Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792 | Staphylococcus aureus strain UP_794 chromosome, complete genome | 9 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 8 | 5 | 12 | 2 |
1. NZ_CP047792
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_1 | 786539-786679 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP047792_1
>1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder GAATTTCGAATAGAAATTCTACAGGCAATGCA >1.2|786619|33|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGAG >1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR TTCGAATAGAAATTCTACAGGCAATGCA >1.4|786632|33|NZ_CP047792|PILER-CR AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_1 >merge|NZ_CP047792|1|786539-786679|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTGTGGTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAATAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGAGAGTTGGGGCGGGCCCCAACACAGAGAAT >NZ_CP047792|1|1|786539-786675|CRISPRCasFinder ATTGTGGTGGGGCCCCAACACAGA GAATTTCGAATAGAAATTCTACAGGCAATGCA AGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGA AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGAG AGTTGGGGCGGGCCCCAACACAGA >NZ_CP047792|1|1|786548-786679|PILER-CR GGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAATAG AAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGT GGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAG TCAGCTTACAATAATGTGAGAGTTGGGGCGGGC CCCAACACAGAGAAT
>NZ_CP047792.1|WP_124780364.1|786224_786425_+|hypothetical-protein MTELNEIINAIQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKIEDARFRTIIKLYSYYTSLKEHS >NZ_CP047792.1|WP_000862543.1|786094_786241_+|hypothetical-protein MKVFYIAFLIILWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNRRKRIKNDRVE >NZ_CP047792.1|WP_160194520.1|784463_785423_-|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSVLLNPIANAADSDINIKPGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKIFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVHDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP047792.1|WP_000897629.1|783774_784008_-|hypothetical-protein MLFKDWEINVVYSGKHEVVTNENSLFVIDEDYDVAIAINYLDNKLKVSHVNYGSEFTIDASNKVLALMIHNPNIDEN >NZ_CP047792.1|WP_001032820.1|782981_783167_-|hypothetical-protein MNKHINKKTTKHLEDYKKVQQRNSEETNRGCLKSAAMLIVLFLFIIFGIVACSTHVNFFFQ >NZ_CP047792.1|WP_124780358.1|782384_782735_+|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MKIKKYLVAGTLAVLLSTTAVSTLDGNKADASSHGNYLTQSEYHDKKIAEELKSLLDQSYVNDLAAGSLNPYYKRMIMMNQYRAKAALKSNNFAKMAEAKVGLESIYKEIDEIINR >NZ_CP047792.1|WP_115390883.1|781735_782233_+|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLAIAAIGITTTTLASTADASEGYGPREKKPISINNNIVEYNDGTFKYQSRPKFNTTPKYIKFRHDYNIVEYNDGTFGYGPRPHFNKPAEKSVATLKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYNVKKMILQERIDQVLKQGLVR >NZ_CP047792.1|WP_000584396.1|780971_781478_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIAQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP047792.1|WP_124780356.1|779895_780297_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKVIIASTVIATGLLTHSNDAKAFFSYEWKGLEIAKKLADQAKQEEERIDKLMRESDKNLKPYKGETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPNGYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWD >NZ_CP047792.1|WP_124780354.1|779843_779936_-|hypothetical-protein MLKTVKSTQLLGINLHTELNSCTPNVGKQC >NZ_CP047792.1|WP_124780366.1|786824_787541_-|superantigen-like-protein-SSL12 MRKSITNKIILTTTLLLLGTTATQTPNSPLNVSTEAKAYYIDQDETNINELIKYYTQKPLTFSNRWLYQYDDGNIYVEFKRYSWSAHIRLWGAESWGNINQLRDRYVDVFGLKDEDTSQLWWVYRDTFTGGVTPAASSSDKTYSLFVQYKDKLQTIIGAHKMYQGNKPILTLKEIDFRAREALIKNKILYHENRNKGKLKITGGGNDYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPQKITVEVLID >NZ_CP047792.1|WP_124780368.1|787649_788375_-|superantigen-like-protein-SSL13 MEKNITKKIILSMALIIIGTATIQSPHSPISMSSNAKAYYIDQEETNVSELTKYYTQRHLTFSNKWLWQKENGTIHATLLQLSWFSHIQVFGPESWGNINQLRNKYVDIFALKDYETWHTYMLAQETFTGGVTPAAKPSDKHYKLNLTYKDKSGTFIGGFPVYEGNKPVLTLKEVDFRIRQTLIKNKKLYHGNYNKGHIKITGGSNNYTIDLNKRLKSTDANRYVKNPQTAHIEILLEKSN >NZ_CP047792.1|WP_000739537.1|788484_789210_-|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSLSGKWLWQKPNGTIHATLQTWVWYTHIQVFGPESWGNINQLRDKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKHYKLSLKYRDKLQTMIGGLEFYQGNKPVITLKELDFRVRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITGGGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNTEIEVILEKSR >NZ_CP047792.1|WP_124780370.1|789647_790649_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIASENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP047792.1|WP_124780372.1|790671_791604_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLKLVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP047792.1|WP_014532609.1|791825_793331_+|YfcC-family-protein MPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYS >NZ_CP047792.1|WP_000149425.1|793639_793867_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVTYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_CP047792.1|WP_124780376.1|794182_795130_-|TDT-family-transporter MRLQKSPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMLKYFINVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINNLITPIWILCLVGIMMHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQSSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIILLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NZ_CP047792.1|WP_124780378.1|795376_795565_+|DNA-binding-protein MRNQIQKLLDSDLSSLQISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANVIFSDEN >NZ_CP047792.1|WP_000398672.1|796458_796593_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_2 | 858889-858982 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_2
>2.1|858919|34|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder AGATTAGAGGAACACCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_2 >merge|NZ_CP047792|2|858889-858982|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACTAGATTAGAGGAACACCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT >NZ_CP047792|2|2|858889-858982|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT AGATTAGAGGAACACCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT
>NZ_CP047792.1|WP_124780412.1|858030_858765_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVAEADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_CP047792.1|WP_124780410.1|857111_858038_+|ACP-S-malonyltransferase MSKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEEGKLGETENTQPALLTHSSALLSALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NZ_CP047792.1|WP_000239748.1|856132_857119_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYNLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NZ_CP047792.1|WP_001548538.1|855555_856128_+|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NZ_CP047792.1|WP_001151505.1|853292_855353_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFNSQGTQTQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDRLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDKVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NZ_CP047792.1|WP_160194526.1|851457_853104_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSKSDQLTTVTELLTEMLAEDSEILTVIIGQDAEQTVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NZ_CP047792.1|WP_000171418.1|851068_851443_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NZ_CP047792.1|WP_000517908.1|850437_850626_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NZ_CP047792.1|WP_000547904.1|849415_850057_+|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVIVHDGLILQIRSTDLN >NZ_CP047792.1|WP_000164332.1|848764_849409_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLDLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >NZ_CP047792.1|WP_000426914.1|859071_859305_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_CP047792.1|WP_000043237.1|859420_860152_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_CP047792.1|WP_124780414.1|860298_863865_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIINVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAIKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDTQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_CP047792.1|WP_000007686.1|863864_865115_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NZ_CP047792.1|WP_000531319.1|865101_865434_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKKHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_CP047792.1|WP_000863474.1|865459_866827_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_CP047792.1|WP_000268754.1|867261_867537_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_CP047792.1|WP_045173560.1|867724_868228_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVYNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_CP047792.1|WP_124780416.1|868227_868965_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTKQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFNGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_CP047792.1|WP_000181404.1|869067_869418_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_3 | 1261054-1261140 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_3
>3.1|1261083|29|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder CGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_3
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_3 >merge|NZ_CP047792|3|1261054-1261140|CRISPRCasFinder TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTT >NZ_CP047792|3|3|1261054-1261140|CRISPRCasFinder TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACT CGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTT
