Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP035109 | Acinetobacter pittii strain NQ-003 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,WYL,DEDDh,cas3 | 0 | 1 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP035109_1 | 2852435-2852516 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP035109_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP035109_1
>1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder ACCCGAGCGCAAGACGAGAGCTGTGCTCGAGTGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP035109_1
The CRISPR arrays of NZ_CP035109_1 >merge|NZ_CP035109|1|2852435-2852516|CRISPRCasFinder GAGGATAAGTAAAGCAACGCTTTACCCGAGCGCAAGACGAGAGCTGTGCTCGAGTGGAAGAGGATAAGTAAAGCAACGCTTT >NZ_CP035109|1|1|2852435-2852516|CRISPRCasFinder GAGGATAAGTAAAGCAACGCTTT ACCCGAGCGCAAGACGAGAGCTGTGCTCGAGTGGAA GAGGATAAGTAAAGCAACGCTTT
>NZ_CP035109.1|WP_086376663.1|2850081_2850777_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEKESSTYTYMLGCEETREAVLIDPVASDIEIYTKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAANLLRERLDCKSVLHRNSEVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMIFTGDALLIDGCGRTDFQQGNAGTLYDSIHKQLFSLPDETIVYPGHDYKGRLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSTSQS >NZ_CP035109.1|WP_086376662.1|2848618_2849890_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFESEQDFYILFEQLKALFPNASLFLAETTTQAIHYKFNTDDISVESMAALTQDHHNQYLEINTPKMRKRFIYQENDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIADQVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMARMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAQAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNANILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPLIVDQILKESSTQLDTMPRHVNQKAMQILLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEVEDLPNELLNAEDYVKLPETNTELTPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >NZ_CP035109.1|WP_086376661.1|2847637_2848549_-|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIIRDSHVLSNEQREHLIHQVLIFSNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKALKDGDISDIIYGTLTRHIVELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >NZ_CP035109.1|WP_086376660.1|2846531_2847590_+|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTHGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAYVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >NZ_CP035109.1|WP_086376659.1|2845716_2846502_+|acetoin-reductase MVNGLKNKVVLVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIALVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYAAINHAEQTLGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQRQHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >NZ_CP035109.1|WP_086376658.1|2844286_2845690_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSEAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIIEEQHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDIQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFNGRAQLTAKEKLEVTDAQGNSQALSAPHIILATGAKARHVPQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVLTDAVVQSIQIENDQVHCVIETANDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGVYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICVEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDATGFVKTVVHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >NZ_CP035109.1|WP_086376657.1|2842737_2844276_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEISDAEIETFIASLGGSAAKPPEAPSEQSKAETSAPVAEKAEQPQSVAASAPAPAKVAKGDYAVPESLQGYQTSDDLFATPHALKLAEKHNVNLEKVTGSGREGRISVQDIQKAVQGAGGQWPDIKQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPTSVNEQSTQCAVAQPQSTITTVAMNGMRKAIASRLQTAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVCEIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >NZ_CP035109.1|WP_004792520.1|2841716_2842736_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENELEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALVAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >NZ_CP035109.1|WP_001177517.1|2840740_2841703_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIERARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDAASKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >NZ_CP035109.1|WP_032034987.1|2839391_2840378_-|lipoyl-synthase MDLKRQIETGIKLRGADKVARIPIKILPTEELPTKPDWIRAKITDFEEINRIKNLLRQQKLHSVCEEAACPNLPECFGGGTATFMIMGDICTRRCPFCDVAHGRPKPLDEDEPKHLAETVANLNLKYVVITSVDRDDLHDGGAAHFVKCIEEIRKRCPETLIEILVPDFRGRLETALSTLSLSPPDVFNHNIETVPRLYKAMRPGSDYQHSLELLKRFKAYCPDIKTKSGLMVGLGEIEAEVLALLNDLKDYQVDLVTIGQYLQPSKSHAPIHRFVNLQEFERYTRHGKRLGFKNIWSAPMVRSSYFADRQYFGEEVPKPFSRQDVLS >NZ_CP035109.1|WP_002113934.1|2852617_2853409_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANAISPVWLMLMFSLVMFTVGYRLISNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLAGIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFHYPVGITSAFALACAVGMLLGRRAIRFIPSAIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >NZ_CP035109.1|WP_086376665.1|2854555_2855473_-|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAAILGLIGIVLLFWHDLVNSQFNAQLLMGIGLCAVGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLSLALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYVWALNAVFGILLILLGNYLMFSKLEIGKKLFNSQKNCEKQA >NZ_CP035109.1|WP_000331400.1|2856478_2857333_+|AraC-family-transcriptional-regulator MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >NZ_CP035109.1|WP_001983845.1|2857329_2857725_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPPHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDT >NZ_CP035109.1|WP_002113669.1|2857820_2858429_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MELLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEIAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVVIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAEALDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQAALDNAAAQIAQLAG >NZ_CP035109.1|WP_005076109.1|2858512_2859862_-|chromate-efflux-transporter MENEKSPLPESIIQVTFWQAFLFWLKLGFISFGGPAGQIAVMHQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTAGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVIAGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWFVAIAAFLAIFVLKLPFPLIVLSAGIAGYLTSKKYPELFSSAAGHKSSQKDYGSAFIDDDTPPPEHAKFHWPRLAKLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGFEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAAFITVGAFIALFRFNVNVLYVIFASALVGLAVTFFS >NZ_CP035109.1|WP_005076108.1|2860045_2861332_-|MFS-transporter MTYTQEEKRSRIRGIVGAASGNLVEWFDFYIYAVFAAYFTQALTAPDMDSTTKSIYVWGVFAASFFMRPIGSWVFGRIADRHGRKKSMVISICLMALSSFLFAALPTYDQVGLFAPFLLLVVRLLQGLSVGGEYGAVATYMSELGLKGQRGFYSSFQYVTLSGGQLLASLLGVILLAFLSEQQLHDGGWRIPFVIGGIAAIFSLLARSRLEETLSHQDSERKESGSLRELFKKHWKTFLLVVGYTSAGSLTFYVETVYSKTYLTNLGMDGKTVGYIMTFALFVYMCAQPVFGAISDRIGRRSSMLAFSLLSAIFIYPVMVIGMRAYIDSPIIIALLLIFMMMLLSFYTSISGLVKAEMFPPHVRALGVGFSYAVGNALFGGSAPSVALQFKAAGIENTFFIYVIVMLIICFLCSLALPKKPDYLEHDH >NZ_CP035109.1|WP_086376667.1|2861848_2864053_+|TonB-dependent-siderophore-receptor MHGMAGSYSMERRSLNLHFMTCSKTALASSIALITSVVYANEAEVSQLPTITVNATQNNDALYTSKKVNLSGFQTSDVKKVPASITTITSERIADQHAKTLTDVIKNDSSLGDGYAAIGYYPNFVARGFALDLGSSYLINSHTIRGEQNVALENKEQVEILKGISAIQSGMSTPGGVVNYVTKRPADVKNITVDANSEGGYTLATDVGGFVNDSFGYRINLAHESIHPNVDHANGKREFGSVALDWKINDRSKLLFDIEAQHQSQRSVPGYQLLDGQEVPTNVDQDRLLGYQSWSKPVVNNSVNASLKYKYAFNDQWNASLSASQSRVVIDDNSAFPWGCYNDNCEVTGLGNTFDKHGNYDIYDFRSPDDTRITNQFAAGLNGQFNTANIQHQIAFELQRTYKTLKHHTPLNVAVGTGNIYEDTIDYSPSSESLGDRYKALESDQTAFTISDRVQFNDQWSTLLGGKLIHLDEQTYNSDGQQSRNTDLNKFLPQLALMYSPTAGTNLYASYAKGLSDGGEAPWFANNALEVLSPKNSEQYEVGVKQQIRNFLVTAAIFDLKQDNQYSKVNADGTFDFIEQGEQHNQGIELGLTGALTDTVDVSSGITYTKSRLVDIDSDSYKGHQTQNVPKVRATAQLSYKVPSVEGLRLLSGMQYSSSKYANKEGTAKVGGYSVFNIGAAYKTNFAGHDTTFRFNIDNLFNKKYWRDVGVFMGDDYLFLGNPRTAQFSTTFSF >NZ_CP035109.1|WP_014206691.1|2864108_2865527_-|aspartate-ammonia-lyase MMNAEITTRIEKDLIGYREINNNDYYGVQTLRALENFNLTQSKVGNFPHLIKALAMVKLACAEANYNLKSLDQTKFEAIEYSCNQLIRGNFHDQFPIDMMQGGAGTSTNMNANEVLANVALEYMGHAKGQYQYLHPNNDINMSQSTNDVYPTAIRLGLLLSLDELNLPFNNLILSFRNKSQEFAHILKMGRTQLQDAVPMTLGQEFGAFAVTLQKDLEQINTLIPNVLAYMNLGGTAIGTGITTEYSYRELAIQALAKISGKKIKSAPDLIEATSDMGDFVLLSGLLKRTATKLSKIANDLRLLSSGPRTGINEINLEARQPGSSIMPGKVNPVIPEAMNLACFQIIANDLAVTLAAEAGQLQLNAMEPLIAFKLFESMDLLGKAMAMFQTKCIDTITANPEHCKALVENSIGIVTALNPYLGYETTTRIAKTANETGQSVLALVQNEGLLSAQVLDDILSINNMVKPKMSA >NZ_CP035109.1|WP_086376669.1|2865931_2866114_+|hypothetical-protein MLKVTAALIILGSFTYYVLYHGEEKSESKTSRLLKEAEQSIASAETSVNKANSIVPISYK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP012711 | Psychrobacter urativorans strain R310.10B plasmid 5, complete sequence | 43400-43435 | 3 | 0.917 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024448 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-5, complete sequence | 20098-20133 | 4 | 0.889 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024446 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence | 63667-63702 | 5 | 0.861 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024445 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-2, complete sequence | 29619-29654 | 6 | 0.833 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024186 | Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence | 95169-95204 | 6 | 0.833 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024186 | Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence | 29226-29261 | 6 | 0.833 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024177 | Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence | 95137-95172 | 6 | 0.833 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024177 | Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence | 29194-29229 | 6 | 0.833 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024186 | Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence | 25313-25348 | 8 | 0.778 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024177 | Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence | 25281-25316 | 8 | 0.778 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP040258 | Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence | 46821-46856 | 8 | 0.778 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024446 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence | 38673-38708 | 9 | 0.75 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_AP017383 | Moraxella osloensis strain KMC41 plasmid pMOSL2, complete sequence | 53808-53843 | 9 | 0.75 |
NZ_CP035109_1 | 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder | 2852458-2852493 | 36 | NZ_CP024183 | Moraxella osloensis strain KSH plasmid p3, complete sequence | 11703-11738 | 9 | 0.75 |
1. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012711 (Psychrobacter urativorans strain R310.10B plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagcccaagacgagagctgtgctcgagtggga Protospacer .******* *************************.*
2. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024448 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-5, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcg-agtggaa CRISPR spacer gcccgagcgcaaggcgagagctatgctcgtagtgga- Protospacer .************.********.****** ******
3. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024446 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagcgcaaggcgagagctatgctcgagtgggc Protospacer .************.********.***********.
4. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024445 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagtgcaaggcgagagctgtgctcgagtgatt Protospacer .******.*****.*******************.
5. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024186 (Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagtgcaaggcgagagctgtgctcgagtgatt Protospacer .******.*****.*******************.
6. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024186 (Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagcgcaaggcgagagctatgctcgagtaggc Protospacer .************.********.*********.*.
7. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024177 (Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagtgcaaggcgagagctgtgctcgagtgatt Protospacer .******.*****.*******************.
8. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024177 (Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gcccgagcgcaaggcgagagctatgctcgagtaggc Protospacer .************.********.*********.*.
9. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024186 (Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gccccgacgcaaggcgagagctatgctcgagtgggc Protospacer .*** ..******.********.***********.
10. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024177 (Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gccccgacgcaaggcgagagctatgctcgagtgggc Protospacer .*** ..******.********.***********.
11. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040258 (Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gccccgacgcaaggcgagagctatgctcgagtgggg Protospacer .*** ..******.********.***********..
12. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024446 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gccccgacgcaaggcgagagctatgctcgagtgagc Protospacer .*** ..******.********.**********..
13. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017383 (Moraxella osloensis strain KMC41 plasmid pMOSL2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gccgcgacgcaaggcgagagctatgctcgagtgggc Protospacer .** ..******.********.***********.
14. spacer 1.1|2852458|36|NZ_CP035109|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024183 (Moraxella osloensis strain KSH plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acccgagcgcaagacgagagctgtgctcgagtggaa CRISPR spacer gccgcgacgcaaggcgagagctatgctcgagtgggc Protospacer .** ..******.********.***********.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2159563 : 2183963
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP035109|2159563:2183963|DBSCAN-SWA TATGGCGGCGCCCAATTCTTCGGCAGGCTGGTTAGAGCGTTTATTTAAGCTAAGCGACAATAAAACCACTTTCCGAACTGAAGTTCTTGCTGGTGTAACTACATTCCTAACGATGTGTTACATCATTATTGTCAATCCACTCATTTTATCTGAAACCGGCATGGATCATGGTGCCGTATTCGTTGCGACCTGTTTGGCAGCAGCAATCGGATGTTTAGTAATGGGGATCATTGCTAATTATCCAATTGCACTGGCCCCTGGTATGGGTTTAAACGCTTACTTTACCTACTCGGTTTGTATGGGGATGGGCGTGCCATGGCAAACAGCTTTAGCCGCTGTTTTTGTTTCAGGCCTTGTCTTTCTTGCAATTAGCTTCTTTAAAATTCGTGAAGCGATTGTTAATGCGATTCCAATGTCACTTAAGTTTGCAATCGGTGGTGGTATTGGTTTGTTCCTAGCACTGATTGCACTAAAAAATGCTGGAATCATTGTTGATAACCAAGCGACCTTAGTCGGTTTGGGCGATATTAAACAGCCTACAGTATTATTAGCGCTATTCGGATTTTTAATGATTGTGGTTTTACACCAATTAAAAGTTCGTGGTGCAATCATTATTAGTATTTTAGTGGTTACGGCCATCGCTACTGCTTTAGGTTTAAATGAATTTAAGGGTGTAGTGGGTCAAATTCCTTCAATTGCACCAACATTAATGCAAATGGACTTTGAAGGTCTATTTACAGCAAGTATGGTCGGCGTCATTTTCGTATTCTTTATTGTCGACTTGTTTGACAGTACAGGTACTTTGGTTGGTGTTTCACACCGTGCAGGTCTTTTACAAGACGGTAAATTACCTCGTTTGAAGAAAGCATTATTTGCAGACTCTACTGCCATCGTTGCAGGTGCCGCATTAGGTACATCTTCAACTACACCATATATCGAATCAGCTTCAGGTGTAGCAGCAGGCGGACGTACTGGTTTAACTGCTGTTGTAGTTGCAGTCTTATTTATCTGCTGTTTATTTTTAGCACCTCTTGCTCAATCTGTACCAGGTTTTGCAACGGCGCCAGCTTTATTGTTCATTGGTGTGTTGATGATCCAAGGGATCACTCACATTGATTGGGATGATATTACTGAAGCTGTTCCAGCATTTTTAACCATTGTATTTATGCCATTCACCTATTCAATTGCTGATGGTATTGCAATGGGCTTTATTAGCTATGCATTAGTTAAATTATTCACGGGTAAGGCAAAAACAGTACCGTACATGGTATGGATTATTGCTGCACTTTGGGTATTTAAATTTATCGCGTTTGGCGGTTAATATGATTTTTTATAATTTTCTTCTTGAGCTATCTTAGAGATAGTTTTCAATAAGAAGAAAATTATAAAAGGGTGTGATTTTGACCACACCCTTTTTTCTTTAGACGTGGAGTTAATATGAATCAAGTCGAGCTGATTCGCGCCTTACCAAAAGCCGAATTGCATGTACATATTGAAGGGACTTTCGAACCTGAATTAATGTTTGCAATTGCCCAGCGCAATCAGATTCAGATTCCTTACAAATCTGTTGAAGAAGTAAAGCAAGCTTATAACTTTCATAATCTTCAATCATTCTTAGATATTTACTATGCTGGTGCAAATGTTCTTATCCATGAACAAGACTTTTATGATTTAGCATGGGCTTATTTTGAGAAATGTGCCGAAGATCATGTTGTTCACACAGAAATGTTCTTTGATCCGCAAACCCACACAGACCGTGGTGTTGCGTTCTCAACTGTGATTAATGGTTTAAAGCGTGCGTGTGCAGATGCCAAAGCTAAGTTTGGTATCAGCTCTCAATTGATTATGTGTTTCTTACGTCATTTGAGTGAAGAAGCTGCTTTTGAAACACTTGAACAGGCTTTGCCATTTAAACAAGATATTATTGCAGTCGGCCTTGATTCAAGTGAAGTAGGGCATCCACCAGCTAAATTTGAACGTGTGTTTGCTAAGGCGCGTGAAGAAGGCTTTTTAATCGTGGCTCATGCTGGTGAAGAAGGTCCACCTGAATATGTATGGGAAGCTTTAGATCTACTTAAAGTGAATCGTATTGATCATGGTGTGCGTTCTGAAGAGGATGAACAATTAATGACGCGTTTAATTAATGAAAAAATGCCATTAACGGTTTGTCCTTTAAGTAATTTAAAGCTATGTGTTGTTAAGGATATGAAAGATCACAATATCCGCCGTCTTTTACAAAAAGGCGTACATGTGACAGTTAACTCAGATGATCCTTCATATTTCGGTGGATATATGAATGATAATTTCTTTGCCATCCAGCAAGCATTAGACTTAAACAATGATGAGTTGAAACAACTCGCAATTAATTCTTTTGAGGCTTCTTTCATTTCAGATGAAGAGAAACAAAAGTGGATTGCAGAAATCCAAAAAATCTAAATAAAAAACCGCCTGTGATAGGCGGTTTTTTTATACATCAGGTTTATTTAGGCTGTTTAGTCATACTATTTAAAATATTGTCTTTATCAATAAAGTGATGTTTCAAAGCTGCAAGTACATGCCCAACAATGAGAAAACCGGCAAACCAAGAAATATAAATATGTAATGGTTTAACAACAGCTAAAAGCTCTGGGTTATCTTGCACTAAACGCGGAATTTCAAATAAATATAAAACAGGGGCAGGGTGACCAGCACTCCAACTAAACAAGCAACCAGTGACAGGTAAAGCCACTAAAATTACATAAAGGAATAGATGACCCACGTGTGCCAGAGTTTTCATCATCGGTGACATGGTGTCAGGTAGTTTTGGAGCTGGATGTGTATAGCGCCATAAAATCCGGATAATGACTAAAAAGATAATGGTGGTTGCAATGTTCTTGTGCAACGTAATCACATCACCTTTAAAGCTGCCATCAACGTCATAGCTTAAAAAATTTCCACTATAAAAGCCAATAACCCATGCGACGATGAAAATAATTGCCATCACCCAATGCAGAATTTGTGCGGTACGGGTGTAATACTGAGAGGAAGCAGCAGGCATAAAAGACCCTTTTTTTGTCGTTTTGATTTGTGATTTTAGGGGAAAGCACAGATTTTAAGAAATGTTTTAAATGTGACAGAGCGTGCTAAAAACAGAACGTTTTACCCCAAAAAAAGTATTTGATGAGCTGAATTTCACTCGGCAAAATAGTTTGCATAAATGCATCAAATTATTTGTTTCTTCTAAAGTTGAGTTTAGGCACAATACGCGCTGCCAACGTTCAATCAAAGGAAAAAATGATGAAAAAATTGATGCTCGCTCTAGCACCAGTTGTTTTAGCTTTAACAGCATGTGCAACAACTACAGGCACTGGTACAGGTGCTGCTTCTGCACAAACCACAACTCAACAATTAGGCGTTGCTGCGTTAAAGGTTGCTGTAAATGCGAAATGTATTACAGAGATTAATAATGTTGCAGCTTGGAAAACAGCAACAAAATATATGACTGCTGAGCAACGTGATAGCATCCAAACGAATGTGTGTGGTTGTGTGAGCGAAAAGGCTCCAAACAGTGTGACAGCAGTAGAATTAGCTGCAGCTGCACTTGATGTAAATACACGTGCTACAATCGTAAACCAAGTGGTTTCTAAAACTGTAAATGCTTGTGTGGCAGAAGCTTTACAAAAGTAATTAATAAATTATGTGTTAAAGAAGGCTGATTACTATTGATCAGCCTCTTTTGTTTAAAGGTAGTGAGTTGATGTTTATTGCTGGTGTAGATGAGGCAGGACGGGGGCCTTTAGTAGGTTCGGTTGTGGCAGCAGCTGTGATTTTAGATCCGAATAATCCAATTTTAGGATTAAATGATTCTAAAAAATTAACTGAAAAGAAACGTGAAAAGTTGTTTATTGAAATACAAGAAAAAGCCTTAGCTTGGTCAATTGCTGAAGCAACTCATGCTGAAATTGATGAGCTAAATATTTTACAGGCGACTTTTTTGGCTATGCAACGCGCTGTTGATGGCTTGAAAACTCAACCTCAAAAAGTGATCGTTGATGGTAATCAAATTCCGAAAGGAATTATTATTCCTTGTGAAGCCATTGTTGGTGGAGATGCAAGCCATGCTGAAATTAGTGCAGCAAGTATCTTGGCAAAAGTGACACGAGATCGACAGATGGCAGAATTAGATCAGCAATATCCGTTATTTGGTTTTGCCAAACATAAAGGATATCCAACCAAAGCACATTTTGAAGCGATTGCCGTGCATGGCGTGATTGATCAGCATCGTCGTAGTTATGCACCTGTTAAACGTGCTTTAGGTCTATAAATACAACCACTTAAAAAATTTAAAGCGACTATAAAGTCGCTTTAATTAGGGAGAGAACAACTTCATACTAACGATTGAAGTTTTTCTGTGCATAATTATCATCTTCATAAGAAACTTGATAATCTTGATCAAGATGTTGAAGGTGTTCATGCATTGCACGTTCATGTTGAATACGTTGATAAATTTCTTCGCGATGAACAGAAACCTCTTTTGGTGCATTCACACCAATACGAACCTGGTTTCCTTTGACGCCAAGCACAGTAACACTGACTTGATCCCCAATCATTAATGTTTCCCCGACACGGCGGGTCAGAATCAGCATGTTTATCTCCTTGCTAAACGCTTAAAACTGCAATATTGGTACCCAAATAAAAAGCTCAACCTCAGTTTTCAGTCAGATTCTAACAGAAATATGAGAACAAAGTCATATTTTGATAATCTCTGCCAAAAAACTTTCCGTTTAATATAACAGAGCCGCTATAAAAAAAACTATAGCGGCTCTGTGTTTTCTTTGATTATTGTCGGACAAGTAAACATTTTTTAATGAATTCTTGACCGGTTGGTAAAATTAAGCGCGAGCGCTGCTTTCACCATGTTCACGATCCAAACCAAAAGCGGTATGTAAGCAGCGAACAGCAAGTTCAAGGTATTTCTCGTCGATAATCACAGAAACTTTAATTTCAGAAGTTGAAATCAT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37 | Acinetobacter_phage(70.0%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
2280837 : 2289161
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP035109|2280837:2289161|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP035109|2280837:2289161|2287772_2288705_+|WP_086376894.1|DBSCAN-SWA MTKNERQFKSGEFQFSFLSFKYWGIWFLAFILMLFAMLPWAIQWRLADLLSKIAWKSLSSRRKTTLRNLQACFPEKTPLQIEAKAKQVFVDTLTGVFEALNAWYCPNWFKSRVHIDGLENLTNNQENGVLLLGTHSTLLDAGGAACTLFFNMDVVYRPQNNPFLDFLIHRSRARVYKNQIARDNMRGLIQNLKHGHAIWYSPDQDFGLKQGVMASFFGIQAATVTAHRRLMDISKAAAVPLYFYRSGDIRNPQYHVLVEPKLENFPSGCEVSEAERVNKIIENQIRIAPTQYMWFHRRFKTRPAGEQKFY >NZ_CP035109|2280837:2289161|2282610_2282844_+|WP_005070233.1|DBSCAN-SWA MIVNIVNEWHIATAVNGNEINVRIVPHVRKQNSLDGYRWVEVGKKIQLQSGEEIELNQDGKSFYTGFNQLYRLNTYC >NZ_CP035109|2280837:2289161|2288945_2289161_+|WP_005070223.1|DBSCAN-SWA MSTSTGTVKWFNETKGFGFIAADEGKDIFAHFTDIQTQGFKVLLEGQRVEFTVVQGKKGPQASNIVILQNS >NZ_CP035109|2280837:2289161|2280837_2282103_-|WP_086376890.1|DBSCAN-SWA MSEPQFSLSEYLGTVQEVIRVAFDEPVWVKAEIRNLNIKGGHYYLELAEKDAETDKVIASCKATIWKFSASKIVLKFERETGIEISSDLNVLIRIRARFDPQYGFSVNIEEIDSSFTLGEIAKRYQQIIERLTQEGLIHKNKLLPTPFDIQNVLVIAPQNAAGLGDFKKDADALERNGVCHFVYHTATFQGNTAATSLIESLGSGLRQWASTFNFPPDLIVIIRGGGSVNDLAYLNDYELAALLCKRSVPIWVGIGHEKDRTILDEIAHRSFDTPSKVIAGIRNHIVERVQEAVDSLQTIKLLSQHQITTYQSKNDQLLHHIKSSAQSQLSSAHRLLDQMKERIQFSSQQQVKFSLAQIESLMKEILLQNPKQVQAKGYAIVRSEGKAIRSIHQISSPAIAIEMQDGVLEANITQVIPNEE >NZ_CP035109|2280837:2289161|2284341_2284596_+|WP_002119927.1|DBSCAN-SWA MTTAMQNRAKQLKNAKRGGYIPTIAKDVNKYKVQKIKRALEEAKQIVNELEDDAFEFDDQVSMQKAIGAITVIELIEQALNGAH >NZ_CP035109|2280837:2289161|2282996_2283668_-|WP_002119885.1|DBSCAN-SWA MALKDRLKDSRIKAKKTQAEVAEAVKMSQPAYQALESGKNLKSAFLPLIAQFLGVDGYWLTTGNTEDSFRESDVFSPTVVSAESTDQYVWIEVVEANFSCGTGESIEFHFDAINGKIPFPASFFKEKRVAQECMRIIKAKGDSMTDYIKDGDLVGIDISQTEVIDGEIYAVYFAGEGMIKQIFKEADGSLILHSLNEKFRDRRVTEENGKNFKVMGRQFWRAG >NZ_CP035109|2280837:2289161|2286096_2287029_+|WP_005064486.