Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807 | Staphylococcus lugdunensis strain APC 3758 chromosome, complete genome | 7 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,DinG | 3 | 2 | 9 | 1 |
1. NZ_CP038807
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807_1 | 662807-662897 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038807_1
>1.1|662840|25|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_1
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_1 >merge|NZ_CP038807|1|662807-662897|CRISPRCasFinder AAAAAGAAATTCACCAAGCAAAGCAAGTTGGGGCGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCTAAAAAGAAATTCATCAAGCAAAGCAAGTTGGGG >NZ_CP038807|1|1|662807-662897|CRISPRCasFinder AAAAAGAAATTCACCAAGCAAAGCAAGTTGGGG CGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCT AAAAAGAAATTCATCAAGCAAAGCAAGTTGGGG
>NZ_CP038807.1|WP_037540733.1|661363_662740_+|MFS-transporter MSNSYQKGKQLIIGIILGILTYWLFAQSLLNIAPHVQHDYKIDMSVVNIAVSLTSLLTGVFIVVAGGLSDKLGRVKMTNIGLILSIIGSLALIISNMPILLLTGRVLQGLSAACLLPSTIALINQFFTGEERQKALSFWSFGSYGGTGLASLFAGTIATYVGWRWIFILSIIFAFIAIILLRGTPESKDRSSDGKRFDVIGIIVFVIMMVSVNVVITQGSKIGWLSPIILTLMIIFVLTLFIFYFYEQRQRHPFIDFSLFSNKVYIGTTIANLLVNTVIGSLALFNIFAQAGLGLTGAQAGLITIPYMLGSLLMIRIGERFMQKKGPQIPLMAGPISISVGILLLALNFLPHILYYIIALIGFSFIGLGLGFFATPALSTAVSNAPESKVGMASGIIKMTSTLGAAFGIAVVTTVYSTLEINHTPHMAATIALIVGACMVISAFIVAFLVIPKQHVKA >NZ_CP038807.1|WP_161510796.1|658318_661351_+|flavocytochrome-c MDKHITDQLTLHCGATLKNRVLMAPMTIQAGYFDGSVTREMIDYYQFRAGSASAIIVESCFVEDHGRGFPGAIGIDTDEKIPGLTRLADAIKSKGSKAILQLYHAGRMANPKLNAGETPISASPVAALRPDASVPREMTHNQILNMIERFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANTYLLQQFFSPHSNRRQDDWGGSREKRTNFPVEVLKKVQQVASEHHAQNFIIGYRFSPEEIEEPGIRFEDTMFLLNTLAQYHPDYFHISANSYKRTSIVNQDDTEPLINKYLSLQNETLAEIPIMGVGSIAQRADAEEALTLGYDLMSVGKAYLVEPNWLEKILNDETVEDFADIHDQQTLHIPSPLWKVMDFMILDKAEEHRKYEKLKALQNKKVAFKAGVYNVYAKGHNGNLPMQVELSKDKIISVHVDDSGESEGIANPVFERLPRDIIDGQTLNVDVISGATVTSQGIIDGIADAITQAGEDPDILRARPKPVVQWSNETIEETTDIVVIGTGGAGLSAAATALDNNKEVIMLEKFPAIGGNTIRTGGQVNAPEPQWQNRFPALAGERDTLRELLSLDEANIAEDYLEDFHKVKDQIKDYLNATEEEKPYLFDSIELHRIQTYLGGKRTDKYGEEISGQYDLVKTLTDNVLTSVKWLTDKGVHFDRSFVDMPVGALWRRGHKPMKAQGLEYIETLSNYVKTNGGRIFTETTAEKLIVEDHKVVGVEARKANGAKVHIRARYGVILATGGFGANTKMLQQYNTYWDNIPDDIKTTNSPAITGDDIRLGAQAGAQLVGMGFTQMMPISDPKTGALFTGLIVTPSNFIFVNKDGKRFVNEFESRDVLSKAALEQPDGLFYIIADANIKELAMNTSEDKINHELEDGTLVKADTLVALAEKLNINPDTFINTIERYNAAVDKGHDDDFGKNAFDLKIEKAPFYATPRKPAVHHTMGGLSINTGAQVLDINGQVIQGLYASGEVAGGIHAGNRLGGNALADIFTFGRIAAQTASEHQVIKE >NZ_CP038807.1|WP_002492444.1|657320_658241_+|FAD:protein-FMN-transferase MNKRQIKAMGTLIQLSINHDDAEYLFDLAEAKIRAWEQRFSANNTQSELMAINQQAGIRPVQVHPELFHLIKKAHQASMSSNLKLNILIGPLVKLWRIGFEDAQLPTNTEIQQRLRRIQPHHLYLNDAKHEIFLAQRGMEIDLGAIAKGYFADELQAFFLQNGVTSGIINLGGNVITIGSPATHKTWHVGIRDPFHHDGLPLLTVEIQQQSVVTSGIYERYFYQDGQLYHHILDSTTGYPVNNDIASVTIISNHSIDGEIWSTLCSFGYAQQNIDLLNQIDRVEGVIIRKNHDILFTHQLRTKLHL >NZ_CP038807.1|WP_002492417.1|656512_657025_-|membrane-protein MMRKQNDKLKWSSLIMGTLLLITAIIIFSHPVKNFYALTWLIGVFIVINGILGLFFRRAAKAMTGSGTLTTFMAVIDIIFGLLVMFNIGVGSAFFIYMFAVWFVISSVIGLMTLSGQGRFKGLSILINMLGLLFGIILLFNPMMGMVIVSMMIGISFTIIGVMYIVDGLA >NZ_CP038807.1|WP_002492387.1|654800_656000_-|putative-C-S-lyase MTYNFDEIIDRRSTNAMNVEGYLPYLFGNADVSDLQHADDLIRLWIADMDFATPDVVLNAIRRRLDQKILGYTQVFHVDYYNAFVKWTQSRYGYHFPQEQLVFSHGIVAGLIELVSYICNNDDHALILTPSYGPFKMACDENQVEVHYSPLINEEEYYRIDFDDVERQIVQHNIKLCIFCNPHNPSGRVWSREELERFGNIMKAHDVWLISDEIHCDIMRKGMQHLPFATVLPDYDKVITAMSQSKAFNIAGLMFSNLIIRHKGLLNTWKQQHFGSENPLSIAATQAAYEQGEDWLQAMNTYLDGNFEWLKQFLQQELPNAKFKIPEATYLAWVDLSDYITQQHISEPMAKYFIKRAGVIIEGQEQFVHNADGHIRINLAVPRTVLQQGLTKIKAALMS >NZ_CP038807.1|WP_002492524.1|652136_653489_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MTEKYDVIIIGAGPGGYVSAIRAAQLGKTVAIIEKNNAGGTCLNVGCIPSKTLLEHGKKVHDIQSADEWGIHTSNLTIDAAQLTSRKVQVVQTLTSGVTHLLKKNKVSYYKGEAKINSDLTVTVNDETLSSQDVVLATGSRPFVPSIPGLENVDYETTDTFFDMEALPKSLVVIGGGVIATELASSMADLGVKVTIVEVADDILLTEIDEVRALLREHLESQGIEIITSADIEKVEKKSLHLKGQDKISFDRLLVATGRQPNIEIVNDLELSRDGKYLQVDVHYQTSKAHLYAIGDLTSGYQLAHAASAHGIHVAEHLAGMQPKTIKQEDITRCIYTRLEAASVGLSAEQAEALGYEVKVTTSGFQGNAKAIIKGEGQGFVQLVIDEKYKEILGAFIVGPHATDLIGELLGVKASEGTIAELSEIIQPHPALLEAIGEGADAYYNQAIHM >NZ_CP038807.1|WP_002479037.1|651100_652048_-|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MEKEQARWIYKTMNEIRYFEEKVHKIFSDGKIPGFVHLYVGEEAVATGVMSQLEDDDYITSTHRGHGHAIAKGCDLNGMMAEIMGKKTGLGHGKGGSMHVAEIDKGMLGANGIVSGGFGLAIGAGISIRNQQKENVAVCFFGDGAANEGNFHEGLNFASILNLPVIFVCENNQFGEGTTHDYASASETIAERASAYNMPGVRVDGMDVMAVLEATEEAVARAKKGEGPTLIECDTYRKYGHFEGDEQKVKSPDDRNADKNATEEFRKQAIEEGWLTEDEADDIEKAAEQAVEDAVKYADDSDLPDVESLYKDVFA >NZ_CP038807.1|WP_002479036.1|650044_651085_-|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MTETRKLTFMGAINEAIDQSMEQDENVILIGTDVSGGAGVKHIKDDDTFGGVFGVTKGLAKKYSRNRVIDTPIAEHITLSAGVGAAATGLRPIAELMFNDFLGFGLDPILNQGAKMRYMFGGKAKIPLVVRTVHGAGAGAAAQHSQSLYNVFAAIPGVKVVVPSNPYDAKGLLMAAVQDDNLVVFSEDKTLLGQKGNVPEEPYTVDIGKARVVREGEDLSIVAIGKMVAVAEETADRLKDDNISVEVIDLRTVSPWDEETVLTSVKKTGRLIVIDESNPQCNVAGDIASVMGDRAFDYLDGPIKKVTAPDTPVPFAANLEQAYIPNADKVLDVAAELVDDLRKVKS >NZ_CP038807.1|WP_002492516.1|648734_650027_-|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSQNIIMPKLGMTMTEGTVEEWFVAEGDDVNEGDSIATISSEKLTQDIEAPATGTLLKIEVQAGEDAKVKGVLGIIGDADEATDNSSSSTESTNETADTSEHDQHETSTETAKDDAQSYSTEKSTADVEKSPQQHTRIFISPLARNMAEDKALDINRIKGTGGNARITKLDIQRVEAQGYDYDDSKATETSVQTSKNVDVTNIGEGLNPMRKRIAQNMRESLANTAQLTLHRKVDADRLLDFKDKLTVELNQADKDVKLTVTALLAKAVVLALKDYGAMNARYDNGELLEYEDVHLGIATSLEEGLMVPVINEADTKSIGALAEEIKKTSQAVRDGHTDDVQLSGATFTITNMGTSGIEYFTPILNLGETGILGVGALMKEVTLDGDSLRQVSRIPLSLTFDHQILDGAGAAEFLKVLAKYIENPYLLIL >NZ_CP038807.1|WP_002460740.1|648250_648589_-|PadR-family-transcriptional-regulator MSVSNQMMKGLLDGAILGLIAKGETYGYEILEKLKENQFPEISDGSIYPVLLRLSKKGYVHTTTRKSDNGGPKRKYYTISDSGLDELTRFKEKWQYLNIGMTNLFGSEINVK >NZ_CP038807.1|WP_002492523.1|663169_663742_-|thiamine-ABC-transporter-permease MKRLTLADILVTVLISFIFGIIYKMVGLTVAALKPLGLHLDQIAYGLWFIAAIVAFLIIRKPGVAILAELAAGAGETILSGELNMSIIMHSLAQGLACELIFLIFKYKSTKASVAMLAGATAGIFTVPVDWFFNYLGNMPWWNVILLYAIRILSGTILSGLFGYYIVLSLEKTGVTRLYQSSTKKDIDSL >NZ_CP038807.1|WP_002460757.1|664243_665311_+|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase MDITQIKQQMTNFITDGKSEDFPQMALTLFNFQFNHNLDYQKFCIAQGKTPQTVRQWQDIPAVPIDAFKQATFSAIPPEDAAYVFMTSGTTRGIKGKNYHLDLDVYDLAMTKFFKQKVMPQIERIDMGILFPSPNDMPHSSLAHYLEVVKQQFGTSLSDTFINQQGIQFESVVQSLRHAEAQGTPYALLGASYSLVHFLDYLADHGLYFKLPKDSFIFDTGGYKNQSRDVPQSEFYSTLEKRFGVPKDKCINMYGVTELSTQFYDDGNAVSPSIKHGPHWCRSRIVNPLTLEPVPNGEKGVLIHYDLANYNSVAAIMMEDIGEARNDGFILHGRTEGALAKGCSLAVESFLNTMK >NZ_CP038807.1|WP_002492392.1|665323_666757_+|acyl-CoA-reductase MTIQLGYVPFLKAEDIHYQTIQVGNYTVKVPDLTQSQLTNVCHQIKSARYHLQAYTINDIIDVIDHAIQILLDRTSKWRQLAEEILPQSTGYPFDKIKVGLTRYLMTFRKHQLHRFIAEDLPNPQILNQFIPNHKGGYTKAVSPALITHLWSGNIPGLPLWSFISSLLVKSGSICKLPHAEPFLASWFAEIIAEIDPVIAQCFAVIYWPGGEIQLESIAIEQSDVILGYGNNDVLSAIAQRIPVTKRFLAYGEKVSLALIGNETLSPNKVEQVTRNIAREIANYDQQGCYSPQMIFIQQGGNYHPLQVAQMIAHQLQQIEQLFPVQSFNLQDSMTRSHWLQQAETQALLTDDIHVFKGAHASWIVTFHKQLTFLPSPLNRFVRIMPFTNITQLTQLLTPYRSYLQTVGIAAATEKMFQWSEALAQVGVCRFSSLETMTLPEAGWHHDGGFNLRDLLSFVDIEQPLLSSSEHFVDYEI >NZ_CP038807.1|WP_002460759.1|666777_667548_+|SDR-family-oxidoreductase MMTTLQDQVILITGASRGIGSAIAEACAQSGAHVIINYKSNTQAAQKTVSRCQAHGGIAEAIQADINQRQQVDEMMHYIQNNYGKLSCVVNNAFRPFEFNAETRQVADEMNWQDYATQFEGALLYTHNVIQAALPYLKQQQAASIINMTTNLIKRPIVPYHSYNVAKSALEAYTKNLAIDLGKYGIRVNCVAPGLVYPTNNTLATKEQLKQQLIQQTPLGRYTVPDDIAGPVMFLASDWSRFMTGQVLYVDGGLTI >NZ_CP038807.1|WP_002492409.1|667753_669289_-|PTS-transporter-subunit-EIIC MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPNTVKTYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAIGLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLAKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKITLPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLVEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQTGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWFVLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVAATERAETIVQGLGGKENIEIVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAKGVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS >NZ_CP038807.1|WP_002492576.1|669536_670115_+|hypothetical-protein MEEVLTNDSFSNLTYTKLKRFNKDYWKFVLIMFPTIPISAILPYLGNIYLKNNKDNIFVHGTIFPDNWTIIAGLIFALLFFYLIVLSPLLSFKNDVQTEIDIVNSVFINNQGELHSFIHLIKCDHFETEYYEHLITFISREYTRVTKQDLSHEQQTRYDEVQPHLSLDEAHRYVRELYLTLEKRYNNINLPE >NZ_CP038807.1|WP_002492541.1|670218_670974_+|SDR-family-oxidoreductase MFKLTNQIALVTGGANGIGKGIAAALAQAGAKVIIGDIDDTRGKETARELNGDFIELDVKQHDQVKDVVDQIVAKYERIDILASNTGVYPQIDIESLTEADWDYIQNINLKGMFFVTQAVLKVMKAQRYGRVIITSSVTGPITGYPGWAHYGASKAGQLGFMRSAALEYAKYGITVNAVQPGNVLTDGLKAQGEAYLEGTRKIIPTHELGEPLDIGYAVTFFASQEAKFITGQSLVIDGGQLLPEEPDGVL >NZ_CP038807.1|WP_002492472.1|671111_671909_+|N-acetyltransferase MMNIRAFEHYMSIDSERYSEPSLEALNDYATRFMYTVPFENINVQNGIPISVDINDLYHKIVDNHRGGFCYELNTLFQAYLKAKGFDAQMMSATVHTANGGHRLEGSHVSLVVPLQGTYYVTDVGFGDLPLHAMPITLEQDSQPVQDISGTFRAIFENENKTRFFVQKWESDTWKTKYDAILKASSIDAFKDKINYNETHPDSIFVQNLLITQPKSYGRVTMSQQHLTVTEQNRKVQYDVTPQNYRQLLQDYFNLNVTIDRLELS >NZ_CP038807.1|WP_002479052.1|672282_672552_-|hypothetical-protein MSERRRSIISSLLLILAVIIISAVVLCDIINFIAGISVNHHIINTQYNMYFVFVSMLLWIISEVFDKQYVKAVIIALVVGVLTIIALII >NZ_CP038807.1|WP_002492383.1|672615_672936_-|hypothetical-protein MVNHCSDVKNILKKGDIIFNKEQHPKLLTVLHIIMIVFVGLAVLTLLISIIAHFIVGGRPFYHFAYVLFIIGMLAEVSINIIQRQTQAAVLSIIMIVLAIIIIFAD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807_2 | 1248851-1248930 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038807_2
>2.1|1248874|34|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder ACCCCAGCTTGCGTTGCACGTAGAAATGCTTGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_2
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_2 >merge|NZ_CP038807|2|1248851-1248930|CRISPRCasFinder GCATTTCTTTGTGCTGGGGCCCCACCCCAGCTTGCGTTGCACGTAGAAATGCTTGGTGCATTTCTTTGTGCTGGGGCCCC >NZ_CP038807|2|2|1248851-1248930|CRISPRCasFinder GCATTTCTTTGTGCTGGGGCCCC ACCCCAGCTTGCGTTGCACGTAGAAATGCTTGGT GCATTTCTTTGTGCTGGGGCCCC
>NZ_CP038807.1|WP_002492997.1|1247995_1248481_+|DUF456-domain-containing-protein MTVLLWLLIIFAFILAFVGLIKPVIPSVLMLWVGFLIYQFAFNNGELSWIFYVSMIVLTVLMFISDFAMNKYFVNKYGGSKISEYVALIGVLVGCFVFPPFGIIIIPFVAVFAVELMQDFDVNKAFKASLGSIVAFLTSNIAKAIIMFIMIVCFFIDVFVI >NZ_CP038807.1|WP_002492949.1|1246776_1247994_+|MFS-transporter MFKALLHIKNYKLFVVNMMLLGMGIAITVPYFVLFATNELGMTTNQFGILLALAAVSQFTINSIVARFSDTHNINRKFLIITALFMGAVSFSIYFYIHDIWLFIITYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRKNAKFANTVLRSMFSFGFLFGPLIGSRLIHFNGYAGLFGGTVAIILFTLLLQVFFYQDLKLTGDQQVGGTAHIETTAPNMLKDVTLFLPFVAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTKQLHISEDYVGTLASLCAGLEVPFMVILGMLATKLQTRTLLIVGALSGGAFYFSIGIFNNIYMMMLGQVFLAFFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGAMSQWVGLENVFFVSASSIFIGMVLIFFTKDQKFTEEKVIS >NZ_CP038807.1|WP_002459796.1|1245836_1246691_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAELLYISQPAVTQRLKAIENNFGVDIFIRTKKQLITTTEGAMIIEHARDMLKRERLFYDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPDVLSLYNTQFPNVEIQVQVGSTEHIKAHHRDYHVMITRGNKVMNLTNTHLFNDEHYFIYPKDKRAEVDKLPFIEFQADPIYINQIKEWYNDNLGQDFHATITVDQVGTCKEMLLSGVGVTILPEVMMKYIDKNQFECEKVLIEGQPLIRSTFMSYEANMLQLPQVDSFVNLMYNFIR >NZ_CP038807.1|WP_002493006.1|1244714_1245329_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIEREYIEVKVNNKRFKGIIGLVTMNKVREPLEVTVVGKHMVVADDHYQWLQILPEKKRYSITAMFDDKGQPLEYYFDINIKNITQKGNARTLDLFLDVLVLPTGKYELVDEDDLMNALVNEQITKRQYHEAYMIAHQLMIEINDNFDELERRIMHCYRKMNQKKHKAKRHHHQAPQPQQRHKRKKRFTED >NZ_CP038807.1|WP_002459798.1|1243863_1244331_+|cupin-domain-containing-protein MISAEEWINRLELMPHPEGGYYKETLRPDDKKRASYSSIYFLLKDADVSHFHRIDADEVWYHHSGETLLIHMITTEGKYYVEQLGQNVADGDVLQCVVPKGTIFASSLKHSKGYGIVGCMCQPAFEFEHFELLAQAILLEKYPQHQEIIKAYAVE >NZ_CP038807.1|WP_002493004.1|1243147_1243864_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPDPNSNQALRLVLERAKTYSVPNHIIDKAIDKAKGAGEENFDHLRYEGFGPSGSMIIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDDTATFAIEGKSADDVLEALMEQDVDVRDVIDEDGLTVVYAEPDQFAQVQDALRAIGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSAEDQETFEKLVDALEELEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP038807.1|WP_002492965.1|1242554_1242914_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSKDKLNQLLNLYKKHKLLSEYIDKKYKLTLNDLAVLKLAKDYTSEKKVLMQSFLKLAIEELDLSRTKLLVSIRRLIDKEKLSKQRSEEDERKIFIYMNDDNIESFNDLFKDVEELLEI >NZ_CP038807.1|WP_002493010.1|1240266_1242411_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNTFFRILTKEEYQPTRCIDGIIVILPIQGDLTIQHFANSTTISDEIYIINNKDIFTIKQNHKSLMLYITSDWFKNHDYVFFDYKYSVNLIKSINKLKQLMLKIAINYINQMPITSNENYIKQMVEVIATEGSVDLETAENQYKFLFYGELSQILEYINKHSHEKLTLNALSQNLFTSKSNISAQFHQNLNMGFKQYVDSLKIAESIEYLLTENSTISHISDKLGFSNSASYTKMFKSYIGITPNDYRSLNIKDKYLLMNYEVLSEDNEQHLKTVLRQQINYYQENIERKIFIDNNKVKTKQNFELVTQINTVEEFKELFFIKIKGKANINTENLIIYVNFGTGTLINNLSDAEIGDMFKKIAANNLHIAFKIQSLEIMDYIERIYVQVVERLNYKKSLANGDRGIIMLVFDMEVIELKEIYRLILKIQNKQFGLRFGLAISCLLNETVMFKTLESQIKRIGFDYLFIDNAHLEQPYLLEDSQHLLLKNILEYQNIEKILTQIDLSYSKVIFLNIENHQFLNNENDLSNSAPLIIETFLKTAELFDGMGVNLYFSRNSFNAIHIFDENGFKTVLGIIIGQIKWMMNQSRTIKDNYIVVENEAQYTLFLYDWRVFESEASITYFGDTEVLIHFEEVAEQSIRLIKSEKVDEKNGNINHIINRHIREKYNWTQELLKEIEDHLHTTMRIIEHDFRKDYFKVNLGYDSLRIIKIFK >NZ_CP038807.1|WP_002459802.1|1239304_1239958_+|membrane-protein MNDFSKKQRHMTDHSQSKSWAYSQVWLYFMYYWLIFGIGCYFGQYLPDEWRMPLSIGLLVLIFSTLIFKRARKYGLIISHIYAIIVGLLSYAMFTTYLQNLGADVFYKNIVLAIGAFVIFGVIGFFFIKDASSIGRYLFVTLLALIVASLIGLFIHNPVFYTVITVVSLFLFLLYTLYDFNRMKRGQFSPREMGFNLFINLLNIILDILSLANRFRN >NZ_CP038807.1|WP_002479388.1|1238133_1238937_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITAASGAAAALTHQHAEAATQHTVKSGESLWSIAQQHNTTVNDIKQSNNLSNNFVFPGQVLSVGGNNTNSSQYSGQNSSATSHTVQAGESLNLIANQYGVSVNDLMRANNLNGYLIMPNQTLNIPSGSGNGAGSGGTTVTPSNTNTTPTFNHSNLYTSGQCTWYVFDRRSQAGKPISTYWSDAKYWAGNAANDGYRVDNSPEVGAIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNTNTRTIPASEVSSYAFIH >NZ_CP038807.1|WP_002492952.1|1249829_1250282_+|hypothetical-protein MKKGLVLLLAAIFLLTACGKGNDEKQSLEQDIQKLEKEKKDLEKQEEKLKSDKEKYKSQRETLEKEVEEMQSNSSDDDKDNKEKTSDKSKEKSSQHQTTHDQNKDQQNQHQNSNNTDNTQTDKDKTNKQQSSQSTKNDTQKQSKQPKQQQ >NZ_CP038807.1|WP_002459790.1|1250407_1250704_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELETLTGRTIVDSTGEINRVVAHLPNFDSDFDTFVATYKLNHQNDFIDAIFTAPKAQRNRLKEIPVHIELISYISKA >NZ_CP038807.1|WP_002492957.1|1250817_1251360_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MTVYIETERLKLRDWEENDLLPFQKLNANPQVRRYFPSLLSYRRSALDMKQMQKNITATGIGLFAVELKETNEWIGFIGLNYIPKDSQYPFNNLPFYEIGWRLIPEVWGNGIATEGAEAVLKYAQKKGVYDIYSLTAETNLSSRKVMEKIGMKVFDRFEFPELNKYHPLKMQVRYYKNLK >NZ_CP038807.1|WP_002479382.1|1251391_1251958_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKKIAVFCGASKGSNPTYVNEAYNLGKYMAQKGYELIFGAGSVGIMGAIQNGVLDHNGTVIGVMPKELDTKEITSQRVSELILVDSLHQRKEKMAELADAFILAPGGAGSLEEFFEIYSWTQIGIYQKPIGIYNLNGFFEPLHQLIIHMIQEGFIDEKYKALAPLYHTKEDLLHGLQNAKPLGERSYD >NZ_CP038807.1|WP_002492972.1|1251973_1252420_-|YaiI/YqxD-family-protein MTSIIIDGDACPVIQSVIELTSGTGIFVIIVRSFSHYTTQTYPEHVKTIYVDDGPDAVDYKIVQLAQSKDIVITQDYGLASLLLNKVKTVLHHKGYIYNSTNIDMLIQQRYNHAQLRKQGGRHKGPTPFSNKDQQHFEHIFRRVLSQI >NZ_CP038807.1|WP_111703913.1|1252424_1252796_-|hypothetical-protein MDKKLQKNIEQRHKEEAKAREKNEKQRIKDLKKTQKYQEKVGLTPGALDDETEKKGEKLAKDNKHDIKKLAKKLQKNIEQRHHDEEKNRDKNKKARIKEIKKYEEHDAQSVTKQNNKETHHES >NZ_CP038807.1|WP_158309366.1|1252809_1253010_+|DUF1736-domain-containing-protein MRFFFANFSPFFSIYSGSFSFAIFFNSRLLSCSCFLSITNSLTSVALLATVLDARDVAAVTFLTSE >NZ_CP038807.1|WP_002459785.1|1253421_1254294_-|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MFLLELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILMDDMWLKSTDFLGSESAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRERFFELLHIGKQHQAPISEEFRSKPRRLNLLHVLVGMIPAGILGLMFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFLGAIYMIIADKYSEKVKHPQNVDQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVLMKMNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLIKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLINKIKLVPFAIYRIILVVIIAILYFGFGIGKGIY >NZ_CP038807.1|WP_002459784.1|1254675_1255116_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSEHHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLSILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEHVDLIKRERSEVDQREVFIHLTEKSEGIKPDLKDASSKVATASSLSADEAQELNRLLGKVINAFTENKE >NZ_CP038807.1|WP_037540845.1|1255340_1256273_+|GTP-binding-protein MKKHNCRNTYISIVSGFLGSGKTTFLQEYMQYLLKTDEKITIIMNEFGTFDVDSLTFNNEVAINALVNGCVCCDLKADLVAQLKNIIADGQTTHIIIEATGIAHPLEIMMACQDPEVIHLISEVKMIGILDASRFLHRHRYSLTTVELMEEQLAYSSTIIINKMDLINDQEQKKLSAELTQINLQATTCYTTFGQLDITTFNNIKHVDNIKSPAKHAHHHGIKSMQYTFSGPIDRQLFYQFILKLPQNVFRLKGFVRFRDCADVIYEFQYAHGLPSYGEVDKEVPLTIVIIGEHIDVERLRNNLDMLQFT |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP038807_3 | 1649545-1649693 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP038807_3
>3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR TCCGTTGGCTTTCTTTTCGAAAGCCTATC >3.2|1649664|12|NZ_CP038807|PILER-CR CGCATTTCTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_3
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_3 >merge|NZ_CP038807|3|1649545-1649693|PILER-CR CCACCCCAACTTGCTTTGTCCGTTGGCTTTCTTTTCGAAAGCCTATCTGTCGGGGCTCCACCACAACTTGCTTTGCTTGGTGAAATGCTTTTCGCATTTCTCTTTGTTGGGGGCCCACCCCAACTTGCTTTGATCGACGAAATACTTTT >NZ_CP038807|3|1|1649545-1649693|PILER-CR CCACCCCAACTTGCTTTGTCCGTTGGCTTTCTTTTCGAAAGCCTA TCTGTCGGGGCTCCACCACAACTTGCTTT GCTTGGTGAAATGCTTTTCGCATTTCTCTTTGTTGGGGGCCCACC CCAACTTGCTTT GATCGACGAAATACTTTT
>NZ_CP038807.1|WP_002493061.1|1645947_1649394_+|pyruvate-carboxylase MKHIKKLLVANRGEIAIRIFRAATELNIKTVAIYSNEDKSSLHRYKADESYLVGKDLGPAESYLNIERIIAVAKEAGADAIHPGYGFLSENEHFAHRCHEEGIKFIGPHLDHLDMFGDKVKARTTAINADLPVIPGTDGPIENFESARAFADEAGYPLMIKATSGGGGKGMRIVREANELEDAFHRAKSEAEKSFGNSEVYIERYIDNPKHIEVQVIGDEFGNIVHLYERDCSVQRRHQKVVEVAPSVGLSKELREKICNAALQLMTKIKYVNAGTVEFLVSGEDFYFIEVNPRVQVEHTITEMITGIDIVKTQILVADGASLFGEEIGLPQQQDIHTLGYAIQCRITTEDPTNDFMPDSGTIIAYRSSGGFGVRLDAGDGFQGAEISPYYDSLLVKLSTHAVTFKQAEEKMERSLREMRIRGVKTNIPFLINVMRNEKFRSGDYTTKFIEETPELFDIQPTLDRGTKTLEYIGNVTINGFPNVQQRPKPDYETTSIPRIAKKQINSLSGTKQLLDQHGPNHVAQWVRQQDDVLITDTTFRDAHQSLLATRVRTKDLMNIASKTAEVFKDSFSLEMWGGATFDVAYNFLKENPWERLERLREAIPNVLFQMLLRASNAVGYKNYPDNVIKKFVAESAKAGVDVFRIFDSLNWVDQMKVANEAVQEAGKISEGTICYTGDILNPERSNVFTLEYYVNLAKQLEREGFHILAIKDMAGLLKPKAAYELIGELRAAVDMPIHLHTHDTSGNGLLTYKEAIDAGVDIIDTAVASMSGLTSQPSANSLYYALNGFDRNMRTDIAGLETLSHYWGHVRDYYNDFESDIKSPNTEIYQHEMPGGQYSNLSQQAKSLGLGERFDEVKDMYRRVNFLFGDIVKVTPSSKVVGDMALYMVQNDLDEESVIRDGHKLDFPESVVSYFKGEIGQPVNGFNKQLQDVILKGQQPLTARPGEYLDDVNFDAVRKELANKQQEEVTDQDLISYVLYPKVYEQYIATKEQYGNLSLLDTPTFFFGMRHGETVEIEIDTGKRLIIKLETISEPDENGNRTIYFVMNGQARRIYIKDENVKTNVNVKPKADKTNPSHIGAQMPGSVTEVKVAVGDEVSVNQPLLITEAMKMETTIQAPFNGIIKQVTVANGDAIATGDLLIEIEKI >NZ_CP038807.1|WP_002478357.1|1644102_1645341_+|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MNNFKNLMRKIGKTSKFIDYPLLIAYVILCLIGLVMVYSASMVAATKGTLTGGVEVAGTYFYDRQLLYVILSFAIVFVIAFLLNGKILKNPQVQVGIMGTIILLLLLTLIIGKNINGSKSWINLGFMNLQASELLKIAIIMYIPFIIDRKMPRVKKDFTLIFAPVGLVLFCLALVFLQRDVGQTLLIIIIFGSILLYSGLGFEKFFKGKFFIILTAIAAAFFIVLLIVALSGHLPGYLQARFSTLVDPFASSAGTGYHISNSLIAIGNGGLFGRGLGNSVMKLGYLPEPHTDFIFAIICEELGLVGGLFVIGLLFFIVYRAFILANKTTSYFNKLVCVGVASYIGSQTFVNLGGISATIPLTGVPLPFISFGGSSMISLSIALGLLLMIGKQIKKEDKLRKQRQKSMPKRIM >NZ_CP038807.1|WP_002459406.1|1643523_1643802_+|YlaN-family-protein MANQTNLKSVAYEQLNKDADRILQLIKVQIDNLTLPSCPLYEEVLDTQMFGLQKEVDFAVQLGLVDKEDGKDLMLRLEKELSKLHEAFTDVK >NZ_CP038807.1|WP_002459407.1|1642894_1643380_-|hypothetical-protein MIQITGEVKYPITLDSTTWIFDDRKVSISDLEQGVFDGSKPIEFDDNREWNRAILEGQTNPPTLNSEIKYKKRAVLEDSFVINMTPFFKNAEPHNNATMIRLIDKNQDAIDVPLDLLPYLFFQFAKDGKRLYEDNAVDSFVYIQNKGYDYQFKHITHIEVI >NZ_CP038807.1|WP_002459408.1|1642638_1642893_-|DUF2197-domain-containing-protein MREVQCIICDRKVFIDEATVEAKRLQNNPIRTFMCDDCKSRLDKPKQRPYTQETQRNATDKRCHKQPKKSLKKNKKTAKTKKTD >NZ_CP038807.1|WP_002459409.1|1640745_1642593_+|translational-GTPase-TypA MTNRREDVRNIAIIAHVDHGKTTLVDELLKQSGIFRENEHVDERAMDSNDLERERGITILAKNTAVDYKGTRINILDTPGHADFGGEVERIMKMVDGVVLVVDAYEGTMPQTRFVLKKALEQNLKPVVVVNKIDKPSARPEGVVDEVLDLFIELEANDEQLDFPVVYASAVNGTASLDAEKQDENMQSLYETIIDYVPAPIDNSDEPLQFQVALLDYNDYVGRIGIGRVFRGKMHVGDNVSLIKLDGSVKNFRVTKIFGYFGLKREEIEEAQAGDLIAVSGMEDINVGETVTPTDNQEALPVLRIDEPTLEMTFKVNNSPFAGREGDFVTARQIQERLEQQLETDVSLKVSPTDSPDTWIVAGRGELHLSILIENMRREGFELQVSKPQVILREIDGVLSEPFERVQCEVPSENAGAVIESLGARKGEMVDMTTTDNGLTRLIFMVPARGMIGYTTEFMSMTRGYGIINHTFEEFRPRVKAQIGGRRNGALISMDQGQATAYAIIGLEDRGVNFMEPGTEVYEGMIVGEHNRENDLTVNITKAKHQTNVRSATKDQTQTMNRPRILTLEEALEYINDDELVEVTPQSIRLRKKILNKAAREKEAKRVKQMMQDNE >NZ_CP038807.1|WP_002478359.1|1640449_1640647_-|hypothetical-protein MQNQKQKSKSIFWILSILAVIFLVLFSFSVGAGSVPMMILTLILLIAIFGIGFTLKKKYRNNHWL >NZ_CP038807.1|WP_002493064.1|1639461_1640277_+|inositol-monophosphatase-family-protein MALYDFAKSLILEAGNNVRLMMKEKLSIETKSNPNDLVTNVDKATETYIYEAIHSNYPEHKVIGEEGHGHNIRNIDGVVWVVDPIDGTLNFVHQRENFAISIGIYYNGKAYAGFVYDVMKDALYHAKVHEGAFENNHRLEAIGTSELKSSLIGINPNWVTKPIIGPIFQPVVNRARSSRAYGSAALEIIAVAKGQLAAYITPRLQPWDFAGGLIILNEVGGKGSNLLGETLEITHPDSVLMANQTVHEELLQQFFLPHQQTLTELHAKYYK >NZ_CP038807.1|WP_002493059.1|1638667_1639279_-|DUF1054-domain-containing-protein MTKYTFKQKDFKAFDVDGLDARMEALEAHVRPQLRALGDYFADYFTSQTGETFYSHVAKHARRSVNPPKDTWVAFATNKRGYKMLPHFQIGLFKDHLFIMYGVMHETKDKAQRVKTFDKHFDTLTHLPEDYRICLDHMKPDKPLIKDLSVDELHEAIDRVKNVKKGEFFVARTLAPNDKRLKSDRAFLNFVEETFNEFIKFYA >NZ_CP038807.1|WP_002459413.1|1637053_1638406_-|divalent-metal-cation-transporter MNKRDTTHQPKHLSLDEINNTIKFDSNGTSSQKFLAFLGPGLLVAVGYMDPGNWITSMQGGAQFGYTLLFIILISSLSAMLLQSMTLRLGIATSHDLAQMTKHYLSKPVAIIFWIIAELAIIATDIAEVIGSAIALNLLLGIPLIVGAIITVCDVFLLLFIMKFGFRKIEAIVGTLIFTVLAIFVFEVFISSPSTTAILEGFVPHKEIITNHGILYIALGIVGATIMPHNLYLHSSIVQSRQYDRHSIKEKAQAIKYATIDSNLQLSVAFVVNCLLLVLGASLFYGVNQDQLGGFYDLYHALRTQPILGAALGAIMSTLFAVALLASGQNSTITGTLAGQIVMEGFLNISLPNWLRRLVTRAIAVIPVIICLIIFKGNEEKIEQLLVFSQVFLSIALPFSLIPLQLSTSNKQLMGPFVNKSWVNYCSWILIIVLSVLNVYLIIETFKEFI >NZ_CP038807.1|WP_002493108.1|1650150_1651062_-|heme-A-synthase MFKQKNLKWLSVLAAIIMGFVQLGGALVTKTGSEDGCGASWPLCHGALLPENLPIATIIELSHRAMSGLSLIIVLWLVITAWKNIGYIKEVKPLCIISVAFLLVQALVGAAAVIWQQNSYVLALHFGISLISFSSVFVLMLIVFEVDQKYEADELYIKKPLRTLTWIMTIIVYLTIYTGALVRHTKASLAYGAWPVPFDHIMPHGEQEWVQFVHRGMALIAFTWILITFIHAVKNYSENRTVRYGYTAAFILIILQVVTGALSIITHVNLIIALFHALFITILFGMIAYFIMLMLRTIRSSHL >NZ_CP038807.1|WP_002493104.1|1651297_1652209_+|protoheme-IX-farnesyltransferase MNKEQTLSHTSSRVSFKELQQIIKMGLVQGNLIPAFAGAWLAVVMTSHSFLSSIPQIILMIIGSTLIMGGACAINNYYDQDIDRIMPSKQNRPTVNDRISDRNLMLLSFGMMLVGEACLFLLNIPTGVLGLVGIVGYVSFYSIWSKRHTTWNTVVGSFPGAVPPLIGWAAIDGQLSLAAFGLFLVVFCWQPIHFYALAIKRKDEYALANIPMLPSVKGIKRTRVSMFFWLVCLLPLPFFFTNLGTTFIVLATLLNLGWLFIGLTTFKKDTDQTKWATKMFIYSLNYLVVFFVMVVVVSLIKMI >NZ_CP038807.1|WP_002478353.1|1652234_1652696_+|DUF420-domain-containing-protein MNVPILPTISTSCIVISAILIAIGWWQIWHRHVNAHKKTMLWAAVFALTFFIIYATRTVFIGNTDFGGPDSLRPFYKGFLFFHINLATLGGIGGLVQIITAFKDKFNIHRKIGPTASVIWFLTAITGVTVYILLYVLYPGGETTSVIKATLGL >NZ_CP038807.1|WP_037540411.1|1652882_1653938_+|CAP-domain-containing-protein MIKLLLKILGVVLLVTFLIYLFYSPRLQFDVLENPNKSTNTSRSDQSAHQNNQKDDGNPKPKEGIGTWIGKDISYLTKKFGQADRSYRYSDHYKNYVFKQQDAYYVVLVRDKRIKSVYATGENANVAPLKINDSAARIFENTSINPDPTFKVNNRTYHFELSDEDLKTQTLIKYGENYAQVYVDQQTNDIMGIRYLDKEALALFKPYRLEDDEQSSKSRIKHSADIPFEQNPNQLMTLYEITNEIRKLKGIKPMRVNSDIAHIAAINLYDATDSDSVAFTEDTLRNQLENQNIEFKTTSQNVGYDFDDVPTLIHSWMNSDIHRSRLLNKKYNEMGGEVMKNYYSLIFVEDK >NZ_CP038807.1|WP_002478351.1|1653954_1654389_+|hypothetical-protein MYTEEMGYILDEIEKLSDMVTDSEIYYQFKEAQLKLDRDDEAHLMYEAFLKYKHMYDEVMRFGRYHPDYQTIMLETRRRKRAYEMLPVVMDYKVKEVKLQNLIDELISKIAHAVSANVKIEAGNPFFQTDERGCASGGSCKCSL >NZ_CP038807.1|WP_002493085.1|1654476_1655403_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MSIKNKRLINWGLAGIGIMSGLLFYKRQQSQQQPKTIPPFFQGRSPYIFAHRGGMAVRPEQTQLAFDHAVSFDVDGFETDVRLTKDEKLIVFHDATVDRTTNGSGKVSEHTVAELKKLDAGYHFTDINGTTPYRGHEKTAILTFDELLKLYPNMRINVDLKDHPGSYEGSIAPQKMFDDILNNQAQDRVLVTSFYSKQIDRFNKIAQNSVAIGASQKEVAEGFLKFFSGTARSFHPQANTFQMPTHFKGIPLTSRRFIQWLNTLNIVPGYYGINSIDMMHDLYLKGAHTLVTDRPDLGKQFKDSLTIK >NZ_CP038807.1|WP_002459394.1|1655561_1655813_+|DUF2129-domain-containing-protein MNLIPRTSLTVYLKHIKHERQLRKYGHIVHTNKQERYVIIYINEVDADVIVHKLMQMKYVRHIDASPYKYLKKTYEKEKHETL >NZ_CP038807.1|WP_002478349.1|1655829_1656219_-|hypothetical-protein MKQSFIVLGEGLTDLFEFLTLIDYDHARVDKIMYFHTPESEKQRSSIALVMQPTEGHHFQAMYIMLNAMSYPYPESNKKFQMINEKAEQYNIQTIGVDVQPIEAFHDLDLYFKYLISILRLQNWIPPLQ >NZ_CP038807.1|WP_002478348.1|1656287_1656839_+|16S-rRNA-(guanine(966)-N(2))-methyltransferase-RsmD MRVIAGKHKSKALESLEGRNTRPTMDKVKEGIFNSLHNVSGLGLDLFAGSGALGIEGLSRGMDKVIFVDQNFKAIKVIQANLQQLDLTEQAEVYKNNADRALKALNKRDIQFDYIFLDPPYNKGLIDKALIQIETFNLLKESGIIICEFSHQEDIAIQSFKELKRYHYGLTDTLLLEKGDKNG >NZ_CP038807.1|WP_002459391.1|1656831_1657314_+|pantetheine-phosphate-adenylyltransferase MGKTKAVIPGSFDPITYGHLDIIERSAGRFDELHVCVLKNSNKAGTFTVNERIELIEESVKHLSNVQVHHFDGLLVDFCDQIGAKTIIRGLRAVSDFEYELRLTSMNKKLNSDVETMYMMTSTNYSFISSSVVKEVAQYKANISDFVPPNVATALKEKFK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807_4 | 1765069-1765155 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038807_4
>4.1|1765099|27|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder ATTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_4
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_4 >merge|NZ_CP038807|4|1765069-1765155|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCTTTGTTTGTCGAATTTCATTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCTTTGTTTGTCGAATTTC >NZ_CP038807|4|3|1765069-1765155|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCTTTGTTTGTCGAATTTC ATTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCC CACCCCAACTTGCTTTGTTTGTCGAATTTC