>NZ_CP047792.1|WP_124780595.1|1259583_1260708_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKVEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSRRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKKLIVEKNDAIALTNRGKVIGNEVFEAFLIND >NZ_CP047792.1|WP_000627147.1|1258506_1259484_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLLNTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >NZ_CP047792.1|WP_000182221.1|1257848_1258475_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNVKQNIDDSVEQTEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >NZ_CP047792.1|WP_000034716.1|1255947_1257780_-|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >NZ_CP047792.1|WP_124780597.1|1254672_1255812_-|molecular-chaperone-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGLAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >NZ_CP047792.1|WP_124780599.1|1253730_1254669_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQRIKDELLNLDELDQHNVQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETCVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >NZ_CP047792.1|WP_001190118.1|1252976_1253729_-|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVAKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >NZ_CP047792.1|WP_124780601.1|1251623_1252970_-|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKSYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >NZ_CP047792.1|WP_000048060.1|1251154_1251331_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >NZ_CP047792.1|WP_001802667.1|1250227_1250911_-|hypothetical-protein MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD >NZ_CP047792.1|WP_000368338.1|1261327_1263151_-|elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >NZ_CP047792.1|WP_001274017.1|1263496_1263748_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >NZ_CP047792.1|WP_001282570.1|1263792_1264767_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKSPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIIDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >NZ_CP047792.1|WP_124780661.1|1264823_1266971_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MLSTFLFILLLYIAYRKNKIVYAPISLFLIIFSTWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTNKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNDNKFVTLKLHSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITIIVLALFAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWMGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFIISHFIVGLTPLNYLVDLSYNFHDWLLYLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGELEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >NZ_CP047792.1|WP_000439692.1|1267029_1267491_-|ComE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAEYLTKG >NZ_CP047792.1|WP_124780591.1|1267582_1268269_-|ComEA-family-DNA-binding-protein MVLLYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDGYSSRNFEDKDTALKQSTSENSSLPKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLSDQKMIFIPHKGQKNVEPQIGVNSVHVKNGNPNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTT >NZ_CP047792.1|WP_000084829.1|1268308_1269025_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDAERLFFIAKK >NZ_CP047792.1|WP_124780589.1|1269027_1269381_-|ribosome-silencing-factor MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTIALEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >NZ_CP047792.1|WP_001019324.1|1269381_1269966_-|HD-domain-containing-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >NZ_CP047792.1|WP_000725157.1|1269955_1270525_-|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHHDFIDVQHRLKMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKSFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENGMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_4 | 1295082-1295270 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_4
|
3 spacers
spacers of NZ_CP047792_4
>4.1|1295102|36|NZ_CP047792|CRT ACTTCCACATTATTGATATCTGACTTTTGGTCAGCT >4.2|1295158|38|NZ_CP047792|CRT CCAACTCTCATTGCCTGTAGAATTTCTTTACGAAATTC >4.3|1295216|35|NZ_CP047792|CRT CTTCCATTGCCTATTGAAATTGGGGTTCCAATTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_4
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_4 >merge|NZ_CP047792|4|1295082-1295270|CRT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTCCACATTATTGATATCTGACTTTTGGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTCTCATTGCCTGTAGAATTTCTTTACGAAATTCTCTGTGTTGGACCCCGCCAACTTCCATTGCCTATTGAAATTGGGGTTCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCA >NZ_CP047792|4|1|1295082-1295270|CRT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCA ACTTCCACATTATTGATATCTGACTTTTGGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGTCC CCAACTCTCATTGCCTGTAGAATTTCTTTACGAAATTC TCTGTGTTGGACCCCGCCAA CTTCCATTGCCTATTGAAATTGGGGTTCCAATTTC TCTGTGTTGGGGCCCCGCCA
>NZ_CP047792.1|WP_000567017.1|1294101_1294770_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQALFGNIEEDPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFYNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEAITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NZ_CP047792.1|WP_160194549.1|1291622_1294100_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPIVKQYFRILQRTILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFKSEDEEMLENIATNDTGASQTTIDDQVEAPMSSNASEEVTSDSTKTDTNVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NZ_CP047792.1|WP_124780577.1|1288650_1291281_-|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKVTTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGDTVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQLKVKSDDQVVDKLTQLQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINSYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NZ_CP047792.1|WP_000426912.1|1288327_1288588_-|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NZ_CP047792.1|WP_000939059.1|1287895_1288324_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NZ_CP047792.1|WP_000134779.1|1287572_1287881_-|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NZ_CP047792.1|WP_000342266.1|1286649_1287288_-|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEVNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NZ_CP047792.1|WP_000137775.1|1285723_1286647_-|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLMDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NZ_CP047792.1|WP_000848304.1|1284443_1285712_-|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NZ_CP047792.1|WP_000648617.1|1283820_1284444_-|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ >NZ_CP047792.1|WP_124780573.1|1295400_1296519_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVVGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKIFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NZ_CP047792.1|WP_000409167.1|1296519_1297662_-|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMTIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLHVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSITAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVETMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NZ_CP047792.1|WP_000985895.1|1297973_1298987_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGEDERTAINDMVKLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHELQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NZ_CP047792.1|WP_000009238.1|1299223_1299370_-|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK >NZ_CP047792.1|WP_000752909.1|1299409_1299592_-|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NZ_CP047792.1|WP_000704122.1|1299691_1300114_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NZ_CP047792.1|WP_124780571.1|1300198_1301473_+|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPRGIIRRMVNTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNNEDVRQALTRAIEDEENGLKTYQPKIDEDAMTYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVGQIPNHLKDGHYQGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLEEIYNNLLKQRP >NZ_CP047792.1|WP_124780569.1|1301633_1302407_-|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHMFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKMISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NZ_CP047792.1|WP_014937034.1|1302406_1302535_-|hypothetical-protein MGLIAFNNCFLVEFWKNNQSNNAKYKILSYYVLMYKSVKEVK >NZ_CP047792.1|WP_160194550.1|1302867_1304634_-|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINRSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDEEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKDMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWPLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_5 | 1382442-1382527 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_5
>5.1|1382470|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder GCCCCAACATAGAGAAATTGGATCCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_5
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_5 >merge|NZ_CP047792|5|1382442-1382527|CRISPRCasFinder TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGATCCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGATGGG >NZ_CP047792|5|4|1382442-1382527|CRISPRCasFinder TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGG GCCCCAACATAGAGAAATTGGATCCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGATGGG
>NZ_CP047792.1|WP_124780533.1|1381239_1382181_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGSKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGHLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRTKLN >NZ_CP047792.1|WP_124780535.1|1378021_1381219_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTIETVVLAKDNNGLKDLYQLSSNIKMNSMENVSFELLQQFSSNLIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQNVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRRERVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDNQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKMFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSRNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLDSFEEQKLAFAKQIIIRNKSHIDTFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_CP047792.1|WP_000058389.1|1376342_1377572_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_CP047792.1|WP_000471571.1|1375290_1376148_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_CP047792.1|WP_000883647.1|1374346_1375291_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYLE >NZ_CP047792.1|WP_000717561.1|1373109_1374078_-|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_CP047792.1|WP_001232650.1|1371330_1373088_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIAEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP047792.1|WP_031920935.1|1369620_1370982_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIATKSNN >NZ_CP047792.1|WP_000829167.1|1368151_1369273_-|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >NZ_CP047792.1|WP_124780539.1|1366834_1368103_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFDDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >NZ_CP047792.1|WP_124780531.1|1382578_1383877_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNEFYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_CP047792.1|WP_000277602.1|1384081_1384495_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP047792.1|WP_000777188.1|1384941_1385631_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_CP047792.1|WP_000161665.1|1385805_1386861_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEISKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPNKEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_CP047792.1|WP_000690003.1|1387176_1388295_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKYGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_CP047792.1|WP_124780529.1|1388435_1388936_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTKLREKYQN >NZ_CP047792.1|WP_000040069.1|1389181_1390384_-|acetate-kinase 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NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_6
>6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder TAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_6
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_6 >merge|NZ_CP047792|6|1384736-1384819|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGCTGGGACCCCAACATGTAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGGCTGGGCCCCAACATGG >NZ_CP047792|6|5|1384736-1384819|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGCTGGGACCCCAACATG TAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGACAA TGCAAGTTGGGCTGGGCCCCAACATGG
>NZ_CP047792.1|WP_000277602.1|1384081_1384495_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP047792.1|WP_124780531.1|1382578_1383877_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNEFYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_CP047792.1|WP_124780533.1|1381239_1382181_-|pApA-hydrolase-Pde2 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>NZ_CP047792.1|WP_000058389.1|1376342_1377572_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_CP047792.1|WP_000471571.1|1375290_1376148_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_CP047792.1|WP_000883647.1|1374346_1375291_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYLE >NZ_CP047792.1|WP_000717561.1|1373109_1374078_-|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_CP047792.1|WP_001232650.1|1371330_1373088_-|pyruvate-kinase 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP047792_7 | 1961776-1961862 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_7
>7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder TGTCTGCAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_7
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_7 >merge|NZ_CP047792|7|1961776-1961862|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGCAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCAT >NZ_CP047792|7|6|1961776-1961862|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCAT TGTCTGCAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCAT
>NZ_CP047792.1|WP_124781293.1|1961544_1961715_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDTNVKEPLKIYYVVILKSRIEMIFS >NZ_CP047792.1|WP_000066892.1|1961068_1961419_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAEKELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP047792.1|WP_124781295.1|1959755_1960967_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFAIERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP047792.1|WP_000951058.1|1959322_1959763_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP047792.1|WP_124781297.1|1958394_1959159_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDTMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP047792.1|WP_001566779.1|1958151_1958403_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP047792.1|WP_000413854.1|1956497_1957763_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDRDGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP047792.1|WP_160194580.1|1953213_1956381_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLDHKWIVIILSTLILVVTIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP047792.1|WP_001161080.1|1952709_1953027_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVIFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP047792.1|WP_000051210.1|1952300_1952465_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP047792.1|WP_000230173.1|1962058_1963081_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP047792.1|WP_000643981.1|1963100_1963700_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYRRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP047792.1|WP_000866971.1|1963706_1963940_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP047792.1|WP_000808500.1|1963945_1964392_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP047792.1|WP_124781291.1|1964405_1964891_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLIRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLTNVCYSLNVRDHEDFTAFEQWLLNKIKNDCGTQLT >NZ_CP047792.1|WP_000259723.1|1964887_1966147_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETTTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYADVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP047792.1|WP_000134534.1|1966209_1966704_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP047792.1|WP_000503820.1|1966705_1967212_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP047792.1|WP_000076926.1|1967242_1968247_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP047792.1|WP_000913006.1|1968415_1969021_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP047792_8 | 2099488-2099571 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_8
>8.1|2099516|28|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder CCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_8
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_8 >merge|NZ_CP047792|8|2099488-2099571|CRISPRCasFinder GGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGCCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGGAAAG >NZ_CP047792|8|7|2099488-2099571|CRISPRCasFinder GGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAG CCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCG GGGCCCCAACACAGAAGCTGACGGAAAG
>NZ_CP047792.1|WP_020977539.1|2098659_2099196_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTNTTIRLANENDAETLHQLMYKAFTPLRELGIDWPSVNANLDAVKENIDKNTTFVMTIDDEIISTITVRYPWGSVKSISGYPFVWWFATNPEYEGKGYGSQLLTYVEEAFLRDTLKSAAVTLGTSARLHPWLLKIYEKRGYEIYSEHENDDGDLGVIMRKVLIPERFDETILGQPPF >NZ_CP047792.1|WP_143565125.1|2097663_2098431_-|sirohydrochlorin-chelatase MNGNIIVAHGMRHGRQNQALLAFIAELVKDDIHHYDIAFLESEHQDLETVMTTLVQSGVDHFKIVPLLIFSAMHYLKDIPDIVHEMKRRYPDIKVEVSEPLGTHPLMRRLIEQRICDALAGDEQQVGVMVVAHGNINGKFTKAHEELQICAQNLQISKPTYARTLYGEISFTNDLESISKRYQKLIVVPLFLYDGRLVNKVKQQMNDMDINTDIHITPSINFDPILKQIINDRLESLNDSNENIKAQTKIKTFLK >NZ_CP047792.1|WP_124780755.1|2095230_2097636_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MAKQKLVMIGNGMAGIRTIEEILERANDLYDITVIGKEPYPNYNRIMLSNILQNKMTVEETIMNPYEWYEEHGIELITNDPVIEVDRANQSVTTANGIEVSYDKLIFATGSKAFVIPVPGSTLPSVIGWRTIDDTEQMMNIAKTKKKAIVIGGGLLGLECARGLLDQGMEVTVLHLAEWLMEMQLDRKAGNMLKADLEKQGMKFEMQANTTEILGEDDVEGVKLADGREIPADLVVMAVGIRPYTEVAKESGLDVNRGIVVNDVMQTSDSNVYAVGECAEHNGKVYGLVAPLYEQGKVLADHLTNKETNGYKGSTTFTSLKVSGCDLYSAGQIVENAEIKGIEIFNSVDNNYKKIFLKDGNVVGAVLYGDIDDGSRFYNMMKKGESTEDYTLVSLLTKGGEEASLSIADMADDETICGCNGVDKGTIVNAITENGFTTVDEVTAKTKAGNSCGKCKPQIAQILQHTLGDDFVAAKPAGICGCTDLTRDQIVTQIRAKGLKTSKEVRHVLNFKNKGGCPKCRPAINYYLNMVYPHDHEDERESRFANERYHANIQNDGTFSVIPQMRGGVTDADQLIRLGEVAKKYHVPLVKVTGSQRVGLYGVKKEELPNIWEDLGMRSASAYGKKTRSVKSCVGKEFCRFGTQYTTRLGIRLEKTFEYIDTPHKFKMGVSGCPRSCVESGVKDFGIISVENGFQIYIGGNGGTEVEKAEFLTTVETEDEVIKLCGALMQYYRETGIYAERTAPWLRRLGFENVKEVLLNPERQNELFERIMDAKKAVEAEPWEAITSNEQARKIFEVEKV >NZ_CP047792.1|WP_000448222.1|2094912_2095227_-|nitrite-reductase-small-subunit-NirD METKEKIKVTTIDELTPLIGKKVIVKGKEVGLFLTESGKIHAIHNICPHKQGPLSEGTVSGEYVFCPLHDQKIDLNTGIVQEPDEGCVDVYEVEVTDGNVYICL >NZ_CP047792.1|WP_124780757.1|2093944_2094922_-|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSVDEYGKVYLIGAGPGNPNYLTKKAERLIREADVILYDRLVNPLILQYAKSTTEIIDVGKKPYAKHIQQEKINDCIVEAARRYNKVVRLKGGDPAIFGRVQEEVDTLNEHHIAFEIVPGVTSASAAVATMQTGLTMRTVAKSVTFSTGHFKDSEENEVDVNSLVNGGTLAIYMGVKRLGKIITQIQQYTDIDYPIAIVFQASCFNEFVVKGRLSNIISKLQHYSIEAKPGICIIGDVVGYTENTPKSYDPTKQFYVVSGSKHDALMLCEHLYDEGYGCLLNPNDTSNGTYHSSQYDYYDAFIKQQENVTYISTDRADANTVLCH >NZ_CP047792.1|WP_124780759.1|2089946_2093636_-|nitrate-reductase-subunit-alpha MGKFGLNFFKPTEKFNGNWSILESKSREWEKMYRERWSHDKEVRTTHGVNCTGSCSWKVFVKNGVITWENQQTDYPSCGPDMPEYEPRGCPRGASFSWYEYSPLRIKYPYIRGKLWDLWTEALEENNGNRVAAWASIVENEDKAKQYKQARGMGGHVRSNWKDVTEIIAAQLLYTIKKYGPDRIAGFTPIPAMSMISYAAGARFINLLGGEMLSFYDWYADLPPASPQIWGEQTDVPESSDWYNASYIIMWGSNVPLTRTPDAHFMTEVRYKGTKVISVAPDYAENVKFADNWLAPNPGSDAAIAQAMTHVILQEHYVNQPNERFINYAKQYTDMPFIIMLDEDENGYKAGRFLRASDLGQTTEQGEWKPVIHDTISDSLVVPNGTMGQRWEEGKKWNLKLETEDGSKINPTLSMTEGGYELETIQFPYFDSDGDGIFNRPIPTRQVTLANGDKVRIATIFDLMASQYGVRRFDHKLESKGYDDAESKYTPAWQEAISGVKQSVVIQVAKEFAQNAIDTEGRSMIIMGAGINHWFNSDTIYRSILNLVMLCGCQGVNGGGWAHYVGQEKCRPIEGWSTVAFAKDWQGPPRLQNGTSWFYFATDQWKYEESNVDRLKSPLAKTEELKHQHPADYNVLAARLGWLPSYPQFNKNSLLFAEEAKDEGIESNEAILKRAIDEVKSKQTQFAIEDPDLKKNHPKSLFIWRSNLISSSAKGQEYFMKHLLGTKSGLLATPNEDEKPEEITWREETTGKLDLVVSLDFRMTATPLYSDIVLPAATWYEKHDLSSTDMHPYVHPFNPAIDPLWESRSDWDIYKTLAKAFSEMAKDYLPGTFKDVVTTPLSHDTKQEISTPYGAVKDWSKGEIEAVPGRTMPNFAIVERDYTKIYDKYVTLGPVLEKGKVGAHGVSFGVSEQYEELKSMLGTWSDTNDDSVRANRPRIDTARNVADAILNISSATNGKLSQKSYEDLEEQTGMPLKDISSERAAEKISFLNITSQPREVIPTAVFPGSNKQGRRYSPFTTNIERLVPFRTLTGRQSYYVDHEVFQQFGESLPVYKPTLPPMVFGNRDKKIKGGTDALVLRYLTPHGKWNIHSMYQDNKHMLTLFRGGPTVWISNEDAEKHDIQDNDWLEVYNRNGVVTARAVISHRMPKGTMFMYHAQDKHIQTPGSEITDTRGGSHNAPTRIHLKPTQLVGGYAQISYHFNYYGPIGNQRDLYVAVRKMKEVNWLED >NZ_CP047792.1|WP_000692645.1|2088397_2089957_-|nitrate-reductase-subunit-beta MKIKAQVAMVLNLDKCIGCHTCSVTCKNTWTNRPGAEYMWFNNVETKPGVGYPKRWEDQEHYKGGWVLNRKGKLELKSGSRISKIALGKIFYNPDMPLIKDYYEPWNYNYEHLTTAKSGKHSPVARAYSEITGDNIEIEWGPNWEDDLAGGHVTGPKDPNIQKIEEDIKFQFDETFMMYLPRLCEHCLNPSCVASCPSGAMYKRDEDGIVLVDQDACRGWRYCMTGCPYKKVYFNWKTNKAEKCTFCFPRIEAGMPTVCSETCTGRMRYLGVLLYDADRVHEAASAVDEKDLYEKQLDIFLNPFDEEVIAQAEKDGIGYDWIEAAQNSPIYKLAIEYKLAFPLHPEFRTMPMVWYCPPLSPIMSYFEGKNTTQNPDAIFPAIEEMRLPIEYLANIFTAGDTEPVKGALQRMAMMRSYMRSQVTQQPFDTSRLERLGITERQTKDMYRLLGLAKYEDRFVIPTSHKETYLDTYHAQGSTGYNYGGEHFGDNCEGCGVAVGSGKTGQEIYNENFYGGIFRD >NZ_CP047792.1|WP_001795300.1|2087829_2088420_-|nitrate-reductase-molybdenum-cofactor-assembly-chaperone MEGFSVINFDNFKKYQESFGYMAQQLCFPEKLTFHPKTFEETISKDHPAYEDLVAFRNVMMTFSLSEIKAIYTDTFDFTKKAPLYMTYNKFDTQKERGQMLAKLKVLYEMFGLEMVDNELSDYLPLMLQFLQVAEWRNDPRAEENIQLIIMIIEDGTYVMANALGEDNNPYAYVIQALRKTLKLCLTSPKGVKHHA >NZ_CP047792.1|WP_000934156.1|2087159_2087837_-|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MLNQFLWVIFPYLCLVVFVAGHIARYRYDKFSWTAKSSELIERKRLMWGSLLFHLGIIPVFFGHVVGLLIPKSWMDAVGVSEHLYHIGAVYIGSIFGIITLVGMFLLTARRVTTKSIRRLSSASDIFVNFLLLLIVFMGCYATLVTNIQHPDFNYRTSLSIWFRQLFMLKPDASLMSGVPIAFKMHILLGFTIMACWPFTRLVHVWSVPLTYINRRYIIYRKNKV >NZ_CP047792.1|WP_000186933.1|2086687_2087140_-|GAF-domain-containing-protein MTPEAIIEDRRFQETLDKIRKEEGYDFAAIAFYESNKPSSPIKWHYVSGNKNNRFKLIILRKGRGLAGTVMKTGKRMVIANVGLALGPEEKIDYPILLSESLTAVLAVPLWYKNQVYGVLLFGQRDGRPLPKIFDNDDIQRKFGIFNDDK >NZ_CP047792.1|WP_000594640.1|2099665_2100490_-|formate/nitrite-transporter-family-protein MIKNNKTVEDTYSTKAIVDSISSSVQMKQVMVQQTPGRYMLKSMMAGFLLSIVTVFMFGIKTQFASTHVDGLINLMGAIAFSLGLVLVVLTNSELLTSNFMYFTVGWYYKVVSLNKMMWILLYCFLGNILGGFVLFFLMKYAHVMTPEMTQALTALVQKKTVDSTWLNIFTKGIFCNFFINIGIFISMQFKGGLTKAFFIACGVIVFVYMGYEHVVFNAGLYAGMVFFNLDAVSWLHVLKNIVFAFLGNFVGGGIFVGLVYAFLNGKRNRLEQQ >NZ_CP047792.1|WP_000079140.1|2100692_2100875_-|hypothetical-protein MAQRYIKVLILYIFTTLLSSITVTSKCVPNKVVRFILRTVVGYGIFAYGLHYFSNLKKNK >NZ_CP047792.1|WP_064129555.1|2100961_2101429_-|glutathione-S-transferase MTIKVEDNKIIFSRTIEAPIEKVFDAYTTKALFEKWFHPKDASTKVFRFNAVSGGDAFYAIKTPTMTSYTLAEYKTVKRPYLIEYIDSFATPQGVKDTKMPSMKITLSFSEFNTTKTTVTSTSVFPTKEAAQQVINMGVEQGMNQTLDQLDALLK >NZ_CP047792.1|WP_000727770.1|2101614_2103162_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein-AdcA MKKKLGMLLLVPAVTLSLAACGNDDGKDKDGKVTIKTTVYPLQSFAEQIGGKHVKVSSIYPAGTDLHSYEPTQKDILSASKSDLFMYTGDNLDPVAKKVASTIKDKDKKLSLEDKLDKAKLLTDQHEHGEEHEHEGHDHGKEEHHHHGGYDPHVWLDPKINQTFAKEIKDELVKKDPKHKDDYEKNYKKLNDDLKKIDNDMKQVTKDKQGNAVFISHESIGYLADRYGFVQKGIQNMNAEDPSQKELTKIVKEIRDSNAKYILYEDNVANKVTETIRKETDAKPLKFYNMESLNKEQQKKDNITYQSLMKSNIENIGKALDSGVKVKDDKAESKHDKAISDGYFKDEQVKDRELSDYAGEWQSVYPYLKDGTLDEVMEHKAENDPKKSAKDLKAYYDKGYKTDITNIDIKGNEITFTKDGKKHTGKYEYNGKKTLKYPKGNRGVRFMFKLVDGNDKDLPKFIQFSDHNIAPKKAEHFHIFMGNDNDALLKEMDNWPTYYPSKLNKDQIKEEMLAH >NZ_CP047792.1|WP_124780751.1|2103454_2103721_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MARLNITFSPQAFEDYKYFQQNDKKMVKKINELLKSIDRNGALKGIGKPEKLKSNLTGYYSRRINHEHRLVYTVDNNHIKIASCKYHY >NZ_CP047792.1|WP_000584500.1|2103720_2103972_-|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MIIKNYSYARQNLKALMTKVNDDSDMVTVTSTDDKNVVIMSESDYNSMMETLYLQQNPNNAEHLAQSIADLERGKTVTKDIDV >NZ_CP047792.1|WP_124780749.1|2104242_2104842_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVAYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP047792.1|WP_031865816.1|2104860_2105220_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP047792.1|WP_124780747.1|2105474_2106725_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSATHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSFDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDPMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLIAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVKTYLNHKRR >NZ_CP047792.1|WP_000615461.1|2106821_2107553_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_9 | 2683026-2683109 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047792_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047792_9
>9.1|2683054|28|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047792_9
The CRISPR arrays of NZ_CP047792_9 >merge|NZ_CP047792|9|2683026-2683109|CRISPRCasFinder AGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACACCAATTTCTACAG >NZ_CP047792|9|8|2683026-2683109|CRISPRCasFinder AGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAG ACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAT AGAGAAATTGGAACACCAATTTCTACAG
>NZ_CP047792.1|WP_124781086.1|2680636_2681428_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIABC MGNKYKDYAQDILIAVGGVENIVDVTYDTKCITIHMQHTIPSTANEVKQIVDVTSVAENDAQLVIKLKGNVDEVYQKLQRLIKNANVEEGANTDNINSQDTSYTPQVKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHEESKVIAPFNGLVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFECFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQQQGYNADVIVVISNSADLGKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >NZ_CP047792.1|WP_000922329.1|2679785_2680490_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >NZ_CP047792.1|WP_000607067.1|2678976_2679678_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NZ_CP047792.1|WP_001792906.1|2678540_2678984_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NZ_CP047792.1|WP_124781084.1|2677687_2678428_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKGDNSASAIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPTYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NZ_CP047792.1|WP_000925394.1|2675945_2677685_+|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NZ_CP047792.1|WP_000608831.1|2675010_2675685_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNDVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NZ_CP047792.1|WP_124781082.1|2673145_2674867_+|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYIAELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKLEYQPQWINALGDFIQAVPERVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGHYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMIMGMLSQTSENEVEILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NZ_CP047792.1|WP_124781080.1|2671424_2673113_+|CDP-glycerol-glycerophosphotransferase-family-protein MVKSKIYIDKIYWERVQLFVEGHSENLDLEDSNFVLRNLTETRTMKANDVKIDGNQFVCRFNVAILDNGYYLPEDKYLLVNEQELDYIAQLNPDVINDAYQNLKPEQEEEYNELETQNGKINFLLQTYLKEFRKGGISKKTVYTVTPEISSDVNEFVLDVVVTTPEVKSIYIVRKYKELRKYFRKQSFNTRQFIFKAIFNTTKFFHLKKGNTVLFTSDSRPTMSGNFEYIYNEMLRQNLDKKYDIHTVFKANITDRRGIIDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRRSQEVIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIKEKNVVPTGVPRTDVLFDEAYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGSGHGTAHYPFFKIDFERLARYCEKNNAIVLFKMHPFVKNRLNIADKHKQYFVDVSDFREVNDILFITDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEGEKVIPFLDKHFKYQDGRSSERLVRNLFGS >NZ_CP047792.1|WP_000610203.1|2670377_2671403_+|alcohol-dehydrogenase-catalytic-domain-containing-protein MINQVYQLVAPRQFEVTYNNVDIYSDYVIVRPLYMSICAADQRYYTGSRDENVLSQKLPMSLIHEGVGEVVFDSKGVFNKGTKVVMVPNTPTEKDDVIAENYLKSSYFRSSGHDGFMQDFVLLNHDRAVPLPDDIDLSIISYTELVTVSLHAIRRFEKKSISNKNTFGIWGDGNLGYITAILLRKLYPESKIYVFGKTDYKLSHFSFVDDVFFINKIPEGLTFDHAFECVGGRGSQSAINQMIDYISPEGSIALLGVSEFPVEVNTRLVLEKGLTLIGSSRSGSKDFQDVVDLYIQYPDIVDKLALLKGQEFEIATINDLTEAFEADLSTSWGKTVLKWIM >NZ_CP047792.1|WP_000031265.1|2683370_2684132_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKEATDWLIQQGAFSQDKQVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTKLRKDMNYITFVAKKEH >NZ_CP047792.1|WP_124781090.1|2684150_2684285_+|hypothetical-protein MIIIIINIAYLYAIIWKLKRLQKIVTSFITKLESSSMGLVENYF >NZ_CP047792.1|WP_000182742.1|2684381_2685296_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTAEAKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEVPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >NZ_CP047792.1|WP_000747873.1|2685323_2685728_-|D-ribose-pyranase MKKSAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >NZ_CP047792.1|WP_124781092.1|2685742_2686624_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHKIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVILLLIGEFGYWLYSAAPQASSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >NZ_CP047792.1|WP_124781094.1|2686855_2687854_-|LacI-family-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSERLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVAGFVDTLRTNQLPEPQIVHTELSKRGGLNIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVTPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >NZ_CP047792.1|WP_124781096.1|2688337_2689714_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSAFSFICLSIFIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATVTFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >NZ_CP047792.1|WP_124781098.1|2689947_2690940_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGLTHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPATANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHNADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >NZ_CP047792.1|WP_000736802.1|2691253_2692204_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHNGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >NZ_CP047792.1|WP_124781100.1|2692255_2692915_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSHRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNPINDTTINEYLQQLNFDDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPQILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWTYTYY |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_3 | 3.1|1261083|29|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1261083-1261111 | 29 | NZ_CP047792.1 | 475585-475613 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP047792_3 | 3.1|1261083|29|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1261083-1261111 | 29 | NZ_CP047792.1 | 522938-522966 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP047792_3 | 3.1|1261083|29|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1261083-1261111 | 29 | NZ_CP047792.1 | 998838-998866 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 462410-462441 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 475643-475674 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 475701-475732 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 686852-686883 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 998893-998924 | 1 | 0.969 |
