * .
17. spacer 1.38|153334|34|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018263 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid8 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aaaataaacaaaaaaataaagcaggcttaacctg CRISPR spacer aaaataaccaaaaaattaaagcagttggaggtac Protospacer ******* ******* ******** . *. .
18. spacer 1.43|153668|38|NZ_CP047602|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693779 (Marine virus AFVG_250M346, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
tggtaaagttacagcaataaatggttcaaatattactc CRISPR spacer aggtaaagttactgcaacaaatggttcaacatctgtaa Protospacer *********** ****.*********** .*..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3906 : 65251
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047602|3906:65251|DBSCAN-SWA CGTGATAGAAGATACTATTGCTGCGATTTCGACTCCAATAGGTGAAGGTGGTATATCCATCATAAGGATAAGTGGCAGTGATGCGATAAAAATTGTTTCTGGTATCTTTAAATCCAAGCGAAACGTGGATTTGAGGAATGTTAAGAGTCATACGGTTCATTACGGTTTTATTTACGATGCGGAAAATGATGAGATATACGATGAAGTTTTGGTAAATGTCATGAAAAGCCCTCATACTTACACAAAGGAAGATGTGGTAGAGATAAATTGCCACGGCGGCTATATTCCTTCTAAAAGAATTTTGGAGCTTGTACTTAAAAATGGTGCAAGGCTTGCTGAGCCTGGCGAATTTACAAAAAGGGCTTTTTTAAATGGAAGATTAGATATATCTCAGGCGGAAGCTGTCATAGACATAATAAGGTCTAAGACAGATCTGTCTAATAAATACGCTTTGATGCAGCTTAACGGAAGCGTCAAAGAAAAGATCACAAAGATAAAGAATGACCTTGTGGCACTTATTGCTCATATATTTGCCCTTATGGATTTTCCTGAGGAAGATGTGGAGTTACTTAATGATGGTGAGCTTATAGACGGCATTAACAATTCTATCAGAGAAATTGATGAGATACTTAAAACATCTGAAAAGGGAAGGATTGTAAGAGAAGGGCTTAACACAGCAATAATTGGGAAGCCTAATGTAGGCAAATCTTCACTTTTAAATGCACTGTTAAATGAAAATAGAGCCATTGTGACAGATGTGCCTGGCACAACGCGGGACATCATTGAAGAACATTTAAGCATAAAAGGCATACCTATAAATCTCATAGATACAGCAGGCATAAGGCAGACTGATGAGATCGTGGAGAAAATTGGAGTCGAAAGAAGCAGAGAAGCTATAGACAAAGCTGATTTGATAATATTCGTCTTTGATAATTCACGGCCTATAGAAAAAGATGATTATGAGATACTTAAATTGATTGAAAATAAGAAAGTTTTGTATATTTTGAATAAGATCGATCTGCCTTCTGCGATTGACATGGATGAAGTTTATAAGTTATCGGGTGGAAGGTATGTAAGATTGTCGTCTGTCACAAAAGAGGGGTTAGAAACATTAGAAAATACTGTATACAATATGGTCTTGTCTGATGGTTTGTCACGCGACGAATTTCTTCTGACAAACATGCGACACAAGGATGCACTGATTAAAGCTAAAGACAGTTTGATGTCATGCCTTAAGACGATAGAAGGCGGTTTGACGGAAGATTTTGTATCTATCGATTTAAACTCTGCGATAGATCATTTAGGCTTGATAACCGGTGAAACTGCAAATGAAGATTTAATCAATGAAATATTTGAAAGATTTTGTGTTGGAAAGTAGGTGGTTGAATGATATACAATGCTGGTGTATATGACGTAGCTGTAATAGGTTTAGGACATGCTGGATGTGAAGCGGCTTTAGCCACTGCACGGCTTGGATTAAAGACAGTCGCTTTTGCCATAAATTTAGATTCTATCGCTTTGATGCCATGTAATCCTGCCATAGGCGGACCGGCTAAGACTAACCTTGTTAGAGAGATTGATGCACTTGGTGGACAGATGGCTATAAACACGGATTTGACATTAATACAGGAGAGGACTTTAAATACCAGTAAAGGTCCTGCAGTAAGAGCTTTGAGGGCTCAGTCGGACAAAAAAAGGTATCAATTCAACATGAAGTATACGCTGGAAAAGCAAGAAAATTTAGACATCAAGCAGGCAGAAGTCGTCGATATAGAGGTTGAAGATGGACAAGTCAAAAGTGTCATTACAAAGACAGGTGCAAGGTATCTTTGCAAATCTTGCATTGTTACGACTGGTACTTATTTAAGAGGTAGGATAATCATAGGTGATGTAAGCTACAGCGGTGGACCAAACGGATTATTTCCAGCCAATGAGCTTTCTAAGTGCTTTGAGAGGCTTAACATCAGATTGATGAGGTTTAAGACGGGTACGCCAGCGAGAGTTGATAAAAAGTCTATAAATTTTGATGCGATGGAGATACAGCCTGGCGATGACAAGATAACGCCTTTTTCATACATGCACGACGAGATAAATGTTGAACAGATTCCTTGCTGGCTTACATATACAAACGAGAAAACCCATGAAGTGATAATGAGAAATATAGATAGATCTCCTCTTTACAGTGGTGAAATTAAAGGTGTTGGACCAAGGTATTGTCCATCTATTGAAGATAAGGTGGTCAAGTTTCCTGATAAGTTGAGGCATCAGCTTTTTATAGAGCCAGAGGGAAGGGACACAAATGAAATGTACGTGCAAGGCATGTCATCAAGCATGCCTGAAGATGTCCAGATAGAATTTTTAAGAACAATTAAGGGGTTAGAGAATGTCAAAGTGATGAGGCCGGGATATGCTATTGAGTACGACTGCATAGATCCTACTCAACTAAAACAGTCTTTAGAGTTAAAGACAATCTCAGGGCTATTTTTTGCAGGTCAAGTAAACGGCACGTCTGGATATGAGGAAGCTGCTGCACAAGGGCTTATGGCAGGCATAAATGCTGCTATGAAGCATTACAACAGGGAGCCGTTTATTTTGGATAGATCTGAAGCGTATATAGGTGTATTGATCGATGATCTTGTAACAAAAGGAACAAATGAGCCATACAGGATGTTGACGTCAAGAGCGGAGTACAGGCTTATTTTACGGCAGGACAATGCTGATTTTCGATTAACCGAAAAAGGAAGGCAGATAGGATTAGTCGATGATGAAAGATACAATAGATTTTTAATGAAAAAAGCGCAGTACGAGAAAGAGATGGAAAGATTGAAAAACACCATGATAACGCCAAGCCACGATGTCAATGAATATTTAAAGTCAAAGGGAAGTTCACCTATCGTCACAGGAATAACCATGTACGATTTGCTTAAAAGGCCTGAGATAGATTATGTTTCATCGAAGGTGATTGATTCAGGCAGGCCGGATGACATTAGAGATGATGTGGCTTTTCAGATCGATATAAATATAAAGTATGAAGGTTATATAAAGAAGCAAATGGAGCAAGTAGAAAAGTTTAAAGCGTTGGAGAATAAGAAGATTCCATCTTGGATAAATTACGATGATATAAAAGGGATAAGCATTGAAGCAAGACAAAAATTGAAAAGCATCATGCCTACATCTGTCGGTCAGGCATCAAGGATCTCCGGCGTTTCACCAGCAGACATTTCTGTTATATTAATTTATTTGCAGTCGAGGAGATAGGCATATGAACAGAGAATACATTGATATACTTATAAGCGGTGCTAATGATTTAGGGATAGAACTCAATATGTTCCATGTGGAACAATTTTTAAAGTACAATGATCTCCTTTTAAAGTGGAATGAGAAAATGAATTTAACGGCCATTACAGAAGAAAGGGAGATCATCATTAAGCACTTTTTAGACAGTTTAACTGCATTAAAATGCAATGTAATAAAAGGCACTGAAAGGATAATTGACGTAGGCGCAGGTGCTGGCTTTCCATCGGTGCCTCTTAAGATTTTATTTCCATCATTGAAGCTTACTATAGTCGATTCTTTAAAGAAAAGGACTGTGTTTTTAAACGAATTGGCTAGCCATCTTAATTTAAATGATGTTGAAATCATACATGGAAGAGCGGAAGACTTAGGTAAAGATATTGATTTCCGCGAAAAATACGACATCTCATTATCGAGGGCTGTTGCACAGCTAAATGTGCTAATAGAGTATTGCATACCTTTTACAAAGGTTGATGGATATTTGATAGCGTATAAGGGGTCTAATGCAGATGAAGAAATAAATGCATCGCAAAATGCTTTGAATGTTTTAAGGTGTCAGATAGAAAATGTCATTGACGTTACATTACCTTACACTGATATTCATCACAAACTTGTCTTAATAAAGAAGTTGAGTGTTACTGACGATAAATACCCGAGAAAGCCAAAATTAATTGAAAAGTCACCACTTTAACGAAAGGATAATGATTTATGAGGGATTTTAGGGCTTGTCTATTGGTTTCAAGAGGCGTTATCATTAATGACGGCAAAGTTCTTCTCGTAAAGCACCAGACGGAAGATGAGGTAGGCTGGGTCTTTCCAGGAGGTCGCGTTGAAGAAAATGAATCGCTTGTAGAGGCATTGGTGAGGGAATGCAAAGAAGAAACAGGGTACGATGTCGTGGCTGATAGCGTCTGTTATCTGGAGGAATACCTTATTTATTACGCTACATATTTTAAATGCAGAATTGTAGGTGGTGATTTGAAATTAGGTTCTGATCCTGATATGCCTAAAGATCAGCAGGTGATTAAAGACGTAAAGTGGGTTGACATATCGCAGTTTGATTGTTTGGACATATATCCAGAAGGGCTCAAAAAGATGATCATGGATGGAAGCATTAAGCATCAGAATTTAAAACTGCCCCAAATATACAGATAAAAAATTTTTGATAAAATATTAGGATAATAATGGAATTATAGGAGGAATTTTGATATTATTGTAGAATATATATAATATAATCTATTGTTTTACGAAGAGGTGTTTTTTATGGTGTCAATAAAACAGCAGGAAATCAAATACTTGCCGATAGACCTTATTAGGCCAAATCCATATCAGCCTCGCAAAATCTTTGACACAGCTAATCTTCAAGAGCTTTGCGATTCTATAAAAGCTTATGGCGTTATACAGCCAATAAGCGTGAGAGTCGTAAATGGCAATTCGTATGAGCTTATATCTGGAGAAAGACGTCTAAGAGCATCAAAGTTGGCGGGCCTTACGACAATTCCTGCTATAGTGTTTGAGGCGTACGATGAAGATTCTGCGGTTATTGCTTTAATAGAAAATTTACAGAGAAAGGATCTTAACTTTTTAGAGGAAGCTGAAGGGTATTACAACCTAATAAACGACCACAATCTTACTCAAGAAAAACTGGCTGTTATGCTGGGGAAAAGCCAATCTACAATAGCTAATAAGTTGAGGCTTTTAAAGCT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58 | Bacillus_phage(27.78%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
77386 : 108741
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047602|77386:108741|DBSCAN-SWA 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27 | Bacillus_phage(44.44%) | transposase,integrase,protease | attL 81139:81157|attR 84421:84439 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
667613 : 679018
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047602|667613:679018|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047602|667613:679018|673242_673734_+|WP_014759409.1|DBSCAN-SWA MAKVAVVMGSDSDFPLMKKALDVFKQFGIDYDVRVISAHRTPDVAHDFAKNAAYRGYEVIIAAAGKAAHLAGVMASMTPLPVIGVPVKSSTLDGLDSLLSTVQMPQGIPVATVAIDGAYNAALLAVEILGVKYPEIMEKVVEYKNNLAEEVIEKDKKLQGEIL >NZ_CP047602|667613:679018|670969_671278_+|WP_084214979.1|DBSCAN-SWA MMHDIRYLPLASRDLSNIVSYIVDELKAPNAAMDLINELDTSISRLAQFPYSCKVYQPEKPLKNEYRVLPVKNYLVFYVVREDVVEIHRIIYAKMDLAKLIK >NZ_CP047602|667613:679018|675864_676875_+|WP_014759406.1|DBSCAN-SWA MDYKDAGVNIDEGNRFVEMIKPIAKATIKGGVLNGIGGFGALYQLTDYKNPVLVSGTDGVGTKLKIAFMMKKYDTIGVDLVAMCVNDIIVSGAKPLFFLDYFATGKLQSDVGIEVIKGIAAGCSEAECALIGGETAELPGMYNEGEFDLAGFAVGAVEKDEIIDGRNIEVGDVIIGLASSGIHSNGYSLVRKVLFDVGKMSTDDYIEEYGLSLGEVILKPTRIYVKAFKSLKGINIKGMAHITGGGFVDNIPRTLKDGVSARIDKKSWDVPHIFSLIKDIGNIDDIEMYRTFNMGIGMIIIVPNHQCDDAVSRLKAAGEKPFIIGEIVNGEKEVLL >NZ_CP047602|667613:679018|673733_674441_+|WP_014759408.1|DBSCAN-SWA MEKLSMLYEGKAKKVYKTTDEDYYIIEYKDDATAFNGIKKGTIQNKGVLNNEISAILFELLEKEGIPTHFVKKLSDREMLVKSVEIYPIEVLIRNYAAGSISKRLGIEEGTKLKRTVLEFCYKNDELGDPFINEYHIEAMELATKEEVDTIKEYSFKINDILSKFFTSKNIILVDFKLEFGKSKDGIVLADEISPDTCRFWDSVTKEKLDKDRFRRDLGNVEGAYVEVLNRLEKQ >NZ_CP047602|667613:679018|671714_673163_+|WP_014759410.1|DBSCAN-SWA MVKNNEKRGFLDNFFKLKENGTTVKTEVIAGITTFITMAYIIFVNPSILMQAGMNAKGLLGTQAVKAGLSIANDPVIGAVFVATILSSVAATLVMGLFANVPFALSAGMGMNAFFTFYVVLTLHYSWQAALSLALISGIINIIITATKLRILIIKAIPQSLRSAIGAGIGLFIAIIGMENGGIVTKSSDTLITLGNFKDPGVILTVIGIAIIAILMSRGVKGAILIGIIATTIIGIPMGITNVSNLKTIVQMPPSLAPTFMKLDFAGLLKPGTDGNIISILTGLITVILAFSLADMFDAIGTLIGTGTKTGIFKEDDFEKSNGGFKTKFERALFADAIGTTLGSFLGTSTITTYVESASGISEGGKTGLTSTVVAILFLVSLFFAPIIGIVPSQATAPALIIVGALMIGSVTKVNFEDFSEAFPAFMTIAFMPFTYSISNGIAAGFIFYPITKIVVGKAKEVHPLMYIIGLLFLLRFAFFMG >NZ_CP047602|667613:679018|669080_670619_+|WP_014759413.1|DBSCAN-SWA MGINREVILILDFGGQYTQLIARRIREANVFCEIVPYNIKPEEIDKRQPKGLVLSGGPASVYTENAPMCDEGIFKLKYPILGICYGAQLMTMIQGGKVAEAPVREYGKTDVVINNNIPLFKGIEKETSCWMSHTDQIELPPKNFKVVASTANCPIAAIANVEGKQYAVQFHPEVVHTPRGTEIIRNFLFEVCDCSADWTMDSLIEQTVKEIRQKVGNDKVVCALSGGVDSSVAAVLVNRAIHDQLICIFVDNGLLRKNEAEKVVDTFKNNFDMEIIKVDAKDRFLEKLKGVKDPEEKRKIIGNEFIEVFKEEAKKIGDVKYLVQGTLYPDVIESGSPVASTIKSHHNVGGLPEDVGFELIEPLRMLFKDEVRQVGRELGMPDEILNRQPFPGPGLAVRILGEVTEEKLNILREADSIVLREMKKYGWYNNVWQSFAVLPDIKSVGIMGDDRTYAYPIILRIVESNDGMTADWVKMPYDILEDISTSIVNEVYGVNRVLYDITSKPPATIEWE >NZ_CP047602|667613:679018|677491_679018_+|WP_014759404.1|DBSCAN-SWA MSKRALISVSKKDGIVDFAKKLDEMGYEILSTGGTYRLLKDMGINAVKVSDVTGFPEILDGRVKTLHPKIHGGLLAIRDDENHRRQLEENGIKPIDIVAVNLYPFKETILKDDVTLEDAIENIDIGGPSMIRAAAKNYRYVTVLVDPDDYDKVVEEIKEYGNTKEETRFYLAMKAFGHTASYDSLIYNYLLDKNGVEFPDTITFSFEKSQDMRYGENPHQKAAFYKNSLKSFGISECVKLHGKELSFNNINDANAAIELLKEFDEPAAVAVKHTNPCGVAVADNIYDAFKKAYECDPVSIFGGIVAFNRKLDANTALELSKIFLEIIIAPDFEEEALAILEKKKNVRILKLSDGYVKEYDLKKVEGGILVQEKDEVDLYDDKLTVVTKNAPSERELKDLRFAWKVVKHVKSNAIVLAKDGMTVGIGAGQVNRIWPTEQSIRQAGEKARGSVLASDAFFPFPDVVEEASKAGITSIIQPGGSINDDASIDAADKAGISMIFTGIRHFKH >NZ_CP047602|667613:679018|670692_670980_+|WP_014759412.1|DBSCAN-SWA MPYIRPVSDLRNNFADISRVVHETGEPVFLTKNGYGDMVVMSMEAYERKLFESEIYFKLKEAELEAQITKKRYSHKEIFDELKAKISDRMKSDNA >NZ_CP047602|667613:679018|667613_669068_+|WP_014759414.1|DBSCAN-SWA MADKFVKEGLTFDDVLLIPAKSDVLPKEVDTKTRLTNSIMLNIPLISAGMDTVTESSLAIAIAREGGIGIIHKNMPIERQALEVDRVKRSEHGVITNPFYLSPEHKIQDAVELMERYRISGVPITVDNKLVGIITNRDIRFESNLDRPIKEVMTKENLVTAPVGTTIDEAREILKKHKIEKLPLVDDDNNLKGLITIKDIEKAVEYPNSAKDSRGRLLVGAAVGVSADVMERVQALVDANVDVVVVDTAHGHSVGVLNTVEKIKNRFPDLQIIAGNVATAEATRDLIERGADCVKVGIGPGSICTTRVVAGIGVPQITAIYDCAEEADKYGIPVIADGGIKYSGDIVKAIAAGASTVMIGSLFAGTEESPGEVEIYQGRSYKVYRGMGSISAMKSGSSDRYFQEGMKKLVPEGVEGRVPYKGPLKDTVYQMIGGLRAGMGYCGVHNIEELRTKTKFIKITNAGLTESHPHDIIITKEAPNYSIK >NZ_CP047602|667613:679018|674450_675848_+|WP_014759407.1|DBSCAN-SWA MIETVKLKEECGVFGAFSLNNPIHHHIYYGLQALQHRGQESAGIAVLKGSYVNCIKGMGLLLEVFSKENIDDLEGNVGIGHVRYSTTGNSDACNAQPFVANFSSGYMALAHNGNLINALELRKELEEEGRILQTTSDSEIILHLIAKYYRNGLVESLVKTIEKIKGSYALVILMEDKLIGIRDKNGIRPLCIGVKDGNYYLSSESCALDVIGAELIRDVEPGEIVIIDKNGLNSVKVDTFEKKMPCVFEYIYFSRPDSVLEGVSVYKARYEMGKRLAIESSVDADLVVPVPDSGVPASRGYSFQSGIPIGEGLIKNKYIGRTFICPKQKDREIGVRVKLNVLKELVKDKRIVLIDDSIVRGTTMKRLVSLLKKGGAKEVHVRISSPPVKYSCYFGIDTPTKKELVGSYMEVKDIRDYIGADSLSFLSLEGLKESVGLESICAACFDGKYPMEVPKEGSKYLFEKK >NZ_CP047602|667613:679018|676871_677480_+|WP_014759405.1|DBSCAN-SWA MRLLVMASGNGTDFQSIIDGIKSGYINAEIVALISDKEGAYALKRAEMNNIPAYCIPKKKLKDKFYNELANVINEINPDGIILAGFITILNEEIVNKYHNRIINIHPSLIPSFCGKGYYGINVHKAVVDYGVKYTGCTVHFVDSGADTGPIIMQDVVKVEDDDTPETVASKVLKLEHRLLPYAVKLFTEGRLKVEGRKVYIK |