>NZ_CP038807.1|WP_002491837.1|1763664_1764900_+|aminoacyltransferase MNFTTLTCEEFNTYVSKHFSHYTQSIQLYEYRKQQHKGVHLVGVKNIYGEVIAACLLTEARVLKIFKYFYSHRGPVMDYNDLSLVKFFFKHLTRYLKKQRGLFVLIDPYILENIRNAEGEIIHTYNNEKLIDTMHRLGYEHQGFSVGYSDMSQIRWHSVLNLQQKSEDQLLKEMSYQTRRNINKTFEMGVEVITLPIEETDRFYRLFKMAEEKHGFNFREESYFEEMQKIYHDNGYIKLAYINLADYLTRLEKQRQKLIVLLNDVKETLEINPNSKKSKTKYQQLTQQLASIDKNIAKTQDLQQEDGNILDLAAALYVYNNHEMYYLSSGSNPKYIQYMGAYRLQWDMICFAKSHHIHRYNFYGITGDFSSQAEDYGVQQFKKGFNAFVEEYIGDFIKPLRPWLYKFYSRK >NZ_CP038807.1|WP_002478289.1|1762597_1763506_+|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVAEAKQETGANVSVVYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLEGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNDDEETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFVGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKIKTLNSCGVKTADTPSEIGTTLIAAAKEAGIYEQLLTIDK >NZ_CP038807.1|WP_002493081.1|1761409_1762576_+|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAKEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDRITLMASEEGGTEIEEVAATTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESINKAAKFLISLYNVFVEKDCSIVEINPLVTTGDGEVLALDAKINFDDNALFRHKDIQELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVKRGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP038807.1|WP_002493079.1|1760531_1761299_+|ribonuclease-HII MKITIKEAKAQLNKVTTLEALSNHALHLDERKGIQQAIRVRQRQLEKELKLEQDYQRMMKYEQEILQQQPDAIICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILNANHHYLGLNDSKKVSAVNRAQLNQDLMANVRGYAYGIASAAEIDQLNIYRATQVAMQRAINQLQVRPTHLLIDAMSIDSTISQTAIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDHLMRDYAQVYPHYGFDKNVGYGTKAHLAGLEQYGVTPIHRRTFEPVKSML >NZ_CP038807.1|WP_002493074.1|1759663_1760548_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVTEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKEMSKWEHYFVEQGFYPVAVDAKHGKNLKGVEAAAIEATKDKFAKEQAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLARKNIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKVLQLLDTPGILWPKFEDELVGKKLSLTGAIKDSIVHLDDVAIFGLNFLIQHDIETLRQHYHISVEEDAAILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYEAVIELLINDLRNAKMGTYCFDLYSEMKRDIAHENND >NZ_CP038807.1|WP_002493075.1|1756815_1759407_-|YfhO-family-protein MTKKLLMIMLFLTLAIIGHTYILYRFIHDGILFTGPNDGIEQMIPMQMYLYDKWSQGQFFYATDFGLGGDFFSDLSYYFSTNLLFIINAIIIYITNLIVSLPTGNVTFWTINAIVISIVKATIAMLVTYLFSMRIVKHRVNSSLIAFLFVMSPLYYRFTVYWPFFSDVFIGLHLLLYAIEHMLQQKKIGLLILAITIIMINNFYFAYYFLLIGAGYLLIRITFPHKDDRMKRITALWLSVLCAFLGLANALFMFYYSAQSYINNRRIPYKDHVPVFESLNINNNIFIDNYLIILLFITIQALLTFKLYKHYYFRLFAFLTCITILFNFMPIVDQIFNGFSAPQKRWHFLLAFNSAMVIGLFIKYFSTIRLKTYIWTNIVAQSAVFISVIVYHQYVPWLVLVPIVSLIGLFTLIIKDATSRLIIKQIYVFSIISLSILVSAVFIKNQIYFKDHEQRANNMYIHSSLYNSELQRQLLSYMTHTKEPWERIDWRVNEQDNTPMYQKFKGLSLYSSIFHHNILDLYYDDLKINLAEESLSRYQSTNGRQNIASLFSVRYMMLKDYQNNLPAYFQKIKSSGQYAIYENKLNLPAVKVTNHLYNDQSIKTSIDREHAMLDGVIVHNGGNNYRKHSKNLLNKVSQSSQHIQCLSNKHIKVNSQQGGMIKLHVPKSIRQHYTDFYLTMYIKRGQPDSNYSVAINGYVNHRLYNQSTYRTGVNTQLYRTQPDENGNISIQLTPSGTFDMKLISLHGENYHKLVQTHRQANFDHRYQDIHDGVRITLAPHSQGMAVVNIPYRKGMMAYVDGKRINPIRVNTMMTGIPVKKSTTSIIIKYLPPHWIVMLLLSSISILCSIMITRIFTKKRKDEE >NZ_CP038807.1|WP_002493078.1|1754204_1756811_-|YfhO-family-protein MQKRTVQAMKTFVMITLISFIATLIIYFPFIKDWISKGYVFSGVGDGFRQMMPFQMYLYEHYTQLKGFYDHSFGLGGDYVKSLAYYYSLSPTMWCNFIMIWLGERLLHWNPHVIGFWPFNQLIVALGRSLLTFICAFYYFRYLKLKQAPLMIATILYGASTVGLYYNFTWSFYGDLLIFLPLSLWGMERFFQRGKIGVFIVAIAITLFSNFYFSYYQAIVLGIYFLLRIIFEYRYDIVTRWQKFYLLMFGTILALFSSIIGFYTGVSSFLNNDRQQNSDFKISLFTDLTQDNYYIFSNGFYITISIIALVALLSFKLYKHYYYKLFAIITWFLLIGSLTQYFDSAFNGFSLPQRRWVYFLVLSTSALMALYIQHISELSIKQYCFTAIPVFIFGLCRYLFAEHFVNWMLISLILIIILALLVWRKKWLYHPLVLLGIVVIFFVQQVVMTIESSKRTIGPYSTTMSTITDPSYYNTKLAKVIQQINHKNNNPLHRIDYMSFYALNSPFIYHYNGISLYSSIFDGSILNYYDHLMQINMPVDKNSTYRYLSNRANLEALWNVQDRFRHPNDLNIPYGFKKIDTIKNGNDTLIHSKNTINYPATHVTNKVFNASDLKSPLDREQAMLQGIVPSDGSIKANTAFKANQNLIDEAKRSTHNATWQNHSHLKVDKNNGGVTYTLPKNVAKKYKDLYVEMDVELLTPDKNHEVGVNEYAQDRNELTYKYRRFVTPVTMRVKASDKLNIHLSQGTYRLSVKGIYGEDYSSLQQSAKDLKAVSVKENKNGYTISKSKSTSGYVVLPMVYADGMKATVNGRHEDVKKVNGIMTAIPVNKGDTHIRLTYTPPHWHLLFIMSILGIILSIAFRFWVKRKV >NZ_CP038807.1|WP_002459304.1|1753607_1753958_+|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRTGDTLRVHVRIIEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIQEIR >NZ_CP038807.1|WP_002459305.1|1752764_1753502_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYAVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMKDIQHNDETRVILMCPQGRPFTQKIAQELSSTEHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFQGMTVPDVLLSGNHAHIEKWRHKQKLIRTYLKRPDLLMAYPLSEQDKEIIESFKKQLKKG >NZ_CP038807.1|WP_037540673.1|1752264_1752765_+|ribosome-maturation-factor-RimM MQVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSHSDFTDTRFQPGEVLTLKHNNDNVELTVTSYRIHKGFHMLKFEGFDNINDVESFKGDYLYQERDHEGIELAEHEFYYSDIIGCTVFNGEIPIGRVTNIIETGANDVWVVKGDKEYMIPYIADVVKDVDIENKTIMITPLEGLLD >NZ_CP038807.1|WP_002491838.1|1765558_1766431_+|DNA-protecting-protein-DprA MDDIVLLKLRYSGIQAPQFQRLIHAYPNFLSFSEDDLLNLLSKTEIKKWFGDIAAQYKRISEDYILTSLYDASVKFITINSQCYSTLLKEIYDFPPILFYRGDISLLNSNTTLAVVGSRKATSYSYKALDFLFSQFNRRFTIVSGLAKGADSMAHELAIQHHHATIAVLGFGHLTHYPKETYILRQKIEAHHLSISEYLPFEPVTKYHFPQRNRLISGISKGVLITEAEKRSGSQITIAHALDQNRNVYVLPGDLFNPLTQGNLYRAREGACIVTGAEDILMDYDINKVF >NZ_CP038807.1|WP_002459295.1|1766602_1768672_+|type-I-DNA-topoisomerase MADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDVDDNFEPKYITIRGKGPVVKELKKYAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSNILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKHPRDIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYQKSKFTAKFLHYKNKPFKLQNKDDVNKVTAKLDGDQFEITNVNKKEKTRNPAQPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMIAQQLYEGIDLKRQGTVGLITYMRTDSTRISDAAKNEAKSYITENYGSNYVSKRQAKGKQGDQDAHEAIRPTSAMRTPNEMKSYLSRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPNLKEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLDSKRFVPTELGEIVYEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDMKWRKVIDDFYNSFKLDVARAEKEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKTIGVTCPTCKKGDVVERKSKKNRIFYGCSNYPECDFISWDKPIGRDCPKCEHYLVEKKKGRSSQVVCSNCDYQEEAQK >NZ_CP038807.1|WP_002459294.1|1768723_1770031_+|FADH(2)-oxidizing-methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)-C(5))--methyltransferase-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGINVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNAVGVLKEEMRRLDSLIIKAADQAKVPAGGALAVDRHDFAGYVTDALRSHPNVTVLNEEITQIPDGHSIIATGPLTTSSLAQEIVNITGKDQLYFYDAAAPIIEKDSIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLAAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPFAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIQLIPGLENVEIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELIGNEHIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGVNLAHKLLAKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNDKNFQPMNANFGLLPVLEKRIKDKKERYETLANRALEYLEKYKKTL >NZ_CP038807.1|WP_002491833.1|1770162_1771056_+|tyrosine-recombinase-XerC MNEIQKAFLYMLKVERNFSDHTIKSYHDDLMQFNEFLAQEMLTLSAFEYKDARNYLSYLYNKNLKRTTVSRKISTLRSFYEYWMTQDETVINPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEAEMDALFETVLHDAKKGLRDRVILELLYSTGMRVSELVHIKKMDIDLTLPGVKVLGKGSKERFLPFGEFCKQSIEQYLLEFGPVKQNDHPFLLVNMNGQPITERGVRYVLNDIVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSKDQLRKVYLNAHPRAKKERN >NZ_CP038807.1|WP_002459292.1|1771056_1771599_+|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MSTSIHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYDDKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKSGILVVSGTGEVIAPDDDIIAIGSGGNYALSAGRALKRHAAHLSAKEMAYESLKVASDICVFTNDNIIVETL >NZ_CP038807.1|WP_002478282.1|1771645_1773049_+|ATP-dependent-protease-ATPase-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSQLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEETKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKNQKKAMVKDEAVAKANDKLVKLLVPSMKKKAAQGNNPLENLFGGAIPNFGNNQEDEEEPPTEEIKTKRSEIRQQLLAGKLEDEKVRIKVEQDPGALGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVPVKTARNILADDFADELIDQETANQEAIELAEQMGIIFIDEIDKVATNNQSSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLTVNDFYRILTEPKLSLVKQYEALLKTEEVTVNFTDGAITKLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPNAVVDITPQYVDEKLKSISTNKDLSAFIL >NZ_CP038807.1|WP_002459290.1|1773070_1773844_+|GTP-sensing-pleiotropic-transcriptional-regulator-CodY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISNVTVTNVFIVSRRGKILGSSLNELLKSERINQMLESKHIPEEYTEQLMEVKQTQSNIDIDNVLTVFPPEDRETFINSRTTVFPILGGGERFGTLVLGRVKDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAINMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERNK >NZ_CP038807.1|WP_002459289.1|1774062_1774851_+|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFIKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFDVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAVLEGQQGVSNEEVAAEQNIDLDEKEEAKDAETTEENTSVESN >NZ_CP038807.1|WP_002459288.1|1775034_1775913_+|elongation-factor-Ts MAISAKLVKQLRERTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDTKPESVDALMETKLPNGQSVDEKMKEAISTIGEKLSIRRFAVKSKSDNDAFGAYLHMGGRIGVLSVVEGSTDEEAAKDVAMHIAAINPKYVSSEQVSEDEINHEREVLKQQALNEGKPANIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKDPDQTVEAFLKSKGGKLVDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >NZ_CP038807.1|WP_002459287.1|1776049_1776772_+|UMP-kinase MTQTSKYKRVVLKLSGEALAGEKGFGINPIIIKSVAEQVAEVAKMDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDPNAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807_5 | 2021938-2022020 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038807_5
>5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAAATGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_5
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_5 >merge|NZ_CP038807|5|2021938-2022020|CRISPRCasFinder TTTTGCATTTCTCTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAAATGCTTTTGCATTTCTCTTTGTTGGGGCCCC >NZ_CP038807|5|4|2021938-2022020|CRISPRCasFinder TTTTGCATTTCTCTTTGTTGGGGCCCC ACCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAAATGC TTTTGCATTTCTCTTTGTTGGGGCCCC
>NZ_CP038807.1|WP_002492339.1|2020734_2021643_+|aldo/keto-reductase MQKNILKSGIEISELGLGCMSLGTNFKTVQSIIDCAIEHGITYFDTADMYDRGMNEELVGKALKKYHNRGDIIVGTKVGNRLLDNGQTTWDPSKKHIKEGVKQSLKRLKMEHIDLYQLHGGTIDDPIDETISAFDELKQEGIIRSYGISSIRPNVIDYYLKHSQIDTIMSQFNLIDNRPERLLEQIHAKQVKLLARGPVFKGLLTANSIDVLDSKFHEGIFDYTHHDLGETIASIKEIDNNLSALSFNYLVSHDALGSIIVGASSVKQLEENVHNYLIKLSLDKVKAARHRVKNIEYTQHLT >NZ_CP038807.1|WP_002478158.1|2020108_2020651_-|NUDIX-hydrolase MDFTETTIDRTVIYNGKIIDLELHEVELPNGKRAKRELIYHNGAVAVCAVTPENEVLLVKQYRKPIEQPLLEIPAGKLEQGEQLESAAKRELSEETGYVAEHLVHITDMYGSPGFSNEKLSIYFTDKLSPGKMHLDDDEFVELHKIPLTEISQRLATNEITDAKTIIALQYLLLHYNNSK >NZ_CP038807.1|WP_002459058.1|2019535_2020000_-|transcriptional-repressor MEDRLNRVKQQLQQSSYKLTPQREATVSVLIENEKDHLSAEDVYLKVKDRAPEIGLATVYRTLELLAELKVVDKINFGDGVARFDLRKEGAKHFHHHLVCMECGRVDEIEEDLLPQVEERVETEFNFKILDHRLTFHGICAECQAKGKGDNKSS >NZ_CP038807.1|WP_002478160.1|2018609_2019497_-|site-specific-tyrosine-recombinase-XerD MNTIIEEYLKFIQIEKGLSPNTIGAYRRDLDKYKLYLETRHIEHIDFIDRQTIQECLGYLIDQGSSAKSLARFISTIRSFHQFALREKYAAKDPTVLLETPKYEKKLPDVLEIDEVVRLLEAPDLSKKNGYRDRTILELMYATGMRVSELVHIEIENINVIMGFVRVFGKGDKERIIPLGDTVIDYLKTYMKEIRPQLLKSTVTNVLFLNMHGKPLSRQGIWKMIKQYGIKSNITKTLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKAQIRQIYNQYHPRA >NZ_CP038807.1|WP_002478161.1|2018081_2018597_+|DUF309-domain-containing-protein MEKALIEFFYQFHRHQHYFLCHDILEDAWKEQPSYSKQDAIVSLILFTTASYHHRRHNYKGALKSYKKALVTICNAVETHQLPLNIEAYQQLIEEKIYQVTKQHEFIPIYLPMTSEAELIVKRFHSDYFFEPETLTDDYIIHHHKLRDRSAVNQARILAKKKKSHNKDFSD >NZ_CP038807.1|WP_002459061.1|2017256_2017988_-|segregation/condensation-protein-A MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >NZ_CP038807.1|WP_002492337.1|2016730_2017264_-|SMC-Scp-complex-subunit-ScpB MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSHGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEMEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP038807.1|WP_002478163.1|2015990_2016728_-|rRNA-pseudouridine-synthase MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGN >NZ_CP038807.1|WP_002459064.1|2015114_2015840_-|response-regulator-transcription-factor MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >NZ_CP038807.1|WP_002492342.1|2013382_2015131_-|HAMP-domain-containing-protein MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDARRISQVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAKINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >NZ_CP038807.1|WP_002491899.1|2022245_2023001_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MIGKHYVVTGGTSGLGLEIVKALLSHGAKVTLIIRDIEKYQSLSLNKYKGHIQTICCDLEQQNDIIALASQWSETIDGIIYSSGLGYFKSIAAHSNKEMIETYAVNLLGFHLLFYGLAPYLVNGASIVAISSQAAFVTQAHAAHYSASKAALNASLNALRIESPELHIMVVNAGPIRTPFHKKADPTMTYATKYSRLMIEPEQLAHRVIKGIIRKEQEINQPTWMHQLLKIYQLAPRTFERIFAPLFKNKM >NZ_CP038807.1|WP_002478155.1|2023088_2023901_+|pyrroline-5-carboxylate-reductase MKLVFYGAGNMAQAIFTGIINANKLESNDIYLTNKSNEERLKTFSTRLGVEYSYDDAALLKGADYVFLGTKPHDFETVAKRIRPYIQDNNRFISIMAGLPIDYIKQQLEVNQPVARIMPNTNAQVGHSVTGISFSNNFGPTAKQEVIDLVNAFGSVIEVDESHLHQVTAITGSGPAFLYHVFEQYVKAGTNLGLEKRQVEESIRNLIIGTSKMIERSDLSMEQLRKNITSKGGTTQAGLDALAEHNISGIFEDCLNAAVKRSIELSKNDN >NZ_CP038807.1|WP_002459053.1|2023988_2024912_-|ribonuclease-Z MEVTFFGTSAGLPTKERNTQAIALNLEPYSNSIWLFDVGEGTQHQILHHSIKLGKVDHIFITHMHGDHIFGLPGLLTSRSFQGGESKPLTLVGPHGIKAFVETTLSLSESHLNYPITFIEIDDGFSYHHNGFKVTAKVLNHGIVSYGYRVEAPTTPGKINVEALKALGLEPGPKYQEVKDNDTFEFNNIIYKSQDFKGLAKPGPIIAIFGDTKPCANEKIIAQDAQLMIHEATYIEGDKVLANNYHHSHIDDVFQLIHQAHVKQTLITHMSNRYNKEDIHHIYNHLLQQDNVPNFIFVNDFDTFKIE >NZ_CP038807.1|WP_002478153.1|2025066_2026551_+|glucose-6-phosphate-dehydrogenase MSTKNKHIPCLITIFGATGDLSHRKLFPSLFHLFQQNNLDEHIAIIGIGRRDLTNDEFRQQVASSIQHHVGNTDLLDEFMTHVYYHRHDVNDEASYQSLLTFSNELDKQYQLQGNRLFYLAMAPQFFGIISDFLKTSGLTNTHGFKRLVIEKPFGSDLKSAESLNKQIRRSFKEEEIYRIDHYLGKDMVQNIEVLRFANAMFEPLWNNKYISNIQVTSSELLGVEDRGGYYESSGALKDMVQNHMLQMVALLAMEAPISLKSEDIRAEKVKVLKSLRKLEPEEVKQNFVRGQYGEGYIDNKPVKAYRDEDRVANDSNTPTFVSGKLMIDNFRWAGVPFYIRTGKRMKSKTIQVVVEFKEVPMNLYYESDKLLDSNLLVINIQPNEGISLHLNAKKSIQGIETEPVQLSYAMSAQDKMNTVDAYENLLFDCLKGDATNFTHWEELKSTWKFVDIIQEEWTLNDPVFPNYESGTNGPLESDLLLSRDGNHWWDDIQ >NZ_CP038807.1|WP_070673702.1|2026692_2027574_+|AraC-family-transcriptional-regulator MDVIKQLQQAIVYIEDRITEPFNLQELSDYVGLSPYHLDQSFKMIVGLSPSNYAQARKMTLAAEDMIQNSSRLVDVAKKYQYANANDFANDFSRFYGLSPIQASTKKNELKIQKRVYIKLSTTEREPFPYRLEETSDIALVGHARYINTNQLSNPFNVPDFLEDLYLDGKIKDLLKYNNVSPYELFVISCPLDNGLEIFVGVPSDRYPMHLESRRLPGRHYAKFNLHGEIDYAVNEAWHFIETSLQLTLPYERDSLYVEIYPHEISFEQPTKIQLWLPIQQETYHVDSEDEIE >NZ_CP038807.1|WP_037555001.1|2027838_2029485_-|alpha-glucosidase MKRNWWKEAVAYQVYPRSFNDSNNDGIGDLPGLIAKLDYLKDLGIDVIWLSPMYQSPNDDNGYDISDYQAIMDEFGTMSDFDQLLNEIHARDMKLILDLVVNHTSDEHPWFIESKSSKNNPKRDWYIWRDPKEDGSEPNNWESIFNGSTWEYDTQTQQYYFHLFSKKQPDLNWHNPEVRTVIFDMMNWWFDKGIDGFRVDAITHIKKTFEAGDLPVPIGKSYAPAFDVDMNQPGIQAWLQEMKDKSLSHYDIMTVGEANGVNPDNAEEWVGEDEGKFNMIFQFEHLGLWSTGDQKFNVNAYKNVLNHWQKRLEGIGWNALFIENHDQPRRVSTWGDDEKYWYESATSHAVVYFLQQGTPFIYQGQEIGMTNYPFESIETFNDIAVKNEYQIVKKSGGDVEKLLDKYKMENRDNARTPMQWDDSVNGGFTEGQPWFPVNPNYKTINVKEQLSNEHSVLNFYKKLIKLKKSDDIYTYGQFDLVDADNSKIFAYTRTLGDKTVVVAANLTKTEAKLNLPFDITHAKIKLHNYPSEVILEKVQPYECFVAEL >NZ_CP038807.1|WP_002491900.1|2029496_2030501_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MARYANVSPSTVSRVIKGNKKISLATIQKVQTAMDELNYFPNQAARTLITKKTNTIGLIFKSETNLLRQNPFYNDVITGISNTCNQFNYATNTTVSNNEKDLLKEVQYFIDSKKVDGFILLYSKENDPIFQLLVNLGIPFVVIGKNYNKNDVIHIDNDNIEAAYKLTDWLILQGYQDILFLSEKGNYAVSADRTIGYQQAMIDASLYPKVHNISNQRLDLQQFVKYLLCLQQLPHAIITSDAMLNLHLLSVLYDNHVFIPKDIGTATFNYSFITESASPPQTCININTECLGQTAATQIINLLAQQQVSNVENQNIYIPTSIIQRQSTQINIKE >NZ_CP038807.1|WP_002492590.1|2032246_2033371_-|M20/M25/M40-family-metallo-hydrolase MINQSRLVDTFLELVQIDSETGHESVIQPILKTKLKQLGLNVIEDQASQHDGLGANNLICTLPSNNTNRDIDKIYFTSHMDTVVPGVNIQPEIKEDGYIYSDGTTVLGADDKAGLAAIIEMIRHIQEHNILHGQIQFIITVGEESGLLGAKALDDSLLDADYGFAVDASVDVGTTVTGAPTQMLLEAIIKGKTAHASTPNKGVSAINIAAKAISKMKLGQIDNVTTANIGKFHGGSATNIVADEVVLEAEARSHSDTMIKQQIHHMKETFESTAKALGGAAEVNVVKSYPGFKIPDDALVTQIAVNSAHALGLSGDTVISGGGSDGSIINMLGIPTVILGVGYEAIHTTSERISVTALCQLTEQLIKIVENVAK >NZ_CP038807.1|WP_014533303.1|2033526_2033622_+|stressosome-associated-protein-Prli42 MNNKVLRVIIIVMLVAVVAALLLTSLVPFMQ >NZ_CP038807.1|WP_062248827.1|2033808_2034291_+|IS200/IS605-family-transposase MSSDTNSLAHTKWNCKYYIVFAPKYRRQVIYGKIKKDIGMILRQLCERKGVEIIEAEACKDHIHMLVSIPPKIGVSSFVGYLKGKSSLMIFDRHANLKYRYGNRKFWCKGYYVDTVGRNKKVIENYIRNQLQEDIVADQISMEEYLDPFTGEEIKKRKKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP038807_6 | 2194873-2194963 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038807_6