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKPTHKIYRTTNWPAYNRALINRGNIALWFDPATQWYAPSKGKQGRNQTYSDAAIQCCLMIKSLFRLSLRMVTGFVQSLIKLCGLNWTAPDYSTLCRRQKHIDIAISYQKSSDGLHLLVDSTGMKFLGEGEWKRKKHGAEYRRQWRKLHIGIDAKTLQIRAIQLTTNNVCDSQVLGDLLNQIPQDEQIDSVYTDGAYDTKQCRQVIADRQAHAVIPPRKNAKPWKDTKSSSLERNELLRTIKRLGRTLWKKWSGYHRRSLVETKMHCIKLLGDKLSARSFDSQVNEVHARVAVLNRFTELGRPLTQVTP >NZ_CP035109|2280837:2289161|2285225_2285771_+|WP_086376892.1|DBSCAN-SWA MNIDEYLEKVISREGGYVNHPSDHGHATKFGITEAVARSNGYQGNMQDLPLSVAKSIYKQKYWLEPQFDQINAISPAIAEELLDTAINCGVNFTKPLLQRALNLLNKQGKEGWPNLVVDGQYGPLTLQALATYLNRRRKEGEKVFVRILNIMQGQHYIEITENNPNYEDFFYGWILNRVTL >NZ_CP035109|2280837:2289161|2284805_2285195_+|WP_161511823.1|DBSCAN-SWA METVSSSGLATFLNFYSIAIMVALAVSLVVAVVLMMRFPRSPQEWIVALICTVVSSLTGGSFIIMKWNLHEWVSDIWGMITLSGFFFICGLPGWAIVRWIFNFINNQEGKTIVEVIKDLKKAKDDLQNS |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2499924 : 2531406
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP035109|2499924:2531406|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP035109|2499924:2531406|2501827_2502277_-|WP_161511845.1|DBSCAN-SWA MDNKNEYVVELVNHLKFWFDEKVNTLSGAANSDAKTISFAANGGDEFANIEGRDKDMFLLGMQAALHGFGAFPIEMTASDGSSLLATNDSNRLEFLISNRIRVEKWNVGPNTEKYFVYNDEDELVSQEFTGRDAIDLAIQKYGSTEEEE >NZ_CP035109|2499924:2531406|2521545_2524566_+|WP_161511869.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP035109|2499924:2531406|2525904_2526246_+|WP_161511872.1|DBSCAN-SWA MDQIQVEGTLPVALKKLVGQTDIKSRKVVMRQMTAIEYLQAQASIEVGQFIGIADLAAMTKLIDAEGNEHDISYDMLGHSSRANLNYLTDLRATLDAKEAAESSLPEQESSED >NZ_CP035109|2499924:2531406|2521188_2521536_+|WP_161511868.1|tail|DBSCAN-SWA MPIPAGIKTPGVYTDVNINTLRTGLPANEQKVLFVTLDVLSGQFTPVDVYDTAGADAKFGANSQAGRMIKAAVKTYRLVNAQAVALSVEGVQTQAAIQTEGGVALQTEGGALIEP >NZ_CP035109|2499924:2531406|2504130_2504349_-|WP_161511851.1|DBSCAN-SWA MADFADVASTLSEQDLDHALANIKHFDQVSNFECEDCGEEIPAQRRQLGGVTRCVGCQTELEAKQKHFRGGL >NZ_CP035109|2499924:2531406|2520147_2520582_+|WP_044424584.1|DBSCAN-SWA MSYATADAMIKKFGEHELIQLTDNEESEYLDAINYDKLNAALQEANSEIDGYLMGRYKLPLQTVPPFLESLACHIARYHACTGAMTDDDPIRTRYIDAINKLKDISKGIVGVGGTPAGESEPVKTSSNNVMFQVGRHDFGGKGW >NZ_CP035109|2499924:2531406|2500574_2500799_-|WP_032007202.1|DBSCAN-SWA MNELLNWATALAYFAVFLMGLGSCFKEAKLAWTTKNNTGLTVFEKRSYKFKAGASITLAFLAIIGLFQAFQGVV >NZ_CP035109|2499924:2531406|2503242_2503914_-|WP_161511849.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP035109|2499924:2531406|2499924_2500374_-|WP_161511842.1|DBSCAN-SWA MKFNKKGNLIKLIHVGKTRLGLEDDVYRDILTSTTGKTSSKDLNLAQLQAVLDRFKQLGFEVESKNKSDVKNLANDAQSKLIRHLWLQLHAAGQVRNGSELALAKFVENKVGVSALQFLSSHHADMIINHLRQWCKRCGIERIHPPVEA >NZ_CP035109|2499924:2531406|2501648_2501828_-|WP_153567463.1|DBSCAN-SWA MATKVNHLDALEKKGLRVVRKFNLCGYFEYHVLDSNNQRIARDTVQQRAIDMALNTLVA >NZ_CP035109|2499924:2531406|2511590_2511902_+|WP_017398468.1|DBSCAN-SWA MSFDLQKIRREGMRWHLLNALDKARPLGALDTLLLDVMRALYADTTPQELHVQLDYLEERKLVEIKKQPDGHWHAKLDRLGIDIVEYTIDCQAGIARPDKYWN >NZ_CP035109|2499924:2531406|2525513_2525894_+|WP_161511871.1|DBSCAN-SWA MAEKAVGFIILSVNGQEYDCATLNPTKNTGKRPIPTMNRTGEVKYTAAGIKTYAVSVAVVVPDSKDTVDWLAIDDARLSIESETGKFRETYIDFNVQTISDTYDVNGETRRNLEGFALSYINETMS >NZ_CP035109|2499924:2531406|2528706_2529882_+|WP_161511874.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP035109|2499924:2531406|2500360_2500573_-|WP_161511843.1|DBSCAN-SWA MGYFIFGLIIGWLVCKSYTKNEIAEKCERLGGFYVDKKTYLCSQIIDHSQDISTPEAIVEAEKGAKNEIQ >NZ_CP035109|2499924:2531406|2529871_2530927_+|WP_024437123.1|DBSCAN-SWA MQDNQGNEIRLVIAGLEAKGWDQVEIDSQIDTPAENWSFTLFETGGLALNPAIKGGAKVQAYYSNQLILTAVADRISEAVSREGYGLQVSGRDLVGQLIDCSVPIFNGRQITLEELVGRYVLGGDLGSLFQDVRIQDNAWLKNKVSVEPGESLWDSLTKAAQITGQHVWLDPDGTLQIGDPFANPYHLQTPLRLMRPLNNSNNVLSLQYDNDVSNVFSHIKVLSQDGNANSILSETTAQTQYAYNRLKMVTLGDVETEAEANAALEKIKKDNDLEAHTLTATVSGWMIDGKLWSTGWYINLETNVLSRATAKWAVYGRTFQLDRKNGKTTKLLLKRQGDWANPLVLKEKKS >NZ_CP035109|2499924:2531406|2514247_2515834_+|WP_161511861.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP035109|2499924:2531406|2520578_2521187_+|WP_161511867.1|DBSCAN-SWA MINLGVVEQGLKDVMAKQVTDKKWLWVKEIKTYGGEFDDGLTAIIRAFPAIWVVFEGSGTPKKISFNKTQYPVKFVVLVGARSVRNEEARRQGAGRDIGTYEMLDRVQKLLIGNNLSSVGVTGLEPLELGRTKTIFNTKTREQSISVLSQEFTTQYTITASDRDREEADESIGEIHRINVNYFFEPGDDVVDASDLVELKEN >NZ_CP035109|2499924:2531406|2515833_2517084_+|WP_161511862.1|head|DBSCAN-SWA MPKAQRPELKALFELPPSDAISYLEKKGFKIGWDWHETLDNAHSRAFTVAKVARMDLLQDIRQSLISAMQQGQTLEQWKASITPTLQSKGWWGKKTVINPEGREQEVQLGSPRRLRTIYDTNMQSAFAAGRYKAMMAGSETRPYWEWRHITISNPRKQHVALDGRLFRFDDPFWSVAYPPSEWGCKCRVIARSAREVEGKEILSSDGYESEIYERVGTDRNTGADVIAKRKQFDIPTKDGKLTFAPAAGFNGSPASSYLLDDVMVRRATDLMGEAKGLQQAQQLITNHNLSKVNESFVKNALSLSKPKKQFSPVGVLQSDSVGFLSAQGQLLESKMVWMRDDVIVNKKYSDISVSVLSALPDLITKVEQKLWDKQTQTLFYLLPDDVVVELKIESGHLQVSRIFKGMPSNDFEVIQ >NZ_CP035109|2499924:2531406|2511249_2511594_+|WP_044424572.1|DBSCAN-SWA MTIELEPYQVFLVLSAVLSAVAGMIKLMGSQINKNIQQNFESTNQKIEEVSRQAAKGQEEVRELERKFLEFKADMPFRYIARDDYIRGQTIIEAKLDAVAEKLEKVQIKQGINP >NZ_CP035109|2499924:2531406|2510396_2510897_+|WP_161511858.1|DBSCAN-SWA MNKTFQTALKRVLQHEGGYVNHPSDPGGETNYGITKSVARQYGYKGSMKDIPMSTVEKIYKDQYWNAMSCDSFPFAIAFQLFDAAVNHGLLNARKLLQRAVGVKDDGIVGPLTLAEVRKTPQLTLISLFNSKRLEFYSKISTIKVFGGGWMVRVAVNLKYGVEDVA >NZ_CP035109|2499924:2531406|2518786_2519212_+|WP_161511865.1|DBSCAN-SWA MTATQNAIVTEFRDGELMPIPLKAGAVVLQGTFALVDATGYAISSSTAVAGTQKCLGVWDNSADNTGGADADRIACVRRNKQFLFANLSTDALTQADLGATVYVADNQTVAKSSNTNARPVAGKFMGFDTQYAEYVWVEIQ >NZ_CP035109|2499924:2531406|2526281_2526455_+|WP_171518913.1|DBSCAN-SWA MQLDLAAALLSDERLDNTHQRTPKNHPPQPLTPPAPASKDEGITFVAMGRKHSKPKG |
