Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835 | Staphylococcus aureus strain UP_883 chromosome, complete genome | 12 crisprs | csa3,cas3,DinG,DEDDh,WYL,RT | 6 | 5 | 10 | 0 |
NZ_CP047836 | Staphylococcus aureus strain UP_883 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_1 | 390774-390855 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_1
>1.1|390798|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder ACGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGTAAAGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_1
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_1 >merge|NZ_CP047835|1|390774-390855|CRISPRCasFinder TTCAACAGGCAATGGAAGTTGGGGACGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGTAAAGAAATTCTACAGGCAATGGAAGTTGGGG >NZ_CP047835|1|1|390774-390855|CRISPRCasFinder TTCAACAGGCAATGGAAGTTGGGG ACGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGTAAAGAAA TTCTACAGGCAATGGAAGTTGGGG
>NZ_CP047835.1|WP_000066091.1|389373_390492_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVIGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKVFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NZ_CP047835.1|WP_000409158.1|388230_389373_+|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMMIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLHVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSITAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVETMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NZ_CP047835.1|WP_000985882.1|386905_387919_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGDDERTAINDMVKLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHELQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NZ_CP047835.1|WP_000009237.1|386523_386670_+|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKEKEDKEK >NZ_CP047835.1|WP_000752909.1|386301_386484_+|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NZ_CP047835.1|WP_000704122.1|385779_386202_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NZ_CP047835.1|WP_160193043.1|384420_385695_-|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPRGIIRRMVDTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNDEDVRQALTRAIEDEENGLKTYQPKIDEDAMTYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVDQIPNHLKDGHYQGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLKEIYNNLLKQRP >NZ_CP047835.1|WP_000682646.1|383486_384260_+|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHMFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKVISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NZ_CP047835.1|WP_031824596.1|383358_383487_+|hypothetical-protein MGLIGFNKCFLVEFWENNQSDNAKHKILSYYVLMYKSVKEVK >NZ_CP047835.1|WP_063651405.1|381259_383026_+|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINKSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDDEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKDMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWSLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH >NZ_CP047835.1|WP_160193044.1|391126_391795_+|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQTLFGNIEEDPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFYNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEAITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NZ_CP047835.1|WP_001283307.1|391796_394274_+|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIIPIVKQYFRMLQRPILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFNSEDEEMLENTATNDTGASQTTIDDQVEAPMSSNDSEEVMSDSTKTDTNVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NZ_CP047835.1|WP_000734079.1|394616_397247_+|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKATTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGTTVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQLKVKSDDQVVDKLTQLQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINGYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NZ_CP047835.1|WP_000426912.1|397309_397570_+|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NZ_CP047835.1|WP_000939059.1|397573_398002_+|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NZ_CP047835.1|WP_000134779.1|398016_398325_+|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NZ_CP047835.1|WP_000342266.1|398609_399248_+|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEVNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NZ_CP047835.1|WP_000137775.1|399250_400174_+|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLMDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NZ_CP047835.1|WP_000848304.1|400185_401454_+|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NZ_CP047835.1|WP_000648617.1|401453_402077_+|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_2 | 423230-423309 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_2
>2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder CGAAAAGAAATTCTACAGGTAATGCAAGTTGGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_2
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_2 >merge|NZ_CP047835|2|423230-423309|CRISPRCasFinder TGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGTAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATT >NZ_CP047835|2|2|423230-423309|CRISPRCasFinder TGGGGCCCCAACATAGAGAATTT CGAAAAGAAATTCTACAGGTAATGCAAGTTGGGG TGGGGCCCCAACATAGAGAAATT
>NZ_CP047835.1|WP_000368341.1|421267_423091_+|elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCVLRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >NZ_CP047835.1|WP_001274017.1|420670_420922_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >NZ_CP047835.1|WP_001282562.1|419651_420626_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIIDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >NZ_CP047835.1|WP_000953312.1|417447_419595_+|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTNKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNDNKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYKPLKRLNLPLFVIKGITIIVLALFAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >NZ_CP047835.1|WP_000439693.1|416927_417389_+|ComE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >NZ_CP047835.1|WP_001788928.1|416149_416836_+|ComEA-family-DNA-binding-protein MVLLYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTT >NZ_CP047835.1|WP_000084829.1|415393_416110_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDAERLFFIAKK >NZ_CP047835.1|WP_001088020.1|415037_415391_+|ribosome-silencing-factor MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >NZ_CP047835.1|WP_001019324.1|414452_415037_+|HD-domain-containing-protein MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >NZ_CP047835.1|WP_000725167.1|413893_414463_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH >NZ_CP047835.1|WP_000218105.1|423654_424779_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDVIALTNRGKVIGNEVFEAFLIND >NZ_CP047835.1|WP_000627140.1|424879_425857_+|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFNNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLLNTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >NZ_CP047835.1|WP_000182215.1|425888_426515_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNVKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >NZ_CP047835.1|WP_000034716.1|426583_428416_+|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >NZ_CP047835.1|WP_001119021.1|428551_429691_+|molecular-chaperone-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >NZ_CP047835.1|WP_001104606.1|429694_430633_+|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVNVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >NZ_CP047835.1|WP_001190118.1|430634_431387_+|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVAKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >NZ_CP047835.1|WP_000108667.1|431393_432740_+|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >NZ_CP047835.1|WP_000048060.1|433032_433209_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >NZ_CP047835.1|WP_001802667.1|433452_434136_+|hypothetical-protein MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_3 | 898049-898130 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_3
>3.1|898075|30|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder TTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_3
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_3 >merge|NZ_CP047835|3|898049-898130|CRISPRCasFinder CTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCACTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA >NZ_CP047835|3|3|898049-898130|CRISPRCasFinder CTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA TTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCA CTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA
>NZ_CP047835.1|WP_000335234.1|897116_897833_+|superantigen-like-protein-SSL12 MCKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP047835.1|WP_001063558.1|896283_897009_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDHETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP047835.1|WP_000739541.1|895463_896189_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >NZ_CP047835.1|WP_000793607.1|894024_895026_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP047835.1|WP_001074342.1|893069_894002_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP047835.1|WP_086037085.1|891341_892847_-|YfcC-family-protein MPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >NZ_CP047835.1|WP_000149423.1|890807_891035_-|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_CP047835.1|WP_001239286.1|889555_890503_+|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NZ_CP047835.1|WP_001245802.1|889118_889307_-|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN >NZ_CP047835.1|WP_000398672.1|888079_888214_-|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF >NZ_CP047835.1|WP_001802045.1|898390_898615_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP047835.1|WP_000765708.1|898571_898718_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP047835.1|WP_000857488.1|899390_900350_+|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP047835.1|WP_000231632.1|900826_901060_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP047835.1|WP_001032817.1|901681_901867_+|hypothetical-protein MNKHINKKATKLLEDYKKVQQRKSEETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP047835.1|WP_000669537.1|902406_902757_-|complement-inhibitor-SCIN-B MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >NZ_CP047835.1|WP_000791580.1|902910_903408_-|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP047835.1|WP_000584398.1|903666_904173_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP047835.1|WP_000739564.1|904843_905245_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSIYWD >NZ_CP047835.1|WP_000739210.1|905613_905943_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047835_4 | 920958-921049 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_4
>4.1|920982|44|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder GGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_4
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_4 >merge|NZ_CP047835|4|920958-921049|CRISPRCasFinder CCTCTTTGATTTTTAATCATTAGAGGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTTCCTCTTTGATTTTTAATCATTATA >NZ_CP047835|4|4|920958-921049|CRISPRCasFinder CCTCTTTGATTTTTAATCATTAGA GGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTT CCTCTTTGATTTTTAATCATTATA