| NZ_CP047792_1 | 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR | 786576-786603 | 28 | NZ_CP047792.1 | 462410-462437 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_1 | 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR | 786576-786603 | 28 | NZ_CP047792.1 | 475643-475670 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_1 | 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR | 786576-786603 | 28 | NZ_CP047792.1 | 475701-475728 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_1 | 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR | 786576-786603 | 28 | NZ_CP047792.1 | 686852-686879 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_1 | 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR | 786576-786603 | 28 | NZ_CP047792.1 | 998897-998924 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_9 | 9.1|2683054|28|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 2683054-2683081 | 28 | NZ_CP047792.1 | 1261004-1261031 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_9 | 9.1|2683054|28|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 2683054-2683081 | 28 | NZ_CP047792.1 | 1611528-1611555 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_9 | 9.1|2683054|28|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 2683054-2683081 | 28 | NZ_CP047792.1 | 1611698-1611725 | 1 | 0.964 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 41168-41199 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 470323-470354 | 2 | 0.938 |
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| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NZ_CP047792.1 | 1382426-1382457 | 2 | 0.938 |
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ttcgaatagaaattctacaggcaatgca CRISPR spacer ttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer ****** ************.********
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ttcgaatagaaattctacaggcaatgca CRISPR spacer ttcgaaaagaaattctacagacaatgca Protospacer ****** *************.*******
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ccaactctcattgcctgtagaatttctttacgaaattc CRISPR spacer ccaactcgcattgcctgtagaatttcttttcgaaattc Protospacer ******* ********************* ********
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35. spacer 5.1|1382470|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to position: 2540541-2540570, mismatch: 2, identity: 0.933
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36. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to position: 41164-41194, mismatch: 2, identity: 0.935
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcctgtagaatttctttttgaaattctcta Protospacer **.***.************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NC_021856 | Bacillus phage phiNIT1 DNA, complete genome | 11902-11932 | 4 | 0.871 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | MF422185 | Bacillus phage BSP10, complete genome | 92099-92129 | 4 | 0.871 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NC_030903 | Bacillus phage SPG24 DNA, contig00001 sequence | 87450-87480 | 4 | 0.871 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | LT960608 | Bacillus phage SBSphiJ genome assembly, complete genome: monopartite | 20551-20581 | 5 | 0.839 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NC_022771 | Bacillus phage Grass, complete genome | 10942-10972 | 5 | 0.839 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | MG000860 | Bacillus phage BSP9, complete genome | 90776-90806 | 5 | 0.839 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | CP034667 | Proteus vulgaris strain PvSC3 plasmid pPvSC3, complete sequence | 2457-2487 | 5 | 0.839 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | CP034667 | Proteus vulgaris strain PvSC3 plasmid pPvSC3, complete sequence | 278299-278329 | 5 | 0.839 |
| NZ_CP047792_3 | 3.1|1261083|29|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1261083-1261111 | 29 | NZ_CP009619 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence | 270872-270900 | 6 | 0.793 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NZ_LT984809 | Cupriavidus taiwanensis isolate Cupriavidus taiwanensis STM 8555 plasmid I, complete sequence | 102950-102980 | 6 | 0.806 |
| NZ_CP047792_1 | 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR | 786576-786603 | 28 | NC_017235 | Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-7, complete sequence | 23717-23744 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP047792_6 | 6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1384763-1384792 | 30 | KM359505 | Prochlorococcus phage P-TIM68, complete genome | 102708-102737 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NZ_CP033579 | Vibrio mediterranei strain 117-T6 plasmid unnamed, complete sequence | 179205-179235 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NZ_MG205641 | Paeniclostridium sordellii strain 7508-A plasmid pCS1-7, complete sequence | 23530-23560 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NZ_MG205643 | Paeniclostridium sordellii strain S0804018 plasmid pCS1-5, complete sequence | 17056-17086 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | NZ_MG205642 | Paeniclostridium sordellii strain 7543-A plasmid pCS1-6, complete sequence | 23530-23560 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | MH617769 | Siphoviridae sp. isolate ctjc_2, complete genome | 30761-30791 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | JF412296 | EBPR podovirus 3, partial sequence | 16302-16332 | 8 | 0.742 |
| NZ_CP047792_1 | 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 786563-786594 | 32 | NC_017235 | Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-7, complete sequence | 23713-23744 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | MN692968 | Marine virus AFVG_117M26, complete genome | 7793-7823 | 9 | 0.71 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | MN693250 | Marine virus AFVG_25M507, complete genome | 24474-24504 | 9 | 0.71 |
| NZ_CP047792_7 | 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1961804-1961834 | 31 | MN694254 | Marine virus AFVG_250M1006, complete genome | 7826-7856 | 9 | 0.71 |
| NZ_CP047792_6 | 6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1384763-1384792 | 30 | AX059140 | Sequence 1 from Patent WO0075335 | 5575-5604 | 13 | 0.567 |
| NZ_CP047792_6 | 6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder | 1384763-1384792 | 30 | NC_004735 | Rhodothermus phage RM378, complete genome | 5575-5604 | 13 | 0.567 |
1. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NC_021856 (Bacillus phage phiNIT1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer gtgtttaca-aatttctttttgaaactctcta Protospacer ***.*.** ***************.******
2. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to MF422185 (Bacillus phage BSP10, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer gtgtttaca-aatttctttttgaaactctcta Protospacer ***.*.** ***************.******
3. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NC_030903 (Bacillus phage SPG24 DNA, contig00001 sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer gtgtttaca-aatttctttttgaaactctcta Protospacer ***.*.** ***************.******
4. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to LT960608 (Bacillus phage SBSphiJ genome assembly, complete genome: monopartite) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer atgtttata-aatttctttttgaaactctcta Protospacer ***.*..* ***************.******
5. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NC_022771 (Bacillus phage Grass, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer gtgtttata-aatttctttttgaaactctcta Protospacer ***.*..* ***************.******
6. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to MG000860 (Bacillus phage BSP9, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer gtgtttata-aatttctttttgaaactctcta Protospacer ***.*..* ***************.******
7. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to CP034667 (Proteus vulgaris strain PvSC3 plasmid pPvSC3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer atctctg-ggaatttattttttaaattctcta Protospacer * **** .****** ***** **********
8. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to CP034667 (Proteus vulgaris strain PvSC3 plasmid pPvSC3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer atctctg-ggaatttattttttaaattctcta Protospacer * **** .****** ***** **********
9. spacer 3.1|1261083|29|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009619 (Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cgcattgcctgtagaatttcttttcgaaa CRISPR spacer tgcattacctgtagcatttcttttttcaa Protospacer .*****.******* *********. **
10. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT984809 (Cupriavidus taiwanensis isolate Cupriavidus taiwanensis STM 8555 plasmid I, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer ccactgcagaatttcattttgaaattttcaa Protospacer . ************ **********.** *
11. spacer 1.3|786576|28|NZ_CP047792|PILER-CR matches to NC_017235 (Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
ttcgaatagaaattctacaggcaatgca CRISPR spacer ccagaatagaaattttacaggaaatgat Protospacer .. ***********.****** ****
12. spacer 6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to KM359505 (Prochlorococcus phage P-TIM68, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tagaatttcgaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer aactatttccaaaagaaattatacagatca Protospacer * ***** ********** ******. *
13. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033579 (Vibrio mediterranei strain 117-T6 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer attctgcaaactttctttttgaaattttagg Protospacer ******.* ***************.* .
14. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG205641 (Paeniclostridium sordellii strain 7508-A plasmid pCS1-7, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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15. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG205643 (Paeniclostridium sordellii strain S0804018 plasmid pCS1-5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer taatttataaattcctttttgaaattctcta Protospacer *. .* .****.*****************
16. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG205642 (Paeniclostridium sordellii strain 7543-A plasmid pCS1-6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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17. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to MH617769 (Siphoviridae sp. isolate ctjc_2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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18. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to JF412296 (EBPR podovirus 3, partial sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer ggacactggaatttctatttggaattctcta Protospacer * * ..******** ****.*********
19. spacer 1.1|786563|32|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NC_017235 (Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gaatttcgaatagaaattctacaggcaatgca CRISPR spacer atatccagaatagaaattttacaggaaatgat Protospacer . **.. ***********.****** ****
20. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to MN692968 (Marine virus AFVG_117M26, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer caaatcaggattttctttttcaaattctcta Protospacer .. * .** ********* **********
21. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to MN693250 (Marine virus AFVG_25M507, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer cagcattagaatttcttgttgcaattctctt Protospacer .. * .********** *** ********
22. spacer 7.1|1961804|31|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to MN694254 (Marine virus AFVG_250M1006, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgtctgcagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer caaatcaggattttctttttcaaattctcta Protospacer .. * .** ********* **********
23. spacer 6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to AX059140 (Sequence 1 from Patent WO0075335) position: , mismatch: 13, identity: 0.567
-------tagaatttcgaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer
tgtaaagatgaatttcgtttcgaaattcta------- Protospacer
******** *********
24. spacer 6.1|1384763|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NC_004735 (Rhodothermus phage RM378, complete genome) position: , mismatch: 13, identity: 0.567
-------tagaatttcgaaaagaaattctacagacaa CRISPR spacer
tgtaaagatgaatttcgtttcgaaattcta------- Protospacer
******** *********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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0 : 21132
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047792|0:21132|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047792|0:21132|6307_6688_+|WP_000611452.1|DBSCAN-SWA MINVTKLIRNAIIANNITDEVNVFNYTIDDHFHEKTDKPIIRIYPLPFNPDTYADDNEISREYHYQIDVWWSQDEPNEQAEKIVELLKVINFQCYYREPLYESDVMSFRHIIRAKGSILSMKLEEN >NZ_CP047792|0:21132|14548_18334_+|WP_111744360.1|DBSCAN-SWA 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21 | Staphylococcus_phage(95.24%) | tail,protease,terminase,capsid,portal,holin,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
406079 : 413899
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047792|406079:413899|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047792|406079:413899|407795_408269_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP047792|406079:413899|407134_407821_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP047792|406079:413899|410013_410727_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP047792|406079:413899|410730_411150_-|WP_000941334.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPNTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP047792|406079:413899|412170_412764_+|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP047792|406079:413899|412747_413899_+|WP_124781459.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYCFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP047792|406079:413899|409330_409915_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP047792|406079:413899|406079_407135_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP047792|406079:413899|408610_409051_-|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP047792|406079:413899|411151_411820_-|WP_053007098.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVIFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
425870 : 440068
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047792|425870:440068|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047792|425870:440068|429436_430942_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP047792|425870:440068|428236_429154_-|WP_124781453.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTYDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP047792|425870:440068|427086_427635_+|WP_000197263.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK >NZ_CP047792|425870:440068|431281_431782_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP047792|425870:440068|433828_435934_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP047792|425870:440068|436051_437023_+|WP_000562497.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFIFDNK >NZ_CP047792|425870:440068|437398_438370_+|WP_000876312.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP047792|425870:440068|433467_433866_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP047792|425870:440068|431801_432668_-|WP_124781452.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >NZ_CP047792|425870:440068|439306_440068_+|WP_000616861.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTIHNQTILEDISIVIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRHRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLQMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGRLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP047792|425870:440068|425870_426929_+|WP_000663021.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP047792|425870:440068|438353_439310_+|WP_124781451.1|DBSCAN-SWA MMRNNKKIIILMTATLLISLLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVALLIITIYLLPCLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRILLVIVSILVSISTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
610240 : 668518
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047792|610240:668518|DBSCAN-SWA 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56 | Planktothrix_phage(22.22%) | transposase,protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
688224 : 696697
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047792|688224:696697|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAATGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAATATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAGAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTATTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAATTATTATGTGAAAAGCACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAGGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAGGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAGGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAGCAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCTAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGTGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACGTCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAACAATTAATGGATGAGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGATTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTTTTAGAAGATAAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGGTTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATAGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCTTTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGCGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTTGTCGATATCGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATATCAAGGTGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGTGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCTGGAGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGCAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGTGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTACGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATTGGTGAAGTAACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATTTGAAGACGAAGTTTATGCTGATATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATACGATCAATACGATCAACAAGTTGGTGCAAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGTAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACTGACTGCTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATTTATCAACAATTAGCAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCTTGCGACATACTTAAGACACCTGTTGTTTCTGGAAACGTTTCTTTATACAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCGACACCAGTCGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTCAACCTAAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAATGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047792|688224:696697|689821_690526_+|WP_124780274.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNLITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDEMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP047792|688224:696697|690790_691462_+|WP_029549731.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP047792|688224:696697|688224_688707_+|WP_000861570.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP047792|688224:696697|688693_689818_+|WP_124780272.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKHNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP047792|688224:696697|695099_696128_+|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP047792|688224:696697|693622_695107_+|WP_000483707.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP047792|688224:696697|691454_693644_+|WP_124780278.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTFEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFQPKVGDKLYLIGDTNDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGETLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP047792|688224:696697|690525_690789_+|WP_124780276.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDKKENA >NZ_CP047792|688224:696697|696130_696697_+|WP_000238666.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