42 | Pseudomonas_phage(41.67%) | transposase,integrase,tail,head,plate | attL 2491111:2491126|attR 2507642:2507657 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3209068 : 3258380
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP035109|3209068:3258380|DBSCAN-SWA 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48 | Bacteriophage(16.67%) | holin,coat,transposase,protease,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3275875 : 3322143
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP035109|3275875:3322143|DBSCAN-SWA 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43 | Mannheimia_phage(28.57%) | tRNA,coat,tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3327991 : 3349650
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP035109|3327991:3349650|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP035109|3327991:3349650|3336097_3337735_-|WP_032025234.1|DBSCAN-SWA MNTQKPRQDTVRVIDWDELPERARNLPNNLNPFEEGVLMKHQVEWLKIKTDIKACPKGRRTGITFAESFDAVFTAAASKEAGGMSVYYIGDTKEKGLEFIGYCAKFSRVIAEAQGQIVQIEEFLFEDQNEKGETRQITAYRIRYASGFQIVALSSRPENIRGLQGKVVIDEAAFHPNVQGVMEAATALLIWGGRISVISSHNGKNNPFNQFVKDIENGVFGEDAAVHVVTFDDAVANGLYERVCFMQGKEATLEGKKKWYTKIRKAYGSRKAAMREELDAIPRDGSSVCLPTLWVERAMTEVRTVLRLQLGDDFTELTPDERDAYIDDWIQRYLEPELQKLDKTKQHCAGQDYARHRDFSFILPFYIAQDLRRIAPFVIEMHKVPSRLQQKILWYMLDRLPRFGGIAMDATGNGETIAENTAEKYGAHMVHQIKLSRAWYGLWTPKLVTAFEEDMIDLPIDADLKNDCSAIEEVDGIYMVSKARAKDIKDPELYRHGDGAVAMILGWFASLHLATAIEFTPLPSKEEMELNSDDYDDWSGSIGWF >NZ_CP035109|3327991:3349650|3334412_3335180_-|WP_032025238.1|DBSCAN-SWA MKTKPIVPWMGGKRRLVSQLIEKMPEHQCYVELFAGGAALFFMREEQSKVEVINDLNGELVNLYRVVQHHLEEFVRQFKWALVSRQMFEWLKSASVEMMTDIQRAARFYYLQHTAFGAKVSGQTFGTATTARPVNLLRIEEQLSEAHLRLSGVTVEHLSWDACLLKYDRPHSFMYADPPYWKLAGYGVGFGLDQYEKMAELMKTCKSKVMLSINDHEDMRATFDGLNIVTTKIKYSVGNSGSGRDEKQELIITNY 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MTNPNLAKQDYLREIAAKLTAAEFGGKAAIVKTACDFLSLSKPQLYRELEKVGFKSERKQRSDKGKTVVPTEVAEMVGGMVHVATRANGKKTLPMTTALEMLIADGKAPKVSAATVARVMKQNMCHPKQLATPSAHTQQKSLHPNHVWQVDASICVLFYLPKGGMQVMDEKKFYKNKPANVKKIENDRVIRYVMTDHFSGSIYVEYVYGSESSENLIEIFLNGIQKRSAQEPMHGVPNILYTDKGCANTSGLFRNLLERLDVTFIPHATGNSQAKGQVENAQNIVETQFEGRLRFMQINNIQELNAKAADWRMFWNETKIHSRTKRSRNAVWQTIKPEQLRIAPPMELCRELISTVPVEKTVKANLTVSHAIQGYGSQDYDVRHVDGVYPKAKLQIVVNPYRAPCIDVLTKDQHGNEVIFTCEPLQVDWVGFGNDAAVIGEEIKAMPQSPIDENRKRILKNAYGADTLEQVDKAIAKKKPAYEGQLNAMADVAAVEVPTYIKRAGEQVTTPKQRRESAPISAVEAAKEIRGLIGDLWTTDHYKALKKSYPDGLVPADAVREIAEAIKAEQELPQQRPQLRVVG >NZ_CP035109|3327991:3349650|3339251_3339752_-|WP_032025228.1|DBSCAN-SWA MAKTFQDALKRVLQHEGGYVNHPSDPGGETNYGITKSVASQYGYKGSMKDIPMDIVEKIYKNQYWDAMSCDSFPFSVGFQLFDAAVNHGLLNARKLLQRAVGVKDDGIVGSLTLAAVRKQPQFALISLFNSKRIEFYTKISTFNAFGKGWMARVAVNLKYAAEDMV >NZ_CP035109|3327991:3349650|3327991_3328420_-|WP_017398456.1|DBSCAN-SWA MYATAAAMIAKFGERELIQLTDNEAPYLEVINYDKLNKALQHANSQIEGYLVGRYKLPLQTVPPFLESIACDMARYHACTGAFSENDPIRTRYDDAIKTLKEIAKGTVSLGNAPAGESEPVKTSSNNVMFQVGRNDFGGRGW >NZ_CP035109|3327991:3349650|3341896_3342784_+|WP_032025218.1|DBSCAN-SWA MSNEVITEVDLIQQHTQSVAGLATQLGYDGALTVGALEDEIRFYQMRTVEACMELGKRLLILKEMTAHGEFEKRIEILGLSPRMARKFMSAVLKFANRNSNSVLQAAKTQTKLLELVVLDDDDLDFIEQGGSIGAVSLDSIDTMSTRELKQALRDAKADKDAADLLLKKKDEKLNELDAKITKLQSPVQIKKRAESEEQLIAAKALEEANTACLTMHNDTVRFKNTVNSVLDTINEHGLYNIQEQLEALVISAFQQIAQTSVELGIQIDFETMVNPAWLPADQDAAAFDATNVEQ >NZ_CP035109|3327991:3349650|3330897_3331374_-|WP_032025242.1|DBSCAN-SWA MTIELGNRELRTRLTRVAEGMLDTSPLGHSIANSFLTVTEDNFDSEGRPAWAGLSLVTLALRKSGKMLFQSGQLRRSITTRVSDNEVEIGTNDPKAPTMHFGAKQGQYGKSSRNGPLPWGNIPARPFLPMDENGNLQHEAELAIFDDVDHYWHQLFNF >NZ_CP035109|3327991:3349650|3338907_3339255_-|WP_032025230.1|DBSCAN-SWA MSQWKRNYRRQLAKSQNGLVNPNKPVDSQYIQGVAVKLKKRWIVENWRSGWLWLSNWFIALIAYVQFYGVPPELIQLLPIATQQRVTTALAVLAFIGRFIDQNRAKPLPPVDEDN >NZ_CP035109|3327991:3349650|3338605_3338908_-|WP_001166711.1|DBSCAN-SWA MQINPATVLALVSFLCNFGLGVYIFVSNRQAAKDKELQETKERLTQVEERIRNMPDHQVIYQMSGDMKALKESVAGLKELISPLAKAVDRVNDYLLHNKD >NZ_CP035109|3327991:3349650|3329328_3329739_-|WP_032025245.1|DBSCAN-SWA MGSILTQEERQTERREVGLIHVPVKAGASVVAGFIAVVDATGYAVTATAATGLTYLGRYEDSVDNTDGGNGDVYVLVRTHDAFLFANSATDPVTQASFGKPCYIENSETVAETDAGGTLSVAGRVVGVDENGVWIE >NZ_CP035109|3327991:3349650|3328423_3329332_-|WP_032025247.1|head|DBSCAN-SWA