>NZ_CP047835.1|WP_000191455.1|919391_919658_-|cell-division-protein-ZapA MTQFKNKVNVSINDQLFTIVGEDNPEHIRYVAHLVDDKIKELGYKAAGLDTSRKAILTAVNIMHEKVLLEEENRRLKQQIHKLQQREQ >NZ_CP047835.1|WP_000234068.1|918869_919391_-|CvpA-family-protein MVIDFIIIIFFVYFVIVGFRRGFWLSMIHLSATIVSLWIASQFYKSIVERLIVFIPYPKTTAFNTTFAFHFNHLQNRFEAIVAFLMITLFCKFILYLIIVTFDKIIAYQNIHIFSRAMGMIVGVFMTIIVLHFTLYLLALYPNEALQHQLKISIVSHSLIFHIPYLSAFTINL >NZ_CP047835.1|WP_000161942.1|917084_918797_-|DNA-polymerase/3'-5'-exonuclease-PolX MTKKDVIKLLEQIATYMELKGENTFKISAYRKAAQSLELDERPLDEISDVTELKGIGKGVAEVINDYRETGESQYLQQLQEEVPEGLIPLLKIQGLGSKKIAKLYKELNIVDKASLQVACENGKVSELSGFAKKTEQNILEAVKQLGAKKDRYPIDQMRRLNQEIIDYIDTLNYIDQYSSAGSFRRFKEMSKDLDFIISTDNPKAVQQQLLNIPNKVKEVAVGNTKVSLELAYDDETIGVDFRLIEPSAFYHTLQHFTGSKEHNIRIRQLAKARDEKVSEYGIEQADGTLIQYDSEAKIYEHFNVNFIPPAMREDGSEFDKDLSNIITIDDINGDIHMHTTYSDGAFSIRDMVEANIAKGYKFMVITDHSQSLRVANGLQVERLLRQNEEIKALDKEYSEIDIYSGTEMDILPDGSLDYDDEILAQLDYVIGAIHQSFNQSEEQIMERLANACRNPYVRHIAHPTGRIIGRRDGYKPNIEQLMALAEETNTVLEINANPHRLDLSADIVRKYPNVKLTINTDAHHTNHLDFMNYGVATAQKGFVTKDRVINALSREAFKDFIENNTKLKK >NZ_CP047835.1|WP_001249281.1|914726_917075_-|endonuclease-MutS2 MRQKTLDVLEFEKIKSLVANETISDLGLEKVNQMMPATNFETVVFQMEETDEIAQIYNKHRLPSLSGLSKVSAFIHRADIGGVLNVSELNLIKRLIQVQNQFKTFYNQLVEEDEGVKYPILDDKMNQLPVLTDLFQQINETCDTYDLYDNASYELQGIRSKISSTNQRIRQNLDRIVKSQANQKKLSDAIVTVRNERNVIPVKAEYRQDFNGIVHDQSASGQTLYIEPSSVVEMNNQISRLRHDEAIEKERILTQLTGYVAADKDALLVAEQVMGQLDFLIAKARYSRSIKGTKPIFKEDRTVYLPKAYHPLLNRETVVANTIEFMEDIETVIITGPNTGGKTVTLKTLGLIIVMAQSGLLIPTLDGSQLSVFKNVYCDIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIVEILKHADKHSLVLFDELGAGTDPSEGAALAMSILDHVRKIGSLVMATTHYPELKAYSYNREGVMNASVEFDVDTLSPTYKLLMGVPGRSNAFDISKKLGLSLNIINKAKTMIGTDEKEINEMIESLEHNYKRVETQRLELDRLVKEAEQVHDDLSKQYQQFQNYEKSLIEEAKEKANQKIKAATKEADDIIKDLRQLREQKGADVKEHELIDKKKRLDDHYEAKSIKQNVQKQKYDKIVAGDEVKVLSYGQKGEVLEIVNDEEAIVQMGIIKMKLPIEDLEKKQKEKVKPTKMVTRQNRQTIKTELDLRGYRYEDALIELDQYLDQAVLSNYEQVYIIHGKGTGALQKGVQQHLKKHKSVSDFRGGMPSEGGFGVTVATLK >NZ_CP047835.1|WP_001018928.1|914239_914554_-|thioredoxin MAIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGPCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL >NZ_CP047835.1|WP_000390539.1|912133_913915_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MEDYKQRIKNKLNVVPMEPGCYLMKDRNDQVIYVGKAKKLRNRLRSYFTGAHDAKTTRLVGEIRRFEFIVTSSETESLLLELNLIKQYQPRYNILLKDDKSYPFIKITKEKYPRLQVTRTVKQGTGKYFGPYPNAYSAQETKKLLDRIYPYRKCDKMPDKLCLYYHIGQCLGPCVYDVDLSKYAQMTKEITDFLNGEDKTILKSLEERMLTASESLDFERAKEYRDLIQHIQNLTNKQKIMSSDKTIRDVFGYSVDKGWMCIQVFFIRQGNMIKRDTTMIPLQQTEEEEFYTFIGQFYSLNQHILPKEVHVPRNLDKEMIQSVVDTKIVQPARGPKKDMVDLAAHNAKVSLNNKFELISRDESRTIKAIEELGTQMGIQTPIRIEAFDNSNIQGVDPVSAMVTFVDGKPDKKNYRKYKIKTVKGPDDYKSMREVVRRRYSRVLNEGLPLPDLIIVDGGKGHMNGVIDVLQNELGLDIPVAGLQKNDKHQTSELLYGASAEIVPLKKNSQAFYLLHRIQDEVHRFAITFHRQTRQKTGLKSILDDIDGIGNKRKTLLLRSFGSIKKMKEATLEDFKNIGIPENVAKNLHEQLHK >NZ_CP047835.1|WP_000079317.1|911195_911810_-|succinate-dehydrogenase-cytochrome-B558 MAQSKNEFYLRRIHSLLGIIPIGAFLVVHLLVNHQATQGAEAFNKASNFMESLPFLIIVEFLFIYIPLLYHGLFGIHIAFTAKENVGHYSIFRNWMFFFQRVSGILTFIFIGIHLWQTRLQKAFYGKEVNYDLMHETLQHPGWAIFYIICIIAVVFHFANGLWSFLVTWGGLQSPKSQRVFTWVSLIVFLVISYIGVTAIIAFM >NZ_CP047835.1|WP_000818278.1|909377_911144_-|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MAEKHLIVVGGGLAGLMSTIKAAEKGAHVDLFSVVPVKRSHSVCAQGGINGAVNTKGEGDSPWIHFDDTVYGGDFLANQPPVKAMTEAAPKIIHLLDRMGVMFNRTNEGLLDFRRFGGTLHHRTAYAGATTGQQLLYALDEQVRAYEVDGLVTKYEGWEFLGIVKGDDDSARGIVAQNMTTAEIETFGSDAVIMATGGPGIIFGKTTNSMINTGSAASIVYQQGAIYANGEFIQIHPTAIPGDDKLRLMSESARGEGGRIWTYKDGKPWYFLEEKYPDYGNLVPRDIATREIFDVCINQKLGINGENMVYLDLSHKDPHELDVKLGGIIEIYEKFTGDDPRKVPMKIFPAVHYSMGGLYVDYDQMTNIKGLFAAGECDFSQHGGNRLGANSLLSAIYGGTVAGPNAIDYISNIDRSYTDMDESIFEKRKAEEQERFDKLLAMRGTENAYKLHRELGEIMTANVTVVRENEKLLETDKKIVELMKRYEDIDMEDTQTWSNQAVFFTRQLWNMLVLARVITIGAYNRNESRGAHYKPEFPERNDEEWLKTTMASFQGAFEKPQFTYDDVDVSLIPPRKRDYTSKSKGGKK >NZ_CP047835.1|WP_000139712.1|908562_909378_-|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MTEQSVKNTPQHETQSKPKQKTVKLIIKRQDTSDSKPYEETFEIPYRENLNVIACLMEIRRNPVNIKGEKTTPVVWDMNCLEEVCGACSMVINGRARQSCSAIVDQLEQPIRLEPMNTFPVIRDLQVDRSRMFDNLKRMKAWIPIDGTYDLGPGPRMPEKKRQTAYELSKCMTCGVCLEVCPNVTENNKFVGAQAISQVRLFNLHPTGSMTKDERLNALMGTGGLQQCGNSQNCVNACPKGIPLTTSIAAMNRETTFHMFKSFFGSDHEVE >NZ_CP047835.1|WP_001039659.1|907526_908327_-|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND >NZ_CP047835.1|WP_000908983.1|921268_923671_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta 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MSEQQTMSELKQQALVDINEANDERALQEVKVKYLGKKGSVSGLMKLMKDLPNKDKPAFGQKVNELRQTIQNELDERQQMLVKEKLNKQLAEETIDVSLPGRHIEIGSKHPLTRTIEEIEDLFLGLGYEIVNGYEVEQDHYNFEMLNLPKSHPARDMQDSFYITDEILLRTHTSPVQARTMESRHGQGPVKIICPGKVYRRDSDDATHSHQFTQIEGLVVDKNVKMSDLKGTLELLAKKLFGADREIRLRPSYFPFTEPSVEVDVSCFKCKGKGCNVCKHTGWIEILGAGMVHPNVLEMAGFDSSEYSGFAFGMGPDRIAMLKYGIEDIRHFYTNDVRFLDQFKAVEDRGDM >NZ_CP047835.1|WP_000435374.1|925109_925850_-|RNA-methyltransferase MEQITSAQNNRIKQANKLKKKRERDKTGLALIEGVHLIEEAYQSGIVITQLFAIEPARLDQQIIAYAQEVFEINMKVAESLSGTVTPQGFFAIIEKPHYDISKAQQVLLIDRVQDPGNLGTLIRTADAAGMDAVIMEKGTTDPYQDKVLRASQGSVFHLPVMTQDLDTFITQFNGPVYGTALENAVAYKEVTSSDSFALLLGNEGEGVNPELLAHTTQNLIIPIYGKAESLNVAIAGSILLYHLKG >NZ_CP047835.1|WP_001788617.1|926089_926197_-|hypothetical-protein MVLLAFVTTIHDTDDGRFFNEHKHANNKLLKHSLI >NZ_CP047835.1|WP_000670950.1|926233_926557_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdG MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHGIETLEGFDGMFVTQTLEQEDFDEVKILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDESSPIINNKVITYDIGYSYMK >NZ_CP047835.1|WP_001242423.1|926575_927310_-|class-B-sortase MRMKRFLTIVQILLVVIIIIFGYKIVQTYIEDKQERANYEKLQQKFQMLMSKHQAHVRPQFESLEKINKDIVGWIKLSGTSLNYPVLQGKTNHDYLNLDFEREHRRKGSIFMDFRNELKNLNHNTILYGHHVGDNTMFDVLEDYLKQSFYEKHKIIEFDNKYGKYQLQVFSAYKTTTKDNYIRTEFENDQDYQQFLNETKRKSVINSDVNVTVKDKIMTLSTCEDAYSETTKRIVVVAKIIKVS >NZ_CP047835.1|WP_001566586.1|927371_928340_-|iron-ABC-transporter-permease MMIKNKKKLLFLCLLVILIATAYISFVTGTIKLSFNDLITKFTTGNNEAVDSIIDLRLPRILIALMVGAMLAVSGALLQAALQNPLAEANIIGVSSGALIMRALCMLFIPQLYFYLPLLSFIGGLIPFLIIILLHSKFRFNAVSMILVGVALFVLLNGVLEILTQNPLMKIPQGLTMKIWSDVYILAVSALLGLILTLLLSPKLNLLNLDDIQARSIGFNIDRYRWLTGLLAVFLASATVAIVGQLAFLGIIVPHVVRKLVGGNYRVLIPFSTVIGAWLLLVADLLGRVIQPPLEIPANAILMIVGGPMLIYLICQSQRNRI >NZ_CP047835.1|WP_001220194.1|928349_929228_-|heme-ABC-transporter-substrate-binding-protein-IsdE MRIIKYLTILVISVVILTSCQSSSSQESTKSDEFRIVPTTVALTMTLDKLDLPIVGKPTSYKTLPNRYKDVPEIGQPMEPNVEAVKKLKPTHVLSVSTIKDEMQPFYKQLNMKGYFYDFDSLKGMQKSITQLGDQFNRKAQAKELNDHLNSVKQKIENKAAKQKKHPKVLILMGVPGSYLVATDKSYIGDLVKIAGGENVIKVKDRQYISSNTENLLNINPDIILRLPHGMPEEVKKMFQKEFKQNDIWKHFKAVKNNHVYDLEEVPFGITANVDADKAMTQLYDLFYKDKK >NZ_CP047835.1|WP_001246683.1|929224_930301_-|hypothetical-protein MRNVKQIATKSIIAIISIGILTYTTMIGSVLADEIKYPSAKFNQPEAKDKTELTTSIFDEKIKENKALELLIFNQENKNVTEEQQLVDEKAQLISDMTGKIYLQVKLKGQIDKEQLVFQNDKNEEFPFVIKDEKDDTIVRILIEQHMDKINMHVKTLAEKKNLDNKEMVYSIHFKEKKVQHDDAKEVPSKHQNQENNQDQLKKDIDDKKDSQKSDTKERRTSLFTEKGLNDIPVQKDKVQQDSNKKIENERPKASGTLKVENSPPTVKKVENNHKEQPKHKDEKSKKEKKKVVEKEKALPAFNRDDDSKNSSQLSSDIKELDEPNHKKQYILFAAGIVLATILLISAHLYSRKRGNQV >NZ_CP047835.1|WP_000789822.1|930300_930984_-|heme-uptake-protein-IsdC 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NZ_CP047835_5 | 998712-998793 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_5
|
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>5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_5
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_5 >merge|NZ_CP047835|5|998712-998793|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTATGGGCCCCAAC >NZ_CP047835|5|5|998712-998793|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACA CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAA TGCAAGTTGGGGTATGGGCCCCAAC
>NZ_CP047835.1|WP_000225831.1|997541_998402_+|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MVAKILDGKQIAKDYRQGLEDQVEALKEKGFTPKLSVILVGNDGASQSYVRSKKKAAEKIGMISEIVHLEETATEEEVLNELNRLNNDDSVSGILVQVPLPKQVSEQKILEAINPEKDVDGFHPINIGKLYIDEQTFVPCTPLGIMEILKHADIDLEGKNAVVIGRSHIVGQPVSKLLLQKNASVTILHSRSKDMASYLKDADVIVSAVGKPGLVTKDVVKEGAVIIDVGNTPDENGKLKGDVDYDAVKEIAGAITPVPGGVGPLTITMVLNNTLLAEKMRRGIDS >NZ_CP047835.1|WP_000861574.1|996858_997341_-|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-mutase MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGLNIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP047835.1|WP_001010406.1|995747_996872_-|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-synthase MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP047835.1|WP_000174053.1|995039_995744_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP047835.1|WP_000848350.1|994776_995040_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurS MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP047835.1|WP_000666799.1|994103_994775_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurQ MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP047835.1|WP_000032746.1|991921_994111_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLLTLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP047835.1|WP_000483713.1|990458_991943_-|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP047835.1|WP_000030821.1|989437_990466_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINGSGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP047835.1|WP_000238664.1|988868_989435_-|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP047835.1|WP_001037831.1|999185_999503_+|DUF5011-domain-containing-protein MNKLLQSLSALGVSATLVTPNLNADATTNTTPQIKGANDIVIKKGQDYNLLNGISAFDKEDGDLTDKIKVDGQIDTSKSGKYQIKYHVTDSDGAIKISTRYIEVK >NZ_CP047835.1|WP_031824143.1|999650_999770_-|hypothetical-protein MERKRKHFNKEFAKSNLSLNNEKWKFVCSKSKHFFKKSS >NZ_CP047835.1|WP_000032836.1|1000074_1001175_+|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-II MSKFKSLLLLFGTLILLSGCSNIEIFNAKGPVASSQKFLILYSIVFMLVICFVVLGMFAIFIYKYSYNKNAESGKMHHNAIIETIWFVIPIIIVAALAIPTVKTLYDYEKPPKSEKDPMVVYAVSAGYKWFFAYPDEHIETVNTLTIPKDRPVVFKLQAMDTMTSFWIPQLGGQKYAMTGMTMNWTLEASQTGTFRGRNSNFNGEGFSRQTFKVNAVSQKDYDKWVKEVKGKKTLDQDTFDKQLLPSTPNKALEFNGTHMAFVDPAADPEYIFYAYKRFNFELKDPNFTSEENMFKDVSDKPLIPARKAQITNANYKRHGMKLMILGNDEPYNNEFKKDESKNAKEMKKISKDAQDQDNDDHGGGH >NZ_CP047835.1|WP_001010762.1|1001174_1003163_+|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-I MNFPWDQLLVKGNWMITMAQIGAPFLVIGLIAVITYFKLWKYLYKEWFTSVDHKKIGIMYLICAVLMFVRGGIDALLIRAQLTVPDNKFLESNHYNEIFSTHGVIMIIFMAMPFIFGLWNIVVPLQIGARDVAFPVLNNVSFWLFFAGMILFNLSFIIGGSPAAGWTNYAPLAGEFSPGPGVNYYLIAIQISGLGTLATGINFFVTILRCKTPTMKFMQMPMFTVTTFITTLIVILAFPPLTVALALMTTDRIFDTAFFTVAHGGMPMLWANFFWVWGHPEVYIVILPAFGIYSEIIPTFARKRLFGHQSMVWATAGIAFLSFLVWVHHFFTMGNGALINSFFSISTMLIGIPTGVKLFNWLLTLYKGRITFESPMLFSLAFIPNFLLGGVTGVMLAMASADYQYHNTYFLVAHFHYTLVTGVVFACLAGLIFWYPKMMGYKLNETLNKWCFWFFMIGFNVCFLPQFILGLDGMPRRLYTYMPSDGWFLLNLISTIGALLMAIGFLFLVVSIVYSHFKSPREATGDNWDGLGRTLEWTTASAIPPKYNFAITPDWNDYDTFVDMKEHGRHYLDNHNYKDIHMPNNTPVGFWIGIFMTIGGFFLIFETVIPALICLFGIFGTMIYRSFQIDHGYHIPAAEVAETEARLREARIKEREAVSHES >NZ_CP047835.1|WP_000017736.1|1003152_1003758_+|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-III MSHDTNTIDSRTHEGELNKLGFWIFITAEFALFGTLFATLLTLQHGGDYAGKMTTELFELPLVLIMTFALLFSSYTCGIAIYYMRQEKQKLMMFWMIITLLLGLVFVGFEIYEFAHYASEGVNPTIGSYWSSFFILLGTHGCHVSLGIVWAICLLIQIQRRGLDKYNAPKLFIVSLYWHFLDVVWVFIFTAVYMIGMVYSG >NZ_CP047835.1|WP_000104254.1|1003754_1004045_+|cytochrome-aa3-quinol-oxidase-subunit-IV MSTIMKHTVGFIASIVLTLLAVYVTLYTSLTFHAKLTIIFGFAFVQAGLQLLMFMHLTEGKDGRLQTFKVIFALVITLCFVVGTYWVMQGGHSSHL >NZ_CP047835.1|WP_000671248.1|1004581_1005775_-|teichoic-acid-D-Ala-esterase-FmtA MKFNKVKLVIHACVLLFIIISIALIFHRLQTKTHSIDPIHKETKLSDNEKYLVDRNKEKVAPSKLKEVYNSKNPKYKKIDKYLQSSLFNGSVAIYENGKLKMSKGYGYQDFEKGIKNTPNTMFLIGSAQKFSTGLLLKQLEEEHKININDPVSKYLPWFKTSKPIPLKDLMLHQSGLYKYKSSKDYKNLDQAVKAIQKRGIDPKKYKKHMYNDGNYLVLAKVIEEVTGKSYAENYYTKIGDPLKLQHTAFYDEQPFKKYLAKGYAYNSTGLSFLRPNILDQYYGAGNLYMTPTDMGKLITQIQQYKLFSPKITNPLLHEFGTKQYPDEYRYGFYAKPTLNRLNGGFFGQVFTVYYNDKYVVVLALNVKGNNEVRIKHIYNDILKQNKPYNTKGVIVQ >NZ_CP047835.1|WP_001031976.1|1006225_1007452_+|polyisoprenyl-teichoic-acid--peptidoglycan-teichoic-acid-transferase MNKFLKYFLILLALVLIVVPIVFATLLFKTSQDAFESSQDSKNANRQSNLRDNKVNPEEQPISILFLGIDDNDGRRKKGQDAEHSRSDAMILTTFNQSKHQIRMLSIPRDTISYIPKVGYYDKITHAHAYGGPIAAMDSVEATMNVPVDYYVRVNMKAFVEAVNELGGIYYDVPYDLNEPNTDDTGKIKIKKGYQKLNGDEALAVARTRHHDSDLKRGQRQMELIKILFQKAQEVDSIDKLDNVIQIVGKNAKHNLTNSEIKALAKMYLTNDVEIKTAQLKGKDDMLNGIYYYHPSVESIQKYANLLRKDLELSPINDKNDFLDQRVINHYGSLIPLTPLDSSLLRKEQNDTTDKDKSSNNTDDSNNSNNNNGVNNQQQPTTGQNTNQDQGNIQQTPQASNNQNGVVN >NZ_CP047835.1|WP_000088431.1|1007499_1007970_+|DUF2538-family-protein MSRKTYEKIANINGMFNMLEQQIIHSQDMAHFRSEFFYVNHEHRENYEALLIYYKNSIDNPIVDGACYILALPEIFNSVDVFESELPFSWVYDENGITETMKSLSIPLQYLVAAALEVTDVNIFKPSGFTMGMNNWNIAQMRIFWQYTAIIRKEAL >NZ_CP047835.1|WP_000491994.1|1008124_1008559_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFSKVNNQKMLEDCFYIRKKVFVKEQGVPEESEIDEYESESIHLIGYDNGQPVATARIRPINETTVKIERVAVMKSHRGQGIGRMLMQAVESLAKDEGFYVATMNAQCHAIPFYESLNFKMRGNIFLEEGIEHIEMTKKLTSLN |