>6.1|2194897|43|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder AGTGCTTCTTATGCATGAGCTTCAGCTCAGGTATTCCTTTATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_6
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_6 >merge|NZ_CP038807|6|2194873-2194963|CRISPRCasFinder GCACTTAACGAGCATGGCGAGTTTAGTGCTTCTTATGCATGAGCTTCAGCTCAGGTATTCCTTTATTGCACTTAACGAGCATGGCGAGTTT >NZ_CP038807|6|5|2194873-2194963|CRISPRCasFinder GCACTTAACGAGCATGGCGAGTTT AGTGCTTCTTATGCATGAGCTTCAGCTCAGGTATTCCTTTATT GCACTTAACGAGCATGGCGAGTTT
>NZ_CP038807.1|WP_002493149.1|2192191_2194825_-|DNA-polymerase-I MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYTPEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMSKDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEHNFEVIHHFDNINFKKLDNAIIHFEIYGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLASYIIDPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLELPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAVDVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKAFKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIHGDDIHAATAMKVFGVEKNQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK >NZ_CP038807.1|WP_002493150.1|2191302_2192175_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVEHVKRGIEPFIINTIIKSVTFSSKVIDGKSDGKETIIKGINLDGFRQFTEGYKIYKVERRSKYINIYIEKNQERRVLISHLGMAGGFFIVNHLDEIYAPNYRKHWHVIFHLSNGKLLVYSDIRRFGEIRNVQALNNYASFKNMAPEPFDESALDHYLTYLNQPKVKHKPIKQLILDHKVIAGCGNIYACEALYRAAIHPATEVQSLNQQARQNLFLEVQAVLNEGIKYGGTSISDYRHADGKTGTMQLRLNVYKQQQCKKCGHKIEQQVIATRNSHFCPVCQK >NZ_CP038807.1|WP_002458885.1|2189534_2190536_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MSTNIAINGMGRIGRMVLRIALKNEALNVVAINASYPPETIAHLINYDTTHGRYDKRVEPIESGIRVEGHDIKLVSDRNPENLPWKDLEIDIVIEATGKFNHGDKAKAHIQAGAKKVLLTGPSKGGKVQMVVKGVNDQDLDTDTYDIFSNASCTTNCIGPVAKVLNDSFGIENGLMTTVHAITNDQNNIDNPHKDLRRARSCGESIIPTSTGAAKALKEVMPELNGKLHGIALRVPTQNVSLVDLVVDLKQKVTVDEVNHAFRDANLQGIIDVEEAPLVSKDYNTNPHSAVIDAKNTMVMGDNKVKVIAWYDNEWGYSNRVVEVANQLGELIK >NZ_CP038807.1|WP_002493146.1|2188354_2189362_-|biotin-synthase-BioB MNLANQIINGKYLTQAECLKIYRDASLATLDLVHEAYLIRRHYFGHKVKLNMILNAKSGICSEDCGYCGQSREMKHKQRYALVSNETICKGADVASNNKIGTYCIVMSGRGPSDKEVEHITKTVKDIKKDHPQLKICACLGLANEEQAEKLKAAGVDRYNHNINTSESYHGQVVSTHTYDERIQTLSYMKEHHISPCSGVICGMGESDEDIIDMAFALKKIDADSIPVNFLHPIQGTKFGSMDDLTPMKCLRILSIFRLINPTKEIRVAGGREVNLRSLQPLALQIANSIFVGDYLITGGQPNELDYQMLEDLGFEIDYGNDDEITFSHPQFKSK >NZ_CP038807.1|WP_002458887.1|2187567_2188038_-|transcriptional-repressor-NrdR MKCPKCSSTHSKVVDSRHADEANAIRRRRECEKCGTRFTTFEHIEVSPLIVVKKDGTREQFLREKILNGLVRSCEKRPVRYQQLEDITNKVEWQLRDEGHTEISSRDIGEHVMNLLMHVDQVSYVRFASVYKEFKDVDQLLASMQGILNDNKRSDS >NZ_CP038807.1|WP_002478057.1|2186190_2187567_-|helicase-DnaB MTMQAYQFDLRPRDSFEVIRHFELSQAHLEILNRLYAPLIGTHAIGLYHYLNQFVSENNQELLTHYTIMNELKVNLLDFRKTMDYLEGIGLLKSFVRHQSDNSNFIYELIQPPTAYQFFNDPMLSVFLFSEVDKKRFVQLKQYFEQDRKDLTNYQNITHKFTEVFKMPNKDIKIDSQNIKSSQYYKGLDLSNEHFDFELLKELLQHHFISSEIVTDEAKALILQLATLYGLTVEAMKRMILNSITSAQTLSFEELRKQARSYYLIEHEQQLPKLAINADKYYDSESQHTRDNSTNTKQDEWLSSLDNISPVDMLSSWSGSEPTHQQKLMIEELVSREKLPLGVINILLQFVMLKNEMMLPKKYIFEVASNWKKLGISNAKEAYERALKMNEPKQVERKPQNAKNRYYGKQIVSREKTPKWLENRDTAKRQEKIKKKDDNLEKDRQQFLEQLKKDWGDD >NZ_CP038807.1|WP_002458889.1|2185270_2186191_-|primosomal-protein-DnaI MKSFKNIMGSDSNLEQRISQIKQQVINDPDVKQFLTMHQSELTNAMIDRDLNVLQEFKDQQKHYDGHDYHSCPNFVKGHIPELYVEDERIKIKYLPCPCKIKYDEARFDSQLVTSHHMQRDTLNAKLNDIFTEDRDRLEIAIKANHICKSIINGESVKGLYIYGPFGTGKSFILGAMANQLKSQKVASTIVYLPEYIRSLKNGFKDGSYEQRLARIREAGILMLDDIGAEEVTPWVRDEIIGPLLHYRMVQELPTFFSSNLSFEELEHHLSITREGAEKTKAARIIERIKSLADDVYLEGKNYRNN >NZ_CP038807.1|WP_002493141.1|2182973_2184911_-|threonine--tRNA-ligase MTKINIQFPDGNKKAFDKGITTEEIAQSISPGLRKKAVAGKFNQQLIDLARPLEEDGEIEIVTPGSEEALEVLRHSTAHLMANALKRLYGNVQFGVGPVIEGGFYYDFDMENKISSDDFEKIEKMMKQIVNENHKIERKVVSREEAKEFFKDDPYKLELIDAIPQDEMVTLYSQGDFTDLCRGVHVPSTAKIKEFKLLSTAGAYWRGDSNNKMLQRIYGTAFFDKKDLKAHLQLLEERRERDHRKIGKDLELFTNNQLVGAGLPLWLPNGATIRREIERYIVDKEVSMGYDHVYTPVLANVDLYRTSGHWAHYRYDMFPPMKLDENEEMVLRPMNCPHHMMIYKNKPHSYRELPIRLAELGTMHRYEASGAVSGLQRVRGMTLNDSHIFVRPDQIKDEFKRVVHMIQDVYKDFGFEDYTFRLSYRDPEDKEKYMDDDDMWNKAESMLKEAVDELGLPYVEAIGEAAFYGPKLDVQVKTAMGKEETLSTAQLDFLLPERFELTYIGSDGEYHRPVVIHRGVVSTMERFVAFLTEETKGAFPTWLAPKQVEIIPVNVDLHYDYARNLQDELKSQGVRVEIDDRNEKMGYKIREAQMQKIPYQIVVGDKEVENNQVNVRQYGSQDQQTLERDEFIWNLVDEIRLKKHR >NZ_CP038807.1|WP_002493144.1|2181016_2182510_-|amino-acid-permease MSKIESQNGGIIRGLKDRHISMIAMGGCIGTGLFMTSGGAIHDAGALGALIAYAIIGIMVFFLMTSLGEMATYLPVSGSFSTYATRFVDPSLGFALGWNYWFNWVITVAADVTIAAQVIQYWTPMAGIPAWLWSCIFLVIIFSLNSLSVRIYGESEYWFALIKVVTVIIFIAIGLLTIIGIMGGKFVGFETFTKGEGPILGGNFGGSLLSILGVFLVAGFSFQGTELIGITAGESENPERAVPKAIKQVFWRILLFYILAIFVIGMLIPYDSNALMGGDNSISTSPFTLVFKNAGLAFAASFMNAVILTSVLSAGNSGMYASTRMLYSMSKDKLAFPIFGKTNKYGVPYLSLLLTAILVIIIFLVQKVSGNAYEYIVAASGMTGFIAWVGIAVSHYRFRRAFQRQHHNKKELKYKAKWFPFGPIFAGILCVIVIIGQDVDFIKTGEFDLNRFVITYMGIPVFLVFFIYHKLRYKTKKIPLEEVDLRQDVHMNEIKHH >NZ_CP038807.1|WP_002478060.1|2180277_2180805_-|translation-initiation-factor-IF-3 MSIIAKDQTQINEKIRAKELRLIGQDGEQIGVKSKREALEMAERVELDLVVVAPNAKPPVARIMDYGKYKFEQQKKEKEMKKKQKVINVKEIRLSPTIEEHDFQTKLKNGRKFLTKGDKCKVSIRFRGRAITHKEIGQRVLEKFADECKDIATVEQKPKMDGRQMFIMLAPVNEK >NZ_CP038807.1|WP_002458881.1|2195144_2196854_-|PAS-domain-containing-protein MLKFHQRLLLLLCTITIISFIGLGAIMHHSIYQTLTDKKVADLTKKTENYSKLEEQGKTEEIKNIAKNENISVKITEGNKIIFETKSHYDINPAIDNAANPSNIIYDRADEGYHYTFKNKFSNEAIYISGIDDEMVNLQKELWKYIALIGVVVLIAIYLAVRSIKRTYIRPINEVTYATSLLADGYYHVRVPESNVKETKALFVTTNELARRLQKLNNKQKIQSNRLKTTLENIPSSVLMIDKYGEIVVANHSYYEVFGLEEKVENKDYNDFIDDKIKQLILEAFKTEKSMYNQVEVNINNVHHKYFDVSCVPILSKSKKHLQGMVVVLHDITNLKKLENLRREFVANVSHELKTPITSIKGFAETLIEGAKDDVASLDMFLNIILKESNRIESLVMDLLDLSHIEQQRELETAYVNLSELAHNTVDNLQNQAKDKNIEIIDEISPDIIFKANKNKIAQVITNLLSNAINYSLENNRVIVRVYRQQSKVYLEIQDFGIGISKEEQKHIFERFYRVDKARSRDSGGTGLGLSITKHIVEAHHGVISVKSEPNKGSTFKVTFTDNYSNNEV >NZ_CP038807.1|WP_037540804.1|2196853_2197564_-|response-regulator-transcription-factor MSQKILVVDDEQSIVTLLKYNLETAGYIVEVAYDGEEALEKVEKVQPDLIVLDVMLPKKDGIEVCKTIRSDKNLVPILMLTAKDDEFDRVLGLELGADDYMTKPFSPREVVARVKAILRRSQFVNESANDAANEEDILIENIRIRPEFFEVYKDDELLELTPKEFELLLYLIERQGRVITREHMLNSVWNYEFAGDSRIVDVHISHLRDKLEENPKQPKLIKTVRGLGYKLERPKA >NZ_CP038807.1|WP_002478051.1|2197767_2199036_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MSAEKIVKTQDGLQVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKQIVWKEVLAGQKAYDETGEWLPSETLKTIEEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQQLDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTEEVKKVIDFLQNEMGASNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNGRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLAHNEFADKVFTWQQYDEIVENDGKEAANKAQERAEQQGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSELLSSVLMLEHLGWQEAADKITDAIESTIASKIVTYDFARLMDGATEVSTSEFADELIKNLK >NZ_CP038807.1|WP_002458878.1|2199083_2200202_-|citrate-synthase MAELKKGLEGVIAAETKISSIIGSQLTYAGYDIDDLAENAEFEEIVFLLKNYRLPTEEELADLKKKLNYYMTLNPRVYKHFEEYVTDNVHPMTALRTSVSYIAHFDPNAEGESEEKILERSIRIQAKVASLVTAFARVRDGKEPLKPKAELNYAGNFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALVLHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANERVMNMLSEVKSVDQVDDYLDEKFANKEKIMGFGHRVYKEGDPRAKYLREMSRKITSETGRSELYDISIAIEKRMKEEKGLIPNVDFFSATVYHSMDIPHDLFTPIFAVSRTAGWTAHILEQYRDNRIMRPRAKYIGEKDRKYIPIEER >NZ_CP038807.1|WP_002458877.1|2200543_2201902_+|amino-acid-permease MEDKLQRELSNRHVQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIAMTGPSILLTYILIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNKYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPQIPNWVSALFCVLILMTFNLLSARLFGELEFWFAIIKIATIVGLIVVGLVMILMAYKTQFGSASFANLYQNGIFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPQKTIPKAINSVPLRILVFYVGALAVIMSIIPWDKVSPDDSPFVRLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLADQQQAPPIFRSTNKQGVPHIAIIGSSVFLLVAALLNYIFPDATLVFTYVTTISTVLFLVVWGLILWAYINYSRRNPELHKQSTYKLPGGKYMGYIILLFFVFVFALLFVNVETRRAIYFTPVWFIILGLMYYRYKQMAKKTK >NZ_CP038807.1|WP_062248820.1|2202409_2202892_-|IS200/IS605-family-transposase MSSDTNSLAHTKWNCKYHIVFAPKYRRQVIYGKIKKDIGMILRQLCERKGVEIIEAEACKDHIHMLVSIPPKIGVSSFVGYLKGKSSLMIFDRHANLKYRYGNRKFWCKGYYVDTVGRNKKVIENYIRNQLQEDIVADQISMEEYLNPFTGEEIKKRKKK >NZ_CP038807.1|WP_161510808.1|2203193_2204954_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMLEKLMKAGMNVARLNFSHGSHEEHKARIDTIRKVAKKLGKTIGILLDTKGPEIRTHDMKDGLIMLEKGKEVIVSMTQVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLVELEVKEIDKANGEVRCEILNTGELKNKKGVNLPGVRVNLPGITDKDADDILFGIKEDVDYIAASFVRRPSDVLDIREILERENNHNITIFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPESVPIVQKDLIRKCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSFVNAIGVSVAHTALNLNVKAIVAATESGSTAVTISKYRPHSDIIAVTPSAHTARQLALVWGAYPVIKKGRKTTDDLLNNSVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGEKGTTNMMKLHLVGDEIAKGQGVGRESVVGQSVVADDASDLEGKDLSNSIIITTSVDETLVPYIEKVAGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTIVGVEHATKEIKDGILITVDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP038807.1|WP_002458875.1|2204971_2205940_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNNIEVYGIYQGYQGLLDDNIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPQFKEAEHRKVGIDNLRKRGIEGLVVVGGDGSYRGAQRISEECPEIQTIGVPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIECVDKIRDTASSHARTFIVEVMGRDCGDLALWAGLSVGAETIMVPEVKTEIKDVAEKIESGIKRGKKHSIVMVAEGCMSGQECADELMKYINVDTRVSVLGHIQRGGSPSGTDRVLASRLGGHAVDLLIQGKSGLGVGITHNQLTATPFDEIFKISDHKFNNDIYELAKKLSI >NZ_CP038807.1|WP_002492588.1|2206102_2207047_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLYDIKNKIESLKESQQKNDVDLQDEIDLLEASLKRETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTLLDYIPHIFDAFIEFHGDRNFRDDPAMVGGIAYLNEMPVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIAKNLIEMASLSVPVIAIVIGEGGSGGALGIGVANRILMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSSLAKMAAETMKITANDLLQLKIIDNVIEEPLGGAHRDIEIQAQHIKAAFENELAELSKLNKKQLAEDRYNKFRHIGSFVD >NZ_CP038807.1|WP_002458873.1|2207048_2207906_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRSSKKKKYLTVQDSKQNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAVSDEGSFQEFDKGMTSANPLDFPGYEEKIEKDQQKTDLQEAVVTGIATLENLPFGIAVMDSRFRMGSMGSVVGEKICRIIDYCTEHRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPEDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRKDMKETLAQILKMHQEVN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP038807_7 | 2431261-2431349 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP038807_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP038807_7
>7.1|2431284|43|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder ATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP038807_7
The CRISPR arrays of NZ_CP038807_7 >merge|NZ_CP038807|7|2431261-2431349|CRISPRCasFinder GTTTTTGACTGACTTCTCAATCAATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAGTTTTTCGACTGACTTCTCAATCA >NZ_CP038807|7|6|2431261-2431349|CRISPRCasFinder GTTTTTGACTGACTTCTCAATCA ATTTATAACTTTATTATACATAATCGTTTTTCTTTTGCAATAG TTTTTCGACTGACTTCTCAATCA