11 | Synechococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
790248 : 829086
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047602|790248:829086|DBSCAN-SWA 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MSFAKRLSELRNEFKLTQKELADKLGVSRGTIGMYEIGQRDPDTDTLLKLSELFNVSVDYLLGNTDIRNPVDEITDAVSDDPELAEFWNELKQREDLKLLFKQTRNLSPKAIKQVMRIIKAIEDEESGE |
57 | Bacillus_phage(22.22%) | portal,capsid,tail,integrase,terminase,protease,tRNA,head | attL 804293:804352|attR 838757:838849 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1383400 : 1393139
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047602|1383400:1393139|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047602|1383400:1393139|1383400_1385224_+|WP_014758727.1|DBSCAN-SWA MNKINLLDDELINKISAGEVVERPMSIVKELVENSIDADSKNITIEIIDGGIPYIKVLDDGCGMNEIDAVLAFGRHATSKIKSTDDLFNIGTLGFRGEALASIAAISKVLLKTKEENSLYGTLINVEGGKILKKAKCGCEKGCSVEVKDVFYNTPARRKFLKRPSTEAMYITDMVAKIALSRPDISFKYIKDKRMEFMTSGNNSVNEVILRLYGDELYSNLIETEYNDEYMNIKIFLCKPSYTRGNRNMQILFVNGRFVKNKIYTTAVEEAYKTLIPVNRYPVVITYLNIDPKNIDVNVHPTKLEVKFSDEKEIFDSIYKSIKNALNRSNLIPAIRHDMFTYTDIPENKVEEKSNPKQLNIIEEESTNKIIEVYPNNKSFISNVKESSEKAYFDYNDVNALKTENTHIENFNTLPDDHDDYKIVGVIFSTYIVVEKNDMIYLVDQHAAHERILYEKFMNMYNNVQGKQTTIPILINIEPGDDVIINENIELFNKLGYKFESFGNNSIILREVPVVLGQPESRQLFIDIIDKLKRDDFNKDINLKEETIIMMACKKAVKAMDSLSKEEISSLFNDLKVTENPYTCPHGRPVIVSIKKYELEKMFKRIM >NZ_CP047602|1383400:1393139|1385234_1386185_+|WP_014758726.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAIPLLIIVGPTASGKSKLSVEIAKFYNGEIISADSMQIYKYMDIGTAKITNEEKQGIPHYMIDIVEPNVKFSVAEYEKMAKSLIDDIFKRGKLPIVVGGTGLYVNSLIYIMNFSEYIGNDDFRSALKNIASVLGNEYLFERLKMVDPKTYSKLHPNDLRRVIRALEVYQFTGIPISVYQELSNKRVNPDYNAVMVGLNYRNRETLYKKIDDRVDTMIKNNLIDEVVNLLKIGYNKYGTSMQALGYKEIIEYLEGKVSLEEAIADLKMKTRRYAKRQITWFKSYETINWFYVDDYSSFEDLEKNIISFLAGKLKFK >NZ_CP047602|1383400:1393139|1386549_1387347_+|WP_014758725.1|DBSCAN-SWA MKIGFIGTGNMGTALINGLINSDFVTANDIYAYDVSYDKLLKLKDELSINISKSNVDVTNECDVIILAVKPNLYDSVLEEIKNDVDENKIIIIIAPGISIDHVKSILKKGKIVRTIPNTPALIGEGITAISYPEDMSSRDKEIVEKIFKSCGEIVEIKENLIDAAMAISSCSPAYVYMFVEALSDAGVSLGLPRDVAYKLSSKAVSGSGSMVLKTGFHPGYLKDMVTSPAGTTIQGVRTLEKYGLRSAVFEAVISSFEKVKGNKQ >NZ_CP047602|1383400:1393139|1388938_1389562_+|WP_014758722.1|DBSCAN-SWA MKDASKISIKQQEIIDFIKSEIKRKGYPPSVREIGKAVGLRSTSTVHGHLSRLEKKGYIRRDPTKPRAIEVLSNDEKYISDVVKLPVIGKVTAGTPILAIQNIEEYYSVPRDLITGYESESFILKVRGESMINAGILDGDYIIIRKQSYADNGDIVVALIEDEATVKRFYKENNHIRLQPENPSMNPIIVDDVMILGKVVGVIRKLK >NZ_CP047602|1383400:1393139|1389585_1390872_-|WP_014758721.1|DBSCAN-SWA MSGNILEEKFNISKDVIFLLEKAENDVKDEFKKVDKIVEKNQYKVLYAMQKNHLSDIHFNGTTGYGYGDIGRDTIEKIYSDIFNAQDALVRPQIVSGTHAISLCLYGVLRPNDELISACGTPYDTLIDIIGKGSNSNNGSLTDLGIIYKEVPLLKNGKIDVEKLIGEVTSKTKMVMIQRSKGYDFRYSLSINDIEFVIKKLKDKKRDIIVFVDNCYGEFTEDLEPTDVGADLIAGSLIKNPGGGLSPTGGYVAGKKELVEKAAYRLFAPGIGKKVGPTLNTNRLTLEGLFFSPLVVGNALKGAIILAKIMEMLGYEVLPKFNELRTDIVQAIRFKTKEELITFIQSIQKGSPVDSHVVPEPWDMPGYDDQVIMAAGGFIQGSSIELSADAPIRKPYTAYVQGGLSYYQVKLSLMIAINNMIEKGFIKI >NZ_CP047602|1383400:1393139|1387343_1387805_+|WP_038068767.1|DBSCAN-SWA MMSIPEVIIYTDGACSGNPGPGGWGAILIYKDTVKEISGYEENTTNNRMELTAAIEALKMLKRPCKVNLYSDSSYLINAFNQKWIDNWLKKGWIKSDKTPVENKDLWLKLLDLSSIHHIKWIKVKGHADNEYNNRCDKLATDEIKKHQISIAK >NZ_CP047602|1383400:1393139|1386227_1386482_+|WP_013788022.1|DBSCAN-SWA MNQKTAINLQDIFLNQVRKEHIAVTVYLINGFQLKGMVKGFDNFTVVLETDNKQQQLIYKHAVSTITPLKPVIFTTTEKDEKQQ >NZ_CP047602|1383400:1393139|1391843_1393139_-|WP_014758719.