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NZ_CP047835_6 | 1117958-1118036 | Orphan |
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_6
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_6 >merge|NZ_CP047835|6|1117958-1118036|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >NZ_CP047835|6|6|1117958-1118036|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>NZ_CP047835.1|WP_000185309.1|1116780_1117710_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFIAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP047835.1|WP_000066053.1|1115159_1116539_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP047835.1|WP_000660040.1|1113964_1115170_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDAADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_CP047835.1|WP_000148855.1|1112282_1113614_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP047835.1|WP_000007967.1|1111382_1111958_-|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP047835.1|WP_000758209.1|1110853_1111378_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP047835.1|WP_000711895.1|1110262_1110838_-|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPKANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPKNTKN >NZ_CP047835.1|WP_000172338.1|1106626_1110103_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMSERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRARQDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLTQIQALFNQLEITNIPRYHEVAPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNKALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP047835.1|WP_000154932.1|1102972_1106626_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDSVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNNEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQFKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP047835.1|WP_000670752.1|1101904_1102807_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP047835.1|WP_000138487.1|1118160_1119405_-|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP047835.1|WP_160193062.1|1119513_1120704_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINVPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP047835.1|WP_000838032.1|1121011_1122139_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEVYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP047835.1|WP_001067294.1|1122499_1122877_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP047835.1|WP_000035058.1|1123292_1123886_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP047835.1|WP_000781161.1|1123949_1124333_+|kinase MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLACLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP047835.1|WP_000054597.1|1124463_1126869_+|Na+/H+-antiporter-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWIWAVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGFTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP047835.1|WP_001081626.1|1126861_1127290_+|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP047835.1|WP_011443624.1|1127301_1127631_+|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-C MIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP047835.1|WP_000573077.1|1127623_1129120_+|Na+/H+-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_7 | 1166678-1166762 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_7
>7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_7
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_7 >merge|NZ_CP047835|7|1166678-1166762|CRISPRCasFinder AAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP047835|7|7|1166678-1166762|CRISPRCasFinder AAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGA AAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP047835.1|WP_001018962.1|1166010_1166397_-|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP047835.1|WP_001065801.1|1165721_1166018_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP047835.1|WP_000571218.1|1164446_1165472_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP047835.1|WP_000520233.1|1163758_1164454_-|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP047835.1|WP_000732326.1|1162919_1163741_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP047835.1|WP_000752917.1|1162371_1162566_-|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP047835.1|WP_001183859.1|1161287_1162139_+|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTSLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPLLLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP047835.1|WP_000168845.1|1160198_1160960_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_CP047835.1|WP_000205572.1|1158793_1160101_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_CP047835.1|WP_000807670.1|1157437_1158679_-|cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >NZ_CP047835.1|WP_000932230.1|1167192_1168071_-|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRLVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMKEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDNLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQEHLKSLDADNEDIPFSGAFSIKFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP047835.1|WP_000662306.1|1168072_1168186_-|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP047835.1|WP_000290490.1|1168249_1168630_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSKMIGE >NZ_CP047835.1|WP_000589549.1|1168787_1169144_-|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP047835.1|WP_001190695.1|1169287_1169608_+|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP047835.1|WP_000422908.1|1169757_1170297_-|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP047835.1|WP_000150018.1|1170379_1171096_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQEDIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP047835.1|WP_000974455.1|1171243_1171666_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDPDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP047835.1|WP_000569884.1|1172064_1172559_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP047835.1|WP_000255561.1|1172713_1173331_+|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP047835_8 | 1384332-1384424 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_8
>8.1|1384364|29|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_8
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_8 >merge|NZ_CP047835|8|1384332-1384424|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >NZ_CP047835|8|8|1384332-1384424|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>NZ_CP047835.1|WP_001813976.1|1383375_1384203_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP047835.1|WP_072467437.1|1382277_1383228_-|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSFITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP047835.1|WP_000365354.1|1381503_1382223_-|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP047835.1|WP_000362974.1|1380719_1381520_-|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVKLLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTASFINKHHDEKHV >NZ_CP047835.1|WP_000735555.1|1380077_1380584_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP047835.1|WP_001222133.1|1379199_1379916_-|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP047835.1|WP_001045423.1|1378242_1379031_-|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLNFLKSVS >NZ_CP047835.1|WP_001018677.1|1377618_1377993_+|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP047835.1|WP_001805017.1|1375741_1376671_+|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNSSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFSSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_CP047835.1|WP_000169042.1|1375322_1375547_+|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK >NZ_CP047835.1|WP_000901749.1|1384575_1385211_-|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIELMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP047835.1|WP_001021139.1|1385480_1387142_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLAAHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP047835.1|WP_001819741.1|1387138_1387522_-|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP047835.1|WP_000655099.1|1387647_1387755_-|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >NZ_CP047835.1|WP_001200748.1|1387829_1388840_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP047835.1|WP_078064452.1|1389338_1389860_-|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLEGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAVLKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP047835.1|WP_000180234.1|1389887_1391183_-|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP047835.1|WP_000477505.1|1391222_1391699_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYQPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP047835.1|WP_000633782.1|1391867_1392404_-|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP047835.1|WP_000808898.1|1392612_1393551_-|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESLAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_9 | 1873328-1873412 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_9
>9.1|1873354|33|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_9
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_9 >merge|NZ_CP047835|9|1873328-1873412|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP047835|9|9|1873328-1873412|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCA CACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP047835.1|WP_000356963.1|1873062_1873266_+|hypothetical-protein MDKESVVASLARNKKIAVETMAGQRYIIERILHTNDEKHIHILKPKDVVLDVDSIKEIDENHLNDAT >NZ_CP047835.1|WP_000171919.1|1872371_1872884_-|DUF4242-domain-containing-protein MTLFLLEANNLDFASTKEELEAKAASLSTKTIPTLIEVQATENLTHGYFIVEANDEAEAKQFLTEADISIQLVKEVRLVGKDLDEVKNGDAHVDYLVTWNIPEGITMDQYLARKKKNSVHYEEVPEVEFKRTYVCEDMSKCICLYNAPDEEAVRRARKAVDTPIDGIEKL >NZ_CP047835.1|WP_000590844.1|1871289_1872030_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIQQLQHHFGSHKVIHNFNLDISKGEIVTFIGKSGCGKSTLLNIIGGFIHPSSGRVIIDNEIKQQPSPDCLMLFQHHNLLPWKTINDNIRIGFQQKISDEEINAQLKLVDLEGRGKHFPEQLSGGMKQRVALCRAHVHKPNVILMDEPLGALDAFTRYKLQDQLVQLKHKTQSTIILVTHDIDEAIYLSDRIVLLGEGCNIISQYEITASHPRSRNDSHLLKIRNEIMETFALNHHQVEPEYYL >NZ_CP047835.1|WP_000826672.1|1870301_1871276_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRLSIIVIIGIFIITGCDWQRTSKEPSKNAQNQQVIKIGYLPITHSANLMMTKKLLSQYNHPKYKLELVKFNNWPDLMDALNSGRIDGASTLIELAMKSKQKGSNIKAVALGHHEGNVIMGQKGMHLNEFNNNGDDYHFGIPHRYSTHYLLLEELRKQLKIKPGHFSYHEMSPAEMPAALSEHRITGYSVAEPFGALGEKLGKGKTLKHGDDVISDAYCCVLVLRGELLDQHKDVAQAFVQDYKKSGFKMNDRKQSVDIMTHHFKQSRDVLTQSAAWTSYGDLTIKPSGYQEITTLVKQHHLFNPPAYDDFVEPSLYKEASRS >NZ_CP047835.1|WP_000197962.1|1869543_1870305_-|ABC-transporter-permease MTRPTNNKFILPIITFIIFLGIWEMVIIIGHYQPVLLPGPALVGKSIWTFIVTGEIFQHLAISLWRFVAGFVVALLVAIPLGFLLGRNRWLYNAIEPLFQLIRPISPIAWAPFVVLWFGIGSLPAIAIIFIAAFFPIVFNTIKGVRDIEPQYLKIATNLNLTGWSLYRNILFPGAFKQIMAGIHMAVGTSWIFLVSGEMIGAQSGLGFLIVDARNMLNLEDVLAAIFFIGLFGFIIDRFISYIEQFILRRFGE >NZ_CP047835.1|WP_000171645.1|1868499_1869531_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MTLETLIKEQLDPHLVEVDEGTYYPRTFIQQLFVDGYFGEAALRKNAEVIEAVSQSCLTTGFCLWCQLAFSTYLENATQPHLNNDLQQQLLSGEILGATGLSNPMKSFNDLEKLNLEHTYVDGQLVVSGRMPAVSNIQEDHYFGAISKHESSDEFVMFILRANQDGITLVEKTNFLGVNGSATYQITLNQVVVPQSQIITHDAKQFAATIRPQFIAYQIPIGLGSIKSSLELIDAFSNAQNGINQYLEYDVEAFKKRYRQLREEYYAILDDGNLTSHLSELISLKKDIGYLLLDVNQASVVNGGSRAYTPYSPQVRKLKEGFFFAALTPTLRHLGKLEAELKG >NZ_CP047835.1|WP_001092004.1|1867923_1868283_-|DUF2294-domain-containing-protein MNTIDTHTKEQQFSNLVRSYRKEYVGKGPNSIRVSFKDNWAIAHMTGVLSKVESFYLNDKRNESMLHYTRTEKIKQMYKEIDVNEMESLVGAKFVKLFTDIDLNDDEVISIFVFDKSIE >NZ_CP047835.1|WP_000706138.1|1866725_1867751_-|NAD-dependent-formate-dehydrogenase MKIVALFPEAVEGQENQLLNTKKALGLKTFLEERGHEFIILADNGEDLDKHLPDMDVIISAPFYPAYMTRERIEKASNLKLAITAGVGSDHVDLAAASEHNIGVVEVTGSNTVSVAEHAVMDLLILLRNYEEGHRQSVEGEWNLSQVGNHAHELQHKTIGIFGFGRIGQLVAERLAPFNVTLQHYDPINQQDHKLSKFVSFDELVSTSDAITIHAPLTPETDNLFDKDVLSRMKKHSYLVNTARGKIVNRDALVEALASEHLQGYAGDVWYPQPAPADHPWRTMPRNAMTVHYSGMTLEAQKRIEDGVKDILERFFNHEPFQDKDIIVASGRIASKSYTAK >NZ_CP047835.1|WP_000826862.1|1865089_1866340_-|MFS-transporter MKRLSTTLKVRLISNFLQLIITTAFIPFIALYLTDMLSQSIVGIYLVGLVVLKFPLSIISGYLIEIFPKKLLVLIYQATMVIMLVFMGVFGSHQLWQIIGFCVAYAIFTIVWGLQFPVMDTLIMDAITEDVEHYIYKISYWMTNLSVAIGALLGGLMYGYSMLLLFLIAACIFLIVLFILYIWLPQDRNQVKQSDDKRHASRYQKLQIMNIFRSYKLVLKDRNYMLLISGFSIIMMGEFSISSYIAIRLKDQFETISIGSYDITGAKMLAILLMINTVVVILLTYSISKVVLKIDFKKALITGLLIYIVGYSGLTYLNQFGLLVVFMIIATVGEIIYSPIVSEQRFKIIPKAKRGTYSAVNALGIHFSETLARLGIVLGVFLTSLQMGLYMFIVLTIGASMLVAGVFGGQKQVNTN >NZ_CP047835.1|WP_025174304.1|1857467_1864643_-|non-ribosomal-peptide-synthetase MIMGNLRFQQEYFRIYKNNTESTTHRNAYWVKLAKNVEATKMMYALSTIVQQHASIRHFFDVTTDDNLTMILHEFLPFIEIKQVPTSSANYDLEAFFKQELSTYHFNDSPLFKFKLFQFADAAYILLDFHVSIFDDSQIDIFLDDLCNAYRGNTVINNTRQHAHLNRNDDKDNQDASHIALDSNYFRLENNSDIHIDSYLPIKHPFEQALYQTYLIDDMTSIDMASLAVSVYLANHIMSQQHDVTLGIHVPSHLPNDLHGNIVPLTLTIDAKDVCQRFTTDFNKCVLQNMSQLQCAKSSLSLETIFHCYHHMMSCCNDVIEDVHQIHDAHTSLADIEIFPHQHGFKIIYNSAAYDLLSIETLSDLVRNIYLQITEENGNKRTTVDELNLMTERDIQLYDDINLSLPEIDDAQTVVTLFEQQVEATPNHVAVQFDGVFITYQTLNARANDLAHRLRNQYGVEPNDRVAVIAEKSIEMIIAMIGVLKAGGAYVPIDPNYPSDRQEYILKDATPKVVITYQALYENGKQNINHIDLNKIAWKNIDNLSKCNTLEDHAYVIYTSGTTGNPKGTLIPHRGIVRLVHQNHYVPLNEETTILLSGTIAFDAATFEIYGALLNGGKLIVAKKEQLLNPIAVEQLINENDVNTMWLTSSLFNQIASERIEVLAPLKYLLIGGEVLNAKWVDLLNQKPKHPQIINGYGPTENTTFTTTYNIPNKVPNRIPIGKPILGTHVYIMQGERRCGVGIPGELCTSGFGLAAGYLNQPELTADKFIKDSNINQLMYRSGDIVRLLPDGNIDYLYRKDKQVKIRGFRIELSEVEHALERIQGINKAVVIVQNHDQDQYIVAYYEAMHTLSHNKIKSQLRMTLPEYMIPVNFMHIEQIPITINGKLDKKALPIMDYVDTDAYVAPSTDTEHLLCQIFADILHVNQVGIHDNFFELGGHSLKATLVVNRIEASTGKRLQIGDLLQKPTVFELAQAIAKVQEQNYEVIPEAIVKDDYVLSSAQKRMYLLWKSNHKDTVYNVPFLWRLSSGLNVAQLQQAVQHLIARHEILRTQYIVVDDEVRQRIVADVVADFEEVNTHFTDEQEIMRQFVAPFNLEKPSQIRVRYIRSPLHAYLFIDTHHIINDGMSNIQLMNDLNALYQHKLLLPLKLQYKDYSEWMSHRDMTKHRQYWLSQFKDEVPILSLPTDYVRPNIKTTNGAMMSFTMNQQMRQLLQKYVEKHQITDFMFFMSVVMTLLSRYARKDDVVVGSVMSARMHKGTEQMLGMFANTLVYRGQPSPDKMWTQFLQEVKEMSLEAYEHQEYPFECLVNDLDQSHDASRNPLFDVMLVLQNNETNHAHFGHSKLTHIQPKSVTAKFDLSFIIEEDRDDYTINIEYNTDLYHSETVRHMGNQCMIMIDYILKHQDTLQICDIPNGTEELLNWVNTHVNDRMLNVPGNKSIISYFNEAVSRQGNHVALVMNDLTMTYETLRNYVDAIAHMLLSNGVGNGQRVALFTERSFEMIAAMLATVKVGASYIPIDIDFPNKRQGAILEDAKVTAVMSYGVEIETTLPVIQLENAKGFVESKENEQYDDLHGNQLENTAMLDNEMYAIYTSGTTGMPKGVAIRQRNLLNLVHAWSTELQLGDNEVFLQHANIVFDASVMEIYCCLLNGHTLVIPDREERVNPEQLQQLINKHRVTVASIPLQMCSVMEDFYIEKLITGGATSTASFVKYIEKHCGTYFNAYGPSESTVITSYWSHHCGDLIPETIPIGKPLSNIQVYIMSDGLLCGIGMPGELCIAGDSLAIGYINRPELMADKWQNNPFGKGKLYHSGDLARYTSDGQIEFLGRIDKQVKVNGYRIELDEIENAILAIRGISDCVVTVSHFDTHDILNAYYVGEQQVEQDLKQYLNDQLPKYMIPKTITHIDCMPLTTNDKVDTTRLPNPSPIQQSNKVYSEPSNEIEQTFVDVFGEVLKQNDVGVDDDFFELGGNSLEAMLVVSHLKRFGHHISMQTLYQYKTVRQIVNYMYQNQQSLVALPDNLSELQKIVMSRYNLGILEDSLSHRPLGNTLLTGATGFLGAYLIEVLQGYSHRIYCFIRADNEEIAWYKLMTNLNDYFSEETVEIMLSNIEVIVGDFECMDDVVLPENMDTIIHAGARTDHFGDDDEFEKVNVQGTVDVIRLAQQHHARLIYVSTISVGTYFDIDTEDVTFSEADVYKGQLLTSPYTRSKFYSELKVLEAVNNGLDGRIVRVGNLTNPYNGRWHMRNIKTNRFSMVMNDLLQLDCIGVSMAEMPVDFSFVDTTARQIVALAQVNTPQIIYHVLSPNKMPVKSLLECVKRKEIELVSDESFNEILQKQDMYETIGLTSVDREQQLAMIDTTLTLKIMNHISEKWPTITNNWLYHWAQYIKTIFNK >NZ_CP047835.1|WP_160193119.1|1873560_1874520_-|cation-transporter MNGKKANTINRYKYFHHVNHQKIQQSSKKTLWASLIITLLFTVIEFVGGLVSNSLALLSDSFHMLSDVLALGLSMLVIYFASKKPTARYTFGYLRFEILAAFLNGLALIVISIWILYEAIVRIIYPQPIESGIMFMIASIGLLVNIILTIILVRSLKQEDNINIQSALWHFMGDLLNSIGVIVAVVLIYFTGWRIIDPIISIVISLIILRGGYKITRNAWLILMESVPQHLDTDQIMADIKNIDGILDVHEFHLWSITTEHYSLSAHVVLDKKYEGDDYQAIDQVSSLLKEKYGIAHSTLQIENLQLNPLDEPYFDKLT >NZ_CP047835.1|WP_000290397.1|1875166_1876654_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MAVNVRDYIAENYGLFINGEFVKGSSDETIEVTNPATGETLSHITRAKDKDVDHAVKVAQEAFESWSLTSKSERAQMLRDIGDKLMAQKDKIAMIETLNNGKPIRETTAIDIPFAARHFHYFASVIETEEGTVNDIDKDTMSIVRHEPIGVVGAVVAWNFPMLLAAWKIAPAIAAGNTIVIQPSSSTPLSLLEVAKIFQEVLPKGVVNILTGKGSESGNAIFNHDGVDKLSFTGSTDVGYQVAEAAAKHLVPATLELGGKSANIILDDANLDLAVEGIQLGILFNQGEVCSAGSRLLVHEKIYDQLVPRLQEAFSNIKVGDPQDEATQMGSQTGKDQLDKIQSYIDAAKESDAQILAGGHRLTENGLDKGFFFEPTLIAVPDNHHKLAQEEIFGPVLTVIKVKDDQEAIDIANDSEYGLAGGVFSQNITRALNIAKAVRTGRIWINTYNQVPEGAPFGGYKKSGIGRETYKGALSNYQQVKNIYIDTSNALKGLY >NZ_CP047835.1|WP_001237005.1|1877080_1877464_+|YbaN-family-protein MRLILIVIGLIFTALGIAGAVLPLLPTTPFLLVAVFCFARSSDRFYNWLINQKIYKEYVENFYLHRGYTLQQKIKILISLYIVIGFSIYMVDVLAVRVGLIIMVIIQTAVLFTFVKTLPKSNNKIEE >NZ_CP047835.1|WP_000480603.1|1877470_1877797_+|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdI MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQGIETIEGFQQMFVTKTLNTEDTDEVKILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK >NZ_CP047835.1|WP_160193083.1|1877861_1879007_-|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MKKIMVIFGTRPEAIKMAPLVKEIDHNGNFEANIVITAQHRDMLDSVLSIFDIQADHDLNIMQDQQTLAGLTANALAKLDSIINEEQPDMILVHGDTTTTFVGSLAAFYHQIPVGHVEAGLRTHQKYSPFLEELNRVMVSNIAELNFAPTVIAAKNLLFENKDKERIFITGNTVIDALSTTVQNDFVSTIINKHKGKKVILLTAHRRENIGEPMHQIFKAVRDLADEYKDVVFIYPMHRNPKVRAIAEKYLSGRNRIELIEPLDAIEFHNFTNQSYLVLTDSGGIQEEAPTFGKPVLVLRNHTERPEGVEAGTSRVIGTDYDNIVRNVKQLIEDDEAYQRMSQANNPYGDGQASRRICEAIEYYFGLRTDKPDEFVPLRHK >NZ_CP047835.1|WP_000779489.1|1879083_1880346_-|nucleotide-sugar-dehydrogenase MKLTVVGLGYIGLPTSIMFAKHGVDVLGVDINQQTIDKLQNGQISIEEPGLQEVYEEVLSSGKLKVSTTPEASDVFIIAVPTPNNDDQYRSCDISLVMRALDSILPFLKKGNTIIVESTIAPKTMDDFVKPVIENLGFTIGEDIYLVHCPERVLPGKILEELVHNNRIIGGVTKACIEAGKRVYRTFVQGEMIETDARTAEMSKLMENTYRDVNIALANELTKICNNLNINVLDVIEMANKHPRVNIHQPGPGVGGHCLAVDPYFIIAKDPENAKLIQTGREINNSMPAYVVDTTKQIIKALSGNKVTVFGLTYKGDVDDIRESPAFDIYELLNQEPDIEVCAYDPHVELDFVEHDMSHAVKDASLVLILSDHSEFKNLSDSHFDKMKHKVIFDTKNVVKSSFEDVLYYNYGNIFNFIDK >NZ_CP047835.1|WP_001230678.1|1880399_1881287_-|capsular-polysaccharide-type-5/8-biosynthesis-epimerase-CapN MRKNILITGVHGYIGNALKDKLIEQGHQVDQINVRNQLWKSTSFKDYDVLIHTAALVHNNSPQARLSDYMQVNMLLTKQLAQKAKAEDVKQFIFMSTMAVYGKEGQVGKSDQIDTQTPMNPTTNYGISKKFAEQALQELISDSFKVAIVRPPMIYGAHCPGNFQRLMQLSKRLPIIPNINNQRSALYIKHLTAFIDQLISLEVTGVYHPQDSFYFDTSSVMYEIRRQSHRKTVLINMPSVLNKYFNKLSVFRKLFGNLIYSNTLYENNNALEVIPGKMSLVIADIMDETTTKDKA >NZ_CP047835.1|WP_000825098.1|1881286_1881844_-|sugar-transferase MKRLFDVVSSIYGLVVLSPILLITALLIKMESPGPAIFKQKRPTINNELFNIYKFRSMKIDTPNVATDLMDSTSYITKTGKVIRKTSIDELPQLLNVLKGEMSIVGPRPALYNQYELIEKRTKANVHTIRPGVTGLAQVMGRDDITDDQKVAYDHYYLTHQSMMLDMYIIYKTIKNIVTSEGVHH >NZ_CP047835.1|WP_001291020.1|1881854_1883060_-|glycosyltransferase-family-4-protein MSEKKILILCQYFYPEYVSSATLPTQLAEDLIANHINVDVMCGWPYEYSNHKQVSKTEMHRGIRIRRLKYSRFNNKSKVGRIINFFSLFSKFVINIPKMLKYDQILVYSNPPILPLIPDVLHRLLKKKYSFVVYDIAPDNAIKTGATRPGSMIDKLMRYINRHVYKNAENVIVLGTEMKNYLLNHQISKNADNIHVIPNWYDMRQLQDNRIYNDTFKAYREQYDKILLYSGNMGQLQDMETLISFLKLNKDQPQTLTILCGHGKKFADVKTAIEDHRIENVKMFEFLTGTDYADVLKIADVCIASLIKEGVGLGVPSKNYGYLAAKKPLVLIMDKQSDIVQHVEQYDAGIQIDNGDAHAIYNFINTHSSKELHEMGERAHQLFKDKYTREINTMKYYNLLK >NZ_CP047835.1|WP_000239646.1|1883060_1884266_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLSTFIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITIIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_10 | 2303902-2303988 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_10
>10.1|2303930|31|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_10
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_10 >merge|NZ_CP047835|10|2303902-2303988|CRISPRCasFinder CCCACCCCAACTTACATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA >NZ_CP047835|10|10|2303902-2303988|CRISPRCasFinder CCCACCCCAACTTACATTGTCTGTAGAA ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCC CCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA
>NZ_CP047835.1|WP_000700928.1|2302232_2303585_-|carboxylesterase/lipase-family-protein MKINTTGGQIHGITQDGLDIFLGIPYAEPPVHDNRFKHSTLKTQWSEPIDATEIQPIPPQPDNKLEDFFSSQSTTFTEHEDCLYLNIWKQHNDQTKKPVIIYFYGGSFENGHGTAELYQPAHLVQNNDIIVITCNYRLGALGYLDWSYSNKDFHSNNGLSDQINVIKWVHQFIESFGGDANNITLMGQSAGSMSILTLLKIPDIEPYFHKVVLLSGALRLDTLESARNKAQHFQKMMLDYLDTDDVTSLSTDDILMLMAKLKQSRGPSKGLDLIYAPIKTDYIQNDYPTTKPIFACYTKDEGDIYITSEQKKLSPQRFIDIMELNDIPLKYEDVQTAKQQSLAITHCYFKQPMKQFLQQLNIQDSNAQLWLAEFAWHDTSSAHYRSAYHILDMVFWFGNLQILAAHQYPTTAHLKFLSRQMQNDLANFAKSGKMPWPMYHNERRYYRTYQ >NZ_CP047835.1|WP_000026189.1|2300983_2302171_+|DHA-family-class-C-beta-lactamase MSIMRLFTFILSIFIVGMVEMMVAGIMNLMSQDLHVSEAVVGQLVTMYALTFAICGPILVKLTNRFSSRPVLLWTLLIFIIGNGIIAVAPNFSILVVGRIISSAAAALIIVKVLAITAMLSAPKNRGKMIGLVYTGFSGANVFGVPIGTVIGDLVGWRYTFLFLIIVSIIVGFLMMIYLPKDQEIQRGPVNHEAPSHENHVTSKILRPAEVAKYLIITFLVLIANSVTFVFINPLILSNGHDMSFVSLALLVNGIAGVIGTSLGGIFSDKITSKRWLMISVSIFIVMMLLMNLILPGSGLLLAGLFIWNIMQWSTNPAVQSGVIQHVEGDTSQVMSWNMSSLNAGIGVGGIIGGLVMTHVSVQAITYTSAIIGALGLIVVFTLKNNHYAKTFKSS >NZ_CP047835.1|WP_000072147.1|2299811_2300588_+|iron-export-ABC-transporter-permease-subunit-FetB MSNTALGLTALLLVIPIIISYKEGLHIIKDLIVATLRAVVQLIILGFLLHYIFKINDKWLLILCVLVIIINASWNTISRASPVMHHVFWISFLAIFIGTALPLAGTIATGAIQFTANEVIPIGGMLANNGLIAINLAYQNLDRAFVQDGTNIESKLSLAATPKLASKGAIRESIRLAIVPTIDSVKTYGLVSIPGMMTGLIIGGVPPLQAIKFQLLVVFIHTTATIMSALIATYLSYGQFFNARHQLVARNTDVKSES >NZ_CP047835.1|WP_000923526.1|2299156_2299819_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLLEIKDLVYKASDRIILDHISLKVDKGESIAIIGPSGSGKSTFQKQICNLISPTSGELYFKGKPYNDYDPEELRQRISYLMQQSDLFGETIEDNMIFPSLARNDKFDRKRAKQLIKDVGLGHYQLSSEVENMSGGERQRIAIARQLMYTPDILLLDESTSALDVNNKEKIENIIFKLVEQDVAIMWITHSDDQSMRHFQKRITIVDGKISKVEELNQHE >NZ_CP047835.1|WP_160193099.1|2297832_2298909_+|M42-family-metallopeptidase MNQSVKLLKHLTDVNGIAGYEMQVKEAMRNYIEPVSDQIIEDNLGGIFGKKNAENGQYSIMISGHMDEVGFMVTKIDKHGFISFTPVGGWWNQVMLSQKVTITTDSGKEIRGIIGSKPPHVLTPEERKKPMEIKNMFIDIGVSSKEEAEEAGVEVGNMVTPYSEFEVLANDKYLTAKAFDNRYGCALAVEVLKRLKDENIGIDLYSGATVQEEVGLRGAKVAANTIKPDLAIAVDVGIAYDTPGMSGQTSDSKLGGGPVVIMMDATSIAHQGLRKHIKDVAKEHNIEVQWDTTPGGGTDAGSIHVANEGIPTMTIGVTLRYMHSNVSVLNVDDYENSIRLVTEIVRSLNDESYKNIMW >NZ_CP047835.1|WP_000074045.1|2297210_2297477_+|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MSNYTVKIKNSAKSDLKKIKHPYLKKTFIEIVETLKNDPYKITQSFEKLEPKYLERYSRRINLQHRVVYTIDDRNKVVLILSAWSHYD >NZ_CP047835.1|WP_000587619.1|2296953_2297211_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MIITSPTEARKDFYQLLKNVNNNHEPIYISGNNAENNAVIIGLEDWKSIQETMYLVSTGTMDKVREREKDSSGTTNIDDIDWDNL >NZ_CP047835.1|WP_000732082.1|2296138_2296594_-|DUF1307-domain-containing-protein MKKLCSLIVVALVCIIALSACGKEQTKTYEGDVSGKHVLTSITYKDDKVLKQSTINTIKYDDLGMDKDEAKKLFAKSESIFKDLKGVKYKVDYKDKKAIEHLDIDYTEVDMKKLNKRLGVSTKENKDISFEKLEKQLKHRGLKEKDKMDDK >NZ_CP047835.1|WP_000143502.1|2294393_2295971_+|FMN-binding-glutamate-synthase-family-protein MTFLTVMQFIVNIIVVGFMLTVIVIGLIWLIKDKRQSQHSVLRNYPLLARIRYISEKMGPELRQYLFSGDNEGKPFSRNDYKNIVLAGKYNSRMTSFGTTKDYQDGFYIQNTMFPMQRNEISVDNTTLLSTFIYKIANERLFSREEYRVPTKIDPYYLSDDHAIKLGEHLKHPFILKRIVGQSGMSYGALGKNAITALSKGLAKAGTWMNTGEGGLSEYHLKGNGDIIFQIGPGLFGVRDKEGNFSEGLFKEVAQLSNVRAFELKLAQGAKTRGGHMEAEKVNEEIAKIRNVEPYKTINSPNRYEFIHNAEDLIRFVDQLQQLGQKPVGFKIVVSKVSEIETLVRTMVELDKYPSFITIDGGEGGTGATFQELQDGVGLPLFTALPIVSGMLEKYGIRDKVKLAASGKLVTPDKIAIAIGLGADFVNIARGMMISVGCIMSQQCHMNTCPVGVATTDAKKEKALIVGEKQYRVTNYVTSLHEGLFNIAAAVGVSSPTEITADHIVYRKVDGELQTIHDYKLKLIS >NZ_CP047835.1|WP_000072440.1|2293449_2294199_-|hypothetical-protein MSNTNKHYIEEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFGLVAVFTQQAPWGFSFPISMNISYILAVIISLAIFRRMHEDAFVPMIRTQIIASTKYKWHILISFTLSVVLFLLLNYFDIFALNVDAFTVFDIYPLIRDYGSISLIVMLWLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRIMPLKITIVLSIILETLFYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFSQLAVILVLHIFM >NZ_CP047835.1|WP_001030706.1|2304251_2305889_-|APC-family-permease MNKDKQLHNDKINLSQLVLLGLGSLIGSGWLFGAWEASSIAGPAAIISWVLGFLVIGTIAYNYIEIGTMFPQSGGMSNYAQYTHGSLLGFIAAWANWVSLVTIIPIEAVSAVQYMSSWPWHWAKPMRYLMENGSISTYGLLAVYLIIVIFSLLNYWSVKLLTSFTSLISVFKLGVPMLTIIMLMLSGFDTSNYGHSASTFMPYGSAPIFAATTASGIIFSFNSFQTIINMGSEIKNPEKNIARGIAISLSISAVLYIILQSTFITSMPHSMLQHSGWNGINFNSPFADLAILLGINWLAILLYIEAFVSPFGTGVSFVAVTGRVLRAMEKNGHIPKFLGKMNEKYHIPRVAIIFNAIISMIMVTLFRDWGTLAAVISTATLVAYLTGPTTVIALRKMGPTMTRPFRAKILKVMAPLSFVLASLAIYWAMWPTTAEVILIIILGLPIYFFYEYRMNWRNTKKQIGGSLWIIVYLIVLSILSFIGSKEFKGLNMIHYPFDFIVIIIVALIFYYIGTTSSFESVYFRRATRINTKMRESLNNESKSSH >NZ_CP047835.1|WP_001291515.1|2306068_2306668_+|hypothetical-protein MSEKQSNEQVEAFLNKESQWQEEYKYLRALIFNETELEEAYKWMHPCYTLNNKNVVLIHGFKNYVALLFHKGAILEDKYHTLIQQTEKVQAARQLRFENLTEIQARSEEIKYYLAEAIKAEKAGKKVEMKKTEEYVIPKELEAKFEEMPQLESSFYKLTPGRQHQYIYHIGQAKRSETRQKRVEKYINQILEGKGMHDK >NZ_CP047835.1|WP_001791736.1|2306671_2306812_+|hypothetical-protein MSKAYRLYNNIQDDTKQPMAHAVGCFFRCVCHGQHFDVGIPLQAWE >NZ_CP047835.1|WP_031824620.1|2306891_2307011_+|hypothetical-protein MDVCPPVTMDACALLQKFDFCNNISHFRHFFAIKQPIER >NZ_CP047835.1|WP_000948976.1|2307337_2308564_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLSIKHLTKIYSGNKKAVDDISLDIQSGEFIAFIGTSGSGKTTALRMINRMIEATEGQIEIDGKDVRSMNPVELRRNIGYVIQQIGLMPHMTIKENIVLVPKLLKWTKEEKDKRAKELIKLVDLPESFLERYPAELSGGQQQRIGVVRALAAEQDIILMDEPFGALDPITRDTLQDLVKTLQRKLGKTFIFVTHDMDEAIKLADKICIMSEGKVVQFDTPDNILRHPANDFVRDFIGQNRLIQDRPNDKTVEGVMIKPITIQAEATLNDAVHIMRQKRVDTIFVVDRDNHLLGFLDIEDINQGIRGHKSLRETMQQHIYTVQIDSKLQDSVRTILKRNVRNVPVVDDQQRLVGLITRANVVDIVYDTIWGDSEDTMQTEHVGKDTASSKVHEQHTTNVKVRDIGDDKS >NZ_CP047835.1|WP_000569110.1|2308560_2309196_+|ABC-transporter-permease MIEFLHEHGGQLMSKTLEHFYISIVALLLAIIVAVPIGILLSKTKRIANIILTVAGVLQTIPTLAVLAIMIPIFGVGKTPAIVALFIYVLLPILNNTVLGVQNIDSNIKEAGKSMGMTQFQLMKDVELPLALPLIIGGIRLSSVYVISWATLASYVGAGGLGDFIFNGLNLYDPLMIVTATVLVTALALGVDALLALVEKWVVPKGLKVSG >NZ_CP047835.1|WP_000721550.1|2309212_2310154_+|osmoprotectant-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKIKYILVVFVLSLTVLSGCSLPGLGSKSTKNDVKITALSTSESQIISHMLRLLIEHDTHGKIKPTLVNNLGSSTIQHNALINGDANISGVRYNGTDLTGALKEAPIKDPKKAMIATQQGFKKKFDQTFFDSYGFANTYAFMVTKETAKKYHLETVSDLAKHSKDLRLGMDSSWMNRKGDGYEGFKKEYGFDFGTVRPMQIGLVYDALNSEKLDVALGYSTDGRIAAYDLKVLKDDKQFFPPYAASAVATNELLRQHPELKTTINKLTGKISTSEMQRLNYEADGKGKEPAVVAEEFLKKHHYFDKQKGGHK >NZ_CP047835.1|WP_000398941.1|2310153_2310849_+|ABC-transporter-permease MEGNLLQQLFNYYVTNFGYLWDLFFKHLLMSVYGVLFAALIGIPLGILLARYTKLSGFVITIANIIQTVPVIAMLAILMLVMGLGSETVVLTVFLYALLPIIKNTYTGIASVDANIKDAGKGMGMTRNQVLRMIELPLSVSVIIGGIRIALVVAIGVVAVGSFIGAPTLGDIVIRGTNATDGTTFILAGAIPIAIIAIVIDVLLRFLEKRLDPTTRHRKNQSNHRPQSINM >NZ_CP047835.1|WP_000381267.1|2311133_2312534_+|MFS-transporter MDTSKQFRGDNRLLLGIVLGVITFWLFAQSLVNLVVPLQSTYSSDVGTINIAVSLSALFAGLFIVGAGDVADKFGRVKITYVGLILNVVGSLLIIITPLPAFLIIGRIIQGLSAACIMPSTLAIINEYYIGTRRQRALSYWSIGSWGGSGICTLFGGLMATYIGWRSIFVVSILLTLLAMYLIKHAPETKAEPIKGMKAEAKKFDVIGLVILVVTMLSLNVIITQTSHFGLVSPLILGLIVVFICSLVGFVYYENKIKHPLVDFSIFKNRGYSGATISNFLLNGVAGGALIVINTYYQQQLGFNSSQTGYISLTYLIAVLSMIRVGEKILSQHGPKRPLLLGSGFTVIGLILLSLTFLPEMWYIVSSIVGYLLFGTGLGLYATPSTDTAVASAPDDKSGVASGVYKMASSLGNAFGVAVSGTVYTVLAANLNLNLGGFTGMMFNALLAIVAFLVILLLVPKNQTNL >NZ_CP047835.1|WP_000684044.1|2312759_2313695_+|2-dehydropantoate-2-reductase MKIAIAGSGALGSGFGAKLFQAGYDVTLIDGYTSHVEAVKQHGLNIMINGEAFELNIPMYHFNDQPDESIYDVVFLFPKSMQLKEVMEDMKPHIDNETIVVCTMNGLKHEEVIAQYVAQSQIVRGVTTWTAGLESPGHSHLLGSGPVEIGELVDEGKENVIKVADLLNEAELNGVISKDLYQSIWKKICVNGTANALSTVLECNMASLNESSYAKCLIYKLTQEIVHVATIDNVHLNVDEVFEYLVDLNEKVGAHYPSMYQDLIVNNRKTEIDYINGAVATLGKQRHIEAPVNRFITDLIHTKESQRHAQD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_11 | 2610039-2610124 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_11
>11.1|2610065|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder CCCAGTTGCAAACAATAAAGCTAAAGATATGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_11
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_11 >merge|NZ_CP047835|11|2610039-2610124|CRISPRCasFinder ACTAATGATACGCAAACATCAGTTGGCCCAGTTGCAAACAATAAAGCTAAAGATATGCAAACTAATGATACGCAAAAATCAGTTGG >NZ_CP047835|11|11|2610039-2610124|CRISPRCasFinder ACTAATGATACGCAAACATCAGTTGG CCCAGTTGCAAACAATAAAGCTAAAGATATGCAA ACTAATGATACGCAAAAATCAGTTGG
>NZ_CP047835.1|WP_000521495.1|2601278_2602634_+|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP047835.1|WP_000894032.1|2600319_2601252_+|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP047835.1|WP_000347896.1|2599508_2600318_+|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP047835.1|WP_000167867.1|2598411_2599320_+|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPAVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGVIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP047835.1|WP_000958531.1|2591107_2592172_+|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP047835.1|WP_001141010.1|2589517_2590960_+|multidrug-efflux-MFS-transporter-LmrS MAKVELTTRRRNFIVAVMLISAFVAILNQTLLNTALPSIMRELNINESTSQWLVTGFMLVNGVMIPLTAYLMDRIKTRPLYLAAMGTFLLGSIVAALAPNFGVLMLARVIQAMGAGVLMPLMQFTLFTLFSKEHRGFAMGLAGLVIQFAPAIGPTVTGLIIDQASWRVPFIIIVGIALVAFVFGLVSISSYNEVKYTKLDKRSVMYSTIGFGLMLYAFSSAGDLGFTSPIVIGALILSMVIIYLFIRRQFNITNALLNLRVFKNRTFALCTISSMIIMMSMVGPALLIPLYVQNSLSLSALLSGLVIMPGAIINGIMSVFTGKFYDKYGPRPLIYTGFTILTITTIMLCFLHTDTSYTYLIVVYAIRMFSVSLLMMPINTTGINSLRNEEISHGTAIMNFGRVMAGSLGTALMVTLMSFGAKIFLSTSPSHLTATEIKQQSIAIGVDISFAFVAVLVMAAYVIALFIREPKEIESNRRKF >NZ_CP047835.1|WP_000636857.1|2588721_2589195_+|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMIVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP047835.1|WP_001237497.1|2587279_2588623_+|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRLIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSVAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP047835.1|WP_000047255.1|2586419_2587103_+|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP047835.1|WP_000884735.1|2585213_2586401_+|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPGESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI >NZ_CP047835.1|WP_000648738.1|2610746_2611853_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINTLAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP047835.1|WP_160193111.1|2611852_2612287_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSVLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP047835.1|WP_000927342.1|2612298_2614431_-|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFVVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP047835.1|WP_160193112.1|2614465_2616004_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNEINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP047835.1|WP_000334465.1|2616684_2618490_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP047835.1|WP_000908175.1|2618721_2619504_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKIPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDEEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPMLAMIYVTHFIEEITSNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP047835.1|WP_000370926.1|2619571_2620429_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAE >NZ_CP047835.1|WP_001792784.1|2621086_2621245_-|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP047835.1|WP_001802298.1|2621924_2622029_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP047835.1|WP_000495671.1|2622470_2623562_-|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_12 | 2622364-2622454 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP047835_12
|
1 spacers
spacers of NZ_CP047835_12
>12.1|2622389|41|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder AAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP047835_12
The CRISPR arrays of NZ_CP047835_12 >merge|NZ_CP047835|12|2622364-2622454|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG >NZ_CP047835|12|12|2622364-2622454|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTG AAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCA TAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG
>NZ_CP047835.1|WP_001802298.1|2621924_2622029_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP047835.1|WP_001792784.1|2621086_2621245_-|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP047835.1|WP_000370926.1|2619571_2620429_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAE >NZ_CP047835.1|WP_000908175.1|2618721_2619504_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKIPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDEEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPMLAMIYVTHFIEEITSNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP047835.1|WP_000334465.1|2616684_2618490_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP047835.1|WP_160193112.1|2614465_2616004_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB 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>NZ_CP047835.1|WP_000648738.1|2610746_2611853_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINTLAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP047835.1|WP_160193110.1|2602919_2610428_+|DUF1542-domain-containing-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISINPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANAQPNANAGAQANPAAQPAAPANQGQPAAQPANQGGQANPAGGTAQPAGGAAQPAAGTAQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQARGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGISKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKSDQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQNANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQTDIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDAKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIGAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIETTMTAQDLERVKNEEISKIENITDSTQTKMDAYNEVKQAATARKAQNATVSNATNEEVAEADAAVEAAQKQGLHDIQVVKSKQEVADTKSKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKQAAYTELDTKKQEARTNLDTANSNSEVATAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEKQAAKDKVDQAVVTANADIDNAAANADVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAINANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTTADTAIDGAHSNAEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDDAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITAILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAAITNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQATQTNVINNDQNATTEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDQAKDAGKNSIQSTQPATAVKLNAKNDVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYLDILNAQTTNDVTQIKDQAVTDIQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKENAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILSDNTTTNEEKGKDIEPVRATYEEGLNNINTANTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKTALDQAAADRKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDAALNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIADAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALESINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDAIQVDATVKPKANQAIEVKAEDTKESIDQSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPEVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNAEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGIDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTATSATDDANDKPQANNNSSVDASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQTSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSVANNKATQNDGANASPATVSNGSNSANQDMLNVTKPEENKVKTKSAQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >NZ_CP047835.1|WP_000495671.1|2622470_2623562_-|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP047835.1|WP_000019745.1|2623827_2624808_-|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHVHVH >NZ_CP047835.1|WP_000003759.1|2624809_2625130_-|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP047835.1|WP_001024093.1|2625281_2625947_+|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDKDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP047835.1|WP_001127960.1|2626382_2627321_+|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP047835.1|WP_000808817.1|2627351_2627582_+|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP047835.1|WP_000123388.1|2628253_2629627_+|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIINVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQPYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP047835.1|WP_001123303.1|2630083_2630497_+|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP047835.1|WP_000070866.1|2630696_2631140_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP047835.1|WP_000160306.1|2631260_2631971_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKTKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 606080-606111 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 694259-694290 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1166988-1167019 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1222633-1222664 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1228067-1228098 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1765232-1765263 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1873401-1873432 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1898534-1898565 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 2465530-2465561 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047835_9 | 9.1|1873354|33|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 1873354-1873386 | 33 | NZ_CP047835.1 | 972543-972575 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047835_10 | 10.1|2303930|31|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 2303930-2303960 | 31 | NZ_CP047835.1 | 1898488-1898518 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_10 | 10.1|2303930|31|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 2303930-2303960 | 31 | NZ_CP047835.1 | 78247-78277 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_10 | 10.1|2303930|31|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 2303930-2303960 | 31 | NZ_CP047835.1 | 972545-972575 | 0 | 1.0 |