953454 : 960616
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047792|953454:960616|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATAACGAGTTATCAAATTAATAAAGATACTGGGATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATTTGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGTGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGCGAAAGAAATCATGTTTAGTGATTTACTGTAAATGTCAATATAAAAATGTACATAAATGATTTTATAAGAATGTACAAAATTGTTTGCTAAGTAATTTCCTTCTTAGGTGAATGATCTTTTAATCTATACGATTTGCCTTTGATTTTAACTACACTTGAATGATGCAATATCCTATCCAAAATCGCATTTGCGATTTTTGGATCATCAAATATTTCATTCCATAAGTTGAAATTGATATTTGTGGTAAATATTGTACTTTTCTTTTCATATCTTAAATCTATTAATTGAAAGAATAGTTTGGCATCTTCACTTCCAATAGGTAAGTACCCAATCTCATCTATGATTAATAACTTATACTTGCTATAGTGCTTCAATCTATTTTCTAATCTGTTCTCAAGTTTTGCTTTTCTTAAATTCTCTATCAAATGATGACATTTAATAAAGTAAGTACTCACTCTATTTTTAGCTGCAGCCATACCAATGCCTGTAGCTAAATGTGTTTTGCCAACGCCACTTGAGCCTAAAAAGACAATGTTTTGATATTTTTCTATAAAACGCAAATCTGTAAAATCCCAAATTTCTTGTTGATTGATGCTCGGTTGAAAATTAAAGTCAAAGTCTGATATTTCTTTTTTAAACGGAAATGCCGCCACCTTTACCATCGATTCAATCAAATTTTTCTCTTTAATTTCGATTTCGTAGTCACTTAATTTAATTAGTGTATCTATAAATGACAGGTTGTTTTTAATACTAAAATCGATAACATCATCAAGATGATTAATCATTTGATTCATTTTCAAATATTCTAAATTCGCTTTTAAGCGCTTATAATTCGTCGAATTATTCATCATACAACTCTCCAATCGCATTCAAATTATCTATCGCAATCTGATTAATATCATCCATTTCTCTATTTCCAAAAGAAGATGACAGTGTTTCTAAATAATGTTCTTTTTGATAATTTAATTTACGTTGTGTGATGAGATGATCACAAATCGATTTAGTGTTATAATAAACGTGTAGTTTTTGATCATAAACTTGAACTTCAACTATTTTCCCACAATATTCAGCTGGTACTGAATATTGATTGGACTTATATGTAATCATATTAGAGCGGTTGACTTTCAAATATTTATGTTTCACTTTATATGAGTTTCTTACATTCACATTCGGTAGTGGTTGTAAGAAACTTTTTTCTTTTTCTAAAGCAATAATAGGTATTTTACCTGTACTCGTATGAACTGAGTAGTTCAGTCGCTCATTAATATTAGAAATAAACTTAGGAATCTCTTCCAAATATAATTCGCCTTGATATGCATGAATTTCATCTAATATTTTCATTATCGATTCAACTTTACCCTTTGTTCTAGGACGGCCGGCAATACAAGGTTTTACTTTAAAATTAAAATCATCAGCGAATTGTTTAAATCTGCGATTTATTTGACCATTTGTACGTTCTGTTCTTGGTTGATCCATGACCGTTTTCATGTTATCCGTTACAAGTTCATTAGGCACACCTCCCATTAGCTCAAACGCTTGTGTCAATAAATTAAATAAGACATCACTTGATTTATTCATTGTCACTTGCATGATTACAAAACGGGAATAAGGAAGTAGTAGTACGCCTATATTTAGTGAAACGATTTGATTATCCTTCGTTTTAAAGTTAATACCTTCTTTCCAGTCAAACTGTGCTTGATGACCGGCTTTTGTCTCGAATCTCGTTGTGCCTTTAGGCGACATCTGTTGATAACCTTTCATAAAATAACGATTAAACTCATCATGTTTAAGGATATAAGCTCTAAATGTAGAATAGGCACACGTTAACCCATGTTTATCCTTCAAATATTGCCAAAGAATACGCTTATAGTAGAACTTTTGTTCACTAGAGTCTGAAAGTAATTTTTCGATGATAGGGTAATACTTGTCAATAATAGACTGACGATTTCTCTTTTTGGTTGGCTCAAAGCCATTTAAATATTTATCAACTGTTCTTCTATCAACACCCATGTGTCTTGCTATTTCACTTTTGTTTATTTTCATGTTTAAGTTCTCCATAACAATTTTTAATTTTGGTAAATCTGTAAGAGTAGTAACTTCAAAATCAGTATTTATGTCTAAAGATAATTTCATTGTTGTTCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTGTTTAAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAAAGTGTACATTATTAAATTATCATTTCCAATTTACTTATGTTTTTCAAAATAGTATAATAATTTTATATAATACATAGAACTTCAGTATATCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTAATACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGTGATTTTGAAAAATATAGGTTATTATAATTTAGAATTGCAAATTATAAATCTTGTCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACAACAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCATAATAATTCAAGTGCTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGTAAAGAACAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAACTATTCTTTCATTTTTACAAAAATTATGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATTAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGACATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATCTAATTTTAAAGTATATTAAATATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCAAATAATATAATATAGAATAGATTGAGACAAGAAATTTTATCAATATATAATAAAAAACGCCAATACTATTAGGTATTAGTTTATGAATTAACTAGATTGGCAAATACAAAGAAACAATCTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATAATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGGATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTCGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGATGGACAAGAGATTAAATTTCTAATAATTTCATGATTGTGTGTCCACGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAATGTATGCATTTTTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAGAAGGCTGAACACAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGTATTCTATACTATACATATTTTGTAATAATGTTTATGTGCATAATTTTTCATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTCTAATATAGCATTTGATTTTATGATTTTTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGCCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTCAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATACGAAGTCATATTCTTTAAATAAAATATTACTTTCTCACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTTTAGTAATATTAGGGTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGAAAAAATTAAAGTCTAAAGATATCTCAATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAGTTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACACTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACTTTAGAAGTGGTTGTAAACTTCAATGAATACTAAACGTTGAAGTTTAGTAAAAGACGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGAAAAGTCGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCCATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047792|953454:960616|958504_958699_+|WP_001798537.1|DBSCAN-SWA MKKCQNTRKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTERLYEYANKVL >NZ_CP047792|953454:960616|957974_958085_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_CP047792|953454:960616|957066_957273_+|WP_072468186.1|DBSCAN-SWA MDEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKSSENNSEC >NZ_CP047792|953454:960616|956558_956771_+|WP_001071312.1|DBSCAN-SWA MNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NZ_CP047792|953454:960616|960167_960422_+|WP_001813273.1|DBSCAN-SWA MKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENERKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK >NZ_CP047792|953454:960616|954581_955874_-|WP_124781593.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLSLDINTDFEVTTLTDLPKLKIVMENLNMKINKSEIARHMGVDRRTVDKYLNGFEPTKKRNRQSIIDKYYPIIEKLLSDSSEQKFYYKRILWQYLKDKHGLTCAYSTFRAYILKHDEFNRYFMKGYQQMSPKGTTRFETKAGHQAQFDWKEGINFKTKDNQIVSLNIGVLLLPYSRFVIMQVTMNKSSDVLFNLLTQAFELMGGVPNELVTDNMKTVMDQPRTERTNGQINRRFKQFADDFNFKVKPCIAGRPRTKGKVESIMKILDEIHAYQGELYLEEIPKFISNINERLNYSVHTSTGKIPIIALEKEKSFLQPLPNVNVRNSYKVKHKYLKVNRSNMITYKSNQYSVPAEYCGKIVEVQVYDQKLHVYYNTKSICDHLITQRKLNYQKEHYLETLSSSFGNREMDDINQIAIDNLNAIGELYDE >NZ_CP047792|953454:960616|953827_954589_-|WP_001066123.1|DBSCAN-SWA MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKIKGKSYRLKDHSPKKEIT >NZ_CP047792|953454:960616|960421_960616_+|WP_160194529.1|DBSCAN-SWA MKSWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NZ_CP047792|953454:960616|953454_953652_+|WP_124781491.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEITSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEFAKKVL >NZ_CP047792|953454:960616|959210_959315_+|WP_000477494.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLRERKIIKNKI |
10 | Staphylococcus_phage(75.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1232649 : 1240961
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047792|1232649:1240961|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCCGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAAGGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAACTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCTATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCGTTATCTCTACTATTACAGAAAACAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATATGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTCAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGGTGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCGATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATAGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTTAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCGGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATGGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTTGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTTAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGCGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCAATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAATACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCTACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAACCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCCGACAACTGTGTCCCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGTGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAGTCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATATCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047792|1232649:1240961|1235920_1237021_-|WP_124780605.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGLFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP047792|1232649:1240961|1232649_1233435_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP047792|1232649:1240961|1237023_1237701_-|WP_000624563.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP047792|1232649:1240961|1234460_1235807_-|WP_160194546.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTYIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIVFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP047792|1232649:1240961|1239161_1240961_-|WP_001217248.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP047792|1232649:1240961|1233560_1234451_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP047792|1232649:1240961|1237831_1238938_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1310325 : 1319368
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047792|1310325:1319368|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGTGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATACACTTTGCTGGAATCAATCGATTTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAAATTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGTATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGTCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGATTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTATCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGATATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCGTCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGTTGGTTTAATTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTTAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTCGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAAGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAACCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAACAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACAGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCATCGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAGATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTTGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGTGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCACCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATCGCAGGGTATAATACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGCCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047792|1310325:1319368|1316174_1317314_-|WP_061642320.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRLLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP047792|1310325:1319368|1318363_1319368_-|WP_123097175.1|DBSCAN-SWA MDERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP047792|1310325:1319368|1310325_1310844_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP047792|1310325:1319368|1315895_1316156_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP047792|1310325:1319368|1317336_1318362_-|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP047792|1310325:1319368|1313341_1315621_-|WP_124780565.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAVIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP047792|1310325:1319368|1310865_1313139_-|WP_124780567.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLIKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKILNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKKSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1444468 : 1489588
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047792|1444468:1489588|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCTTTTTTAGAACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGCGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAGCCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCTCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATGCTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTATTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAATGTGTAACACGCGCAAGATCATCATTAATTGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGAGTCATAAATGTTTTGTAACTGCGCTAAAATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTCTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCTTTTCTTTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTTATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAGAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCATCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTAGTATCTAGCGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGGTTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTACGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATTGTTTGATTTCTAACATCATTTACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATCTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTTATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGATTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTGTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCTTGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCAGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCGTTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTCGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCCGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGTTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCACTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACAGCTTCAATACGTTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGTGCTGCTTGCTTTTTCACTACGTCAACTAAAACAGCATCGATATTATTCTCTGCTGTTGTCGCAGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATTCGCTTGCTTGACACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAATGTTAATTGCAGCATTCTTCTCATCGTCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCTCCGTTTGTATCAGCTTGATTAATATTATTAATTGCCGTTGCTAATTCTTGGTCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCAGTGGTTGCATTTGTATTTTGATTAATTTCTTGTTTTTTTGCAGTTGCTAAGTCAGTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTAACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCATTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAGCATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCGATGGCATTTTTTGCATCTGATTTTACCTTAGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCAACATCATCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTGGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATCGCTGCTTGTCTTTCCTCTTGAGTAGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCAATATGTTGTTGTGCATCATGTGTTACGGCATCTCTTGCTGCTTGCTTGACAACAGTTACAGGCGCAATAGGATTAATGGCATTCAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGCTCTAATGCGTGGTTCGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTACTATTTATTTGTTGTCGTTTCGTTGCTGTCGCTTGGTTAATAGCATCTCTTGCTGCCTGTTTGTGTGTCACTTGTGGAGCAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCATCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCTGTAGCTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCATCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTAATAATCTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCTCCACTTAATGTCTGTATACCTTGATCTTTAATTCTAGTTACGCCTTCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTACCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAGTCTTCCATTTGATCAACTTTTTTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTTCGAATTAATGTGTGTTGCATTTGATTAGTTAATGAATCAATATCTGCTTGAGAAACTCTGTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCATCTAAAATCGTTTGCGCGCGTCGTTTCAAACCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCTTGTTGAATGCGTCTATCAACTTCGGCTTGTAATGCATCTTTATTCATTATGATATCGATAGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATATGTTTTATATGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGTACATTATTAACACGCAGCTTATACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCGTGCCGGCGAATTACCTGAACCT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43 | Staphylococcus_phage(94.29%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_10 |
1500328 : 1525658
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047792|1500328:1525658|DBSCAN-SWA 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19 | Staphylococcus_phage(88.24%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1612243 : 1715886
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP047792|1612243:1715886|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(83.56%) | tail,tRNA,protease,terminase,capsid,portal,transposase,holin,head,integrase | attL 1611747:1611767|attR 1710964:1710984 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
2742782 : 2760733
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP047792|2742782:2760733|DBSCAN-SWA 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MIKQILRLLFLLAMYELGKYVTEQVYIMMTANDDVEAPSDYVFRAEVSE >NZ_CP047792|2742782:2760733|2748525_2748852_+|WP_001025595.1|DBSCAN-SWA MNIQKVMKLILKKIHEMREILKKFNKNIRHKDLIVIKVKDENSVPLVIYKGGELKSKRVVKFLWVTRNGNYEGGYDINIEHYAKSEKGRPGRYEKSGFRSLFFKEDSQ >NZ_CP047792|2742782:2760733|2756071_2756443_+|WP_160194613.1|DBSCAN-SWA MARKARIVTINDKPYRFTKSEMELIESHGITAGMVSKRVKDGWELHEAMDAPEGTRLSEYREKKTIERLEQARLERKLERKRKKEAELRRKKPHLFNVPQKHSRDPYWFDNTYNQMFKKWQEV >NZ_CP047792|2742782:2760733|2744709_2744856_-|WP_001795334.1|DBSCAN-SWA MNGGENFMVDKNKKQETTRSNPLNKSFEKSGASEKLKSTLSEKAKKKD >NZ_CP047792|2742782:2760733|2746238_2746547_+|WP_001153965.1|DBSCAN-SWA MQDQSLKLVKLQLKYHNLSGQIEAYDKSLKEIRYTRDLFNKHLSMNNEDAFAGLEMVEDEITKKLRSAIKEFQKVVKALDKLNGVESDNKVTDLTEWRKVNQ >NZ_CP047792|2742782:2760733|2759791_2760136_+|WP_000817289.1|DBSCAN-SWA MKRCGHPTCNVLINHNESYCDKHKQYANENYNDLRRRNDPEYLRFYKSKTWQNMRRIVLLEHDFICVSCGNQATMVDHIVPTKIDWARRLDKSNLQPLCDACHNQKTKEDLKKY |
38 | Staphylococcus_phage(86.84%) | terminase,integrase | attL 2737764:2737779|attR 2750615:2750630 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP047792.1|WP_000681966.1|1659992_1660169_-|hypothetical-protein |
1659992_1660169_-
Protein sequences of NZ_CP047792.1|WP_000681966.1|1659992_1660169_-|hypothetical-protein>NZ_CP047792.1|WP_000681966.1|1659992_1660169_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK |
58 aa aa | NA | NA | NA | 1612243-1715886 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1382470|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047792 position: 1710979-1710950, mismatch: 2 gccccaacatagagaaattggatccccaat CRISPR spacer gccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer ********* *************.****** |
||||||||||||||
| NZ_CP047792.1|WP_000990056.1|1660410_1660509_-|hypothetical-protein |
1660410_1660509_-
Protein sequences of NZ_CP047792.1|WP_000990056.1|1660410_1660509_-|hypothetical-protein>NZ_CP047792.1|WP_000990056.1|1660410_1660509_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA | NA | NA | 1612243-1715886 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1382470|30|NZ_CP047792|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047792 position: 1710979-1710950, mismatch: 2 gccccaacatagagaaattggatccccaat CRISPR spacer gccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer ********* *************.****** |