>NZ_CP038807.1|WP_000153640.1|2431024_2431243_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA >NZ_CP038807.1|WP_002445364.1|2430702_2431020_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MFNINIDEDEARELLEQAINVRVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >NZ_CP038807.1|WP_002445365.1|2430559_2430706_-|hypothetical-protein MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGCNLTGGLENE >NZ_CP038807.1|WP_001058489.1|2430357_2430567_-|hypothetical-protein MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVDGIEVVSEVSREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP038807.1|WP_002445368.1|2430031_2430355_-|DUF1474-family-protein MNWEIKNLFSDLKLLKDSFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGFSYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDKIIQKFHELEKASSENFGEESDDAQKLKITE >NZ_CP038807.1|WP_002445370.1|2429098_2429968_-|hypothetical-protein MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDGANDHGEIIKKHRNDKNVIYRNVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQSRIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALTVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKEYKQSNASPNVIGYTRRDSAYWRELSFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSYALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >NZ_CP038807.1|WP_002445371.1|2427375_2429085_-|DUF927-domain-containing-protein METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGVALYQLIPSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINVSKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNVKLFSNDKGFQKLIDSFRSKGTLQGYSKKVFAQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDQPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKKAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIVGDGYDSVNYGDVKAVYKHDFLCIKNETVKNKLGHEMQTITGQWNKKGYLITDKKRLQKQVKHKSERHLGYAIKKEIIEELGFDFSHSHNPYNENY >NZ_CP038807.1|WP_002445372.1|2426662_2427028_-|hypothetical-protein MEKEQLKQYMYDYVKEYEEIPIYQLEDLFKELDHDYKGKTSVTHDQDKNIVFWSGWNKLTMYALIELVKGEHLDLVYRGSYVMRYLLDGRVPSLPLAITYPEYGQQTEVPSWVPMLLRVTK >NZ_CP038807.1|WP_002492310.1|2426007_2426649_-|pathogenicity-island-protein MNIEIIANQFETRAAALLRYYTGLLESSKKTPFGFKIYNDPFDMVYVVMEGNLYGHIYIKDCNVRKAFELASPKHTEGLIRSIEGHYAGYEIPDGTHDTISDMMASFMFDNDYFMYGLETFAESNNTDMFTYIEGGLNVEELEGVQSSNADVIGNIEILYQLATGINEPASELVEGLKLVTAFVQDENATLDDYKALERKLSELKSSYYSLSK >NZ_CP038807.1|WP_002445374.1|2425375_2425720_-|hypothetical-protein MQKLVEKEKTYNLPDEHRQVLNVIRNTSKKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYAYPIGCSYKRNERGYYIITTEQEKQQAMISIKKLADGSMKRYEALKRIEV >NZ_CP038807.1|WP_002445345.1|2431415_2432090_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMTQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKCTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY >NZ_CP038807.1|WP_002492309.1|2432103_2433276_+|site-specific-integrase MASYEKRGNTWRYRISLGKDAKTGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRTGDYIAPSTSTFKQVANDWLKQYANEVKVSSVRAREKAIHHAIERFNNKPIQTINKHDYQRFVNDISAQYSKNYIDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEIAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQYQILTPKTESSIGKIPVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >NZ_CP038807.1|WP_002461410.1|2435024_2435309_-|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP038807.1|WP_002461411.1|2435489_2436230_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSRIWISFLTIVIYALAQYLPVFIIKLTSFQIKSPTQLLHVAIYIQVILFIIAAIIIILLQKVIKNPTKLESDYKEPKRYLVQYALLGFIVVMIYQMFAGLINTWIFGELKASPNTERLMDIARQAPIFIILISIVGPILEEYVFRKVIFGEILDRLKGNIVMRFLIASVVSSLLFALAHNDITFIIVYFGMGMIFSLAYVLTKRIAVSIMIHMMQNGFVVIMQVCFGDVLKHLQTQANAIFHLFF >NZ_CP038807.1|WP_062248909.1|2436648_2438157_-|hypothetical-protein MTRKKTKIKYLSASFAIAVSTQVISPHITHAQDNTLYNKVTNEKSTAHSDNLSQDNSNQKDSDNTNQPSNSSNSANNEGKDNRPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPSDGKDNGGTPSHPQPPTQNGGHGHKPTNQPNNKDNNNGQNNGNGNQGWNTSNGQQYPQNGEKTDHNVSDDFINQINGRGHDSGRNSSSYFPRNHYDEGPVANNQRQSIMKRFKSLAIGSFKYNPFIIEQVNKLGESGNQVSDQDLYALFRKQNFSGNSYLNSLQRGSNYFRFEYFNPTNSSKYYKNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPVDKKGEDNHTQRSEDKIISAEGEDHKQGMTDVKFNRLNITLIGSMCVIFVAVMVYWFINRQKEKEQ >NZ_CP038807.1|WP_002461413.1|2438350_2438974_+|nitroreductase-family-protein MGLFSKNSEKSFLNAIEGRRTVYNLKESISISDEELEQIMTQAIKHVPSAFNSQSTRIVLLLNNKNKQFWDNTKAVLKEKMGADRDFTATEQKIDNFKHSYGTILYFEDQSVVKGLQEQMPSYAENFAIWSTQANAMHQFAIWTALSTKGIGASLQHYNPLVDAVTHQDFDIPETWELMAQMPFGDVREEPNEKEIQPVDARFLVRK >NZ_CP038807.1|WP_002492308.1|2439108_2439894_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKLQLLQFNVAYADVNANEHKIKTWFSNSLQQDTDVVILPEMWNNGYALEQLEEKADFDLERSTDFIKNLALQYQVDIIAGSVSNKHHDHIFNTAFAIDKTGKVINQYDKMHLVPMLDEPAFLTAGKNVPETFKLSNGVKVTQMICYDLRFPELLRYPARSGAAIAFYVAQWPSARLNHWQVLLKARAIENNMYVIGCNGCGYDGKTQYAGHSVVINPNGEIIQELSTTEKELTVTIDIDAVEQQRKAIPVFDSLVPHLYK >NZ_CP038807.1|WP_002461415.1|2440440_2441088_+|accessory-gene-regulator-AgrB MRIKQLGINDQMNCVKLYNDTKERDANLKAIDKKIERFARYLQRQNNLDHIQFLKIRLGIQVALGNFFKTIVTYGVALLFHTFLYTLITHLTYFFVRRFAHGAHARSSLLCHIQNLVLFVALPWSIVHFQVSWTFMILLAFIAFIIIICYAPAATKKQPILPHLRKKKKRNAILISICFLVLMLFVSEPYMQLIALGMCLEAITLLPIFFSKEET >NZ_CP038807.1|WP_002461416.1|2441090_2441234_+|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNLLSGLFTKGISVIFEFIGNFSVQDMCNGYFDEPEVPQELIDLHRN >NZ_CP038807.1|WP_002461417.1|2441254_2442544_+|GHKL-domain-containing-protein MEYLNSIFISIFQAVMLIIVAKIIANVKFYLRDYLAVAGIIVPSAVLFVVFGRQSIIFLLIICLIYFYVKIGFYSIIAILGSALIMYISNFFSVSLIILIGNFIKFRIIYVIISLSSYILIGVLCAFMTKYLINKLKKTYLFFNKVYIIVISTFLTFTIAIFYLYSLKFQQTYQEWKLFALLFIGILIFLAIFIIVITFSVHREMQYKRNLKEIETYYEYTLQIESINNEMRKFRHDYVNILSTMSEYIREDDMPGLREYFNNNIVSMKDNLQMNSIKINGTDKLKVRAIKGLVTTKILQAQEKNIPISIEVPELIEHIEMNTVDLSRVIGIIIDNAIEASESLEDALIRIAFIKNEDSVLFIVMNKCSDTTPKIHELFQENFSTKGKNRGLGLSNLKEIIDATPNTLLDTTIDNGYFIQKVEILNNIP |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP038807.1 | 2052395-2052423 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 1295656-1295684 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 2021908-2021936 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP038807.1 | 646265-646293 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP038807.1 | 676876-676904 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP038807.1 | 839839-839867 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP038807.1 | 1664513-1664541 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP038807.1 | 1934835-1934863 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 676779-676807 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 676836-676864 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 839798-839826 | 1 | 0.966 |
| NZ_CP038807_4 | 4.1|1765099|27|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 1765099-1765125 | 27 | NZ_CP038807.1 | 1207737-1207763 | 2 | 0.926 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 2239337-2239365 | 2 | 0.931 |
| NZ_CP038807_5 | 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 2021965-2021993 | 29 | NZ_CP038807.1 | 2400764-2400792 | 2 | 0.931 |
1. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to position: 2052395-2052423, mismatch: 0, identity: 1.0
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer tccgttggctttcttttcgaaagcctatc Protospacer *****************************
2. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 1295656-1295684, mismatch: 0, identity: 1.0
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttggtgaaatgc Protospacer *****************************
3. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 2021908-2021936, mismatch: 0, identity: 1.0
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttggtgaaatgc Protospacer *****************************
4. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to position: 646265-646293, mismatch: 1, identity: 0.966
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer tccgttggctttcttttcgaaagcctctc Protospacer ************************** **
5. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to position: 676876-676904, mismatch: 1, identity: 0.966
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer tccgatggctttcttttcgaaagcctatc Protospacer **** ************************
6. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to position: 839839-839867, mismatch: 1, identity: 0.966
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer tccgatggctttcttttcgaaagcctatc Protospacer **** ************************
7. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to position: 1664513-1664541, mismatch: 1, identity: 0.966
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer tccgttggctttcttttcgaaagcctgtc Protospacer **************************.**
8. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to position: 1934835-1934863, mismatch: 1, identity: 0.966
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer tccgatggctttcttttcgaaagcctatc Protospacer **** ************************
9. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 676779-676807, mismatch: 1, identity: 0.966
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttggcgaaatgc Protospacer *********************.*******
10. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 676836-676864, mismatch: 1, identity: 0.966
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttggcgaaatgc Protospacer *********************.*******
11. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 839798-839826, mismatch: 1, identity: 0.966
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttggcgaaatgc Protospacer *********************.*******
12. spacer 4.1|1765099|27|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 1207737-1207763, mismatch: 2, identity: 0.926
atttcgaaattctctttgttggggccc CRISPR spacer atttcgcatttctctttgttggggccc Protospacer ****** * ******************
13. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 2239337-2239365, mismatch: 2, identity: 0.931
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgtttggcgaaatgc Protospacer ****************.****.*******
14. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to position: 2400764-2400792, mismatch: 2, identity: 0.931
accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttgacgaaatgc Protospacer ********************..*******
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807_3 | 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR | 1649590-1649618 | 29 | NZ_CP013746 | Arthrobacter alpinus strain A3 plasmid unnamed, complete sequence | 107154-107182 | 6 | 0.793 |
| NZ_CP038807_2 | 2.1|1248874|34|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder | 1248874-1248907 | 34 | NC_048170 | Escherichia phage vB_EcoM_Goslar, complete genome | 80796-80829 | 11 | 0.676 |
1. spacer 3.1|1649590|29|NZ_CP038807|PILER-CR matches to NZ_CP013746 (Arthrobacter alpinus strain A3 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tccgttggctttcttttcgaaagcctatc CRISPR spacer ttcgttggctgtcttctcgaaagcctcca Protospacer *.******** ****.********** .
2. spacer 2.1|1248874|34|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to NC_048170 (Escherichia phage vB_EcoM_Goslar, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
accccagcttgcgttgcacgtagaaatgcttggt CRISPR spacer cacggagcttgcgtggcacgaagaaatgcaaacg Protospacer * ********* ***** ******** .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
565981 : 603697
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP038807|565981:603697|DBSCAN-SWA 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33 | Streptococcus_pyogenes_phage(33.33%) | transposase,protease,integrase | attL 563819:563836|attR 590724:590741 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
931047 : 947473
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP038807|931047:947473|DBSCAN-SWA 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24 | Staphylococcus_phage(53.85%) | terminase,integrase | attL 936993:937052|attR 950075:950148 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1271791 : 1278412
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038807|1271791:1278412|DBSCAN-SWA 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ACAATCATTACAACAGCTTAATCCGTCAGCGCTAGTTATTTCCCCAGGCCCGGGTAAGCCTAGTGATTATCCGATAATCGCACAGATTATTGCAGCATTTAAAAAGCGTATTCCCATATTAGGTGTTTGCTTAGGATTTCAATGCATTTACGATTATTTTGGGGGCCGTATTATTCATGGTAAACGACCTGTACACGGCCACACAACAAAGCTTAATCATAATAATAAGGGGATTTTTGCTCAACTGCCACAACATTTTGAAGTGATGCGTTACCATTCTTTGATTGCAGAGCGTCAATCACTGCCGGCACAACTTGAAATTAGTGCTGAAAATGATGAAGGTATTATTATGGCAGTTCAGCATCGACAATGGCCTATTTATGCGGTGCAATATCATCCTGAATCAATTCTCAGTGAACATGGTCATGCACAAATTGAGCTGTTTATTAAAACTTTGGGGGTGAATCAGTGTGACAATACAATTTAATTATAGATATTATTTAGACGATTCACGCTACGAAACGCACCAACTTAAACTCACAGAAAGGTTAGGGCAATATCTAGCATATGAGATGAAAGATGTGGGAGACGTTATCAATTTTGCAGAACAACAGCAGAAAGAAGGGAAATATGTGGCGCTTTATATGACGTATGAAGCGGCACAATACTTTAATCCTGACATGGCTGTGCATCCAACTGCAGACGATGCAATATTAGCAGCGGCTTATAGTTATCAATCGGCACAGCCCATACAACAAGAGACGTCAATAAAGCATTATAATAATAAGCCACAACACCAGTTTGCCTTTCAAGTAAAAGAGGCAACTATGATTCAACATATCAAAGCAGTACAAGCAGCAATTATTGATGGCGAAACTTACCAGGTAAACTATACAACAAGAGTGAGTTCGCCAGTACAAATGCCAATTAAAGACCTGTATGATAAATTAACGCAAACTAAAAATGGCAATTACACCATGTTAATGGATACTGAAGACGTACAAGTCGCTTCTATTTCACCCGAATTATTCTTTCAGAAAGGGCCATTTGATGGTCAAGATAATGTAGTTGTGAGTAAGCCTATGAAAGGCACCATGCCAAGGTCAGATGTCAAACAGCAAGATCAATATAATTATAAATATTTACAACAATCATTAAAGGATAGAGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTATTGAGAAATGATATTGCTAGAATTGCACGAAAAGGTACGGTACATGTGTATCGTCCGTTTTTTATTGAAACTTATGCCACTGTATATCAAATGACAAGTATGGTTGCAGGTCAACTCTCAAATGCAACATTACCATTAGCAACGTTATTTCATGCGCTATTTCCTTGTGGTTCCATAACAGGTGCACCTAAATTAAACACGATGTCATATATTCACAAATTAGAAGACCAACCGCGTTATATTTACTGTGGTACGCTTGGCATATTGATGCCAGATGACAAGATGATTTTTAATGTACCTATTCGCACAATTGAATATCGTGATAATAAAGCGATATACGGTGTCGGCGCGGGTATTACTATTGATTCTGATCCTGAAAATGAAGTGCAAGAATTTCGTGATAAAGCTAAAATTTTGGAGATGCTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP038807|1271791:1278412|1272784_1273807_+|WP_002459768.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAELQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >NZ_CP038807|1271791:1278412|1271791_1272628_+|WP_002492999.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGLPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWPCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIEVHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK >NZ_CP038807|1271791:1278412|1275673_1276345_-|WP_002492964.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNEDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >NZ_CP038807|1271791:1278412|1276680_1277277_+|WP_002479366.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >NZ_CP038807|1271791:1278412|1274536_1275253_-|WP_002459766.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP038807|1271791:1278412|1277260_1278412_+|WP_002459762.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML >NZ_CP038807|1271791:1278412|1273847_1274438_-|WP_002493007.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVMAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY >NZ_CP038807|1271791:1278412|1275252_1275672_-|WP_002459765.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH |
