Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028260 | Pediococcus pentosaceus strain SRCM102736 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 5 | 0 |
NZ_CP028259 | Pediococcus pentosaceus strain SRCM102736 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,csa3,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 1423
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028260|0:1423|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028260|0:1423|472_1423_+|WP_160208620.1|DBSCAN-SWA MSYKTINWDIIEDELDEYVWDKATAQYWLDTRVPVSNDLRDWRTLSGTEKSVINRVVGGLALLDTLQSEEGVDVMRPDVRTRKEAAVLNDFLMMESIHAKSYGTILTSLNDQATVDEVFKWMNNNPRMQYKAKRINDIYQTGNNLEKKVASVFLEGILYYTNFFTPLWYRGNNKLANLSEVIKLVIRDESVHGTYLGYKFQLGYNELSATEQKTFKKWMDELLDDLLENEFAFTEEVYAPIGLAEDVKQFVHYNANKALQNMGFESRFPNAEIKDINPIVMNGISTETANHDFFSQVGAGYLMGNAEAMISGDYDF |
1 | Enterococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
6018 : 8256
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028260|6018:8256|DBSCAN-SWA TTTGGGTACTTCTACTTTATCACGTTTTCAACGTGGTGCGTTAGCTCAACTGGTCAGTGAAGGCCATCATACTTACCAAGATATGGCTGACGCCTTAGGCGTTGCCAAATCAACTATTAGCTATGAATTAGATCGGGTCAAACCCTATGATCCCGAATTAGCGCAACAAGACGCAGATCATAAAAGGCGGGCTTGTGGTCGCCATTCAATTCTAACGCCATCATTGACAATTTTAATTACCAACCACCTACGTTTAACTTGGTCACCAGAAGCGATTGCGACAGCTTTTAACCTGAGCACCGCTTCAATTTATAACTGGCTTAAGCTTGGCTGGTTACCTTTCAACTTGGCTGATCTACCTAATCGAAATGTCCGACAGCGCCGAGCTAATGAGCATCGTGGCACATTTACAAGTGGGACTTCCATTGAACAACGACCAAAATCTGTCAATCAGCGATTAGCTTTTGGTCATTGGGAAGTCGATACGGTACTTTCTAGCCGAGGTCAGTCACGAGCATGTTTGGTCACTTTTGTAGAACGTAAAACCCGGCTTCTATGGGCTATCAAAGCCCCTAATCGCACCGCCAAGGCCTTAAATGATACCTTTGGAAAGTTTATGGGGACCTTCGGTTCCCAAGTGAAATCTATAACTGTTGATCATGGTAAGGAGTTTGCCGATTATCGATCCATAGAACAAGACTATCAGATTAAAGTTTATTTTTGTCACCCGTATTCACCATGGGAACGGGGATCCAATGAATATTTCAATCGACGGTTACGTTGGTTTTTCCCGAAAAAGACTAACTTTGACCAGATAACGACTGATGAAATCCTGGCAGCACTTGAGCTTATTAATCAACGACCATTAAAAATCCATCATCAACAGACTGCCATTGAAAGTTTCCGGGCTTGTTCGGATTAAACTTGTAATTTGCCAATAACATAAATTACAGGCTATAATGGTCCGTAACGGGAATATTGTATGAGGAGGGAGCGGGAACCCGCGACGTGTATGAAAAATAATAAGATTATTATCACGGCTGCCATTGCAGGTTTGCTTGGCGGTGGAGTTGCCTATGGTGGGGCGAGCTTTGTACAAAATCGAATGGAAGCCACTACCACGGCGGTACCAACTGGCTCAAACAAATCAGGGGAAACCCAAACAAGCAATGTGAAGGTTAACGTTAGCAGTCAATCTTCAAAGGCATTTTCTACGGTAAAAGATTCCGTAGTTTCCGTAATTAATTTACAAAAAGAGAATAACAATGATCCTGATAACATTTTAAATTCAATTTTTGGGGACAGTGAATCGTCATCCTCAAAGAAGTCTTCTTCTGACAAACTCCAGACAGCTTCGGAAGGTTCTGGGGTGATTTACAAGAAGAGTGGCGACGCAGCTTACATTGTTACCAACAACCACGTGGTTAGCGGGTCAAACTCGTTGGAAGTAATTATGAGCAACGGAAAGAAACTACCCGCTAAGATTGTGGGAACCGATAGCGTGACGGATCTAGCGGTCCTTAAAATTAATTCGGCTCCAGTAACTACCGTGGCAAGTTTTGGTGACTCAGACAACATCAAGGTTGGGGAAACCGCCTTGGCAATTGGATCGCCGTTAGGTTCTGAATACGCAACTTCCTTGACGCAGGGGATTATTTCAGCGAAGAAACGGACCATCGAAACTTATAATAGTAACGGACAAGGTACTGGCGAAGCAACGGTTATCCAAACGGATGCCGCAATTAATCCTGGTAACTCCGGTGGGCCGTTAATTAACTTAGCTGGTCAAGTCATTGGAATTAATTCGATGAAACTTTCTTCGAGCGGTAATTCGACTTCGGTAGAAGGGATGGGCTTTGCCATTCCATCGAATGAAGTGGTTTCCGTAATTGACCAGTTAGTGAAGAATGGTAAAATTGATCGTCCAGCATTAGGAGTAACACTGGTAGATTTGACGGCAATCTCTTCAGACCAACAAAAATCCATTCTAAAATTGCCTAGCAGTGTAACTGGCGGATCGGTAATTATGTCGGTAAATGCAGGCCCTGCAAAATCAGCGGGCTTAAAGAAATACGACGTGGTTACGAAGGTTGATGGAAAGTCAGTTAAAGACACGGCAGAACTCCGTGAAGCACTTTATAAACATAAAGTTGGTGACACTATTAAAGTGGGGTACTATCATAATGGAAAATACAAGACCACGGACGTTAAGTTAACTAAAACAGCTAGCACTAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028260|6018:8256|7029_8256_+|WP_160208625.1|DBSCAN-SWA MKNNKIIITAAIAGLLGGGVAYGGASFVQNRMEATTTAVPTGSNKSGETQTSNVKVNVSSQSSKAFSTVKDSVVSVINLQKENNNDPDNILNSIFGDSESSSSKKSSSDKLQTASEGSGVIYKKSGDAAYIVTNNHVVSGSNSLEVIMSNGKKLPAKIVGTDSVTDLAVLKINSAPVTTVASFGDSDNIKVGETALAIGSPLGSEYATSLTQGIISAKKRTIETYNSNGQGTGEATVIQTDAAINPGNSGGPLINLAGQVIGINSMKLSSSGNSTSVEGMGFAIPSNEVVSVIDQLVKNGKIDRPALGVTLVDLTAISSDQQKSILKLPSSVTGGSVIMSVNAGPAKSAGLKKYDVVTKVDGKSVKDTAELREALYKHKVGDTIKVGYYHNGKYKTTDVKLTKTASTN >NZ_CP028260|6018:8256|6018_6939_+|WP_121054781.1|transposase|DBSCAN-SWA MGTSTLSRFQRGALAQLVSEGHHTYQDMADALGVAKSTISYELDRVKPYDPELAQQDADHKRRACGRHSILTPSLTILITNHLRLTWSPEAIATAFNLSTASIYNWLKLGWLPFNLADLPNRNVRQRRANEHRGTFTSGTSIEQRPKSVNQRLAFGHWEVDTVLSSRGQSRACLVTFVERKTRLLWAIKAPNRTAKALNDTFGKFMGTFGSQVKSITVDHGKEFADYRSIEQDYQIKVYFCHPYSPWERGSNEYFNRRLRWFFPKKTNFDQITTDEILAALELINQRPLKIHHQQTAIESFRACSD |
2 | Staphylococcus_prophage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
14563 : 18430
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028260|14563:18430|DBSCAN-SWA CATGCCAACTCGTTACGACAAAGAATTCAAACAAAACATTATCAAACTATATAAGCAAGGCGAATCAGCTGCCCAACTGGCCAGAGAATATGGCATTGGCTATTCAACAGTTCATAAGTGGATCCAGGGCCAGGCCAAAACTCAATCCGGTAAATCGCCAGACGAAATCAAAGCGATGGAAAAGCGACTGGCTTCGCTGTCTGAGGAGAACGAAATCCTAAAAAAAGCCCTGGGCTTCCTTGCGCAGAAGTAACCAATATCTTTGATTACATTCACCAAGAAAGCCATCACCACCAGGTAACCAAGATGTGCCGAATCCTCGGTATTTCCAGAGCTCAGTATTATCGTTATCGATCCCCCAAACCTTCAAAACGCCGAGCCGAAGATGCGGACTTGAAACAACGGATTCTGCGGATCTTTGCGGAATTTAAGCAGCGATACGGTGTTATGAAGATCCACCATGAATTGAATCTGGAACTTCAACCACTGCAGCTTCGGTGCAGTCCACGATGGATTTCCCGGCTCATGAAGGAACTGGATATCCACTCCGTTACCGTCAATAAGTGGAAAGCGGCTTCGGCTTCCAAAACCAAGGTTGAACAGCGTCCCAACTTGCTTAAGCAGGATTTCTCGATCACTGGTTTAAATCAAAAATGGACCGCTGATATGACCTATATTCAAATGAAGCGTAATGGCTGGTGTTACTTATCAACCATCATGGACCTGCACTCACGACGGATTATCGGCTATTCGTTCTCAAAAAAGATGGATACTGATTTAGTCTTAAAGACCCTTAAAAGCGCGGTTAAAAATCGAACCATTACTGGGGACCTGATTATCCATACGGATTTAGTATCACAGGATACCAGCGATGATTACAATCAACGTTTAACTGAACTACATATCCGCCACTCATATAGCCGTAAGGGTTGTCCGTATGATAATGCGCCAATGGAATCCTTTCACGCTTCCCTCAAAAAAGAATGTGTTTATCCAGTGCCGGTCTTTGAAGATTATGAAACTGCCGCTGCCGTCCTTTTTGAATATGTGCATGCTTTCTACAATAGGAAGAGAATTCATAGTTCACTGGGCTACCAGCCCCCCCTTACAAGTTGAAATTGCAACACTTACGAGCCAAATGGCTGCCTGATTTAATGCTTTCCAGGGTTCAAATAAGTTATTAATCGCGATTAATGATTTATTTGAGCTGTGGAAGGTAAACGCGGTTCTGAATGTCTCTTAAAATCTGTCTCAAATATTGACTTCAATCCAATTCTTGACGCTACCTTAATAATGTAACGGAATATAATTATTTATGGTTCCTTTAAAGGATATAAAAACTTGCCTTAAGTGGAGGTTAATAGTGCTAACGTGTGAACTATTACACTTTAATTTGTTTAATCCGGATTAGAGTTCAAATCAAATTTATAAGCTATATTATAATATTAAACCAACAGTATAGATGTAACAATAGAGTGTACCCTATTGTGTTACAATTAATTTGTTGAAATCTCGGTATTTATGTATGACACAATAGAGTTGTCACATAAATACTTTAAAAAGGGAGTCAAAAAATTGAAAATAGGATATGCACGAGTGTCTACCACTGATCAGAATTTAGACCGTCAAATCTTTGCTTTAAAAAAAGCCGGAGTTCAAAAAATATTTGAAGAGAAAATTTCTGGTAAAAACATGGAACGCCCAAAGTTAAAAAAAATGCTGGAGTATATTCATGATGACGATGTAGTTACAGTAATAAGTTTGGATCGCTTAGGGCGTAATTCGCGTGATTTAACAGATGTTATTGATAAAATCAGACGGAGAGGAGCAGTTTTGGATGTTCTAGATTTACCTACGTTTGCAGGTGTTGAAGACGGCAATTTAAGAGCTCTATTAACAAATCTTGTATTGGAAATATACAAATATACGGCAGAAGAAGAACGCCAAAAAATCTTAAAAAGGCAAAGTCAGGGAATAAAAATAGCTAAGACAAAGGGCATATATAAAGGAAGAAAAAAAGAATATGCTCCAAATGGTTCAAAACGCTTCATATATAATGGGGTTTTAAACGGAATAAAGAACGGAAAAAGTATTGCGCAAATTTCCAGAGAAACTGGTATCGGACGAACACAGGTTTATCGAATTCGTGACTATGCTAGGTCGATTAATGATTTATAGAGGATGATGTGTATATTGCAACTATCGTTATCAATGTTAATTTAAAGCAGTTTATAGTTCTTAAAAAATTTCTTATAATAGATTTTCAATATCTATTGTGAAAAGTACTAGATATCAAAAGTATCTAAATATCTAAGTATCTAAGTATCTTTGTATCTAAAGATACTTAGATACTTTTTAATAAAGCATATATAAATGGCAAGACCAATAGCTTAGCAGCTTAGTAATTTAAATATTAAACACCAGTTACATTATTAATATGTCATTTTAATTTTTATATCTAAATATCCTTGTATCTTAAGATACAAGGATATAGTACAATCTACCCTTTTTTAAATTAGGTATCCAATTAGAAATACTCAAGTGAGCTTAAAAAAATAGTTTAGTTCAAAAGTATCTTTGTATCTAAAGATATAAAGATATAAAGATACAAAAGACGTTATTAGAATAAGTAAGTTCTAATAACGTCTTTTTGAAATTGTATTACCGGTATTTAATTTCGATGCTATTCCTAATAATTTCTTGTTCTCTTTCAGTAAAGTGATTTTTTAGATATTCATTTACAGCCGTACTGACTAAACCATATGCTTTCGATTCTGGTTTATTTTTGTCGGTCATATTACACATTGTTTTTATTAAATCTAAGACAGGCGGAGCCACTTTAATATTTTTCCTCTCTGCTCCAGTCCATTTCTTTGTTTCCGTTGTTTTTGGATTAAGAGAAGATGTATCTCTACTGACATCAGCTGAATGGAGTGCTTCTGGTGATTCAGTTTCTTTATTTCCTCGATTAATTAAGCCCATTAACATCTAACCCCTTTCCAAGCTTCGTAAGTTTGTTGTCTTTTGTCAAGTAACGACGTTTATATATGTAGTCAGATATATCTCCCTGAGTTTCAAAGGCTTGTATCCTTTCTTCTAATTCACAAAAAATATCCGCAAAAAGTGCAAACATTTTTTTGTCGTGAAAATCATTAAATTGTATACCTTGTGCTGTATACCATTCTAACCTTGCATGGTTTGAGATGATTGTGTTGAACACATTATCTTGACCAAAGAAAGAGACTGTATCGTTAACAATTTTTTTGTGTAACTCTCTTCGATTCTGAAGGAGTACAGGCAAAACGCCTGCTACTTGTACTTTTACCTTCGATCCAAAATCATCAACCAAACTTTGTAGGTAAGAAAATACTAAACGTTTAGATCCATCAAAAGAGAATCGTTGTGTTTCTTGGACCACCACAACATAATCCGCACAAACCATTGCATTATCAACTTTTAAATCTGTTGAAGGTGGAACGTCTATAAATATATAGTCATAACGATCTTTGATGGCGTCTAATAGGTTTGACATATAAAAAGTACGGTCATAGATATTATCAAATTTTTCTATAAGAAAATCCCCGTATTTACGCATATCATATTTACAACCGATCAAATCGAGATTATCGCTTAATTCTACAATACCTTTACTTAAGTCGCCTATTTCTAAGCATCTCATAAGTGTGTAATCTATTTTCTTTAAATTAAAGGTTCGGCCTAAAAAATCTGTAGCGTTACCTTGTAAATCTGTATCAATCACCAATACTTTTTTATCAAATATTGTAGAAGCTACGATTGCTTCCATAACAGTATCAGTTGTTTTCCCAACGCCGCCTTTTTGTTGTGCGTTAATAATAACTTGTGGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028260|14563:18430|17530_18430_-|WP_055126653.1|DBSCAN-SWA MPQVIINAQQKGGVGKTTDTVMEAIVASTIFDKKVLVIDTDLQGNATDFLGRTFNLKKIDYTLMRCLEIGDLSKGIVELSDNLDLIGCKYDMRKYGDFLIEKFDNIYDRTFYMSNLLDAIKDRYDYIFIDVPPSTDLKVDNAMVCADYVVVVQETQRFSFDGSKRLVFSYLQSLVDDFGSKVKVQVAGVLPVLLQNRRELHKKIVNDTVSFFGQDNVFNTIISNHARLEWYTAQGIQFNDFHDKKMFALFADIFCELEERIQAFETQGDISDYIYKRRYLTKDNKLTKLGKGLDVNGLN >NZ_CP028260|14563:18430|16137_16740_+|WP_081035682.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTTDQNLDRQIFALKKAGVQKIFEEKISGKNMERPKLKKMLEYIHDDDVVTVISLDRLGRNSRDLTDVIDKIRRRGAVLDVLDLPTFAGVEDGNLRALLTNLVLEIYKYTAEEERQKILKRQSQGIKIAKTKGIYKGRKKEYAPNGSKRFIYNGVLNGIKNGKSIAQISRETGIGRTQVYRIRDYARSINDL >NZ_CP028260|14563:18430|14563_14815_+|WP_014081540.1|transposase|DBSCAN-SWA MPTRYDKEFKQNIIKLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHKWIQGQAKTQSGKSPDEIKAMEKRLASLSEENEILKKALGFLAQK >NZ_CP028260|14563:18430|17223_17544_-|WP_010625593.1|DBSCAN-SWA MGLINRGNKETESPEALHSADVSRDTSSLNPKTTETKKWTGAERKNIKVAPPVLDLIKTMCNMTDKNKPESKAYGLVSTAVNEYLKNHFTEREQEIIRNSIEIKYR >NZ_CP028260|14563:18430|14868_15678_+|WP_160208633.1|transposase|DBSCAN-SWA MCRILGISRAQYYRYRSPKPSKRRAEDADLKQRILRIFAEFKQRYGVMKIHHELNLELQPLQLRCSPRWISRLMKELDIHSVTVNKWKAASASKTKVEQRPNLLKQDFSITGLNQKWTADMTYIQMKRNGWCYLSTIMDLHSRRIIGYSFSKKMDTDLVLKTLKSAVKNRTITGDLIIHTDLVSQDTSDDYNQRLTELHIRHSYSRKGCPYDNAPMESFHASLKKECVYPVPVFEDYETAAAVLFEYVHAFYNRKRIHSSLGYQPPLTS |
5 | Lactobacillus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
25019 : 38517