MNVNGANLNAIFLNLSKVFNQTFNEVEVEYPAIAMVVPSNGAYVDYRWLANFPQMKEWIGKKHITKLAEYDYVIRNKDYAATIEVRRNDIEDDQMGIYKPQAESAAWSAKQHPDELVFEAVNKAFTAECYDGQPMISGSHKVGKLTFSNKGTKKLSIASLAAAQASYGVARTTLMKFKDESGRPLNVKPNILLVPPAQEDVANALMTVDRLEDGKPNPYKGTAKVQVSTRLTDDDAWFLLDNTKPVKPFVYQVRKKPVFVSQTNMESPSVFMEGVFFFGAEARGAAGYGFWQTIYGSTGKEA >NZ_CP035109|3327991:3349650|3335362_3336049_+|WP_032025236.1|DBSCAN-SWA MQNQSPLKRPFFKTWVFWAIFIYLLIIFFYTVNFYLSDGENKPLPSNEFGDFLAGVFAPLAFFFILLGYKQQSVEIQNNTQERLEQKRQSLLLSQPFFHFKSFSGFIINSDDSFFFNLSLSLSNSRAICRQLFLLLSFEDSLVGQIPAGDTSFGFINNNFEDQRDFYLITESTHLNFENEYAVVYLLINYTDLNDLTQMQSLKLLFKNDKDGSYSFSHYIVDKNSYQH >NZ_CP035109|3327991:3349650|3344547_3345825_+|WP_032025214.1|DBSCAN-SWA MKQQDCSTKLKDLILDNGIIQADLARYVQLSPSSINIIINCLRWPKKNTDFVKARFREFLVNAKISESEIDNAFNEMFDAPPQKTLLERLGSEAASERELDHVYRALVARHGNKQINELLNEDEQAMLLAKQSLTPQAKKLFGLFDNPFTNEVRSVEELFLNSDINYVRQALYQTAKHGGFIAISGESGSGKSTLRRDLLDRIRREKLPILIIEPYVIATEDNDIKGKTLKSSHIAEAIINTVSAGQEKPRMSAEARFRQVHTILKNSSEAGYSHLLVIEEGHSTPIATLKQLKRFFELEDGYKKLIGIVLIGQPELANKLSERNPAVREVVQRCEMVTLEPLTNTSLVEYLQHRVKSIDKKLESIITEDGIQAIVDRLTHINSAGKTTRSLLYPLAIGNLITSSMNLAAEIGEDVITRDIVMGV >NZ_CP035109|3327991:3349650|3337734_3338301_-|WP_161511922.1|DBSCAN-SWA MSKSFMHKLSDEQRTFVEKLLREDRLTLNEMLDEIRAEFPADSIPSRSALGREKKNWAEEAKAMREIAAASEVLVKEFGEDPDDKGGILLAQAVQAIVTKKALDELTNTGDDPEKPKMDIDAVGALARAGRAAMMTKEKAMDNRDEVRRQAREELLKEQDENLKKAAASQGMGDEQIQFWREKVLGIK >NZ_CP035109|3327991:3349650|3349212_3349650_+|WP_032025202.1|DBSCAN-SWA MKFNKKANLIKLIHVGKTKLGLDDELYRDILTSTTGKTSSKDLNIAQLEAVLDRLKKLGFEVESKNKSGVKNLASDDQSKLIRHLWLQLHGAGQVRNSSEKALAKFVEKRVGVSALQFMSSHHADMIITHLRQWCKRCGIERTEQ >NZ_CP035109|3327991:3349650|3341587_3341884_+|WP_032025220.1|DBSCAN-SWA MTSPNKSAAKVLTVLFALRGHYIAGVSNKQLSESLNETPVFITRALQTLEANGWAEKRDNGNYAPSMKAVRFGMACKEECERVQARIDEYKQRLNTQF >NZ_CP035109|3327991:3349650|3348276_3348990_+|WP_161511923.1|DBSCAN-SWA MSMTREEAILKIKKCLALAKSANENEAAIALRQAQSLMREFQIDPDLLDIVEASCESKATKVPQAWEASLVMTIARAMQCKPIFSSGSSTWGIKASWTFIGVDPAPEVASYTFDVLYRQVIRSRKSFIENTLKRVTVKKNKVRRADLFCEGWVDSVKHLITDLDIEVPKNTNERIKKHMDKTRGKLGSFTPKDRNKGKAFNDRAANDYHAGKQSGKSAKLNQAMNGGKQYEKLGAPT >NZ_CP035109|3327991:3349650|3338309_3338603_-|WP_000006500.1|DBSCAN-SWA MSFANHLKEDMRLVVLRLLHELPQYRSNSSVLVAGLDRYGHSFSRDQVKTELHWLADQGLVVLEDDLGSVLVVKLTERGMDVATGRISTHGVKRPSA >NZ_CP035109|3327991:3349650|3348986_3349211_+|WP_001004234.1|DBSCAN-SWA MNELLNWATVLAYFAVFLMGLGSCFKEAKLAWTTRNKTGLTIFEKRSYKFKAGASITLAFLAIIGLFQAFQGTV >NZ_CP035109|3327991:3349650|3329741_3330818_-|WP_032005480.1|DBSCAN-SWA MTDSILVAQCSFDLTVPSDQAEYLVLVPEGVFQGRDGRPTDAPHWVLTPERGREIVAALNQHKVDMVIDYEHATLKSQSTGEPAPAAGWLKSANFRYIDGVGICSTKFEWLDKAKAFIESGEYKYLSPVFFYNKQGEILALINVALTNNPALDQLPEAKLAAAAQQFFAQNNDEDSTMNEFLKLMLKKLGLAETASEQEVLAAANSVFTKLDGAFGTSTANDQTLLAAIDKAIEVKAAANSQAVVDPSKFVPIAVYQEAVAKAVTAEAAQNTKEIDDLILAACSDGRLTGDVTIKYYKELAKTNPDVAKAQIEGLPIIAALTQKQTTTHQHNQPNQQQVSAETLAVGNLMGIDWNEAK >NZ_CP035109|3327991:3349650|3345919_3346138_+|WP_017398481.1|DBSCAN-SWA MADFADVASTLSEQDLDHALANIKHFDQVSNYECDDCGAEIPERRRALGNVKLCIDCQTAVESKSKHFRGGL >NZ_CP035109|3327991:3349650|3341169_3341382_+|WP_032025222.1|DBSCAN-SWA MTSNSEALTPEQVKQNLRAQGKTLKQVALENNLEPSDVYKVMNGSRKGLYGKGHEIAVLLGLKAKPETVS >NZ_CP035109|3327991:3349650|3331370_3332630_-|WP_032025240.1|capsid|DBSCAN-SWA MPTAQRPELNALFTLPPEDAISYLEKKGFKIGWDWHETLDNAHSKAFTVAKVARMDLLQDIRQSLITAMQQGQSLEQWKASITPTLQDKGWWGKKIVVNPEGREQEVQLGSPRRLRTIYETNMQSAFAAGRYKAMLAGAETRPYWEWRHISISNPRKQHVALNGKIFSYDDPFWSVAYPPSEWGCKCRIIARSRREVEGKEILTGKGHARTINEKVGTDRNTGMNVVAKRTQFNIPTKDGTLTFAPAAGFNGSPATSYLLDNVMAQRTTDLMGSYKGLKQTQELLNTPTRAKIHEKFIQNALRLAEPRNETSTIGSLQDVAVKSLFSRGVPLDSPILFLSDAIVVNKEFSGIAVSRLMALPQLIAEAKQVFWDPKNELLFYVLEKDVVQFSMSGTTGTFGVSKIVRKKDWQSEGLELIQ >NZ_CP035109|3327991:3349650|3341442_3341604_+|WP_167468860.1|DBSCAN-SWA MNDHIPLISKLIFALSIFAFVGWYFAEQDNEILRQELISLKYNMTGDHYDITK >NZ_CP035109|3327991:3349650|3339841_3340408_-|WP_032025226.1|DBSCAN-SWA MNKLITIVGFLLLAGCSTQKQPESEAPYVKQNYSESDPAAKLSVSQFANVVKSIYPAYQISHSNDGGEVKFLPNDVKADTKFVPNNNWYSIKIIKDPNTENWKGLVVEVFNKESYEQSKTVAFKDCQKILGNIDNRVPTVINELEDRINKTETESSKNLSSVHRYGYTVYYDASHYNEGYPVSCMVGI >NZ_CP035109|3327991:3349650|3340409_3341069_-|WP_032025224.1|DBSCAN-SWA MHNFVSDRFKSERKRLNLSQEGLGNLIEVSESTVKRWENGASIPSDKLILCAQHGFDITYVLLGDKNVEETSKSDDLFCGEFALVNVYDVAVSAGDGAVCFGAAEPVSRLAFRKDWLSRHGLYAKDLAIVYAKGDSMEPTIHDKEPLLVNTLDKELTDGFIYVVRNQENFWVKRVQRQFNELLLLSDNEKYLPMKLDLNESTDIEIIGRWIPPSRGTFY >NZ_CP035109|3327991:3349650|3347685_3347958_+|WP_032025208.1|DBSCAN-SWA MNKSDLIANIAMDANLTKSQAAAALQAVEDAIGAALAEGGSVSWIGFGTFSVKERAARTGRNPKTGEELQIAAAKVPSFKAGKALKEAVK >NZ_CP035109|3327991:3349650|3346134_3346371_+|WP_017398482.1|DBSCAN-SWA MNTNQKRENFKKDLNKLVDNKHAVIPNELTWEQLQKISDDPEFFELYQEALQGDSGEDCACLIIKAIHNALLRLVGSH |
30 | Pseudomonas_phage(23.81%) | transposase,head,integrase,capsid | attL 3320584:3320599|attR 3346229:3346244 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3593623 : 3604727