NZ_CP047835_10 | 10.1|2303930|31|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 2303930-2303960 | 31 | NZ_CP047835.1 | 1222794-1222824 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP047835_2 | 2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 423253-423286 | 34 | NZ_CP047835.1 | 1228077-1228110 | 1 | 0.971 |
NZ_CP047835_2 | 2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 423253-423286 | 34 | NZ_CP047835.1 | 1765242-1765275 | 1 | 0.971 |
NZ_CP047835_2 | 2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 423253-423286 | 34 | NZ_CP047835.1 | 1749952-1749985 | 1 | 0.971 |
NZ_CP047835_2 | 2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 423253-423286 | 34 | NZ_CP047835.1 | 1873389-1873422 | 1 | 0.971 |
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NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 1749964-1749995 | 1 | 0.969 |
NZ_CP047835_5 | 5.1|998737|32|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 998737-998768 | 32 | NZ_CP047835.1 | 2303977-2304008 | 1 | 0.969 |
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53. spacer 10.1|2303930|31|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to position: 1222564-1222594, mismatch: 2, identity: 0.935
attgggaatccaatttctctttgttggggcc CRISPR spacer attggaaatccaatttctctgtgttggggcc Protospacer *****.************** **********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP047835_7 | 7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 1166707-1166733 | 27 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 715510-715536 | 5 | 0.815 |
NZ_CP047835_7 | 7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 1166707-1166733 | 27 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333734-333760 | 6 | 0.778 |
NZ_CP047835_7 | 7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 1166707-1166733 | 27 | NZ_CP034332 | Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence | 3358-3384 | 6 | 0.778 |
NZ_CP047835_1 | 1.1|390798|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 390798-390831 | 34 | LC371242 | Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence | 15447-15480 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047835_11 | 11.1|2610065|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 2610065-2610098 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047835_11 | 11.1|2610065|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 2610065-2610098 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
NZ_CP047835_3 | 3.1|898075|30|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 898075-898104 | 30 | KT588075 | Acinetobacter phage Ab105-2phi, complete genome | 13350-13379 | 9 | 0.7 |
NZ_CP047835_3 | 3.1|898075|30|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 898075-898104 | 30 | MT349887 | Acinetobacter phage 5W, complete genome | 37720-37749 | 9 | 0.7 |
NZ_CP047835_2 | 2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder | 423253-423286 | 34 | NZ_CP009619 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence | 270864-270897 | 10 | 0.706 |
1. spacer 7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggggccccaacacagaagctggcgga CRISPR spacer tcagggccaaacacagaagctggcgga Protospacer . .** ** ******************
2. spacer 7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cggggccccaacacagaagctggcgga CRISPR spacer taaggcctcaacacagaagctggcgtc Protospacer ...****.*****************
3. spacer 7.1|1166707|27|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034332 (Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cggggccccaacacagaagctggcgga CRISPR spacer gtaggcccagacacagaagctggcggt Protospacer .***** .****************
4. spacer 1.1|390798|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to LC371242 (Escherichia phage EcS1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
acggggccccaacatagagaatttcgtaaagaaa CRISPR spacer attcgtcgtcaacaaaaagaatttcgtaaagaaa Protospacer *. * * .***** *.*****************
5. spacer 11.1|2610065|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cccagttgcaaacaataaagctaaagatatgcaa CRISPR spacer agcatataaaagctataaagctaaagatatgcaa Protospacer ** *. **.* ********************
6. spacer 11.1|2610065|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cccagttgcaaacaataaagctaaagatatgcaa CRISPR spacer tactgtttataacaataaagctaaagttattcaa Protospacer . * *** **************** *** ***
7. spacer 3.1|898075|30|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to KT588075 (Acinetobacter phage Ab105-2phi, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ttgtctgtagaaattgagaatccaatttca CRISPR spacer gaaaaggtagcaattgagaatccaattgga Protospacer . **** **************** *
8. spacer 3.1|898075|30|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to MT349887 (Acinetobacter phage 5W, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ttgtctgtagaaattgagaatccaatttca CRISPR spacer gaaaaggtagcaattgagaatccaattgga Protospacer . **** **************** *
9. spacer 2.1|423253|34|NZ_CP047835|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009619 (Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
cgaaaagaaattctacaggtaatgcaagttgggg CRISPR spacer aaaaaagaaatgctacaggtaatgcagcacttag Protospacer .********* **************. . .*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 24769
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047835|0:24769|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP047835|0:24769|18867_19164_+|WP_000539688.1|DBSCAN-SWA MGWFKKHEHEWRIRRLEENDKTMLSTLNEIKLGQKTQEQVNIKLDKTLDAIQKEREIDEKNKKENDKNIRDMKMWVLGLVGTIFGSLIIALLRMLMGI >NZ_CP047835|0:24769|13042_14533_+|WP_029549971.1|tail|DBSCAN-SWA MQDTIQIDNKTIGWLVVQRGFEIPSFNFVTEKENVKGRAGSIVKNRYLNDIEFDLPLIIRNEKLSPGGEKTHDDILEALVKFFNIKDLTPKKLKFKSQNWYWFAYFDGPLKLPKNPRGSVKFTIKVVLTDPYKYSVTGNKNTAISDQVSVVNSGTADTPLIVEARAIKPSSYFMITKNDEDYFMIGDDEVTKEVKDYMPPVYHSEFRDFKGWTKMITEDIPSNDLGGKVGGDFVISNLGEGYKATNFPDAKGWVGAGTKRGLPKAMTDFQITYKCIVEQKGKGAGRTAQHIYDSDGKLLASIGYENKYHDRKIGHIVVTLYNQKGDPKKIYDYQNKPIMYNLDRIVVYMRLRRVGNKFSIKTWKFDHIKDPDRRKPIDMDEKEWIDGGKFYQRPASIIAIYSAKYNGYKWMEMNGLGSFNTEILPKPKGARDVIIQKGDLVKIDMQAKSVVINEEPMLSEKSFGSNYFNVDSGYSELIIQPENVFDTTVKWQDRYL >NZ_CP047835|0:24769|5279_5612_+|WP_001177486.1|head,tail|DBSCAN-SWA MQLTAEELKLLKKHCKIDHNSEDDLLEIYYSWAFHEIASAVTDKPSKYIDWFKSHPLFARAIYPLASYYFENRIAYLDRDLSLAPHMVLSTVHKLRGSFEQFLESENDEI >NZ_CP047835|0:24769|21931_22390_+|WP_020444758.1|DBSCAN-SWA 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29 | Staphylococcus_phage(100.0%) | portal,protease,terminase,tail,holin,head,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
155447 : 242204
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP047835|155447:242204|DBSCAN-SWA TTCAGTTCGAGAAGATTGAGAGTGTTAAATCGTATTCGCGTATAATTTCGTATCTAGACTTACCATTTTCATAAAGTTTAACCATTTGTAATTTAAAGTCTTTAATATATGTTCTTCTGTCTCTTGTCAAAATAAAATCGCCTACCCATATAGTTTAACAATAATTATTCTCAAATAATTTGTTTAACTATTTGTAGACGATTCTGCATTATCAATAAGGTTATGCAATTTGCTAACTTAATCTGTTTCGAAATTTTCAAATTCGTTTCATTTAATATAAATATTGATATAATCACGGCTATAAATATTAAATCAATAAACCTATCTTTTCATCTAATTCGCTATAATCTATAGTACTAATATAGTTTTCATGAAGAAGATTTTTATTATGTTCATTTATTTCTTTTTTTGAGTCATTTAAAATAAAAATAAACTCATTTTGCCTGTGTCTTTTTATTTTTTTTGCTTGCATAGCATCCGTTATTTTCGACTTAATAATCATAGAATTATTAGGGTTAGAAATAGCATTGATAAATTTTTCTTTTTGATTTTTCTTAGCGCTAATAAAAAAGTCGAAATTATGAACAACACCACTGCTTCCTATAATAGGTAAGTCTCTTCCGTAATAAATGTTATGTTCATCCAATTTGTTTGCAACATCTTCTGTAAATATGTTCTGTGACTTAGGATTAGAAAGTAAGTACATATCATTAACAAATATAAGGCACTGTAATAAATTATGTTTCGATTTATTAAAATTTTTAAAGTTAGTTTGAACAAAAATTTCGTGAGTTTTATCGTTATATTTAATACCGTAAGCTGAAAGGTGCTCTTCAAAAATCTTTTTACGTTTTTTTGATTTATTTAAAGAAATACCATTATTTTCTAAATCAAATATAGTATAGCCGTCATCAGTCAGTGTAATCATGTCTCTGAACTGATCGTATAAAGCGTATATTATTAAATTATCTAAAGAATTATCTTTAAAAGGGGTATCTATTCTTACAAAATTGTTTGATAAATTAGAAAACTCTAAGGTCTGGTTATACCAATCAAGATATTCTTTTTTTAATTTTTTAGCATCAAGCGTAGTCATATTATCCCTCCTTTATTCAAGGTCTTTTATATTATTTTACTCTAAAAACGACATATACACATTATACAAGTTATAGATGTCGGGGAAATCTTTCAAGTTAATTTCATAAGCAAACCTATCCTTTTTATCATACTTATCATTATATATGTGAATATGACTTTTCGGAGCGATTGTTCCATCTGGATTATCGTGAGTACCACCGTTAATATCTATTCTAACTAGGGTGTGATAGGTATCTTTGAAAATGATTGAAATTGAAAATCTATCTTTTTCTATGTTATCCCTTTTTATTGTTAAGAAGTACTTTATTCCTAACTTTAAACTTATTATTTCTTGCCTTTCATTTATTCGACTAGCAACTATTGTTTTTATTCATTTACATCGATATGAGTTTCTGGATATTTTAATTCATTTATTAAGAATTTTACGTGCTCGTCGTCAAGACTATTTAAATCAAGTTTAGCCATGTCTGTTCCTCCTTTAACGTTGTATAGGCATTAATTTTTAATACTTTCTTATTTGAAAAAAGCAAAAAAAGATAGGTGAGATGTATACACAACCAAAAGTGTATATTATCAATTTAGCATCTCGCAATATAATTTTATACAATGTATAATAAGATTTAAAGATACAGCTCATCTCCATTTTCATAGGGGATTTTTAAAATTAAGTATTGAAAAATAAAATATTTATATTATAATATAAATAAGTCAACGACCATGCGTGGACAGTAAAACGAAGTACATGCGAATGTAGTAGCCGTTTACTATGAGACTAGGCATTATAATTGAATATCATAGTATAAATTGCCATGAGAGTAGAAGCTTCAGTTTATGAAGACTTCGAAATCATGGTTTTTTATTTTTAAAGTGAAATTTTAGTTCATAGTAAATATATATATGTTTTTAATTCGGCTAAATCATAGCATTAAATTTTTTAGATGAAGCTAGCGATATTACGAAATGATATATAGAAGATTTCAGTTATAACAGTATACGAAGTAATCCTCTCCATTTAACGGACAATAGTTAATAATCAGTTAATTTTAAAAACAATTATAGATTATTTGTGATAATACAAACATTATTTTTAAATATTTGATTAAAGTTCGTTTTGATTTTTATAGCGAAAAAGTTGAGTATCGGTAATTTTATCATATTGTTCGAGTATAAAGGGAACTATTTAAATGTAATGAACGTTGCATCAAAATGACCGGTTTTCAGCATCATAAATGAATAAATTGTGTCATTTTTAATATTTTACAGCATTTTATTTTTTAATGAACAGTTAATTTTATAAATAAGTTAAATAATCTAGAATAAATTTGTATTAAAAATTTATATAGAAAAAAGTGAAACTTATGTTTAAGAAAAAAATGTTAGCTGCAACTTTGTCAGTAGGACTGATTGCACCTTTAGCATCTCCGATTCAAGAATCTAGAGCAAATACTAATATTGAAAATATTGGTGATGGTGCTGAAGTAATCAAACGAACGGAGGATGTAAGTAGTAAGAAATGGGGCGTTACTCAAAATGTCCAATTCGACTTTGTAAAAGATAAAAAATATAACAAAGACGCTTTAATTGTTAAAATGCAAGGTTTTATTAATTCCAGAACTTCATTTTCAGATGTGAAGGGTAGTGGATATGAATTGACTAAACGAATGATTTGGCCATTCCAATATAATATAGGACTGACGACTAAAGATCCAAATGTTAGCTTAATCAATTACCTTCCTAAAAACAAAATAGAAACTACTGATGTTGGTCAAACATTAGGATATAACATTGGAGGTAATTTCCAGTCAGCACCATCTATAGGTGGCAATGGCTCATTTAATTATTGGCAGTGTGTCAATAGAAAAATGAGAATTTCTTAAATTTTTTTAATAAATATTACTAAAAGAGTACAGAAGAAGAAAAAGAAGCATTTTACTAGTAATATCTATCAAAAACCACAGATTTAAATAGTATGCTTCTTTTTAGATTATGCATTTTATATACAAAATTTATTCGTCCTGTCCTTCCGCGCTCATTGTAAACCATTCGCTTAGATTAACCTATATTAATTGACGGGTTCGTGCCTCACACAGTCATTTAATATAGGTTCACAATTTTGTGTGCTTACATGGTACTTTAGCATTTCCTCACTCGATTTATAGTCAAATATCATTCGAGGCCGTGCATTAATTTGTTTAACAGCTTCATCTAATGACTTTTGTGTTATATTTGCAAAATCCGTACCTTTAGGATAATACTGTCTTAAAAGTCCATTTGCATTTTCAATAGAACCACGTTGATATGGACAACCCAAATCACTAAAATAAATACTACAATTCAATTCATCTTCTATTTGTTCAAATAGAGCAAACTCCTTACCTCTATCCATAGTTATACTTTTGGGTAATAATGGTTTCATAATATTTATAATCTCATTACAAACTACATTGGATTTACGTGTATTTAATCTACTAGCATATAAATATCTTGTCTTTCTTTCAATAATAGTTAACAAGCAATATGTTGATGGTCTAACACTCCAAACAGTATCAATTTCATAATGTCCAAATTCTTCACGATTATTAATACTTTTTGAGCCGATACTTTATAACACGAGACCCTACGTCTAATTTGCCACGCTTTTCAGAAGACTTATTATATTTCTTGCCTGCTTGTCTCATATCACGTTTAACATCAACTTTTACCAATCCATTGCGAATATATCTATATATAGTAGGATAACTTATATAATACCCTGTATCTTTTTCAATTTGACTTGCTATCTGTCTAGGAGACCATTTTAATGAAAGTTTTTCTTCAATATATGCTTTTGTTTCATCATTCAAACGTCTACGTTTAGCAACCTGTTCATCTGAAATACTACGCGATTTTATAGCATCTTCTTCAGCCAATAAAGGATTATAAACACCATCAACAGAACGCTTATTTACTTCTCTATAGAGAACTGCATCATCACGACCTAAAATCTTAGAAATCTGAATGATGTTTAAACCATCATTTAAATACTTTGCGATAGCTAGACGTGTTTTATAGTCTAATTCTTTACGTTTTTTTCTTTTTTTCATGTATATCCTCCTTTACTTTTAAAAAGGTTATTTATAAAATAAGTTATAAGAGGATATATGTTCATCAACTCCCGATACCACCGCTAAAGCGTATAGGGAGTTGATTCTTTATTTTTTCATATTATTTTCTTCATAAACTGGTTTATTATCTTTCTCAAACTTTTCAGCATCAATATTAGAATCTTCTTCATATTTATCGCTAGTCTGATTTATTTTATATACTCTTGAAACTTTTGTATTACTATCTTTAAAAGGCATATAAGTCATTATAATAACCTCACCATCATTATAAATCTTATAATAACTTTTTGACCGCTCAACATTTTTATACTTCTTTGTATTTTTCACATCTTGAATACTTTCTTTTTCTAACTTTGTAACTTCATCAATTTCTTTATCATATTTCTGACCACATGCAGATAATAATATAACTAATCCTAAAATTAATACAAACCATCGCCTCATGATAAATTCACTCCTTTTTACGTAAATTATATCATTGCTATCGTCTTGAAACAAACTAACGTCCTAGAGGTTTTAAATTGAAACGTTTTAAATTATCAATACGCCAACCTTCAGCTGTACGAACTAAATCCAATTGTGCAGATGTTTGACGATGTTCAATTTTATCATCTCCATCTGTTTCAATACGTTCGTCGAACTGAACAAAAACTTTATAACTATCTTTTTTAGGGTCATACGTATCAAAATAAACATGAATATCATTAACCGTTATATCATCATATAAATCATATTTATCTTTAGAATCCTTAAATAATGTATCGTAATAATCCTTTGTAACTAAAGGCTTTATTTGTG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84 | Staphylococcus_phage(93.33%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