8 | Staphylococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1293675 : 1311456
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP038807|1293675:1311456|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Caudovirales_phage(58.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1597197 : 1605667
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038807|1597197:1605667|DBSCAN-SWA 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ATTGTTATACGGCAAAGTGAATCATGAATTTGAAGCGATTGATTTAAGCGATGAAGTGACAAAGGGTGAAGCCGTTAAAAAGGCAATTAGAAATGGTGTGGCTTCACACGTACAGACTGTTGGCAAAGGTGGATTGTTAATTACTCTCGCTAGAATCAGTGCGCATTATAGTCTTGGATTAAAAGCTAAAGTAAATCTTTCAGATGCACAGTTATTCAGTGAAACGCAAGGACGTTATGTGATTGCTGTTAAAGCAGGACAAGAATTAAATATTGAGCATGCAATTGAAATAGGTCAACTTACAGATACGGATGAATTTAATGTTGCAGCTGCTCATACATCAATTTCTAAGAGAGCTTCTGATATAAAAGCACAATGGGAAGGAGCTATTGCGCAATGTTTAACTACAGTGGATTAAACGAAGAGTGTGGCGTATTTGGAATTTGGAACCATGCAGAGGCAGCTCAATTGACATATATGGGATTGCATAGTTTACAACATCGCGGTCAAGAAGGCGCTGGAATTGTTGTCACAGATGGTAACACATTAAAAGGTGAACGTGGTGTAGGGCTGTTAACTGAAGCAATCAAAGAAGTGCAAATGGAACAATTAAAAACAGGTCGTAACGCTATAGGTCATGTACGTTATGCAACATCAGGCAATAAAGGTATCGAGAATATTCAACCATTTCTCTATCATTTTTATGATATGAGCGTTGCAGTATGTCATAACGGAAATTTGATCAACGCACAATCATTACGACAATACTTAGAAAAGCATGGGGCAATATTTCATTCGTCGTCAGATACTGAAGTGATTATGCATTTAATTCGTAGAAGTAAAGCACCAACATTTGAAGAAGCACTAAAAGAAAGTCTACGCCAAATTAAAGGTGGTTTTACCTTTACGATTTTGACGAAGGATGCTTTATATGGTGCAGTTGATCCTAATGCCATTAGACCATTAGCGGTCGGAAAAATGCAAGATGGAACTTATATATTAGCAAGTGAAACATGCGCTATTGATGTTTTAGGTGGAGAATTTATCCAAGATGTTCACGCAGGAGAATATGTCGTTGTCAATGACGAAGGTATAAAAATAAAATCATATACAAAACACACAAGTACTGCGATTTCAGCAATGGAATATATTTATTTTGCGCGTCCAGACTCTACAATAGCTGGTAAGAATGTGCATGCAGTTCGTAAAGCTTCTGGAAAGAAATTAGCTCAAGAAAATCCTGTAGAAGCAGATATGGTTATTGGTGTACCTAATTCATCATTATCAGCAGCTAGTGGCTATGCTGAAGAAAGCCAGCTGCCTTATGAAATGGGATTAGTTAAAAATCAATATGTCGCTAGAACGTTCATCCAACCAACTCAAGAATTGAGAGAACAAGGTGTACGTGTCAAACTATCAGCTGTCAAAGACATTGTAGAAGGTAAAAAAATTATTTTAGTCGATGACTCAATTGTACGTGGCACAACTATTAAACGTATAGTCAAAATGCTCAAAGATTCCGGTGCTAAAGAAGTACATGTAAGGATCGCATCACCAGAATTTATGTTTCCAAGCTTTTATGGTATTGATGTTTCAACTACTGCTGAGTTGATTTCAGCGAGTAAATCACCTGAAGAAATTTGTGACCATATAGGTGCCGACTCATTAGCCTATTTAAGCGTTGATGGTTTAATAGAAGCTATTGGCTTAGACTATGATGCGCCATATAGTGGTCTATGTTTAGAAAGTTTTACAGGTGATTATCCAGCTGGTTTGTATGATTATGAAGAAAATTATTTTAAGCACTTGAGCCCACGACAAAAAGCATATATCGAGAATCACCAACACTATTATGATCGAGAGGGAAATAAAAATGTCTAAAGCTTATGAACAATCTGGAGTAGATATAGAAGCAGGATATGAAGCAGTAGAAAGAATGTCAGCACATGTAAAGCGAACACTACGAAAAGAAGTCTTAGGTGGCTTAGGTGGTTTTGGTGCGACATTTGACTTATCACAATTGCAGATGACAGCGCCTATGCTTGTGTCAGGTACAGACGGTGTAGGAACAAAGTTAAAGTTAGCTATCGATCATGACAGACATGACACCATTGGAATTGATGCCGTAGCCATGTGTGTGAATGACATTCTTACGACTGGAGCAGAACCATTATATTTTTTAGATTATATTGCAGCAAATAAAGTTGTTCCAGAAGTTATTGAGCAGATTGTAAAAGGAGTCAGCGAAGGATGTCAACAAACAAATACCGCACTGATTGGTGGTGAAACCGCGGAGATGGGAGAAATGTATCATGAAGGTGAGTATGACTTAGCTGGCTTTGCTGTCGGTGCTGTTGAAAAAGCAGAATACATTGATGGCTCAAATATAAAAGCAGGTCATGCAATTATTGGTTTAGCTTCTAGTGGGATACATTCAAATGGTTATAGCTTAGTACGTAAATTAATTAAACAGACTGACATTGATTTATACGATGACTTCAATGGTCAAACATATTTAGATACATTCTTAACACCTACGCGACTCTATGTGAAACCGATACTTGATTTAAAAGATAAAGTAACAATCATGGGGATGAATCATATCACTGGTGGTGGATTTTATGAAAATATTCCTAGAGTGTTACCTGATGGTTTAGCTGCGCAAATTGATGTGAATACATTCCCAACACCTCCTATTTTTGACTGGTTACAACAACAAGGACAAATTTCTACGGATGAAATGTATAACATTTTTAATATGGGAATAGGGTATACGGTCATCGTTAGTCAAGATGACATTGCTAAAGCACTAGATGTCCTAAAAAAACACGATGTCCCTGCTTATCACATAGGCAATGTTATAGAAGATGCACATGTGCCTATTTATCTCAAGGGGGTAGAATAGTGACTAAGGTAGCTATTTTTGCCTCTGGATCGGGAAGTAATTTCGAAAATATTGTTTTAAAAGTGGATAAAGGAGAACTCAACAATATAGAAATTACTTCACTTTATACTGATCATCACGATGCGTATTGTATTGAACGCGCAAAACAGTTAAAGGTAGCAGTTAATATCAACGAACCAAAAGATTTTGACTCAAAATCTGCCTATGAACACCATTTGATTCGTATACTAGAGCGTGAAGAAGTTGAATGGATTATTCTCGCAGGTTATATGAGGCTAATTGGTCCTGATTTGTTAGACGCATACGAAGGTAAGATTTTAAATATTCATCCATCATTATTGCCAAAATATAAGGGGAAAGATGCTATTGGTCAGGCTTTTAATAGTGGTGATAATGTTACAGGATCAACAGTTCATTATGTTGATAGTGGCATGGATACGGGAGAAATTATTGAACAAAGACAATGCGAGATCAAACCGGATGATACCAAAGAAAATTTGGAAGAACGAGTCAAACAATTAGAATATGAACTTTATCCTAGTGTTATAGCTAAGGTTATTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP038807|1597197:1605667|1599498_1599759_+|WP_002459451.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >NZ_CP038807|1597197:1605667|1599760_1600432_+|WP_002478380.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVNSWREQHV >NZ_CP038807|1597197:1605667|1598794_1599499_+|WP_002478381.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >NZ_CP038807|1597197:1605667|1597666_1598794_+|WP_002492672.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLRTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >NZ_CP038807|1597197:1605667|1600424_1602614_+|WP_002478379.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFVLKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLLTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD >NZ_CP038807|1597197:1605667|1602592_1604077_+|WP_037540539.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVVNDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV >NZ_CP038807|1597197:1605667|1597197_1597680_+|WP_002478383.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLEKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ >NZ_CP038807|1597197:1605667|1604069_1605101_+|WP_002478378.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDHDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKAGHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE >NZ_CP038807|1597197:1605667|1605100_1605667_+|WP_002492152.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHHDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFDSKSAYEHHLIRILEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2009293 : 2017988
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038807|2009293:2017988|DBSCAN-SWA CTTAGCTAAGAAATAAATTTTTAAGTTTATCTTCATAAGACATTTGACGTTTGACCTTTTTTCGATTATAAATTTTAAGCGGTTTTATATCAGTATCATGGTCACAACATATAGATGGAATATCAGGGACTTCTCCAAAAAATTCTAATAAGTATTTTCGACGACATTGATCAAGTTGGCTATAACTAAGCATACGATTAAGTGCGAGTTGTTTTCTCTCTTGTGCTATTTGGAAAATCTGTTTAAGTTGTGCATAAGTGAAATGAGAATGTAAGATTTCTAATATATCTTGCTTCAATGGCTCAATGTTTGCACCAAGTTCGTAGCAGTCAATATCATAAGGTAAAATCATATCTGCAAAAAGGATGGTTTCTAATAAATAGCGATCATCTGGTTGAAATAGGCTAATTGCTTGGCTCGGTTGCTGATCACGCCCTGCTCTTCCTATTTCTTGGAGATAACTAGACGGACTGGTAGATAGATGAAAATGAATAACCGTGCGAATATCCTTTTTATTGACTCCCATACCAAATGCACTAGTTGCTACAATGACTGGTATATCATTATTGATAAATTGTTGTTGGACGGTTTGTCGTTCTTGATAAGATAAATCACCATGGTATATCCCTGTTAAATACCCATGTTTATATATAGTCTTGGCTAATTCAACACACATTTTTTTAGACGAAACATAAATAATTGTTGGACCAGATTGTTCTATGTAGTGCATTAACCAATTCATTTTTTCTTGATCATTTCTAAAGTTAATGTGCTGAAAACTAATATTAGGTCTATTCATATGTGTTTTGATAACATGAAATGACACATTTAACAGCTGATTTAAATCCTGTTCCAAATGTGGCGGAGCAGTAGCAGTTAGCGCAAGGATGGTAGCATTTTTATAATAGTTGGTTATTTTACTAATAAGCGCATAATGCGGTCTGAAGTCATATCCCCATTCAGAGATACAATGTGCTTCATCTAGTACAATAAGACCAAAATCGATAGTTGAAATTAGTTTGAAGTTTTGAGGTTGTAATATAAATTCAGGACTTAAAAATATAAAGCGACTCTTCGCTAAGCGTTTCATATTCCAGTTTTTTTCATTATCATCCATACCTGAATGAATGTATGCAACAGACTGTTCTCCACTCATTTTTAATTGTGCAACCTGATCGTCCATCAAAGAAATAAGCGGGGAAATAATTAAAGTTGATTGCTGTAATTCATAAGTAGCCATTTGATAACATAGACTTTTACCGCTACCAGTCGGTAAAATGCCCAATGTATGATTTGAATCTAATACACTTTTAATAATTTCCTTTTGTCCTGCTTTAAAGTTATCAAAACCAAACCAGGATTTTAATTTATCCTCTAGCAATAAGCTCACCTCTTTCAATTCCAACAATCATTAGTTTTATTTCAAAATAAGACAAGTTTGGGAAAGCCTGTTTATATGCTTTTAATCGCTCTCCACGATGTTTGTTATAAAATTCATTAAATTGATGGAAACCGTCTTCAGATATGAAATCAAAATAATGAGTGATATAACCTTTAATAAATAACTCTAGTATATGATCTTCGATTGTATTCAGTTTGACGTGTTGTTTTTGAGCAATTTGCGTCATTGAAAAACGTTGTTTTAATTGTTGTTGGGTTATGTGTGTTTTATGTAATAATGACGGTTTAATGATACATTGACTAAGTATTGGATAACGATATTCTATTTCTAGTTCATACATTAGTGTTACAAGTTCGTTCATTTCTAGGTTAAATAAATGCTGTTCAGGTATACTTTCAATCAAACTGATTTGTTGACGGGTATACATTGGTTCTTCATAGCCTTGTAAATAATAATGTAGACAACAATAATTGTTATTATTTGTATATAGAGCTTTAAATAATTGATTTAGCTCAGTGATAAATGCGCTATCCTTATCTTCTTTTTTTATATAGTAGTAGATTTGTTTAACTTTTCTTTGGATAAGGCCATGCTGTGAAATAGGTATAAATGAATAGACCTTTTGTTGCGTGTTTGACAACGTTTGAATAAGTAATTGAATACAATTGAAAGTATGTACTAAACTATCATACGTATATCTTGGATGAACTTTTATCGTCATGTCATTGTTAACATTTTGTGCCATAAATCGCTCGAAAGACGGATATTTTAAATTGGGTAAACTGTGATATAATGATAAAAGTTGTTGACTGCAGGCGTCAAAAAAGGTTTGATGTGTTTTTTTGCCTGTTAATAAATTAAAAATGCTTTTATTTGTTTTATAAGTGAATGAATGTTGTTTAGAATAAAGTATAATATCTTTCAATCTCGACCCTCGCTCTTATGAAACTAATAAATTAATAAAAAGTTTTTTCGATGTATACATGAGTATTTGTTATACTAGTGTAGCATGTTTATCAAAGGAGGCGAATGAAAATGGCTAAATATACAATCGTTGATATGGATACGTGTATTGCATGTGGTGCATGTGGTGCGGCCGCTCCAGATATTTATGATTATGACGATGAAGGTATTGCTTTCGTAATCCTTGATGATAACCAAGGTACTGCCGAAGTGCCAGAAGAGTTATATGAAGATATGGAAGATGCCTTAGAAGGTTGTCCAACTGATTCCATCAAAATAGAAGAAGAACCTTTTGATGGTGATGCTTTAAAATTCGAATAGCACATAGCTATTTTATATATAGTAGATTAGTAGTTAAAGCAAAATATTAATTATAATAATTGCAGGCAATGTTTCTCAAATGGGAGCATTGCCTGCTTTGTATTTACAAGCGTATCTTTAAAAGTTTCATTTACCTGTTAATTATTTAAGTACGCTTTTAATTCTGCGATATAAAAGTATAAATATGATTGAGATGATTGCCCCTTTGATAATATTAAACGGTATGATACCAGAGACGATAATGATTTTTATATTTTTTACAATATCTGCTAAGTTGAAAATCATGCCATATAGTGGCAACAATACGAAATAATTTAAAATACTAAGTACAATGGTCATAACTAATGTAGCCATGACTAATGCAGTTATCATTGCTTTATTAGCAACATGTCCTCTTTTATTAACATAATATGCTGTAAGTAAGAAACTTATACCGGCTAAGAAATTAGCCACAGGACCTACTGGGTCTCCCATATTAAAGAAAAAATTAAGCAAATTTTTAATAAATGCCACTATAATACCTGCTATAGGACCCATTGAAAAAGTTGCTAACAATGTAGGGACATCACTGAAATCTAATGTTAAGTATGGCGGAAAAAAAGGTAGTGGAAACTTTAAAAAAGTCAAAACAAAGCCAATGGCACTTAACATGCTAATGGTTATTAGACGTTTATTTTGTTGCATATGTAGTTTTCTCCTTCCATTCATCTTGCAAAGAATTGGAGGAAAATTGTTCACAACAAATAAACCTCCATCTTCTCCCATCCAGACTATACTGTCGGCTCTAGATTCGCACTAGATCAGCCGCTTGTTGAACACAAGCAGGTCGCAGGCTTTATTTACTGCCGGTTGGGAATTACACCCTACCCCGAAGATGAATTTTAAAATATTTTACGTCATTAATCATACGACAACACTAGCCGCAAAGCAATAAAGTTGCCCGGTAAGAGATGATGATTGAGAGCGGGACAGAATTCATTATGATTTCGTAGTTCCGTATCGGAAAGGTTGACTAGGATGGAAAAAGCTTGGTATAAGGATATTTTCAATTCAGTCAACTACTGCCAATATATCGTGCATAGTTAATCTCAATATGTTTTAACTGATATTAACTATATATAAGGTCAGGCCGGCTCATAAACGTCTCTGCTTAAATAGCCTTCGTCCTTATTTTTATATTAAGTCAAAGTCCAGCACAGAAAAAACTGACTAAACCATTTTTTAACAAAGCAAGCTGAAGTAGTCTCCTAAGCATGCGAGTCAATCATACAAAGTATTGAATATAAAAAAGCACAAAGACGATTTTTAATTTTAAATCATCTTTGTGCTATTATTTGCGGGTTTATGTCCCTGTCTGAATTCAGTGATATTATCTTTGATAAATTTTATAAATAAGCCTGAAGATTAAGGCTTCGGTAACTTGATTGTAAATGTTGTTCCCTCTCCAACGACACTTGATACAGTGATCGTACCTCCATGTTCTTCTATAATCATTTTACAAATGAATAATCCTAAGCCGGTTCCTTGTTTGCCACGTGTTCTGGATGCTTCAACCTTGTAAAAGCGATCAAAAACAAGATTTAAATGTTCAGGAGCAATACCACTGCCTGTATCATTTATGTGAAGCACATTGTACTTATCAGTATCTTCGCTAGTAATAGAAATTGTATCACCAGGTTGAGTATATCTTGTAGCATTATCAATAAGATTTGTGAGCACTTGATCGATTCGATCAGAATCGTAGTACCACAATGCGTCATTAGTTTCTGGAGTTAAGTACATATTTAATGATAAATCACTAGCTTGTTGTCTATACTTTGTTTGTATTTTGTTTAATAATGGTGCAATAGGTTGTATCTCTTTATTAACAGATAACCCTTCAGCATCCATTCTTGCAACATTGAGTAATTCATTAACTAAACGATTGAGCCTATTCGTTTCATCTAAGACAATTGATAATGACTCTTTAATTTCTTCTGGTTCCGTAACGATACCGTCAACAATTGATTCTGTATATCCTTGTAATAATGAAATAGGTGTACGCAATTCATGAGAAACATTAGCAATGAAATCTTTTTTCATTTGATCTAAGTTATGCTCATTAGTCATATCACGAATAATAACGACAATTCCACTGCGACCATCTTCTTGAATCTGAGGAATGTAACTCATAATGAAGACATAATAGCGTGTGTCAAAATCGTATTCTCGAAATTCTGTGCCTTTACTTGTAAAAGTATCTTCGATTTGGTCTTCAATTCGTTCATACATAGATTGATCAATAGTTGGTAAAATTTCATCTGCCATTTTATTTGATAATATAATGTCGCGATGATCATTGATACCTACAACACCTTCAGCCATTGAATTAATTAAACTATCACGAATATTTTTTGAGGTTGATAGTGCTTGAACATTTTCCTGAATTTCGAAACTCATGTCGTTTAATGCGCGAGATAGTTCACCAATTTCATCTTTAGTTGTTACAGATGAAATTTGAGAATAATCCCCTTTAGAAACACTTTTAGCCTGATTTCTAAGCTTTCTAAGTGGTTTAGTAATTCTATTAGATAGGAAAAAAGCGAAGACAGTTGAAATACCTAGGAAAATAATTGCAGTTATCAGAATAATAATCGTAATAGCGTTATTGGTATCTTCTATGGATTTTAAATCCTGATAAATAAAGACGCCACTATAATGACTGTGACTTCCCTTTTGAGCTTTCATAGGATAACCCAGTAAGATATAAGAACGAGAATGGTCATTATGTTTTAATGTTACATTTTGAGTTGCAGATTGACCTTTATTAAACACTGGAGAAAAGTGTTCGTTTTGATTAATCTTAGCCAACATTTGATTATTTAATTGTGACTCTTTAGCATTATGATGTGTTGACTTGTCTTTCATAATAATAACGCCACCAGAACCACTAATCAGTTTTTGGCTATGTTCAATAGCTAACTTTTTATTTTTAGATGTTTCAACAACTTGACTGATTCTTCTGGCATCATCACGAATTGATTTTTCTGTTTGCTCAGTATAATAGTATTGAATAAAAGTTATTAATGCAGCACTTAATAAAATTAAAACTGTCGTTACTATAAAGATAATAGTTAACCACAGTTTTATTACAACACTATTTAGTCGGCTCATCGCTAGCTCTAACTTCAAATTTGTAGCCAACACCCCATACTGTTTGAATCATTTGTGCTGCATCTTCTGAAACACGATTAAGTTTTTCTCTTAAGCGTTTAACATGGGTATCAACAGTTCTTAAGTCACCATAAAATTCATAATGCCAAACTTCTTTAAGTAATTGTTCTCTATCAAATACTTTGTTTGGTGTTTTAGCTAAATATATTAGTAGTTCATATTCTTTGGGTGTTAAGTTAACTTGTTGATTATCAGCTAATACACGATGCGCATCATTATCAATAAGTAAATGATTAAATTCTATGATATCTCTCGCATGAGGCTCGCTTTGTTCGGCGCTTGTTGATTGTGTACGTCTTAATAGCGCTTTCACTCTTAAGACCACTTCACGTGGAGAGAATGGTTTAACAATATAATCATCAGCACCTGATTCGAATCCTTCAACTCGGTTAGTTTCTTCGCCTTTAGCAGTAAGCATAATGATAGGTGTATCTTTATGCTCCCGTAGTTTTGATGCGACCTCGATTCCATCCATTTCAGGAAGCATTAAGTCTAAAAGTATGCATGCATAATTGTGGTCCATGGCTAATTCATAGGCTTCTTTGCCGTCACTAGCCTCATGAATGTTAAAAGATTCTCTCTCTAAGTATAATTTGAGTAATCTTCTAATTCTGTCTTCATCATCTACGATAAGTATTTCCTTACTCATTAATTCATATACCTCCTACACATGCTATTTTCTTGTTTATTATAGCATATGGTAATTGTTAAATCTCTAATTTCAAATTTGATTGTGAAAAAATTAGCAATGATTTTATAACCATAAAATTAACTTCAGCAAACTACATGTAACCGCTTACTAATTACCGTTTTCTGCTTGATGACGTAATACTTTTACTTCATGAGGTGTTAATACGCGTCCTTCTCCAGCGTTAAGACCTTTTAAATTTAGTGAACCGAATTGTATACGTGTTAATTTATTAACGCTATGGCCAAAATGCTCAAACATACGACGTACTTGTCGATTTCTTCCTTCACTAATGGTAATCTCAACTAACGTTGTATTTTTGTCTTTATCTTGGCGTTTAATTTTAACAGTAGCGGGTTGAGTTAAACCATCTTCAAGTTCTATTCCTGCTTCAAGTGCTTTTACTTCTTCGCGCATAAGGTAACCTTTGAGTTTGGCAACATATGTTTTTGGTATATGGTACCGTGGATGGGTCATAAGATTAGTGAACTCACCATCATTTGTTAGTAGTAATACTCCGGATGTATCGTAATCTAAACGACCAACAGGATATATTCTAGTATCTAAGTCTTTAAAATAGTCAGTCACAACTGTTCTTCCACGGTCATCTGATACACTAGTAATGACTTGCGCTGGTTTATGAAACAGAATATATATTTTATCTTCTTGTTCCATTTTGATTCCTTCTACTTCAACTTGATCTGATGGTTTTACTTTTGTGCCAAGTTCAGTGACAACTTCTCCATTCACTTTGACTTTACCTTCAGTAATCAATGTTTCAGCTTTTCTTCTAGACGTATAACCACTATTAGCAATTCTTTTTTGCAATCGCTCTAGTTCTTTGCTCATAATCATTCTCCCTTTTGATTAACTAATTGACTAAAGAAATCTTCCATTTCTTCATCATCTTCTTCGGTAGTCGGTAAATCTTCTATTGTTTCTAATCCAAATACATTTAAAAATAATTCAGTTGTATACAAGTGATGGCTTCTTGAATGTTCAACATCTTTAGCTTCAATCATACCACGAGCAACTAATGTTCTAACAGCACCATCTGAATTAATACCTCGTATTAATTCAATATCACTACGTGTAATAGGTTGATTATAAGCAACGATTGATAACGTTTCCATTGCAGCTTGTGATAATTTCATATTTGACTTTTGTTGAACGAGTTTTTCAATATAATTAGCAGCATCTTTTTTTGTAGTTAATACATAAGTTTGACCGTAGTGATGAATTTCTAGTCCATGAGATGAATAATTATCGATTAATTCAATCAATTGTGGTTTAGTAATGTCCAGTATCTCTAGTAATTGTTTTGTGTCAATACCTTCATCGCCAGCTGTATATAATAATGCCTCTAAGATTGCTTGTTTATCCAACTTGATAATTCACTCCCCTTACAATATCAATATCATCAAAATTTTGCTTTTGACTTATGTTTATTATGCCAGCCTTAGACATTTCTAAAATAGCAAGAAAATGCGTAACGACTTGTTCAATTGGTTCATGAAAAGTAAATAAGCTGAAAAAATTAAACGCTGTTTGTGTACGTAATCTTGTCGTTACAATTTCTGTTGCTTCTTCAATAGTGAATGTTTCTTTACTGATTTCTACAGTTTTTGGTGTGTGATACTCAACGCGATTTTTCACTCTTTGATAAGCAACAATCAGTTCTGTCAAATCAATGGTGTTTGATTTATCCCAACTTTCATTAGTTTCTAAATGAGATAAATCTGTCGGATGTTTTGTAAAGTAGAGATCTCGTTCTGCTTTCATACTATCAAGTATTTCTGTATATTCTTTATAGTTTTGATATTCAATTAGTCTACCTACTAAATCTTCACGTGGATCTTCTTCAAATTCTACATGATCATCTGATTGAGGTAGAAGTAATTTACTTTTAATCATTAAGAGTTCAGACGCCATAACGAGATATTCACTAGCAATATTAATTTCTAGACGCTTCATCGTATGTACATATTGCATATATTGCTCAGTTAATGTTTTCATTGGAATGTCATAAACATCTATTTCATATTTCTGAATTAAATGGAGCAATAAATCGAGTGGACCGCTAAAAGCGTCTAATTTTACTTCATACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP038807|2009293:2017988|2016730_2017264_-|WP_002492337.