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP035109|3593623:3604727|DBSCAN-SWA TATGTTCAAAGGATTTGAAATGAAGCATGAACTCGAACAATATGACAGAGCTTTTTTCGGCCATCCAAAACCATTAAAAACTTTATTTTTTACAGAGCTTTGGGAAAGATTTTCTTATTATGGTATTCGGCCTTTACTCGTTCTTTATATGATTGCAATGGTTAATGACGGTGGTTTAGGTCTTGACCGTCCAACTGCAGCCGCAATTGTTGGGTTATTCGCTGGATCTATGTATTTAATGACCGTTTTTGGTGGCTGGATTGCCGATAACTGGTTAGGTCAGGCACGATCGGTCTGGTATGGTTCTATTATTATTGCACTAGGTCATTTATCTATTGCTCTCACTACCATTTTTGATCAATTCTTTTTTTATTTCGGTTTAGTCCTTATTGTTTTAGGTACCGGATTATTTAAAACCTGTATTTCAGTGATTGTCGGAACGTTATATAAAGCTCAAGATAGTAGGCGCGATGCTGGTTTTTCCATTTTTTACATGGGGATTAATTTAGGTTCTTTTATTGCTCCTCTTCTTACAGGCTTATTAGCACGTGATCATAACTGGCACTTAGGTTTTGGAATTGGTGGCCTTGGGATGTTAGTTGCATTACTTATTTTTCGTGTATTGGCTGTTCCTCAGTTACAAACTTTTAATGAGTTACGTCAAGAAAATGACAATTGGAATAAACCTGTCGTACAAAACAAAAATGCACCAAAAATTGCTTTCTCCTTTTTACTATCTGTTGCAGGCGTTATTGCTCTTACCTTATTTGGTGTCATTCATATCAATCCGGTCGAGGTAGCAACTTATTTAACAGTTGGGATTGGTATTGGGATTATTGCTTATTTTGCATATTTACTGCTTTTCCTGAATTTAGAACAACATGATAAATTTAAAATTATTATTTGCTTTGTTTTATTAGCAGCCTCTGCCCTATTCTGGTCAGCTTTTGAACAAAAGCCCACAACTTTTACTTTATTTGCACAAGACTATACAGATCGTATGTTTTTTGGATTTGAGATTCCAACTGTATGGTTTGAATCAATTAATGCCCTATTTATTATTATTTTTGCCCCAGTTGCAGCATGGCTTTGGGCAAGACTGGGTAAATCAAATAAAGACCCAAGCTATATCAGCAAATTTATTATTGCTTTGTTATTTGCAGCAGGTGGCTTTCTTGTTATGTCTTTTGCTAGTCGTTTTGCAATTGCTGGGGGTCTAGTTTCACCATTTTGGTTAGTAGGAACTTTATTTTTACTTACCATAGGAGAACTGTGTTTAAGCCCTATTGGGCTATCAACCATGACTAAACTTGCACCTGATGTCATACGCGGTCAAATTATGGGGCTATGGTTTACTGGCACAGCTTTAGGTAATCTCATCGCTGGCTTAATTGGCGGGCACGTATCAGCAGATAATATTGACCATTTACCAAATCTCTTTATGCGATGCGTTTTGGCATTAGTCGTTGGTGCAATCGTGTTATTTTTATTAAAGAAACCTATTAATAGATTAATGAACAAAAGTACCAGTAAAGTTCAACCTGAGTTGGAAACTATATGAGCGTTTTAACTGTTCCAGAAAAACTTGAGAAACTTCGTGAACTCATGCGCAATCAGCATGTTGATGCTTTGATTGTGATGAGTGCTGATCCCCATATGTCAGAATATTTACCAGACTATTGGAAAGTAAGGCAGTGGTTAAGCGGTTTTAGTGGTTCTGTTGGTACGCTTGTGGTGACACAAAAGTTTGCAGGTCTATGGGCGGATGGTCGCTATTGGGTACAAGCAGAACAACAACTCGCTGGAACTGGCTTTCAATTACAAAAACTGACCAGTGATGAATCTTCTACACATCTCGCGTGGATTGAGAAAAATCTACCAACTGGTTCGGTCATTTCAGTAAATGGCCAAACATTATCCATTCAACAATTTAAGGCGCTCGAACATACTGCACGACTTAATCACTATAAACTTGAAACCCAGCAAGATTTAGTTGGAGAGATTTGGTTAGACCGTCCAGAACTTCCATCAGAAAAAATCCATTTGATGCCTGAAGGATTAAATGCCCTCTCTCGTAAAGAAAAAATTCAGGCAATTCGCGAGAGCTTAGCTAACAAGAATATTGCGGGTCATTTTATTTCATCTTTAGATGATATTGCTTGGGTCTTAAATGCACGTGGACAAGATGTAGAGTATAACCCTGTATTCCTTTCACATTTGTATATCAGTACTCAACAGGCTGTTTTATTCATTGATAGCAACAAAGTTGATTCAACCTCTCAACAAGCTTTCAAAGCTGATGACATTGAGATTCGTGACTACGAAGATACAGCTAAGTTTTTATCGAATATCACTGATAACTCAGTACTTTTAGATCCAGCCAAAGTCTCGATTTTTCATGAACAAGCCATCGCAAAAGATATTCAGGTTGTCTACGACATCAACCCAAGTACACTTTTTAAATCGCGTAAACATGAAAGCGAAATTGCTCATATCCGTCACGCAATGGTTAAAGATGGAGTCGCGCTTTGCCACTTTTTCCACTGGTTAGAGAAAGCCCTTCATCATGGTGAAAATATTTCAGAACTCACTATTGATGAGAAGATTACAGCTTTCCGTGCTGAGCAAAACGGATTTATAGGCCCAAGTTTTTCAACGATTGCTGGCTTTAATGCTAATGGTGCTTTACCTCACTACCGTGCAACTGAAGAGCACTATTCATTTATTGAAGGCGATGGTCTATTGCTGATTGACTCAGGTGGGCAATATGTAGATGGAACAACGGATATTACTCGTGTTGTTCCTGTAGGCACGCCAACAGGGCAACAAAAACGTGACTATACTCTGGTTTTAAAATGTCACATTGCTTTGGCAAAAACGATTTATCCAGAAGGTTTAGCTGCACAGCTACTCGATTCAATTTGTCGTAATACTTTATGGCAACATGGTTTAGATTATCGACATGGAACAGGCCACGGCGTAGGCTTTGCACTTAACGTTCATGAAGGTCCGCAAGTTCTTTCTTATTACGCACCTATTCATGCCTATAGTAAGTTGCGTGAAGGTATGATTCTTTCCAACGAGCCGGGCTTATACCATGAGGGACAATACGGTATTCGTATTGAGAATCTGGTTGCAAACAAACTTCACTCTGGGTTTGAGAAAACCTACGGCGATTTCTTAGAGTTTGAAACGCTGACGCTTTGTCCGATTCATTTAGATTGTATCGTTGTTGACATGCTTACGAATGAAGAGAAAGACTGGTTAAATGGTTATCATCAAACTGTTCAAGAAAGACTAGCCGAACATTTATCTGGCGATGTTTTAGATTGGCTGATCTATAACACACGTAAGATTTAATCTTCTTTTATGAATAAGGCAGAATAATTTTTATTTCCAATAGAAGTTTATTTTGTCTTATTTCTACTTACTATAATTTTAAAAAGCACCCATTCCCAAAGCTTTTTTCTGCAAATTTCTAACGAATGAAATAGTTAAACTGGTTACTTCTTTTTTTGCTATATTAGCCCATTAGAAAGCGGCTTTTTATTTGATCAAATAAAGGTACTTTTTAAAAAGTGAGTAACATTTTGAGTAATACTCTATTCACTTATTAAATATATATTAACTATCATGAGGTTAAGTTCATCATGCTTCTAATGATCGAAAAGAAGTATTAAACAAATCTAAAAAAATCTAGCAAAATTTATAAATCTACAAATTATTGAAAATTATCAAAAAGACAAATCTAAGCAAATCTAGACAAACTATGCAAAATCACTAATCTTGAGTATCATTTTGAGTACCGCCCTAAAAATCGTAAACGGATACTCAAGATTTCATGTTAAGCGACTCAAAAATCAGAAGTGCAAAACCAAAAGAAAAGCTTTATAGAATTGGTGATTCAGACGGGTTGTGTATTGAAATTAAACCTAATGGAAAGAAGTATTGGCGCTATCGTTTCCAGTGGCTTAAGAAAACTCAAATGATGAGTTTAGGTGAGTACCCTATTATTGGCTTAGCCGAAGCACGTACAAAACGAGATGAGGCTAAATCATTAGTAGCAAGTGGTATAAATCCAGTCGAAGAAAAAGAAAACCAAAAAAAGGCTAAATCTGATGAGTATGAAAATAGAGTTCTCTTTAAACATGTTGCTGCAGAATATAAAGCTGAAAAATTAAATAATCGTTCAGAGAGATACCAGGAAGCTTTTCAACGCGCCCTAGATAAAGATATTTTAAAAGTTATTGGCGATAAGGATATTAAAGAAGTCACCTCAGCAGACGTTTTGACAATTATGAAAAAGACGATTGCACGAGTTAAGCGTCAAAAAAACCATGGTACCGGAGAAGTATCAGCAATCCAAAATCGTACTTTTATTGGTGGCGTTATGCGTTATGCGATCGCCACACTTAGAGCTGAGTATGATCCAACATATGCAGTCAAAAACGTTGTTGAGCGGCCTGAAATAGAACATGCAAGACCAATGGAAAAGCATGAGGCTGCACAACTTAGAAATAAATTAAGTAATTATGGCGGTTCTACTACAGTTCGAAATGCTGGACTTGTAATGCTCTACTCAATGCTTAGGACTATCGAGATTCGACGTATGAAATGGGATTATGTTGATTTCGAAGCTAGAACTATTACATTCCCCAAAGAGATGATGAAAAAGAAGCGCATACATATCGTCCCTATGTCTGATCAGGTCTTCAACATTCTTCAAGAGCAACGTAGTCTAGTTGGCAATCGTGAATATGTATTCCCTGCCATTTACCAAGATGGAATGCTTTCAGCTACCACAATGAATAAAATGCTTGATTATATTGGCTTATCTGATGTAACGGCACATGATTTTCGTGCTACAGCTTCCACGCTTTTAAATGAAAAAGACTACGATGATAAGTGGATTGAAAAACAATTAGCACATGCGGATGGTAACAAAACTCGTGCTACTTATAACCATGCAAAGTATTTAGAAAGCAGACGCAAAATGTTGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP035109|3593623:3604727|3604337_3604727_-|WP_161511938.