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNLIKINEMKDHVGEEVTINGWLYNKRSSGKIKFLIIRDGSGFVQGIVVKNEVDENVFELCDKLTQESSISVSGIVRKDERSPFGFELTIKNVDLVQMAFNDYPISLKEHGIDFLLDNRHLWIRTPRQQAILSVRHEVIRAIQEFLNNNDFVRIDSPIITPSTCEGTSDLFQIDYFGENAYLSQTGQLYQEAAAMAFGKVYSFGPTFRAEKSKTRRHLNEFWMVEPEMAFVDHYGNMEVQEKLVEYIVQSVLENCSRELKELGRDLSKLEKIKTPFPRLTYDEAIELLNKNGYEIQWGNDLGSPDETFLSNQFDKPVFITEYPAECKAFYMQPKEDRPEVVLCADLLAPEGYGEIIGGSQRIHDYDLLLKRLKEENLPIDMYNWYLDLRKYGTVPHSGFGLGIERTVAWITNTEHVRECIPFPRTLSRIRP >NZ_CP047602|1383400:1393139|1387896_1388880_+|WP_014758723.1|DBSCAN-SWA MFISTKDNLELPPILEEFLNYFSTIKARSPNTVKAYLYDLILFFRFIKVRKNLCSDSDFDNIDISDVDISLIESIDLNDLYAFLSFVTHERSNTPPARARKVASLRSFYNYLYAKRKVITKNPALELESPKLGIRQPVYLTLDESVKLLNSIDGEFKERDYAIITLFLNCGLRLSELANINISDIKDDKLTVIGKGNKQRTVYLNDACINAINDYLKVRPHDGVKDKKALFLSKRLQRISIKTIQYIVKKHLKDANLDGKKYSTHKLRHTAATLMYRYGKVDIRTLQRLLGHSNVSTTQIYTHVDDSQLRDAVSKNPLSELNIDNKN >NZ_CP047602|1383400:1393139|1390876_1391767_-|WP_014758720.1|DBSCAN-SWA MSIWSVNFENYKIDKKAKSDDNKNIERDKSLEIEALKELNSLIGLNKVKQIINELYALEQVQIKRKNAGLVTDPIVLHMVFKGNPGTGKTTVARILGKLLKGIGVLNKGHVVEVERADLVGEYIGHTAHRVQENVKKALGGILFVDEAYSLARGGEKDFGKEAIDTLVKAMEDYKDQFVLILAGYRDEMEYFLNTNPGLRSRFPIQIDFPDYTIDELLRIAELMTKNRQYVLTDSAKRKIMKVLINDNTTREIGNARLVRNIIERAIRKQAVRIINKKTITKDDLMIIDSIDIRED |
10 | Wolbachia_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2468326 : 2478448
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047602|2468326:2478448|DBSCAN-SWA TTTATTGTGCATTTGAACTGCTCATAAGCTTTACTTTTGTACTCATGGTTCTGCCATTTCTCCAGAATGTAACAGTTATCGTGTCGCCAACTTTATGCTTAGATATTATGCTTTGCAGTGCATCAAAAGTCTGTACTTTTGTTCCATCTACTGCCGTTATCACATCTCCTGCTTGAAGTCCAGCTTCATCAGCACCGCTTCCTTGCTGTACTTGCGCTATATAGAGTCCAACCGGTATATTGTACTGCGCTGCATCTTGTTGGGTTACTTCCTGTACGCTTACACCCATCATTGGTCTTTCTACATATCCATGTTTTATCAAGTCATCTATTATAGGTTTTGCTTCATTTATCGGAATCGCAAATCCCATTCCTTCAACAGGTGTGCTTTGGCTCTGGAACATTCCAAATGGATCTTGAGTATCTGAACCACCTGTTGATGTCAACTTCACACTTGTTATCCCAACAACTTCACCATTGCTGTTGACCAAAGGTCCACCGCTGTTACCAGGATTTATAGCTGCATCTGTCTGAATGAGGTTAACTGGTCCGTAATCGCTTTGAAGATTTCTGTTAAGACCGCTTATTATGCCTGCTGTAACTGTACCTGCAAAGCTTTCGCCGAGAGGATTTCCTATGGCAACTGCCAGATCTCCTACTTCAAGCTTTGACGAATCACCCAATTTTGCCGGAATCAAATTTGTAGCATTTATCTTCAATACTGCCAAGTCAGTCTTTGAATCCTTTCCTATAAGCTGTGCAGGGAACTTTCTGCCATCAGATAAATTTACTGTTATCTTAGAAGCTCCATCCACAACATGATTGTTTGTCACTATATAGCCTTGTGAGTCGATGATTATTCCTGAACCACTGCCTTCAGGCACCAGTGCGCTGCCAAATCCATTGGAATATGATACGCTTGTATCAATTCCAACAACGGAAGGACTTACAATTTTAGCTATATTGGCAATCAAGCTGTAATTGTTGTTGTCTGATGATGAAAGTGGCAAGTACCTATTTATAACCTGTGTCTGTTGCCCCAAATTAGTGTACTTCATGATTCCTGCCACAGTTCCGCCACCTATAAGTGCTGCAATCAATGCAACAGCCACAAATGAAACCAGCATCCTTCTTCTAAATCTTTTTACCATCTTGCCTAAGCTTTTTTTGTTGCTTCTAAATTCTACCCTTGGATTCGTATAGGTTCCACTTTCTTCAGCACCATATGTTGCTTTAATTTCTTGAGTGTCATCTATATTTTCGCCTTTTATGTCATCAGAACCTAAGGCATCGTCAGTTCTAAAATTATCTATTTCATTTTCGCCTATATTTTTGTTTTGTTCATTTTCAAAATCCATATTCATCATCCTCCTTATCATCTCTCATGATTACATTATAAATTAGAATTTTTAATAAACTGTGAACATATTGTAAATTATTTTTAATAATTTTATATGAGAAGAAAAATAAATGCAGCCCGAGGGGTGGCTCGAGCTGCTATAATAAGGGAGGTCAAGGAGAGGCTTTTCTCTCTCTCGATTATTATTATAACCTTAATTTATGAATAAAGTATGAACAAATTGTAAAAATTTTATTTTACTGCTTAACTTTTTTCGCCCTCAATGTAAAAGTAAATGTAGTTCCGTCTGCATCACTACTGGTAGCCCATATATCCTCATTGTGAAGATTTATGATGCTTCTTACTATATAAAGCCCTAATCCGACACCAGGGCTGCCACTTCTGGCCTTGTCAACTTTGTAAAACCTGTCCCATATATGGTCAATTTCATCAGGCGGTATCGTCTTGCCCTTATTTTGGACTTTTACATGGACTTTTTCCTTCACCTTTTCTGTAGATATGTGTATATAACCACCAGGATTTGAAAATTTAATTGCATTATCTATCAAATTAGTAAGCACTTGTTCTATCTTGTCTTTATCTGCTTCTACAATTTCTTTGTCACTTTCAAAGTCCACCTTAACCATGAGATCCTTATCGCTTATCCTTGCTTCCATCTTTATTATGGTCAGCCTTATAAGCTCGTTTATATCAAATTCTGATATATTTAAAGGGAAAGCCCCTGATTCCATCTTCGTTATATCCAAAAGTTCAGATATTAATCTGGACATGCGCCTCGTCTCTTTTTGAGCTATCTCAAGATAAAATTTGGATTTCTCTGCAGGTATAGTCCCATCCACGACTCCATCTATATAGCCTTGAATGGTTGACAAAGGCGAGCGAAGCTCGTGTGAGACATTAGCCACAAACTCTTTTCTGGCATTATCCATCCTTCCCAATTCACTTGACATTATGTTGAAGGACTTTGCCAAGTCTCCTATTTCGTCGTCATCTACAACGTTTATCTTTGTTGAAAAATCTCCTTTTGCCATTTTTTCTGTTGCAATGCTCATCTCTTTTAAAGGATTAGAGATTCTCTTTGATGTATAAGAAATAAGTATAAATGCTATTATTATGGATATGGCTATGGCTAAAAGCATTATGAAAAATATGTCCATCAAGGTTTTCTGCATCTCTACAATAGGAGCGTGCATGAATATGGCACCTTGAATCTTCCCAGCCAGTACCAGCGGAAAACCAACAGTCAAAACAGGCTGCGTAAATCTGCCGCCAAAATATCCCCTTCTTACAATAGTCTCACCTTTTAAAATGCTTTTGATGTCATCTTTGCTTAATGTGACACCTGTCCAATTCTTTTCAAAGTTCTTCGACTGTATATATATGCGCCCGTCTGTGCTTACAACCCATATCGATGCATTTATAAGCCTGTCAATGACATTCAAATCTTGATTAAGCCTGTCAATGTCTATGTCCCCTATGAGGTAATCGTTCAAAACGGTATTTATTTGCTTGCCTTCTTCTACCATTATCTTTTCTTTATCGCGAAAATAATAATTTTCAAACATGATGTAAAAAAGCACGGAAAGTATAGACATCGTAAGCAGTATTATTGCAATGTTTGTGAAAAGCAGCCTTCTAAAGAGCCTATTTCTGCTCAAATCATTTCACCTCGAATTTATATCCCACACCCCATACAGTTGTTAGTTTCCAGTTCGGACCATCCCCTATTTTCTCTCTCAAACGTTTTATGTGTACATCCACAGTTCGACTATCGCCCATGTACTCGTATCCCCATACGTTTTCTAACAGTTGATCTCTTGTAAAGACCTTATTGGGATGAGTGCACAAAAAGTAAAAAAGCTCCAATTCCTTCGGTGTAAGGTCTACATTTTCACCTTTGTATTTCACTTTGTACTCGCTTAAGCTTATAGAAAGATCAGGATATGTGACACTGTCGCCATCATTTTCCTCATGCTCATACCTTCTAAGCACAGCTTTGACACGAGCAACCAATTCTTTCCCATCAAAAGGCTTTACGATGTAATCGTCGGCGCCTATCTCCAGACCTAAAACTTTGTCAAATGTATCGCCTTTTGCTGTAAGCATTATAATAGGCACATTCGTAAATTTCCTTACTTCTTTGCACAGCGTCATTCCATCAATGCCGGGAAGCATCAAATCAAGTATAATAAGCAAGGGGAGTTCTTCTTTTATTTTGTTTAATGCCGTAAGCCCGTCACTAATCTTCACTGTTGCAAAGCCTTCCTTTTCAAGATAAAGTGAAATTATCTCACATATATTTCTATCGTCGTCAACTATATATATTTTTTTGTTTTCGCCCATATAAACACCCCTCTTTTTAAGACTATTATACATAATTGATTTAAAAACCGCAACGATAGATGTATATATAAAAAAAGGCACCTTAGTGCCTATACAAACAATTTGCTTACAGACATGCCTTCATATATTCGCATTATGGCTTCCGCCAGCAATGGAGCTACAGTCCTTACCTTTATCTTGCTTATCTTCTTTTCTTCAGGAAGTGGAATAGTATCTGTTATAACCAATTCTTTTATCGGAGAATCCATCAACCTTTCTATCGCAGGACCTGACAAAACACCGTGTGTAGCACACGCATACACCTCTTTTGCACCATTGTCGATAAGCGCTTGCGCTCCCTGCTGCAGCGTCCCTGCTGTATCAATAAGATCATCTACCAATATAGCTATTTTACCTCTTACATCACCTATGAGATTCATTATCTCTGCTACATTAGCCTTTGGCCTTCTCTTATCTATTATGGCTATAGGCGCATTAAGTTTTTCCGCAAAATTCCTTGCTCTTACTACACTTCCGTGATCTGGGGATACAACCACCACATCTCCGCCCAAATCCTTTTCCATGAAATATTTCGCCAGTATTGGACCGCCAAGAAGATGGTCAACTGGTATATTGAAATATCCTTGAATCTGTGCCGCATGAAGATCCATTGTGAGAACTCTGTCGGCACCTGCAACTGTAATAAGATCAGCAACCAGCTTTGCTGTTATCGGATCTCTCGGTTTTGACTTCCTATCTTGTCTGGCATAACCATAATAAGGTATGACAGCAGTTATCTCGCCAGCAGATGCCCTTTTAAATGCATCTATCATTATAAGAAGTTCCATAAGGTTATCATTTACTGGTGAACACGTAGACTGAACGACAAATACATTTGCACCTCTTATGCTTTCTTTGATCCTTACGCTTATCTCACCATCGCTAAATGTACCAACTTCTGAATCACCTAATGTAAGTCCTAAGTTTTCGGCAATCTCTCTCGCCAATTCAGGGTTTGAGTTGCCACTAAAAATCTTTATTGCTCCTCCGTGTCTTACCACTCCTATAGTCCTCCTTTTTTTCTTCTTTCTTCTACCCATCCTTCTTTATTCGTCTGGCGACATCTTGCTATCGCCAATGCCCCTTCCGGCACTTCGTCTGTTATGGTTGAGCCTGCAGCTATAAAAGCATTATCGTTGACTTTAAGAGGCGATACCAAGTTTACATTGCATCCAACAAAAACATCATCGCCTATGATGGTCTTGTGCTTGTTCTTGCCATCGTAATTGACGACTATAGAACCACAGCCCATGTTAACG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CATCGCCTTAAAAACTCTTTCTTTCGTCTCTTTGCTTATCCTTGGATTATCCGCAATAACCCTTGATACAGTCGAAGGCGCAACATGTGCTCTTTGTGCAACATCTTTTATAGTTACATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047602|2468326:2478448|2473069_2474443_-|WP_014757664.1|DBSCAN-SWA MDNFVTLILAAGLGKRMKSKHPKVIHKVCGRPMVEWVVKSAKEAGSQDVVVVLGHGANEVKNVLGDSVKYAYQEKQLGTGHAVMVSKDLLPDTGNIMILTGDTPLITSETLKKFYDFHLKEQNSITILSSFFDIPDGYGRIVRDSNGNVLKIVEDKDANDVEKGIHEINSGMYIFNSDYLRKSLQHIGNNNAQGEYYLTDAVEIVIRLGGKVGAYQASNEEIMGVNTRVQLKDAEKVMRKRINERLMLDGVTIIDPDSTYIGPDVMIGMDTIIYPGTMIEGKTTIGEDCEIGPNSYIIDSEIGNGCKIVFSMITESKLHNNIKLGPFAQIRPESVIHDNAKLGNFIEIKKSVIGEGTKVPHLTYIGDAEVGKRVNMGCGSIVVNYDGKNKHKTIIGDDVFVGCNVNLVSPLKVNDNAFIAAGSTITDEVPEGALAIARCRQTNKEGWVEERRKKGGL >NZ_CP047602|2468326:2478448|2476011_2477409_+|WP_014757662.1|DBSCAN-SWA MTIDIENFKRVHFIGIGGISMSGLAHIMLNSGHIVTGSDIKDSHIIKKLRNEGAIINIPHSASNVDGADLVVYTAAVKEDNPEMIRSRQLNIPTIDRATLLGEIMKKYKYGVGVAGSHGKTTTTSLISVLLEEMNYDPTVLVGGEVDIIGGNVRVGNSEYFITEACEYTDSFLKFYPYIAVILNVDSDHLDYFKNIDNIKQSFTQFANLVPNDGFVVACGDDPNTMSVLKDVNRNIITFGIDSNCTWNAKNIKFDEKGFPSFDVYYNGTFVERFELSIVGKHNILNALATLSVCHLLGVDIKKCPDVIKKFKGTHRRFEFKGTIDGAIVIDDYAHHPTEIKATLSSALNYPHNRIICVFQPHTYTRTYSLLNDFAASFDDADITIITDIYAAREKDTGIVRAEDLVNLIKNRGNEVYYIKDFTDIVDYLKNTIKSGDLVITIGAGDVYKVGNMLLSFNKKAAIGA >NZ_CP047602|2468326:2478448|2472116_2473067_-|WP_013786968.1|DBSCAN-SWA MVRHGGAIKIFSGNSNPELAREIAENLGLTLGDSEVGTFSDGEISVRIKESIRGANVFVVQSTCSPVNDNLMELLIMIDAFKRASAGEITAVIPYYGYARQDRKSKPRDPITAKLVADLITVAGADRVLTMDLHAAQIQGYFNIPVDHLLGGPILAKYFMEKDLGGDVVVVSPDHGSVVRARNFAEKLNAPIAIIDKRRPKANVAEIMNLIGDVRGKIAILVDDLIDTAGTLQQGAQALIDNGAKEVYACATHGVLSGPAIERLMDSPIKELVITDTIPLPEEKKISKIKVRTVAPLLAEAIMRIYEGMSVSKLFV >NZ_CP047602|2468326:2478448|2471343_2472027_-|WP_014757665.1|DBSCAN-SWA MGENKKIYIVDDDRNICEIISLYLEKEGFATVKISDGLTALNKIKEELPLLIILDLMLPGIDGMTLCKEVRKFTNVPIIMLTAKGDTFDKVLGLEIGADDYIVKPFDGKELVARVKAVLRRYEHEENDGDSVTYPDLSISLSEYKVKYKGENVDLTPKELELFYFLCTHPNKVFTRDQLLENVWGYEYMGDSRTVDVHIKRLREKIGDGPNWKLTTVWGVGYKFEVK >NZ_CP047602|2468326:2478448|2468326_2469682_-|WP_014757667.1|DBSCAN-SWA MDFENEQNKNIGENEIDNFRTDDALGSDDIKGENIDDTQEIKATYGAEESGTYTNPRVEFRSNKKSLGKMVKRFRRRMLVSFVAVALIAALIGGGTVAGIMKYTNLGQQTQVINRYLPLSSSDNNNYSLIANIAKIVSPSVVGIDTSVSYSNGFGSALVPEGSGSGIIIDSQGYIVTNNHVVDGASKITVNLSDGRKFPAQLIGKDSKTDLAVLKINATNLIPAKLGDSSKLEVGDLAVAIGNPLGESFAGTVTAGIISGLNRNLQSDYGPVNLIQTDAAINPGNSGGPLVNSNGEVVGITSVKLTSTGGSDTQDPFGMFQSQSTPVEGMGFAIPINEAKPIIDDLIKHGYVERPMMGVSVQEVTQQDAAQYNIPVGLYIAQVQQGSGADEAGLQAGDVITAVDGTKVQTFDALQSIISKHKVGDTITVTFWRNGRTMSTKVKLMSSSNAQ >NZ_CP047602|2468326:2478448|2475035_2475854_-|WP_014757663.1|DBSCAN-SWA MNSYKRYERISVILKILTENPNKLYNLNYFMDLFNVAKSTASEDMDILQGILEKFGLGKIKTVAGAGGGIKYIPINNIDNYREFMIDICNKLQDPKRIIPGGFLYTADIIYSPQYANKIGEILSYPFQDKDVDAVVTVETKGIPIAIMCAKALNVPLVIIRQDNRVTEGSSVSINYVSGSQKQIKAMSLSRRSLERNSKVVLIDDFMKAGGTIKGMIELMNEFDAEVIGAGVMISTKEPENKVVKNYFSVFTLVDMNEEKETVKMEISDWLK >NZ_CP047602|2468326:2478448|2477434_2478448_-|WP_013786963.1|DBSCAN-SWA MNVTIKDVAQRAHVAPSTVSRVIADNPRISKETKERVFKAMEELGYYPNAIARSLASKMTYTIGLIMPRSAEDAFSNPFFPEVMRGISVVAHNEKYDLLISTSGNEEEEKQAVIDMVKGRRVDGIVLLCSRTTDELIPWLREEKFPFTVIGKPLDSKGVCWVDNDNIGASRLATNYLIKHGHREIAFISGSLEFVVSLDRLDGYKLALEENNIPFDKELVAQDEFSEDGGYNAMMRILKQKKPTAVVVTDDIMSFGVIRAAIDYGLKVPQDVSLIGFNNIPLSAYANPPLTTIDISTFDLGVKSAELLLKNIKNKDFVADHIIVPVKLIERKSCIKR >NZ_CP047602|2468326:2478448|2474552_2474834_-|WP_013786966.1|DBSCAN-SWA MEITDVRVRKINEEGKMRAVVSVTFDNEFVVHDIKVIEGQNGLFIAMPSRKTPEGEFKDIAHPINSETRAKIQSAILSEYEKAKEQDKPQGQE >NZ_CP047602|2468326:2478448|2469920_2471342_-|WP_014757666.1|DBSCAN-SWA MSRNRLFRRLLFTNIAIILLTMSILSVLFYIMFENYYFRDKEKIMVEEGKQINTVLNDYLIGDIDIDRLNQDLNVIDRLINASIWVVSTDGRIYIQSKNFEKNWTGVTLSKDDIKSILKGETIVRRGYFGGRFTQPVLTVGFPLVLAGKIQGAIFMHAPIVEMQKTLMDIFFIMLLAIAISIIIAFILISYTSKRISNPLKEMSIATEKMAKGDFSTKINVVDDDEIGDLAKSFNIMSSELGRMDNARKEFVANVSHELRSPLSTIQGYIDGVVDGTIPAEKSKFYLEIAQKETRRMSRLISELLDITKMESGAFPLNISEFDINELIRLTIIKMEARISDKDLMVKVDFESDKEIVEADKDKIEQVLTNLIDNAIKFSNPGGYIHISTEKVKEKVHVKVQNKGKTIPPDEIDHIWDRFYKVDKARSGSPGVGLGLYIVRSIINLHNEDIWATSSDADGTTFTFTLRAKKVKQ |
9 | Hokovirus(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2641526 : 2650395