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSHGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEMEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP038807|2009293:2017988|2015990_2016728_-|WP_002478163.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGN >NZ_CP038807|2009293:2017988|2017256_2017988_-|WP_002459061.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >NZ_CP038807|2009293:2017988|2013382_2015131_-|WP_002492342.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDARRISQVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAKINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >NZ_CP038807|2009293:2017988|2009293_2010673_-|WP_002459069.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS >NZ_CP038807|2009293:2017988|2010659_2011619_-|WP_002492332.1|DBSCAN-SWA MKDIILYSKQHSFTYKTNKSIFNLLTGKKTHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERFMAQNVNNDMTIKVHPRYTYDSLVHTFNCIQLLIQTLSNTQQKVYSFIPISQHGLIQRKVKQIYYYIKKEDKDSAFITELNQLFKALYTNNNNYCCLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIESIPEQHLFNLEMNELVTLMYELEIEYRYPILSQCIIKPSLLHKTHITQQQLKQRFSMTQIAQKQHVKLNTIEDHILELFIKGYITHYFDFISEDGFHQFNEFYNKHRGERLKAYKQAFPNLSYFEIKLMIVGIERGELIARG >NZ_CP038807|2009293:2017988|2012119_2012662_-|WP_002478165.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIGFVLTFLKFPLPFFPPYLTLDFSDVPTLLATFSMGPIAGIIVAFIKNLLNFFFNMGDPVGPVANFLAGISFLLTAYYVNKRGHVANKAMITALVMATLVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLADIVKNIKIIIVSGIIPFNIIKGAIISIIFILLYRRIKSVLK >NZ_CP038807|2009293:2017988|2011729_2011978_+|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP038807|2009293:2017988|2015114_2015840_-|WP_002459064.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2144620 : 2153651
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038807|2144620:2153651|DBSCAN-SWA CTTATTCATCATATGAAATTAGACTCATCACGTCATAGTCTTTGATTTTCTCTATACCATTTAAATATTTTAATTCAATAATAAAAGCGATGCCAACAACAATTCCGCCTAACGCTTCGACAAGCTTTATTGCGGCTTCAATAGTTCCACCTGTAGCTAGCAAATCATCTGTAATTAGAACACGCTGTCCTGGTTTAATAGCATCTTTATGCATAGTCAATACATTTGTGCCATATTCTAAATCATATTCATAACGAATAACTTCACGTGGTAATTTACCTTCTTTTCTCACTGGTGCAAAACCTATACCCATTGAATAGGCAACAGGGCAACCAATAATAAATCCTCTTGCCTCAGGACCTACAACAATATCTACTTCTCTTTCTTTGGCATAAGTAACAATTTGGTCAGTTGCATAACCATATGCTTCTCCATTATCCATGATTGTTGTAATATCTTTAAAACTAACCCCTGCCTTAGGCCAATCTTGTACTTCTGATACATATTGCTTTAAATCCATCTTTGTTTCCTCCTAATAGTTAACCCATTTGCTCGATAATCCAATGTTTCAAATGCTGAAAATCATCATACAGCATTAATTTTTCAACTTCTATTCTTGCTTTTCTCGTTTGATAAACTTGACTTGCTTCTATATCCTGTTTATTAGGATTTTGATTTACTGATATTATACCATTGCTATCTATAATAAAGCCCAGTTCAAGAAAAACTTTTAACATAAATTTTAATGTGTTAGGCTGAATCCCCAAAAATTTCGATAATGCCATTCCATCGCTGATTAAATTTACTTTTTGTTTTGACATCAGTATTTTAAAGCAAGCTTTGAATGTTTTTTTATCAGGCATACCTTCGAAATAAATTGAATGTTGATGTTGTAAAACAACATATATTTGAGAAAATTGATGACCATTCATACTTTCTGATAAATGTGCTAATGAAAGGGGTAAATCACGTAATACGACACGACTTACATGTTCATCAATACTTTCGCCATAATGATAATAATTATGATCTAATTTTTCTTTTTGTGGATGAATTAATATGGCTAATTGCTCGTCATGAAAATCGATTGATAGCTGTTTCCGTTTACTTCTATAATCCAAAATTTGCTGTTGATTGATAGCAATATCCTGAATGATAAATTGTGGTGATTGATTGCCATTCCATTCATTGATTTGTAACTGACCTATCATGTTAATTGGTTGATTCAGCTCTAGCTCATCGACTAAACTTCCGCTATTCCAATAAAGTGTAGCCAAATTAGAGTTACCAATTGTCATTTTTAAATGATTCTTATCTTTTCCAATCACTTTCAATGAATTAACATTGACATCATCTAATTCAAATAATGGTTTATTAAAGTCGATTCCAAATGGTTTTAATCGCTCTATATCGTAAATGTTATTAACGGTAATCTCGTCTTCTGTAATTTTCACATCTATTTGTTTTTTCTGATCAAACGATGTCGTCTCAGCCAAATTTGCCATCCATGTATTTAAGCCTTCTCGCAATTCAGATATGTTTTCGATAGGCATTGTCATCCCAGCAGCCATATGATGGCCACCAAATTTAGATATTAAATTTTGATGGTCACTTAAGATTTCAAACATTGAAACTTGTTCAATGCTACGAGCTGATCCTTTTGCATAATGTTGTTCATCATCAATATTAAGAATGAGCGTTGGCAATCCATATGTTTCTACAATTCTAGACGCTACAATTCCCAACACACCTTCGTGCCAATTTTCTTTTGCTAACAGCAGAAATTGACGCCCTTTAGCCACCTCTTCTTTGGCAAGTAACAAAGCCTCTTCTGTAATTTTTGATACAATATCTTTTCGTTCGTTATTAAAATGATTAACTTGCTCTGCTAAAAATGCTGCTTCTTCAGCATCTTCTGTCATAAGTAATTCAGCAGCTAATGATGCGTCTTCTAATCGTCCAACAGCATTTAATCTCGGACCGATGATAAAGCCAATTGTTTCTTCATCAATGGGATCGTTATAGTTTGCTTCATTTAATAGTGCTGCAATTTGAATAGGCTGATAATCGTTTAATATAGATAACCCCGTTTTTACAATGGTTCTATTCTCATCTGTTAACGATACTAAATCGGCAATGGTACCTATTGAAGCAAGAGCAATATAATATGGCGGTACATTATTTTTTAGTAGCGCTTGCGAAACCTTATAAGCGACCCCTGCACCACAAAGGTTCGGACATGGATAGTCGAATTCTGGGTGCATAGGGTGAACAATCGCAAAAGCATCTGGTAAAGTGCTTCCCATTTCGTGATGATCTGTAACAATAACATCTACGCCTAATTCTTGAATCATTTCAATTTCACGATGTCCTTGAATACCATTATCAACTGTAATGATAAGTGAAACACCTTCATCATAAGCATTTTTAAACGCTAACTCATTCGGACCGTAACCTTCAGAAAAACGATTTGGAATATACCAACCTACTTCTGCTCCTAAAGATTGAAGCGTTTTTACCATAATCGTTGTTGATGTCACACCATCTGCGTCATAATCACCATAGATTAAAATGCGCTCGTGTTTATCAATTGCCAAATTAATGCGTTCTATGGCTTTGGTCATATCACTTAATAGCCATGGCTCATGCAATTGTTGTTGCCCATTCAATAATCCTTCAATATCTTTTTCATTTACGATATGTTTACTTTCTAACACTTTTTTTATAATTGGAGAAAGTTTATATTTCTTTGCTATTTGTTCATCTATATATTGAGTTGGTTCATTGTGATTCCAAGTATATTTTGATTTAATCATTAGCCTTCCTCATTTCCAAAAGCCATTATATCGAAAATCTGTTTAAATAAAAAGCTTCAACATATATTTTTTTAAGTTTTATGATGTTTGACTACAGTAAAATAAAAATCTTCTTTGTAGAAGTACTACCGATTTTTTATAAAGTTAGTAGAAAGCGTAAAGAAAATCATAATTTTGCCAAGCACTTTAAAAAATCTGTTGTTCTTAAGTAATATAGCAATAAAAAACATCATCGAACCACTAATTAGATGATTCGATGATGTTTCAGTTGATTAAACTAGAATTTTTTCGTCATTTGATTTTTTCTCTTTATAGACAACCAACTTACCTTTATCAGATTTTTTCAATTGTCGTTTTTTCATAATACCCCAAAGCGGTACAGCAATAAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATTAATCCTACAAGTAAAGCTAACGAGAAGTTAAAGATACTTGGTGCACCGAATAGTAATATGGCAACTACAACAACTATGACGGTAAGCACAGTATTGATTGAGCGTGTCATTGTTTGTCGAATTGATCGGTTAACGATATCATCAATTTGTTCTGGCGACGTAATTACTTTTAGCTTATGCAAGTTTTCACGTACGCGGTCAAACGTTACAATCGTATCGTTGATGGAATAACCAATGATTGTTAATACGGCAGCTATAAACGTGATATCTACTTCAATACGGAATAAACTAAAGACTGCCACAATCATAAATGCATCATGCAATAATGCGAGTACTGAGGACAATCCCATTCGCCATTCAAAACGCAATGATACATAAATGATAATACCGATTGAAGCATATATTAAAGCCTTCAAAGCATTTTTAGCTAACTCTTGACCTATGACAGGTGACACTGTATTTACAGAAGGACTATGTCCAAATTCATTTTTAAATTTATCATTTAATTTGGCAATGTCTTTTTTAGCTAAATCATGTTTAAACATAATAGTTGCTTGCTTTTTACCATCACCATTAATTTGTATTTCATCGGCTTTTAAGCCAACATCTTTCATTGTCTTCTCAACTTTAGCTTGTGATAGTGAATGATTCGATTCAACATCAACACGAGAACCACTTGAGAAGTCAATACCTAAATTCAGTTTGAAAATACTTAGAATAACAATACCAACGATTAAGATAAGAATACTCAAACCAATTAACGGTTTGGCTAGTTTTACAAAGTTCCATCTTTCGAAAGATGTTTTCAAATCGTGAACATCTTTACCTTCATTGATATCATGACGTTGTTTTTTCTTAACACCAAATAACCAGAATTTTTTCTTGAAGTAATTAGATGATACCAGTAATGATAATAGCCCTCTAGAAAGGAAGACTGCAGTTACAAAAATCATTAATATCCCTAATAACAGCATTGTCGCAAAACCTTTAACCGAACTTTCACCAAAGAAGAATAATACAGCGGCTGCAATAACTGTTGTTAAGTTTGAATCAAAAATGGTAAGGAACGAACTTCGATTTGCTTTAGTATAAGCTTGCTTAAGCGTTCGACCAATTCGCAATTCATCTTTTATTCGCTCGTACATAATGATATTGGCATCCACTGCCATACCTACGCCTAAAACAAGCGCAGCTAGACCAGGTAATGTTAATACACCAGAAATGAAATTAAATGCGACAAGTGTTAAATAAATATATGTCGTTAATGCGATAATTGCTACAAAACCTGGTAATCTATAGAAACCAACCATAAATAGATAAATAACAGCAATACCTATAAATGAGGCAAAAATAGTTTTATCTAATGCATCTTGCCCGAATTGTGCACCAACTGATGTAGATGTCAACTCGTCAAGTTTAACTGGTAATGAACCAGCATTGAGCAATTCTGAAATTTGTTTAGCTTTTTTAACCCCTTCTTGGCCATGGAAACCACCAGATATTTCAACACTATCAGAATTAATTGGTTGATTTACAGAAGCAACTGACACATATTTTCTATCATTTTCATTCTTTTTCTGAAGTTCTTTGTGATAACTATCTCCTTTTTCATAATCAAGCCATACAACCATCATATTTTCTTTTTTCTTAGAGATTTCTTCAGTTACCTTTTTAAACTTATCACGATCTTTTAATTTAAATGTAACGGTAGGTTCATTAGTTTGTTGTTTAAATTCTTGTTTTGCTGAACCTTGTACGATATCTTTTCCTGTCAGTTTAACATTATCATTCGCATCCCGAATTGTTAAATTAGCTTGGGAAGATAATACGTCACGAGCTTGGTTTTGATTTTTAACGCCTGCAAGTTGAACTCTAATTCTGTCTGGATCTTCAACTTGAATTCGTGGTTCTGATACCCCCAGCACATTGACACGATTTTCTAAAGTTTGAGCCGTTGATTGAAGCGCTTTTTTATCAATTTTATCGCCTTTTTGCAATGGCTTAACTTGATAAAGGACTTCGAAACCACCTTGTAAATCTAAACCAAGGTTAACATTTTTAATTACATTCTTATATGTAAGCCCCATTCCTGCAAAGAGGAGGACAATAAGTAATATAAATGCAACTATTCTACTACCTTTTTTCACATAAACACCTCATTATTTACTTATGTATCTAGAATAATCCAAACAAACGATAGCTCGCAAGTTAAAAATGGACCTTATAGACATATATAGACTTATATATATTAACATATTCAACTATAATGTGAAAATTTCTTCTTCATTCATAAAAAAACCAAGAAACACAAATGCTTCTTGGCTCACAGTGATTAAGATGGATCTACTTGTTTAATTGCAGGTTTTTCAAAAGTCATTTCAGTGCCATGACCATTAACAGTGATAACAACTGTTGTTTCATCAACAGCTTTAACTGTTCCTTTCAAACCGCCAATTGTTGTGATTTTTTGACCTGCTTCAACTCTATTAACCATTTCACGGTGCTCTTTAGCACGTTTTTGTTGTGGACGAATAATTAAAAAGTAGAATACAAGTAAAAAAAGTACTGGTATTAAAATTGCTGTTAAATTCATTCTGTACTTACTCCTTATTTAAAAATTTTTAGGGTTTTCAACATTAAGTCCATATTGTTCAAAGAACGCTTCTTTAAAATCTAAAAGTCTATCTTCTCTAATGGCCTGTCTAATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGAAGATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAACGTTTCCTCTGCTTTAATTAAATGTCTGATATACGCTCTGGAATAATTTTTACATGTGTAGCAATCACAGTTTTCATCTAGTGGACGGAAATCATTAGCAAATTGTGCATTTTTAATTACAAGACGTCCAATTGATGTCATACAAGTGCCATTTCGTGCAATACGTGTAGGTAGTACACAGTCGAACATATCCATGCCTCTTATACTACACTCAATCAAGGCATCTGGTGAGCCTACGCCCATCAAATATCTAGGTTTATCTTTTGGCATAAACTGTTCTGTATGTTTCACCATATCATACATGACAGGTTTGGGTTCGCCTACAGATAAACCACCAATCGCATATCCAGGAAAATCTAATGCGACAAGTTCTTTAGCGCTTTGTTCACGTAAATCTTTATACTCTCCACCTTGAATAATGCCAAATAATGCTTGATCATCAGGTCGTTTATGTGCTTTTAAACAACGTTCTGCCCACCGAGAAGTTCGTTCAATTGAATCTTTTACGTATTTATATTCTGAAGGCATCGGTGGACATTCATCAAAGGCCATCATAATGTCAGACCCTAAATCATTTTGAATTTCCATGGATTTTTCCGGACTTAAAAAGAGTTTCGAGCCATTCGTATGATGTCGAAACTCAACACCTTCTTCTGAAATCTTACGTAAATTACTTAAACTAAAAACTTGAAAGCCACCTGAATCAGTTAAGATAGGACCATTCCAATTCATGAACTTATGTAAGCCCCCAGCCTGTTTGATAATATCATTTCCAGGTTGTAACCACAAATGATAGGTATTACCTAATATAATTTTAGCTTCTATATCTGTTAATTCTTCAGGACTCATAGTTTTAACTGTCGCCTTTGTCCCCACAGGCATAAACATTGGTGTTTCAAACGAGCCATGTGGCGTGTGAACAATTCCTAAACGCGCGCCAGATTGTTTACAAGTCTTGATATGTTCATATGTTACTGCTGGCATAATTAAACCTCACATTCCTTAAATAATTAACATTGCATCACCAAAACTAAAGAATCGATATTCTAATTCTACAGCTTTACGGTATGCCGTTAAGATAAATTGTCTACTACTAAATGCTGACACAAGCATGACTAATGTTGACTTAGGCAGATGAAAGTTAGTAATAAGTGCGTCAATGGCTTTAAACTCAAAACCAGGATAAATAAATATATCTGTCCATCCACTCGTAGCAATGAATTGTGAATGATCTCGACGAATCGTTTCTAAAGTTCGTGTCGACGTTGTACCTACTGCAATGATTCGATGACCTTGTAACTTTGTATTGTTCAATAACTGTGCGGTATTTTCGGTCATTTGGTAATATTCGCTATGCATCTCATGTTCATTGATATTTTCTACACTCACGGGCCTAAATGTTCCTAAACCAACATGCAGTGTGATAAAAGCTATATTAACACCTTTAGCTTTAATATCTTTCAATAAATTATCAGTGAAATGTAGTCCAGCAGTGGGCGCAGCGGCTGAACCATTCTCTTTAGCATAAACAGTTTGATATCGATCTGGATCGTCTAAACGCGCTTTTATATATGGTGGTAAAGGCATTTCACCTAACTCGTCTAGCCTTTCCTGCAATATGCCTTCATAATGCAATCGCATGATTCTGCCACCTTGGTCTAATTCTTTAATACATTCTGCTATTATTTTCCCTTCACCAAACGACAGTTGGTTACCTACTTTGATTCTTTTGGCTGGTTTAAGTAAAACTTCCCAATCGTTATTTTCGATTTGAGTTAGCATTAACATTTCTACTTTAGCACCCGTCTCTTCTTTAACTCCGAATAAACGTGCAGGCATCACGCGTGTATCATTCAGAACTAAAGTATCTCCAGGATTCAAATAATTAATGACATCTTTAAAATGTTGGTGTTTCATATCGCCTGTTTCTTTATTTAATACTAATAGGCGACTTTGATCTCTATTTTTTAAAGGTGTTTGTGCAATTAAAGATTCTGGTAAATGATAGTCAAAATCCTCAATATTCAAATTTACTCCCTCTTCTCTTTCGATTTCATAAAGTGTTCATAAGCAAATGCAGTTGCTTTACGACCTCTAGGGGTACGTTCGATAAATCCTTTCTGAATTAAAAAAGGTTCATAGACGTCTTCAATCGTTACTCTTTCTTCTCCAATAGATACGGCAATAGTATCTAAGCCAACTGGTCCACCTTGATACTGGTTAATGATGCAATTCATCATTTTATGATCAATATAATCTAAACCTTGCTCATCAACTTGTAGCAACTTTAAAGCTTTCTTAGTCGTTTCTATATATATTTGATCATCACCATTAACTTGCTGAAAATCTCTAACTCGCTTCAATAGACGATTTGCTACTCTTGGTGTACCTCTAGAACGTTTGGCTAATTCAACTGCACTTTCATCATCAATAGAAGTACCTAAAACATCTGCTGTACGAATAATTATTTCTTTTAATTCGTGTTCATTATAGTATTCTAAACGCAAATGCACGCCAAAACGGTCTCTTAAAGGTCCTGTTAAACTACCGGCTCTTGTCGTTGCACCTATTAATGTAAACGGAGGTAAATCAATACGAATGCTTCGTGCTTCATCACCTTTACCAATGATGATATCTAGGAAAAAATCTTCCATTGCTGGATATAAAACTTCTTCAACTACACTACTCAGACGGTGAATTTCATCTATAAATAAGACATCCCCAGGTTGTAATCCAGATAAAATTGCAGCTAAATCTCCAGGTCGCTCGAGAGAAGGACCAGATACAGTTCTAATATTAACTTCCATCTCATTTGCAATAATATTTGATAATGTTGTCTTACCAAGACCAGGGGGACCGAACAATAATACATGGTCTAAAGGTTCTTCTCTTAATTTTGCGGCTTGAATAAATACTTCTAAGTTACTTTTAATCGTTGTTTGACCTATATATTGCTTTAAATATGTTGGTCTTAATGAATATTCAAATGCAGAATCTTCTTGGTGAAATGATTGGTCAACCATTCTATCGTCCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP038807|2144620:2153651|2144620_2145139_-|WP_002458930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVTYAKEREVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEALGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP038807|2144620:2153651|2152646_2153651_-|WP_002478078.