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGLTALLKFYGAAIMVALAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVSDIWGMMALGGFFFISGIPGWALVRWTFNFIDKQEGKTIVEVLKEVKKARNDIENS >NZ_CP035109|3593623:3604727|3597463_3598660_+|WP_161511930.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDSKIRSAKPKEKLYRIGDSDGLCIEIKPNGKKYWRYRFQWLKKTQMMSLGEYPIIGLAEARTKRDEAKSLVASGINPVEEKENQKKAKSDEYENRVLFKHVAAEYKAEKLNNRSERYQEAFQRALDKDILKVIGDKDIKEVTSADVLTIMKKTIARVKRQKNHGTGEVSAIQNRTFIGGVMRYAIATLRAEYDPTYAVKNVVERPEIEHARPMEKHEAAQLRNKLSNYGGSTTVRNAGLVMLYSMLRTIEIRRMKWDYVDFEARTITFPKEMMKKKRIHIVPMSDQVFNILQEQRSLVGNREYVFPAIYQDGMLSATTMNKMLDYIGLSDVTAHDFRATASTLLNEKDYDDKWIEKQLAHADGNKTRATYNHAKYLESRRKMLQDWADIVDSWAS >NZ_CP035109|3593623:3604727|3601963_3602185_+|WP_114172607.1|DBSCAN-SWA MNFTRLTDEQLTQTLIPKRFVPPTPPEYEGKNMVYVFDSEDSFNLTYDELVEIISKARMTGPQMIPILGTVGD >NZ_CP035109|3593623:3604727|3602892_3603138_+|WP_161511935.1|DBSCAN-SWA MKNRFKNNTRSIVLICDTCGEDNFITLSENFYECNTCKRKYTKEELIELNQENIDVNIREVKAEITDQISKEFKKVFKKWK >NZ_CP035109|3593623:3604727|3593623_3595183_+|WP_086376784.1|DBSCAN-SWA MFKGFEMKHELEQYDRAFFGHPKPLKTLFFTELWERFSYYGIRPLLVLYMIAMVNDGGLGLDRPTAAAIVGLFAGSMYLMTVFGGWIADNWLGQARSVWYGSIIIALGHLSIALTTIFDQFFFYFGLVLIVLGTGLFKTCISVIVGTLYKAQDSRRDAGFSIFYMGINLGSFIAPLLTGLLARDHNWHLGFGIGGLGMLVALLIFRVLAVPQLQTFNELRQENDNWNKPVVQNKNAPKIAFSFLLSVAGVIALTLFGVIHINPVEVATYLTVGIGIGIIAYFAYLLLFLNLEQHDKFKIIICFVLLAASALFWSAFEQKPTTFTLFAQDYTDRMFFGFEIPTVWFESINALFIIIFAPVAAWLWARLGKSNKDPSYISKFIIALLFAAGGFLVMSFASRFAIAGGLVSPFWLVGTLFLLTIGELCLSPIGLSTMTKLAPDVIRGQIMGLWFTGTALGNLIAGLIGGHVSADNIDHLPNLFMRCVLALVVGAIVLFLLKKPINRLMNKSTSKVQPELETI >NZ_CP035109|3593623:3604727|3595179_3596982_+|WP_086376783.1|DBSCAN-SWA MSVLTVPEKLEKLRELMRNQHVDALIVMSADPHMSEYLPDYWKVRQWLSGFSGSVGTLVVTQKFAGLWADGRYWVQAEQQLAGTGFQLQKLTSDESSTHLAWIEKNLPTGSVISVNGQTLSIQQFKALEHTARLNHYKLETQQDLVGEIWLDRPELPSEKIHLMPEGLNALSRKEKIQAIRESLANKNIAGHFISSLDDIAWVLNARGQDVEYNPVFLSHLYISTQQAVLFIDSNKVDSTSQQAFKADDIEIRDYEDTAKFLSNITDNSVLLDPAKVSIFHEQAIAKDIQVVYDINPSTLFKSRKHESEIAHIRHAMVKDGVALCHFFHWLEKALHHGENISELTIDEKITAFRAEQNGFIGPSFSTIAGFNANGALPHYRATEEHYSFIEGDGLLLIDSGGQYVDGTTDITRVVPVGTPTGQQKRDYTLVLKCHIALAKTIYPEGLAAQLLDSICRNTLWQHGLDYRHGTGHGVGFALNVHEGPQVLSYYAPIHAYSKLREGMILSNEPGLYHEGQYGIRIENLVANKLHSGFEKTYGDFLEFETLTLCPIHLDCIVVDMLTNEEKDWLNGYHQTVQERLAEHLSGDVLDWLIYNTRKI >NZ_CP035109|3593623:3604727|3599371_3600007_+|WP_161511932.1|DBSCAN-SWA MCANYEPISKDRVHLLDLFEPTFDYKADVYPGYDCPLIFSKDGKIEWRQVKFGMIPPWNHDFKFSKFTYNARTETVDKKPSFRHAWAKSQFALIPVEKIYEPKYVNGKAERWGIYREDGLPFTVAAIYDSTVIDGQQVRSMSMLTINADKHPFMSQFHKPEDEKRSIIVIPEEYREDWLNCKKEDADKFFFEMPIGEFTADYFPKPKKSAN >NZ_CP035109|3593623:3604727|3600648_3601944_+|WP_161511934.1|DBSCAN-SWA MKHENKVFFLIDVNNMYVSCERVFDPSLNNKPVIVLSNNDGCAVARSNESKALNIKMGVPLFQIKDIVQKHNVVVLSSNYVMYAEMSRRFHKILASYVTDEEVEPYSIDECFVDFTAYERNFDLEKVGQQMRQQLWKWLGLPVCVGIGRSKTESKIANHIAKKNAGFNNVCDLVNMDPCNKEYYFSLIDVSEVWGVGRKHAKKLHSMGVKSVLDLACTEAREMQRQFSIVMARTINELQGISCIEIEDTPPSKKQIIKSCSFGAKVTELNDLKEAIAMHAQEACKRLRDEESLCGCLLVFVQSSPFDESAPFYNKSITGAFSEPTDSALDFVKAAVKMVSDIYKEGIKYKKCGVILTGLEPKAGHTYDLLTDFEAIEKKEQLMKTLDNVHTKFGKKKLGVGPCYIPGRTWSMSRDKLTKNPFMWDQLTIVK >NZ_CP035109|3593623:3604727|3603128_3603608_+|WP_161511936.1|DBSCAN-SWA MEIVQTILDMEKSDIIALLALIFSIIGGIFTFINSLKQNKINNQQETINKYILEREEQNHALEKKAQLHLSIINFGKDKKLRISNIGKNDARNIFIEFQENQAHVFSFSDDLFPIELKPMGKIDIVMSQYIGCPTKYNITAQWDDDFKEENKETFIIAR >NZ_CP035109|3593623:3604727|3600154_3600652_+|WP_161511933.1|DBSCAN-SWA MSEIAPSIIQIKPYLTQGAVLSEALLIKQVVPSTHMLVPYALEKISAGFPSPAQDYIDKALDMNEHLIKNETATFIVKVASLSMLNAGIDIDDELIVDRSLDAKHGDIVVALIDNDFTVKRLMIDEKGQWLKAENPDYKNIYLMDGQELIIWGVVTCIIKMIRNS >NZ_CP035109|3593623:3604727|3603716_3604295_-|WP_161511937.1|DBSCAN-SWA MKFINLQRTLGVAVDGKIGRSTLTALFKKLGANQSRAEELALAANVHFKDYSILYNELRFSHFIAQLAHESGNFRYMEEIASGAAYEGRKDLGNVMVGDGVRFKGRGPIQLTGRDNYQKYGRELGIDFESHPELVAIPSIGLLVACKFWTNNGLNELADRDDVLTITRRINGGTNGLVERKANLAKIKSWLS >NZ_CP035109|3593623:3604727|3598833_3599319_+|WP_161511931.1|DBSCAN-SWA MNINVISALSVAFFSAFISFLVQLYFKRNDRKYQAKSFELSIIAEVEATLNIIEKRKYRKGLEEGLFFFELDEKISENKIFTLEIQIQDNYLPIYFNNLDKISFISPEKVKDVVRFYSLLMSLAQDVKPDGLLNKQPSREAYKECLSVFDEAIIIGNRIIK |
12 | Acinetobacter_phage(50.0%) | integrase | attL 3592017:3592030|attR 3599489:3599502 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3619892 : 3655195
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP035109|3619892:3655195|DBSCAN-SWA 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45 | Acinetobacter_phage(81.58%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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