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047602|2641526:2650395|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047602|2641526:2650395|2645601_2646792_-|WP_014757515.1|DBSCAN-SWA MFDTIESAIEDIKNGKMVIVVDDEDRENEGDLVMAAEKVTSDHVNFMIKYGRGLVCVPMMGERLKKLNIGKMVFDNTDKKETAFTVSVDHKNCKTGISAYERALTIKMLIDDESMPDDFTKPGHVFPLEAKEGGVLVRAGHTEAACDLARLAGLKSAGVICEIIKDDGKMARLPELIEFSKKFNLKIISIADLIEYRRKNEKLVKRVAEAYLPTKYGDFTIIGYEEILTGKDHVALVKGDLSDSPTLVRVHSECLTGDIMGSLRCDCGDQLHTAMEKIGKEGGVLLYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDEGLDTVDANIRLGFPADMREYGIGAQILKDLGLKKLRIMTNNPKKLVGISGYGLEIVERVPIEVSINRHNERYLKTKKEKFDHIFTSF >NZ_CP047602|2641526:2650395|2648739_2650395_-|WP_014757512.1|DBSCAN-SWA MLIKGSQVVIEVLKEQGVEVVFGIPGGAVIPLYDALYDSDLRHILATHEQMAAHMADGYARVTGKVGVCFATSGPGATNLVTGIANAYMDSVPIVAITGQVATSLIGKDSFQEVDIAGITMPITKHNFIVKSPDKLADTLREAFFIAKDGRPGPVLVDIPKDIQTADINFVKRKDFYVEVKKHQALESDLEKAAQLISSSKRPVIFAGGGVIWSEASKNLYDFAKKHMIPVATSLMGLGCFPEDDELSLGLIGMHGSRYANTAVYKSDLVIAVGARFSDRVAGKAGGLAPNAKVIHIDIDPAEIGKNIDVDVPLVGDIKEVLSLLNGMIKERENREWINELISIKDKTSFKYKDDGKLKPQWIVEKVQELGGDSLVVATEVGQNQMWTAQYYRFKEPRTFVTSGGLGTMGFGLPASIGAQVGRDDKRVVNIAGDGSIRMNIHALETMSVYNIPVITIILNNQTLGMVRQWQNLLYDKRFSQTDLNPNLNFSKVAEAFGVTGRRIYTKEEFTEAFSDALSNNKPYVLECIIDKDEMVLPFIPAGGTIEEMID >NZ_CP047602|2641526:2650395|2641526_2642798_-|WP_014757518.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDIKRIRNNPDEVKKAIELKKENSNIDEFLEIDEKRREILKELESLKNTRNKESENIAKLKKEGKDAEELIKEMKEISDKIKAMEGEVKQYDEKLEELLWTIPNIPHESVPVGDSDADNVEIRRWGEVREFDFEVKPHWDIGVELGLLDFEAASRVTGSRFTFYKGLGCRLERALINFMMDLHTEKHGYTEVFPPFMVHRRSMFGTGQLPKFEEDAFKVAGTDYFLIPTAEVPVTNMYRETIIDGEKLPIYNCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKITEPEKSYEELEKMVSDAEDVLKTLGIPYRVVSICTGDLGFTAAKKYDLEVWMPSYGRYVEISSCSNCEDFQARRANIKYRPKDGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQKDGSVVVPEALRPYMRCDVIRK >NZ_CP047602|2641526:2650395|2643063_2643600_-|WP_013786854.1|DBSCAN-SWA MKSNTKKEIVSWILTIGLAFIIAMFIRTYVFELVDVPTGSMLNTIQLNDKFIELKFIYRFEPIKRGDIVVFKYPDDPSVSFVKRVIGIGGDTIEIKNGILYRNGKPVKEPYLKEPMNKNETFGPYKVPPNHYFMLGDNRNQSLDSRYWKNKYVSKDAIMGKIVFRIWPLSRFGSMIGK >NZ_CP047602|2641526:2650395|2647435_2648506_-|WP_160175256.1|DBSCAN-SWA MKRALQLAKLGVGHTNPNPLVGAVIVKDGRIIGEGYHEYYGGPHAEVNALKNAKEDVSGATLYVTLEPCCHHGKTPPCVDAVIKSGIKNVFIAMEDPNELVAGKGIKKLKEAGLNVYTGLLKDEAEKLNEVFIKYITSREPYVILKSAMTIDGKISTFTGDSKWITNEKSREHVHKVRGSVMAIMAGINTVIKDNPHLTVRLQGYKNPLRVIVDSHGRIPLDANVIIDKSAKTLIATTDMMPHDKVKALKDLGVDVVTIEKKNNKVHLKKLIHTLGKKGIDSILIEGGGTLNYSALKEGIVDKVMFYIALKIIGGSNSLTPVEGDGIALIKDAIMVEKIDIKKFDDDILIEGYIKK >NZ_CP047602|2641526:2650395|2645107_2645578_-|WP_014757516.1|DBSCAN-SWA MKKYEGKLIGDGLKVGLVVSRFNEFITNKLLDGALDALRRHGIDDESIDIAWTPGAFEIPLISKKMATSKKYDAIIALGAVIRGDTPHFDYVANEVSKGVAKISVDYDVPVIFGVLTTDTVEQAIMRAGTKSGNKGFEAAVTAIEMANLIKEIESL >NZ_CP047602|2641526:2650395|2646806_2647427_-|WP_014757514.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVKMIQRGNITKMAVECKKALDGVKIGDSIAVNGVCLTVTNIGKDLFTSDIMYETLKTSNLGSLKIGSIVNLERALSISGRLNGHIVTGHVDTVGAIIEKNKINGTTTFKIKIDERYSKYVADKGSVAVDGISLTVVESSASYFTVSIIPHTEINTTLNIKRIGDTVNIEVDILSKYAERLLTKKNVDEFLIENYL >NZ_CP047602|2641526:2650395|2643999_2645064_+|WP_014757517.1|DBSCAN-SWA MKDFLSRYQSTIRNSIAILAIILSFYLFVFKLIPFLMPFAVALFLAILIDPAVEFSEKKLKIPRGLSSAFFILLLIAIIGLLISLLVTQLVFELNTLAEHAPSYTKNFDVVISDLIDRIRRYYVSLPTNISTFLESNLQSILNNISVYAKNFAGWILGLATKLPNFFFMSIITIVSTFFLSKDKWLILNFIKRQFPSNWAFHAENIKGDLFQTLIGFIRAEITIMFITFLEVSIGLTIIGFDYAFLLGLLVSFIDILPVLGSGSVLVPWALYNIFTKNYLIGIYLLIIYAIVTVVRQMIEPKIVGQSIGLHPLVTLLSMFIGARLFGGLGLIMGPVFVVVFKTFQKSGIIPSWK |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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