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028260|25019:38517|DBSCAN-SWA CATGACCACTGTTATCTTAGCTGAAAAACCTAGCCAGGCCCGTTCATACGTCCAAGCCTTTCAAAAGAGCACAAAAAAACAGGGTTACTATACGGTTAGTGACCCTGTTTTGCCCAAAAATACGCTTGTCACGTATGGTCTCGGACACTTAGTTGAACTAGCCACACCGGATAAATACGATCAGAAATACCAGCAATGGGCCTTATCTAATTTACCGATTTTCCCCGACAAATACAAGTTTGAAGTGTCAGCTAGTAAAAAAGCCCAATTCAAGGTCGTTAAAGACCTGTTAACGAAAGCCGATACCATTATTGTCGCTACCGATAGCGGTCGAGAAGGTTCCAATATTGCATGGTCAATCATGAATCAAGCCCAGATTGATATTAAAAAGAAGACCATTAAGCGGCTATGGTTGAATAGCCTAGAAAAAGACGCGATTATTACCGGCTTTAAAAATCTTGGTGATTGGCACAAAGACTATTTGGCTTATAAAGAAGCCCAAACCCGTCAAATTAGTGACTGGTTAATTGGTATGAATGGCAGTCCTTTATATACTTTGTTGTTAAGACAAAAAGGAGTACGCGGGGTGTACTCAATTGGTCGCGTGCAGACGCCAACCTTATATATGGTCTATCAAAGAGACCAGGCAATCAAAGACTTTAAGCCGGAACCCTATTTTGAACTAAATGCGGAAATTTTAGCCAACCAGCAAAAATTCGTCGCAAAATTAGACCCCTATCAGCGGTTTAAAGATGAAACAGGGCTAATGGCATTCATGCAAGCTAAACACGTTCAGAAAGGCTCACAGGGCGGTTTAATCAAGGACGTGCAAAGGCAGGCTAAAAAGAGTGCTAGTCCACAGCTGTTCTCGCTTTCCAGTCTCCAAAGTGCCATGAGTAAACGTTATCATGCCAGTGCCAGCCAAACCTTAGCGGCCATTCAGAGTTTATACGAAGCTAAATTCCTTAGCTATCCCCGAACCGATTGTGCTTATATCACTGATGAAGAATTTGATTATTTAGTGGCTAATCTGACGAAGTATCTGGGGTTAGTCTCTACGCAAGTCTCTTTAACCAATACCACACCAGACCAGCGTTATGTCAATGGGAAAAAAGTTGAAGAACACTACGCCATTATCATGACTAAAGTCGTCCCGACTAAAGGTCAATTAGCTGCCTTACCTAAATTACAGCAACAGGTCTATGATTTGGTTTTAAGAACGACGTTAGCGATGTTTGCTGATCCTTACGAGTATGAAGAAACCATCATTATTACCCAAGTTGGCGACGCCAATTTTAAAGCAACGGGTAAGGTCCCAACTAAGCAAGGTTGGCAAGTTTTATTTGATGATCACAAAGCCGACCAGCAAGAGGCAGCCACCCTACCGATCGTTCACCAAGGCGACCAAGTCCAAGCAAATCTGCAAACGCCGCAAAAAGAAACGACCCCACCAGTACCGTTTACCGAAGGGACATTAATCACAGCCATGAAGACGGCCGGTAAAACGCTTGATGATGAAGAAGCCCAGGCGATTCTCAAAGACGTGCAAGGAATTGGGACAAGTGCGACCCGGGCCAATGTGCTAGAAGTGTTAAAGAAACGCGGGTATCTCGTCACTGAAAAGAACAAACTCCACGTCAGTGAAGCTGGGATCACATTATGTAAAGCGGTCGAACTCGAACCCTTGCTAACTAGCCCAGAGATGACAGCGAAATGGGAGCAAGCGTTACAACAAATCAGTACCGAAGAACGCACCCCGGATAACTTTTTGAGCCAAATCAAAAAGTTCGTGGCAAAATTGATTGCTGATATTCCCACGCAATTGACTGGCAGTGCAGCCATTAAGCAACAAATCGATCACCAACAGCAAGCACAAAAGTCCGACGAGGTCTTCTTAGAAACACCACAAGTAACTGTCATAAATAAACAAAAGTTTTACATTGTGAAACCCAAGCAAGGCGAGGACTTTACCCTACCCAAGAAATGGAGTAGCAAGACGCTCGGGAAGACCGCAATTAAAGCGTTAGTTACCAAGGGTGAAACCAGCAAATTAAGGGGTTTCAAGAGCAAAAAGGGGAAGTCGTTTGACGCCAAGTTAAAGCTTGACGGCCATAAATTAAGTTTTGATTTTGATTAGAACCTGCCTACCGCCCTTCACGTTGTTCCGGTTGGTGAAACCGTCATTTAGGTTTACTTTTCAAAAGCCAAAAAGTGAACCTAACCAACGAGTGTAATTGTAAAAGAAGGAGGATATATCATGAAAAATGAACTGGAAGCATTAGCAAGCGAATTACCTATTTTGACGGATAAAAGCAGTTATAAGTACCTATCAGAAGTTGCGGGTAATGGCAAATATATTCAAGTTGCGTGGCAAAAAAAGAATGCCGAATATTTAGCACTTTACGGCACACAATCTATCAAGTTACCCCAAATTGATAATTCTGTAGAGTTTGTAGACGCCGAGGAGGGTTAATCATGCCAAGTAAAGTTGAAACTGAAAAATGGAAAAGGCAGCTTGCCGAAAATGCCGAAAAAGAAATTTTAAAACTAACTGATAGTGAAAAATTTAAAAGTTATCTTGATACCGTAGCAAAGTTTCACCGATATAGCCAACGTAATATTGACCTTATCTATTCTCAAAATCCAAGTGCCAACCAAGTTGCAGGCTTTAAAAAATGGCAGAATGATTTTAAACGATCAGTAAATAAAGGAGAAAAAGGGATCAAGATTGCGGCCCCTATTATTAAAAAACTAACTCCAGAGGATCAGAAAAGGTTTGATACGACCGAAGAAAAAGCCATAGTTGGTTATCGCTATATTCCAGTATTTGACATATCACAGACAGGCGGCGAACCAGTCCTAAGTGCTAAAGATTTTGTCAAAGAAAATTTAGTGGATCATAAAAACGTTACTAACCTATACAACGAACTCAAAGATTATTTGAATAACAATACTGATATTAAAGTCAGTGAAAAAAGTCTGTCAGAACTTGGTGGCGCTAAAGGCTATTTTCAACCCAACACTAATGAAATCGTCATTGGTGGTGATGAGCCCGACAATGCTTTAAAACTGAAGACGTTATATCACGAATATGCGCATAGCCAGCTACACGGCTTAAAATCAGCCTTTAAAGATCGGCCACGAGCCTATCAGGAAACCCAGGCCGAAGCGGTCGCCTATGTTGCCATGCAAAATATTGGCGTTGACACCAGTAACTATTCACTCGGTTATGTGGCTACCTGGGCGAAAGATAAAGCCGTGATCCATAGCGCTTTAAGTGAAATTCAGCAAGTTAGTAACAAAGTGATTGAGCTTAGTGACGGGTTAACCAAACAATTAGGCTTACAAGAAGCCCAAAAAGAGCCTGAGCATGATCTAAAAAAGCTATCAGCCCATGCTCTTAATAAGTCCTATCAAGGCTTGCAACAACAAATTAAGCAAGCAAAGAACCCACAACAAAAATCAGAACTAAAAAATAAATTAAATGATGTGCATCAAAAAATCAGTGAGCGAACACAAAAGCAACTGCAAGCATTTGCTGAACAGAGTCCGAAGATCAAACAACACGAATCCGAGCTTGATCAGAGTCTAAAACGTTAGCCAGTTTTTAAAGGGCATGTTATAATGTAATAGAAAAAGGAAGCCCTGCTGAAGACAGGACTTCCCATGCAAGCCGCTTCAAAGGCGGTGGCGAAGTTAATAAGACAGCATTAAGCTACCCTGTAACCTACCAAAGTTACGCAGGGCGGCTTTTTTATTTGTGGTGCTTGTCGATATAGCTGAGGAGCGCGATTAAAAACGTGCCAAACAGCAACATCAACGAGAGTGTCTGGAAGACGCTCATTGACTGTGAAACCTTCCTGAAGATTATTCCATGTTCCCATGGGCCTCACCTCACAAGGGAAAAGACAGCCACCGCCCTTAAAACTTCCTGCGTAATCCATTATACAGGTGAATTAAGTGTTGACCAAGCACAATAAAAATTAAGTCATGGAGTTTCATAGGATCCTAAATTTGATCAAATTAAGAATCAGCAAAACATCTTTTGTAGATACCCCTTTTTAAGTTCTTGGAGTTTTTCAAGCTTACGCTGATGAAGAGCGATAGTGTGATCAAGTTCGTGGAAGAGGTTCCCAATCTTCTGTTGTTCTTCTTGGCTTTTTGGAATGGTAAAAATTATTTGTTTGAACTCAGTTTTGTTAAACTTGGGTTGAGCACTTATCCCGATTTGTGTTTTTATTAAGTGTTCTCCCGTCGTACTTCTCATTAGTTGGTACATAAACTCACGATCTTGGTCGGATGTTCGTACAAGTATTGAATTGGGACCAAGAGTCATTGGCACATCTAAGATCGGTGCCTTGAACACCAAACCAGCATTAGCACCAACATTTGAAATCAAAATATCGTTTGGGTTTAGACTTGATTTCTTTAAAAAGTCATAACCGGATTTTGAAGTGTAAAGAAACGGGCCTTTGTACCCATTGCTATAATCAGTTAATCTAACAACAATAGCATAGTCAAGTTTGTCCGAGTAAGAAACATTCTCCCTCAAAGAAGCAAAGCTGCCATTCGCGACAAAATCTGTAATAGTGTGGAAAATGGCAGATGACTTACGCTGTTCCCAATCGTCAGCAAACCCTGCAAATCGCAATTCAGGAACTTTAGCTCCATTTTTAGGAAACATTTTTTGCAAGTAGCCTTTTTTCTGTTCCTTGAGCAAATCCAACTTACGCTGGTTAGCAGAGATAAGATTGTCTAGTGTTTCAAAAAACATACCCAATGACTCTTGTTCCTTGAAATTTGATGGGATTGATACCTCTGTTTTGGAGAAATCTTTTTTCGTAATGTGAGGTTGAGCCGACCCAACCTTCATCCTACGCATGAACGCATCAATCAAATTCCCTCGTAAAATCGAAATCATAAACGGAGTCGAAACTTCATTTGGAATTACATTTCGCAAGATTAGCATGGCCGAATTAATTCGAACGCTAGGGTAACTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028260|25019:38517|30339_31962_-|WP_160208643.1|DBSCAN-SWA MSEKTTQASQLESALWNAADVLRGKMDASEYKNYLLGLIFYRFLSEKTLTTFSEWAGETENVTQKYAQYMDPQFELEGVSVQPSLVEYLQNTLGYLIQPQALYATLIGKIQAHTFALDDLSQALHDLEQSTQNLSSAQDFSGLFADVDLSSSKLGSSLQQRNQTISDTMLALNAIDLIHHQGDVLGDAYEYLIAQFASDSGKKAGEFYTPRQVSDIIAQIVTYQRNAGDHQVRTIYDPAVGSGSLLLNVGQHVQNPGLVSYHGQELNTTTYNLARMNLMLHGVSYDDMHLRNGDTLSKDWPVDEPYLFDAVVMNPPYSAHWDNSDKRLSDPRFRDYGVLPPKSKADFAFLLHGFYHLQEHGTMGIVLPHGVLFRGAKEGKIRQKLLLDNRIDAIIGLPANIFHSTGIPTLIMILKKHKTTDDVLFIDASREFEKDKNQNKLTAANIQKIVTTYQNRQDVDKYAHVASPAEIKENDYNLNIPRYVDTFEPEPEIDLDQVKADLKQLDEKISQNEQAFNELASQLVTTQVNDQSKPEAHNER >NZ_CP028260|25019:38517|27493_28618_+|WP_160208639.1|DBSCAN-SWA MPSKVETEKWKRQLAENAEKEILKLTDSEKFKSYLDTVAKFHRYSQRNIDLIYSQNPSANQVAGFKKWQNDFKRSVNKGEKGIKIAAPIIKKLTPEDQKRFDTTEEKAIVGYRYIPVFDISQTGGEPVLSAKDFVKENLVDHKNVTNLYNELKDYLNNNTDIKVSEKSLSELGGAKGYFQPNTNEIVIGGDEPDNALKLKTLYHEYAHSQLHGLKSAFKDRPRAYQETQAEAVAYVAMQNIGVDTSNYSLGYVATWAKDKAVIHSALSEIQQVSNKVIELSDGLTKQLGLQEAQKEPEHDLKKLSAHALNKSYQGLQQQIKQAKNPQQKSELKNKLNDVHQKISERTQKQLQAFAEQSPKIKQHESELDQSLKR >NZ_CP028260|25019:38517|27275_27491_+|WP_003713050.1|DBSCAN-SWA MKNELEALASELPILTDKSSYKYLSEVAGNGKYIQVAWQKKNAEYLALYGTQSIKLPQIDNSVEFVDAEEG >NZ_CP028260|25019:38517|36523_36910_-|WP_160208646.1|DBSCAN-SWA MNNQEFDLATVKHFFEHDYHDRGMMKWQGFYLSDHTAALNQQNQQLNEIYVPRPQQSLAVITEVLADAYQRQQPVTIQLKTVDQNNRHCPDITTLIHGYNANDIVIDADRFIPLQEIRNVSFKNTEKL >NZ_CP028260|25019:38517|25019_27155_+|WP_160208638.1|DBSCAN-SWA MTTVILAEKPSQARSYVQAFQKSTKKQGYYTVSDPVLPKNTLVTYGLGHLVELATPDKYDQKYQQWALSNLPIFPDKYKFEVSASKKAQFKVVKDLLTKADTIIVATDSGREGSNIAWSIMNQAQIDIKKKTIKRLWLNSLEKDAIITGFKNLGDWHKDYLAYKEAQTRQISDWLIGMNGSPLYTLLLRQKGVRGVYSIGRVQTPTLYMVYQRDQAIKDFKPEPYFELNAEILANQQKFVAKLDPYQRFKDETGLMAFMQAKHVQKGSQGGLIKDVQRQAKKSASPQLFSLSSLQSAMSKRYHASASQTLAAIQSLYEAKFLSYPRTDCAYITDEEFDYLVANLTKYLGLVSTQVSLTNTTPDQRYVNGKKVEEHYAIIMTKVVPTKGQLAALPKLQQQVYDLVLRTTLAMFADPYEYEETIIITQVGDANFKATGKVPTKQGWQVLFDDHKADQQEAATLPIVHQGDQVQANLQTPQKETTPPVPFTEGTLITAMKTAGKTLDDEEAQAILKDVQGIGTSATRANVLEVLKKRGYLVTEKNKLHVSEAGITLCKAVELEPLLTSPEMTAKWEQALQQISTEERTPDNFLSQIKKFVAKLIADIPTQLTGSAAIKQQIDHQQQAQKSDEVFLETPQVTVINKQKFYIVKPKQGEDFTLPKKWSSKTLGKTAIKALVTKGETSKLRGFKSKKGKSFDAKLKLDGHKLSFDFD >NZ_CP028260|25019:38517|31975_35143_-|WP_160208644.1|DBSCAN-SWA MLELSFEKEVVKTLTTGSNQWVERKDLYGATPNQLWTNFRDKLNNNNYAKLQGHPLTDTEFNQVKRAIEVRTPYEAAKLLAAENGIGKVEVERDDAKLGTVTLELFWKADVAGGKSSYEVVRQAVRPRLVGTKDVDPDRRFDVTLLINGLPLIQLELKKATVELNQAFNQIEKYAQEGKYTGIYSLLQMFVIMTPDSTAYFANAEPDRFNKAFLFNWRTRDNHPVENGLAFTRQVLNIPMAHKMVSEYTVIDQERQSLILLRPYQIYAIEAVMHRIHDHQDGFVWHTTGSGKTLTSYKTAKLAAQDPGVDKVIFLVDRRDLDEQTTSNFSAYAANDDIAINEAQNTGDLMRKLQQNDGKVLVTSIQKLHRAVKKTQAQLATGKQSRFSKTLKQRVIFFVDEAHRSQFGKMQKEIRAAFVNSNWYGYTGTPIFNENKKQLKGDLAVTTEELFGKVCHVYNLRDALEDQAVLPFNVEHVTTIGKDTLITRALEKETQRVKVRRDKQGRLLSTADEAKIQAKIQAMSVKDLEETYLTPADFEIDEHINQVVQYILQKGPRKTSLGHGNYNAILTTSSIEMAQRYYQAFKAAKKTTHNQLDPDWPRIAITYSLSENEDQSAQKHDQMATILKDYNQQYHTNFDLADLNLYNEDVAKRAARREAVFAHLKPDQEINLVIVVRRLLTGFDAPRLNTLFVDRTLAYQELIQAYSRTNRLQNRELKQEGQIVTFRVPAIMEANEREAYKLYSGEGSFNVIIRPTYQQAVLKFQKAVVDLKAIAPTPTAADDLKGTTAKVQFVKAFRQVNQQLNSLSMYNDFTWENSEKTFGIAQPEVESYTGKYLRIKAAVTNQEPEKVPEELAALDFSLAVGSVVLVDYDYLTQLIQDWIDEQQQYSTPDQAQAHMTDYLQNSAKVQASLNKLAETQPQQAQLIREAMPYIEQQMQQSQQQSDQNQAPVALNARELVADYAQKQLVKKTKTFAHTWGLDQTALLRVAREHNVGTDEWHHEQELTQSASLTAALQAQTATGPKISAVLPLYRIKSQAAWRQFIEHDLAIYLQK >NZ_CP028260|25019:38517|29048_30350_-|WP_160208641.1|DBSCAN-SWA MKDNQAKYPQLRFKGFTDPWEQRKLENIFNIIDGDRGSNYPHNSDFLENGTNVFLDTGNVRPSGFLFNTIKYISNGKDSQLRAGKMEPNDIVMTSRGTLGNIAWYTGDIVDSYPSVRINSAMLILRNVIPNEVSTPFMISILRGNLIDAFMRRMKVGSAQPHITKKDFSKTEVSIPSNFKEQESLGMFFETLDNLISANQRKLDLLKEQKKGYLQKMFPKNGAKVPELRFAGFADDWEQRKSSAIFHTITDFVANGSFASLRENVSYSDKLDYAIVVRLTDYSNGYKGPFLYTSKSGYDFLKKSSLNPNDILISNVGANAGLVFKAPILDVPMTLGPNSILVRTSDQDREFMYQLMRSTTGEHLIKTQIGISAQPKFNKTEFKQIIFTIPKSQEEQQKIGNLFHELDHTIALHQRKLEKLQELKKGYLQKMFC >NZ_CP028260|25019:38517|36902_37223_-|WP_160208648.1|DBSCAN-SWA MNSDIEIIKGRLTLLFKRRPQTRYWLMLTNDTYDQTYNLFFNSQRANERLQSVPLHKLAHYDLADLEKLLKALRQDIKLTIEFVGFTGERWPASQKLIQRKRVPFE >NZ_CP028260|25019:38517|37215_38517_-|WP_160208650.1|DBSCAN-SWA MFFDDEPHGVFFLIDNKSFYASCEAVARGLNPLKVPLVVLSEAENTNGGLILATSPEAKHLFHLKANVSRKRDLPNDPRLWVVPPRMNLYIQRNLQINQIFHQFTTEKEVWPYSIDESILDMTYTWRLFGNSVREVARLIQKTVRQKLGLYTTVGIGDNPVQAKLALDLYAKHNHELIGEIHYETVPDKIWSITELTDVWGIGPRMAKRLNRLQIHNMYELAHTNPYLLKQQLGIIGSQLFATAWGIDRAQVTEPTKVKEASLGNSQVLPRDYFNQVEIETVIKEIGEQVAARLRHHHKLAGCLSLSIGFSYAAAEADGRGGFHQALKIDPTNDNQVLTQQLLWLFRQNWDGQAVRNIGVYSSKLSANSGQQLNLFETPRNQIRRSRLNQVIDEIHRQFGFTKLVYATSLLKGGTAIKRASLVGGHNGGNSYE >NZ_CP028260|25019:38517|28772_28862_-|WP_021353390.1|holin|DBSCAN-SWA MSVFQTLSLMLLFGTFLIALLSYIDKHHK |
10 | Streptococcus_phage(40.0%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_5 |
49747 : 51916
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP028260|49747:51916|DBSCAN-SWA AATGGTAGCTAGCACCCCAGAAATGGAAAATACCTATTTTTACTTAAATAACCTCGTAAATATCCCAAGCAACGGAGAAATTCCGCTACATTATGATCAAGAAGCCCTAAAGGCTTATTTCGAAGAGACAGTTAAACCGAAGACCAAGCAATTTGATTCGTTAAATGCCAAGTTAAATTACTTGGTTGACGAAGATTATATCGATCCAAGTATCCTGGAACAATACTCTCACAAATTTGTGCAGTCCTTGTTCGACCAAATGAGAGACCATCACTTTCGTTTTCGCAGCTTTCTCGGTGCCTACAAGTTCTACACACAATATGCCATGAAAACTAATGATGGCCAGCAATTTTTGGAAGACTTTGTCGATCGCGTCGTCTTCAATGCCCTCTATCTCGCTAATGGTGATGAACAACTTGCCAATGACGTTGCCGATGAATTGATTTCACAACGTTATCAGCCTGCCACCCCCACGTTTCTCAACGCGGGTAAAAAACGGCGCGGTGAAATGGTATCATGTTTTTTAATCGATGTGGCCGACTCCATGCTCTCAATTGGACGTGGCGTTAATTCTGCCCTTCAACTATCTCGAATCGGTGGGGGCGTCGGCGTTAACCTGTCAAACTTGCGCGCCTCAGGTGATCCTATTAAGCAGATTTCCAACGCCTCGTCTGGCGTTGTACCAGTGATGAAGTTACTTGAAGACTCATTTAGCTACAGTAACCAACTTGGGCAACGGAACGGCGCCGGAGTGGTTTATCTCAACGTCTTCCATCCTGACATCTTACATTTTCTGGATACCAAAAAGGAAAATGCGGACGAAAAAATTCGGGTGAAGACCTTGTCCCTCGGTTTGATTGTTCCTGATAAATATTATGAATTACTCAAGACTAACGAACCAATGTATCTTTTTAGCCCCTATGATGTCGAACGTGAATATCGTACGCCATTCGCTTACATCGATATCACCGAAGAATATAACAACATGGTCGCTAACCCCAATATTAAGAAGTCAGTTTTTAACGCGCGGAAACTAGAACAAAAGATTTCTCAACTCCAACAAGAATCTGGTTATCCTTACATCTTGAACATTGATACGGCCAACCAAACTAACCCTGTCGATGGCAAAATTATTATGAGTAACCTTTGTAGTGAGATCTTACAGCCTCAAGAACCGTCAAAACTTGATGATGACCTATCGTACAAGACAACTGGCACCGATATTTCATGTAATCTCGGATCAACCAATATCATGAATATGATTGACTCGCCGGACTTCGGTCACTCAGTTGAGGTCGCTGTTCGTGCGCTCACCCTCGTAACTGACACAACCGACGTTAAGGAAGTACCAACTGTTAAGCATGGTAACGAACTTTACCACACGATTGGATTAGGGGCTATGGGTCTGCATACTGCCCTTGCACGCCACCAAATTGAGTATGGCTCACCAGAGGCCCTTGAATTTACTGATGCCTACTTCCTAGCTTTAAACTACTATTCACTCGTTACGAGCAATCGAATTGCCCGTGAACGCCACGAAACCTTCGCTAAATTTGACCAATCAAAGTACGCTGATGGCAGTTACTTCGATCAATACTTGAACGCAGACTTTGAATTCAAGAGTACCAAAGTTGCAAAAATCTTCAAAAATATTAAATTACCATCTGTTACAGATTGGAAGGCACTCAAGCAAGCTGTGATTACTGGCGGCCTTTATCATCGTAATAGACTCGCTGTGGCACCGAACGGGTCAATTTCGTACGTCAATGAAACAAGTGCATCACTTCATCCAATCACACAATTAGTAGAACAACGTCAGGAAAATAAGGTAGGCTCAATCTTCTATCCAGCACCTTACCTGTCTAACGAAACTTTGCCTTACTACACACCCGCATATGATATTGATCAACGAAAAATTATTGACACCTATGCCGTAGCTCAAAAGCACATTGATCAAGGCATGAGTCTGACACTATTTATGCGTTCAGTTTTGAAACCTGACCTTTACGAGTGGAAGGATAATAACAATTTAAAGATGACAACTCGAGACCTTAACCGGTTACGGAATTACGCCTGGACAAAAGGCATTAAGTCACTTTATTACATTCGAACGTTTACAGAAGACGATGAAATTAAAACGGCAAATGAATGTGAATCATGCATGATCTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP028260|49747:51916|49747_51916_+|WP_160208660.1|DBSCAN-SWA MVASTPEMENTYFYLNNLVNIPSNGEIPLHYDQEALKAYFEETVKPKTKQFDSLNAKLNYLVDEDYIDPSILEQYSHKFVQSLFDQMRDHHFRFRSFLGAYKFYTQYAMKTNDGQQFLEDFVDRVVFNALYLANGDEQLANDVADELISQRYQPATPTFLNAGKKRRGEMVSCFLIDVADSMLSIGRGVNSALQLSRIGGGVGVNLSNLRASGDPIKQISNASSGVVPVMKLLEDSFSYSNQLGQRNGAGVVYLNVFHPDILHFLDTKKENADEKIRVKTLSLGLIVPDKYYELLKTNEPMYLFSPYDVEREYRTPFAYIDITEEYNNMVANPNIKKSVFNARKLEQKISQLQQESGYPYILNIDTANQTNPVDGKIIMSNLCSEILQPQEPSKLDDDLSYKTTGTDISCNLGSTNIMNMIDSPDFGHSVEVAVRALTLVTDTTDVKEVPTVKHGNELYHTIGLGAMGLHTALARHQIEYGSPEALEFTDAYFLALNYYSLVTSNRIARERHETFAKFDQSKYADGSYFDQYLNADFEFKSTKVAKIFKNIKLPSVTDWKALKQAVITGGLYHRNRLAVAPNGSISYVNETSASLHPITQLVEQRQENKVGSIFYPAPYLSNETLPYYTPAYDIDQRKIIDTYAVAQKHIDQGMSLTLFMRSVLKPDLYEWKDNNNLKMTTRDLNRLRNYAWTKGIKSLYYIRTFTEDDEIKTANECESCMI |