366525 : 375568
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047835|366525:375568|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP047835|366525:375568|367531_368557_+|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP047835|366525:375568|366525_367530_+|WP_001005768.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >NZ_CP047835|366525:375568|369737_369998_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP047835|366525:375568|368579_369719_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP047835|366525:375568|372754_375028_+|WP_031918693.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP047835|366525:375568|370272_372552_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP047835|366525:375568|375049_375568_+|WP_000364545.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKTGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
443402 : 451714
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047835|443402:451714|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAACTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATCTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACATACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACCTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGGACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCTGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGACGCATTTACTACTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTAAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTGAGTCATGACATTTCACTTATGAAGTCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTATAAATGATGTTGCGCCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAGTTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTATATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACATAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACAGAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCATTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAACGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATATAGATGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP047835|443402:451714|449912_450803_+|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP047835|443402:451714|448556_449903_+|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP047835|443402:451714|447342_448443_+|WP_000683930.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGIMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTNPFQYI >NZ_CP047835|443402:451714|443402_445202_+|WP_001217262.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP047835|443402:451714|445425_446532_+|WP_160193045.1|DBSCAN-SWA MSDNIVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP047835|443402:451714|446662_447340_+|WP_000624584.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP047835|443402:451714|450928_451714_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
988868 : 997341
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047835|988868:997341|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATCCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACGCATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTATTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATACAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCAACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTCCCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGTGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTACCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAATATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCTGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGGTCATCTTTGATCGCTTCAGTAAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAATACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACTTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGTGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAAGTTAACAACAAACCACCTTTGCCTACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCTGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCAACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTTCCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCATCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACCCCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAAACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCTGGACCCATAAGCACATGCTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCTGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACCGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCCACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAGTCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCAGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGGTCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGCAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATGATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTAAACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP047835|988868:997341|989437_990466_-|WP_000030821.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINGSGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP047835|988868:997341|990458_991943_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP047835|988868:997341|996858_997341_-|WP_000861574.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGLNIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP047835|988868:997341|994103_994775_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP047835|988868:997341|988868_989435_-|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP047835|988868:997341|991921_994111_-|WP_000032746.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLLTLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP047835|988868:997341|994776_995040_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP047835|988868:997341|995039_995744_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP047835|988868:997341|995747_996872_-|WP_001010406.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1017315 : 1050623
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP047835|1017315:1050623|DBSCAN-SWA TATGAATAGTTCATATAAATCTAGAGTATTCAATATTATAAGCATCATAATGGTTTCAATGCTTATTTTATCACTAGGCGCATTTGCTAATAACAATAAAGCCAAAGCCGATTCACACTCTAAACAGCTAGAAATTAATGTTAAGAGTGACAAAGTACCTCAAAAAGTAAAAGATCTAGCACAACAACAATTTGCTGGTTATGCTAAAGCATTAGATAAACAAAGTAATGCAAAAACTGGTAAATATGAACTTGGCGAAGCTTTTAAAATTTATAAATTTAATGGTGAAGAAGATAATAGTTACTATTATCCAGTTATAAAAGACGGTAAAATTGTTTATACTTTAACACTTAGCCCTAAAAATAAAGATGATTTAAACAAATCAAAAGAAGACATGAATTACAGTGTTAAAATTTCAAACTTCATCGCTAAAGATTTAGACCAAATTAAAGATAAAAATTCAAATATCACTGTTCTTACTGATGAAAAAGGATTTTATTTTGAAGAAGATGGCAAAGTTAGATTAGTAAAAGCTACGCCACTACCTGGTAATGTAAAAGAAAAAGAAAGTGCTAAAACAGTTTCATCAAAATTGAAACAAGAGTTAAAAAATACAGTAACACCTACTAAAGTTGAAGAAAACGAAGCGATACAAGAAGATCAAGTTCAATATGAAAATACATTAAAAAACTTCAAAATTAGAGAACAACAATTCGATAACTCATGGTGTGCAGGATTTAGTATGGCAGCATTATTAAATGCAACTAAAAATACAGACACTTATAATGCACATGATATTATGCGTACATTATACCCTGAAGTAAGTGAGCAAGACCTTCCTAATTGCTCAACATTCCCTAATCAAATGATTGAATACGGTAAATCACAAGGCAGAGATATTCATTATCAAGAAGGCGTACCATCATATGAACAAGTTGATCAACTTACAAAAGATAATGTAGGAATTATGATTCTTGCACAAAGTGTATCTCAAAACCCTAATGATCCACATTTAGGACATGCCCTAGCAGTTGTTGGTAATGCTAAAATTAATGACCAAGAAAAACTTATTTACTGGAATCCTTGGGATACAGAATTATCAATCCAAGATGCAGATTCAAGCCTATTACATTTATCATTCAATCGTGATTATAACTGGTATGGTTCAATGATAGGTTACTAAAAAGTAATATAGATATTGATTAAAGGCAGGTAAAACTATGTATCAACTACAATTTATAAATTTAGTTTACGACACAACCAAACTCACACATCTAGAACAAACCAATATCAATTTATTCATTGGTAATTGGAGTAATCATCAATTACAAAAATCAATTTGTATACGTCATGGCGATGATACAAGTCACAATCAATATCATATTCTTTTTATAGATACGGCACATCAACGCATTAAATTTTCATCTATTGATAATGAAGAAATCATTTATATTCTTGATTATGATGATACACAGCATATCCTCATGCAAACGTCATCCAAACAAGGTATTGGCACTTCGCGCCCAATCGTTTATGAGCGCTTAGTATAACTAATTTAAATGATTTCACTTCATAAAGCGGGTTGGCGAGAATTCAATTTCTCACCAGCTCGTTTTTTTGATTGTAATAATAATCTTTAACATTTATTTTTTCTCTATTAATTTTCTCAAACTATCTTATATTTATGATAATTAATTAAAAGCCCCTTTTAAATTCTTATAAAATAAAAAAGCCACCTATCGTCGCTAATAAACGACGCAAGTGACTTAATATCATATTCAAAATAACTTATGGGAATTTAGGGAATTGATCGAAGTCAGGATCACGTTTTTCTTTAAACGCATCACGGCCTTCTTTCGCTTCATCAGTTGTGTAATAAAGCAGTGTTGCATCCCCAGCCATTTGTTGTAAACCAGCTAAACCATCTGTGTCAGCATTCATAGCTGCTTTAAGGAATCGTAACGCTGTTGGTGAGTGTTTCATAATCTCTTTACACCATTGCACAGTTTCATCTTCAACTTTCTCTAAAGGTACCACTGTATTTACTAGACCCATATCTAAAGCTTCTTGTGCATTGTATTGACGACATAAGTACCAAATTTCACGTGCTTTCTTATGTCCAACGATACGTGCTAAATATCCTGAACCATAACCCGCATCAAATGAACCTACTTTAGGACCAGTTTGTCCAAAAATAGCATTATCAGCAGCAATCGTTAAGTCACAAACAACATTTAGTACATTACCGCCACCTACAGCATAACCTTTTACCATCGCGATAACCGGTTTTGGAATAATACGAATTAAACGCTGTAAATCTAATACATTTAAGCGAGGGATTTGGTCTTCACCTACATAACCACCATGTCCACGTTTCTTCTGGTCACCACCAGAACAGAATGCTAAATCACCTTCACCAGTTAATACGATAACTGAAACGTTTTGATCATCACGTGCACGTGAAAATGCGTCAATCATTTCAGCAACTGTTTTAGGTGTAAACGCATTGCGTACTTCAGGGCGATTTATTGTTACCTTAGCAATCCCTTCGTAAAATTCATATTTGATTTCATCATATTCTCTAAGTGTTTCCCATTGTCTGTTAGTCATTTTGCTCCTCCTTTAAAAATCCTAATATCATTGTATCAAATTCATCACTATCTTCCACATGAATTGTATGACCTGTAGCAGAAATTAATTTACATTTACTATTAGGAATTAAATTTGCCATTTTTTTCGCAATCTGTACAAATTTTTCATCATATTCTCCAGCTAATATTAATGTTGGTACTTTAATTTCTTTCAGGCGCGGCCATAAGTTTGGCATTTGACCTGTACCATAATCTCTTAATGCTTTGGCCATTTTATGTGGCGATTGGGACAATCGTTGTTGTCTTATTTGATGTTGTATTTCAACTGGTAATTCTAGTTGCGATTGAAATAATGGCAACTTTTCCCAATCATTAACAAATAATTCAATACCTGCTATGTCTAATACTTTAGCACGTGCATCATCAACAAGACGACGTTCCAATTGATTTGCTTCTTCTTTAATACCTGGTGACGTACTTTCTAATATCAAATTAGATATAGGGATGTGACCATTAATTGCATAATATAATGCAACACGCCCACCCATTGAATATCCAAACAATGTTATTGATTTATCTTTATATTTATCTAAAATTCGGTCTAACAACGTCGTAATATAATCAAAATTCCACGTTTCATCCATTGAAGACTGATCTTCGCCATGTCCTGGTAAGTCTATAGTGATGACATGACAGATATCAGTATATTTATCGATGTGATTATAATAAGTACGACTGTCGCTAAGAAAACCATGCAGTAATACTAAAACTTGATTGGTCTCAACGTTTGCTTCATAGTATTTATAATGTGTCATGAATCATTTCACTCAATTTCTGATATAAAATTTGATGCTGTTTAAAGTTATCTTCGCGATTCGTTATCAATTCATAAATCGTCGAAGTTTCAGATAATAATGTGGCATTTTTAAATTCTGAAACACTGTTAAAACGTTTAAAATCGAATTGATATAACTTAGCTGTATACTCGAAATCCAATCCCGTCGGTGTGCCAAACAACCGTTCAAAATAGTCAGTTGCACTTTCTTTTTGTGGTAAATATGAAAAAATACCGCCACCATCGTTGTTCAATAATACAATATTCATCTGAATATTATTTAATTTTGACATTAATAGTCCATTCATATCATGATAAAATGACAAATCACCTATCAATAATGTAACTCGTTTATGGACAGCCATACCCAGTGCAGTTGATACGATACCATCAATACCATTTGCGCCACGATTTGCATAGATGTCTATATTTTTATTCAATAACAAGTTATCTACATCTCTGATTGGCATACTATTACTAATAAATAATGCATCTTTTTCAGATGTTTTCTTAATCAATTCACCAACGAATGCACTCTCATCTGTAGCTTGTTCCAAATAACATTTAATTTCTTTACGCCCTTTTTTCTCTAAGCGTTGCCATTTTTCTAACCAACTTACGCGATTAACTGTCGTGTCTTCCATTAATGACCTAAAGAAATCATTCGCAGATATTTCATATGAAATATCTGGTGCTATTGGAAAGACATCAATCTTATCATTGTTTTGCACTAATATTTGAAATGCATCAGTTTTCTTTAACCATTGATTCAAATTTTTAGAAATCACTGGTTTCCCAACACGAATTACGAAATCGACTTTTAAGTCTAAACCGCTTCTAAACAACAAATCATATGTACAGATAACATTCGGATGATCAAATTTTCTTAAATGACTTAAAGGATCAGCTAAAATAGGCAAATCATATATCGTTGAATACGTTAGTATTTGATCAACTTCTTGGTGCTGCATATCCCCTACAATAATTAAACCTTTTTTCTTATTTAAAATGTGTCTTAATGCCGATGCATCTATACTTTTTTGATAGTGCGGTAAAATCTTCATCTCAGAAGTTAACAATTCTGTTGCATTCAAATCAGGTGTTAACGGATCTCTAAATGGCAAGTTAAAATGAATTGGCCCTTTATGTGGTCCATATAAATATTGACTAGCAATTTGCATTTGATAGTAAATTGCATCAATGGTCTCTTTACTATCATCCGCAATAGGCATATCGAACTCATAACTTACATAATTATTAAACATATTTACTTGATTAATCGCTTGTGGTGCACCTACACTTCTTAATTCATGCGGACGGTCACTTGTTAAAACGATTAATGGAATTCTACTAATTTGGCTTTCAGCAATTGCAGGCGTATAATTCGCTGCTGCTGTACCTGACGTACATAATATAGCGACAGGTCTTTCACTACCTTTAATTAACCCAACTGCAAAAAACGCTGCACTTCGCTCATCGGGGTGTATCCATGTTTTAATATTTGGATGTGCTTCAAATGCAAGTGCAAGTGGCGTTGAGCGTGATCCCGGACTGATAACTACTTCCCTTACGCC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36 | Enterococcus_phage(16.67%) | transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1193558 : 1205734