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSFHQEDSAFEYSLRPTYLKQYIGQTTIKSNLEVFIQAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEHELKEIIIRTADVLGTSIDDESAVELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNGDDQIYIETTKKALKLLQVDEQGLDYIDHKMMNCIINQYQGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATAFAYEHFMKSKEKRE >NZ_CP038807|2144620:2153651|2150181_2150442_-|WP_002458927.1|DBSCAN-SWA MNLTAILIPVLFLLVFYFLIIRPQQKRAKEHREMVNRVEAGQKITTIGGLKGTVKAVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP038807|2144620:2153651|2147707_2149996_-|WP_037540792.1|DBSCAN-SWA MKKGSRIVAFILLIVLLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVKPLQKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPRIQVEDPDRIRVQLAGVKNQNQARDVLSSQANLTIRDANDNVKLTGKDIVQGSAKQEFKQQTNEPTVTFKLKDRDKFKKVTEEISKKKENMMVVWLDYEKGDSYHKELQKKNENDRKYVSVASVNQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQISELLNAGSLPVKLDELTSTSVGAQFGQDALDKTIFASFIGIAVIYLFMVGFYRLPGFVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYTKANRSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNYFKKKFWLFGVKKKQRHDINEGKDVHDLKTSFERWNFVKLAKPLIGLSILILIVGIVILSIFKLNLGIDFSSGSRVDVESNHSLSQAKVEKTMKDVGLKADEIQINGDGKKQATIMFKHDLAKKDIAKLNDKFKNEFGHSPSVNTVSPVIGQELAKNALKALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILLFGAPSIFNFSLALLVGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSDKGKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP038807|2144620:2153651|2151618_2152644_-|WP_002492120.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNKETGDMKHQHFKDVINYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGVKEETGAKVEMLMLTQIENNDWEVLLKPAKRIKVGNQLSFGEGKIIAECIKELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKARLDDPDRYQTVYAKENGSAAAPTAGLHFTDNLLKDIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVENINEHEMHSEYYQMTENTAQLLNNTKLQGHRIIAVGTTSTRTLETIRRDHSQFIATSGWTDIFIYPGFEFKAIDALITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQFILTAYRKAVELEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP038807|2144620:2153651|2145158_2147435_-|WP_037540789.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWNHNEPTQYIDEQIAKKYKLSPIIKKVLESKHIVNEKDIEGLLNGQQQLHEPWLLSDMTKAIERINLAIDKHERILIYGDYDADGVTSTTIMVKTLQSLGAEVGWYIPNRFSEGYGPNELAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGHREIEMIQELGVDVIVTDHHEMGSTLPDAFAIVHPMHPEFDYPCPNLCGAGVAYKVSQALLKNNVPPYYIALASIGTIADLVSLTDENRTIVKTGLSILNDYQPIQIAALLNEANYNDPIDEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMTEDAEEAAFLAEQVNHFNNERKDIVSKITEEALLLAKEEVAKGRQFLLLAKENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTLILNIDDEQHYAKGSARSIEQVSMFEILSDHQNLISKFGGHHMAAGMTMPIENISELREGLNTWMANLAETTSFDQKKQIDVKITEDEITVNNIYDIERLKPFGIDFNKPLFELDDVNVNSLKVIGKDKNHLKMTIGNSNLATLYWNSGSLVDELELNQPINMIGQLQINEWNGNQSPQFIIQDIAINQQQILDYRSKRKQLSIDFHDEQLAILIHPQKEKLDHNYYHYGESIDEHVSRVVLRDLPLSLAHLSESMNGHQFSQIYVVLQHQHSIYFEGMPDKKTFKACFKILMSKQKVNLISDGMALSKFLGIQPNTLKFMLKVFLELGFIIDSNGIISVNQNPNKQDIEASQVYQTRKARIEVEKLMLYDDFQHLKHWIIEQMG >NZ_CP038807|2144620:2153651|2150460_2151600_-|WP_002458926.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELTDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTSRWAERCLKAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSIGRLVIKNAQFANDFRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEAFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2271020 : 2301275
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP038807|2271020:2301275|DBSCAN-SWA TATGTATCAAACAATTATAATAGGAGGCGGTCCAAGTGGCTTAATGGCTGCAGTTGCAGCAAGCCAATCAGGACAACGTGTATTATTAATAGAAAAGAAAAAAGGTTTAGGACGCAAGTTGAAGATTTCAGGTGGTGGACGCTGTAATGTCACAAATCGCTTACCTTATGAAGAAATAATTAAAAATATTCCAGGTAACGGAAAATTTTTATACAGTCCATTTTCAACATTTGATAATGAATCTATTATTCAATTCTTTGAATCCCGAGCTGTTAAACTAAAAGAAGAAGATCATGGCCGCATGTTTCCCGTCTCAAACAAAGCCCAAGATGTTGTAAATGCTTTAGTTCAAACGATTCATTCTCAGAATGTCGATATAATTGAAGAAACACCTGTAACTCGTATTGAAAAATCAACAAATGATAGTTTTATCGTACATACCCAATCTAAAAGTTATAATGGCAAAACATTAGTGATTGCAACTGGTGGGACTAGTGTGCCACAAACCGGTTCAACTGGAGATGGCTATCGTTTTGCACAAGCAATGGGACATACGATTACCGAATTATTCCCCACGGAAGTACCTATCACATCAAACGAGTCTTTTATTAAAGAACAACGCTTAAAAGGTCTAAGCCTTAAAGATGTTTGTTTATCAGTACATAAGAAAAACGGCAAAATACGTATTAGTCATAAAATGGACATGATTTTCACCCACTTTGGGATAAGCGGCCCCGCTGCATTAAGATGTAGCCAATTTATTTACAAAGAACAGAAACAGCAAAAAACGCAACAAATAACAATGTCTTTAGATGTATTTCCAGATTTAAATAAAGACAAATTAAGTCAAAAAATTAATAAGCGTATTCAATCACAGCCAAATAAAATTATAAAAAATAGTTTACATGGTTTAATTGAAGAACGTTACTTAATATTTGCGTTAGAACGTGCAAACATTAATGATGACATGACAGGACATCACCTTTCAAATCAGCAATTGCAACAACTTGTTGAAATATTTAAAGGATTTAAATTTAAAGTTAACGGCACATTACCTATAGATAAAGCATTTGTAACTGGCGGCGGTGTTTCCTTAAAAGAAATTTGGCCTAAAACAATGATGTCTAAACTTGAACCAGGTTTATTTTTGTGTGGAGAGGTCTTAGATATTCACGGTTATACTGGTGGTTATAATATTACTAGCGCCCTTGTGACTGGACATGTCGCAGGCCTCAATGCCGGAAGTTATTTATATCATTAACTTTATAGCTAGCATTTTTTAAATCACGTTTAGACTTGGCTTTAAAAAATAAACACCCATTTAGCTACCGTTAATAAATGGGTGTTTATTAAATCTATTAAAATTCATTTACTTAAAAATTAAATACGTTTTATTTCTAATCCTTCATTGCCCCAAGCTTTCATACCGCCTTCTACATTGACTGCATGAATATCTTGTTTTTCTAAATATCGAGCTACTTTTTCACTTCGAACACCTGCAGCACAAATAATATAGTAAGTATCATTTGTATTAAAATAATCAATATTTGATTCAATTTTATCCATAGGAATCGTTTCTGCACCAGGTATGATACCCATAGATGTTTCCTCATCTGTACGAACATCAACAATATTAACTGGATTAGATTCTAATACTTTATTTTTCAAATCTTCAACAGTTATTGAATCCATTATTCAACACTCCTTTATTTATTTTGCTACAATATTTACTAGTTTTTGAGGGACTGCTATTACTTTCTTAATTTCTTTACCATCTATAGCCATTTTAACATTTTCATTTTCTAATGCTAATTCTTGCATTTCTTCTTTGGACAGCTCTTTAGGTATGGTTAGTTTTGCACGCACTTTACCATTTACTTGAACGACAATTTCAACTTCACTATCAACCAACAGTGTTTCATTATAAGTTGGCCATGGCTGATAAGTAATCGTTTCATCATGTCCTAATTTTTGCCATAATTCTTCACCTATGTGTGGCGCAATAGGCGCAAGCATCTTCACAAAGCCTTCCGCATATGGTTGATAAATTTCATCTACTTTATAACATTCATTAATAAAGACCATCAACTGACTGATAGCAGTATTAAAATTCAATGTATCAAAGTCTTCTGTCACTTTTTTAACCGTTTGATTATATACTTTATCTAATGATTTATTATTTGATTCAACAAATTTTTGAGATAGGCTATCATCCTCATTGATAAATAAACGCCAAACTCGGTCTAAGAAACGTCTTGAGCCATCTAAACCATTCTCACTCCAGGCAATAGCAGCATCCAAAGGCCCCATAAACATTTCATAAAGTCGTAAAGTGTCAGCACCATGAGAATTTACAATATCATCTGGGTTAACAACATTACCTTTGGATTTACTCATTTTCTCATTGCCTTCACCTAAAATCATACCTTGGTTAAATAATTTTTGGAATGGCTCTTTTGTTGGAACTACGCCTAAATCATATAAGACTTTATGCCAGAATCGAGCATACAACAAATGAAGTACTGCGTGCTCAACGCCGCCGATGTATAAATCAACTGGTAACCAATGCTTTAATTTTTCTGGATCTGCTAACATTTGCTCATTATGAGGATCAATATAACGTAAGTAATACCAACAGCTGCCAGCCCATTGTGGCATTGTGTTCGTTTCACGACGACCTCTCATTCCCGTTTCTTCATCTACAACGTTAACAAAATCATCTATATTAGCTAATGGTGATTCACCAGTTCCAGACGGTTTAATTTCATCAGTTTCTGGTAATAATAGTGGTAATTCTTCTTCTGGTACCGTCGTCATTGTTCCATCTTCCCAATGAATGATTGGTATTGGTTCACCCCAATAACGCTGTCTACTAAATAACCAGTCACGCAACTTATAGTTAACTTTTTTCTCACCGGCACCTTTTGCTTCTAATAACTCAATTGCTTTAGCAATAGCCTGTTCATTATTTAAACCATCTAAGTCACCAGAGTTAACGTGCTCTCCTGCACCAGTATAAGCCTCTTTTTGAACATCTCCACCAGCAATAACTTCTATAATCGGCAAATTAAATTTAACCGCAAATTCGTGGTCGCGTTCATCATGAGCAGGCACTGCCATAACAGCTCCAGTACCATAACTAGATAATACATAATCAGCAATCCAAATCGGTAATTTTTCACCAGATAAAGGATTAATCGCATATGCGCCAGTAAAAACACCAGATTTATCTTTTGCCAAATCCGTACGCTCAAGGTCAGATTTTTTAGATGCAGCTTCTTGATATTTCTTAACTTCTTCAAAATTTTCAGTTGTTGTAATTTTTTCCACAAGCGCATGCTCTGGACTTAATACTAAGAAAGTCGTACCAAAAATCGTATCTGGACGCGTAGTGAAGACGTCTATTGTGTCATTCTCTCCTTCAACTTTGAAAGAAACACGTGCCCCTTCTGAGCGACCAATCCAATTACGCTGCATATCTTTTATCGATTCAGGCCAATCTAAGTCATCCAAATCTTCTAGTAGTCGATCGGCATATTCTGTGATCTTGAGTACCCATTGTTTCATAGGTCTACGGTATACAGGATGGCCTCCTCGTTCAGAAACACCATCAACAACCTCTTCATTAGATAAAACCGTGCCAAGTGCTGGACACCAGTTTACCGCTACTTCATCAACATAAGCTAACCCCTTATTATAAAGTTGGATAAAAATCCATTGTGTCCATTTATAATATTCAGGATCTGTTGTATTAACTTCTCTATCCCAATCATAACTAAATCCTAATTCTTGAATTTGACGTTTAAAAGTTTGAATATTTTGTTTCGTAAATGCTCGTGGATCGTTTCCAGTATCAAGTGCATATTGTTCTGCAGGTAAGCCAAACGCATCCCAGCCCATTGGATGTAAGACGTTATAGCCTTGCATACGTTTATAGCGTGAAATAATATCCGTAGCAGTATATCCTTCTGGATGTCCTACGTGTAAACCAGCACCTGATGGATAAGGAAACATATCTAAGGCATAAAATTTCTTTTGTCCCAAGTTATCACTTGTCTTAAATGTTTGATTATCTAGCCAGAAACATTGCCATTTTTTTTCGATTTTTTTGTGATTGTAATTCACTTTTTTTCCTCCTACTCAATAAAAAAACACCTCATACTATTATAAATAAAGTATAGGGACGACAATTATGCCGCGGTACCACCCTAGTTCACATATATGTGCACTTAATTAAATAGTAAGAGATGTATATTACATTAAATAACGGTAAGTTCACTTAATACTTAACGCTAGTTTACACCACCACTAGCTCTCTGTTGAAAAATATTTAAGTTACTACTCCAATACACTTTAATATTATTGGATAATGTAACTGATTGCAAGTGCAAGTTATTACATAACTGAACAATTAATATAGAAGCCTAGCTCAGTCAATTAACATGGTTATATTGTTTTATCCTTAGGCATATTTTTATCAAAAACAGCTAAAAAACACAATGCTATGCTTAATAACACAATCATGCCAATAAACATGGTACTCATATTAAAGGCATCGACTAAAATACCACCTATAAGTGGCCCAAATGCTTTACCGACCGTAGAAGCTGAATTAACAAACCCCTGATACTGTCCTTGTTTACCATCAGGCGCTAAAAAATTCGCGATAGTTGGGACAGCAGGCCAAACGAACATTTCGCCAAATGTTAATATAATCATACCAATGAGAAAGACACTAAATTGTTCAGCAAAACTAGTCACTAAAAACGACACCATAAAAATAATAATACCTACAATCATTTGTTTTTTTATATTTCCTTTGAGTATACGAATTACCGGACTTATCAAAGGCTGTGCAACTAAAATCATAATACCATTCACTGTCCACAATATACTATATTGCGACATTGAGATATCGATGTCTTGTGTAAATGAAGCAATCGTACTTTCCCATTGTATATATGCAATCCAACAAATACTAAACATAATACATAAAAGGA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32 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2422139 : 2435309
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038807|2422139:2435309|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP038807|2422139:2435309|2423171_2423681_-|WP_002492698.1|DBSCAN-SWA MAEQKYLTTVENIIGLMKEEIKNISPLRLQKTLYFLFAYYGASYGQLSKSKEYEVTKSESLNLPEYLFDAQFEAWQYGPVIRDVYKNNKYSLGYNDIDFSMSNFEIEDKTMQQEITEYLREIIKSTLKISDFGLVERSHEDEEWKNKITQQEIMNNDLIIKEYIGLVNA >NZ_CP038807|2422139:2435309|2429098_2429968_-|WP_002445370.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDGANDHGEIIKKHRNDKNVIYRNVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQSRIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALTVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKEYKQSNASPNVIGYTRRDSAYWRELSFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSYALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >NZ_CP038807|2422139:2435309|2424595_2425117_-|WP_002445376.1|DBSCAN-SWA MKTLDQIEKYKTNIEDYRKEIKNLDAEVKNDGKQLDDINQEYQDLVINGEVEKADKLYTKIEKLESDYRAKSKRLMVMKQSFKKVVIKNCENMQDVADELSDEYNETYQDDLKRYETLNQQLKDAKDKLLGYNDEYSAKQRTLTQYIDRLKRENNIQPVEFIGNVNIIQPFNI >NZ_CP038807|2422139:2435309|2423960_2424533_-|WP_002445377.1|terminase|DBSCAN-SWA MPKLTPKQERFVNEYIRTLNVTQSAITAGYSPKTAHVTGSRLLKKKHINEYIQEQKKKVIDESILSANELLHLLTNSAVGDETETKEVIVKRGEYKENPQNGKIQLVYNEYVELIEIPIKPSDRLRARDMLGKYHKLFTEKKEFTADTPVIINIGEWDEEDEEDKQRTLDKINDNYPNRTMIVDDIPLED >NZ_CP038807|2422139:2435309|2426007_2426649_-|WP_002492310.1|DBSCAN-SWA MNIEIIANQFETRAAALLRYYTGLLESSKKTPFGFKIYNDPFDMVYVVMEGNLYGHIYIKDCNVRKAFELASPKHTEGLIRSIEGHYAGYEIPDGTHDTISDMMASFMFDNDYFMYGLETFAESNNTDMFTYIEGGLNVEELEGVQSSNADVIGNIEILYQLATGINEPASELVEGLKLVTAFVQDENATLDDYKALERKLSELKSSYYSLSK >NZ_CP038807|2422139:2435309|2422139_2422388_-|WP_080047653.1|DBSCAN-SWA MGRRLKHVKENDLAHGELGNWLKNINLDRTQAHRFIKVSEEIKDVGTYQHLGLRALSEIANLPVPERTKIHITSNSKTKIPY >NZ_CP038807|2422139:2435309|2431024_2431243_-|WP_000153640.1|DBSCAN-SWA MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA >NZ_CP038807|2422139:2435309|2430357_2430567_-|WP_001058489.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVDGIEVVSEVSREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP038807|2422139:2435309|2425375_2425720_-|WP_002445374.1|DBSCAN-SWA MQKLVEKEKTYNLPDEHRQVLNVIRNTSKKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYAYPIGCSYKRNERGYYIITTEQEKQQAMISIKKLADGSMKRYEALKRIEV >NZ_CP038807|2422139:2435309|2430702_2431020_-|WP_002445364.1|DBSCAN-SWA MFNINIDEDEARELLEQAINVRVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >NZ_CP038807|2422139:2435309|2430559_2430706_-|WP_002445365.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGCNLTGGLENE >NZ_CP038807|2422139:2435309|2427375_2429085_-|WP_002445371.1|DBSCAN-SWA METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGVALYQLIPSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINVSKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNVKLFSNDKGFQKLIDSFRSKGTLQGYSKKVFAQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDQPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKKAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIVGDGYDSVNYGDVKAVYKHDFLCIKNETVKNKLGHEMQTITGQWNKKGYLITDKKRLQKQVKHKSERHLGYAIKKEIIEELGFDFSHSHNPYNENY >NZ_CP038807|2422139:2435309|2432103_2433276_+|WP_002492309.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYEKRGNTWRYRISLGKDAKTGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRTGDYIAPSTSTFKQVANDWLKQYANEVKVSSVRAREKAIHHAIERFNNKPIQTINKHDYQRFVNDISAQYSKNYIDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEIAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQYQILTPKTESSIGKIPVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >NZ_CP038807|2422139:2435309|2425128_2425386_-|WP_002445375.1|DBSCAN-SWA MKFKGVYYMKANQYEELSEVLDLTESQKLKLYVYQERQNKNIKQDSKESKQNNEEANREKRQKILDIKDDVTRQNAIAKNRELFK >NZ_CP038807|2422139:2435309|2426662_2427028_-|WP_002445372.1|DBSCAN-SWA MEKEQLKQYMYDYVKEYEEIPIYQLEDLFKELDHDYKGKTSVTHDQDKNIVFWSGWNKLTMYALIELVKGEHLDLVYRGSYVMRYLLDGRVPSLPLAITYPEYGQQTEVPSWVPMLLRVTK >NZ_CP038807|2422139:2435309|2435024_2435309_-|WP_002461410.1|DBSCAN-SWA MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP038807|2422139:2435309|2430031_2430355_-|WP_002445368.1|DBSCAN-SWA MNWEIKNLFSDLKLLKDSFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGFSYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDKIIQKFHELEKASSENFGEESDDAQKLKITE >NZ_CP038807|2422139:2435309|2431415_2432090_+|WP_002445345.1|DBSCAN-SWA MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMTQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKCTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY |
18 | Staphylococcus_phage(66.67%) | terminase,integrase | attL 2419516:2419535|attR 2433343:2433362 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP038807.1|WP_002459743.1|1301089_1301488_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI |
1301089_1301488_+
Protein sequences of NZ_CP038807.1|WP_002459743.1|1301089_1301488_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI>NZ_CP038807.1|WP_002459743.1|1301089_1301488_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKVIYFSFSGNVQRFIKRTELSDVMEITEDNCQEEVNEPYILVTGTIGFGEVPQEVQQFLQVNHQHLQAVAASGNRNWGQNFAKAGQTISEQYNVPLLMKFEVQGSNSDVKEFKDKVGQFNENYEREKIQSY |
132 aa aa | NA | NA | NA | 1293675-1311456 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|2021965|29|NZ_CP038807|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038807 position: 1295656-1295684, mismatch: 0 accccaacttgctttgcttggtgaaatgc CRISPR spacer accccaacttgctttgcttggtgaaatgc Protospacer ***************************** |