1 | Enterococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028259_1 | 867035-867147 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028259_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028259_1
>1.1|867064|55|NZ_CP028259|CRISPRCasFinder GCTAATCAAGGTTCCTGTGCTTCCATTTAGAGTTTGAAGTCCGCTATTCAATGTG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028259_1
The CRISPR arrays of NZ_CP028259_1 >merge|NZ_CP028259|1|867035-867147|CRISPRCasFinder TGACTTCCTGAATCTAACTGTTGAACGCCGCTAATCAAGGTTCCTGTGCTTCCATTTAGAGTTTGAAGTCCGCTATTCAATGTGTGACTTCCTGAATCTAATTGTTGAACGCC >NZ_CP028259|1|1|867035-867147|CRISPRCasFinder TGACTTCCTGAATCTAACTGTTGAACGCC GCTAATCAAGGTTCCTGTGCTTCCATTTAGAGTTTGAAGTCCGCTATTCAATGTG TGACTTCCTGAATCTAATTGTTGAACGCC
>NZ_CP028259.1|WP_060743520.1|865363_865999_-|DUF4767-domain-containing-protein MRHMKKPEKRSFGSINSVVWVILALIVVIAGYKFFYPNHVTNTTSSSDRSSSTKVIKVEEGKSSSSKAQSSSKKTKKTEKKIWTDKQDSELAAFISSWQQTMGQTYTGTNTNASVSFGGVSFPDYLSKGQIYVNQQEVSMQWTRSEKSDSEYKVVAVYTGDQYMYLFTFHNGQPEVLVTSQSASNGMNFKVTENADLVAEFQKVAAENTDK >NZ_CP028259.1|WP_060743521.1|864450_865104_-|nitroreductase MEVKQAIQKRHSVRHFTDQKIDSKQLKEMIGIAQKAPSWVNSQPQKVYVAQGETLEAIRKQQQELTITGAKTNSDIPPMSRKLWSEQAQKNMAEWSHGIPAVLGDNWQETLGKEASQLYNAQAVVYLTLPKGYTPWSLFDLGAFSQNILLATTEQGIDSIVAYNFVKYPQILREELKIPDDEEIIVGIGLGFEDEQAQVNRITSKRMDTESILKIKK >NZ_CP028259.1|WP_141822897.1|863703_864417_+|UTRA-domain-containing-protein MYKYEKISQAIRKQIIEQKIKPGALLPDQNQLAKEFNTTRITIGKALQSLIIEGLIYSKRGAGTFVRKDAHLNDEFTNDVDKPLGTTSTHPHSKVTSKYIHLTARIANEVEKKNLLLEDGETVYVIKRTRFIEGKAYSYEQTIMPTKIATITEEVLKKSIYQYLENEYHLELAGSHRQITARKVSEEDAKFLGEKLGDPILVISQTSYLVDGTPFEFSESRFPYQSSAVSADVNLLE >NZ_CP028259.1|WP_141822895.1|862161_863544_-|family-1-glycosylhydrolase MKGKLPDNFLWGNSTSSMQTEGGVHEGGKGPSVYDTYEATETTSNWDVAIDNYHHYEEDLDLMANQGMNCYRFQISWSRVNPTGDGDFNEEGIQYYDRLINDLLKRGIKPMICLYHFDMPLHLAEKYNGFMSRHVVDAFVRFGKKMVDCFSDRVKLWVTFNEQNLYSQTEAFHIAGYLKGDQTDEELQLIAHHVMTAHAQVTNYVHETSDAQIGGMLAYVESYPKNCRPHDVYVARQIDEFLNRNLLEVWVHGHYSTEVTQYIKNHHFDIDFTEQDQIAFEKLKSDFISFSYYASNVVDSTKIPQGTMPNRYLDYGGVENPYLKATDWGWNIDPLGFRDVITKTYNEYGIPMFPIENGIGYREAFDGTEIQDDYRIEYHRDHIQAMIDAVVEDGVPVLGYLGWGLIDIPSSSGNMEKRYGMVYVNRGNHELRDMKRVPKKSYKWFKKVIETNGNDLENDL >NZ_CP028259.1|WP_060743524.1|860803_862147_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MGSSNKESVNDKMQNSKFIAKFTEISVKVGNWVYLRSLRDAFAVILPMFIVAGIGVLLNNVVFTWFLSGDMLTKFQVIGNAIVNGTLNVAGILVAPMIGYSLARNKGFNNPIAAAAMSLASIFILMPGSIQLGTVASAGAKMATVTGGLSYLNTGTQGMFGGIFVGLIATGLFIKLASIKKLQIHLGENVPPAVAASFSVLIPAILLMSFFAIIAALLAGFFNTDLINLIKTWIQEPLRGFNTSIVGYCVIYTLANFLFGLGIHQTVLSGALLDPLVLVNMNENMTAYAHHQAIPNIITTSFVSNYTLIGGSGSTIALIIAILIFSKAKSSRQIAGLSLAPGIFNINEPMIFGFPIVFNLPLIIPFVLFPVVGSLMGYFATLWGWVSRTVVLVPWTTPPLIGPYLSTAGDWRAVILQILIIVVGVFLYLPFLKISERVSEIQAEENL >NZ_CP028259.1|WP_036673200.1|859536_860523_-|lipoate--protein-ligase MRYVTYMGTDAYTNIATDTWLLNNLNAKEPVFALWQNNNAIIVGQNQNTFGEVNQDFVDEHQIEVVRRVTGGGAVYHDLGNLNFTLFVPIESAANVDFKKFSEPVLRALHTLGIDAEASGRNDLLVNGKKISGVAQRYAKGYLMHHGTLLFDSNVDTMVRSLNVADEKFISKAAKSVRSRVGMIKDAAPKGLTLQDFWDAVQYELTDHGKDQEIVLTPQQKQEIIQLTADKFSTWDWNYGRSPEFNFKNHAKYDGGIIDVQVQAEGGTIRDINFTGDFLGLRDWREIKDQFIGLPFETAEIKTVFERNHEGRYFGNITDDELIKLFEA >NZ_CP028259.1|WP_141822893.1|858406_859525_-|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MAVKDDNKQVLDFNLQIEKQTDSFPMLQVLNNDGEIVDEDALKEAGLNEDQLVELMKQMVFSRVLHERSTKLAKQGRLGFYAPTIGEEASQIASNYAFEKGDWLFPGYRDIPQLVMKGWPIYKAFLWSRGHYEGNEFDDVNGWMPQIIIGAQYVEAAGAALGLKMRKQPNVAYAYTGDGGTSQGDFYEGMNFAGAYNAPAVFFSQNNEYAISTPRKLQTKAPHLAAKGWAAGLPSLVVDGMDPIAMYLASKKARQWAVDGNGPVFIETITNRLGAHSMSGDDPLRYRTQEEIDEWTKKEPLIRFRKYLEGLGLWSEEIENDWTEVVNEQIDDGVKQADGIDKQKISDFIEQTLEVPGQAAQEQINKFRGEGK >NZ_CP028259.1|WP_002834184.1|857423_858404_-|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MAQKTYIQAITEAQDLALANDENVVIFGEDVGKNGGVFRATDGLQAKYGEDRVFNTPLAESGIGGMAIGMTTQNYRPIMEIQFFGFVYEVMDSLAGQMARGRFRFHGTRTFPIVVRSPYGGGTKTPEMHADSLEGLVAQTPGLRVVMPATPADAKGLLLSAVESNDPVIFLENLRLYRSIRGDVPEGYYTTPLDKANVIREGKDVSIITYGGMVHTSLAAAEELAKDGIDAEVVDLRTVSPLDLDTIGESVEKTGRVVVAQEAQRQAGIGAMVMSEISERFIMSLKAPIGRVAAPDSVYPFALAENEWLPKADDIIEKVKEVVNFD >NZ_CP028259.1|WP_060743526.1|856117_857431_-|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MTEIFKMPDIGEGMAEGEIANWLVKVGDTIKEEDAVAEVQNDKLLQEILSPYGGKITKLFVEAGTVVKVGEPLIEFDGDGSGAGAESEAPKETPASTEPEPESSAPVNQTAPEVTKVGAEYTSNGQLLAMPSVREYARKNDIDLTQVPATGRHGHITMADVENFKASPASAPTASPAPAASVPETESEKAPSAPATPAAPAEVKAGRVPLSPVRKVIAKTLTNQVQTIPHVTIMDEVEVSKLMDLRNQFKEQAKQKGYKLTYMPFIAKALAGAAHKYPELSAMVDIEKQEIVYYEDTNVSFAVDTDNGLFVPNVKNVKSKSIMEVAQEIDDMAIRGRAGDLKPNELKGGTVTITNIGSESGSGFFTPIINPGESAILGIGRIRKTPVVNEDGELAVGNTLKLSLSFDHRLIDGALAQKIMNELKALLSNPAYMLMEV >NZ_CP028259.1|WP_060743527.1|854708_856115_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MVVGTQAINVDTLIIGSGPGGYVAAIRAAELGQKVVIVERDYIGGVCLNVGCIPSKALIQAGHLYSTLQHGNPFGVSVSESKIDFTKTQEWKQNQVVNKLTGGVELLLKKHKVEIVRGEAYFNDNETVNVINGDDSHVYRFKRALIATGSRPVEIPHFKFSGRVIDSTGALNLKDVPEHLIIIGGGVIGAELAGAYMNLGSKITIIEGLDHILNGFDGELIQPVLNNFKKNGVEIVTEATAVEANQTDKDVTVTYEADGTTKTVTGDYCLVSVGRRPNTDQLGLNNTNIKLSKRGLIEVNDSMQTSVKHIYAIGDVVAGPALAHKASFEAKVAAAAMGGEDAHDTHYVLPAVAYTNIELATVGETPQSIAEKKLDAKSSKFPFAASGRAMTMDQTEGFIRLITDNPTGGIIGAQIVGPEASNLISELTLAIENGLTIKDIELTIHPHPTLGEEIMDAAELAAGLPIHV >NZ_CP028259.1|WP_011673877.1|869601_869922_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MVKNNAALAAFKKNIPLLDALSDERRQQIMITLGESDAGLTVSELTKLIGLSQPAVSHHIKQLKDLNLVSVRKVGTSNIYQLTIKDALAQVQELIDILRKDKKLLR >NZ_CP028259.1|WP_160208480.1|870013_870559_-|DUF1836-domain-containing-protein MVYKLLNKVIEGDQMDSKQLENFAKMSLPKWDELPNIELHLDQVIDLANNYLRPLEVDLLTPTMMHNYLKQAVIIRPQGKLYGRMQLAAVIIIGCLKSIFSLDEIKRGFEAELKLTSSRRAYNNFVNAFNEEVQRISQHGPRNLWNELLAETAVVSLQHSAIISMLTKKMAKDLLSDLEEK >NZ_CP028259.1|WP_060743518.1|870536_871400_-|DegV-family-protein MLKQKIAVLVDSCSDVPAEIANREYFEMIPMGVFFGEEEYQDRVNIEPDEFYQKLAKANPLPTTASPKGELITKALDNLSKRGFTKIIAVCISSGLSGTAQQVKIYAKNYPQLQIEVIDTKNIGIASGFAAVRASEVIEEGWEFDQIVEEVQRVANQTKVFFYVPTLKYLIAGGRIGRVAGLVGSIINLKPIISCDDEGIYYPVAKAHGEKKALKKMLQLVDDTLKNAQKFNLAVVHGLNEGLMNQISTEFKNKYPNMGKIYNGDISPALGVHTGPGLIGIGVQIIK >NZ_CP028259.1|WP_141822899.1|871602_872442_+|methyltransferase-domain-containing-protein MNKIELATQFIQRHLHQFQCPICKSNFNEVQSGTLICNNQHSFNIAKKGSLFFLNNPVNTEYTNEMLTYRNQFLTAGFFNPMLEEVINNISGDLILDAGCGEGTTTKWMASHFDGDFVGLDISKPAINIAGSGIAPQPYPLFMVGDLAQLPFTDQGLTSIVNILSPANYQEFDRTLATHGELIKVIPGNHYLSELRQLVYPDGEHATYDNAPVKNHFIEHYEYVEFSKISYKFPLDDKLFTALFNMTPLTWQAQGRKEAILQDGLKEITAEFEIGVVRK >NZ_CP028259.1|WP_094104217.1|872861_874667_-|DUF2207-domain-containing-protein MKFFTKRTFLLLVTMLTFGIFWNVKTVKADYEISQFRMQINVNKDGSANINQSVLYDFDDDYHGVYLTQDLRGTAGAELEGITVSNNKGTQNQVPINNSGENLTAKVESSKKQMKIKVYNAVSSDDQTKITYHYRINGVVTNYKDTAEINWKVIGSGWDVPLEDAQVTIKLPGKNVKGLHAWSHGEAAGYTTVDKAKGKVTLDIGDNPENTFVEAHMVFPTALTPDNKKIVNQNHLAAVKKQEYQLVKRENEAQARARRIAAYAKITSAIISVLILIGMMGWLKKHGYHRYDIPTPMEHSFDVPSISPAEAEALFNKSKADTKGVSAEMLVLAAEGKLKFKQILYGKRGKETTEIERQGKFNMSFVDRCLDRIGDGQQVTIKQINDYAKKDKKNNVATWYKEWQSEVDANLARFKDTYNISYRHGLLGLAITTPILAFIVGIIGRFGEVTNLYWIGGIVLTLIIEAWVLATWDKVSMYNEAGLQQYNQIRGFKQMMKDIAHFNTAEIGDLILWEQILPYATAFGLAEKVAKKLKTDFGTQLNENVPFYAYYYGINGMHVGIANSISTSISHSVSASSSGSSGGFSGGSSGGFGGGSGGGAF >NZ_CP028259.1|WP_002834264.1|874809_875922_-|low-temperature-requirement-protein-A MKNELLKKVSMIELFYDLVFVYMISQVTGLIHHLQNGVISPSALSIFTLVVIVSINSWMVQTVFNNRYGKSQWSNVILSFVDMAIVLYMSNAFSDTFDRHLIGFFIAAGLLSLTLAIQYLLVFVQTKNEYDRNIAMAFMRILFFRTACLLAGGVLAGRWGTTIALFGIITSWIIPAFTGKHTQKHPIIFSHLLERLTALIIIMFGETIVGISKYFTQNTFSIQSIMIFIIVVSLFFTYIVEFDHLIEEQRTHETGNLLIYLHYFILFGLSLVTVALDFIHESEANAIFSITCLYVGIALFYIGIVIASYYNKTTLKLENYVVVAFIVVTLMGYFTSMCFATFSIIAGVTALTTLINAVVITLSLVRRYER >NZ_CP028259.1|WP_060743514.1|876075_876912_+|manganese-catalase MFKHQKELQFEAKPDRPDPIVAKYLQELIGGQYGEMSVAMQYLFQGWSCRGEEKYKDMIMDIATEEIGHVEMLATMVARLLEDAPIADQQAAMQANPTVGAIISGMNPQHAIIAGLGPRPADSVGNPWSGAYIIASGNLLADFRANLNAESQGRLQVARIYEMIDDQGVKDLLSVLLARDSYHQNLWASAVKELEEKEDSMLVPTTFPRDKERKDIAYDFYNFSQGDESSTGPWASGEALDGEGEYHWYDEPKVEGSAPNLKPVSPKMYGTPENKSEI >NZ_CP028259.1|WP_060743513.1|876964_877690_-|EAL-domain-containing-protein MSELEQKLEGICFYEQPIFLIDAAEKEEKKVIGSELLLRKTGGENRFPAMLYKEYMRDDASNLVFCTWLVKNIIEIINDNPGIQYSFNLDPQQLLYDSTFEAMKGLIPYCDRVMIEVTESIPNNRDIDQYFNYSVRDQIKRIHEMGFSVAVDDVSSGMNSFNAVREYTQDIDRLKLSLIQLRNVEEGMITVTISLWKALAANTGIDLVIEGIDSLEVSKWLLENGLEKQQGYYFATPRKLK >NZ_CP028259.1|WP_023440867.1|877686_878889_-|GGDEF-domain-containing-protein MENTVMNTIIYWAKGFFSFNTVVIAAITVGVLFMLAAGTYVVEMNMDKTKTSSTLIEELLWGVGLTIAMVFLQNVFTHLYSTIASSELGWEYSTAQFVVLFYCLYIVHRKVVLWFNIILPMYVYGLGIVRGQIGFDIAPILAILVIILISYTIYQQNDTLIDENVKYYSTLIMFGLAWWFVLKDIHHLTIVDIMCLTLEFLIAMSIVHFGNKKVRMIMKQYLNLMQEVDTDALTGVYNRNSFNKVVEGVFEFYSNNDAPLTMVMFDIDHFKQFNDQYGHQVGDKVLRLVADRFSYELVDRKAHGQLFRVGGEEFAIIFRGRTADDCEKIVRAIRDDLVKETIRVNNHDRVGIKVSIGISQLRDDDFDFQTFYKRVDDYLYQSKRNKRNSITVEGKVASLN >NZ_CP028259.1|WP_011673888.1|881033_882284_-|PDZ-domain-containing-protein MKTNKLVIVAAIAGLLGGGVAYGGASFIHNQMESSSTAVPTGSNTTGTTKTSNVKVNVSSQSSKAFSTIKDSVVSVINLQKANTNDSDSIISSIFGNESSSSSKSSSSSSELETASEGSGVIYKKSGDTAYIVTNNHVVSGSSSLEIIMSNGKKLPAKIVGTDSVTDLAVLKINSSAVTTVASFGNSDNIKVGETALAIGSPLGSEYATSLTQGIISAKKRTVETTTENGQNNGEATVIQTDAAINAGNSGGPLINLAGQVIGINSMKLSASGSDSTTVEGMGFAIPSNEVVTIIDQLVKNGKITRPALGVALVDLTQVSSTQQKSILKLPSNVTDGTVLMQVNNGPAKTAGLKKYDVITKIDDKAITDTAGLREALYKHKINDKITVGYYRDGKYKTTVVTLTKTSTTTSSTTTK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028259_2 | 1592091-1592196 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028259_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028259_2
>2.1|1592115|58|NZ_CP028259|CRISPRCasFinder CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028259_2
The CRISPR arrays of NZ_CP028259_2 >merge|NZ_CP028259|2|1592091-1592196|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG >NZ_CP028259|2|2|1592091-1592196|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTG CCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCG TTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG
>NZ_CP028259.1|WP_060743451.1|1585466_1586501_+|flippase-like-domain-containing-protein MSRRNKVVLAVMILAGIVIFGFSLRNVNLNQMARDVVHLNMWWLLVALGCIVLYLGLEAVATKMLIQSNGDRLSWRDAIRIPLIEQLFNGITPFSSGGQPAQLVALMQNGIEGGRASSVLLMKFVVFQSMVVINFIFSLLIGFQYLEEKIRFLSWFVLFGFLIHLAVIIGLLMIMYWHNFTKRLISAIFIPIKHFVSKERYTTWKVTLNEKVDSFYQESVRMKSQWRLLAKVALVTFLQLLFYYLIPYFILLALGKSDVNIVMVTCLHVLIFMVISLFPIPGGAGGAEYGFSVIFAQFVGNNSKLVLAMMIWRILTYYFGMFAGMVATVVKPHKVNRVKVVKNE >NZ_CP028259.1|WP_060743450.1|1584436_1585453_+|glycosyltransferase-family-4-protein MPIKVNMFSSASKVKGQGVGSAYEELIRLLKTHFPKQIDVSINKFIKADISHYHTIDPNFYLSTFSKKRGIKVGYVHFLPETIEGSLNIPQPFRSIFYKYIISFYKRMDHIVVVNPTFIDKLVAYGISRDIITYIPNFVRKNEFYRFTEANRDAVRERLEVNNRFTVLGIGQVQERKGVKDFIKLAENNPDKYFIWAGGFSFGRLTDGYADLKQVVDNPPRNLKFTGIVDRNALVEYYNAADLFLLPSYNELFPMSVLEAFSCGVPVMLRDLELYHSIIKGYYIPTQDYEDMNTQLKLVSEDKERLNKFKQLSDEASEEYSEDHLADIWLDFYSSLTK >NZ_CP028259.1|WP_060743449.1|1583211_1584387_+|glycosyltransferase-family-4-protein MNIGLFTDTYFPQVSGVATSIKTLRDQLEKQGHQVYIFTTTDPKVDTNVYERNIFRFTSVPFVSFTDRRIAVSGFIRAAQLAKELNLDIVHTQTEFSLGWMGKFVAKSLKIPLIHTYHTMYEDYLHYVANGKLLKPYHVKQMMRAFCYHIDGIVAPSERVLDTIEGYGINVPIRVIPTGVNLEQYQKPNKRKQWREKLGYDESSPILLSLSRLAYEKNIQEVIDSFPAILKEVPNAQLLIVGDGPARASLENQVHDLHLEDSVQFTGEINNDHVYGFYQLADLFVSASDTESQGLTYIEALASNLKVVAKSGPYTDELLDDISLGKVFNTEDQLVAAIKDYIEHPDAYNDPAPREKKLYEISADYFGKQVVDYYSSAISTHTDLELDEDSE >NZ_CP028259.1|WP_060743448.1|1582348_1583122_+|alpha/beta-hydrolase MKLKLKSGAQIFFEDEGQGTPILFLTGFGGNTEIWSGQVNFFLQRGYRVIRLDYLNHGQSDRVDGELQIGDLADEVLQLVDYLQLKEPIGIGNSMGAAVLWNIINLRGWDFLSKAIFVDQSPKMLNDQQWHLGFKNLAEDNFDEVMNEPIVRPAYKHIDDFVFKNSKAIDSAYPFSQPQNRALVKGHAKKDWRFVLEQATKPVLFIMGEKSPFFDSTKTAELSALNANITVNVMKNVGHIPMAEDPTEFNRLVLQFV >NZ_CP028259.1|WP_002833901.1|1580551_1582276_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MAGTLKGIAASDGIAIAKAYLMVDPDLSFEKKNITDVDAEIKRLHDALEKSKEELSLIKAKAAENLGAEEAEVFEAHLTILSDPELIGNIEDKIKNDTINAEEATKEVTDNFISMFEAMTDNAYMQERAADIRDVTKRLMSHLLGVELPNPALIDSEVVIVAHDLTPSDTAQLDRRYVKGFITDIGGRTSHSAIMSRTLEIPAVVGSEKATTSVKQGEMMIVDGLTGDAIIAPTDDEIKAYQQKGEEFKAQKAEWEKLKNEKTVSKDGVHFDLAANIGTPDDLQGVLDNGGEAVGLFRSEFLYMNASELPSEDEQFEAYKKVVEGMNGKQVVVRTMDIGGDKELPYLPLPEEMNPFLGYRAIRISLDRTDLFRTQLRALLRASAFGKLAIMFPMIATVAEFKKARAIYDDERQKMVDAGQEVGEIQVGMMMEIPAAAMIADKLAKYVDFFSIGTNDLIQYSFAADRGNEKVSYLYQPYNPSLLRLIKQTIDASHAEGKWTGMCGEMAGDQIAVPILMGLGLDEFSMSATSILKTRSLMKKLTTDDMKKLAEKAVTEAETNEDVIKLVQETVDNI >NZ_CP028259.1|WP_002833902.1|1580285_1580552_+|phosphocarrier-protein-HPr MEKRDFHVIAETGIHARPATLLVQSASKFNSDIQLTYKDKSVNLKSIMGVMSLGVGQGADVTISADGDDEADAIAALEDTMKKEGLSD >NZ_CP028259.1|WP_002833903.1|1579951_1580140_+|hypothetical-protein MRDYLQLLNDLKDGSIKELKITAEEFQDFQPRFMEFPERKQVIGKADRGGIVVYHFERIKDK >NZ_CP028259.1|WP_029257840.1|1577527_1579747_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MLCQNCQKNEASIHLYTNVNGQRTEVNLCQNCYQLLKNQRNNNINRNGGARMAQDPFGFGNLDDIFRAMQGGNMGQPENLYGQQVPPTQPGGGNGSGGNPNNRGNGGSLLSQYGLNLTDLAKQGKIDPVIGRDSEIERVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQRIVEGSVPQKLVNKQIVRLDVVSLVQGTGIRGQFEQRMQQLMKEVQANKDMVVFIDEIHEIVGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGDFQLVGATTLKEFRDIEKDAALARRLQPVQVDEPSEEEAIKILKGIQKKYEDYHHVHYTDDAIEAAVKLSKRYIQDRFLPDKAIDLLDEAGSKKNLTINIADPETIQKKIDEAEAQKKAALQSEDYEKAAYYRDQVSKLEKNKDGATSSEEQPTVTEEDMEKIIETKTDIPVGDLQKQEQEQLQNLSENLKDHVIGQDEAVDKISRAIRRNRIGLNGTGRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLAQQLFGSKDSMIRFDMSEYMEPHSISKLIGSPPGYVGYEEAGQLTEQVRRHPYSLVLLDEVEKAHPDVMHMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGTGDVQADVGFGAAAQGKTHSVLDKLGNYFKPEFLNRFDDIVEFQALTKENLMQIVDLMIADVNSMLATQGLHVDVTKPVEERLVDLGYNPKMGARPLRRVIQEQIEDRIADFYLDHPAEKQLNAKIKDDQIEITGAPKKD >NZ_CP028259.1|WP_002833905.1|1577110_1577473_+|DUF1634-domain-containing-protein MNAKKQEMQHVELVIGRVLQVGVYISALVILLGIGLWLFKNGSGYSGALPTRITPIFHGVLAFKPYAVLMFGIFLLILTPVLRVIVSIYAFAKEGDRLYVVITTIVLVILIIGMAIGYRG >NZ_CP028259.1|WP_002833906.1|1576265_1577111_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MASHLIILLLVGLMAGIFGAILGIGGGMIITPVLTVAMGLDIKYAIGASIIAVIATSSGATIAYLKDEMLNLRVAMFLEIATTVGAIVGAIMTGIFNSTVLFVLFGSFLVFSSWNMYRKLRRGGGEEGSTKNDRLANQLNLNGSYYDKALKKNVDYQVENVPGGSAVMFGAGLASGLLGIGSGAFKVMAMDNIMKMPLKPSSATSNLMMGVTAAASAMVYFFNGSIHADIAGPLAIGILFGAQLGSRIMQHLQPRWIRMIFIPVLLYMGLQMILKGFGVNI >NZ_CP028259.1|WP_141822526.1|1594148_1595882_+|pyruvate-oxidase MTEKINASDAMIKVLESWGVHNVYGLPGGSFDSTMNALYNRKSTINYVQVRHEEVGALAAVGEAKVTGKLGVTFGSAGPGAVHLLNGLYDAKHDHMPVLALVGQVPTTLMNTDYFQELNENPIFTDVAVYNRTVMTAEQMPHVVDEAIRQAYKYSGVAVVTIPKDLGWQPIEDNYVSSANLYQAPILPEPDVKQVDEALEILSNAKHPVMYIGQGTRGAGSDIIALSEKLHIPIVTSALAKGIVPDSYKANMGSAGRVATKPGVEALQAADAVMFVGSDFPFQPYFVAPDAKYIQVDIDASKFGRRHVVDLAILADSHKFLKVMLEKAETTAESKWYKAALENKKNWEEWKNSFVGQQDTPLNVENVFAKINALATDDAIFQVDVGNVTIDGMRFLKADQAQRFTTSGWYATMGYALPAAIGAQAEYPDRQVWSISGDGGYAMVMQDVLTQVKYHMPIINVILTNESLGFIEAEQDDSKQPHSGVDLIDADYGTSAQALGAEGFEVRTYDELEQAFEKAKDRKGPVVIDVKITNLRPLPVEQLLLDKETQDPEAVEQFVKKYHAESLIPFRKLLEEA >NZ_CP028259.1|WP_141822528.1|1595951_1596683_-|hypothetical-protein MNKINLPKFNYPIEKKSYLPAINALLLSVVPWYLSSHFSSEIFSKHLSIQILFFLATFMVNFLTIDRLTNKTNLRLMAPLAIIPILTFIILLFSENTYVALLGLLSFVPFLTTFLPFEQKNGVGLLTFSLSVGTLAPLAFFYIRNGFVTSILLKMGLLLSLMIIVILFAIFIKTSFKFAIFALALTLIIMIFAFILLKSWTALIYPILAVFSWFIPKLHLPRNFTLLVLIALIGLASFFITIN >NZ_CP028259.1|WP_002833742.1|1596855_1598046_+|methionine-adenosyltransferase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1075 : 65518
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028259|1075:65518|DBSCAN-SWA 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69 | Lactobacillus_phage(36.36%) | head,plate,tail,capsid,terminase,portal,holin,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
179227 : 188845
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028259|179227:188845|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028259|179227:188845|182616_183102_-|WP_029258026.1|DBSCAN-SWA MISMIWAEDLRHGIGKQQSIPWHIPGDMAFFKKTTSGNTVVMGRKTFDSIGKALPNRKNIVLSHHPTSLPNSVVGVGSLSELQVIFETHPNEKFYIIGGSHLYNALLSQADELLITRIQKDYQCEVFAPDITQNEFKLASSVEHESTERNPAYTFETWIRI >NZ_CP028259|179227:188845|188374_188845_-|WP_002833201.1|DBSCAN-SWA MGNSVYLAGPFFSDLQIERVRKVEELLKKNSTIDSKRIFVPMDNQYDTKEFGSFEWQVGVFETDVRQLRKADIVVAILDYTKNGEEIISDPGTVFEIGTAFEHGNPVALVQFDDSDKINLMLARSHTAFFNGESIKDLATYDFNLLKPVYSDLTVF >NZ_CP028259|179227:188845|185973_187182_-|WP_060743606.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVQIEKMPQEFEDARAVLQKIEDAGFDAFFVGGSVRDTLLNKPIHDVDIASSAYPAEIKHIFKKTVDTGIEHGTVMVIHDGEGYEVTTFRTESGYQDFRRPDRVTFVRSLKEDLMRRDFTINAFALKEDRTVIDIFDGLSDLEHKIIRAVGDPHERFHEDALRMMRAVRFASQLDFKIEAKTLKAIEENNMLLGKISVERILVEFEKMMLGSKPNRGLEDMLTTKLNEYCPGFKDRSKELDQLTKYPLELLENSEQVWIMIAWSLKLTPQEVMPFLKQWKTSNDLIKNVSATLQVLSMDKNDQNERLALFNAGEANVVNAVRVARILGMNREAWLDTYQNLQIKDTHEMAITGKELIQKGIIKPGPQMGQVLNRLKLMVINDELKNESLALLNAVNKLQKDD >NZ_CP028259|179227:188845|183130_184081_-|WP_011673474.1|DBSCAN-SWA MLEEQYLNLERYVLENGHLKGDRTQTGTLSTFGYQMRFDLSEGFPLLTTKRVPFGLIKSELLWFLKGDTNIRYLLQHNNHIWDEWAFKKWVESDEYQGPDMTDFGHRSLTDPEFNELYKIEKQRFTEQILEDDTFSAKYGDLGNVYGSQWRAWKTSTGETIDQISNVIDMIKNNPNSRRMIVSAWNPEDVPTSALPPCHSLFQFYVADGKLSCQLYQRSGDIFLGIPFNIASYALLTELIAKATGLEVGEFIHTIGDAHIYSNHLDQVKEQLERTPRPAPKLKFKQVHDSIFDYEPGDIVVEGYDPHPTIKAPVAV >NZ_CP028259|179227:188845|187435_188320_+|WP_002833200.1|DBSCAN-SWA MQKDESIRFLDFVMIALGCCLYGLGLAVVNIPNNLAEGGITGVTLILRALLGIDPALSTILINIPLIFIGYRFLGKRSLIYTIFGTFALSFWLYVWQRVPISLDIHHDMFIAGILAGIAGGFGSGIVYRFGGTTGGTDVVARILEKRRGIAMGHTLFALDAVVLTISLCYIDVLHMMYTLLAAYVFSRLVSLTQVGAYAAHGLLIVSSKNQEIADALMDELERGASYIHMSGAYSKTEREMVYCVIGPNELNVAKRIIGRIDPQAFTSIIDVHEAIGEGFTYDSPSAKNRNIPN >NZ_CP028259|179227:188845|180309_181047_-|WP_023440467.1|DBSCAN-SWA MSTKIEVQNLKKYYGSNEVLKGLDLIVKDNEVVVMIGPSGSGKSTFLRTLNKLEEPTAGKIIIDGHDLNDPRVNMNQVREKIGMVFQHFNLFNNLTVGENVMLSPVELGKMSKADAELEARELLKEVGLEDKFNAKPQSLSGGQKQRVAIARTLAMKPDMILFDEPTSALDPEMVGDVLAVMKKLAKAGMTMIVVTHEMGFAKEVADRVIFMADGHIMEEGKPEEIFGNPQNERTQEFLNKILNV >NZ_CP028259|179227:188845|179227_180073_-|WP_060743609.1|DBSCAN-SWA MSQIKIVTDSSCGVTDEEIKKYDISIVPLSVMIDDTVYVEGETITNEEFIHKMASSKSLPKTSQPPLGKFVEMFDKLGEDGSQILSFNMLEAISGTVHTAEQAAQLSKADVTVIDSQFTDRALAFQVLEAAKMAQEGASKDEIIQRAEYIRDHTKLYLSVVNLENLVKGGRLSKIGGMLGGLLNIKLLLEVKNGKLDVAGKVRGMKAMKKLWSDIYTEMQGSGKIKGVGISHVEAFDMVEDMKKHVGEFFPVNDIVVRETVPIIATHTGMGAFCILYYSED >NZ_CP028259|179227:188845|184093_185971_-|WP_060743607.1|DBSCAN-SWA MKILKGKNLTKTYGEKKLFNSINFVINEHDRVGLIGTNGSGKTNLLNAVSNLDPADSGTIETPNDYRIAYLKQSEEISQFETVREFIYSGDQHVFQVIKHYEEILERYTNNPTSSTLFEKFTKLENEMNQLDAWNTESNIKTILTQLHVDMLDESIHHLSGGQVKRIALAQALLEPADLLILDEPTNHLDFDSIEWLEKYLADYKGALLLVTHDRYFLDRVTNRIWELSYGDLFEYVGNYEKYVEQKAVRDEQNEASKQKEYKLYKQELEWMKRGPKARGTKQQARINHFEKLDQAVHAPKEVDQDLEIGLTQQRLGKKVIEINDLDLEVGDHQIMKDFSKLIQAGDRIGITGANGAGKSSFLNAIAGVLPIQGGKIEIGETVKIGYYTQKIEPIPEDKRVINYLKEVGQEVINKDGEKISVTSLLEQFLFPSFLHGSLIKKLSGGEKRRLFLIKILMEQPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLESYLKTFKGTVLTVSHDRYFLDKVSDQLLIFDGNAKVEKYTGSISDYLKQNVVQSSKIKSTPKSVEQVEAPKKKKRTYSEEKEWQTIETEIEKLEQKSTSVEEQMSECAADYGKLAELQKELNEISDQLEEKMARWEYLESFEE >NZ_CP028259|179227:188845|181043_182495_-|WP_060743608.1|DBSCAN-SWA MAKIKKTLLSIVFSIVILFGWSVFNSNNVNADEKVYEIGTDVTFPPFEFANDQNQYVGIDMDIIRTIAKNEGFKVKIKPVGFNAAVQALDAGQLDGVIAGTTITDERKQKMDFSAPYFKTGVVMAVGQNSSIKNFQDLKGKRVAIKTGTAAGDYAKSIQKKYGFKTVTFDDSNNVYNDVTTGNSVACFEDQPVMQYAIKTGAKLKIVTKPANGGAYGFSVKKGHNQELLKKFDAGLKKIKSNGQYKKIVAKYLGASAVASQKAHKTQNTFVSLWKQNQSALLGGLEQTVILTVLSIFFATIFGIFFGMLGVVPNKFANGVSTTVIYIFRGLPLLVLALFIYTGVPNLLGEKIPAFVAGIITLTLNEGAYTAAFVKGGIEAVDGGQMEAARSLGLPYGKAMRRVILPQGLKIMVPSFINQFIITLKDTSILSIIGILELTQTGKIIIARNLEGFKIWTMVALIYLIIITLLTWLSKWVERRMKG |
9 | Staphylococcus_phage(37.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
552842 : 561406
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028259|552842:561406|DBSCAN-SWA CTTAGTTAATCAACTTTCTCTGTTTTAATACTTGGCAGATGCTTCTAAAATATAAATCATGTTCAACTTGATGGATACGTTGAGCTAAATGCTCTACATCATCCCCTTGTAAAATCGGTACAGGTTGCTGAGCAATAATCGGGCCAGTATCAATCCCTCCGTCAATCCAGTGAATCGTTACTCCAGTAATTTTTACTCCATATTCAAACGCATCCTCAATTCCATGGCGCCCTGGAAACGATGGTAACAGTGCTGGATGGATATTAAGGATGGCATGTGGATAAGCCTCTAACAAAACTTTGGTTACAATCTTCATGTACCCAGCTAAAATAATTAATGCTAAATTATATTTTTTTAGCTCCCGTAAAATCGCCTCTTCATAGCTCGCCTTATCTTCAAATTCTCTCAAATGATGGGTCCAGACTGGAATTCCTAATTTATCAGCTTTAGTAACAACCGGCGCATGGGGTTGGTCACAAATTAAACATGCAATTTTAATGGGAACTTTTGTTTCTCGAATATGTTGGTGTAATGCCATAAAATTAGTCCCTGTTCCTGATGCAAAAACTGCAATATTAATCATCTGCTCCCTCCCGAAAGATAAACCACTGGTGCATCTTTCTCCCGTTTTTTCACTTTACCAATCTTAAAATATGTTTCTTTCTGTTGTTCAAGTTCTGCTACCACTCTGGCATAATTGTTGGGGCTAACAGCTAGTACCATTCCAATCCCCATGTTAAAAGTTTCATAACAATCTGTCTGGGATAGCTTTCCAAGTTCCGCTAGGATTTTAAAAATTGCCGGCTTTTCCCAACTATCCAACTTAAATTCAGCCTGTTGCTGATCTTGTAACATTCGCGGAACGTTATCTAATAATCCTCCACCGGTAATATGGGCGATTCCGCTGACCAATTTTTGTTTTAAAAGTGGCCAAATCACGTTGACGTAAAGACGGGTAGGTTGCATCAATTCTTCAATCAAACTACCATTTAATCCTGCCAACTGATCATCGAACTGGAAATCATGGTCTTCAAATAAAATTTTACGAACTAACGAATAACCATTACTATGTAACCCACTGGAGGGAAGACCAATTAAATAATCTCCATTGTGGACATTTTTTGCTTGGAGTAAATCACGTTTAGCAGTTAGTCCCACAGCAAAACCCGCTAAATCAAAATGATGTTTCTGATAAATTCCAGGCATTTCGGCCGTCTCTCCGCCTAACAGGGTGATTGACTGAGCCTGGCAGGCTTTTAAAATTCCGTTTAAAATCTTTTTAACCTGATTTTTCTCTAAATGTGATAGTGCTAAATAATCTAAAAAGAATAATGGCAACGCCCCTTGCGCCAATAAGTCATTTACACACATGGCAACCAAATCTTGCCCAATCGTTTCAATTTGACCTGACTGGGCCGCTAAAAGCACTTTGGTTCCCACTCCATCACTTCCCGCTACTAAAACCGGCTGATCCAATTGATCTTTTGATAACTGGTAACATCCAGCAAAACTGCCAAGTCCGCCTAGAACATGAGGGTCTGGAGCACCTAATTTTTGCTTTAGATCAGCTACAAGTTCTTCACCAGCTGCAATATTCACACCTGCTTTTTCATAAGCACTTTCTACCATTATTTTTCCTCCACTTGGGCCATTGCTGATAATGTAAAGTCGTTAGCTGTTTTAGGGATCTCAAAATCTTTTTCATAATCATAAAGGGGGGTGGGATATTTACCATCAAAATACGCTACACATAAGCCATCATTGGGTGCATCTTGATGTAAACCGATCGCCTCAATTAAACCTGGCAGGCTCAAAAAATGCAGTGAATCTGCTCCAATTTTCTGACACATCTCACTTACCGTATAGTTAGCAGCCATCAATTCACGTGTATGTTCAATATCAATTCCATAAAAGCATGGATATTTAAGTGGTGGAGAACTTATCATCAAATGCACCGACTTAGCTCCTGCATTTTTTAGCATTTTCACAATATACTGACTGGTGGTACCCCGCACGATTGAATCGTCAACTAATGCCACATCTTTCCCCGCAATTACTGCTTTTAATGCAGATAATTTCATCTTCACTCCCTGTTCACGTAGTGCTTGGGTCGGTTGAATAAAAGTCCTACTACTATATTGATTTTTAATTAATCCCATTTCATTGGGGACGCCTAGTTGTTCGGCCACTCCAGATGCTGCTGATAACGAAGAGTTCGGCACCCCCACCACCATATCGACCTTAATGGGGTTTTCTTTTGCCAATCGTTGACCCATCCGTTGACGAGCGAGATGAACATTAACGCCATAAAGATCTGAATCGGGTCGTGCAAAATAAATGTATTCCATCGAACAAATTGATAACTGGGTTTTAGTAGTAAAATTACTAATCTGAAGCCCAAGGTGATCAATTTGAACTAACTGTCCTGGTTCAACATTTCGAACCAAGGTTGCTCCGACTGCATCTAAAGCACAGGTTTCACTAGCTACAACATATGAACCGTTAGCTAATTTTCCAATTACTAAGGGCCGAAAACCATTTGGATCAAGAGCCGCGTACAGTGCATCTTTGGTAAGGATTAAGTAGGCAAATCCACCTTGAATTTGTTTTAAACTCGCTTTTAATTTTTCAACAAAAGTTGGACCTTTTTGATGCTGAATTAAATGCATTAGTACTTCCGTATCAGAATTAGATTGAAAAGTAGCACCACTTTTTTCTAATTCGCGTCGTAAACTAACTGCATTGGTTAAATTACCATTATGGGCCATCGCCACATCTCCCTGTAAGTAGTGGAAAAGTAACGGTTGGATATTTTCAATTCCTCGGTTTCCAGCTGTTCCATAGCGCACATGACCAATCGCACTCGGCCCAATTAGCTGTGCCAAATCATCGGGACATCTAAATACATCTGCCAAAAGCCCCTTTCCTTTATGAATTTTCAACTGTCCTTCTTGATTACGAACGACAATACCAGCACCTTCTTGGCCTCGATGTTGTAAGCTGTGAAGTCCGAAGTAGGTCCGTTGGGCAGCTTCTGAATCATTCCAAATACCAAAAACACCGCATTCTTCGTTTAGACCCTTTAATTCAGCTGCCATGCTAGGGCTCCCTTCCAACTCTCCTTAGTATTTTTCAAATCAACATCAATTACATCATCCATCGTTGCAATTTTGATCCGCTTACCGCCAACTTGGCCGATTAAAGTTGCTCTATTTGCCACTTGTGCTTCAAAAATCTTTTGTTTATCTGGAGCAATCGTCACAATAAAGCGGGCCTGATTTTCGGCAAATAGTTCTGTAGCTGTTAAATTAGTCTTGACGTCACATCCTAACTCACTAGCGAACGCGCATTCAGCTAAACCAACGGCTAAGCCACCTTCGGCTAAGTCATGCGCACTATTCAAAAGTTCCGCGTGAATTAACTGAGTCAACAATTCTTGTTGCTCCTGTTCATAGCGTAAATCGAAATTAAATAATGGACCTTCAACATGTCCGAGTTGCATTTTTTGTAATTCACTACCATTAAGTTCTGCTGTTGTTTCTCCCAAAATATAAATTAAATCACCAGGTTTTTTAAAATCTATGGTTGTTATCCAAGCTGGATTTTCAATTAAACCAACCATTCCAACCATTGGTGTTGGATAAATGGGTTGTTGGTTGGATTCATTATAAAGTGAGACATTACCTGAAATGACGGGTGTATCAAATAATTTACAAACCTCCGTCATCCCTTTAGTAGCCTGTTCTAATTCATAGAAACTTTCTGGGTCTTCGGGGCTACCAAAGTTCAAACAGTCGGTAATTGCCAATGGTATTCCACCTGTAGCAACTATGTTTCGAGCGGCCTCACTGACCGCGATTTGTCCACCATAATAGGGATCTAAATGCAAATAACGCGGATTAGCATCGGTCGTGATCGCCAAAGTTTTTTGAGTTCCTCGAATACGAACCACTGCCGCATCACTTTGTGTCGTTGAAATTGTATTAGTTTGAACTTGAGAGTCATACCGTTCAAAAATAGCACCTTTATGCGCAATTGTGGGTTGTTGCAACATCGCTTGGAAGGTTTTAGTTAAATTTTCAATTTTAGGTTGATACTGTTGCTTTTTAGTTTCACTGATATGCTGAGGTTTCTGACTTGGTTGATGGTAAACTGGGGCTTCATCCACCAAAGCATGCACTGGTACATCAGCAACTTGAACGCCCTTAAAGGTTAATTGATAGCGGTCACCTGCAGTAACTTCACCAATTTTTACTGCTTCGCTCTCGTATTTAGCAAATAGTGCTTCAACTGCGGGTTCAAATCCTTGTTTGACACAGAGCAGCATCCGTTCCTGAGATTCAGATAGCATTAATTCATAAGGGATCATTTCTTCTTCACGTTGTGGAACTAAATCCAAATTCAAATGCATTCCATATCCAGCTTTAGCAGCCATTTCTGCAGATGATGAAATCAACCCCGCTGCTCCCATATCTTGAATTCCCACTAGATATTCGGAATGGTTATGAATCAGTTCTAGACACGCTTCCATTAGTTGTTTTTCAGCAAAAGGATCTCCAACCTGGACGGCTGAACGTTGCGTTTCTTGTTCGTCACTAAATTCGGTTGAAGCAAAAATGGCTCCTTGAATTCCATCACGTCCCGTTTTAGCCCCCACGTAGTAAATGGCATTACCTACACCAGCAGCCGCTCCTTTTTGTTGGTCGTTGATATCCAATAACCCCACACACATCGCGTTCATGACTGGATTGTTTTGATAAATTGTATCGAAGGTCGTTTCCCCTCCTACTGTAGGTATTCCCATACAATTACCGTAATCGCCGATTCCAGCTATTGTCTGGTCAACAAGATACTTAGTATGGGCATCATTCAATTCACCGAAATGTAAACTGTCCATTAATGCAATCGGACGCGCTCCCATGGAAAAAATATCACGAATAATTCCTCCAACTCCAGTAGCCGCTCCTTGATAAGGCTCCACTGCCGTAGGGTGATTATGACTTTCTGCTTTAAAGACCACCGCTTGATTGTTACCAATATCAACAATTCCAGCTCCTTCCCCGGGCCCTTGTAAAATCTGTGAACCCGTTGTTGGAAATTGTTTTAAGAGGGGTTTAGAATTTTTATATGCACAATGCTCACTCCACATCGCAGCGAACAAACCCGTTTCTGTAAAATTAGGTAGGCGCCCTAAAGCATCATTGATTTTCTGATATTCGTCTTCGCTTATCCCCCATTGCAAATACAATTTTTGATCTCGAATTTCGGTAGGTGTTAATTCCTTCATCATTGCGAAAACTCCTTTAATTAAACATTTTGCGTCATGCTTTCAATTAAACTTTGGAACAGCATTTTGCCATCTTCGCCGCCTAGGACGGCTTCACTAGCGCGTTCAGGATGGGGCATCATCCCTAGCACATTGCCTTTCTGATTGATAATTCCCGCAATATCGTCTGTACTTCCGTTGGGATTATTTTGATAACGTAAAATAATTTGGTGATGATCCTTTAAATTTTGTAAAGTAGTCGAATCACAATAATAGTTACCTTCACCATGGGCAATGGGAAACATTACGGTCTGTTTTAAATCAAAACGTTTGGTAAAGATAGTCTGATTATTTTCAACCACTAATTTTTGTGGTTTACAAATAAAATTCAAACTATCATTCGATCGCAAGGCCCCCGGAAGCAGCCCGGCTTCGGTTAAAATTTGAAATCCGTTACAAATTCCAATTACTGGGTTTCCCGCATAGGCAAATTTTTTTACAGCATCCATGATGGGAGAAAAACGTGCGATTGCGCCGCTTCGTAAGTAGTCACCATATGAAAAACCGCCTGGAATTAAGACTGCAACTGTATCTTGCGGTAAGGATTTTTCGCGATAGTCCACAAATTGAGGCTCAACGTTCATAACGTCGCGCAAAACATAGTACATATCCCAATCACAATTAGACCCTGGAAAACGAATAATGCTGTAAATCATTGCTAGTCCTCCTCAATCCTGCTAATCTCAAATCGATAAGTTTCCATGTTAATGTTTGCTAGTAGCTCATCACTCATTTTTCTAACTTGCTCTTCAATATTTTGACCATGATCTTCAATTTTTATTTCAAAATATTTTCCGACAGTTACAGCTTTAACATTTTCGTAGTTTAATCGATGTAACGCTGTTTTAATTGCTTCTCCTTGGGGATCTAAGATCGATTCTTTGTAAGTAACGTAAATTTTGGCGTTATCCATGAACTTCCTCCTGTGAATTATTCAAGCGATTTAAAACTTCCTGATAGACGGTCACTAAATCTCCAGTTTTTTTACGAAAAACATCTTTATCAAGTGATTCTTTAGTTGTTAAATCAACCAAGCGACATGAGTCTGGTGATATTTCATCTGCTAATACAATTTCGTCATCTGCGGTTTTACCAAATTCAGCCTTAAAATCAACCAGTTGCAAATGGGCTTTAGCAAAGCGTTCTTTTAAAATTTGATTAATTTCTAACGCCATCTTTTCCAATCGTTGACTCTCTTCTAAGTCAATGATTTTCAACGCAATTGCTTGATTAGTATTAATAAATGGGTCATCTAATTCATCAGATTTATAAAAAAATTCCACAACAGGCTGGTCAAATGCTTGTAGATACGAAACATCAAACTTACGTTGGAAACTGCCTGATGCCGCGTTACGCACGACTACCTCTAGTGGAATAATTTTTACTTTACGATTCAATTGTTCGTTGTTTGAAAGTTTTTGGACAAAGTCCGTGTGAATCCCTTTTGCAACTAATTGCTCGAATAAAATACAATCGATTTGGTTATTCAATTCACCTTTACCAGCAATGTGATCTTTACGTTTTCCATTTAGGGCAGTTGCTTGATCCATATATTCAACCCACACCAAATCCTTTTCATCTGTATTGAAAAGTCTTTTTGCTTTGCCTTCTTTAATCAACGTGGTCTTCTTCATTATTTTATCTCCCAAATGTTTTCTGATTTAATTGAATCTAAGCTTTTTTGAATATCACCTAATATTGTGATGTGTCCCATTTTTCGATTCACTCGACTTTCGGCTTTCCCATAGTCATGAAAATGCCAATCGGGTCTTTGAACTAACTTCTGACGAGCAGCTTCAAGGTGCTGCCCGAGAAGATTTACCATCACCGCTGGTGTAGTTTGTGTGACTTTTGGTAAAGCCAATCCACAAATACTCCGAATGTGAGCTTCGAACTGCGAAATATTACATGCTTCGATGGAATAATGTCCCGAATTATGTGGCCTTGGTGCCATTTCATTAACCAATAATTGGCCATTTTCTAACATAAAAAATTCGATTCCTAAAACGCCCCTTAGTTCTAATCCCTGAGCAATCTTTTGAGCAATTTTTCGGGCATTGTCTTGTACGTTTTGAGAAACTCGGGCTGGCACAATGCTTTGATGTAGAATGTGATGCTGATGTTCATTCTCAGCTACTGGAAAACATTGAATGATTCCTTCGCGGCTGCGTGTTACCATGACAGATAATTCTTTAGTAAAATTTTGACGTTGTTCCAATATACATGGAGCTTGGGCTACTAAACGTTGTCCAGCAAGTAAATCCGCTTCGGAATTAATATCTTGTTGTCCATGTCCGTCGTAACCTCCTTCACTAGTCTTCAAAATGCTTGGATAACCTAATTTAGCAATTGCCACTTCTAAATCAGTAGGCTTTTCAACAACTTGATAGGAGGTAACCGGAATTCCATGACTGCTCAAAAAATTTTTTTCTCGGATTCGGTCTCCAGTAATAGCTAGTAAGTTGGTTCCTTGCGGAATGATTACCAATTCTTGTGCTACTTTCAAACTAGCTAAATCAACATTCTCAAATTCATAAGTTAAAACGTCGCTCCGCTCCGCCATTTGCATTAAGGCGTGATGGTCAGTATATTCGGCTACAATCTGAAAATCACAAACTTGGCTGGTTGGGCAATCTCGCGTAGGATCTAGAACCCCCACCTTATATCCCATAGCTTTAGCCGCTAACGCCATCATTTGACCTAACTGTCCACCACCAATAATCCCAATTGTTGCCGGTGGTAAAATAATCCCTTTTTCAGAATTGCTTTTCACTCTCAATAGCCTCCTGAGTCTGTTTTTGACGGAATTCAATTAATTTTTCAGCAACTTTTTTATCGGTTAACGCTAAAATTTCAGCTGCTAATAAAGCGGCATTTTTAGCACCTGCACTCCCAATAGCCGTAGTCGCAACGGGGACTCCACTAGGCATTTGGACAATTGATAGTAATGAATCCATTCCGTGTAATGCATGACTTTCAATAGGAACCCCAATTACAGGTGAAATTGTGTTGGCTGCTAACATTCCCGGTAAATGAGCTGCTCCGCCAGCTCCTGCAATCAGCACGGCATATCCATTTTCTTGTGCTTGTTCACCAAACTTCTGTAATACTTTCGGCATCCGATGTGCTGAAATAATATGACGATCATAATCGACTTCAAATTCATCAAGTATGTCTGTGGCCAGTTTCATGGTTGACCAATCAGAAATTGAACCCATAACTACTGCGACTTTTCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028259|552842:561406|555923_558131_-|WP_160208454.1|DBSCAN-SWA MMKELTPTEIRDQKLYLQWGISEDEYQKINDALGRLPNFTETGLFAAMWSEHCAYKNSKPLLKQFPTTGSQILQGPGEGAGIVDIGNNQAVVFKAESHNHPTAVEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALMDSLHFGELNDAHTKYLVDQTIAGIGDYGNCMGIPTVGGETTFDTIYQNNPVMNAMCVGLLDINDQQKGAAAGVGNAIYYVGAKTGRDGIQGAIFASTEFSDEQETQRSAVQVGDPFAEKQLMEACLELIHNHSEYLVGIQDMGAAGLISSSAEMAAKAGYGMHLNLDLVPQREEEMIPYELMLSESQERMLLCVKQGFEPAVEALFAKYESEAVKIGEVTAGDRYQLTFKGVQVADVPVHALVDEAPVYHQPSQKPQHISETKKQQYQPKIENLTKTFQAMLQQPTIAHKGAIFERYDSQVQTNTISTTQSDAAVVRIRGTQKTLAITTDANPRYLHLDPYYGGQIAVSEAARNIVATGGIPLAITDCLNFGSPEDPESFYELEQATKGMTEVCKLFDTPVISGNVSLYNESNQQPIYPTPMVGMVGLIENPAWITTIDFKKPGDLIYILGETTAELNGSELQKMQLGHVEGPLFNFDLRYEQEQQELLTQLIHAELLNSAHDLAEGGLAVGLAECAFASELGCDVKTNLTATELFAENQARFIVTIAPDKQKIFEAQVANRATLIGQVGGKRIKIATMDDVIDVDLKNTKESWKGALAWQLN >NZ_CP028259|552842:561406|554469_555939_-|WP_023440671.1|DBSCAN-SWA MAAELKGLNEECGVFGIWNDSEAAQRTYFGLHSLQHRGQEGAGIVVRNQEGQLKIHKGKGLLADVFRCPDDLAQLIGPSAIGHVRYGTAGNRGIENIQPLLFHYLQGDVAMAHNGNLTNAVSLRRELEKSGATFQSNSDTEVLMHLIQHQKGPTFVEKLKASLKQIQGGFAYLILTKDALYAALDPNGFRPLVIGKLANGSYVVASETCALDAVGATLVRNVEPGQLVQIDHLGLQISNFTTKTQLSICSMEYIYFARPDSDLYGVNVHLARQRMGQRLAKENPIKVDMVVGVPNSSLSAASGVAEQLGVPNEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVKMKLSALKAVIAGKDVALVDDSIVRGTTSQYIVKMLKNAGAKSVHLMISSPPLKYPCFYGIDIEHTRELMAANYTVSEMCQKIGADSLHFLSLPGLIEAIGLHQDAPNDGLCVAYFDGKYPTPLYDYEKDFEIPKTANDFTLSAMAQVEEK >NZ_CP028259|552842:561406|559800_560940_-|WP_060743844.1|DBSCAN-SWA MKSNSEKGIILPPATIGIIGGGQLGQMMALAAKAMGYKVGVLDPTRDCPTSQVCDFQIVAEYTDHHALMQMAERSDVLTYEFENVDLASLKVAQELVIIPQGTNLLAITGDRIREKNFLSSHGIPVTSYQVVEKPTDLEVAIAKLGYPSILKTSEGGYDGHGQQDINSEADLLAGQRLVAQAPCILEQRQNFTKELSVMVTRSREGIIQCFPVAENEHQHHILHQSIVPARVSQNVQDNARKIAQKIAQGLELRGVLGIEFFMLENGQLLVNEMAPRPHNSGHYSIEACNISQFEAHIRSICGLALPKVTQTTPAVMVNLLGQHLEAARQKLVQRPDWHFHDYGKAESRVNRKMGHITILGDIQKSLDSIKSENIWEIK >NZ_CP028259|552842:561406|560923_561406_-|WP_011673684.1|DBSCAN-SWA MRKVAVVMGSISDWSTMKLATDILDEFEVDYDRHIISAHRMPKVLQKFGEQAQENGYAVLIAGAGGAAHLPGMLAANTISPVIGVPIESHALHGMDSLLSIVQMPSGVPVATTAIGSAGAKNAALLAAEILALTDKKVAEKLIEFRQKQTQEAIESEKQF >NZ_CP028259|552842:561406|553420_554470_-|WP_060743839.1|DBSCAN-SWA MVESAYEKAGVNIAAGEELVADLKQKLGAPDPHVLGGLGSFAGCYQLSKDQLDQPVLVAGSDGVGTKVLLAAQSGQIETIGQDLVAMCVNDLLAQGALPLFFLDYLALSHLEKNQVKKILNGILKACQAQSITLLGGETAEMPGIYQKHHFDLAGFAVGLTAKRDLLQAKNVHNGDYLIGLPSSGLHSNGYSLVRKILFEDHDFQFDDQLAGLNGSLIEELMQPTRLYVNVIWPLLKQKLVSGIAHITGGGLLDNVPRMLQDQQQAEFKLDSWEKPAIFKILAELGKLSQTDCYETFNMGIGMVLAVSPNNYARVVAELEQQKETYFKIGKVKKREKDAPVVYLSGGSR >NZ_CP028259|552842:561406|558825_559080_-|WP_011673681.1|DBSCAN-SWA MDNAKIYVTYKESILDPQGEAIKTALHRLNYENVKAVTVGKYFEIKIEDHGQNIEEQVRKMSDELLANINMETYRFEISRIEED >NZ_CP028259|552842:561406|558148_558823_-|WP_060743842.1|DBSCAN-SWA MIYSIIRFPGSNCDWDMYYVLRDVMNVEPQFVDYREKSLPQDTVAVLIPGGFSYGDYLRSGAIARFSPIMDAVKKFAYAGNPVIGICNGFQILTEAGLLPGALRSNDSLNFICKPQKLVVENNQTIFTKRFDLKQTVMFPIAHGEGNYYCDSTTLQNLKDHHQIILRYQNNPNGSTDDIAGIINQKGNVLGMMPHPERASEAVLGGEDGKMLFQSLIESMTQNV >NZ_CP028259|552842:561406|559072_559801_-|WP_160208455.1|DBSCAN-SWA MKKTTLIKEGKAKRLFNTDEKDLVWVEYMDQATALNGKRKDHIAGKGELNNQIDCILFEQLVAKGIHTDFVQKLSNNEQLNRKVKIIPLEVVVRNAASGSFQRKFDVSYLQAFDQPVVEFFYKSDELDDPFINTNQAIALKIIDLEESQRLEKMALEINQILKERFAKAHLQLVDFKAEFGKTADDEIVLADEISPDSCRLVDLTTKESLDKDVFRKKTGDLVTVYQEVLNRLNNSQEEVHG >NZ_CP028259|552842:561406|552842_553424_-|WP_060743838.1|DBSCAN-SWA MINIAVFASGTGTNFMALHQHIRETKVPIKIACLICDQPHAPVVTKADKLGIPVWTHHLREFEDKASYEEAILRELKKYNLALIILAGYMKIVTKVLLEAYPHAILNIHPALLPSFPGRHGIEDAFEYGVKITGVTIHWIDGGIDTGPIIAQQPVPILQGDDVEHLAQRIHQVEHDLYFRSICQVLKQRKLIN |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
570235 : 579102
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028259|570235:579102|DBSCAN-SWA ACTATCGCCCTCTCATTTTGAATATATTACATATTTTAATCGTTGCTTTTTCCACAACGCTTTGAAAATTTAAATTCTGACTTAACTGATGTTTTAAAGGCAACAATACATCTGCAACAGCCAATAATTGACGTACGTTGGTCTGATCAGCTAACTCTTGTAACTGACGTCGATTAGCTTCATAAGTAATCGTTTCTTGATCAAACTTTAGTTCTAACAGGTCCATTGCATATAACATCATCAAGTCCAATATTTTTTCTTGATAAAATCGATCCTTAGCCAAAGCCATTACTCGAGTTTGAACATCCACAAATGCAGTTATGTCCCCAGTAGTGGCCGTTATAAACCACTTTTCTAACGCCTTATGGGCATCCAAAATCCAGTTGTTATCTACCAGTGTTTGAATTTCACTCGTATCGTTGGTTAACCGGGTTAAAATTCTAGCATCCGTTTCAGCTATATTTTGCTCTGTCAATTCCTTAATCAATCGATCTTTAGGTAACGATTTTAGTTCAATAATTTCGGTTCTCGACACAATAGTTGGTAGCATCAAACTTCTATTTTCAGCAAGTAAAAACGCCGTTACCTCTCCTGAAGGCTCTTCGATGAACTTCAGCAAACTATTGGCCGCACTCGTTGTCATTTTATTAGCTTGTTCAATAATAAAAACTTTCCGTGCGCCCTCTACCCCGCTTTTAGAGAATTCGGATTTTAAAAAACGAACTTGTTCCACCTTGATTGATTGGCCATCTGGTGCAATTTCTACAACATCTGGATGTTGTCCTGACATGATTCGAGTACACTCTTCACATTCTCCACAAGGCATTGATCCCTGTAAGTCAATACAAAAAAGACGCATCGCTACCCATTGAGCGACGTCTTTTTTTCCAATCCCACCTGCTCCGGTTAACAGGTAGGCATGCGACAAATGATGGCTATCAATCATTTCATTAAAGCGTTTAACAATTTCAGGTTGTTTTTCCACAGCCTGATTAGTTAAATTTTTCAGATCTTCCACTAGAAGCGCTCGAATTGATCTACCGGAAGAACAAGGACGGTTGCACCACCGACTTGAACCTTAATTGGATAGGCTGTAGTACCTTCCATATTAACGTCCATGTTAACAGATGGTGTCATAAATTCTTCTCTGGTATGACTAGCTTTCTTGATAATTTCAAGGACTTCTGGGACACGTTCTTCTTCAATCCCAATCATGAAAGTTGTATTACCTGATTGTAGAAAACCACCAGTTGTGGATAACTTAGTTGCTCGAACATTTTGATCAATAAACTGATCACTCAAATAGTTTGCATCTTTATCTTGTACAATTGCGATAACTAACTTAGTTGCCATAATAATATTCCTCCGCTAATTTAAAATTTGGTCTAACACTTCAATTACATCTCTTTTTACATCATCAAGTTCTTGACTCGCATCAATTACGACAATCCGATCTGGAAATTTCTTAGCTAAATCTAGATATGCCGAACGGACTCGCTGATGAAAATCTAATTGTTCTAAATCTAACCGATCAACATCTTCCGTCCGATGAGTCATAATGCGCTTTAGTCCAAGTTCTGATGGTACATCCAAGTAAATCGTTTTTTCTGGTAATGCTCCTTCAGTAGCAAAGAGATTCATTTGATAGACGGCATCGGTACCAATTTTTCTGCCTGCTCCTTGATATGCAATTGAGCTATCAACAAATCGGTCACAAAAAACCACATGATTTTTTTTCAAAGCTGGTAAAATCGTTTCCACCAAATGTTGTCGTCTAGCAGCTGCATAGAGTAAGGCCTCCGTTCGCTCATCCATCTCGGTGTTGTTTTTATCCAAAATAATAGTTCGAATTGCCTCTGAAATAGGATTTCCGCCGGGCTCTCTCGTTACTGTTAATTGGTCCTTCAAACGCTGTTGGTAATGTTCGACCATCGCTTGCAGAACCGTTGTTTTTCCAGCCCCATCTGGACCTTCAAATGATATAAAATGCCCGTTCACCAGTATTCCCCGCCTTACTTGTTTTAAATTATTTATTGTTTTTATTCTACTTTAGATTTTAAGGACTGTCTATTAACCTTAATTAAAATATCACCATATTAATTTAAAAAAATGAGCTAACGCGTTGGTAAAATCGCATTAACTCATCTTTTAATTATTTTGCTTTACATTTCTGTTCGGCCTTCGACCGCTTTATATAAAGTCATTTGATCCGCATATTCAATATCACTTCCGACCGATAACCCGTGAGCTAAACGAGTAACTTTAATGCCGGACGGTTTAACCAATCTTGAAATATACATCGCTGTCGCTTCCCCTTCTGGAGTTGCATTTGTAGCAATAATAACTTCTTTAATGGCCTCGTTCTTCTGTAAACGGGTAAGTAACGCAGCAATATTGATGTCTTCAGGGCCTTTACCATCCATGGGTGATAACACGCCATGTAACACATGATACAAGCCATGGTATTCTTTCATCTGTTCCATTGACATTACGTCCTTAGAATCTTCGACTACTAAAACCGCTTTTTGATCTCGTGAAGGGTCCTGACAAATATCACATGGATCATCTTCCGTAATATTTCCACAAATACTACAGAAACTTAGGTCCCGTTGTGCTGAAATCAGCGCCTTAGCAAATTCGGTTACATCATCTTTTTCCATATCTAACGTAAAAAATGCTAATCGGGTTGCCGTTTTATAACCAATACCTGGTAATTTCATGAAACTATCGATTAATTTCGCAATCGGTTCTGGATATTGCATAACGGTCTATCACCTACGATTCTTAATTACATTCCGGGGATGCCCTTAGTGTATTTTCCCATTGTTTTATTAGTTTCACTATCCACACGATTCATAGCGTCGTTTACAGCGGCTACAATTAAATCTTGTAACATGTCTGGATCATCTTCATCGATTGCTTCAGGATTAATCACGATGTCTTTCATTCTATGATCACCGGTGAATACAACTTTGACCATGTCATCTGGTGCCACACCCGTAAATTCAGTTTGATTTAATTTTTCTTGTTCTTCTGTTACCTTTTTTTGCATCTTTTGCATTTGACGCATCATGCTTTGCATGTTTCCCATTCCACCACGCATTTGTATTACCATCCTTTAATCATTTTTTATATTTACATTTTCAGAGCCAAATAATTCGACCGCTTTTTTAACAGCTTGATTATCTTCATCCGCTTTGGGTGTAGATTGCTCTGATGCCTCTGGTTCAGATTTTTCTTGATTCTTATCAAAATGATGAGTATTTAAGAAACCTGACCGCACCTCTGGCCACTCTTCAACTGTAACATAAACTACCTTAAAATCGGAACCGGTTAACTTAGCTAAATTTTGTTGAAGTTCAGTACGAAGCACTTCATTATCGACAGCCTTTTCAAACAGAAAGTCGTAATTGAACGCTACGACCACCCCTTCTTTACTAGCTGCAACTGGCTTAGAAACGTGCATCAAAGCCCGTTCTGTAACAGATAGCATATCCATTAGGTCGCGCCAGAGTTCCTGCATTGTATTTAAACTGGCCTTAGTAGCATTTTCCAAGATCGGATAAATCTTGGTTAAATTAGCCGGAGTTTTAACCTGTTTAGCCCCTACCGCTTTTTTCTTAGGTTTAGGCTGAGCTGTTTGTGAATTACTTGGCGTATTTTTTACATTTTGTTGTAGCTTTTGAATTGCTTGTTTTAATTGACTGACTTCTGAACGTAACTGCTCCACTTCTTGGTTATCCACGGAACCGGTTGGGGCTTCGGTGGAAACTTTCGCAGTTTTTCGTTGTGATAGCTTAATCGTCAAAACTTCCAAATAGACATCTGGGTGGGTCGTGAAACGCATTTGTTGCTGAATACTATTCAATGTATCAATCATTTGATACAGCTCCACGCCAGTCACCATAGCTGCTTCTTCAGTAAAAGCTTCCGATAGATCATTCAAGCTTTGTTCTTGCACCAACTGGGGATCTTCTTGGTATAAGAGTAAATTTCTTTGGACAGTAATTAAGTCTTCAATTAATCGTTGTCCATCTTTACCCTCATCTAAAATTTGATGCAAAGTTTCTAATGCCGCTGATGTTTCTTGCTTAAAAATTTGTGTTAAATACTGATCTAATAGTTTTTGGTTAACACTTCCTGTAACTAATAAGGCGTTATCTAAAGTTACTTCTTCGTTACCAAATGAGATCACTTGATCCAAAATACTTAACGCATCTCGCATCCCACCTTCAGCAGCCTTGGCGATAATTGCTAGGGCCTTTTGATCGTACTGGATTCCCTTTTGATCCAAAATATAGACCATGCGATCATAACTTTGAGCTGGTGTAATTCGTTTAAAATCAAAACGTTGTGTTCTTGAAATAATAGTTAATGGAATCTTTTGAGGTTCCGTCGTTGCTAAAATAAAAATTACATTAGCTGGTGGTTCTTCTAAAGTTTTCAACAACGCATTAAATGCTCCGGTTGATAGCATATGGACTTCATCAACAATGTAGACTTTGTAGTCTGCTTCAGTTGGAGCATACTTTGCCTTATCTCGAATATCGCGAATTTCTTCGACACCATTATTCGAGGCCGCATCAATTTCGATTACATCGTTTAAGGTTCCCTCAGTAATCGCTTTACAAGTCACACATTCATTACAAGGCTCACCATCTTTAAGATAGTGACAATTAACCGCCTTAGCAAAAATCTTAGCTGCCGATGTTTTTCCGGTTCCTCGTGGACCAGTAAATAGATACGCATGGCTGGTCTGCTCAGTTATTAATGCATTTTTTAAAGTCCTCGTGACGACGTCTTGACCGACCATATCATCAAACTTTTGAGGCCGCCAAACACGGTATAATGCTTGATAACTCATTTGATTTCCTTCCATATTTGCTTTTTTAAGAAAAGAACCCTTAGCCCAATGGACTAAGAGTTCGTTAATTTACCCAATAACTTAAGGCACAAGCCAGAGCATACTTAGTGCTGCTTCCTTCCGGACCTGACACAATTCGTAAGTCCAACCTTGCCTCAAGGCCTTACGGCAATAACTATGATACTCGAATTTTAAAAAAATTTCCACTATTTTACTTAGTTTTTTTTCTTCTTTTTCGAATTTCTTTAAAAAACGTCTTCATTAACATCGATGCTCGGTCAGCTTCAATCCCTTCATGAACCGCCACTTGATGGTTTAAACGCGTATCTTCGAGTACGGTATACAGGCTTCGAACCGCTCCTGCTTTAGGATCTCGAGCACCAAAAAATACTTGAGGTAATTGTGAATTGATGATGGTTCCACTACACATTAAGCATGGTTCAATGGTCACAAAAAGCTGACAATCCCACAGCCGCCAGCTTTTTAAATAAGCGCAAGCTTCCGTAATAGCTAAGACTTCCGCATGAGTGGTTGAATCCTGTGAGTGTTCTCTTAAGTTATGACCACGACCGATAATTTTACCATCATGAACAACCACTGCTCCAATGGGGACCTCATCAATCATTTTGGCGAATTGGGCCTCTTTAATTGCTTCATTCATATAAAAATTAATTTCATGCTCTGTTAACTTATTCATGTGCACTTCTTAAAATATAATATCCTTTATTCTTTTTTAGGACTTCGACATTCCCAAAGGTTTCTTGCATTAATTTTTTAGCTGAGGGCGCCCCCTGTTTTTTCTGAAGAACAATTACCAGTTGGCCACCTGCTTTTAAATGAGATTTAGCCTCAACGATAATTGTCTCAACTACCGATTTTCCTGCACGGACTGGTGGATTAGAAATAATCGTGGTGAAATCCGTATCATCGATATTCTCATATGCATCTGATTTATAAATTTGAGTCTGTTTTTCGACGCTATTAGCAACCGCATTTCGTTTGGCGAGTCCCAACGCGCGTTCGTTAACATCTGTCATCTGTACTTGTATCTCTGGAAAACTTTTGGCAAGTGATATGCCAATTGGACCGTATCCACATCCCACGTCTAAAATCTTTTCAGCAGAACCTACAATTTGTATTGCTTCAAGCAACGTCCTAGTTCCAAAATCAATTGTGTTTTTTGAAAAAACACCGCGATCCGAAATAAAATTTAATTTATGACCCAAAAGCTCGTAGCTCCAATGCTTCTCGTCATGTTCGGCGTTGGGATTTTCAGTAAAATAATAATCTGTCATTGAAAAGTCCTCCATTCTCTATTAATATAATATCGTATTGTAAATTCAGTTACCAATTTAAAAAGAATAAAATTTAATAAACACCGCCAGCACAATATATAGTGGGATTGTAAAAATATATCCTCTACATATTGTGCTTTTTTATTTCAAATTTAGTAATAAATGTTGTATACTTAGTTCCATGATAAATGAGACAAGGGGGATCAGTATTATGAGAAAAATAATTGTGTACACTAAAAATAACTGCATTCAATGCAAAATGACTAAACGCTTCTTATCCGAAAACGGGGTTACTTTTGAAGAACGTAATATCAATGCAAATCCAGAATATATCGACGCTTTAAAAGCTAAAGGCTTCCAAGCCGTACCAGTCGTTCAATTTTCTGAAGAAAAAGCTGTGGCTGGTTTTAGACCTGATTTACTAAAAAAATTAGCAATTTAGTTCTCCACCAACGCTAACTCAGATGTTCAAGACGCCCCATTCGTACATTGTAAATGCGGAGCGTTTTTTTATTTCACTTGATTGAAGAGAGGATTCGAATTATGACTTTAAAAGATCTAAAAGATGTTACTTACTATGATTTAAACAATGAAATTAACATCCCTGTTGATAACCAAATTCCCCTAAGCAAGGATCGTGAAGCTCTAGCTGCATTTCTAAAAGAGAATGTTCAAGCTAACACCATGCAATTTGATTCTCTACGTGAACGTTTCGATTACCTCCTCAAAGAAGACTATATCGAGGCTGCCCTCGTTGAAGAATATTCATTCGATTTTATCGAAAAACTGTACGACTTCTTAAAGCAACAAGACTTCCACTTTCAATCGTTTATGGCAGCTTATAAGTTTTACGCTCAATATGCCTTAAAAACGAATAATAACGAATATTATTTAGAAAACTTCATCGACCGCGTGGCTATGAACGCTCTCTACTTTGCTGATGGTAATGAAGAATTGGCCATGAATATTGCCGATGAAATCATTCACCAACGCTATCAACCAGCTACTCCTAGTTTTTTAAATGCCGGTCGTAAGCATCGGGGAGAGTTAGTTTCATGTTTCTTAATTCAAGCTAATGACGATATGAACTCGATTGGTCGTACGATTAATTCTGCTCTTCAACTTTCTAAATTAGGTGGCGGGGTCGGAATCAACCTCACTAACCTTCGTGAGGCGGGAGCACCAATCAAGGGGATTGAAGGCGCTGCTAGCGGTGTGGTTCCGGTTATGAAACTACTAGAAGATAGTTTTTCTTATGCCAATCAATTAGGACAACGTCAGGGAGCTGGTGTTGTATATCTAAACGTTTTCCATCCCGACATTGTATCTTTCCTTTCAGCTAAAAAGGAAAATGCCGACGAAAAGATACGGGTTAAAACCCTCTCACTTGGTGTAGTCGTTCCCGATAAATTTTATGACCTCATCAAACACGACGAAGATATGTATCTATTTAGTCCTTATAGTGTGGAAAAAGTTTACGGTGAACCTTACGCCTACGTCGATATTACTAAAGAATACGACAACATGGTCAAAAACCCTGCTATTAAGAAATTCAAAGTTAAAGCCCGTAACATCGAAAATGAAATTTCTAAACTTCAACAGGAATCTGGCTATCCTTACATTGTTAACGTTGATACGGCTAATCGAGAAAATCCAATTTATGGAAAAATTGTAATGAGTAATCTCTGCTCAGAAATTATGCAAGTACAAACTCCATCCGTAATTGATAACAAGCAAAACTATACGAAACTAGGAACTGATATCAGTTGTAACCTTGGTTCAACAAACATTGTTAATATGATGCAAACGCCCCACTTCGGTAAATCGGTCGAAACTATGGTTAGAGCGCTAACTTTTGTTACGGATCATTCTGATATTGACGTTGTTCCTTCTATCCAAAATGGAAATGCTCTTGCTCATACCATTGGTCTTGGAGCAATGGGACTCCATGGTTACTTAGCTAAGAACCACCTTTACTATGGTGAAGCAGATTCGATTGAATTCACTAGTGTTTACTTTATGCTGTTGAACTATTGGACTCTAAAAGCTTCTAACCAGATTGCCAAAGAAAAGAATCAAGTTTTCCACAACTTTGATAAAAGCAAATATGCTGATGGTTCTTACTTTGATAAATATGTAGAAAATGATTTTGGACCTAAATCCAATCGAGTTAAAGAGTTATTTAATGGAATTGAAATTCCAAGCGTTGAAGATTGGAAGCAACTTAAAGCTGATGTGATGGCTGACGGACTTTATCACCAAAATCGAATGGCAGTTGCTCCTACTGGTTCAATTTCTTATATCAACGATGCGACAGCTAGTCTTCAACCCATTGTTAACAAAATTGAAGAGCGTCAAGAAAAGAAAATTGGGAAAATTTACTTCCCAGCTCCATATCTTTCCAATGATACGTTAAAATATTACCAATCAGCTTACGACATTGATATGCGTAAAGTTATTGATATTTACGCTGCTGCCCAACAACATGTTGACCAAGGGATGAGTATGACTTTCTTCATGCGTTCAACAATTCCAGCTGGAATTTATGATTGGAAGGAAGGCCGCACTGATAAAATGACCACTCGTGATCTTAATATCCTTCGTAACTATGCCCATCATGAAGGTATCAAGTCCATCTACTACGTTCGTACCTTCACAGATAATGATGGTGAAGTTGGCGTAAATCAATGTGAAAGCTGTTCAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028259|570235:579102|573022_573337_-|WP_002833269.1|DBSCAN-SWA MRGGMGNMQSMMRQMQKMQKKVTEEQEKLNQTEFTGVAPDDMVKVVFTGDHRMKDIVINPEAIDEDDPDMLQDLIVAAVNDAMNRVDSETNKTMGKYTKGIPGM >NZ_CP028259|570235:579102|576936_579102_+|WP_011673697.1|DBSCAN-SWA MTLKDLKDVTYYDLNNEINIPVDNQIPLSKDREALAAFLKENVQANTMQFDSLRERFDYLLKEDYIEAALVEEYSFDFIEKLYDFLKQQDFHFQSFMAAYKFYAQYALKTNNNEYYLENFIDRVAMNALYFADGNEELAMNIADEIIHQRYQPATPSFLNAGRKHRGELVSCFLIQANDDMNSIGRTINSALQLSKLGGGVGINLTNLREAGAPIKGIEGAASGVVPVMKLLEDSFSYANQLGQRQGAGVVYLNVFHPDIVSFLSAKKENADEKIRVKTLSLGVVVPDKFYDLIKHDEDMYLFSPYSVEKVYGEPYAYVDITKEYDNMVKNPAIKKFKVKARNIENEISKLQQESGYPYIVNVDTANRENPIYGKIVMSNLCSEIMQVQTPSVIDNKQNYTKLGTDISCNLGSTNIVNMMQTPHFGKSVETMVRALTFVTDHSDIDVVPSIQNGNALAHTIGLGAMGLHGYLAKNHLYYGEADSIEFTSVYFMLLNYWTLKASNQIAKEKNQVFHNFDKSKYADGSYFDKYVENDFGPKSNRVKELFNGIEIPSVEDWKQLKADVMADGLYHQNRMAVAPTGSISYINDATASLQPIVNKIEERQEKKIGKIYFPAPYLSNDTLKYYQSAYDIDMRKVIDIYAAAQQHVDQGMSMTFFMRSTIPAGIYDWKEGRTDKMTTRDLNILRNYAHHEGIKSIYYVRTFTDNDGEVGVNQCESCSI >NZ_CP028259|570235:579102|570235_571252_-|WP_060743848.1|DBSCAN-SWA MEDLKNLTNQAVEKQPEIVKRFNEMIDSHHLSHAYLLTGAGGIGKKDVAQWVAMRLFCIDLQGSMPCGECEECTRIMSGQHPDVVEIAPDGQSIKVEQVRFLKSEFSKSGVEGARKVFIIEQANKMTTSAANSLLKFIEEPSGEVTAFLLAENRSLMLPTIVSRTEIIELKSLPKDRLIKELTEQNIAETDARILTRLTNDTSEIQTLVDNNWILDAHKALEKWFITATTGDITAFVDVQTRVMALAKDRFYQEKILDLMMLYAMDLLELKFDQETITYEANRRQLQELADQTNVRQLLAVADVLLPLKHQLSQNLNFQSVVEKATIKICNIFKMRGR >NZ_CP028259|570235:579102|572396_572996_-|WP_002833270.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSFMKLPGIGYKTATRLAFFTLDMEKDDVTEFAKALISAQRDLSFCSICGNITEDDPCDICQDPSRDQKAVLVVEDSKDVMSMEQMKEYHGLYHVLHGVLSPMDGKGPEDINIAALLTRLQKNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPSGIKVTRLAHGLSVGSDIEYADQMTLYKAVEGRTEM >NZ_CP028259|570235:579102|573352_575098_-|WP_060743849.1|DBSCAN-SWA MSYQALYRVWRPQKFDDMVGQDVVTRTLKNALITEQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAVNCHYLKDGEPCNECVTCKAITEGTLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTEADYKVYIVDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPQKIPLTIISRTQRFDFKRITPAQSYDRMVYILDQKGIQYDQKALAIIAKAAEGGMRDALSILDQVISFGNEEVTLDNALLVTGSVNQKLLDQYLTQIFKQETSAALETLHQILDEGKDGQRLIEDLITVQRNLLLYQEDPQLVQEQSLNDLSEAFTEEAAMVTGVELYQMIDTLNSIQQQMRFTTHPDVYLEVLTIKLSQRKTAKVSTEAPTGSVDNQEVEQLRSEVSQLKQAIQKLQQNVKNTPSNSQTAQPKPKKKAVGAKQVKTPANLTKIYPILENATKASLNTMQELWRDLMDMLSVTERALMHVSKPVAASKEGVVVAFNYDFLFEKAVDNEVLRTELQQNLAKLTGSDFKVVYVTVEEWPEVRSGFLNTHHFDKNQEKSEPEASEQSTPKADEDNQAVKKAVELFGSENVNIKND >NZ_CP028259|570235:579102|575309_575795_-|WP_060743850.1|DBSCAN-SWA MNKLTEHEINFYMNEAIKEAQFAKMIDEVPIGAVVVHDGKIIGRGHNLREHSQDSTTHAEVLAITEACAYLKSWRLWDCQLFVTIEPCLMCSGTIINSQLPQVFFGARDPKAGAVRSLYTVLEDTRLNHQVAVHEGIEADRASMLMKTFFKEIRKRRKKTK >NZ_CP028259|570235:579102|571602_572232_-|WP_002833271.1|DBSCAN-SWA MNGHFISFEGPDGAGKTTVLQAMVEHYQQRLKDQLTVTREPGGNPISEAIRTIILDKNNTEMDERTEALLYAAARRQHLVETILPALKKNHVVFCDRFVDSSIAYQGAGRKIGTDAVYQMNLFATEGALPEKTIYLDVPSELGLKRIMTHRTEDVDRLDLEQLDFHQRVRSAYLDLAKKFPDRIVVIDASQELDDVKRDVIEVLDQILN >NZ_CP028259|570235:579102|575787_576393_-|WP_011673695.1|DBSCAN-SWA MTDYYFTENPNAEHDEKHWSYELLGHKLNFISDRGVFSKNTIDFGTRTLLEAIQIVGSAEKILDVGCGYGPIGISLAKSFPEIQVQMTDVNERALGLAKRNAVANSVEKQTQIYKSDAYENIDDTDFTTIISNPPVRAGKSVVETIIVEAKSHLKAGGQLVIVLQKKQGAPSAKKLMQETFGNVEVLKKNKGYYILRSAHE >NZ_CP028259|570235:579102|571251_571587_-|WP_002833272.1|DBSCAN-SWA MATKLVIAIVQDKDANYLSDQFIDQNVRATKLSTTGGFLQSGNTTFMIGIEEERVPEVLEIIKKASHTREEFMTPSVNMDVNMEGTTAYPIKVQVGGATVLVLPVDQFERF >NZ_CP028259|570235:579102|576604_576835_+|WP_011673696.1|DBSCAN-SWA MRKIIVYTKNNCIQCKMTKRFLSENGVTFEERNINANPEYIDALKAKGFQAVPVVQFSEEKAVAGFRPDLLKKLAI |
10 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
802305 : 810561