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047835|1193558:1205734|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP047835|1193558:1205734|1196725_1199098_-|WP_031898814.1|DBSCAN-SWA MAIKKKDRIIGVKELEIPQELKLVPNWVLWRAEWNEKQQNYGKVPYSINGYRASTTNKKTWCDFESVSIEYEVDEQYSGIGFVLSDGNNFVCLDIDNAIDEKGQINSELALKMMRLTYCEKSPSGTGLHCFFKGKLPDNRKKKRTDLDIELYDSARFMTVTGCTIGQNDICDNQEVLNTLIDEYFKENLPVNDVVREESNTNMQLSDEDIINIMMKSKQKDKIKDLLQGTYESYFESSSEAVQSLLHYLAFYTGKNKQQMERIFLNYNNLTDKWESKRGNTTWGQLELDKAIKNQKTVYTKSIDEFNVIQQGSKDVKQLLNQLGHEERTKMEEKWIEGGKRGRKPTTISPIKCAYILNEHLTFILFDDEENTKLAMYQFDEGIYTQNTTIIKRVISYLEPKHNSNKADEVIYHLTNMVDIKEKTNSPYLIPVKNGVFNRKTKQLESFTPDYIFTTKIDTSYVRQDIVPEINGWNIDRWIEEIACNDNQVVKLLWQVINDSMNGNYTRKKAIFLVGNGNNGKGTFQELLSNVIGYSNIASLKVNEFDERFKLSVLEGKTAVIGDDVPVGVYVDDSSNFKSVVTGDPVLVEFKNKPLYRATFKCTVIQSTNGMPKFKDKTGGTLRRLLIVPFNANFNGIKENFKIKEDYIKNHQVLEYVLYKAINLDFETFDIPDASEKMLEVFKEDNDPVYGFKVNMFDQWTIRKVPKYIVYAFYKEYCDENGYNALSSNKFYKQFEHYLENYWKTDAQRRYDNEELAKRIYNFNDNRNYIEPIESGKNYKSYEKVKLKAI >NZ_CP047835|1193558:1205734|1202875_1203340_-|WP_001085186.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMYIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NZ_CP047835|1193558:1205734|1193558_1194050_-|WP_000253083.1|DBSCAN-SWA MVSDFESNDKITEVELLMHYNPKVINSKIKAMRSQIESLYHLNMNHVITNDNDMLVSVSYPLDKLVLYIIEEKDKLEYYMKTAQDRLNLFKDIIKNYSENEQQDVMRYMLSSGKVKNEGVIERLKVDIYKVESRKRQERQNQREELHRIEFNKHLEQVKKELS >NZ_CP047835|1193558:1205734|1194232_1195291_-|WP_000657544.1|capsid|DBSCAN-SWA MKEFKEQFGYQLSNFDDMDIKGYANLYQKDIGKDVSMIEQGLKQLSITETEVLLPEQINRKLLGVLNMNEVNQSSNTWVGTLTKQLVSSENNFNIQELPTARKEVFKELLVNCELPQSLREVITITDDEHVESIPSLTYIKDKLATNGIELSLNGSSKYFDRREGHIYTEVSDSVVHGSDRTLDDLLKEIFINECVAYETTLLLDKNNSSGLIDKGNQDLSLYNQGIKEVSNTSIYDGIKQAMKDIPQTFRRNVSIVMNTEHHDKLIKELAQMGLGGLAGDLSNLFNVTNVVVTDDAHDVFVGDFGHAIYAKYEPIMYNKKKQALKGIYQFALNYVFDIKIIPELLRIVNIK >NZ_CP047835|1193558:1205734|1200986_1202093_+|WP_031898813.1|integrase|DBSCAN-SWA MKHNLNLSHNIYKDTKRGTYYFRITYYDKSNTRKYITRKGFKQRKDAVKKCNEMMDELEGVGQLNRLPFDKLVEEYIDWYSARRKTSSVKALKTHTNNHLLPYFKSIDVFKMTTQDVMKFQNKKLKEGYSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYGALVTQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDEFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMNDIKDYLNWYKENNIYKDDYVLFGTFFKAYSESTIDRWFTTALKVLDDQLPDGQTFPRIVIHELRHSHASMLVNHGASIMVIAQRLGHADSNEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL >NZ_CP047835|1193558:1205734|1203361_1205734_-|WP_001050054.1|DBSCAN-SWA MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSKGHSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEGSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPNVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGHKKKGKQRKGKNERKNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >NZ_CP047835|1193558:1205734|1202104_1202320_+|WP_000586155.1|DBSCAN-SWA MIINGWKLYNNSNINLNFIDNKNSIQAISQMTPAFWVYFEFDLQKEEIIDINPKLCLEINKDNKTIKLFDK >NZ_CP047835|1193558:1205734|1200234_1200972_+|WP_000583241.1|DBSCAN-SWA MIIFRLKEIMEEKNLKISDLHEQTGISRNSISSLLNGKTRGIQFDTLEKITLALNVDVADLFKNVFNELIIKLDDISKVETYRRSKKFKEKKNIIVKKYAVNCDLIEDNDLKKGFIPYEISIELNPNPEIEIKIQFDYSNLFNYLIKFLEDCNNFKLLLVNYLSKKIYCLENKRINEIKSFYSIPDEKVYILSSFPGIFIRRPLRDNNGIFENIELNKIINELNFNSNYNYTYSDQITLTHKNKK >NZ_CP047835|1193558:1205734|1199489_1199714_-|WP_001058500.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIQDIYNTLEAVAYNTSMEYIHNCVDGKKELIENVNREEHLQAIIEWALQQIENNFDFENDTEMEEL >NZ_CP047835|1193558:1205734|1195277_1195484_-|WP_000884055.1|DBSCAN-SWA MLDHTNESVKRVFKYRDKQELLNKYHELLDKYFLHNISFYEEDKNNERIYGLVVHTKNKLGDEDYERV >NZ_CP047835|1193558:1205734|1199864_1200083_-|WP_000163544.1|DBSCAN-SWA MTKLAYPMLYITRKEKGDTQKKVASKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKVGE >NZ_CP047835|1193558:1205734|1199189_1199489_-|WP_001103961.1|DBSCAN-SWA MNWEIKNLMCDLKILKEKFEDLKDNHGSHFEDLYLHEPNHTLNKDDVIKEGFSYHERRIHNDQMFDLLLLYTEKFDELITRFDALEKASSFADQSQDNA >NZ_CP047835|1193558:1205734|1195708_1196053_-|WP_001081426.1|DBSCAN-SWA MNRNRMKQIILEYIKNNDSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWVGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLKLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN |
13 | Staphylococcus_phage(50.0%) | capsid,integrase | attL 1188887:1188901|attR 1202426:1202440 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1256501 : 1270788
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047835|1256501:1270788|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP047835|1256501:1270788|1268892_1269435_-|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP047835|1256501:1270788|1257259_1258216_-|WP_001245574.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVIIILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP047835|1256501:1270788|1262705_1263104_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP047835|1256501:1270788|1259548_1260520_-|WP_000562501.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSETEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP047835|1256501:1270788|1258202_1259174_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP047835|1256501:1270788|1269729_1270788_-|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP047835|1256501:1270788|1260637_1262743_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP047835|1256501:1270788|1264790_1265291_+|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP047835|1256501:1270788|1267407_1268325_+|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP047835|1256501:1270788|1256501_1257263_-|WP_000616862.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSILSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP047835|1256501:1270788|1265631_1267137_+|WP_000193757.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRVTGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPIIIKAMKGIR >NZ_CP047835|1256501:1270788|1263904_1264771_+|WP_001068504.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFMPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP047835|1256501:1270788|1259212_1259368_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP047835|1256501:1270788|1267215_1267317_-|WP_031918684.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIT |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1282759 : 1290579
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047835|1282759:1290579|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTACGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCAATCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTTCCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGATGCTACTTGGATTTCATCTGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTGGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGTGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACATGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCGTATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCGCTGTATTAACTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP047835|1282759:1290579|1283894_1284488_-|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP047835|1282759:1290579|1284838_1285507_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP047835|1282759:1290579|1285931_1286645_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP047835|1282759:1290579|1289523_1290579_+|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP047835|1282759:1290579|1286743_1287328_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP047835|1282759:1290579|1288837_1289524_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP047835|1282759:1290579|1287607_1288048_+|WP_001093556.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP047835|1282759:1290579|1282759_1283911_-|WP_001217793.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQIGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP047835|1282759:1290579|1288389_1288863_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP047835|1282759:1290579|1285508_1285928_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2753970 : 2774420
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047835|2753970:2774420|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP047835|2753970:2774420|2772035_2772185_+|WP_000595265.1|DBSCAN-SWA MIKQILRLLFLLAMYELGKYVTEQVYIMMTANDDVEAPSDYVFRAEVSE >NZ_CP047835|2753970:2774420|2755044_2756061_+|WP_000595401.1|DBSCAN-SWA MIKQLYKNITICTLALSTTFTVLPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKNKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDEGKSKFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHNVKFVKVLNDNEKK >NZ_CP047835|2753970:2774420|2769627_2769876_+|WP_001126839.1|DBSCAN-SWA MPKTDSACKEYLNQFFGSKRYLYQDNERVAHIHVVNGTYYFHGHIVPGWQGVKKTFDTTEELETYIKQHGLEYEEQKQLTLF >NZ_CP047835|2753970:2774420|2762044_2762242_+|WP_001148861.1|DBSCAN-SWA MQAQNKKVIYYYYDEEGNRRPVNIQYNDGYDLMIDPRFIEMTLERHPHLKNNFYGLIDGKEFKLD >NZ_CP047835|2753970:2774420|2768428_2768650_+|WP_001123674.1|DBSCAN-SWA 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MMPKFRAWDKDKKVMSFIDEIDFNSGYILISTGYKSFNEVKLLQYTGFKDVHGVEIYEGDIVQDSYSGEVSFIEFKEGAFYITFSNVTELISENDDIIEIIGNIFENEELLEVMR >NZ_CP047835|2753970:2774420|2764173_2764953_+|WP_000137070.1|DBSCAN-SWA MTEKTNQDVDILTQLGVKDISKQNANKFYKFAIYGKFGTGKTTFLTKDNNALVLDINEDGTTVTEDGAVVQIKNYKHFSAVIKMLPKIIEQLRENGKQIDVVVIETIQKLRDITMDDIMDGKLKKPTFNDWGECATRIVSIYRYISKLQEHYQFHLAISGHEGINKDKDDEGSTINPTITIEAQDQIKKAVISQSDVLARMTIEEHEQDGEKAYQYVLNAEPSNLFETKIRHSSNIKINNKRFINPSINDVVQAIRNGN >NZ_CP047835|2753970:2774420|2771832_2772039_+|WP_000195759.1|DBSCAN-SWA MTQYLVTTFKDSSGLPHEHFTAARDNQTFTVVEAESKEEAKEKYEAQVKRDAVIKLGQLFENIRECGK >NZ_CP047835|2753970:2774420|2764983_2765535_+|WP_000704705.1|DBSCAN-SWA MKITGQAQFTKETNQEKFYNGSAGFQAGEFTVKVKNIEFNDRENRYFTIVFENDEGKQYKHNQFVPPYKYDFQEKQLIELVTRLGIKLNLPSLDFDTNDLIGKFCHLVLKWKFNEDEGKYFTDFSFIKPYKKGDDVVNKPIPKTDKQKAEENNGAQQQTSMSQQSNPFESSGQFGYDDQDLAF >NZ_CP047835|2753970:2774420|2763689_2763950_+|WP_000291489.1|DBSCAN-SWA MYYKIGDVCQKVINVDGFDFKLAVKKQDYSILVNVLDLEDRFIDSINITDENDLYTALDILNQSIYEWIEENTDERDRLINLVMRW >NZ_CP047835|2753970:2774420|2761239_2762028_+|WP_001148565.1|DBSCAN-SWA MQALQTFNFKELPVRTVEIENEPYFVGKDIAEILGYARADNAIRNHVDSEDKLTHQFSASGQNRNMIIINESGLYSLIFDASKQSKNEKIRETARKFKRWVTSDVLPAIRKHGIYATDNVIEQTLKDPDYIITVLTEYKKEKEQNLLLQQEIGELKPKADYVDEILKSTGTLATTQIAADYGISAQKLNKLLHEARLQRKVNKQWVLYSEHMGKSYTESDTIAIVRSDGREDTVLQTRWTQKGRLKIHEIMTEFGYEANVTA >NZ_CP047835|2753970:2774420|2773952_2774420_+|WP_043951428.1|terminase|DBSCAN-SWA MAGRPKKLLSNSNKNYTKEEIIEKERQEAQLNKFSKIDTEPPHFLDEIAKQEYLRILPHMQELPISNLDKAQLAQYCSFYSDFVKASLILEREDLILEDDKGNQKVNPAFNIKEKAGIRLQQTANTLGLTIDSRLRIMVPDEKEDGDPYMEFVSD >NZ_CP047835|2753970:2774420|2767484_2768264_+|WP_000803062.1|DBSCAN-SWA MKPLFSEKINESLKKYQPTHVEKGLKCERCGSEYDLYKFAPTKKHPNGYEYKDGCKCEIYEEYKRNKQRKINNIFNQSNVNPSLRDATVKNYKPQNEKQVHAKQTAIEYVQGFSTKEPKSLILQGSYGTGKSHLAYAIAKAVKAKGHTVAFMHIPMLMDRIKATYNKNAVETTDELVRLLSDIDLLVLDDMGVENTEHTLNKLFSIVDNRVGKNNIFTTNFSDKELNQNMNWQRINSRMKHNARKVRVIGDDFRERDAW >NZ_CP047835|2753970:2774420|2757442_2758480_-|WP_000857176.1|integrase|DBSCAN-SWA MKTRCYDGKKWQYEFKHEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLAEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTDTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEAGSIINLQAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >NZ_CP047835|2753970:2774420|2770882_2771077_+|WP_001795925.1|DBSCAN-SWA MNTRRNWRMKKFNVQITYTGMIEEAIEAESLEEAEFEAHDIARMEVPFDCDEFEINVEVEQENE >NZ_CP047835|2753970:2774420|2766704_2767475_+|WP_000190253.1|DBSCAN-SWA MATFRVYKESGNFVTVHKDFIHDSNISWKAKGILLYLLSRPDNWQIYETELEQHSTDGLSGLKSGIKELEEIGYIQRSRKRDKSGRLNGYEYLVYEQPHHIRFSNVGKTVNGKTNNGKTVNGKSHTTNNNSTNNDLTNNNNTNNEGSILSGNPTVSSIPYKEIIEYLNKKAGKHFKHNTAKTKDFIKARWNQDFRLEDFKKVIDIKTAEWLNTDSDKYLRPETLFGSKFEGYLNQKIQPTGTDQLERMKYDESYWD >NZ_CP047835|2753970:2774420|2759198_2759345_-|WP_001013104.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP047835|2753970:2774420|2753970_2755023_+|WP_000791404.1|DBSCAN-SWA MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTAPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNPKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKEGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDNKSFREG |
42 | Staphylococcus_phage(100.0%) | terminase,integrase | attL 2742550:2742566|attR 2765352:2765368 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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