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP028259|802305:810561|DBSCAN-SWA TTTAACTAAACCAATCAGCTATAGAACGCCCCAAACGAACAAAAATATTAGCTTTTTTCACATCTTGAGTTGGCTTCAATTTCACATGTACACCTTTACTATTTTCAAGGAATTGGTCCTGGTTGCCCTTAACATTCGCCGTCGCAATTACCTTAGAATGTTTAATGGGTGCTTTTTGTTTTTGATCATTTAATTTAATTGCATTAACATGCAGTTTTTCGCTCTGACCTTTTGGAACCCAGTAATCTAGCGGTTGGGTAAGTTCTAATTTAACATCCGCAACTTTAGCTGAGTTAATTTTAACAGAGGCTTGATTCTTCAAATTGGAACTTAAAACGGCCAACTTAGTCATCAACGCATTCCAAATCGTTTTGGTATCTGTGAAACGTTGATTTTCACCGGAACCCAATACAACACTGATTACTCGGTGACCTTTAATTTTACCGGTGGCAGAAAAATCCTCTCCGGCTTTATCTGATGTACCTGTTTTTAGACCATCAATTTGGTATTTTGCTTCATACTGTTCAGCGCCTTTTAGTAATTCATTATGATTAGTAATTTCAAGTTCTTCTTTTCCAGTATTAAAAGTTGTTTTTTGGATTTTAGTGATATTTAGAATCTCAGGGAATTCTTTTAAGACATGGGAAATTACGATTGCCATATCTTTAGCAGACATTTCATTTTCTATATTTCCAGATGTACCAGGGTACTTTTCACTACCAACTTGGCTTTCTAATAAGCCCGCTGCGTTGTACAATTTTGCATCTTTAATGCCCCATTTTTTCACAGTTGACCGCATTTCATTGACAAATTTTTCCGAAGTTCCTGCTTGGGCTTTTCCTAAAGATAAAATTGCCGCGTTAGCTGAATAAATTAATGATGCATCTAACAAGTTACGCACTGTATAAGTTTGATTAGAAGAAAGCGGAACGTTGGTTAATTCACTGTTGTTACTAACTTCTTCCAAGCTCTTATTGATAGACACTTTTTGATTCCAATGCATTTGGCCCTCTTTAACGCTCTTCATGATGAGGTAAGCTGCCACAATCTTCGACATTGAGGCAATCGGACGAACTGTGTTTTCATCCTTGCTATATAGAATCTGGCCTGTGTTTTCATCAACTGCAATCGCTGATTTAGCAGTGATATTACTAGTGGTTGCTTCAATAACTGATTCGTTATTTTCAGCAGCTAGCGCTGGCGCAAAACTCGTCATCATCATTAAAAACGCAATCAGCATCGTGTATAATTTTTTCATAATCTAACTCCTGATCCGAATAAAAAAGACTGTTCCAAAAGGAAGTCTATTTTTCAATGTGGTAACTAACAAGTTAATCTCTTAAAATTTAGTCGCCACAATTGAAGCGTAGCTCTTTGACGAATAGCTCTAAACCATCCTTCAAATCTTTCATCACAGTCTTTACATCTTTTAAATTTTCTATGGTAAGTCCTTACTTACCGGTTGATGCAATGGCAACTGAATCACAAAGCTCGTTCGCTTATCGTTCGAATGAGCTTCGATAGTACCATTATGCATTTCAACGATGCTTTGAGCAATAGCTAATCCAAGTCCTGTTCCTCCAGTGGCTTTGGAACGGGAACCTTCCACTCGATAAAAGCGGTCAAAAAGCTTGCCAAGGGCCTCAGCAGGTACTTTTTCACCATCGTTAGCAACTTCAAAAATTACCGTATCATTAATTTGTTTGGCACTCAAAAAAATATTTTTACCACCATTACCATATTTCAAGGCATTGGTTATCAAATTGTTAAACACCCGACCAATTTTTTCGGCATCCCCGGTAATTTCTAAATCTTTCGGCGTACATTGAGAAGTAATCACAAAATGCTTCTGCTTAGCTTCCAGTTCAAAACTAGCTGCTAACTGTTGGAGCATAGAATCCACATTAATCGTATTAATTGTCAAATGGGGATTAGATTGACTAACCTTGGTATATTCAAAAAGGTCCTCTACCAGTGATTTCATCTGAATTGATTTTAAATATGCTGTATGCGTATATTTTAAAATGTCATCTTCATTTTTAAATTGACGATCTTCAATTAACCTTAGATAACCAATAATTGAGGTTAATGGCGTACGTAAATCATGCGATACATTGGTAATTAAATCATCTTTAGATTGCTTAAGCGCTCGCTCTTCTTCCATGGAGCTAATGACACTGTCAACTAGTGAGTTCACACTATCCACCACTCGTTGATGGTCTCCACTTAATTCAAATGGAATACGATGATCAAAATGACCATTAGCAATGTAATGTAATTCGGCAATAATATGACGTAACTGCATTTGCTTGTAACGTCGTTCTAAGCGCCAATAAAGTACCCCTGCATCAGCCAAAAACATGATTAAAATAAAAATCTTTTGGTAGCTCCAAATCTGTACGCCGCCAATTGTAATTGAATTTTTAACCATAAAGACCGCGTTTGACAAAGCTGGATTCGACTTTAAGGCACTATCAATTAAGATAAAAACTGATAAATTGAGTAATAGTAAGAGAATTACCGTAATAACTCCTTCACCAAACAATTCATATTTTTCACGCCCCGTTAACTTCATTTGAATCTCTCCTAGTGCGCGACTACTTTATATCCAACGCCCCAGACGGTTTCAATAACCTTTTCACCACCCGTAGCTTCTTCAATCTTGTCGCGTAAATGACTAACGTGTACCATTACTGTTTTAGCTGAAATCACACTCTCCTGTTGCCAAACACGTTCAAAAATCTCATCTGCTGAGAACACTCGGTTAGGATGGCTAGCTAAAAGATATAAAATACCGAATTCAAGTGCTGTTAATTGCACATCTTTTCCAGCTAAAGTCCGAACTTCATGTGAATCACTGTTGATGATTAATGAACCAATGTCCAAAATTTCTGGTTCATCAGCTGTCATATCTTTTTCACTACGACGTAGAAGTGATTTTACACGAGCCATGACTTCTAGTGGATTGAAAGGTTTAGCTACGTAATCATCCGCTCCAGTCAAGAGCCCCTTAATCTTGTCCATATCATCTGTTTTAGCAGACAACATTAAGATTGGTAAGGATGAATCCTTACGCACTTCCCGAACCACTTGCATCCCGTCCATTTCCGGCATCATAATGTCTAAAATCATTAAGCTAATATCCGGATCGGTACGTAATTTAGACAAAGCTTCTTTTCCATTGTAAGCAGATACTGGTTCGTAACCTTCATTTTTAATATAAATGTCTAATAATTCAACAATTTCTTTATCATCGTCAACAACTAAAATTTTCATTGGTGAATCTCCCCTTTTTACTGTCTTTTTTACCAGTCTAGCAAATTTCGTTCAAAACACCCGTTACTAGGGCTGGATTTTATTAATCTTTAAGAAAACCTTCCATTTTCAGCAGTTTTTCTTTTAATTCTACCCCTGCACGATAATTTCCAATTTTCCCATCTTTACGAATCACGCGGTGACAAGGAATGACTAGCAAAATCGGATTACGCGCCACTGCACTAGCAACGGCTCGAATGGCTTTAGGTGTTTCTGCTAGTTCTGCTAGTTCCGTATAATTAACCCCTCGACCGTACGTAATTTTCGTTAATGTTTTCCATATCTTTTGTTGAAACTGGGTTCCATTACTTAGATCAATTGCTAAATTAAATTCTTGGCGACGGTTTTCAAGATATTCTTTGATTTGACGTACAGCTTCGATATTTGATTTTTCATCTCCAATTAATTCAATTGCTTGATAAAACTGATTTACTTCATTTAACGTTTGGTTCGGTGAGCCGACAAAAGCTAAGCCCCTTTTAGTCGATGCCACATAGTACGTTGCATCTTTCACTTGAAATTTAGAATAATATAGTTTCATAGCATCACCCTCCTTCTGATTTTAACCTGTAATCATCGTAAAATAAAAAAAGTTAATAGCCAAGGACGAATCCTTGACCATTAACTCTTAAAGTTTTTAATTATTCAATACCAAATTGAATATTTATTTACTATTTATGGTAGTTAGGAGCAATTTTAGTCATTTGAACATCATGTGGATGGGATTCCACTAAACCAGCGTTCGTAATTTGCACGAACTGTGCTTTTTCAGCCAATTCAGCAATGGTAGCTGCGCCCACGTAACCCATTCCAGAACGGAGTCCACCAAGCATTTGGAAGATGATTGTGGCAACTGAACCCTTATATTGTACCCGCGCTTCAATTCCTTCTGGAACCAGCTTATTGGCTTCATTTACGCCACCTTGGAAGTAACGATCAGCTGAACCTTTTTCCATGGCCCCAACCGAACCCATTCCTCGATAGGCTTTGTATTTCTTACCATTATCTTCAATGATTGAACCAGGAGTTTCGTCTGTACCAGAAAGCATGCTACCAAGCATTACTGCATCTCCACCCGCAACTAGGGCTTTAACGATATCACCAGAGAACTTAATTCCCCCATCAGCAATAATCTTCTTGCCATATTCACGAGCTACATTAGCTGCATCATAGATAGCGGTAATTTGTGGTACCCCAACTCCGGCAACTACCCGAGTTGTACAAATTGAACCAGGTCCAATCCCAACTTTCACAACATCAACACCAGCGTCAAACAATGCTCTTGTTCCATCCGCAGTTGCGACGTTTCCAGCAATCAACGTTTGCTTTGGAAAATGTTCGCGAATTTCTGCTACCTTACGAAGTACTCCTGCTGAGTGTCCGTGAGCTGTGTCAATTACGATAGCGTCAGCACCAGCATCGATTAAACCTTGAGCACGTTCAAAAGTATCACTAGTTACACCTACGGCAGCCGCTACTAATAGACGACCTTGGTCATCTACAGCTGCATGCGGATTGTCTTCCAGATTTACATCCGCATTTTTTACGATTGAAACTTCGGAAGCTTGTTGTTCAGCACTCATATTTTTATGAATGACACCCAAGCCACCTTGACGAGCCATTGAGATACCCATTGCAGATTCAGTAACTGTATCCATTCCTGCACTAATAATCGGAATATTAAGCTTAATGTTATCAGCTAATTGAGTTGAAACATCAGCCTCATTCGGTAATACATGGCTTTCGCCTGGAATTAATAAAACATCATCAAAAGTTAAACCTTGTTTTGTAAACTTGTTATCCCAATTGCTCATCATTCTCTCCCTTTTCTTTAACTAAAATATGCCACCAACGATATGAAACTTTCGTCTAAGATACCACCGTCCGCCGAATGCTGCAACCGCTAATATTGCATATCCGTAGAATGGAAGGGTCGGATTGATAACAGGTGGTAGCATTCCAAAGCTAGTATAGAAGATAATCCAAAGGACTACGGCAATTACGACGATTCCCGCTTGTTTCCATACGGAAGGGCGCTTTTTACTAGATCCTAAGACTTTGTAGATATAACCCATACCAATCCCACCGACTGCTGACGTTAAAATAATTGCTAGCAATCCTGAAGGACCTGGTGTGCTAGTAATCGTCTTGGGTTCAATTAACATCATGATTGCGTACATTGCAGCAAACAGAGCGGCAAAAATTAAACCATTATCTAAAGCTCTAATCCACATATTGTTATTTTGGGCTTCAATTTTAGCTTTCTTAGGCCCTTCTATAATTTCATTTAATCGTTGGGTTGGGGTACCAAATAATTGTTTAGCTGTTTTACCAGTTTTTTGAGCTTCTAATAACCGAGTTTCAGTATCAATCAAAGCTTCGCTACGTTGTTCATCGTTAAGCTTGCTTTCTTTAAGCTCTTTTCGTAAACGATACATAAAATCTGCATTACGTTTAGTTAATTCTTGTTTTTTAGGTTCATTTTCATGATGGGCAACTGAACTACTTTGCTTGCCCTCATTACGTGGTTCTTCAGTCATAATCTACTTACTCCTCGTTTGATTTATATTAGACATTAAAGCGGAATTCGATAATATCGCCATCTTGCACCAGGTATTCCTTACCTTCAAGACGTAAACGTCCCGCTTCTCGAACACCTTGCATACTGCCATACTTGTCTAAATCATCAAATGAAACTGTTTCAGCACGAATAAATCCACGTTCAAAATCAGAATGAATTACACCAGCTGTTTGAGGAGCCGTCATTCCCTTCTTAAACGTCCATGCCCGTGTTTCTTTTCCGCCCGCCGTGAAGAAGGTTTGGAGACCTAAAAGATTGTATGAGGCTTGAATTAGACGGTTTAAGCCTGGTTCAGTAATTCCTTCTGCTTCAAGAAATTCCGCTTTTTCGTCATCTTCTAATTCAGCGATTTCTTGTTCAGTTTCAGCTGAAATACCCAAAACTTGCGCATCAAGGTCTTCTTGAGCAACATAATCTTTAATTTCTTTGAAGTACTTGGAAGCTTCAGGATCGGCCATATCGTCTTCTGCAATATTAGCCACATAAAGTACGGGCTTAGTAGTTAGCAAGAAAAGTCCTTTAACAATAGGCATTTCTGATTCATCAAAATCGATTGTACGGGCTGCTTTACCAGCTTCCAAAACTGGATGTAATTTTTCCAGTACCGCTAATTCTGCTACTGCATCTTTATCGCGTCCCTTAGCCGCACGCTGTACCTTAGTCAAACGTTTTTCGACACTTTCCAAGTCAGCTAGACTCAATTCCAAGTTGATGGTTTCGATATCTTCGATGGGGTCAACTTTACCTGAAACAGTTGTGATATTGTCGTCGTCAAAGGCTCGAACAACGTGAACAATTGCATCCACTTGGCGAATATTTTCAAGAAATTTATTTCCAAGTCCTTCACCCTTACTTGCACCCTTAACAATCCCTGCAATATCGGTAAATTCAAAGGTTGTGTGCACAATCTTTTTAGCAGGAATAATTTCTTGAATCCGATCTAAACGTTGATCTGGTACTTCTACCATCCCGACGTTTGGATCGATTGTAGCAAACGGATAGTTAGCCATTTCGGCTCCCGCCTTTGTAATTGCGTTAAATAACGTTGACTTACCGACGTTCGGAAGTCCAACAATACCAGCTGTTAATGCCATTTTAATTCCACTTTCCTTTCAAAACTGCGTGTTCTTCTCTATATATTATCAAAAATTAGGGGTCGTTAACAGACCGTTCAGAACCAAAGTTGCGCTTTCATCACCATCAATAAAGAAATCTCGTATATTACAGTTCTATTTTTTGATTTTAGTTAGTAAAAAAGAGGCACTACGATTTGCAACTTAAAATTGGCTTATCATAATCCCTCTTACAACTTATTCAGCGTGTTCAACGACCTTCTTCAATTTTCGTTCAAATTCACGACGAGGCAACATCACAATGTGGCCACATCCCTCGCATTTAATCTTAATGTCCATCCCTACCCGGATGATTTCCCAAGTATTAGAGCCACACGGATGACTTTTCTTCATCTGAACAATATCATGTAATTCATATTCCATTACTAAATCCTCCTTAGTCTAAAGAAATATTCAAGACATCCAAAATCCGATCAAGTTCTTGGATTGAATCATAATTGATTTCAATTTTACCTTTTTGTTTTGATTTTGCTACAACCAGTGCGCGCGTCCCAAAGCGTTCCCCCAATTGATTTTCAAGTTCTCGAATAAAAGGTGATTTGTTCTTTCGTTTTTGTTTTTGAGCTGCTTCTCGATCTTTATCCAAATTAAATTTAGTTACGATTTCTTCTAATTGACGAACCGTTAATCCCTCTTCGACCGTCCGTTGGGCAAGCTTCTCTAAAGCTTGAGGTTGCTTAATCGCCAACAATGTTCGTGCTTGTCCCATTGAAATTCGTCCCTCTTGGAGCATCAATTTAACGCCCGTTGGCAGTCCTAATAAACGTAAATAATTAGCAATATAAGGCCGACTCTTACCTAATCGTTCCGAAACCTGCGCTTGAGTTAAATTTAACTCTTTAATCATTGCTTGGTAAGCTTCTGCTTCTTCTAGCGGACTAAGATCCTCCCGTTGTAAATTTTCAATAATTGCTGCTTCCATAGTGGCTTCATCAGAAAAGTTCCGAATAATTGCTGGAACCTGTTCTAAACCGGCTAACATACTCGCCCGGTAGCGTCGCTCGCCAGCAATAATTTCATAACGTTCTAATGCAGCAATTGGTTGACGTAGAATCAAAGGTTGATAGATACCAGATTTTTTTATCGATTTAGCCAATTCTTCAAGTCGATCTTTATCAAAGATATGCCGCGGTTGAAATGGATTAGGATAAATCTTAGTAATATCGATCATCTGATACGTTGCGTCATTTTGTGTGTTCAATTGTTCATTTAATACTTTCTTACCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP028259|802305:810561|809709_810561_-|WP_023440818.1|DBSCAN-SWA MGKKVLNEQLNTQNDATYQMIDITKIYPNPFQPRHIFDKDRLEELAKSIKKSGIYQPLILRQPIAALERYEIIAGERRYRASMLAGLEQVPAIIRNFSDEATMEAAIIENLQREDLSPLEEAEAYQAMIKELNLTQAQVSERLGKSRPYIANYLRLLGLPTGVKLMLQEGRISMGQARTLLAIKQPQALEKLAQRTVEEGLTVRQLEEIVTKFNLDKDREAAQKQKRKNKSPFIRELENQLGERFGTRALVVAKSKQKGKIEINYDSIQELDRILDVLNISLD >NZ_CP028259|802305:810561|802305_803562_-|WP_060743552.1|DBSCAN-SWA MKKLYTMLIAFLMMMTSFAPALAAENNESVIEATTSNITAKSAIAVDENTGQILYSKDENTVRPIASMSKIVAAYLIMKSVKEGQMHWNQKVSINKSLEEVSNNSELTNVPLSSNQTYTVRNLLDASLIYSANAAILSLGKAQAGTSEKFVNEMRSTVKKWGIKDAKLYNAAGLLESQVGSEKYPGTSGNIENEMSAKDMAIVISHVLKEFPEILNITKIQKTTFNTGKEELEITNHNELLKGAEQYEAKYQIDGLKTGTSDKAGEDFSATGKIKGHRVISVVLGSGENQRFTDTKTIWNALMTKLAVLSSNLKNQASVKINSAKVADVKLELTQPLDYWVPKGQSEKLHVNAIKLNDQKQKAPIKHSKVIATANVKGNQDQFLENSKGVHVKLKPTQDVKKANIFVRLGRSIADWFS >NZ_CP028259|802305:810561|804890_805580_-|WP_002834114.1|DBSCAN-SWA MKILVVDDDKEIVELLDIYIKNEGYEPVSAYNGKEALSKLRTDPDISLMILDIMMPEMDGMQVVREVRKDSSLPILMLSAKTDDMDKIKGLLTGADDYVAKPFNPLEVMARVKSLLRRSEKDMTADEPEILDIGSLIINSDSHEVRTLAGKDVQLTALEFGILYLLASHPNRVFSADEIFERVWQQESVISAKTVMVHVSHLRDKIEEATGGEKVIETVWGVGYKVVAH >NZ_CP028259|802305:810561|806290_807433_-|WP_011673831.1|DBSCAN-SWA MSNWDNKFTKQGLTFDDVLLIPGESHVLPNEADVSTQLADNIKLNIPIISAGMDTVTESAMGISMARQGGLGVIHKNMSAEQQASEVSIVKNADVNLEDNPHAAVDDQGRLLVAAAVGVTSDTFERAQGLIDAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKVAEIREHFPKQTLIAGNVATADGTRALFDAGVDVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDAANVAREYGKKIIADGGIKFSGDIVKALVAGGDAVMLGSMLSGTDETPGSIIEDNGKKYKAYRGMGSVGAMEKGSADRYFQGGVNEANKLVPEGIEARVQYKGSVATIIFQMLGGLRSGMGYVGAATIAELAEKAQFVQITNAGLVESHPHDVQMTKIAPNYHK >NZ_CP028259|802305:810561|805662_806160_-|WP_060743551.1|DBSCAN-SWA MKLYYSKFQVKDATYYVASTKRGLAFVGSPNQTLNEVNQFYQAIELIGDEKSNIEAVRQIKEYLENRRQEFNLAIDLSNGTQFQQKIWKTLTKITYGRGVNYTELAELAETPKAIRAVASAVARNPILLVIPCHRVIRKDGKIGNYRAGVELKEKLLKMEGFLKD >NZ_CP028259|802305:810561|803742_804879_-|WP_011673829.1|DBSCAN-SWA MKLTGREKYELFGEGVITVILLLLLNLSVFILIDSALKSNPALSNAVFMVKNSITIGGVQIWSYQKIFILIMFLADAGVLYWRLERRYKQMQLRHIIAELHYIANGHFDHRIPFELSGDHQRVVDSVNSLVDSVISSMEEERALKQSKDDLITNVSHDLRTPLTSIIGYLRLIEDRQFKNEDDILKYTHTAYLKSIQMKSLVEDLFEYTKVSQSNPHLTINTINVDSMLQQLAASFELEAKQKHFVITSQCTPKDLEITGDAEKIGRVFNNLITNALKYGNGGKNIFLSAKQINDTVIFEVANDGEKVPAEALGKLFDRFYRVEGSRSKATGGTGLGLAIAQSIVEMHNGTIEAHSNDKRTSFVIQLPLHQPVSKDLP >NZ_CP028259|802305:810561|809510_809696_-|WP_002834122.1|DBSCAN-SWA MEYELHDIVQMKKSHPCGSNTWEIIRVGMDIKIKCEGCGHIVMLPRREFERKLKKVVEHAE >NZ_CP028259|802305:810561|807454_808159_-|WP_023440817.1|DBSCAN-SWA MTEEPRNEGKQSSSVAHHENEPKKQELTKRNADFMYRLRKELKESKLNDEQRSEALIDTETRLLEAQKTGKTAKQLFGTPTQRLNEIIEGPKKAKIEAQNNNMWIRALDNGLIFAALFAAMYAIMMLIEPKTITSTPGPSGLLAIILTSAVGGIGMGYIYKVLGSSKKRPSVWKQAGIVVIAVVLWIIFYTSFGMLPPVINPTLPFYGYAILAVAAFGGRWYLRRKFHIVGGIF >NZ_CP028259|802305:810561|808187_809294_-|WP_060743550.1|DBSCAN-SWA MALTAGIVGLPNVGKSTLFNAITKAGAEMANYPFATIDPNVGMVEVPDQRLDRIQEIIPAKKIVHTTFEFTDIAGIVKGASKGEGLGNKFLENIRQVDAIVHVVRAFDDDNITTVSGKVDPIEDIETINLELSLADLESVEKRLTKVQRAAKGRDKDAVAELAVLEKLHPVLEAGKAARTIDFDESEMPIVKGLFLLTTKPVLYVANIAEDDMADPEASKYFKEIKDYVAQEDLDAQVLGISAETEQEIAELEDDEKAEFLEAEGITEPGLNRLIQASYNLLGLQTFFTAGGKETRAWTFKKGMTAPQTAGVIHSDFERGFIRAETVSFDDLDKYGSMQGVREAGRLRLEGKEYLVQDGDIIEFRFNV |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1012686 : 1059127
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP028259|1012686:1059127|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP028259|1012686:1059127|1029313_1029541_+|WP_138428180.1|DBSCAN-SWA MKCSNESSGAYFMIDNKSFYASVETLRRGLNPVFIPLVVMSEQANTNGGLILVTFPKAKIKVNVSRQRDLTQVKV >NZ_CP028259|1012686:1059127|1023065_1023716_-|WP_060744132.1|DBSCAN-SWA MKKGFVIATVAMSLGIIAPLSQVVTSTPVSAKTTSHSYVTTTSNSISVTNIRKGSTVVLKNNMGQTIATKTAANAGTVTFNLGTQQVNRLTKTDTLAIKLSSGYKFNINFNFINYRTPASNKFVAGIPTELQGHWQAKLGYFTGHWNMTSNRSTLTVNDPQILNNVQYKNLGNHTYVLKGTESYYSNGSTIQYTVKKVSNNHLTLTTANGVSQWYK >NZ_CP028259|1012686:1059127|1012979_1013162_-|WP_011672822.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MTEIKVLNDKELKNVVGGKYYGNGVHCGKKTCYVDWGQATASIGKIIVNGWTQHGPWAHR >NZ_CP028259|1012686:1059127|1028247_1029138_+|WP_138428181.1|DBSCAN-SWA MQLDISEQSLKVYEALASSVRLKIIRLLSDEKMSVKEVAESLNLSSPIVAKHLNKLEEAEIIQTKRLGHRKVSSLKVDTIDIKFPQQIYPKFSAHRTGIPIGHYTEFNVKPSCGLAGEDGYIGNVDNPKYFMLPERMNAGMIWFNNGYVQYQTPNFLGFDEHLEMLDISMELGSEFPFSNNTWPSDITFSVNGKEIGTWRSPGDFSDVRGKYTPDWLPDNVNQYGILKILRITDHGTYLDGQPFTNVCLKDLPINSDVWTIRFEVKPDAKKSGGCTIFGQGFGNYDQNIELSAFYS 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>NZ_CP028259|1012686:1059127|1054491_1055277_-|WP_011669002.1|DBSCAN-SWA MTTSITIGNFKGGVGKTTTCVTFSYLLNKAHRKTLLIDFDPQGNASEIIEKTFPVFKQKNSKSLTDGIKNLDLSESIAHVTDYLDLMPSDWSLSLLPDMLEDYKKSDRPLFLKTLLTKIRNDYDYILIDVPPTLSAYTNNAVLASDYVIMVMQTQEQSYSSSLKFVSYLQGLRKDYDKSFDLLGIIAYLVKKDGPVDHEVLKAANQAFGKALFHGNVFQRERVKRFGKSGIKDEDMWDKRALYMYQVVLDEALSRINLLEE >NZ_CP028259|1012686:1059127|1016811_1016931_-|WP_158190262.1|DBSCAN-SWA MKKENQSSAYRYLKSPNVKTKRRALKIIEEIKKNRTNKR >NZ_CP028259|1012686:1059127|1025718_1026996_-|WP_141822350.1|DBSCAN-SWA MNNAKDESKHFWGFPLTHFSYFFIWAVINGYLTLWLEQVAHLNGTESGAIFSMMAGISLIFQPIFGILSDRLLFKKTLILTISIVGIFIGPYFQWVFMPVLHINSFLVAFVTGVFLSFVLNGGVSVIEQYVQRASLANKFEYAHSRVGGSVAGVAASLISGPIFLWHPNSIFWACTIAAVILTGLLLFSDKINMDNATAAGDTSNSLDMKTAMSVFKIKNLWVLAIFYMGASALYDVFDQQFIIFFKTFFDTASQGTLVYSYMTSAQIAIEFCLMFPIPWIINKIGSRNGLIIYGFLTCIRILGSAFAPNWIWLVGFRLVAGLEMPLLLTSIMKYIAGAFDIRLYATVYALASNFAKQVSVFIFSSVAGTMYDSIGFQHTYLIMGIVVLIITLFAAFFLKKEDPIQAGQIDQTTESLEATANTPD >NZ_CP028259|1012686:1059127|1036330_1036807_-|WP_099300094.1|DBSCAN-SWA MNNQEFDLDTVKHFFEHDYHDRGMMKWQGFYLSDHTAALHQQNQQLNEIYVPRPQQSLTVITEVLADAYQRQQPVTIQLKPVDQNNRHLPDITTLIHGYNANDIVIDADRFIPLQEIRNVSFKNTESYKVLALRIFLNTLFAGSVFSHCFILDNFTSM >NZ_CP028259|1012686:1059127|1049194_1049560_-|WP_132981463.1|DBSCAN-SWA MKLYQSLTQVQINEQFAGQATGYKLSTTLDKPLNYDPTILYQYLDTVLKPGSRHDENNLRYVTNPGYIGENFNYQSVPFTSHMTEFDEKMAFARKLVADLNRHLSVNIKPEDETIELVFVD |
39 | Streptococcus_phage(28.57%) | bacteriocin,holin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1443138 : 1450756
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP028259|1443138:1450756|DBSCAN-SWA TATGGAGCTAGTTGAAGCAAAACATCAAATTGAAGATATGAAAAAAGAAGTCGCTGACTTCGGGAGGTCTCTTTGACTTAGATGCTTTGAATGAAAGTATCAGTGTCAATGAGGCCAAAATGGCAGAGCCTAACTTTTGGGATAATCAAGAACAGGCTCAAATTGTCATCAATGAAAATAATGAGTTAAAACAAAAATACGATAATTTTAAAAATTTAACCGACCATGTTGAAAACTTAGAGGTAACTGCTGAATTATTGGAAATGGAAGATGATCCTGACGTTCAAAGTGAGTTTGAGAGTGAATTAGCCGCCACGGCTAAATTATTGCAGGATTACCGTTTAGGATTATTGCTTAATGGTAAATATGATGCCAATAACGCAATTATAGAAATTCACCCCGGAGCGGGAGGAACAGAATCTCAAGATTGGGGTTCCATGTTGCTAAGAATGTACACGCGTTGGGCTGAGCAGCATCAGTTTAAGGTTCAAATTGAAGATTACCAAGCAGGTGAAGTGGCAGGAATTAGTAGTGTAACCATGCGAATTGTCGGTCACAACGCATATGGTTATTTACGCTCTGAAAAGGGAGTTCATCGGCTAGTAAGACTATCACCATTTGATTCTGCTGGACGACGTCATACTTCTTTTGCATCAGTCGACGTTATGCCGGAATTGGATGATTCGGTTGAAGTTAACATTAACCAAGATGATTTACGAGTGGATGTATATCGTTCTAGTGGTGCTGGTGGACAGCATATTAACAAGACTTCTTCAGCGGTGCGAATTACGCATTTACCAACTGGAATTGTAGTTGCGAGTCAAGCAGAGCGTTCTCAATTACAAAATCGGGCTACCGCTATGAGTATGTTGAAGGCTAAGCTATTTGAGCTTGAAGAACAAAAGAAAGCAGAAGAAAAGGCTAAAATAGAAGGTATTCAACTTGAAATAGGATGGGGATCGCAGATTCGTTCTTACGTTTTCCATCCCTATTCTATGGTTAAAGATCATCGAAGTAACTTTGAGACGGCTAACGTTCAAGGTGTGATGGATGGGGATCTCGATGGTTTTATCAATGCTTATTTGCAATGGAAATTGAAAGAAGATAATCCAAAATAGGGGGATTCGGATGTCAAAGACGATATTAGTTGTAGATGATGAGCCAGCAATTGTGACTTTAATTACTTATAATTTGGAACAAGCTAATTATCAAGTTGTGAGTGTGGATAACGGTTTAGATGCGGTGGAAATCGTCCAAAAGGGCTTAGTTGATTTTGTGATTATGGATTTAATGCTCCCTCAATTGGATGGAATTGAAGCTACCAAACAAATTCGCAAGTTTGATGAACAAATTCCAATTATTATGTTGACGGCTAAGACTAGTCAAGTTGATAAAATATTGGGATTGGAATTAGGGGCAGATGATTATATTACCAAACCATTTAGTCCTCAGGAGCTTCTTTCACGGATTAAAGTAATCTTACGACGGACTGATCGGGCAATTAATTTGGCTGAAATTGATCCAACTCTACAAGCAGAAAATATCGCCATTGATTTCAAAAGAATGGTGGTTAAGAAGAATAATGAAAAAATTCAATTAACACCCAATGAATTTAAACTATTAAGGTATTTATACAAAAATGCCAACCAAGTTTTATCACGCGATCAAATTTTGGAAAAAGTTTGGGGATATGAATATGGGGGACAGACCCGTATTGTGGATATCCACATCAGTCATTTGAGGGATAAACTGGAAAATGATCCGAAACATCCACAGTTGATCAAAACCATTAGGGGGTTTGGATATGAGTTCGTCTCGAAAAAAGGCGATTAAGCGTACCGTGCAATTCGGTTTTGCTAGTTTAATCGGAAATGCCTTTATGGCTTTTCTGGTGTATAAATTAATTGTAAAAGAAAATCCACGAGTAACTAAGGTAGATATGACACTGTTAATCGCCGTGATTTTGTTAATTACGGTTATTGAAATAATTGTATTTTGGAGTAATCAAAAGAAAATTATTGAGCGTCAAAAGTTATTCAGAAAGAACTTAGAAGAAGTTATTAAAGGTAACCATGTTCCCAAGATTCAATTGGATCCAGAAGATCCATTTTATAAATTATCTAAAGTTGTTAATGAAATTGGTACCCATGAGCGTCATCAAATTCACGTTTTGAGAAATCAACAAAGTGAATTAACCGCCATTATGGATAATTTGCCAGTAGGAGTGCTAGTTATCAATCGGCACCGTGAACTACAAGTGGCTAACACGTACGCTATTAACCACTTAGGGATTACTGGACTCGACGTTCCTCACCCATATACCATGGATATTCGGGATCATGAATTAAGTGAATTGGTGGATAACGTGTTTAGAACACGCCAGAGTACTACCAAAACAATTAAACTAGATGGGGACCAGTCATATATTTATGAAACAACGGTTGTTTACAGTCCCAAAGTGCACCATAAATTTGAAATTATTGTGCTACTTTACGATGCAACGGAAACTGTGCGCTCTAAACAAATTGAACGTGACTTTGTTAACAATGCTTCGCACGAACTTCGTACACCAATCACATCGATTGCGGGCTTCGCAGATACGTTACTAAACGGAGCCAAGGACGATCCAGAAACCTTGGATAATTTCTTACGTATTATTAAGACTGAAAGTGATAAGTTAGTGCAATTAACGGACGATATTTTAACCATGTCGCGCGTTAAGAGTGGCGAACGAGAACGTAAAGAAATTAATTTACATAAGTATGTGGATCAACAACTTAAGTTAGTAGAAAGTAACATCAGTAGCATGAATCTACATGTGGAAAACAATATTCCAGCAGATGTTAACGAAGAAGTGATTGAAAATGATTTATTCCAAATCGTCAAGAACTTGATTACTAATGCGATTAGTTACAATCGAAAAGGTGGAAAAATCAAAATTGATTACGGATCACATCATGACCGTTGGAAGCTCGTAGTGAGTGATACTGGTATTGGAATTCCTTTAGGTCAGACGGACCGCGTTTTTGAACGTTTTTATCGGGTGAATAATGCTACTAAAGGTGGTACTGGATTAGGTTTAGCCATTGTTAAAGAAGCGGTTGACGATATGAATGGTAGCGTTCGAATCGAATCAGATGAAGATAGCGGAACCACGGTGATCGTAAAATTCAAGCGTGATATTAATTAAATATTGTGGAATAAAGTCGAATTTTAATTCGGCTTTATTTTTTTACACTTTTTACTATTTTAAAATTCTTTACATAATCTTTACATACCTCATATTTAACCTTTACGTTGCCCTTGTATGCTAATAATCGAAGCTAGAGATTAGGGAAAAGAGGCCAGGACATGAAAAAAGTTAATAAGGGGATTATCTTAGCGTCGATGATGGCAATACTCTTGATTTTGACTGGATGCCAGTCTAAGTCATCTCAAAAAAATTCAGTAACGATTGTGGGATCGACGGCGTTACAACCATTAGTAGAAAAAGCTGCTACTGATTATCAAGTAAAAAATAGCGGTGTGGATATCACTGTTCAGGGGGGCGGATCTGGGACCGGTCTAAGCCAAGTTCAACAAGGCGCCGTAAGTATCGGAAATTCAGATGTTTTTGCAGAACAACAAGATGGAATTGATGCCAAAAAAGTGGTGGATCATAAGGTAGCGGTGGTTGGAATGGCTCCCGTGGTCAACCAAGATGTTCCAATTAAAAATATTTCTATGGCTAATCTACGTAAAGTATTTACAGGTAAAATTACAAACTGGAAACAACTGGGGGGGCCCGATCAAAAGATTGTGGTCATCAATCGAGCTCAAGGGAGTGGTATCCGGAAATCATTCGAACGAGTGGTATTAAAAGGACAACCAGCTTTGAATGCTCAAGAACAAGATTCAAATGGGACGGTACAAAAAATTGTACAAGCAACTCCAGGATCGATTAGTTATCTTTCATTCTCATATTTTAATAACCAAATTAAACATTTAGCGATTGATGGAGTTCAACCTAACGCTAAAAATGTGGAAAATAATCGTTGGAAAATTTGGTCATATGAGCACATGTATACGAAACCTAATGCCAGTGCAGCAACCAATAACTTTATTAAATACATGAAATCTGAAAAAGTACAAAAGAATTTAGTTTCAGACTTAGGTTATATTTCAATCCATGATATGAAGGTAGAACTAACAAGTGATGACCAAGTAATCCCAATTAAAGGAGCTGAGGAATAATGGATGCAGTAAAAAAAGAATTAACGCGTAAATCAAAGGCTTCCAGGCAGGACCAGCGTGGAAAGTTAATTTCCTTAGCTTGTGTAACTTTGATTATGTTGGTAGTCCTTTCAATTTTATACATGATTACCTCTAAAGGTTTAGCAACTTTCTTCGAAAATAAAATGAGTATTGTTGATTTCTTTACTAAGGAGGTTTGGAATCCGAGTGCTAAACCTCAAGCGTTAGTGGGCGCACTACCGATGATTGTAGGATCATTCAGTGTTACCGTTCTTTCAGCCCTTTTGGCAGCGCCATTTGCGATTGCCACCGCCATCTTCATGGTTGATATTGCAGGAAAACGTGGACGTAAAATTTTACAACCGGTCATCGAATTGTTGGTGGGAATTCCATCAGTAGTTTACGGATTTATCGGGTTGACGGTCGTCGTGCCCTTTACTCGAACAGTATTTGGTGGAACTGGTTTTGGAATTTTGTCGGGAACCTTCGTACTGTTTGTCATGGTCTTACCGACCGTAACTTCCATGTACGTTGATAGTTTAAAAGCTGTTCCACAGTTTTATCGCGAGGCTTCATTGGCTTTGGGAGCTACACGGTGGCAAACAATCTACAAAGTTATCATTCGAGCTTCCATTCCAGGCTTACTAACTGCTATTATTTTTGGAATGGCTAGAGCCTTTGGTGAAGCCTTAGCTGTTCAAATGGTAATTGGTAATGCATCGATTTTACCAAGTGACTTAGTATCACCAGCCTCAACGTTAACTAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP028259|1443138:1450756|1447369_1448278_+|WP_060743356.1|DBSCAN-SWA MDAVKKELTRKSKASRQDQRGKLISLACVTLIMLVVLSILYMITSKGLATFFENKMSIVDFFTKEVWNPSAKPQALVGALPMIVGSFSVTVLSALLAAPFAIATAIFMVDIAGKRGRKILQPVIELLVGIPSVVYGFIGLTVVVPFTRTVFGGTGFGILSGTFVLFVMVLPTVTSMYVDSLKAVPQFYREASLALGATRWQTIYKVIIRASIPGLLTAIIFGMARAFGEALAVQMVIGNASILPSDLVSPASTLTSVLTTGIGNTVLGTLPNNALWSLALVLLLMSLVFNLLTRFIGKKGAF >NZ_CP028259|1443138:1450756|1446488_1447370_+|WP_060743355.1|DBSCAN-SWA MKKVNKGIILASMMAILLILTGCQSKSSQKNSVTIVGSTALQPLVEKAATDYQVKNSGVDITVQGGGSGTGLSQVQQGAVSIGNSDVFAEQQDGIDAKKVVDHKVAVVGMAPVVNQDVPIKNISMANLRKVFTGKITNWKQLGGPDQKIVVINRAQGSGIRKSFERVVLKGQPALNAQEQDSNGTVQKIVQATPGSISYLSFSYFNNQIKHLAIDGVQPNAKNVENNRWKIWSYEHMYTKPNASAATNNFIKYMKSEKVQKNLVSDLGYISIHDMKVELTSDDQVIPIKGAEE >NZ_CP028259|1443138:1450756|1449997_1450756_+|WP_023440049.1|DBSCAN-SWA MAKDIITAENVHLYYGQKEALHGISLGFPEKEITALIGPSGSGKSTFIRTLNRMSDLNPEVTVTGAIRLDGEDIYSPKTDTVELRKRVGMVFQQPNPFPFSVYDNVTYGLRLSGIKDKALLDQRVEESLKLAAVWDETKDHLKENALSFSGGQQQRICIARVLAVQPEIILLDEPTSALDPVSSAKVEDSLLAIKDQFTIAVVTHNMQQASRISDQTAFFLDGNLVEFSKTVDMFTHPEKQETSDYLNGKFG >NZ_CP028259|1443138:1450756|1444265_1444970_+|WP_002834460.1|DBSCAN-SWA MSKTILVVDDEPAIVTLITYNLEQANYQVVSVDNGLDAVEIVQKGLVDFVIMDLMLPQLDGIEATKQIRKFDEQIPIIMLTAKTSQVDKILGLELGADDYITKPFSPQELLSRIKVILRRTDRAINLAEIDPTLQAENIAIDFKRMVVKKNNEKIQLTPNEFKLLRYLYKNANQVLSRDQILEKVWGYEYGGQTRIVDIHISHLRDKLENDPKHPQLIKTIRGFGYEFVSKKGD >NZ_CP028259|1443138:1450756|1449183_1449984_+|WP_060743357.1|DBSCAN-SWA MLETKRKEKSILTFPADREIALETNNLQVYYGNNHAMQDASLQFPRYSITALIGASGSGKSTYLRSLNRMNDGIARVDGEIMYRGLDVNADEVDIYQMRRRIGMVFQRPNPFAKSIYNNISFPLREMGIKDKSKIDGIVESSLKQAALWDEVKDDLKRSALALSGGQQQRLCIARSLAMSPDILLMDEPASALDPISTHKLEMTLNDLKEQYTIIIVTHSMEQASRLSDYTAFMHMGKIVEFDTTENIFTNPAVKLTEDYVSGNFG >NZ_CP028259|1443138:1450756|1448278_1449166_+|WP_002834456.1|DBSCAN-SWA MNAKRVDKIATAVIYLLVGIVILILVALLGFILITGLPHVTWSFLTSPASAFNAGGGIGDQLFNSFYLLFLTLLISFPISLGAGIYLAEYAKKNRVTEAIRITIEVLSSLPSVVVGLFGFLLFVVQFKLGFSIISGAIALTFFNLPLLTRNIENSLNGVSNLQREAGLSLGLSRWKTVTKVVVPAALPGIITGIILSAGRVFGEAAALIFTAGQSAPVLNYANWNPFSGDSPLNIFRPAETLAVHIWKINTEGIMPDASQVSAGASAVLIIAVLVFNLGARWAGNYVYRRITASK >NZ_CP028259|1443138:1450756|1443138_1444254_+|WP_141822485.1|DBSCAN-SWA MELVEAKHQIEDMKKEVADFGRSLDLDALNESISVNEAKMAEPNFWDNQEQAQIVINENNELKQKYDNFKNLTDHVENLEVTAELLEMEDDPDVQSEFESELAATAKLLQDYRLGLLLNGKYDANNAIIEIHPGAGGTESQDWGSMLLRMYTRWAEQHQFKVQIEDYQAGEVAGISSVTMRIVGHNAYGYLRSEKGVHRLVRLSPFDSAGRRHTSFASVDVMPELDDSVEVNINQDDLRVDVYRSSGAGGQHINKTSSAVRITHLPTGIVVASQAERSQLQNRATAMSMLKAKLFELEEQKKAEEKAKIEGIQLEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRSNFETANVQGVMDGDLDGFINAYLQWKLKEDNPK >NZ_CP028259|1443138:1450756|1444941_1446327_+|WP_060743354.1|DBSCAN-SWA MSSSRKKAIKRTVQFGFASLIGNAFMAFLVYKLIVKENPRVTKVDMTLLIAVILLITVIEIIVFWSNQKKIIERQKLFRKNLEEVIKGNHVPKIQLDPEDPFYKLSKVVNEIGTHERHQIHVLRNQQSELTAIMDNLPVGVLVINRHRELQVANTYAINHLGITGLDVPHPYTMDIRDHELSELVDNVFRTRQSTTKTIKLDGDQSYIYETTVVYSPKVHHKFEIIVLLYDATETVRSKQIERDFVNNASHELRTPITSIAGFADTLLNGAKDDPETLDNFLRIIKTESDKLVQLTDDILTMSRVKSGERERKEINLHKYVDQQLKLVESNISSMNLHVENNIPADVNEEVIENDLFQIVKNLITNAISYNRKGGKIKIDYGSHHDRWKLVVSDTGIGIPLGQTDRVFERFYRVNNATKGGTGLGLAIVKEAVDDMNGSVRIESDEDSGTTVIVKFKRDIN |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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